Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_LN681228 | Xenorhabdus nematophila AN6/1 plasmid II, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_LN681227 | Xenorhabdus nematophila AN6/1 chromosome I | 4 crisprs | DEDDh,cas14j,DinG,WYL,PD-DExK,RT,cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,cas1,cas2 | 4 | 38 | 22 | 1 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
17873 : 133140
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN681228|17873:133140|DBSCAN-SWA TATGAAATCAGAAAATAAACGCACTCAGCGTGATTATTCACTGGCTTTTAAATTAGCCGTTGTTGATCAAGTTGAAAAAGGCGAGATGACCTACAAACAAGCCCAAAACCGGTACGGTATTCAGGGGCGTTCAACCGTTTTAGTTTGGCTTAGGAAGCATGGTCAGTTAGATTGGAGTCTGGGTTGTACCCCTTTACATCCTCAAGGAGTTGCCGTGACTTCATCCTCCTCACTCACGCCCGAGCAGCGGATAAAAGAACTTGAACAACAATTGGTTGAAATGGAAAAGAAAGCCGAGTTTTTTGAGGCGGTCGTTGATGTGTTGAAGCGGGATTATGGAGTGACTGTCGTAAAAAAGCCACGAGGCAAGTCATCCAAGAGAAAAAAATAATCGGCTTCAATGTGGCTCAATGCTGCCGTTATCTGAGTATTACACGACAAGCTTATTACCAGCAATGTCAGCGGGCAGCTATAAAAGAAAAACAGGAACAGGAGGTGCTTAGGCGAGTACAGTCCATTCGCCTGCAGCAGCCCCGTATTGGCACAAGAAAGCTTCAGTATCTGCTGAATCAATCAAGCCCATTAAAAATAGGCAGAGACAGCCTATTCGATTTACTCAGAACCCATCGCTTACTGGTCAAACCCAGACGGGCTTACCACAAAACGACGCAGAGCCATCATCGTTTTCACTGTCACCCCAATTTACTCAAAGCCGGTCCCAATAAGATAACCCCAACGGGGCCGGAGCAAGTCTGGGTGGCAGATATTACGTATCTGCCCGTGAAAGCAGGAGAAGCGTATTTAAGTCTGATTACGGATGCCTGGTCACGTAAAATCGTGGGGTATCATGTTCACGATAACTTAAGCACAGGCTCGGTCATTCAGGCTTATAAACACGCCTTAAAAAGTCGAAAATTGATTGAACAATCGCTTATTCACCATTCAGATAGGGGATTGCAATATTGTTCAAAACACTATCAAGCGCTACATCAGCACCATGAGATTATCTGTTCAATGACAGACGGTTATGATTGCTATCAGCATGCCCTGGCAGAGCGAGTTAATGGTATCCTGAAAACTGAATTTTTACTCTGTAAACCCGCAGACCTGAAAGAAGCGGCGAAAATGGTAAGTGAGTCGATAGATATTTATAATCGGTATAGGCCTCACTGAGCCTTACACTATAAAACGCCCGATGAAGTCCATCATCAGGCGTTAAGCAAAATAAGTGTCAACGTATATCAGGACTAGACAGTAAAAAGTCTAGTTATAACAAATCTCAACTCTTTCCTCATTTGCTCAAAAAGGGCACTTTCACAGCCCATGTTTATGCACACCATCCCGTAATCTCCGATATTGGGTTCCTGTAACTCAAAACGAATGGAGAATGCGATGATCAATTTTAAGCCTAAACTTCCGGCGTTGCTTGGAGCTCTGGCGGTTCTTACCGCTGGTGCTGCTCATGCAGAGTTGCTGGAATATACCTTTAAGGCTCCAGATGGTACTCAACGGTCTCTGCCTCCGAATACCAACTACGCCAACCCGACGGGCAACGTTTCGTTTGCCTTGAGTGCCGGTATCGACCGCAAGGTCAAGATTTCGGTACTTCGGTCGGATGGAACAGTGGTTTCGACAGCGACCAGTCACCTTCTTGGGGCTACAGATCGCATTACAGTAGGTGGAAAATCCTACTATGGTGCGGAACTTCAACTACCAGCTCCGGTTGCTGGTGCATATCTGGTCAGGGCGGAAATTCTTGCCTCTGATGGATCTACAGTCCAGACAGATGAATACCCTCTGACTGTCGATGTTACCCCTCCAACCTACACTTCGATTGCACCTGTTTACAGTAACTATGGACAGGTCACTAGCGGTGATATTTGGAAGCTGGGTCTAGGTGGCTCTGAGGATAATGCCTTTTTGCTGTCTGGAATTTCTGATGAGTCACCCATCAAAGGCGTCCAAGCAAAGTTGTATCGTCAAGACGGTTCACTCTACAAAGATGTATCAGTGAACTACGATGACGCTAACGGACAAGCTAGACAGTCTTTCCAATCAGGCTTTTTCCCCGGCTCTGACTTGGATGAAGTGTTTACACTTCAGTTTGAGATAAGCGATAGTGCTGGGAATATCTATCCTTCGCCTCGTCAAAAAGTGATGTTTGATAGCATAACCAATGCTCCGTCATCACCTTTTGGTGTTTATGACCCCTCCAGCACAAATAATTTGGGTCCAGGATTGTCGGGATTCGTTGCTTATACGGCTGGAATGGCTGTTAAAACCAACCCTATCAGGTTGGCTTGGCGAGTGCCGCGAGACAACTGGCATGAGTACCGAGAAGGCGGAATTAAGATGGTCAACGCCTTAGGTGAAATGACCAAAGTTGGTGAGGATGGTAACTATGTTTATCTCGTCACAACATCGCCTTATGGAAATACTGACGGCAACTATTGGCGTTGGGTGAACTTCGGCCAGTGGGGTGGAGGAGGCATTGGTTATAACCTCACTCTAGCTCCATCAGCGCCCCAAAGTCCCAAACTCTTGGGGGTGGATTACAACTACAGCGACATCGGGTGGTCAACTATGCACCGCTACTGGGTGAACAGTTCTGTTCTTCCAGTCACTGTTAGCAGTATCCGAGTCAAAGTTGAGCCTCGGCCTTACATTCAAACTGCTGTTCATCGGGGAAGTTGTGAGATACCAGTTGGTCAAGATAACTGTGTGATTGAAAACAGCTTCACTATGACTAAAGGAACAACTGGGTATATCCATGACAATGCTACGGTCTACAACTCTGACAGATCTCTGTCTTCAAATCCTATGTGGGCAGAAGTTAACTGGAACGACCAGCACTACCCTCAGCTAAGTCAGCAATACGATCAAAGCAGCAAGGTATTTACCTTGTTCGTTAACCAGCCAGGACGAGGCGCTTACTTTGATAGGCTGCGTCTGCGAAGTGCTTGGATCGAAGATAGTAAAGGCAACAAGCTGTCCCCAACCGGTGGGTTAATAGCCAACAACTGGGAGAACTACACCTACCAGTGGGATCTAAAAACTCTCCCCGAGGGGCAATACAGTCTCGTTGCCGCAGCAGAGGAAATGCACGGGCCTTTAACTCGGCAACCCATGTTTCAGATCACGTCCGATAGAACTGCACCAACACTGACGATCAGTGTGGCAGATGGAGCTGCTATTCAGACTCTGGACGATGTGGTCATTACTTTGGCTGATGCTGTTGATCCTTCTCCTAAGCTGACCTCTATTGCCCTCGTCGGAGGCCCTGCCGATGACAAGGTTCAGTTGTCTTGGCGCGAAGAGTCGAAAGGGCGATTCCGCCTTGAGTACCCGGTAATGTTCCCGTCTTTGAAGGAAGGGGAATCTTACTCGCTGACTGTGGCGGGAGAGGACGCCCAAGGCAACGCGGTACAAAAGGCTGTTGGCTTCGAGTACAAGCCTCGTCAGGTGATGTTGGCGGATGGTATGGATGGGAAGGTCATGATTCCTGCTGTCACCCATGAATTTGTTCATGCGGATGGCAAACGGATCATTGAGACTAAACCGCTGACGCTCAGTGATGGTGCTGTCGTGACAGGTTCATATGACGTGTTTGCGACTCTCCGCTCTGATGCACAAGTGCCGCTGGTTGTTAATGGTGTTCGCATCGAGCCGGGCCAGACAATGGGAATCATGAGCCAACATGATTTTGGTGCATCAGGTGGACGCTTGAGTATCCCTGTTAAACCTGCTGTACCTGATGAGGTAGGCTCTTCCAGCCTTCTTGTCATGACTTCTGCGCCGAACTCACCCATCCTGGTTGTAGACATCAATACTTGGAAAGGTGCAGCTAAACTCTCTGCTGAGTCATGGACAATTCGCCAGGTTATTGATCCGGTGAAAATCTATGCCTTACCAGAACTGGGAGTTCCTTGCCGGTTCACCACGAAAGCAGATGTTGCTATGGCTGCAGACCCGATTCGTGATCCGGTATGTTTGCTCCAGTGGGACAGAACTCCTGATGAGGCGGAACAAACGACACAGGACAACAACGGCATGAAGGTTGCCGGACTGGTCGGGCAGGCGGTGAGCATTGGTGAGCAACCTGTCGAATACAGCCTGTACCTGTTCAGTGGTGATGGCTCCAAGGTGAAAGTTGGTTCAGGCTCTCAGAACCTGACGGTAACTACAGCCTATGATTCTGTCGGCTACTCACCTATTGATGATATTGCTCAGGTGAATCGCGTCATTGAAGATTTTGATGTGAACTTCAAGCAGAGCAAAGGTCCTGATTGTTCTATCACTCTAAGCGCTGACCGAGCGAAAAACGAGGCTGCGAACAAAGGGGTGGGGAGTACAAGCCGAACCTGTTTGTTTGAGTGGCAGCAGATCCCTGATGGATTGGTCCAAGACCAGTTATCGGAGTCGCCTTCGTTGTCTGGCTCATTGGCTGCGAACGGAGATCACCCAGTGGGCTGGCGGGTAAGTATATTCACCCGTAATGGCACTCGGGTGACATTGAACGACCAGACGTTCAATATCGAAGCTGTTGATCCACCAGCTCCGACCGTGGAACTGTCCTCTAAGTACAACTTCAAAGACAACATTTACATGGTGCCGATGACAGGTAACTACCTGGGTGATGCCGTTATCAACTCTGAACGAGCTGATCTGGATATTGCCATCTCGCGCAACTCTGATGTTTTGGAGTCTGAAACATTCACTCCTGGGTGGGGTGCCACCAACAAGGTGTATCGTCGCATCAACACCGATGAGCGAGCTTTGTGGGAGGAGACTACTTACAAGGTGAATGCTGCGTACAACAAGGTGCCTGATGTAAAAGCGGAGGTTGTCTACCGAGCTATAGCTGCACCTTCTGATAGCATCCGGCCTATCGTTGAGGTTCAAGGTGACACGGCGATTGATACTCAGGCCTTGCCTGTCCGGGTACTTATCCGTGATCAGTACAAACCTGACGGAGACTATGACGCCAACACGATGGGCGT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95 | Enterobacteria_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN681227_1 | 1813975-1814065 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN681227_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LN681227_1
>1.1|1814004|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder AATCTGCGCCCCGCTGGCAATACCGCCGTAAG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN681227_1
The CRISPR arrays of NZ_LN681227_1 >merge|NZ_LN681227|1|1813975-1814065|CRISPRCasFinder CAGTTTGTCTCCGTATTTACGGGGAACACAATCTGCGCCCCGCTGGCAATACCGCCGTAAGCGGTTTATCCCCGTACTTACGGCAAGGTGA >NZ_LN681227|1|1|1813975-1814065|CRISPRCasFinder CAGTTTGTCTCCGTATTTACGGGGAACAC AATCTGCGCCCCGCTGGCAATACCGCCGTAAG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGCAAGGTGA
>NZ_LN681227.1|WP_013184114.1|1810280_1811159_+|pyridoxal-kinase-PdxY MKNILSIQSHVVFGHAGNSAAVFPMRRMGVNVWPLNTVQFSNHTQYPQWRGCVMPPDHLAEIVQGIGEIDKLKSCDAVLSGYIGSAEQGNYILDIIKKIKQTNPEAWYFCDPVMGHPEKGCIVVPGVAEFFCEKALPVSDIIAPNLLELETLSARKIENVEQTISAARELCEKGPKVVLVKHLSRAGYRTDCFEMLLVTKKHSWHISRPLIDTGERQPVGVGDLTSGLLLVNLLKNTSLTDEDLKTALEHVASAVYEVMLETQVRGEYELQIIAAQDKMVTPTHLFSATLLD >NZ_LN681227.1|WP_010847289.1|1808859_1810131_+|tyrosine--tRNA-ligase MSSNNLIKQLQERGLVAQVTDEEALAERLTQGPVSLYCGFDPTADSLHLGHLVPLLCLKRFQLAGHKPIALVGGATGLIGDPSFKATERKLNTEETVKEWVAKIRKQVSPFLSFDGENGAELANNYDWFGEMDVLAFLRDIGKHFSVNQMINKEAVKQRLNRDDVGISYTEFSYNLLQSYDFANLNGKYGVELQIGGSDQWGNITSGIDLTRRLHQKQVFGMTVPLITKSDGTKFGKTEGGAVWLDPKKTSPYKFYQFWINTADADVYRFLKFFTFMDIEEINVLEEEDKNSGKAPRAQYVLAEQVTGLVHGEEGLAAAKRITESLFSGAIADLTEDDFAQLAQDGMPAIELEKDADLQQALVIAEFVPSRGQARTMISSNAVSINGEKQSEPMHVFTDGDRLFGRYTLLRRGKKHYCLIDWK >NZ_LN681227.1|WP_013184112.1|1807843_1808497_+|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase MPEYNEMTIAELRREYIHGGLRRKDLTKEPIELFELWLKQACDAKLSDPTAMCIATVDEQGQPYQRIVLLKHFDARSLVFYTNLGSRKAKHLAQNNRISLHFPWHQLERQVSFLGKAERLSPTEVMKYFHSRPKDSQIAAWASQQSSRVSARGILEGKFLELKQKFQNGEVPLPSFWGGFRVEFDSVEFWQGGAHRLHDRFLYQREGNGWHVDRLAP >NZ_LN681227.1|WP_010847291.1|1806659_1807769_+|anhydro-N-acetylmuramic-acid-kinase MKSGRYIGVMSGTSMDGVDVILAEMSDKVVTQQESYSHPFPQELKQKLLSICQGQQTTLSMVGRFDYELGTLFAEAVQGLLDKAGLTASDITAIGCHGQTVWHEPDGEKPFTMQIGDNNRVAALTNITTVGDFRRRDMAYGGQGAPLVPAFHMAVLGHSTERRIILNIGGIANISALLPNSAVKGYDTGPGNMLMDAWVWRHKQLPYDKDSLWANEGTVNELLLQKMLSDPYFARTAPKSTGREYFNMAWLEKQLADFPEVAPVDVQTTLSELTVVSIAQQVMLSGGCERLLVCGGGAHNPRVMNRLSTLLPNTEVTTTDKYGLSGDDMEALAFAWLAFRTMSGLSGNLPSVTGADRETILGAIYPVVR >NZ_LN681227.1|WP_010847292.1|1805852_1806326_-|glycine-zipper-2TM-domain-containing-protein MFKRFLVGAVVVTTLSGCADMGALSSDTYSMDQAKQAQTVTYGTILSVRPVTIKGNQAGDPNVLGLIGGAVLGGLLGNTVGGGSGQRLATAAGAIAGGMAGQRIEGAIDQTKGVELEIRTDSGKNIIVVQKLDQVVFNRGQRVRIANSGNSLTVSPR >NZ_LN681227.1|WP_010847293.1|1805222_1805660_+|transcriptional-regulator-SlyA MELTLGSDLARLVRVWRALIDHRLKPLKLTQTHWVTLYNISQLPPEQSQIQLAKAIGIEQPSLVRTLDQLEEKKLITRHTCANDRRAKRIKLTGESETFIREVDSVIDLTRKEILEGITHNELILLASVIKKIEKNIGQLHKQVI >NZ_LN681227.1|WP_038251677.1|1804304_1804544_+|DUF1289-domain-containing-protein MSEQLEFFVIPNPCQGICESDSRGFCRGCYRSREERFTWMKLSDSEKRKILRLCHQRYLRILKIKETIEDIIPNQPKLF >NZ_LN681227.1|WP_010847294.1|1803582_1803990_-|lactoylglutathione-lyase MRLLHTMIRVGNMQRSIDFYTQVMGMRLLRTSENPEYKYSLAFVGYSDESQGAVIELTYNWDVENYEMGTAFGHIALGVDDVAATCEHIKLSGGNVTREAGPVKGGTTIIAFVEDPDGYKIELIENESASRALGN >NZ_LN681227.1|WP_010847295.1|1802743_1803403_-|ribonuclease-T MSNKNDQNMLSGRFRGYYPVVIDVETAGFNARTDALLEIAAITLKMDENGWLMPADTLHFHVDPFEGANLDPAALAFTGIDPTNPLRGAVSEYTALHAIFKMIRKGMKDTNCNRAIMVAHNASFDHNFVMAAAERSGLKRIPFHPFATFDTAALSGLVLGQTILAKACITAEIPFDSDQAHSALYDTDRTALLFCELVNRWKRLGGWPLASADSAGDAS >NZ_LN681227.1|WP_010847296.1|1802289_1802670_+|Grx4-family-monothiol-glutaredoxin 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>NZ_LN681227.1|WP_045107664.1|1820542_1821016_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKSKIILSEPERITLQQLALNHPHRDIRTRGTGLLMLARGIKPSQITAEIGCSLRVIYNWVHMWHHSGIAGLLGGHAGGRYLAMTPDMIATAVEAASAESLTLARIAQCVEAKQGALPCTLETLANTLKKQGLTYKRTRLSLKKSVTKRSLLKNPPC >NZ_LN681227.1|WP_143767637.1|1821042_1821678_+|hypothetical-protein MLSIVTVMQIIYLINLSYGAAVGFFKTQKLMIAELFGYLLSISIWGYFLQKFAYNTFGITDFFKLIAACSIFWMSFKIWKFKEEQNGEVLVKSKSIFITTVFNPKSFVFASYVMPYETFTHLTMYFSSILSFIVILLPISLTWCLLGNAFCRQNKNNSKHRLSKNIVLRIASLILLISSSLMIYDVIQQIILFFSAQNSDNKMLLINIIHE >NZ_LN681227.1|WP_013184126.1|1821803_1822850_+|IS630-family-transposase MKIHLTEDQKKALELMHDTTRDSRVCDRIKAVLLAIKAVLLASEGWTTQRIAQALRIPESTVSRHLKDYFSEEKLAPENGGSESRLLAEQATELIEYLTANLMHTTVQIVAYVWARWQVTFTVSGMTKWLHSYKKSMGVPHKFDADKQPQFIETYNALKEKCGQNEPILFIDAVHPTQSTKLSYGWMKSGRKHVKVVETTGSRTRLNIMGALNLHQIENTIIREYPTINAKNVVLFFGAIRETYPLSQRIHLILDGAGYHRSELVQFFAEVLNIELHYLPPDSPNLNPIERLWKYMNEQVRNNVCFPDVKTFRETLHHFFHVVLPKKAQELATRLTDNFQTLKPASSS 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NZ_LN681227_2 | 1814199-1815691 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN681227_2
|
24 spacers
spacers of NZ_LN681227_2
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DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN681227_2
The CRISPR arrays of NZ_LN681227_2 >merge|NZ_LN681227|2|1814199-1815691|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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>NZ_LN681227.1|WP_013184114.1|1810280_1811159_+|pyridoxal-kinase-PdxY MKNILSIQSHVVFGHAGNSAAVFPMRRMGVNVWPLNTVQFSNHTQYPQWRGCVMPPDHLAEIVQGIGEIDKLKSCDAVLSGYIGSAEQGNYILDIIKKIKQTNPEAWYFCDPVMGHPEKGCIVVPGVAEFFCEKALPVSDIIAPNLLELETLSARKIENVEQTISAARELCEKGPKVVLVKHLSRAGYRTDCFEMLLVTKKHSWHISRPLIDTGERQPVGVGDLTSGLLLVNLLKNTSLTDEDLKTALEHVASAVYEVMLETQVRGEYELQIIAAQDKMVTPTHLFSATLLD >NZ_LN681227.1|WP_010847289.1|1808859_1810131_+|tyrosine--tRNA-ligase MSSNNLIKQLQERGLVAQVTDEEALAERLTQGPVSLYCGFDPTADSLHLGHLVPLLCLKRFQLAGHKPIALVGGATGLIGDPSFKATERKLNTEETVKEWVAKIRKQVSPFLSFDGENGAELANNYDWFGEMDVLAFLRDIGKHFSVNQMINKEAVKQRLNRDDVGISYTEFSYNLLQSYDFANLNGKYGVELQIGGSDQWGNITSGIDLTRRLHQKQVFGMTVPLITKSDGTKFGKTEGGAVWLDPKKTSPYKFYQFWINTADADVYRFLKFFTFMDIEEINVLEEEDKNSGKAPRAQYVLAEQVTGLVHGEEGLAAAKRITESLFSGAIADLTEDDFAQLAQDGMPAIELEKDADLQQALVIAEFVPSRGQARTMISSNAVSINGEKQSEPMHVFTDGDRLFGRYTLLRRGKKHYCLIDWK >NZ_LN681227.1|WP_013184112.1|1807843_1808497_+|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase 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>NZ_LN681227.1|WP_010847293.1|1805222_1805660_+|transcriptional-regulator-SlyA MELTLGSDLARLVRVWRALIDHRLKPLKLTQTHWVTLYNISQLPPEQSQIQLAKAIGIEQPSLVRTLDQLEEKKLITRHTCANDRRAKRIKLTGESETFIREVDSVIDLTRKEILEGITHNELILLASVIKKIEKNIGQLHKQVI >NZ_LN681227.1|WP_038251677.1|1804304_1804544_+|DUF1289-domain-containing-protein MSEQLEFFVIPNPCQGICESDSRGFCRGCYRSREERFTWMKLSDSEKRKILRLCHQRYLRILKIKETIEDIIPNQPKLF >NZ_LN681227.1|WP_010847294.1|1803582_1803990_-|lactoylglutathione-lyase MRLLHTMIRVGNMQRSIDFYTQVMGMRLLRTSENPEYKYSLAFVGYSDESQGAVIELTYNWDVENYEMGTAFGHIALGVDDVAATCEHIKLSGGNVTREAGPVKGGTTIIAFVEDPDGYKIELIENESASRALGN >NZ_LN681227.1|WP_010847295.1|1802743_1803403_-|ribonuclease-T MSNKNDQNMLSGRFRGYYPVVIDVETAGFNARTDALLEIAAITLKMDENGWLMPADTLHFHVDPFEGANLDPAALAFTGIDPTNPLRGAVSEYTALHAIFKMIRKGMKDTNCNRAIMVAHNASFDHNFVMAAAERSGLKRIPFHPFATFDTAALSGLVLGQTILAKACITAEIPFDSDQAHSALYDTDRTALLFCELVNRWKRLGGWPLASADSAGDAS >NZ_LN681227.1|WP_010847296.1|1802289_1802670_+|Grx4-family-monothiol-glutaredoxin MTTTNMNTNTVADTTTHEIIEKIKRQISENPILLYMKGSPKLPSCGFSAQAVQAISACGERFAYVDILQNPDIRAELPKYAHWPTFPQLWVDGELVGGCDILVEMYQRGELQTLIKETADKYREQE >NZ_LN681227.1|WP_013184121.1|1817243_1818212_-|IS110-family-transposase MSQPNPLCVGIDVSKASLDIAVNRSVESFTASNDINGFDTIVSVLKQHTVSLVLMEATGGLESAVACSLQAEGFDVVVINPRQARDFARAMGYLAKTDRIDAKVLAQMADVINRHPKRERFIRALPDAERQVLSAMVVRRRQLITMLVAERNRLHPAHPQSRKSINIIISALEAELARIDENMNKHIQTYFKALADRLSAIKGVGAMTAATLLAEVPELGKLSRREISALVGVAPVNRDSGTLRGRRTLFGGRAGVRTALYMATLVATRFNPVIKTFYNRLLAAGKPKKVALVACMRKLLTILNAMIRKDEEWNDSYHQITP >NZ_LN681227.1|WP_013184122.1|1818485_1819508_+|IS110-family-transposase MEQVIGIDLAKRVFQLHIASPLGKMMKNTVVSRNKLTAFLAQQPPSKIVMEACGSANYWSRQFKRFGHEVKQISPQYVAPFRMGSKNDKNDAVAIVEADRRPGMRYVPEKTQEQPDIQCLHRVRQRLMKNRTALINQIRGLGLEYGIAIPESAHKVEQCLPDYLENAENDLTPLSRELFQELLRELKEQQQRLNVLDKRLDQLNAQQEDIRRLLTLPGIGPLGASALMVALGDSTHFKNGRHFASYLGRVPREHSSGGKVRLLGITKRGDSYLRGILIHGARSVVYRVQKLPDEQSNGLQRWLKGVIARSGITKAAVALANNNARIAWALVNQQSVYEAR >NZ_LN681227.1|WP_045107664.1|1820542_1821016_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKSKIILSEPERITLQQLALNHPHRDIRTRGTGLLMLARGIKPSQITAEIGCSLRVIYNWVHMWHHSGIAGLLGGHAGGRYLAMTPDMIATAVEAASAESLTLARIAQCVEAKQGALPCTLETLANTLKKQGLTYKRTRLSLKKSVTKRSLLKNPPC >NZ_LN681227.1|WP_143767637.1|1821042_1821678_+|hypothetical-protein MLSIVTVMQIIYLINLSYGAAVGFFKTQKLMIAELFGYLLSISIWGYFLQKFAYNTFGITDFFKLIAACSIFWMSFKIWKFKEEQNGEVLVKSKSIFITTVFNPKSFVFASYVMPYETFTHLTMYFSSILSFIVILLPISLTWCLLGNAFCRQNKNNSKHRLSKNIVLRIASLILLISSSLMIYDVIQQIILFFSAQNSDNKMLLINIIHE >NZ_LN681227.1|WP_013184126.1|1821803_1822850_+|IS630-family-transposase MKIHLTEDQKKALELMHDTTRDSRVCDRIKAVLLAIKAVLLASEGWTTQRIAQALRIPESTVSRHLKDYFSEEKLAPENGGSESRLLAEQATELIEYLTANLMHTTVQIVAYVWARWQVTFTVSGMTKWLHSYKKSMGVPHKFDADKQPQFIETYNALKEKCGQNEPILFIDAVHPTQSTKLSYGWMKSGRKHVKVVETTGSRTRLNIMGALNLHQIENTIIREYPTINAKNVVLFFGAIRETYPLSQRIHLILDGAGYHRSELVQFFAEVLNIELHYLPPDSPNLNPIERLWKYMNEQVRNNVCFPDVKTFRETLHHFFHVVLPKKAQELATRLTDNFQTLKPASSS >NZ_LN681227.1|WP_013184127.1|1822797_1823226_-|hypothetical-protein MALNHREYLFLLAMAIGSMGGGIWRPMAIFYLVLVQGLNIVDVGLAMTIGAMIALLITGYPAGLLADRLGPANSTLVGSLLRFSAFPWMLVVSTPWQVAIIVMCVSIGERIYWCANPAAIRVLYAINLKMQVLGSENYQSAG >NZ_LN681227.1|WP_143767638.1|1823296_1823872_-|adenylate-kinase MAKLIIPNHRAAQISFIKRQHALVIGSPGAGKSTFARQLSQISSIPLFHLDKEYWQEGWIAPSAEEWQQKLSTLTNQSSWIIDGNYGSSLSQRLEKADTVIHLYIPTYICLFQAIIRITKWHGKQRPDMALGCYEKINFDFLRQIIKYRKYQFKKDKLLLDDFDGNYIQLTSRTAIKVFLQKIAHGNKHNH >NZ_LN681227.1|WP_013184135.1|1827335_1827689_-|YebY-family-protein MKRVLWVLPFFLLSFQGVAAPIQTVSKLQFGKKWAFTREEVMLDCRSDGALFVINPSTLMQYPLNDRAVQLMKSNKVIATSLDTILLDDPEQPAKKMSIESFQKAALALCDQPNDKS >NZ_LN681227.1|WP_010847366.1|1827773_1828772_-|copper-resistance-D-family-protein MISLEALYLFCRFSHFIVVMLMFGLSLFTVMLMSGHFSTLMRERLKSGILISTVLALVTSIIWFVVQAGLMGDGWHDVYVPEIWLAVLSTSFGQIWQWQLLVAIFAVGALFLSNTKIRNNVLLSCSVILLSSHAFIGHAAMYEGKIGLLLQANQVIHLLSAGYWFGGLWPFLVCLQFLRIQKGSETKPYCAGQYAEKKKGAGKGNNSKNITTDQYSEANLYAESIVVMRKFSLYGHLAVFLVIVTGIVSSVILIPGWPVFSRSLSEYQSMLWLKIVLVVGMVLLALINRYILVPRLKQQRCYQLLIINSWLEIILGTTALLCVAIFATQPPV >NZ_LN681227.1|WP_013184136.1|1828771_1829158_-|copper-homeostasis-periplasmic-binding-protein-CopC MSILNIRSFWTKLSTLVVLFVGMSCQQALAHAHLKDQTPAENTTVEAAPQAITLSFSERIELGFSKVKLIGPEKTEVKTGKLELDPETKTKLILPVEGKLAAGEYCVDWSVLSVDGHKTKGVYNFTVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN681227_3 | 3577581-3578770 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of NZ_LN681227_3
|
19 spacers
spacers of NZ_LN681227_3
>3.1|3577611|31|NZ_LN681227|PILER-CR ACTCAAAGTAAGTCAGTCAAAAACAGGCTAT >3.2|3577672|31|NZ_LN681227|PILER-CR GGTCACATCTTGGAAAGCGCGGAACCTGAGG >3.3|3577733|31|NZ_LN681227|PILER-CR AGCTTGCGCCGTTCTGACCGTTTGAGTAACA >3.4|3577610|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT TACTCAAAGTAAGTCAGTCAAAAACAGGCTAT >3.5|3577671|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT TGGTCACATCTTGGAAAGCGCGGAACCTGAGG >3.6|3577732|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT TAGCTTGCGCCGTTCTGACCGTTTGAGTAACA >3.7|3577793|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT CTCAAAGCTCAAATCATTTCATTACGTATCATC >3.8|3577855|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT AGCCGCAGAATCAAGCTGTGCAATATCATAGA >3.9|3577916|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGTCTCGCCCAGTTCTTCGGTGTCCTCATTGG >3.10|3577977|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATATAGCATAGCTGATGAGTTTCTATGTTTA >3.11|3578038|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCAATATCTTTACCGCCTGTGGGCGCATAGG >3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGTTTTTTTCTAAAATGATTTTGTCTATATCA >3.13|3578160|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTCGGTTAATGCAATCTCCCGCCGCGTGGC >3.14|3578221|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACATCAAATGAAATATTAACCTGTGAATTTTT >3.15|3578283|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CATTTTAGAAAAAAACGTAGATGGTGCATCAC >3.16|3578344|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCCAATGAAGCCAGTAATAAATATCGGCAGG >3.17|3578405|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGATAACTCAAGGGAGTGGAGCTGTATTTTAT >3.18|3578466|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCTGAAAGCGTTTGAACCGTCAAAAATCACC >3.19|3578527|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACAGTCTGCCCCAGCAGATTTTTCGCTGTGC >3.20|3578588|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCTTTGAGAACGTGCGGGGCAAACTCATCGTT >3.21|3578649|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCATTGCCTGAACAGTTTTTCGATAACAATC >3.22|3578710|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGCTTTTCATTGCCTATTTTCAAATAAAATGG |
DEDDh,cas3,cas8e,cse2gr11,cas7,cas5,cas6e,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN681227_3
The CRISPR arrays of NZ_LN681227_3 >merge|NZ_LN681227|3|3577581-3578770|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACTACTCAAAGTAAGTCAGTCAAAAACAGGCTATCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACTGGTCACATCTTGGAAAGCGCGGAACCTGAGGCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACTAGCTTGCGCCGTTCTGACCGTTTGAGTAACACGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACCTCAAAGCTCAAATCATTTCATTACGTATCATCAGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACAGCCGCAGAATCAAGCTGTGCAATATCATAGACGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACAGTCTCGCCCAGTTCTTCGGTGTCCTCATTGGCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACGATATAGCATAGCTGATGAGTTTCTATGTTTACGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACTTCAATATCTTTACCGCCTGTGGGCGCATAGGCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACCGTTTTTTTCTAAAATGATTTTGTCTATATCACGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACTATTCGGTTAATGCAATCTCCCGCCGCGTGGCCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACAACATCAAATGAAATATTAACCTGTGAATTTTTCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACCATTTTAGAAAAAAACGTAGATGGTGCATCACCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACACCCAATGAAGCCAGTAATAAATATCGGCAGGCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACTGATAACTCAAGGGAGTGGAGCTGTATTTTATCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACAGCTGAAAGCGTTTGAACCGTCAAAAATCACCCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACAACAGTCTGCCCCAGCAGATTTTTCGCTGTGCCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACCCTTTGAGAACGTGCGGGGCAAACTCATCGTTCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACATCATTGCCTGAACAGTTTTTCGATAACAATCCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACAGCTTTTCATTGCCTATTTTCAAATAAAATGGCGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC >NZ_LN681227|3|2|3577581-3577793|PILER-CR CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACT ACTCAAAGTAAGTCAGTCAAAAACAGGCTAT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACT GGTCACATCTTGGAAAGCGCGGAACCTGAGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACT AGCTTGCGCCGTTCTGACCGTTTGAGTAACA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACCTCAAAGCTCAAATCATTTCATTACGTATCATCAGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACAGCCGCAGAATCAAGCTGTGCAATATCATAGACGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGTCTCGCCCAGTTCTTCGGTGTCCTCATTGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC GATATAGCATAGCTGATGAGTTTCTATGTTTA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TTCAATATCTTTACCGCCTGTGGGCGCATAGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CGTTTTTTTCTAAAATGATTTTGTCTATATCA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TATTCGGTTAATGCAATCTCCCGCCGCGTGGC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AACATCAAATGAAATATTAACCTGTGAATTTTT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CATTTTAGAAAAAAACGTAGATGGTGCATCAC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC ACCCAATGAAGCCAGTAATAAATATCGGCAGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TGATAACTCAAGGGAGTGGAGCTGTATTTTAT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGCTGAAAGCGTTTGAACCGTCAAAAATCACC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AACAGTCTGCCCCAGCAGATTTTTCGCTGTGC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CCTTTGAGAACGTGCGGGGCAAACTCATCGTT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC ATCATTGCCTGAACAGTTTTTCGATAACAATC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGCTTTTCATTGCCTATTTTCAAATAAAATGG >NZ_LN681227|3|3|3577581-3578770|CRISPRCasFinder CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TACTCAAAGTAAGTCAGTCAAAAACAGGCTAT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TGGTCACATCTTGGAAAGCGCGGAACCTGAGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TAGCTTGCGCCGTTCTGACCGTTTGAGTAACA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CTCAAAGCTCAAATCATTTCATTACGTATCATC AGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGCCGCAGAATCAAGCTGTGCAATATCATAGA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGTCTCGCCCAGTTCTTCGGTGTCCTCATTGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC GATATAGCATAGCTGATGAGTTTCTATGTTTA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TTCAATATCTTTACCGCCTGTGGGCGCATAGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CGTTTTTTTCTAAAATGATTTTGTCTATATCA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TATTCGGTTAATGCAATCTCCCGCCGCGTGGC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AACATCAAATGAAATATTAACCTGTGAATTTTT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CATTTTAGAAAAAAACGTAGATGGTGCATCAC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC ACCCAATGAAGCCAGTAATAAATATCGGCAGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TGATAACTCAAGGGAGTGGAGCTGTATTTTAT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGCTGAAAGCGTTTGAACCGTCAAAAATCACC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AACAGTCTGCCCCAGCAGATTTTTCGCTGTGC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CCTTTGAGAACGTGCGGGGCAAACTCATCGTT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC ATCATTGCCTGAACAGTTTTTCGATAACAATC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGCTTTTCATTGCCTATTTTCAAATAAAATGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC >NZ_LN681227|3|2|3577581-3578770|CRT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TACTCAAAGTAAGTCAGTCAAAAACAGGCTAT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TGGTCACATCTTGGAAAGCGCGGAACCTGAGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TAGCTTGCGCCGTTCTGACCGTTTGAGTAACA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CTCAAAGCTCAAATCATTTCATTACGTATCATC AGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGCCGCAGAATCAAGCTGTGCAATATCATAGA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGTCTCGCCCAGTTCTTCGGTGTCCTCATTGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC GATATAGCATAGCTGATGAGTTTCTATGTTTA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TTCAATATCTTTACCGCCTGTGGGCGCATAGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CGTTTTTTTCTAAAATGATTTTGTCTATATCA CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TATTCGGTTAATGCAATCTCCCGCCGCGTGGC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AACATCAAATGAAATATTAACCTGTGAATTTTT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CATTTTAGAAAAAAACGTAGATGGTGCATCAC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC ACCCAATGAAGCCAGTAATAAATATCGGCAGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC TGATAACTCAAGGGAGTGGAGCTGTATTTTAT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGCTGAAAGCGTTTGAACCGTCAAAAATCACC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AACAGTCTGCCCCAGCAGATTTTTCGCTGTGC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC CCTTTGAGAACGTGCGGGGCAAACTCATCGTT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC ATCATTGCCTGAACAGTTTTTCGATAACAATC CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGCTTTTCATTGCCTATTTTCAAATAAAATGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC >NZ_LN681227|3|3|3577887-3578770|PILER-CR ACTCAAAGTAAGTCAGTCAAAAACAGGCTAT CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACT GGTCACATCTTGGAAAGCGCGGAACCTGAGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACACT 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CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC AGCTTTTCATTGCCTATTTTCAAATAAAATGG CGGTTTATCCCCGTACTTACGGGGAACAC
