Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011035 | Pseudoalteromonas translucida KMM 520 chromosome II, complete sequence | 0 crisprs | cas14j,WYL,csa3,cas3,DinG | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP011034 | Pseudoalteromonas translucida KMM 520 chromosome I, complete sequence | 2 crisprs | c2c9_V-U4,cas14j,DEDDh,cas3,WYL,DinG,cas6f,cas7f,cas5f,RT,csx1,csa3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011034_1 | 722793-722948 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011034_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP011034_1
>1.1|722848|46|NZ_CP011034|CRISPRCasFinder CTTGTCAGCACTCCTACACTTGCAGTTATCTGAGTTGGTAAAACTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011034_1
The CRISPR arrays of NZ_CP011034_1 >merge|NZ_CP011034|1|722793-722948|CRISPRCasFinder TTTAGCCTAAGTCACATACTAAATGTATGCTCCTTGGCATAAAAAAGCACTCCGTCTTGTCAGCACTCCTACACTTGCAGTTATCTGAGTTGGTAAAACTATTTAGCCTAAGTCACATACTAAATGTATGCTCCTTGGTATAAAAAAGCACTCCGT >NZ_CP011034|1|1|722793-722948|CRISPRCasFinder TTTAGCCTAAGTCACATACTAAATGTATGCTCCTTGGCATAAAAAAGCACTCCGT CTTGTCAGCACTCCTACACTTGCAGTTATCTGAGTTGGTAAAACTA TTTAGCCTAAGTCACATACTAAATGTATGCTCCTTGGTATAAAAAAGCACTCCGT
>NZ_CP011034.1|WP_058372682.1|720993_722751_+|arginine--tRNA-ligase MNIRTILVEKAIAAMTAVGLPADTNPAVTQSTRPQFGDYQINAAMGAAKKMKSNPRELAQKIIDNLDVSDIAEKTEIAGPGFINIHLKPEFLAQSVKAANSDAKLAVNEHANPQKVVVDYSSPNLAKEMHVGHLRSTIIGDAIVRALEFRGDSVVRQNHMGDWGTQFGMLIAHLEDQISQGVDLDTVALADLETFYRDAKKRFDDEEGFADKARNYVVKLQGGDAHCEKLWKLFIATSVKHSEEVYKRLNVTLTQADIMAESAYNAELNDIISLLKDKNIAVESQGAQVVFLDELANKDGEPSAFIVQKSGGGFLYATTDLAACDYRSNKLGADRILIFVDARQSLHFNQVELTARKAGFLRDETSYEFCPFGTMMGADNKPFKTRTGGTVKLADLLEESINRAAIKLAERESDLSEQERSEIARKVGIGAVKYADLSKHRTSDYIFNWDSMLSFEGATAPYLQYAYTRIRSIFRKLDVDTESLNFLLHGFDVRIVEPQEKALALKLLQLEEVLDLMIAEATPHVLCGYLYELASLYMTFYEACPVLKEGVEPSVRDSRLVLCNLVSKTLETGLDLLGIEVMEQM >NZ_CP011034.1|WP_058372681.1|719347_720937_+|peptide-chain-release-factor-3 MAEQNLLSEINKRRTFAIISHPDAGKTTITEKVLLFGQAIQKAGTVKGRGSNQHAKSDWMEMEKERGISVTTSVMQFPYKNALVNLLDTPGHEDFSEDTYRTLTAVDSCLMVIDAAKGVEDRTRKLMEVTRLRTTPIVTFMNKCDRDIRDPMELLDEVETELKIACAPITWPIGSGKGFKGVYHIHNDEAVLYKTGQGHKIQDVRTIKGIDNPELVDAIGDDLAAQLRDELELVIGASNEFDLELFLAGELSPVYFGTALGNFGVDHVLDGLTKWAPTPLPRETEDRQVVATEENFTGFVFKIQANMDPKHRDRIAFMRIVSGKYSQGMKMNHVRIGKQVSISDAVTFMAGDRERAGDAYAGDIIGLHNHGTIQIGDTFTQGEKLKFSGIPNFAPELFRRIRLRDPLKQKQLLKGLVQLSEEGAVQVFRPLINNDLIVGAVGVLQFDVVVARLKAEYNVDAIYEGVNVNTARWVSSDDVKKFEDFKRKCESNLALDGGDNLTYIAPSRVNLNLSVERYPEVTFSHTREN >NZ_CP011034.1|WP_058372680.1|716314_718981_-|hybrid-sensor-histidine-kinase/response-regulator MKTSKLSIRLLWYITPLVILPLLFLGGFTLTNVTNSTQKQADLIMSRFVEQQQQKVFNYIDSFQSTAKLLSTSPVLNDFLANDLHADGGYTYRLGALMDVFASYSEAYPDIISINLMSVNGKSDAYYSSNLSIAPKSYPFFEKIQQSNLSQQQFMMQKADGTTSLYFIQRIYSIDYYLKRPQQLGFIVLHIDPSILNTSILEAPYNNTLNLLVSNEGKILFSSDYNIRGQYISEFELSQVHNLADIGSLSTIELSSIDKIERMIFAVQMSGGYYVSTIPKAVLYQSGKAISLITGLIVIISVITLPILIFIVVRNLLLNPIELLGAASHRVGDGDLGVSLPAHTDDEVGILFNDFNHMINQIRHYQEQLEEYKHHLEDKVESRTKALETMNSQLELAIGQAEQANQLKSRFLANMSHEIRTPLTAIMGFTEQLLHNDKITNNKQHLSTILRNSKHLLELINNILDLSKIEAEKIGVEQAPLNVVRLMHDIESIIEPLAQQKKLKLSINYQLPLPHTINSDETRLKQILINIASNAVKFTEQGHVSITAHYLPSQELMFVIQDSGIGMAENQIKRLFTPFEQADATTTRRFGGTGLGLCISKNLAQRLGGDITVKSELDVGSCFTITIACNLQTPLADNLFLEQPDQLIPEKDPQLSFASNSFDAHILVAEDNPDNQLLIKLLLQTWGLEPDIANNGAEAVEMALVNDYQLIIMDMQMPVMGGLEATKILRHAAYDGPIIALTANVMNHDVDTYIAAGCDKALAKPIDKDALESVLVSYLHLEKDNQNKWDDILKSEKFQQINANYVANLPTYLAEIKSLQFSGNLVALRALAHNIKGSAGCFNFDDIYHCAARLEEHLKTDSKAALNELTANLINVIEQAISEQSKPV >NZ_CP011034.1|WP_058372679.1|715811_716276_+|ribosomal-protein-S18-alanine-N-acetyltransferase MINFKSVDATAIPQLMAIETACHSHPWTLNTMSSCIGGRYFNLAAFNGDTMVGFYIGEKAGPDFTLMDICVAPSEQGKGIAKQLLSQFIDYGEQQNAENLFLEVRESNTPAIKLYENAGFIEMSVRKNYYPSDNPAKNGFEDAILMGMALGLNF >NZ_CP011034.1|WP_058372678.1|715444_715825_+|hypothetical-protein MHSRYAAVFGIENLELNQHYSLYNQSVKNSSLRSSEPTDSSSSDNQSLNNQPTDVAVINKEFEPITLSSQLLADIKRAAVPIAINSVVQSAALQLHDDQLGLTTPKLKTADKRALWALMSNHLDKL >NZ_CP011034.1|WP_058372677.1|713563_715141_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MSKDIHDSRILILDFGSQYTQLIARRVREIGVYCELWAWDVTEEQIREFNPQGIILSGGPESTTLENSPRAPEYVFNAGVPVLGICYGMQTMAAQLGGSVHSSDKKEFGYAQVEKVGNCALFDAIEDHITDGGNGVLDVWMSHGDKVMDIPQSFKTTAKTSTCPHAAMSNEEKRFYGVQFHPEVTHTHQGQRLLERFAIDICGCEKLWTAAKIIDNAIERIKETVGDDEVILGLSGGVDSSVVAMLIHRAIGERLTCVFVDNGLLRLNEGQQVMDMFGNKFGLNIVKVEAEEQFLNDLAGKSDPEDKRKAIGHTFINVFDEQAKKLKNAKWLAQGTIYPDVIESAASATGKAHVIKSHHNVGGLPADMKMGLVEPLRELFKDEVRKIGLELGLPYDMLYRHPFPGPGLGVRVLGEIKKEYCDLLRRADAIFIEELHKAELYHKVSQAFTVFLPVKSVGVMGDARKYDWVVSLRCVETIDFMTARWSHLPYEFLGVVSNRIINEIDGISRVVYDISGKPPATIEWE >NZ_CP011034.1|WP_011327346.1|711987_713457_+|IMP-dehydrogenase MLRIAKEALTFDDVLLVPGHSTVLPHTANISTRLTRGIKLNLPLVSASMDTVTEARLAIALAQEGGLGFIHKNMTIAEQAKNVRKVKTYEAGIVTYPITVTADLTIADALELSQEKGFSGFPVTDSDNNLVGIVTGRDMRFETKLEQPVSTVMTKKDKLVTVNEGAAREEILGLMHEHRIEKILVVDDAFKLKGMITVKDYQKAQEKPDACKDDQGRLRVGAAVSVGAGTDERIAALVEAGIDVLLIDTSHGHSQGVIDRVAKTRKEYPDLQIIAGNVATAEGAVALADAGADAVKVGIGPGSICTTRIVTGCGVPQITAISDAVDGLKGRDIPVIADGGIRFSGDIVKALVAGASCVMVGSLLAGTEEAPGEVELYQGRYYKSYRGMGSLGAMDQKEGSSDRYFQKSNEADKLVPEGIEGRVAYKGPIATIIHQQVGGLRSAMGLTGCATIEELNTKPQFVRVTSAGMGESHVHDVQITKEAPNYRLG >NZ_CP011034.1|WP_058372676.1|710516_711851_-|exodeoxyribonuclease-VII-large-subunit MFSKPLQTVYTVSRLNREIRALLEQGFASLVLTGEISNFITPASGHWYFSLKDDKAQIKAAMWRGNNRNQSYRPINGAQVTVKARVSLYEPRGDYQLIVEHMEPAGEGQLKQEFDALKMRLAAEGLFSSVYKKPLPQNINRIGVITSATGAAIKDILTVLKRRAPQLEVIIYPAMVQGKDAHLQLIKQIELANIRSEVDVLILGRGGGSLEDLWCFNHEQLARAIFNSQLPIVSAVGHEIDTTISDYVADVRAATPSAAAELVSPNTQELHNKVTQLVNRLANAFKHDMSEKRAQALQLQHRLNLCHPRNQLNQKAQRLDELSIALQQAMRNRLYQQERTLNNLTPRLMRQSPDKKLTQASHQLAQLQARLNQAIQQQLQQANNSLALQASRLDSVSPLNVLARGYSITKTEKQKVVKSVADVKVGDTLITELVDGTLHSQVLS >NZ_CP011034.1|WP_058372675.1|709861_710509_+|hypothetical-protein MLNKSNLFGLCCFILGVGLTSGYFLFLHSMPIQAQQSQPFSYKSIVIKHASNESLNSTDEHVNSADGNLQAESIAPYTHKIATLTSELELKTKQLKRVEQALKLAQLDQLDFAKQLEEKFIAEDENSQWSYEVETALTDFLITSDLSNTAQLTSLECKQTLCKFSLIADKNNQQGHVQWRELNDKLALMPWWQQFKLTASNSTDERIDFIVSTKE >NZ_CP011034.1|WP_011327343.1|709024_709843_+|serine-O-acetyltransferase MRHEIWQQLRSEANEVVKREPLLASHVYSCILNHECLGAALSFIVANKLADAVVSAFTIRELFDQSFVRCERMLTHVAHDIKAVKDRDPAAETYLTVILNLKGFHAIQAHRLANCLWTQNRKELARFIQSRSSEVFGVDIHPACKVGKGIMFDHATGIVIGETAVIEDNVSILQSVTLGGTGNEQGDRHPKIRAGVLIGAGAKILGNIEVGAGARIGAGSVVLSNVPPHTTAVGVPAKIIGRPDCECPAKSMNQNFLAKPEPENESHTSSML >NZ_CP011034.1|WP_058372683.1|723248_723887_+|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase MKLEDIRREYLQNALSEDNLLDDPFKQFETWLEHAVASNLPDPTAMVVATVDDTGQPSQRIVLLKHLDNDGFVFFTNTGSRKAQELKGNNKISLHFPWHPMERQVIVYGEARPLPTSAVAKYFLSRPKESQLAAWASAQSRPVSSRKVLMETFANMKNKFAKGEIPLPDFWGGYCVVPQKIEFWQGGAHRLHDRFMYQRQADNSWQVTRLNP >NZ_CP011034.1|WP_058372684.1|723929_724697_+|TatD-family-hydrolase MQFIDSHCHLDFSEFDSNRETLINECAAKGVKQFVVPGISLAQSCALLEFKTNFAGVKIAAGLHPYFLNQHQESHIEQLFTFATANKTQLVAIGECGLDRSIENLPKQTFLFEQQIALANQLELPLIVHHRQSHDLIAQSFKRCKPKYGGVIHAFSGSLQQAHYYIKQGFKLGVGGVISYPRAVKTRDVIANINTSHLVLETDSPSMPLCGYQGEINTPLQIVRVFDVLCELKPKQHKEQLATELYDSCCDVFCI >NZ_CP011034.1|WP_058372685.1|724663_725284_-|smp-protein MKNNHLKNPINASQKKRLVRLLLATACLVLLSWVGINSSFQSHQLLYDSADSTAKSLTKFMALNAKTPLIEKNKPQLNALCNNISKDEFVLSATIYDQQGILIASSDNWQSLHISGQLSESTPGVSKLKTPFIEPVVSDDDRPVGFVSITYLTRAAVTSSHNHFHDLGRQVLLMLVIVCIFTWQFGRGLKIWQVNRYIQKTSQHES >NZ_CP011034.1|WP_058372686.1|725457_726486_+|phosphoserine-phosphatase-SerB MSQTNMAQPGAEQPLTQLVLNKWFSYQDEVFLPLKKLPNKHQGLFSIAFAGNFTVTHIKAIIDFFAKHNQTVTGLCQYQPDLSLPAALCFYIKQSEQPINPLVLQQFASTLDFQLVQIACPPNLYEPGLLVMDMDSTAITIECIDEIARLANVYDEVASVTALAMAGKLDFSESLNKRVAKLSGIEKSLIDELKNNLPLMPGIKMLCQILKQHQWHLAIASGGFVPFAEQVQTLINLDEVHANVLEFKDNKLTGKVLGTIVDAQQKAVILESLQQQLGLIKSQTVAIGDGANDLKMMAAAGLGVAVHGKAKVVEQAQAAICQGSLLQLLYMLAIPLNSEATV >NZ_CP011034.1|WP_058372687.1|726482_728960_-|PilZ-domain-containing-protein MAEDILLKHEDLISELKHYLGNPKFDLIFKSKIAGLTKPEQFLMKMEMTRLSQPIARFIDLRGLVTGQVKPYDHNGKQHFMDETAIEVFEAALKQHGGYTLAVYEAVMNTENNHRVLQRKAAEKVAVQAIDDSLNTSVIKFASYENRREERMNYSIKVTVEYNDKKSIAASTSDISLSGCKIKLATRYVLKKGHLIAMRLVGLEQDFELGLKNGIQYEVVAIENISKEFNHIRLKRTFIENNEAFDNFLESFIHGNKRRYKVNLDNTLDAVVSKGYEQYYIPRVTSLYVFLSQKDNVFYPSLSLTTENNIFIQRYFTDERHTPCLYSVLNEQRINALLLKQTPVKEDYLYTFTHISAGKIYYYSATRNELEQNPQLKNLFLAFGSQKDTWQCFKIQIMPSHPDDSFIPLSLPNTVSKNIEKLNKPPSPRVEGLVKNVKYMVVLTAIGNKTEQQHYQQLNYDKALINQLKHFGHSKSKSAPYLDIVPLEYVNLRSDKRYLYKTNVSINVNDEVVHGLTRDFSVMGLQLECKQPVSFKKGDIVLLAFPDLQKITKTYQLSELKYEVMAVNKSFTIINLKASRVADLPHAGVLFFTQLINSNKDKLKVSEEAPKVPGLSTALRNMVTKSVCQFPLYLHKEGAHFKAGAIGFGLYPSPLHVLLQNFGLLGNKTDLSSIITDEQIINVITPQIKDLSRQDPPSAFTLVINFDPRKGSISESITSYCIAGEDYNDFQEQISKGLKSNLIFVMRLYISRTGRPDTDYLSNELKYVSQYALHKARELEEALWSVAGVGDIVDITEEALSHLKLEQQQVDQMGRRKLLWLNRLR >NZ_CP011034.1|WP_058372688.1|729326_730712_+|DNA-repair-protein-RadA