Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012757 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain JS395 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP012756 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain JS395 chromosome, complete genome | 7 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,WYL,cas1,cas2,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csm6,cas6 | 2 | 10 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012756_1 | 145082-145161 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012756_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012756_1
>1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder ATTGGGTATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012756_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012756_1 >merge|NZ_CP012756|1|145082-145161|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAAATTGGGTATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_CP012756|1|1|145082-145161|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA ATTGGGTATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCC CGCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_CP012756.1|WP_000218098.1|143646_144771_-|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYASVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKIEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSSRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKKLIVEKNDAIALTNRGKVIGNEVFEAFLIND >NZ_CP012756.1|WP_000627143.1|142568_143546_-|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFSNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIISFVQSEQEEIFINKLLNTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >NZ_CP012756.1|WP_000182215.1|141910_142537_-|nucleotide-exchange-factor-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNVKQNIDDSVEQAEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKENEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >NZ_CP012756.1|WP_000034716.1|140009_141842_-|molecular-chaperone-DnaK MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQEISAMILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKDAEVNAEADKKRREEVDLRNEADSLVFQVEKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKDALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >NZ_CP012756.1|WP_001119019.1|138734_139874_-|molecular-chaperone-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGPAGDLYVVFRVKPSEKFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >NZ_CP012756.1|WP_001104614.1|137792_138731_-|50S-ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQRIKDELLNLDELDQHNVQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETYVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVSVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >NZ_CP012756.1|WP_001190119.1|137038_137791_-|16S-rRNA-(uracil(1498)-N(3))-methyltransferase MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVAKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGELSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYENELMG >NZ_CP012756.1|WP_000108667.1|135685_137032_-|tRNA-(N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))--methylthiotransferase-MtaB MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKLYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >NZ_CP012756.1|WP_000048060.1|135216_135393_-|30S-ribosomal-protein-S21 MSKTVVRKNESLEDALRRFKRSVSKSGTIQEVRKREFYEKPSVKRKKKSEAARKRKFK >NZ_CP012756.1|WP_001802667.1|134290_134974_-|hypothetical-protein MTTILESTAGDTWVEQVSNIIVQPIFTLILTCLTFLGFVYQLYSKKINAAGIIATLSLLILFLGFLIQGNVNMHSILIFSIGVILVVIELFVVGAVIGIIGMILITISITTLGDNLLFMLANVIVALILTIVEWVILVKIFNRKIPFLDKVILKDSTNSESGYNSHDNRSHLVGKTAQTVTDLRPAGIIFCENERIDAVSDGNFILRNKTVKILEVEGTRVVVREVD >NZ_CP012756.1|WP_000368338.1|145332_147156_-|elongation-factor-4 MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCILRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >NZ_CP012756.1|WP_001274017.1|147501_147753_+|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >NZ_CP012756.1|WP_001282573.1|147797_148772_-|DNA-polymerase-III-subunit-delta MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKSPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRNKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIIDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >NZ_CP012756.1|WP_025174621.1|148828_151030_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MLYVALSMIVGVLWNSSKVLSTFLFILLLYIAYRKNKIVYAPISLFLIIFSSWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTNKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNDNKFVTLKLQSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMKRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYQPLKRLNLPLFFIKGITIIVLALFAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWVGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFITSHFIVGLTPLNYLVDLSFNFHDWLLYLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVFDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGEVEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNEYLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYRNASGL >NZ_CP012756.1|WP_000439693.1|151034_151496_-|ComE-operon-protein-2 MERIKWEEYFMAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAKYLTKG >NZ_CP012756.1|WP_072468915.1|151587_152274_-|ComEA-family-DNA-binding-protein MVLLYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDDYTSRDFENKDTALKQSTSENSSLSKLEDVQAKDGDNSKNKGPVYVDIKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSQINLSEKLTDQKMIFIPHKGQKNVEPQFGENSVHVKNGNTNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTT >NZ_CP012756.1|WP_000084840.1|152313_153030_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDVGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDAERLFFIAKK >NZ_CP012756.1|WP_001088020.1|153032_153386_-|ribosome-silencing-factor MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTISLEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >NZ_CP012756.1|WP_001017838.1|153386_153971_-|bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase-(symmetrical)-YqeK MNIDKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYELGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD >NZ_CP012756.1|WP_000725165.1|153960_154530_-|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKKIVLYGGQFNPIHTAHMIVASEVFHELQPDEFYFLPSFMSPLKKHHDFIDVQHRLTMIQMIIDELGFGNICDDEIKRGGQSYTYDTIKTFKEQHKDSELYFVIGTDQYNQLEKWYQIEYLKEMVTFVVVNRDKNSQNVENGMIAIQIPRVDISSTMIRQRVSEGKSIQVLVPKSVENYIKGEGLYEH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012756_2 | 634161-634241 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012756_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012756_2
>2.1|634186|31|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder CAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTTCAATCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012756_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012756_2 >merge|NZ_CP012756|2|634161-634241|CRISPRCasFinder TGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTTCAATCGTGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA >NZ_CP012756|2|2|634161-634241|CRISPRCasFinder TGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA CAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTTCAATCG TGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA
>NZ_CP012756.1|WP_060649654.1|632401_634012_+|MutS-family-DNA-mismatch-repair-protein MSTNQTFLIFVIAIILLTSVIGIVGRYMSRQRLLKSMETLWQTISPLEAFIRPNSHFDYEYKLYKDKFESHSLVDDKTWSDLNMNAIFHKMNYNLTAIGEMKLYACLRGMLSITNKSLLSLINDNAEFRKNVTYHLALIGKTVYPTFPDQITPVKRQNILFLCPFLPVISFVVIFINSQVGILLFLMSCLFNIILSATLKRTYEDDLKSIFYASNVLKQGYTISKIRYAPQPEVNFKQFRTARHLTSVLAEVNDEDIGAMVIKLVKLIFMLDYVLFHSIQKSYTTHMNELKNCFDYIAELDNHYALAMYRRTLECYTEPQIDDSNDGIVFSDLTHPLIADAVANDFSLSQNILLTGSNASGKSTFMKSIAINIILASAIQTVTASKFVYQPGIVFTSMANADDVLSGDSYFMAELKSIKRIVEISDNQKIYCFIDEIFKGTNTTERIAASESVLSFLHEKSNFRVIAATHDIELAELLKQRYENYHFNEVIENNNIHFDYKIKPGKANTRNAIELLKITSFPAKIYERAKDNVSNG >NZ_CP012756.1|WP_078064143.1|632199_632313_-|hypothetical-protein MIKTMSIENMRTYQQRVYNLWIKGVDNVIYCGYQVGK >NZ_CP012756.1|WP_000602061.1|630111_632040_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MILLQLNHISKSFDGEDIFTDVDFEVKTGERIGIVGRNGAGKSTLMKIIAGVENYDSGNVSKIKNLKLGYLTQQMTLNSNATVFEEMSKPFEHIKRMESLIKEETDWLSKHANDYDSDTYKTHMSRYESLSNQFEQLEGYQYESKIKTVLHGLNFSEEDFNKPINDFSGGQKTRLSLAQMLLNEPDLLLLDEPTNHLDLETTKWLEDYLRYFKGAIVIISHDRYFLDKIVTQIYDVALGDVKRYVGNYEEFIQQRDLYYQKRMQEYESQQAEIKRLETFVEKNITRASTSGMAKSRRKILEKMERIDKPMLDAKSANIQFGFDRNTGNDVMHVKNLEIGYQTAITKPISIEVSKGDHIAIIGPNGIGKSTLIKTIANQQKALNGDITFGANLQIGYYDQKQAEFKSSKTILDYVWDQYPLMNEKDIRSVLGRFLFVQDDVKKIINDLSGGEKARLQLALLMLQRDNVLILDEPTNHLDIDSKEMLEQALQHFEGTILFVSHDRYFINQLANKVFDLTIDGGKMYLGDYQYYIEKVEEAEALKAHQEEQSVNVQAHEKSMEQSSYHNQKEQRREQRKLERQISECENEIETLETTILQIDEQLTQPEVYNNPQKANELAIQKQDSEQKLEHAMSKWEELQQKL >NZ_CP012756.1|WP_001283612.1|629223_629859_-|redox-sensing-transcriptional-repressor-Rex MSDQVKIPRATLKRLPLYYRFVSSLKSKGIDRVNSKAISDALQIDSATIRRDFSYFGELGKKGYGYNIDSLLDFFKSELSESDMIKIAIVGVGNLGKALLTYNFSIHDDMTITEAFDVKEDVIGQKIGNVIVKDNDELITTLKKEEIDVVILTTPERVAQKVADELVQAGVKGILNFTPGRINTPSDVQVHQIDLGIELQSLLFFMKNYSE >NZ_CP012756.1|WP_060649653.1|627840_628920_-|YeeE/YedE-family-protein MWMIFSGLIVGGLLGFVMQRTRFCLTGGFRDMYVQKNNKMFYALLIAITIQSIGLLILTATSILQIPAHSFPILGTVIGSFIFGIGIVLAGGCATGTWYRAGEGLIGSWIALVLYAVTAAITKTGILKPVMDKINQPTNVNSDMSQTTGIPFWGLVVILTIITIFLVVRTLNNKKVRVAVPKLKQRYTGIRYYLFEKRYHPFIAAIAIGLIALLAWPMSVSTGRNDGLGITTPSANLVHFLITGETKFIDWGVFLVLGIFIGSYIAARGSREFKWRLPDKITIRNSAIGGICMGFGASVAGGCSIGNGLVGTATMTWQGWIALASMIVGVWTMSHFIFVRPMKKVKQQSAKAQQQTQIV >NZ_CP012756.1|WP_000581077.1|627556_627781_-|sulfurtransferase-TusA-family-protein MIHELGTVGMVCPFPLIEAQKKMATLQSGDELKIDFDCTQATEAIPNWAAENGYPVTNYEQIDNASWTITIQKV >NZ_CP012756.1|WP_001052281.1|626097_627348_-|ammonium-transporter MNLNDTIFMFLCTLLVWLMTPGLSLFYGGLVQSKNALNTVMQSMAAIVLVTFVWVTVGFTISFGEGSLWFGNWEYTFLNHVGFATQEDISPHIPLALFMLFQMMFCTIAISILSGSIAEKMKFIPYLLFVVIWTALVYSPVAHWVWGGGWINKLGVLDFAGGTVVHITSGVSGLVLAIMIGKGNKHSESTPHNLIITLIGGIFVWIGWYGFNVGSAFTFDQIAMLAFTNTVISASAGAIGWLILEYIFKKTTSLLGLLLGALAGLVVITPAAGYVTYLSATIMALIGGICCYIVINYIKVKLKYHDALDAFGIHGVGGIIGAVLTAFFQSKKANPDIENGFIYTGDIHIVLVQILCVTAVVIFSIVMTFIIAKVIKLITPLSVTEQETNIGLDKIVHGEHAYFEGELNRFNKHIRY >NZ_CP012756.1|WP_000790314.1|624963_625914_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MKNISDIAKLAGVSKSTVSRFLNNGSISKKTSEKLTKIIAEHDYQPNQFAQSLRARQTHLIGAIIPRMNSYAVDETIKGLAKQCQKYESQLILNYTGLNIEAEIQALETLARSKVDGIVLMATDITEKHIEVINKMNVPIVIVGQQHEQLHSIVHDDYKAGQIIGEWIGQQGYQQVEVFSVSEKDIAVGIHRKRGLLDQLAKYQIKPNIHETNFTYVEAQKDVANVLENVEQVDAVVGATDTIALAAYKYYSDKKDVMKPHQIYGFGGDPMTQLVSPSIKTIHYNYFEAGKCAMEEIQQMLKKQDMPYSVTVDVNI >NZ_CP012756.1|WP_000141419.1|623330_624815_-|sucrose-6-phosphate-hydrolase MTEWTREERYQRIEDVDTEYFKTLKQQVDQSKFRQQFHIQPETGLLNDPNGLIFYKGKYYVSHQWFPLGAVHGLKYWYNYTSDDLINFKAEGPILNPDTKYDSHGVYSGSAFEYNGHLYYMYTGNHRDNHWQRHASQMIARLKEDGSVEKFPKPVISQQPEGYTSHFRDPKVFKYGEKYYAIIGAQNNDQQGRLLLYNTEDIINWHYLGEINTELDDFGYMWECPDYFNVDNQDVILICPQGIEPKDDQFNNIYQSGYILGTFDIEKLTYEHENFVELDNGFDFYAPQTFLDEKGRRVLIGWMGLPEIEYPTDNEGWAHCLTIPRVLNVENGQLKQRPYPALEKLRHNKETALGYANKFTRKLHPYEGKQYELIIDILDNDATEVYFELRTSKTSSTLIAYNKRENKITLDRSDSGLLPTNVEGTTRSTILDTPLKQLQIFVDTSSIEIFCNDGERVLTSRIFPTEDALGIKTSTESGQVYLQFTKYDLKDEHK >NZ_CP012756.1|WP_001253296.1|622374_623334_-|carbohydrate-kinase