Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_FO203512 | Oleispira antarctica strain RB-8, complete genome sequence | 0 crisprs | csa3,cas3,DEDDh,RT,DinG,WYL | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
929311 : 952742
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_FO203512|929311:952742|DBSCAN-SWA 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MKTMNDFLAMLDEQKSLICIRRKQFDVWIESSVIVPGSNKETEDGFHYMDFEYRLCCMIERLPAAQGGLLCLLVHQFVNGLDRHELETVSVDISDNDGKTVDAEINFGVRDPFYLVPVENSPIVIDGVKMGFGEGGLDVAEVVTLNALS |
28 | Pseudomonas_phage(26.32%) | head,portal,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1490720 : 1498946
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_FO203512|1490720:1498946|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_FO203512|1490720:1498946|1497842_1498202_+|WP_046008635.1|DBSCAN-SWA MLEVSHSNELPPIPSKRYFSIGEVSELCDVKPHVLRYWEQEFTQLKPIKRRGNRRYYQREDVILVREIRNLLYLEGYTIVGARQKLDDQSGDETAVHFDRVLIKDMLAELTELKNILEG >NZ_FO203512|1490720:1498946|1498502_1498946_-|WP_052717901.1|DBSCAN-SWA MIVYTVGTFDLLHVGHLALLEYCKSLGGILAVGVASDRVVNSYKPNVPVIPLEQRMEMLRALSCVDIVRPYDDLEYVSGCKELNADIFVIGEDWGNKPHNLAVEAYLESAGKQIKQVLYNPRTSSSAIKQHVRDQSGIVRNLKMAAV >NZ_FO203512|1490720:1498946|1495128_1497558_+|WP_046008633.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQFSELWLREWANPALETQELVDQITMAGLEVDAIEAAAGEFSGIVVAQIVSFEKHPEADKLNVCKVTDGSEEFQIVCGAPNVREGMVIPFAKIGAVLPGDFKIKKAKLRGVESFGMLCAEEEMGIADKSDGLWDLPADAPLGVCMREYLGLSRGGRDDKIIDVDLTPNRGDCLSIAGLSREVGVLNKVDVTAPVIEAVAATIDTAIDVQLQAPDACPRYVGRVIKGINIKAASPLWMQEKLRRSGIRSIDPVVDVTNFILLELGQPMHAFDLAKLDGGIIVRKATQDETLVLLDDQEIKLNSDTLVIADNSKALAMAGVMGGAESGVNAETTQDILLESAYFNPIAIAGKARNYGLHTDSSHRFERGVDFELQRTAIERATTLLLEIVGGEAGPVVEKTSEADLPSCAEITLVEASIEKMLGLTIEAGEVEEILTRLGMQISKIDSGDKSGWKVIAPSYRFDMAIEADLIEELARIYGYNRLPVRTPMAATPLLPVPENELAMKDVRRQLVGRGYQEAITYSFVDPATQKLLDPEVAPLALANPISADLSVMRTNLWAGLVQTAVHNIKRQQPRVRLFETGLSFVPQPGKDPSNLDESLVQDPKLAMLLTGTRTEQSWSEGDQNVDFFDLKGDFESLIARTGSQARYAFVPAEHPALQPGQTASIQLDGIAVGWIGALHPNLAKPLGLKQAVYLLEISLKAVRQVEVPTFKPLSKFPGMSRDLALVVTNSTSVADVMSLIREKAGDYLTKLNLFDIYQGKGIDPDRKSLALGLTWQHPSRTLNEEEVNEAVDNILAHLADRIDAQLRG >NZ_FO203512|1490720:1498946|1497559_1497865_+|WP_046008634.1|DBSCAN-SWA MRALTKAEMAERLFEDLGLNKREAKEMVDLFFDEIRHSLTHNEQVKLSGFGNFDLRDKSQRPGRNPKTGEEIPISARRVVTFKPGQKLKIRVEAYAGSESL >NZ_FO203512|1490720:1498946|1492649_1493195_+|WP_046008629.1|DBSCAN-SWA