Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012195 | Campylobacter ureolyticus RIGS 9880 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,WYL,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012195_1 | 392816-392931 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012195_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012195_1
>1.1|392845|58|NZ_CP012195|CRISPRCasFinder AGAATTTTATGCAAAAACAAAATTTAACTCTCATCAAATGGCTGAGATCAGAAAAGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012195_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012195_1 >merge|NZ_CP012195|1|392816-392931|CRISPRCasFinder TTTGAAAACTCTCTTAGTTTTGATAAGATAGAATTTTATGCAAAAACAAAATTTAACTCTCATCAAATGGCTGAGATCAGAAAAGGTTTTGAAAACTCTCTTAGTTTTGATGAGAT >NZ_CP012195|1|1|392816-392931|CRISPRCasFinder TTTGAAAACTCTCTTAGTTTTGATAAGAT AGAATTTTATGCAAAAACAAAATTTAACTCTCATCAAATGGCTGAGATCAGAAAAGGT TTTGAAAACTCTCTTAGTTTTGATGAGAT
>NZ_CP012195.1|WP_050333836.1|391785_392667_+|pyridoxal-5'-phosphate-synthase-lyase-subunit-PdxS MSNFCEFLKNAENATKSFMGGVIMDVVTPDQAKIAEASGAVAVMALERVPADIRAAGGVSRMSDPKMIKSIMNAVKIPVMAKCRIGHIVEARILESIGIDFIDESEVLSPADNVYHVNKREFKTPFVCGARNLGEALRRISEGAMMIRTKGEAGTGDVVQAVTHMRSIMSDIRRISNLNKDELYNEAKNLGVSYEMLLYVHENSSLPVANFSAGGVATPADAALMRVLGAQGVFVGSGIFKSGNPEKRAKAIVKAAKNYDNPDIIAEVSEDLGEAMVGINEDEIKIIMANRGI >NZ_CP012195.1|WP_050333833.1|390329_391682_-|PLP-dependent-aminotransferase-family-protein MLTYNIEKNSKKPLYLQLYENIKNDILNLKIKDKLPSKRSLANHLNISVITVENAYNQLIMEGFIYSVPKKGYYANKGIQKQIKPVVQKQNFNENSKFLKEKNLLNLSFSTNSELAFPLSTWKKLLREVLSKNSDEIYEKVPFNGTLKLRLAIKKHLYEYHNLICDENNIIIGAGSQHLYTLISQLLDKDLIYALENPSDTKIGKIYKSLGVKCEFIDIDKSGMSYEKLLKSSANIVHISPSSHFPTGILMKAKRRSELLKWASSKENRYIIEDEYMGEIRQKIVPTLKSLNHEKVIFLNTFSKTLLPTLRVSYMVLPSNLTLKFKKNLSFYSSAVPIFEQLTLAKFINDGYFERFLNKLKRQNLIKKEAFLNKFKEIKIKNLNVIFNETHAFIKSNLTDNKVKQLSYKNNFFINTMSDFYYKNAPKNSSFLIDYNCNMENVKKFLNMIL >NZ_CP012195.1|WP_050333831.1|388794_390222_-|type-I-glutamate--ammonia-ligase MGKFVKNKDEFFKFCDENEVAFVDFRFTDLKGTWHHISYNYKRLPKDFDEGLPFDASSIEAWQPIHKSDMILKPDLETAFLDPFTADVTIIVICDVYDIYKGKMYEKCPRSIAKRAEAFLKESGIGDACYFGPENEFFVFDDVKIVDSMNCAMFNVDSEEGEWNSAKEYKDSYNTGHRPGPKGGYFPVQPIDSMVDLRAEMVQVLEQIGLETFVCHHEAAQAQGEIGVKFGSLVEAADNVQKYKYVVKMVAHLNGKTATFMPKPLYGDNGSGMHVHQSIWKNGKNLFYEKGKYGNLSDLARYYIGGVLKHARSLSALTNPSINSYKRLIPGFEAPNILTYSCQNRSASIRIPYGAGENSTRVEMRFPDSSACPYLAFAALLMAGIDGIKHKYEPVGPMDINLFELHLDEIREKGIEQFPHTLRGSLESLIRDNEFLKPVMCDEFIQTYQRFKFETQVWPYEARPTPFEFKTTYSC >NZ_CP012195.1|WP_050333828.1|386801_388745_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNFFITATNTDVGKTFVTSSLLKAFLDENLNTVAIKPVQSGCAPDTLTDAMVYTKISSKNNFVPRYSLKFPSSPEYAAKKENIKIDFNEILKYCNDFLQNYENVLIEGAGGLFVPLNEKSYIIDFIQTLNLPVVLVCKNELGVINQILLSIEALENRGLKLDLIVLNFSDLNDEISLSNLEYLKDKFNCDIINLEPNLSIQKASLKFRNFIKNYKKTDDFIDLEFDKNHLFHPYTSSIKPLKTYGVSNAKDSYIYINDEKFQNKALIDGMSSWWCAYLGYKNTDFNKAIIKQINKFSHVMFGGLTHAPAINLGKKLLNLMPKNMDKIFYSDSGSVSVEVALKMALQFQQNKNPNKTKIATFKGGYHGDTFGAMSVCDPVTGMHSLFKNTLAKQIFMPKPISKFGSNFDEKSLIEMKKIIYENKDYIAAIIVEPIVQGAGGMWFYHENYLKFLREICYEIDALLIFDEIATGFGRLGEMFAYKIANVSPDIICIGKALTGGVMSFGATICSKEVADGICKNNRVFMHGPTFMANPLACSVAIKSLEILENSNFKEKVKHIEKLLKDELMKCYDFQSVRDVRVLGAIGVVEIDKEVNTENIQSFFVENGVWIRPFGKNIYIMPHFTQNDKELKTLCDAIYNAIKFKKYE >NZ_CP012195.1|WP_050333826.1|385472_386798_-|sodium:solute-symporter-family-protein MSILFFTYLFIIYFIGYLEFKKTKNVTHYTISSKNASWYLVGGSIIASCIGGSATIGVISLSYEVGFPAIWWLLSGASGLLVLCIFLAKKIAISKALTMPEMIEYYIGKKARFVASIIIVLAWSSILAAQLLASAWILAAILKISFNFAVFVSAFIIITYSILAGQASILKSDLAQSMLMFMTFFIIILWFIFVKDVSIANLNFELLNDKFTISRWSYFMLIIGGSYIVCPMLFGRVLSAKSKFDAKFGVAFGVIGIIIGAIMVVLIGLISQNLINPTVINDQILTKDICETLPPFLGAILLVVLFSAIISSADSCLITASSVFCNDILKTKSLKIYRVFTILFGIFALLLTFGKKNILGYLLGANDIYVSGVVLVVFMAMISKKKLNENICLLAMIIGGGIGLIGAMSDEKIYSFIALFLAFIISILAHFKGQKVEARNQ >NZ_CP012195.1|WP_050333824.1|384718_385492_-|threonine/serine-exporter-family-protein MKPEINELTNFLADYADALSGVGAYNARVIRCVKRIASHYGYNASIFILIKFINLTVSNKTNPEIRKSFIKDATQKEINLETISDLSALSWAVSDENLTLQEAKDIYQKIIAKKKRNVLISFTLTSIAFGAFCRLFGGDIFGVIFVIFGTFCGVLLKFLLNFKKVDIRITYIFCAFISSFIAYLGYKFGFSKTPEASISSSILYLFPGIALINSMFDILDKNVLIGLSRAVNATILILCMSIGIYITLSLVDFGLIS >NZ_CP012195.1|WP_050333822.1|384224_384722_-|threonine/serine-exporter-family-protein MSTFLIDAIFAAIAGLGFSYANKPPRRILLFCAMLGGFGYSLRVIFMNYFSYTISTFISAICVSFVAVFLARRVKTPIEIIAFPSLLPMIPGLYAYKAMLAMFLFIQTNVENKKSHYLVEIFDYGSTAVSAIFALAVGVSVVILIFYEKSFTMTRNKDFKKRYLD >NZ_CP012195.1|WP_050333820.1|381467_384200_+|insulinase-family-protein MKKIILILSIFLSVCFGFENDENLKIGKLDNGFSYYLYKNQIPKDSISLILYFNVGSSDELENEKGIAHFVEHMAFNGTKDYTKNDLIKALESLGVKFGADLNAATSFNETIYKLDIKKENLDKALSVLSNMGFKALFEKDDLEAEKGVIIEEERNRKNAYIRIMNQGLKYFYPDSIYANRLPIGDMNIIKNATPALLKGFYNKFYTPNNAKLIIVGDFNENETKTLIKKYFDNIKNGDFTKRVDKSIGYFNDLVIFNPNDEEIANNSVSIMFEDTPYKLNSIENLEKDYKNRFISKMFSLLNEKRKSKSKTLLTTNYYDINLYNLKKLNSFYATVIKDDVNASLSELISLIKTVQKNGFNKDDFLSAKKELLAQNLANFEKKQKRYNSEIISEILNLIEDDTTFLSPKDEKEISQNIIDKMTLDEINKEFKNNVSSSGVLVNLTTKKPISLSKDEFKILQENAQILKDDSLNLPKTILEKKLANKSPISSSIDKNLIYKFEFENGAKVYFKEINTNKDTIYFKAFKKGGLTNFDDIINLNFAINISNGSGIGKFNDYEVRKITAGQMFEYKKFIDKTSLGYIGNTQVKDFENLLKAFFTDFENPKIDDEYLKRYQTLALDLLAKNLNHPDYKFEKEFNEFYFNNSYKMRFSSKDDILNLDKNNLENMLKKAFLNAGEYDFVFVGDISPKEFIEISKNYIGNLSADKNQTFIKDDGIRQILGRKNFTRKYLQENSSKNSIFINSYDLNYTPKNALALSLGTDILNILLREKIREEDSMVYGIYAHNELQNKPYKEASISIYFTSDVKNINTIVKNVKNTINLLKTSYDDEKELKNVKLALKVKLEKLYQTPNFWLNQLSQDLLYEKHFYNYDEMMSLIDSITLNDIKRVVNLAYNLDNFIVKSNIYKGAK >NZ_CP012195.1|WP_050333818.1|380595_381471_+|hypothetical-protein MNNDCLVGVDLGSNSLKISLMNAQFEVLKTDEFGIQSAFGLKENLSNIAKNKIILALEKISKNYDLKNALAVATEAFRVAKDSGEFFKLLNDKFGIKFEVISPLRECELTKLAVYKRCEMLGINTSNLAIVDLGGASCEIVLDEKFKSFKFGIIKVFNNFLDLENIEKNSKFMTKKANEFLKNLNPKNIVLNSTISKKLLNLKQNYKNSKILEFDDFKKLKKLILNNNTKSHLKNSDGQAMDNQILSETNLLLCGIYLYENILKGFDDFIIVDYGLKEGVIIEKILKKENL >NZ_CP012195.1|WP_050333817.1|379018_380596_+|phosphoglycerate-dehydrogenase MNKIIVCDAINEAGFEILAKEKDIEVVDATNVPKDELLNLLVDADVAITRSPTEISESFLNAGKKLKAVVRAGVGVDNVDIDGCSKRGIILMNVPTANTIAAVEMTMCHLLNAARKYVNSCNDLKIDRIWKREKWYGTELYGKTLGIIGFGNIGSRVGVRSLAFGMKVIAYDPYIEPSKAKDLGVGYTSNFDDILKCDFITIHTPKTAETTNMIDEAEIAKMKDGVRIVNCARGGLINEDALLKNLKNGKIAYAGIDVFVKEPATDHPLLDIENLTATQHLGANTVESQKNIAVQAADQAISALRGICYPNALNLPIKTEDIPNEIKLYLDLVSKMSYLATQINKNLIRNIKIEVSSNLKKYLDPMLTFALVGALKTQLGDSINYVNAKFVADERGIKTEAVVTSSLNLKSLVTVKVITDKEVTTFSGVVFGENEERIVNINGFKTDFKPKGKMIFLKNRDIPGFIRDISAILAKENINIADFRLGRGEEKDALAVVLVDEDINSEILKELNSVEACIWARYANV >NZ_CP012195.1|WP_050333841.1|393433_394690_+|U32-family-peptidase MKKPELLSPAGNLEKLKIALSYGADAVYASVGAFSLRQRSAKEFSKETFKEGVEFTHKMGKKFYATINGFPFNAQLDKFKTHIEFLKDLGVDAFIIASPSIISLAKKIAPDTEIHLSTQANVMNYMDAQIYYDMGVKRVVVAREIGLKDVISIKEKVPNLDIEIFIHGSMCFAYSGRCLISALQSGRFSNRGSCANDCRFNYEIYAKNDESGALFKLNEDENGTYIMNSKDLNLSSYVEKIMQSGAVDSFKIEGRTKSQYYAACATNAYRMAIDDALSGKFNAEIYQKELHTLKNRGFTDGYLVSRPFERKDTQNFNSTLEEGTHQVCAIALDGEFFDVKYKISKNTPYEILAPKDSKIEAIENEIGKIYEKYGKFWLEFKVLKAKNNKEFDEIHSGNLNQIISPTKLPNFSFLRKEI >NZ_CP012195.1|WP_050333844.1|394708_395215_+|5-(carboxyamino)imidazole-ribonucleotide-mutase MKFISIIMGSGSDLDIANEAVKVLESFGVKYEMIVSSAHRSPQRTHDYVVAAQNKGCEAFICIAGMAAHLAGVVASLTTKPVLGVPAGGGALGGVDSLYSTVQMPGGIPVATFAVGKAGAKNAAYFASQILSLSNEELALKIKNDRANMVKKVCEDSSKIEIILKEDK >NZ_CP012195.1|WP_050333847.1|395211_396114_+|glycine--tRNA-ligase-subunit-alpha MTFSKIILTLQDFWQAQGCVIVQPYDIPAGAGTFHHATFLRSLGKKPWRAAYVAPSRRPADGRYGENPNRLGAYYQFQVILKPSPSNIQELYLKSLEAIGFNLKNHDIRFVEDNWESPTLGAWGLGWEVWLDGMEVTQFTYFQQVGGIACEPISGEITYGLERLAMYLQNKENVFDIVWNEFKGNVITYGDVHKRSEYEFSKYSFEVADTDMLFKSFENAYNECLKVLKKELSLPAYDYCMLASHIFNLLDARGAISVTQRQDFILKIRYLAKGCAVVYASKDDPILKEKFSEYFIDENS >NZ_CP012195.1|WP_050333850.1|396100_396823_+|Nif3-like-dinuclear-metal-center-hexameric-protein MKIAEIYKILDEIAPFEAQESWDNSGLLLGNMGDEFDKIYASIDLDSNLIQKIEKNSLVITHHPLIFKGLKSLNPSVYPSNLIYEIIKKDIKLISMHTNFDKFVLNQFVASEILGYKITEIRDFLVFFEVNKIFDEFAKEIKQKLKISNLRVVKASEFIKIATLCTGSGADLLGSFKSDCFLTGDIKYHSALESLENKISLIDINHFESEAYFGQSLAKNLQKYNLNIIITNSINPFLYI >NZ_CP012195.1|WP_050333852.1|396834_397554_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MNKNLEQLIQLSNFDKNIDGFSPKIAAIQKELNDKQNEIAEVQKEVEESNKEIKDLADEIEKTDNHIKDLNSQLKAGSKKHSAIKTERELKSLQLEEELTKDQLSSANDEIERLENLMENKKSNQNELLDKEKTLKDEFENIQKSTEDELKNIESQREKFYLEKDKLVKKMDQKIISFYEKIRKWAGNTAVAKVKKQACYGCFMHINDKTYSNVIRSDEIVTCPNCGRILYKDFNDEEK >NZ_CP012195.1|WP_050333855.1|397553_398702_+|lipid-IV(A)-3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid-transferase MFYNLFSFFVWLFLIPFVFIFSFKKKYKKSLPARFFLYKNPPLKKADVHFHACSFGEISALEILALKFKSFSFTTTTATGFEKAKSLNENTRFLPFECFIPFWLTKSKVLVVFEAELWLNLVKTAKKNGSYVILLNARISDRSYKRYEKFKFYYKEIFKYIDLVLAQSQLDKTRLLNLGAKNIEVVGNIKSANFKPANKDYPKFSEFLVTIASTHDGEEELILNNITPNKNQKFIIAPRHPERFCKVAKICEDFASKFNLKFEKFSQNLGFKSNIILLDTMNEVINFYKISDIVILGGSFIDGIGGHNPIEIAQFNKPLINGYFYHNQKALFELVDGVNFSDLSNLNELLSSKLSKTMIKNKADLQSIENLIKIKIKEQNGC >NZ_CP012195.1|WP_050333858.1|398691_399465_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MAVEKAYKLLALQENISNNEAKSLIDSGLVYLSGKKIILARGLVNTSAKFKVTKLKKPTIIFEDENILAINKPEFINSLDIEKKYKFPLINRLDKETSGVILLAKNEEFRQKAIQEFKNLNVKKTYIAIVSGVVSEKIEINDKILTIKNNNSKGKNAAFSKISDNGKTAFTTVYPFMVSGKKSLVKIEIKTGRTHQIRVHLAAYDHAVIGDEKYAKLSSKRLFLHSYKTEILGYSFVALLDNSFNEFGFEISKDMKF >NZ_CP012195.1|WP_050333861.1|399525_400863_+|signal-recognition-particle-protein