Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN554847 | Aliivibrio wodanis genome assembly AWOD1, chromosome : 2 | 1 crisprs | DEDDh,RT,cas3,cas6f,cas7f,cas5f,cas8f,cas3-cas2,cas1,WYL,csa3 | 0 | 18 | 4 | 0 |
NZ_LN554851 | Aliivibrio wodanis genome assembly AWOD1, plasmid : pAWOD19 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LN554850 | Aliivibrio wodanis genome assembly AWOD1, plasmid : pAWOD72 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LN554848 | Aliivibrio wodanis genome assembly AWOD1, plasmid : pAWOD920 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_LN554846 | Aliivibrio wodanis genome assembly AWOD1, chromosome : 1 | 1 crisprs | DEDDh,cas3,RT,PD-DExK,DinG,WYL,csx1,csa3 | 0 | 11 | 5 | 0 |
NZ_LN554849 | Aliivibrio wodanis genome assembly AWOD1, plasmid : pAWOD150 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN554847_1 | 1058738-1061169 | TypeI-F |
I-F
Consensus repeat of NZ_LN554847_1
|
40 spacers
spacers of NZ_LN554847_1
>1.1|1058766|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT ACCATGGAATATTTGCGGCGTTTGCCTGGGGC >1.2|1058826|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT TTGTGTTTATATTTACACCATCAATAACGAAA >1.3|1058886|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT AGCTATACCTTTAACAGCTAAGGTGTGGTGTG >1.4|1058946|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT ATTTTTTGAATACCATTTACCCGGGCGGTGTT >1.5|1059006|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT CTCTGTTATTTACTATAACGGTTCGAATAACT >1.6|1059066|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT TAGAAGATATTGAAACCAATACACTTAAACTA >1.7|1059126|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT ATCACTAAGAATGTGGGTCTTGCTGCTTCTGC >1.8|1059186|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT ATGTGGTCTAGCTTAGCTAGTCTTACTATGGA >1.9|1059246|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT TTCAATTACTTGAGTAGCCATACTGATACAGT >1.10|1059306|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT CTTATCACTCTTCGTCAAATTTAAGGCATTCA >1.11|1059366|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT AGCAAATGAGATTACGCGCTCTTTTGCTAATT >1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT CTCTTTTAACTCTTTAGTTTGCTGCTTGATTT >1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT CGATAAACTATAAAGAAAGTTTTAAATGTAAA >1.14|1059546|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT ACCTAGCCGCTCGAATGCTAATGACTCCCACA >1.15|1059606|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT ATGATCGCAGTTGCTAGAGGTAAGCGTAACGA >1.16|1059666|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT CATCATAAGGCTGTCCTGGAGTTTGAGACGGT >1.17|1059726|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT AGGAGGTCGATTTAACAGATGATTGATGAACT >1.18|1059786|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT TTATATGATAGCTATGGTCTGGTGAGATAAGA >1.19|1059846|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT CTCAACTTGCGTTTTCTCATCAACAAAACAAA >1.20|1059906|33|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT ATTTAGCGGTTGCCTGTTTTGCTTGAGCAAATT >1.21|1059967|33|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT AAACTATCTACGATTGGAACGATTGCCGCTACG >1.22|1060028|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT GAAACTTTAATTTTTTCTTGCTTGGATGAACT >1.23|1060088|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT TATTTAACTTCAATACCGCCAAACGTCAGTTG >1.24|1060148|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT ATGCAACAGCTTCATAGCTTTTTCCGCCACCA >1.25|1060208|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT AAATGAATAAAGAACTTTTAAGCGTAATTAAA >1.26|1060268|33|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT TATTCAACGGTCAAGTTTCCCCCGCTTTTGATG >1.27|1060329|33|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT AAGAAATCATAACATCATCACAAACTTGAGTAA >1.28|1060390|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT TTGCAAATGAAAATTTCGTAGTGGTTTCGTCC >1.29|1060450|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT AACCATCCGCAATCTCTCGACAGGTCTCTGGA >1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT AATAGATTGAATAATTCGTGAATCATCAAATG >1.31|1060570|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT ATATAGAGGGATCATTAACTGGAATAGAAAAC >1.32|1060630|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGTTCTGTGGCTTTGGGTATTCCTCAAGCTAT >1.33|1060690|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTAATCATATTATGAACCCAATCTAGTAAA >1.34|1060750|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTCAAAAGCTACTGCACACCAGTTACACTGTC >1.35|1060810|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTAACGCCCCCACACTATCCATAATTTAATA >1.36|1060870|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGAAAAAGGCGCAAAGAAGTACCGTTTTAA >1.37|1060930|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGCTCCTGATGGCTCTAAATGGGCTTGTGT >1.38|1060990|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGTTCCTATTGACGGTTATATTGCTCCTGAT >1.39|1061050|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCACCTAGGGTTATTTTAGGATTATACTTATT >1.40|1061110|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGATAAGGGTTTTTTAACTAAACGTTCTGGG |
cas6f,cas7f,cas5f,cas8f,cas3-cas2,cas1,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN554847_1
The CRISPR arrays of NZ_LN554847_1 >merge|NZ_LN554847|1|1058738-1061169|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTAATATGCTGCCTGTACGGCAGTGAACACCATGGAATATTTGCGGCGTTTGCCTGGGGCTTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAACTTGTGTTTATATTTACACCATCAATAACGAAATTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAACAGCTATACCTTTAACAGCTAAGGTGTGGTGTGTTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAACATTTTTTGAATACCATTTACCCGGGCGGTGTTTTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAACCTCTGTTATTTACTATAACGGTTCGAATAACTTTTCTAAGCTGCCTGTACGGCTGTGAACTAGAAGATATTGAAACCAATACACTTAAACTATTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAACATCACTAAGAATGTGGGTCTTGCTGCTTCTGCTTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAACATGTGGTCTAGCTTAGCTAGTCTTACTATGGATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTCAATTACTTGAGTAGCCATACTGATACAGTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACCTTATCACTCTTCGTCAAATTTAAGGCATTCATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAGCAAATGAGATTACGCGCTCTTTTGCTAATTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACCTCTTTTAACTCTTTAGTTTGCTGCTTGATTTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACCGATAAACTATAAAGAAAGTTTTAAATGTAAATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACACCTAGCCGCTCGAATGCTAATGACTCCCACATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACATGATCGCAGTTGCTAGAGGTAAGCGTAACGATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACCATCATAAGGCTGTCCTGGAGTTTGAGACGGTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAGGAGGTCGATTTAACAGATGATTGATGAACTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTATATGATAGCTATGGTCTGGTGAGATAAGATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACCTCAACTTGCGTTTTCTCATCAACAAAACAAATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACATTTAGCGGTTGCCTGTTTTGCTTGAGCAAATTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAAACTATCTACGATTGGAACGATTGCCGCTACGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGAAACTTTAATTTTTTCTTGCTTGGATGAACTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTATTTAACTTCAATACCGCCAAACGTCAGTTGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACATGCAACAGCTTCATAGCTTTTTCCGCCACCATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAAATGAATAAAGAACTTTTAAGCGTAATTAAATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTATTCAACGGTCAAGTTTCCCCCGCTTTTGATGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAAGAAATCATAACATCATCACAAACTTGAGTAATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTGCAAATGAAAATTTCGTAGTGGTTTCGTCCTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAACCATCCGCAATCTCTCGACAGGTCTCTGGATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAATAGATTGAATAATTCGTGAATCATCAAATGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACATATAGAGGGATCATTAACTGGAATAGAAAACTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGGTTCTGTGGCTTTGGGTATTCCTCAAGCTATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTATTAATCATATTATGAACCCAATCTAGTAAATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACCTCAAAAGCTACTGCACACCAGTTACACTGTCTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTGTAACGCCCCCACACTATCCATAATTTAATATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGATGAAAAAGGCGCAAAGAAGTACCGTTTTAATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACATTGCTCCTGATGGCTCTAAATGGGCTTGTGTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTGTTCCTATTGACGGTTATATTGCTCCTGATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGCACCTAGGGTTATTTTAGGATTATACTTATTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTGATAAGGGTTTTTTAACTAAACGTTCTGGGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NZ_LN554847|1|1|1058738-1061169|CRISPRCasFinder TTAATATGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC ACCATGGAATATTTGCGGCGTTTGCCTGGGGC TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAC TTGTGTTTATATTTACACCATCAATAACGAAA TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC AGCTATACCTTTAACAGCTAAGGTGTGGTGTG TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC ATTTTTTGAATACCATTTACCCGGGCGGTGTT TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC CTCTGTTATTTACTATAACGGTTCGAATAACT TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCTGTGAAC TAGAAGATATTGAAACCAATACACTTAAACTA TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC ATCACTAAGAATGTGGGTCTTGCTGCTTCTGC TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC ATGTGGTCTAGCTTAGCTAGTCTTACTATGGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTCAATTACTTGAGTAGCCATACTGATACAGT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CTTATCACTCTTCGTCAAATTTAAGGCATTCA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AGCAAATGAGATTACGCGCTCTTTTGCTAATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CTCTTTTAACTCTTTAGTTTGCTGCTTGATTT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGATAAACTATAAAGAAAGTTTTAAATGTAAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ACCTAGCCGCTCGAATGCTAATGACTCCCACA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATGATCGCAGTTGCTAGAGGTAAGCGTAACGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CATCATAAGGCTGTCCTGGAGTTTGAGACGGT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AGGAGGTCGATTTAACAGATGATTGATGAACT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTATATGATAGCTATGGTCTGGTGAGATAAGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CTCAACTTGCGTTTTCTCATCAACAAAACAAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATTTAGCGGTTGCCTGTTTTGCTTGAGCAAATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AAACTATCTACGATTGGAACGATTGCCGCTACG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GAAACTTTAATTTTTTCTTGCTTGGATGAACT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TATTTAACTTCAATACCGCCAAACGTCAGTTG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATGCAACAGCTTCATAGCTTTTTCCGCCACCA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AAATGAATAAAGAACTTTTAAGCGTAATTAAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TATTCAACGGTCAAGTTTCCCCCGCTTTTGATG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AAGAAATCATAACATCATCACAAACTTGAGTAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTGCAAATGAAAATTTCGTAGTGGTTTCGTCC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AACCATCCGCAATCTCTCGACAGGTCTCTGGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATAGATTGAATAATTCGTGAATCATCAAATG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATATAGAGGGATCATTAACTGGAATAGAAAAC 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TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC ATCACTAAGAATGTGGGTCTTGCTGCTTCTGC TTTCTAAGCTGCCTGTACGGCAGTGAAC ATGTGGTCTAGCTTAGCTAGTCTTACTATGGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTCAATTACTTGAGTAGCCATACTGATACAGT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CTTATCACTCTTCGTCAAATTTAAGGCATTCA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AGCAAATGAGATTACGCGCTCTTTTGCTAATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CTCTTTTAACTCTTTAGTTTGCTGCTTGATTT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGATAAACTATAAAGAAAGTTTTAAATGTAAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ACCTAGCCGCTCGAATGCTAATGACTCCCACA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATGATCGCAGTTGCTAGAGGTAAGCGTAACGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CATCATAAGGCTGTCCTGGAGTTTGAGACGGT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AGGAGGTCGATTTAACAGATGATTGATGAACT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTATATGATAGCTATGGTCTGGTGAGATAAGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CTCAACTTGCGTTTTCTCATCAACAAAACAAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATTTAGCGGTTGCCTGTTTTGCTTGAGCAAATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AAACTATCTACGATTGGAACGATTGCCGCTACG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GAAACTTTAATTTTTTCTTGCTTGGATGAACT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TATTTAACTTCAATACCGCCAAACGTCAGTTG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATGCAACAGCTTCATAGCTTTTTCCGCCACCA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AAATGAATAAAGAACTTTTAAGCGTAATTAAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TATTCAACGGTCAAGTTTCCCCCGCTTTTGATG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AAGAAATCATAACATCATCACAAACTTGAGTAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTGCAAATGAAAATTTCGTAGTGGTTTCGTCC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AACCATCCGCAATCTCTCGACAGGTCTCTGGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATAGATTGAATAATTCGTGAATCATCAAATG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATATAGAGGGATCATTAACTGGAATAGAAAAC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GGTTCTGTGGCTTTGGGTATTCCTCAAGCTAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TATTAATCATATTATGAACCCAATCTAGTAAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CTCAAAAGCTACTGCACACCAGTTACACTGTC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TGTAACGCCCCCACACTATCCATAATTTAATA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GATGAAAAAGGCGCAAAGAAGTACCGTTTTAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATTGCTCCTGATGGCTCTAAATGGGCTTGTGT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTGTTCCTATTGACGGTTATATTGCTCCTGAT 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MAKTTLKTPSVLAFEAKLLPSDALMFAGNWQQQEWTPIIVGEKAVRGTISNRLKAAMANDPTKLDAEVSKANLQTVDIAALDHQSDTLKVQFTLRVLSELQVPSTCNNPEYQAALAEKIETYKQEEGFTELAKRYAQNIANGRFLWRNRVGAENVLVKVSAEGKEFTFNSHDFNLRSFDNNPSVDELAEIIQKGLVENHSLIKVEAFTQLGEGQAVYPSQELVMGGGKGDKSKFLYQLNGQAAMHSQKIGNALRTIDTWHPAFEEVGPIAVEPYGSVTNRGAAYRQPKENNDFYKLLDGWMLKDKQPEKEQQHYIMAMLIRGGVFGE >NZ_LN554847.1|WP_045104156.1|1062874_1063846_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy2 MSRYLLLKDISVQNANAIAGLTYGFPAMTNFLGFAHALSRKLPSELTVSLGGVAVISHENIVHARQPKEWGDYVFALTRNPLTQKGTTAPINEEGRMNMTISLLIEVHGLLGGAIEQENSLVNSVKHHIPRLRIAGGQITQIGSISLTNKEEDTKVLRRLMPGFVLLDRSEYLAEHVKNKNEQGDQLSVFDAWCDFYKLKYQATRAESDAEDQDELSNKAKWEFVKKPQMGYLVPIMSGFCAISPLYDEGKVEKVRDTKVPVAFAEAAYGIGEWMSPHRLTSIDDAIWRYEHCEPWYVAKTNPFIDPIIELSMDELDEDDEEI >NZ_LN554847.1|WP_045104157.1|1063847_1065200_-|type-I-F-CRISPR-associated-protein-Csy1 MDNTLSQAIADYIQQRKEAKLEPLQKVLNKVLDKSEDPVEIAEAQALYAEEAAPIKALFVAEVWLSDAAKRAKQTSLATHAAKFTHSDAKASSMLVTEQLNDSNYLVTASLNKKAIDAVGNAAALDVARLLKLECDGESLITQLQQGHINALCSFAKDENQLQEWKGGFEQALGDTKLSSHTLSKQLYFPLIGEDKVSVEYHLLCPLFSSSLAHELYHEVRRTRYGDSKEIRDARKSGKYHEKLDERFLNLAVQNFGGSKPQNISQLNNERHGETFLLNCAPPNWKYIASPPISSSSLFGRELSFKTATLICEFRLFLENLREDEKNVHIRRQRDNAYLLPIIDTVLNHVAVIQMMKDHAGWSNSDECKMKPNHALWLDVYNSDETFQKNREKGDWLTLIATDFANWLTHKLKSNKEKYILGDIEHAYFSKLFLHQLKHFERSTPKLGEL >NZ_LN554847.1|WP_045104158.1|1065208_1068619_-|type-I-F-CRISPR-associated-helicase-Cas3 MMVTFVSQCEKNALKKTRRVLDAFANRIGDNTWQTIITEDGLLTVKKMLRQTASKSTAVSCHWIRSRSRSQFLWVVGNRLKFNTEGVVPVNRTSLNLDHKEWENGWDKLEVIANATSIAGLFHDFGKANDLFQAKLQGTSGAKGEPYRHEWISLRLFEAFVKGKTDQEWLSELSEINRLDNGNRIESYVLDNLHNDHRSGSLSPFKSLSSFATLIAWLIVSHHRLPTPQTKRSKNVNNDQMPQWLTNVFNCDWNSSNAEQLDQIGSEVINKNWTFSQGTPFISKTWQKQASKLAYRTLKNTKLNHEQPWLKQRFVAHLSRLSLMLSDHYYSSLEAERSQLEWRDKDYLPKANTDRKETQLEGRAVFKQQLDEHNIGVSHNAMHFALNLPALKYALPAIGQHKLFSRNAPKKFVWQDKAYKAAKEYARLSEKQGFFGINMASTGCGKTIANARIMYALADEREGCRFSVAVGLRTLTLQTGDSYRDLLKLGDDELAVLIGSQAVKTLHQVNKESNKEKLSSGSESSDDFFEQLFISYDGQIYDGRLKHWLKGNPKLEQLLSAPVVVSTIDHLMPATESLRGGKQIAPMLRLLTSDLILDEPDDFGLEDLPALCRLVNWAGMLGSRVLLSSATLPPSLIAALYHAYLEGRKHFNAANFPENEIQSVVCGWFDENKSHVTEIKSSDAFTEENDIFVQKRIKKLNENKKVLRKGKLVTVHLDDELSEEKDDNHIYQSVAATIHSQIHQLHDSHHVKHSSGRKVSCGVVRMANIDPMINVMKCLSEMSPQEDYSIHFCVYHSQFPLAVRSHKENRLDNTLTRYDEAKLWQEPEVIEALNTTTTANNIFVVIGTSVVEVGRDHDYDWGIAEPSSLRALIQLAGRIQRHRQQEPSSSNLMVLNKNIRALRGDTTAYCKPGFESKDLPLSTHDLNELLNGELESISAISRIEQPKITKKEIKLSEGQAVAVGVNSFVMQEHRALKLALGLPKSPNKQGQKVAYYQSDKEALLWWKDNYHADWNGEFINQTRFRKSDPQEEFILCKADEWDDLGWHQKDTTQKKWVFTPQNHRVVTQSIELSEGNYWWMNTDVETIYINLAEQLEQTVESTGQYFGGISLRAAKEDQVLIWNWNDQLGVYQTKNH >NZ_LN554847.1|WP_045104159.1|1068615_1069611_-|type-I-F-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MDNFSSSDLKSILHSKRANLFYLEYCRVMQKDGRVLFLTEAKNENQYFNIPIANTTVLLLGNGTSITQAAMRMLAQAGVLVGFSGGGGTPLYMANDAEQPIEWFTPQSEYRPTEYLQGWMSFWFDDEKRLAAAKAFQQARLSFLQKIWARDRELKQEGFDLKESGLQAAFERFEERTEAATKQSDLLLTEAQLTKHLYKFAANNVQLQDFKRQHQSTDKANDFLNHGNYLAYGLAATTLWVLGIPHGFAVMHGKTRRGALVFDVADLIKDTIVLPWAFICAKENDTEQEFRQQVLQAFTDHKVLDFMFDTVKEVALMHQKPKSLDGGDQTR >NZ_LN554847.1|WP_045104160.1|1069644_1070640_-|WYL-domain-containing-protein MEQLSRLSIIHKLLSQSKYPVPKNKLLEALECSESTFKRLIRKINDEFDASISYDRELKGYIYAPDSPQLPLSYLSFTDKEWFALLTAEKLFTDLHTGSLSKELEGIKQVLQQTKNRAMDFGIANKIEILSAIRTINHADVFNQITAALWAESSVDIEYQDSSQNITIRTLSPQKVFLYKDAWYLLAWCHLRTEIRIFSLNRLKSAKEGSAPFTALPEGSVQAYLKNSYGLMVGETQYQAVLRFEQSVAPWVLDHTWHSEQQIETQYNGDLILSFSFSDHRELVREIMRFQPNVTVVSPVFLKESVEQCLFQAVEKIQKDRTGSVCDLAVQ >NZ_LN554847.1|WP_011263647.1|1070921_1071155_-|hypothetical-protein MSMTHKWSIKNCPKDIESQVLSVIGLIDKKGSASDMDLCKIFGEVLWSDGKYFNSHAFRFLFDHETLSCEVTKRHLH >NZ_LN554847.1|WP_045104161.1|1071435_1071795_-|glutaredoxin MKLIRLVLGKIILAADFVFTPSGVKRDPAKQAEIDAETANYSLYQFEACPFCVKVRRTIKRQSLKIELRDAKNNEDHKAELLAGGGRVKVPCLRIDNNGETTWMYESSDIMAFLEKQYP >NZ_LN554847.1|WP_045104162.1|1072098_1073595_-|sodium/proline-symporter-PutP MIENNFAITGTFIAYLIMMLAIGLYAYKQTSSSSDYFLGGRTLGPWPAALSAGASDMSGWLLLGLPGYAYAAGLESLWLAGGLLVGTWLNWLICAKRLRTYSMTTDDALTLPEFLSRRFNDKSKLIQTISALFILLFFLFYTSSGLVAGGKLFETVFGLDYKIAVAIGTLCVVSYTLFGGFLAVAWTDLVQGLLMSAALMIVPIAAMQGGFGQLSADLVAINPELMTLWTGMDGKPLSAIAIISLAAWGLGYFGQPHILARFLASRTNRELTTARRIAVVWTALSMVGAVLVGLVGLLYVNGSMAGQAIDGEKIFMLLVNAMFHPVIAGILLAAILAAIMSTADSQLLVSSSALSEDLYKQLVKKDATSKEVVNVGRIAVIALSLIALALAMNPDSSVLGLVSYAWAGFGAAFGPAIVLSLYWKGMNRNGALAGIVVGGITIVVWKQLTGGWFDVYEIVPGIIFATTAIIAVSKLTGKPEEAVAQQHEKFERNLVEFE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN554847_1 | 1.27|1060329|33|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060329-1060361 | 33 | MN694517 | Marine virus AFVG_250M306, complete genome | 9644-9676 | 5 | 0.848 |
NZ_LN554847_1 | 1.8|1059186|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059186-1059217 | 32 | MN693627 | Marine virus AFVG_250M592, complete genome | 48677-48708 | 7 | 0.781 |
NZ_LN554847_1 | 1.19|1059846|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059846-1059877 | 32 | MH384260 | Staphylococcus phage SA780ruMSSAST101, complete genome | 21563-21594 | 7 | 0.781 |
NZ_LN554847_1 | 1.22|1060028|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060028-1060059 | 32 | MG209611 | Aphanizomenon phage vB_AphaS-CL131, complete genome | 17539-17570 | 7 | 0.781 |
NZ_LN554847_1 | 1.23|1060088|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060088-1060119 | 32 | KP007359 | Enterobacteria phage vB_EcoM_VR5, complete genome | 155439-155470 | 7 | 0.781 |
NZ_LN554847_1 | 1.6|1059066|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059066-1059097 | 32 | NZ_CP031118 | Providencia sp. WCHPHu000369 strain WCHPr000369 plasmid p1_000369, complete sequence | 25693-25724 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.6|1059066|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059066-1059097 | 32 | NZ_CP025981 | Escherichia marmotae strain HT073016 plasmid pEM76, complete sequence | 37122-37153 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | KX349297 | Cyanophage S-RIM44 isolate W2_10_0709, complete genome | 64674-64705 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | KX349293 | Cyanophage S-RIM44 isolate Np_20_0711, complete genome | 62522-62553 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | KX349296 | Cyanophage S-RIM44 isolate Sn_13_0910, complete genome | 62564-62595 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | NC_047734 | Cyanophage S-RIM44 isolate Np_42_0711, complete genome | 62519-62550 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | KU594607 | Cyanophage S-RIM44 isolate W2_07_0710, complete genome | 64394-64425 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | KX349291 | Cyanophage S-RIM44 isolate ES_42_0910, complete genome | 62564-62595 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | NC_015288 | Prochlorococcus phage Syn1, complete genome | 62593-62624 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | KX349295 | Cyanophage S-RIM44 isolate Sn_08_0709, complete genome | 64397-64428 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | KX349292 | Cyanophage S-RIM44 isolate Np_05_0604, complete genome | 64397-64428 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | NZ_CP013780 | Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence | 19144-19175 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.14|1059546|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059546-1059577 | 32 | NC_019522 | Pectobacterium phage ZF40, complete genome | 22738-22769 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060510-1060541 | 32 | NC_009819 | Streptococcus phage P9, complete genome | 1627-1658 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060510-1060541 | 32 | NZ_CP009919 | Bacillus megaterium NBRC 15308 = ATCC 14581 plasmid pBMV_1, complete sequence | 60010-60041 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060510-1060541 | 32 | NZ_CP035096 | Bacillus megaterium NBRC 15308 = ATCC 14581 plasmid unnamed2, complete sequence | 49083-49114 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.32|1060630|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1060630-1060661 | 32 | NZ_CP049914 | Vibrio sp. HDW18 plasmid p_unnamed1, complete sequence | 258265-258296 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.38|1060990|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1060990-1061021 | 32 | MN693076 | Marine virus AFVG_25M561, complete genome | 24808-24839 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.38|1060990|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1060990-1061021 | 32 | MN855784 | Bacteriophage sp. isolate 47, complete genome | 4394-4425 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.40|1061110|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1061110-1061141 | 32 | NZ_CP015355 | Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p109822, complete sequence | 2316-2347 | 8 | 0.75 |
NZ_LN554847_1 | 1.2|1058826|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1058826-1058857 | 32 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 425481-425512 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.6|1059066|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059066-1059097 | 32 | NZ_CP011038 | Pseudoalteromonas nigrifaciens strain KMM 661 plasmid unnamed, complete sequence | 41306-41337 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.6|1059066|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059066-1059097 | 32 | MH617672 | Microviridae sp. isolate ctbe519, complete genome | 3673-3704 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | AP014939 | Citrobacter freundii plasmid pKHM-1 DNA, complete sequence, strain: KHM 243 | 150309-150340 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | NZ_LN681228 | Xenorhabdus nematophila AN6/1 plasmid II, complete sequence | 129665-129696 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | NZ_AP018687 | Vibrio rumoiensis strain FERM P-14531 plasmid 1, complete sequence | 44042-44073 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | NZ_CP015630 | Borrelia turicatae strain BTE5EL plasmid lp159 | 146558-146589 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | NZ_CP015630 | Borrelia turicatae strain BTE5EL plasmid lp159 | 151095-151126 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | MT521992 | Rhodococcus phage NiceHouse, complete genome | 58053-58084 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | KU594606 | Cyanophage S-RIM32 isolate RW_108_0702, complete genome | 64936-64967 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.16|1059666|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059666-1059697 | 32 | NC_007603 | Enterobacteria phage RTP, complete genome | 13327-13358 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.16|1059666|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059666-1059697 | 32 | AM156909 | Bacteriophage RTP, complete genome | 13327-13358 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.19|1059846|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059846-1059877 | 32 | LR597641 | Escherichia phage mEp460_ev081 genome assembly, chromosome: 1 | 30692-30723 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.22|1060028|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060028-1060059 | 32 | CP046513 | Bacillus cereus strain JHU plasmid p2, complete sequence | 179562-179593 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.25|1060208|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060208-1060239 | 32 | NZ_CP031943 | Nostoc sphaeroides strain Kutzing En plasmid p2, complete sequence | 31556-31587 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.25|1060208|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060208-1060239 | 32 | MN693082 | Marine virus AFVG_25M510, complete genome | 26680-26711 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.25|1060208|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060208-1060239 | 32 | MN693228 | Marine virus AFVG_25M509, complete genome | 27303-27334 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.28|1060390|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060390-1060421 | 32 | NC_028940 | Pectobacterium bacteriophage PM2, complete genome | 72-103 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060510-1060541 | 32 | NZ_CP032534 | Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_6, complete sequence | 38163-38194 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060510-1060541 | 32 | MK448729 | Streptococcus phage Javan31, complete genome | 1543-1574 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060510-1060541 | 32 | MK448837 | Streptococcus phage Javan10, complete genome | 1543-1574 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060510-1060541 | 32 | MK448691 | Streptococcus phage Javan17, complete genome | 1543-1574 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060510-1060541 | 32 | MK448948 | Streptococcus phage Javan46, complete genome | 1543-1574 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060510-1060541 | 32 | MK448768 | Streptococcus phage Javan47, complete genome | 1543-1574 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.31|1060570|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060570-1060601 | 32 | NZ_AP018682 | Vibrio casei strain DSM 22364 plasmid 1, complete sequence | 15408-15439 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.31|1060570|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060570-1060601 | 32 | NC_019749 | Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.02, complete sequence | 89732-89763 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | NC_018516 | Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-1, complete sequence | 55194-55225 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | NZ_CP053970 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed2, complete sequence | 25652-25683 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | NZ_CP053979 | Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_795 plasmid unnamed3, complete sequence | 283466-283497 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | NZ_CP013277 | Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-2-350K, complete sequence | 152186-152217 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | NZ_CP039723 | Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p2, complete sequence | 269187-269218 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | NZ_CP009348 | Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 2, complete sequence | 152186-152217 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | NZ_CP009334 | Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 2, complete sequence | 338991-339022 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059426-1059457 | 32 | NZ_CP045024 | Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p2, complete sequence | 151694-151725 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | NZ_CP028161 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain 14B4 plasmid p14B4, complete sequence | 27530-27561 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | AP014289 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S24-C75, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 6092-6123 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | AP014107 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C35-MedDCM-OCT-S24-C120, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 11551-11582 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1059486-1059517 | 32 | AP014112 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C35-MedDCM-OCT-S44-C161, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 4314-4345 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.23|1060088|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1060088-1060119 | 32 | MN694453 | Marine virus AFVG_250M327, complete genome | 32998-33029 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554847_1 | 1.2|1058826|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT | 1058826-1058857 | 32 | MN693343 | Marine virus AFVG_25M435, complete genome | 17279-17310 | 11 | 0.656 |
1. spacer 1.27|1060329|33|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694517 (Marine virus AFVG_250M306, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
aagaaatcataacatcatcacaaacttgagtaa CRISPR spacer cagaaatcataacatcatcacgaacctgatcaa Protospacer ********************.***.*** .**
2. spacer 1.8|1059186|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693627 (Marine virus AFVG_250M592, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
atgtggtctagcttagctagtcttactatgga CRISPR spacer aggggtactagcttagctagtcttacaatgtc Protospacer * * * ******************* ***
3. spacer 1.19|1059846|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH384260 (Staphylococcus phage SA780ruMSSAST101, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
ctcaacttgcgttttctcatcaacaaaacaaa CRISPR spacer ttcagcttgtgttttctcatcaacaactcgta Protospacer .***.****.**************** *. *
4. spacer 1.22|1060028|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG209611 (Aphanizomenon phage vB_AphaS-CL131, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
gaaactttaattttttcttgcttggatgaact CRISPR spacer aaaactttaattgtttcttccttggacaactt Protospacer .*********** ****** ******..* .*
5. spacer 1.23|1060088|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KP007359 (Enterobacteria phage vB_EcoM_VR5, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tatttaacttcaataccgccaaac--gtcagttg CRISPR spacer tatataacttcaataccggcaaacagaatagt-- Protospacer *** ************** ***** . .***
6. spacer 1.6|1059066|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031118 (Providencia sp. WCHPHu000369 strain WCHPr000369 plasmid p1_000369, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tagaagatattgaaaccaatacacttaaacta CRISPR spacer cattagatagtgaaaccaatacatttaatcct Protospacer .* ***** *************.**** *.
