CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP012009	Leuconostoc mesenteroides subsp. dextranicum strain DSM 20484 chromosome, complete genome	2 crisprs	DEDDh,cas3,csa3	0	1	10	0
NZ_CP012010	Leuconostoc mesenteroides subsp. dextranicum strain DSM 20484 plasmid pDSM20484, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0

1. NZ_CP012009

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP012009_1

• CRISPR_ID: NZ_CP012009_1
• CRISPR_location: 532345-532466
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of NZ_CP012009_1

Consensus_repeat	Method
TGTTGTTGAGGCTGCTTGTGTTG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP012009_1

>1.1|532368|28|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder
AAGTTGAAGCTGTGTTATAAGTTGAAGA
>1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder
TTGATGAAGTATCAGCAGCAGCTGT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012009_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP012009_1

>merge|NZ_CP012009|1|532345-532466|CRISPRCasFinder
TGTTGTTGAAGCTGTTTGTGTTGAAGTTGAAGCTGTGTTATAAGTTGAAGATGTTGTTGAGGCTGCTTGTGTTGTTGATGAAGTATCAGCAGCAGCTGTTGTTGTTGAGGCTGCTTGTGTTG

>NZ_CP012009|1|1|532345-532466|CRISPRCasFinder
TGTTGTTGAAGCTGTTTGTGTTG	AAGTTGAAGCTGTGTTATAAGTTGAAGA
TGTTGTTGAGGCTGCTTGTGTTG	TTGATGAAGTATCAGCAGCAGCTGT
TGTTGTTGAGGCTGCTTGTGTTG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP012009.1|WP_048592449.1|539036_539762_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-A	unknown	unknown	gnl|CDD|235617
NZ_CP012009.1|WP_002815612.1|528114_528258_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP012009.1|WP_048592450.1|541517_542231_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase	unknown	unknown	gnl|CDD|184516
NZ_CP012009.1|WP_011680437.1|540119_541391_-|uracil-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|236744
NZ_CP012009.1|WP_002815607.1|522940_523960_-|tryptophan--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|183400
NZ_CP012009.1|WP_048592444.1|530763_532008_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|240086
NZ_CP012009.1|WP_002815630.1|538636_538864_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-C	unknown	unknown	gnl|CDD|349425
NZ_CP012009.1|WP_048592447.1|537552_538095_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-delta	unknown	unknown	gnl|CDD|365949
NZ_CP012009.1|WP_014325137.1|526997_528026_-|A/G-specific-adenine-glycosylase	unknown	unknown	gnl|CDD|224115
NZ_CP012009.1|WP_002815619.1|529796_530564_+|pyrroline-5-carboxylate-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|223422
NZ_CP012009.1|WP_048592443.1|528342_529740_+|multidrug-efflux-MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|129794
NZ_CP012009.1|WP_048592441.1|521523_522855_-|amino-acid-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|183096
NZ_CP012009.1|WP_002815624.1|533536_534937_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta	unknown	unknown	gnl|CDD|236447
NZ_CP012009.1|WP_048592442.1|525904_527014_-|AI-2E-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|223701
NZ_CP012009.1|WP_002815626.1|536022_537540_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-alpha	unknown	unknown	gnl|CDD|236448
NZ_CP012009.1|WP_048592448.1|538106_538610_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-B	unknown	unknown	gnl|CDD|180240
NZ_CP012009.1|WP_011680422.1|520116_521295_+|LCP-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|181811
NZ_CP012009.1|WP_025268503.1|524253_525555_+|GTPase-HflX	unknown	unknown	gnl|CDD|274455
NZ_CP012009.1|WP_011680434.1|535099_536008_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-gamma	unknown	unknown	gnl|CDD|235535
NZ_CP012009.1|WP_048592446.1|533078_533522_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-epsilon	unknown	unknown	gnl|CDD|234796

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP012009.1|WP_048592449.1|539036_539762_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-A	gnl|CDD|235617	PRK05815, PRK05815, F0F1 ATP synthase subunit A; Validated.	4.31093e-59
NZ_CP012009.1|WP_048592450.1|541517_542231_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase	gnl|CDD|184516	PRK14115, gpmA, 2,3-diphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase.	3.63338e-133
NZ_CP012009.1|WP_011680437.1|540119_541391_-|uracil-transporter	gnl|CDD|236744	PRK10720, PRK10720, uracil transporter; Provisional.	1.77818e-134
NZ_CP012009.1|WP_002815607.1|522940_523960_-|tryptophan--tRNA-ligase	gnl|CDD|183400	PRK12282, PRK12282, tryptophanyl-tRNA synthetase II; Reviewed.	0
NZ_CP012009.1|WP_048592444.1|530763_532008_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase	gnl|CDD|240086	cd04735, OYE_like_4_FMN, Old yellow enzyme (OYE)-related FMN binding domain, group 4. Each monomer of OYE contains FMN as a non-covalently bound cofactor, uses NADPH as a reducing agent with oxygens, quinones, and alpha,beta-unsaturated aldehydes and ketones, and can act as electron acceptors in the catalytic reaction. Other members of OYE family include trimethylamine dehydrogenase, 2,4-dienoyl-CoA reductase, enoate reductase, pentaerythriol tetranitrate reductase, xenobiotic reductase, and morphinone reductase.	1.08772e-159
NZ_CP012009.1|WP_048592447.1|537552_538095_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-delta	gnl|CDD|365949	pfam00213, OSCP, ATP synthase delta (OSCP) subunit. The ATP D subunit from E. coli is the same as the OSCP subunit which is this family. The ATP D subunit from metazoa are found in family pfam00401.	3.30848e-46
NZ_CP012009.1|WP_025268503.1|524253_525555_+|GTPase-HflX	gnl|CDD|274455	TIGR03156, GTP_HflX, GTP-binding protein HflX. This protein family is one of a number of homologous small, well-conserved GTP-binding proteins with pleiotropic effects. Bacterial members are designated HflX, following the naming convention in Escherichia coli where HflX is encoded immediately downstream of the RNA chaperone Hfq, and immediately upstream of HflKC, a membrane-associated protease pair with an important housekeeping function. Over large numbers of other bacterial genomes, the pairing with hfq is more significant than with hflK and hlfC. The gene from Homo sapiens in this family has been named PGPL (pseudoautosomal GTP-binding protein-like). [Unknown function, General].	7.99251e-156
NZ_CP012009.1|WP_002815619.1|529796_530564_+|pyrroline-5-carboxylate-reductase	gnl|CDD|223422	COG0345, ProC, Pyrroline-5-carboxylate reductase [Amino acid transport and metabolism].	8.00531e-65
NZ_CP012009.1|WP_048592443.1|528342_529740_+|multidrug-efflux-MFS-transporter	gnl|CDD|129794	TIGR00711, Uncharacterized_MFS-type_transporter_YhcA, drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily. This subfamily of drug efflux proteins, a part of the major faciliator family, is predicted to have 14 potential membrane-spanning regions. Members with known activities include EmrB (multiple drug resistance efflux pump) in E. coli, FarB (antibacterial fatty acid resistance) in Neisseria gonorrhoeae, TcmA (tetracenomycin C resistance) in Streptomyces glaucescens, etc. In most cases, the efflux pump is described as having a second component encoded in the same operon, such as EmrA of E. coli. [Cellular processes, Toxin production and resistance, Transport and binding proteins, Other].	1.21827e-90
NZ_CP012009.1|WP_048592441.1|521523_522855_-|amino-acid-permease	gnl|CDD|183096	PRK11357, frlA, amino acid permease.	2.98853e-44
NZ_CP012009.1|WP_048592448.1|538106_538610_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-B	gnl|CDD|180240	PRK05759, PRK05759, F0F1 ATP synthase subunit B; Validated.	3.11677e-33
NZ_CP012009.1|WP_002815630.1|538636_538864_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-C	gnl|CDD|349425	cd18185, ATP-synt_Fo_c_ATPE, F-type proton-translocating ATPase subunit c (ATPE) and similar proteins. This family includes subunit c of F-ATP synthase (also called ATP synthase F(o) sector subunit c, F-type ATPase subunit c, or F-ATPase subunit c) and similar proteins. It is a proton-translocating subunit of the ATP synthase encoded by gene atpE.	4.45064e-17
NZ_CP012009.1|WP_048592442.1|525904_527014_-|AI-2E-family-transporter	gnl|CDD|223701	COG0628, yhhT, Predicted permease, member of the PurR regulon [General function prediction only].	2.82654e-54
NZ_CP012009.1|WP_002815626.1|536022_537540_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-alpha	gnl|CDD|236448	PRK09281, PRK09281, F0F1 ATP synthase subunit alpha; Validated.	0
NZ_CP012009.1|WP_014325137.1|526997_528026_-|A/G-specific-adenine-glycosylase	gnl|CDD|224115	COG1194, MutY, A/G-specific DNA glycosylase [DNA replication, recombination, and repair].	1.05609e-124
NZ_CP012009.1|WP_011680422.1|520116_521295_+|LCP-family-protein	gnl|CDD|181811	PRK09379, PRK09379, LytR family transcriptional regulator.	2.3121e-70
NZ_CP012009.1|WP_002815624.1|533536_534937_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta	gnl|CDD|236447	PRK09280, PRK09280, F0F1 ATP synthase subunit beta; Validated.	0
NZ_CP012009.1|WP_011680434.1|535099_536008_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-gamma	gnl|CDD|235535	PRK05621, PRK05621, F0F1 ATP synthase subunit gamma; Validated.	3.56737e-129
NZ_CP012009.1|WP_048592446.1|533078_533522_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-epsilon	gnl|CDD|234796	PRK00571, atpC, F0F1 ATP synthase subunit epsilon; Validated.	8.97149e-39

