Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012373 | Beggiatoa leptomitoformis strain D-402 chromosome, complete genome | 7 crisprs | DEDDh,cas3,cas10,csa3,RT | 0 | 15 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012373_1 | 552053-552289 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP012373_1
>1.1|552089|30|NZ_CP012373|CRT TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGC >1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCAT >1.3|552223|31|NZ_CP012373|CRT AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCG >1.4|552090|30|NZ_CP012373|PILER-CR TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGC >1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCAT >1.6|552224|31|NZ_CP012373|PILER-CR AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCG >1.7|552089|31|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCG >1.8|552155|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATG >1.9|552223|32|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_1 >merge|NZ_CP012373|1|552053-552289|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACTACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACAAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC >NZ_CP012373|1|1|552053-552289|CRT ATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGC GTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCAT GTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCG GTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC >NZ_CP012373|1|1|552054-552289|PILER-CR TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACT ACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACA TGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAACA AGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC >NZ_CP012373|1|1|552054-552289|CRISPRCasFinder TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC TACCCATCATTGATTGAAGACTTGGGGGGCG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC ATGGAACAATTCCTTGAAGAACAAAACACCATG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC AAGATGCTGATGTAGTGGGTTTTGTATATCGG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAGTAAGGCTGCAAC
>NZ_CP012373.1|WP_062148489.1|551542_551761_-|hypothetical-protein MLGTIRDASSLDIPNIVPGECSLLPKFSIPLGSSTYTPDFSEQSYCDFFTALASFFIFMVVLSAIFITLTKG >NZ_CP012373.1|WP_062148485.1|550726_550945_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicA-family-toxin MPPVPALSASEVIKKFQRLGWIIRRQTGSHIMMNKEGHPALLVVPNHPEVARGTLRGLIRVADITVDEFIKA >NZ_CP012373.1|WP_062148482.1|550523_550727_+|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MYYTVVFEPDEDGIWVAECLELLGCFSQGKTQEEALNNIKDAIKLYLEVKQELNMHSQRKVCQVEVA >NZ_CP012373.1|WP_062148479.1|550129_550489_+|bacteriophage-CI-repressor MSDTTEVLERLYQLHNVKNDAELARKLNIGTSTISNWRTRDTVPYKICVEISKRDNVSLDWLLTGKELTNVNKPKTQAIIEMIENLDDSQKQKVYAVIEDEKRFAEMKKRIDQLERKTA >NZ_CP012373.1|WP_062148476.1|549649_549886_-|hypothetical-protein MNKESMLEQLRDEFGTIQEAAEYFHTSRVLLYQSIDGKGARAVRVALAKYFNAYPSDIWQDGTDTRVLDDYQMTETRQ >NZ_CP012373.1|WP_101539114.1|548824_549573_-|IS5-family-transposase MSRRYALTDEQWSKLEPLLPGRKGHVGMTAKDNRLFIDAVLFRYRSGIPWRDLPERFGDFRVVHTRFSRWSQKGVWERVFKILSADADNEYAMIDSTIVRAHQHSSGGGADEAIGRSAGGLSTKINSVVDALGNPTPFFLTAGQASDLEGADALIPQIKANALLADKAYDADERVRDVLKQKSIEPVIPYRKNRLNPPDYDKALYKARYLIEHFFGKLKQYRAIATRYDKRARNFLSGVYLASTLILLA >NZ_CP012373.1|WP_062148474.1|548294_548771_-|hypothetical-protein MFNPQTGEIVADGQYLLGELRKVIAKEDFTDRETKEVRPGGYEIEILCEVPNARDLLIIAKCPNPEDFTPLLKRRVLVSVKASAFQFGDRDAQVSYTVQASVKPIALDTLIGSSIHAHQHATPAVVPEKIPTVTEKPVETTEKVDSVVPKKTFMGSTV >NZ_CP012373.1|WP_062148470.1|548080_548266_-|hypothetical-protein MTYSTDFRKKVLLVTKLCLVMPIRQALLGGYLNAPRLSPLVLGKRSLQGRHYQAELGNEQI >NZ_CP012373.1|WP_101539229.1|547667_547859_+|hypothetical-protein MFKLIAGALALSLLPIPSSLSPTSLMPSLTPFMASPTPLMPSLTPFTASPTPLTPPIMASPCA >NZ_CP012373.1|WP_062148464.1|547120_547411_-|hypothetical-protein MQELIDFLYAGLVAIFAGIGDLLLYVYFSLMLFLVDIFWKMGQDIIAFYDVMGKIDTLFSNLNPGLVNAFAFFKVKECVHLLATARITRYLFSFIS >NZ_CP012373.1|WP_101539228.1|553077_554283_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MQNLTDLNFTVTNATLLSETAPRNIQVGVRPFYLIEDMEASALKIKLQQCNETPLKKTEFSIGHRGAAMQFPEHTKESYVAAARMGAGIIECDATFTKDKQLVCRHSQCDLHTTTNILATPLAAKCSVPFTPADVANGTPASATCCTSDITLEEFKSLCGKMDASNPKATTVAEYLGGTPDWRTDSYATCGTVMTHAESIALFKQLGVKMTPELKSASVTMPFEGTYTQSQYAQQLIDEYKAAGVPASQVFPQSFNLADILYWIKNEPDFGQQAVFLDELETMDGVDASTARLPELVAQGVKIVAPPTWMLVTTDSNQQIIPSDYAKKAKALGLDIITWTLERSGPLKTGGGWYYQSINNVINNDGDMMVFLDVLAKQVGIRGIFSDWPATVTYYANCMGL >NZ_CP012373.1|WP_062148493.1|554480_555632_+|lipid-A-disaccharide-synthase MRIAMVAGEMSGDILGAGLIRALQVHYPDAQFEGIGGEQMISAGLHSYFPLETLSVMGLVEVLKHYRSIKRCYNQLRETWLNNPPDVFIGIDAPDFNLRLEYDLKQARIPTVHYVSPTVWAWRRYRVKKVIKSCDLVLSIFPFEVDFYRPYPVNVQFVGHPLADEMPLKVNQQAAREWLKLPKASAYIALLPGSRQGEVQKLGTIFLQTAQWLQQYYPDLHFILPIANAHLQQLVMTQITQTAPHLSITLIDGNAREAMAAADVVLTASGTATLETLLSKRPMVVAYKVAFLTYFLFKPLVKVPYFAMANLLADEALAPEFLQYAVTPANLGQAVSGWLEHPAEVYALQQRYTQIHQQLRCNASEQAAQAIVNLLCNLYVNET >NZ_CP012373.1|WP_062148496.1|555615_556173_+|flavoprotein MSTKPEKPRFAWAFTGSGHYLTECLTLANQLQNVDFFFSKAAYEVFRIYELEHHIHAWQEQQGVRIFRDTAASAPPVGLFYRGDYHTLIIAPATSNTVAKCVVGISDTLVTNIFAQAGKCLIPSIVFACDTEPVMETPAPDRIVKVYPRKIDLENTERLCEFERTTVVKSLADLERVIKVREGEL >NZ_CP012373.1|WP_062148505.1|556254_556602_-|hypothetical-protein MLAERVAIWYEEGVQKGMQAGMQAGMQEGLLKGIQQGREEGREQGREQGLMEGQATGIKNAMLAVLTMRFGKVSPVLQQAINDIHEITQLEDLMRQAVIIDSLTTFQQLIHSTNH >NZ_CP012373.1|WP_062148508.1|556658_557726_-|transposase MPDHDPSYKRFFSHPEMVKDLLQGFVHETWVAELDFTTLEKVSGQFISDDLRSRDNDVIWRIRWQNKWLYVYILLEFQSSVDNYMAIRLMVYIGLLYQDLIKAGLTTDKLPPVLPIVLYNGNRRWTAPVNVQDLIEPSPLQNYQPQLHYLLIDEGAYSTTELSRLHNLVAALFRIEKARNKEEVIAVLEALLQWLKEPEQMGIRQAFAVWLNRVYLPHHLPNTELPKLIDLQEINVMLAERVAIWYEEGVQKGMQAGMQEGLLKGIQQGREEGREQGREEGREQGREQGLMEGQATGIKNAMLAVLTMRFGKVSPVLQQAINDVHEITQLEDLMRQAVIIDSLTTFQQLIHSTNH >NZ_CP012373.1|WP_062148511.1|557793_558264_-|6,7-dimethyl-8-ribityllumazine-synthase MTAYTLLEGDFTACNARYAIAVGRFNAFIVDSLLEGALDVLKRHGVDATNITVAKVPGAYEIPLIVQRLAASKKYDAIIALGAVIRGGTPHFDYVAGECTKGIATVALQHDIPIAFGVLTVDSIEQAIERAGTKAGNKGAEAALSALEMVSLLKQL >NZ_CP012373.1|WP_062148514.1|558260_559388_-|bifunctional-3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate-synthase/GTP-cyclohydrolase-II MSLNTIEELIDDIRQGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEKVRAEDINFMARYGRGLICLPLTEERCKQLQLPLMVSDNRTPHGTNFTVSIEAAHGVTTGISAADRAVTIQAAVAPHATPTDLVQPGHIFPLMAQPGGVLRRAGHTEAGCDLARLAGLEPASVLVEILNEDGSMARRPDLELFAKQHNLKIGTVAALIQFRLANEKTVEKVAHCRLPTEFGEFQLEAYQDSIDGTLHFALVKGTPKAEEPTLVRVHITNILCDLTFSTQKECGWPLRDALQRIAAEETGIVVILQQTTNAKSIIKAIQDNHKRELGENLPAQPSTDDLRTYGLGAQILADLGVRKMRVLSAPKKMHGISGFGLQIVDYINQEGTSHS >NZ_CP012373.1|WP_062148520.1|559761_562809_+|PAS-domain-S-box-protein MPNKEFHHANFFTTCKTLLCVIGFDGGLRQFNLAWETELHYSTKELSEFLYLDLIHPEDKSITKNYIDKLITGAESAVFTNRILQKSGYYRAYLWHITACLKEFSFYAVGIETTEEVARQEIAQPMSATNTIDNQYASLFDVAPLLIVHKDKENRIIRANQQAARFWKTTTDKLSGISMDTLMPEDVDHHHADDLDIVVSGQAKRGILQETLNGTLQIDKFPYRNANGNIDGVVWFAVDITERLKVEQALRENQSLLTAIFEVAEIGIGLTDKNGRFVRVNPAYCEMFGYHPNELLGQSLLAVFPNSLHKEVQKLYQDAVSGSQFLAHDEWEGRHKDGHHFDMEITVSRLTQYNKPFVVTLTSDITQRKQMVRSLQNSEAHLRMIVENLPIMVDAMDEKYNFVLWNRECERITGYTANEMLHNPQALEKIYPNVDDRQKLVEALSNVLHTNPGYRRREWQMTCKDGTQKIIAWSINSKIKIPGFAVWGIGEDVTEREKALQQLQRSEESLRESEAHLKFVIENLPIMVNAVNAENQFVLWNRECERITGYSAAEIIGNPDALTLLYPDADYRQKMLAHFQFILEQNPGIHYSEWTVVCHDGIQKTISWAVNSKIKIPGFAVWSIGEDVSEREEALHILKTSEERLKQSEVHLKFVIEHLPTMVDALDTKGNFLLWNQECEQVTGYSAKEMIGNARGLEKLYPDPQYRQKMLDAVQRVAKEDPGYRRGEWVVRCKDGSDKNIVWSVNSKIKIPGFPVWGTGEDVTERQKILKQLADNESRLRSLVENIPIMLMAFDEKGQIVLWNRQCEQVTGFPAEDIVGNPSALAMLYPQPEYRSYRTKPLQYISPYWQNDMTCKDSKLKTIAWKDVSNQFPMSGWAKWITGEDVTFRKKIEQSMGINDGLLIAALNSIDSAVCATNSLEKIVYVNQGFCDLFGYTTEELLKMSIKQIMPSDSRGSFVARHYFSFYTGAHGSFYEETHHAFHHDGHIFKVKLNAHRVKQEKEVHILWIVNYLDG >NZ_CP012373.1|WP_062148523.1|562864_563521_+|thiopurine-S-methyltransferase MNAEFWHKRWERNQIGFHQTEINTHLQTYWQALNLPKGASVFVPLCGKSLDMLWLLEQGYRVLGIELSKVAVRDFFTENNLTPTVTTYKTFNRWAMDEIEILCGDFFHLTPTELQTCTAIYDRASLVALPPEMRNDYAQQLATLFPTNTQILLVTFEYSQAEMQGPPFAVHADEVTQLYQQHFTIEQVAHTDILNENPRFQKLGVTQMQESVYLLRKK >NZ_CP012373.1|WP_062148526.1|563684_564068_+|Co2+/Mg2+-efflux-protein-ApaG MLTSQLHNIIIDVETHYIDEQSDPEIARYVFAYTVTIRNMGKVPARLVTRHWVITDANGKVQDVRGEGVVGEQPYLRPGEGFRYTSAAMIETPVGSMEGSYQMVADSGEQFDAPINPFSLAQPRTLH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012373_2 | 945611-945979 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_2
|
5 spacers
spacers of NZ_CP012373_2
>2.1|945635|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder AATAGTTGACGGTCAACGCACAGGCAGAGGCATTTATACATGGAA >2.2|945704|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder CTTCACCAATGGTATTCGTGAAGGAGAAGGCATTTACCTCTGGAA >2.3|945773|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TTTTGCAGCTAACCGTCGCGAAGGTAAAGGCACTTACCTGTGGAC >2.4|945842|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder CTTTATTAACGGCACACGTCATGGCAAAGGCATTTTAACTTGGGC >2.5|945911|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder ATTTTCCAAAGGAAAGCGCACAGGACAAGGCATTTACACCTCATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_2 >merge|NZ_CP012373|2|945611-945979|CRISPRCasFinder CAATGGCGACAGCTACGAAGGTGAAATAGTTGACGGTCAACGCACAGGCAGAGGCATTTATACATGGAAAAACGGAGATAGCTATCAAGGCGACTTCACCAATGGTATTCGTGAAGGAGAAGGCATTTACCTCTGGAAAAATGGCGACCGCTACGAAGGCGATTTTGCAGCTAACCGTCGCGAAGGTAAAGGCACTTACCTGTGGACAAACGGCGACCGCTACGAAGGCGACTTTATTAACGGCACACGTCATGGCAAAGGCATTTTAACTTGGGCAGATGGCGACCGCTATGAAGGCGAATTTTCCAAAGGAAAGCGCACAGGACAAGGCATTTACACCTCATCAACAGGTGACCGTTATGAAGGGGG >NZ_CP012373|2|2|945611-945979|CRISPRCasFinder CAATGGCGACAGCTACGAAGGTGA AATAGTTGACGGTCAACGCACAGGCAGAGGCATTTATACATGGAA AAACGGAGATAGCTATCAAGGCGA CTTCACCAATGGTATTCGTGAAGGAGAAGGCATTTACCTCTGGAA AAATGGCGACCGCTACGAAGGCGA TTTTGCAGCTAACCGTCGCGAAGGTAAAGGCACTTACCTGTGGAC AAACGGCGACCGCTACGAAGGCGA CTTTATTAACGGCACACGTCATGGCAAAGGCATTTTAACTTGGGC AGATGGCGACCGCTATGAAGGCGA ATTTTCCAAAGGAAAGCGCACAGGACAAGGCATTTACACCTCATC AACAGGTGACCGTTATGAAGGGGG
>NZ_CP012373.1|WP_062149369.1|944239_944860_+|phosphoserine-phosphatase-SerB MKLCVFDFDSTLMDGETIDEIAAACGKKNAVAHITEQAMQGKLDFFEALTQRVAMLAGTSYTKVIDVCQHLPLMNGALETVQGLQQQGYKVVILSGGFHEATAYLGKQLGVDGEFANFLHHKENVLTGKVGGEMMQSTSKGDMLARLQKLLGAEKANTIVVGDGANDASMFPYADKKVAFCAKPILKQQANIIIDHKDLRELLQHI >NZ_CP012373.1|WP_062149366.1|943393_944155_+|adenine-nucleotide-alpha-hydrolase MNQLIKPPKSLLRCVGRAIGDYAMIKANDRVLLGLSGGKDSLSLLHILAHLKRHAPIHFNLGVITVDPLISGFDPSPLKTYLADLNIPYFYQQQPIMEEALRHIRGDSFCAYCSRMKRGIMYSTARKEGYNVLALAQHLDDLAESFLMSAFHGGRLQTMKAHYTNDAGDIRVIRPLIYARERQTADFAKATQLPVIFDNCPACFSKPTQRHHIKQLLATEELAYKQIFRNLLHAMRPLMQGNQPALQETDDDS >NZ_CP012373.1|WP_062155336.1|942189_943086_-|SPFH/Band-7/PHB-domain-protein MSIKSVPQGSNWTVERFGKYIRTLSPGLNFIIPIIENVSKKLSMMEQVMDVPSQEIITKDNAMVRVDGVAFFQIMNASEAAYQVQNLMDAILNLTMTNIRTVMGSMDLDELLSKRDEINHQLLRVVDEATTPWGIKILRIEIKDIAPPKDLIDSMARQMKAERDKRASILEAEGERQADILKAEGEKQSIILAAEGRKEAAFRDAEAREREAEAEAKATMMLSQAISKGNVQAINYFIAQDYVKALGQIASADNQKVIMMPLEAASVIGSIAGIGELAKEAISKRNPSPTIPPAGTSS >NZ_CP012373.1|WP_062149363.1|941730_942186_-|NfeD-family-protein MMSSLYVNFWYWWILAILLSIIELVVPTTLFIWSAAAAVVTGFVVLVFPQMGIEIQLILFSLLSIFIVWLGRSLQAKYPTKTDQPLLNQRGSEYIGRIFSVTEAINDGVGKVRIGDGYWRVEGSDCPVGTKVKVISVDGVRLKVEPLVEEN >NZ_CP012373.1|WP_062149360.1|941105_941546_-|rhodanese-like-domain-containing-protein MTEIVHSIAPREAWRLLEENPKAILIDVRAEMEYLWIGHPKGAIHIPWIDEPDWTVNPHFAAEVRKLLLGGVITDHDDVEHPIDSIPILLICRSGNRSLEAGKELVRKGFSNVYNVIEGFEGPLDHEHHRSTISGWRFHGLPWEQI >NZ_CP012373.1|WP_062149357.1|939809_940817_-|porphobilinogen-synthase MPLTNAPFPALRMRRMRRDEFSRRLMREHHLTTDDLIYPLFIMEGQQQRVAIPSMPEQYRLSIDELLKEAEQLVQLNIPAIALFPVITPDKKSLNAAESYNPDGLVPRAVRCLKQAFPQLGIITDIALDPYTTHGQDGLIDASGYVMNDETTHVLIQQALSHAEAGVDIVAPSDMMDGRIGEIRYAFESSEFKHTRIMAYSAKYASSFYGPFRDAVGSSGALGKGNKHTYQMDIANSDEALREVALDIQEGADMVMVKPAMPYLDIVRRVKTELRVPTFAYQVSGEYAMLKAAAQNGWLDEQSVMLESLIACKRAGADGILTYFAKQAALYLQQK >NZ_CP012373.1|WP_062149354.1|938987_939686_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MLATQEIMLREHALFRHLNKKLVERILSISSIRHLKKGEVLFVKDEAGDALYGVLAGRIRISNRSLEGQELILKIMEKSDIFGEIALLDGSPRTADAVASEDSQLLMIRHRDFTLLLQQEPMLALQMIRLLCERVRQSNEYIEDLTFLDISRRLAKHLLNASREGEKMDEGIRLPLLSHDELAQRLGTTRTEVTKQLHYWRDNGWLLLEKGQITLCDARALQKFINSRADMW >NZ_CP012373.1|WP_062149351.1|937460_938687_+|exo-alpha-sialidase MLRFGVKYLISSYCLCFSLIVSAECLFTTTTGVTVDGHYPRFAELSDGSVLMSADRYIVNEQGQGGQAIVIFRGDKNLLVWEEVVIAAYNPPANFSNAYLTVLKAKGSRPETILLALRAWEGINSHIDVIQSTDKGKTWQFRSQAFGENMGNLTNGESDDGSTVSDVGVYEPSLWVSHDGYNASGNETLFITYASEVSATADHAYENEQVILLQRSDDLGLSWSAPVVVTENEPYQRFGMPAIIAVDNLMAVFYEQVDLTPERVYSWWDFKTRPAWKWSIRSALSVDGGHSWNSGYMMFDSRLGYVDNEGKSINYSGAPVVRFLRFPNSSVDTIGLIFQVANIPTYADRNTAKVSPYYIGLTKEGIEFYRGPLPEPLSAWWASSFQHSISGKIILAGDKEGCMQAGFY >NZ_CP012373.1|WP_062149348.1|936706_937192_-|hypothetical-protein MQRLIQTFNDGSTVAFDSGRFDDWCVYLHRPAQRRYAPSDTYYFARLQILGKLYGFQSLYDDYIAIYEKTNAQINPDVLSLILQLTEKYQVDSLEIAIWFTVIYAGMVAEENKQGAILKKRIKRLGMHQTLIEQIAPNIAANYSRGKKWRELDVLCKEKGF >NZ_CP012373.1|WP_062149345.1|935766_936705_-|hypothetical-protein MIDITQLRFFTTCLLLAILSVAKASEISIDDTYTEIYNVQQELNIIKQYLKIDKEIIPPQVTLQVVPRLTWQKTYQILFKLDHIHEKYNLPRLNIPSREPEKDVSTAVIYEQVCRIRTELFLLKRVFDIKTEIPPPPVFTKKTQLDNYNALNQILYELDAFTGTSFLPSHVFGQAMRIHYDIDALLYALELTDSTLPPPKKDNVLPVDVFNAGLTLIKEMQEIQTHLNINKINLNINVYQRNSIQQITPTETFGMTGFVLAELQVIKAYLGLTNVITPVAQIYQGKIPADTLQILEWNIARIRLISKAIKQL >NZ_CP012373.1|WP_062149375.1|946092_947040_+|4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl-diphosphate-reductase MNVILAQPRGFCAGVVRAIEIVEQALMVYPSPVYVLHEIVHNRYVVDDLRQRGAVFVETLDEVPLGAVCIFSAHGVAQAVVKNAELRQLEVIDATCPLVTKVHQQAQRYVQQGAEIVIIGHAGHPEVEGTRGRIDGIVHILSTVAEAQALQVRDPEKLAYVTQTTLSVDDTKDVIAVLSQRFPTIQGPQLSDICYATQNRQNAVRELATKVNLLLVVGAQNSSNSNRLREAGEQAGVTSYLIQDAHDLNPEWFTGDQQIGVTAGASAPEILIQGVLDRLKTFGVQTISIMDGQPENTTFKLPLALLEKVKQKEVV >NZ_CP012373.1|WP_062149378.1|947346_952341_+|NAD-nucleotidase MTQGIMRKQAWQWLITSGLLAFAPVSLAEMTITEVGRYQSNLFAQGGAEIVAFDSVNKQVFVVNSGLAQIDVLSLNTIATPQKISTIDAKALGAGANSVAVKNGIVAVAIENVDKQANGLVAFYDSTTLKLLKTVTVGALPDMVTFSPDGKTVLVANEGEPNADYTVDPEGSVSIIDISHGVENAVAKIADFSAFNTQKQRLLNKGVRIFGKGANVAQDLEPEYITVTADSKTAYVSLQEANALAIIDIANAKVLDVVPLGYKDHNQGAPSLQTFNFPEMPDLNTSAMGETVKLGGFSGLHFEGVDSATGNYKFVTIPDRGPDAGLVDVDGDGVQERIFTIPQYQIRVVRFEVNPQTGVVQITQQIPLTRQDGTTPITGLPNIAGADESPAEQVPSNGQFTIEGKQYNKLDYDIFGADLEGIVINPVDNSFWMVDEQRPAIYHFLADGKLANRFVPQGTDPEGQARYGAETLPAVYRKRVNNRGFEAVALDTEQNILYAFIQTPLANPNMAASNASTVIRMLGINPDTGETVAEYVYLLEKPVVRGSVVDKIGDATYAGNGQFYVVERDSDLTANSIKPVYKIDLKGATNLLTSNINLLPDLTLEQHTPDQLSSVGIQAVHKRKILNLPSIGYLPSDKSEGLTVLPDGKLAVLSDNDFAANPETAQIQMGLISFGTNYGLDASDKDGMINIRNWPVLGSYMPDSLANIVINGNTYIVTANEGDSRDYAGFSEEVRIGSSKVVLDPIVFPNASDLKTDEQLGRLKITNTQGDIDGDGDYDELYAFGARSFSVWDNRGNLVYDSGDQFERFTAELLPDFFNTSHDNNKFDDRSDDKGVEPEAIAVGEVNGQPYAFIGFERLGGVAVYNLSNPHAPQFVDYVNNRHFAVTPEAGADTGDLGPEGFSFVHASQSPTGQALLIIGNEISGSTTLYQLGDSATAVTLPNLNTGVATDAQGQHVDKQTSFAGGISVKQTAFDKAVGQKLADKATVRGRIYVDPADVGKVADIVVYAAYKPILAANSPTVPANYFMLNAQNQIVTWDGKLSTLSAYQTNLTLSAQQDVLLYDANWLVSGYLELSFGYRLQDGTLVLSGTPITTTINDTPVVALRTSLIHINDSHSHLTEETIDLNLNGKTTRVNMGGFARVATKINALRKTAENPLVLHIGDAVVGTLYYSLFKGAADAAALNTIKFDALTLGNHEFDDGNANLAQFLKQLDNIPALSANIDVSQSADLKDLVKPYLIKEINGQKVALVGITTLKTLVSSSPGADITFSNEVEAAKQVVAELEGMGINKIIFMTHYGYTQDIELAKQVSGIDVILGGDSHTLLGNFSNIGLSSEGAYPTIARTPAGEKVCIGQAWQYAYVVGFMTVDFDDAGNVLYCDGNPTLLLGDNFLQADAAGTFVAVSDAMKTQLSQLINTQYTAEIVPENSDMAGVLSLFSEQVNVLKQSVIGKATDSLLHIRIPGKHTSGVELSHGSMIAPVVAEGFYQQLKTRNYNPDLILQNAGGVRVDLPQGDITVATAYTLLPFGNTIYVLDMTGAEVKQAIEDGLSNYFDNAGSSGSFPYAYGIHYTVDMNKANGERVTSLEVMSKTDGTYSVINPESLYRVGVNSFMATGGDGYTTLKKVAADRRTDTYFDYAESFVNYMKAVGTISAPTSYNLTYIPKQ >NZ_CP012373.1|WP_101539099.1|952476_953859_-|glutamine-synthetase MPTFFHHTPHQFMSFDYLKEWLETRHITEVECLVPDISGVARGKIIPASKFCKEEGMRLPEIIFIQTITGDYPEDESAIDPAEIDMILQPDPSTIRLVPWATEPTAQVIHDCFYRDGSEVDLAPRTVLKRVLKRYDEQGWKPIIAPELEFFLVKKNIDPDYSLEPPIGRSGRPERARQAYGIDAVNEFDPLFEEIYDFCEAQELNIDTLIHEAGAAQMEINFLHGDPLELADQVFLFKRTVREAAMRHDIYATFMAKPMEKEAGSAMHIHQSLVDKETGVNLFSNDKPEMTDLFLSHIAGLQTYLPSAMSFLAPNVNSYRRIARYNSAPINVQWGYDNRTVGLRVPYSDPKSRRIENRVAGADTNPYIVFAASLACGYLGMMQGLKPRPAIEGSAYDMPYELPRNLEESLRFLSEPESIPLREILGERFVKAYRAIKLKEYETFLAVISSWERDFLLLNV >NZ_CP012373.1|WP_062149384.1|954150_954516_+|hypothetical-protein MSQSVAQRLSDILITLPEAEQKNVLAFAEFLHARVRAEHPLTLPLPELLEPPQGESVVAAIKRLSRSYAMLDKTKMLGQTAELMTQHVVYGRTAEEIIPLLETLFMQHYQSFVEHYNKQIG >NZ_CP012373.1|WP_062149386.1|954520_955609_+|AI-2E-family-transporter MVQVLSRWFHRYFSDPQAVFLAILLVGSLTVLMTMGEILAPLLASIVIAYLLEGLVKNLQQWRVARLPAVIIVYSCFLAFLIFVLVILLPLLSNQLSQLFQELPNKLTKWQELLMALPQRYPGFISNEQVDSLLNSIRVGLRSIGQIALSYSIASLGVVIMLMVYSVLVPFLVFFLLKDKEVIIRWALSFLPQNRHAASQLWVEMDAQIGNYVRGKVYEIFIVGIATYIPLAILGMNYASLLAVLVGLSVIVPYIGAVVVTIPVVMVAYIQWGFNSDFIWAMSAYTVIQFIDGNIIVPLLFSEAVNLHPVAIIVSVLVFGGLWGFWGVFFAIPLATLVKALLVAWPRMPDHDMEKRQMDSLY >NZ_CP012373.1|WP_062149388.1|955633_956407_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKVFSAVCLILCLLGTQASYAEKLRFGVEGAYPPFSLIDTQGELQGFDIDIAKALCHAINVECVLVQNDFDGLIPALLAKKFDAIIASVSITEERKKSVDFTKKYYNTPARFVRKKDSGIEATAEGIKGKVVGVQRATTHDKYLTDNYDTTIDIKRYVTLDDAYLDLQAGRIDLLLADSIPLADGFLNKPDGKAYEFTGEPITDPKWFGEGVGIAVRKGDNELREKLNQAIAKIRADGTYKTIQDKYFQFDVYGDE >NZ_CP012373.1|WP_062155338.1|956620_957988_+|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine--D-glutamate-ligase MSNPTSSIPTQTNSYTAIMGMGKTGVSCVHFLVKQGIQLYIMDNRAEPPYFNTLQQTYPQLTYLTGHFDPDILANAQEIIISPGISLENEALQLARQAGVPIIGDIELFARHVTAPVVGITGSNGKSTVTTMLGEMAKQAGRAVQVGGNLGQPALDLLSTAADLYVLELSSFQLETTHSLRPKVAVVLNVCADHLDRYADMQAYAVAKQRIYQYAETCVLNADDPIVMAMAPTDKPIITFSLQADKGDFRVATYQGQAHLVRVKQGQIIPLIATAELALKSAFMRANALAALALGEVLGLPLDSMILILKTFKGLHHRCELVTTINQVEWFNDSKGTNIGASIAAIQGLENPKKIILIAGGDGKGADFSPLAAVAHEHLKACVLIGRDAPLIEIALQGIIPLSHAHSLEAAVKQCAELADAGDIVLLSPACASLDMFKNYEHRGQVFTDAVHGLV >NZ_CP012373.1|WP_062149391.1|958174_963241_-|hypothetical-protein MQWLCKFIFIFLYFSLLPIQIAIPLGLITFFWQSSTKSGVNEKPKTAPERRELFDLLTFYFELRSNHKQWRVTPAEYQDLLTKIEARCKSLVHYHYIDEIEKNRRLTDAWQLLRPQQTPCWEQQATLETESPQTNTQHIDDLIKELDNTLAPVTLPPAVTLPASVVIPKPRVNPVVIKQTVATVKPRIVKPLPSPKTTPTTPSLINRLQVFTRQILLPFIWQNIGWFVGGFCFVSGSGLLVAYTDGFANGLAVLFCLALYTLLILWGAYQIRRQRPELLISHQVLNFLGIFLIPLNFAAAVRLFMTSDGNFALLAVATLCAVGLWGGFLFALKIASGSLERQSLKEYPRLFLFLAGLQFALPLVSSMNSWYFLAVLHILLLAGLSYAFLRFTQGWLKALFLDADLLTYFTVGSLLYAALISFVHLTVSSGLTLPVGYAGGLLMLVCVLLFYVDSCANRDEFKQTIINYFTFLIYALSVTAIVLSYSSAWFIPTLSLAIGLYAAMVWRYLTLSPLYLLLAASVVWYWQVVLVHFTPDEHFLASVPLFVALWQLYRLACRRESPRFIVITYRTLLVLLFSVLAWSLYYAHPSVIGLITSLSASLLIFLLSKGRNTSPYMKTLGFIGAVTLNGIYFPLLPTLTVSVQFTLLFLLLSLIWTVISLSKWLKPAYAPVWFMQAGILSGLISIFISLNTHDILLSLAVTSGFASLLLSIGWIVRVRAFFYSGLLFITGVVVVSKLLFFPQTNLLALLLVTLVLWWVTWGLQRLQQRLLVHDIHLEPLLFLGMPLARTADRFTLLIPPCQISTIILWGVGIFGLLHYLLLPLSILSTGSLLLVLEAVITLLMAGQTRQLWLLPAVLFWLGLVLVPIFSDVQPLVFCFFLACYALGAWLTALIGLQFFHPRLTQLLCWQGGYGQRGGYTRAMQWVFYSTLFLLIGVQGASLSYALLFPHLGDGVLTAIFILSTLYFVILGRYYRYIALSYAALLTITISLLSFIGLPTLFALDLAQVLTILLGIAVALVGVTYPLRLSPVFSDLYYKPLYYTATLLYAYVLLHALSLLVWQFPMTSIWLAYVFGGLVVAQLPIFQWLAKDALHWRGIFLPLQLLAIVLVLFPQGNEFAWLILPFVLLGLAYYGLPWFNRLFALWAIDPTITFMLSFFVLFALPVVNFLQTGQIAWQIMLTVAAYFWLLQQQSHAENNRSLFTHLLFLALFGTFYSLSVTLFVLTAPSIFALWALLLFGLLQLGYRIKECEVWLFLTLIMAIISLFLLAVSLPQQLITFSIISGIALTIGGQQRDTTWFNVGILGGLVALHLLWFFLPATTLWAVLPYYALQNAVLLCVLLTLFPMLKATEDNWFNQLKLEWLIPFITASTLVLWAVGLVANLLVNQPLFGVVDSGILFLTGGIFIALWQAYRVEPTEKFIGIVFLITILAIYSRMSLFGFSSLTLWDSVALMLAAYGSLFSRYFIQLKVLDRLNLLLPCIALVPLLTVSDSTAITLLLFTGAVYYFFLQNQMKTVLPLYLAMILLNIALYLWIPALAQQQHLVQLYVLPAAITVLIMTYIHTQELRTTINHNLRLLALTVLYTSATTDVFLRPELSFFILALGLSMGGIILGIALRTRAFLYAGIVFLMINVLGQLVQFYPEDRLSKAIILILLGGGITVSMIFFNLKREMLLQKIRIMRADLAEWR >NZ_CP012373.1|WP_062149394.1|963450_964125_-|phage-shock-protein-A MFSIFRRVNDILNANVNDLLDKVEDPERMIKQLIREMEEQIASAKDGVVHAIASEKQLLRELEQQKAQSAEWQNKAETALRAYKEDLARSALQRKTEIDNVIRNLEPAWQTAKTTSERLKNQLRQLENKVEETKRKQGALVARQRAAQARQQMGKTLDRFQQGLDTQSRFDRLEDRIGEMEAYSEAMAEVDDTQSELDKEFAKLESTQEVDTLMAELKIKIQQK >NZ_CP012373.1|WP_062149397.1|964590_965529_+|nucleoside-recognition-family-protein MEEIAALILKSGRAGVELALFVLLPVMVVMLTLMRLLEAENILDRIVNWITPIFRPLGIPGLGIFALIQTLFVSFAAPLATLAMMDKSGTSRRHIAATLAMVFTVAQANVTFPMATLGLHVGTTILVSLIAGLLSATVTYHVFARHLPNESEPPEPALNHPQAANVKGVLHVINRAGREAFEIAIASIPMLILALLLVNSLQAIGIMGWLETLLAPVFAWFNYPSASVLLIITKYIAGGTAMMGVSADALQHGTITIVEFNRMAGLLISPFDVAGVAILISAGPHVASVLKPAAYGAIVGTLIKMILHGLLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012373_3 | 1966217-1966399 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012373_3
>3.1|1966255|30|NZ_CP012373|PILER-CR GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGA >3.2|1966323|39|NZ_CP012373|PILER-CR AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGC >3.3|1966255|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGAGGG >3.4|1966323|42|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGCTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_3
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_3 >merge|NZ_CP012373|3|1966217-1966399|PILER-CR,CRISPRCasFinder TCATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAACGTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGAGGGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAACAAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGCTTGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC >NZ_CP012373|3|2|1966217-1966399|PILER-CR TCATTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGA GGGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGC TTGTTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC >NZ_CP012373|3|3|1966220-1966399|CRISPRCasFinder TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC GTACACTCGGTATATTCAGCGTCTGCTGGAGGG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC AAACCATATGGGAGTTTGAACAACGGACTGGTTACACGCTTG TTTCAATCGCCTGCATTGGCGAACCGGCTGTTAAC
>NZ_CP012373.1|WP_062151614.1|1964775_1966083_+|DUF58-domain-containing-protein MRPAPLLLWLLFGWLLFAICTSIFPRLLMLWAIMGGMLLIIALYDLLQLWMQTFPHVTRKAAGSLALGVWCDVELTIFSRYKADQQIEIIDDYPPQADIENLPQTLYLQANTGVATQYQFCPQQRGNLHFNGVHLLLHSSLHLWKRYYYQAIPQAIKVYPNFAAVTKYALFAIENRLGQLGIRKRPRRGEGLEFHQLREYRAGDSLRQINWNATSRLKKLISKEYQDERDQQIIFLIDCGRRMATQDGALSHFDHTLNAVLLLSYVALRQGDALGLLTFSGTESRWIAPRKGMNTVNLVLNTLYDLQPTLRTSDYLNAVEQLLKHHQKRALIILISNLRDEDNEELTIALKLLRAKHLVLLASLREKILNEVLDAPVMQFNDALRYAAIHEYLGHRSQSQENFKNKGVIFVDTEPEQLAIHIVNRYLDIKRGGIL >NZ_CP012373.1|WP_062151612.1|1964064_1964772_+|DUF3108-domain-containing-protein MFRFFILVLHLGCIAPLWADDAFPPPFTAHYTVYAKGVTVGEGTRRLYRQADGRYVFEAKSNTVGVAALFRDDVIEEKSIFDLINNNARPLEYIYSQQGSKKQKFIHIIFDWEKHTAQNIAPEKPWDIHIEDGVVDMMLYQIILMQELQAGKRDLQYAIVDKGEVKTYIPKYLGDDIIDTGLGELNALKYERLSENGKRKTTIWSAPKLHYLPVRVEHEERGDTFSLVLESVEGL >NZ_CP012373.1|WP_062151610.1|1962896_1963928_-|RNA-3'-terminal-phosphate-cyclase MLQTRYLSIDGSQGEGGGQVLRSSLALSIYTQQAFHIHHIRAKRKNPGLQAQHLTAVRAAKMVSNAHVEGDVIGSGELWFTPNLAQGGRYRFNIGTAGSTTLVLQTVLYPLLLAEHPSHLVLSGGTHNTAAPPFEYLTTVLFPLLQKMGCQVTATLDNYGFYPKGGGQITVDIQPTRVLQGLTLLQRGELLQQEAQALITGIPAHVAERELAQVKKKLRWADSCLKFMPVASGYGTGNILLLFLHYAQVSELFSGVAQRGLKAEAVAEHAIVALQAYQAADVPVGEHLADQLLLPLAFAGKGQFLTVAPSQHTLTHCEIIQQFLGLKIQIEQVTSSQYLITVG >NZ_CP012373.1|WP_062151607.1|1956352_1962820_+|ExeM/NucH-family-extracellular-endonuclease MRRTQYPDSWVIKIRQYITSFSIYTLIIFGFLAQSAMAAPKLLISGYLANPQSTDSPYEYVQLIAVENIDFSVTPHAVVFTNNGTATSNGWVAGGALTYGFNLTTGTLNAGDIVYVGGSGKLINGSGSTDISSATWLNAINTATTAGNSFGTAASSGVLGNGGGNADGIAIFDVAVSSITASTVPVDAVFFGTGVGSAKPATGGYTLPTNDLYDNAQGTFGNGTNTFIFSDPAGSGFTKLTGVYNTNTATWTTARTGSSITLSTSSVLSDITTAITLATTDTAPTVISSVPSDSATNVATSSTITLNFDEPVDLTAAAVTVECPTATAQSFTGLPANNVSTVILTPSTTLPNTTSCTVTVIAGQVTDKDGTADNMATNQIISFTTIAAPVGTAPSISFGTNTDDYIDGGVSIAPASPFAITAALNDSTDAVKNAGIDFIIADSDGIATTSVTASSSNSSVVPNTNLTIAGSGTAAVNVKINPVGVGYSTITVTVSDGTNMADYVLNYAVSAASTTPTTTRFHSGKADASSAIAIDTDYMLVADDEDQTIRLYNRANSGLPVASFDFTSSLGLSGSSEVDIEASTRVGNSLYWLGSHSNNSSGNDKPNRERLFTTTLSGTGTTATLTFEHYYKYLEDDLIAWDSSNAHGLGANFFGLSASAAAGVIPETTGGFNIEGFSIAPNSTDTVYLAFRAPIVPTNTRTKALIIPVTNFTTLGDASGGVSGSATFGAPIQLELGGRGIRSMECNTAGCLLIAGSADGTGNFKLYTWSGNALDTPDERSTNLPIITDGSYETIVALPTGATLTAWDNQDVQFLIDTGDMIYYADGTIAKDLPNSNHKKFRSEIVNLGTPPVISKIHTLQGNGAATSLTGTQVIEGIVVGDFQGSTEGKGFYVQEEDADIDADVTTSEGIFVYCNTCTTAVSVGDKVRVTGTISEYSNQTQLGGTLSINVLSTGNSLPSASTVTLPVPSAIAGVDYLERFEGMLVIFSQTLYVSSNYTLGRYGEILLSANGRLSQPTNVTTPGVNASTLQAQNLLNQITLDDGLTSQNPDPAPHGLSASHSIRGGDTVTGLSGILNYNYNLYRVQPTASVSFIASNPRTATPTSVGGTVKVASFNVLNYFNTFTACTLGVGGTANNDNCRGATDATEFARQRAKTIAAIQAINADIVGIMEMENDGYDASSALQDLVNGLNSAMGADTYSFIDPDTALSTVNVMGTDAIKVALIYKSAVVTPAGAAMTSTDAIFDRRPLAQTFQVGIEKFTVIVNHFKSKGSCPTTGTDTANEDSGDGQSCWNAKRQTQATTLLNFIDNTVKVNSGDDDILIIGDLNSYAEEDPITLIKAAGYTNLVTEHSGVNAYGYQYDGLWGYLDHALSSASLTPQINGVTDWHINADEPISLDYNTEYKSAGQLTSLYAADGYRSSDHDPVVIGLTPTVAYQLSLTTTGTGTGTISSSGTPAGTSCGTNCLTYVSTSTVNLQATPTGGASFSGWSCTPTFVSGNTLTANTICAATFTAAVVTPVTPPTSGDYSLAIKVVGTGSGTISGTSAGNYPSGTRISLTALANADSDFIGWSPSTCAATFVLDVNTTCTATFDLKVIPQQYTLSLTTTGTGSGVISGANAGTYPSGTLINLSAIANSDSQFIAWNNALCASPFNLTADTVCIAQFESNPVTPPPPTTLSYTLYLQTTGTGTGMINGTGAGMYPNETLINLNAIANSDSQFITWNNALCASPFTLTADTNCIAQFDKLLPTTPLTYTLTVTPSPFGTVQMASVTCPDDCSVIVDSGTILSLNAIANTGYQFIHWTGDASCGQTVNMTTNIHCEAVFMPITTTTATTPLCPLTGTVNTLCNAQLREITQALTVLPQGNISNLVIATTVLNQGWLSNILVKTTGRITGGILTGYVHNQGILTDIDFKGGYLQGGILAGVILNSSLVDGYIANVRFMENATLTGGILQGRIYGNPNAPAMLNNVRIKTGSHLSGVILGENVIVEDNVIIDKNIILPRLDTLTAYDATGKVITVDSQFVGGISVLNQAYVIKTTQKLADTVNIRGRIFVAPEHVGKTADLFVYSPYWYADNRFISYFMTDSKGQIFAWDEKPLNLIPFKQSVVLEPIQEMDLYTGHFVAIGTLKVVFGYRLSDGTLVMHNEPSTIHIEIQP >NZ_CP012373.1|WP_083991470.1|1955522_1956146_+|GTP-cyclohydrolase-I-FolE MSQETPENKKSQYIVGENAVENLTTMYRNIIVNVGENVERDGLLKTPERAAKAILRLTSGYQQNLNAIVNDALFESDSDQVVLVRDIEFYSLCEHHLLPFFGKCHVGYLPCGKVLGLSKVARIVDMFSRRLQIQEQLTHQVALAIQECTGAYGVGVVMDARHMCMIMRGVEKQSSSTTTSAMLGTFRQNPAARAEFLSLIASSNSSL >NZ_CP012373.1|WP_062151604.1|1954714_1955329_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MEKLAIVVLISGRGSNLQAIIDAADPLVDIRAVISNRPHAQGLHIATQAGIPCEIIDHTQFANRDTFDTALQNCIDHYQAQLVVLAGFMRILTPDFIQHYAGRLINIHPSLLPAFKGLHTHRQALQAGVTEHGATVHFVTPELDSGAPILQGRVPVYPDDTEEQLAQRVLDIEHQIYPQVIHWFAEQRLYLQAQTAYLDNKPIN >NZ_CP012373.1|WP_062151601.1|1953671_1954715_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MKNQTSLTYRDAGVDIDNGDALVERIKPIARRTHRPEMLGGLGGFGALFEIPLDRYRQPVLVSGTDGVGTKLKLAMQLGKHDTIGIDLVAMCVNDVLTSGAEPLFFLDYYATGALDVETATHVISGIGKGCELAGAALVGGETAEMPGMYHGEDYDLAGFCVAVVEKAKIIDGSQVQAGDALIGLASSGVHSNGYSLVRKLLALSNADVHQDFYGRTLGATLLEPTRIYVKPLLQLIRTLPVHALAHITGGGLTGNVPRVIPEGLCARINTNSWHRPPIFDWLQTQGNITDEEMYRTFNCGIGMIVCVAQTDLDATMQCLHDAGETVWHIGEIVTDPQQTIVLHAGT >NZ_CP012373.1|WP_062151598.1|1951827_1953147_-|hypothetical-protein MTHKKHSAVLSIAGILLFSMICLSTIHGLTGFVSPLGAGICAWLAGILLFKRVSRQQKYQVWIILTIGFICMFFSLSQGKTAVLVAAVSINQAVLAMLAAVGFLRLVTQPRLHKHETLPTGKAALLRTLYGVHLFGFFINMSVLVIMGDRLAAHQTGLSRQQAIILSRAFAMAVLWSPFFAAMAVIYLYIPHINFLLLMAMGLPLALCGLWLTGHELVSEAESQHFVGYPMHFASLWVPSLLAVCVVLVHFLFPQLPVLTLITLLPIVLVVIVLSLQQGLPATFHQIFMHITHNLPTMSGELLLFLAAGVMAAGISSVLQITMIQLPLSHFGLLEATLLLFVILLIALIGVHPLISITTLSSLFLPIPHDPNLLGMTFLMGWGLGVSGTPFSAMHLMMQGRFHLSSYLITRWNIRFTLKMIALSLVVLYCYDLVSYYFI >NZ_CP012373.1|WP_062151595.1|1950884_1951805_+|hydroxymethylglutaryl-CoA-lyase MSLPTFVKLVEVGARDGLQNESQFVPTAQKIEFINRLSATGLSVIEVTSFVSPKWVPQMRDNTAVLTGITHQQGISYPVLTPNLQGFDMAVAAGATDVAIFAAASESFSQKNINCSIQESLARFNPLCQRAQQENIRVRGYVSCVLGCPYEGTISPQAVAEVATRLYDMGCYEISLGDTIGTGTPTKACQMLEAVATQIPLSQLAAHFHDTYGQALANLYAALTMGISVIDSSVAGLGGCPYAKGASGNVATEDVLYMLNGLGIETGVNLTALCQAGQFISHYLQRPSRAKVATALCITDYPNQNA >NZ_CP012373.1|WP_083991469.1|1947076_1950874_+|PAS-domain-S-box-protein MTRMSFFTVFTSPPTRRHLLAFQTLLFLLLSTSWLLSFIHWEQPYQWLMITCLSSVIALHLLLGYWIRQEHGNTHILKLIQQDTLDTLFESENRFQAIFENAPIGVTLVDNKTHHFLQANNAICQMLGYSREELLSKTIFDITHPEDIELNRQLFETISPPHPIIIGEKRYLHKTGHTIWAAISSSLPPNSSYRITHIQDITERKQAEVALRESENRFRKAFENAPIGMTLTGLDRLIQQANNSFCMMLGYPANRVIGKNEADFTHAEDNNGGQQWVMQVLEYSISPHPLEKRYVHRDGHIVWAAISSTLQRDINGKPVYLITQVVNITEQKKAEAEIKRLNIELEQRVARRTAELSLISQILSLFIRSNESPLVFETMLQRILELTESEFGFIADVVYDTIGQPYLKCHAIGYLIKQNELSAHFQPLALAGHQIRKLDNPLGLVIQQGERMIINEYATEADEFPRHYPPVHNFLGLPLYRGEHLIGMLGLHNRITNYSEELADSLEPIISTFSQLIEAFHNEQKRQRAEEALRKNQQFLQTLIDSLPVAVFVRDIRDCGFEFVAWNKACEQFFGFNAETVLGKMAHDCMPITLANKLTQSDEIVLDYGQALEIAETQIDSPNLGHRILQPVKVPIFDEQHNPLYILCIAEDITIRKHAEESIAQKTAILEATLENMGQGILMVDKQWRLVAYNQRVIELLKFPAEFLKHRPNFAEIVRNWNEHHGIKEHLLQDTELNTQQMDSFTIEMPIIGDRVIEMGHFPIVDGGFVRTFTDITEHKQIEESLRQAKNQAEAANRAKSAFLANMSHELRTPMNAILGFSQLMQRDPHITPNLQENLEIINRSGEHLLALINDVLAMSKIEAGRMMLNEQNFDLYHLLDGLHDLFHLQAINKDLNVIFQIADNIPHYIRTDENKLRQVLINLLGNAIKFTNQGDITLTVSHVNAPATNNKARLHFQVKDTGPGIAKHEITHLFKAFGQTSTGQQAQEGTGLGLRISQEFVRLMEGEITVESWLGQGTIFSFEINVTLIDASDVPFKETTRRIIGLAPEQPVYRLLVVEDRWENRELICRLLEPLGFAVQKAANGQEAVAIWAKWQPHLIWMDIRMPVMDGVAATRSIKARKTAQQTIIIALTAGAFEEERAAMLEAGCDDFVTKPFREEIIFEKLAQYLGVKYRYAEQGVTPSRDNQATTAQLGTLYDLPVMMQAALQDALYSVDLDQLDTLLTTLNDTHPQLSTVLRECIDNFEYERVLAVLKTPLPDSLPR >NZ_CP012373.1|WP_062151616.1|1966832_1968128_-|adenylosuccinate-synthase MGKNVVVIGTQWGDEGKGKIVDLLTDRAAAVIRFQGGHNAGHTLVIDGKKTVLHLIPSGILRDKVLCLIGNGVVLSLQALMEEVEFLEKSGIPVRERLRISDAAPLLMPYHVALDQAREKARGESKIGTTGRGIGPAYEDKVARRALRVSDLFHRERFAAKLGEVLDYHNFALQHYYKVPVIDFQKTLDETLALADKIAPMVMDVTSLVGQLQKDGKNIMLEGAQGTMLDIDQGTYPFVTSSNTTAGGAATGSGIGPKDLHYILGITKAYSTRVGAGPFPTELFDEIGEYLTKQGNEFGATTGRRRRCGWFDATALRRAKLINSLTGVCITKLDVLDGLDSVRIGIGYRCNGQELYLAPTGADAIANCEPIYIDMPGWKESTIGIRRYEDLPANAKAYLEKLEELIEVPIAMISTGAERNDTIIKQHPFDL >NZ_CP012373.1|WP_062151618.1|1968325_1969498_-|ATP-phosphoribosyltransferase-regulatory-subunit MNHQDRWLLPAGITDALPEEAAHLEHLRRTLLDLYTTWGYELIIPPMIEYLDSLLVGAGHDLDLQTFKLIDQLNGRLMGIRADMTPQAARIDAHRLKREIPSRLCYLGTVLHTRPTGFTGTRSLLQVGVELYGHAGIESDAEILSLLLTTLKTTGVQAFHVDVGHVGIYRALVEQAHLNSEQESQLFAAIQRKSRTEIHDLLTIWQVSPLLQQQLTALIELNGDVSILAEARQALAPAPAEVLEALNSLEQLNKHLSNFTLHFDLAELRGYNYYTGLVFAAYVPEHGQAIALGGRYDNIGKAFGNARPATGFSTDLRILAELTTIPPIRKTAIFAPAGLDAALQTHIQQLRQVGENVIQALPNQQGDALAMGCNRELCWQAGQWQVRNID >NZ_CP012373.1|WP_062155421.1|1969497_1969683_-|DUF2065-domain-containing-protein MWTEFGIAFALLMVIEGMTPFLNPSRFRQTLRAVAELNDKTLRMMGFVSMLFGLLLLYLIH >NZ_CP012373.1|WP_062151620.1|1969816_1970701_-|protease-modulator-HflC MLQNKMVLGVISIVVLLIMMMSLFYVQETEKALKLQFGRVVKADYSPGLHFKIPFFQTIRKFDGRIQSFDSNPQHFLTGEQKNLIVDSFIKWRITDTEAYLKSVGGNPINAGRRLSEFIADGLRSEFGKRTIQEVVSGDRAKIMDIITAEANRRGSEFGIEVVDVRIKQINLPDDVSTSVYQRMDAAREQVAKELRSRGEAAAVRIRAEADRENMEIISKAERDAEQIRGEGDATATEIYARAFNRNVDFYTLTRSLNAYREVFNSKDDVLVIEPNSDFFKFFKGLDPIIAPKE >NZ_CP012373.1|WP_062151621.1|1970700_1971903_-|FtsH-protease-activity-modulator-HflK MAWNEPGNNGNKDPWGHRKNEQGPPDLDEILKKIQDKLNSLFGGGSGGSGMGNMGDMGKGLSWSLLAMIAVGLLFLWSMFGWYVVQPAEQGVETRFGRYINTTTQGLNWHFPYPIESVQKVNVEQVRAITHRALMLTQDENIVDIELVVQYRVANARDYLFNVNDPDGTLQQATESSLREVVGTSEMEKVLTSERDKVTLKTKDLIQVIIDRYKTGLVVISVNMQNAQPPTAVQAAFADVIKAREDEERDKNRAQAYANGVLQRATGQSELLRQEAQAYKAVVIARAEGQTQRFLSILTEYEKAPEITRKRLYIETIESVLSNSTKVMVDVKGGNNVMLLPLDKLFAGRTVTTVPTDTTQPAVPSATALPPFTVFPQSSTLQPIERPSRDDNRTTTRGNP >NZ_CP012373.1|WP_145917075.1|1972054_1972360_-|hypothetical-protein MGRFRKAINTIFGIAILGGISYYTYNFASAESRIRAVCAEIQQGMTTKELQAFALTHGLSSFKLKESGINYVVETKTYGRFGCKVITESGFIKESEYNFAD >NZ_CP012373.1|WP_062151631.1|1972473_1972689_-|hypothetical-protein MKDKYDFSNAEQGKFYRPLEELDIPIYLDNEVKAFFIQKLRARAKDQSFSLNEMINALLKKDIEISIQLIS >NZ_CP012373.1|WP_062151634.1|1973017_1974322_-|GTPase-HflX MFERPRTGERALLVHITIHQFTEQASLEEFTELASSAGAIPILQITGTRPMPDPALFVGKGKLQEILDAIKANDIEIVLFNHSLSPIQERNLEKALQCRVLDRTGLILDIFAQRARSFEGKLQVELAQLQHLSTRLIRGWTHLERQKGGIGLRGPGETQLELDRRLIAGRIKNIHKRLEKVNQQREISRRARQRAEIPVISLVGYTNAGKSTLFNRLTNANVYAANQLFATLDATLRRIDLPDKTPLILADTVGFIQQLPHDLVAAFRATLDETRLATLLLHVVDASDPERQDRISQVNQVLTDIEARHVSQILVYNKVDKLGDEQPHVERDESGRICKVWLSAVTGAGIDLLFMALSEQLHEINIQQWVCVPANNGQLRSRLYQISTVLEEEHAENGDSLLKIQLLPKTLTQLLESEKDLQVVDEPTGLPKAS >NZ_CP012373.1|WP_002683997.1|1974408_1974654_-|RNA-chaperone-Hfq MSKGQSLQDPFLNALRKERVPVSIYLVNGIKLQGQIESFDQFVVLLKNAVSQMVYKHAISTIVPARNVKIPHEDLMQDENG >NZ_CP012373.1|WP_062151637.1|1974726_1975686_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MNEIPCIFLMGPTAAGKTDLAVAIIQQFPCEIISVDSALVYRGMDIGTAKPTADILSIAPHHLIDICDPLEAYSTARFCKEALAHIQHIQAKGKIPLLVGGTGLYFRSLQQGLSDLPPADACVRERLNQELETFGLAALHARLAQVDPVAAQRIHPNDPQRIQRALEVYEISGVSMTEWYANTEKAWSLPHVLKFVIAPAQREVLHAKIAKRFKLMLEQGLVNEVETLFKRGDLHLSLPAMRAVGYRQVWQYLAGELDYAGMVEQSITATRQLAKRQLTWLRAEADATWFDSQQTDMTEHVLKRLVKIPMLSQSTSIIK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012373_4 | 2230950-2231105 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012373_4
>4.1|2230980|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder GACAAGGTCAGCTTGGGCAATGGCAAGGTCTGC >4.2|2231043|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder AGTTAGTTCGGCTTGAACAGTAGTCAATTCGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_4
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_4 >merge|NZ_CP012373|4|2230950-2231105|CRISPRCasFinder TTGAGCGGTTGTTAGTTCGGCTTGAACAGTGACAAGGTCAGCTTGGGCAATGGCAAGGTCTGCCTGAGCCGTTGCAAGGTCTGCTTGAGCGGTAGTTAGTTCGGCTTGAACAGTAGTCAATTCGGCTTGGACTGTTGCGAGTTCCGCTTGAACCGT >NZ_CP012373|4|4|2230950-2231105|CRISPRCasFinder TTGAGCGGTTGTTAGTTCGGCTTGAACAGT GACAAGGTCAGCTTGGGCAATGGCAAGGTCTGC CTGAGCCGTTGCAAGGTCTGCTTGAGCGGT AGTTAGTTCGGCTTGAACAGTAGTCAATTCGGC TTGGACTGTTGCGAGTTCCGCTTGAACCGT
>NZ_CP012373.1|WP_062152166.1|2229873_2230539_-|formylglycine-generating-enzyme-family-protein MGKFLAGDLLGGGDPDEKPVHSVTITSDFYMSQYEITFAQYDLFCDATGREKPSDEGWGRDNRPVINVSWQDATDYSRWLSELTGKRYRLPTEAEWEYAARGGTKTAYWWGDEVKPNMANCIDCGDEFVNQTAPVGSFPANPYGLYDMTGNVWEWTRDWYASYSREPKTDPYGPIIGSHRVIRGNSWEDNARRSRSSFRGYHEPEKKTAYLGFRLIIEMEQ >NZ_CP012373.1|WP_062152164.1|2229159_2229702_+|ATP-dependent-protease-subunit-HslV MEQFDGTTILSVRRNGQVVIGGDGQVTFGNTKLKGNARKVRRLYQNKIIAGFAGGTADAFTLFERFEAKLEKHQGNLTRSAVELAKDWRTDRMLRRLEAMLAVADHTASLIISGNGDVVEPEMGLMSIGSGSMFAQSAARALLENTELSAAEIVEKSLHIAADICIYTNHNLTIEILNAV >NZ_CP012373.1|WP_062152162.1|2227189_2229097_+|M48-family-metallopeptidase MLKVDFFGQQDQAQQKTRWLILYFIIALFVIIGFINLTFFLVGKFISLHHYQLSQWLQSPASHWVIGITLMVILGGTIRRLYQLREGGEALAIMIGATPIEPDTYREEERRLMNVVEEMAIAAGIPVPALYVLQMEHGINSFVAGYHASDVTLVVTRGALEQLDRRELQGVIGHEFSHILQGDMRLNLHLIGILAGILAIGQMGFYLLTGGTYQYEDRLNRNLRDLNIFPFALPFSILLISLGYIGLFCGRVIKSAISRQREFLADAAAVQYTRDPACLVGALLKIKGHRIGSKLYNYRAEEVSHLCFGSAFNLSRLLATHPTLDERITRIDRAYPYRLKYGKLGEQTASQQTAPLSEEYLSFQSTPTVRPPTTKTTVVASIGNPTPEHLAYATKIYQQIPKNILTLVHQQTGAKIITYALLFQGKVADKQAREIVLNTAESTEITQQVIALRQQLDTLGNQVRVPLLDLALPALKKLPYVERTTYLTIINDLIKADGKVSLFEYVLETILRHHLDTHTMRTSTVSYKNLAEALPDISLILSLLAHVGSGQSAYTIALKTLTTQPLPFASIVACKPEKLNGAINRLKYLTPQLKKSVIDACVTCVLADKQVETAELEVLRAVVESLDCPMPPLIG >NZ_CP012373.1|WP_062152160.1|2224367_2226986_+|hypothetical-protein MCVFKQHSNSCVWTDYAFYLLFFIGLSFTFPAQAADTTLPQLEGASGLDTTGESFSPNVIFSGGNAVAGQSYQTTVTQSLNAVADVKATIQVDPTHIGEKADIFVFAVTTLSVSTDVYYFMLGEGLYIDLWDQYTNTIVPFIPNVTLTATQSLSLYQGKFFYPGKLDIYFGYRLLDGTFIYNYQPISITITDTTTEPTPDPDPSTDAINGIPALTSYAFKSEQSKTIQGTSTENATGFNCSGTIKATDQIGRLALVSLFYQNGCYTDGTYNNNNYLVEKGTLNSSTQQQFEAYQIHEPSSKAQAFLASEHAIYYQFPTQEDYTVYSFNNNGLVKVADIAASAITLNEFTPIKSLTVSKVSGSVIYVFIPATQRISPFTALSTNVEAAHLTTTALGTPFKYRYNVNGLPFDTKQGFPYSPSDHANIYAQPRQFFFVRKTNGQIGIVWQNQADHSIQLTWLSNDLQSYTTITLNNNGMDLAVATGDDEGFIYYLTIQSGNGAQTDSSRVATLYKSNENGVLSTSLALDTAKTGLNIVSFDTDNVASLRYAQGKLGLIIGRLMHTSNDGLNHQGAIAVTFDANTLALLKNFGQTSGHSFENILTTNSQNEFVGVDLGDNYPRGINLHKFTDSRIDSRVIYTFKTQHGTTATSPAGKSYPLYSEISDSSHTYYKWSNDNNTYSELGGVIEGQQGYTVIFAGEKSPTGVSLDNSRVGSYLNDPRNLGIVQVIHDFASITPNTDNEVPEGLILTDGLTETGGFYTFNGTWSPQRNTGVVWLTNYQDKTQANVSRLKSVKLNDGNILLLWELWTDSQYVNTYMLKISEQGQKRSDIIALGTEVRLNRTDDILVNDNTVYIVNGNKSEKKLELIALPLTN >NZ_CP012373.1|WP_062152158.1|2221257_2223969_-|response-regulator MSNIIHFAQQTTNRILAVFPLRVVLIVPFLAQLIITVGLVAWLSFANGQKAVQELSQALRSEITQKIQQNLADYLSVPFYVVKNNLALLNQHFLTASDLTKWEKLFREQIYTYKTINSIALANEQKEFVAIRRIEASKLSFALSNEKTNFNLINYDYYTNQEIARSDNFDPRSRSWYKNPVKYNGLRWSDIFIALDTTALQLTVGVPITNVQAQLSGVIASTLRLTYISDFLKNLKIGKTGQTFIIERNGMLVASSTGENLFKKEDNTTKRMAVTESTNALTRYIADVLLQRFTQLSTIQTEQQIDFVWSDARYFLQVTPYQDDYGLDWLIVVLIPEADFMAQIHTNTRVTFVLSLLALIIAIFVGLLTARWVIKPILELNHAAQNLANGQWQAQSLLQTQRQDELGQLANSFQRMADQLYISFKNLENEVVARTQAQASAEAANRAKSTFLATMSHELRTPLNGILGYTQILEDDENLTLEQQEGIKTIQRSGEYLLTLINDILDLTKIEANRLELYPSSFKLKQFLEELVIFFKTNAQQKNVTFLYEALTLLPRFICTDEKRLRQVLINLLSNAVKFTARGGITFRVSYLDEKLCFQIEDTGVGISPEDLIHICESFKQVGDPKYRPDGTGLGLSITKRLLALLGGELLINSELGKGSCFSFCLHLSEIVELEKPTETPLAIGYTGTPRKILVIDDHWENRALLNSLLKPLGFEMIEAVNGADGLEKAKYYIPDLIVTDFVMPVMDGFEVVRQLRKIPALKNIPIIADSMSLLDYPQNTVSNIEINAFLPKPIKIEILLAILEKQLALTWIYKKPQGILSENVEQNATQYIDKTIILPSPTMLRSLHELATMGHINGIFKQLNHLETMDKQFSPFVKQIHVLAKGFQLDEICALIEQYLQQ >NZ_CP012373.1|WP_062152156.1|2220362_2221178_-|hypothetical-protein MQVERKKSFVEKLLTFLSRLKGYKSPLFIVYQPHSFLIKGKDTQEVMHLIKPGDILLRTYNNYLDKYFVKGTFTHAGLYLGEVTENHLRQIAKVDKPERYATGTQMVIHALADTVILEDLIQFCRCDALAILRFPQQLVLQKGRIPPDTVLNYLTEYAKVEAKSHQAAVLKAEIDIMTRLAQGDSLHFDTLFKIIYRVALSELITPHPADFGFDNFSPLSCTELIYFATKSICWNYDIEPTKQKIFFQQRRVIEADTFTNTDLEEVWKKVG >NZ_CP012373.1|WP_062152154.1|2219546_2220359_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MTETANDSLVKVRGLRFSRGKHLIFDNVDMDIPRGKITAIMGPSGTGKTTLLSLIGRQLRPQAGTIEVNGLDINKLSLNELYKIRKQMGMLFQSGALLTDLTVFENVAFPLREHTQLSEALIRNLVLMKLQAVGLRNARALMPSQLSGGMARRVALARALVLDPTMIMYDEPFTGQDPISMGVLVRLISSINKSLGVTSLIVSHDIHETASIADKIYIIANGKVVGEGHPDELRQSSSAWVRQFINAEPDGPVPFHYQGMDYETDLLGDK >NZ_CP012373.1|WP_062152152.1|2218746_2219529_-|lipid-asymmetry-maintenance-ABC-transporter-permease-subunit-MlaE MLDQFQQIGSQTLALFERLGRSVLFMLHLLSGLPSLLLRPRLVVMQLYSVGVLSLSLILVSGLFVGMVLGLQGYNILVNFNATEMLGVMVSLSLLRELGSVLTAILFAGRAGSALTAEIGLMKATEQLAAMEMMAVNPYHRVMAPRFVAGVLAMPLLAAMFNMIGIFGGHLVVVNLLGVDSGSYWSQMQSTVELYDDIFNGLLKSFVFGIAVTWIAVFEGYDCLPTSEGVSRATTRTVVYSALATLALDFMLTAIMFSDV >NZ_CP012373.1|WP_062152148.1|2218354_2218747_-|hypothetical-protein MAKKTIITTCPCGSGQVLQRCCEPYLQRQDYPLTAEALMRSRYTAYVLGNVDYLQTTWHPNTRPATLILDDSCRWVALEVVKTQAGKATDIQGTVHFRAYYKLATGRGGRLEEISQFERIDQQWFYLMGE >NZ_CP012373.1|WP_062152146.1|2214464_2218145_-|PAS-domain-S-box-protein MAVNNPRHSRFFWRSSAMFGILDMECQFKEVNAAWEKTLGLSTGQLLAKTFFAFVHQEDQPSTKYYFEQLEKGMASVSFACRFRHHDGTYRQILWEINGAASQEYAYHAVGMDITGREQPMIADEILSVLQEGVVLQYANGTIGACNPSAEQIIGLPAEQMMGWTLIDPDWRAIHEDGSPFPTETHPAICTLRTGQAYSDVVMGVVKSDESIFWLRVNSYPLWRDDVTTPYAVVISFSDISHYKENELTIRKEIQKRSSSPETVTDNNYELWDWNLDSNEVYFSSRWKKMLGFEEAELPNHIDTWHQRIHPSDYKKVMADIQNHLEGVTPVCENTHRLQHKDGSYRWILSRAVLVRDANGKPQRMVGTHIDVTETRRVEEELQETEKKYRQLLEVENNAVFMIDAESTGILELNKAAVQMYGYGRNDLLKMKTLDLSAQPEKTAKSIKKGLKYTSQQYHKKEDGTVFPVEVTANPFIWRGKQVLMLIVHDISERQKIETALWESESKYRQLFEASSNPTIVFDANTQQIFDVNHAAVDLYGFSKEDWLRLKTEEVSAESMKQRSAFGGGTTKKVQTIPLRWHRKKDGTVFPVEISTGNTYLFQGRSLICATVRDITERKAAEEALRKERDFINMLVQASPAFFFALEPDGKIRLMNKAMLNALGYVLDEVAGKEYLTFVPESERGIVATEFDTLRKSMQPSLLESHVISKSGVPLLVEWHSRAIVKANGALDYIFGVGIDVTERKKAQGHLRLFKSIIESSAEAIFVSNPEGQVVYVNPAHEKLLGYSTKDSRQMNYRTYYSDSSLMVWESDVVPALEEGGSWEGELEVHTQEGQLFPVWERVDAVRDTGGNILFSFGLLHDISEQQRTRDTLYKQAEENHVILNTIPAFIWYRDRENQLVRQNLLADTTFGTGNPLVMQLTDGKDVLRNGLAQFGIIQTYPTKTGDAVRLKIDKLPYHDGLGRVSGVIVYAIQLQDNMSLSANKPTDESVYEALQKLPFMLMAFDKERTLMVWNEMCTTITGYSGEEMVGDPAALKQLYPSIDQLEDILFSTSNQASFHWESLLTAKDGQLKNVVWYDLAKYFALPKWFTWYLGYEIPLDSYDDDALHDDDVMLSAVFDASKLGLCLTDDRGRFLRVNRTYAEFYGYRQDELLGQPFTLVLPSNTHSEAVREYYSLLMTNEQAIMYRQRNEQHRTGAIFETNVMASRVILNDKRRLLLSVVNKVI >NZ_CP012373.1|WP_062152170.1|2232061_2233783_-|hypothetical-protein MSITPAPPTNSSVNNAYYWHFTSDGEMVEAVSLPLFLSLTTTPTGYALSGTPYQVGSHVIELLVGGIAYSYTLLVEMPSSEQALVTIPATDTAVLLVQLNYFNPQTSVVERHFIATAPYISKPTDARANTSFYECIVNKPTVSRELSGAFDGIIKTNTDALTVKNFANERDDWLMQSFGMRRYRMWVGSKNQALDTLTQIAYGYIAREGITTSGETQLSIPFRDATEILDNPLQTNTYTQTHIKNQIYPDVFGTVFNIEPICIDTALLIYQFHSGSSNALTAVRDGGIGLTLGIDYTDVDLQNSTFRLIQPVKYRLTCDVQGATWNGQFVQTVGDIINYVLVNRLPELELVNLAEFNYLCPQPVGIYIKEKMTFKTLFNKLLSSIGAFAITDNEGRLSLKRFGDVTGNPVINIPKNDIVQGSMELAKRIPPVASLRLGYKKNYTVQADSFAEDLTEAERQPFKQEWLIAQTSNTGIEEQWREATLLESTGDITETCLVNELDAFAEASRRTVMYSRMRDVFKFKVYFNASLLPIGSEITIAYNRFGLAVATNVIVLSISAPLIGGSSEIGVLR >NZ_CP012373.1|WP_062152172.1|2233784_2234693_-|hypothetical-protein MRTKYTYSASATLAHVHADIIAILTGETDVNNLSASCNKASSSILTTISTAGWSVHDSSTGTTNKTIIKAPHADNASNYKYVEIYSQTSSLTVTLWEAWNETTNAGTNQSTAVTQPLNLTSGGSVYIWANPRYLVMASEIGASWGNSQNSGVVPIFELSRGQPWNTTSYPSFCLVNFYYTIYSNTAATYIPKAVDNNGNTVTGTNANCYIGSIAALIYLNVPSGATARVPDGSGGFTTPFYPLYLHNPSKYAAPVGQITSICDIWLAPSSLFSNLATIDKEGVTYEAVLIYSTGYHLLIPKG >NZ_CP012373.1|WP_062152174.1|2234692_2235484_-|hypothetical-protein MYLSLSLSSTATNATVLDAIRLALTGTTTLIGLGSACDMANSELLTDVSAGWTLVDSGTGFIVLSAPQETGTAIKFVRIRLISNSLSIDGMEAWNSTTVSGTNVTTAASISLAMPTVNQLNKLVLFSSNRFVAMQSTQNGVVSTLIYACEYTPIYPASLDKVRLLVSGRCVTQFNQDTQILLYNYSATVQTLDADFATTSTGQDTSGNLYAPAYPQFVNPASGGFVLGKLFGLLKTIALSQMEVTLNADSYAVIDTTTLIRKG >NZ_CP012373.1|WP_062152176.1|2235483_2243919_-|tape-measure-protein MSTVTVTVKILADGSALVGTTRLTREELAKLSGGMDYAKTAAGSLDNSFSRLANTLKGVVAAAVGLSVIKQVGSDFVQTIAETQQLNSRLLSLTGTLEGLAEAQDYASNAANKLNTDLQAFKASYASTLVLQQAGLMTTREARALIEGISQVAANIGASSDQVKTAMYGIAQSLGSGVLQMQELMQVAEPLPGILNSVARAAGVTVGQFRQMVSDGKITSEMYKNYLLKAVKEYDGAAQASAKNLIPAYTRLNNAYTEFKNAFEKPISDTLTPLMQNATSALKTMTGYAPQIIGAFSPVVNILGVGGGLYLGMKGLPVVVGGATTAFTTLSRAMYVLTVATSTAIVPTSRLDMALLALRANLAAQTTLLGKTSVLWGTLNTSLYGTAVAAQFASGWMGKLQVAGGLLFAAYAGWEIGSYLYEQFDIAKTGGMFFVSTTLQGWEYLKQGGDNLVGRLSKGWGIMGEAFKSPIQAIQTMFFTTIGAMTDTFIGFIQTVVSIGEYIPAVGDQFTQLNGYLESIKTSSNTTFAELSTTDFATNITKNNAEIDASLADLNKGYADNITQIQKLADEQAVSVVVGNQKVTQLDEEKRNLAEITKMETERTEGHKKQLEAIKTSMAEQLRLSTLNEKQAGAEQTVTELLKNQKFQATEEEKQSLISLQLQIEGNKETRKKAAQVEEQAIKQQADTLKKYVDTAKEAYAEIAQAGLNAQQKTQYEATDKYGNDLGLLVSQAQQAGEAITLLRDKRLELQKVGLSETQQKELDLTQQYNSELAKQVIEIDRLVVSQTALIEAQQGYDASGLTKQAREYLDLMKQVGEETAKQVITLNNQATAKSTGVDRIASLQEEITLLQLTEKERAQYNALVDIAPDQRDAVKSLLEQKAVLENTQKQWETMTNSAADYAEKVATGELKIGDAVKGFIVDINKQNIKDQLTKLKEQITSFFNGDSGKVTLEGALGIADAQTAKDVSAASKIFETYQESLKTGTDDSVKRMIDGVNTGIANLQKGIEESLLKVNIGLNDATANLTKAVEKSNVVSASNTSQTYTAKGNNQSIEAIIQAAVKNGISQTDFLKFASIETGGKFNADAYNSGSGASGLFQFVKSTAKQYGLDSSNVFDPFANANAAAKLYIDNLKQIQKYTNDISATDMYLAHQQGMGGYASIKSAQDTGSFTRSDTRKNILSNVSSADIKKILGIDLNQFKSLNDKEMAENFEKYWKTKVDAIDISKFVTANNTLTQAQQQQAQALTQSTVQKTVTDQQQIVAGQTLATANMQQVDALGLAGQGVQGFANATALSAQAIVDTAKGFASGAGDLVKQVANKIQTTQPSTSKESDKGLLSSITGIFDSDGMLSGVGDLFKTGGALESVGSAVSGLTDKLGKAGGSLGGFSTSIMSLFSGDIKGALTSGISAGLSVALPGVGTALGFAVTPVMNKLFGSWEVESQHLTASFKDLSASFAVKTVEVNKGLIGGGKKTTYSEVDSETNQQLQESIDATVKLIEDAGQKIGKALTDNFNFKSVIDMVHEGTDDFETQFARMQSIMVKNAFTEANIAGVDTSITAVMADKVQNVLKQASDGLYDKATQEFMWKPDTQKYAVQITGTVQDGLNSLIASTDWSGLTFDESQSKLQTYLTDAFNAIGVDVPQETFINMANDFATQIQDGMSWLNDTQDIVDPDAQFFKNMREIVNNFNEWDAQPEEVSAFINSLLGLKDAFKLVGYDAGLISQSLIDASGDIGTLSSNLDTFYSNFLSEEEQRTNKMTVLNDSLTSSFTQLGLEMPKSKDAFRALIDGMASDMSDPALFADAIALSEQVAEYFNLQAESVNDGITNVANGFDILIEQIDALATSLTAQDVGGWLKDSVLNATNAEDAGLRFSNAFANAFQEQMLSTVLSTVSNMVYTGLVEPMLQASSISASNTVSASTLSANQDITASNNSAVSLTAGGSTAATALAAGGQIAAEYIAGVVSEVKNVIAVMTTVMQDESIKAMLADLQPALQDIGSATFSAVSTPTSITAPYVQSQQASAVSDKADTATSNTTQEVEKEVESLDSLRQSLREFGTGLDDTDLKLYQLSDVFKNADLSMINFSGSAEDIANSINGLDDTQLRKIASETGISIDELEGYAVDYLSILREQATAEKERLAEFTAWQTGLLDYTANGSQVAQVTQWLTDSVNRLGMNADSAVGFLQGLNQADIAGYAQDLGITDDELQELIPDVISGLNDFAKSIESFHTSLNDFLTLSDPLNEFAKQTLELGVGSAQAAEWAKSQNPETLAKWAEELGISTDELMQNAVKVVTYMQTAETDARAMADGWISVFTELMDSLDSLNQGIGDDINSLNGLSVDSVARLKEQVYGDYTGNADSILQDPDELKKRISLAGDLRQAIMTQYEEQKSLLEEKHQTELDNANELLDIAQSLKDRVMSIQLNKTYFSAQDRFSTAQTQYQDLLGKAQGGDAEAAKKVGEAFSSYLDVASEMYASSAQFKAIRDAGLKDLTSLGVDLTTKGNSVSQSFQDSTYAGELKGLQESALSELQTLSNVVETTQAQGTNQLVASLKDLGTQFGIDINNVGQVIKDLFPQLGTRTDSVANAVTTPAVSDKQIADYVSQAVQASGGVNQQSVSQIVNTASQYGIAPDRLAGAIGVDKQTVSQTAAQYGQTYNAVSKKDITDYVGAVVAQKGITQESMTEIYNMAKQSGVTSGQLADALGYTREDVLAIAAQYGLPAFAEGGIVTKPTIGLIGEAGREAIIPLNQLPQMTQQGASPELLALIARLIEAQQRTQAILEQLLSSSDRVSSTVKETGDKQAKALEKAGSNGRFS >NZ_CP012373.1|WP_145917083.1|2243925_2244285_-|hypothetical-protein MDKNLSNIGEHWAMLQTRPRAVNIRKDYGYLPDEVIEALEGEQIQTDNVVCQVYACNVPAFNLFLDVCHLWRYLPMGGLIGLDWVQVQAWLALTQQVISPIVIRAVQVIESSAVRTLNK >NZ_CP012373.1|WP_062152180.1|2244265_2244589_-|hypothetical-protein MSFDIAEKIIIPTDVNVITADPKKPIKLRVHYAIVPQDEIDEAVETDGDKGFISAVVEKVEGIVKSGVAVDPVEAVQLIANHPLLSTAVMGAYAELRNRNFRGQKSK >NZ_CP012373.1|WP_062152183.1|2244623_2245772_-|hypothetical-protein MAYEIKFTKRAVVEAALEATAGVNPNSGFTAILANVGAKVDKNSTPIDRNVLDREFGAFGSAITASMFKESIEVEMKALGREAGNILVPEWTVPLQACATVKNDAYVLALSGVTGTFEVGEEVSVTSTVVGVIIDIAGTTLYVRKVGLTTVTPSDVVDGESSSASGTVSTVTTGLLFEPTSDESLMKSMTARFNQDGILKISTYMRGTAVITGAAKALPKIAFDLTGIYNAPTDTAMPDVTTSGVKPIPFQNVTLTWGDLDVSKIMFSEFSLDLGNVVVESEDSKKANSIGGVFITDGLPKLKLIFSQSTLAEYNPFAEHETPVERDFAVTYGVTDKFIRVGARKVQITTIAEQEKNNINFYTLDCTCNKGGLTPKWYIAIY >NZ_CP012373.1|WP_062152185.1|2245774_2246665_-|hypothetical-protein MNNCSRLNLPRQALFPTTFESGFQPAAHNFWFGLPRLRGDIALVGSVTTQDTTALVDSGIVALVGSVTAEQTNLVFTGNIQLVGDVTPTAVIAEQIDAGIVRLVGSVTLIEPTYVDSGVIALTGSVSTQDTTALVDSGAVALVGGVTTGSIIAEDSIVRQQIVLKLKEITDFLEVSGVANLKAGADNVDNMPSAYVFESGVTATDNQAATGVLQTVSTLFVIILMIENNTDDFGSDSSDQMNQLRAQVMSKLLGFKPIGQVQRLEYRGGRVYDFTDDILVWQEHYLLPYTVISDRS >NZ_CP012373.1|WP_062152187.1|2246633_2246987_-|hypothetical-protein MHLLLLIIPFLLLGCAEHPTRLSNGFGLIIHQVDEDRVPTDCATLTGVSYPYVGCTRIFNEENLCIVVAPTDAFPYFNQREQAIVDHEIRHCTEGNYHEPDLRDEQLYEQLLPIKPT >NZ_CP012373.1|WP_062152189.1|2246990_2247788_-|hypothetical-protein MIQNWDSVIAACNAQQVLNFYAPSTTTKGAGTFFNYWGTTWTYGAGVTPSTGAGQTFNKDSVGAIRFTAPPSGEKLYLGKWFMSSSVASSFFLYDFLWGNSGLVGNSLTLQAINSVALPTRASNGEGVQLWVNFYQGTDNAAPSITIKYTNSEGVANRTATATIPATNPVVGQAFPVLLQAGDKGVQSIQSFQMATVTPSAGDIGLMLVKQVSEMSLQQANVAESRDPIALLLPQIDENAAISIMQMCTTTVSGIQQGTFRLLAG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012373_5 | 3241960-3242143 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012373_5
