Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010404 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain GR2 plasmid pGR2B, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP010402 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain GR2 chromosome, complete genome | 7 crisprs | WYL,cas3,DEDDh,DinG,csa3,RT | 2 | 7 | 10 | 0 |
NZ_CP010403 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain GR2 plasmid pGR2A, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010402_1 | 816923-817004 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010402_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010402_1
>1.1|816948|32|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder TTTCATTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010402_1
The CRISPR arrays of NZ_CP010402_1 >merge|NZ_CP010402|1|816923-817004|CRISPRCasFinder ACCCCAACTTCCATTGCCTGTAGAATTTCATTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_CP010402|1|1|816923-817004|CRISPRCasFinder ACCCCAACTTCCATTGCCTGTAGAA TTTCATTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCC ACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_CP010402.1|WP_000070831.1|816089_816719_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDNASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP010402.1|WP_000816304.1|814484_815387_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNEGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >NZ_CP010402.1|WP_001049165.1|813654_814242_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP010402.1|WP_000006551.1|812146_813091_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP010402.1|WP_001248939.1|811040_812036_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP010402.1|WP_000369722.1|810132_811044_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP010402.1|WP_000134963.1|808489_809425_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP010402.1|WP_000057543.1|806983_808423_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP010402.1|WP_001224793.1|806490_806976_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP010402.1|WP_000513305.1|805643_806483_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP010402.1|WP_000654030.1|817420_818434_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP010402.1|WP_000279414.1|818486_819497_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP010402.1|WP_001074742.1|819635_820826_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKDVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_CP010402.1|WP_001260087.1|820947_821709_+|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHESDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >NZ_CP010402.1|WP_001085505.1|821711_823229_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYNKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVENQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGESLIKH >NZ_CP010402.1|WP_001121760.1|823358_824663_+|phosphopyruvate-hydratase MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK >NZ_CP010402.1|WP_000785252.1|825013_825472_+|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NZ_CP010402.1|WP_000556760.1|825538_825772_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM >NZ_CP010402.1|WP_001165962.1|825887_826628_+|alpha/beta-hydrolase MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILKSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGTIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMDHFKPTETLKELSESLDTIKEQVDEVLDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYDHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDWSE >NZ_CP010402.1|WP_001050063.1|826661_829034_+|ribonuclease-R MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSRGQSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVETHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYKEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGRKKKGKQRKGKNQRNNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010402_2 | 836014-836999 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010402_2
|
11 spacers
spacers of NZ_CP010402_2
>2.1|836034|88|NZ_CP010402|CRT TTCGGGTAGTGACTCTACATCAGATAGTGGTTCAGATTCAGCAAGCGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCA >2.2|836142|124|NZ_CP010402|CRT TTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCGAGCGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCA >2.3|836286|106|NZ_CP010402|CRT TTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCAGACAGCGATTCA >2.4|836412|88|NZ_CP010402|CRT TTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCA >2.5|836520|70|NZ_CP010402|CRT TTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCG >2.6|836610|70|NZ_CP010402|CRT CTCAGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCG >2.7|836700|40|NZ_CP010402|CRT CTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCCGACTCA >2.8|836760|46|NZ_CP010402|CRT TAGCGATTCTGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCA >2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT TTCCGATAGCGATTCAGATTCCGACAGT >2.10|836874|52|NZ_CP010402|CRT CTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCTGACTCAGATAGTGACTCC >2.11|836946|34|NZ_CP010402|CRT TTCAGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010402_2
The CRISPR arrays of NZ_CP010402_2 >merge|NZ_CP010402|2|836014-836999|CRT AATTCAGATAGCGGTTCAGATTCGGGTAGTGACTCTACATCAGATAGTGGTTCAGATTCAGCAAGCGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCGAGCGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGTGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCTGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCCGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCTGACTCAGATAGTGACTCCGACTTAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGATTCGGATAGCGATTCAGA >NZ_CP010402|2|1|836014-836999|CRT AATTCAGATAGCGGTTCAGA TTCGGGTAGTGACTCTACATCAGATAGTGGTTCAGATTCAGCAAGCGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCA GATTCAGCGAGTGATTCAGA TTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCGAGCGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCA GATTCAGCGAGTGATTCAGA TTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCAGACAGCGATTCA GATTCAGATAGTGATTCAGA TTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCA GATTCCGACAGCGATTCAGA TTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCG GATTCAGATAGCGATTCCGA CTCAGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCG GATTCAGATAGCGATTCAGA CTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCCGACTCA GACAGTGACTCGGATTCAGA TAGCGATTCTGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCA GACTCAGACAGCGATTCAGA TTCCGATAGCGATTCAGATTCCGACAGT GACTCAGACAGCGATTCAGA CTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCTGACTCAGATAGTGACTCC GACTTAGACAGCGACTCAGA TTCAGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCA GATTCGGATAGCGATTCAGA
>NZ_CP010402.1|WP_001167158.1|833504_834035_+|N-acetyltransferase MQIRQIHQHDFAQVDQLIRTAFENSEHGYGNESELVDQIRLSDTYDNNLEIVAVLQNEVVGHGLLSEVYLDNGAQREIGLVLAPVSVDIHHQNKGIGKRLIQALEREAILKGYNFISVLGWPTYYANLGYQRASMYDIYPPYDGIPDEAFLIKELKVNSLAGKTGTINYTSAFEKI >NZ_CP010402.1|WP_000608182.1|832844_833366_+|hypothetical-protein MINIISAIGSIGTFIMALFYFVSVSVQLYQMKISFLPALGFNQILLEREEDQLNIMNSATEEHHHKDYIKLYNLGGGAAKKIAIEVLLGNDKVIQKKYVNILPSKEGYMLPINKNVYEELERTIENNGYEADLNVRMTYYHNVSRKQQEVILKGQIDRFNTYNNKEIYDLQFI >NZ_CP010402.1|WP_001790158.1|832681_832837_+|hypothetical-protein MMVKKLLKAIKQNFLYEQSNITFKMIVFGYKRLSKMLFQFEINHINFLWEG >NZ_CP010402.1|WP_000757406.1|831518_832247_-|DUF5067-domain-containing-protein MKKVMGILLASTLILGACGHHQDSAKKESTSHKKKENDNEELNEELKEFKSKKNMDIKIKGDTIVSDKFEAKIKEPFIINEKDEKKKYIAFKMEITAKKDDKDLNPSSISHDYINITQDDKNTVNKLRDGYLLSDKKYKDWTEHNQDQIKKGKTAQAMFIYELRGDGNINLNVHKYSEDKTVDSKSFKFSKLKTEDFSHRAETREEVEKKEKEFEEEYKKEQEREKEKEKQKDDDHSGLDEV >NZ_CP010402.1|WP_001058299.1|830841_831165_-|hypothetical-protein MNNEELEMRLLLMKQSIEQLQEELAPNLKTRDLVLLRYMYSYKEINMLDSYLFQLATNKEQITKKQFKTKLENIREVPEIPIRQVNDILEGYKNSELYVELINSILK >NZ_CP010402.1|WP_001085185.1|829055_829520_+|SsrA-binding-protein-SmpB MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIIKLGDQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >NZ_CP010402.1|WP_001050063.1|826661_829034_+|ribonuclease-R MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSRGQSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVETHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYKEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGRKKKGKQRKGKNQRNNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK >NZ_CP010402.1|WP_001165962.1|825887_826628_+|alpha/beta-hydrolase MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILKSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGTIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMDHFKPTETLKELSESLDTIKEQVDEVLDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYDHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDWSE >NZ_CP010402.1|WP_000556760.1|825538_825772_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM >NZ_CP010402.1|WP_000785252.1|825013_825472_+|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NZ_CP010402.1|WP_000791707.1|837448_838987_+|von-Willebrand-factor-binding-protein-Vwb