CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP013978	Piscirickettsia salmonis strain CGR02 plasmid pPSCRG02-4, complete sequence	1 crisprs	NA	0	1	0	0
NZ_CP013977	Piscirickettsia salmonis strain CGR02 plasmid pPSCRG02-2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP013975	Piscirickettsia salmonis strain CGR02, complete genome	2 crisprs	DEDDh,cas3,DinG,csa3	0	0	32	0
NZ_CP013976	Piscirickettsia salmonis strain CGR02 plasmid pPSCRG02-1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	0

1. NZ_CP013978

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP013978_1

• CRISPR_ID: NZ_CP013978_1
• CRISPR_location: 31121-31220
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013978_1

Consensus_repeat	Method
AAAAGCACCTAGTTTGTGATTAAAAAGCACCTAGTT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013978_1

>1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder
GTGATTAAAAAGCACCTAGTTTGTGATT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013978_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013978_1

>merge|NZ_CP013978|1|31121-31220|CRISPRCasFinder
AAAAGCACCTAGTTTGTGATTAAAAGCACCTAGTTTGTGATTAAAAAGCACCTAGTTTGTGATTAAAAAGCACCTAGTTGTGAGAGAAAAGCACCTAGTT

>NZ_CP013978|1|1|31121-31220|CRISPRCasFinder
AAAAGCACCTAGTTTGTGATTAAAAGCACCTAGTTT	GTGATTAAAAAGCACCTAGTTTGTGATT
AAAAAGCACCTAGTTGTGAGAGAAAAGCACCTAGTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013978.1|WP_027242605.1|35583_36879_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase	unknown	unknown	gnl|CDD|234607
NZ_CP013978.1|WP_027242600.1|27139_27730_+|site-specific-integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271175
NZ_CP013978.1|WP_155046644.1|25786_26005_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013978.1|WP_036774189.1|21252_22260_-|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP013978.1|WP_047927058.1|39481_39838_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013978.1|WP_047927059.1|37899_38601_-|HAD-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223620
NZ_CP013978.1|WP_036774869.1|34291_35140_+|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|272946
NZ_CP013978.1|WP_098082828.1|22259_22517_-|transposase	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013978.1|WP_047927063.1|31256_32381_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013978.1|WP_032126795.1|26606_26867_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|171099
NZ_CP013978.1|WP_048876031.1|27757_29161_-|IS4-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP013978.1|WP_036775038.1|37173_37914_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377824
NZ_CP013978.1|WP_155046643.1|21052_21205_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP013978.1|WP_047927062.1|32380_32707_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|200128
NZ_CP013978.1|WP_080963647.1|24586_24757_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379554
NZ_CP013978.1|WP_036774631.1|23783_24248_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013978.1|WP_053063426.1|38576_39362_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|379312
NZ_CP013978.1|WP_053856777.1|33223_33445_+|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin	unknown	unknown	gnl|CDD|376852
NZ_CP013978.1|WP_047927060.1|33434_34295_+|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP013978.1|WP_016211910.1|26330_26603_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin	unknown	unknown	gnl|CDD|284238

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013978.1|WP_027242605.1|35583_36879_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase	gnl|CDD|234607	PRK00062, PRK00062, glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase.	0
NZ_CP013978.1|WP_027242600.1|27139_27730_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	1.0193e-17
NZ_CP013978.1|WP_036774189.1|21252_22260_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	7.05273e-24
NZ_CP013978.1|WP_047927059.1|37899_38601_-|HAD-family-hydrolase	gnl|CDD|223620	COG0546, Gph, Predicted phosphatases [General function prediction only].	1.73419e-33
NZ_CP013978.1|WP_032126795.1|26606_26867_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|171099	PRK11409, PRK11409, YoeB-YefM toxin-antitoxin system antitoxin YefM.	2.8285e-15
NZ_CP013978.1|WP_048876031.1|27757_29161_-|IS4-family-transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	1.99696e-13
NZ_CP013978.1|WP_036775038.1|37173_37914_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|377824	pfam07366, SnoaL, SnoaL-like polyketide cyclase. This family includes SnoaL a polyketide cyclase involved in nogalamycin biosynthesis. This family was formerly known as DUF1486. The proteins in this family adopt a distorted alpha-beta barrel fold. Structural data together with site-directed mutagenesis experiments have shown that SnoaL has a different mechanism to that of the classical aldolase for catalyzing intramolecular aldol condensation.	4.93216e-19
NZ_CP013978.1|WP_155046643.1|21052_21205_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	7.10335e-12
NZ_CP013978.1|WP_047927062.1|32380_32707_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|200128	TIGR01764, Probable_excisionase, DNA binding domain, excisionase family. An excisionase, or Xis protein, is a small protein that binds and promotes excisive recombination; it is not enzymatically active. This model represents a number of putative excisionases and related proteins from temperate phage, plasmids, and transposons, as well as DNA binding domains of other proteins, such as a DNA modification methylase. This model identifies mostly small proteins and N-terminal regions of large proteins, but some proteins appear to have two copies. This domain appears similar, in both sequence and predicted secondary structure (PSIPRED) to the MerR family of transcriptional regulators (pfam00376). [Unknown function, General].	3.33436e-05
NZ_CP013978.1|WP_080963647.1|24586_24757_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|379554	pfam14319, Zn_Tnp_IS91, Transposase zinc-binding domain. This domain is likely to be a zinc-binding domain. It is found at the N-terminus of transposases belonging to the IS91 family.	4.0743e-09
NZ_CP013978.1|WP_036774869.1|34291_35140_+|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein	gnl|CDD|272946	TIGR00180, Probable_chromosome-partitioning_protein_ParB, ParB/RepB/Spo0J family partition protein. This model represents the most well-conserved core of a set of chromosomal and plasmid partition proteins related to ParB, including Spo0J, RepB, and SopB. Spo0J has been shown to bind a specific DNA sequence that, when introduced into a plasmid, can serve as partition site. Study of RepB, which has nicking-closing activity, suggests that it forms a transient protein-DNA covalent intermediate during the strand transfer reaction.	5.68665e-30
NZ_CP013978.1|WP_053063426.1|38576_39362_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase	gnl|CDD|379312	pfam13649, Methyltransf_25, Methyltransferase domain. This family appears to be a methyltransferase domain.	2.25323e-20
NZ_CP013978.1|WP_016211910.1|26330_26603_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin	gnl|CDD|284238	pfam06769, YoeB_toxin, YoeB-like toxin of bacterial type II toxin-antitoxin system. YoeB_toxin is a family of bacterial toxins that forms one component of the type II toxin-antitoxin system in E. coli whose antitoxin is represented by YefM, found in pfam02604. The plasmid encoded Axe-Txe proteins in Enterococcus faecium act as an antitoxin-toxin pair. When the plasmid is lost, the antitoxin is degraded relatively quickly by host enzymes. This allows the toxin to interact with its intracellular target, thus killing the cell or impeding cell growth. These toxins are highly potent protein synthesis inhibitors, specifically blocking the initiation of translation. In the case of YoeB, it binds to the 50 S ribosomal subunit in 70 S ribosomes and interacts with the A site leading to mRNA cleavage at this site. As a result, the 3'-end portion of the mRNA is released from ribosomes, and translation initiation is effectively inhibited.	6.77983e-43
NZ_CP013978.1|WP_047927060.1|33434_34295_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	8.80376e-42
NZ_CP013978.1|WP_053856777.1|33223_33445_+|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin	gnl|CDD|376852	pfam02604, PhdYeFM_antitox, Antitoxin Phd_YefM, type II toxin-antitoxin system. Members of this family act as antitoxins in type II toxin-antitoxin systems. When bound to their toxin partners, they can bind DNA via the N-terminus and repress the expression of operons containing genes encoding the toxin and the antitoxin. This domain complexes with Txe toxins containing pfam06769, Fic/DOC toxins containing pfam02661 and YafO toxins containing pfam13957.	4.51875e-06

Protein sequences

>NZ_CP013978.1|WP_048876031.1|27757_29161_-|IS4-family-transposase
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
>NZ_CP013978.1|WP_027242600.1|27139_27730_+|site-specific-integrase
MGLSKQARILSERQERIVITHLKNTAAPQRNLVLFLLSIKAGLRAKEIAHIQWKMVFDSESQIGDCIQLTNDVSKGDQGGRIIPLNQQLKKALIILFESNPPHHENVPIIISQRKAAFTPQTIVNWFSRLYADLEFNGHSSHSGRRTFVTRAAKNVIHAGGSLRDVQQLVGHSSLQTTQHYIEGDSEAKKKLVELI
>NZ_CP013978.1|WP_032126795.1|26606_26867_-|hypothetical-protein
MLRDNINATAARDNFKSTCDTVCENNAPVLVKRKGAEDVVIISASDFGGMEETIHLLSSRIMATRLMRSMKQLDEGKGVQRDIIEE
>NZ_CP013978.1|WP_016211910.1|26330_26603_-|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin
MSKLNLLTWSDDAWDDYLYWQDTDKKVLKKINKLIKECQRTPTEGIGHPEPLKHDFSGYWSRKIKGEHRLVYSFDATSLMIAACRYHYDQ
>NZ_CP013978.1|WP_155046644.1|25786_26005_+|hypothetical-protein
MPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS
>NZ_CP013978.1|WP_080963647.1|24586_24757_+|hypothetical-protein
MKTQSAKLVPYTCKSCFCSACGKKATEIWIEKQNAVLPQCEYQHISSQKNLVTKSL
>NZ_CP013978.1|WP_036774631.1|23783_24248_+|hypothetical-protein
MNIFYLDHNIKKCAQYHCDTHVVKMILESTQILCTVLAKTGVDTPYRPTHKNHPCTLWAEESLDNWLWLLDLTMALNSEYMYRFNRKTPHKSAIVAQSLVFPEITPIGLTERPQAMPEKYRIPDDPVCAYRQYYLAEKNHLFKYTKRNKPIWQL
>NZ_CP013978.1|WP_098082828.1|22259_22517_-|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN
>NZ_CP013978.1|WP_036774189.1|21252_22260_-|IS3-family-transposase
MDEINKLSKEKNVTAIALCKAVSMPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENMGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK
>NZ_CP013978.1|WP_155046643.1|21052_21205_+|hypothetical-protein
MSEHTNGLIRRFLPKGTGFNEISDKEIAKIEHTLNARRRASLNYGMCQGK
>NZ_CP013978.1|WP_047927063.1|31256_32381_-|hypothetical-protein
MSTKVISKPHTTKQLTNRIDDIIKKKSANFCTTQAKSTEENTAKLFGKMFIDLQREKNIKKPITLEQAMLNIDGSLESLEVLTEFFTKMRNRNDPGVDREYWGKLTTIFEKESRKKRNNVVIPFPDKMLGDKTAIPNAFIRSALFGAVRRGPVELIDIDKPGDEWPLIASWKNTEIRFRGFRLDGRDFDLWIAIVEAVKDQGFGSSITISLYGLLKISMLKNTKSNRDSLKKRLDKLFSAKVHVKVNNASYKGHMVDSIASDDESKDNNKYRISLNSDMIDLFAAGFTKQCISERRKLKGYLTKWMQLYVSSHEVSKKNSKKPHKISLEKLKSLYDPELEMRYFKRDLKDAIKQLNDSNMYHCSIEANNFIATP
>NZ_CP013978.1|WP_047927062.1|32380_32707_-|hypothetical-protein
MAKLISLSDYANSKGMTRQAIAKRISQGKENSVSVNGRPFIKVKTVPEDVDSLPINKEFMSIQKAASYIGSGKTFIRVAVKSGEIKSYRIGVRLFLDAESVRIFKERK
>NZ_CP013978.1|WP_053856777.1|33223_33445_+|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin
MILIVKIISATNAKKYFGNASTQALQEPVIIEKHNRPELVLMSYETFISLKRNSVSSIVDTCQHLKIGDKYVK
>NZ_CP013978.1|WP_047927060.1|33434_34295_+|ParA-family-protein
MSNKTAKVISTANQKGGVGKTNLNFNLGCILADYGYKILFIDNDAQGNLTESILGSKSGLTENTMDLYLNKNVTPLKVSSNIDLIGTDSSLSEIQTSDFEIVFSMDHSIGGFKEQYDFIFIDCGPALGHSLLAALMASSHLLVPVELDGYSASGMEELLNNVNIIKGKSRYNPKLEVAGIIINKKPSPPTKLSKQMESMMRELYGDLIFKQTISVSTSMKECAMPGIGLPITQYVSLHKKRDKAANKVVKEVSNVLQELIFRLGLDKKKSIRSRKNNNSCTKGAVA
>NZ_CP013978.1|WP_036774869.1|34291_35140_+|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein
MSIADFTVGIRKNIGPDKDIGKSNEYIFVDPVLCKNWKYADRQAFELGEIEDLASDIKENGQHQPIVVRPIQDKKYKYEVIAGERRWRACRNIKIKVIAICRDLDDIAAFKVQSAENEKHSLSDYSKAMHYSKVIDNGVISQNELAKSLGVHKSTLSYLMAFSKVDAKVWDSIGDMSNVSGRTAGAIRALCSKGKEYQDAVILLAEKIKEGLGANALQKYVENLVSPKKIKPKKIVIKSKKGKELFTISDKNEIKISSKVLKNSDVDNIKKELKILLEKMVG
>NZ_CP013978.1|WP_027242605.1|35583_36879_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase
MEIIMSLESVFTLAQRVIPGGVNSPVRAFKGVGGDPVFFKNAQGAYLTDIQNKNYIDYVGSWGPMIVGHTHPEVVLAIKNALDNGLSFGAPTLIETQMAEKICQLIPAIEQVRMVNSGTEATMSAIRLARGATGRKKIIKFEGCYHGHSDGLLVQAGSGALTCGTPNSAGVPEEVTQHTLNLPYNDVNILQQTFESFGKEIATVILEPVAGNMNLILPKKEFLDKLRELCTEYGALLIFDEVMTGFRVGLGGASQRFNITPDLVTLGKVIGGGMPVGAFGGKREIMKYLAPEGEVYQAGTLSGNPIAMTAGLKTLELVSEDNFYQKLEEKTALLCQGLEASAETAGIEFTTQYCGSMFGLFFTNQKEITNFVETSACNGEQFKEFFHLMLEEGIYLAPSAFEAGFMSSAHSKDDIEKTINAASRCFQKMNR
>NZ_CP013978.1|WP_036775038.1|37173_37914_+|hypothetical-protein
MINKIYGKARNKKEIITDFSNDCWNGKVLGVIDDVLTPQTIVESPIKVTTGACNFKNLISLWVDAFPDLVYIQDEILYDCYANRVVCRWKVKGIHAGDFYGIPATNRRIDYRGTTFFTVINGKIVNYYADVNLQDIISQINDQNKIKTNAVESANDYLCKTIEQLIGYSLSRRRIECLSLYLMRMTKVKIGEILFISENTVKTHISQTLDAMNVKKYDELLENLISSNSLNLFLSLGARLIQSSIY
>NZ_CP013978.1|WP_047927059.1|37899_38601_-|HAD-family-hydrolase
MVPQKRSITNMNTKLLLIDFDGTICAVHHSVIHCIFHTYQKFNLPRVPDDETIKIILGSGVVIESMFKKLLSHSDINYSDKDLSEMCQYYRKFYASSSINEIKLYKNFDHILKVIKNKHLTSIIISNKEQERLLSATKYLNINHLVDHIIGTDDTVKAKPHQDMFNRKVQPLCSNLDLDNILIVGDTNSDIQFAKNCGFKSCFARYGYGNDNLAETADYVIDSPTELLSLVYA
>NZ_CP013978.1|WP_053063426.1|38576_39362_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase
MKLNQWNPKHYQYNSLIQQNNALDLLSALYTFHGNESILDIGCGDGKITSWIAQKIIFGQVIGIDKSFEMLQFAKQSHTSKNLIFTHCDINDSCFNEEFDLAVSFNCLHWIQGLNTACEKIFNAIKPGGIFLGLVYPRCDSLWIPAEKLSNAPEFRCYFKDFQNPYAFINNNDYKNSFKEASFNEVKITTIKNESKFKEKNEFTGYISGWLPHINAIPIEKQHIFLDQYYDLFMLETNQPPNTPFTLSYEQYNIWCHKKGV
>NZ_CP013978.1|WP_047927058.1|39481_39838_-|hypothetical-protein
MNTDKSNTHRITLRLPESLHKKLTQSSHKNSVSLTSEIVNRLDHSYKTLINDTSNPIQQAQRLVTMLDSVISTLSEATPIEIKSLSADEKMLLSTISTTKDQQQIIKKLIDIVNILNT

