Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831036 | Staphylococcus aureus strain NCTC13435 chromosome 1 | 8 crisprs | WYL,cas3,DEDDh,DinG,csa3,RT | 5 | 9 | 9 | 0 |
NZ_LN831037 | Staphylococcus aureus strain NCTC13435 plasmid 2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LN831038 | Staphylococcus aureus strain NCTC13435 plasmid 3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831036_1 | 821409-821490 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831036_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831036_1
>1.1|821434|32|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder TTTCATTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831036_1
The CRISPR arrays of NZ_LN831036_1 >merge|NZ_LN831036|1|821409-821490|CRISPRCasFinder ACCCCAACTTCCATTGCCTGTAGAATTTCATTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_LN831036|1|1|821409-821490|CRISPRCasFinder ACCCCAACTTCCATTGCCTGTAGAA TTTCATTTCGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCC ACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_LN831036.1|WP_000070831.1|820575_821205_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYNKNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQANQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDNASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQAPQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_LN831036.1|WP_000816304.1|818970_819873_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGMILSNEGGALQTMKLPYKYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >NZ_LN831036.1|WP_001049165.1|818140_818728_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_LN831036.1|WP_000006551.1|816632_817577_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_LN831036.1|WP_001248939.1|815526_816522_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_LN831036.1|WP_000369722.1|814618_815530_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_LN831036.1|WP_000134963.1|812975_813911_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_LN831036.1|WP_000057543.1|811469_812909_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_LN831036.1|WP_001224793.1|810976_811462_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_LN831036.1|WP_000513305.1|810129_810969_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_LN831036.1|WP_000654030.1|821906_822920_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_LN831036.1|WP_000279414.1|822972_823983_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_LN831036.1|WP_001074742.1|824121_825312_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKDVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_LN831036.1|WP_001260087.1|825433_826195_+|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHESDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >NZ_LN831036.1|WP_033857950.1|826197_827715_+|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYSKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVENQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGESLIKH >NZ_LN831036.1|WP_001121760.1|827844_829149_+|phosphopyruvate-hydratase MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK >NZ_LN831036.1|WP_000785252.1|829499_829958_+|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NZ_LN831036.1|WP_000556760.1|830024_830258_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM >NZ_LN831036.1|WP_001165962.1|830373_831114_+|alpha/beta-hydrolase MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILKSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGTIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMDHFKPTETLKELSESLDTIKEQVDEVLDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYDHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDWSE >NZ_LN831036.1|WP_001050063.1|831147_833520_+|ribonuclease-R MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSRGQSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVETHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYKEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGRKKKGKQRKGKNQRNNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831036_2 | 840488-841449 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831036_2
|
12 spacers
spacers of NZ_LN831036_2
>2.1|840520|40|NZ_LN831036|CRT TTCGGGTAGTGACTCTACATCAGATAGTGGTTCAGATTCA >2.2|840592|76|NZ_LN831036|CRT TTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCA >2.3|840700|58|NZ_LN831036|CRT TTCAGCGAGCGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCA >2.4|840790|58|NZ_LN831036|CRT TTCCGATAGTGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCA >2.5|840880|58|NZ_LN831036|CRT TTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCA >2.6|840970|58|NZ_LN831036|CRT TTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCA >2.7|841060|58|NZ_LN831036|CRT TTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCC >2.8|841150|40|NZ_LN831036|CRT TTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCA >2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT TTCAGATAGCGATTCTGACTCA >2.10|841276|22|NZ_LN831036|CRT CTCAGACAGCGATTCAGATTCC >2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT CAGCGATTCAGACTCAGACAGT >2.12|841384|34|NZ_LN831036|CRT TAGTGACTCCGACTTAGACAGCGACTCAGATTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831036_2
The CRISPR arrays of NZ_LN831036_2 >merge|NZ_LN831036|2|840488-841449|CRT GGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGATTCGGGTAGTGACTCTACATCAGATAGTGGTTCAGATTCAGCAAGCGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCAGCGAGCGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGTGATTCAGATTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCTGACTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGACTCAGACAGCGATTCAGATTCCGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCAGATAGCGATTCTGACTCAGATAGTGACTCCGACTTAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGA >NZ_LN831036|2|1|840488-841449|CRT GGCAGCGATTCTAATTCAGATAGCGGTTCAGA TTCGGGTAGTGACTCTACATCAGATAGTGGTTCAGATTCA GCAAGCGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGA TTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGATTCA GCAAGTGATTCAGACTCAGCAAGTGATTCAGA TTCAGCGAGCGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCAGCGAGTGATTCAGATTCA GACAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGA TTCCGATAGTGACTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCCGATAGTGACTCAGACTCA GACAGCGATTCAGATTCAGATAGTGATTCAGA TTCAGATAGCGATTCGGATTCAGATAGTGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGATTCA GATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGA TTCCGACAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGATTCA GATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGA TTCAGATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCAGATTCCGACAGCGATTCAGATTCC GACAGTGACTCAGACTCAGACAGTGATTCGGA TTCAGATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCGGATTCA GATAGCGATTCCGACTCAGACAGTGACTCGGA TTCAGATAGCGATTCTGACTCA GATAGCGATTCAGACTCAGACAGTGACTCAGA CTCAGACAGCGATTCAGATTCC GATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGA CAGCGATTCAGACTCAGACAGT GACTCGGATTCAGATAGCGATTCTGACTCAGA TAGTGACTCCGACTTAGACAGCGACTCAGATTCA GATAGCGATTCAGATTCCGACAGTGACTCAGA
>NZ_LN831036.1|WP_001167158.1|837990_838521_+|N-acetyltransferase MQIRQIHQHDFAQVDQLIRTAFENSEHGYGNESELVDQIRLSDTYDNNLEIVAVLQNEVVGHGLLSEVYLDNGAQREIGLVLAPVSVDIHHQNKGIGKRLIQALEREAILKGYNFISVLGWPTYYANLGYQRASMYDIYPPYDGIPDEAFLIKELKVNSLAGKTGTINYTSAFEKI >NZ_LN831036.1|WP_000608182.1|837330_837852_+|hypothetical-protein MINIISAIGSIGTFIMALFYFVSVSVQLYQMKISFLPALGFNQILLEREEDQLNIMNSATEEHHHKDYIKLYNLGGGAAKKIAIEVLLGNDKVIQKKYVNILPSKEGYMLPINKNVYEELERTIENNGYEADLNVRMTYYHNVSRKQQEVILKGQIDRFNTYNNKEIYDLQFI >NZ_LN831036.1|WP_001790158.1|837167_837323_+|hypothetical-protein MMVKKLLKAIKQNFLYEQSNITFKMIVFGYKRLSKMLFQFEINHINFLWEG >NZ_LN831036.1|WP_000757406.1|836004_836733_-|DUF5067-domain-containing-protein MKKVMGILLASTLILGACGHHQDSAKKESTSHKKKENDNEELNEELKEFKSKKNMDIKIKGDTIVSDKFEAKIKEPFIINEKDEKKKYIAFKMEITAKKDDKDLNPSSISHDYINITQDDKNTVNKLRDGYLLSDKKYKDWTEHNQDQIKKGKTAQAMFIYELRGDGNINLNVHKYSEDKTVDSKSFKFSKLKTEDFSHRAETREEVEKKEKEFEEEYKKEQEREKEKEKQKDDDHSGLDEV >NZ_LN831036.1|WP_001058299.1|835327_835651_-|hypothetical-protein MNNEELEMRLLLMKQSIEQLQEELAPNLKTRDLVLLRYMYSYKEINMLDSYLFQLATNKEQITKKQFKTKLENIREVPEIPIRQVNDILEGYKNSELYVELINSILK >NZ_LN831036.1|WP_001085185.1|833541_834006_+|SsrA-binding-protein-SmpB MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIIKLGDQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >NZ_LN831036.1|WP_001050063.1|831147_833520_+|ribonuclease-R MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSRGQSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVETHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYKEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGRKKKGKQRKGKNQRNNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK >NZ_LN831036.1|WP_001165962.1|830373_831114_+|alpha/beta-hydrolase MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILKSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGTIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMDHFKPTETLKELSESLDTIKEQVDEVLDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYDHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDWSE >NZ_LN831036.1|WP_000556760.1|830024_830258_+|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM >NZ_LN831036.1|WP_000785252.1|829499_829958_+|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NZ_LN831036.1|WP_000791707.1|841916_843455_+|von-Willebrand-factor-binding-protein-Vwb MKNKLLVLSLGALCVSQIWESNRASAVVSGEENPYKSESLKLNGKRSTTITSDKYEENLDMLISSLSFADYEKYEEPEYKEAVKKYQQKFMAEDDALKKFFSEEKKIKNRNTNTNTNTSNYLGLTHERYESIYNSLKKHREEFSKEIEEINNKNPELKEYNNEEQTKADTELNTLENQVLMIGYTFYHSNKNEVEDLYNKLDMILGYKDEERKKKRATNQRMFNNKKEDLETIIDEFFGEIGQQRPTSIPTLAPKEEKETNTNNANKLKYDTEAAKTDESKRSNRSKRSLDSQNYKSVSKEVTAEQKAEYEKRAEERKARFLDRQKSKKEPVVSLEYDFEHKQRFNNANDKQLVVSAPTKKPTTPTTYTETTTQVPMPTVERQTQQQIVYKTPKPLVGLNGESHDFTTTHQSPTTSNHTHNNVVEFEETSALPGRKSGSLVGISQIDSSHLTEREKRVIKREHVREAQKLVDNYKDTHSYRDRLNAQQKVNTLSEGHQKRFNKQINKVYNGK >NZ_LN831036.1|WP_000728072.1|843805_844828_+|extracellular-matrix-protein-binding-adhesin-Emp