CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP013945	Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPSCRG01-4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP013944	Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01, complete genome	2 crisprs	DEDDh,cas3,DinG,csa3	0	0	33	0
NZ_CP013947	Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP013948	Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP013946	Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPsCRG01-1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	3	0

1. NZ_CP013944

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP013944_1

• CRISPR_ID: NZ_CP013944_1
• CRISPR_location: 1098456-1098551
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013944_1

Consensus_repeat	Method
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013944_1

>1.1|1098480|48|NZ_CP013944|CRISPRCasFinder
ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013944_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013944_1

>merge|NZ_CP013944|1|1098456-1098551|CRISPRCasFinder
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAGATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTCCAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG

>NZ_CP013944|1|1|1098456-1098551|CRISPRCasFinder
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG	ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC
CAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013944.1|WP_036771696.1|1094175_1095636_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_CP013944.1|WP_017378004.1|1104922_1108462_+|chromosome-segregation-protein-SMC	unknown	unknown	gnl|CDD|274008
NZ_CP013944.1|WP_017377998.1|1112466_1112997_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|284031
NZ_CP013944.1|WP_146619530.1|1087609_1087867_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_053093668.1|1093393_1093993_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP013944.1|WP_048875961.1|1101698_1103102_-|IS4-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP013944.1|WP_036773793.1|1090382_1090760_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_155046604.1|1092717_1092858_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_017378005.1|1104089_1104809_-|sulfate-transporter-CysZ	unknown	unknown	gnl|CDD|179898
NZ_CP013944.1|WP_048875964.1|1091870_1092650_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP013944.1|WP_017376708.1|1090904_1091306_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP013944.1|WP_027243145.1|1111400_1112456_+|protease-SohB	unknown	unknown	gnl|CDD|236978
NZ_CP013944.1|WP_048875965.1|1115154_1116075_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_017378009.1|1096050_1097796_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_CP013944.1|WP_144420647.1|1093058_1093256_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_017378007.1|1099609_1101553_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226654
NZ_CP013944.1|WP_036773465.1|1109345_1111385_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA	unknown	unknown	gnl|CDD|236137
NZ_CP013944.1|WP_027242834.1|1088615_1089923_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_017378006.1|1103221_1103851_-|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|381113
NZ_CP013944.1|WP_017378003.1|1108528_1109359_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|367907

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013944.1|WP_036771696.1|1094175_1095636_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	8.47893e-06
NZ_CP013944.1|WP_017378004.1|1104922_1108462_+|chromosome-segregation-protein-SMC	gnl|CDD|274008	TIGR02168, Chromosome_partition_protein_Smc, chromosome segregation protein SMC, common bacterial type. SMC (structural maintenance of chromosomes) proteins bind DNA and act in organizing and segregating chromosomes for partition. SMC proteins are found in bacteria, archaea, and eukaryotes. This family represents the SMC protein of most bacteria. The smc gene is often associated with scpB (TIGR00281) and scpA genes, where scp stands for segregation and condensation protein. SMC was shown (in Caulobacter crescentus) to be induced early in S phase but present and bound to DNA throughout the cell cycle. [Cellular processes, Cell division, DNA metabolism, Chromosome-associated proteins].	0
NZ_CP013944.1|WP_017378003.1|1108528_1109359_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|367907	pfam04354, ZipA_C, ZipA, C-terminal FtsZ-binding domain. This family represents the ZipA C-terminal domain. ZipA is involved in septum formation in bacterial cell division. Its C-terminal domain binds FtsZ, a major component of the bacterial septal ring. The structure of this domain is an alpha-beta fold with three alpha helices and a beta sheet of six antiparallel beta strands. The major loops protruding from the beta sheet surface are thought to form a binding site for FtsZ.	1.17377e-13
NZ_CP013944.1|WP_053093668.1|1093393_1093993_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	0.000376208
NZ_CP013944.1|WP_017378007.1|1099609_1101553_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226654	COG4191, COG4191, Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system [Signal transduction mechanisms].	6.24409e-47
NZ_CP013944.1|WP_017377998.1|1112466_1112997_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|284031	pfam06508, QueC, Queuosine biosynthesis protein QueC. This family of proteins participate in the biosynthesis of 7-carboxy-7-deazaguanine. They catalyze the conversion of 7-deaza-7-carboxyguanine to preQ0.	1.95217e-24
NZ_CP013944.1|WP_017376708.1|1090904_1091306_-|transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	0.00109659
NZ_CP013944.1|WP_027243145.1|1111400_1112456_+|protease-SohB	gnl|CDD|236978	PRK11778, PRK11778, putative inner membrane peptidase; Provisional.	0
NZ_CP013944.1|WP_048875964.1|1091870_1092650_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	0.00345182
NZ_CP013944.1|WP_017378009.1|1096050_1097796_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	0.000214736
NZ_CP013944.1|WP_048875961.1|1101698_1103102_-|IS4-family-transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	1.76184e-13
NZ_CP013944.1|WP_017378005.1|1104089_1104809_-|sulfate-transporter-CysZ	gnl|CDD|179898	PRK04949, PRK04949, putative sulfate transport protein CysZ; Validated.	2.22151e-69
NZ_CP013944.1|WP_036773465.1|1109345_1111385_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA	gnl|CDD|236137	PRK07956, ligA, NAD-dependent DNA ligase LigA; Validated.	0
NZ_CP013944.1|WP_017378006.1|1103221_1103851_-|response-regulator	gnl|CDD|381113	cd17569, REC_HupR-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of hydrogen uptake protein regulator (HupR) and similar domains. This family is composed of mostly uncharacterized response regulators with similarity to the REC domains of response regulator components of two-component systems that regulates hydrogenase activity, including HupR and HoxA. HupR is part of the HupT/HupR system that controls the synthesis of the membrane-bound [NiFe]hydrogenase, HupSL, of the photosynthetic bacterium Rhodobacter capsulatus. It contains an N-terminal REC domain, a central sigma-54 interaction domain that lacks ATPase activity, and a C-terminal DNA-binding domain. Members of this family contain a REC domain and various output domains including the cyclase homology domain (CHD) and the c-di-GMP phosphodiesterase domains, HD-GYP and EAL. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	1.63665e-55

Protein sequences

>NZ_CP013944.1|WP_017378009.1|1096050_1097796_-|hypothetical-protein
MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP
>NZ_CP013944.1|WP_036771696.1|1094175_1095636_-|hypothetical-protein
MIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN
>NZ_CP013944.1|WP_053093668.1|1093393_1093993_-|hypothetical-protein
MRIITKPTTAKCNIQAYIRYLLSEPVRTSCTGLSDVLLNISHDSVNRFLLRENYRPEDLWTEVSEKIDLNNGVLSVDDMVIDKPYSNAEKTDLIGFFYSGKHHCVVKGVNVITLYYTDQHDVSVPINFRIIDPDEGKTKNEHFREMLQQVLSWGLQPSWVTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013944.1|WP_144420647.1|1093058_1093256_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVSEDIIRLFSIANSMPRLYFLINFRFSMLEYQQSPAASHGVLSTG
>NZ_CP013944.1|WP_155046604.1|1092717_1092858_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAGAVAVRFKQSIVGMKVVYKSNGTTLRARSEQKRTLAQ
>NZ_CP013944.1|WP_048875964.1|1091870_1092650_-|hypothetical-protein
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP013944.1|WP_017376708.1|1090904_1091306_-|transposase
MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013944.1|WP_036773793.1|1090382_1090760_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
>NZ_CP013944.1|WP_027242834.1|1088615_1089923_+|hypothetical-protein
MKFIYPGINAPLDTEKSLYAETTQGYFSHKESGKALDFNFIKKQESYFSQWDKRTAFTCEEYKALTHQQRLQLYRLHTTRWNYTLSLLLKDPGAGPDSPLYAEKQFLQNLNENEEMRKLYAGWFIDYVESREGETSKAVEALFKKEMQLKPECDLSKEKQIAVKVRGFRDEITELQAWLMNGSSAERIAIEKYDTKAVNQFIKYQLGQVSKSEFNKTFERAQSKCNKVLKNALHLTTSAASILTEKKIDLNSSVEWERLKNSQHLQKAVLILHKSNINLADSWDTLKDNSHLQKAVLTLHHESSINLTEHWDKVKNNSPLQKALAASYDYLNAERSSWSKMHHNHGIRQTHKFIRHLMASENQTLSGIQAEMQQWLHGYGHFSRASGSASNSRMSFALQSGLCPQADTPPTLLFNTSLQATEVEQEVTNQVTLSS
>NZ_CP013944.1|WP_146619530.1|1087609_1087867_+|hypothetical-protein
MFRQKCSHSYRYYAVAMPKINMLTDFTDGDFERIHKAHWNIERFHRATKQLCSIEKFQVRTTECIKNHIFRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP013944.1|WP_017378007.1|1099609_1101553_-|hypothetical-protein
MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS
>NZ_CP013944.1|WP_048875961.1|1101698_1103102_-|IS4-family-transposase
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
>NZ_CP013944.1|WP_017378006.1|1103221_1103851_-|response-regulator
MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD
>NZ_CP013944.1|WP_017378005.1|1104089_1104809_-|sulfate-transporter-CysZ
MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK
>NZ_CP013944.1|WP_017378004.1|1104922_1108462_+|chromosome-segregation-protein-SMC
MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE
>NZ_CP013944.1|WP_017378003.1|1108528_1109359_+|hypothetical-protein
METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG
>NZ_CP013944.1|WP_036773465.1|1109345_1111385_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA
MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN
>NZ_CP013944.1|WP_027243145.1|1111400_1112456_+|protease-SohB
MITQLLADYGLFLIKTATLVAAILIVFSGLLALAMKNRLAKQKGSLEVEKLNDHYDDLKETIEIEVLDKKELKALEKERRKEEKQERKDKKKNKSKETETDDEDAASAARIFVLDFDGDIEASAVHALREEVDALLTFINEKDEVVVRLESPGGMVSPYGLAASQLARFRSKGVKLTIAVDQVAASGGYLMACVADRVIAAPFAVLGSIGVVFQMPNFHRVLKKHDVEYEQLTAGDYKRTLTMFGKNTKEGREKLQEELEDIHYLFKNFVGEYRPQLDIDKVATGEHWFGQRALELNLVDELITSDDYLLSRADEHDIYSVNYMEKQTLADRLGIMARALLGKLATAGVKR
>NZ_CP013944.1|WP_017377998.1|1112466_1112997_+|hypothetical-protein
MQRKAIVLLSGGGYSSLCLYLARSQGYLPYALSLDIPKRHFQLDSAQQFARDVGVAEHQVIAMNENSLSDSKALTYYSSLLSFAVNWAQELSAQDIFIGLHPSAEHTLEYMVEWLQSYQELINLSSTTAIRIQTPLLFMSDKKREQTAEQFNLKLPEPVSKLKSKKKKFIQRIFSE
>NZ_CP013944.1|WP_048875965.1|1115154_1116075_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDFDGCLYNVNIDNVRRAFHSPGKPKEELTLAHLITINQKLIDHLNNQAEKFSSSTVFLGSDRQDYKKERDNSAGPNREGQYCYPLISDFAKKIGAEFDPLLMADIYNNLPLGESFRQALQDYHTPEKHDQDPHTQPDSSKLTLLYAQMHKAATENPDDIVTYEFYDDRKDILLSLQEIFESDPHMIPKNITLYLNHYDGVNLQNLLIIQGQGNPDSQYQHTLKNPAYRKASANPAEAQTDYSISELIKEKFPKISKSFLEIKQKLQQLNLPKLKKSLIREATSVSVATSVGILHIQ

Crispr_ID: NZ_CP013944_2

• CRISPR_ID: NZ_CP013944_2
• CRISPR_location: 1628544-1628653
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013944_2

Consensus_repeat	Method
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013944_2

>2.1|1628570|58|NZ_CP013944|CRISPRCasFinder
CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013944_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013944_2

>merge|NZ_CP013944|2|1628544-1628653|CRISPRCasFinder
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCTCGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGCTATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC

>NZ_CP013944|2|2|1628544-1628653|CRISPRCasFinder
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCT	CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013944.1|WP_155046590.1|1623176_1623341_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_144420681.1|1623520_1623706_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_144420680.1|1621063_1621984_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2	unknown	unknown	gnl|CDD|225212
NZ_CP013944.1|WP_027243096.1|1634352_1634985_-|MarC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225006
NZ_CP013944.1|WP_017376785.1|1627038_1627944_-|LysR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|182768
NZ_CP013944.1|WP_027243095.1|1635806_1638092_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_027242578.1|1626039_1626576_+|DUF2062-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378263
NZ_CP013944.1|WP_027243098.1|1632920_1634066_+|carboxypeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|349453
NZ_CP013944.1|WP_036774017.1|1622299_1623175_+|IS982-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|372648
NZ_CP013944.1|WP_027242577.1|1624720_1626022_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273036
NZ_CP013944.1|WP_144420682.1|1629350_1629512_+|phosphatase	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_017375696.1|1620664_1621048_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_017376798.1|1639006_1639642_+|LysE-family-translocator	unknown	unknown	gnl|CDD|224199
NZ_CP013944.1|WP_155049745.1|1634140_1634317_+|DUF1508-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_048876008.1|1623749_1624724_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP013944.1|WP_017376797.1|1638365_1638725_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_144420683.1|1635161_1635818_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_027243099.1|1631371_1632685_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236722
NZ_CP013944.1|WP_017376784.1|1626612_1626798_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013944.1|WP_155046588.1|1630046_1630256_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013944.1|WP_036774017.1|1622299_1623175_+|IS982-family-transposase	gnl|CDD|372648	pfam13612, DDE_Tnp_1_3, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contains three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.54754e-84
NZ_CP013944.1|WP_027242577.1|1624720_1626022_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein	gnl|CDD|273036	TIGR00361, Recombination_protein_2, DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2. Apparant orthologs are found in 5 species so far (Haemophilus influenzae, Escherichia coli, Bacillus subtilis, Neisseria gonorrhoeae, Streptococcus pneumoniae), of which all but E. coli are model systems for the study of competence for natural transformation. This protein is a predicted multiple membrane-spanning protein likely to be involved in DNA internalization. In a large number of bacterial species not known to exhibit competence, this protein is replaced by a half-length N-terminal homolog of unknown function, modelled by the related model ComEC_N-term. The role for this protein in species that are not naturally transformable is unknown. [Cellular processes, DNA transformation].	2.99327e-41
NZ_CP013944.1|WP_017376798.1|1639006_1639642_+|LysE-family-translocator	gnl|CDD|224199	COG1280, RhtB, Putative threonine efflux protein [Amino acid transport and metabolism].	2.53606e-35
NZ_CP013944.1|WP_144420680.1|1621063_1621984_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2	gnl|CDD|225212	COG2333, ComEC, Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) [General function prediction only].	1.00534e-72
NZ_CP013944.1|WP_017376785.1|1627038_1627944_-|LysR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|182768	PRK10837, PRK10837, putative DNA-binding transcriptional regulator; Provisional.	3.43302e-86
NZ_CP013944.1|WP_027243096.1|1634352_1634985_-|MarC-family-protein	gnl|CDD|225006	COG2095, MarC, Multiple antibiotic transporter [Intracellular trafficking and secretion].	1.76545e-45
NZ_CP013944.1|WP_048876008.1|1623749_1624724_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	1.65717e-79
NZ_CP013944.1|WP_027242578.1|1626039_1626576_+|DUF2062-domain-containing-protein	gnl|CDD|378263	pfam09835, DUF2062, Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2062). This domain, found in various prokaryotic proteins, has no known function.	2.12897e-42
NZ_CP013944.1|WP_027243099.1|1631371_1632685_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236722	PRK10590, PRK10590, ATP-dependent RNA helicase RhlE; Provisional.	0
NZ_CP013944.1|WP_027243098.1|1632920_1634066_+|carboxypeptidase-family-protein	gnl|CDD|349453	cd06234, M14_PaCCP-like, Peptidase M14-like domain of ATP/GTP binding proteins and cytosolic carboxypeptidases similar to Pseudomonas aerugnosa CCP (PaCCP). A bacterial subgroup of the Peptidase M14-like domain of Nna-1 (Nervous system Nuclear protein induced by Axotomy), also known as ATP/GTP binding protein (AGTPBP-1) and cytosolic carboxypeptidase (CCP)-like proteins. This subgroup includes PaCCP from Pseudomonas aeruginosa, a carboxypeptidase homologous to M14D subfamily of human CCPs. Structural complexes with well-known inhibitors of metallocarboxypeptidases indicate that PaCCP might only possess C-terminal hydrolase activity against cellular substrates of particular specificity. The Peptidase M14 family of metallocarboxypeptidases are zinc-binding carboxypeptidases (CPs) which hydrolyze single, C-terminal amino acids from polypeptide chains, and have a recognition site for the free C-terminal carboxyl group, which is a key determinant of specificity. Nna1-like proteins are active metallopeptidases that are thought to act on cytosolic proteins (such as alpha-tubulin in eukaryotes) to remove a C-terminal tyrosine. Nna1-like proteins from the different phyla are highly diverse, but they all contain a unique N-terminal conserved domain right before the CP domain. It has been suggested that this N-terminal domain might act as a folding domain.	9.10914e-164

Protein sequences

>NZ_CP013944.1|WP_017376785.1|1627038_1627944_-|LysR-family-transcriptional-regulator
MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL
>NZ_CP013944.1|WP_017376784.1|1626612_1626798_-|hypothetical-protein
MEKIERVYARDHGISGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLGGYLG
>NZ_CP013944.1|WP_027242578.1|1626039_1626576_+|DUF2062-domain-containing-protein
MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER
>NZ_CP013944.1|WP_027242577.1|1624720_1626022_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein
MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY
>NZ_CP013944.1|WP_048876008.1|1623749_1624724_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP013944.1|WP_144420681.1|1623520_1623706_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP013944.1|WP_155046590.1|1623176_1623341_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI
>NZ_CP013944.1|WP_036774017.1|1622299_1623175_+|IS982-family-transposase
MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG
>NZ_CP013944.1|WP_144420680.1|1621063_1621984_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2
MCKIPTEVATLTYFLCRTHVFLGTLILLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV
>NZ_CP013944.1|WP_017375696.1|1620664_1621048_+|hypothetical-protein
MTINKRDFFDAINYADTAVKIHEYLLNTLEKQQKDFAESCNNDNSSEKSKALASISDVELRFAQLDMLSAIYRKVLLNTLNEIEGCNDQELKTIKNGLLHMVATTLEACVNDFTIEAKITIDIKEEQ
>NZ_CP013944.1|WP_144420682.1|1629350_1629512_+|phosphatase
MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013944.1|WP_155046588.1|1630046_1630256_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP
>NZ_CP013944.1|WP_027243099.1|1631371_1632685_-|DEAD/DEAH-box-helicase
MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK
>NZ_CP013944.1|WP_027243098.1|1632920_1634066_+|carboxypeptidase-family-protein
MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR
>NZ_CP013944.1|WP_155049745.1|1634140_1634317_+|DUF1508-domain-containing-protein
MSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE
>NZ_CP013944.1|WP_027243096.1|1634352_1634985_-|MarC-family-protein
MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA
>NZ_CP013944.1|WP_144420683.1|1635161_1635818_+|hypothetical-protein
MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP
>NZ_CP013944.1|WP_027243095.1|1635806_1638092_-|hypothetical-protein
MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV
>NZ_CP013944.1|WP_017376797.1|1638365_1638725_-|hypothetical-protein
MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG
>NZ_CP013944.1|WP_017376798.1|1639006_1639642_+|LysE-family-translocator
MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3091 : 61661	56	Escherichia_phage(28.57%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	185879 : 322840	120	Acinetobacter_phage(11.11%)	tail,protease,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	330806 : 384244	48	Staphylococcus_phage(57.14%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	441241 : 563627	106	Staphylococcus_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	573742 : 679240	108	Bacillus_phage(16.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	686597 : 758839	48	Staphylococcus_phage(66.67%)	tRNA,transposase	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

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MTKVHTSYEKNVLKIPIFCGRITRFCCQCVSPDSLEKDEEKFINFKKLILKDDKFLNQYSNDKDDDDLLIRKQTIDKVKASRRLFIAVARKISLTKKINEPPFVI
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MSGHYEVATNEKKNLGKSLRNYALGFILSAVLFAVATLLVSKQALSSTGVTLVLLIILAVLLLVQLVCFFGLNTRTENARWDMLTFAFTILVTVVVIGGSLWIMYNLNYYMVH
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MYIPYMKERFNTFEPGSFTEIMAKVRSNSLTEVELFIKAIATKHNVYSDKDEVDEIRFDAACLAFQLGNLGLAQDLLKMIDPDCMQELAMSSVRHQDNQDHSSKSVTDTLRMLKLLPANKSNSSLPFFREQQPAEQQKSADSEFSPAS
>NZ_CP013944|3091:61661|24031_24691_-|WP_048876081.1|transposase|DBSCAN-SWA
MLSTPWLAAIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLIDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_017378478.1|3091_4471_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis GTPase MnmE	NA	NA	NA	NA
WP_017378479.1|4585_6478_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
WP_017378480.1|6525_7152_+	16S rRNA (guanine(527)-N(7))-methyltransferase RsmG	NA	NA	NA	NA
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WP_027242747.1|8088_8979_+	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	I3NLC2	Bifidobacterium_phage	6.7e-14	31.8
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WP_016209328.1|10363_10768_+	F0F1 ATP synthase subunit C	NA	NA	NA	NA
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WP_016209339.1|14306_15698_+	F0F1 ATP synthase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_017378489.1|15722_16151_+	F0F1 ATP synthase subunit epsilon	NA	NA	NA	NA
WP_027242749.1|16244_17609_+	UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase	A0A0N7G7I9	Chrysochromulina_ericina_virus	3.9e-37	40.9
WP_027242750.1|17665_19501_+	glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)	A7IW18	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	5.8e-121	43.7
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WP_027242751.1|20869_22411_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378498.1|22677_23334_-	2OG-Fe dioxygenase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876081.1|24031_24691_-|transposase	IS30 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376300.1|24835_25093_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275376.1|25205_25958_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376303.1|26016_26730_-	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	2.2e-28	36.0
WP_027242752.1|26921_27554_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|29288_30692_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376720.1|30688_30949_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081323800.1|30992_31967_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.3e-30	33.2
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WP_026063559.1|32840_33260_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036816796.1|33357_33804_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242563.1|34148_35147_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_051929591.1|35577_35850_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376728.1|36246_37665_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017376729.1|37891_38833_+	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
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WP_027242562.1|40843_41449_+	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III	NA	NA	NA	NA
WP_016211294.1|41450_41792_+	prokaryotic cytochrome C oxidase subunit IV family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242561.1|41792_42629_+	protoheme IX farnesyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_080963573.1|42794_43112_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_027242560.1|43189_44611_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376735.1|44607_45303_-	TVP38/TMEM64 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376738.1|47632_47971_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420590.1|49974_50919_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046627.1|51123_51297_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075275379.1|53108_53327_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376269.1|56714_57005_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772645.1|59628_60402_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_027243066.1|60820_61177_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013944|185879:322840|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MKKNTITTMLASAIFASATFIAYAENPPTAHTTHNITVNNSSKWYVKIVGISPFQPAYFIDQTNNVYSSELNYTLSKGNSAQYAFAFSFNGSTDFNVAYTITAIDTSQSADADQKKTKSCTFIVGANGPADPNIHVENYQGAQCSYQVIAGKGENFTLN