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP013978_1	1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder	31157-31184	28	NZ_CP013669	Piscirickettsia salmonis LF-89 = ATCC VR-1361 plasmid pPSLF89-4, complete sequence	3279-3306	0	1.0
NZ_CP013978_1	1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder	31157-31184	28	NZ_CP013669	Piscirickettsia salmonis LF-89 = ATCC VR-1361 plasmid pPSLF89-4, complete sequence	3301-3328	0	1.0
NZ_CP013978_1	1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder	31157-31184	28	NZ_CP013789	Piscirickettsia salmonis strain PM58386B plasmid p3PS7, complete sequence	50042-50069	0	1.0
NZ_CP013978_1	1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder	31157-31184	28	NZ_CP013789	Piscirickettsia salmonis strain PM58386B plasmid p3PS7, complete sequence	50064-50091	0	1.0
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13. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039089 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-111 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039089 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-111 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013798 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p2PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013798 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p2PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013978 (Piscirickettsia salmonis strain CGR02 plasmid pPSCRG02-4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012509 (Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012509 (Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013822 (Piscirickettsia salmonis strain PM25344B plasmid p1PS14, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039052 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-081 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039052 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-081 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013945 (Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPSCRG01-4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013945 (Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPSCRG01-4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039057 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-098 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039057 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-098 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038901 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006b plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038901 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006b plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013978 (Piscirickettsia salmonis strain CGR02 plasmid pPSCRG02-4, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.964

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 ****** *********************

32. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013822 (Piscirickettsia salmonis strain PM25344B plasmid p1PS14, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.964

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 ***** **********************

33. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013669 (Piscirickettsia salmonis LF-89 = ATCC VR-1361 plasmid pPSLF89-4, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

34. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013789 (Piscirickettsia salmonis strain PM58386B plasmid p3PS7, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

35. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013817 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p1PS10, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

36. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013793 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p2PS8, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

37. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013809 (Piscirickettsia salmonis strain PM31429B plasmid p3PS12, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

38. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013784 (Piscirickettsia salmonis strain PM49811B plasmid p3PS6, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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39. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039089 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-111 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

40. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013798 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p2PS9, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

41. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013978 (Piscirickettsia salmonis strain CGR02 plasmid pPSCRG02-4, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

42. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012509 (Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

43. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039052 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-081 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

44. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013945 (Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPSCRG01-4, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

45. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039057 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-098 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

46. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

47. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038901 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006b plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893

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******************* ******   

48. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013669 (Piscirickettsia salmonis LF-89 = ATCC VR-1361 plasmid pPSLF89-4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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49. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013789 (Piscirickettsia salmonis strain PM58386B plasmid p3PS7, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

50. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013817 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p1PS10, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

51. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013793 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p2PS8, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

52. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013809 (Piscirickettsia salmonis strain PM31429B plasmid p3PS12, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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53. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013784 (Piscirickettsia salmonis strain PM49811B plasmid p3PS6, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

54. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039089 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-111 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

55. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013798 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p2PS9, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

56. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013978 (Piscirickettsia salmonis strain CGR02 plasmid pPSCRG02-4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

57. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012509 (Piscirickettsia salmonis strain PM32597B1 plasmid pPSB1-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

58. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039052 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-081 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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59. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013945 (Piscirickettsia salmonis strain PSCGR01 plasmid pPSCRG01-4, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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60. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039057 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-098 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

61. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

62. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038901 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006b plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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*********************  *..* 

63. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to NC_047749 (Enterobacteria phage DT571/2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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**** ****************. *  **

64. spacer 1.1|31157|28|NZ_CP013978|CRISPRCasFinder matches to KM979354 (Enterobacteria phage DT57C, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.821

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gtgaataaaaagcacctagttcttcttt	Protospacer
**** ****************. *  **

2. NZ_CP013977

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	0 : 29171	33	unidentified_phage(38.89%)	terminase,capsid,tail,head,integrase,transposase	attL 4301:4360|attR 26438:26729

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013977|0:29171|DBSCAN-SWA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MQANEQFLEFRKRHNLRQKDISEITGYSASHITKWALGREHKDFREVPEQALRLMNYWEEEQKELFKNSGSKVWGLINHKGGVGKTTITFHFGKMLADKGYKVLLVDHDPQRHLTSSFVQDFDDIESTVADIYQGKPWKTLNVKNNLDIIPGYEKLHKVQEIEDATEIIFLLKEAIDSVKDNYDYVLIDSLPSDGPLYKACLVAANLILVPYTPDNYDTWGLHDITKQIDKLKMRGINTNLKIGALIGNNIARPTRSFDKTILQSVAEQFKDQFLTLELSQSVKVKECKNPYICESITEYAPSSQAAKDYDKALKHILKSIMVKA
>NZ_CP013977|0:29171|16372_16855_-|WP_027242949.1|terminase|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP013977|0:29171|2005_2980_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA
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MLKYKGYIGKVEEIHEGDEYIYGIVPNIKDVISFRGKNIKELTKDFKLAIDDYLALCDEREEEPDKPFSGRFMTRLGSDLHEEVFLASMNDSGAKSMNDWVVSACLEKLKHDQTVKR

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155046645.1|2999_3161_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242941.1|3160_3814_-	DUF4376 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876242.1|3825_4203_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
4301:4360	attL	NA	NA	NA	NA
WP_036773116.1|4687_5662_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	3.7e-26	31.2
WP_027242942.1|5681_6359_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_062365785.1|6358_7414_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242943.1|9805_10222_-	hypothetical protein	A0A2R3UA88	Siphoviridae_environmental_samples	2.2e-20	41.7
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WP_027242945.1|11121_11637_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420855.1|12440_12656_-|head,tail	phage head-tail connector protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242948.1|16184_16370_-	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	9.0e-06	47.3
WP_027242949.1|16372_16855_-|terminase	P27 family phage terminase small subunit	Q9B019	Phage_GMSE-1	3.6e-14	34.0
WP_027242950.1|16941_17325_-	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.3e-26	46.3
WP_027242951.1|17537_18404_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|19029_20004_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_080963620.1|20101_20458_-	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	1.7e-16	36.4
WP_048876240.1|20441_20633_-	addiction module toxin, HicA family	NA	NA	NA	NA
WP_027242954.1|20840_21206_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069971681.1|21738_22713_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.2
WP_016211078.1|22889_23243_-	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	6.5e-13	34.8
WP_027242955.1|23235_23496_-	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212329.1|23726_24317_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	3.2e-20	35.3
WP_075278739.1|24382_24739_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|24852_25827_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_016211499.1|27194_28178_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
26438:26729	attR	NA	NA	NA	NA
WP_027242956.1|28193_29171_-	AAA family ATPase	Q7M293	Enterobacteria_phage	7.8e-16	32.7

3. NZ_CP013975

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP013975_1

• CRISPR_ID: NZ_CP013975_1
• CRISPR_location: 1099990-1100085
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013975_1

Consensus_repeat	Method
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013975_1

>1.1|1100014|48|NZ_CP013975|CRISPRCasFinder
ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013975_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013975_1

>merge|NZ_CP013975|1|1099990-1100085|CRISPRCasFinder
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAGATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTCCAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG

>NZ_CP013975|1|1|1099990-1100085|CRISPRCasFinder
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG	ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC
CAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013975.1|WP_017378003.1|1110062_1110893_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|367907
NZ_CP013975.1|WP_155048058.1|1089418_1089601_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_017378007.1|1101143_1103087_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226654
NZ_CP013975.1|WP_027242834.1|1090149_1091457_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_036773793.1|1091916_1092294_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_017376708.1|1092438_1092840_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP013975.1|WP_036773465.1|1110879_1112919_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA	unknown	unknown	gnl|CDD|236137
NZ_CP013975.1|WP_048875961.1|1103232_1104636_-|IS4-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP013975.1|WP_017378005.1|1105623_1106343_-|sulfate-transporter-CysZ	unknown	unknown	gnl|CDD|179898
NZ_CP013975.1|WP_017378004.1|1106456_1109996_+|chromosome-segregation-protein-SMC	unknown	unknown	gnl|CDD|274008
NZ_CP013975.1|WP_144420647.1|1094592_1094790_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_053093668.1|1094927_1095527_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP013975.1|WP_027243145.1|1112934_1113990_+|protease-SohB	unknown	unknown	gnl|CDD|236978
NZ_CP013975.1|WP_144420648.1|1095709_1097182_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_CP013975.1|WP_048875965.1|1116688_1117609_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_017377998.1|1114000_1114531_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|284031
NZ_CP013975.1|WP_017378009.1|1097584_1099330_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_CP013975.1|WP_155046604.1|1094251_1094392_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_017378006.1|1104755_1105385_-|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|381113
NZ_CP013975.1|WP_048875964.1|1093404_1094184_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376573

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013975.1|WP_048875961.1|1103232_1104636_-|IS4-family-transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	1.76184e-13
NZ_CP013975.1|WP_017378007.1|1101143_1103087_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226654	COG4191, COG4191, Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system [Signal transduction mechanisms].	6.24409e-47
NZ_CP013975.1|WP_027243145.1|1112934_1113990_+|protease-SohB	gnl|CDD|236978	PRK11778, PRK11778, putative inner membrane peptidase; Provisional.	0
NZ_CP013975.1|WP_017376708.1|1092438_1092840_-|transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	0.00109659
NZ_CP013975.1|WP_036773465.1|1110879_1112919_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA	gnl|CDD|236137	PRK07956, ligA, NAD-dependent DNA ligase LigA; Validated.	0
NZ_CP013975.1|WP_017378005.1|1105623_1106343_-|sulfate-transporter-CysZ	gnl|CDD|179898	PRK04949, PRK04949, putative sulfate transport protein CysZ; Validated.	2.22151e-69
NZ_CP013975.1|WP_017378004.1|1106456_1109996_+|chromosome-segregation-protein-SMC	gnl|CDD|274008	TIGR02168, Chromosome_partition_protein_Smc, chromosome segregation protein SMC, common bacterial type. SMC (structural maintenance of chromosomes) proteins bind DNA and act in organizing and segregating chromosomes for partition. SMC proteins are found in bacteria, archaea, and eukaryotes. This family represents the SMC protein of most bacteria. The smc gene is often associated with scpB (TIGR00281) and scpA genes, where scp stands for segregation and condensation protein. SMC was shown (in Caulobacter crescentus) to be induced early in S phase but present and bound to DNA throughout the cell cycle. [Cellular processes, Cell division, DNA metabolism, Chromosome-associated proteins].	0
NZ_CP013975.1|WP_017378003.1|1110062_1110893_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|367907	pfam04354, ZipA_C, ZipA, C-terminal FtsZ-binding domain. This family represents the ZipA C-terminal domain. ZipA is involved in septum formation in bacterial cell division. Its C-terminal domain binds FtsZ, a major component of the bacterial septal ring. The structure of this domain is an alpha-beta fold with three alpha helices and a beta sheet of six antiparallel beta strands. The major loops protruding from the beta sheet surface are thought to form a binding site for FtsZ.	1.17377e-13
NZ_CP013975.1|WP_144420648.1|1095709_1097182_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	9.17808e-06
NZ_CP013975.1|WP_048875964.1|1093404_1094184_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	0.00345182
NZ_CP013975.1|WP_017377998.1|1114000_1114531_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|284031	pfam06508, QueC, Queuosine biosynthesis protein QueC. This family of proteins participate in the biosynthesis of 7-carboxy-7-deazaguanine. They catalyze the conversion of 7-deaza-7-carboxyguanine to preQ0.	1.95217e-24
NZ_CP013975.1|WP_017378009.1|1097584_1099330_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	0.000214736
NZ_CP013975.1|WP_017378006.1|1104755_1105385_-|response-regulator	gnl|CDD|381113	cd17569, REC_HupR-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of hydrogen uptake protein regulator (HupR) and similar domains. This family is composed of mostly uncharacterized response regulators with similarity to the REC domains of response regulator components of two-component systems that regulates hydrogenase activity, including HupR and HoxA. HupR is part of the HupT/HupR system that controls the synthesis of the membrane-bound [NiFe]hydrogenase, HupSL, of the photosynthetic bacterium Rhodobacter capsulatus. It contains an N-terminal REC domain, a central sigma-54 interaction domain that lacks ATPase activity, and a C-terminal DNA-binding domain. Members of this family contain a REC domain and various output domains including the cyclase homology domain (CHD) and the c-di-GMP phosphodiesterase domains, HD-GYP and EAL. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	1.63665e-55
NZ_CP013975.1|WP_053093668.1|1094927_1095527_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	0.000376208

Protein sequences

>NZ_CP013975.1|WP_017378009.1|1097584_1099330_-|hypothetical-protein
MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP
>NZ_CP013975.1|WP_144420648.1|1095709_1097182_-|hypothetical-protein
MPTTMIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN
>NZ_CP013975.1|WP_053093668.1|1094927_1095527_-|hypothetical-protein
MRIITKPTTAKCNIQAYIRYLLSEPVRTSCTGLSDVLLNISHDSVNRFLLRENYRPEDLWTEVSEKIDLNNGVLSVDDMVIDKPYSNAEKTDLIGFFYSGKHHCVVKGVNVITLYYTDQHDVSVPINFRIIDPDEGKTKNEHFREMLQQVLSWGLQPSWVTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013975.1|WP_144420647.1|1094592_1094790_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVSEDIIRLFSIANSMPRLYFLINFRFSMLEYQQSPAASHGVLSTG
>NZ_CP013975.1|WP_155046604.1|1094251_1094392_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAGAVAVRFKQSIVGMKVVYKSNGTTLRARSEQKRTLAQ
>NZ_CP013975.1|WP_048875964.1|1093404_1094184_-|hypothetical-protein
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP013975.1|WP_017376708.1|1092438_1092840_-|transposase
MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013975.1|WP_036773793.1|1091916_1092294_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
>NZ_CP013975.1|WP_027242834.1|1090149_1091457_+|hypothetical-protein
MKFIYPGINAPLDTEKSLYAETTQGYFSHKESGKALDFNFIKKQESYFSQWDKRTAFTCEEYKALTHQQRLQLYRLHTTRWNYTLSLLLKDPGAGPDSPLYAEKQFLQNLNENEEMRKLYAGWFIDYVESREGETSKAVEALFKKEMQLKPECDLSKEKQIAVKVRGFRDEITELQAWLMNGSSAERIAIEKYDTKAVNQFIKYQLGQVSKSEFNKTFERAQSKCNKVLKNALHLTTSAASILTEKKIDLNSSVEWERLKNSQHLQKAVLILHKSNINLADSWDTLKDNSHLQKAVLTLHHESSINLTEHWDKVKNNSPLQKALAASYDYLNAERSSWSKMHHNHGIRQTHKFIRHLMASENQTLSGIQAEMQQWLHGYGHFSRASGSASNSRMSFALQSGLCPQADTPPTLLFNTSLQATEVEQEVTNQVTLSS
>NZ_CP013975.1|WP_155048058.1|1089418_1089601_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAAVSFLLIVKGAIIVFDRTYALTAGINFDFSSASMPFIIKSLTTPINKSFLS
>NZ_CP013975.1|WP_017378007.1|1101143_1103087_-|hypothetical-protein
MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS
>NZ_CP013975.1|WP_048875961.1|1103232_1104636_-|IS4-family-transposase
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
>NZ_CP013975.1|WP_017378006.1|1104755_1105385_-|response-regulator
MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD
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>NZ_CP013975.1|WP_017378004.1|1106456_1109996_+|chromosome-segregation-protein-SMC
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>NZ_CP013975.1|WP_017378003.1|1110062_1110893_+|hypothetical-protein
METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG
>NZ_CP013975.1|WP_036773465.1|1110879_1112919_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA
MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN
>NZ_CP013975.1|WP_027243145.1|1112934_1113990_+|protease-SohB
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>NZ_CP013975.1|WP_048875965.1|1116688_1117609_-|hypothetical-protein
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Crispr_ID: NZ_CP013975_2

