Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010467 | Campylobacter jejuni strain CJ677CC024, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas2,csa3 | 0 | 1 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010467_1 | 1315203-1315282 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP010467_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP010467_1
>1.1|1315226|34|NZ_CP010467|CRISPRCasFinder TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP010467_1
The CRISPR arrays of NZ_CP010467_1 >merge|NZ_CP010467|1|1315203-1315282|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTCTTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAATCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC >NZ_CP010467|1|1|1315203-1315282|CRISPRCasFinder TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCTTC TTTTTTAGCTTTATACTCAGCCTTACTCATATAA TCTTTTTGTTCTTTTAAAGCATC
>NZ_CP010467.1|WP_002855339.1|1314802_1315129_+|ribosome-silencing-factor MQERIDLIVKILDEKKAEDIKTIDMSEQEYFVKYVIIAATLGERHALSLIDELKTQLKAKGEEFLNIDSSEEWSVIDLGDILIHLLTPEHRGIYNIEELLENLKKGRV >NZ_CP010467.1|WP_002932561.1|1314229_1314775_+|nicotinate-(nicotinamide)-nucleotide-adenylyltransferase MKIALFGGSFDPPHNGHNSVVLEALEILDIDKLIIMPTYINPFKQNFSADEKQRFLWVKKLWGHFPKVEICDFETKQKRPVPSIESVKYLYKLYNPSKFYLLIGADHLEKLHLWHDFEKLNSLVEFVIANRNDIEIPKNFKDLKTDKKIASSFIRNTLNINEVCEEIKDEVKKYYEKLQKN >NZ_CP010467.1|WP_002868484.1|1313171_1314170_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRCVARIILERNDIELVAINDTTDIELTKYLFKYDTVHGEFKGSVDSEGDDLVVNGKKIKVFKSRNVKDLDFAKHGAQIVLECTGAHLTMAKCQEFIDMGVQKVIMSAPAKDDTPTYVLGVNSELYKGESIISNASCTTNCLGPVCRVLQDNFGIEKGLMTTIHAYTNGQSIIDAKAKDKRRSRAAAQNIIPTSTGAAKAMKLVMPELNGKLHGQSMRVPVIDVSSVDLTAQLSRKVSKDEINEAFRKAATTNLKGILMVDDDERVSSDFITCSYGAIVASDLTQVIADDFIKVIAWYDNEWGYSSRLVDMAVYIANKA >NZ_CP010467.1|WP_002783833.1|1311966_1313169_-|phosphoglycerate-kinase