MAKAAKVEFVCTECGMNYQRWQGQCRCGAWNTLAEFKPSAGQSKKTSARVSVGGYAGGIGGGSKKINDIATAETEKQLTEIGELDRVLSGGVTTGSVNIISGDPGAGKTTLLSDLVARMSQRMPSLYCTAEESLSQFKNRVNRLKLNYNPDALYLLSETSVETIIEELDKNKIKFAVIDSIQAVVTDTANGSPGSPSQVKSAAQALTQYCKQNDVTMFIIAHVNKNNEIAGPQTLVHIVDALLHIDTNDGQIRTLRANKNRFGDIDTVGIFRMCERGMLSVDNPSEIFLSGSTTDSPGSAITCIRKGNRNLLLEIQCLTTEIEAEFPQRVCVGLNMNRIKMLTGILRKHTKTKIFHDTFFNIVGGLKIDESETCIDLALVAALLSSLNDFVVPRTTCIMGELSLNGDVRPIDSGVPRVKEAAQHGFTEIFIPFRNYHKSMEGLGAKITPIKTVHELLSLIN >NZ_CP011034.1|WP_058372689.1|730793_731726_+|hypothetical-protein MKKLVIAAAIVAAGVGGVSYANHVATKEVRAEIDKQLALVSEQTGATFKYADLSASVISNSVEISNMEVISSEGDNVASIQSIEVTGYETDKISPHTTFDVKSFQFNKDFVAKLPADTNIMLASASYDLHSSLDYDEKSGDSDVVVKLDAKDIVSLNMNMGLANTQALMDASLAISKAQQAAGSQPLTYEQELQQQTLIMQAMSKLEPRSVNFELNNQGELKALLESELVKQGMSVEQMQMMVEQQLQQAPVTEEIAEAISGFVKGLNSFSVSAKLPEGKTMMEVNQQIMMLIGQPEKLVEYINLEVKGD >NZ_CP011034.1|WP_058372690.1|731895_733125_-|phosphoglycerate-dehydrogenase MSKVSLAKDKIKILLLEGVHQSAVETLKRNGYSNIDYVKTSLPEDELKERIKDVHFVGLRSRTHINQSVLEAAEKLVAVGCFCIGTNQVDLNAARERGIAVFNAPFSNTRSVAELVLGEILLLLRGIPQRNAAAHRGGWLKTANGSFEARGKTLGIIGYGHIGTQLGIMAENIGMNVEFYDIEDKLSLGNAKQVHNLTQLLQRADIITLHVPETPQTKNLIGTAELAIMKQGAILINASRGTVVDIDALAEALTEKKLSGAAIDVFPVEPKSNDEEFVSPLRNFDNVILTPHIGGSTQEAQENIGIEVAGKLAKYSDNGSTITAVNFPEVSLPELANRSRLLHVHHNRPGVLTQINQAFAQHGINIAAQYLQTDESIGYVVIDVDTDHSEVALKELSAVEGTIRARILH >NZ_CP011034.1|WP_058374511.1|733134_733788_-|ribose-5-phosphate-isomerase-RpiA MTQDELKKAAAWAALEFVKENTIVGVGTGSTVNHFIDALGSIKDTIKGTVSSSEASTARLKALGIEVFELNDVDVLDVYVDGADEINAHNEMIKGGGAALTREKIVAAVAKQFVCIVDDTKLVATLGGFPLPVEVIPMARSYVARELLKLGGDPVYRQGVVTDNGNVILDVHNLKITQAKQLETQINQIVGVVTNGLFAERGADKVIIGTKNGPQIK >NZ_CP011034.1|WP_058372691.1|733840_734437_-|5-formyltetrahydrofolate-cyclo-ligase MSNKRATIRASVRELRNNLSNNQQLIAAQSLKMNFIQYLNGKKSSKKEHIAIYFSNDGELDTSLLINELWDKGHHLYLPVIHPFNGANLLFQRYEKNSPMKANRYGILEPKLNCTQICPLPELDYLLMPLVAFDNQGNRLGMGGGFYDRTLARLHQQHWQKPQLIGLAHECQKVTALPIESWDVPLKTIITPNKTYCW |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP011034_2 | 2299619-2299762 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP011034_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP011034_2
>2.1|2299642|38|NZ_CP011034|CRISPRCasFinder AGTTACAATTTGTGGTTGTTTACTTCCCGGCCTAACTT >2.2|2299703|37|NZ_CP011034|CRISPRCasFinder ACTTAGCGGAGTTGACGTCAAAAATTCTAAATATTTC |
cas6f,cas7f,cas5f,RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011034_2
The CRISPR arrays of NZ_CP011034_2 >merge|NZ_CP011034|2|2299619-2299762|CRISPRCasFinder CCTCTGCCTTTTCGGCAGTTAAAAGTTACAATTTGTGGTTGTTTACTTCCCGGCCTAACTTCAGCTGCCTACTCGGCAGTTCACACTTAGCGGAGTTGACGTCAAAAATTCTAAATATTTCCAGCTGCCTACTCGGCAGTTCAC >NZ_CP011034|2|2|2299619-2299762|CRISPRCasFinder CCTCTGCCTTTTCGGCAGTTAAA AGTTACAATTTGTGGTTGTTTACTTCCCGGCCTAACTT CAGCTGCCTACTCGGCAGTTCAC ACTTAGCGGAGTTGACGTCAAAAATTCTAAATATTTC CAGCTGCCTACTCGGCAGTTCAC
>NZ_CP011034.1|WP_058374587.1|2299132_2299582_+|DUF2384-domain-containing-protein MPSDIQPSANNKFVDILSNGKVNLSSNPLDEIELIQRGLDIKSVEKFRLELDWDIQSFAKAIGTNTRIFERHKKEHKRLNATLSENTFELAHLASTCIDYFENIERWNKWLNTCSLQFSSKTPLTFVNTIAGRRLIRNVVNSLKHGYNA >NZ_CP011034.1|WP_058373763.1|2297978_2298962_+|hypothetical-protein MKPIEKAKAQKLVLKLESGNFDENDIDNIFMRLRAYSHGNRIFREIADFVAHNDERNQGISVESLEAFYLSFKYFLEYVSPKKSLDIGSPFPLYVKKLMKYQIDKCKDADLKEKFNVTKQRLKSRVDSIFSEDKKNKKAFMKKPKISDDTIGALQHILGFIGSHPAFDQEQVILELLAVIKANKLHVNEAELLKHSDKIAACVALLLHDATFEYGGHKQGFCKISCEKTSISYNQKFVDKDGNPSEHKESFGNIQVQGHVVLEKDGKDLTVCYPLMTTNLSVEDWCDDDMFVVEPITEDHPNYLHRKVIFDQDLCFTEGGKIGVIHT >NZ_CP011034.1|WP_058373762.1|2295242_2295995_-|ATP-binding-protein MDNFTASLPLMLKQLKLSTMLQQWNTLGKKAIEEQWSPQQYLSELCHVELATRDDKRLQRLLKDAKLPVGKHLSSFDFTLVDGVSKPLVADLINQPDWLKYGGNILLFGASGLGKTHIASSIGYGLIEQGHKVKFVAASTIVQQLQQAKRHLRLQDELVKLDKYSLLIVDDVGYVRKTEQETSVLFELIAHRYERHSMIITSNKSFEQWDELFEDSTMTVAAIDRLVHHATIIHCEGDSYRRKTALNKSK >NZ_CP011034.1|WP_083497523.1|2294881_2295091_-|hypothetical-protein MGLGGISLWQIFILLFVFFVGALPWILALVSKKAEGTNKVVWFLMSFFISWLGYLVYYFLVIKKLPENN >NZ_CP011034.1|WP_058373761.1|2294020_2294734_+|zinc-ribbon-domain-containing-protein MALVKCKECGEEVSNKAKSCPKCGAKASKKTSLLTWLVLILIILGVYVSGQSTDRATKPSTKVSSSDKGETIKSEKVQKAAPPKPVWVTSVSKDEMTGKFTAFAHSPRAYPSKKMGFPYHDVYSYMGVGCSAGKEWVYLGFNDSPNLSKDTTKSGYNLIKTRIKWNDNVEDISLTQDWGAKFLHFNDDSIVISKIETSNTALVELQWHGEQATYFKYSLSGSSKAISEIRGKCSKNK >NZ_CP011034.1|WP_058373760.1|2291590_2293084_-|acetyl-CoA-hydrolase/transferase-family-protein