Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010511 | Campylobacter jejuni strain CJ677CC061, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas2,csa3 | 0 | 1 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010511_1 | 1274586-1274665 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010511_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010511_1
>1.1|1274609|34|NZ_CP010511|CRISPRCasFinder TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010511_1
The CRISPR arrays of NZ_CP010511_1 >merge|NZ_CP010511|1|1274586-1274665|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTCTTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAATCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC >NZ_CP010511|1|1|1274586-1274665|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTC TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAA TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC
>NZ_CP010511.1|WP_002855339.1|1274185_1274512_+|ribosome-silencing-factor MQERIDLIVKILDEKKAEDIKTIDMSEQEYFVKYVIIAATLGERHALSLIDELKTQLKAKGEEFLNIDSSEEWSVIDLGDILIHLLTPEHRGIYNIEELLENLKKGRV >NZ_CP010511.1|WP_002932561.1|1273612_1274158_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKIALFGGSFDPPHNGHNSVVLEALEILDIDKLIIMPTYINPFKQNFSADEKQRFLWVKKLWGHFPKVEICDFETKQKRPVPSIESVKYLYKLYNPSKFYLLIGADHLEKLHLWHDFEKLNSLVEFVIANRNDIEIPKNFKDLKTDKKIASSFIRNTLNINEVCEEIKDEVKKYYEKLQKN >NZ_CP010511.1|WP_002868484.1|1272554_1273553_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRCVARIILERNDIELVAINDTTDIELTKYLFKYDTVHGEFKGSVDSEGDDLVVNGKKIKVFKSRNVKDLDFAKHGAQIVLECTGAHLTMAKCQEFIDMGVQKVIMSAPAKDDTPTYVLGVNSELYKGESIISNASCTTNCLGPVCRVLQDNFGIEKGLMTTIHAYTNGQSIIDAKAKDKRRSRAAAQNIIPTSTGAAKAMKLVMPELNGKLHGQSMRVPVIDVSSVDLTAQLSRKVSKDEINEAFRKAATTNLKGILMVDDDERVSSDFITCSYGAIVASDLTQVIADDFIKVIAWYDNEWGYSSRLVDMAVYIANKA >NZ_CP010511.1|WP_002783833.1|1271349_1272552_-|phosphoglycerate-kinase MSDIISIKDIDLAKKKVFIRCDFNVPQDDFLNITDDRRIRSAIPTIRYCLDNGCSVILASHLGRPKEISSKYSLEPVAKRLARLLDKEIIMAKDVIGEDAKTKAMNLKAGEILLLENLRFEKGETKNDENLAKELASMVQVYINDAFGVCHRAHSSVEAITKFFDEKHKGAGFLLQKEIDFASNLIKHPARPFVAVVGGSKVSGKLQALTNLLPKVDKLIIGGGMAFTFLKALGYDIGNSLLEEELLEEANKILTKGKNLGVKIYLPVDVVAAPACSQDAPMKFVPAQEIPNGWMGLDIGPASVRLFKEVISDAQTIWWNGPMGVFEIDKFSKGSIKMSHYISEGHATSVVGGGDTADVVARAGDADEMTFISTGGGASLELIEGKELPGVKALRSKENE >NZ_CP010511.1|WP_002932563.1|1270681_1271353_-|triose-phosphate-isomerase MIFAANLKCNHTRASFKIYAEILNKTMGAKCDDIIVFPPSVAFLENENNFIQGAQNFYPCVNGAFTGELGKEHLDEFGIKCVLIGHSERRALGDEELIGAKFDFAKEHGYKIVFCIGENLDTKNSGKTLEFLKKQLEIIDLNYERLIIAYEPIYSIGTGVSAQSTDIAKVLEFLASLTKAPLLYGGSVNENNIKEILSVNHCGGVLIGSAALKVENFIKLIKG >NZ_CP010511.1|WP_002887956.1|1269853_1270678_-|enoyl-ACP-reductase-FabI MIMKGKKGLIVGVANNKSIAYGIAKACFDQGAQLAFTFLNDALKKRVEPIAQEFNSNFVYELDVNNNEHLDSIAEKIKKDLGEIDFVVHAVAFAPKEALENSFLETSKEAFDIAMQTSVYSLLSLTRAVLPILKDKGSILTLSYLGGVKYVPHYNVMGVAKAALESSVRYLARDLGVKGIRVNAISAGPIKTLAASGIGDFRMILKYNEINSPLKRNVSIEDVGNSAMYLLSDLANGVTGEIHYVDAGYNIMGMGDVEKNEEGQTVLCWDNQKG >NZ_CP010511.1|WP_002932564.1|1268356_1269850_-|hydrogenase-small-subunit MAKLSNEKLKNILEDRIKKLENSTLKEDKVINEESVKILARHLSLGNEIPALAQRFFQIAPKTKLVWLHLCECTGCSESLLRSELPSFDELIFDFFSLEYHETLMAANGTKAEELLEYVLEEDFILAVEGGVAAIDTFFLTIGAQGESGYEILEKLAAKAKAIFAVGTCSSYGGIQAAYPNPSKTCGISEVLSQKVVNIPGCPPSDVNIIATLSFFALFGVLPELDEQNRPVWAYGKCLHDMCERKAKFESGIFAEHFDDEAAKNGACLFKIGCKGPYTYNNCPKVKFNAKTSWPVAAGHGCIACSEKNFWDEFGNYEKPMANIFSYAKLCNEELKQEFFLEEQIKILEQIDFEFESNIKLILQNIAKNKLGALLVENYKKSFEKNYAFIEQNFDENPMPSKDFWKYLEMSFILVKGAFLKDKNDFLIAAKNYAFKHASPYDFKLNINAEKPKLDVSKSFRMTLIYLCGGLDFEGIAYSILKAFEDNITKISSLKAS >NZ_CP010511.1|WP_002779147.1|1266297_1266522_+|ferrous-iron-transport-protein-A MTLNELKDGQKAIIVNLNAHKELKNRLLSFGFIKNKNLKKIHSSLKNATIMVELDTSCVILRSDEAKTIEVNLI >NZ_CP010511.1|WP_002932566.1|1264875_1266216_+|MmgE/PrpD-family-protein MFYSEILADFILNIRYENIPDVVVQRAKELMLDSFGTAIAASNEECVLNTFKTFKNLSTEKNTSVWINEQKLDPIYAAMLNGIASHALDFDDTHTEAILHASAILAPLCLSYGFYINKEAQKIIKAFIVGWEIAARVGIASKGTFHKRGFHTTAIAGIFASTSASAILLDLNKEQIINALGLAGSFASGINEFLSNGSNSKVLHIANAIKNGIIIAHFAKNNMSGPLSIFEGRDNIFKCFGIEQECDKTELNKALGEIWQTMQVSIKPYPSCHFAHGLIDCAIALKNDGLKADEIKSICCFVDEVAVSFICDPLEAKYTPNSAYEAKFSMPFLMALGFFDGKITLKSYENLKRKEVLDFAKKITYKKRKSQGFPKYFPGHLEAILQNGNIIQKDVFINKGNFDNPLNFEELKAKFLANAQIYLDNAKANKILDQIINLENLNHFSF >NZ_CP010511.1|WP_002932567.1|1263499_1264867_+|adenylosuccinate-lyase MTGISVFDHRLLADSWSTQEMRAIFCEQNRIQKWLDVEAALAKAQAKLKIIPKKAADEIAKKAHYKFMDMDFIFAEFKKTKHPLVPTVRGLEKACDNNLGEYVHFGVTTQDIIDTGLVLQFKEAMTLVKSELKAIAKALAKLAKTHKNTAMMGRTLALQALPITFGHKVAIWLSELERHFERILELEKRLYVGSIVGAVGTKASLSDECNEVEKLTLENLGLDVPNISWQPARDRFIELGFVLGNINATFNKIAHEILILSHNEIDEVAEPFGKGQVGSSTMPHKRNPAISENAVTVSNAFKANLAILSDIERHEHERDGQVWKMEWKLLPEMFLMLSVVLANMKFALSDLEVKKDKMLKNLNTLNGFVLAERIMFALSDHYGKQHAHEIVYENAMLGIEKQKTFKEVLLADKRVSKVLKEKEIDALLDATTYVGYAPKLVDEFLAKIKNSAILK >NZ_CP010511.1|WP_002932557.1|1274967_1276338_-|phosphoglucosamine-mutase-PgmL MLDVIFREYDIRGLYGKELNEKSVKAIGFCLGQTMLNKGCKNVSVGYDARYSANELFNYLVSGLNKAGIKIYDIGLVPTPLGYFSLYEGLKFDANVMITGSHNPKDYNGFKITINKESFFGVELKEFSKEVYKHLDDDIEENLEVEKYDILSLYVKFMCEQFSFLKDFNYKFGVDCTNGAAGVVIEPLIKALNLKAHVMFAEPDGQFPNHAPDPTEEENLSAIREFLNQNQDYSLAFAFDGDADRMVALSKTHVFCGDELCYLFAKNIPSPRILGEVKCSKNLFDEVAKFGTIFMGKTGHSNIKKMMKEKDIDLAAEVSGHIFFKHRYFGYDDGIYAFLRALELVYKGFDLESMIKALPKLYTTPEIKIPVNEEEKFKFVEEFQKEIEKGALKGVKSLCEIDGARIDFGDGWALLRASNTSPYLITRFEATSLERAKELESTVFSLFNEIKARLKN >NZ_CP010511.1|WP_002868488.1|1276459_1276996_+|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL MDEELENEETKKKKGGSLVIIIVILLFVLLLSIMGVIAWLISSSSSDESEVKEAPKEEAKTDKPKVSAPTQRGSDFANIGPMYPLDPFTLNLLSDSGSRYVKCTIELEQNSELLKPELDKKVPVIRDIIIRTLTAKTFEEVSTQKGKERLKDELVGKINEILTDGFIKNVYFTDFVVS >NZ_CP010511.1|WP_002825806.1|1276996_1277344_+|holo-ACP-synthase MRVGCDIIAISRIEKIHSRHGKNFLDKFLSPKEQILIKNPATLAGLWAAKEAASKALGVGICELCSFFDIEISKDEKNAPKLKYSQKITKDFNITQTSLSISHDNGFAIAIVAIV >NZ_CP010511.1|WP_002862076.1|1277344_1277764_-|hypothetical-protein MKRVRTKIRANFRRRVKRTLKGSLKEKLAGTILLCAIVPLAVLGYLFIVIIGTFFNTARARQGVRALDHFVNASLFNGYAWESVSSHAWRERNRKKWARIVIKITDFFQKDHCKRANKREQPVVDFILSRNLDKQTIGK >NZ_CP010511.1|WP_002932555.1|1277760_1279122_-|cytochrome-P450 MSECPFFPKPYKNKASTLLTFLLKRRSWLDGLYERSYKMQTGYVKMPNFDLYVINDTKEVKRMMVDEVREFPKSAFLHELLSPLLGESIFTTNGEVWKKQRELLRPSFEMTRINKVFNLMSEAVADMMDRFSKYPNHVVIEVDEAMTFITADVIFRTIMSSKLDEEKGKKILNAFVTFQEQSVHTAMRRMFRFPKWLSYVLGDRKRAKAGDVIRQVLSDIIKPRYDMADNAEFEDILGSLLLVVDADTNKRFSFEEILDQVAMLFLAGHETTASSLTWTLYLLSLYPKEQEKAYEEITQVLQGGAIEISHLRQFKYLTNIFKESLRLYPPVGFFAREAKKDTQVRDKLIKKGSGVVIAPWLIHRHEEFWTNPHGFNPSRFEGEYKKDAYLPFGVGERICIGQGFAMQEAILILANILKTYKLELEEGFVPDVVGRLTVRSANGMRIKFSKRKL >NZ_CP010511.1|WP_002932553.1|1279118_1280240_-|hypothetical-protein MDREVFYIAGYDPKSYRFYYDLFKKNLKDYSHAFNIKTDLSKIEKNEQFPFFQISCEGVQTKYHFLTWNDIVKKNWSENYKDALADCYSFFRIYTITGLFIKFGKESIYQLITGYYPFFYVLFSLLFSLVLAFGSFAFLQNYMHFSLAIIIGCFLGFLLNHFLFKLGKKLAVFWIARICAFCATWQDKKIGTIQERIKLFANTIVDKLKQNESKQDYELILVAHSVGTIVCIEVLECILRQNLDLSLLRKLKILTLGECIPLVSYQKKADEFRKKLEFVSRFDLKWYDYTSIIDGACFPQVDFFRTSGVNAKFTPPFLSAKFHTLYEKHEYKKIKRDKNKAHFLYLYSISVKGDYDFFSFIIMPKFLEEKVKI >NZ_CP010511.1|WP_002932552.1|1280312_1281497_-|capsule-polysaccharide-modification-protein-KpsS MRFSTKIKKEFSGKNVLLLQGPVGNFFHHLAMKMKKNQTKVFKLNFNGGDFFFYPSGTRCKCDEKDLENFYRDFFQSKKIDAILMYNDCRIIHAKAIKVAKELGIEIWIFEEGYLRPYCITLEKDGVNANSSLPRDKNFYLSQNIFTKESIKEIPGGFKFMAFDAFLYWLFAFILAPFFNNKLHHRTLYPFEFLFWFRSLYRKYLYKITEKKLNEKIYNLEKKYFLAILQVYSDTQIKYHYKKSIEHFIEETILSFANHARAKSYLVFKHHPMDRGYKNYSKLINDLSQKYHVEGRVLYVHDTHLPVLLRKALGCITINSTVGLSAILEGCPTKVCGNAFYDFEGLSYPKKLQFFWREAHAYKPNPVLVCNFKKYLLQTNQFNGNFYKNFFLDK >NZ_CP010511.1|WP_002932550.1|1281493_1283563_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein MKYYSTSKKLIANVRNFYIISLYKKNLKINKDDLFFGWGRKKSGLKAMNFAKKYKTKFILLEDGFIRSLNLGVENSPSFSIIKDDIGIYYDATMPSKLENLLNAYEFKDEEIKQAKKAIELIKKYKISKYNNNLDIPDDYFQKDEKRVLIITQTANDASLEFGLAKDFKTLDMIKDAIKENPKSKIYIKTHPDVLSGKKQSDLDLNSLPKECILITENFNPIALLEFFDKVYTKTSGMGFEALMQECECICYGMPFYAGWGLTKDKLECKRRIRKRNLEEVFYAAYILYSEYFNPYLNQKSNIFDTIQTLAKYKDIEKANSNRLFMLGFTLWKRHFIKPFFKAKNNEIIFLNSLKSLAGYKLKENDKFFIWGKKYDENTLKNLLLTKAKEQNLTNFSPKVSLVEDGFIRSISLGSDLTRPFSLIVDDKGLYIDPNKPSKLEELLQNEIFDENILNRAKNIIKILLENRFSKYNGLKHEDLKINAKIGQKIILIPAQVEDDASMILGGFGLSTLDLLKEVRSKNQDAYIIFKPHPDVLSGNRVGLKDETRILEFCDEIVKDCSIDSAIKIADEIHTITSTSGFDALLRAKKVFTYGMPFYAGWGLTKDKHKCKRRTRKLSPEELVAGALITYPRYINPKTKTLCEIEVCLDIMLNLQKDYFSKKHIKLAIDFKTFMLRKIRRFYEFLAKK >NZ_CP010511.1|WP_059117083.1|1283939_1284710_-|NTP-transferase-domain-containing-protein MNAIILAAGFGSRLMPLTKDQPKCMVEYKNKKIIDYEIEALKSAGINEIAVVGGYLNDVLKNYLNKYDIEHFFINSKYDKTNMVHTFFCAKDFMLKCIEEKQDLIISYADIVYFQDCVQKLINAKEELAIVVDKSWRKLWSKRFANPLEDAETLKMKNGYIIELGKKANAYDEIEAQYIGLFKFSYQFLSEVITFYEMLDRDILYDNKNFENMYMTSFLQALIEKYNNAKAVEIDGNWCEIDFMSDLTLFISMEMS >NZ_CP010511.1|WP_002931920.1|1284711_1285314_-|gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate-hydrolase-family-protein MFIGITQRLICNESYHEERECLALDWGKLFNKDLFKNFTPLPLSYEIDFSHYKHLIKAVILSGGNDLSFYSPNVLSKKRDLYEKQVIEICLKEKIPLLGICRGAQMIARYFNSHISPCENHIGKHEVFFSKEKFISNSFHNFAIEKLGEDLIELCLAKDNTIEAFRHKYENIFGIMWHIERENGLNNIQILKEWFSLIKE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010511_1 | 1.1|1274609|34|NZ_CP010511|CRISPRCasFinder | 1274609-1274642 | 34 | MH752385 | Bacillus phage Ray17, complete genome | 8509-8542 | 10 | 0.706 |
