CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP011856	Spiroplasma eriocheiris strain DSM 21848 chromosome, complete genome	0 crisprs	cas1,cas2,cas3,DEDDh	0	0	1	0

1. NZ_CP011856

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	477993 : 484956	9	uncultured_Mediterranean_phage(28.57%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP011856|477993:484956|DBSCAN-SWA
AATGAAACAGTATCTAACAATGGCCCAATTTATTTTAGATAATGGTTTAGCCAAGCAAGACCGAACTAATACCGGAACAATTTCTTATTTTGGTTATCAAATGCGCTTTAATTTAGCGGAAGGGTTCCCCTTGTTAACAACGAAAAAAGTTCATTTTAAATCAGTGGTGTATGAATTACTTTGGTTTATTAAGGGTGACACTAATATTAAATATTTAGTTGACCATAATGTCCGAATTTGAAACGAATGACCATATGAAAAATATACAAAGTCACCAGATTATCAAAATGAAACTTTAACTGAATTTGTTGAAAAAATTAAAACAGATGATGAATTCGCAAAGAAATATGGGGATTTAGGTCCAGTTTATGGAAAACAATGGCGTAATTTTGAAGGAGTGAACCAACTAGCAAAGTTAATTGATAATTTAAAAACTAACCCTTATTCACGTCGTCACATTTTAAGTGCTTGAAATCCAAAAGAAGTTGATAATATGGCCTTACCACCTTGTCATACCCTTGTGCAGTTCTATGTTTCTCAAGATAATAAATTAAGTTGTCAATTATATCAACGCAGTGCGGATGTTTTTTTAGGAGTTCCGTTTAATATTGCGAGTTATGCGTTATTAACTTATATGATTGCCCAGGTGTGCGGTTTTGAAGTTGGAGATTTTGTTCATAGTTTTGGTGATTGTCATATTTATCAAAATCACTTAGCCCAAATTAATGAACAATTAACGAGAACGCCCCGCGTATTACCAACCTTAAAATTAAACCCCGGAGTAAAGTCATTATTTGATTTTACTTATGAAGATATTGTTTTAGAAAACTATGATCCATATCCGGCCATTAAAGGTTTGGTGGCAGTGTAATGATTAAGTTATTATGAGCAATGGATCAGCATGGTTTAATTGGAAAGGATAATCACTTACCATGACATATTAAAGCTGAACTTCAACATTTTAAAGCCGAAACTCTTAATAAAACAATTTTATTAGGACGGACTACTTTTGAAGGAATTAATCGGGTGTTACCTAATCGAAAAACAATTGTGGTGACTCATAATCCTAACTATTACTTTAACCATCCGGATGTGCAGGTTGTTCATGATTTACAACCAATCCTCATAGAATATCAACAAAATCCGAATAATGAGTTAATAGTTTGTGGGGGGTCAAAGGTGTATGAGGAAACTTTACCTGTGGCGGATGAGTTAATTATTAGTTATATTAAGGGTGAATATACTGGTGATACTTATTTTCCCCCTTTTAATCTTGATGATTTTGAATTAAAATTTATTCAAGAGTATGATGAATTTACTATTAAAAGATATGTGAGAAGGAGAAGAACTTAATGCCAAATATATGAAAAATTATCTTAACATTGCCCCGTTTTTTACGAATGTTAACAAAATCAAAGAGCATGGCCAGAAAAATTAAACGTGATCCCAATATTGTTTCTGAGGAATACCGTTATCACTGGCTCCAAAAACGAACAAAGTATATGTTATGAATTTTTGATATTAAGTTAATTGTTCATAACGAAGAAAATTGAATTGATAAGGGTTGTTTGATGGTTGCTAACCACCAGTCAAATATTGATCCTGCTATTATTTTTCGGTTAAATGATTTTAATAAAACCGCCCCGTGTGCTTTTATTGCCAAGAAGGAATTAGCAACTGACAAGCGTTTTAAAAATTTTGTGGCTTTAATTGATGTGTTATTCTTAGACCGTAAGAATCCGCGTCAAGCAATTGAAGTTATTAATGAAGCAAACGAATTAATTCGTGTGCCCCGGACAATGGTTGTTTTCCCGGAAGGAACCCGTAGTCATCAACAAGAAATGGGAGAATTCCAAGCGGGAAGTTTTAAAATCGCTCAAAAAGCACATGCGCCAATTATTCCAGTGTCACTTGTTAATTCATACCAAGTTTTAAATAAAAAAGTTAAACAAAAAGGCAAGAAATATATTCATGTTGTGTTTCATAAACCAATTAAACCAGATACTTTTATGACCAAACCAACAGACTTAATTTCGAACAATGTTAAACAAATCATTCAAAAAGGAATTGATCAATATAAAGATGTTGATCATAAGAAAGCCTATGAAAAATATCGTGCCGAATTAAAACAAAAAGCCAAAAATGCTTAAGAAATACATAGGAGATGAAAAAGAATGAGACTTTTAGACTTAATTGAAAAGAAAAAAAATGGTCAAGAACTAACCCAAGAAGAAATTAAATTTATTATTGAAGGATACACTACTGGGGCAATCCCTGATTATCAAATGTCAGCTTTTCTAATGGCAGTTTTTTTCCAATCAATGTCAATTACTGAAATATCATATTTAACTGATGCGATGATTCAATCCGGAGAAGTATATGACTTATCTGGAATCCGGGGGTTTAAGGTTGATAAGCATTCTTCCGGGGGAGTTGGGGATAAAGTTAGTTTAATCTATGCGCCCTTAGTTGCTAGTTTTGGGTTAAAAGTAGCAAAAATGTCTGGACGCGGCCTTGGCCAAACCGGGGGAACAATTGATAAATTAGAAAGTTTTCCGGGGTTCAAAGTCGAAATTTCCTTTGCGGAGTTTGTCCGGATTGTTAATAAAACAAATATTTCAATTATTGCCCAGTCAAGTAATATTGTTCCCGCAGATAAAAAAATTTATGCTCTCCGTGATGTGACAGCCACTGTCAATTCAATTCCCTTAATTGCCGCTAGCATCATGTGTAAAAAAATTGCCACTGGGAGTGATGGGATTGTTTTAGATGTTAAATGTGGGAATGGGGCCTTTATGAAATCAATTTCGGAAGCTAAACAATTAGCTGAAATTATGGTGGGGATTGGCAAACACTTTGATAAAAAAATTGCGGCAGAAATTACCAATATGAACCAACCATTAGGTCGTGCCATTGGAAATGCCATTGAAATTTATGAAGTTGTGAAAACGTTACAAGGCGAAGGTCCCGAAGATTTAAATTATATTGTTTGTGAATCAGCAGCATTGAGTTTATGCCAAGCAAACTTATTCCCTGATTTTGAGAGTGCTTTTAAAGCTTGTCAGGATAAACTCCATAATTCACCAGAACCATTAACTTACTTTAAAAACTTTATCCAAGAACAGGGTGGTGATTTATCTCTAATTAGTGATTTGCATTCGCTGGACCAAATGTTAAAAGTTAAAAATAAAGTTGAAATTAGAGCAAAAGAAACTGGTTTTATTGAAATTGTTGATACTAATGCCTTAGGATTATTATCAGTGCGGTTAGGAGCCGGGCGGAATACCAAAGAAGAAGAAATTGACCATCATGCGGGGATTTACTTAAATAAAAAAACTGGTGAATTTGTTAACGAAGGGGAAACTGTGATGACACTATATACTAATCGTTATGTTACCGATCCAGTTTATGAATGAGCAGAAAGTACTTTTAAAATTACCGACAAAGAACCAAAAGCCTACGAACTAGTATATGAAGTAATTCAATAATTAATCAAGAGAGCTGTGCCCTCTTTTTCTTTCGGATTTTAAAACTCGCGTGCTTATTTCGTAATTTTTTATAATTTTGCTTTGAATTATTATAAAATATCATTATGATATATAAAGAGGAAATAAAGAAGGGAAAGATAATGTTGACAAATAATCCCCGCTATGAAGTAAGTTTAGATAATTTCACTGGTCCGTTGGATTTATTATTGCATCTAATTAAAGAAAAAGAAGTTGATCTTTTTAGTATTAGTTTGTTAGAAGTAACTGATCAGTTTTTAGCGTATTTACATCAATTTGAAAAATTAAACATTGAAATTGCATCCGAATATTTATTAATGGCAAGTTATTTAATTGAAATTAAAACCAAACTAGTTCTCCCCAAAGAAGAAGTTGAAATTGATGAAAACTATGAAAAGGATAGCCGCGAAGAGTTAATTACCCGGTTATTAGAATATAAAAAGATTAAAGAAGTGACCCATTATTTTAAAAACCAACACCAAGAGTCAAGTAAATATTTGTCAAAACCCAAAACTATTATTAAAGGTCAGCGTATTCCCGATGAAGAATTGCCCTTATCCCCTAAAATTAACATTGATAAATTAGCAAATAGTTTTTTAAAAATGTTAGAGCAAATTAATGCTTCCAAACCCTTAAATTCTAATATTATAATTACCGAAGTTTCCCCTGAAGAGGTTGCCATTAAAATTTTAGATATTATTGAAAACACCACTCAGGAATGGTTATTAGAAGATTTATTAGATTATTTTGAACTATCAACCCAGGTGTTTGTTGCTTGTTTTATTGCGATTTTAGACTTAGCTCGTCACCAAAAGATTAGCATTACTCAGCACCAACATTTGGATAACATTTATATTACTTATCTTAACTTAGGAGAGGAGCACCAAAATGAATAATAATGAAAAAATTGCTTTATTAGAAGGATTACTTTTTATTAGTGGCGATGAAGGAATTGGCTTGACTGAAATTAGTGAAGTCTTAGAATTACCAACCTCGGATTGTCAGCAGTTAATTGCAACCTTAGCCAAGGAATACCAAACTAATCCTACTCGGGGGTTAATGATTAATAATTTTGCAAATAAATATCGGTTAACAACCAAAAAAGAATATTATCCGTTTTATTTAAAATTATCCCATCCAAAAGTTGAAGCCCGGCTATCCCAAGCAGCTCTCGAAACATTAGCGATCATTGCCTATCGGGGGCCGATTAGTAAACCAGAAATTGAGGATTTACGAGGTGTTAATTCCGATAATGTTATCTATAAGTTAAAAGCGCGTGAATTAATTGAAGAGGCCGGAAAAAGTGACTTGCCCGGAAAACCACTAAACTATAAAGTTACCGAAGAATTTTTAAAAGCTTTTAACTTAAATTCCCTAGCTGAATTACCACAATTACAAGAAATTACTAGTGATGAAGAAGAGGACTTATTTAAATAATGGAACGGTTACAAAAAGTAATTGCTAATTATGGCTATGCCTCTCGTCGTAAAGCAGAAGAATTAATTACCCAACACCGGGTGAAGGTAAACGGGCAAGTTATTAGCGAAATGGGATTTAAAGTTACGCCCCATGATGTCATTATGATTGATAATAAAATCCTGGAAAATAAAAATCAGCAAAAAGTCTACATAATGTTAAATAAACCGCGTAATACTGTGAGCACTGTTCGTGATCCCCACCACCGGAAAACGGTGCTTTCGTATTTAACCGGGATTTCTCACCGAGTTTATCCAGTAGGGCGATTAGATTATGATACTAGTGGGTTATTATTAATTACAAATGATGGGGATTTTGCTAATATTATTACCCATCCTAAACATATTATTGATAAAACTTATCATGTGCTTGTCAAAGGAGCGGTTACGAAAACGCAACTACGTGATTTAGCTCGGGGCGTAAAAATTGAGGATAATTTTACAACCTCCCCAGCCCAAGCTAGGGTGCTAAAATATTCAGAAAAAGATGATACCACAGTGTTAGAACTAATTATTCACGAGGGTAAAAAACACCAAGTCAAGCGTATGCTTAGTGCGGTTGGCAGTGAAGTTCTAAAGTTAAAAAGAGTGGCGATTGGTTTTTTACAGTTAGATGAAAGTTTAAAGCCAGGAGAATGGCGATACTTAAAACCCAAAGAAATTAAGCGCTTTTTTGGAATTTTTAATAGTATAAAAAAATAAAACTACTTTTAATCATTTTTAAAATACGATAAAATTAAGCAAATGAGAAAAGAGGGAAGTTATGCGAATTACATTAGCGGGAGTAGTTGGGGTTGGAAAATCAACTGTTAGTAAAATGCTTGGCGATAAATATAACTATGTAGTAATGGATGAACCAGTGGAAGAAAACCCATACTTAGATGAATACTATGCTGATCCCAAAAATATGGCGTTTAAAATGCAAGTTTATATGGTGATGGCCCGTAGTAAACAGTTAAAACAAGCTAAAATTGAGCCAAATATTATTTTTGACCGGAGTGTGTTAGAAGATATTATATTTGTCGATGTTCTTCACGAACTAGGGTATATGAATATGACTGATTACAAAGTTTATCGTGAGTTTTATGATATTGTTGTTTTACAAAGTTTATACCTGGATGAAACTATTAAACCGGAGTTAGTAGTTTACTTACGAATTTCACCATTTGGGGCGATGAACCGAATTAAACAACGCGGAAGACCAAGTGAACAAACAGTGAGCCCCGCTTACTGAGAGTTATTAAATAAAAAATATGAAGAATGATACCAACGAAATAAAGATAAGTTTAATTTCTTGGTTATTGATGCGGAAGATAAAACTCCCAATGAAATTGTTGATATAATTTCGGAAAAAATTGATCAGTATCAAAAATAAAAAAGCTGTAAATAATTACAGCTTTTTTATTAATAAATCCTAGTTTACGCTTGACCTAATCCTTTTTCTTTTCAGATTTGCATTACTTTTTCTTTGCCTTCGGTTTCAAGGATTGTTTTATACTCTAAGTAACGATCTTGACACTCTTTAATTTCTTTGAGTGCTTGTTCAACACCACTTCACCCATTAATGCGGACTTCTTTTTTTTGTAATGCTTTATATTGCAAGAAGAAGTTTTCAATTTCATCGCGCAAATGTTGGGGCACATCTGTTAATGTTTGGTAATGTTTAAAACGGGGATCACTATCCACAACCCCAAATATTTTGGTATCAATTTCGCCACTATCAATCATGTTAATTGTTCCCAACACGCGGACATTAATTTGACACCCCGGAACTGTTGGATATGTAATTAATGAAATTACATCTAACGGATCACCATCTCAGTCTAAAGTATTTTCAATAAATCCATATTCACCGGGATAAAAATTAGCACCATATAATACTCGGTCTAAAATAATACGGCCCGTTTGACTATCATATTCATATTTATTGCTTGAACCTTTTGGAATTTCCACAATTATTGGTAGCACATTATTTTTACTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP011856|477993:484956|484392_484956_-|WP_047791291.1|DBSCAN-SWA
MSKNNVLPIIVEIPKGSSNKYEYDSQTGRIILDRVLYGANFYPGEYGFIENTLDWDGDPLDVISLITYPTVPGCQINVRVLGTINMIDSGEIDTKIFGVVDSDPRFKHYQTLTDVPQHLRDEIENFFLQYKALQKKEVRINGWSGVEQALKEIKECQDRYLEYKTILETEGKEKVMQIWKEKGLGQA
>NZ_CP011856|477993:484956|483736_484348_+|WP_047791290.1|DBSCAN-SWA
MRITLAGVVGVGKSTVSKMLGDKYNYVVMDEPVEENPYLDEYYADPKNMAFKMQVYMVMARSKQLKQAKIEPNIIFDRSVLEDIIFVDVLHELGYMNMTDYKVYREFYDIVVLQSLYLDETIKPELVVYLRISPFGAMNRIKQRGRPSEQTVSPAYWELLNKKYEEWYQRNKDKFNFLVIDAEDKTPNEIVDIISEKIDQYQK
>NZ_CP011856|477993:484956|482934_483675_+|WP_047791289.1|DBSCAN-SWA
MERLQKVIANYGYASRRKAEELITQHRVKVNGQVISEMGFKVTPHDVIMIDNKILENKNQQKVYIMLNKPRNTVSTVRDPHHRKTVLSYLTGISHRVYPVGRLDYDTSGLLLITNDGDFANIITHPKHIIDKTYHVLVKGAVTKTQLRDLARGVKIEDNFTTSPAQARVLKYSEKDDTTVLELIIHEGKKHQVKRMLSAVGSEVLKLKRVAIGFLQLDESLKPGEWRYLKPKEIKRFFGIFNSIKK
>NZ_CP011856|477993:484956|480166_481480_+|WP_047791287.1|DBSCAN-SWA
MRLLDLIEKKKNGQELTQEEIKFIIEGYTTGAIPDYQMSAFLMAVFFQSMSITEISYLTDAMIQSGEVYDLSGIRGFKVDKHSSGGVGDKVSLIYAPLVASFGLKVAKMSGRGLGQTGGTIDKLESFPGFKVEISFAEFVRIVNKTNISIIAQSSNIVPADKKIYALRDVTATVNSIPLIAASIMCKKIATGSDGIVLDVKCGNGAFMKSISEAKQLAEIMVGIGKHFDKKIAAEITNMNQPLGRAIGNAIEIYEVVKTLQGEGPEDLNYIVCESAALSLCQANLFPDFESAFKACQDKLHNSPEPLTYFKNFIQEQGGDLSLISDLHSLDQMLKVKNKVEIRAKETGFIEIVDTNALGLLSVRLGAGRNTKEEEIDHHAGIYLNKKTGEFVNEGETVMTLYTNRYVTDPVYEWAESTFKITDKEPKAYELVYEVIQ
>NZ_CP011856|477993:484956|479344_480142_+|WP_047791286.1|DBSCAN-SWA
MPNIWKIILTLPRFLRMLTKSKSMARKIKRDPNIVSEEYRYHWLQKRTKYMLWIFDIKLIVHNEENWIDKGCLMVANHQSNIDPAIIFRLNDFNKTAPCAFIAKKELATDKRFKNFVALIDVLFLDRKNPRQAIEVINEANELIRVPRTMVVFPEGTRSHQQEMGEFQAGSFKIAQKAHAPIIPVSLVNSYQVLNKKVKQKGKKYIHVVFHKPIKPDTFMTKPTDLISNNVKQIIQKGIDQYKDVDHKKAYEKYRAELKQKAKNA