Protein sequences

>NZ_CP012009.1|WP_048592444.1|530763_532008_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase
MQINYDFLDSYTFKNKPITVRNHVVMAPTTLKSSLEDGSVSDNELKYYQMRSNGPGMIIVEAAYVNELGKGWEGGLSAADDDKIEGLSRLASAIHSGGAKAILQLFASGRQSNQTILRGEQIVSASAQPYPHGSHETPRKLKHEEISQTIEDFAAATKRAILAGFDGVELHGANLYLLQQFLSPESNRRQDIWGGTLEKRMRFGLAVTAKVGDTIDKYAERPFLLGYRQSPEESTTPGITLADSLAFVQRLVTLQIDYLHLSLKDAFQKPFRDAKAVKQITTYYTEVLPDNVPLMVAGLIKQPMQVESLLDEGVTFAAMGRALIADPNWVQKVKLNDEKSIRYAVSPADFDLLGVPKPLKKWLLTRFKNGFPVTTDIEFDPKTPWKYYKSMPTQPRQQIDPTKLMTLKKRVDDN
>NZ_CP012009.1|WP_002815619.1|529796_530564_+|pyrroline-5-carboxylate-reductase
MNYGFIGAGNMATAMIKGLIYAGIDSKNIYVSSPHSAAKLAANLHIQAADSETITKKCDIVIIAFLPNQLRTLGNSLNLDGKIVISVLAQVTIADLDEVFPTAFNVRSLPNINSAIGKGSTALAFSKRLSESQIEVVQNYWHLLGTTSVLDEQHFAIFSAIAGSGPAFVLKFIDALTQAGINNGLDGESAAAIAASTVAGTTETLQKSNSDAVTLMNNVASPGGSTRAGLDNFEQNDFDTIVNSAINATVNHKHT
>NZ_CP012009.1|WP_048592443.1|528342_529740_+|multidrug-efflux-MFS-transporter
MNITQKQKTILIILVIGTFLGFLNQTLMNVALPDIMREFHISTDLGQWMTNGYMLVNGVMVPLTAFLIQRLTTRTLYLTAAGLFAVGTVTAGFAPTFDVLIIGRMIQAMGAGVFGPLMNVVVMNLFSPNERGSAMGTIGLALNFAPALGPSLSGLVVTNLSWRFLFYLVAPLIIANFILAYFLLQNIGQQKRLKFDFIGVVLSSIGLGSLLYGFSNAGATPWNEFTVWGFVLIGIIVTSLFIWHQYTTKAPLLNMSVFKYRQFNVAVLINVVLMIAMYGGALMLPLYMQNVRGTTAFQSGLVLFPGALVTAFLSPWSGRLYDRYGAKYLTLVGIMITAFGTFILASLTLTTSLWLAVLGQFVRQLGLVLVLMPIQTEAFNALPLTLIPDGSAMFTTIRQLAASFGTAALVTIMTKSALNYGHKHAHLSAEIVDLHGVQVTFLTAAFLMLVAASLTSLLKLKTRAT
>NZ_CP012009.1|WP_002815612.1|528114_528258_+|hypothetical-protein
MVLKKPLNSFARARKVSHSAAKKQRQAAIAKLQQWAKGKSEELPSTK
>NZ_CP012009.1|WP_014325137.1|526997_528026_-|A/G-specific-adenine-glycosylase
METWNEQTIKEFRKTLLNWYDKEGRVHLPWRVNHDPYRVLVSEIMLQQTRVDTVIPYFDRFMTSLPTVGDLATAPEDVVLKLWEGLGYYSRARNLQKAAQFVVNELHGQWPESSDDLQSLPGVGPYTAAAIASISFNEVVPAVDGNQYRVFSRLLKIDADIADTKSRKIFYDIIAPIVDPERPGDFNQAIMDLGSSYMTTKNPDSLYSPVREFNAAFRDGVEDQYPVKTKKQRPVKQLFMASVFEKDGKLLFEKRPDSGLLAGFWTFPLTQIESIESITGQQLNIKPVTHIFTHRRWEIWLVKQETAMLNDNQQYFSSDEWSALSLPKVQHKLLEKLYDTEF
>NZ_CP012009.1|WP_048592442.1|525904_527014_-|AI-2E-family-transporter
MIPNSKYKNIFFWTIELLALSLLILIVSRFDFLMKPISVFISTVFVPLIVAGFLYYVLKPVLTLLKKITVKGHKMPHQLAVIITFVSFLAVIAGSLILLIPTLVAEITHLITALPEFAQNVQRFVTDSLQSKWLSNLNLSIDIDEVKSAVGKYSASFLTITAGTLGSAVSMVTSVTINVVTIPVVLFYMLSDGDRLLPAIQKLFPVRFADNVKELTLKMDKTIERYISGQALEMLFVGMTMAVGYLIIGEPYAWLLGVIAGITNIVPYIGPWIGVIPALIVASTQSWKQMLLVMIVMMVVQQLDGNFIYPNVIGKSLQIHPLTIMILLMVAGNLWGIFGMILIVPMYAVARTVVKFAIEMRQLTKESLE
>NZ_CP012009.1|WP_025268503.1|524253_525555_+|GTPase-HflX
MQENPRKVFLVGLTTNQGNLDYELEELANLAKANNLEPVETFTQKLERPNPSTYFGKGKVEELGEAVKTYDVDMIVVNDELTPSQIRNLEKTTDATVVDRTGLILEIFAQRAQTKVAKLQVQLARLQYQLPRLRTSMSISLDQQTGTGGAGFTSRGSGETKLEQSRQRITSQMVHVRQELADLDKSENTRSMQRHANNLPNVALVGYTNAGKSTLMNRLLMRFGVGADNDDSKQVFEKDMLFATLNTTVRQLTLPDKRQFLLSDTVGFVSKLPHNLVAAFKSTLQEAANADLILHVVDVSDEHYKAMMETTEKTLTEIGVTGKPVITVYNKADRTDLHYPDISGDNVITLSALDTNSQDALIDLIVKHIFNDSEVVTLHIPFDKGNVVAQLAAKHKFIEEQYDETGSWLTIELSEVERNLFQQYITKEKSMNS
>NZ_CP012009.1|WP_002815607.1|522940_523960_-|tryptophan--tRNA-ligase
MSKEIYLTGDRPTGKLHIGHYIGSLKNRVSMQNSGDYLPFVMIADTQAFTDNARNPEKIRQSLTEVALDYLAVGIDPAKTTIFVQSQIKGLFELTEYFMNLVSVARLQRNPTVKSEIKQKGFDEGIPAGFLTYPVSQAADIAIFRATKVPVGDDQEPMLEQTRELVRSFNNAYKSDVLVEPVGVFPPKGQGRLPGLDGNAKMSKSLNNGIFLSDDADTLVKKVKSMYTDPLHINITDPGHVEGNVVFTYLDIFDPDKKRVQELKDQYTAGGLGDMKIKKHLIDVMEAEMAPIRQRREEYAQDIPAVLNMLQEGSNKANVVAEETMKDVRHVMGLDYFSN
>NZ_CP012009.1|WP_048592441.1|521523_522855_-|amino-acid-permease
MGNNEQKLNRGFGLTASLALVVGTIIGSGIFFKQGSVLESAGSTNAAMLAWIAGGLLTLASGISVAEIGSQMDKTGGIYIYIEKIYGKVWGFLAGWMQVVFYGPAMMGSIAAYFGILFVDLFGLSKSLAIPSAIIALSFVGLINSIPNRFSAGFQIITTTVKMLPIIALIIFGLFFGQHDAIGQTVAQVSQSDQGGFGVAVLATLFAYDGWVTLANISGEIKNPQKVLPKAIIFGILIVLVAYVGVSFGVYQSLPANTIVKLGQNTTLYMATNAFGIIGGRLLSIAVLISLLGTLNGKIVSFPRVLFAMANDGLFPFAKQFAKINMRSRTPNKSIWFMIFLGILMIVFTNPDRLTDIAIFTTFLFYILVFVGVFKLRKKDPFGEKRSFSMPLYPWIPIVAICGSLYVEISEIMHDLSGVIISMAIVAVGYPVYIFLSRRTNKE
>NZ_CP012009.1|WP_011680422.1|520116_521295_+|LCP-family-protein
MKKNKQTAVKSRIDRYSKSSHRLRNIILLIVGLLLIVSGTFAWMAIHNTKSAIDKTYKSSGVTKSRNVSSVVQSGKPLSILLFGTDTGELGRTYKGRTDSMMLLLVNPKTKKTTMISIPRDAMVSIPGYESTFPQKINAAYAYGSTATAIKTVESYLNIPIDFYALVNMSGLEKMVTQVGGISVKSPIDFTYSQETAHAYGANLYRFHKGSTGYEHSDDNGVTWSATKHVMTGDAALAFSRMRYDDPDGDYGRQKRQRLVLEGLIKKSANVSSLLNTKFMNTMSSNVQTDLSFGDITTIASKYINAAKNIVTEHIQGVSTSYPDSEGNNVSYEVVTQKEKQRVTNLARKALGLKHASTGSAYGGDIPSSLQTIADSLRPADDESTDSDDSSN
>NZ_CP012009.1|WP_048592446.1|533078_533522_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-epsilon
MADETTATKGITVQIVTPAGEVYNESGIDIAVVNTQGGQIGIMAKHVPILAALTIDELIVKRGDDKESLAVNGGIAEFSNDTLTVVADSAETSDVIDVSRAESAKERAEARLAHAQDDHNDAELRRARIALMRAVNRIHVAALKSGR
>NZ_CP012009.1|WP_002815624.1|533536_534937_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta
MSTGKVVQVIGPVVDIAFEAGQQVPDINNALVIDKGNGQSLTVEVSLALGDGVVRTIAMDSTDGLQRGMGVVDTGNPIEVPVGEATLGRVFNVLGEPVDNNGAIASDVRRSSIHRDAPKYDELTSSTEILETGIKVIDLLAPYVRGGKIGLFGGAGVGKTVLIQELIHNIAQGHNGISVFTGVGERTREGNDMYHEMEESGVLKQTAMVYGQMNEPPGARMRVALTGLTMAENFRDNEGKDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATEMGQLQERITSTKKGSVTSIQAVYVPADDYTDPAPATTFAHLDATTNLERALTQQGIYPAVDPLASTSSALDPQIVGQEHYEVATEVQRTLQRYRELQDIISILGMDELSDEEKTTVNRARRIQFFLSQPFSVAETFTGINGEYVPVAETVRSFKEILDGKYDDLPEDAFRNVGAIEQVVEKAKTMAQ
>NZ_CP012009.1|WP_011680434.1|535099_536008_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-gamma
MASLQDIQRRISSTKKTRQITSAMQMVSTAKLSQIQKYSAGYGSYAARLEAVVEHLVSAHLFDNADADHIPLIAQRPIKKTGILVVTSDRGLVGSYNANVIKQTNVLMQNLNLDTSNTTILAVGGNGADFYKKRGFEVILEHRGVSDVPTFNEIRSVVKTVTSLYENEVFDALHVVYNHFVNRLTSEYRDVQLLPLTGDTLNAMGGTEEQKAELNVQATYEIEPDTTAVLNVVLPQFAQSLVYEAVLDAKTAEHAASSTAMKGATDNAKDLIGRLELQFNRARQAAITTEITEITGGMAALE
>NZ_CP012009.1|WP_002815626.1|536022_537540_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-alpha
MAIQAEEISALIKQQLEKFDTTLTVEEVGTVTYVGDGVARATGLANALAGELVEFANGTYGMAQNLESSEVGIIILGGFDDIREGDTVKRTGRIMEVPVGEQLIGRVVNALGQPIDGLGEIKTDKTRPVEVKAPGVMERKSVSEPLQTGIKAIDALVPIGRGQRELIIGDRKTGKTSLAIDTILNQKDQNMIVIYVAIGQKNSTVRAQVETLRQMGAMDYTIVVNAGPSEPAPMLYLAPYVGAAMGEEFMYNGKHVLIVYDDLSKQATAYRELSLILRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKLSDELGGGSMTALPFIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQVFLDADQFYAGVRPAIDAGTSVSRVGGDAQIKAMKKVAGTLRLDLASFRELESFAQFGSDLDSATQAKLARGRRTVEILKQPLNKPMPVQHQVVVLYALTHGYLDDVEVADIQRFQDELIAYVDANASELFKAIVETKNLPEEADLNAAIEAFKAGFAGSESAE
>NZ_CP012009.1|WP_048592447.1|537552_538095_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-delta
MAKNIKDIANQYAKAIFELAGEQDNVDEVLTDLRTIKTVLDENQNFITIASSADVAITSRDDLLKTLTGNSTDSVKNLVKLLQVNNRLNILSIVVDEFVSQYNEVNGIVDVQATTAVALDDGRLDKLASVFASKTGAQQVNIENVVDESILGGVILQSQSTLIDGSLQTKIAKMKAQLLG
>NZ_CP012009.1|WP_048592448.1|538106_538610_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-B
MLGITTLAALPLGNMLFIIIAFLLLMLILKKVAYGPLTKVLDERADKISSDIDGAEVARQEAEELASQRQAELAETRQNATKVVNDAKASAQKQSDLIVSAANDRAASISQQAQTDAQKLKEDAISGAKNDVAALSVAIASKLMQKELSLNDQQALIDAYISDLETK
>NZ_CP012009.1|WP_002815630.1|538636_538864_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-C
MDLHNLGVIAAGLAAAGAAVGGGIGNGVLISQFLAGMSRQPELEGRLLSRMFLGVALVEVMPILSIVFAFMLMGK
>NZ_CP012009.1|WP_048592449.1|539036_539762_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-A
MDDPTATFKFLGLTFDWTTIISTLLAMAIVIIVSIVLTRKLSVKPNKRQNAIEYLLDFTNGIVNGQLTKKQARRFGLFAFTLFFFVIVSNEMGLLIQFKLGDGVTYIKSPTADPIVTMTLAIMSLMVAHGMGVQELGFKGYIKNMFFTPYSWMLPLNIIEQLANFLTLSLRLFGNIFAGEMLLTLVANSLAWPGHFNGLWSVLALPIEMVWQGFSLFIGGIQAYVFVILTGVFISQLSGNE
>NZ_CP012009.1|WP_011680437.1|540119_541391_-|uracil-transporter
MSKNQNNAIYDLHDKPPFFTWLGLSLQHLFSMFGATVLVPLLVGLNPGVALFTSGVGTLLHLLITRGKVPAYMGSSFAFIIPMTSLLKTVGYPAVAQGIISVGLVYLVVAFIVTFTGTAWIEHIFPAEVVGPIIMVIGLSLAGSAASSATTMNGHYDIRVFTVALVTLLATIAFNMFLRGFLGLLPVLLGIIFGYIVALITGLVDLSPVASAHWFQLPNFETFIGKDGFVFYPAAVLSMAPLALVTLSEHLGHLMVLSKITGTDFFENPGLKRTLTGDGTASVVAGLIGGPAVTSYGENIGVMQLSRVYSVWVIGGAAFFAVVFSFVGKLSALISTIPGAVTGGVGFMLYGVIAAAGLQVIVDNKVDYSKKRNLMIAAPIMVVGIGNFHLQLSTQVDFSGVAIATILGIVLNLVLPKVAASEK
>NZ_CP012009.1|WP_048592450.1|541517_542231_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase
MAKLVLIRHGQSEWNALNLFNGWIDTKLSEKGIAQAKEAGDFLAAEGIQFDQAYTSVLTRAIQTLHLALEEAGQLFIPEAKSWRLNERHYGALQGQNKAEAAEKWGDEQVHIWRRSYDVLPPLLDSYDETMTVQGNTYPAFDRRYADVPEGELPLGENLKITLERVLPFWESDISKALKAGKNVVIAAHGNSLRALVKHLENISDDDILNVEIANGQPLVYDLADDLSVVSKKTLTK

Crispr_ID: NZ_CP012009_2

• CRISPR_ID: NZ_CP012009_2
• CRISPR_location: 1073654-1073756
• CRISPR_type: Unclear
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers
• Cas_protein_info: cas3

Consensus repeat of NZ_CP012009_2

Consensus_repeat	Method
CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP012009_2

>2.1|1073680|51|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder
CTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012009_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP012009_2

>merge|NZ_CP012009|2|1073654-1073756|CRISPRCasFinder
CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCACCTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCGCCGACGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC

>NZ_CP012009|2|2|1073654-1073756|CRISPRCasFinder
CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC	CTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCG
CCGACGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP012009.1|WP_048592741.1|1070942_1071836_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO	unknown	unknown	gnl|CDD|234643
NZ_CP012009.1|WP_048592739.1|1068164_1068704_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223707
NZ_CP012009.1|WP_011679260.1|1066442_1066841_+|septum-formation-initiator-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368217
NZ_CP012009.1|WP_048592740.1|1068731_1070834_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH	unknown	unknown	gnl|CDD|273520
NZ_CP012009.1|WP_004164715.1|1066079_1066361_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224109
NZ_CP012009.1|WP_011679258.1|1061187_1061832_-|CBS-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|341358
NZ_CP012009.1|WP_011679267.1|1077007_1078456_+|NCS2-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|225161
NZ_CP012009.1|WP_048592745.1|1080080_1080548_+|LytTR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|197918
NZ_CP012009.1|WP_048592742.1|1071923_1073411_+|lysine--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234778
NZ_CP012009.1|WP_048592738.1|1066871_1068164_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS	unknown	unknown	gnl|CDD|238950
NZ_CP012009.1|WP_048592736.1|1061957_1062524_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|235457
NZ_CP012009.1|WP_048592744.1|1079374_1080103_+|membrane-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP012009.1|WP_048592359.1|1083325_1084129_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP012009.1|WP_048592743.1|1073880_1074414_+|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E	unknown	unknown	gnl|CDD|211334
NZ_CP012009.1|WP_048592750.1|1084699_1085821_+|alanine-racemase	unknown	unknown	gnl|CDD|143481
NZ_CP012009.1|WP_048592746.1|1080534_1080945_+|DUF3021-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378668
NZ_CP012009.1|WP_048592737.1|1062524_1066064_+|transcription-repair-coupling-factor	cas3	cd09639_cas3_CAS-I	gnl|CDD|224118
NZ_CP012009.1|WP_048592747.1|1081078_1083169_+|DNA-topoisomerase-III	unknown	unknown	gnl|CDD|376463
NZ_CP012009.1|WP_004164706.1|1074484_1075201_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|237084
NZ_CP012009.1|WP_048592749.1|1084174_1084417_-|transposase	unknown	unknown	unknown

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP012009.1|WP_048592737.1|1062524_1066064_+|transcription-repair-coupling-factor	cas3	cd09639_cas3_CAS-I	2.3e-12	41.4	0.3

