Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013924 | Acinetobacter baumannii strain KBN10P02143 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 8 | 0 |
NZ_CP013925 | Acinetobacter baumannii strain KBN10P02143 plasmid pKBN10P02143, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013924_1 | 2478977-2479062 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013924_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013924_1
>1.1|2479000|40|NZ_CP013924|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013924_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013924_1 >merge|NZ_CP013924|1|2478977-2479062|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP013924|1|1|2478977-2479062|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP013924.1|WP_000795915.1|2477739_2477976_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP013924.1|WP_001124846.1|2476845_2477457_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP013924.1|WP_000885229.1|2476163_2476775_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP013924.1|WP_000376215.1|2475551_2476007_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP013924.1|WP_001990047.1|2473846_2475493_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP013924.1|WP_000115408.1|2470216_2473681_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP013924.1|WP_000107128.1|2469260_2470220_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP013924.1|WP_001025680.1|2468832_2469117_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP013924.1|WP_002017921.1|2468609_2468723_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP013924.1|WP_000937460.1|2467885_2468521_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP013924.1|WP_000983628.1|2479693_2480107_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP013924.1|WP_000432330.1|2480248_2481127_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP013924.1|WP_001990041.1|2481183_2483328_-|catalase-HPII 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MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP013924.1|WP_000482091.1|2485107_2485587_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP013924.1|WP_000108365.1|2485871_2486093_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP013924.1|WP_000132044.1|2486198_2486516_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP013924.1|WP_000498477.1|2486600_2486822_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP013924.1|WP_001136759.1|2486909_2487338_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP013924.1|WP_000251637.1|2487607_2487751_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
992230 : 1082410
