Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013341 | Nitrosomonas ureae strain Nm10 chromosome, complete genome | 4 crisprs | csa3,cas2,cas6,csx1,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,PD-DExK,DEDDh,cas1,DinG,cas5,cas8c,cas7,cas4,cas3 | 0 | 6 | 10 | 0 |
1. NZ_CP013341
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013341_1 | 773885-775124 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013341_1
|
17 spacers
spacers of NZ_CP013341_1
>1.1|773922|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCCTTTGCATCGTACCAGTTAATATATATTC >1.2|773991|35|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAACTAATTCAGTTAGTTTGATTATTTTGTAAA >1.3|774063|34|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTTACTGCTTTACTGCTTTACTGCTTTACTTAA >1.4|774134|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCTTTACTGCTTTACTTAATAATTTCTAAT >1.5|774203|34|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCTAAAGCAATAAGGATATCCTGCTCTTTTGAA >1.6|774274|34|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAGTGTATAAAAGTAGCATCTTTTATATTATG >1.7|774345|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATTTTCCAATAGTAACAGCCATTTTTAAATT >1.8|774414|35|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATTCATCTTGAGCGAGTGATATTTTCCCACGTA >1.9|774486|35|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACGCTCCTGCATTAAGTACTAACCTGAACGTTG >1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCATCATCTAAGTAACCTTCTGTATGTGGTGA >1.11|774627|35|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTCACTGCCCTTAAAATTCGTGAAATTTTTGGC >1.12|774699|35|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAATATAAAACATTATAGTTCTTATAGCCTTGGG >1.13|774771|34|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACAAAATACTTCTACTTTAAATCCTTCTACTT >1.14|774842|35|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGGATGCAGTTAAACAGTTTTATACTTCCGAGCT >1.15|774914|33|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAATTAATTAGTGATTTAAACATGCTTAGAT >1.16|774984|35|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGCAGCGGATCGTCGGGGATTATCCAGTAAGCGTT >1.17|775056|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTCGGATCATCACACCAAGCTTTGATAGCT |
csx1,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013341_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013341_1 >merge|NZ_CP013341|1|773885-775124|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACTTCCTTTGCATCGTACCAGTTAATATATATTCGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACAAAAACTAATTCAGTTAGTTTGATTATTTTGTAAAGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACCTTTACTGCTTTACTGCTTTACTGCTTTACTTAAGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACCTGCTTTACTGCTTTACTTAATAATTTCTAATGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACTTCTAAAGCAATAAGGATATCCTGCTCTTTTGAAGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACGCAAGTGTATAAAAGTAGCATCTTTTATATTATGGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACCATTTTCCAATAGTAACAGCCATTTTTAAATTGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACTAATTCATCTTGAGCGAGTGATATTTTCCCACGTAGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACTTACGCTCCTGCATTAAGTACTAACCTGAACGTTGGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACTCATCATCTAAGTAACCTTCTGTATGTGGTGAGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACTTTTCACTGCCCTTAAAATTCGTGAAATTTTTGGCGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACACAATATAAAACATTATAGTTCTTATAGCCTTGGGGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACAAACAAAATACTTCTACTTTAAATCCTTCTACTTGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACGCGGATGCAGTTAAACAGTTTTATACTTCCGAGCTGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACAAAAATTAATTAGTGATTTAAACATGCTTAGATGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACCGCAGCGGATCGTCGGGGATTATCCAGTAAGCGTTGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGACAACTCGGATCATCACACCAAGCTTTGATAGCTGTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAT >NZ_CP013341|1|1|773885-775124|PILER-CR GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTCCTTTGCATCGTACCAGTTAATATATATTC GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AAAAACTAATTCAGTTAGTTTGATTATTTTGTAAA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CTTTACTGCTTTACTGCTTTACTGCTTTACTTAA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CTGCTTTACTGCTTTACTTAATAATTTCTAAT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTCTAAAGCAATAAGGATATCCTGCTCTTTTGAA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC GCAAGTGTATAAAAGTAGCATCTTTTATATTATG GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CATTTTCCAATAGTAACAGCCATTTTTAAATT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TAATTCATCTTGAGCGAGTGATATTTTCCCACGTA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTACGCTCCTGCATTAAGTACTAACCTGAACGTTG GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TCATCATCTAAGTAACCTTCTGTATGTGGTGA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTTTCACTGCCCTTAAAATTCGTGAAATTTTTGGC GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC ACAATATAAAACATTATAGTTCTTATAGCCTTGGG GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AAACAAAATACTTCTACTTTAAATCCTTCTACTT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC GCGGATGCAGTTAAACAGTTTTATACTTCCGAGCT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AAAAATTAATTAGTGATTTAAACATGCTTAGAT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CGCAGCGGATCGTCGGGGATTATCCAGTAAGCGTT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AACTCGGATCATCACACCAAGCTTTGATAGCT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAT >NZ_CP013341|1|1|773885-775124|CRISPRCasFinder GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTCCTTTGCATCGTACCAGTTAATATATATTC GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AAAAACTAATTCAGTTAGTTTGATTATTTTGTAAA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CTTTACTGCTTTACTGCTTTACTGCTTTACTTAA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CTGCTTTACTGCTTTACTTAATAATTTCTAAT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTCTAAAGCAATAAGGATATCCTGCTCTTTTGAA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC GCAAGTGTATAAAAGTAGCATCTTTTATATTATG GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CATTTTCCAATAGTAACAGCCATTTTTAAATT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TAATTCATCTTGAGCGAGTGATATTTTCCCACGTA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTACGCTCCTGCATTAAGTACTAACCTGAACGTTG GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TCATCATCTAAGTAACCTTCTGTATGTGGTGA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTTTCACTGCCCTTAAAATTCGTGAAATTTTTGGC GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC ACAATATAAAACATTATAGTTCTTATAGCCTTGGG GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AAACAAAATACTTCTACTTTAAATCCTTCTACTT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC GCGGATGCAGTTAAACAGTTTTATACTTCCGAGCT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AAAAATTAATTAGTGATTTAAACATGCTTAGAT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CGCAGCGGATCGTCGGGGATTATCCAGTAAGCGTT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AACTCGGATCATCACACCAAGCTTTGATAGCT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAT >NZ_CP013341|1|1|773885-775124|CRT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTCCTTTGCATCGTACCAGTTAATATATATTC GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AAAAACTAATTCAGTTAGTTTGATTATTTTGTAAA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CTTTACTGCTTTACTGCTTTACTGCTTTACTTAA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CTGCTTTACTGCTTTACTTAATAATTTCTAAT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTCTAAAGCAATAAGGATATCCTGCTCTTTTGAA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC GCAAGTGTATAAAAGTAGCATCTTTTATATTATG GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CATTTTCCAATAGTAACAGCCATTTTTAAATT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TAATTCATCTTGAGCGAGTGATATTTTCCCACGTA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTACGCTCCTGCATTAAGTACTAACCTGAACGTTG GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TCATCATCTAAGTAACCTTCTGTATGTGGTGA GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC TTTTCACTGCCCTTAAAATTCGTGAAATTTTTGGC GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC ACAATATAAAACATTATAGTTCTTATAGCCTTGGG GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AAACAAAATACTTCTACTTTAAATCCTTCTACTT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC GCGGATGCAGTTAAACAGTTTTATACTTCCGAGCT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AAAAATTAATTAGTGATTTAAACATGCTTAGAT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC CGCAGCGGATCGTCGGGGATTATCCAGTAAGCGTT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAC AACTCGGATCATCACACCAAGCTTTGATAGCT GTTTGAACTAAAGACCTGATTAAGAAGGGATTAAGAT
>NZ_CP013341.1|WP_082632993.1|772530_773811_+|DUF1887-family-protein MAAHLCLAGKSIYTHASGRNRKVGHQNLTITAPGRLSRLNRQPLSAANLMKLNTHLILVSAQPIPSITPMLDDAVKPKKVVMLVSPDMQERARALENIFKPRGIGIESYAIADPWNAELISDKVLDILCHYPDGGIALNATGGTKLMSIAACEAFRSANAPIYYVHPRYDRLLWLSPKLPPHELADRLKLKDYLMAYGADLVDIPAGMQSVPPAIQELTGELLAGIDRYADELGTLNYLAYQSDNAQLSAKIGHSRQSRPVLWELLELFEAAGICCLEHRLIRFSDPQMRFIANGGWLEMHTYAACLQLKQKCGIQDVACNIVIQRHPAGKTAVKNEIDVGLIHANRLHLIECKTRHFEKDADMLYKLDSLRDLMGGLQGRTMLVSFNNLGKASRARARELNVSLCCKTELKHLQQHLTNWLTTRG >NZ_CP013341.1|WP_062558113.1|771382_772648_+|TIGR02710-family-CRISPR-associated-protein MTQILICTVGGSHQPIVSAINDLRPDFVVFICTDKDPATNQPGSRVQIEGKGNCIKAHNSDANPTLPNIPTQTGLASEQYETVLTLSDNLDRTYLDCIAAIDGISRRFPYARITADYTGGTKSMSAGLVMAVVESPGIDLQLVTGSRADLIKVQDGSQFSDKADCERVRYRRLTEPYRRAWQRYAYSEAVAGLVGLKPPGGLRNEYTRFRELSRAFAEWDNFNHMQALSILQSYAPSLPDHLKQYIGNARQLNDKSTDKCDAARLFDLYRNAERRAAQGRYDDAVARIYRLIEWSAQWLLKVQAGIETGDVKPEQIPDHLTLTQNRKGQWQAGLFNAWQLVKHYTKGPAAIFISEQENILRSHIEARNTSILAHGFTPIQNNQWQPIYAWLESQFIPMLLEETAKSGIKTLPSQLPDDYPG >NZ_CP013341.1|WP_062558112.1|769592_771308_+|hypothetical-protein MSDFLQHYTLTYTPLSPIHIGTGDSYEPTNYVIDNGTLYEFDTGGALTALTETDRNELNRIVNARASEDMLKAVQRFFYERRDRLKPWAINTMPVLDGVANYYAERIGQTDNHKGGGNQKFNKLEIDRTAYNPINRHPVLFGSSIKGAIRTALLSQVNGKQALSQQDAEKFNLENLSPYERKQREREQKNIFPRLNQTLFQFSAGKFELDPLRLLQFADAAWNDCDGLPTAQILVSVNRKKELKRDKHGNEIFGQAEKNENLCKLLESVPAWRYRAFSGALNLQTTVGVMSKEKLPNENLLFNIRQIAAYCNDHYKPILESEIEVMRERGFLDSEWDKNMQALLSNLSAKSISERVFLLRVGRHSGAEAVTIEGVRHIKIMKGNPEYQSKTKTLWLAANDPKQRTGLFPFGWLLVEVHPSNTPVNDWTELAELCRSQHAQAMQWAEKRAAERLATEQHREQQAIERQRLLEEEQARIAEQQAEEQRRAALTPQQLQIETLRQQFEQKQANKVREQISGQLYGDLRRLIEQAADWPDEARLELSAVAKNIVQFIGAADNKKAKELIKTLLMH >NZ_CP013341.1|WP_062558111.1|768645_769596_+|hypothetical-protein MKTYRITLNLESAFATPLKGDALFGQLCWAIRNRLGENRLTGLLDGYTRGQPFAVVSDAFPQDYLPLPKLPGRFYDKIDGIDRKAIKKRCWLPEEAASVPVTQWLVQAKTVSDVIGQVKNLSEKHPQPHNTINRQTHTTGEGGFAPYSIEQEWFVPDIAWSIYLLLDTDRLSLDDCRQCLEDIGNIGFGRDASIGLGKFSVIGFAETTLPGQAGANACLTLAPCAPQGLGFDGKNSFYQLFTRFGRHGDIAVHQEGKPFKNPVLLAQTAAVFAAQPSASGFIGQGIGGNGKLSKTLSATVHQGYAPGIAIHLQERI >NZ_CP013341.1|WP_062558110.1|768491_768671_+|hypothetical-protein MKPIRKIYQDAPDSIDIPEELRHQPVEIIIWPLTQAEWSELNLSTRHTGKRDENLSNHA >NZ_CP013341.1|WP_062558109.1|767773_768481_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MQLTKIQKLTGQIELLSGLHIGSGNTEIHIGGTDNPVIKNPITQEPYIPGSSIKGKMRSLLEWHLGVVEITQGQPLSFKHLNDINNGVKEKAENLIRLFGGAPDSNNNDDLVKKIGPSRLSFWDCPLDPKWVTEMNEKNLLLTETKMENMIDRIRGVAEHPRNTERVPATAKFDFNLTIRVHDNEDLLDTVLQGLKLLELTGLGGSGSRGYGKIRFTGLKLDDQSVQDKLETINP >NZ_CP013341.1|WP_082632992.1|767316_767763_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MTYQSQSRTGQNRGGYEDRQPTPIDTSKVLFKNIASDLFDDVARKAAEKIAENKNSNKPTQLRRFYDEIVMWENKASLNPSKFPEYLPFVRMINAKAAYARGRKLIDDNYVKLIADCLKQVETTNDLRHFKLFMEAFMGFYKEKRPKD >NZ_CP013341.1|WP_062558108.1|764561_767258_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MSMSSLLEQSSRIALAAFLHDLGKFAERARISNNQEAIEANKHLYCPRQKKFADDKNVRFTHVHAAYTGLAMDLIEDYLPDLTGTDFAPFGSWKTKDADDSFINAAAMHHKPTTFLQWIIATADRVASGFDREEFEQYNQAEEGTATGKNHYTARQLTLFEQIHKVDLDKQQFAYRYPLKPLSPDSIFPVSAGNYEHNDKDKAQQEYLALWNGFTQALQKIPQSHRNNWSLWLDHFETVWGVYTHAIPSATAFNVRPDVSLYDHSRVTAALATALWRFHHEKNQTDDNTRKQLSEQAESWDEKKFLLIQGDFFGIQDFIFASSGETSKRAAKLLRGRSFYVSLLTECAALKMLDALDLPATSQVINAAGKFMIVAPNTDQTKAKLQQVQNELDQWFLSHSFGQASVGLAWTETCCNDFRRKAGNQTNERSPYRQLIDKLFAQMEIKKCQRFDLCNSERIIFDGFLDEFEHGECKIDGRSPAKVQKDGEWISKLANDQIDVGSWLVKSNKQRILITREQLREDKKLSTLGLTIFGYAISFTDDESAKGEFGAEARNGNLLRVWDFSLPKSPDQELWNGYARRNINAYVPTASEKDLLEKQWKKYIGIDEELEIGAAKTLNHLACKDRRPHPDKEDRWIGISALSTLKGDVDNLGNIFQSGLGDDASFSKTAALSRQLNNFFTVYLPWLCQREYPDSYTVFAGGDDFFLIGPWLSQIKLANAMRQAFQDYVAHNTGVHFSAGISTTKPGLPINQIGGLAEQALEEAKAHNSKKADKPPKNAVTCFGRTVSWVEFQELLTQRLPRLQSLVEENTLSTGYVYGLLHLIDMAEKVSKKPENALWHSYFAYRTARMLERNKKLNKDQRKDRQDELAEEIASAGIGMHGGNYRVALFCHLYQQRD >NZ_CP013341.1|WP_062558107.1|763455_764565_+|TIGR02584-family-CRISPR-associated-protein MDTQSILLAVTGLTPQVVTETLYALNDQGEQLPSAVHILTTAEGIQHARLTLINDGWLARFCRDYHLKQPEFTVASIHVLRQANGEPLADIRTQADNRAMADAITEWIRTFTADPHTDLHVSIAGGRKTMGFYAGYALSLYGRARDRLSHVLVSPDYESHPQFYYPTPYSHVIYGNDPSRKPLDTQNAEVMLADIAFVRLRHGLDQALLEGKASFSQSVAAAQQALGPPHLIINPKPRQFIAHGKPVKLSPADLAFYLWLLDRQQTGLPAPSCPSDGAPDEMYASQFLQNYRRINGELGGADRTIDTLKDGMSKTFFEQRKSRINKMLTQTLAYAAQPYLIAPEGKRPRTQYRITLEHNQIEIQQEIIG >NZ_CP013341.1|WP_062558106.1|762475_763426_+|CRISPR-system-precrRNA-processing-endoribonuclease-RAMP-protein-Cas6 MSAINSPSIPLMTYRFYFDTHQPVRLPDYPGSAWRGAFGHALKKTVCVIRNTPCHQCLLKHACAYSYIFETPPPSNTEKMRKYNSTPHPFVFRFAEKPTTEEYSLDMNLFGHGQRFFPYIIHAMHMAGQDGIGGNRQPFRLNRIDAIDFQGPPITVYQEAELRNQSPLQSPSPPQMPEKINITFHSPVRIKQDNKNLGDNHFNFGALFGSLLRRISMICYFHTDTPLETDFAELAAAARNIQFSTQNLHWYDWTRYSSRQQTEMQMGGVLGSVSLDMQGLGDFWPYLWLGQWTHVGKGTSMGMGAYTIDFTSLLDT >NZ_CP013341.1|WP_062558115.1|776003_776519_+|DUF2141-domain-containing-protein MKFKTLHLLFISPKKPVWALVLGFLICAQAYSAESLSIRPQEIPDTCNADLAQIRVTVHGIEPRGVLNVELYDDPEHFLFKKGRKRKVRTPAEEGSQQVCINLEQPGTYAVAAYHDLDGNRKLKRQWNLLPREPFGLSNNPEQHMGFPKFSDSAFTATGLGADIVINLKQP >NZ_CP013341.1|WP_062558116.1|776530_777358_+|alpha/beta-hydrolase MRMLLNLFILLAITYLALVLLVYLGQSRLVFFPDKQLSNTPAMFGLDYSSVSIATADGETLHGWWVPVPDAKGTVLFFHGNAGNISHRINYLTMFRRLGYNTLLFDYRGYGQSSGTPSESGTYLDAQAAWQHLIVTQKIAPEQMILFGESLGGPIAAWLAARENPGLLVLASTFTSVSDLATQIYPFLPVRWISRFEYNTLESLQSVTCPVFIAHSPQDEIVPFQHGQRLYQTVSGPKQFLTLQGGHNNGFIFMQPAWQKALRTFMDEHLASPIN >NZ_CP013341.1|WP_062558117.1|777393_777924_+|CinA-family-protein MTRKTLDFDDDQALLDLAACVGESLRQHGWMLVTAESCTGGWVGQAVTAVAGSSTWYDRGFITYSNRSKCEMLGVQPALLDQFGAVSPQTAQAMVAGALTRSHAQIGLSITGIAGPDGGTAEKPVGMVCFAWASKDGLVQQETRHFKGSRESIRYSAVTTALQGILHLLDNAIVMA >NZ_CP013341.1|WP_062558118.1|778021_782512_-|hypothetical-protein MTTIRVDDVFVDESNATANFTVWLDVANAAPVTVNYRTDLNTATYAGNQDFVFTSGTLTFNPGEISKTVSVSITNNAIAEAIENFELNLSSPSANATIADASALGTIFDNDAPSGTPVVSINDFTVDEATKEATFVIALDRPSTSVVSMNYATQNGTALAGSDFVAKSGSLSFSPGQTAKTVKVSLLNDIAAESSEAFNLVLSALTNATTLDAIGTAIIFENDAAAVSNSRISVDDIFVDESQAYADFLVRLDAPNINPVTVNYRTDLNTATYGGNQDFVFTSGTLNFAPGEMVKTVRVTMSNGSIAEAIENFEFNLSSPSANATIVDASALGTIIDNDAPSGTPVVSINDFTVDEATKEATFVIALDRPSTSVVSMNYATQNGTALAGSDFVATNGSLKFAPGETAKTVKVTLVNNAAFEASEAFNLVLSALTNATTLDAIGTAIIFENDAAAVSNSRISVDDIFVDESQAYADFLVRLDAPNINPVTVNYRTDLNTATYGGNQDFVFTSGTLNFAPGEMVKTVRVTMSNGSIAEAIENFEFNLSSPSANATIVDASALGTIIDNDAPSGTPVVSINDFTVDEATKEATFVIALDRPSTSVVSMNYATQNGTALAGSDFVATNGSLKFAPGETAKTVKVTLVNNAAFEASEAFNLVLSALTNATTLDAIGTAIIFENDAAAVSNSRISVDDIFVDESQAYADFLVRLDAPNINPVTVNYRTDLNTATYGGNQDFVFTSGTLNFAPGEMVKTVRVTMSNGSIAEAIENFEFNLSSPSANATIADASALGTIIDNDAPSGTPVVSINDFTVDEATKEATFVIALDRPSTSVVSMNYATQNGTALAGSDFVATNGSLKFAPGETAKTVKVTLVNNAAFEASEAFNLVLSALTNATTLDAIGTAIIFENDAAAVSNSRISVDDIFVDESQAYADFLVRLDAPNINPVTVNYRTDLNTATYGGNQDFVFTSGTLNFAPGEMVKTVRVTMSNGSIAEAIENFEFNLSSPSANATISDPTALGTIIDNDATSGVPVARITDTVVDETDQTATVTVILDKPSVNGTKVNVAGQDVTANNGGDFRNLHIGTVAFAPGETAKTVTFGLLNDNAVEDAELFDVMLSSPVGLTVGDGRGHVIIAGSDRAALASPVINVANVAASEDKGFIDFQVTLAAPSVGGARVNYSTAAGTASSGTDYVHASGTLAFAPGEVSKIVRVALVNDLTVEALENFSFNLSGVLNATIGNASASAAIIDNESAAPAAPIAMAGTSGNDILQGTQFRDAFTGGAGNDTFNGGDGNDSMVGGGGNDTFLLENAGDTYSEAGGGGTDLAISYLPNHTLGANVENLLLAGTATTGIGNTLANTITGNGGNNTINGSSGNDILNGAAGSDNISGGTGSDFIVFNTALNAATNVDTLADFNLIDDTIRLENAIFTQFTATGAIPANTLVSGPGAVALDSNDFLIYNTTNGNLSYDADGNGAGAQVAFAILTGAPALTAADFVII >NZ_CP013341.1|WP_062560084.1|782899_783511_-|YqhA-family-protein MENNLPGRPIKRTHPIAQFLFLTRWLQLPLYLGLVLAQCIYVFHFWVELVDLIGAVMGNQSALQHILDTVTIKGAERPEKLTETAIMLVVLGLIDVVMISNLLIMVIIGGYETFVSRMNLEGHPDQPEWLSHVNASVLKVKLATAIIGISSIHLLKTFINASAYDEKTLIAQTGIHMAFLLSAMAIAYCDRLISQTGQQSGGH >NZ_CP013341.1|WP_143023473.1|783725_784376_-|hypothetical-protein MDLPKLLDLLHTRSLYFRRADGFSDRFEGALFPSLRKSLDEAFVQKLASDGADYFYRRAREGNYVSCWTIGATDNMALWQLYGGLKTSIAVTSTVDCLFECALFWNRSTHFHKVRYVDHRRVRNYVIGNYTDVLQYKSDAYKYEKELRVIVPQQEDGWEKNPIEVRLALPSVDTLVRGVIVAPEADSNFLEAVRELCKRYDLKAPVKRSRLSTYPK >NZ_CP013341.1|WP_062558120.1|784570_785458_-|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MAILINEKTKIIVQGFTGRIGTFHAQEMIDYGSNVVGGVTPGKGGQTHLGLPVFNTVKEAVEQVDAEASIVFVPPAFAADSIMEAADAGIKYCVSITDGIPTQDMMTVKNFLRRFPKTERMLLTGPNCAGTISPGRAMLGIMPGHIYIRGNIGVVGRSGTLGYEAADQMRLLGIGISTSVGIGGDPIPGSSHRDILERLEQDPETKVALMIGEIGGPQEVDAGKFAKEHMTKPLVAYIAGLTAPEGRRMGHAGAIISSAGESAAEKVAMLKELGVTICPTPSLMGQTVAEVLAKL >NZ_CP013341.1|WP_062558121.1|785467_786649_-|malate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQAKEILAEYGVKIAEGGLAYSVVEAVQRAREIEGDVWVVKAQIHSGARGKAGGIKVCRTHTEVEQAAEELIGKKLVTHQTGPAGKICSRIYVEAGTNISKEMYLSFMIDRASERVIMIGAAEGGMEIEKLAETNPEAIIKIYIEPAVGLQDFQARKMAFGLGIDPAQLNHAVKTIKGCYRALRDLDANILEINPLVITANNEIVALDAKMVFDENALFRRHKIAELRDNTQVDNREVAAAEAGLSYVGLDGDIGCMINGAGLAMATMDMIKLAGGEPANFLDVGGGASAERTEKAFRLVLADSGVKAMLVNIFAGINRCDWIAEGVVQAVKNIDMKIPLVVRLSGTNVEEGRSIIKNNGLPIITADTLAEAAEKVVRARNEVVAQKA >NZ_CP013341.1|WP_062558122.1|786748_787705_-|CoA-ester-lyase MSHTLYETTVQRVQRCELAVPGSNPGMFEKALNSGVDFVFLDLEDAVAPDDKVQARKNVIQALNDLDWKGHGITVSVRINGLDTQYMVRDVVDLVEQAGSKIDTLLIPKAGVYADVYMVEAMVTQLEKQQGLTNRIGLEALIETALGMANVEDIARHGATARLEALHFGVADYAASNRARTTNIGGLNPDYPGDQWHFAISRMIVACRAYGLRPIDGPFGDIKDPDGYALAAKRAAALGCEGKWAIHPTQIELANDVFTPPEREIEKAKRILAALKEAAAQGKGAAALDGRLIDAASERMANNVVKIADAIAAKNGRR >NZ_CP013341.1|WP_062558123.1|788105_789140_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-transferase-subunit-TsaD MLVLGIETSCDETGIALFDTERGLLSHALYSQVEMHSEYGGVVPELASRDHIRRVLPLIKQTLAAAKCDLHQINAIAYTQGPGLAGALLVGASIGAAMSFALKIPALGIHHLEGHLLSPLLSTPAPNFPFIALLVSGGHTQLMQVDAVGHYRLLGETVDDAAGEAFDKTAKLLELGYPGGAALSKLARRGRPGQFKLPRPMLNSGDLNFSFSGLKTAVLTLVNKQELTEQTRADIALAFQDAVVEVLTQKSLAALSQSGLTQLVVAGGVGANEQLRESLDYKAALKGAAVFYPELEFCTDNGAMIAFAGAMRLQAMPEKNWQPAGSFTVKARWDLEMLEKPEAN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013341_2 | 2722971-2723071 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013341_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013341_2
>2.1|2722994|55|NZ_CP013341|CRISPRCasFinder CGCATGCATATGGTTGATCTCATGTATGCACCGACGCAGTGGTTCAATGTCATGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013341_2
The CRISPR arrays of NZ_CP013341_2 >merge|NZ_CP013341|2|2722971-2723071|CRISPRCasFinder TTGTGCCGACATTCATGGATATGCGCATGCATATGGTTGATCTCATGTATGCACCGACGCAGTGGTTCAATGTCATGTTGATGCCGACATTCATGGATATG >NZ_CP013341|2|2|2722971-2723071|CRISPRCasFinder TTGTGCCGACATTCATGGATATG CGCATGCATATGGTTGATCTCATGTATGCACCGACGCAGTGGTTCAATGTCATGT TGATGCCGACATTCATGGATATG
>NZ_CP013341.1|WP_062559622.1|2720778_2721015_+|DUF4266-domain-containing-protein MIRRNNRVIIANCLILAVCAVLSGCKSVAPWERGNLAKMQMEIDPHPLQSEIQSHNYSSREAAPSHKSSSGGGGCGCY >NZ_CP013341.1|WP_062559621.1|2720238_2720739_+|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKKIKFSYFVIALPLLFASPSFAEHLERASSSCHLTTLDGQPTYDLQELKGKVVYMDFWASWCPPCIKSFPFLNQLEQDLKDEGLHVVGINLDEKVTDAQEFLAKNPVDFSIVADPSKQCAKVFELMAMPTSYLIDRNGNIRHVHQGFRSGESEELRALITQLLKE >NZ_CP013341.1|WP_062559620.1|2719753_2720200_+|hypothetical-protein MAQLFFQKALTIIFTLTALGVAGVSHAHDAGATMDPEGNIASFTGYAQVTCSSDTHRLVASVQDTSLPQANLFVNLQMIKGINAISTTDPVSGDGVSSPEVSIAGGGGAYLLLVNKTGPGPRSFIVSYHCMSINNEHTDTGIRVNQFQ >NZ_CP013341.1|WP_062559619.1|2718911_2719649_+|hypothetical-protein MASHNKIKFVAGTVIAAAISVIGQNVFAHTVLEVPFIAEGVRVTNNVVVGHGCGEINVIGTSVVFPDGVDSTITVDGQPHAGALTDFIQNWGNLNTKIYSKAVFTFQGEKTDANGNVSGFWAGGGDSLPHDMAGFIPFRTSAAIIEPTSCAASVKFHVSIVDICEITPVDGFSDETVNRWTLAGLGTPYDRPEDGAASLTITRSETNPLPDSCGGTGQVVEVKPSAAQINRDMPIIFNGSQVWPQ >NZ_CP013341.1|WP_062559618.1|2718044_2718404_+|hypothetical-protein MVISGCSVFMAAKQPEKKDIDLLKEGVTRTQLISEFGAPVISEYKNGKRFEIFKFVQGYSTGTKAGRAFLHGAANVATLGLWELVGTPTEITFSGDDMAFQVQYDESDVVEEVVIIKKE >NZ_CP013341.1|WP_062560208.1|2716011_2717673_-|alginate-export-family-protein MKFIWFFLHIVALSAFIEPIQAASSNPPLIEGGMDKSSVVRIAQTGIADLKTAADKSVDHSKSLPAIVPESKSDANKQLASYYRRSDGYATNPESDPPRYVRRLSDIGIPALSDLTWLDVGLEHRTRYEWRNNDIRRIEGGEDNPIFLRHRAWIGIRDILDPFRFAVEFQDSRVVNNKHAITDQERNEYDLLNAYGELFFKKGLGVDDRNQDRPIRFRVGRMAYETTDRRFIARNEWRNTTNTFEGFRLNLGRDVNDWELDLFGLQPVRRLQTKFDVANDHLWFFGAIGHWRKWSDIVTIQPYYMGQKQSADPNGFTATNQLDREIHMPGFRAYGKVGNFFDFDASYNHQLGYSGPLRQDAQGYTVEVGRTFEHPWKPRLTGFYGYASGDRDPNDGVDNRFDRFFGFARPWSADHYVVYENLKAPKIRFDLQPMQKIGFELTYAWYFLASKRDRMFDILDGNISNTIKDPGFNRDRTGQSGDYAGHSLEGRIRYQVTPKINAVIGYTHFTAEDFVKNRIAASPSCASGNIHPCVDHRSGNTDFLYFEVLISLL >NZ_CP013341.1|WP_143023452.1|2715680_2715962_+|hypothetical-protein MQPTVIINQHRNTALIVASSGKKLLVIKLSKGKLAVTSLSSTEIKDQGYIVSNYSPKLAAQSYLQHGAGVGERARKYLEKIAHSEFSDKLIFI >NZ_CP013341.1|WP_062559616.1|2713236_2715612_+|fatty-acid-cis/trans-isomerase MRMFRPCMYFVSLFFLLPACQINNTLFSSIAPAPTPIALPAPAENPVSYAEEIRPILEKKCVTCHSCYDAPCQLNLEGAEGLLRGAFRESIYGGARTEAMQPTRLGFDEQTISGWRERGFYSVLHAENKQSEALISSMISLAKQFPFPANSKLPDSIELGISRKNQCASSEKFTDYAHEYPLSGMPFAVTGLSDQEYSLLAGWVKQGAVIPDEPVILTSDEKKVIEEWEMFFNQNENRNKLVARWLFEHLFVASLYFPELEGAPRFFEILRSSTPSGTDIEPIVTVNPNDDPMGPFFYRLRPITGSIVHKRRIPYPLHQEKQQRINALFFNKPWPMGNLPGYSYTERANPFVTFVDIPAYARYQFMLDDAEYFVRTFIHGPVCRGQIATDVIRDHFWTLFQDPESDLFVTNTAYQREAIPLLAMPGQNDNLLKMGKNWLHYLKRHNDYQALRQNQYVSQQPQGASLAHIWDGAGKNKNALLTIFRHHNSASVVGGLVGDIPQTLWLMDYPLLERTYYELVVNFDVFGNVAHQLLTRLYFDVIRNGSEHNFMRLMPAGQREAILHDWYQDLGKLKFGIVYERIDDESPSAEIFTTENPKQELAHRILARFQSVNTMPSDPLNRCQNSNCSRPDEPQWVQSADAALSNLAARPAAGLSGIKQLPEVTFIRVTNEKNERTVYSLLRDRAHSNVAFILGEELRYQPEKDQLTIYPGITGSYPNFIFDVPVAQIGEFVTLLGNAEKMEHFEYIVETWGIRRTHPQFWEILHDFTAWQSERQPLIAGIFDINRYENF >NZ_CP013341.1|WP_062559615.1|2711957_2713073_+|alanine-dehydrogenase MRIGVPKEIKIHESRVGLTPTAVRELVAHGHQVMVQKNAGIQIDLDDGKYQSAGAEIVETPQEIYAQADLIVKVKEPQPNEISLLRQGQVLFTYLHLAPDPVQTQGLIDSGCIAVAYETVTDSFGGLPLLAPMSEVAGRMAIQAGAHALELDQGGRGMLLGGVSGVPAARVVVIGGGVVGTNAARIAMGVEAHVTVLDKSIHRLQQLDFQYGSRINTVFSTVDALEELVSSADLVIGAVLLPGGAAPKLVTHEMVKRMNRGAVLVDVAIDQGGCFETSKPTTLANPLFTVHGVVHYCVSNMPGAVAKTSTFALNNATLPFVAALANKGYRKALMEDAHLRNGLNVCQGRLTHEAVARDLKLEYTPATAVLD >NZ_CP013341.1|WP_062559614.1|2711195_2711936_+|SDR-family-oxidoreductase MHSLHGKVAIVTGSARGIGAEIALTLARAGAKVVVNYVENKMAADKVCAAIVKVGGECSAVQADVSDPAAVQKLFTAAAEQFNQIDILINNAGILLFKEISEIRNEEFERIVDINFKSVFYTLREAAAKLADHGRVVTISSTVTRLMLPKYGAYAATKAAVEQLTRIFAREAGKRGITANIVSPGPVDTELFRTGKTAADIARMSGMAALGGIGATDDIAQVVLFLASDEARWVTGQNIGVNGGII >NZ_CP013341.1|WP_062559623.1|2723864_2724731_+|FAD:protein-FMN-transferase MGSPCSIQLYAHHEKKVKRAAKSVMDDVYRLEAKYSRYRTDSFLSDINRIAKQGDRIRVDDETAGLLDYANTCYQQSDGLFDITSGILRRAWDFKSGDIPDPEIIQLLLNKIGWHKISWQRPVLRFMASDMEIDFGGVVKEYAVDRAASLCWDAGIHHGLVNLGGDIRVIGPHPDSSPWRIAIRHPRNPEGLLQTLLLHSGALASSGDYERCIILNGIRYGHVLNPKTGWPVQYMAAVSVLGEFCVVAGSASTIGMLKGEDGAEWLNTLGLPHLWVNVNGESGGSLMA >NZ_CP013341.1|WP_062559624.1|2724816_2726055_+|hypothetical-protein MTIGYFNLAILTSVATLFFCVSTAKAQPEECVDLTAPVTLIESNGLVCLQKIIVSDSFGDQLYKASLQWLGADNPNRFLLLNAEFDDVSETNSPTFSFLTGVLTLPKVDFPKLYGTERYTVSLTWVTDANDATVDAVSVFELNSVALYNNPDYVPNVTWKPYGMLFPEERRAADLLIRSIPYAQLTDAIYDFDNVVVGAWELIKSTGTNSGMDAGVYKNRDTGELALVFRGTETCDFPCSFKELEDTARDAIADLAIGTGTVSDQFKDAFRFAQDVMILHPDEKITVAGHSLGGGLAQAIGAALGLETFAFNSSPVPDHFFDTYPKSVTNEQLQELIYVIADVHDPVSNTDETGKIYLDSHHVTPLIQFNFELREILPTRNVDLEDLRFGRHSIARLTDNATSLMTIYQEGW >NZ_CP013341.1|WP_062559625.1|2726246_2727050_+|AmmeMemoRadiSam-system-protein-B MTTIRSPAVAGFFYPADEQQLRQDVQFLLEKADRHDLKPKALIVPHAGYQYSGAIAATAYASLRTAAANLQRVVLLGPAHRVAMHGLALPGADVFTTPLGDVNVDTDLVNAIAHLPQVSISRAAHALEHSLEVQLPFLQSVLNEFTFLPLAIGMASAEEVAEVLDYLWGDEETLIVISSDLSHFLPYATAQHIDIQTVQSILQLQQPIASDHACGSIAINGLIIAAQKHGLIPHLLDLRNSGDTTGTRDQVVGYAAIAFGQGSNHGA >NZ_CP013341.1|WP_062559626.1|2727039_2727630_+|AmmeMemoRadiSam-system-protein-A MVRDNDPQGRILLQIARTAIARALHVPCAAVAVEEHMSWLSKPGATFVTLIQYGELRGCAGSLKAYDPLLEDVSNNALLAALHDPRFLPLVKDELDTIKIEVSLLSQLQPLTFTSEADALAQLRPNVDGIVLEYELHRSTFLPQVWGDLPKPQKFLAKLKLKARLSEDFWSEKIQLSRYTVRKWREIDNVKECAHG >NZ_CP013341.1|WP_062559627.1|2727622_2728720_+|AmmeMemoRadiSam-system-radical-SAM-enzyme MDEPIGAMQQHPAKYWHLLDDGRIQCDLCPRDCKLHDGQRGACFVRGRSGAAMVLTTYGRSSGFCVDPIEKKPLNQFYPGSSILSFGTAGCNLACKFCQNWDISKSRNFDKLQDQASPEAIASYAKQYGCKSVAFTYNDPVIFAEYAMDVADACHTEGLKTVAVTAGYIHAQPRHDFFAKMDAANVDLKAFTEGFYVKQTGAHLQPVLDTLKYLRHETDVWLELTTLLIPGLNDSDQEIGAMSEWIIKELGTDVPLHFSAFHPDYKLRDIPQTPAETVIRARDIALNAGLNYVYTGNVHFIEGDTTFCPFCNGELIVRDWYEIKQYHLTSDGRCTHCNAAIAGHYDQFPGQFGRQRIPVRMGTMV >NZ_CP013341.1|WP_082633045.1|2728884_2729238_-|DUF2934-domain-containing-protein MSNMKCNQLICPLLRKIKENSHMSSKLNETVSKKSRTKLPKNEPNILANQITHKDQLMDREEAIATSAYYRAEKRGFSNNEADMVQDWLEAETEVDSVLELDDLSDAGFQFMIDETE >NZ_CP013341.1|WP_062559629.1|2729524_2729878_-|hypothetical-protein MKQLSIATQRNINYQLNRRKNNPQFYETGQLRRARMHAARLIETLDGKRLLTPFLRELLEASLTLETTNTRILAAYLKRSPATIRSEFQKICSTLGMYAEFSKDYQKQSSSMVKESA >NZ_CP013341.1|WP_062559630.1|2730104_2730554_-|CBS-domain-containing-protein MTIGEICNREVIVIQRDETAQEAAKLMRQFHVGAVIVIDKPNGRAVPVGMVTDRDLIVEIMATELDETVITVGDIMVPDIFTVKENTEMHEAIELMRRKTIRRLPVVDDAGELIGILTLDDALQWLSESLLDLAKLVKYEQKKEVRHRP >NZ_CP013341.1|WP_158441784.1|2731038_2731215_-|hypothetical-protein MSDSINNYDYGSLRQTHINVIIGSYSEFMAGLVELAMRSCHLLETQIILTNLIEIRRK >NZ_CP013341.1|WP_062559632.1|2731254_2731704_+|hypothetical-protein MYFDKIYKLQTGVSLKISTFALQELIANAITGQKFPELKSIRSTTDLHDYLSIIVCDGVEGLIDRRQRWLDHKIKTTLTAGHPVSFHSFCNLFWRNLDEDDPDGDEWHQLMASDQFYLQLTILLNKLRIVERSLLQRKDIASDLFLSST |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013341_3 | 2891513-2891939 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NZ_CP013341_3