MRRLFSIGEALIDFIPNITNANLKDVQTFTKQIGGAPCNVACTVQKLGQQAHMITQLGNDAFGDSIVETISSIGVDVSNVYRTNEANTALAFVSLTEAGERDFSFYRKPSADMLFEPSFVNDIDVNENDVVHFCSVDLVDSPMRDAHYQLITKTLNANGTVVFDPNVRLPLWDNAEDLRQTIHTFLPLAHIVKVSDEELEFITGIDDENEAIQSLFKGNVTVVIYTKGADGAAIYLKNGINHYHSGYKVKPVDTTGAGDAFIGAVISRILATDVLNLTQLFENEGEEILAFSNSVAAIVTTKYGAINSLPTLQEVEQAF >NZ_CP012756.1|WP_000159047.1|634381_635407_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-transferase-subunit-TsaD MTKDILILAVETSCDETSVSVIKNGRDILSNTVLSQIESHKRFGGVVPEVASRHHVEGITTTINEALVDADVSMEDIDAIAVTEGPGLIGALLIGVNAAKALAFAYDKPLIPVHHIAGHIYANHIEEPLTFPLIALIVSGGHTELVYMKDHLTFEVIGETRDDAVGEAYDKVARTIGLNYPGGPQVDRLAAEGEDTYSFPRVWLDKDSYDFSFSGLKSAVINQLHNQRQKNIPIIEANVATSFQNSVVEVLTFKAIQACKEYGVQRLIVAGGVASNKGLRQSLADQCKVNDIQLTIPSPKLCTDNAAMIGVAGHYLYQQGRFADLALNGHSNIDLEEYSAE >NZ_CP012756.1|WP_000372753.1|635399_635864_-|ribosomal-protein-S18-alanine-N-acetyltransferase MDQQSKEQLNIRAMTKEDVPQVFDIERRSFNDSSWTIDAFYHEIEQNNFAKYFVLEFEQQIIGYLGLWIVIDQAQITTVAIDDNYRGYGLGQMLLKYGINYASHTCDVMSLEVRVNNKVAQHVYENLGFQYGGKRKNYYGEGEDAMVMWVNLND >NZ_CP012756.1|WP_001086733.1|635836_636499_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-dimerization-subunit-type-1-TsaB MNSLLIDTSNQPLSVALMQNDEVLAEITTDSKQNHSVQLMPAISQLFEQSKIAKQQLDAIIVAEGPGSYTGLRIGVTVAKTLAYALDVKLYGVSSLKALAATIDHTDKLLVPVFDARRQAVYAGIFQWQNGQLVTILEDQYMSIEALRAFLEDLNQPFIYIGKDTVKLQDELQGDVIAQLPNASVMYQLIDKPSDVHTFTPKYHKLAEAERNWINSQKNN >NZ_CP012756.1|WP_000590801.1|636479_636941_-|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-ATPase-subunit-type-1-TsaE MIKINNLDEMNQFAMFLVEQLKSGDLILLNGDLGAGKTTLTQFIGKALGVRRTINSPTFNIIKSYRGKNLKLHHMDCYRLEDSDEDLGFDEFFEDQAITVIEWSQFIKDLLPATHLSINISTISENSRQIDLFAQGEHYEQIKEAIIHEFAAH >NZ_CP012756.1|WP_001791591.1|636978_637134_+|hypothetical-protein MIIHCSIVSNFIFNLYIVTNFNLNFLSLKQIISSKLIVRKFKIFVDILKQI >NZ_CP012756.1|WP_001255780.1|637451_639140_+|dihydroxy-acid-dehydratase MRSDMIKKGDHQAPARSLLHATGALKSPTDMNKPFVAICNSYIDIVPGHVHLRELADIAKEAIREAGAIPFEFNTIGVDDGIAMGHIGMRYSLPSREIIADAAETVINAHWFDGVFYIPNCDKITPGMILAAMRTNVPAIFCSGGPMKAGLSAHGKALTLSSMFEAVGAFKEGSISKEEFLDMEQNACPTCGSCAGMFTANSMNCLMEVLGLALPYNGTALAVSDQRREMIRQAAFKLVENIKNDLKPRDIVTREAIDDAFALDMAMGGSTNTVLHTLAIANEAGIDYDLERINAIAKRTPYLSKIAPSSSYSMHDVHEAGGVPAIINELMKKDGTLHPDRITVTGKTLRENNEGKEIKNFDVIHPLDAPYDAQGGLSILFGNIAPKGAVIKVGGVDPSIKTFTGKAICFNSHDEAVEAIDNRTVRAGHVVVIRYEGPKGGPGMPEMLAPTSSIVGRGLGKDVALITDGRFSGATRGIAVGHISPEAASGGPIALIEDGDEITIDLTNRTLNVNQPEDVLARRRESLTPFKAKVKTGYLARYTALVTSANTGGVMQVPENLI >NZ_CP012756.1|WP_000047819.1|639172_640942_+|biosynthetic-type-acetolactate-synthase-large-subunit MSKTQHEVNQNIDPLKMAESLEPEQLNEKTLNDMRSGSEVLVEALLKENVDYLFGYPGGAVLPLYDTFYDGKIKHILARHEQGAVHAAEGYARVSGKTGVVVVTSGPGATNVMTGITDAHCDSLPLVVFTGQVATPGIGKDAFQEADILSMTSPITKQNYQVKRVEDIPKIVHEAFHVANSGRKGPVVIDFPKDMGVLATNVDLCDEINIPGYEVVTEPENKDIDTFISLLKEAKKPVVLAGAGINQSKSNQLLTQFVNKHQIPTVTTLLGLGAVPYEDTLFLGMGGMHGSYASNMALTECDLLINLGSRFDDRLASKPDAFAPNAKIVHVDIDPSEINKVIHVDLGIIADCKRFLECLNDKNVETIEHSDWVKHCQNNKQKHPFKLGEEDQVFCKPQQTIEYIGKITNGEAIVTTDVGQHQMWAAQFYPFKNHGQWVTSGGLGTMGFGIPSSIGAKLANPDKTVVCFVGDGGFQMTNQEMALLPEYGLDVKIVLINNGTLGMVKQWQDKFFNQRFSHSVFNGQPDFMKMAEAYGVKGFLIDKPEQLEEQLDAAFAYQGPALIEVRISPTEAVNPMVPSGKSNHEMEGL >NZ_CP012756.1|WP_000196911.1|640941_641196_+|ACT-domain-containing-protein MTRILKLQVADQVSTLNRITSAFVRLQYNIDTLHVTHSEQPGISNMEIQVDIQDDTSLHILIKKLKQQINVLTVECYDLVDNEA >NZ_CP012756.1|WP_072399972.1|641317_642337_+|ketol-acid-reductoisomerase MEEFIMTTVYYDQDVKTDALQGKKIAVVGYGSQGHAHAQNLKDNGYDVVIGIRPGRSFDKAKEDGFDVFPVAEAVKQADVIMVLLPDEIQGDVYKNEIEPNLEKHNALAFAHGFNIHFGVIQPPADVDVFLVAPKGPGHLVRRTFVEGSAVPSLFGIQQDASGQARNIALSYAKGIGATRAGVIETTFKEETETDLFGEQAVLCGGVSKLIQSGFETLVEAGYQPELAYFEVLHEMKLIVDLMYEGGMENVRYSISNTAEFGDYVSGPRVITPDVKENMKAVLTDIQNGNFSNRFIEDNKNGFKEFYKLREEQHGHQIEKVGRELREMMPFIKSKSIEK >NZ_CP012756.1|WP_000094576.1|642366_643896_+|2-isopropylmalate-synthase MSSHIQIFDTTLRDGEQTPGVNFTFDERLRIALQLEKWGVDVIEAGFPASSTGSFKSVQAIAQTLTTTAVCGLARCKKSDIDAVYEATKDAAKPVVHVFIATSPIHLEHKLKMSQEDVLASIKEHVTYAKQLFDVVQFSPEDATRTELPFLVKCVQTAVDAGATVINIPDTVGYSYHDEYAHIFKTLTESVTSSNEIIYSAHCHDDLGMAVSNSLAAIEGGARRIEGTVNGIGERAGNAALEEVALALYVRNDHYGAQTALNLEETKKTSDLISRYAGIRVPRNKAIVGQNAFSHESGIHQDGVLKHRETYEIMTPQLVGVSTTELPLGKLSGKHAFSEKLKALGYDIDKEAQIDLFKQFKAIADKKKSVSDRDIHAIIQGSEHEHQALYKLETLQLQYVSSGLQSAVVVVKDKEGHIYQDSSIGTGSIVAIYNAVDRIFQKETELIDYRINSVTEGTDAQAEVHVNLLIEGKTVNGFGIDHDILQASCKAYVEAHAKFAAENVEKVGN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012756_3 | 841270-841408 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012756_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012756_3
>3.1|841321|37|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012756_3
The CRISPR arrays of NZ_CP012756_3 >merge|NZ_CP012756|3|841270-841408|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGATTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA >NZ_CP012756|3|3|841270-841408|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA TTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA
>NZ_CP012756.1|WP_000136271.1|840972_841152_-|hypothetical-protein MTEIVEFLSDGKLASRLEIQETMGLQKSYTSELIAELKKLEIIGSEGRGLGTRYYLIRD >NZ_CP012756.1|WP_031926723.1|840140_840323_-|hypothetical-protein MKDSIFWKKAFIPVYFIVAMLVFLLFRFCIKTDNFSIYLMIIFLICLGTASIIYNYKTNR >NZ_CP012756.1|WP_000130129.1|838005_839670_-|acetolactate-synthase-AlsS MTDKKYTAADIVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGVVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPVESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGVISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELDTQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISEKVDEPFINQQHLDELEQLRTHIDEETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDDTTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVNFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN >NZ_CP012756.1|WP_000186133.1|837264_837969_-|acetolactate-decarboxylase MTNVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHVRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFINANIDYKDIADEIREAE >NZ_CP012756.1|WP_000769708.1|836464_836890_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNSIDPSTIKQIQIVVK >NZ_CP012756.1|WP_000044373.1|835354_836170_-|HAD-IIB-family-hydrolase MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVMTAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSTGNHNKDRRILESLVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY >NZ_CP012756.1|WP_060649674.1|833605_835123_+|glycosyltransferase MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKEVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKKYARYFKDNNYIMYKKWINGQLSHIDYFQNRKRIKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKVFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYPKVENMQNNDVKKIFTIHTNHFLSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKELDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAVSFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRGLYTKASLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKKIIHVLKKETLISQFSENARTTIKTNFSYEAVSKKWIELIDEKSK >NZ_CP012756.1|WP_060649673.1|833317_833596_+|hypothetical-protein MTFNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIIFNGSNPYLALNHIIVTEIENYSSLEAFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK >NZ_CP012756.1|WP_001044447.1|831588_832443_-|M23-family-metallopeptidase MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKREFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTMEQIWIDKANQFGVAVIWKNNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTHKNQGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVNGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDINGKVGNSGDSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFLNNRELIKGDVVCGLQGE >NZ_CP012756.1|WP_060649672.1|828966_831390_+|polysaccharide-lyase-8-family-protein MTYRMKKWQKLSTITLLMAGVITLSDGEFRSVDKHQIAVADTNTQTPNYEKLKNTWLDVNYGYDKYDESNPDMKKKFEATENEAKKLLSEMKTESGRTYLWESSKDIDTKSADMTRTYRNIEKIAEAMNHKDTKLNTQDNKNKVKDALEWMHKNAYGKEPDKKVADLTSNFKNKTSRNTNLNWWDYEIGTPRALTNTLLLLNGAISNDEKKKYTAPIKTFAPKSDKILSSVGQPEQAKGGNLVDISKVKLLESIIEEDATMMKESIDAFNKVFTYVQSNATGKERNGFYKDGSYIDHKDVPYTGAYGVVLLEGISQMMPMIKETPFNDSNQNDTTLKSWIDDGFMPLIYKGEMMDLSRGRAISRENETSHTASATVMKSLLRLSDAMDESTKAKYKQIVKTSVKSDSTYGQNDTLSSYSDISKMKSLMEDSTISTNGLTQQLKIYNDMDRVTYHNKDLDFAFGLSMTSKNVARYESINGENLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATANMKQLAGTTTIENEEPKGMDVKKSSKTFVGGTKFDDQHASIGMDFENQDKTLTAKKSYFILNDKIVFLGTGIKSTDSSKNPVTTIENRKANGYTLYTDDKQTTTSNDQETNSVFLESTDTKKNIGYHFLNESKITVKKESHTGKWSDINKSQKQDSKTNQYYEVTQKHSNTDSKYAYVLYPGLSKDDFNTKKDKVTVVKQDDGFHVVKDNESVWAGVNYSNSTQTFDINNTKVEVKAKGMFILKKKDDKTYECSFYNPESTNTASDIESKISMTGYSITNKNTSTSNESGVRFELTK >NZ_CP012756.1|WP_000170975.1|843184_843583_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR >NZ_CP012756.1|WP_001250038.1|843596_844034_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >NZ_CP012756.1|WP_001221849.1|844273_845077_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNKAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKTDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEISDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND >NZ_CP012756.1|WP_000791631.1|845081_845888_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKNKLIIGRYLPNDSYVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFFCHSPLTYLWVLALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGLYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPIAIILFVLKYSGV >NZ_CP012756.1|WP_000027572.1|845877_846738_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MSIRFNDVSYTYQQGTPYEHQAIHDINTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALIKPTSGTVTIDDVTVTHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMDLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSVLAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKTIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKEKEKLAGWHIGLPDIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK >NZ_CP012756.1|WP_000389670.1|846734_847544_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIENVKSGEIFYNNQTITDDNFEKLRKDIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRKVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKMSQLLGNRTSFLTYEGLVNQL >NZ_CP012756.1|WP_000542274.1|848081_848450_-|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV >NZ_CP012756.1|WP_000569649.1|848466_849411_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED >NZ_CP012756.1|WP_000101625.1|849485_849875_-|30S-ribosomal-protein-S11 MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV >NZ_CP012756.1|WP_000090796.1|849898_850264_-|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGVDIPREKRVVISLTYIYGIGTSTAQKILEEANVSADTRVKDLTDDELGRIREVVDGYKVEGDLRRETNLNIKRLMEISSYRGIRHRRGLPVRGQKTKNNARTRKGPVKTVANKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012756_4 | 1030452-1030549 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012756_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012756_4
>4.1|1030482|38|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012756_4
The CRISPR arrays of NZ_CP012756_4 >merge|NZ_CP012756|4|1030452-1030549|CRISPRCasFinder CGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG >NZ_CP012756|4|4|1030452-1030549|CRISPRCasFinder CGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTC CGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG
>NZ_CP012756.1|WP_000019132.1|1029379_1030246_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNEITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP012756.1|WP_001125208.1|1028366_1029053_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP012756.1|WP_000762708.1|1028108_1028213_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP012756.1|WP_000038955.1|1026495_1027935_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIEMMNQIKIDTMLHGYHAGFLFALLITVISFFCSFMLQGKKKEVDSHQ >NZ_CP012756.1|WP_000825936.1|1025595_1026375_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVVIAFVFILAACGNNSSKDKEASKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKAEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSKSAFAFSKKVDDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP012756.1|WP_000479574.1|1024895_1025615_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQLHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKVLRSIARVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYRQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVVSTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP012756.1|WP_000615468.1|1024167_1024899_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVGKGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEIFNNPKTEELKRFLNVINEE >NZ_CP012756.1|WP_000819841.1|1022202_1022565_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFEHKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP012756.1|WP_000162809.1|1021584_1022184_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAEDHHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NZ_CP012756.1|WP_000727758.1|1019745_1021293_-|zinc-ABC-transporter-substrate-binding-lipoprotein-AdcA MKKKLGMLLLVPAVTLSLAACGNDDGKDKDGKVTIKTTVYPLQSFAEQIGGKHVKVSSIYPAGTDLHSYEPTQKDILSASKSDLFMYTGDNLDPVAKKVASTIKDKDKKLSLEDKLDKAKLLTDQHEHGEEHEHEGHDHEKEEHHHHGGYDPHVWLDPKINQTFAKEIKDELVKKDPKHKDDYEKNYKKLNDDLKKIDNDMKQVTKDKQGNAVFISHESIGYLADRYGFVQKGIQNMNAEDPSQKELTKIVKEIRDSNAKYILYEDNVANKVTETIRKETDAKPLKFYNMESLNKEQQKKDNITYQSLMKSNIENIGKALDSGVKVKDDKAESKHDKAISDGYFKDEQVKDRELSDYAGEWQSVYPYLKDGTLDEVMEHKAENDPKKSAKDLKAYYDKGYKTDITNIDIKGNEITFTKDGKKHTGKYEYNGKKTLKYPKGNRGVRFMFKLVDGNDKDLPKFIQFSDHNIAPKKAEHFHIFMGNDNDTLLKEMDNWPTYYPSKLNKDQIKEEMLAH >NZ_CP012756.1|WP_001791249.1|1030743_1030848_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKKVLYGEMQ >NZ_CP012756.1|WP_000792548.1|1030942_1032253_+|immunoglobulin-binding-protein-Sbi MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQSSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNKYYQFKGLIDQTVLTTIGSGYGSYIKPLEIKENSGFAQKSYAQVRNYVTESINTGKVLYAFYQKPELVKTAIKAQETASSIKNTISKLLSFWK >NZ_CP012756.1|WP_000916711.1|1034297_1035245_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENARAANDTEDIGKGNDVEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDPNVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFVTASGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSGDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFKNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_CP012756.1|WP_001056918.1|1035246_1036224_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MNMNKLVKSSVATSMALLLLSNTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKAAGNINSGYERPNPKDYDFSKIYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNYKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETEINK >NZ_CP012756.1|WP_000200951.1|1036282_1036750_-|QueT-transporter-family-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASILGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLVVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NZ_CP012756.1|WP_000286885.1|1036760_1037453_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQNLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGSIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_CP012756.1|WP_000971558.1|1037463_1038579_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKTVGYIDRQYIEVENQRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKNDFEKFMRKYSYHLSSSRLISGSSAAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLTLFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKSLNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQILLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >NZ_CP012756.1|WP_001046647.1|1038556_1039564_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYGTCENKENKNDVSRAN >NZ_CP012756.1|WP_001110067.1|1039565_1040924_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKCKLLSHIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPLLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC >NZ_CP012756.1|WP_001217908.1|1040901_1041588_-|dethiobiotin-synthase MRIFITSTNTDVGKTYVTKHLYHALKRRGHRVCVFKPFQTEERQDGTFPDLEVFKNECDLSYDITSLYTFKQPVSPHLAFKMADQIFLNKQRVLDKVKVLDKEFDFILVEGAGGIGVPIYEDTDDFYMTKDLINDCADCVISVLPSKLGAISDAIVHQDYVNQNVSVNNFLIMNRYTDSYIEKDNQMTIEKLTNKTVYTFEEHATYENFSEAFLKQLIGVKNELHTTT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012756_5 | 1407844-1408306 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012756_5
|
6 spacers
spacers of NZ_CP012756_5
>5.1|1407879|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT TATAAACCCGTTCAATTCGTTATCTTTAAATTCTTG >5.2|1407950|37|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT TACAACTTCGTCATCTTTCATCATTTCTCTTACATCA >5.3|1408022|37|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT TATATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTA >5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT TAAGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGG >5.5|1408165|34|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT CTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA >5.6|1407881|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder TAAACCCGTTCAATTCGTTATCTTTAAATTCTTG >5.7|1407952|35|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder CAACTTCGTCATCTTTCATCATTTCTCTTACATCA >5.8|1408024|35|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder TATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTA >5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder AGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGG >5.10|1408167|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder CATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA >5.11|1408236|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder GTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT >5.12|1408234|36|NZ_CP012756|CRT CGGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT |
cas1,cas2,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csm6,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012756_5
The CRISPR arrays of NZ_CP012756_5 >merge|NZ_CP012756|5|1407844-1408306|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATATAAACCCGTTCAATTCGTTATCTTTAAATTCTTGGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATACAACTTCGTCATCTTTCATCATTTCTCTTACATCAGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATATATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTAGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATAAGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGGGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAACTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTAGATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAACGGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGTGATCGATAACTATCCCGAATAACAGGGGACAGAGTGT >NZ_CP012756|5|1|1407844-1408233|PILER-CR GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TATAAACCCGTTCAATTCGTTATCTTTAAATTCTTG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TACAACTTCGTCATCTTTCATCATTTCTCTTACATCA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TATATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TAAGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA CTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA >NZ_CP012756|5|5|1407844-1408306|CRISPRCasFinder GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATA TAAACCCGTTCAATTCGTTATCTTTAAATTCTTG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATA CAACTTCGTCATCTTTCATCATTTCTCTTACATCA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATA TATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAATA AGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAACT CATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAACG GTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT GATCGATAACTATCCCGAATAACAGGGGACAGAGTGT >NZ_CP012756|5|1|1407844-1408304|CRT GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TATAAACCCGTTCAATTCGTTATCTTTAAATTCTTG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TACAACTTCGTCATCTTTCATCATTTCTCTTACATCA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TATATTTCTTCCATGAATAACACCCTCCTTTTTTCTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA TAAGTTAACGGCATTACCTAATAAAAATATTTTAGG GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA CTCATCTTTCATGTCACTGATTAATTCATTTGTA GATCGATAACTACCCCGAATAACAGGGGACGAGAA CGGTAATAGTTGCTCAATAGGTAATAAAACGTCGGT GATCGATAACTATCCCGAATAACAGGGGACAGAGT
>NZ_CP012756.1|WP_072093071.1|1407118_1407430_-|DUF3387-domain-containing-protein MLSDDFLKDVEGLKQKNVAVELLNRLLKGQVKSLMKTNATVSKRFSEMLRNSINKYNSRSIETSKVIEELIQLAKDIKQEQQRGNELGLNSDEIAFLRCFSFT >NZ_CP012756.1|WP_001015193.1|1406605_1406827_+|hypothetical-protein MNHETTHSDWRTVANCLASQNYISIVKGLVHHFTAIEDEEILDKIYEDFMNNGSITTVLNNDLQDIINYYLSK >NZ_CP012756.1|WP_001092190.1|1406087_1406591_+|DUF1643-domain-containing-protein MNTIKSTIHTEAIFSDDEQHRYLLKKTWDEKKPVCTVITMYPHLDGVLSLDLTTVLILNQLANSEQYGAVYLVNLFSNIKTPENLKHIKEPYDKHTDIHLMKAISESDTVILAYGAYAKRPVVVERVEQVMEMLKPHKKKVKKLINPATNDIMHPLNPKARQKWILK >NZ_CP012756.1|WP_001024805.1|1405761_1406073_+|hypothetical-protein MNINRYITRGISEQLSLDLQILLWHMVEEKDNQPHTDYLHIFKLQEDDNMLSITHEQEQPAYKLEYHYINYEKNQNALPKKVYVIREDDVDVFYYVMLLPEEY >NZ_CP012756.1|WP_000175888.1|1405329_1405668_+|hypothetical-protein MTLSKQLKTYITERFKLNYQETWACETIDAVAEDVLPEKYIKNSPLEHKILNTFTYYNDELHEISIYPFLCYLDKELVAIGYLDNFDLDFIFLNDTHQIIIDERYLLQKGGE >NZ_CP012756.1|WP_000676592.1|1403561_1405241_+|recombinase-family-protein MKGKIALYSRVSTSEQSEHGYSEKEQEQLLIKEVMKNFPGYDYETYTDSGISGKNIEGRPAMKRLLQDVKDNKIEMVLSWKLNRISRSMRDVFNIIHEFKEHDVGYKSISENIDTSNASGEVLVTMFGLIGSIERQTLISNVKLSMNAKARSGEAITGRVLGYKLSLNPLTQKNDLVIDENEAHIVREIFDLYLNHNKGFKAITTILNQKGYRTINQKPFSVFGVKYILNNPVYKGYVRFNNHQNWAVQRRSGKSDKNDVILVKGKHEAIISEDVFDQVHEKLASKSFKPGRPIGGDFYLRGLIKCPECGNNMVCRRTYYKTKKSKERTIKRYYICSLFNRSGSSACHSNAINAEVVERVINVHLNRILSQPNVIKQIASSVIEELKQKHSKQTEIKYDIDSLEKQKAKVKTQQERLLELFLDDEMDSEMLKAKQSEMNQQLEVLDQQIKEAKQANQSQDDIPNFDKLKARLILMITRFSVYLRKATPEAKNQLMKMLIDSIEITTDKQVKLVRYKIDESLIPQSLKKDWGSFFIPKFNFVINVTKKNRIENLSLLPLF >NZ_CP012756.1|WP_001015575.1|1401720_1403337_+|primase MNHILEMLIKLLKVGMEAIDRKGLIAILTSSIGNDEMDDSEQAVMVYNELIDKLQLNIPKDVDYRPNIYSYFGIQKKPNDTILVEMMICIFHIKRFDSELFVFKDKGWQKVSEDELQGLISKMIQVLLVDYKPSLSTLKNVVDGIQKSTDIEKLVEHRQYIGCGRNMFNLKTFKVVDNDLEIFPKTRLDLELDINDTITDKIPPNFKQYMLELANYDHDLQYFLFQHMAVLLTADTKLRRGLFLYGTAKNGKSVYIKLVKSFFYSNDIVSKTLNELGGRFDKESLIGKRIMASDEVGKANIDEATVNDFKKLLSVEPIHADRKGRTQVEVTLDLKLIFNTNAVLNFPSSHAKALERRIAVIPCEYYVEKADPDLIEKLQDEKKEIFLYLMYVYKQIVKNDIEYLQNDRVTEISHDWLNFGYEFVSSKSANIAHQKACINLLRKLIEIKPGSRIKVSRLNEVIRDEIKVSSQVINDLVQANFNVQSRLNNGYKYWVDLGWKETDKKDDMISFDKNENVTDDEFLYEDDLNLGWEDFDDE >NZ_CP012756.1|WP_001058155.1|1401352_1401721_+|hypothetical-protein MNNDRGKSLQIPQSTLLKEGSIYVATLHSVYEKNFSGDIKHQFTYEVELNQETHYVNRNITVKSMSHQLSIADWIKRHSNYNVNHINYDPYIDRKHLVLVGQYNGNYYIQDVAPLDEFGGVL >NZ_CP012756.1|WP_000283873.1|1400250_1401360_+|hypothetical-protein