Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012381 | Lactobacillus helveticus strain CAUH18 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas14j,cas3,csa3,cas2,cas5,cas8c,cas7,cas4,cas1,DEDDh,DinG,WYL,Cas14u_CAS-V,RT | 1 | 9 | 14 | 0 |
1. NZ_CP012381
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012381_1 | 596136-598100 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NZ_CP012381_1
|
29 spacers
spacers of NZ_CP012381_1
>1.1|596168|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTAATTGATGACGGTGCCTTTGCAGCTGCATCA >1.2|596235|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGTGGTGGTTTACTTAACGAAAAAAAGAAAGC >1.3|596301|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTACGAAAAGTTTTACTCAGATGAAAAGGATTGG >1.4|596368|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATCAACTTGTAGGCCCGAAGTATCATCATAGTTA >1.5|596435|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTGGATACCAATCATGCCCACCTACTGTAGTAA >1.6|596502|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAGGCTGGACTACTATCTGGGGTCATAGAAAA >1.7|596568|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACTTAATTGTGTTCAGTCCAGTCGGAAAAATAG >1.8|596635|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCATGGGGAAACGTTTAGCTGTTGGCGCATTAGC >1.9|596701|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATGACGACTTTGTAGCTGGTCAAACGTGGGCA >1.10|596767|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACATCATCAAGCTCATCAAGCTCATCAAGCTCAT >1.11|596834|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTT >1.12|596900|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTT >1.13|596966|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TACTGATACTAATAAAGATGCAAAAACCATCAAAG >1.14|597033|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGTGGCTATCTTCAAGTAGGGCTAAGCAAATCAG >1.15|597100|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCTAATTGCACCGTACTAGGACTATCAGCAGTA >1.16|597166|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTGCCTCAAGCACGTATTGACGAATTGGACAA >1.17|597232|37|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTTTGTTAGAAAATTAAACATCTTTGGAGCATCAA >1.18|597301|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTAATTATATGACTTAAATACGGTTTTGATG >1.19|597367|36|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGGTGTCCCATATGTCATGGGTGCTATGAGTAAA >1.20|597435|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACAAAGAAAACCGATAAGGCAACTGGCGCTTTT >1.21|597502|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATGAAGATAATGGTGGCGAAAAGACTTGGGAAA >1.22|597569|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGCATCAACGGCTCTAATTATGTCATTGCCGGTTT >1.23|597636|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCAAAAAATCACGGTACAAATGATGAAACTGCTT >1.24|597703|34|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT ACTAACTGGAACATCCAAGTACTGTGCGGAAACC >1.25|597769|35|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCGGCTAATTGCTTTTCAAGTGAATCAGCCTTTG >1.26|597836|34|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTGAGACGCTAGACGCTATTAGATCACAGTCAC >1.27|597902|35|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGA >1.28|597969|34|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTT >1.29|598035|34|NZ_CP012381|CRT TTTAGGTCCATTGCACTCTTGCCAGTGAAGTCGT |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012381_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012381_1 >merge|NZ_CP012381|1|596136-598100|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAATTAATTGATGACGGTGCCTTTGCAGCTGCATCAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAAGTGGTGGTTTACTTAACGAAAAAAAGAAAGCGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTTACGAAAAGTTTTACTCAGATGAAAAGGATTGGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATCATCAACTTGTAGGCCCGAAGTATCATCATAGTTAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAATTGGATACCAATCATGCCCACCTACTGTAGTAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAATAGGCTGGACTACTATCTGGGGTCATAGAAAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAACTTAATTGTGTTCAGTCCAGTCGGAAAAATAGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATGCATGGGGAAACGTTTAGCTGTTGGCGCATTAGCGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAATGACGACTTTGTAGCTGGTCAAACGTGGGCAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAACATCATCAAGCTCATCAAGCTCATCAAGCTCATGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTACTGATACTAATAAAGATGCAAAAACCATCAAAGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAAGTGGCTATCTTCAAGTAGGGCTAAGCAAATCAGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAGCTAATTGCACCGTACTAGGACTATCAGCAGTAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTTTGCCTCAAGCACGTATTGACGAATTGGACAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATCTTTTTGTTAGAAAATTAAACATCTTTGGAGCATCAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTCTTTAATTATATGACTTAAATACGGTTTTGATGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTCTGGTGTCCCATATGTCATGGGTGCTATGAGTAAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTACAAAGAAAACCGATAAGGCAACTGGCGCTTTTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTAATGAAGATAATGGTGGCGAAAAGACTTGGGAAAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATAGCATCAACGGCTCTAATTATGTCATTGCCGGTTTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTCCAAAAAATCACGGTACAAATGATGAAACTGCTTGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATACTAACTGGAACATCCAAGTACTGTGCGGAAACCGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATCGGCTAATTGCTTTTCAAGTGAATCAGCCTTTGGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATACTGAGACGCTAGACGCTATTAGATCACAGTCACGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGAGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTTGTCGCACTCCTCGTGAGTGCGTGGATTGAAATTTTAGGTCCATTGCACTCTTGCCAGTGAAGTCGTGTCGCACTCCTTGTGATGCACTTGTGGGTGTA >NZ_CP012381|1|1|596136-597702|PILER-CR GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATTAATTGATGACGGTGCCTTTGCAGCTGCATCA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAAGTGGTGGTTTACTTAACGAAAAAAAGAAAGC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTACGAAAAGTTTTACTCAGATGAAAAGGATTGG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT CATCAACTTGTAGGCCCGAAGTATCATCATAGTTA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATTGGATACCAATCATGCCCACCTACTGTAGTAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATAGGCTGGACTACTATCTGGGGTCATAGAAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAACTTAATTGTGTTCAGTCCAGTCGGAAAAATAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT GCATGGGGAAACGTTTAGCTGTTGGCGCATTAGC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAATGACGACTTTGTAGCTGGTCAAACGTGGGCA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AACATCATCAAGCTCATCAAGCTCATCAAGCTCAT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TACTGATACTAATAAAGATGCAAAAACCATCAAAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAGTGGCTATCTTCAAGTAGGGCTAAGCAAATCAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AGCTAATTGCACCGTACTAGGACTATCAGCAGTA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGCCTCAAGCACGTATTGACGAATTGGACAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT CTTTTTGTTAGAAAATTAAACATCTTTGGAGCATCAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCTTTAATTATATGACTTAAATACGGTTTTGATG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCTGGTGTCCCATATGTCATGGGTGCTATGAGTAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTACAAAGAAAACCGATAAGGCAACTGGCGCTTTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TAATGAAGATAATGGTGGCGAAAAGACTTGGGAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AGCATCAACGGCTCTAATTATGTCATTGCCGGTTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCCAAAAAATCACGGTACAAATGATGAAACTGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATACTAACTGGAACATCCAAGTACTGTGCGGAAACCGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATCGGCTAATTGCTTTTCAAGTGAATCAGCCTTTG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ACTGAGACGCTAGACGCTATTAGATCACAGTCAC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTT >NZ_CP012381|1|1|596136-598034|CRISPRCasFinder GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATTAATTGATGACGGTGCCTTTGCAGCTGCATCA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAAGTGGTGGTTTACTTAACGAAAAAAAGAAAGC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTACGAAAAGTTTTACTCAGATGAAAAGGATTGG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT CATCAACTTGTAGGCCCGAAGTATCATCATAGTTA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATTGGATACCAATCATGCCCACCTACTGTAGTAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATAGGCTGGACTACTATCTGGGGTCATAGAAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAACTTAATTGTGTTCAGTCCAGTCGGAAAAATAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT GCATGGGGAAACGTTTAGCTGTTGGCGCATTAGC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAATGACGACTTTGTAGCTGGTCAAACGTGGGCA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AACATCATCAAGCTCATCAAGCTCATCAAGCTCAT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TACTGATACTAATAAAGATGCAAAAACCATCAAAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAGTGGCTATCTTCAAGTAGGGCTAAGCAAATCAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AGCTAATTGCACCGTACTAGGACTATCAGCAGTA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGCCTCAAGCACGTATTGACGAATTGGACAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT CTTTTTGTTAGAAAATTAAACATCTTTGGAGCATCAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCTTTAATTATATGACTTAAATACGGTTTTGATG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCTGGTGTCCCATATGTCATGGGTGCTATGAGTAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTACAAAGAAAACCGATAAGGCAACTGGCGCTTTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TAATGAAGATAATGGTGGCGAAAAGACTTGGGAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AGCATCAACGGCTCTAATTATGTCATTGCCGGTTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCCAAAAAATCACGGTACAAATGATGAAACTGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ACTAACTGGAACATCCAAGTACTGTGCGGAAACC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATCGGCTAATTGCTTTTCAAGTGAATCAGCCTTTG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ACTGAGACGCTAGACGCTATTAGATCACAGTCAC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTT GTCGCACTCCTCGTGAGTGCGTGGATTGAAAT >NZ_CP012381|1|1|596136-598100|CRT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATTAATTGATGACGGTGCCTTTGCAGCTGCATCA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAAGTGGTGGTTTACTTAACGAAAAAAAGAAAGC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTACGAAAAGTTTTACTCAGATGAAAAGGATTGG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT CATCAACTTGTAGGCCCGAAGTATCATCATAGTTA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATTGGATACCAATCATGCCCACCTACTGTAGTAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATAGGCTGGACTACTATCTGGGGTCATAGAAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAACTTAATTGTGTTCAGTCCAGTCGGAAAAATAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT GCATGGGGAAACGTTTAGCTGTTGGCGCATTAGC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAATGACGACTTTGTAGCTGGTCAAACGTGGGCA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AACATCATCAAGCTCATCAAGCTCATCAAGCTCAT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TACTGATACTAATAAAGATGCAAAAACCATCAAAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAGTGGCTATCTTCAAGTAGGGCTAAGCAAATCAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AGCTAATTGCACCGTACTAGGACTATCAGCAGTA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGCCTCAAGCACGTATTGACGAATTGGACAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT CTTTTTGTTAGAAAATTAAACATCTTTGGAGCATCAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCTTTAATTATATGACTTAAATACGGTTTTGATG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCTGGTGTCCCATATGTCATGGGTGCTATGAGTAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTACAAAGAAAACCGATAAGGCAACTGGCGCTTTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TAATGAAGATAATGGTGGCGAAAAGACTTGGGAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AGCATCAACGGCTCTAATTATGTCATTGCCGGTTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCCAAAAAATCACGGTACAAATGATGAAACTGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ACTAACTGGAACATCCAAGTACTGTGCGGAAACC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATCGGCTAATTGCTTTTCAAGTGAATCAGCCTTTG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ACTGAGACGCTAGACGCTATTAGATCACAGTCAC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTT GTCGCACTCCTCGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTAGGTCCATTGCACTCTTGCCAGTGAAGTCGT GTCGCACTCCTTGTGATGCACTTGTGGGTGTA >NZ_CP012381|1|2|597737-598034|PILER-CR AATTAATTGATGACGGTGCCTTTGCAGCTGCATCA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAAGTGGTGGTTTACTTAACGAAAAAAAGAAAGC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTACGAAAAGTTTTACTCAGATGAAAAGGATTGG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT CATCAACTTGTAGGCCCGAAGTATCATCATAGTTA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATTGGATACCAATCATGCCCACCTACTGTAGTAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AATAGGCTGGACTACTATCTGGGGTCATAGAAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAACTTAATTGTGTTCAGTCCAGTCGGAAAAATAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT GCATGGGGAAACGTTTAGCTGTTGGCGCATTAGC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAATGACGACTTTGTAGCTGGTCAAACGTGGGCA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AACATCATCAAGCTCATCAAGCTCATCAAGCTCAT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATGTTGCTATTAGTATCAGTATCATCACTAGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TACTGATACTAATAAAGATGCAAAAACCATCAAAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AAGTGGCTATCTTCAAGTAGGGCTAAGCAAATCAG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AGCTAATTGCACCGTACTAGGACTATCAGCAGTA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGCCTCAAGCACGTATTGACGAATTGGACAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT CTTTTTGTTAGAAAATTAAACATCTTTGGAGCATCAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCTTTAATTATATGACTTAAATACGGTTTTGATG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCTGGTGTCCCATATGTCATGGGTGCTATGAGTAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTACAAAGAAAACCGATAAGGCAACTGGCGCTTTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TAATGAAGATAATGGTGGCGAAAAGACTTGGGAAA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT AGCATCAACGGCTCTAATTATGTCATTGCCGGTTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TCCAAAAAATCACGGTACAAATGATGAAACTGCTT GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAATACTAACTGGAACATCCAAGTACTGTGCGGAAACCGTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATCGGCTAATTGCTTTTCAAGTGAATCAGCCTTTG GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ACTGAGACGCTAGACGCTATTAGATCACAGTCAC GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT ATCAAGCTTGCCAACGGGTCGATTTTATTCTGTGA GTCGCACTCCTTGTGAGTGCGTGGATTGAAAT TTTTGAATAGATGGCATGTAAGTCTGATATAGTT GTCGCACTCCTCGTGAGTGCGTGGATTGAAAT