|
6 spacers
spacers of NZ_CP013341_3
>3.1|2891545|38|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACTTTGCATGGCTTTCGCGCAGCTGACTTACCGCGA >3.2|2891615|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGGCGATCCTTGGTTGAGTCCTGCTGGTTC >3.3|2891679|33|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTGTTAACTTGGGTTCAAGGGGTGGGTATGA >3.4|2891744|33|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACCTCTTCGTATCGCTCATTTTATAGCTCAATG >3.5|2891809|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACACCTAAAATTTGATGAGATGAAGGTTATTC >3.6|2891873|35|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATACATCTATGAGTGAAATGGGGTCGCACTTTGG |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013341_3
The CRISPR arrays of NZ_CP013341_3 >merge|NZ_CP013341|3|2891513-2891939|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAACTAACTTTGCATGGCTTTCGCGCAGCTGACTTACCGCGAGTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAACATTGGCGATCCTTGGTTGAGTCCTGCTGGTTCGTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAACTGCTGTTAACTTGGGTTCAAGGGGTGGGTATGAGTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAACACCTCTTCGTATCGCTCATTTTATAGCTCAATGGTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAACACACCTAAAATTTGATGAGATGAAGGTTATTCGTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAACAATACATCTATGAGTGAAATGGGGTCGCACTTTGGGTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC >NZ_CP013341|3|2|2891513-2891939|PILER-CR GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC TAACTTTGCATGGCTTTCGCGCAGCTGACTTACCGCGA GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC ATTGGCGATCCTTGGTTGAGTCCTGCTGGTTC GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC TGCTGTTAACTTGGGTTCAAGGGGTGGGTATGA GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC ACCTCTTCGTATCGCTCATTTTATAGCTCAATG GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC ACACCTAAAATTTGATGAGATGAAGGTTATTC GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC AATACATCTATGAGTGAAATGGGGTCGCACTTTGG GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC >NZ_CP013341|3|3|2891513-2891939|CRISPRCasFinder GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC TAACTTTGCATGGCTTTCGCGCAGCTGACTTACCGCGA GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC ATTGGCGATCCTTGGTTGAGTCCTGCTGGTTC GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC TGCTGTTAACTTGGGTTCAAGGGGTGGGTATGA GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC ACCTCTTCGTATCGCTCATTTTATAGCTCAATG GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC ACACCTAAAATTTGATGAGATGAAGGTTATTC GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC AATACATCTATGAGTGAAATGGGGTCGCACTTTGG GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC >NZ_CP013341|3|2|2891513-2891939|CRT GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC TAACTTTGCATGGCTTTCGCGCAGCTGACTTACCGCGA GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC ATTGGCGATCCTTGGTTGAGTCCTGCTGGTTC GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC TGCTGTTAACTTGGGTTCAAGGGGTGGGTATGA GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC ACCTCTTCGTATCGCTCATTTTATAGCTCAATG GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC ACACCTAAAATTTGATGAGATGAAGGTTATTC GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC AATACATCTATGAGTGAAATGGGGTCGCACTTTGG GTCGCGCCCCGCGTGGGCGCGTGGATTGAAAC
>NZ_CP013341.1|WP_062559741.1|2891047_2891338_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMILVTYDVSFKTDTGPKRLRRIAKLCLNYGQRVQYSVFEIEVDMAQWTKLKNELIDAIDEEFDSLRFYYLGNNWERRVEHIGAKTVLDLNGLILL >NZ_CP013341.1|WP_062559740.1|2889997_2891032_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRPLRNVIYVQTQNAWLHKDNENLVLKVDKETKARVPIHKLQGLVCFGQVTISPYLMAHCAENGITITFLNMFGKYLARVEGPASGNVLLRRTQHITGHNVEKSVAIAQTMLTGKLYNQRYVIRRYLRDHSEKINDEKILIDLQVAEKRLTRCLTQLTDCKTIDTLMGREGEAAQVYFGVFNHLIRQADFEFDSRRRRPPTDPVNALLSFFYTLLTHDCRSALETTGLDPASGFLHQLRSGRPSLALDMAEEFRPMVDRFVLSLINKRQVVSKDFETWPNGSMTLKDEPRKTLLAAWQDRKQDNLFHPWFEETVPIGLLPWLQAQILARFLRGDCDSYVPFLWK >NZ_CP013341.1|WP_062559739.1|2889359_2889995_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MIKQVALEPIYLSRLQHYLYCSRQFALIELENIWIENQFTAEGQVLHQRVNQADQQKRGAVRTARALRLANAELRIEGVADVVEYHQQADGTEIPFPIEYKRGKPKAHRADEVQLCAQALCLEEMHGVAIPEGALFYGEVRRRHPVIFDAELRNLTLQTIIACRDIVQTNITPHAIYQARKCNGCSLIDQCHPKDFGKSASAWLAAQLKKD >NZ_CP013341.1|WP_062559738.1|2888152_2889139_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MTIQNRYEFVYLFDVSNGNPNGDPDAGNMPRLDPESSKGLVTDVCLKRKIRNFIELTHSNEPGYQLFIQEKAILNHQIERAYRESESVRKNLELWDQYQKDKKDKKKKAEEKTPQPDRHYEDIAQDWMCENFYDVRTFGAVMSTGSSSDSEDEDGEKKSKIVKRAGQVRGPIQLAFAKSIDPIIPLEISITRMAVTTEKESEEQSGGNRTMGRKHIVPYGLYRVHGFISAKLAEKTGFSETDLEKLWQALSLMFEHDRSAARGEMAARKLVVFKHNDALGNVPAHVLFDRVKVERIHGDTDTPASSFSDYKISVDKANLTDVTIDEKF >NZ_CP013341.1|WP_062559737.1|2886260_2888141_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MILSSLAQYYQRLADMPDAITGLARVPSYGFSDEKISYVLVLSRDGQLLDVQNHMDTSGKKPQPKLVSVPRPEKRTFGIKSNFLWDKTAYVLGVEGNKDKATAQQNPWIVAEKNFDAFKQLHLAALGDVDDAGLKALKVFLQNWHPEHFNQPPCSTEMIDTNLVFKLDGETQFLHQGTAAKNLWARMVAPEEIAVNGQCLLTGESLPIARLHPSIKGGYLTDYGGQSGGCSIVSFNKESFTSFGKEKGGNAPVSEWATFAYTTALNYLLRRKIDKDHSQGNCLSVGDSSTVFWAVASDGDIAHEEELVFANLLIPPSVDDGQETTQIAPLLIKIAQGRPLNEFAPNINPETRFFVLGLTPNVARLSIRYWLDTTFGYLANNICEHYHDLLINPLPWREPPSIWRLLIQTVAHRKNADGSIKKPEYKHVPPQLAGELMRAIITGQSYPRMLLAQLIQRIRSDGDISGIRVAMIKAIIQRDFRKGLIQEEVPMSLDLNITHIAYRLGRLFAAIERIQEAALGRDLNSTVTDKYYGTASTVPFSVFPRLLSGSQNHLTKLRKDKPGYAVNLKKDLAEIIAGIENSFPRHLSVEEQGRFAIGYYHQKQSYFESSKKTDAVADESNESTNN >NZ_CP013341.1|WP_062559736.1|2885580_2886264_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MAYGIKLHIWGDYACFTRPEMKVERVSYDVITPSAARGILDAIHWKPAIRWVIDKIHVLRPVRFESIRRNEVGSKISANKIKTAMRNQSTQDLYLVADDSKERQQRASTVLRNVAYIIEAHFELTDLASEEDNKGKHLDIFNRRARKGQCFQQPCMGVREFPAYFSLIEPEESLPESELTPEQLNRDLGWMLHDIDFANEMMPRFFKAELKSGVITVPDFYSDEVKA >NZ_CP013341.1|WP_062559735.1|2882461_2882710_-|type-II-toxin-antitoxin-system-ParD-family-antitoxin MATTSLSLGEHWEIFIKNEIASGRYGSASEVVREALRGMEERKSKLEALRIYLKEGVEQAERGEFVKDYSIDKIIEELDAKE >NZ_CP013341.1|WP_062559734.1|2882162_2882465_-|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MTFTIKITPRAQQDLKNIGRYTLQKWGKKKRDSYLRDLDRCFRWLAGNPKIGKHRIDIEEGYYCYLQGSHLIFYTIGESCIHIIGIPHQAMGVLNYFDPD >NZ_CP013341.1|WP_062559212.1|2881612_2882050_-|IS200/IS605-family-transposase MRDVVEKASHCGWQIHYHIVFPVKYRRGLLDDAVVKIIMMTAKAIEDRYDIEFEQIGCDEDHVHILCTAHPKIAPGQIVRVFKSITARELFKWKPDLKRDLWGGEFWTDGYYVATVGERADWGVVERYVKNQGKPKEELRQLELF >NZ_CP013341.1|WP_062560221.1|2877250_2880754_+|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MPTKPAFIHLRMHSEYSILDSTIRIHDVVKKAVADQMPGLALTDLANLFGLVKFYQTTYKNGIKPILGCDIWIANESDRSKPIRLLVLCQTHAGYLLLSRLLSRAYRENQFQNRAEIKESWLQPDDWGTEGLIALSGARVGDIGLSLLQNNILQAEIQIQKWANLFPDRFYLEIQRDGHANETMLVQHSLALARKFSLPIVATQAVQFLNAEDYQAHEARVCIAEGYILEDKRRQKSFTEQQYFKTQAEMTQLFADIPAALTNTIEIAKRCNLVLELGVNRLPLFPTPNNEGLDQYLRSQAEIGLIKRMTNLFPDTEVRNARIVQYQSRLEFEVNTIIQMGFAGYFLIVADFINWAKHNNVPVGPGRGSGAGSLVAYSLGITDLDPLRYDLLFERFLNPERISMPDFDIDFCQDRRELVIEYVKQRYGMGKVSQIATFGTMAAKAVIRDIGRVMDLPYNFVDQLAKLIPFEIGMTLKKARQLEPQLNQRAEEEEDVRNLLELAESLEGITRNVGMHAGGVLIASSEITDFCPIYCTESGDSIVSQLDKDDVEKIGLVKFDFLGLRTLTILDRAVGYIRQLHPNIDSHESRPFSLETLPLDDDATYALMRKGNAVGIFQFESRGMIDLLQKAKPDRFEDIIALVALYRPGPMDLIPEFIDRKHGRKQIEYLDPRLEPILGSTYGIMIYQEQVMQIAQVIGGYSLGSADLLRRAMGKKKVEEMAQQRDIFVSGAINNGLSEDKATELFGLMEKFAGYGFNKSHAAAYALIAFQTAYLKAHYPAEFMAACLSADMDDTDKVHIFVEDSIANGIIILPPDINLSDYRFIPVDSKNIRFGLGAVKGTGESAVNSIIAVRRQTGPFTDLFDFCSRVDRRIANRRVMESLIRVGAFDIINPNRASLMASVGLAIESAEQASRSSNQINLFGETSNDSQMQPQLIKAESWHDREKLHQEKIGLGYYFSGHPFNTYASELRHFIGTRLDRLNPQREPQLLAGIIHSIRIQMTRRGKMGVISLDDGKARIELVIFSELFDANRTWLKEDQLLIAEAKIGMRGYNGDEEDGLRITAERLYNLAGIRSRFAKQIKIYCSLLTLDQISGLKKLLIPFCTQTQKSIADFCPITVIYRNDIASGELDLGNDWRVHLHDDLLQSLNTHFKTENVEIVYSKNNK >NZ_CP013341.1|WP_062559742.1|2893333_2894683_+|signal-recognition-particle-protein MFDNLTHRLSGVIKTLRGETRLSENNIQDALREVRLALLEADVALPVVKDFIARVKEKAIGHEVMTSLTPGQALVGVVHQELIAIIGGEKADLNLATVPPAVILMAGLQGAGKTTSSGKLAKWLMENKKKKVLLVSCDIYRPAAIHQLELLANQVGADFFPVEEGQKPGEIGAAALDYARRHHHEVMIVDTAGRLGIDEAMMQEISELEALLRPIETLFVVDAMQGQDAVNTAKAFSDALPLTGVILTKLDGDARGGAALSVKHITGKPIKFAGIAEKLTGLEAFHPDRMASRILGMGDVLGLIEEAQRSADQQEAEKLIKKMKSGKAFDLDDFKAQFQQMRNMGGMSALMDKLPAQFSQAAQNVKVDDKIINRTEGIINSMTKQERAKPEILKASRKRRIAAGAGVSVQEVNRLLAQFEQARKMMKMMNKGGMAKMMRGIRGMLPRFH >NZ_CP013341.1|WP_062559743.1|2895969_2896419_-|dUTP-diphosphatase MKRIDIKILDDRLNEQFPAYATPGSAGLDLRACIEHPMTINPGETSLIPAGIAIHLADTGLAALILPRSGLGHKHGIVLGNLVGLIDSDFQGQILVSCWNRSPAAFYLNPLERIAQLVVVPVIQVAFNRVESFDYSHRGEDGFGSTGKH >NZ_CP013341.1|WP_062559744.1|2896405_2897632_-|bifunctional-phosphopantothenoylcysteine-decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine-ligase-CoaBC MKIGASTVSKKRLLLGVTGGVAAYKIAELARLLTQHGIDVQTIMTEAACRFMGPATFQSLTGNSVYTDLWKTNAAHNMAHIDLSRSADMILVAPASANFIGKLANGLADDLLSVLCIARDCPLMIAPAMNRQMWESPATRRNLSLLRQDEVKIIGPACGEQACGEIGMGRMAEVSVLVEAVQIAFQAGTLLQGKNILVTAGPTYEAIDAVRGITNNSSGKMGYAVAKAALEMGAKITLISGPTCLSPPTVDKFISVVSAEEMLHAVQAEVSQADIFISVAAVADYRAASIKEQKLKKLPANLLIELTPNPDILMTVSTLPNPPFCVGFAAETENLEKNAAAKRNKKKLPLLVANLAQDAIGSDENELILLDDEGKHVLPKAAKIEQARHLMMHIHSLYSKLKKNDEKN >NZ_CP013341.1|WP_062559745.1|2897831_2898506_+|JAB-domain-containing-protein MAITNWPISERPREKLLQKGASTLSDTELLAIFLRTGISGKSAVDLARELLLHFGSLTNVFAASQSNFCQLPGMGIAKYAQLQAVLEMARRTLDEELRCGNAMNSPKLVRDFLRLSLANKQHEVFIGIFLDAKNHAIATEELFSGTLTQASVYPREIIKRALYHNAAAIIFAHNHPSGIAEPSHADKVLTQSLKQALSLVDVKVLDHFIIGNGTALSFAEHDLI >NZ_CP013341.1|WP_062559746.1|2898563_2898800_+|50S-ribosomal-protein-L28 MARVCEVTGKKPMSGHNVSHANNKTKRRFLPNLQHRKFWVESESRWIKLRLTNAALRTIDKNGIDAVLAKMRSEGKNI >NZ_CP013341.1|WP_062559747.1|2898839_2898995_+|50S-ribosomal-protein-L33 MREKVKLESTAGTGHFYTTTKNKRAKPEKMEFMKFDPVVRKHVLYKETKLK >NZ_CP013341.1|WP_062559748.1|2899045_2900236_-|aminotransferase MIYDFLNLISGVVDMPWWGYIVITLIFTHITIAAITIYLHRHSAHRALELHAIPSHFFRFWLWLTSGMVTKEWTAIHRKHHAKCETKDDPHSPVIFGIEKVLAEGSELYRAEAKNAETLKRYGYGTPDDWMERNVYSRHSAKGVALMLIINVVLFGPIGITIWAVQMLWAPVFAAGVINGVGHYWGYRNFQAEDASKNIVPWGILIGGEELHNNHHAYATSARLSNKWYEFDIGWMYIRILEMLGLAKVKKIAPKLRIDQAKTQCDSDTLQAVISHRYEVLAKYTKSLKAIFAKEMIHLKEAAAHYGVDSSTLKRWVLADSKTLQDHEREKLTQVLSNAKTLDKVYTMREELAQIWQRSTATTEELVKQLEDWCRRAEESGIEVLRVFSQRLRCYA >NZ_CP013341.1|WP_062560222.1|2900546_2901101_-|pseudouridine-synthase MPRIILFNKPYGVICQFTPTDGHRSLQDFIPFSDFYPAGRLDADSEGLVLLTDNGKLQNKICSPKFKLPKTYWVQVEGKPDDVALNAIRRGIVLNDFKTKSAQVSVIDEPGFLWARKPPIRFRKNIPTTWLSLILKEGKNRQVRRMTAAVFFPTLRLIRYAIGLYTLRGMASGEWRMLADSDIR >NZ_CP013341.1|WP_062559749.1|2901139_2901592_-|histidine-phosphatase-family-protein MDLILWRHAEAEEGFPDAARKLTTEGLNQAKCMSDWLKSKLPKDTKVIVSPTQRTQQTAMALCSDFITEAAIGPGANVHDTLAVAGWPNFQGAVVIVGHQPTLRNVASYLIPTIPAELRVKKGSVWWIRYQKNKSGFEPVLHTVIYPEML >NZ_CP013341.1|WP_062559750.1|2901627_2901918_-|YggU-family-protein MSWYRYDGTNNLVLTLHIQTGAKITEAVGLLRGALKIRLAAAPVEGKANSTLIKFLAVQFDVPIGQVRLKQGGKSRHKVIVIHRSVHDPRVLFNIG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013341_4 | 2942511-2942613 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013341_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013341_4
>4.1|2942548|29|NZ_CP013341|CRISPRCasFinder TTTTTGCTCTGTGTGACGACGGAACCTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013341_4
The CRISPR arrays of NZ_CP013341_4 >merge|NZ_CP013341|4|2942511-2942613|CRISPRCasFinder GCAATGGTCAATGTTCATTTATGAGTCAGAGAAAATATTTTTGCTCTGTGTGACGACGGAACCTTGGCAATGGTCAATGTTCATTTATGAGTCAGAGAAAATA >NZ_CP013341|4|4|2942511-2942613|CRISPRCasFinder GCAATGGTCAATGTTCATTTATGAGTCAGAGAAAATA TTTTTGCTCTGTGTGACGACGGAACCTTG GCAATGGTCAATGTTCATTTATGAGTCAGAGAAAATA