MKNKLLVLSLGALCVSQIWESNRASAVVSGEENPYKSESLKLNGKRSTTITSDKYEENLDMLISSLSFADYEKYEEPEYKEAVKKYQQKFMAEDDALKKFFSEEKKIKNRNTNTNTNTSNYLGLTHERYESIYNSLKKHREEFSKEIEEINNKNPELKEYNNEEQTKADTELNTLENQVLMIGYTFYHSNKNEVEDLYNKLDMILGYKDEERKKKRATNQRMFNNKKEDLETIIDEFFGEIGQQRPTSIPTLAPKEEKETNTNNANKLKYDTEAAKTDESKRSNRSKRSLDSQNYKSVSKEVTAEQKAEYEKRAEERKARFLDRQKSKKEPVVSLEYDFEHKQRFNNANDKQLVVSAPTKKPTTPTTYTETTTQVPMPTVERQTQQQIVYKTPKPLVGLNGESHDFTTTHQSPTTSNHTHNNVVEFEETSALPGRKSGSLVGISQIDSSHLTEREKRVIKREHVREAQKLVDNYKDTHSYRDRLNAQQKVNTLSEGHQKRFNKQINKVYNGK >NZ_CP010402.1|WP_000728072.1|839337_840360_+|extracellular-matrix-protein-binding-adhesin-Emp MKKKLLVLTMSTLFATQLINSNNAKASVTESVDKKFVVPESGINKIIPSYNEFKKAPKVNVSNLTDNKNFVVSEDKLNKISDPSAASKIVDKNFAVPESKLGNIVPEYKEINNRVNVTTNNPASQQVDKHFVAKGPEVNRFITQNKVNHHFITTQTHYKKVITSYKSTHVHKHVNHAKDSINKHFIVKPSESPRYTHPSQSLIIKHHFAVPGYHAHKFVTPGHASIKINHFCVVPQINSFKVIPPYGHNSHRMHVPSFQNNTTATHQNAKVNKAYDYKYFYSYKVVKGVKKYFSFSQSNGYKIGKPSLNIKNVNYQYAVPSYSPTHYVPEFKGSLPAPRV >NZ_CP010402.1|WP_000824472.1|840694_841165_+|hypothetical-protein MKRKVLVLTMGVICATQLWHSNHANALVTESGANDTKQFTEIVSEEKVITVEHAQINIFQSNSNSNLMEFNILTMGGKSGAMVGYSEIDSSHFTDRDKRVIRRDHVKEAQSLVENYKDTQSADARMKAKQKVNTLSKPHQNYFNKQIDKVYNGLQR >NZ_CP010402.1|WP_001566557.1|841505_842192_+|thermonuclease-family-protein MTEYLLSAGICMAIVSILLIGMAISNVSKGQYAKRFFYFTTSCLVLTLVVVSSLSSSANASQTDNGVNRSGSEDPTVYSATSTKKLHKEPATLIKAIDGDTVKLMYKGQPMTFRLLLVDTPETKHPKKGVEKYGPEASAFTKKMVENAKKIEVEFDKGQRTDKYGRGLAYIYADGKMVNEALVRQGLAKVAYVYKPNNTHEQLLRKSEAQAKKEKLNIWSEDNADSGQ >NZ_CP010402.1|WP_001059082.1|842548_842749_+|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEREDGSDVFVHFSAIAEDGYKSLEEGQKVEFDIVEGDRGEQAANVVKM >NZ_CP010402.1|WP_000005884.1|843243_843462_-|hypothetical-protein MSEWHINNQSTKPFLIQQAEKQLSIVKPLPNGSFQILTEIDLENGNVSNIDHSLLVSVDPKALEISIFDAVN >NZ_CP010402.1|WP_001004394.1|843523_843808_-|hypothetical-protein MNELTKEQKYTIAKFYKLYIERSNKGETETVANFFGDAKDARENYFCDRDYQDFLTNCQILIQNKYLTGEILDDNIYNISILNKTFIEFEQNFG >NZ_CP010402.1|WP_001106652.1|843895_844465_-|hypothetical-protein MNYIKRTIILLILFVVVSPINSPKTIADNKYSEIQDDKFQLQPGDIIVTKGPVMWGFFGHCSIAIDDKTILQIEGPGDKPTTQSFESFKYNYASGKNDWMKVYRCSYPGAGKKAADWVKKNYENTNHRYLVTLNLNSKKFTYCTKIIYQAYKFGVSEKSVKSYGLHIISPYAIKDNFIDPYKLRLVKAY >NZ_CP010402.1|WP_000052076.1|844652_844841_-|hypothetical-protein MSLHFAILFWLALIFLVAATFILVLMKKTGKESKKESYLSFTVILYIFGFAILIYTFIFGVL >NZ_CP010402.1|WP_001059690.1|844869_845130_-|hypothetical-protein MNNILLNAINIVITTTFVIFNILITYNKDLDDLCWLLPGIIICGVILIVSFTIAMITKNWLSEILFFINIVLVLYYIYPIFYSFIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP010402_3 | 1673428-1673513 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010402_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010402_3
>3.1|1673455|32|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder GCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010402_3
The CRISPR arrays of NZ_CP010402_3 >merge|NZ_CP010402|3|1673428-1673513|CRISPRCasFinder TCTGTGTTGGGGCCCCATCCCCAACTTGCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTCCCCAACTT >NZ_CP010402|3|2|1673428-1673513|CRISPRCasFinder TCTGTGTTGGGGCCCCATCCCCAACTT GCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGTCCCCAACTT
>NZ_CP010402.1|WP_000567017.1|1672447_1673116_-|tetratricopeptide-repeat-protein MIDQQTIYQYIQNGKIEEALQALFGNIEEDPTIIENYINAGIVLADANEIEKAERFFQKALTIDPKNGVVFYNLANVYYNQQRYQEAIKLYQQALQTEIEQVDCNYMIGMAFNQLESFKLALPYLMTAAELDKDKDAEVQFQYGLVLCQLEMFNEAITQLKHVLTIDKNHVDARYNLGLALFMKNEDIDEAITHFKEAVTIDPKHLLSQHALKTFTKMKEEE >NZ_CP010402.1|WP_001283311.1|1669968_1672446_-|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MSDPTLFDYSMIKGTVEAILFQNSDNFYTVLKVDTIETNEDFDTMPTVVGFLPNIVEGDVYTFKGQVVDHPRYGKQLKAETFEKEMPQTKEAIISYLSSDLFKGVGKKTAQNIVNTLGDNAINDILDDHSVLEKVSGLSKKKQKQIAEQISANQESEKIMIRLHDLGFGPKLSMAIYQFYLGDTLTILDRNPYQLIYDIKGIGFNKADQLARNIGIAYNDNERLKAALLYTLEEECIKQGHTYLPINVVIDLTVDVLNYQDEEVIEPEKLDEMLQYLNEEKRLIIDNEQVAIPSLYYSEIKSVQNLFRIKTHTNKLTEIEQSDLQMHIGEIEDANQVNYAASQKEALQTAINSKVMLLTGGPGTGKTTVIKGIVELYAEIHGLSLDYDDYVNDDYPVVLAAPTGRASKRLQESTGLEAMTIHRLIGWNQDTKPEDILENEINARLIIIDEMSMVDTWLFHQFLSAVPLDAQLIFVGDEDQLPSVGPGQVFKDLIESKAIPRVNLTEVYRQQDGSSIIELAHRMKLGQKIDITQRFHDRSFINCQANQIPTVVEKVVTSAVNKGYTMADIQVLAPMYKGNAGIKRLNQVLQDILNPKKKDTREIEFGDVVFRKGDKVLQLVNRPNDNIFNGDIGVIVGIFWAKENALNKDVLVVDFEGNEITFTKQDMMELTHAYCTSIHKSQGSEFPIVIMPIVKQYFRMLQRPILYTGLTRAKTSLVLLGDPEAFDIGLKTNGQARLTQLCTLLKNYFNSEDEEMLENTATNDTGASQTTIDDQVEAPMSSNDSEEVMSDSTKTDTNVLTEATMFKIDPMINMGEITPYDFIER >NZ_CP010402.1|WP_000734074.1|1666995_1669626_-|alanine--tRNA-ligase MKKLKASEIRQKYLDFFVEKGHMVEPSAPLVPIDDDTLLWINSGVATLKKYFDGRETPKKPRIVNSQKAIRTNDIENVGFTARHHTFFEMLGNFSIGDYFKQEAIEFAWEFLTSDKWMGMEPDKLYVTIHPEDMEAYNIWHKDIGLEESRIIRIEGNFWDIGEGPSGPNTEIFYDRGEAYGQDDPAEEMYPGGENERYLEVWNLVFSEFNHNKDHSYTPLPNKNIDTGMGLERMASVSQNVRTNYETDLFMPIMNEIEKVSGKQYLVNNEQDVAFKVIADHIRTIAFAISDGALPANEGRGYVLRRLLRRAVRFSQTLGINEPFMYKLVDIVADIMEPYYPNVKEKADFIKRVIKSEEERFHETLEDGLAILNELIKKAKATTNEINGKDAFKLYDTYGFPIELTEEIAVQAGLKVDMTTFESEMQQQRDRARQARQNSQSMQVQSEVLKNITSASTFVGYDTATAQTTLTHLIYNGEEVSQVEAGETVYFMLTETPFYAVSGGQVADTGIVYNDNFEIAVSEVTKAPNGQNLHKGVVQFGQVNVGATVSAEVNQNDRRDIQKNHSATHLLHAALKSVLGDHVNQAGSLVEADRLRFDFSHFGPMTNDEIDQVERLVNEEIWKGIDVNIQEMDIASAKEMGAMALFGEKYGDVVRVVNMAPFSIELCGGIHVRNTSEIGLFKIVSESGTGAGVRRIEALTGKAAFLYLEDIQEKFNTMKSQMKVKSDDQVVDKLTQLQDEEKALLKQLEQRDKEITSLKMGNIEDQVEEINGYKVLVTEVDVPNAKAIRSTMDDFKSKLQDTIIILASNVDDKVSMVATVPKSLTNNVKAGDLIKQMAPIVGGKGGGRPDMAQGGGTQPENISKSLSFIKDYIKNL >NZ_CP010402.1|WP_000426912.1|1666672_1666933_-|IreB-family-regulatory-phosphoprotein MENFDKTMKFDYEELPTQDVRDVLNNVYRTLDERGYNAVNQIVGYLLSGDPAYIPRQNEARNQIRHIDRDVIMEELVSYYLKEQNK >NZ_CP010402.1|WP_000939059.1|1666240_1666669_-|Holliday-junction-resolvase-RuvX MLQHKILGLDVGSRTVGIAISDIMGWTAQGLDTLRINEENNELGIDQLVDIIKKHNVGTVVIGLPKNMNNSIGFRGEASLTYKEKLLEAYPSIEIVMWDERLSTMAAERSLLEADVSRQKRKQVIDKMAAVFILQGYLDSLH >NZ_CP010402.1|WP_054170578.1|1665920_1666226_-|DUF1292-domain-containing-protein MTEHNHDSQLEINNEELLTLFDEEGNEVLYRKVLEFYHPEFKKEYVILAEEGAQSDEDDMIELVPMINEPDESGDGGKLVPIETDEEWDMIEEVVNTEMEE >NZ_CP010402.1|WP_000342258.1|1664997_1665636_-|O-methyltransferase MDDLNKKYLIDLHQHQNSSIEVLREFAEGNEVPIVDRLTLDLIKQLIRMNNVKNILEIGTAIGYSSMQFASISDDIHVTTIERNETMIQYAKQNLATYHFENQVRIIEGNALEQFENVNDKVYDMIFIDAAKAQSKKFFEIYTPLLKHQGLVITDNVLYHGFVSDIGIVRSRNVRQMVKKVQDYNEWLIKQPGYTTNFLNIDDGLAISIKGE >NZ_CP010402.1|WP_000137774.1|1664071_1664995_-|U32-family-peptidase MTELLVTPKSLSHMETLIDLGADAFVIGEQKFGLRLPGEFNRQQMTEAVALAHKNDKKVYAAVNGLFHNYHLDAVEDYINFLHEIRVDRIIFGDPAVVMYVKAQENPIPLHWNAETLVTNHFQCNYWGKRGASRAVLARELNLDEIINIKENSNVEIEVQVQGMTCMFQSKRMLLGNYYTFQDRQMKIERRNDEQSLLLYDEERQNNYPVYEDYNGTHIMSPNDICLIEELAPFFEAGIDSFKIDGILQTEEYINVVTEQYRQAIDLYNEDPEIYEDEKFMLIDPIEEIQPDHRPFDEGFLYKQTVY >NZ_CP010402.1|WP_000848304.1|1662791_1664060_-|U32-family-peptidase MKTIEEIKSTPKTVMKKPELLAPAGNLEKLKIAVHYGADAVFLGGQEYGLRSNADNFTMEEIAEGVEFANRYGAKIYVTTNIIAHDENIEGLESYLRNLEKTGATGIIVADPLIIETCKEVAPKLEIHLSTQQSLSNYKAVEYWKEEGLDRVVLARETGAMEMREMKEKVDIEIEAFIHGAMCIAYSGRCTLSNHMTARDSNRGGCCQSCRWDYELLEVDDNGELDVFYNQGEVTPFAMSPKDLKLIESIPQMMDIGVDSLKIEGRMKSIHYIATVVSVYRKVIDAYAADPDNFKINPEWLIELDKCANRDTAPAFFEGTPGYEEQMFGQQQSKKSPFDFCGLVLDYNEDTKIATIQQRNNFKPGQEIEFFGPEIETFTQVVEAIYDEEGNSLDAARHPLQIVQIKVDRPIYPNNMMRKEIG >NZ_CP010402.1|WP_000648617.1|1662168_1662792_-|uridine-kinase MKATTIIGIAGGSGSGKTTVTNEIMKNLEGHSVALLAQDYYYKDQKHLTFDERLETNYDHPFAFDNDLLIENLKDLKNGKAVEVPTYDYASHTRSDITIDFKPKDVIIVEGIFALENKVLRDMMDVKIYVDTDADLRILRRLTRDTKERGRSMDSVINQYLSVVRPMHDQFIEPTKKYADIIIPEGGSNKVAIDIMTTKIQSLVSKQ >NZ_CP010402.1|WP_000066097.1|1673694_1674813_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MSNKDIRVVVGMSGGVDSSVTAHVLKEQGYDVIGIFMKNWDDTDENGVCTATEDYNDVIEVCNQIGIPYYAVNFEKEYWDKVFTYFLDEYKKGRTPNPDVMCNKEIKFKAFLDHAMNLGADYVATGHYARIHRHEDGHVEMLRGVDNNKDQTYFLNQLSQQQLSKVMFPIGDIEKSEVRRIAEEQGLVTAKKKDSTGICFIGEKNFKTFLSQYLPAQPGDMITLDGKKMGKHSGLMYYTIGQRHGLGIGGDGDPWFVVGKNLKDNVLYVEQGFHHDALYSDYLIASDYSFVNPEDNDLDQGFECTAKFRYRQKDTKVFVKRENDHALRVTFAEPVRAITPGQAVVFYQGDVCLGGATIDDVFKNEGQLNYVV >NZ_CP010402.1|WP_000409167.1|1674813_1675956_-|cysteine-desulfurase MEIYADYAATTPVKPEVVDAMMTIYNSHYGNPSSIHAKGRDARKYLDESRRQIAQLLGADTHEIIFTSGATESNNTAIKGIVKANEQLGNHIITSKIEHHSVLHVFEQLEREGFDVTYLDVDDTGAIDLDQLEETITDKTILVSIMFVNNEVGTVQQIYDIQDIIAETNAYFHVDAVQAIGHLDVKFDEFEIDAMSITAHKFGGPKGVGALLVKDHVTLDYPQLGGEQELKRRAGTENLAQIVGMAKALQLAEKNRDDNNIHLMNLKEQFLVKLQERAIPFELNGSMTDATGHIVNLYFPFVEVETMLTLLDMAQIYVSSGSACTAGSTQPSHVLDAMFEDEERSNHSIRFSFNELTTENEINAIVAEIHKIYFKFKEES >NZ_CP010402.1|WP_000985872.1|1676267_1677281_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MAIKYSALNLVPIREGDDEQTAINDMVNLAQHLDELSYERYWIAEHHNAPNLVSSATALLIQHTLEHTKHIRVGSGGIMLPNHAPLIVAEQFGTMATLFPNRVDLGLGRAPGTDMMTASALRRDQHDGVYKFPEEVSLLQQYFGPAHQQAYVRAYPAVGKNVPLYILGSSTDSAHLAARKGLPYVFAGHFAPQQMKEAIEIYKTLFEPSDVLDEPYVIVCLNTIVAENDDEAQYLASSMAQVMVSITRGRMQPVQPPTHELQNILTPREYAMAMERQKISLIGSENTVQQKIQDFMETYGEVNEIMAISYIYDKDMQLDSYRRFKNVINQINEKNTL >NZ_CP010402.1|WP_000009238.1|1677517_1677664_-|hypothetical-protein MSFMDKAKDAVEKFKNSDNEQVKNVKDKINEYTGSNNEEKKENEDKEK >NZ_CP010402.1|WP_000752909.1|1677703_1677886_-|CsbD-family-protein MADESKFDQFKGNVKETVGNVTDNKELEKEGQQDKATGKAKEVVENAKNKITDAIDKLKK >NZ_CP010402.1|WP_000704122.1|1677985_1678408_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKISTKGRYGLTLMISLAKKEGQGCISLKSIAEENNLSDLYLEQLVGPLRNAGLIRSVRGAKGGYQLRVPAEEISAGDIIRLLEGPITFVESIESEPPAQKQLWIRMRDAVRDVLDNTTLKYLAEYVDTSEDLDGYMFYI >NZ_CP010402.1|WP_000102738.1|1678492_1679767_+|replication-associated-recombination-protein-A MSTEPLASRMRPKNIDEIISQQHLVGPRGIIRRMVDTKKLTSMIFYGPPGIGKTSIAKAISGSTQYKFRQLNAVTNTKKDMQLVVEEAKMSGQVILLLDEIHRLDKAKQDFLLPHLENGKIVLIGATTSNPYHAINPAIRSRAQIFELYPLNDEDVRQALTRAIEDEENGLKTYQPKIDEDAMAYFSTQSQGDVRSALNALELAVLSADNDKDGYRHVTLQDAKDCLQKGAFVSDKDGDMHYDVMSAFQKSIRGSDVNAALHYLARLIEAGDLPTIVRRLLVISYEDIGLASPNAGQRTLAAIESAERLGLPEARIPLSQAVIELCLSPKSNSAMSAIDSALSDIRNGHVGQIPNHLKDGHYQGAKDLGRSIGYKYPHQYVNGYVSQQYLPDKLKNKIYYEPKTTSKSEQQLKEIYNNLLKQRP >NZ_CP010402.1|WP_000682642.1|1679927_1680701_-|tRNA-threonylcarbamoyladenosine-dehydratase MKHQFSRNELAIGQQGLDLLKQQTVVILGVGGVGSFAAEALARTNIGHIILIDKDDVDITNVNRQLHALTTTVGQSKVSLMEERIKLINPDCKVTPLHLFYTEETYEEIFDNYDIDYFVDASDTIMYKVHLMKECLDRGIKVISSMGAANKTDPTRFTISDISKTHTDPMAKIIRQKLKKLGIRKGIPVVFSDESPIVIREDVKDIVGDKNAINRKGQMPPSSNAFVPSVVGLICASYVVNDVLKDIPVRRIKDKGQ >NZ_CP010402.1|WP_031864484.1|1680700_1680829_-|hypothetical-protein MGLIGFNKCFLVEFWKNNQSDNAKHKILSYYVLMYKSVKEVK >NZ_CP010402.1|WP_000044799.1|1681161_1682928_-|aspartate--tRNA-ligase MSKRTTYCGLVTEAFLGQEITLKGWVNNRRDLGGLIFVDLRDREGIVQVVFNPAFSEEALKIAETVRSEYVVEVQGTVTKRDPETVNPKIKTGQVEVQVTNIKVINKSETPPFSINEENVNVDENIRLKYRYLDLRRQELAQTFKMRHQITRSIRQYLDDEGFFDIETPVLTKSTPEGARDYLVPSRVHDGEFYALPQSPQLFKQLLMISGFDKYYQIVKCFRDEDLRADRQPEFTQVDIEMSFVDQEDVMQMGEEMLKKVVKEVKGVEINGAFPRMTYKEAMRRYGSDKPDTRFEMELIDVSQLGRDMDFKVFKDTVENDGEIKAIVAKGAAEQYTRKDMDALTEFVNIYGAKGLAWVKVVEDGLTGPIGRFFETENVETLLTLTGAEAGDLVMFVADKPNVVAQSLGALRVKLAKELGLIDETKLNFLWVTDWPLLEYDEDAKRYVAAHHPFTSPKEADIAKLGTAPEEAEANAYDIVLNGYELGGGSIRIHDGELQEKMFEVLGFTKEQAQEQFGFLLDAFKYGAPPHGGIALGLDRLVMLLTNRTNLRDTIAFPKTASATCLLTNAPGEVSDKQLEELSLRIRH |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010402_4 | 1962339-1962423 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010402_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010402_4
>4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder TTGCCTGTAGAATTTCTTTTTTGAAATTCTCTA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010402_4
The CRISPR arrays of NZ_CP010402_4 >merge|NZ_CP010402|4|1962339-1962423|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCA >NZ_CP010402|4|3|1962339-1962423|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCA TTGCCTGTAGAATTTCTTTTTTGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCA
>NZ_CP010402.1|WP_000636142.1|1961341_1962100_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NZ_CP010402.1|WP_001110179.1|1960738_1961125_-|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NZ_CP010402.1|WP_000149064.1|1960022_1960724_-|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NZ_CP010402.1|WP_001017131.1|1958982_1960026_-|sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NZ_CP010402.1|WP_000153535.1|1958363_1958993_-|two-component-system-response-regulator-VraR MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMEDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NZ_CP010402.1|WP_000037079.1|1957034_1958252_+|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIVFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NZ_CP010402.1|WP_000428172.1|1956481_1956757_+|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NZ_CP010402.1|WP_000228666.1|1956010_1956475_+|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NZ_CP010402.1|WP_000180463.1|1955663_1955864_-|DUF1128-family-protein MTNEEKVLSIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >NZ_CP010402.1|WP_001793428.1|1954404_1955661_-|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAEKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >NZ_CP010402.1|WP_000999718.1|1962689_1963676_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKSYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NZ_CP010402.1|WP_001837236.1|1964165_1964579_-|hypothetical-protein MKPTKLILKDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >NZ_CP010402.1|WP_001790257.1|1964607_1964718_-|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NZ_CP010402.1|WP_000544969.1|1964803_1965535_-|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >NZ_CP010402.1|WP_001250335.1|1965536_1966850_-|lipid-II-isoglutaminyl-synthase-subunit-MurT MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLYLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVEHDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NZ_CP010402.1|WP_000949467.1|1967141_1967642_+|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NZ_CP010402.1|WP_001790679.1|1967723_1967816_-|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NZ_CP010402.1|WP_000613736.1|1968030_1968585_+|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENITYVTNIYGKNLKDKG >NZ_CP010402.1|WP_000140182.1|1968651_1969722_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFLAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NZ_CP010402.1|WP_000548781.1|1969968_1970499_-|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010402_5 | 2207762-2207848 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010402_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010402_5
>5.1|2207789|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010402_5
The CRISPR arrays of NZ_CP010402_5 >merge|NZ_CP010402|5|2207762-2207848|CRISPRCasFinder GCCAACTGATGTTTGCGTATCATTAGTTTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGAGCCAACTGATGTTTGCATATCATTAGT >NZ_CP010402|5|4|2207762-2207848|CRISPRCasFinder GCCAACTGATGTTTGCGTATCATTAGT TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGA GCCAACTGATGTTTGCATATCATTAGT
>NZ_CP010402.1|WP_000648723.1|2206032_2207139_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP010402.1|WP_001292149.1|2205598_2206033_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP010402.1|WP_000927359.1|2203454_2205587_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIILHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSSYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQEMHDKSSNMIDKDDVHVETKDIDGNTSFENEQTSNLTSVFEKHLSDEKSEQLMHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMVLITVLEEPLILPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP010402.1|WP_000083807.1|2201881_2203420_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_CP010402.1|WP_000334465.1|2199395_2201201_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP010402.1|WP_000908179.1|2198381_2199164_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVEMFDKANQCIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP010402.1|WP_000370929.1|2197456_2198314_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITTFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP010402.1|WP_001792784.1|2196640_2196799_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP010402.1|WP_001802298.1|2195856_2195961_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP010402.1|WP_000495670.1|2194265_2195357_+|lytic-regulatory-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVATSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP010402.1|WP_000521495.1|2215244_2216600_-|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK >NZ_CP010402.1|WP_000894032.1|2216626_2217559_-|YbbR-like-domain-containing-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK >NZ_CP010402.1|WP_000347896.1|2217560_2218370_-|TIGR00159-family-protein MDFSNFFQNLSTLKIVTSILDLLIVWYVLYLLITVFKGTKAIQLLKGILVIVIGQQISMILNLTATSKLFDIVIQWGVLALIVIFQPEIRRALEQLGRGSFLKRYTSNTYSKDEEKLIQSVSKAVQYMAKRRIGALIVFEKETGLQDYIETGIAMDSNISQELLINVFIPNTPLHDGAMIIQGTKIAAAASYLPLSDSPKISKSLGTRHRAAVGISEVSDAFTVIVSEETGDISVTFDGKLRRDISNEIFEELLAEHWFGTRFQKKGVK >NZ_CP010402.1|WP_000167873.1|2218558_2219467_-|arginase MTKTKAIDIIGAPSTFGQRKLGVDLGPTAIRYAGLISRLKQLDLDVYDKGDIKVPVVNIEKFHSEQKGLRNYDEIIDVNQKLNKEVSASIENNRFPLVLGGDHSIAVGSVSAISKHYNNLGVIWYDAHGDLNIPEESPSGNIHGMPLRILTGEGPKELLELNSNVIKPENIVLIGMRDLDKGERQFIKDHNIKTFTMSDIDKLGIKEVIENTIEYLKSRNVDGVHLSLDVDALDPLETPGTGTRVLGGLSYRESHFALELLHQSHLISSMDLVEVNPLIDSNNHTAEQAVSLVGTFFGETLL >NZ_CP010402.1|WP_000958531.1|2225661_2226726_-|P-loop-NTPase MLTVDQVKELVGEIKDPIIDVPLKETEGIVEVSIKEEKEHVSVKLAMAQLGGAPQLDLQMAVVNALKENGAKTVGIRFETLPEEKVNQFKPKEENKPKTIEGLLSQNNPVEFIAIASGKGGVGKSTVAVNLAVALAREGKKVGLVDADIYGFSVPDMMGIDEKPGIKGKEVIPVERHGVKVISMAFFVEENAPVIWRGPMLGKMLTNFFTEVKWGDIEYLILDLPPGTGDVALDVHTMLPSSKEIIVTTPHPTAAFVAARAGAMAKHTDHSILGVIENMSYFESKETGNKEYVFGKGGGTKLADELNTQLLGELPLEQPSWNPKDFAPSIYQSDDRLGKIYSSIAQKVIAATNK >NZ_CP010402.1|WP_001141006.1|2226873_2228316_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-LmrS MAKVELTTRRRNFIVAVMLISAFVAILNQTLLNTALPSIMRELNINESTSQWLVTGFMLVNGVMIPLTAYLMDRIKTRPLYLAAMGTFLLGSIVAALAPNFGVLMLARVIQAMGAGVLMPLMQFTLFTLFSKEHRGFAMGLAGLVIQFAPAIGPTVTGLIIDQASWRVPFIIIVGIALVAFVFGLVSISSYNEVKYTKLDKRSVMYSTIGFGLMLYAFSSAGDLGFTSPIVIGALIISMVIIYLFIRRQFNITNALLNLRVFKNRTFALCTISSMIIMMSMVGPALLIPLYVQNSLSLSALLSGLVIMPGAIINGIMSVFTGKFYDKYGPRPLIYTGFTILTITTIMLCFLHTDTSYTYLIVVYAIRMFSVSLLMMPINTTGINSLRNEEISHGTAIMNFGRVMAGSLGTALMVTLMSFGAKIFLSTSPSHLTATEIKQQSIAIGVDISFAFVAVLVMAAYVIALFIREPKEIESNRRKF >NZ_CP010402.1|WP_001793373.1|2228638_2229112_-|multidrug-efflux-transporter-SepA