MYQANIRDLITKLPQSNKTEHFLMNKFSNQDKVQQLQRQISQQLDQQYNELLANEKAKLDQYVEVHHNLEPLKKEIESESINLDTDKLPDIKATMLEKAKNDEHFDKIEQLFDRLDQSLNGTNRLYTQLSLIGTRTHRITTKRFNVQGLPKLVQQMILPSQFKKVYTIDFKSFEPSVAAYMTQDEQLIDYLNHEEGLYDALLRDLSLSKEKRVSVKRAFIGSFLFGGRYSSSKFKINQEVSEINWLQVMSKFKKVIEFKEQVEKYKTMPTPYGIEHDMSAFQGSSIMAIYVQTVASYIFKHILLEVYKAQCEKKTFKIIVPIHDAIMIECNDKGIAQNVAQLMKDTANQLFNGEFAHVTVEALGGIDNE >NZ_CP012756.1|WP_001038847.1|1398067_1400056_+|hypothetical-protein MNKNITALKSTENTTYMQYTVHIDDQIINNIKECTKKFKILPMEDKIPLSPLLQPEYAGEVQDFISTYEQFMINFGKVILDSQGIKIQFESESLSSIQRGIQEHCYLNERTNDIDVTKEWYLCKFSNQILEEDKNQLYNALKQLMNDSKNKKQAFQEVFKVHIDIYLYNKEKSEYKYQVSSYFNLVKENPKITYKKRHLQEKQGVKGTTFTNKLKLLNKMYGVDVAKYQPFYNSNNPEYERGQFGERYISQRSNYEFNRLQYQIIDMLSKILDKHPLPKSDNNYKHIPTIEKAILSGDSHSFYEYFEDIMKEIISMENSSLKEKLLTDFTYQSQCRWYSESEKLKLQLESFMHKVLESNYYEGNKLYRMLSHAIEETINEADEDKVHFNYFKDYFLTDGGVKNWEQISEKITEFNGKVINDIQNEYNKIQFNNANRNQKLNFNYLYHCFEFSNNLVKARVNGNRGYILYFVDKYKIKMPFLDQLLINYLNQEIGQESINYNMQTLFEKERYDRSSTIEKLVATSKFKYEKDDSDLFKQLFNDVENSIDRLGIYLLNNGINSNDENARYYRSFLKELSRIKSKLTPFSLEISKSSGREQHYPDDAIDDKDERRKNKEETYHAFDDKSDIDSKLKNKINVSIDNLLSVKIKSNLYDISPNTKKQ >NZ_CP012756.1|WP_000655859.1|1408378_1409284_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKDVIYVENHYFVTVKENSIKFRNVIDKSEKFYLFEEIEAIIFDHYKSYFSHKLVIKCIENDIAIIFCDKKHSPLTQLISSYGMTHRLQRIQSQFQLSGRTRDRIWKKIVVNKIINQSKCLENNLHNENVKLLVNLAKDVSSGDKSNKEAQAARIYFKDLYGKQFKRGRYNDIINSGLNYGYSILRSFIKKELALHGFEMSLGINHRSKENPFNLADDIIEVFRPFVDNIVYEIVFKKNINTFDVNEKKLLLNVLYEKCIIDKKVVRLLDSVKIVIQSLIRCYEENTPTYLLLPKMIEVGN >NZ_CP012756.1|WP_000281076.1|1409283_1409589_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYLLVSFDLPRDTKFERRVASKYRTRLLELGFSMKQFSLYERYVSDVQKKDKILEILQQEIPDTGSITLYVLPDEVNNSQITILGKEVKVVVRKEPKLIFL >NZ_CP012756.1|WP_000359017.1|1409602_1411876_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MDKKTTLMYGSLLHDIGKIIYRSNDHAFARGTHSKLGYNFLSQFSEFKDNEVLDSIAYHHYKELAKANLANDNTAYITYIADNIASGIDRRDVIEEGDEEYEKQAFNFDKYTPLYSVFNIVNSEKLKQISGKFKFSNESNIEYPKTENIQYSSGNYTTLMKDMSYDLEHKLSIKEDTFPSLLQWTESLWQYVPSSTNKNQLIDISLYDHSRITCAIASCIFDYLNENNIHNYKDELFTKYENTKEFYQKEAFLLLSMDMSGIQDFIYNISGSKALKSLRSRSFYLEIMLEVIVDQLLEKLELTRANLLYTGGGHAYLLVSNTDKGKEKINQFNTELKNWFMSEFTTDLSLSIAFEKCSGNDLMNTSGNYRNIWRNVSSKLSDIKAHKYSSEDILKLNHFHSYGDRECKECLRSDIDINDDGLCSICEGIINISNDLRDKSFFVLSETGKLKMPFDKFISVIDYEEAERLAQNNNHIRIYSKNKPYIGVGISTNLWMCDYDYASQNKDMREKGIGSYVEREEGIKRLGVVRADIDNLGATFISGIPEKYNSISRTATLSRQLSLFFKYELNHLLENYQITAIYSGGDDLFLIGAWDDIIEVSVYINEKFKDFTLGKLTMSAGVGMFSGKYPISKMAFETGLLEEAAKTDEKNQIALWVQEKVYNWDEFKKYILEEKLLVLQHGFSQTDEHGKAFIYKMLALLRNNETINIARLAYLLARSKMTEEFTSKIFNWAQNDKDKNQLITALEYYVYQIREVD >NZ_CP012756.1|WP_000599362.1|1411878_1412304_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MILAKTKSGKKIDLTFAHEVVKSNVKTVKDKRGKENQVLFNGLTTSKLRNLMEQVNRLYTIAFNSTEDQLNEEFIDELEYLKIKFYYEAGREKSVDEFLKKTLMFPIIDRVIQKESKKFFLDYCKYFEALVAYAKYYQKED >NZ_CP012756.1|WP_000286998.1|1412305_1412950_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYSKIKISGTIEVVTGLHIGGGGESSMIGAIDSPVVRDLQTKLPIIPGSSIKGKMRSLLAKHFGLKMKQENHNQDDESVLRLFGSSEKGNIQRARLQISDAFFSEKTKEHFAQNDIAYTETKFENTINRLTAVANPRQIERVTRGSEFDFVFIYNVDEESQVENDFENIEKAIHLLENDYLGGGGTRGNGRIQFNDITIETVVGEYDSTNLKIK >NZ_CP012756.1|WP_000208937.1|1412960_1413869_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MTTKVFKLSFKTPVHFGKKRLSDGEMTITSDTLFSALFIEALQLGIETDWLLNDLIISDTFPYENEIYYLPKPLIKIESKEEGNHKAFKKLKYVPVHHYNQYLNGELSAEDATDLNDIFSIGHFSLQTKVSLSAQEIDSSADSEPYSVGTFTFEPEAGLYFIAKGSEETLDQLKDIMTSLQYSGLGGKRNAGYGQFEYEIINNQQLFKLLNQNGEHSILLSTAMAKEDEIKSALKEARYILNKRSGFIQSTNYSEMLVKKSDFYSFSSGSVFKNIFNGDVFNVGHNGKHPVYRYAKPLWLEV >NZ_CP012756.1|WP_000153149.1|1413871_1414894_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MTIKNYEVVIKTLGPVHIGSGQVMKKQDYIYDFYNSKVYMINGNKLVKFLKRKNILDTYQNFLRYPPKNPRENGLKDYLDAQNVKQSEWKAFVSYSEKVNQGKKYGNIRPKPLNDLHLMVRDGQNKVYLPGSSIKGAIKTALVSKYNNEKNTDVYSKIKVSDSEPIDERHLAIYQKIDINKSEKPMPLYRECVDVDTEIKFKLTIEDEIYSINEIEQSIQDFYKNYYDKWLVGFKETKGGRRFALEGGMPDVLNQNILFLGAGAGFVSKTTHYQLKSREQAKRDSFDILTKKFRRTYGKMKEMPSNVPVALKGTTNQSLHVSYQQGMCKISFQELNNEVL >NZ_CP012756.1|WP_000865879.1|1414893_1416162_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm6 MKVLFSPIGNSDPWSNDRDGAMLHIVRHYKPDVVVLFFTESIWNGNRNIPGRKNFDWENIVSKVSSRTKVDIKVDSIKYENDFDSYKDIFHFYINEIRTKYSDAEILLNVTSGTPQMESTLCLEYISNPHNMKCIQVSTPAPIEGPKRSFAKLETVTEDLNKVNANEKMASNRSKSINIISFREVMVRSQIKSLVNNYDYEGALNLVSDQKSFRNGKLLRKRLLELTNQIKTHEVFPEINDKYRSVALKKSLFHYLLLNMRYNRLDVAETLIRVKSIAEFILKTYIVGHWPTLIIEKDDKPYLNAEDNLSFIYKYKLLLEKRRQNLDVSRILGLPAFIDILTVLEPNSKLLKEVNAVNDINGLRNSIAHNLETLDLDKNKNYKKIMLSVEAIKNMLHISFPEIEEKDYNYFERKNKEFRELL >NZ_CP012756.1|WP_000608705.1|1416158_1416893_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MINKITVELDLPDSIRFQYLGSILHGVLMDYLPNDIADQLHHEFAYSPLKQRIYHKNKKVIWEIVCMSDRLFNEIAELFTSKNRLFLKYYQVYIEIYSFNIEKVNVQNIMNQLLETEELNRYVRINIQTPMSFKYQSNYMIFPEVKRFFRSIMIQFDAFFEEYKMYDKETLDFLEKNINIVDYKLKSTRFNLEKVKIPSFTGEIVFKIKGPLPFLQLTHFLLKFGEFSGSGMKTSLGMGKYSII >NZ_CP012756.1|WP_000669699.1|1418002_1418161_+|hypothetical-protein MKFKSKQLVIANQTKVINYRIQVLLKPQANIETQTQVKNNTLPETDEQSNAD |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012756_6 | 1417028-1417275 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012756_6
|
3 spacers
spacers of NZ_CP012756_6
>6.1|1417061|39|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTCA >6.2|1417133|41|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder AACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT >6.3|1417207|36|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder,CRT AACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGC >6.4|1417061|38|NZ_CP012756|CRT AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTC >6.5|1417132|42|NZ_CP012756|CRT GAACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT |
cas6,csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas2,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012756_6
The CRISPR arrays of NZ_CP012756_6 >merge|NZ_CP012756|6|1417028-1417275|CRISPRCasFinder,CRT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAGAACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTCATTCGATAACTACCCCCGTAGAAGAGGGGACGAGAACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACTATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAGAACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGCATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG >NZ_CP012756|6|6|1417028-1417275|CRISPRCasFinder ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTCA TTCGATAACTACCCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGC ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG >NZ_CP012756|6|2|1417028-1417275|CRT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCTTCTAAGACGCGATATGATTCTAATTGGTCTTC ATTCGATAACTACCCCCGTAGAAGAGGGGACGA GAACTGATATACTCCTTTACCATGTATTAATTCTGGACCACT ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG AACTCATATTCGATCGTGTATATCAAAACTTTATGC ATTCGATAACTACCCCGTAGAAGAGGGGACGAG
>NZ_CP012756.1|WP_000608705.1|1416158_1416893_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MINKITVELDLPDSIRFQYLGSILHGVLMDYLPNDIADQLHHEFAYSPLKQRIYHKNKKVIWEIVCMSDRLFNEIAELFTSKNRLFLKYYQVYIEIYSFNIEKVNVQNIMNQLLETEELNRYVRINIQTPMSFKYQSNYMIFPEVKRFFRSIMIQFDAFFEEYKMYDKETLDFLEKNINIVDYKLKSTRFNLEKVKIPSFTGEIVFKIKGPLPFLQLTHFLLKFGEFSGSGMKTSLGMGKYSII >NZ_CP012756.1|WP_000865879.1|1414893_1416162_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm6 MKVLFSPIGNSDPWSNDRDGAMLHIVRHYKPDVVVLFFTESIWNGNRNIPGRKNFDWENIVSKVSSRTKVDIKVDSIKYENDFDSYKDIFHFYINEIRTKYSDAEILLNVTSGTPQMESTLCLEYISNPHNMKCIQVSTPAPIEGPKRSFAKLETVTEDLNKVNANEKMASNRSKSINIISFREVMVRSQIKSLVNNYDYEGALNLVSDQKSFRNGKLLRKRLLELTNQIKTHEVFPEINDKYRSVALKKSLFHYLLLNMRYNRLDVAETLIRVKSIAEFILKTYIVGHWPTLIIEKDDKPYLNAEDNLSFIYKYKLLLEKRRQNLDVSRILGLPAFIDILTVLEPNSKLLKEVNAVNDINGLRNSIAHNLETLDLDKNKNYKKIMLSVEAIKNMLHISFPEIEEKDYNYFERKNKEFRELL >NZ_CP012756.1|WP_000153149.1|1413871_1414894_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MTIKNYEVVIKTLGPVHIGSGQVMKKQDYIYDFYNSKVYMINGNKLVKFLKRKNILDTYQNFLRYPPKNPRENGLKDYLDAQNVKQSEWKAFVSYSEKVNQGKKYGNIRPKPLNDLHLMVRDGQNKVYLPGSSIKGAIKTALVSKYNNEKNTDVYSKIKVSDSEPIDERHLAIYQKIDINKSEKPMPLYRECVDVDTEIKFKLTIEDEIYSINEIEQSIQDFYKNYYDKWLVGFKETKGGRRFALEGGMPDVLNQNILFLGAGAGFVSKTTHYQLKSREQAKRDSFDILTKKFRRTYGKMKEMPSNVPVALKGTTNQSLHVSYQQGMCKISFQELNNEVL >NZ_CP012756.1|WP_000208937.1|1412960_1413869_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MTTKVFKLSFKTPVHFGKKRLSDGEMTITSDTLFSALFIEALQLGIETDWLLNDLIISDTFPYENEIYYLPKPLIKIESKEEGNHKAFKKLKYVPVHHYNQYLNGELSAEDATDLNDIFSIGHFSLQTKVSLSAQEIDSSADSEPYSVGTFTFEPEAGLYFIAKGSEETLDQLKDIMTSLQYSGLGGKRNAGYGQFEYEIINNQQLFKLLNQNGEHSILLSTAMAKEDEIKSALKEARYILNKRSGFIQSTNYSEMLVKKSDFYSFSSGSVFKNIFNGDVFNVGHNGKHPVYRYAKPLWLEV >NZ_CP012756.1|WP_000286998.1|1412305_1412950_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MYSKIKISGTIEVVTGLHIGGGGESSMIGAIDSPVVRDLQTKLPIIPGSSIKGKMRSLLAKHFGLKMKQENHNQDDESVLRLFGSSEKGNIQRARLQISDAFFSEKTKEHFAQNDIAYTETKFENTINRLTAVANPRQIERVTRGSEFDFVFIYNVDEESQVENDFENIEKAIHLLENDYLGGGGTRGNGRIQFNDITIETVVGEYDSTNLKIK >NZ_CP012756.1|WP_000599362.1|1411878_1412304_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MILAKTKSGKKIDLTFAHEVVKSNVKTVKDKRGKENQVLFNGLTTSKLRNLMEQVNRLYTIAFNSTEDQLNEEFIDELEYLKIKFYYEAGREKSVDEFLKKTLMFPIIDRVIQKESKKFFLDYCKYFEALVAYAKYYQKED >NZ_CP012756.1|WP_000359017.1|1409602_1411876_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MDKKTTLMYGSLLHDIGKIIYRSNDHAFARGTHSKLGYNFLSQFSEFKDNEVLDSIAYHHYKELAKANLANDNTAYITYIADNIASGIDRRDVIEEGDEEYEKQAFNFDKYTPLYSVFNIVNSEKLKQISGKFKFSNESNIEYPKTENIQYSSGNYTTLMKDMSYDLEHKLSIKEDTFPSLLQWTESLWQYVPSSTNKNQLIDISLYDHSRITCAIASCIFDYLNENNIHNYKDELFTKYENTKEFYQKEAFLLLSMDMSGIQDFIYNISGSKALKSLRSRSFYLEIMLEVIVDQLLEKLELTRANLLYTGGGHAYLLVSNTDKGKEKINQFNTELKNWFMSEFTTDLSLSIAFEKCSGNDLMNTSGNYRNIWRNVSSKLSDIKAHKYSSEDILKLNHFHSYGDRECKECLRSDIDINDDGLCSICEGIINISNDLRDKSFFVLSETGKLKMPFDKFISVIDYEEAERLAQNNNHIRIYSKNKPYIGVGISTNLWMCDYDYASQNKDMREKGIGSYVEREEGIKRLGVVRADIDNLGATFISGIPEKYNSISRTATLSRQLSLFFKYELNHLLENYQITAIYSGGDDLFLIGAWDDIIEVSVYINEKFKDFTLGKLTMSAGVGMFSGKYPISKMAFETGLLEEAAKTDEKNQIALWVQEKVYNWDEFKKYILEEKLLVLQHGFSQTDEHGKAFIYKMLALLRNNETINIARLAYLLARSKMTEEFTSKIFNWAQNDKDKNQLITALEYYVYQIREVD >NZ_CP012756.1|WP_000281076.1|1409283_1409589_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYLLVSFDLPRDTKFERRVASKYRTRLLELGFSMKQFSLYERYVSDVQKKDKILEILQQEIPDTGSITLYVLPDEVNNSQITILGKEVKVVVRKEPKLIFL >NZ_CP012756.1|WP_000655859.1|1408378_1409284_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKDVIYVENHYFVTVKENSIKFRNVIDKSEKFYLFEEIEAIIFDHYKSYFSHKLVIKCIENDIAIIFCDKKHSPLTQLISSYGMTHRLQRIQSQFQLSGRTRDRIWKKIVVNKIINQSKCLENNLHNENVKLLVNLAKDVSSGDKSNKEAQAARIYFKDLYGKQFKRGRYNDIINSGLNYGYSILRSFIKKELALHGFEMSLGINHRSKENPFNLADDIIEVFRPFVDNIVYEIVFKKNINTFDVNEKKLLLNVLYEKCIIDKKVVRLLDSVKIVIQSLIRCYEENTPTYLLLPKMIEVGN >NZ_CP012756.1|WP_072093071.1|1407118_1407430_-|DUF3387-domain-containing-protein MLSDDFLKDVEGLKQKNVAVELLNRLLKGQVKSLMKTNATVSKRFSEMLRNSINKYNSRSIETSKVIEELIQLAKDIKQEQQRGNELGLNSDEIAFLRCFSFT >NZ_CP012756.1|WP_000669699.1|1418002_1418161_+|hypothetical-protein MKFKSKQLVIANQTKVINYRIQVLLKPQANIETQTQVKNNTLPETDEQSNAD >NZ_CP012756.1|WP_000377077.1|1419587_1420103_+|hypothetical-protein MDSHLNHILSYWQGPPLEGAKTIISKYGYPQEATMRRLIWYNSGPWKRTIVYKDPVPHNFPTPHLDFLKQTIDYKVPVHLYDAIAAFDGSVYLDRTTGEASAKCHEEAMNFLSLNLLNDIVTGKRDVQGAKAFYAQTAEQFTKYHITSPYTEGFLFPMQYNTADLGVTYFK >NZ_CP012756.1|WP_000790334.1|1420297_1420948_-|organomercurial-lyase-MerB