MFVQIGESLRSAVNKLRIVDDEKALKNALVTLRKALLKSDVHHKVTKDFVAMIEEDLKENGIGQKQFLDSIKKNLTDILTAPGNQGFVYSSKPPTVVLMSGLQGGGKTTSTVKLANNLKQKNKKVLIAAADLQRLAAVEQLKQLCEANEIDLFYIENEKDPVKVAKEALQKAKKELYDVLFVDTAGRLAIDEALMSELKEVKNAINPDEIFYVADAMSGQDGVRTADTFNKELGITGVILSKFDADTKGGVAIGIAHQIGVPLRFVGTGEKVADIEGFIPDRIVGRIMGEGDLATLVEKTSAVFNEKDVKDITKKIKKGKFTFNDFVSQLESVKKLGNMKSLIGMLPGMGNLAEKIGDMDLENSKEIIHIKAMIGSMTPKERENPDLLNNSRKRRIAAGAGLTQMEVNKFIKQFTNASKLAKKLTNKGGIRGMASLMQGGQKFPG >NZ_CP012195.1|WP_016645950.1|400941_401169_+|30S-ribosomal-protein-S16 MATVVRLTKIGRKKRPFYRIVVTDSRKRRDGGYIESIGYYDPMTNPEVVKFDAERLEYWKSVGAKLSERVERITK >NZ_CP012195.1|WP_018712359.1|401177_401423_+|KH-domain-containing-protein MVEEFIRQYALLICEYPEKIKIEKVKIDDNFYEIIIYADKTDTGKLIGKNGQMINAIRTVVLGYKAKDAASYKFSVKALEE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1225359 : 1271608
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012195|1225359:1271608|DBSCAN-SWA TTTAAACCACCCTTAAAATAGCTAGTTCAGCTTTTCTTACCCTATTTGACCACCCATTTAAAAACTTGCCATTTTTATCAGGATTTCTTTTTGCTAGCTCATCATAAAATTTCATAAACTCGGCCTTGTATCTTTCTTCAAAATACCCACTATCAAGGCTATTTAAAGCATTTATTGTATTATTACCAATTATTCCATCAATCTTTACATTTGCCACCATTTGAGCATATCTCACGGCTCTTTTTATGCCAACATTAACTGCAAATTTAAAGATTAAATCAGCAATTCTATCACTTTTAATCTCATCGAGTCTTAATTTATCCCAAAAATTAAGCTTATAAAACTCTTTTACTAAATCCGTTAAAAATACATTTTGATAGCACTCGTAACTGGCTTTATCAAGGTTTTTATAAAGGTCTAATGTTCTATAAACTAGCTCCCAACCTTTCCAACTTGGATGAGCCCCCTCATAAATACCCATAAATGTATAACCACTCTCACCCTTATTTTTATGCAAGGCATTATACGGGCTTGATAGCTCCAAATTTAACATCTCATCAAAGCTTTTATCAAAATTACTCATCATTAAATCTCTTACTTACCATTTTTTTTAAATCGCTTAAGTTATTATGCGTTATCCCGTGCATTTTTAAACTTTCGTTTATACCTTTATCAAGGCGATTTAAAGTCTCTAAATTTATTCTATTTTGAAGCTCTATACTTTTGCTTAGCTCTGTGTTGCTTTGTGAGTTTTTGTTTATTACATCAATTAGCTTATCTTGATTTTTTTCAATATTTTTTGTAAACACTCTTGTATAAAAAAGCAGAACTATAATTATAATTACAACACATACAAACATCACAGCTTGAGAGTTCCACTCACCTACACTTAAAACAAATTTAGTGGTGCTATCTATCATTTTTTCATTCATCATTTAACCTTTTTATAGATTTTAATCTATTATTGCACTGCTCCAACCCAAATTCCAAATCAATTAGCAGTATTGCAACATCAGTATTTGTTTTTACTTCTCTTTCTTGCACCACTACAGGCATTAGAAATATCTCAGGTACTTTTACCCTTTCATACTTAATTTGTGGTTGCCTTGTTCCACAACCGTTTAGAAATAAACTGCACGCTATCATAAATGATAGGATTGATTGTTGTGTTGTTATCTTTTTTCTTATAAATTTCATCTTTTTTACTCTCAACTTCTTTTAGGCTTAAGGTCTTGTTGTTCTCATACTCGTTTAAAACTTTCAAAGTCTTTGTAAATTCAGCATTTAAATAATCTAGGTTTTGGCTTGTTATAGTTAAGTTTTCTGTTAAGCTTTTATTTTCAAGCCTAAGAGATTTGTTTTTACTCTCAAGTACATTTAAACGCCAACCAATCAAGGCTAAAACCAAAGCTATTCCTAAATAGATGTATTTTCTCATACTAGCTTTAACTCTATCTTGTCAAGTTGGGCTTTTGTAGTGCATTTATTTATCGCATCTTCTAGCTTTTGGGTTTTAAAAATTGCTTCTGCTTTTCTAGTTGCAACTTCGGCTGAAAGTTTTACTAACTTTGGTAAGTCAAACGAAACATACTCATTTGTTTTTATGTCTTTTATGGTGTATCCAGCAGGAAGCTTTCCAACTGCTCCAAAGATTGTGATAGTTGCAAGTAAGTCAGCCTGCACATCTGCTCCCATTCTGTAAGTATGGTTTTCAAACTCGTAGTTGCTGAAATTTAGTTCATCTTTTTTTTGATGGATTTGAGATATCATCTCTTTTTTAAGCGTTTTGATATCATCTACCCATTTGCCATTTTGCATGATTTGATTTTCTTTTGGTGGAGTAGGGGTATAGTTTTTAGTGTCAAAATCTAGCGTATCAACTACTACTTTTAGCCCTGTTTCTTTGCTCCAAAACTCTTTGCCTCTTAGATCTTTTTTATACTCCCAAATTTGCTTTTTCTCATCAAAACAAATAGCAAAACCATCTTTTTTTGCTAACGGCTCTATTACTGTTGCATTTGCTGGAATGAGTGGTTTACCACCTATTGGGTCTAATTCAGCAACTTCTTCGCTTAAATATTCCAGTGTGTTTTTATCATAGTTGTATATTTGCATTTTTCACCTTTCTAGTATTTGATATAAAAATTAAGTGCTATGTTGTATGGTCTTGTTTCATTTTCAAAATTTTCAAAGGGATACTGAAGCCCTTTTTTTCTTAAAAGGTTTTTAGTATATCCGCCCCCATCATCGTGATAAGTAAAAGCAACCGAGTCTTCGCTTGGACCAAAATTCATATCATTTTTTGTATTAACCCATTGACTATCAACCACTCCCCATACTGCTCCATCTCCAAGCTTGTCACTACCAGCTCCTGTTGGCAAAAGATGTATATGTCGCCCAATAGCAGAGCCTTGAGTGCTTCCAAACCCTCTACCACTATCAATTGAGCTACCATCTGAAAAGCCTCTTACAAATCTACCTCTTAAATCAGGCAATTTAAAGGTGCTATTATCATCACTTCCAAAGGTTGTTCCTATCACTTTAAAAAGCTTTTGATAACTTGCCCTTGAAATACTTGCACCGTTGCATTTTAAATACCCATTAGGGGTAGATTTTGATGCGCTTTGGATTATAGTTCCAGCTGGAAGCAAAATATCTAAGTCTGTGAGATTGGCTTTTGTTTTATTAAGCTCGTTGATATGTAGGTCTATCCTTTTTCCAAAGCCGTTAAAATGCTCCATTGTTGGAATAAACCCTGTGCTTTCAGTTACCCCCCATCCCCTTTCAATATCAGGGAAATCAGCTATTTCACCACTTTTTGCCTTACTAGCAAAAACTTTACCATCTATGCCTGCCATTTTTTCTCCTTATAAATTCTTGCAAACTTGCCAACACCAAAACCCTTATTTTTCTTATTTTGAACAAATCCAAAGGTGTTTTTATCGGCAATTATTATTAGTTTTAAATTAACGCCTATTGGTCTTATAAAAGCTTTGTTCTTTAAAACTAGCTCCAATAAAAAAGGCGTTACCCTCTCTTTTATAACAATATTCATAGTCATATCGTAGTTATCATAAGCAAAGTTGTCTTCACCAAATAAAAATTTCAAAGATTGATAAAAGTTTTCCAAAGTTCCTGTTTGGTAGTTTTTAATAATTTTTGCTTTTATCATAAATCTATACTCGTAGTCGCTTAAAAGAAAATTCCCATAAAGTGGTGAATGAAGTCTATAAAACTCACCATTTCCAAAACCTTGTTTTTTAGTAGCTTCATTAAAACCAAAAAACTCTTTTAAAATTAAATCTTTTTGCTCTCTTTTAGCTCCTACATGAAGTCCGATTAAATCAAGTGCATAGCCACTTGCTTCTTCAATGTTTAAGATATTTGCAACTTCCAAGCACTCATCAAAAATATCATAAGCACTACCACTTAAAAGCTTTGCTGTTGCTTTTGCTTTTGGTTTTTTCCTATACTGCCAAATTAAATCTACCATTACTCTACTTCTATGTCGATATCTTGTTTTTCTATCACACAAATCTCTCTAGGAGCGATTTTTAAGCTTTGATTATTGTTTATTGTAAACTCTAAAATTTCAAAGCCACTAACTTCATTTACTAAGCAATACAGCCTACTAGCATATACATCTTCACCAATTTTAAAAACATAGTTGCTTAATAGGTCTTTTATTCTTTCAGTATTAATTTCAGTGAAATTTACTAGTCTTTTAAGTCTTAGTTTGATTTTTGGACTTATCTTTACAGGTCTATCAAAATATACACTTCTTTTTTGGTCTAAAAAATCAACCCCTACAACTTCTTTGCCTTGTATTCCACAACCACCTATTTTTTTCTTTAAAATAGCTGTTGCAATCTCTTCTTTATCACCACCCAAAACAATTGCATTTAAAGTGTGTGGTAAAACACCGTTTTCATCGGTTGTATTGGTGTAATTTTCTAAAACTCTTACTTGCTTAACGCCTTTTAGGCTCATTAAATAAGCTTCTAAGCCCTCTCTATCATCATTGTTGTTTATTGAGTGGCTTCTTAAAAATCTGATTAACAGATCACCATCGCTTTCTTCTTCTTCACCTTGAATTACTTTACCATTTACAATAACCCTATCAAGTCCTATTATTATGTTTTGTGTTTTTAATTCACTATTTTCTACAAGTTCAGTTGCTCCACCATCTATTGAAGTTATAGATGTAACTGCTGAACCGTTAGCGCCTAAAGTTATCTTATAGTCAGTTTTCCAAAGTTCATTTTTAAAAACTAGAATTGTATCACTAGGAATTACAACACCTGCATTTCCGTGAAAAACTACACTATCAACAAAGCTTGGAGTTTCATACTTTCTAAGAAGTCCTGCATAAGCCACTCTTTGGTCTAGCCACTCACCTGTTGCAAGATATGGGTCTAGCATTTGAACTATAAAAGTTAAGCACTTGCCGACTTCATCTAAGCACTCGCTAAATAGTCCTATCATTTGACCATCAGGGGTGCTTGAACTTAGATTTAAATCTGATCCATAAATCTCTTTAAACCCATTTTCTAATTTTTCTTTTATTTTTAAAATATCATCTATTATAATTTTGTTTTCAGTTACTTGCATTTGCACTAACCCTTTGTCTTTCATCGTAAATATCTATGTATTCAATGCTTACGATAGCTTTTCTTTCATCCATAACTAAATCTAATTTTTCTAAGCTTTTTACTCCATCAACTTTTAAAACTTGTCTTTTTAGCTCTCTTTTAAGATTTAAAATATTTGGGTTTTTCTTAAGATAGTTAAACCACCTTATTCCATTTTCAAAATCCAAAAACCAATCATTGTAAAGGGATAATATTTCTGTTTTAACATTTTGAGCGATTGCTTTACTTTCAGTTTTAAAACCTAAAGTCCAGTCGTGATTTTCATCTAATGCTCTTACTTTCACTTTTTACCCCCTTATTTTGGCTTTGAAGTAGTGCCACCACTATCACCTTTATGAGTGTGGCCCT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MTGNDLKAFCKKHNLTYKEFAEIVGYTEAGIKTIVSRDDISESLKKSIELLEKVYELENKLKDLENLKNTLKNLLDLK |
