Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013217 | Kurthia sp. 11kri321, complete genome | 4 crisprs | RT,WYL,DEDDh,cas3,csa3,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas6,DinG | 0 | 2 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013217_1 | 467307-467464 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013217_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013217_1
>1.1|467361|50|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder CCCCATCAGTCGCCCCATTTTTTTATATAGAAACATCCAAATATGGCGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013217_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013217_1 >merge|NZ_CP013217|1|467307-467464|CRISPRCasFinder TGTGGTGAAGTGGTTAACACACCGGATTGTGGTTCCGGCATTCGTGGGTTCGATCCCCATCAGTCGCCCCATTTTTTTATATAGAAACATCCAAATATGGCGACTGTGGTGAAGTGGTTAACACACCGGATTGTGGTTCCGGCACTCGTGGGTTCGAT >NZ_CP013217|1|1|467307-467464|CRISPRCasFinder TGTGGTGAAGTGGTTAACACACCGGATTGTGGTTCCGGCATTCGTGGGTTCGAT CCCCATCAGTCGCCCCATTTTTTTATATAGAAACATCCAAATATGGCGAC TGTGGTGAAGTGGTTAACACACCGGATTGTGGTTCCGGCACTCGTGGGTTCGAT
>NZ_CP013217.1|WP_068450961.1|460095_460959_+|hypothetical-protein MEHILRPIYQERASDPNTLGAILVEKIDDLSPETDNIDAILLILVAEAELSVFTKHYTYEEHHAAMHIVTNKQLRKWLLLGTNKKIINWIMDGRVVFDRNETIYSLRQEMRNNPRYGRHVKLGIEFSKLLRRFQEGRVSFEQRDYVDAFFQMMECLHHVARLSIIEVGVYPELKVWEQVKTYNNEIYDLYEGFIEKPRPIEQKILEVIVYIESFIDQKVVESGRHIVEVMKQKDVWTIQELHEHEELKNYSINLEVFVEYLIDKGYIKIELLPTKSNDVKHRLYKVE >NZ_CP013217.1|WP_068450958.1|459481_459925_+|peroxide-responsive-transcriptional-repressor-PerR MAMSEMQLETALDTLKKTGVRITPQRHAILEYLIEAMSHPTADEIYKSLESKFPNMSVATVYNNLRVFKESGLVQELTYGDNASRFDFVTSKHYHTICQSCGKIVDFHYPGLDEIEHFASHVTGFKINSHRLEIYGVCPECQEEQSQ >NZ_CP013217.1|WP_068450955.1|458399_459344_+|D-2-hydroxyacid-dehydrogenase MIYFTFDPRPDLKKDLEQFMPEEQIIYETKVDNNHLNEAEILVTYGEDLTPEHMKSMKNLKWIFVASAGIEKMPLAELDETEIIVSNVRGIHKKPMAESVLAHILSYYRSLPAIYAEQRAHNWKRKMPSKELNGATALILGPGAIGSEMGRLLQAFGVNTIGCNRSGKQADYMDEMIAFNQLLDTLPRAEIVLSVLPSTKETKYLLTADHFKAMNPDTLFLNFGRGDLVATNVLIEALQQKEIAYAVCDVFEQEPLPSDSPLYDLENLTVSPHVSSQSSRYLERSFDIFKENYRHYRKGDYDQITNQVNLKNGY >NZ_CP013217.1|WP_068450951.1|457929_458403_+|thioredoxin-dependent-thiol-peroxidase MESLKNKKAPLFTLPNEKGEQVALENFLGKKNVILYFYPKDMTPGCTTEACDFAAAYEDFSDLDAVILGVSPDPAERHEKFIAKHNLPFSLLVDTDVKVAEAYGVWQLKKNFGKEYMGIVRSTFLINKEGIVQEEWRNVRVKDHVAKVAAVLRGENE >NZ_CP013217.1|WP_068450948.1|456683_457775_-|aromatic-acid-exporter-family-protein MKLGARILKTGVAIVFALYLANWFELPAPIFAGVAAIFALQPSIYRSYKTIIEQVQGNLIGAVIAVIFGLTFGHSYVVVGFAVVVTLIIMMKFKLEGSISLALVTIIVIMEFQEGSFIEFAMWRFVTVMTGVLAAFIINLIFLPPKYEERLFTSIKYLQTDIIKWIRLAVRQASEHTSTKQSLRRLRKQFERVNNLYKLFKEERGYTKKARNMKHRKLVVYRQMLITMTKSIEVLNRLHLHENELSHLPEKFHIMIQERLDFLLTYHEQLLLKYTGKLKAEHTTWIGEEEFLQRNEVMDIFAQHIVHEHASESEEEFSSYHLLHILSRILDYEENLEHLNTLITSFIQHHASESFKEENEEVI >NZ_CP013217.1|WP_068450946.1|454892_456638_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MDSMKRYMKFVKPYKWDIVFAFILGVIKFMIPLAIPLLIKVIIDDVISNDGLPPDEKTKKLFMWIIFMAFLFFIVRPPIEYYRQYFAQRISNRVLYDIRTNMYGHLQKLGQKFYANNRVGDVISRTINDVEQTKEFIVTGLMNVWIDLVTVVIAIGIMLYMDFKLTLVTLIALPFYVISVKFFFTKLRTLTRERSKALAGVQSYLHERVQGMSVITSFTLEQHEQGVFKKANGNFLEKALDQTRWNAKTFMVVNTVTGMAPVAVIGYAGYQVIHGSLTLGVLAAFIGYIDSLYNPLRRLVNSSTTLTQSVASMDRMFELMDEKYDITDRENAKELQQVAGKVTFDDVAFRYNDDGRNVLNQLNFTIEPGQTAAFVGMSGGGKSTIISLIPRFYDVTGGSIKIDGQDIRDLTIESLRRNIGIVQQDNVLFSDSIKENILMGNPQATDEEVYAAAKAANAHDFIMSFPDGYDTLVGERGVKLSGGQKQRVAIARVFLKNPPILILDEATSALDLESEALIQESLDRLAHNRTTLIVAHRLSTITHANQIMLIDHGEVKEHGTHQQLMQAGGAYHDLFQVQVLD >NZ_CP013217.1|WP_068450943.1|454160_454709_+|DUF402-domain-containing-protein MTIPAEGDIVQIHSYKHNGQIHRVWQETMVLKSTPKILIGANERTLVTESDGRTWLTREPSITYFHTELWFNIICMLREDGVYYYCNMSSPFVFDHNAIKYIDYDLDVKIFPDMSYTLLDEDEYEQHKQEMNYPPVIDSILKANVNKLINWIQQRRGPFAPDFIEAWTNRYEFYKQIKQQEE >NZ_CP013217.1|WP_068450941.1|452971_454024_+|A/G-specific-adenine-glycosylase MSYQYKKEFQQFLVEWFQREKRDLPWRKTKDPYKIWVSEVMLQQTRVDTVIPYYENFLEKFPTPEVLAEAEESFLLKQWEGLGYYSRARNLQAGVREVVESYGSIVPNTRDEISKLKGVGPYTAGAVLSIAYGVPEHAVDGNVMRVLSRVLLIEDDIALPKTRKVFEKAVMDLIDPDHPSDFNQGLMELGALVCTPTSPKCLLCPVRDYCGAFAEGRTAELPVKVKKTKVKKLHYDVYVIENEAGQICMEQRPATGLLANMWQFPMVEQTADYSGIAQYTKEHEIELHGQEELVELKHIFSHIVWHLKAFYVKGESKSGKWFTLDEIEHLPLPVPMQKILQSYRVHTKKL >NZ_CP013217.1|WP_068450936.1|451917_452889_-|metal-dependent-hydrolase MDTGTHLVMGITISGLTFADPTVAASTATATAVIAGVMLGSQAPDIDTVLKLRNNAVYIRHHRGITHSIPAVFIWPTLITLVLLLLLPDANVLHLWLWTFFAVALHVFVDIFNAYGTQALRPFTKKWIALGIINTFDPIIFGLNVIAIMIWAFGADPVITMSILYGTLVIYYIIRTWLHHAVKQAVQNTIPDVKDIYLSPTRYFFQYRVAANSDTHHYVARAYGRSITLLDKFKIEPLPEEELFEVAIQDENLRSFLSFSPIYRFEIRKIKNNLTEVRLIDLRYRSNNRYPFVAVAQVDEHLKVVNSYTGWIFSEEKLRSKLG >NZ_CP013217.1|WP_068450934.1|451346_451595_+|hypothetical-protein MKTKIQELAELLQQSNENLSEEKARTWIELLWSDFESTYARAGYSYKGEEMTEKMVRQWIESYGSTLHEFVARNPKYKDLLN >NZ_CP013217.1|WP_068450963.1|467937_468720_+|DUF4111-domain-containing-protein MFIPETVKKAVDTYMSLSHKLLPDYQLELFIHGSIGLNTYESNKSDIDCIIVTNPELTLDQKEILNQLHLQFEQQENIPMDCVYIAKADLSSQSPFLNTYFYYNEGTLSYGDYFNFNPVTWWTLHQNYQDPPFPTTTGSQLRDYVFQNMQQYWKPYIERLKREVQLDLSISDEEIKEEIEWIVLGLLRQFYTLKEVGVTSKYDAGIYGLQHLPKQWHPIIQLAIRIRKNELVVVSVETMNQVIDFAEFLISYCEKLKSTD >NZ_CP013217.1|WP_068450966.1|469031_470429_+|amino-acid-permease MGNQNNKEFTKSMSKVDVLFLSLGAMLGWGWVVLSGEWITGAGFLGTIIAFILGGLLVIFIGLTYAELSAAIPKTGGGLVFVQRAFGKKSAFVAAWGVLFGYVSVVTFEAVALPTVIDYVMPVEHKVSLWTLGGWEVYLTWALIGSVGAVALTALNFFGIKPAAIFQNVFTVAIVLVAALMVYGAFANGDMKNLDPMFTDGFGGTLSVLVMIPFLFVGFDVIPQVAAEIKAPGKTIGRIIIVSIVSAVCFYLFVVFGVAAALPDEQLLTSQLATADAMVALFGSPVWGYVLVIGGIAGIITSWNAFIIGGSRILYAMAEHHMIPKWFAYMHPKYKTPTNAIIFLGILAAVAPFLGRPALVWIVDAGGVGIIVGYLLVSFAFMKLRKVEPELHRPYRIKYWKFTGVAAIALSILFITFYLPGMPSALVWPMEWLILGVWCLIGFVLYMIKPKEAIAFEVVSEGNNK >NZ_CP013217.1|WP_068450969.1|470664_471438_+|hypothetical-protein MKRFIGVFVPALFLIAVITSYMTFAQSYEWTENTIIAHAGGGIEGDKYTNSLEAFQNSYEKGHRLIELDINMTSDGKVVARHDWKDTKDQTYETFKNRLYKDKYKPIDFQQVIKLLKKYDDVYIILDGKTKSPQAVQTLYKKINVYTKNLKPRDKNRLIPQMFYKQDYQLLKNYGFKDVLYVIGRESYTNQSLAEFCDERGIRAVSIDKTFVNTPLVQTLKKKKIVSYTYTVNDRGTMKRHKQMGVHGFFSDFVDAY >NZ_CP013217.1|WP_068450971.1|471461_472037_-|DNA-3-methyladenine-glycosylase-I MEKTRCAWANVSELDQQYHDEEWGVPITKDSDWFETLILESMQAGLSWATILKKRETMREAFDYFDYEKIAQYDEAKIERLLQNEGIIRHRGKLTAMVHNATLFMDIQKEFGSFNEFIWTYTGGTPIQNHFTQLSEMPATTELSTRISKDLKKRGFKFLGPTTVYAFMQASGLVNDHVTTCFCYKKDLHGA >NZ_CP013217.1|WP_068450973.1|472255_473176_+|LD-carboxypeptidase MKQRPMRLQKGDTVGIVAPASPPNQQQLTKALDFIEGLGLQYVMGESVTAKEHYLAGSDELRVRDLQRMVEDPSIRAIFCASGGYGSARIADQLDYMLFEENPKIFWGFSDITFLHTAIGELSNLVTFHGPTLSSLGREDIPERTYLMFQQLFNPAEIYYDERISPLQTIAKGRVRAPIVGGNLTLLCESLGTKFEVDTANKVLLIEDIGLEPAQIDAKLNQLRMARKFEHCAGVVIGSFTHAEPRDYTDSPSLDALFTSYFKDFNKPVVSGFKFGHEDLNVGIPLGVDVILDADEKVLAFLPGVE >NZ_CP013217.1|WP_068450976.1|473212_473902_-|hypothetical-protein MHIQLNEQLTNQITDFKIGTVHYTKIIVEESPQMIKGRTQLYQENLFLDLQDTPVAEHKAIQEWRHIFKTLGADPSRYRPSAEALLRRIAKQQYLQPFHSAVDLNNFFSLQYEIPVGIYDTHALQGAIEMTVGTENSMYEGLNGRDVKLAGIPVSCDEQGPFGSPYVDSKRSAVTEATTDALQIFYLPPSLSHESCEQLLASASKMFTQIHGGDATYAILNKEQLQTTI >NZ_CP013217.1|WP_068450978.1|473962_475096_+|tRNA-epoxyqueuosine(34)-reductase-QueG MNVLSFQQQVREYAQSIGIDKIGFASATPFIDLKARLIQQQQLNYQSGFEESDVTLRTEPTLLLEDAKSIIAIALAYPSKMLNVPQGKKGARRGIFCRASWGVDYHTVLREKLALLEEFIHTHHPHSRTKSMVDTGELSDRAVAERAGIGWSGKNTNIITPEFGSYVYLGEIITDIPFIADEPIEDECLDCRLCIDVCPTGAIVQAGQLNAQRCIAFLTQTKDTLPDEFRTHLGNRIYGCDTCQTVCPKNKRKHNLIHEEFFPDPEIAKPLLEPLLTMSNKQFKQDFGHVSGSWRGKKPLQRNAIYALAHFKEESAIPTLTEVLQKDTRPIIRGAAAYAIGKIDAPASKAILEQALQKEQDEEVLEEIEKGLSFITK >NZ_CP013217.1|WP_068450979.1|475112_475586_+|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MTLHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTNTHLHLIRPLGFSTDDKMLKRAGLDYWSSVNITYYDNVEEFFEKHQQATIYFIETFGTKNYTEFDYSNTEEDIFFMFGKETTGIPRELIEDKQHMCLQIPQSDHVRSLNLSNTAAIIIYEALRQQSFKPIL >NZ_CP013217.1|WP_068450981.1|475636_476191_-|HAD-IA-family-hydrolase MRILWDFDGTIMDTYPAYTDILYDILNGQFTKEEIYQQLKISQSHAMDYFQLTDEQRKEMIEKSRAITNYTPFPYVENVLQQAEVNVIMTHMNRASVERILQETDLAKYFTEIVAGDDGFARKPDPAAYVYLHERYELDYAIGDRELDLIPAKKAGFKTIMFQNDCDVADYTINDYHHFFDLIP >NZ_CP013217.1|WP_068450984.1|476290_476473_+|hypothetical-protein MMKKGKDNVSSGHMTNNFSDVVELGKQMERLRDEQELKRDGYTQDPVQYDDEDEKKEEAK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013217_2 | 1714286-1716211 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013217_2
|
29 spacers
spacers of NZ_CP013217_2
>2.1|1714315|38|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT GGTGATGTAGTGAAAGTAATCGGTCTTACAAAATCGAA >2.2|1714382|35|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT AAAGTGGGTGCTGTTGTCGTATTTGGTTTATATAA >2.3|1714446|34|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT CTCGAAGTATCAGACTATGACGATGATGACGACG >2.4|1714509|37|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT GAATTCATTCACCGTCACGTGTAATGCGGGATGAGGT >2.5|1714575|37|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT GAATTCATTCACCGTCACGTGTAATGCGGGATGAGGT >2.6|1714641|39|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT GTTTAGTGAAAACGCTACTTTTCCATCTGGCAAAATAGC >2.7|1714709|35|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT ACAGAAGAAAATGGTTATTATCATGATGACTATTT >2.8|1714773|36|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT CGAACGCTTTCCTTATTAGTATAAAGAACGTAACAA >2.9|1714838|37|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT GATTTCCTAAAAGAATTACAACACGTATTACAAACAC >2.10|1714904|36|NZ_CP013217|CRT AATAGAAGTTTTCTTAGGTTTTAGGGGTAGAAACTT >2.11|1714969|36|NZ_CP013217|CRT AAGAATACTCACGATATCTTTTAGGGGTAGAAACTT >2.12|1715034|38|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder ATTTTCAGTTCGAGTTCTTCTTTGATTTCATCAAAAGC >2.13|1715101|36|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder GTTTTTTGAGTTAACAAGTGGTGATGATTCTTAGAT >2.14|1715166|37|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder TAAGTAAAGAAACACCTGGTGTAGAAGATGTATTAGA >2.15|1715232|35|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder TGGAATGGTATGCGTGTAAAAATAATCGAAGATCA >2.16|1715296|35|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder TTAAAACGACTGCTCCGTTCAAGCGATGGTTTATC >2.17|1715360|36|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder GAACAGGAATCGAACGTCTTGACTTCGGATAATACA >2.18|1715425|36|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder TTTGATGGGATACGTACCTTTTGACCATGTAGACTA >2.19|1715490|37|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder TGATTTGCTTACCATCTGGTATTTCTAACTCTAAAAA >2.20|1715556|36|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder GGCGCGTGTACCTGAATCGTGGGTGGCGCAAAATCA >2.21|1715621|36|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder AATTCTTAACAAGTTGACGTTGGCAGATCGTATTAA >2.22|1715686|35|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder CATTTGGGTAATACAGTGTACCGTTATGCTTAACA >2.23|1715750|39|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder CAAAACAAAATAAAACCATAAAAAAGCTAATGCAACCAT >2.24|1715818|37|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder ATAATATGTTCTTGCGGTCGTTCTTCGCCAAATGTAT >2.25|1715884|38|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder CACTTGAACCAATCGACGGATGGTTTTCCGTTGAAGCC >2.26|1715951|37|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder CTCGCACGTAACGCGCTTTGTTTCTTTGTTGAATACA >2.27|1716017|38|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder CCATTTTCAGTTTCACTTGGTGGTTTATCGGTTGGTTT >2.28|1716084|35|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder ACGGTGTTTTCCATCATGATGTAATGCACGATGAC >2.29|1716148|35|NZ_CP013217|CRT,CRISPRCasFinder TTAGTAGCACGTATTTACATTTTATTATTATTTGG >2.30|1714316|38|NZ_CP013217|PILER-CR GGTGATGTAGTGAAAGTAATCGGTCTTACAAAATCGAA >2.31|1714383|35|NZ_CP013217|PILER-CR AAAGTGGGTGCTGTTGTCGTATTTGGTTTATATAA >2.32|1714447|34|NZ_CP013217|PILER-CR CTCGAAGTATCAGACTATGACGATGATGACGACG >2.33|1714510|37|NZ_CP013217|PILER-CR GAATTCATTCACCGTCACGTGTAATGCGGGATGAGGT >2.34|1714576|37|NZ_CP013217|PILER-CR GAATTCATTCACCGTCACGTGTAATGCGGGATGAGGT >2.35|1714642|39|NZ_CP013217|PILER-CR GTTTAGTGAAAACGCTACTTTTCCATCTGGCAAAATAGC >2.36|1714710|35|NZ_CP013217|PILER-CR ACAGAAGAAAATGGTTATTATCATGATGACTATTT >2.37|1714774|36|NZ_CP013217|PILER-CR CGAACGCTTTCCTTATTAGTATAAAGAACGTAACAA >2.38|1714839|37|NZ_CP013217|PILER-CR GATTTCCTAAAAGAATTACAACACGTATTACAAACAC >2.39|1714905|36|NZ_CP013217|PILER-CR AATAGAAGTTTTCTTAGGTTTTAGGGGTAGAAACTT >2.40|1714970|54|NZ_CP013217|PILER-CR GTAAAGTGCGAGTAAGTCAAGAATACTCACGATATCTTTTAGGGGTAGAAACTT >2.41|1715053|38|NZ_CP013217|PILER-CR ATTTTCAGTTCGAGTTCTTCTTTGATTTCATCAAAAGC >2.42|1715120|36|NZ_CP013217|PILER-CR GTTTTTTGAGTTAACAAGTGGTGATGATTCTTAGAT >2.43|1715185|37|NZ_CP013217|PILER-CR TAAGTAAAGAAACACCTGGTGTAGAAGATGTATTAGA >2.44|1715251|35|NZ_CP013217|PILER-CR TGGAATGGTATGCGTGTAAAAATAATCGAAGATCA >2.45|1715315|35|NZ_CP013217|PILER-CR TTAAAACGACTGCTCCGTTCAAGCGATGGTTTATC >2.46|1715379|36|NZ_CP013217|PILER-CR GAACAGGAATCGAACGTCTTGACTTCGGATAATACA >2.47|1715444|36|NZ_CP013217|PILER-CR TTTGATGGGATACGTACCTTTTGACCATGTAGACTA >2.48|1715509|37|NZ_CP013217|PILER-CR TGATTTGCTTACCATCTGGTATTTCTAACTCTAAAAA >2.49|1715575|36|NZ_CP013217|PILER-CR GGCGCGTGTACCTGAATCGTGGGTGGCGCAAAATCA >2.50|1715640|36|NZ_CP013217|PILER-CR AATTCTTAACAAGTTGACGTTGGCAGATCGTATTAA >2.51|1715705|35|NZ_CP013217|PILER-CR CATTTGGGTAATACAGTGTACCGTTATGCTTAACA >2.52|1715769|39|NZ_CP013217|PILER-CR CAAAACAAAATAAAACCATAAAAAAGCTAATGCAACCAT >2.53|1715837|37|NZ_CP013217|PILER-CR ATAATATGTTCTTGCGGTCGTTCTTCGCCAAATGTAT >2.54|1715903|38|NZ_CP013217|PILER-CR CACTTGAACCAATCGACGGATGGTTTTCCGTTGAAGCC >2.55|1715970|37|NZ_CP013217|PILER-CR CTCGCACGTAACGCGCTTTGTTTCTTTGTTGAATACA >2.56|1716036|38|NZ_CP013217|PILER-CR CCATTTTCAGTTTCACTTGGTGGTTTATCGGTTGGTTT >2.57|1716103|35|NZ_CP013217|PILER-CR ACGGTGTTTTCCATCATGATGTAATGCACGATGAC >2.58|1716167|35|NZ_CP013217|PILER-CR TTAGTAGCACGTATTTACATTTTATTATTATTTGG |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013217_2
The CRISPR arrays of NZ_CP013217_2 >merge|NZ_CP013217|2|1714286-1716211|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder 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>NZ_CP013217|2|2|1714286-1714904|CRISPRCasFinder TTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT GGTGATGTAGTGAAAGTAATCGGTCTTACAAAATCGAA CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT AAAGTGGGTGCTGTTGTCGTATTTGGTTTATATAA CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT CTCGAAGTATCAGACTATGACGATGATGACGACG CTTTAAATTCCTCTATGTTCAGATAAAAT GAATTCATTCACCGTCACGTGTAATGCGGGATGAGGT CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT GAATTCATTCACCGTCACGTGTAATGCGGGATGAGGT CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT GTTTAGTGAAAACGCTACTTTTCCATCTGGCAAAATAGC CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT ACAGAAGAAAATGGTTATTATCATGATGACTATTT CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT CGAACGCTTTCCTTATTAGTATAAAGAACGTAACAA CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT GATTTCCTAAAAGAATTACAACACGTATTACAAACAC CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAATAATAGAAGTTTTCTTAGGTTTTAGGGGTAGAAACTTCTTTAAATCCCGTAAAGTGCGAGTAAGTCAAGAATACTCACGATATCTTTTAGGGGTAGAAACTTCTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT ATTTTCAGTTCGAGTTCTTCTTTGATTTCATCAAAAGC CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT GTTTTTTGAGTTAACAAGTGGTGATGATTCTTAGAT CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT TAAGTAAAGAAACACCTGGTGTAGAAGATGTATTAGA 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CAGATAAAATACGGTGTTTTCCATCATGA TGTAATGCACGATGACCTTTAAATCTCTCTATGTT CAGATAAAATTTAGTAGCACGTATTTACA TTTTATTATTATTTGGCTTTAAATCTCTCTATGTT CAGATAAAAT >NZ_CP013217|2|3|1715005-1716211|CRISPRCasFinder GGTGATGTAGTGAAAGTAATCGGTCTTACAAAATCGAA CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT AAAGTGGGTGCTGTTGTCGTATTTGGTTTATATAA CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT CTCGAAGTATCAGACTATGACGATGATGACGACG CTTTAAATTCCTCTATGTTCAGATAAAAT GAATTCATTCACCGTCACGTGTAATGCGGGATGAGGT CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT GAATTCATTCACCGTCACGTGTAATGCGGGATGAGGT CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT GTTTAGTGAAAACGCTACTTTTCCATCTGGCAAAATAGC CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT ACAGAAGAAAATGGTTATTATCATGATGACTATTT CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT CGAACGCTTTCCTTATTAGTATAAAGAACGTAACAA CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT GATTTCCTAAAAGAATTACAACACGTATTACAAACAC CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAATAATAGAAGTTTTCTTAGGTTTTAGGGGTAGAAACTTCTTTAAATCCCGTAAAGTGCGAGTAAGTCAAGAATACTCACGATATCTTTTAGGGGTAGAAACTTCTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT ATTTTCAGTTCGAGTTCTTCTTTGATTTCATCAAAAGC CTTTAAATCCCTCTATGTTCAGATAAAAT 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>NZ_CP013217.1|WP_068453955.1|1713682_1714153_+|hypothetical-protein MQIQTYVYDEENQPQLLHQTHNVRLQGGFSNAEGFLTIQTATKHLSTEHAPDELHTLWQSTVDGFAECIERGTAERYFPNTPVMIKMEQQHARMIRCTIDEQTVEAEMNVWMEALYEAGIAWCDWLNTHTHSAIASNLHTQLEQLKKALHDEMQWR >NZ_CP013217.1|WP_068453950.1|1712845_1713670_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MITFDHVSYQYPDGTIALYDLSFTLPQGKKIALLGNNGAGKSTLFKHLNGLFQPTTGTIFMEDTPYQYNRKGLQALRGQVGIVFQDPDAQLFSGTVEQDIAFGPTNLGWSSDKIHAQVEHVITQLELESLRKKPIHFLSLGQKKRVAIAGVLAMEPHILILDEPSAGLDRYYANQIMKHLNDFHTEERTIILSTHDVDFAYEWADLVLVMQDGQMTYMGDPVALFEEQAILQAAHLERPLLFEVAKELGIQNLADYPRSRVQLWKKMKRQTTLV >NZ_CP013217.1|WP_068453948.1|1712069_1712849_+|cobalt-ECF-transporter-T-component-CbiQ MIPIDQYAYTNRLSNVHPLEKMVLALSFLLFAVITKDVLISLITFFVMSTFILFAAKIPLSLYCKLLLLPGFFLLTSIFSILISFTTSTLPPHYWSMSFGSVQLFIGKASVDTAFHLFFSVLASISCLYFIALTTPISAITYAMRQLKIPIIFIELCELTYRFIFVFLQSMQAIYEAQQSRLGYQKKRRWFQSVGYLVTAMFKDVFRRSKQLHEAMASRCYNEDISSHYVTYQTERRNWLGIGVSLCLLGAVYLGGFYL >NZ_CP013217.1|WP_068453946.1|1711789_1712083_+|energy-coupling-factor-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKNLFFLFIVIALAIFPLFIQKGAEFGGADGEAEAAITEIDKSYEPWFSSIWEPPSGEIESLLFALQAAIGAGFIGYFFGLMRGRTKKEKVSHDSN >NZ_CP013217.1|WP_082701568.1|1711109_1711790_+|energy-coupling-factor-ABC-transporter-permease MHIMEGFLPIEWAIFWWAISLPFIIMGIRSIRKTVKEHPETKMMLGLSGAFAFVLSALKIPSVTGSCSHPTGVGLGTVLFGPLAMSVVGSIVLLFQALLLAHGGLTTLGANAFSMAVAGPIIAWYVFKGAQKAGWSFSVAVFLAAMLGDLGTYTITSFQLALAFPSEAGGMLASFAKFASIFSFTQIPLAISEGLLTVIVMNFLRKYNVAELRMLNIFTKKKEAAK >NZ_CP013217.1|WP_068453943.1|1709792_1710167_-|(2Fe-2S)-ferredoxin-domain-containing-protein MTTWNLNGVQSHVLICNGSSCMRKEGEEITQKIRAEITARNLDEQIHTSRTRCNGRCKDACVVVHYPKGDWYSITSEEEATRFVAQLAGEQKTVVPRITFENGAFVRNEDTPAIKGISKVKEEV >NZ_CP013217.1|WP_068453942.1|1708161_1709793_-|precorrin-3B-C(17)-methyltransferase 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MQRDIYMFANGTVKRKDNTIYLISEDEQKRALPIEQIENLHLFGEVNLNTSFLNYVGQKDVAIHIYNYYGFYSGSFLPREKKVSGLVTVNQSAHYLQPEKRLYLAKAFIESAVFHMIRFNRKKHNQDSLYVKEIQKLREGIGNAKSVAQLMGLEGMMRQNYYRALDELIPKEFSFMERTKRPPKDAFNALISFGNTMMYTTILSEIYKTQLNPTISYLHEPSQKRFSLCLDLAEIFKPLFVDPLIVSLVNTKQIQLEHFDFEEGFVYLSEQGRKIFIQAFDKKLKDSIQHRQLKRKVTYRYFIRLECYKLIKHVIGDTSYKPLKAWW >NZ_CP013217.1|WP_068453961.1|1717616_1718117_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDQTVGGLHVQYFAVCKRKLWLYSKQIGFETEHEKVIEGTVLHENSYKRKKKEYNISNHAVVDVVDQEYIQETKLSSKMQKADELQLLYYLYLLKLRGIDKKGRIAYTKEKKVIDVELTEEKEKEIKRILAEIHTILEEPFAPKLKKKPYCKSCAYYDFCYALEEE >NZ_CP013217.1|WP_068453963.1|1718129_1720439_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYYAKSKPTPLTIKEHTDDVVEAVRVLKKAVESDLTFCPNQWELLEIAALYHDIGKYSTGFQQRIQQALQLPINQQNQLRNYPHNYISTMMLPLKSLSKKGYPKNDLIILTLAIGYHHERSQVPHLDELKSIYEEQLAPYLQEIQQDFQQEIGPPNSGFLKHLINRSLIYQQLQKKQLHTNYILLKGLLQKTDRAASAKLPGEDITHYIERATHTNVGKQTEAFIVEKYNQLRPLQLFVSQHKDKNIILIAQTGSGKTEAALIWIDAQKGFITLPLRVSLNALYLRVTNKEGMNYPHVGLLHSTALDYLIQSEMDHEQTSYEQLVLHTQHTERLAEKLTFSTVDQLFKFPLLYQSFEIELATLAYSKVVIDEIQAYDPKIVAILLKGLKMIDELGGKWMIMTATMPAIFLDKMQELELLGKNTVQETILLRDDRDSNPEVPRRHYVEVRNQSIHDFLDDIQEKGRKSKVLVVVNTVKQALALYKECKKNQQIQTNLLHSQFTPLHRTAKEKEIYKFAQLSNEEAGVWICTQIVEASLDVDFDYLFTEAATADALFQRFGRCNRAGKRYNGGVPNEANIFIAANLEEVSGIDYIYEKKIVENSLQELTQLPSPLVDEQQKIQIVKDVFSQEQLEDTKYLQIFEQTFEDLEGLRPFELKKEEAQKILRDITTVPFVAGQKNYEKVIAYIEQYNEAKTLKQYNQMKKIQIDMERYLITVNPYRLENQKKNENFQLNKFAYRDFEHIYFSTDVSYSKEQGLDLVLDETVDYFF >NZ_CP013217.1|WP_068453965.1|1720441_1721146_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MQLLKIKLFQETACYLKPFAFKVGETYPLAPFSTVKGMLHAILNAKEYIPLQLSIQGEFESMFVDYQKKYMYKKSDVPAQLITDGLKEQVETDSNLVTTMPMYQHLLFNVTHVIHVQAEPTILEELYNKFQNLSTTVSLGRWEDLVRVDQVELIEVQEEGNDVTKYTQYIPATLREEYEMGENSPFYHLPRKYTIVRGRRQWDYIEAMLIPKETDISLHDCFDEEGLPIFLMEG >NZ_CP013217.1|WP_068453966.1|1721126_1722053_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MGKTISLSVIVEASPLNYGEGFGNVSEMKKISRVDGNTYPFASRQSIRYDIVRLGNEWFGWNLDTVSKTKGTVQFKDDVTIADSVEMDLFGYLKTSKKTGEKTGEKSRKRAAVARLSHAIALEPYTGNFEFLTNMGLAERIDDTANLANIENHLSYYTYTITIDLSHIGIDQNDSLELSNDEKYERVVQLLDIIKLLSRNIRGRQENLTPKFIIGGLYPVANPFFLGNIKMNVKALELAPLKDTMALTFAGQSIGECTQIGLTQGTFSNEADVVEQFAGQVHTVEQFFQQLSKEVAHYYGVAHATTQD >NZ_CP013217.1|WP_068453967.1|1722036_1723821_-|hypothetical-protein MYEHLYIHEWIYNAGAVAMLQLDSQKEIKVNANRLDVPIEWIEQLPQRLFDYLIENYSRAQNTLEWLQKTINYARKNVDEKDKKQQTAFKISIDRFKNTLKDSLAKVKKYFEEEEEAIEAERLEKESLEALKDKNFELLEHLISEIRILLEKKEVDEKITLNYVKAVILAPASGQVSFLNVSKNKATRQEQQQIFYTDFVEPVLIELRLRMWIEQQDEESLLTFLRKSEYIIAKEWRKAHKKATTIDFEWFEQYPKCAALPNHWGTLPFEEKIFMPLASTSLNDRWFGHKDYIQVISPLARLLLFLSPLGCTRYRKKTANSEEMVFAFLHVEGDCKESLKRNRAFSKIMHNENSLIEALRGTHEKQQQIEKARREVTVLIEWFTESKAKKTLLEYRWIEERFYKYVLNENYISQVYPMEFREAIVQQHLRNYDTKMLIQQELYEQLKKDTRRNTWSVYQCLRIRELMMGGSTVEQQKSLTDRMHGTGRALRLALTSNDVSNSGQNEYKALNSKKLDASIYRILNAAKSGNRTLFFELVIRLSILAGRKISKEFAQCLDREVVNDAKFATMSLAFVAGLMAVQTKEEEKKDGENN >NZ_CP013217.1|WP_068453969.1|1723833_1724538_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRVALQLKVKKLPIQYRMICLAFVKEMIRQSDEEMYNRLYDNVKKPKPLTYSIYMRNFKASQTYYEMEGATFIFSSSDPMIALAFINSVSTIKKFEHQNVSIEIEHVRLVKEVVIREQQAEFAILNAMLVEDVHGKPVLIDDENFETELNHIMNAKFQYLYGRTLKKPLKIVKYRLKKVVVKETNRHANGKTLYYTGQKGRIVLNGHPEDLQNLYYDGIGLRTSSGWGTLEFIK >NZ_CP013217.1|WP_068453971.1|1724897_1725191_-|hypothetical-protein MLTKIRKVKFEPATKKPVYQVIMECPEGQQLYIKFDYTQATGNFWPLQVIYNKKSYGSKLAWYTQKVEKMPVQEFLGNISAKINRKYDFTFKEPLTK >NZ_CP013217.1|WP_068453973.1|1725277_1725754_-|hypothetical-protein MRMKFEIELYEDMMGKPFCLDTYFNCRINILISQNGVEKEFCTSTFHSSILLDLAEGLINMYEQNQQAFMIEMFESTYEYTFTYFQKILTITRYEGYNGETIEIMKCRFDDFVEAFVKEYERYHKAILKQDSYAFKNEDYCIKRDQINILKNHVNGVI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013217_3 | 2118299-2118385 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013217_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013217_3