MKNISEFSAQLNQTFDQGEAVSMEWLFRPLLKMLAEGDPVPVEDIAAETGKPVEEVKQVLQTLPSVELDEQGRVVGYGLTLVPTPHRFEVDGKQLYAWCALDTLMFPALIGRTVHIASPCHGTGKSVRLTVEPDRVVSVEPSTAVVSIVTPDEMASVRSAFCNNVHFFSSPSAAQDWLNQHPESSVLPVEDAFELGRHLGARYEESGPTNGSCCNI >NZ_CP012756.1|WP_000193219.1|1421029_1422673_-|mercury(II)-reductase MTQNSYKIPIQGMTCTGCEEHVTEALEQAGAKDVSADFRRGEAIFELSDDQIEKAKQNISAAGYQPGEEESQPSENSVDFNRDGDYDLLIIGSGGAAFSAAIKANENGAKVAMVERGTVGGTCVNIGCVPSKTMLRAGEINGLAQNNPFTGLQTSTGAADLAQLTEQKDGLVSQMRQEKYIDLIEEYGFDLIRGEASFIDDKTIQVNGQNITSKSFLIATGASPAVPEIPGMNEVDYLTSTSALELKEVPQRLAVIGSGYIAAELGQMFHNLGTEVTLMQRSERLFKTYDPEISEAIDESLTEQGLNLITGVTYQKVEQNGKSTSIYIEVNGQEQVIEADQVLVATGRKPNTETLNLESAGVKTGKKGEVLTNEYLQTSNNRIYAAGDVTLGPQFVYVAAYEGGIVANNALGLAKRKIDLRFVPGVTFTNPSIATVGLTEQQAKEKGYDVKTSVLPLDAVPRALVNHETTGVYKLVVNAQTQKLIGAHIVSENAGDVIYAATLAVQFGLTIEDLTDSFAPYLTMAEGLKLAALTFDKDVSKLSCCAG >NZ_CP012756.1|WP_000968572.1|1422730_1423057_-|DUF2975-domain-containing-protein MMDENRSKGNRWGVWAFFGILLVPLLCCAGPILLVALGSTGIGALFAGATGNWWLTGIFAALAIVMIALILSKLLKNKYNSPEGNGKTKNKTDCCTPPESVDRKHETR >NZ_CP012756.1|WP_001836597.1|1423191_1423872_-|cytochrome-C-biogenesis-protein-region MSFSFLFILTAGMVAAFNPCGIALLPSYISYLIGGETKDHSFRYAIFKGLGLGGAMTTGFLTIFVLAGLLIGGLGSALTGIFPILSLVMGILIALLGLGMLFGKHLPIKIGSFQVKPGKWSIYFYGIAYAVTSLGCTLPAFMLVVSASLNDNSVTAVIIKFIIYSLGMGIVVTAITMVSLISRQLVQKFLHNYMSSIQKIAAVVIFLSGLYMAYYWYFGSGGICTF >NZ_CP012756.1|WP_000746201.1|1423868_1424222_-|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKKRISFTAIMTVLLIGLTACGAESDTANESKVQDIQGNPVSLPNEKPTLIYFMATWCPSCIYNEEIFKEIHQLNPNDVQLITVSLDPNTDTKESFAKFKQDYGGDWPHVLKIGVEL >NZ_CP012756.1|WP_025175377.1|1424238_1424646_-|Hg(II)-responsive-transcriptional-regulator-MerR MGMKISELAKACDVNKETVRYYERKGLIAGPPRNESGYRIYSEETADRVRFIKRMKELDFSLKEIHLLFGVVDQDGERCKDMYAFTVQKTKEIERKVQDLLRIQRLLEELKEKCPDEKAIYTCPIIETLMGGPDK >NZ_CP012756.1|WP_060649728.1|1424945_1426292_-|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MTKKYDLIVIGTGSAGSITAAKCNKAGWNVAMVDDRPFGGTCALRGCDPKKVLHGAAELIDWNKRMVKNGVPSEVSINWKDLMNFKRTFTDDVPKKKEEALNKQGIDTYHGNASFVSEDKLEVNKEVLEGSHFLIASGAKPTPLPIKGEEHLTYSDEFLELDELPQRIVFVGGGYISFEFAHIAARAGSEVHIIHRGQRPLENFDIDLVDILLEKSKEIGIQVHLQHSVESIEKEQGKFHVYARKKEDITRFEADIVIHGAGRVPALDMNLEKGNIERKKHGVHVNEYLQSVSNPNVYAAGDAAATDGLPLTPVASADSHVVASNLLKGNSKKIEYPVIPSAVFTVPKMASVGMSEEEAKNSGRNIKVKQKNISDWFTYKRTNEDFAAFKVLIDEDSDQVVGAHLISNEADELINHFATAIRFGISTKELKQMIFAYPTAASDIAHML >NZ_CP012756.1|WP_001105999.1|1426574_1427249_+|IS6-like-element-IS257-family-transposase MNYFRYKQFNKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGVNVHHSTVYRWVQEYAPILYRIWKKKHKKAYYKWRIDETYIKIKGKWSYLYRAIDAEGHTLDIWLRKQRDNHSAYAFIKRLIKQFGKPQKVITDQAPSTKVAMAKVIKAFKLKPDCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKTRYQSINTAKNTLKGIECIYALYKKNRRSLQIYGFSPCHEISIMLAS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012756_7 | 2111830-2111931 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012756_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012756_7
>7.1|2111863|36|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder ACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012756_7
The CRISPR arrays of NZ_CP012756_7 >merge|NZ_CP012756|7|2111830-2111931|CRISPRCasFinder CATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG >NZ_CP012756|7|7|2111830-2111931|CRISPRCasFinder CATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG ACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTG CATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG
>NZ_CP012756.1|WP_000687415.1|2110789_2111656_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAEILYISQPAVTQRLKAIENAFGVDIFIRTKKQLITTTEGTMIIEHARDMLKRERLFFDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPEVLSLYNAQFPNVEIQVQVGSTEQIKANHRDYHVMITRGNKVMNLANTHLFNDDHYFIFPKNRRDDVTKLPFIEFQADPIYINQIKQWYNDNLEQDYHATITVDQVATCKEMLISGVGVTILPEIMMKNISREQFEFEKVEIDNEPLIRSTFMSYDPSMLQLPQVDSFVNLMASFVERPKA >NZ_CP012756.1|WP_000865625.1|2110029_2110674_+|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLIDREYTEVKVNNNRFKGIIGLVTMKKVRDPLEVTVVGQNIIVADDNYKWLQILPEKKRYSITVMFDNKGNPLEYYFDINIKNITQKGNARTVDLCLDVLALPSGEYELVDEDDLMFALESEQITKKQFHEAYMIAHQIMAELENDFKGFQKKIMYCFNKINAKAQKNRQKPQNKTNFEKSKQIKPKQYNQTKNHQQQKKN >NZ_CP012756.1|WP_001806154.1|2109768_2109885_+|hypothetical-protein MLQLFLMKLTLNGFENDKTIIFIFLKNHFYEEMCVLSN >NZ_CP012756.1|WP_000844823.1|2109203_2109677_+|cupin-domain-containing-protein MKTAKQWINELQLESHPEGGFYRETIREVLKDGHRAPFSSIYFLLTDDNISHFHRIDADEVWYYHAGDSLTIHMINPDGAYTTATLGTDIQNGDVLQYVVPKGTIFASSIENLNSYSLVGCMCQPAFEFKQFELFKQSELFVQYPHLKSVIEKYALK >NZ_CP012756.1|WP_000532969.1|2108487_2109204_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPNPESNQALRLVLERAKTYSVPNHIIEKAIDKAKGAGDENFDHLRYEGFGPSGSMLIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDHVATFGIEGKTVDDILETLMEQDVDVNDVIDDNGLTIVYAEPDQFAVVQDALRAAGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSEEDQVTFEKLIDALEDLEDVQNVFHNVDLK >NZ_CP012756.1|WP_001805574.1|2107938_2108298_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarX MNTEKLETLLGFYKQYKALSEYIDKKYKLSLNDLAVLDLTMKYCKDEKVLMQSFLKTAMDELDLSRTKLLVSIRRLIEKERLSKVRSSKDERKIYIYLNDDDISKFNALFEDVEQFLNI >NZ_CP012756.1|WP_000081596.1|2104300_2104945_+|Bax-inhibitor-1-family-protein MSQNTNHSYFQQNQHAQSISKVWLYFMYYWIIFGIGCYLGQFLPLSWRQPLSFGLLIIILATLVFERARRFGLIISHIYAVVIGLLSYATFTTYLQNLGPDIFYKNIALAIFAFIAFGIIGYFFVGDASSIGKYLFVTLITLIIASLIGIFLQNPIFYTIITVVSLLLFLLYTLYDFNRLKRGDYSPREMGFNLFINLLNIIKDILYLANMFRR >NZ_CP012756.1|WP_000731644.1|2103142_2103940_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITATSGAAAFLTHHDAQASTQHTVQSGESLWSIAQKYNTSVESIKQNNQLDNNLVFPGQVISVGGSDAQNTSNTSPQAGSASSHTVQAGESLNIIASRYGVSVDQLMAANNLRGYLIMPNQTLQIPNGGSGGTTPTATTGSNGNASSFNHQNLYTAGQCTWYVFDRRAQAGSPISTYWSDAKYWAGNAANDGYQVNNTPSVGSIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNMNYRTIPASEVSSYAFIH >NZ_CP012756.1|WP_000120368.1|2101549_2102557_+|inorganic-phosphate-transporter MSYIIIVTIAVVIFSLIFDFINGFHDTANAVATAVSTRALTPKTAILMAAVMNFIGALTFTGVAGTITKDIVDPFKLENGLVVVLAAILAAIIWNLATWFYGIPSSSSHALIGSIAGAAIASEGSFGVLHYQGFTKIIIVLIVSPIIAFCVGFLMYSIFKVIFKNANLTRANRNFRFFQIFTAALQSFSHGTNDAQKSMGIITLALIVANVQNDGSVEPQLWVKFACATAMGLGTAIGGWKIIKTVGGNIMKIRPANGAAADLSSALTIFVASSLHFPLSTTHVVSSSILGVGASNRAKGVKWSTAQRMIITWVITLPISALLAGLLFYILNLFF >NZ_CP012756.1|WP_000491755.1|2100916_2101534_+|DUF47-domain-containing-protein MFSKKKDKFMVQLEEMVFNLDRAAIEFGKMDFNTHLDLKAYSDNIKTYESHGDELVHQVITDLNQTFITPIEREDILSLCDAIDDVLDAIEETAAMFEMYSIEYTDEYMAEFVDNIQKAVAEMKLAVGLLVDKKLSHMRIHSINIKEFETNCDGILRQSIKHIFNSETDPITLIKIKDIYESMEEIADKCQIVANNFETIIMKNS >NZ_CP012756.1|WP_060649806.1|2111948_2113169_+|sugar-efflux-transporter MDMFAALLQIKNYKLFVANMFLLGMGIAVTVPYLVLFATKDLGMTTNQYGLLLASAAISQFTVNSIIARFSDTHHFNRKIIIILALLMGALGFLIYFFVDTIWLFILLYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINVSSSKDRAQFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGAQLIGLKGYAGLFGGTISIILFTLVLQVFFYKDLNIKHPISTQQHVEKIAPNMFKDKTLLLPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTDYLKENEQHVGYLASLCAGLEVPFMIILGVLSSRLQTRTLLIYGAIFGGLFYFSIGVFKNFYMMLAGQVFLAIFLAVLLGIGISYFQDILPDFPGYASTLFSNAMVIGQLGGNLLGGAMSHWVGLENVFFVSSASIMLGMILIFFTKNQKITKEDVIST >NZ_CP012756.1|WP_000152582.1|2113165_2113654_+|DUF456-domain-containing-protein MTIILWLLIIAAFMLAFVGLIKPIIPSVLVLWVGFLIYQFGFHNQHLSWVFYVSMALLTILILCADFLANKYFVNRFGGSKFGEYAALIGVVIGCFVLPPFGIIIIPFILVFIVELIQGYSFERAVKVSIGSIVAFLTSSIAQAIIMFIMIVWFFIDALLIN >NZ_CP012756.1|WP_000842865.1|2113752_2114442_-|DUF1129-family-protein MKSTAQLTKENNVKSLRLSNTDREIFENYMTYMRSDFRVNPHDTELIINRILKQLLSAEQHGLLALDFFNHDPKAHAIKELKAMPNETFKNIFKYIYQHIVLLIGIVSFLKGFLGFFMEKSGSNLYFVSFPFSVVVGFFIVFLFIWFSFKTIQLQCFNNSNWIWIFTYLAIILLIVGFFYVFFIPQSLLAFGPYIQVSNWVFIIFSFIVMPIGLRIERNISKKHSHTFL >NZ_CP012756.1|WP_001259685.1|2114569_2115013_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MRTLNKDEHNYIKQIASIHETLLSQSESNYKCTKLSIALRYEMICSRLEHTNDKIYIYENEGQLIAFIWGHFSNEKSMVNIELLYVEPQFRKLGIATQLKIALEKWAKTMNAKQISSTIHKSNLPMISLNKDLGYQVSHVKMYKDID >NZ_CP012756.1|WP_000733450.1|2115079_2115469_+|hypothetical-protein MKKLIISIMVVMLFLTGCGKSQEKATLEKDIDNLQKENKELKDKKEKLQQEKEKLADKQKDLEKEVKDLKPSKEDNKDDKKDNKKDEDKDKEASQDKQPKDQTKSSNKDNHKKPTSTDKDQKANDKHQP >NZ_CP012756.1|WP_000545116.1|2115606_2115906_+|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELENITGRTIADSTGEIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYRLNHQQDFIDATFTALKSDRARLKEVPVHVELISYISKSK >NZ_CP012756.1|WP_000638618.1|2115985_2116528_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIYCETERLILRDWHEDDLLPFQKMNANYDVRKYFPSLLSYRRSELDMRTMDAVIKDYGIGLFAVEDKESHQWIGFIGLNYIPETSEYPFKELPLYEIGWRLLPEFWGKGLATEGANATLKLAEQHQIYDVYSFTAEANKASQRVMEKIGMTVYDHFELPNLSKYHLLKRQVRYYINLRK >NZ_CP012756.1|WP_000820900.1|2116622_2117189_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKRIAVYCGASKGHDPSYVQKAYNLGKYFAEQGYELVFGAGSIGIMGAIQDGVLDHGGKAIGVMPKMLDEHEITSQRLTELILVDSMHERKNKMAELADAFVMAPGGAGSLEEFFEMYSWAQIGIHEKPIAIYNINGFFNPLQTMIDHMIEEGFIDPKYRALAPLCDTKESLIESILNFKPLGTRSYD >NZ_CP012756.1|WP_060649807.1|2117190_2117649_-|YaiI/YqxD-family-protein MTHIIIDGDACLVVDSIIDLTTETGIFVTIIRSFSHFSNQLYPPHVSTLYVDDGPDAVDYKIVQLSTKDDIVITQDYGLASLLVDKVLIVMHHNGKIYNSKNIQQLLDKRYMNAQIRKQGGRHKGPPPFTKQDQKVFEQSLLRVIHRIKELD >NZ_CP012756.1|WP_000358505.1|2117651_2118335_-|hypothetical-protein MDKKKVIKFMINVLPIVLVPLIVERKRIKQHPDVQKVTDATSKVASKTSAAISNTASDVKEYVGDKKQDFENKRELKKFAREHDPAYIEKKGEKLAKQNRKDADKMNKILQKNIEKRHKEEQKAREKNEVQRIKDMKKTQKYEEKAGLTPNKLDEKTEKKGDKLAEKNRKEIAKMNKKLQKNIEKRHKEEQKRQQEADKARIKSFKKYKDYVAKSASQQNKENNTEA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012756_1 | 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 145106-145137 | 32 | NZ_CP012756.1 | 12435-12466 | 1 | 0.969 |
NZ_CP012756_1 | 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 145106-145137 | 32 | NZ_CP012756.1 | 914126-914157 | 1 | 0.969 |
NZ_CP012756_1 | 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 145106-145137 | 32 | NZ_CP012756.1 | 693549-693580 | 2 | 0.938 |
NZ_CP012756_1 | 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 145106-145137 | 32 | NZ_CP012756.1 | 1071146-1071177 | 2 | 0.938 |
NZ_CP012756_1 | 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 145106-145137 | 32 | NZ_CP012756.1 | 1664982-1665013 | 2 | 0.938 |
NZ_CP012756_1 | 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 145106-145137 | 32 | NZ_CP012756.1 | 2438157-2438188 | 2 | 0.938 |
NZ_CP012756_3 | 3.1|841321|37|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 841321-841357 | 37 | NZ_CP012756.1 | 841232-841268 | 2 | 0.946 |
1. spacer 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to position: 12435-12466, mismatch: 1, identity: 0.969
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctgtgttggggccc Protospacer ****** *************************
2. spacer 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to position: 914126-914157, mismatch: 1, identity: 0.969
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctgtgttggggccc Protospacer ****** *************************
3. spacer 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to position: 693549-693580, mismatch: 2, identity: 0.938
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttggggccc Protospacer ****** ************* ***********
4. spacer 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to position: 1071146-1071177, mismatch: 2, identity: 0.938
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctgtgtttgggccc Protospacer ****** ****************** ******
