Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP026072 | Staphylococcus aureus strain FDAARGOS_35 chromosome, complete genome | 8 crisprs | DEDDh,cas3,WYL,csa3 | 6 | 1 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP026072_1 | 421749-421993 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026072_1
|
4 spacers
spacers of NZ_CP026072_1
>1.1|421768|38|NZ_CP026072|CRT TTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATATTGGGGC >1.2|421825|37|NZ_CP026072|CRT TTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGG >1.3|421881|38|NZ_CP026072|CRT TTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCC >1.4|421938|37|NZ_CP026072|CRT CTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026072_1
The CRISPR arrays of NZ_CP026072_1 >merge|NZ_CP026072|1|421749-421993|CRT CCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATATTGGGGCCCCCGCCAACTTGCATTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGT >NZ_CP026072|1|1|421749-421993|CRT CCCCGCCAACTTGCACATT TTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATATTGGGGC CCCCGCCAACTTGCATTGT TTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGG CCCCGCCAACTTGCACATT TTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCC CCACCCCAACTTGCATTGT CTGTTGAAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGGGG CCCCGCCAACTTGCATTGT
>NZ_CP026072.1|WP_001032814.1|421345_421531_+|hypothetical-protein MNKHINKKAAKLLEDYKKVQQRKSKETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NZ_CP026072.1|WP_000231632.1|420490_420724_+|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVTNEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >NZ_CP026072.1|WP_000857483.1|419054_420014_+|beta-channel-forming-cytolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWIDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_CP026072.1|WP_000765708.1|418235_418382_-|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NZ_CP026072.1|WP_001802045.1|418054_418279_-|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NZ_CP026072.1|WP_000041896.1|416893_417610_+|superantigen-like-protein-SSL12 MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NZ_CP026072.1|WP_001063559.1|416060_416786_+|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NZ_CP026072.1|WP_000739523.1|415240_415966_+|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLETTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHFSLSGKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPRNAEIEVILEKSN >NZ_CP026072.1|WP_000793605.1|413801_414803_-|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEIMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_CP026072.1|WP_001074342.1|412846_413779_-|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_CP026072.1|WP_000669537.1|422352_422703_-|complement-inhibitor-SCIN-B MKFKKYILTGTLALLLSSTGIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR >NZ_CP026072.1|WP_000791587.1|422856_423354_-|complement-convertase-inhibitor-Efb MKNKLIAKSLLTLAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >NZ_CP026072.1|WP_000584398.1|423612_424119_-|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_CP026072.1|WP_000739563.1|424790_425192_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSITWY >NZ_CP026072.1|WP_001791789.1|425151_425244_+|hypothetical-protein MLKTVKSTRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC >NZ_CP026072.1|WP_000739209.1|425560_425890_-|complement-convertase-inhibitor-Ecb MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNVEAAKKYDQYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNFFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >NZ_CP026072.1|WP_001791787.1|426083_426251_-|hypothetical-protein MKRIVILENVIVDNPIWLNHVDYLVKSVLLKSIKLRFQEVRKFEILVKIMNRIHI >NZ_CP026072.1|WP_000049484.1|426378_426882_-|metallophosphoesterase MSKWIIVSDNHTESGVLYQIYEMHPDADVYLHLGDSEFAYDDTELSLFNRVKGNCDFYPEFENEAVAKYNDVKAFYTHGHLYQVNRTRDLLAEKGLELGCLFAFYGHTHVAKYEYINGVHVINPGSISQSRSSMEETYAEVIIDDQTLHGTINFKNRHHETISHTTF >NZ_CP026072.1|WP_000659317.1|426874_427462_-|XTP/dITP-diphosphatase MKEIVIASNNQGKINDFKVIFPDYHVIGISELIPDFDVEETGSTFEENAILKSEAAAKALNKTVIADDSGLEVFALNGEPGIYSARYAGENKSDEANIEKLLNKLGNTTDRRAQFVCVISMSGPDMETKVFKGTVSGEIADGKYGENGFGYDPIFYVPKLDKTMAQLSKEQKGQISHRRNAINLLQAFLEGDKNV >NZ_CP026072.1|WP_001039659.1|427473_428274_-|glutamate-racemase MNKPIGVIDSGVGGLTVAKEIMRQLPNETIYYLGDIGRCPYGPRPGEQVKQYTVEIARKLMEFDIKMLVIACNTATAVALEYLQKTLSIPVIGVIEPGARTAIMTTRNQNVLVLGTEGTIKSEAYRTHIKRINPHVEVHGVACPGFVPLVEQMRYSDPTITSIVIHQTLKRWRNSESDTVILGCTHYPLLYKPIYDYFGGKKTVISSGLETAREVSALLTFSNEHASYTEHPDHRFFATGDPTHITNIIKEWLNLSVNVERISVND |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP026072_2 | 744431-744512 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026072_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP026072_2
>2.1|744455|34|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026072_2
The CRISPR arrays of NZ_CP026072_2 >merge|NZ_CP026072|2|744431-744512|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >NZ_CP026072|2|1|744431-744512|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>NZ_CP026072.1|WP_001018962.1|743487_743874_-|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >NZ_CP026072.1|WP_001065801.1|743198_743495_-|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >NZ_CP026072.1|WP_000571218.1|741923_742949_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_CP026072.1|WP_000520233.1|741235_741931_-|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP026072.1|WP_000732326.1|740396_741218_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP026072.1|WP_000266157.1|739033_740254_+|site-specific-integrase MWLEKFKNKNKETKYRYYEKYKDPLTAKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQRLLNERIEAKLNDKTPTTLKSLTFHVACDEWFQSYIKTSGSKRTTIKTKLSKLNTLKKFVDEDILINKITLSYAQQVFDEMDNKGYVYQVNKDALSIFKNVFEYTRRIYKLQDLEFLKDITLNKRIKSYDEVKAKRNKYLELNEIQSIIKDINTKAQKMHSGIHKRFYLFVALMTEFQALNGMRIGEMLAIQNEDIDFDNKSLNINGTIHWFHDESGGFGVKDTTKTESSYRTIGLSSRSCEILKKAILENKKDSKWNDGYLNRNFVFTNHKGNPMQTERFNKILREAAKDVGIDKEVSSHILRHSHISLLSQQGVSLKAIMDRVGHSDHRTTLSIYSHVTEQMDKDMMNKLEQVKLG >NZ_CP026072.1|WP_000733775.1|738216_738945_+|staphylococcal-enterotoxin-type-K MKKLISILLINIIILGVSNSASAQGDIGIDNLRNFYTKKDFVDLKDVKDNDTPIANQLQFSNESYDLISESKDFNKFSNFKGKKLDVFGISYNGQCNTKYIYGGVTATNEYLDKSRNIPINIWINGNHKTISTNKVSTNKKFVTAQEIDVKLRKYLQEEYNIYGHNGTKKGEEYGHKSKFYSGFNIGKVTFHLNNNDTFSYDLFYTGDDGLPKSFLKIYEDNKTVESEKFHLDVDISYKETI >NZ_CP026072.1|WP_001033316.1|737464_738193_+|staphylococcal-enterotoxin-type-Q MNKIFRILTVSLFFFTFLIKNNLAYADVGVINLRNFYANYEPEKLQGVSSGNFSTSHQLEYIDGKYTLYSQFHNEYEAKRLKDHKVDIFGISYSGLCNTKYMYGGITLANQNLDKPRNIPINLWVNGKQNTISTDKVSTQKKEVTAQEIDIKLRKYLQNEYNIYGFNKTKKGQEYGYQSKFNSGFNKGKITFHLNNEPSFTYDLFYTGTGQAESFLKIYDDNKTIDTENFHLDVEISYEKTE >NZ_CP026072.1|WP_001228759.1|736963_737395_+|hypothetical-protein MRKLLGLALASTLILGACGSNDGDKKEESKSYTTNDIVKGFKDNKLNVINEKEMTREDFGLAPMKTDEAKMFVVQDDKNARVMKFKNSDDLKQTKKYYDELGKESAAFYSHTHSKGKFLIQMNGDIDDATFNKYKNSMDKTLK >NZ_CP026072.1|WP_000281657.1|736488_736947_+|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MYLYEKMVIENKEIPIDDGKSLGNFEGLYDNGVILINKNLSERRKAEVLYEELAHHKLTYGNILDQSKFNNRKFENYARRHGFISAVPLREIVEAYNYGVRNLYELSEYLQLSEEYILEAIEQYKKIYGIGTHYGEYSITFEPLRVFKYKEI >NZ_CP026072.1|WP_000932216.1|744615_745494_-|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_CP026072.1|WP_000660172.1|745495_745609_-|hypothetical-protein MKEKLLGTIIWSIATFYYSRMMEIMNLAILKIKIGGS >NZ_CP026072.1|WP_000290485.1|745672_746053_-|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVAIIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSEMIGE >NZ_CP026072.1|WP_000589549.1|746210_746567_-|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_CP026072.1|WP_001190695.1|746710_747031_+|thioredoxin-family-protein MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NZ_CP026072.1|WP_000422909.1|747180_747720_-|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEGDMPKAPRKNRNLITLY >NZ_CP026072.1|WP_000150017.1|747802_748519_-|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGVPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >NZ_CP026072.1|WP_000974460.1|748666_749089_+|organic-hydroperoxide-resistance-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >NZ_CP026072.1|WP_000569884.1|749487_749982_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >NZ_CP026072.1|WP_000255561.1|750136_750754_+|amino-acid-transporter MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGETQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP026072_3 | 788619-788704 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026072_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP026072_3
>3.1|788649|26|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026072_3
