Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP010953 | Campylobacter fetus subsp. testudinum Sp3 | 5 crisprs | PD-DExK,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,WYL,DEDDh,csx23,cas10,csm3gr7,csx10gr5,csx19 | 0 | 11 | 2 | 0 |
1. NZ_CP010953
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP010953_1 | 43149-43263 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010953_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010953_1
>1.1|43179|55|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder TAATTTAAAAGAATATAAATTTCTAAAGCGTGAGCAAAAGCGAACGGACTTTAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010953_1
The CRISPR arrays of NZ_CP010953_1 >merge|NZ_CP010953|1|43149-43263|CRISPRCasFinder ATTTAGTTCTTTAGTACGAATTTATTCGTATAATTTAAAAGAATATAAATTTCTAAAGCGTGAGCAAAAGCGAACGGACTTTAGTATTTGGTTCTTTAGTACGAATTTATTCGTA >NZ_CP010953|1|1|43149-43263|CRISPRCasFinder ATTTAGTTCTTTAGTACGAATTTATTCGTA TAATTTAAAAGAATATAAATTTCTAAAGCGTGAGCAAAAGCGAACGGACTTTAGT ATTTGGTTCTTTAGTACGAATTTATTCGTA
>NZ_CP010953.1|WP_058908914.1|42243_43002_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MAISIKNAKDLEQLRAANKIVANTLDYLHNYIKPGVSLLEIDKICEDMIRSAGAKPAFKGLYGFPNAACISVNEVVIHGIPNEYKLKEGDIVSVDIGSNLKGYFGDSARTYPVGKISANDEALISCSKDALYFAIEYIKSGMHFKEVCYEIENFILNRGFVPLKGFCGHGIGKRPHEEPEIPNYLEGNNPKSGPKIRNGMVFCIEPMICQKDGTPVIADDKWTVRSKDGLRTSHYEHCLAIIDGKAEVLSQI >NZ_CP010953.1|WP_023384002.1|40979_42242_+|preprotein-translocase-subunit-SecY MNKTLINKILITLGFLFAYRVLAYVPVPGVNVDVIKEFFTSNSSNALGLFNMFSGRAAERLSIISLGIMPYITSSIIMELLAATFPTLGKMKKERDGMQKYMQIIRYATIVITIVQAIGVSIGLQSLTGRGGEQAIMIDINLFIAISCISMLSGTMLLMWIGEQITQRGIGNGISLIIFAGIVSGIPSAIGGTINLVNTGEMNFLVVIGIALVILITVGIVIFVEMGERRVPISYSRKTVMQNQNKRIMNYIPIKVNLSGVIPPIFASAILMFPGTILQASTNEFILAINDFLNPNSYFFNFLTFLFILFFAYFYASITFNAKDISENLKRQGGFIPGVRPGESTATYLNEVASRLTLTGSVYLGLISTLPWILVKFMGVPFYFGGTSVLIVVSVALDTMRKIEAQIYMNKYQTLSAVGL >NZ_CP010953.1|WP_023384000.1|40578_40980_+|50S-ribosomal-protein-L15 MGLENLQKANGSTRNTKRIGRGQGSGWGKTATKGGKGQTARKGYNEKRGFEGGQQPLQRRLPKVGFASKFVKPYAINVEKNEGVKTLSEITLDSLKTVHKFSNSIKKVKLIGAGAKDLASKIKDENITVTGIN >NZ_CP010953.1|WP_023383999.1|40125_40569_+|30S-ribosomal-protein-S5 MEKYNREEFEEVIVDIGRVTKVVKGGRRFRFTALVVVGDKKGHVGFGFGKAKEVPDAMKKAVDDAFKNIVEVKLKGSTIPHDIEVKFNASRILLKPASEGTGVIAGGGARPVVELAGIKNILTKSLGSNNSANVVRATIKALSMLKG >NZ_CP010953.1|WP_023383997.1|39754_40111_+|50S-ribosomal-protein-L18 MVANVLKRKISLRIKRKRRIRAKINGTASCPRISIFKSNRTIYVQAIEDINATTLCASDGRKLGIKANKSGAAVLAKDIAGKLSAKGINEAVFDRNGYLYHGVVAAFAEALRENGIKL >NZ_CP010953.1|WP_023383996.1|39208_39745_+|50S-ribosomal-protein-L6 MSRIGKQPISIPNGLDVSLKGSVLVFKKGNNTKELDTKGNVNIEVKDGNIIFTSKGDDRQSRAYWGTYRALANNVVVGLTTGFTRQLEINGVGYKAAAKGKVLELALGFSHPINYELPEGIEISVEKNIITIKGSDKQVVGQVAAEVRGFRPPEPYKGKGVKYVEERIIRKAGKTSKK >NZ_CP010953.1|WP_002847989.1|38690_39086_+|30S-ribosomal-protein-S8 MINDLISDGLTRIRNASMRRLDTTKLLHSNVVEATLKILANKSYIESYNVVEEGNKKFINVVLKYDERGRSVINELKRVSKPGRRVYQGRDEIKRFKNGYGTIIVSTSKGVLSNDEAHKAGVGGEVLCTVW >NZ_CP010953.1|WP_002847988.1|38494_38680_+|type-Z-30S-ribosomal-protein-S14 MAKKSMIAKAARKPKFSARGYTRCQICGRPHSVYKDFGICRVCLRKMANEGLIPGLKKASW >NZ_CP010953.1|WP_023383995.1|37950_38493_+|50S-ribosomal-protein-L5 MRLKAKYNESIKPALAKEFDIKNPMLIPAIEKIVISVGAGEGAKDQKLLQNMADTISLIAGQKAVITNAKKSVAGFKVREGYPVGIKVTLRKEQMYTFLDKLVSVALPRVKDFRGLPRDGFDGRGNYNFGLNEQLMFPEVVYDQILRTHGMNITIVTTAGDDKQAFKLLELFGIPFAKGK >NZ_CP010953.1|WP_023383994.1|37714_37948_+|50S-ribosomal-protein-L24 MAVKYKIKKGDEVKVIAGDDKGKVAKVIAVLPKKGQVIVEGVKVAKKAVKPTDKNPNGGFISKEMPIDISNVAKVEG >NZ_CP010953.1|WP_002848031.1|43298_43517_+|translation-initiation-factor-IF-1 MAKDDVIEIDGNVVEALPNATFKVELDNKHIILCHIAGKMRMHYIKIMPGDRVKVELTPYSLDKGRITYRYK >NZ_CP010953.1|WP_158004567.1|43881_44019_+|hypothetical-protein MAKKESLFVGISSGANIAVAIRISKLLNNSQNIVTIAPDSGRSYL >NZ_CP010953.1|WP_058908915.1|44088_44313_+|hypothetical-protein MPSIDYDFIISQSENDLKAFAQKDPSSNKDEIYILKSYLTYFATISYRVANYLHLKNEKINARKISENAKNNFV >NZ_CP010953.1|WP_023384007.1|44407_45271_+|DMT-family-transporter MHNLRQNQTKFIALMLLAISFLAFGGIFVKLSELPPINTGFYRILFAVPFLFPFVYKDLKKLSKKEVGLLLLSGVFLAFDLILWHISFSYTTVANANLLANLVPFTIIPVSYFLFKEKINLYFFIGLVVTLVGIVILVSGKLNPTPDNFIGDLMAFSTSIFYALFMITIYKMRDKIKTTTVIFVSAFGSLPVLAIAMGINEGIYIPMSFDELWPLLALALLCHIGGQGLMAFCLGKVSANLSSVLVLAQPVIAGIYAFILFEEVLSIFEVFGMFVVLVGIYFAKKNA >NZ_CP010953.1|WP_002848032.1|45441_45555_+|50S-ribosomal-protein-L36 MKVRPSVKKMCDKCKIVKRKGIVHVICENPKHKQRQG >NZ_CP010953.1|WP_002848033.1|45558_45927_+|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGVDLPKKKRVEYGLTYIYGIGLFTSRKILNAVGISYDKRVYELSEDEAAAIRKEIQEHYMVEGDLRKSVAMDIKALMDLGSYRGLRHRKGLPVRGQKTKTNARTRKGRRKTVGAATK >NZ_CP010953.1|WP_002848034.1|45936_46329_+|30S-ribosomal-protein-S11 MAKRKVIKKKIVRKNIAKGIVYISATFNNTMVTVTDEMGNAIAWSSAGGLGFKGSKKSTPYAAQQAVEDAMNKAKEHGIKEVGIKVQGPGSGRETAVKSIGGVEGIKVLYLKDITPLAHNGCRPPKRRRV >NZ_CP010953.1|WP_023384009.1|46356_46983_+|30S-ribosomal-protein-S4 MARYRGPVEKLERRLGVSLALKGERRLAGKSALDKRPYAPGQHGQRKTKISEYGLQLREKQKAKFMYGVSEKQFRRLFAEAARREGNTGALLIGLLEQRLDNVVYRMGFATTRRFARQLVTHGHILVNGKKVDIPSYRVASGEKIEVAEKSKTNPQIVRAIELTNQTGIAAWVDVEKDKKYGIFTRIPEREEVVIPVEERYIVELYSK >NZ_CP010953.1|WP_023384011.1|46995_47994_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MKKITTSAYMPTEIEVVNVSENVAKIIAYPFETGYAVTLAHPLRRLLYTSTVGFAPTAVKIDGVAHEFDSMRGMLEDVTLFIINLKNLRFKLKNDSKREVIEYSFKGPKEITGSDLNNDIVDIVNPDSYLATINEDAELKFSLIVEKGIGYVPSEEIRDYIDSEYIALDAFFTPVKKAVYEIENVLVEDNPDYEKIVLTVTTDGQVSPIEAFKHSIEAMYKQMSIFNNVLNIDVNMALTSSQSSNEHSKLLESVENLNLSARSFNCLDKADIRYIGELALMEESELKDLKNLGKKSLDEIKAVMAEIGYPFGENTLGDSKEALRKKISELKS >NZ_CP010953.1|WP_023384013.1|48012_48369_+|50S-ribosomal-protein-L17 MRHNHGYRKLGRTSSHRAALLKNLTIAIVKAGKIETTLPKAKELRGYVEKLITRARKGDFNAHKFVFAHLQDKEATNKLVTEIAPKYATRNGGYTRIIKTRVRKGDAAEMAYIELVAQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP010953_2 | 707119-708460 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010953_2
|
20 spacers
spacers of NZ_CP010953_2
>2.1|707148|36|NZ_CP010953|PILER-CR CCAGTAAAGCCATAGCATTTTTTAGAGATAGTACGT >2.2|707213|36|NZ_CP010953|PILER-CR CTTTTATTCATATCCTCTTTTGTTTTTTTAATTTTT >2.3|707278|37|NZ_CP010953|PILER-CR CCTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACT >2.4|707344|37|NZ_CP010953|PILER-CR CCTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACT >2.5|707410|37|NZ_CP010953|PILER-CR CCGTTGTTGTAAATTTAGTTGTTTGTTTAGACTTAAA >2.6|707476|36|NZ_CP010953|PILER-CR CTTCTAAAAGTCGCTATTACCTCTTCATCTCTAACT >2.7|707541|37|NZ_CP010953|PILER-CR CTTAGCAAATGGAGAGATAAAATTATTTTTACCCTAA >2.8|707607|36|NZ_CP010953|PILER-CR CATGTCAGAGCATTTATAAAAGCCTAAATTAGGCTT >2.9|707672|37|NZ_CP010953|PILER-CR CTCACGTTAAGCCTTCTATAAACGAGAATGAAATGGC >2.10|707738|36|NZ_CP010953|PILER-CR CTTTATCCCAGCCATACCTTTCACATAAGGTAATGA >2.11|707803|36|NZ_CP010953|PILER-CR CTTTTTGGTATGCGCTCACCCTCTTTTAAAAACTCC >2.12|707868|38|NZ_CP010953|PILER-CR CATAGCAAATGAAGATAAAATTATTTTTACCCTAAAGC >2.13|707935|37|NZ_CP010953|PILER-CR CTAAAATCCAACGTAATAAGGTAGCTTTGTTTCTACC >2.14|708001|37|NZ_CP010953|PILER-CR CGATATCAAAACAAGATTATTGAAAAAGGAAATAGAA >2.15|708067|37|NZ_CP010953|PILER-CR CTTTTATTTTCCAAAAATGGCAAGAAATACCATTAAA >2.16|708133|37|NZ_CP010953|PILER-CR CATGATAACACTACTAAACCAGAAAAGCCAACTGATC >2.17|708199|36|NZ_CP010953|PILER-CR CTCTGATCCTATTATTTTTGACGATTATAAAATTTC >2.18|708264|36|NZ_CP010953|PILER-CR TAACAAATAGATTGGTTTTGCCGGTTGATATCGTAT >2.19|708329|36|NZ_CP010953|PILER-CR TAACAAATTGTCTTCTATATTTTTGCCCATAGCAGA >2.20|708394|37|NZ_CP010953|PILER-CR TACAAAAAATGTACCGCTAGTGTCTATTAGGACCTCT >2.21|707149|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT CAGTAAAGCCATAGCATTTTTTAGAGATAGTACGT >2.22|707214|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT TTTTATTCATATCCTCTTTTGTTTTTTTAATTTTT >2.23|707279|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT CTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACT >2.24|707345|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT CTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACT >2.25|707411|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT CGTTGTTGTAAATTTAGTTGTTTGTTTAGACTTAAA >2.26|707477|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT TTCTAAAAGTCGCTATTACCTCTTCATCTCTAACT >2.27|707542|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT TTAGCAAATGGAGAGATAAAATTATTTTTACCCTAA >2.28|707608|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT ATGTCAGAGCATTTATAAAAGCCTAAATTAGGCTT >2.29|707673|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT TCACGTTAAGCCTTCTATAAACGAGAATGAAATGGC >2.30|707739|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT TTTATCCCAGCCATACCTTTCACATAAGGTAATGA >2.31|707804|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT TTTTTGGTATGCGCTCACCCTCTTTTAAAAACTCC >2.32|707869|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT ATAGCAAATGAAGATAAAATTATTTTTACCCTAAAGC >2.33|707936|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT TAAAATCCAACGTAATAAGGTAGCTTTGTTTCTACC >2.34|708002|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT GATATCAAAACAAGATTATTGAAAAAGGAAATAGAA >2.35|708068|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT TTTTATTTTCCAAAAATGGCAAGAAATACCATTAAA >2.36|708134|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT ATGATAACACTACTAAACCAGAAAAGCCAACTGATC >2.37|708200|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT TCTGATCCTATTATTTTTGACGATTATAAAATTTC >2.38|708265|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT AACAAATAGATTGGTTTTGCCGGTTGATATCGTAT >2.39|708330|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT AACAAATTGTCTTCTATATTTTTGCCCATAGCAGA >2.40|708395|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT ACAAAAAATGTACCGCTAGTGTCTATTAGGACCTCT |
cas6,cas8b1,cas7b |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010953_2
