Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP009828 | Staphylococcus aureus strain MS4 chromosome, complete genome | 10 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 8 | 3 | 11 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009828_1 | 658079-658186 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009828_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009828_1
>1.1|658118|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder GTTAAAGAATACAGTTGGTTTGCTTGCGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009828_1
The CRISPR arrays of NZ_CP009828_1 >merge|NZ_CP009828|1|658079-658186|CRISPRCasFinder CAACTGCATAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGGGTTAAAGAATACAGTTGGTTTGCTTGCGCACAACTGCATAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG >NZ_CP009828|1|1|658079-658186|CRISPRCasFinder CAACTGCATAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG GTTAAAGAATACAGTTGGTTTGCTTGCGCA CAACTGCATAAGAGCCCCTAATCGCTAAAGCTCAAGGGG
>NZ_CP009828.1|WP_001021155.1|656278_657940_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGGQFGYVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAATNDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_CP009828.1|WP_001819741.1|655898_656282_+|DUF1934-family-protein MLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_CP009828.1|WP_001200748.1|654580_655591_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_CP009828.1|WP_001788287.1|653560_654082_+|hypothetical-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_CP009828.1|WP_000180234.1|652237_653533_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_CP009828.1|WP_000477504.1|651721_652198_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_CP009828.1|WP_000633786.1|651015_651552_+|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTTETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >NZ_CP009828.1|WP_000808897.1|649867_650806_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESLAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVIENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >NZ_CP009828.1|WP_031845074.1|648836_648953_+|hypothetical-protein MILNRGAILEQGNKKAKVIKSELITNYIMLATLQIKNN >NZ_CP009828.1|WP_000882152.1|648150_648780_+|DUF443-domain-containing-protein MLCESRVINQNPKYRIIKYNNEYFMVDLVSTWIAYFLPMINWFIPKKYAKISRKEFESLNIVKPAKNNTFWPVAGFAVLLTTLTRKYIYLLNIHLEKEIVILTCCMILLGVFALFIYINTKLKLHIFDKNKSNNEKIILIPTFKNICLSFFAYIFFGGLSTMALSMLVTSSPQNIIEFLALIGMTACFFLLNMSSVLDKNIHVILKTNK >NZ_CP009828.1|WP_000901752.1|658205_658841_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNANHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKAELRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKSYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_CP009828.1|WP_072358141.1|659089_659917_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKDNDKQGSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_CP009828.1|WP_000143689.1|660067_661018_+|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLSTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPCKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVVADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_CP009828.1|WP_000365354.1|661072_661792_+|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >NZ_CP009828.1|WP_058142965.1|661775_662576_+|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLMLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNVDFEVYQESSAFLFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >NZ_CP009828.1|WP_058142966.1|662711_663218_+|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLANTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAITHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_CP009828.1|WP_001222132.1|663379_664096_+|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVILVIYFTIRLSSRTRL >NZ_CP009828.1|WP_001045420.1|664263_665052_+|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFLSYYLNFLKSVS >NZ_CP009828.1|WP_001018677.1|665304_665679_-|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_CP009828.1|WP_001824079.1|666626_667556_-|DMT-family-transporter MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIVLNIFINPDVFSLHFFSNQTFDYTWFVGGLLGVGYLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIIGIVIMNQFNKNNLLLTDQRYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSITLLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009828_2 | 774570-774655 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009828_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009828_2
>2.1|774598|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder CAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009828_2
The CRISPR arrays of NZ_CP009828_2 >merge|NZ_CP009828|2|774570-774655|CRISPRCasFinder CAATGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGGGCCCCAACAT >NZ_CP009828|2|2|774570-774655|CRISPRCasFinder CAATGCGAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA CAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAGG CAATGCGAGTTGGGGTGGGCCCCAACAT
>NZ_CP009828.1|WP_000197262.1|773938_774481_+|5'-3'-deoxyribonucleotidase MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP009828.1|WP_000663039.1|772721_773780_+|histidinol-phosphate-transaminase MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISSHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP009828.1|WP_000180997.1|770967_772482_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MTNFFDILSERKGQLFSTMIEHIQISFIALLIATAIAVPLGILLTKTKTISEIVMNIAAILQTIPSLALLGLMIPLFGIGRVPAIIALVVYALLPILRNTYTGIKEVDPSLIEAAKGIGMKPFRRLTKVELPIAMPVIMAGVRTAMVLIIGTATLAALIGAGGLGDLILLGIDRNNASLILLGAIPAALLAIIFDLILRLMAKLSYKKLLMTLGVIVMIIILAIAIPMFAQKGDKITLAGKLGSEPSIITNMYKILIEEETKNTVEVKDGMGKTAFLFNALKSDDIDGYLEFTGTVLGELTKEPLKSKEEKKVYEQAKQSLEKKYQMTMLKPMKYNNTYALAVKRDFAKQHNIRTIGDLNKVKDQLKPGFTLEFNDRPDGYKAVQKAYNLNLDNIRTMEPKLRYQAINKGNINLIDAYSTDAELKQYDMVVLKDDKHVFPPYQGAPLFKESFLKKHPEIKKPLNKLENKISDEDMQMMNYKVTVKNEDPYTVAKDYLKAKGLIK >NZ_CP009828.1|WP_000589262.1|769997_770975_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKFKNVTKRYGKHVAVDNISFNINEGEFFVLIGPSGCGKTTTLKMINRLIHLSEGYIYFKDKPISDYPVYEMRWDIGYVLQQIALFPHMTIKENIAQVPQMKKWKEKDIDKRVDELLEMVGLEPEKYKNRKPDELSGGQRQRVGVIRALAADPPVILMDEPFSALDPISREKLQDDLIELQTKIKKTIIFVTHDIQEAMKLGDKICLLNEGHIEQIDTPEGFKNNPQSEFVKQFMGSHLEDDAPCVEENAIIRDLDIMKPIDEVTTMSAYPIVYDNQQIEVLYQHLSESERVIVMQEDSVGQYVIDRKDIFKYLSQKKEVAQHD >NZ_CP009828.1|WP_000983680.1|767994_769776_+|DNA-helicase-RecQ MMQQTLSHYFGYETFRPGQEEIISKVLDHRNVLGVLPTGGGKSICYQVPGLLLGGTTIVISPLISLMKDQVDQLKAMGIQAAFLNSSLTQKEQQRIEKALSNGEIQFLYVAPERFENRYFLNMLQRIKIHLVAFDEAHCISKWGHDFRPSYQNVISKVFTLPQDFTIIALTATATVEVQQDIREKLNIAQTDQIKTSTKRRNLIFKVNPTYQRQKFVLDYIKTHDEDAGIIYCSTRKQVEELQEALESQKIESVIYHAGLSNKEREEAQNDFLFDRVKVVVATNAFGMGIDKSNVRFVIHYNMPGDLESYYQEAGRAGRDGLKSECILLFSERDINLHEYFITVSQADDDYKDKMGEKLTKMIQYTKTKKCLEATIVHYFEPNEKLEECEQCSNCVQQDKSYNMTQEAKMIISCIARMKQQESYSVIIQVLRGESTDYIKYKGYDQISTHGLMKGYTTSELSHLIDELRFKGFLNENDEILMCDTSIKKLLSNEVEVFTTPFKQKATEKVFINTVEGVDRVLFSQLVEVRKKLSDKLTIAPVSIFSDYTLEEFAKRKPASKQDMINIDGVGSYKLKHYCPAFLETIQNYKAKV >NZ_CP009828.1|WP_000525113.1|766099_767983_+|ABC-F-family-ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MGMEAYKIEHLNKSYADKTIFDNLDLSISEGEKIGLVGINGTGKSTLLKVIGGIDDDFTANVMHPNQYRIRYSSQKQDLNEDMTVFDAVLSSDTTTLRIIKQYEQAVQAYADDQSDKLFKRMMDAQEAMDQHDAWDYNAEIKTILSKLGIHDTTKYIKELSGGQQKRVVLAKTLIEQPDLLLLDEPTNHLDFESISWLINYVKQYPHTVLFVTHDRYFLNEVSTRIIELNRGKLASYPGNYESYIEMRAEREVTLQKQQQKQRALYKEELAWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLENEVNQQYKDDKGELNLAYSRLGKQVFELEDLSKAINDKVLFEHLTEIIQKGERIGVVGPNGAGKTTLLNVLSGEDQQFEGKLKTGQTVKVAYFKQTDETLDRDIRMIDYLREESEIAKEKDGTSVSITQLLERFLFPSATHGKKVYKLSGGEQKRLYLLRLLVHQPNVLLLDEPTNDLDTETLTILEDYIHTFGGTVITVSHDRYFLNKVAQSYWFIHDGQMEKIIGTFEDYESYKKSLDKNKSTLKQQSKSSTTVRKKNGLSYKEKLEYEQLMKRIEQAEVRMEEIDVLMIEASADYGKIKELNEEKEQLEIQYDLDITRWSELEEIKEQQ >NZ_CP009828.1|WP_000098285.1|763888_765829_+|polyglycerol-phosphate-lipoteichoic-acid-synthase-LtaS MSSQKKKISLFAFFLLTVITITLKTYFSYYVDFSLGVKGLVQNLILLMNPYSLVALVLSVFLFFKGKKAFWFMFIGGFLLTFLLYANVVYFRFFSDFLTFSTLNQVGNVESMGGAVSASFKWYDFVYFIDTLVYLFILIFKTKWLDTKAFSKKFVPVVMAASVALFFLNLAFAETDRPELLTRTFDHKYLVKYLGPYNFTVYDGVKTIENNQQKALASEDDLTKVLNYTKQRQTEPNPEYYGVAKKKNIIKIHLESFQTFLINKKVNGKEVTPFLNKLSSGKEQFTYFPNFFHQTGQGKTSDSEFTMDNSLYGLPQGSAFSLKGDNTYQSLPAILDQKQGYKSDVMHGDYKTFWNRDQVYKHFGIDKFYDATYYDMSDKNVVNLGLKDKIFFKDSANYQAKMKSPFYSHLITLTNHYPFTLDEKDATIEKSNTGDATVDGYIQTARYLDEALEEYINDLKKKGLYDNSVIMIYGDHYGISENHNNAMEKLLGEKITPAKFTDLNRTGFWIKIPGKSGGINNEYAGQVDVMPTILHLAGIDTKNYLMFGTDLFSKGHNQVVPFRNGDFITKDYKYVNGKIYSNKNNELITTQPADFEKNKKQVEKDLEMSDNVLNGDLFRFYKNPDFKKVNPSKYKYETGPKANSKK >NZ_CP009828.1|WP_000022323.1|762410_763415_+|biotin-dependent-carboxyltransferase-family-protein MSIIIEKSGLFSSFQDFGRRGYEHDGVIPCGALDTLAHEIANRLVANDKNEATLEMTNKMATIRFTEPTLIALAGGNVKAYTEHMTISPYKLYLLDKGDVLKFRETSYTSRVYLAVGGGFELDAWLGSNSTDFNVKIGGFKGRTLQDGDEIKLKRDYTARHHKLFENLAHTKQTDWGIDGYALSFNYMSDVFHVVKNKGTEDFKEDAIQRFVKHDYKVTSKANRMGMMLEGEKIKAFYEDMPPYQTVKKGTIQIKRDGTPIILLNDHYTLGSYPQIGTIASYHLTKLAQKPQGSRLKFQFIDILTAEKNLVKYSNWLNQLFHGIEYRMQLEMMK >NZ_CP009828.1|WP_000708692.1|761716_762427_+|allophanate-hydrolase-subunit-1 MKIYSQGDQAIVVAIEKEVSKSLTEDLLTLRSYLIEQNYPFIIEIVPSESDMMIVYDARDMIKHHNIQSPFLYMKALIESIHLNIKHDFNQQDLIEIPIVYGSKYGPDLESLLKHYKIKLETFIELHSKAQYFVSMMGYSPGFPYLTGLNKKLYINHTSKQKKFIPAGSVVLEGKKCGIVTTDTINDWLVIGYTPLSLFNPKESDFARLKLGDNIKFRPINENELEVGAFKDVNHN >NZ_CP009828.1|WP_014363392.1|761413_761620_+|hypothetical-protein MIIVYIALLLILVYVNYRLVNRLLSENRIYVVRLIATITTVISFILVYALIHELMPFVVRAMDLMYHQ >NZ_CP009828.1|WP_000429011.1|775088_776006_-|diacylglycerol-kinase-family-lipid-kinase MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP009828.1|WP_031760357.1|776098_776200_+|hypothetical-protein MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP009828.1|WP_000193751.1|776277_777783_-|peptide-MFS-transporter MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP009828.1|WP_000930014.1|778122_778623_-|NADPH-dependent-7-cyano-7-deazaguanine-reductase-QueF MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP009828.1|WP_001068497.1|778642_779509_-|DMT-family-transporter MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP009828.1|WP_000692521.1|780309_780708_+|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP009828.1|WP_000855509.1|780670_782776_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-alpha MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYSVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP009828.1|WP_000562498.1|782893_783865_+|class-1b-ribonucleoside-diphosphate-reductase-subunit-beta MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP009828.1|WP_000499195.1|784364_784520_+|hypothetical-protein MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP009828.1|WP_000876317.1|784558_785530_+|ABC-transporter-permease MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMEGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009828_3 | 951822-951979 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009828_3
|
2 spacers
spacers of NZ_CP009828_3
>3.1|951862|27|NZ_CP009828|PILER-CR ATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCGT >3.2|951929|19|NZ_CP009828|PILER-CR CTGTGTTGGGGCCCACTCC >3.3|951922|29|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder ACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009828_3
The CRISPR arrays of NZ_CP009828_3 >merge|NZ_CP009828|3|951822-951979|PILER-CR,CRISPRCasFinder AACTTGTATTGCTTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCGTCCAACTTGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATCTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC >NZ_CP009828|3|1|951822-951966|PILER-CR AACTTGTATTGCTTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGC TCCGCGTCCAACTTGCATTGCTTGTAG AATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACTCCCC AACTCGCATTGCTTGTAGA ATCTCTTTTCGAAATTCTC >NZ_CP009828|3|3|951893-951979|CRISPRCasFinder TCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC ACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATC TCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCC
>NZ_CP009828.1|WP_000390575.1|951508_951817_+|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MEEALKDSILGALEMVIDPELGIDIVNLGLVYKVNVDDEGVCTVDMTLTSMGCPMGPQIIDQVKTVLAEIPEIQDTEVNIVWSPPWTKDMMSRYAKIALGVS >NZ_CP009828.1|WP_001182436.1|950570_951395_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MQPHLICLDLDGTLLNDNKEISSYTKQVLNELQQRGHQIMIATGRPYRASQMYYHELNLTTPIVNFNGAYVHHPKDKNFKTCHEILDLGIAQNIIQGLQQYQVSNIIAEVKDYVFINNHDPRLFEGFSMGNPRIQTGNLLVHLKESPTSILIEAEESKIPEIKNMLTHFYADHIEHRRWGAPFPVIEIVKLGINKARGIEQVRQFLNIDRNNIIAFGDEDNDIEMIEYARHGVAMENGLQELKDVANNITFNNNEDGIGRYLNDFFNLNIRYYC >NZ_CP009828.1|WP_001124491.1|949202_950519_-|CoA-disulfide-reductase MPKIVVVGAVAGGATCASQIRRLDKESDIIIFEKDRDMSFANCALPYVIGEVVEDRKYALAYTPEKFYDRKQITVKTYHEVIAINDERQTVSVLNRKTNEQFEESYDKLILSPGASAHSLGFESDITFTLRNLEDTDAIDQFIKANQVDKVLVVGAGYVSLEVLENLYERGLHPTLIHRSDKINKLMDADMNQPILDELDKREIPYRLNEEIVAINGNEITFKSGRVEHYDMIIEGVGTHPNSKFIESSNIKLDRKGFIPVNDKFETNVPNIYAIGDIATSHYRHVDLPASVPLAWGAHRAASIVAEQIAGNDTIEFKGFLGNNIVKFFDYTFASVGVKPNELKQFDYKMVEVTQGAHANYYPGNSPLHLRVYYDTSNRQILRAAAVGKEGADKRIDVLSMAMMNQLTVDELTEFEVAYAPPYSHPKDLINMIGYKAK >NZ_CP009828.1|WP_000902813.1|948641_949031_+|YisL-family-protein MLHLHILSWVLAIILFIATYLNISKNQGGTPYFKPLHMVLRLFMLLTLISGFWILIQSFMNGGANHMLLTLKMLCGVAVVGLMEVSIAKRKRHEQSHTMFWITIALIIITMVLGVILPLGPISKLFGIG >NZ_CP009828.1|WP_000670755.1|947411_948314_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVERLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NZ_CP009828.1|WP_000154915.1|943592_947246_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTDWLDQLVTPYEEEAQQAELIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMRRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNITAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIHSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISKVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_CP009828.1|WP_000172334.1|940115_943592_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSMKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDSELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYKDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNINIDDEFGGEQ >NZ_CP009828.1|WP_000711897.1|939380_939956_+|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKYNFNPENTKN >NZ_CP009828.1|WP_000758211.1|938840_939365_+|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLVDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NZ_CP009828.1|WP_058142970.1|938260_938836_+|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEMFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLIVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_CP009828.1|WP_001044212.1|952470_954285_+|acetyltransferase MNKTKGFTKYKKMIYMPGLDGLRAIAVLGIIIYHLNKQWLTGGFLGVDTFFVISGYLITSLLLKEYDDTGIIKLKSFWIRRLKRLLPAVIVLLMVVGTATLLLKSENIIRVKHDIIAAIFYVSNWWYIAKDVNYFEQFSFMPLKHLWSLAIEEQYYIFFPVILVTLLLTIKKRYKIGFIFWGVSIISLGLMMFIYSINGDHSRVYFGTDTRLQTLLLGVILAFLWPPFKLKNDPPKVVKYIIDSIGSLSFIVLILLFFIINDETNWIYDGGFYLISILTLFIIASVVHPSTWIAKIFSNPVLVFIGKRSYSLYLWHFAVISFVHSYYVDGQIPVYVYFIDISLTIIFAELSYRFIETPFRKEGIKALNWRPSYIPQFIRMAIVVTLLIPFMLILVGAFNKYGKDIIGEKANSFDTTIEDNYLMRIAPIDNIHIDGLVSEKKKESSDVYNNIKPLLIGDSVMVDIGESFKSSVPKSRIDGKVGRQLYQTLPLVKANYSQYKKSSDQVVLELGTNGDFTVKQLDDLLNQFGKAKIYLVNTRVPRIYEANVNRLLADAAKRKSNVTLIDWYKRSQGHSEYFAPDGVHLEYKGVLALKDEILKALKKK >NZ_CP009828.1|WP_000353962.1|954487_957097_+|ATP-dependent-chaperone-ClpB MDINKMTYAVQSALQQAVELSQQHKLQNIEIEAILSAALNESESLYKSILERANIEVDQLNKAYEDKLNTYASVEGDNIQYGQYISQQANQLITKAESYMKEYEDEYISMEHILRSAMDIDQTTKHYINNKVEVIKEIIKKVRGGNHVTSQNPEVNYEALAKYGRDLVEEVRQGKMDPVIGRDEEIRNTIRILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVKKDVPESLLDKTVFELDLSALVAGAKYRGEFEERLKAVLKEVKESDGRIILFIDEIHMLVGAGKTDGAMDAGNMLKPMLARGELHCIGATTLNEYREYIEKDSALERRFQKVAVSEPDVEDTISILRGLKERYEVYHGVRIQDRALVAAAELSDRYITDRFLPDKAIDLVDQACATIRTEMGSNPTELDQVNRRVMQLEIEESALKNESDNASKQRLQELQEELANEKEKQAALQSRVESEKEKIANLQGKRAQLDESRQALEDAQTNNNLEKAAELQYGTIPQLEKELRELEDNFQDEQGEDTDRMIREVVTDEEIGDIVSQWTGIPVSKLVETEREKLLHLSDILHKRVVGQDKAVDLVSDAVVRARAGIKDPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELAKSLAASLFDSEKHMIRIDMSEYMEKHAVSRLIGAPPGYIGHDEGGQLTEAVRRNPYSVILLDEVEKAHTDVFNVLLQILDEGRLTDSKGRSVDFKNTIIIMTSNIGSQVLLENVKETGEITEPTEKAVMTSLNAYFKPEILNRMDDIVLFKPLSIDDMSMIVDKILTQLNIRLLEQRISIEVSDDAKAWLGQEAYEPQYGARPLKRFVQRQIETPLARMMIKEGFPEGTTIKVNLNSDNNLTFNVEKIHE >NZ_CP009828.1|WP_001047064.1|957155_958025_-|LysR-family-transcriptional-regulator MNLDWYYTFVILAKTLNYRLASEEINLTIPSIHKQIKNLEQHLNVKLFETYKNQIILTEDGHTFLPIAQSFIEQYESGIKHIQLKKTMFQSKLNVVVSSYIATFIMPKFLKSFFNEHPFIDVSLHVKNENIEKDINNHTYDIGISRNQPKLREVHSEKVCEGKIVLIAPNKENNHLLTEASLFEKYKIISDNHPEYWSSLKNNILNIYEKAQFLSINDVHTSIKLIEMNQGISFLPLYITTNSDYNISVINTKILQAPISFTYIYSKKEIPEILVFIKSFKKYIANEQL >NZ_CP009828.1|WP_000619354.1|958134_959280_+|2-isopropylmalate-synthase MIRIQDNTIRDGMQQSNVRKSLFIKKEVLKQINKLNINSVEVGMCTTIEDEFNIHQFRDILSPEKELVVLTRLNEKEIKKIVKLKIHNLVVKILLPISDLHIKEKLNFSNKYYIQKIKDCLEILKKDKKGVDICFEDATRTSREKLKEYMEIISKYQVRTVTFADTVGCSTPLEYGDIFNYFVKKYSNIIFSAHCHNDLGLATANTLAAILNGAKQIETTFLGIGERAGNAPIEEIITILTKKQIESTEFTLPDVYKTSINISKILDFQISENKPIIGENIFKHESGIHQDGTKKNINMYQYLVPSDLGLKNSQVVQFPISNISSKKILHNKFKSIVNTEEIDENISFYKLVNKFSPEVAPEDTVDLLQIIKRRSKDGNFK >NZ_CP009828.1|WP_000404422.1|959263_959905_+|L-threonylcarbamoyladenylate-synthase MEILNDSVKSFEKLYLQLQDGFPVIVPTDTNYNLCSLPNNDLCIDKIFEYKKRSKDKPLSLFIDKPEDWKLYGDNQNTEIVDKLVEIFWPGPLNIILKNKTSYNYMLNNSDSIAIGCVQNKTMRRFISYINSPIAITSANISGTADDILITENEAIKHMGENVRYMLRSQNKTNYKTSSTIIKVTDNKIELLREGDIKFEEIKERLGTGIIYE >NZ_CP009828.1|WP_000695347.1|960999_961515_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MKIKTEFKGNNIPYEYAAGADVSDSINGNPIKSFPFEVTELPEGTKYLAWSLIDYDAIPVCGFAWIHWSVANVSVSGNSISIKADLSRTKGDYVQGKNSFTSGLLAEDFSEIENHYVGPTPPDKDHQYELTVYALGHSLNLKNGFYLNEFLKEVNQHKIDQTSINLIGRKI >NZ_CP009828.1|WP_000769690.1|961825_962260_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFITVTLALGMIATTGATVASNEVSAAEKDKLPATQKAKEMQNVPYTIAVDGIMAFNQSYLNLPKDSQLSYLDLGNKVKALLYDERGVTPEKIRNAKSAVYTITWKDGSKKEVDLKKDSYTANLFDSNSIKQIDINVKTK >NZ_CP009828.1|WP_000682089.1|962516_962702_-|YjzD-family-protein MKHLVTFFWALLLMQMVNFVLNSLVGGDSLNVVNPIIMAVLFTIFTAIFAAVIKPPKDSSQ >NZ_CP009828.1|WP_001100526.1|962996_963938_+|ketoacyl-ACP-synthase-III MNVGIKGFGAYAPEKIIDNAYFEQFLDTSDEWISKMTGIKERHWADDDQDTSDLAYEASVKAIADAGIQPEDIDMIIVATATGDMPFPTVANMLQERLGTGKVASMDQLAACSGFMYSMITAKQYVQSGDYHNILVVGADKLSKITDLTDRSTAVLFGDGAGAVIIGEVSEGRGIISYEMGSDGTGGKHLYLDKDTGKLKMNGREVFKFAVRIMGDASTRVVEKANLTSDDIDLFIPHQANIRIMESARERLGISKDKMSVSVNKYGNTSAASIPLSIDQELKNGKLKDDDTIVLVGFGGGLTWGAMTIKWGK >NZ_CP009828.1|WP_000081240.1|963949_965194_+|beta-ketoacyl-ACP-synthase-II MSQNKRVVITGMGALSPIGNDVKTTWENALKGVNGIDKITRIDTEPYSVHLAGELKNFNIEDHIDKKEARRMDRFTQYAIVAAREAVKDAQLDINENTADRIGVWIGSGIGGMETFEIAHKQLMDKGPRRVSPFFVPMLIPDMATGQVSIDLGAKGPNGATVTACATGTNSIGEAFKIVQRGDADAMITGGTEAPITHMAIAGFSASRALSTNDDIETACRPFQEGRDGFVMGEGAGILVIESLESAQARGANIYAEIVGYGTTGDAYHITAPAPEGEGGSRAMQAAMDDAGIEPKDVQYLNAHGTSTPVGDLNEVKAIKNTFGEAAKHLKVSSTKSMTGHLLGATGGIEAIFSALSIKDSKVAPTIHAVTPDPECDLDIVPNEAQDLDITYAMSNSLGFGGHNAVLVFKKFEA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009828_4 | 1070348-1070440 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009828_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009828_4
>4.1|1070378|33|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder TAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009828_4
The CRISPR arrays of NZ_CP009828_4 >merge|NZ_CP009828|4|1070348-1070440|CRISPRCasFinder AAAAGCCCCTAACAACTAAAGGTTGTAAGGTAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCATAAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG >NZ_CP009828|4|4|1070348-1070440|CRISPRCasFinder AAAAGCCCCTAACAACTAAAGGTTGTAAGG TAAAAGAGGGATACTTGCGTCGAGCGCAAGCAT AAAAGCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG
>NZ_CP009828.1|WP_000033477.1|1069290_1069866_-|ECF-transporter-S-component MSKGLKLSEILVTVLISVVFAVIYNLWWFVYNGVQATGLHLEQLTNGVWFMAAIVCYLIIPKPGIALLAEFAAGAGETIIMGRFDIPTIVYAFIQGLACELVFAIFKYQSRSVMVAMLAGFCTAIAAFPIDYFYGYLNEVAGWNLTLFIVFRLISGAVVAGVLSYLLVKALDKTGVTKLFRPAAKEDYDNL >NZ_CP009828.1|WP_000921971.1|1067875_1069276_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVSDLRLKYPSGQRKIFDHLNITIQDKEKVLLLGPSGCGKSTLLNVLSGIVPNLIELPMKYDELIVDPLSGVIFQDPDSQFCMPKVYEELAFVLENRQVPREDMDALIINALNMVNLNVTPETYIKDLSGGMKQKLAIVETILQQSKTLFLDEPTAMLDVQATEDLWTKLIELWEDQTVVIVEHKVKHIWNHVDRVILMDYNGNIIADECPEIILQKYVHLLSEYGVWHPRAWEFAPSRVDFPTTNSHLLQFKNGRIIRGKSTLLSFSDLEIGLGEWITITGANGSGKTTLLESIMQLIKYQGDVYFENQRLTKIKHAAKHMYLVYQNPELQFITNSVYDEINIHFNHLSKDQSDDETIQLLKLLDLENVKDQHPYELSIGQKRRLSVATALSSKADIIFLDEPTFGLDSHNTFQLIKLFQKRINLGQSIVMVTHDDEIIERYPSRRLKISDGALLDCDGDTNV >NZ_CP009828.1|WP_000273256.1|1067076_1067883_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MYEQWKVRQSFVDDVNIITKLFLGIILFFFIIFVHNFDFMLYITILMLVFLLMFNGTQFKITAIFITISIGFALLSSLFMILYGNGSHTILKFGFIHITTESLVRGLHVSLRTIAISFFGILIALTSQVVMIFYSLMQHLKVKSKVAYAFMAAIRMIPLMISSLIQLRRSLKMRYQMIDAANYRGLKRFKHLIIPLLSQNIRKAHQLSVAMESKGFRDGPRTYYYNVPFSYKDVIFIIVLIAIITLAYYCSITLPITGIDDVRLGRVG >NZ_CP009828.1|WP_001101926.1|1065563_1066811_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MNVLVIGAGGREHALAYKLNQSSLVKQVFVIPGNEAMTPIAEVHTEISESDHQGILDFAKQQNVDWVVIGPEQPLIDGLADILRANGFKVFGPNKQAAQIEGSKLFAKKIMEKYNIPTADYKEVERKKDALTYIENCELPVVVKKDGLAAGKGVIIADTIEAARSAIEIMYGDEEEGTVVFETFLEGEEFSLMTFVNGDLAVPFDCIAQDHKRAFDHDEGPNTGGMGAYCPVPHISDDVLKLTNETIAQPIAKAMLNEGYQFFGVLYIGAILTKDGPKVIEFNARFGDPEAQVLLSRMESDLMQHIIDLDEGNRTEFKWKNESIVGVMLASKGYPDAYEKGHKVSGFDLNENYFVSGLKKQGDTFVTSGGRVILAIGKGDNVHDAQRDAYEKVSQIQSDHLFYRHDIANKALQLK >NZ_CP009828.1|WP_000709285.1|1064063_1065542_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase MKKAILSVSNKTGIVEFAKALTQLNYELYSTGGTKRILDEANVPVRSVSDLTHFPEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRNKPQHLNELSEQHIDLIDMVVVNLYPFQQTVANPDVTMDEAIENIDIGGPTMLRAAAKNYKHVTTIVHPADYQEVLTRLRNDSLDESYRQSLMIKVFEHTAEYDEAIVRFFKGDKETLRYGENPQQSAYFVRTSNAKHTIAGAKQLHGKQLSYNNIKDADATLALVKKFDTPAAVAVKHMNPCGVGIGDTIEQAFQHAYEADSQSIFGGIVALNRAVTPELAEQLHSIFLEVIIAPKFTGEALDILKQKKNVRLLEIDMIIDSNEEEFVSVSGGYLVQDKDNYVVPKEEMKVVTEVAPTDEQWEAMLLGWKVVPSVKSNAIILSNNKQTVGIGAGQMNRVGAAKIALERAIEINDHVALVSDGFFPMGDTVELAAQHGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMANKHGIAMVVTGTRHFKH >NZ_CP009828.1|WP_000238670.1|1063482_1064049_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP009828.1|WP_000030810.1|1062451_1063480_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDLFLEPTKLYVKPVLTLKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGDIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP009828.1|WP_000483727.1|1060974_1062459_+|amidophosphoribosyltransferase MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP009828.1|WP_000032747.1|1058806_1060996_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP009828.1|WP_000666799.1|1058142_1058814_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-I MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP009828.1|WP_000064214.1|1070449_1070584_-|hypothetical-protein MSNENQNKKAAEKAKEVEEKLKDKKEEKTEDINQTKQDIQDTLN >NZ_CP009828.1|WP_000009075.1|1070735_1072031_+|hypothetical-protein MSFLRKHAEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHYMWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKGNVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP >NZ_CP009828.1|WP_000505962.1|1073676_1074219_+|hypothetical-protein MGFKNNLTSNLTNKIGNSVFKIENINEKGAMPTTIKELNERRQRAEAIVKRKSLMSSTMSVVPIPGLDFGVDLKLMKDIIEDVNKIYGLDHKQVNSLGDDVKERVMSAAAIQGSQFIGKRISSAFLKIVIRDVAKRTAAKQTKWFPVVGQAVSASISYYFMNKIGKDHIQKCENVIKNVM >NZ_CP009828.1|WP_000437472.1|1074372_1074639_+|phosphocarrier-protein-HPr MEQNSYVIIDETGIHARPATMLVQTASKFDSDIQLEYNGKKVNLKSIMGVMSLGVGKDAEITIYADGSDESDAIQAISDVLSKEGLTK >NZ_CP009828.1|WP_000040057.1|1074641_1076360_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MSKLIKGIAASDGVAIAKAYLLVEPDLTFDKNEKVTDVEGEVAKFNSAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELPNPSMIDESVVIVGNDLTPSDTAQLNKEFVQGFATNIGGRTSHSAIMSRSLEIPAIVGTKSITQEVKQGDMIIVDGLNGDVIVNPTEDELIAYQDKRERYFADKKELQKLRDADTVTVDGVHAELAANIGTPNDLPGVIENGAQGIGLYRTEFLYMGRDQMPTEEEQFEAYKEVLEAMNGKRVVVRTLDIGGDKELSYLNLPEEMNPFLGYRAIRLCLAQQDIFRPQLRALLRASVYGKLNIMFPMVATINEFREAKAILLEEKENLKNEGHDISDDIELGIMVEIPATAALADVFAKEVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSERVSYLYQPYNPSILRLVKQVIEASHKEGKWTGMCGEMAGDETAIPLLLGLGLDEFSMSATSILKARRQINGLSKNEMTELANRAVDCATQEEVIELVNNYVK >NZ_CP009828.1|WP_001289624.1|1076596_1076830_-|glutaredoxin-family-protein MSEIIVYTQNDCPPCTFVKNYLTEHQIVFEERNINNQQYRNEMIDFDAFSTPFILLNGNPMYHVDLDEINKVLNIQD >NZ_CP009828.1|WP_000381849.1|1077027_1078389_+|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I MDTVEISRFLTAMTLAVHIIFATIGVGMPLMFAIAEFLGIRKNDLQYIAMAKRWAKAYTITVAVGVVTGTIIGLQLSLIWPTFMEMGGHVIALPLFMETFAFFFEAIFLSIYLYTWDRFKNKWTHFLISIPVIIGGSFSAFFITSVNSFMNTPAGFELKNGKMVNVQPIEAMFNPSFIVRSFHVITTAGMTMAFVIASIAAFKLLRNRQPKDTVYHKKALKMSMIVGFFSTLLSMLAGDLSAKFLHKFQPEKLAAYEWHFDTSSHAKLLLFGVLDEKTQQVKGAIELPGLLSFLADNSVKTKVQGLNDFPKSLHPPMIVHYFFDLMVTMGILCFVISGVYVLTLMFKKLRKFSTHKWMLYGILLTGPASMLAIEFGWFLTEMGRQPWIVRGYMRVAEAATQAGGITFVTILFGILYIILMYTCAYVLIRMFKNKPAYEDVNRLAKKQGGEIEK >NZ_CP009828.1|WP_000638454.1|1078385_1079405_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIYAFIGITVLWLFLFCYIIIASIDFGAGFFALHSKLTGDEKKINHLISRYLNPVWEVTNVFFVFFFVGFVGFFPESIKYLGTVLLIPGSIALIMISLRNSFYAFENYGQDTKLAWMIMYGVSGLLIPASLSTALTITEGGYINVRNNVIDLDWVQLLLSPFAWSVVFLAIISVLYISSGFLTYYAKKANDEPAYNLTRQWHIFLGPPMIIICLFVFLSLRIQNSEHFYSAVFDYWWMFAISFLFFTLASLLTFFKKKHGLAFVFVILQMMFAFFGYGISKLPYLLYPFVKITDAYVNPEMGWTLVIVFILGLLLLLPSLILLLRLFVFDKEYVEGKKS >NZ_CP009828.1|WP_000514290.1|1079537_1080200_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein MGKEYVVIGLGRFGGSIVRELNALDMDVMAIDHDENRVNEYSDIATHAVVADTTDEAVMKSLGIRNFDHVIVAIGENIQSSTLTTLILKELGVKKVTAKAQNDYHAKILNKIGADTVVHPERDMGRRIAHNVASASVLDYLELADEHSIVELKATEKMAGQSIIDLDIRAQYGINIIAIKRGKEFIISPNPNINLEIGDILIMIGHDNDLNRFEKNIATR >NZ_CP009828.1|WP_000811375.1|1080313_1082011_-|ribonuclease-J MKQLHPNEVGVYALGGLGEIGKNTYAVEYKDEIVIIDAGIKFPDDNLLGIDYVIPDYTYLVQNQDKIVGLFITHGHEDHIGGVPFLLKQLNIPIYGGPLALGLIRNKLEEHHLLRTAKLNEINEDSVIKSKHFTISFYLTTHSIPETYGVIVDTPEGKVVHTGDFKFDFTPVGKPANIAKMAQLGEEGVLCLLSDSTNSLVPDFTLSEREVGQNVDKIFRNCKGRIIFATFASNIYRVQQAVEAAIKNNRKIVTFGRSMENNIKIGMELGYIKAPPETFIEPNKINTVPKHELLILCTGSQGEPMAALSRIANGTHKQIKIIPEDTVVFSSSPIPGNTKSINRTINSLYKAGADVIHSKISNIHTSGHGSQGDQQLMLRLIKPKYFLPIHGEYRMLKAHGETGVECGVEEDNVFIFDIGDVLALTHDSARKAGRIPSGNVLVDGSGIGDIGNVVIRDRKLLSEEGLVIVVVSIDFNTNKLLSGPDIISRGFVYMRESGQLIYDAQRKIKTDVISKLNQNKDIQWHQIKSSIIETLQPYLFEKTARKPMILPVIMKVNEQKESNNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009828_5 | 1154581-1154832 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009828_5