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP012009.1|WP_048592741.1|1070942_1071836_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO	gnl|CDD|234643	PRK00114, hslO, Hsp33 family molecular chaperone HslO.	1.46247e-101
NZ_CP012009.1|WP_048592739.1|1068164_1068704_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|223707	COG0634, Hpt, Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase [Nucleotide transport and metabolism].	7.74632e-78
NZ_CP012009.1|WP_011679260.1|1066442_1066841_+|septum-formation-initiator-family-protein	gnl|CDD|368217	pfam04977, DivIC, Septum formation initiator. DivIC from B. subtilis is necessary for both vegetative and sporulation septum formation. These proteins are mainly composed of an amino terminal coiled-coil.	1.77007e-05
NZ_CP012009.1|WP_048592740.1|1068731_1070834_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH	gnl|CDD|273520	TIGR01241, ATP-dependent_zinc_metalloprotease_FtsH, ATP-dependent metalloprotease FtsH. HflB(FtsH) is a pleiotropic protein required for correct cell division in bacteria. It has ATP-dependent zinc metalloprotease activity. It was formerly designated cell division protein FtsH. [Cellular processes, Cell division, Protein fate, Degradation of proteins, peptides, and glycopeptides].	0
NZ_CP012009.1|WP_004164715.1|1066079_1066361_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein	gnl|CDD|224109	COG1188, COG1188, Ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit (S4 paralog) [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	2.99369e-29
NZ_CP012009.1|WP_011679258.1|1061187_1061832_-|CBS-domain-containing-protein	gnl|CDD|341358	cd02205, CBS_pair_SF, Two tandem repeats of the cystathionine beta-synthase (CBS pair) domains superfamily. The CBS domain, named after human CBS, is a small domain originally identified in cystathionine beta-synthase and is subsequently found in a wide range of different proteins. CBS domains usually occur in tandem repeats. They associate to form a so-called Bateman domain or a CBS pair based on crystallographic studies in bacteria. The CBS pair was used as a basis for this cd hierarchy since the human CBS proteins can adopt the typical core structure and form an intramolecular CBS pair. The interface between the two CBS domains forms a cleft that is a potential ligand binding site. The CBS pair coexists with a variety of other functional domains and this has been used to help in its classification here. It has been proposed that the CBS domain may play a regulatory role, although its exact function is unknown. Mutations of conserved residues within this domain are associated with a variety of human hereditary diseases, including congenital myotonia, idiopathic generalized epilepsy, hypercalciuric nephrolithiasis, and classic Bartter syndrome (CLC chloride channel family members), Wolff-Parkinson-White syndrome (gamma 2 subunit of AMP-activated protein kinase), retinitis pigmentosa (IMP dehydrogenase-1), and homocystinuria (cystathionine beta-synthase).	1.94521e-07
NZ_CP012009.1|WP_011679267.1|1077007_1078456_+|NCS2-family-permease	gnl|CDD|225161	COG2252, COG2252, Xanthine/uracil/vitamin C permease [Nucleotide transport and metabolism].	1.71168e-119
NZ_CP012009.1|WP_048592745.1|1080080_1080548_+|LytTR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|197918	smart00850, LytTR, LytTr DNA-binding domain. This domain is found in a variety of bacterial transcriptional regulators. The domain binds to a specific DNA sequence pattern.	6.68728e-17
NZ_CP012009.1|WP_048592742.1|1071923_1073411_+|lysine--tRNA-ligase	gnl|CDD|234778	PRK00484, lysS, lysyl-tRNA synthetase; Reviewed.	0
NZ_CP012009.1|WP_048592738.1|1066871_1068164_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS	gnl|CDD|238950	cd01992, PP-ATPase, N-terminal domain of predicted ATPase of the PP-loop faimly implicated in cell cycle control [Cell division and chromosome partitioning]. This is a subfamily of Adenine nucleotide alpha hydrolases superfamily.Adeninosine nucleotide alpha hydrolases superfamily includes N type ATP PPases and ATP sulphurylases. It forms a apha/beta/apha fold which binds to Adenosine group. This domain has a strongly conserved motif SGGXD at the N terminus.	8.80077e-75
NZ_CP012009.1|WP_048592736.1|1061957_1062524_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase	gnl|CDD|235457	PRK05426, PRK05426, peptidyl-tRNA hydrolase; Provisional.	6.24365e-94
NZ_CP012009.1|WP_048592746.1|1080534_1080945_+|DUF3021-family-protein	gnl|CDD|378668	pfam11457, DUF3021, Protein of unknown function (DUF3021). This is a bacterial family of uncharacterized proteins.	1.35967e-07
NZ_CP012009.1|WP_048592359.1|1083325_1084129_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	1.8117e-44
NZ_CP012009.1|WP_048592743.1|1073880_1074414_+|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E	gnl|CDD|211334	cd02566, PseudoU_synth_RluE, Pseudouridine synthase, Escherichia coli RluE. This group is comprised of bacterial proteins similar to E. coli RluE. Pseudouridine synthases catalyze the isomerization of specific uridines in an RNA molecule to pseudouridines (5-ribosyluracil, psi). No cofactors are required. Escherichia coli RluE makes psi2457 in 23S RNA. psi2457 is not universally conserved.	1.54002e-100
NZ_CP012009.1|WP_048592750.1|1084699_1085821_+|alanine-racemase	gnl|CDD|143481	cd00430, PLPDE_III_AR, Type III Pyridoxal 5-phosphate (PLP)-Dependent Enzyme Alanine Racemase. This family includes predominantly bacterial alanine racemases (AR), some serine racemases (SerRac), and putative bifunctional enzymes containing N-terminal UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase (murF) and C-terminal AR domains. These proteins are fold type III PLP-dependent enzymes that play essential roles in peptidoglycan biosynthesis. AR catalyzes the interconversion between L- and D-alanine, which is an essential component of the peptidoglycan layer of bacterial cell walls. SerRac converts L-serine into its D-enantiomer (D-serine) for peptidoglycan synthesis. murF catalyzes the addition of D-Ala-D-Ala to UDPMurNAc-tripeptide, the final step in the synthesis of the cytoplasmic precursor of bacterial cell wall peptidoglycan. Members of this family contain an N-terminal PLP-binding TIM-barrel domain and a C-terminal beta-sandwich domain. They exist as homodimers with active sites that lie at the interface between the TIM barrel domain of one subunit and the beta-sandwich domain of the other subunit. AR and other members of this family require dimer formation and the presence of the PLP cofactor for catalytic activity. Fungal ARs and eukaryotic serine racemases, which are fold types I and II PLP-dependent enzymes respectively, are excluded from this family.	1.44367e-116
NZ_CP012009.1|WP_048592737.1|1062524_1066064_+|transcription-repair-coupling-factor	gnl|CDD|224118	COG1197, Mfd, Transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [DNA replication, recombination, and repair / Transcription].	0
NZ_CP012009.1|WP_048592747.1|1081078_1083169_+|DNA-topoisomerase-III	gnl|CDD|376463	pfam01131, Topoisom_bac, DNA topoisomerase. This subfamily of topoisomerase is divided on the basis that these enzymes preferentially relax negatively supercoiled DNA, from a 5' phospho- tyrosine linkage in the enzyme-DNA covalent intermediate and has high affinity for single stranded DNA.	3.34088e-69
NZ_CP012009.1|WP_004164706.1|1074484_1075201_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator	gnl|CDD|237084	PRK12378, PRK12378, YebC/PmpR family DNA-binding transcriptional regulator.	9.18473e-131

Protein sequences

>NZ_CP012009.1|WP_048592742.1|1071923_1073411_+|lysine--tRNA-ligase
MAEEKALNDQMLARRQKLATIVSDLHLDPFGKRFERTAKAQELHNLYDASSLEELENAKHEVVIAGRMVAKRGAGKVIFADFRDVSGKIQVYARRDDLADNYPIIKRADLGDFLGIKGIMMKTEAGELTVLATELTHLSKALRPMPDKFHGISDVETRYRKRYLDLIANEDSFKKFQERSHIISAIRAYMDRNDFLEVETPILQTEAGGAAARPFITHHNALNIDMYMRIATELYLKRLVVGGMERVYEIGRIFRNEGMDPKHNPEFTTMESYAAYMDFTDVMDETEGIFKAAASVVSDDLKITYQGTEIDLGTKFARKHLVDLIKEQTGIDFCQEMSVEEAQKLADDNHVKYEKYWGVGHIINAFFEEFVEDTLVQPTFVYGHPVEVSPLAKKNTDDPRFTDRFELFIMGSEYANAFTELNDPIDQRARFEAQAAERENGNDEAEGIDEDFIEALEYGMPPTGGLGVGIDRLVMLLTDSDTIRDVVLFPTMRPE
>NZ_CP012009.1|WP_048592741.1|1070942_1071836_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO
MADQFIKAITKNKYFRTFAVNGTNLVHQAAQIHETSRIATVVLGRGLLATTLTAQAVLKGEETLSTKINGRGPIGNVVVESDAKGSVRGYVTNPNLETLINEAGQLDVAKAVGKNGFLQVTKFAPYSDPYIGQSQLVSGEIGDDFTYYLAQSEQTPSVIGVSVYMNSDDTVAGAGGFLVQALPDATDEAIDQLELALKNMKPLSEMIQERYTPLEVLEEIFGKGEVEILQTAGIGLAAEPSKDAYAKMLLTLPASEIQAMIKEDHGAEIVGKFSGKRYFFTEEQLSEILKQIEKNNE
>NZ_CP012009.1|WP_048592740.1|1068731_1070834_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH
MNNNKGGFLRSSVFYIFIFLAVVGMVYGLFGNDKTTTKTITSSEFIKALNDKELKSVTVQPGNSIYNVTGTYKKAQTATRDKGLSLFQPTQKVTKFTSTLLPNDASLKSVTDAATKTKTELVTKQAENSGFWLNLLVSLVPVLLIVAVFYLMMNQAGGGKGGQGGMMSFGKSKAKPSDPKDNKVRFADVAGAEEEKQELVEVVEFLKAPKKFVNLGARIPKGVLLEGPPGTGKTLLAKAVAGEASVPFFSMSGSDFVEMFVGVGASRVRDLFENAKKSAPAIIFIDEIDAVGRRRGTGMGGGNDEREQTLNQILIEMDGFEGSEGVIILASTNRSDVLDPALLRSGRFDRKILVGAPDVKGREAILNVHAKNKPLADNVDLKAIAQQTPGYVGADLENLLNEAALLAARRNKSKVDAADIDEAEDRIFQGPAKTNHNMSESERRTTAYHEAGHALVGLVRSEASVVRKVTIVPRGRIGGYALMTPKNDRYNLKYSEAKEQLAGLMGGRASEIVMFNEASSGASNDFQQATGLARQMVTAFGMSDKLGMVQLEGNASVGYADQAGNRAYSEETARLIDEEVRRLAREAFDDAIAILRDNKDKLTAIAEALLEVETLDEKQIKDIYLTGTFTRKDIQDDTELAKAKSFEEAKAAADAKDSQAEQRFEKQDEEKSSDDHSESKNEDTDSTDKSETDDNNTGNK
>NZ_CP012009.1|WP_048592739.1|1068164_1068704_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase
MDNDIQEVLYDQESIQKAAERLGKQITQDYAGSTPLFLSVLKGAYLWTADLLREVDLYAELEFIKISSYHGGVSSSDEITLVTDVRSDVRGRNVIILEDIVDTGQSLLFLKELLAKRGAKSIKVATLLDKIEGRKVEVDADYAGFNVRNEFVVGYGLDYEEHYRNLPYVGILKKEVYTK
>NZ_CP012009.1|WP_048592738.1|1066871_1068164_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS
MTEKILQTIKQYNWPETVIVAVSGGVDSVVLVHALSKTKANLVIAHVNYRLREESDDDADFVRQLATQTGAIFEEQVWQHIPDHAVEKAARQFRYDFFEELAQKYHTNTIAVAHHADDQAETVLLKMIRGGRLQQMGGMQTKNHKVIRPFLSITKQELITYAQDNQLGWRQDKTNFDVDYTPRNLLRNDVLPKLTTINQRAVRHMNNMAAQILQQQRLIDNQAKIYANDIQDWQKIPTLWQLPTLKYWLQKNKLFNIKENQLQQMIQLLSNTHKPNGKIALADNFEFIKTYQKISIQKQQNMAQVLMPVMLKLNQWHSFAKTTFMWTDNVPMNGQSFIKFQLTRSLPYLSLRPAKASDKIALINGHKNLRRLAIDEKLTPQERTMMWVLATADDEVIAVHLRSNRWRVNADFAVKENTQPYWLVCQIEET
>NZ_CP012009.1|WP_011679260.1|1066442_1066841_+|septum-formation-initiator-family-protein
MAGNFKRRQSNITPLNPAIAREIKKSERANSEAAKHYRKAHARREKKILLFGGLIAIIFVVQLLIGQVKLHAANQELTNTQDRLEKVQKTNTDLTADTKRLKDATYLQQLLRDKYGYSKQGELVYNLPSDNN
>NZ_CP012009.1|WP_004164715.1|1066079_1066361_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein
MRLDKYLKISRLIKRRTVAKEIADQGRISINGKVAKSSSDVSTNDELEVRFGNKTLTVKVLKIVETTKKEESADMYEVISEKFQQDFRKIGDE
>NZ_CP012009.1|WP_048592737.1|1062524_1066064_+|transcription-repair-coupling-factor
MTLIDFLSDTVTIKKLNEQATVGSAQLLLGVNGTARAASIAALYRKNPRPMLIISDTQVHADQFFDDLSSLLEDLVYNFPAEESIATEMAISSSELRLQRVQALLALKTEKPIIVVTSLAGAERLVPKKQSLEQAHLHVKVGDAYNLNVIKNTLMMMGYTPTKLVQTPGEFAHRGSIVDVYPITFDDPIRLDFFDDELDQLKSFDVATQKSTTSFDEINIDPATDFIVSEHQYDQAKLAIETAFSDYRINLSGVDKKHATDGFAPTQYMLNERERGSALVPYAPFFFDGQTTLLDYFPTDSLIIIDEYTRLMETRLQQMTRDQEWIEQQIEAYQLLPKQTWRTEITDLLVSNQHATIYLANFQRGLNRIKFTNVEEVTTRPANQYYGQIPALKNDLIYAQESGITMVLLIPDAKRRANFSRSLSELEVPVTETRDIVKNQVQIMPDELSAGFEWPKLHLTVLTTHELFTQAKHSAPRTRKIANSERLKSYNELNVGDYVVHINHGIGRYEGLQTIEADGGKQDYLTIAYQQNAKIFIPVTQLNLIQKYVGASDVAKKPKLNKLGGSEWAKTKRQVAAKIEDIADDLLELYAKREAQQGYVFPPDDHAQIKFDDSFGYPETPDQIRSIEEIKVDMQKLRPMDRLLVGDVGFGKTEVALRAVFKAAHSGKQVAFLAPTTILVQQHYETMLARFSDFPEIKIGVLSRFQTPTQNKMIIEQLQNHEIDVVVGTHRLLSKDVDFSDLGLLIIDEEQRFGVKHKERLKQLRTSVDVLTLTATPIPRTLNMAMVGARDLSVIETPPANRYPIQTYVLAMDWKIVRDAIEKEIARNGQVFYLHNRVADLDRIVSQIEELIPSARVAAIHGQMSETQLESILYDFLNGQYDVLVTTTIIETGVDIPNANTLIVENADHMGLAQLYQLRGRVGRSTRLAYAYFTYPFTRTPSEEAEKRLEAIRDFTELGSGFRIAMRDLSIRGAGDLLGKQQHGFIDSVGYDMYTQMLKDTVAQKQGKQVTTSQPETDAELILGVLAYLPDEYVSDNAQKIELYSRIRQAKTDAEFEDIESDMLDRFGEMPDEVARLLLVGQIKQLADQSQITNIRRQRKQLIMTFNETATKNLAGEAIFETMVDVPLKAAVRTEEGNLQVIFTVNDVAESSIWLNILRNFLLVIIDKLSAKTLNELHH
>NZ_CP012009.1|WP_048592736.1|1061957_1062524_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase
MKFIFGLGNIGAEYDQTRHNIGFMAVDAFATANHMSFSPSKQFALVAKTIIGGESVMLVKPTTYMNDSGKAVRAILDYYDGDVDDVLVLVDDMDLPFGKMRFRAKGSAGGHNGLKSIMTHTGSQTFLRLKFGLGHPVHEQNVVINYVLGKFTAAEKPDIDAMLDRSTQAIADWIQGATAPELSNRYNG
>NZ_CP012009.1|WP_011679258.1|1061187_1061832_-|CBS-domain-containing-protein
MFQKSLVIPKSELTTVTENATIQEVYDIFNDPENAHTRTMPILDESGKLFRGNVYKQHVFEHVAKNGNMNLPATAIMRNSTKFIYTNSKFYEVFFAIRDLPFIAVLDENHQFYGIFTHDALMDLLSQSWSVRSGGVAIAISTHNTQGDLSKISKIITRYSNIESLLTIQSELKPLTVLFTLPLQEDSEQLEKLIKRLEKKGYHVSSVENLNRFR
>NZ_CP012009.1|WP_048592743.1|1073880_1074414_+|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E
MIVLFNKPYNVLTKFTDAEGRPTLADYIDIPRVYAAGRLDMDSEGLLLLTDSGKLNHGLTDPDNKAYKTYVVQVEGVPTKSQLKQLEQGVALKDGLTLPAKVKRIPYPKWLWEREKPIRIRKNQPTSFIQLKIKEGRNRQVRRMTAAVGIPTLRLIRTHIDEYHIADLKPGQYRIVK
>NZ_CP012009.1|WP_004164706.1|1074484_1075201_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator
MGRKWENIKMKKAQTDGAAAKVNSKYGIEIYAAAKQGGSPDPEANSTLKFVIERAKQAQVPKHVIERAIEKAKGSGDETFIEGRYEGFGPNGSLIIVDTLTSNVNRTATNVRTAFNKNGGTYGAAGSVSYLFDETGVIVFEGEDADATLETLLDAEVDVRDAEQQDDHIVVYTEPTALHQAIAALRESGVSDFSTTEISMLPQSEMTLAGEDLEIFEKLIDVLESDDDVQKVYHNVEL
>NZ_CP012009.1|WP_011679267.1|1077007_1078456_+|NCS2-family-permease
MEKLFQLKENKTTVRREIIAGITTFVSMAYIFFLNPQILGQAGVPTQAVFLAAILVAVFGTLFMGLFANVPFALAPGIGMQAYFTYTIVFGFGFTWQQALAIVFLVGVVDIVITLTHGRRAIVKGIPTELKAAIGGGIGLFVTYIGLKNAGFINFIVDPSNIMTLNGKPFTGEVHGAVNSILANGGVTPELTKFNNASTLLALIGFVILVVLVMRKVPGAFLISLIVTTLIGIPMGVTNTHIGAGTSVSHAFGELGQVFGQSLGAQGLGSLFNNWHHASLALVTIFAMGLTGLFDAIGTLIGIGNQTGIFSKEDQKSFESSNGFNSKMDRALVVDTFTTAFAGIVGTSNTTTFIESASGVAAGARTGLANVVTAAGFALMILFAPLVGVVPTAATSPLLILVGIMMMGEFKKISWESLEVALPAFFTSVFMAFSYSISYGIAAGFIFFIIVKFALGKFKEVSPVLLIVSAFFLLNFAVLAFM
>NZ_CP012009.1|WP_048592744.1|1079374_1080103_+|membrane-protein
MIKKRKLVFEFQNLLGNIITLFFGFAFAPMMALVFGNSYANVPQALDQLYLGFFCTIPLSMVFVGFSSLFSQEVEQGFTLRAELFGYSRVSQALHKFMALTVFVLLSSIIYSWIFLSHFNLPLPNEVIIGQMAIFQILNTAVYFIIVFILTTILKKFSRVYGISMISYFAIMIISGIMGNMDVGKLGDYLPIKLFVTNYTNHLNDTDYISGKIGLYLLILLGILGVILKVIVRNKNGNKHQY
>NZ_CP012009.1|WP_048592745.1|1080080_1080548_+|LytTR-family-transcriptional-regulator
MEININIDDKLKDVQVVISGSDSEQLADIAQYLKSRNTPSRQLAIKTADNIRVVDKENIILVESYGNDLTFTLKNNHKITTRKTLKRFLEENQKSDFVQISKSEVMNLSYLSKMESAFSGNYYAFLTNQARVTVSRRFIKGILKRLEGSAEDEAF
>NZ_CP012009.1|WP_048592746.1|1080534_1080945_+|DUF3021-family-protein
MKHFKEAIVYLLVGIGVGSFISLLSFTLNHATPSMKQFGLLMTMSAIMGLLSLIFEYDKITFITQLISHFIVEMLTYGFFIWLTFGSAVITFGNIPTFVITYVIIFIYFRKQGSDNARRINEQLQKNKPIKSDSTN
>NZ_CP012009.1|WP_048592747.1|1081078_1083169_+|DNA-topoisomerase-III
MPNYLILTEKPSAAANFTKALGGKTGVFSDFTYKITNLRGHVMTLKDPEEMVAEDLKKQYKSWLVKHLPWNLEDFSWARTYIRQRNIRTGKIESTKKLIDELKKESKSGYDAIVIATDTDPSGEGELLAWEALDAIGWRGQVLRANFMDESVSGIQKAMHQLRNVSDKMADGEYVKGESRNRWDFASMQLTRIATTAAKKEGFKVVAREGRLKSVIVWRIYQQLAAIKNYIKTPYFEVKFKDPAGHIFGRVTPQGEVIPWRFATKEQAKVDFNNYHETEVINEKHQTRTQAPGKLLDLAGLASILAPRGFSSKEVLSTYQKMYEAQIMSYPRTEDKTVTPEQFNELLPLIDQIAGVVGVDKNLLTHRSPRKTHVKSQGAHGANRPGENVPQTTQSLAKFGSSGPAIYEVLAKNYLAMLAEDYVYDHVTANLKDYPEFKTAFNIPIKLNFKLVYDSQKAIKVEEGEEEESISGQLGPQATPYLHEGANPKPQVPTTKWIMAFLEKHNVGTGATRVSTLSEMSRGTKAMLTEKRGKLVLTETGNVSAIMVKDTWIASPKITKRLFEMMDQVGRFEMTMVQVLDSATKVVEHDMPIMLDNAQTLETLLGKPKPSIKKPRKTSEKMTGIWQGQEITFAREWSGHVFTDEELQKLLTGSEVSFPAKSKRGKLYTAVGKMAKQTFKENTFYGFKLNPKTKKA
>NZ_CP012009.1|WP_048592359.1|1083325_1084129_-|IS3-family-transposase
MGLPLVNQFLAQGYALVRILSALKIKPSTYYNWRHWQPSRQEKCRESLKPYILDVWKTFKFYGYRRIAAYSQQTDGPKVSEYMTLKLMRELGIKSRMQKRYRKPKTVVTVDQKPNLIRHLHDLSGVWQTDITYIQLTNHRGVYLATVLDPEKRKVLGYKIGDTMTAELATSALQMALDKHRKPLIIHSDMGSQYTSAEFNIKCQNYGLKHSYSLKGHPYDNGRMEAFHSILKREEVYLKAYETLTQVQAAIGWYINFYNRNRISNVA
>NZ_CP012009.1|WP_048592749.1|1084174_1084417_-|transposase
MSIRYSQDFKDSLVKLHQEGRSLKSLAEEFGPSKDSIAIWVKQANPIMIKGQSKTLKDVKKLEKRLAILEEENEILSRIA
>NZ_CP012009.1|WP_048592750.1|1084699_1085821_+|alanine-racemase
MNYNAPHRHAVIELSQSAVVHNLKVIKENTHAKEIMAVLKANAFSHGLPEMASLSITAGATRFGMAMLDEALTLRDLGYIQPIDVLGLTDPRYARLAAERNITLAFSTKESIKAAAEQLAGTGLTLKVSLPVDTGLNRIGFKSREDLVAAIQEVSAQDTLIFQSMWTHFATADTPNVDYVDFQISEWQRLTHDLPVEPNEKHFANTGIATWYPEKINTDIVRLGIGLFGINGSVPIMSMPFELIPALSLKAKVVNSKPLKKGNAVGYGAEYHAPNDGYLITIPIGHSDGYPFNGSGMRALVADGQIGHIVGGVAMDQSMIFVTNPVAVGTTVTLIGRVGDQSITMQDLAEHTQSSIVALMNDFAPRLQRKIVS

