Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012386 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 2, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP012385 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 1, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 1 | 0 |
NZ_CP012384 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas3,cas9,cas1,cas2,csn2,DinG,DEDDh,csa3,cas14j | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012384_1 | 943793-943955 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012384_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012384_1
>1.1|943845|59|NZ_CP012384|CRISPRCasFinder GAAGCAATCTTTCAAATGCCGTTTACTAAGGGGAAGGATGTCCAGCTCGATTAGTAAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012384_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012384_1 >merge|NZ_CP012384|1|943793-943955|CRISPRCasFinder ATAATTTGAAAATAGCTTTCCATATTTTTGAATTATTCGGCTTAATTCCGCCGAAGCAATCTTTCAAATGCCGTTTACTAAGGGGAAGGATGTCCAGCTCGATTAGTAAAGATAATTTGAAAATAGCTTTCCATATTTTTGAATTATTCGGCTTGATTCCGCC >NZ_CP012384|1|1|943793-943955|CRISPRCasFinder ATAATTTGAAAATAGCTTTCCATATTTTTGAATTATTCGGCTTAATTCCGCC GAAGCAATCTTTCAAATGCCGTTTACTAAGGGGAAGGATGTCCAGCTCGATTAGTAAAG ATAATTTGAAAATAGCTTTCCATATTTTTGAATTATTCGGCTTGATTCCGCC
>NZ_CP012384.1|WP_053108761.1|942559_943753_+|MFS-transporter MSKYQRKVLLSTSAGIALENMDIMFLAFSLSSMIATFHISGTQAGMIATITNLGMLVGGIFFGLMADKYGRVKVFSQTVLLFSIASLLMFFASNIYLVYLFRFIAGIGAGGEYGACMSLISESFSKKQIGRASSIAGIGAQVGAALAAILAAVVIPWLGWKMLYVIGVLPVLMVLVIRRGLKEPEDFQKTRATGKTTKLSHLFETKHLAWQTIGLSIMVTVQIAGYFGLMNWLPSIMQAQLGLSVSGSSLWMVSTIVGMSLGMLTFGIIMDKLGPRTAFTIFLLCSSLSVFLLVMAHSQWSLVAAAVVVGYFINGMYGGYGAIISSLYPTEIRATANNFIMNLGRAVGGFSSIVIGFLMDHYNLTAVIIFLSSIYLVSLLVLMTITGVKELKISLQE >NZ_CP012384.1|WP_016177002.1|941579_942398_+|MurR/RpiR-family-transcriptional-regulator MNYIYLIKEHYPLLTKSEKKVADLILTSGKTIIYSTMSDIKEKTKVGDATIIRFCQKLGFSGFSDLKIEIAKEDFSQKKEQPSSGKYYDEIANNLTEALHSTARLLNEEKLDEAIQLISEANHLYIFGVGSSGNTSLDLESMFLRVGVQAKAVLDPHFQAQVASLLKEGDVIVAFSLSGKTKDTFDSVEIAKKNGAKILAITNYIHSPIGQTADLVLQTAIEEFLNGGSLAGKISQLYICDLLVQGYEQKNNINAVELRERVLRSILDKSID >NZ_CP012384.1|WP_005877168.1|940730_941420_-|N-acetylmannosamine-6-phosphate-2-epimerase MDKQSFLEAISGGLIVSCQALPGEPFYTEEGGLMPYFALAAQRAGAVGIRANSVRDILEIKEKVSLPMIGIIKRDYPPEAPFITATMREVDELVATGVEVIALDCTLRKRHDGLSINAFIAQIKEKYPHQLFMADISTFEEGKNAWEAGVDFVGTTLSGYTEESKKQDGPDIELIEQLVEAGICVIAEGKIHTPEQARQIKELGVAGIVVGGAITRPQEIAERFIHALN >NZ_CP012384.1|WP_053108759.1|939217_940720_-|PTS-transporter-subunit-EIIC MFKKFSQLGRAFMLPIAILPVAGLLLGLGGALTNESAINAYPILAQPWLHTILSIMSYAGNAVFANLALIFAIGVAVGLSNGDKGTAGLAGGVAYLVYTATISGFLELFSAKGATLDTGVVGSIAIGGTVAFLHNRYRKIELPQFLGFFGGSRFIPIISSLAAIIIGSFFYLIWPPIQNGLVVAGEHIAQMGSLGTFLYGFLLRLTGAVGLHHTIYPLFWYTSLGGTESVAGVSVSGAQNIFFAQLADPNHTGLFTYGTRFFAGRFATMMFGLPAACYAMYRAIPKQNRKKNGGLYFSGALTSFLTGITEPVEYMFLFVAPWLYVIHAFLDGLSFYFADILNIRVGNSFSGGLIDFLLFGVLQGNDKTNWIKLIPFGLAWAVIYFVVFTFFIKKFKVAIPGMTEETDTLSEQPLNKNTSLHEEALTIIKALGSEANIETVEACATRLHVAVIDGQIVDKQTIQQLGATAVFEVKGGIQAVFGGKADLLSQEINQILEKDN >NZ_CP012384.1|WP_005877164.1|938723_939206_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MFKMFKKKKQETITAPCSGKVIPISAVKDPVFSQKLLGDGFAVIPEDQTIYAPLAGRVTTIFPTKHAISIKSDSGIDYLIHIGLDTVEMKGAPFTILVNENEQITIDTPLVEVDFDQIIQAKKDPAVIVVFTEAEQISELVLQTGALLHGEPCGTIERMK >NZ_CP012384.1|WP_053108758.1|937391_938276_+|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MQKALLVVNPSSGGEQAKEYEQLAHEKLKTIFDEVVILHTKKAGDAKNFAREATIEGYHSVFVMGGDGTVNEGISGIAEQEHRPNFGFIPLGTVNDLARALEIPLEPEEAIENLSIDSFKSLDIGKINEDYFMNVVAIGTIPEAINDVNPEKKTKLGKLAYFISGIKQLAGTQSYSFHLTVDGQEEKIESSTLLVGLTNSIGGFETLIPDAKVDDGKLHLIYLKDSSLLDTLKTLPDLLKGVDESTDNLAYQACEKVEVSLSDNAELATNVDGDEGVKLPVKISILPAHLTVYC >NZ_CP012384.1|WP_005877158.1|933493_935014_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEIFNSFFGSDIKREIELLRFLYKQNRFVSIEEISHVLKMDRRSIQKYYDFLVHSPLLTYEDRENILISKYGLGYKFVGTKKDYKALTKQVLQSNPFFELFETLFLENEINLVKFAYENYVSESTVRKRLYELEKLLDPIGFTLKKNKGYVYLEGNEARIRYFMVTFFWRIFSGLHWPFPNISEEKCTQISRNIYQAAQIEVNEIEIRITTYLLATNVVRYRKCYRIDPDTLRLEPPLTGGDQLLFSQLIDKDTLIFKQLQNELDQHYVFDSTEINFIYYWLQSSLGSSFSDEQLNDYFPHSFSQSKTTTDLKKLIIAISKDSDLKKLSAEKKQLILRTILTGFLSVELFGDTDHTLTGYDMYDFVSQNFPNLFIQSEKILTTLNIYEEERKRKGLALHVATAWTLIFPPSKFMKPIKIKLETDLPPVLEQNIKERIEAPFKNFYNIDIRSNFNDDEYDLYLSTASLTETLIEHPVLLINAQVTLNDLLMIQKEIEAISQNNMSRI >NZ_CP012384.1|WP_016176468.1|932201_933161_-|IS30-like-element-IS6770-family-transposase MTYKHLTIDELTMIESYYLQHNKPVEIANRMGRAIQTIYNVVNKFKQGKTALDYWHQYKENKKKCGRKVIQLPAHEVDYIKEKVTLGWTPDVIIGRKGRPVSCGMRTLYRLFSKGIFDIDTLPMKGKRKPNGHQEKRGKQQYQRSIHDRPDNYPDFNSEFGHLEGDTIVGIHHKSAVITLVERLSKVIITIKPNGRKALDIETALNQWFSRFPKNFFKSITFDCGKEFSNWKAISNQHDIDIYFADPGTPSQRPLNENSNGILRRNGLPKSMDFREVNQTFISSVSNQRNHIPRKSLNYRTPIEIFLSYVQEAFYSSLI >NZ_CP012384.1|WP_053108755.1|928810_929863_-|zinc-binding-alcohol-dehydrogenase-family-protein MSNDPLMQAVGFFEGLPIDDPKSFIDQKKEIPIPEARNILIKVKAVSVNPVDTKLRQTAPKSDTLKVLGFDGVGEVVKIGEKVSKFKIGDRIFYAGTTTRSGSNQEYQLVDERIAALAPKHLSDEEAVALPLTSLTAYELLFDKFGLIPEENANQGKKILVINGAGGVGSILNQLAKWAGLEIYATSSPKNFEWLTSVGVDHPLDYHHDLKQSLQELGVEAVDYIAVLFDITHYLEQITHLIKPFGHVGTIVGVNEPLNLSAWKNLSVSLDWEYMFAKTDYDYQIETQGEALAMIASLAERGVLKTTLTKVYSDGINAKNLRAATKEVESGHMLGKVVLTGTFNGEVAPF >NZ_CP012384.1|WP_053108753.1|926928_928635_+|DUF4091-domain-containing-protein MKFMIVDESYKASTELSHEEPTQITTITSSKNSCAVFQLLLHDGKKNHFILNKQFSIPDEIEIPVYRIAIKSDLPYQAQFVDYYLGTDGLAYADELIGETAYTYSGDRYAPIYIEIPIDKQVKPGTYPVQLSVYRSFINQEDQLVAEKSIEVSVLDFAFPDDVQQDFRLDIWQQPSNLARTFHVPLWGDAHFDLVDQMADKLAAIGQKAVTVIAGEIPWKGWFNYIVKDYPANLYEYSMIPIRKNMEGALICDFSILDRYLACFEKYGINQEINLFGLLGVWKPPYFPLNEQSGHSEKIVLRYFDESTDKITFIEQAADFTAYLKQLVFHLKEIGVWERTYVTADEPKSHEVEAFIQAVNDLKAIEPSIQIKVAFDKESVLNSLESVIDYPVTSFYCTCNNQQQLLEKFGKKLNYYICNYPTKPNTFLHSPLIETRVQGLLAYYFKTDGLLRWALNCWPTNARTDIRYNTGALPIGDNCLIYPGYNGDLLLSLRYKQLLRGIEDFWLLKHAEEQNEKKVQQLLDEFLVVTDPKDWMLNSHQANPEAFQLTEEKYQQLRNVLIRINQGE >NZ_CP012384.1|WP_053108763.1|944241_945450_-|MFS-transporter MNKRISPILTLLALVINAFAIGSTEFISVGLMPLIVNSFHVTLAQAGLTVSLYAIGVTIGAPLLTVLTGKWNRKYLMIVIMLLFIIGNLVAAFALSFSMLLGGRIISALAHGLFMSVSSVIAADVVEPNKRASAIAIMFTGLTVATVTGVPLGTFIGQQTNWHFTFIFIAIIGALGLVANLFLIPKHLPIPGVVDLRGIIRIFKNKFLLGSFIVTALGYGGTFAAYTYLTPILEDKIGYSAHAVVLLLVVYGIMVAIGNTIGGHFSNKQPLKSLSLMFGLLSLSLVFLFVAILSNQLILATLATLVLGLFSFMNVPGLQLYVVQLAEEYTPKDITLASAFNISAFNIGIAFGSFVGAQVTKSIGVTYTPIFGAIIVLLAVFLVLQLLHITRKTSSLKEKTAE >NZ_CP012384.1|WP_016177004.1|945709_946081_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MEKIYHIGVEATLEVIGGKWKPIILCHLGNGPIRTGELKRQIPTITQKMLTQQLRELEEDRIVDRKVYNQVPPKVEYSLTEEGKSLREILVAMSVWGEERIERQQEAGNEVTLLHTHGGYLNY >NZ_CP012384.1|WP_005877180.1|946208_946535_+|nucleotide-pyrophosphohydrolase MNSMDKVNQFRDERDWRQFHNEKDLAISISLEASELLELFQWKQPEEVTANNLERIKEELADVLIYSYMLADNLNLDLDEIIEEKLKKNCLKYPLEKSKGQRTKYTEL >NZ_CP012384.1|WP_053108764.1|946519_947269_+|class-A-sortase MYGTVGQKRRRGSEKEGKVKKWLINILLFLLLLIGLALIFNEQIKDFFVKNTGDQYAIANLTKEDINKNKEKDASFDFDAVESMSTESVLKAQLNHTELPVIGSIAVPSVSINIPIFKGLDNANLLYGAGTLSPDQQMGKGNYALASHRANNPELLFTPLENLTLGDKIYLVDLDNVYTYKATFKQKVAPTDTQLLNVQEGKELVTLITCGDMNAVTRLVVQGELEKITPMKEATQEMKKAFDMPTRTF >NZ_CP012384.1|WP_053108766.1|947507_948359_+|PRD-domain-containing-protein MVIEKVLNNNVVVSKNELGKEIICMGKGIAFQKKPGDHISKNDVQKEFILKDSFATHQFQQLMVDVPLEEVELVKSIVDFAEEKLQVSFSPNIYLTLTDHIHYAINRAKEKIELPNPLLFETKKFYPKEYQTAIAVLQLIEQKMGISLPMDEAGFIAFHFVNSQQSNGDMQVTMTATTMVRDVVSIISKFFGIVFDEDSLNYQRLITHLQFFAQRYLKGESSDEQDEFLYALVQGKYPKAFRCSERINEYLVQTQKEPMGVAEQIYLTIHIQRVVTEKQSTQS >NZ_CP012384.1|WP_016177006.1|948483_950352_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MDNQAVGKRVWEAVGGKNNVNSLVHCATRLRFKLKDESLAKTQELKNDPDVIQVVQSGGQYQVVIGSNVADVYQSIVDEQGLADHADTEEKSKNPLNRFIDIISSIFTPFLGAMAAAGILKGFLSLAIVLGWLTVDTGAYQILYAAADGVFTFLPVMLAFTAAKKFKANQFLSVAIAMALVYPAITELAGAGGAVDFFSLPVILSPSGYTSSVIPIILAVWVQSKFEPLVKKVIPQFLQMIFVPMIVLLVMVPLTFLVLGPIGTVIGNGLGSLFNSIYGFSPLVAGFIMGALWQVFVMFGMHWGFVPIMFLNIEQYGFDVLMPMLLPAILAQGGAALAVAVRTKDAKLRSLGISSMITSLFGITEPTVYGVTLPLKKPFIVACLSGGIGGAMIGFAGVKAFSSGLVSLLTIPTFISTNEAVESSVMMAVIATAVSFILAFVGTLIIGFDESAQDENLEGNKQTTAGDSIGTARHNLKSPLSGKVLPLSEVPDKVFSSGAMGKGIAIEPENGDLLAPADGVITTIFPTGHAVGITTTDGIELLMHIGMDTVELEGRGFEVFVKQGDTVHTGDLLVRFDIDTIKKAGYSVITPIVVTNTDHFADVLEFDQEEIIASEDFLAIVK >NZ_CP012384.1|WP_005877190.1|952562_953264_+|GntR-family-transcriptional-regulator MKRTRVLYLEVADKIKEDIFSGKYPVGTMLPTENELEELFQVSKITVRKAIELLAADEYVEKKSGRGTTVLSNRPYNRLSKAASFTQILKNSQYEVRKETLELKKIALKKDDPLYGYFGSHATRFKRLYYLNDEPYIYFIHYLPSEMIRVKRKEFDEESLYRLLTQKGEYIDVFSDDFSAIFLSEEEQEILKTSAQIGIKRIRRSSNQQGEILEYSEAIYHTDLHPYHIDYET >NZ_CP012384.1|WP_053108768.1|953559_954429_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MDKFVGIIERRIMPVANRIGTQRHMTAIRKGIIATMPLTIVGSFFTILLNIPIESVAAVIEPYREILDIPFRYTVGILALYATFGIASSLAKSYKLDSLTAGILALMSFLIVAAPTLRVVEDLEGVTAGRYINIANLGSGSLFGAIVTAIVSVEIYRFFIEKKITIKMPDGVPPEVTNSFVALIPGAVILIFFWVVRHMLGFDLNGFLSQLLMPLKGVLAGNSLFGGLLTVFLICFFWVLGIHGPAIMGPVIRPFWDISIAENIDAFNAGTNAQNMPNIFTEQFLQWFV >NZ_CP012384.1|WP_005877194.1|954471_954897_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIC MFSKSKYLKSLGRLSILPGLFNINEPMIFGAPIVMNPVLGIPFIVAPLVTTTLSYILTVSGVVPMMVARLPFAMPAPIAAWMSTNWSVAAGVLVVVNFLITLAIYYPFFKVFEKQQLAREAEELAKEEAAKMMDGITQEQA >NZ_CP012384.1|WP_053108770.1|954921_956019_+|DUF871-domain-containing-protein MKRSLGVSLYPDHSDLDEDKEYIKLAQKYGFTRIFMSMLEVTEDPEIVKEKFRQLITFAKSLGFETILDVAPNIFEQLDISYDDLGFFHETGADGIRLDLGFDGKKEALLTYNPYQLAIELNMSNDVAYLENILSHQANQPFLYGCHNFYPQEGTGLPYAFFQSCSERFKKHGIRTAAFISSQVGTIGPWDINDGLPTLEMHRHLAVETAAKHLFATNLIDDVIIGNAYASEEELQALGNLDCYQTTFTAEFVSGLNEVERAIMLNEQHVRRGDITEQVIRSTEVRKKYSGQSNPAHDTTFEFQRGDVVIGNDSFGKYKNELQIVLEPHSDSRKNKVGSIIPEEKILLDFIHPWSKFKFIEKQAR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012384_2 | 2066477-2066555 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012384_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012384_2
>2.1|2066501|31|NZ_CP012384|CRISPRCasFinder ATATTTAAGCTGAGGCTGGGACAGAAGGAGT |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012384_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012384_2 >merge|NZ_CP012384|2|2066477-2066555|CRISPRCasFinder TGCTTCTGTTCCCACCGTTTATTCATATTTAAGCTGAGGCTGGGACAGAAGGAGTTGCTTCTGCTCCCACCGTTTATTC >NZ_CP012384|2|2|2066477-2066555|CRISPRCasFinder TGCTTCTGTTCCCACCGTTTATTC ATATTTAAGCTGAGGCTGGGACAGAAGGAGT TGCTTCTGCTCCCACCGTTTATTC
>NZ_CP012384.1|WP_005875911.1|2065230_2066154_-|tRNA-pseudouridine(55)-synthase-TruB MDGLLPLWKERGMTSHDCVFKLRKILHTKKIGHGGTLDPDVDGVLPICIGKATKVIEYLTDSGKTYEGEITLGFSTTTEDRSGEKVESKRVGIPLEEGQIDAAMESFVGEITQIPPMYSAVKVNGKRLYEYARNNETVERPVRKAQIYRFERTSDIHWNETDGLLSWRFEVECGKGTYVRTLAVDTGKKLGYPAHMSDLTRTASAGMKKEQAITLQQVAYYMESGTIEAHLLPLEVGVARFKRVDISDDVWQKVKNGMRLEYNVFQLDRMPTEEIALFYRDQVVSIYQPNPKEKNKLKPSKVLRNEV >NZ_CP012384.1|WP_005875909.1|2064290_2065226_-|riboflavin-biosynthesis-protein-RibF MKIIKIRHPYQMDQIPKEDVVLVLGFFDGVHKGHQKVIQTGKKIAEKEGLKLALMTFNQHPSIVFKKINPSQVKYLTTLAQKEEKMAALGVDYLYEIDFTSSFAHLAPQDFVDQYIVGLHAKYAVSGFDYTYGPREIADVAHLPQYAKKRFEVVTIPKEENEGEKISSTRIRHLLDNGKLEEVTKLLGSVYEVEGVVVHGDARGRLLGFPTANVKVKSTVHLPKEGVYVTEIKVGDTWYRAMGSIGHNDTFGEGRELTVELYILDFAQDIYGEHVTIRWNHFLRDQVKFSSAEALIDQLKADEQATADYFN >NZ_CP012384.1|WP_053109105.1|2063203_2063989_-|glucose-1-dehydrogenase MYKDLENKVAVVTGGSKGIGTAISERFGKEKMKVVVNYNSDKEGADEAVAAIKEAGGEAVAVQADVSTEEGINRLLETALNKFGQLDIWVNNAGMENQSATHELSLEDWEKVIKVNLTGVFLGTKAALNYFKGENRKGNIINMSSVHEQIPWPTFAHYAASKGGVKLFTETVAMEYAPDHIRINSIGPGAIKTPINAEKFEDPKQKEILENMIPMARVGQPKEIAAAAAWLASEESSYVTGITLFVDGGMTLFPSFQGGKG >NZ_CP012384.1|WP_005875905.1|2062541_2063003_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MKDYYSVQELAEQLNVTTRSIRNYLQEGKLHGTKAGGKWRFTEQDLYDFLYGVEETNQDQENKQIFEAPVTLRFSLVTTDFYAMQKFKDTVFTYHLDVYANKKERLLHYQHLKQNHYELTIGGNFNYVMNFSHWIYKLLQKQSSITLKKMASS >NZ_CP012384.1|WP_053109104.1|2060782_2062141_+|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein MMEKLSIKKLLLVASLIFGMFFGAGNLIFPAHLGQLAGDHWLSAGIGFLLSATLLPLAALVALSKTKSTGLYDFAKHVSPWYGVTFLVMNHLALGPMFATPRTAALGYQFSLGNFLPAKYSTIGLLIFSAIFFGLAYYLSIHESNLLKIIGKWLNPLFLIILFLLFIVAFLSPFGPLDGTPIATYQHGATTNGFLEGYNTMDALAALAFGVTIIRSLQGMGIHKEDAIAKNTIKTGSLAMLLCGGIYLGIIALGSMSLTRFTVSENGGIALTQIIQAYFGKAGLALMGTMTILAVFTTAIGLIASFAQDFSVRFPILSYKGWLRVTTILSFTTANFGLNTIISWTMPFLMLLYPLAMAMILPSLCSSLFKNRKIVYQMTTLFTVIPALLDGIKALPVQNSFTSALTSWYIHTIPFAANGLGFILPTFAGFILGLLLCLFEKNYSYQKTISSK >NZ_CP012384.1|WP_005875899.1|2058128_2058647_-|hypothetical-protein MGKFRKVKRIVLVLLCSCFIGVACYYYYFIHYTRPVVVANQKNGAESKYVKNMSDKEFSAYLQGQADKSQFRLKMESDMFFEKADKVGKVTILNPNSNHYAIRVQTTIENQEAIIYDSGIIKPKQFVENGELKKTIPQGVYKVNHHVIYYELTNLKQKVGETVIVGQLAINQ >NZ_CP012384.1|WP_005875891.1|2054077_2054677_-|hypothetical-protein MNQTSFSRRIIQSASIFFGTFFLALFIGQYFLSEGFLREYNTGGNITFSSNLFFSILQIFLFNLLSILAIIVANLFSKRKTAEQAYRGSGFLVLFVLGTIFGLTLGSNSFGVVRENAVLSQKLFDLFKLTQYSALWEFSALILVNSVTIDKGILLTTGKKTHVRSFREISYSSAELKMLSLAFLFLLVGAVVESRLLTK >NZ_CP012384.1|WP_053109103.1|2053542_2053959_-|NUDIX-domain-containing-protein MRKKSIECWIYNRIEKQFLLLLVSNSAVTFWQPITGGIKRNESSENAAIREIYEETGIIVEHNCIFSIGKHSVAINADLVIDKQLYLMVTTEKDVKISKEHADYRWGKAENIPDNLKWKNNIESFTHSLKLVQSFLFN >NZ_CP012384.1|WP_115252178.1|2052740_2053424_-|hypothetical-protein MAFFSVSIFYFFNKIKQEDIVKEESKTINIINYSQLDGYYLGFMKNANSDDPKQLVFFRLDKVRPKDAQTPQADITYQAIDPSVSEDISYDFLTSELNKKAPEKLLDSLAVFGQGPLYWCKTTEISEASKEAAASLYTSKKNDKLSLIISYSGSDEPNLSSFSLAKVNKNKMNDKGIASIKQYLLNPEKNEQSLLSYYGIFELDKAIAMVNQGMFRYIGVRATPIFD >NZ_CP012384.1|WP_082192121.1|2052310_2052505_-|hypothetical-protein MGQKCLTPRNKKKFTKIAFQIFVNFGLFPKELLLLPPFIRESIAKLIFRFGPHSFFVQIGQFKL >NZ_CP012384.1|WP_005875913.1|2066768_2067116_-|30S-ribosome-binding-factor-RbfA MANYRDRRVGQEILKEVNDILRKKVRDPRVENVTITDVHVTGDLQQATIYYSILSDLASDKKKAKEGLEKASGLIRRELGHNLSIYKTPELTFELDESVVYGNHIDQLLRNLNKD >NZ_CP012384.1|WP_005875915.1|2067138_2069418_-|translation-initiation-factor-IF-2 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
286425 : 359696
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012384|286425:359696|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP012384|286425:359696|346439_347822_-|WP_053108518.1|DBSCAN-SWA MEKLWGGRFQGKSEEWIDEFGASISFDQKLAKQDILGSLAHVKMLGHTGILTVEETAAITEGLQTLQAKLQEGNLQFSIENEDIHLNIETLLHQEIGAVAGKLHTARSRNDQVATDMHLFLKDVVQEILEKLHHLRQTFVEKAEEHVETIAPGYTHLQHAQPISFGHHLLAYYQMFTRDYARLTESLKRIDLSPLGSAALAGTTFPIDREFAAKELDFSGVYANSLDAVSDRDFILEFLSNCSLLMMHLSRFCEELILWCSYEFQYIELTDTFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKTGRVYGNLFGLLTLMKGLPLAYNKDFQEDKEGMFDTSETVLACLTIMDGLVATMKVNKSRMYAATQKDFSNATELADYLAAKGLPFRQAHEIVGKLVLRCTQKGGYLQDIPFEEYQAISPLIEEDIYVTLQPETAVKRRHSLGGTGFDQVRLQLDHAHKELLTEN |
52 | Bacillus_phage(17.65%) | transposase,protease,tRNA,integrase | attL 334232:334246|attR 360937:360951 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
376783 : 434138
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012384|376783:434138|DBSCAN-SWA