>NZ_LN681227.1|WP_013185247.1|3576462_3577212_+|DNA-polymerase-III-subunit-epsilon MSTAITRQIVLDTETTGMNKLGVHYEGHNIIEIGAVEVINRRLTGRHFHIYIKPERLVDPEAFEVHGISDEFLQDKPLFADIADEFIEFIRGAELIIHNATFDIGFMDYEFSKLNRDIPPTADFCTITDSLMLARKLFPGKRNNLDALCDRYHIDNSKRTLHGALLDAEILSDVYLAMTGGQTSLAFSMEGEVSSHALVSEIHKITRPQVGLKVIYASDEELTQHESRLDLVEKKGGSCLWRPKSEQIH >NZ_LN681227.1|WP_013185246.1|3575928_3576399_-|ribonuclease-HI MNKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGILLRYQQHEKKLNGGYFRTTNNRMELMAAIIGLETLKHPCTVILTTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKKADKSPVINVDLWQRLDKAISRHEIDWRWVKGHTGHRENEICDELARAAANNPAQVDNGYIENEN >NZ_LN681227.1|WP_013185245.1|3575191_3575932_+|methyltransferase-domain-containing-protein MRSTRSVKQITPPTSWAELPWGEYYRTVLERQLEPWWPKIFGFHLLKIGNLSTAIDSRSCLVSHQVNIGLPGENMDVMADPHYLPFATKSVDACLLAHMLTYSVDPHWLLREVDRVIIDDGWVIISGFNPISALGLKTAVSSIYRRQPCRVRMFSMLRQLDWLRLLNYEVIYHANFHVLPWQNGSRCHRSDPSIFGCLNMIIARKRTIPLTLNPMRSTRLKPKFSNALGAVKNVHRRHLKDDGDTG >NZ_LN681227.1|WP_010846227.1|3574384_3575140_-|hydroxyacylglutathione-hydrolase MELIRIPALSDNYIWLLCDEDKHCVIIDPAESLPVIDILAANKIIPVAILLTHHHHDHVGGVPGLRKKYPELPVYGPEETQYKGATHIVHEHDTVEIPPFSFRVIALPGHTLGHIAFYQAPYLFCGDTLFSGGCGRLFEGTAEQMFSSLGKISSLPDNTLICCAHEYTAANMTFAKTVLPNNQAINDYYQKIITLRENNQATVPTTLQLEKKINVFLNCHHIDLQKNIGIKPNSISLSSVFQRLRAYKDQF >NZ_LN681227.1|WP_013185244.1|3572980_3574312_-|murein-transglycosylase-D MKTKAILFASVLLAGCQSGLQPKTPAQQHTQKMSSTNQKTDGIAEPEDSANWKESPTAQQDLWGHIRDELKMEIPSNSRMLEQQNDYLKHKSYLQNVTLRASPYIYWIVEQLDKREMPMELVLLPIVESAFNPYATSYAKAAGIWQIIPSTGRHYGLTQDKWYDARRDVAASTTAALDMFERLNKRFNGDWLLTIAAYNSGEGRVMRAIKDNEAKGKPTDFWSLSLPRETMNYVPKILALSNIIRYNEQFGFKVPEPSHQQALTKVEVGQPIMLSQAADLSGLSLTSIRAYNPGYKQGMTSPDGPHYIMLPKKNVNQFKTSLADDSVLKDVRLAVVHNTRKLQQQGRYTVRAGDTLSAIAKRFNTTHRELQKLNSLKTADRLKIGQVLKVDNSSPVTYRVRKGDSFSSIAKRHGVNLNDLMNWNKNIKIKEMKPGIALTLYLN >NZ_LN681227.1|WP_013185243.1|3571416_3572532_-|spermidine/putrescine-ABC-transporter-ATP-binding-protein-PotA MTENTSLTPLVELKALSKGFDSKQVISQLDLTINDGEFLTILGPSGCGKTTVLRLIAGLEDADSGKILLEGQDITNIPAEHRHVNTVFQSYALFPHMTVFENVAFGLRMQKTPEKEIAPRVEEALRMVQLEEFAQRKPAQLSGGQQQRVAIARAVVNKPKVLLLDESLSALDYKLRKQMQNELKALQRKLGITFIFVTHDQEEALVMSDRIVVMRNGHIEQDGSPREIYEEPKNLFVARFIGEINIFDANVLQRIDAQRIRANVEGHECDIFTTLPVTVGQTLKVLLRPEDLRVEEINHGEQVSGLIGYVRERNYKGMTLDSVVEMENGKMVMVSEFFNEDDPDVDHSLNQKIAVTWVESWEVVLVDEEDA >NZ_LN681227.1|WP_010846224.1|3570572_3571433_-|spermidine/putrescine-ABC-transporter-permease-PotB MKKTRKLFQNIVITGMVSWLMLFVFLPNLMIIGTSFLTRDDTNLVQMVFSLDNYTRLFDPLYAEVLLHSLNMAIVATLCCLMIGYPFAFFLARMPEKLRPLMLFLLIVPFWTNSLIRIYGLKMFLSTRGYMNDFLLWVGIIDKPLRIMYTPEAVVLGLVYILLPFMVMPLYSSIEKLDKPCLEAARDLGAGKLQTFIRIIIPLTMPGIIAGCLLVLLPAMGLFYVADLMGGAKNLLIGNVIKSQFLNIRDWPFGAATSICLTLVMGLMLLVYYRAAKLLNKKVELE >NZ_LN681227.1|WP_010846223.1|3569796_3570576_-|spermidine/putrescine-ABC-transporter-permease-PotC MIGRLLRGGFMTIVYAYLYIPIIILLVSSFNQSRFGISWQGFTTEWYSLLFSNDSLLQAAGHSLTMAVTSATFATLIGSLTAVALYRYSFRGKKFVGGMLFVVMMSPDIVMAISLLVLFMLLGVSLGFWSLLFSHITFCLPFVVVTVYSRLKDFDVKMLEAARDLGASELTILHKIILPLAMPAVMAGWLLSFTLSMDDVVVSSFVTGPGYEILPLKIYSMVKVGVSPEVNALAAILLLMSLVLVLISQFVMRDRTGKS >NZ_LN681227.1|WP_013185242.1|3569485_3569776_-|hypothetical-protein MVGYVFISLITSCLSLSVRMTFLITNSVRNKWLYPVKHRSYNSRFFGDRFTRAYMILTHQLRGETLHEKQHEKVVLSVSRWDDGIKHWFGECRCRR >NZ_LN681227.1|WP_041573956.1|3568512_3569565_-|spermidine/putrescine-ABC-transporter-substrate-binding-protein-PotD MKKWFCLLAAGMMALSIGSVNAAAADDGKTLYFYNWTEYVPPGLLNQFTKETGIKVIYSTYESNESMYTKLKTYKDGAYDLVVPSTYFVSKMSNEGMLQKIDKSKLNNFHNLDPNLLHKSFDPNNDYSIPYIWGATAIGVNSDNVDPKSITSWADFWKPEYKSSLVLTDDAREVFQIALLKLGYSGNTTDPKQIEAAYQELRKLMPNILAFNSDNPANPFMEGEVDVGMMWPGSAYVARQSGTPVEIIWPKEGGIFWMDSLAIPANAKNVEGAMKLINFLLRPDIAAQVAEKVGYPTPNLAAKKLLPKAMTKDKSLYPDNAIIEKGEWQNDVGHASILYEEYFQKLKAGQ >NZ_LN681227.1|WP_013185250.1|3579334_3579634_+|transposase MKIYSIKFKVSIQRKLLPPHNLSIPYLAKKEGISKSTLYQWRKEASVLNSTYVIKQLQQEIRHLKRKLAYREKTLSERLSRSEMWKILKIIFIIFFRML >NZ_LN681227.1|WP_013185251.1|3579863_3580262_+|VOC-family-protein MVPELTVTDFVASLDFYQRILGFGILIRRGNPDFVYLGLGEAQLMLEALHDSGWNTGELNKPLGRGINLQIEVDDVTPILTNLEINGITLYRPLKDNYYWIGDTQACQREFLVQDPDGYLLRFSQYIDHKQD >NZ_LN681227.1|WP_013185252.1|3580314_3583065_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MPELINNIAYLNQYWGKAKKNPYSDEEYHLLAYHCLNVAAAGHLLLSPHKKITQDLADFLELSPEKFQNLFAFFLALHDIGKFASAFQQLYSPENTDLIKPDQLKPYDSRYFRHDRLGLFFWRKIQDDVLIALTGNSDLPVSEKAPKLQAQKTLMVLMQCMLGHHGKPIDDNRWEDIIDFTDARNVDDAAAFAHDLLTLFQPHLPLEKLLSKEWRLKLKQVSWQLAGIVVLADWIGSDCKYFRYQTQALPLSEYWRITQKQAQIALNGNDIYNTPVISPYTSIQDYYHFAPTPLQKWAEEVPIDDSPQLFILEDVTGAGKTEAALALTHRLMQTGAADGFYFGLPTMATSNAMFGRIAKHYHRMFDTKNGKLPSIVLAHGARDMNDDFQDIVLTSEHDDSDYTRDDITATAQCHQWLADSNKKALLASVGVGTIDQALLAVLPRKYQSLRLIGLNRKVLIFDEVHAADEYMFALLESLLSLHLHQGGSVILLTATLSLKQRQKLVDNWLSASGIPPQKLQETAFPLATQVTLDPENPVIETPLGSRADVSRTVMVKTVNHLDECVQIALNAARDGQCVVWVRNSVDDALQAFQLIRSLMDQLENSLLFHSRFILFDRKRIENRVLDIFGKENKQEKRQGKILITTQVFQESLDADTDVMISDICPIDDLIQRVGRLHRHTRDADGKYQKDITDSRSAPELYLHAPEWDDHPEADWLSKDFPNTQHVYRSPGRLWLGLRELLRLGAIRMPSEARTLIEAVYGEEADKHIPDALTPKDDDDLNDKRVKDAIARSQVLKWQHCEYSKSSAGGWYDDNIDISTRFNDIEMVNVLLVKLTETGELVPWVKDEKHPVQFSTLKLRKNKFADKLQPIPESLSKAVEKLQNTFKSVKYLQIWLPEIDPNFAYDPNIGFYPKQEK >NZ_LN681227.1|WP_013185253.1|3583064_3584681_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNLVKDPWLTFRMRNGGEEKLPLSAICDPAVVDFALPRADFQGAAYQLVIGLLQTVFAPEDEEEWEAFYRNAPAQADLQAAFNRVEHAFNLTGEGPLFMQDFDPLEGAKSTEISGLLIEAPGANTLRLNTDHFIKRGQCDVISPEMAAIALFTLQINAPAGGVGHRVGLRGGGPLTTLIQPQELDSSLWQKLWLNVINLDLWRYPAPDLNNPTVFPWLGKTHISQKAGTEIYAHNVHELHMYWAMPRRIRLEIDDKPAICQLTGQKTQQSVSGYRTQNYGNNYSGTWRHPLTPYRWNPKKPNEEHLSIKGQPGGITYKIWDSLTFSENNEGQEAARVVDHFGKLNDYVEDEQSNRPHLWVFGYDMDNMKARGWYATTLPLFSMPIEKKDAVFRRVKTLQNLSTYALTQCRTQIKSAWFNRPNEAKGDMSFIDALFYQRTQAPFFKAVQQIIASQHKASSLSTDEARTWLYQLRNTCFDLFDEFVLSEDNDPKNLPEKIEARQILTKWLVVSKDIKSFMTEHKIETQSSKKKKEDVVDE >NZ_LN681227.1|WP_013185254.1|3584673_3585225_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MNSLFESCVIPWWESMFLTQDELKKKKIRPAPTLYKAQLKRCQDIDSVTWAEGFRALWFSLPENVTEKAEQKNITLWAMIAVTLVYVKTNTTTNLATAAGTKTENDKPIVSAHRFAQLQAARTPDEFIMRLRRVLQQLDGKVSVLSLANDIDQWMKEYHQSRPNRANKRLCVQWAMDYYKAAK >NZ_LN681227.1|WP_013185255.1|3585274_3586312_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHLLTSYPPANLNRDDLGRPKTAKMGGTERLRISSQSLKRHWRVSDLFQAALAEHLGFRTKRFGFQVYQRLLNGGVKEKQAAEWATTIAEVFGKNKKDEPLEIEQLAHISPKEKEMTFALADKLIAENRAPTKEELQLLSREQIAVDMALFGRMLASSPAYSVEAACQVAHAISVHNVAVEDDYFTAVDDLNNGKSDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKSLLLENLAGNEALANKAIAALVEAAVKVAPSGKQNSFGSRAYASYVLAEKGEYQPRSLSVAFLRPIVGEDQATSAISALENQVENFDKVYGACADTRYSISAVTGEGSFAELVQFVTD >NZ_LN681227.1|WP_013185256.1|3586325_3587090_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTYLVFRLYGALASWGVEAVGKDRPTASYPTRSAILGLLGAALGIRRDDEARLAALQQSVNIAIKQRISGSLMRDYHTSQVPSQEKKRVHLTRKSELSDKSKLNTILSSRDYRTDGIWIIAISLTEQAHFTLNTLHDALIKPVFTLSLGRKSCPLALPMMPQLAEYPSLKSALDTPFPPLTQSKKSDRYLLGLYGKYDEVSYFWEGEKDEINIPDTTVLTNRLWDEPLSRSRWQFTQRTMHQLSIMEETDVSV >NZ_LN681227.1|WP_013185257.1|3587076_3587754_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSKVTLRPSVYPIQAPSLKKTKNDVYTAHQLLWQLFTEQEERNFLFREEISLSGRPEFFVLSRTAPIINSPQFQVQTKPFAPQLHNGQKLAFKLRVNPTVCITEKDSGKQRRHDVLMRAKYQQKGSGISADEIESLMTQAAQAWIQDEKRLANWGFRFDFMPDMERYTQHRSFKSSGQKIEFSSVDFQGVLTLSDRDLFLEQYSKGFGRAKSFGCGLMLIRAL >NZ_LN681227.1|WP_013185258.1|3587753_3588674_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAYIPLKPIPIKDRNSMIFIGMGRIDVKDNAFVVIDEVNGERMHIPVGSIACIMLEPGTRISHAAVKLASTTGTLLIWVGEAGVRLYSVGQPGGARSDRLLYQAKLALDEDLRLKVVRKMFELRFGEPAPQRRNVEQLRGIEGARVRKSYQILAKQYGVKWQGRNYDHTDWDKGDLINRCISAATSCLYGVTEAAILAAGYAPAIGFLHTGKPLSFVYDIADILKFDTVVPIAFKVAASNSMTPDRQVRIACREKFRTDRTLKRLIPLIEEILAAGEISPPPPPADAQPPAIPEPISIGDIGHRSQ >NZ_LN681227.1|WP_013185259.1|3588676_3588970_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSMTVVVTEAVPPRLRGRLAIWLLEIRAGVYVGDISHKIREMIWEQITEQTEDGNAVMAWKTNTESGFDFQTFGENRREPIDFDGLRLVKFKPLAEE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN681227_4 | 3589054-3589936 | TypeI-E |
NA
Consensus repeat of NZ_LN681227_4
|
14 spacers
spacers of NZ_LN681227_4
>4.1|3589082|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder GAAAGTTTCAGCACCTATTAACGGAATTATTCT >4.2|3589143|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAGCAGCTATCAGCGGGTATGAGGCAGGCGAGA >4.3|3589204|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAATCCATTGTTGATAATGGCGCTGATTTCAAA >4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTCGGCGATTTCTGCGGGGGTGGCACTCTATTG >4.5|3589326|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR CCGCGACAGAGCGATTACACTGAGGGAGGGGGC >4.6|3589387|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAATGACTCACCTCAGCTTTGCCATTACAGGTC >4.7|3589448|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR GTGGCCTGTGAAAGTGGATGCAGGAAAAACTAA >4.8|3589509|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR GAACATATTCAGAAAATGGCATGTCAATTATCA >4.9|3589570|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR GATTTTTCGCCTGTACGTCGTAAAACTGCTCAA >4.10|3589631|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR GGGATAGATCCTCGTAACTTGGATGACCCCACA >4.11|3589692|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder GGTAACGCAGACAAAAACCTACATCGACAAAGC >4.12|3589753|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder GCGTGACGATGTTATCTGAAAATATTAATGAAC >4.13|3589814|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder GCCATATCTGGTTATCGAAGTCAATCTCATCCC >4.14|3589875|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder GGATATTATCGACGCAGCGAATGATTTAACCGA >4.15|3589083|32|NZ_LN681227|CRT AAAGTTTCAGCACCTATTAACGGAATTATTCT >4.16|3589144|32|NZ_LN681227|CRT AGCAGCTATCAGCGGGTATGAGGCAGGCGAGA >4.17|3589205|32|NZ_LN681227|CRT AATCCATTGTTGATAATGGCGCTGATTTCAAA >4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT TCGGCGATTTCTGCGGGGGTGGCACTCTATTG >4.19|3589327|32|NZ_LN681227|CRT CGCGACAGAGCGATTACACTGAGGGAGGGGGC >4.20|3589388|32|NZ_LN681227|CRT AATGACTCACCTCAGCTTTGCCATTACAGGTC >4.21|3589449|32|NZ_LN681227|CRT TGGCCTGTGAAAGTGGATGCAGGAAAAACTAA >4.22|3589510|32|NZ_LN681227|CRT AACATATTCAGAAAATGGCATGTCAATTATCA >4.23|3589571|32|NZ_LN681227|CRT ATTTTTCGCCTGTACGTCGTAAAACTGCTCAA >4.24|3589632|32|NZ_LN681227|CRT GGATAGATCCTCGTAACTTGGATGACCCCACA >4.25|3589693|32|NZ_LN681227|CRT GTAACGCAGACAAAAACCTACATCGACAAAGC >4.26|3589754|32|NZ_LN681227|CRT CGTGACGATGTTATCTGAAAATATTAATGAAC >4.27|3589815|32|NZ_LN681227|CRT CCATATCTGGTTATCGAAGTCAATCTCATCCC >4.28|3589876|32|NZ_LN681227|CRT GATATTATCGACGCAGCGAATGATTTAACCGA |
cas2,cas1,cas6e,cas5,cas7,cse2gr11,cas8e,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN681227_4
The CRISPR arrays of NZ_LN681227_4 >merge|NZ_LN681227|4|3589054-3589936|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGAAAGTTTCAGCACCTATTAACGGAATTATTCTGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGAGCAGCTATCAGCGGGTATGAGGCAGGCGAGAGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGAATCCATTGTTGATAATGGCGCTGATTTCAAAGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGTCGGCGATTTCTGCGGGGGTGGCACTCTATTGGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCCCGCGACAGAGCGATTACACTGAGGGAGGGGGCGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGAATGACTCACCTCAGCTTTGCCATTACAGGTCGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGTGGCCTGTGAAAGTGGATGCAGGAAAAACTAAGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGAACATATTCAGAAAATGGCATGTCAATTATCAGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGATTTTTCGCCTGTACGTCGTAAAACTGCTCAAGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGGGATAGATCCTCGTAACTTGGATGACCCCACAGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGGTAACGCAGACAAAAACCTACATCGACAAAGCGAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCGCGTGACGATGTTATCTGAAAATATTAATGAACGAGGTCTCCGTACCTACGGAGATAAACCGCCATATCTGGTTATCGAAGTCAATCTCATCCCGAGGTCTCCGTACCTACGGAGATAAACCGGATATTATCGACGCAGCGAATGATTTAACCGAGAGGTCTCCGTGGATACGGAGATAAACCG >NZ_LN681227|4|4|3589054-3589935|CRISPRCasFinder GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GAAAGTTTCAGCACCTATTAACGGAATTATTCT GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GAGCAGCTATCAGCGGGTATGAGGCAGGCGAGA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GAATCCATTGTTGATAATGGCGCTGATTTCAAA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GTCGGCGATTTCTGCGGGGGTGGCACTCTATTG GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC CCGCGACAGAGCGATTACACTGAGGGAGGGGGC GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GAATGACTCACCTCAGCTTTGCCATTACAGGTC GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GTGGCCTGTGAAAGTGGATGCAGGAAAAACTAA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GAACATATTCAGAAAATGGCATGTCAATTATCA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GATTTTTCGCCTGTACGTCGTAAAACTGCTCAA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GGGATAGATCCTCGTAACTTGGATGACCCCACA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GGTAACGCAGACAAAAACCTACATCGACAAAGC GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GCGTGACGATGTTATCTGAAAATATTAATGAAC GAGGTCTCCGTACCTACGGAGATAAACC GCCATATCTGGTTATCGAAGTCAATCTCATCCC GAGGTCTCCGTACCTACGGAGATAAACC GGATATTATCGACGCAGCGAATGATTTAACCGA GAGGTCTCCGTGGATACGGAGATAAACC >NZ_LN681227|4|3|3589054-3589936|CRT GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG AAAGTTTCAGCACCTATTAACGGAATTATTCT GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG AGCAGCTATCAGCGGGTATGAGGCAGGCGAGA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG AATCCATTGTTGATAATGGCGCTGATTTCAAA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG TCGGCGATTTCTGCGGGGGTGGCACTCTATTG GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCC CGCGACAGAGCGATTACACTGAGGGAGGGGGC GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG AATGACTCACCTCAGCTTTGCCATTACAGGTC GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG TGGCCTGTGAAAGTGGATGCAGGAAAAACTAA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG AACATATTCAGAAAATGGCATGTCAATTATCA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG ATTTTTCGCCTGTACGTCGTAAAACTGCTCAA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG GGATAGATCCTCGTAACTTGGATGACCCCACA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG GTAACGCAGACAAAAACCTACATCGACAAAGC GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACCG CGTGACGATGTTATCTGAAAATATTAATGAAC GAGGTCTCCGTACCTACGGAGATAAACCG CCATATCTGGTTATCGAAGTCAATCTCATCCC GAGGTCTCCGTACCTACGGAGATAAACCG GATATTATCGACGCAGCGAATGATTTAACCGA GAGGTCTCCGTGGATACGGAGATAAACCG >NZ_LN681227|4|4|3589115-3589691|PILER-CR GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GAGCAGCTATCAGCGGGTATGAGGCAGGCGAGA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GAATCCATTGTTGATAATGGCGCTGATTTCAAA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GTCGGCGATTTCTGCGGGGGTGGCACTCTATTG GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC CCGCGACAGAGCGATTACACTGAGGGAGGGGGC GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GAATGACTCACCTCAGCTTTGCCATTACAGGTC GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GTGGCCTGTGAAAGTGGATGCAGGAAAAACTAA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GAACATATTCAGAAAATGGCATGTCAATTATCA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GATTTTTCGCCTGTACGTCGTAAAACTGCTCAA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC GGGATAGATCCTCGTAACTTGGATGACCCCACA GAGGTCTCCGTAGGTACGGAGATAAACC
>NZ_LN681227.1|WP_013185259.1|3588676_3588970_+|type-I-E-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MSMTVVVTEAVPPRLRGRLAIWLLEIRAGVYVGDISHKIREMIWEQITEQTEDGNAVMAWKTNTESGFDFQTFGENRREPIDFDGLRLVKFKPLAEE >NZ_LN681227.1|WP_013185258.1|3587753_3588674_+|type-I-E-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MAYIPLKPIPIKDRNSMIFIGMGRIDVKDNAFVVIDEVNGERMHIPVGSIACIMLEPGTRISHAAVKLASTTGTLLIWVGEAGVRLYSVGQPGGARSDRLLYQAKLALDEDLRLKVVRKMFELRFGEPAPQRRNVEQLRGIEGARVRKSYQILAKQYGVKWQGRNYDHTDWDKGDLINRCISAATSCLYGVTEAAILAAGYAPAIGFLHTGKPLSFVYDIADILKFDTVVPIAFKVAASNSMTPDRQVRIACREKFRTDRTLKRLIPLIEEILAAGEISPPPPPADAQPPAIPEPISIGDIGHRSQ >NZ_LN681227.1|WP_013185257.1|3587076_3587754_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas6/Cse3/CasE MYLSKVTLRPSVYPIQAPSLKKTKNDVYTAHQLLWQLFTEQEERNFLFREEISLSGRPEFFVLSRTAPIINSPQFQVQTKPFAPQLHNGQKLAFKLRVNPTVCITEKDSGKQRRHDVLMRAKYQQKGSGISADEIESLMTQAAQAWIQDEKRLANWGFRFDFMPDMERYTQHRSFKSSGQKIEFSSVDFQGVLTLSDRDLFLEQYSKGFGRAKSFGCGLMLIRAL >NZ_LN681227.1|WP_013185256.1|3586325_3587090_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas5/CasD MKTYLVFRLYGALASWGVEAVGKDRPTASYPTRSAILGLLGAALGIRRDDEARLAALQQSVNIAIKQRISGSLMRDYHTSQVPSQEKKRVHLTRKSELSDKSKLNTILSSRDYRTDGIWIIAISLTEQAHFTLNTLHDALIKPVFTLSLGRKSCPLALPMMPQLAEYPSLKSALDTPFPPLTQSKKSDRYLLGLYGKYDEVSYFWEGEKDEINIPDTTVLTNRLWDEPLSRSRWQFTQRTMHQLSIMEETDVSV >NZ_LN681227.1|WP_013185255.1|3585274_3586312_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cse4/CasC MSQFIQLHLLTSYPPANLNRDDLGRPKTAKMGGTERLRISSQSLKRHWRVSDLFQAALAEHLGFRTKRFGFQVYQRLLNGGVKEKQAAEWATTIAEVFGKNKKDEPLEIEQLAHISPKEKEMTFALADKLIAENRAPTKEELQLLSREQIAVDMALFGRMLASSPAYSVEAACQVAHAISVHNVAVEDDYFTAVDDLNNGKSDTGSAHIGEAGFAAALFYSYICINKSLLLENLAGNEALANKAIAALVEAAVKVAPSGKQNSFGSRAYASYVLAEKGEYQPRSLSVAFLRPIVGEDQATSAISALENQVENFDKVYGACADTRYSISAVTGEGSFAELVQFVTD >NZ_LN681227.1|WP_013185254.1|3584673_3585225_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse2/CasB MNSLFESCVIPWWESMFLTQDELKKKKIRPAPTLYKAQLKRCQDIDSVTWAEGFRALWFSLPENVTEKAEQKNITLWAMIAVTLVYVKTNTTTNLATAAGTKTENDKPIVSAHRFAQLQAARTPDEFIMRLRRVLQQLDGKVSVLSLANDIDQWMKEYHQSRPNRANKRLCVQWAMDYYKAAK >NZ_LN681227.1|WP_013185253.1|3583064_3584681_+|type-I-E-CRISPR-associated-protein-Cse1/CasA MNLVKDPWLTFRMRNGGEEKLPLSAICDPAVVDFALPRADFQGAAYQLVIGLLQTVFAPEDEEEWEAFYRNAPAQADLQAAFNRVEHAFNLTGEGPLFMQDFDPLEGAKSTEISGLLIEAPGANTLRLNTDHFIKRGQCDVISPEMAAIALFTLQINAPAGGVGHRVGLRGGGPLTTLIQPQELDSSLWQKLWLNVINLDLWRYPAPDLNNPTVFPWLGKTHISQKAGTEIYAHNVHELHMYWAMPRRIRLEIDDKPAICQLTGQKTQQSVSGYRTQNYGNNYSGTWRHPLTPYRWNPKKPNEEHLSIKGQPGGITYKIWDSLTFSENNEGQEAARVVDHFGKLNDYVEDEQSNRPHLWVFGYDMDNMKARGWYATTLPLFSMPIEKKDAVFRRVKTLQNLSTYALTQCRTQIKSAWFNRPNEAKGDMSFIDALFYQRTQAPFFKAVQQIIASQHKASSLSTDEARTWLYQLRNTCFDLFDEFVLSEDNDPKNLPEKIEARQILTKWLVVSKDIKSFMTEHKIETQSSKKKKEDVVDE >NZ_LN681227.1|WP_013185252.1|3580314_3583065_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MPELINNIAYLNQYWGKAKKNPYSDEEYHLLAYHCLNVAAAGHLLLSPHKKITQDLADFLELSPEKFQNLFAFFLALHDIGKFASAFQQLYSPENTDLIKPDQLKPYDSRYFRHDRLGLFFWRKIQDDVLIALTGNSDLPVSEKAPKLQAQKTLMVLMQCMLGHHGKPIDDNRWEDIIDFTDARNVDDAAAFAHDLLTLFQPHLPLEKLLSKEWRLKLKQVSWQLAGIVVLADWIGSDCKYFRYQTQALPLSEYWRITQKQAQIALNGNDIYNTPVISPYTSIQDYYHFAPTPLQKWAEEVPIDDSPQLFILEDVTGAGKTEAALALTHRLMQTGAADGFYFGLPTMATSNAMFGRIAKHYHRMFDTKNGKLPSIVLAHGARDMNDDFQDIVLTSEHDDSDYTRDDITATAQCHQWLADSNKKALLASVGVGTIDQALLAVLPRKYQSLRLIGLNRKVLIFDEVHAADEYMFALLESLLSLHLHQGGSVILLTATLSLKQRQKLVDNWLSASGIPPQKLQETAFPLATQVTLDPENPVIETPLGSRADVSRTVMVKTVNHLDECVQIALNAARDGQCVVWVRNSVDDALQAFQLIRSLMDQLENSLLFHSRFILFDRKRIENRVLDIFGKENKQEKRQGKILITTQVFQESLDADTDVMISDICPIDDLIQRVGRLHRHTRDADGKYQKDITDSRSAPELYLHAPEWDDHPEADWLSKDFPNTQHVYRSPGRLWLGLRELLRLGAIRMPSEARTLIEAVYGEEADKHIPDALTPKDDDDLNDKRVKDAIARSQVLKWQHCEYSKSSAGGWYDDNIDISTRFNDIEMVNVLLVKLTETGELVPWVKDEKHPVQFSTLKLRKNKFADKLQPIPESLSKAVEKLQNTFKSVKYLQIWLPEIDPNFAYDPNIGFYPKQEK >NZ_LN681227.1|WP_013185251.1|3579863_3580262_+|VOC-family-protein MVPELTVTDFVASLDFYQRILGFGILIRRGNPDFVYLGLGEAQLMLEALHDSGWNTGELNKPLGRGINLQIEVDDVTPILTNLEINGITLYRPLKDNYYWIGDTQACQREFLVQDPDGYLLRFSQYIDHKQD >NZ_LN681227.1|WP_013185250.1|3579334_3579634_+|transposase MKIYSIKFKVSIQRKLLPPHNLSIPYLAKKEGISKSTLYQWRKEASVLNSTYVIKQLQQEIRHLKRKLAYREKTLSERLSRSEMWKILKIIFIIFFRML >NZ_LN681227.1|WP_013185262.1|3590425_3591421_+|hypothetical-protein MNLTNTKKLITATLCLAASYSYADSDRPLFSLTMTESGVPQTNNDGSLAHSVKSESRILPIWGDAARAKGYDLPEPFGASYSYMNMRQDIVVDSIKFQFTNSEFKPWESAITINAGDTRQKSETHLLKLDSWIFPFLNVYGVYGKTKGTSKSNLDSIYLPGTEPGKPAWDNLPFELNFKGKTFGGGATFAGGYNQFFATLDANYTRTNLDILDGDISAFVLTPRIGYEFVFNPLISGQGNTKVQVWVGAMYQDITQRFKGDVSKLDLPPELSLFDLIKDQTDIKFDVKQHLAHKWNNTVGARFEVTRNFNITSEVGFGNRNTFFVSGEFRF >NZ_LN681227.1|WP_013185263.1|3591420_3592572_+|BamA/TamA-family-outer-membrane-protein MFDFTTLKRLVISSLLIFTASAARADILPDRQKIDGWLNELGGSNSFDARKKIDWGVLPGPFYTPEMGMGIGVAVVGLYRPDSSDHISQTSSLGLSGFGSSTGAFGLNLTNYNFLANDQWRFFVSGTVNNTPTYYWGKGYNAGRDKGNKEKYNSQVFDIRPRLLYRVADATYMGLGWNFSSVNASDPDAGAKRYFEQSVGGRSVVSSGASVHFSYDTRDFLPNAQHGQAFEIIYTYFSPEFGGDHRFQTTQLQFSTYHPLSDKTVLAFDNYARFSAGDVPWNQLSLLGNSQRMRGYYEGRYRDNTIFTTQLELRHKLDWRHGIVGWIGTGTLGESPSKLGSKHWLPSVGVGYRFEFKPRMNVRLDFGVGKGSTGFYFQVGEAF >NZ_LN681227.1|WP_013185264.1|3592580_3593702_+|DUF4056-domain-containing-protein MTLCLGFLLMACQGKPEPLNPVEPVLTSDTHEQAQEEWTALSPISPPEGLRACCVFGYNIKAKLGGIPVPFYNIDNIVEAGKLGEHHYNDSVLGASAALLGVSDEKIGLLYTHKGGFVDISHVRDTADYTLFLFSQIYARLGQKWELTLDNELAARKIHFFAFTPPEDPAERYTLSVYLATKLAFKLAVWHEIAQWYGYQSVPGFPESVSAFSPEDLYSNLLGARLALTLILEGHASSVSQFSAAIAKILPTALSELGDYSRSGTKEMFDSVDGLWWNSYQRIPEKFLVLHRNYDIQDNRYPLMPSGKENFALRLALPEYYLHFSLDKLAEFQLWPTNAMKNLPAPKQYWTAEDFKMLVEKAQDEDARQLLIH >NZ_LN681227.1|WP_010846236.1|3593806_3594277_-|MarR-family-transcriptional-regulator MPDSKVFVDNYLPALLGQAWMLVSSEFHDIVEAQGLSVLEWRVLSTLAGSGPIGISLLAQRTVSKQPTITRVLQRLESQGHVARFSNGGGDRRITLVRLTETGLEVVEELLAEAKSHEQSVLEPLGNGKSQLLKEVLQELIKQHTPIRKVLGELGK >NZ_LN681227.1|WP_013185266.1|3594590_3594854_-|PAAR-domain-containing-protein MSNKAVIRLNDTMDHGGKVITAIDGYVYQGIPVAGKGDLVVCPKCEDTFPIVEGSESLKYQGRQITLEGMCTACGAKLITSQKKLLA >NZ_LN681227.1|WP_038220138.1|3595254_3595500_-|hypothetical-protein MRRAWRVALSDSCNMTIEFNEEQCNKLKNHAFNAYIDELVVHCNESYPYLEIKLGKEGLKTVLAAAVEKAKNDGFCCSVLY >NZ_LN681227.1|WP_010846242.1|3596321_3596900_-|outer-membrane-beta-barrel-protein MVMNKTLFTTLVISGFLYGALAYADSHTVAVGFAQSKVQDFKHIRGVNLHYRYEWDYPVSIIGSLAYMKGSEHTRSTGENYVEKGSGDVKYYSLMVGPAYRINDYVSIYGLLGFSHFKVDYSYHESERINDKISSYHGSENRKSTNFAYGAGIEVNPIQYLSIYAGYEGSEEKFNDKSFNINGFNIGVGYRF >NZ_LN681227.1|WP_010846244.1|3597360_3598635_+|bifunctional-O-acetylhomoserine-aminocarboxypropyltransferase/cysteine-synthase MKLETLSIHAGYSPDPETKAVAVPIYQTTSYAFDDSQHGADLFGLKVAGNIYTRLMNPTTDVLEKRVAALEGGIGALAVASGMSAITYAIQTIASAGDNIISIAKLYGGTHNLMAHTFPNIGIETRFVDHNDIAAIEAMIDEKTKAVFCESITNPSGNIIDIQAMADVAHRHGLPLIVDNTVATPCLCRPFEHGADIIIHSLTKYIGGHGTSIGGMIVDSGKFPWAEHQDRFAILNTPDESYHGINYTDHFGAAAYIARCRVGPLRSMGAALSPFNAFLILQGLETLTLRMERHTENALKIAQYLEQHPQVSWVKYAGLPTHPEHDLAVRYMGGKPSSVLSFGIKGGKEAGIRFIDALQLIVRLVNIGDAKSLACHPASTTHSQLSDKDLIEAGVSQDLIRLSIGLEHSDDIIADLAQALDAAK >NZ_LN681227.1|WP_013185270.1|3598720_3598891_-|hypothetical-protein MDMLLLVIIGSELMLDRKNHIIINIKIIYIVGNEFASQSLPSGERQEPLINPREHR >NZ_LN681227.1|WP_038220140.1|3598984_3599506_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MSEHTATTAPFTLESLYGAHQGWLKTWLTRKLQSAFDADDIVQDTFLRVMRNDSLASIRDPRSFLCTIAKRVIVDLFRRNALEKAYLEMLAQLPEAHAPSLEVRESQLETLQLLDKMLDGLSGKTRDAFLLSQLEGLTYNDIACRLSVSVSSVKKYVARAMEHCLLFRLEHGL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN681227_2 | 2.22|1815509|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815509-1815540 | 32 | NZ_LN681227.1 | 3544163-3544194 | 0 | 1.0 |
NZ_LN681227_2 | 2.45|1815509|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1815509-1815541 | 33 | NZ_LN681227.1 | 3544163-3544195 | 0 | 1.0 |
NZ_LN681227_3 | 3.7|3577793|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 3577793-3577825 | 33 | NZ_LN681227.1 | 2521314-2521346 | 0 | 1.0 |
NZ_LN681227_1 | 1.1|1814004|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder | 1814004-1814035 | 32 | NZ_LN681227.1 | 881837-881868 | 1 | 0.969 |
1. spacer 2.22|1815509|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 3544163-3544194, mismatch: 0, identity: 1.0
gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacc CRISPR spacer gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacc Protospacer ********************************
2. spacer 2.45|1815509|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to position: 3544163-3544195, mismatch: 0, identity: 1.0
gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacca CRISPR spacer gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacca Protospacer *********************************
3. spacer 3.7|3577793|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 2521314-2521346, mismatch: 0, identity: 1.0
ctcaaagctcaaatcatttcattacgtatcatc CRISPR spacer ctcaaagctcaaatcatttcattacgtatcatc Protospacer *********************************
4. spacer 1.1|1814004|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder matches to position: 881837-881868, mismatch: 1, identity: 0.969
aatctgcgccccgctggcaataccgccgtaag CRISPR spacer aatctgcgccacgctggcaataccgccgtaag Protospacer ********** *********************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN681227_3 | 3.14|3578221|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578221-3578253 | 33 | NZ_FO818639 | Xenorhabdus bovienii strain CS03 plasmid XBC_p, complete sequence | 4359-4391 | 0 | 1.0 |
