Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP010780 | Acinetobacter baumannii strain XH386 plasmid pAB386, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP010779 | Acinetobacter baumannii strain XH386 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
15599 : 98445
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP010780|15599:98445|DBSCAN-SWA ATCATGCTTCCACCTTATCCGCACGAGCTTGGGCTTGCTCATTTGAATAAGTGCCTTTGCTATAGCGCTTACCCAATTTTGCCATATTCGCCGCAATCGTTTCCTCACGGCTTACCCCGATGATTTGGCGAATACGTTCCATGTAGAACTCTAAATCACCAAGTTCTTCAATCACGTTTTCACGATCTAGCGGTTTGCCGTAAATTGCATGTTTCTTGATTGCGTCAAGAAGTTCACCAGATTCACCTGAAACACCGACACCCATGTGAAGTAAATCGGCTTGCTCTGGTGTCATATCATTCAGGATGTCCTGACCTTTTTTCACCAAAGCCGTGACCATTTCGCTAAAAATGATTTGATCAGCCAACTTTGTTCTCCAAGTTAGTTACACGCGAATTCAAGCTATTGATTGAATTGCCTTGAGTGACATTCACTCCTTCTGCATTATTCATGCGGCTTGTCAAAGTTGAAATTGAGGTGCTTTGACTAGCGTTAGTGTTTTCAACATTTGTAACGCGATTAGCAAGAGTATTAACGGAAGCAACATCAGCCTTTTGAGTCAATTGGCTCTTAAGGTTGTTAATTTCCATTTCGATCTGTTCGTTAGTCATAGTCATGTGCTATCTCCTGTTAATGACATAGACGGTTTAGACTTTTATTTTCTTTTTGACCTCAAGGCCTTCATTACCTGCGGCTTGATAAGCTGCGGTCAAATGCTCAATTGCGGCATCAATGTGGCGATTAAATTCAGGATTGATGCGCTCTAGGTAATACTGATGCCTAGTCAGGTGGTCATTCACCATGCTTAAAAGGACATAAGATGTATGTAATGCCTCATGTCTGAACCACTTAGGATTTACCTTCGTTTTACTCATTACCCGTTCATCTCCTGAAAGACTTCCGTTAATGCTTTTCGTGTTTTGATAGCGCGCGCAATTTCGACATTGTTATCTTCAATGCGAGTTGTAGCGGATCGAATTAATTCATTTTGAACATCGTTGTCCTCTAACAGGCGCTCTTCTAAATCGAAAAGCTCACTCAGCTTTTGCTCAAGATCAGCCGTGATATGGCGAACTGTTTTAGGCTTGACTTGGCCCATGCCAACTTTTTCTTCAAGATGTTCGGTAGCTTTACTTTGTCCGATTCCAAAAATATTCATGACTTACTCCTTGTTTTTCGATAAGAAGATTTCTGCTTCAATGAATTTGCGATGTTGTAACCAGCCTTTTAGATTTCCGTGCATTGTTGGGTTGGCATACTTTTCCGTGCGGTGATCAAAGCTGTCAGGTGTTGCTTGGTGCTCAAAAGGTGAAGCATGCAAAGGTTCAGCTCCGACCAAGCGTTCGCAAAGTTTTAAATCTTCACCAACATTTGATTTATTGCCGTAATGGTTCATGAAAGAGACGCGGCAACAACGGGCACCAGATACCTTTTTTAATACCTCGATTTTGTGCTGCTTCCGTTCCTCGTCTGTGATATATGGCAAGTGCCATTCACCAAATTTGAGCTTTTTAGGTGTTGAAGTACGCATTGCTTTTTCAATGAGATAAGCAACAGCGAAGATTTCGAACTGTGCGTCCTCATGGATACGGAGATCGAAAAAGTTATCCATTTCCGTAGAGCTAAGAACCACATGCATAAATTGCCAAGGCATCAATAAGCGGTTGGCCGTTTGCTTGTGCAGTCCTAATTTCATTAAGGACCATACAACACCGCACATCAGGCGACCTGACCATTTCCATGCAAATCGGCACAAGCGAATCTTGCGTTTTGAAAACTGTTCATTCGCTTGCATGCCAGCCTTGTTTTTGCCCCAAAAGATTGGATATGCCGGATTGTTCCAGACTTGCTGAATGATCTTTGAAATAGGAATGGCGCGGTTAGATGCGGCATTACGGCTGAATACACGATGAGTCATCATTTCGGCATGTATTGGTAACCAATACATAAGCTCAAAGGTGACAAGGCGATCGCCGTATTCATTGATGCTGTCTGCCAAGATTTTTACTTTGATTTGACCTTCCTCAATTGCTTTATCAATGAGGTGTACGAGGTCGAAATTAGTAATTTGCAATTTAGTTCCTCCTTACCAAACCAAAGCACCGCCAACTTTGTAGTCAGTGACGCGGGTTTCGAAGAAGTTCTTTTCTGACGTATTAGGTTTAGAGAACTGCTCAACCCAAGGGAATGGATTTTTTACGCCTGGATATGGCACAAACGGCGCTTGAATTTGTTCAGCACGGAGGTTTGCAAGATGCTTGATGTAATCCTCAATAGCTTTAGGATTCGTTACGCCTTTAGTAATGTATTTCCCCCAACTGATTTCCATTTCTGATGAAGTCAGGAACACTTCAAGAGCTTTATTCCAGAAGGATTGGGTAAAGACGTCTTTATTTTCGTGACGAAGGGTGTCTAGCATATGTGCGAACAAATCTAGGTGCGTTCCTTCTTCATCACGTTGGATATAGCGAATCATGTCGGCTGAACCTAACATTTCACCCTTATCGGCAAGCAGATAGAACGAAAGGAAACCTGAGAAGAAATAAACACCTTCAAGCAAGACGTTTGATACACATGAAAGGGCAAAACCTTCAGCCGAGAATTTTTCACCGAGTAATCGCGACTGTTTGAGAATGAACTGGTTTTTTTGAGCCAATAACCCATCACGTTCAAATGTCATGTAAACGCTCATTGGATCAAGACTGACTGTCTCAATGATCGTGGCGTATGATTTGACGTGTAGCGCTTCTTCCCATGCTTGACGTGACAAACACATGGAAACTTCCGGAGAGGTTACGTGTTTTGCAATATTCTGGTTGATGTTGTTGAATTGAATGCCGTCTAGGTTTGACAAGAAAGCTAATGCTTTATCAAACATGAAACGATCTGCGGCATTTAAGCGGTTATAACTGGCAACATCATCTGCCATATTTACGACATGCGGAAACCACGTATTATTTTCCATGCGGTCGAGAATGCCTTTTGCCCATGTATGCTTCATCGGGCTAATTGCCATTAGGTCATCCTTGGGACCTAAAATTAGACGTCGGTCATTAATACGATTTGCGTAAGTCATAATTTCTTTAATACTCACAAATAAAATAGGGATGAACTTTTCATCCCTATAATTATAGTAAGCGCTTACTAATATTTGCGCCTAAATTAAAAAAGTTTTACTGGCAGCTTTCACAATCTGGATCGAGAATTGAACACATCTTTGGTGCGCTTTCAGTTGGTTCTGAAAGTTTGCCTAAAGCTGCGTTAGCTAATTCCGCAATAACTTTGGTTCGCATTGAAGCGCTCTTCTCTGCATCAGATTGATTGCGTAAGTAGTAAGTGGTTTTCAAGCCAAGTTTTTTAGCTGTTGTATACCACAAATCTAAATCACGACCAGTTGTACCTTGTTTTGCAAAGAGGTTAGTTGATTGAGACTGGTCAATCCACTTTTGACGAACTGCGGCTGCCTTAATGATGTAGAGTTGGTCGACATAATACGATTCTTTGAGCAAGTGATATTTGTCACCGACATGAGCAATTGCAGGATCGACGACTTGGTAAGTACCACCTAGGTTAGACTTGAAGTATTCAAGCAAGAACGGCGGTTCTGTGCATTGAGTTGTTCCTGCAATATTCGAAATCGTTGCAGTCGGCGCAATCGCCATAACGTTCGAGTTACGCATCCCTTTTTTGACTTTTTCACGTAAAGCCTCCCAGTCGAATCGACGAGGTTGATCAAAGAATGGTTTGCCGTCTTCCATCAATTTGGCGTTATCGATTGGCAAGATACCTTTAGACCAGTTAGAACCTTCAAATGATGGATATGAACCGCGTTCTTGAGCCAAGTCTGCTGAAGCCTCGATAGCAAAGTAAGAAATTGCCTCAAACAATGCGTCAGCTTGCTTTAAGTGTTCTTCGCTTTCGAAATCCACACCTTGTTTTACCAGCCATTCGTAATAACCCATCACACCCAAGCCGATAGGGCGGTGTTTGAAGTTAGAGTTGGATGCGCGGTCGCTAGGGTAGTAATTCACGTCAATTACAGAATCCAAATTACGAATAGCCAAGCGGATAACTTCACGTAATCTTTCTAAAGGATTTGGAGCTGACATTACTTGTGAAAGGTTAATAGAACCTAAATTGCATACCGCTGTTTCGTCTTTAGATGTATTTAACGTAATTTCAGTACACAAGTTACTGTGATGAATAACGCCTGCATGTTGTTGAGGATTACGGCGGTTACATTCATCTTTGTAAGTGATCCAAGGATGACCTGTTTCAAATAAATTGGTCAACAAATGGCGCCATACCTGAATAGCCGGAAGTTGGAAATCATATTCACCAGCGGCTTCTAGTTCTTCATAGCGTTTAACGAAATCTTCGCCGTAAAGTTCATGCAATTCAGGGAAGCGTTTAGGCGAGAAGAAAGACCACATGGCATTTGGATCTTCTTTGCGTTCGATCAAGAGATCAGGAACCCAAGCGGCAGGGAATACGTCATGAGCACGGCGGCGGTCGTCACCAGATTCTCTTTTAAGCTCACAAAACGCCATAAAGTCTGGATGCCAAGCTTCTAAGTATGGGGCAACCGAACCCTTACGTTTACCGCCTTGGTTTACGGCAACTGCGGTATTGTTCTGGACCTTGATATATGGAACTACACCACTTGAAATACCATTGGTTCCAAAAATTAATTCATTTTCACCGCGTACTGGCGTCCAGTCTGTACCAATACCGCCCGCAAACTTAGAAAGTAACGCCGTTTCTTCAATTGCTCCAAAAATAGAAGCAAAGCGGTTATCACCTTCATCAGCAGCAATGGTGTCTGAGACTTGGTTCAGGTAACAGCTTGATAACTGAGGATGTAACGTACCAGCATTAAATAGGGTTGGGGTAGAGGAGACGTATTCTAATTTCGAATAAAGCTCATAATAAGCCAGCGCTACAGAAGTACGGATTTCAGGTTTTTCTTTTAAGGCAACACCCATTGCTACACGCATCCA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MANNDTSNVKLGVCKVFFGGVDLGFTKGGVEVTVETETHEVQVDQYGNTPISEYVMGRTITVAVPLAETTLDNLVATMPGAKLVTDSTAGTSKAIVPTGVGVNLLDFADELVLVPKGVNGSLNYNDAVRVPKAATPGAMTFAYKLDEERIFNCNFKGYPVIEGNDEVLYQVGTVTPPAAKA >NZ_CP010780|15599:98445|91383_91785_-|WP_000084570.1|DBSCAN-SWA MSQVQEIFLIGEDFEPGIVGNSEIDILLGHDTAICGEFAIRKEDGYTHCPDYCEDKNITFRELYKLNLHPLILPASHESSKRRSKKALEKAEQLQDKFVAVFILGSEFYVTRPFESENTALACVLWYALAYYS >NZ_CP010780|15599:98445|25222_26338_-|WP_002017393.1|DBSCAN-SWA MSNFPYAVISDTHNHNWSAFSETTPENVNSRLQIILNETMRAAEEVKAMGGTHLYHTGDLFHVRGSISPSVLNPTIATYKVIQQLLGIKVRILAGNHDLEFREANRNGSAVTALEGIGCEIINETSLFLDERVAMIPWFQDVNELKSEIERVKLQINSMPSRSPLRTIETVSDWTLMIHAPVDGVIAGIPSHGLSATWLGSQGFKRVFAGHYHHHKDFGNGVYSVGALTHNSWSDVNSDAGFLLVNDSKVTWRCSHAPQFVEIDGSMSEVDMALKASGNYVRCTVNSSAKQSDIETIRQFLMDNNAKGVVILSQKKIVEVEREEVSSIKAGASLEVSINDFVNKMGIGSKADDLSKLCLSILEKARMEVVE >NZ_CP010780|15599:98445|18771_21144_-|WP_001103335.1|DBSCAN-SWA MNVTKRNGATEPFSPSKIEKAVNWAVDGTSVESQEVIDKAILLIYDGIKTSDIQQALIKGAAKLVSATKADASLVSARLLLLDLYKTVCGVNGKVSGGGFQYPHIKDYLEKGVSLKLLDPELLNYDLERINAAIKPERDLSFHYLGLDTLADRYFIRANRDIRLEKETGNMSGNIIELPQHFWMRVAMGVALKEKPEIRTSVALAYYELYSKLEYVSSTPTLFNAGTLHPQLSSCYLNQVSDTIAADEGDNRFASIFGAIEETALLSKFAGGIGTDWTPVRGENELIFGTNGISSGVVPYIKVQNNTAVAVNQGGKRKGSVAPYLEAWHPDFMAFCELKRESGDDRRRAHDVFPAAWVPDLLIERKEDPNAMWSFFSPKRFPELHELYGEDFVKRYEELEAAGEYDFQLPAIQVWRHLLTNLFETGHPWITYKDECNRRNPQQHAGVIHHSNLCTEITLNTSKDETAVCNLGSINLSQVMSAPNPLERLREVIRLAIRNLDSVIDVNYYPSDRASNSNFKHRPIGLGVMGYYEWLVKQGVDFESEEHLKQADALFEAISYFAIEASADLAQERGSYPSFEGSNWSKGILPIDNAKLMEDGKPFFDQPRRFDWEALREKVKKGMRNSNVMAIAPTATISNIAGTTQCTEPPFLLEYFKSNLGGTYQVVDPAIAHVGDKYHLLKESYYVDQLYIIKAAAVRQKWIDQSQSTNLFAKQGTTGRDLDLWYTTAKKLGLKTTYYLRNQSDAEKSASMRTKVIAELANAALGKLSEPTESAPKMCSILDPDCESCQ >NZ_CP010780|15599:98445|27060_27516_-|WP_047938264.1|DBSCAN-SWA MCRVQRLNSLLPGKYQENPLFKDKTIEQILEENHPTAIIELIRFRDNTIKNRIKCGLATDQAVNAFHKEVHMCLDLYIYTNYDSLKRYYIRFKKDRLKLELHEYNAKKKQEDREKKMAVEIERRLAQEKELQEQLRIQERQKFYGDVLGSW |
78 | Pseudomonas_phage(34.88%) | transposase,integrase,portal,tail,terminase | attL 18731:18750|attR 75315:75334 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010779_1 | 2403302-2403387 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010779_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010779_1
>1.1|2403325|40|NZ_CP010779|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010779_1