>NZ_CP012381.1|WP_014563208.1|595683_595974_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVVVSYDINTESKSGQRRLRHVAKICLDYGQRVQNSVFECKVNSMQLELMKERLLDEIDDSQDSLYFFNLGKNYKNRIKSYGIKEVINLESPVIF >NZ_CP012381.1|WP_014563207.1|594642_595674_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRQLLNTLYINTPDSYLSSDGNNVVVKIKNNAVGRLPLQNFEAIVTFGYSGVSPSLMQKCLEQDISISFLSRTGRLKGRVVGEPTGNVYLRKTQFFNSENDAASLLIAKNMIIGKVYNHRWIIERFIRDHGMQIDRDKFKSISENLKNGLKDLQQVDTIDSLRGLEGSLANGYFSVFDDMIINQKDDFFYHGRSRRPPLDRLNALLSFSYSLLANECADALTTNGLDPYEGFMHVDRPGRKSLALDLMEELRGVIADRFVLRLVNKKEIHASDFVCKADGAYLLTDDARKSFLAKWQDNKISELEHPFLKEKIEWGLVPFAQAQLLARYLRGDLDEYPPFMWK >NZ_CP012381.1|WP_012212133.1|593989_594646_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MSYDEKDYLMISGIQHFVFCKRQWALDHIENQWADNYLTVSGNRLHEKADDPYISETRGSKFVVRAMPIHSQEYGLTGIFDVVEFQKDTKGVQVFGKKEKYLPIPVEYKHGKSKIDDSDRLQVLAEAVCLEEMLFCHLDYGYLYYGRTRHREKVEFSEELRTELKKVISEMHYYWEKKYTPKVKVTKKCKSCSLRDICLPELLKRESVSNYISRKLNQ >NZ_CP012381.1|WP_012212134.1|593135_593987_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 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MNWISDLAKVYDDNESIAGKAETVSVGKEKTKTVTLVPISHIAVNIPIQINLDKDGGFKGADVIDEKDNQRTIIPATLKSASRSSGSAPMPIDDTLKYIAKDYYPEISNKDKDSHYYSDYINQLKGFVEYVNNKNSSDRVRQQVNAIYTYVSQNDIFADLLFKAHLFGDEIKQVSAIPMKWTGKEEKPAVYKAITGDLDRSFVRFNVRGLGLDRSFEDPDLYEAWGKYYLTTLRNDTGVDYVDCNNDAILTDNHPKGIIPSASNAKLISANDTTNYTFKGRLLNSDEVATIGYLNSQKAHHALRWLIDKQGFSIGGRYYLAWGRKQQNYMIDNQTSPMFKILTSTYNTDQAESYTNERLAKSYYNSLVKGIELNGDNLEDLVYLMQIDTSTPGRADIVSYQALDLNQYIRKLSSWYGKISLFIQNKAGEFVDPPYSLRTIANMIHGSKANDDLKKNTISELISVILGSQIVPRGIIMPLYNKAIRPLSFNPKDPEARFIGWQPIVRLTSKLLKIWYENEGIKAMLNDEINDRSYLYGRLLAVADVLEGDALKNKEVDRPTNAQRYMSAFAQRPADTWKTIYMNAQPYFKQSKGNRRGQILIDHIFDKLQINEENINRLNDPLDGKFLIGYSQQKVDWFRKIREYSEKKQKEQEKGDK >NZ_CP012381.1|WP_012212136.1|590416_591160_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MLNEIIKSPSFSYKVFGDWALFTDPIMRLGGEKFTYSIPTYQALKGIAESVYWKPTIVIHIDKVRVMKPILVEAKDMRLFKYNNSRSSDLARYTYLKDVEYQVLAHFEFNMNRLDLAKDRNIKKHLAIMKRCIKRGGRRDVFLGTRECQGYVEPCKFGEGEGYYDNSDDRLFGTMFHGFDYPDETGNSMLKARLWNVVMKKGVVDFIRPEDCPVHKPLHELQVKKFKKGENLESVDQLYSQMLEGDS >NZ_CP012381.1|WP_014563206.1|587867_590402_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MVGNFIGHTKKLKNNTIETQSLRDHLLNTQKYAEKYASDLSLEHVAGLAGILHDLGKYQSKFQEYIIESTRKGDQSKKGSIDHSSFGAIFLRDFISENFSEKENYYDFLDFGGILENAIFSHHNYLGLKDYINPDLMSPFLNRIEKFKDDEEKKRQLKKCKELFYKDVITEEKFTKYFQLAFDEYEAFISKIRNKVTLKTEQILNENAKNNKQVMLELQAKYFLSEYVYSCLLDADRTDATAFKLSKNPNFSDNTELFEKYYSKLVGKLHKLNKNDNSKINQLRAEISEECDQAAERPSGIYTLSASTGSGKTLTSLRFGLKHAKLYHKKHIIYVLPYITIIEQNSEVIRKFLNDNKDDSQNILEFHSNVSQKVADKSEETTNALDLTEDSWDSPIIVTTMVQFLDSIFASGTKHRRRFHNLCDSIVIFDEVQKVPIKCLDMFNEAVNFLKNFGNTNVLLCTATQPALEEVKQKLDLNIDHEIIPNLIEHEQQFKRVEFIDKTQNDDGIDLVLNSIQAAELIFKKSQNFKSILGIFNTIDVTKKIYSNLKNKFDSISDQIKLEYLSTNMCPADRKERIKNVLNLVKEGKRVICISTPLIEAGVDASFECVFRSLSGLDSLVQAAGRCNRNNELKLGKVYLLNMDPSEEHIAKLNEVKTGKDQVLELLSEGIKADDFLNANVIKKYFEMFYSKLASTMSYPTNGINLENYIDGIKNVHELAYQSKRKDASKFEKLTQFSGSETIAKYFQVIKNNTKSVLAPYGDKGEKLIADLNGNQDINSLIMLVKDAQPYIVNLYDNKFNQLFEEGDIYTLCQVGNEVIYAFRPYAYNKLVLGDRKQIEKSIF >NZ_CP012381.1|WP_054607252.1|586361_587621_-|ISL3-family-transposase MSSLNHCIKFELDVKDENIVFKDYFYKSIKLQKHKIYEAELIQPACPFCGSLDLLHNGHLITNIHYPTANASLPVIIRLAKQRVKCRDCEGWSMAQSELVNKYCSISNASKLKVLSALTEDRSMTSIASENNVSINTVQRVLGNCSHRFIDSYEYLPAHLAFDEFKGVDRQLHFICLDGDSHQVVQILRTRYKKNLLKYFGRFSPQARANVRTVTMDLNFYYQDIVRACFPNAQIVIDRFHMIQMLTRSFNSLRVKVMKTFDKRSRQYQLLKSPWKLYLKKFDELEKVHPRYNWHYKDCLTQAQVVTEGINANTALENSYNLMQDFIQAIETGNTQTLKSLINCKDQIGTLMHKTLLTFKHNLTAVLNGAELPYSNGCLEGFNRKIKQIERTAFGYSSFTNLLTRIRLEENLYKENILT >NZ_CP012381.1|WP_023062002.1|582970_584230_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MKDDLVLLVVGSGGREFAVAKKLKESRHVKTVYCAPGNVGMQTIGVETVPIEETDLDGLLDFAQSKHVDWTFVGPENVLCAGITDKFEKAGQKIFGPNQRAAQLEGSKDYALRFMNKYDVPTARHETFTSAETCIAGLKDFAYPVVIKEDGLAGGKGVTIAQNEAVAQETIKEMFAGGQTAVVLEECLVGPEYSMFVVVSEDQFTILPMAQDHKRVGDGDKGPNTGGMGSYSPLPQLKKEDRQRMIHEIVKPTMNGLVQGNYHYCGVLYIGLMMTEGGPKVIEYNVRLGDPETQVVLPRVKNDFAELIDAAVNHEKLPEIEENDQSVLGVVVCSKGYPTHPAPNVKIGKLPEGTNTYIDYANVKGDLDNLTGDGGRLFMVISEADNLVQAQDNVYSYLSKLDLPDCFYRHDIGNRALRD >NZ_CP012381.1|WP_014563204.1|581416_582958_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase MKRALISVSDKTNLVDFAKGLVRNGYEIISTGGTKKTLDEAGIKTISVEEVTNFPEILDGRVKTLNPYIHGGLLAKRDDPEHMATLKKLNIQPIDLVCVNLYPFKQTIEKADVTREEAIENIDIGGPSLLRAASKNYQDVTVVTDKADYDLVLKEIEEKGNTTLETRAKLAAKVFRATAAYDAIIANYLTKQVGLEDPEKLTLTYDLKEKMRYGENSHQKAWLYEDAIPKSFSILQAHQLHGKKLSYNNIKDADEALRCIREFQDEPTVVAMKHMNPCGIGRGDTLEEAWDRAYEADSVSIFGGVIALNRKVDLATAEKMHKIFLEIIIAPGFDDDALAVLEKKKNVRLLELDFSKENEKTRPEVVSVMGGILQQEQDILIENTDDWKVVTKAEPTATQLKTMMFALRAVKHTKSNAIVVANDERTLGVGAGQPNRIDSAKIAIKHAGDAIDDRTVLASDAFFPFNDCVEYAAKHGIKAIVQPGGSIRDKDSIEMADKYGVAMVFTGYRHFRH >NZ_CP012381.1|WP_014918443.1|598698_601362_+|DNA-polymerase-I MADKKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLESFKSPDGLHTNAIYAFKNMLDVLLKDVDPTHVLVAFDAGKVTFRTKMYGEYKGGRAKTPEELLEQMPYIQEMLHDLGIKTYELKNYEADDIIGTFAAKGEKAGFTTTIVTGDRDLTQLASDKTTVEVTKSGVSQLEAYTPEHMKEVNGVTPTEFIDMKALMGDNSDNYPGVEGIGPKTASNLIQEYGSVENLYDHIDEMKKSKRKERLIRDKDKAFLAKKLATIDRDSPVTIDIDDVKREPVDYEKLWQFYEKMNFRKFLAELNASGAGQDGAEVEKVEYTVLNDDNVKDVKATEKDTVEFYLEMLGANYHLADFVGFSLKINDKIYVSRDVDLLEEDNIKHILEDEKIKKNVFDLKRSMVGAHRLGIHTHGLDYDMLLASYLVNNENNSNDLGEIAHLYGDYSVKTDLEVYGKGKSEHIPDDDDELFNHLASKVNAIESLKKTLLEKLKDHEQDDLFDTIEIPTARVLAKMEINGMKVEASTLIQLQNEFAVKLQDLEKKIYQQAGEEFNLNSPKQLGHILFEKLGLPVLKKTKTGYSTSVEVLDQLKTQSPIVKEILDYRQIAKIQSTYVKGLLDVIQPDGRVHTRYLQTLTATGRLSSVDPNLQNIPTRTEEGKQIRKAFVPSDPDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDQNMQEAFKTGYDIHSHTAMKIFHLESPDEVTPLMRRHAKAVNFGIVYGISDYGLSKNLGISRKRAQEFIDNYFEQYPQIKDYMNKAVQEARDKGYAETIMHRRRYLPDIHAKKYTVRAFAERTAINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVVQVHDELIFDVPKDELETIKKIVPEVMQSAVKLDVPLIADSGWGHNWYDAK >NZ_CP012381.1|WP_014563219.1|601370_602201_+|DNA-formamidopyrimidine-glycosylase MPEMPEVETVRRTLIPLIKGKTIEKVILWYPKIVATDHEKFLSELPGKKIIDIDRYAKYLLIRLSDNLTIVSHLRMEGKYHLTISDAPKDKHDHVEFIFTDGTALRYNDVRKFGRMQLILTGTERQTTGIGKLGYEPNSSEFTSEYLVNGLKRKKKNIKNTLLDQSVVAGLGNIYVDEVLWRTKIHPLSQANKIPAEKVIELHDQINQIITEAIKLQGTTVHSFLNANGQVGGFQSKLQVYGHVGEPCPVCGTKFEKIKVNGRGTTFCPHCQVIYK >NZ_CP012381.1|WP_054607253.1|602197_602800_+|dephospho-CoA-kinase MSYVLALTGGIATGKSTADDFFRKKNIPIIDCDQIAHELMEPGNASWQAIKDHFGMEYLNSDQTINRKKLGQLVFSNKQALSELNQVAHPLIFDKTVAKIKEYRDFALVILDVPVYFEAGLDKKHVANGVLVITLPEQLQIERLKKRNNLTDQEAINRINSQMPLVEKEKMADFVVANTGKIKELENKLEQILIKIREEE >NZ_CP012381.1|WP_003627138.1|602802_603270_+|transcriptional-repressor-NrdR MECPNCHQNASRVIDSRPSDENRAIRRRRECENCGFRFTTFERIETAPLLVIKNDGTREPFNRKKILHGVMAAGQKRPISSDQFEQLVDHVENKVRKQGISEISSKKIGQYVMDELADLDDVAYIRFASIYREFKDMSSFMKTMEDMMAKKGKGN >NZ_CP012381.1|WP_054607254.1|603272_604604_+|DnaD-domain-protein MFETADPKHLYYVANRVRLFPEDEKVLIKLYQPLVGAVAVALYQTLIQNYDPYGIISDSKGIYSLQEQLDCSLKQLFNSLHKLEAVGLVQTFLSDNVFNNVLVFKLLQVPAADKFFATPLLASLLKEKVGVPTFHDLSHAFAQEAKLKEKPIKNAKDVSANFFDVFRLPGDEAITPSSDVVQAAQENKVHEVETAKVNDHDSIDWDFIKQEYSRYQIPASEIDLNKEQIRGLIQTYGLSEKEFVDESLPCLHGSYSLNMRDISNTLAENYKRTNTRENVQAQLNEGRKKALVAIKDMDDNDKKLLKAANESSPAEFLYKLKTQKGGITSANEKQIINNLHTQYGLPEDLINILTYTCLTYDTVVSSNLAYKIANDWLQHGVATAVQALQYVKKRRNSFGKKRPVRTYQKRVEKGTDWSKKKADRDAGISTEQLKNLFKDFNNK >NZ_CP012381.1|WP_023061996.1|604635_605544_+|primosomal-protein-DnaI MEPIDKVIKKIVKERNLGDEQSLISQALHDPDVQAFLTANANKIDQKMVQNSMSNLYEYYSQKHTANKVMAGYAPQLFLNGKVIDIRYVPTKTKLAQDRKQAAERRLQLIDVPTRLHDVSLSEIDVNDDRKQVLTLIYDFLRKYKQDPHVQGLYLSGDYGVGKTYILAGLANYVVTNMNKNVVFLHVPTFIAGLASHFDDNSLQSEIRRLSECDLLILDDIGAESLSQWSRDDVLGVILQARMDNVLPTFFSSNLDMEALESHFEETRNATDPVKARRLMQRVRFLAKEVVVSGPDRRNSLH >NZ_CP012381.1|WP_023061995.1|605834_607769_+|threonine--tRNA-ligase MSFSITLPDGSKKDFEESLTIADLAHNIATSLGKAAVAGKVNGELKPLDYKLDSDSEVAIITNKDEEGLDVLRATAAFVFEAVAKCEYPELRLGEHVADEGGFYVDTDKDDQIKVGELPKLEKAMQKVIKNGEKIEHVQIAKSELEDLYKNDKFKSELLAKVEGDTVDAYKLGDFVDFGFDALLPNTGKIKQFKLLSVAGAYWLGKSSSPMLQRIFGTAFFKEADLKADLKRRQEIKERDHRTIGRDLDLFFVDPKVGAGLPYWMPKGATIRRVVERYIIDREVADGYQHVYTPVLMNLDAYKTSGHWAHYRDDMFPPMDMGDGEMLELRPMNCPSHIQIFKHHIRSYRDLPLRVAELGMMHRYEKSGALSGLQRVREMTLNDGHTFVALDQVQTEFAKILKLIMDVYKDFDITDYYFRLSYRDPKNTDKYFANDEMWEKSQKMLKGAMDDLGLDYVEAEGEAAFYGPKLDIQTKTALGNDETMSTIQLDFMLPDRFGLTYVGKDGEEHRPVMIHRGIVGTMERFIAYLTEIYKGAFPTWLAPVQAEIIPVNNEAHGEYAEKVRAELAKRGFRVEVDDRNEKMGYKIRESQTQKVPYTLVLGDEEMKSGKVNVRCYGTDEEISKSLDDFINEIDADVKSYSREN >NZ_CP012381.1|WP_014563224.1|607926_608448_+|hypothetical-protein MKRKLILFLTACSIIFSVALINQRKASAASWGAKSLYTTPKQTRGTWYYKKNGKIKKLRITAHTFDKVKLYKMLSNKQTRKWTKKLAKADQESGFKLAKKVGTSQYEADDFKFHKSAGFTINGWLSSDNADSGHTYVTVKKKYKGSKIKTLRVGNGADNAFLYYCYRTKKLAK >NZ_CP012381.1|WP_023061994.1|608598_609129_+|hypothetical-protein MKKKLLLFLGAILLILGFAKLSSVNADAATIKAIDWGAKKVFTTPKKTRGVWYYKEGKKVKKFKITAHTIDGVKLYKELNGKTSDRWVNKLIKADKKSGYKLADKVGESAWACHTIKYHKIIGFNADGWLAGSGDGFYYVPVKKNVKGKKVNALRVGEGAGNYLSYYAYKSRKLVK >NZ_CP012381.1|WP_014563226.1|609592_610843_+|DUF389-domain-containing-protein MSRKNYLSPQFLTKISEDGTLNIESLIILTCAIFIASIGLNVNSTATIIGAMLISPLMGPLLAIGTGLALYNTNILRKGAISLLAEIVISLVASTIYFHFSPLTYASQEIIARTSPTIWDVIIAFFGGSAGIIGARKKDANNIVPGVAIATALMPPLCTVGYSIAAGNLKYFLGSGYLFLINCVFITLTAFLGVKIMKWLSHSAGQPGLSFFRKPTLKETGIVLVVIILIIPSILSAGHMVNKTLVDQNVQNLVAHELGDVDLIKENVDSQEKTINLTVSGKKINAKKIQAAKANLAEYNLKGYSLNIVQVAQVNPNAENQLDRQVNNILNQRQREQEQANEERQQEQEKHNQEIEKLSPAISSVTAVSDNKNKQITLIELKKNISAKKKKALVKQIKEKYPNINLVEFVQESEKE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012381_2 | 719184-719395 | Orphan |
I-B,III-A,III-B
Consensus repeat of NZ_CP012381_2
|
3 spacers
spacers of NZ_CP012381_2
>2.1|719219|26|NZ_CP012381|PILER-CR GACTTCAAATTATTATCAATCAGACT >2.2|719280|26|NZ_CP012381|PILER-CR CTCCGGAGCCAGAACTTCTAACCCAA >2.3|719213|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT TGGACTTCAAATTATTATCAATCAGACTCTGG >2.4|719274|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT AACTCCGGAGCCAGAACTTCTAACCCAACTAC >2.5|719335|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT TGCTCTAAATTATCGTGATATTCTTGAACATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012381_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012381_2 >merge|NZ_CP012381|2|719184-719395|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTTGGACTTCAAATTATTATCAATCAGACTCTGGGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTAACTCCGGAGCCAGAACTTCTAACCCAACTACGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTTGCTCTAAATTATCGTGATATTCTTGAACATCGTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCTT >NZ_CP012381|2|3|719184-719336|PILER-CR GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTTGGACT TCAAATTATTATCAATCAGACTCTGG GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTAACTCC GGAGCCAGAACTTCTAACCCAACTAC GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCTTG >NZ_CP012381|2|2|719184-719395|CRISPRCasFinder GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCT TGGACTTCAAATTATTATCAATCAGACTCTGG GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCT AACTCCGGAGCCAGAACTTCTAACCCAACTAC GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCT TGCTCTAAATTATCGTGATATTCTTGAACATC GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCTT >NZ_CP012381|2|2|719184-719395|CRT GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCT TGGACTTCAAATTATTATCAATCAGACTCTGG GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCT AACTCCGGAGCCAGAACTTCTAACCCAACTAC GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCCT TGCTCTAAATTATCGTGATATTCTTGAACATC GTATTCTCCACGTATGTGGAGGTGATCTT