The CRISPR arrays of NZ_CP010953_2 >merge|NZ_CP010953|2|707119-708460|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCAGTAAAGCCATAGCATTTTTTAGAGATAGTACGTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTTATTCATATCCTCTTTTGTTTTTTTAATTTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCGTTGTTGTAAATTTAGTTGTTTGTTTAGACTTAAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTCTAAAAGTCGCTATTACCTCTTCATCTCTAACTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTAGCAAATGGAGAGATAAAATTATTTTTACCCTAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATGTCAGAGCATTTATAAAAGCCTAAATTAGGCTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCACGTTAAGCCTTCTATAAACGAGAATGAAATGGCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTATCCCAGCCATACCTTTCACATAAGGTAATGAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTTTGGTATGCGCTCACCCTCTTTTAAAAACTCCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATAGCAAATGAAGATAAAATTATTTTTACCCTAAAGCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAAAATCCAACGTAATAAGGTAGCTTTGTTTCTACCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGATATCAAAACAAGATTATTGAAAAAGGAAATAGAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTTATTTTCCAAAAATGGCAAGAAATACCATTAAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATGATAACACTACTAAACCAGAAAAGCCAACTGATCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCTGATCCTATTATTTTTGACGATTATAAAATTTCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAATAACAAATAGATTGGTTTTGCCGGTTGATATCGTATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAATAACAAATTGTCTTCTATATTTTTGCCCATAGCAGAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAATACAAAAAATGTACCGCTAGTGTCTATTAGGACCTCTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC >NZ_CP010953|2|1|707119-708459|PILER-CR GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CCAGTAAAGCCATAGCATTTTTTAGAGATAGTACGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CTTTTATTCATATCCTCTTTTGTTTTTTTAATTTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CCTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CCTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CCGTTGTTGTAAATTTAGTTGTTTGTTTAGACTTAAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CTTCTAAAAGTCGCTATTACCTCTTCATCTCTAACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CTTAGCAAATGGAGAGATAAAATTATTTTTACCCTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CATGTCAGAGCATTTATAAAAGCCTAAATTAGGCTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CTCACGTTAAGCCTTCTATAAACGAGAATGAAATGGC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CTTTATCCCAGCCATACCTTTCACATAAGGTAATGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CTTTTTGGTATGCGCTCACCCTCTTTTAAAAACTCC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CATAGCAAATGAAGATAAAATTATTTTTACCCTAAAGC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CTAAAATCCAACGTAATAAGGTAGCTTTGTTTCTACC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CGATATCAAAACAAGATTATTGAAAAAGGAAATAGAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CTTTTATTTTCCAAAAATGGCAAGAAATACCATTAAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CATGATAACACTACTAAACCAGAAAAGCCAACTGATC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA CTCTGATCCTATTATTTTTGACGATTATAAAATTTC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA TAACAAATAGATTGGTTTTGCCGGTTGATATCGTAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA TAACAAATTGTCTTCTATATTTTTGCCCATAGCAGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA TACAAAAAATGTACCGCTAGTGTCTATTAGGACCTCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAA >NZ_CP010953|2|2|707119-708460|CRISPRCasFinder GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CAGTAAAGCCATAGCATTTTTTAGAGATAGTACGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTTATTCATATCCTCTTTTGTTTTTTTAATTTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CGTTGTTGTAAATTTAGTTGTTTGTTTAGACTTAAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTCTAAAAGTCGCTATTACCTCTTCATCTCTAACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTAGCAAATGGAGAGATAAAATTATTTTTACCCTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC 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GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTTATTCATATCCTCTTTTGTTTTTTTAATTTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTAAAATCCTCAAGAACAGCTAGGTCAGTTGGTACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CGTTGTTGTAAATTTAGTTGTTTGTTTAGACTTAAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTCTAAAAGTCGCTATTACCTCTTCATCTCTAACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTAGCAAATGGAGAGATAAAATTATTTTTACCCTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATGTCAGAGCATTTATAAAAGCCTAAATTAGGCTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCACGTTAAGCCTTCTATAAACGAGAATGAAATGGC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTATCCCAGCCATACCTTTCACATAAGGTAATGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTTTGGTATGCGCTCACCCTCTTTTAAAAACTCC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATAGCAAATGAAGATAAAATTATTTTTACCCTAAAGC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAAAATCCAACGTAATAAGGTAGCTTTGTTTCTACC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GATATCAAAACAAGATTATTGAAAAAGGAAATAGAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTTATTTTCCAAAAATGGCAAGAAATACCATTAAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATGATAACACTACTAAACCAGAAAAGCCAACTGATC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTGATCCTATTATTTTTGACGATTATAAAATTTC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAT AACAAATAGATTGGTTTTGCCGGTTGATATCGTAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAT AACAAATTGTCTTCTATATTTTTGCCCATAGCAGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAT ACAAAAAATGTACCGCTAGTGTCTATTAGGACCTCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC
>NZ_CP010953.1|WP_058909196.1|705555_706470_+|phage-tail-protein MAIAELRKPIIKILYNGVDKTSSMDWISISIEDNEGDEADKCNIKLRWVNAKPRFKDEIIIYANGYFLGSFKISAIKFDYKKSFDIEAISADFMSGFKDKKNRTFANQSYKNIILSIANENGYKTKIDFIRADEVVTLEQHDKSDVAFLQKIATDLDLTFSVKNNTLILIDKNKESNRISYTLNADECISLSYEQKETTNYSSCEVTYRDSKTGLDEVVKAGSGTPVLKLVSMQEDRNEALKLAQSKLQKQGNANLKGNLSIIGRPYFAGAFLNLSMEDGNKKFIIKKVTHKIDKSWISDIEFF >NZ_CP010953.1|WP_058909195.1|705361_705565_+|tail-protein-X MTYYIAKDGDQLDFICFKAYGTLDKEVYAEFLRENEHLLSDELKAGDTVNLPDINIKKDDEVAYLWQ >NZ_CP010953.1|WP_058909194.1|704885_705365_+|hypothetical-protein MSAKFDAKAVSAMFKNALNRTLTKIAKEQKKMLRDDIKVKNKHLHAKRLKRVRAKQNDLSIKLTSTTKYITPFMLEKSARPHPSGYYELENKRGGKFYGTRKKDVSVSGWNIGKGRISGRAYYYVQKISNLDDALLAYTDKLKQKAESIFNLEIKKDWK >NZ_CP010953.1|WP_058909193.1|704502_704889_+|hypothetical-protein MIIQIDKFFFMVKDNIESVTKTLSINLDKQDTITKPIYTHLGGYEESLSFEANILLNEQSRFKDFEKLVKEVKPLKISCFDLVISEYIVINSLTQIAKNFIKTQYNGVAYYAKTLTISGVLVSKGMKI >NZ_CP010953.1|WP_058909192.1|702192_704499_+|phage-tail-tape-measure-protein MANTTLTFGVDLSALGSALKEIDKRTDKLSEDLNKGVNDAVKAYNNGLKQLSFIKNPLKIEETTSKLNQLKADIKKATIAKIDLRLDEAKKKLDGLKSQIIATVGSVMAISSPVKIAIDFEKSMVNVKKLVDFDSDKEFKSFSNDIIKLTREVPKTMNELAGITSEGAKLGIKKDELIDYTKLVAKMSNAFEMSAEETGKNIATLKNVFKIDSIKGVEELGDMINTVADSFNTSVPQVIDLLTSVGSAGKMINLGTKEVANLGAAMTSLGLQSGEAGTTMTKVFSVLSGSGNATAEAKEAFKGLGVDIDDMKKAFEKDGQGTLIKFFDRLKGFDRYKKAEIIKALFGQEHIKNVSTLVDGMDEWKNIIKLTSNEANYLNSIQKEDERQKESLSYKLQILKQNFQELGQRVGELFLPTLKMVTETISSLVNLISSLVSTFPNLTKYIFTTAVAFIALRTVILAKNIAVASSTLLLGNYQKILTKMPFSCANFSGSLKPCIDNLKKLNLTAMLSSPLTMLKGLLLGVAGSIKVLTTALFTNPFGLIALGIGVALFLVWKFWDGFKALFSGFVSGFSTIKGAFLLAFSPFEPVLTMVKNIFGGFGVVLSPVIGWFKELFSQSELSKESMSGWQSVGEVIGKVFASIFGVIATLITAIIGVISLILGIPASFEEAINKVKAIWNSIKEIWAKIWGDDVNATATTNTNITQSTAGSLEPVIAKEKAIMQNTKQNQINDYKTLNINMNNSNATPEQVAKAVQNNSYKFEDIAWR >NZ_CP010953.1|WP_058909191.1|701929_702160_+|hypothetical-protein MRVKNYLSNRYFKANLSPAKDMISKKVSYFALNLELKSIRKIFKRGLKMIYTILKKITKQNIKIVPISSNTNQPFY >NZ_CP010953.1|WP_058909190.1|701563_701821_+|hypothetical-protein MLKKIEPAKVTFKFSDDQEVVLYAPTLAQIRASEKAKDETERLISLLIDMSRGEMDKDFINSLPVAEVAMISETISELVGIETKN >NZ_CP010953.1|WP_058909189.1|701322_701553_+|hypothetical-protein MELNEDELRIFNIGLLEDKRMKLGSVRSDIYSLKSELTEALNEPMDLRQFETITKEIILKLKLKNKLIFEIENLKN >NZ_CP010953.1|WP_058909188.1|700811_701312_+|phage-major-tail-tube-protein MSNITAGAITGGNLFIGGIGMFGDLVSTEMPKFEHETIEASTNIGKYELVLPTLKPLSAKFTISNVNMIYFDLLLLNKTQKIYVKNNISSMNGVETGVVATFEGNLKILEMPNFEMNKEAQMSFEMSCTFVKYEVDKKAALVYDAQNGFYVVDGIDQYEKIRKNIN >NZ_CP010953.1|WP_058909187.1|699605_700715_+|phage-tail-sheath-family-protein MASKFGVNVELYNGSLKPYDIENSRPIAIVGDDDTLDAGLYIYSTIEDALKNVGAGSIKNALDDFNATGIHTQIILSAFKPSANENTETKKTEDLASVLNAIDALKKAEAEIMAKPKFILAPECNDTGVHEKLKQLGEYLRAVYAIEINAINETEALKAVKDLQTKTAIISFQKVIRVDKVVRPASAFLIALYAKVMSETEYGFSQTYSNRVIGGITGVEQKVEFIQGVDCEADRLRSEGVTCIIADNGLRAWGGETRDEDFNSLHTYVIFYTAIDTIFEAQKSAIDKRMRDVLKNVIDSLEAFYRRLVANNVALGFKATVPLDINDNQTIAEGKIYIKHEVQEMPLLKNITNRIYRVDAYSQVLIEEL >NZ_CP010953.1|WP_058909197.1|708660_708921_+|hypothetical-protein MKSYCLKLDDDTFAQLNQIVKNSKTTMAEFIRNALDQKLKETKGSLSYRLTTLSYCDKKESDEILDSVKHLNDDELKIAKKETINL >NZ_CP010953.1|WP_023384768.1|708917_709187_+|hypothetical-protein MKLEINYTKVSIKFFDKHKDIKDKFITNIGKFISGESVDIKALKGIEEPKLYRMRVGKFRVVFWINDKGELVIINVINADSRGGIYKGV >NZ_CP010953.1|WP_058909198.1|709487_709763_+|hypothetical-protein MVNPTITFGVDLTALGNALKEIDKRTDKLSQNLNQGLKDAQKSYNNLQYIKNPLKIEETIAKLNKLKADIKKATIAKFDLKIDNAKKARRA >NZ_CP010953.1|WP_144428492.1|709880_712415_+|hypothetical-protein