AATGACCTACAAACATCTTACCATAGACGAACTGACAATGATAGAATCATATTATCTTCAACATAATAAGCCGGTTGAAATCGCTAACCGAATGGGACGTGCTATACAAACTATTTATAATGTAGTCAATAAGTTCAAGCAAGGCAAGACTGCTCTTGATTATTGGCACCAGTATAAAGAAAATAAGAAAAAATGTGGTAGAAAAGTCATTCAATTACCTGCTCATGAAGTAGATTACATTAAAGAGAAAGTCACTCTTGGTTGGACGCCTGACGTCATTATCGGGCGAAAAGGAAGGCCTGTTTCATGCGGTATGAGAACACTTTATCGTTTATTTTCTAAAGGAATATTTGATATTGACACACTACCGATGAAAGGTAAAAGAAAACCCAATGGCCATCAGGAAAAACGGGGAAAACAACAGTATCAGCGCTCAATCCATGATCGACCTGATAATTATCCTGATTTCAATTCTGAGTTTGGTCACCTTGAAGGTGATACGATCGTTGGCATTCATCATAAAAGTGCCGTCATTACTTTAGTTGAAAGATTATCTAAAGTCATTATCACGATTAAACCCAACGGCCGTAAGGCATTAGATATTGAAACTGCCCTTAATCAATGGTTTTCTCGCTTCCCTAAAAACTTCTTTAAATCTATTACGTTTGACTGTGGAAAAGAATTTTCTAACTGGAAAGCCATTAGTAACCAACATGATATTGATATATATTTTGCGGACCCTGGAACACCTTCTCAACGCCCATTAAACGAGAATTCTAACGGGATTCTGCGTCGTAATGGACTGCCGAAATCAATGGATTTTAGAGAAGTGAATCAGACATTTATTTCCAGTGTCAGCAATCAACGTAATCATATTCCAAGAAAATCATTGAATTACAGAACACCAATCGAAATATTTTTGAGCTATGTACAAGAAGCATTTTATGCTAGCTTAATTTGACAAATCATAATATTAAAAGAGTTTTTCATAAAAATTTACAAAAAGAAAATTTGGACAAAAATTTAGAGAAATCTGTAGTTCACAGTAGATATATGGATTTTTCTCAAAGCATAATTGTTCCAGAGGATGAAACACTTACTATAGCTAAATTTCCACCAAATAGATTTTCTGAAAAAATAGGAACACATCCAGATTTTACTGATGATAGTTTACTTCCAAAGACACAATATATTTGTTCAATTTTTTTAGATATTAAAGGTTCCACTAGATTAGCACTCAAGTATGATTTAGAAACTGTTCAGAAAATAAAAAATGCTGTTATTTCAACTGGAATTGAAATCATTAGATATTTTGGTGGTCATATCCACCGACTTCAAGGAGATGCAATTTTTGCTTTTACTGGACATAGTAAAATTTCAAAAAGTGATGCAATAATTCAAGCTATAAATGCAGCTTCAATCATACAATATATGAATCAAAATATTTTGAAAGAGTATTTTGAGAATGTTTTAGGTGTATCATCATTAAAAATAAGAATTGGTATAGATTTTGGGGATGATGATGAAGTTCTTTGGTCTAAATATGGCATCGATGATATTAATGAAGTTACTGTGACTAGTTTACATGCTGATTTGTCATCTAAACTCCAAAATAAGGCTTCTGCAAATAGTATTATGATTGGTGAAAATGTTTTTTCATACTTGCAATTACCAGATGATTTGCTCAGTGATATCTACATTAAAGGTAACTCTGAAGAAAAAGACTATTATATTATGAAATATAAGTCATTTAATTATAAAATGAAAAATTTTGATTGGTCAAAATATTTGGAAAGAATAGCCCATTTTGAGTCTTATGAGGGAGACTTTCAAATGAAATGTTATTACTTTTCAGAAAGCGAAGGTTGGATACCTTACTATTCAGAAAAAGCATTAGAAAAAGATACAGACATAGTTTATCGGATTGAAGCTAGTCAGCTTTTGCTACATAAAATTAACAGTGTAGAATGGACTGTTTCAAACTCTGGTATTGAAGCTTCTGAAGAAGAAGAGTTAGACTATGTTGTCCCAAAAGACGCTTTCTCGGAGGAAGACATTGCTGATTTTCGATGCCCGAGGCATACTGCTTTTAATGGACTGCATTACATGATTTGTAAGATAAAATCTGAAGGAAACATTACTAAAAACAAATATTTTAGTTTATATGTTAATGACAATGATTTATCTAGAAGTTACTTAAAAAAATCTGAATTGGAGTGATACTTATATGTCATCATCAAAAAAAGACTTTGTTTATTCACAAAATGACTATCTAAACAATTATATACAGTTTGCAGATACTAAATCAGCAGTATTTATAACTGTAAACGGTGTATTGATGGGATTTTTGTATACTCAATTTAAAGATACTTTACCTTTCGAATTAGAAAAATCGAGTCATCTTGTTTTATTAGTGAGCATCGTACTGTTACTTGTAGCTTATGTTTTTTTATTTTTAGTTATCTTTCCACGTAGAAGCTATAGAAATGGCAACGGAATTGTTTTTTGGGAAGACGTAGCTACCTATAAAGATGCTGAATCTTATAAAATAAAAGTATCTGAAATCTCTCAAGATAGTTTTGAAGAAGTCATGATTGAACAAAACTATTATCTTGCAAAGACAGCAACTAAAAAGTATAAAAACTTACACTGGAGCTTTATATTTTCAATAGCTTCTTATATATTTGTAGTTATTTTCAGTATTCTAAATATTTTACAATAACTATTGAAATATGTGATTACTGAACTTTATGGGAAATTTTTACTAAAGTTTGACAAATAACTATACTTATGATTACCTCGAAATATATTGAGCTTTATATATGCACCAAAAGTCTTCTTGACTTATTTGATAAGCATAGAATTAAAAAAGGAGAATGAGATGGATGTCAATAAATCTCTATTAAATTTTATTACAGATGGAGTGGTTACTTGTAAGCAGCTTGACGATTTTTATAATGCTTATCATGAGAATAAAGAATTTAAGAATGCAGTTGATTTTCTAAATGGAAGTATTGTAATAGATATGGGGCAATTAAAAGAAGAATTATATCAATCAGAAGATGCACACGTATTAGGTGCAGTGGAATATATGCAGAAACATTACCCTTCAGCAGTTTCGTTCATAGACTTGATTTCTAAAGATAAAAGAAAATTTATTTAATAAGTGTATAACTATTGATTTTTTTATTTTTCATAATTATTGGTTTAGAGCATAAAAACTTTCCGTATTCTAATAAATTGGGTCTATTTTATTTTAGAAATGTTATCTAACCCCTTGTTAAATAAGGCTAAAGTCCGTGTAGTTTTTGGGTCTGGATTTTGAAAAATTAATGTAAATCGAAGAATTTAAGACAGTATTCTAATGTATAAAATATGGTGAGGAAAACCATTACAAATGTTGATATAAAAGGATTTCCGTTTAGCTCTTAAACGTGCTGGCTTACTTACTCGTGACGCACGTATGGTCGAACGTAAAAAAACAGGTCTTAAGAAAGCTCGTAAAGCTTCACAATTCTCTAAACGTTAATCGTTGTTATACCAACGATTTCAAGCACTTTCCATTCGTTTGGAAGGTGCTTTTTTTATTTTGGTTATGAGCTTGGTTACGACTATTTTTTTCAACTTGTTTTTTGCCGATAATCTTCCAAGTGCTTGACGGTTTCTTTTTGAACTTCTGGATTTACATGCCCGTAAACATTTCGTGTAATCTCAGATGTTTCCGCATGACCGACTAGAGATTTTACGATTAAATCATCCACACCATTGTTCAAAAGGTCACTGACAAAGGTGTGTCGCAAGCCGTGTGGTGTTATTTTGGGAAGACCAAATTTCTTTGAAAGAGCATCAAGTTTATTGTTAAGATAGTCTGGATGCAAAGGTTGGTTTAGTTCTCCCTTTTGAGTTGTATAAGTGAAGATAAATTGATCATCGGTTGGAAAAATATTGACTTGTTGTAGCTCATTAAATTGAACTTTTTTCCATTTTACCAATAGATCGATGACGGAATCTGCTACTGGAATCGTTCGAAAGCGATAGGAGTTTTTCATTCCTTTTACACGCTCGTATTTTCCGGTAGCTTTATTTTTCACCAATTTATGCATGAGGGAAATCGTCTTGTTTTTGAAATCAACATCTGACCAGACCAAAGGATAGATTTCCCCTTTAGCTGCTCCTAATTGATAAACCAAAGAAAGTAACGTAAAGTCTCGCATCCCATATTCTTGTTTCATTAAAGTTAGCACTTGTTGGATGAGTTCCTTAGAATAGTACTTTTGCTGACGTTTTTCTTCCTTTTTGTTCTTTAGGTCTGCATTTACAGGCATCTCCAATAAATCATAGGGATTCTTTTGGATATAGCCTTTCACTAGGGCATAGCGTAATACTTGTTTGGTGTAGGAGACACAGTGTTTATAGTTAGCATAAGGTTTAATGCCTTTTTCCTCATTGCCAAATGACCACAAAATTTGGGTATCTTCTAATAGGTCATAGGTAATCTTATTAATCGGAATCTCCCCTAAGTAAGGAAGAATTCTCTTCTCAAAGCAAGTCTTGGTTCGATCTAAAGTAGACTGCTCATGATGTTGTGTAACGGTGTATTTCTTATCCCACCACATTTGGTAAACCTCTTTGAATGTATAAGAACCTTTCTTCTTTTTCACTTCTCCTTTCAATTTTTTTAGTTTTGCTTCTGTTTCTAAAATCTCTGCCTCGTGTTTGCTATCCGCATAAGCCACGTATCGAGAAGCATCTGCCCCCATATAAACATTGACTTTATACGAGCCATTTTCCATTAGACTAATTGCCATTTCTATCTTCCTTTCAAAAATGGCATATCAGTATCACTACACACTCATCATACAGCGCCTTGCTGTGCTTTGGAATACTCCCTTAGCCATTTATCGATCTCTTCTCGCTGGAATCGTACAACTCCCCAAAGATGTATCATGGGAAGTCCTGCATCAATCCATTTATCAAGCGTGTTGTTGGCGATACCTAAA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51 | Streptococcus_phage(21.43%) | tRNA,transposase,integrase | attL 376687:376746|attR 414054:415119 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
597021 : 730422
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012384|597021:730422|DBSCAN-SWA AATGACCTACAAACATCTTACCATAGACGAACTGACAATGATAGAATCATATTATCTTCAACATAATAAGCCGGTTGAAATCGCTAACCGAATGGGACGTGCTATACAAACTATTTATAATGTAGTCAATAAGTTCAAGCAAGGCAAGACTGCTCTTGATTATTGGCACCAGTATAAAGAAAATAAGAAAAAATGTGGTAGAAAAGTCATTCAATTACCTGCTCATGAAGTAGATTACATTAAAGAGAAAGTCACTCTTGGTTGGACGCCTGACGTCATTATCGGGCGAAAAGGAAGGCCTGTTTCATGCGGTATGAGAACACTTTATCGTTTATTTTCTAAAGGAATATTTGATATTGACACACTACCGATGAAAGGTAAAAGAAAACCCAATGGCCATCAGGAAAAACGGGGAAAACAACAGTATCAGCGCTCAATCCATGATCGACCTGATAATTATCCTGATTTCAATTCTGAGTTTGGTCACCTTGAAGGTGATACGATCGTTGGCATTCATCATAAAAGTGCCGTCATTACTTTAGTTGAAAGATTATCTAAAGTCATTATCACGATTAAACCCAACGGCCGTAAGGCATTAGATATTGAAACTGCCCTTAATCAATGGTTTTCTCGCTTCCCTAAAAACTTCTTTAAATCTATTACGTTTGACTGTGGAAAAGAATTTTCTAACTGGAAAGCCATTAGTAACCAACATGATATTGATATATATTTTGCGGACCCTGGAACACCTTCTCAACGCCCATTAAACGAGAATTCTAACGGGATTCTGCGTCGTAATGGACTGCCGAAATCAATGGATTTTAGAGAAGTGAATCAGACATTTATTTCCAGTGTCAGCAATCAACGTAATCATATTCCAAGAAAATCATTGAATTACAGAACACCAATCGAAATATTTTTGAGCTATGTACAAGAAGCATTTTATTCTAGCTTAATTTGACAAATCATAACATTTAAAAATCATTAAGGAACGTTATGCAAATTTAAGTATAAAAGAGTTACTAAAGGCAATGAATAATAAGGTATCAGTTACTTGGGGATCAGGAGATTTAAAATCTTCTTTTGAAGTCTACTTAGGCACTGGGAAATCTAAAAAGGCAGCAAATTTATTTTCAAGTAAGGTTACGGGATTGATCTTGTACTCTTGGATGATGACGATTCAATATTTATTGTATATTGGTGTGCTCTTGGCCTGTATTTATTTGTTCAATTCTAAAAGTAAAATAGCTTTATTATGTATGATTTATATTACCGGTTATTTTACATTCTTGCTATTTTGGGAGGCTAGTCCTAGATATGCAATGGGAATTTTTGTTCCAGCAATTTTATTGATTGGTGTATTACTAGAAAGATTTTCAGTTAAGGACAAGCAAGTGTAATTCTACTTAATAAATAATGTAAAGTTTAAAAATAATTCTACAGGCAATGTGCGCTTAGCTATTTTTGAGCTAGGGATTGTTTGAACGTTTTTAAAGAGTTAGGGATATAAATCATGACGAAATATCTAGATGCTAGTCGACTTGATTGGCATTTAGATTATTTTTTTGTACCAAAATAAGAGTATATTTGCTAGACCTCTAAATAGAGAAATACTTCCAGATTGGTAATTCCTTATTGATTCAATGAAGTGATTATCTCTGTGTACAATTTTTCAACATGCAGCATACCGTACTCTTTTTTGGGAATGATTATGATAGGTCTTGTAGGAAATTTTTGTTAGATCTCAGTTTTTGCATATCCAAAAGTAGGAGTCAATAAAAGAGTTAATAGACTCTCCCTTTTTTTCTTTCTATCATAAATTAGTCCAAAAGGATAAACGGTTTTTCAAAGACTGATCTTTATCTAAGTGTATGTTGATCTAAAAATACATGTGTCGCTTTACGATAGTTGAAGGTTGTTGGTCAATTTTAGAGATGAAAGTATTTTTTGTAATCCAGAATCACTTGATCAATTCGCTGAGTACATTTTTTGAAACATTTGCTGTTACATGATACCCTTCAATTAGGGTGTTAGAAAAGAGGGAAATGAATGAGAGTCGTGATCGTTGGTGGTTCCTTCGCAGGAATCCACACTGCAATGGCACTGCGCAAGCATTGTCCGGATAGTGAAATCATATTGATTGAAAAACAGGCGAAGATAGGTTTTATCCCCAGTGGAATCAACTTGCTTTTGAAAAAAGAAATCACTGAGGAAAAGCAGCTTTACTGGATGACAAAAGAAAAAATGGAAGCGTTCTACAATGTGGATGTGCGAATCAATACAGAAGTGGCTTCGTTAGGGACAACGACGAACACGCTTATTTTGCAAAACGGTGGCCAGTTGACTTTTGATCACTTAGTCATCGCTACAGGGTCGAACCAACAATTCAAAACGATCAGTACAGAAAGTGAATTGATCCGTTCGGTGAGAGATGCTCATTTAAAGGAACCTTTAGAAGAAAAAATCGCACAAGCACAAAAGGTAGCTATTGTTGGTGCCGGTCAGGTGGGTATTGAACTGGCGGAAGGATTGGTGGGTCAAAATAAGCAGATCCACTTATATGAAAGCCGAAAAAATTTGTTGTTCCGCTATTTTGATCCTGAAATGGTTGCCCCGTTACGTGAAGAACTGGAAAAAAGAAAGATTCCTGTCTTCTTGAACGAGCAGGTCCAATCGTTGGTGGAATCTGAGTCAGTGACAGTCACTACGGATCAGCGAAAAGAACGGTATGATCTGGTTTTATTGGCAAACCACACAAGACCAGATAACCGACTTTGGCAAGAAAAATTGAAACTAAATGATGACGGAACGATCTGGGTGGATGATTACTTACAAACTTCGGCAAAAAACATTTACGCAATTGGTGACACGATCCAGGTGAATTTTCGTCCGACAGAAGAAAAAATGTACGTGTCACTGGTAAATAATGCGATACGCACGGCACATGTCGTTAGTCGAACGATCAGTGGTAAACCAACGAAAGATCCGGGAACCTATCGTCCAGTGGGCAATCATTGGTTTGGCTATTTTCTAGGAAGCGTAGGGATAACAGAAGAAGAAAGTATTTTTTATCCCCAACAAATCACAAAAGAGTATCTAACAACTCAGGTTTCTGCTACGGATCATCAGCCAGTAAAGATCAAGATCATCCAAAATGAACAGCAACAGTTAGTTGGTGCGCAGCTTCAAAGCAAAGGCAATATTTTCCATCTGTTGGATCAATTTACGCTAGCAATCGAAGAAAGCTGGACATTGGAACAACTTGAGGAACACGAATTATTCTTCCAACCGGAATATCGGATGCCGATCCCTTTTACAAAGGTGGTTGAAGACACCCATGAAGATTGAACAATTATTGGAAAAAAAAGAACAGTTACAAGTCTTGTTGTTGCGAGAACTTGTATTGCAAGGTGGCAAGGCCTCTAGCAGTGAACTAAGGGAGAAAGTGAATCTTTCTAAATCAGCCTTTGACCAGTATCTGGAAGATATTGAATGGATCGGCTCGATGATGCGCAAAAAAGTAGAAGTCAAAAGAACAGAGTTTCAAGTTATCCTTGAGTTAGGTGATGACACGAGTTTAGAACAGATATGTCTATTCTTGCTTCAACAAAGTTTGAAATTCAATTTGCTCACATATCTTTTAGAACATCAACAAGCCTCGATCGTTCGTTTAGCTACTGCATTCAATATCAGCGAATCTTCTGTTTTTCGCAAAATCAAAGAATTGAATCATTTATTGAAAGAATTTTCTCTTCAAATCAAAAATGGACAAATCTATGGGGAAGAACTACAAGTTCGGTACTTTTATTATGTCCTCTTTCAATTCATCCCAGAATCTCAACGACCTCTTTTCTTACAGAATACACCGGAAAAACGACCATTGATCCTAGGGTTGGAACGTTCGGTAGAAACAACTTTTTCAGCGGATGCATCAATAAAAATTGCTTGTTGGTTAGGAATCACGAGGAAACGACTAATGAGTGAAAAAACGACTTTCAAAACGTTGAAAACAAGAAAAACACTTTATGAGAATGATCGGTTGTACCAAGTGATCGATCCAGTCCTTTCGCTTTATCTAAGTCGAACTGCGGCTGACTTGAGTAATTATGAAACACTCATGTTCTACAGTTTTTTTGTGTCATTTGCAGTATTGGATGAGGAACACTTTTATCAGTATGATTTGACGCGCAGCAAAAAACTGCCGACTGCTGTCTTGGATACATATATCCGAGAAACAATGCTGTGGCATTATCGGCCCAGACGTCTAAAAATAAAGGAAGAAAAGGCTGTGGGTTATCAACTGTCACAAATCAATAATGAACTGTATTTTTTTGATGGGCATATGCTGATCTACGATCAAGAACATCTATTGGAACAACAAAAAAAGATGTTGGGACATTCCCTCAGTCAGTTACTAGAACGGCTAAAAGAAACAACCATTGAACAATTTTCTTCTAAAAAATTTGACGAGACACAATTAGAATATTTGATGATCCAATATGCGAATGTTTTGATGATGATCGATTTTTACATTGCCAAGTCTGTCAAAATCGGGATCGATATCGACACATTGCCGATTTATCGAATTGCGTTCCAACAATTTTTACTTAGAGAACTTAAAGGGATCAGTGGAATCGATATTGAAAATGTGCGTGCAGACAAATCCTATGATCTAGTAATCACTTTTAATCAAGAAAAACAAAATCAACACTATTATTATTTATCAGAGTTTGCTTCAAACTATGATATCAAAAGGTTGAAACAGAAAATTGAGCAAGAAAAAAAGCTAAAAATTGAGAAAACTGTCAAAAAAAGTCCAAATTGCTATTTTTTTGGCAGTTTCTTTGAAATAAATGGGTGTAAGATAAAAACAGATTAAGAAAGCGTTTGCAAAAAATGGAGGAGATTATAATGACTGAATCAACGTATATCATGGCCATCGACCAAGGAACAACTAGTTCACGAGCAATCATCTTTGACAAAAAAGGGAGACATATCGG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105 | Streptococcus_phage(23.53%) | tRNA,transposase,integrase | attL 641392:641408|attR 720537:720553 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
907624 : 933161
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012384|907624:933161|DBSCAN-SWA 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21 | Streptococcus_phage(40.0%) | transposase,integrase | attL 907009:907025|attR 919298:919314 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1182685 : 1253387
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012384|1182685:1253387|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(35.71%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1458734 : 1467781
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012384|1458734:1467781|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012384|1458734:1467781|1461545_1461800_+|WP_005876462.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKNAVHRLGYDTVEEIRIGKYFEIQVSAEKQAVEETIEAICDKLLANVNMETYRYEIEQLEEI >NZ_CP012384|1458734:1467781|1464684_1466124_+|WP_053108959.1|DBSCAN-SWA MPYEVKSLNEECGVFGVWGHSDAASITYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDQGKLLGHRDLGLLSEVFKDQRKLKALSGEAAIGHVRYATAGNGSVDNIQPFLFKFYDQSVGLAHNGNLTNARSLRTELEKDGAIFHSNSDTEILMHLIRRSGEQTFLGKLKHALNEVKGGFAYLLLTEDAMIAALDPNGFRPLAIGQMKNGAYVIASETCALEVVGAKFVRDVRPGEIVIIDDSGYRIKTYTKDTQLAICSMEYIYFARPDSNIAGINVHTARKNMGRNLAKEALVDADMVVGVPNSSLSAASGYAEASGIPYEIGLVKNQYIARTFIQPTPELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRIVMVDDSIVRGTTSRRIVRLLKEAGAKEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHSVEEIRQCIEADSLEFLSEEGLIQAIGLAEDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEKYQESLKEKVSFF >NZ_CP012384|1458734:1467781|1460171_1460546_-|WP_053108957.1|DBSCAN-SWA MEESTYAKRFLSELSPEEKARLYNDLLSIKDVYLCNKDTIFYTFRKIRRAAKRRTECRKRTFQFQTNTKHHLVICQIHEQRLFKNHYRIQVTYDQQEFTYTFIEELLQLLHTQHFAYGDHAVYA >NZ_CP012384|1458734:1467781|1460799_1461516_+|WP_053108958.1|DBSCAN-SWA MDKRDLLYEGKAKKMYRTSDEEVIWIEYLDQATALNGAMKDEIVGKAELNNQITSKIFNYLNDQGIENHFIKQLSKHEQLVKKLNIIPLEVVVRNVAAGSFSKRLAIPEGQKLPQPIVEFYYKNDQLDDPFINDEHVLFLKVATMAEIAELKEQAKRVNDALVPLFKQIGLQLIDFKLEFGKTSDGTILLGDEISPDTCRLWDLETEAHMDKDVYRRKIGEIVPVYQEVLNRLEKINQ >NZ_CP012384|1458734:1467781|1467190_1467781_+|WP_005876472.1|DBSCAN-SWA MRIAVFASGNGSNFQALVEYFRERGLTDQFVWLFCDQPNAYVLERASKLDISTSVFSPKEFQTKKAYEEKILECLLDKEVDLIVLAGYMRIIGSTLLDQYESRIINIHPSLLPDFPGLHGIRDAFEAGVKKTGVTIHYIDKGVDTGPIICQESVEIKKGDTLEELERRIHQVEHRIYPKVIEQVVKEMKTMEAHIK >NZ_CP012384|1458734:1467781|1462477_1464700_+|WP_005876467.1|DBSCAN-SWA MKTLSEPSALEIKEKKIYSQWGLTDEEYRMIEEDILGRMPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPILRKFPTSGPQVLQGPGEGAGIVDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIAILDSLRFGELDNSRTKYLLDEVVAGISGYGNCIGIPTVGGEIAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIDHQNIQKGQASGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFSQEEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELVLDHADILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGSGLVLSLDDVPQRESHMTPYEMMLSESQERMLICVKKGAEAQVKELFKKYDLDAVTIGKVTDDGLYRLYHHGEEVANLPVDALAEDAPVYEKEAKEPARIKEFKELGQYQPVITDPNEVLLDLLRQPTIASKHSIYETYDSQVQTNTVVRPGSDAAVLRIRGTEKALAMTTDCNARYIYLNPEIGGQIAVAEAARNIVASGGQPLAITDCLNYGSPDKPEVFWELKTSAEGISEACKVLGTPVISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLIEKQQNITTQEFKEAGDLIYLLGETYEDFNGSELQKLQLGKIQGDIEHFDLTIEKENQQIVLAAIKAGVVASAHDCAEGGVAVALAEAAFPKGFGLDVRTTMTTAQLFSETQSRFVLTTSSENKAAFETIVGEKATLIGQVTTEKRITIQASDGKIDVATQVAYRNWKEAIECLMK >NZ_CP012384|1458734:1467781|1466147_1467194_+|WP_005876470.1|DBSCAN-SWA MGNAYANAGVNVEAGYEVVERIKKHVKRTERLGVMGALGGFGGCFELGSFSHLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIESGIHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYLATGKNSPEKLEKVVAGVATGCVEANMALIGGETAEMPGMYTEDEYDLAGFAVGIAEKAQLITGKAIKAGDVLLGLPSSGIHSNGYSLVRKIFFEKHAFALSDTISGLSEPLSTELLKPTKIYVSSLLPIMKEQKIKGAAHITGGGFVENIPRMLPEETAARIQLGSWPTLPIFDCLEKYGEIPTNEMYEIFNMGIGMVLAVEATEADEIMEKIQKQGEAVYRIGEVVPLETEKVEFAEATR >NZ_CP012384|1458734:1467781|1461801_1462476_+|WP_005876464.1|DBSCAN-SWA MRFAVVVFPGSNCDADMLWAIREIMGVEADYVRYDETSLAGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSSIMEEVIRFADEGKPVFGTCNGFQILTEAGLLPGVLRRNDSLRFICKSVPLKVNNQTPFTSEYEADEVIQLPVAHGEGNYFCDEETLQELKENNQIAFTYATENINGSVANIAGITNKKGNVLGMMPHPERAMEELLGSEDGKRFFASMIKNFGKVTV >NZ_CP012384|1458734:1467781|1458734_1460030_+|WP_053108956.1|DBSCAN-SWA MLERYTRPEMGNIWTEQNKYQAWLEVEILADEAWAELGEIPKEDVQKIREHASFDIDRILEIEKSTRHDVVAFTRAVSETLGEESKWVHYGLTSTDVVDTAYGYQIKQANDILREDLKRFTAIIGEKAKEHKLTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLATWYSEMKRNIERFEHAAKGVEAGKISGAVGTFANIPPFIEEYVCDKLGIRPQEVSTQVLPRDLHAEYFATMSLIATSIERFATEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMAGLARVIRGHMVTAYENVSLWHERDISHSSAERIILPDTTILLDYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMSATFGLIYSQRVMLKLIDKGMTREEAYDLVQPKTAYAWDNQVQFRPLLEEDPAITSVLSKEDIDDVFDYRHHLKNVDVIFKRVGLE |
9 | Gordonia_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1816076 : 1902176
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012384|1816076:1902176|DBSCAN-SWA 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77 | Enterococcus_phage(18.52%) | tRNA,tail,holin,integrase,transposase | attL 1846234:1846249|attR 1888057:1888072 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2076609 : 2135196
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012384|2076609:2135196|DBSCAN-SWA 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MKESVFQGRSLLAEKDFTKEELQYLIDFSEHLKDLKKRGIPHHYLEGKNIALLFEKTSTRTRSAFTTAAIDLGAHPEYLGANDIQLGKKESTEDTAKVLGRMFDGIEFRGFSQKMVEELAEFSGVPVWNGLTDEWHPTQMIADFLTIQENFGTVEGITVAYCGDGRNNMANSLLVTGAILGTNMRIVAPKDLQPEEEIVKMAEGFAAKSGAKLMITDDVDKGVDGADVLYSDVWVSMGEEDKFEERIKLLKPYQINMEMVEKTHNTDRLIFLHCLPAFHDTNTVYGEQMKERFGITEMEVTDEVFRSKYARQFDQAENRMHSIKAIMAATLGNLFIPRV >NZ_CP012384|2076609:2135196|2115164_2116118_+|WP_005879477.1|DBSCAN-SWA MNLKTKLCTITSTLLLIGLLGACSSTDKTKTAETSTTESTNATHTVTDTLGHKVAIPNQPKRIIGSYLEDYLIALGEKPVAQWTVGSGSIQDYLQSELKGVPTISYDLPYEKVLSFEPDLLLISSSATVEGGKYDQYSKIAPTYVVENGTEVTWETQLKDIGKVLDKKEQADKIISDYQKKVTETRTELADKINGKTAAVLWVTNNSAFMVSENRSSGRIVYGDLQFGVPPLVAEVSKEATSDWSAVSSEKLAELDADYIILVNSDKKAAMFNEATWKNLKAVKANNVLEFGPESSWLYNGPIASEQMVDDIKERLN >NZ_CP012384|2076609:2135196|2117605_2118067_+|WP_053109111.1|DBSCAN-SWA MSWNMTDYPPSMKNLEELVRKKAIAIGNALLADGYPDDRAIPIAIKQAKEWYENADKSEKKEFSEEKNPSKTDKHEKNPRASELINANVNVRFEEDQWIVISDGAKKASQRFATKKEAIEKGKEIAQNKETTLTIYKKDDSKEKEISYSAEKN |