The CRISPR arrays of NZ_CP026072_3 >merge|NZ_CP026072|3|788619-788704|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NZ_CP026072|3|2|788619-788704|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NZ_CP026072.1|WP_000369722.1|787274_788186_-|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP026072.1|WP_001248939.1|786282_787278_-|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP026072.1|WP_000006551.1|785228_786173_-|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP026072.1|WP_001049165.1|784068_784656_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP026072.1|WP_000816295.1|782923_783826_+|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKALFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >NZ_CP026072.1|WP_000070826.1|781591_782221_-|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP026072.1|WP_042903673.1|781136_781403_+|hypothetical-protein MRVGVGPQHSEIGSSQFLQAMQVGVGPQHSEIGSSQFLQAMQVGVGPQHSEIGSSQFLQAMQVGVGPQHREIGFPISTGNGSWGGTTK >NZ_CP026072.1|WP_000654029.1|779698_780712_-|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDRQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP026072.1|WP_000279414.1|778635_779646_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP026072.1|WP_001074749.1|777306_778497_-|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_CP026072.1|WP_000134963.1|789065_790001_-|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP026072.1|WP_000057551.1|790067_791507_-|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDMEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDVMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP026072.1|WP_001224793.1|791514_792000_-|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP026072.1|WP_000513309.1|792007_792847_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGSVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKYLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP026072.1|WP_000958224.1|792852_793785_-|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP026072.1|WP_000662681.1|794446_797293_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >NZ_CP026072.1|WP_000229258.1|797300_799286_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKGLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP026072.1|WP_000638419.1|799554_799791_-|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP026072.1|WP_000538141.1|799787_800438_-|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP026072.1|WP_000749380.1|800611_801451_-|CHAP-domain-containing-protein MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKSPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVTKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP026072_4 | 951009-951101 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026072_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP026072_4
>4.1|951041|29|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026072_4
The CRISPR arrays of NZ_CP026072_4 >merge|NZ_CP026072|4|951009-951101|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAGCGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCTTAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG >NZ_CP026072|4|3|951009-951101|CRISPRCasFinder TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCATCTTTAG CGATTAGAGGCTTTTATGCAGTTGTGCCT TAGCATCCAACTGCGTTCCTCTTCACCTTTAG
>NZ_CP026072.1|WP_001813976.1|950052_950880_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_CP026072.1|WP_001790232.1|948954_949905_-|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVTGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_CP026072.1|WP_000365354.1|948180_948900_-|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >NZ_CP026072.1|WP_000362967.1|947396_948197_-|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >NZ_CP026072.1|WP_000735558.1|946754_947261_-|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLVNTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_CP026072.1|WP_001222134.1|945876_946593_-|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAVIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >NZ_CP026072.1|WP_001045421.1|944919_945708_-|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLKFLKSVS >NZ_CP026072.1|WP_001018677.1|944294_944669_+|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_CP026072.1|WP_001553862.1|942417_943347_+|DMT-family-transporter MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIILNIIINPEVFTIHFYNNQSFNYTWVVGGLLGVSFLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >NZ_CP026072.1|WP_000169042.1|941998_942223_+|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNVVTEQVARDSMNALVDLNIIKSNSGTITKVHSAQIIDKTTTVLFEDKK >NZ_CP026072.1|WP_000901764.1|951318_951954_-|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_CP026072.1|WP_001021145.1|952342_954004_-|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_CP026072.1|WP_001819741.1|954000_954384_-|DUF1934-family-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_CP026072.1|WP_000655099.1|954509_954617_-|hypothetical-protein MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN >NZ_CP026072.1|WP_001200748.1|954691_955702_-|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_CP026072.1|WP_001788287.1|956200_956722_-|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_CP026072.1|WP_000180230.1|956749_958045_-|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_CP026072.1|WP_000477504.1|958084_958561_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_CP026072.1|WP_000633782.1|958729_959266_-|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >NZ_CP026072.1|WP_000808902.1|959476_960415_-|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDNNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP026072_5 | 1218854-1218955 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026072_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP026072_5
>5.1|1218878|54|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026072_5
The CRISPR arrays of NZ_CP026072_5 >merge|NZ_CP026072|5|1218854-1218955|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA >NZ_CP026072|5|4|1218854-1218955|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATA TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT CAAATTTAATACTCAATTCATAAA
>NZ_CP026072.1|WP_000956132.1|1217880_1218837_+|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >NZ_CP026072.1|WP_000394698.1|1217100_1217763_+|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >NZ_CP026072.1|WP_000763768.1|1216550_1216958_+|hypothetical-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >NZ_CP026072.1|WP_000421410.1|1215459_1216038_-|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >NZ_CP026072.1|WP_000793009.1|1214191_1215460_-|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILLLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >NZ_CP026072.1|WP_000264071.1|1212687_1214154_-|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_CP026072.1|WP_000424966.1|1211121_1212663_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP026072.1|WP_000237797.1|1209860_1211054_+|site-specific-integrase MVKDPIKKAKNGTYYFRANLGYDSKGKKIQKYRSGFTTKKEAREEYSKLLLMKPEELSENKDKMTFKHYIFEIFLPWYKTQVKLRTYENRLPTIKKHFSYFDKMAVSDIEPIDVQNWQLKLSKKCKSSYVRAVQGLFSVAMDRAIVLGITTTNPSKIIGNVKKQKSKIEFWTKEEFEKVISLIYKEDYYQHFLFISLWFLFMTGMRIGEATAIQWEDIDFDSGVLTINKTLYYKNQSNYRFVEPKTKASVRHIVLDKCTLTYLSEWKEVQQNLIQTDFVMSYNGIPTQKHTLSYAIERYAKLAGIHRIRIHGLRHSHASLLISMGENPLIIKDRLGHEDIETTLGTYGHLYPNSNFEVANKLNGAISFKEAKQNYDTSPKNQFTVDYLRNKEMKKVQ >NZ_CP026072.1|WP_000633907.1|1209633_1209834_+|DUF3173-family-protein MITVTKKDLVELGYGTSFSADIIKKAKELMITKGHIYYQSRKLDRVPREAVEEILGIRFSNENRSE >NZ_CP026072.1|WP_071875954.1|1209349_1209553_-|conjugal-transfer-protein MTREEYLSNRTALAKLTGISLLHGSHVAVPIACDASNARTMAIREYHYHDKKVMAAILLKITFELLT >NZ_CP026072.1|WP_001789518.1|1219627_1219729_-|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNSVVIGGKGK >NZ_CP026072.1|WP_000991007.1|1219813_1221202_+|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH >NZ_CP026072.1|WP_001289311.1|1221282_1222038_-|NADPH-dependent-oxidoreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >NZ_CP026072.1|WP_000052781.1|1222529_1223099_+|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >NZ_CP026072.1|WP_000930486.1|1223114_1224638_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDDKSKELKDLLTEITDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKKLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMNTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLNDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_CP026072.1|WP_001795623.1|1224716_1225010_+|hypothetical-protein MINLIYTTRCAIMLKVCTSRKQINMKNDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLVQPIMQLFIDKAILNNVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >NZ_CP026072.1|WP_000746687.1|1225082_1225709_+|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >NZ_CP026072.1|WP_000868248.1|1225963_1226347_+|hypothetical-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVEKNDSP >NZ_CP026072.1|WP_000158374.1|1226412_1226994_-|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSRAEAVDLKVENCKPYIIE >NZ_CP026072.1|WP_000211676.1|1227171_1227381_+|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPKFPHINLLLFNPILSTFSNIIIHIDHFHANKKDDN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP026072_6 | 2013908-2013999 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026072_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP026072_6
>6.1|2013939|30|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder GGAAGCGTAGTGACCTCAGGTTGTTAGGGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026072_6
The CRISPR arrays of NZ_CP026072_6 >merge|NZ_CP026072|6|2013908-2013999|CRISPRCasFinder CTTTTATGCATGCGCTAAAGCGCAGGCGAACGGAAGCGTAGTGACCTCAGGTTGTTAGGGACTTTTATGCATGCGCTAAAGCGCAGGCGAAC >NZ_CP026072|6|5|2013908-2013999|CRISPRCasFinder CTTTTATGCATGCGCTAAAGCGCAGGCGAAC GGAAGCGTAGTGACCTCAGGTTGTTAGGGA CTTTTATGCATGCGCTAAAGCGCAGGCGAAC
