Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013995 | Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,RT,cas14j | 0 | 1 | 6 | 0 |
NZ_CP013994 | Enterococcus faecium strain 6E6, complete genome | 1 crisprs | csa3,cas14j,cas3,DinG,RT,DEDDh,cas2 | 0 | 0 | 12 | 0 |
NZ_CP013996 | Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed2, complete sequence | 0 crisprs | csa3,RT | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013995_1 | 358139-358267 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013995_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP013995_1
>1.1|358163|18|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder TTATCAACGTTTTGGCAC >1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder GCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTG |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013995_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013995_1 >merge|NZ_CP013995|1|358139-358267|CRISPRCasFinder GGTATGATTTTCATACCCTCTGATTTATCAACGTTTTGGCACGGTATGATTTTCATACCCTCTTGAGCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTGGGTATGATTTTCATACCCTCTGAT >NZ_CP013995|1|1|358139-358267|CRISPRCasFinder GGTATGATTTTCATACCCTCTGAT TTATCAACGTTTTGGCAC GGTATGATTTTCATACCCTCTTGA GCCCCAAGGGATTCAGCGTCTGATTTTTCGTCGAGGGTG GGTATGATTTTCATACCCTCTGAT
>NZ_CP013995.1|WP_002323647.1|356498_356831_-|hypothetical-protein MSYTGILSLKDICHYGKRCTATEKITKKLSTGQSKTVVQCKKYIIQKDKVSEEMIYYIGKQKQIILKDPIPLKELYPTIKHVYDQNGVLIGRRKNGVLRCTAKGMGRLIG >NZ_CP013995.1|WP_002295674.1|355538_355880_-|DUF5406-domain-containing-protein MKNYDPNIRLGTHTIKVSFQRWDYKGFVTFRRGGNCKGLDVLALDEDDLYDQTLTDNPIGFGLLPEDDEGNEWFKMTLMNDNGDELSVEDTWSYLSDYIVSFEIIEFVADKEE >NZ_CP013995.1|WP_002297404.1|354051_355302_+|IS110-family-transposase MKLFVGIDVSSEKLDVCFLTDDNQLSILSEISVANDIEGASFIRETILEFNDSYHFDQIVIGMESTSMYSFHPSMFFHEDEKLKKLNTLVTIENPFRVKQFSRMFDENKTDRNDALRIADFLRIQRFTTSPIKEEKYMALQRLTRTRYQLIKQLIRTKQHFLENLTYKCNTLAREMRDESTSLFSATLISLMTEDFTLDELAELPLEAFCDLLQEKGKGRFKQPEKIAKAIQRAITMSYRLGALAQESINVVLSVLVREIRALEKNIKELDKAIEQVIVVIPEYQCLTSIPGVGKVYAAGLIAEIGQIERFEDQTKLAKYAGLSWKVNQSGNYQSQNTPLTKQGNRYFRYYLVEAANSVKNYLPEYKAFYQSKYKEVPKHQHKRALVLTARKFTRLVDTLLRKHQLYTPPRSVIEK >NZ_CP013995.1|WP_002295673.1|353402_353642_-|hypothetical-protein MARPVLEAMDMDTLTKGRYVQLLARGYSPKEVFKALSKGTDMEKERLRKEFDYWRTHNGIKDLKPARPVIKRKKKITQD >NZ_CP013995.1|WP_002295672.1|353126_353336_-|hypothetical-protein MNYEEIENRKKVSKEMEEKLLKTMKQKHLKRLSVAQYINDMQLTGKEKACLLGSMKNFEQLRRTYRIHF >NZ_CP013995.1|WP_002336710.1|352395_353067_-|class-A-sortase MKKWLFGFLGVTLIVFCSVFGYVSYQKHEGEVFKQNIEKKMPVDQINAHAKSYKEDATNVNNDMSLGQMLSIQKEAIEMGVNKQVFAQIQIPALGLALPIFKGANQYTLSLGAATYFYEDAEMGKGNYVLAGHNMEMPGVLFSDIQKLSLGEVMDLVSNDGVYRYKVTRKFIVPGYFKLIDGVPEENSFLSLPKKGEKPLLTLFTCVYTSQGKERYVVQGELQ >NZ_CP013995.1|WP_010729784.1|350366_352343_-|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein MAINRYVKKAGMLVGMLGIIAGCFQGYQVHAEDVTQKTPPEKVNITVHKLMYDQGTQLNVDIDGIKNDGYTHDQYPTGVTKYNKADYGDVEFTLGNITDQVLPREDSDLTNAKVDEIVQDVEDKGSNSEYVKNATNKITSAVDENGEITFTDQPAYVNSKGNVYVVYESKSAAGLVTQKAKPMVVIAPMTDKTGSGFLKNIHLYPKNIVSKLSFELTKFGDDGADQSKQTLLKGAKFELYKGEPGKGTKLGDLVSDDQGKLTATDLTLGKYYFVEVPSEVVVGSDQEPTADQYLLGADARNDAHNKLTFEITNDGVTSDLKASYVNYKAPVIDKTVTNGTGQEHSFQIGDAVNYQGTIHIPTDIAGGADGITVNGVKSETSPYSVFKWGDTAGKGLSYVAEKADIKVTNNDGSVVLKENTDYKIENSDSGFVIDFIVNNGQVSDTVANLHGQDLKMTYNMFVNDSAEIANPLTNSVDFVYNNNPFNQEEHHEKTKADVVTYGAKFLKVDSGLFGTGIKATPLEGAEFAAKNAEGKYYGGLTDTDKDGVKEAVWVDDVANAAILKSDKEGHFEITGLTEGDYSLEETKAPENYQKLTKEISFKVDKDSYKEENRITIKNNQKASVPMTGSNGFQSYVLISCLLLGAGGLSAVVYFKKKA >NZ_CP013995.1|WP_010729785.1|349598_350354_-|class-C-sortase MIIRKPPKRRVMHKLMIFFWLLSAVAVYLIPVVETNVAKFQQQQRILAIENLEKTDSSLDVAKIELGDPVGVLTIPSISLKLPIYDGTSDKILENGVGITEGTGDITGGNGKNPLIAGHSGLYKDNLFDDLPSVKKGQKFFIKVNEEQHAYQIYRIEEVKAEELQKNYLDYLMPEKDQDRITLMTCTPKGVNSHRFLVYGERVSFSKEDLKLQKKAKNRKSISLDWRLALLFAFFCVPIIFIYKKIRRRSE >NZ_CP013995.1|WP_002350398.1|348777_349602_-|hypothetical-protein MNKRKWLFVCVAALFSTVAYSQLSFADSSDSSTTQTIDNSITAPSETDSSENTTEETADSNISFTESTNPTSESSSETSEKPQDVEDTQVIKQAIHIQKIISSNQINNQGSQVAQQEGINGAKFIVYDITNILEEMSQDDNEKNQSVEIIESKLKDRAKKLSYDQLKKVAEGETKTIDDQEGVIEFSIEVPANKKQAYYIVNESSPENISNSEDIVLLTPVSNEKGEFLTDVWLYPKSEKSEPKEEIKKVVSTGVKKNFFENCWEFFAQLFFDN >NZ_CP013995.1|WP_025481135.1|346377_348489_-|isopeptide-forming-domain-containing-fimbrial-protein MEGIMENKIHCTTGRVITLVLFLFLLLFARGTAVQALEKVDPSQIKENNNLVLYHDSDSLRNIEVTGINGFKILDEYSTKKQKVLAWPKVKDLKSTSKIVAHYQKVGTYLGKEIDCDVTFSNFVAHAGVNQDGLAKTINGKKYYNYLLFDKNIYRGFFMQSINVMNAKLEFKYAGTKTKVALSEPQPEIQSKMRSMRAAGIDLNDTFLSIYSLNGQYQQRVSWYNDNNESVGERNIDMREFVGYEKMGSLPYFVTTDTACAEYKAPALSTNNLTSKVVGGRAEKAYSSNDHFTDVVGADTYHRSGVTYTLQGASPTFMIGANTNSMMFSFDTALLWTPQPSKPTKEVFNKANTEEAAHNIDKKVIPQGSDVYYHIHQKFDALTVNTMNKYKSFKITDTFDSKNFDMVSDGKNYDGALWYVEANGTWKKADTGGKLTVSGNTVTYTASDSFLANAANYGRDYILQLHMRAKNDAKGIAPNVATVTFNNDPNKGTQKTNTVENYFSLKPNKKVEQDGKDVDGRNDGKKGTPTAPLNAGSEVQYLVTQKWHTKGVDIASDHYKQFSIQDPVEDRLTYKEGSARVIDMSTGKDITSEGTLTYDSNSRTLKWEASADFLSKNLLDGREIQLIFTAKTPLNEELDIDNQAKVSVESIEKATNVVTIGVKPNLPQIIVPKTGSNHLVLTVIGSILFLTLASLGYVVLKLK >NZ_CP013995.1|WP_002348857.1|360046_360241_+|hypothetical-protein MMGFFLRFYIIELTGRLTVFFGNFAIKPFAEVTAHYICKWLDCKNKIKKVFHYISSSPCQIRPG >NZ_CP013995.1|WP_002323589.1|360947_362096_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MEQLKAYKFRIYPTEEQEIFFAKSFGCVRKVYNLMLDDRKKAYEEVKNDSSKKMTFPTPAKYKKEFPFLKEIDSLALANAQLNLDKAYKNFFRDKSVGFPRFKSKKNPVQSYTTNNQNGTIALIDSKFIKVPKLKSLVRIKLHRQPKGIIKSATISRHSSGKYYISLLCKEEIIELPKTNSTIGIDLGIMDFAILSDGQKIDNNKFTSKMEKKLKREQRKLSRRALLAKNKGTNLFEAKNYQKQKRKVARLHEKVMNQRTDFLNKLSTEMIKNHDIICIEDLNTKGMLRNHKLAKSISDVSWSKFVTKLQYKADWYGRKIIKVDKWFPSSQICSECGHKDGKKSLEIREWTCPVCHTHHDRDINASINILTEGLRLHSMGLA >NZ_CP013995.1|WP_002287522.1|362112_362517_-|IS200/IS605-like-element-ISEfa4-family-transposase MELDTNNHSVFLLYYHLVLVTKYRRQVIDDEISDYAKTTFERISESYHITLVEWNHDKDHVHIMFKAQPKTELTKFINAYKSASSRLIKRDFPRVKQFLWKEMFWSKSFCLLTTGGAPIDVIKKYIQNQGNNHK >NZ_CP013995.1|WP_002323399.1|362875_363130_+|hypothetical-protein MGKELKVRKIGNSVGVILPSSLGLKSGDIIQAKQEGNLFILDTTQIAKEHDRKLIEESFQDFEKGLTVSEIEMVKAFGKYGWSE >NZ_CP013995.1|WP_002290394.1|363130_363448_+|type-II-toxin-antitoxin-system-RelE/ParE-family-toxin MKEYTLVYSKSFQTSLETIIEEWENELALSPASIKRFVGAIQKALELTKNFPTMHEEVSEIYGMDIPTYRIVIGKSYALFYRIDHEKKEILVGRIFQSKQMKLGF >NZ_CP013995.1|WP_002323400.1|364006_364942_+|hypothetical-protein MNILNEKRYVWFAGKKYITTFKRLSELMQQTVKSAMPEGYKFNFVQSSVSTESIYFSILSESRLFHFRISSHVKKTDVDIYTFRTNNYKNLNDLSRSISEYLKGNSYLKIRFSHILILLPYLNENFTLIQVDKSFIASGNQGNMNITSNKTSRVLLALMGYGILYRDDQNGQILINRAGRSLLMKYRKFIPEDFQNLQLENMRLEDLFRLAEDDKYRFEVLKIQKNELLNKLYPENAIKAHFGDANHMYSWFIPKRFRGKINAGDQVKVLNRNSTDVVMITDIYVEDEDIIKYMKPVIKLVNKNKGTRGAS >NZ_CP013995.1|WP_002287522.1|366248_366653_+|IS200/IS605-like-element-ISEfa4-family-transposase MELDTNNHSVFLLYYHLVLVTKYRRQVIDDEISDYAKTTFERISESYHITLVEWNHDKDHVHIMFKAQPKTELTKFINAYKSASSRLIKRDFPRVKQFLWKEMFWSKSFCLLTTGGAPIDVIKKYIQNQGNNHK >NZ_CP013995.1|WP_002287525.1|366669_367818_+|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MEQLKAYKFRIYPTEEQEIFFAKSFGCVRKVYNLMLDDRKKAYEEVKNDSSKKMTFPTPAKYKKEFPFLKEIDSLALANAQLNLDKAYKNFFRDKSVGFPRFKSKKNPVQSYTTNNQNGTVALIDSKFIKVPKLKSLVRIKLHRQPKGIIKSATISRHSSGKYYISLLCKEEIIELPKTNSTIGIDLGIMDFAILSDGQKIDNNKFTSKMEKKLKREQRKLSRRALLAKNKGTNLFEAKNYQKQKRKVARLHEKVMNQRTDFLNKLSTEMIKNHDIICIEDLNTKGMLRNHKLAKSISDVSWSKFVTKLQYKADWYGRKIIKVDKWFPSSQICSECGHKDGKKSLEIREWTCPVCHTHHDRDINASINILTEGLRLHSMGLA >NZ_CP013995.1|WP_002314387.1|368867_371117_+|alpha-galactosidase MYKDNEMNIIYRSENQQFHLFNQEISYIFKISEDGKLLHLYYGENLPDNDYSHLIEMHHRPMTTYRNENDLLYSLEHLKQEFPEYGTTDFRHPAISLLQKNGSRLSDFVYQGYEVEEGKPKLEGLPATYVDNNDESKTLKVYILDSVTNVQVELLYTIYRDYPVITRSARVMNKGKDIQIIENISSLSLDLPDANYEWQQLSGAWGRERTIKSRTLQQGIQSIESTRGISSHQHNPFVTLKRKNTDENQGEAIGAALVYSGNFLIQAEVDTWDVTRLQVGINPFGFNWKLNPGEIFTAPEAILVYSSKGLNAMSQTFHQLFRKRLARGKWREKDRPVLINNWEATYFDFDEEKLVNIAKKAFDVGIELFVLDDGWFGERENDCAGLGDWHVNPKRLPRGIGSLSEKIRSFGMKFGLWFEPEMVNKDSELYRTHPNWIISTPNRKPNHGRNQYVLNFGLDEVVENIFDQMCKIIDESNLDYIKWDMNRPLTDVFDSHLSADQQGEVFHRYVLGVYRLYEKLITKYPNILFESCSSGGGRFDPGMLHYAPQAWASDDSDAIERLKIQYGTSMLYPLSSIGAHVSIVPNHQTNRITPIKTRGNVAFFGAFGYELDLNELSEGDLRIVKEQIAFYKKYRTIIHNGTFYRLLSPFDDDNQTAWMVVSHDKKTAIVAHYKTLNEVNAPYRRLKLKGLDNDGLYNVGQNSLRSGMELMRAGLVCSDASSGQINDQNRRPETFDFDSKIWVITQEEK >NZ_CP013995.1|WP_002336205.1|371119_372295_+|MFS-transporter MNNQKSLLQKGAILSISLMLTSSQAINGVIPQMKQSLGISQSQSELLGTAPSITVILFILLSSYFAKRIGMKKTIILGLLLAGIGGIIPVFTATFQTVLISRVILGAGLGVYNSLAVTYISSLYSGNTRATLLGIRNSMEALGQTILIFLAGVLVNINWTASFLVYAIAFPVALLFALKVPEIRDENSDIPENHVKEKMNPMVFALVLFAILLVMNSIAISVRFASIATEIKGVNFNASNYLALMPILGILAGFMFGPINKWIGKGTLYLGIIFFIISNLLIAVSNGNMTFLLTGLFLSSITGSWCFPFIFSNLDKVTTKNTINFATSLIFIGCNIGNFIAPIAMQLAQFLTRSTNLTAPFFVFAGIFIVILFVTFFATNKKNTRVTRGAS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP011282 | Enterococcus faecium strain E39 plasmid p1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP025426 | Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence | 221216-221254 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | LT603679 | Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 2 | 452-490 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP018832 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence | 244126-244164 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP040369 | Enterococcus faecium strain VB3240 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP043485 | Enterococcus faecium strain DMEA02 plasmid pDMEA1, complete sequence | 27883-27921 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP020485 | Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed1, complete sequence | 96547-96585 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP041262 | Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence | 454-492 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP012385 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 1, complete sequence | 95092-95130 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP013995 | Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence | 358205-358243 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP014450 | Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence | 119937-119975 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP018073 | Enterococcus faecium strain VRE001 plasmid unnamed3, complete sequence | 111370-111408 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP027518 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP027498 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP027507 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004055 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP027502 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135298 | Enterococcus faecium isolate E7429 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135288 | Enterococcus faecium isolate E7199 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135333 | Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 3 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135340 | Enterococcus faecium isolate E7356 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP046076 | Enterococcus faecium strain VRE plasmid p5_03A17012, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | MT074686 | Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP025756 | Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence | 126934-126972 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP027513 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004028 plasmid unnamed1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135244 | Enterococcus faecium isolate E6988 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135279 | Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135783 | Enterococcus faecium isolate E4239 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135294 | Enterococcus faecium isolate E7237 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135255 | Enterococcus faecium isolate E7098 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135236 | Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135198 | Enterococcus faecium isolate E6055 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135259 | Enterococcus faecium isolate E4457 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135182 | Enterococcus faecium isolate E1774 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135365 | Enterococcus faecium isolate E8195 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135220 | Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135415 | Enterococcus faecium isolate E8328 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135395 | Enterococcus faecium isolate E8290 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NC_021987 | Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence | 107198-107236 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135409 | Enterococcus faecium isolate E8284 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135352 | Enterococcus faecium isolate E8014 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP050649 | Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 ALE plasmid pBIOPOP-3_ALE | 91402-91440 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP044265 | Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR134106 | Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP018129 | Enterococcus faecium strain A_020709_82 plasmid unnamed1, complete sequence | 17089-17127 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP023805 | Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04619.3A isolate isolate plasmid pER04619.3A.1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP035221 | Enterococcus faecium strain SRCM103470 plasmid unnamed1 | 86167-86205 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_AP019409 | Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NC_020208 | Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence | 61653-61691 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP034948 | Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence | 5084-5122 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP016164 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_11 plasmid ISMMS_VRE11_p1, complete sequence | 177278-177316 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP018827 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence | 244126-244164 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | LR135186 | Enterococcus faecium isolate E4413 genome assembly, plasmid: 2 | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP012461 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence | 192113-192151 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP023795 | Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04484.3A plasmid pER04484.3A.1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_MG674581 | Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP023781 | Enterococcus faecium strain Efaecium_ER03933.3A isolate isolate plasmid pER93933.3A.1, complete sequence | 453-491 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LT598664 | Enterococcus faecium isolate Ef_aus00233 plasmid 2 | 168263-168301 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP027401 | Enterococcus faecium strain FDAARGOS_323 plasmid unnamed, complete sequence | 109448-109486 | 1 | 0.974 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR135175 | Enterococcus faecium isolate E4402 plasmid 2 | 453-491 | 1 | 0.974 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_LR134096 | Enterococcus faecium isolate E1334 plasmid 2 | 453-491 | 1 | 0.974 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP042833 | Enterococcus faecium strain FA3 plasmid unnamed1 | 47629-47667 | 1 | 0.974 |
NZ_CP013995_1 | 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder | 358205-358243 | 39 | NZ_CP012367 | Enterococcus durans strain KLDS 6.0933 plasmid unnamed 1, complete sequence | 3358-3396 | 4 | 0.897 |
1. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011282 (Enterococcus faecium strain E39 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025426 (Enterococcus faecium strain SC4 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to LT603679 (Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018832 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040369 (Enterococcus faecium strain VB3240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043485 (Enterococcus faecium strain DMEA02 plasmid pDMEA1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020485 (Enterococcus faecium strain CFSAN059070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041262 (Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012385 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0930 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013995 (Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014450 (Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018073 (Enterococcus faecium strain VRE001 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027518 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027498 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027507 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004055 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027502 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135298 (Enterococcus faecium isolate E7429 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135288 (Enterococcus faecium isolate E7199 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135333 (Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 3) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135340 (Enterococcus faecium isolate E7356 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046076 (Enterococcus faecium strain VRE plasmid p5_03A17012, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to MT074686 (Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025756 (Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027513 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135244 (Enterococcus faecium isolate E6988 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135279 (Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135783 (Enterococcus faecium isolate E4239 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135294 (Enterococcus faecium isolate E7237 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135255 (Enterococcus faecium isolate E7098 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135236 (Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135198 (Enterococcus faecium isolate E6055 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135259 (Enterococcus faecium isolate E4457 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135182 (Enterococcus faecium isolate E1774 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040905 (Enterococcus faecium strain N56454 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041256 (Enterococcus faecium strain 515 plasmid p26, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019209 (Enterococcus faecium strain 2014-VREF-41 plasmid p41-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017798 (Enterococcus faecium strain E243 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135429 (Enterococcus faecium isolate E8927 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135436 (Enterococcus faecium isolate E8691 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135483 (Enterococcus faecium isolate E4456 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135204 (Enterococcus faecium isolate E7171 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135180 (Enterococcus faecium isolate E0595 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135227 (Enterococcus faecium isolate E7025 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135489 (Enterococcus faecium isolate E8414 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135365 (Enterococcus faecium isolate E8195 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
48. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135220 (Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
49. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135415 (Enterococcus faecium isolate E8328 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
50. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135395 (Enterococcus faecium isolate E8290 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
51. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NC_021987 (Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135345 (Enterococcus faecium isolate E8202 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
53. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135325 (Enterococcus faecium isolate E7654 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg CRISPR spacer gccccaagggattcagcgtctgatttttcgtcgagggtg Protospacer ***************************************
54. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135358 (Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135409 (Enterococcus faecium isolate E8284 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135352 (Enterococcus faecium isolate E8014 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050649 (Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 ALE plasmid pBIOPOP-3_ALE) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050651 (Enterococcus faecium strain BIOPOP-3 WT plasmid pBIOPOP-3_WT) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135385 (Enterococcus faecium isolate E7933 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044265 (Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135318 (Enterococcus faecium isolate E7663 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134106 (Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135373 (Enterococcus faecium isolate E8172 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP006031 (Enterococcus faecium T110 plasmid pEFT110, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011829 (Enterococcus faecium strain UW8175 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR132068 (Enterococcus faecium isolate E0139 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019395 (Enterococcus faecium strain QU 50 plasmid pQL50, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LN999988 (Enterococcus faecium isolate EFE11651 plasmid II, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033042 (Enterococcus faecium strain Enterococcus faecium JE1 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025687 (Enterococcus faecium strain CBA7134 plasmid pCBA710401, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040741 (Enterococcus faecium strain VRE1 plasmid pVRE1-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014530 (Enterococcus faecium strain E745 plasmid pl1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023424 (Enterococcus faecium strain K60-39 plasmid pTT39_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022342 (Enterococcus faecium strain KUHS13 plasmid pKO1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040877 (Enterococcus faecium strain HB-1 plasmid punnamed, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032307 (Enterococcus faecium strain HY07 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040704 (Enterococcus faecium strain HOU503 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044275 (Enterococcus faecium strain V2937 plasmid pHVH-V2937-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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79. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017793 (Enterococcus faecium strain E240 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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80. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019993 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-268 plasmid p268-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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81. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035655 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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82. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023790 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04462.3A plasmid pER04462.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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83. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023800 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.5A plasmid pER04526.5A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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84. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035137 (Enterococcus faecium strain SRCM103341 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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85. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035661 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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86. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035667 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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87. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NC_017963 (Enterococcus faecium DO plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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88. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035649 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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89. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040850 (Enterococcus faecium strain F17E0263 plasmid p_unnamned1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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90. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042840 (Enterococcus sp. DA9 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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91. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135171 (Enterococcus faecium isolate E4227 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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92. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135192 (Enterococcus faecium isolate E4438 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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93. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041271 (Enterococcus faecium strain VVEswe-S plasmid pVVEswe-S1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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94. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037956 (Enterococcus hirae strain CQP3-9 plasmid pCQP3-9_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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95. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135308 (Enterococcus faecium isolate E7240 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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96. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040237 (Enterococcus faecium strain VB3025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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97. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018066 (Enterococcus faecium strain E1 plasmid pE1_230, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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98. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023809 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04526.3A plasmid pER04562.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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99. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033207 (Enterococcus faecium strain RBWH1 plasmid pRBWH1.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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100. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018129 (Enterococcus faecium strain A_020709_82 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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101. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023805 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04619.3A isolate isolate plasmid pER04619.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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102. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035221 (Enterococcus faecium strain SRCM103470 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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103. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019409 (Enterococcus faecium strain SMVRE20 plasmid pSMVRE20L, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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104. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NC_020208 (Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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105. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034948 (Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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106. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016164 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_11 plasmid ISMMS_VRE11_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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107. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018827 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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108. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to LR135186 (Enterococcus faecium isolate E4413 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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109. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012461 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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110. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023795 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04484.3A plasmid pER04484.