MIVNYLKHKFYNLLTTMVVLFIFVLSGAIFLTFLGFGLYGLSRILIYFRLGDFTYNRSMYDNLLYYGSYIIFGYFIIFAVEHLMDYFRKMLPENAYFRGATFHLISYTVATTLFYFIIHLNYVYINIDFWVIMVIIGFLYVCKLQFYPESKNLNNRK >NZ_CP010402.1|WP_001237503.1|2229210_2230554_-|MFS-transporter MRLKSIITVIALILIMFMSAIESSIISLALPTIKQDLNAGNLISLIFTAYFIALVIANPIVGELLSRFKIIYVAIAGLLLFSIGSFMCGLSTNFTMLIISRVIQGFGSGVLMSLSQIVPKLAFEIPLRYKIMGIVGSVWGISSIIGPLLGGGILEFATWHWLFYINIPIAIIAIILVIWTFHFPEEETVAKSKFDTKGLTLFYVFIGLIMFALLNQQLLLLNFLSFILAIVVAMCLFKVEKHVSSPFLPVVEFNRSITLVFITDLLTAICLMGFNLYIPVYLQEQLGLSPLQSGLVIFPLSLAWITLNFNLHRIEAKLSRKVIYLLSFTLLLVSSIIISFGIKLPVLIAFVLILAGLSFGYIYTKDSVIVQEETSPLQMKKMMSFYGLTKNLGASIGSTIMGYLYAIQSGIFGPNLHNVLSAVAVISIGLIVLWVVFFKEQSSQSKE >NZ_CP010402.1|WP_000047255.1|2230730_2231414_-|hemolysin-III-family-protein MSKSTKKSNDTIVETFKDIIPLSFGEEIGNAASHGVAALLTLLVLPYAAVHSYIAHGTLASVSMSIYVISIFMMFISSTIYHSMQNETPHKYILRIIDHSMIYVAISGTYTPILLTVVGGWIGWTVFILLWGTTLWGILYKSIAVKVNQKLSLIVYLVMGWVGIILLPIIFIRTSWIFILFIFLGGVSYTIGAWFYAQKNRPYFHMIWHIFIVIASLLHLIAILYFM >NZ_CP010402.1|WP_000884737.1|2231432_2232620_-|UDPGP-type-1-family-protein MLDKNQLAKYKQDHLCEYEKIMSNNEKEALEEKVASLDLDFIAKLYNDLYINKKTIDDVSAVSEVKYDIKSQMSDDEIKRLEEQGLQAIKEGQFAVLLMAGGQGTRLGYKGPKGSFEIEGVSLFELQANQLKTLNHQSGHTIQWYIMTSDINHEETLAYFEAHSYFGYDQEAIHFFKQDNIVALSEEGKLILNQQGRIMETPNGNGGVFKSLDKAGYLEEMSNNGVKYIFLNNIDNVLVKVLDPLFAGFTVEHDYDITSKTIQPKPVESVGRLVNVDCKDTVLEYSELDPEVANQFNNANIGIHAFKLGFILNAVNRELPYHLAIKNLKQLDENFGVIEQPTLKFELFYFDIFTYGTSFVTLQVPREEEFSPLKNKEGKDSVATATEDLRRMGLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010402_6 | 2431671-2431764 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010402_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010402_6
>6.1|2431704|28|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder CACTTCGCTTCGGTTCGCCTGCGCTTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010402_6
The CRISPR arrays of NZ_CP010402_6 >merge|NZ_CP010402|6|2431671-2431764|CRISPRCasFinder GCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAGAGGTCACTTCGCTTCGGTTCGCCTGCGCTTTTGCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAAAGGT >NZ_CP010402|6|5|2431671-2431764|CRISPRCasFinder GCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAGAGGT CACTTCGCTTCGGTTCGCCTGCGCTTTT GCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAAAGGT
>NZ_CP010402.1|WP_000727323.1|2431157_2431514_+|DUF4889-domain-containing-protein MKKKKGFGLGISLIAIMLIVCIVLVIMMMTGGKKDTYYGIMKDNATIEKMISEKDESIEKNVKLPSDADVKVKKGDFVIVYKLADSDKIVKVKKVDHDDVPHGLMMKIHDMGKMHMKH >NZ_CP010402.1|WP_000071906.1|2430470_2430893_+|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein MSNSQAIQAIENVLATSKVGVLSTAYNNKPNSRYMVFYNDGLTLYTKTNIHSAKVKEIKDNPAAYVLLGYNDTTTRSFVEMEATIEVVTDQKVIDWLWETQDKSFFSSKEDPELCVLKVTPQSVKLMNDKSLDTPIKIDL >NZ_CP010402.1|WP_000128366.1|2428294_2430400_+|AraC-family-transcriptional-regulator-Rsp MTCQLKIHHTLSTIPSRNINNIMVLFSLTSKLNITINGETKDVSNYIILINHGDIYNINHGENIIELMIPVFYFYQQDDDFFNGYLDRHLLQSSNYIKSLIADLISTPTSSSLMGKNIGQSIIDTLLKEAFIRIDHEYLPNIALSNPVFIDCVNYIHDNIDAHLSLKDIAMHCNISESYCSNLFVRYLSMNFKDYFTSIKLVNAINLLLSTKHSITTVSELAGFNSHTNFANQFKNYLHFSPKQFRSLVSKITEPPQIHFQQDNVSQFTELISTIDLTAQLATNTTDIHIDDFNPKDRSQRAKVFVRFSNFNELFQFIFNEYYDINFEHLPKPVVFIDDIHDIEISQTNYNLLNRCFEKLFEKNIGLAIAIKSTQQFETMKQLILTFLQGNQDYKTSKKLVKFMLVFCSNSMTAEEIHLCHLKIKNKNKEIKYSVTVDGFLETYSTVEQVYDVMQRLKFHYYFIDIENSKTATHLITKNQHYHQTDTHFEQYKKFILDSGISSTQFVYNNLSVSGFKYTNDGKNPIQLSDIVYHLIALLRYGGGISYQLLDDHSNYISLYNKYGSPLPLMHLYKMFRPFVNEDIEITNNYVLSRKDNNYHFLLFNKINDRYMSDVKQDFIFHNELPQDSLMIIKTLNHEHGSIQHLLPISDQLVYIEKEILDELDKTNYPKTELAVQEETGRTFELKLNHDEVKYICFKPS >NZ_CP010402.1|WP_000664361.1|2426423_2426807_+|YbgA-family-protein MKERGHIEQLWREEKYHVLLHSQQSYQMIRNALKTDLSLHQVQQMIDDALLIEPSIGSVCNAFDHMWGYFKKCANEEERKQSKLLKADFINSKIDTQTLLDFLAELANKYDVQYLLQSRVLNTKRKR >NZ_CP010402.1|WP_001108129.1|2424798_2426241_-|PTS-sucrose-transporter-subunit-IIBC MNYKQSAEEILNAIGGEENLDAMAHCATRLRLVLNDESLVNEEALNNMDVVKGTFSTGGQYQIIIGSGTVNKVFSELEKLTGKEASTTSEVKAQSAKNMNPLQRFVKMLSDIFVPIIPAIVAGGLLMGLNNILTAKDLFFSGKSLIDVYSQFAGLAEMINVFANAPFTLLPILIGFSAAKRFGGNPFLGAALGMILVHPSLMSAYDFPKAVEAGKAISYWDVFGLHINQVGYQGQVLPMLVAAYILASIEKGLRKVIPTVLDNLLTPLLSIFITAFLTFSFVGPITRQLGYWLSDGLTWLYEFGGAIGGLIFGLLYAPIVITGMHHSFIAVETTLIADATKTGGSFIFPIATMSNVAQGGAAIAAFFIIKQNKKLKGVASAAGISALLGITEPAMFGVNLKLRYPFIGAIVGSGIGSAYIAFFKVKAIALGTAGLPGFISINPVHAGWLHYFVGMTISFIVAITVTLILSKRKANKEVVE >NZ_CP010402.1|WP_000633068.1|2423768_2424713_+|magnesium-transporter-CorA-family-protein MITSFRHSEDIDKHIIKTPLDHTASWINVVEPDREEIENLMEQYNIPEDFIRDPLDSEESSRIEYDEDTGYSLIIIDLPIVNSTNRSVLSFVTIPLGIIIGNGIIVTVCDAENEFLENLPKRDINLKFHSRFALEILTTIADHYNRNLRLLNKSRIRIEKELKNNITNKQLFKLMEVEKSLVYFLAALKGNDTIIKKLFRLPAIKRFEEDEELLEDLIIENNQAIETTELHQRILESITTSYASLLSNDMNTIMKTLTLFTVLLTLPTLVFSFFGMNVPLPIDDHSYISWIIVVGISLILVVIVSIFLWRKQKL >NZ_CP010402.1|WP_000656766.1|2423099_2423723_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MKEDRRIRKTKSSIKQAFTKLLQEKDLEKITIRDITTRADINRGTFYLHYEDKYMLLADMEDEYISELTTYTQFDLLRGSSIEDIANTFVNNILKNIFQHIHDNLEFYHTILQLERTSQLELKINEHIKNNMQRYISINHSIGGIPEMYFYSYVSGATISIIKYWVMDKQPISVDELAKHVHNIIFNGPLRIMAENRLHKSNLDSLT >NZ_CP010402.1|WP_001020030.1|2421661_2422939_-|YhgE/Pip-domain-containing-protein MNIFKNKLLWIAPIATMIILVIFSLAFYPAYNPKPKDLPIGILNEDKGTTIQDKNVNIGKKLEDKLLDSDSNKIKWVKVDSEKDLEKDLKDQKIFGVAIIDKDFSKDAMSKTQKVVMDSKKEEMQQKVASGEIPPQVVQQMKQKMGNQQVEVKQAKFKTIVSEGSSLQGSQIASSVLTGMGDNINAQITKQSLETLTSQNVKVNAADINGLTNPVKVDNEKLNKVKDHQAGGNAPFLMFMPIWIGSIVTSILLFFAFRTSNNIVVQHRIIASIGQMIFAVVAAFAGSFVYIYFMQGVQGFDFDHPNRIAIFVAFAILGFVGLILGVMVWLGMKSVPIFFILMFFSMQLVTLPKQMLPESYQKYVYDWNPFTHYATSVRELLYLNHHIELNSTMWMFIGFMIFGAVSSLVSAIVRKHSTKRTEVPS >NZ_CP010402.1|WP_001253464.1|2421023_2421455_-|DUF2871-domain-containing-protein MRRLLYSFLFYMIIGLFSGFFYRELTKAYDFTGTTQLSLVHTHTLILGMFMFLILLPLEKLFKLSSYYLFNWFFYVYNIGVIVTIGMMVTKGFFQVTGKSYSPEAFAGFAGIGHTGMLAGLLLLFFLLRQAILKEPRDESFKK >NZ_CP010402.1|WP_001806771.1|2420802_2420919_-|hypothetical-protein MANYAIYFNNININSIMALNDNNYQFERVNERNEYRES >NZ_CP010402.1|WP_001173165.1|2431796_2433074_-|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter MALFKRKISLPMQVVIALVLGVVVGLLLYGQENVANYIKPFGDVFLNLIKMIVIPVVFCSLALSISNVGESKTVGRYGWKTILYFEIITTIAIGLGIIFGNLFKPGAGLDPTKLPKGDISKYQSTAHAAEQSTYGNHFIDTIVHIIPTNFFEALNKGELLPIIFFAVFFGLGLAAVGKKAEPVKEFLSGSLEAVFWMINKILKLAPLGVFAFICTTIITFGASALLPLLKLVLVVVFAMVFFVFAILGLVAWMCGINIMNIIRILKSELLLAFSTSSSEAVLPVMMKKMENFGSPKEITSFVIPIGYTFNLDGSALYQSIAALFVAQMYGMHLTLSEQIVLMLTLMITSKGMAAVPGTSIVVLLTTLGAMGLPAQGLALIIGVDRILDMVRTCVNVIGNALSTIVIAKWENVYDKAKGQEYLKSI >NZ_CP010402.1|WP_000727537.1|2433255_2433621_-|DUF3139-domain-containing-protein MKKKKNAIKVIIILFISLIVAVAFFFGLKTYQGHKNIQLIDSYLEEKNLKDKIKSEKTEYSAKKGLFYKEVTFKDEPGVTYVVQPISTNKGLFVEGFDTETKKSLKTAKHKYFNQNYKPSK >NZ_CP010402.1|WP_000289213.1|2434018_2434465_+|MarR-family-transcriptional-regulator MYVENSYLSKQLCFLFYVSSKEIIKKYTNYLKEYDLTYTGYIVLMAIENDEKLNIKKLGERVFLDSGTLTPLLKKLEKKDYVVRTREEKDERNLQISLTEQGKAIKSPLAEISVKVFNEFNISEREASDIINNLRNFVSKNFDYSDKK >NZ_CP010402.1|WP_077477314.1|2434680_2435109_+|Hsp20-family-protein MILNFNQFENQNFFNGNPSDTFKDLGKQVFNYFSTPSFVTNIYETDELYYLEAELAGVNKEDISIDFNNNTLTIQATRSAKHKSEQLILDERNFESLMRQFDFEAVDKQHITASFENGLLTITLPKIKPSNESTSSTSIPIS >NZ_CP010402.1|WP_033845358.1|2435215_2436385_-|NarK/NasA-family-nitrate-transporter MYKTKGGFQLTLQTLSLVVGFMAWSIIAPLMPFIKQDVNVTEGQISIILAIPVILGSVLRVPFGYLTNIVGAKWVFFTSFIVLLFPIFFLSQAQTPGMLMASGFFLGVGGAIFSVGVTSVPKYFPKEKVGLANGIYGMGNIGTAVSSFLAPPIAGIIGWQTTVRSYLIIIALFALIMFIFGDTQERKIKVPLMAQMKTLSKNYKLYYLSYWYFITFGAFVAFGIFLPNYLVNHFGIDKVDAGIRSGVFIALATFLRPIGGILGDKFNAVKVLMIDFVVMIIGAIILGVSDHIALFTVGCLTISICAGIGNGLIFKLVPSYFLNEAGSANGIVSMMGGLGGFFPPLVITYVANLTGSSHLAFIFLAVFGCIALFTMRHLYQKEYGSLKNG >NZ_CP010402.1|WP_000706315.1|2436812_2437466_-|response-regulator-transcription-factor MKIVIADDHAVVRTGFSMILNYQNDMEVVATAADGVEAYQKVMEYKPDVLLMDLSMPPGESGLIATSKIADSFPETKILILTMFDDEEYLFHVLRNGAKGYILKNAPDEQLLLAIRTVYKGETYVDMKLTTSLVNEFVSNSNQDTANTTDPFKILSKRELEILPLIAKGYGNKEIAEKLFVSVKTVEAHKTHIMTKLGLKSKPELVEYALKKKLLEF >NZ_CP010402.1|WP_000606546.1|2437488_2438523_-|sensor-histidine-kinase MINEDSIQLDTLLKKYYEHSIEKIVFADDNGKIIAMNDAAKDILSEEDNYSAVANAICHRCEGYTNAYDVQSCKDCFLESMQVQATNFQVFMKTKDQKVMPFTATYQLIDQDRGIHAFTLQNVSSQIEQQEKLHQQRMMRKTISAQENERKRISRELHDSVIQEMLNVDVQLRLLKYQEDTTKLLEDAENIEYIVAKLIDDIRNMSVELRPASLDDLGLEAAFKSYFKQFEENYGIKIIYTSNIKNTRFDSDIETVVYRVVQEAILNALKYADVNEINVGIRQTGRHLVAEVIDAGNGFDPSSKPKGSGLGLYGMNERAELVSGSVNIETKIGEGTNVTLNIPI >NZ_CP010402.1|WP_000186933.1|2438546_2438999_-|GAF-domain-containing-protein MTPEAIIEDRRFQETLDKIRKEEGYDFAAIAFYESNKPSSPIKWHYVSGNKNNRFKLIILRKGRGLAGTVMKTGKRMVIANVGLALGPEEKIDYPILLSESLTAVLAVPLWYKNQVYGVLLFGQRDGRPLPKIFDNDDIQRKFGIFNDDK >NZ_CP010402.1|WP_000934153.1|2439018_2439696_-|respiratory-nitrate-reductase-subunit-gamma MLNQFLWVIFPYLCLVVFVAGHIARYRYDKFSWTAKSSELIERKRLMWGSLLFHLGIIPVFFGHVVGLLIPKSWMDAAGVSEHLYHIGAVYIGSIFGIITLVGMFLLTARRVTTKSIRRLSSASDIFVNFLLLLIVFMGCYATLVTNVQHPDFNYRTSLSIWFRQLFMLKPDASLMSGVPIAFKIHILLGFTIMACWPFTRLVHVWSVPLTYINRRYIIYRKNKV >NZ_CP010402.1|WP_000606772.1|2439688_2440264_-|nitrate-reductase-molybdenum-cofactor-assembly-chaperone MINFDNFKKYQESFGYMAQQLCFPEKLTFHPKTFEETISTDHPAYEDLVAFRNVMMTFSLSEIKAIYTDTFDFTKKAPLYMTYNKFDTQKERGQMLAKLKVLYEMFGLEMVDNELSDYLPLMLQFLQVAEWRNDPRAEENIQLIIMIIEDGTYVMANVLGEDNNPYAYVIQALRKTLKLCLTSPKGVKHHA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP010402_7 | 2464684-2464781 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010402_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010402_7