5. spacer 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to position: 1664982-1665013, mismatch: 2, identity: 0.938
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttggggccc Protospacer ****** ************* ***********
6. spacer 1.1|145106|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to position: 2438157-2438188, mismatch: 2, identity: 0.938
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttggggccc Protospacer ****** ************* ***********
7. spacer 3.1|841321|37|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to position: 841232-841268, mismatch: 2, identity: 0.946
agctcacaaaacccttgatatcattggtttcccatga CRISPR spacer agctcacaaaacccttgatatcactggtttctcatga Protospacer ***********************.*******.*****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012756_5 | 5.5|1408165|34|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT | 1408165-1408198 | 34 | NC_013373 | Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence | 26794-26827 | 2 | 0.941 |
NZ_CP012756_5 | 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1408096-1408129 | 34 | MK936475 | Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome | 14281-14314 | 2 | 0.941 |
NZ_CP012756_5 | 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1408096-1408129 | 34 | MT926124 | Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome | 2846-2879 | 2 | 0.941 |
NZ_CP012756_5 | 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1408096-1408129 | 34 | MK922548 | Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome | 3204-3237 | 2 | 0.941 |
NZ_CP012756_5 | 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1408096-1408129 | 34 | MK922547 | Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome | 3197-3230 | 2 | 0.941 |
NZ_CP012756_5 | 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1408096-1408129 | 34 | KJ210330 | Staphylococcus phage GRCS, complete genome | 3491-3524 | 2 | 0.941 |
NZ_CP012756_5 | 5.10|1408167|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1408167-1408198 | 32 | NC_013373 | Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence | 26794-26825 | 2 | 0.938 |
NZ_CP012756_5 | 5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT | 1408094-1408129 | 36 | MK936475 | Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome | 14279-14314 | 3 | 0.917 |
NZ_CP012756_5 | 5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT | 1408094-1408129 | 36 | MT926124 | Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome | 2846-2881 | 3 | 0.917 |
NZ_CP012756_5 | 5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT | 1408094-1408129 | 36 | MK922548 | Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome | 3204-3239 | 3 | 0.917 |
NZ_CP012756_5 | 5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT | 1408094-1408129 | 36 | MK922547 | Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome | 3197-3232 | 3 | 0.917 |
NZ_CP012756_5 | 5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT | 1408094-1408129 | 36 | KJ210330 | Staphylococcus phage GRCS, complete genome | 3491-3526 | 3 | 0.917 |
NZ_CP012756_5 | 5.11|1408236|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1408236-1408269 | 34 | NZ_CP043848 | Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence | 50879-50912 | 6 | 0.824 |
NZ_CP012756_5 | 5.12|1408234|36|NZ_CP012756|CRT | 1408234-1408269 | 36 | NZ_CP043848 | Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence | 50879-50914 | 6 | 0.833 |
NZ_CP012756_6 | 6.2|1417133|41|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1417133-1417173 | 41 | MF417907 | Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome | 31442-31482 | 6 | 0.854 |
NZ_CP012756_6 | 6.2|1417133|41|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1417133-1417173 | 41 | KY653129 | Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome | 11951-11991 | 6 | 0.854 |
NZ_CP012756_2 | 2.1|634186|31|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 634186-634216 | 31 | KM983333 | Clostridium phage phiCTC2A, complete genome | 10859-10889 | 7 | 0.774 |
NZ_CP012756_2 | 2.1|634186|31|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 634186-634216 | 31 | KM983330 | Clostridium phage phiCT19406A, complete genome | 10859-10889 | 7 | 0.774 |
NZ_CP012756_2 | 2.1|634186|31|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 634186-634216 | 31 | KM983329 | Clostridium phage phiCT9441A, complete genome | 11320-11350 | 7 | 0.774 |
NZ_CP012756_6 | 6.5|1417132|42|NZ_CP012756|CRT | 1417132-1417173 | 42 | KY653129 | Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome | 11951-11992 | 7 | 0.833 |
NZ_CP012756_6 | 6.5|1417132|42|NZ_CP012756|CRT | 1417132-1417173 | 42 | MF417907 | Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome | 31441-31482 | 7 | 0.833 |
NZ_CP012756_5 | 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1408096-1408129 | 34 | KR131711 | Fusobacterium phage Funu2 supercont1.1, partial genome | 26442-26475 | 8 | 0.765 |
NZ_CP012756_5 | 5.7|1407952|35|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1407952-1407986 | 35 | AP014336 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C72, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 7580-7614 | 9 | 0.743 |
NZ_CP012756_5 | 5.7|1407952|35|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1407952-1407986 | 35 | AP013668 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C107A-MedDCM-OCT-S23-C39, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 12965-12999 | 9 | 0.743 |
NZ_CP012756_5 | 5.7|1407952|35|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder | 1407952-1407986 | 35 | AP013410 | Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C107A-MedDCM-OCT-S27-C42 | 17610-17644 | 9 | 0.743 |
1. spacer 5.5|1408165|34|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT matches to NC_013373 (Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
ctcatctttcatgtcactgattaattcatttgta CRISPR spacer ctcatctttcatatcattgattaattcatttgta Protospacer ************.***.*****************
2. spacer 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to MK936475 (Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
agttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer agttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer *******.**************.***********
3. spacer 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to MT926124 (Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
agttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer agttaacagcattacctaataaaaatatttttgg Protospacer *******.*********************** **
4. spacer 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to MK922548 (Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
agttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer agttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer *******.**************.***********
5. spacer 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to MK922547 (Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
agttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer agttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer *******.**************.***********
6. spacer 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to KJ210330 (Staphylococcus phage GRCS, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
agttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer agttaacagcattacctaataaaaatatttttgg Protospacer *******.*********************** **
7. spacer 5.10|1408167|32|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to NC_013373 (Staphylococcus sp. CDC3 plasmid SAP020A, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.938
catctttcatgtcactgattaattcatttgta CRISPR spacer catctttcatatcattgattaattcatttgta Protospacer **********.***.*****************
8. spacer 5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT matches to MK936475 (Staphylococcus phage SA03-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aaagttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer ********.**************.***********
9. spacer 5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT matches to MT926124 (Staphylococcus phage vB_SauP_EBHT, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aaagttaacagcattacctaataaaaatatttttgg Protospacer ********.*********************** **
10. spacer 5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT matches to MK922548 (Staphylococcus phage SA46-CTH4, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aaagttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer ********.**************.***********
11. spacer 5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT matches to MK922547 (Staphylococcus phage SA30-CTH2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aaagttaacagcattacctaataagaatattttagg Protospacer ********.**************.***********
12. spacer 5.4|1408094|36|NZ_CP012756|PILER-CR,CRT matches to KJ210330 (Staphylococcus phage GRCS, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taagttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aaagttaacagcattacctaataaaaatatttttgg Protospacer ********.*********************** **
13. spacer 5.11|1408236|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043848 (Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
gtaatagttgctcaataggtaataaaacgtcggt CRISPR spacer ggaatagttgctcgataggtaataaaacgtttac Protospacer * ***********.****************. ..
14. spacer 5.12|1408234|36|NZ_CP012756|CRT matches to NZ_CP043848 (Staphylococcus epidermidis strain NCCP 16828 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.833
cggtaatagttgctcaataggtaataaaacgtcggt CRISPR spacer cgggaatagttgctcgataggtaataaaacgtttac Protospacer *** ***********.****************. ..
15. spacer 6.2|1417133|41|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to MF417907 (Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.854
aactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer tattcatatactcccttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer *.* *********.**.**********************
16. spacer 6.2|1417133|41|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to KY653129 (Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.854
aactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer tattcataaactcctttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer *.* *** ********.**********************
17. spacer 2.1|634186|31|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to KM983333 (Clostridium phage phiCTC2A, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
cagaagctggcggaaagtcagctttcaatcg CRISPR spacer gatgaactggctgaaagacagctttcaattg Protospacer * .*.***** ***** ***********.*
18. spacer 2.1|634186|31|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to KM983330 (Clostridium phage phiCT19406A, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
cagaagctggcggaaagtcagctttcaatcg CRISPR spacer gatgaactggctgaaagacagctttcaattg Protospacer * .*.***** ***** ***********.*
19. spacer 2.1|634186|31|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to KM983329 (Clostridium phage phiCT9441A, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
cagaagctggcggaaagtcagctttcaatcg CRISPR spacer gatgaactggctgaaagacagctttcaattg Protospacer * .*.***** ***** ***********.*