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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111. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_MG674581 (Enterococcus faecium strain HL1 plasmid pHLSA, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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112. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023781 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER03933.3A isolate isolate plasmid pER93933.3A.1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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113. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LT598664 (Enterococcus faecium isolate Ef_aus00233 plasmid 2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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114. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027401 (Enterococcus faecium strain FDAARGOS_323 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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115. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135175 (Enterococcus faecium isolate E4402 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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116. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134096 (Enterococcus faecium isolate E1334 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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117. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042833 (Enterococcus faecium strain FA3 plasmid unnamed1) position: , mismatch: 1, identity: 0.974
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118. spacer 1.2|358205|39|NZ_CP013995|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012367 (Enterococcus durans strain KLDS 6.0933 plasmid unnamed 1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.897
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DBSCAN-SWA_1 |
2318 : 54386
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013995|2318:54386|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(40.0%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
60876 : 112511
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013995|60876:112511|DBSCAN-SWA 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49 | Bacillus_phage(20.0%) | transposase,integrase | attL 85490:85505|attR 97245:97260 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
136738 : 195231
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013995|136738:195231|DBSCAN-SWA 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48 | Streptococcus_phage(16.67%) | transposase,integrase | attL 127020:127036|attR 196868:196884 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
202396 : 257050
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013995|202396:257050|DBSCAN-SWA 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57 | Streptococcus_phage(42.11%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
279556 : 305854
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013995|279556:305854|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013995|279556:305854|290321_290561_-|WP_002299886.1|DBSCAN-SWA MNYEEIENRKKVSKEMEEKLLKMMKQKHLKRLSVMQYINDMKITGKEKACLLGSMKNFEQLRRTYVKTGSNCQLLLEVS >NZ_CP013995|279556:305854|299102_299393_-|WP_000026576.1|DBSCAN-SWA MSINTFVYSHPINVYIIKNLGITVEQFCELYAYPQGTVASWITRQRRIKSLPASFVYDLSLASSLNMSDVYEKLLSLEKEYDSFKIKHDKKIKKHI >NZ_CP013995|279556:305854|289505_290195_-|WP_002299887.1|DBSCAN-SWA MNKNNKTLFNPYVGVIIVFLLFSYFAYQGYQKDKIAEKVDGVTKTIHIQEQAKTYQDNLTSLTDISKRQLITNQKQALEKDLKGEIAGKLVFSSTGFILPVFQGANSDTLSLGVASTYYLDTEMGNGNYILAGYNVDTPSVLLSDMTDLSEGEEIDLIDAHYKYQYEVSKRGKISDYSQVVQSKENNSFLSLPKAGKKPLLTLLAFQANNMKKCDVIQCELVNVEKINK >NZ_CP013995|279556:305854|296287_296614_-|WP_002299230.1|DBSCAN-SWA MAEDNRSQAAVSRLLGNKNKKNYKPKEVEEIELTKKNISKVIKDQGSSVRTADSIRINPILMSALKYWTTIAESDKSKPDVIEDALLKSIPEEYLIEGYKLAKKQNKI >NZ_CP013995|279556:305854|294898_295939_-|WP_002302900.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013995|279556:305854|292228_292561_-|WP_002310954.1|DBSCAN-SWA MSYTGILSLEDICHYGKRCTATEKITKKLSTGQSKTVVQCKKYIIQKDKVSEEMIYYIGKQKQIILKDPIPLKELYPTIKHVYDQNGVLIGRRKNGVLRCTAKGMGRLIS >NZ_CP013995|279556:305854|297719_298898_+|WP_059355959.1|transposase|DBSCAN-SWA MNDFTTEIVQTLVTKGDLNELFRSHLEKAINTLLRTELTAFLDYEKYDRTGFNSGNSRNGSYFRSIKTEYGELTLEIPRDRNGEFKQQTLPAYKRTNDTLETTIIHLFEKGVTMSEIADLIEKMYGHHYTPQTMSNMTKVLTEEVNAFKSRALNDKYVAIFMDATYIPLKRQTVSKEAIYIAIGIREDGTKEVLSYAIAPTESTYVWNELLQDINSRGVQEVLLFITDGLKGMKDTIHQIYPKAKYQHCCIHVSRNIAHKVRVKDRKEICDDFKAVYQANSKEEANTFLSSMIEKWKKNYPKVTQSLIENQDLLTFYDFPPSIRRTIYSTNLIESFNKQIKRYSRRKEQFQNEESLERFLVSIFDTYNQKFLNRSHKGFQQVTDTLVSMFTE >NZ_CP013995|279556:305854|303220_303493_+|WP_002303415.1|DBSCAN-SWA MLGSFKKDKEVKTRGALTPSQQNKLGTKATFHPVRDQANQKELIGVCVGFTSEKFFPIIECKIHGITTREVARKVVKWHTSQTKTNHKKR >NZ_CP013995|279556:305854|292819_294121_+|WP_002302440.1|transposase|DBSCAN-SWA 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30 | Streptococcus_phage(57.14%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
344282 : 376661
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013995|344282:376661|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013995|344282:376661|368867_371117_+|WP_002314387.1|DBSCAN-SWA MYKDNEMNIIYRSENQQFHLFNQEISYIFKISEDGKLLHLYYGENLPDNDYSHLIEMHHRPMTTYRNENDLLYSLEHLKQEFPEYGTTDFRHPAISLLQKNGSRLSDFVYQGYEVEEGKPKLEGLPATYVDNNDESKTLKVYILDSVTNVQVELLYTIYRDYPVITRSARVMNKGKDIQIIENISSLSLDLPDANYEWQQLSGAWGRERTIKSRTLQQGIQSIESTRGISSHQHNPFVTLKRKNTDENQGEAIGAALVYSGNFLIQAEVDTWDVTRLQVGINPFGFNWKLNPGEIFTAPEAILVYSSKGLNAMSQTFHQLFRKRLARGKWREKDRPVLINNWEATYFDFDEEKLVNIAKKAFDVGIELFVLDDGWFGERENDCAGLGDWHVNPKRLPRGIGSLSEKIRSFGMKFGLWFEPEMVNKDSELYRTHPNWIISTPNRKPNHGRNQYVLNFGLDEVVENIFDQMCKIIDESNLDYIKWDMNRPLTDVFDSHLSADQQGEVFHRYVLGVYRLYEKLITKYPNILFESCSSGGGRFDPGMLHYAPQAWASDDSDAIERLKIQYGTSMLYPLSSIGAHVSIVPNHQTNRITPIKTRGNVAFFGAFGYELDLNELSEGDLRIVKEQIAFYKKYRTIIHNGTFYRLLSPFDDDNQTAWMVVSHDKKTAIVAHYKTLNEVNAPYRRLKLKGLDNDGLYNVGQNSLRSGMELMRAGLVCSDASSGQINDQNRRPETFDFDSKIWVITQEEK >NZ_CP013995|344282:376661|350366_352343_-|WP_010729784.1|DBSCAN-SWA MAINRYVKKAGMLVGMLGIIAGCFQGYQVHAEDVTQKTPPEKVNITVHKLMYDQGTQLNVDIDGIKNDGYTHDQYPTGVTKYNKADYGDVEFTLGNITDQVLPREDSDLTNAKVDEIVQDVEDKGSNSEYVKNATNKITSAVDENGEITFTDQPAYVNSKGNVYVVYESKSAAGLVTQKAKPMVVIAPMTDKTGSGFLKNIHLYPKNIVSKLSFELTKFGDDGADQSKQTLLKGAKFELYKGEPGKGTKLGDLVSDDQGKLTATDLTLGKYYFVEVPSEVVVGSDQEPTADQYLLGADARNDAHNKLTFEITNDGVTSDLKASYVNYKAPVIDKTVTNGTGQEHSFQIGDAVNYQGTIHIPTDIAGGADGITVNGVKSETSPYSVFKWGDTAGKGLSYVAEKADIKVTNNDGSVVLKENTDYKIENSDSGFVIDFIVNNGQVSDTVANLHGQDLKMTYNMFVNDSAEIANPLTNSVDFVYNNNPFNQEEHHEKTKADVVTYGAKFLKVDSGLFGTGIKATPLEGAEFAAKNAEGKYYGGLTDTDKDGVKEAVWVDDVANAAILKSDKEGHFEITGLTEGDYSLEETKAPENYQKLTKEISFKVDKDSYKEENRITIKNNQKASVPMTGSNGFQSYVLISCLLLGAGGLSAVVYFKKKA >NZ_CP013995|344282:376661|375800_375941_+|WP_154591461.1|DBSCAN-SWA MADIKGLDIFGNNKGLAKIKKEAEAKKKQQAITPSENKQLGSVAKF >NZ_CP013995|344282:376661|346377_348489_-|WP_025481135.1|DBSCAN-SWA MEGIMENKIHCTTGRVITLVLFLFLLLFARGTAVQALEKVDPSQIKENNNLVLYHDSDSLRNIEVTGINGFKILDEYSTKKQKVLAWPKVKDLKSTSKIVAHYQKVGTYLGKEIDCDVTFSNFVAHAGVNQDGLAKTINGKKYYNYLLFDKNIYRGFFMQSINVMNAKLEFKYAGTKTKVALSEPQPEIQSKMRSMRAAGIDLNDTFLSIYSLNGQYQQRVSWYNDNNESVGERNIDMREFVGYEKMGSLPYFVTTDTACAEYKAPALSTNNLTSKVVGGRAEKAYSSNDHFTDVVGADTYHRSGVTYTLQGASPTFMIGANTNSMMFSFDTALLWTPQPSKPTKEVFNKANTEEAAHNIDKKVIPQGSDVYYHIHQKFDALTVNTMNKYKSFKITDTFDSKNFDMVSDGKNYDGALWYVEANGTWKKADTGGKLTVSGNTVTYTASDSFLANAANYGRDYILQLHMRAKNDAKGIAPNVATVTFNNDPNKGTQKTNTVENYFSLKPNKKVEQDGKDVDGRNDGKKGTPTAPLNAGSEVQYLVTQKWHTKGVDIASDHYKQFSIQDPVEDRLTYKEGSARVIDMSTGKDITSEGTLTYDSNSRTLKWEASADFLSKNLLDGREIQLIFTAKTPLNEELDIDNQAKVSVESIEKATNVVTIGVKPNLPQIIVPKTGSNHLVLTVIGSILFLTLASLGYVVLKLK >NZ_CP013995|344282:376661|354051_355302_+|WP_002297404.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MIIRKPPKRRVMHKLMIFFWLLSAVAVYLIPVVETNVAKFQQQQRILAIENLEKTDSSLDVAKIELGDPVGVLTIPSISLKLPIYDGTSDKILENGVGITEGTGDITGGNGKNPLIAGHSGLYKDNLFDDLPSVKKGQKFFIKVNEEQHAYQIYRIEEVKAEELQKNYLDYLMPEKDQDRITLMTCTPKGVNSHRFLVYGERVSFSKEDLKLQKKAKNRKSISLDWRLALLFAFFCVPIIFIYKKIRRRSE >NZ_CP013995|344282:376661|373702_373975_+|WP_002314366.1|DBSCAN-SWA MNNYSVMIKNSAKADLKKIKQSNLKPQFEKVIQTLKEDPYLPTQSFEKLKPTHEGRYSRRLNRQHRVVYKVDEDEHVVEIYSARTHYESQ >NZ_CP013995|344282:376661|352395_353067_-|WP_002336710.1|DBSCAN-SWA MKKWLFGFLGVTLIVFCSVFGYVSYQKHEGEVFKQNIEKKMPVDQINAHAKSYKEDATNVNNDMSLGQMLSIQKEAIEMGVNKQVFAQIQIPALGLALPIFKGANQYTLSLGAATYFYEDAEMGKGNYVLAGHNMEMPGVLFSDIQKLSLGEVMDLVSNDGVYRYKVTRKFIVPGYFKLIDGVPEENSFLSLPKKGEKPLLTLFTCVYTSQGKERYVVQGELQ >NZ_CP013995|344282:376661|366669_367818_+|WP_002287525.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MTDFKFFKADRVYNELFYQFPKVFIVSDEYKKMKDSTKIAYMLLKARLEIAISKRQIDEEGNVYFTYTTNELCRVLNCQKQKAIAIKKELESFGLLLQKQMGFNKQLGKNNPNRLYLAELKVSENDIYLLEKFDRENRENVDKSEGMKIIPTLDEKSDAESLGAQEGMKIIPCQNVDKSEGMKIIPELNNNILDTNRHNIDTEKDRLQDQLLLDNFETIMTNDSIATFVPERVLNLIKTFSSSYSEAQKTVQTIHNAKKKAEIESDISIVFEELDSYYVNAEQELYTTLLKAYQKLKTEKVENIQNLIFVYVKNWFIEKPIAAKVSSEKRLNYASSPSTITKDWLE >NZ_CP013995|344282:376661|363130_363448_+|WP_002290394.1|DBSCAN-SWA MKEYTLVYSKSFQTSLETIIEEWENELALSPASIKRFVGAIQKALELTKNFPTMHEEVSEIYGMDIPTYRIVIGKSYALFYRIDHEKKEILVGRIFQSKQMKLGF >NZ_CP013995|344282:376661|371119_372295_+|WP_002336205.1|DBSCAN-SWA MNNQKSLLQKGAILSISLMLTSSQAINGVIPQMKQSLGISQSQSELLGTAPSITVILFILLSSYFAKRIGMKKTIILGLLLAGIGGIIPVFTATFQTVLISRVILGAGLGVYNSLAVTYISSLYSGNTRATLLGIRNSMEALGQTILIFLAGVLVNINWTASFLVYAIAFPVALLFALKVPEIRDENSDIPENHVKEKMNPMVFALVLFAILLVMNSIAISVRFASIATEIKGVNFNASNYLALMPILGILAGFMFGPINKWIGKGTLYLGIIFFIISNLLIAVSNGNMTFLLTGLFLSSITGSWCFPFIFSNLDKVTTKNTINFATSLIFIGCNIGNFIAPIAMQLAQFLTRSTNLTAPFFVFAGIFIVILFVTFFATNKKNTRVTRGAS >NZ_CP013995|344282:376661|348777_349602_-|WP_002350398.1|DBSCAN-SWA MNKRKWLFVCVAALFSTVAYSQLSFADSSDSSTTQTIDNSITAPSETDSSENTTEETADSNISFTESTNPTSESSSETSEKPQDVEDTQVIKQAIHIQKIISSNQINNQGSQVAQQEGINGAKFIVYDITNILEEMSQDDNEKNQSVEIIESKLKDRAKKLSYDQLKKVAEGETKTIDDQEGVIEFSIEVPANKKQAYYIVNESSPENISNSEDIVLLTPVSNEKGEFLTDVWLYPKSEKSEPKEEIKKVVSTGVKKNFFENCWEFFAQLFFDN >NZ_CP013995|344282:376661|362112_362517_-|WP_002287522.1|transposase|DBSCAN-SWA MELDTNNHSVFLLYYHLVLVTKYRRQVIDDEISDYAKTTFERISESYHITLVEWNHDKDHVHIMFKAQPKTELTKFINAYKSASSRLIKRDFPRVKQFLWKEMFWSKSFCLLTTGGAPIDVIKKYIQNQGNNHK >NZ_CP013995|344282:376661|353126_353336_-|WP_002295672.1|DBSCAN-SWA MNYEEIENRKKVSKEMEEKLLKTMKQKHLKRLSVAQYINDMQLTGKEKACLLGSMKNFEQLRRTYRIHF >NZ_CP013995|344282:376661|374942_375800_+|WP_002292680.1|DBSCAN-SWA MVAKKYVIGNFKGGVGKSTCAQMLGFESAVNEGKRTLIIDLDMQGNTSDVMNLTHMNFTNEEGGGEGEPIVYENTVTDVLINNLPPKEAVYKVINNLYILPADMSFEMYDDWIKDQYNDSLSQFKYMKEKLEPLFDEFDVIYLDVPPSISVYSKSAMYIADWAIVVLQTQVKSMRNAMQYLEYMDFFVKEFDTNLYVAGVIPFMLESGDAVDQEMYKQAQEIYGEHLIKNVVLKNARLKRYDGSGITMEKTKKGLLKQWDRKSHELFISILKELEEHENWYAEVE |