|
4 spacers
spacers of NZ_CP009828_5
>5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR AAGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATG >5.2|1154663|30|NZ_CP009828|PILER-CR AAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACG >5.3|1154719|40|NZ_CP009828|PILER-CR AAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGG >5.4|1154785|30|NZ_CP009828|PILER-CR TGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGGCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009828_5
The CRISPR arrays of NZ_CP009828_5 >merge|NZ_CP009828|5|1154581-1154832|PILER-CR TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGTGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGGCAATGGAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAG >NZ_CP009828|5|2|1154581-1154832|PILER-CR TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAG AAGCTGACGAAAAATCAGCTTACAATAATG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAG AAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAG AAGCTGGCAGAAAGTCAGCTTACAATAACGTGCAAGTTGG GGTGGGGCCCCAACATAGTGAAATTG GATTCCCAATTTCTACAGGCAATGGAAGTT GGCGGGGCCCCAACATAG
>NZ_CP009828.1|WP_001802045.1|1154153_1154378_+|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NZ_CP009828.1|WP_000765708.1|1154050_1154197_+|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NZ_CP009828.1|WP_000857485.1|1152418_1153378_-|beta-channel-forming-cytolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAADNFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_CP009828.1|WP_000231631.1|1151708_1151942_-|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVANEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >NZ_CP009828.1|WP_001032817.1|1150904_1151090_-|hypothetical-protein MNKHINKKATKLLEDYKKVQQRKSEETDRGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NZ_CP009828.1|WP_000669535.1|1149838_1150189_+|complement-inhibitor-SCIN-family-protein MKFKKYILTGTLALLLSSTAIATLEGNKVEASSKKDYIIQSEYHDKQIADELRSLLNKSNVYDLAAGSLNRYYKQTIMMNEHRAKAALRSNNFDKMAEAKVALEKIYKEIYEIINR >NZ_CP009828.1|WP_000791583.1|1149187_1149685_+|complement-convertase-inhibitor-Efb MKNKLIAKSLLTIAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDVTIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVK >NZ_CP009828.1|WP_000584398.1|1148422_1148929_+|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_CP009828.1|WP_000739567.1|1147353_1147752_-|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWRGLEIAKNLADQAKKDDERADKLIKEADEKNEHYKGKTVEDLYVIAKKMGKGNTRAVVKIKDGGKNGYYTFDITRPLEEHRKNIPVVGSGEISEITWQ >NZ_CP009828.1|WP_000739208.1|1146654_1146984_+|complement-convertase-inhibitor-Ecb MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNAETVKKYNEYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNLFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >NZ_CP009828.1|WP_001038858.1|1155047_1155764_-|superantigen-like-protein-SSL12 MNKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NZ_CP009828.1|WP_001063565.1|1155871_1156597_-|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPISSSTEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQQHLTFSNKTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NZ_CP009828.1|WP_000739527.1|1156691_1157417_-|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLGTTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYSQPHLSLSNKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPKNAQIEVILEKSN >NZ_CP009828.1|WP_000793607.1|1157854_1158856_+|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_CP009828.1|WP_001074342.1|1158878_1159811_+|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_CP009828.1|WP_078065166.1|1160047_1161538_+|YfcC-family-protein MILFILTVVAVIATWVIPAGAYSKLSYEPSSQELKIVNPHNQVKKVPGTQQELDKMGVKIKIEQFKSGAINKPVSIPNTYERLKQHPAGPEQITSSMVEGTIEAVDIMVFILVLGGLIGVVQASGSFESGLLALTKKTKGHEFMLIVFVSILMIIGGTLCGIEEEAVAFYPILVPIFIALGYDSIVSVGAIFLASSVGSTFSTINPFSVVIASNAAGTTFTDGLYWRIGACIVGAIFVISYLYWYCKKIKKDPKASYSYEDKDAFEQQWSVLKDDDSSHFTLCKKIILTLFVLPFPIMVWGVMTQGWWFPVMASAFLIFTIIIMFIAGTGKSGLGEKGTVDAFVNGASSLVGVSLIIGLARGINLVLNEGMISDTILHFSSSLVQHMSGPLFIIVLLFIFFCLGFIVPSSSGLAVLSMPIFAPLADTVGIPRFVIVTTYQFGQYAMLFLAPTGLVMATLQMLNMRYSHWFRFVWPVVAFVLIFGGGLLITQVLIYS >NZ_CP009828.1|WP_000149420.1|1161845_1162073_+|hypothetical-protein MTHLTKVLDTLTGICVVLLFSKYFVAYANMVFDWKLRWYLLENIPHLPIILFILMFIFGVPSEMIKDRQRKNNGV >NZ_CP009828.1|WP_001239297.1|1162378_1163326_-|TDT-family-transporter MRLQKAPLVTSGLVLGLLGLGNLLKDLSLTLNAVCGIFAFLIWIHLLCTMLKYFNNVKEQLNSPLVSSVFTTFFMSGFLGTTYLNTFFSNITFINSLITPIWILCLVGIMTHMIIFSIKYLKDFSLENVYPSWTVLFIGIAIAGLTAPVSGYFFIGQLTVIYGFVATCIVLPIVFKRLKAFPLQTSIKPNTSTICAPFSLVAAAYVIAFPKANAFIVIILLLLAQIFYFYIIIQLPKLLKEPFSPVFSAFTFPLVISATALKNSLPVLMFPVIWKGLLFIEVLLATVIVLRVFIGYLHFFLKKENQDKFLRNASQ >NZ_CP009828.1|WP_001245798.1|1163575_1163764_+|hypothetical-protein MRNQIQKLLDSDLSSLHISKQTGVPQSTIHRMRKNERSLDNMSLKNAELLYKFANGIFSDED >NZ_CP009828.1|WP_000398672.1|1164676_1164811_+|beta-class-phenol-soluble-modulin MEGLFNAIKDTVTAAINNDGAKLGTSIVSIVENGVGLLGKLFGF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009828_6 | 1229445-1229537 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009828_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009828_6
>6.1|1229475|33|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder AATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009828_6
The CRISPR arrays of NZ_CP009828_6 >merge|NZ_CP009828|6|1229445-1229537|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACTAATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCATAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT >NZ_CP009828|6|5|1229445-1229537|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT AATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCA TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT
>NZ_CP009828.1|WP_000167269.1|1228586_1229321_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MTKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKEKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVADADEVKAMIKEVVSQFGSLDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKATPQMLRQRSGAIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVIGLTKSAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKEQMLTQIPLARFGQDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >NZ_CP009828.1|WP_001043838.1|1227667_1228594_+|ACP-S-malonyltransferase MNKTAIIFPGQGAQKVGMAQDLYNNNDQATEILTSAANTLDFDILETMFTDEDGKLGETENTQPALLTHSSALLAALKNLNPDFTMGHSLGEYSSLVAADVLSFEDAVKIVRKRGQLMAQAFPTGVGSMAAVLGLDFDKVDEICKSLSSDDKIIEPANINCPGQIVVSGHKALIDELVEKGKSLGAKRVMPLAVSGPFHSSLMKVIEEDFSSYINQFEWRDAKFPVVQNVNAQGETDKEVIKSNMVKQLYSPVQFINSTEWLIDQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKLTSIQTLEDVKGWNEND >NZ_CP009828.1|WP_000239738.1|1226688_1227675_+|phosphate-acyltransferase-PlsX MVKLAIDMMGGDNAPDIVLEAVQKAVEDFKDLEIILFGDEKKYKLNHERIEFRHCSEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTIDGKGFVFLDVGANADAKPEHLLQYAQLGDIYAQKIRGIDNPKISLLNIGTEPAKGNSLTKKSYELLNQDHSLNFVGNIEAKTLMDGDTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKDTIMSSTKNKLAGAILKKDLAEFAKKMDYSEYGGSVLLGLEGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEQNIVQTMKETVGESNE >NZ_CP009828.1|WP_001548538.1|1226111_1226684_+|transcription-factor-FapR MRGETLKLKKDKRREAIRQQIDSNPFITDHELSDLFQVSIQTIRLDRTYLNIPELRKRIKLVAEKNYDQISSIEEQEFIGDLIQVNPNVKAQSILDITSDSVFHKTGIARGHVLFAQANSLCVALIKQPTVLTHESSIQFIEKVKLNDTVRAEARVVNQTAKHYYVEVKSYVKHTLVFKGNFKMFYDKRG >NZ_CP009828.1|WP_001151491.1|1223849_1225910_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MAKVNLIESPYSLLQLKGIGPKKIEVLQQLNIHTVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQAEDQSNVTIEGQVYTAPVVAFFGRNKSKLTVHLMVNNIAVKCIFFNQPYLKKKIELNQTITVKGKWNRVKQEITGNRVFFNSQGTQNQENADVQLEPVYRIKEGIKQKQIRDQIRQALNDVTIHEWLTDELREKYKLETLDFTLNTLHHPKSKEDLLRARRTYAFTELFLFELRMQWLNRLEKSSDEAIEIDYDLDQVKSFIDCLPFELTEAQKSSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLMALFGDSMNVALLTGSVKGKKRKILLEQLENGTIDCLIGTHALIQDDVIFHNVGLVITDEQHRFGVNQRQLLREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIITTWAKHEQYDNVLMQMTSELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQQYYGVSRVGLLHGKLSADEKDEVMQKFSNHEIDVLVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSDQQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANLVEDYRMLEVARDEAAELIQSGVFFENTYQHLRHFVEENLLHRSFD >NZ_CP009828.1|WP_000623917.1|1222013_1223660_+|DAK2-domain-containing-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTMTSGREEVENNLSKNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIESESEINSKLLAESFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAQAAVEKANNTEDCIELMEYIIVKANESLENTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKALKGEKVEAKVAKLDKDEFVHDEHDFHGVINTEDIIYGYCTEMMVRFGKNKKAFDEQEFRQDMSQFGDSLLVINDEEIVKVHVHTEYPGKVFNYGQQYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQHTAKPKMETVETAIITISMGEGISEIFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSKCKRAIILPNNKNILMASEQAASIVDAEAVVIPTKSIPQGISALFQYDVDATLEENKAQMADSVNNVKSGSLTYAVRDTKIDGVEIKKDAFMGLIEDKIVSSQSDQLTTVTELLIEMLAEDSEILTVIIGQDAEQAVTDNMINWIEEQYPDVEVEVHEGGQPIYQYFFSVE >NZ_CP009828.1|WP_000171418.1|1221624_1221999_+|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MTLEISNDYGKIDISNEVIASVVGGKAVECYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHENYAKGIKVTENNGVVDIDMYIIVSYGVKISEVANNVQSTVKYTLEKSLNVSVNSINIYVQGVRVNNTGKKA >NZ_CP009828.1|WP_000517908.1|1220993_1221182_-|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCFVTGRKASTGNRRSHALNSTKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV >NZ_CP009828.1|WP_000547905.1|1219970_1220612_+|thiamine-diphosphokinase MHINLLCSDRHLPQDIWAKSNEGKWGGVDRGALILLKHQIIPFFSVGDFDSVSKEERQLLTEQLQIKPVQAEKADTDLALAVDKAVALGFDSITIYGATGGRLDHFFGAIQLLLKKAYYKHDVHIEVIDQQNKIELLPKGQHTVEKDKSYPYISFIPMTDDVELSLAGFKYNLARQMLNIGSTLTISNEIESLQAKVTVHDGLILQIRSTDLN >NZ_CP009828.1|WP_000164340.1|1219319_1219964_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MTKLYPSLLSVDFLVLQHELKRLEEAGVDGVHFDVMDGQFVPNISIGLPILDAVRKGTTLPIDVHLMIENPEKYIASFAEHGADMISIHVESTPHIHRAIQMIKHLDKKAGVVINPGTPISQIEPILDIVDYVLVMTVNPGFGGQSFIDQCVEKIAGLNAIKMERQLNFDIEVDGGVNTDTAKVCVENGATMLVTGSFFFKQEDYKKVTQALKG >NZ_CP009828.1|WP_000426914.1|1229626_1229860_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NZ_CP009828.1|WP_000043237.1|1229975_1230707_+|ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NZ_CP009828.1|WP_000262685.1|1230853_1234420_+|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIKSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKSSLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NZ_CP009828.1|WP_000007686.1|1234419_1235670_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGAK >NZ_CP009828.1|WP_000531320.1|1235656_1235989_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NZ_CP009828.1|WP_000863474.1|1236014_1237382_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTKLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NZ_CP009828.1|WP_000268754.1|1237727_1238003_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NZ_CP009828.1|WP_001261990.1|1238190_1238694_+|ribosome-maturation-factor-RimM MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEYYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >NZ_CP009828.1|WP_000687320.1|1238693_1239431_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFAGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >NZ_CP009828.1|WP_000181404.1|1239533_1239884_+|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009828_7 | 1437446-1437525 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009828_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009828_7
