Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013723 | Listeria monocytogenes strain Lm 3136 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas3,DinG,WYL,csa3,casR | 0 | 1 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013723_1 | 2754766-2755350 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013723_1
|
7 spacers
spacers of NZ_CP013723_1
>1.1|2754805|39|NZ_CP013723|CRT TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG >1.2|2754883|39|NZ_CP013723|CRT TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAATCTTGAGGTGCTG >1.3|2754961|39|NZ_CP013723|CRT TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG >1.4|2755039|39|NZ_CP013723|CRT TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA >1.5|2755117|39|NZ_CP013723|CRT GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG >1.6|2755195|39|NZ_CP013723|CRT CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA >1.7|2755273|39|NZ_CP013723|CRT GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAAGTGGAGAAGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013723_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013723_1 >merge|NZ_CP013723|1|2754766-2755350|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATGTGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTGGATGTAAGTCATTTTGATACAAGTTCAGTAACTAATATGTCTTACATGTTTTATGATAATAGAAATCTTGAGGTGCTGGATGTAAGCAACCTTGATACCAGTTCAGTAACTAATATGTATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTGGATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATGTATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTAGATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATGGTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTGGATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATGCGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTAGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGGCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAAGTGGAGAAGCTTGATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG >NZ_CP013723|1|1|2754766-2755350|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATG TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG GATGTAAGTCATTTTGATACAAGTTCAGTAACTAATATG TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAATCTTGAGGTGCTG GATGTAAGCAACCTTGATACCAGTTCAGTAACTAATATG TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG GATGTAAGTCATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATG TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA GATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATG GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG GATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATG CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAAGTGGAGAAGCTT GATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG
>NZ_CP013723.1|WP_054314226.1|2752318_2753857_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVELLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLASFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELRERNLSISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVTYSGDRWPFSFVQYDEITDLLESCPKEIYRANSIDKGMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEITYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASERVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINRFNNIVPGYTDLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMRLLKPFEERLASDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIVYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKD >NZ_CP013723.1|WP_031665242.1|2749948_2751499_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIEHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGMAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIAEMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NZ_CP013723.1|WP_003721245.1|2748855_2749956_+|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTNSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NZ_CP013723.1|WP_009911497.1|2747571_2748855_+|cytosine-permease MTENKTVEQAQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVVFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPILLFVCIYGLVVSLNNGGLAVVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMIAVGAILALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAIAGGLGTVLAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVPGVNWLGVTSWLVGAVIAGIPVILTFFPALPQLPNQPLIGIILSLAVYLVGAKVLSGKTNNVENLEGK >NZ_CP013723.1|WP_047932815.1|2745842_2747438_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEARVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIREDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKIDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHSSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERIIEASKQIGEHELVQLHLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGVLTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRNNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMAQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKSLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRLLGGNNNNK >NZ_CP013723.1|WP_003721242.1|2744739_2745687_-|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NZ_CP013723.1|WP_054314227.1|2743586_2744735_-|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLASRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRSFVKNTYHDGDLIDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPATFGKVRARQQVVYPLFKKQFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPNVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEENGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCMDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEQANLLSRWERETK >NZ_CP013723.1|WP_054314228.1|2741430_2743590_-|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTATWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHVVMIIIVSGIYYAKGGILAGNWLGSFFQITFNSFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRIMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIATPNRISADSLKRNGLFYHGFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPIPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSGDVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSSDYMPYPYGTQAVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIESYLSTSGTFTYSTDDAKETPMGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTPDKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETATSNVEIPSWVWWIPAGLVVALLALAIVFRRRIRGYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFGTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQVYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NZ_CP013723.1|WP_003721239.1|2740558_2741314_-|DUF4866-family-protein MTTIFPKEQNVTPLFEQILANPTACRRFKDVFLDNLESYQETRGFEKDDTLFAKIILSAYRQSDVSALLLGVCGRTLFELLRQAFLIPKKLTVDNPFFLTDKEGNFIAKKDDISNREQEKFQEIYQSDLHHSETTIFLVDDDDIVHSYEPDFSISTKRINKKRGILVLYSLPNTLKLEMTESEVYAFIWKTFLHIQEIIPSSRIFYGQETSENADELGVFLPIHHFEKKMLQNIEQVNELVDALREQMVNK >NZ_CP013723.1|WP_010989471.1|2739872_2740538_-|DUF1275-domain-containing-protein MARTRQISESIGLGLLLALAGGFMDAYSYIERGQVFANAQTGNILLFGINISEGNWAIAIQYFWPVVSFTVGIALSEVIHRRDIRRLHWRQLSVLIEAVILIGVAFIPLDHNLIANSLISFVCGIQVESFRKMHGRGVATTMCIGNLRSATQNLCDYFEYKEKQYLHNSFLYFSVILSFIIGAVVGNFFIQLFAQYAILVCAFLQLIAFMMMFIDRESKII >NZ_CP013723.1|WP_009931585.1|2756243_2756717_+|hypothetical-protein MKKKKVVVISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDPSAVEWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWRSDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NZ_CP013723.1|WP_009931584.1|2756736_2757222_+|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVIFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELERVGATSDVITSSFKSNNSTVTMANPVIGSFSGYAIEETEVSKIQIGSPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NZ_CP013723.1|WP_003733941.1|2757249_2757555_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFLLSPERVQASQTVVEVFISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQHMLPKAGDTVTNYTLLGLVLVLIWLIMQRKRKKKE >NZ_CP013723.1|WP_003721255.1|2757630_2757897_+|transposase MARIEYGEEIQKSLLVLYSRGSTIDSICKEYGIPRYEFHKWMKLHDADKLETKEVKTLLQIRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NZ_CP013723.1|WP_010989429.1|2758437_2758722_+|DUF3130-domain-containing-protein MREIKVDERTFQQHATKLASESTGSYLPLKNGNMAYSKANSIDQLRSALIELVDVVEDFQHVTKKDASRLKKMGIAYAKQDQLMGQKINQLEVR >NZ_CP013723.1|WP_031671594.1|2758722_2759091_+|hypothetical-protein MDSAHSQLEQQLQQIKKAKITAETDADQTRRKQNEQDWLEEDSNQLTQEKRVLLDFLRSGWQGEEASGFHRYLEEQQHEESQAWRRDLQDKRTDLDKELQENKDKLHTLETKQATLQKEWSK >NZ_CP013723.1|WP_077310202.1|2759087_2760464_+|hypothetical-protein MSRIDIAELNDFLHGLRSSNAEAKAMIRKIKEAAMDYAQDNSLKGEAVSTSKRYFSSTYKSICQSIIEALDESEERLAQYIREFGSQVDSSPSARIDAEILQEAMAKVSQLQRKEEDLHRQLTAPNTKPDMQQVYAVKSRSVHTQLLKAIEQENILEKYLAFEQSHGQFFSALDELIRATARAVQELLHHVSFNDKTGTYSVPKSAANSLLLMKKARDKARKENDKDPYPKAFEDYTVLAYTYVNDQGETVTMWLLEKDGKRVENKELQDFLEKHGQELDPLLYTNLSGEELERKVNDSWKEGINYLNGQKVSGVSGATLRSSAYVASMKDWTDDAGLTDMALGLGFGIAAARNKVIIPKKTSTAKSSGKDIFNYTDKVNEHMANLDRAVPVQTLKEAIKGGIPMPDPRGSRATMYYSEIYINGKKYNFEVLYDNTTNTIYHFKYDRRPLGPLSAISK >NZ_CP013723.1|WP_003721260.1|2760485_2760758_+|hypothetical-protein MTKKEQLYFLLNGLDNGEIEINNFTNQFMKIFDLEIDYDELSKEEYTILGNVSDMAARFSDSEEDLKLPNVYYSEKQIREEVTRSLEALA >NZ_CP013723.1|WP_003721261.1|2760785_2761133_+|hypothetical-protein MQKDTYNGIRLSVIQLIDSKKENLKENNIKLTIIKNEKDGYVVELDNDKCMAEIVVEEPTYAPYRYISFEVVSLMDGKVKIIYSWYDDETSQWSDIEKELNKGIQFLNNFKTMEQ >NZ_CP013723.1|WP_003733213.1|2761536_2761779_+|hypothetical-protein MKRIILTSTLIVWTIVCIYMSISMVSNNTGIAFPIWLHIILLICFLATSIVNVKKKEYLWSTMLFEGELVVLLSLIIVLV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013723_2 | 2793937-2794225 | Orphan |
I-A
Consensus repeat of NZ_CP013723_2
|
4 spacers
spacers of NZ_CP013723_2
>2.1|2793966|36|NZ_CP013723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA >2.2|2794031|36|NZ_CP013723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC >2.3|2794096|35|NZ_CP013723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA >2.4|2794160|37|NZ_CP013723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013723_2
The CRISPR arrays of NZ_CP013723_2 >merge|NZ_CP013723|2|2793937-2794225|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATCGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTAGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATTGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGCGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATGCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAAGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAATTTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGCGTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT >NZ_CP013723|2|1|2793937-2794225|PILER-CR GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT >NZ_CP013723|2|1|2793937-2794225|CRISPRCasFinder GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT >NZ_CP013723|2|2|2793937-2794225|CRT GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT CGATAAAAAAGATATTAGTAATTTATTTGCAATTTA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TGCTCTCTTTTGTGTAAAGCACATCAAGCATGTAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT GCGATTTTTGTCAAAGGGACAGCGATGGGTTACAA GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATGTAAAT TTACCACCAAAGTCCCTACACTCAATACCACCAAAGC GTTTTAGTTACTTATTGTGAAATATAAAT
>NZ_CP013723.1|WP_003733190.1|2792763_2793699_+|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MAGKMKLFSVTSERPLATKIADYLDIPLCEVELQKFSDGEVKINIEESIRGTNAYVVQSMNSNVNERLMELLIMVDALKRASVHSINIIMPYYGYARQDRKARSREPITAKLMANLIQRAGANRLITVDLHAAQIQGFFNIPIDHLSAIPLIGDYLIENYGEKDVVVVAPDHSGVVRARRIADRLNAPIAILNRKPRPHEDEIMSVIGDVKGKVAIVVDDIIDTGVRATTSADILLEKGAVEVIACATHSVMAGNATERLQNSNIKEVITSDSIDLPEDKQFDKLTTISIGRILGRAIEGVQENRSLHPLF >NZ_CP013723.1|WP_003721294.1|2791352_2792624_+|PTS-galactitol-transporter-subunit-IIC MDIILDFFKYIIGLGVTVMMPIIITILGVIFRKKISVAFKAGLTVGVGFVGLGVITSLMLTTITPVTKALVENYNFKLTATDIGWGVGSSLAWGTEVVPFVFVAIIATNILMIAFKWTKTMDVDIWNYWQPLFIASALYLTTGSMIIAVLSSIINMAIIFKIADWTQKDVEDVLGLEGISLPQIQTTGWALVGYPMNWLLGKIPGVRKINWSTEKVQSRLGIFGEPMLMGLIIGGGLAAIAQMPLSQVLQTGVTIAASLVLIPRMVSLLMDGLTVISEAAHEFMEKRFPGRELFIGLDSAVGIGHPFVLSLGLLMIPITLILAFILPGNKVLPLADLTALPFYMIFAIVPSKGNLFRGIFTGIVIVIITLYLSGAAAPLMTELAGQIGYNIPKDAVEVTSLAVGTQWYTWIVYYGLHWFGGIL >NZ_CP013723.1|WP_003721293.1|2791044_2791338_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIB MKKKRIYVCCGTGIATSTVISKKVRAVLDEKRIPYEISQCTVQEVASKVSTSKPDIIVSSTTVTGDVGDVPVVIGRSFLTGLKKQETIDEILAILQD >NZ_CP013723.1|WP_009930756.1|2789982_2791029_+|galactitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKALKLYGKRDLRYEEADMPTIEEPDDVILKVKTVGICGSDISRYSKLGPYVPGMVWGHEFSGEVIEVGSEVTDIEIGDRAAGCPALYCGECEYCKKGEFARCRKLTVIGARHPGAYAEYIKLPAENVVKIPNELDYEAAALVEPSAVVVHGFYHTKLQAGDDVVVVGSGNIGLLAIQWAKVFGARRVIAIDVDDKKLALAKEVGADVVINSLKEDPLEVVAAHTDGLNADLVVEAAGSPITSAQVFAYAKKGGGVVFLGIPYADVTIERFYFEKIVRSELTVWGSWNAISAPFPGKEWQTTIHFLANKQINIEPMITHRLSLAEGPEVFERIYERNEFFGKVLFFPE >NZ_CP013723.1|WP_003721291.1|2789335_2789986_+|ribulose-phosphate-3-epimerase MAKIVPSVFGADIGRINEQLQVLEKNDIDLLHVDMMDGSFVPNIAFGPDQIKMMKKGTKLQFDVHMMVYEPDRYIPRLVEAGAHMITVHQEATTHLHRTIQLIKSYGVRAGVVLNPGTPPSTLEYVLDDIDCILLMTVNPGLGGQKFFQSSLEKIRKTKAYIGNRPIQIEVDGGVNDELAKECTLAGADLIVVGSYLFEGDIEANLEKLAKGVLTE >NZ_CP013723.1|WP_003721290.1|2788926_2789325_+|hypothetical-protein MGSFFASFVDWLIGSPGRFVVNLIEDNMLIFMVVVMIYATTILYAKWTLAYYLPKKMSQLAEMKTWELDELYAAWQTEKKALPWYILVPSRNEFWVKSARNAPESTKLLHFSQQKLKLSDKEKLQKIIEIQS >NZ_CP013723.1|WP_003733191.1|2788442_2788910_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MDVLEYFKEEMVRFSNEQNKEKLLAEMAEQLCEVGAVKPSYKDAVIKREKVFPTGLLTAHAGVAIPHTDSEHVIRPVVAVRILKKPVSFIEMASDNEAIDVRIVFMMALRSADEQLDMLQTLIQLIQDEEVMTTLLKAQETGDVLSAIEHFSKNN >NZ_CP013723.1|WP_003733192.1|2787812_2788415_+|SIS-domain-containing-protein MDKQAILNNIHQTWQEEANAISRLPEVTSEEALVKTVEKIAECTGKIVVAGCGTSGVAAKKLVHSFNCIERPAVFLTPSDAVHGTLGVLQKEDILILISKGGNTGELLNLIPACKTKGSTLIGVTENPDSVIAKEADIFFPVSVSKEPDPFNMLATASTMAVIASFDAVIVCLMTYMNYTKEQFSVIHPGGAVGNKLLNK >NZ_CP013723.1|WP_010989498.1|2785748_2787809_+|BglG-family-transcription-antiterminator MYLDNRSKTLFQEVIKNPNITNKQLEVKYKLSRYQISYSFQKVNEWLKWKNYPEVKRSKNGRFILEPELTALFSEKETRDPSVEYLPSENERANLILLMLLTSKEELSLAHFTTKIQVSKNTILRDLKVAQKLLPKETTVTYSRASGYQLAGSEWELRKVLTQVVSSVKEMFRGEHYFLSYSGIEKVQLMEIRRTLEEAEAMMQIKFTYEQIELLPYLLSVMFLRIRDRRLIDTAFHIDEKSLSDTREYHITDILLEKTGPVPEQERLFITLQLLTTNIFSGEILTEKLTEDLEKVVLTCLDLFEKKALVSLKNKHILIEKLLLHLKPAYYRIKYQMNLEDTLYEKFNQEFEALNFIVKEAFDPLAKFIGREIPAGEIFFISLFIGSDMIPQNDIYHKQKRAIVLCPSGVTFSKIMENILVKLFPEIHFYPTISVREYAFFKAEVDIVFSSIPLKDGENVFVVQPFMNDIEKTQLRQHVLQNLFGMGNQLTSIDKIMEVVERNADIKDPNAIRDGIIDILSANIATDENKRVKKVYLHDLITEDNIMICEDVKNYQEAIRLASQPLLLQQAITANYVKTMIDNHKFHDPYIIIGEDIAIPHAMPNAGVNRLAMSLLVVKNGVYFSETEQVHFVIVIAPVDKEQHIEALYQIVHLAENHQILDDLLENVTKEKIMQTINQLVIREDE >NZ_CP013723.1|WP_010989497.1|2784989_2785640_+|transaldolase MHLDSANLDDVKKIQASSIFKGITTNPTILVKEKCNRQTAINRILELTDKQVFVQTVGFTYEEILADARMLLTMFGKDKIAIKIPAHEAGTNVIDTLKKEDKTIQILGTAIYSADQAITAALAGADFVAPYVNRMSAANIDPFKEITQMRHFFDKKALKTQIMAASFKHSGQVMQAYESGADTVTIPYEIYSQMTNKVLAVEAIRVFNEDAVLYEK >NZ_CP013723.1|WP_012951247.1|2794484_2795063_+|hypothetical-protein MKKILVPILLLATILASCSSPNEKITKDTKISKTNTIRADYKVPKDIKELEDDSANIVKVKFLQNKTIGKDGSTISEIEILTSYKGNLEKGSKVDISEPWYLSDGKYVAVENYIALDKEQEYTIFLGEKDKDTYPLSSLGYGKFGGSLKEDQAVLADFNILGEVQKFDFISENTEEVKNYQLIKEQVAGKYK >NZ_CP013723.1|WP_003721297.1|2795169_2795850_+|type-1-glutamine-amidotransferase MIIDVLQHVPHEGPGLIANWARENQHQLKIHSLFEENAHVPNDSDFLIVLGGPMGINDTAEFPWLKDERKLIKRLSEQHKPVFGVCLGAQQIAATFGSEITVNKEKEVGWFPVKRTSDKLLFFPESLNVFHWHQDTFALPTGSTRLFASEGCLNQAFLYGENIIGLQFHFEMEKAGIETILRIDEAFITPGKYVQSVEVMREKDVPEDNKQMLEAILDYLINPKTI >NZ_CP013723.1|WP_003721298.1|2795874_2796234_-|hypothetical-protein MEQILFIQTGFGVDVHGQNITKAAERAVRNAIFTNSMPGIQGLLPDGDLQNMVVNIKLALPCDADQLDEDTIRAIIPYGTVTIEKMAGGMMTTSGIFLEDKEDKNDLMYIVNASVETGY >NZ_CP013723.1|WP_009932856.1|2796240_2796699_-|MarR-family-transcriptional-regulator MNNEQNMNQQIALFYFGYKAFTETADLIIAKHSLKRLHHRILFFTARMPGLTINELLTFLEISKQALHQPLAELKERELLTIEQGRRDKRQRCIFLTSAGKELENELGAAQRKQMSEIFTNSADTDGMHFTEVMEGYAKNRPGAAFIKDFKE >NZ_CP013723.1|WP_054314221.1|2797080_2798916_+|lmo0514-family-class-1-internalin MKKALKLFLATICMFIMIYPSTAAHAEETNIVNIPDANLKTYLNGLLKQASDAPITKTQMNTIQTVTLSGSTYTDLTGLEEAGNLVTLSINNTNIQTLEPIKNQTSLTYLTVGGDNVKDSLFVDLNGLVNLQSLSINGSEVTHNVFKTFNKLPKLTYLYAQNSMKITDISALASLPALTTLFLQFDGIDDFRPLNDFESFKNGNLKALAAFGQNTGRTNPRITLKSGKLDYNETNQTLYLPFSMMPKPLTSFDGTVAPFSKSTSASNTYLGFNDVALPSARLSITEDGITVSGVTKEEFDNLDEIEYNARYDFPTGSYPTPPSMNSYTISSGTYDQYFDISHTLDLTADESFDYNQYDATSEEQFLKDVHAETDDGTAVKSDFDQVVKLNVPGEYTVTLNAENAAGLKATPVTVKVTVHEKPVITSDSQISYKKETTKSVDEFLKEIHGSVTGNAVLTSDFDKVVDLNTPGEYTVTLNAINDRGQKADPVTVVVTVTTSDSGHVDPVPPTPEIKPTPQEETDQTIIPEPQSETTEDSVKEDQAKDGQAKSEEKADKTSLTTKENKVEKSEKTNQPKTKALPQTGDTNKTALPIAGVMLSLAALLIFRKSKS >NZ_CP013723.1|WP_003721301.1|2799016_2799448_+|universal-stress-protein MEKYHRILVAVDGSEPAKLAFEKGLELALKLDGVLGIASIVDLRAFSPNVSYDGSLEEKAELELKTSVNEYAEKARTAGVKQVETFVAKGNPKILLSTDIPAEFQADLIICGATGMNRVEKLVLGSVSSYIMAHAICDTLIAR >NZ_CP013723.1|WP_003721303.1|2801044_2801860_-|histidine-phosphatase-family-protein MKKNIFKLLMALCAVLLIAGCGNSTSADKKETKETKEDGTVTFYVVRHGKTMLNTTDRVQGWSDAVLTPAGEEVVKSAGKGLKDVDFSAAYSSDSGRAIQTANLILKESDKSADKEVQTDPRFREFNFGSYEGDLNENMWTDIAKSQGKTLEEWQKAGLSPKDFANSVAALDKTRVKEGENWPAEDYATIQARLKEGLTDVAKKESKNGDSNVLLVSHGLSIGALLDTIEPGYKLPAEGIKNASVTKITYKDGKFTIGDVNDLSYVEKGSK >NZ_CP013723.1|WP_003727296.1|2802140_2802509_-|DUF1304-domain-containing-protein MAILAFILTFIVMIEHIYIMILEMFFANTKLAAKTFGVEKELLANKKVQTLFANQGLYNGFLAAGLVWGLFFAGAGFAETVQIFFLSCVVVAALFGGATSSKGILVKQGLPAVLALVAVLLV >NZ_CP013723.1|WP_009931218.1|2802655_2804071_+|multidrug-efflux-MFS-transporter MQQEATGGQKIRPIPIIASFLMAGFIGLFSETALNMALSDLIQVFDISSATVQWLTTGYLLTLGILVPISGLLLQWFTTRGLFFTAVSFSIAGTLIAALSPTFAMLMIGRVVQAVGTALLLPLMFNTILLIFPEHKRGSAMGMIGLVIMFAPAVGPTISGLILENLTWNWIFWISLPFLIIALLFGMKFMQNVSVVTKPKIDILSIILSTLGFGGVVFAFSSAGESGWGSATVLVSIIVGGIALGLFVWRQLTMEKPLMDLKVFKYPMFTLGLILVFISFMMILSTMILLPLYLQNSLALAAFSAGLVLLPGGVLNGLMSPFTGRLFDAYGPRALVIPGFIVAVVALFFLTRIEVGTSALTIIVLHSVLMIGISMVMMPAQTNGLNQLPPKLYPDGTAIMNTLQQVSGAIGTAVAITIMSAGQKAYMETAQGVGPEQMVASLTAGIQNAFVFGLIMACIGLLCSLFIRKAK >NZ_CP013723.1|WP_045131588.1|2804202_2805207_+|ROK-family-transcriptional-regulator MAIPRDLKELNKKNIKSILRQQGAMTKAEIAEVTGLSVVTVNKLIRDLVENEEILEQDNSVATGGRRAVSYEINPNFQQVLVISLQEKWKKITYSFSVYNLLGEPEFVEDMSGEDLDITALKRNTKDIICAFPKISCVVIGVPGIEIGGKLRAMDFPLLLNVQLRETLEAEVNLPVLVETDTNAAILGYKNRPVKEENIVGLYYPERFPPGAGLLMNGEILKGQNGLAGEIKHMPLQVDWDNFDFSVDEIKAHIRKMALLTMSFYDPETIVLYTNFYFGQKDFMEELKEELKQVYPYAVLPEIVLSRKFTTDYRIGLLAFGIDYLENNMTDWRI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013723_2 | 2.3|2794096|35|NZ_CP013723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2794096-2794130 | 35 | MH341453 | Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome | 10139-10173 | 1 | 0.971 |
NZ_CP013723_2 | 2.3|2794096|35|NZ_CP013723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2794096-2794130 | 35 | NC_009813 | Listeria phage B054, complete genome | 10139-10173 | 2 | 0.943 |
1. spacer 2.3|2794096|35|NZ_CP013723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MH341453 (Listeria phage PSU-VKH-LP041, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
gcgatttttgtcaaagggacagcgatgggttacaa CRISPR spacer gcgatttttgtcaaaggaacagcgatgggttacaa Protospacer *****************.*****************
2. spacer 2.3|2794096|35|NZ_CP013723|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009813 (Listeria phage B054, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
gcgatttttgtcaaagggacagcgatgggttacaa CRISPR spacer gcgatttttgtcaaaggaacggcgatgggttacaa Protospacer *****************.**.**************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
465468 : 472891
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013723|465468:472891|DBSCAN-SWA AATGAAAAAGGTTATTACATATGGAACATTTGACTTGCTTCATTGGGGGCATATTCACTTATTAAAGCGCGCTAAGGCTCTTGGTGATTATTTAATAGTAGCAATTTCTTCCGATGAATTTAATCGAATTAAACATAAAGAAGCTTATCATAGTTACGAACACCGTAAATTAATTATTGAAGCAATACGTTATGTGGATGAGGTGATCCCAGAGAATAACTGGGAACAAAAAAGAGATGATATAGAGAAATACGGAATTGATGTTTTTGTAATGGGTGATGACTGGGAAGGCGAATTTGATTTTCTAAAAGATGTGTGTGAAGTTGTTTATCTTCCTCGAACAGAAGGGATTTCTACGTCTCAAATAAAAGATGAACTAAAATAAAAATGTGAGAGGAGCATTCTTTTGGAACCTTTAGTAAGTGTAATTATTCCAGTTTATAATGTAGAAAAGTATGTTAAACGATGCTTGGATTCAGTTCTTGAGCAAACATATCATAACCTCGAAGTTATCGTAGTTAATGATGGAGCGACTGATAATTCAGCTAAAGTCATAAAAAGTATCTCAGATAATCGAATTCGTTATTTTGAAAAAGAAAATGGCGGACAAGCTACTGCCCGAAATTTTGGATTAGATGTGGCTACGGGAGATTACATCGTGATGGTAGATAGTGATGATTACATTAGCAAAAACCTAGTAGAAACTTGTTTGGATACTGTACAAAAAACGAATGCTGATTTAGTCTTGTTTACTTCATATAATGTGAATCAGGAAGGAAAAATGCAGTATATAAAGCGTGATAAAGGCATCAAAGTTTTAGATGCAGGTCCAACTCCATGGAACAAATTTTATCAAGCAGATCTATGGAAGGGTTCGCGTTTTCCAGTAGGTTATTGGTATGAAGATCTAGGAATTATTCCAGTCGTCACGCTAAAAGCAAAAAATCCAGTGAAAATCCAGGACGCACTTTATTACTACATAACTGATAGAGCGGATTCACAATCGAATATTCAACAAGTAGATCACTTTTTAGATGTGGTTATTATGTTGGAAAATGTTGAAACAGAATTAAAAAAACTAGGTATTTACGAAGAATCAAAAAATCAACTTGCGTACCTATATATAGAACATCTAATTTATCGTTTAGTTTTACGAAAAGCGATTTACATTACTGATAAGCAAGAACGTAAAAAACTTATTAAGAAAATTAGTACAATTATTCAAGAGAAGTTCCCTAATTGGGGTAGTTATCCTTATCAAGCGGGTGGAAAACTAACGGCAACATTAAAGAAAAAAGCATTATGGCTTTATTTACATCATTTGTACTTGTTGGGTGATTTAGTATGGAAATATCCATTTTCTATCAGAAGTAAGCAAACAGGGTTTTAAAGGAGGTTATCATTTTGCATAAATTAAGTGTGGTCATTGCCGTATATAATGTTTCTGAGTATATAGAAGCATGTTTAACATCAGTCTTAGAACAAAACTACAAGAATGTGGAATTAATTATTGTCAATGACGGTTCAACTGATGATACCTTTCAAAAAGTAGAAAAACTAGTAGACGGACATACGAATGTTATTTTGATTGATCAAGAAAACCAAGGTGTTTCTGCTGTCCGAAATAATGGTGTAAAAGCCGCTACAGGTGATTATCTAGGCTTTGTCGATGGAGACGATATCATTGCTAAAGATATGTTTCAAAAAATGATGGATTCTTTTGAAATGTCGGATGCAGATATGGTAACAATTGGTGTGGCAAGACTTTCAGGAGATAAAGTATACCCTTCTACATTACACGAAAAATATATGGTAGAAAAAAAAGAAGCCACAACAATTGAAGAAACACCGGCACTTTTATATGATACTACTTCGTGGAATAAAGTATTTAAAAAATCTTTTTGGGATAAACACCATTTGGAATTTCCAGAGGGCCAAATGTATGAAGATATCGCATTAATGATTCCAGCCTTTTTGTATGCAGAAAAGGTAAATATTATTCCTGATGTTGGCTATTATTGGCGCAGTCGCGAGGGTGGAGCAAAATCAATCACTCAAAGACGAAATGACATTGCCATGGTGAATGATCGTTTACTTGCTTTGAAAAAAGTAAATCAAGTACTTAATGAGAAAAATATTCAGGGTGATTTAAGATATCAAAATGAACGTAAAAACTTTGAAATTGATTTGTTTTCCATGATTGAATGGGCATTTTTAGCGCCGAAGGATTACTATTTGGCTCTTCAACCACTTATCAAAAATTATGTTGAGCAAGAAATGAAAACAACTGCTTTGAATGATATTCCAAAAGAAAAGAAACGACTTTTCAAAGCTTTGTTAGCAAATAATCGTCCGGCTTTTCTCCTAAATAGTTACATTTATTTTGGTAAGAAAGCTGTGAAAAAAATAACGAAATAAGAGACAAAGGACAAAATACTTCGGATCTTTAGTACACTTGTAAACAATTGATTCAAGTGTGCCATTGCATCATTAGAAGTACTATGTCTTAGGCTCTTTTTTTGTTAGTAACAGTTAATTTAATAGTGAATCTACCTTTTATATGCTATGATAATTGGTATATAATAAGTCAAATTAATGCTTATAAAAAATGATAGGAGCAGAAGAAATGACAAATTTATTTCAAGATGATAGTCTAACGCTGCATACAGACTTATATCAACTAAATATGATGAAAGCGTATTTTGACGATGGACTTCATGAGCGTAGATCGGTATTTGAAGTGTTTTTCCGGGATATGCCATTTGATTCGGGTTTTGTTGTATTTGCTGGACTGGAACGAATTATTCATTATATGCAAAATTTACGTTTTACAGAAACGGATATTGCTTATTTACACGACGAACTTGGTTTTGATGGACCTTTCCTCGAATATTTACGTAATTTTAAATTTAAAGGAAATATTCTTGCTGCAAAAGAAGGGGAATTTGTTTTTAAAACAGAGCCAATTCTTCAAGTAGAAGCAAGTCTAGCAGAAGCACAATTAATCGAAACAGCTTTGCTTAATATTGTGAATTTCCAAACGCTGATTGCAACAAAAGCGGCGCGAATCCGTTCTGTTATTGACGACGAAACGTTTGCAGAATTTGGTACAAGACGTGCACAAGAAATGGATGCGGCTATTTGGGGCACACGAGCAGCTTACATCGGCGGTTGTGATTCGACAAGTAATGTTCGCGCTGGGAAGATTTTCGGCATACCTGTGTCTGGTACGATGGCACATGCGATGGTTCAAGCTTACCGCGACGAACTAGAAGCATTTAGAAGTTACGCAAAAACGCATTTTGATTCAATTTTCTTAGTAGATACATACGATACGCTAAAATCTGGCGTACCAAATGCGATTAAAGTGGCGAAAGAAATGGGCGATAAAATTAACTTTATCGGCATCCGCCTAGATAGTGGCGATATGGCTTTCTTATCTAAAAAAGCACGCCAAATGTTAGACGAAGCTGGCTTTACAGAAGCAAAAATCTTTGCTTCAAGTGACTTAGACGAACATACTATTTTATCCCTAAAAGCGCAAAAAGCAAAAATCGATTCTTGGGGCGTTGGCACAAAACTAATCACCGCGTACGACCAACCAGCACTAGGTGCCGTTTACAAAATGGCGGCAATTGCTGATGAAAATGATATTTTACAAGATTCGATTAAACTTTCAAGTAACACCGAAAAAGTGTCGACACCTGGTAAAAAGAAAGTTTACCGGATTATTACGAATGAAGATGGCTTGAAAGCGGAAGGCGATTATATTGCTTTAGCGGACGAATCACTCGAAAATGTCGATAAACTAACGATGTTCCATCCAGTTCATACGTATATTATGAAAACAGTCGAGAATTTTACCGCGCGTGAGCTACTTGTACCGATTTTCCAAAATGGGGAACTTGTGTATGATATGCCTTCACTAGATGAAATTAAAGCTTATAAAGAAGAAAACTTGGCGCTACTTTGGGACGAGTACAAACGAACAGTTCGTCCAGAGCAATACCCAGTTGATTTAAGTGTAAAATGTTGGAAAAATAAGATGCGTAATATCGAAAAAGTACGTAAAAGTGTCCAACTTCATTCACCAGTTGAACTAGATATGCCGTTTTAGGAGGAATTATAATGGAAATCAGAGAAAGAATTTTAGCAGATATGCAAGTGGCAGAAACGATTGATGCACACGAAGAAATCCGAAAAAGTGTCGAGTTTTTAAAAGCATATTTAAAAAAGAATACGTTCTTAAAAAGCTTTGTTCTTGGGATTTCTGGGGGACAAGATTCGACTTTAACAGGAAAACTAGCACAGATGGCGATAAGTGAAATGCGAGCGGAAACGGGTGACGATGAGTACCAATTCTTCGCTGTGAGCTTGCCATACGGAACGCAACTAGATGAATCGGACCGTCAAGATGCACTGAACTTTATGGAACCAGATAATCGTTTAACCGTAAATATTAAAGCTTCAGTGGATGCGAGTGTTGCGGCGCTTGCGGAAGCGGGAGTGGAACTATCTGATTTTGCTAAAGGAAATGAAAAAGCGCGCGAACGGATGAAAGTGCAATATGCGATTGCGGCGATGCATAAAGGCGTAGTGGTTGGAACCGATCACTCCGCGGAAGCAGTTACTGGCTTTTATACGAAATATGGCGACGGGGGAACGGATATTAACCCACTGTTCCGCTTGAATAAAAGACAAGGCAAGGCGCTTCTTAAAGAGCTCGGCTGCCCAGAACATCTATATTTGAAAAAACCAACAGCAGATTTAGAAGATAATAAACCGGCACTTCCTGATGAGGTCGCGCTTGGTGTGACTTATGACCAAATTGACGATTACTTGGAAGGCAAAGAAGTTCCAGCAGATGCTGCGGCAAAAATCGAGAACTGGTTTATTAAAACCGAACATAAACGCCATATGGCAATTACTATATTTGATGATTTCTGGAAATAGGAGGTTGTTTAAATGAAAGTTGGTTACGGGTTATTAACTGCATTTTATACACATCCAGGAGAAAAAGACAATTTAGTGAAAATTTTGCTTGAAGCAGCAGAGGCTTTGGATGATTACAACACGTGTATCCAATATATCGTCAGTGAATCTGAAACCGAGGCAGATACGGTGTTTGTTTCTGAGATTTGGGTCGACAAAGGGCATCATGCAGCATCACTTGATAACCCAGCAGTACAAGAAATAATTGCGCGCGCCAAACCGATGATAAAAGAAATAAAACAAATACAAGAATTAGACATACTCGGTGGAAAAGGCGTATAATTTTAACAACAAGAATGATTCTGGGACTTTCCTGGAATCATTTTTTTGGAGGGATGACAAATGCAAACGTTGATGATTGTTTGTGCTGGCGGTGCGACGTCAAGCTTAATGGCACAAAATGTCGTGAAAAGCGCGACGTCAGAGGGAATGGACGCAGTTTTACTATTTCCTGATGATGTGAAATATAAAGATAGTTTTCTCGAGAAATATAGCGAGCGGGATTTAGTTGTTGTCATGGGTCCAGTCGGCGCAATTACTGCTGGGAAATTCCGTGACTACAAAGAACAAGTCGATGCAGTTTTAGTAGCACCACAAGTAAAATATATGTACAAAACAGTGGAGGAAGTATTAGGCGAACTAAATATTCCTTGCGCTAATATTGATTCACTCGATTTCGGTCGGATGCGCGGCGACAAGATTCTCACACAAGGTCTAGCCTTAATGAACGCGAAAAATTCCAAATAAGGTGTTGCAACTTTAGAGGGGAAACGTTAAAATGAAAGAAGATGAAAAGGACAAGTGATTTGTCCTTTTCTTATATTATTGTGAAGTAACCGCGATTTTGCGGTTTCATTTTATAGATAAGGGTGGTTTTGTTTAAAATTATGAAAGACTTTACCGAGCAAGAGAAAATTATCGTTCTAGATTTTGGTAGTCAGTACAATCAACTAATTACGCGCCGCATTCGTGAATTCGGTGTGTACAGTGAATTACATCCGCATACTATTACAGTTGAAGAAATGAAAGCACTAAATCCAACGGGGATTATTTTTTCAGGAGGACCTAACAGTGTGTATGACGAAGATGCCTTCCGCGCTGACGAAAGAATCTTTGACATGGGAATTCCAATTTTGGGAATTTGTTACGGCATGCAATTAATGACAACGCACTTCGGTGGCAAAGTAGAACGTGCGAAAGACCGCGAATACGGGAAAGCGGACATTCACGTTGAGAAGCCAAACCGTTTATTTGCTGGACTACCAACCGATCAAGTTGTTTGGATGAGTCACGGCGATTTAGTCGTTGAGGAGCCTGCTGGTTTTGAAGTAACAGTTACTAGTAAATCTTGCCCAATTGCAGGTATTGCGGACGAAGAACATTCACTTTACGGCGTGCAATTCCACCCAGAAGTACGTCACTCCGTTTATGGCAACGAATTACTGAAGAATTTTGCATTAAATGTTTGTGGCTGTAAAGGCGACTGGACAATGGAAAACTTTAGTGAAGTAGAAATCGCAAAAATCCAAGAAATCGTAGGCGACAAAAAAGTCTTGCTTGCACTTTCTGGCGGCGTAGATTCCTCTGTTGTTGGTGTGTTAATTCATAAAGCAATTGGCGACCAACTAACATGTATTTTCGTTGATCATGGCCTTCTTCGTAAAGGGGAAGCTGACCAAGTAATGGCGACATTACAAGGCGAGTTCAACATGAACATCATCAAAGTAGATGCGAAAAAACGCTTCATGGACAAACTTGCTGGCGTTTCTGACCCAGAACAAAAACGTAAAATCATCGGTAACGAATTCATTTACGTATTCGACGATGAAGCCAACAAACTAGACGGCGTAGAATTCCTAGCTCAAGGAACACTTTACACAGACATCATCGAAAGTGGTACAGCAACTGCCCAAACAATCAAGTCTCACCACAATGTCGGTGGTCTACCAGAAGATATGCAATTTAAACTAATCGAACCTTTAAATACACTGTTCAAAGATGAAGTTCGCGCACTAGGAACAGAACTTGGCATGCCTGACGCAATCGTTTGGCGCCAACCATTCCCAGGCCCAGGCTTAGGAATCCGCGTTCTTGGCGAAATTACGGAAGAGAAATTAGAGATTGTCCGCGATTCTGATTACATCTTGCGTGAAGAAATCAAAAACGCAGGTCTAGAACGCGAAATCTGGCAATATTTCACAGCACTTCCAAATATCCGTAGCGTTGGTGTTATGGGTGATGGTAGAACGTATGACCATACTGTGGTTGTTCGTGCGGTGACGAGTATTGATGGTATGACAGCCGATTGGGCACGTATTCCGTGGGATGTACTGGAGAAAATTTCGGTACGGATTGTGAATGAAGTGGATCATGTGAATCGTGTTGTTTATGATATTACGAGTAAACCACCAGCTACGGTTGAGTGGGAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013723|465468:472891|465873_466857_+|WP_026749861.1|DBSCAN-SWA MEPLVSVIIPVYNVEKYVKRCLDSVLEQTYHNLEVIVVNDGATDNSAKVIKSISDNRIRYFEKENGGQATARNFGLDVATGDYIVMVDSDDYISKNLVETCLDTVQKTNADLVLFTSYNVNQEGKMQYIKRDKGIKVLDAGPTPWNKFYQADLWKGSRFPVGYWYEDLGIIPVVTLKAKNPVKIQDALYYYITDRADSQSNIQQVDHFLDVVIMLENVETELKKLGIYEESKNQLAYLYIEHLIYRLVLRKAIYITDKQERKKLIKKISTIIQEKFPNWGSYPYQAGGKLTATLKKKALWLYLHHLYLLGDLVWKYPFSIRSKQTGF >NZ_CP013723|465468:472891|471334_472891_+|WP_077944318.1|DBSCAN-SWA MFKIMKDFTEQEKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELHPHTITVEEMKALNPTGIIFSGGPNSVYDEDAFRADERIFDMGIPILGICYGMQLMTTHFGGKVERAKDREYGKADIHVEKPNRLFAGLPTDQVVWMSHGDLVVEEPAGFEVTVTSKSCPIAGIADEEHSLYGVQFHPEVRHSVYGNELLKNFALNVCGCKGDWTMENFSEVEIAKIQEIVGDKKVLLALSGGVDSSVVGVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEADQVMATLQGEFNMNIIKVDAKKRFMDKLAGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEANKLDGVEFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRALGTELGMPDAIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRDSDYILREEIKNAGLEREIWQYFTALPNIRSVGVMGDGRTYDHTVVVRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >NZ_CP013723|465468:472891|466871_467885_+|WP_026749862.1|DBSCAN-SWA MHKLSVVIAVYNVSEYIEACLTSVLEQNYKNVELIIVNDGSTDDTFQKVEKLVDGHTNVILIDQENQGVSAVRNNGVKAATGDYLGFVDGDDIIAKDMFQKMMDSFEMSDADMVTIGVARLSGDKVYPSTLHEKYMVEKKEATTIEETPALLYDTTSWNKVFKKSFWDKHHLEFPEGQMYEDIALMIPAFLYAEKVNIIPDVGYYWRSREGGAKSITQRRNDIAMVNDRLLALKKVNQVLNEKNIQGDLRYQNERKNFEIDLFSMIEWAFLAPKDYYLALQPLIKNYVEQEMKTTALNDIPKEKKRLFKALLANNRPAFLLNSYIYFGKKAVKKITK >NZ_CP013723|465468:472891|468093_469584_+|WP_003721509.1|DBSCAN-SWA MTNLFQDDSLTLHTDLYQLNMMKAYFDDGLHERRSVFEVFFRDMPFDSGFVVFAGLERIIHYMQNLRFTETDIAYLHDELGFDGPFLEYLRNFKFKGNILAAKEGEFVFKTEPILQVEASLAEAQLIETALLNIVNFQTLIATKAARIRSVIDDETFAEFGTRRAQEMDAAIWGTRAAYIGGCDSTSNVRAGKIFGIPVSGTMAHAMVQAYRDELEAFRSYAKTHFDSIFLVDTYDTLKSGVPNAIKVAKEMGDKINFIGIRLDSGDMAFLSKKARQMLDEAGFTEAKIFASSDLDEHTILSLKAQKAKIDSWGVGTKLITAYDQPALGAVYKMAAIADENDILQDSIKLSSNTEKVSTPGKKKVYRIITNEDGLKAEGDYIALADESLENVDKLTMFHPVHTYIMKTVENFTARELLVPIFQNGELVYDMPSLDEIKAYKEENLALLWDEYKRTVRPEQYPVDLSVKCWKNKMRNIEKVRKSVQLHSPVELDMPF >NZ_CP013723|465468:472891|465468_465852_+|WP_003721506.1|DBSCAN-SWA MKKVITYGTFDLLHWGHIHLLKRAKALGDYLIVAISSDEFNRIKHKEAYHSYEHRKLIIEAIRYVDEVIPENNWEQKRDDIEKYGIDVFVMGDDWEGEFDFLKDVCEVVYLPRTEGISTSQIKDELK >NZ_CP013723|465468:472891|470801_471206_+|WP_003732712.1|DBSCAN-SWA MQTLMIVCAGGATSSLMAQNVVKSATSEGMDAVLLFPDDVKYKDSFLEKYSERDLVVVMGPVGAITAGKFRDYKEQVDAVLVAPQVKYMYKTVEEVLGELNIPCANIDSLDFGRMRGDKILTQGLALMNAKNSK >NZ_CP013723|465468:472891|470432_470741_+|WP_023549061.1|DBSCAN-SWA MKVGYGLLTAFYTHPGEKDNLVKILLEAAEALDDYNTCIQYIVSESETEADTVFVSEIWVDKGHHAASLDNPAVQEIIARAKPMIKEIKQIQELDILGGKGV >NZ_CP013723|465468:472891|469595_470420_+|WP_003727000.1|DBSCAN-SWA MEIRERILADMQVAETIDAHEEIRKSVEFLKAYLKKNTFLKSFVLGISGGQDSTLTGKLAQMAISEMRAETGDDEYQFFAVSLPYGTQLDESDRQDALNFMEPDNRLTVNIKASVDASVAALAEAGVELSDFAKGNEKARERMKVQYAIAAMHKGVVVGTDHSAEAVTGFYTKYGDGGTDINPLFRLNKRQGKALLKELGCPEHLYLKKPTADLEDNKPALPDEVALGVTYDQIDDYLEGKEVPADAAAKIENWFIKTEHKRHMAITIFDDFWK |
8 | Hokovirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
604805 : 664296
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013723|604805:664296|DBSCAN-SWA TTTATTTAGCTGCTTTACTCGCGGCCGAAATGACTAAAACTTGTTTCAAACCTTTACTAATAAGGCGTAAGATAACAAACCAAACAACAAAGATTAAAACAATTTGTTTAAATGCAATTGCTGGAAGCGGATTGAACGGGCAATCCCAAACGAAATGTAAAGCAATCGGAATAATAAACCATTTCCAGAAAGTTCCTGTGAAAATGTGGTGCATTCCAAGTTTTTGATCACCTTTAGCGATAACAAGAGCGGCACCAGTAATAGCAGCCCAGACAACATGTCCACCGATAGACTGCCAACCACGGCTAAAGATAACATTGATCATCGTTTCACCGGCAATATGAATATCTTTGAATAAGAAAGCAGCATCCACACTATAGTTAAACGCATAACCAAGTGATTCAAATGCAGCAAACCCAGCTCCAACAGCGGCACCGATAAGTAAACCATTTAAAATGTACTTTGAGTTTAACGAACGAATAAAGAGGGCAACAATAATCATTTTCCCAGTTTCTTCAATAAAACCAACCAAAAGGGCATTAAAATAATTTAATTTTCCAACTGGAATAATGGAGTAAATAACAAGTGTTGCAACAAGCGCTGCTACACCACCGATAAAGAACATTCTCACTACATCAAAAACGCTGATGTTACGAGGTGCATTCGTTTCGAAAAAGAATAATAAGACAGAAAACGGAACTGCAAATGAACCAATTACCATAAGGCCAGGTATTGTATTACTGTTATCAAACAAATATGTACAAGCTAGAAGTAAAAAATAAGTGATGATTAACACTAAGAAAACTCTGGAGAATACCCAAGGATGCGGCCAAGAATGAGGGATATCACTCGTTGCTGGCGTAGTATACTTAGTACCAGCGATAAAGACTTTTTCGCCTTCTTCTTTCGAGTGCTTTTTAAAAACAGCAGAGAAAAGGTTGCCAATTTTTAATTCTGAATTCCCGTGATTCAAAGCATGTTGATGCAATTCTGTTTGTTTAAATGCGACCCACTCTGGATGAGGGGATTTTTGGACCAATGTAAGATTATTAATCTCTTTCTTTCTATATAGAGCAATCATCTCTACATTTGTAAAAGGTCCAACTTTCTGTTCGTTCTTTTTGAAGTACCATTCTGACAAATGAAACTCCCCCTTTAGCTTTTTATTTTGACTCCATTAATTATTCCCAAAAACGCTAAAAGTTAAACGAGCGAAGGGAATTAATCGTTTATTTTCTTCGCTTGTTCGTAAAGGAAATTAATTGAATCAGCTAAAAAAGCTGCTGCGGACTCATTTAGTGGTTGTCCATCTAAATTTAAATCATCCTCATATTTTAAATCTTCACTAATTTTAGTTATTCTTTTTCCAATATCTTTCTCGTTTTGGAATTCACTAGGAGCATATGTTGGGATACTTTGTTGTCCAAGTAAATAATCGACACTAACATCATAAAGTGTTGCAATTTGAGTCACCATTTCTAAATCTGGCTCCCGAATACCATATTCCCAATTGCCATAAGTGGAAGGTGCTTTTAAACCAAGTCTTCTAGCTGTTTCTGCTTTTGACCAACCTTGTTTTTCCCGTAATAAAGTAAGTCTGTTACTTAAATTTGGCATAATTTCACTCCTTTTTGTTTGATTATACAATATCTTACTCAGTTTAGCTATATTTTAACACATAACGTATTATTTTGTGATTGACATAGTCGTATTGAGTTGGTAATATTGTATTAACAACTCAAATTGTGTAGATAAGGAGAAGATGACATGAAAACAGTAGACACCAGAAGAATTAATACAACAAAAATTCGAGAATTACGATTGCAGCGAGGAATCACCCAAGCTTTCATTGCGCGACGGATGGGCTATAGGTACACATCAGGTTACAGTAACATTGAAAAAGGAACTGTTAGACTATCACACAAAAATGCTGTTATTCTAAGTGAAATTTTAATGTGCGATTTGAAATTCTTTTATGAATAACTAGACACGGGATAAAAATGTTAAATAAAAAGATTATCTTTTTAACAAACGTTTTATGGAATTTATTTAAAATGAATACACACAAAGTGTGTGGAATAAGAGCGAAGGAGAAAACATCATGAGGAAAAAAACGTTAGCAGTGTTTCTTATTTTTACGGTGTTAGTTGCATTATTAGCGCCAACTAATGCAAGCGCATATACAAAACTTGGGTATGTGATGACAAAGTCTAGTGCAAAAAATTTTAAAATTTATATTAACGGTTCGGCGAAAGGGTTTAAAAATATTATTATTAGTGGCGCAAAAGCCTGGAACCCATCTCCCTACTTGAATACAGTAAGCATAGGGAACGATGTCAAACCTAACTATACGGTTAGTAGTTCAGGGACAAACAAGGGAAGTGTTTTGGCGGTATGCAACACAACTTACTACAAATCAAATAAATTGATCTCCAAAAACGAGATCACTTTGTACAAAGGTTTTCGTTCGCTTTCAACTAACCATAAAATAGAAACTATTGTACATGAATTTGGACATGGCTTTGGCCTAGGGCACGTGAAAACTAAAAATGCAATTATGTTAGACAAAGGGTTTATAAATAAAACAAAACCTCAAACAGACGATTTCAATGGCATCAAAGCTTTATATAAGTAAAATAAGGAGGATTGACAATGAAGAATAGGATTACAATGATTGCAGGTATAGTATGCCTTAGTATTTTAACTGCTTGTTCTAGTAGTGAGAGTGTGAAAGGAACGACATCAGAAGAACAAACAACATCACAAAGCGGAGCAGAAATGATAAAAGCAAATAACGGGGTTGTCTCTTACCACGGAAAATACCTCAAACTTGCTGAAAATATGGATAACCTTGAAAAAGATGCCCCAATTATCATTAAAGCAACCAAAAAATCCGAAAAAACAACTGTAACAAAAGAAACAAAAGAAAATGTATTTCCAACCGATTTTTATACGATGAGCGATGTGCAAATAAATTCTATCGAGAAAGATACAACAGGAAAATTGAGTGAGAATATGACTATTAAAGTGTTGGAGTATAGCGTGGAAAATGTTTTGGTAGAAGGAGAAGAATATGATTTAACTATTGATGGCTATAAAAATATGGAAAAGGGAGAAGAGTATACGCTTTTCTTAGAAAAAAATCCAGATGGTGACAATTATATACTATCAAATGCAGTTATAAGTAAATTCCCAGTGGAAGAATTATCTGAAGAAGAATTGTTCTTAGATGGCGGGCAAGCAACAGAAGAAACAGATAGCATAGAAGAAATTTATCAGGAAGTCTATCAAGAAGTTTTGGAAGAATACAGTGAATAAAAAGTTTTAACGCCCGCAAGACCTCGGTGTAAAAATCGAGGTCTAATTTTTTTGAAACAAAAATTTGATAAAAATTGAAGCTTAATCTAGACAATTTTTCGTAATAAAACACCATAAAAACCTCTTGACAGAAGCAGACGATACAAGTAGAATGAATCAAACCAAATCAACATTTTTTGCTACAAATGGTTAGATTTTTAACAATAAGGGTAAATCCAGTTAGTATAAATAAAGCTTTTTCAAATAAAAGGAGATAAAACGATGAGTGGAAGTGGTGCTTTTTTTCCAATGAGTGTTAAAAAATTTCTGGAAAAAGGGATTACCTCGTTGTCCGAAGAAGAAAAAATGAGTACGCTGCATTATTTGGAGAATGCGTATCATCAAGAGCCTTGCAACGAGGAAATTGTACATAGATTAATTCAATTTTATAATCAGACAGATAAAACGAAGAAAGCGCAAGAAATCGGCCAAAACTTTTTGACGATGAATGGCTATAATAAGGAAATTCTTGGAGAGCTATCTGTAACTTTTATGAAAGAAGATAATATGGATACGTACTTTACATTAGTTAGGCATTATATGGAAGAAGAAAAAAAGAAGCAACGGAAGAAATAGCTGATAATGTTATTCCTTTTCCCAAACAGTTTGTTCCAAGAAGAGATATTCGTGAATTTGCGTCTTGGCAGACGACGGAACAATTGGAGTTTTTACAAGAAGCTCGTTTCTTAGAAATAGATTCCTTTTTGTCAGCATTTAAAGATTTTCTAGCGGATGACACTTTTTCCCCGTTTGTTCAGTCGATGATTTTCGAATTAATGCAAGAAAAAGAAATAAATGAAGATGTTACAGTCCGAAAAATAGATAAGCATGGTACCTTTAATCCAAGTCTTGTGCCAATGCTTGCTGATAACAAATTTGCGGAAGCCATTTTTGCTGGACTTGCTGAGATGCTCGAACATAGTAATCCAAGCCTTTTAGAGCAAGTGATTGGAATTATACAGCAACATCTATTTATGCTTTATCCTTTTGAATTAGAACCTCGGGAAGTAGATGTTTGGGTAAACGCATACTATAAATGGGCGAATGCAATGTATGGTAATTATTGCGTTATTTCGGACGATGTGAATCACTTAGCAGTAGAAGAAGCTATTTCCATTATTGAAGAGTTAGAAATTAGGCAACAAAATTATTTTATATAATGATATTTCTTGTTTTCAAGTCAGGGATATCTGTGTTATTATTAGTGAGTATGGCTGAAACTTGTCATGAGAGTAATTAAATTGAACTAAATAGATGATGGAGGGAATTATACCATGTCAGTAAAATGGGAAAAACAAGAAGGTAATGTTGGAAAACTTACTTTTGAAATTGAACAAGAAAAAGTAAAAGAAGGTTTAGATAGAGCTTTCGTAAAAGTGCGTAAAACTCTTAATGTGCCTGGCTTCCGTAAAGGGAAAGTTCCACGTCAAATTTTCAATCAACGTTTTGGTGAAGAAGCTCTTTTCCAAGATGCGCTTGATATCTTGCTTCCAGAAGTATATTCTGCAGCAATTGACGAAGCTGGTATTGATCCAGTGGATACTCCTCAAGTAAACATTGAGTCTATGGAAAAAGGCGAAACTTGGGTTTTAACAGCTGAAGTTACAGTGAAACCTGAAGTGAAACTTGGAGACTACAAAGGT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59 | Bacillus_virus(16.67%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1157121 : 1165407