NZ_LN681227_3 | 3.22|3578710|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578710-3578741 | 32 | NZ_FO704549 | Xenorhabdus doucetiae strain FRM16 plasmid XD_p, complete sequence | 6458-6489 | 2 | 0.938 |
NZ_LN681227_3 | 3.15|3578283|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578283-3578314 | 32 | NZ_FO704549 | Xenorhabdus doucetiae strain FRM16 plasmid XD_p, complete sequence | 6677-6708 | 4 | 0.875 |
NZ_LN681227_3 | 3.15|3578283|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578283-3578314 | 32 | NZ_FO818639 | Xenorhabdus bovienii strain CS03 plasmid XBC_p, complete sequence | 6369-6400 | 4 | 0.875 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NZ_AP023208 | Escherichia coli strain TUM18781 plasmid pMTY18781-3, complete sequence | 57516-57547 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NZ_CP022660 | Salmonella enterica subsp. enterica strain RM11060 plasmid pRM11060-2, complete sequence | 43707-43738 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NZ_CP045061 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG26 plasmid pLG26p2, complete sequence | 43713-43744 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NZ_CP045054 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG24 plasmid pLG24p2, complete sequence | 43718-43749 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NZ_CP045058 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG25 plasmid pLG25p2, complete sequence | 43717-43748 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NC_004313 | Salmonella phage ST64B, complete genome | 4894-4925 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | LN997803 | Escherichia coli phage phi467 | 8143-8174 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | KU927493 | Salmonella phage 118970_sal3, complete genome | 3220-3251 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | KU927493 | Salmonella phage 118970_sal3, complete genome | 42805-42836 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | KC814930 | Shigella phage SfIV, complete genome | 4946-4977 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | AY055382 | Salmonella typhimurium phage ST64B complete sequence | 4894-4925 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NZ_CP049244 | Rhizobium pseudoryzae strain DSM 19479 plasmid unnamed3, complete sequence | 64097-64128 | 5 | 0.844 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | NZ_AP023208 | Escherichia coli strain TUM18781 plasmid pMTY18781-3, complete sequence | 57516-57548 | 5 | 0.848 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | NZ_CP022660 | Salmonella enterica subsp. enterica strain RM11060 plasmid pRM11060-2, complete sequence | 43706-43738 | 5 | 0.848 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | NZ_CP045061 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG26 plasmid pLG26p2, complete sequence | 43712-43744 | 5 | 0.848 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | NZ_CP045054 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG24 plasmid pLG24p2, complete sequence | 43717-43749 | 5 | 0.848 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | NZ_CP045058 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG25 plasmid pLG25p2, complete sequence | 43716-43748 | 5 | 0.848 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | NC_004313 | Salmonella phage ST64B, complete genome | 4894-4926 | 5 | 0.848 |
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NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | KU927493 | Salmonella phage 118970_sal3, complete genome | 3220-3252 | 5 | 0.848 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | KU927493 | Salmonella phage 118970_sal3, complete genome | 42805-42837 | 5 | 0.848 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | KC814930 | Shigella phage SfIV, complete genome | 4946-4978 | 5 | 0.848 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | AY055382 | Salmonella typhimurium phage ST64B complete sequence | 4894-4926 | 5 | 0.848 |
NZ_LN681227_2 | 2.19|1815326|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815326-1815357 | 32 | MT774382 | CrAssphage cr10_1, complete genome | 61413-61444 | 6 | 0.812 |
NZ_LN681227_2 | 2.20|1815387|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815387-1815418 | 32 | NZ_CP040258 | Moraxella osloensis strain MOXF1 plasmid pMOXF1, complete sequence | 236154-236185 | 6 | 0.812 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | NZ_CP049244 | Rhizobium pseudoryzae strain DSM 19479 plasmid unnamed3, complete sequence | 64097-64129 | 6 | 0.818 |
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NZ_LN681227_3 | 3.1|3577611|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 3577611-3577641 | 31 | NC_019956 | Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795 plasmid pTHETHE01, complete sequence | 37718-37748 | 6 | 0.806 |
NZ_LN681227_3 | 3.16|3578344|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578344-3578375 | 32 | LR135896 | uncultured phage genomic DNA containing rbcL region region | 97416-97447 | 6 | 0.812 |
NZ_LN681227_3 | 3.22|3578710|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578710-3578741 | 32 | KT351734 | Pectobacterium carotovorum plasmid Drgb3, complete sequence | 26847-26878 | 6 | 0.812 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NZ_CP010862 | Marinovum algicola DG 898 plasmid pMaD7 | 48077-48108 | 7 | 0.781 |
NZ_LN681227_2 | 2.7|1814596|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814596-1814627 | 32 | MT932211 | Escherichia phage VEcB, complete genome | 135681-135712 | 7 | 0.781 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP020897 | Rhizobium phaseoli Brasil 5 strain Bra5 plasmid pRphaBra5a, complete sequence | 212331-212360 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP013524 | Rhizobium phaseoli strain R744 plasmid pRphaR744b, complete sequence | 293662-293691 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP013576 | Rhizobium phaseoli strain N671 plasmid pRphaN671b, complete sequence | 302395-302424 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP013548 | Rhizobium phaseoli strain R611 plasmid pRetR611a, complete sequence | 302391-302420 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP013533 | Rhizobium phaseoli strain R650 plasmid pRphaR650a, complete sequence | 302391-302420 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP013543 | Rhizobium phaseoli strain R620 plasmid pRphaR620a, complete sequence | 305805-305834 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP013570 | Rhizobium phaseoli strain N771 plasmid pRphaN771b, complete sequence | 302395-302424 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP035002 | Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23d, complete sequence | 461486-461515 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP029452 | Sinorhizobium fredii CCBAU 25509 plasmid pSF25509b, complete sequence | 2158980-2159009 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NC_017958 | Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM3, complete sequence | 885301-885330 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP012886 | Mycobacterium chimaera strain AH16 plasmid unnamed1, complete sequence | 343033-343062 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP023071 | Sinorhizobium fredii CCBAU 83666 plasmid pSF83666b, complete sequence | 2225256-2225285 | 7 | 0.767 |
NZ_LN681227_2 | 2.42|1815326|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1815326-1815358 | 33 | MT774382 | CrAssphage cr10_1, complete genome | 61413-61445 | 7 | 0.788 |
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NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_CP013345 | Sphingopyxis macrogoltabida strain 203N plasmid unnamed1, complete sequence | 371385-371416 | 7 | 0.781 |
NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_CP027859 | Streptomyces clavuligerus strain ATCC 27064 plasmid pCLA1, complete sequence | 1304928-1304959 | 7 | 0.781 |
NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_CP032054 | Streptomyces clavuligerus strain F1D-5 plasmid pSCL1, complete sequence | 907024-907055 | 7 | 0.781 |
NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_CP016560 | Streptomyces clavuligerus strain F613-1 plasmid pSCL4, complete sequence | 563914-563945 | 7 | 0.781 |
NZ_LN681227_1 | 1.1|1814004|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder | 1814004-1814035 | 32 | NZ_CP040758 | Paracoccus sp. 2251 plasmid unnamed7, complete sequence | 25381-25412 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_1 | 1.1|1814004|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder | 1814004-1814035 | 32 | NZ_CP046917 | Paraburkholderia sp. DHF22 plasmid p1, complete sequence | 144140-144171 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NZ_CP020900 | Rhizobium phaseoli Brasil 5 strain Bra5 plasmid pRphaBra5d, complete sequence | 248896-248927 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_2 | 2.7|1814596|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814596-1814627 | 32 | NZ_CP034684 | Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence | 63903-63934 | 8 | 0.75 |
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NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP021026 | Rhizobium sp. TAL182 plasmid pRetTAL182b, complete sequence | 223831-223860 | 8 | 0.733 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP013586 | Rhizobium phaseoli strain N161 plasmid pRphaN161a, complete sequence | 305263-305292 | 8 | 0.733 |
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NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP013528 | Rhizobium phaseoli strain R723 plasmid pRphaR723a, complete sequence | 299957-299986 | 8 | 0.733 |
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NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP013591 | Rhizobium sp. N871 plasmid pRspN871a, complete sequence | 257584-257613 | 8 | 0.733 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | NZ_CP013603 | Rhizobium sp. N731 plasmid pRspN731b, complete sequence | 278453-278482 | 8 | 0.733 |
NZ_LN681227_2 | 2.15|1815082|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815082-1815113 | 32 | NC_008271 | Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3, complete sequence | 167752-167783 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_2 | 2.18|1815265|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815265-1815296 | 32 | MT774378 | CrAssphage cr106_1, complete genome | 55610-55641 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_2 | 2.21|1815448|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815448-1815479 | 32 | NC_047738 | Rhizobium phage RHEph01, complete genome | 9556-9587 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_2 | 2.30|1814596|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814596-1814628 | 33 | MT932211 | Escherichia phage VEcB, complete genome | 135681-135713 | 8 | 0.758 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP020897 | Rhizobium phaseoli Brasil 5 strain Bra5 plasmid pRphaBra5a, complete sequence | 212331-212361 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013524 | Rhizobium phaseoli strain R744 plasmid pRphaR744b, complete sequence | 293662-293692 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013576 | Rhizobium phaseoli strain N671 plasmid pRphaN671b, complete sequence | 302395-302425 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013548 | Rhizobium phaseoli strain R611 plasmid pRetR611a, complete sequence | 302391-302421 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013533 | Rhizobium phaseoli strain R650 plasmid pRphaR650a, complete sequence | 302391-302421 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013543 | Rhizobium phaseoli strain R620 plasmid pRphaR620a, complete sequence | 305805-305835 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013570 | Rhizobium phaseoli strain N771 plasmid pRphaN771b, complete sequence | 302395-302425 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP035002 | Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23d, complete sequence | 461486-461516 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP029452 | Sinorhizobium fredii CCBAU 25509 plasmid pSF25509b, complete sequence | 2158979-2159009 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NC_017958 | Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM3, complete sequence | 885300-885330 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP012886 | Mycobacterium chimaera strain AH16 plasmid unnamed1, complete sequence | 343032-343062 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP023071 | Sinorhizobium fredii CCBAU 83666 plasmid pSF83666b, complete sequence | 2225255-2225285 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_3 | 3.3|3577733|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 3577733-3577763 | 31 | NZ_CP018921 | Serratia marcescens strain UMH7 plasmid unnamed4, complete sequence | 11692-11722 | 8 | 0.742 |
NZ_LN681227_3 | 3.6|3577732|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 3577732-3577763 | 32 | NZ_CP018921 | Serratia marcescens strain UMH7 plasmid unnamed4, complete sequence | 11691-11722 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_3 | 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578099-3578130 | 32 | LT603682 | Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 5 | 16880-16911 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_3 | 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578099-3578130 | 32 | NZ_AP017563 | Pseudanabaena sp. ABRG5-3 plasmid ABRG53c, complete sequence | 72273-72304 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_3 | 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578099-3578130 | 32 | NZ_CP045339 | Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_a, complete sequence | 250796-250827 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_3 | 3.14|3578221|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578221-3578253 | 33 | MT611523 | Escherichia phage DK-13, complete genome | 120721-120753 | 8 | 0.758 |
NZ_LN681227_3 | 3.14|3578221|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578221-3578253 | 33 | MT446392 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH15, complete genome | 144551-144583 | 8 | 0.758 |
NZ_LN681227_3 | 3.15|3578283|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578283-3578314 | 32 | MT446416 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH47, complete genome | 126849-126880 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_3 | 3.22|3578710|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578710-3578741 | 32 | NZ_FO818639 | Xenorhabdus bovienii strain CS03 plasmid XBC_p, complete sequence | 6586-6617 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_4 | 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 3589265-3589297 | 33 | NZ_CP022370 | Bosea sp. AS-1 plasmid unnamed1, complete sequence | 152914-152946 | 8 | 0.758 |
NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_CP015743 | Shinella sp. HZN7 plasmid pShin-07, complete sequence | 120557-120588 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_CP010861 | Marinovum algicola DG 898 plasmid pMaD6, complete sequence | 36413-36444 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_CP022370 | Bosea sp. AS-1 plasmid unnamed1, complete sequence | 152915-152946 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_4 | 4.22|3589510|32|NZ_LN681227|CRT | 3589510-3589541 | 32 | MT939242 | Enterococcus phage 9184, partial genome | 28353-28384 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_4 | 4.28|3589876|32|NZ_LN681227|CRT | 3589876-3589907 | 32 | NC_009816 | Corynebacterium phage P1201, complete genome | 24004-24035 | 8 | 0.75 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NC_008010 | Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO01, complete sequence | 170469-170500 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NZ_CP023068 | Ensifer sojae CCBAU 05684 plasmid pSJ05684b, complete sequence | 1242291-1242322 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | NZ_CP022363 | Azospirillum sp. TSH58 plasmid TSH58_p03, complete sequence | 26326-26357 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_2 | 2.7|1814596|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814596-1814627 | 32 | NZ_CP021437 | Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence | 216102-216133 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_2 | 2.7|1814596|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814596-1814627 | 32 | NC_048651 | Aeribacillus phage AP45, complete genome | 22981-23012 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_2 | 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814901-1814930 | 30 | MN855771 | Siphoviridae sp. isolate 189, complete genome | 33805-33834 | 9 | 0.7 |
NZ_LN681227_2 | 2.13|1814960|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814960-1814991 | 32 | NZ_CP009619 | Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence | 263595-263626 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_2 | 2.14|1815021|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815021-1815052 | 32 | NZ_CP032182 | Citrobacter freundii strain AR_0116 plasmid unnamed4, complete sequence | 43660-43691 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_2 | 2.22|1815509|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815509-1815540 | 32 | MN586016 | Mycobacterium phage MarysWell, complete genome | 37067-37098 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_2 | 2.22|1815509|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815509-1815540 | 32 | MH338235 | Mycobacterium phage Dublin, complete genome | 36824-36855 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_2 | 2.22|1815509|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815509-1815540 | 32 | NC_028960 | Mycobacterium phage Theia, complete genome | 37045-37076 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP021032 | Rhizobium sp. NXC14 plasmid pRspNXC14b, complete sequence | 172972-173002 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP021026 | Rhizobium sp. TAL182 plasmid pRetTAL182b, complete sequence | 223831-223861 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013586 | Rhizobium phaseoli strain N161 plasmid pRphaN161a, complete sequence | 305263-305293 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013597 | Rhizobium sp. N741 plasmid pRspN741b, complete sequence | 257215-257245 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013559 | Rhizobium phaseoli strain N841 plasmid pRphaN841b, complete sequence | 301932-301962 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013528 | Rhizobium phaseoli strain R723 plasmid pRphaR723a, complete sequence | 299957-299987 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013538 | Rhizobium phaseoli strain R630 plasmid pRphaR630a, complete sequence | 294771-294801 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013501 | Rhizobium esperanzae strain N561 plasmid pRspN561a, complete sequence | 257581-257611 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013581 | Rhizobium phaseoli strain N261 plasmid pRphaN261a, complete sequence | 299960-299990 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013507 | Rhizobium sp. N1341 plasmid pRspN1341b, complete sequence | 257215-257245 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013518 | Rhizobium sp. N113 plasmid pRspN113a, complete sequence | 257581-257611 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013491 | Rhizobium sp. N6212 plasmid pRspN6212a, complete sequence | 257584-257614 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013513 | Rhizobium sp. N1314 plasmid pRspN1314b, complete sequence | 278453-278483 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013496 | Rhizobium sp. N621 plasmid pRspN621a, complete sequence | 257584-257614 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013591 | Rhizobium sp. N871 plasmid pRspN871a, complete sequence | 257584-257614 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_2 | 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814901-1814931 | 31 | NZ_CP013603 | Rhizobium sp. N731 plasmid pRspN731b, complete sequence | 278453-278483 | 9 | 0.71 |
NZ_LN681227_3 | 3.8|3577855|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 3577855-3577886 | 32 | MK250021 | Prevotella phage Lak-B2, complete genome | 444271-444302 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_3 | 3.8|3577855|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 3577855-3577886 | 32 | MK250023 | Prevotella phage Lak-B4, complete genome | 443481-443512 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_3 | 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578099-3578130 | 32 | NC_011737 | Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742402, complete sequence | 138922-138953 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_3 | 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578099-3578130 | 32 | NZ_CP014175 | Clostridium argentinense strain 89G plasmid pRSJ17_1, complete sequence | 20005-20036 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_3 | 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578099-3578130 | 32 | MF974397 | Leptospira phage LE4, complete genome | 47751-47782 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_3 | 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578099-3578130 | 32 | MF974396 | Leptospira phage LE3, complete genome | 48173-48204 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_3 | 3.18|3578466|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578466-3578497 | 32 | NZ_CP016462 | Blastomonas sp. RAC04 plasmid pBSY18_1, complete sequence | 109400-109431 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_3 | 3.19|3578527|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578527-3578558 | 32 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 2284922-2284953 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_4 | 4.15|3589083|32|NZ_LN681227|CRT | 3589083-3589114 | 32 | JN231330 | UNVERIFIED: Uncultured phage contig03 MexF-like gene, complete sequence | 1510-1541 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_CP039902 | Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5877 plasmid pTiCFBP5877, complete sequence | 7342-7373 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_CP039893 | Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5499 plasmid pTiCFBP5499, complete sequence | 192166-192197 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_KY000025 | Agrobacterium genomosp. 6 strain AR125 plasmid pTi_AR125, complete sequence | 13675-13706 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_4 | 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT | 3589266-3589297 | 32 | NZ_KY000029 | Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP5499 plasmid pTi_CFBP5499, complete sequence | 13675-13706 | 9 | 0.719 |
NZ_LN681227_1 | 1.1|1814004|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder | 1814004-1814035 | 32 | NC_012586 | Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234b, complete sequence | 254894-254925 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | MH536819 | Gordonia phage Fury, complete genome | 38651-38682 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_2 | 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814535-1814566 | 32 | MH576960 | Gordonia phage Pleakley, complete genome | 38652-38683 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_2 | 2.18|1815265|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815265-1815296 | 32 | MK629528 | Escherichia phage Lidtsur, complete genome | 41423-41454 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_2 | 2.24|1815631|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1815631-1815662 | 32 | NZ_CP026318 | Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 2, complete sequence | 35970-36001 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | NC_008010 | Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO01, complete sequence | 170468-170500 | 10 | 0.697 |
NZ_LN681227_2 | 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR | 1814535-1814567 | 33 | NZ_CP023068 | Ensifer sojae CCBAU 05684 plasmid pSJ05684b, complete sequence | 1242291-1242323 | 10 | 0.697 |