20. spacer 6.5|1417132|42|NZ_CP012756|CRT matches to KY653129 (Staphylococcus phage IME1365_01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.833
gaactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer atattcataaactcctttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer . *.* *** ********.**********************
21. spacer 6.5|1417132|42|NZ_CP012756|CRT matches to MF417907 (Uncultured Caudovirales phage clone 7F_7, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.833
gaactgatatactcctttaccatgtattaattctggaccact CRISPR spacer atattcatatactcccttgccatgtattaattctggaccacg Protospacer . *.* *********.**.**********************
22. spacer 5.9|1408096|34|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to KR131711 (Fusobacterium phage Funu2 supercont1.1, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
agttaacggcattacctaataaaaatattttagg CRISPR spacer aattaactgcattatctaataaaaatggttactg Protospacer *.***** ******.***********. ** *
23. spacer 5.7|1407952|35|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to AP014336 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S36-C72, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caacttcgtcatctttcatcatttctcttacatca CRISPR spacer agtatcggggatctttcatcatttgtcttacatca Protospacer . *. * ************** **********
24. spacer 5.7|1407952|35|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to AP013668 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C107A-MedDCM-OCT-S23-C39, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caacttcgtcatctttcatcatttctcttacatca CRISPR spacer aatatcttttatcattcatcatttcttttacatca Protospacer * *.. *.*** ************.********
25. spacer 5.7|1407952|35|NZ_CP012756|CRISPRCasFinder matches to AP013410 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C107A-MedDCM-OCT-S27-C42) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
caacttcgtcatctttcatcatttctcttacatca CRISPR spacer aatatcttttatcattcatcatttcttttacatca Protospacer * *.. *.*** ************.********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
116712 : 125024
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012756|116712:125024|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTGGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGTGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGCGTTTCTAAGATTTTCGGTATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAGCATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGTACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGCGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAACAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTTTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTCAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAACATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCCTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACCACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTTCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATTCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAATGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGTTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCCTTACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAGCCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCTTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGCAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAACTTTCGGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTCTTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGAATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAATTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACATATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTCGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTTACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAATACCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATGGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAACTATATTGTTCTAGGCTAATTAATGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGTACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAACTGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCTGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAATGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGCGCTTTATCTAAGTTGTATAACAACTTTCTTTTTTGAAAAATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGGCCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCATTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTAGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAGTAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCGATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012756|116712:125024|117623_118514_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP012756|116712:125024|118523_119870_-|WP_001062182.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANVAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIVFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP012756|116712:125024|121894_123001_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP012756|116712:125024|116712_117498_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP012756|116712:125024|123224_125024_-|WP_001217240.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLLERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISFMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQQFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP012756|116712:125024|121086_121764_-|WP_000624564.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTESLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSAQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINEEIAVIERVL >NZ_CP012756|116712:125024|119983_121084_-|WP_000683922.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESKGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
327436 : 396432
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012756|327436:396432|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCATTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAATAATGCTGCGCCTGTAATTAGTGCTAATTCTTTTAATGGTAAATCCATTTCTTCAGAACCAGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCACTTCTTGTTTATCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCAAGTTGCCCCACTTTTGGTGACGCTTTTATCACTTCAGCAGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAATAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCGATCATTCTATTACCATCTGCAACATATTGATCTATTAACGCTTTCACTTTAGCCAATTGTTCTGGTGTTGCAATCGCTTTGAATTTCGCATAGGTTTGTTGCGCAATATTTTCAATGCGCATTAAGCTATGTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACCGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCTGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGTACTAAATGCGTAACACGTGCAATATCTTGGTTGATTGTTTTTTCGGCCTCCGGTTTTTTAACAGGATGCACATCTAAACCTTGTATTGTTTGAAGATTAAATGATGCTGTTTTATCCACTTGTGCATTGCTACGGTCATGATCAAGTTGTCCGATTGCTGCGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAAAACACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAACATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCATTGAGCAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCCCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATGTGTTGTTTCGCTTTTATTAATGCTTGTTCTACTTGTGCTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCATTATTTGATTTGATTAAATTAATTTTATGAGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAACGCTGTTGTTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATCGATACTATTTTGATTAACTTGCGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTGACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTTGTTACCATCAGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATATCATTTTTAATTGCATTAACAATTTTATTTAACGCAGCAATAGCAACATTTCGTTCATCTTGCGTTGTATCTAGCGTATTTCGTATTGCATCGAGTTGATTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTGCGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATCGTTTGATTTCTAACATCATTGACAGCTGCATCTTGTGTCGTATTGTCTATATTTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCGTTAATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCAGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGGTTAACTGCGCTCGCTTTTATGGCTTCTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGTGCTTTTTAACCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGTTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAATGCAATGTCGTCAAGCGCTTGATTTGTTGAGTCATTAACTTGCTGATTTGTTCTATCATTTGTGATATTTGTCATAGCTTTAGCAACTAAATCATTGATTTTATCTAACGCCGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCTTGATTAATTTGCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCTGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATCATTTTTATCGCAGTTATACCATCTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGCTAATGCTTGTAAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTAATCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACTGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCCACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCTGCATTTGTATTAGCTAGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAATGTTGATTGCAGCATTCTTCTCATCATCTGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATACTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTCATTGCTTGTTTACCTGCTTGTAATGCTTGATCTACTTCTGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAAATCTTGATCTACTTGATTTAATGCTACTTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAGTCCGTTAATACACCTGTGGCTGATTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGTACCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATCTATTGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGATATCGCCTCACGTGCTTTTTCATTTACAGTATTACGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTCGCCGGTTGAATCGCAAGTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGCAATTGTTGTGCTGCTTGTTGCTCTTCTAAGGTCGCATCATTATTATTAAATATCGCATTATGTTGCGTTTCTGCACTTTGATCAATAGCGTTTTTAGCATCTGTTTTAACCTTTGTAGCTGGCTCAATGGCCTGTATTCCTTGAATCGCATTTGTCTTCACTTGCTCAACATCAGCATTGCTATTAGCATTTAAAATATTAGTATTCGCAGCAGCTACAGCAGCATTTACTTTCTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTTGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCGATATGCTGTTGTGCATCATGTGATACGGCATCTCTTGCAGCTTGCTTAACAACAGTTACAGGAGCAATTGGATTAATGACATTTAGACCATCACCTTTGGCAGTATCTACATCATCATTGGTTGTCGCTTGATTGATTTGTTCTAATGCGTGGTTTGTGGCTTGCGTTAATTCATTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCTTGTGTTGCTTCTCTATTGCTATTTATTTGTTGTCGTTTCGTTGCTGTCGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCTGCTTGTTTGTGTGTCACTTGTGGCACAACTGCACCAATTGTATTAATACCATTATTTTTAGCTGTTTCAACATCAGCATTGGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTTGTTAATTGATTTAATGCATCTTGAATTTCGTCTTGAGTAGCATCTGGTGTGTTATTGATAATTTCTCTTTGTTTCGCTGCTTTATCACGTATAGCTTGTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCACCACTTAAGGTCTGTATACCTTGATCCTTAATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTCCCAATAATTTCATTTTTATGTTCCTCGATAACTTGAATCGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGGTTAACTAAATCTTCCATGTCATCAACTTTTCTATTAACGGCATTTTCAGCGTCAACACTACGAATTAACGTATGTTGCATCTGATTTGCTAATGAATCGATATCTGCTTGAGAAACTCTTTTGTTTAAAGGTACATTGTTACGGTTTTCATCTAAAATTGTTTGTGCGCGTCTTTTAAGATCATTAAAAATATCTAATGATGCAAATGTATAATCCGCCTGTTGAATTCGTCTATCGACTTCAGCTTGTAATGCGTCTTTATTCATGATGATATCAATTGTATATGGATTTGTACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGAAAATGTTTTATACGTTAATGTATCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTTGGCACATTGTTCACACGTAGCTTATACTTCAAATCCAATATTTTATCAGGCATAAGTCGTGCCGGTGAATTCCCTGAACCT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66 | Staphylococcus_phage(95.56%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