7. spacer 1.6|1059066|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP025981 (Escherichia marmotae strain HT073016 plasmid pEM76, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tagaagatattgaaaccaatacacttaaacta CRISPR spacer taggagatattgtaaccaatacagatgcatca Protospacer ***.******** ********** *. *..*
8. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KX349297 (Cyanophage S-RIM44 isolate W2_10_0709, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gtataaattataaggaaagttttaaaaatgga Protospacer *****.*****.************ .*..*
9. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KX349293 (Cyanophage S-RIM44 isolate Np_20_0711, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gtataaattataaggaaagttttaaaaatgga Protospacer *****.*****.************ .*..*
10. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KX349296 (Cyanophage S-RIM44 isolate Sn_13_0910, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gtataaattataaggaaagttttaaagatgga Protospacer *****.*****.************ .*..*
11. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047734 (Cyanophage S-RIM44 isolate Np_42_0711, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gtataaattataaggaaagttttaaagatgga Protospacer *****.*****.************ .*..*
12. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU594607 (Cyanophage S-RIM44 isolate W2_07_0710, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gtataaattataaggaaagttttaaaaatgga Protospacer *****.*****.************ .*..*
13. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KX349291 (Cyanophage S-RIM44 isolate ES_42_0910, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gtataaattataaggaaagttttaaaaatgga Protospacer *****.*****.************ .*..*
14. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015288 (Prochlorococcus phage Syn1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gtataaattataaggaaagttttaaaaatgga Protospacer *****.*****.************ .*..*
15. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KX349295 (Cyanophage S-RIM44 isolate Sn_08_0709, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gtataaattataaggaaagttttaaaaatgga Protospacer *****.*****.************ .*..*
16. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KX349292 (Cyanophage S-RIM44 isolate Np_05_0604, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gtataaattataaggaaagttttaaaaatgga Protospacer *****.*****.************ .*..*
17. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
---cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gttttttaa---ataaaaaaagttttaaatttaaa Protospacer . *** *****.************ ****
18. spacer 1.14|1059546|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019522 (Pectobacterium phage ZF40, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
acctagccgctcgaatgctaatgactcccaca CRISPR spacer gccttttttctcgaatgctgatgacgcccaca Protospacer .*** .. **********.***** ******
19. spacer 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009819 (Streptococcus phage P9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aatagattgaataattcgtgaatcatcaaatg CRISPR spacer tgttttttcaataattcgtgaaccatcaaatt Protospacer .* ** *************.********
20. spacer 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009919 (Bacillus megaterium NBRC 15308 = ATCC 14581 plasmid pBMV_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aatagattgaataattcgtgaatcatcaaatg CRISPR spacer agtgatgggaataatacgtgaatcatctaatg Protospacer *.*.. ******* *********** ****
21. spacer 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035096 (Bacillus megaterium NBRC 15308 = ATCC 14581 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aatagattgaataattcgtgaatcatcaaatg CRISPR spacer agtgatgggaataatacgtgaatcatctaatg Protospacer *.*.. ******* *********** ****
22. spacer 1.32|1060630|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP049914 (Vibrio sp. HDW18 plasmid p_unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ggttctgtggctttgggtattcctcaagctat CRISPR spacer gctccggtggctttggggattgctcaagccgc Protospacer * *.* *********** *** *******...
23. spacer 1.38|1060990|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN693076 (Marine virus AFVG_25M561, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttgttcctattgacggttatattgctcctgat CRISPR spacer actttgatgttgatggttacattgctcctgat Protospacer . ** *.****.*****.************
24. spacer 1.38|1060990|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN855784 (Bacteriophage sp. isolate 47, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttgttcctattgacggttatattgct---cctgat CRISPR spacer ccattcctattgtcggttacattgctggacct--- Protospacer ...********* ******.****** ***
25. spacer 1.40|1061110|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015355 (Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p109822, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttgataagggttttttaactaaacgttctggg CRISPR spacer tttataagggttttttcactaaatttcttgct Protospacer ** ************* ******. *..**
26. spacer 1.2|1058826|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttgtgtttatatttacaccatcaataacgaaa CRISPR spacer tcttgtttatctttacaccaccaataagtttc Protospacer *. ******* *********.******
27. spacer 1.6|1059066|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011038 (Pseudoalteromonas nigrifaciens strain KMM 661 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tagaagatattgaaaccaatacacttaaacta CRISPR spacer acctaagtattgaaaacaatacatttaaactt Protospacer *..******** *******.*******
28. spacer 1.6|1059066|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH617672 (Microviridae sp. isolate ctbe519, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tagaagatattgaaaccaatacacttaaacta CRISPR spacer tagaagatataaaaaccaatacaaacggcata Protospacer ********** .*********** ... **
29. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014939 (Citrobacter freundii plasmid pKHM-1 DNA, complete sequence, strain: KHM 243) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer ctcttttaacgctttattttgctcgtgagctg Protospacer ********** ***** ****** * ...*
30. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LN681228 (Xenorhabdus nematophila AN6/1 plasmid II, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer ctcttttaacgctttattttgctcgtgagctg Protospacer ********** ***** ****** * ...*
31. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP018687 (Vibrio rumoiensis strain FERM P-14531 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer ctcttttaacgctttattttgctcgtgagctg Protospacer ********** ***** ****** * ...*
32. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015630 (Borrelia turicatae strain BTE5EL plasmid lp159) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer atctaagctataaagaaagttataaaactcat Protospacer ***.************** **** * *
33. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015630 (Borrelia turicatae strain BTE5EL plasmid lp159) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer acctaaactataaagtaagttataaaattcat Protospacer ************ ***** **** * *
34. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT521992 (Rhodococcus phage NiceHouse, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer taggatactaaacagaaagttttaaatgtcca Protospacer ... * **** * **************** *
35. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU594606 (Cyanophage S-RIM32 isolate RW_108_0702, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer gtgtaaattatagagaaagttttaaaaatgga Protospacer .****.****.************* .*..*
36. spacer 1.16|1059666|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007603 (Enterobacteria phage RTP, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
catcataaggctgtcctggagtttgagacggt CRISPR spacer ggtggtaaggctgccctggcgtttgagaagag Protospacer .* .********.***** ******** *.
37. spacer 1.16|1059666|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to AM156909 (Bacteriophage RTP, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
catcataaggctgtcctggagtttgagacggt CRISPR spacer ggtggtaaggctgccctggcgtttgagaagag Protospacer .* .********.***** ******** *.
38. spacer 1.19|1059846|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to LR597641 (Escherichia phage mEp460_ev081 genome assembly, chromosome: 1) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctcaacttgcgttttctcatcaacaaaacaaa CRISPR spacer caatacttgagttttctcatcaaaaaaccttg Protospacer * ***** ************* *** * .
39. spacer 1.22|1060028|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP046513 (Bacillus cereus strain JHU plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
gaaactttaattttttcttgcttggatgaact CRISPR spacer aatcctttaattttttattacttggattcttt Protospacer .* ************ **.******* .*
40. spacer 1.25|1060208|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031943 (Nostoc sphaeroides strain Kutzing En plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aaatgaataaagaacttttaagcgtaattaaa CRISPR spacer tcaccgaacaagaatttttgagcgtaattaaa Protospacer *. .* *****.****.************
41. spacer 1.25|1060208|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693082 (Marine virus AFVG_25M510, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aaatgaataaagaacttttaagcgtaattaaa CRISPR spacer aaatgactgaagaacttttaagccgagaagat Protospacer ****** *.************** *. .*
42. spacer 1.25|1060208|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693228 (Marine virus AFVG_25M509, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aaatgaataaagaacttttaagcgtaattaaa CRISPR spacer aaatgactgaagaacttttaagccgagaagat Protospacer ****** *.************** *. .*
43. spacer 1.28|1060390|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028940 (Pectobacterium bacteriophage PM2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ttgcaaatgaaaatttcgtagtggtttcgtcc CRISPR spacer ttgaaaatgaaaatatcgtagtgtctaaatat Protospacer *** ********** ******** .* .* .
44. spacer 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032534 (Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aatagattgaataattcgtgaatcatcaaatg CRISPR spacer agagatgggaataatacgtgaatcatctaatg Protospacer *. .. ******* *********** ****
45. spacer 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448729 (Streptococcus phage Javan31, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aatagattgaataattcgtgaatcatcaaatg CRISPR spacer tgttttttcaataattcgtgaaccatcaaact Protospacer .* ** *************.*******.
46. spacer 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448837 (Streptococcus phage Javan10, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aatagattgaataattcgtgaatcatcaaatg CRISPR spacer tgttttttcaataattcgtgaaccatcaaact Protospacer .* ** *************.*******.
47. spacer 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448691 (Streptococcus phage Javan17, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aatagattgaataattcgtgaatcatcaaatg CRISPR spacer tgttttttcaataattcgtgaaccatcaaact Protospacer .* ** *************.*******.
48. spacer 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448948 (Streptococcus phage Javan46, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aatagattgaataattcgtgaatcatcaaatg CRISPR spacer tgttttttcaataattcgtgaaccatcaaact Protospacer .* ** *************.*******.
49. spacer 1.30|1060510|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448768 (Streptococcus phage Javan47, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aatagattgaataattcgtgaatcatcaaatg CRISPR spacer tgttttttcaataattcgtgaaccatcaaact Protospacer .* ** *************.*******.
50. spacer 1.31|1060570|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP018682 (Vibrio casei strain DSM 22364 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atatagagggatcattaactggaatagaaaac CRISPR spacer ggcgattgtgatcattaactcgaataaaaaac Protospacer . * * *********** *****.*****
51. spacer 1.31|1060570|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019749 (Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.02, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
atatagagggatcattaactggaatagaaaac CRISPR spacer atatagagggatcaaaaactggatattcactc Protospacer ************** ******* * *
52. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018516 (Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid pBTHD789-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer cctcggcaactcttttgtttgctgctttatca Protospacer *... .******** *********** **.
53. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053970 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_796 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer cctcggcaactcttttgtttgctgctttatca Protospacer *... .******** *********** **.
54. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053979 (Bacillus thuringiensis strain FDAARGOS_795 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer cctcggcaactcttttgtttgctgctttatca Protospacer *... .******** *********** **.
55. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013277 (Bacillus thuringiensis serovar israelensis strain AM65-52 plasmid pAM65-52-2-350K, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer cctcggcaactcttttgtttgctgctttatca Protospacer *... .******** *********** **.
56. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039723 (Bacillus thuringiensis strain BT-59 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer cctcggcaactcttttgtttgctgctttatca Protospacer *... .******** *********** **.
57. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009348 (Bacillus thuringiensis HD1002 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer cctcggcaactcttttgtttgctgctttatca Protospacer *... .******** *********** **.
58. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009334 (Bacillus thuringiensis strain HD1011 plasmid 2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer cctcggcaactcttttgtttgctgctttatca Protospacer *... .******** *********** **.
59. spacer 1.12|1059426|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045024 (Bacillus thuringiensis strain JW-1 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
ctcttttaactctttagtttgctgcttgattt CRISPR spacer cctcggcaactcttttgtttgctgctttatca Protospacer *... .******** *********** **.
60. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP028161 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain 14B4 plasmid p14B4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer agataaaagataaagaaagttttagttacttg Protospacer ****** ***************. *.. .
61. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014289 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S24-C75, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer tctgatgttataaagaaatttttaaatataat Protospacer . * ..********** ********.***
62. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014107 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C35-MedDCM-OCT-S24-C120, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer aataaaattataaagaaagttgtaaattaact Protospacer . ***.************* ***** *
63. spacer 1.13|1059486|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014112 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C35-MedDCM-OCT-S44-C161, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
cgataaactataaagaaagttttaaatgtaaa CRISPR spacer aataaaattataaagaaagttgtaaattaact Protospacer . ***.************* ***** *
64. spacer 1.23|1060088|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694453 (Marine virus AFVG_250M327, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tatttaacttcaataccgccaaacgtcagttg CRISPR spacer tatttaactacaatacccccaaacaagcaaga Protospacer ********* ******* ******. . .
65. spacer 1.2|1058826|32|NZ_LN554847|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693343 (Marine virus AFVG_25M435, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
ttgtgtttatatttacaccatcaataacgaaa CRISPR spacer agccatttatatttacattatcaataacagcc Protospacer ..************..*********..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
580371 : 589355
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN554847|580371:589355|DBSCAN-SWA ATCACTCTTTCCCCATCACCATAGCCACACGACCAACCACCTTAATATCATCTTCTTCAACATTGATAGTTGAGCCATTAAAACTGATCGCTAACTTCTTACCCGGTAGACGTTGTAGTTCGTTGATCGAGAACGAGCCATCGATATCAATTAAGTATTTACCTTGGTTTGCTTTTGTTTCATTTTTATCTACGAAGTAAGAAGTTTCATCATGCTCTAAAAGGATTAGATCATCGCTCCCAATTTTCTCTATGAATGCTTTATCAAATGAAAGCGTTCGTAATTCAACTAATTCACTTCTTTGAATGGTAAATAATGGTATTGATAAACTCTCTTTTGAAGTTTGTTCTTCTTTTGAGGGAAATGGTTCGCCTTTACCCAGAGCAAGGTATTCAATTGGCACACCTGTAGCCAAATGTAGGCGAATAATGACTTCGAATGGAGTTAATCCACGTTGATGCCATGTTGATATCGTCCCTTTTGGGATTCCTAAAATAGAACATAGAGATAAAAAATCACGTGATTTTGTGATCTCTTTCATCCTTTCTGTAACTTCTCTACCTGTAATGTACTCGAAAGGCAGAATTTGTTCTTGATATTCACTCATAAGAAGTCTATATTCACTCAAAAGGTGGTGAGGGGCAACTCAGCACATTATTAAACATTCAGTAACCCAAAAGGATACCACTATGAATAACCCTTTGTCATTTCAAGTAGTTATTCCTGTGCCATTTATGACGTATAAGGAGTATTCCAAGTTTTCTGGAATCACTATTCGTACTCTTAAAAGCTGGCAACAGCAGGGAAAACTTATCATTAAGAAAAAAGATAAGCCTCGTGAAACCCCATTAGTAAACGTAATTGCAATGCAAGAGCTTGCTACTCGTGAAGCTCTTAGCTACTTGGGTTAACGCTATGGCTAACCAATCAAACCCAAATGAAACAACAACATTGGAAATCATTGTTGCAATAGTAGTTCTGGTTTCCCTTGGTTTTGTCATTTGAGTATCGGACAGATAGAGGATTAGCTCAATGTGCGATTTACGTGAGCCTAAACAAAATGCTTTTGACAATGCATGTTACGCATTTGCAGATTCAGAAAACATGGAACAAGTAGCAAAGCAGTGTGGAATAAACCCAACAATGCTACGTAACAAGTTAAACCCTGAACAACCGCATAAGTTAACAGTAGGGGATTTAACCGCGATTACGGAAGCAAGCGGCAATTACTGCATCATTAATAGTGTTTTGCTTAGTCTCAATATGGTTGGCGCAAAAGTCGATCCAAATGCAAACCAAGAAACCTTAATTAAACGAGCTTTAGAAAATAGTGTTCATGCCGGTGATTTATCTCGCCTTGCATTAGAGAACGGTGACGAAATTCGTTTACCACGTTCTAAGCGTAATGAGCTGTTAGACAAAGCACATAAAAGCGTTAGTAACTTGGTGTTGCTAATGAATGATCTTGAAAACAAAACATCCGGCTTATCACCGTTTTTATCTATGAGTTTAGATTTCGTTGTAAACGGCGCACCAATACCGGGTTTATCGTGAGGAACAAATCATGTCTCAATTAGTACAAGTATCAAATCCTGTTCCATCAGCACAAGAAAGCATTAATACGTGTAAGGCTCTTTTCTCTACAGGGCATAAACGAAATCAAATCAAAATAGCGTTTAACTCTTTGACTGTTCGTGCTCGTGGAATGATTTGTATTGCTGGCGGATTACCCGTTGCAGATTGCCATCGTAGTTTTGAAGACTTTAACGATATTGAATTACAAAAGATTCGTCGTGGCTTGCTTGAATTGAAAGGCATCACCAAGCGCTTTGATACCAAAGTCGGTGATGTAAGCAAGTTAAAACCAAGCCATTTCCAAGCCTAATTAATACCTAGCCAACCTTTGCCCCTGTAACAGGGGGCTTTTTTTGTACCTAAATTTTGTTTATTACACAGGAATAATGAAATGAATGACTTAAAAACAGCAGAGCAGTTTTATCAAGCATCACTGGAAAACCTCAATAAAGCGAATGAACTGCATGAAAAAATGGAAGCAACAGAAAGAAAAACGGTAGCGTTATTCTCTCGTTTTATTGATGGAACAAAATCTATTTCTGGCGATGTTGAACTTGTAGCGAAAGATAATCTTAAAGCTATCCAACAGCGCGATGTATTGGCAGTGATTAATTCAATTACTGCTATGACGTTAGATATGCCAAAACCGTACCTTGCTTATTGTTCTGTGAGTTCAGCAGCAACATCATCGTTCTATCTTGTTGTTTGGGTGCCGAGTGATAAAAAGGGTACACCCGCGCTGTTGGAGGTAAGTCTAACGCTTGATGAATCATCAGTACTTGAAGATGCTCTTTCGTTAGAAAGCCAGTTGGCTGAATTCATCATTAAAGCAAAAGACAACGCAGAGGTAACGGCATGAGTAAAGATAAATTCTTAGCAAAAATGGCGATTGCTTATATGCAAAATCATGATCATGCACCTACAGAGTACCAGTTAAATGATTGGTCTGAGTTGTATGTTGTTCTTGAAAGAAAGGGGAACTAATCATGCTTCGTTTCTTAGCGGTAATCTTAAACAGTGGCGGTGGTGTTGTTCGTGATACCAAGTCGAATGAAATTCAAATGAAAGAGCTTGGCGAGTTTGAATCAAAAGAACTTGCTATTGATAACGCATGTGAAAGCTTAAAGTGTGAACATGTTACTAAGGGCATTATTGTTAGAGGCAATAACACTGGTGGCTATATGGTTTGTGATACACAGGAGTTTGCAGAGTTATGAATATGATTGAATGTACTCAAAAAGTAGAAATGTTATTGGATGAAGTGCTAAAAGCACCAAAGACACGTGAAGAGATAGAAGCGTTGTTTCAAAAGTTAAAGAAAGAATTATGGAGTGAAAAAGTTATGCCTACAGAAGTACATATCGCAATTCAAAAAGCGGCAGGTAAAGCAATTAATGTAGGCATGAATAATGTTATTTATAGAGATCTTAAGGTTTTTCTTTCAACAGAAAAACCGAATCAAACCCTTTTACTGGGCCGCTCTCTTTGAGTAAGTCAACTAAACCAAAAGATCCAAATTCTTGGGTTAGTTTAACTAGTTGGCCTAATCCACCAACGGTGATGGTTCTGTATTCTTCTTTGCCAGCAGCACCAATAATGGCTGCTAGATACTCAGGGCCATCGGTTTCACATTCATTAGCCTTAAGCCATTCTTCAATTTTGTTGTCGTTTGGTAGTTTGTCTTCTGGATTAACTAATTTTGTTTTCATATTTACCAACTGTAATTAAATTATGAAGTTATCTTTTACCACAGAAGAACAACGTGCAGCCACTAAAGCTTGTTTAAGCTTTGGTGGTTTGTGCGTATTCCCTCAAAAGCCAAAAGAGATCCTAACGCTTTTACCTGATACATCCGTCAAAAACAAAGAACCTGATGATATGTCGATTGTTGAGCGTAAGCTTTATCTAGTTGATAGAGTAAATCACGAATGGCGCCGACAGTTCTTTTCTGGCTTACCTAACTATTTAGCAAGGTACTTTGCTGATCGCTATATCTCAATTTTCAAAAAAGAGGGTCGTGCAAAAGCGGCTAAGTTCTTAACAGAAAAGATGGGTGATGAACTGCAGCGCCGTGTAAGTGTTGTGCTTTATCGTTACCGCCACCTACCAACATACAACAAGATTAAATTGATGAGTGAAGACACTGATCAATCTGATTTTGATGAAGTGCCAAATATTGGCCAGCTTGAATTTAATCTTGAAGCAGTTAAAGCGAAAAAACCAAAGTCTCGTTTACTTGCAGAGCTTGAGTTGGATGAGATTAAAGATATGGCGTTTAAAATATCTAAGATCATACAAGACCGTTTCACTCAATTAAGTATTGAGCATAACGGTGAAACAGATAAAGAAATTGATGCCGGTATTATTAAAGTATTTGAGGGTTTAGCTACATTAACTTATAGCTTTGGCATTGTTGCGCCTCATAAGAAAAAGAAAGTTCTTACTGCAGAAGATGTCTACAGCGATATTTTCAGAATGCAGGATGAAAAATGGTGGCGTGGCCGTTTAGTGAAAGCGCGTAAAATCATGCGTGAACATTTGGCCATAGCTATGGGGCAGGTATCAAAACGTGCCTCGGCTTATTGCTCTTATGATTGTGTTCGTGAACACCAAGAACAGCAAAAGCGCAATTGGGATGCAATTCAAAACAAAATCCTCATCGATGAAGAAACCCAAGAAGAATGTGAATTAAAAGACATGGTTTTAAAAAGCGTGTCGAATCCGGCTATTCGTCGTCATGAACTTATGACAAGAACTAGAGGCTGTGAAAATATCGCAGATGAAATGGGGCTTTGTGGTTTGTTCTTAACGTTAACGACTCCGGGTAAATATCATAACAGTTACCAACGTGGCGGATTTATTCCTCATTGGAGTGGTGCAAGTCCTCGTGATGCTCAAATCTACTTAAATGGAGTTTGGTCACGTATTCGCGCTAAGTTAGGCCGTGATGAATTTCGTTGGTTTGGGATTCGTGTTGCTGAACCGCATCATGATGGAACACCACACTGGCATTTGCTTCTATGGTGTAAGCCTGAAGATAAAGCTGAGATTATTCGCATCTTCATCGATTACGCGACGAAAGAAGACAAACAAGAATTAATGAAAAGCGGAGAGTTTGATCACTCTGCGCGTTGTGATGTAAAAGACATAGACCCTGAACAGGGCTCTGCTACTGGCTACATTGCCAAATACATTTCTAAAAATATTGATGGCTATGCGATGGATGATGCGGTTTCTGATGAAACTGATAAGCCAATAAAAGACATGGCCAAGAATGTCAGTGCTTGGAAAAGCCGTTGGAACATTCGTCAATTTCAATTTATTGGTGGCGCACCGGTTACTACTTACCGTGAATTACGCCGCTTGGCCAATCTTGATAAAGCTTCTTATATGGATTTCTTACATTCTCAAGAACGTTCACAGTTATTAACTGTTTATCGCTCGATGGTGTTTACCCATGTAGGACCACAACAACCAGATGCAGCATTTACTAAACCTGACTTAATGAAACGTTTAGGTGATGCTTATCAACCAACGGTTACCCATCCAAACGGAAGTGTGATTAAAACCATGCGTTCTGCTGATGAAGGAAATTGGCAAGGTTACATCATGGGGCAGGGTGGCCCATTCGTTAAGCGTGCCGCTTTGATTGTTCGTAATGCTTATGAAGAGCTACCGTTTTCTTCTCGTTACTCTGAAACCATCCGTAAGGTGGAAGGGATACTTGCAGCTGGTGAGTTTATCAAAACTCGCGTAAGAACATGGACGATTCAAAACAAGGTTAAGAAATTCGATGAACTTGAAGCGGAGGCTCTTGCTCTTGATAGCAGCGCAGCTGCTCCTTGGAGTTCTGTCAATAACTGTACGGACGATCCCGAAAAGGATCAAAAAGGACAGGTGAGCGATAAGCTATCTAAAATACTAACGCCTTTAGGTAAAAAGCCTGAATCCCTTGATGAACATGCACTTAACGCATTTATGAAAGGCAGCTCTTTGAACCTCAATGATGGTCGTAAGGTGAAAATACGTTCAGGTTATGTGGATGAAGAAGGGAACGTTCGCCCACCAGAACTGATGGAAATAGAAAAAGAGCCGGAAGATTTACGATGGCTTGATTTTAAAGGTTGGCCAGAGCCACCAAACGAGTCAAAAACTGACGAATACCAACAACCAAACCTCTCAATCTTCCCCGAATATGAATTTGGTGATGATGAGTGGCCGTTAATCTAAGGAATATGTATGTCTGCAATTGATCCTGTAAATGAAAAGAAAGTATTTGAAGCAATGATCATAATGAAAGGCCATTTAGAAGAAATAGGCTTGAACGAACATGAAAGAATAGTTCTTCTGAAGAATTTAGCGAGCCATGAAGAAACGACATTAGACCGTAAAAATGCAGCAACAGCTATGTTTGCGGCTTTACGTAAAATTGGGGTGTAAATCACACTGTAGAAACCACTGTTTATTTATACAGTGAAATACTGTATTCTTATACAGGTCAAATGGTTAAGGCGTGGCAATGCTATGAATAATAAAGAATTATACCTAGAAGCAATGGAATTTATTTTAGAGGGTACTGCGCTCAGTACTCATGGTGAAAGCAAAAGTGGCATTGCTATGTATCTAGTAGGATTAGTCGTTGCTGACCAAAAAGAAGAGTTGAAGCCTGAAAAGATGGACGCTCTACGGATGATTATCCAAATGGCTGATGAAGCTGAATCACAAAAAATGGCCCTCTAGTGTGAGGGCTTCTTTTTGTTTATAAGATAGAAAGTTCTAACTGTAATTCTTTGCGCTGTTCTGGCGCTAAACCTCTCACCAATTCAATAGCCATTTGAGAAGTTGTTTTTGCTGAAGGGCTTAAAGTATGGCTGAAACTCAAATTCATCACATAAGTATGGCCACACTCGGGGTCACTACAACTGCAATATAAGTCTGAATAACTCTCTGAAATTCGATTGGTCTTTTGAATGCGGCTTTTGTTGCCGCATTCAGGGCAGAATACTCGCATAAAAACATCCATTTGATTCACTAACTGACATTTTAATTATAAATCAAATTACTGGTTTTTTATACAGTGACCAACCTATTGATGATTTACTTAATTATCAATAGGTTAATTAAAATGATATAGATCACAGTATTGTTATGAGGTGAGTTATTTAATAAGGATATATGAGAATCTCGTTTAAAAATATATTTAGTTCAAGGAATGAGGTTTGATAATGCAAGGAACAATTATAAAGCAGATAGATGATATAACTGTGTTAGTAAGCTATAAAAAAAATGATAAACAAATGGAAAGGGTGATGAGATTATCTAATATAAATTGTCTTAGAAATCAGGATCTAAAAGGAGCTAAGGTTTCTTTTTCGTTAGATAATGTAGATGCGTATGGCCGACTTTTGTTTTAATTGATATTGGTGATTTATGTGTAACAGCAACAGCAACAGCAATCAGTACATAACAATTATTATTAGTGTGCTGCTTTCTGGCTTAGTTTCTTGTGGGACTGCTTTTTTTACAACTTCATACCAAACAGAACAAATAATTAAGCAAAAGACATATGAAAATAAAATATCTGCATACAATGAGTTTTTATCGAAAATTAATAATGAGAAGTATTCAAAAATAAACTCTCTTTTTTAATTAATAAGATGTTAGATAATTTAACTGTGGATGAAAGCATACAAAAAATAGAAGATTCTATTTTTCTTCTCTCTAAAGAACAGGAGTTTTTATATATATTAGATAACCACCTTAAAATACTTAGTTTATATGGCAGTGAAAAGGTTAAAATTTATTGTAGCGATATACTTTCTGTATATTTAGATAATGAATACAGCGTAAACTGGGATTATCATTCAGAATTCGTTAGAAATACAAGGGATGACTGGGTAAATAATGATGGGGTTATTATTGGATGGGAACGGAAAGTTACCGATGAGACTAGAGCAAAGTTTGCTATTATTTCAAGGCAGTATGCAGAGTTGATTAATCAACTTAGTATAGAGCTTAAAGAAGGTATCTAGAAAACTAGTAAATAAATTTAAACTTATATTTAAAAGGGGAATAAAATGACAAAGGGAAATTTAACTTCAAAAAATCATAAAGAAATGGAAAGTTTTTTATTTATGGTTTTAGAAGGTTATAAAAATAGTGATATATCTAAATCTGAAGCTATGAATGGTTTAGCTCATGTAATGGCTGCATTAGATCTAAGGAATACACAAGAGGCTGTTTCTTGGTTTAACCAAAATGACTTACAGTTTTTTAAAGACCCAACGAAAAAAAATTCATAGGTAGTAATTTTAGAGTTATATTTTTACTATTACAATAAACAACTCTTTCCCACGTAAATCGCACTCCTCCTACCCACCTGCGGCCTAAAACGAACACTTTTTTTTGCAGTTTTAAGTTCTTCATTTTTGGGGCTGGTGAGTAGGGTGGTAATTAGCGCGAGAGCCCTTATCTATTGGGCTCTCAGCGTATGTGAAGGGCAAAGAAATACTTAATTTTGTGGGATTTCAAAACTGAAAAATTGAAATTATTTTCACGTTATTTCAGTAATAAAGATCTCTTAATGATCTGTTTGGTTTTTCTAACTCTTTGAAAGTATGTAGATTGTTGTGTTTTACGTCATGATTTAAAAGATCTTGTGTGATTTATAAATGATCTCGTAATCAGTTCTAAAGCGTAAGCGCTTAACTAACCACACATATCAATATTAAGCATGCTTTGCCATAGTATCTTTTTAATCGGAGGTATTATGAATCAACAAAGTAAGCGCGACCATTGGGCTAATATTTTAGATCAACAGAAAGAGAGTAACCTATCTATCAAGCAATTTTGTATTGATAATGAAATAAGCTACCAAACCCTTTATTACTGGTCAAAGAAGCTCAGCGAGTTAGAAGTCACAACAAAAATTCACCCCATTATCGTGACAGAGCCAACACAAGAGCCGTCAAATATTGTGGTGCTGACATGTAATAATGGCCTTCGTGCCGAGTTACCAGCAAACCTTAATTCCAAACAAATAAAACATTGGGTTGATGCATTGCAATGATACAGTCAGGAAAGGTTTACCTCGTCGTTGGCGTCACCGACATGAGAAAATCCATTGATGGCTTATCACTCATTGTCGCCGAAACGCTGGAAATGGACCCATTCAGTGAAGCCTGGTTTATTTTTTGTAACCGCAATCGAGATAAACTCAAGATCTTGTTTTGGGATACCAATGGTTTTTGGCTTTATTATCGTCGCTTAGAAAAAGGGACGTTCAAATGGCCAACTCCCAATATTGATGGTGCGCTCCACATTAGCAGACAACAACTCAACTGGCTTTTATCTGGACTGACTTTAGATCATGCTAAAGCTCATAAGCCGTTATTTAACCTAGAAGTGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN554847|580371:589355|586704_586956_-|WP_045103789.1|DBSCAN-SWA MRVFCPECGNKSRIQKTNRISESYSDLYCSCSDPECGHTYVMNLSFSHTLSPSAKTTSQMAIELVRGLAPEQRKELQLELSIL >NZ_LN554847|580371:589355|581934_582255_+|WP_045103782.1|DBSCAN-SWA MSQLVQVSNPVPSAQESINTCKALFSTGHKRNQIKIAFNSLTVRARGMICIAGGLPVADCHRSFEDFNDIELQKIRRGLLELKGITKRFDTKVGDVSKLKPSHFQA >NZ_LN554847|580371:589355|582800_582929_+|WP_099047782.1|DBSCAN-SWA MSKDKFLAKMAIAYMQNHDHAPTEYQLNDWSELYVVLERKGN >NZ_LN554847|580371:589355|583372_583654_-|WP_045103786.1|DBSCAN-SWA MKTKLVNPEDKLPNDNKIEEWLKANECETDGPEYLAAIIGAAGKEEYRTITVGGLGQLVKLTQEFGSFGLVDLLKESGPVKGFDSVFLLKEKP >NZ_LN554847|580371:589355|580371_580977_-|WP_045103779.1|DBSCAN-SWA MSEYQEQILPFEYITGREVTERMKEITKSRDFLSLCSILGIPKGTISTWHQRGLTPFEVIIRLHLATGVPIEYLALGKGEPFPSKEEQTSKESLSIPLFTIQRSELVELRTLSFDKAFIEKIGSDDLILLEHDETSYFVDKNETKANQGKYLIDIDGSFSINELQRLPGKKLAISFNGSTINVEEDDIKVVGRVAMVMGKE >NZ_LN554847|580371:589355|582336_582804_+|WP_045103783.1|DBSCAN-SWA MNDLKTAEQFYQASLENLNKANELHEKMEATERKTVALFSRFIDGTKSISGDVELVAKDNLKAIQQRDVLAVINSITAMTLDMPKPYLAYCSVSSAATSSFYLVVWVPSDKKGTPALLEVSLTLDESSVLEDALSLESQLAEFIIKAKDNAEVTA >NZ_LN554847|580371:589355|581059_581281_+|WP_045103780.1|DBSCAN-SWA MNNPLSFQVVIPVPFMTYKEYSKFSGITIRTLKSWQQQGKLIIKKKDKPRETPLVNVIAMQELATREALSYLG >NZ_LN554847|580371:589355|586469_586685_+|WP_045103788.1|DBSCAN-SWA MNNKELYLEAMEFILEGTALSTHGESKSGIAMYLVGLVVADQKEELKPEKMDALRMIIQMADEAESQKMAL >NZ_LN554847|580371:589355|583673_586175_+|WP_052662881.1|DBSCAN-SWA MMKLSFTTEEQRAATKACLSFGGLCVFPQKPKEILTLLPDTSVKNKEPDDMSIVERKLYLVDRVNHEWRRQFFSGLPNYLARYFADRYISIFKKEGRAKAAKFLTEKMGDELQRRVSVVLYRYRHLPTYNKIKLMSEDTDQSDFDEVPNIGQLEFNLEAVKAKKPKSRLLAELELDEIKDMAFKISKIIQDRFTQLSIEHNGETDKEIDAGIIKVFEGLATLTYSFGIVAPHKKKKVLTAEDVYSDIFRMQDEKWWRGRLVKARKIMREHLAIAMGQVSKRASAYCSYDCVREHQEQQKRNWDAIQNKILIDEETQEECELKDMVLKSVSNPAIRRHELMTRTRGCENIADEMGLCGLFLTLTTPGKYHNSYQRGGFIPHWSGASPRDAQIYLNGVWSRIRAKLGRDEFRWFGIRVAEPHHDGTPHWHLLLWCKPEDKAEIIRIFIDYATKEDKQELMKSGEFDHSARCDVKDIDPEQGSATGYIAKYISKNIDGYAMDDAVSDETDKPIKDMAKNVSAWKSRWNIRQFQFIGGAPVTTYRELRRLANLDKASYMDFLHSQERSQLLTVYRSMVFTHVGPQQPDAAFTKPDLMKRLGDAYQPTVTHPNGSVIKTMRSADEGNWQGYIMGQGGPFVKRAALIVRNAYEELPFSSRYSETIRKVEGILAAGEFIKTRVRTWTIQNKVKKFDELEAEALALDSSAAAPWSSVNNCTDDPEKDQKGQVSDKLSKILTPLGKKPESLDEHALNAFMKGSSLNLNDGRKVKIRSGYVDEEGNVRPPELMEIEKEPEDLRWLDFKGWPEPPNESKTDEYQQPNLSIFPEYEFGDDEWPLI >NZ_LN554847|580371:589355|582931_583162_+|WP_045103784.1|DBSCAN-SWA MLRFLAVILNSGGGVVRDTKSNEIQMKELGEFESKELAIDNACESLKCEHVTKGIIVRGNNTGGYMVCDTQEFAEL >NZ_LN554847|580371:589355|588022_588247_+|WP_045103792.1|DBSCAN-SWA MTKGNLTSKNHKEMESFLFMVLEGYKNSDISKSEAMNGLAHVMAALDLRNTQEAVSWFNQNDLQFFKDPTKKNS >NZ_LN554847|580371:589355|583158_583434_+|WP_045103785.1|DBSCAN-SWA MNMIECTQKVEMLLDEVLKAPKTREEIEALFQKLKKELWSEKVMPTEVHIAIQKAAGKAINVGMNNVIYRDLKVFLSTEKPNQTLLLGRSL >NZ_LN554847|580371:589355|581402_581924_+|WP_045103781.1|DBSCAN-SWA MCDLREPKQNAFDNACYAFADSENMEQVAKQCGINPTMLRNKLNPEQPHKLTVGDLTAITEASGNYCIINSVLLSLNMVGAKVDPNANQETLIKRALENSVHAGDLSRLALENGDEIRLPRSKRNELLDKAHKSVSNLVLLMNDLENKTSGLSPFLSMSLDFVVNGAPIPGLS >NZ_LN554847|580371:589355|589010_589355_+|WP_045101017.1|DBSCAN-SWA MIQSGKVYLVVGVTDMRKSIDGLSLIVAETLEMDPFSEAWFIFCNRNRDKLKILFWDTNGFWLYYRRLEKGTFKWPTPNIDGALHISRQQLNWLLSGLTLDHAKAHKPLFNLEV >NZ_LN554847|580371:589355|587170_587359_+|WP_045103790.1|DBSCAN-SWA MQGTIIKQIDDITVLVSYKKNDKQMERVMRLSNINCLRNQDLKGAKVSFSLDNVDAYGRLLF >NZ_LN554847|580371:589355|587602_587977_+|WP_045103791.1|DBSCAN-SWA MLDNLTVDESIQKIEDSIFLLSKEQEFLYILDNHLKILSLYGSEKVKIYCSDILSVYLDNEYSVNWDYHSEFVRNTRDDWVNNDGVIIGWERKVTDETRAKFAIISRQYAELINQLSIELKEGI >NZ_LN554847|580371:589355|586184_586385_+|WP_045103787.1|DBSCAN-SWA MSAIDPVNEKKVFEAMIIMKGHLEEIGLNEHERIVLLKNLASHEETTLDRKNAATAMFAALRKIGV |
17 | Vibrio_phage(85.71%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
721568 : 771354
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN554847|721568:771354|DBSCAN-SWA 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49 | Leptospira_phage(30.0%) | integrase,transposase | attL 766093:766128|attR 774026:774061 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
791250 : 827864
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN554847|791250:827864|DBSCAN-SWA 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MELVVPSLELESEFLAFFEDYAANDISNIESYLLGKEDFSSYIQSLTDESNGINLREGFVPCSHFWLINDNQSILGVVRIRHNINNEFLALEAGHIGYDIAPSFRRNGYGKSILKLALTKAKELGLNRVLLTADEDNIASRKIIESNGGKFENIVMGKVFPNPLARYWVRC >NZ_LN554847|791250:827864|797760_797982_+|WP_045103941.1|DBSCAN-SWA MATASIRLDQDLVQKATIMAKAFSRTAPKQIEHWAKIGEMMEDNPELSYEFVKQAIIAKAEKEAGKLESYSFG >NZ_LN554847|791250:827864|806189_806669_-|WP_045103973.1|DBSCAN-SWA MQKTNIHTGDIVVSNFGVYQHWSIVSDTFCENGFPMLISATKRTGTVKEEAWDIVTQGKHTYPAKVNYDRPVTEVLELARSKIGSWNYSVSDRNCEHFAKWATGLKVSSTQIVAGTTGAVLGASLVGICSENPKFAKFLTGALALGTLAVIATRAVEKK |
47 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1399750 : 1434985
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN554847|1399750:1434985|DBSCAN-SWA 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MDAITIKNLDVVFGKKTKQALELLDQGKTRQEIIDEIGQVVGVDNVSLSVKEGEICVLMGLSGSGKSSLLRAVNGLNEVSRGELMIKNGDKLVDVALCDEETLRHLRTQRVSMVFQNFALMPWLTVLDNVAFGLEMQGIAKNERRARAREQIEMVGLAEWETKYPHELSGGMQQRVGLARAFTMDTDILLMDEPFSALDPLIRSQLQDELLLLQTKLNKTILFVSHDLDEALKIGNNIAIMESGKLIQHGKPEDIVLNPKTEYVKDFVAHTNPLNVLKGRSLMQPLDSLKQENNCWKICDAKDLWINQRQGKLNIEDQPTLTLIEWNESTTNLSSINHSTLVIANPEISMRDAIKLKQRSNHPILLVEHNQLVGILDNSEFYNALIGDFQLNSAA |
29 | Mycobacterium_phage(20.0%) | protease,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
42808 : 83597
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN554848|42808:83597|DBSCAN-SWA TCTAAAATACAGCATAGTATCCCATTCTAACCCAAGATAAAAACGTCACATGACATAGCGTTACGTGTGTTTTATAACGCTCGTACTCTTGAATAGGCAAGCACAATTCAAGAGTCTCCACTCTTGTTCCTGTTTCGGTTTTTGGTAAACGTGATACCTGTGCCTTAATTCGATAGCTCAACTCTCTATGACTGCATGAGCTTAAATCTTGCTCTAACTGTTTTCTAAAGCAACGCAAGCCCAATTCATCAAGCGTCACATCATGAACACGCGCACGCTCTATCACTGTTGCTAACTCTTTTGTCGTCAACGGAATTTTGATTTTTCGAGTCGTTCGTTTCTTTTTATCTAATGCCATAGGTAACGATATTACACTGTCTTCTGGTATGGTTGGATTGCTCTCTTTACCCTGTGAGAATGCTTCAATGAGCAACGCAATACGTTGCGCTGCTGCTTTGGTTTCTTGTTGGCTCACGTGCGTATAACGCAATGTCATTGATAATCGTTTATGCCCAAGCATCTTTGAAATCATCGGCAACGTTGCATTCATTAAGGCCGCATGACTAGCAAACGTATGTCGTAAATCATGAATACGCACATCGTTAACATTGGCATGCTTTCTCACCTTGCACCAATACGCGGGCACGTGTTGCTGTGGCCGCCCGTCCGGTTGCTCAAACACATAATCAGTCAGTCTGTCTTGCCTTGATAGCAATTCCTTTGCTGCATGGCTTAAATACACCGACCTTGCCCCTGTTTTACTGTCAGGTAAATGAATTTCATGGTTATCAATGTATGACCACTTTAATTTTACGATTTCATTGCATCGACACCCTGTTAATAACAGTAACCGAAAAATATCAGAGCATTGTCGCTCTCGCTCTCCACCTTGTAAGGTGAATTGCTTCATCACCCTATCAACGCTACCGATTTCATCCATGCTTAAAAAACGGTTTAACGTCCGCTTGGGGTTCTGCGTAATGCTTGCGCACACATTCTCTTTGATGTGCCCATGCACTATCGCTAGTCGAATAATAGATTGTAAAATATCGAGCGCCCTATTTGCTCCGCCTGCCTTTGTTATGCTGTACTCTTCAAACCAATGACGCACATCTAACACGGTTAATAAATGCAAACGACGATGACCAAAACGAGGCAAAAACTGTCGAGCTAATACACTGTTAGCCATTCGTTGTGTACTCGGCTTCCAACGCTCAAATACCTCTTTTTTCCATTCAGAGTGAATGAATTCTGAAAACGTTGGGGACTGTTTTATGTCTTTGCTTCCTTTTTGCCATAGCGTTAAACAGTCAATACTTTTCTGCCTTGCCTCTGTTATCGACATCACAAGACAAAGCCCTAACGTTTGAGTTTGAGCGCGGCTATTCACACGCCACATCGCCACAAAGACTTTCTTTCCTTTGGGAGACACCCGAATGCCAAGCCCTTGGCTTTTACTGTCCATCACGGTGTAACTTTTAGGCTCTGCTTTTAATTGTGCAATGCTGCGCTGTGTGAATATCATCGTTTTCATAACGATAGCCCTCGCGCTAATTGACTTGATACTTTTTCAGCCGCTACATAAACATGCTCATTCGCTAAGTGGGCGTACCTCAACGTGGTACTGGCTTCACTGTGCCCTAATAATTGCCCTATCGTTAATAAGTGCTCCCCTGATTGCAGCGCAAAACTGGCGTAACTGTGGCGTAAATCATGGATATTCACATCCTCTAGCTCTGCATGGAAACGAAATCGTTTCCATGCACTGAGCACCGCCGCATAGCTAATAGGTACAGATGTCAAAGAGGGAAAAAACAGCACAGCATCATCACTGAGTTGTCTCGCTTGCTCTAATAACCCCATTGCTACATCAGAAAGATACACCGTTTTCGCCCCTGTTTTACTGTCAGTTAAATACAAATGTTCATGACGGTATTCTTGCTGACGAAGTAACCGAATTTCTGAGCATCGACACCCTGTGACGATTAGCAGACGAAACAAAATCACCATCAATGGCGGCTCTGCGCTGTTATCAAGTACAGACCATAAACGGTGCAGTTCATTTTTAGTGAGATAACGCATTCGCACATCATAGTTACGTTTTCGTAACCCTTTACAAGGGTTACTGTTATTCAGACGATAGCCATATTCTTGTGCTTGCTTCATCATGACCGACAACAACGCCAACGGGGTATGGTCTTTTCTTGATTGTTTCGATAACCAACGCTTAACCTGCGATGCATCAATGTCTTTCACATTACAGTGACCAAACTCAGGCACTAATTTGTTATTAAAAATACTTAAATTTAATTTTCCTGTTCGTGCTTGTTTCCAGTGTCTCGCGTAGCGTTTAAAAAACAACTCTCCATAGGTAATAAAATCAATATCAGTGATAATATGACCTTGTTGCGCGGCTTGCTTTTCAATCGCACAAGCGCGCGCCTCATCCATGGATATTGAGGTCGATTTACCTAAATGATACGAATGCCTTTCACCTTGATATTGGTAACGCACATGATAAGAAATAGCCCCTTTGGGCATCACTTTTATGTAAAAAGAAGGGATTGTTTTGTCAAAAAAGTATTGAGTTTGACCATTTGCCGCACATTGATTGACAAATTTTTGCGTTAATTTAATACGAGCCATAGTAAATTACGTCTCTTTTTTATGGCGATATTTTTGTGTCACTTTTTAATATAAATGACACAAAAATCTCATCCAACTTCAAAATGACGATTTATTTTCACTCGATAATTCAACACGTTAAATACAGACAACCACTTGTGCATAACTTTGTTATGCATGGGGTGTAGGCTTTTTTAGAACGGTATATTACGCCAAAACTGTAAATCTTATTTACGCCTGAATTTTTACTTGGTGGGGCTTTCTTGTGGTGCGAAAGCGGTATTTACGTGGAGACGCTCGCGCTATATTGATTATATACCCACAGAGTTACGTATAACGCAGCAAGCGCAGAGTTTACGATATATTCGTATAATCTACTCACGCATACAAAAAACTCAACCACGCGCAGCATAGGAAGAATTAACCCAATACAATGACCAGATCCAGAAACAAAAAAAGCCCGCACTAGGCGGGCTGAACTTACAACGAATAATTAATATTCAGAGGGTAATAGAAAGGTGGTTGCACTTCGATCTGATTCGGTAATGATCCAGATCTTAATATCATCGTAATGATATTCTGACATAATACGCCCTCCGTCATGTGTGCCCTCGTTATTAAGTGCGCTATCTTCTTCACAAGTAGAACCCCAATCACAAGAACGGTGACGATCTAAAAATGGGATGAGTTTTTCATGAACACCATTAACTAACTCGTCAATGCCTCGCGTAATGACAATGCGCCCTAGTCTAAATGGGGTCGGTTTAATTACTTCTTGACAAATATCGGTCATAATTTTATATTCCTTGATAGTGATTTAGAGGGGCTTAAAGAAAACTTTTGCTGAGATTCTTTAAGCCTTTTCTATTTATACGAAAGGTAGATTAATTAATTTACATTTCGCGGCCTTTGCAATTTGAAATGGTGTCATTCCTAATTGTCTTAATATATTGCATGAACATTTCGCACCCTCTTCTGTTTCACCTCCTTTTAAATACCTTTTTAAATCTTTAACGTGATAACTGATAACCAACTTATCAATATCATTATTACTTAACCGTTTTACTTCGTCGCTCATTTGAAAGCGTATGGCTGAATAGCCCATTTTTTTACTCCTTACTGGTTATTAAATTAATCAACGTCTTCTGTTTTCAATATATATTCATAGTGTGCTTGTATTTCCTCCTCGGTTATTTTGTAACTCGCTAACTTATCGACACAATCGCTTATATCGCCTGTATAAAAACATTCATGATTAAATAACTCACGGCGAATAATGGCTTTTTTACCGTGTTCATCTAGATCATTATTTACGCCCTCAATATTGATTTTTTCTAACTCTTCAATAAGCCTTTTCGCGTTCTCTTTTGGTACAACTAAACCAGCGACTAACGAAACATAATCCACGCCCTCAACTTTTGACTCTTCAAATTGTTGTTGAGAAAACGCGAAAAATGCGCCTGTTTCTTTAAATAGTGCCGTCTGTTTTTCTTGCGTGAAATCAGATAAATATTTCATGTTTTATTCCCTTGTAAAAATTAATAACGATGTAGATCTACACATGCATTTTCAGTGCATACGTAATTCAGTGGATTGAAATTTGAAACGGTTTTTTGCTCACGTTTTAGGCCGTGAATTTCACGTAAACGATTAATGATTTTTAATGCTCTTACGCTCTTTCTTTGCTCTAAAGAAATTTCATTTTTGGGAGAGCCTGCTCTTGCTTGGCTCGCTTTTGATCCTTTAGTGATTGTTGAGTTGATAGTGTTTGAATAAGTCATGGCTGCTTTTCCTATGGTTAAGTGTATTTTCATCTTCGTCGTCGCCTGACTGTCCGGCCTCCTATCATGGTTCTACATTGCAATGGCGCAACGCGGCGAAGCGAACCATTGCAATGTAGGTTCTGATAGGAGACGGTTAACAGGAAGTAGCGAGGACGAGATGGAAATTCACGCATAGGAAATGCAATGACTTATGAGAATGCTATTGACGATTACAAGAACAAAGGATCAGAAGTGAAAGCTCTTGCTGTTGGCTCTGGCTTTTGATGTTGCGATAGGGATTGTCTATCAGGAACGTAGAGGCCGTTTAAGCTCTGCTTAAATACGGGATCACGTTATCGATAGGAGGAGCGAAGCGACGAAAAGCCTGTTAAATCGCCCTAGAGAAATAGATAAGATGAAGAAGAAAGAAGATCAATAGGAATAAGCACAATCAAATAAATGCTCAATAACGTCTGATTAAAAACACAAAAATACAGCCCTTAAACCCCTTACAAAAGCAGATAACTACCGCGTAGTTACCATCTTCGCTCTTAATCGCTTTTGACTCACAGCGAGCGTTAAAACGCTCTGTGTGTAGTGGTCTACATAATG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN554848|42808:83597|66943_68101_+|WP_045104652.1|DBSCAN-SWA MKKLLLLSVIGLTLAGCGGSDDNTEPTPMANPSSVIGTVDSVNSESNTVTVNGYSYQIANVTYGSTSLPTTYLQPNMMVQIGSNISRSTAVNVQLEPTMIGIIRIIDANTFSLNGATLTFNGLSSEIENGDRVMVSSLPTANAGYKVLSVVKFDIEFGEPDEIEGRISNINVNTKTFTLGANVNVQYDERIINLQIGQWVEVEGAMQGNDFVASKVEVENYDYFNGDNEVEGIVTWVAKDQSEFTLNYRGSFVVDNTTRFEDGLKAHLKQGVEVEVRSRMNAGKRIATIVEFDDMDSDQDNEWDGKEFECEGLVSNLDQDGRTFTMTRCENGFDQVIPNRTVTIDAQTRFDGILEQNITNGIHIEVEGFIIGDQNIASEVEYEFN >NZ_LN554848|42808:83597|51661_52177_-|WP_045104644.1|DBSCAN-SWA MSSVPKNKDELVDAISSISSKLLVDYQSIPSELSRDLEIEGNVKNTKVSVCDTLSYLIGWGKLVLKWYQLKSDGKPVDFPETGYKWNQLGELAQSFQAHYKNWDFVDLQLEFKSTTKEILDLINSLDNYALYEILWYEQWTLGRMIQFNTSSPMKNMRTKVRRFKKAHGIN >NZ_LN554848|42808:83597|68413_68926_+|WP_045104653.1|DBSCAN-SWA MMNKLLFSTLFLASMVVNASNISVDMKDLDSGKTVGSILIEQNEYGVVFTPNLSGLPSGLHGFHIHENNSCDTAEKNGKTILGGAAGGHYDPMKTGRHGFPWSNDNHLGDLPPLYISMNGNAVQPVLAPRITLPNLSGRSLMIHAGGDNHSDHPKTLGGGGTRLVCGVIK 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>NZ_LN554848|42808:83597|79618_80305_-|WP_080889906.1|transposase|DBSCAN-SWA MDFSGYQYPSDIILQAVRYYVSYKLSTRDIEDIFTERGNAIDHSTVNRWVITFAPMLEQNARQLKRKVSPSWRMDETYIKIKGEWWYYYRAVDKFGDIVDFYLSKERDEKAAKAFLRKAINTNGLPNKVVIDKSGANALALHNMNISLWLSVVFMLNLIEIVDVKYLNNIVEQSHRPIKQKMYQALGWKSVEGAIATMSGQEVWTQIKRGQVGDLSLPVWGRFYALAA >NZ_LN554848|42808:83597|52874_53825_-|WP_045104646.1|DBSCAN-SWA MKYPGQPQTPPSWYKDRGQSYIEKEFSKELGDLANAIEAEHWFGDKEKHGRFRVDFILKDARLIIELDGHEYHSTKEQLEKDAIRQRYLSRAGYTVIRFTGREINRNPQSCVAEVREIYIERMQRAPAKYRVMYIDYPFLYRETAKALSFFKKINPDKTLKPVSIDELIPHAIEWLHEKSFITAFVFHPPEDEHEIKHLDGSIKEYKKGEVRINTVSKEWYTLELGEHMESFSHLFDEFILIADDPVYIKPLRAVLPDELSDREHGSYSFKYLANGKLLRHGNEETSYVGSELVHVFWQRIWYIIGASMGLSLYEM >NZ_LN554848|42808:83597|66041_66671_-|WP_012552308.1|DBSCAN-SWA MYIFGYLRASTKEQDAKRAQDSLKSFAEDKGARIAGWYIENVSGASLQRPELMRLLKDAEKGDAILIEQVDRLSRLNDEDWETLKALINKKQLKVISLDLPTSHTVLMKHHNDDFTSAMFRAINNMMLDMLAAIARKDYQDRRRRQEQGIERAKVEGFYRGRRPDLDMHEKIIQLRVHNQLSVNATAKLVGVTARTVIRIVKIYNEDRV >NZ_LN554848|42808:83597|53982_54447_-|WP_045104647.1|DBSCAN-SWA MIQLRPMTSNEYPAYCDYFIDDYSREIAENYGHSMDRALELANQDLLRSFPNGLETNDHELLCIESGSELVGYLWHSINENDKSTFIYDFFIFPNCRNNGYGKLAITALESQLKLIGIEQIKLRVAYQNQRALKLYQEVGFAISGYNMSKKIVS >NZ_LN554848|42808:83597|69287_70226_-|WP_045104654.1|transposase|DBSCAN-SWA MSKKNTTTPHDGLFKAFLSKADTAKDMLEIHLPTHLKTLCDLSTLKLESGSFLEDDLRPYYSDVLYSMKTECGDGYIYALIEHQSSPDEHMAFRMFRYAIAAMQKHLDAGNKELPLVVPLLFYHGKTSPYPYSMNWLDCFTKPEMAKALYNNDFPLVDVTVMADSEIMQHKRIALLELVQKHIYQKDINDILESLAILLLNDYHTDSQVRTLIEYLVTVGESQNVNTLLEELAHQVPKHEGTLMTIAEQLILQGEQKGLQQGRQEGRQEGHQEGRQEALKEMARNLLQSGVDKAAIMKATGFSSRELELISH >NZ_LN554848|42808:83597|77153_77501_-|WP_045104663.1|DBSCAN-SWA MWTVLTTDIFDEWFDSQLEDAQEKILAGLMVLKNGGPSIGRPLVDTVNASKYKNMKEIRIQHRGEPIRAFFAFDPLRQAIVLCAGNKVGNEKRFYKVMIPVADREFTKHLSELEN >NZ_LN554848|42808:83597|60244_61513_-|WP_045104684.1|DBSCAN-SWA MLAQRKNLYRPGYFEAQKSGNEGSILLNISFNQNINLGLSIFVLVAIIAFITFAEYTKRETLVGIVSPLGGMVKVQANNSGYVENLFVKEGEHVEIMAPLYRIKTERFDGTGIGVKKRILTSIKNQYQLLLERRQQESEKSEFDQQSLTEDISRLDSEINILNYVLTLSYHELELTQKLVNKQKTLLNNKFMSEIDFQKQQLDLLAKESQTQTHKLNLKKLLREKQNLITKKRNIDINLNLTLKDIDRQLETINQNKVEFLYESDNQIMSPIKGVIASILTEKGHSVINGQPLLVIIPESKRAFVELYAPSKSIGFMRIGQKVKLRFDAFPHEKFGVQTGIITSVSKSSVAPDMIPNRDLIKSVAIEGLYQVKVELSKPTITVYGQEEHFVSGMTVVADVELDSRKIYEWILEPLYTIKGKI >NZ_LN554848|42808:83597|82910_83597_-|WP_080889906.1|transposase|DBSCAN-SWA MDFSGYQYPSDIILQAVRYYVSYKLSTRDIEDIFTERGNAIDHSTVNRWVITFAPMLEQNARQLKRKVSPSWRMDETYIKIKGEWWYYYRAVDKFGDIVDFYLSKERDEKAAKAFLRKAINTNGLPNKVVIDKSGANALALHNMNISLWLSVVFMLNLIEIVDVKYLNNIVEQSHRPIKQKMYQALGWKSVEGAIATMSGQEVWTQIKRGQVGDLSLPVWGRFYALAA >NZ_LN554848|42808:83597|50231_50486_-|WP_012548929.1|DBSCAN-SWA MKFSRVKEGEFKRLVETKTITTLIAQESNNEHNKFSLFGIDEKNQLGYAVRHGRVDELRTWRLDILSAFVKSLGFKSIEVYFSK >NZ_LN554848|42808:83597|52143_52326_-|WP_099047817.1|DBSCAN-SWA MIIWLTIASTRFATFGILGFFEFTVLSGKLELNLHGSKRVMQALCEWSLKCPQSQKIKMS >NZ_LN554848|42808:83597|70637_71465_+|WP_045104655.1|DBSCAN-SWA MILYKYVSLISAIEIIKNRSLGFTCLEDLNDPFEGTNFGFSDVGDVSPRSATNAFKSNFSRKYSVLSLTRNPLNPLMWSHYGDSYKGIVIGIDVDIANLTSESEFIIPAHMGEISYVATKNRDLNGVPSVQHLNSIKKELEFKNEIQNNLKQAFLYKAIEWGYEEEIRVIKSLLSFNYSYHGTHDEVINDCWDKRRLSSLGQPLFCFKIPINSIKEIYLGEKIDRNRCRTNNGQDEEKFQENLKFIKSQDCPIYVCEADVSSWKLKARLLDSCFR >NZ_LN554848|42808:83597|63555_63957_-|WP_052662933.1|DBSCAN-SWA MKTLSQLNKIISQNTPYIHVGDDMNWVIGAFIELCARSNQYYDIDIKSFLHWVKPAILHGQYKLFYTEDGVVKSGFILWAWVDDDTLSRYHTSNRFYLHPTEWNEGRNLIIIDYLDLHYSKKILEIRIGCLNI >NZ_LN554848|42808:83597|42808_44341_-|WP_052662931.1|integrase|DBSCAN-SWA MKTMIFTQRSIAQLKAEPKSYTVMDSKSQGLGIRVSPKGKKVFVAMWRVNSRAQTQTLGLCLVMSITEARQKSIDCLTLWQKGSKDIKQSPTFSEFIHSEWKKEVFERWKPSTQRMANSVLARQFLPRFGHRRLHLLTVLDVRHWFEEYSITKAGGANRALDILQSIIRLAIVHGHIKENVCASITQNPKRTLNRFLSMDEIGSVDRVMKQFTLQGGERERQCSDIFRLLLLTGCRCNEIVKLKWSYIDNHEIHLPDSKTGARSVYLSHAAKELLSRQDRLTDYVFEQPDGRPQQHVPAYWCKVRKHANVNDVRIHDLRHTFASHAALMNATLPMISKMLGHKRLSMTLRYTHVSQQETKAAAQRIALLIEAFSQGKESNPTIPEDSVISLPMALDKKKRTTRKIKIPLTTKELATVIERARVHDVTLDELGLRCFRKQLEQDLSSCSHRELSYRIKAQVSRLPKTETGTRVETLELCLPIQEYERYKTHVTLCHVTFLSWVRMGYYAVF >NZ_LN554848|42808:83597|46300_46537_-|WP_045104639.1|DBSCAN-SWA MGYSAIRFQMSDEVKRLSNNDIDKLVISYHVKDLKRYLKGGETEEGAKCSCNILRQLGMTPFQIAKAAKCKLINLPFV >NZ_LN554848|42808:83597|46970_47246_-|WP_045104641.1|DBSCAN-SWA