MKKKLLVLTMSTLFATQLINSNNAKASVTESVDKKFVVPESGINKIIPSYNEFKKAPKVNVSNLTDNKNFVVSEDKLNKISDPSAASKIVDKNFAVPESKLGNIVPEYKEINNRVNVTTNNPASQQVDKHFVAKGPEVNRFITQNKVNHHFITTQTHYKKVITSYKSTHVHKHVNHAKDSINKHFIVKPSESPRYTHPSQSLIIKHHFAVPGYHAHKFVTPGHASIKINHFCVVPQINSFKVIPPYGHNSHRMHVPSFQNNTTATHQNAKVNKAYDYKYFYSYKVVKGVKKYFSFSQSNGYKIGKPSLNIKNVNYQYAVPSYSPTHYVPEFKGSLPAPRV >NZ_LN831036.1|WP_000824472.1|845162_845633_+|hypothetical-protein MKRKVLVLTMGVICATQLWHSNHANALVTESGANDTKQFTEIVSEEKVITVEHAQINIFQSNSNSNLMEFNILTMGGKSGAMVGYSEIDSSHFTDRDKRVIRRDHVKEAQSLVENYKDTQSADARMKAKQKVNTLSKPHQNYFNKQIDKVYNGLQR >NZ_LN831036.1|WP_001566557.1|845973_846660_+|thermonuclease-family-protein MTEYLLSAGICMAIVSILLIGMAISNVSKGQYAKRFFYFTTSCLVLTLVVVSSLSSSANASQTDNGVNRSGSEDPTVYSATSTKKLHKEPATLIKAIDGDTVKLMYKGQPMTFRLLLVDTPETKHPKKGVEKYGPEASAFTKKMVENAKKIEVEFDKGQRTDKYGRGLAYIYADGKMVNEALVRQGLAKVAYVYKPNNTHEQLLRKSEAQAKKEKLNIWSEDNADSGQ >NZ_LN831036.1|WP_001059082.1|847016_847217_+|cold-shock-protein MNNGTVKWFNAEKGFGFIEREDGSDVFVHFSAIAEDGYKSLEEGQKVEFDIVEGDRGEQAANVVKM >NZ_LN831036.1|WP_000005884.1|847711_847930_-|hypothetical-protein MSEWHINNQSTKPFLIQQAEKQLSIVKPLPNGSFQILTEIDLENGNVSNIDHSLLVSVDPKALEISIFDAVN >NZ_LN831036.1|WP_001004394.1|847991_848276_-|hypothetical-protein MNELTKEQKYTIAKFYKLYIERSNKGETETVANFFGDAKDARENYFCDRDYQDFLTNCQILIQNKYLTGEILDDNIYNISILNKTFIEFEQNFG >NZ_LN831036.1|WP_001106652.1|848363_848933_-|hypothetical-protein MNYIKRTIILLILFVVVSPINSPKTIADNKYSEIQDDKFQLQPGDIIVTKGPVMWGFFGHCSIAIDDKTILQIEGPGDKPTTQSFESFKYNYASGKNDWMKVYRCSYPGAGKKAADWVKKNYENTNHRYLVTLNLNSKKFTYCTKIIYQAYKFGVSEKSVKSYGLHIISPYAIKDNFIDPYKLRLVKAY >NZ_LN831036.1|WP_000052076.1|849120_849309_-|hypothetical-protein MSLHFAILFWLALIFLVAATFILVLMKKTGKESKKESYLSFTVILYIFGFAILIYTFIFGVL >NZ_LN831036.1|WP_001059690.1|849337_849598_-|hypothetical-protein MNNILLNAINIVITTTFVIFNILITYNKDLDDLCWLLPGIIICGVILIVSFTIAMITKNWLSEILFFINIVLVLYYIYPIFYSFIG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN831036_3 | 1208993-1209077 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831036_3
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831036_3
>3.1|1209023|25|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831036_3
The CRISPR arrays of NZ_LN831036_3 >merge|NZ_LN831036|3|1208993-1209077|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >NZ_LN831036|3|2|1208993-1209077|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>NZ_LN831036.1|WP_000181404.1|1208345_1208696_+|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >NZ_LN831036.1|WP_000687328.1|1207505_1208243_+|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MKIDYLTLFPEMFDGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >NZ_LN831036.1|WP_001261987.1|1207002_1207506_+|ribosome-maturation-factor-RimM MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEFYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >NZ_LN831036.1|WP_000268754.1|1206539_1206815_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >NZ_LN831036.1|WP_000863479.1|1204737_1206105_+|signal-recognition-particle-protein MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTQLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >NZ_LN831036.1|WP_000531320.1|1204379_1204712_+|putative-DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >NZ_LN831036.1|WP_000007687.1|1203142_1204393_+|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGSK >NZ_LN831036.1|WP_000262700.1|1199576_1203143_+|chromosome-segregation-protein-SMC MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLMELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIQSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKASLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >NZ_LN831036.1|WP_000043237.1|1198698_1199430_+|ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >NZ_LN831036.1|WP_000426914.1|1198349_1198583_+|acyl-carrier-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >NZ_LN831036.1|WP_000915242.1|1209150_1211757_-|lipoteichoic-acid-specific-glycosyltransferase-YfhO MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLSSFSSLYDASFGLGGDYMKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSTNMIATILYGMSTVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVSRTQKLICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFYITISILTIVALLSFKLYRFYFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVSIIALLYVLPSPTHPLALIVGIILLMVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIAILDNNKNMAIKPYQQSISTLKQHDYHSNYVNQLIKKINQNATGPFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNVNDRIRVNHDDNLPYGFKINSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNTKDVNTHFKANKNLLSDSTIKLNSAAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLTYKYRRFVTPVTIRIKASDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKQGYTITKNKNSSGYIVLPTAYNQGMKATSGDQSLKVEQVNGIMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK >NZ_LN831036.1|WP_000236712.1|1212157_1213042_+|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MVIQWYPGHMAKAKREVSEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDEVINQKPRVVILNKKDMSNLNEMSKWEQFFIDKGYYPVSVDAKHGKNLKKVEAAAIKATAEKFEREKAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLAKRSIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGNALQLLDTPGILWPKFEDEEVGKKLSLTGAIKDSIVHLDEVAIYGLNFLIQHDIERLKAHYKIDVPEYAEILAWFDAIGKKRGLIRRGNEIDYEAVIELIIYDIRNAKIGNYCFDIFKDMTEELANDANN >NZ_LN831036.1|WP_000176405.1|1213025_1213793_+|ribonuclease-HII MTLTIKEVTQLINAVNTIEELENHECFLDERKGVQTAITRRRKALEKEQALKEKYVEMTYFENEILKEHPNAIICGIDEVGRGPLAGPVVACATILNSNHNYLGLDDSKKVPVTKRLELNEALKNEVTAFAYGIATAEEIDEFNIYKATQIAMQRAIDGLSVQPTHLLIDAMTLDNALPQVSLIKGDARSVSIAAASIMAKVFRDDYMTQLSKDYPEYGFEKNAGYGTKQHLLAIDDIGIMKEHRKSFEPIKSLL >NZ_LN831036.1|WP_001020803.1|1213901_1215068_+|ADP-forming-succinate--CoA-ligase-subunit-beta MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAEEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYAKELLGKTLVTHQTGPEGKEIKRLYIEEGCAIQKEYYVGFVIDRATDQVTLMASEEGGTEIEEVASKTPEKIFKETIDPVIGLSPFQARRIAFNINIPKESVNKAAKFLLALYNVFIEKDCSIVEINPLVTTADGDVLALDAKINFDDNALFRHKDVVELRDLEEEDPKEIEASKHDLSYIALDGGIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDAGGSATREKVTEAFKIILGDENVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVEAVKEVDLTLPLVVRLEGTNVELGKKILKDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >NZ_LN831036.1|WP_000110253.1|1215089_1215998_+|succinate--CoA-ligase-subunit-alpha MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTKIVAGVTPGKGGQVVEGVPVFNTVEEAKNETGATVSVIYVPAPFAADSILEAADADLDMVICITEHIPVLDMVKVKRYLQGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNEDDETKAVVMIGEIGGTAEEEAAEWIKANMTKPVVGFIGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTAEEKIKTLNSCGVKTAATPSEIGSTLIEAAKEAGIYESLLTVNK >NZ_LN831036.1|WP_001041668.1|1216224_1217343_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MNKQQSKVRYSIRKVSIGILSISIGMFLALGMSNKAYADEIDKSKDFTRGYEQNVFAKSELNANKNTTKDKIKNEGAVKTSDTSLKLDNKSAISNGNEINQDIKISNTPKNSSQGNNLVVNNNEPTKEIKIANLEAQNSNQEKMNKVTNNYFGYYSFREAPKTQIYTVKKGDTLSAIALKYKTTVSNIQNTNNIANPNLIFIGQKLKVPMTPLVEPKPKTVSSNNKSNSNSSTLNYLKTLENRGWDFDGSYGWQCFDLVNVYWNHLYGHGLKGYGAKDIPYANNFNSEAKIYHNTPTFKAEPGDLVVFSGRFGGGYGHTAIVLNGDYDGKLMKFQSLDQNWNNGGWRKAEVAHKVVHNYENDMIFIRPFKKA >NZ_LN831036.1|WP_000672867.1|1217370_1218615_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhC MKFSTLSEEEFTNYTKKHFKHYTQSIELYNYRNKINHEAHIVGVKNDKNEVIAACLLTEARIFKFYKYFYSHRGPLLDYFDAKLVCYFFKELSKFIYKNRGVFILVDPYLIENLRDANGRIIKNYNNSVIVKMLGKIGYLHQGYTTGYSNKSQIRWISVLDLKDKDENQLLKEMEYQTRRNIKKTIEIGVKVEDLSIEETNRFYKLFQMAEEKHGFHFMNEDYFKRMQEIYKDKAMLKIACINLNEYQDKLKIQLLKIENEMMTVNRALNENPNSKKNKSKLNQLNMQLSSINNRISKTEELIFEDGPVLDLAAALFICTDDEVYYLSSGSNPKYNQYMGAYHLQWHMIKYAKSHNINRYNFYGITGVFSNEADDFGVQQFKKGFNAHVEELIGDFIKPVRPILYKFAKLIYKV >NZ_LN831036.1|WP_000593192.1|1218787_1219660_+|DNA-protecting-protein-DprA MIKLFLLKLYWAHFSTKQIHQFLMAYPNVIKEEGRKKDSYLCEWVNREENVHLLRKYYAFIKLDHNDIIKELQKLKVSYITYMDSEYPVLLKEIYQFPLLLFYKGNIKLINNMHHLAVVGARDSTSYTQQSLEFLLSNDKSKYLTIVSGLAQGADAMAHQIALKYNLPTIAVLAFGHQTHYPKSTLALRNKIEEKGLVISEYPPHTPIAKYRFPERNRIISGLSKGVLITEAKEQSGSHITIDFALEQNRNVYVLPGSMFNPMTKGNLLRIQEGAKVVLNANDIFEDYYI >NZ_LN831036.1|WP_001557331.1|1219833_1221909_+|type-I-DNA-topoisomerase MTLADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKKYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDTEDNYEPKYITIRGKGPVVKELKKHAKKAKNVFLASDPDREGEAIAWHLSKILELEDSKENRVVFNEITKDAVKESFKNPREIEMNLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWTIEGEFRYKKSKFNAKFLHYKNKPFKLKTKKDVEKITAALDGDQFEITNVTKKEKTRNPANPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMVAQQLYEGIDLKKQGTIGLITYMRTDSTRISDTAKAEAKQYITDKYGESYTSKRKASGKQGDQDAHEAIRPSSTMRTPDDMKSFLTKDQYRLYKLIWERFVASQMAPAILDTVSLDITQGDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVETKDDSDSEKENKLPKLEQGDKVTATQIEPAQHYTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLESKRFVPTELGEIVHEQVKEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDITWRKVIDGFFSSFKQDVERAEEEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKSIGVKCPKCNDGDVVERKSKKNRVFYGCSKYPECDFISWDKPIGRDCPKCNQYLVENKKGKTTQVICSNCDYKEAAQK >NZ_LN831036.1|WP_000195254.1|1222064_1223372_+|methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)--C(5))-methyltransferase-(FADH(2)-oxidizing)-TrmFO MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAERGIKVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNALTNGVGVLKEEMRRLNSIIIEAADKARVPAGGALAVDRHDFSGYITETLKNHENITVINEEINAIPDGYTIIATGPLTTETLAQEIVDITGKDQLYFYDAAAPIIEKESIDMDKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEDEFNRFYDAVLEAEVAPVNSFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGKRPYAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIKLIPGLENVDIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELISQPNIQFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGINLAHKILGKGEVVFPRETMIGSMAYYISHAKNNKNFQPMNANFGLLPSLETRIKDKKERYEAQANRALDYLENFKKTL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN831036_4 | 1677983-1678068 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831036_4
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831036_4
>4.1|1678010|32|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder GCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831036_4
The CRISPR arrays of NZ_LN831036_4 >merge|NZ_LN831036|4|1677983-1678068|CRISPRCasFinder TCTGTGTTGGGGCCCCATCCCCAACTTGCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTCCCCAACTT >NZ_LN831036|4|3|1677983-1678068|CRISPRCasFinder TCTGTGTTGGGGCCCCATCCCCAACTT GCACATTATTGAAAGCTGACTTTTGGTCAGCT TCTGTGTTGGGGCCCCGTCCCCAACTT