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP012009_1	1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder	532419-532443	25	NZ_CP020439	Streptococcus equinus strain FDAARGOS_251 plasmid unamed1 sequence	26331-26355	2	0.92
NZ_CP012009_1	1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder	532419-532443	25	NZ_CP020439	Streptococcus equinus strain FDAARGOS_251 plasmid unamed1 sequence	211779-211803	2	0.92
NZ_CP012009_1	1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder	532419-532443	25	NZ_CP018188	Streptococcus salivarius strain ICDC2 plasmid, complete sequence	31262-31286	2	0.92
NZ_CP012009_1	1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder	532419-532443	25	MN480762	Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence	94816-94840	2	0.92
NZ_CP012009_1	1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder	532419-532443	25	MN693385	Marine virus AFVG_25M376, complete genome	10660-10684	4	0.84
NZ_CP012009_1	1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder	532419-532443	25	MN693400	Marine virus AFVG_25M353, complete genome	10777-10801	4	0.84

1. spacer 1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020439 (Streptococcus equinus strain FDAARGOS_251 plasmid unamed1 sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92

ttgatgaagtatcagcagcagctgt	CRISPR spacer
atgatgaaatatcagcagcagctgt	Protospacer
 *******.****************

2. spacer 1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020439 (Streptococcus equinus strain FDAARGOS_251 plasmid unamed1 sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92

ttgatgaagtatcagcagcagctgt	CRISPR spacer
atgatgaaatatcagcagcagctgt	Protospacer
 *******.****************

3. spacer 1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018188 (Streptococcus salivarius strain ICDC2 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92

ttgatgaagtatcagcagcagctgt	CRISPR spacer
atgatgaaatatcagcagcagctgt	Protospacer
 *******.****************

4. spacer 1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder matches to MN480762 (Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.92

ttgatgaagtatcagcagcagctgt	CRISPR spacer
atgatgaaatatcagcagcagctgt	Protospacer
 *******.****************

5. spacer 1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder matches to MN693385 (Marine virus AFVG_25M376, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84

ttgatgaagtatcagcagcagctgt	CRISPR spacer
ttgatgcagtatcagcagcagttac	Protospacer
****** **************.*..

6. spacer 1.2|532419|25|NZ_CP012009|CRISPRCasFinder matches to MN693400 (Marine virus AFVG_25M353, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.84

ttgatgaagtatcagcagcagctgt	CRISPR spacer
ttgatgcagtatcagcagcagttac	Protospacer
****** **************.*..

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1448 : 47400	47	Bacillus_phage(33.33%)	transposase,integrase,tRNA	attL 21536:21553|attR 28384:28401
DBSCAN-SWA_2	145351 : 150375	6	Escherichia_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	472756 : 483527	12	Pandoravirus(14.29%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	522940 : 583921	58	Bacillus_phage(23.53%)	transposase,bacteriocin,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	618772 : 656419	36	Bacillus_phage(30.77%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_6	970327 : 1024481	51	Lactobacillus_phage(27.78%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	1256651 : 1269816	13	Bacillus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_8	1459217 : 1525082	48	Lactobacillus_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	1548350 : 1652609	107	Staphylococcus_prophage(16.67%)	transposase,holin,integrase	attL 1577184:1577199|attR 1613991:1614006
DBSCAN-SWA_10	1662373 : 1695696	30	Staphylococcus_prophage(50.0%)	transposase,protease	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP012009|1448:47400|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_155403319.1|1590_2253_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.3e-17	33.8
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WP_048592161.1|4520_6398_-	ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	3.8e-59	32.2
WP_048592162.1|6491_7430_+	dihydroorotate oxidase	A0A1V0SH91	Hokovirus	7.2e-59	42.5
WP_048592163.1|7459_8716_-	acetate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_048592164.1|8872_9736_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	M4ZRP4	Bacillus_phage	2.7e-12	33.3
WP_011680001.1|9735_10035_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592165.1|10094_12287_-	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592166.1|12410_12842_-	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592167.1|13183_13660_-	MscL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155403320.1|14139_14484_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080968804.1|14697_15492_-|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X2	Lactobacillus_phage	4.3e-28	33.5
WP_048592170.1|17182_17986_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	7.8e-30	36.4
WP_048592171.1|18031_18274_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	2.1e-07	38.2
WP_048592172.1|18711_19626_+	cysteine synthase family protein	A0A1W6JIM2	Lactococcus_phage	1.4e-59	40.7
WP_048592173.1|19636_20776_+	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_048592174.1|20789_21284_+	serine acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
21536:21553	attL	NA	NA	NA	NA
WP_048592170.1|21601_22405_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	7.8e-30	36.4
WP_048592175.1|22413_22674_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	1.4e-09	40.5
WP_010292079.1|22940_23363_+	RinA family protein	E3W8E2	Leuconostoc_phage	1.4e-09	32.5
WP_048592176.1|24103_24640_+	DUF308 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592171.1|24807_25050_+|transposase	transposase	Q6J1X3	Lactobacillus_phage	5.3e-06	36.1
WP_048592170.1|25095_25899_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	7.8e-30	36.4
WP_053079864.1|25964_26402_+	S24 family peptidase	A0A097BY95	Leuconostoc_phage	2.5e-46	63.0
WP_048592177.1|26468_27074_+	Ltp family lipoprotein	A0A097BY93	Leuconostoc_phage	2.0e-06	65.9
WP_048592178.1|27253_28327_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	Q6A1Z6	Oenococcus_phage	3.8e-40	33.4
WP_002814789.1|28389_28665_-	HU family DNA-binding protein	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.6e-27	70.8
28384:28401	attR	NA	NA	NA	NA
WP_011680007.1|28838_30149_-	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
WP_042253034.1|30223_31414_-	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
WP_164907664.1|31508_32186_-	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_048592179.1|32200_32758_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592180.1|32831_33422_-	ECF transporter S component	NA	NA	NA	NA
WP_048593107.1|33685_34435_-	rRNA pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_048592181.1|34427_35027_-	SMC-Scp complex subunit ScpB	NA	NA	NA	NA
WP_048592182.1|35019_35796_-	segregation/condensation protein A	NA	NA	NA	NA
WP_010293841.1|35762_36137_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042253043.1|36142_37039_-	site-specific tyrosine recombinase XerD	S5W9T9	Leptospira_phage	3.9e-22	28.8
WP_048592183.1|37035_37899_-	S1 RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592184.1|37987_38434_-	GatB/YqeY domain-containing protein	A0A292GL36	Xanthomonas_phage	8.0e-16	36.7
WP_011680015.1|38516_38702_-	30S ribosomal protein S21	NA	NA	NA	NA
WP_014324864.1|38838_40107_-	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	3.0e-44	28.1
WP_048592185.1|40246_41794_+	PucR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592186.1|41895_43302_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_048592187.1|43358_44225_-	YitT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592188.1|44326_46102_-|tRNA	aspartate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_048592189.1|46098_47400_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2K9L0H9	Tupanvirus	3.6e-24	25.7