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013924|992230:1082410|DBSCAN-SWA CATGTCTACTGTATCAAATCAGATGAATAAAGACAAATTGTTAGAGTTAAAGCGCCAGCAAAGTTACCAGTCCTGGCATGGGCCAGCTTTAAAAACGCTTGCCGATTTATTGAAAGAACGCAAAGCGAACTTAAAGAAACGTAACCATGATGAAAACCAAGCAGCGGTAACACGTGATGAGTTTATGCAAGGCCTAGTTAATGATCATGGTGTACACGGCATAAATCTTTATCACGCGGGTGTAATTATCTCGAGTCTGTATAGGGCTAAAAAAATTCGATATTTGGGTAGCTTCATCCAAATTATTGAAGGGGATGGTGGCGCGTGATCCCACAAGAACTAATTAATGAAATTAGGCAAAATGCCCTTTTTGTTATAAATCATAGCGGTGGAAAAGATAGCCAAGCCATGATGATAAAACTACTTGAGTTTGTTCCTAAGGAGCAAATTCTTGTAGTTCATGCAAGTCTTGGTTTTATGGAATGGCCAGGAGCATTAGAGCTTGCACAGAGTCAAGCTGCTGCAGCTGGCGTTGATTTTATTGTGGCCAAAGCAAGTAAAACATTTCTTGATATGGTTCTGAAACGATTTTCTGAACGCCCTGAGGTTCCTTCATTTCCTTCACCTAAGTACCGCCAATGCACCAGTGACTTAAAAAGAGATCCTATCAAGCGAGAGGTACGCCGTTACGCAAAGGCTAATGATTTCAATCGAATAGTAAATTGTGTTGGTTTGCGTGCTGAGGAATCTAGCCATCGTGCAAAGCAAATGATCTTTAAACCTGCAGCTGAGAATGGTAAAGCAGGTCGCACCTGGCATGACTATCTTCCGATACATTCTCTTACAACCAATGAGGTTTTTCAGACCATTAAAAATGCTGGTCAATCACCTCATTGGGCGTACCAGGATAATGATCGTTTAAGTTGTATCACTTGCATTATGGCAAGCGCGAGAGACTTAATTAATGGTGCAACAAAAAATCCTGAATTCTATGCATTGATGTGTCTGGTAGAACAAATTACTGGATATGCAATGCACGCTAGTTTGCGGTTCCTTCCTGATCTAACCGGTATACATCCTAATTATTCACTTTTAAGCGAATACCAAGATCTAGTTTCAAAGTTTTCAAATACGCGCTCTAACAGAAAACGTATACAAATGCTGGAGGTTGCAGCATGAGTAAGTATGTCCCTAATTCATTCCAAGTTGCGAACGCTTTTGTAGATGAAGCAATGAGTAAAATCTCTGATGCTTCAGTAAAAATCTATTTGATTATTAACCGTAAAACACGTGGCTGGGCAAAAGAATGTGATGCGCTTTCACTTACGCAACTAGAAGAACTGTCAGGGAAAAGTCATCCAACAGTCGTTAGATGTACAAAAGAGCTTGTTAAAGTTGGTTTAGTAAGAAAACATGAGCAATCTGTATATGGGAATGTTTACTCATTAATAGACAATTATTTTGTTGGTGAGCATGTAAACTTCCCAAACAAGAGTTCAGTACTTGTTCAGTCTTTTAGCTTATTTAATGGGCAGCTAGTTAAAATTTTTAACTACCAAAAGCCTGTGTCTAAAAAATCAGTTAAGAGCAAAAAGAGTAAAAATCTGTGTTTAAATTTTCCACAAAAATCTCGGTTGCTAGTTAAAAATTTTAACTACCTTGAAAATACTAGCCAGTTAAATTTTTTAACTACTGCTAGTAAAAATTTTTTACCCCTACTAGTTAAAATTTTTAACACACAAAACACACTATCAAAACCAACTTATCAAAATAAAAAAAATACATGGTTTGTTTTAGAAAATTTGAAGTTTGAAATTTGTTCTATCAATCCGTCAATTGATACGGATGAGATTTTCAAGGCCTCTTGGTTTGAGAGAGAGTTAAAAGCATTCAAAGGTTTTAACGAAGGTCGCAATCACTCTGATTACGATATGGTTCGATTCTTTGCTGAGTGGATGCTTAAAGCACGCGCTAAATACGCCAAGATGAAAACACCGGCACCTCGCCAAAACAATTATTCAAATGGTCAGTCAGCTAAACCAGCTAATCAAATTCCTGAAGTAATTACTTTCGCATCTGAAAAACAACTATTCGCGTTCGCACGCCGTTTAGTAAACCATCCTGATTTCAAAGATACATTTTGCCATACCGGTGAATCATGGATGGATGCTGGAAAGCGTATGGCTCAAAAGTTGGTAGATCCTCAGGAACAAAAACCATTTATTCCGTATTTGATCGAGATGGGTTTTAAAAACTCATCCAAGGAGACGGCTGCATGATTACTCTAAATAAAACTACCGGCATTCAAAAATTAAAAGAGATTCTTCAAGAATTTGATTCTTGTATGTACATCGAACGTGACAATTTTTTTGACAAGCATTATGACCTAGTTAAAAGCGAAAGTGATATTGAGCAAATTCGTATTGCAGTCAAAGCAGCTGAATTAAAGAGGGGTACACGTGTCAAAGTAAATTTCACACATGTACCAGACAAGGGTCAAAACAAAATTCATTTTGTTGGCAATGGTACTGTCGATCTGTTTGAAGATAACCGGGTATTTGGTCGTTTAGATGATGGCCGACCTTTTTGCTGTTTAGTCTCAGATATAGAAATTTTGGTTTCAGAAAAATTAGAAAAGGAAGATGGCTACGAAGAATCTAAGGCAGTCAATAAAGTCTATTTTTTTCTTTGTTTGGTCTTGGGCTGTGCAGTAGTTAAGGGGTGTGGCCTATGAAAAAGGTTATCAGTTTTAGTGGTGGACGTACTTCAGGGTATGCAGTCAATCTCTTTAAAAATGATCCTGATGCTTATTTTATTTTTATGGATACTGGCGCAGAGCATCCAGCTACTTACCAATTTATTAAAGATATTGTTAAACATTGGAAAATAAATCTTGTATGTCTTCGTGTAGTCGTTAATCCACAAATGAAAAAGGGTGTGGGCTACAAAATTATACCCCTTGATGAGCTCAAACAAGACTTGGAACCTTGGAGAGATATGCTCAAAAAGTATGGAAGTCCTTATTACGATATGCCGTTTTGTACAGCTCGTATGAAAACTGAACCTTTTGAAAAATATTGCAATGATGTGTTTGGGAAAAACAACTATGAACGATGGATTGGTATTAGATCTGATGAGCCAAAACGGTTGCCAATTGAGGTTTTAGAAAAGCTTGGTTTACCTATTCATAAAGACGCAAAGAAGCAGAAAGCCGGGTTTAGATATTTAGCTGAAATTAGTGATTTCACTAAAGAAGATGTTTTGGACTGGTGGGAACAACAACCTTTTGATTTAGCAATTACAGAACATCTAGGTAATTGTGTTTTTTGTATTAAAAAACACTTAAACAAAGTTGCACTAGCTGCCAAAGACGAACCTGAACAAGCAGTGAAATGGATAGCGGTTACTGAAGGCGAAAACGTCAGATCTGAAGGTAGAAAATACAACCATCATCGGATGTATCGAACGCGGTTACATTTGAGCGATGTTATAGAGGCTTTCAAAAATCATGACAGAGATGAGCTTTACAACGCTCTTAGAAGTAGCAAGCGCTATGAAACAGGCTCTTGTACTGAATCATGCGAAGCCATTATTTGAGGGAATGGTGGATGAAGTTAACTAAACAACAACGGGCAGAGTTAAAACAAAAATTTGGCGGCCATTGTGCGTATTGCGGTGAAATGCTCGGTGATAAATGGCATGCGGATCATATCGAAGCTGTGAAACGAGATTTAATTCATGTTGGCGGTGGCAAGTTGATTACTGGAGAAATGACTAGACCGCAAAACGACACTTTGGAAAACATGAATCCAGCGTGTGTTCCTTGTAATACAAACAAGTCGTCTATGCCCTTGGAAGGGTGGCGGAGGATGCTCACACATTATCGTGATGTTCAGTTGTTACGAGATAGCACACATGCTCGTCATTTACTACGTTTTGGGCTGATTGAAATCAAATCTGAGCCTGTGAAGTTTTTCTTTGAGAGTTATAAAGAGGGCCAGTCATGAATAAACCATTAGAAACTTTTGATATAGACGCAGCAAAGGCTCGCTACGAAAAATTACGAGGCCGATATAACCGGAGTGGGCTATCTAATACTGATTACAACGAGCTACTTCAATTAGAAAAGGCAATCGAGCAAGCAAAGAAAGTTAATGAAGGAGCGCCGATTGATGAGCGAAAATAAGTTATCACCAAGACAGTTGGTACTCATTCGACGGGCAGCTGAAGATGCTATACATGCTTGCAATAGACATTACGGCCCATTTGTTGACTATGTTGCTCACCCATTAAATATCATTTCATTGGTTGATATGGCGCAAGAAAGCCTACACCAGCAAGAGCTAATAAAACAAAAGGATACAGTAATAAAATTTGCTAACAGTATGGCGAATTTAGATCAACAGAAGTTCAAGGAATTACAAGAACGGATAAATCTTGCCCTGCAACAAATACAAGGCAATTTGCAATATGTTGAGCAGGATAAGAGAGAAAACTTTGAATTTCTGCAAATGGCTATGATTCGAGCATTTAAAGAATTAGAGAAAGTGCTCAATGGTGGTGAGCCTAAATGACATCGATGAGTTTAGCGGATTATCACTCTAAATTTCCAAACGGCCATAAAGCTAAAAAGGGCCGTAATAAATTTAATGCTTCAAAAGTCACATTAGATGGGATGACTTTCGACAGCAAAAAAGAACTCAAGCGATATATCGAACTTAAAGCCATGCAGCAACGCGGTGAAATCTTTGGATTAGAGCACCATGCAAAATTTGAATTGGCTCCTAAAACTAAGATAGAGGGGGAAAAGAGAACAAAGCCGGCACTTAGATATTTTGCTGATTTTACTTACTACCTCATCAATGGCGAGTACATCGTTGAGGACGTTAAGTCTATTGCTACTAGGAAATTACCTAGTTATCGCAATAAGAAACATTTAATGAAAACTGTACACGGTATTGATATTAGAGAGGTTTGAGAAAAGTTTATGAGCGACATTG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120 | Acinetobacter_phage(87.0%) | capsid,tail,holin,terminase,integrase | attL 1015071:1015085|attR 1083714:1083728 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1248996 : 1263793