• CRISPR_ID: NZ_CP013975_2
• CRISPR_location: 1672037-1672146
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013975_2

Consensus_repeat	Method
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013975_2

>2.1|1672063|58|NZ_CP013975|CRISPRCasFinder
CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013975_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013975_2

>merge|NZ_CP013975|2|1672037-1672146|CRISPRCasFinder
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCTCGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGCTATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC

>NZ_CP013975|2|2|1672037-1672146|CRISPRCasFinder
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCT	CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013975.1|WP_155046588.1|1673539_1673749_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_155635850.1|1670123_1670291_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_144420682.1|1672843_1673005_+|phosphatase	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_027242577.1|1667922_1669224_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273036
NZ_CP013975.1|WP_081078116.1|1669835_1670024_+|DUF2062-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378263
NZ_CP013975.1|WP_027243098.1|1676413_1677559_+|carboxypeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|349453
NZ_CP013975.1|WP_027243099.1|1674864_1676178_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236722
NZ_CP013975.1|WP_027243095.1|1679299_1681585_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_048876008.1|1666951_1667926_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP013975.1|WP_155046590.1|1665046_1665211_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_027243096.1|1677845_1678478_-|MarC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225006
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NZ_CP013975.1|WP_155046589.1|1666722_1666872_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_155049745.1|1677633_1677810_+|DUF1508-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_062365724.1|1669241_1669589_+|DUF2062-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378263
NZ_CP013975.1|WP_017376785.1|1670531_1671437_-|LysR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|182768
NZ_CP013975.1|WP_036774017.1|1665501_1666377_+|IS982-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|372648
NZ_CP013975.1|WP_144420683.1|1678654_1679311_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013975.1|WP_017376798.1|1682499_1683135_+|LysE-family-translocator	unknown	unknown	gnl|CDD|224199

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013975.1|WP_027243098.1|1676413_1677559_+|carboxypeptidase-family-protein	gnl|CDD|349453	cd06234, M14_PaCCP-like, Peptidase M14-like domain of ATP/GTP binding proteins and cytosolic carboxypeptidases similar to Pseudomonas aerugnosa CCP (PaCCP). A bacterial subgroup of the Peptidase M14-like domain of Nna-1 (Nervous system Nuclear protein induced by Axotomy), also known as ATP/GTP binding protein (AGTPBP-1) and cytosolic carboxypeptidase (CCP)-like proteins. This subgroup includes PaCCP from Pseudomonas aeruginosa, a carboxypeptidase homologous to M14D subfamily of human CCPs. Structural complexes with well-known inhibitors of metallocarboxypeptidases indicate that PaCCP might only possess C-terminal hydrolase activity against cellular substrates of particular specificity. The Peptidase M14 family of metallocarboxypeptidases are zinc-binding carboxypeptidases (CPs) which hydrolyze single, C-terminal amino acids from polypeptide chains, and have a recognition site for the free C-terminal carboxyl group, which is a key determinant of specificity. Nna1-like proteins are active metallopeptidases that are thought to act on cytosolic proteins (such as alpha-tubulin in eukaryotes) to remove a C-terminal tyrosine. Nna1-like proteins from the different phyla are highly diverse, but they all contain a unique N-terminal conserved domain right before the CP domain. It has been suggested that this N-terminal domain might act as a folding domain.	9.10914e-164
NZ_CP013975.1|WP_017376798.1|1682499_1683135_+|LysE-family-translocator	gnl|CDD|224199	COG1280, RhtB, Putative threonine efflux protein [Amino acid transport and metabolism].	2.53606e-35
NZ_CP013975.1|WP_027242577.1|1667922_1669224_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein	gnl|CDD|273036	TIGR00361, Recombination_protein_2, DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2. Apparant orthologs are found in 5 species so far (Haemophilus influenzae, Escherichia coli, Bacillus subtilis, Neisseria gonorrhoeae, Streptococcus pneumoniae), of which all but E. coli are model systems for the study of competence for natural transformation. This protein is a predicted multiple membrane-spanning protein likely to be involved in DNA internalization. In a large number of bacterial species not known to exhibit competence, this protein is replaced by a half-length N-terminal homolog of unknown function, modelled by the related model ComEC_N-term. The role for this protein in species that are not naturally transformable is unknown. [Cellular processes, DNA transformation].	2.99327e-41
NZ_CP013975.1|WP_081078116.1|1669835_1670024_+|DUF2062-domain-containing-protein	gnl|CDD|378263	pfam09835, DUF2062, Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2062). This domain, found in various prokaryotic proteins, has no known function.	5.20918e-06
NZ_CP013975.1|WP_062365724.1|1669241_1669589_+|DUF2062-domain-containing-protein	gnl|CDD|378263	pfam09835, DUF2062, Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2062). This domain, found in various prokaryotic proteins, has no known function.	2.07282e-26
NZ_CP013975.1|WP_027243099.1|1674864_1676178_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236722	PRK10590, PRK10590, ATP-dependent RNA helicase RhlE; Provisional.	0
NZ_CP013975.1|WP_017376785.1|1670531_1671437_-|LysR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|182768	PRK10837, PRK10837, putative DNA-binding transcriptional regulator; Provisional.	3.43302e-86
NZ_CP013975.1|WP_036774017.1|1665501_1666377_+|IS982-family-transposase	gnl|CDD|372648	pfam13612, DDE_Tnp_1_3, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contains three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.54754e-84
NZ_CP013975.1|WP_027243096.1|1677845_1678478_-|MarC-family-protein	gnl|CDD|225006	COG2095, MarC, Multiple antibiotic transporter [Intracellular trafficking and secretion].	1.76545e-45
NZ_CP013975.1|WP_048876008.1|1666951_1667926_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	1.65717e-79

Protein sequences

>NZ_CP013975.1|WP_017376785.1|1670531_1671437_-|LysR-family-transcriptional-regulator
MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL
>NZ_CP013975.1|WP_155635850.1|1670123_1670291_-|hypothetical-protein
MEKIERVYARDHGISGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRSKVG
>NZ_CP013975.1|WP_081078116.1|1669835_1670024_+|DUF2062-domain-containing-protein
MIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKK
>NZ_CP013975.1|WP_062365724.1|1669241_1669589_+|DUF2062-domain-containing-protein
MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSCVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP013975.1|WP_027242577.1|1667922_1669224_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein
MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY
>NZ_CP013975.1|WP_048876008.1|1666951_1667926_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP013975.1|WP_155046589.1|1666722_1666872_-|hypothetical-protein
MTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP013975.1|WP_155046590.1|1666378_1666543_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI
>NZ_CP013975.1|WP_036774017.1|1665501_1666377_+|IS982-family-transposase
MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG
>NZ_CP013975.1|WP_155046590.1|1665046_1665211_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI
>NZ_CP013975.1|WP_144420682.1|1672843_1673005_+|phosphatase
MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013975.1|WP_155046588.1|1673539_1673749_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP
>NZ_CP013975.1|WP_027243099.1|1674864_1676178_-|DEAD/DEAH-box-helicase
MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK
>NZ_CP013975.1|WP_027243098.1|1676413_1677559_+|carboxypeptidase-family-protein
MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR
>NZ_CP013975.1|WP_155049745.1|1677633_1677810_+|DUF1508-domain-containing-protein
MSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE
>NZ_CP013975.1|WP_027243096.1|1677845_1678478_-|MarC-family-protein
MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA
>NZ_CP013975.1|WP_144420683.1|1678654_1679311_+|hypothetical-protein
MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP
>NZ_CP013975.1|WP_027243095.1|1679299_1681585_-|hypothetical-protein
MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV
>NZ_CP013975.1|WP_017376797.1|1681858_1682218_-|hypothetical-protein
MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG
>NZ_CP013975.1|WP_017376798.1|1682499_1683135_+|LysE-family-translocator
MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	3456 : 56568	54	Escherichia_phage(28.57%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	185958 : 322960	120	Acinetobacter_phage(11.11%)	tRNA,protease,transposase,tail	NA
DBSCAN-SWA_3	330926 : 384340	49	Staphylococcus_phage(57.14%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	441343 : 563731	107	Staphylococcus_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	573558 : 679354	107	Bacillus_phage(16.67%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	686709 : 758939	54	Staphylococcus_phage(44.44%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	771412 : 831636	51	Acinetobacter_phage(18.18%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	845299 : 903960	48	Bacillus_phage(26.67%)	protease,transposase,integrase	attL 871378:871437|attR 887535:888031
DBSCAN-SWA_9	909335 : 1046864	117	Staphylococcus_phage(18.52%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_10	1052076 : 1104636	52	unidentified_phage(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_11	1112934 : 1154996	34	Burkholderia_virus(40.0%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_12	1195184 : 1250035	44	uncultured_Mediterranean_phage(25.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_13	1260934 : 1305990	38	uncultured_Caudovirales_phage(12.5%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_14	1376129 : 1406556	29	Staphylococcus_phage(28.57%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_15	1412222 : 1517660	93	Burkholderia_phage(13.64%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_16	1575995 : 1591566	15	unidentified_phage(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_17	1606553 : 1719488	110	Staphylococcus_phage(25.93%)	tRNA,protease,transposase,integrase	attL 1626736:1626795|attR 1654201:1655195
DBSCAN-SWA_18	1739252 : 1861929	103	Acinetobacter_phage(13.33%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_19	1891684 : 1941970	40	Staphylococcus_phage(37.5%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_20	1949049 : 2005185	52	Burkholderia_virus(33.33%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_21	2022687 : 2084777	44	Staphylococcus_phage(22.22%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_22	2089281 : 2214407	111	Staphylococcus_phage(19.05%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	2226218 : 2281544	48	Staphylococcus_phage(41.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_24	2353420 : 2400135	40	Synechococcus_phage(20.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_25	2405830 : 2442109	34	Acinetobacter_phage(25.0%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_26	2487211 : 2553112	56	Staphylococcus_phage(18.18%)	tRNA,plate,transposase	NA
DBSCAN-SWA_27	2557113 : 2620914	51	Planktothrix_phage(10.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_28	2652707 : 2696067	42	Staphylococcus_phage(22.22%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_29	2749048 : 2784988	31	Staphylococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_30	2808197 : 2848413	45	Staphylococcus_phage(42.86%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_31	2935810 : 3047890	102	Staphylococcus_phage(12.5%)	tRNA,protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_32	3080884 : 3142291	57	Acinetobacter_phage(33.33%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013975|3456:56568|DBSCAN-SWA
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MKHSIPISKIMNTDLITVNENNKFSELRSIMEKNGINHLPVMENRKITGIISYKDVLKTSFSDRYTNQQESDQLLDYSMAITDFMTKELFTIKETDTVKHATQMLVEKKFNALPVVDNNANLVGIITLHDLLVFLLDQY
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MPHIELKYSDDLIIDTNKIFEAIENTINEYDSSSGVCKSRAYATSLYKHTHILVSVFLLKKPHRDDNFSQGLTYNLEQVVMEFIQQECHFSLSLEYKSDFYITNQYSVEKNC
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017378479.1|4950_6843_+|tRNA	tRNA uridine-5-carboxymethylaminomethyl(34) synthesis enzyme MnmG	NA	NA	NA	NA
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WP_016209339.1|14671_16063_+	F0F1 ATP synthase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_017378489.1|16087_16516_+	F0F1 ATP synthase subunit epsilon	NA	NA	NA	NA
WP_027242749.1|16609_17974_+	UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase	A0A0N7G7I9	Chrysochromulina_ericina_virus	3.9e-37	40.9
WP_027242750.1|18030_19866_+	glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)	A7IW18	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	5.8e-121	43.7
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WP_017378498.1|23042_23699_-	2OG-Fe dioxygenase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376300.1|25200_25458_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275376.1|25570_26323_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376303.1|26381_27095_-	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	2.2e-28	36.0
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WP_155046628.1|31053_31278_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_051929591.1|35942_36215_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376728.1|36611_38030_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_027242561.1|42157_42994_+	protoheme IX farnesyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_080963573.1|43159_43477_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013975|185958:322960|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP013975|330926:384340|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP013975|330926:384340|341438_341627_-|WP_080963634.1|DBSCAN-SWA
MPTQNLTALYLLDSEQSLQYYFDHYAKPMRDDGIKKFGNHFRATRNILKISQSFTLKSLNIR

