Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013948 | Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP013947 | Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP013946 | Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 3 | 0 |
NZ_CP013945 | Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPSCRG01-4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP013944 | Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01, complete genome | 2 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,csa3 | 0 | 0 | 33 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013944_1 | 1098456-1098551 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013944_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013944_1
>1.1|1098480|48|NZ_CP013944|CRISPRCasFinder ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013944_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013944_1 >merge|NZ_CP013944|1|1098456-1098551|CRISPRCasFinder CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAGATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTCCAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG >NZ_CP013944|1|1|1098456-1098551|CRISPRCasFinder CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC CAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG
>NZ_CP013944.1|WP_017378009.1|1096050_1097796_-|hypothetical-protein MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP >NZ_CP013944.1|WP_036771696.1|1094175_1095636_-|hypothetical-protein MIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN >NZ_CP013944.1|WP_053093668.1|1093393_1093993_-|hypothetical-protein MRIITKPTTAKCNIQAYIRYLLSEPVRTSCTGLSDVLLNISHDSVNRFLLRENYRPEDLWTEVSEKIDLNNGVLSVDDMVIDKPYSNAEKTDLIGFFYSGKHHCVVKGVNVITLYYTDQHDVSVPINFRIIDPDEGKTKNEHFREMLQQVLSWGLQPSWVTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013944.1|WP_144420647.1|1093058_1093256_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVSEDIIRLFSIANSMPRLYFLINFRFSMLEYQQSPAASHGVLSTG >NZ_CP013944.1|WP_155046604.1|1092717_1092858_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAGAVAVRFKQSIVGMKVVYKSNGTTLRARSEQKRTLAQ >NZ_CP013944.1|WP_048875964.1|1091870_1092650_-|hypothetical-protein MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ >NZ_CP013944.1|WP_017376708.1|1090904_1091306_-|transposase MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013944.1|WP_036773793.1|1090382_1090760_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP013944.1|WP_027242834.1|1088615_1089923_+|hypothetical-protein MKFIYPGINAPLDTEKSLYAETTQGYFSHKESGKALDFNFIKKQESYFSQWDKRTAFTCEEYKALTHQQRLQLYRLHTTRWNYTLSLLLKDPGAGPDSPLYAEKQFLQNLNENEEMRKLYAGWFIDYVESREGETSKAVEALFKKEMQLKPECDLSKEKQIAVKVRGFRDEITELQAWLMNGSSAERIAIEKYDTKAVNQFIKYQLGQVSKSEFNKTFERAQSKCNKVLKNALHLTTSAASILTEKKIDLNSSVEWERLKNSQHLQKAVLILHKSNINLADSWDTLKDNSHLQKAVLTLHHESSINLTEHWDKVKNNSPLQKALAASYDYLNAERSSWSKMHHNHGIRQTHKFIRHLMASENQTLSGIQAEMQQWLHGYGHFSRASGSASNSRMSFALQSGLCPQADTPPTLLFNTSLQATEVEQEVTNQVTLSS >NZ_CP013944.1|WP_146619530.1|1087609_1087867_+|hypothetical-protein MFRQKCSHSYRYYAVAMPKINMLTDFTDGDFERIHKAHWNIERFHRATKQLCSIEKFQVRTTECIKNHIFRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP013944.1|WP_017378007.1|1099609_1101553_-|hypothetical-protein MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS >NZ_CP013944.1|WP_048875961.1|1101698_1103102_-|IS4-family-transposase MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP013944.1|WP_017378006.1|1103221_1103851_-|response-regulator MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD >NZ_CP013944.1|WP_017378005.1|1104089_1104809_-|sulfate-transporter-CysZ MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK >NZ_CP013944.1|WP_017378004.1|1104922_1108462_+|chromosome-segregation-protein-SMC MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE >NZ_CP013944.1|WP_017378003.1|1108528_1109359_+|hypothetical-protein METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG >NZ_CP013944.1|WP_036773465.1|1109345_1111385_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN >NZ_CP013944.1|WP_027243145.1|1111400_1112456_+|protease-SohB MITQLLADYGLFLIKTATLVAAILIVFSGLLALAMKNRLAKQKGSLEVEKLNDHYDDLKETIEIEVLDKKELKALEKERRKEEKQERKDKKKNKSKETETDDEDAASAARIFVLDFDGDIEASAVHALREEVDALLTFINEKDEVVVRLESPGGMVSPYGLAASQLARFRSKGVKLTIAVDQVAASGGYLMACVADRVIAAPFAVLGSIGVVFQMPNFHRVLKKHDVEYEQLTAGDYKRTLTMFGKNTKEGREKLQEELEDIHYLFKNFVGEYRPQLDIDKVATGEHWFGQRALELNLVDELITSDDYLLSRADEHDIYSVNYMEKQTLADRLGIMARALLGKLATAGVKR >NZ_CP013944.1|WP_017377998.1|1112466_1112997_+|hypothetical-protein MQRKAIVLLSGGGYSSLCLYLARSQGYLPYALSLDIPKRHFQLDSAQQFARDVGVAEHQVIAMNENSLSDSKALTYYSSLLSFAVNWAQELSAQDIFIGLHPSAEHTLEYMVEWLQSYQELINLSSTTAIRIQTPLLFMSDKKREQTAEQFNLKLPEPVSKLKSKKKKFIQRIFSE >NZ_CP013944.1|WP_048875965.1|1115154_1116075_-|hypothetical-protein MLSTPWLAALDFDGCLYNVNIDNVRRAFHSPGKPKEELTLAHLITINQKLIDHLNNQAEKFSSSTVFLGSDRQDYKKERDNSAGPNREGQYCYPLISDFAKKIGAEFDPLLMADIYNNLPLGESFRQALQDYHTPEKHDQDPHTQPDSSKLTLLYAQMHKAATENPDDIVTYEFYDDRKDILLSLQEIFESDPHMIPKNITLYLNHYDGVNLQNLLIIQGQGNPDSQYQHTLKNPAYRKASANPAEAQTDYSISELIKEKFPKISKSFLEIKQKLQQLNLPKLKKSLIREATSVSVATSVGILHIQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013944_2 | 1628544-1628653 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013944_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013944_2
>2.1|1628570|58|NZ_CP013944|CRISPRCasFinder CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013944_2
The CRISPR arrays of NZ_CP013944_2 >merge|NZ_CP013944|2|1628544-1628653|CRISPRCasFinder TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCTCGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGCTATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC >NZ_CP013944|2|2|1628544-1628653|CRISPRCasFinder TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCT CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC
>NZ_CP013944.1|WP_017376785.1|1627038_1627944_-|LysR-family-transcriptional-regulator MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL >NZ_CP013944.1|WP_017376784.1|1626612_1626798_-|hypothetical-protein MEKIERVYARDHGISGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLGGYLG >NZ_CP013944.1|WP_027242578.1|1626039_1626576_+|DUF2062-domain-containing-protein MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER >NZ_CP013944.1|WP_027242577.1|1624720_1626022_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY >NZ_CP013944.1|WP_048876008.1|1623749_1624724_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013944.1|WP_144420681.1|1623520_1623706_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP013944.1|WP_155046590.1|1623176_1623341_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP013944.1|WP_036774017.1|1622299_1623175_+|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP013944.1|WP_144420680.1|1621063_1621984_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2 MCKIPTEVATLTYFLCRTHVFLGTLILLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV >NZ_CP013944.1|WP_017375696.1|1620664_1621048_+|hypothetical-protein MTINKRDFFDAINYADTAVKIHEYLLNTLEKQQKDFAESCNNDNSSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKVLLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ >NZ_CP013944.1|WP_144420682.1|1629350_1629512_+|phosphatase MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013944.1|WP_155046588.1|1630046_1630256_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP >NZ_CP013944.1|WP_027243099.1|1631371_1632685_-|DEAD/DEAH-box-helicase MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK >NZ_CP013944.1|WP_027243098.1|1632920_1634066_+|carboxypeptidase-family-protein 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---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
3091 : 61661
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013944|3091:61661|DBSCAN-SWA 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56 | Escherichia_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
185879 : 322840
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013944|185879:322840|DBSCAN-SWA 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120 | Acinetobacter_phage(11.11%) | tail,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
330806 : 384244
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013944|330806:384244|DBSCAN-SWA 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48 | Staphylococcus_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
441241 : 563627
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013944|441241:563627|DBSCAN-SWA 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106 | Staphylococcus_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