>NZ_CP026072.1|WP_001173165.1|2012579_2013857_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter MALFKRKISLPMQVVIALVLGVVVGLLLYGQENVANYIKPFGDVFLNLIKMIVIPVVFCSLALSISNVGESKTVGRYGWKTILYFEIITTIAIGLGIIFGNLFKPGAGLDPTKLPKGDISKYQSTAHAAEQSTYGNHFIDTIVHIIPTNFFEALNKGELLPIIFFAVFFGLGLAAVGKKAEPVKEFLSGSLEAVFWMINKILKLAPLGVFAFICTTIITFGASALLPLLKLVLVVVFAMVFFVFAILGLVAWMCGINIMNIIRILKSELLLAFSTSSSEAVLPVMMKKMENFGSPKEITSFVIPIGYTFNLDGSALYQSIAALFVAQMYGMHLTLSEQIVLMLTLMITSKGMAAVPGTSIVVLLTTLGAMGLPAQGLALIIGVDRILDMVRTCVNVIGNALSTIVIAKWENVYDKAKGQEYLKSI >NZ_CP026072.1|WP_000727537.1|2012032_2012398_+|DUF3139-domain-containing-protein MKKKKNAIKVIIILFISLIVAVAFFFGLKTYQGHKNIQLIDSYLEEKNLKDKIKSEKTEYSAKKGLFYKEVTFKDEPGVTYVVQPISTNKGLFVEGFDTETKKSLKTAKHKYFNQNYKPSK >NZ_CP026072.1|WP_000289213.1|2011188_2011635_-|MarR-family-transcriptional-regulator MYVENSYLSKQLCFLFYVSSKEIIKKYTNYLKEYDLTYTGYIVLMAIENDEKLNIKKLGERVFLDSGTLTPLLKKLEKKDYVVRTREEKDERNLQISLTEQGKAIKSPLAEISVKVFNEFNISEREASDIINNLRNFVSKNFDYSDKK >NZ_CP026072.1|WP_001797427.1|2010544_2010973_-|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MILNFNQFENQNFFNGNPSDTFKDLGKQVFNYFSTPSFVTNIYETDELYYLEAELAGVNKEDISIDFNNNTLTIQATRSAKYKSEQLILDERNFESLMRQFDFEAVDKQHITASFENGLLTITLPKIKPSNETTSSTSIPIS >NZ_CP026072.1|WP_000278558.1|2009268_2010438_+|NarK/NasA-family-nitrate-transporter MYKTKGGFQLTLQTLSLVVGFMAWSIIAPLMPFIKQDVNVTEGQISIILAIPVILGSVLRVPFGYLTNIVGAKWVFFTSFIVLLFPIFFLSQAQTPGMLMASGFFLGVGGAIFSVGVTSVPKYFPKEKVGLANGIYGMGNIGTAVSSFLAPPIAGIIGWQTTVRSYLIIIALFALIMFIFGDTQERKIKVPLMAQMKTLSKNYKLYYLSYWYFITFGAFVAFGIFLPNYLVNHFGIDKVDAGIRSGVFIALATFLRPIGGILGDKFNAVKVLMIDFVVMIIGAIILGISDHIALFTVGCLTISICAGIGNGLIFKLVPSYFLNEAGSANGIVSMMGGLGGFFPPLVITYVANLTGSSHLAFIFLAVFGCIALFTMRHLYQKEYGSLKNG >NZ_CP026072.1|WP_000332063.1|2007265_2008006_-|MerR-family-transcriptional-regulator MAYTYTLKDIIEITGVTKRTLHYYDEIGLLVPDKNDKNYRVYKQQDLEKLQKILILKSFDFDIAKIKQYISYDNEQLRKLLSEQISKLDKKISDLQLIRRSVCEFIKGLSLIDTSILNKTLQSQYDKEASIKYGHTKAYQSFIRRKDSLQSQDIRHKLTTIFNKFNHMSLSHYPIQDCSDLVFEWKAFMNTIADFDDETLCCIAKTYEDDTRFKDYFNSYDNQNLASYISEAVNYFLSNVNKSDNF >NZ_CP026072.1|WP_000706315.1|2006354_2007008_+|response-regulator-transcription-factor MKIVIADDHAVVRTGFSMILNYQNDMEVVATAADGVEAYQKVMEYKPDVLLMDLSMPPGESGLIATSKIADSFPETKILILTMFDDEEYLFHVLRNGAKGYILKNAPDEQLLLAIRTVYKGETYVDMKLTTSLVNEFVSNSNQDTANTTDPFKILSKRELEILPLIAKGYGNKEIAEKLFVSVKTVEAHKTHIMTKLGLKSKPELVEYALKKKLLEF >NZ_CP026072.1|WP_000606546.1|2005297_2006332_+|sensor-histidine-kinase MINEDSIQLDTLLKKYYEHSIEKIVFADDNGKIIAMNDAAKDILSEEDNYSAVANAICHRCEGYTNAYDVQSCKDCFLESMQVQATNFQVFMKTKDQKVMPFTATYQLIDQDRGIHAFTLQNVSSQIEQQEKLHQQRMMRKTISAQENERKRISRELHDSVIQEMLNVDVQLRLLKYQEDTTKLLEDAENIEYIVAKLIDDIRNMSVELRPASLDDLGLEAAFKSYFKQFEENYGIKIIYTSNIKNTRFDSDIETVVYRVVQEAILNALKYADVNEINVGIRQTGRHLVAEVIDAGNGFDPSSKPKGSGLGLYGMNERAELVSGSVNIETKIGEGTNVTLNIPI >NZ_CP026072.1|WP_000186933.1|2004821_2005274_+|GAF-domain-containing-protein MTPEAIIEDRRFQETLDKIRKEEGYDFAAIAFYESNKPSSPIKWHYVSGNKNNRFKLIILRKGRGLAGTVMKTGKRMVIANVGLALGPEEKIDYPILLSESLTAVLAVPLWYKNQVYGVLLFGQRDGRPLPKIFDNDDIQRKFGIFNDDK >NZ_CP026072.1|WP_000934151.1|2004124_2004802_+|respiratory-nitrate-reductase-subunit-gamma MLNQFLWVIFPYLCLVVFVAGHIARYRYDKFSWTAKSSELIERKRLMWGSLLFHLGIIPVFFGHVVGLLIPKPWMDAVGVSEHLYHIGAVYIGSIFGIITLIGMFLLTARRVTTKSIRRLSSASDIFVNFLLLLIVFMGCYATLVTNIQHPDFNYRTSLSIWFRQLFMLKPDASLMSGVPIAFKMHILLGFTIMACWPFTRLVHVWSVPLTYINRRYIIYRKNKV >NZ_CP026072.1|WP_000727328.1|2014199_2014556_-|DUF4889-domain-containing-protein MKKKKGFGLGISLIAIMLIVCIVLVIMMMTGGKKDTYYGIMKDNTTIEKMISEKDESIEKNVKLPSDSDVKVKKGDFVIVYKLADSDKIVKVKKVDHDDVPHGLMMKIHDMGKMHMKH >NZ_CP026072.1|WP_000071901.1|2014820_2015243_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein MSNSQAIQAIENVLATSKVGVLSTAYNNKPNSRYMVFYNDGLTLYTKTNIHSAKVKEIKDNPAAYVLLGYNDTTNRSFVEMEATIEIVTEQEVIDWLWETQDKSFFSSKEDPELCVLRVVPQSIKLMNDKSLDTPIKIDL >NZ_CP026072.1|WP_000128360.1|2015313_2017419_-|AraC-family-transcriptional-regulator-Rsp MTCQLKIHHTLSTIPSRNINNIMVLFSLTSKLNITINGETKDVSNYIILINHGDIYNINHGENIIELMIPVFYFYQQDDDFFNGYLDRHLLQSSNYIKSLIADLISTPTSSSLMGKNIGQSIIDTLLKEAFIRIDHEYLPNIALSNPVFIDCVNYIHDNIDAHLSLKDIAMHCNISESYCSNLFVRYLSMNFKDYFTSIKLVNAINLLLSTKHSITTVSELAGFNSHTNFANQFKNYLHFSPKQFRSLVSKITEPPQIHFQQDNVSQFTELISTIDLTAQLATNTTDIHIDDFNPKDRSQRAKVFVRFSNFNELFQFIFNEYYDINFEHLPKPVVFIDDIHDIEISQTNYNLLNRCFEKLFEKNIGLAIAIKSTQQFETMKQLILTFLQGNQDYKTSKKLVKFMLVFCSNSMTAEEIHLCHLKIKNKNKEIKYSVTVDGFLETYSTVEQVYDVMQRLKFHYYFIDIENSKTATHLITKNQHYHQTDTHFEQYKKFILDSGISSTQFVYNNLSVSGFKYTNDGENPIQLSDIVYHLIALLRYGGGISYQLLDDHSNYISLYNKYGSPLPLMHLYKMFRPFVNEDIEITNNYVLSRKDNNYHFLLFNKINDRYMSDVKQDFIFHNELPQDSLMIIKTLNHEHGSIQHLLPISDQLVYIEKEILDELDKTNYPKTELAVQEETGRTFELKLNHDEVKYICFKPS >NZ_CP026072.1|WP_000664394.1|2018906_2019290_-|YbgA-family-protein MKERGYIEQLWREEKYHVLLHSQQSYQMIRNALKTDLSLHQVQQMIDVALLIEPSIGSVCNAFDHMWGYLKKCANEEERQQSKLLKADFINGKIDTQTLLDFLAELANKYDVQYLLQSRVLNTKRKR >NZ_CP026072.1|WP_001108126.1|2019472_2020915_+|PTS-sucrose-transporter-subunit-IIBC MNYKQSAEEILNAIGGEENLDAMAHCATRLRLVLNDESLVNEEALNNMDVVKGTFSTGGQYQIIIGSGTVNKVFSELEKLTGKEASTTSEVKAQSAKNMNPLQRFVKMLSDIFVPIIPAIVAGGLLMGLNNILTAKDLFFSGKSLIDVYSQFAGLAEMINVFANAPFTLLPILIGFSAAKRFGGNPFLGAALGMILVHPSLMSAYDFPKAVEAGKAIPYWDVFGLHINQVGYQGQVLPMLVAAYILASIEKGLRKVIPTVLDNLLTPLLSIFITAFLTFSFVGPITRQLGYWLSDGLTWLYEFGGAIGGLIFGLLYAPIVITGMHHSFIAVETTLIADATKTGGSFIFPIATMSNVAQGGAAIAAFFIIKQNKKLKGVASAAGISALLGITEPAMFGVNLKLRYPFIGAIVGSGIGSAYIAFFKVKAIALGTAGLPGFISINPVHAGWLHYFVGMTISFIIAITVTLILSKRKANKEVVE >NZ_CP026072.1|WP_000633068.1|2021000_2021945_-|magnesium-transporter-CorA-family-protein MITSFRHSEDIDKHIIKTPLDHTASWINVVEPDREEIENLMEQYNIPEDFIRDPLDSEESSRIEYDEDTGYSLIIIDLPIVNSTNRSVLSFVTIPLGIIIGNGIIVTVCDAENEFLENLPKRDINLKFHSRFALEILTTIADHYNRNLRLLNKSRIRIEKELKNNITNKQLFKLMEVEKSLVYFLAALKGNDTIIKKLFRLPAIKRFEEDEELLEDLIIENNQAIETTELHQRILESITTSYASLLSNDMNTIMKTLTLFTVLLTLPTLVFSFFGMNVPLPIDDHSYISWIIVVGISLILVVIVSIFLWRKQKL >NZ_CP026072.1|WP_000656771.1|2021990_2022614_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MKEDRRIRKTKSSIKQAFTKLLQEKDLEKITIRDITTRADINRGTFYLHYEDKYMLLADMEDEYISELTTYTQFDLLRGSSIEDIANTFVNNILKNIFQHIHDNLEFYHTILQLERTSQLELKINEHIKNNMQRYISINHSIGGVPEMYFYSYVSGATISIIKYWVMDKQPISVDELAKHVHNIIFNGPLRIMAENRLHKSNLDSLT >NZ_CP026072.1|WP_001020023.1|2022774_2024052_+|YhgE/Pip-domain-containing-protein MNIFKNKLLWIAPIATMIILVIFSLAFYPAYNPKPKDLPIGILNEDKGTTIQDKNVNIGKKLEDKLLDSDSNKIKWVKVDSEKDLEKDLKDQKIFGVAIIDKDFSKDAMSKTQKVVMDSKKEEMQQKVASGEIPPQVVQQMKQKMGNQQVEVKQAKFKTIVSEGSSLQGSQIASAVLTGMGDNINAQITKQSLETLTSQNVKVNAADINGLTNPVKVDNEKLNKVKDHQAGGNAPFLMFMPIWIGSIVTSILLFFAFRTSNNIVVQHRIIASIGQMIFAVVAAFAGSFVYIYFMQGVQRFDFDHPNRIAIFVAFAILGFVGLILGVMVWLGMKSVPIFFILMFFSMQLVTLPKQMLPESYQKYVYDWNPFTHYATSVRELLYLNHHIELNSTMWMFIGFMIFGAVSSLVSAIVRKHSTKRTEVPS >NZ_CP026072.1|WP_001253464.1|2024258_2024690_+|DUF2871-domain-containing-protein MRRLLYSFLFYMIIGLFSGFFYRELTKAYDFTGTTQLSLVHTHTLILGMFMFLILLPLEKLFKLSSYYLFNWFFYVYNIGVIVTIGMMVTKGFFQVTGKSYSPEAFAGFAGIGHTGMLAGLLLLFFLLRQAILKEPRDESFKK >NZ_CP026072.1|WP_001789934.1|2024794_2024911_+|hypothetical-protein MANYAIYFNNININSIMALNDNNYQFEHVNERNEYRES |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP026072_7 | 2129688-2129881 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026072_7
|
3 spacers
spacers of NZ_CP026072_7
>7.1|2129711|33|NZ_CP026072|CRT CAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATG >7.2|2129767|36|NZ_CP026072|CRT TAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCA >7.3|2129826|33|NZ_CP026072|CRT CAGAAGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026072_7
The CRISPR arrays of NZ_CP026072_7 >merge|NZ_CP026072|7|2129688-2129881|CRT TACAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGAACGGGGCCCCAACACAGAAGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA >NZ_CP026072|7|2|2129688-2129881|CRT TACAAGTTGGCGGGGCCCCAACA CAGAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTACAATAATG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA TAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGACAATGCA AGTTGGGGAACGGGGCCCCAACA CAGAAGGTGACGAAAAGTCAGCATACAATAATG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA
>NZ_CP026072.1|WP_000230173.1|2128523_2129546_+|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP026072.1|WP_000643991.1|2127904_2128504_+|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPVITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP026072.1|WP_000866971.1|2127664_2127898_+|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP026072.1|WP_000808500.1|2127212_2127659_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP026072.1|WP_000602937.1|2126713_2127199_+|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP026072.1|WP_000259718.1|2125457_2126717_+|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFVDGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP026072.1|WP_000134528.1|2124900_2125395_-|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTLIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSNQ >NZ_CP026072.1|WP_000503817.1|2124392_2124899_+|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIDGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP026072.1|WP_000076929.1|2123357_2124362_+|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKYRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP026072.1|WP_000913019.1|2122582_2123188_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG >NZ_CP026072.1|WP_001790034.1|2129940_2130111_-|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNGMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NZ_CP026072.1|WP_000066900.1|2130236_2130587_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP026072.1|WP_000184419.1|2130688_2131900_-|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP026072.1|WP_000951058.1|2131892_2132333_-|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP026072.1|WP_000600967.1|2132494_2133259_+|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP026072.1|WP_001549681.1|2133250_2133502_-|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP026072.1|WP_000413865.1|2133890_2135156_+|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMKTSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP026072.1|WP_000592303.1|2135272_2138440_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP026072.1|WP_001161085.1|2138626_2138944_-|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP026072.1|WP_000051206.1|2139188_2139353_-|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDIEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP026072_8 | 2255219-2255369 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP026072_8