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP012009|145351:150375|DBSCAN-SWA
TATGTCAATTCGTTATTCACAAGATTTTAAAGATTCACTGGTTAAACTTCACCAAGAAGGACGTTCACTTAAATCATTGGCAGAGGAATTTGGACCTTCAAAAGATTCTATTGCTATTTGGGTCAAGCAAGCTACCCCAGTCATGATTCAGGGTCGGTCAAAGACGTTAAAGGATGTCAAGCAATTAGAAAAGCGTCTCGCTATTTTGGAGGAAGAAAACGAAATTTTATCACGCATAGCCTGACAGGCATTGAGCGGCCATCTTACTAGCCAAAAAATAGTCCGTAATGTGGGATTGCCGCTAGTTAACCAATTTTTAGCACAAGGCTACGCGCTTGTGCGTATTTTAAGTGCACTTAAAATCAAACCTAGTACCTATTACAACTGGCGCCATTGGCAACCCAGTCGACAAGAAAAGCGTAGAGAATCCCTGAAACCTTATATTTTAGACGTTTGGAAAACCTTTAAATTTTATGGTTATCGTCGTATTGCTGCTTATAGTCAACAAACCGACGGGCCGAAAGTATCTGAGTATATGACACTCAAATTGATGCGTGAATTAGGGATTAAATCCCGCATGCAAAAACGTTATCGCAAGCCAAAAACTGTGGTGACTGTTGATCAAAAGCCCAATTTGATTAGACACTTGCATGATTTGAGCGGTGTTTGGCAAACAGATATCACTTATATTCAGTTGACTAACCACAGATGGGTCTATTTAGCGACCGTTTTGGATCCTGAGAAGAGAAAAGTATTGGGCTATAAAATTGGCGATACAATGACAGCCGAGCTAGCCACAAGTGCCTTACAGATGGCTTTAGATAAGCATCGAAAGCCATTAATTATTCATTCAGATATGGGGTCACAATACACGAGTGCTGAATTTGATATTAAATGTCAAAATTATGGCTTGAAACATTCATATTCACTCAAAGGACATCCATACGATAATGGCCGTATGGAAGCATTTCATTCAATATTGAAACGTGAAGAGGTGTATTTGAAGGCATACCAAACATTAATTGAAGTCCAAGCAGCCATTGGTTGGTATATCAATTTTTATAATCGCAATCGTATCTCAAATGTTGCCTAAGTAACTGAATAAAAATAGTCCAATTTATTGACTTCTGAGCATATTTGTCGGGATGGATAATTATTGTTACATAAACTAATGGTGGCCAAAATTAATATTCCAGCGATAAATAGCAGTCTTTTTTTTAACATATTCTCCTCCTTTCTGACAAAATCAAACGATTATCATTACATCAGTTACAATTTAAAATGAATATAACAAAAATGTTTCTTTTTTTACATGTACTGGCTTTCACAATCAAGGGGCTGAAAGTGTACAAAACCACTTTCCCACCTCACCATTATTTAATTATTATATTTACCATTAATTGCACAGGTTGTACAGAATATCTAATAATCAAATTAGAACATACAATTATTCTAATGTAATGATATCCAAGTCGTTTCACTTGACTTATTAGCAAATAGATGTTAAATGATATTTATTTCACAAATAGTTTAACGCATAATTCAAATAAAAAAAACCTAATCTTCACATCAGAAAAGGTTTTTTCTAGACATCTTTTGCTTCATTAAGACACTATGCTATTCAAAAATGATTGCAACGCCTCACGCCAACTCAAAATCTCAAATCCCGTCGCCTTAGCCTTATCCAAACTCATAACAGAATGCTTTGGTCGGTATGCTTTTTGTGGAAATTCTGCGCTAGTTACTGGGGCAACTTCAACGTCTGTATCTTTCAAAATTTCCCGAGCAAAGTCAAACCACGTGGCAATACCGTCGTTAGACAAATGATAAATACCATAGGCGGCCTTAGTATCTACCAAATGAAGCATAAACTCAGCCAAAGTACGTGTCCAAGTTGGCCGTCCAAGTTGATCGTTCACGACTGTCAACTTGGGATGAGTGGCTGCCAAGCGTTGCATGGTGTAAACGAAGTTATTGCCAAACTCGCCAAACACCCAACTTGTACGAACGATATAGGCATTTGCGCCACTTTCAGTAACAGCCAATTCACCGGCTAGTTTAGCTCGTCCGTAGGAATTTTGAGGATTGACCGCATCTGATTCGAGATATTCGCCCTCGTTGGTACCATCAAAAACATAATCTGTTGAAACGGCTACTAGTTTCGCCTCGTATAACTTAGCAGCATCAGCAACATTTTTTGTCCCATCAACATTAACCTGCCAGTTTAACTCGCGCCCGTCATCTTCAGCTAGATCAACTTTTGTATAAGCCGCCGCATGCAAAACAACATCCGGTTGCGCTTGTTCAAATGCTGATAACACAGCTGCGCTGTTCGTAATATCGAGCTGTTTTGAATCAAAAGCAACAAAATCTAGTCCACGCTCGCGCAATAATTTTTGTAATTCTTGCCCTAGTTGACCATTAGCACCTGTAATTAAAAATTTCATTCCAATTCTCCCTCATAGACAAAAAACTCACATGCGTGAGTTTTAACTTTATTGATTATTCTGTGCGTACTTGGCTTCAACTTCATCTTTTTCAGCCTGCCACCAAGCTTGGTTATCTTTGTACCACTGAATGGTATCAGCTAGGCCAGTTTCAAAATCAGTATACTTTGGTGCCCAACCCAACTCTTCGCGAATTTTTGTGGCATCAATTGCATAACGTAAATCGTGGCCTGAACGATCTTGAACAAAGTCGAAGTCATCTTCAGCTTTACCCATATATTTCAAAATAGCGCGCAATACCGTGATGTTGTCTTTTTCACCATCAGCACCAACCAAGTAAGTTTCGCCAATTTTTCCCTTAGTCAAAATTGCCCAAACTGCTGTCGCATGGTCATATGTATGAATCCAATCACGGACGTTTTTACCGTTTCCATACAACTTTGGCTTAATCCCACTGATAATATTCGTCACCTGACGAGGGATGAACTTTTCAATGTGTTGGTATGGGCCGTAGTTGTTTGATGTGTTTGAGATAGTAGCTTGCAAACCAAACGAACGTACCCAAGCACGAACTAACAAATCAGAACTAGCCTTTGTTGATGAATAAGGGCTTGAAGGACGGTATTGTGATTCTGGTGTAAACTTTTCGCCAGCACCCTCGCCATGTCCTGGCAAATCTTCACGCAATGGCAAGTCGCCATAAACTTCGTCAGTTGATACATGGTGAAAACGCTTGTTATACTTGCGTGCTGCTTCAATTAAGGTATATGTACCAATAATGTTCGTCTGTACAAATGGGGATGGGTCTTTTAATGAATTATCGTTATGACTCTCAGCGGCATAGTGGATCACGGCATCGGTTTCAGAGACCAATTGATCAACCAATGGCGCATCAGCAATGTCACCAACCACTAATTTCACGCGGTCTTCAGGCAAACCTGCCAAGTTTTCCTTGTTACCAGCATAGGTTAATTTATCTAAAACTGTCACAAAAACATCAGGATGTTCTTCGACAATGTAACGGACAAAGTTCGCCCCGATGAAGCCGGCACCGCCCGTTACTAAAATATTCTTATATTCAGTCATGAATGTTCTCCTATTACAATTGCTCTTTTGTTAGTGGCACGACATCTTTTAGCAAAGGATGGTTTTTGTCTGCTTCACTTACTTCAGCATTTTCAACATCATGCCATTCAATACCCAAAGCAGGATCTGCATAATTTACAAAGGCATACTTTGGCTTTAAATCTAGTGCCCAGTAGTCATTGACTAAGTATGAGTACGATACTGTTTCACTCAATACTTGGAATCCATTAGCAACACCCCGTGGTACATAAATGCCCTTGCTAGCATCGATAACCGTTTGGTAAACATGTCCAAATGAATCACCCTCGCGTAGGTCAACCCAAGAGCCCAACACACGACCATTATCAGCCACAGAAATGTACTTGTCCCATGGTTCAGCATGCAGGCCACGTAGCACACCCTTTCGTGATAAGGACACATTGTTTTGTAACTTATCTTCTTTAAAGAAGGATTCTGGAAAACCAAGCGGTAACATCTTTTCTTTTTGGAAGTTTTCCTTAAACCAACCACGATTATCACCGTGAACAGGAATATCGAAAGCAATCATCCCCGGAATAGCTGCAATTGGTTGTGCTGCCAATTTTTTCTCAAAAAATTCTTCAGTCATCTAAACACCTTATTCCCCTTCTTCATCAACAATTCTGAGCAAATATTGACCGTAATCATTCTTCTTCAGTGGTTGTGCCAACTTTTCTAATTGCGCAATATCAATATATCCCATACGGTAAGCAATTTCTTCTAATGAAGCAACTTTTAAGTTTTGTTGTTTTTGAATCGTTGCAATGAAGGAAGAAGCTTCGAGAAGTGAATCGTGTGTCCCAGTGTCAAGCCAAGCATAGCCACGTCCCATGACTTGAACATCCAAATCGCCACGCTCTAAGTAAGCTTGGTTAATATCAGAAATTTCAATTTCACCACGCTCTGATGGTTTAACGTTGGCAGCGATTTCCACGACATCATTGTCATAGAAATAAAGACCGGTTACGGCGTAATTGGACTTTGGGTGTTCTGGTTTCTCAACAATGGACAAAGCTTTGCCATCCTTGTCAAATTCAACCACACCAAATCGTTCCGGATCCTTAACTTGATAACCGAACACTGTGGCACCAGATGTTTTCAGAGCAGCTTCTTGTAATTTCTCTGATAACCCTGCGCCATAGAAAATATTGTCACCTAGCACCAGAGCCACAGCGTCATCACCGATAAAGTCAGCGCCAACAATGAACGCATCAGCCAAACCACGAGGCTCTTCTTGAATCGCATATTCGATATTTAGACCAATATCATGACCATTACCAAATAGTTCTTCAAAGCGTCCAACGTATTCAGGCGTTGAAATTAGCAAAATATCCTTAATACCAGCTAACATCAGAACAGACAATGGATAATAAATCATTGGCTTGTCGTAAATTGGTACCAACTGCTTACTTGTTGCCTTAGTGATTGGATAAAGTCTCGTGCCAGAGCCTCCGGCTAGGATAATACCTTTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP012009|145351:150375|147845_148883_-|WP_048592250.1|DBSCAN-SWA
MTEYKNILVTGGAGFIGANFVRYIVEEHPDVFVTVLDKLTYAGNKENLAGLPEDRVKLVVGDIADAPLVDQLVSETDAVIHYAAESHNDNSLKDPSPFVQTNIIGTYTLIEAARKYNKRFHHVSTDEVYGDLPLREDLPGHGEGAGEKFTPESQYRPSSPYSSTKASSDLLVRAWVRSFGLQATISNTSNNYGPYQHIEKFIPRQVTNIISGIKPKLYGNGKNVRDWIHTYDHATAVWAILTKGKIGETYLVGADGEKDNITVLRAILKYMGKAEDDFDFVQDRSGHDLRYAIDATKIREELGWAPKYTDFETGLADTIQWYKDNQAWWQAEKDEVEAKYAQNNQ
>NZ_CP012009|145351:150375|149499_150375_-|WP_048592251.1|DBSCAN-SWA
MKGIILAGGSGTRLYPITKATSKQLVPIYDKPMIYYPLSVLMLAGIKDILLISTPEYVGRFEELFGNGHDIGLNIEYAIQEEPRGLADAFIVGADFIGDDAVALVLGDNIFYGAGLSEKLQEAALKTSGATVFGYQVKDPERFGVVEFDKDGKALSIVEKPEHPKSNYAVTGLYFYDNDVVEIAANVKPSERGEIEISDINQAYLERGDLDVQVMGRGYAWLDTGTHDSLLEASSFIATIQKQQNLKVASLEEIAYRMGYIDIAQLEKLAQPLKKNDYGQYLLRIVDEEGE
>NZ_CP012009|145351:150375|146954_147797_-|WP_048592249.1|DBSCAN-SWA
MKFLITGANGQLGQELQKLLRERGLDFVAFDSKQLDITNSAAVLSAFEQAQPDVVLHAAAYTKVDLAEDDGRELNWQVNVDGTKNVADAAKLYEAKLVAVSTDYVFDGTNEGEYLESDAVNPQNSYGRAKLAGELAVTESGANAYIVRTSWVFGEFGNNFVYTMQRLAATHPKLTVVNDQLGRPTWTRTLAEFMLHLVDTKAAYGIYHLSNDGIATWFDFAREILKDTDVEVAPVTSAEFPQKAYRPKHSVMSLDKAKATGFEILSWREALQSFLNSIVS
>NZ_CP012009|145351:150375|148896_149490_-|WP_014947523.1|DBSCAN-SWA
MTEEFFEKKLAAQPIAAIPGMIAFDIPVHGDNRGWFKENFQKEKMLPLGFPESFFKEDKLQNNVSLSRKGVLRGLHAEPWDKYISVADNGRVLGSWVDLREGDSFGHVYQTVIDASKGIYVPRGVANGFQVLSETVSYSYLVNDYWALDLKPKYAFVNYADPALGIEWHDVENAEVSEADKNHPLLKDVVPLTKEQL
>NZ_CP012009|145351:150375|145639_146443_+|WP_169747273.1|transposase|DBSCAN-SWA
MGLPLVNQFLAQGYALVRILSALKIKPSTYYNWRHWQPSRQEKRRESLKPYILDVWKTFKFYGYRRIAAYSQQTDGPKVSEYMTLKLMRELGIKSRMQKRYRKPKTVVTVDQKPNLIRHLHDLSGVWQTDITYIQLTNHRWVYLATVLDPEKRKVLGYKIGDTMTAELATSALQMALDKHRKPLIIHSDMGSQYTSAEFDIKCQNYGLKHSYSLKGHPYDNGRMEAFHSILKREEVYLKAYQTLIEVQAAIGWYINFYNRNRISNVA
>NZ_CP012009|145351:150375|145351_145594_+|WP_011679759.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSIRYSQDFKDSLVKLHQEGRSLKSLAEEFGPSKDSIAIWVKQATPVMIQGRSKTLKDVKQLEKRLAILEEENEILSRIA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011679759.1|145351_145594_+|transposase	transposase	Q6J1X3	Lactobacillus_phage	3.1e-06	36.1
WP_169747273.1|145639_146443_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.1e-31	36.8
WP_048592249.1|146954_147797_-	dTDP-4-dehydrorhamnose reductase	A0A1D8EQE2	Escherichia_phage	7.0e-29	34.5
WP_048592250.1|147845_148883_-	dTDP-glucose 4,6-dehydratase	A0A1D7XFE8	Escherichia_phage	1.0e-74	45.7
WP_014947523.1|148896_149490_-	dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase family protein	H9NC63	Sphingomonas_phage	2.5e-09	29.7
WP_048592251.1|149499_150375_-	glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RfbA	I7I009	Enterobacteria_phage	9.6e-98	59.4