54 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase,protease,tRNA,integrase | attL 2104716:2104753|attR 2139690:2139727 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012385_1 | 95026-95154 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012385_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012385_1
>1.1|95050|18|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder TTATCAACGTTTAGGCAC >1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder GCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012385_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012385_1 >merge|NZ_CP012385|1|95026-95154|CRISPRCasFinder GGTATGATTTTCATACCCTCTGATTTATCAACGTTTAGGCACGGTATGATTTTCATACCCTCTTGAGCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTGGGTATGATTTTCATACCCTCTGAT >NZ_CP012385|1|1|95026-95154|CRISPRCasFinder GGTATGATTTTCATACCCTCTGAT TTATCAACGTTTAGGCAC GGTATGATTTTCATACCCTCTTGA GCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTG GGTATGATTTTCATACCCTCTGAT
>NZ_CP012385.1|WP_016177599.1|93385_93718_-|hypothetical-protein MSYTGILSLKDICHYGKRCTATEKITKKLSTGQSKTVVQCKKYIIQKDKVSEEMIYYIGKQKQIILKDPIPLKELYPTIKHVYDQNGVLIGRRKNGVLRCTAKGMGLLIS >NZ_CP012385.1|WP_002347362.1|92019_92259_-|hypothetical-protein MARPVLDAMDMDTLTKGRYVQLLARGYSPKDVFKALSKGTDMEKERLRKEFDYWRTYNGIKDLKPARPVVKRKKKITQE >NZ_CP012385.1|WP_002322851.1|91714_91954_-|hypothetical-protein MNCKEIENRKKVSKEMEEKLLKTMKQKHLKRLSVMQYISDMQITGKEKACLLGSMKNFEQLRRTYVKISSNCQLLLEVS >NZ_CP012385.1|WP_016177598.1|89957_90629_-|class-A-sortase MKKWLFGFLGVALIVFCSVFGYVSYQKHEGEVFKQNIEKKMPVDQINAHAKSYKEDATNVNNDMSLGQMLSIQKEAIKMGVNKQVFAQIQIPALGLALPIFKGANQYTLCLGAATYFYEDAEMGKGNYVLAGHNMEMPGVLFSDIQKLSLGEVMDLVSNDGVYRYKVTRKFIVPEYFKLIDGVPEENSFLSLPKKGEKPLLTLFTCVYTSQGKERYVVQGELQ >NZ_CP012385.1|WP_053109470.1|87928_89905_-|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein MAINRYVKKAGMLVGMLGIIASCFQGYQAYAEDVTQKTPPEKVNITVHKLMYDQGTQLNVDIDGIKNDGYTHDQYPTGVTKYNKADYGDVEFTLGNITDQVLPTEDSDLTNAKVDEIVKYVEDKGSNSEYVKNATNKITSAVDENGEITFADQPAYVNSKGNVYVVYESKSAAGLVTQKAKPMVVIAPMTDNTGSGFLKDIHLYPKNIVSKLSFELTKFGDDGTAQSKQTPLKGAKFELYKGEPGKGTKLGDLVSDDQGKLTATDLTLGKYYFVEVPSEVVVGSDKEPTADQYLLGADARNDAHNKLTFEITNDGVTSDLKASYVNYKAPVIDKTVTNGTGQEHSFQIGDAVNYQGTIHIPTDIAGGADGITVNGVKSETSPYSVFKWGDTAGQGLSYVAAKANIKVTNKDGSVVLKENTDYKIQNSENGFVIDFIVNNGQVSDTVASLHGQDLQMTYNMYVNDSAAVANPLTNSVDFVYNNNPFNQEEHHEKTKADVVTYGAKFLKVDSGLFGTGIKATPLEGAEFAAKNAEGKYYGGLVDTDKDGVKEAVWVDDVANAAILKSDKEGHFEITGLTEGEYSLEETKAPENYQKLTKEISFKVDKDSYKEENRITIKNNQKASVPMTGSNGFQTYVLISCLLLGAGALSAVVYFKKKA >NZ_CP012385.1|WP_053109467.1|87161_87914_-|class-C-sortase MIIRKPKKKRIMSKWIIAFWLLSAVGVLLLMPAEASVAKYQQNQQIAAIDRTGTAAETDSSLDVAKIELGDPVGILTIPSISLKLPIYDGTSDKILENGVGITEGTGDITGGNGKNPLIAGHSGLYKDNLFDDLPSVKKGEKFYIKVDGEQHAYQIDRIEEVQKDELQRNFVTYLEPNPNEDRVTLMTCTPKGINTHRFLVYGKRVTFTKSELKDEENKKQKLSWKWLLGSTVSLSVMIIGSLFVYKKKK >NZ_CP012385.1|WP_016177596.1|86390_87146_-|hypothetical-protein MRNRKWLFVCAAALFSFTAYTQLTFADRQESTDSTEQTIQTSDSSTIQSSDETVDSSTVDSSEEPKIAEDDQIVKQTIHVQKIISSEQLDNQGHEKQEGVNGAKFSVYDVSDILQKIDVKDLTTDQIESQLKDRVKKLSSDQLKLVSNGETKTIDQQTGVFEFSVEVQANQKQAYYIVNESSPENISNSEDILLLTPVSDKNGEFLKDVWIYPKSEASQPKEEVKKIVSTGVKKNFFENCWDFVTHLFSRD >NZ_CP012385.1|WP_002314405.1|86117_86378_-|hypothetical-protein MKLIKLLLFNLSCLTAVFLYCGLLFSKLSILPSYQLYLMRILNIPAASMPLDIMEKLIRNPLFTTINLIVIVGISLVIYKKEGMKG >NZ_CP012385.1|WP_053109465.1|84030_86121_-|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein MNFKHSWTRRLKYVFPIMMMLGTLFGLKTANVFAEKVIVDPSNPIQNVKNNFIIPKDVPNAKTNITVNGASKVYKYHVDANKGGFTDDYVGLVEGNKNIRYPSFQKEYGETNLVLEGVTTNTKVNIDYGKIGTYNGKKVNIKLVLSNIHLYSDTLPWNLLDNNYTKTHFRDDGYKNTNGAMSKSKKRTVLWISDNLFSGIVYHSTQMNVQLVATYEDGSPVQFSGDTFISFNSLNPAGGKSTDLKGEYAHYDKMNTTDWYVRKDTVLSEFKSFYNNLNVVGGHPGGSSKLTQADNDFNNLHDKLGDPKFGQGTVSFKISEANPTFVIGSSNVQTWFTLSSATIFSVVPDQPEKTGVDKNGNNVNDKMLQVGDTIQYRIKQKVNRLGVDLLAVYDRFELIDNLPKEVNYVDAHVESGTNKKFDVSGEVTYDKTKHQVKYAAKADTLKNRMKYNGETYELVINVKVNELANQNSVAKNQGTSIINKVEKNTNIITVYFPKIPVKEVQQNGKDVNGRNDGKKGTPAAPLNAGSEVQYLVTQKWHTKGVDAASDHYKQFSIQDPIEARLTYKEGSAQVIDKSKGKDITSEGTLTYDSNSRTLKWEASADFLSNNLLDGREIQLIFTAKTPLQSEKNIDNQAVVAVDNVSNKTNVVTIGVDPNLPQVIVPKTGSTHLVTISAVSLLLLVLATFSYAVLRYI >NZ_CP012385.1|WP_053109459.1|81965_83405_-|topoisomerase-C-terminal-repeat-containing-protein MKTVILAEKPSQAKAYADSFSKATRKDGYFEIQDRLFTGETVITYGFGHLVELDSPDMYDEKWKQWALEDLPIFPNQYHYHVPKDKKKQFSVVKRQLQSADTIVIATDSRYVNNKKVQEHYAIIPTKTVTTAAAFEQLSPLQQAIYEQVLKTTVAMFAEKYTYEETTILTQVQQLQLKAIGKVPLDLGWKKLFGKESDGKEKEEQPLLPKVTKGEMVTVDLQVLEKETKPPQPYTEGTLITAMKTAGKTVDSEEAQSILKEVEGIGTEATRANIIETLKQKEYIKVEKNKLVVTNKGILLCQAVEKEPLLTSAEMTAKWESYLLKIGERKGTQTTFLANIQKFVSHLLEVVLGQIQSTDFGSTLQEVKAASEKQEAARHLGICPKCQEQEVLLYQKVAACTSEACDFKLWTTIAKKKLTATQLKEIIQNSRTSQPVKGLKGQKGSFEATIVLKEDFTTGFEFSEKKKTNFKKRTRRTAK >NZ_CP012385.1|WP_010861530.1|96386_97295_-|IS982-like-element-ISEfm1-family-transposase MRSSKYTEHYTDTFITFKEIMRTVSNIYHNCVPDKIKNRRNTDQLKQRDTVIIACVIWGIINGYTSQRATYRAVCSVLFPNGDFPSRSRFTRLSSNLAYTIKIILYFFIKKLTKGELVGIIDSFPSPLCKPVRNRQAKLLNQIAKVGYNSTKKSYFYGLKIHMIVTKTGFPITYSITNPGVHDVKVLETLSEEANLPNILGDKGYISHKIHEKLALKGITISVPPRKNMDKSEKLDHSLLGKQRKTVETVFSSLEKLGCQNFNSRSVKGLESRFESILLAYSVLLSRAQRRFEGTLRYSLGY >NZ_CP012385.1|WP_002290397.1|98919_99174_+|AbrB-family-transcriptional-regulator MGKELKVRKIGNSVGVILPSSLGLKSGDTIQAKQEGNLFILDTTQIAKEHDRKLIEESFQDFEKGLTVSEIEMVKAFGKYGWSE >NZ_CP012385.1|WP_002290394.1|99174_99492_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MKEYTLVYSKSFQTSLETIIEEWENELALSPASIKRFVGAIQKALELTKNFPTMHEEVSEIYGMDIPTYRIVIGKSYALFYRIDHEKKEILVGRIFQSKQMKLGF >NZ_CP012385.1|WP_053109474.1|100004_100685_+|IS6-family-transposase MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNISYREVQENLYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKECTLFGFSVCTEIKVLLGIPA >NZ_CP012385.1|WP_002292747.1|100976_101522_-|hypothetical-protein MLPTSNSRFPIRRITTLALFSAACIVGRILFTWIPNVQPMTAILLLLAFYGSYTDALIVTLVSLLGTNLYLGMGSWTISQLIAFSSIVTVFHFLSNCALIKHHISIQAIIAFLCGLLYGLIVSRVEVFIYQLPSFWAYYFQGLFFDILHGTGNLIFYLVLVPVFKRILLPTINSSKNKLNS >NZ_CP012385.1|WP_053109475.1|101671_104155_+|vitamin-B12-dependent-ribonucleotide-reductase MNYPKKYIEKLNQDISSYKEVAKITAEMTQTFDGISRLIMLDRYAFKDMSGKTLTVGDLVILTTRADPQYPARGIGKIEEINKEQLIIRIEEEFQSSLTNPEEIASGRVIRNIIEVEKPLELYFEQIAARVARGISDIEGEKKAQFFTEFYQHLTEQNLIPAGRVLYGAGTNSEVTYFNCYVMPFIHDSRGGLAKHRQEVMEIMSRGGGVGTNGSTLRPKSAIVHGVNGKSSGSVSWLNDLANLTNLVEQGGSRRGAQMIMLNDWHPDIFEFIISKIQNPAILQNLIHTSQSPIVRQLASEKLTFEPLIANEKEWLEYLVDHPTNDMEDKFLKTAQQKLKAGGTYSVKDPDFLTGANISVCLTKEFMEAVETDQTYELRFPAIEDYDASEMADYDQHWMEIGDVREWAETGRKVKIHQTIKARELWDLITYCATYSAEPGIFFIDNANEMTNAQAYGQKVVATNPCGEQPLTPYAVCNLAAINLANMVDKETKVVDFEKLADVVRASVRFQDNVIDATPYFFEKNEQQAKGERRVGLGVMGLADLLIYCEKVYGSEDGNRLVDQVFEKIAVTAYQTSVELAKEKGSFPFLVGKTVEETTALRQRFIESGYMKKMPESIRQAILKYGIRNSHLLTVAPTGSTGTMAGVSTGLEPYFSFSYFRSGRLGKFIEVNAEIVSEYLEKNPETAADNLPPFFVSAMELSPEAHVSVQCTIQRWVDSSISKTVNAPKGYQVKQVAAIYEDLYQGGAKGGTVYVDGSRDSQVLTLEADDNVFEEPVVGVVNNQITLDSLESSEAEEICPICHEGRIEEIGGCSTCTNCKVQLKCGL >NZ_CP012385.1|WP_002292745.1|104168_104732_+|cob(I)yrinic-acid-a,c-diamide-adenosyltransferase MKIYTKSGDKGNTSIIGGKRIKKSDARVCAYGSMDEVNSWVGKIISELDDKKFELLKKELVALQILLFDIGTDLATPIGIKEMIVGKEEVTKIETLIDFYQAKVPVIEKFILPGGHPVACDMQITRTVIRRAEREITRLIVSDEPINLHAYKIINRLSDLFFVLARYVNTVYSVTEPFYERAGKVFH >NZ_CP012385.1|WP_002319346.1|104747_105152_+|DUF4430-domain-containing-protein MKKFATLLTVFIGLFIMTGCQSNQNDQTSSKASTQATSEVAKSSASIKLTDSDKEITSKKVTYQSGDSLLEILKANFEVKEKDGFITSIDGHAQDETQKKYWTFTINGKMGEKGANETKLANNDQVVFNLGVFK >NZ_CP012385.1|WP_002292150.1|108606_109179_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MTENKATQERTPQERLQEEQEHKEHVHHTKINAAAIADHLLGNMHTLHVKLHQYHWYVKGANFFTLHEKFEELYNENEKWFDKLAERLITSGHKPASTTVEFEKYSMLSEDAVNKYAKAEDMVENIIEDFRSTRDLTIRAIRLAQDEGDDALEDTLIAFKNDLDKNIWMLQAFIGKEALEDDDALDEDED >NZ_CP012385.1|WP_002316708.1|109410_110028_+|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MNYIAEKAHTKQYQKGEFLFRSQEKEDTLYIINRGKIRIYRLADSGKEQLVRILNPGDFTGEWTLFNPDAVHEEYAEATRDTVVCMIQQKDVQDFLEQYPAISLKLLAEMSKRLESSERQTTQVAVESVITRLVLFLAENVEPEMGNSPTITLPMAKKDIASYLGTTPETISRKFGELEDEGLIQQLSGKRIKIQDLDDLLLYSE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP011282 | Enterococcus faecium strain E39 plasmid p1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP025426 | Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence | 221216-221254 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | LT603679 | Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 2 | 452-490 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP018832 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence | 244126-244164 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP040369 | Enterococcus faecium strain VB3240 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP043485 | Enterococcus faecium strain DMEA02 plasmid pDMEA1, complete sequence | 27883-27921 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP020485 | Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed1, complete sequence | 96547-96585 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP041262 | Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence | 454-492 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP012385 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 1, complete sequence | 95092-95130 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP013995 | Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence | 358205-358243 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP014450 | Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence | 119937-119975 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP018073 | Enterococcus faecium strain VRE001 plasmid unnamed3, complete sequence | 111370-111408 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP027518 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP027498 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP027507 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004055 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP027502 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135298 | Enterococcus faecium isolate E7429 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135288 | Enterococcus faecium isolate E7199 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135333 | Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 3 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135340 | Enterococcus faecium isolate E7356 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP046076 | Enterococcus faecium strain VRE plasmid p5_03A17012, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | MT074686 | Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP025756 | Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence | 126934-126972 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP027513 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004028 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135244 | Enterococcus faecium isolate E6988 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135279 | Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135783 | Enterococcus faecium isolate E4239 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135294 | Enterococcus faecium isolate E7237 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135255 | Enterococcus faecium isolate E7098 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135236 | Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135198 | Enterococcus faecium isolate E6055 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135259 | Enterococcus faecium isolate E4457 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135182 | Enterococcus faecium isolate E1774 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP040905 | Enterococcus faecium strain N56454 plasmid unnamed, complete sequence | 153621-153659 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP041256 | Enterococcus faecium strain 515 plasmid p26, complete sequence | 129212-129250 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | LR135186 | Enterococcus faecium isolate E4413 genome assembly, plasmid: 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP012461 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence | 192113-192151 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP023795 | Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04484.3A plasmid pER04484.3A.1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_MG674581 | Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP023781 | Enterococcus faecium strain Efaecium_ER03933.3A isolate isolate plasmid pER93933.3A.1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LT598664 | Enterococcus faecium isolate Ef_aus00233 plasmid 2 | 168263-168301 | 0 | 1.0 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP027401 | Enterococcus faecium strain FDAARGOS_323 plasmid unnamed, complete sequence | 109448-109486 | 1 | 0.974 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR135175 | Enterococcus faecium isolate E4402 plasmid 2 | 453-491 | 1 | 0.974 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_LR134096 | Enterococcus faecium isolate E1334 plasmid 2 | 453-491 | 1 | 0.974 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP042833 | Enterococcus faecium strain FA3 plasmid unnamed1 | 47629-47667 | 1 | 0.974 |
NZ_CP012385_1 | 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder | 95092-95130 | 39 | NZ_CP012367 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0933 plasmid unnamed 1, complete sequence | 3358-3396 | 4 | 0.897 |
1. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011282 (Enterococcus faecium strain E39 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025426 (Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to LT603679 (Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018832 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040369 (Enterococcus faecium strain VB3240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043485 (Enterococcus faecium strain DMEA02 plasmid pDMEA1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020485 (Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041262 (Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012385 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013995 (Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014450 (Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018073 (Enterococcus faecium strain VRE001 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027518 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027498 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027507 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004055 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027502 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135298 (Enterococcus faecium isolate E7429 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135288 (Enterococcus faecium isolate E7199 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135333 (Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 3) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135340 (Enterococcus faecium isolate E7356 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046076 (Enterococcus faecium strain VRE plasmid p5_03A17012, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to MT074686 (Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025756 (Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027513 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135244 (Enterococcus faecium isolate E6988 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135279 (Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135783 (Enterococcus faecium isolate