>7.1|2464713|40|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder TTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010402_7
The CRISPR arrays of NZ_CP010402_7 >merge|NZ_CP010402|7|2464684-2464781|CRISPRCasFinder TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGCTTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTATTTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC >NZ_CP010402|7|6|2464684-2464781|CRISPRCasFinder TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC TTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTAT TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC
>NZ_CP010402.1|WP_000019127.1|2463677_2464544_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP010402.1|WP_001125208.1|2462664_2463351_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP010402.1|WP_000762708.1|2462406_2462511_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP010402.1|WP_000038960.1|2460792_2462232_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGVVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NZ_CP010402.1|WP_000825921.1|2459892_2460672_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP010402.1|WP_000479576.1|2459192_2459912_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP010402.1|WP_000615461.1|2458464_2459196_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NZ_CP010402.1|WP_001012218.1|2457117_2458368_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLIEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKHNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDKLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMFYKIQQYLNHKRR >NZ_CP010402.1|WP_000819843.1|2456500_2456863_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP010402.1|WP_000162810.1|2455882_2456482_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NZ_CP010402.1|WP_001789935.1|2464974_2465079_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYGEMQ >NZ_CP010402.1|WP_000792572.1|2465173_2466484_+|immunoglobulin-binding-protein-Sbi MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNVKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNTYYKYKGAIDQTVLTVLGSGSKSYIQPLKVDDKNGYLAKSYAQVRNYVTESINTGKVLYTFYQNPTLVKTAIKAQETASSIKNTLSNLFSFWK >NZ_CP010402.1|WP_000594514.1|2467018_2467948_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGENFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_CP010402_1 | 1.1|816948|32|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 816948-816979 | 32 | NZ_CP010402.1 | 170872-170903 | 2 | 0.938 |
NZ_CP010402_1 | 1.1|816948|32|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 816948-816979 | 32 | NZ_CP010402.1 | 289897-289928 | 2 | 0.938 |
NZ_CP010402_1 | 1.1|816948|32|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 816948-816979 | 32 | NZ_CP010402.1 | 368352-368383 | 2 | 0.938 |
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NZ_CP010402_1 | 1.1|816948|32|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 816948-816979 | 32 | NZ_CP010402.1 | 809866-809897 | 2 | 0.938 |
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NZ_CP010402_1 | 1.1|816948|32|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 816948-816979 | 32 | NZ_CP010402.1 | 2317984-2318015 | 2 | 0.938 |
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NZ_CP010402_3 | 3.1|1673455|32|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 1673455-1673486 | 32 | NZ_CP010402.1 | 1019657-1019688 | 2 | 0.938 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010402_2 | 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT | 836826-836853 | 28 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 2650-2677 | 2 | 0.929 |
NZ_CP010402_2 | 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT | 836826-836853 | 28 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 152971-152998 | 3 | 0.893 |
NZ_CP010402_2 | 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT | 836826-836853 | 28 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 152953-152980 | 4 | 0.857 |
NZ_CP010402_2 | 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT | 836826-836853 | 28 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 153631-153658 | 4 | 0.857 |
NZ_CP010402_2 | 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT | 836826-836853 | 28 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 3202-3229 | 5 | 0.821 |
NZ_CP010402_2 | 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT | 836826-836853 | 28 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 16787-16814 | 6 | 0.786 |
NZ_CP010402_2 | 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT | 836826-836853 | 28 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 17621-17648 | 6 | 0.786 |
NZ_CP010402_2 | 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT | 836826-836853 | 28 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 17783-17810 | 6 | 0.786 |
NZ_CP010402_2 | 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT | 836826-836853 | 28 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 18869-18896 | 6 | 0.786 |
NZ_CP010402_2 | 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT | 836826-836853 | 28 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 19265-19292 | 6 | 0.786 |
NZ_CP010402_2 | 2.11|836946|34|NZ_CP010402|CRT | 836946-836979 | 34 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 3196-3229 | 7 | 0.794 |
NZ_CP010402_5 | 5.1|2207789|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 2207789-2207821 | 33 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23035-23067 | 7 | 0.788 |
NZ_CP010402_5 | 5.1|2207789|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 2207789-2207821 | 33 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7568-7600 | 7 | 0.788 |
NZ_CP010402_6 | 6.1|2431704|28|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 2431704-2431731 | 28 | NZ_CP017941 | Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed1, complete sequence | 286024-286051 | 7 | 0.75 |
NZ_CP010402_2 | 2.11|836946|34|NZ_CP010402|CRT | 836946-836979 | 34 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 152947-152980 | 8 | 0.765 |
NZ_CP010402_4 | 4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 1962365-1962397 | 33 | MT150133 | Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540, complete genome | 25909-25941 | 8 | 0.758 |
NZ_CP010402_4 | 4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 1962365-1962397 | 33 | MK234886 | Escherichia phage AnYang, complete genome | 114958-114990 | 8 | 0.758 |
NZ_CP010402_4 | 4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 1962365-1962397 | 33 | MF036691 | Serratia phage CBH8, complete genome | 7593-7625 | 8 | 0.758 |
NZ_CP010402_4 | 4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 1962365-1962397 | 33 | MF036690 | Serratia phage CHI14, complete genome | 7593-7625 | 8 | 0.758 |
NZ_CP010402_4 | 4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 1962365-1962397 | 33 | MF036692 | Serratia phage X20, complete genome | 7813-7845 | 8 | 0.758 |
NZ_CP010402_1 | 1.1|816948|32|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder | 816948-816979 | 32 | NZ_CP018781 | Ochrobactrum pituitosum strain AA2 plasmid pOAAA2, complete sequence | 148984-149015 | 11 | 0.656 |
NZ_CP010402_2 | 2.8|836760|46|NZ_CP010402|CRT | 836760-836805 | 46 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9997-10042 | 12 | 0.739 |
1. spacer 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 2, identity: 0.929
ttccgatagcgattcagattccgacagt CRISPR spacer ttccgacagcgattcggattccgacagt Protospacer ******.********.************
2. spacer 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
ttccgatagcgattcagattccgacagt CRISPR spacer ctccgatagcgattcagattccgatagc Protospacer .***********************.**.
3. spacer 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ttccgatagcgattcagattccgacagt CRISPR spacer ttccgatagcgattcagattccgaaccg Protospacer ************************
4. spacer 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ttccgatagcgattcagattccgacagt CRISPR spacer ctccgacagcgattcggattccgacagc Protospacer .*****.********.***********.
5. spacer 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ttccgatagcgattcagattccgacagt CRISPR spacer cagcgacagcgattcggattccgacagt Protospacer . ***.********.************
6. spacer 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
ttccgatagcgattcagattccgacagt CRISPR spacer cagcgatagcgattcagactctgacagc Protospacer . ***************.**.*****.
7. spacer 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
ttccgatagcgattcagattccgacagt CRISPR spacer cagcgatagcgattcagactctgacagc Protospacer . ***************.**.*****.
8. spacer 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
ttccgatagcgattcagattccgacagt CRISPR spacer cagcgatagcgattcagactctgacagc Protospacer . ***************.**.*****.
9. spacer 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