>7.1|1437471|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder GCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009828_7
The CRISPR arrays of NZ_CP009828_7 >merge|NZ_CP009828|7|1437446-1437525|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGGCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCGCCAACTTGCACTTTATTGTAAGCTG >NZ_CP009828|7|6|1437446-1437525|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTG GCTTTCCGCAGCTACTATGTTGGGGACCCG CCAACTTGCACTTTATTGTAAGCTG
>NZ_CP009828.1|WP_000192137.1|1436268_1436928_-|response-regulator-transcription-factor-ArlR MTQILIVEDEQNLARFLELELTHENYNVDTEYDGQDGLDKALSHYYDLIILDLMLPSINGLEICRKIRQQQSTPIIIITAKSDTYDKVAGLDYGADDYIVKPFDIEELLARIRAILRRQPQKDIIDVNGITIDKNAFKVTVNGAEIELTKTEYDLLYLLAENKNHVMQREQILNHVWGYNSEVETNVVDVYIRYLRNKLKPYDRDKMIETVRGVGYVIR >NZ_CP009828.1|WP_000166795.1|1434916_1436272_-|sensor-histidine-kinase-ArlS MTKRKLRNNWIIVTTMITFVTIFLFCLIIIFFLKDTLHNSELDDAERSSSDINNLFHSKPVKDISALDLNASLGNFQEIIIYDEHNNKLFETSNDNTVRVEPGYEHRYFDRVIKKRYKGIDYLIIKEPITTQDFKGYSLLIHSLENYDNIVKSLYIIALAFGVIATIITATISYVFSTQITKPLVSLSNKMIEIRRDGFQNKLQLNTNYEEIDNLANTFNEMMSQIEESFNQQRQFVEDASHELRTPLQIIQGHLNLIQRWGKKDPAVLEESLNISIEEMNRIIKLVEELLELTKGDVNDISSEAQTVHINDEIRSRIHSLKQLHPDYQFDTDLTSKNLEIKMKPHQFEQLFLIFIDNAIKYDVKNKKIKVKTRLKNKQKIIEITDNGIGIPEEDQDFIFDRFYRVDKSRSRSQGGNGLGLSIAQKIIQLNGGSIKIKSEINKGTTFKIIF >NZ_CP009828.1|WP_058142977.1|1431829_1434628_-|2-oxoglutarate-dehydrogenase-E1-component MTNERKEVSEAPVNFGANLGLMLDLYDDFLQDPSSVPEDLQVLFSTIKNDDSIVPALKSTSSQNSDGTIKRVMRLIDNIRQYGHLKADIYPVNPPKRKHVPKLEIEDFDLDQQTLEGISAGIVSDHFADIYDNAYEAILRMEKRYKGPIAFEYTHINNNTERGWLKRRIETPYKVTLNNNEKRALFKQLAYVEGFEKYLHKNFVGAKRFSIEGVDALVPMLQRTITIAAKEGIKNIQIGMAHRGRLNVLTHVLEKPYEMMISEFMHTDPMKFLPEDGSLQLTAGWTGDVKYHLGGIKTTDSYGTMQRIALANNPSHLEIVAPVVEGRTRAAQDDTQRAGAPTTDHHKAMPIIIHGDAAYPGQGINFETMNLGNLKGYSTGGSLHIITNNRIGFTTEPIDARSTTYSTDVAKGYDVPIFHVNADDVEATIEAIDIAMEFRKEFHKDVVIDLVGYRRFGHNEMDEPSITNPVPYQNIRKHDSVEYVFGKKLVNEGVISEDEMNSFIEQVQKELRQAHDKINKADKMDNPDMEKPADLALPLQADEQSFTFDHLKEINDALLTYPDGFNILKKLNKVLEKRHEPFNKEDGLVDWAQAEQLAFATILQDGTPIRLTGQDSERGTFSHRHAVLHDEQTGETYTPLHHVPDQKATFDIHNSPLSEAAVVGFEYGYNVENKKSFNIWEAQYGDFANMSQMIFDNFLFSSRSKWGERSGLTLFLPHAYEGQGPEHSSARLERFLQSAAENNCTVVNLSSSSNYFHLLRAQAASLDSEQMRPLVVMSPKSLLRNKTVAKPIDEFTSGGFEPILTESYQADKVTKVILATGKMFIDLKEALAKNPDESVLLVAIERLYPFPEEEIEALLAQLPNLEEVSWVQEEPKNQGAWLYVYPYVKVLVADKYDLSYHGRIQRAAPAEGDGEIHKLVQNKIIENALKNN >NZ_CP009828.1|WP_001115452.1|1430547_1431816_-|dihydrolipoyllysine-residue-succinyltransferase MPEVKVPELAESITEGTIAEWLKNVGDSVEKGEAILELETDKVNVEVVSEEAGVLSEQLASEGDTVEVGQAIAVIGEGSGNASKENSNDNTPQQNEETNNKKEETTNKSADKAEVNQTTDDNQQRVNATPSARRYARENGVNLAEVSPKTNDLVRKEDIDKKQQAPASTQTTQQAPAKEEKKYNQYPTKPVIREKMSRRKKTAAKKLLEVSNNTAMLTTFNEVDMTNVMELRKRKKDQFMKDHDGTKLGFMSFFTKASVAALKKYPEVNAEIDGDDMITKQYYDIGVAVSTDDGLLVPFVRDCDKKNFAEIEAEIANLAVKAREKKLGLDDMVNGSFTITNGGIFGSMMSTPIINGNQAAILGMHSIITRPIAIDQDTIENRPMMYIALSYDHRIIDGKEAVGFLKTIKELIENPEDLLLES >NZ_CP009828.1|WP_000334509.1|1429158_1429968_-|hypothetical-protein MCGLRSITLGTTNIEQTKHFMVDILGLNCEELLENSIRFGDADISPGTRLQFIQVPSEQLEESHFVGIGLRTPTDSGLEEYAEILSSKEIPFTTTKELNGNKYFSFEDNNGHIFSIYSNENNYGVGLGMPSFESAVNPLHQVQGLGPVILKVNHVDITGQILTNIFGLEVFAEYQPFDNADYHVQVFKIGTGGLGGEIHLMPVETEMTMPEYGAVDQVEFETKDADFFNQAKSRLDEVEIPYQTLEQDDIESIRITENSGLSFIFTLQK >NZ_CP009828.1|WP_000902174.1|1428926_1429130_-|hypothetical-protein MLHETWKERTPIKKVEVINTDAKKFTVSDMLTVGKQYDVINETEEYYQIIDNSGLIGGYYKTYFKEV >NZ_CP009828.1|WP_001185421.1|1427954_1428746_-|MoxR-family-ATPase MALKHYKNSDSTVFNDAKALFDLNKNILLKGPTGSGKTKLAETLSEVVDTPMHQVNCSVDLDTESLLGFKTIKTNAEGQQEIVFVDGPVIKAMKEGHILYIDEINMAKPETLPVLNGVLDYRRQITNPYTGEVIKAVPGFNVIAAINEGYVGTLPMNEALKNRFVVIHVDYIDGDILKNVIKEQSLLQDDKQIEQIIKFNEDLRTMSKQGQISEEAASIRALLDLCDLITVMPVERAIKRTIIDKLEDEREQQAIYNAVELNF >NZ_CP009828.1|WP_001283670.1|1426054_1427941_-|nitric-oxide-reductase-activation-protein-NorD MSDRFIKFNDEQLDAKQVMMLQDLARLLLKNEQTQVKIQKFPYYNPVQNVLITSWFWSHRPSHIEMAGLKTDVMLAAYGYHMMDVQIVNEVVQDKTFKHPKFYQQLFKLLEDMRVLNSIKVERPSTAKLIDLRLDTRISYTESQIKVYRTKTQYTDLLFLYLEHAFLSQDFFDIPSIHSDLDDILVNMFLYLPNFFQNQNSEDNMYLAQRIMYQVDDILKEDMLNEYYYLPKTLYNTLASPEFEDLKRTDASQVDGQDDTSEDDDNQSEKADSKSADSESKGGAYLEMELHEGQNSETLGNDEAREGDATDDMTDMMTKKGKGSNDTLNREEGDAVGQSQAFQLDGVNKNVEIKWQIPEIEPQYVLEYQESKQDVQYEIKDLIQIIKKTIEREQRDARFNLTKGRLQKDLINWFIDDQYKLFYKKQDLSKSFDATFTLLIDASASMHDKMAETKKGVVLFHETLKALNIKHEILSFSEDAFDSDEHAQPNIINEIINYDYSTFEKDGPRIMALEPQDDNRDGVAIRVASERLMRRNQHQRFLIVFSDGEPSAFNYSQDGIIDTYEAVEMSRKFGIEVFNVFLSQDPITEDVEQTIHNIYGQYAIFVEGVAHLPGHLSPLLKKLLLKSL >NZ_CP009828.1|WP_001039275.1|1424486_1425830_-|branched-chain-amino-acid-transport-system-II-carrier-protein MNKNTWVIGFTLFAMFFGAGNLIFPPNLGLDSGQFFWPAILAFVLTGIGLPLLGVIVGALDKEGYIGALNKISPKFSILFLIIIYLTIGPLFAIPRTASTSFEMTITPIIHSNSSIALFIFTIIYFIVVLYICLNPSKLIDRIGSLLTPLLLITILAMIIKGYLDFSGNSAGKGNEALYHSNFSSFAEGFTQGYLTMDAIAAIAFSMIVVNAVKLTGITKTNQIFKQTLTAGLIAAVALIFIYISLGYIGNHMPVSDMTLDQLKSKDRNIGTYLLTTMASTGFGSFGKYLLGIIVALACLTTACGLIVAVSEYFHRIVPKVSYKAFVLVFILMSFIIANQGLNAVISMSIPVLSIVYPVAITVVLLILIAKFIPTKRISQQIPVIIVFILSIFSVISKLGWLKINFIESLPLRAYSLEWFPVAIIATILGYLVGIFVKQDPIKYQQE >NZ_CP009828.1|WP_000138424.1|1423276_1424413_+|toxic-anion-resistance-protein MTENKSFKESHPLDDFISDKELSNTTIQKEKLTIEQQKQVDTISKQINPLDNEGLLAFGSGLQKQMSQFSHQMLDEVQSKDVGPIGDTLSDLMSKLKSVNPNELNTDKPSMLKRIFSRAKSSINEIFSRMQSVSAQVDRITIQLQKHQTHLTRDIELLDTLYDKNKQYFDDLSLHIIAAQQKKLQLENEKLPQLQQQAQQSTNQMDIQQVADMQQFIDRLDKRIYDLQLSRQIALQTAPQIRMIQNVNQALAEKIQSSILTSIPLWKNQMAIALTLMRQRNAVAAQRAVTDTTNDLLTANAEMLKQNAIETATENERGIVDLDTLKRTQRNIIETIEETLIIQQHGREERQLAEKELQQLEQDLKSHLVNIKGPNKQS >NZ_CP009828.1|WP_000084773.1|1438069_1438684_-|phosphatase-PAP2-family-protein MSQWKRISLLIVFTLVFGIIAFFHESRLGKWIDNEVYEFIYSSESFITTSIMLGATKVGEVWAMLCISLLLVAYLMLKRHKIEALFFALTMALSGILNPALKNIFDRERPTLLRLIDITGFSFPSGHAMGSTAYFGSGIYLLNRLNQGNSKGILIGLCAAMILLISISRVYLGVHYPTDIIAGIIGGVFCIILSTLLLRNKLIN >NZ_CP009828.1|WP_000160908.1|1438700_1439771_-|undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MTKIAFTGGGTVGHVSVNLSLIPTALSQGYEALYIGSKNGIEREMIESQLPEIKYYPISSGKLRRYISLENAKDVFKVLKGILDARKVLKKEKPDLLFSKGGFVSVPVVIAAKSLNIPTIIHESDLTPGLANKIALKFAKKIYTTFEETLNYLPKEKADFIGATIREDLKNGNAHNGYQLTGFNENKKVLLVMGGSLGSKKLNSIIRENLDALLQQYQVIHLTGKGLKDDQVKKSGYIQYEFVKEDLTDLLAITDTVISRAGSNAIYEFLTLRIPMLLVPLGLDQSRGDQIDNANHFADKGYAKAIDEEQLTAQILLQELNEMEQERTRIINNMKSYEQSYTKEALFDKMIKDALN >NZ_CP009828.1|WP_000620194.1|1439782_1440292_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRLGKMSDLDQILNLVEEAKELMKEHDNEQWDDQYPLLEHFEEDIAKDYLYVLEENDKIYGFIVVDQDQAEWYDDIDWPVNREGAFVIHRLTGSKEYKGAATELFNYVIDVVKARGAEVILTDTFALNKPAQGLFAKFGFHKVGEQLMEYPPYDKGEPFYAYYKNLKE >NZ_CP009828.1|WP_000342123.1|1440691_1442182_-|S41-family-peptidase MDDKQHKSSSDDERAEIATSNQDQQTNSSKRVHLKRWQFISILIGTILITAVITVVAYIFINQKISGLNKTDQANLNKIENVYKILNSDYFKKQNSDKLSKAAIDGMVKELKDPYSEYLTKEQTKSFNEGVSGDFVGIGAEMQKKNDQIMVTSPMKGSPAERAGIRPKDVITKVNGKSIKGKALDEVVKDVRGKENTEVTLTVQRGSEEKDVKIKREKIHVKSVEYKKKGKVGIITINKFQNDTSGELKDAVLKAHKDGLKKIVLDLRNNPGGLLDEAVKMANIFIDKGKTVVKLEKGKDTEAIQTSNDALKEAKDMDISILVNEGSASASEVFTGALKDYHKAKVYGSKTFGKGVVQTTREFKDGSLLKYTEMKWLTPDGHYIHGKGIKPDVTIDTPKYQSLNVIPNTKTFKVGDDDKNIKTIKIGLSALGYKVDNESTQFDQALENQVKAFQQANKLEVTGEFNKETNNKFTELLVEKANKHDDVLDKLINILK >NZ_CP009828.1|WP_000801007.1|1442373_1442595_-|hypothetical-protein MKNYSFYQFVMTVRGRHDDKGRLAEEIFDDLAFPKHDDDFNILSDYIETHGDFTLPMSVFDDLYEEYTEWLKF >NZ_CP009828.1|WP_000473654.1|1442594_1443095_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MFKKLFGKGKEVQKDIAIYAPLTGEYVKIEDIPDPVFAQKMMGEGFGINPTEGEVVSPIAGRVDNVFPTKHAIGLKADNGLELLVHIGLDTVQLDGEGFEVLVSSGDEVNVGDPLVRFNLEYINNNAKSVISPIIITNTDQAASINIYDENAVIKGETKVIDVTMN >NZ_CP009828.1|WP_000913315.1|1443106_1443535_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MLKKDKSELTDIEYIVTQENGTEPPFMNEYWNHFAKGIYVDKISGKPLFTSEEKFHSECGWPSFSKALDDDEIIELVDKSFGMLRTEVRSEESNSHLGHVFNDGPKESGGLRYCINSAAIQFIPYEKLEELGYGDLISHFDK >NZ_CP009828.1|WP_000159902.1|1443527_1444061_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase-MsrA MTKEYATLAGGCFWCMVKPFTSYPGIKSVVSGYSGGHVDNPTYEQVCTNQTGHVEAVQITFDPEVTSFENILDIYFKTFDPTDDQGQFFDRGESYQPVIFYHDEHQKKAAEFKKQQLNEQGIFKKPVITPIKPYKNFYPAEDYHQDYYKKNPVHYYQYQRGSGRKAFIESHWGNQNA >NZ_CP009828.1|WP_000166052.1|1444150_1444990_-|fatty-acid-kinase-FakB2 MTKQIIVTDSTSDLSKEYLEANNIHVIPLSLTIEGASYVDQVDITSEEFINHIENDEDVKTSQPAIGEFISAYEELGKDGAEIISIHLSSGLSGTFNTAYQASQMVDANVTVIDSKSISFGLGYQIQHLVELVKEGVSTSEIVNKLNHLRENIKLFVVIGQLNQLIKGGRISKTKGLIGNLMKIKPIGTLDDGRLELVHNARTQNSSIQYLKKEIAEFIGDHEIKSVGVAHANVIEYVDKLKKVFNEAFHVNNYDINVTTPVISAHTGQGAIGLVVLKK >NZ_CP009828.1|WP_000175746.1|1445004_1445484_-|dihydrofolate-reductase MTLSILVAHDLQRVIGFENQLPWHLPNDLKHVKKLSTGHTLVMGRKTFESIGKPLPNRRNVVLTSDTSFNVEGVDVIHSIEDIYQLPGHVFIFGGQTLFEEMIDKVDDMYITVIEGKFRGDTFFPPYTFEDWEVASSVEGKLDEKNTIPHTFLHLIRKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP009828_8 | 2202676-2202760 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009828_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009828_8
>8.1|2202706|25|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder TGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009828_8
The CRISPR arrays of NZ_CP009828_8 >merge|NZ_CP009828|8|2202676-2202760|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NZ_CP009828|8|7|2202676-2202760|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTT TGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NZ_CP009828.1|WP_031844964.1|2202426_2202597_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNDMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NZ_CP009828.1|WP_000066900.1|2201950_2202301_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP009828.1|WP_000184418.1|2200637_2201849_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDRSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAINLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP009828.1|WP_000951066.1|2200204_2200645_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKYQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP009828.1|WP_000600972.1|2199277_2200042_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIETVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKAKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP009828.1|WP_031844963.1|2199034_2199286_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNTLTILSIVLAIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP009828.1|WP_000413855.1|2197380_2198646_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEIQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP009828.1|WP_000592326.1|2194096_2197264_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSVQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASASNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGGNLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQYQEGLGVVSTTYKKALHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATMVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP009828.1|WP_001161085.1|2193592_2193910_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP009828.1|WP_000051210.1|2193183_2193348_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NZ_CP009828.1|WP_001824308.1|2202937_2203960_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLNVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEEHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP009828.1|WP_000643988.1|2203979_2204579_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP009828.1|WP_000866974.1|2204585_2204819_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQGLTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP009828.1|WP_000808500.1|2204824_2205271_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP009828.1|WP_000602934.1|2205284_2205770_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRDEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP009828.1|WP_000259720.1|2205766_2207026_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQQDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKTVKAKVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP009828.1|WP_000134534.1|2207088_2207583_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIYKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSGQ >NZ_CP009828.1|WP_000503820.1|2207584_2208091_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP009828.1|WP_000076924.1|2208121_2209126_-|molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeB MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSACTTCGDIPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP009828.1|WP_000913006.1|2209294_2209900_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINLKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009828_9 | 2357302-2357394 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009828_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009828_9