NZ_LN681227_3 | 3.8|3577855|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 3577855-3577886 | 32 | MN693360 | Marine virus AFVG_25M250, complete genome | 18647-18678 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_3 | 3.8|3577855|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 3577855-3577886 | 32 | MN693394 | Marine virus AFVG_25M234, complete genome | 13512-13543 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_3 | 3.10|3577977|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3577977-3578008 | 32 | NZ_CP031942 | Nostoc sphaeroides strain Kutzing En plasmid p1, complete sequence | 8534-8565 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_3 | 3.11|3578038|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578038-3578069 | 32 | NC_020841 | Psychrobacter phage pOW20-A genomic sequence | 19342-19373 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_3 | 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578099-3578130 | 32 | NZ_CP020413 | Leptospira interrogans serovar Copenhageni strain FDAARGOS_203 plasmid unnamed1, complete sequence | 95089-95120 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_3 | 3.15|3578283|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578283-3578314 | 32 | MN693567 | Marine virus AFVG_25M189, complete genome | 16992-17023 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_3 | 3.19|3578527|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578527-3578558 | 32 | NZ_CP034999 | Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23a, complete sequence | 201169-201200 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_3 | 3.22|3578710|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578710-3578741 | 32 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 121015-121046 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_4 | 4.1|3589082|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder | 3589082-3589114 | 33 | JN231330 | UNVERIFIED: Uncultured phage contig03 MexF-like gene, complete sequence | 1510-1542 | 10 | 0.697 |
NZ_LN681227_4 | 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 3589265-3589297 | 33 | NZ_CP039902 | Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5877 plasmid pTiCFBP5877, complete sequence | 7341-7373 | 10 | 0.697 |
NZ_LN681227_4 | 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 3589265-3589297 | 33 | NZ_CP039893 | Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5499 plasmid pTiCFBP5499, complete sequence | 192165-192197 | 10 | 0.697 |
NZ_LN681227_4 | 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 3589265-3589297 | 33 | NZ_KY000025 | Agrobacterium genomosp. 6 strain AR125 plasmid pTi_AR125, complete sequence | 13675-13707 | 10 | 0.697 |
NZ_LN681227_4 | 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR | 3589265-3589297 | 33 | NZ_KY000029 | Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP5499 plasmid pTi_CFBP5499, complete sequence | 13675-13707 | 10 | 0.697 |
NZ_LN681227_4 | 4.15|3589083|32|NZ_LN681227|CRT | 3589083-3589114 | 32 | NZ_CP043832 | Bacillus sp. BS98 plasmid unnamed2 | 86116-86147 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_4 | 4.15|3589083|32|NZ_LN681227|CRT | 3589083-3589114 | 32 | NZ_CP040345 | Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence | 322382-322413 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_4 | 4.15|3589083|32|NZ_LN681227|CRT | 3589083-3589114 | 32 | NZ_CP020434 | Bacillus sp. FDAARGOS_235 plasmid 1, complete sequence | 231361-231392 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_4 | 4.22|3589510|32|NZ_LN681227|CRT | 3589510-3589541 | 32 | NZ_CP012748 | Paraburkholderia caribensis MBA4 plasmid unnamed, complete sequence | 383746-383777 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_4 | 4.22|3589510|32|NZ_LN681227|CRT | 3589510-3589541 | 32 | MT446408 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH35, complete genome | 47407-47438 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_4 | 4.28|3589876|32|NZ_LN681227|CRT | 3589876-3589907 | 32 | NC_028835 | Lactobacillus phage CL2, complete genome | 12250-12281 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_4 | 4.28|3589876|32|NZ_LN681227|CRT | 3589876-3589907 | 32 | KR905066 | Lactobacillus phage CL1, complete genome | 11235-11266 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_4 | 4.28|3589876|32|NZ_LN681227|CRT | 3589876-3589907 | 32 | NC_028911 | Lactobacillus phage iLp1308, complete genome | 10943-10974 | 10 | 0.688 |
NZ_LN681227_2 | 2.3|1814351|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814351-1814382 | 32 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 958874-958905 | 11 | 0.656 |
NZ_LN681227_2 | 2.13|1814960|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814960-1814991 | 32 | NZ_CP021811 | Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid accessoryA, complete sequence | 157672-157703 | 11 | 0.656 |
NZ_LN681227_2 | 2.13|1814960|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT | 1814960-1814991 | 32 | NC_018682 | Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A, complete sequence | 68670-68701 | 11 | 0.656 |
NZ_LN681227_3 | 3.14|3578221|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3578221-3578253 | 33 | NZ_FO704549 | Xenorhabdus doucetiae strain FRM16 plasmid XD_p, complete sequence | 8426-8449 | 11 | 0.667 |
NZ_LN681227_4 | 4.22|3589510|32|NZ_LN681227|CRT | 3589510-3589541 | 32 | CP015514 | Vibrio vulnificus strain FORC_036 plasmid unnamed, complete sequence | 572288-572319 | 11 | 0.656 |
1. spacer 3.14|3578221|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_FO818639 (Xenorhabdus bovienii strain CS03 plasmid XBC_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aacatcaaatgaaatattaacctgtgaattttt CRISPR spacer aacatcaaatgaaatattaacctgtgaattttt Protospacer *********************************
2. spacer 3.22|3578710|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_FO704549 (Xenorhabdus doucetiae strain FRM16 plasmid XD_p, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
agcttttcattgcctattttcaaataaaatgg CRISPR spacer agctttttattgcctatattcaaataaaatgg Protospacer *******.********* **************
3. spacer 3.15|3578283|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_FO704549 (Xenorhabdus doucetiae strain FRM16 plasmid XD_p, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
cattttagaaaaaaacgtagatggtgcatcac CRISPR spacer agttttagaaaaaaatgtagatggttcatcac Protospacer .*************.********* ******
4. spacer 3.15|3578283|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_FO818639 (Xenorhabdus bovienii strain CS03 plasmid XBC_p, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
cattttagaaaaaaacgtagatggtgcatcac CRISPR spacer aattttagaaaaaaatgtagatggttcatccc Protospacer **************.********* **** *
5. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP023208 (Escherichia coli strain TUM18781 plasmid pMTY18781-3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
6. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022660 (Salmonella enterica subsp. enterica strain RM11060 plasmid pRM11060-2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
7. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045061 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG26 plasmid pLG26p2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
8. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045054 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG24 plasmid pLG24p2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
9. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045058 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG25 plasmid pLG25p2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
10. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004313 (Salmonella phage ST64B, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
11. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to LN997803 (Escherichia coli phage phi467) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
12. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU927493 (Salmonella phage 118970_sal3, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
13. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU927493 (Salmonella phage 118970_sal3, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
14. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to KC814930 (Shigella phage SfIV, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
15. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to AY055382 (Salmonella typhimurium phage ST64B complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgc Protospacer *** ********** **************
16. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP049244 (Rhizobium pseudoryzae strain DSM 19479 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc- CRISPR spacer ccggccgccagccagaccatgctgg-tgatcta Protospacer ********** *****.******** **** .
17. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_AP023208 (Escherichia coli strain TUM18781 plasmid pMTY18781-3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
18. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP022660 (Salmonella enterica subsp. enterica strain RM11060 plasmid pRM11060-2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
19. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP045061 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG26 plasmid pLG26p2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
20. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP045054 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG24 plasmid pLG24p2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
21. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP045058 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Muenchen strain LG25 plasmid pLG25p2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
22. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NC_004313 (Salmonella phage ST64B, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
23. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to LN997803 (Escherichia coli phage phi467) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
24. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to KU927493 (Salmonella phage 118970_sal3, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
25. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to KU927493 (Salmonella phage 118970_sal3, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
26. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to KC814930 (Shigella phage SfIV, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
27. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to AY055382 (Salmonella typhimurium phage ST64B complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccgcaggccacccagaaaatgctggatgatgcc Protospacer *** ********** ***************
28. spacer 2.19|1815326|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774382 (CrAssphage cr10_1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
aactca--agaccaaaagatttaaatgacattct CRISPR spacer --cttaatagtccagaagatttaaatgacattgt Protospacer **.* ** ***.***************** *
29. spacer 2.20|1815387|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040258 (Moraxella osloensis strain MOXF1 plasmid pMOXF1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
aatttttcatcctcattgagtat-ttgcaatag CRISPR spacer aatttttcatcctcactgattatgttgtaaac- Protospacer ***************.*** *** ***.**
30. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP049244 (Rhizobium pseudoryzae strain DSM 19479 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.818
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc- CRISPR spacer ccggccgccagccagaccatgctgg-tgatctac Protospacer ********** *****.******** **** .
31. spacer 3.1|3577611|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to CP003185 (Thermoanaerobacterium saccharolyticum JW/SL-YS485 plasmid pMU3262, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
actcaaagtaagtcagtcaaaaacaggctat CRISPR spacer acgaataaaaagtcagtcaaaaacaggcaat Protospacer ** * *. ******************* **
32. spacer 3.1|3577611|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NC_019956 (Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum M0795 plasmid pTHETHE01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.806
actcaaagtaagtcagtcaaaaacaggctat CRISPR spacer acgaataaaaagtcagtcaaaaacaggcaat Protospacer ** * *. ******************* **
33. spacer 3.16|3578344|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR135896 (uncultured phage genomic DNA containing rbcL region region) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
acccaatgaagccagtaataaatatcggcagg-- CRISPR spacer acccgatcaagccagtaataaata--agcaagag Protospacer ****.** **************** .***.*
34. spacer 3.22|3578710|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT351734 (Pectobacterium carotovorum plasmid Drgb3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
agcttttc----attgcctattttcaaataaaatgg CRISPR spacer ----tttcgcgtattgccgattttcaaaaaaaatgg Protospacer **** ****** ********* *******
35. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010862 (Marinovum algicola DG 898 plasmid pMaD7) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc- CRISPR spacer gcggctgacacccagatcatgct-gatagagca Protospacer ****.* *************** ***.. **
36. spacer 2.7|1814596|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT932211 (Escherichia phage VEcB, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
cacagtaaatattaatttgtactcattctgta CRISPR spacer cagagtaaatattattttgtactctgttaata Protospacer ** *********** ********* *. .**
37. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020897 (Rhizobium phaseoli Brasil 5 strain Bra5 plasmid pRphaBra5a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .********************.** . ..*
38. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013524 (Rhizobium phaseoli strain R744 plasmid pRphaR744b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .********************.** . ..*
39. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013576 (Rhizobium phaseoli strain N671 plasmid pRphaN671b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .********************.** . ..*
40. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013548 (Rhizobium phaseoli strain R611 plasmid pRetR611a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .********************.** . ..*
41. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013533 (Rhizobium phaseoli strain R650 plasmid pRphaR650a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .********************.** . ..*
42. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013543 (Rhizobium phaseoli strain R620 plasmid pRphaR620a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .********************.** . ..*
43. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013570 (Rhizobium phaseoli strain N771 plasmid pRphaN771b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .********************.** . ..*
44. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035002 (Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23d, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .********************.** . ..*
45. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP029452 (Sinorhizobium fredii CCBAU 25509 plasmid pSF25509b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcgtactcgccggcggaaacga Protospacer .************.*******.** * ..*
46. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_017958 (Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa- CRISPR spacer tgccgtcttcgtattcgccggt-gcgcagat Protospacer ** * ***************** **.. .*
47. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012886 (Mycobacterium chimaera strain AH16 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cgtcatcgtcgtattcgccgatggcattgt Protospacer .* * ** ************.*******.
48. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023071 (Sinorhizobium fredii CCBAU 83666 plasmid pSF83666b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcgtactcgccggcggaaacga Protospacer .************.*******.** * ..*
49. spacer 2.42|1815326|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to MT774382 (CrAssphage cr10_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aactca--agaccaaaagatttaaatgacattctc CRISPR spacer --cttaatagtccagaagatttaaatgacattgta Protospacer **.* ** ***.***************** *
50. spacer 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP013345 (Sphingopyxis macrogoltabida strain 203N plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
gtcggcgatttctgcgggggtggcactctattg- CRISPR spacer gtcggcgatttcagcgggcgtggc-cgcaagggc Protospacer ************ ***** ***** * * * *
51. spacer 4.17|3589205|32|NZ_LN681227|CRT matches to MK047643 (Phage NGI136, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
aatccattgttgataatggcgctgatttcaaa CRISPR spacer aaagcattgttgataatggtgttgattttact Protospacer ** ***************.*.******.*
52. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP013345 (Sphingopyxis macrogoltabida strain 203N plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tcggcgatttctgcgggggtggcactctattg- CRISPR spacer tcggcgatttcagcgggcgtggc-cgcaagggc Protospacer *********** ***** ***** * * * *
53. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP027859 (Streptomyces clavuligerus strain ATCC 27064 plasmid pCLA1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tcggcgatttctgcgggggtggc-actctattg CRISPR spacer tcggcgatctcggcgggggtggcgaccatgtc- Protospacer ********.** *********** **. *.*.
54. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP032054 (Streptomyces clavuligerus strain F1D-5 plasmid pSCL1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tcggcgatttctgcgggggtggc-actctattg CRISPR spacer tcggcgatctcggcgggggtggcgaccatgtc- Protospacer ********.** *********** **. *.*.
55. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP016560 (Streptomyces clavuligerus strain F613-1 plasmid pSCL4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tcggcgatttctgcgggggtggc-actctattg CRISPR spacer tcggcgatctcggcgggggtggcgaccatgtc- Protospacer ********.** *********** **. *.*.
56. spacer 1.1|1814004|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040758 (Paracoccus sp. 2251 plasmid unnamed7, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aatctg---cgccccgctggcaataccgccgtaag CRISPR spacer ---ctgacccgccccgcggacaataccgccgtcga Protospacer *** ******** *.************ ..
57. spacer 1.1|1814004|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046917 (Paraburkholderia sp. DHF22 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
-aatctgcgccccgctggcaataccgccgtaag CRISPR spacer cggactg-gccacgctggcaatcccgccgtaca Protospacer .. *** *** ********** ******** .
58. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020900 (Rhizobium phaseoli Brasil 5 strain Bra5 plasmid pRphaBra5d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer tcggccgcctcccggatcatgctgtcggaatc Protospacer .******** ***.********** ** *
59. spacer 2.7|1814596|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP034684 (Bacillus sp. BD59S plasmid pBTBD59S1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cacagtaaatattaatttgtactcattctgta CRISPR spacer atgaaaaaatattaatttgtacacattctaca Protospacer *. **************** ******..*
60. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021032 (Rhizobium sp. NXC14 plasmid pRspNXC14b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcctcgtattcgccggcggagacga Protospacer .******.*************.** . ..*
61. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021026 (Rhizobium sp. TAL182 plasmid pRetTAL182b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
62. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013586 (Rhizobium phaseoli strain N161 plasmid pRphaN161a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcttcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .***.****************.** . ..*
63. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013597 (Rhizobium sp. N741 plasmid pRspN741b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
64. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013559 (Rhizobium phaseoli strain N841 plasmid pRphaN841b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcttcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .***.****************.** . ..*
65. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013528 (Rhizobium phaseoli strain R723 plasmid pRphaR723a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
66. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013538 (Rhizobium phaseoli strain R630 plasmid pRphaR630a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcttcttcgtattcgccggcggagacga Protospacer .***.****************.** . ..*
67. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013501 (Rhizobium esperanzae strain N561 plasmid pRspN561a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
68. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013581 (Rhizobium phaseoli strain N261 plasmid pRphaN261a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
69. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013507 (Rhizobium sp. N1341 plasmid pRspN1341b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
70. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013518 (Rhizobium sp. N113 plasmid pRspN113a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
71. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013491 (Rhizobium sp. N6212 plasmid pRspN6212a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
72. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013513 (Rhizobium sp. N1314 plasmid pRspN1314b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
73. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013496 (Rhizobium sp. N621 plasmid pRspN621a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
74. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013591 (Rhizobium sp. N871 plasmid pRspN871a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
75. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013603 (Rhizobium sp. N731 plasmid pRspN731b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacga Protospacer .*********.**********.** . ..*
76. spacer 2.15|1815082|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008271 (Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ggcggcacgttcgtgcaaacgggcaacccggc CRISPR spacer ggcggcacggtcgtgctaacgggtgtctccga Protospacer ********* ****** ******.. *.* *
77. spacer 2.18|1815265|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774378 (CrAssphage cr106_1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aactttctaaatcagagagtaaatgctacacg CRISPR spacer aactttctaaaccagacagtaaagagtccaaa Protospacer ***********.**** ****** . * ** .
78. spacer 2.21|1815448|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047738 (Rhizobium phage RHEph01, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aaaacggacagcaacatccatcttatcgaatt CRISPR spacer aacgcggacagctacatcaatcttatcacttc Protospacer ** .******** ***** ********. *.
79. spacer 2.30|1814596|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to MT932211 (Escherichia phage VEcB, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
cacagtaaatattaatttgtactcattctgtac CRISPR spacer cagagtaaatattattttgtactctgttaataa Protospacer ** *********** ********* *. .**
80. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP020897 (Rhizobium phaseoli Brasil 5 strain Bra5 plasmid pRphaBra5a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .********************.** . ..*
81. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013524 (Rhizobium phaseoli strain R744 plasmid pRphaR744b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .********************.** . ..*
82. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013576 (Rhizobium phaseoli strain N671 plasmid pRphaN671b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .********************.** . ..*
83. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013548 (Rhizobium phaseoli strain R611 plasmid pRetR611a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .********************.** . ..*
84. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013533 (Rhizobium phaseoli strain R650 plasmid pRphaR650a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .********************.** . ..*
85. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013543 (Rhizobium phaseoli strain R620 plasmid pRphaR620a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .********************.** . ..*
86. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013570 (Rhizobium phaseoli strain N771 plasmid pRphaN771b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .********************.** . ..*
87. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP035002 (Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23d, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .********************.** . ..*
88. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP029452 (Sinorhizobium fredii CCBAU 25509 plasmid pSF25509b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcgtactcgccggcggaaacgac Protospacer .************.*******.** * ..*
89. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NC_017958 (Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer tgccgtcttcgtattcgccggtgcgcagata Protospacer ** * ****************** * *
90. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP012886 (Mycobacterium chimaera strain AH16 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cgtcatcgtcgtattcgccgatggcattgtg Protospacer .* * ** ************.*******. .
91. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP023071 (Sinorhizobium fredii CCBAU 83666 plasmid pSF83666b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcgtactcgccggcggaaacgac Protospacer .************.*******.** * ..*
92. spacer 3.3|3577733|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP018921 (Serratia marcescens strain UMH7 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agcttgcgccgttctgaccgtttgagtaaca CRISPR spacer ttcctgcgccgttctgacggtttcagtgagg Protospacer *.************** **** ***.* .
93. spacer 3.6|3577732|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018921 (Serratia marcescens strain UMH7 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tagcttgcgccgttctgaccgtttgagtaaca CRISPR spacer tttcctgcgccgttctgacggtttcagtgagg Protospacer * *.************** **** ***.* .
94. spacer 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LT603682 (Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgtttttttctaaaatgattttgtctatatca CRISPR spacer cgtttttttctaaaatcattttgattgctcct Protospacer **************** ****** .*.. .*
95. spacer 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP017563 (Pseudanabaena sp. ABRG5-3 plasmid ABRG53c, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgtttttttctaaaatgattttgtctatatca CRISPR spacer ggtttttctctaaaatgattttgttaaaactt Protospacer ******.****************. * *..
96. spacer 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP045339 (Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgtttttttctaaaatgattttgtctatatca CRISPR spacer taagtttttctaaaaggatttagtctataaaa Protospacer .. *********** ***** ******* *
97. spacer 3.14|3578221|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT611523 (Escherichia phage DK-13, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
aacatcaaatgaaatattaacctgtgaattttt CRISPR spacer agctaaacatgaaattttaacttgtgaattttg Protospacer *.* * ******* *****.**********
98. spacer 3.14|3578221|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT446392 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH15, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
aacatcaaatgaaatattaacctgtgaattttt CRISPR spacer agctaaacatgaaattttaacttgtgaattttg Protospacer *.* * ******* *****.**********
99. spacer 3.15|3578283|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT446416 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH47, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cattttagaaaaaaacgtagatggtgcatcac- CRISPR spacer catttaagaaaaaaacgtggat-gtaatttatg Protospacer ***** ************.*** **. *.*.
100. spacer 3.22|3578710|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_FO818639 (Xenorhabdus bovienii strain CS03 plasmid XBC_p, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
agcttttcattgcctattttcaaataaaatgg CRISPR spacer ctgttttcattgactattttcaaataaaggct Protospacer ********* ***************.
101. spacer 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP022370 (Bosea sp. AS-1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
gtcggcgatttctgcgggggtggcactctattg---- CRISPR spacer gtcggcgatttcagcggtggtgg----ccatgggggc Protospacer ************ **** ***** *.** *
102. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP015743 (Shinella sp. HZN7 plasmid pShin-07, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tcggcgatttctgcgggggtggcactctattg CRISPR spacer ccggcgatttcggcgggagtggcagaatggtg Protospacer .********** *****.****** *. **
103. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP010861 (Marinovum algicola DG 898 plasmid pMaD6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tcggcgatttctgcgggggtggcactctattg CRISPR spacer gcgcgccttgctgcgggggtagcactctatgg Protospacer ** ** **********.********* *
104. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP022370 (Bosea sp. AS-1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tcggcgatttctgcgggggtggcactctattg---- CRISPR spacer tcggcgatttcagcggtggtgg----ccatgggggc Protospacer *********** **** ***** *.** *
105. spacer 4.22|3589510|32|NZ_LN681227|CRT matches to MT939242 (Enterococcus phage 9184, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aacatattcagaaaatggcatgtcaattatca CRISPR spacer gaaggatgaagaaaatggcatttgaattatca Protospacer .* . ** ************ * ********
106. spacer 4.28|3589876|32|NZ_LN681227|CRT matches to NC_009816 (Corynebacterium phage P1201, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
gatattatcgacgcagcgaatgatttaaccga CRISPR spacer gatattatcgacgtagctaatgaggcagccag Protospacer *************.*** ***** .*.**..
107. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008010 (Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer gtcaacgccacccagatcgtgctgggtgaaac Protospacer . . *************.******.*** .*
108. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023068 (Ensifer sojae CCBAU 05684 plasmid pSJ05684b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer ccggccgccacccagagcaagctgctgcgcgt Protospacer **************** ** **** ..*.
109. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022363 (Azospirillum sp. TSH58 plasmid TSH58_p03, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer caggccgccatccggatcatgctggccaccac Protospacer * ********.**.*********** .. ..*
110. spacer 2.7|1814596|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021437 (Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB240, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cacagtaaatattaatttgtactcattctgta CRISPR spacer gttaatttatattaatttgcacttattctgtt Protospacer .*.* ***********.***.*******
111. spacer 2.7|1814596|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048651 (Aeribacillus phage AP45, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cacagtaaatattaatttgtactcattctgta CRISPR spacer tagttgtattattaatttgcactctttctgta Protospacer .* * **********.**** *******
112. spacer 2.12|1814901|30|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN855771 (Siphoviridae sp. isolate 189, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaa CRISPR spacer ttttacggtcgtattcgccggcggcattac Protospacer * . . *************.*******
113. spacer 2.13|1814960|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009619 (Vibrio coralliilyticus strain RE98 plasmid p380, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cctgactttttcaacctgattaaatgtcatta CRISPR spacer gtggactttttgaacctcattaaatgcggttg Protospacer . ******** ***** ********. .**.
114. spacer 2.14|1815021|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032182 (Citrobacter freundii strain AR_0116 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
taccccctccaccagctcatcaggaatttcaa CRISPR spacer aaccccctcctgcagctcatcaggcagaagca Protospacer ********* ************ * *
115. spacer 2.22|1815509|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN586016 (Mycobacterium phage MarysWell, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacc CRISPR spacer tgcgatccgctcgaacgactccgtcgcctcgc Protospacer *. **** ********** *******. *
116. spacer 2.22|1815509|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH338235 (Mycobacterium phage Dublin, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacc CRISPR spacer tgcgatccgctcgaacgactccgtcgcctcgc Protospacer *. **** ********** *******. *
117. spacer 2.22|1815509|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028960 (Mycobacterium phage Theia, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacc CRISPR spacer tgcgatccgctcgaacgactccgtcgcctcgc Protospacer *. **** ********** *******. *
118. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP021032 (Rhizobium sp. NXC14 plasmid pRspNXC14b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcctcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .******.*************.** . ..*
119. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP021026 (Rhizobium sp. TAL182 plasmid pRetTAL182b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
120. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013586 (Rhizobium phaseoli strain N161 plasmid pRphaN161a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcttcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .***.****************.** . ..*
121. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013597 (Rhizobium sp. N741 plasmid pRspN741b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
122. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013559 (Rhizobium phaseoli strain N841 plasmid pRphaN841b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcttcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .***.****************.** . ..*
123. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013528 (Rhizobium phaseoli strain R723 plasmid pRphaR723a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
124. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013538 (Rhizobium phaseoli strain R630 plasmid pRphaR630a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcttcttcgtattcgccggcggagacgac Protospacer .***.****************.** . ..*
125. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013501 (Rhizobium esperanzae strain N561 plasmid pRspN561a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
126. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013581 (Rhizobium phaseoli strain N261 plasmid pRphaN261a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
127. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013507 (Rhizobium sp. N1341 plasmid pRspN1341b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
128. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013518 (Rhizobium sp. N113 plasmid pRspN113a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
129. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013491 (Rhizobium sp. N6212 plasmid pRspN6212a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
130. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013513 (Rhizobium sp. N1314 plasmid pRspN1314b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
131. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013496 (Rhizobium sp. N621 plasmid pRspN621a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
132. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013591 (Rhizobium sp. N871 plasmid pRspN871a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
133. spacer 2.35|1814901|31|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP013603 (Rhizobium sp. N731 plasmid pRspN731b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
tggcctcttcgtattcgccggtggcattaaa CRISPR spacer cggcctcttcatattcgccggcggagacgac Protospacer .*********.**********.** . ..*
134. spacer 3.8|3577855|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250021 (Prevotella phage Lak-B2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agccgca---gaatcaagctgtgcaatatcataga CRISPR spacer ---catatatgaatcaagctgcgcaatataataat Protospacer *..* ***********.******* ***.
135. spacer 3.8|3577855|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK250023 (Prevotella phage Lak-B4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agccgca---gaatcaagctgtgcaatatcataga CRISPR spacer ---catatatgaatcaagctgcgcaatataataat Protospacer *..* ***********.******* ***.
136. spacer 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011737 (Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742402, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgtttttttctaaaatgattttgtctatatca CRISPR spacer gatttttccctaaaatgattttgtccggctct Protospacer .*****..****************.. **
137. spacer 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP014175 (Clostridium argentinense strain 89G plasmid pRSJ17_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgtttttttctaaaatgattttgtc-tatatca CRISPR spacer ggtttttatcaaaaatgattttgttacatgct- Protospacer ****** ** *************. .**...
138. spacer 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF974397 (Leptospira phage LE4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgtttttttctaaaatgattttgtctatatca CRISPR spacer aaactttttctaaaatgattgtttctagttcg Protospacer . .**************** * **** **.
139. spacer 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF974396 (Leptospira phage LE3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgtttttttctaaaatgattttgtctatatca CRISPR spacer aaactttttctaaaatgattgtttctagttcg Protospacer . .**************** * **** **.
140. spacer 3.18|3578466|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016462 (Blastomonas sp. RAC04 plasmid pBSY18_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
agctgaaagcgtttgaaccgtcaaaaatcacc CRISPR spacer gcgccaagccgttacaaccgtcaaaaatcacc Protospacer . . **. **** *****************
141. spacer 3.19|3578527|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aacagtctgccccagcagatttttcgctgtgc CRISPR spacer aagagtctgccctagcagattttaaaatcatc Protospacer ** *********.********** . * *
142. spacer 4.15|3589083|32|NZ_LN681227|CRT matches to JN231330 (UNVERIFIED: Uncultured phage contig03 MexF-like gene, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aaagtttcagcacctattaacggaattattct CRISPR spacer caagttgcagcacctattaacagaaccaaagc Protospacer ***** **************.***..* .
143. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP039902 (Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5877 plasmid pTiCFBP5877, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcggcgatttctgcgggggtggcactctattg CRISPR spacer ccggcgatttcggcaggggtggcacaatggct Protospacer .********** **.********** *. .
144. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP039893 (Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5499 plasmid pTiCFBP5499, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcggcgatttctgcgggggtggcactctattg CRISPR spacer ccggcgatttcggcaggggtggcacaatggct Protospacer .********** **.********** *. .
145. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_KY000025 (Agrobacterium genomosp. 6 strain AR125 plasmid pTi_AR125, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcggcgatttctgcgggggtggcactctattg CRISPR spacer ccggcgatttcggcaggggtggcacaatggct Protospacer .********** **.********** *. .
146. spacer 4.18|3589266|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_KY000029 (Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP5499 plasmid pTi_CFBP5499, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcggcgatttctgcgggggtggcactctattg CRISPR spacer ccggcgatttcggcaggggtggcacaatggct Protospacer .********** **.********** *. .
147. spacer 1.1|1814004|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder matches to NC_012586 (Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aatctgcgccccgctggcaataccgccgtaag CRISPR spacer gatctgcgcaccgctggcaaaacccggagaca Protospacer .******** ********** *** . * .
148. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH536819 (Gordonia phage Fury, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer gacgccgccacccagatcaggatggacagcac Protospacer **************** * ****.....*
149. spacer 2.6|1814535|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH576960 (Gordonia phage Pleakley, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgc CRISPR spacer gacgccgccacccagatcaggatggacagcac Protospacer **************** * ****.....*
150. spacer 2.18|1815265|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK629528 (Escherichia phage Lidtsur, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aactttctaaatcagagagtaaatgctacacg CRISPR spacer ctctttataaatcagtgagtaaatgaaagtaa Protospacer **** ******** ********* * .
151. spacer 2.24|1815631|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026318 (Vibrio campbellii strain BoB-90 plasmid unnamed 2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tttttgttttattttcctaagcttaacctttg CRISPR spacer aggctgttttattttcttaaacttaacaatgt Protospacer .************.***.****** *
152. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NC_008010 (Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO01, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer gtcaacgccacccagatcgtgctgggtgaaaca Protospacer . . *************.******.*** .*
153. spacer 2.29|1814535|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_CP023068 (Ensifer sojae CCBAU 05684 plasmid pSJ05684b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
ccggccgccacccagatcatgctggatgatgcc CRISPR spacer ccggccgccacccagagcaagctgctgcgcgtt Protospacer **************** ** **** ..*..
154. spacer 3.8|3577855|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693360 (Marine virus AFVG_25M250, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
agccgcagaatcaagctgtgcaatatcataga CRISPR spacer caacaattaatctagctgtacaatatcatagc Protospacer . *. **** ******.***********
155. spacer 3.8|3577855|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693394 (Marine virus AFVG_25M234, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
agccgcagaatcaagctgtgcaatatcataga CRISPR spacer caacaattaatctagctgtacaatatcatagc Protospacer . *. **** ******.***********
156. spacer 3.10|3577977|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP031942 (Nostoc sphaeroides strain Kutzing En plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gatatagcatagctgatgagtttctatgttta CRISPR spacer ctaattggatagctgatgagtttctaggcggt Protospacer ** * ****************** *.
157. spacer 3.11|3578038|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_020841 (Psychrobacter phage pOW20-A genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ttcaatatctttaccgcctgtgggcgcatagg CRISPR spacer tttaatctctttaccgcctgtggtgtggtcaa Protospacer **.*** **************** .* ..
158. spacer 3.12|3578099|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP020413 (Leptospira interrogans serovar Copenhageni strain FDAARGOS_203 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cgtttttttctaaaatgattttgtctatatca CRISPR spacer cgttttcttccaaaatgattttggaagaaaat Protospacer ******.***.************ . *
159. spacer 3.15|3578283|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693567 (Marine virus AFVG_25M189, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cattttagaaaaaaacgtagatggtgcatcac CRISPR spacer ggagtaagaaaaaaacgaagatggtacatata Protospacer . * *********** *******.***
160. spacer 3.19|3578527|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP034999 (Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23a, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aacagtctgccccagcagatttttcgctgtgc CRISPR spacer ggaggcgctccccagcagctttttcgctttgc Protospacer .. .*. . ********* ********* ***
161. spacer 3.22|3578710|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
agcttttcattgcctattttcaaataaaatgg CRISPR spacer gtatcttcattgcctatttacaaaaaaagatt Protospacer . *.************** **** ***.