The CRISPR arrays of NZ_CP010779_1 >merge|NZ_CP010779|1|2403302-2403387|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP010779|1|1|2403302-2403387|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP010779.1|WP_000795915.1|2402064_2402301_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP010779.1|WP_001124846.1|2401170_2401782_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP010779.1|WP_000885229.1|2400488_2401100_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP010779.1|WP_000376215.1|2399876_2400332_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP010779.1|WP_001990047.1|2398171_2399818_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP010779.1|WP_000115408.1|2394541_2398006_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP010779.1|WP_000107128.1|2393585_2394545_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP010779.1|WP_001025680.1|2393157_2393442_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP010779.1|WP_002017921.1|2392934_2393048_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP010779.1|WP_000937460.1|2392210_2392846_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP010779.1|WP_000983628.1|2404018_2404432_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP010779.1|WP_000432330.1|2404573_2405452_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP010779.1|WP_001990041.1|2405508_2407653_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP010779.1|WP_001145693.1|2407707_2409117_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP010779.1|WP_000482091.1|2409432_2409912_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP010779.1|WP_000108365.1|2410196_2410418_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP010779.1|WP_000132044.1|2410523_2410841_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP010779.1|WP_000498477.1|2410925_2411147_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP010779.1|WP_001136759.1|2411234_2411663_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP010779.1|WP_000251637.1|2411932_2412076_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1153350 : 1168147
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP010779|1153350:1168147|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1271673 : 1312187
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010779|1271673:1312187|DBSCAN-SWA 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60 | Acinetobacter_phage(94.74%) | plate,integrase,capsid | attL 1271655:1271671|attR 1313450:1313466 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1373143 : 1393987
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP010779|1373143:1393987|DBSCAN-SWA 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19 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1572543 : 1625015
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP010779|1572543:1625015|DBSCAN-SWA 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73 | Acinetobacter_phage(96.61%) | transposase,integrase,terminase,capsid | attL 1561108:1561123|attR 1597235:1597250 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2170504 : 2200307