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036771639.1|376211_377186_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_027242739.1|377546_380216_-	aminopeptidase N	A0A0P0IY26	Acinetobacter_phage	5.5e-19	24.5
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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP013975|441343:563731|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017378374.1|455405_456392_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	2.2e-42	34.2
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WP_017378378.1|459894_460944_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
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WP_017378384.1|467574_469956_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|469961_470249_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
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WP_144420757.1|483466_484030_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_017377702.1|484133_484682_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377275.1|503618_504341_-	aquaporin family protein	M1H9L8	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.6e-26	37.6
WP_017377274.1|505402_506755_+	PAS domain-containing protein	A0A1B0V854	Salmonella_phage	3.2e-36	45.7
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WP_017377271.1|508907_509237_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP013975|573558:679354|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017376586.1|604425_605517_-	anhydro-N-acetylmuramic acid kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017376587.1|605513_606878_-	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	A0A088FRM7	Mycobacterium_phage	2.6e-17	52.2
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WP_017376590.1|609751_610420_-	hypothetical protein	A0A2H4JFM9	uncultured_Caudovirales_phage	4.7e-28	44.1
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WP_017376593.1|613358_613763_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243040.1|613996_615079_+	alanine racemase	A0A0P0YM39	Yellowstone_lake_mimivirus	1.4e-18	27.2
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WP_017377725.1|670014_670536_+	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_017377724.1|670569_670821_+	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	3.9e-20	57.6
WP_017377722.1|673088_673616_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377721.1|673732_676045_-	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773913.1|676173_676989_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377718.1|677245_677710_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|679126_679354_+|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP013975|686709:758939|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017376209.1|729709_730774_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242906.1|732976_734044_-	hydroxymethylglutaryl-CoA reductase	NA	NA	NA	NA
WP_036771893.1|734328_736746_+	outer membrane protein assembly factor BamA	NA	NA	NA	NA
WP_017376207.1|736826_737360_+	OmpH family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376206.1|737470_738520_+	UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_075275393.1|738537_738984_+	3-hydroxyacyl-ACP dehydratase FabZ	NA	NA	NA	NA
WP_017376204.1|738983_739757_+	acyl-ACP--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_027242907.1|739775_740930_+	lipid-A-disaccharide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017376201.1|741143_741713_+	ribonuclease HII	V5LS49	Emiliania_huxleyi_virus	3.4e-27	43.4
WP_017376200.1|741736_745243_+	DNA polymerase III subunit alpha	A0A291AVA6	Streptomyces_phage	1.9e-192	38.6
WP_027242908.1|745320_746280_+	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_017376198.1|746254_747715_+|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	NA	NA	NA	NA
WP_017376197.1|747750_749280_+	SulP family inorganic anion transporter	A0A2H4J153	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-85	42.6
WP_080999970.1|749313_750717_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155635845.1|752874_754443_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876012.1|754527_755931_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_036771330.1|757964_758939_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP013975|771412:831636|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP013975|845299:903960|DBSCAN-SWA
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MQKEVDKPGQNLHEHYFDLQGQALVEGQLKGKAGPRKVLVAVDLVVRSAGKSEEAQAQVRTQAKLDFFYQQLAGTLPPELSRVKLRANFDVLTCSDQRFSIIPIHKEMYFHVLRCVNAVTIDQDRARAAFEFAYNHVYQLINADIAAFLNDRKGVRVGELNRFIDQQRVKYAAVAESMVMSHLLSPPVADLREKKRKWLKTHTAADMDFIATNHVTGVLTHVTGCKQSSHSKKDQPAAMMAIDRYALARPDDAKPLQSQVKVPSLKEFKAEGDSITVSQQIRDFMVDHNLQGRDTPLVVYNLLTSLPRGVDSCDQQASAKKIFKGAHHYNATRDNRPMFYVMNLPINQHTQYLYYTGSPEQREALLLADLAMVHTVLRDLVPGSRLVANIDTLYQNYLRKRSSDKEPWESYFSKSLEGKQAIKLLRALKEGINHGKVIDFSANDDVTRDVLLKKALLKLYASKYPGHKVDDQKEYASLAQALFLAATNNYNFKGCKSANERFSYIENLNALLFAFKAGTLQGDIARQMRDALTTYIEGGNERDFALTLHCINDRYNVYNAGVVPSCMDTGTPKCYTKPDKNVASGKELRVGGTNTNFFLARSYCNVSQDKASAVQAHAKKMGKRMNKLQEFTEKQWEKYHRTYCSSSSDGKVIKIADMRRVARAVIADYAEKAFAWGSHFKQEARDFLADNTDLFLVKSESESKWTVEKSRELLKKTVVLRKKIQGSEKFSHKSTFNTRLLFTEHVLQSHLDAAKKTAEEVEVPEPVLVEV
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MPTTSKLKAYLNRPNNINRRRALEEMLPFIQEAYQNVSLNNTVIGAEQTWPEIQRVFSEQYSELISQLSMLEYFRLFTLFDYLSDTGADATQHMPHGDFCQAVAQIIGLATPHLAKKSIPGFVTTTNHHIEQFIRWGTKQCRQEIVHATHDLAQQLTACRDNFIHSYTQKKDANEDENMIGYVLTYRDKIEMTPYLPTKRNLN
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MFKVIFLLVLFAMLMPVHAISVSLSVYLDENIPTKIILSQVKEYDKGLEKKFQRKYHLYL
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MPKFNLLSVMDNQESADHLLFSVKDKLYNKEVTLKNCYFNLQGQLLAEGWICGSRTLIEVNLTSELKPEWYVEALDSAIEKIKKTEVSDKNYPGANTHMLSFLEAYFLNYVEKGLAEIDGEKKGSLLQKLNAKLSFLSSLESNGTTLRARSEQKRTLAQ
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MSDEKNGRDESSKLLYCSFCGKSQHEVRKLIAGPSVYICDECVSLCGDIVREELKEGETSEEPSQLPTPREIKQVLDEYVIGQKQAKKVLAVAVYNHYKRLMPGGGEVKADDVELSKSNILLVGPTGCGKTLLAQTLARLLDVPFTIADATTLTEAGYVGEDVENIIQKLLQKCDYDVEKAQKGIVYIDEIDKISRKSDNPSITRDVSGEGVQQALLKLIEGTVASVPPQGGRKHPQQEFLQVDTANILFICGGAFDGLEKVIRERSEKGGIGFSAEVRGKDETKNTSDVLQSVEPEDLMKFGLIPEFIGRLPVTAVLRELDEDALVRVLKEPKNSLVKQYKRLFEMEGVELDLRDDALRAIARKSIERKAGARGLRSVLEQVLLNTMYEIPSQEEAKTIVVDRSVIEGQSEPLIVYEESNDNDQQQQRAGQQ
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
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MKIKRTMLFLCAIGVTVTAYANEKASCQQFLKYGNPGGVDQYLCRKGYVVGYNYATKQPRWVAYRLTRSSVSHAFLQKEAFYADDDIPSSFRVIPKDYSKSGYSYVQFAPQASMDFNKLSLKQSFLLSNTSPQNKQLSRLAWRKLEKDVRNWTNRYGEVYVYTGPTFDGDHLKKIGNGIFVPTGFFKIIYAPKQEKALAFWVPNKKVAPRKIGLYLTTVKVIEERTGLRFLSKLNSSSQDHINIAYNKLWPSYN
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MKKSKSFKQLQQISTATLLEESNHLRLATLAIICSTMILITLLIWASLSKITETAVTSGEIVPQGKIQVIQHLEGGTVLQIFVKDGDHVRKNQLLAQLDPTTTLADVDKLKSQFTTLTLKSKRLRAYINKLDHKILKPNKINKAKISSKYTENLNEIIADNQSLLSSQNKKRRAQRAVLTAQLAQSEEKIHQLQQEMKTLDKNVELMTQEFEMYKKLTKTNILSRKDFLVMLRGVNKAQGEKTSLLSMQQQAKQALVEAQNRLYQLDSESYETALQELNDINEQRLQISHTLEKAQKRLQDTNINAPVTGIIKDITIAPSSVVASGGVLMEIVPMEDPLVVSTRIDPRDIGHIHTGAKATIKIMTYDFTRYGSISGTIQTISASTSLTPEGSPFYKAIIKLDQQSLGPQQLPLLPGMTVQADIITGKKSLLQYLLKPIHRSIESAFRER
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MLSTPWLAAVEFINPQCMYETGWSTEARSINPHSAITMHEEPKNSGWTCFFSTKHYTLKAYVSTAPYLYTSMYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_017377305.1|845299_846601_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	6.5e-135	57.3
WP_017377306.1|846668_849101_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	1.2e-219	52.7
WP_016209655.1|849204_849477_+	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_075275280.1|849559_851458_+	surA N-terminal domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377308.1|851489_852374_+	hypothetical protein	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.2e-41	35.7
WP_017377309.1|852382_852778_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875932.1|853201_855349_+	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	3.1e-25	36.2
WP_017377313.1|855320_856670_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017377314.1|856666_858787_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_017377315.1|858783_860487_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	3.4e-22	25.0
WP_017377316.1|860621_861764_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_017377317.1|861820_862849_-	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_026063623.1|862975_864490_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_017377319.1|864596_864797_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420630.1|864941_865277_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275281.1|865421_865658_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420772.1|865928_866807_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875933.1|867443_868388_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080999974.1|868661_870065_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420631.1|870069_870855_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.2e-06	29.7
WP_075275282.1|871245_872088_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
871378:871437	attL	NA	NA	NA	NA
WP_017377467.1|872084_872381_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_017377471.1|873862_874474_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377472.1|874542_875349_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771639.1|875652_876627_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_017377475.1|876798_878691_+	DNA topoisomerase IV subunit B	A0A172JHT4	Bacillus_phage	3.6e-81	32.3
WP_144420632.1|879263_881579_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|881993_883397_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875935.1|883837_884317_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420633.1|884384_885641_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036772665.1|885787_886312_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017376899.1|886716_886857_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051929562.1|887054_887759_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376902.1|888613_888925_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
887535:888031	attR	NA	NA	NA	NA
WP_017376903.1|888988_889168_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243159.1|889730_889913_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376905.1|889976_890204_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063576.1|890411_891176_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	6.3e-29	33.0
WP_026063577.1|891402_891696_+	HU family DNA-binding protein	A3E2K9	Sodalis_phage	4.7e-17	52.8
WP_048875878.1|892221_893625_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376909.1|894094_895072_-	malate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_027243158.1|895168_896629_-	TolC family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376911.1|896655_897309_-	protein-L-isoaspartate O-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376912.1|897433_898000_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774028.1|898296_900030_+	thiol reductant ABC exporter subunit CydD	W8CYL7	Bacillus_phage	1.6e-32	30.0
WP_047927497.1|900101_901808_+	thiol reductant ABC exporter subunit CydC	W8CYL7	Bacillus_phage	3.6e-24	26.3
WP_017376916.1|901799_902858_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875936.1|903111_903960_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.4e-16	31.4

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP013975|909335:1046864|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP013975|1052076:1104636|DBSCAN-SWA
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MQDHALSVSGLTKTYPGGFQALQGVDFHVRAGEFCALLGPNGAGKSTTINIITTLLPASAGQVKIFGHDIRTQASEAKRLVGLVPQEFNFNMFEKIIDILLVQAAYYGIKRSQAKKNAEMYLKKLGLWQKRHQRARTLSGGMKRRLMIVRALIHHPKLLILDEPTAGVDIELRRSMWQFLKDINEKEKITIILTTHYLEEAEKLCKQIIIINQGKIIRNTDKKNLLQSLDVEYFIVVLSKPLNVAPELQGYITDVDHDGNLEIGVKVGQNLNRAFEQLSDLGVEVMSLSNKHNRLEELFLQYTATAEEE
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MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MKRMLINASQPEELRVAMVDGQHLYDLDIETAGYEQKKASVYKGRVTRIEPSLEAAFVEYGADRHGFLPLKEIAPEYYDVTANTDKRGRVHIRDAVREGQEVLVQIDKEERGTKGAALSTYITLAGCYLVLMPNNPRAGGISRRIDGEEREELKQILEQLNLPNDMGLIIRTAGIGKNLEEIQWDLSILQKQWQAIRAGFARIAAPSLIYRESDVVLRAIRDYLRPGVNEIVVDDRDVYDRIAHHLKQLRPDYLNCLKHYQDPVPLFSRFNIEGQIESAFEREVRLPSGGAIVIDHTEAMISIDINSARATKGGDIEETAFNTNIEAAEEVARQLRLRDLGGLVVIDFIDMVQPRHQRDVENCLRDALKMDRARVQTGRISRFGLLEMSRQRLRPALGESSQHVCPRCSGHGYIRGIESLALAVMRLLEEEAMKGQQGQIQAQLPVEVATFLLNEKRGILAQIERRHRVSLLLIPNINLQTPHYQVMSVSDHAREDAASYSLVSQVQSAEDLTKAAVKYEEPVVKDLSYGASPKRGLLNKLWQYLSGASHSHNAQASEDTTATVEPIRPVKVHSSSLSSSSEGRDRNRRQGSTGGSSGRRSQGGGQLAAAPSKGQSSGGRHRRNEGGTATKGNLASSGESHERSSNRSNSNKMTDARRKSTGGKSSSASQQRKSVKSASDVDKDASKKSVTTQRTEVIAEVKAAVEPVSVKAAVEQVSSVVSSSAEAKVTTTGRATTSGQKTETVIVEQAAVMEKVVRAKRPNFTQLESQVETAVISSGVIESAVPSSYHHGNIGAHRLEPWRSALSAAASPIIEIKQIETIANDENSTESVIAKVVEKLHQGRSPLQWHERLKGSQAAISHSIEHIRQVETKVAVAIAAAENQVKTNIQ
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MFRQKCSHSYRYYAVAMPKINMLTDFTDGDFERIHKAHWNIERFHRATKQLCSIEKFQVRTTECIKNHIFRCEPWSAKHGVSRPR
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MVRRSIQWFISRLWLVLLSFFLFAPAYATLTLKVTQGVDRPIPVAVADFSNSDNSHLNIQGLLEGVAGLIRQNLQTSGLFSVLERTKMPSFYVNPAEVNISTWKKTGAESLLVGQVQLTEAGRYNISFRLLSVFGQLTSQQIIGERYKNIRPGQMRMLANHISDLIYHALTGKQGVFATRIAYVQLDRERTAYQLLVADADGYNPRTLLKQSQPIMAPTWSPNGQYLAYVSFEDKTMSIWISDLVSGKRRKISSVDGINSAPAWSPDGSRLALALSKAGSAETNIYVINLNTGKRKQITRGYAINTSPAWSPDAKSLIFTSNRGGSPQIYQYDFSTRQIVRLTYQGNYNADARFLPNGQGVVMMHQVIADGQTRFNIAHLNLATGEFRVLTHGYNDESPTVAPNGQMILYTKDRGGNTMLAEVSLDGRVHLNLPSGNGYVRAPAWGPFSS
>NZ_CP013975|1052076:1104636|1070497_1071508_+|WP_017377889.1|DBSCAN-SWA
MVEHDRIVTVLEHQEDEPTVDRAMRPKLLCDYQGQPAVCEQMQVFIHAARKRQEALDHTLLFGPPGLGKTTLAHIIANELEVNIKQTSGPVIDKAGDLAALLTNLEENDVLFIDEIHRLSPAIEEVLYPAMEDYQIDIMIGEGPAARSIKLDLPPFTLVGATTRAGLLTSPLRDRFGITQRLEFYSVEDLTRIILRSARVLGISLDNSGAYEIAKRSRGTPRIANRLLRRVRDFADFDGVVQVNAQMADKALKILDIDEQGLDLMDRKLLNAIFVKFEGGPVGVDSLAAAIGESRDTIEDVLEPYLIQMGLMMRTPRGRVTTSHAAHYLGLAPDIS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075275292.1|1052076_1052907_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046605.1|1053134_1053284_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242840.1|1053478_1054300_+	ParA family protein	H7BUL8	unidentified_phage	3.9e-16	33.0
WP_017375751.1|1054296_1055190_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375750.1|1055235_1055757_+	chemotaxis protein CheW	NA	NA	NA	NA
WP_017375749.1|1055834_1056320_+	DUF2802 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875957.1|1056453_1057110_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	9.6e-10	31.9
WP_017375746.1|1057106_1057415_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	1.7e-09	41.4
WP_036771957.1|1057763_1058735_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377899.1|1059039_1059831_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875958.1|1059820_1060684_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377897.1|1060710_1061130_-	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	1.2e-05	29.4
WP_017377896.1|1061182_1062139_-	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
WP_027242839.1|1062621_1065294_+	Rne/Rng family ribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_017377894.1|1065374_1066001_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063687.1|1066157_1067756_+	glutamate--cysteine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_017377892.1|1067845_1069267_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_017377891.1|1069297_1069819_+	crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC	G3MA90	Bacillus_virus	2.0e-10	34.2
WP_017377890.1|1069815_1070421_+	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_017377889.1|1070497_1071508_+	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	6.9e-07	30.8
WP_017377888.1|1071620_1072325_+	protein TolQ	NA	NA	NA	NA
WP_017377887.1|1072359_1072791_+	protein TolR	NA	NA	NA	NA
WP_036771700.1|1072793_1073888_+	cell envelope integrity protein TolA	NA	NA	NA	NA
WP_048875959.1|1073947_1075300_+	Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB	NA	NA	NA	NA
WP_017377882.1|1075335_1075977_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420778.1|1076049_1076949_+	tol-pal system protein YbgF	NA	NA	NA	NA
WP_027242836.1|1076951_1077599_+	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	J9PV61	Bacillus_phage	1.6e-36	38.6
WP_027242835.1|1077649_1078453_-	AAA family ATPase	A0A0E3G5H5	Synechococcus_phage	6.8e-42	43.1
WP_017377879.1|1078634_1078850_+	SlyX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377878.1|1078853_1079087_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377877.1|1079148_1080741_-	exodeoxyribonuclease VII large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017377875.1|1080943_1081873_+	ABC transporter ATP-binding protein	W5SAS9	Pithovirus	7.0e-14	31.9
WP_017377874.1|1081874_1082642_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_047927659.1|1083007_1083778_+	gamma-glutamylcyclotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1083836_1084811_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_017377870.1|1084918_1085281_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377869.1|1085450_1087160_-|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_048875961.1|1087400_1088804_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_146619530.1|1088855_1089113_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155048058.1|1089418_1089601_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242834.1|1090149_1091457_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773793.1|1091916_1092294_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376708.1|1092438_1092840_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155046604.1|1094251_1094392_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420647.1|1094592_1094790_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053093668.1|1094927_1095527_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420648.1|1095709_1097182_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378009.1|1097584_1099330_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243143.1|1099765_1100626_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378007.1|1101143_1103087_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875961.1|1103232_1104636_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP013975|1112934:1154996|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

