Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012801 | Bacteroides cellulosilyticus strain WH2 chromosome, complete genome | 1 crisprs | PD-DExK,PrimPol,WYL,cas3,RT,DEDDh,DinG | 1 | 1 | 3 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012801_1 | 92169-92275 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012801_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012801_1
>1.1|92192|19|NZ_CP012801|CRISPRCasFinder TGGCAACCGTGGTGGTGGC >1.2|92234|19|NZ_CP012801|CRISPRCasFinder TGGCTACGGCGGCGGCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012801_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012801_1 >merge|NZ_CP012801|1|92169-92275|CRISPRCasFinder CGTGGTGGTGGCTATGGCGGCGGTGGCAACCGTGGTGGTGGCTATGGCGGCGGCAATCGTGGCGGTGGCTACGGCGGCGGCAATCGTGGCGGTGGCTATGGCGGCGG >NZ_CP012801|1|1|92169-92275|CRISPRCasFinder CGTGGTGGTGGCTATGGCGGCGG TGGCAACCGTGGTGGTGGC TATGGCGGCGGCAATCGTGGCGG TGGCTACGGCGGCGGCAAT CGTGGCGGTGGCTATGGCGGCGG
>NZ_CP012801.1|WP_007213973.1|91432_91882_+|cold-shock-domain-containing-protein MAVKRVTSSKRDREKAKQSKREEKQKRKEERLSSGSRSFEEMLAYVDENGILHSTPEGVKPKEEIDASEIEISIPKKGEAEEVLPLNGRIEHFNVSRGYGFIKDLGSGEKYFFHVTSAPEGITEGDNVTFEIERGTRGMNAVRISIINK >NZ_CP012801.1|WP_007218351.1|89938_91105_-|formate-dependent-phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MKKILLLGSGELGKEFVISAQRKGQYIIACDSYAGAPAMQVADEYEVFSMLDGDALERVVRKHQPDIIVPEIEAIRTERLYDFEKEGIQVVPSARAVNFTMNRKAIRDLAAQELGLKTAKYFYAKTLDELKAASEKIGFPCVVKPLMSSSGKGQSLVKSADELEHAWEYGCNGSRGDIKELIIEEFIKFDSEITLLTVTQKNGPTLFCPPIGHVQKGGDYRESFQPAHIDPAHLKEAQEMAEKVTRALTGAGLWGVEFFLSHENGVYFSELSPRPHDTGMVTLAGTQNLNEFELHLRAVLGLPIPNIKQERIGASAVILSTIASQERPDYRGIEEVTKEEDTYLRIFGKPTTRVNRRMGVVLCYAPLKSDLDALRDKAKRIAEKVEVH >NZ_CP012801.1|WP_007213976.1|89178_89880_+|ribose-5-phosphate-isomerase-A MKWDNQLINHLQWSNAIINREGKEIVAQEIAAMAKDGDVIGAGSGSTVYLTLFALAERIRKESLHIEVIPASAEISMTCIQLGIPQTTLWNKRPDWVFDGADEVDPEKSLIKGRGGAMFKEKLLIKSSSKSFIIIDDTKLVDHLGSHFPIPVEVFPGALTFVESEMQRLGASDVKLRLAGGKDGPVLTENGNFIFDTRFSYVDPSLEQNLKAITGVIESGLFIGYDVEIVVAK >NZ_CP012801.1|WP_167555821.1|88995_89166_+|hypothetical-protein MSRRSQLEHEVSLAQKRIKEAPQNTPANIREIWEQELVELEVELNNLTDDEEDNND >NZ_CP012801.1|WP_007213978.1|88429_88915_+|PepSY-like-domain-containing-protein