162. spacer 4.1|3589082|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder matches to JN231330 (UNVERIFIED: Uncultured phage contig03 MexF-like gene, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gaaagtttcagcacctattaacggaattattct CRISPR spacer ccaagttgcagcacctattaacagaaccaaagc Protospacer ***** **************.***..* .
163. spacer 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP039902 (Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5877 plasmid pTiCFBP5877, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gtcggcgatttctgcgggggtggcactctattg CRISPR spacer tccggcgatttcggcaggggtggcacaatggct Protospacer .********** **.********** *. .
164. spacer 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP039893 (Agrobacterium tumefaciens strain CFBP5499 plasmid pTiCFBP5499, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gtcggcgatttctgcgggggtggcactctattg CRISPR spacer tccggcgatttcggcaggggtggcacaatggct Protospacer .********** **.********** *. .
165. spacer 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_KY000025 (Agrobacterium genomosp. 6 strain AR125 plasmid pTi_AR125, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gtcggcgatttctgcgggggtggcactctattg CRISPR spacer tccggcgatttcggcaggggtggcacaatggct Protospacer .********** **.********** *. .
166. spacer 4.4|3589265|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_KY000029 (Agrobacterium genomosp. 6 strain CFBP5499 plasmid pTi_CFBP5499, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gtcggcgatttctgcgggggtggcactctattg CRISPR spacer tccggcgatttcggcaggggtggcacaatggct Protospacer .********** **.********** *. .
167. spacer 4.15|3589083|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP043832 (Bacillus sp. BS98 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaagtttcagcacctattaacggaattattct CRISPR spacer tcacgttcatcacctattaactgaattaacga Protospacer * **** *********** ****** .
168. spacer 4.15|3589083|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP040345 (Bacillus albus strain DLOU-Yingkou plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaagtttcagcacctattaacggaattattct CRISPR spacer tcacgttcatcacctattaactgaattaacga Protospacer * **** *********** ****** .
169. spacer 4.15|3589083|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP020434 (Bacillus sp. FDAARGOS_235 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaagtttcagcacctattaacggaattattct CRISPR spacer tcacgttcatcacctattaactgaattaacga Protospacer * **** *********** ****** .
170. spacer 4.22|3589510|32|NZ_LN681227|CRT matches to NZ_CP012748 (Paraburkholderia caribensis MBA4 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aacatattcagaaaatggcatgtcaattatca CRISPR spacer tgaaagcacaggaaatggcaagtcaattatct Protospacer . * .. ***.******** **********
171. spacer 4.22|3589510|32|NZ_LN681227|CRT matches to MT446408 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH35, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aacatattcagaaaatggcatgtcaattatca CRISPR spacer ggagtggaaagaaaatggcaagtgaattatca Protospacer .. .*. *********** ** ********
172. spacer 4.28|3589876|32|NZ_LN681227|CRT matches to NC_028835 (Lactobacillus phage CL2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gatattatcgacgcagcgaatgatttaaccga CRISPR spacer ccaaagatcgccgcagcaaatgatttaacaat Protospacer * **** ******.*********** .
173. spacer 4.28|3589876|32|NZ_LN681227|CRT matches to KR905066 (Lactobacillus phage CL1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gatattatcgacgcagcgaatgatttaaccga CRISPR spacer ccaaagatcgccgcagcaaatgatttaacaat Protospacer * **** ******.*********** .
174. spacer 4.28|3589876|32|NZ_LN681227|CRT matches to NC_028911 (Lactobacillus phage iLp1308, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
gatattatcgacgcagcgaatgatttaaccga CRISPR spacer ccaaagatcgccgcagcaaatgatttaacaat Protospacer * **** ******.*********** .
175. spacer 2.3|1814351|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
tgttgcttttccatctacaacatccatctggc CRISPR spacer aacatctttaccatctaaaacatccatcatta Protospacer .. **** ******* **********
176. spacer 2.13|1814960|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021811 (Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid accessoryA, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
cctgactttttcaacctgattaaatgtcatta CRISPR spacer gctgacttcttcaaccagattaaactcggcgt Protospacer *******.******* *******. . ..
177. spacer 2.13|1814960|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018682 (Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
cctgactttttcaacctgattaaatgtcatta CRISPR spacer gctgacttcttcaaccagattaaactcggcgt Protospacer *******.******* *******. . ..
178. spacer 3.14|3578221|33|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_FO704549 (Xenorhabdus doucetiae strain FRM16 plasmid XD_p, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
aacatcaaatgaaatattaacctgtgaattttt CRISPR spacer ---------tgaaatattaacatgtgagttttt Protospacer ************ *****.*****
179. spacer 4.22|3589510|32|NZ_LN681227|CRT matches to CP015514 (Vibrio vulnificus strain FORC_036 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
aacatattcagaaaatggcatgtcaattatca CRISPR spacer gtggaattcagaaaagagcatgtcaattcagg Protospacer . . ********** .*********** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
101830 : 107826
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN681227|101830:107826|DBSCAN-SWA TTTACTGCATTGACAATGTTAACTGGTGCCCGATAACCGCTGCCGCCTTACCCACTGTATCTATCTTAGTTGAATGCCGTAAATCGAAGATGCGCGTGACTTCCTGTTTCTTCACTCCCATACGGCTGGCCAGTTCAGTTTGCGTTAATTTAGAATCAATAAACGCATTAAGCATAAGCACCTTAGAGGTTATGCTTAAGGGCACATCGACATAATCGTCATCTTGTCCTATAGGGCTAGGAAGCGGAATTTTCTCATTATCTTCGAAGTAAAATTCGAAAGACGTTATTAGCGCATCAAGTGCCATCTCTAGCGCTTCTTCCCGTGTCTCCCCTTGAGTTAAAGCTTCGGGGATATCCGGGAACGAGACGAAATAACCGCCTTCTTCCACTGGCTCTAGTGTTACTGGATATCGCATCGTGTTTTATGGTGACCTATGGCGAGAACCAGCCCCTTACGAGGCTGGTTTTTATCACAATCCTAATTGCTTAAGAATTGCTTTCCTCAGTGGTTCTTTTATCTCTTGGCTGGGGTGTCTCGGCATAATGCTTCGTCTCCCCCTTATATTTCAGTTTCAGATGGTTTGTTCCGTTTGAAACTTCAACACCTTGAGCTTCCAGCCACCGTCTAAACTCGCTTTGCTTCACCACTCCTCCTTTCTGTTAAACATGGTATTATAGTAAACATTTATGCTTACCTTGTCAGCTTTTTCGTTTACTTTATTCAGGCAGATAAAAATAAACCCCGTCGGAGCGGGGTCAGTTAATCAAGCCTTAAGTTAGCCAATCACAGGCGAATACTTCTGTTTCAGCCCATCCGATTTATGCGCCGTGTTGCGTATCGCGCTGGCGTTCTCCGGGGTGTCGGTATTGTGATGGGTATGCGCGGCGGTCAGTTCGGCCAGTTCTTTGACGACATCCAGCGTGTCTAACATCAGGGTCATCACGTTGATTTGCTGGCTGCCCACCCAGACCACGGGGGCAACGATTTCTTGCTGGCCTTTCGGTATCCATGTGAGGGTCATGTTTTCATTGGTCAGGTTGACCTTGCTCAGCCGCTGCTGATTGACTACCACGCCGGGGCGCAAAGATGGGATCATGGGCAGGGTCACGTGATAGCCCGTGCCATTATGGGTGTAGTGCGGAATCGGTTTATCGGTATAAGGTGCATCTTGATGAATGTTATTGAGTGATCTACTTGGATGGTAATACGCACCAATCATTTCATGATGAACGGAGGGAATATAATTGCACTACAACAGATATTAGGTCACGCCAGCATAACCCAGATAATGGCCTATGCTAATCTTTCCCCTGATTATCTGCAACATGCAATTATATTAAATCCGCTTAAGGGTGGGGATTAAGGTAGTATAAGGAAAAAGAGTGTGGAGATCGTCCACCGACCGTCCACACTCAAAAAATTTTACGTATTCTCTAACTCTTTCGTACTTTTTTATGTTGTTGTTTTTACAGGGGAATTGACTATAAGTCATTGAAAAAAAAGCCCCTCAAGGGGGCTGAAAGACAGGGATGGTGTCTATGGCAAGGAAAATCGTTGTTGATGCTACTGTGCGCTAGATTATGAGCAAAATTCAGTGCATCTCTTGAGCAGTTTGTCCCTCATAACGTTTGTATAGTCGTTCTTTCTGCTCTGGTGTTAACAATTGGTACATCTGGTTGCGAATACGTGCAATTTCTACACCCAGATCAATATTCTTTTCTGCTATTTTCTCAAGTTGCAGCCGAACCGCAGCTTCATCAAACTCTCTCTCAATCAAAAGATGGTACATCTTCTGACGTTCAACCCGCATATCAATTATTGATTGCTCATGCAGATGTTGTTTTTTTACTAAATCCCACATCTGCTGGCGCTGTTGTTCAGTTAGTGTTATTCCGCCGAAGACATAACTATAGTTGTAATTATGCTCATCACTGCGGTAGTAACCAGAGTCCCTTTTATGCTCATATGACAGGCAATATGGCGAGGGGTTTGCAGCCTCAGGAGTATCATCCGTATCAGCAGTGTCAGCTAAGGCCAGTGTTGATCTAAGAACAACCATTGACGCTAGAGCCAATATTGCTATGTTACGCATTAAATTTCTCCGCTTTCTCGAATAGCTCTATTCGATTCAGTGTGGATAACTATAACCCTGCGGCTGCAAACTAGCGTCAGAGCATGTAAAAGAACGTAAAGTCATGGAATAGCGGAGTTTGTTATCGTATTTTGCTCTTGGAGGAAGAATTAATGCACAAAATCTTATTAGTTGATGATGATCGCGAGCTGACATCGCTATTAAAAGAATTGCTCGAGATGGAAGGATTCAATGTCGTCATTGCCCATGATGGCGAGCAGGCTTTACAGTATATCGATTCTTCAATTGACCTGTTGTTGCTGGACATCATGATGCCACGCAAAAACGGCATTGAAACGCTTAAGGAGTTACGGCAGTACCATCAGACTCCTGTTATTATGTTAACGGCTCGTGGAAGCGATTTAGACCGCGTTCTGGGATTAGAGTTGGGCGCAGATGACTATCTCCCTAAACCTTTTAATGATCGTGAGCTGGTTGCCCGTATCCGTGCAATTTTGCGTCGTTCCAACTGGAGTGAGCAACAGGCTGATATCGGAACACCGATACTTGAGATTGATAAACTGCAACTTAGTCCCGGGCGTCAGGAGGCCAGTTTTGACGGTACGATTTTGGATCTGACCGGAACAGAATTCACTTTACTCTATTTACTAGCACAACATTTGGGGCAGGTTGTTTCCCGTGAACATTTAAGTCAGGAAGTCTTGGGGAAACGCTTAACACCGTTTGATCGTGCCATTGATATGCATATTTCTAACCTGCGCCGCAAATTGCCGAATCGAACTGATGAACTTCCATGGTTTAAGACATTACGTGGTCGTGGATATTTAATGGTTTCCGTAAAATGATCAATAGCCTGACAGCCCGTATATTCGCCATTTTCTGGCTCACTCTTGCACTTGTCCTGATGGTGGCCTTAATGGCCCCCAAACTGGATTCACGGCAACTGACACCACTTCTGGACAGTGAGTATCAGCAAGGAAATAAACTGGCGAAGCAGCTAGAAGAAGAATTAACACGTTACCCTGCAAACGACCTCTTCTGGTGGTTACGGTTGGATCGCGCCATTGCTCAACTCACGCCGCCAGGCCAAAGCTTACTCCTTGTTACCAGTGCAGGGAATATCATTGACATCAATACTCCGACGCGCCAAAAGCAAGTGGTTCGTAACTTTATAGGGCAATCTGATAACGCAGATCACCCTAAAAAGAAAAAATATGGTCGCTCTGAAATACTTGGCCCTTTTTCCATCAGAGATGGTGAAGATCACTATCAACTTTACTTCGTAAGGCCGGCCGGCAGTCCACAATCAGATTTTATTAACTTGATGTTTGACCGACCATTTTTACTGCCAGCGGCAACCATGTTAATCAGCGCACCTTTACTATTATGGTTGGCATGGAGTTTGGCAAAACCTGCCCGTAAATTAAAAAATGCAGCCGATGACGTCGCTAAAGGAAACTTACGGCAACACCCTGAATTAGAATCCGGCCCACAAGAATTTTTGGCTACAGGCAGCAGCTTCAACCAGATGATAAGTGCTCTGGAAAGGATGGTCACTGCCCAACAACGGCTGATTTCTGATATCTCCCATGAACTGCGTACACCGCTGACTCGCTTACAATTGGCGACGGCCTTACTGCGCCGCCGTCATGGTGAAAGCAAAGAACTGGCACGCATCGAAACAGAAACCCAGCGTTTAGATGGGATGATTAATGACTTGCTGGTGCTTTCACGCAATCAGCACAAGAACGAATTACTCCGTGAAAATATCAAAGCCTACGATATATGGCATGACATTCTGGAGAATGCCAAATTCGAAGTAGAACAGATGAACAAAACGCTGGATATCGTATCTCCACCCGGTGCCTGGGTAATTTACTGTAACCCCGCCACACTTGGCAGCGCGCTGGAAAACATCGTCCGTAATGCGCTTCGCTATTCTGATAGCCATATTGCAGTAGCGTTCAAGGCAGATAATCAAGGTGTCACAATTACGGTTGATGATGATGGGCCTGGAGTAAGCCCTGAAGACCGAGAGCAAATCTTCAGACCATTTTATCGGACAGACGAAGCAAGGGACAGAGAGTCTGGTGGAACCGGGTTGGGATTAGCGATTGTTGAAACGGCAATAAGTCAGCATCGAGGTTGGGTGAAAGCAGAAGACAGTCCTTTGGGAGGATTACGGTTGGTGATTTGGTTGCCGTTACATGGGCATGGGAGGTAGGCAGCTTTCAGCTTAAGATTGAGTTAGTTACATAATGTAATAATTAACGAAAAAAACACGATTATAACTTGACCTCATAGCATCAAGGTACTAATCTCGTCGCTGCTTAACACAAATCGTTGATATGTTAGTTTTTGGTAAATGGAAAAATCCTTTTATACTAAGAGGATAAGCCAAATTTTCATACATGGCAGGCACTCTGGGAGCCGTAACCTAGTGCGGTAGCTTTGAGTTAATTCTAGAGCGTAACTATCATTGTATTTATCTCACTCTTTTCTAATTGATACCCACATAAACTAGAAAAATGCTCTTAATATGAGAACATTTTTTTAGCTTATTCCTATATGGTATATCAAAGGCCTATAATATGTCATTTCTGAGTGAATTAATTAACAAGTTTGATAATAAAAGTGCAAGTGTAGCTATTGTTGGATTAGGGTATGTCGGATTACCTTTAATGCTGCGATACAGTGATATTGGTTTTAAAGTTATCGGTTTTGATATAGATCAAAATAAAACGGATAAGTTAAGTCAAGGTTTAAGCTATATAGAGCATATATCCTCTTCTAAAATTAAAAAAGCTATTGAAACAGGCTTTGAAGCAACAACTGACTTTTCAAGAATTTCCGAATGTGATGCGATTATCCTCTGTGTACCAACTCCATTAAATAAATACAGAGAACCTGATATGAGTTTCGTCATAAATACTACTGATATGGTGAAACCATTCTTAAGACAGGGTCAAGTACTTTCCTTAGAAAGTACAACTTATCCAGGAACAACTGAGGAAGAGCTATTACCAAGAGTAGAGGAAAATGATTTAACAGTCGGTGAAGATATATTCCTCGTATATTCACCGGAACGAGAAGATCCGGGTAATCCAGATTTTGAAACGAGAACAATCCCTAAAGTTATTGGTGGACATACAGAAAACTGCTTAAAAGCAGGTATTGCCGTTTATCAACCAGCTATTGATCAAGTTGTTCCAGTTAGCTCCACAAAAGCAGCAGAAATGACTAAGCTGCTTGAGAATATACATAGGGCCGTTAATATAGGTCTAGTTAATGAAATGAAGCTCGTTGCAGACAAAATGGGCATTGATATACATGAAGTCATTAGAGCTGCTGCAACAAAACCATTTGGATTCGTCCCTTATTACCCAGGTCCAGGTCTAGGTGGTCATTGTATACCTATCGATCCTTTCTATTTAACATGGAAAGCCAGAGAATACGGTATAAATACTCGCTTTATCGAACTTTCTGGTGAAGTTAATTCGTCAATGCCTGATTATGTTGTTACTAAAACGGTCTTGGCATTGAATAAAATTAATAAATCCATTAATGGCAGTCGTGTACTTGTATTAGGAATTTCATACAAGAAAAATGTTGATGACATGAGGGAGAGTCCATCAGTCCATATAATGGAAAAACTAAGGGAATTAGGTGCGCTAGTAGAATATTCAGACCCTCACGTTCCTGTTTTTCCTAAAATGCGCGAACATCACTTCGATCTAATAAGCCAATCATTAACTTCCAATAATTTAAATAAATTCGATTGCATAGTTTTAGCAACAGACCACGATAAATTTGACTATGAGTTAATTATAAATAACGCAAAATTAATTGTTGATACTCGTGGGAAATATTCTCCTAATCATAATAATGTAATAAAAGCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN681227|101830:107826|101830_102247_-|WP_010847564.1|DBSCAN-SWA MRYPVTLEPVEEGGYFVSFPDIPEALTQGETREEALEMALDALITSFEFYFEDNEKIPLPSPIGQDDDYVDVPLSITSKVLMLNAFIDSKLTQTELASRMGVKKQEVTRIFDLRHSTKIDTVGKAAAVIGHQLTLSMQ >NZ_LN681227|101830:107826|106515_107826_+|WP_013183088.1|DBSCAN-SWA MSFLSELINKFDNKSASVAIVGLGYVGLPLMLRYSDIGFKVIGFDIDQNKTDKLSQGLSYIEHISSSKIKKAIETGFEATTDFSRISECDAIILCVPTPLNKYREPDMSFVINTTDMVKPFLRQGQVLSLESTTYPGTTEEELLPRVEENDLTVGEDIFLVYSPEREDPGNPDFETRTIPKVIGGHTENCLKAGIAVYQPAIDQVVPVSSTKAAEMTKLLENIHRAVNIGLVNEMKLVADKMGIDIHEVIRAAATKPFGFVPYYPGPGLGGHCIPIDPFYLTWKAREYGINTRFIELSGEVNSSMPDYVVTKTVLALNKINKSINGSRVLVLGISYKKNVDDMRESPSVHIMEKLRELGALVEYSDPHVPVFPKMREHHFDLISQSLTSNNLNKFDCIVLATDHDKFDYELIINNAKLIVDTRGKYSPNHNNVIKA >NZ_LN681227|101830:107826|102607_103051_-|WP_010847567.1|DBSCAN-SWA MIGAYYHPSRSLNNIHQDAPYTDKPIPHYTHNGTGYHVTLPMIPSLRPGVVVNQQRLSKVNLTNENMTLTWIPKGQQEIVAPVVWVGSQQINVMTLMLDTLDVVKELAELTAAHTHHNTDTPENASAIRNTAHKSDGLKQKYSPVIG >NZ_LN681227|101830:107826|104765_106148_+|WP_013183087.1|DBSCAN-SWA MINSLTARIFAIFWLTLALVLMVALMAPKLDSRQLTPLLDSEYQQGNKLAKQLEEELTRYPANDLFWWLRLDRAIAQLTPPGQSLLLVTSAGNIIDINTPTRQKQVVRNFIGQSDNADHPKKKKYGRSEILGPFSIRDGEDHYQLYFVRPAGSPQSDFINLMFDRPFLLPAATMLISAPLLLWLAWSLAKPARKLKNAADDVAKGNLRQHPELESGPQEFLATGSSFNQMISALERMVTAQQRLISDISHELRTPLTRLQLATALLRRRHGESKELARIETETQRLDGMINDLLVLSRNQHKNELLRENIKAYDIWHDILENAKFEVEQMNKTLDIVSPPGAWVIYCNPATLGSALENIVRNALRYSDSHIAVAFKADNQGVTITVDDDGPGVSPEDREQIFRPFYRTDEARDRESGGTGLGLAIVETAISQHRGWVKAEDSPLGGLRLVIWLPLHGHGR >NZ_LN681227|101830:107826|104076_104769_+|WP_013183086.1|DBSCAN-SWA MHKILLVDDDRELTSLLKELLEMEGFNVVIAHDGEQALQYIDSSIDLLLLDIMMPRKNGIETLKELRQYHQTPVIMLTARGSDLDRVLGLELGADDYLPKPFNDRELVARIRAILRRSNWSEQQADIGTPILEIDKLQLSPGRQEASFDGTILDLTGTEFTLLYLLAQHLGQVVSREHLSQEVLGKRLTPFDRAIDMHISNLRRKLPNRTDELPWFKTLRGRGYLMVSVK >NZ_LN681227|101830:107826|103423_103924_-|WP_010847568.1|DBSCAN-SWA MRNIAILALASMVVLRSTLALADTADTDDTPEAANPSPYCLSYEHKRDSGYYRSDEHNYNYSYVFGGITLTEQQRQQMWDLVKKQHLHEQSIIDMRVERQKMYHLLIEREFDEAAVRLQLEKIAEKNIDLGVEIARIRNQMYQLLTPEQKERLYKRYEGQTAQEMH |
6 | Cronobacter_phage(40.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
153915 : 206292
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN681227|153915:206292|DBSCAN-SWA 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51 | Morganella_phage(23.53%) | integrase,transposase,capsid,protease | attL 146442:146457|attR 181939:181954 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
427805 : 478351
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN681227|427805:478351|DBSCAN-SWA 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51 | Escherichia_phage(17.65%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
605383 : 625959
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN681227|605383:625959|DBSCAN-SWA 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17 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
654812 : 717937
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN681227|654812:717937|DBSCAN-SWA 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55 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | integrase,transposase,protease,tRNA | attL 697671:697688|attR 715722:715739 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1004881 : 1129769
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LN681227|1004881:1129769|DBSCAN-SWA 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120 | Salmonella_phage(26.32%) | tRNA,protease,plate,transposase,tail,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1416410 : 1426933
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN681227|1416410:1426933|DBSCAN-SWA 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AATGGTGCGGTGACAAGCAAAATTAACCCGGCTGCCCAGTTAATCGGAAAAACAGTAATCAAAATTAAAATTGGGATTATGGCAGCAAGCGTCATCTGAGGCAGGTAACGTGAATAGAAATCCTGCATATCATCGATTTGTTCTAGAATAATCGTTGCCCAACTTCCTGCGGGTTTTCCCTTAACCCATACTGGCCCTAATTGTTCCAGTTTATCCAACACCATGCGGCGAATTTGTTGGCGTACAATTTTGCCACAGATAAAACCAACACGTTCCCGGATTGCATTGACAACTGCGCGTAATGTAAAGGTGGCTGCCAGCATCAGAAACTGATTAATGAGATTTTCACGGGGAATATTATCCATAATCAGAGCCTGGAGGATTGAAGTCAGAAGCCAGGCTTGAGAGATGATCAGTAATCCGCTGATTAGCCCGAGTATCATGGATAGACGAAGCCACTGACGGGCAGGGGCACTTTGCTGTTTCAGCCATCGCACAAGTTCAGATTGTCTTGTTTTGTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN681227|1416410:1426933|1419617_1419938_+|WP_010846890.1|protease|DBSCAN-SWA MTEFYNDLKVKEFIKDDTKQTLRPPSMYQVVLNNDDYTPMEFVVDVLQKFFSYNVERATQLMLDVHYKGKAVCGIYTAEVAETKAAQVNMYAREHEHPLLCTLEKV >NZ_LN681227|1416410:1426933|1423418_1425161_-|WP_013183911.1|DBSCAN-SWA MRILFPFLTLYRRHWFLISLGMVLSIVTLLASIGLLTLSGWFLAGTALAGFAGLYTFNYMLPAAGVRGAAIFRTAGRYGERLVSHDATFRVLAHLRVFAFKKILPLSPGGIARFRQGELLNRLVADVETLDHLYLRVISPVLAAFVVILVLTFGLGFLDITLAYTLGGIMLGLLLILPFMFYYAGKPYGRNINLQRAQYRTLLTSALQGQAELTVFGSLKRFRQSMAEVELDWLRSQQKQANLTGLSQAIMIFATGMAVTLMLWLAAAGIGENSQPGALIALFTFCTLAAFEALGPVTVAFQHMGQVISSATRISQLTHQKPEVLFPSHGAKTYGELSLEIKNVDFTYPDQPLPVLKNISLSLASGEHIALLGKTGCGKSTLLQLLTRAWDASHGKIQLNQKSISDYDEATLRSMMSIVPQRIHVFSHTLRENLLLAKPDANDDELITVLKQVGLGNLLDTDEKLNCWVGEGGRQLSGGEQRRLGIARALLHDAPLMLLDEPTEGLDADTEQQILSLLRHSCQNKTLITVTHRLTGLHHMERICVMDGGRIIEQGKHDVLLAQQGRYYQFYQRQHYPQQA >NZ_LN681227|1416410:1426933|1422346_1422565_-|WP_010846892.1|DBSCAN-SWA MAKEENVEMQGTVLETLPNTVFRVELENGHVITAHISGKMRKNYIRILTGDKVTVELTTYDTEKGRITFRSR >NZ_LN681227|1416410:1426933|1416410_1417139_-|WP_013183908.1|DBSCAN-SWA MSIQLKNINCFYSTHQALFDINFECTSGETVVLLGPSGAGKSSLLRVLNLLEMPRSGQLNVATHQFDFRQQPNHREILALRQKVGMVFQQYNLWPHFTVIDNLIEAPCRVLKQPKQQAREKAMKLLSRLRLDKYADRFPLHLSGGQQQRVAIARALMMEPQILLFDEPTAALDPEITSQIVDIIKELAETGITQVIVTHEVELARKTASQVVYMEQGRIIEKGDALRFTQPQTEAFAHYLSH >NZ_LN681227|1416410:1426933|1419969_1422255_+|WP_010846891.1|protease|DBSCAN-SWA MLNQELELSLNIAFAKARDNRHEFMTVEHLLLALLSNTSAREALEACKVDLVMLRQELESFIAQTTPLLSENDDRDTQPTLSFQRVLQRAVFHVQSSGRSEVSGANVLVAIFSEQESQAAYLLRKHDVSRLDIVNFISHGTRKDEPDNDSHHSINPVQEEQVISEDRLENFTVNLNQLAQKGQIDPLVGRQHELERTVQVLCRRRKNNPLFVGESGVGKTAIAEGLAWRIVNRDVPEVIQDCTIYSLDIGSLLAGTKYRGDFEKRFKSLLKTLEQDSKSILFIDEIHTIIGAGAASGGQVDAANLIKPLLSSGRIRVIGSTTYHEFSNIFEKDRALARRFQKIDILEPSSEETVQIINGLRGRYEAHHDVRYTAKAIRAAVELSVKYITDRHLPDKAIDVIDEAGARTRLIPVSRRKKTINVADIESVVAHIARIPEKTVSASDKDVLRTLDDRLKMLVFGQDKAIGALTEAIKMSRAGLGQEHKPIGSFLFAGPTGVGKTEVTVQLAKMLNVKLLRFDMSEYMERHTVSRLIGAPPGYVGYDQGGLLTDAIIKHPHSVLLLDEIEKAHPDVFNLLLQVMDNGTLTDNNGRKADFRNVILVMTTNAGVRETQRKSIGFSEQDNSTDGMEEIKRIFTPEFRNRLDGIIWFDALSSEVIQQVVDKFIVELQAQLDEKGVSLEISANARQWLCDKGYDKAMGARPMARIIQDNLKKPLANELLFGSLVHGGSVRINLDKIKQVLIYDFKSSQKSSKKKPEDAVL >NZ_LN681227|1416410:1426933|1422702_1423410_-|WP_013183910.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSIAKLDNSYKFPHPTNALAEPNGLLAFGGDMSAERLKVAYNEGIFPWYSPDELPLWWSPDPRAVLIPGELHIGRTLRRFIRKHTYQITVNYAFDRVIYSCAQRQEGTWIGSEVQSGYQTLHQEGLAHSIEVWHEHQLVGGLYGVCIGALFCGESMFSKMENASKCAFIAFYHHFLRHGGQLFDCQVLNHHTESLGAKNIQREEFLQHLYQLRDQSLQSGCWSTQVLDLSLSLKD >NZ_LN681227|1416410:1426933|1417463_1418366_-|WP_010846887.1|DBSCAN-SWA MYSGLLIILLPLSLGYLIHLNNKSVLAQVHQLLNVMVYIILVLMGVSLAMLENLGNNLLSILLYATTFFLCIFVFNILALFLLDKRDPWIVNTHKQEKPPSRLHMALDSLKLCGALLFGFIIGLTGWSWFHFSSNASEIALIFLLFLVGIQLRNNGMSLKQTLLNRRGTIVALVVAISSLLGGVLAAFLLGLPTKTGLAIASGYGWYSLSGILLSDAYGPVLGSTAFFNDLVRELASIMLIPMLINRYRSTALGLTGATSMDFSLPILQRCGGVGIVPAAIVHGFILSLMTPLFIAFFTQ >NZ_LN681227|1416410:1426933|1425163_1426933_-|WP_013183912.1|DBSCAN-SWA MDKTRQSELVRWLKQQSAPARQWLRLSMILGLISGLLIISQAWLLTSILQALIMDNIPRENLINQFLMLAATFTLRAVVNAIRERVGFICGKIVRQQIRRMVLDKLEQLGPVWVKGKPAGSWATIILEQIDDMQDFYSRYLPQMTLAAIIPILILITVFPINWAAGLILLVTAPLIPLFMALVGLGAADANRRNFVALSRLSGNFLDRLRGLETLRLFHRGEAEVKQITESTEDFRLRTMEVLRMAFLSSAVLEFFAAVSIAVVAVYFGFSYLGELHFGSYGIGVTLFAGFLALILAPEFFQPLRDLGTFYHAKAQAVGAAESLFTLLSSDGEQAIGSGEKVLSNGKPVSIEANELEILSHDGHRLAGPLNFTIDTYQRIALVGKSGAGKSSLINVLLGFLPYRGSLKINDIELCELDLTKWRECLSWVGQNPHLPEQTLLNNIRLGQYDATQEQINDVIERAYVNEFVHDLPDGLNTVIGDNAARLSVGQAQRIAVARALLNPCQLLLLDEPAASLDAHSEQRVMMTLNKAAHQQTTLLVTHLLEETLEYDQIWVIEHGLLIEKGDYQNLSQAQGAFSRLLSHRSVEL >NZ_LN681227|1416410:1426933|1419054_1419285_-|WP_010846889.1|DBSCAN-SWA METGTVKWFNNAKGFGFICPSSGGDDIFAHYSTIQMDGYRTLKAGQKVNFSVHQGPKGNHASLIVPLEDGSKSKKE >NZ_LN681227|1416410:1426933|1418677_1418998_+|WP_010846888.1|DBSCAN-SWA MGKSSLLDALTVLLSPKPELYHFNKLDFYHAWNENKAKKRDLQIILIFCENQIGEHRERRLRHFHPMWVGSMRELKRICSIYPLLVVGGKKNRSLVGERKSRLNVL |