MQLERIRNSNLHQKVMSAEQASQFIKDGMTVGMSGFTRAGEAKAVPRALVKRVKNNPIKINLMTGASLGNDLDKLLTEAGVLARRMPFQVDSTLRKAINNGEVMFIDQHLSETVEQLRNHQLTMPDVAVIEAVAITEEGHIVPTTSVGNSASFAIFAKEVIIEINMLHSPELEGLHDIYIPSYRPVRQPIPLTKVDDRIGSTAIPIDPAKIVGIVFTNQSDSFSTVTDPDVDTAAIASHLVSFFKEEVAQKRMAENLGPLQAGIGNIANAVMMGLLDSDFEDLTMYSEVLQDSTFDLIDAGKLKFASGSSIVLSERCNAKVFNNLSEYKDKLVLRPQEVSNHPEIVRRLGIVAINTALEFDMYGNVNSTHVCGTRMMNGIGGSGDFARNAHLAIFVTKSIAKDGAISSVVPMVSHVDHNEHDVDILVTEQGLADLRGLAPRERAVQVIKHCVHPDYRDAMLDYYERACKRGGHTPHLLEEAFSWHIRLEEQGSMKKA >NZ_CP011034.1|WP_157756050.1|2291169_2291412_+|hypothetical-protein MLIHKIRVLDQQTSDTGSAVAVIQFCSMIAGATGMMLVSIRPDELISDLGIIQLSIGAIALVLWLLVKNKSYVINNLYKT >NZ_CP011034.1|WP_058373758.1|2290195_2290885_+|DUF1826-domain-containing-protein MNALAPLTHSTPATMQLLRKAAKSTNANVLPQIYNEDTNIVIWQRSTAEKLTKAVNILIAISALKPLELAVSPNDAFEQLIKALKPEDNNSDEVNTLCEDIALLVEMFCCLCDLKRAGLRLKVLDKPMCPRFHVDKIPCRLVTTYHGVATQWLNHSDVNRSKLGAGNLGKPDEESGLFKSLSNINQLQQGDVALLKGEYWDDNEGAGLVHRSPPVAANEQRLLLTLDFI >NZ_CP011034.1|WP_058373757.1|2288996_2290196_+|GTP-binding-protein MINKLPVTVLSGFLGAGKTTVLSHILNNRQSKKVAVIVNDMSDINIDADTIKSGVSLNHSDEKLVEMSNGCICCTLREDLLVEVGKLAKEGRFDYLVIESTGISEPLPVAETFTFADDNGISLGDVATLDTMVTVVDAVNFLNDYEQANDLQDTGESLGEDDERSVADLLVDQVEFADVILISKTDLITNDELNRLTAILNTLNTQAKIIPISNGNININEVLNTGLFNFERAQQAPGWLKEMRGEHIPETEEYGISSFNYTARRPFDPEKFYNFLHSTEQFGKLIRSKGYFWLATRPLFCGQWSQAGGIAHYEFAGMFFKAIPQKEWPTEPELLADINNKWVEPFGDMRQELVFIGQSLNQQAMIKALDDCLLSEDAVLKGKDFWRTYNDPFPIWEEE >NZ_CP011034.1|WP_058373756.1|2288339_2288744_+|transporter MKAIIMVVIGFIFGLGLIISGMTNPAKVINFLTYGNQWDASLIIVMAVAMLIMMLTWLWVAKKEKPLLSRSFNLSDLKKVDTRLITGSILFGLGWGLSGICPGPGLVQLVSLKMEFLLFFAAVLGGMWLTKKLT >NZ_CP011034.1|WP_058373764.1|2299879_2300482_-|type-I-F-CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6/Csy4 MKRYYFTITYLPQSCDVSLLAGRCIGILHGFMSSREISNIGVCFPKWNEQTIGNELAFVSTNKKQLTNLSQQSYFEMMAHDKLFGLSKILEVPVNQSEVMFVRNQSVAKAFVGEKQRRLKRAKKRAEARGEVYNPEYKFEAKDIGHFHSIPVSSKGNGQSYVLHIQKNENAESIKNQFNNYGFATNQIFLGTVPSLNTLL 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1062879 : 1073658
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011034|1062879:1073658|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011034|1062879:1073658|1062879_1064742_-|WP_058372917.1|DBSCAN-SWA MSEPVTFESLNLSPAILKAVEELGYKTPSEIQAQCIPLLLERKDVLGLAQTGTGKTAAFALPLLNNIDPSVKQPQILVLTPTRELAIQVAEAFEQYAKHVRGIEVLALYGGQSYSIQLSALRRGAQVIVATPGRLIDHINRGTIKFDALQALVLDEADEMLRMGFIDDVESIMEKTPREKQTCLFSATMPKQIQNISSKYMNNPEQVHISARNSTVSSVEQVFWNASIHKNKAIVRFLEAEQYEGAIVFVRTRNDTVQLAELLEREGFSAAPLNGDMNQQARERTVERLKSGMLNVVIATDVAARGLDVDRLSLVINYDIPQDSEAYVHRIGRTGRAGRTGKAILFVKHNERYLLKNIIRHTNSDIAQVELPTAKIVEEKRIEALQAKLTLALENKDITFFNEVAANMAQKLELSAEDLAGALLCLAQQQSPIKVEEVKIQPRERNERNDRNPRSNDRGDRGRRNERGGERGGERGGERAERKPRERNSRDAGPMDTYRIEVGREHGVQVKNIVGAIANEADISSKFIGDIRLHDNHSTVQLPKNMPKDVLDHFQKVFICKRPMGLTITADQGPAEPRSERSERPAGGEKRSFNKDDSARGDKRSGPRKERRPVSFTTPK >NZ_CP011034|1062879:1073658|1066252_1066699_+|WP_011327682.1|DBSCAN-SWA MRTVDLSPLYRSFIGFDHLASLMDAAASSDKQPSFPPYNIEALDKDKYRITMAVAGFSESELSIESENNTLVVAGIKTGKEQASERKFIHQGIAERNFERKFQLGDHVKVLGADLANGLLSINLEREIPEALKPRKIEIGSGSLIEGK >NZ_CP011034|1062879:1073658|1065515_1065962_+|WP_011327681.1|DBSCAN-SWA MRTVDLSPLYRSFIGFDHLASLMDAAASSDKQPSFPPYNIEALDKDKYRITMAVAGFSNSELTIESENNTLKVSGVKQSKDDSKERKFIHQGIADRNFERKFQLGDHVRVIAADLAHGLLSIDLQREIPEALKPRKIAIGGNDLLEDK >NZ_CP011034|1062879:1073658|1068978_1069434_+|WP_041454374.1|DBSCAN-SWA MTKLEQDLVAMLTPAVEMLGFELHGLEFVQAGRHSTLRVYITHEAGISVDNCADASRQISAILDVEDPITNEYDLEVSSPGVDRLLFKQDHYEQAQGEEVQLRTKLPQDGRRNFKGDLIAVTSDMITLSSDGTEHLIMLSNIERANIIAKF >NZ_CP011034|1062879:1073658|1070997_1073658_+|WP_058372921.1|DBSCAN-SWA MAEVNVEKLAGDIGTTVDKLLQQFSQAGITKQAGESVTEAEKATLLDHLSKQHGGTGSDGPARMTLQRKSKSTLSVTGSTGKAKSVQVEVRKTRTYVKKSAMEQEQEELRLAAEEKLRLEEQQKAAQEAAELKAKQEAERKAKEDADRKAKEEAKRKADAERKAKQKQMTPEQSAKSEKDRIEAERLQKEAEEAALKKAEEEAKRQAEEARKLAEENSARWKKEEEERKKREETSDHHLTTSTYAREAEDVADARDEQGTRRAKKKKKAPAKDKFAASKGRNKGKLKAPTSLQHGFTKPTVDVKNEVRISETITVAELASRMAVKGAEVVKTMMKMGDMVTINQVIDQEAAQLVAEEMGHKVIIVKENELEQKVLNDRHEDGKSEPRAPVVTVMGHVDHGKTSTLDYIRSAKVASGEAGGITQHIGAYHVDVNGNMITFLDTPGHAAFTSMRARGAQATDIVILVVAADDGVMPQTKEAVQHARAAGVPLIIAVNKMDKEGVDPDRVKNELAQLDVIPEEWGGDTQYVHISAKTGLGIDELLEAVLNQSELLELTAPTVGMAAGVVIESRLDKGRGPVASILVQSGTLNQGDIVLCGLEYGRIRAMRDENGKDIKSAGPSIPVEILGLSGIPAAGDEATVVKDERKAREVALYRQGKFRDVKLARQQKAKLENMFSHMTEGDVSEVNVVLKADVQGSIEAISDSLTKLSTDEVKVKIVGSGVGGITETDATLAAASNAIVVGFNVRADASARKVIESENLDLRYYSVIYSLIDEVKQAMSGMLAPEFKQEIIGLAQVRDVFKSPKIGAIAGCMVTEGVIKRSAPIRVLRDNVVIYEGELESLRRFKDDVADVRNGMECGIGVKNYNDVRVGDQIEVFETVEIQRTL >NZ_CP011034|1062879:1073658|1069472_1070972_+|WP_058372920.1|DBSCAN-SWA MAKEILLVAEAVSNEKAVPKEKIFEALEFALATATKKKHGGDIDVRVAIDRKTGDYDTYRRWQIAAVLEDGSLENPYSEITLEAAQVEEPDLQMGDYVEEQIDSIKFDRITTQMAKQVIVQKVREAERALVVEEYKSKEGELVTGVVKKATRDAIVLDLGNNAEAVIYRDDMLPRENFRPGDRIRGLLYEVKPEARGAQLFVTRSKPEMLMELFRIEVPEIGEEMIELRAAARDPGSRAKIAVKSNDKRIDPIGACVGMRGARVQAVSSELGGERVDIVLYDDNPAQFVINAMAPAEVASIVMDEDTHSMDIAVEADNLAQAIGRNGQNVRLASQLTGWELNVMTVEDMRSKNEAESDKLLNLFTENLEIDDEFASLLINEGFSSLEEVAYVPASEFLEIDGLDEETVDLLRSRAKDALTTKALKTEESLDGAEPAEDLLALEGLERHLAFVMASKGVITLEDLAEQGIDELVDITELSPEKAGELIMAARNICWFADE >NZ_CP011034|1062879:1073658|1066778_1068332_-|WP_058372919.1|DBSCAN-SWA MTHFNTLRLILGDQLNPAHSWYKNKQTNTLYVIAELKQETSYVKHNIQKICAFFCAMENFATALNQAGLNVLHLTLNETCNDEDLPALLTRIAAQHQCNTIEYQYPDEYRLKTQLANFANTSPLTVSGVDSEHFLLPFEEIKHRFVKDKHITMEHFYRAMRKQFNILMDSNKPHGGKWNFDSNNRNKFSAADLAQIPPPKLFNNDVSAIIARLNKHNVSYFGKAAEQLPWPTTRKQAISCLDYFCLYLLPYFGQFQDAMTEQSKHNSSLYHSRLSFALNAKLIHPLYVIKRVIAQYEQRPSEISIAQVEGFVRQILGWREYVRAIYWINMPDYATKNQLKAKNTLPPYFWHAKTKMNCMHHALCESLTTAYAHHIQRLMVIGNFCLLTAINPDEVDAWYLGVYIDAIEWVEMPNTRGMSQFADDGIIATKPYAASGNYINKMSDYCKNCHYKLKQKVGDDACPFNSLYWHFMHTHRAKLEKNPRIGMVYKNWDKQEGTLQQSTLQQATYYLNNLASL >NZ_CP011034|1062879:1073658|1064902_1065166_-|WP_058372918.1|DBSCAN-SWA MLTVIFGREGCPFCVRAKDVAEQLSNERDDFKFRYIDIIKEGISKDDLEKSAGKPCPTVPQIFVDQKHIGGFTEFEAYAKENLGLYQ |
8 | Agrobacterium_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1310235 : 1317861
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP011034|1310235:1317861|DBSCAN-SWA TCTATACTCCGTGGTTTAGTTTATTTAGCGCGTCTGTATGCGCTTGGTTAACGCGAGCAACATAATCGCTGCTATCTACGTTGGCTGATTTACAGTGACCTTTAAGCTCTTGCAGTAAGTGCTTATGGTTCAGGGTTAATACTGATTCGTTTTCCGCTGTGGCTATGCGGTCAAAAATAGATGTGTTAAGCCAGGTGATGAACTTTTTGTTAGCCGCTAGGCTGTTCTCTTGCGCCTTTGCTTCAAGCTCAGCTTTTTTGCGGTCTTTTATTTCAACGGCCTTGTTGCGTATATCAATACGATTAAGTGCCGCAGCAAATTTATAAGCCTGGTTGTAATGCTCGCGCATTGTTTCCATGCTTGTAGCTTGCTCGATAGCATCAAGGTACTTATCAAATTTGGCCGATGGCATTGCCCAATCGGGTAGGGCAGGTGGAAACCACTCTGCATCCATTCTAGGGCCGCCCTTATTACCTTTATTTAGCGGTATGCGGATATACTCGCCATTACATTCAAAGCGATTTTGAACCGGTGCGCATGTTGCAAACTCGGTATCAAGCGAGTAAAGGTAGCGGCCAATGCCGAACTGAACTGCGCAGCGTTTCATAGCGCCAGACAAAGCACCCTTTAGCGCTTCAATTGGCGTGTACTCTGAGCCATCCCATTTAGTAATCCAGTTATCACCAAAGCGAACTTTTAAGCCGCACAAGTAACCTTTGCCGGCTGCCGCCTCCTGGTAAATATTTTCCCAGGCGTCAATACCTACAACATCGTCAAGGCGCTGTTGAATAGCGCGGTTGGTGATGTAAGGAATAACCATTACCCAAGGCTTTTGCTTTGCAGTTACGCCGCTTTGCTGAACGCGCCATTCAATATCGTGTTCCTCGAAGGGATCAGCTAATAAGCGCTGTATTTCTGCTGGTGTTTTATTGTTGCTCATTGGCTTAGCTCGCTAACTTAATGTGTGGTGCAAACGATTTATCTTGTTTTTTGTATGCACGAACTTGGTTAAACGCGTTCTCAAGCTGGGCCACTGCATCAGTGTCAGTTAGCTTGATCATGAATGACTTAGCAGATACGTCATTGACGTAAATAAACACGTTAATAAACGGCGTCTGTGCGTTGGTAACTACATTTACATGCACGTTTTCACGAAAGTTGAATGATTCAACTGCAAGCGCTGCAATTAGCGATTTCGCTTCAAGTGATAAAGCAGGGTGTGTTTGGGTTTTATGACTCATATTGATCGCCTGTTTTGTATAACTCATTAAACAATGATTCAAAGTATATTGAATTATACAGTTTGGTCAAGTGGTTTGTTTAATTAATTATACAGTCGAGCTAATAAAAAGCACCTAAGTAGGTGCTTTTATTGTTGAGGAGAGTTGTTGAGGCTATTTATTTTTACATTTATACGCGTCAGCTGAAACGCTTGGGGAGTAACCTCCGTTTATTGAGTGCCACACTAAATGCGTGCCCCCTAAGTCTATGGCTTGCTGTTTGGCCTGTTCTTTAGCATTATTTATACCCGTTGTAGCCGCTAACCCTCCCCAACCAGACGTTCCTGTTACGTTGGTAATGAATTGGCATCCGGTAACTTCACTTAGTACAGTTTCTTTGATTTCACCGATAGCCTGTTGAGAAGCGCAGCCAGCAATAGCGGCCGATATAATTGCAATTGTTATTCTTCCATTCATTCTAACATCCTGAACATTTATTTTTTATTGAATATATTTCTGCAGGACATAGCTACAAGCTTGGCGGCAGTGTCTGATTTTGCGTTTCCTATATTGCTAAGAATGCACTCATTAGCATTTGCAGGGGTTAAATAGGCTTGTATAGCTGCAAAGGCTATTAAGGCAGCAATCACACTAGCTACTATTGTATTTCTAGTCTTTTGATTCATTAGTAACCTCTTTAACAGTAACTGGGTTTAAAAATCCTGAATAACCTGTTTTACCACGCCAATGATAGTGCAGTTTCCATTAATTGGCATGGTTGGGTAGCTGTTATTAAAGGGCTTTAAATATTTGGCCCCGCCATCTATCACTAACTGCTTTAGAGTGGCTTCTTCACTATCGTTTAACATCGCTACTACAACTTTACCATGCTCAGCACCAATGCAAGGATCCACGATAATTACCGAGCCTTCGGGAATTGATTTGCCGCCGGTAAAGCTGGTCATGCTATCCCCCTTAACGCGCAGAGCAAATGCTTCGTCACTTACGTTGGCGGTGTGCTGATAAAAAATAGTATCACTAGTTTGTTGCAGCACTTCCATGTCGATCTCTTTCCATTTACCTGCTTGCACCCATGATATTAAAGGTGCTTTGCCCCTTAAGTCTGGCCCAAGCTCTAATTCCACATTGCCTTCCGGCACTCCTGAGCCTGACGCTAACCACCTGGCATTGCATCTTAGTGCTTTAGATAGCTTTAATAAATTTTCACTTGATGGGATTACTTGGCCTGTCCGCCAGTGACTAACAGAAGCTCGACCAGTCCCTAGCTGTCTAGCAAGCTCACTACCTTTTATTCCAAGTTGGTTCATTCGTGAAATCAAGCGTTCTGAAAAGCTCATGGTGCCTCGCGCATAAAGTTTAGTTATCTATACATTATATTTAAATTGTGTATCTTTGTGTTGAACAATGGTTTCGTATAATCTACTATACAAACATTGCAAACTAAGGAGCGCTCATGAAAACTCAAGACGCAATTGATTACTTTAAAACTAAGGCGGCATTAGCCAAAGCATTTACACCGCCCTTAACGCGAGGCGCTATAACGCACTGGGCCAATGATGGCCACCTTCCTCGTGGTCGCGCTTTTGAGCTTCAGTTAATTACTAAAGGGAAGCTAAAAGTTGACCTTTCGGTTTACGAGACCGAACACCCTAAAACCGCAGCATAGGAGAAACTATAAATGCTTTTATCTAAAAAGAGTACGAGAAACGCTAAGCCTAGCGCTCGATGCGCACTTGAAGCAGCGGCAAGTATTGCGAGTGATTTTAATGTGTCTGAAATTGCGCGCGTTATGGCTAAGTCGCCAACAACGCTTAGCAATAAGCTGAATACAAATATTGATTCGCATGTATTAACGCTGCAAGAAGCTATTGCCATTCAGAATATAACTAATGACAGTCGAATTTTAAACGCCTGGGCTTATAGCGAAGGGAAAACGGTTATTGATTTGCCAGACGTTGGGCTATCTGACGAAGAGTTGGCAGATCAGGTTTTGCATTTGCAAGAAGCGAGCGGCGATTTTGCCAAGTCTGTGCGTTTGTCGCGTGCGGATGGAGTTATTACGGCGAGTGACTTTGATGTTATTCAAAAGCGTTCTTTGGCCGCAATTACAGCAATTTTACATGTAACGGCTGAGCTTGAGCAGATGGTTAGGCCTGATCCTAATAAGCCGGTATCAGCTAAAGCTACAGCGTTGAAGGTGGCGTAATGAGCGATCCGGCAGATGTTGCACAGCTAGACATTGAGCATGCAGAGGCTGTTGCTATTGCGAACGCCAGGCGGCCAGAAGTAGTACCAGCCGACGAATGCATTGAGTGTGGCAATGAGATAAGCGAGGGCCGTAAAAAGGCCATTAAAACCAATTTATGTATTGGTTGTGCAGAAATGCGCGAGTTACGTAGCAGAAACTACGCAACTCGCAGATAAAACAAAACCCGCATCAGCTTTGGTCGGCACGATAGCGGGTTTCAATTTCAACGAGGTAAGTATGAGCAATTTAGCAGAAGTTTACAAGTTCCCTGATAAACGAGGGAGCGAAATTAATCAACATGACACAGGTGGTTATGTGAAAGCAGATATTGAGCAAGGTTATGACAGGCTAGCCCAAAAGCTAACTGACACGCTTGCAAACCCACCGGTGAAGCTAAGTGCGCGCGAGTATCAAATTGTGTTTGCTGTGATCAGTAAAACGTATCGCTGGCAGAAAAAAAATGACTGGATGACTAATACGCAAATTAGCAGCTTGACCGGAATTGATAGTACGAATATCGGGAAAATAATTAAAGGTTTGATCGCTAAGAAAGTGTTATTTCGTGATGGTAAAAACACTGGAATTAACCCTGTTGTTAGTGAGTGGCAAGAAATAGAGACTAGTCAAAACCAACTAAAAACTAGTCAAAAACGACTAGTTAAAAATACCCCTAAAACTAGTCAAAAACGACTAGCTAACTCGTCAAAAACGACTAAAAAACTAGTCGAAAATGACTGCCACATAAGAAAAGAAACTAATACAAAAGATAATAATAAAAAAATAAACAAAAAAAGTTTGCTTGAATCTTTAGATTTTTCTACTTGGCCAGCCATGCCTAGCAATCAAATTTTTGATGATTGGATTGCTATGCGTAAATCCAAAAAAGCGAGCGTTAGTCAAACCGTGATTAACAACTTTGGGGCTCAGTTTCAAATTGCTTTTCAAAACGGGCTCAGTGTCGATGAATGTTTATCCGAGTGCATAACGCGAAACTGGCAGGGATTTAAATATTCTTGGATAGCCAATTCAAATCAAAACTCATCGCAGAGCTTTGGCAGTCAATCTAGGTTCGTTGGCGATCAACTGGCAGCTTTGCAGCATTCAGTGGCCCACATTCCAACTCCGCACGATGACGAGGTGCTTTGATGAACACTCAAGTTTCAACAATCCACAGCGCAGACAAGCGGCAGACTAACGATGTGCTGGTTAAGCTGATCAGCGATGAGGTGTTGCCATCACTAAAAGCGTACTACCCAAACAGTGATTTTAACTGGCGCGGCAACCTTGTTTTATTTGCAAATGAATATGCTGGGCAGCTTTACGGTATGGGGATCATCGCTAAGCACGTAAGAGCTGCGTTAGATATGGCCCGATTACTTTCAACAAGCGAGAGACACGCACCAAACCCAATTGAATTTAAAATTTTATGCCTACAAGCGAAGGGTATGCCAACGCTCGATAGCTGCATGAGCGAGATAAACGAACAGCGCATTAAAAATTACGGAAAAGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP011034|1310235:1317861|1316924_1317299_+|WP_058373095.1|DBSCAN-SWA MINLTLPYPPTVNHYWKSTVKRVAGNKGRVITRVSDEGKAFAEQVFWLVREQKAHKKLKADLKLVIHIYVPDRRRRDIDNLSKSLFDAMQKAGVYEDDTQIKDYRMIHSGIVKGGKVTLSIEEI >NZ_CP011034|1310235:1317861|1311178_1311475_-|WP_058373083.1|DBSCAN-SWA MSHKTQTHPALSLEAKSLIAALAVESFNFRENVHVNVVTNAQTPFINVFIYVNDVSAKSFMIKLTDTDAVAQLENAFNQVRAYKKQDKSFAPHIKLAS >NZ_CP011034|1310235:1317861|1315866_1316190_+|WP_058373092.1|DBSCAN-SWA MTTIKKSTFTQLSAAGEIFCDGFITNAKDQAAKAIQGGAQVNHDAAFGNLTKAVAVLADKNQLDRQMRDVLLTIGAHILVQAQKEAVAAQEGEAKTGPGKKQGKAAQ >NZ_CP011034|1310235:1317861|1313153_1313681_+|WP_058373087.1|DBSCAN-SWA MLLSKKSTRNAKPSARCALEAAASIASDFNVSEIARVMAKSPTTLSNKLNTNIDSHVLTLQEAIAIQNITNDSRILNAWAYSEGKTVIDLPDVGLSDEELADQVLHLQEASGDFAKSVRLSRADGVITASDFDVIQKRSLAAITAILHVTAELEQMVRPDPNKPVSAKATALKVA >NZ_CP011034|1310235:1317861|1310235_1311174_-|WP_058373082.1|DBSCAN-SWA MSNNKTPAEIQRLLADPFEEHDIEWRVQQSGVTAKQKPWVMVIPYITNRAIQQRLDDVVGIDAWENIYQEAAAGKGYLCGLKVRFGDNWITKWDGSEYTPIEALKGALSGAMKRCAVQFGIGRYLYSLDTEFATCAPVQNRFECNGEYIRIPLNKGNKGGPRMDAEWFPPALPDWAMPSAKFDKYLDAIEQATSMETMREHYNQAYKFAAALNRIDIRNKAVEIKDRKKAELEAKAQENSLAANKKFITWLNTSIFDRIATAENESVLTLNHKHLLQELKGHCKSANVDSSDYVARVNQAHTDALNKLNHGV >NZ_CP011034|1310235:1317861|1312167_1312782_-|WP_083497501.1|DBSCAN-SWA MNQLGIKGSELARQLGTGRASVSHWRTGQVIPSSENLLKLSKALRCNARWLASGSGVPEGNVELELGPDLRGKAPLISWVQAGKWKEIDMEVLQQTSDTIFYQHTANVSDEAFALRVKGDSMTSFTGGKSIPEGSVIIVDPCIGAEHGKVVVAMLNDSEEATLKQLVIDGGAKYLKPFNNSYPTMPINGNCTIIGVVKQVIQDF >NZ_CP011034|1310235:1317861|1316625_1316928_+|WP_058373094.1|DBSCAN-SWA MSLISKKIRNSARGQECQVRIPSVCNRNNETVILAHVGKGSGMGQKCDDIHATYACSACHDVIDRRVRQDNASEVQVYAYEGMVRTQKLLLEQELIRVAK >NZ_CP011034|1310235:1317861|1313960_1314869_+|WP_058373089.1|DBSCAN-SWA