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>NZ_CP013975|1195184:1250035|1196139_1197114_+|WP_036771332.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYQHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP013975|1195184:1250035|1216151_1216505_+|WP_017376407.1|DBSCAN-SWA
MKKLFAILALLAVSSASFAADAPAAGATSSLMSFLPLVVIVIIFYFLLIRPQSKRAKEHRKLLSELAKGDEVSTSGGVLGKVTKVDESVVTIEIASDVEIQVQKSAVSAVLPKGTIK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017376409.1|1218415_1219360_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	2.4e-38	35.2
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WP_016209938.1|1220234_1220873_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376411.1|1220847_1222272_-	aminodeoxychorismate synthase component I	A0A0B5J984	Pandoravirus	3.9e-40	33.4
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WP_081078111.1|1228415_1229168_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017375910.1|1239202_1239931_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_017375910.1|1240333_1241062_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_075275409.1|1241125_1241953_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376424.1|1243418_1244234_-	septum site-determining protein MinC	NA	NA	NA	NA
WP_017376423.1|1244517_1246578_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420655.1|1246574_1247000_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_062365695.1|1247184_1248642_-	neurotransmitter symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275417.1|1249870_1250035_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP013975|1260934:1305990|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377485.1|1268526_1269123_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
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WP_017377488.1|1271054_1272968_+	molecular chaperone HtpG	A0A1B1ISV4	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-117	38.6
WP_017377489.1|1273172_1274210_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRAKAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENALRHLKCNTTLY
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MRGIRHYGRYGQQVLQQHEYFLSTEERDDRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MKLLRLAIMALGFTFFNVTGVHVFALSIGELSVFSEPEQPLRAVLAINQLGATSYQQIKVAMPSAMKLRKLGLLPGQIASLNFNVFAGRKGSALVYIRSARPLSDLSAIALDIRWPHGQKTEGFLLNLEKTKQYYSKLYQSYRNLTLTQSSGRLEGKLYGPIHPYDTLWKVAERVRPSKSVTVQQTMLALLEQNPRAFIAGDMNQMQRGQVLLIPPKQIIATIPKRGARFVVQQQIKAWQQGKRLSGPKPADQVVHLAPGDLPLINSNDHWRVIQQLVLQIQNLQGALVNIQQGNEKLHKQLVSFEAQMGQLVLSVERQRHYRHAQPQFSVEKASANPIATSSAATSDNMANFTAPSSVKTVVHSVASGYKQSLPREIIPEQKPLWLQALDSMTYWGTAVVVLLFLGLFWLAWRLRREHVRRLEDQAVLRATIERMQHTGR
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MRKINMARPVVMSEPEYRKHIVNTAKYLVITEGIGQLSMREIAKAAKTSVTQMYRKGIAGIEDIIFMLNEKTLDILIEHIAQIDLGQCDGEDGLRQLAAVYLEFSRPASEYYPLWELMQRLNADRLDSPVSYQQKTALLFSYGERAVQKAIPRLTGTELTEATRILWASIHGICHLHARDKLVSTGQSPINIMVKRLIHIFINGLRG
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MKQSQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPVAKNVLDRDFSATRPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKTGLIWHSDRGSQYASESHREILKDYKIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
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MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRVFKGLAKKSKSTMGWYYGFKVHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_017378219.1|1376129_1376600_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA
WP_144420785.1|1376709_1377960_+	AMIN domain-containing protein	A0A067ZJB6	Vibrio_phage	1.7e-15	27.4
WP_016211840.1|1378648_1379113_+	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	4.7e-19	32.9
WP_155635849.1|1381674_1381884_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420662.1|1382029_1382233_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378212.1|1382423_1382822_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875983.1|1383007_1383613_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	6.3e-48	49.5
WP_017375549.1|1383621_1383918_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875984.1|1383922_1384459_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046598.1|1384603_1385173_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771639.1|1385252_1386227_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_048875986.1|1386223_1386721_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910640.1|1387128_1387545_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053856767.1|1387612_1389016_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275305.1|1389012_1389633_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773116.1|1389904_1390879_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
WP_036773538.1|1391043_1391667_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017376442.1|1391663_1393604_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	1.8e-72	33.0
WP_017376443.1|1393759_1394413_+	glutaredoxin 2	NA	NA	NA	NA
WP_017376444.1|1394581_1395757_+	formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376445.1|1396110_1397436_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063532.1|1397528_1398317_+|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
WP_017376447.1|1398418_1399291_+	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_017376448.1|1399477_1400740_+	bifunctional tetrahydrofolate synthase/dihydrofolate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017376449.1|1400813_1401344_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376450.1|1401365_1402871_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	7.7e-87	40.4
WP_017376451.1|1402883_1403549_+|tRNA	tRNA-(ms[2]io[6]A)-hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376452.1|1403642_1405403_+	gamma-glutamyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036773947.1|1405680_1406556_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP013975|1412222:1517660|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_16

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MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKGNTVKYAWIKENKCVFPIGRLCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLAKRIKGIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQSQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPVAKNVLDRDFSATRPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKTGLIWHSDRGSQYASESHREILKDYKIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_087910642.1|1577778_1578932_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	6.8e-59	44.2
WP_048876004.1|1579053_1579746_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242833.1|1579754_1580942_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	5.2e-22	34.3
WP_017376484.1|1581091_1581718_+	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.2e-33	41.3
WP_017376485.1|1581763_1582993_+	hypothetical protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.6e-08	21.9
WP_144420789.1|1583187_1583634_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376487.1|1583825_1585184_+	dNTP triphosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_075275317.1|1585849_1586023_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876005.1|1586152_1587070_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.6e-26	32.4
WP_053093673.1|1587411_1588071_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420674.1|1588151_1588655_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.0e-19	40.7
WP_017376491.1|1588627_1588915_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036771628.1|1589207_1590329_-	calcium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1590591_1591566_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP013975|1606553:1719488|DBSCAN-SWA
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MSVINIFKQLKSAQKKGVAVEIDCDVLAKDKQQRYSESIKSIKGWVLSLNKEEVKLKSFMPTSVKMIDIDKIISIKISYY

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211147.1|1644148_1644502_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378515.1|1644505_1645570_-	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	NA	NA	NA	NA
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1654201:1655195	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_062365722.1|1659908_1660403_+	helix-turn-helix domain-containing protein	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.4e-05	34.9
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WP_017376829.1|1709901_1710129_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212182.1|1715746_1715932_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376833.1|1716321_1718277_+	transglycosylase SLT domain-containing protein	K4NWI2	Pseudomonas_phage	9.2e-16	39.7
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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP013975|1739252:1861929|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017376107.1|1780796_1782335_-|tRNA	glutamate--tRNA ligase	A0A2K9L594	Tupanvirus	2.6e-05	22.4
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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP013975|1891684:1941970|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_048876023.1|1894192_1895296_+|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	8.0e-25	31.1
WP_017375861.1|1895635_1896136_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211829.1|1896832_1897186_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375862.1|1897486_1899214_-	penicillin-binding protein 2	NA	NA	NA	NA
WP_047927270.1|1899317_1900043_-	lipoprotein-releasing ABC transporter ATP-binding protein LolD	G9BWD6	Planktothrix_phage	6.4e-31	38.7
WP_017375864.1|1900035_1901274_-	lipoprotein-releasing ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017375865.1|1901411_1902449_+	agmatine deiminase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375866.1|1902503_1903406_+	carbon-nitrogen hydrolase	M1HCD5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	3.2e-56	40.7
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WP_144420795.1|1908434_1909112_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375871.1|1909239_1909788_+	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_027242997.1|1981949_1982426_+	flagellar protein FlgN	NA	NA	NA	NA
WP_027242998.1|1982479_1983001_-	peptidylprolyl isomerase	A0A1V0SCU1	Indivirus	3.8e-25	53.4
WP_027242999.1|1983082_1984177_-|tRNA	tRNA 2-thiouridine(34) synthase MnmA	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|1985143_1986547_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017375758.1|1994613_1994820_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420701.1|1994916_1995273_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_047927692.1|2004996_2005185_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP013975|2022687:2084777|DBSCAN-SWA
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MSFNYRRRKFCRFTAEDIKEIDYKDTVMLRNYVTESGKIVPSRITGTRARYQRQLATAIKRARFVALLPYTDRHQ
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MEHKMSKLDDVFSNFWETYTKNNPHVTKIHNLLLKEGEIVENDHIALRTFNDPRVNIDRLSRLFIAQGYKEAGEYHFKEKKLYAKHFEHEDESQPRIFISELLLEEFSQELQQVVKTSIDQIPHDILHAEGLPWAQLVWGPIKHELYQGLLKESEYAAWVYAFGFQANHFTVNVNALKKYDTLEKLNEFLKSKKVTLNSSGGEIKGSTEVGLEQSSTMAGKIDVTFLEGIFKIPSCYYEFAQRYEVDGKLYTGFVASSADKIFESTNKSGAVA
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MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMGWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLKKRGIIA
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MNSATRQAIQASSAVLITLLLAYIFPLDHATWSTLTAVILVSSTFGESIKKASERIGMTLVGGGVATAFYYVFLKGHPVGLAIFLLLSASCVVYFLATSYAWASFFITASVVRCEPWSAKHGVSRPR
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MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVYCFFRTKFRLYLAAKPLVFQILLMSNSRCLAKIKIIG

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377787.1|2024863_2025091_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
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WP_036771312.1|2030987_2031983_+	glycosyl hydrolase family 17	NA	NA	NA	NA
WP_048876036.1|2032280_2032919_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.1e-09	35.7
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WP_017375977.1|2034985_2035939_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_017375975.1|2038068_2038392_-	YqcC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046584.1|2038640_2038817_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242782.1|2050773_2051856_-	chorismate synthase	A0A291AU41	Pandoravirus	4.5e-73	42.4
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WP_027242784.1|2053757_2054306_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017378207.1|2063197_2063953_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771639.1|2064661_2065636_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_017378201.1|2068544_2069216_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875961.1|2070294_2071698_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242788.1|2073285_2076687_-	AAA family ATPase	S5M596	Bacillus_phage	4.5e-10	23.3
WP_017378193.1|2076683_2079377_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378192.1|2079680_2081180_+	sugar porter family MFS transporter	O13311	Aichi_virus	2.2e-33	28.1
WP_027242789.1|2081846_2082668_-	DUF1338 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_146619408.1|2082739_2083225_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876012.1|2083373_2084777_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP013975|2089281:2214407|DBSCAN-SWA
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MVKQLKLKQQHNRLSYKTIRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP013975|2226218:2281544|DBSCAN-SWA
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MARVTVEDCLTRVDNRFQLVLVAAKRARQLAYGSEATLTWENDKPTVMALREIAEGKVTRDILNEDEQ
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MRVSFKLKKGPTCGQVPIQVNFNFHNYQDLRIDNKIQLCTYKKLVFSVRFFHNLHEVLS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036771330.1|2280569_2281544_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP013975|2353420:2400135|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377980.1|2359844_2360885_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A1D7SR00	Cyanophage	2.9e-69	45.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP013975|2405830:2442109|DBSCAN-SWA
TATGAGCAGTGTCGGTGCTTGCGTTGACAATGCGGTTGTCGAGCGTTTTTTTGGCAGCCTAAAGCACGAATGGCTGTTGAATGTGATTCACTTAACCCGTGATACTATGAAGGAGGATGTTGAGGCCTATATTCGATATTACAATCATGATCGGTCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTGCATACAGCCAATGCTAACCTATCGCCTATTAATTTTGAAAAGTCTCAATTAAAAGTGTCCAATATGACTTGACCAGAACATCTTTTTCATAAAGCTCGCCGACAATACTTGATACATTCGGCTTTAGAAAGCCATTACCAATAATTAAGAAAGTCAGCCCCCAAAAAAAAGCAGCTTGACCCGGTAGTGCACACAATAAGTAACTCAGTACAAATAATAAGCCGCCCAAAATAATCGAGCGCTGAAAGCCAATATAACGATCCGCAACAAAACCCCCTAAAACAGGAGTTAAGTAAAGTAATGCACTGAATGTCCCATACAGTAAGTAGGCACGATGATCTGAAAATAATAGACCTTTACTCATATATAAGATCAAAATAGTCTGTACTGTATAAAATCCAAACCGCTCCCACAACTCGGTAAAGCAAAGTAAGTAAAGCCCATTTGGTTGCTGGTTAATCATTAAAATATCTCTTAGTTCATAAAAAATAAATAGCTTCAAAATATTTTAAGCTAAGGGTGAATTCAAGGCTACAGAAAACGGTGAGGTTAACATTAAAAATTTAATGTTTTTATTATGGATAAAAAAATGCCCTTTTAAAATAAAGGGCATTTTCAACTTAGAGCTATTTATCTTACATAAAACAATAGCAGGGTCATTTATTATCAACACCCTGTTGCCAAGCAATGTCTAACTCTTTTACTGCTTTAACATCATCGAGACGACGCACAGGCAAAGTATAAGGTGCAGCATGTAAAAATTCAGGATTTTTAACAGCTTCTGCACGAATATTAACCATTGCATCTACAAATGCATCCAACTCTTCCTTGCTTTCAGTTTCCGTCGGCTCAATTAAAAAGCACTCTGGGACCAATAGTGGAAAATAAGTCGTTGGTGCATGCATGCCATAATCTAATAAACGTTTAGCGACATCCATTGCTGAAACGCCAATGCTTTTTTTCTCTGCTGCAAGCGTTAAAATAAACTCATGAGTCGCACGACGCCCTGGATAAGCCATGGTAAAGCCTGCTTGCGCGAGGCGCGCCATTAAATAATTTGCACTTAAAGTCGCATAGCGGCTGACTTCCTCAACACCAGACTTGCCCAACAAACGAATATAGACATAAGCGCGTAATAACACACCACTATTGCCCATAAAGGTACTCATTCGCCCGATGCTTTTCGGCGCTGCTTTGCGATCAACAAGACAATATTCAGTGCGATTACTTTTAGTCTGCTTTTGTACATAAGGGATAGGCAAATAGGGTTTTAAGCGCTCACTCACCGCCACAGGACCTGCACCAGGACCACCACCACCATGCGGAGTGGCAAAGGTTTTATGTAAATTCAAATGAATCACATCAAAGCCCATATCCCCTGGACGCGTCTGTCCTAAAATAGCATTAAGATTCGCCCCGTCATAGTACAATAAGCCACCCGCTTGATGAACAATCGCAGCAATTTCCTTAATTTTACGCTCAAACACGCCAAGCGTTGACGGGTTTGTCAACATAATCCCCGCCGTTTTTGCACCAACCATAGCTTTTAAGGCATCGATATCAACATCGCCATCACGTGTTGTTGGAATCTCTTTAACTTTAAAACCACACATCACCGCAGAAGCAGGGTTCGTTCCATGCGCCGCATCCGGCACAAGAATTTCATCACGCTCATAATCACCGTTATCCAGATGATACGCACGAATCATGGCAACCCCTGCATATTCACCTTGAGCCCCTGCCATTGGTGATAAGGCAACCGCAGACATGCCAGTCATTTCAGCAAGCATCTCTTGCAACTCATGCATGCAGCTTAAAAAGCCTTGATTATCCTGGTCGGCTAAATAGGGGTGACGATTTAAGAAGCCTTCCAAGCTTGCCGCCTTATGTGCCCCGCGTGGGTTATACTTCATCGTACATGAACCCAAAGGATAAAACTGGCTATCGATTGAAAAGTTCTTCTGTGATAACTGAGTATAATGACGCACTACTTGCATTTCAGACACTTCAGGCAGTACCGGCTGGTCTTTGCGCCGGTGCTGTTCAGCAAACTGTACTGGCTCAATTTCTCGCGGTGCTTGTGCGGTTGCCGTGCGCCCTGTTGCAGAACGTTCAAAAATTAGCATGACACACCCTCCGCTTTTAATACCTCAAGTAAAGCATCATAATATTGCTCTAAATCATGAGCTGTTTTCATTTCTGTCGCACACACCAACAGACAATGTCCCATAGTTGAATAGTCTCGACCTAGGTCATAGCCCGCTAAAATCCCTTTTTTGCTCATGGCCGACAATGCTGTTTTAGCACTGATCGGTAGGCGAATCACTACTTCATGAAAGCTATTATCACGTGAATACACCTGCTCAACACCCGGAATTTGACAAATTCGTTCGGCCAAGGCTCGAGTATTCGCACACGAATGTGTGGCAACTTGCTTTAAGCCTTTATAGCCCAACAACGCTAAATAAATCGTCGTCGCCGTGACTAATAAACTTTGGTTAGTACAAATATTCGATGTTGCTTTCGCCCGGCGAATATGTTGCTCACGCGCTTGCAAGGTCAAAGCAAAGCCTTCTTTGCCATCCAAATCCGTCGTGCGGCCAATAATTCGCCCTGGCATCTGCCGCACATGGGCTATTTTACAGGTCATAAAACCACAATACGGCCCACCTGAAGCCAACGGTACCCCTAAAGGCTGACCTTCACCACAAGCAATATCCGCCCCTTTTTCGCCCCACTGACCTGGCGCATGCAATAAAGCTAAGGCTGTTGGATTCACAGCAGCAATGACAATAGCTTGTTGCCGATGTGCCCAATCGGTTAACTCATTCACCGCTTCTAACTGACCCAAAAAGTTCGGCTGACTGATAATCACCGCAGTAATATCTTCAGCCTGCCATGGCTTTAAATCACTGAGCTGCACCGTACCCAAGGCTGCATTAAACGGCACATCGACTAATTCAATTTTTTGGCTAGAAACCAGAGTATGAATGGTCTCACGATAAGCCGGGTGCAAGGCACCTAAAACCAAAATACGGCGTGATTTTGAGCGACGGTTTAAGCGCACACTCATCAACACCGCTTCAGCTAAACTACTGGCGCCATCGTATAACGAGGCATTCGCCGCATCCATTCCTGTCAGCGAGGCCATCATTGATTGATACTCATAGAGTAACTGCAATGTCCCTTGGCTGGCTTCAGCTTGATACGGTGTATACGCAGAATAAAACTCACCACGTGAGACAATATCCCACACCGCTGCAGGAATATGATGCTCATAGGCACCTGCACCAACAAAGTTAAGTTGGGATTTATCCAGGCGTGCTCGCTCACGCATTAAACGCAAGATCGCCATCTCAGACAAAGCCTCAGGTAAATCTAAGCCTGCCACTTTTAATTCTGCTGGAATTTCATCAAACAAATCTTCAACAGACTTCGCACCAATCGTCGCTAACATCTGACTGATATCTGTTTTTGTGTGAGGAATAAAGGCCATGTTACCCCCCAGTTACTCTTCTTCAGCCAATAAAGCAGCGTAGGCTTCAGCATTCATCAAGCCATCAAGGTCAGCTGCACTATGTGGTGCTAAACGATACATCCAACCGTCATCAAAAGGTGATTCATTGATTAATTCCGGACTATCCAGCAACGCTTCATTGACTGCCAACACCCTTCCAGCAATCGGGTTATAAGCATCCGCGGCAGCTTTCACTGATTCAATCACTCCCACCTCAGTTCCAGCATCATATTCAGCGTCGATTTCAGGTAATTCAACAAATACAACATCACCGAGTAAGGACTGGGCATGATCACTAATCCCAATCACCATACTACCATCAGCCTCAACACGGACCCATTCATGCGATTTTGTATATTTTAATTCATTATTTACTTGGCTCATGCCAGAATCTCCTCAACAGCTTTAGACGGTTTACCCATACGAACAAAAGGACCACGCACGATATGCGCAGGAAAACGTTTATTACGAATTTCAACTTCAACACTCGCGGCATCACTGACAGGAATACGAGCAAAAGCAATCGCCACACCTAAACTGGGTGAGAATGTCCCACTGGTAATCACGCCTTCTCCTACGCCTTCAACAATGACTTTCTGACCATGACGCAACACGCCTTTTTCTGTCATTACCAAACTGACCAAACGATGCGTGACACCTTGTGTCTTGATACTTTCTAGCGCCTTACGGCCAATAAAATTACGCTCACTAGGCTCTAATGCCACGGTCCAGCCTAAATTAGACTCATAAGGGTGAGTTAATTCATTCATATCCTGACCAAATAAATTAAGGCCAGCCTCCAAACGTAATGTATCTCGTGCCCCCAGACCACACGGAGTAATTCCCGCCGTAATAAGATCTTGCCAAGCCTGAGTAACCTGGTCCGTTGGCAAAATCAGTTCAAGACCATCTTCACCGCTATAGCCAGTACGAGCAATCGTCCAGCCTTCAATAGACCCCACAGCAAAAGGCTGCAGTTGACTAATCAGCTCAACCTTAGGCGCAGAAAGCACAGAAATAACCCGAGCCAATGCTTGA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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377945.1|2427154_2427487_+	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	4.7e-05	34.2
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WP_036771330.1|2432296_2433271_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
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WP_017377690.1|2434110_2435145_+	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
WP_146619455.1|2435248_2435506_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876071.1|2436100_2437261_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.8e-25	32.0
WP_069971647.1|2437229_2437826_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046570.1|2438794_2438965_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|2438961_2439936_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_087910645.1|2440955_2442109_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	8.9e-59	44.2

Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP013975|2487211:2553112|DBSCAN-SWA
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MIKLIKKILSTFLSRTFITLLLCLALCAVIWFYSPLLAFNNHYYFTDPLPRVIAILVIALLWGISNLRFRIQPWRTHKITSSVHLKKNKNPHDSKIQALCEILKKRNFNKSNIIIVTGDDNSAKRFIFNQVNIIKSSDHTSDNSINWVLTQQQALIYIPHDHLINDNLKKSIYPLIKINSVSPVNSIIIIESCESIFNNNKINNKNIKSINQLNQAIGYSVPVYFYFSNSNEITGYKQYAKLADQSKVSSTIELYSYERNNIIFLTDFNHLIKTKLSYYYQITNNDNKFENILSFRFLLELSKLKDIINKFIKEISHYTTVNPLYIQGLYLSPITEGKPNQGDDTVVFSSNSLIHEIINHSHKISDNFNESRFKRKKFKHAIIASVILFCTITIASIWMVALNKKINYVYDISNDINKNFINSSNITSIDKLANYIQSHSWFSFGLFNINSVPRQTVKLYNYYLSQSFLPYISTIAENQIKSAINHHNTLYLYQWLSSYLMLNDKQYLNKEAIYNTYADYWGERAGYNNTTKQNRLFQLNSLLQLKFQPIDLNTDLVSQARAVLDNKTLAEQAYLNLNNFYHQKNQSLTTSPVDLDSTLSIRKNTTIPYLFTKNGYITEFKSSYTDFLQTVINNQWILGKSFQINDQATLEAQMNNSYWSQYLDVWNNYIANIEVSPFNQLAAATQNLGLLAKDSDSAIVKLLQVISDNTSFTSDKSTLSNNVISNAYSAANSLLIQTDKNTPAPIHNYIQAINNLYRYFVNIQQSAVPDQAAFEQARKLFSDGQTNPIKQLRILALQAPEPLATWLNQIVHSSLITVFNSANKYIETQWDNSIKNQFNTAFKNSYPFTTASSNNASPDDFLNFINQDGEISTFFKKYLNSFIFSDKNYQAKSLYNVKFPINLNISKTLTSVTHLKSMFNLSKESKVSFIIEPRLLSKNIRNINLSYGDNSFAYAYGPIFPYHWNWPLSSLNQDLIIKVQLFSGIVRTYSFSGPWSLFKFLASSKITQRSPTTYTVEYSSDGLILSLTLIANSSSNPFKETLSTALAPLVRYISIS
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MSKKLYIQTYGCQMNEYDSAKMAELLGESEGFIKTDTPDDADVLLVNTCSIREKAQEKVFHQLGRWRKFKEKNPNVIIGVGGCVASQEGENIVKRAPFVDLVFGPQTLHRLPEMMQESKNDKRSVVDISFPEVEKFDNLPEPKADGPTAFVSIMEGCSKYCTFCVVPYTRGDEISRPLDDVLAEVVSLAEQGVREINFLGQNVNAYRGVMHDTAEKADLAMLISYTAAIDGIDRIRFTTSHPVEFTDSLIEAYATVPELASFLHLPVQAGSDRILAAMKRGHTTLEYKSKIRKLRKARPDLCLSSDFIIGFPGETDKDFEDTMNLIADIGFDNSFSFIYSRRPGTPASDLPDDIAMEVKRARLERLQERIKQQTMAISRRMLGNVENVLVTGVSKKNPDELQGRTENNRVVNFIAPIAAIGGFAKVKVTKVLGFSLRGELVRCEPWSAKHGVSRPR
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MAGYWYARAFRALTSRFSDKGNMRVSWLRRGQAAMSLMADCLKTTVLFKLNFKKIRFNVIEESTRQVSALKFLKLLSAGLRAVISVEGKILAVEVVRIEQFFLRVGFSSAQLWQLKQLMFTPQVLPLEQLIHQLRPLLLKQLEWRQLALQALCMSCYVSERGRKHRIARFRYLSERLGYSQAEISAVETAFATSAEHRRRHKRHKSTVKTELGWAYRQLELLPGATMQEIKVAYRRLMSRYHPDKLVARGLGPIEIAESTQKAQRIQQAYRQLLSS
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEESLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
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MTEGVALQMTEGAIIKIIGDGAELISEAGLSLDGIVQVVEQDLRIDNKIQLCTYKKLVFSVRFFHNLHEVLS
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MSTKVLILGANGFIGSSLSEYILEHTDWEIYGLDLSHHKLDQCIGHPRFHFTEGDMLIHKEWVEYHVKKCDVVLPLVAIATPATYVKDPLRIFELDFEANLEVVRWCAKYNKHVIFPSTSEVYGMCEDDAFDEESSNFINGPINKPRWIYSNSKQLMDRVIHALGEKDGLNYTLFRPFNWIGGRQDEVFNIKEGGARVLTQFISNIIHGRDIQLVDGGEQRRCFTYIDDGIEALARIIECRDSSANRQIINIGNPENNHSIKELAEVLLAEIKKYDQYQAQADKVRVIITQSDRYYGEGYQDVKARIPAIENAKKYLNWQPKTDFVTAIQKTLAYHLA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_027242861.1|2492483_2493620_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376336.1|2494482_2495340_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376335.1|2495481_2496282_-	adenosylmethionine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376334.1|2496380_2496956_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.2e-57	50.0
WP_027242862.1|2497038_2497710_-	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_027242863.1|2497755_2498655_+	DUF3530 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048876074.1|2501842_2504347_+	LPS-assembly protein LptD	NA	NA	NA	NA
WP_017376325.1|2504353_2505622_+	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA	NA	NA	NA	NA
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WP_017376323.1|2506619_2507441_+	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_017376322.1|2507485_2507878_+	Co2+/Mg2+ efflux protein ApaG	NA	NA	NA	NA
WP_017376321.1|2507952_2508759_+	symmetrical bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_036774104.1|2508946_2509375_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|2509433_2510408_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
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WP_048876012.1|2510903_2512307_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376011.1|2512887_2513049_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376015.1|2514269_2514641_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376019.1|2517686_2518679_-	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_017376020.1|2519057_2520428_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_027242570.1|2520636_2521776_+	hypothetical protein	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	9.3e-61	41.7
WP_062365741.1|2521989_2522592_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.0e-10	35.7
WP_036816881.1|2523275_2523494_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376024.1|2523571_2523820_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772149.1|2529475_2530156_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376634.1|2530220_2531507_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376633.1|2532108_2532378_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420813.1|2532561_2533533_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.0e-15	29.3
WP_017376631.1|2533600_2534575_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.3e-14	31.3
WP_017376630.1|2534672_2535749_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_144420721.1|2535829_2536822_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_036772145.1|2536826_2538629_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243119.1|2538646_2539948_-	aspartate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_027243118.1|2539963_2541247_-	diaminopimelate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376625.1|2541379_2541772_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376624.1|2541878_2542964_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376623.1|2543179_2544196_-	bifunctional UDP-4-keto-pentose/UDP-xylose synthase	D5GW02	Campylobacter_virus	1.9e-12	28.7
WP_017376622.1|2544198_2545206_-	glycosyltransferase	B9UDL7	Salmonella_phage	2.2e-37	34.4
WP_026063550.1|2545209_2546364_-	DegT/DnrJ/EryC1/StrS family aminotransferase	A0A2K9L0G1	Tupanvirus	3.9e-38	33.0
WP_016209558.1|2546378_2546741_-	small Multidrug Resistance family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243117.1|2546737_2548453_-	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063546.1|2548552_2549227_+|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|2549255_2549660_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243116.1|2549684_2550644_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017376616.1|2550776_2551559_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075275357.1|2551660_2552620_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0N7C035	Escherichia_phage	1.2e-13	34.3
WP_017376613.1|2552764_2553112_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP013975|2557113:2620914|DBSCAN-SWA
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MECADSRHATLCDADSRGFIVVAFCSAILHHWMCKIPTEVATLTIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
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MLNPFRQHLIDANESYFSHMRFALRQCGRLFTAACCLMLHALLPFILTHTASYLIDKINHDLEEKRSRKPQ
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MIADYTRDSQAAPNSSLQGFSLIEVLIVLTLLSSLILLSLPTLFHLKEQQIHQQAASQLEQLIKLGREQALYQQNKVTLCPTANQTHCQTSWQLPLMLFLDQNQNNQRDHEEPMITTLTLPNSIQLAWNRGNHLSFYGASGLAASNGTLSFCTPHISRQFILNRQGRLRQTTQPCTF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_062365744.1|2585425_2586694_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377052.1|2588129_2588555_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242609.1|2591884_2592238_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377060.1|2597542_2598496_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	2.9e-31	27.9
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Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP013975|2652707:2696067|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377106.1|2656257_2656728_-	Hsp20 family protein	A0A1B1IW69	uncultured_Mediterranean_phage	6.0e-22	36.6
WP_017377107.1|2657030_2658401_+	adenylosuccinate lyase	A0A2H4UUU6	Bodo_saltans_virus	1.5e-110	45.1
WP_075275363.1|2658730_2659198_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377110.1|2659210_2660221_-	DUF481 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_053856766.1|2660422_2661826_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377118.1|2668242_2668695_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242633.1|2670901_2671999_-	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	3.5e-49	34.9
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WP_036774495.1|2673753_2674011_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017375801.1|2677826_2678867_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017375809.1|2684962_2685982_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_017375810.1|2686084_2686879_-	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	1.1e-103	69.0
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WP_017375812.1|2687771_2688821_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063478.1|2688996_2690277_+	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	4.6e-24	34.7
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WP_017375815.1|2691085_2691367_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_026063480.1|2692252_2692651_-	MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	1.2e-07	31.4
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WP_017375821.1|2694838_2695060_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420724.1|2695056_2696067_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP013975|2749048:2784988|DBSCAN-SWA
CTTAAGGAGCGGATGAACATTTTTTATTGCTATTTTTCTTCATTCTTTTAGTTATTTCTGCCTTTTCCAATTCCCTGCTTTTATTCAGTCGCCTGAATGCTTTGGGACGTTTTTTAACAGCCCGAGGTTCAATCCGTCCAGGCCTATTCCCAACCTTGTTTTTTATGATTGCATGCAACAATATTGCATGGGCTTTATTACAGTCTGCCGAGAAACTGAGTAATGACACAAAGCTATTAAATAACTGTATTACACCCTTGAAACTAACCTGTATAGGAAGGCGTTCAGTATTACGACAAGCTTCTGCAATAAGCGTTCTAATTAAGTTGTATGCTAAAAAGTGTACTGCAATTTCTTTATGTACCATGTCAGGTGTCTTACTTCTTAAATGATCCATTGACATAATGCTTTTTAAGCTGTTGAAATTGATTTCAATGTGCCACCTTTGTTTGTAATGATTAGCCAATGCAACTTTATTGTATTTTTTATGATCTTGAAAAGTTGTTACATAAACCTCCCCTTTGATTTTGAACTCTCTTACCGTCATTTGATCAGGATAACTATCGTATGTTTCTTGTGTCATCCAGTCAGGTTTGTGAGGCTTTTTCCAAATGACAAGGTGATTTTTTGAACCCAACTTCCTTCCTTTACGAAAGTCATACTTCCTCTGTGAATGTGCTTTAAAAATACCATCAGCACCTATTGACTGCAAATCACCCATCACGAAAAAACAAGGGAAATACCGATCACCCATCACAATATCATCCTTATGAATGCTGTCCTTAATTTGTCTTAACAGCGCGTGTTCACCCGTTCCTTTACCTTTATAAGCGCCAACTGCATAATCAATAATGCCTCCCGTTGTAAGTGACATAATGGCAACAAGTCGCATAATAGGGAAGCCTGCGCCTGCCTTTTGAGCATCATGTTGAGGATAACGTGATTGATTTTCCTCGCTATCTGCCATCGTAAGGCTTGTCCCATCAATAAGCTTCACCTCTCGATTATAAATCTTCCAACGTGCATTACTGCTTTTAGATAAACTATCTCCACTGAGTTTAACGAGTGATTCAAGCGTTTCTATTGGTAACTTTTGACGTGCTTTACAGTAAGGTCCTGTATTGCTTGATGGGATGTTATTATTATCCTCTGTCGACACTGATGCAAGGAAAGTAGCAACCGTATTTTTGCATGATTTATCTGGAGAGAGTACTTGCCGTATAAATAGTATGAGTGTTACAAATGGCGTATAAAAACGCGATCTAAAGCTTCGGCAATTGTTGATGATGCTTTGAAACTTATCGGAGGACAGAAGGCTTTCAATGCTTAGACTTCCTTCATCATCTAAAAGGGTTGCTTTTTGTTTTTCAATTTGTGATTTTAGTTTATTAATTACATAATGCATCTGTCAGTTTCCGTCTGAGTTGTTAGACGAAAATATACAACCTTATACGGTTGCTGACTTCAAGTGATTATTGCGCTAAAGTGCGTTTTTGTTCAGATCTAGCTCTTAAGGTAGTGCCATTACCGCATAGGCCCTCTACTTTGTTGGTTTGCGCGAATACTCTCAGGATTATTTTTAAATTTGGAAATCATGACGTCCCCAAGACCTACTCTCGTCATATAATCAATAAAATCAGCACCAGACACTCCTGTCGACTGCCCTTCATATAATATTTTGGTCCATTGCGTCCTGCCAAAACTAAATTTTGACACTCTAGTGCTCTGAATAGCTAGAGCAAGAATATTCTTTGTAGCCTCCACTGCTGCATGCTCTGTACTGAATAAACCACTATTACTCTGTGACTCCAGTATTTTCGCTAAGTGTTTAGGAATACAGTACACATCACTGCCCAAGCTCACATGCTTACCATACTTAGTCGCTTGAAAATCAGCAGCCTTTAGAAGATTCCCTAACCATTCTTTATGCTTCTCATTTACATTTAAAGCCACAGCCTGTTTATTTTTTTGGCTAGCTTGTACATATTGTTCATGGTTTTGTAAGGAGCCCTTTGATTCTTCCAGTAATTGTGCTCTAAAGGGATCGGCTTCACCACTATATTTAGCAGGAATACTACCGTCAGAAAAATGTTGCTCTGCACTTGCTGGATTTCTTCTCAACTCCTGTGCTAATACAAATTTAGCAAAAGAATTATTCCTCATATAGCAAGTTCCGTCTGCTCCCGCAGCACAGCCACTATTATAATTTTCCAGTGCTGCTTTTGTTATCTGATGCAGTTCATCGTCATTTAAACCTACTAAGAGGCATAGTACATACTCACAGATCGCCTGTAGCTGCGTATGTGAATCATAATTTGTTTTGCCATATTTACGACTTCTACCGGTACAATTTCGCCCCAACAGCCTTTCTAACTGAGCGAAATAGTCTGCTGGAAATCCTTCTTCCCCAGAGAGAAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCGCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGGTTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGACACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGAGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGTCGTGACCACCAATCTTATTTATTAACACTGGTCGATAAGGCGAATAAAATGTGTTGTATAAGGAAAATGCCTAACAAACAAGCCAAGACTGTTATCAATACATTCATGAATGTGGTTGGCTCAACTTTCTTTGATTTTAAAACCATCACTTCTGACAACGGAACAGAGTTTGCCGGTCATGAGGCCATTTCAAAGATCACTGAAGCAGACTTTTACTTTGCTAGACCTTATCGTTCTTGTGATAGAGGTCTAAATGAACACACAAATGGTTTGATAAGGCGTTTTCTACCTAAAGGGACGGATTTTAATGAAGTTAGTGACAAAGAAATAGCAAAAATAGAGCATACATTGAATACCAGAAGAAGAGCGAGTTTGAATTATCGCTCACCTAATCATGTTTTTTTAGAGTATTTGATGGCGGCTTAGTATAGAGTAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGAAATTGTTTCATTTTCTTAACTGAATAACGACTATTAGCAGCTAATAGCTCATCAATTACTCTAAACAATCCCATAGAGTCACCCCTTACCTTAAATGAATACATTATGTATTTAAGATAATTATTAATATCATATTAGCAGTAGTATTTTATTTAGAAAAGAGTTTTTATTTTGTATAAATAAATTAATATAGATAGCGCACGAGATAGGCTATAACCCTGCCCAGCATTACTCTGCATCGTACGCTTTATGCGATATATTTATTAATGGTTTAATCCCAATTTAAAATCACCTTGCCACTTTGGCCGGATAACATTGCATCAAAACCTTGCTGGAAATCGTCAATTGAAAAATGGTGGGTAATAATCGGGCTTAGGTCTAAGTCACTTTGCAACATACTCGTCATTTTATACCACGTTTCAAACATCTCACGGCCATAGATACCTTTAATCTGCAACCCTTTAAAAATAACATGATTCCAATCTATCGCCATCTCACCTGGCGGAATACCCAATAAGGCAACCCGGCCACCATGATTCATCGCCTCAAGCATCTGCCCAAACGCCTGACCATTCCCAGACATTTCCAAGCCAACATCAAAGCCTTCAGTCATATTAAGCTCATCCATCACAGTAGTTAACGACTCACGCGCAACATTAACAATGCGTGAAGCACCCATTTTTTGAGCAAGGGCTAAGCGGTAATCATTCACATCGGTAATCACAATATGACGTGCACCAACATGGCGTGCAACTGCGACCGCCATCGCACCAATCGGCCCCGCCCCAGTGATTAGCACATCTTCACCCACCATCTCAAAGGATAAAGCAGTATGTACCGCATTGCCATAAGGGTCGAAAATAGCAGCAATATCATCACTAATTTCATCAGGGATCTTAAAGGCATTCACCGCTGGAATCGCCAAATACTCAGCAAACGCACCCGCGCGATTGACCCCCACACCCACAGTATTACGACATAAATGACGACGACCCGCCCGACAATTGCGGCAATGACCACAAGTTAAATGACCCTCACCAGACACTCGATCACCCAGGTTAAACCCCTGAACTTCACTACCAATTTCAACAATCTCACCCACATATTCATGACCAACATGCATCGGCAGCGGAATCGTCTGGCTCGCCCAATGATCCCAGTTATAAATATGAATATCAGTTCCACAAATTGCTGTTTTTTTAATTTTAATTAAAACGTCATTATGGCCCACTTTAGGATGCTCAACATCCACCATCCATAGCCCTGCTTCAGGCTTAATTTTTGCTAACGCCTTCATTAACTACCCCTTTCTTGATAAATTTCACACTTAAATCATCTTATCTTTAAGTGTTAAAAAGTTAGGGCAATCATGCCCTAAAATAAAATAATACAACCAAAAATAAATTATTTAATTGCACCAAACTTACGGCCTGCACGCACAAATGCGGCAACTGCATGATCGATTTGCTCTGGGGTAT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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377343.1|2769677_2771102_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.0e-16	42.3
WP_052106221.1|2771166_2772216_-	UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
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WP_144420730.1|2773268_2774159_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377336.1|2775501_2778312_+	phosphoenolpyruvate carboxylase	NA	NA	NA	NA
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WP_080963630.1|2780013_2780871_+	HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|2781040_2781769_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_048876012.1|2781969_2783373_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376920.1|2783518_2784016_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875863.1|2784085_2784988_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP013975|2808197:2848413|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP013975|2935810:3047890|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_31