MKKFNFSLLAGLLLLISASVCAENTPEKVQETFKKMYPKVTTVEWMHKSDYHIAGFVSDSHEMNAWFGNNAQWIMTETNVESLEDVPAPVAKAFMQTETPPIQIRYIKIITFPKMPAVVIIDIEEYNSDREIQLFYAPDGKLLQSLDVSGGDGEIYPELFG >NZ_CP012801.1|WP_007213979.1|86793_88260_-|RimK-family-alpha-L-glutamate-ligase MNNVLILVDSLDDWKPYSKTNSILTVSDYLKYKSPGKDRKLVINLSNDYSYNSEGYYCSLLAQTRGHKVIPGVDIINKVEAGAGIRMDSSLQKLCYQWIQKNEITDDLWSLNVYFGTCKEKGLERIARFIFENYPAPLLRVTLNTRHKNQIENIQFLPLSSLNNEEEDYFANALDLFNRKVWRNPQASKSARYNLAILYDPDEKFPPSDKKALHKLLELAKKMDIHAELLTEEDATRLMEFDALFIRTTTSLNHYTFRLSQLATQNGLAVIDDPQSIIRCTNKVYLKELFEKEKIPAPLSMLLFKSNVNSYEEITEQLGSPFILKIPDGSFSIGMKKVNNEIELDEALKVLFDKSSILLAQEFTPTDFDWRIGILNGEPLYACKYYMAKGHWQIYCHYASGRSRCGLVETIPIYQVPRKVLDTALRAASFIGKGLYGVDLKMVNDRAIVIEINDNPSIDHGLEDAILGDELYYRLLNNFWRMLDVKRF >NZ_CP012801.1|WP_029427941.1|86326_86788_-|ribosomal-protein-S18-alanine-N-acetyltransferase MEQRFILRLAEIDDIPSIMEIEQICFDKDSFSKRQFVYLISQAKGYFCVVEYQQRVGGYFSVLINQRACSLRIYSIAVHPDFRGKKVGQLLIDQIAVIAQKQGLKRITLEVNVSNSPAIHLYEKNGFKCISIKENYYHNGTSAYYMQRPTIVE >NZ_CP012801.1|WP_007218357.1|85111_86056_+|Dyp-type-peroxidase MNPHQNPFAGNTPQDVTERQGENAIFIVYGLNQSPDAVDKVKDVCTNFSALIRSMRNRFPDAQFSSTISFSANVWDRIFPGKGKPKELETFKEIRGSKYTAVSTPGDILFHIRARQMGLCYEFASIIDEKLKGAVEAIDETHGFRYMDGKAIIGFVDGTESPAVDENPYHFAVVGEEDPDFAGGSYVFVQKYIHDMNAWNALPVEEQEKVIGRRKFNDVELSDEEKPANAHNAVTNIGDDLKIVRANMPFANTSKGEYGTYFIGYASTFSTTRQMLESMFIGNPVGNTDRLLDFSTAVTGTLFFAPSYDLLGED >NZ_CP012801.1|WP_007213982.1|83211_84732_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta MSQIIGHISQVIGPVVDVYFEGTDAELMLPSIHDALEIKRSNGKTLIVEVQQHIGENTVRTVAMDSTDGLQRGMKVYPTGGPITMPVGDQIKGRLMNVVGDSIDGMKELDRAGAYPIHRDPPKFEDLTTVQEVLYTGIKVIDLLEPYSKGGKIGLFGGAGVGKTVLIQELINNIAKKQHGFSVFAGVGERTREGNDLLREMIESGVIRYGEEFKKSMEEGNWDLSKVDYSEVEKSQVSLIFGQMNEPPGARQSVALSGLTVAESFRDQGAETGGSRDILFFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLATEMGAMQERITSTRNGSITSVQAVYVPADDLTDPAPATTFTHLDATTVLSRKITELGIYPAVDPLESTSRILDPHVVGEEHYEVAQRVKQILQRNKELQDIISILGMEELSDADRTLVNRARRVQRFLSQPFAVAEQFTGVPGTMVPIEDTIKGFKMILDGEVDYLPEPAFLNVGTIEEAIEKGKKLLDQVNN >NZ_CP012801.1|WP_007213983.1|82942_83188_-|ATP-synthase-F1-subunit-epsilon MKKLYLNIVSPEKEIYNGEVESVTLPGTIGTFTILPQHAPIVSSLREGKVMYVPTEGEEQTLDIEGGFIELSGGVVSACVD >NZ_CP012801.1|WP_007213969.1|94888_96406_-|DUF4301-family-protein MITPQDKELLRQKGISEEQIAEQLTCFEKGFPYLKLAAAASLEKGILAPAAEEQKLYLDAWDAYTRTDKVVVKFVPASGAASRMFKNLFEFLGADYDVPETKFEKTFFEQIEKFAFYNDLNAACEKAFEKNIPALMAEGDYKAVVAALLEAAGLNYGALPKGLLKFHRYEDGSRTPLEEHLVEGALYAANKNGKVNVHFTVSPEHRRLFENLVADKAAVYAKKYGVDYNVTFSEQKPCTDTIAADMNNQPFRDNGKLLFRPGGHGALIENLNDLDADIIFIKNIDNVVPDKLKGDTVLYKKLIAGVLVALQQKAFAYLELLDSGRYTHEQVLEILQFLQKKLFCKNPETKNLEDAELVLYLKEKLNRPMRVCGMVKNVGEPGGGPFLAYNSDGTISLQILESSQIDMDDPEKKEMFEKGTHFNPVDLVCAVRDYKGHKFDLVNFVDKATGFISYKSKNGKDLKALELPGLWNGAMSDWNTVFVEVSLSTFNPVKTVNDLLREQHQ >NZ_CP012801.1|WP_004303751.1|96827_98051_+|site-specific-integrase MKQTDVTVTFYLKKSEMNDEGHCPVMAKLVVGKFSEAAFSAKMSVPAALWASGRATGKSNAAREINRQLDDLRASAISIYDELSATRENVTAEEIRNLLLGTAFGQETLLGYFRTFIEHFEKRVGVNREKGTAQSYRYACNCVAAFIQEKYKLSDVPFTALNRSFIDNYDLYLRTERRFALGTIVLLVTRLNTIVGEAIAEGIITADPFAGYEAEHPEREQKYLTAAELQRLMTTPLHDPKLYHIRDLFLFSCYTGIPYGDMCRLTTEDLEVAEDGEVWIKTARKKTKIDYEVPLLDIPLLILDKYRDMAPEGKLLPMYSNNELNRTLKRIAAICGIERKLVFHCGRHTYATEITLSHGVPLETVSKMLGHSRISTTQIYAKVTDDKIDMDTRSLEEKIAGRFSVAI >NZ_CP012801.1|WP_007568639.1|98082_99372_+|site-specific-integrase METNNKEIKRRSTFSLLFYINRTKVRKDGTCKLLCKVSIDAKSAPININAFVDPSLWNPETKRANGRSENARTVNQAIEKLTEKITGHYRHIRKSLGFVTAELVKNAVEGIGQKPFTLLALFREHNEEFRKRVGVDRKEETYESYENSYNILASFVKKRKEKEDVALRSLDREFYDDFEIFLRTDREMKPKTVHEHLYRLKKMTKRAVSQGTLRRDPYGKLHPELPRRKSRHLKLEDLKKLMETPVGKPNLQRVRDWFLFATFTGLSYADLKRLSEKDITQSDDGTYWIHIRRQKTETPSAIRLLNVPLQIIEKYRHERKSDRIFNLYCRGYLIKLTRELGRTYGFDMTFHKARHNFGTHITLSLGVPIETVSRMMGHKSISTTQIYAKVTDRKVDEDMKRLKEQTKGRKINLYEEDEPETADIITVNG >NZ_CP012801.1|WP_007559043.1|99400_99766_+|hypothetical-protein MTMTTREPISIENGRVEIHTPENRVWLTRHQIADLFGVFVPAVGSNIRSILKSGILREERVYRRERNRDGGIVELYSLEMIAALAFRLKSGNAEAFRRWLVRRATTTAVVWQLPGMNTILN >NZ_CP012801.1|WP_004295430.1|99799_100111_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSHYFIDKHDPRVADLFRRLEKAGKALDKLESSGGRTLKGERFVTDEELSRLLKISRRTLQEYRTARIIPYYLIQGKVLYMESEIQKFLEDSRKKCIGGQEWV >NZ_CP012801.1|WP_004319131.1|100107_100401_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MEIISMDVKAFDALAGHVEAIERKAEALCRRQEDVSLKKWLDNQDVCDVLGISKRTLQTYREKGLLPFSRIRHKIFYKPEDVGKLLQSSHYPNTAAL >NZ_CP012801.1|WP_004319132.1|100944_101196_+|hypothetical-protein