MKIHLTIGKAAMTYSNTINSTITKGSKASQARAGSPKNEISLEQRKSVRALKIINRLREIHGLKREQKTVSNFNPLNYVCTENACVDLHRY >NZ_LN554848|42808:83597|55470_56244_-|WP_052662932.1|DBSCAN-SWA MESSFYKYCPITDDKNLENEYSLINLLSNQVTFSRRKNFNDLFDSKVDFIKPAHKELKALIPQIKGKKRVIFKSVFLKNENEFINDFVEKLEKRFDEYLFYCVTDDPENNLMWSHYASSHRGFCIEWDSSIIKAEKVSYESDIASFKVIDLIKSHFNIISNDEPARNMWKALRIKLKEWEYESEYRLQLNDQKYYHVIERNSNFVLVGYEPEWIKSIIFGYRMSEESRQYVISKMPKGTKYKEIVVGKSSVRVVDIN >NZ_LN554848|42808:83597|52334_52694_-|WP_045104645.1|DBSCAN-SWA MDKQLIEKVHELWDLCGPIDCSESVENLEKEIIKFFDMIEPCRNWLSKRNKLKNIKRTPDSYTLKHEVEFSVKKWVPHSVFIFSAYLEGFNLSRSSLRSDIYVVATNIGAEKSNKYKQA >NZ_LN554848|42808:83597|80512_81718_+|WP_045104666.1|DBSCAN-SWA MDTNQTTKTFQELKDGADSYIKRRNLRLLANHKKELRNFTRAESVAYLGVDGKTIDKYVASMGIDPRRHEDSQWSLNIEEIYQMRDCFPDALRKELKFTRTEHQTTQVIVVQNQKGGVGKTVSSATIGSGLATEFHQELRIGLIDMDGQATLSMYYAPEAEQEGYLSVGDLMMRNFDLDDGETFEEAVSDAFLPTTIPNLRILPASQSDRAIEGWFHEKVFNNQLEKPYSVLNEVIEAVKDEFDIIIIDTPPSLSYGTYNSYFAATSVVFPLSITENDIDATCSYFSYIPQVWALLANADHPGYDFMKILITNHRDSSTTTELMNNLYEQFAPYLYSKEFKHSEAIRQASSLLSTVFDMSKSEYPKSKATFQSAQQNAFEVTSQIMRDVMSVWNEQEKENG >NZ_LN554848|42808:83597|54919_55264_-|WP_017020975.1|DBSCAN-SWA MWEVITTDTFDEWFDSLNDSERANVIAGMLLLQNKGPHLSRPYADTVYGSKFTNMKELRVQSNGDPLRAFFAFDPERKGILLCAGNKGGNEKRFYKQMIPIADQEFQAHLNNRG >NZ_LN554848|42808:83597|61758_62097_-|WP_045104650.1|DBSCAN-SWA MFCLTESEILMVDGGGEGSGAPAGYGGGSYSGSNGSSNYPSYNNGGRHSNSDLTNNPSVACLTSAINDGLAAANVSLGSRSSPASAATAGVMTSFGSMYSGGCFSMGPGGHN >NZ_LN554848|42808:83597|44337_45453_-|WP_045104637.1|integrase|DBSCAN-SWA MARIKLTQKFVNQCAANGQTQYFFDKTIPSFYIKVMPKGAISYHVRYQYQGERHSYHLGKSTSISMDEARACAIEKQAAQQGHIITDIDFITYGELFFKRYARHWKQARTGKLNLSIFNNKLVPEFGHCNVKDIDASQVKRWLSKQSRKDHTPLALLSVMMKQAQEYGYRLNNSNPCKGLRKRNYDVRMRYLTKNELHRLWSVLDNSAEPPLMVILFRLLIVTGCRCSEIRLLRQQEYRHEHLYLTDSKTGAKTVYLSDVAMGLLEQARQLSDDAVLFFPSLTSVPISYAAVLSAWKRFRFHAELEDVNIHDLRHSYASFALQSGEHLLTIGQLLGHSEASTTLRYAHLANEHVYVAAEKVSSQLARGLSL >NZ_LN554848|42808:83597|45925_46225_-|WP_045104638.1|DBSCAN-SWA MTDICQEVIKPTPFRLGRIVITRGIDELVNGVHEKLIPFLDRHRSCDWGSTCEEDSALNNEGTHDGGRIMSEYHYDDIKIWIITESDRSATTFLLPSEY >NZ_LN554848|42808:83597|46563_46950_-|WP_045104640.1|DBSCAN-SWA MKYLSDFTQEKQTALFKETGAFFAFSQQQFEESKVEGVDYVSLVAGLVVPKENAKRLIEELEKINIEGVNNDLDEHGKKAIIRRELFNHECFYTGDISDCVDKLASYKITEEEIQAHYEYILKTEDVD >NZ_LN554848|42808:83597|72654_73197_-|WP_045104657.1|DBSCAN-SWA MKTRFLPLLFLISSSVYAANHQIGVGIGYGGTEGANDFTDSGFASKIDYSYQFHPNFSTEIGYAGIDGMTSNIISTAFDQSKQQVKYSTGYLGLKASLYPVSFFNIYALGGANYSNVEKTFTPTGQAERTVSHKGLNPYYGLGAEVVAFSTIGFNVEYRKFILANDFESDVFFAGLNLKF >NZ_LN554848|42808:83597|79082_79382_+|WP_045104665.1|DBSCAN-SWA MSTIVVNITLAFIISLLQFFYIKLNKLINDTFIAHGYIAIIFIIMLFIETTPLLKILFLVILWLLTEYKPLIYIFNMDQSTRLYLIVFSTMLVLMNTLF >NZ_LN554848|42808:83597|65053_65740_-|WP_080889906.1|transposase|DBSCAN-SWA MDFSGYQYPSDIILQAVRYYVSYKLSTRDIEDIFTERGNAIDHSTVNRWVITFAPMLEQNARQLKRKVSPSWRMDETYIKIKGEWWYYYRAVDKFGDIVDFYLSKERDEKAAKAFLRKAINTNGLPNKVVIDKSGANALALHNMNISLWLSVVFMLNLIEIVDVKYLNNIVEQSHRPIKQKMYQALGWKSVEGAIATMSGQEVWTQIKRGQVGDLSLPVWGRFYALAA >NZ_LN554848|42808:83597|49991_50141_+|WP_045104642.1|DBSCAN-SWA MPKKSALTGLFVICLTILCFTWMVRGSLCELQIKNGSAVIQATLAYEAE >NZ_LN554848|42808:83597|54612_54915_-|WP_045104648.1|DBSCAN-SWA MARTLQEIMANEKPEVVAQAQELATEMLLNIHLAELRERASLTQNELALAMGVKQPTISGMEKVGQDIKLSSLKKYIEATGGKLRLDVEMSDGSHFGFAV >NZ_LN554848|42808:83597|78279_79086_+|WP_045104664.1|DBSCAN-SWA MNKYILLLSLFIITNTLNIVQASHLSGPENYLCKHMPIGWKDNKNTIEAGYEYCIRSNRANVKFTNLTQDSIFISSKIGHIFEIEPESVSQLLPYSRQGVFHFVTKTQGRVYMMGNNNNIIVSPYLTRDITKDVYSRVKNNLQTSSMKKVPMFRVRDISYENPIFIDNPDFNFVEKQTFAFPAIVVIGVGGGIAGAINAWDPNGFCGPDVVRGAIIGAITGLGTAMMAIPSGGGIIIGAASGAALNKSLSGACLACHKSGNSYCGERI >NZ_LN554848|42808:83597|76848_77151_-|WP_045104662.1|DBSCAN-SWA MARNLNDMMASRSVESQNRISEMAEEMLLEVKLQSLREELEFTQSELAKNMGISQPSVVAIEQRGSDVKLSTMKRYVEAMGGRMSIDIELPTGKHVGFNI >NZ_LN554848|42808:83597|74793_75567_+|WP_045104659.1|DBSCAN-SWA MKKWMLLIALALPFMTSAKALNHISGYEDSYLLGSYTDSINKDEYISGGFEDADGLQNVEVKFQFSLAVPIVQINNSTSLMFSYTQKSLWQLGNSEISSPFRETNYKPQFFVMHQSNMLIFNSAEFGYMHESNGQTSGLSRSWDRIYGGLERLDGPVQYGVRAWYVFSDEENNEDINDFMAPYDVWLKVGNDIGEFSTQFHYNFATDKGGVEAAYTLYVNQFVGLYVQGWTGYGETLIDYNYDHSRIGIGMRLLPPN >NZ_LN554848|42808:83597|81710_82784_+|WP_045104667.1|DBSCAN-SWA MAKKRGNQSPLGNAVGAQQAQQNAAKSNLESLTKQLSSELEKAGENTTAFLASNFGLESVSQSIEWTLASGKKALFNEVTLSHAQVKEDTVVTFHVNGRDQSLLTKESLEDLNSLEFQQFYPAVGRQVDGKIDVLDGSRRRAWFLLQEGCIKEFRILVTNDDISMADAKALAKQLQSAKEHNLREIGLQCVALQKANQDITQAEIAQQVGLSQSGVSKAIKAANVSEKLVQLFPVVNALSHPDYALLDKVMKACDESKSLNNFISKIAKKVVNIQAEYSTQDQKDAIVSSIKLELKIAEAKKEKAEIEVTTLAEFDAKGMFARKKVKGRNFSYEFGRLSKEVQAELDRVIKSVLDKN |
38 | Salmonella_phage(30.77%) | integrase,transposase | attL 40206:40221|attR 52501:52516 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN554846_1 | 1600416-1601944 | Orphan |
I-F
Consensus repeat of NZ_LN554846_1
|
25 spacers
spacers of NZ_LN554846_1
>1.1|1600444|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACAGTAAGCAAACGTGGATCTTTTCCTTTC >1.2|1600504|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGGTATTATTATTCGTGAATTTCCGCAAAAT >1.3|1600564|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGAGGGGACAGAGATCCCGCCTGAATGCAGAC >1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTGAGCAACTTGGATTTCTTTTGATTTGTCA >1.5|1600684|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCCGACAAAGCTATTAAATCCATGTTTATGAT >1.6|1600744|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTGTTCATTCTATTTCACCATTTTAATTA >1.7|1600804|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAATCCAAGGGACAGCCTACGTATTTTTTA >1.8|1600864|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCGACTTGATGGTGTAGCATTAAATCCATTA >1.9|1600924|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCAGCGTAATCGACTGGAAAAGTGTCTACT >1.10|1600984|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCTGTGTTGATGAGTGTCATCGCTTGGATT >1.11|1601044|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGGTCTGGTTTACCCCCGTAATACTAGACG >1.12|1601104|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCCGAAGTTCAACACGTCGTCGCAGAAGAAA >1.13|1601164|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTGTATGAGCAATTAAAATGTTATCGCAAG >1.14|1601224|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGGAGGTGTTGGTGGGTCAAACGGTTCAATT >1.15|1601284|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTTATGACTTTCCGACCTTTCTCCAAAGCA >1.16|1601344|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAAGTGAATTAGAACTCGCGTTCCTTCTTGT >1.17|1601404|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACAGTCGGAGAAGTTAAGATTCTTGCGTAT >1.18|1601464|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATAATGTTTTTTGTTGGATCTTCTGGCAAT >1.19|1601524|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATTGGTCTTGCTGCGATTGGTTTCGGTATC >1.20|1601584|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGACACTGTTCACTTTCAGATTAATGGGACT >1.21|1601644|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGGTTTGAATTACTTCCTGCTTTGCGTGAG >1.22|1601704|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGTCGCCAGTTTTAGATCCTTTTTGACAGG >1.23|1601764|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTACTGCATCAATGACACCCGAATCATCATAA >1.24|1601824|33|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTAATCCCTCACGTTTCATAGCGTCAAATAAT >1.25|1601885|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGAGCAAGACTAACACCAGCTAAATCAGCAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN554846_1
The CRISPR arrays of NZ_LN554846_1 >merge|NZ_LN554846|1|1600416-1601944|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTAACAGTAAGCAAACGTGGATCTTTTCCTTTCTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTGGTATTATTATTCGTGAATTTCCGCAAAATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACCGAGGGGACAGAGATCCCGCCTGAATGCAGACTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACCTTGAGCAACTTGGATTTCTTTTGATTTGTCATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGCCGACAAAGCTATTAAATCCATGTTTATGATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTGTTTGTTCATTCTATTTCACCATTTTAATTATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGAAAATCCAAGGGACAGCCTACGTATTTTTTATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAGCGACTTGATGGTGTAGCATTAAATCCATTATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAATCAGCGTAATCGACTGGAAAAGTGTCTACTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACAATCTGTGTTGATGAGTGTCATCGCTTGGATTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGTTGGTCTGGTTTACCCCCGTAATACTAGACGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACCGCCGAAGTTCAACACGTCGTCGCAGAAGAAATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTCTGTATGAGCAATTAAAATGTTATCGCAAGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGCGGAGGTGTTGGTGGGTCAAACGGTTCAATTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTGTTATGACTTTCCGACCTTTCTCCAAAGCATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGGAAGTGAATTAGAACTCGCGTTCCTTCTTGTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACATACAGTCGGAGAAGTTAAGATTCTTGCGTATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTAATAATGTTTTTTGTTGGATCTTCTGGCAATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTGATTGGTCTTGCTGCGATTGGTTTCGGTATCTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACATGACACTGTTCACTTTCAGATTAATGGGACTTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTTGGTTTGAATTACTTCCTGCTTTGCGTGAGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTTTGTCGCCAGTTTTAGATCCTTTTTGACAGGTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGTACTGCATCAATGACACCCGAATCATCATAATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACGGTAATCCCTCACGTTTCATAGCGTCAAATAATTTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAACTGAGCAAGACTAACACCAGCTAAATCAGCAGATTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NZ_LN554846|1|1|1600416-1601944|PILER-CR TTTTTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TAACAGTAAGCAAACGTGGATCTTTTCCTTTC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTGGTATTATTATTCGTGAATTTCCGCAAAAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGAGGGGACAGAGATCCCGCCTGAATGCAGAC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CTTGAGCAACTTGGATTTCTTTTGATTTGTCA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GCCGACAAAGCTATTAAATCCATGTTTATGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TGTTTGTTCATTCTATTTCACCATTTTAATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GAAAATCCAAGGGACAGCCTACGTATTTTTTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AGCGACTTGATGGTGTAGCATTAAATCCATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATCAGCGTAATCGACTGGAAAAGTGTCTACT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATCTGTGTTGATGAGTGTCATCGCTTGGATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GTTGGTCTGGTTTACCCCCGTAATACTAGACG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGCCGAAGTTCAACACGTCGTCGCAGAAGAAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTCTGTATGAGCAATTAAAATGTTATCGCAAG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GCGGAGGTGTTGGTGGGTCAAACGGTTCAATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTGTTATGACTTTCCGACCTTTCTCCAAAGCA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GGAAGTGAATTAGAACTCGCGTTCCTTCTTGT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATACAGTCGGAGAAGTTAAGATTCTTGCGTAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TAATAATGTTTTTTGTTGGATCTTCTGGCAAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TGATTGGTCTTGCTGCGATTGGTTTCGGTATC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATGACACTGTTCACTTTCAGATTAATGGGACT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTTGGTTTGAATTACTTCCTGCTTTGCGTGAG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTTGTCGCCAGTTTTAGATCCTTTTTGACAGG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GTACTGCATCAATGACACCCGAATCATCATAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GGTAATCCCTCACGTTTCATAGCGTCAAATAAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TGAGCAAGACTAACACCAGCTAAATCAGCAGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NZ_LN554846|1|1|1600416-1601944|CRISPRCasFinder TTTTTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TAACAGTAAGCAAACGTGGATCTTTTCCTTTC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTGGTATTATTATTCGTGAATTTCCGCAAAAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGAGGGGACAGAGATCCCGCCTGAATGCAGAC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CTTGAGCAACTTGGATTTCTTTTGATTTGTCA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GCCGACAAAGCTATTAAATCCATGTTTATGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TGTTTGTTCATTCTATTTCACCATTTTAATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GAAAATCCAAGGGACAGCCTACGTATTTTTTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AGCGACTTGATGGTGTAGCATTAAATCCATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATCAGCGTAATCGACTGGAAAAGTGTCTACT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATCTGTGTTGATGAGTGTCATCGCTTGGATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GTTGGTCTGGTTTACCCCCGTAATACTAGACG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGCCGAAGTTCAACACGTCGTCGCAGAAGAAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTCTGTATGAGCAATTAAAATGTTATCGCAAG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GCGGAGGTGTTGGTGGGTCAAACGGTTCAATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTGTTATGACTTTCCGACCTTTCTCCAAAGCA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GGAAGTGAATTAGAACTCGCGTTCCTTCTTGT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATACAGTCGGAGAAGTTAAGATTCTTGCGTAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TAATAATGTTTTTTGTTGGATCTTCTGGCAAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TGATTGGTCTTGCTGCGATTGGTTTCGGTATC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATGACACTGTTCACTTTCAGATTAATGGGACT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTTGGTTTGAATTACTTCCTGCTTTGCGTGAG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTTGTCGCCAGTTTTAGATCCTTTTTGACAGG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GTACTGCATCAATGACACCCGAATCATCATAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GGTAATCCCTCACGTTTCATAGCGTCAAATAAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TGAGCAAGACTAACACCAGCTAAATCAGCAGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC >NZ_LN554846|1|1|1600416-1601944|CRT TTTTTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TAACAGTAAGCAAACGTGGATCTTTTCCTTTC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTGGTATTATTATTCGTGAATTTCCGCAAAAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGAGGGGACAGAGATCCCGCCTGAATGCAGAC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CTTGAGCAACTTGGATTTCTTTTGATTTGTCA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GCCGACAAAGCTATTAAATCCATGTTTATGAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TGTTTGTTCATTCTATTTCACCATTTTAATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GAAAATCCAAGGGACAGCCTACGTATTTTTTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AGCGACTTGATGGTGTAGCATTAAATCCATTA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATCAGCGTAATCGACTGGAAAAGTGTCTACT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC AATCTGTGTTGATGAGTGTCATCGCTTGGATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GTTGGTCTGGTTTACCCCCGTAATACTAGACG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC CGCCGAAGTTCAACACGTCGTCGCAGAAGAAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTCTGTATGAGCAATTAAAATGTTATCGCAAG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GCGGAGGTGTTGGTGGGTCAAACGGTTCAATT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTGTTATGACTTTCCGACCTTTCTCCAAAGCA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GGAAGTGAATTAGAACTCGCGTTCCTTCTTGT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATACAGTCGGAGAAGTTAAGATTCTTGCGTAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TAATAATGTTTTTTGTTGGATCTTCTGGCAAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TGATTGGTCTTGCTGCGATTGGTTTCGGTATC TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC ATGACACTGTTCACTTTCAGATTAATGGGACT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTTGGTTTGAATTACTTCCTGCTTTGCGTGAG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TTTGTCGCCAGTTTTAGATCCTTTTTGACAGG TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GTACTGCATCAATGACACCCGAATCATCATAA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC GGTAATCCCTCACGTTTCATAGCGTCAAATAAT TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC TGAGCAAGACTAACACCAGCTAAATCAGCAGA TTTCTAAGCTGCCTGTGCGGCAGTGAAC
>NZ_LN554846.1|WP_080889796.1|1598723_1600382_-|sensor-domain-containing-diguanylate-cyclase MPIFLPMLQPLLIFCYIIPYNVLMIFIRLSVMSYVVRPVLNSKYALPIVVFIIGLILTLFAASHVVKDNRKQAYQETVNYSERHANRIKTQIQQDVFFLGALASLVDENSDYWINQFDSVSQHIMSGSSSMISIQWSPHVNLTQIEEHRNKIKSHYEGFTEFNFHEGAEKRFTKLLDRGFPLYMVSQVYPETGANSSILGYYSVSDRFEDTLLKMKTTQQPFLSDRVFLLQDSYNRKISEVERQKKQNGLLMYYPVFNQNKSQLIGYFISAIQIDAFFEKYLTLDAVKSRGYRIKVFDHGPSGSDDPVLYQSKAWVELGETIEVSQLIDIYGRPWEIQYQKSVLRTFSFTSNAIITLICGVFISLLIACIVRFSLHSKEALKRKLAKRTKELQYLVEHDTLTGVHNRYALCNHFEILIEQQIRFSLIAIDVDKFKHINDTYGHCAGDTALKYVAERVKAVISSEDMLARMGGDEFSILTRVTDKNQLTDMCDKICKAVNVKPIILKDIAIPITISIGAKRCHTTNIDDLYHEVDQEMYKSKNKGRNDFSIAV >NZ_LN554846.1|WP_045102113.1|1596908_1598594_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MNKLPMKVKFFLIAIIPMLLVLIVSLSITVSLQKDALEQEVNNYQDVLLSERKKQLKDNVLVGKAVVEDIITKHGVTEKSKTLALEALVNARFGEAGSGYFFVFDGSGTYVVHAEKRSMIGKSGMGLTDPNGVKIVVGLQNAARNGGGFVPYVYEKPGSSSPQPKISYSSPINGSKWFIGTGVYIDDINTSVANYREDAQQRLRHQIKLVLLWSIGLLIMTIVVMNYVAYKVTAPLRSMLSTFEDIANGEGDLTHRVNAEGKDEIAKLGQAFDLFVSKLHGIMSEVSATTGQVSQAATTINQQTEHLKSQLEEHNQETEQVVTAVTEMSSTAHEVAQNANQVSNATSDANKDAKEAQDKVTISTESINSLEMNVEKTSHHMGSLHDQSQKINGVLQVIGEIAEQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRNLASRTQGSTHEIKVMLDELHQFVQQAVSSMNESQATCGLVVSSSSDISSGLNAVSNAVESINDMTAHIATAATEQSSVTEEINRNLVSIRTIVSSLVESSYDSSKVANELTDAGNQLQQLVKQFKL >NZ_LN554846.1|WP_045102112.1|1595934_1596816_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MTILFLLQASLVVGGLLFLYMLISLWRRKRESEKNTNVIAIGLIGGFANFCDTLGVGSFAIKTAGYKQFKLLDDKDLPGTMNAQATMATVFQALIFLTAVNVDLTTLLSLIVSACVGATVGARLVSNFDRQLIRLIMTGALFIVALLMFAGQFHLFPLGGDALGLTGEKLTIAIIGNFIFGALMTVGIGLYAPCMTMIYLLGMNPLAAFPIMMCSCAFLCFFSSGNFIKKEALNSRAALVVAITGSIGVFIAAFIVKSLDVEMLSWLVSFVVLYTAITMFRSWQQGRERTVTN >NZ_LN554846.1|WP_080889795.1|1593772_1595797_-|GGDEF-domain-containing-protein MGCKWMRMKSLNNIKIITIFIVVSVVTFFLILRPFQIEKPKPIATEAVPVFMPDHQLLMLPYGSRVLALRDLSRSDAKRAAMMLNLMDEKGIFGRESIYRVYYFMVLGNIALHKGDDNKARYYAQQLKEFAKNNNMIWVEADSLVELAIEHLKKGEIEKGINKAEYAIELAKGINYEYLLIKAYNTIGAAYNIKSQYSKALYYFHQGVKLAESYPEHIYNSKLISNLALIYIHLQEWDKALVNIDKAKELYNISMLNELSVLGILDINASYVYFNLENAKQARKYYDMAKKEITTSDSVRLNALLLKALSELYWLENNYKEALVTANRCINYDGINTAPLQKGLCLKIKAKVDLEYKNIDDAIESLVEATNIFTVIESKVYLNEVYELLSIAYEEKGFPILALDYYKLYSKGNERILFDRRQSEVFHLEEEFNTEQIQKNMKLIKTQNELNNLYVEKQQLRTRIVSTIVILVALGLFKLVRHNFSIVREKEALLEQSTKDALTDLNNRHYYESAIQQLDQNKAFYRDKHFTVAIIDIDHFKRVNDTYGHDVGDKVLINIASYMQSIIAEPDVLVRWGGEEFVCLFMTSGNNDCEIRLNRLRVAISQLAIAISDKETLTITVSIGALQNLMIDDVIHRNTESLRLADQYLYQAKEEGRNKVIIFSHGVDEQKKWH >NZ_LN554846.1|WP_045102110.1|1591656_1593675_-|GGDEF-domain-containing-protein MKTNNNLKKISLFICVSVAIFFYILRPFQLIEPKPEKKAAEKRFLPDDLLKNLPYSVDILNARDISYRDAAMALEKVSQLDAKGVFNHGAIYRTYYFLILRNIALLEGDRDKINYYNVELSLLAKNHEFPWLKAELIIDAGIELLKKGKMDEGIVLIEKAIMLSKSVNYNYLLVKAYNTLGVAYNIQSQYVKALEYYHLGIKLGRDYPSHSYNSKLIANLGLIYIYLEEWDKALDYIDRSSYLYTQSKIIDGVSIVINNVNLSYIYFNLGDAEKTRIYYDKGANQLDSTEDVRIVGLMRKTEADTLWIEDRYKESLAVANRCLQLPEIETVPQQHGLCLIAKSRTEIYFGNIEIAIKSLELALERLESINNASYVIKTYQLLAEAYEQSGNTELAYKYFKLYAKLDKDILFDRRQSEVYHLEEQFNTKQIKKNMELTNTQSELKTLYVEKQKLRTRVVASILILVGFGLFFLIRRNFTIEKEKEVLVEQSTTDALTGLNNRHYYNHALKELELNKALHEKKVFTAAVLDIDHFKAVNDTYGHDIGDAVLQNVAARLTAVIDDSDILVRWGGEEFVCLLPESKFYGCEVKLERLRMAISQLPISIDHIQKDLIVTISIGAIKNLTIDDVLYINKESLQLADVCLYRAKQEGRNRVVFESKEQLNRDKIQLCST >NZ_LN554846.1|WP_045102109.1|1591026_1591593_-|elongation-factor-P-like-protein-YeiP MPKASDIKKGSAIELNGKVFFIKEISKLTPSGRAGASLYRMRMYDVATGLKADESFKADEVISLADFSRRSATFSYIDGNEYVFMDAEDYTPYSFNKEAIEEELLFITEETQGLQVLIVNEAPVAIELPSSVDLEIVETDPSIKGASASARTKPATLTTGLTVQVPEYIANGEKIKINTSEHKFMSRA >NZ_LN554846.1|WP_045102108.1|1589791_1590967_+|threonine/serine-exporter-family-protein MPSQYRINRIVDIGDTLHRCGCAPYKVERYTMFYANKHGVNCMIQATPTAINYQFPDDNNAVILKRHKPASIDLGLLANTIIRLQQPLSETPPPPAEGVHFPTWVVALANILIPPAFLMLVGSTYEALWVSFLLGFVVWACQAVCTKRRSLAVEFFSAVIVTLIVTFIASLGIPIPVLALCIAAIVLFVPGLSIANALECLAFNDLVSGTSLLGQCFLTLIKLFIGIIIGLHVGEALWGVPEYTDYQNEFPIWLQIIGLPIISFSIGVMFKARPKDMIYSLPVAVLGMWGPFYLGFDGGWVVGTWVTTVLITLYGTWIAKKLNLTGIIFIMQGIIILVPGSRVLVSASQSVFEASILPIPSIGLSALFMFSAIVAGQVTAYSIYSPKIERD >NZ_LN554846.1|WP_045102107.1|1588283_1589705_+|16S-rRNA-(cytosine(1407)-C(5))-methyltransferase-RsmF