MDIEKELSNELNLPQMQIRASLQYLWDNHANDGMFKNKRDIYNTIKMLIGYQDYAGNSFKNPNMAYIATKTNDKRMSDMVISRDSAGVTHLNKDKKMSETDKNIFDSKSVVETPKSQRKQQVLGVQMNTSKEHYSPTNNSIIPQNSKQVKPTSEAGDDMIAITKLKNEIDELKATKQGGKYLSSQVKAEVIDKSNELGKLIDERISQGKSINQTLVSEYKAQIQRARYQASKEAKPTNVPVKTEVKTEPTTNKYLSGIKELEKVDYDSLNAHQKDIYDVFAGKKSSTILKVSDIDDLATLEQGNRNAGARKIMIKHAGVEKTGGLNGDELVNIEQTLLKGKIDNNNFEMRNDSLRYAYDYEYKGVKLHVVVDEFNDGKKIFDYYSDRNFVDYDVADAKPQPGSSATSSIIPQNIDNINPASEAQNFFKTLSEYNNLRDNIAKNNKKIDNEHFTLSKSIHNEINGNLSKIFNLVKERDIAAKSRLKKLETMFKFKGVTGNEALKDYLDDLTLMHFNSFSKEELDFIKLTKDKIIKSQGDILAGANKARSFRYGNLDTADDLKNKVFKLFSDLNIKANNFFELEPLLLSHSAKENELRHIVSLDTVSNARLAMEKEANITPIKEFGTNYAEFYHDGSNAIKKLLIEKQGQVAGAFEKEGLGDIDLVWGDDKIGLNKILSKHLDDFSEFEGVSKYDKLNNALNEIISAGKLVDKNGVKTIFYHKGDKEFKVGLSKGFNGVGDNSWVITACDNTDRLTRASGKTYGDTTFTAKRPLANPNIDIIPQNTKFDNTPTFLNKYPKLIDDLKWDKTLKFSSAPKSKEELKARQAFLNEFKILSSKEKIDIKI >NZ_CP010953.1|WP_058909201.1|714775_715126_+|hypothetical-protein MKNTSPLSKDEAVKHIDKTGVERVWKKSNTHIYEKHDTEPKDVVKALNSINTMAKNKNNKYINAFSDNGYFIVFNGNEIVTCFKHKDGNKATFNYFKNASIYDKKEVIKWKIANLL >NZ_CP010953.1|WP_058909202.1|715101_715422_+|hypothetical-protein MENRKLIIEFLGIEWFIEIPNYDDKVTKGLGIIAPITSVKNGKIARIFDIFAPETECIDKAKEHKEFYEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNRGTPQVGL >NZ_CP010953.1|WP_172527660.1|715863_716037_-|hypothetical-protein MEDVKKFLWIIFCTFLIIGTIVNIKEAAVPLISIIVLSPLYFWLDYKLNPHKYKKDP >NZ_CP010953.1|WP_058909203.1|716337_717054_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIYQLKVFLKLNQNVDFINSPEFLSTNLHKAMLGDEALRSIHMQRYLKPYSIGFLYSMKGKKDTFVSGEDMYFYVRSIDESFISKLRICLENSKNLGFNVYLSKFENLDIKQVDRLYTMSPATIVLKEGDKTIPWRRENSDITVLKEALISNLKNKYEYFLDKKIEIKDDIIELIEIKTNRAFAFRYKNGKIYAYRYQIHFSQNRLAQEFANIAMILGVGVKNTLGFGFCMRSNNAV >NZ_CP010953.1|WP_023384778.1|717043_718735_+|hypothetical-protein MLFELLDEFKKQLEKNKHIVTQNHILKDGVYARISDEKCEIFYVKTITEKIGKTAQKRTILYKQNGDIALNDDMQWFEQADYLSFLWDMNKAVLPNKKFHSINFLSLFFKLEESEYVKENLEEYFDIFRDYSAFNKAKDKEILSFYMDYIKDENRQNLITNSVVLSKKYFNDINDFAVQNNFKKCYIKFFIDKDFEIYEKESQIYIDLKIYNSNEHNIKYNNEIFGLSNFNMGMNSKKPFLEHKNRLFKIPYAISQKDALASKMLFDWLGSQNKRIIRDFNSIFISKFNKQSKAVVSDFEYVPVDKNKFKFDKFKLKNFMNIENGEKEILSFDDFKQVIDEQLYHKCLFGNLYNDEIRVSKRISEDMQNLLYQTRCSMVEYFDKFNNNEFYYVIQKYSNDFIKIAMQDSEFGRLNGKKSINLLLSIKEIKGEKVDIDGIKNRVISALTDDNVTKLSGNEYYFLVGNLAMYLVSKSKTWKKTFALTDPYTKARNTKKLKMALFIDFDRYNYDIFLENGILKKAFSLAQNCEDIVMSNNDQQMVLIGMMTKNIIKKPGEKDEISE >NZ_CP010953.1|WP_058909204.1|718718_719660_+|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MKLANRIYGIIGIKSTMANWNADFSGRPKSTGNGDIFASDKALKYPMKKMWESYGKNILFVKSLKQGKSKDGNDKLVPNTLGERYGLLFGDIKKAKSTKEVLSNLFNCIDVKNFGATFPEDGYNLSITGAVQIGQGFNKFGDINIEVQNILSPFADSRAKEKNENGEDASQSTLGTKIVTDEAHYFYGFCINPLAYNDYKEILGDDFGYNEDDYAEFKKAARFCATYFNSNSKFGCENEFAMFIETAVDAYLPDLSSYMDFICKDKNRLVNLEKIEKMIESSDVKKVEIYYNPLSLDVETKFDKFDIYSGNKI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP010953_3 | 713110-714581 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010953_3
|
22 spacers
spacers of NZ_CP010953_3
>3.1|713140|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGCGTAGCACCAAAAGAAGCGTATGAAAGCATAG >3.2|713205|36|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACTAGTGGCAAATGGGCTAAGAGTTTTTATAAGT >3.3|713271|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTATCATTTTAAATTTCCTTTTTTTATTCTGTTT >3.4|713336|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCGGACTTTTTAAATATTTTAAACAAAATGACTGA >3.5|713401|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGAAATGCTCAAATAACTTGTACATTTCTTTTAA >3.6|713466|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGAAAGATAAACTTTTGTAGGAGATACAAAATA >3.7|713531|36|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGATAAAAAGCTATACAAGCAAAGCAAGACAACTT >3.8|713597|36|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGTTATTTTATACTCTACCCCCGAGTAAAGAAAT >3.9|713663|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACTAGTATCTATAAATGACTTCTTAAGTACTTT >3.10|713728|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAACTAGTATCTATAAATGACTTCTTAAGTACTTT >3.11|713793|36|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAATTTGCTTAAGAACATATTTACCGTATTATTT >3.12|713859|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAAAAATACTCTTTGCACTCCTCTTTACTAAGCCC >3.13|713924|36|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGGAAAACTCCTCCGTCTTAAGCTTTACTTGTGCT >3.14|713990|37|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTTTACAAGCACGTCTCCCTCATATATTCTAATCC >3.15|714057|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAGGAGCAAGGGCTTGGAAATGGTTTAGCAATCT >3.16|714122|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAATATAAAAGAATTGCTGAGTTTTTTTATAGGGC >3.17|714187|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATATTCAGTGACGTTCTAAGCGTTGTTGATACT >3.18|714252|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGCATTGTGATAGTGTTTCCTACGTTTAAAGGC >3.19|714317|36|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACATAACATAATAGCTGATATAAACTACAGATATA >3.20|714383|36|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAATAAGTTAGTTAAACATAATTTTAAAGAGTCT >3.21|714449|36|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAAATACCGCTTTGGATATATAGAAAAATTAACTT >3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT CTAAGACTTACACCTGTTTTTGATACATTAGAAAACA |
cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010953_3
The CRISPR arrays of NZ_CP010953_3 >merge|NZ_CP010953|3|713110-714581|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAGCGTAGCACCAAAAGAAGCGTATGAAAGCATAGGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAACTAGTGGCAAATGGGCTAAGAGTTTTTATAAGTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAAACTCTATCATTTTAAATTTCCTTTTTTTATTCTGTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCGGACTTTTTAAATATTTTAAACAAAATGACTGAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAGAAATGCTCAAATAACTTGTACATTTCTTTTAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATAGAAAGATAAACTTTTGTAGGAGATACAAAATAGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAATAGGATAAAAAGCTATACAAGCAAAGCAAGACAACTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCTGTTATTTTATACTCTACCCCCGAGTAAAGAAATGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAACTAGTATCTATAAATGACTTCTTAAGTACTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTAACTAGTATCTATAAATGACTTCTTAAGTACTTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTTTAATTTGCTTAAGAACATATTTACCGTATTATTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCAAAAATACTCTTTGCACTCCTCTTTACTAAGCCCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCTGGAAAACTCCTCCGTCTTAAGCTTTACTTGTGCTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATCTTTACAAGCACGTCTCCCTCATATATTCTAATCCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACAAAGGAGCAAGGGCTTGGAAATGGTTTAGCAATCTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACGAATATAAAAGAATTGCTGAGTTTTTTTATAGGGCGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTGATATTCAGTGACGTTCTAAGCGTTGTTGATACTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATAGCATTGTGATAGTGTTTCCTACGTTTAAAGGCGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACCACATAACATAATAGCTGATATAAACTACAGATATAGTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAACGAAAATAAGTTAGTTAAACATAATTTTAAAGAGTCTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACTCAAATACCGCTTTGGATATATAGAAAAATTAACTTGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACCTAAGACTTACACCTGTTTTTGATACATTAGAAAACAGTTTGCTAATCACAAAGCTCGTTTAAAATC >NZ_CP010953|3|2|713110-714514|PILER-CR GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGCGTAGCACCAAAAGAAGCGTATGAAAGCATAG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAACTAGTGGCAAATGGGCTAAGAGTTTTTATAAGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAAAC TCTATCATTTTAAATTTCCTTTTTTTATTCTGTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCGGACTTTTTAAATATTTTAAACAAAATGACTGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGAAATGCTCAAATAACTTGTACATTTCTTTTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATAGAAAGATAAACTTTTGTAGGAGATACAAAATA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAT AGGATAAAAAGCTATACAAGCAAAGCAAGACAACTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTGTTATTTTATACTCTACCCCCGAGTAAAGAAAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAACTAGTATCTATAAATGACTTCTTAAGTACTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAACTAGTATCTATAAATGACTTCTTAAGTACTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTAATTTGCTTAAGAACATATTTACCGTATTATTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CAAAAATACTCTTTGCACTCCTCTTTACTAAGCCC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTGGAAAACTCCTCCGTCTTAAGCTTTACTTGTGCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATCTTTACAAGCACGTCTCCCTCATATATTCTAATCC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAGGAGCAAGGGCTTGGAAATGGTTTAGCAATCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GAATATAAAAGAATTGCTGAGTTTTTTTATAGGGC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TGATATTCAGTGACGTTCTAAGCGTTGTTGATACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATAGCATTGTGATAGTGTTTCCTACGTTTAAAGGC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC CACATAACATAATAGCTGATATAAACTACAGATATA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC GAAAATAAGTTAGTTAAACATAATTTTAAAGAGTCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCAAATACCGCTTTGGATATATAGAAAAATTAACTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC >NZ_CP010953|3|3|713110-714581|CRISPRCasFinder GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGCGTAGCACCAAAAGAAGCGTATGAAAGCATAG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAACTAGTGGCAAATGGGCTAAGAGTTTTTATAAGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAAAC TCTATCATTTTAAATTTCCTTTTTTTATTCTGTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCGGACTTTTTAAATATTTTAAACAAAATGACTGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGAAATGCTCAAATAACTTGTACATTTCTTTTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATAGAAAGATAAACTTTTGTAGGAGATACAAAATA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAT 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GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTAAGACTTACACCTGTTTTTGATACATTAGAAAACA GTTTGCTAATCACAAAGCTCGTTTAAAATC >NZ_CP010953|3|2|713110-714581|CRT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGCGTAGCACCAAAAGAAGCGTATGAAAGCATAG GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAACTAGTGGCAAATGGGCTAAGAGTTTTTATAAGT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTAAAAC TCTATCATTTTAAATTTCCTTTTTTTATTCTGTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCGGACTTTTTAAATATTTTAAACAAAATGACTGA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAGAAATGCTCAAATAACTTGTACATTTCTTTTAA GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATAGAAAGATAAACTTTTGTAGGAGATACAAAATA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAT AGGATAAAAAGCTATACAAGCAAAGCAAGACAACTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCTGTTATTTTATACTCTACCCCCGAGTAAAGAAAT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAACTAGTATCTATAAATGACTTCTTAAGTACTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TAACTAGTATCTATAAATGACTTCTTAAGTACTTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TTTAATTTGCTTAAGAACATATTTACCGTATTATTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CAAAAATACTCTTTGCACTCCTCTTTACTAAGCCC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTGGAAAACTCCTCCGTCTTAAGCTTTACTTGTGCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATCTTTACAAGCACGTCTCCCTCATATATTCTAATCC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC AAAGGAGCAAGGGCTTGGAAATGGTTTAGCAATCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC GAATATAAAAGAATTGCTGAGTTTTTTTATAGGGC GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TGATATTCAGTGACGTTCTAAGCGTTGTTGATACT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC ATAGCATTGTGATAGTGTTTCCTACGTTTAAAGGC GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC CACATAACATAATAGCTGATATAAACTACAGATATA GTTTGCTAATGACAAGATTTGTGTTGAAAC GAAAATAAGTTAGTTAAACATAATTTTAAAGAGTCT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC TCAAATACCGCTTTGGATATATAGAAAAATTAACTT GTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAAC CTAAGACTTACACCTGTTTTTGATACATTAGAAAACA GTTTGCTAATCACAAAGCTCGTTTAAAATC
>NZ_CP010953.1|WP_144428492.1|709880_712415_+|hypothetical-protein MDIEKELSNELNLPQMQIRASLQYLWDNHANDGMFKNKRDIYNTIKMLIGYQDYAGNSFKNPNMAYIATKTNDKRMSDMVISRDSAGVTHLNKDKKMSETDKNIFDSKSVVETPKSQRKQQVLGVQMNTSKEHYSPTNNSIIPQNSKQVKPTSEAGDDMIAITKLKNEIDELKATKQGGKYLSSQVKAEVIDKSNELGKLIDERISQGKSINQTLVSEYKAQIQRARYQASKEAKPTNVPVKTEVKTEPTTNKYLSGIKELEKVDYDSLNAHQKDIYDVFAGKKSSTILKVSDIDDLATLEQGNRNAGARKIMIKHAGVEKTGGLNGDELVNIEQTLLKGKIDNNNFEMRNDSLRYAYDYEYKGVKLHVVVDEFNDGKKIFDYYSDRNFVDYDVADAKPQPGSSATSSIIPQNIDNINPASEAQNFFKTLSEYNNLRDNIAKNNKKIDNEHFTLSKSIHNEINGNLSKIFNLVKERDIAAKSRLKKLETMFKFKGVTGNEALKDYLDDLTLMHFNSFSKEELDFIKLTKDKIIKSQGDILAGANKARSFRYGNLDTADDLKNKVFKLFSDLNIKANNFFELEPLLLSHSAKENELRHIVSLDTVSNARLAMEKEANITPIKEFGTNYAEFYHDGSNAIKKLLIEKQGQVAGAFEKEGLGDIDLVWGDDKIGLNKILSKHLDDFSEFEGVSKYDKLNNALNEIISAGKLVDKNGVKTIFYHKGDKEFKVGLSKGFNGVGDNSWVITACDNTDRLTRASGKTYGDTTFTAKRPLANPNIDIIPQNTKFDNTPTFLNKYPKLIDDLKWDKTLKFSSAPKSKEELKARQAFLNEFKILSSKEKIDIKI >NZ_CP010953.1|WP_058909198.1|709487_709763_+|hypothetical-protein MVNPTITFGVDLTALGNALKEIDKRTDKLSQNLNQGLKDAQKSYNNLQYIKNPLKIEETIAKLNKLKADIKKATIAKFDLKIDNAKKARRA >NZ_CP010953.1|WP_023384768.1|708917_709187_+|hypothetical-protein MKLEINYTKVSIKFFDKHKDIKDKFITNIGKFISGESVDIKALKGIEEPKLYRMRVGKFRVVFWINDKGELVIINVINADSRGGIYKGV >NZ_CP010953.1|WP_058909197.1|708660_708921_+|hypothetical-protein MKSYCLKLDDDTFAQLNQIVKNSKTTMAEFIRNALDQKLKETKGSLSYRLTTLSYCDKKESDEILDSVKHLNDDELKIAKKETINL >NZ_CP010953.1|WP_058909196.1|705555_706470_+|phage-tail-protein MAIAELRKPIIKILYNGVDKTSSMDWISISIEDNEGDEADKCNIKLRWVNAKPRFKDEIIIYANGYFLGSFKISAIKFDYKKSFDIEAISADFMSGFKDKKNRTFANQSYKNIILSIANENGYKTKIDFIRADEVVTLEQHDKSDVAFLQKIATDLDLTFSVKNNTLILIDKNKESNRISYTLNADECISLSYEQKETTNYSSCEVTYRDSKTGLDEVVKAGSGTPVLKLVSMQEDRNEALKLAQSKLQKQGNANLKGNLSIIGRPYFAGAFLNLSMEDGNKKFIIKKVTHKIDKSWISDIEFF >NZ_CP010953.1|WP_058909195.1|705361_705565_+|tail-protein-X MTYYIAKDGDQLDFICFKAYGTLDKEVYAEFLRENEHLLSDELKAGDTVNLPDINIKKDDEVAYLWQ >NZ_CP010953.1|WP_058909194.1|704885_705365_+|hypothetical-protein MSAKFDAKAVSAMFKNALNRTLTKIAKEQKKMLRDDIKVKNKHLHAKRLKRVRAKQNDLSIKLTSTTKYITPFMLEKSARPHPSGYYELENKRGGKFYGTRKKDVSVSGWNIGKGRISGRAYYYVQKISNLDDALLAYTDKLKQKAESIFNLEIKKDWK >NZ_CP010953.1|WP_058909193.1|704502_704889_+|hypothetical-protein MIIQIDKFFFMVKDNIESVTKTLSINLDKQDTITKPIYTHLGGYEESLSFEANILLNEQSRFKDFEKLVKEVKPLKISCFDLVISEYIVINSLTQIAKNFIKTQYNGVAYYAKTLTISGVLVSKGMKI >NZ_CP010953.1|WP_058909192.1|702192_704499_+|phage-tail-tape-measure-protein MANTTLTFGVDLSALGSALKEIDKRTDKLSEDLNKGVNDAVKAYNNGLKQLSFIKNPLKIEETTSKLNQLKADIKKATIAKIDLRLDEAKKKLDGLKSQIIATVGSVMAISSPVKIAIDFEKSMVNVKKLVDFDSDKEFKSFSNDIIKLTREVPKTMNELAGITSEGAKLGIKKDELIDYTKLVAKMSNAFEMSAEETGKNIATLKNVFKIDSIKGVEELGDMINTVADSFNTSVPQVIDLLTSVGSAGKMINLGTKEVANLGAAMTSLGLQSGEAGTTMTKVFSVLSGSGNATAEAKEAFKGLGVDIDDMKKAFEKDGQGTLIKFFDRLKGFDRYKKAEIIKALFGQEHIKNVSTLVDGMDEWKNIIKLTSNEANYLNSIQKEDERQKESLSYKLQILKQNFQELGQRVGELFLPTLKMVTETISSLVNLISSLVSTFPNLTKYIFTTAVAFIALRTVILAKNIAVASSTLLLGNYQKILTKMPFSCANFSGSLKPCIDNLKKLNLTAMLSSPLTMLKGLLLGVAGSIKVLTTALFTNPFGLIALGIGVALFLVWKFWDGFKALFSGFVSGFSTIKGAFLLAFSPFEPVLTMVKNIFGGFGVVLSPVIGWFKELFSQSELSKESMSGWQSVGEVIGKVFASIFGVIATLITAIIGVISLILGIPASFEEAINKVKAIWNSIKEIWAKIWGDDVNATATTNTNITQSTAGSLEPVIAKEKAIMQNTKQNQINDYKTLNINMNNSNATPEQVAKAVQNNSYKFEDIAWR >NZ_CP010953.1|WP_058909191.1|701929_702160_+|hypothetical-protein MRVKNYLSNRYFKANLSPAKDMISKKVSYFALNLELKSIRKIFKRGLKMIYTILKKITKQNIKIVPISSNTNQPFY >NZ_CP010953.1|WP_058909201.1|714775_715126_+|hypothetical-protein MKNTSPLSKDEAVKHIDKTGVERVWKKSNTHIYEKHDTEPKDVVKALNSINTMAKNKNNKYINAFSDNGYFIVFNGNEIVTCFKHKDGNKATFNYFKNASIYDKKEVIKWKIANLL >NZ_CP010953.1|WP_058909202.1|715101_715422_+|hypothetical-protein MENRKLIIEFLGIEWFIEIPNYDDKVTKGLGIIAPITSVKNGKIARIFDIFAPETECIDKAKEHKEFYEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNRGTPQVGL >NZ_CP010953.1|WP_172527660.1|715863_716037_-|hypothetical-protein MEDVKKFLWIIFCTFLIIGTIVNIKEAAVPLISIIVLSPLYFWLDYKLNPHKYKKDP >NZ_CP010953.1|WP_058909203.1|716337_717054_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKIYQLKVFLKLNQNVDFINSPEFLSTNLHKAMLGDEALRSIHMQRYLKPYSIGFLYSMKGKKDTFVSGEDMYFYVRSIDESFISKLRICLENSKNLGFNVYLSKFENLDIKQVDRLYTMSPATIVLKEGDKTIPWRRENSDITVLKEALISNLKNKYEYFLDKKIEIKDDIIELIEIKTNRAFAFRYKNGKIYAYRYQIHFSQNRLAQEFANIAMILGVGVKNTLGFGFCMRSNNAV >NZ_CP010953.1|WP_023384778.1|717043_718735_+|hypothetical-protein MLFELLDEFKKQLEKNKHIVTQNHILKDGVYARISDEKCEIFYVKTITEKIGKTAQKRTILYKQNGDIALNDDMQWFEQADYLSFLWDMNKAVLPNKKFHSINFLSLFFKLEESEYVKENLEEYFDIFRDYSAFNKAKDKEILSFYMDYIKDENRQNLITNSVVLSKKYFNDINDFAVQNNFKKCYIKFFIDKDFEIYEKESQIYIDLKIYNSNEHNIKYNNEIFGLSNFNMGMNSKKPFLEHKNRLFKIPYAISQKDALASKMLFDWLGSQNKRIIRDFNSIFISKFNKQSKAVVSDFEYVPVDKNKFKFDKFKLKNFMNIENGEKEILSFDDFKQVIDEQLYHKCLFGNLYNDEIRVSKRISEDMQNLLYQTRCSMVEYFDKFNNNEFYYVIQKYSNDFIKIAMQDSEFGRLNGKKSINLLLSIKEIKGEKVDIDGIKNRVISALTDDNVTKLSGNEYYFLVGNLAMYLVSKSKTWKKTFALTDPYTKARNTKKLKMALFIDFDRYNYDIFLENGILKKAFSLAQNCEDIVMSNNDQQMVLIGMMTKNIIKKPGEKDEISE >NZ_CP010953.1|WP_058909204.1|718718_719660_+|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MKLANRIYGIIGIKSTMANWNADFSGRPKSTGNGDIFASDKALKYPMKKMWESYGKNILFVKSLKQGKSKDGNDKLVPNTLGERYGLLFGDIKKAKSTKEVLSNLFNCIDVKNFGATFPEDGYNLSITGAVQIGQGFNKFGDINIEVQNILSPFADSRAKEKNENGEDASQSTLGTKIVTDEAHYFYGFCINPLAYNDYKEILGDDFGYNEDDYAEFKKAARFCATYFNSNSKFGCENEFAMFIETAVDAYLPDLSSYMDFICKDKNRLVNLEKIEKMIESSDVKKVEIYYNPLSLDVETKFDKFDIYSGNKI >NZ_CP010953.1|WP_171941710.1|719656_720421_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MMKAISFKLSGKFAHFKKPDVNEYVYFTYNNIPKPTLLGLLGAIIGLKGYAQKTYNNKKDKKSLLNNENRSNEPEFYERLKHLKICIIPLVKYGKFSKKIQVFNNSVGYASTEEGGNLIVREQWLENPSWQILIEDDGSAEFETISQYLFDKKAKFIPYLGKNDHFADISEVEKIDLAESKKDKIVIKSLFLDNLAKQVDDPDDEISYLFNEFYPIGFNELMFYKLEKTTFTNQICQAMDGKWYEFKDGTICFF >NZ_CP010953.1|WP_160323841.1|720408_722799_+|CRISPR-associated-helicase-Cas3' MLLLNIYLAHKAPNKDPETLQAHCDLTKEYLQKIKNSKNLNDIIKNLANQILNDDVILEFFDDFIINHDLGKMNPAFQRFKMENKEFNEASGESTHSNHSFNKLKDKYRDFFSNSTDQDINKIICVFYYLLSNVLNHHGHLKDGFDDKYLKISDKEEDFDTLDKKFYNSKKRTDFDFELFILIKLHFSLLIASDFYATSEYMNDIKIDDFGVFDKDKKEIIYSKFREFYSSLKPRSDIDILRSDIFQKSSKTLYDNLDKNIFYLEAPTGSGKTLTSLNLALNLLNLNSNLNKIFYVFPFNTLISQSKSIFESIFGDEFDISVINSITPPKFNEGNDQENSESKYDKTYINRVFYNYPFILTSHVALFKTLFGISKEENYGLFSLANSVIILDEIQSYRSNLWEFMALFFDSFAKHLNIKFIIMSATLPKISNLLKNNDDKWCDLLANSNYFQNTLFKDRVKVDFSLLEIGQDELFETIVSKIKEHKKDKILVEFIKKSSARDFYNFIRFKFDGYDIFELSGDDNKLYQKIVIAKLKNSNTKAIVVATQVIEAGVDIDMDIGFKDIATFESEEQFLGRINRSALKPGSLAYFFDYDNASMIYKNDSRIKFSLKDDGLKKCLIDKNFNPYYEKLLYELKCENSRVNGGFNSVRENFQKYISSINFIKISENMQLINDDRVRIFLPFKIDVSDFDMSEYGDVEHFMDGNFLDGKKIWEAIICLNEVKEYGKRKIEALSLNSLADIFSFNVFMVDDLLSISSQMRYGYIYIEDCDGFIDENGKFDRTAFAKKFNNEDLLL >NZ_CP010953.1|WP_058909205.1|722795_723281_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKITGTLINYFFHCKRQCYLFYNRINLEDNSEDVKIGKVLHEIKFEDEIKFENIALDKITDEYVIEFKKSDSDETASMWQLLFYLKKLKEIGIFRKGLLEFGENRNLPTKRLKVELTTHKELELEQIYSQISELMSLKTPPDPLKSSLKCKKCAYFNYCFI >NZ_CP010953.1|WP_058909206.1|723289_724291_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MPKLHTRYIFSMGELSRKDNSLAFKNEKGTTYIPIVGIREIYCMNEVSMNSKLFDFLAKNGITIHFFNYYGNYSGSFYPKKHLISGRIITSQVEALATRNIIAKSIVKGIALNMHEVLYHYYRHGKAELKPLLDYLKLKVPNMLINANTIPQIMFIEGQIWSKFYDSFELFLDESFSLAKRVKRPPDNPMNAMISFGNSLLYTKTISAIYQTHLEQSISYLHESSDARFSLSLDLSEVFKPIIVFKTVFELINLKKINIKKHFEKKVEFCLLNEAGRKIFVESFEERLNESFLHSKLGRKVSYKTALKLEGYKLIKFICEAREFIPFSLKDKR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP010953_4 | 725137-726554 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010953_4
|
20 spacers
spacers of NZ_CP010953_4