|
2 spacers
spacers of NZ_CP026072_8
>8.1|2255247|38|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder GAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAAC >8.2|2255313|29|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder TAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP026072_8
The CRISPR arrays of NZ_CP026072_8 >merge|NZ_CP026072|8|2255219-2255369|CRISPRCasFinder TAGAAAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTGAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAACTGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTTAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCATGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTT >NZ_CP026072|8|6|2255219-2255369|CRISPRCasFinder TAGAAAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTT GAAAAATAGAGGAACACAGTTGGATGCTACGCATCAAC TGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTT TAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCA TGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTT
>NZ_CP026072.1|WP_001802298.1|2254782_2254887_+|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP026072.1|WP_000115564.1|2252959_2254096_+|SAP-domain-containing-protein MSVNARDLLVLHTNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPTKKGEEILKKTEYLTSFIQSYGEISLERAYYLVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYDNGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNIYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSNVKKESRSNTLIELSKILENGYTIDKEEFKKEDDYLSKYIFTDIDYLKKLESKINVAIDIRSGEIHLVLDDDSLDILIQNQKYGNEF >NZ_CP026072.1|WP_001790138.1|2252578_2252671_-|hypothetical-protein MFIFKTTSKSHFHNNVKSLECIKIPINKNR >NZ_CP026072.1|WP_000370924.1|2251016_2251874_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAEHFLAE >NZ_CP026072.1|WP_000908176.1|2250166_2250949_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMFAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP026072.1|WP_000334465.1|2248129_2249935_+|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP026072.1|WP_000083807.1|2245910_2247449_-|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_CP026072.1|WP_000927363.1|2243743_2245876_-|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP026072.1|WP_001292149.1|2243297_2243732_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP026072.1|WP_000648718.1|2242191_2243298_-|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVEDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAAYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP026072.1|WP_000495671.1|2255386_2256478_-|lytic-regulatory-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP026072.1|WP_000019744.1|2256743_2257724_-|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP026072.1|WP_000003759.1|2257725_2258046_-|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP026072.1|WP_001024094.1|2258197_2258863_+|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >NZ_CP026072.1|WP_001127960.1|2259297_2260236_+|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP026072.1|WP_000808817.1|2260266_2260497_+|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP026072.1|WP_000123393.1|2261168_2262542_+|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRISNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP026072.1|WP_001123303.1|2262999_2263413_+|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP026072.1|WP_000070866.1|2263612_2264056_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP026072.1|WP_000160304.1|2264176_2264887_-|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP026072_2 | 2.1|744455|34|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder | 744455-744488 | 34 | NZ_CP026072.1 | 103958-103991 | 0 | 1.0 |
NZ_CP026072_2 | 2.1|744455|34|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder | 744455-744488 | 34 | NZ_CP026072.1 | 194477-194510 | 0 | 1.0 |
NZ_CP026072_7 | 7.2|2129767|36|NZ_CP026072|CRT | 2129767-2129802 | 36 | NZ_CP026072.1 | 417849-417884 | 0 | 1.0 |
NZ_CP026072_3 | 3.1|788649|26|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder | 788649-788674 | 26 | NZ_CP026072.1 | 1691096-1691121 | 1 | 0.962 |
NZ_CP026072_7 | 7.2|2129767|36|NZ_CP026072|CRT | 2129767-2129802 | 36 | NZ_CP026072.1 | 2650212-2650247 | 1 | 0.972 |
NZ_CP026072_1 | 1.4|421938|37|NZ_CP026072|CRT | 421938-421974 | 37 | NZ_CP026072.1 | 421994-422030 | 2 | 0.946 |
NZ_CP026072_3 | 3.1|788649|26|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder | 788649-788674 | 26 | NZ_CP026072.1 | 679735-679760 | 2 | 0.923 |
NZ_CP026072_7 | 7.1|2129711|33|NZ_CP026072|CRT | 2129711-2129743 | 33 | NZ_CP026072.1 | 194523-194555 | 2 | 0.939 |
NZ_CP026072_7 | 7.1|2129711|33|NZ_CP026072|CRT | 2129711-2129743 | 33 | NZ_CP026072.1 | 417796-417828 | 2 | 0.939 |
NZ_CP026072_7 | 7.1|2129711|33|NZ_CP026072|CRT | 2129711-2129743 | 33 | NZ_CP026072.1 | 788606-788638 | 2 | 0.939 |
NZ_CP026072_7 | 7.1|2129711|33|NZ_CP026072|CRT | 2129711-2129743 | 33 | NZ_CP026072.1 | 1854409-1854441 | 2 | 0.939 |
NZ_CP026072_7 | 7.1|2129711|33|NZ_CP026072|CRT | 2129711-2129743 | 33 | NZ_CP026072.1 | 2492133-2492165 | 2 | 0.939 |
NZ_CP026072_7 | 7.2|2129767|36|NZ_CP026072|CRT | 2129767-2129802 | 36 | NZ_CP026072.1 | 2481327-2481362 | 2 | 0.944 |
NZ_CP026072_7 | 7.2|2129767|36|NZ_CP026072|CRT | 2129767-2129802 | 36 | NZ_CP026072.1 | 2830308-2830343 | 2 | 0.944 |
NZ_CP026072_7 | 7.3|2129826|33|NZ_CP026072|CRT | 2129826-2129858 | 33 | NZ_CP026072.1 | 103913-103945 | 2 | 0.939 |
NZ_CP026072_7 | 7.3|2129826|33|NZ_CP026072|CRT | 2129826-2129858 | 33 | NZ_CP026072.1 | 194523-194555 | 2 | 0.939 |
NZ_CP026072_7 | 7.3|2129826|33|NZ_CP026072|CRT | 2129826-2129858 | 33 | NZ_CP026072.1 | 417796-417828 | 2 | 0.939 |
NZ_CP026072_7 | 7.3|2129826|33|NZ_CP026072|CRT | 2129826-2129858 | 33 | NZ_CP026072.1 | 788606-788638 | 2 | 0.939 |
NZ_CP026072_7 | 7.3|2129826|33|NZ_CP026072|CRT | 2129826-2129858 | 33 | NZ_CP026072.1 | 1854409-1854441 | 2 | 0.939 |
NZ_CP026072_7 | 7.3|2129826|33|NZ_CP026072|CRT | 2129826-2129858 | 33 | NZ_CP026072.1 | 2492133-2492165 | 2 | 0.939 |
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cagaaggtgacgaaaagtcagcatacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ****** *************** **********
19. spacer 7.3|2129826|33|NZ_CP026072|CRT matches to position: 1854409-1854441, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaaggtgacgaaaagtcagcatacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ****** *************** **********
20. spacer 7.3|2129826|33|NZ_CP026072|CRT matches to position: 2492133-2492165, mismatch: 2, identity: 0.939
cagaaggtgacgaaaagtcagcatacaataatg CRISPR spacer cagaagctgacgaaaagtcagcttacaataatg Protospacer ****** *************** **********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_CP026072_3 | 3.1|788649|26|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder | 788649-788674 | 26 | NZ_CP034332 | Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence | 3359-3384 | 5 | 0.808 |
NZ_CP026072_3 | 3.1|788649|26|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder | 788649-788674 | 26 | NZ_CP022605 | Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence | 715511-715536 | 5 | 0.808 |
1. spacer 3.1|788649|26|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022541 (Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer taaggcctcaacacagaagctggcgt Protospacer ...****.*****************
2. spacer 3.1|788649|26|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034332 (Tabrizicola piscis strain K13M18 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer gtaggcccagacacagaagctggcgg Protospacer .***** .****************
3. spacer 3.1|788649|26|NZ_CP026072|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022605 (Ochrobactrum quorumnocens strain A44 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcgg CRISPR spacer tcagggccaaacacagaagctggcgg Protospacer . .** ** *****************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4903 : 14733