>5.1|3241985|53|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TAGTTATAGCGGACAAACTTATGCACAGGGAATGGGATTATGGGGTTATGGTT >5.2|3242063|56|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder GCATTATAACGCGACTTTGTACGGGCAGGGCGTTGGGGGTGCAAAAGGCTTAGGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_5
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_5 >merge|NZ_CP012373|5|3241960-3242143|CRISPRCasFinder TATTATTAGATTTACAAGGAAATGATAGTTATAGCGGACAAACTTATGCACAGGGAATGGGATTATGGGGTTATGGTTTATTATTTGATTTACAAGGAAATGAGCATTATAACGCGACTTTGTACGGGCAGGGCGTTGGGGGTGCAAAAGGCTTAGGTTTGTTGTTGGACATGCAGGGTAATGA >NZ_CP012373|5|5|3241960-3242143|CRISPRCasFinder TATTATTAGATTTACAAGGAAATGA TAGTTATAGCGGACAAACTTATGCACAGGGAATGGGATTATGGGGTTATGGTT TATTATTTGATTTACAAGGAAATGA GCATTATAACGCGACTTTGTACGGGCAGGGCGTTGGGGGTGCAAAAGGCTTAGGTT TGTTGTTGGACATGCAGGGTAATGA
>NZ_CP012373.1|WP_145917111.1|3239160_3240387_+|hypothetical-protein MPSHLNWTLIDQAMVSLVNFLTGVLVARLLGLDAFGFFALLWTILFFFSGLQIAFILSPLLSLGTQQTPEQADSYYSIVLIQQLIFAGLSSVFILLGLYLSDIFFPTWHTAPYALLLALTSFTYQLQDFIRRYFFTTGNTHSAFTNDVISYLGQLAGLLGLFYWQIISISAVLWVTMLSSLFAVGVGLCQFRWRAWNKTFFYQITQRHWQYARWLFASVLLERLHDAIMKAVITAVLGVQAVGVFRACQNVIGMSHVLLLALENFAPPQAGREYLQHGIVGLRRYLSRITFNGGVVMAGIALLLGCFPTTWLYLFYGDEFSDYGYVLTSYVVVYFIVFFLSPVKIGLRVLEKTRPLFHALLWAVLISLVVIYPFTVWFGLQGTLLQLMLFNLIQVVYLFWVLRLQLRH >NZ_CP012373.1|WP_062153681.1|3234319_3239131_+|tetratricopeptide-repeat-protein MNITLITITEKSFINNGFSAELAFNHQRRYQITITPPFDEKQEHNLAWYFEKYLAFPFTDNVRFNETALSIKTYGEQLFKQVFHEPDAYSDYRDALKTGFTLEIIGSPAFHALHWESLHDEKRPAPFALQFEIVRKPLHFNSPYQAITPQVSPTLNVLLVVARPNGRNDVAYRTISRPLVEMVRNSADLHVHFDILRPATFQALTQHLEDVKKKKGAGFYQIVHFDVHGAVLDYTTAQTAETAGRISFDYGRGELQPFEGKKAFIFLNHEQTGKAAPISAESLTDLLFQHGVPVVLLNACQSAKQENTSTETSLASYLMQAGTQAVVGMAYSVTVSAATLFMQTLYEQLFEGASLAVAIQRGRFELDKQKERQVYYNQLIKLEDWLLPVVYQNVPQVQFALRAFSVEEERTFYEQDALRFSEPKTAYGFFGRDLDILEIETAVLKRNSLLIQGMGGAGKTTLLKHLGAWWQTTHFVDKVFYFGYDEKAWTRQQIMRDIAIQLWGKLEYEQRFQAFSEDAQQKKLAKALRSERHLLILDNLESVTGSALAIQHVLTVTERENLQHFLQELVGGASLVLLGSRGAETWLKTGTFEINQFILNGLDSEAASQLVNEILNRHQIKTEYKQQDDFKKLLKLLAGYPLALQVVLQNLTTKTPTDILTALTAGDSAIDLNSTDKTQSILRCIEYSHSNLSPDAQQLLLCLAPFVGVINTNGLAVYTELLKQQPALAHLPFEKWETVLQEAKNWGLLGQHESHIYLTIQPTLPYFLQTQLQNKVEVKTAIETAFRLYYEKMAAGIYQLQKSKDPKQKQLGQLFASIEFENLQQSVQFALTAQVSIFYPYIALSNYFDATQNLQQGLVFGQQVLTQLEQYSPEKLAGQLGAELVGVIDNIANCFLQSQEYALAEQTYQKALKIWKNLTFFEKTERAKLNANTYHQLGMVAQAQRQWSQAQDYYQQALAILIEFNDRYSQASTYNQLGMVVEEQRQWSQAQDYYQQALAIWIEFNDRYAQAGTYHQLGNVAYEQRQWSQAQDYYQQALAILIEFNDRYSQASTYNQLGMVVEEQRQWSQAQDYYQQALAIWIEFNDRYAQAGTYHQLGNVAYEQRQWSQAQDYYQQALAILIEFNDRYSQASTYNQLGRVAEEQRQWVQAQDYYQQALAIWIEFNDRYSQAGTYHQLGRVAEEQRQWSQAEDYYQQALAIWIEFNDRYSQARTYHQLGRVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIKIEFNDRYSQAYTYHQLGRVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIKIEFNDRYSQASTYHQLGMVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIFIEFNDRYSQASTYHQLGMVAQEQRQWSQAQDYYQQALAIKIEFNDRYSQASTYHNLGMVAQEQRQWSQAEDYYQQALAIKIEFNDRYSQASTYHSFGSVAQEQRQWSEAQDYYQQALAIYIEFNDRYSQARTYHSFGSVAQEQRQWSQAQDYYQQALAIYIEFNDSYSQAGTYHQLGRVAEEQRQWSQAKDYYQQALAIWIKFNDSYSQASTYHQLGLLAEAQEDWEQAIEYLLQAYIIFAEYQDEHNLQITLENLARIYQQHPNLVEQKYKALGISMNGNS >NZ_CP012373.1|WP_062153679.1|3233961_3234309_+|hypothetical-protein MTEYTVIFSPELDIQPAEFATFWNAQSQLQQQAVAQVQDAQKTAHYEMDGLTMMALIFIGNFALDIFKDVTKDAIKDFLKKRWLNKPEQKATEFDLIEKKTEDGKTLIIVLPKQN >NZ_CP012373.1|WP_062153677.1|3232774_3233920_+|OpgC-domain-containing-protein MSLISTSSPHSTITQRELKLDFFRGLALCIIFVAHIPDNWLANYTHGRFGFSDSAELFIFVSGYTAARAFGRTFSQLGFWVGTVRVLHRCWQLYIAHLALFFLLAAICAAGNKLQYIDYIGRLNIYFFFEHTPEAIVGLFSLSYVPNYFDILPMYIAILASVPLIMLLARVRPVLVPIACLGIYLGMWWFNLALPAEIDSDRPWFFNPFGWQLLFFTGFMLGAGWIKSPHLTSVLAFVCLLFILLSIPLSNYPIYSQSEWLNQLRTNIDPLVIKTNFGILRWIHFLALTGLTLYLLKYWKNFFYTLFAQCLIKIGQQGLALFLCSMILSYLAGMLMDYTGRHIIDTVVINGIGIGGLIGIAYMVAWFKTVPWKNKAVMCFG >NZ_CP012373.1|WP_062153675.1|3230458_3232258_-|aspartate--tRNA-ligase MRSHYCGQINEAFIDQIVTLCGWVHRRRDHGGVIFIDLRDREGLVQIVFDPDTQDAFNIAERLRNEFVVQIQGLVRRRPEGTENPDLSTGHIEILGRQVEILNASEALPFQMDENNVNEETRLRYRYLDLRRPIMQERMKLRTRVSRLVRNYMDSNGFMDIETPFLTKATPEGARDYLVPSRTHNGEFFALPQSPQLFKQLLMMSGMDRYYQIVRCFRDEDLRADRQPEFTQIDVEMSFVDETIVRDTMEKMIRGIFKEELNVEFPEPLQCMTYHEAVSRFGSDRPDLRNPLELVDVGDLMQGVEFKVFAQPAKDPNGRVAALLVPGGGHELSRGQIDGYTDFVTIYGAKGLAYIKVNDIMTGRDGLQSPILKFLPDDVVKQLLERTKANTGDLIFFGADKAKIVNESLGALRLKIGDDLKLTQQAWKALWVVDFPMFEWDDKENRWMSLHHPFTAPKVNDIAEMEANPGACLSRAYDLVLNGSEIGGGSIRIHRPDLQSAVFRLLGIGEEEARAKFGFLLDALKFGCPPHGGLAFGLDRLVMLMTGASSIRDVIAFPKTQTASCPLTSAPSPASEMQLRELHIRLRTPATKETVVAKD >NZ_CP012373.1|WP_062153673.1|3230071_3230329_-|hypothetical-protein MPTYDYHCSANGQTLEAKHSMNEELNTWGELCANTGLALGATPADAPIMRLITGGQIVSSRALKNPEMPACASGGCGGGMCGLMN >NZ_CP012373.1|WP_062153671.1|3229305_3230028_+|glutamine-amidotransferase MKKLFLVKTGKTFPALIKRRGDFDQWFIQCLGFSPDHIEIVEVFEGEPLPDELDDVAGVLVTGSPAMVTDRERWSELTAKWLCQVHQSSIPLLGICYGHQLIAHALGGKVANNPNGFEAGIVEIHLNEACDTDILLKELPKTLSVHAMHRQVVVTLPPETVILASNPHTDYQAYKIGETTWGLQFHPEFDADIMRTYLAEREAVFIKEGIDVETARQNAADTPYGDMLLKRFATLVQTRI >NZ_CP012373.1|WP_062153669.1|3228395_3229181_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MNTSSTIVRGVYDKQKCYVSITTDKTEVRQAQALRYQVFSEEMGATLNTSLSGYDIDIFDDYCQHVLVRESDTHQVVGCTRILTSEQARLAGGFYSESEFDLSRVLQREGRFMEIGRTCVHPDYRTGGVITLLWSGLARFMVEEGFDYLMGCASIPMPTADHHSLFDRFRERYFSDDQLRVTPKIPLRKTVEDTFNLDIPSLLKAYLRLGAQICGEPYWDADFKVADVFIFLDLDNLQDRYMKHFVDRARPTPHTLHSVAA >NZ_CP012373.1|WP_062153667.1|3226842_3228144_+|CHRD-domain-containing-protein MKKVIHSFLLLTTSLFLWTSAVFSQQAVFGVNTFTEYEAFLSAEQELGEENNSPAQGYGRLSFADDLSTAKLDVFIKDVDVNQITAFHIHCGSPNVLGPIIADLSVFGNFTDTIVNGHFAATLTNEHIVFVTMPPPAPNAGESFTLPLPEGCPNDYGQLGQVYTIAGLEALAKKGLLYFNLHTVTNPFYGEMRGQLYPLTQYKSAPTASSISFGTDSFTHYTANLSPKQELGEANGSQASGQGTVSFVQNLSYAQVELTINNLDASQLTAIHIHCGSPNVLGPYIIHFGDVATKVVNGKLSMKLTNKDIVFVTQAPPPPELGQSFTLPLPEGCPNDIGQVGQVYTIAGLEALARKGLLYFNVHTVTNAFYGEIRGQLGSEHPRADRAVYDNNYLMIPAVDVLDQDGKTVTYKADMMRLNTDNWLFELTSATEK >NZ_CP012373.1|WP_062153665.1|3225713_3226691_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MSFFLSPISEEVKSSSLFNPYLYTFAFASLYLLYCLLYIWLSSEIASHFAFSIQELTSIEQWKGTVFVFVTTLFISVILLLTLKRIEEYQNQILHQQNLLIQSERRATAGIFAASVAHDMNNYLFSMSGAIELIKESPSLNITDKQQQLLNSVEVGLQALMNLSTSLVSVEQETLQRDVTLIDINNFIEEIIGLTKHHQRVKKCTVRLEPMQLPQVLVDVNLIKQALINLIINAADAIQHPEGVILFKTALTHQQLLIEVHDNGTGIPENLRQKVFEPFFTTKNNGSGLGLLSVKVCMDKHHGNIKITNSASLGGCCIQLAFPLN >NZ_CP012373.1|WP_062153686.1|3242903_3244868_-|hypothetical-protein MLQGMRAGIQGWLGWALIILISIPFALWGIQEYLSPSRGVAVAEVNGVEISSLNFEQAVDQQKRQLRSMTQQADLSFMEAQIRKETLNRLIEQEVLMQTAINHGMRIGDMMLAKQIHQFPMFQQGGMFSQPIYEQALRSQGMNPSGFEVEMRRSLLVSQLQDGITNSAFISSAELTQRTQLEKQQRSVSYLTIPANRFTAQVVVDDAEINKYYQDHPDAFKTPEKVSLEYIEFSQEELAAAQAITEEHLKEQYKERLASFTTPGQWQAKHILIEVPQDASPEKLADAEKQANDILAKIKAQEKTFDESAKAFSADTSNKDKGGDLGWFGEGFMVKPFEEAIKSMKVGDISDKPVKTQFGFHIIQLVDAKPTITKPFESVRDELLKKVQTEEAEQAFYTHAEQMADLAFENPNSLQAIADTLKHPIKTTALFAKTETGEKDTFLSNRKVIESAFSEQVLENRYNSEVLELDKPQHVAVIRLKEHQPAQLRPLADVKEEIIAKLKQEKSTAEAEKLGKTLLADLQKGEAPDALFKKQDLQPQPAQWIERQNSRLGYPEIVREAFKMGHPTETKALYQGVSLNNGDYAIVILLAVKAGEIPAVVVENGKETANPEADRSKTQIKRALGDAGFKQIVAEMKVGTDVMVYQDRITDKVQ >NZ_CP012373.1|WP_062153687.1|3244894_3245533_-|Vat-family-streptogramin-A-O-acetyltransferase MLGPDKNAIYPLKNYNRLCFLKNIITNPNILIGDYTYYDDFEDIHNFEKNVKYHFDFIGDKLIIGKFCMIASGATFIMGGANHRMDGITTYPFTIFGHGWETITPTLNDLSLKGDTIIGNDVWIGTNATIMPGVHIGDGAIIATNATVTKHVEPYAIVGGNPAREIRKRFSTQQIKELLEIQWWNWDIEKITANLHHLVNNNIDKLKTNSSV >NZ_CP012373.1|WP_062153688.1|3245913_3246186_-|HU-family-DNA-binding-protein MNKSELVQAVAESIDIPKTTAAKAVDAVLDSIKKALTEDDTVTLIGFGTFTVRERAARTGRNPRTGKPLDIKAAKVPVFKPGKALKDSVN >NZ_CP012373.1|WP_062153689.1|3246328_3248773_-|endopeptidase-La MAYDDKTSEVIEDTRLVLPVLPLRDVVVYPHMVIPLFVGRAKSIHALEQAMTTDKQILLVAQKNAAEDEPNIEDIYRIGTVSNILQLLKLPDGTIKVLVEGGQRAKIINFLSVDDMFSAQVMPLASSDGEEREVEVLSRSVTSHFDQYIKLNKKVPPEILSSLSSIEEPSRLADTIAAHMAIKIEEKQKILEITSIRDRLEHLIALMESEIDLLQIEKRIRKRVKGQMEKSQREYYLNEQMKAIQKELGELEEVPSEIDELTRKIEEAGMPKEAKAKAYSELNKLKLMSPMSAEATVVRNYIDVLVNVPWRKRSKISRDIAKAEQVLEADHYGLEKVKERILEYLAVQQRVNKLKGPILCLVGPPGVGKTSLGQSIARATNRKFIRMALGGVRDEAEIRGHRRTYIGSMPGKIIQNLVKVSTRNPLFLLDEVDKMAMDFRGDPASALLEVLDPEQNHTFNDHYLEIDYDLSDIMFVATANTMNIPAALLDRMEVIRLSGYTEEEKVNIAINYLVSKQIKSNGLKKEEININEAAIRDIVRFYTREAGVRNLEREIAKLCRKVVKEILLKPSLKKITITPRNLEKYLGVQRFRYGRAEEQDRIGQVTGLAWTEVGGDLLTIETAMMIGKGKLTYTGQLGDVMQESIQAAMSVVRSRASSLGITSDFYQKYDLHIHVPEGATPKDGPSAGISMCTAIASVLTNIPVRADVAMTGEITLRGEVLPIGGLKEKLLAALRGGIRTVIIPDENKRDLQEIPDNIKKSLSIRPVKWIDEVLEIALQHMPTPLEAREEAVGEEQTVVDQAANVQKKQSVQTH >NZ_CP012373.1|WP_062153690.1|3248903_3250187_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit-ClpX 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012373_6 | 3500127-3500706 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_6
|
8 spacers
spacers of NZ_CP012373_6
>6.1|3500163|32|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGT >6.2|3500231|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTG >6.3|3500297|31|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCAT >6.4|3500364|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCC >6.5|3500430|36|NZ_CP012373|PILER-CR GACCGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTT >6.6|3500502|34|NZ_CP012373|PILER-CR ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGAC >6.7|3500572|34|NZ_CP012373|PILER-CR TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTT >6.8|3500642|32|NZ_CP012373|PILER-CR TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTC >6.9|3500430|33|NZ_CP012373|CRT CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTT >6.10|3500499|34|NZ_CP012373|CRT ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGAC >6.11|3500569|34|NZ_CP012373|CRT TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTT >6.12|3500639|32|NZ_CP012373|CRT TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTC >6.13|3500163|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGTGTTGCAGCCTTAC >6.14|3500231|43|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTGGTTGCAGCTTTAT >6.15|3500297|44|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCATGTTGCAACCTTAC >6.16|3500364|43|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCCGTTGCAGCCTTAC >6.17|3500430|46|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTTGCAGCCTTAC >6.18|3500499|47|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTTGCAGCTTTAT >6.19|3500569|47|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTTGCAGCCTTAC >6.20|3500639|45|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTTGCAGCCTTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_6
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_6 >merge|NZ_CP012373|6|3500127-3500706|PILER-CR,CRT,CRISPRCasFinder GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGTGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACAGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTGGTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCATGTTGCAACCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACCACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCCGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGGTTGAGACCGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTTGCAGCCTTACTCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC >NZ_CP012373|6|3|3500127-3500706|PILER-CR GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTG GTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCAT GTTGCAACCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCC GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGGTTGAGAC CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTT GCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACATA ATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTT GCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTCA TCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTT GCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAACTTG TCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTT GCAGCCTTACTCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC >NZ_CP012373|6|2|3500127-3500706|CRT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTG GTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCAT GTTGCAACCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCC GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGGTTGAGAC CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGAC GTTGCAGCTTTATACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTT GTTGCAGCCTTACACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTC GTTGCAGCCTTACTCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC >NZ_CP012373|6|6|3500140-3500706|CRISPRCasFinder ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ACCATAATCCCTAGGTGGACTTTGACATACGTGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC AGAAGCGACTTGATAACGCTACGAATTCTGGTTGCAGCTTTAT ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTCATCAAATGTGTCTCGCCCGTCGATTCATGTTGCAACCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC CACAATGGAATTGATGAGTATTTGCTCCCCGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGGTTGAGAC CGTGCATTTCTCGCGCTGTTAAAATCAAGAGTTGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC ATAATCAACGATGGCGATGTTGCGTAGTGTTGACGTTGCAGCTTTAT ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TCATCTATAAAAATCTATTAAGCACTTACCGTTTGTTGCAGCCTTAC ACGCCAATGCAGGCGATTGAAAC TTGTCAGTCTCTCCACCATACTGCATTAGTTCGTTGCAGCCTTAC TCGCCAATGCAGGCGATTGAAAC