>NZ_CP013341.1|WP_062559783.1|2941157_2942411_-|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase MLIPERDITIGMYVFAIFLLLLILSNSALANPRYSSIVIDADTGAVLHESSADASRYPASLTKMMTLYMLFEAMEQRKMTVDTRMPVSTHAAAMPQTNIGLRAGDSISVRDAIPALIVRSANDVAAVVAEALGRSEANFGRMMTDKARQLGMRSTTFRNASGLPNLEQKTTARDMVILSTRLMKDFPKYYHYFSTQSFSYKGITYNSHNRMVRNTSGVDGLKTGFIRASGFNVATSAKRGNRRVVAVVMGGNTAAARDQHMAQLIDRSFNQGNRSIQVASNSQNARAVAVTVVKVNAPTPALKPYPEQPKASESIVTQQYVVPPVSAQPVQLQKVALQLQTNDDWAVQIGSYHEPSRAYANAQAAARWIPGEIVVTEVEISNRRLYRARLVGLQENQARSACQSLTRQGIECLVVRS >NZ_CP013341.1|WP_062559782.1|2940378_2941056_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MPSVIEVDHLNFSFGSGALTQPVLKNVTISIEEGEIVLITGPSGSGKTTFLTIIGGLRQAFHGSVKVLGHQFVNSNEQIKVKTRQQIGYIFQQHNLLKSLTALQNVCMTLEINAVTTEQQRSSRAAEMLIAVGLGDRLDYKPDQLSGGQRQRVSIARALVGQPKIILADEPTASLDKQSGHEAVSLLKRLAKESHTTILLVTHDYRILDIADRVVELEDGMIKQE >NZ_CP013341.1|WP_062560226.1|2939245_2940379_+|FtsX-like-permease-family-protein MAWRQLVFDRTKLVAATCGVLFACVLVFMQLGFKDSLYASAASAPVKLDGDLFLMHKQSEAMWRPVQFKRSELMRALGNPAVAEAYPLYLGLAPFKNIQTQTKRTLMVYGFDPDSQMFNVDAVRNKHAELRLKDTVLFDEYSRPEFGPVRQLLDAGENVTEINDYKIIIVGLFQLGVSFAADGNVITSDLNFMRIFPRRNLDDIDMGVIRLNSGASVKSVQAELKNHLNEFVNVFTYEELLHYEKDYWANTAPIGFIFGFGTVMGWVVGLVIVYQILFTDIANHRNEFATLKAMGYKHGYFVRVVFASSFFLAVLGFIPGYLLSLGLYNLAESQMYMPMPMLISKIITVFMFILSMCFMAGLLAIRKLKDANPADMF >NZ_CP013341.1|WP_062559781.1|2938313_2939213_+|HlyD-family-efflux-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MLLRILRSLFGMSILAVLCSSVFAGTSCRLDTQQGIGALGRIEPRSRVIKVSHNAGPEGARVEQLLFQEADSVKAGDKLAILSEYFKRKAEVETAKMRVKVLEAERVVEQTTLAFNQREHARHQSLESGSAVSISLADAKQLAFEQSAANLKRLSAQIAHAKSEQKIAEAELENTLIYAPITGTIVKIFARPGERIGDNGLLQLADLSNIDVVAEVYESELPQIKIGQQGCITASGFKRSYNAQVRELGFQVRKNDLNDTDPLADRDNRIIEVRLTLEREAATDLRHQIFRQVKVRIIP >NZ_CP013341.1|WP_062559780.1|2937419_2938085_+|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MQQTIRSFVLRQGRLSNAQRRACETLLPRHGIPFSESLLDLNHIFGRQAPKILEIGFGMGESTATIAKTHPQNDYLGIEVHAPGVGSLLNQIEQLGLTNLRIIQHDAVTVLHHMLPAGCLDGIHIFFPDPWPKVRHHKRRLIQPALVTRLCTHLKSGGYMHVATDWEDYAVQILHVLRQESQLSNTAVNYAPRPEYRPLTKFEQRGLKLGHDVWDLIFLRN >NZ_CP013341.1|WP_062559779.1|2936571_2937387_+|thiazole-synthase MDNLIISGKTYTSRLLVGTGKYKDFSETRAAVEASGAEIITVAIRRTNIGQNADEPNLLEVLPPSRYTLLPNTAGCYTLDDAVRTLRLARELLDGHSLVKLEVLGDPNTLYPNMVETLKAAEILIKEDFQVMVYTSDDPIIAKQLEDMGCVAVMPLASLIGSGMGILNPWNLQIIIDNAKIPVLVDAGVGTASDATIAMELGCDGVLMNTAIAAAKNPVLMASAMRKAVEAGREAYLAGRMAKKLYSASPSSPTEGVIAQADKITKKPANS >NZ_CP013341.1|WP_062560225.1|2936326_2936530_+|sulfur-carrier-protein-ThiS MIQLTINGQPQQFESPINVTQLVDHLALQGKRIAIERNGEIIPRSQFSEQMLVHGDHLEVVIAVGGG >NZ_CP013341.1|WP_062559778.1|2934670_2936104_+|matrixin-family-metalloprotease MAFSDPITSPLASNTYINGLLWGSHWNDPIAGTRLKVYIAGQGENEVFDFGGTAVTAHTVPQEVTAFLESMQFIENICNIDFMMANSQADADIIVGVVGNSDAGGALGTSVPPGEDIGPVVNRQGAVILNRDAYYSTDYSSLQPGGYDFTTFIHEFGHAVGLKHTHDAGGGDRPNFPGVTAPFGDYGDFNLNQGLYTMMSYNDGWPAGPDGPLDPASISGYGYEGTPMAFDIAALQFLYGSNTNFQTGNNVYTLGSTNAPGTFYSAIWDTKGIDTIRNPSAIDSTIDLRAATLLHATGGGGYLSSVDGINGGFTIAKGVNLENAIGGNGADTMIGNWAANTLTGNAGNDRINGLGGADKIIGGTGADMLAGGGGADDFTYVAVNDSRGQPDIIKDFVHALDDIDVAAIDANGADAGNPAFVFRGNAAFTGAGAEVRFVKNATNNVTNVLFDIDGNKSADMTIRLTGLITLDAGDFIL >NZ_CP013341.1|WP_062559776.1|2932252_2932762_+|IS30-family-transposase MKKAGHSQSEIATVIDRSVSTISRELSRNRGARGYRPKQAHNEAVERKAINARAIDDATWQFRQEKLMLQWSPDQISNYADISIETVYQRVYADKRNGGILWKNLRCQKQRRKRYGKTDRRGIIPNRQSIEQRPAIVDARSRIGDWEADTIIGKNHRQAEVVPQNWTGC >NZ_CP013341.1|WP_062559775.1|2931512_2931986_+|hypothetical-protein MTSIPDQKIKKDNEILLTIIIFLIFVLGTLSLYFYKDVKSDIDKLQQTIPAETDTSNYLRTIDNNVIKSLAKLNEAIHLINKHQLSIENINPTLDTLKSNNQEFINQLNASLDKLASELKEETNKNVIDENLNKFVEQITEEIRRNSIQEQEHSNPE >NZ_CP013341.1|WP_062559784.1|2943025_2943991_+|methyltransferase-domain-containing-protein MQNKFESLELGQFIPLHYHHNMLNDTIRMKGFKEAINLVVKPGAKVLELGGGTGVQSFFAAQKAQKVFCVERNPELVSAARSFLAQNINGDKVEVIQADALYYLPPEPVDVVICEMLHTGLLREKQIPVIDSFKKRYLEKFGGPLPIFIPEASIQAIQPLEQNFQFEGFYAPTILFQDPCVIQERSKNLADPEVFQLLSYAEPFDQTCHWDGEITIAKDGQFNALRVITKNILAINMLTCSTIDWHTQYIIFPLSTPFTVCAGDQISLRFKYQGGAPLNALSDSLEIYQISKQVPIFQLALETLSYSSDYQSITPSQAGGI >NZ_CP013341.1|WP_062559785.1|2944248_2945391_-|DUF1207-domain-containing-protein MINLRFIALSGVMLFNSAAAQVTLPSDAYIAGYATSMLRYRLNLDIPSLIVQNGIILLPKGSLNISDQSHVVQVLSEIPGVNEVKIAEVTTEVPVATAPSQPIQQSAEQTVAITNTDPTLLPTGLLPSGHLFKPLLADPRWAHFSASYRHFVNDNFEGRNIGAVSFGETIPFYRGNFGRSLAQWEAGLQAGVFSDFNLGAPSADLINTDFIASAYSSIRAKQFSAFGRIYHQSSHLGDEFLLRRVNSTFERINLSYEGADLRLSYEFPYGIRLYGGGGGLFHKEPSSLKVWMTQYGVEFRSPWRLDFAPVRPILAADFKNFQENNWSTDVSARAGVEFDNLQVLGRKLQILLEYFNGNSPSGQFLRNNVEYIGVGAHYHF >NZ_CP013341.1|WP_062559786.1|2945399_2945873_-|BON-domain-containing-protein MRTTDKDIQGILIKRVIVIVGLFAIFGLASCQQEGPAEKIGEKIDRSVENVEQKMEQITEQVGKEINEARKTITNESEESNQYLDDSVITVNVQTAIVNDPLLEVSDIKVTTVNGTVQLSGMVDSQELIDRAAEVAYAQKDVKSVENNLIVKVVLPE >NZ_CP013341.1|WP_062559787.1|2946113_2947862_+|gamma-glutamyltransferase MSWLGIKPLFFSVLCIGSLLAHASNPIIVPEVASGFSAIKSANYSKAMAVTANPHASRAAVKILRQGGSAVDAAIAAQLVLGLVEPQSSGIGGGAFMLHWQARSGELVVWDGRETAPASVSEAYYINTDGQPMDFFSAVIGGHSVGVPGVLAMLEASHKEHGKLPWANLFKPAIILAEQGFAISERLHILLSRMPRVAVNPQIREYFFHRSETGWQPKTEGSVLQNLAYAQTLRRLAALGVTDFYQGELAKQIVQAVNNDPNRPGRLSLPDMKAYQPKKREALCGQFRIYRICGVPPPSSGGTTVLAILGLLEAYESRYGEHADWHHSFIEASKLAFADRNAYVGDPAFVSVPTQGMIDRDYLHQRAMLIRNNSVLSNVNAGLPPGAEPRLSSNLPEFPSTTHLSIVDAEGNVVSMTSSIETAFGSRIMIGGFLLNNQLTDFSFMPRTADGMPVANRVQSGKRPRSSMSPTIVFKDGRALLVIGSPGGTRIINYVAGSLYRILAKQLPLAEAIADGHIIAMGYGVELESGRVDESTLIRLRERGHNIVLRDQTSGLHVIRIDEKAGLEGGADPRREGEISGF >NZ_CP013341.1|WP_062559788.1|2948249_2949665_+|dihydrolipoyl-dehydrogenase MNEILDVIIVGGGSAGLSALREVRKHTDRFVIINDGPWGTICARVGCMPSKALIEAANAFHRRNTFEEFGIRGSDQLTLDIPAALQRVRKLRDDFVASTVKTTEELGKRAISGRARLLAPDRLEVNGKELRAHKIIIATGSHPIIPTSWSNSLRDRLLTTDTLFEQETLPTHVAVIGMGFIGVEMAQALSRFGIKVTAFGGNQFAGLTDPQVIATATDLLGKEFPLHLGEKANLNLVHEGIQVRAGSVEIVVDCVLAALGRRPNIDHLGLETLGVSLDQHGMPPVNRNTMQIANLPVFLAGDANDQAPLLHEAADEGYIAGLNAMRSDPLCFTRRTPLTIIFTDPNIAIVGSRFQTLDSAKTLIGEVHFDRQGRARVSQRNKGIQRLYADAESGRLLGAEMCAPAGDHMAHLLALAIDRSLTVQQLLRLPFYHPVLEEGMRTALRALAAQLPVVNEFDLSMCGTFNTEALD >NZ_CP013341.1|WP_062559789.1|2949899_2951510_+|APC-family-permease MHEETVMHDLKAKGLKKGSVSKWAAVTIGLAATAPAYSLTGALGYGAAGSGYQLPIVFILSVIPMFFVALSYKHLTTSAPDAGTIFTWGTKAVGPKFGWFGGWALLLASVLAGVAATQIMVNAAAVIFHLTNIPKWFHIGVAGLFIFSTTYLTALGAKESSRTTMILTIAQYGILIALAAFLLLRVMQGGAVSTAETFSLEWFNPFAIDSFTAFLDGFLIALFIFWGFDASLAMSEETEGSAEQAGRSGIISMIITVITYVVFSTTALAYAGIDSHHQSSLTFKDNIDSSITVLATDIIGTQGALIAALIIGVSAFSATMSTIMPAARAALAMATYRAIPKRFSSVNEATQTPKFATWSIGLMTLIIYSTLSLISESIIKDTIHSVSIAICTYYSVAALSCALYFHRTALNHWRTAVSQVLLPIMAAVVLIAVGIFQAWNMMDPDYGSSGSIAGMGAVFLIGVVALFLGIPLMMWCYFRDPRFFHGETLPLERAHIVSDSNSHNTSNTVIPCHISDSSLSHPAEQIELSIKDERNP >NZ_CP013341.1|WP_062559790.1|2951585_2951966_-|sulfurtransferase MQHNPGFLKLVEEVKKRIKECTVGDVHAKLIQGIQFHFIDVREDHEFLIDHAAGARHLGKGIIERDIETVIPEKNTLIILYCGGGYRSALVADTLQLMGYKNVLSLVGGIKALRDAGFPLKRNESI >NZ_CP013341.1|WP_062557704.1|2952183_2953446_-|methane-monooxygenase/ammonia-monooxygenase-subunit-B 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MATTYGTTSGAASANYDMSLWYDSKYYKIGMLTMLLVAIFWIWYQRTFAYSHGMDSMEPEFDKVWMGLWRVHMTLMPLFALVTWGWILKTRDTKEQLDNLDTKLEIKRYFYWMMWLGVYLFGVYWGGSFFTEQDASWHQVIIRDTSFTPSHVVVFYGSFPMYIVCGVAAYLYAMTRLPLYSRGTSFPLVMAIAGPLMILPNVGLNEWGHAFWFMEELFSAPLHWGFVILGWAGLFSGGIAAQIITRYSNLTDVTWNNANREILNNRIVP |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| NZ_CP013341_1 | 1.7|774345|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774345-774376 | 32 | NZ_CP013295 | Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence | 120101-120132 | 7 | 0.781 |
| NZ_CP013341_1 | 1.1|773922|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 773922-773953 | 32 | MG765275 | Lactobacillus phage Bassarid, complete genome | 29042-29073 | 8 | 0.75 |
| NZ_CP013341_1 | 1.3|774063|34|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774063-774096 | 34 | NC_011882 | Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742503, complete sequence | 9382-9415 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP013341_1 | 1.4|774134|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774134-774165 | 32 | NZ_CP022346 | Bacillus thuringiensis strain c25 plasmid unnamed1, complete sequence | 279109-279140 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.7|774345|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774345-774376 | 32 | MH319749 | Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_11 genomic sequence | 58398-58429 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP038645 | Acinetobacter baumannii strain ACN21 plasmid unnamed1, complete sequence | 25286-25317 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP039519 | Acinetobacter baumannii strain TG22653 plasmid pTG22653, complete sequence | 50872-50903 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | CP033517 | Acinetobacter baumannii strain 2008S11-069 plasmid p2008S11-069-1, complete sequence | 58364-58395 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP016301 | Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab66 plasmid pCMCVTAb1-Ab66, complete sequence | 101546-101577 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP016296 | Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab4 plasmid pCMCVTAb1-Ab4, complete sequence | 101547-101578 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP016299 | Acinetobacter baumannii strain CMC-MDR-Ab59 plasmid pCMCVTAb1-Ab59, complete sequence | 101546-101577 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP024125 | Acinetobacter baumannii strain AYP-A2 plasmid pAYP-A2, complete sequence | 28599-28630 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP010398 | Acinetobacter baumannii strain 6200 plasmid p6200-114.848kb, complete sequence | 56928-56959 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP015484 | Acinetobacter baumannii strain ORAB01 plasmid pORAB01-1, complete sequence | 58988-59019 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP020585 | Acinetobacter baumannii strain CBA7 plasmid pCBA7_1, complete sequence | 37366-37397 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | CP031744 | Acinetobacter baumannii WM99c plasmid pWM99c-2, complete sequence | 58989-59020 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP050905 | Acinetobacter baumannii strain DT-Ab057 plasmid unnamed1, complete sequence | 64883-64914 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NC_020524 | Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2, complete sequence | 58989-59020 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP021327 | Acinetobacter baumannii strain XH386 plasmid pXH386, complete sequence | 10307-10338 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_MK386680 | Acinetobacter baumannii strain ABAY04001 plasmid pABAY04001_1A, complete sequence | 76965-76996 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP018257 | Acinetobacter baumannii strain AF-673 plasmid pAF-673, complete sequence | 53691-53722 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774558-774589 | 32 | NZ_CP010780 | Acinetobacter baumannii strain XH386 plasmid pAB386, complete sequence | 110424-110455 | 9 | 0.719 |
| NZ_CP013341_1 | 1.12|774699|35|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 774699-774733 | 35 | NZ_CP010909 | Candidatus Pantoea carbekii strain US plasmid pBMSBPS2, complete sequence | 5848-5882 | 10 | 0.714 |
1. spacer 1.7|774345|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013682 (Clostridium botulinum strain 1169 plasmid pRSJ8_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
cattttccaatagtaacagccatttttaaatt CRISPR spacer tttctaccattagtaacagacatttttaaata Protospacer . *.* *** ********* ***********
2. spacer 1.7|774345|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013295 (Clostridium botulinum strain CDC_54064 plasmid pNPD1_1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.781
cattttccaatagtaacagccatttttaaatt CRISPR spacer tttctaccattagtaacagacatttttaaata Protospacer . *.* *** ********* ***********
3. spacer 1.1|773922|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG765275 (Lactobacillus phage Bassarid, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ttcctttgcatcgtaccagttaatatatattc CRISPR spacer ttaacaaacatcgtatcagttaagatatattc Protospacer ** . .*******.******* ********
4. spacer 1.3|774063|34|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011882 (Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742503, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ctttactgctttactgctttactgctttacttaa CRISPR spacer aactactgcattactgcattactgctttcaaaaa Protospacer .****** ******* ********** **
5. spacer 1.4|774134|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022346 (Bacillus thuringiensis strain c25 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
ctgctttactgctttacttaataatttctaat CRISPR spacer tcttttacctgctttatttaataatttgtaaa Protospacer .. .** ********.********** ***
6. spacer 1.7|774345|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH319749 (Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_11 genomic sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
cattttccaatagtaacagccatttttaaatt CRISPR spacer ttagtcccaatagtaacagatatttttaaagc Protospacer . *.************* .********* .
7. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP038645 (Acinetobacter baumannii strain ACN21 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcatcatctaagtaaccttctgtatgtggtga CRISPR spacer tttaattataagtaaccttctgaatgtgatgt Protospacer *. * ************** *****.**
8. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039519 (Acinetobacter baumannii strain TG22653 plasmid pTG22653, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcatcatctaagtaaccttctgtatgtggtga CRISPR spacer tttaattataagtaaccttctgaatgtgatgt Protospacer *. * ************** *****.**
9. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP033517 (Acinetobacter baumannii strain 2008S11-069 plasmid p2008S11-069-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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10. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016301 (Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab66 plasmid pCMCVTAb1-Ab66, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcatcatctaagtaaccttctgtatgtggtga CRISPR spacer tttaattataagtaaccttctgaatgtgatgt Protospacer *. * ************** *****.**
11. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016296 (Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab4 plasmid pCMCVTAb1-Ab4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcatcatctaagtaaccttctgtatgtggtga CRISPR spacer tttaattataagtaaccttctgaatgtgatgt Protospacer *. * ************** *****.**
12. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016299 (Acinetobacter baumannii strain CMC-MDR-Ab59 plasmid pCMCVTAb1-Ab59, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcatcatctaagtaaccttctgtatgtggtga CRISPR spacer tttaattataagtaaccttctgaatgtgatgt Protospacer *. * ************** *****.**
13. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024125 (Acinetobacter baumannii strain AYP-A2 plasmid pAYP-A2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcatcatctaagtaaccttctgtatgtggtga CRISPR spacer tttaattataagtaaccttctgaatgtgatgt Protospacer *. * ************** *****.**
14. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010398 (Acinetobacter baumannii strain 6200 plasmid p6200-114.848kb, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tcatcatctaagtaaccttctgtatgtggtga CRISPR spacer tttaattataagtaaccttctgaatgtgatgt Protospacer *. * ************** *****.**
15. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015484 (Acinetobacter baumannii strain ORAB01 plasmid pORAB01-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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16. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020585 (Acinetobacter baumannii strain CBA7 plasmid pCBA7_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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17. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP031744 (Acinetobacter baumannii WM99c plasmid pWM99c-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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18. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050905 (Acinetobacter baumannii strain DT-Ab057 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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19. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020524 (Acinetobacter baumannii MDR-TJ plasmid pABTJ2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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20. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021327 (Acinetobacter baumannii strain XH386 plasmid pXH386, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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21. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK386680 (Acinetobacter baumannii strain ABAY04001 plasmid pABAY04001_1A, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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22. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018257 (Acinetobacter baumannii strain AF-673 plasmid pAF-673, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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23. spacer 1.10|774558|32|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010780 (Acinetobacter baumannii strain XH386 plasmid pAB386, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
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24. spacer 1.12|774699|35|NZ_CP013341|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010909 (Candidatus Pantoea carbekii strain US plasmid pBMSBPS2, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
acaatataaaacattatagttcttatagccttggg CRISPR spacer aaaatataaaacattatatttctaataaattatct Protospacer * **************** **** ***. .*
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
194252 : 203213
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013341|194252:203213|DBSCAN-SWA CTTACATATCCATGCCGCCCATACCACCCATGCCGCCCATACCACCCATACCACCACCGGCGGGCGCATCTTCCTTAGGCAATTCAGCAACCATTGCATCAGTAGTTAACATCAAGCTTGCAACAGAAGCTGCATTCTGTAAAGCAGAACGAGTTACTTTAGTCGGATCGAGAACGCCCATTGCTACCAAGTCACCATATTCGCTGGTTGCGGCATTGTAGCCAAAATTTCCTTGACCTTCAGCTACCTTATTAACCACAACGGAGGGCTCATCACCACAATTCGTTACAATTTGACGCAAAGGCTCTTCAAGTGCGCGCAAAACAATCTTAATGCCGGCGTCTTGATCATGATTATCACCTTTGGTGTTTTTGACGGCTGAAATGGCACGTAATAAAGCCACACCGCCACCTGGAATAACGCCTTCTTCCACGGCAGCACGAGTTGCATGTAATGCATCTTCAACCCGAGCTTTTTTCTCTTTCATTTCAACTTCTGTAGCAGCACCAACTTTAATTAGCGCCACACCACCGGCCAGCTTAGCAACACGTTCTTGCAGTTTTTCTTTGTCGTAATCACTTGTAGCTTCTTCAATTTGTGCACGGATCTGTTTGACACGGCCTTCAATATTATCGGTATTGCCTGCGCCATCGATAATTGTAGTATTCTCTTTCCCTACTTCAATACGTTTGGCTTGACCAAGATCATTTAATGTAGCTTTCTCTAGCGTCAAACCAACTTCTTCGGCAATAACCGTGCCGCCAGTTAAAATTGCGATGTCTTCAAGCATCGCTTTACGACGATCACCAAAACCAGGCGCTTTAACTGCACACGTTTTGAGAATACCCCTTATATTGTTCACAACCAATGTGGCAAGCGCTTCGCCATCAACATCTTCAGCGATAATCAGTAACGGCTTACCCGCTTTCGCAACCTGTTCCAATATCGGTAATAGATCACGAATATTAGAAATTTTCTTATCATGCAGCAAAATATATGGATTATCTAACAGTGCAATCTGTTTTTCCGCGCTACTTACAAAATAAGGCGACAGATAACCACGATCAAACTGCATACCTTCAACAACTTCCAACTCATTCTGCAATCCCGATCCATCTTCAACTGTAATTACGCCTTCCTTACCCACTTTGTCCATTGCATCCGCAATGATCTTGCCAATTTCATTATCAGAATTTGCAGAAATACTACCCACTTGTGCAATTTCCTTTGCTGTCGTGCATGGTTTTGACAATTTCTTTAATTCACCGACCGCTGTGGTTACTGCTTTATCGATTCCACGTTTGAGATCCATTGGATTCATACCAGCCGCTACATATTTCATGCCTTCTTTTACGATCGCTTGCGCCAACACGGTTGCGGTGGTTGTACCATCACCGGCCACATCAGATGTTTTGCTCGCCACTTCTTTTAACATCTGCGCGCCCATATTTTCAAATTTATCTTTCAATTCAATTTCTTTGGCGACAGATACCCCATCCTTAGTGATGGTGGGTGCACCATAGGAACGATCCAGAACAACATTCCGTCCCTTCGGTCCTAATGTCACTTTTACCGCATCGGCTAAAATATTTACACCGGCTACCATTCTATGACGTGCTGAATCACCAAACTTCACTTCTTTTGCTGACATATTCTTCTCCTAATCTCTCAATACATTATTTTTGCGTGTCATCGAACTACGAGTTAACCTTCAATCACACCCATAATATCTTCTTCGCGCATGACTAAAAGTTCTTCGCCTTGAACCTTAACGGATTGCCCAGCATATTTACCAAATAATACTTTATCGCCGACTTTCACTTCCAACGGGCGGATTTTTCCATCATCCCCTACTTTTCCTTTACCTATTGCTAAAATCTCGCCTTGATCTGGCTTTTCTGCCGCGCTGTCAGGAATAACAATACCTGAAGCTGTTTTACGTTCATCTTCCAATCGCTTTACGATAACACGATCATGTAAAGGACGAATTTTCATGCTGCTGTCTCCTTTGAAAATTAATAAGCTGATATATACACATCATTTTTTAACACTACGAAAAAGTCAAGGTTCTAATATTAGGATTATTAGCACTCCATAACCACGAGTGCTAATAGTAGGGTTTGTGGCTCAGAATTTCAAGAGCGCAAAATAATAAAATTATTAATTTTATATAACGCTATGAATACAAAAATGAAATAAATATGGAACAAAAACGAAACAAATGCGAAATTAATTGTCGTAAGAAAGAAAATAAATCCGGAATAAAAAGAAACAACTCCGGAATTATATTATTGACTCTGGTATTTCAAACTAAATCTCGTTTTAATCATCGCCATGATAATCTCTATCATGAGACTTTCACTTAATCCGATTTAATTTCCTAAGAGACGTATTTATAGTCTTAGCACAAACTTTCAATTCTGTTATTTTAAAACTTATTTACATTCTCCAGCTTTCAAATATTGATGAACTATGAAGTACGAACTTAGGCCGGCCAGACAAGATGATTACACTTACTGTTATCGCCTTACTAAGCGGAATATGTATGAATTTTTCTGTCGTCACTGGGGTGGTTGGGTTCCACATGAGTTCCGGAGAGGGTTCGTAATTGAAAACATATCTATGGTTATTATTGCGGATAGAAGAGCAGGTTACATCAACGTAATAAAGGAACCTTTACCCGTCTACATTGTTAATCTCCAACTATCTCCTATTTGGCAGAACCAGGGAATTGGCACAAAGCTGTTGAAGCGCTTGCTTGCCCTTTATTCGAGTGACTGTATTGAACTCACGACATTTGAAGACAATCCAGCGAAAAGGCTATATGAGCGAATGGGATTTGTCGTTGTAGAGAAAAATGGTATGACAGTTAAAATGGGAAAAAACCCCAGCAAAGCGATACAGACTAGCTCATCTACGTTTCAAATCATTCGTCCAAATGTTTCAAAGCAATTGTCCATTGTCATGTGTTCATCCCAAAACTGTACATAGTGTGATAACTAAAATGTAAACGTAATACACACGACATTAATCATCTTATAATTTACGCTATGCTAAATTGTAGATAGTCATTTTGAAGTATCGGAACAGATAATTTGAAATGCCTCTCAGGCGTTAAAAAAATGATTTTCTTAATCCCCATTAATCAGCGCCAAATAACAAGAGAATTTAACGCTTATCAGAAATAAAAAATAACCGCTGCAACCATATTTCCAGAGAGCTTTCCAGCAGCATCAAAACTGTAGTTTTATCACCGGTACTGCAACACTCTTCAAACGGTTGCTGTCAGTCACCAAAAGTCAGCGTGCAAGATCGCTTGCTCACGCGGTGGTTTTGAGTCGGCTATCGGAATCGAAGCTGCGTGCATACGCCTGGTTATTACCCCACACCCAACTCTTGGGCTCGCCAAACGGTTGATGGACGATATTGCTCAATAACAGATTGCCATTGACCCGGATCTCATTCGGGAGGCCATCGGCCGCCATAAGCGGTAGTTACCTATTTGAGATTACATCTGATACAGAACTGAAGTATTTGCCTTACGGTATCGGACAACGCTTCCATACCACACTGATTGGAAAGGAAAAACATCTGAAAAATTCAGTTCAGCCTCTAGGTTAAGCTTTCTTGCATTGTTTTTTGTGCATTTGACATCGTTAATGATGGTGTGTTTGAATATAGTTACATATTTCAATATGGAGTGATTCAAACATGTCAAATCGAGGCGGAAAAAGGGAAAATGCGGGTAGGCCGCGAGGCCAGGGTAAGTTTGGCGAATCGACAGTTACAATGCGCATACCGCAAAGTCAAACAGCAACGATCCGAAGCTTTCTGGAAGCCTTGCAGTGTAAAAGAGCGAATGCTGCGAGTGAAAATACAATTCCAGAGGAAGAAGTGGATGAGTTTTTCACCCCCGTGATTAGTGAACAACCCACGCTATTGCCATTATTCGCTACCAAAGTCGCGGCGGGCTTTCCCAGTCCGGCCGATGATCATGTCGAGAAACGGCTCGATGTCAGTGAATTCCTGATCGATCACGCAGCATCGACGTTCTTTGTGACGATCCGCGGAGAATCGATGATTGATGTCGGGTTGTTACCGGATGATAAAGTGGTCGTGGATCGCTCCAAAACACCCAGCATCGGAGATATTGTATTAGCAGTGGTTGATCGGGAATTTACGATTAAAATCCTTGATTACGGTGCAAATAAAATGCCAAGGCTGATGCCAGCCAATTCGACGGGTGCTTACCGGCCCATTTACATTCGCCCCGATACGCAGTTTGAGATATTCGGTGTCGTGACAGGATCATTCCGCCGCTTTAAATGAGTACGTTGTTGCCGTGCTATGTGTTGTTGGATCTGGAAACAACAGGAGGCACTCCAACCCAGGATCGTATCACTGAAATCGGCTTGATCCGCTATGAGAATGGCGTTGAAACCGGCCGCTGGAATACGCTCATCAACCCGGGAATCAATATTCCACCTTTCATCCAGCGGCTGACGGGAATCACTCAGGACATGGTCGATCATGCCCCCACTTTTTCTCAGGTGTGTGAAACACTGCTGCAATGGCTCGATCAAGCGGTATTGTGTGCGCACAATGCGCGTTTCGATTATGGTTTTCTCAAAAATGAATTCAAGCGCATCGGTGTTACCTTCCAAAAGAAACTACTGTGCACGGTCCAGCTCTCCAGGAAACTTTATCCGCAGCATCATTCGCATAGTCTCAATGCCATTATCGAAAGATTCCGATTGGTCTGTGACCAGCGCCACCGCGCCATGGGCGATACCGAAATGATGGCGGCATTCATTGATGTTGCCATGCATGAATTGGGGGAAGCAACGATTCAGGAAATGGCGCTGACCCTCCTGAAGCAACCAGCGATTCCGGTAGGCCTCGATCACCTGGATATCGATACTCTTCCGGCAACCTTCGGTGTTTATTTATTCCATGGCGATAGTGCAGTGCTGTATGTCGGCAAAAGTGTTTCCTTGCGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013341|194252:203213|197571_197736_-|WP_158441751.1|DBSCAN-SWA MAADGLPNEIRVNGNLLLSNIVHQPFGEPKSWVWGNNQAYARSFDSDSRLKTTA >NZ_CP013341|194252:203213|198576_199968_+|WP_062557655.1|DBSCAN-SWA MSTLLPCYVLLDLETTGGTPTQDRITEIGLIRYENGVETGRWNTLINPGINIPPFIQRLTGITQDMVDHAPTFSQVCETLLQWLDQAVLCAHNARFDYGFLKNEFKRIGVTFQKKLLCTVQLSRKLYPQHHSHSLNAIIERFRLVCDQRHRAMGDTEMMAAFIDVAMHELGEATIQEMALTLLKQPAIPVGLDHLDIDTLPATFGVYLFHGDSAVLYVGKSVSLRSRVFNHFQGDHRSAKEMRIAQEIKRVEYRITGGELGALLLESRLIKDFQPIHNRQLRRERQLCSWQVSRDPNAKPLVTLINDSDIDWRTADHVYGTFKTKRQAVEVLSKLADEYGLCDKALGLEKGAGVCFAHQLKHCKGLCAGRESAESHWLRLLTALSQYRLLTWPYAGRIGIRERNPEYAITEIHIFDQWCHLGTVKDYQELDELSAWPRFDRDTYRYLLKFLPRKNVEIIALHG >NZ_CP013341|194252:203213|199960_201256_+|WP_062557656.1|DBSCAN-SWA