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026072|4903:14733|DBSCAN-SWA AATGCAATCTTTTGTAAAAATCATAGATGGTTACAAGGAAGAAGTAATAACAGATTTTAATCAGCTTATATTTTTAGATGCAAGGGCTGAAAGTCCAAACACCAATGATAACAGTGTAACTATTAACGGAGTAGATGGTATTTTACCGGGCGCAATTAGTTTTGCGCCTTTTTCATTAGTATTAAGGTTTGGCTATGATGGTATAGATGTTATAGATTTAAATTTATTTGAGCATTGGTTTAGATCTGTGTTTAATCGCAGACATCCTTATTATGTTATTACTTCTCAAATGCCTGGTGTTAAATATGCAGTGAATACAGCTAATGTTACATCTAATTTAAAAGATGGTTCTTCAACTGAAATTGAAGTAAGTTTAAATGTTTATAAAGGGTATTCTGAATCAGTTAATTGGACCGATAGCGAGTTCTTATTCGACTCTAATTGGATGTTTGAAAATGGAATTCCTCTTGATTTCACACCTAAATATACTCATACATCAAATCAATTTACTATTTGGAACGGTTCTACTGATACGATAAATCCACGATTCAAGCACGATTTGAAAATATTAATTAATTTAAATGCGAGTGGAGGATTTGAACTGGTTAACTATACAACAGGTGATATTTTTAAGTACAACAAAAGTATAGATAAAAACACTGATTTTGTTTTAGATGGTGTGTATGCATATCGAGATATAAATAGAGTGGGAATTGATACAAATAGAGGCATTATAACATTAGCGCCAGGTAAAAATGAATTTAAGATTAAAGGAGACGTCAGTGATATTAAAACTACATTTAAGTTTCCTTTTATTTATAGGTAGGTGATTTAATGGATTATCATGATCATTTATCAGTAATGGATTTTAATGAATTGATTTGTGAAAATTTACTAGATGTAGATTATGGTTCTTTTAAAGAATATTATGAACTGAATGAAGCTAGGTACATCACCTTTACAGTTTATAGAACTACTCATAATAGTTTTGTTTTTGATTTATTGATTTGTGAAAACTTCATAATTTATCATGGTGAAAAATATACAATTAAGCAGACAGCGCCAAAGGTTGAAGGTGATAAAGTTTTTATTGAAGTTACGGCATATCACATAATGTATGAATTTCAAAATCACTCAGTGGAATCAAATAAGCTTGATGACGACAGTAGCGAAACTGGTAAAACGCCAGAATACTCTTTAGATGAGTACTTAAGATATGGATTTGCAAATCAAAAAACTTCGGTCAAAATGACCTATAAAATAATTGGAGATTTTAAGCGAAAAGTACCGATTGACGAATTAGGTAACAAAAACGGCTTAGAATACTGTAAAGAAGCGGTAGACCTGTTTGGCTGTATAATTTACCCAAATGATACAGAGATTGGTTTTTATTCTCCTGAAACATTTTATCAAAGAAGCGAGAAAGTGATTCGATATCAATATAATACTGATACTGTATCTGCAACTGTCAGTACATTGGAATTAAGAACAGCTATAAAAGTTTTTGGAAAAAAGTATACAGCTGAGGAAAAGAAAAATTATAATCCTATTAGAACAACTGACATTAAATATTCAAATGGTTTTATAAAAGAAGGTACTTATCGTACCGAAACAATTGGGTCTAAAGCTACTATTAACTTTGATTGCAAGTATGGTAATGAAACAGTTAGATTTACAATAAAAAAGGGCTCTCAAGGTGGAATATATAAGTTGATTTTAGACGGCAAGCAAATTAAGCAAATTTCTTGTTTTGCTAAGTCGGTTCAGTCTGAAACAATAGATTTAATAAAAAATATTGATAAAGGCAAGCACGTTTTAGAAATGATATTTTTAGGAGAAGACCCCAAAAATAGAATTGATATATCTTCAAATAAAAAAGCTAAGCCTTGTATGTATGTTGGAACTGAAAAATCAACAGTCTTAAATTTAATTGCTGATAATTCAGGTCGCAATCAATACAAAGCAATTGTCGACTACGTCGCAGATAGTGCAAAGCAGTTTGGGATTCGATATGCTAATACGCAAACAAATGAAGATATCGAAACACAGGATAAGCTGTTAGAATTTGCAAAAAAGCAAATAAATGATACTCCTAAGACTGAATTAGATGTTAATTATATAGGTTATGAAAAAATAGAGCCAAGAGATAGCGTATTTTTTGTTCATGAATTAATGGGATATAACACTGAATTAAAGGTTGTTAAACTTGATAGGTCACATCCATTTGTAAACGCAATAGATGAAGTGTCTTTCAGCAATGAAATAAAAGATATGGTACAAATTCAACAAGCACTTAACAGACGAGTTATTGCACAAGATAATAGATATAACTATCAAGCAAATCGTATAAATCATTTATACACTAGTACTTTGAATTCTCCTTTCGAGACAATGGATATAGGGAGTGTATTAATATAATGGCAACAGAAGAAGTTAAAATCAAAGCGCTACTTGAAAACGATAAACAGTACTTTCCAGCTACACACTGGAAAGCTATAAATGGGATACCTTATGCAGGCAGTAGTGATATTGATGGATTGCCTCAAGACGGTATCATTTCGGTAGATGATAAAAATAAATTAGATAAATTAAAAATAGGCGAAGCAGGAATTATTCAAAATAGCATTGTACAGAAATCCCCAAACGGTAAATTGTGGAAAATAACAGTTGACGATAGTGGGAAACTTGGTACAGTGCTATTTTATTAGAAAGGAAGGTGCATTATGGAAAATTTGTATTTAATAAAGGATTTGGGAGCTTTAGCAGGTCGAGATTATAGAGCTAAAGAAATTCAAAACCTGCAAAGAATAGAGCAATTTGCGCTTGGCTTGACAACAGAGTTTAAGTTGCATCAGAAAGCTAAAACAATGCAACACTTCGCTGAGCAAATTTATTATAATGGTAGATCGCAAGCAGCAGTAAACAAATCTTTACAAAGTCAAATTAACGCACTTGTTGTGGCACCACGTAATAACAGTGCTAATGAGATTGTTCAAGCTCGAGTTAATGTAAACGGCGAAACCTTTGACACATTAAAAGAACATTTAGACGATTGGGAAACCAAAACTCAAATTAATAAAGAGGAAACTATAAGAGAATTAAATAAGACCAAACAAGAAATTCTTGATATCGAGTATCGTTTTGAACCTGATAAGCAAGAGTTTTTATTTGTGACAGAACTTGCACCTCTTACAAATGCAGTAATGCAATCCTTCTGGTTTGATAATAGAACAGGCATAGTATACATGACACAAGCTAGAAATAATGGCTATATGCTAAGTCGTTTAAGACCTAATGGTCAATTTATAGACAGCTCATTGATTGTAGGTGGGGGTCATGGTACACATAACGGTTATAGATATATTGATGATGAGTTATGGATTTATAGTTTTATCTTAAATGGTAATAATGAGAATACATTAGTTCGTTTCAAGTATACGCCTAATGTGGAAATTAGCTATGGCAAGTATGGTATGCAAGATGTATTTACAGGACACCCAGAAAAACCCTACATCACCCCTGTCATAAATGAAAAAGAAAATAAAATTCTATACAGAATTGAGAGACCTAGAAGTCAGTGGGAACTTGAAAACTCAATGAATTATATAGAGATAAGAAGTTTAGACGATGTTGATAAAAATATTGATAAAGTTTTGCATAAAATCAGTATCCCTATGAGACTAACAAACGAAACCCAACCAATGCAGGGTGTGACTTTTGATGAAAAATACTTGTATTGGTATACAGGAGACAGTAATCCAAATAATAGAAACTATTTAACGGCTTTCGATTTAGAAACAGGAGAAGAAGCGTATCAGGTTAATGCTGACTATGGTGGAACACTAGATTCATTTCCTGGCGAATTTGCGGAAGCAGAAGGTTTGCAAATATACTATGACAAAGATAGTGGTAAAAAAGCTTTGATGCTAGGTGTTACTGTCGGTGGTGATGGAAATAGAACACATCGTATTTTCATGATTGGGCAAAGAGGTATTTTAGAAATACTTCACTCAAGAGGCGTTCCTTTTATCATGAGTGACACAGGTGGTAGAGTTAAACCTTTACCAATGAGGCCTGATAAACTTAAGAATCTTGGGATGTTAACAGAGCCAGGTCTTTACTATTTATACACTGATCATACAGTTCAAATCGATGATTTCCCATTACCAAGAGAATGGCGTGATGCAGGTTGGTTCTTGGAAGTTAAGCCACCACAAACTGGCGGTGATGTAATTCAGATATTGACGCGTAATAGTTATGCAAGGAATATGATGACTTTTGAAAGGGTGCTTTCTGGAAGAACTGGAGACATTTCGGACTGGAATTATGTGCCTAAAAATAGTGGTAAATGGGAGAGAGTACCTTCATTCATCACAAAAATGTCAGATATTAACATAGTAGGCATGTCGTTTTATTTAACTACGGATGATACAAAACGTTTTACAGATTTTCCAACTGAACGTAAAGGGGTAGCTGGTTGGAACTTATATGTAGAAGCTTCAAACACAGGTGGCTTTGTTCATAGGCTAGTTCGTAATAGTGTTACAGCATCTGCTGAGATACTATTGAAAAATTATGATAGTAAAACAAGTTCAGGGCCATGGACTTTACACGAAGGGAGAATTATAAGTTAATGAGTAATTTAGAGAAATCTGTAGCTATAAATTTAGAAAACACAGCGCATTATGAAAATATTTCAAATCTAGATATAACTTTTAGAACAGGAGAGAGTGATTCTTCTGTTCTTCTTTTTAATATCATTAAAAATAATCAACCGTTATTACTGAGTGAAGAAAATATCAAAGCACGAATAGCGATTCGAGGTAAAGGAGTAATGGTAGTTGCTCCACTAGAAATATTAGATCCATTTAAAGGTATTTTAAAATTTCAATTACCTAATGATGTAATTAAAAGAGATGGAAGTTATCAAGCTCAAGTTTCGGTTGCAGAATTAGGTAATTCAGACGTGGTAGTTGTAGAGAGAACTATCACATTTAACGTTGAAAAAAGTTTGTTTAGCAAGATTCCCTCTGAAACAAAACTACACTATATTGTTGAGTTTCAAGAATTAGAAAAAACTATTATGGATCGCGCGAAAGCAATGGACGAGGCTATAAAAAATGGTGAGGATTATGCGAGTCTGATTGAAAAAGCTAAAGAAAAAGGTCTATCAGATATTCAAATAGCAAAATCTTCAAGTATTGATGAATTAAAGCAACTTGCTAATAGCCGTATATCTGATTTGGAAAATAAAGCGCAAGCATATTCAAGAACATTCGATGAGCAAAAGCGATATATGGATGAGAAACATGAAGCCTTCAAGCAGTCAGTGAATAGTGGTGGTTTAGTCACAAGTGGTTCTACTTCAAATTGGCAAAAAGCTAAGATTACTAAAGATGATGGTAAGATAATGCAGATTACTGGATTTGATTTTAATAATCCAGAACAAAGAATAGGTGATTCAACCCAATTTATTTATGTTTCGCAAGCTATAAATTATCCAAGAGATGTTAGTACTAACGGTACTGTCGAATATTTAGTAGTAACTTCAGATTACAAGCGTATGACTTATCGACCGAACGGTACAAATAAAGTGTTTGTTAAAAGAAAAGAAGCGGGTTCATGGTCTGAGTGGTCAGAATTAGCTATTAATGATTACAATACACCTTTTGAAACTGTTCAAAGTGCCCAATCAAAAGCTAATATGGCCGAAAGTAACGCTAAATTATACGCAGATGACAAGTTTAATAAAAGGTATTCGGTTATTTTTGATGGAACAGCAAATGGTGTGGGCTCTACATTGTACTTAAATGAGAGTTTAGACCAATTTATTTTATTAATTTTTTATGGGACTTTTCCAGGTGGTGACTTTACAGAGTTTGGCAGTCCTTTTGGAGGAGGAAAGATTTCATTGAATCCCTCAAATCTTCCAGATGGTGATGGAAATGGTGGAGGTGTTTATGAGTTTGGATTAACTAAATCTAGTCGTACATCTTTAACTATATCAAACGATGTCTATTTCGACTTAGGAAGTCAAAGAGGCTCTGGTGCGAACGCAAATAGAGGGACAATTAACAAAATTATAGGAGTGAGAAAATAATGCAAATATTAGTTAACAAGCGTAATGAGATAATTTCATACGCTATCATTGGCGGCTTTGAAGAAGGTATTGATATTGAAAATTTACCAGAAAATTTCTCTCAAGTTTTTAGACCTAAAGCCTTTAAATATTCAAATGGGGAAATAGTTTTTAACGAAGATTATTCAGAAGAAAAAGATGACTTGCATCAACAGATTGACAGTGAAGAACAAAACACAGTCGCTTCTGATGACATCTTACGAAAAATGGTTGCTAGTATGCAGAAACAAGTTGTTCAAAGTACAAAGTTATCGATGCAAGTTAATAAGCAAAATGCACTAATGGCAAAACAACTTGTGACACTTAATAAAAAATTAGAAGAGGTTAAAGGAGAGACTGAAAATGCTTAAATTAATTTCACCAACATTCGAAGATATTAAAACATGGTATCAATTGAAAGAATATAGTAAAGAAGATATAGCGTGGTATGTAGATATGGAAGTTATAGATAAAGAGGAATATGCAATTATTACAGGAGAAAAGTATCCAGAAAATCTAGAGTCATAGGTTATAATCTTATGGCTTTTTAATTTGAATAAAGTGGGTGGTGTAATGTTTGGATTTACCAAACGACACGAACAAGATTGGCGTTTAACGCGATTAGAAGAAAATGATAAGACTATGTTTGAAAAATTCGACAGAATAGAAGACAGTCTGAGAACGCAAGAAAAAATTTATGACAAGTTAGATAGAAATTTCGAAGAACTAAGGCGTGACAAAGAAGAAGATGAAAAAAATAAAGAGAAAAATGCTAAAAATATTAGAGACATCAAGATGTGGATTCTAGGATTAATAGGGACGATTCTAAGTACATTTGTTATAGCCTTGTTAAAAACTATTTTTGGCATTTAAAGGAGGTGATCACCATGCTTAAGGGAATTTTAGGATATAGCTTTTGGTCGTGTTTCTGGTTTGGTAAGTGTAAGTAATATTTAAGAGTCAGTGCTTCGGCACTGGCTTTTTATTTTGGATAAAAGGAGCAAACAAATGGATGCAAAAGTAATAACAAGATACATCGTATTGATCTTAGCATTAGTAAATCAATTCTTAGCGAATAAAGGTATAAGTCCGATACCAGTAGATGAAGAAAGTGTTTCATCGATTATCTTAACAGTTGTTGCTTTATATACTACATATAAAGATAATCCAACATCTCAAGAAGGGAAATGGGCGAATCAAAAATTAAAGAAATATAAAGCTGAAAGTAAATATAGAAAAGCAACAGGGCAAGCGCCAATTAAAGAAGTAATGACACCTACGAATATGAACGACACAAATGATTTAGGGTAGGTGATGACCAATGTTGATAACAAAAAACCAAGCAGAAAAATGGTTTGATAATTCATTAGGGAAGCAGTTCAATCCTGATTTGTTTTATGGATTTCAGTGTTACGATTACGCAAATATGTTTTTTATGATAGCAACAGGCGAAAGGTTACAAGGTTTATACGCTTATAATATTCCATTTGATAATAAAGCAAGGATTGAAAAATACGGGCAAATAATTAAAAACTATGATAGCTTTTTACCGCAAAAGTTGGATATTGTCGTTTTCCCGTCAAAGTATGGTGGCGGAGCTGGACATGTTGAAATTGTTGAGAGCGCAAATTTAAACACTTTCACATCATATGGGCAAAATTGGAATGGTAAAGGTTGGACAAATGGCGTTGCGCAACCTGGTTGGGGTCCTGAAACTGTTACAAGACATGTTCATTATTACGATGACCCAATGTATTTTATTAGATTAAATTTCCCAGATAAAGTAAGTGTTGGAGATAAAGCTAAAAGCGTTATTAAGCAAGCAACTGCCAAAAAGCAAGCAGTAATTAAACCTAAAAAAATTATGCTTGTAGCCGGTCATGGTTATAACGATCCTGGAGCAGTAGGAAACGGAACAAACGAACGCGATTTTATCCGTAAATATATAACGCCAAATATCGCTAAGTATTTAAGACATGCCGGTCATGAAGTTGCATTATATGGTGGCTCAAGTCAATCACAAGACATGTATCAAGATACTGCATACGGTGTTAATGTAGGCAATAAAAAAGATTATGGCTTATATTGGGTTAAATCACAGGGGTATGACATTGTTCTAGAGATTCATTTAGACGCAGCGGGAGAAAGTGCAAGTGGTGGACATGTTATTATCTCAAGTCAATTTAATGCAGATACTATTGATAAAAGTATACAAGATGTTATTAAAAATAACTTAGGACAAATAAGAGGTGTAACACCTCGTAATGATTTACTAAACGTTAATGTATCAGCAGAAATAAATATGAATTATCGTTTATCTGAATTAGGTTTTATTACTAATAAAAAAGATATGGATTGGATTAAGAAAAACTATGACTTGTATTCTAAATTAATAGCTGGTGCGATTCATGGTAAGCCTATAGGTGGTTTGGTAGCTGGTAATGTTAAAACATCAGCTAAAAACCAAAAAAATCCACCAGTGCCAGCAGGTTATACACCCGATAAAAATAATGTACCGTATAAAAAAGAAACTGGTTATTACACAGTAGCTAATGTTAAAGGTAATAATGTAAGAGACGGTTATTCAACTAATTCAAGAATTACAGGGGTATTACCCAACAACACAACAATTACGTATGACGGTGCATATTGTATTAATGGTTATAGATGGATTACTTATATTGCTAATAGTGGACAACGTCGCTATATTGCGACCGGAGAGGTAGACAAGGCAGGTAATAGAATAAGTAGTTTTGGTAAGTTTAGCACGATTTAGTATTTACTTAGAATAAAAATTTTGCTACATTAATTATAGGGAATCTTACAGTTATTAAATAACTATTTGGATGGATGTTAATATTCCTATACACTTTTTAACATTACTCTCAAGATTTAAATGTGCGTAACTGGCAGGTACTTCGGTACTTGCCTATTTTTTTATGTTATAGCTAGCCTTCGGGCTAGTTTTTTGTTATGATGTGTTACACATGCATCAACTATTTACATCTATCCTTGTTCACCCAAGCATGTCACTGGGTGTTTTTTCCTTGCGATAGAGAGCATAGTTTTCATACTACTCCCCGTAGTATATATGACTTTAGCATTCCCGTATAACAGTTTACGGGGTGCTTTTTATGTTATACTTACTTTTATATAGTAGGAGTGAACTATATAGCCGGGCAGAGGCCATGTATCTGACTGTTGGTCCCACAGGAGACATCTTCCTTGTCATCACTCGATACATATATCTTAACAACATAGAAATGTTACATTCGCTACAACCGTATCTTAATCGATACGGTTATATTTATTCCCCTACAACCAACAAAACCACAGATCCTATTAATTTAGGATTGTGGTTATTTTTTGCGTTTTTTCGGGGCGAAAAAAGGGCAGATTATTTGAAAAAGGGCAAACGCTTGTGGAAAATCTAAAAGGTTAAAAATGACAAAAACATTGATACAACAGTGTTTTTGGACGCTCGTGTACGTTAGAGAATGACCGCTTTACCATCACATTATGACGATATGTTTATTTTAAACACACAAGCTCATGCGCGTCTTGATCAAATGGCACAACAGTTTGAAGTTGTTTGTAATGGCTTGAACGAAAATGAAGGACAAGCAATTCAAACGATGGATCAATCTGCCTCTCTAATACGGTCAAACTTAATTCAAGTTAAAGAACAATTAGAAAAACTAGCTGTATACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP026072|4903:14733|12028_12331_+|WP_000339146.1|holin|DBSCAN-SWA