>NZ_CP012373.1|WP_062154083.1|3496556_3499832_+|methylmalonyl-CoA-mutase 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>NZ_CP012373.1|WP_062154081.1|3495488_3496289_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MHYDITLKDLFQQLPKQLFQTLWGALPVELLNLEFSQTKQRRPDIIAKLANGQIHHLELQSDNDADMQWRELEYYSLIYQAYQIEPIQQVLYVGNKPSRFTTTIQHKQLNFSYQLIDIRELDCLSLLESEEISDNILSLLGRLPDRREAVRRVLNKIAALTENHRNDVITRLAILSGLRPLELPNLLKEEVRTMSIRVNLMENPLFREGYEKRFEEGIQLGEQRGEQRGINKTTQQIARQMLAEGLPIALITKVTQLTAEEIQRLH >NZ_CP012373.1|WP_062154079.1|3492403_3495265_+|filamentous-hemagglutinin-N-terminal-domain-containing-protein 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MSEIEGKYQKIKYLSLRWKFSIPLIALGLLGIISFTWLFSLFFINKIEMQVLKQTKQTMQIISYATERVFINTEQLQGFISLIANDDDIQDVLILSGEPLRVIATTNRQFIHKPLDAVFHDTLLYTHLVDAIKDNRPYYDQINQQELRFIMPLRFYEDFQSAEPISSNSAMLLIVNTSDIYTVQSETLWHIFSFSLGFVVLIGTAIYLLLNRLVLHPAKIIRDAISRQTNNNKIILMPRLAMDEIGLIAQTFNTMLLEQERNQNEIRKLALVVERTNNAVIITDAQQRIEWVNQGFTRMTGYRLHEVIGRVPGHFLQGVETDPNTVQYMRQKLAEGNAFQVELVNYSKIGRRYEVAIETQPVCDEQGRIVQFMAIESDITARKAAELEIRQTKDFLNTIVSHLPLALFAKEPENLRFILWNKYCEQLFGLNEADVLGKTDYDFFPVKEASLYQTYDRQVLNNGSLVDIPEEIIHSKTLGERIAHTRKVAVLGQDKKVVMLLVILEDITEQKNAAQALQASEERFRTLVEASSDWVWETNTHFINVYSSPKVADLLGYTPEEIQGRSLYSFMSSKETEQAIQTINPYLQTQKPFRFVQNQWLHKDGHLVILEMNGVPMLDTQGKYIGYRGIGRDVTARYEMEMAVRQQAQELSLLNQELLRASRLKDEFLANMSHELRTPLNSILALIEILQEQVYGVVNAQQQKYLSNIDTSGRHLLALINDILDLSKIAAGKMELEIQSTILEGVCQASMNFIREQALRKKIRVTTHYDHNVNKIEADERRLKQILINLLTNAVKFTPEKGEIGLEYKGIPDKKTLEIHIWDTGIGIDKNELSNLFKPFTQLNTTQHEGTGLGLALVRRLTALHGGDVQVNSEMGKGSRFIITLPWRPNDIDNTAPTTAPTAETATIELHKPDDNPLILIVDDNDANILSISDYLTLKGYRTTIAHNGIEAIESANKLHPDLILMDIQMPVMNGLDAITHLRADKTFKTVPIIAVTALAMSGDRERCLNVGANEYLAKPIGLRHLVSVIERLRQQVLDNSIIS >NZ_CP012373.1|WP_062154087.1|3504438_3505542_+|cell-division-protein-ZapE MPTPLARYQRDLQRPDFVSDEAQKRAVQHTQQLYEALIHANTPPTDSLLSVLRAKLSKRKKEPVKGLYFWGGVGRGKTYLIDNFYDCLPFSEKMRIHFHRFMRQVHEDLQKFKALQNPLTHVARHLAQQTQVLCLDEFHVADITDAMLLTGLLKALFDNGVTLVSTSNVAPDLLYKGGLQRDRFLPAIALLKQYTQVLNVDGGVDYRLRTLEQAEIYHYPLDAQADINMLNSFMALSPEEGFNNQALEINGRSIQTKRCADGIVWFDFEVLCNVPRAVSDYIEIAQCFNTVFLSNIPVLDVYKDDHALRLINLVDEFYDRNVKLIVSAATSVDKLYTGQRQAFQFQRTISRLLEMQSHDYLQRPHLP >NZ_CP012373.1|WP_062154088.1|3505657_3509755_+|PAS-domain-S-box-protein MSYLIILECLKIGMLAVVLASLSVINQQLKNTRKTGWYLLFGGFCLISLEKSFYLSAEIPLHSTDFIVTELISLCGFIGYLLFVSGIFYVLPYGSKLSRMVHRYLLKKQKKQVNIKANSELLAQETLARLNELIKTSPLAVMEWDEKGIIHRWSLSAEKIFGYSEAEILGRNIFEVNFIYEEDSEHVLKVKDRLLMGIEQNNICVNRNYSKDKRIIFCEWHNSVQPATDNYPLSVLSFAQDITEREEHHQALHNSEEKFRQVTEHLNEVCYVVDLQSQRIIYVNAAFEQVWGIPVQQLLTNPHVWLDAVHPEDKKYVKTLFFNDFFQEKNLTYHQAEYRLLKANGDIYWVRDKCYPVIDRNGHVYRLVGIAEDVTYYKNTENTLREQQELLSQRNIELSKTYENLQFHIDNSPFAIVEWDAEGQISYWSTTAEKMFGWYASEMLGKSLFEVDWVHQADIRVIKILIKRLICREMSTIMHISRHYTKEKQLLFCEWHVSVRLDEQGQILSLLSFALDVTLREQLRLTLQYSEEQFRQLAEHIEEVFYIFDIEQNKLLYISPSHEKIWGQSTKDLLQNPALWAEIIHPDDRNMVEKAFRRFQQGGEFIQEYRIIRVEDKEIRWIRDRSYPIYNATGQLYRVVGIAEDVSDYKYAEIALKQSKVELQQRNFEIRELYEFTQQLNYRLNMDEVLRIFYEYLYRLIPAITCSCFISNDTNSYQLFIASREKLSPTLIQNIREEVFATLTSLNPHHGITAEEIPIVWLKQYSLQNTFNNTTLLSSRLNIPLEKTTPTLQNKAKPSSILWLGTVMKDAFTHNQLRLCYIFINHLANTFKRIQEVFIKEQRDLQSIVMYLPIGVVLFDKKAKILFVNQQAQQYFPFLIDDNKDYLAEKIFNPLLYNTNSEQNYLNRQYINIENLFLELTTRQLDYGSYSTHYLMVIQDITEQKKIESALKAERVLLAQQVEKRTAALSDANLELAKANRLKDEFLASMSHELRTPLNAILGMSEALNEEVYGKLNEKQHKFLHHIHESGQHLLALINDILDLSKIEAGKVQLMLDTTNIAELCQSCLTLIKQQAENKKLHVHFHLDGQAQVIYADQRRLKQILLNLLSNAVKFTAEGGDIGLEVEHDAEKQAIHFIIWDKGIGIDNENMQQLFKPFTQLDSRLSRQYEGTGLGLVLVHRLTELHGGSIKVESQAGQGSRFTVSLPAVSEKWRAYIQSEDPQIVLKPPSTINATIAQQAPLILIAEDHLNNILVLIDYLMAHGYRVNTARTGTEALEQLHEETPHLILMDVQMPGMDGIEATRQIRLNAQFASLPIIAMTALTMPGDREQCLAAGMNDYISKPFALKQLLNLIQQYLGVKTEKT >NZ_CP012373.1|WP_062154090.1|3509874_3510522_+|cytochrome-c4 MKKLTLALYILLGSPFVYATEQATGNGAIVGTAEAGKAKATTVCVACHGADGNSINPEWPSLAGQHASYIEQQLHDFKAGVRENALMSSQAANLTEQEIADLAAYFADQTKKQGAASSAELATQGERIYRGGNQSTGLPACAGCHGPKGSGNGGAKYPALSGQHAKYVQKQLADYKSGARGSKSDQATKLMMRQIAQKLSTEEIAAVAEYISGLH >NZ_CP012373.1|WP_062154092.1|3510720_3511086_+|transposase MTYSIDFRKKVLKVKQEENLTLAAVAKRFQIAIASVVRWSKVLEAKGTRNRPTKIDMEALKQDVALYPDAYHYERAARFGITEGGIRHALKRLGISRKKNPQTSQSQPRSTASLSKQNEPL >NZ_CP012373.1|WP_106405021.1|3511072_3511543_+|IS630-family-transposase MNRYKQSDRQIVFIDESGFAHDMPRRFGYAPIGKRCSGTQDWNAKGRTNVIGALLNFCLLTVSLVSGAINSDVFFAWITQDLLPKLPQNSVIVMDNATFHKRSDIQQAILDAGHLLEYLPPYSPDLNPIEHKWAQAKTLRKQQHCSIDELFLLNSI >NZ_CP012373.1|WP_062154094.1|3511630_3514441_-|phosphoenolpyruvate-carboxylase MKNLVKDKPLRRRVKLFGKLVGKVLRARAHGQVYATVEELRKGYIQLRKTPDSVKQHKLERMITLLSPEVLSEVIRAFNIYFSLTNIADELFKHQSRREQVHKGGALWEESFDATFREFIKAGLSPQDIQSLFDNLLYTPVFTAHPTELRRRTLMLALRRVFLATEKLDQRGLSWVEHAELEAALEAELHILWKTDEVRLRQMHVEDEISNGLNYFRESLFTAVPLAYRAAERTIKRLYNDTNQTPVVVPSFLRFGSWIGGDRDGNPFVKPATTVKALRLQKVEILREYERQLYDLSDIITHSKSFCQPSQALLESIEQDAGLLARNNLYTYSEHIFEIYRRKLSMMRIRIKNNLEATEARLNNALTGMVIADKERIGYTNEAEFLADLQLIYQSLLSHDDQAVADGALKDLIRSVETFGFYLMKLDIRQESTRHTEAVTELLTAQNIDYNSLSENARLALLIQLLQTEQALLTNNTRWSELTAETLEVFQIVHDMRQEISPDAFGSYVISMTHSASHVLEVLLLAQQYKLVDKNGGYCYIGVSPLFETIDDLNHIEHVLSTLFTQPFYRQLLRASGNTQEVMLGYSDSCKDGGIITSSWLLHEAQKKITALAEANQLACRLFHGRGGAVGRGGGPTYEAIISQPAGTVHGQIKFTEQGEVLAYKYSNPETAMYELTVGAAGLLKASSVLMHKHKSVDSRYIEIMNYLAKQGEKQYRLLTDHTEGFMPFFYDATPVAEIGLMNIGSRPARRRSDNPSKYSIRAIPWVFGWSQARYTLPAWFGLGTALEKFCDKDVDNLAKLQKMYVEFPFFKSLLSNIQMSLFKTEMDIARRYADLCSDKRQAEKIFAMIEAEYVRSEQYLLQVANISELVADNPSLQLSIERRLPYIDPLNAIQVYLLGQYRQTTASGNAEEAKRWFDPLIRSINAISAGMRNTG >NZ_CP012373.1|WP_062154096.1|3514730_3515318_+|rhomboid-family-intramembrane-serine-protease MFDTFTPKSSQTYNGVFTLIIINLVMYVLDHILQLPLERLYLNHHNPALYQFVTSLFCHASWQHLSGNLFFLYLFGKLVEEEEGASGVIISYLVCGIGANLMSWLLQSGYFSSLGASGAVFGLFSVSVLIRLSWDWRRLLEVLILGQFVIMQVIQETQQLGQADGVNRIAHLGGAFVGVVFILGLLRLAKSKKTS >NZ_CP012373.1|WP_062154099.1|3515579_3517190_+|hydrogenase MRRFDWLAELLARFEDQTIQVGNGSKTTLQPAHLLHIPAPEWGRALAEVAQFACRFSALWVTETLPTAKDEYYGFFILSCCVEKRGDYVVFRTEIASDTPEIASITPFYPAANRVERHIQDLFGIRFIDHPDKRRWIRHQAWQEHEYPLRKAFSAQGAPPHLTPPDSDYPFLQAQGIGVYEIPVGPVHAGIIEPGHFRFQAVGEKILNLEEHLGYIHKGTEKIAEGRDPIALAKLAGRVSGDSTVAHTWAACMAMERAAQVTIPPRAQFLRAILCERERVANHLGDVGAICNDVAFSFAFYQFARLREEWQRLNVASFGHRFLMDCIIPCGVKTDLAANLIPEHKAQLHVFQQEVEELAGIIDRHTGIEDRLETTGILSLETASRLGCLGYVGRASGLTYDVRRACPYPPYDEIVVEVPVFKKGDVKARLQIRLAEIQATLTLLNQLLSFLPTGDIVGQWQIPLENAEGLGIIEGWRGEIVSYIRFGKAGLIDRFYPRDPSWLTWSALELMIRNDIVPDFPVCNKSVNGSYSGVDL >NZ_CP012373.1|WP_062154101.1|3517208_3518315_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MQKYHFIFLIFSYLLSNVTVTLAESPAKTLTVVSWGGKYTDSQIAAYYKPFADKFGVAIQANTYNGGLGQIRSQVKTHNIKWDVVDLSLADAVKGCNDGLLEPIDLTSFPPSSNGISPLNDFYDITILTSCAAPLVVWSTVVAYNETAFAKAKKKPNKIADLFDIETFAGKRGFRKTPQVTFEWALMADGVPSTEVYNVLATAEGVERVFTMLDKIKKQIIWWDTGAQALQLLNNNEVVMTTIYNGWVADAIVNNAKPYKIIWDGQLFDLDVLSIVKGTKQLDLAIEFIKFASDTQALAEQTRYIAYSPARKSALKYLPTIAQLGYDIRPLLPMTPANFTNAIRYDFTWWAKHQEVLTDKFNAWLARN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012373_7 | 3708841-3708935 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012373_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012373_7
>7.1|3708864|49|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder GGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAGGGTTTACAACTTGGAGAAGAGCGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012373_7
The CRISPR arrays of NZ_CP012373_7 >merge|NZ_CP012373|7|3708841-3708935|CRISPRCasFinder GGATTGGAAAAAGGCTTGCAAATGGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAGGGTTTACAACTTGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAAGGTTTACAACT >NZ_CP012373|7|7|3708841-3708935|CRISPRCasFinder GGATTGGAAAAAGGCTTGCAAAT GGGAGAAGAGCGCGGCGTTGAAAAGGGTTTACAACTTGGAGAAGAGCGC GGCGTTGAAAAAGGTTTACAACT
>NZ_CP012373.1|WP_062154420.1|3707600_3708122_+|co-chaperone-HscB MTSPNYFELFGLPVCFTIDSEVLAACYRDLQKMIHPDKFVDAPERERRLAMEKATLINEAFQTLKQPVNRARYLLELQGVSLNNDSDTFMDATFLMAQMELRETLAEIKNQINPLAALSQFLTTLNKQSQTLIDKLNQQFTQQDWQAARNSVRQLQFFNRLQEETLQLEETLL >NZ_CP012373.1|WP_101539159.1|3707276_3707597_+|iron-sulfur-cluster-assembly-protein-IscA MISLTPKAATHIQKSIDKRGKGVGLRLGVRTSGCSGMAYIMEFADQVEEQDQIFESQGVKVIVDPKSLSYIDGTELDYVREGLNEGFKFNNPNIKDECGCGESFNV >NZ_CP012373.1|WP_101539113.1|3706033_3706782_-|IS5-family-transposase MSRRYALTDEQWSKLEPLLPGRKGHVGMTAKDNRLFIDAVLFRYRSGIPWRDLPERFGDFRVVHTRFSRWSKKGVWERVFKILSADADNEYAMIDSTIVRAHQHSSGGGADEAIGRSAGGLSTKINSVVDALGNPTPFFLTAGQASDLEGADALIPQIKANALLADKAYDADERVRDVLKQQGIEPVIPFRKNRLNPPYYDKVLYKARYLIEHFFGKLKQYRAIATRYDKRARNFLSGVYLASTLILLA >NZ_CP012373.1|WP_145917120.1|3704764_3706015_-|type-II-secretion-system-protein-GspL MMTGSTYMRYFLLCRLGTDVDALISWVLYDHAGKRIDSANAVSLATLPPPASHVLSVLVPSTACLLTTAHVPTTQRQRLLQAVPYALEELFAEDVEALHFALGERLVSEQVAVAVTTHQKMQQWLALFTERGYKPQTIMPDVLAVPRPENTWGILFYNQVVLVRTGDYSGFGIELETLQTALQLALHQQAAPARLVVYYARVAPPSLTVLRGLGIPIEEQAHTEDSLGWLLQGITQKNKTINLLQGEYRPQDKIQTLWKPWRLTIGLLLVWGVILFIQQIVEYQDLSQQRTALNTEIEALYRQTFPDAKRIVNARVQMEQQLNTLKNQQSNPLKGESYLTTLAQLSPILKQAAGLHLKRLDYRQGRFDLELELANLQALEQIKQSLSQMGFTVELQSASSRDNVVEARLRLQKNPI >NZ_CP012373.1|WP_062154414.1|3704024_3704678_-|hypothetical-protein MGKEIDRISSDIACLNIEHFPATLVSTTGSHCEVWQAFRTSFDNAEKTTLNFVVKRHYQPCEFREVRNLCRDYYILKEKLTDIIPNALFVQTSIDNRANLIVIAETNTPWFNLANPINETEAIPTLRQNPKALSQLKRFLQAAKQWHDEKGWVIDLYGLDNLILNKNSEVRYIDSFSVFFYEDMLKFVTDDDSLQEKIDLSLKRRSYLEYIYAQATP >NZ_CP012373.1|WP_062154412.1|3703651_3704020_+|DUF1992-domain-containing-protein MVNIDKIAEAYILEAIEKGELDNLAGMGKPLELEDLSHVPEELRMAYKILKNAGCVPEEVQLRKDIMQLQTLLQTVDDEKTRTQAVKRLNLLFAKLGNQRAGSLQAMDTQYYQKTVDKLLSE >NZ_CP012373.1|WP_062154410.1|3702527_3703505_+|quinone-oxidoreductase MTVNAIQIHQTGGIDVLRWEKIEIGEPAAHQIRIRHTAIGLNYIDVYFRMGLYKPAAYPFIPGMEAAGVVEAVGAAVTDLHVGDRVAYGATLGAYTEARVIDAERVVKIPDGISDQTAAAMMLKGMTAQYLLRQTYPVKAGDTILFHAIAGGVGLIACQWAKKLGVTVIGTVGSAEKAELAKAYGCDYPIIYTKENFVTRVKELTNGKGVPVVYDSVGQDTFMQSLDCLQPMGTIVSFGQSSGSVPPLDIGILSAKGSLFLTRPTLMSYTASRQQLLTCTDDLFAVVQSGDVKIDVNQIFSLKDAGKAHAALETRQTTGSTVLLP >NZ_CP012373.1|WP_062154406.1|3701700_3702471_+|5'/3'-nucleotidase-SurE MKILVSNDDGYRAAGIVCLVNKLKTFADITVVAPDRNRSGASNSLTLEYPLRAHTADNGFLYVDGTPTDCVHLAITGLLEELPDIVVSGINEGANLGDDVIYSGTVAAAMEGRFLGLPAIAVSLAGYPNPTHYDTAARIVEILLNHLHEGNLPLPVDTILNVNVPNVPFAALQGIQVTRLGSRHRAAPVVKDQDPRGRDIYWVGAPGKEQDAGVGTDFHAIRNGFVSVTPLHVDLTRYSAMDVTRTWLKAFETLKP >NZ_CP012373.1|WP_062154404.1|3700899_3701553_+|endonuclease-III MNAAHRHALFARLQAQNPNPKTELVYHSTFELLISVILSAQATDISVNKATVKLYSVANTPQAILNLGADGLKGYIKTIGLYNAKAKNILQTCQVLVDKYNGEVPHERAALEALAGVGRKTANVVLNTAFGEATIAVDTHIFRVANRTGLASGKTVRAVEDNLLKAVPPEYQQHAHHWLILHGRYTCTARNPKCASCVIAEFCEFKEKNLVMPNKAG >NZ_CP012373.1|WP_145917119.1|3698332_3700546_-|LPS-assembly-protein-LptD MPKRHKLILFITLLITLPTNSHALEWGMCQAIAEITPLPPQLPPPPENNAVRLYADDGEMSEKEGKVTANGNVILQRGEQVLKTDLAIYLRDQETVDAEGNFTFWDKQFIVSGNRAKLLPNHQGEMHDVHYWLLNRRGRGQATFLQRESENNASLQQTTYTTCDPSAEVWRLDAANVHLNQETGRGTANNVFINVLNIPVFYSPYLSFPIDERRLSGFLAPSMGSSDEVGVEFSIPYYLNLAPNYDATITPRFMSKRGLLLGTEFRYLLANSGGKIEWEYLPSDRVADINRSLLKVRHSGMVVPSLYTDIVYDEVSDDLYFRELGDNLTVSSTTHLEQRGDLRYFGHGWNVLGRLQRYQSLDANPATRPYERLPQIILSSDVPERNKKINVQGQVELVNFERSYDEAPVGNRYDFKSTISFPWRTASGFFVPSAILRHTRYDLSQIPIAEADRFSETPTRSTYTLMADSGLFFDRELSLFNRNLLHTLEPRLFYRYTPYENQDDIPIFDTAEYDLSFGQLFRENRFIGADRVDDSNQLTAALTTRFIDQATGLENLRVSVGQIYYFADREVVLPSELFETNSSSNIVAEISSQFNSRLSGSATVLWNPYDSKAELSIWRLRYRPNPESLYNFAYRLRENRLEQTDVSWRFPLSSQWRTLGRWNYSLDEHKDLEVFLGLEYESCCWAMRGVARRYLNTVDGAYLNGFFFEVELKGLGGVGKKASAFLEDSIVGYDDRF >NZ_CP012373.1|WP_062154423.1|3709148_3711032_+|Fe-S-protein-assembly-chaperone-HscA MPLLQISEPGQSTAPHQHRLAAGIDLGTTNSLIATVRSGIAETLPDQQARHLLPSVVHYATDTQTVIGYEALAFASSDPLNTIASVKRLMGRGLHEVKTLGTQLPYDFIDQQGMPLLRTVKGELSPVQISADILRSLKQRAEATLGGELSGVVITVPAYFDDAQRQATKDAATLAGLQLLRLLNEPTAAAVAYGLDKKAEGIHAIYDLGGGTFDISILRLHKGVFEVMATAGDSALGGDDLDREIARWIMTQAGIADNSTQGHIRYLLDSAKTAKEALTIQDSVMLNLTLSNGQPWTGVLNRETLHSLVDTYIQKTLLPCRRALRDAGITIEDIHEVVMVGGSTRMPRIREKVADFFQRQPHVDIDPDKVVAIGAAIQADILVGNKPDDDMLLLDVIPLSLGLETMGGLVEKVIPRNTTLPVARAQEFTTFKDGQTAMAVHVVQGERDLVSDCRSLARFELRGIPPMVAGAARIRVTFQVDADGLLSVSAQEQTTKIKSEINVKPSYGLQDADIERMLKEAISYADLDAKKRTLREQQVEADRVINALRAALQADGQTLLKHQEFLAINVALDELLTVAQGNEPMVIKQAIEKLDNLTQEFAARRMDQAIKHAMQGHKINEFMEENK >NZ_CP012373.1|WP_062154424.1|3711031_3711370_+|ISC-system-2Fe-2S-type-ferredoxin MPKITFLPHPELCPDGITIEVSTGTSVLDAALDNHVALEHACDKSCACTTCHIIIREGFDSLTPATDEEEDLLDKAWGLESESRLGCQATIKMDDLVVEIPKYTINYARENH >NZ_CP012373.1|WP_062155576.1|3711392_3712379_-|NAD(P)H-quinone-oxidoreductase MNYIKLNPIDTPDALVLAHETIPAPKAGEVLIKVAAAGVNRPDVLQRQGLYPPPAGASTVLGLEVAGTIVAVGETVDENLLNQPVCALVNGGGYAEYCIADVELCLPIPQGLDFISAAAIPETYFTVWTNIFERAKLQAGETFLVHGGTSGIGTTAIQLAKAFGATVIATAGNEAKCQVCRELGAHHVINYHTHDFVEVVKKLTAGQGVNVVLDMVGGDYIAQNIKVLALEGRLVQIAFLTGSKVTLDFMPIMLKRLTLTGSTLRARSVAQKAQIAQALLQNVWTLLEKGQVKPVIYKTFPLSHAADAHRLMESNQHIGKIVLVMEGA >NZ_CP012373.1|WP_083991626.1|3713013_3714057_+|diguanylate-cyclase MLADANSQFKHINTLVEQILDYKSYLKTPRLSSHPNALNFHHNSQAVLGTDFFQGYKSNTQQAYPLTHQPLLRALQGERVYIDDLEIQLENSILPLEVWATPIFNEKQEVLYAIAVFQDISQRKQAEAERIRLAQEREAKDAALRMNALLAQEIQERRRAEAELAKANQELQRLASLDGLTQLANRRRFDEYLDQEWRRAVREDVPLSLILCDVDFFKRYNDTYGHQAGDDCLRQVAMAMSQAVKRPADLVARYGGEEFAVILPNTHTDGAKTVAQNIADAVKALCLEHRASTVQPIVTLSVGVAGIYPSRGQSSIFLIKTADEALYLAKNAGRNQVFTRAIQLENS >NZ_CP012373.1|WP_062154426.1|3714053_3715010_-|MoxR-family-ATPase MDVSVFNTLRQSLEQQIIGQHHLVNSMLIALLSDGHILVEGMPGLAKTTAVKSLATAIEGEFHRIQFTPDLLPADLVGTDIYQQETGEFTFRPGPLFHNVLLADEINRAPPKVQSALLEAMAERQITVGQTTYRLPNLFMVLATQNPVEHEGTYTLPEAQLDRFLLYVKVSYPSRAEELAIIELHEQNAPTTRSTPAYHLSQADVFAARDAVMQVYIDPRLKEYIVDIVRASREPLAYDKDLHRWQRFGASPRASIALVHCARACAWLAGEKYVTPAHIQTVLPDILRHRLLLSFEAEADAISTDMFIERLLRVVGVP >NZ_CP012373.1|WP_062154427.1|3715162_3715693_-|hypothetical-protein MQLKLLISSLLLAISTVAMAAKPITEEEVLAAQKTWGEAIVAIGKAYVAKEDYKAVATKTVETLYGYHEGEVLFKPTKASQQQFRLTKEEAISYFISGVIPEDHGFAIQPWTNVRFENKDIIIDSDSAIAMGNYYFTDAKTDKEAKVEFTFGYKRGVDDNLLINLHHSSFPYTPTY >NZ_CP012373.1|WP_062154429.1|3715903_3717532_+|VWA-domain-containing-protein MIKNLFFVLLGSLLLTACNQSTSSNNEISHIETAPKVGSVSVTESFNRGQPQPASIPADYRPPLEDREKYAHVSDNPIKSAKEQPVSTFSIDVDTGSYSNIRRFLNQGSLPNPDAVRVEEMLNYFTYNYPYPVSTTPPFKVTTEFAPAAWNPKTHILLIGIQGYDVPRAQLPPANLVFLIDVSGSMNSPDKLGLLKSALQLLAESLTAKDRVSIVVYAGASGVVLEPTAGNETATINAALQRLVAGGSTNGGEGIQLAYAMAQQAYIPNGINRILLATDGDFNVGTTDFEALKSLVSEKRKSGIALTTLGFGTGNYNDQLMEQLADAGNGHYAYIDTLNEARKVLVDEVSSTLQIIAKDVKIQIEFNPAQVAEYRLIGYENRVLAREDFSNDKVDAGEIGAGHRVTALYEVTLQGSGGERLESLRYNETKSQGAMSNAEIAFLRLRYKMPNAEKSELLEFPISSTLLNKNVSNTSENFRFASAVVAFGQLLRGGKYTEHFGYDDVLALAQAAKGLDEFGYRNEFINLVKLAKSLSTRSLEKE >NZ_CP012373.1|WP_062154431.1|3717652_3718693_+|glycosyltransferase-family-4-protein MVLVLMLLAFFVALVLTRQFTHPDTFLYVVNVPNQRSLHTRPTPITGGVAFLSGFAVAMFITYFFYTEISTDLLWIYFGALLIAFISFLDDCYELSALKRLIIHIIATILLLSQGGYWLTHLLLPNVAWLLPKSLQVVVSLFFVVWMINLYNFMDGMDGFAGGMAIVGFGAFAILGGLKGDMVFMLVNLLLISAIAGFLVFNFPPAKIFMGDTGSSTLGFLVAALSLWGQRYGIFPLWIAVLIFSPFIVDATVTLFKRLFRGEKIWQAHKSHYYQKLVQLGWGHKRTVLTEYGLMSACSISALIALYFPPTTQWILIIAWCVIYIFLMYLVFLLEKQAALKKLTGF >NZ_CP012373.1|WP_062154433.1|3718678_3719449_-|ParA-family-protein MLRVIFNQKGGVGKSTITCNLAAISATKGYRTLVIDLDAQANSSYYLLGKQLTEETQGITTFFEQLLTFTFQEKKITAFIHPTPYENLSVLPANANLSYLESKLESRHKIYKLRDALKTLLQEYDQIFIDTPPALNFYTQSALIAADRCLIPFDCDDFSRRALYSLSDNVREIQQDHNDRLRIEGIIVNQFQPRAKLPTQLVDELISEGQPVLNTRLISSVKVRESHQAAMPLIHFAHDHKITEAFKQLFAELETR >NZ_CP012373.1|WP_062154435.1|3719583_3719967_+|hypothetical-protein MKSNKQRRLEIKANRLKQAKKQQKKLIAIPVPLPKGAILANPQALAHNHTYGILPTYYLDRPFTCRDCGVVEVWTAKQQRWWYEIAKGNINSRAVRCSACRHKIREQKRLQREHMDEKSSNIKKQNC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012373_1 | 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT | 552155-552186 | 32 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 28579-28610 | 5 | 0.844 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552156-552187 | 32 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 28579-28610 | 5 | 0.844 |