>4.1|725166|37|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT TAATTCTCTTTATAGGGATAGATGTATGAGCGAAAAT >4.2|725232|37|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT TATTTTTGACGAATGTGATCCAGACGGAGATGCGGAA >4.3|725298|37|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT TCATTTATTAGTTTTTTCTCTAAAGCCACCAGAGCGT >4.4|725364|37|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT TTGCTCTATAAGACCATTTTGTATAAAATGGTGGTGC >4.5|725430|38|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT TACAAATATTTTTGAAAGCAAATACTTTGTCAAAATTT >4.6|725497|38|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT TCTCTGTGTAGAATTAGAAACAATATTTGCAAATTCAA >4.7|725564|37|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT TTTGCTATTTGCAAATTTTGCAGGGACGGCTTTACCA >4.8|725630|38|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT CTTAGCTCTTGCGATGGCTTTATCAAAATTCATATTTA >4.9|725697|37|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT CGTTTTTTCCTTTAAAATATCGTGAGCTTCCTCTTCC >4.10|725763|37|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT CTCGCCTATGAACAGAGCTAGTCCGTTTTCATTTATT >4.11|725829|37|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT CTTGTAGATCCATATTGTTATTTCTACTTTACATTTT >4.12|725895|37|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT CACTTTAGTATTTAAATAAGCCGTATTAAAAGCGTTT >4.13|725167|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder AATTCTCTTTATAGGGATAGATGTATGAGCGAAAAT >4.14|725233|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder ATTTTTGACGAATGTGATCCAGACGGAGATGCGGAA >4.15|725299|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder CATTTATTAGTTTTTTCTCTAAAGCCACCAGAGCGT >4.16|725365|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder TGCTCTATAAGACCATTTTGTATAAAATGGTGGTGC >4.17|725431|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder ACAAATATTTTTGAAAGCAAATACTTTGTCAAAATTT >4.18|725498|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder CTCTGTGTAGAATTAGAAACAATATTTGCAAATTCAA >4.19|725565|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder TTGCTATTTGCAAATTTTGCAGGGACGGCTTTACCA >4.20|725631|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder TTAGCTCTTGCGATGGCTTTATCAAAATTCATATTTA >4.21|725698|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder GTTTTTTCCTTTAAAATATCGTGAGCTTCCTCTTCC >4.22|725764|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder TCGCCTATGAACAGAGCTAGTCCGTTTTCATTTATT >4.23|725830|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder TTGTAGATCCATATTGTTATTTCTACTTTACATTTT >4.24|725896|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder ACTTTAGTATTTAAATAAGCCGTATTAAAAGCGTTT >4.25|725962|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder AAAACATTTTTAGAGGCGTCTTTGGCTACTGCTTC >4.26|726027|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder CATGAAATTTCCGTTGATATAAAAATAAGTTTAATG >4.27|726093|69|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder TTAAGTTTGCTAATGACAATATTTGTGTTGAAACATGATACAAAGCGTGGTTGGTAGATATTATATTTC >4.28|726192|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder AAAACATTTTTAGAGGCGTCTTTGGCTACTGCTTC >4.29|726257|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder ACGAAATTTCCGTTGATATAAAAAATAAGTTTAATG >4.30|726323|70|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder TTAAGTTTGCTAATGATAATATTTGTGTTGAAACACTTTAGTATTTAAATAAGCCGTATTAAAAGCGTTT >4.31|726423|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder CAAAGCAGGTTTTAGTTCATCACGTTAAGCCTTCTA >4.32|726489|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder TTGTCGGCATCACCGCAATGAACTATTGTATCTACA >4.33|725961|36|NZ_CP010953|CRT CAAAACATTTTTAGAGGCGTCTTTGGCTACTGCTTC >4.34|726026|37|NZ_CP010953|CRT ACATGAAATTTCCGTTGATATAAAAATAAGTTTAATG >4.35|726128|34|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT TGATACAAAGCGTGGTTGGTAGATATTATATTTC >4.36|726193|34|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT AAACATTTTTAGAGGCGTCTTTGGCTACTGCTTC >4.37|726258|35|NZ_CP010953|CRT CGAAATTTCCGTTGATATAAAAAATAAGTTTAATG >4.38|726357|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT ACTTTAGTATTTAAATAAGCCGTATTAAAAGCGTT >4.39|726423|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT CAAAGCAGGTTTTAGTTCATCACGTTAAGCCTTCT >4.40|726489|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT TTGTCGGCATCACCGCAATGAACTATTGTATCTAC |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010953_4
The CRISPR arrays of NZ_CP010953_4 >merge|NZ_CP010953|4|725137-726554|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,CRT,PILER-CR,CRT 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MEDVKKFLWIIFCTFLIIGTIVNIKEAAVPLISIIVLSPLYFWLDYKLNPHKYKKDP >NZ_CP010953.1|WP_058909202.1|715101_715422_+|hypothetical-protein MENRKLIIEFLGIEWFIEIPNYDDKVTKGLGIIAPITSVKNGKIARIFDIFAPETECIDKAKEHKEFYEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNRGTPQVGL >NZ_CP010953.1|WP_058909207.1|726671_726986_+|hypothetical-protein MENRKLIIGYYGIEWAIKVPDYDDKGTKGLGIIAPITSVKDGKIVEVFDILTPHKEDIDDAKEYKEFYEICDFEVPQTNHKFTGTFIDALEYIKDTFNQVSKTV >NZ_CP010953.1|WP_160323842.1|727114_727261_+|hypothetical-protein MRKINLYIGKEIEWGIYDPNIPIYDKKILIKNAYAIILLLLLKLRITK >NZ_CP010953.1|WP_058909208.1|727260_727458_+|hypothetical-protein MHFFDIGAITSEILDIAKNDELMQETCEFEVLIHNTFKENFTGTFIDALEYIKDTFNRGIPQVGL >NZ_CP010953.1|WP_173636912.1|727697_727925_+|hypothetical-protein MEAKMSPEEFGLSQYERMLLGGLNLSAGFEVGFGASYCKCDSLVLKEYCKNCGIDFLWAYSIFKRYANVLNKVED >NZ_CP010953.1|WP_023384796.1|728665_730111_+|acetyl-CoA-carboxylase-subunit-A MIHKILIANRGEIAVRIVRACKDLHIKNVAIYTEPDRECLHVKVADEAYQIGKDPIKGYLDSKRIVEVAKACGADAIHPGYGFLSENYEFAKEVEDAGLIFIGPNSDIIRKMGNKNIARFLMKKNGIPVVPGTEKLNSETIETIKDYAMKIGYPVILKASGGGGGRGIREVWNEDELESNYESCKREAKAFFNNDEVFMEKFIEKPRHIEFQILGDNYGNLIHLCERDCSIQRRHQKVIEIAPCPTISEDLRKRMGVAAVAAAKAVGYTNAGTIEFLLDDYNNFYFMEMNTRIQVEHGVTEEITGVDLISRQIRIAAGEILDIEQSEVRPQGVSIEARITAENVWKNFAPSPGRITGYFPALGPGVRVDSHIYQDYAIPPFYDSLVAKLIVKGTSYDLAVSKLERALDEFKIEGVRTTLPFLLAISKRRHFRRGFFDTSYIEERLQDILENTQDHHQENKEEVIAAIAAAIKKVKEDRAKE >NZ_CP010953.1|WP_023384797.1|730117_730354_+|hypothetical-protein MNDFFDSLKNIKNELVKEQKSQEVKVPKKPKPNPNRDEFKDIFTEPNEIEMPDAKEHRLKDEFLEFIKHSDVKKLERD >NZ_CP010953.1|WP_039362197.1|730340_731057_+|arginyltransferase MREIDFCTLDTLCPYLKDRNSRSMYRYVSQCSFDYNSNLVKHGYRRFGSYFSKPVCDGCDECKSIRIDAFNFKFTKSHRRIINKNSNTKIVVSKPYISQKHIDLYEKYHKFMHEKRGWEYYDLDFRRYYSVYVEGAGDFGYEIDYFVDDELVCVDLVDIVDDGISSIYCYWDIDFAHLSLGKFSLLNQIKIALKNDLRWIYLGFYVKDCASLAYKGEYKPYETLKKYCDMDEKPIWEF >NZ_CP010953.1|WP_023384799.1|731112_731937_+|adenylosuccinate-lyase MQITQTLESITITTDDCDLFLNLSNKIRQSFANAIGNRDKVIIFYNENELVQRKYFLKLIGKIYANSVGKGIDFLLTHHKNIKLVYKKPNSLQILINVDVKFENSRVVFDLKNSEELFTKYLIRGLGDTRHEYFESKKILVISPKTTENVELLDNILNFREHLKYIVNFNYDKKSYDEFKKRAKILTSKTYIRRFSMLANLLEEHFETLGCKATDDFETVRTNYLNLTKVYHPDKHVGEPNEVQKSYIDKFQKIGLAYEALKPYFKEQKSFISA >NZ_CP010953.1|WP_058909209.1|731981_732755_+|pyridoxine-5'-phosphate-synthase MKLGVNIDHAAVLREARAVNDPQIIHAMFEAVSGGADQITIHLREDRRHINEDDVKNIINLSPIPVNLECSISSEIIDIVCALKPHRATIVPEKREELTTEGGLSLDSLNLKNVISKLNDNDIKVSLFIDPKKNDVTVSKELGATCVELHTGAYANTFLMLNSNLNHTKYKIDSLNLKRSELEILLNSELTRIKEAANLGINLGLEVAAGHGLNYQNVTAIAAIKDIFELNIGQSIVAKSVFVGLKNAVKEMMELVK >NZ_CP010953.1|WP_023384801.1|732751_733675_+|4-hydroxythreonine-4-phosphate-dehydrogenase MNLPKIAISVGDINGVGIEIALKSHNEIKNICSPVYFINNELLNSAANILKFTIPNDFEIFECGNSFNIKPGHVSKKSGKFSFVSFQNALLYTQNKHAQALVTMPINKESWKKAGVPYVGHTDALGKYFGKNAIMMLGCEELFVALYTDHLALKDVSAKIKAKNLALFLVDFYNSSKFENIGVLGFNPHASDNETIGGKEEKEIIKAIKLANNRLKKEVFTGPLVPDAAFTKSSLKRCNRLVSMYHDVGLAPLKALYFDKSINVSLNLPIVRTSVDHGTAFDIAYKGKAEIKSYIEAIKFAIKSCGY |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP010953_5 | 1183321-1183502 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010953_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP010953_5
>5.1|1183361|44|NZ_CP010953|PILER-CR AGTTGCTGAACCTAAACCGCTATAGATATAACCGCCATAGACAT >5.2|1183445|44|NZ_CP010953|PILER-CR GGTATTTGAATTTGCTGAACCTTTATTGCTATGACCACCATAGA >5.3|1183419|46|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder GGTATTTGAATTTGCTGAACCTTTATTGCTATGACCACCATAGATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010953_5
The CRISPR arrays of NZ_CP010953_5 >merge|NZ_CP010953|5|1183321-1183502|PILER-CR,CRISPRCasFinder CCTGAGATAGTTACAGTGTTGTTAGTTGCTGAACCTAAACCGCTATAGATATAACCGCCATAGACATTGTTATTTATAGTTCCACCTGAGATATTTACGGTATTTGAATTTGCTGAACCTTTATTGCTATGACCACCATAGATATTATTTATAGTTCCACCAGAGATATTTACAGTGTTGTT >NZ_CP010953|5|6|1183321-1183502|PILER-CR CCTGAGATAGTTACAGTGTTGTTAGTTGCTGAACCTAAAC CGCTATAGATATAACCGCCATAGACATTGTTATTTATAGTTCCA CCTGAGATATTTACGGTATTTGAATTTGCTGAACCTTTAT TGCTATGACCACCATAGATATTATTTATAGTTCCACCAGAGATA TTTACAGTGTTGTT >NZ_CP010953|5|5|1183390-1183493|CRISPRCasFinder TTATTTATAGTTCCACCTGAGATATTTAC GGTATTTGAATTTGCTGAACCTTTATTGCTATGACCACCATAGATA TTATTTATAGTTCCACCAGAGATATTTAC