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017376536.1|300698_301058_+	iron-sulfur cluster insertion protein ErpA	A0A2H4N7M3	Lake_Baikal_phage	4.4e-25	50.5
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WP_016210862.1|313147_313393_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376547.1|313579_314371_+	3-hydroxybutyrate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_017376548.1|315070_315793_+	putative N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_017376549.1|315789_316671_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243038.1|316694_318185_+	sodium:solute symporter	A0A219Y9P9	Aeromonas_phage	8.0e-20	23.8
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WP_036773116.1|320650_321625_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
WP_069971669.1|321601_322840_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP013944|330806:384244|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP013944|441241:563627|DBSCAN-SWA
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MNILEMEQLNLDGKRVLIREDLNVPLKNGQVTSDARLLAALPTIQQALAKGAAVIVMSHLGRPTEGEYDTAFSLAPVAERLAELLGQTVRFEKEWLDGITIESGEIVLCENVRFNLGEKKNDPQLAKKMADLCDVFVMDAFATSHRAQASTVGVGVYAKEACAGRLLMRELNSLGKALMAPERPLLAVVGGSKVSTKLTVLKSLAEKVDQLIVGGGIANTFLAAQGINVGSSLYEAELLDEAQAIMSMMTAKGGIVALPEDVRVATEFSEQAHAQVKNVADVADDEMILDIGPKAQEQLAVLLTHAKTIVWNGPLGVFEFDAFGEGTKALSAAIAESSAFSLAGGGDTIAAIEKYQIEEKISYISTAGGAFLEFLEGKTLPAVDMLSTRARSGV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_048875895.1|441241_442405_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.8e-25	32.0
WP_144420756.1|442458_443460_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_017378362.1|443541_444111_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_144420608.1|444324_445296_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	7.3e-22	25.9
WP_017378364.1|445307_446903_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772406.1|446923_447955_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378367.1|448286_449390_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378368.1|449501_450686_-	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378369.1|450763_452752_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_155046621.1|453202_453424_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420609.1|453911_455285_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378374.1|455302_456289_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	2.2e-42	34.2
WP_080963622.1|456291_457446_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	2.3e-14	28.2
WP_017378376.1|457442_458138_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	8.6e-09	32.3
WP_017378377.1|458280_459771_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017378378.1|459791_460841_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_027242727.1|460907_462302_-	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378381.1|463234_465166_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	3.1e-117	36.0
WP_075273353.1|465170_465701_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_017378382.1|465735_465930_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|465972_466332_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_017378383.1|466463_467459_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2I2L4E3	Orpheovirus	3.2e-33	36.5
WP_016211707.1|469860_470148_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_080963621.1|470414_470621_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378388.1|472229_473003_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378389.1|473004_473946_-	hypothetical protein	A0A068C8G6	Acinetobacter_phage	1.7e-20	26.5
WP_017378390.1|474079_475657_-	FMN-binding glutamate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036816949.1|475850_476249_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378392.1|476826_476979_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378393.1|477249_477456_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875897.1|478260_478905_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.7e-09	35.2
WP_069971672.1|478972_480229_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376600.1|480484_480664_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927402.1|480886_481114_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377704.1|482389_483148_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420757.1|483365_483929_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_017377702.1|484032_484581_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910634.1|485177_486330_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.3e-59	44.5
WP_017377698.1|486675_486972_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420758.1|487231_488143_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_146619438.1|488377_488929_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046620.1|490079_490217_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|490463_491192_-|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_017377686.1|491238_491847_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210764.1|493121_493382_-	30S ribosomal protein S20	NA	NA	NA	NA
WP_017377283.1|493555_495094_+	murein biosynthesis integral membrane protein MurJ	NA	NA	NA	NA
WP_017377282.1|495272_496199_+	bifunctional riboflavin kinase/FAD synthetase	A0A1V0SJE1	Klosneuvirus	1.6e-10	34.5
WP_048875900.1|496303_497236_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	9.4e-27	33.8
WP_017377279.1|497732_500546_+|tRNA	isoleucine--tRNA ligase	K7YVP8	Megavirus	1.0e-76	26.8
WP_017377278.1|500538_501048_+	lipoprotein signal peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_017377277.1|501051_501495_+	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_027243089.1|501590_502892_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377276.1|503154_503523_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377275.1|503514_504237_-	aquaporin family protein	M1H9L8	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.6e-26	37.6
WP_017377274.1|505298_506651_+	PAS domain-containing protein	A0A1B0V854	Salmonella_phage	3.2e-36	45.7
WP_017377273.1|506644_506884_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875901.1|507418_508393_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	6.2e-29	32.6
WP_017377271.1|508803_509133_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377270.1|509518_509884_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377269.1|510007_510868_+	DUF692 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP013944|573742:679240|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017376593.1|613535_613940_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP013944|686597:758839|DBSCAN-SWA
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MAKKGQQGAQFMPKMNITAEIRKGKTDKDRQMQLHFDSQELAEAFLDHLLGNFEVGQVPQAYIDPTLMQFRNNPFGFVPGQSHDRPQTLNFPCYEVKHPYSTVKPEDQEYGINFGSAKARDGLIKTLVWATEQQGFDWFKTYEDRATTLYIKQIAFEHGNFLISDPDRRPAHALKGKLGKIKYDHLLEKLFDPEYAKQVIAKHSHLEEFIQLALRHTHGLFRDTALKYCLAQLGDSRPEKREPMVAKMATATQGGRASVCHFLLETYVKVMLEENAPVIPGLLERVLLARYLQKHAEKFGIEGNPELLEGLLNAVFLPNSQIPECMPIKFQTPYQTPPAVIDTRTSFGQLQVRHDSIHALRNLLWQDECFNPAKLDRIIEAERGELFREIPFAKAALIAITICGRNKNFSDFSQLGLFGNGSQRQQCIYALAGVNTQTDNADVIHAKVARFTQQAIQAIHDRSQQKSADSYQEHPQEQPRVRKRKYQSLFHDQAAAEAQAPARQAQIGEPDGEPEPGAPEPGALR
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MQQYRNGRKRLALHFLFWFGCAWAIFFIDRYTEQTKMIRITLSSVLYPFEYAAAAPYQLSQWLKHSVSERYQLFIENKKLNEEVVRLQVMLQQLLVLKTENQQLQALLNASHKLSPQRYRLAKVLQVKTSAYKQMIVVDQGISSGVYVGQPVVDAYGVLGQVVDVGLWSAKVLLLSDSDSALPVFDQRSGVRAILSGQGKGGELELKHVPDTANIQMGDVLLTSGMGGRFPVGYPVGVVRKVVRHPGSAFAQVAVDPAAHMDRGRLVMLVWQDKDNDSNTATHMQVQDKTKDKTQKGRL
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MRWRLLAWICIDLILVFALLLGAGAFYIYVEFAHPKVWLERLAKRQGVALSEVNVRTVENNIFSPAFEIKNLVMSNKSQGWSAEVKYYYVHFNLLKSIWHWRLSTDDIAMRGATIDFDIEQAHFNQQNKHSLLTVFPWLNAQEKVQLSDIRLNLQQGKIKDHLFLNALWQSSAESMSTLTLRARGERDEKLTVNAEVKKTKLGGFQSAHIDLRTQKLLLSWLNLAKVKVAKQDYRLDMNAKFSGSLDKSQFFSRFSLQGARVNVLQSLDGEFSAKVHDGKAQFFLPKLNINGQAYPQPIELNLNYNRLNRQLHASGLVLKPLVPLVYLLDTTSFGYPRELDRLSSLQGHLTEIHGDWQSAERWQLAVRLVDLGVKPTITEPGITGVSGELVIAPDHMRFDLDSPNLHWLWPDTDKRQTPLLNTQAKIQVKQLKPGIKLSVSHIKVNHPQAHLAGKVSMIFRQQAAPVVTSRLDYTLATPEFVKKFLPHQGVNPELFTWLQKALLAGKTQGIAILNGALSDFPFTDGQGQFFVQFDVRDGQLDTDRGWPIIRQGDARVTFAGPQLTITANKALMAGLWLHDIRLKMADIMPGVPTELNIQGQSEFNLKKGMALIAKSPLKALVEKIKVSSGQGKINLNLQIPFGYVDKNKLTTVNGMLNVKNTSVDFTGKKVALTKLAGTFNFDEQGLVFAKDAKALIYGEPVNFSVNSQLQKQGLITTINFNSWLSAAVIKGLANIDLGSFIKGRTPIIGTYRFGEHSGNLSVNSKLQGLSSSLPAPFNKAINSQALLSLQEKKGNNEQAIALTYGDQVKLEGHLNQEKKSTPALFLQANLKTLNLNEWGKTIQRLFSRELKSSNKDIIGSLNLTLDKLIIDEKSLSDVSLKVDRQTSGVSIDVTSSALSGVVHYQQGVNIPELSLDFSKADLNIAQSIYHWYQTDFSGGNQSAGVLKRTKHLPKVAATLNNVNYKNYQFKSVGLILMPVNYGYQLDSLQLTGPNYTVHATGELNLIQRQNPSFIKGNVHFSNVGKGLDALGINNLIGGGRGSLFFDLEWLGLLTDVKPETLLGRIKVNLVNGHITKVNPGLISLINVFNVDSFWQRIKFDSSGVLQKGLAFSELTGLLSIFHGNLFTNDMVVKGPDLQLSIGGRVGFANKDVDLLVGAVPQVSGSIPVIALAAGGLSFAPIAGALWLFEKALSSEVSNPFVFQYHVYGPWGDVQTKAVNSNNNKK
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036773116.1|709723_710698_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
WP_017376224.1|711010_711895_-	DUF2608 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376223.1|712025_712847_-	2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376221.1|713889_716547_-	[protein-PII] uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376220.1|716624_717434_-	type I methionyl aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376218.1|718772_719651_+	elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
WP_017376217.1|719654_720392_+	UMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017376216.1|720395_720953_+	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
WP_026063514.1|720960_721707_+	isoprenyl transferase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	6.6e-23	44.0
WP_080963646.1|721621_722521_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771906.1|722609_723485_+	lipid A biosynthesis acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_144420622.1|723581_725159_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376211.1|728050_728590_-	isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_017376210.1|728586_729615_-	diphosphomevalonate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376209.1|729604_730669_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155069468.1|730656_732870_-	hydroxymethylglutaryl-CoA synthase	NA	NA	NA	NA
WP_027242906.1|732871_733939_-	hydroxymethylglutaryl-CoA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_036771893.1|734223_736641_+	outer membrane protein assembly factor BamA	NA	NA	NA	NA
WP_017376207.1|736721_737255_+	OmpH family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376206.1|737365_738415_+	UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_075275393.1|738432_738879_+	3-hydroxyacyl-ACP dehydratase FabZ	NA	NA	NA	NA
WP_017376204.1|738878_739652_+	acyl-ACP--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_027242907.1|739670_740825_+	lipid-A-disaccharide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017376201.1|741038_741608_+	ribonuclease HII	V5LS49	Emiliania_huxleyi_virus	3.4e-27	43.4
WP_027242908.1|745218_746178_+	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_017376198.1|746152_747613_+|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	NA	NA	NA	NA
WP_080999970.1|749213_750617_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155049759.1|752522_754343_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036771330.1|757864_758839_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP013944|771312:831536|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP013944|845199:989406|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036771639.1|988431_989406_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP013944|1008468:1051661|DBSCAN-SWA
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MVKGIQAIRGMNDILPTESAYWQWLEVAVRDTVNAYGYQEIRFPIVEKTELFVRGIGEATDVVEKEMYTFEDKGGESITLRPEGTASCVRAALQHGLLYNQQQKLWYLGPMFRYERPQKGRYRQFHQFGVEVFGYCQAELDAEVILLSANLFKRVGVFDQLTLHINSLGTSAERLAHRVALVNYLKENQAVLDEDSQHRLAKNPLRILDSKNPLMQEMIAAAPRLLNYLGEESLAHFERLKELLAVAGLSYQVNPCLVRGLDYYSRTVFEWMTDRLGAQATVCAGGRYDGLVEQFGGKPTPAVGFGLGIERLLLLIETLGKRPEVLASPHIYCIATGKREMAQVVILAERLRSQLPDLRILSHGDQGSLKSQFKKADKSMAQLALIIGEDELAKECVTIKFLRELREQVSCAQGELMTTIETLLK
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MEGDIATEVARPKLQVPPMYKVVLLNDDYTPMDFVVDVLKRYFTMDEDRATVIMLEIHTKGRATCGLYSRDVAETKVAQINDYSKESGYPLLCIMEVDRQ
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MSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMGWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSQHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_155046586.1|1010690_1010864_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420643.1|1011068_1012382_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_036772015.1|1013541_1014729_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_027242844.1|1014909_1015551_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376060.1|1015624_1016974_+	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	7.5e-33	27.6
WP_048876123.1|1017077_1019258_+	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_036772169.1|1019327_1020203_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080999977.1|1020249_1020546_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376065.1|1020669_1021077_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420776.1|1021056_1021635_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	6.9e-20	34.3
WP_017376067.1|1022057_1022720_+	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|1022750_1023119_+	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376068.1|1023129_1024446_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_144420644.1|1024692_1025304_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_065653731.1|1025379_1025559_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211261.1|1025729_1026023_-	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_036772670.1|1026263_1026566_+|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	7.5e-10	40.0
WP_017376072.1|1026620_1028894_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.3e-167	42.0
WP_016211259.1|1028953_1029199_-	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_048875954.1|1029323_1030079_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875955.1|1030187_1031162_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.3e-30	33.2
WP_036771709.1|1031369_1032131_-|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376076.1|1032114_1033071_-	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_017376077.1|1033333_1035832_+	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	2.4e-85	42.9
WP_017376078.1|1035835_1036576_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376079.1|1037025_1037820_-	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017376080.1|1037982_1038771_+|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA
WP_017376081.1|1038767_1039979_+	aminotransferase class V-fold PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_144420777.1|1039971_1040328_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376083.1|1040422_1040851_+	nucleoside-diphosphate kinase	A0A167REB2	Powai_lake_megavirus	1.8e-17	39.4
WP_036771725.1|1041002_1042112_+	23S rRNA (adenine(2503)-C(2))-methyltransferase RlmN	NA	NA	NA	NA
WP_017376085.1|1042108_1042837_+	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
WP_017376086.1|1042894_1043782_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376087.1|1043866_1044241_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376088.1|1044340_1045618_+|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A2I2L577	Orpheovirus	3.6e-21	24.8
WP_080963644.1|1045629_1046361_+	tetratricopeptide repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875956.1|1046347_1047589_+	outer membrane protein assembly factor BamB	NA	NA	NA	NA
WP_027242841.1|1047698_1049102_+	ribosome biogenesis GTPase Der	NA	NA	NA	NA
WP_155046606.1|1049254_1049425_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275292.1|1050830_1051661_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP013944|1055207:1112456|DBSCAN-SWA
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
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MSLDERLIELETKFVFQEDMINQLNQVIIQQQAQLEQLTQALIQLKTKLAAQDVDQPASMIDPAYERPPHY
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MPTLTLTQINQANLLKNDLQQIVQETIDELKAKIGKNLFYEKNRNVRREERITELTALQASLNNAVSDFTQSSTLSGSFFSYLKSKFDNFVQKYLHHKDSESISTFLKKAEQCFSKHNLTEDNDWVFVKDTLYSEVKVQGATSISTPQQHSDDSSLHYSDIDHSGNTQQQKEGDYANLPAPQGASGHSGQEEEIFGTVGGFQSQSQGASGHSDQAGSYETSSQQQSSTPKALPKGHVDPNATYATVDLTKKHTDRAQDLQSSTLFMRQQAQNQQSADQSSNYEFKK
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MLSTPWLAAIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
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MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_048875958.1|1058574_1059438_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377897.1|1059464_1059884_-	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	1.2e-05	29.4
WP_017377896.1|1059936_1060893_-	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
WP_027242839.1|1061375_1064048_+	Rne/Rng family ribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_017377894.1|1064128_1064755_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063687.1|1064911_1066510_+	glutamate--cysteine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_017377892.1|1066599_1068021_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_017377891.1|1068051_1068573_+	crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC	G3MA90	Bacillus_virus	2.0e-10	34.2
WP_017377890.1|1068569_1069175_+	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_017377889.1|1069251_1070262_+	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	6.9e-07	30.8
WP_017377888.1|1070374_1071079_+	protein TolQ	NA	NA	NA	NA
WP_017377887.1|1071113_1071545_+	protein TolR	NA	NA	NA	NA
WP_036771700.1|1071547_1072642_+	cell envelope integrity protein TolA	NA	NA	NA	NA
WP_048875959.1|1072701_1074054_+	Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB	NA	NA	NA	NA
WP_017377882.1|1074089_1074731_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420778.1|1074803_1075703_+	tol-pal system protein YbgF	NA	NA	NA	NA
WP_027242836.1|1075705_1076353_+	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	J9PV61	Bacillus_phage	1.6e-36	38.6
WP_027242835.1|1076403_1077207_-	AAA family ATPase	A0A0E3G5H5	Synechococcus_phage	6.8e-42	43.1
WP_017377879.1|1077388_1077604_+	SlyX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377878.1|1077607_1077841_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377877.1|1077902_1079495_-	exodeoxyribonuclease VII large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017377875.1|1079697_1080627_+	ABC transporter ATP-binding protein	W5SAS9	Pithovirus	7.0e-14	31.9
WP_017377874.1|1080628_1081396_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_047927659.1|1081761_1082532_+	gamma-glutamylcyclotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_048875960.1|1082590_1083565_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
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WP_017377869.1|1084204_1085914_-|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_048875961.1|1086154_1087558_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_146619530.1|1087609_1087867_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242834.1|1088615_1089923_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773793.1|1090382_1090760_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376708.1|1090904_1091306_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875964.1|1091870_1092650_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046604.1|1092717_1092858_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420647.1|1093058_1093256_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053093668.1|1093393_1093993_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771696.1|1094175_1095636_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378009.1|1096050_1097796_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243143.1|1098231_1099092_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378007.1|1099609_1101553_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875961.1|1101698_1103102_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017378006.1|1103221_1103851_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017378005.1|1104089_1104809_-	sulfate transporter CysZ	NA	NA	NA	NA
WP_017378004.1|1104922_1108462_+	chromosome segregation protein SMC	NA	NA	NA	NA
WP_017378003.1|1108528_1109359_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773465.1|1109345_1111385_+	NAD-dependent DNA ligase LigA	A0A0K2QQN8	Ralstonia_phage	7.1e-128	40.9
WP_027243145.1|1111400_1112456_+|protease	protease SohB	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP013944|1119320:1153462|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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>NZ_CP013944|1119320:1153462|1149897_1151646_-|WP_027242894.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP013944|1119320:1153462|1138561_1139596_+|WP_017377773.1|DBSCAN-SWA
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MNLIRKNDKRLRLLESARELIHTQGFSKTTLADIAQHADVPLGNVYYYYKTKEMLALAVIERFSKNLKYHLQGLNDLDGPVLRLNALLLEVEEEVTVIAESGYFLNSLSLEFSREQGVLGQATRALFCQLLSWIEQQFVQLVSSEHAAECAQKYMSQLQGAALLTQALADTYVLEKQLCDLKRWIEGLTQ
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>NZ_CP013944|1119320:1153462|1131897_1132125_-|WP_017377787.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017376600.1|1120832_1121012_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420651.1|1121331_1121985_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0N7C035	Escherichia_phage	5.8e-15	33.1
WP_075275295.1|1122189_1122516_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048876012.1|1123287_1124691_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377761.1|1124861_1126232_+	NAD-dependent succinate-semialdehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_144420780.1|1126278_1127178_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_017377763.1|1127158_1129963_-	response regulator	A0A1V0SGX0	Hokovirus	6.9e-57	31.8
WP_017377764.1|1130042_1130639_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377765.1|1131052_1131808_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|1131897_1132125_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
WP_027242898.1|1133241_1133883_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377768.1|1134152_1135478_+	acetyl-CoA C-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_047927230.1|1135474_1137532_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377771.1|1137509_1138082_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_144420781.1|1138164_1138497_+	DUF1820 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377773.1|1138561_1139596_+	beta-N-acetylhexosaminidase	NA	NA	NA	NA
WP_027242897.1|1139583_1140705_+	mechanosensitive ion channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_122941582.1|1140798_1141782_-	magnesium transporter CorA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242896.1|1141938_1143606_+	AMP-binding protein	A0A1V0SBX8	Catovirus	1.2e-19	25.3
WP_027242895.1|1143892_1144744_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377782.1|1145152_1147621_+	bifunctional aspartate kinase/homoserine dehydrogenase I	NA	NA	NA	NA
WP_017377783.1|1147634_1148609_+	homoserine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017377784.1|1148595_1149864_+	threonine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_027242894.1|1149897_1151646_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375591.1|1151825_1152029_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420652.1|1152247_1152925_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.6e-34	38.8
WP_047927086.1|1153204_1153462_+|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	4.1e-09	47.8

