Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013134 | Rickettsia rhipicephali strain HJ#5 plasmid pHJ51, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP013133 | Rickettsia rhipicephali strain HJ#5, complete genome | 0 crisprs | cas3,PD-DExK,RT | 0 | 0 | 2 | 0 |
| NZ_CP013135 | Rickettsia rhipicephali strain HJ#5 plasmid pHJ52 sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
1. NZ_CP013133
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
616083 : 690981
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013133|616083:690981|DBSCAN-SWA AATGAAAAAAACTATTCTTTCCGGTGTGCAAGCAACCGGTGCTTTACACCTCGGTAACTATCTTGGTGCAATTAAAAACTGGGTTAAAATGCAGGAAGAATATAATTGTTTTTTCTTCTTAGCAGATTTGCATGCTATCACGGTTGATATTAAGCCATCAGAACTTAACAATTCAATTATGGAGGTGCTTGCTGTTTATTTAGCAGCAGGGCTTAACCCCAACAAAGTAACGATTTTTGCCCAAAGTATGGTGAAAGAGCATACTGAACTTGCTTGGCTACTAAATTGTGTTACACCGCTTGGATGGTTAAAGCGCATGACGCAATTTAAAGATAAAGCAGGTAGTGATCAAGAAAAGGCTTGTCTGGGGTTATTTTCCTATCCGGTACTTATGGCAGCGGATATCTTAATATATAAAGCCGATATAGTGCCTGTAGGTGAGGATCAGAAGCAGCATTTAGAGCTAACAAGAGATATTGCAGGGGTAATAAATAGAAAATTTAACAAAGAAATTCTAAAAGTTCCTGAGGTTTTAATTAGTGAAACAGGCACAAGAATCATGAGCTTACGGGATGGATTAAAGAAAATGAGTAAATCTGATATTTCGGATTTTTCCCGTATCAATTTAAAAGATGATAACGATCTTATTCATCAAAAAATAAAAAAAGCCAAAACCGATCACTTAAGTTTTGTTAGCTATGATAAAGAAACAAGACCGGAAATTAGTAATTTATTAGATATTTATAGAAGTTTATCTGAAGAAAGCTTGGAAAAAATAATCGGTAATTATCAAAACCAAGGCTTCGCAAAATTTAAAGAAGATTTGGCAGAAATTATTATTACAAATCTACAACCGATACGTGATAAATATTTAGAATTAATGAATGATAAAGAATATTTATTAAAAATACTGCACAAAGGAGCAGAAAAAGCAAGCATTAGAGTTTCTGAAACGGTTAACGAAGTGAAAGAACAATTCGGATTTGTAATTTAAATTCATATATTGCAAGATTTCCCTTGAAATATATAAGATTATTTGGTATGAATCTTCTTGGATAGGTGGCCGAGCGGTTTAAGGCACTAGTCTTGAAAACTGGCGTACGGGCAACCGTACCGTGGGTTCGAATCCCACCCTATCCGCCAGCTCAGTTTATAGTATTATGTCCTTTTATTTTCTTTATAGTGCTTAGTATATTTATCTAGTAAAATCCTAATCATTTTTTGATAAGGGGCATGTGCAGTTGCTGCTTATGATTTAAAAAATTCTACGCTCTCTTTACTTAAAGAAATGGTGAATCATCTTTTAATAAAAGTTCTCTAGGGTGCGGCAAGAAATCTTTTACTATTTTTACTTCCCCTATTTCCCCATCAATGTATTTTATTCTCTTGCTCATAAATTCTCTTACCTTTATGCCAGTATCCTACTCCAAAAATTCTTATATAATTATCTCGGAACGTAAAACGGACTGTTAAAATATTACCATTAAAACTGTACCTAAAATATCTTTTTTCTGTAATACTTATGGTCTACATCTTGAAGTATTATCCTTTTGATATCTAGAAAAGCTCTTTGAGCTTCATAAAAGCTTACGTTATGCTTACCAATATTAATTTTATTTTTTTTCTTCATCCTATTCAAAAGAAGAATGCATTTTTAGCCTTTAATCGATTAATTTAATAATACTTAGCTCTATACTAAATGTCCATATATTTATATGGGTAATAAACCATACTGTTTTCAGTTTTAAATTAAAATTTAAGAAAAAATTTATTAATTATTTTATCGCCATATTTCATTATTCCAAAGAGTATCTAAAAATTCTTGAATAGGCCAAATGGTAATTTTTTTATTTTCTAAATTAATTATACGTTTTGTTTTTTCAAAAGATATAACATGTAATTTAAAATCACTATCTTTACTAAACTCTAATAGACCTTTTAAATGATTTTTTTGTATAGAAGAAGCAATTTTAACTTCAAATGCATTATTTTGAAATATAAAATCAACCTCATATCCTTCTTTAGTACGCCAAAAAAATAACTCATCTCTTTTGTCGTTTAAATATTTATAAGCTATTAATTCTAAGAATACATAATGCTCAAAAGATTTACCAGCATCAAACCCTGTCATTTCCTGATATTCATATTTCCTTAGGTAATTGCTAAGTGCGGTATCGAAAAGGTAAAATTTAGGCATTTCCGTAATAATTTGCCTTTTACTACGTGATCTTCTATACGGATAAAGATGATATCCTAAATACATATCTTCTAATATTTCAAGATATGTTCTAACAGTTTTTGCATCAACACCGCAATCTCTTGCTATATTACTATAATTTATCATCTCACCGTTTGAAATGCCTATAATCTCTAGAAACATTGCAAATGCTTCGCGTTTTCTTAAATTTGCTTCAAACTGTACTTCAGGTAAAATATAGTCATATAAATAGGACGCAAGATATTTATGAATCTTTTTTGATGCAATATAATGATTAGGTATTAAGTAGTCCATGATTAAAAATTTTATGCCAATCAAGCTCTTTTATCTCAGAATAGCATAGCGGCAAAAACATATATCTCCAAGCTCTTCCGCCAAGTAAATTGCTACCTGTTGATTTTAAGCGCCTAGCACTGGAGCCACAAAGGATAAATTGTAAAGATTTATTAGATTCTGTTAAATAATGAATCTCTAACAGTAAGGGAATTTTTTGCACCTCATCAATAATAATATTTGAGATGCCGTCTTTTGACTTAAGCTCTTCTCTTAAACGTTCAGGATTTTGAAAGTAAACTTTATAGATATCAGCTTGTAATAAATCTATATATAAACTATCCGGAAAACGTTGTTTCAGATATGTTGACTTACCAGTTTTACGTGCTCCTCACAAAAAACAGGACTGTCCTTTTGGTAACTCTAAGTCTAAATATCTATTTGTCTAGTTGATTTAAGAGGTTATCTGTAAATAAATTGTAATTAGCAAGTAAAGAGCTTTTTTAGCAAAAATTGATAAGATTTTTGATAGGATGTTATTCATATTTCAAAAAAATCTTATAATTTGCAGCAAAAAAGAATTGGATTATCGATTAAAATTTATTTACAGATAGCTTCCAACATCATTTTAGCAGCTTTTATGCCTGCTTCTGTTGAAGTTTTTATATTGGTAGTTTCGGTATGGAAAGTTATTTTACTGCCGTCAAGGTTACCGAGCATAAAATCGGTTTGTATATTAGACATCTTTCCAAACTCTACTTCTAGTGGGAATTTGTACGTCAGTTCGGTACTCGCATCTGTGCGATCGCTTTTGTACGCTGCGGTGGCAAGTGCTTCCGTGTTTCCTTCAAATGCCTTCCTATCCCTATAAGCGAGTTTGGAAAGATGTCTAGGATCTGCATCTAGATATTGTGAATAAGCAGCAATCGGGGTGCGGCAATTAGCATCTAGATACTCTAAAAATGCTCTTTCGGGTTTTATTAGTTCAAAAGTGGGAAGATGATTAATTTGGTTGCATATCTTAAGCATAGCATTATCGTCTTTTCTAATCTCAACTGCAATGACTCCCTGCCCTATACATGGTAACATCTGTGAATACTCTATCAAATGGCAATACTCCGGATTAAACGCTTCTAACCTTTTAAGACCTGTATATGCTAAAATTGTTGCGTCAACTTCGCCGGTCATTAGCTTTTTTATTCTTGAATCAACATTCCCCCTAAAAACCGTTACCTTTAAATCCGGTCTTATTTTTTGGATAAATGCTTTTCTTCGTACTGCCGAGCTACCTATTACGGCATTTTGCGGCATCTCTTCTATAGATTTATATTTTAGACAAACAAAAACATCTCTGGGATCTTCACGCTCTAAAACAGCAGCTATTACTAGCGGTTCAGGTATTCTACCCGGTACATCTTTTAAAGAATGAACAGCTAAGTCAATTTTTTTATCAAGCAAGGCTTGCTCTATTTCCTTTAAAAATAAGGCTTTACCGCCTATATCATATAATGGTTTATTTTGGATTAAATCCCCGCTAGTAATAATCGGCACTATTTCACAATTAATATCAGGAAAAAATTGTTTGATTTGCTGAATAACTAAATTAGTGTGTATTAAAGCAAGTGGACTTTTTCTTGTACCTATTCTGATAGAATTTGTCATTTGTTTTCTACTATTGCAAAAGGGCTAGTAAAACTTAAAACATTACTGTTTATAATTGCTTCATGATTCATAATAACCGGATGATTTACTTCTCCATGCCCTATTCCTGCTGCTTTATAAGTTCCAATATTTTGAATATGATTTAAACAAAAACTTTTTATAGCTTGTTCTACAAACTCATCCCCTTTAGTAAAATCACCAAAGATTATTGCCTGTATGCATTCAAATATACCGGTATTTTTTAATTGAACTAGATTACGATGTACGGCATAGGCTTTTTCATTAACGTCTTCAAGCAATGGAATTTTATTGTCATCCCCGTGAAAACGGGGATCCAGTATTATTTTTTCTGGATTCCCGCTTCCGCGGGAATGACATAAAGAAGCATAGGAATGAGAATGAATTTGCAAACCAGTACTAATCAATTTAGTTAAAACCGTTAAATTTCCGCCTGTTATTGTACCTGTTATATTTTCCTCACTAATTTTCTTTATAGGTATAAGTTGTATTTCACTCTTTTCTCCTTTAAGAACATTTATTATAGGCATAATATCCTGATTAGTAGGCGGTAGTAACGAATTTAACACTGAACCGTGAATAGTTGGGATATTATAATGGTTATTTAGTAATAAATGCAAAACGGTAATATCGCTATAGCCTATCAGGACTTTATTCCCTTTTTGTTCTATATTAAAACAATCTTCTACAAATTCACTGCATCCATATCCGCCGCGAAAAGCCCAAATTATTTTAACTTGTTCATTTTCCATATCTTCTTTAAACATTCTCAACCTTTCCTCTTTAGAAGCAGCGAAAAAAGGCAATTCATCACCTGAAAAAATCTTAT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57 | Wolbachia_phage(20.0%) | tRNA,transposase,integrase | attL 660355:660375|attR 707548:707568 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
725984 : 762808
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013133|725984:762808|DBSCAN-SWA 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29 | Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage(33.33%) | transposase,integrase | attL 743722:743737|attR 767091:767106 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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