>NZ_CP010953.1|WP_039362588.1|1179165_1179735_+|recombination-protein-RecR MQKQKLEKFNELVSCFEKIPGVGKKSALKYAYHVALGDSFFGLNLAHTIEDAVRFLRHCSMCGGISENEICDICSDINRDKTTLCIVETPKDILTIEHSNSFSGLYFVFDDANKLDKLKSNIKENGINELIFALTPSINSDGMMLYIEDKLKDFDVSFTKIAQGIPTGVSLENVDILSLSKAIKDRRSL >NZ_CP010953.1|WP_039362587.1|1177928_1179185_+|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKYSLTTKITIIFAIGFTVICALFFMFSKLQHESVLDKVKENQYNSINWLLSLYKKSNMPEDWEQYFKNFNLAYIKDPNLEKLILNNGDLIERVDTPIGIIETIFYANELFLRIKNQSVVITLQSTLKGTNDSLLIGFIITIALFISLYVSIFKSLLPLKNLRDDIRKFAAGNMDSICCKNIVKGDDEIAEVAYEFNNAACKIKELIMSRQLFLRTIMHELKTPIGKGRIVSEMLDDETQKDRLVAIFERLNILINEFAKIEQLLSKSYALQYENYHFSLILDQTKDILLLDDFDNKVSVDIKEDALLRVDFQLFCLAIKNLIDNALKYSDDKKAIIICDKEYICIKNRGNPLEKPIKHYKQAFIRDNTSKSTGMGLGLYIIEHICAMHKFEFLYEYTDGYHTFFITFKKPTNAKTKA >NZ_CP010953.1|WP_023385407.1|1177260_1177932_+|response-regulator-transcription-factor MINVLMIEDDPEFAQILSEYLLKFNIKVTNYEDPYLGLSAGIKNYDLLILDLTLPGMDGLEVCKEIREKYDIPIIISSARSDVNDRVVGLQIGADDYLPKPYDPKEMHARIISLIRRYKKTNEIQEETTDTAFKVDDKRHEISYSGNVLTLTPAEYEILEYLIKQHSFSVSREQLVYHCKSLKDKDSKSLDVIIGRLRSKIGDSSKSPKHIFSVRGIGYKLIG >NZ_CP010953.1|WP_023385405.1|1175978_1177067_-|molecular-chaperone-DnaJ MEFDYYEILEVSRDADGETIKKAYRKLALKYHPDRNQGDKEAEEKFKRINEAYEILSDENKRSIYDRYGKDGLSGSGFDEGFDLGDIFSSFFGGDFGGTRSSRNSYKYPLDIEVNITLNFNEAVFGCEKEIKYSYKVPCETCNATGAKDGKKSTCSHCGGRGKISHRQGFMNFVQTCPYCAGTGEIIKDKCSDCSGNGYNETSDNIKINIPQGVDNGNRIRIQSKGNKSSNGSGDLYVRINVRDDEHFVRNGDDVYIEIPVFFTQAMLGETIKIPTLRGESELKLPVGAKDKQQFVLENEGIQNTHTKLKGRLIAQIAINTPKKLTDEQKELLEKLQNSFGIKSGESSGDEGIFDKIKSWFK >NZ_CP010953.1|WP_002849757.1|1175687_1175948_+|30S-ribosomal-protein-S18 MAEKRKYSKKYCKYTEAKVEFIDYKDTTLLKYCLSERFKIMPRRLTGTSKKYQEMVEKAIKRARHVALIPYIVDRDNVVTNPFEGM >NZ_CP010953.1|WP_039362580.1|1175045_1175675_+|single-stranded-DNA-binding-protein MFNKVVLVGNLTRDIELRYAQSGSAIGSTGIAVTRKFSGANGEKREETCFIDITFFGRQAEIANQYLNKGSKVLVEGRLKFDQWQDQNGNNRSKHSITVESMEMLGSQTQGGFRDSHQDQTNSQYSNTSYSSNYQNPTGYQNDSNMNSGYRQQESFAQKAPKRAMNEQPYEEKIPEIDIDSDLPAQSQNRQNKPKQNIDVNIDDEEIPF >NZ_CP010953.1|WP_023385402.1|1174637_1175024_+|30S-ribosomal-protein-S6 MKHYELLFILKPTLTEDEAKVKVDFIKEVITKNGGEIANVIEMGTRKLAYKIDKYERGTYVVIYFKAPTQLIAELVRNVRITEEIIRFLTVKYENKREISAWDKLSKGQKLMPAKKELKAPEKPVEAE >NZ_CP010953.1|WP_023385400.1|1173552_1174545_+|DNA-polymerase-III-subunit-delta MYKKEFQNLLNSNRLPNYFLLFGNEEYQVEIFAKEFISKFKKENLLSLYFDEYDFGIAKSHLMESSLFCDSSTLHIKTDKKIPAKELKYLIDLCKKNANNAFIYELHEGDMKTIFDTKKVFGENFVRFFAPNTPAEGVSLLMYHAEKLGLNIQTSALYQIYSLQNESLYLASSELNKLANLTKTINDDSVKKLVFSLNGVSFELFFNKLIALQNIKDDYFSYTNDSNFNEIALINSLYSSFFRLFKIQTYVKINGKFDIEKAIGYTPPPTILNQIKSQALSIKTELYMDIFMKLNSIEYDIKTKKDIDKECFLLSSILSIQNLIAKNSKS >NZ_CP010953.1|WP_058909386.1|1171631_1173560_+|VacB/RNase-II-family-3'-5'-exoribonuclease MKEFLNALANGVDDKFIKIDEREILRVLEQIKAVKKHKNKFYLNDGYVCGKLDISSGGTGFLMPYDARFKQDIIIENRDLNGAHFGDIVLAKLTKSKKSRLHATMIAVLAMANETSVVYTKKFGQVIMGVSIPNALTIALKASQKSLKELPIGTVLKINNLDNDITEVLGVLSDPSIDEKISLAIYNKKNLFPKICENEAKSFGDSVDKSMYPNRVDLTNLPFCTIDPVDAKDFDDAIYYDVKNRTIYVAIADVSEYVAAYSGIDKEAKFRGFSIYFPHIAIPMLPRALSENICSLKPNCDRLAFVFKISLDESLEPVKEELFEAVIHSKKRFNYDEVDEILALNLKADDEIQEWILPLFETAKKLKFKRLQNGFDFRSKELRMSISPNGDILKTAYEKETPSHSLIEDCMLLANKAAAKKINHGIFRNHAPADLKKINTLLDDLAVLGIEATYESDLVALISKIQTQADSLNIREDVDKLIIKAQKRAEYASKPTGHFGLGFDLYSHFTSPIRRYSDLILHRLLKANLANNAKLFNYLLLDIEGVCRGLNELEREADRVAWDFMDRKFARWAENHIDEVFRCYISEVGNQTIAKLDDEIKGARIYIENFTCSLLASVMVQIKEVDIPNAKIIGKVVQKLDV >NZ_CP010953.1|WP_058909385.1|1170822_1171635_+|HDOD-domain-containing-protein MNQAIYKSIKTLPPLDDTIVRIQQICNDENSDINDLITVIQKDPMLTANILRSANSPLYGFSREITDINRAVTLFGMATIRGFALCGAIKKSFSIDLSPYNIRDSQFMEIATTQNALAFNWYNKIDRELLNILSPASFMMEIGKIVIAKEILENDKSAAFKDALAHISTPSELSDLETDMVGISNEEVTVKIFEQWNLETEMIDAILYSNSPDDAPNHIRASSIALKIIKNSVNIFGILSDENIQSTLTLLDTYGLEQAKFIDAVKKVKG >NZ_CP010953.1|WP_058909388.1|1183994_1184792_-|shikimate-dehydrogenase MRYFAVFGNPINHSISPRLHNLALQGFGLDGFYSRVHLTDGLKLIDTFDKLRLSGANITVPFKEVVLEQCDEIDETAKNIGSLNTLVKKNGKIFGYNTDAPGFMLAISEFKDIKNALILGAGGTARAICYILQKNGIDVEILNRTDKKEQFKNYSFFTPQSYTPKGYDLVVNTTSAGLADDFLPTDQDILKQIFASSKFAFDVIYNKSTPFLNLANSCSLTCKDGKDMLLFQAVLAFNAFYENKFENEKIKTFMQQAFHLSKFRY >NZ_CP010953.1|WP_023385417.1|1184791_1185559_-|SPOR-domain-containing-protein MEENNKGLQDILLDKNEDDKSSKIRKILISVAGLVILFVIVLIVMKLLNGGSPSTDTKEESLALPAEPELRVETNQPTTAPTNEIFEQVPIISDTNPKDNFENIVNEYKNNQAAINNNQTVAAPLKTPEPATTVKDNTPKAETNKNITPKVPTQKKAESAAKPAQKPVAVKPVKTGNLASGNYIQVASLSKVNSNDPFIKKIKENGFDYHAYETTVNGKNVVKILIGPYSGAELNTNMEKIRKNISSGAFLFKVQ >NZ_CP010953.1|WP_058909389.1|1185569_1186112_-|DUF1882-domain-containing-protein MQSIDLTLIKMITDHYYIKRDAILNKIEYKGRHFFDKFERVDEPLNYNIQKEHEERKIIAAHSLISKNDKIENIVFDYNGRTPERFWHRAQLMLREEGFINFTAYESKTPGHLHLYVHKGHTTLSEGYQIANRLSVMLAQKLPQEWRMFPTLDLPREFNILALPYALYQKERGASWSKHM >NZ_CP010953.1|WP_039362597.1|1186111_1187356_-|serine-hydroxymethyltransferase MSLESFDKDIYSLVNKELERQCNHLEMIASENFTYPDVMEVMGSVLTNKYAEGYPSKRYYGGCEFVDEIEQIAIDRCKKLFGCEFANVQPNSGSQANQGVYGAFLKPGDKILGMDLSHGGHLTHGSKVSSSGKYYESFFYGVELDGRINYDKVEEIANITKPKMIVCGASAYAREIDFKRFREIADSVGAYLFADVAHIAGLVVAGEHNNPFPHCHVVSSTTHKTLRGPRGGIIMTNDEEFAKKINSSIFPGIQGGPLMHVIAGKAVGFKHNLSDEWKVYAKQVKANAKKLGEILIKRGYDLVSGGTDNHLVLVSFLNKEFSGKEADIALGNAGITVNKNTVPGETRSPFITSGIRVGSPALTARGMKEGEFELIANRIADVLDDINNSSKQEKIKAELKELAHKFIIYDKAMF >NZ_CP010953.1|WP_039362598.1|1187352_1188867_-|lysine--tRNA-ligase MIFENELELTRLAKADELRSLGVNPYPHFLKRDMSINEFKTKFAYIKDLNDDEKRADEEVTISGRLKLKRVAGKSTFANMEDENDNIQIYYSLGSIGEEDYTKFKKNLEVGDIVLVTGYAFITKTGEFSIHASKIVLASKAISPLPEKFHGLTDIEMRYRQRYLDMIMDKDVRADFVKRSLIISTIRRFFEDRGFLEVETPMMHPIAGGANAKPFITHHNALDVDRYLKIAPELYLKRLIVGGMEAVFEMNRCFRNEGMDLTHNPEFTSIEFYWAWHNYFEVMDLTEELFAVLLDRLNLPKIIEFDGKSIDFSKPFARVKYIDAIVEIGGISRDIATNKEKILARLKADKFEANDKLDLGHLQAELFDNYVEDKLINPTFIVDFPISISPLSRRSDADKNVAERFELFIAGRELANAFNELNDPIDQYERFKSQIEAKDAGDDEAHEMDEDYCQALGYGMSPTVGWGLGVDRLVMLLLNKKSIRDVILFPAMKPLKTENKENKK >NZ_CP010953.1|WP_023385424.1|1188877_1189342_-|transcriptional-repressor MTNVDNIEYDTLLDRFKKVLRDNGLKYTKQREILLKTLYNNSDHFTPEQLYLYIKDSHPDLNLGIATVYRSLNLLEESGMVTSISFGAQGKKFELATKPHHDHMICRTCGNIIEFEDPIIEKRQSIISKEHGFKLTGHMMQLYGVCQECSKKKN >NZ_CP010953.1|WP_039362600.1|1189338_1189917_-|CvpA-family-protein MNFVTWFDIIVIALVVILGIKGIINGLVKEVFGLIGLIGGVIIASRNAQSVGDLISSHIYQLNDSSSFFFGFLATLILFWFVCLIAGNIFSKMLSLSGLGFLDRILGFFIGSAKIFLVFAIFCAIISNISVLSQKIEPYFENSKVYPVLLASGKFIMNIDLNRTKQDVIEKFDNEPMSVDSNETNSTKEDSQ >NZ_CP010953.1|WP_023385428.1|1189916_1190978_-|type-IV-pilus-twitching-motility-protein-PilT MNIETLLKTVMHNKASDLHLVSRSEPQIRIDGSLRPLEGKVLDGSDIENLCYVILTDAQKSELEENRDLDFALELPGIGRFRGNCYYTMNGSLAAAFRMIPLNVPSLDDLSAPKIFKELVKKEKGLVLVTGGTGAGKSTTLAALLNEINLTERKHIITIEDPVEFVHQNKNSLFSHRNVGTDTKSFARALKYALREDPDIILVGDLRDPETISIAIAAAETGHLVFGTLHTNSSVQTINRIVDSFNETEQAQVRNMLSLSLNAIISQTLVPKADNGRFAIYEILINNHAISNLIRENKSHQIYSQIQLNQQNTGMQTQTQAMEKAVKMGIITKENAIRYSTNQQELAGKLGVI >NZ_CP010953.1|WP_058909390.1|1190983_1191271_-|Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-GatC MQIDDKMLEKLEKLSALKIPDHNREEFKSQLGKIVDFVDILNELDLDDIEATVSTIGGGTPFREDISKEGDVIDGILAHAPKKQNRYFEVPKIIE >NZ_CP010953.1|WP_144428493.1|1191442_1191715_+|hypothetical-protein MLELPKFYVKDTILAIKDDLNYIKTEISSQEQFLENAIRSERFIKKIKNNYSDSCSSSNSVNSLRGFKSDKIKQHSRIKQRLHYSFIKSK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP010953_2 | 2.39|708330|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT | 708330-708364 | 35 | NZ_CP014569 | Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence | 38414-38448 | 2 | 0.943 |
| NZ_CP010953_2 | 2.39|708330|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT | 708330-708364 | 35 | NZ_CP007000 | Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence | 33026-33060 | 2 | 0.943 |
| NZ_CP010953_2 | 2.19|708329|36|NZ_CP010953|PILER-CR | 708329-708364 | 36 | NZ_CP014569 | Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence | 38413-38448 | 3 | 0.917 |
| NZ_CP010953_2 | 2.19|708329|36|NZ_CP010953|PILER-CR | 708329-708364 | 36 | NZ_CP007000 | Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence | 33026-33061 | 3 | 0.917 |
| NZ_CP010953_4 | 4.36|726193|34|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT | 726193-726226 | 34 | NZ_CP007000 | Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence | 34205-34238 | 5 | 0.853 |
| NZ_CP010953_4 | 4.36|726193|34|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT | 726193-726226 | 34 | NZ_CP014569 | Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence | 37236-37269 | 5 | 0.853 |
| NZ_CP010953_3 | 3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT | 714515-714551 | 37 | NZ_CP008809 | Campylobacter fetus subsp. fetus 04/554 plasmid pCFF04554, complete sequence | 8753-8789 | 6 | 0.838 |
| NZ_CP010953_3 | 3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT | 714515-714551 | 37 | NZ_CP018792 | Campylobacter sp. RM8964 plasmid pVIC8964, complete sequence | 22032-22068 | 6 | 0.838 |
| NZ_CP010953_3 | 3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT | 714515-714551 | 37 | NZ_CP018794 | Campylobacter sp. RM12175 plasmid pVIC12175-1, complete sequence | 22299-22335 | 6 | 0.838 |
| NZ_CP010953_3 | 3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT | 714515-714551 | 37 | NZ_CP043436 | Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354 plasmid p3226, complete sequence | 2677-2713 | 7 | 0.811 |
| NZ_CP010953_3 | 3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT | 714515-714551 | 37 | NZ_CP008812 | Campylobacter fetus subsp. venerealis 97/608 plasmid pCFV97608-2, complete sequence | 17906-17942 | 7 | 0.811 |
| NZ_CP010953_3 | 3.3|713271|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 713271-713305 | 35 | NZ_CP013615 | Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence | 76846-76880 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP010953_3 | 3.17|714187|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 714187-714221 | 35 | NZ_CP009044 | Campylobacter iguaniorum strain 1485E plasmid pCIG1485E, complete sequence | 37179-37213 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP010953_3 | 3.3|713271|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 713271-713305 | 35 | NC_019909 | Yersinia phage phiR1-RT complete genome | 144996-145030 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP010953_3 | 3.3|713271|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 713271-713305 | 35 | NC_028820 | Yersinia phage vB_YenM_TG1, complete genome | 137211-137245 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP010953_3 | 3.16|714122|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 714122-714156 | 35 | MN694734 | Marine virus AFVG_250M466, complete genome | 239-273 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP010953_3 | 3.3|713271|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 713271-713305 | 35 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 475386-475420 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP010953_3 | 3.4|713336|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 713336-713370 | 35 | NZ_LR215032 | Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 2 | 43357-43391 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP010953_2 | 2.35|708068|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT | 708068-708103 | 36 | NC_008758 | Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02, complete sequence | 126292-126327 | 11 | 0.694 |