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP010779|2170504:2200307|DBSCAN-SWA 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46 | uncultured_Caudovirales_phage(37.04%) | head,tail,capsid,terminase,protease,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2663621 : 2718840
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP010779|2663621:2718840|DBSCAN-SWA 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50 | Escherichia_phage(27.78%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2786542 : 2818578
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP010779|2786542:2818578|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(43.33%) | head,tail,integrase,protease,terminase,capsid,portal | attL 2786329:2786382|attR 2822415:2822468 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2829609 : 2858283
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP010779|2829609:2858283|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2862241 : 2874589
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP010779|2862241:2874589|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3102157 : 3110254
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP010779|3102157:3110254|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP010779|3102157:3110254|3107769_3108225_-|WP_000549863.1|DBSCAN-SWA MHLDLSLAVEEGMQSSVTRDKSIEEIDNVLFEVDQAVKKATNNKVEFGWRKKGFNTLGLLTGLTSLPITDVKIESQEPESRVLYVSATDDKTQRFDITILVISPDGFPCEMNVNGNKLISHDAESLLEQFKPLLSSAFVGDKIRKLMKKGA >NZ_CP010779|3102157:3110254|3108215_3109100_-|WP_001076477.1|DBSCAN-SWA MNQSLFVGFWNINLSPPIGNRWNKSKVDKKIKVSRVIQGLLKLDFDFLCLCEVSPEDMEFIDNSIQLIGMGYDYNIYRKNYGGLYFDTCVIFKNTFDFVQSKVEVDGEEKNKLKVFQKYEFLSGHLEERIIFYVTHWLSQLNDNKEKRRTVASFIKKDTNDEKKFFNKTKFVVLGDFNVEPYDSAILEGLRSTRDQKVISNNSSLFYNPFWKFLQIKEDQPSGTHHCTKNEFHHWHIYDQILVSGNFFRDGWNLDDNLVLVFDDKMISSLHNDSFSNPSDHLPICLKLEKTKCI >NZ_CP010779|3102157:3110254|3109096_3110254_-|WP_000947475.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPIMGCKEARQLARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPINEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFKRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPAERMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYIFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKTTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVENWIGTNS >NZ_CP010779|3102157:3110254|3106269_3106485_+|WP_001292077.1|DBSCAN-SWA MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI >NZ_CP010779|3102157:3110254|3103392_3104421_+|WP_000805204.1|DBSCAN-SWA