>NZ_CP012381.1|WP_023192402.1|717977_719027_-|IS30-family-transposase MDSLHSIMDKRKKGTHLSLEERVIIQTRLKDHCSLRSIAREIGCSPSTIHYEIKRGTVKLYHGNIKRYKAQQGQSVYQNHRQHCGRKSDFLKKHRFIDYVQRHFFEDGWSLDVCSNRCTAVGEFASSDIVCTRTLYNYVDQGLLSIHNYDLPEKLKRNTKIHRVRKNKKKLGRSIEQRPQEVNKRNVFGHWECDLVLGHKTKDDEVLLTMSERMSREFLIIKIPDKTVASVMNAFKSLRKQYSEHWNDIFKTITTDNGSEFADLSQLEDISKTLVYYAHPYTSCDKGTVERHNGLIRRFIPKGDYIHNYSLQQIINIETWCNSLPRKILAYHTPDEIFERELDQIYQTA >NZ_CP012381.1|WP_155248852.1|717653_717791_-|hypothetical-protein MLKKTKWNTAIVAVLLGAGIVSTNHVQADAVSDAQSNTQVVQNSN >NZ_CP012381.1|WP_081008668.1|717310_717562_-|hypothetical-protein MLLSIRDAALTQVDHQAKKGYHYLTSKLVTPADSAPVLKLNNGKYISAKKSLIAKVKGYQNPKGYHQVHYTQIKPYGHVGYNL >NZ_CP012381.1|WP_081008667.1|716650_717277_-|C40-family-peptidase MHRMGTWYGKNYYNQATYNAVKNFQRRHGLKATGNVNLKTWQKMGFSKKSWYGIDSYVAPLKAKAWQGRKAHVEAMINQAYKYMGKPWLAGCSSSPAYGVDCSGLVIQGLYAGGISPVPTSSIGHAHPGNEWNSRNLGADKHLKRVAYSQRRRGDLVFYYQPGTHTIWHVAIYLGNNRVIESWPPCVMVAPISNSQRNVIAGIKRPFI >NZ_CP012381.1|WP_054607282.1|715663_716284_-|C39-family-peptidase MLKNVRKIPHTKHYSYFDQLGRRRMKNTSTKKAYYWINKKGQITGIKNNAKVICQRPQMPTGCEITAVTMMLNFAGKKVSKYQAAKVMPRSSNPNKGFVGSPYKKFPLGFWVAPGGVKPVVQHYLGKSKIMTNCSINAIKQKLLRSHLVVVWVGMFDGISNHAITLTGYHGNTLYYNDPWTGTKRKISVTKFKIHWALDGHRAISY >NZ_CP012381.1|WP_054607281.1|715317_715551_-|hypothetical-protein MYIYYQIGIFVGLVFVALAINIFRQARKSGYPSNLVNCIFSITISTAGICIIVASLAAIQPHNWYTSSLLWKILIAG >NZ_CP012381.1|WP_054607280.1|714419_715274_+|DNA/RNA-non-specific-endonuclease MNKRKTITLFSSFLLLFTLSGCSNTQSSQGTVLAKAPKTVIRYNRTAQQKAKKIEAKNYKTEKKIQTLDKKIAKLRKELKKYSGAHAVESVSATKLANLTYKGQDIITVNNNDPNFSQSDLNTANGAWQRYGNLDGLNRVTAANALLNKSLMPTSQREPLHVNPTGWHNKRIASGWLYNRCHLIGYQLTGQNNNLKNLMTGTRQLNDPDMLRYEDEVADYLKESNSNYVRYRVTPVFRGNELLARGVEMEGQSVKSNSVHFNVYIFNVQEGVSLNYATGTSKVG >NZ_CP012381.1|WP_054607279.1|713739_714420_+|hypothetical-protein MDTLKKVGKVILWIFFWYYLIPYYLLKKYAFKQVKHRVFWSSLSSLVVVFVLFCWWGSTIPDDDSTQAETTKPKIHYVVKKVGREKLAQAKAKEKVLNKEEKKEEVEYEKLSAALVAAKAKDKKEKAAKIKAEKKVNEEAKQQNNAVSKSHTSTQTNTSRSHHTTGAAASNHGDMNTAQTGKIVGNHNSKIYHVPGQAGYRMNFANAVYFNSEAEAKAAGYRKSLR >NZ_CP012381.1|WP_054607278.1|713403_713736_+|hypothetical-protein MKKAKKVALILSAVLMMFSEMAISPAIFNNSDNTVVAATHRRHRCHTRRHHVRRRNKAKIWTDDYKIVGNKRSKIFHVIYGHSYRMNCENAVFFKSKAAARAAGYRESKR >NZ_CP012381.1|WP_054607277.1|712781_713276_+|hypothetical-protein MNFTKVEFYFENVECGTIPSDIIEDMQFDDLHEDKHQGFEDGNIVFTNYLVADNCLIKLDYELANQYFTNFDEPLGKRLCEHDDIVDVTLHFADNTQERIEIAWSDNSDDDNEWQSHQLEVKKLLDKSDLDQIEPGLAEEMKEIEQNDRFLNRKILRIYIGKED >NZ_CP012381.1|WP_054607285.1|719546_719747_+|hypothetical-protein MARTEPEKKAQKKYYLKNKNMYKINSYRSRAKNFILKYATTDELIWLRGLIDERLSKKKFEVAITD >NZ_CP012381.1|WP_042753948.1|719866_720193_-|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MRDGETIKNDIINQLATVIDPELNVDVVNLGLIYEIDLDKDGICLINMTLTTPACPLTGYLIDSITQAVKKVPEVKNVDVEFVWYPVWTPDRMSDAAKKYFNIDEKQD >NZ_CP012381.1|WP_054607286.1|720194_721079_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MYNHIKEIVADSEKQQKPISELIIEQECKLSGLPRQKVWNRMKHNLATMRAAVERGKSGAGVFSKTGLTGGEAVKIKKYRQTHHTLSGDTIMAAVQNAVATNEVNASMGVICATPTAGSSGTLPGVLFLLEKRMDLSEEQMIRSLFTAGGFGLVIANNAEIAGATGGCQAEVGSASAMGAAAAVEAAGGSAEQSAQAMSIAMSNLLGLVCDPIAGLVEVPCVKRNAIGAGNALISADMALAGCTSMIPADECIDAMKKVGHQMPASLRETGIGGLAGTPTGQAIKAKIFGKDAG >NZ_CP012381.1|WP_054607287.1|721093_721756_-|serine-dehydratase MTNRYKSVFDIIGPVMVGPSSSHTAGAVAIGRAGNKLFGGVPRKVTVHYYGSFAQTHRGHGTDYAIAAGILGFDTDDLRVPNAPEIAKKRGIDIRFVEEDGPSPIDHPNTAILDMSSETKKAQISGCSIGGGSIEIRHLVIHDTAITPTGSLPIIIWLDYEKEILNEQNLTSLLQEKAPFSKKRIFHTKDCNIYEYDVENYLKPALVKELKEKFENIIWL >NZ_CP012381.1|WP_054607288.1|721858_722149_+|hypothetical-protein MNKEKDELKRNLEKVAEEQGGQQAVSYQDLFNPRFMQKNTHFTTIDVFVRELGVKNFPEIEQLGQKVIDDFVKKETNFNIWEELHQVSISMICWRE >NZ_CP012381.1|WP_003627894.1|723021_723681_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MDWTIIQQALPAYGHGFVLTVWLSLVGIIGSIIVGVIASLLQYFKTPILSQIATAYVELARNTPLLIQLFFLYYALPVIGWRMSSVTAGIIGLIFLGGGYMAEGFTGGFQGVTDSQINSGEALGMNRFQLARYVVFPQGFALSMPALAANVIFLIKETSIFTVIAIPELTNTALDLIGMYYRSNEYLLMLVIGYAIIMIPVILLLNWLERKVRYGAFGD >NZ_CP012381.1|WP_014563318.1|723661_724336_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MAHSGINVLFSGSNFDRLLVGLWTSIWIAALSIFIGLLIGTVFGVLRTMPNKIIRCILRVYMEIFRILPSVVLLYLVYYILPRSLHINWPGTWMAVLAFSLWVAAEFSDIVRGALQSVPLAQKESGLALGLSKTQLFLYVLLPQAFKLELPATINLATRVIKTTSILMLISVMDVINVGQQIIEANNQKFPTGVFWVYGLIFFFYFILDYPLSVWAKSLMAKQK >NZ_CP012381.1|WP_014563319.1|724345_725086_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MTEEILKVEHLNKFYGDWQALHDISFNLKKGEVLAILGPSGSGKSTLLRTLNGLENYKNGEIVFHGKKVQSSQKEWQAIRQKIGMVFQSYDLFPNLTVMQNILLAPTKVQKRDRAEVEQEAHHLLKRVNMDQYADTYPRELSGGQQQRVAIVRTLVMKPEIILLDEITASLDPEMVRGIEDIVKKLSENDHMTMVLVTHQMNFAKRVADQVLFLEKGRILEKTPCEQFFTEPQSERAQQFLTDMDF >NZ_CP012381.1|WP_007126420.1|725098_725959_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MSGRKIFNTIISVIAAVVVLASAYMGLTKPYLARSAGGGGWSNNNSVTQIKRRGYIRIGVYGDLPPYGWVNSQGKRVGFDLRLARELAKELGVKPRFTQLNGNNRVDALNSNKVDMVLANFTKTPERAEVVDFAHPYMKVSTGVVSPKSHPITSEKQLRGKQLILLKGSTGENYFANRPGIKLLRFDSETQQFNAMKNKRGAALADDNSYLYAWIKKNPQYVVGIRSIGPHQFIAPAVKKGNKSLLKWTNKQIDRLTAEGFFKKDYQIELKPYFGKGIVPSDILLK >NZ_CP012381.1|WP_054607289.1|726005_726320_-|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MRDSETIKNEIINHLAKVIDPELNIDIVNLGLIYGIDLDEDGICLINMTLTTPACPLTQFLIDKIKAEVEQVEEVKNVDVEFVWYPVWSPNKMSDTAKKYFGIE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012381_3 | 1657944-1658123 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012381_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012381_3
>3.1|1657965|58|NZ_CP012381|PILER-CR ATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCC >3.2|1658044|59|NZ_CP012381|PILER-CR TCTCCTACGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012381_3
The CRISPR arrays of NZ_CP012381_3 >merge|NZ_CP012381|3|1657944-1658123|PILER-CR ATGTGGGATTCGAACCCACGCATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCCATGTGGGATTTAAACCCACGATCTCCTACGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGGATGTGGGATTTGAACCCACGC >NZ_CP012381|3|4|1657944-1658123|PILER-CR ATGTGGGATTCGAACCCACGC ATGCTGGATCCACAAACCAGTGTGTTAACCCCTTCACCAATTCCGCCATAAACGGTCC ATGTGGGATTTAAACCCACGA TCTCCTACGTGACAGGGAGGCGAGATAAACCACTGCTCCAATGGACCAATCAGAGGAGG ATGTGGGATTTGAACCCACGC
>NZ_CP012381.1|WP_054607516.1|1656329_1657796_-|MFS-transporter MNKKQITMVTIALMLGNVMSGLDGTIINTAIPTIVAALHGIQFMGWIVAIFLLGMSISIPIWTKIGEKITNKKAFEISLVLFVLGAALQGMAPNIIFFLCSRFIMGIGAGGMGSLPYIIAGYVFKNIKTRTKVLGYLTASWNGAAILGPLVGGWLIDAFSWHWVFYINIPIGLIALIICLIYYKPVTPEKTPVFDIPGAGLLVIGLLLFLMGVQLVGLTANWIVISLIIISLVFIVLFFIRENHAANPIIPVSLFKNKNLDGDFLLFAFTWGAFIAVNTYMPMWAQALLGLSALLGGMTLIPNSIVEIIASQSVAAIQEHMSTFKLALIGIIAMMISSAGLFLADIHTPVQMLTFIGAFSGIGVGFIFVAMQLKVQLDAGLKNMATATSTSYLIRILAQTVMAAVYGVIMNLNLASGVHTYKGITMAMMNKLSDAKSAKLLPQELVPTMRTIFHAGIKEIMLVSLILLIIAFVLNFYFNFGKKRKKLQ >NZ_CP012381.1|WP_013854589.1|1655809_1656322_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MNMKSLHTQQHIEKALFSLLQKKPYAEISIAEITRKAHVSRTSFYRNYSQKNDVLTLFLANQYKKFIVDINEHKLKTLTKQLVAYLTFFKGNPKVMKILLDAGFEGSLLNFQTRYLKKLLSVYHPDLNLPDYAIAYQSGGIYMLLIWWVKQDYATPLEDLINYAEKHIML >NZ_CP012381.1|WP_014564044.1|1652868_1653345_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MYMKAFPAWERFSMLSLLAMSLHRNVKFHAIYDNGKFCGITYYAENDNTVYLTYLAVSEKLRGHGYGSKILTVLEDQFPDKQIVIDIEPVTKKAKNYKQRVSRLKFYERNGFHRTDQKLKDPDGEFEALTTGKKLDKNSFIKTLRQMSFGFYQAKVEK >NZ_CP012381.1|WP_054607679.1|1652013_1652829_+|PTS-system-mannose/fructose/sorbose-family-transporter-subunit-IID MTKANTKTNSGKLTKKDLFRANWRWLWASQLSWNYERMMAPGYFYAVLPFLKRWYKDDELVEMMQMQTQFFNVNAYDGNFIIGVDLALEESQGIKSKDTVAGIKTGLMGPLAGIGDTIFSAIIPTICGSIGAYMGLRGNPLGSILWILVDIIILFLRFSFLPMGYYQGTKLIDSASGKLNAITDSAILLGVMVVGALIPTVIKAKVPYVFHTGKITLKMQSILNQIMPSLVPVLLVALVYWLLGKKVVTSTKMIWFVLILGIVLSYFHILG >NZ_CP012381.1|WP_014564041.1|1649182_1650019_-|aldo/keto-reductase MEKSVTLNNGVKMPRLGFGVYQIDDLAQAQQVVEDGLEVGYRLVDTAQIYGNEQAVGDAIKHSAVPREDIFVTSKIWVDDYGYDQTLKAFDESMKKLQLDYLDLYLIHKPYNDYYGTWHALERLYKEGRIRAIGVSSFWNERLADLITFNDVKPAVNQIETNVWNQEWKSQKYMEKEGVQPEAWAPFAEGADHVFTNPVLEEIAEKHHKTTAQVMLRWFLQRNYVVIPKSVHKERLAQNFDIFDFELDKTDMEKIKTLDQGRSILEDEMDPEIAESFR >NZ_CP012381.1|WP_023060908.1|1647799_1649128_+|NCS-family-uracil:cation-symporter MSKKENFRNPDAILDVYEKPEFGQGVLLSLQHMFAMFGSTVLVPILIGINPSIALLSSGIGTLVHMILTHFKIPAYLGSSFAFVATMQALMKADGYPAVAQGAIASGLVYVIVALIIAKVGSGWVNKVLPPIVVGPIIIVIGLSLATTAANDAMMNNQKYDLTYFGVAIFTLVMTLVFQMCFKGFTSLVSIMLGIICGYVLACFLGIVDFSGVEKAAWFSIPSLDVMGISYHFKWYPAAILAMAPIAFVTMTEHMGHIMVLNSLTKRNFFKNPGLHRTMMGDGISTIIAGFIGGPPTTSYGENIGVLAMTKVHSVWVLAGAAVCAIIFSFVGKLAALIESIPMPVIGGISFLLFGTIASNGLKILVDDKVDFGEKRNMLITSVILVIGIGGAYLQLGNFELTSVALSTIIGMILNWVLPKQAASEKALAEKNKEKQEGKIYQ >NZ_CP012381.1|WP_023060907.1|1647256_1647787_+|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR MAKEIIDAIGMKRALMRMTYEIVERNKGTENLVLVGIKTRGLYLAQRIAANLKKLEDVEITVGAIDVSQYRDDLPESKKEKMIHDQQLDFDITDKNVVLVDDVLFTGRTIRAALDALMDQGRPAKINLAVLVDRGHRELPIRPDFIGKNIPAAMNEEVKVSMTEVDDKDSIELINK >NZ_CP012381.1|WP_054607515.1|1645496_1646966_-|MFS-transporter MNKKQLFMVTLALLLANIMSGLDATIINTTIPAIVSDLHGIQYMGWIVACFLLGMSVSVPIWGKLGERMGNKFAFELSLALFILGSLLEGIAPDIYFFLIARILMGVGAGGMGSLPYVIVGYIYPNIKRRTVILGYILASFSAASIAGPLVGGWIVDTLSWHWVFYINVPLGLIAIILSFVYYKGIRKPNKNTQFDKLGAFTLIAGLTSFLIRIQLLGMVSLPVVLGFIILGILLLVVFIRAERKAKSPVVPLSVFTNKALVGDFLIFALAWGSYIAVNTYLPMWAQAILGASALVGGMTLIPNSIVEIVGSQTAPYFLRHVNNYRLLIANLTIMAITAVGLILAPISTPYQILALIAAFSGFSVGSIFVILQIKVQVDASEKDMAPATSLSFLIRILAQTIMAAIYGVIMNLALGRGIAGHPGITMTMMNKLSDAESAKSLPVQLLPTMRKIFYGGIREIMIVSLVLLVAAYVVNYLYNRHEAKIMAE >NZ_CP012381.1|WP_054607514.1|1643071_1644154_-|M42-family-peptidase MQKEQEIQMLKEFSDANSTSGFEKEFVKLFTSYAEKTANIEVDGMLNVYASKKENKGDRPVIQLDAHSDAVGFITQAVRPNGLIKFVPLGGWVKYNIPALKVKVRNRDGEYIPGVVATKPPHFMTAAERNNVPDVVDMSIDVGSSSREETIKDYKIDTGCPIFVDVKCEYHEKSGLFFGKDFDDRFGAGAMIDVLDNLKGEETNFDVVAALSSQEEVGLRGAYVTARKVKPDLCLVLESCPADDTFTPDWLSQTGLKRGPMLRDMDTTFLPNPKFQQYACDLADKNNIPYTRSVRTGGGQDGAAIYYENGAPTIVIGIPVRYEHSPYCFSSYKDFKASVDLATAIIRDITQEKLDSFKKF >NZ_CP012381.1|WP_054607513.1|1641345_1642968_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVSDLSLKFGGRTLYEDVNLKFTPGNCYGVIGANGAGKSTFLKLLEGKLEPTTGSISIDPNERMSSLNQDHFAFEDFTVMDTVIQGHKELYQVMKEKDALYAKPDFGDEDGVKAAELESKFAELDGWNAEANASKLLQSLDIPESEHQMLMKELPESEKVKVLLAQALFGNPDILLLDEPTNGLDVHTVEWLENFLADYPNIVIVVSHDRHFLNQVCTEMCDVDRGKIQLYVGNYNFWYESSKLANELVANQNAKKEEKIKQLQEFIARFSANASKSRQATSRKKQLDKITLDDIKPSSRKYPFVKFEMHRDLGNDLVKVENVSYSVDGEKILDNVSFIVRPGDKVAFLSRNALAATALLDIIAGKIKPDTGTVTWGQTTAFNYMSRDLNANFNNDDLTILDWLRQYATKEQDDNTFLRGFLGRMLFSGEEIEKKIKVLSGGEKVRCQLSRMMLEPANVLIMDDPTNHLDLEAITALNDALVAYPGSILFTSHDHEFIQTIANHIIEVGPKGIVSRQDTTYDEFLDKESIQDQVEKIY >NZ_CP012381.1|WP_003633097.1|1658291_1658792_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIIKPLISEDEAKETSRLFQKCWQNTYKDILPDVFLDNIPENAWVKRLNESGRHNLIFIDDDNKIRAAVSYGRPRDTRMLGCGELMALYVEPDFQGFNIGKTLLNAAENELKKMGYGKIYLWCIDGDENARQFFEHFGWVNNATEKFVEIAGKEYKYLLYQKNLHD >NZ_CP012381.1|WP_054607517.1|1659466_1660873_-|ISLre2-family-transposase MESIIADIVKIIKSENNVIAREKALMCYFFDLIRELMTAALEEVDAGLVEETKKQGYQIEKKNKRSVVTAFGEISYWRRRYVCPGKKAQYPLDKLMGYDKYKRYSVLAVKDVLQVSAVATYRNTALAVNTLSCFKISHSQVGKLIVQAGKQIKAQQQSEERYDGITQKKKAPVLYLEGDGVVIKGTKKRLEFHRYQVCEDIINLSKTRRKRVQAKEFVSLSRLDALQEIKAYLANAYDLSDTLIISNADGGAGYAKKDFDEIVGYCRQHEHFLDVFHLNKKIKDRLGFMPAMPSKLISAVEFKYDRHLTDVILDTIESNLVDELNTPENHENLKRLRSYLHRRWVDIKPFKMRHLSVIKAIGCCESNHRKYTYRVKGQGKYWSEDGAEGILRVLTCIKNKELEYWLSSEFAGGKLDIGDQEELKGAVRASLRKTHEAHLGIHHGAIESLTAGHSYLNDFSRKINQINI >NZ_CP012381.1|WP_054607518.1|1660997_1661381_-|hypothetical-protein METIQLIKDIILNELQDRVKYILSFKNKLEILEENDIQQGVTVARALQSFINAEDKEVTKTRYDRLMKSNNYLSNYKGFILEFRQFNGQITKRNLHSFIFEITSAHESTVLNALFPNGNVQFKDLSV >NZ_CP012381.1|WP_014563294.1|1662609_1663788_+|IS256-family-transposase MNDFTKNMAQALFNQDKINDLLRKELQQAVNDLLEAELTAFLGYNPYARDGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGKIEIQVPRDRNGLFHQHTLPDYKQHADVLENMIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHKRKLNDKFFCVYLDAAYVPLRRITFDREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPNENIEVWTELLQSMKSRGLEQAELFLSDGVVGMKTALAKTYPQAHFQRCLVHVMRNICAKVRVEDREAIMNEFKQIHQQANKAAAVDVLHAFYAKWDKSYNHVIRNLKDIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDTFIGIQAMSYNDRYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD >NZ_CP012381.1|WP_148224876.1|1663848_1664193_-|hypothetical-protein MNRILGIESYFRNERLTLRDKINKFIEELPESYRELLSEHVGNTDDWIGKLVSTRVFLTHGDRENMAVSNPYKLVQMTKKFGFMVRIFILQKLGITIDKPKILNKFKNVLTTHY >NZ_CP012381.1|WP_014564049.1|1664527_1664728_+|cold-shock-protein MQNGTVKWFNADKGFGFITGSDGTDVFVHFSSIKTDGFKSLEEGQKVSYDVEQGRRGPQATNVVPQ >NZ_CP012381.1|WP_014564050.1|1664822_1666154_-|ISL3-family-transposase MDYSTRTALGIKDSHLELDTAHFKNVIESHDNQVVVHLIQSYPLRCPRCGQLMLKNGFKIVNVLGPSLHYQPTIWSIRNQKYLCKPSSACPSTITELAKVKDIKYRHHISQAIKQQVMIQLTTNESQIDIAKELGISDWTVRRVIFNLDQFFKPNYHWLPRHIAFDDFKSGRFAPSGMSMILMNIENHRTIDIILSRRNRYLRNYFLRYDRAARLAVRTVTVDLYTPYRHLIHELFPHAIIIADHFHVVAQAYRALNKIRVKAMNQAGNGSHQWRALKHFWKLILTPAGLLKYDNYWSRRNFGYTQLTDVEVIQRLLAFNDDLKQAYRYYQDLILAINHRSKDELNHLLAIKWTQLPQSLQKVQRTLRRHRKEIITSFKYGDYTNGPVEGTNNKIKVIKRAAYGFRNFFNFRARILLALPNSYFAINWKNKRTAHVQSQTRAV >NZ_CP012381.1|WP_023060767.1|1666249_1667173_-|IS30-family-transposase MSTTILSLQNRVVIETLHNEGRSLRYIANYLGFSKTTIFNELHRLNSEYQAELAQTDFERKVSQRGRKSSLTKNLKHLIEEKIQVQKWSPEQVAHVVGIAYKTVYNWIDQGWLDIQLPDLPDHGIRRHRAKEKRGTFNHGRSIEERPHQVETRQKFGHFEADTVLSGKRKGQAVATFVERKSRLTIVKRLHGRDSQSMTQAVLELASQLQDKLKTLTVDHGKEFANYQTIERQTGTQVYFAHAYSPHERGSNENRNRVLRRFIPKGQAIEELSDHKLIQINWYLNSRPLKCLNWHTPIEIFLLNLRH >NZ_CP012381.1|WP_041809658.1|1667614_1668985_-|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD MEKNQIIDLEITDLSYEAMGVAHYNGMTVFVTNALPGEVVSAKILKVKKNFAFAKIEKIKKESPDRVKVKLNQGVQSGLASLAHIKYDKQLDFKRNQVVNLLKKAHLENIEVGETLASPEEVGYRNKAQVPVREVNGQLEIGFFRRHSHDLMPLTHFFTTDPEIDRVLVAVRDILRKYKVPAYDEINNNGEVRYLEVRRSKSTGEMMVILVCLHKDFMQLPNVAAEVSQIPGVSGLILNHNPKKTNVILGPKDYLVFGNDQITDQIGDLKFRISPQSFFQINSLQTPRLYNLAIKQADLKPDDVVIDAYSGIGTIGLSVAKHVKAVRGIEVVRDAIKDAKDNAKLNDITNAKYYLGKAEEIMPRWAKSGLKTDVVFVDPPRKGLTPEFINAAVKTGPKKIVYISCNPATLVRDLQLFQEKSYEFNRIDPVDMFPQTPHVESVTVLKRTKNSRQTAL >NZ_CP012381.1|WP_054607519.1|1669350_1670727_+|Na+/H+-antiporter-NhaC MKKEKVSFTESIIILIALLAILGISVIKFGLSPEVPVLFTVLLLTFWARFRGFTWKDVQDGIKEGIGVAIIPIFIFILIGALIGLWIKAGIIPSIMVLGFHLISGSFFVPSVFIACAIVGVAIGSGFTTISTVGIAFFGIGASMNANPALVAGAIISGAVFGDKMSPLSDSTNLSSAVAESELFAHIKNMMWSTIPSFVVSLILFWILGNSGHMDPTKIERTSHVLQTNFSISWWAVVPIVFMLLCAWRKVPAIPTLFINIAATVIMIFVQNPHESVQSLNNLIMNGFVAKTSDASVNALLTRGGISSMMATVALIISTLSLGGMLMKFNVVQSAMEPLVKHLRKPGRLITVTILSGICINLFVGEQYLSVILPGRAFKPAFDKIKLSPLALSRVLEDGGSVINYLIPWGVAGSFAATTLGVPVLQFLPFAFFSLLSPVFSIISGFTGIGLKWAKNKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012381_4 | 1790471-1790625 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012381_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012381_4
>4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder TTTTTTTATTGCATAAAAAAGGAGGACATAGTCCCCTGTAATAAAAAAT |
Cas14u_CAS-V |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012381_4