65 | Haemophilus_phage(30.3%) | tail,terminase,integrase,capsid,plate | attL 1221988:1222006|attR 1281467:1281485 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1481407 : 1490581
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012195|1481407:1490581|DBSCAN-SWA AATGAAAAAAATTATTTTAGCAAGCATTGTAGCTTCGACCATGCTTTTTGCAAGTGGGCATAATCATGATAACGATGCAAATATGATAAATGAATTTAATCCAAAAAGTGTCGAGCATATTGTTGTTGAGATGAATATGCTTGATGAAAATGGAGATAAAAAAGTTGGTGAAGTTGTAGCTATAAATACAAACTATGGAGTTGCACTATTTCCAAATATGAGTGGCTTAGGAGAAGGCGGCATGCATGGATTTCATATTCACGTAAATGCTGATTGTGGTGCAACAGATAAAGGTCTTGGCATGAAAGCTGGTGGTCACTGGGATCCAAACGATACAAAAAAACACTCATTTGCATGGGATGATAGTGGTCACAAGGGTGATTTACCAGCTCTTTATGTTGACAAAAATGGAGTTGCAAATTACCCAGTTTTAGCTCCAAAAATCAAAAATATAAACGAACTTAAAGGCCATTCTATAATGGTTCATGTAGGCGGAGATAACCATAGTGACAACCCTGCTAAACTTGGCGGTGGCGGTGCTAGAATGGTTTGTGGCGTTATAAAATAAAATATCAAGCATAAAGCACAATATTTGCTTTATGCTTTTTGTTACTAAATGTTATACCGATATAAAAAAACCTTTAAAACTTCTTTAATTTATTGTATTTTATGCTTTTATCTATTAAAATGTAACATTAAATACAATTAAAAGGCTTATTGATGAAAAAACTTATAGACAGATTAATCTCCTCAGAAAGCGGAGCTGGGATGCTGCTATTATTTGCGGCATTTTTAGCACTTGTTTTTGCAAATATCCCAGGTCTTGATAAACTTTATAATTGGTTTGTTCATTTTACACCTTTTACAATACCATCTTTTAATATCTTAGGAAGTATGCACTTTTGGATAAATGATGCTTTAATGGCTTTATTTTTCTTTGCAATTGGGCTTGAACTAAAAAGAGAGATGTTAGAAGGACAACTAAAACATTTTTCTCAAGTTTTACTTCCTGTTTTTGCAGCTCTTGGTGGTGTAATATTTCCTGCATTAGTATTTGTTATAATAAATTTAAATGCACAAAATCATGCTATCCATGGCTGGGCTATACCAACAGCTACTGATATCGCCTTTGCAGTTGGAGTTTTAGCACTTCTTGGAAGAAGAATTCCGTCAAGTCTTAAAATATTTGTTTTAACTCTGGCTATAATGGATGACTTATGTGCTATTGTCATAATTGCACTTTTCTATACTGGCGATTTAAGCTTTTTATACCTTTTACTTTCATTCATGATAGTTGGAGCTTTAATTTTCATAAATAAACTTGGCGTAAGCAACAAAACACCATATGTAATTCTTTCATTAATCCTTTGGTTTTTTGTCTTAAACTCAGGCATTCATGCAAGCATTGCAGGTGTTGTGGCTGCATTTACCATACCTCTTTATACAAAAAAAGGTAACTCGATGTCAAAAGAAATGGAGCAAACCTTAGGATTACCAGTAAATTACATAATATTACCTCTTTTTGCTTTTGTAAATGCTGGAGTTAGCATGCACGGACTTGATGCAAGTCACGTTTTTGGAACAGTTCCTATGGGAATTTTCCTAGGGCTTTTTGTAGGAAAACAGATAGGAATATTTTTATTTAGCTTTATTATAATAAAAGCAGGCTTTGCCTATATGCCTGAAAAAGCAAATTGGAAACAGCTCTATGCTATAGCCATAATTTGCGGCATTGGTTTTACAATGAGCTTATTCGTTGATGGACTAGCATACGGAGAAAACTCAATTCTTCTCTATCATGGGACTGACAAGCTAGCTATTTTATGTGGCTCTTTAGTGTCAGGTGTAGTTGGATATTTTGCTGCCAAAATAGTTGGCAACAACCCAGACGGAAGTCCAAAAAAAGCAAAAAATTAAATTTGAGTGTCATCAGTACACTCAAATTTTAACTATATTTTTTAGTTAAAATAAGCAAAAATAGATTTTAAAGTTCAAATTTATAATAACTTGATATAATTTTGGCTTAAATTTATGGTCTCGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGTGGTCGTTGGTTCAAGTCCAATCGAGGCCACCATTACCTATCCTTAATTATCCATATTCAATTTAAAGAAAAAAATTAATACTAGTATTTGTAAAAAATGCTATTTTATTAATATTAAAAAGTTTATAAAATAAAATCAAACTAAATAAAGTTAGTCAATTGCAAAATCATAATCATAAATTTACTATTTTTTGGCTAGACTTTTACAAAAGGAGTTTACAAAATGCAAACTATAACCTTACATGCTGATAAAAACACAATAGATAAACTATTAGAGTTTATAAGTGCTAATAAGCTAAATATCAAAATAGATAAGCAAGACAAGATTAAAAATGAGCTTTTAAAAGATATTGATGACTATAAAAATGGAAAATTAAAAGTAAGTCCGTTAGGCAACAATTGGAAGTATCTAAATGCTAATAATTGAAAGTGAAAGATTTACTGATAATTGTATTTGTGGTTTTATTACAAAAGATAGCATCAACAAAGCATCTTAAAAGGACTATATTCAAACTTAATATTTTTTATACTTTATTTAAATATGAAATTAATTCATTTAAAAATAAAAATATTAAAGATTTATTTTTAAATACTTGTTGTGTATAAAATAACTACTAAAATAAAATATTTTTTCTAGATTAGTCTAAAATATTTTAAAACTGTTAATAGTCTTTTTTATAGATAATGAAAATTTTAAAATTTTCATTATTACAGCAACCAAACAAGGTGCTAAAAGGCACCTTGAAGTTTAGTTTATCTCCAAATAACAACCTCATCCAAGCTTTGTCTGATTTTCGGAGTACTTTTTTCATCACTTAAACCTAAAGCCACAACAATGCAAGGCCTAAGCTCATTTGGTAAATTTAAAAATTTAGTTAATTTTTCTTTGTCAAATCCACCTATTATGCAACTTTTAACTCTTTTTGAATAAGCAATATTTACTAAATTTGCTAAAGCCATATAGCACTGAAGTGATGCATAGTTATAAAGTTCATTCTCAGTCATTAAATCAGTTTTGGATGAAACCATTTTTAAAAATTTAATTGCCTTATCTTCACCTTTATTTTTGCTATAAATAATATGCTTTAAATACTCATCCTTGCTTTGTAAATCAGTTCTAGCAGTTATTACAACTATATGTGAACAATTTGATACTTGTGGTTGATTAAGACAAATTTCACCCATTTTTTTAATATCATTATCTTTTGATATAACTATAAATTTCCAAGGCTCAAGCGCCAAAGAGCTTGGAGTTAGACGTGTAAGGTCTAAAATTTCATTTATAACTCCATCTTTTATCTTTTCATCTTTAAAATTTCTACATGAATGCCTATTTTGCATAATATTTTCTATATATTCCATAATTTCTCCTTTTTACAAAATTTTACTATTTTAAATTATTATTTAAATTTATAATAATCCCACTTTTTTATCACTATCAAAAGCTGAAATTTGTTCTTTTTTAATCTCATCAATAAAATCTCTCAAGGTAAAAACATCGTCATCTCTAACAGCCACTTTCAATGCTGTATTTTTCAAAACAAGAGTTATTTGGGCTCCGCTAAGTTCAAATTTAGCAAGCTCATTCAAGCTAAAGTTCTCTTCAAAATTTGCATTTTCTGGCATTATTTTTTGCCAAATTATAAGTCTTTCATTAAAATTAGGTTTTTTAAATTCTATTTTGAAATAAAATCTTCTTGAAAAGGCACTATCCAAGCTTTGTAAAAAATTTGTTGTAGCTATTAAAACACCTTCAAATCTCTCAATTTGCTCTAAAAAAATATTTTGCATTTGATTGTGCATTTTATCGGCACTACTTGTTCCACTTTCCATTCTACTTGATAAAAATTGATCAGCTTCATTTAACAAAAGCACAGGCTCGATTTTTGCCTCTTTGCAAATGCTTTTATAAGTATCAAAAATTTTCCTTACATTTTGTTCGCTTTCGCCAACATATTTTGATAAAATTTTCGAACAGTCAAAACTTAAAACTTGCTTTTTTAGACTTTTTGCCAAACTTAAAGCACTCATTGTTTTGCCAGTTCCAGCAGGTCCGTAAAAAATAATTTTAGCATCGATTCCTTTTTTTGTCTTTATGCCCCAACTACTAAGTTTATTTATAACATCTTTATCAAGTTGTTTTAAAATAGAATTTAAAACTTCTTTAATTTTTGGATTTAATACAACATCATCAATATCGGTATTTGGCTCAATAAGCTCAAAAATTTCGCTTTCTTTTACTATATTTTCAAGCATTGCTTTTTTTGTTTTTTTATCATTTTTTTGTGGATGCATTATGCTATAAAGCACATCTTCACAAATAAAATAGCTTTTATTTATAGAAGTAGTTCCTAAAATTTCATCATAATCTATCAGTCCTAAACTCATTAATTTTGCATTTTCTTCTAATAAAGTTCTATTTTTTAACTTATGCATCTCATCTTTGCTAACCATTGAAATAAGGGTATTAAAATCTCTTAATATCTCATCCTCGTTTGAATATTCCTCTTTCAAAAGCGCTAAAAATATGATTTTTTCTTCTTGGCTTAATGAGTATTTTTTAAAAAGTTGTTCAACGCTTAAATTTATCTTAGTTAAATTTACTCTTTGAGCGATTATGTTTGTAAGTTTTTCTATTTTTTCATCAAGTTTTGTTCTTATGTCTTTACTTTGTGAATTTAACTTTTTTTTATATAAATTCACGAGTAAAAACTGATCTTCTAAATATTTAAGCTCATCATCGTATTTGGTTATTTCAGGAAGTGTTGTTTTAGTTATGCCACACTCCAAAACAGACAAAAAATATTCGCTTAACTCGATTTCACTATGCAAAAGCGATAGTTTTGTGTTTTGTTTGCTTTTTGAAAATATATTAATATTTTGTGTGATATATCCTAAATTTAATAAATTTTTTATATCATCAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012195|1481407:1490581|1483705_1483909_+|WP_050335769.1|DBSCAN-SWA MQTITLHADKNTIDKLLEFISANKLNIKIDKQDKIKNELLKDIDDYKNGKLKVSPLGNNWKYLNANN >NZ_CP012195|1481407:1490581|1488245_1488761_-|WP_026320363.1|DBSCAN-SWA MSKEKMVYLNEDIRAKEVRCVGDDGENYGVISKDEALDLANKQGLDLVLIAPDAKPPVCKIMDYGKFRYQQEKKQKEAKKKQKVIEIKEIKLSAKIAQNDINYKIKHAMNFLEGGKHVRFRVFLKGREMANPEVGVELLNDVYNSISDICDKDSEPKFEGRYVNMLVVPKK >NZ_CP012195|1481407:1490581|1482126_1483323_+|WP_050335768.1|DBSCAN-SWA MKKLIDRLISSESGAGMLLLFAAFLALVFANIPGLDKLYNWFVHFTPFTIPSFNILGSMHFWINDALMALFFFAIGLELKREMLEGQLKHFSQVLLPVFAALGGVIFPALVFVIINLNAQNHAIHGWAIPTATDIAFAVGVLALLGRRIPSSLKIFVLTLAIMDDLCAIVIIALFYTGDLSFLYLLLSFMIVGALIFINKLGVSNKTPYVILSLILWFFVLNSGIHASIAGVVAAFTIPLYTKKGNSMSKEMEQTLGLPVNYIILPLFAFVNAGVSMHGLDASHVFGTVPMGIFLGLFVGKQIGIFLFSFIIIKAGFAYMPEKANWKQLYAIAIICGIGFTMSLFVDGLAYGENSILLYHGTDKLAILCGSLVSGVVGYFAAKIVGNNPDGSPKKAKN >NZ_CP012195|1481407:1490581|1488757_1490581_-|WP_050335780.