NZ_CP012373_1 | 1.8|552155|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 552155-552187 | 33 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 28579-28611 | 5 | 0.848 |
NZ_CP012373_1 | 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT | 552155-552186 | 32 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 2374100-2374131 | 6 | 0.812 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552156-552187 | 32 | NZ_CP054613 | Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence | 2374100-2374131 | 6 | 0.812 |
NZ_CP012373_1 | 1.3|552223|31|NZ_CP012373|CRT | 552223-552253 | 31 | NZ_CP033050 | Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence | 179798-179828 | 7 | 0.774 |
NZ_CP012373_1 | 1.6|552224|31|NZ_CP012373|PILER-CR | 552224-552254 | 31 | NZ_CP033050 | Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence | 179798-179828 | 7 | 0.774 |
NZ_CP012373_3 | 3.1|1966255|30|NZ_CP012373|PILER-CR | 1966255-1966284 | 30 | NC_022050 | Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI8, complete sequence | 40999-41028 | 7 | 0.767 |
NZ_CP012373_3 | 3.1|1966255|30|NZ_CP012373|PILER-CR | 1966255-1966284 | 30 | NZ_CP050093 | Rhizobium leguminosarum bv. trifolii strain 22B plasmid pRL22b5, complete sequence | 147618-147647 | 7 | 0.767 |
NZ_CP012373_1 | 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT | 552155-552186 | 32 | NZ_CP007767 | Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence | 32674-32705 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT | 552155-552186 | 32 | NZ_CP044261 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence | 31359-31390 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT | 552155-552186 | 32 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 331988-332019 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552156-552187 | 32 | NZ_CP007767 | Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence | 32674-32705 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552156-552187 | 32 | NZ_CP044261 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence | 31359-31390 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552156-552187 | 32 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 331988-332019 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_1 | 1.9|552223|32|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 552223-552254 | 32 | NZ_CP033050 | Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence | 179798-179829 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_6 | 6.1|3500163|32|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT | 3500163-3500194 | 32 | MN417334 | Clostridium phage CPAS-15, complete genome | 23071-23102 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_6 | 6.1|3500163|32|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT | 3500163-3500194 | 32 | MF001357 | Clostridium phage CP3, partial genome | 641-672 | 8 | 0.75 |
NZ_CP012373_6 | 6.2|3500231|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT | 3500231-3500260 | 30 | MN692957 | Marine virus AFVG_117M60, complete genome | 36488-36517 | 8 | 0.733 |
NZ_CP012373_6 | 6.4|3500364|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT | 3500364-3500393 | 30 | NZ_CP013238 | Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence | 20042-20071 | 8 | 0.733 |
NZ_CP012373_6 | 6.4|3500364|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT | 3500364-3500393 | 30 | JQ680349 | Unidentified phage clone 1013_scaffold24 genomic sequence | 29804-29833 | 8 | 0.733 |
NZ_CP012373_1 | 1.1|552089|30|NZ_CP012373|CRT | 552089-552118 | 30 | AP014207 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 2322-2351 | 9 | 0.7 |
NZ_CP012373_1 | 1.3|552223|31|NZ_CP012373|CRT | 552223-552253 | 31 | MN871444 | UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome | 49553-49583 | 9 | 0.71 |
NZ_CP012373_1 | 1.4|552090|30|NZ_CP012373|PILER-CR | 552090-552119 | 30 | AP014207 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 2322-2351 | 9 | 0.7 |
NZ_CP012373_1 | 1.6|552224|31|NZ_CP012373|PILER-CR | 552224-552254 | 31 | MN871444 | UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome | 49553-49583 | 9 | 0.71 |
NZ_CP012373_1 | 1.8|552155|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 552155-552187 | 33 | NZ_CP007767 | Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence | 32673-32705 | 9 | 0.727 |
NZ_CP012373_1 | 1.8|552155|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 552155-552187 | 33 | NZ_CP044261 | Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence | 31358-31390 | 9 | 0.727 |
NZ_CP012373_1 | 1.8|552155|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 552155-552187 | 33 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 331988-332020 | 9 | 0.727 |
NZ_CP012373_1 | 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT | 552155-552186 | 32 | MN693402 | Marine virus AFVG_25M260, complete genome | 22109-22140 | 10 | 0.688 |
NZ_CP012373_1 | 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 552156-552187 | 32 | MN693402 | Marine virus AFVG_25M260, complete genome | 22109-22140 | 10 | 0.688 |
NZ_CP012373_4 | 4.1|2230980|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 2230980-2231012 | 33 | AP013497 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S35-C79 | 4324-4356 | 10 | 0.697 |
NZ_CP012373_4 | 4.1|2230980|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 2230980-2231012 | 33 | AP013775 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C68A-MedDCM-OCT-S26-C73, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 8948-8980 | 10 | 0.697 |
NZ_CP012373_4 | 4.1|2230980|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder | 2230980-2231012 | 33 | AP013498 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S38-C76 | 24489-24521 | 10 | 0.697 |
NZ_CP012373_6 | 6.8|3500642|32|NZ_CP012373|PILER-CR | 3500642-3500673 | 32 | MN694562 | Marine virus AFVG_250M829, complete genome | 31480-31511 | 11 | 0.656 |
NZ_CP012373_6 | 6.12|3500639|32|NZ_CP012373|CRT | 3500639-3500670 | 32 | MN694562 | Marine virus AFVG_250M829, complete genome | 31480-31511 | 11 | 0.656 |
1. spacer 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
atggaacaattccttgaagaacaaaac-accat CRISPR spacer gtcgaacaattcgttgaagaacaaaactatca- Protospacer .* ********* ************** *.**
2. spacer 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.844
atggaacaattccttgaagaacaaaac-accat CRISPR spacer gtcgaacaattcgttgaagaacaaaactatca- Protospacer .* ********* ************** *.**
3. spacer 1.8|552155|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.848
atggaacaattccttgaagaacaaaac-accatg CRISPR spacer gtcgaacaattcgttgaagaacaaaactatcat- Protospacer .* ********* ************** *.***
4. spacer 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
atggaacaattccttgaagaaca-aaacaccat CRISPR spacer atggaacatttccttgaagcacacgaacaata- Protospacer ******** ********** *** .**** .*
5. spacer 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.812
atggaacaattccttgaagaaca-aaacaccat CRISPR spacer atggaacatttccttgaagcacacgaacaata- Protospacer ******** ********** *** .**** .*
6. spacer 1.3|552223|31|NZ_CP012373|CRT matches to NZ_CP033050 (Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer accatgctaatgtagcgggttttgtagttgg Protospacer * *****.******.********** * *
7. spacer 1.6|552224|31|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_CP033050 (Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer accatgctaatgtagcgggttttgtagttgg Protospacer * *****.******.********** * *
8. spacer 3.1|1966255|30|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NC_022050 (Paracoccus aminophilus JCM 7686 plasmid pAMI8, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gtacactcggtatattcagcgtctgctgga CRISPR spacer aagcgctcggtatattcagcgtctgcaaca Protospacer . .*.********************* . *
9. spacer 3.1|1966255|30|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_CP050093 (Rhizobium leguminosarum bv. trifolii strain 22B plasmid pRL22b5, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gtacactcggtatattcagcgtctgctgga CRISPR spacer cgacactcggtatatgcagcgtcaccgcga Protospacer ************* ******* * **
10. spacer 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT matches to NZ_CP007767 (Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
11. spacer 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT matches to NZ_CP044261 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
12. spacer 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gtacaacaataccttcaagaacaaaacaaaaa Protospacer .*. ****** **** ************ *
13. spacer 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_CP007767 (Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
14. spacer 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_CP044261 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaaga Protospacer * .**** ************ ******* .
15. spacer 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gtacaacaataccttcaagaacaaaacaaaaa Protospacer .*. ****** **** ************ *
16. spacer 1.9|552223|32|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033050 (Virgibacillus halodenitrificans strain Bac324 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcgg CRISPR spacer accatgctaatgtagcgggttttgtagttgga Protospacer * *****.******.********** * *.
17. spacer 6.1|3500163|32|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT matches to MN417334 (Clostridium phage CPAS-15, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
accataatccctaggtggactttgacatacgt CRISPR spacer actgatatgcctatgtggactttgacatattt Protospacer **.. ** **** ***************. *
18. spacer 6.1|3500163|32|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT matches to MF001357 (Clostridium phage CP3, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
accataatccctaggtggactttgacatacgt CRISPR spacer actgatatgcctatgtggactttgacatattt Protospacer **.. ** **** ***************. *
19. spacer 6.2|3500231|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT matches to MN692957 (Marine virus AFVG_117M60, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
agaagcgacttgataacgctacgaattctg CRISPR spacer acgttgtacttgataacgctactcattctg Protospacer * . *************** ******
20. spacer 6.4|3500364|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cacaatggaattgatgagtatttgctcccc CRISPR spacer aacaatggaattgatgtgtatatgtcagct Protospacer *************** **** **.. *.
21. spacer 6.4|3500364|30|NZ_CP012373|PILER-CR,CRT matches to JQ680349 (Unidentified phage clone 1013_scaffold24 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cacaatggaattgatgagtatttgctcccc CRISPR spacer cttcatggaattgatgagtattggcatatc Protospacer * . ****************** ** . .*
22. spacer 1.1|552089|30|NZ_CP012373|CRT matches to AP014207 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tacccatcattgattgaagacttggggggc CRISPR spacer acgctctcattgattgaagtcttggggaaa Protospacer *. ************* *******..
23. spacer 1.3|552223|31|NZ_CP012373|CRT matches to MN871444 (UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer ctctacctgatgtagttggttttgtagattg Protospacer ********** ********* **.*
24. spacer 1.4|552090|30|NZ_CP012373|PILER-CR matches to AP014207 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C8-MedDCM-OCT-S26-C6, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tacccatcattgattgaagacttggggggc CRISPR spacer acgctctcattgattgaagtcttggggaaa Protospacer *. ************* *******..
25. spacer 1.6|552224|31|NZ_CP012373|PILER-CR matches to MN871444 (UNVERIFIED: Serratia phage KpGz_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
aagatgctgatgtagtgggttttgtatatcg CRISPR spacer ctctacctgatgtagttggttttgtagattg Protospacer ********** ********* **.*
26. spacer 1.8|552155|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP007767 (Campylobacter peloridis LMG 23910 plasmid pPEL1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccatg CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaagat Protospacer * .**** ************ ******* .
27. spacer 1.8|552155|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044261 (Campylobacter armoricus strain CA639 plasmid pCA639-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccatg CRISPR spacer aaagaaccattccttgaagatcaaaacaaagat Protospacer * .**** ************ ******* .
28. spacer 1.8|552155|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccatg CRISPR spacer gtacaacaataccttcaagaacaaaacaaaaaa Protospacer .*. ****** **** ************ * .
29. spacer 1.2|552155|32|NZ_CP012373|CRT matches to MN693402 (Marine virus AFVG_25M260, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gctcaacaattacttgaagaacaaaacctttc Protospacer .. ******* *************** .. .
30. spacer 1.5|552156|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to MN693402 (Marine virus AFVG_25M260, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
atggaacaattccttgaagaacaaaacaccat CRISPR spacer gctcaacaattacttgaagaacaaaacctttc Protospacer .. ******* *************** .. .
31. spacer 4.1|2230980|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to AP013497 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S35-C79) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gacaaggtcagcttgggcaatggcaaggtctgc CRISPR spacer accaatgtcagcatgggcaatggcaagagtaaa Protospacer . *** ****** **************. . .
32. spacer 4.1|2230980|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to AP013775 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C68A-MedDCM-OCT-S26-C73, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gacaaggtcagcttgggcaatggcaaggtctgc CRISPR spacer accaatgtcagcatgggcaatggcaagagtaaa Protospacer . *** ****** **************. . .
33. spacer 4.1|2230980|33|NZ_CP012373|CRISPRCasFinder matches to AP013498 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G19, isolate: uvMED-CGR-C68A-MedDCM-OCT-S38-C76) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
gacaaggtcagcttgggcaatggcaaggtctgc CRISPR spacer accaatgtcagcatgggcaatggcaagagtaaa Protospacer . *** ****** **************. . .
34. spacer 6.8|3500642|32|NZ_CP012373|PILER-CR matches to MN694562 (Marine virus AFVG_250M829, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
ttgtcagtctctccaccatactgcattagttc CRISPR spacer agtacagtctctccaccttcctgcatttcccg Protospacer ************* * ******* ..