MHDNIFLPEAFLTQVQETMPSHLSMEEFIAACKRPLRRSIRVNTLKNSVEEFKQRADEKQWKLEPVPWCDTGFWLTRPETDTVKLGSTAEHMSGLFYIQEASSMMPVTALLKDNDNIEMALDMASAPGSKTTQLAAGMKNQGALVANEFSSSRVKVLCSNVQRCGVSNVALTHFDGRVFGGWLPETFDSILLDAPCSGEGTIRKDPDAMHNWSPESVIEIGDTQRDLIESAFHALKPGGVMVYSTCTLNHQENQNICHHLVEQFGDAVTFEPLGDLFENAEKALTQEGFLHIYPQIFDSEGFFVAKIRKNSATVPPEVKKRLGKFPFTPASSKEAKDIETELNATLQLSIPEANELWIRDKEVWAFPKRMKPLIGEMRYHRIGFKLAETHKKGYRWQHEAIMALAEANNPTACELTIEQAREWYMGRDVRPETVDKGETIVTYCGAVIGLGKWVGNRIKNGLPRELVRDGNLF >NZ_LN554846.1|WP_080889794.1|1585991_1588022_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKRQSISSRINLILGFISIVILIFSFTVIYLSSKINTATEQVADYDLPEALNSLAMLEELGDMNSNLLEYLLGEEEEQQEYFNNYAELVRFRNLIPKDIKEQNTLERVVRLVEGHKQKAISQVFEVYFPSKERRAAKQIDDLLKNVGMPLEALLDQMKEEEISDVGSTNNPQDVINDDLPGVRFYLELTDEAGDMLADLNRFVLADASAKREFFANALQFETYLAQLKPLEQKPQEIIHINEIERLFNELKAGGTNIFEHYQTQNKISATKAIDDLEHQIFNEAEKILDNLSGNARKEAIKSMDDLSRISSNISLILLVSTLLIISLVVSMIVITRRTIFNPLAEVTMTIERLRRGERDFELTSFNRNDELTDILSNLQLFQTELAELDELRSNEQKIQSELLVERDNATQSFQQLQETQTKLIATEKMASLGTLVAGVAHEVNTPLGVSVTMASTLTSNLTDFLEEVKSGVLNRSKLETFEVESMRSLELLENSLQHAAQLIHSFKQVAVDQTSNKRREFNLYETLNEIAQTLHHKIKRTNIKYSIKGSKDITLDSFPGPLGQVITNLFNNAMLHGFEGKDSGEIQIRFDLIGNEVKLLFSDNGNGVEDKNIKKLFDPFFTTKLGRGGSGLGLNIVHSIVTNLMGGEISVESRIGTTFELKLPLITPQQKENTYE >NZ_LN554846.1|WP_045102106.1|1583791_1585999_-|EAL-domain-containing-protein MSDFILNLVDDISEKEEKTEHCWKIAIIDDESSVHDVTKLALSNTKIQSKNLEFISAYSGQEGFELLKNNPDCAVVLLDVVMEESDSGLLLTQRIRKELKQTNLQIILRTGQPGYAPEEDIISKYEINDYKTKSELTRDKLLTSLSTAIRSYNHLQALEESKEGLKNVINASSELMKERSINEFAKGVLQQINALFHLSSQGIFCVSQRPLKGPNDFEDKKNNAFLVVATTQGYNSMYGKDIYEYSNDTASGIAQKALTIKSHVLEKNFSALYLSTPSQWQGVVVIEGGLNLSDVDEELLQVFCLNIALGLENAKFFSHLNRSAYYDSVTDLYNRGGLVQFSNTIEKQAKDTISLYVIDIDYFHDITDSLGFDFGNNVLVAMSSILKRIFHKQAMIARLHSDVFAVLVADSQLSLKSLVHACSRPFVLNENSMRLGVSLGEAHVAIKEEFNIELLFRHAKMALKVAKESKRGMAQAFEPQFEKDTESRRTVLAEFRHAMMKEELFLMLQPKVSMSTGAVVGYEALIRWQHPEKGVIPPNAFIPIVEQAGLYFDLDMYVFRSAVNIIKKYPQINKPISVNISANSLHHHDFIEDIKTVIKEENADITNIELEITENALVRKDMAIQHLNGLKEIGFVLCMDDFGAGYSSLAYLIKLPLDVIKIDRAFISNITEDKDSLVLLKGMLQICNDLNKKVVLEGVETQEQIDILKHYDVDVIQGFFYFRPQPIEEILKKAL >NZ_LN554846.1|WP_045102115.1|1602159_1602846_-|TVP38/TMEM64-family-protein MNKKLIVLMALLVSFAIVYFNFGHLLTLEQIKGFHQTLQSDIQENLFFYSAAYFIAYVVVTALSIPGAAVVTLLGAALFGFWWSLLLVSFASTIGATIAFLSSRYLLREWVDSKFKDKLVPINQGVEKDGAFYLLTLRLIPIFPFFLINLLMGLTKITAGRFYLFSQLGMLPGTMVYLNAGTQLSEITSLSGLVSPQILGSLALLGLFPIIIKFVINTIQKNRGQLKE >NZ_LN554846.1|WP_045102116.1|1602848_1603424_-|glutaredoxin MKPIKITLYRWAGSWGPFKVNIPCGECTLTTDILQDTFETELAGIPIELEVKDWLSNWWEPLKLKAWHAPIIIVEDKVISEGEALNRGVLIQAVIAKVAEREQIKGNVVFGKATCPFCVKAKAALDAAGIEYIYHDVVKDSAALYRMIPEVKAIIGEKTPVTVPQIWLDGKYVGGFDDLTKTMNTDVKAGS >NZ_LN554846.1|WP_045102117.1|1603578_1604139_-|TetR-family-transcriptional-regulator MKEDKRINALQKTIELCALHGFHGTSMDKITAATGLSKATIYKYFQSKENLITSALGLFSEQSLTNVKILFENTELTLEEKIAQRFKGLAGCIDVESFNGCYFQLAYSEYSNEDQGITEVSLQYKQHTQKLLIELLNRHHIDNAELRAKKAGLIFNGLLASLQLTKDPTLIELAHQMFLETIIKSE >NZ_LN554846.1|WP_045102118.1|1604387_1604798_-|acyl-CoA-thioester-hydrolase-YciA MRNSVKTDQVPKGQLLLRTLSMPADTNANGDIFGGWIMSQLDLAGAILAQEISGGRIVTVSVSSITFKKPVKVGDVVCCYGECTKVGRTSMSIDLEVWVKPIKEDEVSHRFQVCEATFNYVAIDSEGKPRPIPKNS >NZ_LN554846.1|WP_045102119.1|1604923_1605730_+|crotonase/enoyl-CoA-hydratase-family-protein MSYHHIHVEQQNTIMIIRLQRPEKLNAVNYPMFDELIHVSRQIEKDRTIRSVILTGSGGNFSSGLDFASIMKKKSHAMKLLFKLWPGNANKAQKVSANWRNLSVPVIVAIEGYCWGAGLQIALGGDFRIASPKANLSIMESKMGLTSDMAGSLTLREIMPKDQAMRISMCASQLDAETALKYGLITEVNDDPLEAAIQLSQQFARTSPDAIAATKHIYNRYWTAPKWKLLAYETYSQIRILIGRNFVQVQYALKKKASPLFKVRQRFW >NZ_LN554846.1|WP_045102120.1|1605840_1606272_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKQKKNIILLASLMSSLVLTGCASNDEQITQQKSQIEQINTLESKVSTLESQVNTLETELQKQKSTDSEIYQTVHRLDVAQNKLKEQAQQQADEAIMYYMIKQGDTLYSIARDHGIALEDIIQLNPHIVNPKRLLIGDLLNVK >NZ_LN554846.1|WP_045102121.1|1606523_1607282_+|HAD-IIB-family-hydrolase MIKMLVCDFDGTINGGSSLGVDQFSAYLNTQPELHFIIATGRTLPSIQEGLTTHNYPKPRCIISDIGTRINYEYDLIADERWQHQLQDKWNKSAIQTALQDITFLGECNPSYQGDYKITFEGKLDHKQYSSIATALAQQSINVDITYSHDWFLDITPKGINKATAIHYIMQKYNLTAEEVCVAGDSANDTSMLTMPGINAILVANHYTEVAHLSALNHVYTSNASHAEGVLEGLIYWQNIAVQNNTSSETTI >NZ_LN554846.1|WP_045102122.1|1607417_1608101_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MKISPYSSGRFYSFLASKSNKFKELLYQCQVSTGYVDVGTEILRQGEALDYIYVVPGGRVSMSILALNGRRFQLGEANCDYHIFGEMEFFTQTPCQWTVAADEYLQVDTICLKALTKALYKQPEMMFFFAAALAEDYQDSMDIYTNRLLHPIAYNIGYDLLMQKSGITAALGSFDKVLQEAERFGTSERVYRRAVKSLIDKNLIEKSDQGLVIINEDELRSFLEGNE >NZ_LN554846.1|WP_045102123.1|1608231_1608966_-|nucleoside-phosphorylase MSKQPHICVDETQVAPYVIVCGEPDRVNRIVELMDNVELLAENREYRVFNGQYKKTPITVCSTGIGAPSMIIAVEELKLCGATHVIRVGSAGAMQDHIKLGELIVAEGAVRDEGGSKAYIRSAYPAYASFTLLKEINHFLESQSVKYYFGVVRSHDSFYTDEEEQLCQYWNKKGILGADMETSALFTVGRLRGLQVASILNNVVLYQQDVKEGVNQYVNDNEAMMNGERLAAITALEALCKQGS >NZ_LN554846.1|WP_045102124.1|1608962_1609697_-|nicotinamide-riboside-transporter-PnuC MDLLSLLDINNTLVNIPIGGGYAMSWVEGFGTIFGLLCIWFASQEKTINYVFGLLNVTLFAVIFFQIQLYGLLLLQLFFFCANIYGWYAWTRPNSSGEILEVRWLSKSKLLAISGSSIVAIALLTIYIDPFFFALATIAVDSMNLFGADLSQPILEPDAFPFWDSSMTVLSIVAQILMTRKYVENWMLWIVINIISVGIYATQGVFAMSVQYSILMFIAANGAREWARTAKENRNEKQVEKAIA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN554846_1 | 1.25|1601885|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601885-1601916 | 32 | MH617650 | Inoviridae sp. isolate ctba176, complete genome | 1618-1649 | 2 | 0.938 |
NZ_LN554846_1 | 1.23|1601764|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601764-1601795 | 32 | MN379636 | Chicken microvirus mg7_1, complete genome | 1572-1603 | 4 | 0.875 |
NZ_LN554846_1 | 1.23|1601764|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601764-1601795 | 32 | MN379629 | Chicken microvirus mg4_76, complete genome | 1599-1630 | 4 | 0.875 |
NZ_LN554846_1 | 1.13|1601164|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601164-1601195 | 32 | MG065691 | UNVERIFIED: Campylobacter phage A11a, complete genome | 75200-75231 | 6 | 0.812 |
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NZ_LN554846_1 | 1.18|1601464|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601464-1601495 | 32 | MH491968 | Escherichia phage LL5, complete genome | 412-443 | 6 | 0.812 |
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NZ_LN554846_1 | 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600624-1600655 | 32 | NZ_CP010399 | Acinetobacter baumannii strain 6200 plasmid p6200-47.274kb, complete sequence | 37156-37187 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600624-1600655 | 32 | NZ_CP035935 | Acinetobacter cumulans strain WCHAc060092 plasmid pNDM1_060092, complete sequence | 24397-24428 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600624-1600655 | 32 | NC_020818 | Acinetobacter baumannii strain GF216 plasmid pNDM-AB, complete sequence | 43283-43314 | 9 | 0.719 |
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NZ_LN554846_1 | 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600624-1600655 | 32 | MT002974 | Acinetobacter baumannii strain AB17 plasmid pAB17, complete sequence | 255-286 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600624-1600655 | 32 | NZ_CP032142 | Acinetobacter sp. WCHAc010052 plasmid pNDM1_010052, complete sequence | 30330-30361 | 9 | 0.719 |
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NZ_LN554846_1 | 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600624-1600655 | 32 | LC537594 | Acinetobacter lwoffii SU1904 plasmid pSU1904NDM DNA, complete sequence | 255-286 | 9 | 0.719 |
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NZ_LN554846_1 | 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600624-1600655 | 32 | NC_019281 | Acinetobacter lwoffii plasmid pNDM-BJ02, complete sequence | 45880-45911 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600624-1600655 | 32 | NC_025116 | Acinetobacter sp. M131 plasmid pM131_NDM1, complete sequence | 8316-8347 | 9 | 0.719 |
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NZ_LN554846_1 | 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600624-1600655 | 32 | NZ_CP041229 | Acinetobacter haemolyticus strain AN54 plasmid pAhaeAN54e, complete sequence | 8269-8300 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.6|1600744|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600744-1600775 | 32 | KM507819 | Escherichia phage 121Q, complete genome | 9609-9640 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.12|1601104|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601104-1601135 | 32 | NZ_CP030263 | Ensifer adhaerens strain Corn53 plasmid AA, complete sequence | 920073-920104 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.12|1601104|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601104-1601135 | 32 | NZ_CP015236 | Rhodococcus fascians D188 plasmid pFiD188, complete sequence | 164958-164989 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.12|1601104|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601104-1601135 | 32 | NZ_CP015881 | Ensifer adhaerens strain Casida A plasmid pCasidaAA, complete sequence | 1253176-1253207 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.19|1601524|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601524-1601555 | 32 | NZ_AP014640 | Leptolyngbya boryana IAM M-101 plasmid pLBX | 24869-24900 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.19|1601524|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601524-1601555 | 32 | NZ_AP018205 | Leptolyngbya boryana NIES-2135 plasmid plasmid2 DNA, complete genome | 308834-308865 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.22|1601704|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601704-1601735 | 32 | NC_019699 | Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01, complete sequence | 217995-218026 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.25|1601885|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601885-1601916 | 32 | MN693169 | Marine virus AFVG_25M309, complete genome | 35873-35904 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.25|1601885|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601885-1601916 | 32 | MN693552 | Marine virus AFVG_25M467, complete genome | 34173-34204 | 9 | 0.719 |
NZ_LN554846_1 | 1.8|1600864|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1600864-1600895 | 32 | KU160494 | Vibrio phage vB_VmeM-32, complete genome | 168109-168140 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554846_1 | 1.19|1601524|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601524-1601555 | 32 | NC_011987 | Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c, complete sequence | 355515-355546 | 10 | 0.688 |
NZ_LN554846_1 | 1.19|1601524|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1601524-1601555 | 32 | MK448719 | Streptococcus phage Javan255, complete genome | 820-851 | 10 | 0.688 |
1. spacer 1.25|1601885|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH617650 (Inoviridae sp. isolate ctba176, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
tgagcaagactaacaccagctaaatcagcaga CRISPR spacer tgagcaaggctaacgccagctaaatcagcaga Protospacer ********.*****.*****************
2. spacer 1.23|1601764|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN379636 (Chicken microvirus mg7_1, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
gtact-gcatcaatgacacccgaatcatcataa CRISPR spacer -tattagcatcaataacatccgaatcatcataa Protospacer **.* ********.***.**************
3. spacer 1.23|1601764|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN379629 (Chicken microvirus mg4_76, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.875
gtact-gcatcaatgacacccgaatcatcataa CRISPR spacer -tattagcatcaataacatccgaatcatcataa Protospacer **.* ********.***.**************
4. spacer 1.13|1601164|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG065691 (UNVERIFIED: Campylobacter phage A11a, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
---ttctgtatgagcaattaaaatgttatcgcaag CRISPR spacer ataatccgt---agcaattaaaatgttatctcaag Protospacer **.** ****************** ****
5. spacer 1.13|1601164|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG065686 (UNVERIFIED: Campylobacter phage A18a, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
---ttctgtatgagcaattaaaatgttatcgcaag CRISPR spacer ataatccgt---agcaattaaaatgttatctcaag Protospacer **.** ****************** ****
6. spacer 1.18|1601464|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH491968 (Escherichia phage LL5, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
taataatgttttttgttggatcttctggcaat CRISPR spacer acataatgtcttttgttgcatcttctggcgtt Protospacer *******.******** **********. *
7. spacer 1.3|1600564|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP022607 (Mycobacterium branderi strain JCM 12687 plasmid pJCM12687) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
cgaggggacagagatcccgcctgaatgcagac CRISPR spacer tgaggggacagggatcccgccggattttcgac Protospacer .**********.********* ** * . ***
8. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017945 (Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer tatgcgagacttggatttcgttttatttgtca Protospacer . ** * .*********** *** ********
9. spacer 1.6|1600744|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015221 (Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
tgtttgttcattctatttcaccatt--ttaatta CRISPR spacer agtttgttcattttatttctccattactcagt-- Protospacer ***********.****** ***** *.*.*
10. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020413 (Leptospira interrogans serovar Copenhageni strain FDAARGOS_203 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer ttgtattaacttgtatttcttttgattcgtga Protospacer .* * .****** *************.** *
11. spacer 1.8|1600864|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
agcgacttgatggtgtagcattaaatccatta CRISPR spacer aaggacatgatggtgtagaattaaatgaaaga Protospacer *. *** *********** ******* * *
12. spacer 1.8|1600864|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
agcgacttgatggtgtagcattaaatccatta CRISPR spacer aaggacatgatggtgtagaattaaatgaaaga Protospacer *. *** *********** ******* * *
13. spacer 1.18|1601464|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK813941 (Aeromonas phage 4_L372XY, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
taataatgttttttgttggatcttctggcaat CRISPR spacer cgttagtgttttttggtggatcttctggctca Protospacer .. **.********* *************
14. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045197 (Acinetobacter indicus strain TQ23 plasmid p23TQ-NDM, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
15. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KX832928 (Providencia rettgeri strain 06-1619 plasmid p06-1619-NDM, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
16. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045133 (Acinetobacter indicus strain TQ18 plasmid p18TQ-NDM, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
17. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP045130 (Acinetobacter indicus strain TQ04 plasmid p4TQ-NDM, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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18. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_023322 (Acinetobacter bereziniae strain CHI-40-1 plasmid pNDM-40-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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19. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010370 (Acinetobacter nosocomialis strain 6411 plasmid p6411-9.012kb, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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20. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032278 (Acinetobacter sp. WCHAc010034 plasmid pNDM1_010034, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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21. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KM210086 (Acinetobacter lwoffii strain JN49-1 plasmid pNDM-JN01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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22. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP027532 (Acinetobacter baumannii strain AR_0088 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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23. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026127 (Acinetobacter baumannii strain ABNIH28 plasmid pNDM-0285, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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24. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025000 (Acinetobacter lwoffii strain Iz4b plasmid pNDM-Iz4b, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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25. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010399 (Acinetobacter baumannii strain 6200 plasmid p6200-47.274kb, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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26. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP035935 (Acinetobacter cumulans strain WCHAc060092 plasmid pNDM1_060092, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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27. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020818 (Acinetobacter baumannii strain GF216 plasmid pNDM-AB, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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28. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KJ003839 (Acinetobacter pittii strain Acinetobacter pitti plasmid pNDM-AP, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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29. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AMXH01000087 (Acinetobacter pittii strain XM1570 plasmid pXM1, complete sequence, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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30. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019985 (Acinetobacter baumannii ZW85-1 plasmid pAbNDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
31. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LC483156 (Acinetobacter pittii SU1805 plasmid pSU1805NDM DNA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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32. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT002974 (Acinetobacter baumannii strain AB17 plasmid pAB17, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
33. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032142 (Acinetobacter sp. WCHAc010052 plasmid pNDM1_010052, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
34. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026425 (Acinetobacter sp. ACNIH1 plasmid pNDM-9c17, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
35. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LC537594 (Acinetobacter lwoffii SU1904 plasmid pSU1904NDM DNA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
36. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019268 (Acinetobacter lwoffii plasmid pNDM-BJ01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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37. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019281 (Acinetobacter lwoffii plasmid pNDM-BJ02, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
38. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_025116 (Acinetobacter sp. M131 plasmid pM131_NDM1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
39. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK053934 (Acinetobacter nosocomialis strain IEC38057 plasmid pIEC38057, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
40. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KM210088 (Acinetobacter sp. JN247 plasmid pNDM-JN02, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
41. spacer 1.4|1600624|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041229 (Acinetobacter haemolyticus strain AN54 plasmid pAhaeAN54e, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cttgagcaacttggatttcttttgatttgtca CRISPR spacer cttgtgcaacttggacttctttttttaaacct Protospacer **** **********.******* * ..*
42. spacer 1.6|1600744|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KM507819 (Escherichia phage 121Q, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tgtttgttcattctatttcaccattttaatta CRISPR spacer gttctgttaattctatttcaccttttttggtt Protospacer *.**** ************* **** . *
43. spacer 1.12|1601104|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP030263 (Ensifer adhaerens strain Corn53 plasmid AA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgccgaagttcaacacgtcgtcgcagaagaaa CRISPR spacer cgccgaagttcaagacgtcgccggcatagttg Protospacer ************* ******.** . ** .