MNIRRDNKRGARAERPSINDNIKAKEVRLIDAAGDQAGVVSIEDALVAAQAAGLDLVQISDGDPIVCKIMDYGQKLYEEKKQRNAAKKKQVQTQVKEIKFRPGTEDGDYQVKLRNLVRFLENGDKAKCSLRFRGREMAHQHLGMQLMLRLEKDLEAYGTVEQRPKMEGRQMIMVLAPVKKK >NZ_FO203512|1490720:1498946|1493531_1493885_+|WP_046008631.1|DBSCAN-SWA MARVKRGVQARKRHKKILKLAKGYYGARSRVFRVAKQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAGARVNGLSYSRFINGLKVASIEVDRKILADLAVNEKGAFAALVEKAKASL >NZ_FO203512|1490720:1498946|1490720_1492649_+|WP_046008628.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPVITLPDGSKREFDQAVTLMQVAEDIGPGLAKATVCGRINGELVDACELIERDSDISLITGRDAEGIEVIRHSFAHLIGHAVKQLYPTAKMAIGPVIEDGYYYDIDYERPFTPEDLTAIEKRMKELVKKDYLVNKEMTPIKEARRIFVDREEDYKVELIDDLITKGETAVGLYHHEEYVDMCRGPHVPSTKSMRIFKLMRVSGAYWRGDSQNKQLQRIYGTAWNDKKELKEYLHRLEEAEKRDHRKLAKQLDLFHLQEEAPGMVFWHPNGWTIYQALEQYMRKVQNDAGYQEIKTPQVVDRALWEKSGHWEHYADGMFVTESEKRTYAVKPMNCPCHIQVFNQGLKSYRDLPLRLAEFGCCHRNEPSGALHGIMRVRGFTQDDAHIFATEGQIRQEAIDFIKLTLEVYKDFGFDNVEMKLSTRPEGRIGDDTQWDAAEAALEDALNDAGLDWELQPGEGAFYGPKIEFSLRDCLNRVWQCGTIQLDFMLPERLGAQYVGEDNDRKTPVMLHRAILGSFERFIGILIEHYAGAFPAWLAPKQVVILNITDNQGEYCKKIEESLKIDDIRASADLRNEKIGFKIREHTLHKVPYLIVVGDKEVESNTVAVRTRKGDDLGTMSLDAFKELLAKDVARRGRVETE >NZ_FO203512|1490720:1498946|1494063_1495080_+|WP_046008632.1|tRNA|DBSCAN-SWA MENLDSLVSEALAKVTSASEENALYQVQVEYLGKKGTITSLLKTLGKLSNEERPQAGALINEGKVTVQTAINVRKTDLQTLALAEKLAAEQIDVTLSGRNQQSGGLHPVTRTLERIEAFFTNVGYNVAEGPEVEDDFHNFEALNIPSHHPARAMHDTFYFNANTLLRTHTSPVQVRTMETQEPPIRVICPGRVYRCDSDITHTPMFHQVEGLLVDKDVSFADLKGTVQQFLKVFFEKDLAVRFRPSYFPFTEPSAEVDMECVMCSGKGCRICSHTGWLEVMGCGMVHPKVFKESGVDAEKYSGFAFGMGVERLAMLRYGVNDLRLFFENDLRFLQQFR >NZ_FO203512|1490720:1498946|1493304_1493499_+|WP_084687486.1|DBSCAN-SWA MPKIKTKSGAAKRFKKTANGFKHRQAHRAHILTKKSTKRKRHLRANLMVHASDVATVKRMLPNL |
9 | Tupanvirus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2828351 : 2903857
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_FO203512|2828351:2903857|DBSCAN-SWA 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MSGIQQELDKEIELHKKKIAELEQLKLDQEKKIEGFTEFDQTIQRLCNQMALTEAELYVSRGDQIIKWVEELGKTERPGRIYESLKKHFEKAIKKDTRKEGKKEKVSTLPKPKLAIGRYKNPATHETIEKIKRNPRQLEDWINEYGFETVRTWKM |
55 | Bacillus_phage(37.5%) | plate,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3959194 : 4021117
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_FO203512|3959194:4021117|DBSCAN-SWA 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52 | unidentified_phage(16.67%) | protease,tRNA,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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