ttccgatagcgattcagattccgacagt CRISPR spacer cagcgatagcgattcagactctgacagc Protospacer . ***************.**.*****.
10. spacer 2.9|836826|28|NZ_CP010402|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
ttccgatagcgattcagattccgacagt CRISPR spacer cagcgatagcgattcagactctgacagc Protospacer . ***************.**.*****.
11. spacer 2.11|836946|34|NZ_CP010402|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
ttcagatagcgattcagattccgacagtgactca CRISPR spacer cagcgacagcgattcggattccgacagtgactcc Protospacer . **.********.*****************
12. spacer 5.1|2207789|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactga CRISPR spacer ttgcatatctttagctttatagcttttatatgc Protospacer ******************** *.** .* **
13. spacer 5.1|2207789|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactga CRISPR spacer ttgaataactttagctttattgttataaacagt Protospacer *** *** **************** *** *
14. spacer 6.1|2431704|28|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017941 (Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
cacttcgcttcggttcgcctgcgctttt CRISPR spacer tgtttcgcttcggatcgcctgagcttcc Protospacer ...********** ******* ****..
15. spacer 2.11|836946|34|NZ_CP010402|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ttcagatagcgattcagattccgacagtgactca CRISPR spacer ttccgatagcgattcagattccgaaccgcaggca Protospacer *** ******************** * **
16. spacer 4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder matches to MT150133 (Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgtagaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer taacaaagagaatttctttttcaaaattctcta Protospacer * .* . *************..**********
17. spacer 4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder matches to MK234886 (Escherichia phage AnYang, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgtagaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer taacaaagagaatttctttttcaaaattctcta Protospacer * .* . *************..**********
18. spacer 4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder matches to MF036691 (Serratia phage CBH8, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgt---agaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer ---gatgtgaaaggatttcttttttgaaattatctt Protospacer *** **.***************** ***
19. spacer 4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder matches to MF036690 (Serratia phage CHI14, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgt---agaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer ---gatgtgaaaggatttcttttttgaaattatctt Protospacer *** **.***************** ***
20. spacer 4.1|1962365|33|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder matches to MF036692 (Serratia phage X20, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgt---agaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer ---gatgtgaaaggatttcttttttgaaattatctt Protospacer *** **.***************** ***
21. spacer 1.1|816948|32|NZ_CP010402|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018781 (Ochrobactrum pituitosum strain AA2 plasmid pOAAA2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
tttcatttcgaaattctctatgttggggcccc CRISPR spacer accatcttcgtaatgctctatgttggggcggt Protospacer .. .**** *** ************** .
22. spacer 2.8|836760|46|NZ_CP010402|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 12, identity: 0.739
tagcgattctgactcagatagcgattcagactcagacagtgactca CRISPR spacer cgaagaagatacatcagatagcgactcagactcagacagcgactca Protospacer ... ** *. ***********.**************.******
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
52311 : 58261
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP010402|52311:58261|DBSCAN-SWA GATGGTAGATAATATTATTAAATCAGTAGCAGAGAAATTATCCTCTCTGTCTTATATAGAAGGTATTGTTTTAGGTGGTTCACGTGCAAGGGGCACCCATACAGAGGATTCGGATATAGATATCGGCATCTATTACAATTCAGAATCATTTGACATAAATACTATTAATCAATTCGCTACAAAGCTGGATGATGAGCATAGAAATAACCTTGTTGTACCTCCCGGAGCATGGGGTGATTGGATTAATGGCGGCGGATGGTTAGTCATAAACGGGTATCATGTGGATTTAATTTTACGTGATATTAAACGTGTGGAACAAATAATGAAAGATACAGAGCACGGAATTGTTACTGCCAATTATCAGACTGGGCATCCCCATGGTTATATTAGTGCAATGTATCGAGGAGAATTAGCGATTAGCAAAATACTATATGCTAAGAATGAAAGCTTATGCGAATTAAAAAAACAGGCAGAAACTTATCCCAATGCTTTGCAGAAAAGTTTAGTTAACTTTTTTATGTTTGAAGCAGGGTTCTCTTTAATGTTTGTAAAAGCAAATTCGGGAACAGACGATAAATATTATATTGCGGGTCATGTTTTTCGTATAGTTTCATGTTTAAATCAAGTGTTATTTGCATGTAATAATGCTTATTGTATCAACGAAAAGAAAGCTATAAAACTGCTTGAAACTTTTGAACATAAACCTGAAAAATATACCGAGAAGGTAAATCATATTTTTGAAGTACTCGGTATCTCACTTTTTGAATGCTACGACATGACCGAGAAGCTTTATAATGAAGTGAATGAAATTGTATCGGAGATAAATAACTTTTTAAACGAGGAGAGTTCAGATGAAAGAAAACAAATATGATGATAATATATTTTTTCAAAAATACAGTCAAATGAGTCGCTCGCAGAAAGGACTGGCTGGTGCGGGAGAATGGGAGACTTTGAAAAAGATGCTACCTGATTTTAAGGGTAAGCGTGTGCTTGATTTAGGATGCGGCTATGGATGGCACTGTATATATGCGATGGAAAACGGTGCTTCCTCTGTAGTAGGTGTTGATATTTCTCATAAAATGCTCGAAGTAGCAAAAGGAAAAACCCATTTTCCACAGATTGAATATGAATGCTGTGCCATAGAAGATGTGGATTTCCCAGAGGAGAGCTTTGATGTAATACTAAGTTCGCTTGCGTTTCATTATGTAGCAGACTATGAGAATTTAATAAAAAAGATATATAGGATGCTGAAGGCTGGTGGCAATTTAGTTTTTACAGTTGAACATCCTGTTTTTACTGCTCATGGAACACAAGACTGGTATTATAACGAAAAAGGAGAAATACTGCATTTCCCGGTGGACAATTATTATTATGAGGGCAAACGGACAGCTATGTTTTTGGAAGAAAAGGTTACAAAATATCATAGAACACTGACCACATATCTAAATACACTGCTTTCAAATAGTTTTATAATAAATCAGATTGTGGAGCCACAGCCGCCAGAGAACATGATGGATATTCCGGGGATGGCGGATGAAATGCGACGCCCAATGATGCTGATTGTATCGGCAAAAAAGAAGATGTAATAATATAGAAAAAATAAACGAGGAGTATGTAAATGAGATCAGAAAAAGAAATGATGGATTTAGTACTTTCTTTAGCAGAACAGGATGAACGTATTCGAATTGTGACCCTTGAGGGGTCACGCGCAAATATTAATATACCTAAAGATGAATTTCAGGATTATGATATTACATATTTTGTAAGTGATATAGAACCGTTTATATCTAATGATGACTGGCTTAATCAATTTGGGAATATAATAATGATGCAAAAGCCGGAGGATATGGAATTATTCCCACCTGAAGAAAAGGGATTTTCCTATCTTATGCTATTTGATGATTACAATAAAATTGATCTTACCTTATTGCCCTTGGAAGAGTTAGATAATTACCTAAAGGGCGATAAATTAATAAAGGTTCTAATTGATAAAGATTGTAGAATTAAAAGGGACATAGTTCCGACTGATATAGATTATCATGTAAGAAAGCCAAGCGCAAGGGAGTATGATGATTGCTGCAATGAATTTTGGAATGTAACACCTTATGTTATTAAAGGATTGTGCCGTAAGGAAATTTTATTTGCTATTGATCATTTTAATCAGATTGTTCGCCATGAGCTGCTGAGAATGATATCATGGAAGGTCGGCATCGAAACAGGCTTTAAATTAAGTGTAGGCAAGAACTATAAGTTTATTGAAAGGTATATATCCGAGGATTTGTGGGAGAAACTTTTGTCCACCTACCGGATGGATTCCTATGAAAACATATGGGAAGCATTATTTCTATGCCATCAATTGTTCAGGGCGGTATCCGGTGAGGTGGCGGAAAGGCTTCATTATGCCTATCCGGAGTATGATAGGAATATAACAAAATATACCAGGGACATGTATAAAAAATACACTGGTAAAACCGGCTGCCTGGATAGCACATATGCCGCTGATATAGAAGAGAGGCGGGAACAGTGATTACAGAAATGAAAGCAGGGCACCTGAAAGATATCGATAAACCCAGCGAACCATTTGAGGTGATAGGTAAGATTATACCGAGGTATGAAAACGAGAATTGGACCTTTACAGAATTACTCTATGAAGCGCCATATTTAAAAAGCTACCAAGACGAAGAGGATGAAGAGGATGAGGAGGCAGATTGCCTTGAATATATTGACAATACTGATAAGATAATATATCTTTACTACCAAGACGATAAATGCGTCGGAAAAGTTAAACTGCGAAAAAATTGGAACCGGTACGCTTATATAGAAGATATCGCCGTATGTAAGGATTTCAGGGGGCAAGGCATAGGCAGCGCGCTTATCAATATATCTATAGAATGGGCAAAGCATAAAAACTTGCATGGACTAATGCTTGAAACCCAGGACAATAACCTTATAGCTTGTAAATTCTATCATAATTGTGGTTTCAAAATCGGCTCCGTCGATACTATGTTATACGCCAACTTTGAAAACAACTTTGAAAAAGCTGTTTTCTGGTATTTAAGGTTTTAGAATGCAAGGAACAGTGAATTGGAGTTCGTCTTGTTATAATTAGCTTCTTGGGGTATCTTTAAATACTGTAGAAAAGAGGAAGGAAATAATAAATGGCTAAAATGAGAATATCACCGGAATTGAAAAAACTGATCGAAAAATACCGCTGCGTAAAAGATACGGAAGGAATGTCTCCTGCTAAGGTATATAAGCTGGTGGGAGAAAATGAAAACCTATATTTAAAAATGACGGACAGCCGGTATAAAGGGACCACCTATGATGTGGAACGGGAAAAGGACATGATGCTATGGCTGGAAGGAAAGCTGCCTGTTCCAAAGGTCCTGCACTTTGAACGGCATGATGGCTGGAGCAATCTGCTCATGAGTGAGGCCGATGGCGTCCTTTGCTCGGAAGAGTATGAAGATGAACAAAGCCCTGAAAAGATTATCGAGCTGTATGCGGAGTGCATCAGGCTCTTTCACTCCATCGACATATCGGATTGTCCCTATACGAATAGCTTAGACAGCCGCTTAGCCGAATTGGATTACTTACTGAATAACGATCTGGCCGATGTGGATTGCGAAAACTGGGAAGAAGACACTCCATTTAAAGATCCGCGCGAGCTGTATGATTTTTTAAAGACGGAAAAGCCCGAAGAGGAACTTGTCTTTTCCCACGGCGACCTGGGAGACAGCAACATCTTTGTGAAAGATGGCAAAGTAAGTGGCTTTATTGATCTTGGGAGAAGCGGCAGGGCGGACAAGTGGTATGACATTGCCTTCTGCGTCCGGTCGATCAGGGAGGATATCGGGGAAGAACAGTATGTCGAGCTATTTTTTGACTTACTGGGGATCAAGCCTGATTGGGAGAAAATAAAATATTATATTTTACTGGATGAATTGTTTTAGTACCTAGATTTAGATGTCTAAAAAGCTTTAACTACAAGCTTTTTAGACATCTAATCTTTTCTGAAGTACATCCGCAACTGTCCATACTCTGATGTTTTATATCTTTTCTAAAAGTTCGCTAGATAGAGTTCTATATTAGAGATGTAAAGAGTTTTGGTGAAGAGGTTTGTGAGTATGGCTTTTATAACCAGGGTGCAATGAGAAGCACTAACAGCAGCTAGCTTAAGAACGCATAGGATATACTTTTTATGGAAGTCACAGAGGAGGAATAAAATTTGAACAGGATTAACAGAGTAACCTCTATTCTTATTCAGCTGCAATCAAAAAAAATAATTCCTGCCAAAGAAATTGCACAGCGATTTAATATAAGCTTAAGGACAGTTTACAGAGATATCCGGACACTTGAAGAAGCCGGAATACCAATTGGATCTGAGGCCGGAAAAGGATATTTTCTTGTAGAGGGCTTCCTACTTCCGCCGGTAATGTTTACAGCGGCGGAAGTGGGTGCATTGATTACAGCAGGGAAATTTTTAAATTGCCATGGAGATGAATCATTTATAAAGGATTTTGATTCAGCTATGTATAAAATCAAATCTATTTTGAAGCATGGTGAAAAAAACTATGCACAGGAGTTGGAGAACAGTATTAACGTGTACAGCACATCTGGACAGAAAAATACATTGGCGGATAACGTTATTGCAGCAATTCAGACTGCAATCTGCAATAAAAGGGTAATATCAATTCAATATCCTGCATCAGGAGGGCAAGAACCGGAAAGCAGAATGATAGAGCCTATATCACTGGGGTTTTATGAACAGAACTGGTACTTAATCGGTTTTGCAGGCTAAGAAATGAATATAGGAATTTTCGTGTGGATCGGATTAAAAGCATTTGCATAGAAGAAGAGCTCTGTCAAAGCCATGATGGCTCTTTGGAACAAATATTAAAACAAATGCTTTCATATAAAAAACTATATAATGTAATTCTTAGAGCTGAAAAAGGGGAGACATACAATTCTATCAAGAACAGGTATTCTCTCGGCTTCCTTGAAGAAACCGATTTGGGAAGTAAAATGGAAATCGAATTCCAGACAGATTCCTTTGAGATATTGAGCAAGCAGCTGATTGAATATGGATCAGGCATTGAAATAGTCCAACCTGATGAATTAAAATGCATAACCCGTAAACACCTGGCACAAATTACGAATCACTGCCTAAACTTGATTTAGAGAAAGCGATTGGTCTGTTATGTATTTTTTGTAAGGTTTCATATCCCCTGCTGACATACAGCTGTCAGTGTATTATGATATTCTACTATCAAAAAGGAGGATTGAAAAATATGAAACCAAAGATAATTATGCACACACAAATTAGCCTTGATGGCCGCATTAAAGGCTTTGATAATCCGGAAGTTTACTACCAGGTTGCCGGGGGAATTCATTCGGATGCGGTGCTGTTTGGGTCCAATACTGTTTTTACTGCATTTGAAAAATATCCTGCTGAAACAGAGGCTGATTTTGAGAAAATCATAACAAGCCCGGAGGACCCCAGACCAATAGGAGTCATACCTGACAGCAGAGGTATCTTGAGAAGTCTTCATTGCTTAAGAAATCTTGGATATCTGAAGGAAATTGTCATTCTGGTATCAACTGCCACTCCGAAGGAATATTTGAATTATTTGGAGGAAAGGCATTACCCATATATTGTGTCAGGAAATGATCATGTGGACTATGAAAAAGCCTTTCAGATCCTGCATGAGCAATATGGGTGTAAATACATGCGGACAGACAGTGGCGGTGGATTAACCAACAAATTATTAGAAAACGGACTTATTGATGAAATCAGTCTTGTGATATCACCATGTTTTGTAGGTAATAAAGAAAAACAACTATTTGATAACCTTCTGTTATCTGAAAAAGTTAATTTGGAATTGCAGGGAACAGAGAATGCAGAACATGGCTGTCTGTCATTGCGCTATGCTGTGAAAAATAAGGATTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP010402|52311:58261|56538_57111_+|WP_001079938.1|DBSCAN-SWA MNRINRVTSILIQLQSKKIIPAKEIAQRFNISLRTVYRDIRTLEEAGIPIGSEAGKGYFLVEGFLLPPVMFTAAEVGALITAGKFLNCHGDESFIKDFDSAMYKIKSILKHGEKNYAQELENSINVYSTSGQKNTLADNVIAAIQTAICNKRVISIQYPASGGQEPESRMIEPISLGFYEQNWYLIGFAG >NZ_CP010402|52311:58261|57601_58261_+|WP_000802831.1|DBSCAN-SWA MKPKIIMHTQISLDGRIKGFDNPEVYYQVAGGIHSDAVLFGSNTVFTAFEKYPAETEADFEKIITSPEDPRPIGVIPDSRGILRSLHCLRNLGYLKEIVILVSTATPKEYLNYLEERHYPYIVSGNDHVDYEKAFQILHEQYGCKYMRTDSGGGLTNKLLENGLIDEISLVISPCFVGNKEKQLFDNLLLSEKVNLELQGTENAEHGCLSLRYAVKNKD >NZ_CP010402|52311:58261|55468_56263_+|WP_001096887.