>9.1|2357327|43|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder GCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009828_9
The CRISPR arrays of NZ_CP009828_9 >merge|NZ_CP009828|9|2357302-2357394|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG >NZ_CP009828|9|8|2357302-2357394|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG GCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCTACTACGTTCCTTTGTC TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAG
>NZ_CP009828.1|WP_000019124.1|2356225_2357092_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLIMLIVFAVNQSLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQKVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP009828.1|WP_001125208.1|2355213_2355900_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP009828.1|WP_000762708.1|2354955_2355060_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP009828.1|WP_000038954.1|2353342_2354782_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILAHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NZ_CP009828.1|WP_000825921.1|2352442_2353222_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP009828.1|WP_000479576.1|2351742_2352462_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP009828.1|WP_000615464.1|2351014_2351746_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTLVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NZ_CP009828.1|WP_001012236.1|2349667_2350918_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEENPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPLLYKVQTYLNHKRR >NZ_CP009828.1|WP_000819839.1|2349050_2349413_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVAMVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP009828.1|WP_000162810.1|2348432_2349032_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NZ_CP009828.1|WP_014532694.1|2357598_2357694_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYG >NZ_CP009828.1|WP_000792557.1|2357788_2359099_+|hypothetical-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYTDKYFKYKGTIDKTVLSVFGNGYKSYIQPLKVEDQKNYVSKSYAQVRNYVTETLNTGKVLYAFYQNPNVVKAAITTAETAASIKNIFSSFTSFFK >NZ_CP009828.1|WP_000594519.1|2359590_2360520_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_CP009828.1|WP_000916705.1|2361087_2362035_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSDLPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_CP009828.1|WP_000783428.1|2362036_2363014_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NZ_CP009828.1|WP_000200957.1|2363065_2363533_-|hypothetical-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPVALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLILASVLGSLISRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NZ_CP009828.1|WP_000286874.1|2363543_2364236_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYIKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_CP009828.1|WP_000971541.1|2364246_2365362_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDVDRLFEILHQED >NZ_CP009828.1|WP_001046638.1|2365339_2366347_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKEKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN >NZ_CP009828.1|WP_001110080.1|2366348_2367707_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIVIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMAAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYDAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSQIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009828_10 | 2703193-2703278 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP009828_10
|
1 spacers
spacers of NZ_CP009828_10
>10.1|2703223|26|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP009828_10
The CRISPR arrays of NZ_CP009828_10 >merge|NZ_CP009828|10|2703193-2703278|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT >NZ_CP009828|10|9|2703193-2703278|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT CCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTT
>NZ_CP009828.1|WP_000491384.1|2702615_2702969_-|DUF3147-family-protein MFSIGSAILHFVIGGIAVALASIIADKVGGKLGGIIATMPAVFLAAIIALALDHRGTQLVEMSMNLSTGAIVGILSCILTVFLTSLYINHKGYRKGAIFTVVCWFVISLAIFSIRHL >NZ_CP009828.1|WP_000779135.1|2702152_2702548_-|DUF3147-family-protein MKLTLMKFFVGGFAVLLSYIVSVTLPWKEFGGIFATFPAVFLVSMFITGMQYGDKVAVHVSRGAVFGMTGVLVCILVTWMMLHMTHMWLISIIVGLLSWFISAVCIFEAVEFIAQKRLEKHSWKAGKTNSK >NZ_CP009828.1|WP_001054123.1|2701332_2701902_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNLSKQIKKYRERDGYSQEYLAEKLYVSRQSISNWENDKSLPDIHNLLMMCELFNVTLDDLVKGTIPFVPDIKVQRSLNLWAYVMIIFMTLAAILTGPLIVYWNWAWGITVMVIYGIGYYASMKIEDFKKVHKMDNYDRIVAFMNGKDPSEVQTTKARNIKTSVLSFIAFVGAIILVALISMYLANKFL >NZ_CP009828.1|WP_001059079.1|2701005_2701206_+|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEQENGGDVFVHFSGIASDGYKTLEEGQKVTFEITEGQRGDQAVNVQTV >NZ_CP009828.1|WP_000672036.1|2700422_2700614_+|peptide-resistance-ABC-transporter-activity-modulator-VraH MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSVVTTPIIGIPVGLLGGAYYLKRREEKGK >NZ_CP009828.1|WP_000586238.1|2699468_2699966_-|hypothetical-protein MIINLETQQIHFDLEHETPYFQSPEKNRIRLDIDVLNKKQISNIINVIFNNQSKTKCTFLSEYLYPVKFREKTRIGRFFNITNWYEEIHSTDEKYVIATIKNIKNKDLIDYSLYIKKGLVEPFIVFYNQENIFYISNTVIDIISVSKDTLGYIKSEFNDHCASPY >NZ_CP009828.1|WP_000672028.1|2698670_2698862_+|peptide-resistance-ABC-transporter-activity-modulator-VraH MKFRELVKQSYEDLKNLTVTWYNVIALAMIVIVLSSVTTPIIGIPAGLLGGAYYLKRREEKGK >NZ_CP009828.1|WP_000154165.1|2695949_2696708_+|peptide-resistance-ABC-transporter-ATP-binding-subunit-VraD MTILSVQHVSKTYGKKHTFQALKDINFDIQKGEFVAIMGPSGSGKTTLLNVLSSIDQISSGSVIANGQELNKLNQKALAKFRKESLGFIFQDYSILPTLTVKENIMLPLSVQKMSKATMEENYKAITTALGIYDLGNKYTSELSGGQQQRTAAARAFVHKPQIIFADEPTGALDSKSANDLLQRLEEMNKSFDTTIVMVTHDPVAASFAERVIMLKDGQIHTQLYQEGRSKQAFYEDIVHLQSVLGGVSNDI >NZ_CP009828.1|WP_000410770.1|2695147_2695660_-|HdeD-family-acid-resistance-protein MEKGNQGIKWSSLIMGVLLLMLAVVIFTFPIENFYAITWLIGLFVLINGVIQIVYRRKAKALVGGNQNWILFMGIVDILFGLIVIFNVGASSAFFIYMFAFWFIFSSIAGLFTFSGSGSLKLISVIFNLLGIVFGVILLFNPLMGIVFISTMIAIAFVFVGVIYVVDALA >NZ_CP009828.1|WP_000047373.1|2695010_2695151_+|hypothetical-protein MSKTDAQEILISKEKVFLYRHSAQTQQKGCGTNFMPHPSFEPLHFT >NZ_CP009828.1|WP_000742837.1|2703578_2704418_-|nucleoid-occlusion-protein MKKPFSKLFGLKNKDDIIGHIEEDRNSNVESIQIERIVPNRYQPRQVFEPNKIKELAESIHEHGLLQPIVVRPIEEDMFEIIAGERRFRAIQSLNLPQADVIIRDMDDEETAVVALIENIQRENLSVVEEAEAYKKLLEIGDTTQSELAKSLGKSQSFIANKLRLLKLAPKVLLRLREGKITERHARAVLSLSDSEQEALIEQVIAQKLNVKQTEDRVRQKTGPEKVKAQNLRFAQDVTQARDEVGKSIQAIQQTGLHVEHKDKDHEDYYEIKIRIYKR >NZ_CP009828.1|WP_000215588.1|2704460_2705180_-|16S-rRNA-(guanine(527)-N(7))-methyltransferase-RsmG MTVEWLAEQLKEHNIELTETQKQQFQTYYRLLVEWNEKMNLTSITDEHDVYLKHFYDSIAPSFYFDFNQPISICDVGAGAGFPSIPLKIMFPQLKVTIVDSLNKRIQFLNHLASELQLQDVSFIHDRAETFGKGVYRESYDVVTARAVARLSVLSELCLPLVKKGGQFVALKSSKGEEELEEAKFAISVLGGNVTETHTFELPEDAGERQMFIIDKKRQTPKKYPRKPGTPNKTPLLEK >NZ_CP009828.1|WP_000249657.1|2705179_2707057_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-enzyme-MnmG MVQEYDVIVIGAGHAGVEAGLASARRGAKTLMLTINLDNIAFMPCNPSVGGPAKGIVVREIDALGGQMAKTIDKTHIQMRMLNTGKGPAVRALRAQADKVLYQQEMKRVIEDEENLHIMQGMVDELIIEDNEVKGVRTNIGTEYLSKAVIITTGTFLRGEIILGNMKYSSGPNHQLPSITLSDNLRELGFDIVRFKTGTPPRVNSKTIDYSKTEIQPGDDVGRAFSFETTEYILDQLPCWLTYTNAETHKVIDDNLHLSAMYSGMIKGTGPRYCPSIEDKFVRFNDKPRHQLFLEPEGRNTNEVYVQGLSTSLPEHVQRQMLETIPGLEKADMMRAGYAIEYDAIVPTQLWPTLETKMIKNLYTAGQINGTSGYEEAAGQGLMAGINAAGKVLNTGEKILSRSDAYIGVLIDDLVTKGTNEPYRLLTSRAEYRLLLRHDNADLRLTDMGYELGMISEERYARFNEKRQQIDAEIKRLSDIRIKPNEHTQAIIEQHGGSRLKDGILAIDLLRRPEMTYDIILEILEEEHQLNADVEEQVEIQTKYEGYINKSLQQVEKVKRMEEKKIPEDLDYSKIDSLATEAREKLSEVKPLNIAQASRISGVNPADISILLIYLEQGKLQRVSD >NZ_CP009828.1|WP_000362507.1|2707123_2708503_-|tRNA-uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34)-synthesis-GTPase-MnmE MDLDTITSISTPMGEGAIGIVRLSGPQAVEIADKLYKGKHLLNDVPSHTINYGHIIDPESKEVVEEVMVSVLRAPKTFTREDIIEINCHGGILTINRVLELTMTYGARMAEPGEFTKRAFLNGRIDLSQAEAVMDFIRSKTDRASKVAMNQIEGRLSDLIKKQRQSILEILAQVEVNIDYPEYDDVEDATTEFLLEQSKEIKQEINHLLDTGAQGKIMREGLSTVIVGKPNVGKSSMLNNLIQDNKAIVTEVAGTTRDVLEEYVNVRGVPLRLVDTAGIRETEDIVEKIGVERSRKALSQADLILFVLNNNEALTQEDYTLYEVVKNEDVIVIVNKMDLEQNIDINEVKDMIGDTPLIQTSMLKQEGIDELEIQIRDLFFGGEVQNQDMTYVSNSRHISLLKQARQTIQDAIDAAESGVPMDMVQIDLTRTWEILGEIIGETASDELIDQLFSQFCLGK >NZ_CP009828.1|WP_001789343.1|2708646_2709000_-|ribonuclease-P-protein-component MLLEKAYRIKKNADFQRIYKKGHSVANRQFVVYTCNNKEIDHFRLGISVSKKLGNAVLRNKIKRAIRENFKVHKSHILAKDIIVIARQPAKDMTTLQIQNSLEHVLKIAKVFNKKIK >NZ_CP009828.1|WP_000240855.1|2709120_2709258_-|50S-ribosomal-protein-L34 MVKRTYQPNKRKHSKVHGFRKRMSTKNGRKVLARRRRKGRKVLSA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009828_10 | 10.1|2703223|26|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder | 2703223-2703248 | 26 | NZ_CP009828.1 | 1154817-1154842 | 0 | 1.0 |
NZ_CP009828_10 | 10.1|2703223|26|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder | 2703223-2703248 | 26 | NZ_CP009828.1 | 1292087-1292112 | 0 | 1.0 |
NZ_CP009828_3 | 3.2|951929|19|NZ_CP009828|PILER-CR | 951929-951947 | 19 | NZ_CP009828.1 | 820985-821003 | 1 | 0.947 |
NZ_CP009828_3 | 3.2|951929|19|NZ_CP009828|PILER-CR | 951929-951947 | 19 | NZ_CP009828.1 | 830154-830172 | 1 | 0.947 |
NZ_CP009828_3 | 3.2|951929|19|NZ_CP009828|PILER-CR | 951929-951947 | 19 | NZ_CP009828.1 | 1292154-1292172 | 1 | 0.947 |
NZ_CP009828_3 | 3.2|951929|19|NZ_CP009828|PILER-CR | 951929-951947 | 19 | NZ_CP009828.1 | 2236979-2236997 | 1 | 0.947 |
NZ_CP009828_5 | 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154607-1154636 | 30 | NZ_CP009828.1 | 830124-830153 | 1 | 0.967 |
NZ_CP009828_5 | 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154607-1154636 | 30 | NZ_CP009828.1 | 1054152-1054181 | 1 | 0.967 |
NZ_CP009828_5 | 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154607-1154636 | 30 | NZ_CP009828.1 | 1712606-1712635 | 1 | 0.967 |
NZ_CP009828_5 | 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154607-1154636 | 30 | NZ_CP009828.1 | 2703259-2703288 | 1 | 0.967 |
NZ_CP009828_5 | 5.2|1154663|30|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154663-1154692 | 30 | NZ_CP009828.1 | 784047-784076 | 1 | 0.967 |
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NZ_CP009828_5 | 5.3|1154719|40|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154719-1154758 | 40 | NZ_CP009828.1 | 2202731-2202770 | 2 | 0.95 |
NZ_CP009828_5 | 5.3|1154719|40|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154719-1154758 | 40 | NZ_CP009828.1 | 2237053-2237092 | 2 | 0.95 |
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38. spacer 5.3|1154719|40|NZ_CP009828|PILER-CR matches to position: 2202731-2202770, mismatch: 2, identity: 0.95
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39. spacer 5.3|1154719|40|NZ_CP009828|PILER-CR matches to position: 2237053-2237092, mismatch: 2, identity: 0.95
aagctggcagaaagtcagcttacaataacgtgcaagttgg CRISPR spacer aagctggcggaaagtcagcttacaataatgtgcaagttgg Protospacer ********.*******************.***********
40. spacer 10.1|2703223|26|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder matches to position: 2040962-2040987, mismatch: 2, identity: 0.923
ccgccagcttctatgttggggccccg CRISPR spacer ccgccagcttctgtcttggggccccg Protospacer ************.* ***********
41. spacer 10.1|2703223|26|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder matches to position: 2041300-2041325, mismatch: 2, identity: 0.923
ccgccagcttctatgttggggccccg CRISPR spacer ccgccagcttttgtgttggggccccg Protospacer **********.*.*************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009828_5 | 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154607-1154636 | 30 | MT670422 | Pseudomonas phage phiPsa397, complete genome | 92792-92821 | 6 | 0.8 |