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013924|1248996:1263793|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1375830 : 1438301
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013924|1375830:1438301|DBSCAN-SWA 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60 | Escherichia_phage(37.5%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1636589 : 1730898
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013924|1636589:1730898|DBSCAN-SWA 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131 | Acinetobacter_phage(99.2%) | integrase,capsid,transposase,terminase | attL 1625112:1625129|attR 1666146:1666163 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2711106 : 2768257
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013924|2711106:2768257|DBSCAN-SWA 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51 | Escherichia_phage(28.57%) | integrase,tRNA,transposase | attL 2753530:2753589|attR 2767489:2768309 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2845327 : 2874001
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013924|2845327:2874001|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2877959 : 2890307
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013924|2877959:2890307|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3109089 : 3121873
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013924|3109089:3121873|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013924|3109089:3121873|3114374_3114509_-|WP_001031749.1|DBSCAN-SWA MNKFEILAWGLLISFFTAAISGAVVWWWLARKELDEKGASHESN >NZ_CP013924|3109089:3121873|3113553_3113916_-|WP_095357150.1|DBSCAN-SWA MSASMEMLRARLIELLTPHLSGRYVKWREAYFTRFTKCGGDSGWMFCVGPHEFHIDGALRRYYSGSIDITYNQKDRYFLVGEKKKVKCKACKGFGFIRDDGWGHIDKCEMCDAEKGASHE >NZ_CP013924|3109089:3121873|3121183_3121873_+|WP_000550612.1|DBSCAN-SWA MHLQKNVKYLLKKYSTTTTGLSKKSGVPQPTLFRWENGQYKEPKISTVEKLASWAGYDANTLLNNDLEAIDNINNDLDELVLDNNVNLSNKIKLDGEQIPVISWVAAGSFTDVQTVLKDTEVLEWLPPMKKAGKNGYGLIVTGTSMLPKFEPGDRIYVNPDYPVFDLKTNDLVIVSCAGDTQATFKRLIIEDGEEKYLEPLNTKWPEQIIKLTEECKLVGKVVGMHREF >NZ_CP013924|3109089:3121873|3114505_3115255_-|WP_000544506.1|DBSCAN-SWA MHEITLNEVRQLIASLRTVYAAQFNKQFPATGESAIPLSVVEQIALKTLVGVQQNQFNNALARLLTAGGRFMPSFAEFRTWCIGESWMSPEEAWSRACKFTTDRSVVITQITKYALDEVMYLIEAGQMRAAQDNFFGTYNVMVAKAQLKGRQQEFYTPPLQLEHKEPKHVPVSNDEAQKHLKSLMERLKINGRKPAPVQKLEAKEKEPELIKELGPDPFDNPHEYAEMCRREGMPIPRNILQLIDGANV 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19 | Acinetobacter_phage(53.85%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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