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >NZ_CP010402|52311:58261|52311_53181_+|WP_000228166.1|DBSCAN-SWA MVDNIIKSVAEKLSSLSYIEGIVLGGSRARGTHTEDSDIDIGIYYNSESFDINTINQFATKLDDEHRNNLVVPPGAWGDWINGGGWLVINGYHVDLILRDIKRVEQIMKDTEHGIVTANYQTGHPHGYISAMYRGELAISKILYAKNESLCELKKQAETYPNALQKSLVNFFMFEAGFSLMFVKANSGTDDKYYIAGHVFRIVSCLNQVLFACNNAYCINEKKAIKLLETFEHKPEKYTEKVNHIFEVLGISLFECYDMTEKLYNEVNEIVSEINNFLNEESSDERKQI >NZ_CP010402|52311:58261|57083_57491_+|WP_072387101.1|DBSCAN-SWA MVLNRFCRLRNEYRNFRVDRIKSICIEEELCQSHDGSLEQILKQMLSYKKLYNVILRAEKGETYNSIKNRYSLGFLEETDLGSKMEIEFQTDSFEILSKQLIEYGSGIEIVQPDELKCITRKHLAQITNHCLNLI >NZ_CP010402|52311:58261|53928_54837_+|WP_001255866.1|DBSCAN-SWA MRSEKEMMDLVLSLAEQDERIRIVTLEGSRANINIPKDEFQDYDITYFVSDIEPFISNDDWLNQFGNIIMMQKPEDMELFPPEEKGFSYLMLFDDYNKIDLTLLPLEELDNYLKGDKLIKVLIDKDCRIKRDIVPTDIDYHVRKPSAREYDDCCNEFWNVTPYVIKGLCRKEILFAIDHFNQIVRHELLRMISWKVGIETGFKLSVGKNYKFIERYISEDLWEKLLSTYRMDSYENIWEALFLCHQLFRAVSGEVAERLHYAYPEYDRNITKYTRDMYKKYTGKTGCLDSTYAADIEERREQ >NZ_CP010402|52311:58261|53161_53896_+|WP_000662263.1|DBSCAN-SWA MKENKYDDNIFFQKYSQMSRSQKGLAGAGEWETLKKMLPDFKGKRVLDLGCGYGWHCIYAMENGASSVVGVDISHKMLEVAKGKTHFPQIEYECCAIEDVDFPEESFDVILSSLAFHYVADYENLIKKIYRMLKAGGNLVFTVEHPVFTAHGTQDWYYNEKGEILHFPVDNYYYEGKRTAMFLEEKVTKYHRTLTTYLNTLLSNSFIINQIVEPQPPENMMDIPGMADEMRRPMMLIVSAKKKM >NZ_CP010402|52311:58261|54833_55376_+|WP_000627290.1|DBSCAN-SWA MITEMKAGHLKDIDKPSEPFEVIGKIIPRYENENWTFTELLYEAPYLKSYQDEEDEEDEEADCLEYIDNTDKIIYLYYQDDKCVGKVKLRKNWNRYAYIEDIAVCKDFRGQGIGSALINISIEWAKHKNLHGLMLETQDNNLIACKFYHNCGFKIGSVDTMLYANFENNFEKAVFWYLRF |
8 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
741905 : 749725
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010402|741905:749725|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTAGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTATATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCATTTTTTTAGGTGAGAAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATTGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATAAAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTTTCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAAGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGATTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACAACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTATTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTTATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACAAGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010402|741905:749725|743621_744095_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP010402|741905:749725|746556_746976_-|WP_000941340.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDNTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP010402|741905:749725|744436_744877_-|WP_001093560.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNIDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP010402|741905:749725|745839_746553_-|WP_001062965.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQLWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP010402|741905:749725|742960_743647_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP010402|741905:749725|741905_742961_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP010402|741905:749725|747996_748590_+|WP_000604515.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP010402|741905:749725|746977_747646_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP010402|741905:749725|745156_745741_-|WP_000604990.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP010402|741905:749725|748573_749725_+|WP_001217797.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
761697 : 776026
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP010402|761697:776026|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP010402|761697:776026|763094_763637_+|WP_000197262.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP010402|761697:776026|772007_772979_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP010402|761697:776026|775264_776026_+|WP_000616840.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP010402|761697:776026|765390_766896_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP010402|761697:776026|774311_775268_+|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP010402|761697:776026|769784_771890_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP010402|761697:776026|769423_769822_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP010402|761697:776026|761697_762756_+|WP_000663035.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESVDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP010402|761697:776026|767756_768623_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP010402|761697:776026|765211_765313_+|WP_031835073.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGREKIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP010402|761697:776026|764203_765121_-|WP_000429006.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP010402|761697:776026|767236_767737_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP010402|761697:776026|773159_773315_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP010402|761697:776026|773353_774325_+|WP_000876319.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFVNHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
947209 : 1000998
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP010402|947209:1000998|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(33.33%) | tRNA,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1021226 : 1029699
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP010402|1021226:1029699|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP010402|1021226:1029699|1021226_1021709_+|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP010402|1021226:1029699|1029132_1029699_+|WP_000238658.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHIESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHGIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVSLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDCGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP010402|1021226:1029699|1028101_1029130_+|WP_000030803.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEIIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP010402|1021226:1029699|1026624_1028109_+|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP010402|1021226:1029699|1022823_1023528_+|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP010402|1021226:1029699|1024456_1026646_+|WP_000032727.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP010402|1021226:1029699|1023527_1023791_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP010402|1021226:1029699|1021695_1022820_+|WP_001010406.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP010402|1021226:1029699|1023792_1024464_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1468684 : 1555854
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP010402|1468684:1555854|DBSCAN-SWA 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103 | Staphylococcus_phage(83.12%) | tRNA,protease,terminase,plate,head,holin,tail,portal,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1610975 : 1619305