>NZ_LN831036.1|WP_000567017.1|1677002_1677671_-|tetratricopeptide-repeat-protein MIDQQTIYQYIQNGKIEEALQALFGNIEEDPTIIENYINAGIVLADANEIEKAERFFQKALTIDPKNGVVFYNLANVYYNQQRYQEAIKLYQQALQTEIEQVDCNYMIGMAFNQLESFKLALPYLMTAAELDKDKDAEVQFQYGLVLCQLEMFNEAITQLKHVLTIDKNHVDARYNLGLALFMKNEDIDEAITHFKEAVTIDPKHLLSQHALKTFTKMKEEE >NZ_LN831036.1|WP_001283311.1|1674523_1677001_-|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MSDPTLFDYSMIKGTVEAILFQNSDNFYTVLKVDTIETNEDFDTMPTVVGFLPNIVEGDVYTFKGQVVDHPRYGKQLKAETFEKEMPQTKEAIISYLSSDLFKGVGKKTAQNIVNTLGDNAINDILDDHSVLEKVSGLSKKKQKQIAEQISANQESEKIMIRLHDLGFGPKLSMAIYQFYLGDTLTILDRNPYQLIYDIKGIGFNKADQLARNIGIAYNDNERLKAALLYTLEEECIKQGHTYLPINVVIDLTVDVLNYQDEEVIEPEKLDEMLQYLNEEKRLIIDNEQVAIPSLYYSEIKSVQNLFRIKTHTNKLTEIEQSDLQMHIGEIEDANQVNYAASQKEALQTAINSKVMLLTGGPGTGKTTVIKGIVELYAEIHGLSLDYDDYVNDDYPVVLAAPTGRASKRLQESTGLEAMTIHRLIGWNQDTKPEDILENEINARLIIIDEMSMVDTWLFHQFLSAVPLDAQLIFVGDEDQLPSVGPGQVFKDLIESKAIPRVNLTEVYRQQDGSSIIELAHRMKLGQKIDITQRFHDRSFINCQANQIPTVVEKVVTSAVNKGYTMADIQVLAPMYKGNAGIKRLNQVLQDILNPKKKDTREIEFGDVVFRKGDKVLQLVNRPNDNIFNGDIGVIVGIFWAKENALNKDVLVVDFEGNEITFTKQDMMELTHAYCTSIHKSQGSEFPIVIMPIVKQYFRMLQRPILYTGLTRAKTSLVLLGDPEAFDIGLKTNGQARLTQLCTLLKNYFNSEDEEMLENTATNDTGASQTTIDDQVEAPMSSNDSEEVMSDSTKTDTNVLTEATMFKIDPMINMGEITPYDFIER >NZ_LN831036.1|WP_000734074.1|1671550_1674181_-|alanine--tRNA-ligase MKKLKASEIRQKYLDFFVEKGHMVEPSAPLVPIDDDTLLWINSGVATLKKYFDGRETPKKPRIVNSQKAIRTNDIENVGFTARHHTFFEMLGNFSIGDYFKQEAIEFAWEFLTSDKWMGMEPDKLYVTIHPEDMEAYNIWHKDIGLEESRIIRIEGNFWDIGEGPSGPNTEIFYDRGEAYGQDDPAEEMYPGGENERYLEVWNLVFSEFNHNKDHSYTPLPNKNIDTGMGLERMASVSQNVRTNYETDLFMPIMNEIEKVSGKQYLVNNEQDVAFKVIADHIRTIAFAISDGALPANEGRGYVLRRLLRRAVRFSQTLGINEPFMYKLVDIVADIMEPYYPNVKEKADFIKRVIKSEEERFHETLEDGLAILNELIKKAKATTNEINGKDAFKLYDTYGFPIELTEEIAVQAGLKVDMTTFESEMQQQRDRARQARQNSQSMQVQSEVLKNITSASTFVGYDTATAQTTLTHLIYNGEEVSQVEAGETVYFMLTETPFYAVSGGQVADTGIVYNDNFEIAVSEVTKAPNGQNLHKGVVQFGQVNVGATVSAEVNQNDRRDIQKNHSATHLLHAALKSVLGDHVNQAGSLVEADRLRFDFSHFGPMTNDEIDQVERLVNEEIWKGIDVNIQEMDIASAKEMGAMALFGEKYGDVVRVVNMAPFSIELCGGIHVRNTSEIGLFKIVSESGTGAGVRRIEALTGKAAFLYLEDIQEKFNTMKSQMKVKSDDQVVDKLTQLQDEEKALLKQLEQRDKEITSLKMGNIEDQVEEINGYKVLVTEVDVPNAKAIRSTMDDFKSKLQDTIIILASNVDDKVSMVATVPKSLTNNVKAGDLIKQMAPIVGGKGGGRPDMAQGGGTQPENISKSLSFIKDYIKNL >NZ_LN831036.1|WP_000426912.1|1671227_1671488_-|IreB-family-regulatory-phosphoprotein MENFDKTMKFDYEELPTQDVRDVLNNVYRTLDERGYNAVNQIVGYLLSGDPAYIPRQNEARNQIRHIDRDVIMEELVSYYLKEQNK >NZ_LN831036.1|WP_000939059.1|1670795_1671224_-|Holliday-junction-resolvase-RuvX MLQHKILGLDVGSRTVGIAISDIMGWTAQGLDTLRINEENNELGIDQLVDIIKKHNVGTVVIGLPKNMNNSIGFRGEASLTYKEKLLEAYPSIEIVMWDERLSTMAAERSLLEADVSRQKRKQVIDKMAAVFILQGYLDSLH >NZ_LN831036.1|WP_000134779.1|1670472_1670781_-|DUF1292-domain-containing-protein MTEHNHDSQLEINNEEELLTLFDEEGNEVLYRKVLEFYHPEFKKEYVILAEEGAQSDEDDMIELVPMINEPDESGDGGKLVPIETDEEWDMIEEVVNTEMEE >NZ_LN831036.1|WP_000342258.1|1669549_1670188_-|O-methyltransferase MDDLNKKYLIDLHQHQNSSIEVLREFAEGNEVPIVDRLTLDLIKQLIRMNNVKNILEIGTAIGYSSMQFASISDDIHVTTIERNETMIQYAKQNLATYHFENQVRIIEGNALEQFENVNDKVYDMIFIDAAKAQSKKFFEIYTPLLKHQGLVITDNVLYHGFVSDIGIVRSRNVRQMVKKVQDYNEWLIKQPGYTTNFLNIDDGLAISIKGE >NZ_LN831036.1|WP_000137774.1|1668623_1669547_-|U32-family-peptidase MTELLVTPKSLSHMETLIDLGADAFVIGEQKFGLRLPGEFNRQQMTEAVALAHKNDKKVYAAVNGLFHNYHLDAVEDYINFLHEIRVDRIIFGDPAVVMYVKAQENPIPLHWNAETLVTNHFQCNYWGKRGASRAVLARELNLDEIINIKENSNVEIEVQVQGMTCMFQSKRMLLGNYYTFQDRQMKIERRNDEQSLLLYDEERQNNYPVYEDYNGTHIMSPNDICLIEELAPFFEAGIDSFKIDGILQTEEYINVVTEQYRQAIDLYNEDPEIYEDEKFMLIDPIEEIQPDHRPFDEGFLYKQTVY >NZ_LN831036.1|WP_000848304.1|1667343_1668612_-|U32-family-peptidase MKTIEEIKSTPKTVMKKPELLAPAGNLEKLKIAVHYGADAVFLGGQEYGLRSNADNFTMEEIAEGVEFANRYGAKIYVTTNIIAHDENIEGLESYLRNLEKTGATGIIVADPLIIETCKEVAPKLEIHLSTQQSLSNYKAVEYWKEEGLDRVVLARETGAMEMREMKEKVDIEIEAFIHGAMCIAYSGRCTLSNHMTARDSNRGGCCQSCRWDYELLEVDDNGELDVFYNQGEVTPFAMSPKDLKLIESIPQMMDIGVDSLKIEGRMKSIHYIATVVSVYRKVIDAYAADPDNFKINPEWLIELDKCANRDTAPAFFEGTPGYEEQMFGQQQSKKSPFDFCGLVLDYNEDTKIATIQQRNNFKPGQEIEFFGPEIETFTQVVEAIYDEEGNSLDAARHPLQIVQIKVDRPIYPNNMMRKEIG >NZ_LN831036.1|WP_000648617.1|1666720_1667344_-|uridine-kinase MKATTIIGIAGGSGSGKTTVTNEIMKNLEGHSVALLAQDYYYKDQKHLTFDERLETNYDHPFAFDNDLLIENLKDLKNGKAVEVPTYDYASHTRSDITIDFKPKDVIIVEGIFALENKVLRDMMDVKIYVDTDADLRILRRLTRDTKERGRSMDSVINQYLSVVRPMHDQFIEPTKKYADIIIPEGGSNKVAIDIMTTKIQSLVSKQ >NZ_LN831036.1|WP_000066097.1|1678249_1679368_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MSNKDIRVVVGMSGGVDSSVTAHVLKEQGYDVIGIFMKNWDDTDENGVCTATEDYNDVIEVCNQIGIPYYAVNFEKEYWDKVFTYFLDEYKKGRTPNPDVMCNKEIKFKAFLDHAMNLGADYVATGHYARIHRHEDGHVEMLRGVDNNKDQTYFLNQLSQQQLSKVMFPIGDIEKSEVRRIAEEQGLVTAKKKDSTGICFIGEKNFKTFLSQYLPAQPGDMITLDGKKMGKHSGLMYYTIGQRHGLGIGGDGDPWFVVGKNLKDNVLYVEQGFHHDALYSDYLIASDYSFVNPEDNDLDQGFECTAKFRYRQKDTKVFVKRENDHALRVTFAEPVRAITPGQAVVFYQGDVCLGGATIDDVFKNEGQLNYVV >NZ_LN831036.1|WP_000409167.1|1679368_1680511_-|cysteine-desulfurase MEIYADYAATTPVKPEVVDAMMTIYNSHYGNPSSIHAKGRDARKYLDESRRQIAQLLGADTHEIIFTSGATESNNTAIKGIVKANEQLGNHIITSKIEHHSVLHVFEQLEREGFDVTYLDVDDTGAIDLDQLEETITDKTILVSIMFVNNEVGTVQQIYDIQDIIAETNAYFHVDAVQAIGHLDVKFDEFEIDAMSITAHKFGGPKGVGALLVKDHVTLDYPQLGGEQELKRRAGTENLAQIVGMAKALQLAEKNRDDNNIHLMNLKEQFLVKLQERAIPFELNGSMTDATGHIVNLYFPFVEVETMLTLLDMAQIYVSSGSACTAGSTQPSHVLDAMFEDEERSNHSIRFSFNELTTENEINAIVAEIHKIYFKFKEES >NZ_LN831036.1|WP_000985872.1|1680822_1681836_+|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MAIKYSALNLVPIREGDDEQTAINDMVNLAQHLDELSYERYWIAEHHNAPNLVSSATALLIQHTLEHTKHIRVGSGGIMLPNHAPLIVAEQFGTMATLFPNRVDLGLGRAPGTDMMTASALRRDQHDGVYKFPEEVSLLQQYFGPAHQQAYVRAYPAVGKNVPLYILGSSTDSAHLAARKGLPYVFAGHFAPQQMKEAIEIYKTLFEPSDVLDEPYVIVCLNTIVAENDDEAQYLASSMAQVMVSITRGRMQPVQPPTHELQNILTPREYAMAMERQKISLIGSENTVQQKIQDFMETYGEVNEIMAISYIYDKDMQLDSYRRFKNVINQINEKNTL >NZ_LN831036.1|WP_000009238.1|1682072_1682219_-|hypothetical-protein MSFMDKAKDAVEKFKNSDNEQVKNVKDKINEYTGSNNEEKKENEDKEK >NZ_LN831036.1|WP_000752909.1|1682258_1682441_-|CsbD-family-protein MADESKFDQFKGNVKETVGNVTDNKELEKEGQQDKATGKAKEVVENAKNKITDAIDKLKK >NZ_LN831036.1|WP_000704122.1|1682540_1682963_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKISTKGRYGLTLMISLAKKEGQGCISLKSIAEENNLSDLYLEQLVGPLRNAGLIRSVRGAKGGYQLRVPAEEISAGDIIRLLEGPITFVESIESEPPAQKQLWIRMRDAVRDVLDNTTLKYLAEYVDTSEDLDGYMFYI >NZ_LN831036.1|WP_000102738.1|1683047_1684322_+|replication-associated-recombination-protein-A MSTEPLASRMRPKNIDEIISQQHLVGPRGIIRRMVDTKKLTSMIFYGPPGIGKTSIAKAISGSTQYKFRQLNAVTNTKKDMQLVVEEAKMSGQVILLLDEIHRLDKAKQDFLLPHLENGKIVLIGATTSNPYHAINPAIRSRAQIFELYPLNDEDVRQALTRAIEDEENGLKTYQPKIDEDAMAYFSTQSQGDVRSALNALELAVLSADNDKDGYRHVTLQDAKDCLQKGAFVSDKDGDMHYDVMSAFQKSIRGSDVNAALHYLARLIEAGDLPTIVRRLLVISYEDIGLASPNAGQRTLAAIESAERLGLPEARIPLSQAVIELCLSPKSNSAMSAIDSALSDIRNGHVGQIPNHLKDGHYQGAKDLGRSIGYKYPHQYVNGYVSQQYLPDKLKNKIYYEPKTTSKSEQQLKEIYNNLLKQRP >NZ_LN831036.1|WP_000682642.1|1684482_1685256_-|tRNA-threonylcarbamoyladenosine-dehydratase MKHQFSRNELAIGQQGLDLLKQQTVVILGVGGVGSFAAEALARTNIGHIILIDKDDVDITNVNRQLHALTTTVGQSKVSLMEERIKLINPDCKVTPLHLFYTEETYEEIFDNYDIDYFVDASDTIMYKVHLMKECLDRGIKVISSMGAANKTDPTRFTISDISKTHTDPMAKIIRQKLKKLGIRKGIPVVFSDESPIVIREDVKDIVGDKNAINRKGQMPPSSNAFVPSVVGLICASYVVNDVLKDIPVRRIKDKGQ >NZ_LN831036.1|WP_031864484.1|1685255_1685384_-|hypothetical-protein MGLIGFNKCFLVEFWKNNQSDNAKHKILSYYVLMYKSVKEVK >NZ_LN831036.1|WP_000044799.1|1685716_1687483_-|aspartate--tRNA-ligase MSKRTTYCGLVTEAFLGQEITLKGWVNNRRDLGGLIFVDLRDREGIVQVVFNPAFSEEALKIAETVRSEYVVEVQGTVTKRDPETVNPKIKTGQVEVQVTNIKVINKSETPPFSINEENVNVDENIRLKYRYLDLRRQELAQTFKMRHQITRSIRQYLDDEGFFDIETPVLTKSTPEGARDYLVPSRVHDGEFYALPQSPQLFKQLLMISGFDKYYQIVKCFRDEDLRADRQPEFTQVDIEMSFVDQEDVMQMGEEMLKKVVKEVKGVEINGAFPRMTYKEAMRRYGSDKPDTRFEMELIDVSQLGRDMDFKVFKDTVENDGEIKAIVAKGAAEQYTRKDMDALTEFVNIYGAKGLAWVKVVEDGLTGPIGRFFETENVETLLTLTGAEAGDLVMFVADKPNVVAQSLGALRVKLAKELGLIDETKLNFLWVTDWPLLEYDEDAKRYVAAHHPFTSPKEADIAKLGTAPEEAEANAYDIVLNGYELGGGSIRIHDGELQEKMFEVLGFTKEQAQEQFGFLLDAFKYGAPPHGGIALGLDRLVMLLTNRTNLRDTIAFPKTASATCLLTNAPGEVSDKQLEELSLRIRH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831036_5 | 1966894-1966978 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831036_5
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831036_5
>5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder TTGCCTGTAGAATTTCTTTTTTGAAATTCTCTA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831036_5
The CRISPR arrays of NZ_LN831036_5 >merge|NZ_LN831036|5|1966894-1966978|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCA >NZ_LN831036|5|4|1966894-1966978|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCA TTGCCTGTAGAATTTCTTTTTTGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCA
>NZ_LN831036.1|WP_000636142.1|1965896_1966655_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NZ_LN831036.1|WP_001110179.1|1965293_1965680_-|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NZ_LN831036.1|WP_000149064.1|1964577_1965279_-|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NZ_LN831036.1|WP_001017131.1|1963537_1964581_-|sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NZ_LN831036.1|WP_000153535.1|1962918_1963548_-|two-component-system-response-regulator-VraR MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMEDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NZ_LN831036.1|WP_000037079.1|1961589_1962807_+|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIVFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NZ_LN831036.1|WP_000428172.1|1961036_1961312_+|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NZ_LN831036.1|WP_000228666.1|1960565_1961030_+|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NZ_LN831036.1|WP_000180463.1|1960218_1960419_-|DUF1128-family-protein MTNEEKVLSIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >NZ_LN831036.1|WP_001793428.1|1958959_1960216_-|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAEKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >NZ_LN831036.1|WP_000999718.1|1967244_1968231_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKSYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NZ_LN831036.1|WP_001837236.1|1968720_1969134_-|hypothetical-protein MKPTKLILKDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >NZ_LN831036.1|WP_000544969.1|1969359_1970091_-|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >NZ_LN831036.1|WP_001250335.1|1970092_1971406_-|lipid-II-isoglutaminyl-synthase-subunit-MurT MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLYLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVEHDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NZ_LN831036.1|WP_000949467.1|1971697_1972198_+|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NZ_LN831036.1|WP_001790679.1|1972279_1972372_-|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NZ_LN831036.1|WP_000613736.1|1972586_1973141_+|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENITYVTNIYGKNLKDKG >NZ_LN831036.1|WP_000140182.1|1973207_1974278_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFLAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NZ_LN831036.1|WP_000548781.1|1974524_1975055_-|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >NZ_LN831036.1|WP_001147864.1|1975224_1976586_-|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN831036_6 | 2212320-2212406 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831036_6