MKPTLFTPETWAEFTQQLKNSWEKDNAGTDSPIFVVQEKKIVWGLDPASDSVEITNIVDADDESTYKSIDDFFESLKATDKHALNGLAIEEEDELFLDVKASTQINILSDWNERNIHICHGKYFWEDVNCHLTRSAADAFIKRKSHDFGELRVFVKSLYWCEEFKNLLNAIISGEVGLTSIDDDNILNVLGPIEPKADKEINSTQAKKSAKKANNKEENWTRYHNDKPVESPLAGLIEKLKKTKTADAANSLIEETKDWASEDQKSFLTELNKHLVIIAGQSKENISISERVKRATDLTTLDAIEIDISEADERIQEPLMELVIKRRKELEVENNFLLESPQ >NZ_CP010779|3102157:3110254|3105557_3106067_+|WP_000578497.1|DBSCAN-SWA MIFYDRAFFEENFKKTETFKQESNIRKNDILVFSETMNGYFNIVTNKAWLLWKKEMQAHADWYKNDDPIAYKWAKDGSPEYEADFYTSAKAWAAAKAQAGPTWISVKDEEPPTDIMVLICWDDAPDVTPEQDYITIDEDLNSVWANYYNDPPSHWMHFHSVPNVSGAEQ >NZ_CP010779|3102157:3110254|3104852_3105032_+|WP_000464381.1|DBSCAN-SWA MFEVKTAVQFDDDDVWIGSVLISKCGGNDEWTAYLDNDVEKEFETLEQAVTYCLEQAND >NZ_CP010779|3102157:3110254|3104561_3104852_+|WP_000986115.1|DBSCAN-SWA MMRNIPDSMSFPFTVWMCENGYYPSHKNGFIILKRGKEVAKISMNETKDGYPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQMVA >NZ_CP010779|3102157:3110254|3106485_3106656_+|WP_000119264.1|DBSCAN-SWA MSWYSLRQLAKELGMAPNTFKKYYLEKFPPDRESKTYKGWTSQSVAKIKVEIQGAK >NZ_CP010779|3102157:3110254|3105024_3105561_+|WP_000609004.1|DBSCAN-SWA MINLANQREALIAEVEVFKKDSMELWFVPDLAASYTNRDFFSYSIIEDNQVFFMIEQTRQLWEFWNKAKDHNLPKGSVLIVEDQIKTMWQDNEEPENCVNKEKDFNCLGDCLDIEDIISITKQRYAYISAEKVYGTWVAKFEAGELKKDYFFVGSQKECEEIVESNKALYSSRMGANS >NZ_CP010779|3102157:3110254|3102699_3103380_+|WP_000643997.1|DBSCAN-SWA MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIEADIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKAKAICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLFLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI >NZ_CP010779|3102157:3110254|3102157_3102529_+|WP_001260065.1|DBSCAN-SWA MRTNYLRGSKRYENNLNGQVNQKSTFREFVGKDEEHGLYKVRLGYTVYAANHTLTRVYTVNENNELTPVSQYTLNTKEWILRNLETEIKYRRGRELGQILQKTHIPSPDRKAYKIRRGFLGTR >NZ_CP010779|3102157:3110254|3106063_3106273_+|WP_000028957.1|DBSCAN-SWA MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG >NZ_CP010779|3102157:3110254|3106662_3107655_-|WP_000527288.1|DBSCAN-SWA MGNKYYDQLVNNDSHFEITFNDFEEFITFIRPDKLHVKDLMTQLRLEFNPSAVNFPFFKIKDFKGYSTLDKSIIYRGHGESDWDLKPTFYRNKKNIGWVKTNWSVDQNYESEILLKFQDSCDLAGVQLPSDNDQLRRRQKNKLSKYRKSFGRDQLDWFDDDFFELAVYAQHYGVETRLLDWTKNPFVASYFACSHALKMNYDPNSKFCIWVLNSESITNELNQVLEVLDPPKGLNQHISHQQGVLTYTKNHIKIFNKFGTRPCLKDILKYYESGYRLLKITLGYELIVELFNYCNIHNFNACHLFRGANGAAMHTTDLLNFDDYKYPIED |
14 | Acinetobacter_phage(57.14%) | integrase | attL 3103002:3103016|attR 3114914:3114928 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3774722 : 3831796
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP010779|3774722:3831796|DBSCAN-SWA 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54 | Staphylococcus_phage(14.29%) | transposase,tRNA,integrase | attL 3807568:3807582|attR 3839839:3839853 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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