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP012009|472756:483527|DBSCAN-SWA
CTCATCGCTTTGTTCCTTCAACTGCTTGCCTTAAATCTGCCAATAGGTCCTCTTTATCTTCTAATCCGGCACTCACACGCACCAATTGATTGGTAATACCCAAGTGATCACGCTGCTCTTGACTCATATCGTGATGTGTTTGCACCGCAGGAATCGTAATTAGCGTTTCTGGACCACCCAAGCTTTCCGCAAAAGACCCGATTTGTAATCCTTTCAAAAAAGCATCTACATCATAATCGTTTGACAAATAAAAACTCAACATTCCACCAACACCAGCATATAAGACTTTATCTATACCGGGAATACACGGTAATTTTTTGGCCAAATATTGACCATTTCCATTGTGGCGTTGCATCCGAAGATGCAACGTTTTCAAGCTACGCAACAATAACCAAGAGCTAAACGAATCTAAAACCTGTCCGCGTGTCGTCAGTGATATTTCTAATTTTTCAGCTAAATCATCACTATTAACAATTACTGCTCCAGCCAAAATATCATTATGTCCACCAAGATACTTTGTGGCGGAATGAACGACAATATCCGCGCCAAGTGTCAATGGCTGTTGAAAAATAGGTGTTAAGAAAGTGTTATCAACAGCAATTAAAATATCAGGATTGATGCCTTTTACTTTTGCACTTAACTTCTGAATATCGATTACTTTCATCGTTGGATTAGATGGTGTTTCCAACCAAACAAGTCGCGTGGTTTCGTTAATTAAGGTCGAAATGTCATCCACCCCATTCCAAACATCATAGCTCACGCCACTCTGTTCAACAATGGCATCGAAATAGCGATATGTGCCGCCATATAGATCATCCGAGGTAACAAAATGGTCACCATTTTTAATCAATGACGCAAACAAAAGATCAATCGCTGCCATACCAGAGCTGGTAGCAAATGCCTGCACGCCCTGTTCCAAATCCGCTAACTGCTCTTCCAATATTTGACGTGTGGGTGTTTGTAAACGTGCATAGTCAAAGCCAGATGATTCACCCAAATTGGGATGTCGATAGGCCGTTGAAAAATATAATGGACTAACTACTGCCCCTGTTTTAATGTCATCACTGCCGTTACCGCCCTGTGCTAATAATGTATCAATTTTAATGCTCATAAGTATTTACATTGCGAGGTCCCTAGACCCAGCTTGTTCCTCTCTTGATTTAATGTTGGTATTGTTGATCTTGATGAAGTCATCTTTTCCATCAACAGTTCCCCCCAATTTACAAAAAATTTTTCAGCATAAGTCTGCCATGTATTGGTTGGTTTATTATTATAAAAATAGTTCTTAGGCTTAATTGTGTTTGGGTCAATTGCTATATCACGAAGATATTCGTTCTCTAAAGTCTCAGTGTCGTATTCGAAATGTCCAGTAATGTAGGTTGAGTTTACATGTTCATCCCTCAAAATAAATGCGCCCAAAATATCGTCACCAGCAACTTTCAAGCGTCTAGCCACACCAAAATTTGGTACCGTAAAGTAACGAGATTGTGGCATACTAATGTTTTCCAAATCTTTTAATAATGAATGACGTTTAAAAATTTGGCTAGCTTGAAAGACGCCCGAAATTTTTTCTGACAAGGCTTTAACAGGAAAGTTTCTCTCTGCATAGCCAGCGCCATACGCTGCCCAACATGCAAATAGACTTTCAGTTACATGTGTTTTTCGCCATTCTAGTAAATGACGAAATTCATCCCAATAGTCGATTTGTTCAAATTTCATGCGATCCACTGGCGCACCTGTAACGATCATGCCATCGAATTTTTTGTGCCAAATATCGTTGAGTGTGACATAGTTAGTCATAATTGCATCCGTGTCGTGGCGAATTTCATGCTCACTTGGTACTGCAAATGTTACTCGCACATTGATAGGTAAATGACTCAACAATCTTGTGAACTGCTTTTCAGTCTGTAATCGATTGGGCATTAAGTTGACCAAGAGTATATTGATAGTCGGTTCTAATACTTCAAAACGACCGATTACAAAGCTTTCACGCTTCAACAAACCGTTATTTAATATAACACTCATACGTTCCCTCCAAATTCTTAAAAAATAAAAAACGTCCCGTAGTATCTAAAGATACTACGGGACGTTAATTGACGTGTTACCACCCGGTATTTATGTAAACATTGCAAGTTTACACCTCCAAACGTACGCCAAAAAATTTCGTCGAGAACATCTGTGAAAGCTTTGGTTTATACGTTGTCCAGTAACGGGGACGCCCGATTTCAACTTACCGCGTAACACATATGAGTGTTCGCTTGCTCGTATCCGTAAAAAACTCCAAGACCATTTTCCAACTAATTATCTTACCCGCTTTCACCAAACACGAGCTCTCTAACTAAGATTCAAAGATGTACTTATCTTTTCAACGTTTATATTGATTATTACTATAACTTTTAATTTGATATATGTCAATAGTTTTTAATATTTCTCATGGTATTTTTTTATATCTTCTTTCATCTCGGTTTTATATTCAGCATTAGAAACTACTTTATGGTATAATTCTACTAGAATTTAGTGAGGTAAATAAATTATGTACGAACCAACACATAACTCAAATGAAGCTGTTGAGGAACATATAAACAAGCCCGGTCGTCATGTCATGTTTCTTTCTGCAGATTGGTGTGGTGATTGTAAAGCCATAAAGCCTTTTATTCAAACTATCAAAGATGAAGTTACACAAACTGCTGAATGGTTTGATGCTGATAGAGACGAAAATATTGATGTCGCAACAAAACATAACATGCGTGGTATTCCATCTTTTGTTTTGTTTGAAAATGGACAAGAAATTTCACGTATCGGACACGGCGAACGCCTAACACCAAAAGAAATCGTAGATTGGTATCATTCAACACTTTAGTTTTAATGCCAAAAATAGCCCATAAATATCGCAAGAAATTACTAAACTTGTGATATTATGGGCTCTTTCTATGTTGCGTTAATATGTTAGTTGCTACTTTTCGGTATTCTTAATAAATGTCTGAACAATATCTGCTGGAATAGCAAATCCCATGCCTTCAACACTCGTACCGTCCGTAGAAGAAGCTATTTTTGACGAGTTAATACCAACTACTTGACCTTTTAGGTTAATCAATGGTCCACCAGAATTACCAGGATTGATAGCGGCATCTGTCTGAATAGCAGTAGTTGCTGAAGAACCCGTTTCTTCAGCAGAAAGTGTGCGGCGTGGGGCTGAAACAATACCACTAGTCAAAGAAGTAGCATAATCAGAACCCAAAGGAGAGCCGATTGCTAAGACCTGTTGACCAGACTGCAGTTTTTTGGCATTACCAAAGGATGCTGATGTTTTGATATCTGTGGTTTTTGCCTTTAACAGAGCCAAATCTTTGCTTGAATCTGTGCCAACGATAGTTGCTTGAATTTTTTTACCGCTAGCGGTAATTAATTGTAATTCATCAGAATCAGCTACCACGTGATTGTTGGTAATAATATACGCATAGCCACCAGAAATTTTATAAACAACACCTGAACCCTCTGATGCTGTTTCCAATTCAGAACTACTATCTTGCTGATTTTGCTGGAAATATGATGACCAACTACTGCTTGACGATGTTTTCTGTAAATTCTGAACGGTAACCACAGCGTTTTTCACTTTGTTATAAGCCGTTGTTGCCGTATCACTACTTGTGTAAGCTGTTTTGGCAATAGTTGTTGTACCAGCTGAGTTGCTTGTTTTTGTTGTATTTGTACGTTGCTGGAACCAAGAATCTGGTTGCAATCCAGAATAGACAACAAAACTTGCTACCAATGCCGAAACTATAGCAACGATAATTAAAGAATACTTTTTCATAACTCGCCCTTTCATATGTGTACATTATTGCTTTTCTGACAAAATCCACACCCTATTATATCCATAATAATGACGTAAAGTAAATTAAACATTAAAGGGGTAAAATGACTTTAAAAACAGTACCTTGCGGCTGATTATCTGCTACTGTTATTTTACCACCGTGAGCATGAACTACCCATTCAGCAATCGATAATCCAAGTCCGGTACCACCAGTTTGACGATTACCAGTTTTGTCTTCACGATAGAAACGATCGAAGACATGTTTTTTAGCCTCATCACTAATTCCTCGACCGCTATCAGCAATGGTGAGGACAAACTTTTTCTTTTCAATACCTGCTTTCACAGCAATTGTCGCACCAGCATCTGAGTACTTCAATGCGTTATCAAGTAACAAAACTAGTAACTGATGAATTCGTTTCTGATCTATAAAGATCGCTTGATTTACATCAACCTCAAGTGTCACAGCTTTCTCTTCAAACTCTGCCATTTCTTGATATGGTGTAATAATGTTTTCTAAGAATTGCTTGACATCCGTTGATTCTTTTTCAATGGCGGTCATATTAGACCCTGTTTTTGCTAACGTTAACATATTATTTGTTAAAGAATTTAACCGTCGCACTTCAGAAAGCGATAAAATAATAGCATTTGACTGATCACGAACCGTTGATTCCGGTTTTGTCAGCATTGTCTCTAGCTTACCTTGAATAACGGCCATAGGTGTCCGTAATTCATGAGCCGCATTGTTAACGAAGTCTTGTTGTTGTTGCCAGGATTTTAATATTGGTTTCATATTTCGCCGAGCAATTAAATATGATACTATCACTAACAAAATACCAAAAAGACCAAAGGACCAGAACAATACTTTCTTAAAATTATTCAAGTTATCCATGGTGTCTGTAACATTAACCGTTACCATACCATGGACTGCAATTTGATTATAGCCCTTAGCAGCATTTTTCTTGAACTGAAAACCAATGATTCGGTAATAATTACCATAAAATTTATAGGTATTAGGTTTAACCGTCATTGTTGCTTTATCAAATTTGATAGCTTGTTGTAGCGCTTTTTGCAAAGCTGCTTGACGTGTATCCTCCGTATTGCTATCAATTATCAACTTACCATTTTTGTCAAATAACCATGTTTCTGTTCGCGTGCTGGTATTATTATACAAAGGTTGTGGCTTCTTGAC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CTGCTACAGCGAACATTGAATATCCAGCAAAGTCAAAAAATAAATTCAAACCGTAAATATACATATACGCTATTATCCACCATGACCATCCGCCTTGAGCGTGTGCAGAAATAATCGCCATACGCTCAACATTTGGCATTAATACAGTTCCCAAAGCATGAGAGACGATGAATTTATACAAAAAACCAATGAAAAGGTATTTGACAGCTTTGCCAAGCATTTCTAGATACTTATCGCGCGTCGGTGCTTTCTCAACATCTTTCACAAAACGACGGTACCGATCAATAGGACCTGACGAAATTGTTGGCATAAACAGCATGAACCGCAAGAAAAGCCAAGGATTAAATTCTTGAATCGAACCATCACGTATTTCCATCACCATACCAACTGAACGGAATGTCAAATACGAAATACCCATAAATCCGAGTAAGGTTGTCACTTGCAACCAATTAGCAACTGGCGCAACCTTAATTAATACTAGTGGCAAGATAGCTAAAATAGTTGTGACATAAAACACCCAAGTTCGGTTGTACTTTTTACGATACAAAGTATAGGCCCAAACAAGCAGCCATTGCCAAATCATGTAGATAATTAATGCGATACCTTCATGGTATTTCTCACCATCAAACATCAAGAAAATAAAGACAAGTGAGACCAGCACTTCATACCAAGCTATACGCTTTCCAAAGTATAAACCAATGGCTAGAGGCAGTAGTACCAACAATAAAATAATGAAGTACTGCGGATCTGCATAGGGTTGTAGATTAAGCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MSIKIDTLLAQGGNGSDDIKTGAVVSPLYFSTAYRHPNLGESSGFDYARLQTPTRQILEEQLADLEQGVQAFATSSGMAAIDLLFASLIKNGDHFVTSDDLYGGTYRYFDAIVEQSGVSYDVWNGVDDISTLINETTRLVWLETPSNPTMKVIDIQKLSAKVKGINPDILIAVDNTFLTPIFQQPLTLGADIVVHSATKYLGGHNDILAGAVIVNSDDLAEKLEISLTTRGQVLDSFSSWLLLRSLKTLHLRMQRHNGNGQYLAKKLPCIPGIDKVLYAGVGGMLSFYLSNDYDVDAFLKGLQIGSFAESLGGPETLITIPAVQTHHDMSQEQRDHLGITNQLVRVSAGLEDKEDLLADLRQAVEGTKR

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_002815833.1|475288_475615_+	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592424.1|475708_476566_-	trypsin-like peptidase domain-containing protein	W5SAB9	Pithovirus	6.7e-11	29.8
WP_048592425.1|476657_477956_-	HAMP domain-containing histidine kinase	A0A1V0SGX0	Hokovirus	4.4e-14	26.5
WP_011680398.1|477936_478638_-	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	4.0e-30	35.4
WP_002815839.1|478718_479084_-	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	A0A2P0ZKX3	Lactobacillus_phage	9.4e-07	36.8
WP_048592426.1|479122_480244_-	alanine racemase	A0A0P0YM39	Yellowstone_lake_mimivirus	2.4e-29	29.5
WP_002815841.1|480240_480651_-	holo-ACP synthase	NA	NA	NA	NA
WP_048592427.1|480721_482008_-	D-alanyl-lipoteichoic acid biosynthesis protein DltD	NA	NA	NA	NA
WP_010292689.1|482012_482249_-	D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit DltC	NA	NA	NA	NA
WP_048592428.1|482318_483527_-	D-alanyl-lipoteichoic acid biosynthesis protein DltB	A0A125RNP0	Pseudomonas_phage	6.5e-20	26.7

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP012009|522940:583921|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP012009|522940:583921|560565_560703_-|WP_155403326.1|DBSCAN-SWA
MADDFEQLPDEPEWYKGFNRTKAGAIRGTVMCSEVNKLDYFYSVT
>NZ_CP012009|522940:583921|536022_537540_-|WP_002815626.1|DBSCAN-SWA
MAIQAEEISALIKQQLEKFDTTLTVEEVGTVTYVGDGVARATGLANALAGELVEFANGTYGMAQNLESSEVGIIILGGFDDIREGDTVKRTGRIMEVPVGEQLIGRVVNALGQPIDGLGEIKTDKTRPVEVKAPGVMERKSVSEPLQTGIKAIDALVPIGRGQRELIIGDRKTGKTSLAIDTILNQKDQNMIVIYVAIGQKNSTVRAQVETLRQMGAMDYTIVVNAGPSEPAPMLYLAPYVGAAMGEEFMYNGKHVLIVYDDLSKQATAYRELSLILRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKLSDELGGGSMTALPFIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQVFLDADQFYAGVRPAIDAGTSVSRVGGDAQIKAMKKVAGTLRLDLASFRELESFAQFGSDLDSATQAKLARGRRTVEILKQPLNKPMPVQHQVVVLYALTHGYLDDVEVADIQRFQDELIAYVDANASELFKAIVETKNLPEEADLNAAIEAFKAGFAGSESAE
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MFIGNNVKLSHYHEEDGKKLASWQWDEDFVTPLASDMIHPYTAEDWEKIFRDASNSYENVEFTIRKVSDDSLVGFVDLSDISVRNHSCELGIGFPKKEDRSKGYGTEALSLILSYGFNNLNMHKIKLSVYPFNIGAVKSYTKAGFVKEGTAKNEIFYNGKWVDIDYYAIFQEDWYARQQ
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MDLHNLGVIAAGLAAAGAAVGGGIGNGVLISQFLAGMSRQPELEGRLLSRMFLGVALVEVMPILSIVFAFMLMGK
>NZ_CP012009|522940:583921|559050_559392_+|WP_048592465.1|DBSCAN-SWA
MDENSKIVPVEIKGWNWGAFMYNIFWGIGNKTYLPLLCLIPLFNFIWIFVCGFKGNEWAWQKGDYTDVEKFKAVQATWNRAGLVQFILTIAILVLYFLLFVVLFSSVLNQNNY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_002815607.1|522940_523960_-|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_025268503.1|524253_525555_+	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_048592442.1|525904_527014_-	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_014325137.1|526997_528026_-	A/G-specific adenine glycosylase	NA	NA	NA	NA
WP_002815612.1|528114_528258_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592443.1|528342_529740_+	multidrug efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_002815619.1|529796_530564_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	2.3e-18	29.0
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WP_048592445.1|532068_532707_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	K7QMG8	Staphylococcus_phage	3.1e-05	39.4
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WP_011680434.1|535099_536008_-	F0F1 ATP synthase subunit gamma	NA	NA	NA	NA
WP_002815626.1|536022_537540_-	F0F1 ATP synthase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
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WP_048592449.1|539036_539762_-	F0F1 ATP synthase subunit A	NA	NA	NA	NA
WP_011680437.1|540119_541391_-	uracil transporter	Q9KX94	Enterobacteria_phage	1.0e-60	38.1
WP_048592450.1|541517_542231_-	2,3-diphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_002815634.1|542338_542539_-	cold-shock protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	2.8e-21	73.8
WP_048592451.1|542717_543392_-	DUF4811 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014325143.1|543388_544900_-	multidrug efflux MFS transporter	A0A0M3UL24	Mycobacterium_phage	1.4e-08	22.7
WP_048592452.1|545020_545710_-	type I pantothenate kinase	A0A1B1ISL9	uncultured_Mediterranean_phage	2.6e-26	32.0
WP_048592453.1|545709_548073_-	ATP-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592454.1|548306_548726_+	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592455.1|549771_550761_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048593123.1|550822_551440_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_048592456.1|551600_551903_+|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592457.1|552106_552547_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592459.1|553266_554070_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.0e-29	36.0
WP_048592460.1|554078_554339_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	7.2e-09	39.3
WP_048592461.1|554992_555601_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592462.1|556385_556901_+	ClbS/DfsB family four-helix bundle protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592463.1|556952_558122_-	DUF2075 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592464.1|558431_558971_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_048592465.1|559050_559392_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592466.1|559496_559757_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	1.9e-09	40.5
WP_048592467.1|559765_560569_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.9e-31	36.8
WP_155403326.1|560565_560703_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592468.1|561696_561891_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053079875.1|562035_562611_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	L0P7E1	Lactobacillus_phage	1.3e-15	41.1
WP_080968823.1|562528_562834_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592470.1|562909_563539_-	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592471.1|563684_564002_-	hypothetical protein	E3W8E2	Leuconostoc_phage	2.0e-05	25.6
WP_048592472.1|564706_566263_-	ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L0W2	Tupanvirus	2.0e-42	26.4
WP_002815665.1|566622_566955_+	lactoylglutathione lyase	NA	NA	NA	NA
WP_011680466.1|567008_568061_-	alcohol dehydrogenase AdhP	NA	NA	NA	NA
WP_002815670.1|569655_570873_-	phosphoglycerate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_048592474.1|570958_571789_-	glycosyl transferase	NA	NA	NA	NA
WP_048592475.1|571785_573231_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_048592476.1|573569_574454_-	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592477.1|574547_576440_-	endopeptidase	E3T4I7	Cafeteria_roenbergensis_virus	5.5e-74	30.1
WP_048592478.1|576545_577481_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.1e-22	33.3
WP_011680474.1|577483_578533_-	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	1.0e-13	29.6
WP_048592479.1|578547_579573_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_048592480.1|579584_580502_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_048592481.1|580585_582220_-	peptide ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592482.1|582682_583921_+|transposase	ISL3 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	4.4e-40	29.3