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSDIIAYKLNGNIIDTLSVDENEKGLEPIYFDNSTESLEIIRHSCAHLMAEAILELYPDAKFFVGPAIEDGFYYDFRAFKEDGSKIGEADLKEIEKKMKSLIEKKADFIKTNSTKTEVGAKFKSDDLKQEVLKRIPDGVVSIYSQGKFEDICRGPHVPNTKYLRFFKLTRVAGAYLGGDEKREMLTRIYGVAFADKESLNEHLKMLEEAKKRDHRKLGNEMKLFTFDEEVGAGLAIWLPNGARMRSKLEKALFKIHRDRGYEPVRGPEILKADAWKTSGHYDNYKENMYFTKIDEQEYGIKPMNCVGHIKVYQSEIRSYRDLPLKFFEYGVVHRHEKSGVMHGLFRVREFTQDDAHIFCAPNQIKENVLEILNFVENIMKTFNFDYEMEISTRPDKAIGDEKVWEVATNALKEALYENGYKYGIDEGGGAFYGPKIDIKITDALKRKWQCGTIQVDFNLPERFDLAYIDENNEKKRPVMLHRAILGSFERFIGILIEHTAGELPFFIAPTGVGIVPINDKHFDYAKKIALELRKLEVDSEILSKNETLNKRIRTAEKAHIPYILVIGDEEVEKNSVALRDRRARTQSNLSFDEFIKFIKEKLDEVHF >NZ_CP012195|1481407:1490581|1484892_1486602_-|WP_050335773.1|DBSCAN-SWA MKYLMDFLEKPASKTQIYSLLKLNENEAKILQFLTKSYIEGSPINSVFSILSTTFEESGYGFLIYLDDIKNLLNLGYITQNINIFSKSKQNTKLSLLHSEIELSEYFLSVLECGITKTTLPEITKYDDELKYLEDQFLLVNLYKKKLNSQSKDIRTKLDEKIEKLTNIIAQRVNLTKINLSVEQLFKKYSLSQEEKIIFLALLKEEYSNEDEILRDFNTLISMVSKDEMHKLKNRTLLEENAKLMSLGLIDYDEILGTTSINKSYFICEDVLYSIMHPQKNDKKTKKAMLENIVKESEIFELIEPNTDIDDVVLNPKIKEVLNSILKQLDKDVINKLSSWGIKTKKGIDAKIIFYGPAGTGKTMSALSLAKSLKKQVLSFDCSKILSKYVGESEQNVRKIFDTYKSICKEAKIEPVLLLNEADQFLSSRMESGTSSADKMHNQMQNIFLEQIERFEGVLIATTNFLQSLDSAFSRRFYFKIEFKKPNFNERLIIWQKIMPENANFEENFSLNELAKFELSGAQITLVLKNTALKVAVRDDDVFTLRDFIDEIKKEQISAFDSDKKVGLL >NZ_CP012195|1481407:1490581|1484235_1484844_-|WP_050335771.1|DBSCAN-SWA MEYIENIMQNRHSCRNFKDEKIKDGVINEILDLTRLTPSSLALEPWKFIVISKDNDIKKMGEICLNQPQVSNCSHIVVITARTDLQSKDEYLKHIIYSKNKGEDKAIKFLKMVSSKTDLMTENELYNYASLQCYMALANLVNIAYSKRVKSCIIGGFDKEKLTKFLNLPNELRPCIVVALGLSDEKSTPKIRQSLDEVVIWR >NZ_CP012195|1481407:1490581|1486639_1487479_-|WP_050335774.1|DBSCAN-SWA MKRIGAHVSAAGGVENAPLNALEIGADAFALFVKNQRQWNAKALEVESINKFNENLKLANIKKEHVLPHNSYLINLGHPDAEKRKKSINAFIDEIQRANLLGLKMINFHSGSHLREISENECLENISNSINFIIANTSDVKLVIENTAGQGSNLGYKLEHLAYLIDKTQNKQRVGVCIDTCHFFAGGYDLRSKESYKKTMSEFDKLVGYKYLSGMHLNDSKNGLGVKKDRHESIGKGTLGLEVFENIMRDENIDEIPLILETINPEIWADEIKLLRQMC >NZ_CP012195|1481407:1490581|1481407_1481974_+|WP_050335764.1|DBSCAN-SWA MKKIILASIVASTMLFASGHNHDNDANMINEFNPKSVEHIVVEMNMLDENGDKKVGEVVAINTNYGVALFPNMSGLGEGGMHGFHIHVNADCGATDKGLGMKAGGHWDPNDTKKHSFAWDDSGHKGDLPALYVDKNGVANYPVLAPKIKNINELKGHSIMVHVGGDNHSDNPAKLGGGGARMVCGVIK >NZ_CP012195|1481407:1490581|1487475_1487940_-|WP_050335776.1|DBSCAN-SWA MNKIFKIFFLICIIVFGGCATKNLTKQNGVLFTMVSPDFKFSDAGFIKTSNKSTELQIYSSGVNILKISIKDKICYNGVCKDEIEFNRNFLKMPYYKGFFAEILGKKPIYNGRDLVKTDCGFDQNLSNITYQICDNKVYFKNQKGVKIVIKEIN |
9 | Salmonella_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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