MDKNNRSIALIDVNNFYVSCERVFNPKLEGRPVVVLSNNDGCAVARSNEVKALGVRMGQPWFQLKDLAKKHGIIAYSSNYALYADMSNRVMEILAMFSPDQEIYSIDECFLDLTGFKTKNLAPYGQHIRQTIKQWTGLPVCVGIGSTKTLAKLANHMAKKNPEWNGVCDFNSLSFQQQADWFQRTGVGEIWSIGKRLAPRLQEIGIKTVLDLKTASPSQMRARFSVVMEKTIREINGTACIELEEINPSRKQIISSRSFGIPVSDLASLEESVTLYISRAAEKLRRQQSCAGSVHVSIRTSRFNENKPYYANSMTIALPRQTDNTILLTKAALWGLRKIYRRGHKYQKAGVVLFELMVPTQYRQLDLFGAIPVTDTKSSKLMSVMDQINSRMGRGTLKIASEGFKQPWKMKQGNKSPNYTTNWNELICVTK >NZ_CP013341|194252:203213|196723_197242_+|WP_082632970.1|DBSCAN-SWA MKYELRPARQDDYTYCYRLTKRNMYEFFCRHWGGWVPHEFRRGFVIENISMVIIADRRAGYINVIKEPLPVYIVNLQLSPIWQNQGIGTKLLKRLLALYSSDCIELTTFEDNPAKRLYERMGFVVVEKNGMTVKMGKNPSKAIQTSSSTFQIIRPNVSKQLSIVMCSSQNCT >NZ_CP013341|194252:203213|195955_196246_-|WP_013648311.1|DBSCAN-SWA MKIRPLHDRVIVKRLEDERKTASGIVIPDSAAEKPDQGEILAIGKGKVGDDGKIRPLEVKVGDKVLFGKYAGQSVKVQGEELLVMREEDIMGVIEG >NZ_CP013341|194252:203213|197962_198580_+|WP_062557654.1|DBSCAN-SWA MSNRGGKRENAGRPRGQGKFGESTVTMRIPQSQTATIRSFLEALQCKRANAASENTIPEEEVDEFFTPVISEQPTLLPLFATKVAAGFPSPADDHVEKRLDVSEFLIDHAASTFFVTIRGESMIDVGLLPDDKVVVDRSKTPSIGDIVLAVVDREFTIKILDYGANKMPRLMPANSTGAYRPIYIRPDTQFEIFGVVTGSFRRFK >NZ_CP013341|194252:203213|194252_195902_-|WP_062557653.1|DBSCAN-SWA MSAKEVKFGDSARHRMVAGVNILADAVKVTLGPKGRNVVLDRSYGAPTITKDGVSVAKEIELKDKFENMGAQMLKEVASKTSDVAGDGTTTATVLAQAIVKEGMKYVAAGMNPMDLKRGIDKAVTTAVGELKKLSKPCTTAKEIAQVGSISANSDNEIGKIIADAMDKVGKEGVITVEDGSGLQNELEVVEGMQFDRGYLSPYFVSSAEKQIALLDNPYILLHDKKISNIRDLLPILEQVAKAGKPLLIIAEDVDGEALATLVVNNIRGILKTCAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGTVIAEEVGLTLEKATLNDLGQAKRIEVGKENTTIIDGAGNTDNIEGRVKQIRAQIEEATSDYDKEKLQERVAKLAGGVALIKVGAATEVEMKEKKARVEDALHATRAAVEEGVIPGGGVALLRAISAVKNTKGDNHDQDAGIKIVLRALEEPLRQIVTNCGDEPSVVVNKVAEGQGNFGYNAATSEYGDLVAMGVLDPTKVTRSALQNAASVASLMLTTDAMVAELPKEDAPAGGGMGGMGGMGGMGGMDM >NZ_CP013341|194252:203213|201557_203213_-|WP_062557657.1|DBSCAN-SWA MKKRFNQSSEVTELLRPFLAWIMLSAGAGIAAGAATVALLDTINHVLHYPEGLTGNLLLVFTALCVLVLIGRMVSDMSTNLVGQRLVAQIRKTLARKILGAPIDALERYRTHRLMPVLTQDIDMISDVAFTLASTVIAIAIVLGCLGYLAWLSPQLFVLLIVALIVGATVQAWAQARGVAGFWKARDLEETLHKAYRGISDGAKELRMHRSRRSRVLEDQIDLTVDKIRAINQKAINTYVMATAFGSALFFMLIAVVLWWATIQHPAPEVVSGFVMVLLFLKGPMEQIIETLPGIGRAKVAFQRIKDLSVRFASPEAYLNLALEPSMISLNESIQLVGVRYAFNVPEGGEAFVLGPIDLILKPGELVFVVGDNGSGKTTLIKLLLGLYAPQEGEIHLDGKPVVADSHDDYRQLFTTVFSDFYLFEELVTDEIYRAHGLSEKALPYLQRLEIAHKVSVKDGTFSTIDLSTGQRKRLALVHAYLEGRPVLVFDEWAADQDPTFRHLFYTELLPELRTKGHLLVVISHDDRYFHLADRVVCMKFGQIVDNSKYR |
8 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
1647515 : 1739313
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013341|1647515:1739313|DBSCAN-SWA 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MNIIFISSNTERARKLTLTRSRIILLLGVFSAIVVIAALGLNFISLRYADKIDAPLLRAILVNPQEEKHQKIQAHLQENLNIMASKLGHMQAQLIRLDALGERLVESSGIKSRDFLFKEAPGQGGPKSSLDLLADELTVGEFDDMLQELSTMLDERADKLGALDSLLRYGRVTKFVLPSEMPVETDWYSSGFGYRVDPFTGKKAFHEGVDFAAKTGTPIKAAASGVVIYSDRHSEYGNMVEIDHGDDLVSRYAHASKRIVKLGEVVLQGQKIAEVGSTGRSTGPHLHFEIRHKDKPQNPAKFLKKPG >NZ_CP013341|1647515:1739313|1684531_1686049_+|WP_062558792.1|DBSCAN-SWA MAPRIEHGSFAVDEHIWGHRLYDEQLPHLVILEFLNVLQSNLNDPLRAPSSVKISYQPQHQIRLRSLLFNNPYVEVVRARKIPDDTKWDTWIELFKRDAVEMGDMFFDHLRKSFISFDDFARSIELLRSSAFEGKSNKRWSSKFVFPFGPDALYEDLRFDANDNVSNDRRFFARTGELLYLMLGRASNGRVLGHQLVERLFRQPSNMNRLVKVLQGPVQQAPNRRDVGYLPYAQLPRFDRLCDDWLAILARDIPIYDGLDHITTMTGLNLLLYFLERGKNSLGDVEPVEIVCEVVSSQRTKVRALSGESFQANQTISLRAVKALVENIRTTPEWEAALNSEDPKGECAHIMAERFQYDKDDEIDIHQLSGEGLIEKLLKKAETRHAQHVEKIHSTWSRAIGLSSRRLARRVRYAPNDRLLKALVVTVVDDRMEFGEFLAEIYRRYGLVIGHVEGIRHIQNNQVDQEALMINAEHLETRLYGLGLVRRLSDSCAFVENPFHRQGDM >NZ_CP013341|1647515:1739313|1666526_1666850_-|WP_062558778.1|DBSCAN-SWA 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57 | Xanthomonas_phage(16.67%) | transposase,protease,integrase | attL 1662751:1662810|attR 1735121:1735181 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1748167 : 1814039
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013341|1748167:1814039|DBSCAN-SWA AATGCTATCGAAAAAGAATGAAATATCGAGTTCTGGATATGCCTTCCGAGACGGCGGGGTTCGAAACGAAATATTCATTTTGGAGCAAAAAACTTTATTTCAATTTAAAAGGATGCACAAAATGAACCAGCAAATGGATAAACCGAAATCAAACGGTGGAGCGGTAGAAGTAGTAATGAACGCTTTCAGCGAATACAAAAACGCAAACGATAAGAATCTCGAACAACGCGATAATGCTTTGAATAGCAAAATCGAGGAGCTGTATAGCCAGACAGATCGAATCGAGGAATTGTTAAACCGGCCTTTTGGTACTGTTCCCAAGCCGGAGGCATCTCAACCGAATCGATTTGCGATTACAGTTGCAGGGAAAAAAATCCCAGTTTTGGCTAGGGAGGATAGTCTAGCAAGCTATTTTCGTCCGCAATCTTCAAACGGTGAACAAGAATGGAATTTGCAAGATTTCGTTCGGAATAGCATGGGTTTAAGCAATATTAAAAATAGCGTTGTTGAAAGAGGTTCAGCAAATGCGCCTGAGTTTTTGAGCAGCCAAATTGTGGATGCGGTGCGAGCTAAAAGCACATTGATTAATTCCGGTGCATTAACTCTACCAATCGACGGCGCGACCATTATCGCACGGATTGACACGGATGCTGTCTGCCACAGCCATGTCGAAGGTATAGATGACATTGATGAGAGCTTGCCAGTATTTACGCCTATCGAATTAAATCCCAATATGCTGTCGGTACAGATCCCATTAAGCGCGGAAGTTGCGGAAGATTCGGCAAATTTAAATTTACTTTTAAAGACAAGTATTGCCGCTGCTATTGCAAAAAAAATTGATCAACTAGGAATCGCAGCACTGTTAGCAGATAGTGCAATCGAAGAATCAGCTGTAAGCCAAGATACAGAGACATGGGCCGGGCTTTTGCAAGCAGCAGGATCGTCTATAGCCCTTGATAATGAATGGCCGAAAACTGTTATCAGCAATGCATCTGACTACGCTAAACGCATAAGCCAAGTTTCAGGAGATGGTCAATGGCTGGTAAATCCTCCTCCCTTGGCAACTATGAAAGACTTGTTTAGTACTCACATGACTGCTGGTAAGGCATTGATGGGCGATTTTGAACGCTCGGTATTGCTGGCTATACGGTCTGAGTTGCGGATTGAAATCGTGCGCTGGCACCGCCCTGGATCTGCTTCTCATTTAATGATTGCATACATGAGAGGAGCTTTCTACACAGTGCAACCCGGCTCACTCTATCGCCAGTTGAAAACAGTAGTTTAGTAACAATGCAGCAACCCCTTGCCGCGAGGGGAATATAAGAGCGGATTGAGGATTAGACGGGCAGTGCCTCACTGTAATAAAACCCCGTCATCCCTCGCTTAGGCTATGCTCACACCAAGAGAGCATAGTCTTTGGTGGAGGGAATCTAATAGAAGGAGCCGGGGCATTCAGTCTCTGGAAAAAATAGATTTGATAAACCGCCACTAGCCCAAATAATCGCACGTGCAAAACAATAAAAACGGTTTTTAGTAACCGGGAACCAAATCTCTACATTTTTTTATTTACATAAACCGCAATTAGCCTTCGATTTAACGCTAACCCATAATTTCCCGCACCCGGATATGCGCTCACGCACGAGGTAATATGAAACAAAAGCTACCAAAAGAGATATTGAGCCTAGTTAATCGCAAATCGCATGCTTTTGGTCTTACTTACGCAGAACAGACCAAGCAACTATTGCTTAATGAGCTGGATTCTATGCGTTCTAAGGGGGCTACATTGAACGATCTAGAAAAGTACATAGGTAACAGGCCACCGCCTATCTTCACGAATTTTAATTATAGAAACCATGCCTAGCCTTTCTGTTGCTAATCCTAACCAAAAAAGTTTTTTTGTATGTAAAAAATTACATATTGGACATTGGCTTTAAAATTTTGGTGAAGAAGCCGATAAAGTTTTAGAGCAAAATTGAGAAACCTGAAATCGATTCCAGTTGTGTTGACTAATAGAGAAAAGAACAAGTACTATGCAAATTAGCATAATCTAACCTATAAATAAAATTAACTAGCTATGTCTACACAAGCAAGGGAAATACTTGAAAAATACTGGGATAAGGAAATACCTATCGATCCCATAAAGTTAGCCAATGCGTTGGGCGCTGAGGTAAAGGCTGATCCCGATTTGGCCACAAGTGGGGAATTCAACTGCACTAACGATGGCCCTTTAATTCAGTACAATAATACAGAATCAAAGGTACGTCAGAGATTCACTATAGCTCATGAACTTGGACATTTTGTCCTTGGGCATGGTGGGGCGTATCGAGATAACCCTGAAGAATTTTCGTTAGCCAATCATGATCCCTTAGAAATTGCAGCAAACCGATTTGCAGCGGAATTGCTTATGCCTGAAGCCGTTATAAATCTTTTAATTTTTAAAAAAGGAATAAAGGATATAGCCAAGCTTTCTAGTATGTTGCAAGTTTCTCAGATTGCCATGCAATTTCGTTTAAAAAATCTTGGGTTGATAAGCTGAAGTGAGTGAGCGTTCTTTCTTAAAGAATCCTATTAAAGTAATAAATGATTTATCTTCAAGCGATCCACTACCAAATTTTAAGCAAGAGTTAATAGCTGAAGAACTTCTGGAAATTCAGAATCGAAATATATTTAAAAGTTGGCTTTTCTGGGGTATTAGTAGTGCATTCGTAACGACTTTTATATTGCTAATAACGTTTATAAGTTTTCGTATTTCCATACAATCCTTTGGTGAAACAATTCCTCTGCCTGAGCGGTTAACTATTATCGGTATTTTAGCCGCAATTAGTATTGTTCTACCATTAGCATTGTTGCGCGTAATTTATACTGCCCCAAAAACCAAAGATGATTCCGGAGATAGTGTTTCGATCTGGCAAAGCCTCTTTAAAGAACTAATTGATATTTTTAGAAAATATTTAGAAAACAAAAGCCATTAAAACCTGGTGATACAAATAGCATTAAAGTTTAAAATTATTATTTATTGACACCCCATCCATTCAGGATTATTCTTTCTTTAAGTGCTCAAAACACTCAACAAGCGGACATACCCGCGCCCGATAGTCGTGGCTTTTTTGCGTCCAAATTTTGTTATGGCCGGGCGTTAGGCTAATAAAATACCTGCTTGCGGGAAATATGCCAGCCGTCTTGTTGCGGTTTTGAGCACCTGGCCGCCCAACAAAGGGCAATCATCAAAAAATCAACAAGGAGTCAATCATGACAACTATATCTACCCGTGCACCCGCACGTCGCAAAACCAAATCAGTTACAAAACCCACACATTTAACCTACGAGCTACGCAGAAAAAAGGCAAAGAAAGAAATACTTGATTTCATGGAAGCCAATCCATGGGATAGTCCGGCAATGAAGATAGTAGGGCATGTATGCCCTTGGGGCGATCCAGTAACTGGAATAAAAGAAATCCGTCGCTTGCTTGGTGAATCCATCGCCAAGTGCAAAGTAATTCCATTTCCTGTCGGTGGCAAGCGCGGCCTTAAAATTTCTAAAGGGGCTTAATCATGAAAATAAAAGCCCCTATCACATTAGATTTATTTCCTGCACGCAGAAATTACAAGGCAGAATTAGAAGAAGTTAGTGCGCTTGCTTTGCCGTTTGTATCAAAGCAAGATCGGTCTAAGCCTGGTAAAAAATATTGGGACGTAAAACCCATAAACGACTACAGTTTGGCTTGTAATATTGGCGCTGAGTATGCTGCGCACTTCGTTCAGTATCTAAAGAATAATCCTAATGATGTAGAAATTAATCTTCTTGGCTCAATAGTTGAAGATATGGATTTCACCGATGATTCATGCGCGAAAGGATATCATGTTGGATTTTTTACTTATCTTGAATTTCTGCTTTATAAGAGTGTAAAGAAAAGAAAAGTTTTCCATGATCTGGATAAACATCGCGATAAATGCCGGTTAGAAGAATAAAACTTTTAATAAACCCGTCCGAGTGGCGGGTTTATTATTGTTTGAAGCTGTTTTTAGTTGTTGGGTAGTATGTGGGGTTTATAATTAATCGTTTTGTAACTTATTGATTTTATTGATGCGCTGGCGGAGAAAGCGGGATTCGAACCCGCGGTACGGTTTAAGCCGTACACACGCTTTCCAGGCGTGCACCTTCAGCCACTCGGTCACTTCTCCAGGGTGCTAATCAGCAGGGGGCAAAGAATAAACCAGTTCTTGGTTTCGGGCAAATTTGTTTTGTGTTGAGTAGATTTGAAGAAATTGAATTCAGTCCAAATATTTCCAATTGGAGAAAGTGGCGCCTTGTCCAATTGCTGTGCCGTCAGGTTTGTGTATATTCCAAATGGTGGCTTGATTAACCAGAAAACGTTTTCCTGTGCTGGAAATCCTGATACCGCGATAATTGGAAATGTAGCCTTGTATTTTAGCTTGTTGCAGCATGCGTGTACGTTCTTCACGGTTGGGTGACTCAGCTGTGAGGCGTGAGGGTGTTTGTGTGAATTGTTGCCAATCCATGGCCCATAAATTAAGGGCTGCCTGGTTACCATAATTTAATATGGGATCAGCTTCCGCGCCATGCGATGCCACAACAAACGCACTGTTGAACAGTCGCTCGGCTTGTGTCAGCAAAGTGCCGCTACGATCCATTAGCTCCAGTTTGGTCCAGTGAACATAGCTGTCGAGAAGATATTGACACCAGTTTATGACGTTCGGATTGGTCCAGTGGGCTTGCATTGCTCATGAAGGGGCGGAAGAAGGTTATGAGTGTAACGCACACGATTGTGAAATGACAACTACTTAGTCGTCCCTGAAAAACCCCATCAATCGCTATATTTGTATCAGTGGTTTCAAAAGATGGTTTGTCAATAAAGTAAACGAACAGGCTAATTTTGATCTATCAAAGAATCTGTGAAACTTGTAATCTTCGCCACGGGAAGAAAAACAAAAAAATGGGCAACAGCCATTAGTTTGAGATTCCAGGCGGCAGCCATCAGC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56 | uncultured_Mediterranean_phage(20.0%) | transposase,capsid,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1823769 : 1832081
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013341|1823769:1832081|DBSCAN-SWA AATGGCCAGTAAACCTGAGAAAAACCTTGAAACATTTCCAAATCCATTTATTAATCGGGATTATCACATTCATATGGAAATTCCTGAATTTACTTGTTTGTGTCCCAAAACAGGACAGCCAGATTTTGCGACTCTGATTCTGGATTATGTTCCGGATAAAAAATGCATTGAACTTAAAAGCTTAAAATTGTATATCTGGTCATACCGGAATGATGGTGTATTTCATGAAGCGGTGACAAACTTAATTCTTGATGACCTCATCGCAGTTTTGAAACCGAGATATATCCGATTGATAGCGCGTTTTTATGTGCGTGGTGGCATTTTTACAAACATTATCGTGGATCATCGCAAAAAAGGATGGATGTCTAAGTCTATGATTCCTATAGGAGAGCTATCGGGGCAGTTAAATTTTCGAGAATGATTATTAATTATTGATATAAAGATAATCGTCTAACATTATGATATGTAATGGTATATATATATATTGCAATATGGCAGTATGAAAAAAACAGTTTGCAAATAGTCAATTTTTATATATCCTGTCAGGCGATATAGGTATATAAAAGTATATATAGATGATTATAAAAAGAAATGTCATTTTTGCTATATTATTCTTACTGATTTCCGCTGCGTGTTCTTTTTTATCGTTTAATGCATTTGCAGATCGATTATTGCACGACAAAGCTCAGCATAGTTCAAATTTGTGGGAACGTATTCGTAACGGGTTTGCATTAGCCCTCCCACCTTCTCCGAATAATAAAGCAATTCGCAAGATTGCGCTCAATTATATACAGAATCCCCACGCATTTAACAGCATTGTCGCAAACGGTGAACGTTATTTGTTTTATATAATGGAGGAAGTTGAGCGTCGTGGAATGCCGATGGAAATAGCATTGCTGCCGATAATAGAAAGCGCTTATGATCCTTTGATAAAATCAAATAGCCAAACAGCAGGGCTGTGGCAATTTATTCCGGAAACAGGGCGAATCCTGGGCTTGGAACAAAATGTCTGGCATGATGATCGGCGCGACATTGTGGCATCAACTCAAGCGGCTCTTGATTATCTTCAATATCTTTATCTAAAATTCGATAATTGGAAGCTGGCGTTAGCGGCTTACAATCTGGGTGAAGGTGCTGTAAGCAAAATTCTGGCAAAGCACATCCATAAAGGAAGGACCGTTAATTTTTATGATGTGAATTTGCCGGTTGAGGTTAAGCATTATGTTTACAAGATTTTGGCCATAAAAGATATCGTTGCCAATGCTAAAAAATATGGTATACAGCTACGGTCGATACCAAATCGCCCGTACTTTGATACTGTAAAGATTCATGAACACATCGATATTCCGCTCGTTACACGCCTTGCTAATATTTCCGAGGTTGAATTCACAGCGCTAAATCCGGCTTATAATCGTTACGTTATTAAAGTCAGTAATGAGCCTCGTACTTTATTGATACCAAGAGAAAAGAAAGAGATATTTGTTAGAAATCTGGAAACTTATCATGATCCTAGAATTTCATGGCAATTTTATCGAGTCAAGAAAGGAGAGAAAATTAATGAGATCGCTACTCGGCATGAGACTACTGTAAAACAGCTCCAAACAATCAATGGGATTGCTCGAAACAAAAATCTTACACTAGGTCAAAAAATATTGGTGCCTCAAATTGTGGCAGGAAATCAAATCGCTCGATCATCCTGGAAGATACCAACACAACGTAATCAATCTGTTGTTTATGTGGTGAAAAAAGGCGATACCCTATATGAAATTGCAAAGCGTTATCGCACAACAGTTGATCAAATTAAACACTGGAATAATAGCGATGAAAATTTGTCCATAGGTCAGAAGCTGGTCATGCTAAGAGGCTAATCTGTGCCAAGGCAGCATGTAACCTTGTAAGCATTTGTAATAAATGCTATTCAATATTTTTAAGAAATTCAATAGCCCAATTAACACCAAATCCTGTAATCTCACTGTTAACCGCACCTAACCCCCCTTTGTGATTGCTCGCGGATAAATCCACGTGTAACCATGGCGTGTTCTGTATGAATCGTTTTAAAAAACATGCAGCAAGTATATGATCGAAATCCCCGTCTAACTGACATTGTTTGATATCGGCGATATCGCTTTCAAGACTTTCTTCATAATCTGTATCCATCGGAAAAACACAAACACGTTCTCCACTTTTCGTTCCTGCGACAATAGCTTTCTGGCATAAATCATCTTGATTGCTGAAAATTCCGCTATATCGGGATCCCAAAGCTGTTTTCATACTGCCTGTTAAAGTGGCAAAGTCAATGATCAGATCAGGTTTTTGTTGACTTGCTAAAGTCAATGTATCTGCCAAAACCATTCGACCTTCAGCGTCAGTGTGTACGATTTCAATCGATAATCCGTTTAATGCTGAAATAATATCGTTTTGCTTATAGGCACGCGGGCTGATATGGTTTTGTGCAATGGCAAGCCAACAATCAATTGTGACAGGTATTTCGGCGCGTGTGGCTGCAAGAAGAATACCTAAAGCAACAGCAGAGCCATTCATATCTTCGTGCATGCCCTGCATATAGCGAGCTGGTTTTATATTGTAACCACCAGTATCGAAGCAAATACCTTTGCCCACAATCGCAATTTTTTTATTTTGGGAGCCAGGCTTGCAATTATGCTGTAAATGTACAATAGCAGCATCTTCTGTGTCGCTTCCTTGTGCAACCGCAATAAAAGCGCCTGCTCCCATTTCTTTCAATTTATTAAAATCAAATTCTTGATACTTCCATCCCTCATTTTCAGCCAGTTTCTTGATCTGTTGTCGATAAGTCTTAGGCATTAATTCATTTGCAGGAAGAGCAGTTAATCCGCGCGCTAATAAATTTCCTTCTGCTAATGCACGTTGCAAGGAAAAATTATTAGCATCTTGATAGCCATATAGAAACATCTTAATCAGCGGTTTCCTGATCGGTTTACTTTTGCGCATCGGCAATACAGCTCCATTGATCCAAACTGTGTAAACAGCCAGTTCAGCAAAGTTTCTTTTTTGCTGCAGGGTGCCATAAACAGCAATATGTATTTCATCCGGATTTTCTAGAAGCAGAAATTTTATTGCCTTGCGTAGGCGCGTTTGTTGTTCAAAAATGGGTTTGTCAGTATCAAGCATTACCCAACTACATAATTCACCATTCTGGAGATTTGCACTCACGGGAGTTTCGCTAAGCTCTGTTAATTCCATATTGCGCCGCAATAGTAATTTATTCAGAGGCTCTTCACCGGGAATACTATATTTCTTGGGTAACTTGTCTAACTTAGGAAGTACTACGAGAATATGAGGTGTTTTAATTGATTGATCAATAGATGATATATTCTGGAAAAGGGATGCCAGCATTGAAAGCTTTCCTGTGAAATATTATTTTCTGTGTAGCGATGTCGGGAGTCATTACAAAAAGAACGATTGCAGATAATATTGCTATTATATACGTGTTATGTATGCTGTGGCAGGGATAGCCCGTTGCAGATAGATTAAAAAAACATGAATAGGGGATTTTAAATAAGAATGCGTCAATATCTCGAATTAATGCAACATGTTATTGATTACGGTTTTCAAAAAACAGATCGAACGGGTATTGGTACATTATCGATTTTTGGTCATCAAATGCGTTTTAATCTAAATGATGGTTTCCCGTTAGTTACAACCAAGAAATGTCATTTAAAGTCAATCATTCATGAGCTGTTATGGTTTATTCGGGGTGATACCAATGTACGTTATCTACATAAATATGGTGTTTCAATTTGGGATGAGTGGGCTGACGTAAATGGCAATCTGGGTCCTATTTACGGTCAACAATGGCGTTCCTGGATGAGTGCAGACGGACAGGAAATTGATCAGCTTCAGCAGGTAATTAAACAGATTATAGATACACCTGATTCGCGTCGAATGCTGGTTTCTTCGTGGAATGTAGGTGAATTGCACAGAATGCGATTGCCTCCATGTCACGCTCTTTTTCAATTCTATGTCGCCGATAATAAGTTATCGTGTCAGCTCTATCAGCGAAGTGCGGATATTTTCTTGGGCGTGCCATTTAATATTGCTTCGTACGCCTTGCTAACAATGATGATTGCGCAGGTTAGTAATCTCGGGATAGGGGAGTTCGTTCATACGTTAGGCGATGCGCATCTTTATCTGAATCATTTGGAACACGCGCGCGAGCAGTTATCGCGTGAGCCACGGTCATTGCCCGTAATGAGATTAAATCCGATAATACGAACAATTTCCGAGTTTGAATATGAGGATTTTGTCTTGGAGGGCTATGATCCTCATCCATTAATCAAAGCACCTGTAGCCGTATGATTTCAATGCGTCTTTCTATCCTGGTGGCTATGGCTAAGAATCGAGTTATTGGCGGAAATAATCAATTGCCCTGGCATTTACCGGCTGATCTTAAGCACTTTAAGTTCCTGACAATGGGTCAAACCATTGTGATGGGAAGAAAAACCTATGAGTCTATCGGTAGACCGTTACCCGGACGAGAGAATATTATTATTACCCGACAATCAGGCTATGACGTGCCGGGAGCAACTGTAGTGAATTCTCTTCAAGATGCCTTGTTGATATGCGAAGAAAGCAGTACGATCAATAAGGAAAGCTTTATTATTGGTGGTGAGAAACTGTACCGGCAAACGCTGGATATTTGTCAAAGAATGTATATTACTGAAATTCAGAGTGATTTTGAAGGTGATGTAGTTTTTCCGGAATTTAATCGCAACAACTGGGAAGAAATACAGCGCGATAAACATATATCAGTGAATGATGCGCAAATCGAATATCATTTTGTCATTCTTGAGCGTAAAGTATGACTCAAACATCCTTCAGGATTGATCTCTGCTCTTAATAGATGATATGACCAATATAAATGGTGAAACTATGCATCAAGTGCCATTTCACCATTTATTAGGATTATTGCTGTAGGTATGAGTGATCGCGGATTGTTCAGATCACTTTCACATCAGGTAAAGGAAATCCATTGAAATTACTTGCGTATGCGGTAGTGTAAGCACCTGCGTTCGGTATATAAATGAAATCTCCTTCCTGTATATTATTTGGTAGCATCAACTCATGCATCAAGATATCAACTGAATCACAAGTGGGGCCTGCAATTGACCAAGGGATGTTATTGCCTTTTCGGTCTGTTAGGATTTCATAACGCAATCCTTCAGTCATTTCTATGACACCGCCAAACATACCTGCATCCCAATACATCCATCGTTTTCCATTACGGGTTGCGGTACCCACGACGCGACATACAAAATAAGCTGAATCAGATACTAGGTAACGGCCTGGTTCTGCCATAATGCGGATGCTTTCCGGTAAATCAGCAATGGCTTCGTTGATAACTTCTGCGATGATTTCGATTGAAGGAATGGGTTTGACATGTCGAACTGGATAGCCTCCACCAACATTCAGCAATCGGGGGTTCAAGCCGACACATCGCATTTCAGCAAAGACTTTCTTTGCACGTTCGATACCAACGCGCCAATTTTGTGGATTACGGCATTGAGAACCGACATGGAAAGTGACGCCGGCCAGATCTGCTTTGAGTCTCACAGCTTCATGAATAATCTCATTAATATCGGCAAGATGCGTGCCAAATTTTCCAGCTAACGGCCAGTCACTGCCAATATTCGGTGTATCAATACGCAAGTACATTTTGGCATCCGGCCTGACGCTGACAATTTTTCGTAGTTCCTCAATGCTATCGAGCACATACCATTCAACCCCTTTGGCAGCAGCATATTCTATGTAAGCACGGGATTTCATCGGATTACTATAAAATATTTCAGCAGCCGGTACGCCTAACTTAAGTAGCAAGTCCAGCTCGGCAATAGAGGCGATTTCAAATCCAACGCCTTCATCGATCAAAGTATTAAGTACACGCTCATCAGGATTTGCTTTGACAGCATAATGTGGATGAACCCGGGGCATGACGGTAATAAAACGTCGGGACTTATGTCGGACAATATCGCTGTCCACTAGTAAAAAAGGGCGTTGATAGCCATTTTTCAGGGTATCTTGAACATGTTCAAAATTAAGACTAATTTCGGGATGAGTGTCGAACAGAACTTCAGATTGATTATGCTGCTGAAGTGAAGATGCGAGTTTAGGCATGCGAATGCTCCTTTAAATGACGCTACGTTTCAGGAATATGAATATTGACTAAATCAGCTGGAGCGAAAAAGTTCTTTATACTTCTCATGATGACCTCCTCATCAATAATTTTATGGATAAACAAATTGCACGCATTATAGTCTCCATTGTGGGCAAATCAAGTATTTTTTATATAAAAAATAATTTTTAATTGCAAAGAATAAACTATTGGAAACAATGTGTTGTATTAAATAAAATGATCGTCTCGTTAGGCGGTTGTTTTATAAAAAGTTTAGAGCAGGTTTAGGGTTTTCTGATAGCTTGTCAGTGCCATTGTATATTTAGGTAGCCGTCTGTTTTTTCATTAAATTTAAAGTGAAATTGATTTTCACCGCGGCTAATGGTTTTTTGTTGCATAAATGGGCTAAAAGGTCCAGCAGCAGAAAATGATTGTTCGATCCTTAAACGCCCCGTACGTGGCGAAAAGAATTTCAACATAAACTGTTTCGGACTTACTTCTTCTATATGCGGAGCGAAAGGTTTTGCCAATGGTTCACCGATGAATAGGCCTTGACCTGGTCAAGCAACACTTTTCCAATAGGCCTCAAGCGCAGAGGCACCTAATGCATACTGAAACATGGTAACTATGGGTGAGGGAAATTTTTGTGAAAAACTACACGGCTCAACAACGGTTCCATAGCTTGCTGTAGCTCCGGCCTCCAGCCATCGTAAACTGCTCATTTGCGGAGAATCAGTCAACATGCCGCCAGCTGACGTTAAATGATCTGCTAAAGCGCCTGGAAGAAAATACAATGTTTCGAGCATAGGCACTTTTTTCAAACCGGTAAAGTAAAAAAGCACATCCTTGCGCTCAGAAATATAATCGGCTGCTAGTATTTGTAGGGGAAATAGCTCACCCAGCTCTTCCGCAGCTTGTGTAAAGCTGGTTGCCCGACTGTTGCGTGCTTTATCCGAAGTATTCATTAAATAGGCTTGGCCTTTAGGAAAGCTGTAATCTGAACGTATGCCACGGTCGATCAATGCCTTGATGTGTTCGAAAGAGGTTCCGGCCAGCATCATCGCAGGGCGCAGCTTGTAATCGTCGTAGGGATAAAGGCTGGACGAATTGAAATAAGGACTAAGAGCGGTCGATCCACAGGGTTCGGCGCAGTATTTCTTGTCGAAACCAAAAGCCAACGCGGATGTTAACGACATGCAACCAACTCGGTATGGCGTAGTCCAGGCAACTGCGAATGCCTGCACATGTTTAGGGGTAAGCTGGTCAATAGTTGCTTTTAGTTGCTTGAATTCCTTTGGGGTTATAATGCTAAGTTTAGATGAGAAGCGTAGTTTAATGATGTTTGTTTCGGGTATTTGTCTAGCTTGCAGGTAGTAATTGCCTATTTGTCGCGACAATGGATCGTTTTCATTAATGATGACCGCGATATCATTGGGCCCCAAACTTGTTCGCGGCAAGGAAATACGATTCTGTGCTTCCACTGGCAAAGCTGCGGAAAGAGAGATAAACATCAGTAAGACGAAAAATTGCTGGATCAAGGTGAAATTTTCTTGCGTCAAATCAAAGCGCTTTCACGCTGATTAAGAAATACAACTTTAGATTTTTGGCAGCGTCACGCCATGCTGTCCTTGATATTTGCCGCCTCGATCCTTATATGAAGTTTCACAAACTTCATCCGCTTCAAAAAATATTACTTGTGCAACACCTTCATTGGCATAGATTTTAGCTGGTAGAGGTGTGGTATTGGAGAATTCCAATGTCACATACCCTTCCCACTCCGGTTCAAAAGGGGTTACATTGACAATGATGCCGCAGCGGGCGTATGTGGATTTGCCCAGACAAATGGTTAATATATTGCGCGGGATACGGAAATATTCGACAGTGCGGGCCAGGGCGAAGGAATTGGGTGGAATGATGCATACATTATTTTTGACATCAACAAATGAGTTGGAGTCGAAATTCTTCGGATCAACAATCGTTGAATTGATATTGGTGAACAATTTAAATTCATCAGAACAACGGATATCGTAACCATAGCTTGATGTGCCGTAGGAAACAATCCGTTGATTATCCTTTTGACGAATTTGATCGGGTTCGAATGGCTCAATCATGCCGTATTCCAGGACCATGCGGCGTATCCATTTGTCTGACTTAATTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013341|1823769:1832081|1825682_1827143_-|WP_062558885.1|DBSCAN-SWA MLASLFQNISSIDQSIKTPHILVVLPKLDKLPKKYSIPGEEPLNKLLLRRNMELTELSETPVSANLQNGELCSWVMLDTDKPIFEQQTRLRKAIKFLLLENPDEIHIAVYGTLQQKRNFAELAVYTVWINGAVLPMRKSKPIRKPLIKMFLYGYQDANNFSLQRALAEGNLLARGLTALPANELMPKTYRQQIKKLAENEGWKYQEFDFNKLKEMGAGAFIAVAQGSDTEDAAIVHLQHNCKPGSQNKKIAIVGKGICFDTGGYNIKPARYMQGMHEDMNGSAVALGILLAATRAEIPVTIDCWLAIAQNHISPRAYKQNDIISALNGLSIEIVHTDAEGRMVLADTLTLASQQKPDLIIDFATLTGSMKTALGSRYSGIFSNQDDLCQKAIVAGTKSGERVCVFPMDTDYEESLESDIADIKQCQLDGDFDHILAACFLKRFIQNTPWLHVDLSASNHKGGLGAVNSEITGFGVNWAIEFLKNIE >NZ_CP013341|1823769:1832081|1828102_1828612_+|WP_062558887.1|DBSCAN-SWA MISMRLSILVAMAKNRVIGGNNQLPWHLPADLKHFKFLTMGQTIVMGRKTYESIGRPLPGRENIIITRQSGYDVPGATVVNSLQDALLICEESSTINKESFIIGGEKLYRQTLDICQRMYITEIQSDFEGDVVFPEFNRNNWEEIQRDKHISVNDAQIEYHFVILERKV >NZ_CP013341|1823769:1832081|1823769_1824189_+|WP_062558883.1|DBSCAN-SWA MASKPEKNLETFPNPFINRDYHIHMEIPEFTCLCPKTGQPDFATLILDYVPDKKCIELKSLKLYIWSYRNDGVFHEAVTNLILDDLIAVLKPRYIRLIARFYVRGGIFTNIIVDHRKKGWMSKSMIPIGELSGQLNFRE >NZ_CP013341|1823769:1832081|1827311_1828106_+|WP_062558886.1|DBSCAN-SWA MRQYLELMQHVIDYGFQKTDRTGIGTLSIFGHQMRFNLNDGFPLVTTKKCHLKSIIHELLWFIRGDTNVRYLHKYGVSIWDEWADVNGNLGPIYGQQWRSWMSADGQEIDQLQQVIKQIIDTPDSRRMLVSSWNVGELHRMRLPPCHALFQFYVADNKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTMMIAQVSNLGIGEFVHTLGDAHLYLNHLEHAREQLSREPRSLPVMRLNPIIRTISEFEYEDFVLEGYDPHPLIKAPVAV >NZ_CP013341|1823769:1832081|1831514_1832081_-|WP_062558889.1|DBSCAN-SWA MTIKSDKWIRRMVLEYGMIEPFEPDQIRQKDNQRIVSYGTSSYGYDIRCSDEFKLFTNINSTIVDPKNFDSNSFVDVKNNVCIIPPNSFALARTVEYFRIPRNILTICLGKSTYARCGIIVNVTPFEPEWEGYVTLEFSNTTPLPAKIYANEGVAQVIFFEADEVCETSYKDRGGKYQGQHGVTLPKI >NZ_CP013341|1823769:1832081|1824343_1825636_+|WP_062558884.1|DBSCAN-SWA MIIKRNVIFAILFLLISAACSFLSFNAFADRLLHDKAQHSSNLWERIRNGFALALPPSPNNKAIRKIALNYIQNPHAFNSIVANGERYLFYIMEEVERRGMPMEIALLPIIESAYDPLIKSNSQTAGLWQFIPETGRILGLEQNVWHDDRRDIVASTQAALDYLQYLYLKFDNWKLALAAYNLGEGAVSKILAKHIHKGRTVNFYDVNLPVEVKHYVYKILAIKDIVANAKKYGIQLRSIPNRPYFDTVKIHEHIDIPLVTRLANISEVEFTALNPAYNRYVIKVSNEPRTLLIPREKKEIFVRNLETYHDPRISWQFYRVKKGEKINEIATRHETTVKQLQTINGIARNKNLTLGQKILVPQIVAGNQIARSSWKIPTQRNQSVVYVVKKGDTLYEIAKRYRTTVDQIKHWNNSDENLSIGQKLVMLRG >NZ_CP013341|1823769:1832081|1828745_1829921_-|WP_062558888.1|DBSCAN-SWA MPKLASSLQQHNQSEVLFDTHPEISLNFEHVQDTLKNGYQRPFLLVDSDIVRHKSRRFITVMPRVHPHYAVKANPDERVLNTLIDEGVGFEIASIAELDLLLKLGVPAAEIFYSNPMKSRAYIEYAAAKGVEWYVLDSIEELRKIVSVRPDAKMYLRIDTPNIGSDWPLAGKFGTHLADINEIIHEAVRLKADLAGVTFHVGSQCRNPQNWRVGIERAKKVFAEMRCVGLNPRLLNVGGGYPVRHVKPIPSIEIIAEVINEAIADLPESIRIMAEPGRYLVSDSAYFVCRVVGTATRNGKRWMYWDAGMFGGVIEMTEGLRYEILTDRKGNNIPWSIAGPTCDSVDILMHELMLPNNIQEGDFIYIPNAGAYTTAYASNFNGFPLPDVKVI |
7 | Pneumococcus_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1930904 : 1986779