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP012009|618772:656419|DBSCAN-SWA
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MSKKKMKKTLPEQVMDKHKVKYEPLELNILDKTPVQRDAILETFHVKHDDIYKTLAAHGDKTGPIVAVLPITKHLSLKKLAAASGNKKVAMLPLKELQRTTGYIHGANNPVGIWQNKHFPIYFDLSAAEQPFILVSGGELSRSDKINPRDVASLVGAEFVDLLEHD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_025268551.1|618772_619273_+|tRNA	aminoacyl-tRNA deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_048592495.1|619946_621410_-	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	3.6e-97	43.3
WP_002815497.1|621411_621864_-	50S ribosomal protein L9	NA	NA	NA	NA
WP_048592496.1|621880_623908_-	DHH family phosphoesterase	NA	NA	NA	NA
WP_004911134.1|624077_624362_-	30S ribosomal protein S18	NA	NA	NA	NA
WP_002815494.1|624394_624961_-	single-stranded DNA-binding protein	A0A218MNB4	uncultured_virus	4.2e-38	69.6
WP_048592497.1|624994_625291_-	30S ribosomal protein S6	NA	NA	NA	NA
WP_048592498.1|625548_626979_-	dipeptidase PepV	NA	NA	NA	NA
WP_011680505.1|626975_627803_-	energy-coupling factor transporter transmembrane protein EcfT	NA	NA	NA	NA
WP_048592499.1|627804_629481_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	5.3e-20	34.3
WP_002815489.1|629512_630076_-	ECF-type riboflavin transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592500.1|630101_630962_-	SAM-dependent chlorinase/fluorinase	NA	NA	NA	NA
WP_048592501.1|631314_633123_-	DNA helicase RecQ	A0A2K9L3P7	Tupanvirus	3.6e-75	35.4
WP_048592502.1|633169_633613_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592503.1|633682_633943_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	1.1e-09	40.5
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MSKIREPRYRKIAFQIAEKIVNNEYKVGSKLHARSTLSVTFGVSAETARKAINILSDLDIVKPIHGSGIEVLSRERAKYFLNQAQETTNIQTIHDQINDLIETQRTSLNSLSDSLTALFDQTQRVQRHNPLTPYEFSLSDSSKQLGESIGNLNIWQNTGATIIAILHNEELVVSPGPYAVIESGDTLYFVGTEMAFHAVQNFFQ
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MTKVAWILKHNRTKIYYLVVTILLLLLFSWTIMTGFDALRHRFSFISFNIWNVLEFVTFVSGNIGIVFWQYLKWRRDESLYRLIREMRQVARENSDMTISWRAPYAPTTQALIDVSNTIAENTRRIREEERQSERSKDEMITNISHDLRTPLTAIIGYLGLVEMGQALSEKDRKKYIHTAYSKSNQMKVLVEDLFEYSQTQAQDAALNITSLSLNDLFGQLLAGYELEAQEKNIALNQLTNPEMIVIEADSDKLARVLMNLVSNAFKYGDGATFIKLTAQIDDKNVVIRVTNDGVKIPDEAIGDIFDRFYRVESSRNSKTGGTGLGLAIVKGIVVQHHGSVAVESDDDMTSFIITLPLKQT
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MKHNPYLEERDNKNDARANLPTRLRILLFISFILMVALVVQLGFLTIKQGANYLAEVNRSEETVEKGNTPRGLVYDSTGRVLAGNKAQTAITFTRGTNITSSTMRSTAIKLGKYLTVDTTRLSDRSKADFYLADATNAAKVQKRVAKEHKNGSSLTTSEINSLSVSYVEEHNLLSKVSDNDAMIFQRMSGAYSLSTTFIKEDDVTETELAEIGERLSQFPGIKIGTSWARQYPEGNDFKALIGTVTSEDNGLPDDKLHTLLAQGYSQNESVGSSNLESSYESLLKGSASQTVVTTASDGTVKSSSVKYKGQSGDSLKLTINADFQKEVQKILEDNLPTGDVQGAYATVMNPYTGGIYAMAGVDRDYSTGTKTADPLGNINHAIVMGSVVKPAVLATAFQKGVITPSNSTLLDQAIKIAGTPTITSYWNKTGTPVSVDAQTALERSSNTYFVQLGMKIGGQTYSSGSALALNSDAFQTLRNGLGQFGLGTKTGIDVSGETAGYRGDTTGSNIGKYLYESFGQYDTYTTLQLARYVATIANGGYLIQPHLVSSILQSSTNSSKKRTVWTATPNIQGQVQLDSDEWKVIHEGMNRVANGTDTYNTGGTDIHKLEPHVYAKTGTAETTTNGHTTYTESIVAYVPGQPMVMAMAIPGMNNYLDGTNGKIAAKIINAYWKYVQNKP
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MQDSTSVNPKHHLVQKTEDDLSLSDVNGSIEVPENGSFWRKLLAFSGPGALVAVGYMDPGNWVTSVAGGAQYRYTLLSVVLISSLIAMMLQYMAGKLGIVKQEDLAQATRDRTNKVGGFVLWIMTELALIATDIAEVIGGAIALHLLFGWSMIASVLTTAFDVILLLLLMKFGFRKIEAIVMTLIITILVIFAYLVILSTPQLSALFGGYLPQLQTLSSHTPIGGGDSQLTLTLGIIGATVMPHNLYLHSSISQTRKVDRNNKSELKEAVRFMTWDSNIQLSLAFVINSLLLILGAALFFGLADKVGTFGSMYNALKDNSIAGAIASPILSTLFAVALLASGQNSTITGTLTGEIVMEGFLHLRIPMWLRRVVTRGLALIPVVAFTLIYGGSEGKLDDLMVQSQVFLSIALPFTMAPLIYFTSSKKIMGEEFANPKWIAVLGWIAFAVLTYLNVQLVVQQLMGS
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MAHITFDTKNIENFVADHELDEMQPLIKMANEQLRNRSGAGAEYSDWITLPTDYDKDEFARIQTAAQKIQSDSKVLVVIGIGGSYLGAKMAVDFLNPMFNNELADNQRQGVKIYFAGNSTSASYINDLVRVIGDQDFSVNVISKSGTTTEPSIAFRVFKQLLEKKYSAEAAKQRIYATTDANRGALHDEAKISGYETFTIPDGVGGRFSVLTAVGLLPIAASGADIEALMTGARDAQEEYSDSDIKNNEAYKYAAVRRILYDKGYTTELLINWEPTMQYLSEWWKQLMGESEGKNQKGIYPSSANFSTDLHSLGQYIQEGRRDLFETVVKLDNPVSNIDLPHEDGNNDGLQYLEGVTIDEVNTKASQGVTLAHVDGGVPNLAVHLPAQDAYSLGYLIYFFEIAVGASGYTFGINPFNQPGVEAYKTAMFALLGKPGYEEQTKVYRARLGK
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MDNNMSRMARQNQAPRPDDKQPRKPKRRHKKWRWIVSIIVILLIIGGVVISMLLSNIKESVDTMHRSANITKARDVNQVLKDGKPFSILVLGTDTGALARDRTGLTDSMMLITVNPKSKTTTMLSIPRDIMVSIVGREDTFPQKLNAAFPIAGVGATMSTLQNYLNVPIDFYALVNMGGLEKVIDQVGGVKVKSPLTFTYQPENDKSDVYKFYKNQEKYEYASDGKNFKTYTTMDGYAALSFSRMRYDDPEGDYGRQKRQRLVLKALVKKSASAKTLLNAKFMKSISKNAETDLTYNNVTKIALSYMAATKNQKSDHLQGVGDMYNGVSYQMVKASEKQRVTNLLRKSLNLGSKTTGTQFGSSVPVLSYGVAEYNLNVIGETLDAQ
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MSFLELKDIHKSYFLGKDEFPVLKGINLSFDKGEFVSILGESGGGKSTLMNIIGGLDRNFSGDVLINGNRLDHKQEKKLDVYRRETIGYIFQSFNLINYQTNLENVETSLNMTTLSSAQRKQRAMELLEKVGLSEHVHKYPSQLSGGQKQRVAIARALAADPDVMIADEPTGALDSVNTTEVLELLEQIAQEGKLVIVVTHSQAVANYGTRILHMADGKIDEEKNLKDKFEAPSAPDRLTSRPLSTRSVWDMAFDHLKYKKLQNFLIILGSAIGVFSVILFLGLGNGIKGYINNQVSSLANPNYPTVVKNTLDDDDASSNERVQARAQASTTNYSSIVFSDNVIKKVSNVKNVAKIYQGYEFNGAVFKYGKAQSQAGTQVQTWSPIYADKVIKAGHKPSGDNEIVIDKTFAQKANKNWKSLIGKNITYTYVAYNQNNQAVPVTSTMKIVGITDGGQAGTVFATTFAAMKKDLAKANAMTEANYLTLKVNDTENVKSTVSAVNKIKDNGKQAVVAVSIGSVLDTINTITSLASYVLAAIAGISLIVSAIMIIVTTYMSVSERTKEIGVLRALGARSKDIRGLFTNEALLMGIISAVLGIVTAYLGQFAMNAALYGLIKFDIVQVSLGNVIFAVVISLVIALVASFVPSRRAANLNTIDALAAD
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MPKVEIKHLTKIFGKRPKAAMKMVKQNKSKNEIVEKTGSTVGVYDINMSIEEGEIFVIMGLSGSGKSTLIRLLNRLIEPTAGQLFIDGQEITKLNKKQMIEIRRKKMSMVFQNFALFPHRTLLENTEYGLEIQGVGKEERRKRAEQALENAKLLSFKDQYPHQLSGGMQQRVGLARALTNDPDILLMDEAFSALDPLVRGDMQDELLDLQANVEKTIIFITHDLNEALRIGDHIAIMKDGRLQQIGTGEEILTNPANDYVKTFVGDVDRSKVLTADSIMIPALTSNIYVDGPTVALRKMTAEEVSGLVAVNRHRQLEGYLSSEEAVRARREKLPLADVLTEMPKIKPDTLIMDIMPIIYDAQTPVAVVDDDNRLKGVVIRGAVLKALADTEGEDDNE
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MTNQLFIVIKDTFLSQFKSRGYWMLVIAPLIFAALAGAVIFSITKMQGNTTPNIAVVGNQEVRSILVQSEKELDIHVSNITNEKKANTALQNEKLDGVLTVNKNEATITTRPKSEQIPKEKITAILGNLSRSQKATQYGLTAEQTADLVQPYNLKSVVKQAKQSTNSGNTESANQLIASAIGIITIIIVMWYTSMIANAIANEKSSRIMEILLAATSARVQYFGKIIGIFALVTTHLLIYVIAGFTTFNFFKENSFVKGLASNLNGVTLSFIIYAVIFVLVSVALYLVLTSMIASLINDNAQVQQAIQPISMIAMVGYVFSFIMTQMPNNLLIRILSYIPFASQSMMPIRLVTHTEGWPAAISALLIAVITLFLLLWFGQGIYARNVLSYSDEPIMKQLASRLRHK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_158085800.1|970327_971122_-|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X2	Lactobacillus_phage	1.7e-29	33.2
WP_048592509.1|971154_971430_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	2.4e-10	43.5
WP_048592684.1|971800_972118_+	hypothetical protein	E3W8E2	Leuconostoc_phage	1.5e-05	24.6
WP_048592685.1|972261_972891_+	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592686.1|972966_973503_-	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase	NA	NA	NA	NA
WP_048592687.1|973530_974103_-	uracil-DNA glycosylase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004906421.1|975539_975815_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	5.2e-10	43.5
WP_048592689.1|977379_977880_+	MepB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592690.1|978196_980881_+|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0S951	Catovirus	4.8e-156	41.7
WP_048592691.1|981060_982029_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_048592692.1|982346_983654_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	A0A0A7NU10	Lactobacillus_phage	1.4e-12	44.2
WP_048592693.1|983613_984009_+	C40 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_048592694.1|984200_985319_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	K4ID66	Lactobacillus_phage	1.1e-05	46.5
WP_048592695.1|985394_986648_+	aminoacyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_048592696.1|986728_988771_+	penicillin-binding protein 2	NA	NA	NA	NA
WP_048592697.1|988893_989163_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592698.1|989152_989788_+	SdpI family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592699.1|989993_991982_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.1e-32	42.5
WP_011679206.1|992186_993347_+	LCP family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592700.1|993396_993798_-	YbaN family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592701.1|993857_994781_+	exopolyphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_048592702.1|994773_995979_+	hydroxymethylglutaryl-CoA reductase, degradative	NA	NA	NA	NA
WP_048592703.1|995962_996913_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592704.1|996954_997659_+	NAD-dependent protein deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_048593136.1|997772_998678_+	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_048592705.1|999052_1000447_+	Nramp family divalent metal transporter	NA	NA	NA	NA
WP_010290864.1|1000485_1000953_+	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592706.1|1001037_1001382_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592707.1|1003620_1004568_+	ribonucleoside hydrolase RihC	NA	NA	NA	NA
WP_011679216.1|1004644_1005364_+	16S rRNA (guanine(527)-N(7))-methyltransferase RsmG	NA	NA	NA	NA
WP_004164768.1|1005382_1006144_+	ParA family protein	A0A0K2FLP4	Brevibacillus_phage	1.5e-22	31.2
WP_048592708.1|1006133_1007033_+	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	S5VSZ7	Leptospira_phage	9.4e-16	31.0
WP_048592709.1|1007032_1007242_+	DUF951 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592710.1|1007243_1008344_+	redox-regulated ATPase YchF	NA	NA	NA	NA
WP_004164763.1|1008388_1009087_+	DUF1129 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592711.1|1009123_1009816_+	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	2.3e-38	38.0
WP_048592712.1|1009812_1010898_+	HAMP domain-containing histidine kinase	W8CYF6	Bacillus_phage	6.4e-27	26.8
WP_048592713.1|1010905_1012240_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	B6DZZ7	Stx2-converting_phage	1.0e-10	29.8
WP_014324272.1|1012374_1013076_+	glucosamine-6-phosphate deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_048592714.1|1013123_1014476_+	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_011679222.1|1014594_1015209_-	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592715.1|1015424_1016618_+	glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	5.8e-29	36.6
WP_042251183.1|1016604_1018326_+	ABC transporter permease/substrate binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592716.1|1018363_1018843_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592717.1|1018857_1020078_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011679226.1|1020070_1020964_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.2e-18	28.8
WP_158085800.1|1021077_1021872_-|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X2	Lactobacillus_phage	1.7e-29	33.2
WP_048592509.1|1021904_1022180_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	2.4e-10	43.5
WP_004164747.1|1022670_1022877_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_004164746.1|1023018_1023234_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_158085800.1|1023686_1024481_-|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X2	Lactobacillus_phage	1.7e-29	33.2

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

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>NZ_CP012009|1256651:1269816|1260811_1261969_+|WP_011679405.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_048592840.1|1257918_1259190_+	insulinase family protein	A0A167R9K4	Powai_lake_megavirus	1.1e-17	32.2
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WP_048592842.1|1260090_1260672_+	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011679405.1|1260811_1261969_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	1.1e-117	65.1
WP_048592843.1|1262051_1262744_+	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	6.3e-36	35.0
WP_048592844.1|1262983_1263892_+	phosphate ABC transporter substrate-binding protein	M1U9L0	Synechococcus_phage	2.1e-10	27.8
WP_048592845.1|1263975_1265316_+	two-component sensor histidine kinase	W8CYF6	Bacillus_phage	1.0e-29	35.2
WP_048592846.1|1265457_1266339_+	phosphate ABC transporter substrate-binding protein PstS family protein	H6WG65	Cyanophage	4.4e-10	28.8
WP_048592847.1|1266391_1267315_+	phosphate ABC transporter permease subunit PstC	NA	NA	NA	NA
WP_048592848.1|1267314_1268199_+	phosphate ABC transporter permease PstA	NA	NA	NA	NA
WP_011679412.1|1268206_1269049_+	phosphate ABC transporter ATP-binding protein	A0A1V0SE00	Indivirus	1.0e-11	28.4
WP_048592849.1|1269045_1269816_+	phosphate ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.6e-16	29.3