44. spacer 1.12|1601104|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015236 (Rhodococcus fascians D188 plasmid pFiD188, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgccgaagttcaacacgtcgtcgcagaagaaa CRISPR spacer agcagaagttcagcacgtcgtcgccgctcatc Protospacer ** ********.*********** * *
45. spacer 1.12|1601104|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015881 (Ensifer adhaerens strain Casida A plasmid pCasidaAA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cgccgaagttcaacacgtcgtcgcagaagaaa CRISPR spacer cgccgaagttcaagacgtcgccggcatagttg Protospacer ************* ******.** . ** .
46. spacer 1.19|1601524|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014640 (Leptolyngbya boryana IAM M-101 plasmid pLBX) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tgattggtcttgctgcgattggtttcggtatc CRISPR spacer tgattgctcttgctgagattggtataactgcg Protospacer ****** ******** ******* * . *..
47. spacer 1.19|1601524|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP018205 (Leptolyngbya boryana NIES-2135 plasmid plasmid2 DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tgattggtcttgctgcgattggtttcggtatc CRISPR spacer tgattgctcttgctgagattggtataactgcg Protospacer ****** ******** ******* * . *..
48. spacer 1.22|1601704|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019699 (Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.01, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tttgtcgccagttttagatcctttttgacagg CRISPR spacer catgtcgccagttttaaatcctttgtggataa Protospacer . **************.******* **. ..
49. spacer 1.25|1601885|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693169 (Marine virus AFVG_25M309, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tgagcaagactaacaccagctaaatcagcaga CRISPR spacer ccgatataactaacaccagctaaaccagcagc Protospacer . ...* .****************.******
50. spacer 1.25|1601885|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693552 (Marine virus AFVG_25M467, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tgagcaagactaacaccagctaaatcagcaga CRISPR spacer ccgatataactaacaccagctaaaccagcagc Protospacer . ...* .****************.******
51. spacer 1.8|1600864|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KU160494 (Vibrio phage vB_VmeM-32, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
agcgacttgatggtgtagcattaaatccatta CRISPR spacer catcatcagattgtgtagcatgaaatccattt Protospacer .. *.. *** ********* *********
52. spacer 1.19|1601524|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011987 (Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tgattggtcttgctgcgattggtttcggtatc CRISPR spacer gctcaggtcttcctgcgattggcttcggcggc Protospacer . ****** **********.*****.. *
53. spacer 1.19|1601524|32|NZ_LN554846|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448719 (Streptococcus phage Javan255, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
tgattggtcttgctgcgattggtttcggtatc CRISPR spacer gttctctgcttgttgcgattgttttcggtatg Protospacer .* ****.******** *********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
712894 : 720142
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN554846|712894:720142|DBSCAN-SWA AATGAAACTGCCAATTTACTTTGATTATTCGGCGACTTGTCCTGTTGATGAGCGTGTAGCGAATAAAATGATTCAACATATGACAATGGACGGATGCTTTGGTAACCCTGCATCACGTTCACACCGCTACGGCTGGCAGGCTGAAGAAGCAGTAGATACTGCTCGTGATAATATTGCCGCTTTATTAAATGCCGACCCACGTGAGATCGTATTTACATCAGGCGCTACAGAATCAGATAACCTTGCAATTAAAGGTGCTGCACATTTCTATCATAAGAAAGGTAAGCACGTTATTACTTGTAAAACTGAGCATAAAGCAGTTCTGGATCCATGCCGTCAACTTGAGCGCGAAGGTTACGAAGTAACGTACCTAGAGCCTGAATCAAATGGTTTAGTTGACCTAGCTAAATTAGAAGCAGCAATGCGTGAAGATACCGTTCTTGTTTCTATTATGCATGTGAACAATGAAATTGGTGTGATTCAAGATATCACAGCAATTGGTGAGCTTTGTCGTTCTCGTAAAATTATTTTCCATGTTGATGCAGCACAATCAGCAGGTAAGATCCCTCTTGATGTACAAGAAATGAAAGTGGATTTAATCTCTCTTTCTGCTCATAAAATGTATGGTCCTAAAGGGATTGGCGCATTGTACGTTCGTCGTAAACCGCGTATTCGTTTAGAAGCACAAATGCACGGTGGTGGTCATGAGCGTGGTTTCCGTTCTGGTACGTTAGCAACTCATCAAATCGTTGGAATGGGTGAAGCGTGTCGTATCGCAAAAGAAGAGATGCAAAAAGATTATGACCATTGTTTAGCAATGCGTGATCGTCTTCTTGATGGTGTTAAAGATATGGAAGCAGTACACATTAATGGTGATTTAGATCAACGTGTACCACATAACTTAAACATCAGCTTCGAATTTGTTGAAGGTGAATCACTGCTAATGGCACTGAAAGATCTTGCGGTTTCTTCGGGTTCTGCATGTACGTCAGCAAGTCTTGAGCCATCGTATGTATTACGTGCGTTAGGTCTGAATGATGAGCTAGCACACAGTTCAATTCGTTTCTCATTTGGTCGTTATACGACGGAAGAAGAGATTGATCATGCAATCACACAAATTAGCCAAGCAGTAAATAAACTGCGTGATATGTCTCCATTATGGGATATGTATAAAGAAGGCATCGACTTAAACACGGTTGAGTGGGCACACCACTAACACGGACGTTCCAGAATTTAGAGGTATTTATTATGGCTTATAGCGAAAAAGTAATCGATCACTACGAAAATCCACGTAACGTTGGTTCATTTGAAAAAGATGACCCATCAGTTGGTAGCGGTATGGTTGGTGCACCAGCGTGTGGTGATGTTATGAAATTGCAAATCAAAGTATCTCCAGAAGGTATTATTGAAGACGCAAAATTTAAAACATACGGTTGTGGTTCAGCAATCGCATCAAGCTCACTAGTTACTGAGTGGGTTAAAGGTAAAACATTAGACGAAGCAGCAGCGCTTAAAAATGCTGAAATCGCTGAAGAGCTAGAATTACCACCAGTGAAAGTTCACTGTTCAATCTTAGCGGAAGATGCGATTAAAGCAGCGGTATCTGATTACCGTAATAAACACTAAGATTAAGTAACGTTATAAAGCGTCTGTTTACGTGATATCGTGTAAATACGGCGCTTTATTGTCTAATATAGGTCGTTATTGATTAACGACACCCATGACCACAAACAAATATAGTAAAGGTTGTAGTATGGCCATTTCAGTAACTGAAGCAGCAGCAAGCCGTGTTCAAACATTTCTTGAAAACCGAGGAAAAGGCATTGGTCTACGTTTAGGCGTAAGAACCTCTGGTTGCTCTGGTATGGCGTATATTCTTGAATTTGTTGATGAACTAAACGAAGAAGACCAAGTGTTTGAAGAGTTTGGGGTTAAGATTATCATCGATCCAAAAAGCTTAGCTTACATGGATGGAACTGAGTTAGATTTTGCCAAAGAAGGTCTAAATGAAGGGTTCCAATTCAACAATCCAAACGTAAAAAGTGAATGTGGGTGTGGTGAAAGCTTCAACGTATAGAGCATAACGTTAACTATGAATCATTTTGAATTATTTGGGCTACCAAACCAGTTTGACCTGGATGGTGGCCTTCTTTCTGCTCAATTCCGTGAATTGCAGAAACGATTCCACCCTGATAACTTCGCGACTTCGTCAGAACGTGACCGTTTACTTTCCGTTCAAAAAGCGGCGCAAATTAACGACGCTTATCAAACGCTAAAAAATCCAGTCTCCCGTGCAGAATACTTACTTTCAGAACAAGGTCATGACATTCGTGGTGAACAAACGACGATGCAAGATCCAATGTTTTTAATGCAACAAATGGAACTGCGAGAAGATTTAGAAGATATCTCATCAAGTTCTGATCCTGAAAGTGCACTATTTGATTTTTCTGAAAATGTTTCCGCAATGCGTAAATCACAATTGGCTGAGTTGAAACAGCAATTAGACGCGGATGCATGGGAAGATGCAGCACAAAGCGTACGTAAATTGAAGTTTATTGATAAGCTCAATCAAGAAGTCGAAAAGTTAGAAGATAAATTATTAAATTAATCTTTGTTAGATTAATTAAGTGAAGGATATTACCCATGGCATTTCTACAAATTTCTGAGCCTGGACAAAGTGCAGCACCACATCAACATAAACTAGCAGTCGGCATCGATTTAGGCACAACTAACTCACTAGTCGCTTCGGTTCGAAGTGGTGAAGCAAAGACATTACCGGATACAAAAGGCAATGTAATTCTTCCGTCCGTAGTGCAATATCAAAACGATAAAATTTGTGTGGGTGCCAACGCTTACCAGTCTGCGGCTTTAGATCCTCAAAATACAATAATTTCTGTAAAACGCTTAATGGGACGCTCATTAAAAGACATTCAAGCACGCTACCCAGAGTTACCTTACCAGTTTAAAGAGAGTGATAACGGGTTACCTGTTATTAGCACTCCTCAAGGTGATGTGAATCCAGTTCAAGTATCAGCTGAGATTCTTAAATCATTATCTAATCGTGCTCAAGCAACGTTAGGTGGTGATCTTGAAGGCGTTGTAATTACAGTACCTGCTTATTTTGATGATGCTCAACGAGCAGGGACAAAAGATGCAGCGACACTTGCTGGCTTAAATGTTTTACGTTTGTTGAATGAACCAACAGCAGCAGCGATTGCTTATGGCTTAGATTCAGGTCAGGAAGGCGTTATTGCAGTTTATGATCTTGGTGGTGGTACGTTTGATATTTCAATCCTACGTTTATCAAAAGGCGTGTTTGAAGTATTAGCAACGGGTGGAGATTCTGCACTTGGTGGCGATGACTTTGACCATGTAATTACCACTTGGATTAAAGAACAAGCAGGTATTATTGCGGAGTTATCTAAACAAGATCAGCGTGAATTATTAACATTAGCAACAGAAACTAAAGTTGCTTTATCAGATACAGACTCAGTTACCGTTTCTTTTAAAGCGTGGTCTGGTGTGTTGACGGTTGAAGTATTTAATCAACTTATTCAACCATTAGTGAAAAAGACATTAATGGCATGTCGTCGAGCACTAAAAGACGCAAACATTATTTCAGAAGAGATAATAGAAGTAGTGATGGTTGGTGGTTCGACAAGAACACCTATCGTGCGCAGCTCTGTTGGTGACTATTTTGGTAAAACACCATTAACCAGTATCGATCCCGATCAAGTGGTTGCTATTGGTGCTGCAATTCAAGCGGATATTTTAGTCGGTAATAAACCAGATGCTGAAATGTTATTACTTGATGTTATTCCATTGTCTTTAGGTATTGAAACTATGGGTGGCTTGGTTGAAAAAATCATTCCACGTAATACCACGATCCCTGTAGCGAAAGCACAAGAATTTACCACTTTTAAAGATGGTCAAACTGGCATGATGGTTCATGTCGTTCAAGGTGAGCGTGAAATGGTGGAAGATGGGCGCTCTCTTGCTCGCTTCTCATTGAAAGGTATTCCACCGATGACGGCGGGTGCTGCACATATCCGAGTGACTTACCAAGTGGATGCTGATGGTCTTTTATCTGTAACTGCAATGGAAAAAAGTACCGGTGTTCAATCTCATATTCAAGTTAAGCCTTCTTACGGTTTAAGTGATTATGAAGTCGCGAATATGCTAAAAGATTCAATGACGTTTGCAAAAGAAGACATGCAAGCGCGCGCATTAGCAGAACAACAAGTTGAAGCAGATCGAGTTATTGAAGGTCTTGTTGTTGCATTAAATAATGATGGCGATACCTTGCTATCAAAAGAAGAACAAGCAGAAATTTTACAAGCAGTTGAAGCGTTGATCACAGTACGTCAAGGTACAGATACGCAAGCAATTGAAGATGGAATTAAACACGCTGATGAAGCAAGCCAAGAGTTTGCTGCGCGTCGAATGGATGCCTCTATTCGTGCCGCATTAGCCGGTCAATCTATTGATGAGGTATAGAAATGCCAAAGATTATTGTTCTACCACACGATGAGTTATGCCCAGAAGGTGCAGTGCTTGAAGCAAATGAAGGTGATACAGTTTTAGACGTTGCTTTAAAAAACGGTATTGCGATTGAACATGCTTGTGAAAAATCATGTGCGTGTACAACGTGTCATATTGTTATTCGTGAAGGGTTTGATTCACTAGAAGAGAGCGATGAGCTTGAAGATGACATGCTAGATAAGGCGTGGGGTCTAGAGCCTGAGTCTCGTTTAGGTTGCCAAGCAAGAATGGCAAAACAAGATTTAGTGGTAGAAATTCCAAAATATACACTAAACTTAGCATCAGAAGATCATTAATCTTACCTGATTAATTGAACTACTGTTGATAAAGGTAAGAGATGAAAAGTAAGTGATAAACTTACATTTCAGAGCTTACCTTTTTTTATATCTATAATAATTAAGGATGAAATTATGAGCATTAAATGGATAGATTCACGTGACATTGCAATTGAGCTTTCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN554846|712894:720142|717845_718046_+|WP_045101382.1|DBSCAN-SWA MSIKWIDSRDIAIELSEQYPEIDPQTVRFTDLREWVMALKEFDDDPNHSGEKILEAIVLCWMDERD >NZ_LN554846|712894:720142|714985_715501_+|WP_045101379.1|DBSCAN-SWA MNHFELFGLPNQFDLDGGLLSAQFRELQKRFHPDNFATSSERDRLLSVQKAAQINDAYQTLKNPVSRAEYLLSEQGHDIRGEQTTMQDPMFLMQQMELREDLEDISSSSDPESALFDFSENVSAMRKSQLAELKQQLDADAWEDAAQSVRKLKFIDKLNQEVEKLEDKLLN >NZ_LN554846|712894:720142|717392_717731_+|WP_045101381.1|DBSCAN-SWA MPKIIVLPHDELCPEGAVLEANEGDTVLDVALKNGIAIEHACEKSCACTTCHIVIREGFDSLEESDELEDDMLDKAWGLEPESRLGCQARMAKQDLVVEIPKYTLNLASEDH >NZ_LN554846|712894:720142|715536_717390_+|WP_045101380.1|DBSCAN-SWA MAFLQISEPGQSAAPHQHKLAVGIDLGTTNSLVASVRSGEAKTLPDTKGNVILPSVVQYQNDKICVGANAYQSAALDPQNTIISVKRLMGRSLKDIQARYPELPYQFKESDNGLPVISTPQGDVNPVQVSAEILKSLSNRAQATLGGDLEGVVITVPAYFDDAQRAGTKDAATLAGLNVLRLLNEPTAAAIAYGLDSGQEGVIAVYDLGGGTFDISILRLSKGVFEVLATGGDSALGGDDFDHVITTWIKEQAGIIAELSKQDQRELLTLATETKVALSDTDSVTVSFKAWSGVLTVEVFNQLIQPLVKKTLMACRRALKDANIISEEIIEVVMVGGSTRTPIVRSSVGDYFGKTPLTSIDPDQVVAIGAAIQADILVGNKPDAEMLLLDVIPLSLGIETMGGLVEKIIPRNTTIPVAKAQEFTTFKDGQTGMMVHVVQGEREMVEDGRSLARFSLKGIPPMTAGAAHIRVTYQVDADGLLSVTAMEKSTGVQSHIQVKPSYGLSDYEVANMLKDSMTFAKEDMQARALAEQQVEADRVIEGLVVALNNDGDTLLSKEEQAEILQAVEALITVRQGTDTQAIEDGIKHADEASQEFAARRMDASIRAALAGQSIDEV >NZ_LN554846|712894:720142|719707_720142_+|WP_045101384.1|DBSCAN-SWA MTIERTFSIVKPDAVKRNLIGAIYRRIEKTGMQVVAAKMLLLTKEQAQGFYAEHEGKEFFAALVEYMTSGPVMVQVLEGEDVIVRYRELMGKTNPEQAACGTIRSDYAISMRYNSVHGSDSPESAAREIAYFFAEDEICSRPAE >NZ_LN554846|712894:720142|714141_714519_+|WP_045101377.1|DBSCAN-SWA MAYSEKVIDHYENPRNVGSFEKDDPSVGSGMVGAPACGDVMKLQIKVSPEGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLVTEWVKGKTLDEAAALKNAEIAEELELPPVKVHCSILAEDAIKAAVSDYRNKH >NZ_LN554846|712894:720142|712894_714109_+|WP_045101376.1|DBSCAN-SWA MKLPIYFDYSATCPVDERVANKMIQHMTMDGCFGNPASRSHRYGWQAEEAVDTARDNIAALLNADPREIVFTSGATESDNLAIKGAAHFYHKKGKHVITCKTEHKAVLDPCRQLEREGYEVTYLEPESNGLVDLAKLEAAMREDTVLVSIMHVNNEIGVIQDITAIGELCRSRKIIFHVDAAQSAGKIPLDVQEMKVDLISLSAHKMYGPKGIGALYVRRKPRIRLEAQMHGGGHERGFRSGTLATHQIVGMGEACRIAKEEMQKDYDHCLAMRDRLLDGVKDMEAVHINGDLDQRVPHNLNISFEFVEGESLLMALKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLNDELAHSSIRFSFGRYTTEEEIDHAITQISQAVNKLRDMSPLWDMYKEGIDLNTVEWAHH >NZ_LN554846|712894:720142|718277_719564_+|WP_045101383.1|DBSCAN-SWA MSQKLTVQLSSIAAPAHWGVNAPLSFTTEGAVIHCIDSDVYSAIQRAARKLTGQGLVAVELEGSEWDLESIWSFVQGFRDSKSNNDVTWTALETADEKELNDRILTTNWTREIINKTAEEVAPRQLTTMAAEFIKSVAPAGTVTAKIVKDKDLLTEGWTGIYAVGRGSERTSAMLQLDYNPTGDADAPVFACLVGKGITFDSGGYSIKPSGGMASMKADMGGSALATAGLAMSILRGLDKRVKLILCCAENMISGRALKLGDIITYKNGKTVEILNTDAEGRLVLADGLQFASAQNPELIIDCATLTGAAKMAVGNDFHSLLSFDDELSQKALASAQEENEGLWRLPLMEFHRTMLPSSFADLANIGSGPYSPGASTAAGFLSYFVDDYKKGWLHMDCSATYRTAPSDKWSAGATGVGVRTLANLLTK >NZ_LN554846|712894:720142|714646_714970_+|WP_045101378.1|DBSCAN-SWA MAISVTEAAASRVQTFLENRGKGIGLRLGVRTSGCSGMAYILEFVDELNEEDQVFEEFGVKIIIDPKSLAYMDGTELDFAKEGLNEGFQFNNPNVKSECGCGESFNV |
9 | Faustovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1091800 : 1161918
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN554846|1091800:1161918|DBSCAN-SWA ACTACTTTTTGCTTTGAACAAATTCTTTGCTAACATCAACAATGGCAATGTCTTGAATAAATTCTCTACCCAATAAAACAGAATGGGTCATATGGGAGCGATCAGCAAGAGTAAACTGTACTTTTTCATGGATAGCGCCAAGTTTGATCCACAGTTCAACTACTGGACGGCGCTCCAGTTCTTCTGTTGTGGATTGGCGTATTTTTACACTACGAATAACAGGAGCAGCTATCCACTCTAGTTCATTACTACCTTTTTGTATATTTTGGTTAAGTAGATGAAATCTAACCCATTTATTTCCATTTCGTTCGAATTCTTGTAAATCGATAGCATTAAGAGATGAAGTGGTTGCACCTGTATCAATTCGGGCGCTAAAACCTTGTTCAATATCAGCTATTTCAACATTTTCAATCGCACCTAAAATAAGAGTGTCTTTGAGTACTTGGTTTTGAAGTGATACCGGAGATGGTGTTAAGTGCTTCTTCTTTTCTGTTACTAATTTTAGTGCAGTCTGAATTTTATTTTGTTCCGATCTAACTAATGACAGTTCTTCAGAAACATTGGATAACTCTTTTTCTAACGTCGCAATATACTCATTTTGAATTTCAATCTTGCTCTCCATGCCGCTTAAACGTGTATTTAAATTTGATTCCATGGATTTAATTGCTGCAACTGTTTCGGTGTTATCGGTTGATACTTGCTGAACTTGTGGCGTTAATGCACAGCCCGAAAGACTTAAAATGGCAACCAGAGGTAGAATTCGTTGGATCATTTGATGTTCCGTTGAGTTAGAGTAACATAGGAATAATAACGATAATAAATGGGAGCGAATAGCCCCCAAATGTTAGAGTTTAGTCAGGTTTTTTAGCAATTAAGATTGCACGCTTAGGAGCCGGGTGGCCTTCAATTGTTTTTGTTGGGTCATTTGGGTCTAAATATTCAGGCAATGAATTGTGTTTCATCCATTCTGTTGAACGTTGTTCACCGGTTGTAGTCACGCATTCATCAACAATGTTAACGTCTACAAAACCCACACTTTCAAGCCATACTTTTAATGCTCGTGCAGATGGGAAGAAGAAAACATTACGCATTTGAGCATAACGGTCAACAGGCATTAATACTGCGTTTTCATCACCATCAATAACCAGTGTTTCTAATACTAATTCACCACCAGCGACTAATTGGTTTTTTAATTGAATTAGGTGATCTAATGGAGAGCGGCGGTGATAAAGAACCCCCATGCTAAATACAGTATCAAACGCATTTAATTCAGGAAGCTGCTCAATACCTAAAGGTAATAAATGTGCGCGTTGATCATCGCCCATTAATTTACGAATGGCTTCAAATTGAATTAAGAATAAATGTGATGGGTCAATACCAACACATAAACGAGCTTCTTCGCCTAGCATACGCCACATGTGGTAGCCATTACCGCAACCAACATCTAAAACTGAGCGGTTTTTAAGTGGAGTAATGTGAGGCAGTAGACGATCCCATTTCCAATCTGAGCGCCACTCTGTATCAATATGAATATCATGAACCGTAAAAGGCCCTTTACGCCAAGGATGAAAGGTCTGTAATAAGTTTTCTAATTTTTTACGCTGTCCATCTACTAAAGGCTCATTATTTGATAATGTCACCGATGTTTTTAAATCAATGTTATCTGCACATCCTTCAGGGATTTTTTTAAGTGCTTTAGTCCAGCGCTCAATATCACCATGCTCTGCGTTCTGCCAATCAGTGAGTTGCTGAGGAAGAACATTTAACCACGGCTGAAGAATAGTATCTTGAGAAATTAGAGTGTAAAAATTAGCAAAGTTAATCATTGAGGCATCTTAAATTAATAAATTAGAAAAAATAAATGGCAATATTCAGTTATTTAATGGCAAACATAGAACCGAAATTGAAGCATTGGAACCATACTTCTGCGCTTTTAAAGCCAATATCATTAAAGCGCTGTTTATGAGTTTCAATAGTGTCAGGTAGCATCACATGTTCGATAGCACTGCGTTTTTGGCTGATCTCTAGTTCACTGTAGCCATTTGCACGTTTGAAATCATGGTGCAGGTCGATAAGTAACTCGTTCGCACTTTCATCTTCAAATATGTACTTCTCAGATAAAATAAGAATGCCGCCAGGACGCAAACCGGCGTAAATCTTTTCAAGTAAAGCACGACGATCGGCAGGAACTAAGAACTGCAAAGTGAAGTTAAGTACCACAACAGAGGCATCCTTTATATCGACATCACGGATATCTGCTTCAATAATGGTGACTGGTGTGTCAGAGCGATAAGCATTGATAAGTAGACGGCATCGCTCAACCATTGCTGATGAATTATCGACACCAATAATTTGGCAACCTTCTTGATCAATATGACGACGCATAGAAAGTGTTGCAGCGCCTAATGAACAGCCTAAATCATAAACCGTTGAATGAGGTTTTGCATAACGTTCAGCCAGCATTCCAATTGCGGAAATAATATTACTGTAGCCTGGGATTGAACGTTGGATCATATCTGGAAAGACTTCAGCAACACGTTCATCAAACGTAAAATCACCAATTTTATCAATCGGTGCTGAAAATATTGTGTCTGGGTTAGCCATGGGGTTCTCACAAAGGCAGTTTTTATATCCATACGACATCATACAATTCTAGGTAAATATTGGTGTACTACTTACCTAGAATGGCATTTTCTTGTGCTCTCCTGCACATTAGGTCGCTATTGTAGTTAATTCTTATCTTAATGTCTTTAGGGCTATGAAAATTGAAAGTGAACTTTTTTTTCTCCTTACTATGTCGTTAAAGGGATTTTCCTTTATAATGTCGCTATATTTTTGCGTTTAGCTTATTAATTCAGCAAGGTAGCTGTTTTATTCGTCATTTTAGCAAGCGTAAATTGGTTTATGAAAAGTGCAGTAAGTCTTTTTACTGCGTTTACTATTGATATGTATATTAGATTGGGAAAATCATCATGCGCACCCATTACTGTGGTAACCTGAACAAGTCCCTTGCAGGGCAAACTGTAGAACTTTGCGGCTGGGTAAACCGTCGCCGTGACTTAGGCGGTCTTATCTTTATTGATATGCGAGATCGTGAAGGTATCGTTCAGGTAGTTGTTGATCCAGATATGAAAGATATCTTTTCAATCGCTAACCAACTGCGCAATGAATTCTGTATCAAATTTACTGGTGAAGTACGTGTTCGTCCTGACAGCCAAGTAAATAAAGATATGGCTACAGGTGAAGTTGAACTTTACGCGACAGGTCTTGAGATCATCAACCGCTCAGAAGCGCTTCCACTGGATTTCAACCAAACGAACTCAGAAGAACAACGCCTGAAGTACCGTTACATTGATCTACGTCGTCCAGAAATGAGTGACCGTATCAAGTTACGTGCTCGTGCATCTAGCTTCGTTCGCCGCTTCTTAGATGAGAACTTGTTCTTAGATATCGAAACACCAGTACTAACTAAAGCAACACCAGAAGGTGCTCGTGATTACCTAGTACCAAGCCGTGTTCATAAAGGCAGCTTCTACGCACTTCCACAATCACCACAGTTGTTTAAGCAACTTCTGATGATGTCTGGTTTTGACCGTTACTACCAAATCGTTAAATGTTTCCGTGATGAAGATTTACGTGCTGACCGTCAACCTGAATTCACTCAAATCGATATTGAAACGTCTTTCTTATCATCGACTCAAGTTCGTGAAATCACAGAGCGTCTAGTTCATGATATGTGGAAAGAGCTATTAGATGTTGAACTTGGTCAATTCCCAATCATGCCATTCTCTGAAGCGATCCGTCGTTTTGGTTCTGATAAGCCAGATCTACGTAACCCACTAGAATTAGTTGACGTTGCTGATCTTCTTAAAGAAGTTGAATTCCAAGTATTCGCTGGTCCTGCTAACGATGAAAAAGGCCGTGTAGCGGTTATTCGCGTTCCTGGTGGCGCATCGCTTTCTCGTAAGCAAATTGATGAATACGGCAAGTTCGTAGGTATCTACGGCGCGAAAGGTCTAGCTTGGATGAAAGTGAACGATCGTGCTGCAGGATTTGAAGGTGTTCAATCTCCTGTTGCTAAGTTCCTAAGCGAAGATATCGTAAACAGCATTTTAGAGCGTACTGAAGCTGAAACTGGCGACATCATTCTATTTGGTGCCGATAAAGCTGGTATCGTTGCAGAAGCAATGGGCGCTTTACGTATTAAACTAGGTGATGATCTTGAGCTTACAGATAAGAAAGCGTGGGCTCCACTTTGGGTTATTGATTTCCCAATGTTTGAAGAAGATGGCGAAGGTAACTTGCACGCAATGCACCACCCATTCACTTCTCCATTAGGTATGACAGCGGAAGAGCTTAAAGCAAATCCAGCAGCAGCAAACTCTGATGCATACGACATGGTTATCAATGGCTATGAAGTTGGTGGTGGTTCAGTTCGTATCCACAATGCTGAAATGCAAACGGCAGTATTCAGTATTTTAGGTATTGAAGAGAAAGAGCAACAAGAGAAATTTGGTTTCTTACTTGAAGCGCTTAAATACGGTACGCCACCACACGCAGGTCTTGCATTCGGTCTTGACCGTTTAGCTATGCTTCTTTGTGGAACTGAAAACATCCGTGATGTTATCGCATTCCCGAAAACAACAGCAGCTGCGTGTCTATTAACGAACGCACCAAGTCTTGCAAATCCAGAATCTCTTACTGAGCTATCGATTGCAGTAAAACTTGCTGAGAAAAAAGACGCTTAATTAAGTTTTCTTTATTCTTAAAAATGCCCGCATTATGCGGGCATTTTTGTATCTGTTATATCTAAAATGAGAAAGTAGCACATGACTAATACCTTGAGTTTATGGGGATACCTCGCTAATATACATGTATAAATACTCAGTGGTTTTACTATGTCTATCATTTTAGGGATCGATCCCGGCTCTCGCATTACCGGTTATGGTGTTATTCGTCAAAATGGCCGACACCTACAATATTTAGGTAGCGGTTGTATC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57 | Bacillus_virus(28.57%) | protease,integrase,tRNA,plate,transposase | attL 1089672:1089687|attR 1123325:1123340 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1629647 : 1726658
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN554846|1629647:1726658|DBSCAN-SWA 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96 | Vibrio_virus(11.76%) | protease,integrase,tail,portal,tRNA,plate,transposase | attL 1683352:1683411|attR 1726626:1728975 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2405168 : 2412717
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN554846|2405168:2412717|DBSCAN-SWA CCTATTTTAATATCAATTTCTTTGGAAGAACAAATGAGAAGGTGCTACCTTTGCCCAATTGACTCTGAATTTCTAATTGTGAATCGTGATGACTAAGTGCATGTTTTACAATGGCAAGACCAAGACCACTCCCGCCCGTATCTCTTGAACGCGCTTTATCTACCCGATAAAAGCGCTCTGTTAAACGAGGGATGTGCTGTGGCTCAATTCCTTGACCAGAATCCGTTACCGTTAAAAGTGCGCCAGATTGTGCTTTTTTCCACTCAACCATAATCTCTGCGCCATCAGTAGTATGCTTAACCGCGTTATACACTAAGTTTGAAATCGCACTGCGTAATTGGTCTTCATCACCTTGCACTTTAAGATCATGATCTATATTAAAGGTTACTTTGTGATTTCTATTCCCACTTAACGCGATCGCTTCTTTTTCTAAAATATCTAACATGCATGGCACATCGACACGATCTTCTAACATTGAGGTTGCAGCCGCTTCTATTTTTGATAACGTAAGTAGCTGCTCAACTAAACCTTCCATTCGAGACAATTGCTCAGTCATCACACCATGCGCTCGATTCCACATTGGTCCAACAAGCATCTCAGGATCTTCTGACATTTCTAGATAACCACGAAGTACCGTCATAGGGGTTCGTAATTCATGAGACACGTTAGCAAAGAAGTTACGGCGCATTCCCTCTAATTGCTTAATTTGGGTAACATCGCGCACCACCATTAAATATTCACCTTCACTGTACGGCACAATACGGATCTCAAGTGTCTTATCTGTGTTAATTGGTGAGGGCATATCTAATGGAATATCAAAATGCTGAGCCATTAAATATTGAACAAAATCAGGTGTGCGGATCAAATTAGTAATCGGCTGTCCTGAATCACTAGGCCAACGAAAACCCAGTAAAGATTGTGCTAAGGTGTTACACCACACAATATTACCTTCATGACGAAAAACCACCACCGCATCAGGCAGCGCTTCAGCCCCTTGCCTAAAACGACGAATTAACGTTGATAATTCTTTACGACGCTTTTTATGTCTTTTTTGTAAACGATAAGTCTCATCAAAAATAGGTTCCCAACTTCCTGAAGCAGAGGGAGGCGTTGCCTTACGCCCTTCATGCAACCAATGAGACATTTTAATTTGGTTATGCAAATGCCAAATTAATAAAATAAATGAAGCAATAAACAACAATGGCCATAACGCATCAAACAGATACCCAACAATAACCCAAGGTACATAGAAAAAAGCCAGTTCACCTACCATTTTTTTCCATGAAAGACGTTCAACCATGTATTTTATCCTTCACTTATAGTTATTATGATTTACGACATTTGAACAGAGAAACGGTAACCGGCACCACGAACCGTTTGAACTAAACGATCATGGCCTTCTGTCTCTAGTGCTTTACGTAAACGACGAATATGAACATCTACCGTACGATCTTCTACGTAGACATTAGTACCCCACACGTTATTCAATAGCTGTTCACGGCTATAAACACGTTCTTGATGCGTCATAAAGAAATGCAGCATTTTAAATTCAGTTGGCCCCATATCTAACGGCTTATCATTCGCTGTGACACGATGAGAAACAGGGTCTAATTTCAAACCTTGTACATCAATCAATTCTTCAACAGACGTAGGTGATACACGACGAATTACCGCTTTTAAACGCGCCATTAATTCTTTTGGTGAGAATGGTTTAGTTATGTAATCGTCCGCACCCACTTCAAGACCTCGAACTTTATCTTCTTCTTCACCACGAGCGGTTAACATTACCACTGGGATCTTTTTAGTGAACTCATCACGCTTAAGGTGTTTGATCAAATTGATGCCTGAGCCACCTGGCAACATCCAATCCAACAAAATTAAATCAGGGTAAGGTTCGCAGAGTAAACCAAGCGCAGTATCATAATCTTCTGCTTCAATTGGTTCATAGCCTTTCTGCTCTAAAACAAAGCACAGCATTTCACGAATTGGGGCTTCATCTTCTACGACAAGGATCCTTCTAGACATTATCTTTTACCTAAGTTAACCAACAAAAATGTGTGACGCTATTATTAAAGGTAATTATGACACTTTTGTGACCATTGAAAAGAAAACTTCATAATTTAATCATTGATTTTCAACCTTATAGAGATTTCCCCAAAATCCCGAAAACTCTACAAGCATAATGCGTCAAAATCTCCTATCATAAGCGCACTTAAAAAAGACAGGAATTCAACAGCATGATGTGGTTTAAAAATTGTTTAATTTATCGTTTTACAAAAGAAGTTGACCTCAATCCTGAGCAACTTGAAAAACAACTGAACGATTTTCGTTTCACACCTTGTGGCAGCCAAGATATGCAAAAGTTTGGCTGGGTAACTGCAATGGGCCGTCATGGTGATATGCTGACTCACGTAGCAAGCAAAAATATTCTTATCTGTGCTAAGAAAGAAGAAAAAATGTTGCCAGCGTCAGTGATTAAAGAATCAATGAACGCAAAAATTGATGCCATGGAACTTGAGCAAGGTCGCCCTCTTAAGAAAAAAGAAAAAGACTCTATCAAAGATGACATCGTGATTGATCTTCTTCCACGAGCATTCAGCAAGCATCAACAAACCTATGCCTTAATCTTGCCTGAATCTGGCTTTATTATTGTTGATGCGGGTAGCTATAAGAAAGCAGAAGATGTATTGGCTCTGCTTCGTAAATCTATCGGCAGCTTACCTGTTGTTCCTCTTACTTCAACGCAACCTATTGAAAATGCATTAACCGAATGGGTTAAAACAGGCACGACTCCTCAAGGTTTTGAGATGGGTGAAGAAGCGGAACTAAAAGCAATTTTAGAAGATGGCGGCGTGATCCGTTGTAAGCAGCAAGAATTAGTATGTGATGAGATCCATGCTCATATTGATGCAAACAAAGTCGTGACTAAATTAGCGCTAACTTGGCAAGACCGTTTAGAGTTTATCCTTGCCGATGACCTATCGCTAAAACGCCTAAAATTCAGTGATGACATTAAAGACCAAAACGAAGATATTGGTTTTGAAGATAAAGCAGCACGTTTTGATGCTGATTTCTCTCTAATGAGCTCTGAGCTTGATGCTCTGCTTCCTGATCTATTCAAAGCACTTGGTGGCATTGAAGAGAAAGAGTAAGACGATACGCTTCGCGTCTAGATACTATAAAAGCAATATACTTACCTGCTCTTATAGTTTCTAGTTAGCGTAGCGTATAGTTCCTAGGCCAATACCCCTATAAAATACAAGTTCAATCTTGCTAATCCCTAGCACTTCCCTCACTTTCCATGTAAAATCCGGCCTCCTTCATATCCACGTGATATGACCTGACCTGAGATCAGAATACAACATTGGGAAGCAATCATGTTTAAGCCAGAACTACTTTCGCCTGCGGGCAGCCTTAAAAATATGCGTTATGCGTTTGCCTACGGTGCAGATGCAGTTTATGCAGGCCAGCCACGTTACAGCCTTCGTGTTCGTAACAACGAATTCAACCATGAAAACCTAGAAATCGGCATTAACGAAGCGCACGCGCAAGGTAAAAAACTGTATGTGGTATGTAATATCCAACCACATAACTCAAAGTTAAAAACCTTCATTCGTGATCTAGAGCCAATCGTTGCTATGGGCCCTGACGCATTAATCATGTCAGATCCTGGTTTAATCATGATGGTTCGTGAAGCTTTCCCTGAAGTAGTTATTCACCTGTCAGTTCAAGCTAACGCCGTTAACTGGGCGACAGTGAAATTCTGGTCTACTCAAGGTGTTGAGCGTGTGATCTTATCTCGTGAATTATCACTAGAAGAAATTGAAGAGATCCGTGAACACTGTCCTGATACAGAACTAGAAATTTTTGTACACGGTGCATTATGCATGGCGTACTCTGGTCGCTGCTTGCTTTCTGGTTACATGAACAAGCGTGATCCAAACCAAGGTACATGTACTAATGCATGTCGTTGGGAATACAAAGCTGAAGAAGCAAAAGAAGACGAAAACGGTCAAATCGTTGAAGCTAATCCAACGGGTGTTGAGATCCAAGATGTGGAAGTTCAAGAAGAGCGCCCAGACAACACACTAGGTCTAGGCAAACCAACGGATGAAGTAGTTCTTCTTTCTGAAGCACACCGCCCTGAAGAGAAAATGGCAGCATTTGAAGACGAGCATGGTACTTACATCATGAACTCTAAAGATCTTCGTGCTATCCAGCACGTAGAGCGCCTAACTAAAATGGGCGTTCACTCTCTTAAAATCGAAGGTCGTACTAAGTCTTTCTACTACTGTGCTCGTACTGCTCAAGTTTATCGTAAAGCGATTGATGATGCCGTTGCTGGTAAACCATTTGATGAAAGCCTAATGGGTACGCTAGAGAGCCTAGCTCACCGTGGTTACACTGAAGGTTTCCTACGTCGTCATACACATGATACGTATCAAAACTACGATTACGGTTACTCTATCTCTGACTCTCAACAGTTTGTTGGTGAATTCACAGGTAAACGTCGTGGTGATTTAGCGGAAGTTGATGTTAAAAACAAATTCCTTGTGGGTGATTCAGTTGAGATCATGACACCACAAGGTAACTTAACATTGACGCTAGAAGTGATGGAAAACCGTAAGAGTGAAGCAGTAGATGCAGCAAAAGGCAACGGCCACTTTGTATTCATCCCTGTTCCTGCAAACGTTGATTTAGAATATGCACTTCTAATGCGTAACTTACACACGGGTGAAGATACTCGTAATCCACACGGCAGTAAGTAATGGCGTTATTGATCAATAAAAAATGCATCAACTGTGATATGTGTGATCCTGAGTGTCCCAACGAAGCGATCACCATGGGCGATAAGATCTACGAAATTAATCCAGATCTCTGTACTGAATGTAAAGGCCATTACGATGTTCCTACTTGTCAGTCAGTTTGCCCAATCAACAATTGTGTCGTTTCCGATCCAAACAACGTAGAAACAGAAGAAGAGCTATTAGAAAAATTCGTTAAGCTTCAAGGTCTAGCGTAATAATCTCTAATCACCTAAACTGATTCAATTAAAAACGCCCAGCGATATCACTATCTCTGGGCGTTTTTGTATCGATTTACAAAGTAAGTAGCTAACAGCTTATTTTGTCACAAGACCATAGGGCTTACTTTTAAATACCTTTGGTTCATTTTGAATCGTCGGTGCGGCATGCGGTGTTTGCCAATCAAGTAACATTATCGCTAATACATTACGGTGCTCACCATCAGTTAAATCAGTACTGTTTGATGTTGATGGCACCATATTCTTCTCACGGTTAATCGCATCTTGAATATGTTTTTGCGTTTTATACACCACAGGATCATTTTCTAACCCTGCCAGTAAGAAGGTAATGCCTACTTCTGAAATAATGTCTTCTTTGGCTCTTTCTAAAATAGCATCGATGTTATTACGCAGGTAATCGTATATCCATTGATGATCAGACTCTTTTAATGGGTATTGATAATATTGAGAATCAGCCAATAAAATATGCGTTAATCCGTAGATCTTATTGCCATATTGCTGCTTAGTAAGCTCTGCATCTTTCTCATCTGGGTAGGCTAATTTAAACGCTTCTACAAAATCATCAACCACATCTTGCTCGCCCAATTGACGTAACCAATAAACTTGATTCGCTAGTTGAGCTGCCCACGCTTTAATCATCGCCTCATCTGTCGCGTATTTTTTAAAATCATACCGGCGGATAATTTCTCGCAGCTGTTTATCATTACGATGCTTTAAACCGTATTCATTAGCACGAGCCATTGAGCCAAGTAAATCAACACCAAGATAGAAGTACTCTGGCATAGTTTTGGTCGCTTGATAGCGTAAAATACTACGGATATCAGTATCATCTACGTAGGTGCTTAGCCGTTTATTGGAATACGCTTCAATCTGTTTTGGTGTATGAACTTCTGAAGAGAATTGATTAAGTCGACTTGCCACTCGCGCCATATCAGACCAAACCGCCGCTGAATATTTAGGATCCATCGTTTGACGGTACATGCGTAAACCATAATGGCCCGCTTTAAATGCAGATAACGTATAGAGCCGAGTTTCATAGGTGTGACGAATTGAGGCCGCATCTTGCTTAAAGCTCGGGACTGTTCTTCCACCCTCCATTATTTCGGCATTGGCAGTAGTTGAACTAAGCAGTAAAACAATAAATAGCGATAACGTCCGTTTAAATAACCCCATACTCACTCTCTTCTACATTAAGAAACTAAAAATACAATTGGTTACATAATAAACGAGAAGAATAGGAAATGGTCAGCAATATGTAAATAAACGACGTCAGATCATTTGTTGGCGACATAAAAAAAGCCTAATGATATAAAATGAATATCATTAGGCTTAAGTTTATTGGTTGATGGATTAACTAAAATTATTTAGTTAAATCATCAAAAAAGTTCTTAACACCAGATAAGAAACCTTCTGATTTAGGATTGTGCTTCTTCGCATCTTTTCCATCAAATGATTCTTGGAACTCTTGCAGAAGTTCTTTTTGACGTTTCGTTAGCTTAACTGGAGTTTCAACAATCAGCTTAACGATTAAGTCACCCGCACTATGAGTACGAACGCCTTTCACACCTTTACCACGCATACGGAACATACGTCCTGTTTGAGTTTCTAGAGGCACTTTTAAGCTTACACGACCATCAAGAGTTGGAACTTCAACTTCGCCACCTAAGGCAGCCATCGTAAAGCTTACTGGTACTTCACAGTATAAGTTGTTACCGTCACGTTCAAAGATGTTATGTTCTTTTACGTGAACTTGTACATATAGATCGCCTGCTGGAGCGCCGTGCTCTCCCGCTTCACCTTCATTAGATAGACGAATACGGTCACCAGTATCAACACCTGATGGGATCTTAACATTAAGTGTTTTTGTCTTTTGAACTCGACCTTCACCATGACAAGAATTACATGGGTCTTTAATAATCTTGCCTTTACCGTGACAAGTAGGACAAGCCTGTTGCACAGCAAAGAAACCTTGGCGCATTTGAACTTGGCCGTGACCATGACAAGTGCTACAAGTAGATGAAGAGGTGCCTTTCTTAGCGCCTGTACCTTCACATGGATCACAAGACACTAATGTTGGTACTTCAATCTCTTTATCACAACCACGAACCGCTTCTTCTAGCGTAAGTTCCATGTTGTAACGTAAATCTGAACCGCGTTGTGCACGTTGCTGACCACCGCCACGACGACCGCCACCAAAGATGTCACCAAACACATCACCAAAGATATCGCCAAAGTCACCTTGACCGCCGCCAAAGCCGCCACCACCGCCCATGCCACCTTGTTCAAAGGCTGCATGACCGTATTGATCATAAGCTGAACGCTTTTGAGCATCCGTTAAGATCTCATACGCAACTTTTACTTCTTTAAACTTTTCTGGCGCTGTTTCATCGCCCTGATTACGATCAGGGTGGAATTTCATCGCTAGACGTTTATAGGCTTTCTTAATATCACGCTCAGAAGCATCACGGCTTACGCCCAATACTTCATATAAATCACGTTTAGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN554846|2405168:2412717|2410289_2411384_-|WP_045102758.1|DBSCAN-SWA MGLFKRTLSLFIVLLLSSTTANAEIMEGGRTVPSFKQDAASIRHTYETRLYTLSAFKAGHYGLRMYRQTMDPKYSAAVWSDMARVASRLNQFSSEVHTPKQIEAYSNKRLSTYVDDTDIRSILRYQATKTMPEYFYLGVDLLGSMARANEYGLKHRNDKQLREIIRRYDFKKYATDEAMIKAWAAQLANQVYWLRQLGEQDVVDDFVEAFKLAYPDEKDAELTKQQYGNKIYGLTHILLADSQYYQYPLKESDHQWIYDYLRNNIDAILERAKEDIISEVGITFLLAGLENDPVVYKTQKHIQDAINREKNMVPSTSNSTDLTDGEHRNVLAIMLLDWQTPHAAPTIQNEPKVFKSKPYGLVTK >NZ_LN554846|2405168:2412717|2408544_2409936_+|WP_045102756.1|tRNA|DBSCAN-SWA MFKPELLSPAGSLKNMRYAFAYGADAVYAGQPRYSLRVRNNEFNHENLEIGINEAHAQGKKLYVVCNIQPHNSKLKTFIRDLEPIVAMGPDALIMSDPGLIMMVREAFPEVVIHLSVQANAVNWATVKFWSTQGVERVILSRELSLEEIEEIREHCPDTELEIFVHGALCMAYSGRCLLSGYMNKRDPNQGTCTNACRWEYKAEEAKEDENGQIVEANPTGVEIQDVEVQEERPDNTLGLGKPTDEVVLLSEAHRPEEKMAAFEDEHGTYIMNSKDLRAIQHVERLTKMGVHSLKIEGRTKSFYYCARTAQVYRKAIDDAVAGKPFDESLMGTLESLAHRGYTEGFLRRHTHDTYQNYDYGYSISDSQQFVGEFTGKRRGDLAEVDVKNKFLVGDSVEIMTPQGNLTLTLEVMENRKSEAVDAAKGNGHFVFIPVPANVDLEYALLMRNLHTGEDTRNPHGSK >NZ_LN554846|2405168:2412717|2411571_2412717_-|WP_045102759.1|DBSCAN-SWA MSKRDLYEVLGVSRDASERDIKKAYKRLAMKFHPDRNQGDETAPEKFKEVKVAYEILTDAQKRSAYDQYGHAAFEQGGMGGGGGFGGGQGDFGDIFGDVFGDIFGGGRRGGGQQRAQRGSDLRYNMELTLEEAVRGCDKEIEVPTLVSCDPCEGTGAKKGTSSSTCSTCHGHGQVQMRQGFFAVQQACPTCHGKGKIIKDPCNSCHGEGRVQKTKTLNVKIPSGVDTGDRIRLSNEGEAGEHGAPAGDLYVQVHVKEHNIFERDGNNLYCEVPVSFTMAALGGEVEVPTLDGRVSLKVPLETQTGRMFRMRGKGVKGVRTHSAGDLIVKLIVETPVKLTKRQKELLQEFQESFDGKDAKKHNPKSEGFLSGVKNFFDDLTK >NZ_LN554846|2405168:2412717|2406499_2407192_-|WP_045102755.1|DBSCAN-SWA MSRRILVVEDEAPIREMLCFVLEQKGYEPIEAEDYDTALGLLCEPYPDLILLDWMLPGGSGINLIKHLKRDEFTKKIPVVMLTARGEEEDKVRGLEVGADDYITKPFSPKELMARLKAVIRRVSPTSVEELIDVQGLKLDPVSHRVTANDKPLDMGPTEFKMLHFFMTHQERVYSREQLLNNVWGTNVYVEDRTVDVHIRRLRKALETEGHDRLVQTVRGAGYRFSVQMS >NZ_LN554846|2405168:2412717|2407404_2408319_+|WP_080889813.1|DBSCAN-SWA MMWFKNCLIYRFTKEVDLNPEQLEKQLNDFRFTPCGSQDMQKFGWVTAMGRHGDMLTHVASKNILICAKKEEKMLPASVIKESMNAKIDAMELEQGRPLKKKEKDSIKDDIVIDLLPRAFSKHQQTYALILPESGFIIVDAGSYKKAEDVLALLRKSIGSLPVVPLTSTQPIENALTEWVKTGTTPQGFEMGEEAELKAILEDGGVIRCKQQELVCDEIHAHIDANKVVTKLALTWQDRLEFILADDLSLKRLKFSDDIKDQNEDIGFEDKAARFDADFSLMSSELDALLPDLFKALGGIEEKE >NZ_LN554846|2405168:2412717|2409935_2410190_+|WP_045102757.1|DBSCAN-SWA MALLINKKCINCDMCDPECPNEAITMGDKIYEINPDLCTECKGHYDVPTCQSVCPINNCVVSDPNNVETEEELLEKFVKLQGLA >NZ_LN554846|2405168:2412717|2405168_2406467_-|WP_045102754.1|DBSCAN-SWA MVERLSWKKMVGELAFFYVPWVIVGYLFDALWPLLFIASFILLIWHLHNQIKMSHWLHEGRKATPPSASGSWEPIFDETYRLQKRHKKRRKELSTLIRRFRQGAEALPDAVVVFRHEGNIVWCNTLAQSLLGFRWPSDSGQPITNLIRTPDFVQYLMAQHFDIPLDMPSPINTDKTLEIRIVPYSEGEYLMVVRDVTQIKQLEGMRRNFFANVSHELRTPMTVLRGYLEMSEDPEMLVGPMWNRAHGVMTEQLSRMEGLVEQLLTLSKIEAAATSMLEDRVDVPCMLDILEKEAIALSGNRNHKVTFNIDHDLKVQGDEDQLRSAISNLVYNAVKHTTDGAEIMVEWKKAQSGALLTVTDSGQGIEPQHIPRLTERFYRVDKARSRDTGGSGLGLAIVKHALSHHDSQLEIQSQLGKGSTFSFVLPKKLILK |
7 | Bacillus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2457245 : 2467811