10 | Bacillus_phage(33.33%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1642878 : 1780190
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LN681227|1642878:1780190|DBSCAN-SWA 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88 | Tupanvirus(21.21%) | integrase,transposase,tRNA,protease | attL 1715984:1716001|attR 1789234:1789251 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1808859 : 1982567
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LN681227|1808859:1982567|DBSCAN-SWA AATGTCTAGCAATAACCTGATTAAACAACTGCAAGAGCGGGGCCTTGTTGCCCAGGTAACGGATGAAGAGGCGTTAGCTGAGAGACTGACGCAAGGTCCGGTTTCTCTCTATTGTGGCTTTGATCCTACCGCTGACAGCTTGCATTTGGGCCATCTGGTTCCCTTGCTGTGTTTAAAACGATTCCAACTTGCTGGGCATAAGCCTATTGCGTTGGTCGGTGGTGCGACAGGTTTGATTGGCGATCCAAGCTTTAAGGCAACTGAACGCAAATTAAACACAGAAGAAACTGTTAAAGAATGGGTTGCGAAAATTCGTAAACAAGTTTCTCCGTTCCTGAGTTTTGATGGTGAAAATGGGGCGGAATTAGCCAACAACTATGATTGGTTTGGTGAAATGGATGTGCTGGCTTTCCTGCGTGATATCGGTAAACACTTTTCTGTTAATCAGATGATCAATAAAGAAGCGGTAAAACAGCGTTTGAACCGTGATGATGTTGGTATTTCATATACTGAATTTTCTTATAACTTATTACAGTCATACGATTTTGCAAACTTGAATGGAAAATATGGTGTTGAGTTGCAGATTGGTGGTTCAGATCAATGGGGCAACATCACTTCAGGTATTGATTTGACTCGCCGCTTACACCAAAAACAAGTATTCGGCATGACAGTACCACTGATCACTAAATCTGATGGAACTAAATTCGGCAAGACGGAAGGTGGAGCGGTTTGGCTTGATCCGAAGAAAACCAGCCCATACAAATTCTACCAATTCTGGATTAACACAGCAGATGCCGATGTTTATCGTTTCTTGAAATTCTTCACCTTCATGGACATTGAAGAAATCAATGTACTGGAAGAAGAAGATAAGAATAGTGGTAAAGCGCCTCGTGCCCAGTACGTATTGGCAGAGCAGGTTACGGGGTTGGTACATGGCGAAGAAGGTCTGGCTGCGGCAAAACGCATCACTGAGAGCTTGTTCTCTGGTGCTATTGCTGATTTGACCGAAGACGACTTTGCTCAATTGGCGCAAGATGGTATGCCTGCGATTGAACTTGAAAAAGATGCTGATTTGCAACAAGCACTAGTGATAGCTGAATTTGTTCCTTCCCGTGGGCAGGCGCGTACTATGATCAGTTCTAATGCAGTGTCCATTAATGGTGAAAAACAATCGGAACCGATGCATGTGTTTACGGATGGTGATCGTTTGTTTGGACGTTATACTTTATTACGTCGTGGCAAAAAACATTATTGCCTTATCGACTGGAAATAATACATAAGAATGTTATTAAAGGGCAACAGTCATGTTGCCCTTTGAGTATTTGGCGTATACCCAGCAAATTTCGAGATACCGCGGGAATTTGAAAATCGACAGATCTGGCAGCCATTCATGAATCTCAAAATAATAAACTAGGCCTTATCATGAAAAATATTCTTTCAATTCAGTCTCATGTTGTTTTTGGTCATGCAGGAAATAGTGCCGCTGTTTTTCCAATGCGTCGTATGGGAGTGAACGTATGGCCATTGAATACAGTTCAATTTTCTAACCATACTCAATATCCTCAATGGCGTGGTTGTGTGATGCCACCAGACCATTTGGCAGAAATTGTGCAGGGAATTGGCGAAATTGATAAATTAAAATCCTGCGATGCGGTATTGAGTGGTTATATTGGTTCGGCAGAGCAAGGAAACTATATCCTTGATATTATAAAGAAAATTAAGCAAACGAATCCTGAAGCATGGTATTTTTGTGACCCTGTTATGGGACATCCAGAAAAAGGGTGTATTGTCGTGCCGGGTGTTGCGGAATTTTTCTGTGAAAAAGCCTTGCCTGTCAGCGATATTATAGCCCCTAACTTATTGGAGCTTGAAACCCTGAGCGCGCGGAAAATTGAAAATGTAGAACAAACGATATCCGCTGCTCGTGAGTTATGTGAAAAAGGCCCTAAAGTTGTATTAGTTAAACATCTTAGCCGTGCGGGTTATCGAACAGATTGTTTTGAAATGCTGTTGGTAACTAAAAAACACAGTTGGCATATTAGCCGCCCATTGATCGATACTGGTGAGCGGCAACCTGTGGGCGTTGGTGATTTAACGAGTGGTTTATTACTGGTTAATTTACTGAAAAATACATCTTTAACAGATGAAGATTTAAAAACAGCATTGGAACATGTCGCATCGGCAGTCTATGAAGTTATGTTAGAAACACAAGTGAGGGGAGAATACGAGCTACAAATTATTGCAGCTCAAGACAAGATGGTCACACCAACACACCTGTTCAGTGCTACATTGCTTGACTGATCAATAAATATTAGCAAAATCCGCCGTAAACCCTCGCACAATGCGAGGGTGCTCTTTCCCTTGCTGACATCCTTGACCAGCAAGCGAACGATATGCTGCCGCACAGATGGCACTTTTTAACCGAATTGTATTAAATATAATTAAACAGAATACCCGTATAAAGGACAGTCTGGTGACTAAACGCCGAAGCGCAATCTGGTCAGGGAAATCCGCATTGAGGGTCAGGAAGAAGGGAAGGCTGAATTTATCCGAAACTTTTTTCAAGACACTACAGAGATAAATAAAAACATAACTTCATATGAGTGCCTTGAAATGGTCCATCATTAAGTTCCAGAATATGAATTTAATATAAGCATTATTATTCTGTTAAATACTCTTCAATTCTCTTTTTATCAACAATAAGAAAACAATCTTTAGATTCTTTAATGAGTCCTTTTCTAAGAAAAAATTTCATAAAATATCCGATTCGGGATCGGGTTGTACCTACCATACAGGGCGCGAGCATACTTTGATTAACATTCAGCCAAAGAAAACTTTGGCGCGGTAATCATCACACCAGCTGGCTTTTTTAAGCTTATTTCTTTGGCTCGGTGCCTCACAAGCACATTGCCTGACCATGTTCAAAACCAGACGCCGGAATAACGCCAGATTCTCAATGGCCCCCTCTAAAACAATCCGGGAATCATCTTCTTTAAAAACGACATCAAGAATAGAGTGCTGGCTATTTTCAATTCGCCAATGCTGACGAATGTAATACCCGAGGGATTTATCGCGGGCGAAAGAGAACTCACATAATACGACGTATCCACTGTCCCTTTGCCATTTTGTGTCCGATGGCGTTCAACCGCAATAATGCTACGGATCGTTGGCCATCGCTCCGCCATTTCAGGGGTAAATTTCGGTTTTAACTGGAATACATAGCGCTCTTCGCGTCGGCCATGAGCTTCTTGCCTGATTTCCGTTATCACTTGCTCTTTACCCGCATCAAGCACGGCCTGAAATTGAGACTGAACCGCGTCCCACAAGTTGGGTTGATTTTTCTTCACCTGCACAACCACATGCGCTTTCTTTTACCTGATTTTTTCCAGCGTTTCACGCTGGCAATGTAGGGCATCAAGGGTCACGATACTGCCTTTTATATTAAGGATATCCAGCATTTGGCGGACGGTACTGATTTCCCCGTTTTTGGTCGCTGTCGCTTTCTGGCTTAACACCAATCCTGCCTCGGTATCATAGGCAGTGACCAGTTGGACGGCATTTTTCTTGTCATTACGATAGGCGCGCCGCAAGACTTTCCCATCAAAAGCGATAACCGGTTTGTACCCCAATTCACGCTGCTCATTGACCCAGTTAAGTAAGGCTTCCAGCAGAGAATCCAGCGCGATAGCCCGCAATATTCTCGCCATGGTATGCCGGCGGGGTATTCCATTGAGGAAGGGGCGATACGTTTTCAGCCAGTTAATCTTTGCCCGGCCATAAGTTTCAATATCCTGCCAGCCTTCGGCACCCGCCATAATGGCACTGACAACAAGGAAAATCACATCAATCAGATCATACAGACGATTAATATCAGAGCGGGTTTCTTTAACAACGGATAAATGTTCAATCAGGGTCATAAGCAAGCGATTAGAAGAGAAATAAGGCTAATGAGATCATGCTATTACTTTTCATGCAATAGGTGTTAAAAAAGTATGCTCGCGCCCTGGGGAACATGGTGCAATTCTTATTTTCTCATAGGAACGATATGATCATCGAATGGATTTATAGTTTGACCTTTATTTGCTTTGAATTGCGGATAGCCAATCCTGATAGTCAGGATCAGAGTGTTGAACCTCGAATCATGATCCACAGTAAGGTATACAAACTTCTTTCTTGTGGAATATGACGCTTGTAGCATTATTCCTAATGAATATTTCAACTATCTTATTATTGTGACTGGCACGGAAGCGCATTTCTCATATTTATAAAAATCGGGAATAAGGTAAATTATAAAAATGAAAAAGAAGATCAAAAATGTTATATGTGCTAATTTTAATTAATTAACTTTTTCTGAATCTATCAATTATCAAGAAACCTTTCAGAAAAGGTATCTTAAGGATAGAATGTTTTTTGATATTACTGACCGAAAATTATACTTTCATGGAAAATAATATCCGCCATTTTTTATATCAAGATTCACATATCCATCATGAATTTTATATAATAGGGAAATTAATTTATTGTTATTTCTTATAAGAGTGATTATATATCATTGAATAACAATATATTTTTTGTTAAATATTGACTGTCATATTTTCTTTTTGTTCCTATTTAACATGAGGTAATATTTGTATTCGCGCATATAGCGTATCATTCCGAACACCCAGCTCTCTGATTACATCTGGTTTTATTTTCATGGCACTTCCATTATATCGACAATCAATCTCTTTTTAGTATTGTGTATATTTTCTTGTGAAAGTAAAGATGATGAATATTATGCCATATGGTTACCTGCGTTAGTTATCTCATTTATCACTTTATTGTTACCATTTCTTTACGGTGCTAGAAACATGAGTTTGATGTATTTTTGTTTTATGATTATTGTATTTCCATCATCATATTTCACCTTAATGTTCAGATTAGCTAAAATAAATAAGCTATTAAATATTGTATTATCGTGGGTAGTTTTTATTTTTTCTGTTTTAACAGCCTGAATGTTT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103 | Escherichia_phage(10.81%) | tRNA,protease,transposase,tail,integrase,holin | attL 1863578:1863602|attR 1897259:1897283 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2270335 : 2349896
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_LN681227|2270335:2349896|DBSCAN-SWA 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56 | Salmonella_phage(18.75%) | lysis,transposase,portal,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2454282 : 2502435
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_LN681227|2454282:2502435|DBSCAN-SWA 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36 | Escherichia_phage(20.0%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2874485 : 2934710
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_LN681227|2874485:2934710|DBSCAN-SWA 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46 | Cronobacter_phage(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2954496 : 3004507
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_LN681227|2954496:3004507|DBSCAN-SWA 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39 | uncultured_Caudovirales_phage(22.22%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
3025385 : 3059900
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_LN681227|3025385:3059900|DBSCAN-SWA AATGAAAAAAGTTATCTGTACGCTATTTCTACTGGTTTCATTTGGGGTTTTTGCACAATCAACGAATGACTCAATTTTGCAAAAATCTATGAAATCATGGCAACCGTTATCAATCAGTGATAAAGGGGGTATCATTACACTTACGATGAATGAAGATCGGATAACCAACGATATTTATAAAGCCGTCATTAACATTGGGGTATGCACCCCACTTTGGTTTGAAGACAAAAACGGCTCATACCTGAAAAAAACAAAAGAGATTCGGGTACTGAACAAACACAATCATTCTGGTTACGTTTTTGAAAATCCGCATTCATCATGTAATGAGTTGGGTAAAGCAACAAATGATAAAATTAGCATTATAATTTCATCCCACACTCATGGGCATATGAATCAATAGTGAAGTATTTAGTCTCTATTAAGAATAAACCCCAAATTTTTATCTGGGGTTTATTTGTTTTCAATCAAAATTCAAAACTAAAAATTCATGACTGTTTGCTGAGCATTGGTAGGGTGTGGTGGGGCTGTCTCAATCAAAGTGGGCTTAGTCACGTACCGGACAAAGGTTTCATGGCTGACGAACGTCGCACCGCAATTGATATTCTGGCACTGGTTGTAACGTTCTTTGGTTTGAGGCGTGTGTTCAAAGCTGCTGCGGGTGTGGGCAACATGGAAGCAAAGGGGGCATTTCATCATGATATGCGTACCTTCTTGGAAAGGGCTGCCAGCTCTGTTAGGCAATGGCGCGATTATAACAAATCCCGCGCCCGTGTCTTTTTCTTCTCTTAAAAATCATACAGAAAAAATATTCTTCACAAAAAAAGCCCATCTGATTGAATCATAACGTGCTTTTGTGATTATCTATTTATTTAATCTGGGCGGGCTATTGCATCCAAAAAGTCTCGCAGCTCTTTTTTTTCCTTATCTGTTCGACAATTAACGGTTGCATACACGCCACTAAAAAAGAGTACTTTCCACGCTTTTGCAAGCAATGTGAAAGCAATCTTTATTTTATCAAGAGGTTTTTTAGCATTCATGACTAACACTAACATGATAATTACCCAAATAAATGCACATGGCCTGATTATACAAGAATTAGCCGATGAACTCGACCTGTGTGGTATTTCATACAATAGAAGCCCAATGTATTTTTCAGCAGGCGCATTGGAATGGTTACAAATAGCACTGCCTGCTGGCGCGAGTGCGGCCCGCGTTTTTATTGCTGTGATTGTTGCAAAGATAAACAAAAACAGAAGAGCAAAAGTAACATTTAACGATGGGAGTCCAATAAAAGAAATAGAAGCCGCAAGCCCGGAAGATTTGAAGAAAGTCTATGAGTATATTAAATCTATTGAAATAGAGAGACAATAGATTCTTTAATTAAATGATTGCCGGCTTTACCAGAAAGCCAGGCAATCACGCGCTCATGTCAGCATCCGCTATTTTCACTTCCAGCGCTAAGGCCGAAGTTAACCCGCTGTCATTCAGGGTGTGGGTCACGGTGACCAGTGTCCAGTCAGCCTGATCAATTTCAGGCTTAAAGCCGCTGACCCTCACTTTCATTTCAGGAAACAGTTCCGGCCGGCCTTTGGCCAGTTGCAGGGAAAAGGAGGCGACACCGCGCTGGATCTTTTCCCATTCCGCTTTGGCAGCGCGTTCCGCATTGGCTTTATTGGCATAAGTATGTTTCATCACCAGGACATTACCTTCACTGCCGGCCAGATATTCCCCCTGTTTTTCGTCTTTTTTCTCCGGTGTGGTTTTGCGTTGCTTACGCTTGACCGTAATGTTTTCTTTTTTCTTGGGTTCACGGGTGTTAAGCCAGCTGGCCGACACACCGGTATAGGCGCTGCGATCAGACAATGAAAAGCGGTAGCCATCACCGGACTGGCGGGTGATGAAAATCTGAGGCAACGGTTTACCGCTGACCGTCTGGTTTTGGCCCTGCCGCATAAACAGCAAACAGCCGTTCTTGACGGCGGCCACGGCCCCTTCCTGTCTGGCCAGCCGGGTTAAGAAGCTGCCGTCGGATTCGTTGGTCTGGTCGATATGGTTCAATCGGATATCGGCCAGCGTGTTGTCTACTTCCGGTTTAAGGTTATTGCGCGTGGCGACGGTGCGCACAATGTCGCTGAGCGTTTTCTGGTGATAGGACAATTCCCGGCTGATATTGAACGTGGCCCGAAAATCAGCACTGCGGGCGCGTACCGTGATTTTATCCGGCGCGCTGCTGTACTCAATTTCATCCACAATAAAGGTGCCTTTGTGGATCAGCGACTCCCCCTGCCAGCCCAGATGCAACGACAGTGTCGTTCCGCGCGGGGGCAGGGACAGCAGGCCGTCGCTGTCGTCCAGTTCAATGTCGAGCTGGTCAGCTTCAAAACCCCGGTTATCGGTCAGGCTCAGGGACATCAGCCGGTTCTGGATGCGGGCATTGATATTCGTTTCACCGGCACTGAGTACGTAAACGGGGGTGTTGGTGTTGCCGGTTATCCAGTCAATGCGGGGCATGTGGGGCAGGGGCATTATTTTAAGACTCCGTTGAGGGTGCGGGTGACGTTGGCTTTCAGGTCAGTCAGTTGGCGGCGCAGGTCGCCGAACATCTCACCGAGGTTTTCATCCACCCGCTTGAGAGTGACGGTAAAGTCAATTTTGCGGGCGGCCCCGTCGATAAAAAATTCACTCTTGGTCTGGTCGAGACTTTCAATGATAAACATGCCGTAAATGGTGCCGCTGCCGTCCAGAAATGACCATGCCTTGCCGCTTTCGGCCATTAGTTCGAGCGTCAGCAGTGACAGGCGCCCGCCGGTGATTTCAGGGTACAGGGCACCGGACAGCGTGAGGGTGTCATTATCCGGCCCCATAAACTGGAAAGCCGGCCGGGCACCGATCCGGTTGTTAAAGCCGTAGCGCCATGACTGTTGGTGTTGCAGGCTCTGGTAGGGCGTGGTTTTCAGCATAAAGACAAATAAACCTAATGCGGCCATCATGATTAAAATCCCTCGCTGTCGTAGAAGGTACTGTGTGCACGGGCGCGGCGTTGTTGCTCCCGGCGGTCAATTTCCTGCGCCACCATCCGCGCAATGTCCTGCGGTGACTGGGCGGGTGTGGGGTAAATATTAATCGTATACGCGGGGCGGCTGTCGCTTTGCTGCTGGTTGATCACCGCGACATTGGCCGGTTGGTACTGAGATGCCGGCAGGCTGTAGGGATGCAGGGGCGCCTGTTGGGTACTGGCTGAGGTCGCACCCAATGACAGCGCCGCGGCGGCCATGGTGGCGAGGGCAGCAGTTTGTCGTCGGCTGGTGACGCGCACCGGGCCGTTAATCAGCTCCGGGCCATGTTCCCCGACCAGCCCGAATTTACCCGTTGGGATAGTGCCGCCGCGATCATGAGCACCGGAAAACGCCGTAAACGGGTTAGCATGTGGGCGGGTGGCGTCGTTATAGGCCTCCAGAGCCTGTTTCACCTGCGGTTTTTGGCGTTGATCCTTCATAAAATCCGGGGTCACCGCGTCCTTAATTTCGGTACCCAAATTTGCGATGCTCTGTTTCAGGGCTTTCCATTTCTCTTTGATGCCGTTAATTAGTTTGTCGATGATCTCAGTGCCGAACTGCTTAAATTTTTCCGGCAGTTTTTTGGTGTCTTCAACAATTTCATCCCATTTATCAGCAATGGTTTTTTTGATGCCATCCCATTTGTTTTGGGTATCCTGTTTGATTTCTTCCCACTTGTTGAGGATTTTCTGCTTAATGTTCTCCCATGCCGTGGAAACCCACAACGCAATGTCATTCCACAGTTTTTTGAACCACGGGCCGAGCTTATCCCAGTTTTTCCAGATAAGATACGCGCCGACGGCAATCAGACTGATGATAAACAGGATGGGATTCATCAGCATAATCCGCCCGAGCCACAAGAACCCCTTACCCAGAAAAGAAATGGCACGCCCCACCAGTTTAAGTCCACTTACGCCCTGTTTGCCCAGCCATTTGAACCCGTTCCCCAGAAACGTGGTAACTTTCCCCAACCGTTGCAGAGAGCCGGCGCCCTTGATGCCGAGGATGGACAGGCTAAACCTGACGAGCGCCAAGGGACCCAGCAAGGCCGCCAGTGCTAGAGTGATTGTCCCAAATACCGACAAAATGACACCCAGTCCAATCGCGACCATCGTTAACGTCTTGGTCAGTTCGGGGTTGGCTTTCATCCATTCGCCTGTTTTGCTGATGATTTTGGTTATACGTTGGGTGATCCCGCGCAAAGGACTGTCCACACCGCCAAAGATTTCGATGCCGAGATCTTCCCAAGCTGAAGACAGGGCTTTCAGGTCACCGTCCAAATTGTCGGTCATGGTACCCGCGACTTTCTTCGCTTCCCCCTGCGCCTGTTTCAGTTCCTGAGTCAGTTTTTGCAGCGCCCCTGAACCGGCCTGTTCGGACAGTACTAATAAGGCTGAAAAAGCCTCTTCCCCAGCAATCGCCTTAAAGATCCCCGCACGCTGGGCATCGCCCATTTTGGCGGTTTTGGCGTTCAGCTCGGTCAAAATCTCCGGCAGGGCACGCAGATTACCCTTGGCATCTTTGGTCTGAATGTTCAGCTTTTTAAGTGCCTTGGCGGCGGCGGTAGGCGGTGCAGCCAGTCGCCCCAGAATGGATCGCAGAGCCGTCCCGGCCATACTGCCCTGAATACCGGCATCCCCCAGTTTACCAGTGGCCGCAGCGGCGGTTTCAATATCGACACCCAATCCGGCCGCCACGGGGGCAACATACTTCATCGTTTCGCCCAGCATCGACAGGTTGGTGTTAGAGCGGGTAAAGGCACCGACCAAGACATCACTGACCCGCCCCATTTCTTCCGATTTCAGTTTAAAACCGGTCAGGATATTCGAGCCAATGTCTGCCGTGGTGGCCAAATCGGTATCGCCGGCCAGTGACATCGCCAGCGTACCGGGCATCGCGGCACGTATCTGGTCAGGTTTAAAGCCCGCCATCGCATAAAAACTT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49 | Salmonella_phage(48.72%) | portal,capsid,plate,lysis,tail,head,terminase,integrase,holin | attL 3025138:3025153|attR 3059966:3059981 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
3244820 : 3343226
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_LN681227|3244820:3343226|DBSCAN-SWA CGTGACAAAAAATATCCCAGCTATTCGTGGCATGAACGATTGCCTTCCTGCCGAAACGGCCATTTGGCAACGAGTTGAATCTACAGTGAAGCGTGTGCTGTCAGGTTATGGTTTCAGCGAAATCCGGACACCGATTGTAGAGCAGACCCCGTTATTTAAACGGGCGATTGGGGAAGTGACCGATGTGGTCGAAAAGGAGATGTATACCTTTGACGATCGCAATGGAGAAAGCTTGACCCTGCGCCCGGAAAATACCGCAGGTTGTGTCCGTGCAGGTATTCAGCATGGTCTGCTGTACAATCAGGAACAGCGTTTATGGTATATCGGGCCTATGTTCCGTTATGAGCGCCCACAAAAAGGCCGCTATCGTCAGTTCCATCAGCTAGGTGCGGAAGTATTTGGTCTGCAAGGGCCGGATATTGATGCGGAAATGATTTTAATGACTGCCCGCTGGTGGCGTGAATTGGGCATTGCTGACCATGTAACACTTGAATTGAATTCCATTGGTTCACTAGAAGCGCGTGCAAATTATCGTGAAGCGTTGGTCGCATTCCTTGAGCAGCACAAAGAGAAACTGGACGAAGACTGCCAGCGTCGGATGTATACCAATCCACTGCGTGTCCTGGATTCCAAAAATCCTGAAATTCAGCAACTTCTTAATGATGCTCCGGAACTGTTTGATTATCTTGATGCCGAATCAAAAGCGCATTTTGATGGCCTGTGTCAGATCCTTGATAGCACGGGTATCAAATATCGTATCAACCAACGTCTGGTTCGTGGTCTTGATTACTACAACCGCACTGTTTTTGAATGGGTAACATCTGCATTAGGTGCACAGGGAACAATCTGTGCCGGTGGACGTTACGATGGTTTGGTTGAACAATTGGGCGGAAAGGCAGCAACACCGGCAGTGGGTTTTGCAATGGGTATGGAACGTATGGTTCTGTTAGTTCAGGAAATCAATCCTGACTTTGTTGCAGACTTGAGGGTTGCTGATGTGTATCTTTCTTCCTTTGGTGAAGGCAGCCAGCATGCAGCATTGATACTGGCAGAAAAGATCCGCGATCAACTACCGGAATTACGTCTGATGACCAATCATGGCGGGGGAAACTTCAAGAAACAGTTGGTGCGTGCAGGTAAGCATGGCGCTAAAGTTGCCCTTCTCCTTGGAGAAGATGAAATTCAGGCAGGCAATATCACGGTGAAAGATTTACGTAACGGTGAACAAGAAACGTTGCCACAACAAACGATCGCCGCGCGTTTGAGCGAATTGTTAGGCTAAGGAGAAAGATTCTGTGGAACTTTATACCACTGAAACTGAACAAGTTGACGCAATAAAGCGTTTTTTCGCCAACAACGGTAAATACCTTGCTGTTGGTTTAGTTTTGGGTATTGGTGCTTTGATTGGCTGGCATTATTGGCAGACTCATCAGACAAACCAATTACACGAGACGGCAGCTACCTTTGAGGTGTTAAACAAATCACTGGCGTCAGGGTCGAAAGAAAGCATTGCTGCTGTGGACAAATTCGCTGATGAAACGAATAACATCTACGGTGTCATGGCTGAGCTGGAACTGACAAAGCGTGCTGTTGAGAAAAATGATTTGGCTCAGGCAGAGAAAAATTTGTTAATTGCATCCGTCAAGGCCAAAGATGAGGACATGAAAGCAGTGTCCAACCTTCGCTTGGCCCGGGTTCAATTAGCAGAAGATAAAACCGATGCGGCATTGAAAACACTGAAACAGGTCAAAGGCAAAGGCTGGTTGGTTCTGACTGAAGACCTCCGTGGCGATATTCTGGCAAAAAAAGGTGATATTGCTGGTGCACGAGCAGCATATTCCAGAGGGCTTGAATCAGATGGTCCTCAGAAAATGAAAGATTTCATCAAAATTAAATTTAATAACTTATCCAACTAAGGGAGCCAACCTCTAATGCAACTACGAAAAACACTCTTGGTTGGGCTGGTTGCTTCTGTTCTGCTAGCGGGTTGTTATAGCGAACAGGATACGGTAACAGTGTCACCGTTGCCGAAAGTTGAAAATCAATTCAATCCCCGTGTAGTTTGGGATAAGTCCGTTGGAAACGGCATTGGGCAGTATTACTCTCGCTTATCACCCGTTTGGCAGGGTTCAGCAGTTTATGTTGCTGACCGTAAAGGTGTTGTCAAGGCACTGGATATCGATAGTGGCAAGGAGCTGTGGGCAACGGATTTGTCGGAGAAAACGGGTTTTCTGTCATCCAATCTGTCGGCATTGCTTTCCGGTGGTCTGACAGTATCTGGTGATCGTCTTTATATCGGTACAGAGAAAGCAAAAGTCATCGCGCTGGATACAAAAAACGGCAAAGTTGAGTGGGAATCAACGGTTGCCGGAGAAGCATTGTCACGTCCTGTCGTAGAAGATGGATTCGTTCTGGTTCATACTGGCAATGGTATGTTGCAGGCATTGAAAGAGACCGACGGAAGTGTTGTCTGGGCAGTCAATATGGATACACCGCCGTTGTCAGTTCGTGGTGAATCGGCTCCTGCTGTAGCTTATGGTGCAGCGATTGTCGGTGGTGACAATGGCCGTATCAGCGCAGTCCTGCTCTCTCAAGGCCAGTTAATTTGGCAACAGCGCATTTCTCAGGTAACAGGTTCTACTGAAATCGATCGCCTGAATGATGTTGATATGACTCCGGTCATTTCTGGCAATATCGTTTACGCCATTGCTTATAATGGTAACTTAGTTGCATTGGATATGCGGTCAGGCCAGATTATCTGGAAACGTGACTTAGGCTCAGTGAATGATATGGTTGTGACTGATGACAAGATTTTTATTGTCGATCAAGATGACCGTATTTTGTCCCTGCGTAAGAGTGATGGTGTGACATTATGGGCACAAAGTGAGCTTTTACACCGTCATTTAACTGCGCCAGAAATGTATAATGGTTACCTGGTCGTAGGGGATAGTGAAGGTTACCTGCATTGGTTGAACATGTCTGATGGTACATTTGCGGCTCAGCATAAGGTTGATGGTTCTGGCCTGTTGAGTCGTCCCGTTGTTGCTGGTGATAAACTGATGGTACAAGCGAAGGACGGGACAGTTTACCTGTATACCCGCTAATGCCAGAACAGGTGTTAATGCTATACCCAATGGATTTTTAACTGTAGCTGATAAGGCCTTGGTTTAGAAAGATAAAGGGAACATAAGTAGTAGCACAAAACTTTACACGGCTCCTGTGCTGACAGTAACAGGAGCCGTTTCGTCTTTTTAGTATCTTGTTGTGGTCGGCTGTGTCGTTATGGACAACATTGCTATGGACAACATTGCTATGGACAATATTGTTATGGTCAATGTTGTCGTAAACAACGCTGCATGTTTTTACTTTCAGCAGGATATAGATTTAAATTTAGTCATGAGGCATCAAAAATGATACCTGTCGTTGCACTGGTTGGGCGCCCCAATGTTGGAAAGTCCACCTTATTTAACCGATTAACCCGAACCAGAGATGCGCTGGTAGCGGATTTCCCTGGCTTAACCCGTGATCGTAAATATGGACGGGCAGAGGTTGAAGGGCAGGAGTTCATTATCATTGATACGGGAGGTATTGATGGTACGGAAGAGGGTGTAGAAACCCATATGGCTGCGCAATCTCTGATGGCTATCGAAGAAGCGGATATCGTCCTGTTTATGGTTGATGCCAGATCAGGATTAATGCCAGCGGATCATGCGATTGCAAAGCACCTGCGTAGTCGTGAAAAAGCGACCTTTCTGGTTGCGAACAAGACTGATGGCATTGACATTGAAACTTCTGTTGCGGAATTTTACTCCTTAGGATTGGGTGATATTTATTCCATCGCGGCTTCTCATGGTCGTGGCGTAACGCAGCTGATTGAACGGGTATTACGGCCTTTTTCTGATAAAGAAGAAACAGAAGAGGTTGAGTTAACCGAAGAAGAAGCCAATGCTGCTTATTGGGCAGAGATGGAACAAGCCGAATTGGATGCTGCGATTGAAAAGGAGCCAGAAGAGGAGTTCGATCCTACGACTTTACCTCTGAAACTTGCCATCGTTGGCCGTCCAAATGTGGGTAAATCCACATTAACCAACCGCATTTTGGGGGAAGAACGCGTTGTCGTTTTTGACATGCCAGGTACAACCCGTGACAGTATCTATATTCCCATGGAGCGTGATGGCCGTGAATATATTCTGATTGATACCGCAGGGGTTCGTAAACGTGGAAAAGTCACTGAAACGGTCGAGAAATTTTCTGTTATCAAAACACTTCAGGCGATTGAAGATGCCAATGTTGTATTGTTGGTGATCGATGCTCGTGAAGGCATTTCAGATCAAGATCTCTCTTTGCTTGGTTTCATTCTGAATAGCGGTCGTTCTCTGGTTATCGCCGTCAATAAATGGGATGGCATGAGCCAGGAAGATAAAGATCACGTTAAGGACATGCTGGATCTGCGTCTGGGTTTTGTTGATTTTGCCCGTGTTCACTTTATTTCTGCTTTACATGGCAGTGGTGTCGGTAACTTATTTGAATCAATTCAAGAAGCCTATGAGAGTGCAACCCGTCGTGTGAATACGTCTTTGCTGACTCGTATTATGCGTATGGCAGAAGACGATCATCAGCCGCCAATGATCCGCGGTCGCAGGGTGAAAATGAAATACGCTCACGCAGGAGGTTACAACCCGCCTATTGTTGTGATTCATGGTAATCAGGTAACCGATTTACCTGATTCTTATAAGCGTTATTTGATGAATTATTTCCGCCGCTCTTTAAAAGTGATGGGAACACCTATCCGTATCCAATTTAAAGAAGGGGCTAACCCTTACGCAGGTAAGAAAAATACATTAACGGCAACTCAGCTTCGTAAGCGTAAGCGTTTGATTGAGCATTTGAAAAAGCGTTAATTACTTTAGATATGGAAATAATAAAGGGCTAGAAATAGCCCTTTGTTATAAAAAAGCTCCCTTATTTTCTCTGATTTCTAAGTAAGACCTTCATTAGTT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106 | Vibrio_phage(18.03%) | portal,tRNA,capsid,protease,plate,transposase,tail,head,terminase,integrase | attL 3243065:3243079|attR 3344432:3344446 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