>3.1|2118324|37|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder CCTTAAATCAAATGAAATTACAATAGCTTGTAAAGTA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013217_3
The CRISPR arrays of NZ_CP013217_3 >merge|NZ_CP013217|3|2118299-2118385|CRISPRCasFinder TTTATTCTTAACACACATTATTTTACCTTAAATCAAATGAAATTACAATAGCTTGTAAAGTATTTTTTCTTAACACACATTATTTTA >NZ_CP013217|3|4|2118299-2118385|CRISPRCasFinder TTTATTCTTAACACACATTATTTTA CCTTAAATCAAATGAAATTACAATAGCTTGTAAAGTA TTTTTTCTTAACACACATTATTTTA
>NZ_CP013217.1|WP_068454945.1|2117953_2118226_-|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLKRMGANKAPFYRIVVADSRSPRDGRSIETIGTFNPLTSPEEVKIDEAKALAWLGNGAKPSDTVRNLFSKQGIMEKFHNSKKGN >NZ_CP013217.1|WP_068454942.1|2117687_2117921_-|KH-domain-containing-protein MEQLIETIVKPLVDFPDDVNITVQESSNRIVYKLSVNPRDVGKVIGKQGSVAKAIRAIVYSAASSHRMKKTYVDIQD >NZ_CP013217.1|WP_068454939.1|2117107_2117623_-|ribosome-maturation-factor-RimM MEWFNVGKIVNTHGIRGEVRVISQTDFPEERYEVGAELGIFIPGEKKPTIVKVASARAHKNFILLTFEGYPFIQDVEKFKGSELKIHEKYLDDLGDDEFYYHEIVGCTVFDEEDNEIGEITEILQTGANDVWTVKGVNGKMHYIPVILDVVKEVDVDEKRITIELMDGLLS >NZ_CP013217.1|WP_068457516.1|2116370_2117108_-|tRNA-(guanosine(37)-N1)-methyltransferase-TrmD MNIHVLSLFPDMFEGVFGSSILKKAQEKGAVQMNVTDFRSFSQNKHNQVDDYPYGGGAGMVLKPEPLFHAVEDLVAQGKKPRIILMCPQGERYDQKKAEELAKEEDLIFLCGHYEGYDERIREYLVTDEISIGDFVLTGGELAAMTVIDSVVRLLPGVLGQEASHVNDSFSTGLLEHPHYTRPADFRGMKVPDVLMSGNHAKIEQWRMEQSLKRTFERRPDLLEHIELTKEQQAYLKQLKNNSKL >NZ_CP013217.1|WP_068454936.1|2115889_2116234_-|50S-ribosomal-protein-L19 MSNIITEITKDQLRTDIPAFRAGDTVSIDVKIVEGTRERIQKYEGVVIKRRGGGISETFTVRKISYGVGVERTFPVHTPKIASLTVTRRGKVRRAKLYYLRNLRGKAARIKEIR >NZ_CP013217.1|WP_068454933.1|2115205_2115772_-|signal-peptidase-I METKQKKEKNELWEWTKALIIAFALAAFIRYVLFTPIVVDGESMMPTLHSGDRMVVNKVSYKISDIHHSDIVVFHAPEKRDYIKRVIGLPGDTIEYKNDVLYRNGKAIDEPYLQQFKKAIQDGGTLTEDFQLQDYVQKDRVPEGYVFVMGDNRRNSKDSRHIGLIPENKIIGKASIVFWPLDQFGLVK >NZ_CP013217.1|WP_068454930.1|2114334_2115189_-|ribosome-biogenesis-GTPase-YlqF MTIQWFPGHMAKARRQVTENLKLVDIVFELIDARLPMSSRNPMLDDIIHQKNRLLILNKADMADEVQTKRWVQYFTDKGHHVVAVNSLDSKGLKRVVKAAEAVLKPKWDRMRAKGLKTRAIRAMIVGIPNVGKSTMINRLAKKNIARTGNTPGVTRSQQWIKVEKELELLDTPGILWPKFEDQEVGYKLALTGAIKDTITNMDDLAIYGLRFLEKYYPTRLEERYKITTVAEEVVETFDHIGRLRNVKAAGGEIDYDQVSELIVRDIRNEHLGKLTFDFVEDYE >NZ_CP013217.1|WP_068454927.1|2113459_2114230_-|ribonuclease-HII MKTIKAIKEALAQEHTWQEWMTELEQDEREGVKKGLQSWKRQQEKREKLQQEHEAKIQFDDAYRTHEGAYIAGTDEAGRGPLAGPVVTAAVILPAECDALIGLNDSKKLSLEKREQFMRLIEEHALASYIHFQSEEAIDTLNIYEATRQSMKASIEGLSIQPDFVLADAMTLDITIPQESVIKGDAKSLAIAAASILAKTARDHYMEQMDEKYPGYGFAKHAGYGTKQHLEAIQHLGVTPIHRKTFEPIKSMLQKE >NZ_CP013217.1|WP_068454924.1|2111448_2113452_-|hypothetical-protein MNLSGVNVGQIQGAANTAQPVSMQEGQVLHGTIKKLYPNQQAEINIGGQKMMAKLETPMQAGNTHFFQVTATTPDLTLKMVSGPVDEKASLMDQTKQMIDTMKLPQTKEMQQIVSQLVKNNIPFNKEQLIAAEQLLKGANGAERPQALDALQKMIELKLPMTSTSLQAVMEGSLKGGFTNLLGNLEQSIRLDTQLASQLKEAILQQLAQLKSPLSEQTGNIALGKLLGSNTPEAGQILQQAGVGAKAETTDIVKQLFQQFKTEPNEAIRQLLQQPMTKENLQNLSQAIQQHPTLTKDQQQAIQQAITRMQLAPSASNQAQVIQEVTTQLASAKESIPQLMSQLKNATAETQPAIIQKLATAVAENPTLTMQQKQEVIAQLGQVQKNGAENVFKALVTAFSTQVGLQPTEEATSQLSQLLGVSKDQLSSLMQNLTRTLQQQSTPFAQQMLQDVENLQMTQLSGHAVQASMKKTLSELGLSLEANILQSNPEQAQLSSTLKSLMHALVHENVTNSTRNLAEQVIGRMNGQQLLSMDQGQQQQIVMQIPLQFFGKRIDATLQWSGSKNKDGKIDSNFARIMFYLHLENLHETVIDMQVQSRVVTLNIYTENQQSQGIIDPLKEVLKARLAEQDYRLSGVFLKKFDEPKPTVKQQSKIIGKSEDGGVDFRI >NZ_CP013217.1|WP_068454921.1|2111173_2111452_-|EscU/YscU/HrcU-family-type-III-secretion-system-export-apparatus-switch-protein MKKENRKEAVALSFNSEQSEAPKVIAKGKGLVADSILNKAQESGVPIQEDPNLVQLLGQLNLNESIPEELYQAVAEVFAFIYKLDQINGKNK >NZ_CP013217.1|WP_068454951.1|2119750_2120083_-|putative-DNA-binding-protein MLLDKTTRMNFLFDFYQALLTDKQRSYMQLYYLDDLSLGEIAESYEVSRQAVYDNIRRTEAMLEEYEEKLQLFHKFKKRQKITDKLSACLQDDTTEKADLLPLVEQLKQD >NZ_CP013217.1|WP_068454955.1|2120544_2121795_-|signal-recognition-particle-docking-protein-FtsY MSFLKRMKEKLMGGPSKEEVKEPEQQVEEVVETEEPAQAELPAVEEGKEQEVVEETTKPVEEETVETVQEEKQEVAIVEEVKDEPEAEKESKGWFRSAFSITEKFKSGLTKTRDSFTSKVNDLVARYRTVDEDFFEELEEVLLQADVGFETVMELTEILRYEVQKKNIKSTDGIQALISEKLVEIYEKAGDDHIELNLQPKGELTVILFVGVNGVGKTTTIGKLAHRLKSEGRSVMLAAGDTFRAGAIDQLQVWGDRVGVEVIKQSEGSDPAAVMYDAVHAAKNRGVDVLICDTAGRLQNKVNLMKELEKVHRVISREVPNAPHEVLLALDATTGQNALIQAQTFKEATNVTGIVLTKLDGTAKGGIVIAIRNKLHIPVKFVGLGEKMDDLQPFDPERYVYGLFADALDEQLKEEE >NZ_CP013217.1|WP_068454957.1|2121810_2125371_-|chromosome-segregation-protein-SMC