NZ_CP009828_5 | 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154607-1154636 | 30 | NC_023601 | Pseudomonas phage phiPsa374, complete genome | 91744-91773 | 6 | 0.8 |
NZ_CP009828_5 | 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154607-1154636 | 30 | MT670421 | Pseudomonas phage phiPsa381, complete genome | 92566-92595 | 6 | 0.8 |
NZ_CP009828_1 | 1.1|658118|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder | 658118-658147 | 30 | NZ_CP023312 | Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence | 270977-271006 | 7 | 0.767 |
NZ_CP009828_5 | 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR | 1154607-1154636 | 30 | LN846932 | Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome | 10621-10650 | 7 | 0.767 |
NZ_CP009828_2 | 2.1|774598|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder | 774598-774627 | 30 | KC139649 | Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds | 9669-9698 | 9 | 0.7 |
NZ_CP009828_2 | 2.1|774598|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder | 774598-774627 | 30 | KC139636 | Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, and hypothetical proteins genes, complete cds | 9669-9698 | 9 | 0.7 |
NZ_CP009828_2 | 2.1|774598|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder | 774598-774627 | 30 | NC_025443 | Salmonella phage 9NA, complete genome | 7835-7864 | 9 | 0.7 |
1. spacer 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR matches to MT670422 (Pseudomonas phage phiPsa397, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
---aagctgacgaaaaatcagcttacaataatg CRISPR spacer tgcaggc---cgaaaaatcagcttccaataacg Protospacer *.** ************** ******.*
2. spacer 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR matches to NC_023601 (Pseudomonas phage phiPsa374, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
---aagctgacgaaaaatcagcttacaataatg CRISPR spacer tgcaggc---cgaaaaatcagcttccaataacg Protospacer *.** ************** ******.*
3. spacer 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR matches to MT670421 (Pseudomonas phage phiPsa381, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
---aagctgacgaaaaatcagcttacaataatg CRISPR spacer tgcaggc---cgaaaaatcagcttccaataacg Protospacer *.** ************** ******.*
4. spacer 1.1|658118|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023312 (Vibrio anguillarum strain VIB12 isolate Sea bass plasmid p292, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gttaaagaatacagttggtttgcttgcgca CRISPR spacer aagtaagaatacagttgctttgctcgcgcc Protospacer . ************* ******.****
5. spacer 5.1|1154607|30|NZ_CP009828|PILER-CR matches to LN846932 (Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aagctgacgaaaaatcagcttacaataatg CRISPR spacer atgaagacgaaaaatcagattacgataaat Protospacer * * ************* ****.****
6. spacer 2.1|774598|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder matches to KC139649 (Salmonella phage FSL SP-069 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, hypothetical proteins, deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, hypothetical proteins, NinH, head morphogenesis protein, hypothetical proteins, capsid related protein, hypothetical proteins, enolase-like protein, hypothetical proteins, tail fiber, hypothetical protein, putative endolysin, hypothetical proteins, and DNA polymerase genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
7. spacer 2.1|774598|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder matches to KC139636 (Salmonella phage FSL SP-062 hypothetical proteins, RdgC exonuclease, hypothetical proteins, TerL, and hypothetical proteins genes, complete cds) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
8. spacer 2.1|774598|30|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder matches to NC_025443 (Salmonella phage 9NA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
cagagaaattggaacgccaatttctacagg CRISPR spacer agctttaattggtacgccaatttctacatc Protospacer . ****** ***************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
752920 : 760740
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009828|752920:760740|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP009828|752920:760740|759011_759605_+|WP_000604508.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDIINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP009828|752920:760740|757992_758661_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP009828|752920:760740|759588_760740_+|WP_001217800.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIVRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP009828|752920:760740|753975_754662_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP009828|752920:760740|756171_756756_-|WP_058142967.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIIMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP009828|752920:760740|757571_757991_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP009828|752920:760740|756854_757568_-|WP_001062976.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP009828|752920:760740|752920_753976_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP009828|752920:760740|755451_755892_-|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP009828|752920:760740|754636_755110_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
772721 : 787231
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009828|772721:787231|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP009828|772721:787231|776277_777783_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP009828|772721:787231|776098_776200_+|WP_031760357.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP009828|772721:787231|778122_778623_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP009828|772721:787231|775088_776006_-|WP_000429011.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP009828|772721:787231|784364_784520_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP009828|772721:787231|778642_779509_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP009828|772721:787231|780309_780708_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP009828|772721:787231|772721_773780_+|WP_000663039.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISSHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP009828|772721:787231|784558_785530_+|WP_000876317.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMEGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP009828|772721:787231|785516_786473_+|WP_001245572.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFIITLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP009828|772721:787231|773938_774481_+|WP_000197262.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP009828|772721:787231|782893_783865_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP009828|772721:787231|780670_782776_+|WP_000855509.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYSVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP009828|772721:787231|786469_787231_+|WP_000616873.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQTILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
867870 : 889371
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP009828|867870:889371|DBSCAN-SWA 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MNKKLLTRTLIASALVLTTVGSGFHSSSNYNGINNVAKASEITDRDLWKNVRDALKEANIIDKTANETVGVTYNLNNGGESSITGTADLDELSNFNNKPINTDSVKRIDLSRINPNGNRFDANDAWKKLTDKLKEKQIVKNGDTVTIHSKDKNDPPISAKVGENYNGNKGLMLNQRDITKITITK >NZ_CP009828|867870:889371|870565_871786_-|WP_000266157.1|integrase|DBSCAN-SWA MWLEKFKNKNKETKYRYYEKYKDPLTAKWRRVSVVLNKNGKQSQKEAQRLLNERIEAKLNDKTPTTLKSLTFHVACDEWFQSYIKTSGSKRTTIKTKLSKLNTLKKFVDEDILINKITLSYAQQVFDEMDNKGYVYQVNKDALSIFKNVFEYTRRIYKLQDLEFLKDITLNKRIKSYDEVKAKRNKYLELNEIQSIIKDINTKAQKMHSGIHKRFYLFVALMTEFQALNGMRIGEMLAIQNEDIDFDNKSLNINGTIHWFHDESGGFGVKDTTKTESSYRTIGLSSRSCEILKKAILENKKDSKWNDGYLNRNFVFTNHKGNPMQTERFNKILREAAKDVGIDKEVSSHILRHSHISLLSQQGVSLKAIMDRVGHSDHRTTLSIYSHVTEQMDKDMMNKLEQVKLG >NZ_CP009828|867870:889371|881803_882331_+|WP_000771368.1|coat|DBSCAN-SWA MKLLKTKNCLYYRNGDNKLSEYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKAGLQNYKNRSINNMALLKKVLNHYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNTAIENSKIARVNAYHQSSYVKVV >NZ_CP009828|867870:889371|873871_874330_-|WP_000281657.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP009828|867870:889371|869601_870423_+|WP_000732334.1|DBSCAN-SWA MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGSKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP009828|867870:889371|875545_875755_+|WP_001058486.1|DBSCAN-SWA MNNEQKEVIEHLVYQLELSVMNNLESYEHTEYVNGIEVVSEISREKHLELIMKWCAQELKNNFQLEKGE >NZ_CP009828|867870:889371|880585_880927_+|WP_001190615.1|DBSCAN-SWA MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIKV >NZ_CP009828|867870:889371|885677_885878_+|WP_000382163.1|DBSCAN-SWA MDVDNMSDYKLKIIELIKSDITGYQIHKQTGVAQYVISQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYSYARQVL >NZ_CP009828|867870:889371|877027_878497_+|WP_000390454.1|DBSCAN-SWA MEDVTNEEVFEMIDSRTGVLNANDWKSQLRRSATTQALKKTTTNAEIILCNDESLKGLVQYDAFEKVTKLKRLPYWRSKGDTNYYWADIDTTHVISHIDKLYNVQFSRDLIDTVIEKEAYQNRFHPIKSMIESKSWDGIKRIETLFIDYLGAEDNHYNREVTKKWMMGAVARIYQPGIKYDSMIILYGGQGVGKSTAMSKLGGHWYNQSIKTFKGDEVYKKLQGSWICEIEELSAFQKSTIEDIKGFISAIVDIYRASYGKRTERHPRQCVFVGTTNNYEFLKDQTGNRRFFPITTDKNKATKSPFDDLTPDVVQQMFAEAKVYFDEDPTDKALLLDKEASEMALKVQEAHSEKDALVGEIEEFLERPIPSDYWYRTLEEKRVSAHDVIDQDYIKLYGDGKLIELPNTKPGAYVWRDKVCSMEIWKVMMKRDDQPQQHHLRKIDKALRNTSYCGQSKSRHRFGEGIGRQYGFGINLISYYQGLKSKEQK >NZ_CP009828|867870:889371|881534_881753_+|WP_000448773.1|DBSCAN-SWA METKYELNNTKKVANAFGLNEEDTNLLINAVDLDIKNNMQEISSELQQSEQSKQKQLGTTLQNLAKQNRIIK >NZ_CP009828|867870:889371|872625_873354_-|WP_058142969.1|DBSCAN-SWA MNKIFRILTVSLFFFTFLIKNNLAYADVGVINLRNFYANYEPEKLQGVSSGNFSTSHQLEYIDGKYTLYSKFHNEYEAKRLKDHKVDIFGISYSGLCNTKYMYGGITLANQNLDKPRNIPINLWVNGKQNTISTDKVSTQKKEVTAQEIDIKLRKYLQNEYNIYGFNKTKKGQEYGYQSKFNSGFNKGKITFHLNNEPSFTYDLFYTGTGQAESFLKIYNDNKTIDTENFHLDVEISYEKTE >NZ_CP009828|867870:889371|887429_888281_-|WP_001183851.1|DBSCAN-SWA MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_CP009828|867870:889371|882671_883241_+|WP_001293067.1|terminase|DBSCAN-SWA MSELTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPKSGKVQLVYNEHVELIEVPIKPSDRLKARDMLGKYHKLFTDKHDINGNVPIFINIGEWDGDDEELDKAVKDVSNANPNHTVIVDDIPLED >NZ_CP009828|867870:889371|882462_882675_+|WP_045181470.1|DBSCAN-SWA MADDNIDDHIVKNHLEMIVDRVANDKEFYIFDSLIQGRSFKDISNVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE |
33 | Staphylococcus_phage(77.78%) | integrase,coat,terminase | attL 866177:866198|attR 886839:886860 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
977643 : 1023369
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP009828|977643:1023369|DBSCAN-SWA 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38 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase,tRNA,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1055576 : 1064049
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP009828|1055576:1064049|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP009828|1055576:1064049|1056045_1057170_+|WP_001010401.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISSQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETCECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP009828|1055576:1064049|1062451_1063480_+|WP_000030810.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDLFLEPTKLYVKPVLTLKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGDIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP009828|1055576:1064049|1057173_1057878_+|WP_000174047.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKNLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATSANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP009828|1055576:1064049|1063482_1064049_+|WP_000238670.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP009828|1055576:1064049|1058806_1060996_+|WP_000032747.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP009828|1055576:1064049|1057877_1058141_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP009828|1055576:1064049|1058142_1058814_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP009828|1055576:1064049|1055576_1056059_+|WP_000861570.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP009828|1055576:1064049|1060974_1062459_+|WP_000483727.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1322191 : 1329695