MDAKVITRYIVLILALVNQFLANKGISPIPVDEESVSSIILTVVALYTTYKDNPTSQEGKWANQKLKKYKAESKYRKATGQAPIKEVMTPTNMNDTNDLG >NZ_CP026072|4903:14733|12341_13796_+|WP_000909213.1|DBSCAN-SWA MLITKNQAEKWFDNSLGKQFNPDLFYGFQCYDYANMFFMIATGERLQGLYAYNIPFDNKARIEKYGQIIKNYDSFLPQKLDIVVFPSKYGGGAGHVEIVESANLNTFTSYGQNWNGKGWTNGVAQPGWGPETVTRHVHYYDDPMYFIRLNFPDKVSVGDKAKSVIKQATAKKQAVIKPKKIMLVAGHGYNDPGAVGNGTNERDFIRKYITPNIAKYLRHAGHEVALYGGSSQSQDMYQDTAYGVNVGNKKDYGLYWVKSQGYDIVLEIHLDAAGESASGGHVIISSQFNADTIDKSIQDVIKNNLGQIRGVTPRNDLLNVNVSAEINMNYRLSELGFITNKKDMDWIKKNYDLYSKLIAGAIHGKPIGGLVAGNVKTSAKNQKNPPVPAGYTPDKNNVPYKKETGYYTVANVKGNNVRDGYSTNSRITGVLPNNTTITYDGAYCINGYRWITYIANSGQRRYIATGEVDKAGNRISSFGKFSTI >NZ_CP026072|4903:14733|7625_9536_+|WP_000429558.1|DBSCAN-SWA MENLYLIKDLGALAGRDYRAKEIQNLQRIEQFALGLTTEFKLHQKAKTMQHFAEQIYYNGRSQAAVNKSLQSQINALVVAPRNNSANEIVQARVNVNGETFDTLKEHLDDWETKTQINKEETIRELNKTKQEILDIEYRFEPDKQEFLFVTELAPLTNAVMQSFWFDNRTGIVYMTQARNNGYMLSRLRPNGQFIDSSLIVGGGHGTHNGYRYIDDELWIYSFILNGNNENTLVRFKYTPNVEISYGKYGMQDVFTGHPEKPYITPVINEKENKILYRIERPRSQWELENSMNYIEIRSLDDVDKNIDKVLHKISIPMRLTNETQPMQGVTFDEKYLYWYTGDSNPNNRNYLTAFDLETGEEAYQVNADYGGTLDSFPGEFAEAEGLQIYYDKDSGKKALMLGVTVGGDGNRTHRIFMIGQRGILEILHSRGVPFIMSDTGGRVKPLPMRPDKLKNLGMLTEPGLYYLYTDHTVQIDDFPLPREWRDAGWFLEVKPPQTGGDVIQILTRNSYARNMMTFERVLSGRTGDISDWNYVPKNSGKWERVPSFITKMSDINIVGMSFYLTTDDTKRFTDFPTERKGVAGWNLYVEASNTGGFVHRLVRNSVTASAEILLKNYDSKTSSGPWTLHEGRIIS >NZ_CP026072|4903:14733|11383_11548_+|WP_000916020.1|DBSCAN-SWA MLKLISPTFEDIKTWYQLKEYSKEDIAWYVDMEVIDKEEYAIITGEKYPENLES >NZ_CP026072|4903:14733|7319_7610_+|WP_000179858.1|DBSCAN-SWA MATEEVKIKALLENDKQYFPATHWKAINGIPYAGSSDIDGLPQDGIISVDDKNKLDKLKIGEAGIIQNSIVQKSPNGKLWKITVDDSGKLGTVLFY >NZ_CP026072|4903:14733|11001_11391_+|WP_001166599.1|DBSCAN-SWA MQILVNKRNEIISYAIIGGFEEGIDIENLPENFSQVFRPKAFKYSNGEIVFNEDYSEEKDDLHQQIDSEEQNTVASDDILRKMVASMQKQVVQSTKLSMQVNKQNALMAKQLVTLNKKLEEVKGETENA >NZ_CP026072|4903:14733|14517_14733_+|WP_000126130.1|DBSCAN-SWA MTALPSHYDDMFILNTQAHARLDQMAQQFEVVCNGLNENEGQAIQTMDQSASLIRSNLIQVKEQLEKLAVY >NZ_CP026072|4903:14733|5736_7320_+|WP_000384474.1|DBSCAN-SWA MDYHDHLSVMDFNELICENLLDVDYGSFKEYYELNEARYITFTVYRTTHNSFVFDLLICENFIIYHGEKYTIKQTAPKVEGDKVFIEVTAYHIMYEFQNHSVESNKLDDDSSETGKTPEYSLDEYLRYGFANQKTSVKMTYKIIGDFKRKVPIDELGNKNGLEYCKEAVDLFGCIIYPNDTEIGFYSPETFYQRSEKVIRYQYNTDTVSATVSTLELRTAIKVFGKKYTAEEKKNYNPIRTTDIKYSNGFIKEGTYRTETIGSKATINFDCKYGNETVRFTIKKGSQGGIYKLILDGKQIKQISCFAKSVQSETIDLIKNIDKGKHVLEMIFLGEDPKNRIDISSNKKAKPCMYVGTEKSTVLNLIADNSGRNQYKAIVDYVADSAKQFGIRYANTQTNEDIETQDKLLEFAKKQINDTPKTELDVNYIGYEKIEPRDSVFFVHELMGYNTELKVVKLDRSHPFVNAIDEVSFSNEIKDMVQIQQALNRRVIAQDNRYNYQANRINHLYTSTLNSPFETMDIGSVLI >NZ_CP026072|4903:14733|4903_5728_+|WP_001190533.1|tail|DBSCAN-SWA MQSFVKIIDGYKEEVITDFNQLIFLDARAESPNTNDNSVTINGVDGILPGAISFAPFSLVLRFGYDGIDVIDLNLFEHWFRSVFNRRHPYYVITSQMPGVKYAVNTANVTSNLKDGSSTEIEVSLNVYKGYSESVNWTDSEFLFDSNWMFENGIPLDFTPKYTHTSNQFTIWNGSTDTINPRFKHDLKILINLNASGGFELVNYTTGDIFKYNKSIDKNTDFVLDGVYAYRDINRVGIDTNRGIITLAPGKNEFKIKGDVSDIKTTFKFPFIYR >NZ_CP026072|4903:14733|9535_11002_+|WP_000067127.1|plate|DBSCAN-SWA MSNLEKSVAINLENTAHYENISNLDITFRTGESDSSVLLFNIIKNNQPLLLSEENIKARIAIRGKGVMVVAPLEILDPFKGILKFQLPNDVIKRDGSYQAQVSVAELGNSDVVVVERTITFNVEKSLFSKIPSETKLHYIVEFQELEKTIMDRAKAMDEAIKNGEDYASLIEKAKEKGLSDIQIAKSSSIDELKQLANSRISDLENKAQAYSRTFDEQKRYMDEKHEAFKQSVNSGGLVTSGSTSNWQKAKITKDDGKIMQITGFDFNNPEQRIGDSTQFIYVSQAINYPRDVSTNGTVEYLVVTSDYKRMTYRPNGTNKVFVKRKEAGSWSEWSELAINDYNTPFETVQSAQSKANMAESNAKLYADDKFNKRYSVIFDGTANGVGSTLYLNESLDQFILLIFYGTFPGGDFTEFGSPFGGGKISLNPSNLPDGDGNGGGVYEFGLTKSSRTSLTISNDVYFDLGSQRGSGANANRGTINKIIGVRK >NZ_CP026072|4903:14733|11593_11893_+|WP_000466784.1|DBSCAN-SWA MFGFTKRHEQDWRLTRLEENDKTMFEKFDRIEDSLRTQEKIYDKLDRNFEELRRDKEEDEKNKEKNAKNIRDIKMWILGLIGTILSTFVIALLKTIFGI |
11 | Staphylococcus_phage(90.91%) | tail,plate,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
441082 : 499494
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP026072|441082:499494|DBSCAN-SWA 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75 | Staphylococcus_phage(83.61%) | holin,terminase,tRNA,plate,head,portal,tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
551088 : 559561
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026072|551088:559561|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAGAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGTGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCGATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCAATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTACCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCGTAAAAACTTGGAAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCAGGCCCCATAAGCACATGGTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCGTTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGCTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCTACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAATCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCTGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCTATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGATCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGAAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP026072|551088:559561|551088_551655_-|WP_000238664.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP026072|551088:559561|556323_556995_-|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP026072|551088:559561|559078_559561_-|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP026072|551088:559561|557967_559092_-|WP_001010412.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP026072|551088:559561|552678_554163_-|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP026072|551088:559561|554141_556331_-|WP_000032727.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP026072|551088:559561|551657_552686_-|WP_000030812.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP026072|551088:559561|557259_557964_-|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP026072|551088:559561|556996_557260_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
579547 : 607109
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP026072|579547:607109|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP026072|579547:607109|604784_607109_-|WP_000455278.1|protease|DBSCAN-SWA MEWTLVDIGKKHVIPKSQYRRKRREFFHNEDREENLNQHQDKQNIDNTTSKKADKQIHKDSIDKHERFKNSLSSHLEQRNRDVNENKAEESKSNQDSKSAYNRDHYLTDDVSKKQNSLDSVDQDTEKSKYYEQNSEATLSTKSTDKVESTEMRKLSSDKNKVGHEEQHVLSKPSEHDKETRIDSESSRTDSDSSMQTEKIKKDSSDGNKSSNLKSEVISDKSNTVPKLSESDDEVNNQKPLTLPEEQKLKRQQSQNEQTKTYTYGDSEQNDKSNHENDLSHHIPSISDDKDNVMRENHIVDDNPDNDINTPSLSKTDDDRKLDEKIHVEDKHKQNADSSETVGYQSQSTASHRSTEKRNISINDHDKLNGQKTNTKTSANNNQKKATSKLNKGRATNNNYSDILKKFWMMYWPKLVILMGIIILIVILNAIFNNVNKNDRMNDNNDADAQKYTTTMKNANNTVKSVVTVENETSKDSSLPKDKASQDEVGSGVVYKKSGDTLYIVTNAHVVGDKENQKITFSNNKSVVGKVLGKDKWSDLAVVKATSSDSSVKEIAIGDSNNLVLGEPILVVGNPLGVDFKGTVTEGIISGLNRNVPIDFDKDNKYDMLMKAFQIDASVNPGNSGGAVVNREGKLIGVVAAKISMPNVENMSFAIPVNEVQKIVKDLETKGKIDYPDVGVKMKNIASLNSFERQAVKLPGKVKNGVVVDQVDNNGLADQSGLKKGDVITELDGKLLEDDLRFRQIIFSHKDDLKSITAKIYRDGKEKEINIKLK >NZ_CP026072|579547:607109|597198_597300_-|WP_001790623.1|DBSCAN-SWA MKFAANKLTLTIFRKFCINNEKEIWIKYEEVFL 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30 | Enterococcus_phage(25.0%) | bacteriocin,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
721740 : 742949
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP026072|721740:742949|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP026072|721740:742949|741235_741931_-|WP_000520233.1|DBSCAN-SWA MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP026072|721740:742949|724938_725139_-|WP_000382163.1|DBSCAN-SWA MDVDNMSDYKLKIIELIKSDITGYQIHKQTGVAQYVISQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYSYARQVL >NZ_CP026072|721740:742949|736963_737395_+|WP_001228759.1|DBSCAN-SWA MRKLLGLALASTLILGACGSNDGDKKEESKSYTTNDIVKGFKDNKLNVINEKEMTREDFGLAPMKTDEAKMFVVQDDKNARVMKFKNSDDLKQTKKYYDELGKESAAFYSHTHSKGKFLIQMNGDIDDATFNKYKNSMDKTLK >NZ_CP026072|721740:742949|726466_727267_-|WP_000278085.1|DBSCAN-SWA MYKRLFISHVILIFALILVISTPNVLAESQPDPKPDELHKSSKFTGLMENMKVLYDDNHVSAINVKSIDQFLYFDLIYSIKDTKLGNYDNVRVEFKNKDLADKYKDKYVDVFGANYYYQCYFSKKTNDINSHQTDKRKTCMYGGVTEHNGNQLDKYRSITVRVFEDGKNLLSFDVQTNKKKVTAQELDYLTRHYLVKNKKLYEFNNSPYETGYIKFIENENSFWYDMMPAPGDKFDQSKYLMMYNDNKMVDSKDVKIEVYLTTKKK 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MYLYEKMVIENKEIPIDDGKSLGNFEGLYDNGVILINKNLSERRKAEVLYEELAHHKLTYGNILDQSKFNNRKFENYARRHGFISAVPLREIVEAYNYGVRNLYELSEYLQLSEEYILEAIEQYKKIYGIGTHYGEYSITFEPLRVFKYKEI >NZ_CP026072|721740:742949|732333_733791_-|WP_000390455.1|DBSCAN-SWA MEDVTNEEVFEMIDSRTGVLNANDWKSQLRRSATTQALKKTTTNAEIILCNDESLKGLVQYDAFEKVTKLKRLPYWRSKGDTNYYWADIDTTHVISHIDKLYNVQFSRDLIDTVIEKEAYQNRFHPIKSMIESKSWDGIKRIETLFIDYLGAEDNHYNREVTKKWMMGAVARIYQPGIKYDSMIILYGGQGVGKSTAVSKLGGHWYNQSIKTFKGDEVYKKLQGSWICEIEELSAFQKSTIEDIKGFISAIVDIYRASYGKRTERHPRQCVFVGTTNNYEFLKDQTGNRRFFPITTDKNKATKSPFDDLTPDVVQQMFAEAKVYFDEDPTDKALLLDKEASEMALKVQEAHSEKDALVGEIEEFLERPIPSDYWYRTLEEKRVSAHDVIDQDYIKLYGDGKLIELPNTKPGAYVWRDKVCSMEIWKVMMKRDDQPQQHHLRKIDKALRNTNYCDTVKKQTRYGEGIGKQYGFSVDLASYYKNLKV |