1. spacer 1.1|1274609|34|NZ_CP010511|CRISPRCasFinder matches to MH752385 (Bacillus phage Ray17, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttttttagctttatactcagccttactcatataa CRISPR spacer cttacaagctttatactcagccttattgatcgtt Protospacer .** . *******************.* **
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
149848 : 229710
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP010511|149848:229710|DBSCAN-SWA TATGGAAAAAGAAGTTATTGCGTATTTGGATAATGAGACAATAATTGACTCTCAAAGTGTGAAAGATACAAATTTAAAAGAAATTTATTTTGATAATTCTAAAGAAAGTTTAGAAGTAATCCGCCATTCTTGTGCACACTTAATGGCACAGGCGATTAAGAACTTGTATCCTGAAGCTAAATTTTTCGTTGGTCCTGTTATAGAAGATGGATTTTATTATGATTTTCGTGTAGAAAGTAAGATCGGCGAAGAAGATTTAGTAAAAATTGAAAAAAAGATGAAAGAACTTGCTGAAGCAAAGATTGAAATTTCAAAATATGAAATCACAAAAAGCGAAGCTTTGGCTAAATTTCAAAATGATGATTTAAAACAAGAAGTTTTATTGCGTATTCCTGATGGAGCTGTAAGTATTTATAAACAAGGTGAATTTGAAGATTTGTGTCGTGGTCCTCATGTGCCAAATACGAAATTTTTACGCTTTTTTAAACTCACTCGTGTTGCAGGAGCGTATTTGGGTGGCGATGAAAAAAGAGAAATGCTTACTCGAATTTATGGTACTGCTTTTGCAGATAAGGAAAGTTTAAAAGAGTATTTAACTATTATTGAAGAAGCTAAAAAACGCGATCATAGAAAGCTTGGAACAGAGCTTAAGCTTTTTACTTTTGATGATGAGATTGGAGGGGGTCTTCCTATCTGGTTAAGTAATGGTGCAAGACTTAGATCTAAACTTGAACACATGCTTTATAAGATCCATCGTTTGCGTGGTTATGAACCTGTGCGTGGGCCTGAACTTTTAAAAGCAGATGCATGGAAAATCAGTGGGCATTATGCAAACTATAAAGAAAATATGTATTTTACACAAATTGATGAACAAGAATATGGTATTAAGCCTATGAACTGTGTGGGGCATATTAAAATTTATCAAAGTGATGTAAGAAGTTATCGTGATTTGCCTTTGAAATTTTTTGAATATGGCGTAGTGCATCGTCATGAAAAAAGTGGGGTTTTGCATGGACTTTTTAGGGTGAGAGAATTCACTCAAGATGATGCACATATTTTTTGTATGCCAAGTCAGATTAAAGATCAGGTTTTAGAAATTTTAGCTTTTGTGGATAATTTGATGAAATTATTTGATTTTAGCTATGAAATGGAAATTTCAACTAAACCTGAAAAAGCCATAGGCGATGATGAAATTTGGGAAGTAGCGACTAAGGCTTTAAAAGAAGCTTTAGATGAACAAGGTTTAAAATACGGTATTGACGAAGGTGGAGGGGCTTTTTATGGGCCAAAGATTGATATTAAAATCACCGATGCTTTAAAAAGAAAGTGGCAATGTGGAACCATACAAGTAGATTTTAACCTGCCAAGTCGTTTTAAACTTGAATACACTGATAGTGATAATGAAAAAAAACAACCTGTAATGTTGCATCGTGCGATTTTAGGTTCTTTTGAAAGATTTATAGGAATTTTAACCGAGCATTGTGCGGGTGAGTTTCCATTTTTTATCGCACCAACTGCGGTGGGTATAGTGCCAATAGGCGAAGCACATATTGCTTACGCAAAAGAAATTCAAAAAGAATTATTAGAGCTTAATATCGATAGCGAGGTGTATGAAAAAAATGAGAGTTTAAGTAAGAAAATACGCACAGCTGAAAAACAAAAATTACCTATGATTTTAGTTTTAGGCGATGATGAGGTGGCAAAGCGTAGCGTTGCTTTAAGAGATAGAAGAGCTAAAGAACAAAAAAATCTTAGCTTAGATGAATTTATTAAATTAGTTAAGGAGAAAATGAGTGAGGTACACTTTTGAGTAAAGAAAAAGAAGTATTGCTCAATGAAGAAATAAGAGCGGATGAAATCAGATGTGTTGGCGATGATGGCAAGGTTTATGGTATTATTAGTAGTGATGAAGCTTTAGAAATTGCAAATCGTTTAGGACTTGATCTTGTAATGATAGCTGCAGATGCTAAGCCACCTGTTTGCAAGATTATGGACTATGGTAAATTCCGTTATCAACAAGAGAAAAAACAAAAAGAAGCAAAGAAAAAACAAAAAGTGATTGATATAAAAGAAATCAAACTTTCTGTAAAAATTGCTCAAAATGATATTAATTACAAGGTAAAACATGCTTTAGAATTTTTAGAACAAGGTAAGCATGTGAGATTTCGTGTGTTCTTAAAAGGACGTGAAATGGCAACTCCTGAAGCAGGTGTAGCTTTGCTTGAAAAAATTTGGACTATGATAGAAAATGAAGCTAATCGTGACAAAGAGCCAAATTTTGAAGGTCGTTATGTAAATATGCTTGTAACTCCAAAAAAAGCTTAATCCACTTTTGTGGATAAGGCTTTTAAAGGTTTTAAATTTTGAAAGAAAATCCTTCTTTTTTAAAAGAGCAAATTATAACTTATCTTGGAAATAAAAGAGCGCTTTTAAGTTTTTTAAATAAGGGCTTTAAGGTAGCTAAAAAAGAACTTGGTAAAGATAAATTTAGTTTTTGTGATATATTTAGTGGCTCAGGTGTTGTAAGTCGTTTTGCAAAAGCACACTCAAATTATATTTTAGCCAATGATTTAGAGGATTATTCAAAACTCATCAATGAGTGTTATCTTGCCAATAAAGACAAAGATTTACTTCAAAATATAAAAAAGCATTATAAAAATTTAATCCAAAATTTAGATTTTCAAAAAGGTTTTATCAGTGAGCTTTATGCTCCAAAAGATGATGATGATATTAAAAAAAATGAAAGGGTTTTTTATACTTTTAAAAATGCTTTATATCTTGATACTATAAGGCAAAAAATCGAAAATGAAATTCCAAAAGAATTGAGGCATTTCTTTATAGCTCCTTTGATTTATGAAGCCAGTGTTCATTCAAATACTAGTGGAGTTTTTAAAGGTTTTTATAAGGGTAAGGATGGCATCGGAAAATTTGGTGGCGAAGGACAAAATGCACTTAAACGAATTAAAGGAGAAATAGAGCTTAAAATGCCTATTTTTTCAAATTTTTCTTGTGAATTTGAAGTGATGCAAAAGGATGCAAGTATGCTTGCAAAAGAACTTGATTTTTTTGATGTAGTGTATCTTGATCCCCCTTATAATCAGCACCCTTATAGTTCTAATTATTTTATGCTAAATTTAATCGCAAATTATAAAAAACCTGAAGAAATTTCTAAAATCAGTGGCATTCCAAAAGATTGGAACCGTAGCACTTTTAATAAGCCAAAATTTGCCCAAGATGCTTTATTTGAACTTATTAATGATTTAAAAGCAAGAGTGATTTTACTTTCTTATAATTGTGAAGGTTTTGTAAAAAAAGAAATTTTTTTAAAGCGTTTAAGTACTCTTGGAAAATGTCGGATTTTAGAACAAAAATATAATACTTTTAGAGCTTCTCGCAATCTTAAAAATCGTAATATCCATCTTCATGAACAACTTTATATTTTAGTTAAAAATTAAATTTTGTGCTAAAATTATATTTATAAAAAGGAGGGATTTATGAAACTAAAATTATCTTTTTGTGCATTAATGGCATTTGGTTTTTCTAATTATCTTTTTGCTTCGGCCATTGATCCAAAGTTTTATTTTCAAGAATATCTTGATTTTGCTAGCAATAAGGGTAAATTTCAAGTAGGTCAAATTGGCTTTGAAATTTTAGCAAAAAATCCTAATCAAAACATCTCTTTCAATGTACCTATGATTGATTTTTCTACTTCAAATCGTGGAGGAAAATTCCAAGGAGAATTTACCAATATAGGACAATCTTATATAGTCAGTGCTTTTCATATGAGTACAAGTTCAAATACTGGGGAAGTAAATAAAGGCTATGTGAAACAAGGTAGTGTTTTACACTTTGGAGGTGTAGCAAATAGAATCGTAAGCTCAAGTGATAATTTTACTTATAAGAAAGAAAATGTGGATTTTGCTGTTTTAAAAATGAGTAAGATCAATCTCAATAAAAGTGCAAATTTGAGTAAAGATTTCAATTTTATTGAAAAAGATTCTGGCGATGGTGGAGATATTTATGAATACAAGGATCCTTTTTGGGATAGTTGTCAAAGTGGAAAATGTGATTATTCTAAAGGCAAAGGCAAGCTTTTTGATAGTTCGCGTTATGAGTACTTTGTAAGAGAGGGAAGTGGTATTGTAGCTTTAGGTTTTGAAGATACAAATAAAGTACCCATTAAGATTTTTGATTCTAATGAAATTAATTTAGGAGGTTTTGTCAGTTTAGCTCCTAAAAATACTGAAGATAAGCGTTTTAAGTTGCAATTTCTTAATTATACCAATGATAAAAGAAATCCTTTTGCAAGTTCTTCAACACCTGGGGATTCTGGAAGTGGAGTTTATGTTTATGATAAGATTGATAAAAAATGGTATTTAGTAGGTGTAGTAAGTACGAGTAATTGTAATGCCCATTTTACTGATGGATATACTTGTTCACAGGTTGATTATGCTTTGATCAATCAAGCAAAGATCAATGAATTTCAAAATACTCATAAAGTAGCCATAGGATCTGGAACTTATGCACTTAGTAGTGATGGTTTGATGAAAGATGGTAAAAAAATAGAAAATGTAAGTTTGATTTCTGGGACTAATGCGGGTTATGTAAGCTATAAAAATTCTTTTGATGATAAGACTAAATATGATAAGAGAATTGAAGAAATGCAAAATAGCAAGGATTTGTATTTTTCTCAAAATGGAAGTATAAATTTAAATAGCGATGTGGATTTAGGCGCTAGTGTTTTAAATTTTGAACAAAATTCAAATTGGCAAATAACAGGCGACAAATGGCTTATACATGGAGGAATTTACGCTGATAAGGGTTCAAGTATAGAATATAATGTTAAAACCAAAAAAGATGATTTTCTTTATAAAATGGGCGAAGGGGAGCTTATTGTCAAAAGTCAAAGTGTGGATGCAGGACTTAGAATGGGTGAGGGCAAGGTAAGTCTTGAGGGTGAAGGTTTGAGTTTTGGCGAAATTTATATGAATGGTGGAACT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99 | Campylobacter_phage(38.46%) | terminase,tRNA,protease,plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1296949 : 1310254
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010511|1296949:1310254|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010511|1296949:1310254|1297677_1299201_-|WP_002922022.1|DBSCAN-SWA MILITSAKYSSSDFTLEFGKISPSFLPLGNKRLYEYQIELFKNFNQKIFLSLPSDFKLSKFDEKKLKELNVEILFVPNNLSLGESVVYCLNVCCAFGEKLYILHGDTFFKELIFKENSLQVAKVKENYDWAYLDNEFNILSKTLEDDLILAGAYSFSHPQFLIKCIVESSYSFVDGMKAYSKAYAFDIIKNDTWLDFGLITSYFHSKKAVSTQRNFNNIDISNGYIKKSSSWQEKIKAEINWFDNLPKELFIYTPKVITYEDSYEIEYICNNTLAELYVFGKLPSYVWKRIFKSLKEFLDKLHSFKSNDKDINFNCKEKTLKRLQEFSKQSGIDLHKNIVINSKSYPSILTLVDKLDFYMNDINEFSLIHGDFCFSNIMYDFRAGVIKTFDPRGFDFNGKITPYGDKKYDFAKLVHSVFGLYDFIIAGFFECKVNSDNIEFFIEEDVNILDIQKEFLDVFDIDDNIKALTLHLFLSMLPLHNDFKEKQMAFLANAFILYDKFFKESK >NZ_CP010511|1296949:1310254|1301032_1301758_-|WP_002934356.1|DBSCAN-SWA MLNIVVPIAGKSYFFDNEKDGFPKPFIEICGKTMLEHFVKNYENVKSKRFIFILKEEDVKRYHLDDAINVLTNNQSKIIILKNETQGMVCSVLMAIDEINLNDSLLIVNMDQIFECDLNEVISDLSLNDAGVLSFESVHPRWAYVKCDENNFVLEAFEKKPVSKNAIAGFYYFNKAKFFITSAFDMIKKDVNYEGKYFIAPILNELILQDKKIINISIDKNRYFTFYSHAKINEYERIKNA 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16 | Synechococcus_phage(38.46%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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