35. spacer 6.12|3500639|32|NZ_CP012373|CRT matches to MN694562 (Marine virus AFVG_250M829, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
ttgtcagtctctccaccatactgcattagttc CRISPR spacer agtacagtctctccaccttcctgcatttcccg Protospacer ************* * ******* ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1479746 : 1529871
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012373|1479746:1529871|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP012373|1479746:1529871|1507681_1508170_-|WP_062150532.1|DBSCAN-SWA MTNYSVRKGVADDIPVVFALVKTLAIYENALSEVINTPEQLLQDGFGERAYFEFFVAETAKKEVVGMILYYYSYSTWKGKSLYVDDLVVNEAHRGQGVGYLLFDALIREAVTQNVGKLHWQVLDWNEPAIRFYKRLGAVFDPEWVNCKLSREQLQAYVKQKV >NZ_CP012373|1479746:1529871|1481381_1481747_-|WP_062150062.1|transposase|DBSCAN-SWA MTYSIDFRRKVLKVKQEENLTLAAVAKRFQIAIASVVRWSKVLEAKGTRNRPTKIDMEALKQDVALYPDAYHYERAARFGITEGGIRHALKRLGISRKKNTQTSQSQPRSTASLSKQNEPL >NZ_CP012373|1479746:1529871|1499528_1500728_-|WP_062150514.1|DBSCAN-SWA MKLGTPLTATALKVMLLGSGELGKEVIIALQRLGVEVIAVDRYPNAPGHQVAHRFHVIDMTNPHALHALVVLEKPDIIVPEIEAIATDMLLEIEQAGLAQVVPTARAAQITMNRERIRSLAADVLKIPTSRYAYANSEAELRSHIETIGFPCFVKPVMSSSGKGQSMLHNAEDIHSAWQHAMSAGRVSGGTVIVEEFIDFDFEITLLTVRALNSKGEIETYFCEPIGHIQKQGDYVESWQPQAMTPTALKIAQEMARKVTDNLGGRGIFGVELFVKGDQVWFSEVSPRPHDTGMVTMVTQMQNEFELHARALLGLPVSTALRNEGASAVIYGGYDSENGLIYEGIDEALQIPQTDLRLFGKPEAFIKRRMGVALAMGKTVEEAREHAKLAASKVRTVKP |
40 | Hokovirus(30.77%) | tail,transposase,integrase,tRNA,protease | attL 1479957:1479972|attR 1525104:1525119 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2166063 : 2173568
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012373|2166063:2173568|DBSCAN-SWA GTTATGTAAATGTTTGTTCTATGGTTGGAAATGCTTTACTTTTAACTGCTTGCGTGTAGGCTTGAACAGCCGCTTGGATGGAATACTGTTCTGTCAGAAAGTTTTTAGAAAATGAAGGGGGTTTTACCGTTAAACCCAACATGTCATATAACACCAGAATTTGTCCGTCACATTCAGCACCCGCTCCAATACCGATGACAGGTATGTGTAAGGCTTGGGTGATTTCTGCTGCTAATTTACCCGGTATGCACTCTACCAATAACATTGATGCCCCTGCTGCTTGTAAGGCGAGAGCATCTTGACGCAATCGTTCTGCATCGCTGTTGGCGCGACCTTGTACCACATAACCACCCAGTTGATGAACGGATTGGGGCATGAGTCCTAAATGAGCGCATACAGGAATTCCTCGTTCTGTGAGGAGTTTAACCGTATCAACTAGCCAATTTCCCCCTTCCAGTTTTACCACTTGGGCATAGCCTTCGCGCATTAAGCGTGCTGCATTGTGTAAGGCTGTATCGGGTGTTGCGTAACTCATAAATGGCATGTCGACCATTAAGAGCATGTTGTCACTACCACGATGTACTTGTTGAGCATGATAAATCATTTCTTCAATAGAAACAGGGAGTGTGCTTTCATGCCCTTGAATCACCATTCCCAAAGAATCGCCAACCAATACCAATTCAATGCCCGCTTCTTCTATCAGATGGGCAAAGCTCGCATCATAAGCGGTTAGAGAAGCAAACTTTTCGCCTTGGCGTTTAAGTTTGCGAAAGTGATTAAGTGATAAACGTGGCATCAGTTTTCTATCCTATATAAGCCATCCATCGGACAGTGTTGTAGTAATATTTCTAGGGGTGTTCCATCGGGTAATATTAATGCGGGTTCGCATTCATACAAGGGGTATAGTACAAATGCCCGTTGTGTCAGTCCGATATGTGGCAAACACAAACGCGGGTCTGTGGATTGTAGTGCGTCATAAAGAAGGATGTCTAAATCCAACGTGCGTGCGCCCCATCGCTCCCCTCTCACTCGTCCTTGTTGATTTTCTATCGCTTGCAAGTGTTCTAGGAGAATATATGGGGGGAGTTGTGTCTCTAAAACGGCTACGGCGTTAATATAATCGGGTTGTAGCATATTAGCGAGCGGTTTGCTTTGATACAGTCCAGATTGTTTACGCAATTGTGTTTGCGGTAACGTAGCGAGAGATTGAAAGGCCTGATGTATTTGTTTAACTGGTTCGGCAAGATTACTGCCTAACCCGATATAAGCGATACTATTCACCATAATGACCCACTAGGATTCGCTTTGCGATGCGTCGTTTCTACGCCGATAAGGACGACGTTTCCTGCGATTATGATGCGGTTGTTTATGAATGGCGGGATGCGTCGGTGGTGTTGATATTATTAATGTTTCTTCTATTTCAGCAATAACGGGTGTATTCTCTTCAGGCACACGCGCCACAACTTCTGTGGTCAATGCCTGCGTCCACCATTCTGCCCCTTCACGCGCTTCCGCGTCTAAAAATGCCCGCAATAAGAGGAAATCATAAGCGGCCCGAAAACGGGGATGTTCCATTAATAATAGGCGTTTACGCTTATTTTTTCGTTGTAACAAACGTGGTTGCATTAACCAAATTTCTTGCATAATCACACTAATACGTTTAGGAATAGCAACTTGTTTAACTTGTTTATTCATCACTCGTTGCATTGCATTAATCAGACAATCTTGTTCACTCGCCCCTTCTTCACGGTGAAAAGGTAAGACTTTGAGAATAGGCGACCAGAGCAACGCGGCGAATAAAAAGGCAGGATTAACGGATTGCTGTTTAGCAACTCGCTCATCTGTATTTTTTAATACTTGTTCGACCATCGTCAAGACATTGGGATTTTCTAGAATGCACTCATGTGTTTGACGAAATAAATGTTCAAATAAACCGTATTGTCGTAAATAGCGGAAAGATTTTAAACCATGTCCACTTAAAAACAGTTTTAAAACTTCATCATGCAAACGTGCAGAAGGTACATCGGCTAATAAACCACCCAGTTGTGGAATGGGTTCAGCCGTATAGTTTTCAATCGTAAAACCCAATTTTGCCGCAAACCGCACCGCCCGCAACATACGCACAGGGTCTTCTTGATAACGTAACATCGGGTCGCCGATTAAACGCACAATACCCGCTTGTAAATCTGCCATGCCATTGGCGTAGTCTAAAATGGCAAAATCATTTATGTCATAATACAAAGCGTTAAAAGTAAAATCTCGACGATTCGCGTCTTCATCAACGGTTGTACCATACACATTATCACGCACAATTCTTCCGTCTTCTATCACCCGTTCATTGCCATTCACTTTGCCACCATGGCTTGCTCTAAAGGTAGCGACTTCAACAATTTCTTGTCCAAAATACACATGCGCGAGTACAAAGCGACGACCAATTAAACGGCAATTGCGAAAAACGTTTTTAACTTGTTCAGGTAAGGCATTAGTAACAATATCAAAATCTTTTGGTTGTTTACCTAAAAGAACATCACGAACACCACCACCCACAATATAAGCCTGAAAACCAGCACTTTGTAATTGATACAACACTTTTAGGGCAGATTTACTAATATTTTTACGAGAAAGGGCGTGTTCTGCACGTGAAATACGTAAAGGAACAGGCTTTTGCGTATCTATAATAGATGACAACGCCGTCTGCGGTTGCACCTCAGAAGGTTCAAAAGATTTTAATATTTTTTTTATGCCATCAACCAAGCGTTTATAAGGAGTCATCGTTTTCCTTGATGAGAATTAAGCACTACTATTTTACATTAATACCATTACCTAAAACATTATATGCTTTTGTGGACGGTTTGAAAGGTGGAAATGACGTAACTCGTCAGTCTTACGCACATCTTGATATTGGTAATACTACATTTATATGAATGAATTTACACTAATTTTATGGCAAGCTTACAACTCTACGCACTTATCCCCCAAACCCATGTTTTAGGCCCTTTCACCCGTTTTGCCTTATGGGTACAAGGCTGTCCATTCCGTTGTCATGACTGCATGACACCTGATGCGTTGCGTGTGGATGGCGGAACATCTGTGGAAATTACAGAATTAGCTCAACAAATTCTAAACACTCCCACGATTGAAGGGATTACTCTATCAGGTGGTGAACCCTTTGCACAAAGTGCTGAGTTACTAGAATTAATTCATCAAATTAAACGGGTTAAGTCATTAGGAATTATTGTTTATTCAGGCTATACCCTAGAACAATTACAAAAAATGGCTAAAAAACATCCCGCTGTTGCAGGCTTATTAGACCAAATAGATGTATTAATTGATGGTTTATATATTGCAGAACAAAACGATGGCTTGAGTTTGCGGGGTTCAAAAAACCAACAAATCCACGCACTGACTCCACGATATGCGGCACTCATTGCTGAATATTATGCGCAATCTCAACGCGCTGTTGAAATGCACTTATTAGCCGATACCGTTATGCTGGTTGGTATTCCGGGAATAAATTTATTATCAACATGGCAAACACAGATTAAAAAACAATCTTAGCTTTTATTAACAAATAATTGCACATACTGCTTTGCAACTTGTTCCCATGAAAAATGTTCCATAACCCATTGTCTGCCTGCATCCCCTAATACCTTTGTTTGCTGTCGATTTGTTATGAGATATTTAAGCGTTGTTTGTATCTCATCATTATTTTGCAATGCCAACAAATACCCTGTTTCCCCATGACGTACAACCGACTCATGTCCTGTTACTTGACTAGCAACAATTGCAAGCCCTGATGCCATTGCCTCCAACAACACATTAGGCATTCCTTCATATAAAGAAAAACTTAATAAGCAATCTGCCTGTTGATAACAAGCACGTAATATTGTCTTATCTAACCAACCATGCCAAATTAACACATCATCAAGTTGCAACTGTTGTGCATAGGCTTGTAATGCTGTCTTCTGGTATCCATCACCAACTAAATGACAACAAAAGGCTAATGTCGTCGTATCGCGTAATTTTTTTAACTGCTTTAATAAAAAGAATAAATTTTTCTGTTCCTGAAAACGTCCAACGAATAAAAATTGAAAAATTGGGTTTTCATGCGGAATAGGGAAAAAAAAGTGGGTATCTACACCATTAGCTATTATTTGGGTCTGGAAGGGGTCAGCTTTTTGCGCGACTTGTTGTAAGCCAATAGAGTTAGCAACAATGGCTATTGCTTGTTTTAAAATTACACGGCGTAACGGTTGCAATATGCGGTGTATCCACATAATACGCGGCTCTAAACCGGGAACATCGCCCCCCCGTAATGACACAATGTAAGGTGTTTTATACAAAAGCTTAGCCCATAGACCCAATGGGCCACAAGGAATTGAAAAATAAACAATAATTCCTTGAATATTCTGTTTCTTTAACAAACGGGGCAAAACCATCATTGCGGATAAAACAAAAGAAAATTGCTCAAACAAACTAGAACGACTGACTTGATGACGGAAAGCTAAACAACGATAAATAAATACACCCTGTTCTTCTGACCAACCACGTAATTCTTGGAAACAACTGGTTAAAACAGTAACCTGATGCCCTTGCTTAGCCAACTCATGGGCGGTATTCCACGTTGCAGTTGCCGCTCCACCGCCAATAGGCGGAAACTCGTAATTTATCAATAGTAAATTCATATTTTCTAAAAAGACTTAGATTCACTCCAACGACTTAATAACGATAGATTCCATAAAAACGCCCGATTATCAACCGTATTGCATCTATGTTCATGAATTTTTTCTTGAATAAAAGGACTATGTAACAGGGGAAATGTTGTCGGTATTGTTAGTTTCCCTTGTGCTAACCATTTCCCAATGGGTACACCAAAACCTTTTTTACTGCGATATAAAATCTCGTTGGGCAATATACCTTCCAATGCCTTTTTTAATAAGTATTTCGTCTGTCCATGACGGAATTTATAATCACTGGGAATTTGACGGATAAAATTAACC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012373|2166063:2173568|2166857_2167346_-|WP_062152023.1|DBSCAN-SWA MVNSIAYIGLGSNLAEPVKQIHQAFQSLATLPQTQLRKQSGLYQSKPLANMLQPDYINAVAVLETQLPPYILLEHLQAIENQQGRVRGERWGARTLDLDILLYDALQSTDPRLCLPHIGLTQRAFVLYPLYECEPALILPDGTPLEILLQHCPMDGLYRIEN >NZ_CP012373|2166063:2173568|2172608_2173568_-|WP_062152037.1|DBSCAN-SWA MHSLSLIIPVYNEAENIPLLQEKIAKTLAQLSYPYEIIYVDDGSQDQSFAVLTALAQNNAFIKVIQFTCNHGQTAAIAAGIDHATGDVIIFMDADLQNDPADIPMILNKLDEGYDLVSGWRANRQDAWLTRTLPSNMANWLISKVTGVRLHDYGCTLKAYRKEVLQGYRLYGEMHRFLPAYAAQVGARIAEIPVNHNPRRFGQSKYGLERIFKVILDLFTVKFLSKYGQKPIYLFGSIGAGFIVGSFLLLIYLLLDKFFYAQSLVTSPLLLMSAMFFIVGVQSIFFGLIGELLMRTYYESQDKPTYSIRTRFNITADKP >NZ_CP012373|2166063:2173568|2170752_2172606_-|WP_062152034.1|DBSCAN-SWA MCGIAGFIGTGTIADLRSLTHRLQHRGPDAEGLWHEQTVFLGHRRLAIVDLSGGQQPMLTSDKDLVIVFNGEIYNHIALRQQLQCKGHVFVTDHSDTEVLLHGYREWGTELPNKLNGMWSFVLYDRKQQVIFCSRDRFGEKPFFYTCQKDLFVFASELQAITAHPAVTPTLFPLALQKYFAYGYIPAPHTLYKNIYKLPAGHSLIYNLQTQHCNIQKYWDFVLEPFTTIPSNPDIVWAEQLRELLDNAVKIRLMADVPLGIFLSGGVDSSAVAAFARRHVDRDKLNTFSIGFTEADFDESKYAQQVASYLGTQHHLDVLSLDKAQTLLPSIIDKLDEPMGDSSLLPTYLLCRFARQTVTVALGGDGSDELFAGYDPFRALRWATLYQKFIPKPLHQGIRLLFARLPVSHRNMSVDFKIKRTLRGLSYPPSLWSPVWMATLDPQELNDLFQEPIDLENLYSEAIIQWDACQQDNLVDKTLQFYTKLYLQDDILVKLDRASMMVSLEGRCPFLDIDLVNFIRQIPSDYKFRHGQTKYLLKKALEGILPNEILYRSKKGFGVPIGKWLAQGKLTIPTTFPLLHSPFIQEKIHEHRCNTVDNRAFLWNLSLLSRWSESKSF >NZ_CP012373|2166063:2173568|2169005_2169620_+|WP_062152029.1|DBSCAN-SWA MASLQLYALIPQTHVLGPFTRFALWVQGCPFRCHDCMTPDALRVDGGTSVEITELAQQILNTPTIEGITLSGGEPFAQSAELLELIHQIKRVKSLGIIVYSGYTLEQLQKMAKKHPAVAGLLDQIDVLIDGLYIAEQNDGLSLRGSKNQQIHALTPRYAALIAEYYAQSQRAVEMHLLADTVMLVGIPGINLLSTWQTQIKKQS >NZ_CP012373|2166063:2173568|2166063_2166858_-|WP_062152021.1|DBSCAN-SWA MPRLSLNHFRKLKRQGEKFASLTAYDASFAHLIEEAGIELVLVGDSLGMVIQGHESTLPVSIEEMIYHAQQVHRGSDNMLLMVDMPFMSYATPDTALHNAARLMREGYAQVVKLEGGNWLVDTVKLLTERGIPVCAHLGLMPQSVHQLGGYVVQGRANSDAERLRQDALALQAAGASMLLVECIPGKLAAEITQALHIPVIGIGAGAECDGQILVLYDMLGLTVKPPSFSKNFLTEQYSIQAAVQAYTQAVKSKAFPTIEQTFT >NZ_CP012373|2166063:2173568|2169616_2170747_-|WP_062152032.1|DBSCAN-SWA MNLLLINYEFPPIGGGAATATWNTAHELAKQGHQVTVLTSCFQELRGWSEEQGVFIYRCLAFRHQVSRSSLFEQFSFVLSAMMVLPRLLKKQNIQGIIVYFSIPCGPLGLWAKLLYKTPYIVSLRGGDVPGLEPRIMWIHRILQPLRRVILKQAIAIVANSIGLQQVAQKADPFQTQIIANGVDTHFFFPIPHENPIFQFLFVGRFQEQKNLFFLLKQLKKLRDTTTLAFCCHLVGDGYQKTALQAYAQQLQLDDVLIWHGWLDKTILRACYQQADCLLSFSLYEGMPNVLLEAMASGLAIVASQVTGHESVVRHGETGYLLALQNNDEIQTTLKYLITNRQQTKVLGDAGRQWVMEHFSWEQVAKQYVQLFVNKS >NZ_CP012373|2166063:2173568|2167355_2168834_-|WP_062152026.1|DBSCAN-SWA MTPYKRLVDGIKKILKSFEPSEVQPQTALSSIIDTQKPVPLRISRAEHALSRKNISKSALKVLYQLQSAGFQAYIVGGGVRDVLLGKQPKDFDIVTNALPEQVKNVFRNCRLIGRRFVLAHVYFGQEIVEVATFRASHGGKVNGNERVIEDGRIVRDNVYGTTVDEDANRRDFTFNALYYDINDFAILDYANGMADLQAGIVRLIGDPMLRYQEDPVRMLRAVRFAAKLGFTIENYTAEPIPQLGGLLADVPSARLHDEVLKLFLSGHGLKSFRYLRQYGLFEHLFRQTHECILENPNVLTMVEQVLKNTDERVAKQQSVNPAFLFAALLWSPILKVLPFHREEGASEQDCLINAMQRVMNKQVKQVAIPKRISVIMQEIWLMQPRLLQRKNKRKRLLLMEHPRFRAAYDFLLLRAFLDAEAREGAEWWTQALTTEVVARVPEENTPVIAEIEETLIISTPPTHPAIHKQPHHNRRKRRPYRRRNDASQSES |
7 | Ostreococcus_lucimarinus_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3030129 : 3096069
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012373|3030129:3096069|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012373|3030129:3096069|3068175_3068924_-|WP_101539153.1|transposase|DBSCAN-SWA MSRRYALTDEQWSKLEPLLPGRKGHVGMTAKDNRLFIDAVLFRYRSGIPWRDLPERFGDFRVVHTRFSRWSKKGVWERVFKILSADADNEYAMIDSTIVRAHQHSSGGGADEAIGRSAGGLSTKINSVVDALGNPTPFFLTAGQASDLEGADALIPQIKANALLADKAYDADERVRDVLKQQGIEPVIPFRKNRLNPPDYDKALYKARYLIEHFFGKLKQYRAIATRYDKRARNFLSGVYLASTLILLA >NZ_CP012373|3030129:3096069|3061441_3061828_-|WP_062153410.1|DBSCAN-SWA MHKKSEEGRKWVNPDTGEEYDISHLKGFQTSFEVKLDNEIKNIDVRVEFSYHCYTKKQEDGGKEPVFRIETRKDGTKEERVFCPKRWEFSKSLPDIIRGLNYKGCLQGNSHEIIYRQEQSSNQGGHDG >NZ_CP012373|3030129:3096069|3046917_3047172_-|WP_062153394.1|DBSCAN-SWA MVKKIKVTPFPMPYEKVTAQTIGEIVRAQRTRLGLKQVELAAIANLNIKTINSLENNNGSTLENTLHVLNGLGIKLTFEGLLDD >NZ_CP012373|3030129:3096069|3068956_3069250_-|WP_145917105.1|DBSCAN-SWA MNKIYINPHDPLAIITAAFQDSLIEDDPSILQAALKSYADQIGMSSLIKESGIKSRSSAYKSLASSGSPKWETIVKIAHSIIQIARACHQIVKNVIL >NZ_CP012373|3030129:3096069|3047505_3049734_-|WP_062153396.1|DBSCAN-SWA 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56 | Mycobacterium_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3351382 : 3421019
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012373|3351382:3421019|DBSCAN-SWA 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51 | Wolbachia_phage(30.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3434692 : 3511543
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012373|3434692:3511543|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012373|3434692:3511543|3434692_3435691_-|WP_062153996.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNDLSQLITQAQQAIQNANDLSTLDQLRVHFLGKKGVLTEQLKQLGKLSPEERPRAGQVINEAKNTLQSLLENRYTLLQSAVLEAQLAADKIDVTLSGRGQVSGGLHPITLTRQRIQDLFVQLGFSVEEGPEVETDYYNFEALNIPSYHPARAMHDTFYFDAHTLLRTHTSPVQIRTMEKHPQPPLRIIAPGRVYRCDSDQTHTPMFHQVEGLMVDEGVSLADLKGILHDFLQRFFERELEIRVRPSYFPFTEPSAEVDVEWIGKNGERRWLEVLGCGMVHPNVFKSVGIDTEKYTGFAFGMGIERLAMLRYGVNDLRLFFENDLRFLRQFT >NZ_CP012373|3434692:3511543|3467480_3468164_+|WP_066246149.1|DBSCAN-SWA MLDKVYLNSGNKSLLALIESYNNLRILDIGCGAGDNARLLKSYAPSCQIDGITISAQEATLASSVMNQCWVKDVEVDSLDYLSPNSYDCIIFSHILEHFRSPDVQLERFCQFLTENGSILIALPNIVALRQRWQILKGKFEYQAMGVTDDTHLRFFTYETADKYLLRRHPPLTLVYKGVTGAIPLWLLRRYLLPTSISVWLDKQGCYLFPNLFGNQILLKLIKVRKT >NZ_CP012373|3434692:3511543|3450164_3452237_-|WP_062155562.1|DBSCAN-SWA 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55 | Tupanvirus(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3584859 : 3593807