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP013944|1193938:1254286|DBSCAN-SWA
ATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTTTCATGTTTTTACGAATCTTTGTGATAAGTTGAAGTCCTTTTTCATACAATTGATCAAATAATTTTTGTGAAATATAGCCTTTATCACCAATAATTTTACCTGTTAAGTTCTCGGCCATTTTAGGTAATACGACACGGTCATCTGTAGTAGCTTTACTCATTTTAAAGGCCATTAACTCTCCCATATCATTCACAATAATGTGGAGCTTAAAGCCGTAGTACCACCCCATCGTTGACTTAGATTTTTTAGCTAATCCCTTGAAAGCTCTATTTTGAGACGCACGTTTTTCATGACAAACACGGAGTATTGTCGAATCAACAAAATAAATCCCTGTTGCTGTTTTACCTTGGGCCGCAATGAAAAAACACAGAGGCAATAAGATGCTCGGCATGAGTTCAACGAATCTGTTGTAGCTAACGCTGTTTGGAAAGTATTTTACCATGCTACCTTTTATTACATGAAGATAATACATCTTAAAATTTCGGTAATTAGATTTGTGAAAATAAATCATAATTGTCATTATTTCACTTGTTGACATTTGTGAAGGCTTATTACGTTTTTTATTCGTATCTTCTAGCAAAATAGCATTCCATTGAGGTAATAACTCTTGGCAGAAATCATCTATTACACAAAAGAGAGAAATCAATGTTAAGTCCATTTTATTGCTTCTTTAGAACTAAATTTAGACTCTATTTAGCCGCAAAACCACTGGTTTTTCAAATACTTCTTATGTCGAACTCACGTGAATTAATAAATTTTAATCGCAGCAATTGTTATTATAAGTCTGTACGGTGTACCAAAGATAAAATGGAGCTGCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCAGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCGACAAATTTCAGAAGAGGCAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAAGACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGTCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAGCACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATATATTGAACACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGCTTTCTTACGATTCACTCGCATGCCGTCACGGCGCAGAACTTTTGTTACGCGACGATAACCAAAACAAGGACTCTTGTACCAAATGTCATAAATACGATTCATCATCACCGTATCATCAACTTTTGGCACCGGCTTATAATAAAGCCCGCTGCGCTCAACGCTAAGCAACTCACACTGACGGGCGACCGTAATTTTCAGCTCTGGACTTACGAGCAATCGACGTTCTTTAGAGGTTAGATGCTCGCGAAGCCCTTTTTTAAGTAATCCACCTCTAGGCTCAGTTCGCCAACCTTTTTAAACAACTGGTCACGTTCATGCTCTAAACGAACATCGGAGGTTTTATAGCCTTTTTCAAAAAGTTCACAGCCTCGCTCAAGCAAGTCTTTTTTCCACTTTGAAATTAATGTGGGTGCAATGCCGTGCTTGGTGCTGAGAGCTGCAATGGTCTCTTTGCCCTTTATTGCTTCAAGCGCAATCTGGAACTTTTTGCTACCTGAATACTGCTGTCTGCTCATGTAAAAATCTCCAAAAGTATGCCTTAAATTAGACATTAAATTTTGGGGATCATTTCATGGTTATGGGTAAATTAAAAATCAATAAGGCGCTATATGATTTAGTTTTTTACATGGTTATATCTTGATGAGGTGAAGAGAAGTAGATTGAGAAAGGGTGCTTTGGGGGCGTTTTAATAGGTTAAGTATCTTGTTTATTAAATCGTATTGTGTACGTCATGACTGACTGATAAATTTCTTTTAATATGATCGCTAGTTATATTATTCGGTGTGGGTAAGGCAAGGTTGAATATCCATACTCACACCTGAACTTTCTATGATTACTAAATCATATACTTTTAGTAAGCGGCAGTAATCGCAGGAGCTGTATCAGCATTAGCATGTTGGTCATGGGCATTTGTAAATGCATTAAGCATGAGGGTGCTAGTGCGACAAGATTGCTGGAGACAAGCATCAGCTCTTTTTCTACTTATTGGAGCTGCGGCGGATACAGCATCTGTTGTCGATTTTTCAGTATGTTCTTGAAAGCCACTTTGGATAAATCGTTTTAATCTTGCAGAGTTTATTGAATGAAGTTCTTCTGGTTTGCTATTGCTTTCGATTGCTGTTAATTCAATGCTAAATAACTCTTGTGCTGTTGGAATTATTTCATTGTTAGGTAAATCTGCTTTTGCTAAGTGATAGGCATCAATTAACCTTTTACACTGCTCAGAAAGGTTATTAACGCTTTCTGGTGATTTTACAATGCTAGATAATTTTGCAAAAATATTTCGTCTTGCTGCATCCAGAGTATAATACTTTTGAATAGTGACATGTAAATTTGAATTGGCGATATCAGGATTGGTTAAAAGCCCTTTAAGTTTTTGCAGTTCTACTTTAAGGTTTTTTAGCTCTTGAGGTGTACCTGGAGTATCTGGAATTTCTTTTTCTTTATGTTCTATATATTTTACGGCGGCTTTGGGCTCATTACCACTTAAAAATGCACAAAGAATATTAAACGCTCTTTGGGACTCTTGGTAAGGTTGACTAAGAGCTATTTCAGCGCTGCCTAGTTTATGTATGTTTTGCAGGAGGGTTGAAAGTTGCAGAGAAACCTGCTGCTTTAAATGTTCTTTTGGAAGAGGAGTGTTGCTGCTATCAGGCTGGCTATAAGCAGAGGCTCTTTTTCTGGTTGGTGGTAGTGATTCCAAGGTAATCGCTCTTTCTTTGTTTTTTGGCGTTGCGGTTGTTATAGTCGCTGAGCTATCTAATTTTTCAGCATGCTTATGCTCAGGAAGGTCTTGAAAATCATTTTTAACAAATTCTTTGAGCTGCTCAAAATTTATTGAATTAAGCTCGTCTGGCTTACTGTTTTTTTCAATAGCTTGTAATTCAGCGTTAAATAGCTCTTGAGCTGATGGTGTTATATCATGATGAGCTAATTGTGATTTTGCTAAGTTGTATGCACTAATTAATTCTTTAAATTGATCATAAAGCTTATCAATATTTTCTGATGATTTAGTAATGTTAGATAGTTTTGTGTAAATAGCTTTTCTGATTTTCTCTACAGCATACTGCTTTTGAATAGTAGTATGTAAATATTTATTGTGAATATCAGGATCAATTAAAATCTCTTTAAGTTTTTTTAGCTGTATTTTAAGGTTTTTTAGCTCTCGGGGGGTGTCTGGGCTATCTGGAATCTCTTTTTCTTTATGCTCTATTAGCTTTATTGCTGCTTCAGGGTCATTGCCATTTAAAAATGCACAAAGAGAATTAAAAGACTCTCTTGCTTGATGATAGGCTTGTCCATATCCTTGTGAGCCTAAAGTATGTATGTTTTGTAAAATAGTAGAAAGTTGCAAGGATAATTGTTTGTTTAAAAGTTTTACGTGCTTTCGTCGAGCTGTGTTTTGAATAGCCTTGACGATATCTTTATTGCTTTTAAATAAGGACATTACCGTATTTCTAAATGATTCTTGAAGCTTGGTTTCTAGGCTTTCAATGTGGCTTTTATAAAATAATTTTTCATCATGACTAATATCAAGTGATTCAATATCATTCGTAAGCCCTTCTTTCATTTGGCGATAGCTTTTAGGGTTTTGGATAATATATTGGCTAAGTGCTGGTGTAGCTTCGAGATAGTCTTTTATATGCTCTAAAATATTTATTTGCCTCTGCGTGAGCCATGATTTTGGTAAGGCTAAATAGGTATTGACTAAGCCGACCAGAGTGTAGAGGTCATTCTCACTTTCAAAGGGGGCAATATTTGTAATCGCTTTGTTGGAGAAGGGGTGGCCGCAATCATACACATAAAGGTCGGTGCCGGAGCCATCAGCACGTAGCTTTGCAGCCGCATTTTGACCTCTGGATCCGAGCATATCATAATCGCTTATTGTCAACATTGCTGCAAGGTAACGCGTATGGGCAGTAACTTTACTTGCGGATTGGTCATGGATAAGAGAAGATTCCCAGTGTGTTTTTACACAAAATTTTGCTTCGCCATTTTTATATTTTTTAACCAATACAGAGGCTTGAGGAGCA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>NZ_CP013944|1193938:1254286|1233018_1233207_+|WP_026063530.1|DBSCAN-SWA
MDKRLLEILACPACKGKVIYDKKHSELVCKFDRLAYPLRDTIPVMLEAEARTLTLEELDAVR
>NZ_CP013944|1193938:1254286|1242873_1243692_-|WP_017376425.1|DBSCAN-SWA
MAKIVVITSGKGGVGKTTTSAAFATGLAERGYKTVVIDFDVGLRNLDLIMGCERRVVYDFVNVLQDEANLTQALIKDKHVDNLFILPASQTRDKDALTKEGVEKALNELKEKFDYIICDSPAGIEKGALMALYFADEAIIVTNPEVSSVRDSDRILGVLSSKSYRAEQGQPPVKEHLLVTRYNAERVENGDMLNIESVKEILAVPLMGVIPESKAVLRASNTGNPVILDKDSDAGQAYADAVSRFLGEEIEYRFITVRKKNIFQRLLGGLKA
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MADEKNIQSQKDADNAVSDELIETAQRDSGENSIEDALEQVLADTTANSSEDSQFGSYQTGYRGEGLEEPEDTGGGPERSDTNLESANQGGEFGNNAAPLEEINVSFQSGLDGVETEFDVGAGDGASLNPILGITPDINNNAAVQSGGAANRGGVTEEESVAEEAEEVVVEAATSPTDDAEAAESEIPLPDDDSDLSLSAEPAADDDTVTVNGDSDEPVINNNPRAIDDNLTLSEDLAFTFNAADILVNDSDADGDALALTGISQSPEHGELIDNGDGSWTFTPAENYNGQDSFIYTVSDGQGGFATATVALTIDPVNDDPVVIDSLESGTEDVPLVFDVSDLISDIDSNNTFIDSFEQPENGILTLDGTTFTFTPHEDWHGDTRFNYVVADGEGGTAAGSVDMHLTAVNDDPTAQGHTFELKEDGSIRFSEADLLAGATDVDGDNLSVTAVSNPANGDLVNNGDGTWTFTPDDNWNGETQFDYTLVDGQGGEVTETVTLDVDPQAEKVNVEFILNDQQTIYPDYSDEDTNYIVQSPDDFGVTELISGEQMATQGIGNSDQISVGYQDENAASIQLESGWNSIKNIFAVSDEAADVSISDFVRTDVQLGDGGDSTVNIEGAKRGDITTGDGSDTINISAETNGAGWDNTFNIVSAEGADFINLSGDQDITVFNVNAGSGDDVIQLGNGYANSTIHAGYGDDTVRGGTGEDAIFGGAGDDDLRGGAGNDPLRGGQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGNDALRGGQGEDSLRGGAGDDDLRGGAGEDVLRGGQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRGGQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRGGQGEDSLRGGAGNDDLRGGAGEDVLRGGQGEDSLRGGAGDDDLRGGAGEDVLRGGQGDDVLDGGEGVDTVYAGQGNDAATFVVGQSEGIDQYYGGSGEDTLRIELSAEQLENSDIITDLHGLNDFITDHADESSHNGPAETFEHLGVQVGDFEKLDIIVDGQPMSIDDIPVVNQWRNDDFSQESSGRYTHYQVGDPEHSPEGGDALETHRGSDSTRDHEGEWHINADHHRGLEGEEGARDVLTGSDSNDAYTLDWGGREEVASVEEFNTGAGDDIVDLASYRYEYGDTVMNLGEGSDVGWGNIGEDQIFGGAGNDWLAGNSGNDLLKGGLGDDRLEGNAGDDEIHVGQGDDIAMGHSGSDLFVFNLDEGNLGQNWVSGGEGEDSLQLSGSGGQNWVLHVENGGDGEVIHGTTGEAGQYGAEGGLSFSGSITFEDGQSKVQFSDIEKIEWF
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MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRVFKGLAKKSKSTMGWYYGFKVHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG
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MKRLLFNTVVGILAVGSSAVSFATSSYLVAPGKIRLSLQRPSTSSFIVRNTGDTTLHLRAKLEYYPTSSEVLGLGSQKKSFDDDLLTHARVLISPPLLVMPAGQQRTLRVSVRPKAGLKEGTYRAYLRFSPSELIKQPIKVTNDATGNQVGAQINIRLDTVTSIYADKGKGEEKLTVRCINSQKNTKVTIANDSPWLYRGAIANNNANDQDASVPVILMGYNTQTFELKNSRSVIELAEENSKGKQKISCS
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MRLMLKFVIPVEKGNQAAADGSMMQAIQELIGKLQPESTYFYLQEGKRAGTIIFKATDQSQMVVINEPLFAKLHAEIEIQPALDLEDLTRAL
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MVARCKDRPVSNHKFRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MKDKKQYKRYSTAFKEEAVALVTEQGYSAQQAADAVGVRTNMIYRWKDQHDKEANSTLTPDEKAELQSLRKKVKQLQMEKEILKKASAFFAKEMK
>NZ_CP013944|1193938:1254286|1213752_1214868_+|WP_026063528.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MSFELLHKDGRARRGRLSFPRGVVETPAFMPVGTYGTVKGLTPEEVSATGAHIVLGNTFHLMLRPGTEIIEQHGDLHDFMQWQGPILTDSGGFQVFSLGALRKLDEKGVTFRSPVNGSKVFMGPEESMWVQRKLGSDIVMIFDECTPYPASYETARESMELSLRWARRSKDAHGDNSAALFGIIQGGMYPDLRQRSTEGLLEIGFDGYAIGGLSVGEPKHEMFSTLDATTPLMQEDKPRYLMGVGTPDDLVEGVRRGVDMFDCVMPTRNARNGHLFTSEGVIRLRNSANKTDTRPVDEACACSTCRHYSRAYLHHLDKCNEMLGARLNTVHNLHYYQKVMRGLRTAIDAGKLDEFVCQYYAKQNKDVPELA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036771332.1|1194893_1195868_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.3e-30	33.2
WP_017376395.1|1196755_1199482_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773116.1|1200005_1200980_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
WP_017376397.1|1201177_1202659_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209947.1|1203118_1203781_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_017376399.1|1205412_1208184_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	6.9e-150	39.4
WP_017376400.1|1208252_1208696_-	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_017376401.1|1208848_1210321_-	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	1.8e-43	30.2
WP_017376402.1|1210432_1211494_+	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_027242800.1|1211490_1212525_+	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_017376405.1|1212527_1213568_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_026063528.1|1213752_1214868_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	2.2e-94	49.2
WP_017376407.1|1214906_1215260_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	1.1e-07	46.5
WP_017376408.1|1215280_1217149_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_017376409.1|1217170_1218115_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	2.4e-38	35.2
WP_017376410.1|1218348_1218627_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|1218989_1219628_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376411.1|1219602_1221027_-	aminodeoxychorismate synthase component I	A0A0B5J984	Pandoravirus	3.9e-40	33.4
WP_017376412.1|1221227_1221905_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_027242801.1|1222025_1223300_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	50.9
WP_017376414.1|1223367_1224123_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376415.1|1224174_1225092_+	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420654.1|1225518_1226298_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376231.1|1226350_1226638_+|transposase	IS3 family transposase	A9YX41	Burkholderia_phage	2.2e-06	37.2
WP_051929627.1|1226697_1227048_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046603.1|1227241_1227394_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080999981.1|1227321_1227795_+|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.9e-32	48.0
WP_048875973.1|1227807_1228443_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036773947.1|1228954_1229830_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376433.1|1231436_1232795_-	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	3.9e-37	26.0
WP_026063530.1|1233018_1233207_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376430.1|1233220_1234354_-	patatin-like phospholipase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875975.1|1234554_1238427_+	tandem-95 repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_062312104.1|1238461_1239187_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|1239576_1240305_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_017375910.1|1240707_1241436_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_075275409.1|1241499_1242327_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242802.1|1242508_1242877_-	cell division topological specificity factor MinE	NA	NA	NA	NA
WP_017376425.1|1242873_1243692_-	septum site-determining protein MinD	NA	NA	NA	NA
WP_017376424.1|1243792_1244608_-	septum site-determining protein MinC	NA	NA	NA	NA
WP_017376423.1|1244891_1246952_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420655.1|1246948_1247374_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376421.1|1247559_1249053_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376420.1|1249185_1250001_-	exodeoxyribonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_017376419.1|1250096_1250513_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376418.1|1250895_1251435_-	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420656.1|1252351_1252513_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_144420657.1|1253224_1254286_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211418.1|1340984_1341446_-	YaiI/YqxD family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048876012.1|1355690_1357094_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275305.1|1357090_1357711_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_062312136.1|1359128_1359749_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_026063532.1|1365614_1366403_+|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
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WP_017376456.1|1375475_1378046_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SJ67	Klosneuvirus	3.5e-31	23.0
WP_017376457.1|1378153_1378639_+	CinA family protein	B5TK85	Pseudomonas_phage	8.0e-38	56.9
WP_017376458.1|1378813_1379854_+	recombinase RecA	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	5.8e-118	66.3
WP_017376459.1|1379831_1380314_+	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
WP_017376460.1|1380310_1382905_+|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	2.4e-88	41.3
WP_017376461.1|1383211_1383475_+	carbon storage regulator CsrA	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	4.1e-12	68.6
WP_069971651.1|1383847_1384723_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046597.1|1384837_1385014_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376465.1|1385558_1387121_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772167.1|1387662_1388610_-	sphingomyelin phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
WP_017376467.1|1388829_1390305_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_017376469.1|1390824_1391847_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376470.1|1392203_1393571_+	glycerol-3-phosphate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_026063533.1|1393846_1394101_+	RNA chaperone Hfq	NA	NA	NA	NA
WP_048876132.1|1394149_1395403_+	GTPase HflX	NA	NA	NA	NA
WP_027242811.1|1395422_1396637_+|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
WP_017376474.1|1396636_1397530_+|protease	protease modulator HflC	NA	NA	NA	NA
WP_017376475.1|1397727_1399026_+	adenylosuccinate synthase	A0A2R8FF47	Brazilian_cedratvirus	2.4e-65	34.1
WP_027242812.1|1399115_1400393_+	NCS2 family permease	A0A0R6PHV4	Moraxella_phage	7.5e-51	33.1
WP_036772166.1|1400406_1402806_+	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	5.2e-69	33.3
WP_017376476.1|1402802_1403561_+	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_017376477.1|1403737_1404127_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|1405655_1406384_-|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP013944|1424236:1469720|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_144420668.1|1468350_1468662_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875874.1|1468754_1469720_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP013944|1540898:1675994|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_087910642.1|1542681_1543835_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	6.8e-59	44.2
WP_048876004.1|1543956_1544649_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242833.1|1544657_1545845_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	5.2e-22	34.3
WP_017376484.1|1545994_1546621_+	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.2e-33	41.3
WP_017376485.1|1546666_1547896_+	hypothetical protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.6e-08	21.9
WP_144420789.1|1548090_1548537_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376487.1|1548728_1550087_+	dNTP triphosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_075275317.1|1550752_1550926_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876005.1|1551055_1551973_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.6e-26	32.4
1551936:1551995	attL	NA	NA	NA	NA
WP_053093673.1|1552314_1552974_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420674.1|1553054_1553558_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.0e-19	40.7
WP_017376491.1|1553530_1553818_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036771628.1|1554110_1555232_-	calcium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