33 | Staphylococcus_phage(77.78%) | coat,terminase,integrase | attL 724462:724478|attR 740397:740413 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
822521 : 837194
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP026072|822521:837194|DBSCAN-SWA ATCAATCCTTAAAATATAAACAAATCCTTTGATTTCTTATATGTTCAATTTGAATATTCATGTCATATAAATCACTTAAAACACTACTTTGAATGACATTATCTTTCAAATCTGACTTAACTAGTTGTCCGTTTTTCAATGCTACAATCTGATCTGAATAACAGGACGCAAAGTTAATATCATGTAACACAATGACAATCGCTTTATTCATTTTATGCGCTAACATTTTTAACGTTTGCATAATTTGAACAGCATGCTTCATATCTAAATTATTTAATGGTTCATCTAGCAAAATATATTCAGTATCTTGTGCTATTGTCATTGCAATGTATGCACGCTGACGTTGTCCACCAGATAATGACTTAATATTACGATTTCTGATATCTTGTAGTTGCAACAAATCTAGCGCATCATTGACAATATCATGATCCTCTTTCGTCAAACGACCTTTAGAATAAGGGAATCGTCCAAAGTTTACCAACTGCTCTACCGTAATATTCATTTCAGTATGGTTTGTTTGTTTTAATATAGATATTTTTTTCGACAAGTCATTATTTTTATAATCAGACATGAGCTGTCCATCTATTTTCACTTCACCGTTCTCAAAACGAATTAACCTACATATCGCTGAAAGTAAAGTACTCTTACCCGCACCATTAGGTCCAATTAAAGAAGTCAATTTACCTTTTTCGATATCTATGCTAATATCTTCCAATATCATTTGATTATTTATAGTTTTAGTTAAATTTTCAACTTGAATCATTGCGCATTTCTCCTTCTAACTAATAGATAAATGAAATAACTTCCACCAATCAAATCAATAAGTATACTCATTTCTGTCGTAGCTTCAAACACATTTTCAACTACCCATTGCGCACTAAATAAACTAATCCAACTCAAGCAAATTGTCGCAATTAAAATATACTTATGTTCATACGTCTTCATTAGTTCATGCGCTAGATTTACAGTTAATAAACCTAAAAATGTAATTGGTCCTACTAATGCAGTTGACACAGAAACTAAAACTGAGACTATTACAAGTAGAATTCGCGTTAATTTTTCATACGATATCCCAAGATTAATTGCTTCAGCACGACCTAAAAGCAATACATCTAAATAAGGCAATAGTAAAATTGTAATGACTAATAAGATTACTAATAGCACTGCTGAGAAAGTAACTAAATTCGAATTAGAAGCATTAAAATTAGCAAACATACTACTTTGTATTGCTAAAAATGACTCAGGATCCATAATCAGTTGAATAAAACCTGTTATGCTTCTAAAAAATGTTCCTAAAAGGACACCAATAAGTAAGATAAAATAAATTGAAAAATGTCCGATTTTAAAGATACCTTGGAATAGGATTAGTGCGAATAACACCATCGTTATAAGTGTTAATATAAAGTTCAAATATACATTAGTAACCCATACCGATTGAATTCCAAATAAAAAGACTGGCAATACTTTGATAAATAAATAAACTGCATCTAACCCCATTATTGATGGTGTCAATAGACGGTTATTTGTAATCGCTTGAAAAATCACCACTGAAGTTGCAATGGCAGCACCTACTAAAATAATTAATATGAACTTTCTTAAACGACTTGAAAATTGATATTCAAATATTTCAAAATCAATACCTACAAATAAGTACAGCATACTAATTAATAACGTTACTGCAATTAAAAGCATTATTTTTTTATTATTGTTGCGCATAATTTTTCCTACCTTTCATAAGCAAGATAAGGAAAATGATTGTTCCAAATACACCTATTGTTAAACCAATATTTATTTCATATGGATAAACAACAATTCTGCCAACTATATCAGAAAATAATACAAAGATGGCACCTAACATCATCGTATGAGGGATAGCATTTTTCAAATGATCACCTCGATAAATTGAAATAATATTTGGTATTACTAGTCCTAAGAACGGTAATGTTCCAACAGTCACCACTACCAATGCTGTAATAGTTGCAGTAATAAACAATGCGATGTTAATTAATTTTTCGTAACTCAAACCTAAATTATTAGTAAAGTCTTTACCCATTCCTACAATCGTGAAATGATTAGCAAAAAGATATGTCAATGCTAAAAGAGGAATACTTAAATATAAAATTTCATAGCGTCCACTTGTGATAATGGCAAAGTTCCCGTTAAGCCAGTTACCAATGCTTTGAACAGCATTCGTGCGCAATGAGATGAAGGTTGTGAAACTTGCAACAATCCCACCCATCATAATTCCTAAAAGCGGTACAAAAATGACATCTTTCACTTTTATAAAATCAATGATTTTAACAAATAAAAACGTACCGCAAATACTGCAAATAACAGCAAATACTAGTTTTAATAAAATATGACCGGTTGGAAAGAACAATAAAGCAATTAAAATACCTAGTTTAGCCCATTCCATCGTTCCAGCTGTAGTCGGACTAACAAACTTATTTTGCATCATTTGTTGCATTATCAAGCCTGCTAAAGCCAACGAACTTCCAGCAATTAAAATACTCATCGTCCTTGGTATTCGGCTTGAGAATAAAATATTCCGCTGTGACTCAGTTAAATGTAGTAAATCTTTAATTGATAGTTCACTCACACCTATGAACAACGAAATAATTGTCAACAATATTAGTAATAGAAGCAAAATATTTCCCTTTAATAAATACTTCATTACAAATTTTTCTCCCTTTAAATTAATGATAATCATTATCATTGATAATATTTCTCATTAATAGTAGCGTTTTTTGACCATAATTTCAATAGCCTTTCAAATAATTTAGTGTCAATTTTATTGATATTTGCAATTAAACTGAAATTTAATTTTTCGGAATGTGTATTTTGTTTACTTAAAGTAAAATAGAACACTTAAGATTTTGATGTCTGGGAATAGTGGAAATGATAAAAACTACTAATGATTGATTAAGTAGTGGTTCTTAACATTAGCCTCAGCTAATGTGTACTTAAAAATAGGAATACATGAGTAAAACTCATGTGGAAGTGATAATTTCTAAAGGAAAAAGTTTTTCTTTATGTTGGGGCCCCGCCAACTACTGCCAATATAAATAGCATTGTACATCTTAGAGCATTGATTTCTTACTCAGACTCATAATGAGTTAGATACACATAAAAAAAGACCTTCAACATGTAGGAGACAAGACGAAACGAATCGCTATTTCCCTTTACATGTGAAGGTCTTTTAATTTAATTGTTATTTGTTGTCAAATACAAAGTCATCATCTTGTAATGCTTCTACGTTTAATGCTAATACATAACCATCACCTTTTACTGAGAAGAAGTCATGGTTTTTAGTTGTTGTATCTAAGGCATTCTCAATGATTGGGTTAAATTCACGTTCCTCAAAATAAGGTTCAAAGCCTAAGTTTGAAAGTGCTTTGTTTCCATTATATTTAACATAGTTTAGCACATCTTCAGTGATTCCAAGATCATCGTATAACATTTTTGTGTATGACTCTTCATTTAAATACAAGTCATTTAGCAATTTATACATTTCTTGATCTGCTTTTTGTTTCTCACTTTCAGATAGTTCATTTCGTAAATGCTGTGCATCTAAACCGGTAAATACACCATGAATAGATTCATCTAAAAGAATTTTACGAATGATTTCACCTGATGTCGTCATTTTCCCTTGACCAGCAAGATATAGTGGATAATAGAAACCTGAGAAGAATAAGAATGTTTCTAAAAATACACTCGTAACTCTGGCCATATATTGGTCGTATATCGAAGCTTCTTTACCCCAAAGTTTGTGATAATTAGCAACAATTTTATCAGATTTATATTTTAAATGGGGTTCCTCTAAAACCCATTCATCTAATAGGTAGTTTGTTTCACTAGATGGTAATAGTGTTGTGAAAATATGTGAATAGCTTTTCGCGTGTATTTGCTCCATCATCGCCATAAATGAATAAACTGCTTTTTTCCTTAAGTCAGTCGTATGTAGCATAACTAAAGGCATGCCATCATCTGCTTGATGTGTATCTAAGCCTGTTAAACCAGCTAATGCTTTTTTAAATGTGTCTTGTTCAGCTTCAGATAAAGTCTTCCAACTTGCAATGTCTTTTGATACTTTAAATTCTGTTTCAACCCACATTTGAGATATATTTTGTCTCCAAAACATATTCGTCATATCTTCTTGTGTGTTCCAATTAACAGCTATCATGAATATAATTTCCTCCTGTAATGTTACTCAATAATTGACAAATACAGACATAGCAGTCTAATCATCTGCTAATTCAGACCAGATGATTAGCTGTTTGTCATTTTCAACATTTAATTGTTAGATAGAACAACTTGTACATTCTTCTACACTTAATAATTTATTTCTAGTATAGTAAAGTGATTTTAATCCTTTATAGTGCGCATATACATATAATCTTGCTAACTCACGTGTAGAAATTTCAGAATTAACATAAAGGATCGTTGAGATACCTTGGTCAATATGCGTTTGAATTGTCGCAATTAAATCGATTAATTTCATCTGATCAGTATTGAATGCTGATTTGTAGTACCACATTGTTTGTGGTGATAAGAATGGCATAGGGTAAAATGTTTCCGCATTACCATAAGTACGACGTTCAATTTGGTCAACGATTGGCATTACAGAACTTGTTGCATTTTGAACATAAGAAATACTTTGTGTTGGAGCAATTGCTAATCTATATGCATGATATAAACCATATTGTTCAACATCTTGTTGTAGTTTCTTCCAATCCTCAGAAGTAGGAATAGCCATACCATCGAATAATTCACGTACTTTTTCGAATTGAGGTTCAAATTCTTGAGTTGTATAGAACTCGAAATATTTGCCATTAGCATAATCAGACTTTTCAAAGTCTTGATATTTGATACCACGCTCTTTAGCGATTTCCATTGAACGTTCGATTGAGTAGAAATTCATCATCATAAAGAAGATATTTGCAAAATCTTTTGCTTCTTCTGACTCATAACCAATTTTATTTTTTGCTAGGTAACCGTGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP026072|822521:837194|833589_834507_+|WP_000429014.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP026072|822521:837194|830087_830954_+|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP026072|822521:837194|835242_835785_-|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP026072|822521:837194|826820_828926_-|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP026072|822521:837194|836135_837194_-|WP_000663030.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP026072|822521:837194|823279_824236_-|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP026072|822521:837194|822521_823283_-|WP_000616842.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFENGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP026072|822521:837194|824222_825194_-|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP026072|822521:837194|828888_829287_-|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP026072|822521:837194|831814_833320_+|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP026072|822521:837194|825232_825388_-|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP026072|822521:837194|830973_831474_+|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP026072|822521:837194|833397_833499_-|WP_001790641.1|DBSCAN-SWA MVINEIDFYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIS >NZ_CP026072|822521:837194|825731_826703_-|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
849166 : 856986
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP026072|849166:856986|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTCACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTGCGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTATTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATACTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTGCTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAGCATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTTGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCATGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTCGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCATCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGCAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTGCAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATTAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAAACGCCCTCCTCTTATTTTGACCCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGCTGGTGCTGTTATCACAACATTAGCTTTAGGTGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP026072|849166:856986|854796_855270_+|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP026072|849166:856986|853150_853735_+|WP_000637687.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP026072|849166:856986|849166_850318_-|WP_001217785.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHAMCTHSLAKDDIYAAAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKYHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP026072|849166:856986|855930_856986_+|WP_000244412.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCNEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENEDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP026072|849166:856986|854014_854455_+|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP026072|849166:856986|851915_852335_+|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP026072|849166:856986|852338_853052_+|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP026072|849166:856986|855244_855931_+|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP026072|849166:856986|851245_851914_+|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP026072|849166:856986|850301_850895_-|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1174848 : 1247667
