Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP011024 | Lactobacillus reuteri strain IRT chromosome, complete genome | 0 crisprs | RT,cas14j,cas3,DEDDh,DinG,PrimPol,csa3 | 0 | 0 | 9 | 0 |
1. NZ_CP011024
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
245554 : 307313
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011024|245554:307313|DBSCAN-SWA TATGGCTGAACAAAAACCAACTTATTACATTACAACACCAATTTACTATCCATCTGGTAAACTCCATATTGGTAATTCATACACAACAATTGCATGTGATGCAGAAGCACGTTTTAAGCGTTTGATGGGCTATGACGTATTCTACTTGACAGGAACCGATGAGCATGGCCTTAAGATTGAACAAAAGGCTGAAAAACTCGGCATGAAGCCACAAGAATACGTTGATCAAATGGCTGCCCAAATTAAAGAGCTATGGAAAAAACTTGAAATTACAAATGACAAGTTTATTCGGACAACCGATGACTACCATGAAAAAGCTGTCCAAAAGATTTTTCAACAATTGCTTGACCAAGGGGATATTTACAAGGGCAAGTATACTGGTTGGTACTCAGTTGATGATGAAGAATACTTCACAGAAAGTCAGTTAGCAGAAGTTTACCGTGATGAAGACGGTAATGTGATCGGTGGAAAAGCGCCATCAGGTCATGAAGTTCAATTAGTTGAGGAAGAATCATACTTCTTTAAGATGAGCAAGTATGCTAACTGGTTAATGAACTACTATAAGGAACATCCTGATTTTATCGAACCGCAATCACGGATGAATGAAATGATTAATAACTTCTTAAAGCCAGGACTAGAAGATCTTGCAGTTACGCGGACATCATTTAACTGGGGGGTTAAGGTTCCTAGTGATCCTAAGCACGTGGTATACGTATGGATTGATGCATTATCAAACTATATTACTGCGCTGGGATATGGTAGTGATGATGATAGTCTTTTCAAGAAGTACTGGCCTGCTGATGTTCACATGGTAGGAAAAGAAATTGTTCGTTTCCATACGATTTACTGGCCAATCATGCTTCATGCGCTTGGCTTACCATTGCCAAAACACATCATCGGTCATGGTTGGTTAACAATGCGTGACGGTAAGATGTCGAAATCAAAGGGAAATGTTATTTATCCTGAAACTCTTGTTGATCGCTACGGCCTTGATGCCACACGTTACTACTTATTGCGGGCAATGCCATTTGGTAATGATGGCGTCTTTAGTCCAGAAGACTTTGTTGATAAGGTAAACTATGACCTTGCTAACGATCTAGGAAACTTGCTCAATCGGACTGTTGCGATGATTAATAAGTATCAAAATGGTAAATTAGTTGGCACTAATGATGCAACGACTGATTTTGATGCTGATTTAGAACAAACTGCTAGTGATGTAATTGCTGAGTATAAAGAATTAATGGATAAAACACGGTTTGCTGAAGCATTGGCAACTGTTTGGAAGTTGGTTAGTCGTGCTAACAAGTACATTGATGAAACTGAACCATGGGTACTAGCAAAAGATGATAGTAAGAAGGATGTATTATCAGATGTGATGACCCATCTAGCAAAGAGTTTGTGGATTATTGCAGCCTTAATTCAACCAATTATGCCGCATGCACCAAAGCAAATTGTTGAACAACTTGGGATTGAAGGGACTGACTTATCATTAACTGATCTTCAATTTAATGATTTCCCAGCAGAAGCTCAGGTTGTCGCCAAAGGAACTCCGATCTTCCCACGTTTGGATGTGAAGGCCGAGGTTGAATTTATTAAGAGCAAGATGACAGCAAACGAAAAGAAGAAAGGAAGAAAGGCAATGGCTGAAGCAAAAGAAAAAGCCCAAGAAACAGCACAAGAAGAGAAAACAGATGGCAAAAAGCCAATTCGGATTGATGTCTTTGACAAAGTTGAATTGAAAGTAGCTCAAATCACTGCTGCCGATCATGTAGAAGGTGCTGATAAGCTTCTAAAATTCCACATGGATGATGGAACAGAAGAAGGCCGGCAAATCCTTTCTGGAATTGCCAAATGGTATCCAGACCCTTCTGTTTTAGTAGGTAAGAAAGTTTTGATTGTTGCTAACTTGAAACCACGGAAAATGCGGGGCGAATTAAGCCAAGGAATGCTTTTGTCTGCTGAAAAAGACGGTAATGTTCAAGTAGTAACTGTTCCTGACAATTTAGTACCTGGAATGGGCGTTGAATAAAGTGCATAATCATCAACACCAGCAATTGGTTTATGATTCCCATACCCACCTAAATGACGATGCGTTTTATGATGATGTGCCTGCCTTTATTAACCGTGCTGCTCATTATGGCGTGACGGAGATGAATATTATTGGCTCAAACCAACTATTAAATACCCGTGCCTTAAAGTTGGGACACCAGTATGATAACCTTCATCCAATTATTGGTTGGCATCCAGAAGATATTGCTAATTGGAATAGCGAAACCAAGAAAGAGTTATGCCAACAATTAGCAGATCCCTTAGTTGTAGGAATTGGAGAGATTGGCTTAGATTATTATAATGACGAGCATTCTCCTCACCAGCAACAACAAGAAATTTTTGCTGAACAGCTTGAGTGGGCGCGAGAACTGAAATTACCAGTTTCGATACACTGCCGAGATGCAATGGCTGACACGTATGAAATTTTGCGGAATGCCCACATCGATGAATTTGGCGGTGTTATGCATAGTTTTAATGGGACGCCAGAATGGGCAGAGAAATTTATGGATCTCGGGATGATGATTTCATTTAGTGGTGTCGTAAGTTTCAAAAATGCGACAGAAGTCCATGAAGCCGCGTTAGTTGTTCCCTTGGAAAAGATGATGGTTGAAACAGATGCACCTTACTTAACACCACTCCCATACCGGGGAAAGCAAAATGAACCCGGTTTTACTAAGTTTACGGTGGATGCAATTGCAGATTTAAAGCAGGTTGATGCTGGTAAGGTGGCATATAAAACATTTACGAACGCCCGCCGCTTATTTTTGGAAAATAAAGAAAGAGGCCTATGATTAGAATAAAAGAAGTTATAGTTGTTGAAGGTAAAGATGATACTAAGCAAATTTTAAAAGCGGTTGATGCCGATACCTACGAAACAAATGGGTCTGCAATTTCAACGGCTGACTTGGCGAAGTTGAAAAAGTTACAAGCAAGCCGGGGCCTAATTGTTTTTACTGATCCAGACTTTAACGGGGAGCGGATTAGAAAAATAATCAGTGAAGCCATCCCAGGAGTTAAGCATGCTTTTATTAAACGAAAAGATGGTGTACCAACTGAGGCTCATGGTAGCTTGGGAGTTGAGCATGCAACGCCAGCAGTTATAAAATCAGCTTTGGAGCACCTTTATACCCAAACAACGACACCTCAGCAAGTTTTTAAGCGAGAAGACTTGCAAAAATGGGGATTAACAGGTCAAGCAGATTCACGAAAACGGCGTGAAAAGCTAGGGCAATTACTCGGAATCGGTTATGGAAATGGGAAACAATTGATTCACCGTTTAAACATGTTTCAAGTTGACCGAGCAACATTTGAACAAGCAATTAAGCAAATAAATCAGGAGGAAGATCATGAGTAATTCACCAGAAATTGGTAGTCGAACACGTACCCGCGCGATAATGGAAAAGTACGGGATCCGAACAAAAAAGAGTTTCGGCCAGAATTTCCTTACTGATTTGAACGTCTTAAAAAATATCGTTGAGGCGGCGGATATTACAGCTAATGACAATGTAATTGAAATTGGCCCTGGAATTGGCGCTTTAACGGAGCAATTAGCACAAGCGGCGGGAGAAGTTTTAGCCTTAGAAATTGATCAAGATTTAATTCCGGTATTAAAAGAAGTATTATCACCATATGATGATGTAAAAGTGATTAATCAAGATGTCCTTCAAGCTAATTTACCAGAGTTAATCAAAAAGGAATTTAAGGATCCTAGTCGACCAATTAAGGTGGTTGCTAATCTCCCTTATTACATTACGAGTCCCATTCTAATGAATTTGCTGGCTAGTCCTGTTGAGTGGGCGACGATTTGTGTGATGATGCAAAAGGAAGTTGCTCAACGACTCACGGCTAAACCAGGAACTAAACAATATGGTGCGTTGACATTAGCGATTGAATACCAAATGCAAGCTAAAATTGCTTTTGATGTTTCACGAAAAGTGTTTGTGCCAGCACCTAATGTTGATTCAGCAATTGTGGTATTAACGCCACGGACAAATCCACTTCCAGTTCAGCCTTTTGATAAGCAAAAATTATTTGGCTTTATCCGGGGATGTTTTGCTCATCGTCGCAAGAGTCTTTGGAATAACTTGCAAAGTGTAATTGGTAAGGATCCAGCGGCAAAAGAGAAAATGACGGCCGTTTTAAACCAGCTGGATATTTCGCCGCAAATCCGTCCTGAGAAACTAACCCTCGAACAATTTATTGAACTTGCGAATGCTCTTCACCAGCAAAATCTCTTGTAAAAGATGGTTGACCGTTATAAAACATTATGGTACAATTTTGCTTTTTGTGTAAAAAAAGAGTATGCTAGTCTACAGTGAGGTGAAGGAGTCGTGCCTAATAGCATTGTAGAAATTAAGAAGAAGCTAGATGAACGGATTGGCGAGCATGTTTTAGTAAAAGCACAAGCTGGACGTAAACGTATTACCACCCATCACGGTATTTTGAGTAAGACCTATCCTGCAGTATTTGTTATTCATTTGAATGATGAACAAGGAACATTGGATCGGGTTTCCTATAGTTATACTGATTTGTTAACACGAAATATTTCAATTGCCTTCGATGAAGCAGAATAAACTGATAATTTAAAATTCATATTTATAAAATAATAGGAGTGGGTAAAAATACCTTTCAACAGGAAGGCAGTTTTTATTCACTCCTTTTGCTTTAGGAATAGTTAGGAAACAGTAGTTGCAAGGATTATAGTTCCGTTAGTATAATTTAACTAACTAAATTATTATAAATTAAGGAGGGTTGCCGGATGATAGTTACAGAAAAAGCACCAGCAAAATTGAATTTGAGTTTAGATACGCCGATGCGATATTTTGATGGTTCTCCTCAATGGGATATGGTAATGGTTTCGGCAGACCTGGCTGATTATGTAACTGTTGAGACACACCGGCGCCCTGCAACAATTAAAGTTTATACAAATAGTGGCTTTTTACCCAATGACC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59 | Pseudomonas_phage(15.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
732396 : 752663
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP011024|732396:752663|DBSCAN-SWA 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23 | Staphylococcus_phage(27.27%) | terminase,protease,head,portal,tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
782606 : 791810
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP011024|782606:791810|DBSCAN-SWA TATGGCAAGTAATAAGATTATTGGTATTGATTTAGGTACTACTAACTCTGCGGTTGCTGTTATGGAAGGTAATGAACCTAAGATTATCACCAACCCAGAAGGAAGTCGGACAACACCATCTGTTGTTTCATTTAAGAATGGTGAAACTCAAGTTGGGGAAGTAGCAAAGCGTCAAGCAATTACTAATCCTAACACTATTTCATCAATCAAGAGTCACATGGGTGAAGCAGGATACACTGTTGAAGTTGATGGTAAGAAATATACTCCACAAGAAATTTCAGCAATGATTTTGCAATACCTTAAGAAATATGCTGAAGACTACATTGGTGATACTGTTACTCAAGCAGTTATCACTGTTCCTGCATACTTCAACGATGCTCAACGTCAAGCTACTAAGGATGCCGGTAAAATTGCGGGCCTTGATGTAAAGCGGATTATTAACGAACCTACTGCTTCATCCCTAGCATACGGTCTTGACAAAAAGGACAAAGATGAAAAGATCCTTGTTTATGACCTTGGTGGTGGTACATTCGATGTTTCCATTCTTGAATTAGGTGACGGTGTCTTCCAAGTTCTCTCTACTAATGGTGATACTCATTTAGGTGGGGATGACTTTGACCAAAAGATTATGGATTGGTTAATCGATGGCTTTAAGGAAGAACACGGTGTTGATCTTTCTCAAGATAAGATGGCGCTTCAACGTTTGAAGGATGCTGCTGAAAAGGCTAAGAAGGACTTGTCTGGTGTTCAAGAAGCACAAATCAGCTTACCATTTATTTCAGCTGGTGAAAACGGCCCATTACACTTGGAAAAGACATTAAGTCGGGCACAATTTAACCAATTAACTAACGATTTGGTTGAGCGGACAAAGCAACCGGTATTGAATGCTTTGAAAGATGCTGATCTTACTTTTGATGACATTGATGAAGTTATCTTAAATGGTGGATCTACTCGTATTCCTGCCGTTCAAGAAATGGTTAAGGAATTAACTGGTAAGGAACCTAACCACTCAATTAATCCTGACGAAGCCGTTGCTCTTGGTGCAGCTATTCAAGGTGGGGTTCTTACTGGTGATGTTAAGGATGTCGTATTACTTGATGTTACTCCACTTTCACTTGGTATTGAAACCATGGGTGGTGTCTTCACTAAGTTGATTGACCGTAACACAACTATTCCTACTTCAAAGAGCCAAATCTTCTCAACTGCTGCTGATAACCAACCAGCTGTTGACATTCACGTTCTTCAAGGTGAACGTCCAATGGCAGCAGATAATAAGACTTTGGGTAACTTCCAACTAACTGATATTCCTGCTGCTCCTCGTGGTGTTCCTCAAATCAAAGTTACATTTGATATCGATAAGAACGGTATTGTTAATGTTTCTGCTGAAGATCAAGGAACTCATAAGAAGCAAAACATCACTATCAAGTCTAACTCAGGCTTAAGTGATGAAGAAATTGAACGGATGAAGAAGGATGCTGAAGAGCATGCTGAAGCCGACAAGAAGAAGAAGGAAGAAGTTGACTTGAAGAATGAAGTTGACCAAGAACTCTTCCAAGTTGATAAGACTTTGAAGGAAGTTAAGGGTAAAGTTCCTGAAGATGATATCAAGAAGGCTGAAAGTGCTCGTGACGAATTAAAGAAGGCTAAAGAAAGCGGCAACCTTGATGAAATGAAAGCTAAGAAGGATGCTTTGAACAAAGTTATTCAAGACCTTAGCGTAAAGCTTTACCAACAAGCTCAAGGTGCACAAGGTGGCGCTGCTAATGGTCAACCTGGTGATAGCCAACAAAATGGTAATGACAACGGTAATGATGACAATACTGTTGATGGTGATTTTAAGGACGTTACACCAGACGACAAGAAATAGCCTGCGGTAAACAGTCTTAAAATGTTAGTGTAAAAGCCAAAGGCCAGAAAAAAGGACTTTGGCTTTTACTTTCGTTTGCTGGCTGTGGTATAACTAAACAAGCAATAAAGTAATGAGGTATTTATTATATGGCAGAACAAGATTATTATGACATTTTAGGTGTCTCTAAGGATGCATCCGAAAAAGACATCAAGCGTGCATATCGTCGGCTTGCGGCAAAATACCACCCAGATGTTAACCACGAGCCTGGTGCAGAAGAAAAGTTTAAGAAGATTAATGAAGCATATGAGACATTGAGTGATAGTCAAAAACGTGCTCAATATGATCAATTTGGTTCAGCTGGCCCACAAGGTGCTGGCGGTCAAGGCTTTGGCGGCTTTGGTGGTGGTCAAGCTTATTCTAACTTTGGTGGCGGCTTTGACGACATCTTTAGTCAATTCTTTGGCGGCGGCGGTCGTACTCGTCGGGACCCAACAGCCCCGCGTCAAGGGCGTGATTTACAATATGCAATGACTCTTGATTTTATGGATGCGGTTTTTGGTAAAACAACTACTATCAAGTATGACCGTGATGCAGAATGTAAGACTTGTCATGGAACCGGAGCTAAGCCTGGCAAATCGCCAATAACTTGTCCACGGTGTCATGGTGCCGGAGTGATTACGAGCGTTCGTCAAACACCGCTAGGCAATATGCAAACTCAAACTACTTGTCCAGAATGTAATGGAACTGGAAAGATTATTAAGCCCGAAGATCGTTGTGATACTTGCCATGGTGCAGGACATGTTCACGAACGTCATGAGCTAGAAGTGAAGGTGCCTGCCGGAGTTGATGATGGTCAACAAATGCGGCTCCAACACCAAGGAGACGCTGGTGAGAACGGTGGCCCAGCCGGAGATTTGTATATTGTCTTCCGGGTAACACCAAGTCGAGAATTCCGTCGCGATGGTTCAACAATTTATGTTGATCGTGATATTTCGTTTGCTCAAGCAGCCTTGGGAGACGAAGTAAAAGTTAAAACGGTTCATGGTGATGTCAACCTTAAAATTCCTGCTGGAACACAATCAGAAACTAATTTCCGCTTGCGTGGCAAGGGTGTTCCACACCTTAACGGTAATGGTAACGGGGATGAACATGTTACTGTCCATGTTAAGACACCTAAGAGCCTTAACAAACGTCAACGTGAAGCAATGTTAGCTTTTGCGGCTGCTAGTGGTGAAGATGTTAAGGGTGTGAAGAAGACAGTTCTTGATAAGTTACGTGATGCCTTTGAGGATAAGTAAATAATTTTTATGAAGCAGGAAAAGCTTAATATTTTTCCTGCTTTTTGTATATCTAGTAGAAGGTTTCCCATTCTAAACGAGGATTTGGTATACTAGATAAAGAATATTCGTTGAAAGTGAGTCTTTTTAAATGAACCTAGAAGAAATGAAAGAGCGGCAAAAACACATTCGGAATTTCTCGATTGTTGCCCACATTGACCATGGAAAATCAACGCTTGCTGATCGTATTTTAGAAATGACTGATTCAATCAGCAAACGTGAAATGAAAAATCAGATTCTTGATGATATGCCTCTAGAACGAGAACGGGGCATTACAATCAAATTAAATGCTGTTGCCTTGACGTATCATGCTAAAGATGGTGAAGATTACATTTTCCATTTAATCGATACACCAGGCCACGTCGATTTTTCTTATGAAGTATCACGGTCTCTTGCTGCCTGTGAAGGTGCCGTCTTAGTAGTCGATGCAACGCAAGGAGTAGAAGCGCAGACGCTTGCTAATGTCTTTTTAGCGCTTGACAATGACCTTGAAATTTTACCTGTTATCAATAAGATAGATTTACCTTCTGCTGATCCTGAGGGTACTAAGAAGCAGATTGAAGATGAAATTGGTTTAGATCCTGATGAGGCAGTTGATATTAGTGCTAAGACTGGAATGGGCGTTGATGAAGTCCTGGAAAAAATCGTTAAGGATGTTCCAGCACCAACAGGAGATTTAACTGCGCCTTTGAAAGCTCTTATCTTTGATTCAAAGTATGATGATTATCGTGGAGTTGTCCTTAGTGTCCGGGTTGTTGAAGGAACTGTAAAAAAAGGTGACCGAATTAAATTAATGAACGGTGGTACCGAATATGAGGTAGCAGAAGTAGGAATTAACTCTCCTAAACCATTGGCCCGTGATGTGTTAATGGCTGGGGATGTAGGTTACATTACGGCGGCAATTAAAGACATTAAAGATACCCGGGTTGGTGACACGGTCACAAGTGCGGATAATCCTACAGATAAGCCGTTAGAAGGATATCGGCAAATGACGCCAATGGTATATGCTGGACTCTATCCAACCGATAATGCTAAATTTAATGATTTACGTGATGCGTTGGAAAAGCTTCAACTTAATGATGCAGCATTAACCTTCGAACCGGAATCATCGCAAGCATTGGGATTTGGGTTCCGTTGTGGTTTCTTAGGGTTACTTCACATGGATGTTATTCAAGAACGACTTGAACGTGAATTTAATCTTGATTTAATCACGACTGCACCATCAGTTACTTATCATGTTGAATTAGCAGATGGGACAACAAAGGAAGTGGAAAATCCGGCTGAAATGCCGGACGCTTCTTCCATTAAAGCGATTAAGGAACCGTATGTCCGCGCCTCAATCATGGTCCCCAATGATTATGTTGGCCCAGTAATGGAACTTTGCCAACGGAAACGGGGAGACTTTGATACGATGGAATATCTAAGCGATACCCGGGTAAACGTTATTTATCATATTCCGTTGTCAGAAATTATTTTTGACTTCTTTGATAAGTTAAAAAGTTCTACACGAGGATACGCTTCCTTAGATTATGAAATTGATGGCTACCGTCCAAGTAATTTGGTTAAGATTGACATCTTGCTTAATGGCGATAAGGTGGATGCATTAAGCTTTATTGCTCACCGTGACTTTGCGGCAGAACGTGGTCGAGAAATTACTGCTAAATTAAAGAAGATCATTCCACGGCAAAACTTTGAAATTCCAATTCAAGCAGCAATCGGTTCTAAGATTATTGCCCGGACTAATATTAAAGCCTACCGGAAAGATGTTACTGCCCGTATTCATACCGGGGATCCAGACCGGCGTGCCAAATTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP011024|782606:791810|789891_790128_+|WP_003668162.1|DBSCAN-SWA MTPLNKNIIIVNDKKDIDNITELESFYSEFPTDSNIGIDELKTLMTGKALIDVSDGEYIHWLQLDKHALRFAKTILEK >NZ_CP011024|782606:791810|787868_789029_-|WP_003668165.1|integrase|DBSCAN-SWA MNGNVRKRGKKWYYRFDIADKDGKRRQYERVGGDSYKEAMHRLRVALELYENTGAVTNTDKISTHDYFEFWYDNYVKTNLSKNTQLNYRHVLDKYVQPTLGIYQLSKVTPELIQKTINKIADSTEYKPDHSRLHGHTVEIILMVIKEGFRQAVHPWHILTQSPAEYVRQPKYNHPKTTREDLKIITLQQFNQLLEQFPLGHPFHLPLLISFYTGMRRGEVAGLEWDNVSLPDAEINVTQQMKQYSKTDVRLGKLKTAASYRTIAIGDQLIHALKVQRRLQNENRLRYGKNYHESNFVCTKENGKPVTPNSIKYYASTVTKELGFPFNFHSLRHTHATMLLEAGASAKEVQVRLGHNKIATTLDTYVHLSNKKKHQTANLLDQIAKM >NZ_CP011024|782606:791810|782606_784472_+|WP_003668169.1|DBSCAN-SWA MASNKIIGIDLGTTNSAVAVMEGNEPKIITNPEGSRTTPSVVSFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTISSIKSHMGEAGYTVEVDGKKYTPQEISAMILQYLKKYAEDYIGDTVTQAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLDVKRIINEPTASSLAYGLDKKDKDEKILVYDLGGGTFDVSILELGDGVFQVLSTNGDTHLGGDDFDQKIMDWLIDGFKEEHGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVQEAQISLPFISAGENGPLHLEKTLSRAQFNQLTNDLVERTKQPVLNALKDADLTFDDIDEVILNGGSTRIPAVQEMVKELTGKEPNHSINPDEAVALGAAIQGGVLTGDVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIDRNTTIPTSKSQIFSTAADNQPAVDIHVLQGERPMAADNKTLGNFQLTDIPAAPRGVPQIKVTFDIDKNGIVNVSAEDQGTHKKQNITIKSNSGLSDEEIERMKKDAEEHAEADKKKKEEVDLKNEVDQELFQVDKTLKEVKGKVPEDDIKKAESARDELKKAKESGNLDEMKAKKDALNKVIQDLSVKLYQQAQGAQGGAANGQPGDSQQNGNDNGNDDNTVDGDFKDVTPDDKK >NZ_CP011024|782606:791810|791648_791810_-|WP_080502980.1|DBSCAN-SWA MGRNSICDYLKGKYEAKQDKLHSLVKALNVDEGWLMGYNINQEKIAILKCQLI >NZ_CP011024|782606:791810|789152_789887_-|WP_003668163.1|DBSCAN-SWA