MSNLAEVYKFPDKRGSEINQHDTGGYVKADIEQGYDRLAQKLTDTLANPPVKLSAREYQIVFAVISKTYRWQKKNDWMTNTQISSLTGIDSTNIGKIIKGLIAKKVLFRDGKNTGINPVVSEWQEIETSQNQLKTSQKRLVKNTPKTSQKRLANSSKTTKKLVENDCHIRKETNTKDNNKKINKKSLLESLDFSTWPAMPSNQIFDDWIAMRKSKKASVSQTVINNFGAQFQIAFQNGLSVDECLSECITRNWQGFKYSWIANSNQNSSQSFGSQSRFVGDQLAALQHSVAHIPTPHDDEVL >NZ_CP011034|1310235:1317861|1312928_1313141_+|WP_058373086.1|DBSCAN-SWA MKTQDAIDYFKTKAALAKAFTPPLTRGAITHWANDGHLPRGRAFELQLITKGKLKVDLSVYETEHPKTAA >NZ_CP011034|1310235:1317861|1316186_1316639_+|WP_058373093.1|DBSCAN-SWA MSKKVLTVTNVQYLMPQVGKAIRDILKQGKNVVVEFKEHKAKRSLAQNRLLWVWNQEIANHFREHFGQENSSEDVHEVFVRKKFGVKVIQAGNEEPIIVRKRTRKLNTKEFCEYLNWMEQYCAEYLELMLPQPDDLYHLAMYGEANNVAH >NZ_CP011034|1310235:1317861|1317300_1317861_+|WP_058373096.1|DBSCAN-SWA MQPIKLLSKLTTKTLNLTGTFGGSGQDVIDWRTAAHALAGLPSCQTNWAYFRYVGEETRLNRVIRSLTMHITLFIKIKRYKVKPETLNGIVMSAVYEFVQPVCGECDGSGLAPGQVATNLDAQICIKCHGRGRKPVSTRSRCKIIGIGHKSYTDSHDDITKELLRLIAGWESDIFKNIRVKMGEVA >NZ_CP011034|1310235:1317861|1313680_1313899_+|WP_058373088.1|DBSCAN-SWA MSDPADVAQLDIEHAEAVAIANARRPEVVPADECIECGNEISEGRKKAIKTNLCIGCAEMRELRSRNYATRR >NZ_CP011034|1310235:1317861|1311628_1311931_-|WP_058373084.1|DBSCAN-SWA MNGRITIAIISAAIAGCASQQAIGEIKETVLSEVTGCQFITNVTGTSGWGGLAATTGINNAKEQAKQQAIDLGGTHLVWHSINGGYSPSVSADAYKCKNK >NZ_CP011034|1310235:1317861|1311948_1312140_-|WP_058373085.1|DBSCAN-SWA MNQKTRNTIVASVIAALIAFAAIQAYLTPANANECILSNIGNAKSDTAAKLVAMSCRNIFNKK >NZ_CP011034|1310235:1317861|1315443_1315857_+|WP_058373091.1|DBSCAN-SWA MKSYEQDQKEFIRALKEILGVHYQSALADAKQARLAALQGIKNPTPKQLGFATAEANRAMARAAKACGVDSVPQYIKDKKEQGRNHYASQARTKQTARQSNIKANPGNFTSSKVPANQGYSLNAELEKTFNNARKTA >NZ_CP011034|1310235:1317861|1314868_1315447_+|WP_058373090.1|DBSCAN-SWA MNTQVSTIHSADKRQTNDVLVKLISDEVLPSLKAYYPNSDFNWRGNLVLFANEYAGQLYGMGIIAKHVRAALDMARLLSTSERHAPNPIEFKILCLQAKGMPTLDSCMSEINEQRIKNYGKDKDWSEPLVYWLNQQIAAARATLTDSAWKKMAKNRYTELADKYGKGELGPIPLKIEYNALPAYLRYAGVGR |
16 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1321269 : 1362274
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP011034|1321269:1362274|DBSCAN-SWA 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30 | uncultured_Mediterranean_phage(88.0%) | capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_4 |
1419035 : 1450984
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP011034|1419035:1450984|DBSCAN-SWA AATGGCAATCAGTGACACCAAATTAAGAAAGCTGCTAGATAAAAATCAAACACCGTGCGTATTATCGCATAGAGACAGTTTAAGTGTAAGAGTATCAGCCAAAGGCACAATCACTTGGCAGTATCGTTGTCGCGTGGATAACAAACAAGTAATAATATCGCTTGGACGTTATCCAGGGCTAAGTATAAAAGAAGCGCAAGACTACATACCACTACTTCAAAACTGGCTAAGCCAGGATAAAGACCCACGAACCGAACTAAAGCTTATGCGTAACCAAGCCAAAGGTTTGCCAACAATGGCAAAAGTGGCAACCGACTGGTTAAATAAAAAAGTACCCGACCTAAAAGAAAAAACCCAAACTTTATACACAAACCAAGTGGGCAAATGGATAGTGCCGCTTTTAAATGACGAAGCAATGCCACTCGACCTAATGACCATAAAAGACTGGTTTATTTATTTTGATAAAGTTAAAGAGCAAGGCAGCGCCAAAACTGCCGGCACAATATTAGTGCGCATAAAATCAATAATAGGCTGGGCCGAAAAACGCGGTGAAGCAAAACCATTTAACCCAGTACTAACCTTAAACGTAAACGACGTAGGCGAACAAGCAACAATAGGCCAGCGCGTAATGCGCTTTGATGAAATAGCAAAACTGTGGATACAAATAGAAAGCTCAAAAGCCACGCCAGCTACCAAAGCATGTTTGCAATTAATTTATATAACAGGCGCTAGGCAATCAGAAGTTCGCTTGGCCAAGTGGGAGCATTTCGACTTTGATAACAACATTTGGACAGTACCGCCCGAAAACTCAAAAACAAACCAAGCCATACGCAGGCCAATATCTAAAAAAATGCACAGCATATTAAATACACTTGCCATGGTTTACGGCAAAAGCGGCTATTTAATACCGGGCAATAACCCGCGCAAACCAGTAACCACCCACAGCATAAACCGTTACTGCTGCAGAATGTGGGATCACTTGTTTACTAAGTACAAAACACCCAAGTTTTTACCACATGACGCCCGCCGTTCAATATCAACATTACTCAGCGAAAACGGCATAGCGCCACACGTAACAGAAAAAATGCTAGGCCACACAATGCGTGGAGTAATGGCAATTTATAACAAACACGACTGGATAAAAGAGCAGGCTGAAGGGTACGAACTATATTGCCAATTCATAGATAAGGCGATAGAAAATGAATTTGTAAAGAGCAATTAACTTTGAATCATAAAGTGTAGTAATATCAAATAGTATATAGTCGGAAAAGAGGTTAAAGTGTTGTTAACTTCTAATATCTCTCGTTAAATACTTACTGTAAAGGAATATGTAATGAATTACCTGTTTTCAGCTATAGATCCAAGTTATGTTCATAAAGATTTATTTGGGATTGGAGCGATTTTTGATTTAGAAAATGGTCAACAGGGATGGAGTGAAATTCAAGATATAACAGTCGGAGATAAAGCCGCTGTAATTAATGTGAAACGCAATATCCCAGTTCTATATGAAGTTACAAAAATCGAAAAGTCAGATAAACAGATCGTCGTTTTTGGAAGAGTGATAGACAGAATTGATATGAATTATGAAAAGTTTATTCGCCAACATAATATTACTAGCAGTCGTATAAGTTCCAATCATCAGATGATGCAAGGCTTTAATTTGGCTATATGGAAATAAACCCTAACAAAATAAATCTATAATATTTATTTGCAAATGACAGTGATTTTAAATGATCCATTGTGCTTATATATTAGGTAGATAATTTTAAGTCTGTAAATAATTTTTATTCAATTAATTAAAATCTTAGGAGCTACTTTGAACAACAAACTTATTGGTGACTCGGGCGAATACTTCGTCTCATATAATTTATCCCGAAGAGGGTTATCTTGTGCTCTTATGAACAATGGAGCAAAAGGCGTAGATATTCTTGTTACCGACGATGGAAAAAGCGTTGTTAGCATTCAGGTTAAAACCTCTCAAGGAAAGTCTCAGCCTAGACAGTGGATGGTTGGAAAGAACGCGCCGAGTGCTTCCAATAATTTTTTCTTCGTTTTTTGTAATATTTGGAAGGATTTCGACAAGGCCCCTGAGGTATTCATTATTCCTAGTCAGTACGTCAAAGATAATGTCAATTGGGACTCCACAGCCCCCTTATTTAAGATAACACCAGAGGTTGCAGATAAGTATCGAGAAAATTGGGAACAAATACTTGCACTCTTTATCTAAATGTAATTGATTAATATGCTGGTTGTATTGACCCACTAATAAAGGTAGCAAACTGTGGTATATCCATATTATTAATTATAAATAGATAACTAAAACATTTAACAATGTGTTGATATATTAAGGGATTAAAGTGTCGTCGAGTGAAGAGCAATTAGATAGACTGTCTGCAGCCGCAAAAAAAAATAATAACATTACCGAGAAAATAGTTGAGAGAACAGTCACATTTTCTCAGGTTTGGTTTACTTTAATAGCACCTATCATAATAGGTGTTGCAGCTACTTATTTCACTTCTGATAAAAAAGATGATTTAGGCGGTTTAGTAATCGCACTTATTTGTATAGTCATAGTTGGTTTTATAATAGTACATATTTTTCTATCATATATAAGCCATGAATATAGTAAAAAAGAGTCTTTATATGCTGAAATCGTAGACATGAAGCATCAAAAAGATCAAGAAGTTGGAAAATTAAGAAGTGAGTTAGCACAAAATAAATTAGGTCTTAGGAGGATAACTGATTTATATAGCAATCAAATATCAAGCCTTTACTTATCTGCGCATGCTACAGATATAGCAATAGGTGACTTAAAGAAAATGGAAATTGATGATAAAAATGTCACAGAAGATGATTTTTGGAATAAAGTAACAACCTCATTAAGTCCAATATTGCAACCACTTATTATTGAACGAGAGTCGTTATTTGGCTTCAAATCTGAAGGGAAGTATAATGTGGCTTTATATTTTTATGATGCTGACGATGATGATTTAGGTATTGTTTGGAGGGATTGTGATAGCCGCTTACCTCAAAGGAATAGAAATTGGAAACCAGGGCATGGACATGTTGGGCTAGCATTTTTACACAAAGAGGCAAAGTTTTGTCCTGATATCACAATGAGTAGTGAGCTTAACCCAAGCTATACGAGTAGCGATGGTTCTAATTATAGAAGTTTTATATCAATACCTATACTTAGATGTGATGATAATGGAGAAATGCTTGAAAATGATATGAAGCCGTTAGGAGTATTAGTTCTAACGAGTGCTAAACCGGAGCAATTCATAAAAGAAAGAGATTTGCGCTTTCTTACTATTATTTCTAAGCACCTTGCCATATACTTATCATCAGTAGAAACATTTTTAAGTCACAATGTGTTGATTGAAAATGATGCAGAATAAGGATGGGTAGATTTATGAAAGAAAAAAATAATGTTAAAAAACAAAATCAAAATCAAAGTAATGCTTCTACAGAATCTTTAAGTATGTCTCAAGGTCTAGAGCTAATTAAGGCTATCAAGAACGAGCCCTCTAAAGTAGATGAATGGTTTAGTAAGCAAAGGTTAGAGATGCACAAGTTTGCCAATACCTTAGTTAATTAATATAGCCCGCCAAGCGGGCTTTTTTGTGCCGGTATAAATGTCACCTCGGGCCAAACGGCCCAACCTTGTTTTAACCTTAACGGTAACTTAGTATATAAGTTTGCAATATTATGGAAAATAAAAGGATTAGGCATGTTAAAAATTATTGGTTGGGTATTAGGTATTGTAGCAATTGGCTTTGTGGGTATGTACTTCGACAAAGGCGAGTTTTTAGCCGGGTTCGTTTGTGTGCTAGCAATTGGTTTTTTAATACCGCCGTTGTTAAATAAAATAAATAAAAACAGCAAAGAAAGCGCAGAAAAAAAAGGCAAAGAATATAAAGAGCTAACGCCAAAATCCAGTATCATCGGTGGCGTTGTGTTGCTTATAATTGCAGCTATCATGGGTAATGGAAGTAGCAACAATGAACAAGTAGCATTACCAAGCTGGTATGACAGTAGCGCAACAGAGCTAGTATCAAAAAAAGCATCTGATTGGCACAAAGCAACCGACTCACAAAAGCTATCAGCAAGCGCAGATATAATTTATACAGTATGGAAAGATGGTAAATTAAAGCCAAAAATCAGCAATAAAATTAAAAGCGTTGACGACATAAAGCCATTTGCTAATGGCCTAGCAAAAGAATTAGATAAAGCTTTTGATGGCAGCCCATCAGAAACAGGCGCTAACCCAGCCATTAAAGAAGGAGCTGTTACGCTACTAGTTCTTAATGGATGGATATAAATAAACACCAAACAAACAGCCCGCACTTAGCGGGCTTTTTTGTGCCTGCAATTTAGCAAACTAAAACGACTTACCTGCAAATATTATTTTACCTACCAACGTACAGTTGCCGTTTATTGCTATTAGTTGTTCTGGCCAGTTAGGGTTAGCTGCTTTTAAAAACTTTTGGCCGCTTTCAATTATAAGCTGTTTAAAGGTGGCTTCGTTGTTGTCATCTAAACGCGCTACTACGTACGAACCGTGTATGCACTCGGCTTCAGGGTCCACAAAAATTAAATCGCCCTCATAAAATTTAGGCTCCATGCTCACGCCTTGCACTTTCAATACAAACGTTAGATCACTGCAATTAACTGGGCACATAAAGCGTTCGGCATCATAGGCTTTAATTTCGCTAATTTCAGACCATGCACCTGCTTGTACCCAGCTTATAAGCGGGGCAGTTGCCTTAATTGCTGGTCCTGGCGAAACGTTACTATTTATGTTTTCAATTACACCAAATTGCAAAAATTCAGGAGTGCACTGTAACGCTTTTGCTAGTTCATTTATTTTTTTAGTAGTTTTAGTTGTTCCATCTTCAATCCTTTGGAGTGATTGCTGAGCTATCCCAATCATTTCTGAAAGCTTAACTTGAGTTAAATCTAGTTCTTTTCTTCTTTCTTTTACTCTTTTTCCAATGCTC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>NZ_CP011034|1419035:1450984|1433877_1434795_+|WP_058373186.1|DBSCAN-SWA MAKQTGWVIAATEGATVDGRIISKEWINDMAASYSVDEYTALIWPEHFRSSWGPTEGKNWGQVDEVKAAKKDGKLRLFVKITANDYLLAANKDGQKLFMSIEPNPDYKSEGRCYLQGLAVTDSPASSGTSRLKFSIGDNEVNHEYSQLEALQHSDFITTNSEPTAPNSKQAKAQSLMAQLFSLFSSDQQPADQQEPSTEEEPMNKEQFDALMGKFEGLDAKVTDLETKFSKPAEEPEVKPEPTPEPEIKPEPATGVTAEQFSQLMDKMEGFGKKVDGIETKFNALSQEQNGQEPDPVGGETVSLV >NZ_CP011034|1419035:1450984|1426585_1429072_+|WP_058373179.1|DBSCAN-SWA 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MLGATLNNKLIGDSGEYFVSYNLSRRGLSCALMNNGAKGVDILVTDDGKSVVSIQVKTSQGKSQPRQWMVGKNAPSASNNFFFVFCNIWKDFDKAPEVFIIPSQYVKDNVNWDSTAPLFKITPEVADKYRENWEQILALFI >NZ_CP011034|1419035:1450984|1441873_1442140_+|WP_058373197.1|DBSCAN-SWA MKQTITLTIAGTDFKFNMTVQDHSDFVDSVARGGSMTAASHNMVMRTIGDEQKEELKKVLESSPGSELQIASMLKTEFSPVLEITVKK >NZ_CP011034|1419035:1450984|1437294_1437744_+|WP_058373189.1|head|DBSCAN-SWA MSFGFEATAQSSIAIDETSGWPALSTGEFRAHRRIPEFYEETVIADSLNRSALEVQQQLLKYIMKENTDVAFTLTNAVPNFNTAQQSVYRGAVYARSHSDLMGYFSSVDQKDAGNNKADDVDQQDAILAQSNRSIRLLLGLGRAGVHLL |
42 | Pseudoalteromonas_phage(81.82%) | integrase,tail,portal,capsid,terminase,head | attL 1409118:1409133|attR 1439335:1439350 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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