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013341|1930904:1986779|DBSCAN-SWA AATGAAGATTATTTTTTGGTATTTGCAAGAATATGTAAAGACTGTAGATAAGTGGTTGTTATTTTTTTGCAGTGTATGGATTAGTCTCTTGATGGTTCTGAATTATCAGTGGGATATTGAGCGTGTCATGATCGTTGGTATGAGTTCTCGGTATTATCAATTTATTGCGCTTTTTACCGTCTACTGCTGCGCTTTTGTCGTTCCCTATTTATTTGCCATCCAATTCAGGAAACATGTGATCACCCCTGCGCCTGCATTTTGGTTGTTGTTGCTGTTTGCGCCAGCTTTATTTGCGCTCAAAGTGAGCATTGCCAATCCGCTGGAAAATATGTTGCAAGGCGTCTGGGGTGATTATTTGACGGTGGTGACTACATTGCCATTCAAATTTCTGGTCGTGCTGATCCCATTGGCAGTTTTATACCAAATACTTCCCACACAACCCAGTTTCTGGGGTGCAACAGTCAAAGATATTCGATGGAAACCTTACTGCATAATGTTGATGCTGATGATACCGCTGGTCATTTTTGCCAGTATGCAACCGGATTTCCTGAATGCTTACCCACGATTAAAGCAAATTGCTTTTATTGTGCCGCATACGGACAACTTGCCGGTGTATCAACTGTTGTACGAGATCAGCTACGGGATCGATTTTGTGACCATTGAATTATTCTTCCGCGGTTTTCTGCTATTCGCTTTTGTACGCTACGCCGGAGCAGCGGCAATTTTACCGATGGCTACGTTCTATTGCAGTATTCACTTCGGTAAACCGCTGCTGGAGTGTATTTCCTCCTTCCTGGGTGGATGGATATTGGGCGTTATTGCCTATAGAACCCAATCCATCGTGGGAGGATTGGCAGTGCATCTGGGAATTGCCTGGATGATGGAAATCGGAGGATATATGGGAAATCTCTGGTTGGGGCGGAATATTGCATAAATACTCGGAAATGAAGAGAGTAACTATGAAATGAAAAAGGGTTAAGGAAATTCCGGAAGCAGCACTCAGGCTTCTGTGGCAGTGTCTTACAAGGAATGTCAGTGCTCATGAGTACAGGGTGGAAAGAATATCGTTTCTCGGATAATTTGTTAGCCAGTCAAGTTTGTAATTCTCTAATATTAACTGTTGCGGTTAGCGATTGAATTCACCATACTATGAATGCACCCAACGATGTTTGGTGTTGTTCTTCGTAGCACAAGGATTCTTATTTTGAACTTCAACACCATCTTGAGTTTTTAAATTAGAAAATATCACTAATGAAAGGTGGCAACTTTATTAGGAGAATATAACATGAAGAACTTGTATATTAAGCTGTTTTTGTTGGTGGCGTTGTTTTTTGGGTTAAGTGCCGTATATGCCGCAAATGAGTTGAAATTCGAGGCGGACTTAAGCGGCGCGCAAGAGGTTACCACTCCCGCAGGCGGAGTGGCTACCGATGCTACCGGCACAATTGAAGTTGAATTTGATGCGGCGTTGACCAAAGCACAGTTTCGTCTCACTGTGCGTAGTGGTAGCGGGATCACACAGGCACATTTCCACTGTGCATCTGCAGGTGTGAACGGACCAATCGTGGCCTTTCTCTTCGGTCCGGTAGATCCGCCAGTGGATGTGGGCGAGGGATCAGTTGAGGTTACTCTGGATAACAGCGATATCTTATCGCCTGCAACGCCTGAGGCAATTGAAGCCTGTGGTGTACCGCTTAATAACATCGCTTCTCTGGCTTTCGCAATGCGTGCTGGAAAAATCTACGCGAATGTGCATAGCACGACTTTCCCGGCAGGTGTGATTCGGGGGCAACTACTGGAAGATAAGTCTGATGACTCTGACTCGCTTCAGTAGTAGGGTAGAGTGAATCTACTATCATGATCTGATGTCAGATGGTTTGAGAAGATCATGGGGTAATTGATTCTTCAGTCAAGTCTGATATCGTTGTGCCGGGTGTTTTTTGCCCGGCACAACGCATTATGTAAGGCACATTAATCAACATGAAGTGCCCGTGCAGGTTTTGAATTTGGCATTCGAATTCTTTTTTCTGCTTGCTTTACAGCCCGGCTCACAGCAATAAGAAGGCATGTAAAATGCAAGTCTGACCCCGTGTTCCTACTGTTTTGGTGCTTAATCAAGGGGATTGATAATGCGTGAAGGTAAAGAAAAAATCACCGTCTATTATGATGGCGCATGTCCCAGTTGTATCAAGGATCGGAAGAACTATGAAAAGTTAGCTGGGGAAAGTGGGGAAGACGTATGCTGGTTCGATATCACCGGGCAAGACAAACATTTGCGTGACATCGGTATCGATCCACACTTGGCCTTGACTCAGTTGCATGTTCGTGATGAACATCAAAAAATAGTTTCCGAACTGGATGCTTATATATTGTTGATGTCCCGGGTATTCTTATTAAAGCCGCTGGCTTGGTTCATCGGCCTGCCAGTGATTCGGCCATTGCTTTCGTCACTTTATCACCGGATGGTCAACCGGCGTCTGGAGAGGAGCGGGCGCTTGTAGATGGATGAGAAACGATATTTCCAAGGTGAAGACGGTGTGAAACTCGCATACCGGCGATGGACGCCGGTGCAAAGCAGGCGGAATACGCCATTCTTGTCTGGCTGCGTCGGCTTCATGAAGCCAACACTACGCAACTAAAAGAAATGCTGGCATGGTATGTGGATATCTGTGGTTACCCATGTGAAATATCAACAGATCCTAGTAAGAGCTTATACGGTGATGCCGAAAAGATCCGCAAACATTCTATGGAACGGTATGCTTAGTCATATAGCTTCTTGAAAACCTCCGGCAAAGTGAATAATCCACTCATCAAGGTGTGTGTGCAAATTAAACCACTACAATATCTATTTTGTCCGCCGCTTAACAGCATAACCATATTGGATAGGCCATTCGGGTTCTATCCCTAACGTGTGCTGCGCCTTGAGCGCCCAGTACGGCTCCCGCAGTAACTCTCGACCGATAAAAACGAGATCTGCCTGGCCGCTGGTAATGATTTCATCTGCGTATTGCGGATCGGTAATCAGTCCTACCCCGCCTGTGTGGATTTGTGCTTCATCACGGATTTGTCGGGCAAATGGAACCTGGTAGCCTCTGGCAACCGGAATTCTTGCATCCGGTGTCGAACCACCGGATGAGACATCGATCAGATCCACCCCAAGTAACTTCAGTTCTTTGCACAGAATAATCGATTGTTCTATATTCCAGCCCCCATCGACCCAGTCGGTTGCAGAGATTCGCACGAAGAAAGGCAGTTTGGATGGGATAACATCGCGGAGGCGCTTGGCAACCCTTAGCAAAAGTCGCATGCGATTTGCCAGGTTGCCGCCATAATTATCAGTGCGATGGTTGCTTAAAGGCGATAGAAACTCGTGCATCAGGTAGCCGTGTGCTGCGTGAAGTTCTATTACTTTGAAGCCCGCATCCAGCGCACGTCGAGCGGCTGCTCCCCATGCATCAACACAATACTCAATATCTGTTTCCGACATGGGTGTTGGAACCGGGTCGTCAGCGTAAAACGGCGAAGAACTGGGACCAATCACTGGCCAGCCTCCTTCCGCCGGCGTTTTCAGGCTGCTGCCGCCATTCCACGGGGCATCACAACTGGCTTTGCGCCCGGCATGTGCGAGCTGGATGCCCGGAATCGCACCTTGCATCTCCACAAATCGCGCAATGCGAGCTAGCGGCTCGATATGTTCATCTTTCCAGATTCCCATGTCTCCCGGTGAAATGCGTCCTTCAGCCGTAACTGCAGTGGCTTCAACAACCACAAGCCCTACGCCCCCGATTGCCCGGCTGCCCAGATGGACGAGATGGTAGTCGTTGGCAAAACCATCGTGGGCGGAATACATGCACATGGGCGACATTGCGATCCGGTTGCGGAAAGTAACGTCGCGAAGGGTAAGTGGGGACATCAGGTCCACTTCCGGAATTTCTCGGTCGTGCTCGCTCTGACATTGTGTTTGGATGGCGGCATTGCTTAGCTGACGATCGCTGATGGGAGCGGCTGTTGCAACTTCCGTGGTGGAACTGGCGGTAGGGCCTGCCCTGCTTAGAAGGTCAGGAGTTCCAGCTGTGTCGTGTTTGTTCTCGTCGTAATGGGACATGATTTTTTCCTCATTGAAAAATTGCCAGTGGCCTTTTGATTTTCCTGAAATATTCGTAGCGGAGCATTTGCTTTTTGGGTGCATATCCGCTCTGATGCTCTCAAGGCTGTTACTTGAGGATTGGTATTTGTGAAACACATCTTCTTCAAGGTGATAGCGTCCCACGGTAGATGCTAGGTTATCCCACGACCTGCAACATCGGTGACCTCTGAGACATCGTTAATCAGCCTGACCACGTGCGGCATATCCATTTCTCCTACCGGGAAAGCTTCGTACGAATCCTTTTCTGGATCCAGTTCACCAAAGAATACTGATCGAAATTTTTTCATCCATTGGTAGAAAGATAGCTCCTTGTGCCTTAAGCGTCAAGTAGTTACAATCTTGGCACGTAGTCACCACATTTTCATAGCTTCCAGAAATTCCTTCGGCCAGCGGTAATGAATATTTGTATTGATGCTTTCCCGGCGACATAGCTCAGCAATTTTGTCTTCGCCTCGATGATCCTCCAATTCGGATGCGAATCTTTCCTTCGACTGAATAATAACGGCGGGCTGCGCGACGAAAATCCCCTGCTGTTTTCTCAACATTGCGTTTGATATGATCATTCTTTGTCATCATCGTTACTTAGTTGGAGAACAATGAATCAAAACTATCTCTTACGCAATCAGGCTATTTTGTCCAATTTTTGCTGATGGAACACGATGTGCAAAAATCAGCAATTGAAATGGTTATGCACGATGCAAAGTATCGTAAGTGAAGTCATTGATTTTCACATAACTTTCTAAAGGGCACCTCTAAAAATCCATATTTCGTCACAATACATTGTTGTTCACAAAAAATATTTCCTTACATATCAATTATATGCTGCGTCAACATTTTTTGTTCTCGCCTCGTC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50 | Oenococcus_phage(14.29%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2247888 : 2262549
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013341|2247888:2262549|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013341|2247888:2262549|2248942_2250019_+|WP_062559214.1|transposase|DBSCAN-SWA MQMSFGTLELAERLKRENVLVKIEGLIEWEELRPKLTGLYKRELSHGGGQEPFDGLLMFKAILLGQWHSLSDAALEQALCVRIDFLQFCGLSLSDAIPDETTLCRFRNRLITNDRLDDLLASINEQLQSHGLMIKGATGAVIDATLIESAARPKKTITLEVDAEEGKVVQFEDGSQPGINCIEEQSADPDATWLKKGKKSQFGYRSYLVVDAQDGYVRGVHTAPANQSEMMHFEAAIDGAHIEANRVYADKGSASNANRQFLRKQKIKSAIMHRAYKNKPLSSRQKLANQLISKKRYIVEQCFGTIKRLFRMGRASYFGTTKVNAQVILKSICMNLKKAANKIFVDQPLRGAIRPNIT >NZ_CP013341|2247888:2262549|2251711_2252305_-|WP_062559217.1|DBSCAN-SWA MLNHRVPWQYVVTVVFIGTVFFIIALLGSLISGYLNWNSIITVIFLILGFIIIIWIIPTLLNLSRSFYAFLFILLLLQIGTTILAFALHYKSSGLIGECGEFIPDLSDAIYFSITTFTTLGYGDLQPLESHRLTTSYEALAGMASMAIGASLIWLWCQENLIPKEMALFDGDRTNKKTFIEGRIRVRTLTGKEKELY >NZ_CP013341|2247888:2262549|2254960_2255503_+|WP_062559222.1|DBSCAN-SWA MKRLFIFVIFCLISACANLPKGPSIMALPGSGKSFEQFRSDDNECREYAFQQLEGNTPQHASNSSGVQSAVVGTGLGAAAGGAIGGGEGAAIGAGLGLLMGAIFGRSNASTSGNIHQQTFDNNYIPCMYAKGHSVPVAGNVTKNPSSTYNGANRTTPTLSPNINPPLPPSDNPPPPPSIR >NZ_CP013341|2247888:2262549|2254389_2254764_+|WP_062559221.1|DBSCAN-SWA MEKSEKLSNIDKTSQFAHEAIDKATNATYKVATKIVDKGDELNQVANKIVDKGDELNNLAHETIDKATTATHEAIDNLQEKKDQLINAEQEVIAKYSTYVRENPVRALGIAVGVGFLVSKFLNR >NZ_CP013341|2247888:2262549|2258325_2258949_+|WP_082633026.1|DBSCAN-SWA MRFTILLFLLLVPRIAFAENLLVNSNKLFNFAEKSYPELFSPASTATFNLDNYLVRYYPNTGNYLGTLGEDIYVYGDVFNGLLKAGVISNFIELEPDSDELLAQLFGGGQSNVQVYGSGVVTSILSDDLDGSRHQRFIIELKSKQTLLIAHNIDLAPRVDGLSLNDQIEFFGEYEWNDKGGVIHWTHDDPEEIHVNGWIFHNNVIYQ >NZ_CP013341|2247888:2262549|2250302_2251163_+|WP_062559215.1|DBSCAN-SWA MLWKTGRRSQNIEDRRGLSVSRGVGGGGIGILLLVLAALFFDIDPRIVMQGTEILSGGSASLHTQTQPIPSGQEEAKEFTSVILADTEDTWRTLFSEQLNKKYKEPTLVLFSGAVQSACGFAQAAVGPFYCPYDQKVYIDLTFFDDMKKLGASGDFAQAYVIAHEIGHHIQILLGISDKVIAEGKNMNKYHKNALSVRQELQADCFAGVWANNAHRARNILESGDIEEGLNAASAIGDDRLQKQSQGYIVPESFTHGSSEQRVRWFRKGLKSGKIGDCDTFTADKL >NZ_CP013341|2247888:2262549|2247888_2248326_+|WP_062559212.1|transposase|DBSCAN-SWA MRDVVEKASHCGWQIHYHIVFPVKYRRGLLDDAVVKIIMMTAKAIEDRYDIEFEQIGCDEDHVHILCTAHPKIAPGQIVRVFKSITARELFKWKPDLKRDLWGGEFWTDGYYVATVGERADWGVVERYVKNQGKPKEELRQLELF >NZ_CP013341|2247888:2262549|2261102_2261744_+|WP_158441771.1|transposase|DBSCAN-SWA MVRNCGARGYRPKQAHNKAIERKAINARAIDDVTWQFAQEKLMLQWSPDQISNYAGISIETVYQRVYADKRNGGILWKNLRCQKQRRKRYGKTDRRGIIPNRQSIEQRPAIVDARSRVGGWEADTIIGKNHRQAIVSLVERKTGYTLIRKVERKTTEAVIKATTRLLKPHRRRVHTITSDNGLPAESTDIYLKNIPGTCTVPNNKSRPSAACT >NZ_CP013341|2247888:2262549|2252981_2253179_-|WP_062559219.1|DBSCAN-SWA MDFEKFLSLIDKSALYFPRLDKLSKVDPYEGHFTHVNAMIGNEEITLFDQLKHQVIAHIDKEKKG >NZ_CP013341|2247888:2262549|2252355_2252985_-|WP_062559218.1|DBSCAN-SWA MIEVDNKSFEDAEDWGKKKYEGDKINIDLIALAHREIPRAVLNDRNKIFVHSWHMQEYESAAMWSLYAKYSNGIAIVSTYNDLVQSVLDNQDYIVYIGIVNYIDYRKDHIPVKNMLSPFLYKRKSFEHEKELRALIHVRKYDEYDRPIDTDQNINGIYVNVNLNELIKIIYISPTAEEWIVDLIKSILKKYNLNLLVFHSDLQSSAPIY >NZ_CP013341|2247888:2262549|2256491_2257658_+|WP_062559223.1|transposase|DBSCAN-SWA MHSGKLVFAQLMDYLPLHTFRRCVQRYPSKYPTKTLSHLDQFLCMAFAQLTYRESLRDIETCLRAHQAKLYHLGIRGNIAKSTLADANEQRDCRIYMDFAMSLIQIARKLYSSDSLAVELEQTVYALDTTTIDLCLSVFPWARFRQTKAAVKMHTLLDLRGNIPTFIHISDGKMHEVNVLDFLIPEAGSFYIMDRGFTDFARWFTMHQAQAFFVTRAKSSLLFRRVYSHSVDKSTGLRCDQTIALTATKASKDYPQHLRRIKFYDAEHDKHLVFLTNNFDLPALTIAQLYRCRWQIELFFKWIKQHLRIKQFYGTTENAVKTQIWIAISVYVLVAIVKKRLNTETSLYTILQILSLTLFEKTNLDQLLKNTEMQMITHHNNNQLNLFN >NZ_CP013341|2247888:2262549|2254080_2254344_+|WP_062559220.1|DBSCAN-SWA MKNIDTVVDFASKTIDNTMNATNNTIDKVSKVTKEVADTIGEKGDQIRSVEQRLVKETTSYIRDNPLRSVGIAVGVGFLLSKWFNDR >NZ_CP013341|2247888:2262549|2261799_2262549_-|WP_062559227.1|transposase|DBSCAN-SWA MKATHALPAEITIGFEPTADYHRNVAFWFKHQGAQCMLASSLSVARAREMLFKTWDKHDRKDARLILYLMQQGMVRPFYDPLVESTMDIQELSNIYHQISLSRTRIQHSLLNHYLTLYFPEMERYLHSTRAEWFCRLLLKFPTPTSILRYKKATFVKRAWDIVGRKVCKQRFLEEVYEIAAHSIGLPVALKGLGITTFKLQLPRYLELSIQRNELEKMAESMLSQRTDYQRLRTLPGVGPIISLIKLLC >NZ_CP013341|2247888:2262549|2259844_2260921_+|WP_062559225.1|transposase|DBSCAN-SWA MQMSFGTLELAERLKRENVLVKIDALIEWEDLRPKLTGLYKRELSHGGGQEPFDGLLMFKAILLGQWHSLSDAALEQALCVRIDFMQFCGLSLSDAIPDETTLCRFRNRLITNDRLDDLLATINEQLQSHGLMIKGATGAVIDATLIESAARPKKTITLEVDAEEGKVVQFEDGSQPGINCIEEQSADPDATWLKKGRKSQFGYRSYLVVDAQDGYVRGVHTAPANQSEMMHFEAAIDGAHIEANRVYADKGSASNANRQFLRKQKIKSAIMHRAYKNKPLSSRQKLANQLISKKRYIVEQCFGTIKRLFRMGRASYFGTTKVNAQVILKSICMNLKKAANKIFVDQPLRGAIRPNIT >NZ_CP013341|2247888:2262549|2248651_2248837_+|WP_062559213.1|DBSCAN-SWA MNQKNQGEGNREAAKEYNEATKDFVESGKVEKNMNKHINLTDEEKKEIQEAEVKGKEKAKK |
15 | Rhodococcus_phage(100.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2484286 : 2525170
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013341|2484286:2525170|DBSCAN-SWA 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37 | Staphylococcus_phage(40.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2528642 : 2658177
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013341|2528642:2658177|DBSCAN-SWA 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MATNVNKIDSNITGLRIAEEESINVLPVTPNWVPAEPNDYGDIGSKITTLVRNPITDGRQRKKGVVTDLEASASFGSDFTQTNFQELLKGVFYANYRTKAERTDIPSVTVQAGDDTYELASTTGFLVGSLVFGSKFTNASNSGLHRVTAVDPDVSIAVAETLTTEASPPADSKLVVVGHQFASGDITVDVSGSLPKLVSAAFDMSTLGLTVGEWIYIGGDEEAQNPLNAVNSGFKRIRLIDPDFLELDKSDSTMVTDAGTSKTVRIYFGRKLQNETGVNIVRKTYQLELSLGAPDTAQPSQIQALYMKGCLADKLDISIGTATKITNNISFIATDSETRASTVGLKSGNRPTLEDSDAYNTSSDVKRIKMAKVSNTDEAAAKFFSFVTDLNLSISNNHKPAKAVGVLGAFDISAGTFAVTGDVTAYFTDIEAINSIRNNEDITIDAIVVKDNAGFAIDLPLISLGGGNPNIQLDEAVKLPLTMDAATAASISPDLDYTASITFFDYLPDVAEV >NZ_CP013341|2528642:2658177|2608082_2608313_-|WP_062559514.1|DBSCAN-SWA MGNVEIYAPLVNGSVFPYYENGESCKYLVERILGDDLRPPARSLTIRIITTSGKEVVIVIPNDHSEATVRLDGEKI |
139 | Pseudomonas_phage(28.89%) | transposase,terminase,tail,integrase | attL 2581129:2581146|attR 2661445:2661462 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2663641 : 2701087
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP013341|2663641:2701087|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP013341|2663641:2701087|2665581_2667183_-|WP_062559579.1|DBSCAN-SWA MTSVNYRRRQFLQYAALGTITAAMPGFSLAEIRSAGKTANSAFKADVEIALTAQAADMPILPGAHTHVLTYRGKVLNGPQTALKELPGYLGPILNFERGQKVRIYFRNQLPEPCITHWHGMHVPQVMDGHPMYAIDQGEQYIYEFEVDNPAGTNWYHAHTHELTATQVYQGLGGLITVTDEAERRLELPSGEYDLPLIIQDRSFTQGNQLRYMLGMHQRMQGFWGDTILLNGQKDNVIPVKTRAYRLRILNASNARIYKLGWNDGTPLTAIGTDGGLLPRPETFPYIMLAPAERVELWVDFSDRKVGSDLTLHSLPYQIPTSHMGGMGGRGRMGMMDQAGQHEALSIATFRIAERTSDSPKLPDRLIPMQRWTASHVTQPDKTVPIAIGMRHMSFQLNGRTFEMENYQEIEKIPVNSLQRIRIFHESGMRMGRMGGGMRGGGMGMMMSQPHPIHIHGQQFQIVSRTQTNSQSSAYNTIKDGFINNGWKDTVLVWLGEEIEIIKPFQDHVGLFLYHCHNLEHEDMGMMRNFWVG >NZ_CP013341|2663641:2701087|2670619_2670919_+|WP_158441782.1|DBSCAN-SWA MSAIFILVSTSVSSQSPQPQNNLNRDSMGSSQSDSLSRDLSRDGSQVNPNNPAIVNPNDPTGVNSNMPGSPAAPSSNPSGMNSNVPSGTSPSNPAGSNY >NZ_CP013341|2663641:2701087|2688431_2689253_-|WP_062559595.1|DBSCAN-SWA 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36 | Enterococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
2784539 : 2814219
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP013341|2784539:2814219|DBSCAN-SWA 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35 | Paenibacillus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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