MVNRKIRRSQSEYYDAFIEQLKFLNYAAKLYDSGERTAIKMATPQLRTLFYQQSYGDILINLIPEVNKDQFLSTCQFGEKPIIYGGSVTNAFVAGKYVYLPSCYEKNLEIGHYISFEHWWNGRILIASDTSFTRKELVRFIVNKDGGAHIDPELNEKYYNLKNDIYSLQATKMPNMPGIPFKELHLALLRQVVHETLMSFKKMNFIKDYDPGKNCFNMKNNIFPLHVTQMTINEGKSATPTIYY >NZ_CP011024|782606:791810|785882_787718_+|WP_003668167.1|DBSCAN-SWA MNLEEMKERQKHIRNFSIVAHIDHGKSTLADRILEMTDSISKREMKNQILDDMPLERERGITIKLNAVALTYHAKDGEDYIFHLIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGAVLVVDATQGVEAQTLANVFLALDNDLEILPVINKIDLPSADPEGTKKQIEDEIGLDPDEAVDISAKTGMGVDEVLEKIVKDVPAPTGDLTAPLKALIFDSKYDDYRGVVLSVRVVEGTVKKGDRIKLMNGGTEYEVAEVGINSPKPLARDVLMAGDVGYITAAIKDIKDTRVGDTVTSADNPTDKPLEGYRQMTPMVYAGLYPTDNAKFNDLRDALEKLQLNDAALTFEPESSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNLDLITTAPSVTYHVELADGTTKEVENPAEMPDASSIKAIKEPYVRASIMVPNDYVGPVMELCQRKRGDFDTMEYLSDTRVNVIYHIPLSEIIFDFFDKLKSSTRGYASLDYEIDGYRPSNLVKIDILLNGDKVDALSFIAHRDFAAERGREITAKLKKIIPRQNFEIPIQAAIGSKIIARTNIKAYRKDVTARIHTGDPDRRAKLLDKQKRGKKRMKAVGKVDIPQAAFMAVLKTDEQLDEK >NZ_CP011024|782606:791810|790727_791186_-|WP_003668160.1|DBSCAN-SWA MKFKNIIALSLLGICGGTVTTSLANNNYVYAASTNDDYPDITSKFDVNNMNQYDDSDLFTDVSIKKFYVQSISYDKHHNERIIFTNTPESTNYYFTVLQGRKHKKRIAVGDPITIKGQLNGRLEIEKTQANSWFAKKYFGKNAIMVLTDSYK >NZ_CP011024|782606:791810|784600_785752_+|WP_003665811.1|DBSCAN-SWA MAEQDYYDILGVSKDASEKDIKRAYRRLAAKYHPDVNHEPGAEEKFKKINEAYETLSDSQKRAQYDQFGSAGPQGAGGQGFGGFGGGQAYSNFGGGFDDIFSQFFGGGGRTRRDPTAPRQGRDLQYAMTLDFMDAVFGKTTTIKYDRDAECKTCHGTGAKPGKSPITCPRCHGAGVITSVRQTPLGNMQTQTTCPECNGTGKIIKPEDRCDTCHGAGHVHERHELEVKVPAGVDDGQQMRLQHQGDAGENGGPAGDLYIVFRVTPSREFRRDGSTIYVDRDISFAQAALGDEVKVKTVHGDVNLKIPAGTQSETNFRLRGKGVPHLNGNGNGDEHVTVHVKTPKSLNKRQREAMLAFAAASGEDVKGVKKTVLDKLRDAFEDK >NZ_CP011024|782606:791810|790179_790629_-|WP_003668161.1|DBSCAN-SWA MNKGFKIMLAVGLAGVSLATTTVVVNTNSSNITVVQASKRSRINKAVSIMQEEYGDSADVYYDKENDVIAIKPTDEEFEDEMIAVLDGDESEHDWNKLTKSIDDLSETIYDDCHIKTPIAIVNPENTDKVLYMSYDGESLYDVMHDDNN |
9 | Lactobacillus_phage(28.57%) | integrase | attL 776101:776115|attR 789864:789878 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
848169 : 856234
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP011024|848169:856234|DBSCAN-SWA CATGGCAAACAAAGCAGAATTAGTAAGCAATGTTGCTACTGCAACTGGCTTAACCAAGAAGGATGCTACTGCAGCTGTAGATGCTGTTTTCAGTTCAATTCAAGCATCTTTAGCTAAGGGTGAAAAGGTTCAATTGATCGGCTTCGGTAACTTCGAAGTACGTCAACGTGCTGCACGTAAGGGCCGCAACCCACAAACTGGAGAAGAAATCAACATTCCTGCAAGCAAGGTACCAGCATTCAAGCCTGGTAAAGCTTTAAAGGACGCTGTTAAGTAATTAACAGTTAAATGTTAAAAAGAGACTAGGAAAGAATTTATCCTTCCCAGTCTTTTTTCTTTTTAAAGACTTGTTCAATGCTTAAAATCATCGATTGTGATATATTTAAAAGTGATAGTAAAAGGAGGGCATAATATGACCTACTCAGAACAAATGCTTGATCAATTAGAAGCAGGAAAGTTAAAAGAAGCCCAAAACTCATTTAAACTCGCACTAATTAATGATGATGATGATATGTTATTTAGCCTTGCAGAAGAATTATATGCATTAGGCTTTCTTCAACAGGCACGAACGATTTACTTAAAATTATTAGATCGTTATCCAGATGAAGACGAATTAAAGACTAATTTAGCGACGATTGCAATTGATGAAGGACATAATGACGAAGCTTTATCATACTTAGCCCAGATTAAACCAGACTCGCCAGCTTATGTTCAATCATTACTGGTTGCTGCGGATTTATATCAGACTGAAGAAGAATTTGAAGTGACGGAGGAAAAGTTAAAAGAAGCTTACGCCTTGGCTCCCGATGAACCAGCTGTTGAATTTGCGCTCGGTGAATTTTACTTTATGGTTGGCCAATATTCTGAAGCAATCCAATATTACTTTCAACTAATTAAAAATGGATATACTGACTTTGCGAAAGTTGATATTGCGGGACGTCTAGGGATTTGTTACGCTCAGAGCGGTCAGTTTAAGAAGGCTTTAGGGTACTTCAATCAGGTTAAACCGGAATACCAGACTAGTGATATTCGTTTCCAAAAGGGATTGACCCAACTTCAATTAGGAGATACTGAAAAGGCAATAAAGACTTTAGAGGATCTTATCAACGATGATAACCAATATGCATCCGCTTATCCTGAACTAGCAAAGGCGTATGAAAAGGAAAATAAGTATCAGCAAGCATTACGGGTTGTCCAAGAAGGGCTCAGTGTTGATCAATACAATGAATACCTTTATTCATTAGCAGCTGAAATTACCAGCCACCTTGGCGATCAAAAGTTAATGAAGAAATACTTGGTAAAGGCGCATGAACTTGCTCCAGAGAATATGACGATTACTTTGCAATATAGTAATTTCTTGCTTCACCAACACGATGATGAGGCAAATATTAAACTCCTGAGTCCATTGGTAAAAGAAGATGAAACAGATCCACAATTATATTGGAATCTAACGCGGTCATATCAACGAACTGATCAGCTTGAATTAGCCGGAAAATATTATGAAGCTGCTTTGCCGGCATACAGTGAAAATCCAACATTCTTAAAAGAATTAATTAATTACTACCGCGAAACTGGTGAAACTGATAAGTTAATGGATGAATTGGAACACTATCTTCGGTTAGTCCCAACAGACACTGAAATGCAAGATCTTTATGACCAATATGAAGATTACAAATAATTTTTAATTTAAATGAGACAGGAAACGTTAACGATTTTAACCGTTCTTTACGCTTCCTGTCTCTTTTTAGTAGTAACTTAATTTGTTATAATCAACTTTGATTATCAAAATGAGGACATGATTAAATGAAAATAAAACAATTACCAGCTATATTTGAACCAGCACGACCTGTCTTACAAAAAATAGAGGAGGCTGGCTACGAAGCATATTTTGTTGGCGGTTGTGTCCGTGACACTATCTTGCATGATGAGATTCATGATATAGATATAGCGACGAGTGCTTACCCTAGTGAAATAAAGGCGATTTTTAACCATACTGTTGATACCGGAATTGAACATGGTACAGTTATGATTCTCGACCATGGAACGGGATATGAAACAACTACTTTTAGAACCGAGTCAGGTTACCAAGACTACCGCCGTCCTGATAAAGTAACTTTTGTTCGTTCATTAAGTGAAGATCTCCAGCGTCGAGACTTCACAATCAACGCCCTCGCCTTACGTGAAGATGGGGAAGTTATTGATCTATTTGACGGACTAGAAGACCTGCAAAAACATCTTATTAAAGCGGTTGGCAACCCTAATGAACGTTTTCATGAAGATGCTTTACGGATGATGCGGGCCGTGCGTTTTGCAAGTAAGCTTGATTTTGTCATTGATACTGCAACGTTAAAAGGAATCAAAGAAAATGCACCATTATTAGAAAAAATTGCAGTTGAACGAATCCGGGTTGAGTTAGAAAAACTATTGTTGGGTCAAAATCCAGTAGCGGGCTTAAAAGATTTTATTGCGACTGGATTGTATCAATATTGTCCAGGGTTGGAAAATGCTCAAGCTGCTTTATCGGCTTTATTAATCCTTAACCAATGGCATTTGGAAAATGAGGCTCAATTATGGTCAGTTTTAGGCTTACAACTCCAGCTTGATCAAAAAGAAATTGGTAAATTCTTAAAGAAGTGGAAGACAGCAAATGATTTAATTGCACAGGTCAAAAAAGTAGTTCCAGCAGTCCAAGCAATTCGTCAACGTGCGCTTACACCAACACTAATGTTTAATACCGGTGAAACAGCCCTCCATGATGCTAACCAAGTAGCTAAGTTATATGGATGGGCAATTGATGATGAAGAATTGCAAAAAGCTTATCAAAAGTTACCAATTAAAAACGCTAAAGAATTAGCAATTGATGGTCGAGTATTAATTACCAAAGCGGGGGTAAAACCAGGACCATTGATGGGGAAGATTCTTCAGCAATTAACGCTGGCAGTGGTAAATGGTGAGATAGCTAACAATGCAACAGTCTTATTAGAAAAAGTAGAAGAGATAACGAAAGAGGGATAATATGCAAACAATGCGTGCAGAGGGTCTAACCAGCACATACGGTGAGAAGACCTTATTTGATGATATTTCGTTTATTATCAATGAAAATGATCGAATTGGACTGATTGGTGTTAATGGAAGTGGAAAAACCAGTCTTCTTAACGTAATTAGTGGGGAAGTAAATCCAGAAGGCGGCGGGCAGATCACTAAGCCTAATGATTACACGATCGGTTATTTAAAACAGCAGCCTGAACTTGATGAAAATAAAACAATCATGGAAGCTGTTTTTGAAGGTAAACAACCAGTCTTTGAAACAATTCGTCAATATGAGCTGGCTCTTGAACGTTTTACAAAGCATCCAGAAGATCCACAAGCAATCGACCGTTACACAAAAATGCAGGCACGGATGGACCAAGAAGATGCATGGGAGGCAGATAGTCGGGTGAAGACGATTCTGACCCAGTTAAAGATAAAAGATGTAAGTCAAAAGATTGCTCAACTTTCTGGAGGACAAAAGAAACGGGTTGGGTTAGCGCAAGTCTTAATTCAACAGCCAGACCTCTTATTGCTCGATGAACCGACTAACCACTTAGACCTTGATTCGGTAGTTTGGCTCCAGGATTTCCTTCGCAGTTATAAGGGTGCTGTCCTCGTTGTTACCCATGATCGGTACTTCCTTGATCAAATTACAAATCATATCTGGGAGCTATCTTTTGGTAAACTTTATCACTACGAGGGAAATTATCAGGACTTTGTAGCAAAAAAGGCGGAACGAGTAGAGTTAGCTAAAGATACTGAGAAAAAGAATCAACAGCTGTATAAAAAAGAATTAGCCTGGATGCGGACAGGTGCAAAAGCCCGTTCTACAAAACAAAAGGGACGGATCAATCGGTTCCACGAATTAGAAGGAAAAATCGGTAATCTTAAAACCGATGAAGATATTGCTATCAATCTTGGATCACAACGTCTAGGGAAAGATGTTATTCAATTTAAGGATGCTAACTTAAAATTTGATAATCACCAAATCCTCCATGACTTCAATTGGCTTGTTCAGGCAGGCGATCGAATTGGAATTACTGGTGAAAACGGAGCGGGTAAGACGAGTTTATTAAATGTGATTGCCCAACGTGTTCCCCTAGATAGTGGTGTCCTTAAGATTGGGGAAACCGTTAAGTTAGGGTATTATACCCAGCAAACAGAAGGAATTGACAATGATAAGCGGATGATTAGTTTCTTGTCTGAAATTGCTGATAATGTTACTGATAAAGATGGCAATAAGCTCAGCGTTACCCAATTATTAGAACGCTTCTTATTCCCTCGTTTTATGCATGGTACTTTGATCCGAAAACTTTCTGGGGGTGAAAAGCGGCGATTATACCTCTTAAAGATCTTAATGCAGCAGCCCAATGTCTTATTACTAGATGAGCCAACTAACGACCTTGATATTGGAACATTGACAGTTCTTGAAGATTACCTAGATAATTTTGCGGGAACTGTAATTACGGTTTCTCATGATCGCTATTTCTTAGATAAAGTGGCTGACAACTTGCTAGTCTTCAACGGGAATGGAGATATTGAGCGTTATACGGGACGCTTTACTGATTATCTAACTGCTAAAAAGGAAGAGGCAGATAAGGATAAAGGGCTTAAAAATGATCAAAAAGCCCTTGCCAAAAAGCAGGTAAATAAGCAAGAACCAGCTAAGAAAGAAAAAACAAAACTTACTTATGCTGAACAACTTGAGTGGGATCATATTGATGAAGAATTAGATGCCCTTGATCAACAGCATCAGCAATTAGAAAATGAAATGGCTGAAGCAGCAAGCGATTATACGAAAATTGCTAAGTTACAGAAGCAGCTAAATGAAATACAAGAAAAAATTGATGAAAAGACAGCTCGTTGGGAGTATTTAAGCACATACGTTGACGAGTAAAGGAAGGGACAAATAAGGATGGCAACAAATGTAAATGAAGAGCAATACTTAGACTTAATCCGTTATGTTTTGGCGAATGGACATCAAAAGGGTGATCGGACAGGAACAGGTACTAAATCTGTTTTCGGATATCAGATGCGATTTGACCTAAGCAAAGGTTTTCCTATTTTAACGACTAAGAAAGTCCCATTTGGCTTGATTAAGAGTGAATTACTATGGTTTTTACGCGGTGATACCAACATTCGCTTCTTACTTCAACACAAGAATCATATTTGGGATGAATGGGCATTTAAGAAGTGGGTGGAAAGTGATGAATATCAAGGTCCAGATATGACGGACTTTGGTCACCGCTGGCTTAAAGATCCAGAGTTTAAGCAGGTCTATCTTCAAGAAAAGAAGGCTTTCTGTCAGCGAATTCTTGAAGATGATGATTTTGCCCAAAAATATGGCGACTTAGGACTTGTTTATGGAAGTCAGTGGCGAAAATGGAAGACGAGTCAAGGCGACACAATTGATCAAATTGCTAATGTTATCCAGCAGATTAAAACTACTCCGGATTCACGACGGATGATTGTTTCGGCTTGGAATCCAGAAGATGTTCCTTCTATGGCTCTCCCTCCATGTCACACCATGTTCCAATTTTATGTTAATGATGGAAAGCTTAGTTGTCAGCTCTATCAACGGAGTGCCGACATCTTTTTAGGGGTTCCATTCAATATCGCTAGTTATGCCTTATTGACGCATATGATTGCTCACCAATGCGGTTTAGAACCTGGCGAGTTTGTTCATACATTAGGGGATGCTCACATTTATCTGAACCATCTTGATCAAGTTAAAGAACAGCTGACAAGAACACCTCATGAAGCTCCTAAATTGATTTTACCTGCTGAACCAAAACCAATCGATCAATATGAAATGACTGATATTAAGTTAGAAGGCTATACTCATGAGCCGGCAATCAAGGCTCCCGTAGCAGTTTAAAAGGAGTGGTTCAAAATGAGTGAGCTGAATTTAATCTGGGCCGAAGATTTAAATGGCTGGATTGGCAAAGATAATACAATTCCATGGCATGTTTCTGCTGATATGAAGCATTTTAAGACAAAGACTACTGGTCACCCAATTATAATGGGGCGAAGAACTTTTGCCTCACTTGGCAATAAACCGTTGCCTAAGCGGGAAAATATTGTGCTTACCAGTAGGAACATAGATGCTGAAGGAGTGGAAGTCGTTCATTCTTTAGCTGCCCTTAAAGAATATCTTAAAGCAAATCCAAACGAATATTTTGTAATCGGTGGGGCAACGATCTATCAGCAATTACTTCCAATGGCGACAAAGCTAACACGAACGGTGATAAATAAGCAAATTGTTGGAGATACAAAAATGCCAACGATCGATTATGACCGTTGGCACTTAGTAAATCACAATAATTATGAAAAAGATGACCAGCTAATTTGTCGTTTTGAAGAATGGGAACTAAACGTATAAAAGAATTGAAAAATACATTAATATCGTGCCGATGAGGACAAAAATATGCCAAATCAAATGGGTATATGCCGTTGGACGACTGTAAAAGAGGGCCCCAAGAGTAAAGGAAAGTCCTCCTAGTAAAAGCAAGCCGAAGCCAACTGGACCAAGTGCACGCCAGAGAGGCATGAAGGCGACTAGACATAGCCAGCCCATAAGAATGTAAATAATGGTTGAATATTTACTTTTATGTTTTAACCAAATACATTTATACACGATTCCGATAACGGATAGGCCCCAAATCACTCCGAAAATTGTCCAACCTAACCAGCCGCGAATGCTAACTAAGCAATAGGGGGTATAAGTTGCGGCAATAAGCACAAAGATCATTGAATGGTCGAGAATTTGAAAAACCCGTTTGGCTCGTGTAAAGATCAAGGCATGAAATAAGGTTGACGAAAGGTAAAAAAGAATTAAAGCACTTCCGTAAATAGTAAAGGTAACAATTCGCATGGGACTACCAGTATGAACAGCTCTAATAATTAACAAGATCAAGCCAGCGATCGATAGTCCTGCCCCGATCCCATGAGTAACCGCATTACCTATTTCTATTAACAAAGTACGCCGATCTCTTGTCTCTTTTTGTGTATCCATCAAAAAACCCCTTTCCAAAGACCAATGAATTTTTAAAATATTTTTGTTATACTAAATAAATAGTAATTGATCCTACAAAATTAGATAAAATTTAGTATAATAGTACTTGAAATAAAATATCTAGTTCTCAATACTAGATAATTATAGCACAAATTGTTCAGGAAGAGTGGTAAGTTTCATGGCAAAGATAAAAATTGTTTGTGACTCATCAGCAGGATTAACTGATGAAGAAATTAAAAAATATGACATTACAATTATACCATTAAGTGTAATGATCGATGGGACGGTATACGTTGAGCGTGAAACAATTACAAACGAACAGTTCCCTGAAATGATGAAGAATGCTAAGTCACTACCAAAGACTTCCCAACCACCAATTGGAAAGTTTGTCGATGCGTTTGATAAGCTAGGCGAAGATGGTAGCGAAGTATTATGCGTTACAATGATGGAATCAATTAGTGGGACCGTCCACGCGGCTGAACAAGCGGCTGGAATGACGAAGACAAAAGTTACAGTCTACGATTCTCAAACGACTGATCGGGCAATGGCTTTTCAAATCATTGAAGCGGCAAAGGTAATTGAAAATGGTGGCTCAGTTCAAGAGGCTATTGAACGAATGAAGTATATATTTGATCATTCAAAAGTTTATTTGGCAATTGATAACTTAGATAATTTAGTTGCTGGGGGCCGAATTAGTAAGTTTGCTGGTGCTTTGTCTAACTTACTAAATATCAAAGTGATGCTTCAAATTGCTGATGGACAAATCCATATTATTATGAAGGGACGAGGAAAGAAAGCTCTTCATAAGGAATGGGATCGAATCTTGAATGAAATGAAGAATGGGCCAAAAGTTATGGGTGCCGGAATCTCCCATGTTGAAGGGAATAGTGAGGTTAATCGTCTTCTAACAAAGATCAAGGCATTTGAGCCTAACTTAGACATCGTTGTTCGAGAGACAGTGCCAATTATTGCAACCCACACTGGAATGGGTGCTTGTTGTTTGCTATACTATACGGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP011024|848169:856234|849971_851183_+|WP_003668104.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKIKQLPAIFEPARPVLQKIEEAGYEAYFVGGCVRDTILHDEIHDIDIATSAYPSEIKAIFNHTVDTGIEHGTVMILDHGTGYETTTFRTESGYQDYRRPDKVTFVRSLSEDLQRRDFTINALALREDGEVIDLFDGLEDLQKHLIKAVGNPNERFHEDALRMMRAVRFASKLDFVIDTATLKGIKENAPLLEKIAVERIRVELEKLLLGQNPVAGLKDFIATGLYQYCPGLENAQAALSALLILNQWHLENEAQLWSVLGLQLQLDQKEIGKFLKKWKTANDLIAQVKKVVPAVQAIRQRALTPTLMFNTGETALHDANQVAKLYGWAIDDEELQKAYQKLPIKNAKELAIDGRVLITKAGVKPGPLMGKILQQLTLAVVNGEIANNATVLLEKVEEITKEG >NZ_CP011024|848169:856234|855391_856234_+|WP_003668100.1|DBSCAN-SWA MAKIKIVCDSSAGLTDEEIKKYDITIIPLSVMIDGTVYVERETITNEQFPEMMKNAKSLPKTSQPPIGKFVDAFDKLGEDGSEVLCVTMMESISGTVHAAEQAAGMTKTKVTVYDSQTTDRAMAFQIIEAAKVIENGGSVQEAIERMKYIFDHSKVYLAIDNLDNLVAGGRISKFAGALSNLLNIKVMLQIADGQIHIIMKGRGKKALHKEWDRILNEMKNGPKVMGAGISHVEGNSEVNRLLTKIKAFEPNLDIVVRETVPIIATHTGMGACCLLYYTE >NZ_CP011024|848169:856234|854091_854580_+|WP_003666061.1|DBSCAN-SWA MSELNLIWAEDLNGWIGKDNTIPWHVSADMKHFKTKTTGHPIIMGRRTFASLGNKPLPKRENIVLTSRNIDAEGVEVVHSLAALKEYLKANPNEYFVIGGATIYQQLLPMATKLTRTVINKQIVGDTKMPTIDYDRWHLVNHNNYEKDDQLICRFEEWELNV >NZ_CP011024|848169:856234|853113_854076_+|WP_003668102.1|DBSCAN-SWA MATNVNEEQYLDLIRYVLANGHQKGDRTGTGTKSVFGYQMRFDLSKGFPILTTKKVPFGLIKSELLWFLRGDTNIRFLLQHKNHIWDEWAFKKWVESDEYQGPDMTDFGHRWLKDPEFKQVYLQEKKAFCQRILEDDDFAQKYGDLGLVYGSQWRKWKTSQGDTIDQIANVIQQIKTTPDSRRMIVSAWNPEDVPSMALPPCHTMFQFYVNDGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTHMIAHQCGLEPGEFVHTLGDAHIYLNHLDQVKEQLTRTPHEAPKLILPAEPKPIDQYEMTDIKLEGYTHEPAIKAPVAV >NZ_CP011024|848169:856234|851184_853095_+|WP_003668103.1|DBSCAN-SWA MQTMRAEGLTSTYGEKTLFDDISFIINENDRIGLIGVNGSGKTSLLNVISGEVNPEGGGQITKPNDYTIGYLKQQPELDENKTIMEAVFEGKQPVFETIRQYELALERFTKHPEDPQAIDRYTKMQARMDQEDAWEADSRVKTILTQLKIKDVSQKIAQLSGGQKKRVGLAQVLIQQPDLLLLDEPTNHLDLDSVVWLQDFLRSYKGAVLVVTHDRYFLDQITNHIWELSFGKLYHYEGNYQDFVAKKAERVELAKDTEKKNQQLYKKELAWMRTGAKARSTKQKGRINRFHELEGKIGNLKTDEDIAINLGSQRLGKDVIQFKDANLKFDNHQILHDFNWLVQAGDRIGITGENGAGKTSLLNVIAQRVPLDSGVLKIGETVKLGYYTQQTEGIDNDKRMISFLSEIADNVTDKDGNKLSVTQLLERFLFPRFMHGTLIRKLSGGEKRRLYLLKILMQQPNVLLLDEPTNDLDIGTLTVLEDYLDNFAGTVITVSHDRYFLDKVADNLLVFNGNGDIERYTGRFTDYLTAKKEEADKDKGLKNDQKALAKKQVNKQEPAKKEKTKLTYAEQLEWDHIDEELDALDQQHQQLENEMAEAASDYTKIAKLQKQLNEIQEKIDEKTARWEYLSTYVDE >NZ_CP011024|848169:856234|848169_848445_+|WP_003666054.1|DBSCAN-SWA MANKAELVSNVATATGLTKKDATAAVDAVFSSIQASLAKGEKVQLIGFGNFEVRQRAARKGRNPQTGEEINIPASKVPAFKPGKALKDAVK >NZ_CP011024|848169:856234|848580_849846_+|WP_011953444.1|DBSCAN-SWA MTYSEQMLDQLEAGKLKEAQNSFKLALINDDDDMLFSLAEELYALGFLQQARTIYLKLLDRYPDEDELKTNLATIAIDEGHNDEALSYLAQIKPDSPAYVQSLLVAADLYQTEEEFEVTEEKLKEAYALAPDEPAVEFALGEFYFMVGQYSEAIQYYFQLIKNGYTDFAKVDIAGRLGICYAQSGQFKKALGYFNQVKPEYQTSDIRFQKGLTQLQLGDTEKAIKTLEDLINDDNQYASAYPELAKAYEKENKYQQALRVVQEGLSVDQYNEYLYSLAAEITSHLGDQKLMKKYLVKAHELAPENMTITLQYSNFLLHQHDDEANIKLLSPLVKEDETDPQLYWNLTRSYQRTDQLELAGKYYEAALPAYSENPTFLKELINYYRETGETDKLMDELEHYLRLVPTDTEMQDLYDQYEDYK >NZ_CP011024|848169:856234|854568_855213_-|WP_003666062.1|DBSCAN-SWA MDTQKETRDRRTLLIEIGNAVTHGIGAGLSIAGLILLIIRAVHTGSPMRIVTFTIYGSALILFYLSSTLFHALIFTRAKRVFQILDHSMIFVLIAATYTPYCLVSIRGWLGWTIFGVIWGLSVIGIVYKCIWLKHKSKYSTIIYILMGWLCLVAFMPLWRALGPVGFGLLLLGGLSFTLGALFYSRPTAYTHLIWHIFVLIGTILMYFSILLYV |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
870885 : 909568
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP011024|870885:909568|DBSCAN-SWA ATTAGAAAAAAGGTGAAAGTTGTTCTTCTGTGACATGACTCAAGAATACTTCTAATGGTGTACGATAATTAAGAGATTTTCGTGGGATATTGTTGCGACGATGCATTAGCTGAGTGACTAGTTCGTCTGGTAAATCGCGAAAATCTAGCTTTTTACTAAGACCATCACGACGCAAGAGGCCGTTATTATTTTCGTTTAACCCTCGTTGATTGGGAGCACCGACTTCCGCAAAATAGGTGTGAAGATCATACTTATTGGCTATTTCTCGCCATCCAGCAAATTCTTTCCCGTTATCAAAAGTAATTGATTTAACAAAGTGACGTGGCAGTTTAGCGAGCCATTGATCAAGCTGGCAATTCACTGCTTCGTCTGTTTTATGATGAATATTAAGGACAATCATTACTTTGGATTGTCGCTCTACTAGCGTCATTACCGCTCCGCGGTGAGCTTTACCTTGAACTGTATCAGCTTCAAAGTGCCCAAATTCATGTTGGTAATGCGGAAAATCACGATATCGTTGATAGATACTGCGTCCTAATTGGCCAGCTTTACCACGATGTTCCACATAGCCATTGGGATGGCGTTTTCCTTTCATCGGTAGCTGTTTAACGGAAAAGCCATACTGATTGCGGGCAAACATGCGATAAAGGGTGCGCATACTGCAGCTAATTGGGTGTTCATGACGACCAATAATAGTATCAGGAGTCCAACCTGCCTTGATTTGCGCATGGATATAGTTAACTTCGATAGTTGGCAGTTGGGTCTGCTTCCGACCACAACGACGCTTATGTCGCTGATAAGTCTGAAGATATTGGTCGATGGTTTTACCGTCGTTGAGGAAACGATAAACACGATAGATGGTTTCTTGACTACGCTGAAGTAATTTAGCAGCCCGATAAGCTTTAGTACCTTGATACCAAAAATCAGCTATGAGAGTTAATTCACGTGTGGTAAGATGTTTATAGGTCATTTGTGATTGCCTTTCTTTTGATTAGGGATATTCAAAAGTCTATCACAAATGGCTTTTTATTTTTTCTAACTTAATTTTACAAACGACGAAATTAAAAACTGAGGAAAATCGCAAAATTTTTCTCAGTTTTTTTGAGCTTTAAATTTCAAAGCTTATTCTTAATTAGTTAAAATATAAGTACTGATTTTAAGAAATGGGGTTGATATTAATGAATATCACATTTACTGATCAAGCTATTGAACGTTTACAGCGTTATGAATTATCTTCTAAGAAGATGCTCCTAGATTTTGATGATGGGGTGGGCCCATTTTCTGCCGTTGGGAGTTGCAGTTTAGATGGTGATTATCGACTAATCCTTGTTAAAGAGGATTTAGATACCCCAGATTATAATGAAAAAATTACCTCTAATTTGGGGGATGTTTTTATTAAAGACCATACAGCAGTTCAATTTGATGATGAAATGGAAGTAAGGTTTAATCCGCGATACTTTACAATGCCACTTGTCAGTCCTAAACGCGTTTTAACGGATAATCTTGAAGTTCTGGATCTTAGTAAGACAGACTTAAATTCTCAAATTGATCGAGCGCATGATTGCTAACAATATAATAAGGGAGCGTGATAGAAGCCAGATACGACTTCATGATCATGCTCCCTTATTGCTTTTAAAGGATAATCCTGAAAATAAAAGTGATGATAATTGCAAAAATTCCAATAATCGTTGCATAGGAAAAATGTTTACGTTGAGCTGGTTTAATTAATGCTTGCCTCCCCCATGAAAATTGTGAATAAAGCCCATAAAAAAGCGGCAATAAGCAAAATATATAATTTCCAGTTAATTGGAAGATGATGGTAAAAATCGCCATAAAATACCATCATGCCGATAAACATCACAATAGCATAGGCATAGTTATCGCGGTGAAAGTTAAAATTAAAAAGATAAGCAAACGCGCAAAATAATAAAATACTAATAATATCGTTTAAAATCATACCCTCTACACACTTCCTTATGGTTTTTATTATAGTCATTAACAGGATAAAGATAAAATATTAAGAAGCAATCGCAAATAATATGATATGATGGTCTTGTTAGAATTAATGAAGGCGGTGCTTACAGTGAAGAAAAAAGCTATGCGACGAGAAATAAAATTATTAACTGAAGAAAATCAACAATTACGTCGATATACCTTACTAGCATCAATCGGAATTTTATTAAGTATGATGATTGGGTTAGTTCGAATGGTTCAAAAAAATTAGTTAGGAAATTTTTTAGAGGGAAGTATAGTGGAGTTAGGATACCGAAAAGCGACACTTGAAGATTTACCAAAAATTGTTGAAATTTATAACCAAATTATTCCGTCAAGGTTAGCGACTGCAGATCTTACTCCGATAACGGTTGAGAAACGGAAAGAGTGGTTTGAAGCGTTTGACGAAAATTATCCAATCTGGGTAATTGAATATCAAAAAGAGGTTCTCGGGTGGGTTGCCCTTGAGCACTTTTATGGTCGTCCAGCCTATGATCATACTAGTGAAATTGCCATTTACCTTGATCAACGGTTACGGAAACAAGGGGTTGGTACAAAAACCATGGAATTTATTATCGGTCAATTGCCTAAATTAACAGTTGATACAATCGTGGCTTATATCTTTGGTCATAATATTCCAAGCCTAAAGTTATTTAAATCGTTTGGTTTTACGCAATGGGGGCTTTTACCACAAGTAGCAGAGCTTGATGGGATTAAACGTGATTTAGTTATTTTAGGACGTCATTTTAAATGATTATTGTGTAAATATGACATAAGTAAAGCCACGTCCATAAGAAGTAACCAGAATAGGCCTCCAACGCCCGGTAAAGCCGAATGCTGGAGGCCTATGGTGCATATGAGAGCTTCGTATTGAAAACGAAGGTGCCCGTGATGCTTTGCTCGTTCCCTTATTTTGTATCTTTTTTTACTTCTTCTTTTGTTTTAACATCATTGATATGTAGCTCAAACTTAACTAAATTTAAACCAGTCATCTTATCGATTGCACGCTGCACCTCAGAACAAACAGCCTTAAAAATTTCTGGAGCACTTTTACCATATTCGATGGTAGCTTCCATTTTTAATGCGACTTGCTTTTCACCAACATCAGCATCGATTCCCTTTGTTGGATTGCTTCCGGAAGTTACTTTATCTGCTAATTCACTAAACATATTTCCGTCGAGGGAAAGGATCCCAGGGACTTTGCTAGCGGTAATTCCAGCAATTTTTTCAATTACCTGATCATCAAATGTTAATTGTTCATCAATTGTTTTATTATTTGTAGTGGTTGTCATATTAATTCCTCCTTGAATTAGTTGGCAAATTTATCTAACATTTTTATCGCGAGTTTATTTAATGAATAGCCTTTTGCATCAAGAACATAGCCAATTCCGCCTAAGATAGTGACAGCTAACAGAATGCCAATCATTGGGAAAAAGCCCCACATAATCCAACTAATGCTGATAAGCAGTCCTAAGATAACGCCAATTGTAGCAAGTTTCATAGTGTACCTCCTTTTTAGACAATGTTAACTGATTCTTTGTTTGAGTATGGACTTAACTTAATATGTAATTTATTAAGATCAATGTCGAAGTCTCGTTTAAGGTTTTCTTTAATTGTCTGGAGTAGTACTGTATGAATTAGTTTTGGATTGGTTCTATTGGACATCATTCCGTGAATGGTAACATCTGCATTATGATTGTTACGGTGCATTTTGAGTTTAATTACTGGGTTATAAAGGTCAAATTTAGCAATTGAAGTAGTTAAGCTATGTTCAACTGCATGTTGATCAATTTGAACTTTATTAGCACCATCCTTAGCGATTGTCATTTGTTTAGTCGTTGTTGGGCGAAAAACGGCAATTGCTATTACGGTTAAAGCAACGATAATTAAAAATACTGCGACTCCGGCTGAGAAACTTTGACCGATGGGGCTGTGAAGCCAATCGTTAACTGGAATCGTCCAAGTTTGGTCACGATAAAACCATAATGATACGACAACGATTCCAATAATTACCTGAAGCATCATCACAAATGAAACCCACCATTTTTTCCATGCGGCCATTAGTACCACTTCCTTTCTATAAATGTTTTTTTGCTATGAATTAATAATAACATAAGAGAAAGCGTTTTACGTTGATTACAAAAATGCTAAAGGTAATATTAAGAACCTATTAACAGAATAGTCATAATTAAAAATCGATCTTACAATCATGTTCCGATGTAAGATCGATTTTTAATTCTTTAATTATTTTGGCGCTCTTGTAGTTTGGCAATTTCAGAATAAGCAGGGGCAAGCATATCTTCAATTTGTTGGAAGAGTGGAGTATAACGTTGATATACTTTTACTGCGGTTGGATCTGGTTGGTAAGAACTGACCTTACCAATGAACTTTTGTGGTGTATCAAGACTATCGATCATTCCCAAACTTTGCATAGCCATAACTACTGATCCAAGGCAGCCTGATTCAAATGAGTCTGGAACATTAACAGGACAGTTTAAGATATCGGCAAGCATTTGACGCCATACTTTTGAACGGGCAAAGCCACCTGTTGCGGTAACGCTTGCTGGTTCGCCAACTAAAGCCCGTACTGCTTGGAAGACTGTTGCAATATTCATGCTAATTCCTTCCATGACTGCCCGTAGCATATCAGCCCGTGTATGAATATGAGAAAGGCCAAAGAAACTACCGCGCGCTTTGGCATTCCACAATGGCGCCCGTTCACCGCCCAGGAAGGGATGGAAGAGAAGTCCATGTGCCCCTGCTGGTACTCCTTCAATAACGTGATTTGCTAAAGTATAAGGATCCACCTGTTCGTTCTTAACAGCGCTACTATCGACAAGGTGTTTTACTGCCCATTCATAGACATCGCCACCGTTATTAAGCGGGCCACCAACGACCCACAATCCTTTATTAATAGCATAGCAGAAGAGGCGTCGTTCTGGATCAATAACAGGATGGTCAGTTACGACTCGTACAGCTGCAGAAGTGCCAATTGTAATTGCTACTGT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58 | Lactobacillus_phage(46.67%) | terminase,head,transposase,portal,tail,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1040703 : 1096923
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP011024|1040703:1096923|DBSCAN-SWA 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50 | Lactococcus_phage(20.0%) | integrase,transposase | attL 1032917:1032934|attR 1106478:1106495 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1100931 : 1173889
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP011024|1100931:1173889|DBSCAN-SWA 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56 | Lactobacillus_phage(21.43%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1326773 : 1392457
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP011024|1326773:1392457|DBSCAN-SWA 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57 | Enterococcus_phage(26.67%) | protease,tRNA,integrase,transposase | attL 1387735:1387754|attR 1397642:1397661 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1638004 : 1657231
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP011024|1638004:1657231|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP011024|1638004:1657231|1646832_1647420_-|WP_003668972.1|DBSCAN-SWA MKKLMEVLAIASLGVALTGCGNQSTQSSSNTAKTNSEASSSQSTATTNNTSSSESHHDSSLWNNQKNEQLASFMQKWGPTMHQSYEQYDGQNELKVSTGITYPDGLSKELVEGQSGLIGWAPSGKGDYEYNVVAIYNHDGTEPPLPNRITYFFAFHNGKPVVLVDQSNNGDPDCHPTTNMDLESNFERIATESTK >NZ_CP011024|1638004:1657231|1656013_1657231_-|WP_003668983.1|integrase|DBSCAN-SWA MIVLAKTKYPDVYVDNKGHYYYLVELGHDLLTGKRIQKKSRRDANNNRFRSAHDAYKECLRIKNEYQSQNGYANYGLLYGDFMENYYIPSYKSDVEHSTFKSRQSIFKHLINWFGQYKLRSIRSIDCEKFRVYLLNKSGYSQGFSSMVYGLFRNTLDYAVRMDFLTKNPSRKTKAINKGKSNVEFWTKSEFEKVLSVIYTKDYYQHMCFTILYLYFTCGMRVSEGLALTYDDVDYKRHRLRINKTLDMTNKEHYTIKPYTKTINGIRTISLDNDTIRVLKSWQKDQQAHGVYHFIMSYDDTPMSRTTIPLIIKRFAKIAGVKPIQAKGLRHSNVSYLINEFNADVLTVSRRLGHSGPDITLKYYSHLWPHNDESIADKMEGNIIFKNAKENKLAFNGNQHLHSTK >NZ_CP011024|1638004:1657231|1638004_1638691_-|WP_003668960.1|protease|DBSCAN-SWA 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MQKKTKVIISVLVAVMVVIGGFYLYASRTVAKRLPGHVYEYTSVSGNQNAYMTFATSGDQVVVTPDKDTAIKASNSASDFQQAYQDNAEDGKWNYKAQGNRLTLSKLQDGKVSMWQYNHMLALGKKMRSGNFTYQIANAGQGIDHKATKFEQIR |
19 | Streptococcus_phage(40.0%) | protease,integrase,transposase | attL 1640739:1640753|attR 1668395:1668409 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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