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831036_6
>6.1|2212347|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831036_6
The CRISPR arrays of NZ_LN831036_6 >merge|NZ_LN831036|6|2212320-2212406|CRISPRCasFinder GCCAACTGATGTTTGCGTATCATTAGTTTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGAGCCAACTGATGTTTGCATATCATTAGT >NZ_LN831036|6|5|2212320-2212406|CRISPRCasFinder GCCAACTGATGTTTGCGTATCATTAGT TTGCATATCTTTAGCTTTATTGTTTGCAACTGA GCCAACTGATGTTTGCATATCATTAGT
>NZ_LN831036.1|WP_000648723.1|2210590_2211697_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_LN831036.1|WP_001292149.1|2210156_2210591_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_LN831036.1|WP_000927359.1|2208012_2210145_+|BglG-family-transcription-antiterminator 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>NZ_LN831036.1|WP_000370929.1|2202014_2202872_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITTFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_LN831036.1|WP_001792784.1|2201198_2201357_+|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_LN831036.1|WP_001802298.1|2200414_2200519_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_LN831036.1|WP_000495670.1|2198823_2199915_+|lytic-regulatory-protein 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MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK >NZ_LN831036.1|WP_000347896.1|2222118_2222928_-|TIGR00159-family-protein MDFSNFFQNLSTLKIVTSILDLLIVWYVLYLLITVFKGTKAIQLLKGILVIVIGQQISMILNLTATSKLFDIVIQWGVLALIVIFQPEIRRALEQLGRGSFLKRYTSNTYSKDEEKLIQSVSKAVQYMAKRRIGALIVFEKETGLQDYIETGIAMDSNISQELLINVFIPNTPLHDGAMIIQGTKIAAAASYLPLSDSPKISKSLGTRHRAAVGISEVSDAFTVIVSEETGDISVTFDGKLRRDISNEIFEELLAEHWFGTRFQKKGVK >NZ_LN831036.1|WP_000167873.1|2223116_2224025_-|arginase 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1 spacers
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831036_7
The CRISPR arrays of NZ_LN831036_7 >merge|NZ_LN831036|7|2436151-2436244|CRISPRCasFinder GCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAGAGGTCACTTCGCTTCGGTTCGCCTGCGCTTTTGCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAAAGGT >NZ_LN831036|7|6|2436151-2436244|CRISPRCasFinder GCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAGAGGT CACTTCGCTTCGGTTCGCCTGCGCTTTT GCGCATGCATAAAAGCCCCTAACAACCAAAGGT
>NZ_LN831036.1|WP_000727323.1|2435637_2435994_+|DUF4889-domain-containing-protein MKKKKGFGLGISLIAIMLIVCIVLVIMMMTGGKKDTYYGIMKDNATIEKMISEKDESIEKNVKLPSDADVKVKKGDFVIVYKLADSDKIVKVKKVDHDDVPHGLMMKIHDMGKMHMKH >NZ_LN831036.1|WP_000071906.1|2434950_2435373_+|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein MSNSQAIQAIENVLATSKVGVLSTAYNNKPNSRYMVFYNDGLTLYTKTNIHSAKVKEIKDNPAAYVLLGYNDTTTRSFVEMEATIEVVTDQKVIDWLWETQDKSFFSSKEDPELCVLKVTPQSVKLMNDKSLDTPIKIDL >NZ_LN831036.1|WP_000128366.1|2432774_2434880_+|AraC-family-transcriptional-regulator-Rsp MTCQLKIHHTLSTIPSRNINNIMVLFSLTSKLNITINGETKDVSNYIILINHGDIYNINHGENIIELMIPVFYFYQQDDDFFNGYLDRHLLQSSNYIKSLIADLISTPTSSSLMGKNIGQSIIDTLLKEAFIRIDHEYLPNIALSNPVFIDCVNYIHDNIDAHLSLKDIAMHCNISESYCSNLFVRYLSMNFKDYFTSIKLVNAINLLLSTKHSITTVSELAGFNSHTNFANQFKNYLHFSPKQFRSLVSKITEPPQIHFQQDNVSQFTELISTIDLTAQLATNTTDIHIDDFNPKDRSQRAKVFVRFSNFNELFQFIFNEYYDINFEHLPKPVVFIDDIHDIEISQTNYNLLNRCFEKLFEKNIGLAIAIKSTQQFETMKQLILTFLQGNQDYKTSKKLVKFMLVFCSNSMTAEEIHLCHLKIKNKNKEIKYSVTVDGFLETYSTVEQVYDVMQRLKFHYYFIDIENSKTATHLITKNQHYHQTDTHFEQYKKFILDSGISSTQFVYNNLSVSGFKYTNDGKNPIQLSDIVYHLIALLRYGGGISYQLLDDHSNYISLYNKYGSPLPLMHLYKMFRPFVNEDIEITNNYVLSRKDNNYHFLLFNKINDRYMSDVKQDFIFHNELPQDSLMIIKTLNHEHGSIQHLLPISDQLVYIEKEILDELDKTNYPKTELAVQEETGRTFELKLNHDEVKYICFKPS >NZ_LN831036.1|WP_000664361.1|2430903_2431287_+|YbgA-family-protein MKERGHIEQLWREEKYHVLLHSQQSYQMIRNALKTDLSLHQVQQMIDDALLIEPSIGSVCNAFDHMWGYFKKCANEEERKQSKLLKADFINSKIDTQTLLDFLAELANKYDVQYLLQSRVLNTKRKR >NZ_LN831036.1|WP_001108129.1|2429278_2430721_-|PTS-sucrose-transporter-subunit-IIBC MNYKQSAEEILNAIGGEENLDAMAHCATRLRLVLNDESLVNEEALNNMDVVKGTFSTGGQYQIIIGSGTVNKVFSELEKLTGKEASTTSEVKAQSAKNMNPLQRFVKMLSDIFVPIIPAIVAGGLLMGLNNILTAKDLFFSGKSLIDVYSQFAGLAEMINVFANAPFTLLPILIGFSAAKRFGGNPFLGAALGMILVHPSLMSAYDFPKAVEAGKAISYWDVFGLHINQVGYQGQVLPMLVAAYILASIEKGLRKVIPTVLDNLLTPLLSIFITAFLTFSFVGPITRQLGYWLSDGLTWLYEFGGAIGGLIFGLLYAPIVITGMHHSFIAVETTLIADATKTGGSFIFPIATMSNVAQGGAAIAAFFIIKQNKKLKGVASAAGISALLGITEPAMFGVNLKLRYPFIGAIVGSGIGSAYIAFFKVKAIALGTAGLPGFISINPVHAGWLHYFVGMTISFIVAITVTLILSKRKANKEVVE >NZ_LN831036.1|WP_000633068.1|2428248_2429193_+|magnesium-transporter-CorA-family-protein MITSFRHSEDIDKHIIKTPLDHTASWINVVEPDREEIENLMEQYNIPEDFIRDPLDSEESSRIEYDEDTGYSLIIIDLPIVNSTNRSVLSFVTIPLGIIIGNGIIVTVCDAENEFLENLPKRDINLKFHSRFALEILTTIADHYNRNLRLLNKSRIRIEKELKNNITNKQLFKLMEVEKSLVYFLAALKGNDTIIKKLFRLPAIKRFEEDEELLEDLIIENNQAIETTELHQRILESITTSYASLLSNDMNTIMKTLTLFTVLLTLPTLVFSFFGMNVPLPIDDHSYISWIIVVGISLILVVIVSIFLWRKQKL >NZ_LN831036.1|WP_000656766.1|2427579_2428203_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MKEDRRIRKTKSSIKQAFTKLLQEKDLEKITIRDITTRADINRGTFYLHYEDKYMLLADMEDEYISELTTYTQFDLLRGSSIEDIANTFVNNILKNIFQHIHDNLEFYHTILQLERTSQLELKINEHIKNNMQRYISINHSIGGIPEMYFYSYVSGATISIIKYWVMDKQPISVDELAKHVHNIIFNGPLRIMAENRLHKSNLDSLT >NZ_LN831036.1|WP_001020030.1|2426141_2427419_-|YhgE/Pip-domain-containing-protein MNIFKNKLLWIAPIATMIILVIFSLAFYPAYNPKPKDLPIGILNEDKGTTIQDKNVNIGKKLEDKLLDSDSNKIKWVKVDSEKDLEKDLKDQKIFGVAIIDKDFSKDAMSKTQKVVMDSKKEEMQQKVASGEIPPQVVQQMKQKMGNQQVEVKQAKFKTIVSEGSSLQGSQIASSVLTGMGDNINAQITKQSLETLTSQNVKVNAADINGLTNPVKVDNEKLNKVKDHQAGGNAPFLMFMPIWIGSIVTSILLFFAFRTSNNIVVQHRIIASIGQMIFAVVAAFAGSFVYIYFMQGVQGFDFDHPNRIAIFVAFAILGFVGLILGVMVWLGMKSVPIFFILMFFSMQLVTLPKQMLPESYQKYVYDWNPFTHYATSVRELLYLNHHIELNSTMWMFIGFMIFGAVSSLVSAIVRKHSTKRTEVPS >NZ_LN831036.1|WP_001253464.1|2425503_2425935_-|DUF2871-domain-containing-protein MRRLLYSFLFYMIIGLFSGFFYRELTKAYDFTGTTQLSLVHTHTLILGMFMFLILLPLEKLFKLSSYYLFNWFFYVYNIGVIVTIGMMVTKGFFQVTGKSYSPEAFAGFAGIGHTGMLAGLLLLFFLLRQAILKEPRDESFKK >NZ_LN831036.1|WP_001806771.1|2425282_2425399_-|hypothetical-protein MANYAIYFNNININSIMALNDNNYQFERVNERNEYRES >NZ_LN831036.1|WP_001173165.1|2436276_2437554_-|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter MALFKRKISLPMQVVIALVLGVVVGLLLYGQENVANYIKPFGDVFLNLIKMIVIPVVFCSLALSISNVGESKTVGRYGWKTILYFEIITTIAIGLGIIFGNLFKPGAGLDPTKLPKGDISKYQSTAHAAEQSTYGNHFIDTIVHIIPTNFFEALNKGELLPIIFFAVFFGLGLAAVGKKAEPVKEFLSGSLEAVFWMINKILKLAPLGVFAFICTTIITFGASALLPLLKLVLVVVFAMVFFVFAILGLVAWMCGINIMNIIRILKSELLLAFSTSSSEAVLPVMMKKMENFGSPKEITSFVIPIGYTFNLDGSALYQSIAALFVAQMYGMHLTLSEQIVLMLTLMITSKGMAAVPGTSIVVLLTTLGAMGLPAQGLALIIGVDRILDMVRTCVNVIGNALSTIVIAKWENVYDKAKGQEYLKSI >NZ_LN831036.1|WP_000727537.1|2437735_2438101_-|DUF3139-domain-containing-protein MKKKKNAIKVIIILFISLIVAVAFFFGLKTYQGHKNIQLIDSYLEEKNLKDKIKSEKTEYSAKKGLFYKEVTFKDEPGVTYVVQPISTNKGLFVEGFDTETKKSLKTAKHKYFNQNYKPSK >NZ_LN831036.1|WP_000289213.1|2438498_2438945_+|MarR-family-transcriptional-regulator MYVENSYLSKQLCFLFYVSSKEIIKKYTNYLKEYDLTYTGYIVLMAIENDEKLNIKKLGERVFLDSGTLTPLLKKLEKKDYVVRTREEKDERNLQISLTEQGKAIKSPLAEISVKVFNEFNISEREASDIINNLRNFVSKNFDYSDKK >NZ_LN831036.1|WP_077477314.1|2439160_2439589_+|Hsp20-family-protein MILNFNQFENQNFFNGNPSDTFKDLGKQVFNYFSTPSFVTNIYETDELYYLEAELAGVNKEDISIDFNNNTLTIQATRSAKHKSEQLILDERNFESLMRQFDFEAVDKQHITASFENGLLTITLPKIKPSNESTSSTSIPIS >NZ_LN831036.1|WP_033845358.1|2439695_2440865_-|NarK/NasA-family-nitrate-transporter MYKTKGGFQLTLQTLSLVVGFMAWSIIAPLMPFIKQDVNVTEGQISIILAIPVILGSVLRVPFGYLTNIVGAKWVFFTSFIVLLFPIFFLSQAQTPGMLMASGFFLGVGGAIFSVGVTSVPKYFPKEKVGLANGIYGMGNIGTAVSSFLAPPIAGIIGWQTTVRSYLIIIALFALIMFIFGDTQERKIKVPLMAQMKTLSKNYKLYYLSYWYFITFGAFVAFGIFLPNYLVNHFGIDKVDAGIRSGVFIALATFLRPIGGILGDKFNAVKVLMIDFVVMIIGAIILGVSDHIALFTVGCLTISICAGIGNGLIFKLVPSYFLNEAGSANGIVSMMGGLGGFFPPLVITYVANLTGSSHLAFIFLAVFGCIALFTMRHLYQKEYGSLKNG >NZ_LN831036.1|WP_000706315.1|2441292_2441946_-|response-regulator-transcription-factor MKIVIADDHAVVRTGFSMILNYQNDMEVVATAADGVEAYQKVMEYKPDVLLMDLSMPPGESGLIATSKIADSFPETKILILTMFDDEEYLFHVLRNGAKGYILKNAPDEQLLLAIRTVYKGETYVDMKLTTSLVNEFVSNSNQDTANTTDPFKILSKRELEILPLIAKGYGNKEIAEKLFVSVKTVEAHKTHIMTKLGLKSKPELVEYALKKKLLEF >NZ_LN831036.1|WP_000606546.1|2441968_2443003_-|sensor-histidine-kinase MINEDSIQLDTLLKKYYEHSIEKIVFADDNGKIIAMNDAAKDILSEEDNYSAVANAICHRCEGYTNAYDVQSCKDCFLESMQVQATNFQVFMKTKDQKVMPFTATYQLIDQDRGIHAFTLQNVSSQIEQQEKLHQQRMMRKTISAQENERKRISRELHDSVIQEMLNVDVQLRLLKYQEDTTKLLEDAENIEYIVAKLIDDIRNMSVELRPASLDDLGLEAAFKSYFKQFEENYGIKIIYTSNIKNTRFDSDIETVVYRVVQEAILNALKYADVNEINVGIRQTGRHLVAEVIDAGNGFDPSSKPKGSGLGLYGMNERAELVSGSVNIETKIGEGTNVTLNIPI >NZ_LN831036.1|WP_000186933.1|2443026_2443479_-|GAF-domain-containing-protein MTPEAIIEDRRFQETLDKIRKEEGYDFAAIAFYESNKPSSPIKWHYVSGNKNNRFKLIILRKGRGLAGTVMKTGKRMVIANVGLALGPEEKIDYPILLSESLTAVLAVPLWYKNQVYGVLLFGQRDGRPLPKIFDNDDIQRKFGIFNDDK >NZ_LN831036.1|WP_000934153.1|2443498_2444176_-|respiratory-nitrate-reductase-subunit-gamma MLNQFLWVIFPYLCLVVFVAGHIARYRYDKFSWTAKSSELIERKRLMWGSLLFHLGIIPVFFGHVVGLLIPKSWMDAAGVSEHLYHIGAVYIGSIFGIITLVGMFLLTARRVTTKSIRRLSSASDIFVNFLLLLIVFMGCYATLVTNVQHPDFNYRTSLSIWFRQLFMLKPDASLMSGVPIAFKIHILLGFTIMACWPFTRLVHVWSVPLTYINRRYIIYRKNKV >NZ_LN831036.1|WP_000606772.1|2444168_2444744_-|nitrate-reductase-molybdenum-cofactor-assembly-chaperone MINFDNFKKYQESFGYMAQQLCFPEKLTFHPKTFEETISTDHPAYEDLVAFRNVMMTFSLSEIKAIYTDTFDFTKKAPLYMTYNKFDTQKERGQMLAKLKVLYEMFGLEMVDNELSDYLPLMLQFLQVAEWRNDPRAEENIQLIIMIIEDGTYVMANVLGEDNNPYAYVIQALRKTLKLCLTSPKGVKHHA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831036_8 | 2469164-2469261 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831036_8
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831036_8
>8.1|2469193|40|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder TTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831036_8