The CRISPR arrays of NZ_CP012381_4 >merge|NZ_CP012381|4|1790471-1790625|CRISPRCasFinder GGCTCTATAATTTTTCCTGTTGATGACTTATCAATATGATAAGCTGTTAACAGTTTTTTTATTGCATAAAAAAGGAGGACATAGTCCCCTGTAATAAAAAATGGCTCTATAATTTTTCCTGTTGATGACTTATCTATATGATAAGCTGTTAACAG >NZ_CP012381|4|3|1790471-1790625|CRISPRCasFinder GGCTCTATAATTTTTCCTGTTGATGACTTATCAATATGATAAGCTGTTAACAG TTTTTTTATTGCATAAAAAAGGAGGACATAGTCCCCTGTAATAAAAAAT GGCTCTATAATTTTTCCTGTTGATGACTTATCTATATGATAAGCTGTTAACAG
>NZ_CP012381.1|WP_003590074.1|1789548_1789668_-|IS3-family-transposase MPTRYDKEFKQNIINLYKQGESAAQLAREYGIGYSTVHK >NZ_CP012381.1|WP_014564135.1|1788520_1789363_-|IS3-family-transposase MCRILGVSRAQYYRYRSPKPSKRRAEDADLKQRILRIFAEFKQRYGVMKIHHELNLELQPLQLRCSPRRISRLMKELDIHSVTVNKWKAASASKTKVEQRPNLLKQDFSTTGLNQKWTADMTYIQTKRNGWCYLSTIMDLHSRLIIGYSFSKKMDTDLVLKTLESAVKNRTITGDLIIHTDLGSQYTSDDYNQRLTELHIRHSYSRKGCPYDNAPMESFHASLKKECVYPVPVFEDYETTAAVLFEYVHAFYNRKRIHSSLGYQTPLQVEIATLTSQMAA >NZ_CP012381.1|WP_041809692.1|1786795_1787800_-|lactate-dehydrogenase MKIVCYGVRPIEEPYFRKLNKHHYDLKLVNAYLDHDNVTEAEGCDAVLVRANCACDEQNLKKFKSYGINWVFTRTVGFNHYDLKAAKELDIKIARVPNYSPYAVANLAFTLGAALTRHVVAAVDAVHQGNFTVSPYYFSTEFNRLTVGIYGAGKLGAIEGKMWKSIGAKVLAYDPYPSDFARQYVKFVSEDDLLQSSDIVSVHVPYFPGKNDNLINSDFLKKMKETAFLINTARGQLADTNAVAKAIEDNEIAGYGADVVIDETRINGHKFNSLAEVPNSSVQSLMKLYPKVLITPHMGSFTEPALEDMISISYDNFHEMQETGDVKNKVEYKG >NZ_CP012381.1|WP_054607546.1|1783910_1784627_-|minor-capsid-protein MLANASPSDKLSKRLQAIFAQASISRRDMLGAMIGAGMNIATAKSESFAVIELKQQYIDGYNNSSPNKLSTVPDKVANQAEYSQQIWVHGDVMTTRMKETLNKGLSRRMKKSDINKMTRSIPQSGDRIDDNLATPMNQMLSRIHTLTTNESIRNSNGGKNRAYDEQNVQYVMWLTEEDDRVCDICEPLDRQTFAYGQAPIPVTDTHPRCRCQLVACDEDGNLLSGELDRVFKEQKKPT >NZ_CP012381.1|WP_003606447.1|1783532_1783781_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MHWLWVLIIGAIIGAIAGAITSKGKSMGWIANIVAGLVGSSIGEAILGSWGPQLAGMAIIPSIIGAVIVVAVVSFFVGKSKN >NZ_CP012381.1|WP_167541415.1|1782597_1783248_-|IS6-family-transposase MKNYFKGRHFQQNIILVAVGYYFRFNLSYRDVVEILRDRGITVHHTTIMRWAHHYGPIFQVLWRRHKHSASQSWRVDETYIKVKGQWCYLYRAIDNQGLTLDFELRKHRDYQSAYHFLKRLFTTDGRPNCLVTDQYGGTLKAIKQVIKDGLLEKANHQCSKYRNNLIEQDHRFIKRHRVRSSGFQTIRTAAKTLAGVEVVHVIRKETRRNGSFFRF >NZ_CP012381.1|WP_023061699.1|1781141_1781432_+|hypothetical-protein MPDQECDREISCLVTTSNYYYITHKASENIHHVQHHYHQYIKYHSKNTQDLSWDFGELCTIKFQACKFRINDVKSGKEEWEVVLTNLDRKNYPLKN >NZ_CP012381.1|WP_041809686.1|1779785_1780136_-|hypothetical-protein MKKRKLLVFAIIAVHLFFWGIYLNSDVYVTHQVNTKVNRVIQARNTKELKRISNDKTTYKFLISLSNSTRCKDTSDFQGGTNKNAYYVTTLNKQKIGVHMYKASLFNWRIKNVEKQ >NZ_CP012381.1|WP_042753976.1|1779604_1779802_-|hypothetical-protein MSKNNRVFVIFFSILLFLTVGMSEKAYAEQISGTVHNELVGTFDKSQTSNRTIEEIKKLQEMITT >NZ_CP012381.1|WP_014564125.1|1778513_1779335_-|NAD-dependent-protein-deacetylase-SIR2-family MADFTKVKEWIKDADAVIVTAGNGMAKEEGLDILSEENFDDQFGKIADNYDVHTIGDALDKKFDSWSEQWSFWSELVNEYSLQYEPSETMQALKQILQDKDYFIATSTFAHFFENAGFKENRIFDAFGDWTKMQCSSGINHGQKDDREVVKRFLKAIKENNVTEDLVPKCEDCNSPMELHMPLNANFFPDTDANTRFRWFLTGNEDKKVVVLELGVDETSPQLLDPMVKLVEQFPNWKYVAADLADEDMPDDLKKRAAGFATNSHDVLMNLTK >NZ_CP012381.1|WP_054607549.1|1790712_1791990_+|ISL3-family-transposase MSSLNHCIKFELDVKDENIVFKDYFYKSIKLQKHKIYEAELIQPACPFCGSLDLLHNGHLITNIHYPTANASLPVIIRLAKQRVKCRDCEGWSMAQSELVNKYCSISNASKLKVLSALTEDRSMTSIARENNVSINTVQRVLGNCSHRFIDSYEYLPAHLAFDEFKGVDRQLHFICLDGDSHQVVQILRTRYKKNLLKYFGRFSPQARANVRTVTMDLNFYYQDIVRACFPNAQIVIDRFHMIQMLTRSFNSLRVKVMKTFDKRSRQYQLLKSPWKLYLKKFDELEKVHPRYNWHYKDCLTQAQVVTEGINANTALENSYNLMQDFIQAIETGNTQKLKSLINCKDQIGTLMHKPLLTFKHNLTAVLNGAELPYSNGCLEGFNRKIKQIERTAFGYSSFTNLLTRIRLEENLYKEKEPNSLLMAA >NZ_CP012381.1|WP_054607550.1|1792080_1793358_+|ISL3-family-transposase MSSFNNCIKFDLDIKEKNIVFKDYFYKMVQMKKHKIYEAELIQPACPYCGSLALLHNGHLIANIRYLTANASHPATIRLAKQRVRCRDCSRWSMAQSELASKYCSISNASKLKILSALTEDRSMTSIASENNVSVNTVQRVLGSCSHRFLDSYEYLPAHLAFDEFKGVDRQLHFICLDGDSHQVVQILRTRYKKNLLKYFGRFSPQARANVKTVTMDLNFYYQDIVRACFPNAQIVIDRFHMIQMLTRSFNSLRVQVMKTFDKRSRQYQLLKSPWKLYLKKFNELEKVHPRYNWHYKDCLTQAQVVTEGISANTALENSYNLMQSFIQAVETGNTHELKSLINCQDQIGTLMHKTLLTFKHNLTAVLNGAALPYSNGCLEGFNRKIKQIERTAFGYSNFTNLLTRIRLEEDLYKEKEPNTLLMVA >NZ_CP012381.1|WP_023061546.1|1793418_1793925_-|hypothetical-protein MRTNDLVSLYVSFVETNGGKSRPVLIRRVSEQTVEAFKITSQYEKKSAYIKQQYYPIQDWQSAGLKKPSWVDLGNIYRFPKAGLNFKEIGHLSKLDQNKISDFTLDLKSKRRGKGQKIIQQRSSKRKHKESKAELTQRIQKQLKDFAKHNPEIKPKNNPENKNDRSSY >NZ_CP012381.1|WP_014564139.1|1793914_1794196_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelB/DinJ-family-antitoxin MAVKEKKRVQVKIDKDLADDTEAILSELGLNPTTAINMFYKRIVANGALPFNASLSEEERANLRFLKATEGTPVTEFKDAKEVADWLNDPDED >NZ_CP012381.1|WP_080553177.1|1795285_1796308_-|hypothetical-protein MSVQLVFTQTGVKDLYTGETDWNGEWTKMQSFVTVTSPTIKGFHTDRPEVGPYEIEVTNDKYDDNLDKEDTVVYVANPTETVSRDKVVNQVIHYVYENGETAAPDHVSVQLVFTQTCVKDLYTGETDWNGKWTKIQSFVTVTSPIIEGYTADRPEVGPYDITVTNNNYGDNLDKEDTVIYKKTSDPVVPGPDTPDIPDSDEPKPDTPDPDTPDDPTPENPDPTPDQEEDFTPPLAEEEPGSEYPDQPEKDEEEKTIVPKAEKTDKYVSSTVTSVKATDTREDIPEAVSTEKTQVTQKEEALPETGEKDSSKAGAILSSLAAALGITGLAGTSKKRKKKDE >NZ_CP012381.1|WP_023061541.1|1796614_1797628_-|Protein-I/II-V-region MIYSNNVAKNQNENSRIYFGDNLLNGFFYKNSKGMTMSMKLYDAEGKLITLRENSAYITIGSLNSDAGHNNEYIEKAEIINSDGHYGSGVALPESSVTVHQGANGNDILYADKNNELLYDDKITQAERKQAIDIWGKEIVEKYLNWDSSTDRSKEIFGAGLFKVWGNGITIRFSNEIGSAWATYSTTVPKLGFNMDKPELDPLDVTYTSGKIVLDKSNVYIHYVDVHEHANANPGKTEFLPEHGIEIDGVGESFLDHAIGANYEHTLWDWLSHGYELATLLVDDNVKGGTVKEGDQHYYVYLKHGMDTNASRDKVVNQEIKYIYENGETAAPDYKGV >NZ_CP012381.1|WP_081008698.1|1797602_1798664_-|hypothetical-protein MTAKKNFNKKKINKNRKELTPKAKKAAVGTASVLLGASLMGNAKPIKKIVGGKREDDISLVVKADTIEGTEESSDVITSAGQEDQVAETETMPVEEETTVNDDTQTSAVAEQVDDEVVAEPQDDTTTVETDAVPASDGQTETQETETNTPVSATTNVDDQNQDIAVGEPPRDEEGKDPAHNELVDKVEQTNKDSETEIHNAVNDLLSTIDDAYKAGLTITSTGETKEFHATAANIDDVINQLKDYNADQIKEVTEKIKNQIEQYQSDLNKYEEAKAAYIAELMKLGLWDEKSHTDPDTISQDLVLDKTDQTIVSVETMDKNHVQESNGSILGFLDKLYTVSGDVEGDLQQQRC >NZ_CP012381.1|WP_023061539.1|1798857_1799598_-|nicotinamide-mononucleotide-transporter MEREHENYFVWLFNQLKGWPVQNYCLWFFAFGFQLALLIQAKVTSVTLITFIGTLLGTLCVLAINATKAINGWLGLVSAACFIYAGWSAKNYLSIFEQIAYIATLDLPVILSVKSWNDDTKNHLRKFGSKEWLIAIVGTLLVYVISGYLIGKFTNDPRPWVDAISFAISLTAGIMCFMRYNNQYFWWTASGIFQLILWSITYAQGDANLAMAINSLIYVVNDILAFTVSPWFNMGRRHAGLKEISK >NZ_CP012381.1|WP_014564142.1|1799938_1800094_+|hypothetical-protein MFKSTKSQFAIRKLTQGAVAVLLTFGIFANTTSGIVSAAVNQLPRNKFRGL >NZ_CP012381.1|WP_054607551.1|1800194_1801436_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MDQSVVIKAQLLNIDDETAQAFSNTMCKYRDACNFISQYIFEHAFELKQSKLNKALYHDLRDKFELKSQMAQSAIKTVIARYKTVKTQLFQHPFRYDTGKKDGKGRGIWAQIYRDLTWLWQPINFKSPQLDLQRGRDWSYLSATNQLSLNTLNGRRKVDFVCKGFDQYLDQTKWKFGSLKMLQLRGKWYIHLSATTAIPEFEAEQAVHVVGIDRGLRFLAACYDEKGKSILFSGQKILRKRRKYKKLRAELQAKGTKSAKRRLKKIGQRENRWMSDVNHRLTKTLIDHYGSNTIYALEDLTDVRFATEKSPKDQRYEIVSWAFYQFEQFLTYKANLNSSAVVKVPAKYTSQRCPKCGRIHKDNRDHELHLYTCDKCGYKSNDDRLAAMNIQFLGTLYRSGEEAPQFNKQASVE |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012381_4 | 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder | 1790524-1790572 | 49 | NZ_CP012381.1 | 1509834-1509882 | 0 | 1.0 |
1. spacer 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder matches to position: 1509834-1509882, mismatch: 0, identity: 1.0
tttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat CRISPR spacer tttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat Protospacer *************************************************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012381_4 | 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder | 1790524-1790572 | 49 | NC_015598 | Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW1, complete sequence | 36641-36689 | 1 | 0.98 |
| NZ_CP012381_4 | 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder | 1790524-1790572 | 49 | NC_015598 | Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW1, complete sequence | 194668-194716 | 1 | 0.98 |
| NZ_CP012381_4 | 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder | 1790524-1790572 | 49 | NZ_CP014891 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1992 plasmid pL11992-1, complete sequence | 52502-52550 | 1 | 0.98 |
| NZ_CP012381_4 | 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder | 1790524-1790572 | 49 | NZ_CP012291 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1535 plasmid pL21535-3, complete sequence | 15570-15618 | 1 | 0.98 |
| NZ_CP012381_2 | 2.1|719219|26|NZ_CP012381|PILER-CR | 719219-719244 | 26 | KU645528 | Acidianus tailed spindle virus isolate 1, complete genome | 64516-64541 | 5 | 0.808 |
| NZ_CP012381_2 | 2.1|719219|26|NZ_CP012381|PILER-CR | 719219-719244 | 26 | LC168164 | Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome | 130413-130438 | 5 | 0.808 |
| NZ_CP012381_4 | 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder | 1790524-1790572 | 49 | NC_002102 | Lactobacillus helveticus DSM 20075 plasmid pLH1, complete sequence | 6538-6586 | 5 | 0.898 |
| NZ_CP012381_2 | 2.3|719213|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT | 719213-719244 | 32 | LC168164 | Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome | 130411-130442 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP012381_2 | 2.4|719274|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT | 719274-719305 | 32 | NC_011885 | Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502, complete sequence | 68077-68108 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP012381_2 | 2.5|719335|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT | 719335-719366 | 32 | AP013817 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C15-MedDCM-OCT-S44-C148, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 10418-10449 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP012381_2 | 2.5|719335|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT | 719335-719366 | 32 | MG945649 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 251-1602, partial genome | 3486-3517 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP012381_1 | 1.9|596701|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 596701-596734 | 34 | MN830254 | Lactobacillus phage JNU_P2, complete genome | 1451-1484 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP012381_1 | 1.9|596701|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 596701-596734 | 34 | MN830255 | Lactobacillus phage JNU_P4, complete genome | 36995-37028 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP012381_1 | 1.17|597232|37|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 597232-597268 | 37 | CP046512 | Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence | 342693-342729 | 9 | 0.757 |
| NZ_CP012381_1 | 1.17|597232|37|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 597232-597268 | 37 | NZ_CP023246 | Bacillus cereus strain HBL-AI plasmid unnamed1, complete sequence | 353802-353838 | 9 | 0.757 |
| NZ_CP012381_2 | 2.5|719335|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT | 719335-719366 | 32 | MK387337 | Vibrio phage ValB1MD, complete genome | 126821-126852 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP012381_1 | 1.3|596301|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 596301-596335 | 35 | MF988720 | Pseudoalteromonas phage J2-1, complete genome | 87633-87667 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP012381_1 | 1.10|596767|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 596767-596801 | 35 | MN693880 | Marine virus AFVG_250M607, complete genome | 22544-22578 | 11 | 0.686 |
1. spacer 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder matches to NC_015598 (Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.98
tttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat CRISPR spacer gttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat Protospacer ************************************************
2. spacer 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder matches to NC_015598 (Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.98
tttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat CRISPR spacer gttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat Protospacer ************************************************
3. spacer 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014891 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1992 plasmid pL11992-1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.98
tttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat CRISPR spacer gttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat Protospacer ************************************************
4. spacer 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012291 (Pediococcus damnosus strain TMW 2.1535 plasmid pL21535-3, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.98
tttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat CRISPR spacer gttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat Protospacer ************************************************
5. spacer 2.1|719219|26|NZ_CP012381|PILER-CR matches to KU645528 (Acidianus tailed spindle virus isolate 1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
gacttcaaattattatcaatcagact CRISPR spacer tactgcaaattattatcaatcaacat Protospacer *** *****************. *
6. spacer 2.1|719219|26|NZ_CP012381|PILER-CR matches to LC168164 (Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
gacttcaaattattatcaatcagact CRISPR spacer atgttcaaactattatcaatcagtct Protospacer . ******.************* **
7. spacer 4.1|1790524|49|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder matches to NC_002102 (Lactobacillus helveticus DSM 20075 plasmid pLH1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.898
tttttttattgcataaaaaaggaggacatagtcccctgtaataaaaaat CRISPR spacer gttttttattgcataaaaaaggaggacatactcccccgtaataaaaagg Protospacer ***************************** *****.**********.