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MKINNSVTKLLNIEHPIISAPMGIIAGSMLANEVTQAGGLGMIGGGYCNKKSIGRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_144420687.1|1726475_1726661_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048876011.1|1734547_1735597_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376107.1|1737302_1738841_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	2.6e-05	22.4
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WP_017376105.1|1739779_1741012_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	8.9e-33	27.2
WP_017376104.1|1741211_1742033_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017376103.1|1742082_1742892_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876018.1|1743047_1746914_-	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.6e-51	26.5
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WP_075275424.1|1748019_1748298_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420689.1|1748442_1749018_+	nitronate monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_017376099.1|1749066_1749225_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051929528.1|1749973_1750690_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_026063521.1|1751818_1752235_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420690.1|1753149_1754079_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.2e-60	44.9
WP_144420691.1|1754050_1754209_+	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017376276.1|1754357_1754672_-|transposase	transposase	A0A1P8CWP5	Bacillus_phage	6.9e-06	36.5

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP013944|1758586:1818736|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP013944|1848491:1962308|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_027242997.1|1938784_1939261_+	flagellar protein FlgN	NA	NA	NA	NA
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WP_027242999.1|1939917_1941012_-|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

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MSFNYRRRKFCRFTAEDIKEIDYKDTVMLRNYVTESGKIVPSRITGTRARYQRQLATAIKRARFVALLPYTDRHQ
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP013944|2057206:2108283|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP013944|2123446:2184304|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377006.1|2166627_2168238_+	SpoVR family protein	NA	NA	NA	NA
WP_052106204.1|2168344_2169238_-	thiol:disulfide interchange protein DsbG	NA	NA	NA	NA
WP_017377003.1|2169347_2169971_+|protease	site-2 protease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377001.1|2170677_2171376_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP013944|2209198:2253493|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_048876012.1|2213289_2214693_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377826.1|2215954_2217400_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_048875904.1|2218595_2219471_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376521.1|2223191_2223665_-	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	2.4e-26	43.4
WP_017376522.1|2223790_2224447_-	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	6.8e-40	44.2
WP_017376523.1|2224443_2225118_-	riboflavin synthase	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	6.0e-31	37.7
WP_017376524.1|2225123_2226272_-	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A1V0SE20	Indivirus	4.7e-44	34.8
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WP_017376526.1|2226805_2228056_-	serine hydroxymethyltransferase	A0A219Y950	Aeromonas_phage	2.4e-102	54.4
WP_017376527.1|2228182_2229862_+	energy-dependent translational throttle protein EttA	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	3.0e-39	26.6
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WP_036771330.1|2235848_2236823_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_027242983.1|2236979_2237618_-	SGNH/GDSL hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377748.1|2239053_2240715_-	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
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WP_036773645.1|2241458_2242544_-	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	9.8e-76	43.3
WP_036773644.1|2242585_2245222_-	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.5e-98	32.6
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WP_017377755.1|2248349_2249066_+	bifunctional 2-polyprenyl-6-hydroxyphenol methylase/3-demethylubiquinol 3-O-methyltransferase UbiG	NA	NA	NA	NA
WP_017377756.1|2249062_2249704_+	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_144420715.1|2249696_2249831_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242981.1|2250079_2250535_-	glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_027242980.1|2250626_2250971_-	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|2252089_2253493_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP013944|2308413:2355121|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

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MSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRSLRAMEC

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377934.1|2370310_2371369_-	lipopolysaccharide heptosyltransferase I	NA	NA	NA	NA
WP_017377935.1|2371365_2372376_-	lipopolysaccharide heptosyltransferase II	NA	NA	NA	NA
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WP_017377937.1|2375588_2376440_-	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_144420810.1|2376522_2377068_-	chorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_027243057.1|2377165_2378026_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_155048031.1|2378168_2378534_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377942.1|2378615_2379122_+|protease	protease inhibitor I42 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377945.1|2382140_2382473_+	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	4.7e-05	34.2
WP_047927125.1|2382590_2383100_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377687.1|2386174_2386927_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|2387282_2388257_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_016209908.1|2388389_2389100_+	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	2.2e-31	34.8
WP_017377690.1|2389096_2390131_+	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
WP_017377691.1|2390234_2390576_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876071.1|2391086_2392247_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.8e-25	32.0
WP_069971647.1|2392215_2392812_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP013944|2442243:2507865|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP013944|2442243:2507865|2444278_2447449_+|WP_027242860.1|DBSCAN-SWA
MIKLIKKILSTFLSRTFITLLLCLALCAVIWFYSPLLAFNNHYYFTDPLPRVIAILVIALLWGISNLRFRIQPWRTHKITSSVHLKKNKNPHDSKIQALCEILKKRNFNKSNIIIVTGDDNSAKRFIFNQVNIIKSSDHTSDNSINWVLTQQQALIYIPHDHLINDNLKKSIYPLIKINSVSPVNSIIIIESCESIFNNNKINNKNIKSINQLNQAIGYSVPVYFYFSNSNEITGYKQYAKLADQSKVSSTIELYSYERNNIIFLTDFNHLIKTKLSYYYQITNNDNKFENILSFRFLLELSKLKDIINKFIKEISHYTTVNPLYIQGLYLSPITEGKPNQGDDTVVFSSNSLIHEIINHSHKISDNFNESRFKRKKFKHAIIASVILFCTITIASIWMVALNKKINYVYDISNDINKNFINSSNITSIDKLANYIQSHSWFSFGLFNINSVPRQTVKLYNYYLSQSFLPYISTIAENQIKSAINHHNTLYLYQWLSSYLMLNDKQYLNKEAIYNTYADYWGERAGYNNTTKQNRLFQLNSLLQLKFQPIDLNTDLVSQARAVLDNKTLAEQAYLNLNNFYHQKNQSLTTSPVDLDSTLSIRKNTTIPYLFTKNGYITEFKSSYTDFLQTVINNQWILGKSFQINDQATLEAQMNNSYWSQYLDVWNNYIANIEVSPFNQLAAATQNLGLLAKDSDSAIVKLLQVISDNTSFTSDKSTLSNNVISNAYSAANSLLIQTDKNTPAPIHNYIQAINNLYRYFVNIQQSAVPDQAAFEQARKLFSDGQTNPIKQLRILALQAPEPLATWLNQIVHSSLITVFNSANKYIETQWDNSIKNQFNTAFKNSYPFTTASSNNASPDDFLNFINQDGEISTFFKKYLNSFIFSDKNYQAKSLYNVKFPINLNISKTLTSVTHLKSMFNLSKESKVSFIIEPRLLSKNIRNINLSYGDNSFAYAYGPIFPYHWNWPLSSLNQDLIIKVQLFSGIVRTYSFSGPWSLFKFLASSKITQRSPTTYTVEYSSDGLILSLTLIANSSSNPFKETLSTALAPLVRYISIS
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MANKTPYISVVIPVHNEEDVLNDLYQRLFPVLDQMHKPFEVLFTNDGSRDSSSEILTGFFNERPDQIRVIEFNRNYGQHMAIMAGFERVRGEIVITMDADLQNLPEDIPKLVEKVEEGHDVVGGYRVDRQDRLWRKFVSKAHNFLRKHITKIDMQDEGCMLRAYRREIVELMIASGESSTFIPALAVSYAANPTDVPVRHAAREAGESSYNLYKLIRYNFDLFTNFSLVPIQMFTFIGLAVALGSLVLFLYLMVQRILHGPDVDGIFTLFAIVFFLMGVMLTGMGIMGEYIGRIFQEVRRRPRFVIRHILEQQETTEIKEVKASITEFNPNLKAE
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MTEGVALQMTEGAIIKIIGDGAELISEAGLSLDGIVQVVEQDLRIDNKIQLCTYKKLVFSVRFFHNLHEVLS
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MLVVIDNYDSFTYNLVQYLAKLGADVRVFRNDQITLSELIALDPRHIVISPGPCTPNESGISLEVISYYTGKIPVLGVCLGHQALGQCLGARVEPAPYVMHGKTSEIWHTQQGLFKTLPRRFFVTRYHSLIVAEESLPECLEAVAWCKNKGSGRLIMAMQHKEYPLYGVQFHPEAVLTEYGYELLAQFLMQ
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MQKLKLHGFNNLTKSLSFNIYDICYAKTPEEQQQYLEYIDEAYSASRITELMNQVTETIGAHVLNIAYQDYEPQGASVTMLIAEGPVMLPTKTITPDAVVAHLDKSHIAVHTYPEMHPDNEHGICTFRADIDVSTCGLISPLKALNLLIDSFECDIATVDYRTRGFTRDIYGNKLYMDTPINSIQNFFTEEVRRCYEMIDVNIYQENIFHTKMLLKEFDLDNYLFGATTKELSSGNEQLIRSRIKREMLEIFYGRNMADVPIDGCY
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MSCYVSERGRITPDNRVIRYLSERLGYSQAEISAVETAFATSAEHRRLNKRHKSTVKTELGWAYRQLELCPGAVMQSIKVAYRRLNESLSP
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MSRYHPDKLVARVLGPIEIAESTQKAQRIQQAYRQLLRT
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MKALQRLFLTLGLGAFTTTLTFAAPPAIPLNQSIAIVNNQVITSQDLAIETSFMAAQLRGQSQADIKHAALNNLITQNVLLELAKRNNIHASSDVVSNAFNSVAHQNKMSAEKFTMALTKQGINVDHYRKFLKNQLIIRSLEQRVLAGAGLQVSEAEVAQYMQRQHTKQQATTRYSINTILITSKTQAAHILQEIKDKKITFKKAAKDYSQGSNRSQSGNLGWLKTSELPIMLVTPAQKLKLGELSPLLDTGNGYLIIQLAGKKSDYQQAIKVTENKIRQIILQTTPIFSDEQAVAKLTQLRQQLTNAKISFAKVAQNYSEDPASSAKGGELGWVLPGQLPPELEQHIDKLDINTISEPIRTPTDWRLIEVTARRQIDASRTIEKAQAKQAIFIKKAEAYIANWRKQIRDQAYVHILGQDES
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MSQKRKKPSAEFKTKVVLEVIEGDQTLNQICSKYELVPKTVQNWKKVFLANASLAFNIDNAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYETRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYKSVRCTKDKMELLRAIDRIYTETPFYGYRKVHQQLIEGGYSVGLNRVRNYMNELGLKVIYPTKKVCTTLAHPEHKKYPYLLRDLEVYKPNQVWSTDITYIRLDGGFVYLAAVIDWHSKAILSHKISTTMDSSLVINVLKQALERYGTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MKKLYVGNLPYSADDASLEELFSQFGAITSVKVIQDRETGRSKGFAFVEFDEKDAAEAALKLDGQDNGGRPMKVSMAKPQEKRQPRNHY
>NZ_CP013944|2442243:2507865|2489421_2490498_-|WP_017376630.1|DBSCAN-SWA
MTRISFWWRFSKNPLAVCGGALVLCVGLLALFAGFIAPYGADDYGKPYTNQMPPTVIHVVHPETGKLSWPFIYGYQRSFDKNTFTIEYHENKNEIYPLQFFVSGSQYRLFGVIPMNIHLFGVRAPGKLFIFGCDRYGRDIFSRIVWGAQISLLLALMATCVSLILGCIIGGIAGYIGGWLDNLIMRFIEVIYAIPTLFLLLALRALLPMDLDPLYVMYAMVLILGLLGWGGLARVVRGSVLSLKTKDHVLAAKVLGFSRRRILFLHILPELYGFILVTVTLAIPANLLITSFLSFLGLGVNDPYVDWGLLLNNAQTAGAIGIMQMPWILIPGLFLIITVVAFNLLGDGIRDLLDPRQE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_027242858.1|2442243_2443551_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
WP_027242859.1|2443555_2444266_+	DotU family type IV/VI secretion system protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242860.1|2444278_2447449_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242861.1|2447515_2448652_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376336.1|2449514_2450372_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376335.1|2450513_2451314_-	adenosylmethionine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376334.1|2451412_2451988_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.2e-57	50.0
WP_027242862.1|2452070_2452742_-	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_027242863.1|2452787_2453687_+	DUF3530 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376331.1|2453721_2454105_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_155601403.1|2454255_2454375_-	molecular chaperone DnaJ	NA	NA	NA	NA
WP_062312176.1|2454355_2454631_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_062312179.1|2454611_2455022_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376328.1|2455723_2456749_-	phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_048876074.1|2456879_2459384_+	LPS-assembly protein LptD	NA	NA	NA	NA
WP_017376325.1|2459390_2460659_+	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA	NA	NA	NA	NA
WP_017376324.1|2460660_2461644_+	4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase PdxA	NA	NA	NA	NA
WP_017376323.1|2461656_2462478_+	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_017376322.1|2462522_2462915_+	Co2+/Mg2+ efflux protein ApaG	NA	NA	NA	NA
WP_017376321.1|2462989_2463796_+	symmetrical bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_036774104.1|2463983_2464412_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|2464470_2465445_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_017375660.1|2465468_2465906_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876012.1|2465940_2467344_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376011.1|2467924_2468086_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376015.1|2469306_2469678_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242569.1|2469785_2471336_-	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376017.1|2471368_2472208_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376018.1|2472204_2472720_-	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_017376019.1|2472723_2473716_-	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_017376020.1|2474094_2475465_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_027242570.1|2475673_2476813_+	hypothetical protein	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	9.3e-61	41.7
WP_075275355.1|2477026_2478001_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.3e-30	33.2
WP_036816881.1|2478024_2478243_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376024.1|2478320_2478569_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772149.1|2484224_2484905_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376634.1|2484969_2486256_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376633.1|2486857_2487127_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420813.1|2487310_2488282_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.0e-15	29.3
WP_017376631.1|2488349_2489324_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.3e-14	31.3
WP_017376630.1|2489421_2490498_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_144420721.1|2490578_2491571_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_036772145.1|2491575_2493378_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243118.1|2494714_2495998_-	diaminopimelate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376625.1|2496130_2496523_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376624.1|2496629_2497715_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376623.1|2497930_2498947_-	bifunctional UDP-4-keto-pentose/UDP-xylose synthase	D5GW02	Campylobacter_virus	1.9e-12	28.7
WP_017376622.1|2498949_2499957_-	glycosyltransferase	B9UDL7	Salmonella_phage	2.2e-37	34.4
WP_026063550.1|2499960_2501115_-	DegT/DnrJ/EryC1/StrS family aminotransferase	A0A2K9L0G1	Tupanvirus	3.9e-38	33.0
WP_016209558.1|2501129_2501492_-	small Multidrug Resistance family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243117.1|2501488_2503204_-	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063546.1|2503303_2503978_+|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|2504006_2504411_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376618.1|2504435_2504576_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376616.1|2505529_2506312_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075275357.1|2506413_2507373_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0N7C035	Escherichia_phage	1.2e-13	34.3
WP_017376613.1|2507517_2507865_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP013944|2511866:2575639|DBSCAN-SWA
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MATLSSLQGGLELKQKLIEGAKKDRDVVRAKAFEKCDTLEKLCEAVITDSSYHTSAVKEITRAFLKGANKPEFQEVAAALKPPGAEKVTKQDLQACALGLAPGEAFDQRLLTQFEYKAHNEAVASPKPRKDNHRSVQQIIRETTAYLNSGKSLSDPKWQSLQQECGQIAQRLGSEKPEKARGLQPGIIGTFRGIIDAIDKRKEKAQREEDRQAINQLDRLFKTATAAAARYQVNNAVGAEYQVAMASSGPCALEVQQPKAQTKLHIIPGM

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_048875883.1|2512928_2513465_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_051929685.1|2513724_2514627_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017376607.1|2515616_2516606_+	murein tripeptide/oligopeptide ABC transporter ATP binding protein OppF	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.5e-19	32.4
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WP_017376605.1|2517109_2517685_+	ribonuclease HI	M4QMN0	Micromonas_pusilla_virus	1.1e-33	55.1
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WP_017376603.1|2518135_2518975_+	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.4e-45	43.6
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WP_053856764.1|2524475_2525402_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036772137.1|2525720_2526281_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377036.1|2526750_2528070_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
WP_017377037.1|2528137_2529004_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	6.3e-25	31.1
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WP_017377039.1|2529930_2530149_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377041.1|2531549_2531879_-	Grx4 family monothiol glutaredoxin	NA	NA	NA	NA
WP_026063593.1|2532113_2532818_+	purine-nucleoside phosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_017377043.1|2532798_2535027_-	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.7e-82	34.8
WP_017377044.1|2535289_2536303_-	quinone-dependent dihydroorotate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_017377045.1|2536411_2536633_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377046.1|2536637_2538275_-	NAD+ synthase	A0A2L0UZF5	Agrobacterium_phage	3.4e-88	37.8
WP_017377047.1|2538413_2538947_+	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377048.1|2539067_2540186_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_027242608.1|2540178_2541501_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772661.1|2541487_2542624_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377052.1|2542854_2543280_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242609.1|2546609_2546963_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772169.1|2546997_2547873_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_051929903.1|2548029_2548434_-	heavy metal-responsive transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_051929897.1|2548581_2549757_-	acyl-CoA desaturase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377059.1|2550559_2552044_-	MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	8.5e-46	28.0
WP_017377060.1|2552267_2553221_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	2.9e-31	27.9
WP_027242611.1|2553201_2554293_-	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_027242612.1|2554595_2554838_-	sulfurtransferase TusA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155048025.1|2555738_2555924_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377064.1|2555905_2556481_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036772726.1|2575090_2575639_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.1e-06	34.3

Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP013944|2607430:2650789|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP013944|2703484:2739424|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_026063625.1|2710368_2710746_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377353.1|2714780_2715284_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.9e-13	41.2
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WP_017377349.1|2717663_2718902_-	8-amino-7-oxononanoate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_036773024.1|2718901_2719864_-	biotin synthase BioB	NA	NA	NA	NA
WP_017377348.1|2719907_2720660_+	ComF family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_144420819.1|2723443_2723893_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377343.1|2724113_2725538_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.0e-16	42.3
WP_052106221.1|2725602_2726652_-	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_036818827.1|2726942_2727674_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420730.1|2727704_2728595_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377336.1|2729937_2732748_+	phosphoenolpyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_048875864.1|2733040_2734066_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080963630.1|2734449_2735307_+	HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|2735476_2736205_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_048876012.1|2736405_2737809_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376920.1|2737954_2738452_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875863.1|2738521_2739424_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP013944|2762633:2802853|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_087910654.1|2802199_2802853_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP013944|2868936:2923561|DBSCAN-SWA
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MEQILLILLIVAAVVMIVLILIQQGKGATAGASFGTGASQTVFGSAGAASFLVKATAMCALVFFVICLVLGRMAAQQGQLSPTSATVKTTAAPAAALQEATTPTSASSQPQTTDESGVQK
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MKHNESLTEMLSLVVTGLGFELWGIEQVPQGAQSVLRVYIEGPEGVTVEDCATVSRQIGAVLDVEDPIAGNYSLEVSSPGLDRLLFTSEQYQRYLEQELQIRLKILNNGKRRIRGRLTAVTEQGVCIDVKDEQFDIRWADIDRANVFTKF
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MRYLGAVVGMWVHRRWLKKCLVQHHVSRVTQLSAGQLHAKNVKVLALDYDGVLVSHGRTELTAEYQHWLASLINEFKGEVCILSNKPEMVRELYLQKKFPSVGFIADVEKKPSPQGLLHIAAHYGVQPEEILLVDDRLLCGMLAVARAKAQGVYIDKPLTEFSSAFLCESFFASLRVWERWSVRLLTLFYGS
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MSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
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MSIENGLNGLTITMREQIDYWLTKFPHDQKQSASLAALMVVQKENNGYLTNVLMDAVADYLDMPAIAVYEVATFYSMYEHKPVGQHKICVCTNISCMLNGSDKIVEHLERRLGVKMGGDVTPDGKFSIKEVECLGACVNAPMFQIGDDYHEKLTPERVDQILDNLE
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MSDQKVALITGGMGGIGVYIARKLADEGNQVIVTYNSGGANSERAQHWLAEQEAQGYRFDALFCNVSDFNSCKEMIDDIISRYSQIDILVNNAGITRDAQLKKMSQDAWQAVMQTNLDSVFNMTRNVINTMIDHGYGRIINISSINGQKGQFGQANYSAAKAGMHGFTKALAQEVARNGITVNTISPGYIGTDMVMAIREDIREQIIAGIPVGRLGKPEEIAKAVAYLACEEAGFITGSNLAINGGQHMC
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MSENIRVIKKYPNRRLYDTSISSYITLNDVRQLVVDCVKFQVIDARSKDDLTHTTLLQIINEQEDKGAPMFSTQILENIIRFYGNSMQDFARGYLDRSMALFVEQQSSIKDKIENLVNSTPNPMNMNQQLFSTFSEMAQSNLNMWSEMQKNFQNVAQTQTTANSTEKEEEN
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MLGQIFIKNLVQQASMGVHNWEKEIKQRLEFDITVEFNLARAIETDDCANTVDYTVITQLVHHLINQQHFNLLETLAYHLSSEIYKKYPTIKTIEVTIRKPSAVAMTDTVGVTFKHEY
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MKILKQWAKTFLLIELLKGLKLTLKHLFTKSVTVQYPEEKTPISPRFRGLHALRRYPNGEERCIACKLCEAVCPALAITIESEQREDGSRRTTRYDIDLFKCIYCGFCEEACPVDSIVETKVFDYHFEERGENIMTKAKLLEIGDQYEEQIAAAKAQDAPYR
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MKKVFILGSMLLLSSSLSFASDLYCPSQVACTYNQGQYQCAWKQGFMSNGGVAPLEDEEYGPSFTATFEAAYAGYTESGEMPSCDYEIKGVETHVVNLMPRETTAVIDNSTSDNAWKATGVVGNVTRYMCNTTNPKLCPIKTTESPKFNPSLSF
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MARRNKGRALNGILLLDKPTGLSSNHALQRMKRCYQAQKAGHTGTLDPLATGMLPICFGEATKFSRFLLDTDKCYQTVATLGERTDTLDSEGEVIESVPVKMTETDIIGILPNFRGEITQIPPMYSALKQDGRPLYKLARQGIEVERAARDVTVYELELMTLKQDQAKLKGQFQVHCSKGTYIRSLVDDIGQVLGCGAHVSELRRTNVAHFSEEQLVPWSVIERLAKQGDLAGLDAYLLPIESMLQGMPELRLTAEMAYYMGTGRPVSLNTQQAIGAYVCVFDEKAHQFIGVAEVVAENQLKAVRLLATKVSNC
>NZ_CP013944|2868936:2923561|2874235_2874952_+|WP_017378089.1|DBSCAN-SWA
MNTKDPVILVTGASSGIGYHTAKNLAASTNCHIIAIARSAAALEALKADCQNTPGTIYPVTIDLLIENDLNKLQNFITEAFGKLDAIINNAGLLINKPFTELTDNDWRTTLETNLLAPVKLIRMFYQELCHSQLAHVVNISSMGGFQGSVKFPGLSAYSTAKGGLSILTESLQAEFGEKITVNCINLGAVDTPMLQQAFPDLKTTVSPNQISEFISTFTLHHHHICKGKTIPLAATTP
>NZ_CP013944|2868936:2923561|2886023_2887091_-|WP_017378103.1|DBSCAN-SWA
MLDLMQLEQEVFDYQTRLQEFAALTKEESRSDIMPEQALVGELIAENSLWQLQSYSNNKTGRPLLVVYALLNSPRILDLSKDCSFLAGLIRAGFDVYLLSWKNDQHVAGVRSYHEYIINQGLSQAVDTVLLHCKQPQLELLGVCQGGVFSLCLSLLQPDKLKRLILMGTPVDLHTADNILMQRAKRSIALKGQLNYVRAKAGKLINSRSINHWLACQQPTRLLMLKYANFIHLEPQQRHEFYQLEQWLWGSGWLSADALNEFIDDFYVNNLLFSGRLLIEEQPLYLASLAVPTLNLYANHDSLVPASASQALGQVVQHERLDYQEYGFNTGHIGLYISDKVQMQVIEKIVMTIEK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036771330.1|2868936_2869911_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_036771442.1|2869930_2870716_-	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378082.1|2870732_2871086_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378083.1|2871115_2871694_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242676.1|2871811_2872573_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_048875857.1|2872811_2873786_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.8e-29	33.2
WP_017378088.1|2873889_2874246_+	dihydroneopterin aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_017378089.1|2874235_2874952_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_017378090.1|2874959_2875445_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_062312192.1|2875603_2876527_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	2.1e-26	32.0
WP_017378092.1|2876681_2877146_+	DUF3757 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_062312195.1|2877649_2878993_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081323804.1|2879034_2879469_-	transglycosylase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_062312201.1|2879401_2879998_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378095.1|2880192_2881602_+	polynucleotide adenylyltransferase PcnB	G3MAR3	Bacillus_virus	7.6e-28	30.0
WP_017378096.1|2881598_2882096_+	2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase	S4VNV0	Pandoravirus	9.2e-13	32.9
WP_017378097.1|2882292_2883471_+	acetyl-CoA C-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378098.1|2883554_2884307_+	acetoacetyl-CoA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_017378099.1|2884414_2884930_+	polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR	NA	NA	NA	NA
WP_017378100.1|2885060_2885471_+	phasin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242678.1|2885610_2885958_+	phasin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378103.1|2886023_2887091_-	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017378104.1|2887084_2887603_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378105.1|2887698_2889870_-	polyribonucleotide nucleotidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209298.1|2889937_2890204_-	30S ribosomal protein S15	NA	NA	NA	NA
WP_017378106.1|2890267_2891212_-|tRNA	tRNA pseudouridine(55) synthase TruB	NA	NA	NA	NA
WP_017378107.1|2891211_2891565_-	30S ribosome-binding factor RbfA	NA	NA	NA	NA
WP_017378108.1|2891613_2894289_-	translation initiation factor IF-2	A0A2H4UTS4	Bodo_saltans_virus	1.3e-25	24.1
WP_017378109.1|2894305_2895823_-	transcription termination/antitermination protein NusA	NA	NA	NA	NA
WP_016209273.1|2895899_2896352_-	ribosome maturation factor RimP	NA	NA	NA	NA
WP_017378110.1|2896570_2898010_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit NuoN	NA	NA	NA	NA
WP_017378111.1|2898009_2899548_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit M	NA	NA	NA	NA
WP_017378112.1|2899562_2901533_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit L	NA	NA	NA	NA
WP_016209309.1|2901536_2901842_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit NuoK	NA	NA	NA	NA
WP_017378113.1|2901865_2902489_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit J	NA	NA	NA	NA
WP_017378114.1|2902508_2902997_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit NuoI	NA	NA	NA	NA
WP_027242679.1|2903010_2904036_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit NuoH	NA	NA	NA	NA
WP_017378117.1|2904040_2906434_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit G	NA	NA	NA	NA
WP_016209307.1|2906483_2907773_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit NuoF	NA	NA	NA	NA
WP_017378118.1|2907779_2908280_-	NAD(P)H-dependent oxidoreductase subunit E	NA	NA	NA	NA
WP_017378119.1|2908279_2909533_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit D	NA	NA	NA	NA
WP_017378120.1|2909534_2910212_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit C	NA	NA	NA	NA
WP_016209262.1|2910229_2910715_-	NADH-quinone oxidoreductase subunit B	NA	NA	NA	NA
WP_016209283.1|2910705_2911074_-	NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 3	NA	NA	NA	NA
WP_017378122.1|2911752_2912115_-	preprotein translocase subunit SecG	NA	NA	NA	NA
WP_017378123.1|2912128_2912890_-	triose-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_017378124.1|2913191_2914538_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771461.1|2914634_2915177_-	1,6-anhydro-N-acetylmuramyl-L-alanine amidase AmpD	NA	NA	NA	NA
WP_017378126.1|2915292_2916126_+	carboxylating nicotinate-nucleotide diphosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_027242680.1|2916147_2916741_+	thymidine kinase	A0A0B7MRR0	Enterobacteria_phage	6.4e-53	53.6
WP_048875856.1|2916916_2917936_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017375571.1|2918206_2918608_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378129.1|2918618_2918942_-	DUF423 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_065653735.1|2918965_2919976_-	lipase	NA	NA	NA	NA
WP_017378132.1|2920042_2920891_-|protease	zinc metalloprotease HtpX	NA	NA	NA	NA
WP_026063707.1|2921007_2921919_-	Nudix family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_036772169.1|2922685_2923561_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

>NZ_CP013944|2929640:2977750|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017378150.1|2943045_2943828_+	exodeoxyribonuclease III	E3T4M6	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.8e-31	33.0
WP_017378151.1|2943955_2944876_+	SPFH/Band 7/PHB domain protein	J3IZE5	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus	2.2e-20	27.5
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Sequences of DBSCAN-SWA_33

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33

>NZ_CP013944|3072544:3106943|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_33

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>NZ_CP013944|3072544:3106943|3084052_3084505_+|WP_017378404.1|DBSCAN-SWA
MVARFKDFFNASHAIEISHKKTPEYSATITQLPETRHLTKKDCWRQQKSQYPQGFPEKIKNKLEKLKENPEISAEDILYLECELLATPMAIYSQDSKKLNNHLFLTQGFCLENYINERIIAIYQDMLSHIEHHYHLQEQRRAIKLLELLI
>NZ_CP013944|3072544:3106943|3082623_3083187_+|WP_017378402.1|DBSCAN-SWA
MQIKPLVILDRDGVINEDSEHYIKSAAEWQPIKDSLTAIAKLNTAHIKVAIATNQSGIYRGYFTLATLHDMHKKMAHLLAEQYGHIDHIEYCPHGPTEGCSCRKPAPGMLKTIITHFQLTPEHAYFVGDSFKDIQAAQAIGCTPILVLSGKGGDTLKKHPKLEKQIKIFHTLNHFVNELLANANTTA
>NZ_CP013944|3072544:3106943|3085473_3086370_+|WP_027242707.1|DBSCAN-SWA
MKALKLIKSALPKHTAIIYMIISAVCIASAGFFAKIAMQYTSVQITLLARFGVPLLLLILFFSFYQRWSQLKFTYAKTHFIRAFFLTLAQFLLFISIIHLSLAEATVLYSTGPIFIAIFSFFKNKKINLQSLIAVLLGAVGVALMMHIENGIINPYVIVGLLSGFCLSASQLLLHSATKKEKNSHVMLFVYLFSTLLSLIYFGLINIEEELKTLTPMLSFSIPIIGILILVGLASLGNQFFRGKAYQQVKDPASIAPLIYISILVAGLYDIFFYNHLPNIEVIIGAILIVTSALFSKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_017376171.1|3072544_3073519_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_155046560.1|3073785_3073959_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|3074064_3075468_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875844.1|3075472_3076492_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275373.1|3077108_3077438_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378398.1|3077663_3078062_-	DUF3135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378399.1|3078929_3079880_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_017378400.1|3079879_3081958_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_017378401.1|3082099_3082615_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_017378402.1|3082623_3083187_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017378403.1|3083167_3083914_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378404.1|3084052_3084505_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927132.1|3084640_3085477_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242707.1|3085473_3086370_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017378407.1|3086402_3087470_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_080963575.1|3088170_3089622_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017378410.1|3089628_3091008_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_036773239.1|3091048_3092362_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_026063734.1|3092351_3093326_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	1.3e-10	35.9
WP_017378413.1|3093419_3093923_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	5.4e-13	37.1
WP_017378414.1|3094057_3095209_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|3095205_3095685_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242705.1|3095831_3098153_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	7.9e-99	35.9
WP_080963576.1|3098097_3098724_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378416.1|3098728_3099628_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_036773242.1|3099815_3100370_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|3100409_3101384_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_017378420.1|3101973_3102351_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|3103085_3104060_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_036773655.1|3104620_3105025_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053856772.1|3105491_3106943_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP013948

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	7327 : 21123	18	Moraxella_phage(18.18%)	head,transposase,capsid,tail	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013948|7327:21123|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP013948|7327:21123|8904_9489_-|WP_027242598.1|DBSCAN-SWA
MPTQKYLKKTRDLIGKFDSRIAHLQEEIDICAKYDHDLHRCLQEQKTQNLPLHQQYENLKEFSKSNYNPIAQSASRKLALLCKFRGILEKSTYDIGTAKKGLGSLNAIFSICRFSGGKYHYPKVFEAIGCGLFSKTKKLCSQARELLKERISVEAEAAQSAGKWRTASPVLNALQSFQVTSSAPSPEANVPGQP
>NZ_CP013948|7327:21123|14672_15014_+|WP_017375786.1|DBSCAN-SWA
MLNFPSLLPTKIDADKVKPRLRITPLGDGYMQREADGLNTLRHYFTVSFIGLSEIEKDSLINFVTERTGLEAFLWYHPGEKRYFQIICSEWQANLQHNYWTVILRFEEDFNPL
>NZ_CP013948|7327:21123|20145_21123_-|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
>NZ_CP013948|7327:21123|15010_15682_+|WP_017375787.1|tail|DBSCAN-SWA
MSLIESAKIYLFTLDLTPLQSSIKYHFCHSPDGNQAVSFGGVEYQPIPLKTDGFERTTIHQPTPSIVLGNVKPLLLPLLKAHDNLRGALIRRVMTYVKHLDGHSDPDASATLPEQVYVIERKSQHNNLTITFELGSKLPSDLKLPRRTQLASCSKIYRQWDEEQQVWIAGSCPYAAAQYYNEFGQQTTDKTKDQCGKKLANCMARFGNGHALPFEGFEGIKPF
>NZ_CP013948|7327:21123|15611_16397_+|WP_144420832.1|DBSCAN-SWA
MAWRASATDTLCPLKDSRALNLFKAYALEQYPKEAVGLILPADHFMPCPNLSTTPEENFCIDPTQLIDTPSGTLLIHSHPDGTVEPSLADMVGQRDTGLLWGIVALNQHAITDVIVFGEQLFTQQLLERPFLHGIFDCYSLIRDFYAVEKKIFLPDFPRQRSWWEIEKYNLYERYFTDASFIEVDKASPLHRGDVLLMRVGRTTCINHGAIYLGEDCRLKEDRNAVSLPGMILHHVCDNLSRREMLSEWQKRIAKVVRYEN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036771639.1|7327_8302_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	4.9e-26	30.9
WP_075275454.1|8351_8891_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	9.3e-35	44.2
WP_027242598.1|8904_9489_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375778.1|9873_10185_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	5.6e-08	30.8
WP_017375779.1|10181_10607_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	3.9e-12	37.9
WP_017375780.1|10785_11181_+	HK97 gp10 family phage protein	Q6UAX1	Klebsiella_phage	4.3e-05	39.6
WP_017375781.1|11177_11528_+	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375782.1|11527_11950_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375783.1|11951_12275_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375784.1|12331_12598_+	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771950.1|12601_14680_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	1.6e-50	31.2
WP_017375786.1|14672_15014_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375787.1|15010_15682_+|tail	phage minor tail protein L	W6EC15	Rhizobium_phage	1.4e-27	33.6
WP_144420832.1|15611_16397_+	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	5.1e-42	41.1
WP_017375789.1|16386_16944_+|tail	tail assembly protein	K7PM97	Enterobacterial_phage	2.7e-21	35.6
WP_027242568.1|16940_19631_+	host specificity protein J	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	6.1e-111	32.9
WP_017375652.1|19689_20118_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|20145_21123_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9