E4239 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135294 (Enterococcus faecium isolate E7237 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135255 (Enterococcus faecium isolate E7098 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135236 (Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135198 (Enterococcus faecium isolate E6055 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135259 (Enterococcus faecium isolate E4457 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135182 (Enterococcus faecium isolate E1774 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040905 (Enterococcus faecium strain N56454 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041256 (Enterococcus faecium strain 515 plasmid p26, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019209 (Enterococcus faecium strain 2014-VREF-41 plasmid p41-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019989 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-63 plasmid p63-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017798 (Enterococcus faecium strain E243 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135429 (Enterococcus faecium isolate E8927 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135436 (Enterococcus faecium isolate E8691 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135483 (Enterococcus faecium isolate E4456 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135476 (Enterococcus faecium isolate E8423 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135204 (Enterococcus faecium isolate E7171 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135180 (Enterococcus faecium isolate E0595 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135227 (Enterococcus faecium isolate E7025 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135489 (Enterococcus faecium isolate E8414 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135365 (Enterococcus faecium isolate E8195 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135220 (Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135415 (Enterococcus faecium isolate E8328 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135395 (Enterococcus faecium isolate E8290 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NC_021987 (Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135345 (Enterococcus faecium isolate E8202 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135325 (Enterococcus faecium isolate E7654 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135358 (Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135409 (Enterococcus faecium isolate E8284 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135352 (Enterococcus faecium isolate E8014 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
57. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050649 (Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 ALE plasmid pBIOPOP-3_ALE) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
58. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050651 (Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 WT plasmid pBIOPOP-3_WT) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135385 (Enterococcus faecium isolate E7933 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044265 (Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135318 (Enterococcus faecium isolate E7663 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134106 (Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135373 (Enterococcus faecium isolate E8172 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006031 (Enterococcus faecium T110 plasmid pEFT110, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011829 (Enterococcus faecium strain UW8175 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR132068 (Enterococcus faecium isolate E0139 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019395 (Enterococcus faecium strain QU 50 plasmid pQL50, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LN999988 (Enterococcus faecium isolate EFE11651 plasmid II, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033042 (Enterococcus faecium strain Enterococcus faecium JE1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025687 (Enterococcus faecium strain CBA7134 plasmid pCBA710401, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040741 (Enterococcus faecium strain VRE1 plasmid pVRE1-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014530 (Enterococcus faecium strain E745 plasmid pl1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023424 (Enterococcus faecium strain K60-39 plasmid pTT39_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022342 (Enterococcus faecium strain KUHS13 plasmid pKO1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040877 (Enterococcus faecium strain HB-1 plasmid punnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032307 (Enterococcus faecium strain HY07 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040704 (Enterococcus faecium strain HOU503 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044275 (Enterococcus faecium strain V2937 plasmid pHVH-V2937-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017793 (Enterococcus faecium strain E240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019993 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-268 plasmid p268-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035655 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023790 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04462.3A plasmid pER04462.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023800 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.5A plasmid pER04526.5A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035137 (Enterococcus faecium strain SRCM103341 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
85. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035661 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035667 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NC_017963 (Enterococcus faecium DO plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035649 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040850 (Enterococcus faecium strain F17E0263 plasmid p_unnamned1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042840 (Enterococcus sp. DA9 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135171 (Enterococcus faecium isolate E4227 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135192 (Enterococcus faecium isolate E4438 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041271 (Enterococcus faecium strain VVEswe-S plasmid pVVEswe-S1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037956 (Enterococcus hirae strain CQP3-9 plasmid pCQP3-9_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135308 (Enterococcus faecium isolate E7240 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040237 (Enterococcus faecium strain VB3025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018066 (Enterococcus faecium strain E1 plasmid pE1_230, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023809 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.3A plasmid pER04562.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033207 (Enterococcus faecium strain RBWH1 plasmid pRBWH1.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018129 (Enterococcus faecium strain A_020709_82 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023805 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04619.3A isolate isolate plasmid pER04619.