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP009828|1322191:1329695|DBSCAN-SWA TATGAATTGCTATGATGAAATATACAATACAATCAAAAAATTGATAGAAAACAAAGAGATAACGAGTTATCAAATTAATAAAGATACAGGAATAAGTTACGGTAATATTAATGCTATGCGCCGTGGAGAAAGAAGAATAGAAAATTTAAGCTTAAAGAATGCAAAGATCTTATATGAATATGCGAAAAAGGTATTATAATATAAGCATTGAGTTCAATAGGCATACAATAACTGCCCAAACTAGTGACTGAGTGGGAGTTTTTATAGTATTAAAAGTTTTCTAAAAGCGAAAGAAATCATGTTTACTGATTTACTTATGTTTTTAGAAATAGTATAATAATTTTATATAATATATAGAACTTCAGTATACCTTTTGAGTATATATGGAGTTCTTTCTTTTTTACAAGATGTATATGTATAAATGGAAATGTTTATTACATTACATAAAAACCTTTAGGTGCTCTTAGATGGATGTTAATCATAAAACAAAGAGATTTTGAAAAATATAGGCTATTATAATTTAGAATTACAAATTATTAATCTTGCCATTGGATATGGGAATTCAAACATATCACTTACTCCAATTTGTGGAATGTTAAATAACTATAAAGAGGAAAGGAGAAAAAATGATAAGAATGGTTAAAGAAAAAGAACGAATAGCAAAATTAAATTTCGAATAGCTGTGACGAGCTTAATAATTCAAGTACTTAATTTTATCAAATCGTTCTTTTAAAAAGGCAAAGGGCAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTACCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAAAATAAACTATTCTTTCATTTTGACAAAAATAATGAACCAGTTTAAAGAAATTTATAATACAATAGAAAAATTACTAAATGATAAATCAATATCTAATTATAGAATTAATCAAGACACTGGTGTTTCTTATGGTGGTATAAGTGAATCAAGAAGCGGGAAAAGAAAAGTGAATAATTTAACTTTAGAAACAGCGGAAAAACTCTATAATTACCAAAAACAATTAGAAATAATGATTGAAGATTAAAATAAGGCCATATCTTTTGAAATATCATGGAGTGAGCCTTTTAAATCATATAATTTTAAAGTATATTAAAGATGGATAGCTTAATGTGAATATAAATAAAAAATTATCGAATAATATAATATAGAATATATGAAGACAAGAAATTTTATCAATATATAATAAAAAAAGCCAATACTATTAGGTATTAGTTTTTGAATTAACTAGTTTGGCAACTACAAAGAAACAATGTATTGCTAAACGTAGTTACTGCATTAGGATTATTATAATTATAAATAGAAAGAGAGCGTGATTAAAAATGAATGAGATTGAAACTATTATAAGTGAAATAGAAAAGTTATTAACTAACAATACACCATATAGTATTTCAAAAAACTCAGGTGTACCACGTCAAACAGTTACTGATTTAAAGGTAGGTAATACTAAAATAAAGGATGCCAAATTTAAAACAATAATCAAGTTATACGAGTATCAAAAGTCGTCAGAAAATAATTCAGAGTGCTAATAAATATACCTTGTTTGATTAGGTGGACAAGAAATTAAATTTCTAATGATTTCATGGTTGTCTGTCCACGCTTTGTCCACCTCAATAAAATTATCTCTAGGTTTTTAAAATTGTACATGTTTAAACAATCAAAAGTATGCATTATTATATTATCATTTCCATAAAAATTTAAATGATCTTTAAGTGATGATATAAAAGGCTGAACATAGTAAATAAGTTAACTTTAATGCAGCATACTATACATATTTTATAATAATGTTTATGCACATAATTTTTTATTGACAATTTTTTATATTAAATTGTGTAATTGGCATATATGATGATTTGTGATAATTATATTGTAATATAGCATTTGGTTTTATGATTCTAAAATTAATAGATTTGAAAAGTATACTTTATTTCATGAAAGTTTTTGGTACATTTATTTGAAAATGTTTTTATTACAAAGTTACATGGCTAAATGTTTCTTAACAAAATTAATTCATCGAGTGTAAAGAATCGTGTGGTAAACATAATTTATATAGATTATAAGGAGGTGAAAATGGTCGAGGAAGTAAAAACGATAAAATAGTTTGAATGTTTTGATTTCAATTCTGATAGGACTATTGAATTTGCAAACTAATAAGAATGTGAGGTTTGATTTAATTCGAAGTCATATTCTTTGAATAAAATATTACTTTCTTACCATTAGTAAAATGAAGATGACTATTAAAGTGCGAAAAACAAATAAAAAAGAGAAAATAGAATTTTTAATAGGGACGTTTATAATTATTCTAGTAATATTAGGCTTCAAAATTATGAAATAAATGTATAGTATTTGAGAAGTCTATATGACTCCGGAAAAATTAAAGTCTAAAGATATTTCAATATCTCAAATTTAATAGACTACTGGAATTAGTAGTTTGAATATTGAAAGACTCTAATCTAATAAAAATACATAAAAGGTTAAACTTTAGAAGTGGTTGTAAACTTCAATGAATACTAAACATTGAAGTTTAGTAAAAGGCGTAAGGTATACAAGACAAATCGTTTGTCTTTGACAAAGTAATTGATGATGTAAAGTCGTTAATATGTAGAAACAAAAATTGAAAATATGAAATTTAACTATTATGAAGTGATGATAGCCATTAATGAATAGAAAAATAATAAAATCATTTATAAATAAAAAATACGTTAAGTTCACAGAATTTCGAAAAAAAGCAGTAAACATTGTACAGATATGGAGATGAAAAAAATGTCAGAATACAAGAAAAAGATAATTGAATTAATTGAAAGTAATTTAACAGGATATGAAATTTCTAAAAAAACTGGAGTTTCTCAATACGTACTTTCACAATTAAGACAGGGCAAACGCGAAGTAGATAATCTAACCCTGAATACAACAGAAAAATTATATGAATATGCCAATAAAGTTTTGTAATATAACTACTGTATAAATTAATCAAGCTATGTTTATTTGATTTAACTATTAATAAAAATCATATGGTGAATGGATATTATAATAATTAAAATACAAAAATAGTAGATTCCAATTTGTGAAAAAGGAGTATGTTGTTTCATTTAGAATTTATTGCACGAAATTAGCATCGAATAAGGGAAAATAAGTGTTAAGTTTTAAATGATAAAAAAGATTGGAATGGATCGTCTTGAAATGCTCCCTTCAAAGTTTTCATTTTTTCAATGTCTACTTCGAAGGGGGCATTTCCATTAAATTGTTATAGCTTTTTATATTTGTATAATGAACATATAAGTTTAAGAAGATGCGAGTGAAGGAAATAAAAAAGCTCAAATGTACCAAATTGTTAATCTTAATAAATCTCTACTTTATAAAGATTGAATGGACATTCGAGCGTTAATCAGTCAGGAGGGAATTTCACTCCTACAATTTAATAATAATACTTGCTTCACCACTGTACAAGGAGTGATTTGTTATGTTCAAAGTGAATTATTCGATTTTAAGTTATTATCCAGAATATAATATCGCAGTAAGTTGGCAACGTTTAAGAGAAGGAAAAATAATAAAAAACAAGATTTAATACTGCTGCGTCATGAGGCGCTTGAACATTATTTGATGAATAAGTATAATTACAACTATGATTATGCACATAAAATTGTATCAAAAAATACGATTATTCAATTTTTATAAAAATAAGGTGGATTAAATGCTTACATTAATAAAATTGAAAGAAGATGAACAGGTTATAATATATGAATATATACCTGAAGATGATATAAGTAACGGTAAAGGTTCAGTAACTTTTAATAAAAAAGATGCAGAGGTTATAGATTTTTCATTATCTGAAATAGAAAATGAAGAATATTTTATGTTATATCGTAATAAGTCTTTTTCTGTAGTAAGAGACTTTATCGAGAAGCAAGAATTTCCCGAAAATTATAAAATAGCTTGGTATTAAAGCATCCTTTCTACACAGATAAAGAGAAAGTGGTGCTATTTTTATACACTTTTTTAACTATTTACTGAAATAGCAGAATCACAAAAGTTAACATATTTAAAAGAACTTGGTGAAGATGGTGAATATAAATATGTTGCCAAAATAGATAGTGAAACATCTAAATTATGTCATTCACTCAACGGAAAAATATTTAAAGTTAAAGATATGATACCAGGTGTGAATGCGCCACCTATGCATCCTTGGTGTAGAAGTACCGCAGTGCCATATGTCGGCAAATGGCGAGACAAGTTCTTTAAAGAGCGTGAAGGTAAATATCAGGTAGAAGTAAAAGAAGCAAAATTACAGGAAAAAGCTAAAAACCAGATGAAAGAAATGATTGAAAGTGGTAAAATAAAAATAGAAATAAATCCTGAAAAACAGAATAGACATTCTTTAGGTCATAGACTATACGAAGAATATAAAAAAAGAATTTGTTGAAAGGAAAACAAACACCGAGTTATACACTACTAAAAAATGATGAATTAAATAAAATGCTAAATCAAAAATTTGGCACTGGACGGTTGATTATTGAAAATGAAAGAAAATGGAAAAATAAAGAAATAATTAATTTTGGTCAAATTATAGGAAAATATTACATAGATGGAAAATTTATAGAAACTAAATGGGGTACTGTTCATTATTCCAAAACTGGTAGTCATATTATTCCAAATGGAAAGGAAGGTAAGTAATGAAGTTATGGACTTACATTGGTAAAAAAGTAATGATCGAGTTAACTAATGGGCAAAAATTTATTGGAGAAGTTACAAATTATGACGATGAAATAGATAACGAAAGTGGAGAAGATTCTATACATTTAGATGACGGAATAGATTTATATGATTTTGATGAAAGCCAAATCAAATATATTGAAGTTTTAAAATAAGTATACTTTTGTAAGAAACGAATGTGTTACTATTTTTATACATTTTTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP009828|1322191:1329695|1328753_1328948_+|WP_001217295.1|DBSCAN-SWA MRIEDAYRKDVIITLLNNEEYEGFVTDYENEFESETGNLVVDIQTDFAVYSFDETEIKSIRLLK >NZ_CP009828|1322191:1329695|1325039_1325225_+|WP_000006110.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >NZ_CP009828|1322191:1329695|1326692_1326947_+|WP_001813273.1|DBSCAN-SWA MKGKQTPSYTLLKNDELNKMLNQKFGTGRLIIENERKWKNKEIINFGQIIGKYYIDGKFIETKWGTVHYSKTGSHIIPNGKEGK >NZ_CP009828|1322191:1329695|1323078_1323303_+|WP_078065144.1|DBSCAN-SWA MTKIMNQFKEIYNTIEKLLNDKSISNYRINQDTGVSYGGISESRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQLEIMIED >NZ_CP009828|1322191:1329695|1326288_1326696_+|WP_166517775.1|capsid|DBSCAN-SWA MAESQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSETSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTAVPYVGKWRDKFFKEREGKYQVEVKEAKLQEKAKNQMKEMIESGKIKIEINPEKQNRHSLGHRLYEEYKKRIC >NZ_CP009828|1322191:1329695|1322191_1322389_+|WP_001659797.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIYNTIKKLIENKEITSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNAKILYEYAKKVL >NZ_CP009828|1322191:1329695|1325736_1325841_+|WP_000477491.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPEYNIAVSWQRLREGKIIKNKI >NZ_CP009828|1322191:1329695|1329026_1329695_+|WP_064137920.1|capsid|DBSCAN-SWA MAESQKLTYLKELGEDGEYKYVAKIDSKTSKLCHSLNGKIFKVKDMIPGVNAPPMHPWCRSTTVSHVGNWRDKFFKEREGKYQVEGSFIESGALNNKSDEYGIKRNRHAQIYYNSVRNRDKQIEISKIAKNTNINKNTIQRVYEHIFENKYLLESGFKQFDPDFYMAQSWQRLREGKNIKKMDIIMLKHEALEHYLMNKYNLNYIEAHKLTEIKYNYSILIN >NZ_CP009828|1322191:1329695|1326946_1327141_+|WP_000780597.1|DBSCAN-SWA MKLWTYIGKKVMIELTNGQKFIGEVTNYDDEIDNESGEDSIHLDDGIDLYDFDESQIKYIEVLK >NZ_CP009828|1322191:1329695|1327296_1327575_+|WP_000440735.1|DBSCAN-SWA MERNESNITDVTQNEEQLDNSDEQSQQNEKTFSQEEVSQLIKERIARERKKSDERIKDAKENNDSNEVAYLLKGGKVTKVYGDQGSVSYMLR >NZ_CP009828|1322191:1329695|1323598_1323805_+|WP_001002343.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGNTKIKDAKFKTIIKLYEYQKSSENNSEC >NZ_CP009828|1322191:1329695|1327201_1327330_+|WP_071665623.1|DBSCAN-SWA MKVIFYCPKCADDILKASMEYQSTDYKRRYISWKEMKVILLM >NZ_CP009828|1322191:1329695|1324500_1324611_+|WP_001788716.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >NZ_CP009828|1322191:1329695|1325967_1326219_+|WP_000956747.1|DBSCAN-SWA MLTLIKLKEDEQVIIYEYIPEDDISNGKGSVTFNKKDAEVIDFSLSEIENEEYFMLYRNKSFSVVRDFIEKQEFPENYKIAWY |
14 | Staphylococcus_phage(87.5%) | capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1503993 : 1628857
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP009828|1503993:1628857|DBSCAN-SWA CTTATGGATATAAACGGTTTAATAATCTTGGGAATGGCGCTGTTTCACGAACGTGTTCAACACCAGAAATCCATGCTACTGTACGCTCTAAACCTAAACCAAATCCACAGTGTGGCACACTACCATAACGACGTAAGTCTAAGTAGTAACTATATGCTTCTTCGTCTAATCCATGTTCTTTAACGCGTTGTTCTAACAATTCTAAGTCATCCACACGTTCAGATCCACCTATAATTTCACCGTATCCTTCAGGTGCAATTAAGTCTGCACATAATACAGTTTCTTCATTCTCAGGATTTGGTTGCATATAGAAAGGCTTAATTTTAGTTGGATAATTAGTAATAAACACCGGTAAATCATAATGATTAGCAATGGCAGTTTCATGTGGCGCACCAAAATCTTCGCCCCATTCAATATCATCAAAGCCTTCTGCTTTTAAGAATTCAATTGCATCATCGTATGAAATTCTAGGGAATGGTGTCGCAACTTTTTCAAGTTTTGATGTATCACGCTCTAAAATTTTCAACTCTAGTTTACAATTTTCTAAAACTGATTTTACTACATGTGTTACATATTGTTCTTGAATTTCTAAACTTTCAGCATGATTTGTGAAAGCCATTTCCCCTTCAATCATCCAGAACTCGATCAAGTGTCTACGTGTTTTTGATTTTTCAGCTCTGAAAGTTGGACCAAATGAAAATACTTTTCCGTGTGCCATTGCCGCAGCTTCTAAGTATAACTGACCACTTTGAGATAAAAACGCATCTTGATCAAAGTATTTAGTATGGAATAATTCACTTGTACCTTCTGGTGCACTTGCTGTCAAAATTGGTGGATCAACCTTTGTAAATCCATTTTTGTTGAAAAATTCATACGTTGCACGAATAACTTCATTTCTAATTTTCATTACAGCATGTTGTTTTTTAGAACGTAACCATAAATGACGGTGATCCATTAAAAATTCTGTACCGTGATTTTTAGGTGTAATCGGATAGTCATGCGCTTCTGAAATAACTTCAATTGATTTCACTTGCATTTCGTATCCTAAGTCAGAACGATTATCTTCTGTAATTGTGCCTGTAACATATAGAGATGATTCTTGAGTAATTTCTTTCGCAAGTTTGAATACCTCTTCATCAACTTCTGATTTAACTACTACGCCTTGCATAAAACCTGTTCCATCACGTAATTGTAAAAAGGCGATTTTACCACTTGAACGTTTATTTGTTAGCCAAGCACCAATTGTAACGTCTTGGTTTAAATGATCTTTCGCTTGTTTAATCGTTGTTTTCATAACCATTCTCCTATTTATTTTTTCGTTATACAATACTCATTCATTTTAACAAAATCCGCTTTCAAGTTCTAGAACTAGACTAAAAGATAACGTGTAAATGGTAATGATTTAAGCACAGATTTGAACATTAATTTATATTAAGACAGTGCAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATATTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAGAACATAGCACATGTCATGTCACAAGAATTTTACTTTGTATCTCACTTTTTCTTTTTTTGAATTTGTCTTAATAATTTTCCAAACTGTTGAATGTCGCCTTTTTTCTGACGATAATTTTCAAGTGTTTGTTCAAAAAAGTTTTTATAATTACTGTTTATGAGTCGATCATCAAATGAAACTATTATGCCGCGATCATTTTCATTTCTAATTAATCTTCCAAGTCCTTGTCTAAAACGTGTAACTGCATCAGGTAATACATATTCCTTGAAAGTTGAAGTGAATTCAGAATCCATAAGCCAATATTTTGCATTATGCTTGTTCATAAACGGTAACTTCGCTATCATCACACATTTAATACCATTTGCTTGAAAATCAAAGCCTTCAAAAAATGTTGACGTACCAAGCAGTATGGCCTTATCAAAATTATTAAACTGTTGTACTATTTTATAATTTTGGTTCTGCTGTTGTGTTAATACAACATAATCTTCAAATTCTGGCAATTCATTTAGCATATCTTGTACCATATGCATCATTTTATAACTCGTAAATAAGACTAAACATTTTGATGACGTTATAGTCGTATATTCAATAATATAGCTTACAATCGATGCTACATACTCATCTATATTTTTATATTGATAAGATGCTACATCACTCGGTATAAATACACTTGTATTTTTTGCACTTTGTAACGACGTGTTAACTTCAAATGTATTAAAGTGAACATCTTTGTTGAATAACTGTTTAAAAGCATCAAACGAATGATTAAATTTTAAAGTACCAGATATAAAAATGAGTGATTTAAATTTTTCCAATACTTGTTTCGTCAATACATCTTTTACAGCGTAATCTTTCACATATAAACGTATTGTTGATTTTTGAGATAAATTTTTAATTGAAATGAAACTAGTATGTCCAGCTTTTAAACTTTGTTCGATATTTTTAAATTTATCTTTTAAATACAACAACTGTTTCCGTAATGATTTAACTGTTTTATGACTAATGCCATTGAATATTTCTAGCGTTTTATTTAACTTATCGATAATCGCATGTAAATCCTTCAAAATGTCTTTTGTTTCAAAAGTAAATACATTATGGAAACGATGAATATCATCATCATAAACATCAGAATCATTGATAATCGTAAATATCGTTGAGAACAATTGCTCATTTAACTCATGAATCTCATTCATACTAGCCTTCAAGCCAAAAATATCAATTGGTGCAATATCTAATTTTTCCAATATTCGTTGCTTTTCCAGTTGATCAATTGCCTTTAACAATTTTTCATTTTCGTTTTTACCAATCAAACCAAGCTGATATTTAATATCAGCATAACTCAACTCATTTGTCACTTGATTTAAGGCATAGTCTGGTAAGCGATGTGCTTCATCTACTATACAATCATCAAACAATTGATATATTGAATTTTCAACATCAGAATGAATTAAATGTGCATGATTTGTAATACCAATTTGAATGTTCTGTGCATTTCGCTTAATAAAATTATAATAATGAACATCGTGACGTGCCGGTACATATGTTTCGATTTTCTGGTCAAAATACATCTTTTGACCACCTTTTAAATTTAATTCCTGGATATCTCCGGATGGCGTCTCTGTAATCCAAATCAGCAATTGCATTTTCAAGATATTCACTTCGTAATTACTTGTGTCATCTTTTAAAATTTGACTAATAAGTCCCAATGAAATGTAATCACTTTTACTTTTAATCAATAGTGCATTAATTTTAAAATTCAACGCTTCATTCATTGCTGGAATATCTTTTTCTAACAATTGACTTTGCAGTAATTTGGTATTGGTAGAAATCATGACATGCTTCCCAGTTTCAATATTATACATCAAGGCCGCAAGTAAATATGCTAATGATTTACCACTGCCTAGTGATGCTTCAATCATTGCTTTTTCACTATGCATGAGCTGATCTAATATAGTTTCCGCTAAATATAATTGCTGCGGTCGATATGTTAAGCCAAGTTGATCTACAGCTTTGCTATATAAAGACTTCAAGCTGCCTTTATAATTTGTTGTCGGCTTTTTAAAATCAACTTGCTTACGATAGATAATCTGTTCGAACTTTTCGTACGATTTATCCAATGGCTTTGCATCATATTGCCTAACCATCTCAAAGAAAATATCATACAAATCGTATTTCAACTGTTTACTTAAATAATATAATTGCTTTAAAGTATCTAACGGTAACTTTTCAAATTTTTCAAAAGCTAATATCATCAATTTAGCAGTAGTAGCGGCATCTTCGTCAGCTCGATGGGCATTTGCTAAAGTAATACCATGTGCCTCTGCTAATTCACTTAATTGATAGCTTTTATCTGTAGGAAAAGCTATTTTAAAGATTTCTAGTGTATCTATAACTTTTTTGGGACGATATTGAATATTACAATCTTTAAATGCCTTTTTAATAAAATTTAAATCAAAATCTACATTATGAGCGACAAAAATGCAATCTTTTATCTTATCGTAGATTTCTTGTGCAACTTGATTAAAATATGGCGCTTGTTGTAGCATATTTTCTTCAATGGATGTTAACGCTTGAATGAATGGCGGAATCTCTAAATTTGTTCTAATCATAGAATGATATGTATCAATAATTTGGTTATTGCGCACAAACGTTATACCAATTTGAATGATATCGTCAAAATCTAATTGGTTGCCTGTTGTTTCCAAATCCACAACGGCATAGGTTGCCATACCCATAGCTATCTCTCCTTGCTTTAGTGTTAAAAATCTATATCTGCACTAATTAAACGGTGTGATTCACCCGCTTCATCTCTAACAATTAGATAGCCATCGTAATCTAAATCAATTGCTTGTCCTTTAAACTGTTTATCATTTTCTGTAAATAGCAACGTTCTATTCCAAATATTAGAAGCTGCAATATATTCTTCACGAATTTCAGAAAAAGGTAACGTTAAAAATTGATTATATCTTTTTTCAATTTCTTGAAGTAATCTCTCTAAAAATTGATATCTATCTAATTTATTTTTATCATGTAATTGTATACTTGTTGCTCTATGTCTAATACTTTCATCAAAGTCTTCTAGTTGTTGCGTCAAATTAATACCTATACCACATATTATTGCTTCTATACCATCATTATTAGCAACCATTTCAGTTAAGAAACCACACACTTTACCATTATCAATATATATATCATTCGGCCATTTCACTTTGACTTCATCTTGACTAAAATGTTGAATCGCATCTCTTATCCCTAATGCAATAAATAAATTAAATTTAGATATCATTGAGAATGCAACGTTAGGTCTTAACACGACAGACATCCAAAGTCCTTGCCCTTTTGAAGAACTCCAATGTCTATTAAATCGCCCACGACCTTTCGTTTGTTCATCACTCAAGATAAAAAATGAAGATTGATTTCCAACAA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184 | Staphylococcus_phage(90.51%) | protease,capsid,integrase,tRNA,head,portal,tail,holin | attL 1580992:1581051|attR 1623164:1623275 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1683979 : 1692291