573742 : 679240
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013944|573742:679240|DBSCAN-SWA 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108 | Bacillus_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
686597 : 758839
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013944|686597:758839|DBSCAN-SWA 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48 | Staphylococcus_phage(66.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
771312 : 831536
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013944|771312:831536|DBSCAN-SWA 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51 | Acinetobacter_phage(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
845199 : 989406
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013944|845199:989406|DBSCAN-SWA 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115 | Staphylococcus_phage(16.67%) | integrase,protease,tRNA,transposase | attL 869978:870037|attR 920402:921162 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1008468 : 1051661
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP013944|1008468:1051661|DBSCAN-SWA 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44 | Orpheovirus(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1055207 : 1112456
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP013944|1055207:1112456|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(20.0%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1119320 : 1153462
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP013944|1119320:1153462|DBSCAN-SWA 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28 | Burkholderia_virus(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1193938 : 1254286
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP013944|1193938:1254286|DBSCAN-SWA 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49 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1282959 : 1299574
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP013944|1282959:1299574|DBSCAN-SWA 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15 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_14 |
1334221 : 1406384
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP013944|1334221:1406384|DBSCAN-SWA 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54 | Klosneuvirus(15.38%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1424236 : 1469720
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP013944|1424236:1469720|DBSCAN-SWA 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48 | Acinetobacter_phage(15.38%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1540898 : 1675994
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP013944|1540898:1675994|DBSCAN-SWA 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126 | Staphylococcus_phage(21.88%) | integrase,protease,tRNA,transposase | attL 1551936:1551995|attR 1622181:1622472 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1695758 : 1754672
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP013944|1695758:1754672|DBSCAN-SWA 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53 | Acinetobacter_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1758586 : 1818736
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP013944|1758586:1818736|DBSCAN-SWA 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44 | Burkholderia_virus(50.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1848491 : 1962308
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP013944|1848491:1962308|DBSCAN-SWA 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94 | Staphylococcus_phage(23.08%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1979810 : 2046170
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP013944|1979810:2046170|DBSCAN-SWA 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49 | Burkholderia_virus(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
2057206 : 2108283
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP013944|2057206:2108283|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(27.27%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
2123446 : 2184304