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035221 (Enterococcus faecium strain SRCM103470 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019409 (Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NC_020208 (Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034948 (Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016164 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_11 plasmid ISMMS_VRE11_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018827 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to LR135186 (Enterococcus faecium isolate E4413 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012461 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023795 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04484.3A plasmid pER04484.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG674581 (Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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112. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023781 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER03933.3A isolate isolate plasmid pER93933.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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113. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LT598664 (Enterococcus faecium isolate Ef_aus00233 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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114. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027401 (Enterococcus faecium strain FDAARGOS_323 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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115. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135175 (Enterococcus faecium isolate E4402 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgcctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ******************.********************
116. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134096 (Enterococcus faecium isolate E1334 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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117. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042833 (Enterococcus faecium strain FA3 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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118. spacer 1.2|95092|39|NZ_CP012385|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012367 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0933 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer agccccaaggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer . *** *.*******************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4365 : 125416
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012385|4365:125416|DBSCAN-SWA CATGACCCAAGTACATTTTACACTGAAAAGCGAAGAGATTCAAAGCATTATTGAATATTCTGTAAAGGATGACGTTTCTAAAAATATTTTAACAACGGTATTTAATCAACTAATGGAAAATCAACGAACAGAATATATTCAAGCAAAAGAATATGAACGAACAGAAAACCGACAAAGTCAACGAAATGGCTATTATGAGCGCAGCTTTACGACACGTGTAGGCACGCTAGAATTAAAAGTACCCAGAACACGTGATGGCCATTTTTCACCCACAGTGTTTGAACGTTATCAACGAAACGAAAAAGCCCTCATGGCTTCAATGTTGGAAATGTATGTATCAGGCGTTTCAACTCGTAAAGTATCAAAAATTGTGGAAGAACTTTGTGGTAAATCCGTCTCTAAGTCCTTCGTTTCTAGCTTAACAGAACAGCTAGAACCTATGGTTAACGAGTGGCAGAATCGTTTATTATCAGAAAAAAATTATCCTTACTTAATGACCGATGTACTCTATATAAAAGTACGAGAAGAAAATCGAGTACTCTCAAAAAGCTGTCATATAGCGATTGGAATAACCAAAGATGGCGACCGTGAAATTATCGGCTTCATGATTCAAAGTGGCGAAAGCGAAGAGACCTGGACAACATTTTTTGAATACCTAAAAGAACGCGGTTTACAAGGTACGGAACTCGTTATTTCTGATGCGCACAAAGGATTAGTCTCTGCCATTAGAAAATCCTTCACCAACGTAAGTTGGCAAAGATGCCAAGTTCACTTCCTAAGAAATATCTTTACCACCATTCCTAAAAAAAATTCAAAATCTTTCAGAGAAGCTGTTAAAGGAATTTTTAAGTTCACAGATATTAACTTAGCGCGTGAGGCTAAAAATCGATTGATTCATGATTATATCGATCAACCAAAATATTCAAAAGCTTGCGCATCATTGGATGATGGATTCGAAGACGCCTTTCAATATACCGTACAAGGAAATTCCCACAATCGACTAAAGAGTACCAATCTAATTGAACGACTGAATCAAGAAGTACGCAGAAGAGAAAAGATTATTCGCATCTTCCCCAATCAAACATCAGCCAATCGCTTAATTGGAGCCGTTCTTATGGACCTACATGATGAATGGATTTATTCTTCAAGAAAATACATCAATTTTGATAAGTAGAAATGGTAAAAACATTGTATAGCATTTTACACAGGAGTCTGGACTTGACTTGAATTATCTTCATTCTCATCATAAATAAGTTTATCGGGTAAAAGATTATCTAAGTTATCTACTAAAGATAGGCTATTAGCTTTCTTGGCATAAGATATTAATTTTAAAATATTATTATTTAGGAATAATCTATATTCTTCTCCAGATAATTCTTCTAAAAATTGTGATAGGAATTGATTATATCTGTTACTAGAATTCCAATTAAAAATAGAGTTTTTTGTATAGATATCGAAAAAATCATTTACTTTTTTATATCTCGCGAATTGTAAAATTAAGTTAGAAAAATAAAAAGACATTTATGGTACACTCAAATTGTATTTCCGACGAAAGAAAACAAAGGAGTGTAACCATAAATGACCTACAAACATCTTACCATAGACGAACTGACAATGATAGAATCATATTATCTTCAACATAATAAGCCGGTTGAAATCGCTAACCGAATGGGACGTGCTATACAAACTATTTATAATGTAGTCAATAAGTTCAAGCAAGGCAAGACTGCTCTTGATTATTGGCACCAGTATAAAGAAAATAAGAAAAAATGTGGTAGAAAAGTCATTCAATTACCTGCTCATGAAGTAGATTACATTAAAGAGAAAGTCACTCTTGGTTGGACGCCTGACGTCATTATCGGGCGAAAAGGAAGGCCTGTTTCATGCGGTATGAGAACACTTTATCGTTTATTTTCTAAAGGAATATTTGATATTGACACACTACCGATGAAAGGTAAAAGAAAACCCAATGGCCATCAGGAAAAACGGGGAAAACAACAGTATCAGCGCTCAATCCATGATCGACCTGATAATTATCCTGATTTCAATTCTGAGTTTGGTCACCTTGAAGGTGATACGATCGTTGGCATTCATCATAAAAGTGCCGTCATTACTTTAGTTGAAAGATTATCTAAAGTCATTATCACGATTAAACCCAACGGCCGTAAGGCATTAGATATTGAAACTGCCCTTAATCAATGGTTTTCTCGCTTCCCTAAAAACTTCTTTAAATCTATTACGTTTGACTGTGGAAAAGAATTTTCTAACTGGAAAGCCATTAGTAACCAACATGATATTGACATATATTTTGCGGACCCTGGAACACCTTCTCAACGCCCATTAAACGAGAATTCTAACGGGATTCTGCGTCGTAATGGACTGCCGAAATCAATGGATTTTAGAGAAGTGAATCAGACATTTATTTCCAGTGTCAGCAATCAACGTAATCATATTCCAAGAAAATCATTGAATTACAGAACACCAATCGAAATATTTTTGAGCTATGTACAAGAAGCATTTTATTCTAGCTTAATTTGACAAATCATATCTATATTCTTTCCTTCAAGATACACACATTTTATTTCGGAATAAATAAATTTGGATAAACGCTCATAAACATCATAATCGATAGTATTGTACGTATTTATTTCATCAAATTTATTCATGTCTATACTAGTGAAAAAGATAGACATAAATTTTAATTTTTTTTCATAGTCTTTATTTTCTTCACATTGATCTATATACATATCCATCAGATCGATTTCTTCTATCTCTCCATGTTGATCCACTGAATTCCATATGAGAGACCATATTTCTTTCTGAACAGCTTCATTCTTGGATAAGTTACTAATATATCTTTTCCTACATTCTGTTCTATATTTAACGGTTTCACTAGAATTGTTTTTTGAATAAGTACGCTTGTTAATAATCCAAAAATAGCACCTAACTAACGATAGAATAGATAAGCTTATGCCGATTACATATAAAAGAAGTACTATACAGTTAAGTTTTCTATAAAACTCATTACTTGCTGAATTTGTTTGATAGAAAAGTAAAGGCAATGTTAACAATATTAGTCCAAAAGACAGTTTTTTTATTTTTATAACTTGATCAAATACTACCATTTTATCCCAATCAACAGCATTCTCATTTTCAAATAAAAATGTAGCAATTGGTATAAATAATGCCAACACTGTACTTGTTATATTCCATAAAAATCCCGAATCCATAATTATTTTCCTCCTATATAAAATTTGTAAAATGTAAATATAATTACTCAATTATCTTTTTAAAAGCTTCCTCCATTAATATAATATTATCATCCAAATCGTCGATGTTGGGAGCGTCAATAATTTTGTGTAAATAACTCGTCCTTCTGCAAAATAATGGGTTACTCAGTAAACATTGAAGCTAATGTATCCGTCACTTGTTGGAAGCCTTTATGGCTTCTATTTAAGAATTTTTGATTGTATGTATCAAAGATGGATACTAGGAAACGCTCTAGTGATTCTTCATTTTGAAACTGATCTTTTCTGCGGCTGTATTTCTTGATTTGTTTATTGAAAGATTCGATTAAATTAGTTGAGTAAATGCTTCGGCGGATACCAGGCGGAAACTCATAAAAAGTCAATAAATCTTGATTTTTTATCAGTGACTGCGTCACTTTAGGATAAGTTTTCTGCCACTTCTCAATCATACTCCCTAAAAAGGTATTTGCCTCTTCCTTTGAGCTAGCTTGATAAACAGCCTTAAAATCATCACAGATTTCTTTTCGATCTTTGACACGTACTTTATGAGCAATATTACGGGAAACGTGAACACAGCAATGTTGGTATTTAGCTTTAGGATAAATCTGGTGAATCGTATCTTTCATGCCTTTTAAGCCATCGGTAATAAACAGTAAGACATCATGAACCCCTCTGGAGTAAATGTCCTGTAACAACTCATTCCAAACGTAGGTCGATTCAGTCGGAGCAATCGCATAACTTAGTACTTCTTTAGTGCCGTCTTCTCGTATACCAATGGCAATATAGATTGCTTCTTTGGAGACGGTTTGCCGTTTTAAAGGAATATAAGTAGCATCCATGAAAATAGCGACATACTTATCATTTAGAGTTCTAACTTTAAATGCATTTACTTCTTCAGTCAGCACTTTAGTCATGTTGGACATGGTTTGGAGCGTGTAGTGATGCCCATACATTTTCTCAATCAAGTCTGCGATTTCCGACATGGTAATACCTTTTCGGAAGAGGTGAATGACGGTCTCCTCTAAGGTATCATTCGTCCGTCTATAAGCAGGAACAGTCTGTTGCTTGAACTCGCCGTTGCGGTCGCGCGGAATCTGGAGATGAAGTTCCCCGTACTCGGTCTTGACCGTACGGTCATAGGAGCCGTTACGAGAATTACCCGTGTTAAAACCAATACGATCGTACTTTTCGTAATCAAGGAAAGCCGTTAACTCCGTTTTGAGAAGCGTATTGACAGCTTTTTCCAAATGGACACGGAATAATTCATTCAAATCGCCTTTGTTCGCTAGAGTCTTTAGAATTTCTGTAGTAAAATCGTTCATAGGGAAGTCCTCTTTTCTGTGAATGTGTTGTGGTAACTCTATTCTACAGAAGGGACTTCCTTTTTTCTATTTACACAAAATATTTTACACTCTCTCGATGTTACATCTATAGAATTCTTTTATTACTTTCAAAGTATCTAAAGTTATCACAAATGATAGTTTTTCCAATACATGTATTTGTAACGCTGATTCTATTCCAATATTTGATGCAATATGATTAATAGTGCCAGTTCCATGAACATCCATTGATCCAATTCCATATATAGAAAAATATAGAGATTTGTCGATATTAAGTCTTTTCATCAACTTCAGTATGCTTGTTTTCTTTTCTTGGTCTAAATCGTACCAATGCCTATTGTCCCATCTTTTTGTTCCTTTATACTTAAATAATTTTTTCTGTTCATTCTTGTAATACGTAATTATATCATAT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99 | Staphylococcus_phage(32.35%) | bacteriocin,integrase,holin,transposase | attL 4264:4323|attR 121970:121987 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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