Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP012372 | Francisella tularensis subsp. tularensis MA00-2987, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas9,cas4,csa3,cas3 | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
208779 : 270216
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012372|208779:270216|DBSCAN-SWA 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59 | Morganella_phage(23.53%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
351054 : 384343
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012372|351054:384343|DBSCAN-SWA 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28 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
900108 : 909272
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012372|900108:909272|DBSCAN-SWA AATGATTTTAATCGATGGTAAGTCTCTCTCAAAAGACCTTAAAGAGAGATTAGCAACTCAAGTTCAAGAATATAAGCATCATACAGCAATCACCCCAAAACTTGTCGCAATAATTGTTGGTAATGATCCGGCAAGTAAGACATATGTTGCCTCAAAAGAAAAAGCCTGTGCCCAAGTTGGTATAGATTCTCAAGTGATTACACTACCAGAGCATACTACAGAATCAGAACTTTTGGAGCTGATCGATCAGCTAAATAATGACTCTAGTGTTCATGCGATTTTAGTGCAGCTACCATTACCAGCACATATCAACAAAAACAATGTAATATATAGTATAAAACCAGAAAAAGATGTCGATGGTTTTCATCCTACAAATGTTGGTAGACTACAACTTAGAGATAAAAAATGCTTAGAATCTTGTACACCTAAAGGTATCATGACTATGCTAAGAGAGTATGGTATAAAAACAGAGGGGGCCTATGCAGTGGTTGTCGGCGCAAGTAATGTTGTTGGTAAACCAGTATCACAATTGCTGCTAAATGCTAAAGCTACAGTGACGACTTGTCATAGATTCACAACTGATCTTAAATCACATACTACAAAAGCAGATATCCTAATTGTTGCTGTTGGTAAGCCTAACTTTATCACAGCTGATATGGTCAAAGAGGGTGCTGTAGTTATTGATGTTGGTATTAATCATGTTGATGGTAAGATAGTTGGTGATGTTGATTTTGCTGCTGTAAAAGATAAGGTCGCAGCAATTACCCCAGTACCTGGAGGGGTTGGACCAATGACAATTACTGAACTGTTATATAATACTTTTCAGTGTGCTCAGGAGTTGAATAGGTAGTTTATAGATTTGATTTTATCATGGGTAGTCATACCCGCGTAGGCGGGTATCTCTAAACTAATGGGTTAAATCGAAAGGATTCCCGCCTGTGCGGGAATGACAAGTGTTTTTAGAAACATGTTAATGCTAGAGGTTTTAGAAGTATAGGATCTCTTGACAGGAACAATTAAGTAATAAGATTCTGGATCAAGTCCGGAATGACAAATATTTTTAATTGATTAAAAGGAAATAAAATGGCAGGCTTAAAATATGAAGATGCTGGCGTAAATATCGAAGCTGGTAATCAAGCTGTAGAAAGAATGAAGCAGCATGTCAAAAAAACTTTTACCCAAGATGTTTTGACAGGTTTGGGTAGCTTTGGTTCTTTATACTCACTAAAAAATATTATAAATAATTATGATGATCCTGTCTTAGTACAGTCGATTGATGGTGTTGGTACAAAGACAAAAGTCGCGGTAATGTGTGGTAAGTTTGAAAACCTTGGTTATGATCTTTTCTCAGCTGCGACAAATGATATTGTTGTAATGGGTGCCAAGCCAATTACGTTTCTAGATTATGTCGCGCATGATAAGCTTGACCCTGCAATTATGGAAGAGCTCGTCAAAGGGATGTCAAAAGCTTGTGCTGAGTGTGGGGTTTCGCTGGTAGGTGGCGAGACTGCGGAAATGCCTGGAGTATATCAAGCTGGTGAGATTGACATGGTTGGAGTTATCACTGGTATCGTTGATAGAAAAAGAATTATCAATGGTGAGAATATCAAAGAGGGTGATATTGTCTTTGGGCTTAGTTCATCAGGATTACATACAAATGGCTACTCTTTTGCACGTAAACTATTTTTTGATGTAGCAGGCAACAAACATACTGATACTTATCCAGAGTTAGAGGGTAAAACTATCGGTGATGTGCTACTTGAACCACATATCAACTATACTAATATCATCCATGATTTCTTAGATAATGGTGTTGATATCAAAGGTATGGCACATATCACAGGTGGCGGGTTTATCGAGAATATTCCACGCGTATTACCACAAGGTTTAGGTGCCCAAATTGACAAAGATAGTTTTGCAACTCCAGCTATTTTTAAGCTAATGCAGAGAATCGGCGATATAAGCGAGTTTGAAATGTATCGCTCATTTAATATGGGTATTGGTATGACGATAATTGCTAGCCAAGATCAATTTGACAAGATGCAAGAATTAGCTAAAAAACATACTAATACAAAACTATATCAAATTGGTAAAATCACAAATTCAGGAAAGGTAGAAATTATCTAATGCTTGATAAACAAATCATTGCTAATAATATAAAAAATGTTCTAAAATCAACAAATCTTGATATCAAGAATAAATATATAGGTAAAGTAAGAGATATGTACTTTACTGATGACAAAAGTATTTTGATATCTACAGATAGACAATCTGCTTTTGATAGATCTTTGGGTTTTATACCATTTAAGGGGCAAATCCTTGCACAATCATCAGTATGGTGGTTCAAAGAAACAGCACATATTGTCAAAAACCACTTTATAGACTCTCCAGATCCAAATGTTGTCATCGCGAGAAAGGCAAAAGTATTGCCAATTGAGTTTGTCGTTAGAGGTTATATAACTGGTTCAACTTCTACATCATTGTGGACACATTATAAAAACGGTAGCCGTGACTATTGTGGCAATATCCTGCCAGAAGGTTTAAAAAAGAATCAAAAATTACCACAAAATATCCTTACACCAACTACCAAAGAGCAAGATCATGATCGCCCAATTTCAGCTGAGGATATTGTCAAGGAAGGTTGGCTAACTCAGCAGCAGTGGGATTTTGCTTCACAAAAGGCTCTAGAACTTTTTGAGTTTGGACAAAAAAAAGCCTTAGAACATGGCTTAATTTTGGCGGATACTAAATATGAGTTTGGTATTGATGAGCAAACTGGAGAGATTATTTTGATCGATGAGATCCATACTCCAGATAGCTCAAGATTTTGGCTAAAAGATAGCTATGCTACAAGATTTGAAAATGGTGAAGAACCAGAGAATATTGATAAAGAATTTTTTAGATTATGGTTTGCAAAAAATTGTGACCCATATAATGATGAAGTTTTACCACAAGCACCACAAGAGTTAGTTGTCGAATTATCTCAAAAATATATAGCCCTTTTTGAAATGATAACAGGGCAAAAGTTTGAAGTACCAAGAGATTTAGAAAATATAAATCAACGTATTGTTAAAAATGTTACAGATTACTTAAATATGGAGAAGCCAGTGAATATTCTTCTAGTAGGATCAGGAAGTAGAGAGCATGCGATAGCAGAAGCAGTCAAAAGAAGCTCTATTGCAAATAAGCTTTTTTGTATAAGCACAGCGATTAACCCTGCGATAGATAAGATAACGCAAGGGTATCAAATCGCTGATATTTGTAATTGTGATGAAGTACTAGAGTATGCAAAATCACAAAGTATTGATATTGCGATTATCGGTCCTGAAGCACCACTTGAGGCTGGTCTAGCTGATGCACTTAAGACAGCAGCAATTGGCGTAGTTGGTCCAACCAAAAAGTTAGCACAGCTTGAAACATCAAAAGGTTTCACTAGAGATCTGATCCGTGATTATGATATAGGCGCTAATCCTTTCTTTAGAAAGTTTAACTCGATGGATGGAGTCGAAGAGACTCTCAAAAAATATCAAAATCAATTTGTCATAAAAGCTGATGGTTTATGTGGTGGTAAAGGAGTGCTTGTTTGGGGCGATCATTTGCACAGCCTTGATGAGGCGATTAGACACTGTCAGTCATTAGTAGATGCTGGCAAAGAGTTTGTTATCGAGGAGAAGCTTGTTGGCCAGGAGTTCTCGCTGATATCATTTGCTGATGGCAAAAATTTTATCCATATGCCAGCAGTCCAAGATCATAAGCGTGCCCATGAAGGTGACAAAGGTCCTAATACCGGTGGTATGGGTACTTATTCTGATGCTAATCATAGTTTACCGTTTTTATCAGCTGCTGATATCGAAAGAGCAAAACAAATAAATGAGAAAGTTGTCAGAGCTTTAGCTGATAAATTTGGTGAACCATATCAAGGTATCCTTTATGGTGGCTTTATGGCGACAAAAGATGATACTAAAGTGATCGAGTATAATGCACGTTTTGGTGATCCAGAAGCGATGAATCTACTTACACTGTTAGAGACAGATTTTGTTGAGATTGCTCAAGCTATTACACAGGGTAAACTTGATACGGTCAAAGCTAAGTTTAAAAATCAAGCAAGCGTATGTAAATATCTAGTACCGCTTGGCTATCCAAACCAATCAGTTAAAAACTTTGAGATAGATATTTCACAATGCCCTGATAATGTCGAGCTTTTCTTAGGTGCTGTTGATTATAAAGATGGTAAGCTAATTGGTACAGGTTCTAGAGCTATAGCTGTACTTGGTTTAGGTGATACAATAGCTGAAGCAGAGCAAAAAGCCGAAAATGCTGTCAAAAATATTTATGGTAAACTATTTCATCGTCCAGATATTGGTACTAAAGAGCTTATCAATAAGCGTATCAAACACATGAATTTGTTGCGTGGTGATAAATATCAGGAGCTTAAATAAATAATGTCTAAGCTAAATCTTGTTATATTAGGCTCTACGCGTGGGACTAATATGCAAGCTATAATAGATGCAATAGCAAATAAGCAGCTAAATGCTCAGATAAGCCTAGTAATTTCAAATAAGTCAGATGCTTATATATTACAAAGAGCAGCAGATTATAATATCCCAACTAAATATATAGCAGCTAAAGGTTTGACTAGAGAGCAGTATGATGAGCTAGTTGTTGCTGAAATCCAAAAATATAATCCAGATTTGATTTTGCTGATAGGCTTTATGCGTATTTTAAGCTCGGTGTTTATCAAAGCTTTTGAAGGTAAGATCTTAAATATTCATCCATCACTATTGCCAAAGCACCGAGGATTAATGGATTTGGCAGTGCATCAGTCAGTTATCGACGCTGGAGATAGTATATCTGGATGCACTATCCATCAAGTAAGTGAAGAAGTCGATGGTGGTGATATAGTTTTGCAGTTAAAATGTGATGTGGTGAAAGAAGATACGGCTGATAGCTTAAAAGAAAAAGTACAAGCCTTAGAGAGTAAAGCTTGGATAGAAGTTATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012372|900108:909272|905241_905733_+|WP_003020895.1|DBSCAN-SWA MSVQVGVIMGSKSDWSTMKECCDILDNLGIGYECEVVSAHRTPDKMFDYAETAKERGLKVIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVLGVPVKSSTLNGQDSLLSIVQMPAGIPVATFAIGMAGAKNAALFAASILQHTDINIAKALAEFRAEQTRFVLENPDPREH >NZ_CP012372|900108:909272|907250_909272_-|WP_003020904.1|DBSCAN-SWA MNSIIEDSKLPKLAEFKVNEVKPAIDKLFSLAQSNLENALQTQNPNWQTLLKLEEDDEKISQAFSTISHMNAVCNSKELRESYEYAIAKLTDYYTKLGQNKDLYDLYKQIQKDNLTNEQAQAVRKAIIGFEQSGVNLDEAKRKRLQQISQELAQLSTKFENNVLDATMDWLYTTDDEKELKGLSQHTIESAKAKANQKNIAEKYALGIDIPTYLAVMQQADNRKLREKFYKAYCTKASKEADNKNFDNDENIEKILKLRIEKSQILGFDNYAENSLFTKMAETPEQVLELLNKLLEKSLPQAKKELNELRRFAEDAGLVDALQPWDSAYYSEKLKKAKFDFTEEELREYFPLEKVQDGLFKILKQIYNLDVKENTQYTKYVPEQQTFDFFKNDQYVGSIICDFFARDNKRGGAWMDDSRTAFTTSSGSKQNPVAYVNCNFLPPSKDGANLTHNDVVTLFHEFGHALHHILSQVTIPSISGTNGVEWDAIELPSQFMENFCWCQEGLAVISGSRDGKVLSSKQIDKLVGTRHFHSALMMVRQLEFGIFDMNIHYKKLTSATEVQKELDSIREKINLIKTPSYNKFQNGFSHIFAGGYAAGYYSYKWAEILSSDVFSRFEQEGILSHKVGNELLENIISKGSSRDAMDNFVAFMGRKPNEDALLRHSGINYKIYI >NZ_CP012372|900108:909272|906830_907184_-|WP_003020901.1|DBSCAN-SWA MQTIEIGNKAELQACKFLHTQALEILAHNFKALPYGEIDIIALDKDTLIFIEVKYRSKTKFAQAEEMLTYSKQQKLVNSASIYLQHNPQYQDYQCRFDLIAINESNINWIKNAFGVI >NZ_CP012372|900108:909272|905736_906834_+|WP_003020898.1|DBSCAN-SWA MKIGIIGAGQLARMLSLAGTPLGLEFHCLGKNGDCAEEVVKTVTDIELTKVNDVVAWAKQFDVITFENENISHELIKAINHEVSVYPSAKAIAISQDRLLEKSFMQDHGIATAKFVNIDSLAKLQSAVDDHGLPAILKTRRFGYDGKGQFVIRSQEDITKAWDVLKDAPDGLIYEAFVDFDYEVSQICTADLKGNIAFYPLARNTHKQGIIVESEAPFENVVLAEKAQQIAKILVKEFAYVGTLAIEFFVKGDELIVNEIAPRVHNSGHWSIDGAVTSQFENHVRAIAGLILGDTTSRKTVMLNCIGGMPATKDLAALDRVKIHSYNKEPRKGRKVGHLNLNLNDETDEYQLLQVKKLIALSEEI >NZ_CP012372|900108:909272|901190_902234_+|WP_003020889.1|DBSCAN-SWA MAGLKYEDAGVNIEAGNQAVERMKQHVKKTFTQDVLTGLGSFGSLYSLKNIINNYDDPVLVQSIDGVGTKTKVAVMCGKFENLGYDLFSAATNDIVVMGAKPITFLDYVAHDKLDPAIMEELVKGMSKACAECGVSLVGGETAEMPGVYQAGEIDMVGVITGIVDRKRIINGENIKEGDIVFGLSSSGLHTNGYSFARKLFFDVAGNKHTDTYPELEGKTIGDVLLEPHINYTNIIHDFLDNGVDIKGMAHITGGGFIENIPRVLPQGLGAQIDKDSFATPAIFKLMQRIGDISEFEMYRSFNMGIGMTIIASQDQFDKMQELAKKHTNTKLYQIGKITNSGKVEII >NZ_CP012372|900108:909272|904549_905125_+|WP_003017844.1|DBSCAN-SWA MSKLNLVILGSTRGTNMQAIIDAIANKQLNAQISLVISNKSDAYILQRAADYNIPTKYIAAKGLTREQYDELVVAEIQKYNPDLILLIGFMRILSSVFIKAFEGKILNIHPSLLPKHRGLMDLAVHQSVIDAGDSISGCTIHQVSEEVDGGDIVLQLKCDVVKEDTADSLKEKVQALESKAWIEVIKNWDK >NZ_CP012372|900108:909272|902233_904546_+|WP_003020892.1|DBSCAN-SWA MLDKQIIANNIKNVLKSTNLDIKNKYIGKVRDMYFTDDKSILISTDRQSAFDRSLGFIPFKGQILAQSSVWWFKETAHIVKNHFIDSPDPNVVIARKAKVLPIEFVVRGYITGSTSTSLWTHYKNGSRDYCGNILPEGLKKNQKLPQNILTPTTKEQDHDRPISAEDIVKEGWLTQQQWDFASQKALELFEFGQKKALEHGLILADTKYEFGIDEQTGEIILIDEIHTPDSSRFWLKDSYATRFENGEEPENIDKEFFRLWFAKNCDPYNDEVLPQAPQELVVELSQKYIALFEMITGQKFEVPRDLENINQRIVKNVTDYLNMEKPVNILLVGSGSREHAIAEAVKRSSIANKLFCISTAINPAIDKITQGYQIADICNCDEVLEYAKSQSIDIAIIGPEAPLEAGLADALKTAAIGVVGPTKKLAQLETSKGFTRDLIRDYDIGANPFFRKFNSMDGVEETLKKYQNQFVIKADGLCGGKGVLVWGDHLHSLDEAIRHCQSLVDAGKEFVIEEKLVGQEFSLISFADGKNFIHMPAVQDHKRAHEGDKGPNTGGMGTYSDANHSLPFLSAADIERAKQINEKVVRALADKFGEPYQGILYGGFMATKDDTKVIEYNARFGDPEAMNLLTLLETDFVEIAQAITQGKLDTVKAKFKNQASVCKYLVPLGYPNQSVKNFEIDISQCPDNVELFLGAVDYKDGKLIGTGSRAIAVLGLGDTIAEAEQKAENAVKNIYGKLFHRPDIGTKELINKRIKHMNLLRGDKYQELK >NZ_CP012372|900108:909272|900108_900957_+|WP_003020886.1|DBSCAN-SWA MILIDGKSLSKDLKERLATQVQEYKHHTAITPKLVAIIVGNDPASKTYVASKEKACAQVGIDSQVITLPEHTTESELLELIDQLNNDSSVHAILVQLPLPAHINKNNVIYSIKPEKDVDGFHPTNVGRLQLRDKKCLESCTPKGIMTMLREYGIKTEGAYAVVVGASNVVGKPVSQLLLNAKATVTTCHRFTTDLKSHTTKADILIVAVGKPNFITADMVKEGAVVIDVGINHVDGKIVGDVDFAAVKDKVAAITPVPGGVGPMTITELLYNTFQCAQELNR |
8 | Enterococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1624755 : 1683920
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012372|1624755:1683920|DBSCAN-SWA AATGCAAGTACAAACGATACAAAAAATATATGCTTGGCTAGTGCATCTTTTTACATCATTAGGTGCCGTGTTCGGTATCTTAGCTATTATATTTTCAATAGAGGCTGCTAAAACAATTGTATTAGGTCAAACAGATCTACATCACTACTATATTAAGCTTTCTATGTTTAGTATTATAATGGCGATATTTATTGATTCGATAGATGGTAGCTTAGCAAGACTAGTTGATATCAAAAAACTTGCTCCTATAGATGGCGCCCTTCTTGATAATATTATAGACTTTACAACATATTCAATTGTTCCTTGTATCTGGATATATGTATCAGCAGTAGTTAGCCAACAATGGCTAATCCCAATAATAATAATGATAACTATCTCCTCCTCATATCAGTTCTGTCAGCTAAATGCAAAAACTGATGATTATTTTTTTGTCGGTTTCCCAAGCTACTGGAATGTAATTGTAATGTATATGCTATGTTTTCAGTCAAACCAATTAATTAATGAAATAATGATAACGATATTATCAATATTTTCTTTTATACCAATTAAATATATTTATCTATCAAGAACTGAACATATCAGTAAGAGTAAACTTGTCAAAATATTCACTTTTATTTTCACAATGTTAGCAGCTATTGCAACTTTCCTAGCGGTATTACTTTATCCATTAAAAACGCCAACACCACTGGTAACAATAATATTAGTGTTTACAATATTTTATATAATCTTTAGTCTAAAACTAAATATTAAACCTGTAAAAAGTTAATCTGTTTACCTCTTAATCACTTCTATATGATAATATATTAAATAAGTTAAGCTGTTTTTATAATTCTATATGAAAGTTTTAAGTCAAGAAGAGCGCCAAAAACTCTTTTTAGAAAATATTTTCCCATATAAACATAAGATTCCTCGTAATGTATATGAAAAACAAAAGCATTATCTTCAGATAGAACTATTAAAATTTCAGAAATGGGTAAAAGAGAATAATAAAAAAGTTCTGATAATTTTTGAAGGTAGAGATGCAGCTGGTAAGGGTGGAACTATAAAAAGAATGATGGAGCATCTAAATCCACGTGGCGCCAAGGTAATTGCTCTAGAGAAACCATCAGAACAAGAGAGAAATCAATGGTATTTTCAACGATACATAGAACACCTACCATCTGGTGGTGAAATCGTACTTTTTGATAGGTCTTGGTATAATCGAGCTGGTGTTGAAAGAGTTATGGGCTTTTGTACTGAGAGAGAATATTTCTTATTCCTTGAACAAGCACCCCAACTAGAAAAAATGCTAGTTGATAGTGGTACTATGATAATAAAATTTTGGTTCTCAGTTAGCCAGCAAGAACAAAAAAATAGATTTGCTGCTAGAGAAAGTCATCCCTTAAAACAGTGGAAACTTAGCCCTATAGATAAAGCATCCTTAGATAAATGGGATGACTATACTGAAGCTAAAGAAAGGATGTTTATATATACTGACAAACCATATGCACCATGGGTAATCGTTAAGTCTGATGATAAAAAACGTGCCCGCCTAAATGCAATAAGATATATACTTAACAATGTTGACTATGATAACAAAGATCATGAAGTAGCAATACCTCCTGATCCTCTTATCGTAGGCACTTCTTCAAAAATATATAAATAAGCGCAAAACAAAAATAGTCCTTGACTAACAGTTCTATTTAAAATATAATCGTCTCTAAGTTTTGGGCCTATAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCCGGACTCATAATCCGTAGGTCGTAGGTTCGAGTCCTACTGGGCCCACCAAAAATATTTTTCATACTTTTTACATGGTATACTGACAAAACTAACGATCTAGATTTACCCAAAACATCAGATATAATTAGCTAAGATAATCAATAAATAAGAATATTTAAAAAATCTAGCTTAATATTTCGACTAAATTTTAAAATACAACTTAAGCACATACCTATAAAAATTACTTGTTTGTTATTCATGCATATTCAAAAAATGTTATAGTTATTTTTTATAGATGATCATAAATAGTTACAACAACACTTACTAATGTTATTTGATATTGTTTCTTCTGTCAAATAGTTCTGCTTATAGGTCACAATATTCTCATATGATTGTTTTATCGTTGCTTCTGCAACCTCTCCGGATTCTACAAGTTTTGCGATATTATCTATTATAGTATCTGGATTACCATCACTGAATATAAATATATTAACACCTGCATTAATAGCTAGTTTCAATGACTCTAATTCTCCATAATATTCTGTCACAGCCTTCATTTCCATAGCATCTGAGATTATAACTCCATCGAATTTAATATCTGTTCTTAATATTTTAATTATTTTATTAGACAGTGTTGCTGGATTAGTTTCATCGATGTTTCTGTTCATAACATGTGCAGTCATAACCATACAATGCTTATTTTCTGGTAATAACCTTATATATGGAATAAGTTCTTTTTCTGTCCATGTGTTAGTAATATCAGCAGCACCTAAATGAGAGTCATTAGTAGAGCTGCCATGTCCAGGGAAGTGTTTTAATACAGAACCTATTTTATATTTTTCAGTAGCTTTACAAAAAAGATTAGCACAATCTACAATAGTATTAACATCAGTAGAAAAACTACGCTCATATTTACCAATAACGGGGCAATTATCGTTGTGAATGTCTACACAAGGAGCTAAATTTAAATTAATTCCTACCTTATACATGGTTTTAGCCATTTCCCTAGCAACATGAGCTTGTTCTTGTATATCTAGCTCTGAAAATTTTTTTGCAGTAAAAGTTTCAGGAAATCCATATTTTGTTTTCAATCGATTTACTTTACCGCCTTCATAGTCAATAGCAATTATTAATGGTACCTGTGGACGCATATATAAATCATTATAAATCTTAGTATATTTCTGTAAGTCGCTATTTAAAGTCTTTAACTGTTCTGGACTTTTTATGTTGTCCTTGTCTTTTCTATCAAACAATATTACACCACCGATATTATTATCTTTAATATGTTGAACAATTTCCGATTTTTCGTCAATTGCTTGACCGAAGAAACCTACAATCAACATCTGACAATCATTTCCTTTAAAGAAACGGCATATATAGTGTCCGTAAAAATTAAAAAAAATATTGTAATAATAAACCTTACTTGTCTACACATAAAATATACCTCATAAATTTATTTATTTTTATTATAAATTAATAATTATTTATAATAATTTAAATTTACAGAAAATATGAATAAATATTTACTTATAACCTACTAGATATAAAAGTAGTACTAACTGAAATAGCTTAAAACTAAGTTGTTTTAGTGGGTTCCGTACAGAATGACGTACTACTTTTTAGTATAGTTAGTTATATGCTATTCTAGGAAGCCACACTACAATGTATTAGCTTAACTTTAAGGTTTTTAAATTGAACTGATGAGGTTAATATAACAATAGTAAAAATCTAGCTATTGTATTTCAAATATTAACTGGGGTATAAAATTGAATTTTTTAAATTAGGCTTATCCCATATCTCTTCATCTGATAAATCAGTTTCTATAAACTCTATTATTGCGCCATTTTCTTCAATAATTGCAACCCTAAAGCCTTCTATAGGGAAGTATGGTTTTAGCAAAATATTTTTATCTTTTATAGCTTGGTCAAGATCGGAGACCTTATAAGCAATATGAGGCATAGTTTGTATAAGTTTATCTAATGAACATTTCGGACCAAAGCGATGATATTGTACTCTTCCCGGCAACTCCCCTCCTGATGTATACATATATCCATGCTAGGGCTATAACGCTCTCCTGGTCTTGGCTCAGTAACTGGAATCCCAATATGATGATATTTATATTCCATAAATTCCCCTTAGGAAATATCTGTTTTACAAATTATGATATAACTTCTCAAACTAAAGTATTGAAATAAAAATCAAGGATAAAAGTAATGTTATAAAATAGCTGCTAGGTAATTTTGTTTATCTTTTTTTGTAAGTCTGACTTTATGTTCATTCATTAATGTTCCATGGAAAGCTTTGGCTAAAGCCTCTAGGATATCTAACATTAATTCGTAACATGTTTTAACATCATAATCCATACTAGCAAGCTTTCTATAATTCATTACGGCAATAATACCGGTTACACTCCCATCTGTAGCACTAGAAAATTCTTGCTCTTGATTATCAGGTAAGATACTAAATATAACATCCTTGTAGTTAACTTTCTGGAAAGCTTTATCATCAGTATATTTAATTCCATAGTATTTTAAAAATGTAGCTAAATCTTTTACTTGAATTGGTTCAATCGCTTCAAAATAAAGTAGCAAAAAACCATCTCTTAAGAGTGGATATTCTTGTTGAACATTTTCGATATTAGCCGCATACTCTGGGAAACTTTTAGCTTGAGTTATAAGCTCCTGAGCATTATTCTGTTCGATGTTCCTAAGTATTTCTACTTGTTTAAGTCGCAAACTTTTACGATATAGATCTATTATTATTAATACCACTAAAACTAAAACTAATGCCAATATCAATGTCATTTATCTAATACCTATACTTTTTTATACTGATGTATTATATATATAAAGATTATAAAAATTAAGATTTTTCTATCATAGTATCTAATACTTGAATGATCTTACTCTCAGTATCGATAACCATTTCTTTGTGAATTTTTTCAAATTCTTCTACTATATAATCATTACGCCGCTTATCATCAAACAACCTTTTTAACTCGCTAAATAAATTATCTACTGTACAGTCTTCTTGTATTAATTCTTTGATAATTTCATTTTTATGCAAAATATTAGGGAAAGCCCAATAACTATGATTACCAATAAGCATCCTACCAATTAAAGCCGATAGCCATGATAGTTTATAGCCTACAACCATAGGTAATTTGCATAACATAGCCTCCAATGTAGCTGTTCCTGATGCCAATAAACTTAAATCAGATGCTTTTAAAACATCATGTGAATTCGTTTCAAAAACTTCGATACCTAAACTATCAATTTGTTCTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012372|1624755:1683920|1646202_1646646_-|WP_003022496.1|transposase|DBSCAN-SWA MIGISNLQDKDIILDFFAGSGTIGDAVMQLNAEDGGKRKYILAQLDELIDEKKEAYKFCQDNGFEPMISSITIERLNRAGEKIKADIQAEFDAENSKKKPNQEKLVELREKYIRVFGVDPVVKPQDDKEIQQSPFYGLTVESIANKG >NZ_CP012372|1624755:1683920|1674875_1675409_+|WP_003022532.1|DBSCAN-SWA MRNKYFETSVGIFIIIGVLCLLFLTFKVSGTSFKAFNTQEYTITADFKSVGSLRTNASVKIAGVEIGRVTKIALEKSYNGFMAVVTMAINSDKKIPANYSASIAMSGILGDNYVALSPPSEDIMAIAGIADANNSSEQDKYLHQGSVIQLENTQSAIDLGSLINTFVAGKDDDKSKE >NZ_CP012372|1624755:1683920|1639844_1640390_+|WP_003022484.1|DBSCAN-SWA MKKLIVSSIIASIMLPATTFANNKQLNQGEVAYHNTFPISQSEAYDIFITNTDYANTVIMSNTIAGVMYGYLIKQKYPKMKFNKDYLYGSLIGQLMQESDMSSQLAQNFNPNDPDQLIHNSTYANILLQAGQGGPYQINDYSKRLPSAEAKGDLSLVNYNAVAAILGYSIQDQDDGSQTKK >NZ_CP012372|1624755:1683920|1676144_1676438_+|WP_003014804.1|DBSCAN-SWA MITVTNHKWTIETELTLKTVANIYRNFRKNLKKIDKTWIIDFARCDRIDSAGLSLIIEYIKYAQKNNIQIVFKNIDQKTLSLAKVHGAKTILEEYIN 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56 | Erysipelothrix_phage(33.33%) | holin,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1739343 : 1748163
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012372|1739343:1748163|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012372|1739343:1748163|1745285_1746431_-|WP_003024261.1|tRNA|DBSCAN-SWA MALLKFLKKLFYQCLKNKIIVIMENKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCSAEQDIADAQAVCDSIGIPFKKINFAAEYWDNVFEHFLIEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLSYVHLLGGDYIATGHYAQTRLAADGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLRQTIFPIGNIEKSKVREIAKENNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPAQKGEIHDENGIKIGMHDGLMYYTIGQRQGLGIGGVKDRPEVPWFAAKKDLENNVLIAVQGHDHPLLFKQSLQAIELSWVAGMAPADKFRCAAKVRYRQKDQSCEVEVNQDGSVNVTFDQPQRAITPGQSVVFYIDDVCLGGGVII >NZ_CP012372|1739343:1748163|1742006_1743218_+|WP_003022626.1|DBSCAN-SWA MFEQIKNNVENAIEALKQGKPVVVLDDYDRENEGDLILPGQKATEENIAFMLEHTSGIICLAMDSKKARELNLTPMVAADQNNSTFTTPFTVTIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASKADSKAEELARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMKLSGFNSAGVLCELMNKDGTMMKAAELEAFAKKHDLPLLTIAELYQYRLATENFVTKMASSTIPFKKIGELEMSVYKDNFSGDEVVVLSKPYSGNNPLVRMHSSCITGDIFGSLRCDCQDQLHKGIEMISEEGGFFIYLDQEGRGIGLTNKLKAYNLQMNENMDTLEANLALGLPADARKYDLAIQVLKYNNVNRCRLISNNPEKLAALRNVDIETQPVYCEAFVNSHNRNYLITKKIKAKHTIKGI >NZ_CP012372|1739343:1748163|1744273_1745266_+|WP_003022628.1|DBSCAN-SWA MEFSMRNIFKKTLLILLLSVIIASCGMLSNDQFVYLGHGENSPDYQLYYDKTQKLFVLIDKRNGCFQKDDTGTCLAFTLKQAREFREYVLAKMIEIDVRLAKDDYGNYAIEELRKAGVTTVNKPIKTKKVFATPVKQIVLDRKQQYHLVRKEYEIDSNLVAMVVNDKEGKKRIKVAYTVDFPGLEKEYSTELRPFIIDPEYLYTHMTIDAVHEAQFMQRDVMKSQTNVKKKVDDYLKDVVDSDKKDTGYTHQEVASSVAALDNDLITKADEQREDKETTLASGSSISTIAKKPINQESSGSTIQTATKTASTTQVDSNDTPKTTLASDNK >NZ_CP012372|1739343:1748163|1740348_1741416_+|WP_003022623.1|DBSCAN-SWA MKNIDKYYMQQALTLANRGRLTVSPNPMVGCIIVKNGAIISEGWHETVGEAHAEVHALTKAVDKAKGATAYVTLEPCCHCGRTPPCTDTIIKAGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVERLKNAGITVEVGLLEKQAQELNKIFFHYQTTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNDGDSKKISSHQAFVNTHELRNICDAILIGKQTLIDDNPSLDVRININKIKHPTRFILANHLTTINHNWRVLDQRHAKTIFVCSKISARVATKLNQLGIEYWLLPQSQHQVCLDTLLEKMGKIGITSLLVEGGNKTLNSFINQKLVNEFYTYLAPVIIADYNPKQQLSFNQISVREDIIINSCFKENSNV >NZ_CP012372|1739343:1748163|1741408_1742014_+|WP_003022624.1|DBSCAN-SWA MFSGIVQQLGTIKKITTKDSLKTFCIKFDNSLQCSIGDSVAINGTCLTVTKLDKQNLTANFDAVPETLKKTNLDTLKENQLVNIELAMRYGDHIGGHMVQGHIDEPGQIKSIQNVGGAWLIEISASREFLKYLVKKGFVTIDGMSITVINVLKDSFTVTLIPHTIEVTIAKNYSNGSMVNLEADATGKYIYKYIQGFKENV >NZ_CP012372|1739343:1748163|1746378_1748163_-|WP_003022642.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQVCNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQTYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPILNKIDLPSAEPDRVAQEIEEIIGIDATGATTCSAKIGIGVEDVLETIVAKVPAPEGDVNAKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRVKNGTIKKGEKFKVMSTGVAYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGAPVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKAIKKDGEIIEVDNLSKLPEPGAIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVITICIEKRGVQVDLNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSVTKGYGSLDYELIRYEPANMVCLDVLINGDKVDALASIVHKDQAKYKGRELVERLKELIPRQMFEVAIQAAIGGTIVARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNIGSVEIPQEAFLSVLKK >NZ_CP012372|1739343:1748163|1743667_1744192_+|WP_003017613.1|DBSCAN-SWA MNMSLEILKYPHPVLKEVAKEVTKDEINDDLRATIAEMHELMLEANGVGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEEQNPEIITIINPEIIEQNGKIIDEEGCLSFPGVSAKVNRATVVKIKALNEFGEEIEVEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLMQENAKS >NZ_CP012372|1739343:1748163|1743227_1743671_+|WP_003017614.1|DBSCAN-SWA MRKLAIVVSEFNSLITDKMLEGALEEAYAQGLKDSQICIKKVPGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCVIRGETDHYDYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGKYSIQAAITMAKMKKDILEQGV >NZ_CP012372|1739343:1748163|1739343_1739958_-|WP_003022621.1|DBSCAN-SWA MSEYSLFVMLCVIAAISSYFNLRFLKLPKAIGLTVVSALISLMLVVLIKLEPKLFYPAYHMLNSIDFKILVLKVLLGYLLFAAAMHLNFLEIKNFLASIFVLSSLGVVVSTFIIGTLCWLAAPIVIKHDVSYIYCLIVGAIFSPTDPVTVFAVFKTSKSVPMRVKSILSGEAMFNDVFSIVIFLILLSLVISGKSDIVNPRVFC |
9 | Indivirus(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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