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP013944|2123446:2184304|DBSCAN-SWA 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55 | Burkholderia_virus(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
2209198 : 2253493
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP013944|2209198:2253493|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2308413 : 2355121
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP013944|2308413:2355121|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013944|2308413:2355121|2347475_2348189_+|WP_017377914.1|DBSCAN-SWA MTIAILIAMEEEVQLLKEHTTGITHEVNNILFHEAKIHDQDALIVQTKIGKVNAAMATTLLIERFQPSLVINTGTAGGFHQDLKIGDIIIADKILHNDVDVTGFGYAYGQIPGLPTHFEPDEQAKTHAEITCQQANLTYYIGTIATGDSFLSTPFLIDRAKTNINNLYAGEMEAAAVAQVCFHANVPALFIRAISDIAGTDDQEKDFSANIQAASKKYTHFISEFFKQHANSLKIKL |
41 | Synechococcus_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2360816 : 2397095
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP013944|2360816:2397095|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013944|2360816:2397095|2361916_2363386_-|WP_017377929.1|DBSCAN-SWA MLIFERSATGRTATAQAPREIEPVQFAEQHRRKDQPVLPEVSEMQVVRHYTQLSQKNFSIDSQFYPLGSCTMKYNPRGAHKAASLEGFLNRHPYLADQDNQGFLSCMHELQEMLAEMTGMSAVALSPMAGAQGEYAGVAMIRAYHLDNGDYERDEILVPDAAHGTNPASAVMCGFKVKEIPTTRDGDVDIDALKAMVGAKTAGIMLTNPSTLGVFERKIKEIAAIVHQAGGLLYYDGANLNAILGQTRPGDMGFDVIHLNLHKTFATPHGGGGPGAGPVAVSERLKPYLPIPYVQKQTKSNRTEYCLVDRKAAPKSIGRMSTFMGNSGVLLRAYVYIRLLGKSGVEEVSRYATLSANYLMARLAQAGFTMAYPGRRATHEFILTLAAEKKSIGVSAMDVAKRLLDYGMHAPTTYFPLLVPECFLIEPTETESKEELDAFVDAMVNIRAEAVKNPEFLHAAPYTLPVRRLDDVKAVKELDIAWQQGVDNK >NZ_CP013944|2360816:2397095|2366439_2367732_-|WP_144420809.1|DBSCAN-SWA 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34 | Acinetobacter_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2442243 : 2507865
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP013944|2442243:2507865|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(18.18%) | plate,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2511866 : 2575639
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP013944|2511866:2575639|DBSCAN-SWA 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53 | Planktothrix_phage(10.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2607430 : 2650789
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP013944|2607430:2650789|DBSCAN-SWA 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43 | Staphylococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2703484 : 2739424
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP013944|2703484:2739424|DBSCAN-SWA 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32 | Staphylococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2762633 : 2802853
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP013944|2762633:2802853|DBSCAN-SWA 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44 | Staphylococcus_phage(42.86%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2868936 : 2923561
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP013944|2868936:2923561|DBSCAN-SWA GATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTACCGTGTCCGTCCACAGCAGCTTTCCCGAGTCTGCCCAACCATATTCAAACTGCAACTGATCAATCCCAACAACAAGCTCATGTCGGCCGCTACCATCACGCACAAACAACGCAGGTTGACCGGTTGCTATTTTAGCAACATAAAATACATGCAGCTCTAATGGCCATATCATGGCTCCTGCCACCACATCATGATCTAAAGTTTGCTCCAAAATGAGGTTACTACGATAGCTATGCCCTGCAAGCAGCAAATTAACTTGGCAGTTTGCCAACAGCCACAAAGCCCCTTGAACACACAGAGTCTCAGCATGATTCAAGCGCAAGCGAGTCTCACCAGCTTTCACAACAAATTCTAGATAATTCATCCTAGCGATAGGGATATAAGCAGCCAAAACCCCCGTGCCAGCCAGCGCATTAATCCCCAGTTGCGCTAACCTATGATCCTCTGCATGATAAATTTTAACTAATTGCACCTGCGAATCAGCTAAACCGAACCATGAAGGGGTCATTACATGAGCAAAATGAAATTGAAGTTCAGGCCTTGGGCAATTTAAAGGAGAAAGATCCTCTAACTTATGTAGTTCATTAATAAATAACTGCACCCCTACGGCGACCTTACGTGCTGCATTAAGTTGCTGATATGCTGACTTTGCAGCATGACTTGCATATGTATAAAGCATCCCTGCGATCCCAATGATAAGACTACCAAGTAACAGCACAATCATCATTTCAATAAGACTTAGACCACGCTGCTTATGTATATGCATATCTTTAGGTATTTTCTCAGGTATTTTCTATCGCCACACCTAAACAAGGACTAAAAGCTTGCTGACAACTTGTGCGCTCTCCAATAATCCGCTGCCCCCAGGTGAGCACCAAATGGTCTTGGCTCTGATGCAATTGCCCCAAAGGCAACCGCGCACTAATCCGCTGTTGCCACAATGCCTGTAAAGTCGTTTGCTTTAATGCATAACGACTAACAGCCCGTTGCTCAGCAATAATCTCTGACAATAAAAAACGTGCGTGTTGGCGTACAAGAGCCTGCCCGGTTTGCAAGCTCAGCTGACTGATGACCTGCACACTCATGAGCATCACACTAACAATAGTTAATGCAATTAAAATTTCAACTAAATTCACTTATTTTCATCATCCATGATTACTCAAAACTACGACCCATAAAATAAAGTCAGCAATCTAACGCTCCAACGCTCCCACACTCTTAATGAGGCAAAAAAACTTTCACATAAAAATGCACTAGAGAATTCCGTCAGTGGCTTATCAATATACACACCCTGTGCTTTAGCCCGTGCCACGGCCAGCATACCACAAAGCAGTCGATCATCCACCAACAATATTTCTTCTGGTTGCACGCCATAATGTGCCGCAATATGCAATAAACCTTGTGGTGATGGCTTTTTCTCTACATCCGCAATAAAGCCAACGCTTGGAAATTTTTTTTGTAAATACAGTTCCCGAACCATTTCTGGCTTATTCGATAAAATACAAACTTCACCTTTAAACTCATTGATTAAGCTTGCCAACCAGTGTTGGTACTCTGCTGTTAATTCAGTGCGGCCATGCGAGACCAAAACACCATCATAATCTAAGGCTAATACTTTGACATTCTTTGCATGTAGCTGACCTGCACTTAATTGAGTCACACGTGATACATGGTGCTGGACTAAGCACTTCTTCAACCAGCGCCGATGTACCCACATTCCAACCACAGCACCTAAATACCTCATAACTTACTCACTTTACTTATAAAAATATCTAAATCTAAAAACAATGACTATACTTCAATTGTGCAACATGTCATTTTATACAGCTTAAACCTCATACCCACAAGGGGAGTATAACGTATGAACATCCTGGGCAAGACTATCGTAATCACAGGAGCAGCTCAAGGCCTGGGCCAGGCAATGGCTATTCAGCTTGCAAAATCAGGTGCCACCCTCGTACTTGTTGACCTAAATAAAAATAAACTCGATAAAACAGCCGCGCTTTGTGAGCAAGCCGGCGGGCAGGCGATTTGCCTAGCTGCAGATGTTTCCTCAGAAAATGACGTTATCACTCTTTTCAAAGAGGCTCAATCCCAATGCGGCCCTTTACATGGTTTGATCAATAATGCAGGTATTACCCGTGATGCATTATTAGTTAAAGCAAAAGGTAATAACATTATCAGCACCATGTCACTTGAAGCTTGGCAAGCGGTGATTGACGTTAACTTAACCGCTGTGTTTTTATGCACACGTGAAGCTGCACGTCAGATGATTGAAAACAGCAGCGCCGGAGTGATTATTAACATCAGTAGCATCTCCAAAGAAGGCAATATTGGTCAGACCAATTATACAGCAGCCAAAGCTGGTGTTGCAGCAATGACGGTAACCTGGGCCAAAGAGCTCGCTCGCTATAATATCCGTGTTGGCGGCATTGCCCCTGGTTTTATCGCGACCGAAATGACCCAAACTATAAAACCAGAAGTGCTCGAACGTATTGAAAAAAGCATTCCATTACAAAAAATGGGGCAGCCTGAAGATATTGCCAAAGCCGCTCAATTTATTTTAGAAAACGACTACTTTACCGGCCGTATTATCGACTGTGATGGTGGTTTGCGCCTATAAAGCCAAATAAGAAAACAACAAACAGCTGAAAGCACTAAACTTTCAGCTTAATCTCAATTATTTTATCTTCAATCTTAAACCTGACCTAATATATTTAAAATTTCAAAATTAAACTTTTAAAGGTCACCCCACTACACCATCTATCTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGATTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTCTTCAAGCGGTTCCTTTTTCAATCAAACTTAGGTAGCATTGGGTCTCTTCAGGTGAGGATTAAAGCATGCTCGGACAAATATTTATTAAAAATCTAGTACAACAAGCCAGCA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57 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2929640 : 2977750
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP013944|2929640:2977750|DBSCAN-SWA 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40 | Erwinia_phage(18.18%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
3072544 : 3106943
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP013944|3072544:3106943|DBSCAN-SWA 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31 | Staphylococcus_phage(50.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
2595 : 16033
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013947|2595:16033|DBSCAN-SWA AATGCTTAAATACAAAGGTTATATTGGAAAAGTTGAAGAGATTCATGAAGGTGATGAATATATTTATGGGATTGTTCCAAATATTAAAGATGTTATTTCTTTTAGAGGTAAAAATATAAAAGAGTTAACGAAAGACTTTAAGCTGGCTATTGATGATTATTTGGCTTTATGTGATGAGCGTGAAGAAGAACCCGATAAACCATTTTCTGGTAGATTTATGACTAGATTAGGTAGTGACTTGCATGAAGAGGTTTTTTTAGCTTCTATGAATGATTCAGGTGCAAAATCAATGAATGATTGGGTTGTATCTGCATGCTTAGAAAAGTTGAAGCATGATCAAACCGTTAAACGGTGAATTATGTTATGTACAGTTATTAAGAAGTTATGTTTTTGCATTTTTCTTATAAATAAGATAAAACCCTTTTGTTTGGAATTACTTCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGCAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAAGACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGTCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATATATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTTATCAATAAATTTTATTTATATTGCCGATCAATATACTTTAAAATTCTATGCAGTCAAAATAGGACTTTCATGGATAAGAAACAAGCTAAGACAATAGCTGACGCTATTGTTAATGAGGACGTTTTGCCTTTTTTAAAATCATTACAGTCCAAAATGGTCAGTGATGAGGTGTTTTTAGCCTTTTGTCAGACGGTTATTTTAACACTGACCAATACCATGTATAAATTTTGTGATGATTTTGAGGAGTTTGAAAATAAACCGTTATGGATAGATAGCGTTAAAAAAAGCCTTCATCGCACAACATAGCTCGTCGGAGATTGAACAAATAGATGAGGATATACCTTTCTAAAAGTTAGATAAGAAAAATATACCATTAACAAAATCAAGTACTTATCAATGCTTTTGAAATTCAAGAATTTTAAGTCTGTGCGAACCGTTATTTTAATTGCAACTAGGAGCCTGAAAAATGCTAAATATCACGCAAGTTAGAAGTATGTTGGCAGATTGGGGCGATTATATACAGCGAGGCGCAGAGCATGGCTCAAGTAACTCTATTTTTGGCATGATACAAAAATACGGCGGTGTCGTCATACAAAACAATAACAGCGGTAATGATCCTTATATCGCGAATAGTGATGCACTGGAAGTGGATCGAATCGTCAACGAGCTTTTACACAGTGATTGCAAGAGTGATCAAACCATGGCGCGTATACTGGTGATTCATTACGGGATAACTGGCTCAGCCGCTAAAAAGCAAGCGATTTATCATATATCATCACCTACTTATGACAGTTATCTAGGTAAAGGAGTGAGCTATGTGCGTGGGTGTTTAAATGCGCTAATGTGTAAGCCTGCTTAAGCAGGCTCGTGCTGTTGCATTTTTTAATAAAATCACATCATAAACCTCAACCTCTTGAGTTTCTAAAATACTTAACTGTAACCCTTGAAATAGTACTAAAATATAGTACTATATAAATATGATACTAAATTTTGGTACTATACTTTGAATAATAAACACAAGAAGACCTTACGAGAGATTTATACTGACCCGATCAAGGTGAATATTGTGTGGTCTGATGTTGAAAAAATGCTGATTGCAGCAGGTGCCACTATCGAAGAGCGTAGCGGTTCAGCAATTGCAATTTTTTTAGGGGATGAGTATTTGGGAATACACCGACCTCACCCAGAAAGAACAGCTCAGCGCTATGTTGTAAAAAAAGTGCGTGAGCTTTTAAAGAGGAATGGCATACATGCTTAGATATAAAGGTTATGCGGCAGTCGTTAATTTTGATGATCACGATAAAATATTACACGGTGAAATTTTAAATATTCGTGACATGGTGACATTTGAATGTGAAGACCTCCAGGGAATAGAGCTAGCCTTTCATAATGCTGTGGATGATTATGTAGCCATGTGTAAAGAGAAAGGCCGTACACCCAATAAGCCCTATTCTGGTACGACTAATTTACGTTTAGGTACAGTGCTACATGAAATGTGTGCCTTAGCGGCAGCTGAGAATGATCAGAGTTTAAATGACTGGATTATTCAACAATTAAACAATAGTCTGCATGAGAATAATAATGCTTCAAAAAATTAAAGAAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGAGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGATGTACTGGGCAAAACTATTCAGTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGAATTAAAGCACGGCGAAAGTACAAAGGCATTAGACGAGGTTTGAGAAAGTTACTCTAAGTTCTCAACGACTGTTCCTTGATGGCAAGCTATTTTCCAGCTACCTGAGTTTACGTGCTTCCATACACCCTCTGTCATCTAATTGGTTAATGATCATTTTTTGAGCAATTTATCAGTATAAATTAACTAACTCTAGTAAATTATAGAAATTTGCTATATTTACTTTTTTACTGTGGAATTGAATGATATTTCCTTTTGCAAGGAAAGGGAGATAATGATATGCCAAAATATGATCAAATGATTCAAAAAGAAATAGAGCAGAGTAGTCGCAGATTATATAAAGACGTAGATGCATTAAGAAGTGGCAATACTCCGGTTGAAATGATTCCAGTAGCTCACCATACTGTAGAGTACAGTAATCATAAAGCAAAATTGAGTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013947|2595:16033|7434_8301_+|WP_027242951.1|DBSCAN-SWA MPKYDQMIQKEIEQSSRRLYKDVDALRSGNTPVEMIPVAHHTVEYSNHKAKLSALSSRMPQSEAERTRDIHDFIAHSSARAALSGLARCEESLTSFMKVHIQSEAAELLPYMTVIFFNVQDPKVPENKNNHCFLMLSANDPSAQLQGFDFKTQVARVNQARQELLSVFERNPGDNYLVDPYLVECVSLKKALKGNNAEFMDAYDERSYLGLASADLGTVDSRDIDIHLITKKERELVTEFKQGNPDFVLNNSIHHTAGPWKDRFQFPFLSAHEEPEPEGEEAALYYCG >NZ_CP013947|2595:16033|15616_16033_+|WP_027242943.1|DBSCAN-SWA MKKTIHGTGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVIHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYANT >NZ_CP013947|2595:16033|2595_2949_+|WP_016211078.1|DBSCAN-SWA MLKYKGYIGKVEEIHEGDEYIYGIVPNIKDVISFRGKNIKELTKDFKLAIDDYLALCDEREEEPDKPFSGRFMTRLGSDLHEEVFLASMNDSGAKSMNDWVVSACLEKLKHDQTVKR >NZ_CP013947|2595:16033|13182_13398_+|WP_144420855.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTEGESHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013947|2595:16033|8513_8897_+|WP_027242950.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLKDDKLIPAIEVDHIKPHDGDYELMWNQHNWQALCKPCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGV >NZ_CP013947|2595:16033|12134_13109_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013947|2595:16033|4632_4998_+|WP_027242954.1|DBSCAN-SWA MLADWGDYIQRGAEHGSSNSIFGMIQKYGGVVIQNNNSGNDPYIANSDALEVDRIVNELLHSDCKSDQTMARILVIHYGITGSAAKKQAIYHISSPTYDSYLGKGVSYVRGCLNALMCKPA >NZ_CP013947|2595:16033|8983_9466_+|WP_027242949.1|terminase|DBSCAN-SWA MSRAKGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDRVAICPDYFDEIAKGAFESAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSTVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKTSLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDKILD >NZ_CP013947|2595:16033|9673_10648_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013947|2595:16033|14201_14717_-|WP_027242945.1|DBSCAN-SWA MFKTLKRSVLVCVIPVLSSSLLITSAYATCYVDYKNSSENTWNITLKNLEGDTAHIYCPNKTLGYKESCTFPVNPGDSVSVGFSHTAGMIKAYISFSSTINGHSESLNDLLVEAIDDHCPEIYYNDSVPYGITLNKPSIGNVIFAPYSENESTLNKFSKINFEADTNKKFS >NZ_CP013947|2595:16033|5142_5397_+|WP_027242953.1|DBSCAN-SWA MNNKHKKTLREIYTDPIKVNIVWSDVEKMLIAAGATIEERSGSAIAIFLGDEYLGIHRPHPERTAQRYVVKKVRELLKRNGIHA >NZ_CP013947|2595:16033|9468_9654_+|WP_027242948.1|DBSCAN-SWA MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKAPSVI >NZ_CP013947|2595:16033|10744_11137_+|WP_075275490.1|capsid|DBSCAN-SWA MLDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAATGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA >NZ_CP013947|2595:16033|3125_4100_+|WP_081323805.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013947|2595:16033|5380_5737_+|WP_080963620.1|DBSCAN-SWA MAYMLRYKGYAAVVNFDDHDKILHGEILNIRDMVTFECEDLQGIELAFHNAVDDYVAMCKEKGRTPNKPYSGTTNLRLGTVLHEMCALAAAENDQSLNDWIIQQLNNSLHENNNASKN >NZ_CP013947|2595:16033|11172_11754_-|WP_027242946.1|DBSCAN-SWA MPTQKHMEKITNLIDDLQKRITKLDGQIEAEAKSSFISSGLLEREKSKGSRPVEYYHNVREFSRKLLPKIASWARKALLLCECKNFLEEMTKDDSKALEHATHLNETYLRHSNLAVFEARFRSMTKSLCSKTYKILKSIAKENQQSAVAATNWGGGAYAVADIVNRHQSSGLTSVEEGLQVVELPQTQPAMQG >NZ_CP013947|2595:16033|15062_15620_+|WP_027242944.1|tail|DBSCAN-SWA MKTKIYLHGRLGRICGPFFELNIHHAREALYALSTQLPEFKKIIQAGEWAIFRKRQSLNLEQLELNCAGGELHIVPKPKGAKNSGFVQVLIGAALITAGYFSVGTALAPIAGGLSAAGTGLVISGALTMLSPQPSYDNDYSTTDPNASTLFSGVDNVAAPGAPVPLIYGEHLVGSSVVSSQYKTL >NZ_CP013947|2595:16033|5834_6809_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA |
18 | unidentified_phage(33.33%) | terminase,transposase,capsid,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1736 : 67874
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013946|1736:67874|DBSCAN-SWA TTCAGCTGCGTCTAAAACTATCCGGCATGCCGAGACTGGTCATCTTATTTAAAATACCCGCGCCAATTAGTCCTTCATTTTTCTGACGCGATATCTCTCTGGACTGCATCGTGTTGCCCAAAATGCGTTTGTAACGCTGAATCGCCAACTCAGAATAATTACGCTTGCCGTATTGTCGTGTCTTTTGCCAGTGCATTCTACCATGATCTTTAATCTCATTAAAATTTATGTTTCTAATCGCGTGGTTATTTTCATCAAATACGGCATTTTTAGGAGGAGGGATAACAACATCAGCATTAGGTGAGTGGTTTAAAACGGAATCGTAAACATCATGGCTATCGTAGGCTCCGTCTGCAGTGAAGCGATCAAACGGCTCATCAATTTGCTCCAGTAGCTCATCCACAACCTCCTCATCTGCTTCATAGCGATCGGTGATGAGTGCGGCTTGAATATAGTGATCATCATCAACGGCCACATGAAGTTTACGCCAGCTGCGCTTTGCTGATATCTTGTATTTTTCTTGGTGCCACTCGTCACGGCCAAAACGCTTAAGGCCTGTAGAATCAATGGCTATTCCCGCAATATCATCATCTGGCTTATCTGTTTTGCGATAGCGTGGGACCTTAATATCGAGCTCCGCTAACCTTTTTGATAACACCGTATAGTCAGGGCATTTGATCGGCAGTCCTTGGGATTCAAAGAAGGAATCAATTAGGCCCTGAGTCTGGCGTAATGGCTGTTTAAACACTTTACGAATTTCATGACAGGTGATGATCGCCAGGTCTGAGTATAGAAACGGCGTGCCTGTACCATCATAAACTCGGTCTTTTTTGTACCAACCTTCAATGGCTTTCTCTGAAATCCAAACATCAATACGGCCACGATTACGCAGGCTATCGGTGTACTTTGCCCAGTTTGTAACGCCATATTTTTGTTTAGGGATATCCCACCCTTTTCCTTTTGGATATTTATATGGCACTGCAACTCATCACAACTATTAGTTTGATGTTAATGTAGCAGCAGGGTAGGCAAACCTCCAGAATTGATCACTTTTTGAGCTATGCAACAAAGCCTATTAGTTTGATGTTAATGTAGCAGCAGGGTAGGCAAACCTCCAGAATTGATCACTTTTTGAGCTATGCAACAAAGCCTTTGTAACGCCATATTTTTGTTTAGGGATATCCCACCCTTTTCCTTTTGGATATTTATATGGCACTGCAACTCATCACAACTATTAGTTTGATGTTAATGTAGCAGCAGGGTAGGCAAACCTCCAGAATTGATCACTTTTTGAGCTATGCAACAAAGCCCCTCAGTGAAATACCGCTCATATAAATTATATTTTTCGATTTCCCACCATGACCGTTGGCGCGGAAAATCAGGCAAAATAATCTCATTTTCAACCGCATAAAAATCACGAATTAACGAATAACAATCAAAAATGCCATGCAAAAACGGCCGCTCGAGTAATTGCTGGGTGAATAACTGTTCACCAAAAACAATAGTATCAGTGATTGCGTGTTGATTGAGTGCAACAATCCCCCACAATAATCCGGTATCACGTTGGCCGACCATATCCGCTAATGAGGGTTCAACGGTGCCATCCGGGTGGGAATGTATCAGTATCGTACCGCTCGGGGTATCAATGAGTTGAGTGGGATCTATGCAAAAACTCTCTTCAGGTGTGGTGGATAAATTAGGGCAAGGCATAAAATGATCTGCCGGTAAAATCAGCCCGACGGCTTCTTTGGGGTATTGCTCGAGTGCATAGGCTTTAAAAAGGTTTAATGCCCTCGAACCCCTCAAAAGGTAAAGCGTGTCCGTTGCCAAAGCGCGCCATGCAATCTGAAAGTTTTTTACCACATTGATCCTTTGCTTTATCAGTGGCTTTGTTGCATAGCTCAAAAAGTGATCAATTCTGGAGGTTTGCCTACCCTGCTGCTACATTAACATCAAACTAATAGTTGTGATGAGTTGCAGTGCCATATAAATATCCAAAAGGAAAAGGGTGGGATATCCCTAAACAAAAATATGGCGTTACAAACTGGGCAAAGTACACCGATAGCCTGCGTAATCGTGGCCGTATTGATGTTTGGATTTCAGAGAAAGCCATTGAAGGTTGGTACAAAAAAGACCGAGTTTATGATGGTACAGGCACGCCGTTTCTATACTCAGACGGCTTTGTTGCATAGCTCAAAAAGTGATCAATTCTGGAGGTTTGCCTACCCTGCTGCTACATTAACATCAAACTAATAGGCTTTGTTGCATAGCTCAAAAAGTGATCAATTCTGGAGGTTTGCCTACCCTGCTGCTACATTAACATCAAACTAATAGTTGTGATGAGTTGCAGTGCCATATAAATATCCAAAAGGAAAAGGGTGGGATATCCCTAAACAAAAATATGGCGTTACAAACTGGGCAAAGTACACCGATAGCCTGCGTAATCGTGGCCGTATTGATGTTTGGATTTCAGAGAAAGCCATTGAAGGTTGGTACAAAAAAGACCGAGTTTATGATGGTACAGGCACGCCGTTTCTATACTCAGACCTGGCGATCATCACCTGTCATGAAATTCGTAAAGTGTTTAAACAGCCATTACGCCAGACTCAGGGCCTAATTGATTCCTTCTTTGAATCCCAAGGACTGCCGATCAAATGCCCTGACTATACGGTGTTATCAAAAAGGTTAGCGGAGCTCGATATTAAGGTCCCACGCTATCGCAAAACAGATAAGCCAGATGATGATATTGCGGGAATAGCCATTGATTCTACAGGCCTTAAGCGTTTTGGCCGTGACGAGTGGCACCAAGAAAAATACAAGATATCAGCAAAGCGCAGCTGGCGTAAACTTCATGTGGCCGTTGATGATGATCACTATATTCAAGCCGCACTCATCACCGATCGCTATGAAGCAGATGAGGAGGTTGTGGATGAGCTACTGGAGCAAATTGATGAGCCGTTTGATCGCTTCACTGCAGACGGAGCCTACGATAGCCATGATGTTTACGATTCCGTTTTAAACCACTCACCTAATGCTGATGTTGTTATCCCTCCTCCTAAAAATGCCGTATTTGATGAAAATAACCACGCGATTAGAAACATAAATTTTAATGAGATTAAAGATCATGGTAGAATGCACTGGCAAAAGACACGACAATACGGCAAGCGTAATTATTCTGAGTTGGCGATTCAGCGTTACAAACGCATTTTGGGCAACACGATGCAGTCCAGAGAGATATCGCGTCAGAAAAATGAAGGACTAATTGGCGCGGGTATTTTAAATAAGATGACCAGTCTCGGCATGCCGGATAGTTTTAGACGCAGCTGAATTGTGCCTGGAATATGGGACCAGAGGTTACGCAACAACGCCCTTCTATGAAAACTTCAAATTGCGACAGGACCCAAAAACCAGCATCATATCATCAGATCAAATTGTGACAGAACCATTATAGCTCATCATCTTCATATCTTGTATGTTTAGGATCATTACAAACATACCATCCACTAAAACTAGAATTTGTACATACCCCATACCTTTTAGATAAATCAAAGTACATAGTTGTGCTAGAAGGAGATTGTGATGATTTAGCATCAAAAAGTGAGCCAAAATGATTGTAAGTCGTGACATATAAATTACTTTTATCTGAATTTTTAATATATATTGCGCTGACAGGATCATTTACTCTACTTTCTAAAAACCATTTTAAATTATTAGGTACGTTATCCATAAATGGATCACACTGTTTGAAATAAACCCAATCCCAATCCGTCGTTTTTCCAGCAATATTAGAAGTTAAACAGCTTAAAAACCAACCATCAGATGAAAATGCACGGCCATATAGTGAAAGCATCAATATTCTAGAATTTTTCATATCATAGTATGTTCTATTCAAATAATTTGAATTATACGAACCTGAATACATAGGATAGTAATTATTATCAGATTTATCATAAAACCTCATACCAATTTCATACCAAAATGTATTTACTTTTGATGGTGTTTTAAAAAAGTATTTAGACATTTTATTTGCATCTAAAACAATATCAGTTCCACTTGATTTTGAAATAATTCCATAGTCGCCATACCATTGGATAGATAGATCTTTATTTAAACGAGGTTTTAATTTTCCATCTCTTACATCCCATTTTTGATAAGTGTTATGAATATCACAAGGCCAAAACTCTACATAATCCCATTTATCATCACCTTTGATGACATTTTCTGGTGCAGTCATACATAGAGGGATTCCAAATTGAGATTTAGAGAAAGCAACTCTGCCAAGAGTATCATAAATAGCTTTTTGACTTTCTACATTAGAACATGTTTGAGCGTATAAATAAGATCGAGACGTTTTCATAGAAGAGTCTCTTGATTGAGTTGGAGCTAAACAGTAACCTCCCTGAGTTGTAATTAACTGGCTTGGTATTGTAGGTAAATCTTTAAATTTTGTTTTTTGTAAAGATTTTTCGCTATAGTCACACCTAGGTGCTGGTCTTGGTGTGTTATTACCTGAGTTTACAGATCTTTTTTGTGTCGATGGTAACGAGGCTCCAGTACCAGCACAACTCATAGCGTAATTGACAGTTGCATGAGAAGTATCTGTATGTTCTTCAAGACTGCTAGAAGTATTATTAATATAAGCAAAAAAATCAACATCCGCATCCTCTGAAGAGGTATCAGCTGGATTTGAAGTTTGTGGAGCAGGCAAAGATGGAGCAACAAAATGAGGGTTGTTAATATATTCTCCGGTCGCTTCGTATTCATTCATAGATTGATTAAATCTATATAATCTAGCTCTATGAATTTCATCTGATCTGATACCATCCCTAACTACCCACTCATCTTCTTCGTAATATCTCGTTAGTAAGTTCCTAGCAATACGTAGATCTGATGCAGAATGATCGGATTCTAAATAGTCTTCTAGCATCCAATTCATATTATAAGCTCTATCAATAGCTGCTGTTTCATAAACCCAGTAGTCAGGTCTTGATTGTCCTCTT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57 | Streptococcus_phage(35.71%) | integrase,transposase,portal | attL 15514:15573|attR 67908:68422 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
72592 : 128586
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013946|72592:128586|DBSCAN-SWA 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57 | Streptococcus_phage(56.52%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
163497 : 168428
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013946|163497:168428|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013946|163497:168428|164452_165784_+|WP_048876205.1|terminase|DBSCAN-SWA MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYAGDPGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKGEWYGKKITLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALASRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDSQTQDGLNVHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIEDDTFFGIIYTLDKEDDWTDERVWIKANPNLGISKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKTCAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWSDEGYLTLTEGNVIDYNRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP013946|163497:168428|165988_166423_+|WP_047927581.1|DBSCAN-SWA MCKIPTEVATLTYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQDFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVAIAMAVGRLIAGEDHNSIYNERELLIL >NZ_CP013946|163497:168428|163967_164450_+|WP_075278733.1|terminase|DBSCAN-SWA MSRMRGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDGVAICPGYFDEIAKGAFDSAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSAVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSSAIESEIDKILD >NZ_CP013946|163497:168428|166933_167668_-|WP_036771649.1|transposase|DBSCAN-SWA MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRHQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRIVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAASF >NZ_CP013946|163497:168428|167714_168428_-|WP_048876202.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTALLQKI >NZ_CP013946|163497:168428|166509_166896_+|WP_087910668.1|portal|DBSCAN-SWA MSASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETDGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTSVRRDEKTKKLIYRHCCEKL >NZ_CP013946|163497:168428|163497_163881_+|WP_027242929.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPVTEVDHIKPHDGDHDLMWNQRNWQALCKPCHSRKTVNDDGGFGRKRSPQGRGI |
7 | Streptococcus_phage(42.86%) | transposase,terminase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
7327 : 21123
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013948|7327:21123|DBSCAN-SWA 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18 | Moraxella_phage(18.18%) | head,transposase,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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