MRNEEKNKWKQKSSNLPLGIKAKVGLAVKVGAVALGFHVWGIDFIWVVLGFTFCYDILRGIFSCLVSLVALIGFFYFLFTHIF >NZ_CP012801.1|WP_029427939.1|101208_102201_+|hypothetical-protein MTKYISLFGATTTDTQVQVVKKNQVIIGIGAGASRKRYVVYKVEHTARGYVYHMVNTETKEISQTDILRPLSQTFGIGRYYDDVNPEFMDAFEVALLVRQAEEQATAQAIAAAKEKAEHDRIAEIGAQRLRRIMPEGVQGVIIAELNETEYTDPSYECSTTRSVRTVILGFSATSRNGFGELRKAAANFPQTAHLSEYDPKNEHRYPVFTLGKSPKYGWSVCKLTHYTREGYIDRLAYIAGNEENICLPEPKDEKRAERTETSVQGGFIIVDYSEKAIVVFGDTKPVKDALHALGGRFNARLTHDGQKRAGWIFQKTKEDEVRRLLGKDE >NZ_CP012801.1|WP_004319134.1|102201_102657_+|PcfK-like-family-protein MLNTGRLAAPQYQKIMAQGTDYFKLTIQNYLDARAREDELFAPRYANPKKNIDDCCTFIINQVRQSGCNGFADEEIYSMALHYYDEEDIDIGKPVSCKVVVNHTVELTEEEKAEARRNAIRKAESEAYAKLAKAKSKPKKIEDNKLMPSLF >NZ_CP012801.1|WP_009123635.1|102659_103943_+|PcfJ-domain-containing-protein MKPRTKFQQSVVAASKHLPPLTPAQIEWGYKNCIEHIGRRTPKGLITCTECGHTWQSENGELTDNLLGCECPHCHTTLKVETTLRRKFNDYEYLCIVTRCKGFQVLRFVYIECWAKVGQTPVYTHIEAVQRWIAPDGRSATFARLRPMGFFVHGWSWSSALELRAENDGKYNITPTRIYPRQRLIPELRRSGYGKQLPDVTPFDLIHLLLSENKAETLLKAGQTALVRFFARSSRNIADYWPAIRIAIRNGYAIGKPTEWCDYIDLLRFFGKDLHNAHFVCPADLPAAHDLYMAKKRRHMQMERRQEERRKALEQEASFVEAKGRFFGVEFSDGEICIKVLDSVEAIRQEGEAMHHCVFTNEYYLKADSLILSATIDGKRIETIEVSLKRMEVVQSRGVCNKNTPYHGQILKLMKGNMSLIRKRMTA |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012801_1 | 1.1|92192|19|NZ_CP012801|CRISPRCasFinder | 92192-92210 | 19 | NZ_CP012801.1 | 92162-92180 | 1 | 0.947 |
1. spacer 1.1|92192|19|NZ_CP012801|CRISPRCasFinder matches to position: 92162-92180, mismatch: 1, identity: 0.947
tggcaaccgtggtggtggc CRISPR spacer tggtaaccgtggtggtggc Protospacer ***.***************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012801_1 | 1.1|92192|19|NZ_CP012801|CRISPRCasFinder | 92192-92210 | 19 | MF472895 | Mycobacterium phage Kimona, complete genome | 31602-31620 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|92192|19|NZ_CP012801|CRISPRCasFinder matches to MF472895 (Mycobacterium phage Kimona, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
tggcaaccgtggtggtggc CRISPR spacer tggcaaccgtggtggtggc Protospacer *******************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
5118 : 34139