MYLKRLEVIGFKSFAERIGIDFVPGVTAVVGPNGSGKSNVTDAIRWVLGEQSAKSLRGAKMEDIIFAGSESRKALNFAEVTLILDNEDERLPISYNEVSVTRRVYRSGESEYLLNKQTCRLKDITDLFLDSGLGKEAFSIISQGRVDEILNSKPDDRRAIFEEAAGVLKYKKRRKKAEHKLFETDDNLNRVLDILHELDERIEPLQLQASTAKDYLEMKDTLRQFDIGVLIHDIEQIDHTVEKLLQDQHQWNTSQQEKLVEIQKLEQHIASMKDELLQVGQKLDADQKTVVEVSENYARLQGEQNLFAEKQKNASAQLSKLKESLKQAQSKRDQWQKSLIEKEHALKEAQNHVHKLRKHVKQLETDLNRSTDELDAEIEDQKSTYIERLNEQAATNNELKSIEQQIQQQRQSDEKITSKSSELTTELQQAQATLAEVEPKLDAIRLEIAEHLKDYEATQAELQKANTQLAEKQKMLYEGYNHVQQLRSRRDTLAELEADFAGFYQGVKAVLKAREQNQLQGVQGAVAELIHAKGAYTQAIETALGAAMQHIVTATDEDAKRAIRYLKQVRAGRATFLPMNIMKSRKLSQAALQPILDHPSFIQTADELVQVDERYRSIAENLLGHILVVKDLDGATQIAKFLQYRYRVVTLDGDVVNAGGSMSGGGANKQQNTVFSRKAELETLQANLVEMEETIQQAEKVVAEWQQKAQSAATLLDVQRDHGEQLRVQENELEATYQATVTQEKMLQQSLSIYGSEQQDTTSRHAMLVTKQEALVQQLDQTAKEIQHLEQEIERLNELKVQMKTARDTLLNELANQREDHAQAMGKFESIQTSTEETRSYFNEAAEEVSKIRREIEFVTKGDATNGLSEEQFEQEIAKQLKRKQQLETAIEQSVEKRANLQQRVDEETTTLKEMQRIHQQFVNEQNQVKIQLGKLEVKRANAVEQLQQNYDLTFEEAQLEPALEVDLEVAKRKVNMLSQSIKELGDVNISAIEEYEAVAERHEFLTSQRNDLLEAKDTLYEAIREMDEEMTTRFGTTFKQIRIHFQEVFKELFGGGKADLILLEPDQLLTSGIEIVAQPPGKKLQNLGLLSGGERALTAIALLFAILRTRPVPFCILDEVEAALDEANVSRYSQYLKKFSEDTQFIVITHKKVTMEGADVLYGITMQEQGVSKLVSVKLEQETVS >NZ_CP013217.1|WP_068454959.1|2125381_2126134_-|ribonuclease-III MRIEELSQKNSAISEHAKKKFEELQKNLKISFHNKNLLYNAFTHSSYVNEHRRKGFEDNERLEFLGDAVLELTVSKFLFLMFPKMTEGELTKLRAAIVCEPSLVTFANELSFGHYVLLGKGEELTGGRERPALLADCFEAFIGALYLDQGLETVVAFLEKVVFPKVELGTFSHVVDFKSQLQEMIQQANSGVLTYEIIKEQGPAHNRTFISRVTLNGETLGEGNGKSKKEAEQKAAQTAMRALKEQFPKG >NZ_CP013217.1|WP_068454961.1|2126295_2126532_-|acyl-carrier-protein MATVLERVTKVVVDRLGVDESEVTLEASFKEDLGADSLDVVELVMELEEEFDMQIDDEDAEKISTVGSAVSFIESKIG >NZ_CP013217.1|WP_068454964.1|2126649_2127393_-|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MKFNGQAAIVTGASRGIGREIALKLAEEGAKVVVNYSGSKEKAEAVAAEIIAKGGEAIVHQANVANVDEVKGLVDATMAAFGSVDILVNNAGITRDNLIMRMKEEDWDAVIDTNLKSVFLCTKAVSRQMMKQRSGSIVNVASIVGVAGNAGQANYVASKAGVIGLTKTTAKEFAARHIRVNAVAPGFIETEMTDVLPEDVKETMLTQIPLAKLGQAKEIANVVAFLASDEASYMTGQTLHVDGGMVM >NZ_CP013217.1|WP_068454967.1|2127382_2128342_-|ACP-S-malonyltransferase MTKVAFIFPGQGSQTVGMGAELIEANASSKAFYTEADQLLGFDLSKLMLEGPQEELTLTYHAQPALLTTGVMVAQQLMDHGIHPNFTAGHSLGEYAALVASGVMRFEDAVVAVHKRGLFMNDAVPAGQGSMAAVLGLDAEALQAVTDAASEEVGEVVQLANLNCPGQIVISGTAKAVEVASEKAKEAGARRVLPLVVSGPFHSELMRPAASKLQEMLADIQMNDAKAPVIANVTAKAVTDATEIRSLLVEQLYSPVRWEETVRQLVAEGVDTFIECGPGKVLSGLVKKVDRKLTTYCVFDEASLQQVVEAAKEWNTSEV >NZ_CP013217.1|WP_068454970.1|2128341_2129334_-|phosphate-acyltransferase-PlsX MKIAIDAMGGDHAPKEIVEGVFQAVEDFKDVEFLLYGDEVKMAPYLKQHERVQVIHCSEVIEGTDEPVRAVRRKKDASMVRMAQAVADGEADACVSAGNTGALMAAGLFIVHRIDGIDRPALATTLPTLDGAGFDMLDLGANADAKPENILQYAIMGSIYAKQVRGIEKPTVGLLNIGTEDKKGNDLTKQAFKLLKEQNDINFIGNVEARELLNHAADVVVTDGFTGNMVLKTIEGVAGNIFAMLKEEFLSSTKTKVAAMMMKNNLKNLKTKMDYSEYGGAPLFGLKAPVIKAHGSSKAQAIYSAIRQTHIMVEHRVCQTIDQTISKENA >NZ_CP013217.1|WP_068454973.1|2129330_2129909_-|transcription-factor-FapR MKYSKKERQKLLKQTIEDNPFVTDDQLASKFNVSVQTIRLDRMELSIPELRERIKDVAAHNFENEVKTLPIDEVIGEIIDIDLDDRAISIFDVKEEHVFQRNGIARGHHLFAQANSLAVAVIDDDLALTVKSDLTYTKPVHAGNRVVAKAVVTKQDADTNRTYVTVTSTVEGKTVFIGNFEMFRTKGKGGNE >NZ_CP013217.1|WP_068454976.1|2130012_2132061_-|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MANELTQSVTELNGVGKAVAEQLEQMNVHTIEDLIWTFPYRHEDFRLKDLAETPHNERVTVEGRIESVPTVLFLGHKKSRLQVQMLAGRHLIKVVFFNQGYLKNKLEPGMTVTVTGKWDRGRQVINGTKITFGTKDEQADFEPVYSVKGKLSQTKFRHFMRQALDQYGCYIEETLPTELLEQYRLQTIQQALEGIHFPKQLQDTKQARRRFVYEELLHFQLKIQALRKTRKEDEKGIAIAYDVEKLREFFDSLPYELTGAQKRVVNEICTDLRTPHRMNRLLQGDVGSGKTVVAAAMLYAAVTAGFQGALMAPTEILAEQHAENLAMWLEPFGVRLALLTGSTKAKARREILSRLESGEIDILMGTHALIQPTVIFNRLGLVITDEQHRFGVEQRRILKEKGDNPDVLFMTATPIPRTLSITAFGEMDVSIIDELPAGRKQIETNWVKHEQFNQVLQKMAHELRAGRQAYVICPLIEESDKLDVQNAVDVYQQLATVFHGQYEVGLMHGRLKSEEKDAVMREFSEGKLNVLVSTTVVEVGVNVPNATFMVIYDAERFGLAQLHQLRGRVGRGEHQSYCILLADPKSEEGKERMISMVEVTDGFRLAEKDLELRGPGDFFGRKQSGLPEFKVADLVHDYRALETARQDATNFVASEAFWQEEAYAPLRRVIESSGILEGERID |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013217_4 | 2423026-2423122 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013217_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013217_4
>4.1|2423060|29|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder AAAACGAGTAGCGAGTGGACTGTTTCCGC |
WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013217_4
The CRISPR arrays of NZ_CP013217_4 >merge|NZ_CP013217|4|2423026-2423122|CRISPRCasFinder CCTCGAATGGCCCGTTTGATCGGATGAATGGCCCAAAACGAGTAGCGAGTGGACTGTTTCCGCCCTCGAATAGCCCGTTTGATCGGATGAATGGCCC >NZ_CP013217|4|5|2423026-2423122|CRISPRCasFinder CCTCGAATGGCCCGTTTGATCGGATGAATGGCCC AAAACGAGTAGCGAGTGGACTGTTTCCGC CCTCGAATAGCCCGTTTGATCGGATGAATGGCCC
>NZ_CP013217.1|WP_068455708.1|2421477_2422725_-|MFS-transporter MNSQQYIEHPEKVEKLYKRTLWIVVCSQIFGGAGLAAGITVGALLAQDLLQTNAFAGLPSALFTLGSALAALWVGRFSNRFGRRMGLSTGFIVGGLGAVGVVIAAIFANVWLLFISLFIYGAGTATNLQARYAGTDLATPKQRGTAVSIAMVSTTLGAVAGPNLVEVMGDFATSIGIPPLAGPFILSAAAFLTAGIILFIFLRPDPFVIALHLNKNKQKTQTMDATERTENNRKGIRMGAAIMVISQIIMVAIMTMTPVHMGHHGHSLRAIGLVIGFHVGSMYLPSLFTGVLVDKIGRPAMAVASGVTLLVAGIVAATTSGDSIVVLIIALSLLGIGWNFGLISGTALIVDSTEPMTRAKVQGSVDVLIALSGAAGGMLSGMVVAGTSYTVLALSGGLLALLLIPIVISTRTLKA >NZ_CP013217.1|WP_068455705.1|2420401_2420983_-|DUF1643-domain-containing-protein MARYPQNTFVDSIERDVIRIDGERHLLRYVLTLDNMESESEKTATVVHLHPMGAEQQYSDAMTNQMVRFLSKEDFQSISFVTLFPYHVPTATQLRELIVDPRLEEVMEKNRRFIHERLMNSDVFVLAWGDRPYYIPNRQFDEAFQYVMHLIQMWQKEKNVYVFRYSHAPSFTKNGQPDTPQKKVIEGILPIHT >NZ_CP013217.1|WP_068455702.1|2419912_2420392_+|hypothetical-protein MDTYWFSKKTFEQLQVKYETLQFSKKEQYDLLNQAIQMDHSSDNLTEEFLKYKEIQKTLQQIEEVIQRAKIIEDSPAYQKRLPNEVHVGTIVTLQFNEEELYQYTIVGYGEGDLQKNHLSYTTELAQAILKRKINERFIFVQNGFEHRVKILDIRPQLN >NZ_CP013217.1|WP_068455699.1|2418797_2419826_-|WYL-domain-containing-protein MLPTKNKLFLTYYVLKQYSNKENPMNATEVAKKVQEVFELEKAPNRRTIYDHFEDLELISEVYEQTVSFRLVRTPNRKVYIESTISSGEAHLLSDAVATSRFIDLEQSRSLIQKLGVVVGQNLKNFFEPRLHFKATDKKEYNEQLFQNIDVLTEAIKKGKKVTLQYLKYDVNKQLVPSRPDENNGYKKIRPYYLIWQINKYYLMYYYDDSTSPRFMRVDKMRDVTMIDEAVGELKDIPNLSDYTRNQAYMFGGMPEYIRFRCKMYSIGQVIDFFGEDVTIKPIDEEYFQVEVYTSCESIKFWLMQYISSIDQIEPLKLAVEIEEMLEDGLRRNRVKQKETFL >NZ_CP013217.1|WP_068455695.1|2418551_2418737_-|DUF3955-domain-containing-protein MHYLLGALSFLTFNLIGSRVATDGPLQEPFFLIPIGFMLLFIGIIWIALRFIMSKNQKVNI >NZ_CP013217.1|WP_068455692.1|2416948_2417881_+|LysR-family-transcriptional-regulator MTFEQLKYIVTVEKFGTLKDAAEHLHITLSALSQGLNKIEAELGLTLFQRNRTGSTITKEGRIIVAQAKKILFALDDLYESAEVLQNKLTGTLKVASIPGPFFQLFATAQQMKSIYPDINIQIREQNSQTMLEELKSEKVDIALAVYNHEDLEKYPDLAFTKIQDCEVFIVAHKDSPVIQGGKVVTEELGEQPVILFDDKIVIATMNEMKRVFGRNDIVISVNNPHIVQQYVEENKAYTIGLDLTFNHSQRFMQDMSSVKIDFLTEIPTTHSFGIVTKSNRHETQLMKEFAYRLKKDFQEQQPNLTETSL >NZ_CP013217.1|WP_068455689.1|2416561_2416819_-|YhdT-family-protein MKNNRYRIANREALMGIGLVIVNFAIWYGFAYGLGSGDPEKYTYVLGFPAWFFYSCIAGTVFMIILIYFVIKFFFKEVDFEEEEE >NZ_CP013217.1|WP_068455686.1|2415116_2416562_-|sodium/panthothenate-symporter MQWSVILPLAIFVIIIFGIGFWSNKFVTKSDSFLSEYFLGGREMGGFLLAMTMMATYGSASSFISGPGVAYNTGLGWVLLALAQLPAGYFVLMILGKKFAIVTRKFKSITLIDFLRARYNSNAVVILSAISIIIFLFASMVAQWVGGARLIESLTGMKYTTALFIFAVVVLVYVVIGGFRAVALTDALQGTIMVIGTIILLVGVVIAGGGIDNIMSDLVKENAELVSPFGVGHAYSPAYVSSFWILVGVGVIGLPQIAVRAMSYKNSRGMHRAILIGTIGIATIMFGMHLVGIFGRAVLPGIELGDKVMPALTMNVLPPFVAGIVLAAPMAAIMSTVNALLMMVSSTIVKDIYLHYIKPDSSDEHVKKTSFIITAVVGILVVIMSLNPPEIIVWLNLFAFGGLEAVFVWPIVLGLYWKKANKFGAMASMLVGVVLYIAITQFSPNIFGVHSITFPIVCGLITFVIVSLLTHHKIKEAPQYI >NZ_CP013217.1|WP_068455683.1|2413112_2413730_-|LysE-family-translocator MAILGTFLLMSFLLIILPGPDSSLVIQNSIMYGQKAGFKTVMGSVSGLLIHTSAAVLGLSALLMQSATLFTILKYIGAAYLIYIGFSALRTLKNPPTEEEIVVKGKEKSFFLQGFITCASNPKVAVFFLTFLPQFVQPNYNHMLQFAVMGIIYAMMTIIWFLLYVYLIDVFSKWLKRPTVQKSIQGCTGIVLLLFGLRLALEKTN >NZ_CP013217.1|WP_082701477.1|2412381_2413002_-|DUF1643-domain-containing-protein MLYMKKVALNVGEYQGVTYYSDNEEERYLLKAIRDPEVDKSVTVIMLNPTTTEEALADPVVQKVIHYFPNKAGKVNIVNLFPFQENHIHQLDEHMKGQNMRDFSIIKQNLHMIKLAIKDADEIILAWGSLPDGFSEAHYHTCIRDIVHLIRVFHKTNHCYVFEIEGQKSLLTWDNHPHHPREGKIKGLQHVSELWIEDGYLVLRFQ >NZ_CP013217.1|WP_068455711.1|2423282_2424614_+|guanine-deaminase MNYTHIVRGTAFTSRSLKEVAVLKDHLFCIDEQGMIAKVLRPEEAHLVDASIPVTTLPEGQFLLPGFIDLHVHAPQWAQSGTALDLPLYDWLNTYTFPLEAKFSDVDFAEKVYTHLVDTLLANGTTTVLYFASIHKEASYKLAEICAKRGQRGLVGKVVMDDAQENPDFYRDASTAEALQDTEEFIIAVKELAKSVKQGVYPVVTPRFIPSCTDEALQGLGELAKKYDTHVQSHCSESDWAHGFVKDRFQKNDAFALHDFGLLRDKSVMAHSNFLEDADADLFAETGTAIAHCPISNAYFANSVLPVAHLHEKNVEIGLGTDVSGGFSPSLYDNIRQAVMASRMLEDGVNPDLAPHVRGRQDSRITVNEAFYLATAGGGESLSLPIGRLEEGYCFDAQVIDTTSLPIFDATEPLEDIFQKILYLTRPEHIQQVFVQGECVHKK >NZ_CP013217.1|WP_082701478.1|2424893_2425067_+|DUF4017-domain-containing-protein MKKLGYALVVYVIVCGITILLPASPGYDVWSWKLLVGQVYAIPAFIVTLLILYFLGR >NZ_CP013217.1|WP_068455714.1|2425071_2426004_-|IS30-family-transposase MSYYHLTTSERAKIEVLKGLGYSCRAIARHLNRSHTTISRELKRLNEWSAEKAQWHAAAQKKKCGVRSKCTDELRKVIEEKLKATWSPEQIVGSLFQGKLSFKTIYRWLYSGKLHVTLQVLRQKGKRQAPRETRGRFNVGTSIQQRPKEVKTRETFGHWELDTVVSARGTKGCIATFAERKTRFYVGIQIPNRSAQSMKWAIEQLISRYPRPCFQTFTTDRGKEFSCYAELEKQYSIPFYFADPYAPWQRGTNENSNGLLREFFPKRMDLGQLTPSKIEKALFLINNRPRKCLNWNTTQDAFEYQVVQLI >NZ_CP013217.1|WP_068455718.1|2426257_2426857_+|hypothetical-protein MKKKFLLSTGLCLTLFLAACGDEKAPENTIQDGKTEAQEIEVEAATLGLSNQLAVDLPEITENTLNLRLRSREYIDQQEKLFAGVGIKEKVDSTITPQQLTDNVEDYFETVVSFKGDVVSFHEKEEGALPYRFIHLYAEDGQSYLYITYEPLGNIALDDSLQVVGIPLGIHEFANVGGGVTKAIVLFGGTIEKQTPNEG >NZ_CP013217.1|WP_156422374.1|2427721_2429086_-|hypothetical-protein MKRLYIVGILLLAAIFFIPQQASAATTLTSGKWVTGEITDTTTKQTYQFKLTKPSKVTVEVKSYMNELEAFVYNSKETNMVKPMHFFAADPTNPITQKETVYLQAGTYTIHTNRVAFSGQTGKYQVKATWKTNGSNEVEPNDEPNQAQPIEVNKTKIKGQLGLDDLADYYMVEVDRAGKLTVQTKSYMPFLQVELYNLAQVQMTKVNDFQQATNTKAVTRSGSMYVEKGQYLIKISNTGVLDSMGLYEMQAKFVGASNNEKEPNNSPEKAQTLKPNVAPITGLISFGDRLDYYKLNVPKTAEVKVQVKSHMKWLEVSIYNQSFKRIDTHNYFTGASDQLLVSKTLKNKLKTGVYYIGVKEMGYFGTYQINASIPTIVPKAPTVKAVKKGATRVTGTTYKKSQVTVKIGKKEYKGKSNTKGAFSIKVPKQKAKTNIYVSVTTDSGTSNYKKVQVK >NZ_CP013217.1|WP_068455724.1|2429795_2431142_-|hypothetical-protein MKKFFFTCFIAFALYFIVASPQAQAADYPVIQSGQTIEGTLAEEDRVLYQVNVTKPGYVKFQGTSYSRDLYLSLLDENHNKIVGLHDSFSNATATAPVTRTTGEYVEPGIYYIEAYSSGWHDEYFKYRFTMTVVDSKTTEIEPNDGSELAMAIKPTQKPVTAQFSWSDSTDYYKVKLDQAGLLNIKMTAYMDRMYVQVFDSDLYEVEGWSDYYGGSELSGKVRQDGYYLEKGTYYIKVSQWHSYTGKYKIETKFSKTSNNEKEPNNGLEQAQKIKPNVQSVTGLISWNDSSDFYKVDVSKTGVLNVHMTVYQNKDIKIYDRDGDTLLDRWIFKSSNTSSDKWSTSLNVKKGTYYIQIYGSTGLYKLNVKVPEMLPKSPKAKATKTKVTGTTYANSKVTAKIGSKKYTGKSNSKGAFSIKIPTQKVKTKVYVSVTTGTGTSKSTKVQVK >NZ_CP013217.1|WP_068455727.1|2431334_2431814_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MTFEAMLEKLEPMISAHMRKLHIYKEHEQFRQSARVAIWHAWQRFDAEKGDFEPYAFQTIRGALLDELKMSARYEERFVPTEDDALYEQIQGEGCQRTRDFVEFLAPHTTPEECMILHAYYIEGYDHTEIAAMLGMSRAALQKKKSRLLLRLRKEMSRP >NZ_CP013217.1|WP_068455733.1|2432697_2433867_-|hypothetical-protein MKSKKWIIVISVIIIAVIIFAIVMMTKQSNDTISDEDLLYSDSKAVIYYSTTVDNTFNSVAAFVSKDNTVKGYAMDGLELGSSTYSEKTKTILLEDKNSLKFVTDDGIQTAKFDNPEYTATSKGFLSKNNTFYSVNNTGVQEQNGEGYYSTIRYGNKDYTDSQLVDDWIQAVGNNGEDTIYSFVNYVSIKGEDATDNYRLIQSKLNDKKEFETTTIDELTSLNKLKDISIFNDFVYKDGVLYNLLNYKDDNNEVKTDLFVYDLKTKKLDLKPIADYDGAEFGLLNPTENIEMEGDNLYFVEDTGAVHQINMKTQTTKVLYTIDKGTNKDPLLQIKNNKLYLYILKDKAYYLDVLDLQTGKQLTSDKLQGMDEALNLGEGTNPYDLLILE >NZ_CP013217.1|WP_068455736.1|2434288_2434903_+|hypothetical-protein MDSHSIKDLLDLPALNICSIDANIFSKNTNDNLSKNNSEIEEHILVIEEYIIEKEKYTDQNKLSFAEYIKNNNIKISKIDIKTEHSELAKRVQNIENYLLSNESSSFIYFSNKNKISIFSPYDIQSLNDYYYLLLTMIVYVLASYYLFIPFQKKDTEKEEINTSSTNNKNSSEEKGNVSFIQSISSITLGTILFLFITNHDKKD >NZ_CP013217.1|WP_068455739.1|2435359_2435665_-|hypothetical-protein MEFVKTAFQTVIQRYVDEQVNIEDMGCETIEMEREAVDPQYVPSDVLVTLPNSFLVTCLNYTVTSGETYLFMGIWGDSVENMLFQVVLRENEVLEQTTKVT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013217_2 | 2.3|1714446|34|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT | 1714446-1714479 | 34 | KP063118 | Proteus phage pPM_01, complete genome | 58510-58543 | 8 | 0.765 |