The CRISPR arrays of NZ_LN831036_8 >merge|NZ_LN831036|8|2469164-2469261|CRISPRCasFinder TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGCTTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTATTTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC >NZ_LN831036|8|7|2469164-2469261|CRISPRCasFinder TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC TTATGCATTAGTAGCGAAGCTAACTAATGCGTTCCTTTAT TTTCTGCGAATTTTATGAGCTAGAAAGGC
>NZ_LN831036.1|WP_000019127.1|2468157_2469024_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_LN831036.1|WP_001125208.1|2467144_2467831_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_LN831036.1|WP_000762708.1|2466886_2466991_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_LN831036.1|WP_000038960.1|2465272_2466712_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGVVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NZ_LN831036.1|WP_000825921.1|2464372_2465152_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_LN831036.1|WP_000479576.1|2463672_2464392_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_LN831036.1|WP_000615461.1|2462944_2463676_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NZ_LN831036.1|WP_001012218.1|2461597_2462848_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLIEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKHNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDKLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMFYKIQQYLNHKRR >NZ_LN831036.1|WP_000819843.1|2460980_2461343_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_LN831036.1|WP_000162810.1|2460362_2460962_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NZ_LN831036.1|WP_001789935.1|2469454_2469559_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYGEMQ >NZ_LN831036.1|WP_000792572.1|2469653_2470964_+|immunoglobulin-binding-protein-Sbi MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNVKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNTYYKYKGAIDQTVLTVLGSGSKSYIQPLKVDDKNGYLAKSYAQVRNYVTESINTGKVLYTFYQNPTLVKTAIKAQETASSIKNTLSNLFSFWK >NZ_LN831036.1|WP_000594514.1|2471498_2472428_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGENFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_LN831036.1|WP_000916704.1|2472995_2473943_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKKTNHVKAMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRVHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_LN831036.1|WP_000783428.1|2473944_2474922_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NZ_LN831036.1|WP_000200945.1|2474973_2475441_-|QueT-transporter-family-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSLLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NZ_LN831036.1|WP_000286875.1|2475451_2476144_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFAAAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDCIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_LN831036.1|WP_033845360.1|2476154_2477270_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MKFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLNIADLEKRLEKYPNQNIPKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >NZ_LN831036.1|WP_001046646.1|2477247_2478255_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNEVSRAN >NZ_LN831036.1|WP_001110064.1|2478256_2479615_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSKKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSHIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831036_1 | 1.1|821434|32|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 821434-821465 | 32 | NZ_LN831036.1 | 367665-367696 | 1 | 0.969 |
NZ_LN831036_1 | 1.1|821434|32|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 821434-821465 | 32 | NZ_LN831036.1 | 1050524-1050555 | 1 | 0.969 |
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NZ_LN831036_2 | 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT | 841222-841243 | 22 | NZ_LN831036.1 | 599284-599305 | 1 | 0.955 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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NZ_LN831036_2 | 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT | 841222-841243 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15820-15841 | 1 | 0.955 |
NZ_LN831036_2 | 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT | 841222-841243 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15874-15895 | 1 | 0.955 |
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NZ_LN831036_2 | 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT | 841222-841243 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9901-9922 | 1 | 0.955 |
NZ_LN831036_2 | 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT | 841222-841243 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9955-9976 | 1 | 0.955 |
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NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15868-15889 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15904-15925 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15922-15943 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9751-9772 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9895-9916 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9589-9610 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9679-9700 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9805-9826 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9949-9970 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9985-10006 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 156007-156028 | 2 | 0.909 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 17465-17486 | 3 | 0.864 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 18779-18800 | 3 | 0.864 |
NZ_LN831036_2 | 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT | 841330-841351 | 22 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 19925-19946 | 3 | 0.864 |
NZ_LN831036_6 | 6.1|2212347|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 2212347-2212379 | 33 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23035-23067 | 7 | 0.788 |
NZ_LN831036_6 | 6.1|2212347|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 2212347-2212379 | 33 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7568-7600 | 7 | 0.788 |
NZ_LN831036_7 | 7.1|2436184|28|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 2436184-2436211 | 28 | NZ_CP017941 | Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed1, complete sequence | 286024-286051 | 7 | 0.75 |
NZ_LN831036_5 | 5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 1966920-1966952 | 33 | MT150133 | Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540, complete genome | 25909-25941 | 8 | 0.758 |
NZ_LN831036_5 | 5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 1966920-1966952 | 33 | MK234886 | Escherichia phage AnYang, complete genome | 114958-114990 | 8 | 0.758 |
NZ_LN831036_5 | 5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 1966920-1966952 | 33 | MF036691 | Serratia phage CBH8, complete genome | 7593-7625 | 8 | 0.758 |
NZ_LN831036_5 | 5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 1966920-1966952 | 33 | MF036690 | Serratia phage CHI14, complete genome | 7593-7625 | 8 | 0.758 |
NZ_LN831036_5 | 5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 1966920-1966952 | 33 | MF036692 | Serratia phage X20, complete genome | 7813-7845 | 8 | 0.758 |
NZ_LN831036_2 | 2.8|841150|40|NZ_LN831036|CRT | 841150-841189 | 40 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 16613-16652 | 9 | 0.775 |
NZ_LN831036_2 | 2.8|841150|40|NZ_LN831036|CRT | 841150-841189 | 40 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 16925-16964 | 9 | 0.775 |
NZ_LN831036_2 | 2.8|841150|40|NZ_LN831036|CRT | 841150-841189 | 40 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 18281-18320 | 9 | 0.775 |
NZ_LN831036_2 | 2.12|841384|34|NZ_LN831036|CRT | 841384-841417 | 34 | MN582098 | Podoviridae sp. ctKoA10, complete genome | 1995-2028 | 10 | 0.706 |
NZ_LN831036_1 | 1.1|821434|32|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder | 821434-821465 | 32 | NZ_CP018781 | Ochrobactrum pituitosum strain AA2 plasmid pOAAA2, complete sequence | 148984-149015 | 11 | 0.656 |
1. spacer 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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2. spacer 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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3. spacer 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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4. spacer 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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5. spacer 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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6. spacer 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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7. spacer 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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8. spacer 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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9. spacer 2.10|841276|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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10. spacer 2.10|841276|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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11. spacer 2.10|841276|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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12. spacer 2.10|841276|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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13. spacer 2.10|841276|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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14. spacer 2.10|841276|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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15. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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16. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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19. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