| NZ_CP010953_3 | 3.4|713336|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 713336-713370 | 35 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 38815-38849 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP010953_3 | 3.4|713336|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 713336-713370 | 35 | NZ_CP015128 | Lactobacillus plantarum strain CAUH2 plasmid pCAUH202, complete sequence | 5420-5454 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP010953_3 | 3.4|713336|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 713336-713370 | 35 | AP018701 | Lactobacillus curvatus NFH-Km12 plasmid NFH-Km12_plasmid2 DNA, complete genome | 20791-20825 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP010953_3 | 3.15|714057|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 714057-714091 | 35 | MF001365 | Staphylococcus phage SA3, partial genome | 119024-119058 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP010953_3 | 3.15|714057|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 714057-714091 | 35 | MT080583 | UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW13, complete genome | 108094-108128 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP010953_3 | 3.17|714187|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 714187-714221 | 35 | LN713926 | Pseudomonas fluorescens SBW25 plasmid pQBR57, complete sequence | 188407-188441 | 11 | 0.686 |
| NZ_CP010953_2 | 2.15|708067|37|NZ_CP010953|PILER-CR | 708067-708103 | 37 | NC_008758 | Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02, complete sequence | 126292-126328 | 12 | 0.676 |
1. spacer 2.39|708330|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014569 (Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
aacaaattgtcttctatatttttgcccatagcaga CRISPR spacer aataaattgtcttctatgtttttgcccatagcaga Protospacer **.**************.*****************
2. spacer 2.39|708330|35|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP007000 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
aacaaattgtcttctatatttttgcccatagcaga CRISPR spacer aataaattgtcttctatgtttttgcccatagcaga Protospacer **.**************.*****************
3. spacer 2.19|708329|36|NZ_CP010953|PILER-CR matches to NZ_CP014569 (Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taacaaattgtcttctatatttttgcccatagcaga CRISPR spacer aaataaattgtcttctatgtttttgcccatagcaga Protospacer **.**************.*****************
4. spacer 2.19|708329|36|NZ_CP010953|PILER-CR matches to NZ_CP007000 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.917
taacaaattgtcttctatatttttgcccatagcaga CRISPR spacer aaataaattgtcttctatgtttttgcccatagcaga Protospacer **.**************.*****************
5. spacer 4.36|726193|34|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP007000 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293 plasmid pCfviMP1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853
aaacatttttagaggcgtctttggctactgcttc CRISPR spacer acacgcttttagatgcgtctttagctactgcttc Protospacer * **..******* ********.***********
6. spacer 4.36|726193|34|NZ_CP010953|PILER-CR,CRT matches to NZ_CP014569 (Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.853
aaacatttttagaggcgtctttggctactgcttc CRISPR spacer acacgcttttagatgcgtctttagctactgcttc Protospacer * **..******* ********.***********
7. spacer 3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP008809 (Campylobacter fetus subsp. fetus 04/554 plasmid pCFF04554, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
ctaagacttacacctgtttttgatacattagaaaaca CRISPR spacer cctaagcttatacctgtttttgatacattagaaaaaa Protospacer *. *..****.************************ *
8. spacer 3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018792 (Campylobacter sp. RM8964 plasmid pVIC8964, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
ctaagacttacacctgtttttgatacattagaaaaca CRISPR spacer cctaagcttatacctgtttttgatacattagaaaaaa Protospacer *. *..****.************************ *
9. spacer 3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018794 (Campylobacter sp. RM12175 plasmid pVIC12175-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.838
ctaagacttacacctgtttttgatacattagaaaaca CRISPR spacer cctaagcttatacctgtttttgatacattagaaaaaa Protospacer *. *..****.************************ *
10. spacer 3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP043436 (Campylobacter fetus subsp. venerealis NCTC 10354 plasmid p3226, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
ctaagacttacacctgtttttgatacattagaaaaca CRISPR spacer cctaagcttatacctgtttttgatacgttagaaaaaa Protospacer *. *..****.***************.******** *
11. spacer 3.22|714515|37|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP008812 (Campylobacter fetus subsp. venerealis 97/608 plasmid pCFV97608-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.811
ctaagacttacacctgtttttgatacattagaaaaca CRISPR spacer cctaagcttatacctgtttttgatacgttagaaaaaa Protospacer *. *..****.***************.******** *
12. spacer 3.3|713271|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013615 (Clostridium perfringens strain JP838 plasmid pJFP838A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tctatcattttaaatttcctttttttattctgttt CRISPR spacer tctatctttttaaattacctttttttaccaattgt Protospacer ****** ********* **********.. * *
13. spacer 3.17|714187|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP009044 (Campylobacter iguaniorum strain 1485E plasmid pCIG1485E, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
tgatattcagtgacgttctaagcgttgttgatact CRISPR spacer tttgcgtaagtgtcgttctaagcgttgatgatact Protospacer * * **** ************** *******
14. spacer 3.3|713271|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019909 (Yersinia phage phiR1-RT complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tctatcattttaaatttcctttttttattctgttt CRISPR spacer tcccgaattttaaatttcttttttctattctttca Protospacer **. ************.*****.****** *.
15. spacer 3.3|713271|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028820 (Yersinia phage vB_YenM_TG1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tctatcattttaaatttcctttttttattctgttt CRISPR spacer tcccgaattttaaatttcttttttctattctttca Protospacer **. ************.*****.****** *.
16. spacer 3.16|714122|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694734 (Marine virus AFVG_250M466, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gaatataaaagaattgctgagtttttttatagggc CRISPR spacer aagaaaaaaagaatttctgagtttttttatatatt Protospacer .*. * ********* *************** . .
17. spacer 3.3|713271|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tctatcattttaaatttcctttttttattctgttt CRISPR spacer aaaattattttaaattttctttttttatgttttca Protospacer **.***********.********** .* *.
18. spacer 3.4|713336|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR215032 (Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 2) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tcggactttttaaatattttaaacaaaatgactga CRISPR spacer ttaaaaactttaaatatcttaaagaaaatgacttg Protospacer *...* .*********.***** ********* .
19. spacer 2.35|708068|36|NZ_CP010953|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_008758 (Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
ttttattttccaaaaatggcaagaaataccattaaa CRISPR spacer ttttgttttcgaaaaatggcaagaaacctggcctta Protospacer ****.***** ***************. . ... *
20. spacer 3.4|713336|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tcggactttttaaatattttaaacaaaatgactga CRISPR spacer gaaaactttttaaaaatcttaaacaaaataaaatc Protospacer ..********** **.***********.*
21. spacer 3.4|713336|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015128 (Lactobacillus plantarum strain CAUH2 plasmid pCAUH202, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tcggactttttaaatattttaaacaaaatgactga CRISPR spacer caacactttttaaatatttaaaacataataatctt Protospacer . . *************** ***** ***.*..
22. spacer 3.4|713336|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP018701 (Lactobacillus curvatus NFH-Km12 plasmid NFH-Km12_plasmid2 DNA, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tcggactttttaaatattttaaacaaaatgactga CRISPR spacer caacactttttaaatatttaaaacataataatctt Protospacer . . *************** ***** ***.*..
23. spacer 3.15|714057|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF001365 (Staphylococcus phage SA3, partial genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaggagcaagggcttggaaatggtttagcaatct CRISPR spacer attttttgaagggcttgaaaatggtctagcaatta Protospacer * *********.*******.*******.
24. spacer 3.15|714057|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT080583 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW13, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
aaaggagcaagggcttggaaatggtttagcaatct CRISPR spacer attttttgaagggcttgaaaatggtctagcaatta Protospacer * *********.*******.*******.
25. spacer 3.17|714187|35|NZ_CP010953|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to LN713926 (Pseudomonas fluorescens SBW25 plasmid pQBR57, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.686
tgatattcagtgacgttctaagcgttgttgatact CRISPR spacer caatattcagtgacgttctaagggctgcctggaag Protospacer ..******************** *.**.. . *
26. spacer 2.15|708067|37|NZ_CP010953|PILER-CR matches to NC_008758 (Polaromonas naphthalenivorans CJ2 plasmid pPNAP02, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.676