28 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013994_1 | 278735-278844 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013994_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013994_1
>1.1|278761|58|NZ_CP013994|CRISPRCasFinder CGAAAGGAGTTTCCTTTCGAGCAAAGCGAGTAGAATCACTATGAACGAAGTGAATAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013994_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013994_1 >merge|NZ_CP013994|1|278735-278844|CRISPRCasFinder TGATGAACAATACTGGTTGAGCAAAGCGAAAGGAGTTTCCTTTCGAGCAAAGCGAGTAGAATCACTATGAACGAAGTGAATAGGTGATGAATAATACTGGTTGAGCAAAG >NZ_CP013994|1|1|278735-278844|CRISPRCasFinder TGATGAACAATACTGGTTGAGCAAAG CGAAAGGAGTTTCCTTTCGAGCAAAGCGAGTAGAATCACTATGAACGAAGTGAATAGG TGATGAATAATACTGGTTGAGCAAAG
>NZ_CP013994.1|WP_002294587.1|277817_278507_+|50S-ribosomal-protein-L1 MAKKSKKMQDALKKVDSSKVYPVAEAVALAKETNIAKFDATVEVAYRLNVDPKKADQQIRGAVVLPNGTGKTQTVLVFAKGDKAKEAEAAGADFVGDDDMVQKIQNGWFDFDVVVATPDMMATVGRLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVTKAVNEVKAGKVTYRVDKAGNIHVPIGKVSFDDEKLVENFAAIHDVLLKAKPSAAKGQYMKNVTITTTFGPGIHVDQASF >NZ_CP013994.1|WP_002291638.1|277291_277714_+|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVEKIVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGLIIPVVISVYEDRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAKIEKGSGEPNKNKVAKVSSDQVREIAELKMEDLNAANVEAAMRMVEGTARSMGITVE >NZ_CP013994.1|WP_002294585.1|276280_276949_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-beta MKDLRYRSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAARIGKIIRSIFGEQPDSVDIYLYESFAKTYRGHGTDIALVGGLLGMEPDDERLADSLKLAYEAGMEVLFVPKSEKAEHPNSVKMLLKKGTRKLSVTGISIGGGNIQISELNGFKISLSMGTPTLIVVHQDVPGMIAKVTSILSETNTNIGTMTVTRESKGENAIMIIEVDDPQVEETVKRLKQLPNIDSVNYFD >NZ_CP013994.1|WP_002294584.1|275395_276268_-|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MFLSIEELVDQAKAYPSVAELMIAVEMEMSGRSRSHIIEIMEKNLSVMEQSINEGKEGVTSVTGITGGDAKKLDDYLNEADFLSGETILKAVRNAVAVNEVNAKMGLICATPTAGSAGVVPGVLMAVRDRLDLTHEQQLEFLFTAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMAAAALVCAKNGTPHQAAQAVAITLKNMMGLICDPVAGLVEVPCVKRNALGSSQAFISADMALAGIESVIPPDEVVAAMYQVGRQMPSIFKETAEGGLAVTPTAKRLAEEILNKRA >NZ_CP013994.1|WP_002294583.1|274285_275305_+|L-lactate-oxidase MEAGAFGYIRGGSEDEWTMKENTTSFNTKKIMPRILRGIDSADLHTSVFGIELDTPIIQAPSAAQGLAHEKGEADTAKGVAAAGSIFSISTYANTTIKDAADAAPGAPQFFQLYMSKDDRFNEFILNKAVEAGAKAIILTADSTLGGYREEDVINQFQFPLPMPNLAAYSEQSASGNGEGKGIAEIYAAAKQGLTPDDIKTIKEITHLPVIVKGIQSPEDAVIAISAGADGIWVSNHGGRQLDGGPASFEVLPKIAEVVNKRVPVIFDSGVRRGEHVFKALASGADLVAIGRPVIYGLNLGGAEGVTSVFEHLNKELSITMQLAGTKTIDEVKNTKLMD >NZ_CP013994.1|WP_002294581.1|273225_274113_+|alpha/beta-fold-hydrolase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
412202 : 482834
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013994|412202:482834|DBSCAN-SWA 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58 | Streptococcus_phage(26.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
495255 : 535271
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013994|495255:535271|DBSCAN-SWA 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47 | Enterococcus_phage(34.78%) | tRNA,terminase,head,tail,portal,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
740205 : 812141
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013994|740205:812141|DBSCAN-SWA GATGGCAAAAGACTTATTACTTGAAATCGGGCTGGAAGAAATGCCTGCCCATGTTGTCACACCAAGCATGAAACAATTAGAAGAAAAAACAGCAAAATTTTTAGATGAAAACCAATTGACTTATGATACGATCGAAACATTTTCCACACCGCGCCGTTTAGCAATCAAAGTAACAAATATTCCAGAACGACAAGCGGACAGTGAAGAAGAAGTCAAAGGACCAGCCAAAAAAATTGCTTTGGACGCAGATGGAAACTGGACGAAAGCAGCGGAAGGATTTGTCCGCGGACAAGGTCTGACGACAGACGCTATCACTTTTAGAGAATTAAAAGGTGTGGAATATGTCTATGTAACGAAATACACTCATGGTAAGGAAGCAAAAGAAGTATTGACAGGCTTAGCAGGGGTGATCAAAAGTTTGACTTTCCCTGTAACGATGCATTGGGCAGAATACGATTTTGAATATATCCGCCCTATTCACTGGATCGTGGCATTGTTAGATGACGAAGTAATCCCATTCGAAATCTTGGATGTCAAAACAGGCAGAGCCTCTCGAGGTCATCGTTTCTTAGGCGAAGATGTGACATTTGCGCATGCAAAAGAATATGAAGAAAAATTGAATGAACAATTCGTCATTGCGTCTCCGCAAAAAAGACAAGAAATGATCGTTACACAAGCAAACGAATTAGCAGAAAAAAATCACTGGGTTATTGATCTAGACGAAGATTTACTAGAAGAAGTCAACAATTTAGTCGAATATCCAACTGTCTTTTCTGGCGACTTCGAAGAAAAATATCTTTCTGTTCCTGAAGAAGTACTAGTCACTTCTATGAAAGAACATCAACGTTATTTCGAGGTACGGAATGATCAAGGTATGCTGCTTCCTCATTTTATTTCTGCTCGTAATGGTGATCGGGTAAAATTGGAAGATGTGGTTCGAGGCAATCAAAAAGTATTGACGGCTCGTTTAGAAGATGCGGAATTCTTTTATAATGAAGACAAGAAAGCTTCAATCGACCAATACGTTGAAAAACTAAAAACTGTTACTTTCCATGAAAAAATCGGTAGTATCTATGAGAAAATGCAACGGGTACAAGTCATTGCCCGTATCATTGGCGAACAAGTAGGACTATCTGAGGAAGAATTGATGGATTTGCAACGAGCTGCTGAAATCTATAAATTTGATCTAGTAACCAACATGGTAGGGGAATTTCCTGAACTACAAGGGATCATGGGCGAAAAATATGCTCTTCTGAAAGGCGAGAAACCTGCTGTAGCGACAGCGATTCGTGAGCATTACATGCCTATATCCAGTGAAGGAGAGCTACCTCAGTCTACAGTAGGTTCTGTTTTAGCGATTGCAGATAAATTAGATAGCATCTTTTCTTTCTTTGCAGTTGGGATGATTCCAAGCGGGTCAAACGATCCTTATGCCTTACGTCGCCAAGCATACGGTGTCGTTCGGATCATCGAATCGAAAAAATGGGCCTTTCCTTTGTCTGTTCTGCAAGAAACGATTAGCGATGTTATCAGTAAAGATACGGATCGTTTCGGCATTGGTTTATCAGAAGGGCAACAACAAGTGATCGACTTTATCAAAGGCCGTCTGCGCCAATTATTGACAACGAAGAATATTCGTCATGATGTCATCGATGCTGTTTTGAATGCGGAACAAAAAGATCTGACAAAAGTATTTGCAGCAGCACAATTGTTCAAACAACATCTTGCAGATGAAGACTTCAAACCTTCAATGGAAGCTTTGACACGTGTCGTGAACTTAGCGAAAAAAGCGCAGCTTGAAAAACAATCAGAAGTAGACCCTGAGCTGTTCGAAAACGACGCAGAGAAAGAATTACACAAAGCAGTAGAAGCAATGAAAGCAAGTTTTGCTGACCAAACGATCCACGAAAACTACGACCAGCTTGTCGCTCTTCGTCCACTGATCGAAAATTATTTTGATCAAACGATGGTCATGGCTGATGAACCAGCAGTACGTAAGAACCGACTAACACAACTAAGTCAAATAGCTGCCATGGCTTTGTCATTAGCAAGCTTGGATCAAATCATCACAAAATAGTCTTTTGTTTGAAAAACAGAGAGCATGCACGAAACGTGCTGTGTCTCTGTTTTTTTTGTTATAAATAGCTGTTATTAATTCTATTTTAATAATTTTTGTTATTTTATTCTTTGTTCGAATTTTCAAAACGCTCATGAAAAGTGAGGAAATAAAAATGAAAACGATTAATTATAATCTTGTTACTGTTTTATTTACTTTTAAATTAGGAATTTCCCTAGTCAAAAAAACTGTATGTGGTATGATTATATAGGGAAAACCTGTTTATAAATATTTCTATGAATATATTAGTTTAATTATGCTTTTAAAATAAAAAGCGCTCATTCTGATGTGAATGAATCACATCTTTACTTATCTATCATCAATATTTAGGAGTGAATCTATGGAAAAGCCGTTCGTCAAGTTATTGGCTACTGTGGCGGTAGGCACAGGCGCTATTGTGATTTGCTTGTTTGGATACCATCTCAATAATCAGCGGCAATATCATCAACGGATCAATTACGCAGAATCTGCCATCACCAATCAAAAAGACACCGTGACCTCTTTATCAAAAGAAGTAGATAAGCTGTACAGTACAAAAGAAAAAATTTTCCTAAATCCTGAAATAACAGAAGAAACAGTTTCAAATTTGTCACATAAACTATCTTCTATCAAACTTTCGGCAGATGATTATGACATCAAGGAATCAGAATTACCTAAAGAAGCTGCTGCGATCCAAGAAGAAAAGAAAGCAGTCTTAACGCAGTTAGAGGATGCAGAATCAAAACTGAAGATCCAGACGGCTGTCAATAAATTATTTACTAAAAACGTATCAAACTGGCAGCAAGCTGTGGATGATGTCATCATCAAAGAAAAGTTGGCAAGTGCAGATGTCGCCCATGTACGTGAAAATATGAGCTTTTTTAAGGATAGTGCTTGGAAAACAGTCGTTATGCAATATCTAGGATTCGCTGATACCCAAATTGCACAAGTCACGCAACTAGATCAGCTATTCGATACGATGCTGAAAGACGGTCAAGTAACAGCTACCGCTACTTACGATCAATATTTGACGGCGCTCAGTCAAATAGAGCAGATCCGGAATGAAAAAATAAGAGCCGCATACGCAACAAAAGCACAAACTGTTGCTCAGCAAATGGGCTATAGCAATATAAGCTATTGACAGTTAAAACGTTGATTCAAGCAAGGTTAGCAAACGGAGGAAACTATGGCAAGACGAAGAAGAAAATCAAGAGGGAAAAAAATATTTTTGATTATTTTAGCAGTTCTTATCGTATTAGTATTAGCAATTGTAGGAGTAGGAGCAAAATTATATCTGGATCTCTCACATTCTATTGAGAAAACTTACGAATCAGTGGAACGAACCCAAGGAGAACGAACGAAACCAGTTGATCTGGACAAACAAGAATCTTTCTCTGTTCTATTGATGGGGATTGATACTGGAGATTTAGGTCGGGTCGATCAAGGAAGATCAGATACGATGATGGTTGCCACAGTCAGTCCTGAAGACAAACAGACAACGATCGTCAGCATTCCTCGAGATACGTATGTCGACATCGTAGGTCGTGACACAAAAGACAAGATCAACCACGCTTACGCATTCGGCGGAGCTGCCATGGCGATGGATACCGTACAAAAATATGTAGACATCCCAATCGATCACTATGTCTCTATCAATATGAAAGGACTAAAGGAACTCGTTGATGCAGTTGGTGGTATCGAAGTCAATAATGACCTCACTTTCTCACAAGATGGCTATGACTTTCCAATCGGTAAAATTACATTGAACGGGGATCAGGCATTATCTTATTCTCGTATGCGTTATGAAGACCCAAATGGTGATTACGGTAGACAAGGGCGCCAAAGAAAGATCGTAGAAGGCGTAGCGAAAAAAGTATTGAGTCTAAACGGTGTCAGCAACTATCAATCCGTTTTGAATGCTCTAGAGTCGAATATGAAAACAGACATGAACTTTGATGAAATGAAAAAAATTGCTTTAGATTATCGGGAGGCATTTGGTACGATTAAGCAAGATCAGCTGCAAGGAGAAGGCTTCATGCAAGATAATATCTCCTATCAAAAAGTCAGTGATCAAGAACTTGATCGTGTGAAAAAAGAATTAAAAGATCAAATGAATCTAGAGAATAAATAGGAAAGTGGAGAAAAAATGGAAGAGACAATCAGCTTGAAAGAAATTTTTGAAACATTACGCAAACACTTGGTAATAATCATCATCTCAATGTTTGCTGGCTTGGCCATCTCAGGAATCGTAACATTTTTCATCTTGACACCAAAATACAGTTCACAAGCACAATTGATCGTGACACTGCCACAATCAGACACTGCAAATGTCAATGATGTCAATACGAACCTGCAAATGATCAATACGTATAAAGATATGATCGTCAGTGATTTAGTGCTCAATGAAGTCAAAGATCGTTTAGAAACAGAAGACAATGTGAAAATGACTGCTGAACAAATCAAAGATGCCATCTCAGTTAATCAGGCAGAAAATTCACAAATGTTCTCGATTCAGGCAATAAGTACGAATGCAGTGGCTGCTCAACAGATCGCTAACACAACTTCACAAGTTTTCCAAGAGAACGCAAAAGATGTGATGAATGTTGATAAAATCTCGATCATTTCAGGTGCAGTTGCCAATACGACACCTGTTTCGCCAAATAATAAATTGAATTTAATGACTGGCTTAATGTTAGGAATGATGGTAGGTGTAGGTCTGGCATTCTTATTGGAATTACTCGATCGGACAGTGAAAGATGAAAAATATGTGACAGATACATTAGGATTCCCAATCTTAGGAACAGTTCCAGAAATGTCAGCGAAAGAATTGAACGCTGGTATCCGTAAAAAAGGAACAGCTCCTGCACGACCAAAAGCTACAAACGATAAAACAGCCCCATCACGC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60 | Streptococcus_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
827068 : 984220
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013994|827068:984220|DBSCAN-SWA 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161 | Streptococcus_phage(23.53%) | tRNA,terminase,head,transposase,integrase,tail,portal,capsid,holin,protease | attL 828264:828304|attR 928917:928932 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1044814 : 1053974