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP012009|1459217:1525082|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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MYMIYIALAIGAGLILAAQNAVNAQLSFLLKSPLVACFMAYIVGSFLLLILTVILGDFSKIELIFSAPIWMTTGGLFGLVFITSCIILFPKIGSVETVMFPTLGQILSGMFFETFGWFNTTVVMVSVTRIIGIIILLAGTYIAVVLSARHSAIELASSEHSKSQMLNRLWAFGAGILCTVQSTFNGQLGHYIQSPTVSALWAFIIGLIVLAFLKNNNWRHLRIGIHLSQSWFAGLAGAAFVTLMSLLILPLGPGLTVSISTLGVMIGAMLIQQFGLFQSKQQSISIYQIIGVIGMLIGTLIIKIY
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MLRRHSPVWLHHFIVFVIICVSSLLSTLPAFTNNTLKLSYDGNIHLARYDAITQALSHGSLPPLVNFIGLHHTGLAMNGMYPWITSTIFIIPKLLFNNPIVALMVGFIILNFLTIFNVFLLAKFITHKRWIQILGVTIYQFSSYHMAVLYSRNALGEALAYVFLPLVLLGCLKIWHNLTNGWLYLGFGMGAIANSHILSLIIVTIMIAIFCFIRILRHQLTRKEVINYTKAAVLAILSSFYTLTNIGSLLSSNLLMSPTPKLVPLNATKYWQALLDNSIIERSASFNMGPINTFLLFFLMIMLFTNKSGLWRHWTIATIIVFFSTFDWLPWQNLTSTPINMIQFLGRLLFISALLLAISVMYYFDQYPLKYKDINFVITLALVAVSLNAVHTYHNKTTKDGYRFWLTKENYDQTIKNSAIGIDYLPANNKHQLQSRITALQNASVSSLKIKSQTYNSAEYMITTAKEGYYSLPIAVYSGIRYNVTLNHKKVKLANIHALKLKIPKGLNHLKITVTVNISNYFTMLISLLTTVYSIGKLTFANSNSFARKNKKRQKDK
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MTQQYDYDVLYLGSGHGTFDGAVPLAQSGVKVGIIEKDLIGGTCPNYGCNAKITLDAPVTLLRESERFSGVVAGNLKINWKESVAHKQEVIDELPGMIGGLIKSSGINIIQGSGVFQDNHTILVDGQPKTADKIVISTGLRPHRLDIPGSELAHDSREFMDLTELPDKIVIIGSGYISMEFVTIANAAGSDVTVLMHGDKALKEFYQPYVNKVIDDLKERGVKFVKNAKVSSFEKSGDQVIVNYGDDQSLSVGWVLDATGRIPNTDNLGLSEIGVNYNEKGVIVNEYLQTNVDNIYASGDVIDKTQPKLTPTAIFESTYLFKRFSGQSREPITYPVIPSVVFTSPRIAKVGVTVEEAKENIYQIEENNLVGDWYRKVNKETISENTLIFDDEHRLLGATEVSEQAENVINTLLPAVEFKFNKEEIARLIHLFPSISASTWDLL
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MNYVSTRGQAPAVTSSQAIINGIAPDGGLYVPERWPKLKLDWKNLSQQSYQEIATQVFDAFFDDFTVQEIDHIISKSYGNQWDAESIVTLHNENKLHYIELFHGPTLAFKDVALQALPHLLTTAAKKQSLNDKIVILTATSGDTGTAAMSGFANVENTEIVVFYPEVGVSDIQRQQMQTEEGHNAHVTAITGNFDDAQKAVKSILSDEKLIQELSEKGMRFSSANSINIGRLVPQIVYYIYAYAQLVKNDVVAPGEEINIDVPTGNFGNVLASYYASQLGLPVHQFTVASDENNVLTDFFNTGIYDRQRDFKVTNSPAMDILVSSNLERLLYFASGRNDEEVRQYMKSLAENGQYTLADKTRNYLQKFTAKFATQSQVVDTIKDVFENSGYLIDPHTAVGRFAYEEETHQTLLAATASPYKFPQTVLAALQEKNEGGVVDLQKLAERTNTVIPAQVATLFDKTIVHTKIIEPAMIMQSIKDELSI
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MQTKSELRIQQKAALARENLMKRKREEEQLYALLFQTPEWQSADSIAVTLSMEFELNTSPIIIKAWEKNKRVLVPKIINHKMIFVEIDSNTRYQTGMLNIKEPLIDNYQAVEQLDLVIVPGLAFTVSGKRLGFGAGYYDRFLEHYAGPTISVALSTQLLDDLPTENHDQTVQRILYAK
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MSYQELDPIVWSAIQQESARQNRTIELIASENFTSQAVRAAQGSVLTNKYAEGYPYKRYYGGTEYVDVVEQVAIDRLKELFGAEYANVQPHSGSQANAAAYMAFLKPGDKILGMSLVAGGHLTHGAKVSFSGKVYESHTYGLNSETETLDYEAITKQAREVKPQMIVAGASAYSRIIEFDKFRAIADEVGAYLMVDMAHIAGLVAAGLHPNPVGIADVVTSTTHKTLRGPRGGVILSQEKYAKQLNSAIFPGSQGGPLEHIIAGKAIAFGEALQPKFKDYAQQVIKNAQAMAKVFNDTEDIRVVAGGTDNHLFNLDLTKTALNGKQTQELLDTVSITTNKEALPNEQLSPFVTSGIRIGTAAITTRGFDEDDATNVAELIVTAIHHYDDEKVLKQVKREAEALAMTHLFE
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MAIIRGIVLYTRQYKDNDLLVRILTETYGMRTFLARGAKKATSKLSAGTQPYTIVTFDGALPKRETGLGYMNDVQDIKVYSRLIEDIEANAYAALIASLIDASFEEGEKITRWYNQLYVALQKLDEGLDPQIIANIFEIQLLVPLGVAPNLRADPITGQVDGKFDYSEKYNGIISEHHFNLDDQRLMLDQKTVFYLRQFSVIDMRQVHDIKMSAITKRGLQRVIDYIYEKQVGLKPRAKSFIEQMHSWQNTLVNFRRNK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011679553.1|1459217_1459907_+|tRNA	tRNA (adenine(22)-N(1))-methyltransferase TrmK	NA	NA	NA	NA
WP_048592903.1|1459903_1460689_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592904.1|1460733_1461969_+	peptidase T	NA	NA	NA	NA
WP_010289296.1|1462021_1462219_-	YjzD family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592905.1|1462412_1465751_+	DNA polymerase III subunit alpha	A0A2L1IZ23	Streptomyces_phage	4.3e-138	29.5
WP_048592906.1|1465846_1467268_+	pyruvate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_048592907.1|1467431_1468628_+	ammonium transporter	H8ZJB2	Ostreococcus_tauri_virus	1.1e-30	30.8
WP_048592908.1|1468731_1469724_+	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	2.1e-45	45.8
WP_011679559.1|1469723_1470206_+	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_048592909.1|1470189_1470657_+	diacylglycerol kinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592910.1|1470698_1471610_+	GTPase Era	NA	NA	NA	NA
WP_011679561.1|1471679_1472459_+	DNA repair protein RecO	NA	NA	NA	NA
WP_004164191.1|1472461_1473424_+	asparaginase	NA	NA	NA	NA
WP_048592911.1|1474011_1475367_-	aspartate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_048592912.1|1475398_1476277_-	homoserine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_004164184.1|1476273_1477551_-	homoserine dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_048592913.1|1477674_1479132_+	threonine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_048592914.1|1479227_1480460_+	serine hydroxymethyltransferase	A0A240F3L3	Aeromonas_phage	7.7e-93	51.0
WP_048592915.1|1480497_1481034_+	5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase	NA	NA	NA	NA
WP_048592916.1|1481132_1482329_+	class I SAM-dependent methyltransferase	A0A2K9L0U7	Tupanvirus	7.5e-53	37.8
WP_048592917.1|1482396_1483230_-	aldo/keto reductase	A0A1V0SDE7	Indivirus	9.0e-21	27.7
WP_048592918.1|1483351_1484269_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_048592919.1|1484268_1484964_-	ribose-5-phosphate isomerase RpiA	NA	NA	NA	NA
WP_048592920.1|1486017_1487028_-	LacI family DNA-binding transcriptional regulator	C6ZCU4	Enterobacteria_phage	7.1e-28	28.6
WP_048592921.1|1490318_1491602_+	chloride channel protein	NA	NA	NA	NA
WP_031295622.1|1491666_1492623_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	5.7e-19	29.7
WP_048592922.1|1492606_1493458_-	3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase	E3T537	Cafeteria_roenbergensis_virus	7.2e-50	42.0
WP_004164151.1|1493714_1494164_+	transcriptional repressor	NA	NA	NA	NA
WP_048592923.1|1494399_1495290_+	zinc ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592924.1|1495297_1495984_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A1V0SKJ1	Klosneuvirus	2.9e-09	27.5
WP_080968815.1|1496619_1497414_+|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X2	Lactobacillus_phage	3.6e-27	33.5
WP_048592925.1|1498362_1499694_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_048592926.1|1499770_1501444_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592927.1|1501640_1503341_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080968804.1|1504433_1505228_-|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X2	Lactobacillus_phage	4.3e-28	33.5
WP_048592929.1|1506116_1507529_+	deoxyribodipyrimidine photo-lyase	A0A1V0SGL1	Hokovirus	2.4e-66	34.9
WP_048592930.1|1507555_1508602_+	FtsX-like permease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011679588.1|1508606_1509302_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.2e-28	36.4
WP_169747278.1|1509428_1510232_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.6e-30	36.0
WP_036088706.1|1510277_1510520_-|transposase	transposase	Q6J1X3	Lactobacillus_phage	1.4e-06	37.3
WP_021210664.1|1510705_1511911_-|transposase	IS110 family transposase	A0A1X9I619	Streptococcus_phage	7.2e-96	46.7
WP_048592932.1|1512405_1514658_+	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	4.5e-131	32.8
WP_048592933.1|1515977_1516550_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592934.1|1516669_1517779_-	AraC family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592935.1|1517968_1518211_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592936.1|1519898_1520885_+	LacI family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592937.1|1520887_1521841_+	LacI family DNA-binding transcriptional regulator	C6ZCU4	Enterobacteria_phage	2.5e-11	24.6
WP_048592171.1|1524839_1525082_+|transposase	transposase	Q6J1X3	Lactobacillus_phage	5.3e-06	36.1

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP012009|1548350:1652609|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_010000411.1|1548350_1549268_+|transposase	IS30 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	2.7e-42	38.7
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WP_010284241.1|1551535_1551895_+	PTS cellobiose transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_080968838.1|1551851_1552406_+	sugar transporter	NA	NA	NA	NA
WP_179944413.1|1552423_1553758_+	PTS cellobiose transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_048592950.1|1554283_1555570_+	purine/pyrimidine permease	Q9KX94	Enterobacteria_phage	1.7e-18	25.6
WP_048592951.1|1555562_1556675_+	acyl-CoA synthetase	NA	NA	NA	NA
WP_048592952.1|1556686_1558153_+	acyl-CoA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_048592953.1|1558165_1558933_+	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	3.3e-17	30.1
WP_048592954.1|1558993_1559503_+	energy coupling factor transporter S component ThiW	NA	NA	NA	NA
WP_048592955.1|1559510_1560332_+	hydroxyethylthiazole kinase	NA	NA	NA	NA
WP_048592956.1|1560351_1560657_+	PTS sugar transporter subunit IIB	NA	NA	NA	NA
WP_048593150.1|1560674_1561910_+	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_014324675.1|1561909_1562245_+	PTS lactose/cellobiose transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_048592957.1|1562237_1563662_+	glycoside hydrolase family 1 protein	A0A0B5JD41	Pandoravirus	4.5e-28	24.9
WP_011679702.1|1563831_1563936_+|holin	putative holin-like toxin	NA	NA	NA	NA
WP_048592958.1|1564229_1564796_+	NAD(P)-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592959.1|1564882_1565242_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011679705.1|1565435_1565903_+	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592960.1|1565892_1567233_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	7.4e-33	25.6
WP_048592961.1|1567249_1568188_+	NADP-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_042251754.1|1568205_1568565_+	DUF1304 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_038534127.1|1568635_1569460_-	glycosyltransferase family 8 protein	NA	NA	NA	NA
WP_025268068.1|1569867_1570611_+	metal ABC transporter ATP-binding protein	Q9EMR9	Amsacta_moorei_entomopoxvirus	5.6e-14	29.0
WP_014324683.1|1570603_1571446_+	metal ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_179944414.1|1571528_1572467_+	zinc ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592963.1|1572554_1573265_-	acetolactate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_048592964.1|1573404_1574751_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_025268071.1|1574940_1575612_+	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	4.1e-40	38.2
WP_048592965.1|1575612_1576680_+	HAMP domain-containing histidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_011679716.1|1576765_1577287_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
1577184:1577199	attL	NA	NA	NA	NA
WP_048592966.1|1577512_1577746_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592967.1|1577925_1578534_+	PepSY domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592968.1|1578704_1579937_+	LCP family protein	NA	NA	NA	NA
WP_042253081.1|1580282_1580726_+	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048592969.1|1582263_1584954_+	HAD-IC family P-type ATPase	M1I547	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	7.3e-64	28.2
WP_042253086.1|1585151_1585583_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_042253088.1|1585755_1586634_+	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	4.1e-48	37.4
WP_014324695.1|1586654_1587041_+	MerR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011679725.1|1587209_1587674_+	YbaK/EbsC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_042253091.1|1587732_1588305_+	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
WP_014324698.1|1588344_1589304_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	A0A1V0SBV6	Catovirus	8.5e-31	31.3
WP_042253092.1|1589607_1590471_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	A0A2P0VP75	Tetraselmis_virus	3.2e-05	26.0
WP_014324707.1|1590820_1591444_+	Type 1 glutamine amidotransferase-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592970.1|1591656_1592307_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_048592971.1|1592410_1593733_+	Y-family DNA polymerase	Q6DMX4	Streptococcus_phage	8.8e-87	39.7
WP_011679732.1|1593725_1594106_+	hypothetical protein	E3W8I0	Leuconostoc_phage	3.7e-14	35.7
WP_011679733.1|1594092_1594344_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_004915382.1|1638876_1640202_+	2-hydroxycarboxylate transporter family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048592309.1|1647714_1647990_+|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	5.2e-10	43.5
WP_048593006.1|1649745_1650393_+	pyroglutamyl-peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_048593007.1|1650451_1651369_-|transposase	IS30 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	3.0e-41	37.5
WP_048593008.1|1651944_1652211_+	N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_013102191.1|1652504_1652609_+|holin	putative holin-like toxin	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP012009|1662373:1695696|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_048593027.1|1672426_1674382_+	type IV secretory pathway, VirB4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_048593028.1|1674383_1674578_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048593029.1|1674581_1675832_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	G9FHQ8	Rhodococcus_virus	4.2e-06	35.6
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WP_048593031.1|1676272_1676830_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048593035.1|1680667_1682803_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048593036.1|1682813_1683695_+	class A sortase	NA	NA	NA	NA
WP_048593038.1|1686147_1687173_+|transposase	IS30 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.2e-38	34.4
WP_048592303.1|1687438_1688356_+|transposase	IS30 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.2e-42	38.7
WP_048592977.1|1688806_1689724_-|transposase	IS30 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	3.5e-42	38.7
WP_048593039.1|1689847_1690192_+	HAD-IIIA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_048593040.1|1690234_1690573_-	ASCH domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048593041.1|1690625_1691240_-	cadmium resistance transporter	NA	NA	NA	NA
WP_048592981.1|1691418_1692336_+|transposase	IS30 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	2.7e-42	38.7
WP_048593042.1|1692402_1692816_-	cytidine deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_080968842.1|1693032_1693461_+	HIT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048593044.1|1693566_1693974_+	DUF2000 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004906421.1|1695420_1695696_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	5.2e-10	43.5