3. NZ_CP013946

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1736 : 67874	57	Streptococcus_phage(35.71%)	integrase,transposase,portal	attL 15514:15573|attR 67908:68422
DBSCAN-SWA_2	72592 : 128586	57	Streptococcus_phage(56.52%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	163497 : 168428	7	Streptococcus_phage(42.86%)	transposase,terminase,portal	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013946|1736:67874|DBSCAN-SWA
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MECAASRHVTLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
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MKQKKSIITGLFFSFFIVSINAVVPAKPISKAFHCNGFMKYGVPGKTDQYLCREGYSVGYDYKTKQPKWVAYHLTSQSVSKRIKRHDEFRPDSEIPYKYQAQLSDYKQSGYDRGHLAPYAAMDFDKKSASQSFLLSNMSPQKAGLNRQGWAKLESNVRFWAKYKKEVYVYTGPIFEGKNIKTIGKGKVAVPTAFFKVIFAPEKKQVLAFVMPNKRVAKNKVAEYRTNMNHIEKLTGLNFLNQLPLIERENLVTKTEKMWRTHYS
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MKRSKLTESQIVAMLNEGQAGVKVEDICRQYGIAKSSYYKLRSKYQGMGVSDLQRLKEFEDENRRLKQMYADISLEHKVLKDIVEKKL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036771347.1|4084_5062_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_144420843.1|5180_7064_-	DUF1561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927782.1|7859_8249_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|8164_9142_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_048876196.1|9171_10320_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036774350.1|13638_14367_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	6.4e-39	43.1
15514:15573	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_051929623.1|36951_40293_+	DEAD/DEAH box helicase	C3VNU0	Bombyx_mandarina_nucleopolyhedrovirus	2.6e-50	28.7
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WP_036774644.1|47385_48447_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027243200.1|49702_50107_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|50413_51388_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
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WP_036772437.1|52489_54388_-	DUF1561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876182.1|54743_56639_+	DUF1561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375632.1|57338_57674_+|transposase	transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.3e-23	51.5
WP_017375836.1|57868_58072_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243203.1|58165_58960_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	2.5e-36	35.9
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WP_081000017.1|64804_65056_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_048875857.1|65456_66431_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	2.2e-26	31.5
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67908:68422	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013946|72592:128586|DBSCAN-SWA
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MRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
>NZ_CP013946|72592:128586|102767_103310_-|WP_027243193.1|DBSCAN-SWA
MRIYTESSGWTSWNRIDNTPDSIQSETLSRKQNADGSLQIELLIDQLYPVGKIELTFDENYIPPFQGKGATWKKITDIDADHAGRLLTVAGSSNFTIDAGAKAGSTRTNDHTLSIDEMPEHNHGIPNESAIQRGGADVGVVTPTTTNKSNDYTFNTGGGKPHSHDLDPARSGVIVWERTA
>NZ_CP013946|72592:128586|123733_124462_+|WP_017377694.1|transposase|DBSCAN-SWA
MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_144420837.1|73462_74395_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377511.1|74424_75153_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_017377512.1|75155_75428_-	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377511.1|76278_77007_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_144420838.1|77062_77683_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|78831_79560_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_144420839.1|79755_80682_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377667.1|81351_81522_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_146619477.1|81666_81960_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036815609.1|83824_84280_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036816769.1|84523_84922_-	putative toxin-antitoxin system toxin component, PIN family	NA	NA	NA	NA
WP_047927763.1|84918_85182_-	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243210.1|85595_86330_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.9e-36	42.2
WP_017377525.1|88209_89007_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275471.1|89547_90522_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.3e-26	31.2
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WP_048876214.1|91293_92022_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.1e-38	42.6
WP_017377521.1|92530_92884_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|93811_94540_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_027243190.1|95122_98467_+	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876213.1|98775_99666_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275473.1|100904_101081_+	carbon storage regulator	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	1.7e-06	46.0
WP_027243191.1|101197_101905_+	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	1.2e-34	40.0
WP_048876212.1|101858_102737_+	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243193.1|102767_103310_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876211.1|103581_104286_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.9e-10	31.7
WP_036772541.1|104297_105026_-|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	5.4e-38	42.2
WP_051929563.1|105055_105445_-	recombinase family protein	A0A219Y912	Aeromonas_phage	1.1e-10	40.0
WP_017375910.1|105467_106196_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_036815979.1|106198_106807_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-10	34.6
WP_155046641.1|106987_107152_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420841.1|107178_107403_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243184.1|107395_107734_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052133264.1|107747_108152_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375840.1|108196_108415_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275474.1|109383_110496_+	replication initiation protein	A0A218MNI2	uncultured_virus	2.1e-25	29.8
WP_017377655.1|110837_111083_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_017377656.1|111079_111466_+	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_036772434.1|111553_112282_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	9.3e-38	42.2
WP_080963659.1|112260_112881_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_017377658.1|113226_113913_+	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_082304501.1|114862_115225_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212146.1|115227_116967_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046629.1|117368_117521_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051929558.1|117548_118232_-|transposase	IS5 family transposase	Q1MVF0	Enterobacteria_phage	5.1e-22	33.3
WP_036771347.1|118313_119291_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_081000019.1|119366_119537_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048876210.1|119577_120306_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	4.6e-37	42.2
WP_036771293.1|120851_121118_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036772437.1|121413_123312_-	DUF1561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|123733_124462_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.1e-38	42.2
WP_080999960.1|124529_124682_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046630.1|125098_125263_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375754.1|125283_126570_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771359.1|126752_127481_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.5e-37	41.7
WP_036771347.1|127608_128586_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP013946|163497:168428|DBSCAN-SWA
ATTGCCTAGACGTGCGAAACAGATTTGCTGTTATGCCGGATGTCATAACACAACCTATGCACGCTACTGCGAATACCACGAACAACACGGCAATCGATACCATGCCCCACGTAAGACAACAGCCCAGCGTGGCTATGGGGGGCGGTGGCAACGTGAACGTAAGATATTTTTACAAGATCATCCACTGTGCAAGCAGTGCTTACAAGATGACAAATTAATCCCAGTGACTGAAGTGGATCACATTAAACCGCATGATGGTGATCATGATTTAATGTGGAACCAACGCAATTGGCAAGCGCTGTGTAAGCCCTGTCACTCACGTAAAACAGTGAATGATGATGGTGGCTTCGGTCGTAAAAGATCACCCCAGGGGAGGGGTATATAAAATGTCTATGACCTTTATTTCCTGACCACCCGCCTAGTCGAATTTTTACGCATGCGAAATTAGAACTAAAAACTTGGAGGTTTTTGATGTCGAGAATGAGAGGTCAAGGCAGAAAGCCAAAACCAACAAAAATTAAGAAAATTACAGGGAATCCTGGATGTAGAAAACTAAATGAGCATGAGCCAAAACCACAGGATGGGGTTGCCATTTGTCCAGGTTATTTTGATGAAATAGCAAAAGGAGCCTTTGATTCAGCCGTCTCTGATCTTGAATATATGCACATCAAAACAGCCTCTTTTCAAAAACAACTAGAAATTTATGCGAGTGCTTATTCTGACTGGCGGCAGCTATCCGCTGTCATAGAACAAAAGGGCCGTACGTTTGAAACGACGACGCAAGCCGGGGATACCATGTACCGCAGCCGCCCCGAAGTGGCTCAACGCAATGAAGCCTGGAAACAAGTCAAAGCCTCATTAAGTGAGCTTGGATTAACACCAACCGCGATTAGTCGGCTCAATGCTCAAGTATCTAGTGCTATTGAGTCAGAGATAGATAAAATTTTGGATTAACTATGATTAAAAGCGACCCGGTAAAAACCGCCCTCACCTACTGCGATAATGTACTAAGCGGCCGCGTCATTGCCTGTGATTATGTAAAAAAAGCCTGTCAGCGTCATTTAAACGATTTAAAGTATGCTGGTGATCCCGGTTTTTACTTTGATAAAGAAGCGGCCTGTAAAGTCGTTAGATTTTTTAGTTACTGCAAACACAGCAAAGGTGAGTGGTATGGGAAGAAAATTACTTTAGAGCCTTGGCAACTATTTATTATTACTACCGTGTTTGGTTGGAGGCGTGAAGTTGATGGTATGCGGCGTTTTCGTACCGTTTATGAGGAAGTCGCACGTAAAAATGGCAAGAGTACGAAATTATCAGGCACTGGCTTGTATTTATTTTGTGCTGATGAAGAGCCGGGTGCAGAAGTCTATGCCGCGGCAACCAAACGCGATCAAGCAAAAATCGTTTTTGATGATGCGGTCAAAATGGTTAGAGCCTCTAAAGCCTTAGCTTCTCGCATCGGTATTTATAAAAATAATATGCATTATCCCAAGGATTTACCGAATAATAAGTTTGAACCGTTATCGAGCGATAGCCAGACACAAGATGGCTTAAATGTGCATAGTAGTATTGTAGATGAGTTGCATGCCCATAAAACCGGCGATTTGTGGCGGGTATTAGAGACGGGCACCGGCTCCAGGCGTCAACCGTTGCTGTATGCGATTACAACCGCCGGCTTTGATCAGACGGGGATTTGTTATAGTTTGCGTGATTATGCGGTTAAAGTGCTGGAAAATATCATTGAAGATGATACCTTTTTCGGCATTATTTACACCCTCGATAAAGAGGACGATTGGACAGACGAGCGTGTTTGGATCAAAGCCAATCCAAATTTAGGCATTAGTAAAAAGCTTGATGACATGCAACGCCAGTGCGTAAAAGCTCAACAAATGAAGGGTGAACGCAATGGCTTTTTATGTAAGCATTTAAATATCTGGACGAATGCCGAAACCGCTTGGTTAGATTTAGAACGCTGGAAAACTTGCGCTGAATATACCTTTAAACGTGAATCACTGGAAAATCGGCCCTGTTATATAGGTCTGGACTTAGCCAGTACCAACGATATCGCCGCCTTAGTTGCGGCTTTTTTAATGCCAGATGATTCAGTACGTTTATTTTGTCGCTTTTACTTACCTAAAGAAACCGTAATGACTCGAGCCAAGCAATCCCCCGTGCCCTATCAGCTATGGTCAGATGAGGGCTATTTAACCCTCACTGAGGGTAATGTGATCGATTACAACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACATATATCAAAGACGATATTTACCAGCTCAATAAAGAATTTGATGTGAAAGAGATTACTTATGACCCGTGGAATGCCACCCAGCTGGCCAATGATTTACTCGAAGAAGGCGCGAATATGGTGGAGTTTCGCCAAGATTTTAAGTCCATGACCCCAGCATTAAAAGAACTTGAGCGCTTGGTAATTTCAACAAAGCTCCATCATAACAATAACCCCGTGTTGAACTGGATGGCCTCGAATTTAGTCGTTGTTGAAGATGATGCGGGGAATATGAAACCTTCTAAGCGTAAATCCACAGAGAAGATTGACGGTATGGTGGCCATTGCGATGGCCGTCGGGCGTTTAATTGCTGGGGAAGATCATAATTCGATTTATAACGAGAGAGAACTGCTCATTTTATGAAGTTATTTAAACGCTGGTTTGGTGCGGCAACGGAGCTTGAGCCAAGTAGCGAATATGGTGGTTATGAGCTTTTAGATACTGCGCCCATGAGTGCCAGCGGTCAAAGCATCCACCCCGATAATGCCATGCGCTTAGCAACGGTTTATGCCTGCATTCGTGTATTAGCCGAATCGATTGCGGCTTTGCCTTTGCATGTGTATCGCTATGAAACAGATGGTGGTAAAGCCTTGGCTACAGATCACCCGTTATATTCTGTCTTGCATGATCTGCCGAATGGTGAAGTGACTAGTTTTGATTTACGTGAAAACCTCGTCGGCCATTTATGTTTACGTGGTAATGCCTATTGTCAGATTATTCGCGATGGTGCAGGGCGGGTACGTGAATTAATCCAACTGCCCACTGATAACACCAGCGTCCGCCGTGATGAAAAAACTAAAAAGCTCATTTATAGGCACTGTTGCGAAAAGTTATAGGGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGTTCGCGGCCTTAGAATGAAGCCGCCAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGGGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACTGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAATTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCATGTTTATCGACATTCACAATACGTGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGATGTCGACTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP013946|163497:168428|166509_166896_+|WP_087910668.1|portal|DBSCAN-SWA
MSASGQSIHPDNAMRLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETDGGKALATDHPLYSVLHDLPNGEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDNTSVRRDEKTKKLIYRHCCEKL
>NZ_CP013946|163497:168428|165988_166423_+|WP_047927581.1|DBSCAN-SWA
MCKIPTEVATLTYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQDFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVAIAMAVGRLIAGEDHNSIYNERELLIL
>NZ_CP013946|163497:168428|166933_167668_-|WP_036771649.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRHQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRIVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAASF
>NZ_CP013946|163497:168428|163497_163881_+|WP_027242929.1|DBSCAN-SWA
MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLQDDKLIPVTEVDHIKPHDGDHDLMWNQRNWQALCKPCHSRKTVNDDGGFGRKRSPQGRGI
>NZ_CP013946|163497:168428|163967_164450_+|WP_075278733.1|terminase|DBSCAN-SWA
MSRMRGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDGVAICPGYFDEIAKGAFDSAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSAVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKASLSELGLTPTAISRLNAQVSSAIESEIDKILD
>NZ_CP013946|163497:168428|164452_165784_+|WP_048876205.1|terminase|DBSCAN-SWA
MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYAGDPGFYFDKEAACKVVRFFSYCKHSKGEWYGKKITLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALASRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDSQTQDGLNVHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIEDDTFFGIIYTLDKEDDWTDERVWIKANPNLGISKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKTCAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWSDEGYLTLTEGNVIDYNRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP013946|163497:168428|167714_168428_-|WP_048876202.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTALLQKI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_027242929.1|163497_163881_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	9.5e-26	45.5
WP_075278733.1|163967_164450_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	Q9B019	Phage_GMSE-1	8.1e-14	33.3
WP_048876205.1|164452_165784_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	6.1e-112	46.3
WP_047927581.1|165988_166423_+	hypothetical protein	E4ZFM0	Streptococcus_phage	1.3e-26	45.8
WP_087910668.1|166509_166896_+|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	2.1e-25	50.0
WP_036771649.1|166933_167668_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	42.6
WP_048876202.1|167714_168428_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.2e-11	31.2

4. NZ_CP013947

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	2595 : 16033	18	unidentified_phage(33.33%)	terminase,transposase,capsid,tail,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013947|2595:16033|DBSCAN-SWA
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MFKTLKRSVLVCVIPVLSSSLLITSAYATCYVDYKNSSENTWNITLKNLEGDTAHIYCPNKTLGYKESCTFPVNPGDSVSVGFSHTAGMIKAYISFSSTINGHSESLNDLLVEAIDDHCPEIYYNDSVPYGITLNKPSIGNVIFAPYSENESTLNKFSKINFEADTNKKFS
>NZ_CP013947|2595:16033|13182_13398_+|WP_144420855.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MTEGESHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016211078.1|2595_2949_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	6.5e-13	34.8
WP_081323805.1|3125_4100_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	3.7e-26	31.4
WP_027242954.1|4632_4998_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242953.1|5142_5397_+	addiction module toxin, HicA family	NA	NA	NA	NA
WP_080963620.1|5380_5737_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	1.7e-16	36.4
WP_036771330.1|5834_6809_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_027242951.1|7434_8301_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242950.1|8513_8897_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.3e-26	46.3
WP_027242949.1|8983_9466_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	Q9B019	Phage_GMSE-1	3.6e-14	34.0
WP_027242948.1|9468_9654_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	9.0e-06	47.3
WP_036771330.1|9673_10648_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_075275490.1|10744_11137_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	7.0e-24	45.0
WP_027242946.1|11172_11754_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|12134_13109_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_144420855.1|13182_13398_+|head,tail	phage head-tail connector protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242945.1|14201_14717_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242944.1|15062_15620_+|tail	tail assembly protein	K7PGY0	Enterobacteria_phage	7.9e-21	36.2
WP_027242943.1|15616_16033_+	hypothetical protein	A0A2R3UA88	Siphoviridae_environmental_samples	2.2e-20	41.7