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP026072|1174848:1247667|DBSCAN-SWA 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86 | Staphylococcus_phage(44.44%) | transposase,coat,terminase,integrase | attL 1164140:1164155|attR 1250932:1250947 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2381017 : 2466671
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP026072|2381017:2466671|DBSCAN-SWA 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116 | Staphylococcus_phage(91.76%) | capsid,terminase,holin,protease,portal,head,tail,integrase | attL 2381167:2381184|attR 2429888:2429905 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2526703 : 2645128
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP026072|2526703:2645128|DBSCAN-SWA 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110 | Staphylococcus_phage(90.77%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2772227 : 2781270
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP026072|2772227:2781270|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTTTTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAACGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGCGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGAATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAATGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAATTGAAATTAAAAATAAAGGTGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTAGACGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTAGTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACGGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATACGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGGAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAATGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTACAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP026072|2772227:2781270|2778456_2780730_+|WP_000594993.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTATTILVITLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDVEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP026072|2772227:2781270|2780751_2781270_+|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP026072|2772227:2781270|2775439_2775700_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP026072|2772227:2781270|2772227_2773232_+|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP026072|2772227:2781270|2774281_2775421_+|WP_001112050.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITGEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP026072|2772227:2781270|2773233_2774259_+|WP_001019172.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLIEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP026072|2772227:2781270|2775974_2778254_+|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2850408 : 2858720
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP026072|2850408:2858720|DBSCAN-SWA TTTGCGAATAGATCAATCGATCATTAATGAAATAAAAGATAAAACCGACATTTTAGACTTGGTAAGTGAATATGTAAAATTAGAAAAGAGAGGACGCAATTATATAGGTTTGTGTCCTTTTCATGATGAAAAGACACCTTCATTTACAGTTTCTGAAGATAAACAAATTTGTCATTGTTTTGGTTGTAAAAAAGGTGGCAATGTTTTTCAATTTACTCAAGAAATTAAAGACATATCATTTGTTGAAGCGGTTAAAGAATTAGGTGATAGAGTTAATGTTGCTGTAGATATTGAGGCAACACAATCTAACTCAAATGTTCAAATTGCTTCTGATGATTTACAAATGATTGAAATGCATGAGTTAATACAAGAATTTTATTATTACGCTTTAACAAAGACAGTCGAAGGCGAACAAGCATTAACGTACTTACAAGAACGTGGTTTTACAGATGCGCTTATTAAAGAGCGAGGCATTGGCTTTGCACCCGATAGCTCACATTTTTGTCATGATTTTCTTCAAAAAAAGGGTTACGATATTGAATTAGCATATGAAGCCGGATTATTATCACGTAACGAAGAAAATTTCAGTTATTACGATAGATTTCGAAATCGTATTATGTTTCCTTTGAAAAATGCGCAAGGAAGAATTGTTGGATATTCAGGTCGAACATATACCGGTCAAGAACCAAAATACTTAAATAGTCCTGAAACACCTATCTTTCAAAAAAGAAAGTTGTTATACAACTTAGATAAAGCGCGTAAATCAATTAGAAAATTAGATGAAATCGTATTACTAGAAGGTTTTATGGATGTTATAAAATCTGATACTGCTGGCTTGAAAAACGTTGTTGCAACAATGGGTACACAGTTGTCAGATGAACATATTACTTTTATACGAAAGTTAACATCAAATATAACATTAATGTTTGATGGGGATTTTGCGGGTAGTGAAGCAACACTTAAAACAGGTCAAAATTTGTTACAGCAAGGGCTAAATGTATTTGTTATACAATTGCCATCAGGCATGGATCCGGATGAATACATTGGTAAGTATGGCAACGATGCATTTACTGCTTTTGTAAAAAATGACAAAAAGTCATTTGCACATTATAAAGTGAGTATATTAAAAGATGAAATTGCACATAATGACCTTTCATATGAACGTTATTTGAAAGAACTAAGTCATGATATTTCGCTTATGAAATCATCGATTTTGCAACAAAAGGCTTTAAATGATGTTGCACCATTTTTCAATGTTAGTCCTGAGCAATTAGCTAACGAAATACAATTCAATCAAGCACCAGCCAATTATTATCCAGAAGATGAGTATGGCGGTTACATTGAACCTGAGCCAATTGGTATGGCACAATTTGACAATTTGAGCCGTCAAGAAAAAGCGGAGCGAGCATTTTTAAAACATTTAATGAGAGATAAAGATACATTTTTAAATTATTATGAAAGTGTTGATAAGGATAACTTCACAAATCAGCATTTTAAATATGTATTCGAAGTCTTACATGATTTTTATGCGGAAAATGATCAATATAATATCAGTGATGCTGTGCAGTATGTTAATTCAAATGAGTTGAGAGAAACACTAATTAGCTTAGAACAATATAATTTGAATGACGAACCATATGAAAATGAAATTGATGATTATGTCAATGTTATTAATGAAAAAGGACAAGAAACAATTGAGTCATTGAATCATAAATTAAGGGAAGCTACAAGGATTGGCGATGTAGAATTACAAAAATACTATTTACAGCAAATTGTTGCTAAGAATAAAGAACGCATGTAGCATGTGATTTTAAAGAATAATACGAATAATGATTATGTCAAAATGTATAAGGGTAAATGATAGTTACCGCATTTAAACAACACTATTGAAAAATAAATATTGGGATTAGTTCCAATTTGTAAAATAAAATTAAAAATATGGATGAATTAATTAAGAATTTAGTTTAAAATAGCAATATTGAATAAATTTCGAATGTTCATATTTAAAATCGGGAGGCCGTTTCATGTCTGATAACACAGTTAAAATTAAAAAACAAACAATTGATCCGACATTAACATTAGAAGATGTTAAGAAGCAATTAATTGAAAAAGGTAAAAAAGAGGGTCATTTAAGTCATGAAGAAATTGCTGAAAAACTTCAGAATTTTGATATCGACTCTGATCAAATGGATGATTTCTTTGATCAATTAAATGATAATGATATTTCACTAGTTAATGAAAAAGATAGTTCAGATACTGACGAGAAACTGAATCCAAGTGATCTTAGTGCCCCTCCAGGTGTTAAAATAAATGACCCAGTTCGTATGTACCTTAAAGAAATTGGGCGTGTTAACTTATTAAGTGCACAAGAAGAAATCGAATTAGCCAAACGTATTGAACAAGGTGATGAAGTAGCAAAATCAAGACTTGCAGAAGCGAACTTACGTTTAGTTGTAAGTATTGCTAAAAGATACGTAGGTCGTGGTATGTTATTCCTTGATTTAATCCAAGAAGGTAATATGGGTCTTATTAAAGCTGTTGAAAAATTTGACTTTAACAAAGGATTTAAGTTTTCAACATATGCAACATGGTGGATTAGACAAGCAATCACTCGTGCAATTGCTGACCAAGCACGTACGATTCGTATCCCTGTGCATATGGTAGAAACAATTAATAAATTAATTCGTGTTCAACGTCAATTATTACAGGACTTAGGTCGAGATCCAGCACCAGAAGAAATTGGTGAAGAAATGGATTTACCAGCAGAAAAAGTTCGTGAAATTTTAAAAATTGCGCAAGAACCTGTTTCATTAGAAACACCAATTGGTGAAGAAGATGATAGTCATTTAGGAGACTTTATTGAGGATCAGGAAGCACAAAGTCCTTCAGATCATGCTGCTTATGAATTATTAAAAGAGCAATTAGAAGATGTGCTTGATACATTAACTGATAGAGAAGAAAATGTATTACGATTAAGATTTGGTCTTGATGACGGCAGAACAAGAACACTTGAAGAAGTTGGTAAAGTTTTCGGTGTTACACGTGAACGTATTCGACAAATTGAAGCAAAAGCACTTAGAAAATTAAGACATCCAAGTCGTAGTAAACGTTTGAAAGACTTTATGGATTAATTTATATCAATTTTAATGATTGATACCAAGACATGAATAAGCGCTTATTTATTTTTAGATTAAGATTTAACTTGAGTGAGGTTGGTACATTGAATAATGTTCAACCTCTTTTTTCATAAAGGAGAATAAAATGATTTCGTTAAATAACCGATTAACGACGGTAAGTCGATTTTTAAAACAAGGTACAATCGCGGATATTGGCTCAGATCATGCTTATTTGCCAATCTATGCAATTCAAAACCATTTATGCGAATGCGGTATTGCTGGAGAAGTTATTCAAGGCCCTTTTCAAGCTGCTGTGAAAAATGTAGCTGCAAACCAATTAGTAGATAGAATTGATGTACGTTTAGGGGATGGCTTAAGTGTTATTCAACCTGAGGACGTAATCGATAATATCACAATTTGTGGTATGGGCGGACCACTTATTGCTAAAATTTTAAAAGATGGGCAAGATAAGTTAAGTCAACATCCAAGGTTGATTTTACAAAGTAATATCCAAACTGAAAATTTAAGACAAACATTACAACAATTGAATTATGAAATAATTGATGAAATAATAATGGAAGAAAAAGGCCATATTTATGAAATTGTTGTAGCAGAATATTCTACAGAATTAATAGAGCTATCATCTGATGAATTGAAATTCGGACCAAAATTGCTGAACAACAAAAATGAATATTTTATAAAAAAATGGCAAAGAGAGTTAGAAGCACTTTATCATATTAAATCGAAACTCAATACTGAACAACATCATCAACGTTTAGCTCAAATTAATGACGAAATTGCTGTAATTGAAAGGGTGTTATAGTAATGAAAATAGCTGATTTAATGACATTGTTAGATCATCATGTGCCATTTAGTACTGCTGAATCTTGGGATAATGTAGGATTGTTAATAGGTGATGAAGATGTTGAAGTTACTGGTGTTTTAACAGCATTAGACTGTACGTTGGAAGTAGTAAATGAAGCAATCGAAAAAGGTTATAATACTATTATTAGTCATCATCCTCTAATCTTTAAAGGCGTAACATCATTAAAAGCTAATGGTTATGGTTTGATCATTAGAAAACTAATTCAACATGACATTAATTTAATAGCGATGCATACAAATTTAGATGTAAATCCGTATGGTGTCAATATGATGTTGGCGAAGGCGATGGGTTTGAAGAACATTTCAATAATAAATAATCAACAAGATGTATACTATAAAGTTCAAACATATATACCTAAGGATAATGTTGGACCATTTAAAGATAAGCTTAGTGAAAATGGATTAGCGCAAGAAGGTAATTATGAATATTGTTTCTTTGAAAGTGAAGGAAGAGGGCAATTCAAACCAGTTGGTGAAGCTAATCCAACAATAGGACAAATTGATAAAATTGAATATGTAGATGAAGTTAAAATTGAATTTATGATAGATGCATATCAAAAGTCAAGGGCTGAGCAATTAATTAAACAATACCATCCATATGAAACACCGGTATTTGATTTTATTGAGATAAAACAAACATCCCTTTATGGACTTGGCGTTATGGCAGAAGTGGATAATCAAATGACATTGGAAGATTTCGCAGCTGATATTAAATCTAAATTAAATATCCCAAGTGTCCGTTTTGTTGGTGAGTCTAATCAGAAAATTAAACGTATTGCAATTATTGGTGGTTCAGGTATTGGATATGAATATCAAGCTGTCCAACAAGGCGCAGATGTCTTTGTTACAGGTGATATTAAACATCATGATGCCTTAGATGCTAAAATTCATGGTGTGAATTTAATTGATATTAATCATTACAGCGAATATGTGATGAAAGAAGGTTTAAAAGCGTTACTAATGAATTGGTTCAATACAGAAAAAATAAATTTAGATGTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP026072|2850408:2858720|2853668_2854346_+|WP_000624584.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTELIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP026072|2850408:2858720|2854348_2855449_+|WP_000683931.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKALLMNWFNTEKINLDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP026072|2850408:2858720|2850408_2852208_+|WP_001217261.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP026072|2850408:2858720|2855562_2856909_+|WP_001062180.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP026072|2850408:2858720|2856918_2857809_+|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP026072|2850408:2858720|2857934_2858720_+|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP026072|2850408:2858720|2852431_2853538_+|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD |
7 | Caulobacter_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2913844 : 2951538
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP026072|2913844:2951538|DBSCAN-SWA 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58 | Staphylococcus_phage(89.47%) | terminase,protease,integrase,portal,head,tail,capsid | attL 2910665:2910679|attR 2938611:2938625 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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