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017378122.1|2957295_2957658_-	preprotein translocase subunit SecG	NA	NA	NA	NA
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WP_027242680.1|2961690_2962284_+	thymidine kinase	A0A0B7MRR0	Enterobacteria_phage	6.4e-53	53.6
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WP_017378138.1|2972394_2973645_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017378141.1|2976216_2977269_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378142.1|2977587_2978553_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378143.1|2978855_2979680_-	phenylalanine 4-monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_017378144.1|2979881_2980958_+	4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_017378145.1|2981042_2982029_+	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242685.1|2983879_2984542_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242686.1|2984801_2986685_-	phosphomethylpyrimidine synthase ThiC	NA	NA	NA	NA
WP_017378149.1|2986998_2988498_+	bifunctional ADP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase/NAD(P)H-hydrate epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_017378150.1|2988588_2989371_+	exodeoxyribonuclease III	E3T4M6	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.8e-31	33.0
WP_017378151.1|2989498_2990419_+	SPFH/Band 7/PHB domain protein	J3IZE5	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus	2.2e-20	27.5
WP_017378152.1|2990442_2990901_+	NfeD family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875854.1|2991022_2991898_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_048875853.1|2994458_2994650_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875852.1|2994854_2996150_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275379.1|2996469_2996688_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375941.1|2996724_2998104_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	3.0e-53	30.9
WP_017375942.1|2998131_2998590_-	dUTP diphosphatase	G0YQD9	Erwinia_phage	3.5e-51	68.0
WP_036773720.1|2998567_2999785_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	6.3e-39	34.3
WP_017375944.1|2999977_3000214_+	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
WP_016210730.1|3000227_3000383_+	50S ribosomal protein L33	NA	NA	NA	NA
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WP_017375949.1|3003990_3005805_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_32

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32

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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
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MILLIDNYDSFTFNLYQQLIELDRDVKIVKNDEVTASEVIALAPQAIIISPGPGRPDDAGNCLEIVRECSKTIPILGVCLGHQVIANAFGGDIVSSDEIIHGKDDYIYHDRSMLFSGLKLPFPAARYHSLIVDKESIRESFNIHGEVADETVMAISHKKLPLYGVQFHPESILTPNGQNIIKNFLNAAVELH
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209719.1|3103922_3104210_-	trp operon repressor	NA	NA	NA	NA
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WP_075275373.1|3115652_3115982_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378398.1|3116207_3116606_-	DUF3135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378399.1|3117473_3118424_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
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WP_017378403.1|3121711_3122458_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378404.1|3122596_3123049_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927132.1|3123184_3124021_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242707.1|3124017_3124914_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017378407.1|3124946_3126014_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|3126032_3126401_-	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_080963575.1|3126426_3127878_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017378410.1|3127884_3129264_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_036773239.1|3129304_3130618_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_026063734.1|3130607_3131582_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	1.3e-10	35.9
WP_017378413.1|3131675_3132179_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	5.4e-13	37.1
WP_017378414.1|3132313_3133465_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|3133461_3133941_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242705.1|3134087_3136409_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	7.9e-99	35.9
WP_080963576.1|3136353_3136980_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378416.1|3136984_3137884_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_036773242.1|3138064_3138619_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773116.1|3138986_3139961_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
WP_017378420.1|3140204_3140582_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|3141316_3142291_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

4. NZ_CP013976

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4907 : 54774	56	Streptococcus_phage(31.82%)	terminase,portal,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	61826 : 70300	12	Staphylococcus_phage(28.57%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013976|4907:54774|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036772441.1|7597_7870_+	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|7945_8674_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_048876229.1|9242_10214_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048876208.1|11078_11906_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.2e-17	32.1
WP_036771289.1|12759_13230_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046633.1|14123_14267_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212068.1|15246_15450_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242940.1|15473_16073_-	DUF1353 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375850.1|16426_17203_-	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	NA	NA	NA	NA
WP_036771279.1|17563_18292_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.1e-38	42.2
WP_155046634.1|18361_18562_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876229.1|18480_19452_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242938.1|19865_20234_+	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_017375972.1|20235_20544_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375841.1|20988_21198_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242937.1|21504_21723_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242936.1|21719_22172_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242935.1|22314_22530_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876207.1|23035_24511_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017375966.1|24511_25078_-	HAMP domain-containing histidine kinase	NA	NA	NA	NA
WP_146619519.1|25222_25660_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375964.1|25691_26117_-	hypothetical protein	A0A1B1IUG5	uncultured_Mediterranean_phage	5.1e-12	43.9
WP_036817204.1|26387_27383_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036817201.1|27686_28094_-	AAA family ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_017375960.1|28201_29245_-	NAD(P)-dependent alcohol dehydrogenase	A0A2K9L339	Tupanvirus	2.2e-77	44.0
WP_017375959.1|29546_29780_+	hypothetical protein	A0A0M3LQB1	Mannheimia_phage	5.1e-06	45.2
WP_146619517.1|29917_30070_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_081078123.1|30099_30462_+	HigA family addiction module antidote protein	A0A2I7RIN6	Vibrio_phage	3.5e-06	46.6
WP_026063496.1|31340_31706_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242932.1|31838_32066_+	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242931.1|32074_32482_+	DUF4411 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242930.1|32627_34010_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375952.1|34199_34403_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242929.1|34598_34982_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	9.5e-26	45.5
WP_075278733.1|35068_35551_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	Q9B019	Phage_GMSE-1	8.1e-14	33.3
WP_048876205.1|35553_36885_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	6.1e-112	46.3
WP_048876204.1|37077_37524_+	hypothetical protein	E4ZFM0	Streptococcus_phage	1.3e-26	45.8
WP_087910668.1|37610_37997_+|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	2.1e-25	50.0
WP_036771649.1|38034_38769_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	42.6
WP_048876202.1|38815_39529_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.2e-11	31.2
WP_144420848.1|40910_41096_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243190.1|41099_44444_+	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377509.1|44624_45353_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.2e-38	42.2
WP_075275482.1|45446_46421_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.9
WP_027242596.1|46734_47097_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242595.1|47136_47646_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420849.1|47877_48858_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|49323_50301_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_062365770.1|50382_50616_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771347.1|50634_51612_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_027243211.1|52005_52260_+	type II toxin-antitoxin system prevent-host-death family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_027243212.1|52249_52537_+	type II toxin-antitoxin system RelE/ParE family toxin	A0A2H4JBF4	uncultured_Caudovirales_phage	9.6e-15	50.5
WP_036771347.1|53031_54009_-|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
WP_051929558.1|54090_54774_+|transposase	IS5 family transposase	Q1MVF0	Enterobacteria_phage	5.1e-22	33.3