MSDIISIKDIDLAKKKVFIRCDFNVPQDDFLNITDDRRIRSAIPTIRYCLDNGCSVILASHLGRPKEISSKYSLEPVAKRLARLLDKEIIMAKDVIGEDAKTKAMNLKAGEILLLENLRFEKGETKNDENLAKELASMVQVYINDAFGVCHRAHSSVEAITKFFDEKHKGAGFLLQKEIDFASNLIKHPARPFVAVVGGSKVSGKLQALTNLLPKVDKLIIGGGMAFTFLKALGYDIGNSLLEEELLEEANKILTKGKNLGVKIYLPVDVVAAPACSQDAPMKFVPAQEIPNGWMGLDIGPASVRLFKEVISDAQTIWWNGPMGVFEIDKFSKGSIKMSHYISEGHATSVVGGGDTADVVARAGDADEMTFISTGGGASLELIEGKELPGVKALRSKENE >NZ_CP010467.1|WP_002932563.1|1311298_1311970_-|triose-phosphate-isomerase MIFAANLKCNHTRASFKIYAEILNKTMGAKCDDIIVFPPSVAFLENENNFIQGAQNFYPCVNGAFTGELGKEHLDEFGIKCVLIGHSERRALGDEELIGAKFDFAKEHGYKIVFCIGENLDTKNSGKTLEFLKKQLEIIDLNYERLIIAYEPIYSIGTGVSAQSTDIAKVLEFLASLTKAPLLYGGSVNENNIKEILSVNHCGGVLIGSAALKVENFIKLIKG >NZ_CP010467.1|WP_002887956.1|1310470_1311295_-|enoyl-ACP-reductase-FabI MIMKGKKGLIVGVANNKSIAYGIAKACFDQGAQLAFTFLNDALKKRVEPIAQEFNSNFVYELDVNNNEHLDSIAEKIKKDLGEIDFVVHAVAFAPKEALENSFLETSKEAFDIAMQTSVYSLLSLTRAVLPILKDKGSILTLSYLGGVKYVPHYNVMGVAKAALESSVRYLARDLGVKGIRVNAISAGPIKTLAASGIGDFRMILKYNEINSPLKRNVSIEDVGNSAMYLLSDLANGVTGEIHYVDAGYNIMGMGDVEKNEEGQTVLCWDNQKG >NZ_CP010467.1|WP_002932564.1|1308973_1310467_-|hydrogenase-small-subunit MAKLSNEKLKNILEDRIKKLENSTLKEDKVINEESVKILARHLSLGNEIPALAQRFFQIAPKTKLVWLHLCECTGCSESLLRSELPSFDELIFDFFSLEYHETLMAANGTKAEELLEYVLEEDFILAVEGGVAAIDTFFLTIGAQGESGYEILEKLAAKAKAIFAVGTCSSYGGIQAAYPNPSKTCGISEVLSQKVVNIPGCPPSDVNIIATLSFFALFGVLPELDEQNRPVWAYGKCLHDMCERKAKFESGIFAEHFDDEAAKNGACLFKIGCKGPYTYNNCPKVKFNAKTSWPVAAGHGCIACSEKNFWDEFGNYEKPMANIFSYAKLCNEELKQEFFLEEQIKILEQIDFEFESNIKLILQNIAKNKLGALLVENYKKSFEKNYAFIEQNFDENPMPSKDFWKYLEMSFILVKGAFLKDKNDFLIAAKNYAFKHASPYDFKLNINAEKPKLDVSKSFRMTLIYLCGGLDFEGIAYSILKAFEDNITKISSLKAS >NZ_CP010467.1|WP_002779147.1|1306914_1307139_+|ferrous-iron-transport-protein-A MTLNELKDGQKAIIVNLNAHKELKNRLLSFGFIKNKNLKKIHSSLKNATIMVELDTSCVILRSDEAKTIEVNLI >NZ_CP010467.1|WP_002932566.1|1305492_1306833_+|MmgE/PrpD-family-protein MFYSEILADFILNIRYENIPDVVVQRAKELMLDSFGTAIAASNEECVLNTFKTFKNLSTEKNTSVWINEQKLDPIYAAMLNGIASHALDFDDTHTEAILHASAILAPLCLSYGFYINKEAQKIIKAFIVGWEIAARVGIASKGTFHKRGFHTTAIAGIFASTSASAILLDLNKEQIINALGLAGSFASGINEFLSNGSNSKVLHIANAIKNGIIIAHFAKNNMSGPLSIFEGRDNIFKCFGIEQECDKTELNKALGEIWQTMQVSIKPYPSCHFAHGLIDCAIALKNDGLKADEIKSICCFVDEVAVSFICDPLEAKYTPNSAYEAKFSMPFLMALGFFDGKITLKSYENLKRKEVLDFAKKITYKKRKSQGFPKYFPGHLEAILQNGNIIQKDVFINKGNFDNPLNFEELKAKFLANAQIYLDNAKANKILDQIINLENLNHFSF >NZ_CP010467.1|WP_002932567.1|1304116_1305484_+|adenylosuccinate-lyase MTGISVFDHRLLADSWSTQEMRAIFCEQNRIQKWLDVEAALAKAQAKLKIIPKKAADEIAKKAHYKFMDMDFIFAEFKKTKHPLVPTVRGLEKACDNNLGEYVHFGVTTQDIIDTGLVLQFKEAMTLVKSELKAIAKALAKLAKTHKNTAMMGRTLALQALPITFGHKVAIWLSELERHFERILELEKRLYVGSIVGAVGTKASLSDECNEVEKLTLENLGLDVPNISWQPARDRFIELGFVLGNINATFNKIAHEILILSHNEIDEVAEPFGKGQVGSSTMPHKRNPAISENAVTVSNAFKANLAILSDIERHEHERDGQVWKMEWKLLPEMFLMLSVVLANMKFALSDLEVKKDKMLKNLNTLNGFVLAERIMFALSDHYGKQHAHEIVYENAMLGIEKQKTFKEVLLADKRVSKVLKEKEIDALLDATTYVGYAPKLVDEFLAKIKNSAILK >NZ_CP010467.1|WP_002932557.1|1315584_1316955_-|phosphoglucosamine-mutase-PgmL MLDVIFREYDIRGLYGKELNEKSVKAIGFCLGQTMLNKGCKNVSVGYDARYSANELFNYLVSGLNKAGIKIYDIGLVPTPLGYFSLYEGLKFDANVMITGSHNPKDYNGFKITINKESFFGVELKEFSKEVYKHLDDDIEENLEVEKYDILSLYVKFMCEQFSFLKDFNYKFGVDCTNGAAGVVIEPLIKALNLKAHVMFAEPDGQFPNHAPDPTEEENLSAIREFLNQNQDYSLAFAFDGDADRMVALSKTHVFCGDELCYLFAKNIPSPRILGEVKCSKNLFDEVAKFGTIFMGKTGHSNIKKMMKEKDIDLAAEVSGHIFFKHRYFGYDDGIYAFLRALELVYKGFDLESMIKALPKLYTTPEIKIPVNEEEKFKFVEEFQKEIEKGALKGVKSLCEIDGARIDFGDGWALLRASNTSPYLITRFEATSLERAKELESTVFSLFNEIKARLKN >NZ_CP010467.1|WP_002868488.1|1317076_1317613_+|flagellar-basal-body-associated-protein-FliL MDEELENEETKKKKGGSLVIIIVILLFVLLLSIMGVIAWLISSSSSDESEVKEAPKEEAKTDKPKVSAPTQRGSDFANIGPMYPLDPFTLNLLSDSGSRYVKCTIELEQNSELLKPELDKKVPVIRDIIIRTLTAKTFEEVSTQKGKERLKDELVGKINEILTDGFIKNVYFTDFVVS >NZ_CP010467.1|WP_002825806.1|1317613_1317961_+|holo-ACP-synthase MRVGCDIIAISRIEKIHSRHGKNFLDKFLSPKEQILIKNPATLAGLWAAKEAASKALGVGICELCSFFDIEISKDEKNAPKLKYSQKITKDFNITQTSLSISHDNGFAIAIVAIV >NZ_CP010467.1|WP_002862076.1|1317961_1318381_-|hypothetical-protein MKRVRTKIRANFRRRVKRTLKGSLKEKLAGTILLCAIVPLAVLGYLFIVIIGTFFNTARARQGVRALDHFVNASLFNGYAWESVSSHAWRERNRKKWARIVIKITDFFQKDHCKRANKREQPVVDFILSRNLDKQTIGK >NZ_CP010467.1|WP_002932555.1|1318377_1319739_-|cytochrome-P450 