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21. spacer 2.9|841222|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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23. spacer 2.10|841276|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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24. spacer 2.10|841276|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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35. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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37. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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45. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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47. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgattcagactcagatagc Protospacer ******************.**.
48. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagtgattcagactcagacagc Protospacer ***.*****************.
49. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagtgattcagactcagacagc Protospacer ***.*****************.
50. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagtgattcagactcagacagc Protospacer ***.*****************.
51. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagtgattcagactcagacagc Protospacer ***.*****************.
52. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcagactcagacagc Protospacer .********************.
53. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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54. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcggactcagacagt Protospacer .********.************
55. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
56. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
57. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
58. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
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59. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcagactcagacagc Protospacer .********************.
60. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
61. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcggactcagacagt Protospacer .********.************
62. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
63. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
64. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcagactcagacagc Protospacer .********************.
65. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcagactcagacagc Protospacer .********************.
66. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcagactcagatagt Protospacer .*****************.***
67. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
68. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcggactcagacagt Protospacer .********.************
69. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer tagcgattcggactcagacagt Protospacer .********.************
70. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgactcagactcagacagc Protospacer ******.**************.
71. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgattccgactcagacagc Protospacer ********* ***********.
72. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.864
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgattcagactcagactca Protospacer *******************
73. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.864
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgattcagactcagactca Protospacer *******************
74. spacer 2.11|841330|22|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.864
cagcgattcagactcagacagt CRISPR spacer cagcgattcagactcagacgca Protospacer *******************.
75. spacer 6.1|2212347|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactga CRISPR spacer ttgcatatctttagctttatagcttttatatgc Protospacer ******************** *.** .* **
76. spacer 6.1|2212347|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
ttgcatatctttagctttattgtttgcaactga CRISPR spacer ttgaataactttagctttattgttataaacagt Protospacer *** *** **************** *** *
77. spacer 7.1|2436184|28|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017941 (Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.75
cacttcgcttcggttcgcctgcgctttt CRISPR spacer tgtttcgcttcggatcgcctgagcttcc Protospacer ...********** ******* ****..
78. spacer 5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder matches to MT150133 (Enterobacteria phage vB_EcoM_IME540, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgtagaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer taacaaagagaatttctttttcaaaattctcta Protospacer * .* . *************..**********
79. spacer 5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder matches to MK234886 (Escherichia phage AnYang, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgtagaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer taacaaagagaatttctttttcaaaattctcta Protospacer * .* . *************..**********
80. spacer 5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder matches to MF036691 (Serratia phage CBH8, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgt---agaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer ---gatgtgaaaggatttcttttttgaaattatctt Protospacer *** **.***************** ***
81. spacer 5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder matches to MF036690 (Serratia phage CHI14, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgt---agaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer ---gatgtgaaaggatttcttttttgaaattatctt Protospacer *** **.***************** ***
82. spacer 5.1|1966920|33|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder matches to MF036692 (Serratia phage X20, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
ttgcctgt---agaatttcttttttgaaattctcta CRISPR spacer ---gatgtgaaaggatttcttttttgaaattatctt Protospacer *** **.***************** ***
83. spacer 2.8|841150|40|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.775
ttcagatagcgattcagactcagacagtgactcggattca CRISPR spacer tagcgactctgattcagactcagacagcgactctgattca Protospacer * **. .*****************.***** ******
84. spacer 2.8|841150|40|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.775
ttcagatagcgattcagactcagacagtgactcggattca CRISPR spacer tagcgactctgattcagactcagacagcgactctgattca Protospacer * **. .*****************.***** ******
85. spacer 2.8|841150|40|NZ_LN831036|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.775
ttcagatagcgattcagactcagacagtgactcggattca CRISPR spacer tagcgactctgattcagactcagacagcgactctgattca Protospacer * **. .*****************.***** ******
86. spacer 2.12|841384|34|NZ_LN831036|CRT matches to MN582098 (Podoviridae sp. ctKoA10, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tagtgactccgacttagacagcgactcagattca CRISPR spacer tgacaactccgactttgacaacgactcagacgtt Protospacer *....********** ****.*********. .
87. spacer 1.1|821434|32|NZ_LN831036|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018781 (Ochrobactrum pituitosum strain AA2 plasmid pOAAA2, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
tttcatttcgaaattctctatgttggggcccc CRISPR spacer accatcttcgtaatgctctatgttggggcggt Protospacer .. .**** *** ************** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
51795 : 57745
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN831036|51795:57745|DBSCAN-SWA GATGGTAGATAATATTATTAAATCAGTAGCAGAGAAATTATCCTCTCTGTCTTATATAGAAGGTATTGTTTTAGGTGGTTCACGTGCAAGGGGCACCCATACAGAGGATTCGGATATAGATATCGGCATCTATTACAATTCAGAATCATTTGACATAAATACTATTAATCAATTCGCTACAAAGCTGGATGATGAGCATAGAAATAACCTTGTTGTACCTCCCGGAGCATGGGGTGATTGGATTAATGGCGGCGGATGGTTAGTCATAAACGGGTATCATGTGGATTTAATTTTACGTGATATTAAACGTGTGGAACAAATAATGAAAGATACAGAGCACGGAATTGTTACTGCCAATTATCAGACTGGGCATCCCCATGGTTATATTAGTGCAATGTATCGAGGAGAATTAGCGATTAGCAAAATACTATATGCTAAGAATGAAAGCTTATGCGAATTAAAAAAACAGGCAGAAACTTATCCCAATGCTTTGCAGAAAAGTTTAGTTAACTTTTTTATGTTTGAAGCAGGGTTCTCTTTAATGTTTGTAAAAGCAAATTCGGGAACAGACGATAAATATTATATTGCGGGTCATGTTTTTCGTATAGTTTCATGTTTAAATCAAGTGTTATTTGCATGTAATAATGCTTATTGTATCAACGAAAAGAAAGCTATAAAACTGCTTGAAACTTTTGAACATAAACCTGAAAAATATACCGAGAAGGTAAATCATATTTTTGAAGTACTCGGTATCTCACTTTTTGAATGCTACGACATGACCGAGAAGCTTTATAATGAAGTGAATGAAATTGTATCGGAGATAAATAACTTTTTAAACGAGGAGAGTTCAGATGAAAGAAAACAAATATGATGATAATATATTTTTTCAAAAATACAGTCAAATGAGTCGCTCGCAGAAAGGACTGGCTGGTGCGGGAGAATGGGAGACTTTGAAAAAGATGCTACCTGATTTTAAGGGTAAGCGTGTGCTTGATTTAGGATGCGGCTATGGATGGCACTGTATATATGCGATGGAAAACGGTGCTTCCTCTGTAGTAGGTGTTGATATTTCTCATAAAATGCTCGAAGTAGCAAAAGGAAAAACCCATTTTCCACAGATTGAATATGAATGCTGTGCCATAGAAGATGTGGATTTCCCAGAGGAGAGCTTTGATGTAATACTAAGTTCGCTTGCGTTTCATTATGTAGCAGACTATGAGAATTTAATAAAAAAGATATATAGGATGCTGAAGGCTGGTGGCAATTTAGTTTTTACAGTTGAACATCCTGTTTTTACTGCTCATGGAACACAAGACTGGTATTATAACGAAAAAGGAGAAATACTGCATTTCCCGGTGGACAATTATTATTATGAGGGCAAACGGACAGCTATGTTTTTGGAAGAAAAGGTTACAAAATATCATAGAACACTGACCACATATCTAAATACACTGCTTTCAAATAGTTTTATAATAAATCAGATTGTGGAGCCACAGCCGCCAGAGAACATGATGGATATTCCGGGGATGGCGGATGAAATGCGACGCCCAATGATGCTGATTGTATCGGCAAAAAAGAAGATGTAATAATATAGAAAAAATAAACGAGGAGTATGTAAATGAGATCAGAAAAAGAAATGATGGATTTAGTACTTTCTTTAGCAGAACAGGATGAACGTATTCGAATTGTGACCCTTGAGGGGTCACGCGCAAATATTAATATACCTAAAGATGAATTTCAGGATTATGATATTACATATTTTGTAAGTGATATAGAACCGTTTATATCTAATGATGACTGGCTTAATCAATTTGGGAATATAATAATGATGCAAAAGCCGGAGGATATGGAATTATTCCCACCTGAAGAAAAGGGATTTTCCTATCTTATGCTATTTGATGATTACAATAAAATTGATCTTACCTTATTGCCCTTGGAAGAGTTAGATAATTACCTAAAGGGCGATAAATTAATAAAGGTTCTAATTGATAAAGATTGTAGAATTAAAAGGGACATAGTTCCGACTGATATAGATTATCATGTAAGAAAGCCAAGCGCAAGGGAGTATGATGATTGCTGCAATGAATTTTGGAATGTAACACCTTATGTTATTAAAGGATTGTGCCGTAAGGAAATTTTATTTGCTATTGATCATTTTAATCAGATTGTTCGCCATGAGCTGCTGAGAATGATATCATGGAAGGTCGGCATCGAAACAGGCTTTAAATTAAGTGTAGGCAAGAACTATAAGTTTATTGAAAGGTATATATCCGAGGATTTGTGGGAGAAACTTTTGTCCACCTACCGGATGGATTCCTATGAAAACATATGGGAAGCATTATTTCTATGCCATCAATTGTTCAGGGCGGTATCCGGTGAGGTGGCGGAAAGGCTTCATTATGCCTATCCGGAGTATGATAGGAATATAACAAAATATACCAGGGACATGTATAAAAAATACACTGGTAAAACCGGCTGCCTGGATAGCACATATGCCGCTGATATAGAAGAGAGGCGGGAACAGTGATTACAGAAATGAAAGCAGGGCACCTGAAAGATATCGATAAACCCAGCGAACCATTTGAGGTGATAGGTAAGATTATACCGAGGTATGAAAACGAGAATTGGACCTTTACAGAATTACTCTATGAAGCGCCATATTTAAAAAGCTACCAAGACGAAGAGGATGAAGAGGATGAGGAGGCAGATTGCCTTGAATATATTGACAATACTGATAAGATAATATATCTTTACTACCAAGACGATAAATGCGTCGGAAAAGTTAAACTGCGAAAAAATTGGAACCGGTACGCTTATATAGAAGATATCGCCGTATGTAAGGATTTCAGGGGGCAAGGCATAGGCAGCGCGCTTATCAATATATCTATAGAATGGGCAAAGCATAAAAACTTGCATGGACTAATGCTTGAAACCCAGGACAATAACCTTATAGCTTGTAAATTCTATCATAATTGTGGTTTCAAAATCGGCTCCGTCGATACTATGTTATACGCCAACTTTGAAAACAACTTTGAAAAAGCTGTTTTCTGGTATTTAAGGTTTTAGAATGCAAGGAACAGTGAATTGGAGTTCGTCTTGTTATAATTAGCTTCTTGGGGTATCTTTAAATACTGTAGAAAAGAGGAAGGAAATAATAAATGGCTAAAATGAGAATATCACCGGAATTGAAAAAACTGATCGAAAAATACCGCTGCGTAAAAGATACGGAAGGAATGTCTCCTGCTAAGGTATATAAGCTGGTGGGAGAAAATGAAAACCTATATTTAAAAATGACGGACAGCCGGTATAAAGGGACCACCTATGATGTGGAACGGGAAAAGGACATGATGCTATGGCTGGAAGGAAAGCTGCCTGTTCCAAAGGTCCTGCACTTTGAACGGCATGATGGCTGGAGCAATCTGCTCATGAGTGAGGCCGATGGCGTCCTTTGCTCGGAAGAGTATGAAGATGAACAAAGCCCTGAAAAGATTATCGAGCTGTATGCGGAGTGCATCAGGCTCTTTCACTCCATCGACATATCGGATTGTCCCTATACGAATAGCTTAGACAGCCGCTTAGCCGAATTGGATTACTTACTGAATAACGATCTGGCCGATGTGGATTGCGAAAACTGGGAAGAAGACACTCCATTTAAAGATCCGCGCGAGCTGTATGATTTTTTAAAGACGGAAAAGCCCGAAGAGGAACTTGTCTTTTCCCACGGCGACCTGGGAGACAGCAACATCTTTGTGAAAGATGGCAAAGTAAGTGGCTTTATTGATCTTGGGAGAAGCGGCAGGGCGGACAAGTGGTATGACATTGCCTTCTGCGTCCGGTCGATCAGGGAGGATATCGGGGAAGAACAGTATGTCGAGCTATTTTTTGACTTACTGGGGATCAAGCCTGATTGGGAGAAAATAAAATATTATATTTTACTGGATGAATTGTTTTAGTACCTAGATTTAGATGTCTAAAAAGCTTTAACTACAAGCTTTTTAGACATCTAATCTTTTCTGAAGTACATCCGCAACTGTCCATACTCTGATGTTTTATATCTTTTCTAAAAGTTCGCTAGATAGAGTTCTATATTAGAGATGTAAAGAGTTTTGGTGAAGAGGTTTGTGAGTATGGCTTTTATAACCAGGGTGCAATGAGAAGCACTAACAGCAGCTAGCTTAAGAACGCATAGGATATACTTTTTATGGAAGTCACAGAGGAGGAATAAAATTTGAACAGGATTAACAGAGTAACCTCTATTCTTATTCAGCTGCAATCAAAAAAAATAATTCCTGCCAAAGAAATTGCACAGCGATTTAATATAAGCTTAAGGACAGTTTACAGAGATATCCGGACACTTGAAGAAGCCGGAATACCAATTGGATCTGAGGCCGGAAAAGGATATTTTCTTGTAGAGGGCTTCCTACTTCCGCCGGTAATGTTTACAGCGGCGGAAGTGGGTGCATTGATTACAGCAGGGAAATTTTTAAATTGCCATGGAGATGAATCATTTATAAAGGATTTTGATTCAGCTATGTATAAAATCAAATCTATTTTGAAGCATGGTGAAAAAAACTATGCACAGGAGTTGGAGAACAGTATTAACGTGTACAGCACATCTGGACAGAAAAATACATTGGCGGATAACGTTATTGCAGCAATTCAGACTGCAATCTGCAATAAAAGGGTAATATCAATTCAATATCCTGCATCAGGAGGGCAAGAACCGGAAAGCAGAATGATAGAGCCTATATCACTGGGGTTTTATGAACAGAACTGGTACTTAATCGGTTTTGCAGGCTAAGAAATGAATATAGGAATTTTCGTGTGGATCGGATTAAAAGCATTTGCATAGAAGAAGAGCTCTGTCAAAGCCATGATGGCTCTTTGGAACAAATATTAAAACAAATGCTTTCATATAAAAAACTATATAATGTAATTCTTAGAGCTGAAAAAGGGGAGACATACAATTCTATCAAGAACAGGTATTCTCTCGGCTTCCTTGAAGAAACCGATTTGGGAAGTAAAATGGAAATCGAATTCCAGACAGATTCCTTTGAGATATTGAGCAAGCAGCTGATTGAATATGGATCAGGCATTGAAATAGTCCAACCTGATGAATTAAAATGCATAACCCGTAAACACCTGGCACAAATTACGAATCACTGCCTAAACTTGATTTAGAGAAAGCGATTGGTCTGTTATGTATTTTTTGTAAGGTTTCATATCCCCTGCTGACATACAGCTGTCAGTGTATTATGATATTCTACTATCAAAAAGGAGGATTGAAAAATATGAAACCAAAGATAATTATGCACACACAAATTAGCCTTGATGGCCGCATTAAAGGCTTTGATAATCCGGAAGTTTACTACCAGGTTGCCGGGGGAATTCATTCGGATGCGGTGCTGTTTGGGTCCAATACTGTTTTTACTGCATTTGAAAAATATCCTGCTGAAACAGAGGCTGATTTTGAGAAAATCATAACAAGCCCGGAGGACCCCAGACCAATAGGAGTCATACCTGACAGCAGAGGTATCTTGAGAAGTCTTCATTGCTTAAGAAATCTTGGATATCTGAAGGAAATTGTCATTCTGGTATCAACTGCCACTCCGAAGGAATATTTGAATTATTTGGAGGAAAGGCATTACCCATATATTGTGTCAGGAAATGATCATGTGGACTATGAAAAAGCCTTTCAGATCCTGCATGAGCAATATGGGTGTAAATACATGCGGACAGACAGTGGCGGTGGATTAACCAACAAATTATTAGAAAACGGACTTATTGATGAAATCAGTCTTGTGATATCACCATGTTTTGTAGGTAATAAAGAAAAACAACTATTTGATAACCTTCTGTTATCTGAAAAAGTTAATTTGGAATTGCAGGGAACAGAGAATGCAGAACATGGCTGTCTGTCATTGCGCTATGCTGTGAAAAATAAGGATTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN831036|51795:57745|56022_56595_+|WP_001079938.1|DBSCAN-SWA MNRINRVTSILIQLQSKKIIPAKEIAQRFNISLRTVYRDIRTLEEAGIPIGSEAGKGYFLVEGFLLPPVMFTAAEVGALITAGKFLNCHGDESFIKDFDSAMYKIKSILKHGEKNYAQELENSINVYSTSGQKNTLADNVIAAIQTAICNKRVISIQYPASGGQEPESRMIEPISLGFYEQNWYLIGFAG >NZ_LN831036|51795:57745|56567_56975_+|WP_072387101.1|DBSCAN-SWA MVLNRFCRLRNEYRNFRVDRIKSICIEEELCQSHDGSLEQILKQMLSYKKLYNVILRAEKGETYNSIKNRYSLGFLEETDLGSKMEIEFQTDSFEILSKQLIEYGSGIEIVQPDELKCITRKHLAQITNHCLNLI >NZ_LN831036|51795:57745|53412_54321_+|WP_001255866.1|DBSCAN-SWA MRSEKEMMDLVLSLAEQDERIRIVTLEGSRANINIPKDEFQDYDITYFVSDIEPFISNDDWLNQFGNIIMMQKPEDMELFPPEEKGFSYLMLFDDYNKIDLTLLPLEELDNYLKGDKLIKVLIDKDCRIKRDIVPTDIDYHVRKPSAREYDDCCNEFWNVTPYVIKGLCRKEILFAIDHFNQIVRHELLRMISWKVGIETGFKLSVGKNYKFIERYISEDLWEKLLSTYRMDSYENIWEALFLCHQLFRAVSGEVAERLHYAYPEYDRNITKYTRDMYKKYTGKTGCLDSTYAADIEERREQ >NZ_LN831036|51795:57745|57085_57745_+|WP_000802831.1|DBSCAN-SWA MKPKIIMHTQISLDGRIKGFDNPEVYYQVAGGIHSDAVLFGSNTVFTAFEKYPAETEADFEKIITSPEDPRPIGVIPDSRGILRSLHCLRNLGYLKEIVILVSTATPKEYLNYLEERHYPYIVSGNDHVDYEKAFQILHEQYGCKYMRTDSGGGLTNKLLENGLIDEISLVISPCFVGNKEKQLFDNLLLSEKVNLELQGTENAEHGCLSLRYAVKNKD >NZ_LN831036|51795:57745|51795_52665_+|WP_000228166.1|DBSCAN-SWA MVDNIIKSVAEKLSSLSYIEGIVLGGSRARGTHTEDSDIDIGIYYNSESFDINTINQFATKLDDEHRNNLVVPPGAWGDWINGGGWLVINGYHVDLILRDIKRVEQIMKDTEHGIVTANYQTGHPHGYISAMYRGELAISKILYAKNESLCELKKQAETYPNALQKSLVNFFMFEAGFSLMFVKANSGTDDKYYIAGHVFRIVSCLNQVLFACNNAYCINEKKAIKLLETFEHKPEKYTEKVNHIFEVLGISLFECYDMTEKLYNEVNEIVSEINNFLNEESSDERKQI >NZ_LN831036|51795:57745|54952_55747_+|WP_001096887.1|DBSCAN-SWA MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKMTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYEDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF >NZ_LN831036|51795:57745|52645_53380_+|WP_000662263.1|DBSCAN-SWA MKENKYDDNIFFQKYSQMSRSQKGLAGAGEWETLKKMLPDFKGKRVLDLGCGYGWHCIYAMENGASSVVGVDISHKMLEVAKGKTHFPQIEYECCAIEDVDFPEESFDVILSSLAFHYVADYENLIKKIYRMLKAGGNLVFTVEHPVFTAHGTQDWYYNEKGEILHFPVDNYYYEGKRTAMFLEEKVTKYHRTLTTYLNTLLSNSFIINQIVEPQPPENMMDIPGMADEMRRPMMLIVSAKKKM >NZ_LN831036|51795:57745|54317_54860_+|WP_000627290.1|DBSCAN-SWA MITEMKAGHLKDIDKPSEPFEVIGKIIPRYENENWTFTELLYEAPYLKSYQDEEDEEDEEADCLEYIDNTDKIIYLYYQDDKCVGKVKLRKNWNRYAYIEDIAVCKDFRGQGIGSALINISIEWAKHKNLHGLMLETQDNNLIACKFYHNCGFKIGSVDTMLYANFENNFEKAVFWYLRF |
8 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
746391 : 754211
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN831036|746391:754211|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTAGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTATATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCATTTTTTTAGGTGAGAAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATTGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATAAAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTTTCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAAGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGATTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACAACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTATTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTTATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACAAGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN831036|746391:754211|750325_751039_-|WP_001062965.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQLWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_LN831036|746391:754211|751463_752132_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_LN831036|746391:754211|748107_748581_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_LN831036|746391:754211|746391_747447_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_LN831036|746391:754211|749642_750227_-|WP_000604990.1|DBSCAN-SWA MILYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_LN831036|746391:754211|751042_751462_-|WP_000941340.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDNTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_LN831036|746391:754211|752482_753076_+|WP_000604515.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_LN831036|746391:754211|747446_748133_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_LN831036|746391:754211|753059_754211_+|WP_001217797.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_LN831036|746391:754211|748922_749363_-|WP_001093560.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNIDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
766183 : 780512
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN831036|766183:780512|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCTGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCGTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCTTTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGTATTTCTTGCCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGTAAGTGGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTTGTAGAGCATTGAACATTGATTTATGTCTCAAGCTCAATGCAGTGTGAATGATGAGGTGAGAGTATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCACATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAATATATCACTTGAAAAATTTCATGTAGAAAAGATGATGGATAGGCTATAAAGTAATTGTGACTGAGATGAACTTTTATGTCTTAGACACTACAACACTATATTGGCAGTAGTTGACTGCGGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTGTAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAACCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAAAAACGAATATAAGGTGCGTTGAATCTTATGATTACACTCCAAACCTAATATAATATCGGGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTGATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGGCCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAACCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGACATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAAAATAGTTATAGCTGTCTATAACGAGCATATTAAGCTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAGTAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATATATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAATTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAAACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTACCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN831036|766183:780512|771722_772223_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_LN831036|766183:780512|772242_773109_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_LN831036|766183:780512|779750_780512_+|WP_000616840.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_LN831036|766183:780512|778797_779754_+|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_LN831036|766183:780512|769876_771382_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_LN831036|766183:780512|773909_774308_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_LN831036|766183:780512|777839_778811_+|WP_000876319.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFVNHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_LN831036|766183:780512|768689_769607_-|WP_000429006.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_LN831036|766183:780512|776493_777465_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_LN831036|766183:780512|774270_776376_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_LN831036|766183:780512|769697_769799_+|WP_031835073.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGREKIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_LN831036|766183:780512|767580_768123_+|WP_000197262.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_LN831036|766183:780512|766183_767242_+|WP_000663035.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESVDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_LN831036|766183:780512|777645_777801_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1025694 : 1034167