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013723|1157121:1165407|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013723|1157121:1165407|1163063_1163309_-|WP_015454911.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIREVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >NZ_CP013723|1157121:1165407|1160164_1162384_-|WP_014602076.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQRIYQEMGLTDSEYDLVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELHMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEEAFVPVIDDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPEVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKASGDVIFLIGETKAEYSGSELQKIQQGKISGRAPELDLVTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFALSQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTADETIRVKHKEDLVTVKTTELRSIWEGAIPCLLK >NZ_CP013723|1157121:1165407|1163320_1164034_-|WP_054314363.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITALIFSHLAEAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGEQIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLEVATTSEMDTIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDAAGEILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NZ_CP013723|1157121:1165407|1158752_1160180_-|WP_058877360.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAATGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NZ_CP013723|1157121:1165407|1164114_1165407_-|WP_003733238.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVETYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >NZ_CP013723|1157121:1165407|1157684_1158734_-|WP_009933235.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERIGAMGALGSFGGMFDLSSLNLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGADDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVQAGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNEFTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVTVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPMLPIFDVVKKYGQLNEMEMYEIFNMGIGMVLAVAKSDVEKTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRESNAVIFAGGKKG >NZ_CP013723|1157121:1165407|1157121_1157688_-|WP_003722243.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGSGSNFQALVDDEFIKPYVKLLVCDKPNAYVLERANKHDIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRRLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSGTGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVTIETAETTDTLAEKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >NZ_CP013723|1157121:1165407|1162376_1163060_-|WP_003733240.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYIWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTELYEEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKENNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1680101 : 1720815
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013723|1680101:1720815|DBSCAN-SWA CTCACGTCATAACCTCGCAAAAAATAATATCTTCTATATTAATGTCAATTATTCTTTCGTCAAAGCGCTGTAATTGAACTATATTTCTTTCATGGTCCAAATAAACAGGCACGACATACTTGTATCGCACGTGATGATTGTTCTTTAAAAACAGTACTTCTATTGACCAATTTCTTTTTAACGCATCTGTTAATACTATGGAATGCTCTAAAATGTCATCAATTAAATTATACATTTCGTCACCTCTTGCTAACATTATACGAACAAACGTTCTTAAAATCAAGCGGTAAATAGGATTAAAATAAAATAATGTTTGACTTCGTATAATACATGTATTATAATGTAAGTATAGAAAGGAGTTGAGACAGTGAAGGATGTTTTAGAGGAAATAAAAATAGTCCTCGAAATTATCACTCTTGCAGTAGCGCTGATAACATTACGCAAGAAAGATAAAAACAAGGACAAGTAAATTCAGAGGGGTGAAATTCCCCTCCCTCTATTAAATTATAACATGCCTTTCACAAATTATGAATAAATATATCTGGATTATATTAATTGTTATCTGTGTTAACGGACTCGCTAGTTACTTTCAGAACACAGCATTAACTATCATTGCTATACTGACTACATTAGCTTGTTTAGTGTATTTAATAAAAAATAGGAAGTGATTAATTATGACGAAAAAAACGACCTCTGATGCGCAGTTGAAAGCAAATAAGGCATGGCAAGATAAAAATAAAGAACATGCAAATTATTTAAAAAGCCGTTCAGCTGCGCGATCTTTTATTAAGAAAAAAGCCACTTTAGAAGACTTGGAAGAACTAGAAATTGCAATAAAGCAAAGAAAAACTGAAATAATTTCATTAGACAATAGCTCTGAATGAAAAATTTCGGGGTTTTTATTTTAAAATAAATTTAATAAAACTATTGACTACTACGATTATTCGTAGTATAATATATATATAGTAAAGGAACGGGAGGAATACACAATGTTTAACAAGGCAGAAATTATGAAACAAGCTTGGAACTGGTTCACTGATAGCAATGTTTGGTTAAGTGATATCGAATGGGTAAGTTACACAGACAAAGAAAAAACTTTCTCCGTATGTTTAAAAGCCGCTTGGTCTAAAGCAAAAGAAGAAGTTAAAGAAGTAGAAAAAGAGATCAAACACATCTCTAAAAGCGAAGAACTTAAAGCTTGGAATTGGGCTGAAAGAAAACTAGGATTACGTTTTAATATTTCAGATGATGAAAAATTCACTAGTGTAAAAGATGAAACTAAACAGCATTTCGGCTTAAGTGTTTGGGCTTGTGCAATGAAAGCAGTTAAACTACACAATGACTTGTTTCCACAAACAGCAGCTTAAAATTATATTATAGAAAAGGAATGTGATTAAAATGACAATAACAACAGCACAAAAAAGATATTATGACGCGATGAATGAATTTGAAGCAATTATCAGTAAAGAATTAGAACAAACACCAGCGTTTTCGCAGGATTTACTTAATGACTCTGACTACTTAGTTATTACAAAAAATGAAGCGTATGCAGTAGCACTTTGCCTGCTCGATGATGACAAGCTATATTTAGATGAAACTTTAGTTCACTCGACACGTTTGGATATTGAAGATGAAACTTATTATATTAACTTTGTAGTAACTAATGAAGATGATTTTAAACTAGCTACAGATGAAGATAAGGAAAAACACGATAAACAAGAAGTAATTATAAAAAGTGAGTTGAACTAAAAATATGTCAATAAAACTATTAGATGAATTCTTAAAAAAACACAGTAAAACGAGGTATCAGTTAAGCAAACTGACTGGTATCTCGCAAAACACATTGAACGATTACAATAAAAAAGAGTTAAACAAGTATTCTGTTTCATTCTTGCGCGCACTCTCAATGTGTGCAGGAATATCTACATTTGATGTTTTCATCGAGCTAGCAGAATTGGAAAAAAGTTATGACGATCTTGCTGGATTTAAACACTTATTAGATAAGTATAAGTTGTCATTTCCTGCACAAGAATTTGAGCTGTACTGCTTAATTAAAGAGTTTGAATCTGCGAACATTGAAGTGCTCCCTTTTACATTTAATAGATTCGAAAATGAAACGCATGTAGATATAGAAAAAGATGTTCGAAAAGCACTGGAAAATGCTATCACTGTGTTAAAAGAGAAGAAAAACGAATTGATATAACAAATGCGCTAAGCTTATGTTTAGCGTGTTTTTTGCATAAAAAAAGCCCTAACGGCAAGGTTAGGGGATAATTAAGATTTTATTATTACTTCTTTGAGCCTATTATATCGAATAAACATATCATACTCATTAAGTTGACTCGTTTCAGGTGTATGTAAAACATACTCGAAACCGTTTCTCGAATAAAAATCAACATATTCATATAAAGCTGATACTTTTAATGCTGAAAACCCTATTCTTTCTTTAATATCACAAATTAACACTTCAAACACTTGTTTTAATAACTGTGTCCCATATCTATATTCATTGTTTCTTTGATATTCTTTATTCAATGCAATATATGCTAAATGAATAACAGGATAGGTTTGATTCCCTCCATCAGCAAACATAGTATTACTATCAAAACCCGGTGTATGCCGGACAAATTTATCGTTTCTTCTTGTAAACTCGATTACTCCAGCGTTTAATGTGTAAAAACCAAGTATCCTTTTTTCTTTATTATCATAAACTATGGTAGTATTAGCTAAATTAGAGAGGTTTAATTCGCGTGATTCTTTATATAAAAAATTATTAATGGAAGGGTTATGACAATCAAACGTTTCTTTATTTAAATCACCAACATATTCAACAACAGAAAATGTTGAAACATCGAATTCTTTATCTCTTGTCATTAGTAATGTTCATCTTTGGAATTTGTGCAAAATTCTCTCTTATACTAGCAATTGCTTTTCTTTCCGAAATATTATTAATAGTAGGATTGAACTTTTCGCCTAATAATTTTTGACCCTTAGCATCATCAACCATGATTGTTGTTTTAAACTGAACGCCTACCATTTTCATCCCTCCAAGTTTTAAGTCCTTACAATATATACTATACACATTTAGCTTAAAAGTAAACATTTTTTTAAATTCAAATCATCTTAAACAGCTTTTAAATGCTTTTATACGTGCTTAACAGCGCTTAACAGCTACAAAATGATGTCATATTCATTTTAGCTTATTTATTAGCTTTTAAAGTATCGCAAAAGTATCCTTAAATAAAAAAACCCCCGCAAGAAGCGAGGGCAACAAACTAAATCTTTTTAACAAACTTTGTGTTGGCAGTGAGATAGTAACCGCTCTTCGTCTTCAAGCGAGGTGTTCCGCCTTTAGTTTTCCCCATCCCCGAAATCGTGAAGACTGTGCCTGGCGGAAATGTTCCACCAGTTTTATTTTTTGTTGTAAAGTCTACTGAATTGTATAGATCACATTGTACTAGTGTTTTAACTTTTCGCGGATTTTCTGTGTAGTATGTGTTTTTGCTTGCTGGTGTGTGTGGTTTTCCTGCTTTTAACTTCGCTAATAATGTTGTGTTCTGCGTTGCTGTTCCTGTGTAATTCTTAATTCCGTATTGATTTGCTAGTTTTTTACGATTCGCAAAGCTTGAATCTAGTTTATTTAAATTCATATAATCTACTAATCCTAGACTGTTTGTGTTTGCATTTGCGCTTGGTTTAGAAGAATTACTAGTACTAGCTCCTTTTCCAAAAGTATCAGTCCCATAGCCTTTATAATTAAATTGAAGGTGTGGATTATCTACAAATCCAGACCAATCACCGCCCCATTCAAATCCAAGGGACTTCGCTTTTGCCACAAATTTCTTGCCTTTATCTGAACGATAAGCGCCCCAATCAACAGTTTTACCTTTCGTCATGGCGAAATCTAGCGCTTGTCCTACTAAATGATAAGAGCGCATTGTTTGAGACGCTCCGCTGTTAACATTTGCGGCTTGTTGTTCTTTCGTTCTAATTGTTTCGTAGATTAATACTTCAATTCCGTTGTTCTCGGACCAATCTAGCAACTTTCTCGCCGCTGCTTTTGTATTGTCTGCTAACTTATTTACATTCGCTAAACTTCTACTATAATAATAACTTGTCATTATTTATCATCCTTTCTTGGTTCTGAATAATTCATTACTTTTAAACTATCGGAGAATTTACTAGTTGTTGGGTCCATCAAAATTCCGATAACAGCTACTACTGTTGTAACAATCGCCATTGGGCTATTTAGGAACCTTACAAATGAAAGCCACAAAGCAGACCAGTTATCCAAATCGGATATAGTAAAACCTCCCGCTGTCCACGCGACGCCAAGAACTGTAATAAGTGTTGCTACAACAGTTCGCCAGTTTTTCAATCGTACCTTCCAGTTAATTTTCATCATTTCACCTCCTTTTCATTTTTTTCAGTAACATACTTCCAAATCGCTTTATCTTCCCGTTTCAATAAAGCAATCTCTTTATCATGATCGTTTTGCTTTTCTCGTAAACTCATACGATCTTTCTTGCTTTCGGACATTTCTTCTCTTAGACTTTTTAAAGTGATATCCAGAGAATCAATCATATTTCTTAAAGGTGCGACTAATGCCCACCTAATCACAAAACCTACGATTGCCGCTATTAAACTAATTAAAGCTATTAGCTCCCCCACACTCATCCCTGCTATCGAAATACTCCCAAGTACCAATTTTCATCATCTCCTCATTGTCACTCCATAAAAAATAAGCCTTGCTCGGCTTTAATCTAAAACATAAAATAATTGATTTAACGCAAAATAAGTAACGCTAGTGTCGACGGGCATAAAACTCATCGCATTTGCGGAAGACGCATGTACTCGACCACCAGTCGATTTGCTCGTTGGCGCGTAAGCCATCGCCGTTCTTGTTGTCTGTATCTCAAGAGGCACAGAAGCAAAAGCGTTAGCTGATGCCCATGCGGTTGATTTTTGAACTTGACCACGGAAAAACACAATTCTAATTC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65 | Listeria_phage(94.83%) | tail,terminase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_5 |
1864103 : 1871947
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013723|1864103:1871947|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013723|1864103:1871947|1870987_1871947_-|WP_003722610.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NZ_CP013723|1864103:1871947|1867035_1868766_-|WP_031645160.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMETNEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGEEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNADGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVEGGSLLEDLEQIYADFGYYKEDLVSLTLSGKDGSRRIKEITSSFREQLPTSMGGFPVERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESTAKLEKVKADLMQHIEA >NZ_CP013723|1864103:1871947|1866052_1866928_-|WP_003722606.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKAIQQKYETTISHRDMKRRKGR >NZ_CP013723|1864103:1871947|1868807_1869869_-|WP_003734087.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMINDHDMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGSNHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGKIDAKMTYTLNNKNEWLVDYEARSNQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHTFILKHENGRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIDERAVPKYAGITMETQGLVDAINHDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >NZ_CP013723|1864103:1871947|1869885_1870869_-|WP_054314441.1|DBSCAN-SWA MGIAVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHRESIHKKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVIHFSASSLVGESMEVPLDYLNNNVYGTQIVLEVMEEFDVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYGMKFVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIRALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY >NZ_CP013723|1864103:1871947|1865082_1866051_-|WP_054314442.1|DBSCAN-SWA MKKETKPRVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEITASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQINEKE >NZ_CP013723|1864103:1871947|1864103_1865075_-|WP_003722604.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSSQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2382613 : 2389138
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013723|2382613:2389138|DBSCAN-SWA TTCAAAACTTCTTGTAAACATCAATGGAATTGCCAAAATTAATGAAATATCCACCATAATCATACATTGGACCATATTTTTCCGCGTAATGAGAAACTGTATGGCGCAAAAATTCTTCTGTTACCTCTAAAAACTCCGCTACTTCAAAATATTCTCGTAAGCCTAGATAAAAACAAGCAATGATGTCATCAAGCGGTATTAGTTCCTCATAACCTTTGCGACGAGCGAAAATTTCTTGTTTTTTATCCATGATTGTTTCCTGTTTGGTGATATTACCTACAGTGTATTTGTAATGCATCAATTCTTCTACTAAAACACAGCCTTTTTCAATGGAAGATTGATCCTTACTAATAAAAATCATCCCATTTAAATAAAGTCCCGGAAGTTTGTAAGGCATTTTCTCTTCTCTGATTGTTACCTCATCTTGGTATTTATTTACCAATTTTTCGTACAATAAAATCACATCCCGCGATGGAGTTTTTTCTTCATCTCTATATAAGCTAAAATATCCCGCATTTCTTCCTCGGTTACGTCATCATCAATATGGGCTGCAATTGTTACCAAGCGTTCATCAACAGGGGGTAAATTTCTTTCAGGAAAAAAGTCATCTAATCGTTTGTTGAAGATTTTTGCAAGTTCAAATAAAACATCTTGATTTGCTTTTCGATCACCATTTTCATAACGGCTAATAGTTTGGCGAGTTGTATGAAGCTTTTCTGCTAATGCTTCTTGATTTAAGCCTCGTTCCTCGCGATATTGTTTTATTTTATTTCCTACAAATTTATTTAGCTCCATAATAATTGTCCTCCATATGTTTATGGCTTCAGTATAGCACTTTTAGCACCAAAACGGAACTTTTTCGAACATATTTGTCGGATAAAGTTTACCAGTAACCAAAATGGTGCTATAATATTTGTAGAGCTAGAAAATAAATGCGGCTGATTTTGCACCGATAGCACCGAATCGGTGACAAAGCTACTATATTAATTTATGAGATGGAAGTGGGAATGGATGGATAGAAAACTTTTAAAAGAAAAGCAAATCCAACTAATTTTTCAACTAGAACAAGAAGAAAATCGATTTATTCGAAAGCGTTTGATAGAAGAGTTGGAGTTTTTTGAAGCACTTGGGGATAGGGAAAAAGGACTTCTAACGGCGGAGCAAAAGTTGCTTATTTTAACACCTAGTGAGTACCGAGAATACAAAAGAACCAAATCAGATGTGCAAATTAGTAGGATAATTGGAGTATCGAGATCGTCACTTGCAGAATGGAAACGAAAAAAAGGTTTAAATAGAAAAAAGTCGCAACCGGTTCAGCAGGAAATGATTGATGTATTAGCTTTTCATTTAGATAAAACAAAAGAAGAAATTGGCGCTTTACCTGCTTCGGCGATTGAATGTCAGTATGAGGCTTTTGTGATTAATGAAGCCAATAATTAAGGAGTGATAAAATGCAGGTTTTAGTTTTACCAGAAAATAAGGATATCAATTATATAAAAACGGTCCATGAAGTAAAACGATTTTTTGCGGATTTCGAGAGATTTCGGATGATTACGGGGTTATCAAAAAAGCCACATTTACTTAGAAATGGTTTTCTGGAAGAGCCGCAGTTTGAGCCGGTAGCATTTTCTGCTAGACATAATAAAGAAGTCATTTTGGAAGCGCGATGGTTGGTAGAGAAATATACTGAAATGTTGAATCAGATGGATGATTTATATCGAACTATTTTGATGGAATGTTACGTGGAACGAAAACAAGATGTGGCGGTAATGATGGATTTACCGTATGAAATTGCCCAGTTTAAACGGATAAAAAAACGGGCAGTGCTAGAACTTGCAACGCTAATGGGAATTTTAGTAAGGAAATGATGATACTTTCGTGATATTTTGAAACATCATTTTCCTATTAATATAGAAGTAAGCTAATTGTCCAGTAAGCGGATGACAATAAAAGCTGCATCAGAATGAAGGTGCACCGATTTTCTGATAATAAAAGATGTTGTATAAGAAATTTGTTTTTATGATTGGATTTAAATCCGTTGAGATAAACAAATATTCTATTTTGGAAAGTAAAGTTCGGAGGAATAAATTATTAAATGTGGTCTTGACCGAACTTTGCTTTCTGTTTTAAAGGAGTGAACGCTTGGTGAAGAGTTTGAGCTTCATGAGAGTTTTGGAAGCAGTGAGAACAATGCTCCAGGAAAAAGGCGGACTAGATGTTTCTATTGTAATGCGTGACCAAGTGGAAATGCCTACAACGATGATCGAGATGATTGATCAAGAGGAAGAAGAAAGCCAAACTGCCTGGAAAGAAAAATACCGTTTTGCTATACATCATTATACAAATGAACAGGACTTAGCGGGGGTCGAGAAGATTGATACGCTTATCCAAATGGGTTTCATTTTGCCCGAGGGATACAAATTAGTCGCAGTTCGACATTATGGAAAACAAAATTTAGTCAAAGAAAATACGTTAATTCACGCAAAAACCAGTTTTGAAGTAAGTATTTGTCGTGAGTTAAAAGTAAAAATTTAGGGGGAAATATTAATGGCATTTGAAGAGAATTTATATTGTGATTATACACCGGGAGCTGCTAAAGCGGTCGCGGGGAAAGATGTAATTTTAGCAGTTTTTAACGCAGCGGGGGATAAACTATTGGCTGTTGCGGGCCAACAAGGTCTGACTGTAAACCGTTCTAAAGATAGTATTGAAATTACATCCAAAGATACAGTGGGCGGATGGAAATCCAAAATTGGCGGTATGAAAGAATGGTCAATTGAAAATGACGGGTTATATGTCGCTGATGCAGAGTCTCACAAAGAATTGGCGAAATATTTCGAAAGTGATAGCCCGGTTTGCGTGAAAATCATTAATCAAGCATCTAAAAAAGGTCTTTTCGGTGGTTTGGCAATTGTAGCTGACTATAGTTTTGAAGCGCCTTTTGATGAAGCGATGACTTACTCTGTAAAACTAGACGGAATGGGCGCGCTTGTTGATTTAACAATTACTGAGGGCGGCGACCAAATGCCCGGCGAAACACCTGTAGCACCAGCAGAATAAAATAGAGAGCCACTGAAATAAGTGGCTTTCCCTTAGGAGGAAAATAAATGTTTGAAGTGAATGATACAACTTATATTTTACGATTTAATAAGCAAAAAGTTAAAACGGTGGAATTAACATCAGGGATTAGTTTAGTTGCAGCTTTGACTGCGAATAAAGGGATTTTGAGCTATCAAGTGATTGAAACACTATTTGTTTCAGGACTTGTGGAAGAAAAAGGCTTAGTACCTGTAAAACAAAAAGAAGCTTTGGAGATTTTCGATAAATTAGTAGAAGAACAAGGCTTAATTTCGCTTAATGTAGCTGTTATTGAGAAATTGCAAGAGGATATGGGTTTTTTGTTCCGTTAAAACAGATTGAATTTGAGTATTTTGGTGCTGAGGACGAAGAAGTGGATAGTGAAATGAACCATGATTTTGATTTGGAAAAACAGTTCGCTTTTTTTGTAGTCAATTTTCAAATGTCCAAGCAAGATTTTGAAGAACTTACTGAAGTGGAGAAAAATTTCATCATGAAAGAATGGGAAAACAAGGTGATTTTTGAATCTACTATGCTTCGAAATGCAGTTTTAAATGCGGAACAAAATCTCAATCGAAAACGAAATTCCCGTTTTATCGACTTGCATAAAAAACGTCAGAAGAAAGCCGATGTTAATTATACAGTAAATGCACTTCAAGCAATTTCCGAGAATGAAGCGAAGGAAGGTAAAGCGTGGATTGATCGGATTTATGGTGCAAATGGGTTGCGAAGACCTAAGAATAAAGAAGAAAGGAGGAACGTGAATGGCGGATTCTAAAAGTTTTACATTTGAACTCAACGAGAGCGTTTTAACAGCGCAAGTTGGCAGGCTAGATGAAATGGCGATGGTTGTAGAGCGGCGGTTTTCAGAGCTCAAAATGACTATTGAAGATGTTGGAAATGCTGATCCAGGTTCGAAAATTTCCGAATCTTTAGGTGGGCTGCAGTCTGGGCTTGGCACGATTAGTTCGGCGTTTGGACAGCTGGGTTCTAGTAGTGAGGCGATTACATCCGGATTCGGTACTGCGGTTGGTTCTGTTGGTGGAATCACAGATGCGTTTAAAAATCTAGGGTCAAGCGTCCAAAATGGTACGTTATTTTCAAGCTTGGCAACCGGAATTGGTGGCATGAGTACCATGCTTGGTGGAGTATCTGGCGGAGTTCAAGGAATTACAAATCTAGCTAGTGGATTTATGGAATTGAAGAATCATTTAGGCGGTTTGATGTCTTCTATTGGCGGCGTTGGTGGAATTATGGGTAAACTGACTTCTCCAATGGGGTTAGTAATTATCGGGATTGTTGCGCTAGTTGCTGCTTTTACGTACTTGATGACGACGAATGAATCGTTCCGAAATACCGTGATGTCAGTCGTAACGCAGGTTGCGCAGTTGTTCGGGCAACTTGTCGCTAGTTTAATGCCGATTATTATGCAAATTGTTACTGCGGTTATGCAAATTGGTGCCGCGTTAATGCCGATGGTTATGCAGTTTATTAGCTTTTTTGCCCAGTTGTTAGCTCAATTAATGCCATTTATTAATATGCTGATTTCTATGCTTATGCCTGTTATTATGCAGATTGTTCAAGTTGTTATGTCGCTTGTTTCAGCGTTATTACCAAGCATTATGACAGTGATCCAAGGCATTATGAGTGTTATTCAATTTTTAATTCCGATAATTATGCAAATCGCGACGGTGGTTGTACAAATTGTTGTAACGATTATTTCTTATATAAGTAAAATTATGCCGATTGTTATGCCGATTATTGGCGTTATTGTTTCGATTATCACAACGATTATTAGTTACGTCGTTATTATTGCGACGACGATTGCTAGTGTTATTGGGAAAATTATTAGCTTTATTGCGAGTGTTATTACGGCAGTTATTGGGATTGTGCAACCAATTATTGGCTTTATTACTAATATCTTTACGACTATCGTAACGATTATTGGTGCAGCTTTCCAAATGGTATTTACTGTTGCATCCAAAATTTGGAATTCCATTATGTCGACTATTTCCGGAATTATTGAAGGGATCAAAGCAGTCATCACAGGTATTTCTACTACAGTTTCATCAGTGTTTAACGGAGTGAAGCGCATTATTACAGGTGTTTTTGACGGAATCAAAAGTGCTTGGGGTGGTTTAACTGATTTTGTAGGAAATATTTTCGATGGTGTTTCAAGTGCAATTCAAACAGTGGTAGACAATGTCAAAGGTTTTGTAAACGTGGTAATTCGAGGGATTAATGGAGCCATTGGTTTAATTAATAAGATTCCAGGAGTTGAAATCGGCAAAATACCGCAATTAATTTCCGGAACAACAAATTTCCAAGGTGGCTTTGCTCGAATGAATGAAGGCGGCCGAGGCGAAATGGTTGTTTTACCGTCGGGTTCGCAAGTAATTCCGCACGATGCAACGATGAAATACGCAAGAGAAAGTGCGCGCGGAAATAAATCAATGCTTTACACGAGTCAAGGCGCTGATTTGGCTAGAGTTGAAAATCTTCTCGAGCGCTTACTACAAAAAAATCCTGTAATCAAAATGGATGACAAAGTGGTAGCTGAGGTAGTTAGCCGTAATCAAGCTAACTCATTTGATCAGTACAACTACACAATGGGAGGTGCAGCTTATTCATGAGTGACTTGTTTTTAGAATTAAATGGAAAAGTGCATTCGCTTAGTGAGACATTTCCAGGTCTTTCTGTACAAGAAGTTTCCAGACAAAGTCCCCAGTTAAGCATGGAAACTGCTGAAATCGCTGGGACTGATGGGGTTATCCCGGGAATGACCCAATTTAAACCGTTTATCTTTTCAGCAAAATGTAATTTGCAAGCACTTGATATTCCAGATTATCATTTGGCAGTCAGAGAAATTTATGAATTTTTATTCCAGCGCGATAGTTATTATATTTGGAGCGATCAAATGCCAGGAATTCGGTATGAGGTGCATCCTAAACCAGTTGATTTTAGTCGAGAATCGGATCGTGTTGGTTTACTCACTATAGAATTTGATGTATTTAAAGGTTATGCGGAGTCACGTGGCACGAGCCTTGACCCTATGACTTTTGAAGTGGATTTATGGCAAATGGGAATGAATTTATCGAACCGTGATGATTTATTTTATATTTTTAAAGAAAATACATTTCGGGTCTATAATGCGGGGAGCGACCGTGTTAATCCACTGATGCGGCATGAACTAGATATTGCGATGACGGCGAATGGGACACCAACGATTCATAATCTTACAACGGGAGAATCCTTCGAGTATCAGAAAGAGCTCCGAAAAACAGATGTTTTACTGTTGAACAATATTTATCCACTTGTTAATAACCGCCGTGTTGGAAAAGATACCAATCATGGGATTATCACCCTTGAAAAAGGCTGGAACGATTTTGAAATCAAAGGTGTAACGGATGTAACGATTGCTTTTAATTTTCCGTTCATTTATCGGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013723|2382613:2389138|2382613_2383066_-|WP_003721739.1|DBSCAN-SWA MYEKLVNKYQDEVTIREEKMPYKLPGLYLNGMIFISKDQSSIEKGCVLVEELMHYKYTVGNITKQETIMDKKQEIFARRKGYEELIPLDDIIACFYLGLREYFEVAEFLEVTEEFLRHTVSHYAEKYGPMYDYGGYFINFGNSIDVYKKF >NZ_CP013723|2382613:2389138|2386063_2386468_+|WP_077944101.1|DBSCAN-SWA MDSEMNHDFDLEKQFAFFVVNFQMSKQDFEELTEVEKNFIMKEWENKVIFESTMLRNAVLNAEQNLNRKRNSRFIDLHKKRQKKADVNYTVNALQAISENEAKEGKAWIDRIYGANGLRRPKNKEERRNVNGGF >NZ_CP013723|2382613:2389138|2385159_2385672_+|WP_003721744.1|tail|DBSCAN-SWA MAFEENLYCDYTPGAAKAVAGKDVILAVFNAAGDKLLAVAGQQGLTVNRSKDSIEITSKDTVGGWKSKIGGMKEWSIENDGLYVADAESHKELAKYFESDSPVCVKIINQASKKGLFGGLAIVADYSFEAPFDEAMTYSVKLDGMGALVDLTITEGGDQMPGETPVAPAE >NZ_CP013723|2382613:2389138|2385719_2386022_+|WP_003721745.1|DBSCAN-SWA MFEVNDTTYILRFNKQKVKTVELTSGISLVAALTANKGILSYQVIETLFVSGLVEEKGLVPVKQKEALEIFDKLVEEQGLISLNVAVIEKLQEDMGFLFR >NZ_CP013723|2382613:2389138|2384757_2385147_+|WP_003732221.1|DBSCAN-SWA MKSLSFMRVLEAVRTMLQEKGGLDVSIVMRDQVEMPTTMIEMIDQEEEESQTAWKEKYRFAIHHYTNEQDLAGVEKIDTLIQMGFILPEGYKLVAVRHYGKQNLVKENTLIHAKTSFEVSICRELKVKI >NZ_CP013723|2382613:2389138|2384063_2384480_+|WP_003732220.1|DBSCAN-SWA MQVLVLPENKDINYIKTVHEVKRFFADFERFRMITGLSKKPHLLRNGFLEEPQFEPVAFSARHNKEVILEARWLVEKYTEMLNQMDDLYRTILMECYVERKQDVAVMMDLPYEIAQFKRIKKRAVLELATLMGILVRK >NZ_CP013723|2382613:2389138|2386454_2388323_+|WP_054314464.1|DBSCAN-SWA MADSKSFTFELNESVLTAQVGRLDEMAMVVERRFSELKMTIEDVGNADPGSKISESLGGLQSGLGTISSAFGQLGSSSEAITSGFGTAVGSVGGITDAFKNLGSSVQNGTLFSSLATGIGGMSTMLGGVSGGVQGITNLASGFMELKNHLGGLMSSIGGVGGIMGKLTSPMGLVIIGIVALVAAFTYLMTTNESFRNTVMSVVTQVAQLFGQLVASLMPIIMQIVTAVMQIGAALMPMVMQFISFFAQLLAQLMPFINMLISMLMPVIMQIVQVVMSLVSALLPSIMTVIQGIMSVIQFLIPIIMQIATVVVQIVVTIISYISKIMPIVMPIIGVIVSIITTIISYVVIIATTIASVIGKIISFIASVITAVIGIVQPIIGFITNIFTTIVTIIGAAFQMVFTVASKIWNSIMSTISGIIEGIKAVITGISTTVSSVFNGVKRIITGVFDGIKSAWGGLTDFVGNIFDGVSSAIQTVVDNVKGFVNVVIRGINGAIGLINKIPGVEIGKIPQLISGTTNFQGGFARMNEGGRGEMVVLPSGSQVIPHDATMKYARESARGNKSMLYTSQGADLARVENLLERLLQKNPVIKMDDKVVAEVVSRNQANSFDQYNYTMGGAAYS >NZ_CP013723|2382613:2389138|2383071_2383407_-|WP_003721740.1|DBSCAN-SWA MELNKFVGNKIKQYREERGLNQEALAEKLHTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELAKIFNKRLDDFFPERNLPPVDERLVTIAAHIDDDVTEEEMRDILAYIEMKKKLHRGM >NZ_CP013723|2382613:2389138|2383623_2384052_+|WP_003732219.1|DBSCAN-SWA MDRKLLKEKQIQLIFQLEQEENRFIRKRLIEELEFFEALGDREKGLLTAEQKLLILTPSEYREYKRTKSDVQISRIIGVSRSSLAEWKRKKGLNRKKSQPVQQEMIDVLAFHLDKTKEEIGALPASAIECQYEAFVINEANN >NZ_CP013723|2382613:2389138|2388319_2389138_+|WP_009911828.1|tail|DBSCAN-SWA MSDLFLELNGKVHSLSETFPGLSVQEVSRQSPQLSMETAEIAGTDGVIPGMTQFKPFIFSAKCNLQALDIPDYHLAVREIYEFLFQRDSYYIWSDQMPGIRYEVHPKPVDFSRESDRVGLLTIEFDVFKGYAESRGTSLDPMTFEVDLWQMGMNLSNRDDLFYIFKENTFRVYNAGSDRVNPLMRHELDIAMTANGTPTIHNLTTGESFEYQKELRKTDVLLLNNIYPLVNNRRVGKDTNHGIITLEKGWNDFEIKGVTDVTIAFNFPFIYR |
10 | Listeria_phage(33.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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