3474402 : 3566137
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_LN681227|3474402:3566137|DBSCAN-SWA 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88 | uncultured_virus(20.0%) | integrase,transposase | attL 3482800:3482853|attR 3511422:3511475 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
3642053 : 3692665
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_LN681227|3642053:3692665|DBSCAN-SWA AATGAGTGACTATAAAGACACCCTGAATTTACCGGAAACAGGGTTCCCTATGCGCGGGGATTTAGCCAAGCGCGAACCAGATATGTTAAAACGTTGGTACAAAGAAGAGTTGTATCAGGCAATCAGAAAAGCAAAATCTGGCAAGAAAACCTTTATTTTGCATGATGGCCCTCCTTATGCAAATGGCAATATTCATATTGGTCACTCAGTTAATAAAATTCTCAAAGATATTGTTGTTAAGTCCAAAGGATTATCAGGCTACGATTCGCCTTATATTCCGGGTTGGGACTGCCACGGTTTACCCATTGAGCTCAAGGTTGAGCAAATTATCGGTAAACCGGGGGAAAAATTTTCCGCCGCTGAATTCCGTGCTGAATGCCGCAAATATGCCATGACTCAGGTTGAGGCACAGAAAGCGGACTTCAAACGTCTGGGCGTTCTGGGCGACTGGGATAAACCTTACCTGACAATGGACTTCAAAACTGAAGCAGACATTATTCGTGCATTGGGTCGCATCATCAAAAATGGTCATTTGCTGAAAGGCGTGAAACCCGTTCACTGGTGTACTGACTGTGGTTCCTCCCTCGCTGAAGCAGAAGTGGAATATTACGATAAGACCTCTCCTTCCATTGACGTGAGCTTCAACGCTGTTGATGCTGATGCCGTGTATGCCAAATTTGGCGTTAAACCACAGGGTCTGCCCGTTTCTCTGGTCATCTGGACAACCACACCGTGGACATTGCCTGCTAACCGTGCCATTGCATTAGGCGCAGAAATCACCTACCAGTTAGTCAAAATTGATCATGAATACCTGATTCTGGCAGCTGAACTGGTCGAGCAGGTTATGCAGCGTGCCGGTATTACGTCATGGGAAGTCGTCAGTGATTGTACTGGCGCCGATCTGGAACTGATGCGCTTCAATCACCCATTCATGGGCTTCGACGCTCCCGCCATCCTCGGTGATCACGTTACGCTTGAAGCCGGTACAGGTGCTGTGCATACCGCTGGTGGTCACGGTCCCGATGACTACTCCATCAGTCTGAAATATGGTCTTGAGATTGCCAACCCAGTTGGCCCGAATGGCTGCTTCATTTCTGGTACATATCCTTCACTGGATGGTCAGTTTGTCTTCAAAGCGAACGATATCATCGTTGAGCTGTTGAAAGAAAAAGGTGCACTGCTGAGTCTGCACAAAATCCAGCACAGCTATCCTTGTTGCTGGCGCCACAAAAAGCCCATCATCTTCCGTGCAACACCACAATGGTTTATCAGCATGGATAAAAACGGCCTGCGTACTCAGTCAATGAAAGAGATCAAAGACGTTCAGTGGATACCGGGTTGGGGACAGGCCCGCATTGAGTCCATGGTAGAAAACCGTCCTGACTGGTGTATCTCCCGTCAGCGCACATGGGGTGTACCAATGTCTCTGTTTATTCATAAAGAGACTCAGGAACCCCATCCACGCACCGTAGAATTGATCGAAGAAGTCGCTAAACGTGTTGAAATCGATGGTATTCAGGCATGGTGGGATCTGGACGCCACAGAACTGCTGGGTAATGAAGCCGCTGATTACATTAAGGCTCAGGATACACTGGATGTCTGGTTTGACTCAGGAAGTACCCACTCTTCCGTTGTTGATGTCCGTCCGGAATTCAGCGGCAACTCTGCCGATCTCTATCTGGAAGGCTCTGACCAGCACCGTGGCTGGTTCATGTCCTCATTGATGCTGTCTACGGCGATCAAAGGCAAAGCACCTTACCGTCAAGTACTGACTCATGGTTTCACCGTTGATGAGCAAGGGCGCAAGATGTCCAAATCCATTGGTAATACTGTCAGTCCACAAGATGTGATGAACAAGCTGGGTGCGGATATCTTGCGTTTATGGGTAGCATCTACCGATTATACTGGTGAAATCGCAGTTTCAGACGAGATCCTGAAACGCTCAGCCGACGCTTACCGCCGTATCCGCAACACCGCTCGTTTCCTGCTGGCAAACCTGAATGGTTTCAACCCAGAGCAGCATAAGGTAAAAGCCGAAGATATGGTGGTTTTGGATCGCTGGGCAGTAGGTCGTGCTCAGGCAGCACAAGCGAATATCCTCAAATACTATGATGAATATGATTTCCACTCTGTGGTTCAGCGTTTGATGCAATTCTGTTCCGTGGAAATGGGTTCTTTCTATCTGGATATCATCAAAGATCGTCAATACACTGCGAAAGGCGACAGCCTTGCCCGTCGCAGTTGCCAGACCGCATTGTTCCATATCGCAGAAGCACTGGTTCGCTGGATGGCACCAATTATGTCGTTCACTGCGGATGAAGTCTGGAATGAATTGCCGGGTGAACGTGCTAAATATGTCTTTACCGAAGAGTGGTATGAAGGTCTGTTCGGGCTGGCGGATGGCGAAGACATGAACGATACTTTCTGGGCGACTCTGCTGGAGGTACGCGGCGAAGTCAATAAAGTTCTGGAACAGGCCCGTGCTGATAAACATATCCGCAGTTCTCTGGAAGCGGCTGTCACACTCTATGCAGATGAAGCGCTGGCAGAAAAACTCAACAAACTGTCTGATGAATTGCGTTTTGTTTTGCTGACATCTCAGGCTGAAGTGGCTGCTTATGTCGCGGCAGGTGATGACGCTCAGCAAAGCGAGCTTGCGGGTCTGAAAGTGGCCTTCCGCAAAGCAAACGGAGAGAAATGTCCGCGTTGCTGGCATTATGCGACAAATGTGGGCGTGGTAGCGGAACATGCAGAACTTTGCGGCCGCTGTGTGACTAACGTTGCCGGTAACGGTGAAGAGCGTAAATTTGCCTGATGAATAAACCCATTTGCTCCACTGGACTCCGCTGGCTCTGGCTGGTTGTTGTGGTATTAATATTGGATTTGGGAAGTAAATACTTAGTATTGCAACACTTTACTTTGTATGAATCTATTCCATTAATACCCTATTTCAACTTGGCTTATGCCCAGAATTTAGGGGCTGCATTCAGCTTTCTGGCCGATAAAGATGGTTGGCAGCGCTGGTTCTTTGCATTGGTCGCAATAGCCATCGTCACTGTACTGCTGGTGATGATGTATCGCTCCAGCGCCAGGCAAAAACTAAGTAATATTGCTTACGCCCTCGTGATTGGTGGGGCATTGGGGAATTTGTTCGATCGGCTGGTACATGGCTTTGTTGTCGATTTCATCGACTTTTATGTCGGGGAATGGCACTGGCCTACGTTTAATATCGCTGATACTGCAATCTGCATCGGAGCGGCTCTCATTATCATAGAGAGCTTTATCAATCCGGATGACAAGAAGGCAGCATCACAAAAATAGTCATTGAAAGCATGATAATAAATCAGCACCGGTTAACAAAACCGGGGCTGATAATTTCATACCGTATGACGGTATACTTGCAATCATATTAAGTAAAAGGTCTGAGCAACATGTCAATGCAGGTGCAAGCACATAGTGCTGTTTTATTACACTTCACATTAAAACTGGACGATGGCTCAACAGCGGACTCGACTTACAGTCAAGGCAAGCCCGCATTATTCCGCCTTGGTGATGGCAGCCTCTCTGCCCCACTGGAACAGCAGCTTCTTGGTTTGAAAGCCGGTGATAAACATCAATTCACCCTGGCGGGAGAAACCATTTTTGGTAAACACAATCCTGACTTAGTGCAATACTTTACTCCACGTGATTTTGCTGATTCCGGTATCCCGGAAGTCGGAACCATTATGCTATTTACCGCCATGAACGGCAGCGAAATGCCCGGATTGGTCAAAGAAATTGCTGAAGGTTCTATCACTGTTGATTTTAATCATCCACTGGCTGAACAAAACATCACTTTTGATATCGAAGTGTTGGAAATTGACCCTCAGTTGGAGGAAACCCATGCAAATATTACTGGCTAACCCTCGTGGTTTTTGTGCTGGTGTTGATCGTGCCATCAGCATCGTAGAAAGAGCGCTGGAATTATACGGTGCGCCTATTTATGTTCGTCATGAAGTCGTGCATAACCGTTATGTCGTTGATAATTTAAGAAAACGGGGCGCTATCTTCATTGAAGAAATCTCAGAAGTCCCTGATGGCGCTATTCTGATCTTTTCTGCGCACGGTGTTTCCCAAGCCATTCGCGCGGAAGCCCGTTCCCGTGATTTAACCATGTTGTTTGATGCTACCTGCCCGCTGGTCACCAAAGTCCATATGGAAGTGGCAAGGGCAAGCCGCAAAGGTAAAGAAGCCATTCTGATTGGTCATGCCGGTCATCCTGAAGTGGAAGGCACAATGGGGCAATACAATAACCCTGAAGGTGGCATGTATCTGGTGGAATCACCCGAAGATGTGTGGAAATTACACGTCAAGGATGAAAATAATCTCTGCTTTATGACACAGACAACCCTGTCCGTTGATGACACATCGGCGGTGATTGATGCACTTAATGCACGATTCCCCAATATTGTCGGCCCACGCAAAGATGATATTTGTTATGCCACCACCAACCGTCAGGAAGCGGTCCGTGATTTGGCTGTGGGTGCTGATGTGGTTTTAGTCGTTGGTTCCAAAAACTCATCAAACTCAAATCGCCTGGCTGAACTGGCACAGCGCGTAGGGAAACCTGCTTACCTGATCGATTCTGCCGATGATATCCAAGCAGAATGGGTTAAAGGCGTAAGTGCAATCGGCGTCACTGCGGGCGCATCAGCACCGGATATTCTGGTACAGCAAGTTATTGAACGGCTGAAAACTTTTGGAGCAAAAACAGTTAACGAACTGCATGGGCGTGAAGAAAACATTGTTTTCGAAGTTCCAAAAGAATTGCGGGTTGATGTGAAAGAGGTTAATTAGTCGGTTAATTCCTTACTCCTCGCGTATTGAAGAGTAAGGAATCTTCATAATTTGAGTGTATCACTATGGTGAAAACCCATTAATACGATCACAATTCTATGTCATACTGCACTGACAACTTACCTTTCTTTTCCTGTATCGCCTGTATCTTAAGCCCATTAATT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40 | Escherichia_phage(22.22%) | integrase,transposase,tRNA | attL 3644588:3644603|attR 3700336:3700351 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
3760164 : 3893597
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_LN681227|3760164:3893597|DBSCAN-SWA CATGAGCAAAAATAAACTTGAAGATTATACCGAAGCTGAGTTTCTAGCATTCATTACTAAAATTTTCGATGTCGATTACGGTACGGAACAACTGGTAGATGATGCAGTTTCCGAGTTTGAACACCTAACTCAGCACCCAGATGGCAGTAATTTAATTTATTATCCTAAAGATAATAATGATGACTCTCCTGAAGGTGTTCTAGAACGAGTCAAAAAGTGGCGTGCTAAAAACGGACTGCCATTATTTAAAAAGTAAAAATTAGGGGGGGGACCACGGTCCCCCCCCTATTCAAACAGCCATTACCATGCGGATAAAGTTAATTCGTTATTACCAGAGCACTCCGATTCTCAACGCCCTAAGGGGTTTTCTATAAACCCCTTTTCATTCGTTTAATCAGATAGCCCAACCTCCGGCATAAAATACCACCAATACAATCGCCAGAATCGTCGTGCCAATATTCAGTTTGCGCCATTCGCCCGAAAAAATACGTCCGACAACCAGTGCACTGAAGCCCAGCATAATTCCTGTCACAATATTACACGTCAATACGATAAATACGGCGCACAGTAAGCCGGACATCGCACTGACAAAATCATTGAAATTCAGTTTCCGTACATTACTCAACATCAATAATCCGACATACATCAGGGCAGGAGCCGTAGCATAAGCCGGAACTAAATACGACAGCGGGGACAGGAATAAAATCAGCAGGAACAAAATACCCACAACAGAGGCGGTTAAACCGGTTTTACCGCCGACAGCAGTTCCGGCGGCGGATTCAATATAAACACCCGCAGGAGAAGATCCGATAGCTCCCGCGAAAATACTGCAAGCAGAATCCGCGGTCAGGGCTTTGCCACCATTAATAATCTGCCCTCGCTTATCTAATAAATTTGCCTGACTTGCCACCGCCTGAATGGTTCCGGTCGCATCAAATACCGCGGTCATGACCAACGCCAACAGGCTCGGTAATACGGCGGGTTGTAATGCGCCGATAATGTCCATATTAAAAATCAGGGATAACCCATCTTCTCCCAATGTCGGCAATTTAAAGAATCCTTGATATTTTACCGCCGGGTCAAAAATCAAACCGATAATGGAAATAGCGATAATCACCAACACAATACCGCCCGGGACTTTTTTTCGCTCCAGTCCAATCGTGGCGGCTAACCCCAACAGGGTCATAATCACAGGAAAAGCAGTCAGGGAGCCGAATGCAACCGGCAAACCAGCATGTGGATTCTTAATCACCAACCCAACACCATTGGCTGCAATCAACAAGAGAAACAGCCCAATACCAATGCCTGTTCCATGTGCTATATCCATTGGTATATTGCGTAAAATCCATGCGCGCACACCTGTCACTGAAATCGCCGTAAACAGGCATCCCATCAGGAAAACCGCACCCAGTGCCACAGGAATACTCACCTGTTGCCCCAACACCAAACTGAACGCAGTAAATGTGCACAATGAAAGCGCACAACCAATTGCCATCGGCAAATTAACCCATAAGCCCATCAATAACGAACCTAAGCCCGTGACCAGACAGACAGAAATAAACACAGCAGTATGAGGAAATCCGGCTTGACCAAGCATACCCGGCACCACAATGACGGAATAGACCATCGCTAAGAATGTTGTTAAACCCGCGAGAATTTCCTGACGTACCGTTGATCCCCGTTCAGTAATCTTAAAATACTTATCGAGTTTGCATTGAGTTGGCGCCTGCATACCAGACATGTTTTTCCCCTGCTTTCTGTTGAATTTTTTGCATTGAGCATCTGTCGCAATTTCCTACCACTTCACCGTACGAAAACGATTACGTCATAAAATAACAACAATTGGTGCTGTCCTTGTCGGTTCAGCCATTTACTTGCGCAATCGTTTGGCTTTTCGGGCAAAAAAATGGTGAGGAAAATTGAGGCGAATGATTATCCGGCGAATCAGGGATGAGAATCAAGCAGTAATCGCAAATTTTGTGGTTAGCCTTGTTTATTTGTGTGAAATTCGATTCATCCTATATTAAACAGACAATTCACATTGCTGAAAAAGATAAATAACAAAAATATTCTTTAATTTATCAATGGCGTATATTCCATCTATATAAAATATTTTCACCACAGACAATAAAATAAAAATTTTAATAGAATACGATCGTAGCATCAATTTAAATAAAAAAATCAAAATAAAAAACATTTAAAAACTTAAGACTACACAAAACGTATTATACGTTGAATAATATCCTATTTGTTTAAAATAAAGTTATATCCTTAGCATTTATCACTAATACATTTTAAACGCTAATAACATTAAATGTTATTATGTAAACAATCTGCCTGTTATTAATCAATAAATAGCGTGAAGCAGCGCTATATTTTGAAATCATCATTTAGTCAAAACCAAAAACATTATGTAATGTCCGTTTCTCTGTATCACAAGGAGATAACATGTTAACTAAAAAACAAAATGGCAGTCGATTCTTACGAACAGTGGAATGGCTGGGTAATGCCTTACCCCATCCTGTTATTATTTTTGTTATTCTTATTGCTATCTTATTGGTTTCTTCGGCAATCGGACAATATTTTGATATTACTGTTATTGATCCTCGTCCAGAAGGTGCAAAAGGGCGGGCAGAAGATGGTTTAATTCATATTATCAGCTTACTGGATGCAGAAGGTATTCGTAAGATCTTATCCAATCTGGTCACTAATTTTACGGGCTTCGCGCCATTAGGCACAGTATTGGTTGCTTTAATGGGTGTCGGTATTGCCGAACGTGCCGGGCTGCTTGCTGCCTTAATGCGTTTGGTCGTGATGAAAGCTCCACGTAAATTGACGACGCTGGCAATTGTATTTGCGGGCATTATGTCAAATACAGCAGCAGAATTAGGCTATGTCGTATTAATTCCGTTGGCAGCGATTATTTTCCACTCCCTTGGACGCCATCCACTGGCAGGATTGGCGGCTGCATTCGCTGGTGTATCAGGTGGTTATTCTGCCAATTTGTTATTAGGAACAATCGATCCACTGCTTTCTGGTATTACCCAGCAAGCCGCCCGGATTATTGATCCCACTTATGTTGTCGGTGCCGAAGCAAACTGGTACTTCATGTTTGCCAGCACCTTCCTGATATCTATTCTGGGTTATTATGTGACTGAAAAAATCGTCGAACCTCAACTCGGACCCTATAAAAATGAACTGGATGAGGATGAGAATACGCTGAAAAATTCAGCGGAGGTCACTGCTCAAGAGAAAAAAGCGCTTGTCGCAGCAACACTGACATTTATTTCACTGTCCATACTCTTATTATTAAGTGTGGTGCCTGAAAATGGTATTCTGAGAAATCAGGAGACAGGTTTAATCGGTAATTCTCCCTTCTTGAAGTCCATTGTTGTGTTTATTTTTCTCTTCTTTGCTATTCCGGGCATCGTATATGGGTTTGCCGCCAACAGCATGAAATCCGGTAAAGATGTTGTGGATGCAATGGCAAACGCCATGAGCACATTGGGCTTATATCTGGTTATTATCTTTTTTGCTGCCCAATTTGTTGCTTTCTTTGGTTGGACCAATATCGGTCAGATTATCGCAGTGAAAGGTGCCAACTTTCTCAATAGCATTAACTTGAATGGCGGGTTGCTGTTTATCGGATTTATCCTGATTTGTGCCTTTATAAATCTGATGATTGGTTCGGCATCTGCGCAATGGGCAGTTACCGCACCTATCTTTGTTCCCATGTTGATGCTGGCGGGTTATGCGCCGGAAACCATTCAGGCAGCCTATCGTATCGGAGATTCAGTAACCAATATCATTACGCCAATGATGAGTTATTTCGGTCTTATCATGGCGATTGTCGTGAAATACAAAAAAGATGCAGGTATCGGCACACTCGTATCCATGATGCTGCCTTATTCCCTGATTTTTATGGTGGGTTGGTCGCTGTTTTTCTATATATGGGTGTTTATTCTGGGCTTGCCTGTCGGCCCCGGTTCACCTATTTACTACAACCCGGCAAGTTAGCAAATAAAACGCATGCCCTGTCAATTCACAGGGCATTTTATTAACGTTCTTCGGGGACTTGATAGCAAAATACTTTTTTATAGGAAATATTGTAATTGTTTATATTTTATGCAATCCTGCGATATAATTGATATAAACCATATCAACATTCTCTATACCCCATCAGTTCCAAGTTGAAGTACAGCGGGGAACACATCCCCAAGAGCCTGGCCAACCTAGCTTTGTGGCTAATAAATTGACTCAAGCAAAAAATACAGCTAACAGAAAAGATGACGGGTATATGTTTTATGCCAATGCCAATAAGGGGTCTAGAGTGAATACCAAGGTAGCAAGAAAAAGCAGGGCAAAGGAAAAAACGCTCAGTTTAGGTTACGTTTCTCTTCTTGATGTTCTTTCGTCTCAACAAGAACATATTGAGCATATTCATGTCACCGAGATTCCCCCGAATGAAGCTGATCGCTTCTTACTGGTTGAATTACCGGAAGAGACAGGCGGGGATTTTGATGTCAGGGATCTGCGCATTGCCCTGCTGAGTGCGCTGAATACAGCCACTTCCATAAAACGCAACGCTTCTCCCAATAAATTGCCACCTAAATTCAATCTGGAACTTTGTGATCACCCGGATGATCTCCTTGGCGAAAATCCAAAAGACTCCTGGCGAACATCAAACCGAAAAGATCGCATTGAGACACTGAAAAATGCCATTCTCGAAGAATCAACTTGGCTCCCAGCCTATGAACTCAGCCAGTCCGCGGGTTTTTCGCTACTCAATCCCAGCGCAACACCCAATCGCTGGAAAAAAACCAAAAAAATCTTCGCCATTTCAGTCAAAGGGAAGGATTTATACCCCAAATATGCACTGGATGAAGGCGGGTTACCCATGCCTATCGTTAAAAATATCATTGAAGTTTTTGATGGCAAAAAAACGTCCTGGGGGATGGCAATTTGGTTTAATACACCGAATTCATGGTTAGGAAAAGAAA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110 | uncultured_Caudovirales_phage(25.0%) | portal,tRNA,capsid,bacteriocin,protease,transposase,tail,head,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
3930292 : 4029979
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_LN681227|3930292:4029979|DBSCAN-SWA 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92 | uncultured_Caudovirales_phage(24.24%) | portal,tRNA,capsid,protease,transposase,tail,head,terminase,integrase | attL 3972249:3972293|attR 3990113:3990157 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
4051878 : 4101402
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_LN681227|4051878:4101402|DBSCAN-SWA 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42 | Escherichia_phage(11.11%) | integrase,transposase,tRNA,protease | attL 4059977:4059991|attR 4092553:4092567 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
4104650 : 4151504
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_LN681227|4104650:4151504|DBSCAN-SWA GATGGGTTACAGTCTAGATTTTCGAAGAAGAGTACTGGCATACAAAGACAAGCATGCATTGACATTCGAGCAAACCCGCGACCACTTTGAGGTCTCTATCCGCACTCTGTTTCGGTGGTGCAATAAAATAGAACCCTGTATGACACGTGATAAGCCGCCCACGAAAATCAGTGATGAGACACTTATCGCCGATGTCAAAAATTATCCCGATGATTATCAATGGGAAAGAGCAAAACGTCTGGGTGTCTCACAATCGGCTATCCATTACGCCCTGAAACGACTCAAAATAACCGTCAAAAAAAACGCACAAACATCCCGCCGCTGACGAACACGCGCGTCAGGTATTTGGCGAGCGTATCCGCCATCATGAGCAGGCGGGCAAACAGATTGTTTATCTGGATGAAAGCGGCTTTGAGCAGTCCATGCCACGTACGCATGGCTATTCGTTAAAAGGGTCGCGCTGTTTTGGTTTACATGACTGGCAGCACAAAGGCCGTATTAATGCCATTGGTGCTATCATTAAAAATACCTTTGTGACCTTAAGTTTGTTTGCCGGAACCCTTAATGCGAATGTGTTTCATGCCTGGCTGACACAAGATTTGTTGCCGAAGCTCCCTAAGGGGACAGTGATTGTGATGGATAATGCCCCTTTCCATAAACGCGGTGACACGCGACAAGCGATAACCGATCACGGATGCCAGTTGGAATGGATTCCGCCTTACAGCCCAGATTTAAATCCTATCGAAAACAAATGGGCTGAAACAAAAACAACAAGAAGACGAGAAAGATGCTCTATTGATGAGCTGTTTACAAAGCATGTGACTTATGTCTGATTATATTGATTCTGCTATATGCTTGCGACTACGTTGTCAGAAAAATTTACTCACCCACTTGAATTAAGTCGGTGTCCATATATTTATTTAACCTCAGCTTCGTTTAAAGATAGCGATTTCATTATCCCGTAGATTCAAGCTCGGTTTTTTAGGTTGGAATGTATAAGCAATAAGACCGGCAGCAACTTCCAACAAAAAACCGAGCTGACTGCGATGCCTTGAATGCTCTATCTGAGAAATATTTTTGAGCTGGTCGACGACCGTTTCTATCAAAAATCTCCGTCTTAACATCAACCTATCCCAGAGAGATAATGCTTTGGTTTTCATGTTATTCCGGACATTGGTGATTAACGTGACACCTTCCGCTTCTAACTCATCGCATAAAGCCTGGGATAAATACCCCTTATCACCATACAAACATCCTGTTAGTCCTTTTGTCAGCGCTCTGACTGGCTGACGATCATCCTGGTTTCCTGCGGTGAGTTTCACGGCTAACAATTCACCGCAATCATTGATAACCAAATGAAGTTTAAAGCCATAAAACCAGCCTGTACTCGTTTTACCTCGTTGTGCCATCCCTTCAAATACGCGATGACGGGGAATACGAAGATTGTGACAAACAGCAATTTTGGTAGAATCAATAAAAGCAATCCCTTGAGTTTGCGCCTTACGTGATGAAAGAAAAGCGCATAAAGGAATAAGCGCCCTTTTCTTCAGGGTGAGGATACGAGTATAGCTGACTAATCCGGGAAAATCGGCTGTAAAATATTGTTTTACATGTTCAATATAAAATGTTTTAAAATCACGATAATGACTCATATGAAATAAAATGAGGATCATCATGACTTCACTGAGAGAAAGGGATGCCTCACGGTGCCGTTTACGTAATCCATTTTCAATGAGTTGTTGATGCCAGAGAGGGATAAATTTTTGGCAAAAGTCATCGACGCAGCAGTAAAGTTCTTCTAAATTATACATGCCTGAGGGTCTCCACTATTTTGTTTTCTTTAGCAAAAACGTTGATCGTGCCTCAGGCACTTTAGTTCCCTTCCCTTAAGCGAAGCTCAGGTTATTTATATAAAGCCCCTGTAACTCACATTACAGTGGCTTTTTTCCGAATTAAAAACGTTTAGCTATTGGGATAAAACACATCTGCATGGATATAATCTTCATCTAAGAGATAATCCGTTTTTAATAGATTAGTCATATCACTAATCATATTGGGAGAACCACACATATAGACATCTATGTTGTCATTAACATGAATTTCCCTTTTAAAAATATCTTGTACATACCCACGTTGACTTTCCAAATTATCGTTTTCATCGGGTTTAGACAAAATCATATGAAAATGAAAATCAGGTAGTGTTCTCTTCCAGTTCTCTATAATTTCGGAGAAATGTAAGCGGCTCATTTAGACCGTCTATCGGTATTCCCCTGATTCGGGGAAAATAATGTCCATCATTTATAATGGACACTATCGCTATGAAATATCGGACATTGCTCCTCGACGCTTTGCGCTTACATTTTGATGAACACCTATCCAGACTCGATGTTGGCCGTCGGCTTGGGATCCCGAAAAGCACCATCTGCGCTCTCTTTGTTCGCTTCAAAAAGCTGGGAATGAGCTGGCCGCTGCCTGATAACATGACCGCCGATAAGCTCGAATCGCAACTTTACCCCGCGCGTACCCATGCCGTCAGGCTTGATATCCCTGCGCCGGTTTTAGCGGATGAACCCGTTGTACGCAAGCGGTCATGCCGCCCGAATTTTCCACTTGCGTTTAAAATCTCTCTGGCCGAAAAATCACTGCAACCTGGCGCCAATGTCGCACAACTGGCGCGTGAACACGGCATCAACGACAACCTGTTGTTTAACTGGCGTCACCTTTATAAACGCGGACTTCTGTGCCCTCGGGAGGACCGTTCATGGCTCCTGCCTGTTACACAGCCGGTCTCCGCGATGCAGCAACCCGCTGCCAGGGAGCCTTGCTGTGAACTGGCGCTTCCCGCCGGCATACTGCGCATCCGGGGTGAACTGACTTCCGAACTGCTGCGTATGTTGATTAGTGAAATGAAGGGGGGTGGATGCGTATTACCATGAAAGAGATCAGGTAATAGCATCGATGGAGATCACTTCTTACCCGACTCATAGAACCTGTTAATAAACTATATGGACTGATCTCCATCTGTCAAGGTTGCACCTTGTTTACGCATCGATTCGCCCTTCAATTCGACTTTGATACTCCCGTGAACCAGCCTGTCCAGGATGGCATCCGCATGGGTCGCATCCCCTATCATTTGGTGCCATTTTTCTATCGGTAACTGGCTTATCAACAACACCGAACCCCGTTGATACAGCTGATCCACTATCTCCAGTAAATCACTGCGCTGGTCGGCGCTCAGACTCTCCAGTCCCCAGTCATCCAGGATAAGCAACTGACTGCGACTCAGTTTGCTCAACAACCGCGGATAACTGCCATCACCATGACTCTGGTAGCACAGGGCCAGCAACCCTTTCACCCGGTAGTAATACACCGTATAACCCTGACGGCAGTAATGCCGTCCCAATGCACAGGCAAAATACGTTTTCCCGCTGCCGGTCGCTCCCGTCAGCAGCAGATTCTGATGCTGTTTCAGCCACTGTGCCTGCGCCAGGCTTCTGACCTGCGCTTTCTCCAGACCCCGGCTGGCCCGGTAATCCAGCGCTTCCAGTTCGCCCTGAAGCCGGAAGCGAGCCTGCCTGATGAGCCGTTCTCCCTTCTGGTTTCGCCGATGGGTGATTTCTTCTTCAACCAGCAGCAATAAACGCTCTTCAAAGCTCAGTTCGTGATAGGACGTGGGCAGCGATAACTGCTGGCGAAGCGCTTCCCGAAAGCCGTTCAGCCTGAGTTCAGTGAGGTATTCATAAAGACTGTTCACGCGGGGACTCCTTAATGGTAATAATGACTGCCGCGCACGTTAGTGTGCTCAAGGTCAGCCAGCGGATCAACGGTATGGCGAGCGGGAACCGGTTGTTTATCCAGCCCTTTATCAAGGATGGATTTCAGGCCTTTCAACCGGTAAATCCCCATCGCCAGAGCTCGGTGGCAGGCGTTGTTAAGACGTTCATAGCCATAGCTTTTATGCAGTCCCATCACGCCGAGCACATAACGATACCCCTGCTCGGGATGCTGACGGGTGGCCAGGATATGCGTCACGTAGGTTTTGACATGTTCTCCGGCCAGGGTGGCCCATTCGAGTAAGCGTTCCGGCGTCCATTGGGCATGATGCTGATGGGCGGGCGGCATGTGCTTCTCCTGGGTACTGTAGCCACATTGATGTCGCCGGGGATGCACCGCCACGACAGTCCCCTGGTGGTACAGAGTCACCTGTTCACGGCTGACATGGGCTTCTAATACGGTTCTCAGCAGTTGATAAGGTACGGAGTAATAATGTTTTTCCACTTCCACATGATAGTCGGGGTGAACCCGAACCTTTTTCACCTGGGTATAAAGATAAGGCTGCCGGGGTAACGGGTTGAGCGCCGGTTTATCCAGTTGTTCAAACAACGTCCTGCGGGACGCGTTGAGCTTTTGCATCGGTTTCTGATTCAGTCCTGCCAATAATTGTGCGATACGCTGGTTGAGAGACGCCAGGCTGAAGAAGGTTTCATGGCGGAGTTTCCCCATGATCCAGCGTTCAACCACCTGCACGGCCGATTCCACTTTGGCCTTGTCCCGGGGTTTGGCGGGGCGGGCGGGCATCACCGCCACCTGATAGTGCGCCAGCATCTGCTGGTAAGTCGGATTGATATCCGGATCATAACGGCAGGCCCGGGCGGTACTGCTTTTCAGGTTGTCCGGCACGACCAGGGCAGGCGTCCCGCCCAAATACTGAAAACAACGGACATGGCTCATGACCCAGTCTTCCAGCGTCTGGCTCCAGGTGGCTTCCGCATAGGTATAACTGGATGCCCCGAGGGTGGCGACAAAGACCTGAGCCTTACGGGCTTCGCCGGTGTCCGGGTTAATGACCGGCAGCGTGGGACCGCAGTAATCGATAAATAATTTCTCACCGGCCTGATGCGGCTGACGCATAGAGGGCGCGGTGGTTTTCGCCCAGGCTTTATACAAGCGACAGTAGTGGTTATAGCTGTAATGCCCGCCCGGATGGCGTTGGGTATACT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35 | Stx2-converting_phage(20.0%) | integrase,transposase | attL 4095465:4095482|attR 4155271:4155288 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
4290644 : 4425029
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_LN681227|4290644:4425029|DBSCAN-SWA 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113 | Planktothrix_phage(11.76%) | plate,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
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NZ_LN681227.1|WP_010846340.1|3489529_3489823_+|co-chaperone-GroES |
3489529_3489823_+
Protein sequences of NZ_LN681227.1|WP_010846340.1|3489529_3489823_+|co-chaperone-GroES>NZ_LN681227.1|WP_010846340.1|3489529_3489823_+|co-chaperone-GroES MKIRPLHDRVIVKRTEVESKSAGGIVLTGSAAGKSTRGEILAVGNGRILENGEVKALDVKVGDTVIFNEGYGVKTEKIDNEEVLIMSESDILAIVEA |
97 aa aa | NA | NA | NA | 3474402-3566137 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 2.22|1815509|32|NZ_LN681227|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LN681227 position: 3544163-3544194, mismatch: 0 gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacc CRISPR spacer gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacc Protospacer ******************************** 2. spacer 2.45|1815509|33|NZ_LN681227|PILER-CR matches to NZ_LN681227 position: 3544163-3544195, mismatch: 0 gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacca CRISPR spacer gccattccggtcgaacgactgcgtcgcccacca Protospacer ********************************* |