498861 : 569192
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012756|498861:569192|DBSCAN-SWA 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73 | Staphylococcus_phage(75.68%) | holin,tail,integrase,terminase,protease,coat,transposase | attL 504075:504089|attR 569688:569702 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
598796 : 614049
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012756|598796:614049|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012756|598796:614049|602323_602851_-|WP_060649631.1|coat|DBSCAN-SWA MKLLKTKYCLYYRNGYNKLSEYQLLTQFNPTFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIQIIETKARLQNYKNRSINNMALLKKVLNYYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPCNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNTAIVNSKIARVNAYHQSSHVKVV >NZ_CP012756|598796:614049|612072_613689_-|WP_000240652.1|DBSCAN-SWA MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVSVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >NZ_CP012756|598796:614049|600626_601136_-|WP_000840479.1|DBSCAN-SWA 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22 | Staphylococcus_phage(83.33%) | coat,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
722370 : 736077
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012756|722370:736077|DBSCAN-SWA 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14 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
740963 : 746344
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012756|740963:746344|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012756|740963:746344|742873_743227_-|WP_001227347.1|DBSCAN-SWA MRKKEDKYDFRAFGLAIKEARLKRGLTREQVGALIEIDPRYLTNIENKGQHPSIQVLYDLVSLLHVSVDEFFLPANNLVKSTRRLQIEKYMDSFTDKELSLMESLASGINEARNIED >NZ_CP012756|740963:746344|744841_745045_+|WP_000814511.1|DBSCAN-SWA MKQTDIPIWERYTLTIEEASKYFRIGENKLRRLAEENKNANWLIMNGNRIQIKRKQFEKIIDTLDAI >NZ_CP012756|740963:746344|742646_742814_+|WP_000336323.1|DBSCAN-SWA MCPVCGNKTRLKIREDTELKKFPLYCPKCRQENLIEIKQFKVTVITEPDAKTQSR >NZ_CP012756|740963:746344|743731_744154_+|WP_000804885.1|DBSCAN-SWA MKPSSFQTTIENQFDYICKRAMEDERKNYMLYLSRIAKREVSFSDVGDYLVSQFATTDNYSTDFQIFTLNGLSVGVENDLLSEALRELPDKKREILLLFYFMDMSDSEIADLLKLNRSTVYRHRTSGLALIKKFMEEFEE >NZ_CP012756|740963:746344|745126_746344_+|WP_001291561.1|integrase|DBSCAN-SWA MSEKRRDNKGRILKTGESQRKDGRYLYKYIDSFGEPQFVYSWKLVATDRVPAGKRDCISLREKIAELQKDIHDGIDVVGKKMTLCQLYAKQNAQRPKVRKNTETGRKYLMDILKKDKLGVRSIDSIKPSDAKEWAIRMSENGYAYQTINNYKRSLKASFYIAIQDDCVRKNPFDFQLKAVLDDDTVPKTVLTEEQEEKLLAFAKADKTYSKNYDEILILLKTGLRISEFGGLTLPDLDFENRLVNIDHQLLRDTEIGYYIETPKTKSGERQVPMVEEAYQAFKRVLANRKNDKRVEIDGYSDFLFLNRKNYPKVASDYNGMMKGLVKKYNKYNEDKLPHITPHSLRHTFCTNYANAGMNPKALQYIMGHANIAMTLNYYAHATFDSAMAEMKRLNKEKQQERLVA >NZ_CP012756|740963:746344|740963_742214_-|WP_001573639.1|transposase|DBSCAN-SWA MKLFVGLDVSSDKLDACFLTDTLTILHQGSYANDIEGATQIKETIVNMFEQFAFDKVVIGMESTSMYSAHPLIFFHEDEDLKNMHCVVTIEDPFKIHNYAKVFNADKTDTNDAFFIADFLRSERYSHSPLKEEQFLSLQRLTRSRMQLVNMLVETKQHFIENLYYKCNTLSRELRDEESLSTTVFSTSIIELITSDMGLDEIAQLPLNKLAETLQTLGRGRFKHPEKLAKTIQKAIRSSYRLSPTFETSIDIVLATLVGQMRSLEASIKQLEKGIERIVKAMPEYQCLTSIPGVGLVYAAGIIAEVGQIERFENQAKLAKYAGLHWKKSESGNYKSENTPLTKRGNRYLRYYLIEAANSVRRHLPEYNEFYRKKYQETPKHQHKRAIVLTARKFVRLVDTLLRNHQLYTSPRSVES >NZ_CP012756|740963:746344|744150_744381_+|WP_000857133.1|DBSCAN-SWA MKTQYPMIPFPLIVKATDGDTEAINQILHHYRGYITKRSLRLMKDEYGNQSMVVDEVLRGRMETRLITKILSFEIK |
7 | Streptococcus_phage(100.0%) | transposase,integrase | attL 736841:736856|attR 755356:755371 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1387372 : 1450715
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012756|1387372:1450715|DBSCAN-SWA 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60 | Staphylococcus_phage(58.33%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2142901 : 2150720
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012756|2142901:2150720|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTACGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCATGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAATGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAATAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTTAGCAACATAATGTGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAGCAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACGCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCGAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTAAGTGAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGATATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGCGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCTTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012756|2142901:2150720|2147972_2148641_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP012756|2142901:2150720|2142901_2143957_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP012756|2142901:2150720|2147551_2147971_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP012756|2142901:2150720|2143956_2144643_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP012756|2142901:2150720|2144617_2145091_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP012756|2142901:2150720|2148991_2149585_+|WP_000604517.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKVTAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP012756|2142901:2150720|2146834_2147548_-|WP_001062976.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP012756|2142901:2150720|2146151_2146736_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP012756|2142901:2150720|2149568_2150720_+|WP_001217805.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFKKAENINSIYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP012756|2142901:2150720|2145431_2145872_-|WP_001093554.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAAAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2162696 : 2176974
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP012756|2162696:2176974|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP012756|2162696:2176974|2165151_2166069_-|WP_000429016.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLTIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP012756|2162696:2176974|2170371_2170770_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP012756|2162696:2176974|2168704_2169571_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP012756|2162696:2176974|2175259_2176216_+|WP_001245580.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQSITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVIPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLVTMVLFALLLFQVIFKIGQFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVILVALLIITIYLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEQLTRILLVIVSILVSISTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVKRRNAQ >NZ_CP012756|2162696:2176974|2162696_2163755_+|WP_000663018.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNDDTALVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP012756|2162696:2176974|2168184_2168685_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP012756|2162696:2176974|2163912_2164461_+|WP_000197263.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEKEK >NZ_CP012756|2162696:2176974|2172955_2173927_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP012756|2162696:2176974|2166338_2167844_-|WP_000193753.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGTSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP012756|2162696:2176974|2174301_2175273_+|WP_000876313.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINVALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRVIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP012756|2162696:2176974|2166159_2166267_+|WP_060649813.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIVVYNEHIKFLFILISWI >NZ_CP012756|2162696:2176974|2176212_2176974_+|WP_000616860.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTIHNQTILEDISIVIEKGELTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRTRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLQMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGRLVKSDLKDNVIQSNVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP012756|2162696:2176974|2170732_2172838_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2229065 : 2243321
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP012756|2229065:2243321|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP012756|2229065:2243321|2239889_2240231_+|WP_001190601.1|DBSCAN-SWA MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDHGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIEV >NZ_CP012756|2229065:2243321|2235008_2235218_+|WP_001058489.1|DBSCAN-SWA MNNEQKEVIEHVVYQLELSVMNNLESYEHTEYVDGIEVVSEVSREKHLELIMKWCAQELKNNFQLEKGE >NZ_CP012756|2229065:2243321|2231459_2231924_+|WP_001085185.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIIKLGDQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >NZ_CP012756|2229065:2243321|2241096_2241624_+|WP_060649826.1|coat|DBSCAN-SWA MKLLKTKHCLYYRNGDNKLSEYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKAGLQNYKNRSINNMALLKKVLNHYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNTAIVNSKIARVNAYHQSSYVKVV >NZ_CP012756|2229065:2243321|2238619_2238904_+|WP_000998182.1|DBSCAN-SWA 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MNKNQLKSEILEYIKAHAGTSFVEIERVFEENNFDYKGDGAYTSGQHPNVVFWIGWNQEAFDVIAELKKDRRIEMDICEPIVYMVDGKGLDLPIVRSKNIKTDHWLPVTFTISKKETQCV |
21 | Staphylococcus_phage(80.0%) | coat,integrase,terminase | attL 2228735:2228750|attR 2235155:2235170 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2413461 : 2421934
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP012756|2413461:2421934|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP012756|2413461:2421934|2416691_2418881_+|WP_060649841.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVIGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACEILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVYYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEYESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP012756|2413461:2421934|2420336_2421365_+|WP_060649842.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGVVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQDVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP012756|2413461:2421934|2418859_2420344_+|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP012756|2413461:2421934|2421367_2421934_+|WP_000238656.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVDHVELGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP012756|2413461:2421934|2415762_2416026_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP012756|2413461:2421934|2415058_2415763_+|WP_000174046.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINKVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP012756|2413461:2421934|2416027_2416699_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP012756|2413461:2421934|2413930_2415055_+|WP_001010394.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGDNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDNRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP012756|2413461:2421934|2413461_2413944_+|WP_001807502.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQKSSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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