cttttattttccaaaaatggcaagaaataccattaaa CRISPR spacer attttgttttcgaaaaatggcaagaaacctggcctta Protospacer ****.***** ***************. . ... *
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
22246 : 32066
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP010953|22246:32066|DBSCAN-SWA TTTGAAGATAATTAAACGTGATGGAAGTTTGCAAGATTTTGCAAGTTATAAAATAGAAAATGCAATAACAAAAGCTTATAAAAGTGCCATTAAAAAACCAAATGCAGAGCTTATAAAAAATGTATTGTCTGTGGTAAAAGACAAAATGAGCGTCGAAGAAATTCAAGATATCATAGAAAAAGCACTCTTTGATAGCGGCGATTTTAGCGTGATGCGAAGTTTTATGCTTTATAGACATACTCATACTATGCAGCGCGGTGGTGAGCTTGATGAGCGCACAACTTATATAAACTCGACTCAAACCATAGAAGAGTATATCGGAAAGTCTGATTGGCGTATTATGGCAAACTCAAATACGAGTTATTCAAACGCTGGACTTATAAACAACACAGCTGGAAAAGTCATCGCAAACTATTGGCTAGACGCTGTTTATAATGATCATGAGGGCGCAGCTCATAGAAACGGTGATTATCACATACACGACCTTGATTGTTTGACTGGATACTGCGCTGGTTGGAGTCTTAGAGCTTTGCTAAATGAAGGATTTAACGGCGTAAGAGGAAGAGTCGAGAGTAGGGCGCCAAATCATTTTAGAGAAGCTTTATATCAAATGGCGAATTTTCTAGGGATTTTACAAAGCGAATGGGCAGGAGCACAAGCATTTAGCAGTTTTGACACATATCTTGCACCTTATGTTTTTAAAGATAAACTTAGCGATAAAGAGATCAAAAAAGCTCTTACTAGCTTTATATTTAACTTAAATGTTCCTGCTCGTTGGGGTCAAAGTCCATTTACGAACGTTACTATCGATATGGTTCCTCCAAGTGATTTAAAAGGACAAATTCCTACTAAAAACGACATTCATTTATTTACAAATTTAAATGATGAAGAGTTGGAAGCTGAGTGTAAAAAACGGGGTCGTTCAAATCTTAAAGATATGACTTACGGTGATTTTAAACCCGAAATGGATAGGATAAATATCGCTTTTTACGAGATACTTACGCAGGGCGATAAATGTTCGCAGCCATTTACGTTTCCTATACCGACTGTAAATATCACCGAAGATTTTGACTGGGATAGCAAGGTTGCTACAAAGCTTTTTGAAAATACCGCCAAAATGGGTTCTAGCTATTTTCAAAATTTCATCGGATCTCAATATGTGAAAGATGAGTTTGGCAACCGCATTCCAAATGAAAAAGCCTATAAACCAGGCGCTGTTCGTTCTATGTGCTGTAGATTGCAGCTTGACTTGCGTGAGCTTTTAAAGCGTGGCGGCGGACTTTTTGGAAGTGCTGAGATGACAGGAAGTATCGGCGTAGTTACTCTAAATTTAGCGAGGCTTGGATATCTTTTTAAAAATGACAAAAAAGCTCTTTATGCAAGACTTGATGAGCTATTAGAACTAGCAAAAAGCACACTTGAAAAGAAGCGTAAATTTATAAATGAGATGTACGAAAGAGGTCTTTATCCATACACTGCACGGTATCTTAAAACGTTCAATAACCATTTTAGCACTATCGGAATAAACGGTGCAAATGAGATGATACGAAATTTTACGAATGATAAGGAAAATATAACTACTAAATTTGGTATAGAGTTTGCAAAAGAGCTTATAGAGTATCTAAGAGCTAAGATGATAGAGTTTCAAGGGACTACTGGAAATTTATATAACCTTGAAGCAACTCCGGCTGAGGGAACGACTTATCGCTTTGCTAAAGAAGATAAAAAACGCTACCCAGATATCATTCAAGCGGGATTTGATGAAAAAGTATATTATACGAACTCGACTCAGCTTCCAGCGAATTTCAGCAGCGATCCGTTTCATAGTTTAAATTTGCAAGACGAGCTTCAAAGCAGCTACACAGGCGGAACGGTCTTTCACTTGTATATGAATGAAAGACTAAGTAGCGTCTCGGCTTGCAAAAAGCTTGTAAAAAATATAGTAGAAAACTATAAGCTTCCGTATATCACGATAACTCCTGTATTTAGTATATGTCCAAAACACGGATATATCGCAGGTGAGCATGAGTATTGTCCAAAATGCGATGAGGAGATTTTGAGTTTAGCTTGACTTATCTTTTTTCTGTTTTGTTTAGAGTTTGCTAAAAGTTTTTAGTTGCGTATTATAAATTTAAAAAAGATTTTTATATGTATTTGAATTATCAAATTTAAGCCCTTTTTTGATAAAATCGTCATAAAATTTAAAGGTAAAATGCAGATGAATTTAATCCTAAATACGGATAGTTACAAAATTTCGCACTATCTCCAGTACCCAAAAGATGTGAATTACGTAAGTTCCTACATAGAATCACGCGGCGGTAGGTGGAACAGAGTTTTATTTTATGGCTTACAAATGTTTTTGATGGAGTATCTAAGCAAAAAAATCACGTATGAAGATATAGAAGAGGCAAAAGATTTTATAAAATTTCACGGACTTTCATTTAATGAAGATGGTTGGCGATACATAGTAGATGAGCACGGCGGCGCACTTCCACTTGAGATAGAAGCGGTAAAAGAAGGCAGCATCGTTCAAACTGATAACGTGCTGTTGCAGATACGAAATACTGATCCAAAACTTCCTTGGCTTGTGGGCTACCTTGAGACGGCTATTTTAAGGGCTATTTGGTATCCAGTTGCCGTGGCTACGAATAGTTATTTTTGTAAGCAAAATATTTTACAGTTTTTAAATGAGACTGGAACTCCTGATCTTATCGACTTTTGTCTGCATGATTTTGGTGCGCGCGGTGTGAGTAGTTTTGAGAGTGCAGGTATCGGTGGAAGCGCTCATATGGTAAATTTCAAAGGCTCAGATACGATAACTGGAGCTGTATTTGCTAAAAAGTACTATGACGCTGATATGGCGGCATTTAGTATCCCAGCAAGTGAGCATAGCACGATGACTACTTGGGGAAAAGAGAATGAAAGCGATGCTTATAAAAATATGGTTGATAAATTCGGTAAAAGTATTTTTGCTTGCGTGATCGATAGTTATGATACGCTAAATGCGATAGAACTTTGGGGAAAATTATTTGATGAGGTTAAGACAAAAGGTGGTCGCGTCGTGCTTCGCCCAGATAGCGGAAATCCAGTAACAATGGCTAGCGAGTGCTTAGAAAAGATGATGGATATAGCGGGATTTAGTGTAAATCAAAAAGGCTACAGAGTACTTCCAAAACATATCAGGCTGATTTATGGCGATGGTATAAATCCGCAAAGTTTAGTTGATATTTTAAATGAGCTTAAACTTAGAAAAATAAGTGCGGATAATATCGTTTTTGGTATGGGTGGGGCGCTTTTGCAACATCTTAACCGTGATACTCTTAAATTTGCGATGAAAGCAAATGCTGTATCAAAAGACGGTAAGCGCTGGACAGATGTGAAAAAAGATCCTATCACCGATCCTTCAAAACGCTCGAAATCCGGACGTCTTGCACTGGTGAGAAAAGGAAATTTGTTTAAAACTGTTCGATTAAACGAGCTAAAAAAAGAAGAAAATAAACTTAAACCAGTTTTTAAAGACGGTAAAATCCTAAGCAAAGTAAGCTTTGATGATATCAGAGCTAGGGTTAGAGAATTTAATTAAAGGATAAAATATGAAAAAACAAGAGATACTAACTAAATTCAAAGACAAACGTACAAAATGCGTGGTTTATACTAGAGTTATGGGCTATCACAGACCAGTTGAGAGTTTTAATCTTGGAAAACAAGGTGAGCATAAAGAGAGGATCAAGTTTTTAGAACCTGCTAAATGTTAGATAAATTTATCTATGATATCACGCCTTTTAGCGTTGTTGATTATCCTGATGAACTCGCTTGTTTGGTGTGGTTTGCGAAGTGCAATATGCGCTGCGTTTATTGCTACAACAAAGATATAGTTTTGGGTGAGGGCAAGTTTGATATGCATTATCTAAGCGAGTTTTTAAATTCACGCCAAAACCTTTTAAGCGCGGTAGTTTTAAGCGGTGGGGAATGCACTAAAAGTTTGCATTTTAGTGATGTTTTGAAGCTAGCTAAAGATCTTGGATATAAAACCAAAGTCGATACGAATGGAAGCAATCCTGAGATTATAGAAGAAAATTTGAGTTTGATCGATTTTATATCGCTTGATTTTAAAGCTCCAAAGGCTAAATTTGAAACGATCACCGCGTCAAATTTATATGATAAATTTATAAAAACACTTCAAATTTTACTAAAAAACAGAGCTAAATTTGAGTGTAGAACGACTATCCACGCAGATATACTAAACGAAAATGATATCAGCGATATGGCAAAAGTTTTAGAGCAAAACGGATATCGCCAAACTTACTATCTGCAAAACTTTTTTGAAGCCTCAAATTTAGGAAATTTACAAAAACCAAAAGCTAAATTTGATCCAAATTTGATAAACTCAAATTTAAGCATTGCACTTAGGAATTTTTGATTTTATTAAAATTAGATAAAAGCCATTTTTAGCTTTTATCAACTGTTTTATCTAATGACTCTAGCTCCGCTAAGTGGCGGTGAAAATACAAAAAGTTGCTTAGGTTCTATATCTACAAAAAATTCTAAAACGCAACGTACTAGTCCGACTCTATTTTCTATCGGCACATTTGGATTTTCAAATGTTCCTAAACACTCATTTGTTTTTAGAACGAGTGAGCGTAGTTGCATAGCTCCGCTACTTGTCGGTATGATCTGAAAAATAGTCTCAAACTCGCCACTATCATAGTCTTGTTTGCAGTTTTTCAACGCTAAAAATCCGCTAGGAGCGATCTGAAGGCACATTTTTACGTCGGCTGCTACTTGAAACTGCAGGTATCCAAAAGGAAAAGAATTTGCAAACTTATCAGCTTTTTTTATTTTAGGATCTACTCCTAAATCATTTAAAAACCAGTTTTGGTAATTAAACTGCCCTGAAAATCGTTTTATATTTATAGGAATTCCGGTGTTTGCATTGCGTATTTGAAAGGCATCGGTTATGTTTTCATTTGCGAAAATTATGCTTGTAAAGAAAAATATTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP010953|22246:32066|27260_28061_-|WP_023383973.1|DBSCAN-SWA MRKIVMIIFMATLSFAKPEDYKLATWNLQGSSAVTESKWNISIRQIISGENPADILAIQEAGNLPQTAHPTGRSINQGGTIVTEHLWQLGSISRPFQVYVYYAQIDTGANRVNLAIVSRIIADEIIILPPPTVASRPLIGIRIGNDVFFNIHALANGGIDAPAIINSVFDRFRNMPDITWMILGDFNRSPESLRGTLGLETRIRVTFLAPPAPTQRSGGTLDWAIVGNSAGGIVETALVAVLMLANLRTHLVSDHFPVNFRKFGDN >NZ_CP010953|22246:32066|31412_32066_+|WP_039361604.1|DBSCAN-SWA MMELRTLPFNPATNAVVSEETCSYHYGKHHQTYVNNLNNLIKGTDFEGADLFEILTHSEGAIFNNAAQIYNHDFYWDCIAAKTDISDELKAALQSDFADFKSEFLKSATTLFGAGWTWLVYNPNSHKLEIKNTSNAGTPVTEGLIPLLVVDVWEHAYYIDARNARAAYLEKFYENINWDFVSAAYEWAKKEGLSSVKFYIDEIYKGSGCCGGHCGCH >NZ_CP010953|22246:32066|22246_24316_+|WP_058908910.1|DBSCAN-SWA MKIIKRDGSLQDFASYKIENAITKAYKSAIKKPNAELIKNVLSVVKDKMSVEEIQDIIEKALFDSGDFSVMRSFMLYRHTHTMQRGGELDERTTYINSTQTIEEYIGKSDWRIMANSNTSYSNAGLINNTAGKVIANYWLDAVYNDHEGAAHRNGDYHIHDLDCLTGYCAGWSLRALLNEGFNGVRGRVESRAPNHFREALYQMANFLGILQSEWAGAQAFSSFDTYLAPYVFKDKLSDKEIKKALTSFIFNLNVPARWGQSPFTNVTIDMVPPSDLKGQIPTKNDIHLFTNLNDEELEAECKKRGRSNLKDMTYGDFKPEMDRINIAFYEILTQGDKCSQPFTFPIPTVNITEDFDWDSKVATKLFENTAKMGSSYFQNFIGSQYVKDEFGNRIPNEKAYKPGAVRSMCCRLQLDLRELLKRGGGLFGSAEMTGSIGVVTLNLARLGYLFKNDKKALYARLDELLELAKSTLEKKRKFINEMYERGLYPYTARYLKTFNNHFSTIGINGANEMIRNFTNDKENITTKFGIEFAKELIEYLRAKMIEFQGTTGNLYNLEATPAEGTTYRFAKEDKKRYPDIIQAGFDEKVYYTNSTQLPANFSSDPFHSLNLQDELQSSYTGGTVFHLYMNERLSSVSACKKLVKNIVENYKLPYITITPVFSICPKHGYIAGEHEYCPKCDEEILSLA >NZ_CP010953|22246:32066|24463_25828_+|WP_058908911.1|DBSCAN-SWA MNLILNTDSYKISHYLQYPKDVNYVSSYIESRGGRWNRVLFYGLQMFLMEYLSKKITYEDIEEAKDFIKFHGLSFNEDGWRYIVDEHGGALPLEIEAVKEGSIVQTDNVLLQIRNTDPKLPWLVGYLETAILRAIWYPVAVATNSYFCKQNILQFLNETGTPDLIDFCLHDFGARGVSSFESAGIGGSAHMVNFKGSDTITGAVFAKKYYDADMAAFSIPASEHSTMTTWGKENESDAYKNMVDKFGKSIFACVIDSYDTLNAIELWGKLFDEVKTKGGRVVLRPDSGNPVTMASECLEKMMDIAGFSVNQKGYRVLPKHIRLIYGDGINPQSLVDILNELKLRKISADNIVFGMGGALLQHLNRDTLKFAMKANAVSKDGKRWTDVKKDPITDPSKRSKSGRLALVRKGNLFKTVRLNELKKEENKLKPVFKDGKILSKVSFDDIRARVREFN >NZ_CP010953|22246:32066|25838_26000_+|WP_023383969.1|DBSCAN-SWA MKKQEILTKFKDKRTKCVVYTRVMGYHRPVESFNLGKQGEHKERIKFLEPAKC >NZ_CP010953|22246:32066|25993_26665_+|WP_023383970.1|DBSCAN-SWA MLDKFIYDITPFSVVDYPDELACLVWFAKCNMRCVYCYNKDIVLGEGKFDMHYLSEFLNSRQNLLSAVVLSGGECTKSLHFSDVLKLAKDLGYKTKVDTNGSNPEIIEENLSLIDFISLDFKAPKAKFETITASNLYDKFIKTLQILLKNRAKFECRTTIHADILNENDISDMAKVLEQNGYRQTYYLQNFFEASNLGNLQKPKAKFDPNLINSNLSIALRNF >NZ_CP010953|22246:32066|30709_31339_+|WP_023383979.1|DBSCAN-SWA MDSLERARCQKMADDIADVIELTPMVYKAFCSTPRTDFVPVSVNAFKLDAHPIGGNQWISSPLTVAKMTLALEAENCDNILEIGCGSGYQAAILSRLAHRIFSIERIEKLANEAKAKMKKLDFNNVNIRYDDGNVGWKSYAPYDRIILSCACSSVPTRLFEQLKDDGILVAPIKENNKQFIVKFKKIGSNLEKIVLDECEFVPLLDGRE >NZ_CP010953|22246:32066|29989_30652_+|WP_058909663.1|DBSCAN-SWA MISNLGFLHLNSAGTINRTSEFLNLVKDIKPGELVLASELCVSGYENLGDEFENELIANLKNVLLAGAFLGFTHFSGGFNEFVLLNGDKEIHKQKKAILFTPNLEQDKFKAGKVEDINLFEICGVKIGVLICFELRFTELWERLKGADIILVPSLWGKERKRHFEVLCEALALQNRCYVIACSDRDLKFGAVFKPNGEIAKSFKFEPDLASEFKKSLGLI >NZ_CP010953|22246:32066|28069_28726_-|WP_058908913.1|DBSCAN-SWA MTETILKHIKNSLILLFCMTIFNACSSKITEISTQKTDPLGSVFGKADLNFKQPTINLQGIPPDLFDRTSDFLVIMGANGVAITVWYSSPGNWLWGYALYTSGNLGGYRVWRLILLPDNEVMIVNFNTRTTCMNTYKNGVIHSPCNKNNPFQKFVLRPMTNGAVQIYNKATNSCLQTPVDNLFGFDVFGAINLTTKCTDTIDQQWYLLPPPQVGRLLY >NZ_CP010953|22246:32066|26712_27261_-|WP_058908912.1|DBSCAN-SWA MRVLTIIFFFTSIIFANENITDAFQIRNANTGIPINIKRFSGQFNYQNWFLNDLGVDPKIKKADKFANSFPFGYLQFQVAADVKMCLQIAPSGFLALKNCKQDYDSGEFETIFQIIPTSSGAMQLRSLVLKTNECLGTFENPNVPIENRVGLVRCVLEFFVDIEPKQLFVFSPPLSGARVIR >NZ_CP010953|22246:32066|28977_30000_+|WP_023383975.1|DBSCAN-SWA MNRKKIYNPSSDETLNDRKVFGGNPHGILNFTKAKYTWALKLWDLMEANTWFPKEVDTTDDVRDYACNLTTAEKRMYDLVWSQLISMDSFQTNNLADNINPYITAPEINAILARQAYEEANHSKSYAVMVEAICDNTDLIYEMEKYDDVLRKKNDYISSVYEELAGEVTDEKMLLAMVANQILEGVYFYSGFTAIYALARAGKMLGSAQMIRFIQRDEITHLLLFQNMINSVRKERPDLFTSEVETKIYEMFKKAGDLEIEWGKYITGNQIMGFTDDIIEEYIHYLVDDRLVSIGLKKLYNAKHPIKWVDDFAKFNDQKSNFFESKVTNYSKGSLTFDDF |
11 | Enterobacteria_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
668885 : 745015
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010953|668885:745015|DBSCAN-SWA 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98 | Campylobacter_phage(17.86%) | portal,plate,capsid,tail,terminase,tRNA,integrase | attL 658384:658401|attR 678294:678311 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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