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013994|1044814:1053974|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013994|1044814:1053974|1048259_1048613_+|WP_001227347.1|DBSCAN-SWA MRKKEDKYDFRAFGLAIKEARLKRGLTREQVGALIEIDPRYLTNIENKGQHPSIQVLYDLVSLLHVSVDEFFLPANNLVKSTRRLQIEKYMDSFTDKELSLMESLASGINEARNIED >NZ_CP013994|1044814:1053974|1047983_1048055_-|WP_013670292.1|DBSCAN-SWA MKYIIYNKFPYIGFLSKKVVYLQ >NZ_CP013994|1044814:1053974|1052632_1053775_+|WP_010729705.1|DBSCAN-SWA MNNLEFALEMKNKRLASGLSQGELASLTHVSRYSINRFENGKANASKETQNIILRCLNYYICDKPFYLLVDYLSVRYPTTDALEIIRKVLGMKADYFIHYDYGYYGYKEHYAYGEIKVMASDDEHMGVFLELKGAGSRNMEYVLQAQNRDWYSFLNRCLDCDGVIRRFDLAINDMCGLLDIPVLSEKYRNGGADCRCKNYENVQGGKLSGKNRNLASTLYIGSKASTKYFCLYEKQKEQATKKKHTDIINRFEIRLRGTKAVQAVEELLLTYNPHGLVFYLITDFVQFPDYPLWEIFISHDSLPFEMNPVPVNMERTLQWLERQVMPSIVMIEEIDRLTGSNYMKMIDECTHLSEKQEMLVEQMCTDIADVIESEGVFYE >NZ_CP013994|1044814:1053974|1044814_1045981_+|WP_002289374.1|DBSCAN-SWA MATKRDYYEVLGLSKGASEDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEPDAEEKFKEVSEAYEILSDPQKRAAYDQYGHAGTDPNYGAGGAGGGFGGFGGFSGGGFGGFEDIFDSFFGGGGRSVDPNAPRQGADLQYTVDLSFEEAIFGVEKEIKYNREEICHTCGGNGAKPGTQPTTCHKCHGAGTINVERQTPLGRVMSRQTCDVCHGTGKEIKEPCPTCHGSGHEKKAHSVKVNVPAGVEEGQQMRLAGQGEAGENGGPFGDLYVVFRVEESDIFDREGSEIYYELPLSFVQAALGDEVQVPTVHGDVKLKIPAGTQTGTNFRLRGKGAPKLRGGATGDQHVKVKLITPKNLNEQQREALRAFAEAGGIKVEEQQEDGFFDKFKDAFGGKKRK >NZ_CP013994|1044814:1053974|1048672_1048858_-|WP_011058338.1|DBSCAN-SWA MNYKWILCPVCGNKTRLKIREDTELKKFPLYCPKCRQENLIEIKQFKVTVITEPDAKTQSR >NZ_CP013994|1044814:1053974|1052263_1052416_-|WP_153274509.1|DBSCAN-SWA MTQGVMAVSLRGFRHRVRNTLSASSVLPFLTSSISTDIHIYGFNQIGISF >NZ_CP013994|1044814:1053974|1051485_1052121_-|WP_008788621.1|DBSCAN-SWA MEGYAMKISHLGNNIQTIRKFRGMKQQELADKIGINMQSLSKIERGLNYPAYETLEKIMEVLDVTPNELLSGEWKYVNQSEKEVCQFLRAEERLNAELKHGHYDNFFDSEEEWLEYELEKLREYITDYINGKSIEASDLYPIKEFIQHLKFQKLLDRYDDLYSMDMFGESIEGHKYKTPYQVVKMINPNSKEDMELLREVLRNNNFDDEDE >NZ_CP013994|1044814:1053974|1047336_1047756_-|WP_022278534.1|DBSCAN-SWA MRTSSFEHIVRLQFNSLMLIVIKNKVKSRNRQLARHSKREVLFCEIAETKQVERGTIDTCFYDCVSFKVLHFTIYVSDETLGTVLHRLSEKQRSAILLRYFQGMNDREISELYHVSRSAICSRRTRGLRKLKMLLSERK >NZ_CP013994|1044814:1053974|1046062_1046692_-|WP_002296524.1|DBSCAN-SWA MGQLSDNQQLCQERINPLLELLERVFSYYGQALLTVHRQQIIILVNRISRASLLSLLDKIQTKFNKMYQLQLNFGIGSLCYTEQETPQSFLHAKQVCEWIAFHQSVNEIRFFEDLDLGIVLPAIPSDQRTLYVKRILKSLTEEEVHLFKKTLACFSKNNGSIKNCSEELFIHKNTLQYRLNKFHSLTGYTPRNYDDYHILKLAFLLVQT >NZ_CP013994|1044814:1053974|1048958_1050878_-|WP_000691736.1|DBSCAN-SWA MKIINIGVLAHVDAGKTTLTESLLYNSGAITELGSVDKGTTRTDNTLLERQRGITIQTGITSFQWENTKVNIIDTPGHMDFLAEVYRSLSVLDGAILLISAKDGVQAQTRILFHALRKMGIPTIFFINKIDQNGIDLSTVYQDIKEKLSAEIVIKQKVELYPNMCVTNFTESEQWDTVIEGNDDLLEKYMSGKSLEALELEQEESIRFQNCSLFPLYHGSAKSNIGIDNLIEVITNKFYSSTHRGPSELCGNVFKIEYTKKRQRLAYIRLYSGVLHLRDSVRVSEKEKIKVTEMYTSINGELCKIDRAYSGEIVILQNEFLKLNSVLGDTKLLPQRKKIENPHPLLQTTVEPSKPEQREMLLDALLEISDSDPLLRYYVDSTTHEIILSFLGKVQMEVISALLQEKYHVEIELKEPTVIYMERPLKNAEYTIHIEVPPNPFWASIGLSVSPLPLGSGMQYESSVSLGYLNQSFQNAVMEGIRYGCEQGLYGWNVTDCKICFKYGLYYSPVSTPADFRMLAPIVLEQVLKKAGTELLEPYLSFKIYAPQEYLSRAYNDAPKYCANIVDTQLKNNEVILSGEIPARCIQEYRSDLTFFTNGRSVCLTELKGYHVTTGEPVCQPRRPNSRIDKVRYMFNKIT >NZ_CP013994|1044814:1053974|1053767_1053974_+|WP_002341493.1|DBSCAN-SWA MSNAQDIPVWEKYTLTIEEASKYFRIGENKLRRLAEENKDAGWLIMNGNRIQIKRRQFEQVIDKLDAI >NZ_CP013994|1044814:1053974|1050893_1050980_-|WP_012386611.1|DBSCAN-SWA MLCMPMVMHKNPSDKSIYHWDFYALLGF >NZ_CP013994|1044814:1053974|1047104_1047311_-|WP_025481129.1|DBSCAN-SWA MICKASSGDEMAVKEILKFYDGYISKLCLRPFYHSESGKIIMQVDEELKGEIHTDMMKAILKFEIGVK |
13 | Streptococcus_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1198641 : 1228107
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013994|1198641:1228107|DBSCAN-SWA 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29 | Streptococcus_phage(28.57%) | transposase,integrase | attL 1207977:1207992|attR 1221061:1221076 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1545270 : 1554331
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013994|1545270:1554331|DBSCAN-SWA GTCATTTCAGATAGCCTCCATTTTCAATAATTTCACTAATCACTTCTGGATAGATTCGATGCTCTACTCTATGGATTTTTTCTTCTAAAGAATCGAACGTGTCCTCCTGTTCAATTCTCACTTTTTCCTGCCGGATGATTGGTCCAGTATCTACACCTTGGTCGATATAATGAATTGTGACACCCGTTTCTTTTACTCCAGCTTCAAAGGCATCACGTATGCCATGCAAACCAGGGAAGGCAGGTAAAAGAGACGGATGGATATTGATGATTCTTTTATCATAATTTTTCAGCAATACCGGTCCAATGATTCGCATATATCCAGCTAATACGATCAAATCGATCTTTTTTTCTTTCAATTTATGCAAAATTGCTTCTTCATACTCTTTTTTTGAATCAAATTCTTTAGGTGAAAAACAATCTGCCGGTACACTCAACGCAGTTGCACGTTTCAAAACATATGCTTCAGGCTGATCACAAAACAACCAGTCAATCGAAGATTCCAATCCTTTTTTCGATAGATAATCGGCTAGCGCTTGAAAGTTGCTTCCGTTTCCAGAAGCAAAAACAGCGATTCTCATCGTTCTTCTCCTATAAACACCACACGATGTTTTTCTTTGGCGATCACTTTCCCGATTTCATAAACTTTTTCGCCAGCTTGCTCAATTTCGTGTACTATTTCTTTTACTTTCGATTCTTCGACTGCCAGGACCATACCGATGCCCATATTGAAGATTTCATACATCTCCATCTCAGGAATTTCACCATATTTTTGTAAACAGCCGAATATTGGAAGAATCGGCCATGAGCCAAGTTTGATTTGTGCAGCCATAGATTCTGGTAACATTCGCGGGATATTTTCTACAAACCCTCCACCAGTGATATGTGCAGCTCCTTTTATTTTCTTTTCTTTGATCAGCGGAAGCAAGGAAGAAACATAGATTTTCGTTGGCTCAAGCAATTCTTCGCCAAGTGTTTTTTTCAATTCTGGCAGTTTTGATGATAAAGAAAACTGCTGCTGCTCAAAGAAAATTTTGCGAACAAGAGAGTACCCATTTGAATGAATCCCGCTAGATGCTATTCCAAGCAACACATCTCCTGGGTTGATCGTTTCTCCTGTCAATAATTGAGATTTTTCAGCTATCCCTACAGCAAATCCGGCTAGATCATAATCATTACCTGAGTACATACCAGGCATTTCAGCTGTTTCTCCGCCAATCAGCGCCATATTTCCTTGAACACATCCATCTGCTACACCTTTTACTACATTTTCCAAACGTAACGGATCATTTTTCCCCGTTGCTAAGTAGTCTAAGAAATATAACGGCTCTGCGCCTTGTGCTAAGATATCATTGACACACATCGCTACGCAGTCGATCCCGATTGTATCGTGTTTGTCTGCTTCGATTGCCACTGCTAATTTCGTCCCCACGCCATCGGTCCCCGAGACAAGGACTGGCTCTTTTAATTGAAAGACCGATAAATCAAAACAACCGCCGAATCCTCCTATAGCGCCCATCATACCTAAACGTTCCGTTTTTTTGACATGCTTCTTGATCCGTTCTACTACTTCATATCCAGCTTCGACATCTACGCCAGCTTTTGCGTATGCATTTGCCATTGAATTCATATACTCCCTTCTTGGTCTGCTTTTAAAAGAACGATACTTTTTCTTTTAGTGATTCCTGATATTTTTCTTCATAGTCATATAACGGCGTCGGATAATCTCCGTTGAAATAAGCCATACACAATCCTGAATACGGAGCATCTTTTTCCAGACCGATCGATTCGATCAGACCCTCTTCACTTAAAAAACCTAAAGAATCTGCACCGATACATTCTTTGATTTCATCAATCGTGTGATTTGCCGCAATGAGTTCTTTACGCGTTTGAATATCAATCCCGTAAAAACATGGATATTTCAAAGGAGGAGAAGCAATCCTCACATGGACTTCTTTTGCCCCTGCTTCTTTCAAAAGATGGACGATCCGTCTGCTTGTCGTACCCCGAACAATTGAATCATCGACCATAATCACCTTTTTACCTTCCACTACTCCTCGTACAGCAGATAATTTCATTCGAACACCTTGCTCTCTTAGCTCAGGCGTTGGCTGGATAAATGTTCGGGCAATGTATTGATTTTTTACTAATCCGATTTCATAAGGGATTCCACTAGCTTCCGCATAACCGCTTGCGGCTGACAAAGAAGAATTAGGTACGCCAACGACCATATCTGCTTTTACTGGCGATTCTTTCGCTAAATTCCGTCCCATATTTTTCCGTGCAGTATGCACATTGATCCCTGCGATGTTTGAATCTGGTCTGGCAAAATAGATATATTCCATCGAACAAATAGAAAGCTGCGTGTCCTTCGTAAAGCAATCAATCTGGATTCCTTCGTCATTGATGATCACTATCTCACCAGGCTGGACATCTCTTATAAAACGTGCCCCAATAACTTCTAATGCACAAGTTTCCGAGGCAATCACGTATGCTCCGTTTTTCATTTGTCCGATTGCTAATGGACGAAAACCATTTGGGTCCAAAGCGGCAATCATTGCCGTTTCTGTCATTAATAAATAGGCAAAGCCACCTTTGACTTCATTCAAAGCACTTTTTAATTTATTTAAAAAATCTGTTTCTTCACTTCGTCGGATCAAATGCATCAATATCTCCGTATCGGAGTTAGAATGGAAGATCGCCCCATTTTCCTCTAACTCTTTTCTAAGGGAACGAGCATTGATCAAGTTACCATTATGCGCTAAGCCGATCGACTGATCATGAAATTTGAATAGAAAAGGCTGAATATTGTCCACACTTCCATTGCCTGCTGTTGCATAACGTACATGTCCGATTGCAGCTTCTCCTGTTAACTGCTGCAATTTTCTTTGATCTTTGAATACCTCAGAAAGCAGCCCCAAATCTCGATGCCCCTTAAGCTTTCCTCGATCATTGGACACGATACCTGCACCTTCTTGTCCTCGATGCTGAAGACTATGGAGCCCGAAGTATGCCACACTAGCGGCGTCTGGATGACCCCAAACACCGAAGATCCCGCATTCTTCATTTAAACTCTTCACTTCATAAGACATACGATTGCATCCTCCCAGCACTTTCTTGCTACTGCAGTTTCTATTTTGATCTGACCGTCAGTTGCTGAAATTTCGATTATCGCTTCATCCGTCACCTTACCTGCTAAAACAGCAGCATCTCCCATCATTTCTTCGAATCGTGTCTTATTTTCCGGTGCGACTGTCAACACAAATCTTGATTGAGTTTCTGCAAATAATTGAGCAGAGGACAATTCAAACTGTACAGATATCCCTAGCTGATGTTTGAAAGCTGATTCTGCCAGTGCAATTGCCAAGCCACCTTCTGAACAGTCATGAGCACTTTCAATCAATCCGTTTTGGATGGCTGTCAATACTAACTCTTGGTTTCTCTTTTCAATGGATAGATCAAAGTTTCGGATCACACCTTCGATTCTTCCAAGCTGCATCTTTTGTAATTCACTGCCATCAAAATCTGCAAACGTCTTACCTAATATATAGATTAGATCCCCTGATTTTTTGAATTCCTGAGTAGTGATATGTTTATGATCCTCAATCAATCCGACCATACCAATCATTGGTGTTGGATAGATTGCTTGACCATCCGTTTCATTATATAAAGAGACATTTCCTGAAATAACAGGAGTTCCTAACGTTTCACACGCAGCAGCAATTCCGTCAGCTGAAGTCGATAATTCCCAAAAAACTTCTGGTTTATCAGGAGAACCATAGTTCAGGCAGTCGGTGATCGCCAAGGGCTTACCACCGCTAGCAATAATATTTCTAGCAGCTTCTGCCACTGCTATTTGTCCTCCGATTTTTGGATCCAAATACAGATAGCGCGCGTTGCAGTCTGTGGTCATAGCTAACGCTTTATTCGTCCCTCTAACCCTCATCACAGCAGCATCGCTTCCTGGACGGACAACTGTATTGGTTTGTACTTGTGAATCATAAGTTTCGTAGATTGAACGTTTTGAAGCAATCGTCGGTTGCTGCAGCAGATCAAGCAATACTTGTCCAGGTTCTTCGATAACTGGCTGATAAGGAGCTAACTGCTGAAATTCTACGATTCGAGCTGGTTCTTTCATTTCTTTATGATAAACTGGTGCATCTTCAGCTAATGCATCGACTGGCAGATTTGCTACTTCTTCTCCTTGATGATATAGCCGATATTGCCCGTCGTCTGTTACTTTACCGATAGTGACTGCATCTAGATCATACTTCTGAAATAGTTCTTGGATTTTTTCTTCCTCTCCTGATTTAACACAAATCAACATCCGTTCTTGTGATTCCGATAACATCATTTCATAAGGTGTCATCCCAGTTTCTCTTTGTGGGACTTCATCTAATGTCAATATAAGTCCTGAGCCAGCTTTTGAAGCCATTTCCGCACTAGATGAAACAAGTCCTGCTGCTCCCATATCCTGTATACCTATTAGAGAATCCGAATGATGCAAGATTAATTCCAAACACGCTTCAAGCAGCAGCTTTTCCATAAAAGGATCGCCTACTTGTACAGCAGAACGTTGCTGTTCTTCTTCTTGATTAAATTCTTCTGAGGCAAAAGTTGCTCCGTGGATACCGTCGCGACCTGTTTTTGCACCTACATACATGATCGAATTACCGACGCCAGCGGCTTGCCCTTTCTGGATATGTTTGTGTTCAATCAAACCTACGCACATTGCATTGACTAATGGGTTTCCTTCATAACAAGGATCAAATGCAATTTCGCCGCCTACAGTCGGTATGCCGATACAATTGCCGTATCCGCCGATACCTGCAACTACTTCTTCTAGTAAATATTTCGTTCTTGGATTATCTAATTCGCCGAACCTCAATGAATCTAGCAACGCAATTGGACGAGCCCCCATGCTGAAAATATCTCTGATGATTCCGCCAACTCCTGTCGCAGCTCCTTCATAAGGCTCCACGGCTGAAGGATGATTGTGAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013994|1545270:1554331|1545270_1545849_-|WP_002288010.1|DBSCAN-SWA MRIAVFASGNGSNFQALADYLSKKGLESSIDWLFCDQPEAYVLKRATALSVPADCFSPKEFDSKKEYEEAILHKLKEKKIDLIVLAGYMRIIGPVLLKNYDKRIINIHPSLLPAFPGLHGIRDAFEAGVKETGVTIHYIDQGVDTGPIIRQEKVRIEQEDTFDSLEEKIHRVEHRIYPEVISEIIENGGYLK >NZ_CP013994|1545270:1554331|1545845_1546889_-|WP_002321731.1|DBSCAN-SWA MANAYAKAGVDVEAGYEVVERIKKHVKKTERLGMMGAIGGFGGCFDLSVFQLKEPVLVSGTDGVGTKLAVAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLYFLDYLATGKNDPLRLENVVKGVADGCVQGNMALIGGETAEMPGMYSGNDYDLAGFAVGIAEKSQLLTGETINPGDVLLGIASSGIHSNGYSLVRKIFFEQQQFSLSSKLPELKKTLGEELLEPTKIYVSSLLPLIKEKKIKGAAHITGGGFVENIPRMLPESMAAQIKLGSWPILPIFGCLQKYGEIPEMEMYEIFNMGIGMVLAVEESKVKEIVHEIEQAGEKVYEIGKVIAKEKHRVVFIGEER >NZ_CP013994|1545270:1554331|1550567_1551239_-|WP_002288017.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDADMLWAVREIMGADAEFVRHDESSLEGFDGVLLPGGFSYGDYLRCGAIARFSTIMEEVIRFAEEGKPVFGTCNGFQILTEAGLLPGVLRRNESLHFICKTVPLKVNPKTAFTSEYEADEIIYLPVAHGEGNYFCDEETLQELKKNNQIAFTYNDNINGSVENIAGITNKAGNVLGMMPHPERAVEDLLGSEDGKRFFASILKNFGKVTV >NZ_CP013994|1545270:1554331|1551240_1551495_-|WP_002295474.1|DBSCAN-SWA MYFVKVYVTYKDSVLDPQGEAVKKAVHRMGYETIEDIRIGKYFEIQLADAEEPIDTVIETICDKLLANVNMETYRYEIKKMEEV >NZ_CP013994|1545270:1554331|1553035_1554331_-|WP_002288023.1|DBSCAN-SWA MLERYTRPEMGNIWTEENKYRAWLEVEILADEAWAELGEIPQEDVKKIREHASFDIDRILEIEKLTRHDVVAFTRAVSETLGEERKWVHYGLTSTDVVDTAYGYLIKQANDILREDLKRFTEIIGEKAKEHKYTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLATWYSEMKRNIERFEHAAKGVEAGKISGAVGTFANIPPFIEEYVCKQLGIRPQEISTQVLPRDLHAEYFSAMALIATSIERFATEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMAGLARVVRGHMVTAYENVTLWHERDISHSSAERIILPDTTILLNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMSATFGLIYSQRVMLKLIDKGMTREEAYDLVQPKTAYAWDNQVQFRPLLEEDPTITSVLSKEEIDDAFDYHHHLKNVDVIFKRVGLE >NZ_CP013994|1545270:1554331|1552478_1552856_+|WP_002297115.1|DBSCAN-SWA MEDAIKQGQLFLSELTAEERSCLYNDLLSIKDVYLCNKDTSFYTFRKIRRATKRCAECRKRTFLYQTEHKGELSISQIHEQKRFKNHYRIQILFNGQEMEYAFLENLLQHLHNQHFSYNSQAIYA >NZ_CP013994|1545270:1554331|1548344_1550567_-|WP_002288015.1|DBSCAN-SWA MKTLKEPTAEEIKKKRIYAEWGLTDEEYRMIEEDILGRMPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTSGPHVLQGPGEGAGIVDIGDGLAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGELDNPRTKYLLEEVVAGIGGYGNCIGIPTVGGEIAFDPCYEGNPLVNAMCVGLIEHKHIQKGQAAGVGNSIMYVGAKTGRDGIHGATFASEEFNQEEEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLELILHHSDSLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLILTLDEVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLICVKSGEEEKIQELFQKYDLDAVTIGKVTDDGQYRLYHQGEEVANLPVDALAEDAPVYHKEMKEPARIVEFQQLAPYQPVIEEPGQVLLDLLQQPTIASKRSIYETYDSQVQTNTVVRPGSDAAVMRVRGTNKALAMTTDCNARYLYLDPKIGGQIAVAEAARNIIASGGKPLAITDCLNYGSPDKPEVFWELSTSADGIAAACETLGTPVISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLIEDHKHITTQEFKKSGDLIYILGKTFADFDGSELQKMQLGRIEGVIRNFDLSIEKRNQELVLTAIQNGLIESAHDCSEGGLAIALAESAFKHQLGISVQFELSSAQLFAETQSRFVLTVAPENKTRFEEMMGDAAVLAGKVTDEAIIEISATDGQIKIETAVARKCWEDAIVCLMK >NZ_CP013994|1545270:1554331|1546920_1548360_-|WP_002288013.1|DBSCAN-SWA MSYEVKSLNEECGIFGVWGHPDAASVAYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDRGKLKGHRDLGLLSEVFKDQRKLQQLTGEAAIGHVRYATAGNGSVDNIQPFLFKFHDQSIGLAHNGNLINARSLRKELEENGAIFHSNSDTEILMHLIRRSEETDFLNKLKSALNEVKGGFAYLLMTETAMIAALDPNGFRPLAIGQMKNGAYVIASETCALEVIGARFIRDVQPGEIVIINDEGIQIDCFTKDTQLSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHTARKNMGRNLAKESPVKADMVVGVPNSSLSAASGYAEASGIPYEIGLVKNQYIARTFIQPTPELREQGVRMKLSAVRGVVEGKKVIMVDDSIVRGTTSRRIVHLLKEAGAKEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTIDEIKECIGADSLGFLSEEGLIESIGLEKDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEEKYQESLKEKVSFF >NZ_CP013994|1545270:1554331|1551494_1552223_-|WP_002288021.1|DBSCAN-SWA MEKKELLYEGKAKKIYLTSDENLIWIEYLDQATALNGARKDQISGKGELNNQITSAIFRYLTQRGIKNHFIEQLSKTEQLAKKVQIIPLEVVIRNIAAGSFSKRLGVPEGKEFIKPIIEFYYKDDQLDDPFINEEHIYFLQLAKPEEISELKAQALAINEILTELFAKVGLVLVDFKLEFGRSNGQILLADEVTPDTCRLWDERTNEHMDKDVYRRDLGDLIPVYQEVYNRLSELTEEKERV |
9 | Synechococcus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1792822 : 1906434
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013994|1792822:1906434|DBSCAN-SWA 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123 | Streptococcus_phage(12.24%) | terminase,head,transposase,integrase,tail,portal,capsid,holin,protease,plate | attL 1841733:1841751|attR 1877701:1877719 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1924191 : 2000237
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP013994|1924191:2000237|DBSCAN-SWA 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91 | Enterococcus_phage(32.26%) | tRNA,terminase,head,transposase,integrase,tail,portal,capsid,holin,protease | attL 1960264:1960299|attR 1999586:1999621 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2019322 : 2027794
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP013994|2019322:2027794|DBSCAN-SWA AATGAAAGTAAATTATGAAGAAAAAACTGTCGTTACTCAGCAGCCAGAGACATCCCAGATGAAAGTCATCAAACGCGATGGCCGCCATGTTGATTTCGATGAACAAAAGATCAATGAAGCACTGATCAAAGCAGAAAAGAAAATTCACGGCTCATTATCACCACTTACTTATGAAAAAATTCAAATGATTGCAGACTTGGTTGTCCAAGAAATCAAAAGCCGGTTTGCTGAAAATGTCAAAATCTATGAGATTCAAAACATCGTGGAACATATATTACTAGAAAAAAACGAATATGAATTAGCAGAAGAGTACATCAATTATCGTACCAAACGAGATTTTGCTCGCAGTAAAGCAACAGATATCAACTTTTCGATTGAAAAGCTAATCAACAAGGACCAAACTGTCGTGAACGAAAACGCAAATAAAGACAGTAATGTTTTCAATACACAGCGAGATCTGACAGCCGGGATCGTTGGAAAATCAATCGGACTGAAAATGTTGCCACCACATATAGCAAATGCGCATCAAAAAGGCGATATCCATTACCATGATTTGGATTATCATCCTTATACACCGATGACGAATTGCTGCTTGATTGATTTCAAAGGCATGCTGAACAATGGGTTCAAAATCGGCAATGCCGAAGTCGAATCGCCAAAATCTATCCAGACCGCCACAGCACAAATCTCACAGATTATTGCCAATGTAGCGTCAAGTCAATATGGTGGCTGTTCTGCCGACCGAACAGATGAATTGCTTGCTCCTTTTGCAGAATTGAACTATAAAAAACATCTAAAAGACGCGGAAGAATGGATCGATTCGCCAGAACGCCAAAAAGAATATGCAAAAGCAAAAACCAAAAAAGATATCTTCGATGCTATGCAAAGTTTGGAATATGAAATCAATACCTTATTTACTTCAAATGGACAAACTCCTTTCACTTCATTAGGATTTGGACTAGGAGAAAACTGGTTTGAAAGAGAAATTCAAAAAGCAATTTTACAGATTCGAATCAATGGATTAGGGAGTGAAAAGCGGACAGCTATCTTCCCTAAACTGATCTTCACTTTGAAAAAAGGTGTGAACTTAAACCCTGAAGATCCTAATTACGACATCAAACAACTAGCATTGGAATGTGCAACGAAAAGAATGTATCCTGATATTCTGAATTACGATAAAATCGTTGAATTAACTGGAAGTTTCAAAGTACCTATGGGCTGTCGTTCATTCTTGCAAGGGTGGAAAGACGAAAATGGTCAAGAAGTAAATGTCGGACGAATGAATTTAGGTGTTGTTACATTGAATTTGCCAAGAATCGCGATCGAATCAAAAGGAGATCAGAATAAATTCTGGCAGTTACTGTCTGACCGCTTAGAAATCATGAAAGATGCGCTTCTCTATCGTGTAGAACGTTGTAAAGAAGCCATTCCAGCAAATGCGCCAATTTTATATATGTATGGTGCTTTCGGGAAACGTCTTTCACGTACCGATTCTGTCAATGAATTATTCAAAAACCGTCGAGCTACTGTATCGTTAGGCTACATTGGATTGTATGAAGTTGCTTCAGCTTTCTTCGGTGGCGAATGGGAAACAAACCCAGAAGCAAAAGCTTTCACACTTGATATCGTCAAAGAATTAAAAGCTAATGCAGATGCATGGGGGGATGAATATGGTTATCATTTCAGTGTCTATTCAACTCCAAGTGAAAGTCTAACTGACCGTTTCTGCCGTTTGGATACAGAAAAATTCGGCATCATCGAAAATATCACAGATAAAGAATATTATACAAACAGTTTCCACTATGATGTGCGTAAAAACCCAACGCCATTTGAAAAATTGGAATTTGAGAAGGATTATCCAAAATATTGTTCAGGTGGATTCATCCACTACTGTGAATACCCTATGCTCCAACAAAATCCGAAAGCTTTAGAAGCTGTATGGGATTTTGCATATGACAAAATCGGGTATCTTGGTACGAATACGCCAATCGATCATTGCTATCAATGTGGTTTCGAAGGTGATTTCAAACCGACAGAACGAGGGTTCGAATGTCCAGAATGTGGAAATCATGATCCAAAAACATGTGATGTAGTCAAACGTACTTGTGGCTATTTAGGAAATCCGCAAGCTCGTCCGATGGTACATGGCCGCCATAAAGAAATTTCCTCACGTGTGAAACACATGAAATGAGGTTGTGAAAAAGCTGTCCTGCATCAAGTAATAAGAATAGCTAAACAAAAATAGTTCCTCATATTTTTCGTTTAGTTGGGCTTATTACTGCAGATGCAAGCTTTTGAACACCGTTTATTCAGAATAAGAGGCTATGACAAGTCTTTTTTCACCACCCTCTTTCGATGGCTTTGTATCTTTGAACGCCCTCTATCAAAATAAGAACAAGCTTTCTTGAACAATGGATTTAGGTCAGTTTGTTCTTATTTATGTGGTCGAGTAGATTTTATCTTCAATAGCTATATCTTTGAACCTTAAATGAAAGAAGTTTTTTTATGAGAAATCCAAAACCAAAAGAATGGTTAGCAAAAGACTACAGCCAAAACTATATTGCTGACTACAAACCGTTTAATTTTGTCGATGGTGAAGGTGTCCGCAACAGTCTTTACGTTAGTGGCTGCTTATTTGCCTGCGAAGGCTGCTTCAACAAAGCTGCACAAAATTTCCGATATGGCAAACCATTCACACCTGAATTAGAAGAACAAATCATCGCTGACTTGCGCAACGATTACGTGCAAGGATTAACTTTACTTGGTGGCGAACCTTTTTTGAATACAGATGTTTGTCTGCAAGTCGTACGACGTATCCGAAAAGAGTTCGGTACGACAAAAGATATCTGGTCATGGACAGGCTATACCTTTGATGAATTGCTACAAGATTCAGAAGATAAATTAGAACTCCTTTCGCAAATCGATATCCTTGTTGACGGACGCTTTGAATTAAGCAAACGTGACCTAAAACTACAATTTCGCGGAAGTAGCAACCAGCGGATCATTGACGTCCAAAAATCTTTAGAATCCAATCAAGTTGTGATTTGGGAAAAATGTACGGATGCAACAGAAACCTATGAACAAATCAAAAAGCAAGACTTGATATAAAAACAGCTTTGGGAGAGAAAACGGATTTCCGGTTTCAACTCTCAAAGCTGTTTTTATATTTCTTGATTTTCCCATAATGGAAGGACGATGTTTTCATAAGTCATCGGGTCCAGATTCGTCAAAGTAATCCCTAACAATCGGATTCCTTTTTCTACTCCCAAGATTTCCTCCCATATAAGGCTTGCTTGATAAAAGAGTGCTTCTTTTTTATAGATATATTCTGGCAATGTCACTCTTTTGGTCACAGTAGAATAGTCCGTGTACCTGACCTTCAAAACTACTGTTTTCCCATGTTTTTGGACTCTTCTCAGTGCTTCTTCTACTTTTTCAGCTAGTTGGCGCAACTGAGTCAGCACTGCTTCTTCCGTTTGCAACGGCTGCCCATAAGTATGCTCTTTTCCCACAGATTTTCGCTCTCTTGTAACGTTTACTGGAGAATCATGGATTCCTCTGACTTTACGATAAAGAGAATAGCCCATTTTTCCAAAATTTCGAATCAACATCATTTCTGTGCATTCATATAGGTCTTTTCCTGTATAAATCCCTAGCTCATGCATTCTAGGTACAGTTTTCTTCCCTACCCCATGAAATTTTTCAATTGGCAAAGCTTTTAAAAATGGCACAGCGTCTTGAGGGGCAACTACCGTGATTCCTCTAGGTTTTTGATAGTCTGATGCTAATTTGGCCAAAAACTTATTGTAACTTACTCCCGCAGAACATGTTAGCTGGACACTCTCCCAAATATCTGCTTGGATCATTCGGGCGATTTTGATGGCTGACTTGCAATTGATTTTATTTTCGGTCACATCAAGATACGCTTCATCGATACTAACTGGTTCCACAATATCTGTATAACGATAGAATACTTCCCGTACTTGTTTGGAAATATCGCTGTATTTATGATGGTCGCCAGGCTTAAAGATGGCTTGCGGACAAAGCTCATACGCTTTTTGTGCACTCATTGCTGAATGAATTCCGAATTTTCTTGCTTCATAATTTGCTGTAGTCACTACTCCACGCCCACCAGTGTCACTGGGGTGTCTGGCAATTACTAATGGATGTCCGCGAAACTCAGGATGATCTCGTTCTTCAACCGAAGCGAAAAAAGCATCCATATCAATATGAATGATTTTTCTTGATGTATCATTATGTAAAGGAAATTGCAGCTCCATCATCCTCACCTCTTATTCATTATACAAGAACATTCGTTCACGTTCAAGAGATTTGAAAAGTTAGTAGCTGATTTCCTCATTAGTCTTTCATTATAGACAACTTATACTATCTCAGTCTAATTCATGGTACTGACGGTAGACTTCTTGTTTTTTCAGCCCATTTTTCAGCGCTACTGCTTTGATAGCAGCATTTGGTTTTTCGCCTGAAGCGATCTTTGCTTCTACTTGTTCCTTTAACGTTCCCAACTCTTCATCAACTTCCGTCACTGGCATTTCGAACAAATTCCCTTCTACAAGCAGACAACATTCACCCTTTACTGGATGTTCTTCGATATAAGCGAGTAGCTCTTCCGTACTTCCTCTAAGGTATTCTTCATGGACCTTTGTCAATTCCCGACACAAAACGACTTGGCGATTTCCAAAAATTTCTAAGAAATTCGTCAATGTAGCAGTGATCCGATAAGGTGACTCATAAAAAATCAGCGTAACTGTCTGTTCTTTTAGCTTTTTCAATGTTTCTTTCTGTTCTTTTTTCTTACGTGGAAGGAAGCCATAAAATAAAAATGGTTGAGGCACTAGCCCTGAAGCAATCAAAGCCGTCATCCCAGCTGTAGGTCCTGGGATAGAGATCACAGAAATCCCTTCTTTTATGCAGGCTAAAACTAGCTCATGTCCAGGATCGCTGATGGAAGGCATTCCTGCGTCACTGACTTGAGCAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP013994|2019322:2027794|2022482_2023604_-|WP_002294035.1|DBSCAN-SWA MMELQFPLHNDTSRKIIHIDMDAFFASVEERDHPEFRGHPLVIARHPSDTGGRGVVTTANYEARKFGIHSAMSAQKAYELCPQAIFKPGDHHKYSDISKQVREVFYRYTDIVEPVSIDEAYLDVTENKINCKSAIKIARMIQADIWESVQLTCSAGVSYNKFLAKLASDYQKPRGITVVAPQDAVPFLKALPIEKFHGVGKKTVPRMHELGIYTGKDLYECTEMMLIRNFGKMGYSLYRKVRGIHDSPVNVTRERKSVGKEHTYGQPLQTEEAVLTQLRQLAEKVEEALRRVQKHGKTVVLKVRYTDYSTVTKRVTLPEYIYKKEALFYQASLIWEEILGVEKGIRLLGITLTNLDPMTYENIVLPLWENQEI >NZ_CP013994|2019322:2027794|2021826_2022429_+|WP_002288081.1|DBSCAN-SWA MRNPKPKEWLAKDYSQNYIADYKPFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAAQNFRYGKPFTPELEEQIIADLRNDYVQGLTLLGGEPFLNTDVCLQVVRRIRKEFGTTKDIWSWTGYTFDELLQDSEDKLELLSQIDILVDGRFELSKRDLKLQFRGSSNQRIIDVQKSLESNQVVIWEKCTDATETYEQIKKQDLI >NZ_CP013994|2019322:2027794|2019322_2021512_+|WP_002288083.1|DBSCAN-SWA MKVNYEEKTVVTQQPETSQMKVIKRDGRHVDFDEQKINEALIKAEKKIHGSLSPLTYEKIQMIADLVVQEIKSRFAENVKIYEIQNIVEHILLEKNEYELAEEYINYRTKRDFARSKATDINFSIEKLINKDQTVVNENANKDSNVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKMLPPHIANAHQKGDIHYHDLDYHPYTPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNAEVESPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRTDELLAPFAELNYKKHLKDAEEWIDSPERQKEYAKAKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSLGFGLGENWFEREIQKAILQIRINGLGSEKRTAIFPKLIFTLKKGVNLNPEDPNYDIKQLALECATKRMYPDILNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKDENGQEVNVGRMNLGVVTLNLPRIAIESKGDQNKFWQLLSDRLEIMKDALLYRVERCKEAIPANAPILYMYGAFGKRLSRTDSVNELFKNRRATVSLGYIGLYEVASAFFGGEWETNPEAKAFTLDIVKELKANADAWGDEYGYHFSVYSTPSESLTDRFCRLDTEKFGIIENITDKEYYTNSFHYDVRKNPTPFEKLEFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPMLQQNPKALEAVWDFAYDKIGYLGTNTPIDHCYQCGFEGDFKPTERGFECPECGNHDPKTCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEISSRVKHMK >NZ_CP013994|2019322:2027794|2023712_2024585_-|WP_002288078.1|DBSCAN-SWA MYNQKSFKGNPVYGDLYLVPTPIGNLEDMSYRSVRMLQESDLIASEDTRNTQKLLNHFEIHTPQKSLHEHNYKERVPQLIALLKEGKTIAQVSDAGMPSISDPGHELVLACIKEGISVISIPGPTAGMTALIASGLVPQPFLFYGFLPRKKKEQKETLKKLKEQTVTLIFYESPYRITATLTNFLEIFGNRQVVLCRELTKVHEEYLRGSTEELLAYIEEHPVKGECCLLVEGNLFEMPVTEVDEELGTLKEQVEAKIASGEKPNAAIKAVALKNGLKKQEVYRQYHELD >NZ_CP013994|2019322:2027794|2024993_2025818_-|WP_002288073.1|DBSCAN-SWA MVEVVGVRYRDAGHIYYFAPGDSEYVYSDKVLVESQQSLHIATVVLPKKEIDPNDLPEAIRPILHKASQAELEKDKKNKKDAYDALKIAKEKVQLRELEMKMVKAEYTFDRNKLIFSFTADGRIDFRELVKDLAAVFRTRIELRQIGVRDEAKIIGGIGPCGRPLCCSSFLGDFVPVSIKMAKDQSLSLNPTKISGLCGRLMCCLQYESEEYETAKKELPDFGKVIATPDGKGKVVGLNLLSRIVSIRLTGRENPVEYEWDELKEFIQVGEMNG >NZ_CP013994|2019322:2027794|2027149_2027794_-|WP_002294039.1|DBSCAN-SWA MNGLFITIEGPDGAGKTSILNELYPLLKEVAKTEIIQTREPGGIPIAEEIRAVILDPKNDRMDERTEALLYAAARRQHLVEKVLPALAKGKIVLCDRFVDSSLAYQGAGRRIGVTEIARLNEFATEGTTPDFTLYLDVDSDTGLRRIKKNRQNQIDRLDSEGLEFHQRVRHAYLKLAEENPERIHKVDARKSFEEVLQTSYHTIIEQYPQFFEN >NZ_CP013994|2019322:2027794|2026805_2027135_-|WP_002292340.1|DBSCAN-SWA MKIILAIIQDKDSNRLSNELIDANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIVGIEDDRVEEALEIIKKTCESRKQFVSTPVTLDISMDGGVPYPVEVEVGGATVFVLPVEGFHQF >NZ_CP013994|2019322:2027794|2024653_2025001_-|WP_002288076.1|DBSCAN-SWA MDKRSLYDGLNQLESELRNTLTELVEMKHALHEIVEKNTTLEMENQRLREHLRELNQVAQAPAENVKQELSKSRMNLEKIYEEGFHVCYDLYGSRRDNDEPCAFCLEVIYRESGR >NZ_CP013994|2019322:2027794|2025853_2026792_-|WP_002288071.1|DBSCAN-SWA MNQEINLAQMQPIVYQQLQRSFEHGRIAHAYLFEGEKGTGKHEVGIWLAQHLFCTQMKDNLPCGKCNNCQRIEKKEHPDVLVIEPEGQTIKVDQIRRLQTEFSRSGYESRKKVFLIKEAEKMNSSAANSLLKFLEEPPGDFLAVLETDAVGRILPTIQSRCQVLHFQELSKEALIHRLQEEQIPLEKAKLLAFLTNSLGKAVEISQDEWFNDAKDLIYQWFVYLQKQDTQAFIYVQKKLVKSFKEKTQQFTGLSVLMFYYQEAQRQAVANGEYGKVKQINQIIERILIAEQKLRSNVSFQAVAEQFVLHTIF |
9 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2461277 : 2530287
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP013994|2461277:2530287|DBSCAN-SWA 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56 | Streptococcus_phage(27.27%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2835152 : 2852048
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP013994|2835152:2852048|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013994|2835152:2852048|2850113_2851118_+|WP_002297346.1|DBSCAN-SWA MNLKKVGVISLTFLTISFMGILMCVGLLFGEDSEGNGSSGTSPGGTSVSEEVLKHRAMVEKYAKESDITEYIPILLAIIQVESGGTMEDVMQSSESAGLPPNSLSTEASIKQGCLYFASLVKRSKELGCDQDSIIQAYNYGGGYLDHVGKNGKKHSFALAESFSKEKSGGQKVDYPNPIAIKENGGWRYNYGNMFYCLLVKQYLTTTQFDDKIVQEIFDEAFKYEGTAYVFGGSSPETGFDCSGLTQWCYAKVDLKLPRVAQDQYDAMTHIDLKDAKPGDLVFFHSTYDAGTYVTHVGIYAGENRMFHAGDPVGWTNLTENYWRQHLIGAGRYK >NZ_CP013994|2835152:2852048|2844365_2844590_+|WP_033658092.1|DBSCAN-SWA MSGTYLSIYQWFLTNAQSLVLLAIVVIGLFLGFKREFSKLIGFLVIALIAVGLVFNASGVKDVLLSLFNRIVGA >NZ_CP013994|2835152:2852048|2847993_2850117_+|WP_002297347.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013994|2835152:2852048|2835854_2836199_+|WP_002311649.1|DBSCAN-SWA MKIMEINVEHILDCLDQYGKGELTEEQLVKALTSDEKMFLIIHQGLLGENSDSEEDSDVLDWLGEEESFFIVVEVNENLCRQAESILEEIGVEMPDAIEGFLNQLVETKQLPSS >NZ_CP013994|2835152:2852048|2851136_2852048_+|WP_002297345.1|DBSCAN-SWA MKIKIERNQKEKSPKKKKERVVSVGKHRKMVLALWLLLSCSLAFGVYKNFTAIDQHTTHEKVVIKEKVVNTSGVESFTEDFAKEYFSWKNNKEAIEKRMSNLEQYLTENGLALIQDMVRADIPTSSEVQSVKILDVEKHSEEFVVSFLVEQHITEGKKTQSISSAYRVTIFEDENRNHLVTSLPTMIGKPDKAKYEAKQVENDSEIDAKTTEEITDFLETFFKLYPSASEKELEYYVENGAMRPINIDLKFSELENPVYLQNGKNFLVSTKIKYLDNVSKTTSYFQYKLVLQKNGNWKIVDVK >NZ_CP013994|2835152:2852048|2839041_2839749_+|WP_002297356.1|DBSCAN-SWA MLNSKAYIPQSRERIFLIGHSRDACTEQVFPIIGPSSTSDQNIRNLVNINPSNRGMGGQVYGSDGVAPTLTGDEGIKIALPARDGISVAGLLPGKFEQGNRVYEVTGTAPTLSTKQGGTKIMIRKNETEYQEVKPEDSVNLAFPNSTSRRGRLGKQSVHTLLTGDQQAIVTDQYQIRKLTPRECWRLQGFPDWAFDRDSQVNSDSQLYKQAGNSVTVPVIFDIARRLKELDVHGL >NZ_CP013994|2835152:2852048|2838606_2839041_+|WP_002321810.1|DBSCAN-SWA MRFLDLFAGIGGFRLGMEQASHHCIGFCEIDKFARRSYKAIHDTSKEVEMHDITSVSDEFIQSLGPVDILCGGFPCQAFSIAGKRQRFSDTRGTLFFEIARFTTLLRPKLLFLENVRGLLNHEGGATFETILRTLDGLGYDVEW >NZ_CP013994|2835152:2852048|2845165_2845555_+|WP_002297349.1|DBSCAN-SWA MKKIKSYTSIWAVEKVIYAINDFQLPFPVTFNQMAWFVLSLLFVIVFAHVPPLSMIEGAFLKYLGIPVAVTWFMSQKTFDGKKPLGFLRSFISYHLRFKVTFAGKKVKEQKKRWDEPITLVRSVNYVPD >NZ_CP013994|2835152:2852048|2841468_2841606_+|WP_002317225.1|DBSCAN-SWA MKRGIVMGIVKDIFLVFGGSMLGVTVMCLMNASAAADRAMEKKGK |
18 | Streptococcus_phage(92.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
12380 : 46599
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013996|12380:46599|DBSCAN-SWA AATGACAGAACAAATCGAAAAAAATTCAAAAAGCTTATATCAGGCACTGTGGAATTCCGCAGATATCCTGCGTTCAAAAATGGACGCTAATGAATACAAGAGCTATTTACTAGGCTTGGTCTTTTATAAATACTTATCCGACAACATGCTGCGGTATGTCTCCGTTCTATTGGAGGAAGAAACGGACGACCTAAATAAAGCACAAGACCTTTACGTTGAAGCATTTAAAGATGCAGATATAAAGGATGATCTCTTGTATGAACTAAAAGATGAGTTTTCATATACCATCGCACCCGCATTGACCTTTACCGCGCAAGTGGCAGCCATTCATGATGGATCTTTTCAATTAGAAGACCTGGTACAAGGTTTCCGTGACATTGAACAATCCAGCGAAAACTTTGAGAACTTATTTGAAGACATTGATCTGTATTCTAAAAAACTGGGGTCAACCCCACAAAAACAAAATAAAACCATCGCAGATGTTATGAAAGAATTAGAAGGGTTAAACATGGCGGGGCATGCTGGCGATGTCTTAGGCGATGCCTATGAGTACTTAATTGGCCAATTCGCATCTGAATCCGGTAAAAAAGCCGGTGAATTCTATACCCCACAACCGGTCGCAAAATTGATGACACAAATTGTTTTACAAGGAAAAGAAGATAAAAAAGGCTTTTCTGTTTACGACGCGACCATGGGTTCGGGCTCGTTACTTTTGAACGCTAAAAAATATTCCCATCAACCGGGAACCATTTCTTATTTCGGACAAGAGTTGAATACGTCTACCTATAATTTGGCGCGTATGAACATGATTTTGCATGGGGTTCCCATTGCCAACCAACACTTGCATAATGCGGATACCTTGGATCAAGACTGGCCAACAGAAGAGCCAACGAACTTCGATGGGGTGCTCATGAACCCACCGTATTCTGCAAAATGGTCGGCTGATAAAGGCTTCTTAGATGACCCACGCTTCTCTGCCTATGGCGTATTAGCCCCTAAATCAAAAGCGGACTTTGCTTTCTTATTACATGGCTACTATCATTTGAAAGATACGGGCGTCATGGCCATTGTTTTGCCACATGGGGTGCTCTTTAGAGGGGGCGCAGAAGGGAAGATACGCAAAGCCTTGTTAGAAAATGGTGCCATTGACACCGTCATTGGCTTACCTGCTAACATCTTCTTTAATACGTCCATTCCAACGACCGTAATTATCTTGAAGAAAGACCGTGCGAAAAAAGATGTGCTCTTTATTGATGCGTCACAAGATTTTGAAAAAATAAAAACGCAAAATACGCTACGAGATTACCATATTGACGCTATTTTAGAGGCCTATAAAACCCGTACAATTAAAGACAAGTATGCTTATGTCGCAGAATTTGATGAAATTGTGGAGAATGATTACAACTTAAACATTCCCCGTTACGTGGATACCTTTGAAGAAGAAGAAGTGATTCCCCTTGACTCTGTTTCGAAGTCTATTCAAGAGACTAAAGCAGAGTTAGCACAAGCAGAAACTGAGTTATTTAATATGTTGAAAGAATTAAACGGGACAACTGAAGAGGCAGAGAATGAGTTACAAGCGTTTATTTCACAATTGATGACTGATGGTGATAATAATGAATAAAGAAAGGGCAATACCTAAAGTTCGTTTTAAAAGCTTTAGTGGAGACTGGAAAAAATTAAAATTAAGTTCGGTTACTAGTAGAGTCCGAGGAAATGATGGAAGAATGAGCTTACCAACATTAACGATATCTGCTAGAAATGGATGGTTAGATCAAAGAGAACGTTTTTCAGGTAATATTGCAGGAAAGGAGCAAAAAAATTATACGCTTCTACGTAAAGGTGAACTATCTTATAATAAAGGGAATTCAAAACTAGCTAAATATGGAGTCGTATTTATGTTAGATAATTTTGAAGAAGCGCTTGTTCCAAGGGTCTATCATAGTTTTAAAACTACAAATGAAGCATCATCAAAATATATCGAATATTTATTTGAAACTAAAAAGCCAAATAAGGAATTAAGAAAACTTATAACATCTGGAGCTAGAATGGATGGATTATTAAATATAAATTATGATGACTTTATGGGGATTAAAATAACTATTCCTAAAATTAAAGAACAAAAAAAATTGGATCCTTATTCAAACAAATAGATGGCACTATTACCCTTCAACAGCAACTCCTAACCGACTACAAGCAATTTAAAAAAGCGTTGTTGCAACAGCTATTCCCACAAAAAGGAGAATCAGTACCGAAAATTCGATTTACTGGGTTTAGTGATGATTGGGAATTGAAAGAATTAAAAGAATTCATTGGTGAAGATGTATCTGATGGTGATTGGATTCAAAAGGAACACATACATGAATCAGGAGAGTATAGAATAGTTCAAACTGGAAATATAGGGATAGGAAGATACATAGATAAGCCTGAGAGTGCAAAATACCTCAACCAAGAAAGTTTTGATGAGTTAAAAGCAAATGAAATAAACCCTGGTGATATTTTAATATCCCGATTAGCTGATCCAGCAGGAAGAGCACTTATTCTGCCATTTACTTCTTCAAAAATGGTGACTGCAGTGGACGTTGCTATTATTAGACCAAATAAAAATTTCATTTCTCATTTTCTTGTCACTAGAATGAATTCATCAGAAACACTAAATGATATTTCGAAACAAGTAAGTGGTACCTCACATAAAAGATTAAGTAGGAAAAATTTAGAAAAAATAGAACTTAATGTACCTAATATTGAAGAACAAGAAAAAATCGGTCAACTCTTCAAAAAACTGGACGAAGCCATCGCAGGGCATGAACAGAAACTCGCCACCTATCAAGAACTCAAGAAAGCTCTATTACAACGGATGTTTGTTTAAAGTAAAGAGAGGAGGAACATCATGGCGATTACCTTTACATCTGAATCGGAATTAGAACAAACCCTCATCCATCAGTTGATTGGGGGGGAATCACAATGGACCTATCGCGGGGATTTGAATACCGAAGACAAGCTCTGGGATAACCTGCGTGAAAAATTGGAACGCAATAATAAAGATGTCTTAAATGACGTGCATTTAACCGAACAAGAATTTCATCAAGTGAAAAACCAATTACAGTTTGCCAACTTTTATCAAGCGTCCAAATGGTTGGCAGGGGAGAATGGCATTGCCAAAGTACAGGTGCAACGGGAAGATGCCTCCTTAGGGACCATTCGTTTAAAAGTTTTAAATCGGGCTGATATTGCCGGTGGCATGTCGTCGTATGAAGTTATTAATCAATTCCAAAGCTTTAAACAAAGCACCGATGACCGGGACCGTCGTTTTGACGTCACCCTTTTAATCAATGGCTTACCCCTGATTCATATCGAACTAAAAAACCGTGCTCATTCCTACATGGACGCCTTTCGGCAAATCAAGAAGTACTTGGTACAAGGGAAATTTACCGGTGTTTTTTCCGCTCTACAAATGTTTGTCGTCTCCAATGGCAGTGATACCCGTTATATTGCGGCGGCACAAGATACCCGGCTTAATGAACAATTCTTAGCAACCTGGGTAGATGCCAACAATGATCCGGTCACCAGTTACTTAGCCTTTGCGCAACACGTTTTATCGATTCCGCAAGCGCATAAAATGGTCACCCAGTATACGGTCATTGACAGTGATAAGAAAGCCTTGCTCTTATTGCGTCCCTATCAAATTCATGCCATTGAGGCCATTAAACAAGCCTCTATCCGGCAAGAATCGGGCTATGTCTGGCATACGACCGGGTCCGGGAAGACCTTGACTTCTTATAAAGCAGCCCGGAACCTCTTACATATTCCGTCTTTAGATAAGACGATTTTTATTGTAGACCGCGTTGATTTGGACCAACAAACAACGTCTTCCTTTGCTTCTTATGCAGAGAACGATGTCATTCAAATTGACGAAACGGATAACGTCAAAGACTTGATTAAAAAACTATTATCTGCTGATCGTACGGTCATTGTGACCACCATTCAAAAACTGAATCATCTGATGCGACGCATTGAAGGTAAAGAAACCACACCCCGCTATAAAAAATTAAGAGCATTGAATGTTGCGTTTGTGGTTGATGAATGCCATCGGGCAGTCTCCCCTCAAAAGAAACAAGAAATCGATCGTTTCTTCAGGCAACCTTTGTGGTATGGCTTTACCGGCACCCCCATTTTTGCCGAAAATGCAAAAAAAGAAACGGGAAACTTAGCTCGTACGACGGAAGAACAATACGGCAGTCGCTTGCATGAGTACACCGTTAAGGAGGCCATTCACGACAAGGCGGTTCTGGGCTTCCAAATCGAGTATAAATCCACCTTTTCAGACGATGAATTAGATGACCTCGTCTTACAAGTAGATCCAGACGCAGATGTGCGTGCCTTAACGGTCTTAGAAAAAGAAGCGATTATTCCTAAATCGGTTTATGAACATGAACAGCATATGTTAGAAGTGATTCATTCCATTTTGAATAAATCGCGCCGGAAATTAGGCTTTCAAAATGGTTCTGGGAAAACCTATACAGCCCTGTTAACCACGTCCTCAATCGCACAAGCACAAGCCTACTATGACTTATTCAAAAGAGTTGTGGCAGGCGAGACGGCTCTGGATATTCATGAAAAGGTCAAAAGTGTCTTACCTGATTTTCCAAAAATTGCGATGACGTACTCGTTGTCCGGGAATGAGGAGGCATCTGTTTCCCATCAAGCCAAGATGGCGGAAGCCCTTGCGGATTACAATTCGCTCTTTGATACGAATTTTTCCATTGAAACCATGCGGGCTTACAATCGAAACGTGAATGACCGCTTAGCGCGCAAACAAGAAAAGTACCTCTTTCGGAAAGAACAGTTGGATTTAGTCATTGTCGTGGACCGTCTGTTGACGGGATTTGATGCGCCGTGTTTATCGACCCTCTTTATTGATCGGCCTGTGATGCAGCCGCATAACGTGATTCAAGCCTTTTCACGAACCAATCGTTTGTTTGATCGCTCGAAGCAATTTG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38 | Streptococcus_phage(51.85%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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