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013976|61826:70300|DBSCAN-SWA
GCTAATCACCAACAACCTCATAATCGCCATTAATAGCTTCTAATACTGGATCATCATTAACGTTGTGTTCATGGTAGTATGATTGGCTTAGAGGGTTGGTTACACGACTCCCATTACGAGGAAATGGTTTGGATTTTTTTTTACCTAAATAAAGCTGTTCACCAATGACAGATTCAATATCCCTTTCGTCTTTTATTGAAGAAGAGTGACTAGCAATATAATCTAATAATTTCCTATAATCTTCTATCGCTGCTCCGTTTGCAACGAATTTATTATAAGCAAAAGAAAGCTTATCTCTATTTATATTTTCTGAATTTTCAAGTGTGTCAATCACTAAATTTAGTCCTTTGATAAATCCAGCCACGGAAACTTTTTCATCAACCCTTTCCTCTTTTATATCACGAACAATATCTTTACGTTTACTTTCAAATATAAAAGAGATATGAGTAACTTTACGACCAGTTTTTACAGGCTTATAATCCATAGAAATATCTGTACATCGATTAATTTCAGACTTTGCTGGCTCTAAAATACGCTGTTTCACTGATCCAAACATTTTATAAGATTTTTCATCATTGATCTCAAGCCTTCCCTTTAGCCAGTCAAGAGTGACCGTTCTCTCACCAAAAGCACCAAATTGCTTCAGTAGCTCATAAATCCTAATCGCATAAGAACTCTTAATTCCGGCAATAAGATTTAAATCATAAGATGTAAATTTAGACTTTAAATCAGTCAAAAAAGGCTCTACGCGCTCAGAAAAACGTACTCTTGCTGTCCCTTGTTTATTCAAATACACCTTTTCAGATAACCATCTAAAAGATATTTCGATATCGTTTTGTTTGTCATAAACCGATACAGATCGATCATAAAGAGTGTTGATGACTGCCTTAAGTTCCCTATAAGCACCTTTTAAAGCAATTGAATATTGATCAGCATATTGCTGTGCAGTAATGGTATATTCTGTACTTAATTCAACGTTTTTAGAATTTATTTGGCTTATACAAAGCAATAAAACTCTTTGCTCTTGAAGGCTTAACTTATAACCAGCTTCAATCAATTTATTAGACTTCACTACAATTTTCTTTGACTTACTCATGATGCATAACCAAACCATAAATATAACAAAACCATAGCTATGTTATATGTTATTTTTAATAAAAAATCAAGTGGTAAGCCTTTTAAATAAGGAGAAATGCCTTATGTCTGATAAAGCAAGAGATTTGTTATAGTTCATTCAAGTTGTGAGTTAAGTGTTTTTATAGGATATATGCCAAATAACAGCTTATTTAACCATTTGAAATAAGGTAGCAAGAGATTTGTTATAGTTAACCTCTACAGCTACAAACCTAAGAAAAATATTATAATAATCATTACCTTTTCAAGAAAACATCACTTTACAAAACCCAACTTATTGATTGACCGTAACATTAGTATTGCTAAAACGTCGTCTCCAATAACATTTAAAACATGAAATTAATACAAGCAAGAGATTTGTTATAGTTGCCTCTTAAACACCTTGATACACAAGGGCTAGCGCGATCAGTAAAAAGGTAAAAGGTTATAAAAAAAGTAAAAGGTTATAAAAAGAGAGAAAAGAACTCTATCGAAAAGACAACCTACGAAATCAGAATTCTAACTGTTACTACACAGTAACAAAACTAGAAGTAATGAAAAGCTCTTTTGAAAGAGTTTCTAACATTACAGGAATGCCATTAACCGAAGTTAAAGAGAAAGGACTTCAAGCGATGGATTTAGAAAAAACTTTTATAAACCAACCATAAGAATCTATTTGAATGATGTTGACACCTTCTAAAACCGCATTTCAAGCTGCGTTCTCCTCTAACTTGATGAAAGGTGTAGGTTTTGTTGTTGCGTGACTTATAAGCGCTGTAAATGGGTTTGTGACGGTGACGTAGCTGGTCGAAATTTGAGCAGGTTACAAATCGTACCGAAATCACCTAAGCAATTACTGACCTACTCACATTTTATTCAGAAGTTATTCACCAAGGCTGTGTATTAGTTTTTCAGGCTTAAAGCTGATAAAATTTGGACTGTTGATAAGCAAGCTGGATATATTTTATAATGAGTTCGACATTTGAAGATTTAACCAAGAAGTTGATGGATGAGCACATCGTGACTAAAGCTGAGATGATTCAGGCTATACATGAAAACAATTCTGATTTAAAAGAGCAGTTTGTGGCTTATCAAAAAGAAGCAAGGGTTCATACTCGCTGGCTGATTGGTATCGGTATTACGCTGATTATCGGTGTGGCGGCTTTAATTATTAAGACTCACTTTTGAATACAGGAATACAAACCTTAGACTCTGAAATTGTTCTAGATCGGATGGAAGCAGAGATTGTTAGTAAAGGTCCAGAGTATACACTTCCTGCTAAGTTGTCAGATTCTTGGTTAGAGTTTCTTTTAGATGCACCTGTGACTCAAAATTACAGATCAAACCAAGATAACGTTATCTGTTCATTTGTTGTTGTCATTTTTGGCGCGCAGTTAAGAGAGCCTGCAACAACTGAAGAAGAACTAAACAGAGTTTTACTTCAAGGTGCTACTGATTATCTAAGAGAATTGATGTGTGAGTATGATTACAGAAAAGGTCATATTTATTATGATAAGGCAACCTTAAATTCGATATTAAGGGGCCGAGATATAAAGCTCATTCAGCTTAAAGGTCGAAGTCGTTATCATAGCAACTATGAGAAGTTGGATAGCGTGCAGTTAGAATATAGTCACTAGGCAAGGTTTATTAATGAGATTAATTGCAGCAGAAGATTATGCGGACTGGAAAGGCGTTAAAATACAAGAGGTTTATCAGTTAATTAAGAATGGTGACATTAGATCACTTAATAAATCAAATGGCAGTTTGAAGCGATTAGAGTTGGTTTACGTAGACCAAGTACCTGAGCACATCCTGTCACTAGATTCTGAGGTTGAGCACTTAAACCAAAAGCAAGCGGCGAAAAAACTGAATGTCTCAGTAGATAGTCTTCGTCAACGGTTACGGGAGAATGAAGTTAAGAGTTTTACTATAAAAGGCTATTGTTTTATTCCCATGAATCAATTTAATGAAAGTGTCACATTTAGATGAAACCCTCATGATTGTATGCTTCACGTAATAGAGAGATTACACGAAAACGCCAGATAGGCATGATTACTTCATCGGCAAAATAAATACTTTCCCAGCTCTCATCATCCTCAGACAATCTGCCACGAGTCACAGAAATATGCACATGTACACACCGATAGCAATTAGCAGGATTAATGCACAAGTGTCTAGCAATGGCTGAGTTAGAGATTGACAATATTTTAGATTAAATGTTAGTGAGGTGTTTTAACCTATGACAAGAGCATTTATTACCTTTTTTAGATGTTTTGCCATTTTTTTACAACATGAATTATTTTCTTGTTCTAGATGATTGAATTTTGCAGAAATCTCTTGGTATGGTAGATAAGGAGTTATACCTATAGCCTCTTCTTCTTCTTTTAACCATCTCATTGAGTAAAGTATAAAATATCGATGAATATCTTCATGGCCTTTGGGTTCATGTTGAGAAGACAAAACTAGATATGTTTTACATAGAATGCGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTCAGTAGAGAGTTCATATTCATACAGATAAACTCTCTAGTTCTCCTTTTGACTTAGAGGGTAGAGATGATTTATCGGCACTTAAATGAAAAAGATCGTTTTTATATCGAACAACGGTTATCAGAGGGAGACTCGCTCAGATCAATTGCTAGAGCACTTGGCTTTTCTCCTAGCACGATTAGCCGTGAGATTAAACGGCACACCCCAATCGATTTTAAAGGTCTTTATTGTCACCGGCTTACTTCTCGCTGCGCACAAGAAAAACGAGCTAACGCTAAGCAAGGACAAGCTTTTCAACAAATTTCAGAAGAGGAAAAAATGTTGATTCATCAGCGGTTAAGCACTCATACATCCCCCGATGTTATCAGTCAAGAACTTATACGTGAGCATAATATTCAGGTGAGTGAGAGCACGATTTACCGTTATATTTATGATGATAGAGAGCGGGGCGGAGAGCTTTACAAAAACCTGCCTCATTCAGGAAAACCTTATAAGAAGAAGGTGAGTCGTGGTGATCAAACAAAAATACCTAATCGCGTTGGTATTGAACAACGGCCTGCTATTGCTGATGAAAAGACAGAGTTTGGTCATTTTGAAATTGATACGGTTGTGGGCACTGTTGCGAAAAATTATAGTGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGCTCTCTGCTTAGAATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGAGACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATAATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGTAATTCACTCTTAATTTCAGTTGATTGCTACACCATACTCAAATCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCACCAAAACCGTAAAGAGCTAAAAAATTGCTTAGATTATTTACGTGACGAAGATACTTTGGTTGTGACTAAACTTGATCGCCTTGCACGCTCAAATACTCATTTAAACCAAATCGTCGAAGGTTTGATGGCTGCTGATGTAAATCTGATTGTTTTAGACCAAAAAATAGATACACGCAGCGCACTAGGTAAAATGATGTATCAATTATTGGGCGTTTTTGCTGAATTTGAAAATAATATACGCAAGGAACGCCAAGCTGATGGAATCAGAATAGCCAGAGAAAAAGGTATAAAGTTTGGTCGTAAGGGCACTGTTGCGAAAAATTTAGATTTGAGTATGGTGTAGCAATCAACTGAAATTAAGAGTGAATTACTGTGGCTAGACGTAAACGATTTAAAAAGAATCAACCCTTTAAATGGAAGCACTACTCTGGTGAGATCATTCTTTGGTTGGTGCGCTGGTATGGCCGCTATGCTTTGTCTTATCGTGACCTCAAAGAAATGACAGGTGAAAGAGGTCTTGAGCTTGAACGTTCAACAATCTGTCGTTGGGTTCATGAATATGGACCTGAAATCGCTAAACGGTTACGGCCCCACTTTCGCCAAACGTGTGCCTCTTGGCGGCTGGATGAAACGCTGGTTAAAATTAAAGGGCGCTGGTATTACCTTTATCGAGCGATTGATAAATATGGCCATACTTTGGATTGGATGCTCAGTCGTCAGCAAAATGCTAAAGCGGCCTTGCGCTTTTTCAAAAAGGCAATAGCCCAACCTTATGTGAAATCACCGCGTGTTGTGAATGTCGATAAACACGCTTCATTTCCACCCGCTCATCAAAAAGCCAAAGATGAAGGTGTCTTTTCTAGGCGATGTAAACTCAGGCGAGTGAAGTATTTAAATAACTGCATTGAAAATGATCACAAAGCGATAAAGCGCAAATCCCGTTTTCGCCAATGGTACCAATCACTTTCTACAGCACGATCTACCATTGATGTGATGGAAGCAATGCGTATGATTCAAAAAGGTCAATTACGTTATATTAAAAAGCAGGATATCTGCGCCCAAAACCAGCTCATTGATAAATTATTTGGATTAGCTGCTTAATTCTAAGGTAGCTAACACAAGAAAATAACCTTTCTGAAACTCACGATAACTTTTCGCAACAGTGCCGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCATAAGGCAAACTAGAGAGTTTATCTGTATGGATATGAACTCTCTACTCGGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTCGCAACAGTGCCAAAAACTCACCCAGCTTAGAAACTACAAAAGATCATTGGTGGACGGCTAACGTTGTTCGTGTTCCTAATTCGCCTGACTTAACACAGACCATCACAGGCTTAGCCGTAGACGGCACATCCCCTACTTTTGTGCGTATCTATACAGAAAGCTCTGGCTGGACATCGTGGAATCGCATAGATAACACACCCGACTCGATTCAAAGTGAAACACTAAGCCGGAAACAAAACGCTGACGGCTCTTTGCAAATCGAACTACTCATAGATCAACTCTACCCGGTCGGAAAGATAGAACTAACTTTTGACGAAAACTATATCCCACCATTTCAAGGAAAAGGGGCAACTTGGGGCTTTGTTGCATAGCTCAAAAAGTGATCAATTCTGGAGGTTTGCCTACCCTGCTGCTACATTAACATCAAACTAATAGTTGTGATGAGTTGCAGTGCCATATAAATATCCAAAAGGAAAAGGGTGGGATATCCCTAAACAAAAATATGGCGTTACAAACTGGGCAAAGTACACCGATAGCCTGCGTAATCGTGGCCGTATTGATGTTTGGATTTCAGAGAAAGCCATTGAAGGTTGGTACAAAAAAGACCGAGTTTATGATGGTACAGGCACGCCGTTTCTATACTCAGACCTGGCGATCATCACCTGTCATGAAATTCGTAAAGTGTTTAAACAGCCATTACGCCAGACTCAGGGCCTAATTGATTCCTTCTTTGAATCCCAAGGACTGCCGATCAAATGCCCTGACTATACGGTGTTATCAAAAAGGTTAGCGGAGCTCGATATTAAGGTCCCACGCTATCGCAAAACAGATAAGCCAGATGATGATATTGCGGGAATAGCCATTGATTCTACAGGCCTTAAGCGTTTTGGCCGTGACGAGTGGCACCAAGAAAAATACAAGATATCAGCAAAGCGCAGCTGGCGTAAACTTCATGTGGCCGTTGATGATGATCACTATATTCAAGCCGCACTCATCACCGATCGCTATGAAGCAGATGAGGAGGTTGTGGATGAGCTACTGGAGCAAATTGATGAGCCGTTTGATCGCTTCACTGCAGACGGAGCCTACGATAGCCATGATGTTTACGATTCCGTTTTAAACCACTCACCTAATGCTGATGTTGTTATCCCTCCTCCTAAAAATGCCGTATTTGATGAAAATAACCACGCGATTAGAAACATAAATTTTAATGAGATTAAAGATCATGGTAGAATGCACTGGCAAAAGACACGACAATACGGCAAGCGTAATTATTCTGAGTTGGCGATTCAGCGTTACAAACGCATTTTGGGCAACACGATGCAGTCCAGAGAGATATCGCGTCAGAAAAATGAAGGACTAATTGGCGCGGGTATTTTAAATAAGATGACCAGTCTCGGCATGCCGGATAGTTTTAGACGCAGCTGA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013976|61826:70300|64919_65144_-|WP_144420841.1|DBSCAN-SWA
MLSISNSAIARHLCINPANCYRCVHVHISVTRGRLSEDDESWESIYFADEVIMPIWRFRVISLLREAYNHEGFI
>NZ_CP013976|61826:70300|65170_65335_-|WP_155046641.1|DBSCAN-SWA
MRWLKEEEEAIGITPYLPYQEISAKFNHLEQENNSCCKKMAKHLKKVINALVIG
>NZ_CP013976|61826:70300|68036_68741_-|WP_048876211.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTALLRKVIVSFRKVIFLC
>NZ_CP013976|61826:70300|64170_64575_+|WP_052133264.1|DBSCAN-SWA
MEAEIVSKGPEYTLPAKLSDSWLEFLLDAPVTQNYRSNQDNVICSFVVVIFGAQLREPATTEEELNRVLLQGATDYLRELMCEYDYRKGHIYYDKATLNSILRGRDIKLIQLKGRSRYHSNYEKLDSVQLEYSH
>NZ_CP013976|61826:70300|66126_66855_-|WP_017375910.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNICAQNQLIDKLFGLAA
>NZ_CP013976|61826:70300|66877_67267_+|WP_051929563.1|DBSCAN-SWA
MIATPYSNLNFSQQCHQNRKELKNCLDYLRDEDTLVVTKLDRLARSNTHLNQIVEGLMAADVNLIVLDQKIDTRSALGKMMYQLLGVFAEFENNIRKERQADGIRIAREKGIKFGRKGTVAKNLDLSMV
>NZ_CP013976|61826:70300|64588_64927_+|WP_027243184.1|DBSCAN-SWA
MRLIAAEDYADWKGVKIQEVYQLIKNGDIRSLNKSNGSLKRLELVYVDQVPEHILSLDSEVEHLNQKQAAKKLNVSVDSLRQRLRENEVKSFTIKGYCFIPMNQFNESVTFR
>NZ_CP013976|61826:70300|65515_66124_+|WP_036815979.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGTVAKNYSELQKGYFLVLSA
>NZ_CP013976|61826:70300|69322_70300_+|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
>NZ_CP013976|61826:70300|63907_64126_+|WP_017375840.1|DBSCAN-SWA
MSSTFEDLTKKLMDEHIVTKAEMIQAIHENNSDLKEQFVAYQKEARVHTRWLIGIGITLIIGVAALIIKTHF
>NZ_CP013976|61826:70300|61826_62939_-|WP_075275474.1|DBSCAN-SWA
MVWLCIMSKSKKIVVKSNKLIEAGYKLSLQEQRVLLLCISQINSKNVELSTEYTITAQQYADQYSIALKGAYRELKAVINTLYDRSVSVYDKQNDIEISFRWLSEKVYLNKQGTARVRFSERVEPFLTDLKSKFTSYDLNLIAGIKSSYAIRIYELLKQFGAFGERTVTLDWLKGRLEINDEKSYKMFGSVKQRILEPAKSEINRCTDISMDYKPVKTGRKVTHISFIFESKRKDIVRDIKEERVDEKVSVAGFIKGLNLVIDTLENSENINRDKLSFAYNKFVANGAAIEDYRKLLDYIASHSSSIKDERDIESVIGEQLYLGKKKSKPFPRNGSRVTNPLSQSYYHEHNVNDDPVLEAINGDYEVVGD
>NZ_CP013976|61826:70300|67296_68025_+|WP_036772541.1|transposase|DBSCAN-SWA
MARRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEMTGERGLELERSTICRWVHEYGPEIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAALRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSRRCKLRRVKYLNNCIENDHKAIKRKSRFRQWYQSLSTARSTIDVMEAMRMIQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075275474.1|61826_62939_-	replication initiation protein	A0A218MNI2	uncultured_virus	2.1e-25	29.8
WP_017375840.1|63907_64126_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052133264.1|64170_64575_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243184.1|64588_64927_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420841.1|64919_65144_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046641.1|65170_65335_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036815979.1|65515_66124_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	8.9e-10	34.6
WP_017375910.1|66126_66855_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
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WP_036772541.1|67296_68025_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	5.4e-38	42.2
WP_048876211.1|68036_68741_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.9e-10	31.7
WP_036771347.1|69322_70300_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9