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP010402|1610975:1619305|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCGATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGGGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATCGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTGATTCTGTCGACTCCAATAATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAATGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCCCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTCGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGCTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAATACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGACCAGTTCGTCCGACTCTATGCGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAGCCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAATAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGGATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAATTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGGACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGATATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGCGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAAACCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATACGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATGATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGTGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGTATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGGTTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCAGCAATACCGCATTCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCTGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTTTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCTTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAATTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGTACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAGTTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAACTGCTCAGGACTGACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGCAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTTACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGTAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCCGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGCGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAATTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP010402|1610975:1619305|1610975_1611761_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP010402|1610975:1619305|1615349_1616027_-|WP_000624580.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP010402|1610975:1619305|1611886_1612777_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP010402|1610975:1619305|1612786_1614133_-|WP_001062180.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP010402|1610975:1619305|1614246_1615347_-|WP_000683933.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP010402|1610975:1619305|1616157_1617264_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP010402|1610975:1619305|1617487_1619305_-|WP_001217257.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTTFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1688619 : 1697662
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP010402|1688619:1697662|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGACCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTTGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTCAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTATACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCTATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGCGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCCGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP010402|1688619:1697662|1694189_1694450_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP010402|1688619:1697662|1689159_1691433_-|WP_000594999.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP010402|1688619:1697662|1696657_1697662_-|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP010402|1688619:1697662|1688619_1689138_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP010402|1688619:1697662|1691635_1693915_-|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP010402|1688619:1697662|1695630_1696656_-|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP010402|1688619:1697662|1694468_1695608_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1821243 : 1893413
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP010402|1821243:1893413|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATCCATTCCTTCAGAACCTGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCGATTCATGTGTCTCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCTGGCTGAATTTCTTTTGGTGATACTTTCGTCGCTTCAGCTGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTGTGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTCTATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATACTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATCGCTTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATGCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCTTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAAAGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAAGCAGTGACGCGTGCAAGATCATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAATATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAATATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCGTTGAATAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTTTCATTATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATTTGTTGTTTAGCTTTAATTAACTCTTTTTCAACTTGTGCAATTGCAATATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCGTTATTTGCTTTAATTAAATTAATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAATGCTGTTGTTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATTTATACTATCTTGATTAACTTGGGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAGTCTTTCTTCTTCAGTTGATAAATCGCTTTGATCGATTAGTGCATTTTGAGCTTCGGCTTTTACACCAACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTCGTTGCCATCAGTCTCAGTTCGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATGTCATTTTTAATTGTATTTACAATTTTATTTAAAGTATCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCTATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTATTTTCTATTTCTTGTTGCGCTTGTTTGAGTGTGTCGCTAATTAATTGATTCGCTTCATCTAATTCATCAACTGTTGCATGTGGTGTATCTTTTATTGATTCTACTTGATTTTCTGCACTTGCTTTTATTGCTTGTTGTGCTTCAGGCTTAATTACAATATGAGGTTGTACACCTTTTAGTGTAGCAATGCCATTTGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGTTACTGCTTGATTGATGTTTTGTAATGCAAGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCAGCTTGCTCTATTTCTTGCTTTTTAGTCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTACTTGTCTTTCTTCTGCTGTTGCTTCTTTATCCTGATTAATCTTAGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCAGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATAATTTTAATCGCTGATACACCATTTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTTGCTAATGCTTGTGAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTTACCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACAGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGCCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCTACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCTGCATTTGTGTTAGCTTGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAGTATTGATTGCAGCATTTTTCTCATCATTCGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCCGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAACTCTTGATCCACTTGATTTAAAGCCACTTGCTTTTCTTCAGTTGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAATCATTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGCGCCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATTTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTTGCATTGATATTTGTTATCGCCTCTCGCGCTTTATCATTTACAACATTGCGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGTAATTGTTGTGCTGCTTGTTGTTCTTCGAGCGTCGCATCATTATTATTAAATATCGTATTATGTTGCGTTTCCGCACTTTTATCAATGGCATTTTTTGCATCTGTTTTTACCTTTGTAGCTGGTGTAATTGCTTGTATTCCTTGTATCGCATTTGTCTTCACTTGTTCCACTTCAGCATTGGTATTAGCGTTTAAAATGTTTGTGTTTGCTGCAGTTACAGCAGCATTCACTTTGTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCGATATGTTGTTGTGCATCATGTGATACAGCATCCCTTGCAGCTTGCTTAACAACAGTTACAGGAGCAATTGGATTAATGGCATTTAGACCATCTCCTTTGGCGTTATCAACATCAGCATTTGTTGTTGCTTGATTGATTTGTTCTAAAGCATGGTTGGTTGCTTGAGTTAATTCGTTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCCTGAGTTGCTTCTCTATTACTATTTATTTGTTGTCTTTTCGTTGCTGTTGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCAGCTTTTTTATGAGTTACTTGAGGAACAACTGCTCCAATAGTATTGATGCCATTATTTTTAGCTGTTTCAACGTCAGCATTTGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTAGCTAATTGATTTATTGCATCTTGAATCTCGTCTTCAGTAGCATCTGGTGTTGCATTGATAATTTCCCTTTGTTTCGTTGCTTTATCACGTATTGCTTTTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCCCCACTTAAGGTCTGTATACCTTGATCTTTGATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTACCAATTATTTCATTTTTATGTTCCTCGATAACTTGTATTGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAATTCATCATTTTGATTAACTAAATCTTCCATTTGGTCAACTTTTTTATTAACTGCATTTTCAGCATCAACACTTCGAATTAACGTATGTTGCATTTGATTAGTTAATGAATCAATATCTGCTTGAGAAACTCTTTTATTTAATGGTACATTGTTACGATTTTCATCTAAAATCGTTTGTGCGCGTCGTTTCAGACCATTAAAGATATCTAATGACGCAAATGTATAATCAGCTTGTTGAATACGTCTGTCAACTTCGGCTTGTAATGCATCTTTATTCATGATGATATCGATAGTATATGGATTTGTATTTATAGTATGACTTTCTGCAGCTGAATTAATGAAATCTTGTGTATATGTTTTATACGTTAATGTCTCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTCGGCACATTATTTACACGTAATTTATATCTTAAATCGAGTATTTTATCAGGCATAAGTCGTGCCGGAGAGTTTGCTGTACCT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70 | Staphylococcus_phage(94.64%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1975322 : 2070778
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP010402|1975322:2070778|DBSCAN-SWA 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111 | Staphylococcus_phage(85.33%) | tRNA,protease,integrase,terminase,head,holin,tail,portal,capsid | attL 1973280:1973301|attR 2059915:2059936 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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