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN831036|1025694:1034167|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN831036|1025694:1034167|1026163_1027288_+|WP_001010406.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_LN831036|1025694:1034167|1025694_1026177_+|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_LN831036|1025694:1034167|1027995_1028259_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_LN831036|1025694:1034167|1027291_1027996_+|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_LN831036|1025694:1034167|1033600_1034167_+|WP_000238658.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHIESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHGIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVSLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDCGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_LN831036|1025694:1034167|1031092_1032577_+|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_LN831036|1025694:1034167|1028260_1028932_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_LN831036|1025694:1034167|1032569_1033598_+|WP_000030803.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEIIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_LN831036|1025694:1034167|1028924_1031114_+|WP_000032727.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1473237 : 1560407
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN831036|1473237:1560407|DBSCAN-SWA 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103 | Staphylococcus_phage(83.12%) | plate,capsid,protease,portal,head,tail,terminase,tRNA,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1615528 : 1623858
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LN831036|1615528:1623858|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LN831036|1615528:1623858|1620710_1621817_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_LN831036|1615528:1623858|1617339_1618686_-|WP_001062180.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_LN831036|1615528:1623858|1622040_1623858_-|WP_001217257.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTTFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_LN831036|1615528:1623858|1615528_1616314_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_LN831036|1615528:1623858|1616439_1617330_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_LN831036|1615528:1623858|1618799_1619900_-|WP_000683933.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_LN831036|1615528:1623858|1619902_1620580_-|WP_000624580.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1693174 : 1702217
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN831036|1693174:1702217|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGACCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTTGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTCAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTATACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCTATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGCGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCCGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAATCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCATTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCGTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCCGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTAAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCATCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN831036|1693174:1702217|1693174_1693693_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_LN831036|1693174:1702217|1699023_1700163_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_LN831036|1693174:1702217|1700185_1701211_-|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_LN831036|1693174:1702217|1696190_1698470_-|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_LN831036|1693174:1702217|1698744_1699005_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_LN831036|1693174:1702217|1701212_1702217_-|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_LN831036|1693174:1702217|1693714_1695988_-|WP_000594999.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1825800 : 1897968
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LN831036|1825800:1897968|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCGTTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAACAAAGCCGCACCTGTAATCAGTGCAAATTCTTTCAATGGTAAATCCATTCCTTCAGAACCTGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCGATTCATGTGTCTCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCTGGCTGAATTTCTTTTGGTGATACTTTCGTCGCTTCAGCTGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTGTGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTCTATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATACTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATCGCTTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATGCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCTTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAAAGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAAGCAGTGACGCGTGCAAGATCATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAATATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAATATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCGTTGAATAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTTTCATTATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATTTGTTGTTTAGCTTTAATTAACTCTTTTTCAACTTGTGCAATTGCAATATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCGTTATTTGCTTTAATTAAATTAATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAATGCTGTTGTTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATTTATACTATCTTGATTAACTTGGGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAGTCTTTCTTCTTCAGTTGATAAATCGCTTTGATCGATTAGTGCATTTTGAGCTTCGGCTTTTACACCAACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTCGTTGCCATCAGTCTCAGTTCGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATGTCATTTTTAATTGTATTTACAATTTTATTTAAAGTATCAATAGCAACATCTCTTTCATCTTGAGTAGTATCCAACGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGATTTTTATTATTTTCTTCAATGCTATCAAGCGCAGCTCGTTTACGTCTTACTTTAGGTTTTATTTGCTCTATTGCCTTGATTGTTTGATTTCTAACATCAGTAACAGCAGCATCTTGATTTGTATTTTCTATTTCTTGTTGCGCTTGTTTGAGTGTGTCGCTAATTAATTGATTCGCTTCATCTAATTCATCAACTGTTGCATGTGGTGTATCTTTTATTGATTCTACTTGATTTTCTGCACTTGCTTTTATTGCTTGTTGTGCTTCAGGCTTAATTACAATATGAGGTTGTACACCTTTTAGTGTAGCAATGCCATTTGTTTCAACACGTTTCACATCATTATTCGTTACTGCTTGATTGATGTTTTGTAATGCAAGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCAGCTTGCTCTATTTCTTGCTTTTTAGTCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGTTCAGGCGCTACTAAAGCAATGCTATCAAGCGCTTGACTTGTTGTATCATCAACTTGTTGATTTGTTCTATTATTCGTAATATCTGTCATGGCTTGATTTACAAATTCATTGATTTTATCTAGTGCTACTTGTCTTTCTTCTGCTGTTGCTTCTTTATCCTGATTAATCTTAGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCAGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATAATTTTAATCGCTGATACACCATTTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTTGCTAATGCTTGTGAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTTACCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACAGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGCCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCTACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCTGCATTTGTGTTAGCTTGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAGTATTGATTGCAGCATTTTTCTCATCATTCGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCCGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAACTCTTGATCCACTTGATTTAAAGCCACTTGCTTTTCTTCAGTTGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAATCATTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGCGCCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATTTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTTGCATTGATATTTGTTATCGCCTCTCGCGCTTTATCATTTACAACATTGCGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGTAATTGTTGTGCTGCTTGTTGTTCTTCGAGCGTCGCATCATTATTATTAAATATCGTATTATGTTGCGTTTCCGCACTTTTATCAATGGCATTTTTTGCATCTGTTTTTACCTTTGTAGCTGGTGTAATTGCTTGTATTCCTTGTATCGCATTTGTCTTCACTTGTTCCACTTCAGCATTGGTATTAGCGTTTAAAATGTTTGTGTTTGCTGCAGTTACAGCAGCATTCACTTTGTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCGATATGTTGTTGTGCATCATGTGATACAGCATCCCTTGCAGCTTGCTTAACAACAGTTACAGGAGCAATTGGATTAATGGCATTTAGACCATCTCCTTTGGCGTTATCAACATCAGCATTTGTTGTTGCTTGATTGATTTGTTCTAAAGCATGGTTGGTTGCTTGAGTTAATTCGTTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCCTGAGTTGCTTCTCTATTACTATTTATTTGTTGTCTTTTCGTTGCTGTTGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCAGCTTTTTTATGAGTTACTTGAGGAACAACTGCTCCAATAGTATTGATGCCATTATTTTTAGCTGTTTCAACGTCAGCATTTGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTAGCTAATTGATTTATTGCATCTTGAATCTCGTCTTCAGTAGCATCTGGTGTTGCATTGATAATTTCCCTTTGTTTCGTTGCTTTATCACGTATTGCTTTTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCCCCACTTAAGGTCTGTATACCTTGATCTTTGATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTACCAATTATTTCATTTTTATGTTCCTCGATAACTTGTATTGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAATTCATCATTTTGATTAACTAAATCTTCCATTTGGTCAACTTTTTTATTAACTGCATTTTCAGCATCAACACTTCGAATTAACGTATGTTGCATTTGATTAGTTAATGAATCAATATCTGCTTGAGAAACTCTTTTATTTAATGGTACATTGTTACGATTTTCATCTAAAATCGTTTGTGCGCGTCGTTTCAGACCATTAAAGATATCTAATGACGCAAATGTATAATCAGCTTGTTGAATACGTCTGTCAACTTCGGCTTGTAATGCATCTTTATTCATGATGATATCGATAGTATATGGATTTGTATTTATAGTATGACTTTCTGCAGCTGAATTAATGAAATCTTGTGTATATGTTTTATACGTTAATGTCTCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTCGGCACATTATTTACACGTAATTTATATCTTAAATCGAGTATTTTATCAGGCATAAGTCGTGCCGGAGAGTTTGCTGTACCT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70 | Staphylococcus_phage(94.64%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1979879 : 2075335
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LN831036|1979879:2075335|DBSCAN-SWA 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111 | Staphylococcus_phage(85.33%) | capsid,protease,portal,head,tail,terminase,integrase,tRNA,holin | attL 1977837:1977858|attR 2064472:2064493 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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