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP009828|1683979:1692291|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCTATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAACAAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTATTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACTTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACAATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAACGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCCGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCACGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATGCCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTCTATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACACACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTGCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTTTCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAGTGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP009828|1683979:1692291|1688353_1689031_-|WP_000624567.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVERIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP009828|1683979:1692291|1690491_1692291_-|WP_001217251.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPASYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERSFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNIINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP009828|1683979:1692291|1684890_1685781_-|WP_000924210.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDCFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP009828|1683979:1692291|1685790_1687137_-|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP009828|1683979:1692291|1683979_1684765_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP009828|1683979:1692291|1689161_1690268_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP009828|1683979:1692291|1687250_1688351_-|WP_000683914.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVAVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGVSNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1762935 : 1771978
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP009828|1762935:1771978|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP009828|1762935:1771978|1768505_1768766_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP009828|1762935:1771978|1770973_1771978_-|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP009828|1762935:1771978|1768784_1769924_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP009828|1762935:1771978|1769946_1770972_-|WP_001019166.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFKPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGYRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP009828|1762935:1771978|1765951_1768231_-|WP_000749798.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPKQKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP009828|1762935:1771978|1762935_1763454_-|WP_000364543.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP009828|1762935:1771978|1763475_1765749_-|WP_058142979.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLNKPTEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDSLQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAEMKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVALKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIDNIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLNFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1897955 : 1943882
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP009828|1897955:1943882|DBSCAN-SWA 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43 | Staphylococcus_phage(94.29%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_11 |
1949436 : 1957750
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP009828|1949436:1957750|DBSCAN-SWA ATCATTCACCTTGTAATCCGCAGACCACATCACCCTTGATAAGTTCTCGATTATTTATAAATCGAATTTTCAAAGATGTACATGCTTCAATATTCTTATCATTCATTACTTGAAAATGTATATGAGGTTCAGTAGAGTTGCCAGAATTCCCAACCTTCCCAATGATGTCACCATATTTAACATTTTGCCCCTCGTCCACAATGATTGAATATTGTTGTAAATGAGCGATTAAGCTATACTCATTTTCTGCGTGCTTGATTACAATATAATTTCCTAAAAACTGTGATTCATTCGTGCTTCCAATACTATTGTCTTGAACTCCACTCACAACTTTTTCAACTGTACCATTTGCTGGCGCAATGATATCTTTTCCAAAACAAAAATAATCAGTATTTACTTTTCCTAGGTTCTTATATGTTTTATGATTTTCTTTAATAACTAAATCAATAGCATACCTTTGATGTGGGTATAAATAGTGATAATTATATAATTCATTATCTCCACCCCAAAAAACCTCATAGCAATCAGTTGTCGGCACTGCATATTTTAAAGTCGTTTCATTCTTAATCGCATCATAATTGATTAACGGACGCATAACAAATCCGATAATACTATTATCTTTCCAAGTCACTGACACTCCAAATTGATTTGCTTTATCTATCCATATTTGCTCAATAGTACCATCATTTTGAGTACACACTTTTAATTCATGTACATCAGACTGCCTTGTATAAGATTTGAAAAGTTTCCTAAACTGCCAATAACTAAACTCTTGCTTCAAATTTTGATCAAAAATCTTATATATTTTCCTGCTCTTACTTTTATTTAAATAATCCCCAAAGTTTGTTTTATTCATATATACTTAACCTCTTATATTTATTTTGGTATCAATTCTATATTAATAATATGTTCATAATTTTGATTAGGACATTTTTCATATAAAATAGGAGTTTATCTCACTTATAATTCATTATCCAATTATATTTTAATATATACGTGATGCAATTCAATATTATTCTCATGATTTTTACTGTAATGATTTATTATTTATAAGATTTCAAAAAAATCCCTCACTGACAAATAGTGGGGGATTTTATGCATTACTATTAAATAAACATCGATTGAAGTAAGCCTTTTTTCTGTTGTTGAAGTATTTCTATTTTTTGTTTTTCTAATTCAATTTGTTGGTCAAATCTATCTAAGAATTCTGCTATTTTTTGCTGTTCTAACTTATTGGGCAAAACTAAAGGTAATTTTGCATATTCTTCACTATTAATGCCCGGTTGACCAGATCTTACAGACATGACCTTCACCCATTTGTTATATTTTGATGTTAGTGTAAATTGGTATATGAACAAAGGATTATTTTGTTCGTCTATTTCAAATTTTATTAAAAATCCAGCGAAATAGTAATTATAAATATCCTTTTCTTCTTTGTGAATATAACTTTTGCCCGTGCTAGCACCAGTTCGTGCAAAAAGAATATCATTTCTTTTCAGCTTGTACTTATTATTAAGTTCATCAGGTGTAGTTAAGTTTTGATAATTTAATTTCCTTGATTTTTCATCAATATCAGTAATTCTTATATATATATTTTTCGAATCAAACCTTGTTGCAGATGCACCTATACCATACATAGATTGTTCTGTAATATCCCCTAACTTCTTCTCTTTCCAAACTGGAGACTTTTAACATAAAATTACTTATCATTCAAAAAGTAAAACAGCATAATATCAAGGTTTATAACTTTATCATTATCAATAATACCTCATATAAAATAAAATTTTAGGGACTTTTTAGGGACTTTAAATTTAAAATTACAAGTTTAATAGAAACATCAAAATAATCACATGTTTGTGTGGAATGTACACCCCAAAAGCTAGACTGAAAAATCTATTTTTTGAGGTGTATTTTTATAGGTAAATATAATAAATTAGAGTAGACAACTCAGAATTCCAATTTTATAATAATATTGCTTGACATATCAAACTAGATAGTACTATTTTGAATATATTATTATAATCAAAAATTCATTGTAAACTTTTAGACAAAAGGAAGTAATAAAAACGTGAAATTTAAAACAACTAAAGAATGTAAAAGTAATAATATCTTTAAAAGAAGTCAAGAAATTAATAATAGAGAAAGTGAAAAGGGTTGTTTATGGGGCATTAGCATGTTGATTCTACTTTTCTTATTGATTCTGTTTGGAATAACTGCTTGTTCATCAAGCATTCACTTTATTAATTAGATTTTTTTACTTGGAGGTATCATGTGAAGAACCATACAAATATAATTAATATCTTATTAGTTATAGTCAACTCATTAACTCATTTTCTAACTCTAAACACCTCATTTTTTAATAATTCAGCATCGGATTTCTGTTTTATCATAGGGGCTATATTTTTCTTAATCGGAATTTTTGTTGCAATATACGGTATGAAGCGAGCAACATATTGGTTAAACTTATTGATTTTATTTACCAATATTTTTTATTTTCTACACTTCTGTGTGTTACTTTTGTTAAAATATATAGGATTTAAATTATTTATTTATGAAGGGTGTGTATTGTTATTTATCTAATTTATAGTCTAATTGTCTATTTCATCTGCATTATAAATTTTTTCATAATGGCTGCACCATTCTTAATGACTAATGCTGATTATGTATGGACGCCTATGACTACAGTTACGTTATTTATTTTGAGTTTGATTATTTTCTTGATATTTATAAAAACAAAAGATGTCGTTCATTTAACAATTTTCATATTAAACTTACTTTTTTCAATACTTTATTGTTTGCCTATACTGTTTTATTTATGAACACTTTTATATTATCTAGAAAATTAAAACCACCCGTAAAAGGGTGGTTTTTTTAATATTTACTTTTTAGTGCTTCGTCAATTTCGTTATAAATCTTTTGAAGTTGATATTTTGCTTCTGACATTTTCTTAAAGTCTTTTGACTTAAGAGCATACATTGCTTTTTGACCTGAAATTTTTATAGTTCGCTTATAATAAGTGTTTAAACTTCCAGTAGCTAATTCATTAACATTTAGTTCATCTAATAACGATTTTAATTCATTAGCTAACTTTTCGTTTTGATATTCATTCGATGTTGGCAAGCTTGTGCTAGCTTGTGCCTCATTTTTATCTAGATTAGTTACTAGTGGTGATGCTAAAACGATTGCTAAAGTTCCCGCAAGTATAGATTTTCTAATTTTCATTTTTTATTCTCCTTAGTAATTAGTACTAATTTATTTTAATGACTAACTAAAAAAAAGTACATTAATTATTCATTAACTATATAGATCTTCTTATTAAATGAAAATTAATAAATTATCAAATTGACATACCTTATTGTATTTATAGAAAAACAAAAAAAGGTAAGCACCGAAATGCTTACCTACTTCCCATAAACAATATAACACATATACATTGATTTGGAAAGCGCAAAAATAAATTTAATATACTAGCCCGAAGGGGAGCAATACATAAAAAATGAAAGGCGCTCCTTGAAAACGCCCAAGGTAATATTAACATAAAATGGCTACTATTGCATTATCTAATTTTATTTAATTAAAACAAATATATATAGCACAAAAAAACTAGCCCGAAGGCTAGCTTATGAATAGATGAAAATTTGAACACATTGCTGTGTCTAAGATAAATATAGCACATATTAATTACTATTAATAGAAAAATTATAGCGTTTTTTAGATTATTTCAATTTATCGAGACCAAATTCATCAAAACACTAATTGAATTTTAATTTTTAGTTAAAAATAATTAATCTTTTATTAATTTCAAGTTAATTAATATATTTCGTCGATTAGATTAAACTCATTTTAGGAATTTCGCAAAACTAACTATAAATTTAAATATAGAATTTAAGGAGAATTAACATCATTATGAAAAAGAAATTAGCAACAACAGTTTTAGCATTAAGTTTTTTAACGGCAGGAATCAGTACACACCATCATTCAGCGAAAGCTTTTACTTTTGAACCGTTTCCTACAAATGAAGAAATAGAATCAAATAAGAAAATGTTAGAGAAAGAAAAAGCTTATAAAGAATCATTTAAAAATAGTGGTCTTCCTACAACGCTAGGAAAATTAGATGAACGTTTGAGAAATTATTTAAAGAAAGGCACAAAAAATTCTGCTCAATTTGAAAAAATGGTTATTTTAACTGAAAATAAAGGTTACTATACAGTATATCTGAATACACCACTTGCTGAAGATAGAAAAAATGTTGAGTTACTAGGTAAAATGTATAAAACATACTTCTTTAAAAAAGGAGAGTCTAAATCATCTTATGTAATTAATGGTCCTGGAAAAACTAATGAATATGCATACTAATAGTAGTTACATAAATTAAAAGGTAGATATTTCTTTTTTATATAAAGGTTTGGCAGACATTTCATAACTTGCCAAACCTTTATATATCTAATTATCAAACTGCACTAAACTTACCAAAACTGCTTATTCTATTACCTGCCTTGTCTACCTCTCCTGTCGCTATATAACGACGTTGTCCACTATTAGCAATATAAGTAATCCATCTATAGCCATTAATGCAATATGCGCCGTCATATTTGATAGTTGCGTTATTGGGTAATACACCTGTAATTCTTGAATTAGTTGAATAGCCATCCCTCACGTTATTACCTTTAACATTGGCAACTGTGTAATAACCAGTCTCTTTTTTATACGGTACATTGTTTTTATCGAGTGTATAACCTGCTGGCACTGGTGAATTCTTTTCATTTTTAGCTGGTGTTTTAACATTACTGATACCTGATACACACTTCCAATAAAAATAACCACACCATTTAAGATGCGGTGTAGCGACTGTAATATTTCTATGTTGTTGAGATATATGTATCGAGTGAAGGGCAAAAAGGATATCAATTGCAGGATAAGTGTTAGGTTACTAGGCCACTTAACAGGCTATATAGTTCACTCCTACTATATACAGTTAATTATAACATAAAAAGCACCCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP009828|1949436:1957750|1954522_1955284_-|WP_001066124.1|DBSCAN-SWA MNNSTNYKRLKANLEYLKMNQMINHLDDVIDFSIKNNLSFIDTLIKLSDYEIEIKEKNLIESMVKVAAFPFKKEISDFDFNFQPSINQQEIWDFTDLRFIEKYQNIVFLGSSGVGKTHLATGIGMAAAKNRVSTYFIKCHHLIENLRKAKLENRLENRLKHYSKYKLLIIDEIGYLPIGSEDAKLFFQLIDLRYEKKSTIFTTNINFNLWNEIFDDPKIANAILDRILHHSSVVKITGKSYRLKDHSPKKEIT >NZ_CP009828|1949436:1957750|1951993_1952254_+|WP_001791826.1|DBSCAN-SWA MCIVIYLIYSLIVYFICIINFFIMAAPFLMTNADYVWTPMTTVTLFILSLIIFLIFIKTKDVVHLTIFILNLLFSILYCLPILFYL >NZ_CP009828|1949436:1957750|1956961_1957750_+|WP_000206347.1|DBSCAN-SWA MTTFDAKKLKKEYLDWYNQILEFSNLSNNVVKIDTPFKDNSLDNLKIYALYDQSRDMITLTDDGYTTFGLENNGVSLNKFKKRKKIFEEHLSAYGTKYNDKTHEIYVQTNFKNFNKSKHNLLQCLIFVSDMYLLSNPKSQNIFSEDVANKFDEHNIYYGRDLPIIGSSGVVHNFDFFISAKKNQKEKFINAISNPNNSMIIKSKITDAMQAKKIKRHRQNEFIFILNDSKKEKNEHNKNLLHENYISTIDYSELDEKIGLLI >NZ_CP009828|1949436:1957750|1953341_1953791_+|WP_000727649.1|DBSCAN-SWA MKKKLATTVLALSFLTAGISTHHHSAKAFTFEPFPTNEEIESNKKMLEKEKAYKESFKNSGLPTTLGKLDERLRNYLKKGTKNSAQFEKMVILTENKGYYTVYLNTPLAEDRKNVELLGKMYKTYFFKKGESKSSYVINGPGKTNEYAY >NZ_CP009828|1949436:1957750|1950541_1951087_-|WP_049280116.1|DBSCAN-SWA MTEQSMYGIGASATRFDSKNIYIRITDIDEKSRKLNYQNLTTPDELNNKYKLKRNDILFARTGASTGKSYIHKEEKDIYNYYFAGFLIKFEIDEQNNPLFIYQFTLTSKYNKWVKVMSVRSGQPGINSEEYAKLPLVLPNKLEQQKIAEFLDRFDQQIELEKQKIEILQQQKKGLLQSMFI >NZ_CP009828|1949436:1957750|1952306_1952657_-|WP_000702263.1|DBSCAN-SWA MKIRKSILAGTLAIVLASPLVTNLDKNEAQASTSLPTSNEYQNEKLANELKSLLDELNVNELATGSLNTYYKRTIKISGQKAMYALKSKDFKKMSEAKYQLQKIYNEIDEALKSKY >NZ_CP009828|1949436:1957750|1949436_1950291_-|WP_001044434.1|DBSCAN-SWA MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKQEFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTIEQIWIDKANQFGVSVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKNLGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVSGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVDEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFINNRELIKGDVVCGLQGE >NZ_CP009828|1949436:1957750|1953885_1954227_-|WP_165596011.1|DBSCAN-SWA MSNVKTPAKNEKNSPVPAGYTLDKNNVPYKKETGYYTVANVKGNNVRDGYSTNSRITGVLPNNATIKYDGAYCINGYRWITYIANSGQRRYIATGEVDKAGNRISSFGKFSAV >NZ_CP009828|1949436:1957750|1951503_1951683_+|WP_000669789.1|DBSCAN-SWA MKFKTTKECKSNNIFKRSQEINNRESEKGCLWGISMLILLFLLILFGITACSSSIHFIN |
9 | Staphylococcus_phage(77.78%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP009828.1|WP_000384172.1|1923365_1923590_-|hypothetical-protein |
1923365_1923590_-
Protein sequences of NZ_CP009828.1|WP_000384172.1|1923365_1923590_-|hypothetical-protein>NZ_CP009828.1|WP_000384172.1|1923365_1923590_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKGTK |
74 aa aa | NA | NA | NA | 1897955-1943882 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 8.1|2202706|25|NZ_CP009828|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009828 position: 1922086-1922110, mismatch: 1 tgtcagcttctgtgttggggccccg CRISPR spacer tgtcagcttctatgttggggccccg Protospacer ***********.************* |