8. spacer 2.3|719213|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT matches to LC168164 (Tenacibaculum phage pT24 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tggacttcaaattattatcaatcagactctgg-- CRISPR spacer agatgttcaaactattatcaatcag--tctgatt Protospacer *. ******.************* ****.
9. spacer 2.4|719274|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011885 (Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
---aactccggagccagaacttctaacccaactac CRISPR spacer ggtgaatc---agccagagcttttaacccaactag Protospacer .* ** *******.***.***********
10. spacer 2.5|719335|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP013817 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C15-MedDCM-OCT-S44-C148, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgctctaaattatcgtgatattcttgaacatc CRISPR spacer acctctaaattttcgttatattcttttaattc Protospacer ********* **** ******** * **
11. spacer 2.5|719335|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG945649 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 251-1602, partial genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
tgctctaaattatcgtgatattcttgaacatc CRISPR spacer tggtcttaattatcgtgatattcagttatttc Protospacer ** *** **************** *. **
12. spacer 1.9|596701|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN830254 (Lactobacillus phage JNU_P2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aaatgacgactttgtagctggtcaaacgtgggca CRISPR spacer cacatccgactttgtggctggtcaaacttggggc Protospacer * *********.*********** ****
13. spacer 1.9|596701|34|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN830255 (Lactobacillus phage JNU_P4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aaatgacgactttgtagctggtcaaacgtgggca CRISPR spacer cacatccgactttgtggctggtcaaacttggggc Protospacer * *********.*********** ****
14. spacer 1.17|597232|37|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP046512 (Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ctttttgttagaaaattaaacatctttggagcatcaa- CRISPR spacer ctttctgttataaaattaaacatc-ttaatctattaat Protospacer ****.***** ************* **.. .**.**
15. spacer 1.17|597232|37|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP023246 (Bacillus cereus strain HBL-AI plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.757
ctttttgttagaaaattaaacatctttggagcatcaa- CRISPR spacer ctttctgttataaaattaaacatc-ttaatctattaat Protospacer ****.***** ************* **.. .**.**
16. spacer 2.5|719335|32|NZ_CP012381|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK387337 (Vibrio phage ValB1MD, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tgctctaaattatcgtgatattcttgaacatc CRISPR spacer aaataaagattatcgtgatattcttcaagatg Protospacer . * *.***************** ** **
17. spacer 1.3|596301|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF988720 (Pseudoalteromonas phage J2-1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tttacgaaaagttttactcagatgaaaaggattgg CRISPR spacer gacacgaaaagttttacccagaagaaaagaaccct Protospacer .**************.**** ******.*..
18. spacer 1.10|596767|35|NZ_CP012381|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693880 (Marine virus AFVG_250M607, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aacatcatcaagctcatcaagctcatcaagctcat CRISPR spacer gttttcatcaaggtcatcaaggtcatcaaaggaaa Protospacer . . ******** ******** *******. *
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
10523 : 50592
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012381|10523:50592|DBSCAN-SWA 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33 | Organic_Lake_phycodnavirus(20.0%) | integrase,transposase | attL 25162:25186|attR 49262:49286 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
572646 : 581415
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012381|572646:581415|DBSCAN-SWA CATGTCTGAAATAAGCGTAATTATGGGTAGTAAGTCAGATTGGCCAACGATGAAGCATGCGTGTGAAATCTTGGATCAGTTCAATGTTAGCTATGATAAACATGTTATCTCGGCCCATAGAATGCCAAAGGAAATGTACGATTTTGCCCAAGCCGCTGAAGAAAAAGGCACCAAGGTGATCATTGCTGGTGCAGGTATGGCAGCGCATTTGCCTGGGATGACAGCCGCTAATACCGTGATTCCAGTAATTGGTGTTCCTGGACAAACTAAAGCATTGGGAGGGATGGATTCTCTTTTATCGATTGTTCAAATGCCAACCGGTATCCCTGTAGCTACCACTGCCATTGGTAATGCTGGTGCAAGCAACGCGGCACTTCTTGCACTAGAAATTTTGGGAATTAGTGACGAAAAAATAAGACAGCAATTGAAAGACTATCGCCAAAAGATGCATGATGAAGCAAAAGGAAGCAGTGCGGAACTTGATTGATCCAGATTTTATTGAACAAGGAAAGACTATTGGCATCATTGGAGGCGGACAACTAGGTCAAATGATGGCTTTGTCAGCCAAGTATGGTGGAATGAAAGTCATCACCTTGGATCCAACGCCAGACTGTCCTTGTGGTCAGGTTGCTGACAAGCAGATTGTGGCCGAATATTCAGACATTAATGCAATTGAAGAGCTGGCTAAAGAGAGCGACGTATTAACGTATGAATTTGAAAATGTTGACCTTCAAGCTTTAAAGGATGTTGCCGATAAAGTGAAAATTCCTCAGGGGACTAATCTGCTTTATATCACTAAACACCGACTGCGTGAAAAGAACTTCCTGCGTAGTGCCGGTTGTATGACTGCGCCATATTTGCCCGTTAAAAATATGGCGGATCTAAAAGAGGCGATTAAAAAGATCGGCTATAACTGTGTCCTTAAAACCTGTGAAGGTGGCTACGATGGCCACGGCCAAGAAGTTTTAAAGAGCGATGCCGATCTGAAAAATAATGCGCATATCAAAGAAATTTTAGCTACGAGAGACTGCATTCTTGAAGGCTGGGTGCCATTCAAAGTTGAAGCTTCTGTCATGGTCGCAAGAAATGCAAAAGGCGAAGTGACAGTTTTCCCAGTTAGTGAAAACTACAATGCCGATGAAATTTTGCATATTAGTATTGTGCCAGCACGTGTTTCAAAAGAAATTTATGCTAAAGCACAGGCTATTGCTAAGCAAATTGCAGAAGCAATTCATTTGCGCGGTATTTTGGGTGTGGAGCTATTTATTCTGGATAACGGTGATATTTATGTCAATGAACTAGCACCACGTCCGCATAATTCAGGTCACTATTCGATTGAAGCCTGCAATTTTGACCAGTTTGATATCCATGATCGTGCTATTTGCAATTGGCCGTTGCCTAAGATTAAGCTGTTGTCCAAAGTGGTAATGGTGAATGTTTTGGGTCAACATGTAGCCGGCGTAAGAAAAGTCATTCCTGAAAAGAGCAACTGGCATTTTCACTACTATGGCAAGGCCGAAATCCGTCATAATCGTAAAATGGGCCACGTTACAATTCTTACTGACGATATTGAAAAAACGTTGCAAGAAATTAATGACACCCATATTTGGAAAACAAAAGTAAATTAATCTTGTTTAAGCAGAGCTATTAAAGCTCTGTTTTTTATTTATCATTTTTACTAAAACAAGAACAATACTTCATGATAGTATTGTTAATGTTCCATAGTATATTGACATTATAAGCGATAGTTGATAATATTGTTAGCATAAAAGTGAACAAATTAGTATTCACTCTTTAATAATGTTCGTGTTTTTTACCAAGGAGAAAAATAAAATGGCAAAGTTGTTGTATACCGGTAAAGTTAAGGAAATGTGGTCTACAGATGACCCAGAAGTTTTACGTGTGGTTTATACAGACCAGGCAACTGCCGGTAACGGCGAGAAGAAGGATAACTTTAAGAACAAAGCCTATTTAAACAACGAAATTTCAACTTTGATTTTTGAATACTTGTCCAAAAACGGAGTTCCAACTCATTTCATCAAGAAAATCTCAGACACTGAAGAATTAGTTAAAAAGTGCGACATGTTCCCACTTGAAGTTGTTACTAGAAATATTGCAGCTGGCCATTTCTCAAGTCGTTATGGCTTGGGCGAAGGTGAAAAATTCGATACGCCAGTCGAAGAACTTTTTTATAAGAGTGATGAACTCGACGACCCAATCATGAACGAATCTGATGCGATTGCATTACATATTGCGAACGCTGAAGAGCAAAAGAAGATCTGGAAATTGTCTCGTCAAGTTAACAAGCTTTTGATTCCGCTTTTTGATAAGGCTGGAATGGAATTAGTCGATTTCAAACTTGAATTTGGTAAAGATGCAGATGGAAATATCATCCTTGCAGATGAATTTTCACCAGATAACTGCCGTCTTTGGGATAAAAAGACCAAGAAGCATATGGATAAAGATGTCTACCGTAGAGACATCGGCGATTTAACCACTGTTTATGAACAAGACTTAGCCCGCATTCAAGAAGCACTTAAGGAGATCTAAATGACTACTGTCCGTATTTACGTAACCTACAAACCTTCAGTTTTTGATCCACAAGGAGCTGCAATCACCGATTCAGTTAATTCCCTTGGTCATGACGAAGTCAAAAAAATCGTTGTTGGTAAGTTCTTCGATGTAACTGTTGATGAAGATGACTTAGATAAAGTTAAGGCTGATGTGAAGGATATCGCTGAAGCTTTATTGGTTAACTTCAACATGGAAACTTACAAGATCAAAGTTTTGGAGAAAAACGCATGAAAATTGCAGTAATAGTTTTTCCAGGTTCTAACTGCGATATCGACATGTACGAAGCTTTTCGCACTGTTTGCCAGGCAGATGTCGAATATGTTTCTTACAAGGAAAAAAGTTTAGCTGGCTTTGATGTAGCTGTTTTACCAGGTGGCTTTTCTTATGGGGATTATTTAAGAACCGGCGCAATTGCTCGCTTTTCAAACATTATTCCAGCCGTTAAGAAGATGGCAGAAGAAGGAAAGTTAGTTTTAGGTGTCTGCAATGGTTTTCAGATTTTAACAGAAATGGGACTGCTTCCAGGAGCACTTAAGAAAAACGATAGCCTTCAATTTGTTTGCGAGACTGTCACTTTAGAAGTTGAGAATACGCATACGCCATTTACTACTGAGTATGAAGATAAAGAACTTGTCCGTATTCCTATTGCTCATGGCGACGGCAGCTATTACGCAGATGAAGATGTACTTGAAGATTTAGAAGTAAATCACCAAGTTGTCTTTAGATATCATGGTGAAAATCCTAACGGCAGTCTGCATGATATAGCTGGTATTTGTAACAAAGAAGGAAATGTTCTAGGCATGATGCCACACCCTGAAAGAGTGGTAGAACAAATTCTCGGTGGAACAAATGGGTTGCCTTTATTTAAGTCACTTTTAAAAGCAGGAGTTCAAGCATGAAACAAGCGATGACACCAGAAGAAATCAAAGAAAAGAAACCTTACCTTGATTGGAGTTTATCAGAACGTGAATATGACTATATTTGCGATCATTTGCTTCATCGCTTGCCCAACTACACAGAAATCGGCTTGTTCTCCGCAATGTGGAGCGAGCACTGTTCTTACAAAAAGTCTAAGCTAGTGTTGAAGCTGTTTCCAACCACGGGTAAACGCGTAGTACAAGGTCCAGGTGAAGGTGCTGGTGTAGTTGATATCGATGATGGTCAAGCCGTTGTTTTTAAGGCTGAAAGTCACAATCACCCAACTACAGTGGAACCTTACCAAGGTGCCGCAACCGGTGTTGGCGGTATTTTAAGAGACGTTTTCAGTATGGGAGCTCGCCCCGTTGCAATCCTTGATTCTTTGCACTTTGGTGAATTGAAAGATAATCCAACAATGCGTTACAAGATGGAAGAGACCATCAAGGGCGTCGGCGACTATGGCAACTGCATGGGAATTCCTAATTTAGGCGGAGAAACAACTTTTGATCCTTGCTATAATGGCAACATTTTATTAAACGCCATGAATGTGGGAATCATGGATATTAAAGATATGGAGCATGGGGATGCTACAGGCGTTGGCAATGCGGTAATGTACGTCGGTGCTAAAACCGGGCGTGATGGTATTCACGGTGCTACCTTTGCTTCAGCCGACTTTTCTGAAGAACATGCGACCCAACGTTCAGCGGTTCAAGTTGGTGATCCATTTATGGAAAAATTGTTGATGGAAGCTTGCTTGGAACTGATCTTGAATCATCGTGAATGGCTTGTTGGTATTCAAGACATGGGAGCAGCCGGCATCGTTTCTTCAAGTGCTGAAATGGCCACTGAAGGTAAATCCGGGATGGATCTCAATCTTAACTTGGTACCTCAGCGTGAACCTAACATGTCAGCTTACGAGATTATGCTTAGCGAATCGCAAGAAAGAATGCTCCTTTGTGTAAAGAAGGGCCATGAAGAGGACGTTAAAAAGATCTTCGATGAATTTAATCTTGACGCTGTAACTATTGGTCGCATTACTGATGATGGTAGATACGTGCTTCATCACGATGATCAAGTGGTATGTGATATTCCAGTGGTAACTTTAACTGAAAAAGTCCTTGAAGAAAAAAGCGCAGAAAAGAAACCACAAAGAATCATTGATGCTGAGCAAAGTGAAAATTGGCAACCAAATATTGAAAGTGCCGGTCAAACTTTAAAAGATCTTTTGAGCCAGCCAACCATTGCTAACGATCAATTTGTAACGCAACAATATGATTCACAGGTTCGAACGGACACGATTGTAGGTCCTGGTTCAGATAGCGGCGTCTTGCGCGTGCGCCATACTAAGAAGGCAATTGCGATGACTACTGATACTAATGGACGCTTTGTCTATCTTGATCCAAAAGTTGGTGGTCAAAGAACTGTCCTTGAAAGTGCAACAAATATCGTGGCTAGTGGTGCCCAACCTTTAGCAATTACTGACTGTCTTAACTATGGTGACCCTAATGATCCAGAAATTTTCTGGGAATTGCATCAATCTTGTCAAGGGATTGCCGATGCATGTGAAATCTTAGAAACACCGGTTGTTTCAGGAAATGTCTCTCTTTATAACGAAAATAATGGCAAGGCAATTTATCCATCACCAATGATTGGGATGGTTGGTTTAATCAAGGATTATGATCACGTCATTCCAATGCACATGCAAAAAGCAGGCGGCAAGATTTATCTAGTGGGTAAGACAGATGATGATTTTGCCGGCTCAGAATTGCAAAAGATGATTACTGGTGAAATTAGCGGTTTGCCACATGCACCAAACTTACCAGAGATAAAGCAATATCTTTACAAACTGCAAGCATTAATGGCTAACGGTTTAGTCAAAAGCGCGCACGATCTAAGCGAAGGTGGCTTAGGCGTTTCCTTAGCGGAAACACTTTTTGATACAGACTTTGGTGCAAAGATCGAACTTGATTTTGATAAAAATCTGCTTTTCAGTGAGACTCCAGGTCGCTTGATCGTTTCAGTTGATCCTGCAAATGCGGAAAAATTTGAACAAGAAATGGGCGATTCCGTTAGTGAAATTGGTCAAGTTACTGCTGATCAGCAATTGAACATTTCGCTGGCCAACGATCAAGTAAATGAAGATGTAGCTGAATTGCAAAAAATTTGGAAGGAGTGCATCCCTTGTTTAATGAAATCAAAAGCCTAAATGAGGAGTGTGGCGTCTTCGGTGTTTTCGGCGCTCCTGATGCTAGTCAATTAACATATCTGGGTTTGCATAACCTGCAGCACCGCGGACAAGAAGGGGCCGGCATCGTCTCAAGCGATGGTGAGCATTTGTATCAACACCGCGATCGTGGACTTTTATCCGATGCTTTTGCTGATCCGAATGATTTAAAAAAATTGGTCGGCGACAGTGCCATTGGTCACGTTCGCTACAGTACAACGGGTCGTAATTCGATTCAAAACGTACAACCATTTCTCTTTCATTTTCTAGACGGTGATGTTGCTTTAGCCCACAACGGCAATTTAGTTAATGCCGTGTCTTTACGAAACAAGCTCGAAAAACAAGGTGCGATTTTTCAATCCTCATCTGATACCGAAATCTTAATTCACTTGATTCGTAATCATATCAAAGATGGCTTTATTTCAGCTTTAAAGCAAAGTCTGAATGAAGTTCACGGTGGTTTTGCCTTCCTGCTTTTGCAAAAAGATCGCATGATTGCGGCACTTGATCCTAATGGGATTCGTCCCTTATGTATTGGTGAATTGGACAATGGCGCCTACGTTGTTTCTAGCGAAACTTGTTCACTTGACATCATCGGTGCCAAGTTCGTTCGTGATGTGCAGCCTGGTGAATTAATCATCATTGATCGAGATGGGATGAAAATTGATCATTTTACTAAAAATACGCATTTAGCAATCTGCTCAATGGAATACATCTATTTTGCTCGTCCTGATTCAATCATACATGGTGTGACTGTTCATAATGCTAGAAAAAGAATGGGGCGGCTGCTAGCTCGTGAGGCTCCAGCCGATGTCGACATGGTAATTGGCGTACCAAACTCATCTTTGTCAGCTGCTTCTGGTTACGCCGAAGAATTGGGGTTGCCTTATGAAATGGGTCTGGTTAAAAACCAATACGTTGCCAGAACCTTCATTCAGCCAACTCAAGCCTTGCGTGAAAAGAGTGTTAAGTTAAAACTGTCAGCTGTTCGTGGTGTCGTTGCTGGTAAAAAGATCGCGGTCATCGACGATTCGATCGTAAGGGGAACCACTTCTAAGCAAATTGTCAAAATGCTTAAAGATGCTGGTGCTAAAGAAGTCCATTTAAGAATTGCTAGTCCGCCATTTAGATTCCCTTGTTTTTATGGCATCGATATTTCAACTCGTTCTGAACTGCTGGCTGCCCATTACTCAGTAGAAGAAATGCGCAAAATCATTGGCGCTGATAGCCTTGGCTTTTTAAGCATTGATAGCTTGATCAAGGCCATCGATGTACCTGATAGAGGCGATTCATCGGGTCTGACAGTTGCCTACTTTAATGGAAAGTATCCAACTAAATTGGATGACTATGAAGCTGGCTATTTAGCTTCTCTTAATGCCCAGGAACGGCGACAAAGAAAGGAATTATCAAATGAATCGTTATAAAGAAGCCGGCGTAGATGTCACTGCTGGTTACGATTTAGTTAATCGAATCAAGCCGATGGTAGCTGCAACTAAGCGTAAAGGCGTCAGGGGTGGGATTGGTAGCTTTGGCGGCATGTTTGATTTAGAAGAATTGGGTTACAAGCATCCCGTTCTTGTTTCAGGCACGGATGGTGTAGGTACCAAATTAATGATTGCGCAAAAGATGCACCAAAACGACACGGTCGGCATCGATTGCGTGGCCATGTGCGTTAACGATGTGCTAGCCCAAGGTGCGGAACCTCTGTTTTTCTTAGATTACATTGCCTGTGGTCATAACGATCCAAAGAAATTGGCTGACGTAGTTAAGGGCGTGGCTGAGGGATGCAAGCAAAGCGGCTCTGCCTTAATTGGTGGTGAAACCGCGGAAATGCCCGATATGTATGAACCCCACGAATATGATTTGGCTGGTTTTTCAACTGGGATTGCGGAAAAAGAGGACTTATTATCTAGTTCTTTAGCCAAAGCAGGCGATCATTTAATTGCTTTGCCATCGAGTGGCGTCCATTCTAATGGTTTCAGTTTAATTAGAAAAATTTTGTTCAAAGATCACAACGTTTCATTAAGCGACAAACCAGCAGAATTAGCGGTCAAAACCGTAGGCGAAACACTCCTTACGCCAACCAGAATCTATGTCAAAGCAGTTTTGCCACTAGTAAAAAAGCATTTAGTTCACGGCATTGCCCATATTACTGGTGGCGGCTTTATCGAAAACCTACCTCGAATTTATGGCAATGACTTGCAAGCAGTGGTTAATAAAGGTTCGTGGCCTGTTTTACCAATTTTTGATTATCTGAAAAAACTAGGCGATTTAGATGAACGAGATTGCTACAACACTTTCAATATGGGCGTTGGTTTAGTTTTAGCCGTTCCAGTAGAAAACGTTGCTGCAGTCAAAGAACAACTAAATCGCGAGAATGAAAAATTCTACGAAATTGGTCAATTAGTTGCACGCCCCGAAGGGGAAGAAAAGATCGTAATCAAATAGAGGAGAAAAATGAGAGTTGCTATTTTAGCTTCTGGGAATGGAACCAACTTTGAAGCTTTAACTAAAAAGTTTCAAGCTGGCGAAATTCCCGGAACCGAGGCTTTAATGTTTTGCAATCATCCAAATGCCCCGGTAGTGAAAAGAGCCGAGAGATTAGGCATCCCGCATGAAGCATTTTCCGTTAAAGAATGCGGCGGCAAGACGGCTTATGAAAAGCGCCTGCTAAAAGTTTTGCAGGATTATCAAATTGATTTCATTGTTTTATCCGGATATCTCAGGGTGGTTGGACCCACGATTTTAAACGAATATCCCAATGTAATTATCAACTTGCATCCCGCCTTATTGCCAAGTTATCCCGGCCTCAATTCAATCGAAAGAGCTTTTGAAGATTACAAGCAAGGCAAGATAAAAGAAACCGGCGTGACGGTGCATTTTATCGATGCCCATTTGGATCATGGGCCTATCATTGCTCAACAGGCTGTCCCAATTTATCCAGATGATACGGTTGAGACGCTTGAGGCAAGAGTCCATGAAACAGAACATCAACTATTTCCAGCTACGTTAAAAAAAGTATTGAGTCAAAGAATGGAAAAGGAAGAAAACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012381|572646:581415|575195_575450_+|WP_041809376.1|DBSCAN-SWA MTTVRIYVTYKPSVFDPQGAAITDSVNSLGHDEVKKIVVGKFFDVTVDEDDLDKVKADVKDIAEALLVNFNMETYKIKVLEKNA >NZ_CP012381|572646:581415|579771_580809_+|WP_041809380.1|DBSCAN-SWA MNRYKEAGVDVTAGYDLVNRIKPMVAATKRKGVRGGIGSFGGMFDLEELGYKHPVLVSGTDGVGTKLMIAQKMHQNDTVGIDCVAMCVNDVLAQGAEPLFFLDYIACGHNDPKKLADVVKGVAEGCKQSGSALIGGETAEMPDMYEPHEYDLAGFSTGIAEKEDLLSSSLAKAGDHLIALPSSGVHSNGFSLIRKILFKDHNVSLSDKPAELAVKTVGETLLTPTRIYVKAVLPLVKKHLVHGIAHITGGGFIENLPRIYGNDLQAVVNKGSWPVLPIFDYLKKLGDLDERDCYNTFNMGVGLVLAVPVENVAAVKEQLNRENEKFYEIGQLVARPEGEEKIVIK >NZ_CP012381|572646:581415|578318_579785_+|WP_035515999.1|DBSCAN-SWA MFNEIKSLNEECGVFGVFGAPDASQLTYLGLHNLQHRGQEGAGIVSSDGEHLYQHRDRGLLSDAFADPNDLKKLVGDSAIGHVRYSTTGRNSIQNVQPFLFHFLDGDVALAHNGNLVNAVSLRNKLEKQGAIFQSSSDTEILIHLIRNHIKDGFISALKQSLNEVHGGFAFLLLQKDRMIAALDPNGIRPLCIGELDNGAYVVSSETCSLDIIGAKFVRDVQPGELIIIDRDGMKIDHFTKNTHLAICSMEYIYFARPDSIIHGVTVHNARKRMGRLLAREAPADVDMVIGVPNSSLSAASGYAEELGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQALREKSVKLKLSAVRGVVAGKKIAVIDDSIVRGTTSKQIVKMLKDAGAKEVHLRIASPPFRFPCFYGIDISTRSELLAAHYSVEEMRKIIGADSLGFLSIDSLIKAIDVPDRGDSSGLTVAYFNGKYPTKLDDYEAGYLASLNAQERRQRKELSNESL >NZ_CP012381|572646:581415|573097_574273_+|WP_054607249.1|DBSCAN-SWA MKQKEAVRNLIDPDFIEQGKTIGIIGGGQLGQMMALSAKYGGMKVITLDPTPDCPCGQVADKQIVAEYSDINAIEELAKESDVLTYEFENVDLQALKDVADKVKIPQGTNLLYITKHRLREKNFLRSAGCMTAPYLPVKNMADLKEAIKKIGYNCVLKTCEGGYDGHGQEVLKSDADLKNNAHIKEILATRDCILEGWVPFKVEASVMVARNAKGEVTVFPVSENYNADEILHISIVPARVSKEIYAKAQAIAKQIAEAIHLRGILGVELFILDNGDIYVNELAPRPHNSGHYSIEACNFDQFDIHDRAICNWPLPKIKLLSKVVMVNVLGQHVAGVRKVIPEKSNWHFHYYGKAEIRHNRKMGHVTILTDDIEKTLQEINDTHIWKTKVN >NZ_CP012381|572646:581415|574478_575195_+|WP_054607250.1|DBSCAN-SWA MAKLLYTGKVKEMWSTDDPEVLRVVYTDQATAGNGEKKDNFKNKAYLNNEISTLIFEYLSKNGVPTHFIKKISDTEELVKKCDMFPLEVVTRNIAAGHFSSRYGLGEGEKFDTPVEELFYKSDELDDPIMNESDAIALHIANAEEQKKIWKLSRQVNKLLIPLFDKAGMELVDFKLEFGKDADGNIILADEFSPDNCRLWDKKTKKHMDKDVYRRDIGDLTTVYEQDLARIQEALKEI >NZ_CP012381|572646:581415|575446_576118_+|WP_014563199.1|DBSCAN-SWA MKIAVIVFPGSNCDIDMYEAFRTVCQADVEYVSYKEKSLAGFDVAVLPGGFSYGDYLRTGAIARFSNIIPAVKKMAEEGKLVLGVCNGFQILTEMGLLPGALKKNDSLQFVCETVTLEVENTHTPFTTEYEDKELVRIPIAHGDGSYYADEDVLEDLEVNHQVVFRYHGENPNGSLHDIAGICNKEGNVLGMMPHPERVVEQILGGTNGLPLFKSLLKAGVQA >NZ_CP012381|572646:581415|576114_578343_+|WP_054607251.1|DBSCAN-SWA MKQAMTPEEIKEKKPYLDWSLSEREYDYICDHLLHRLPNYTEIGLFSAMWSEHCSYKKSKLVLKLFPTTGKRVVQGPGEGAGVVDIDDGQAVVFKAESHNHPTTVEPYQGAATGVGGILRDVFSMGARPVAILDSLHFGELKDNPTMRYKMEETIKGVGDYGNCMGIPNLGGETTFDPCYNGNILLNAMNVGIMDIKDMEHGDATGVGNAVMYVGAKTGRDGIHGATFASADFSEEHATQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLELILNHREWLVGIQDMGAAGIVSSSAEMATEGKSGMDLNLNLVPQREPNMSAYEIMLSESQERMLLCVKKGHEEDVKKIFDEFNLDAVTIGRITDDGRYVLHHDDQVVCDIPVVTLTEKVLEEKSAEKKPQRIIDAEQSENWQPNIESAGQTLKDLLSQPTIANDQFVTQQYDSQVRTDTIVGPGSDSGVLRVRHTKKAIAMTTDTNGRFVYLDPKVGGQRTVLESATNIVASGAQPLAITDCLNYGDPNDPEIFWELHQSCQGIADACEILETPVVSGNVSLYNENNGKAIYPSPMIGMVGLIKDYDHVIPMHMQKAGGKIYLVGKTDDDFAGSELQKMITGEISGLPHAPNLPEIKQYLYKLQALMANGLVKSAHDLSEGGLGVSLAETLFDTDFGAKIELDFDKNLLFSETPGRLIVSVDPANAEKFEQEMGDSVSEIGQVTADQQLNISLANDQVNEDVAELQKIWKECIPCLMKSKA >NZ_CP012381|572646:581415|580818_581415_+|WP_014563203.1|DBSCAN-SWA MRVAILASGNGTNFEALTKKFQAGEIPGTEALMFCNHPNAPVVKRAERLGIPHEAFSVKECGGKTAYEKRLLKVLQDYQIDFIVLSGYLRVVGPTILNEYPNVIINLHPALLPSYPGLNSIERAFEDYKQGKIKETGVTVHFIDAHLDHGPIIAQQAVPIYPDDTVETLEARVHETEHQLFPATLKKVLSQRMEKEEN >NZ_CP012381|572646:581415|572646_573132_+|WP_054607248.1|DBSCAN-SWA MSEISVIMGSKSDWPTMKHACEILDQFNVSYDKHVISAHRMPKEMYDFAQAAEEKGTKVIIAGAGMAAHLPGMTAANTVIPVIGVPGQTKALGGMDSLLSIVQMPTGIPVATTAIGNAGASNAALLALEILGISDEKIRQQLKDYRQKMHDEAKGSSAELD |
9 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
586361 : 651527
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012381|586361:651527|DBSCAN-SWA ACTAGGTTAGTATGTTTTCTTTGTACAGATTTTCTTCCAAACGAATTCTGGTTAAGAGATTGGTAAAACTAGAATAGCCAAAGGCAGTTCGTTCAATTTGTTTAATTTTGCGGTTGAAGCCTTCAAGACAACCATTAGAATAAGGCAATTCTGCTCCATTGAGCACTGCTGTTAGATTGTGTTTAAAGGTTAAAAGCGTTTTATGCATTAGAGTTCCAATTTGATCTTTGCAGTTGATTAATGACTTAAGCGTTTGAGTATTACCCGTTTCAATGGCTTGAATAAAGTCCTGCATTAGGTTATATGAATTCTCTAAAGCAGTATTGGCATTGATGCCTTCTGTGACTACTTGGGCTTGAGTTAAGCAGTCTTTATAATGCCAATTGTAGCGAGGATGAACCTTTTCGAGCTCATCAAACTTCTTCAAGTATAATTTCCAAGGAGATTTGAGCAGCTGATACTGTCTGGATCTTTTATCAAAGGTCTTCATGACTTTAACTCTGAGCGAGTTAAAAGAACGCGTAAGCATTTGAATCATGTGAAAGCGATCGATGACAATCTGAGCATTAGGGAAACAGGCTCTGACAATGTCCTGATAGTAAAAGTTGAGATCCATCGTAACGGTTCTAACGTTGGCTCTGGCTTGAGGCGAAAAACGTCCAAAATACTTAAGCAGATTCTTCTTATAACGCGTTCTAAGAATCTGCACGACTTGATGACTATCGCCGTCTAAGCAGATAAAGTGCAGCTGACGATCAACGCCTTTGAATTCATCGAAAGCCAAATGAGCTGGCAAATATTCGTAGCTGTCAATAAATCGGTGTGAACAGTTGCCCAGCACTCTTTGAACGGTATTGATCGAAACATTGTTTTCGCTGGCAATGCTGGTCATAGATCGATCTTCAGTTAAAGCTGATAATACTTTGAGCTTAGAAGCGTTAGAAATAGAACAGTATTTGTTTACTAGTTCAGATTGAGCCATGGACCAGCCCTCACAATCACGACATTTAACTCGCTGCTTAGCCAATCTGATAATGACAGGCAAACTGGCATTAGCTGTCGGATAGTGAATATTGGTAATCAAGTGGCCATTGTGCAAGAGATCCAGGGAGCCGCAAAAAGGACAAGCAGGTTGAATCAGTTCAGCTTCATAGATTTTATGCTTTTGCAGTTTGATCGATTTATAAAAATAATCTTTAAAAACAATATTTTCGTCTTTAACATCAAGCTCGAATTTAATACAATGATTAAGAGAGGACATAGAAATCACCTTTATTTATAAGAATTTGTGTGGAAACGATTTTTATTAAAGAGGACTATGTCCTCCTTTTTTAATGCAATAAAAAACCTGTTAACAGCTTATCATATAGATAAGTCATCAACAGGAAAAATTATAGAGCCACATTTTTTATGTGTGTCTTTTGTTTTAGTATTGAAAATTAAATAGATCCAAATTATACTGGACACGGTTAAAAAGAGAAGAATTATTAAGAAAGAGATAAAATATATGGTGGGAAATTTTATTGGTCATACCAAAAAATTAAAAAATAATACCATAGAGACACAGTCTCTCAGAGATCATCTTTTGAATACTCAAAAGTATGCAGAAAAATATGCATCAGATTTATCACTTGAACATGTTGCTGGCTTGGCTGGAATTTTACATGATCTTGGTAAATATCAAAGTAAATTTCAAGAATATATCATTGAATCTACTAGAAAAGGTGATCAATCAAAAAAAGGTAGTATTGATCATTCCAGTTTTGGTGCAATTTTTTTAAGAGATTTTATTAGTGAAAATTTTTCTGAAAAAGAGAATTATTATGATTTTTTAGACTTTGGAGGTATTTTAGAAAATGCTATTTTTTCTCATCATAATTATTTAGGGTTAAAAGATTATATAAACCCTGACTTAATGAGTCCTTTTCTAAATAGAATAGAAAAATTTAAGGATGATGAAGAAAAGAAAAGACAATTAAAAAAATGTAAAGAGTTATTTTACAAGGATGTTATAACTGAAGAAAAATTCACTAAGTATTTTCAATTAGCATTCGATGAGTATGAGGCATTTATTTCAAAAATACGTAACAAAGTAACATTAAAAACAGAGCAAATTTTGAATGAAAATGCGAAAAATAATAAGCAAGTAATGTTGGAATTACAAGCTAAATACTTTCTTTCCGAATACGTATATTCATGTCTTCTAGATGCCGATAGAACAGACGCAACAGCATTTAAACTTTCAAAAAATCCTAACTTTTCAGATAATACTGAACTGTTTGAAAAATATTATTCAAAATTAGTTGGTAAATTACATAAATTAAATAAAAATGATAATAGTAAAATTAATCAATTGCGAGCTGAAATATCTGAAGAATGCGATCAAGCAGCTGAAAGGCCATCGGGAATATATACTTTGTCAGCTTCGACAGGTTCTGGTAAAACGCTTACCTCACTAAGATTTGGATTGAAACATGCCAAGCTTTATCATAAAAAACATATTATTTATGTACTTCCATACATAACCATCATTGAACAAAATTCTGAAGTTATAAGAAAGTTTTTGAATGATAATAAAGATGACTCACAAAATATTCTGGAATTTCATAGTAATGTTTCTCAAAAAGTTGCTGATAAGAGTGAAGAAACAACGAATGCCTTGGATCTTACTGAAGACAGCTGGGATTCACCGATAATTGTAACTACTATGGTTCAGTTCCTAGATTCTATTTTTGCCTCAGGGACAAAACATAGGAGAAGATTTCATAATCTTTGTGATTCGATTGTTATCTTTGATGAAGTTCAGAAAGTACCAATTAAGTGTCTTGATATGTTTAATGAGGCAGTTAATTTCTTAAAGAATTTTGGTAATACAAATGTATTACTTTGTACTGCGACACAGCCAGCTCTTGAGGAAGTTAAACAAAAGCTAGATTTAAATATAGATCATGAAATTATACCCAATTTAATTGAACATGAGCAGCAATTTAAACGGGTGGAGTTTATCGATAAAACACAAAATGATGATGGCATTGATCTAGTATTAAATTCGATTCAAGCTGCTGAGTTAATTTTTAAAAAGTCACAGAACTTCAAATCGATATTAGGTATTTTTAATACGATTGATGTTACTAAAAAAATATATTCAAATTTAAAAAACAAATTTGATAGTATCAGTGATCAAATTAAGCTTGAATATTTGAGTACTAATATGTGTCCTGCCGATAGAAAAGAAAGAATTAAAAACGTTCTTAATTTAGTTAAGGAAGGCAAGCGAGTAATTTGTATTTCAACTCCACTAATCGAAGCCGGTGTTGATGCTAGTTTTGAATGTGTATTTAGATCACTTTCTGGTTTGGATTCACTTGTTCAAGCTGCAGGACGATGTAATAGAAATAATGAATTGAAACTCGGAAAAGTTTATTTACTCAATATGGATCCTTCTGAGGAACATATTGCTAAACTTAATGAAGTCAAAACAGGTAAAGATCAAGTGCTTGAATTACTTAGTGAGGGTATAAAAGCCGATGATTTTCTAAATGCAAATGTGATTAAAAAGTATTTTGAAATGTTTTACTCAAAGCTTGCAAGCACAATGTCATATCCAACTAATGGCATTAATCTAGAAAATTATATTGATGGTATTAAGAATGTACATGAACTTGCATATCAGAGTAAAAGAAAAGATGCCTCCAAGTTTGAAAAACTCACGCAATTTTCAGGCAGTGAAACAATAGCGAAATACTTTCAAGTTATTAAAAATAATACTAAATCAGTTCTAGCACCGTATGGTGATAAAGGGGAAAAATTAATAGCTGATTTAAACGGAAATCAAGATATCAATAGCTTAATTATGCTAGTTAAAGATGCACAGCCTTACATTGTTAATTTATACGATAACAAATTCAATCAACTATTTGAAGAAGGTGATATATACACATTATGTCAAGTAGGAAACGAAGTGATCTATGCTTTTAGACCATATGCATACAACAAATTGGTCTTAGGAGATAGAAAACAAATTGAGAAAAGTATTTTTTAGAAAGGAAGGACAGAATGCTGAATGAAATAATTAAGTCCCCAAGTTTTTCATATAAAGTCTTTGGTGATTGGGCTTTATTCACTGATCCCATTATGAGATTGGGTGGAGAGAAATTTACATATTCAATTCCAACGTATCAAGCTTTAAAAGGTATAGCGGAAAGCGTATATTGGAAACCAACCATCGTTATTCATATTGATAAAGTTAGAGTAATGAAACCAATTTTAGTTGAGGCAAAGGACATGAGACTCTTTAAATATAATAATAGTCGATCCTCTGACTTAGCCCGATATACTTATTTAAAAGATGTTGAATATCAGGTTTTAGCTCATTTTGAATTTAATATGAATCGTCTAGATTTAGCTAAGGATAGAAATATAAAGAAACACTTGGCAATAATGAAGCGCTGTATTAAACGTGGCGGTCGTAGAGATGTTTTTTTGGGCACTAGAGAGTGTCAGGGATATGTTGAACCATGCAAATTTGGAGAAGGAGAAGGCTACTACGATAATTCTGATGACCGACTTTTTGGAACAATGTTTCATGGCTTTGATTATCCAGATGAAACTGGTAATTCTATGTTAAAAGCAAGATTGTGGAATGTTGTTATGAAAAAGGGTGTAGTTGATTTTATCAGACCAGAAGACTGTCCAGTTCATAAGCCATTGCATGAACTTCAAGTCAAAAAGTTTAAAAAAGGTGAAAACTTAGAATCTGTAGATCAATTATATAGCCAAATGTTAGAAGGTGATAGTTGATGAATTGGATATCTGATTTGGCCAAAGTATATGACGATAATGAATCTATTGCTGGAAAGGCAGAAACAGTTTCTGTTGGTAAAGAAAAAACGAAGACCGTTACTTTAGTTCCAATTTCGCATATTGCAGTTAATATTCCTATTCAAATTAATTTGGATAAAGATGGAGGATTTAAAGGCGCGGATGTCATCGATGAAAAG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55 | Bacillus_phage(33.33%) | bacteriocin,integrase,transposase,protease,tRNA | attL 584634:584693|attR 627061:627140 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
839194 : 847645
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012381|839194:847645|DBSCAN-SWA GATGGATTATCCTAAGAAATTATTAGAGGAAGTAAAAGAACGGTCTAAAGGCATGCGCTTGGAAGGAATAAATTCAGGTAGTGGACCAAAGCATCCCTTGTTAATGATTGTCGGTGAAGCACCAGGACGTAATGAGATTGTTAACAATATCCCATTTAGTGGTGATGCCGGCAAGGAACTGGATAAATCCTTGAAGCAAATTGGTTTATCACGAGATCAGGTTTATATCACTAGTGCGGTTCGTAGCCGTCCATTTAGCGTGAAAAAAGTTTTCAGCAAACGAGAAAATAAAGAGGTAATTAAAAGACCTAATCGTAAACCAACTAAAAAAGAAGTACTCGCGCATGCACCATTTCTTGATTATGAAATATCTTATGCGGATCCTCAGATTATTGTTGCTTTAGGAAACACTGGCTTAGAACGATTACTTGGTCCAGGTCACAAAATTTCGGCTGAACATGGCAAAGTTATTGAAAACACACCAATCCTTGAACTTAATACAGCTAAAGATGGCTATGTTTGGTCAAAAAAGAAGTACACGGTCATTCCGGAATATCACCCTGCAGCAGTTTTTTATAATCGTAAATTAAGCGATGATATTGTAAAAGATTGGGAAGTAATAAAACCTTATATCGATAAAGAAAGGGAAAGCAATGAGTAACGAAACTTTTTTAATTCCAATTAGACAAAATAATGATCTATCCGATATCGCTCTTAATGAATTACGTATGGACTTAGATGAGCATCCCTTGCATCAAAGAGCCTATACAGAATTAGCCTATTTAACAGGTAACAGTCGCAAATATAGCCTAAATAATGTCAAAACGATTGATAGCCCACTTAGAAATAAAAAGATTCTATTTTGGGGCTCATCTGTAACTTTTGGCTTCGGGGCTTTAGGTGAATCTTTCGTTGATTATTTATGGAAAAAAGATGGCATTGCGGCCATTAAAGATGCGGAAAACGGAACTACATTAGTAGATCAAGAGACTAGTTATCATGGTGATTCCTGTGTTGCTCGTTTCAAGGAAAATCTTAAAACTCCAATTGATATGTTGGTTTTACAGCTTTCTACTAATGATGCACGTACCAACCAGAAATTAGGCAAAGTTAGTGATGATGACCATTTTGATACGCAAACAATCATCGGTGCGATGGAGTATATCATCAGTCAAGCTCAAGCTACATGGCATTGTCCAATTATGATTTATACTAATCCATATTTTGAAAATAAGTTATATGAACAAATGGTAAAAGCAGCACATCAATTGGCTCAAAAATGGAATATTGAAGTCTTGGATTTATATAATAATCCTGATTTTAAAGACCAACCAGCTCTTTACATGGCTGATGAAATTCATCCAACGCGAGCAGGATATTTAGAAAAATGGCTGCCAGTTTTTGAAGATGAATTAACTAAAATTTTGGCAAAAAAATAAACCCAAGCCATTAGCTTAGGTTTGCTTACTAATCGATATTGTTTCTGTAAAGACCAACTACTTTACCTAAAATAGTTACCTCAGGTAAGATAATTGGAGCCATTGTATCATTTTCTGGTTGCAAACGGTAATGACCTTTTTCTTTATAAAAACGTTTAACAGTGGCTTCATTTTCGTCAGTCATAGCTACTACGATTTCGCCATTATTAGCGGTGTTTTGTTTTTTGACGATAACGTTATCACCGTTCAAAATGCCGGCATTGATCATGCTTTCACCGTGAATTTTTAACATAAAGAGTTCACCAGCATCATTTTCAAGATCTGGTGGAAGTGGGAAGTATTCATCTATGTCTTGAACTGCTAAAATTGGTTGTCCAGCAGCAACAACGCCAACAACTGGAATTCTCTTTGGCTTGATGCCTAATTCTTTTTTACCCTCATCGGTAATTTCGAGTGCACGGGGTTTAGTTGCATCTTTGATTAAAAGGCCTTTGCGTTCTAATCGAGCCAAATGCCCGTGAACGGTAGACGTAGAAGATAGCTTAACTGCAGCACAAATCTCCCGAACTGTTGGTGGAAAGCCACGATGGTCGACAGTATCATAAATATAGCGTAAAATTTCTAGTTGTTTGGTATCACTGTTTTTCTTAGACATAATTTTTCTCCGTTATTGTAAAAAAGATTTTATTTATGCTTATTTTAACAAAAAAATAGCATAGTCTCAAACGAACGTTCTATGAAAAGTATCTTTTTTTATTGTATAAAATACGGTAGACTAAAGATTGTTAATGCGGGGTGAATATATATGAATAAAGATGCAATGAGTAAAGAAGAGGAAAAAAAGGTAACAGATCGAATTAACGAACTTTACCATAAGAAAGAAAAGGAAGGTTTGACTCCTGAAGAGGAACAAGAACGTAAAGAACTTCACAAAAAATTCCTTGCCAACTTCAGAGTTGCCTTTAAGCAAGATGTTGAAAATATGGTAATTATTGATAAGAATGGCAAGGAAGTAACTTCCGAAAGAGCCAAGCGTGCACAACGCAAAAAAGGTCTTAGAAAAGATTAATTAAGTCTTTAAAAAAGATGAAAATTTATGTAAGATATTATTGTTAGTTATGGAGGATTAATATGAATTTAGGTTTAGCAATTTTTTTGATTATTATTGCACTTTTGGTCGGCGCTGTTGCAGGTTTTTATGGTGCAAGAGCATACATGAAGAAATATTTTAAGGAAAATCCTCCAATTAGTGAAGACATGATTGTTGCTATGATGTCTCAAATGGGACAAAAGCCTTCTAACAAGAAGGTTCACCAAGTAATGAACATGATGAAACACCAACAAAAATAATTTGATTTCTTGTTGGATTGAAGGGTAAAGGTTTTTCCTTTACTCTTTTTTTATACTTTTTTAGGAAAATGAGGTGAAAAAGTGGGTATTTTTAGCAAATTAGGATGGTTTTTTAAACAGGAAAAGAAGCGCTATTTTATTGGAATTACTTTTTTAGCGTTGACTTCACTAGCTAACTTAATTCCTCCGAGAGTTTTAGGCTTAATGGCAGACCAATTAGACAAGGGTCACGTTTCCTGGAGCGAATATGCTGCATTAATTATTGCCGTTTTAGCGGCTGCTTTTACTCTTTATATTTTGCGTTACTTTTGGCGAAAGCAAATTTGGGGTGGAGCTGCTGAGCTTGAACGTCAAATGCGCTCAAAACTGTTTGATCATTTCATGATCATGGATCGAACTTTTTATCAGAGACACCGAACTGGAGACTTGATGGCTCATGCCACCAATGATGTGAGTGCCATTCAAAATGTAGCTGGTGATGGCGTGTTGACTCTAGTTGACTCATTAGTCATGGGTTTATCGACAATGGTTGCCATGATTATTTTTGTGGATTGGCGATTAACGATCGTTGCATTGTTGCCTTTGCCATTTTTGGCTCTTGGTGCCTGGAAATTAGGTGATCATTTACACGATGCATTTGATAAATCACAAGCAGCATTCTCACGGTTAAATAATAAAACTCAAGAATCAATTACTGGGATTAAAGTATTAAAGACATTTGGTCAAGGCAAAGAAGATACAGCTGCTTTCGATAAAATGGTCGATGATACGATTAAAATCAATAAAAAAGTTTTTGTGTGGGATTCATTATTTGATCCCTTAGGTACGGCAATTATTGGAGCTACTTATGTAATCACAATTATTTATGGTGGCTTACTAGTAAATCACCATGTTTTATCAATTGGACAATTGGTATCATTCATTGCTTATATTTCTAATATGGTTTGGCCGATGTTTGCCATTGGCTATTTGTTCAATATTTTAGAGCGTGGTAGTGCTAGTTATGATCGTGTAGAAAAGCTTTTGCAAGAAAAGCCATTGATTACGGATGCACATGCAGATAACACGCTTTCCGCGGAAGATTTACAGGGAGACTTGGATTACCAAATAAAGTCCTTTGCATATCCAGATGAAAAAGATATTCCTGTTTTGAAGAATATTGATTTTAAATTGAGACCAGGACAAACACTTGGCTTAGTTGGCCGAGTCGGCGCAGGAAAGACAACAATTATTGAATTGCTGTTAAGAGAATTTGATCAGTATGATGGTCAAATTACATTGAATGGTAAAGATATTCGAACAATTCCGTTAAAATTGTTGCTTAGTCAAATCTCGTATGTACCACAGAATAATTTCCTATTTTCTACTAGTATTGGAAGAAACATTGCATTTTCTTCAGAGGATGCGGATCAAGAAGATATTGCTTTGGCAGCACAAAAGAGTGATTTGCATGAAGATGTTTTAAAGATGCCTAAGGGCTATCAAACTCTAGTAGGAGAAAATGGACTATCATTGTCTGGTGGACAACGACAAAGAATGTCAATTGCTCGTGCCGTATTAAAAGACACTCAGATTTTGATTTTAGATGATGCTTTATCAGCTGTAGATGCAAAAACTGAAACGGAAATTTTGTCAGCATTGAGAAAAGAAAGAGAAAATAAGACGACTATGATTGCAGCTCATCGTTTGACTTCAGTTATGGATGCGGATTTGATTCTAGTATTGAAAAATGGGCAAATTGTTGAACGAGGCAATCACCAACAGCTTTTAGCTGAAAACGGTTGGTATGCAGAAATGTGGCGCAGACAAGAAAATGGAGGTGAAGATATAAATGAATGATGAACAACAAGAGTCAATCTGGGCTAAGGCAGTCCCATTTAAAGAACAAGTGACCATTTTTAAACGCTTGATGAAGTTTGTTAAGCAATTCAAAACTGAAATGATTATTGCTCTATGTGGTGCATTTTTAGTAAGTGTCATCAATATCTTATTGCCTAGAGGTTTGCAGTATTTTTTAGATCATTTTTTGCTTCATCAAAGTACCTCAGTTCAAATTATTTTATTTGCGGGTTTACTGTATGCGATAGGTTCGCTTCTTAAAGCAATAATTCAATTTACATATCAGTATTTCTTTGCGTTAGGTTCGGAAAAAACATTGGAGAGTGTACGTCGAGCTTTATACAGAAAATTGCATCAATTGGGAATGCGTTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012381|839194:847645|842063_843821_+|WP_014563414.1|DBSCAN-SWA MGIFSKLGWFFKQEKKRYFIGITFLALTSLANLIPPRVLGLMADQLDKGHVSWSEYAALIIAVLAAAFTLYILRYFWRKQIWGGAAELERQMRSKLFDHFMIMDRTFYQRHRTGDLMAHATNDVSAIQNVAGDGVLTLVDSLVMGLSTMVAMIIFVDWRLTIVALLPLPFLALGAWKLGDHLHDAFDKSQAAFSRLNNKTQESITGIKVLKTFGQGKEDTAAFDKMVDDTIKINKKVFVWDSLFDPLGTAIIGATYVITIIYGGLLVNHHVLSIGQLVSFIAYISNMVWPMFAIGYLFNILERGSASYDRVEKLLQEKPLITDAHADNTLSAEDLQGDLDYQIKSFAYPDEKDIPVLKNIDFKLRPGQTLGLVGRVGAGKTTIIELLLREFDQYDGQITLNGKDIRTIPLKLLLSQISYVPQNNFLFSTSIGRNIAFSSEDADQEDIALAAQKSDLHEDVLKMPKGYQTLVGENGLSLSGGQRQRMSIARAVLKDTQILILDDALSAVDAKTETEILSALRKERENKTTMIAAHRLTSVMDADLILVLKNGQIVERGNHQQLLAENGWYAEMWRRQENGGEDINE >NZ_CP012381|839194:847645|845701_847645_+|WP_023062046.1|DBSCAN-SWA MRRYLAVRGGAGDVAEPDLNAKPQANLYLAVNSEGLSKAEIPADQTSAGVSTELDIKIEKRMMKDFADIASGKEKMPDIRDFDKAIALYKIAKNFDKRDAEKANPIQNDLQKILDLTNFDKFKDNATELFMGPYALPFVFDVDADMKNTDVNVLHFGGPSTFLPDTTTYKTPEAKKLLDILEKQSINLLEMAGIGKEEARVYVQNALAFDQKLSKVVKSTEEWSDYAAIYNPVSLTEFLAKFKSFDMADFLKTILPEKVERVIVMEPRFLDHADELINPANFDEIKGWMLVKYINSVAKYLSQDFRDAAFPFNQAISGTPELPSQIKQAYRLANGAFDEVVGIFYGKKYFGEEAKHDVEDMIHNMLKVYEQRINDNNWLSEDTKKKAIIKLRALVLKIGYPEKIEKIYDLLQIDPERSLYENEAQMATVRTKYMLDKLTQPVDRSVWLMPGNLNNACYDPQRNDLTFPAGILQAPFYDIHQSRGANYGGIGATIGHEVSHAFDNSGAKFDEHGNMNNWWTDEDFAEFNKRVGQMVDIFDGLQYGPAKINGKQVVGENIADLAGLACAVQAGKNDNVDLKDLFENYARSWMQKQRPEAIKTEVQVDVHAPQPTRVNIPVQCQDDFYTAFDVKPDDGMWLDPEDRITIW >NZ_CP012381|839194:847645|839846_840632_+|WP_014563411.1|DBSCAN-SWA MSNETFLIPIRQNNDLSDIALNELRMDLDEHPLHQRAYTELAYLTGNSRKYSLNNVKTIDSPLRNKKILFWGSSVTFGFGALGESFVDYLWKKDGIAAIKDAENGTTLVDQETSYHGDSCVARFKENLKTPIDMLVLQLSTNDARTNQKLGKVSDDDHFDTQTIIGAMEYIISQAQATWHCPIMIYTNPYFENKLYEQMVKAAHQLAQKWNIEVLDLYNNPDFKDQPALYMADEIHPTRAGYLEKWLPVFEDELTKILAKK >NZ_CP012381|839194:847645|843813_845607_+|WP_023062044.1|DBSCAN-SWA MNDEQQESIWAKAVPFKEQVTIFKRLMKFVKQFKTEMIIALCGAFLVSVINILLPRGLQYFLDHFLLHQSTSVQIILFAGLLYAIGSLLKAIIQFTYQYFFALGSEKTLESVRRALYRKLHQLGMRYFNQTPAGSIVSRVTNDTMTLSNFLTVLSTVVIGLFSVVTALVAMFTTNVVAGWIVLVFVPILLFVIWLYSQKSSRLYRNYRERLSRINANLNESIEGVSIIQQFNQEKRMTNHFEGENGGLMQTRFNMIRVNSLLLSPLTSLLYSLALAVSLMYFGFPLREVFVPAGVVYAFSQYISQLFNPISTMMDQMTFFQDGIIAGKRIFRILDDEQYEPQQDAQAGLTINRGKIEFKHVSFSYDGKHEILHDVSFVVNPGETLGIVGHTGSGKSSIINVMMRFYEFGKGQVLIDDVDIRKYPKEELRKKLGLVLQEPFMFYGDIASNIRLYNQEITDDQIKKAAQTVQADQFIEKMPGKYHAKVIEGGAELSQGQKQLISFARTLVTDPKILVLDEATANVDTETETLIQEGLKRLRKGRTTLAIAHRLSTIADADQIIVLDQGRIVERGNHEELLAKKGYYYNLYTLQKNEGEN >NZ_CP012381|839194:847645|839194_839854_+|WP_041809461.1|DBSCAN-SWA MDYPKKLLEEVKERSKGMRLEGINSGSGPKHPLLMIVGEAPGRNEIVNNIPFSGDAGKELDKSLKQIGLSRDQVYITSAVRSRPFSVKKVFSKRENKEVIKRPNRKPTKKEVLAHAPFLDYEISYADPQIIVALGNTGLERLLGPGHKISAEHGKVIENTPILELNTAKDGYVWSKKKYTVIPEYHPAAVFYNRKLSDDIVKDWEVIKPYIDKERESNE >NZ_CP012381|839194:847645|840660_841287_-|WP_014563412.1|DBSCAN-SWA MSKKNSDTKQLEILRYIYDTVDHRGFPPTVREICAAVKLSSTSTVHGHLARLERKGLLIKDATKPRALEITDEGKKELGIKPKRIPVVGVVAAGQPILAVQDIDEYFPLPPDLENDAGELFMLKIHGESMINAGILNGDNVIVKKQNTANNGEIVVAMTDENEATVKRFYKEKGHYRLQPENDTMAPIILPEVTILGKVVGLYRNNID >NZ_CP012381|839194:847645|841763_841982_+|WP_012212011.1|DBSCAN-SWA MNLGLAIFLIIIALLVGAVAGFYGARAYMKKYFKENPPISEDMIVAMMSQMGQKPSNKKVHQVMNMMKHQQK >NZ_CP012381|839194:847645|841452_841701_+|WP_041809906.1|DBSCAN-SWA MSKEEEKKVTDRINELYHKKEKEGLTPEEEQERKELHKKFLANFRVAFKQDVENMVIIDKNGKEVTSERAKRAQRKKGLRKD |
8 | uncultured_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1004009 : 1061747
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012381|1004009:1061747|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP012381|1004009:1061747|1042042_1042282_-|WP_003626373.1|DBSCAN-SWA MNQIAFNQQLSDKLNEVLNPTLYSTPGKGEITVVANEKNDLREYRIITENNKVVKVEDAYDAKHDADYDKMMDFLKDYR |
54 | Paenibacillus_phage(22.22%) | integrase,transposase | attL 1004137:1004152|attR 1031342:1031357 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1138127 : 1203157
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012381|1138127:1203157|DBSCAN-SWA 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57 | Aureococcus_anophage(11.11%) | protease,integrase,tRNA,transposase | attL 1153232:1153248|attR 1183013:1183029 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1229775 : 1305774
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012381|1229775:1305774|DBSCAN-SWA AATGGACTCTTTACATTCTACCATGAATCAGCACGTTAAAGGCAAGCACTTGTCATTTGAAGAACGGGTTATTATCCAAACTCGCTTAAAAGATGGCTGCTCTATTAGAGCAATTGCTCGCGAACTGGGCTGCTCTCCTTCTACGATCAGCTATGAAGTCAGACGGGGCACTGTTTCTCTCTATCACGGCAAGCAGAAGCGCTACAAGGCTGATCAGGGCCAAAGCGTTTATCAAATAAATCAGCGCCACTGTGGCCGCAAATCAGCTTTCTTGAAGAAGGCTGGCTTTATCAATTATGTCATTAAGCATTTCTTTGAAGACGGCTGGTCGCTTGACGTTTGTGCCAACCGTAGTTTAGCTACCGGGGAATTCTCGCATTATCAAACAGTCTGCACCAGAACCCTGTACAACTACGTTGATCAAGGACTGATGACCATCAAAAACTATGACTTGCCCGAAAAGCTCAAGCGCAATACCAAGCTTCATCATGTTCGCCAAAACAAGAAGAAGCTGGGACGAAGCATCGAAGAGCGGCCTAAAGAGATTGAGCAGCGCAGCGAATTTGGTCATTGGGAATGCGATCTTGTCTTGGGTCATAAGACCAAGGAAGATCAGGTTCTGTTAACTCTTTCCGAGCGCATGAGCCGCGAATCCCTGATTATTCGTATACCTGACAAGACCTCTGCCAGCGTCATGCAGGCTTTTCAAATGCTTCAAAAACAGTACAGCGAACATTGGAACGATATCTTTAAGACAATTACTACTGATAATGGTTCAGAGTTTGCGGATCTAGCTAATCTGGAACAAGTCTCTAAAATGCTTATTTATTATGCTCATCCTTATACTTCTTGTGATAAAGGAACTGTTGAAAGACATAATGGCCTGATCCGCAGATTCATTCCTAAAGGAGACTGCATCAATAACTATTCTCTCCAACAAATCATTGATATTGAAACCTGGTGCAACTCTTTGCCCAGAAAGATCCTGGCATATCACACGCCAGATGAAATCTTTGAGAGAGAATTAGATCAAATCTATCAAGCAGCTTAAGCGTTCAATTTATTATTGCAATTTACGTAAATTAAAATTTGCTAAATTGAGTTTACATTGATATAGAAACATAGAGGATACATGATGACTAATTTTGTTTTTGACTTAATTAACCAATTTAGCTACATGGCCATCAGTTTTTTAATTGCCATCGAAAATGTCTTTCCACCTATCCCTTCAGAAGTCATTTATCTTTTGCAGGATTTGCCACACACCACTCCCAAATGACGGTTGTAGGAACGGTTATTGCTTCTACTATTGGGGCAGTCCTTGGAGCTTTAATTTTATACGGTATCAGCTGGTTCTTAAATGAAGAACGCTTAGAACGCATCTTAGATCATAAAGCTTTTAAAATGCTTGGCTTTAAAAGAGGCGATGTACAAAAGGCAATCAATTGGTTTGATAAGTACGGCACAGGCGCTATTTTCTATGGGCGCTGCATCCCTGTCGTACGAAGCTTAATTTCAATTCCTGCTGGAACTGCAAAAGTAAAAATGGCTAAGTTCTTAATTTACACTACTTTAGGGAGCTTAGTTTGGAACACAATTCTAGTAGCGTTGGGTTCTTACATGAGAGAAAAATGGCATGTAATAGTTACTATTTTTGAAGAATACTCTTTGATTATTGCTGGCCTAATTCTAATTGCAATGATCTTCTTCTCCTTCAGATGGTACAAACAAAAAATTAAAAACTAACATAAAAGTCCTATTTCACATGAATAGGGCTTTTTCTTCTTCAAAAAATTAAAAAGATAATGTAAAATTAATCTAACTCTATTTTAAGGGATGATGTAATGGGATTTTACATTTTTAGGAAACAGAGCATTCAAAATTATCTTAGCAAAGATATCAAATTTGCTAAGACAATTAATGCGGTAGATTTAATGTCCCTCGGTGTTGGTGCTGTAATTGGTACTGGGATCTTCATTTTACCAGGGACAGTAGCTGCTACTCTTGCAGGACCCGGGGTAAGTCTATCATTTGTAGTAGCCGCCATAGTTTGTGCGCTGGCTGGAATGTGCTATGCCGAATTTGCTTCAGCCATTCCAGTAGCCGGGAGTGCTTATTCATACGGTAATATTGTGTACGGCGAATTCACTGGCTGGATTATCGGCTGGTCCTTAATTCTAGAATACATGCTTTCGGTAGCAACGGTAGCTGCTGGCTGGTCCTCTTATTTCAGCTCCTTCATAAGTCCATTCGGGTTGAAAATTCCACATGCTGTTTCTGGGCCAATGAATCTTTCTCATGGGGTTTACTTTGACTTAGTTTCAGTCTTAATAATTTTACTAATTAGCATCCTGCTTTCTCGCGGGATGAAAAATTCTATCAAAATCAACATCGTAGCCGTTTTTATTAAAATAGCTATCATTTTAATTTTCATCTTTGCCGGTTTACACTTCATTAAACCAGCCAATTATCATCCATTTTTGCCATATCATTTCTCAGGCGTAATCAAAGGTGCTACTACAGTCTTCTTTGCTTTCCTTGGATTCGATGTAGTTTCATCTTCTGCTGCCGAAGTTAAAAATCCTAAGAAAAATATGCCATTAGGAATTATCGGTACTTTAGCAATTGCAGCTCTGCTTTACTTTGGTGTTTCAATAGTTTTAACAGGGATGGTCAACTATACCAAGCTTAATGTATCTAATCCAGTTGCATTCGCCTTGCAATACGTTCACCAAAATTGGGTAGCAGAACTGCTCTCATTTGGGGCAATGCTAGGAATGGCTACAATGATGCTGACGATGATTTATTCAAGTTCTCGTTTAATTTATGCCATGGCAAGAGACGGCTTGCTTCCTACAGCTTTTAGTAAGTTAGATAAAAAGCATAATTCTCCTCAAAATGCCTTAATAGTTGTAACCATTATTATTGCTTCAGGAGCCGCATTTTTCTCAGTTGATCAATTAGCCAACTTAGTAAATTTCGGCACACTTTTTGCCTTTACCTTAGTATCATTTGGTATTTTAAAACTAAGAAAAAGAACAGACATTACCAACGATGGCTTTAAGGTTCCAGGGTATCCATATTTGCCAATTATTTCTGGTTTAATCTGTATCTTTATGATTTGTCACCTAAGTTCCGAAGTTTATCTAATGGCAATCATTTGGCTCGTAATCGGTAGTGTGATTTACTTCGTTTATGGCTACCATCACAGTCAGCTTGACCATGACTAACATACCAAAAATTATGTAAAATAAAAAAGCAATTTTGCAATTGCTTTTTTATTTTTGCCTCTAATTAATTTGATTAATAGCCTTACCATCCTTGAAGAAGGACAAAACATTGTTAGCTGCTTCTTTAGATAAATTATATCTAGCAACATGTGTAGCTGAGCCTACATGTGGGGTCATAATCACATTATCCATCTCCACTAATTCTTGTCTAGGATGAGGTTCATTTTCAAACACGTCTAACGCTGCACCAGCAATCTCATCATTCTTTAAAGCTGAAATCAATGCATTGCTATCAACTAAAGAACCACGAGCTACATTAATTAAAAATGCAGTATCCTTCATTTGTTTAAACGCATCAGCATTAATAATGTGGTAAGTTTCAATCGGTTAAAGGAGCAGCAAACTTAAGAAATCTGCATTCTTGATCAAATCAGCAAAATCAACATACTTAGCATCAAGTTCTGCTTCAAGTTTTTCATCAAGTTGATGGCGATTATGATAGATAATCTTCATTCCTAAAGCTTTAGCAAAACGTGCAACTTGTTGACCAATTCTGCCCATGCCTAAAATACCTAAAGTTTTGCCTTCAATTGAATAGCCTTGATTATCATATTCATCAGCATTCAAAAATACGCCTTCACGCAAAGTATGGTCATAATAACGAAGACGACGTGCCGAAGCTAAGATCATTGTTAAAGCCAATTCGGCTGTTGGACGCAAAACGCTTTCAGGACAATTTGAAACTACAATTCCCTTTTCCTTAGCATATTCTGTATCAACATGATCAAAGCCAACACCATAAGTAGAAATAATTTTCAAATTCTTGGCAGCATCAATCATTTGCTTATCAAAGATCATCTTAGCCACAATTACGCCATCATATGCAGCAATATGATCTAAACCCATTGACGATCATCATCTGGGCGATGTCCAACAGGTCCAACAGTTATATCACATACTTCTTTTAATTCTGTTAAGGCGTCGTCTCTCAAACCGCCTAAAACTAAAACTTTTGCTTTACTCATCTTTATTAACCTCTATTTAATATTTCTTAAGCCAAGATACCACTAATTGCTTTAAATTAACATCTATTTTGCAAATTTATTAATAGCTACAGCGACGCCATCATGATCACAATCTGCTGTTACTGCATCGGCATGCTTCTTAGTGTAATCTACAGCATTCCCCATGCCACACCTATTCCAGCATATTCCAGCATCGGTGCATCATTTGCTTGATCACCTAAAGCCATAACATTTTCTGGAGCGATTTTCAAATAATTGCACAGTCTTTCTAATCCAGTTCCTTTATCAACTCCAGCTGCAGTAGCTTCATAATAAAAAGGTTCAGTTTTAGAAAAAACTACTCTGTCTTTCATCTGTTAAAATAACGGACTAGTAATTTTGCTATCTAAATAATCTGGATCATCAATATACATACACTTAATAATCGGAATATGTCGCATCTCTTCTTGAGTTCGATAAGAGACTTCTAATTTTACCACCCGTGAATTATAGATCGTATAGTGTCCTAGATCGCGATTAGCTGTATAAATTCGATCTAGACTCACGCTATGAAAATGCAAATTCAATTTGCGAACGATCGCTTCAAGATCAATATAGTCTTCATATTTCAAACCTTGCTTGAAAATAACTTGACCATTTGTCGATTCAACTACCGCTCCATTGAAGCTTACTACGTACTCATTATCCTGACAATTTAAACCTAACTCATCAAGATAACACTGCGCACCAGATAGAGGACGACCTG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60 | Lactobacillus_phage(15.79%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1424640 : 1495912
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012381|1424640:1495912|DBSCAN-SWA 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60 | Streptococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1510025 : 1569144
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP012381|1510025:1569144|DBSCAN-SWA 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54 | Streptococcus_phage(28.57%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
1604538 : 1666154
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP012381|1604538:1666154|DBSCAN-SWA 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50 | Bacillus_phage(15.38%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
1732377 : 1852921
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP012381|1732377:1852921|DBSCAN-SWA 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95 | Lactobacillus_phage(18.18%) | transposase,protease,capsid,tRNA,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
1873772 : 1933567
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP012381|1873772:1933567|DBSCAN-SWA 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56 | Streptococcus_phage(20.0%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_13 |
1978067 : 2026492
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP012381|1978067:2026492|DBSCAN-SWA 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35 | Lactobacillus_virus(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_14 |
2083030 : 2137538
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP012381|2083030:2137538|DBSCAN-SWA 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47 | Lactobacillus_virus(28.57%) | protease,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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