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012801|5118:34139|DBSCAN-SWA TATGGTAAAGTTTAATATGCCCGATGGATTATCGGATGAAACGCAAAAATTTATGCGGGATGTAGTCAAGGAACTAAATAAAAGAAAGATTATACAAAGCATTGATCTGGGAGCACTCCGAATGCTCGCTACCAGTTACGAGATGTACTTACAGGCTACGGATATTTTGCTTGCTGATGGCCCTGTTGTTATGATTAAATATGAAAGGGCTGCCAATCCCGCACAGAATATTGCTACTAAAAATTATGCCCAAGTCATGAAGATCATGACAGAATATGGCCTGACCATTAAAAGCCGGGGAAATATCAAGGAAATGAAATCAGATAAGGAAGAAGAATCTCCATTGGACAGGTTTATCAAAAAGGCTCCGGGAAAAAAGAGATGAAAGGCTATTATCAATATGCTGCTGATGTACGCGACGGTAAAGTGGTAGTAGGTGAATTCATTAAGCTGGCCGTAGAACGTTTCTATTCCTTATTTGACCGTGATGATATCGAATTCCGTGAAGAATGTGCAGATTACGCTATTGAATTTATTGCCTTACTCCGCCATTATACGGGACGCCATGCCGGTATGTCTTTCGAATTATTACCATGGCAGAAGTTTGCAGTGGCTAGCATTTACGGATTCTATAAAAAAGATGAGGATGGGACCTGGTGTCGACTAATTTCATTTGTGTACATAGAGATGGCCCGCAAAAATGGCAAGTCCGCTTTTGCTGCTGCTCTTTGTCTTTATCATCTTATTGCTGACGGTGAATCCGCGGCCGAAGTATATTTGGCCGCCAATTCCAAAGACCAGGCTAAGGTCAGTTTCAAGATGTGTCGCAACTTTGTCTCCGGACTTGATCCAAAGCATAAATATCTGGACTCATTTCGTGACCAGATCAATTTCGATAAGACTCTATCTTTTTTGAAAGTTCTGGCAGCTGATTCATCCAAACTGGACGGTCCGAACCCTTCCATGTTCTTGCTTGACGAGTATCATGCCGCAAAGAATTCAGGTCTAAAGGATGTATTACAATCCGGACAGGGTATGCGGGACGATCCAATGGGCGTTATAATTACTACAGCAGGCTTTGATAAGTTAGGACCATGTTATCAGTTCAGGGACATGTGTACAGAAATTCTAAAAGGCCTAAAAGAAGACGATACCATATTCGCATTGATATACTCGCTGGATGAAGGGGATGACTGGAAAGATGAAAAGAACTGGGCCAAAAGCAACCCGAACCTTGGAGTAACGGTCAAGGCAAAGTATCTGCGTGAACAGGTACGTAAAGCTATGAATTCGCCATCCGAAGAGGTCGGCATCAAAACCAAGAACATCAATATGTGGTGCGATGCCGAGACGGTTTGGATACCTGAACACTATATTTTGAACTCGTCTGCCAACATTGATTTTGATGATTTCATAAACAAGGACTGTTACATGGGTATTGACTTATCAAGTACCAGTGACTTAACCTGCGCTGCATTCATGTTCCCAACTGAAGAAAAGTATTATTTCAAGGTTAAATACTACCTGCCGGAAGTCGCGCTTCAGGAGAAGCGTTTCAAGGAACTTTATGGGGAATGGCGCAGGCAGGGATTGATAACAATCACTCCGGGAAACGTGACTGACTATGACTATATCCTCAATGACATTATGGATATCCGGGATAAGGTTTATATCCAAAAGATTGCTTACGATAGCTGGAATGCCACCCAATTTACCATCAATGCTGAGGAAAAGGGTTTGCCTATGGAACCTTTTAGCCAGGCTCTTGGGAATTTTAACCGGCCTACCAAAGAGATGGAGCGTCTTCTGCTTTCCGGGAAAGCCGTGATAGATAATAATGTGATAAACCGGCATTGCTTCCGCAATGTAGTAATGGCCAGGGACAGAAACGGCAACACCAAGCCATCTAAGCAGTTTGAAGAAAAGAAGATAGATGGTGTGATCGGTATGCTGGAAGCATTGGGTGGATATCTGACATCACCACGCTACGGAGAATTTTATTAAAATGTCCGACACTTTTTTGGTTGGTGTAGAAAAGTGTGATATGAACATATTCGGATACAATTTGAAATAAGAAAAGCTTCAAAACAGGAAACATCCCGTATTCCTGCGTGGAGCTACTCCGGTGGCCACGCTCCCTTGCTGAGCCGTAGCAAACCTATGCTGTTGTCAACAGTTTACCGCTGTGTAGACCTCATATCTGATAGTGTGGCGGTGCTTCCACTTAAGACTTATGAACTTGACAGGGATGGATTCAAACGGGAATATAAGGAACATCCGGCTTATCAAGTACTGGACTTGGAACCTAATGAAGATATGACAAGGTTTGTGTTCTTCAAGACACTTATGGCTTCTGTTTTATTAACAGGAAATGGATATGCATATATTGAGAGAGATAGTAATTTGGCCGTTTCTCAACTTATTTATATGCCGACATCCCATGTCTCTGTAGTCTGGGTTACTGACGGCAAAGGCATTATGCGAAAACGCTATCAGATTACGGGGTTTAAAGAGCTTGTCGAACCGAGAGATATGATCCATGTTCTCAATTTCTCATACGATGGCATTATAGGTGTTTCCACTCTTACCCATGCCCGACAGACTCTTAATATCGCCACGAGTTCGGAAGAACACGCTGTGGGATTTTTCAAGAATGGGGGAATGTCCGGAGTCCTGACAGTCGAAGGCGCCCGTCTCGATAAAACTCAAAAGGATCAGATATACCAAACCTGGGAGGAACGAATCATTAACCACCCCAATGGTATTGCAGTGCTGGAAGCTAATATGAAATACCAGCCTATTACTATTAATCCCAAGGACGCCCAGCTGCTTGAGTCAAGGCAGTTCAATGTAGTTGATCTTTGCCGCTTTTTTTCTGTATCTCCAGTGAAAGCATTCGACCTGAGTAAATCAAGTTATTCTACTGTTGAGGCTACGCAGCTCCAATATCTGACGGATACCGCATTGGCCGTGATAACAAAGATTGAGCAGGAAATCAACAGAAAAGTATTCTTACCGGCAGAGCGAGGCAGGGTACTTGCTGAATTCGATACGTCTGCCATTCTACGTACGGATAAGAGTGCACAGGCTGCCTATTGGAGGGATTTGTCTGTCATCGGTGCGGCAACGCCGAACGAGGTACGTCGTGAAAACAATCTTCCAAAAATTGAAAATGGTGACAAGGCATTCGTACAGGTGAATGTGCAGACCTTAGATAACGCAGTTAAAGAAAATCTTGCAAAAAATGAAGAAAATTCAAAAGTGTCCGACAAATCTGTGGTTAGTGAGTAAAAGCTAAGATTATGGACGAAAAAAGAGAAATCAGAAACACGGCTTTTCAGGTGCAAGTAACCGGAGAAGAAGAGGAAAAACGGACCGTAGAGGGCTATGCCTTACTGTTTGGGGTATCTTCTGACGGTTTGTCCTTTGAGGAGGTGATTGATCGAGGAGCTTTAGATGGAGTCATTGAAAAAAGTGATGTGTTTGCATTACTGAATCATAACCAAAACCGGGAGTACTTGCCCGGTGTACAAATGGAAACGGATCACTGGCGTTATCAGTCGATAGCAAAGGACTTAAGTATCGTTTTGAGGCACCTAAGACAGCACTTGGAGATGAACTGCTGGAAAATATCCGCCGGGGAGAGATTAGCGAGAGTTCTTTCTGCTTTGATGTGGAGAAAGACACTTGGGAAAAGAAAAGTGATGGTGTATGGAAACGGACAATCTCTAAGATAGGGAATCTATACGACATTGCTCCTGTGTACAATGCCGCATATAGTAAGACTTCGGTGTATATGCGTGGTAAGGAACAGGCTGAGGAAGAATTTGCCCGTCAAAACAACGAAAATTTGGAAGAGTATTACTCAAATATTGAAAAATCATTAAACATTTAAATGTTATGGCTAAAGAAAAAAGTATCACAGAGTTGAAGGATGAGAAGAAACAGCTTTCCACTCGTTCAAAAACGATTCTTGAAACTGCTAAAGGAGAAAAACGCCTGTTAACAACTGAGGAAAATGAAGAATTGGGAGCTAACCAGGTACGTATGGCAGAAATTAATCTTGAGATTGAGGAACACGAAGACATGAATCGCCGGCAAGGCCGTCGACACCAGCCGCAAGGAGGCAAATTCTCATTGCGTCGTGCTATTGCCAACATGGTGGACGGAAACCAGCAAAATGATGTGGATGCCGGTGTTATCGATGTGGCTACTACACTGCATAACCAGTCAGGTGCCCAGATGGCCGATAAACGTAGTATCGTAGTGCCGGTAAACATGGAAAACCGTGCAGCATTTACCGCTGCAACGGAAGCTGCTACAGGTGTTATTATTGACGAGGAACAACAGGAAATGTTGTTGCCGTTACAATCGGCACTGGTCCTGGCGCGTGCCGGTGCACGTTTCATGACTGGTCTGCAAGGCAACATTTACTGGCCGTCATTCTCCGGTGCGAATGTATTTTGGGAAGATGAAAACGCAGAAGCTAAGGATGGCGCCGGGAAATTCTCTAAAGGTAATGTGTTCAAACCACTACGATTGACTGCTTATGTCGACATTTCCAAACAGTTACTTGTGCAGGAGAATGCTTCTGTAGAAGCATATATCCGTCAGGCTATCGCTGTAGCCATCGCGCAGAAGATAGAGCAGACAGCTTTCAGCAAGAATACCGGTGTGGATAATACGCCTGACGGTATGTTCCACACCCTTGATGCAAATATCAAAGGTGATATGACATGGGCACAGATCGTTGCGATGGAAACTAACGCGGATACTCGGAATGCATTGTTCGGTAGCTTGTCTTACATTCTGCACCCGTCACTTGTTGGTAAGGCAAAAACGAAAGTTAAAGATGCATCCGGTGCCGGAGGCTTTATCTTTACAGGTAATGGCGATGGCCAATTGAATGGTTACAAAGCGCTGCGGACAAACAACCTGCCGAAAGAGCTTGGTGAAGGTGCTGATGAATTCGGTATTGTTTTTGGCAACTGGGCAGACTA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29 | environmental_Halophage(16.67%) | terminase,head,integrase,capsid,portal,tail | attL 31116:31132|attR 43368:43384 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
786898 : 794745
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012801|786898:794745|DBSCAN-SWA 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11 | Bacteroides_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
5084218 : 5139649
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012801|5084218:5139649|DBSCAN-SWA 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MIENQKYWFAARTRDKQEFAVRKSLDKFKAEEGLDLDYYLPTRTVVSQLKYRRKRTEVPVIRNLIFIYATKQTACDLSNVYGVRLYYMKDLFTHSMLVVPNKQMEDFIFIMDLNPDGVSFDSEPFAIGNKVKVIKGDFSGIEGEIATQANKTYVVIRIKDVLVASIKVPKSYLKLIN |
50 | Ostreococcus_lucimarinus_virus(12.5%) | protease,integrase,tail | attL 5138570:5138590|attR 5139993:5140013 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
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NZ_CP012801.1|WP_004319134.1|102201_102657_+|PcfK-like-family-protein |
102201_102657_+
Protein sequences of NZ_CP012801.1|WP_004319134.1|102201_102657_+|PcfK-like-family-protein>NZ_CP012801.1|WP_004319134.1|102201_102657_+|PcfK-like-family-protein MLNTGRLAAPQYQKIMAQGTDYFKLTIQNYLDARAREDELFAPRYANPKKNIDDCCTFIINQVRQSGCNGFADEEIYSMALHYYDEEDIDIGKPVSCKVVVNHTVELTEEEKAEARRNAIRKAESEAYAKLAKAKSKPKKIEDNKLMPSLF |
151 aa aa |
40
gnl|BL_ORD_ID|40 information
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NA | NA | No | NA |