>NZ_CP011856|477993:484956|482386_482935_+|WP_047791288.1|DBSCAN-SWA
MNNNEKIALLEGLLFISGDEGIGLTEISEVLELPTSDCQQLIATLAKEYQTNPTRGLMINNFANKYRLTTKKEYYPFYLKLSHPKVEARLSQAALETLAIIAYRGPISKPEIEDLRGVNSDNVIYKLKARELIEEAGKSDLPGKPLNYKVTEEFLKAFNLNSLAELPQLQEITSDEEEDLFK
>NZ_CP011856|477993:484956|477993_478863_+|WP_047791284.1|DBSCAN-SWA
MKQYLTMAQFILDNGLAKQDRTNTGTISYFGYQMRFNLAEGFPLLTTKKVHFKSVVYELLWFIKGDTNIKYLVDHNVRIWNEWPYEKYTKSPDYQNETLTEFVEKIKTDDEFAKKYGDLGPVYGKQWRNFEGVNQLAKLIDNLKTNPYSRRHILSAWNPKEVDNMALPPCHTLVQFYVSQDNKLSCQLYQRSADVFLGVPFNIASYALLTYMIAQVCGFEVGDFVHSFGDCHIYQNHLAQINEQLTRTPRVLPTLKLNPGVKSLFDFTYEDIVLENYDPYPAIKGLVAV
>NZ_CP011856|477993:484956|478862_479345_+|WP_047791285.1|DBSCAN-SWA
MIKLLWAMDQHGLIGKDNHLPWHIKAELQHFKAETLNKTILLGRTTFEGINRVLPNRKTIVVTHNPNYYFNHPDVQVVHDLQPILIEYQQNPNNELIVCGGSKVYEETLPVADELIISYIKGEYTGDTYFPPFNLDDFELKFIQEYDEFTIKRYVRRRRT
>NZ_CP011856|477993:484956|481623_482394_+|WP_047792000.1|DBSCAN-SWA
MTNNPRYEVSLDNFTGPLDLLLHLIKEKEVDLFSISLLEVTDQFLAYLHQFEKLNIEIASEYLLMASYLIEIKTKLVLPKEEVEIDENYEKDSREELITRLLEYKKIKEVTHYFKNQHQESSKYLSKPKTIIKGQRIPDEELPLSPKINIDKLANSFLKMLEQINASKPLNSNIIITEVSPEEVAIKILDIIENTTQEWLLEDLLDYFELSTQVFVACFIAILDLARHQKISITQHQHLDNIYITYLNLGEEHQNE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_047791284.1|477993_478863_+	thymidylate synthase	A0A0N9SH48	Staphylococcus_phage	9.5e-98	56.7
WP_047791285.1|478862_479345_+	dihydrofolate reductase	G3MBI7	Bacillus_virus	2.0e-20	35.7
WP_047791286.1|479344_480142_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_047791287.1|480166_481480_+	pyrimidine-nucleoside phosphorylase	A0A0H3UZD4	Geobacillus_virus	7.9e-112	50.9
WP_047792000.1|481623_482394_+	segregation/condensation protein A	A0A1B1IVW1	uncultured_Mediterranean_phage	6.4e-13	36.5
WP_047791288.1|482386_482935_+	SMC-Scp complex subunit ScpB	A0A1B1IVT7	uncultured_Mediterranean_phage	6.3e-15	31.9
WP_047791289.1|482934_483675_+	rRNA pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_047791290.1|483736_484348_+	deoxynucleoside kinase	A0A0M3UL55	Enterococcus_phage	1.7e-16	32.4
WP_047791291.1|484392_484956_-	inorganic diphosphatase	A0A2H4J8U1	uncultured_Caudovirales_phage	2.7e-21	37.8