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012373|3584859:3593807|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012373|3584859:3593807|3586319_3587159_-|WP_062154220.1|DBSCAN-SWA MIEVAPLKFGVVFKHAFSQVTVFKNFVKDVIDIDINIDKVHTEYEYPTQIGFVKSKYDLFAEDIEKRIIVEIQHIKEEDFFDRFLYYHLISLVEQIGTYQKYQFEKTVYTIVVLTSLPRNKSVQFSCAVSDMSPIDEHGKKHNIYPHRLIFLCPRLVNEDTPVNVKTWLELIEDSLDGKLEENKFTAQKFKDILNAIHQQRIDPALLAQIKDEAAWEDVKREERKEGFEAGVQLGLQEGVQQGERRKALETAQKMLSKGFSLKEVVELTGLSETDLKES >NZ_CP012373|3584859:3593807|3592984_3593455_-|WP_106405021.1|transposase|DBSCAN-SWA MNRYKQSDRQIVFIDESGFAHDMPRRFGYAPIGKRCSGTQDWNAKGRTNVIGALLNFCLLTVSLVSGAINSDVFFAWITQDLLPKLPQNSVIVMDNATFHKRSDIQQAILDAGHLLEYLPPYSPDLNPIEHKWAQAKTLRKQQHCSIDELFLLNSI >NZ_CP012373|3584859:3593807|3587160_3588012_-|WP_062154222.1|DBSCAN-SWA MIEVAPLKFGVVFKHAFSQVTVFKNFVKDVIDIDINIDKVHTEYEYPTQIGFVKSKYDLFAEDIEKRIIVEIQHIKEEDFFDRFLYYHLISLVEQIGTYQKYQFEKTVYTIVVLTSLPRDKSVQFSCAVSDMSPIDEHGKKHNIYPHRLIFLCPRLVNEDTPVNVKTWLELIEDSLDGKLEENKFTAQKFKDILNAIHQQRIDPALLAQIKDEAAWEDVKREERKEGFEAGVQLGLQEGEKRGVQQGIQLAHLETAQKMLSDGIPLETVLKYTGLSEIDLKES >NZ_CP012373|3584859:3593807|3589956_3590694_+|WP_062154228.1|DBSCAN-SWA MSTQLPLGIGLPESASFTNYIPGPNQAVFNILQQIIDGEWENCLYIYGGAGTGKSHLLQAACEQTAKRGGRPVYLPLALFYQSGPDILEGLDALDLVCLDDIHTVAGQPLWEEALFRLYNQLRASGIPQIITGNTIPNKLGLKLPDLVSRLNWGGAFALQPLDDASTLQALQKHAKGRGMELSDKVAQYLIHHCPRDMNTLLKWLRQLDYESLSNRRKLTLPFVRHLVQNTVVSLQDNASWHGNK >NZ_CP012373|3584859:3593807|3593441_3593807_-|WP_062154092.1|transposase|DBSCAN-SWA MTYSIDFRKKVLKVKQEENLTLAAVAKRFQIAIASVVRWSKVLEAKGTRNRPTKIDMEALKQDVALYPDAYHYERAARFGITEGGIRHALKRLGISRKKNPQTSQSQPRSTASLSKQNEPL >NZ_CP012373|3584859:3593807|3588881_3589745_-|WP_062154226.1|DBSCAN-SWA MIEVAPLKFGVVFKHAFSQVTVFKNFVKDVIDIDINIDKVHTEYEYPTQIGFVKSKYDLFAEDVEKRIIVEIQHIKEEDFFDRFLYYHLISLVEQIGTYQKYQFEKTVYTIVVLTSLPRDKSVQFSCAVSDMSPIDEHGKKHNIYPHRLIFLCPRLVNEDTPVNVKTWLELIEDSLDGKLEEDKFTAQKFKDILNAIHQQRIDPALLAQIKDEAAWEDVKREERKEGFEAGVQLGLQQGLQEGEKRGEKQGERRKALETAQKMLSKGFSLKEVVELTGLSETDLKES >NZ_CP012373|3584859:3593807|3592142_3592649_+|WP_062154234.1|DBSCAN-SWA MARVYVSVGSNIEPLQHIRAGLTDLQQHYGTLQLSSVYESAAVGFTGENFYNLVLAFETKQTVQQVNQLLHDIEARHGRTRDGQRYSARTLDLDLILYDNLVLQDKANKVEVPRGEIEKYAFVLLPLAELIPTLKHPILGKTYAELWDNFQGKEKQALWKVDIALLAD >NZ_CP012373|3584859:3593807|3590675_3591683_+|WP_062154230.1|tail|DBSCAN-SWA MAWKQITIAIGVSFLLTMLGSYLLFNNRLNTLAMQVDALETREFQQLDQQYARTQYVDKLNQELRATLAAAVNASTEQNLYLTAQVNNAYRLADTLLGKVNKQAEQHTAVLAQITSLKQTLTKLIDIVDGLKKNTAYNVPTGTIIGYAGNIDSEQQQILQQLGWLLCDGREVSRQQYPALFSAISTLYGVSTEQTFHLPDFRGVFLRGLDLGRQLDVERALGVLQEDDNKAHQHTGTTTTAGVHQHRGTTDLGGEHRHKLEAMGFWYTTKSWIERRAMTNEVDDGETYNTSLDGEHRHTFVTPIGGEHQHNLLTEMSGNIEARPKNYAVVYFIKY >NZ_CP012373|3584859:3593807|3588013_3588880_-|WP_062154224.1|transposase|DBSCAN-SWA MIEVAPLKFGVVFKHAFSQVTVFKNFVKDVIDIDINIDKVHTEYEYPTQIGFVKSKYDLFAEDIEKRIIVEIQHIKEEDFFDRFLYYHLISLVEQIGTYQKYQFEKTVYTIVVLTSLPRDKSVQFSCAVSDMSPIDEHGKKHNIYPHRLIFLCPRLVNEDTPVNVKTWLELIEDSLDGKLEENKFTAQKFKDILNAIHQQRIDPALLAQIKDEAAWEDVKREERKEGFEAGVQLGLQEGVQQGLQQGVQQAHLETARKMLKKGFDLENIAELTGLTVSELRSLSKEES >NZ_CP012373|3584859:3593807|3584859_3585330_-|WP_106405021.1|transposase|DBSCAN-SWA MNRYKQSDRQIVFIDESGFAHDMPRRFGYAPIGKRCSGTQDWNAKGRTNVIGALLNFCLLTVSLVSGAINSDVFFAWITQDLLPKLPQNSVIVMDNATFHKRSDIQQAILDAGHLLEYLPPYSPDLNPIEHKWAQAKTLRKQQHCSIDELFLLNSI >NZ_CP012373|3584859:3593807|3591784_3592141_+|WP_062154232.1|DBSCAN-SWA MDIIYLRDLRIDTVIGIYGWERQVKQTIVLDIEMATDICKAAATDHIEDTLNYKAVAKRIIDFVTHSEFELVETLAERITEIILSEFQVPWVRLQLNKQGAVRGARDVGIIIERGIKI >NZ_CP012373|3584859:3593807|3585316_3585682_-|WP_062154092.1|transposase|DBSCAN-SWA MTYSIDFRKKVLKVKQEENLTLAAVAKRFQIAIASVVRWSKVLEAKGTRNRPTKIDMEALKQDVALYPDAYHYERAARFGITEGGIRHALKRLGISRKKNPQTSQSQPRSTASLSKQNEPL >NZ_CP012373|3584859:3593807|3592686_3592905_-|WP_062154236.1|DBSCAN-SWA MTVSAESISKTIFNDIKEMEKKPSDEGKAINDRIRRAVEDKLNLKSIGLRRLVRGEWKLCSLVCKPKNVANR |
13 | Bdellovibrio_phage(100.0%) | tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3774698 : 3832530
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012373|3774698:3832530|DBSCAN-SWA AATGCTAACTTGCCCTAGTTGTAAAGTGACACATATCGTGAAATATGGAAAACCCCACACAGGGACACAAAACTACAAATGTCGCGAATGCGGACGGAGATTTGTATAGTAACCGTCATTTGTGAAATACGATAAAAATTAATATTTTTTAATCAAAAGATTGGAAAATATAGTTGAAATATAGACAGGATAATACAGAAGGGAAGAGAAACAACGCGGTTTAAGGTGGGGGAAAATCAGCGATGTGGAGGAAGACATCGCTGAGTATTGTATGGCGGGATATAGCGGGCGGGAAATATTCGGGGTAAATTCATTACTTGTAAAAACAACATCATTATTCGTATTCTCCTTTTAACCAATCACATAAGGTGCGTTTTAACGATTGTTTATCGCTCATCCGTTTACCTGTTTTGGATTGTTCGTGTACGCCACCTTTACGCAAAATGGGGGCGCGAGCAATGGGGTTGTGGACAACTTGCCGTTGTTTGGACGGCATGGCTTTGTAATTGGGCATAGCTATTTTCCTTGTAAAAATAATACCATCGATAATCCAGTGTGTGCGTGTATGGTGATGACATAAAAACCTCCATTATAAAAAAAATGTTAAACATGACTTCCCGCTTGTCGTGTGACAACAAGCAGGAAGAGGACTCACTAGACTTATTTAATTCTTGCTTTCAGAGATACCAACTTCTTTTGCGAATTCCAATACCTTACCATCAGGTTTATCGGAGCAGGCTTTTGCCAAGTTGTTGACAAACTCACCTAATGACGCAGGGTCAAAAGAAGTGTCGTCTGTTACCCCTGATAAATAACCATCTAACCAAAACAACATCATAGATGCCGTTTCTTTATCCATGCCATCTAAATCCTTACAAGTCATGTTTTTTAAGTCCACTGCACCAGCGGCATTGACTAAAGGTGTTGCGCCTAAGCAAGCCAATAAAGCAATTGCACCGAACAACTTTTTCATAAACGACTCCGTTAAGATGGTAAATTAAGCATAAGTGATAAACAGATAACATGCCGTTATCCGTGCATTTACTCTAGCATAAAAAATGCCGAGTAATAGCGGTGTCCTCATAATTTTTAGTGGTGAACTATTAGCGATAACATTATGTATTTTGAATCTGAGATGTTTTTCACTCATAAGCACGTTAAAATCTATGGTAGTGAAAAGATTCCTTCGCAATTTCCTTGTTTACGTGCTTCTCTTTGCTGATAGAAAGGGGTGAAGAAGGAAAAATTCAGCCATTATTTAGCATTACTCAATCAATCTATTCTTTCATAACGCTTTAGGATTCATGGAATGCACTTGCTTTCGCGTTGGTATGTTCAAGTTTTTTTAATAATAATTGCCGTTATTGCTGTTTATGCGCAAACCGTAGATGTTCCGTTTTATTTAGATGATTTTTCATCGATTCAAGAAAACCCCGTTATTTATCAGTGGAAAGGCACGCTTGCTGAGTTATGGAATTTTTCGGCACTGCGTATTTTGGGGTATTACACCTTTGCCTTAAACTTTCAAACTCATCAGTTTGAACTTTTTGGCTATCATCTGGTCAATATTACGATACACGCATTAGCGGGCGTGGCTGTTTTCGCGTTTGTTCGCAGTTTGATGCAGACACCCACCATGCGCCATCATTTATCCGAACAAAGTATATTATGGTTACCCATTCTTGTTGCCTTGTTGTTTGTGTTACACCCGCTACAAACGCAAGCGGTTACTTATATTGTTCAACGTCTAGCGTCGCTCGCTGCGTTGTTTTATATCGCCGCATTAGCCTGTTATTTACAAACCCGTTTAGCAACAACCGTTACCAAACGAACAATATGGTTAATAGCTTGTTTAATCTTATGTGTTTGCGCTTTTTTTACCAAACAAAACACGGCAACGCTTCCCTTAGCCTTTCTCTTATTAGAATTACTCTGTTTCCCCTTACATATAAAACGCTTAAAAATAGCCGCAGGGGTTATGGTACTTGGATTAATAGCAGGGGCGGTGTTGATAACCATTATCTTGGGATACAACCCTTTTTCTTTAGAGGCAATGCAAGCACTTACCCAAGAAACACAAGAAATTTCGCGTCTAATTTATTTAGCAACACAATTCAGTGTGTTATGGGCGTATATCGGATTATTTTTCTTTCCTGTTGGACAACACATTGATTATTTTTATCCACTAGCCACCAGTTTTTGGAATGGACAAGTTTTGTTTGCTTTAGCAGGACATTTAATGGTAATCGGTTTTGCACTTTCTCAAGTAAGACGTTTACCCTTATTAGTTTTAGGCATTTTATTTTATTACCTTGCTCATCTGGTTGAATCTAGTGTTATACCCATTACCGACGTTGTTTTTGAACACCGCACATATTTGCCCAATTTAGGGCTATGTTTACTGAGTGGATGGTTTTTATTAGAAGTGGTCTTTCAATGGTTTGACCAACGACATACCGTTATTCTTATTAGTATCATACTAATAACATTAGGTATTACCACATGGCAACGTAATCAATTATGGCGTGACCCCATTGCATTATGGCAAGACAACACCACAAAATCGCCCAAAAAAGAACGGGGTTGGGTTATTTTGGGTAAACACCTTATTCAAGCAAATCGCCCAACCGAAGGATTACAAGCCTTACAAAATTCAGTAACACGGATTACCAACAGTGACGGCACCCAATCTGTGCGTATCACTGTAGAAACCATGCTGAATATGGTTGTAGCGCATCGCATGTTAAAACAATACGACCAAGCGAATAACTTAATCAATCAAGCCCTCAGTTCGCCGAGCTTGCGCCCATTTGACCGCGCTAAATTTCTTGTTAATCAAGGAAATATTTTTTACGAACAGCACTTATATGCAGAAACAGAAGCTGCTTATCGTCAAGCGATTGAATATTATCCTGAAGGCTTAACCGCGCGAGCCAATTTAGCCAGTATTTTGGCAGCAACTGGTCGCGAGGCAGAAGCGATTAAGATATATGAGGAAATTCTAAAAATAGACCCAAATAATGCGATTGTGTTGGAAAATCTCAAAACAATCCAATCGGAACAATACTCATCGGTAGGTACTACAAAATAACCGTAATACCTTGAGACTGAAAGAATATGGATAACACCGCTAGAGGCGATGATATCCGTATTCGCGGTAGGGTGGGTGTTGCCCTGCCACGTCTTTATTTAATAGTATTAAAATCATGTACTTAAGCTATTTTATAGCGACAAGCCAATTAATGAAATCCCAGAAAAATTAACGCAATTGTTTTTGCGTAATCCCACATGTTCCTAATCACCGCGCAATCCGCCCGACAAGGCTTTATATTTTTGATGTAATAGAGAGGAAATATAGAGCCTGTCATCAAATAAGAAGGGTTAAAGGTTCAAGCTAAAAGAATCAAGGTAGAAGCCAAATAGACCCCACTTAAGAAATTCCTAGCGCGTTTATCATATCGAGTAGCTATTGCACGGTATTGCTTTAATTTACCAAAGAAATGCTCGATTAAATAACGTGCCTTATAAAGGACTTTATCATAATAAGGTGGATTTAAACGATTTCTCTTGAACGGAATCACAGGTTCTATGCCTTGCTGTTTTAATACACTTCTAACTCGTTCATCTGCATCATAAGCCTTATCAGCCAATAAAGCGTTTGCCTTTATCTGTGGAATAAGGACATCAGCCCCTTCAAGGTCGCTTGCCTGTCCCGCAGTCAAAAAAAAAGGGTCGGATTGCCCAGTGCGTCAACAACGGAGTTAATCTTGGTACTTAACCCCCCTGCACTACGCCCAATGGCTTCATCCGCGCCACCGCCACTATAGTGCTGTCTATCATGGCATATTCGTTATCAGCATCGGCACTTAGTATCTTGAAAACACGTTCCCAGACACCTTTCTGAGACCAACGACTGAAGCGGGTATGGACAACACGGAAATCACCAAAGCGTTCGGGAAGGTCGCGCCAAGGAATGCCACTGCGATAACGGAATAGAACAGCATCAATAAACAAGCGGTTATCTTTAGCTGTCATTCCAACATGTCCTTTACGTCCAGGGAGTAGCGGTTCTAGTTTTGACCATTGTTCATCTGTTAAGGCATAACGACGACTCATTGTTTTATCCTTGGTGATATCTGGATATATACTTATAATATAACATTTTTTACTATTTAATGACACGCCCTAACTGTTGAAGGTATTAATATGACCGCTTGTGAGAGAATAATTGACGGTGTAGCCAAACTTTCAACTGTATTTACTCCCTAAAATAAATGATGGAGGTGCTTTCTTGAATATCGGTGAATTATCTAAATTAGAACATCATATTATGTTTCATATTTTAAGTAGTCATTTTGGTGAAACAATGGCAAATGTTGTACTTCACCAACTCATTGTTAAGGAACGCACATTTACTACTTCGTCCATAATGCCAAGTCTTTGTTCGGGTTCATTTACAGATTTTGAACCATTTGATAACTCACGTTTGGGAAAATTAGACTGCACATATTATGCTGATGCCGAACATCCCTTACTTCCAGGAACAGGTTGTAGCATTGTTTTATTTGCAACGGAAGATAGAACCTCATTTAATTTTTTAGAACTTAGTTTTTATGGGGAATCTTTACCTATTGATTTGGTAACTGCTGAGTTACATGGTTTTACAATAATTACTTATGACCCCCTGATTAGTCGGGATTTGTAACCCTAACTAACATTAACGCACCATAATACACAGATTTTTAAGTTATTTAAGCGTTTTTTAACCGCCTTTTTGGCGAACTAAGCGCGGAAACCGCACTTTGTGCCAATAATCCCCTGTATCAGGTTTATTACACTCGCGATAAAGCAGGACGAATTACCCAGAAATTAGAAACGATAGAAGGCATTACCCACAGTATTGATTACAGTTACGACCTCGCAGGACGCTTAATTGAAGTCAAACAAGACGGCACAGTCACAGAAACCTATCAATACGATGCCAATGGAAACCGCCTCAA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50 | Morganella_phage(58.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
4202809 : 4253658
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012373|4202809:4253658|DBSCAN-SWA ATTACATAACATGGCGTGTAAACTCGGTCGTTTTCACCAACTCGCGTAAAACAGTGGTTGCATACGCACCTGCGGGCAGATGAAACGCCAATTGCAGTGAGGTTTCACTTAACCATGTCCATTGTAAATTTTCCACTATCAAGCGCAAGCTACGCCATTCAAGTTCTAAACCCTCACGAATTAAACCCTCACACCAGCCTTGATGAGCAGATAAAATTGTTTGCATCAACGCCAGTGCGTCTAAAGAGGCTAAATTTTCCCCTTTTCCCCATAATGGCGCGGCGGGGTGAATGTCAAAACAAGTAAGACGACGTTGAATTTCATCATCAATATTCGTAATTGGAAAAACTGAATGCGAGCCTGCTAACTGCATTACATCACCATTAATAGCCTGATTCCATGAGCCTTGTGTTACTCTTTCTGACAAAATACGATTGAATAAGAAAGACCGTGCCGCTGATAAATATAAACTTCGTTGATGACGGTCTTTTATAATGGCTTGTGCAACGAGAATCTGCTCGGCCGCTTGCAAATTATTATGATTGTGTCCAAAACGTTGTTCACCAAAATAATTGGGAACACCGTGTTGTGCAAGGTATGTCAAGCGTTGTTCTAAGGTAGCATGATTACCTGTAACATTTCGTAAACAAAGAATAAATTGATTATCACGCAACGCACCACGCCGTAGTTTACGGCTATGACGTGTTTGCTGTACAACTTGAATCGTATCACTATTTAATGTTTGCCAATCGGGAGCTATTTTACCCGCCAGTTGTATGCTAAACCATTGCGTTGTTACTGCATGACGGTCTTTTAAACCCGCATAACTAACTTCATGTGGTTTAACATTCGCAAACTGTGCTAGCTGTCGTGCTAACCAATCCGTATTGGTATCGCGCTTGCGAATTTGTAAAAAAACATGTTCCCCTGTTCCAGTTGGCTCAAAACTTAAGGTTTCTACTACCTGAAAATCTTCGGGATAAGTCCGTACATCAGCCGTTATGGTGGGCGCGCCTAAAATGTAGGCAAAATCTGGGAGTGTTATTGGTATCATTGTGTCGTTAAAAAAGGAAAAGTTATGCGTTTACAACCGATTGCTTTATGGTTATTTTTACTGGTGCTGTTTTTTTATTTGATTAAAGTTGGCGAATCAATTTTGATGCCTTTATTGATTGCAATCGCTATTTGGTATCTTATTGATGCTTTAGCGGATGGTTATCATTTATTACAATTTAGACAGTGGCAACTCCCTTTAACAGTATGCTTTTTTCTGTCTATTTTGACTTTTTTAGTATTTTTTTGGATATTTGTGCAATTAATTAGTAGTAATATTGATAAAGTTATTACAGTTTCACCTATTTACCAAGCAAATTTTGAAAAATTATTACTTCGTTTATTCGCCCTAGTGGGTGTGGAACAATTACCTAATCTTGCTAACTTTAAAGATAGTATCAATATTCCACAGCTTATTTCTACCTTGGCTATTTCGCTAACCAATTTAGCGGGTAATACGGGAATTATCTTATTATACGTTATTTTTCTTTTTTTAGAGGAAAAAACCTTCTACCAAAAGTTAAAAGTATTATTGTCCGCTGAGCCAGAACAGGAAAGTACCGTAGAACGGATTTTATGCCAAATAGATGAAGACATTAAAACTTATATTGGTGTAAAAACCTTGATGAGTATTCTGACAGCGGTCATCAGTTTTTTTATTATGTGGGGGGTTGGTGTTGATTTTGCCGCTTTCTGGGCTATTTTGATTTTTTTCCTGAATTTTATCCCTAATGTTGGCTCTATCATTGCGACCATATTTCCTTCTTTACTCGCCTTGGTACAGTTTGATACGTTTTATCCTTTTATCATTATTATTAGTTCATTAGGAACAACTCAGTTTCTAATTGGTAATTTTCTTGAGCCGAAAATGATGGGCAGTTCATTAAATTTAAGTCCGTTGGTTATTTTATTTTCCCTTGCTATTTGGGGGAGTTTATGGGGGGTGGTTGGAATGTTTTTATGCGTGCCTATTATGGTAATTGTAATGATTGTATTTACTTATTTTCCAAAAACCAGACCATTGGCTATTTTATTATCCGAAAATGGCTATATACGCATACGGCACAAAGAAAAAATTGCGGTAATGCCGAAGTAAGGATAAGTTATTTTCTTGAATAAAAGACGGTTTGAATCAAGATTCTCAAAACTAATAGCGTTATCAAAGAATTTTTACCCATTGATGTGAAGAATCCTGATTTAGACAATCATTAGTCTTTGTCCTTTTCTGTTTGGCACTATTTTTTTTAGATGGGAATCTTTTTCATCTTAACATCACCCATTACCAAAACCTGTTACCATTTTTGGAATCGAGACTGATACAATTCTAAGCGTGAAAATGATGTAAGGTTTGATAGATTCAATAAATAAGGCACATGGGGGTTATTATGCAGGTTGATTGGTTAATTGTTGGGGCGGGGTTTACAGGTGCAGTGTTAGCAGAACGTATTGCTAGCCAATTAAAGCAGAAGGTATTAATCGTCGAACAACGCGACCATATTGGTGGCAATGCTTATGATTATCATGATGAACAGGGCGTATTAGTTCACCAGTATGGACCACATATTTTTCATACAAATGCCAAACATGTTTGGGATTATCTCGCCCAATTTACGCAATGGCGTAGTTATTATCATCATGTTTTGGGGGTTGTTGACGGGAAATCTGTGCCGATTCCCTTTAATCTCAACTCGTTATATTCCTTATTCCCCCCACAGTATGCGGCAAAATTAGAGCAGGCATTGTTATCTGAGTATGGATTTAATGTTAAAGTTCCTATTTTAAAAATTCGGGAGTCTGCTCCCAGTGAAGATTTAAAATTTTTGGCGGATTATATCTATCGCAATGTTTTTCATAGCTATACATTAAAACAGTGGAATTTAACACCTGAAGAACTTGCTCCTTCAGTTACTGCCCGAGTGCCTATTTATATCAGTCGTGATGACCGTTATTTTCAAGATACCTATCAGGGCTTGCCAAAAAATGGTTATACCCCACTATTCCGTAATATGTTGAATCACCCGAATATCAAAGTGTTATTAAACACGACATTGAGCGATATTGAAGGCGAAATTCAATATAAACGAATGATTTATACTGGGGCAATTGATGATTTCTTCCAGCATATACATGGTGAATTACCTTACCGCAGTTTGCATTTTAATTTTATTCATACCCCTGTAGAGCAATATCAGGCTGTAGGGACGGTGAATTACCCTAATGAATACCATTACACGCGAATAACTGAATTTAAACACTTAACAGGACAACGTAGTTTTGGCACAAGCTATGTGGAGGAATATCCACAGGTTTATGTTAGGGGAAAAAATATTCCTTATTACCCTATTCCTAAAGATGAGTATCGGTTGTTATATAAAGAATATGAGGCTGAAGCGCAGAAGTTAGCGGGAAAAGTTTTGTTTGCGGGGCGGTTGGCGGATTATCAGTATTACAACATGGATCAGGCAATTGCACGAGCTTTAAGTTTATTTGATAAAGTGATTTGTCAAGCATAAAGCTTATTATAAACCATTGTTTATAAAATATTACCTATTACTAACGGATACCACATTAAATGCGGGTATCCGTTAGGCGACTGTATCAACGCGCTTTACTCAGCGTTTGTTTATAACCAATCCCAGCGCAACGTTAGCATAAAACTTCTCCCTTCTTGCGGAATTAAAGAGTTACGAAAACCAGCACTGCGTTGGCTAAAATCATTGCCTGAATCGGCTTGTTCAAAACCGGGAACTAAATAACCTTTATCAAATAAGTTATTGATTTTAAAAGAAGCAGAAAATGGCTTGTTTTTATAACCAATATTCAAATGTACTAGGGTGTAGTCTTCTGCTTTAATCCCTAATGGTGTTAAGGCATTACGTGAGTAAAGTTCACGACTACTCACATAGTTAATCCGCGTATCAATAAACCATTTTTCGTTCAAGGGGAAATTTAATCCAAAATTCAGTTTATGGGGGGCAATATCACCAACATCTGCCTCTCCCTCTACCCAGTCTTGCAAATCATGGTCATAGTGAATGCTACTGCGTGCTTCGGTATAGGTATAATAGACATAGCCTGTTATATCAGGAGCTTGTATAAAGTTAGGGAAGGAGTAACGTCCACGATATTCCAATCCATAAACATCCCGTTCACCCGCATTTTCAGCTTCTTCCTTAATCACGTTTTTATAGTTAGCATAATATAAAGACACGTCATGTAACCAGTTATCCATTTGATAAAGCGTGATAAATTCATAATTTTTCACTTCTTCAGGCACTAAATTAGGATTGCTTAAACGTCCACTCCATCCGCCCCAAACTTGTTGGGGTGCAGGCTCTTGAAAAGCATAGCCATTTAAGAATTTAAATGAGAGTTTATCTGACCAACGATAAATTGCCGATGCACGCGGATTGATAGTGCTACCATACAAACTATTATGGTCGTATCGTACACCTGCATTTAATCGCCAAGCGTCTTTATCCCAAATACCTTGTAGATAAATACCTTTGTCCACCGTTGTCATGCGGTCATCTTCTGGCACGTCGGCGGCAGTTCCATCCGCAATCACTGGGGTGGGATCTGTGCTATAAAAAACCCCTTCACCCAAACCATAAGGGCCTGAATCTTCCCCATCAGAGCTAGAACAATAAGAACTTATCCAATAAGAACAAACATCATAGGCTTTAGTGAGACGTTTATTTTCATACTTAACGCCCCCTGTCATCCGCCATGTGTTGCTTAATGTATAATCATAGTCTTGTTTTAAAAGAAAACTTTCGCTTTCTGAATTCCAATCGGAATAACTTAAATAAGAATAGTTTGTATCCGTCCTGTCAGGGATAGCCTCTGCCCATTGCCCCCATGTATTACTCCTACGGAACAAAGCTAAAGAGGTGATGTTTAAACTATCCGTGAATTTATCATTATGTTTTAAATAAAATTGTGAA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44 | Streptococcus_phage(12.5%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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