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN554846|2457245:2467811|DBSCAN-SWA AATGAGCCTATCAATAACCGAACTTAATATTCTAACTCGTAATGGTTCTACTTTATTACCCTCTTGTTCTTTATCAATACAGAAGGGAAAAGTACTCAGTGTCATGGGGCCTAGTGGCTGTGGTAAATCAACCTTACTAAATGTCATCGCTGGACATCTAAGCTCTGATTTTCACTATACTGGGAAAATATATATTGATGAAAAACCTATACATCAACTTCCCTCTCATGAACGTAATGTTGGGATATTATTTCAAGAAGATCTTCTTTTTCCTCATTTATGCATCTGGGAAAACCTAGCTTTTGCATTACCTAATTACATCAAAGGATCACAGCGAAAAATAGAAGCAATGGAAGCATTAGAAAGCGTACAATTAGAAAAATTAGCTACTGTATTTCCAGATCAAGTTTCTGGTGGTCAACGAGCTAGGATCAGCTTAGTCCGTATGTTATTAGCCAAGCCTAAAGTTGCATTATTGGATGAACCTTTTAGCAAACTTGATAAAGTATTGCGAGTTCAATTTCGAGATTGGGTTTTTGAACAGTTAGCGTCAGCAAATATTCCAGCATTGCTTGTAACACACGATGTTGATGATATTCCTAAAGACAGCCAACAATTAATTTGGCCAGTGGAGCGTAAACATGCTTGATAAATTCAGTATTAGAGTTATCAAAAAGCCCTTATCGATGATTGCTAGCCGTTTACATCAATTTGGGATCACAGCTAATCAAACAACCGTGTTTGGTTTTATTTTGGGGTGCTTAGCTTTTCCTGCTCTGATTTTTCAAGAATATAATATTGCGTTAATTCTCATATTATTGAATCGAATTTGTGATGGTTTGGATGGGGCACTAGCCAGAATTAATGGTATTACTGATTCTGGTGGCTTCTTAGATATTAGCTTAGATTTTTTATTTTACTCACTCATCCCTTTTGGTTTTATCTTGGCAAATCCTGAGCAAAATGCAATTGCTGGTGCACTGCTTATCTTTTCTTTCATCGGAACCGGAAGTAGCTTTTTAGCTTTTGCTATTATGGCTGGAAAACGAAATATTGATAATCCGATATATAAAAACAAATCCCTCTATTACATGAGTGGCTTAACGGAGGGGACAGAAACCATTGCTTGCTTTGTTCTATTCTGCTTATTTCCTACTCACTTTACCCTCATTGCCTATGTCTATTCTGCTTTATGTTGGATCACTACATTTAATCGTATTTGGTCTGGATTTCATACTTTACAAGAAAGTGAAAAACAGGAGACTTCATAAGAAAAAAGCCCCAACATGAAATTGCAGGGGCTTTTATTATCTTATTAATCTGAGTTATATTTATGAGGTTTAATGCTCTTCAATTGCGAATAGTGTTTCCATATTCAAGCCTTGCTGCGTCATAATTTCTCTCAGACGTCGTAGACCTTCCACTTGAATTTGTCTTACTCGTTCACGCGTTAAACCAATCTCTTTACCAACTTGTTCTAGTGTTGCTGTTTCATAGCCTAATAAACCAAAACGACGAGCGACTACTTCTTTCTGTTTTGGGTTTAGCTGTTCAAGCCAACCAACTAGAGATGCATTAAGATCATTTTTTTGCGCTTCCGATTCAGGGTCGTTATGTTTGGTGTCTGGTAAAATATCCAGTAAGGCTTTATCTGACTCACCGGCAACCATTGAATCTACAGAAGTTACTCGTTCATTTAAACGCAGCATACGACTCACATCACTAACTGGTTTATCTAATTTTTCTGCAATTTCTTCAGGCGTTGGCTCATGATCTAGTTTTTGTGAAAGCTCACGTGCAGCTCGCAAATAAACATTAAGCTCTTTTACTACATGAATAGGTAAACGTATGGTTCGAGTTTGATTCATAATGGCACGCTCAATAGTCTGGCGTATCCACCATGTTGCATAGGTAGAAAAGCGAAAACCTCTTTCTGGGTCAAACTTTTCAACCGCTCGGATCAACCCAAGATTACCTTCTTCAACTAGATCTAACAGTGCAAGACCACGATGATTGTAACGGCGTGCTATTTTTACAACGAGTCGAAGGTTACTCTCAATCATTCGAGAACGTGCCGCTTGATCACCTTTTAAGGCTAAACGACTAAAATAAACTTCTTCTTCTGCAGTTAATAATGGAGAAAAGCCAATTTCACCCAAGTAAAGTTGCGTTGCATCCATTACTTTTTGTGAACTGGTTACCTCAAGACGTTCCGAACTTTCCTCAGCAATAACGTCACTGTCATTAACTGTATCTAGCTCGAACTCTTCAACTTCTTTAGTTACTGTATTGCTTTTACTCATAGCGCCTCCCCATGGCGAGCCAGCAAGACATTACAACTCAGCTATGTCATCCCTGTTACGGTAAATACCGTTGTGGATTTACCGATTTCCCTCTAAAGCGAACCTCAAAATGCAAACGAACACTGCTCGTACTTGAGCTGCCCATCGATGCTATTTTTTGCCCCGCATTGACATTTTGACCTTCTTTAACAAACAGTGACTCATTATGAGCATAGGCACTTAAATAATCGTCGTTATGCTTAATAATAATTAAATTACCATATCCTCTTAACGCATTACCTGCGTAAACCACTGTTCCTTTTGCGGTAGAGATGATTGCTTGACCTCGCTGGCCTGCAATATCAATCCCTTTATTACCTTGATCTCCTGTTGAAAACTTGGCGATTACTCGCCCTTTTGTTGGCCATAACCATGAATCTACCTTATCCGATTTTTTTTCTACTGGTTTTGGTTTAGGTGAAGGTTTGGGCTTAACTATTGGCTTATCTTTAACAATCGGCTTTGGTTTAACTGTTTTTTTAGGCTCTACAACTGACGTTGATTTAGAAGATGTTACCGAATTGTTAGATTTAACATACTCCTTAGGTTTAGTGTTTTCAACCTTTTTTGTGCTTTGTTTTTGTACAGGTGATGAGTTTGTGCTATTCGACACATTTGACTCGTTATTACTGACATATTCATTAGTAACAACTGGTACAACGGCAATCGCTGTTGTACCAGTTGTTACTGTTGCTGGGGACGTATTCTTTTTACTAAAATCATGGCCATCATTTCCATAAACTGGGGCGACATATTTAGGCCCCCATAATTTAATTTTTTGACCAGGATGAATAATATAAGGGGCATCTAATTCATTAAAAGCAATCAGCTCTTTAACATCTTTATTCGTTACGTATGAAATAAAATATAATGTATCACCTTTCTCTACTTGATAATAACTACCACGATAGCTACCACGTTCAGCACCAGCATAAGAAGAAGAGTGATTGACACTAGAGACAGGTGCAGGGCTATTAGCCGTCATACTACAACCAGAAAGCAATACACCGCATGTTGCAGCAATCAAGTACGAACGAGGAAGAGACATTATTATTTTCATTATTATTATGCTAATTCACCGGCAACTAATGGAACAAAACGGACATCTTCAATCACTTCTGAGTAAAATTCATCCCCATAACGAGTAATACGTAGTAATTGTTGTGTTAATTCACCAACAGGAATTACTAGCCTACCACCTTCTTTTAACTGTAATAATAACTCATTAGGTATCGATTCCGCAGCAGCAGTCACAATGATTGCATCAAATGGACTTTGACTCGGCCACCCTTTCCACCCATCACCATGCTTTGTCGATACATTATAGATATCAAGCTGCTTAAGTAGGCGTTTTGCATTCCATTGAAGTGATTTAATTCGCTCTACTGAATGCACATGGTCAACTAATTGGGCTAAAACTGCAGTTTGATAACCTGAACCTGTACCTATTTCTAGGACATCAGCATCCCGTTGTAATGCTAATAACTCAGTCATTTTAGCGACAATATAAGGCTGAGAAATAGTTTGTCCTTCGCCAATTGGCAACGCATTATTTTGATAAGCTTGATGTGACAGTGCTTCTGATACAAAACGTTCACGTGGTAATGCACGCATAGCCCTCAAGATTGCTTCATCTCGAATACCTTGTTGACGTAAAAATTGCTCTAACGACCCTGAGCGAGAGTTAATCATAATATTGAGCTCTCTTTTAATAACCAATCTGCCATTATGGTTAATGAATCATGGGCGGTCAGATCTACTTGTAATGGAGTGATAGAAACACAGTTATGCTTCACTGCATAAAAGTCTGTCCCTTGACCTGCATCCTGTTTCTTCCCAGGAGGTCCCAACCAATAAATAGTTTCACCACGAGGGTCTGTATCTTTAATCATGCTCTCTGAATGGTGCCTAGCACCCAAACGGGTAATTTCCCAAGAAGATATTTGAGCATATTCACAGTCTGGGACATTCACATTCAGCACTCTTTTTGTCGTTAGTGGCTTTTCTAAATGGTTTTGCACTAGCTTTAAAGCAACCAGCGCTGCTGTATCAAAATGTTTATCACCCACTAAAGACATTGCTATTGCTGGTAATCCTAGAAAATGCCCTTCTGTTGCAGCTGCTACCGTTCCAGAATACAAGGTATCATCACCCAAATTAGCACCATGGTTAATGCCTGTAATAATAAGGTCTGGAAGGTTACTTTTCATTAATTCATTCAACGCAAAGTGCACACAATCTGTCGGTGTTCCTTGTACTGAATGAATTTGAGCTTCAATTTGACGAACTCGAAGTGGTGATTCAAGTGTAAGTGAATTCGAAGCACCTGAACGGTTTCGGTCTGGTGCAACAATCGTAATATCAGCAATATCAGACAATACTGCTGCCAGGGTGTTGAGCCCTTCAGCAAAAACACCATCATCATTACTTAATAATATACGTAATTTTTTGTTCACTCTTATCTCCACTTCTTTTACTGAATTTTGTATTATTCGTACGTTCTTTCTACTTCAATTTCTTGCAATAACTCACGGACAATTACCGTTGCAAAACTGCCTGATGTTAAAGAGAAATTCAGCGTTAACGTATCACCCTCAGAAGACCAAGTGAGGTTATCAGGATGTAATTCAACACTGCGACGTTCATGACGCATGCGGTTACCACAGATCAGCGCCATTAAATCAGGTTCAGCATCTAAGTTTGGCTGTTCCAATGCTAGCGCTGTATCTGTCGTTGGTAATTGATTATCACCAGCTAATGCCGCACTGATTGATAATTCACCACTCTGAATTTTTTGAATGTTCTCTTCTGAGGTTACATTCTCATTAACGATACGATCTGAACGATCTAGAAGAATATCACCATCAACAGGTTGAGAGAAGTAACCCTCTGTTATTCTTTGAGAAACAATATGGTTAAAGATCCAAGAACGCGCAGCGGATAAATAGAAGCTACGCTTAGTATTATCACGAGTACGCACATTTTCACGACCCCAACGGCGTGCTTCGGTCACGTTATTACCTTCATGACCAAAACGTTGTGAACCAAAATAGTTAGGCACCCCAGATACTTTGACTTTCTCTAAACGAGCTAATACATCGTCCATGTCAGTTACTTCGGTCGCTATTAACTGGAAGCTATTTCCTAGAAGATCACCTGGACGCAATTTTTTGTTGTGGCGCGTCATTTCTAAAATTTCAACACCAGGATGAGTGGCTTCAAACAAAGCAAACTTAAGATGATCACTTTTTGGTAAATGAACGCTTAACCATTGTTCAGTCACAGCATGACGATCTTTTAAACCAGCCCAACTGATGTCTTTTGATTTTACACCACAAAATTTAGCTAATTCATTGGCAACATATTTGGTATTTTCACCCGTTTTACGGATCTTAACCATTAGATGCTCACCTTTACCAGTGAACGAAAAACCGAGCACTTCTTTTACAATGAAATGTTCTGGCAGTTGCTTTAATTTACCTGTTGCTACTGGCTTTCCGTATAACCACGAAAAATTAGACATGATGTCTGACATAGAATATATCTCTAATTAATAAGATGCTTTAACTAACAACACCACCGCTTCACAAGCGATGCCTTCTTTTCTTCCTGTAAAACCGAGACGTTCAGACGTTGTCGCTTTTACATTTACATTACCAAGTTCTGTTTCTAAATCTTCAGCAATTGCTGCGCACATTGCTTGAATATGTGGTGCCATTTTAGGGGCTTGAGCAATAATAGTTACATCAGCATTACCTAAAACTAACCCTTTCTCTTTTACACGACGGTAGACATCACGCAATAAAGCACGACTGTCTGCACCTTTCCACTTATCATCAGTATCAGGAAAGTGACGACCAATATCACCCTCAGCAATAGCCCCAAGCAACGCATCACTCAGTGCATGGAGTGCAACGTCGCCATCAGAGTGTGCTATTAAACCTTGCTCATAAGGAACATTGACACCACCGATAATGACTGGGCCTTCGCCACCAAATTTATGTACATCAAATCCGTGTCCAATTCTCATTATTTGGTTTCCTTTTTCATTTTTTGAAGGTAGAACTCAGCTAAATCAAGATCTTCAGGTTGCGTGACTTTTAAGTTATCGGCACGCCCATGAACGAGTTTAGGCAGATAACCCATGAATTCAATAGCTGAAGATTCATCGGTAATCGATAAGCCTTTTTCTAATCCTGTTTTTAATGCTGAATACAGTATCTCAGTTGTGAAAAGTTGCGGAGTTAAAGCATGCCATAACACACTGCGATCAATGGTGGTTTCAATGGTCGAATCTTGGTTGGCTTGCTTCATTGTATCTCGTACAGGAGAAGCCAAAATCCCACCAATCTGATGAGGGACAACTTCAGTGATCAATTTTTCAATATCACTATGTCGAATGCAAGGACGCGCAGCATCATGCACCATGACCCACTCACTGAGTTGATGTTCTTTTAAATATTCTAAGCCAGAAAGTACAGAGTCTGCTCGCTCTCCCCCTCCAGTTACACGTATTACTCGATTATCTTTTGATATCGGTAATTCATCAAAATAAGGATCGGTATCACTAATGGCCACAATTACTTTATCAATAACAGGAAAAGCCAGTAACTGCTCGATGGTATGCTCCAAAATGGTTTTTCCATCAAGTAATAAATACTGTTTTGGGCGATCCGCTTTCATACGACTGCCCACACCTGCTGCCGGAACAATAGCAACAATGGACGACGCTTCTGTTAAATACATTGCTTACCCTTCACTATTATTATCAATGATTCGATAAAATGTTTCGCCTTTTTTTATCATTCCCAACTCATGTCGAGCACGTTCTTCTATCGCTTCTAAGCCTTTTTTCAGATCATCAATTTCAGCAAACATTTGCTCATTACGATTTCGCAACCCTTGATTCACTTCTTCTTGTAAAACGACATCATTGGACACTTTTGCATAATCTGACATCCCATTCTTTCCAAACCATAAGGTATATTGAAGCCAACCTAGGGTGGCCAATAATAAAATGGCAAATGCACGCATACTTGCTCCAATAAATTAATAATGATAAAAATTGAAGGTTAACTATATCAACCCCTTATTAGAACTTCACTAGCTGTGTAGCTGAAATAAAAAAACCGCCTCAAATGAGACGGTTTTTATATCTAAATTCTAATCGAACGATTAAAGAATTAAGTCAGATTCTCAGAAGCTGAGATTATTGACCTTTAACTTCTTTAAGACCGTTGAATGGCGCTAGTTCACCTAGAGCTTCTTCGATACGGATTAGTTGGTTGTACTTAGCAACACGGTCAGAACGGCTCATAGAACCAGTTTTGATTTGACCTGCTGCTGTACCAACTGCTAGATCAGCAATTGTTGCATCTTCAGTTTCGCCAGAACGGTGAGAGATAACTGCTGTGAAACCAGCATCTTTAGCCATCTTGATTGCAGCTAGAGTCTCTGTAAGTGAACCGATTTGGTTGAACTTGATAAGAATTGAGTTAGTGATGCCTTCTTCGATACCACGAGCAAGAATCTTAGTATTTGTAACGAATAGATCGTCACCAACTAGTTGAATCTTGTCACCTAGAAGTTCAGTTTGGTGCTTGAAGCCAGCCCAATCAGACTCGTCTAGACCATCTTCGATAGAAACGATTGGGAATTGCTCAACAAGACCAGCTAGGTAATGGTTGAATTCTTCAGCAGTAAATTTCTTACCTTCACCTTTAAGGTCGTAGATACCGTCTTCTTTGTTGTAGAACTCAGAAGCAGCACAGTCCATAGCAAGAGTAACGTCTTTACCTAGCTCGTAACCAGCAGCTTCAACAGCTTCTTTGATTGCAGCTAGTGCAGCAGCGTTAGACTCAAGGTTAGGAGCGAAACCACCTTCATCACCAACTGCTGTGCTTAGGCCTTTAGCTTTAAGTACTTTAGCTAGGTTGTGGAAAACTTCTGCGCCGATGCGTAGAGCTTCTTTAAGCGTTTTAGCGCCAACAGGTTGAATCATGAATTCTTGGATATCAACGTTGTTATCAGCGTGCTCGCCACCGTTGATGATGTTCATCATTGGTAGAGGCATAGAGAATACGCCAGGAGTGCCGTTTAGATCAGCAATGTGAGCGTAAAGAGGCATAGATTTAGCAGCTGCAGCAGCTTTTGCATTTGCTAGAGAAACAGCAAGGATTGCGTTAGCACCAAAGTTTGCTTTGTTTTCTGTGCCATCTAAATCGATCATGATTTGGTCGATTTCAGCTTGGTTTTTCGCATCTTTGCCGATTAGAGCTTCTGCGATTGGACCATTTACAGCAGCGATAGCTTTAAGAACACCTTTACCTAGGAAACGAGATTTGTCGCCATCACGTAGCTCAAGAGCTTCACGAGAACCTGTAGATGCGCCAGATGGAGCAGCAGCCATACCTACAAAACCACTTTCTAGGTGAACTTCAGCTTCAACTGTTGGGTTACCACGAGAATCGATGATTTCACGACCTAGAACTTTAACGATCTTAGACATTGTGTTTCCTCTATTTTCTTTAATTTAAAAGCTAAAAATAGCTGCTACAACATTGAGCAGCTATCCGTAAATCCTATTACTTTTCGAATTCACCGCGAGCATTTTCACCTGCTGCTTTAACAAAACCTTCAAATAATGGGTGACCATCACGAGGGGTTGATGTGAATTCTGGGTGGAATTGAGCAGCCACAAACCATGGGTGGTTAGGAAGTTCAATAATTTCCACAAGCTTCTTATCAGCTGATAGACCAGAAATTTTAAGACCGGCTTTTTCAAGCTGAGGAAGTAAATTATTATTTACTTCATAACGGTGACGGTGACGCTCTTCAACAGTTGCGTTACCGTAAAGCTCACGAGCTTTAGAACCTTTAGCAAGGTGACATAGCTGAGAACCAAGGCGCATTGTACCGCCTAAATCTGATGTCTCAGTACGCTCTTCAACCTTACCTTCACCATCAATCCACTCTGTGATTAGACCAACAACAGGGAATTTAGTGTCTTTAGAGAATTCAGAAGAGTGAGCCCCTTCCATATTAGCAACGTTACGCGCATATTCAATAAGCGCAACTTGCATACCCAGACAGATCCCTAAATATGGTACTGCATTTTCACGAGCGTATTGAGCAGCAAGGATCTTACCTTCAATACCACGGTCACCGAAACCACCAGGAACTAGAATTGCATCTAAGCCTTCAAGGATTTCAGTACCTTTAGACTCAACATCTTGCGAGTCTACATATTTAATAGTGACATTTAGACGGTTTTTCAAGCCCGCATGTTTTAATGCTTCATTTACTGACTTGTAAGCGTCTGGTAATTCAATGTATTTACCAACCATACCGATAGTAACTTCACCAGTAGGGTTCGCTTCTTCATAAATTACTTGTTCCCACTCAGAAAGATCAGCTTCAGGAGCCGTAATACCAAAGCGTTTACATACTAACTCATCAGTACCTTGTGCTTTAATAAGTTGTGGGATCTTGTAGATTGAATCTACGTCTTTCATTGAGATAACTGCTTTTTCTTGTACGTTACAAAAAAGAGCAATTTTCTTACGTTCGTTTGCTGGGATAACACGATCAGAACGACAAACTAAGATATCTGGCTGGATACCAATAGACAGAAGTTCTTTTACTGAGTGCTGAGTAGGCTTAGTTTTAAGCTCACCAGCAGCGCCTAAGTAAGGCACAAGAGTTAGGTGCATAAACATTGTATGTTCACGGCCTATCTCAACAGCAAGTTGACGAATCGCTTCCATGAATGGTAGAGATTCGATATCACCAACTGTACCACCAACTTCAACGAGTGCGATATCATGGCCTTCAGCGCCAGAGATAACACGTTCTTTAATCGCATTCGTAATGTGAGGGATAACTTGGATTGTCGCACCTAAGTAGTCACCACGACGTTCTTTACGTAAAACGTCTGCGTATACTCGACCTGCCGTAAAGTTATTACGTTTAGTCATTTTGGTGCGGATGAAGCGCTCGTAGTGACCTAAATCTAGATCAGTTTCTGCGCCGTCTTCCGTGACGAATACTTCACCGTGTTGAGTTGGGCTCATTGTGCCTGGATCAACGTTGATGTATGGGTCAAGCTTCATCATAGTGACTTTTAAGCCACGAGCTTCAAGAATAGCTGCTAATGATGCTGCTGCAATACCTTTACCTAGTGAGGATACAACCCCGCCAGTTACAAAAATGTAATTCGTCGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN554846|2457245:2467811|2460651_2461278_-|WP_045102793.1|DBSCAN-SWA MINSRSGSLEQFLRQQGIRDEAILRAMRALPRERFVSEALSHQAYQNNALPIGEGQTISQPYIVAKMTELLALQRDADVLEIGTGSGYQTAVLAQLVDHVHSVERIKSLQWNAKRLLKQLDIYNVSTKHGDGWKGWPSQSPFDAIIVTAAAESIPNELLLQLKEGGRLVIPVGELTQQLLRITRYGDEFYSEVIEDVRFVPLVAGELA >NZ_LN554846|2457245:2467811|2466170_2467811_-|WP_045102800.1|DBSCAN-SWA MTTNYIFVTGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLKVTMMKLDPYINVDPGTMSPTQHGEVFVTEDGAETDLDLGHYERFIRTKMTKRNNFTAGRVYADVLRKERRGDYLGATIQVIPHITNAIKERVISGAEGHDIALVEVGGTVGDIESLPFMEAIRQLAVEIGREHTMFMHLTLVPYLGAAGELKTKPTQHSVKELLSIGIQPDILVCRSDRVIPANERKKIALFCNVQEKAVISMKDVDSIYKIPQLIKAQGTDELVCKRFGITAPEADLSEWEQVIYEEANPTGEVTIGMVGKYIELPDAYKSVNEALKHAGLKNRLNVTIKYVDSQDVESKGTEILEGLDAILVPGGFGDRGIEGKILAAQYARENAVPYLGICLGMQVALIEYARNVANMEGAHSSEFSKDTKFPVVGLITEWIDGEGKVEERTETSDLGGTMRLGSQLCHLAKGSKARELYGNATVEERHRHRYEVNNNLLPQLEKAGLKISGLSADKKLVEIIELPNHPWFVAAQFHPEFTSTPRDGHPLFEGFVKAAGENARGEFEK >NZ_LN554846|2457245:2467811|2464335_2464620_-|WP_045102798.1|DBSCAN-SWA MRAFAILLLATLGWLQYTLWFGKNGMSDYAKVSNDVVLQEEVNQGLRNRNEQMFAEIDDLKKGLEAIEERARHELGMIKKGETFYRIIDNNSEG >NZ_LN554846|2457245:2467811|2464795_2466094_-|WP_045102799.1|DBSCAN-SWA MSKIVKVLGREIIDSRGNPTVEAEVHLESGFVGMAAAPSGASTGSREALELRDGDKSRFLGKGVLKAIAAVNGPIAEALIGKDAKNQAEIDQIMIDLDGTENKANFGANAILAVSLANAKAAAAAKSMPLYAHIADLNGTPGVFSMPLPMMNIINGGEHADNNVDIQEFMIQPVGAKTLKEALRIGAEVFHNLAKVLKAKGLSTAVGDEGGFAPNLESNAAALAAIKEAVEAAGYELGKDVTLAMDCAASEFYNKEDGIYDLKGEGKKFTAEEFNHYLAGLVEQFPIVSIEDGLDESDWAGFKHQTELLGDKIQLVGDDLFVTNTKILARGIEEGITNSILIKFNQIGSLTETLAAIKMAKDAGFTAVISHRSGETEDATIADLAVGTAAGQIKTGSMSRSDRVAKYNQLIRIEEALGELAPFNGLKEVKGQ >NZ_LN554846|2457245:2467811|2459602_2460649_-|WP_099047741.1|DBSCAN-SWA MMKIIMSLPRSYLIAATCGVLLSGCSMTANSPAPVSSVNHSSSYAGAERGSYRGSYYQVEKGDTLYFISYVTNKDVKELIAFNELDAPYIIHPGQKIKLWGPKYVAPVYGNDGHDFSKKNTSPATVTTGTTAIAVVPVVTNEYVSNNESNVSNSTNSSPVQKQSTKKVENTKPKEYVKSNNSVTSSKSTSVVEPKKTVKPKPIVKDKPIVKPKPSPKPKPVEKKSDKVDSWLWPTKGRVIAKFSTGDQGNKGIDIAGQRGQAIISTAKGTVVYAGNALRGYGNLIIIKHNDDYLSAYAHNESLFVKEGQNVNAGQKIASMGSSSTSSVRLHFEVRFRGKSVNPQRYLP >NZ_LN554846|2457245:2467811|2463136_2463616_-|WP_045102796.1|DBSCAN-SWA MRIGHGFDVHKFGGEGPVIIGGVNVPYEQGLIAHSDGDVALHALSDALLGAIAEGDIGRHFPDTDDKWKGADSRALLRDVYRRVKEKGLVLGNADVTIIAQAPKMAPHIQAMCAAIAEDLETELGNVNVKATTSERLGFTGRKEGIACEAVVLLVKASY >NZ_LN554846|2457245:2467811|2461274_2462054_-|WP_080889816.1|DBSCAN-SWA MEIRVNKKLRILLSNDDGVFAEGLNTLAAVLSDIADITIVAPDRNRSGASNSLTLESPLRVRQIEAQIHSVQGTPTDCVHFALNELMKSNLPDLIITGINHGANLGDDTLYSGTVAAATEGHFLGLPAIAMSLVGDKHFDTAALVALKLVQNHLEKPLTTKRVLNVNVPDCEYAQISSWEITRLGARHHSESMIKDTDPRGETIYWLGPPGKKQDAGQGTDFYAVKHNCVSITPLQVDLTAHDSLTIMADWLLKESSIL >NZ_LN554846|2457245:2467811|2458584_2459547_-|WP_045102791.1|DBSCAN-SWA MSKSNTVTKEVEEFELDTVNDSDVIAEESSERLEVTSSQKVMDATQLYLGEIGFSPLLTAEEEVYFSRLALKGDQAARSRMIESNLRLVVKIARRYNHRGLALLDLVEEGNLGLIRAVEKFDPERGFRFSTYATWWIRQTIERAIMNQTRTIRLPIHVVKELNVYLRAARELSQKLDHEPTPEEIAEKLDKPVSDVSRMLRLNERVTSVDSMVAGESDKALLDILPDTKHNDPESEAQKNDLNASLVGWLEQLNPKQKEVVARRFGLLGYETATLEQVGKEIGLTRERVRQIQVEGLRRLREIMTQQGLNMETLFAIEEH >NZ_LN554846|2457245:2467811|2457885_2458515_+|WP_045102790.1|DBSCAN-SWA MLDKFSIRVIKKPLSMIASRLHQFGITANQTTVFGFILGCLAFPALIFQEYNIALILILLNRICDGLDGALARINGITDSGGFLDISLDFLFYSLIPFGFILANPEQNAIAGALLIFSFIGTGSSFLAFAIMAGKRNIDNPIYKNKSLYYMSGLTEGTETIACFVLFCLFPTHFTLIAYVYSALCWITTFNRIWSGFHTLQESEKQETS >NZ_LN554846|2457245:2467811|2462074_2463121_-|WP_045102795.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSDIMSNFSWLYGKPVATGKLKQLPEHFIVKEVLGFSFTGKGEHLMVKIRKTGENTKYVANELAKFCGVKSKDISWAGLKDRHAVTEQWLSVHLPKSDHLKFALFEATHPGVEILEMTRHNKKLRPGDLLGNSFQLIATEVTDMDDVLARLEKVKVSGVPNYFGSQRFGHEGNNVTEARRWGRENVRTRDNTKRSFYLSAARSWIFNHIVSQRITEGYFSQPVDGDILLDRSDRIVNENVTSEENIQKIQSGELSISAALAGDNQLPTTDTALALEQPNLDAEPDLMALICGNRMRHERRSVELHPDNLTWSSEGDTLTLNFSLTSGSFATVIVRELLQEIEVERTYE >NZ_LN554846|2457245:2467811|2463615_2464332_-|WP_045102797.1|DBSCAN-SWA MYLTEASSIVAIVPAAGVGSRMKADRPKQYLLLDGKTILEHTIEQLLAFPVIDKVIVAISDTDPYFDELPISKDNRVIRVTGGGERADSVLSGLEYLKEHQLSEWVMVHDAARPCIRHSDIEKLITEVVPHQIGGILASPVRDTMKQANQDSTIETTIDRSVLWHALTPQLFTTEILYSALKTGLEKGLSITDESSAIEFMGYLPKLVHGRADNLKVTQPEDLDLAEFYLQKMKKETK >NZ_LN554846|2457245:2467811|2457245_2457893_+|WP_045102789.1|DBSCAN-SWA MSLSITELNILTRNGSTLLPSCSLSIQKGKVLSVMGPSGCGKSTLLNVIAGHLSSDFHYTGKIYIDEKPIHQLPSHERNVGILFQEDLLFPHLCIWENLAFALPNYIKGSQRKIEAMEALESVQLEKLATVFPDQVSGGQRARISLVRMLLAKPKVALLDEPFSKLDKVLRVQFRDWVFEQLASANIPALLVTHDVDDIPKDSQQLIWPVERKHA |
12 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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