MSECPFFPKPYKNKASTLLTFLLKRRSWLDGLYERSYKMQTGYVKMPNFDLYVINDTKEVKRMMVDEVREFPKSAFLHELLSPLLGESIFTTNGEVWKKQRELLRPSFEMTRINKVFNLMSEAVADMMDRFSKYPNHVVIEVDEAMTFITADVIFRTIMSSKLDEEKGKKILNAFVTFQEQSVHTAMRRMFRFPKWLSYVLGDRKRAKAGDVIRQVLSDIIKPRYDMADNAEFEDILGSLLLVVDADTNKRFSFEEILDQVAMLFLAGHETTASSLTWTLYLLSLYPKEQEKAYEEITQVLQGGAIEISHLRQFKYLTNIFKESLRLYPPVGFFAREAKKDTQVRDKLIKKGSGVVIAPWLIHRHEEFWTNPHGFNPSRFEGEYKKDAYLPFGVGERICIGQGFAMQEAILILANILKTYKLELEEGFVPDVVGRLTVRSANGMRIKFSKRKL >NZ_CP010467.1|WP_002932553.1|1319735_1320857_-|hypothetical-protein MDREVFYIAGYDPKSYRFYYDLFKKNLKDYSHAFNIKTDLSKIEKNEQFPFFQISCEGVQTKYHFLTWNDIVKKNWSENYKDALADCYSFFRIYTITGLFIKFGKESIYQLITGYYPFFYVLFSLLFSLVLAFGSFAFLQNYMHFSLAIIIGCFLGFLLNHFLFKLGKKLAVFWIARICAFCATWQDKKIGTIQERIKLFANTIVDKLKQNESKQDYELILVAHSVGTIVCIEVLECILRQNLDLSLLRKLKILTLGECIPLVSYQKKADEFRKKLEFVSRFDLKWYDYTSIIDGACFPQVDFFRTSGVNAKFTPPFLSAKFHTLYEKHEYKKIKRDKNKAHFLYLYSISVKGDYDFFSFIIMPKFLEEKVKI >NZ_CP010467.1|WP_002932552.1|1320929_1322114_-|capsule-polysaccharide-modification-protein-KpsS MRFSTKIKKEFSGKNVLLLQGPVGNFFHHLAMKMKKNQTKVFKLNFNGGDFFFYPSGTRCKCDEKDLENFYRDFFQSKKIDAILMYNDCRIIHAKAIKVAKELGIEIWIFEEGYLRPYCITLEKDGVNANSSLPRDKNFYLSQNIFTKESIKEIPGGFKFMAFDAFLYWLFAFILAPFFNNKLHHRTLYPFEFLFWFRSLYRKYLYKITEKKLNEKIYNLEKKYFLAILQVYSDTQIKYHYKKSIEHFIEETILSFANHARAKSYLVFKHHPMDRGYKNYSKLINDLSQKYHVEGRVLYVHDTHLPVLLRKALGCITINSTVGLSAILEGCPTKVCGNAFYDFEGLSYPKKLQFFWREAHAYKPNPVLVCNFKKYLLQTNQFNGNFYKNFFLDK >NZ_CP010467.1|WP_002932550.1|1322110_1324180_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein MKYYSTSKKLIANVRNFYIISLYKKNLKINKDDLFFGWGRKKSGLKAMNFAKKYKTKFILLEDGFIRSLNLGVENSPSFSIIKDDIGIYYDATMPSKLENLLNAYEFKDEEIKQAKKAIELIKKYKISKYNNNLDIPDDYFQKDEKRVLIITQTANDASLEFGLAKDFKTLDMIKDAIKENPKSKIYIKTHPDVLSGKKQSDLDLNSLPKECILITENFNPIALLEFFDKVYTKTSGMGFEALMQECECICYGMPFYAGWGLTKDKLECKRRIRKRNLEEVFYAAYILYSEYFNPYLNQKSNIFDTIQTLAKYKDIEKANSNRLFMLGFTLWKRHFIKPFFKAKNNEIIFLNSLKSLAGYKLKENDKFFIWGKKYDENTLKNLLLTKAKEQNLTNFSPKVSLVEDGFIRSISLGSDLTRPFSLIVDDKGLYIDPNKPSKLEELLQNEIFDENILNRAKNIIKILLENRFSKYNGLKHEDLKINAKIGQKIILIPAQVEDDASMILGGFGLSTLDLLKEVRSKNQDAYIIFKPHPDVLSGNRVGLKDETRILEFCDEIVKDCSIDSAIKIADEIHTITSTSGFDALLRAKKVFTYGMPFYAGWGLTKDKHKCKRRTRKLSPEELVAGALITYPRYINPKTKTLCEIEVCLDIMLNLQKDYFSKKHIKLAIDFKTFMLRKIRRFYEFLAKK >NZ_CP010467.1|WP_002932548.1|1324176_1324689_-|adenylyl-sulfate-kinase MINSPYIIWLTGLAGSGKTTIGQALYEKLKLKYKNLIYLDGDELREILGHYAYDRQGRIDMALKRAKFAKFLNDQGMIVIVTTISMFNEIYDYNRKQLKNYYEIYIECDMHELMQRDQKGLYTKALNKEIDNVVGVDIEFDKPGADLVINNSCRNNLEEKVELIIKKLAL >NZ_CP010467.1|WP_059110961.1|1324892_1325657_-|NTP-transferase-domain-containing-protein MNAIILAAGFGSRLMPLTKDQPKCMVEYKNKKIIDYEIEALKSAGINEIAVVGGYLNDVLKNYLNKYDIEHFFINSKYDKTNMVHTFFCAKDFMLKCIEEKQDLIISYADIVYFQDCVQKLINAKEELAIVVDKSWRKLWSKRFANPLEDAETLKMKNGYIIELGKKANAYDEIEAQYIGLFKFSYQFLSEVITFYEMLDRDILYDNKNFENMYMTSFLQALIEKYNNAKAVEIDGNWCEIDFMSDLSSIYRTF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP010467_1 | 1.1|1315226|34|NZ_CP010467|CRISPRCasFinder | 1315226-1315259 | 34 | MH752385 | Bacillus phage Ray17, complete genome | 8509-8542 | 10 | 0.706 |
1. spacer 1.1|1315226|34|NZ_CP010467|CRISPRCasFinder matches to MH752385 (Bacillus phage Ray17, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttttttagctttatactcagccttactcatataa CRISPR spacer cttacaagctttatactcagccttattgatcgtt Protospacer .** . *******************.* **
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
71536 : 150136
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP010467|71536:150136|DBSCAN-SWA TATGGAAAAAGAAGTTATTGCGTATTTGGATAATGAGACAATAATTGACTCTCAAAGTGTGAAAGATACAAATTTAAAAGAAATTTATTTTGATAATTCTAAAGAAAGTTTAGAAGTAATCCGCCATTCTTGTGCACACTTAATGGCACAGGCGATTAAGAACTTGTATCCTGAAGCTAAATTTTTCGTTGGTCCTGTTATAGAAGATGGATTTTATTATGATTTTCGTGTAGAAAGTAAGATCGGCGAAGAAGATTTAGTAAAAATTGAAAAAAAGATGAAAGAACTTGCTGAAGCAAAGATTGAAATTTCAAAATATGAAATCACAAAAAGCGAAGCTTTGGCTAAATTTCAAAATGATGATTTAAAACAAGAAGTTTTATTGCGTATTCCTGATGGAGCTGTAAGTATTTATAAACAAGGTGAATTTGAAGATTTGTGTCGTGGTCCTCATGTGCCAAATACGAAATTTTTACGCTTTTTTAAACTCACTCGTGTTGCAGGAGCGTATTTGGGTGGCGATGAAAAAAGAGAAATGCTTACTCGAATTTATGGTACTGCTTTTGCAGATAAGGAAAGTTTAAAAGAGTATTTAACTATTATTGAAGAAGCTAAAAAACGCGATCATAGAAAGCTTGGAACAGAGCTTAAGCTTTTTACTTTTGATGATGAGATTGGAGGGGGTCTTCCTATCTGGTTAAGTAATGGTGCAAGACTTAGATCTAAACTTGAACACATGCTTTATAAGATCCATCGTTTGCGTGGTTATGAACCTGTGCGTGGGCCTGAACTTTTAAAAGCAGATGCATGGAAAATCAGTGGGCATTATGCAAACTATAAAGAAAATATGTATTTTACACAAATTGATGAACAAGAATATGGTATTAAGCCTATGAACTGTGTGGGGCATATTAAAATTTATCAAAGTGATGTAAGAAGTTATCGTGATTTGCCTTTGAAATTTTTTGAATATGGCGTAGTGCATCGTCATGAAAAAAGTGGGGTTTTGCATGGACTTTTTAGGGTGAGAGAATTCACTCAAGATGATGCACATATTTTTTGTATGCCAAGTCAGATTAAAGATCAGGTTTTAGAAATTTTAGCTTTTGTGGATAATTTGATGAAATTATTTGATTTTAGCTATGAAATGGAAATTTCAACTAAACCTGAAAAAGCCATAGGCGATGATGAAATTTGGGAAGTAGCGACTAAGGCTTTAAAAGAAGCTTTAGATGAACAAGGTTTAAAATACGGTATTGACGAAGGTGGAGGGGCTTTTTATGGGCCAAAGATTGATATTAAAATCACCGATGCTTTAAAAAGAAAGTGGCAATGTGGAACCATACAAGTAGATTTTAACCTGCCAAGTCGTTTTAAACTTGAATACACTGATAGTGATAATGAAAAAAAACAACCTGTAATGTTGCATCGTGCGATTTTAGGTTCTTTTGAAAGATTTATAGGAATTTTAACCGAGCATTGTGCGGGTGAGTTTCCATTTTTTATCGCACCAACTGCGGTGGGTATAGTGCCAATAGGCGAAGCACATATTGCTTACGCAAAAGAAATTCAAAAAGAATTATTAGAGCTTAATATCGATAGCGAGGTGTATGAAAAAAATGAGAGTTTAAGTAAGAAAATACGCACAGCTGAAAAACAAAAATTACCTATGATTTTAGTTTTAGGCGATGATGAGGTGGCAAAGCGTAGCGTTGCTTTAAGAGATAGAAGAGCTAAAGAACAAAAAAATCTTAGCTTAGATGAATTTATTAAATTAGTTAAGGAGAAAATGAGTGAGGTACACTTTTGAGTAAAGAAAAAGAAGTATTGCTCAATGAAGAAATAAGAGCGGATGAAATCAGATGTGTTGGCGATGATGGCAAGGTTTATGGTATTATTAGTAGTGATGAAGCTTTAGAAATTGCAAATCGTTTAGGACTTGATCTTGTAATGATAGCTGCAGATGCTAAGCCACCTGTTTGCAAGATTATGGACTATGGTAAATTCCGTTATCAACAAGAGAAAAAACAAAAAGAAGCAAAGAAAAAACAAAAAGTGATTGATATAAAAGAAATCAAACTTTCTGTAAAAATTGCTCAAAATGATATTAATTACAAGGTAAAACATGCTTTAGAATTTTTAGAACAAGGTAAGCATGTGAGATTTCGTGTGTTCTTAAAAGGACGTGAAATGGCAACTCCTGAAGCAGGTGTAGCTTTGCTTGAAAAAATTTGGACTATGATAGAAAATGAAGCTAATCGTGACAAAGAGCCAAATTTTGAAGGTCGTTATGTAAATATGCTTGTAACTCCAAAAAAAGCTTAATCCACTTTTGTGGATAAGGCTTTTAAAGGTTTTAAATTTTGAAAGAAAATCCTTCTTTTTTAAAAGAGCAAATTATAACTTATCTTGGAAATAAAAGAGCGCTTTTAAGTTTTTTAAATAAGGGCTTTAAGGTAGCTAAAAAAGAACTTGGTAAAGATAAATTTAGTTTTTGTGATATATTTAGTGGCTCAGGTGTTGTAAGTCGTTTTGCAAAAGCACACTCAAATTATATTTTAGCCAATGATTTAGAGGATTATTCAAAACTCATCAATGAGTGTTATCTTGCCAATAAAGACAAAGATTTACTTCAAAATATAAAAAAGCATTATAAAAATTTAATCCAAAATTTAGATTTTCAAAAAGGTTTTATCAGTGAGCTTTATGCTCCAAAAGATGATGATGATATTAAAAAAAATGAAAGGGTTTTTTATACTTTTAAAAATGCTTTATATCTTGATACTATAAGGCAAAAAATCGAAAATGAAATTCCAAAAGAATTGAGGCATTTCTTTATAGCTCCTTTGATTTATGAAGCCAGTGTTCATTCAAATACTAGTGGAGTTTTTAAAGGTTTTTATAAGGGTAAGGATGGCATCGGAAAATTTGGTGGCGAAGGACAAAATGCACTTAAACGAATTAAAGGAGAAATAGAGCTTAAAATGCCTATTTTTTCAAATTTTTCTTGTGAATTTGAAGTGATGCAAAAGGATGCAAGTATGCTTGCAAAAGAACTTGATTTTTTTGATGTAGTGTATCTTGATCCCCCTTATAATCAGCACCCTTATAGTTCTAATTATTTTATGCTAAATTTAATCGCAAATTATAAAAAACCTGAAGAAATTTCTAAAATCAGTGGCATTCCAAAAGATTGGAACCGTAGCACTTTTAATAAGCCAAAATTTGCCCAAGATGCTTTATTTGAACTTATTAATGATTTAAAAGCAAGAGTGATTTTACTTTCTTATAATTGTGAAGGTTTTGTAAAAAAAGAAATTTTTTTAAAGCGTTTAAGTACTCTTGGAAAATGTCGGATTTTAGAACAAAAATATAATACTTTTAGAGCTTCTCGCAATCTTAAAAATCGTAATATCCATCTTCATGAACAACTTTATATTTTAGTTAAAAATTAAATTTTGTGCTAAAATTATATTTATAAAAAGGAGGGATTTATGAAACTAAAATTATCTTTTTGTGCATTAATGGCATTTGGTTTTTCTAATTATCTTTTTGCTTCGGCCATTGATCCAAAGTTTTATTTTCAAGAATATCTTGATTTTGCTAGCAATAAGGGTAAATTTCAAGTAGGTCAAATTGGCTTTGAAATTTTAGCAAAAAATCCTAATCAAAACATCTCTTTCAATGTACCTATGATTGATTTTTCTACTTCAAATCGTGGAGGAAAATTCCAAGGAGAATTTACCAATATAGGACAATCTTATATAGTCAGTGCTTTTCATATGAGTACAAGTTCAAATACTGGGGAAGTAAATAAAGGCTATGTGAAACAAGGTAGTGTTTTACACTTTGGAGGTGTAGCAAATAGAATCGTAAGCTCAAGTGATAATTTTACTTATAAGAAAGAAAATGTGGATTTTGCTGTTTTAAAAATGAGTAAGATCAATCTCAATAAAAGTGCAAATTTGAGTAAAGATTTCAATTTTATTGAAAAAGATTCTGGCGATGGTGGAGATATTTATGAATACAAGGATCCTTTTTGGGATAGTTGTCAAAGTGGAAAATGTGATTATTCTAAAGGCAAAGGCAAGCTTTTTGATAGTTCGCGTTATGAGTACTTTGTAAGAGAGGGAAGTGGTATTGTAGCTTTAGGTTTTGAAGATACAAATAAAGTACCCATTAAGATTTTTGATTCTAATGAAATTAATTTAGGAGGTTTTGTCAGTTTAGCTCCTAAAAATACTGAAGATAAGCGTTTTAAGTTGCAATTTCTTAATTATACCAATGATAAAAGAAATCCTTTTGCAAGTTCTTCAACACCTGGGGATTCTGGAAGTGGAGTTTATGTTTATGATAAGATTGATAAAAAATGGTATTTAGTAGGTGTAGTAAGTACGAGTAATTGTAATGCCCATTTTACTGATGGATATACTTGTTCACAGGTTGATTATGCTTTGATCAATCAAGCAAAGATCAATGAATTTCAAAATACTCATAAAGTAGCCATAGGATCTGGAACTTATGCACTTAGTAGTGATGGTTTGATGAAAGATGGTAAAAAAATAGAAAATGTAAGTTTGATTTCTGGGACTAATGCGGGTTATGTAAGCTATAAAAATTCTTTTGATGATAAGACTAAATATGATAAGAGAATTGAAGAAATGCAAAATAGCAAGGATTTGTATTTTTCTCAAAATGGAAGTATAAATTTAAATAGCGATGTGGATTTAGGCGCTAGTGTTTTAAATTTTGAACAAAATTCAAATTGGCAAATAACAGGCGACAAATGGCTTATACATGGAGGAATTTACGCTGATAAGGGTTCAAGTATAGAATATAATGTTAAAACCAAAAAAGATGATTTTCTTTATAAAATGGGCGAAGGGGAGCTTATTGTCAAAAGTCAAAGTGTGGATGCAGGACTTAGAATGGGTGAGGGCAAGGTAAGTCTTGAGGGTGAAGGTTTGAGTTTTGGCGAAATTTATATGAATGGTGGAACT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96 | Campylobacter_phage(33.33%) | tail,protease,plate,terminase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1333767 : 1348196
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010467|1333767:1348196|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP010467|1333767:1348196|1344605_1345544_-|WP_002934348.1|DBSCAN-SWA MSKKVLITGGAGYIGSVLTPILLEKGYEVCVIDNLMFDQISLLSCSHNKNFTFINGDAMDENLIRQEVVKADIIIPLAALVGAPLCKRNPKLAKMINYEAVKMISDFASPSQIFIYPNTNSGYGIGEKDAMCTEESPLRPISEYGIDKVHAEQYLLDKGNCVTFRLATVFGISPRMRLDLLVNDFTYRAYKDKFIVLFEEHFRRNYIHVRDVVKGFIHGIENYDKMKGQAYNMGLSSANLTKRQLAETIKKYIPDFYIHSASIGEDPDKRDYLVSNAKLEATGWKPDNTLEDGIEELLRAFKMMKVNRFANV >NZ_CP010467|1333767:1348196|1335618_1337142_-|WP_002922022.1|DBSCAN-SWA MILITSAKYSSSDFTLEFGKISPSFLPLGNKRLYEYQIELFKNFNQKIFLSLPSDFKLSKFDEKKLKELNVEILFVPNNLSLGESVVYCLNVCCAFGEKLYILHGDTFFKELIFKENSLQVAKVKENYDWAYLDNEFNILSKTLEDDLILAGAYSFSHPQFLIKCIVESSYSFVDGMKAYSKAYAFDIIKNDTWLDFGLITSYFHSKKAVSTQRNFNNIDISNGYIKKSSSWQEKIKAEINWFDNLPKELFIYTPKVITYEDSYEIEYICNNTLAELYVFGKLPSYVWKRIFKSLKEFLDKLHSFKSNDKDINFNCKEKTLKRLQEFSKQSGIDLHKNIVINSKSYPSILTLVDKLDFYMNDINEFSLIHGDFCFSNIMYDFRAGVIKTFDPRGFDFNGKITPYGDKKYDFAKLVHSVFGLYDFIIAGFFECKVNSDNIEFFIEEDVNILDIQKEFLDVFDIDDNIKALTLHLFLSMLPLHNDFKEKQMAFLANAFILYDKFFKESK 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15 | Synechococcus_phage(38.46%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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