NZ_CP013217_2 | 2.32|1714447|34|NZ_CP013217|PILER-CR | 1714447-1714480 | 34 | KP063118 | Proteus phage pPM_01, complete genome | 58510-58543 | 8 | 0.765 |
NZ_CP013217_2 | 2.3|1714446|34|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT | 1714446-1714479 | 34 | NC_031059 | Rhodovulum phage vB_RhkS_P1, complete genome | 16299-16332 | 9 | 0.735 |
NZ_CP013217_2 | 2.32|1714447|34|NZ_CP013217|PILER-CR | 1714447-1714480 | 34 | NC_031059 | Rhodovulum phage vB_RhkS_P1, complete genome | 16299-16332 | 9 | 0.735 |
1. spacer 2.3|1714446|34|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT matches to KP063118 (Proteus phage pPM_01, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ctcgaagtatcagactatgacgatgatgacgacg CRISPR spacer tcggacgagtcagactttgacgatgatgaagacg Protospacer .. ** * .******* ************ ****
2. spacer 2.32|1714447|34|NZ_CP013217|PILER-CR matches to KP063118 (Proteus phage pPM_01, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
ctcgaagtatcagactatgacgatgatgacgacg CRISPR spacer tcggacgagtcagactttgacgatgatgaagacg Protospacer .. ** * .******* ************ ****
3. spacer 2.3|1714446|34|NZ_CP013217|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_031059 (Rhodovulum phage vB_RhkS_P1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ctcgaagtatcagactatgacgatgatgacgacg CRISPR spacer tgggctgcggcagacgatgacgatgatgacgacg Protospacer . * *.. ***** ******************
4. spacer 2.32|1714447|34|NZ_CP013217|PILER-CR matches to NC_031059 (Rhodovulum phage vB_RhkS_P1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
ctcgaagtatcagactatgacgatgatgacgacg CRISPR spacer tgggctgcggcagacgatgacgatgatgacgacg Protospacer . * *.. ***** ******************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
362890 : 371211
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013217|362890:371211|DBSCAN-SWA TATGATCGCACGTTATACACGACCTGAAATGGGAGCTATCTGGACAGAGGAAAATCGCTATCAAGCATGGTTAGAAGTAGAAATTCTAGCATGTGAAGCTTGGGCAGAGTTAGGGGTTATTCCAAAAGAAGATGTTCAAAAATTACGCGAAAATGCATCGTTTGAAATCGATCGTATTTTAGAAATCGAAAAAGAAACACGTCATGATGTTGTTGCATTTACACGTGCAGTATCAGAAACATTAGGTGAGGAACGTAAATGGGTACATTACGGTTTAACTTCAACAGATGTCGTTGATACAGCTCTTTCTTACCAAATTAAACAAGCTAACGATATTATCCGTAAAGATATTCAAAACTTTATTGATATTATCACTGAAAAAGCAAAAGAACATAAAATGACGGTTTGCATGGGACGTACACATGGTGTGCATGCAGAGCCAACAACTTTCGGTTTAAAACTAGCACTTTGGTTAGAAGAAATGCGTCGTAACCAAGTTCGTTTTGAAGCAGCTGCTAAAACGATTGAAGCAGGTAAAATTTCAGGCGCAGTTGGAACGTATGCAAATATCGATCCATTCGTAGAAGCATATGTATGTGAAAAATTAGGTTTAACACCTGCACCGATTTCAACACAAACATTACAACGTGATCGTCATGCAGAATATTTCTCAGTGCTTGCACTAATCGCAACATCAATCGAGAAGTTTGCAACAGAAATTCGCGGCTTACAAAAATCTGAAACACGTGAAGTGGAAGAAGGGTTTGCAAAAGGACAAAAAGGTTCTTCAGCAATGCCACATAAACGTAATCCAATCGGTTCAGAAAATATGGTTGGTATGGCACGTTTAGTACGTGGTCATATGGTAACTGCATTTGAAAATGTTCCTTTATGGCATGAACGCGATATTTCACACTCATCAGCAGAACGTGTCATTATTCCAGATACAACGATTGCACTGAACTATATGCTAAATCGTTTTGGTAACATCGTGAAAAACTTAACAGTATTCCCAGAAAACATGAAGCGTAACATGACACGTACATTTGGTTTAATTTACTCACAACGTGTGTTACTTGCGTTAATTGAAAAAGGTCTATCTCGTGAAGAAGCATATGATACAGTTCAACCATTAACGGCTCGTTCTTGGGATGAACAAATTCAATTCCGTCCGTTAGTAGAAGAGAATGAAAAAATTTCTTCATTACTATCACCTGCTGAAATTGAAGACTGCTTCGATTATAACTATCATTTGAAAAATGTAGACATGATTTTTGAAAGATTAGGCTTAAACTAAACAACCTATTTCATTCCATCTCATCAACGGTTCAATTCGTTGATGGGAAAGGAATGGATGAACTTTTAAAAGTTTTAATATTTCAAAAAAACGCAATACTTAAAATTATTTACCGGGGGAATGAACGTGGAAAAAGGTCAACTATTGTATGAAGGTAAAGCGAAAAGATTATATGCGACAAATGAGGAAAATGTATTGTTTGTAGCTTATAAAGACAGCGCAACAGCTTTCAACGGAGAAAAGAAAGAAGAAATTGCTGGTAAAGGTGTTTTAAATAATAAGATTACATCACTTATTTTTGAAAAACTTCATGCAGCAGGTATTCCATCACACTTTATCCGTCAAATTTCCGATACAGAACAATTGGTGAAAAAAGTTGAGATTATTCCAATTGAATTAGTTGTACGCAATATTGCAGCAGGTAGTTTAGCAACGCGATTAGGAATTGAAGAAGGTACAAAACTAAAACGTCCAATCGTTGAGTATTACTACAAAGATGATGCATTAGGAGACCCGTTCATTACAACAGAACATATTGATATTTTAGAAATTGCAACACCAGAAGAAGTGGAAACACTTTATCAAAAAGGCTTAGAAGTAAACGCTGTGTTACAACCATTTTTCCATGAAATCGGTGTAACGCTCGTTGACTTTAAATTAGAATTTGGTCGCGATGAACAAGGCACTGTACTATTAGCAGATGAAATTTCACCAGATACATGTCGTCTATGGGATGAAGAAACAAAGCAACACTTAGATAAAGACGTGTTTCGCCGTAATTTAGGAAGTTTAACAGAAGTATACGAAATCATATTATCTCGTCTAGGAGGATTTACAAAATGAAAAAAGTAAAAGTTTATGTAACACTTCGTGAAAGCATTCTTGATCCACAAGGCTCGGCAGTACAAGGTTCCCTACATAACATGGGGTACGAGGAAGTAGCAGATGTACGAATCGGTAAATACTTAGAGCTACAAATCGAACCAAAAGAGCGCGACATGGATACGTTAATTAAAGAAATGTGTGAAAAACTACTAACAAATACAGTGATTGAAGACTATCGTTATGAAGTCGAGGAGGCCAACTAACATGAAATTCGCAGTACTTGTATTCCCAGGTTCAAACTGTGACTTAGATATGTATCATACGATTAAAGACGTATTAGGCGAAGAAGTGGAATACGTATGGCATGATGCAACAGATTTAAGTGCATATGACGGTATTTTAGTACCTGGTGGATTCTCCTACGGTGATTACTTACGTTGTGGCGCAATGGCGAACCAATCGAATGTAATGGAAGAAGTAAAGAAAGCAGCAGAAGCTGGAAAGCCAGTATTAGGCGTATGTAATGGATTCCAAATTCTAACGGAAGCAGGATTACTACCTGGTGCGTTATTACGTAATAAGAATTTAAAATTCATTTGTAAGGACGTAAATTTACGCGTTGTAAATAATGATACGTTATTTACAAATCAGTACGACAAAGATGAAATTATCACAATTCCAATTGCACATGGTGAAGGAAACTATTACTGTGACGCAGAAACATTGGAACAACTACAACAAAACAATCAAATCGTGTTCACATATGAATCAGAAAATCCAAACGGTAGTTTAGCGGATATCGCAGGTATTGTGAACGAACGTGGGAATGTTTTAGGCATGATGCCACACCCAGAGCGTGCAGCAGATGAGGTACTTGGGAATGCGCAAGGTCTTGCTTTATTCAAATCAATTGTAAAACAGTGGAGGGAATCAAATGTCAACCAAGCTTGAGCCAACAGCACAACAAATTAAGGAGCAAAAATTATATGCTTCTATGGGGTTAACAGATGAAGAATTTGCGTTAGTGGAATCGATTTTAGGACGCACACCGAATTGGACAGAGACAGGTTTATTCTCTGTTATGTGGTCAGAACACTGCTCATATAAAAACTCAAAACCAGTTTTACGTAAATTCCCAACAGAAGGAAAACACGTACTACAAGGTCCTGGTGAAGGTGCAGGGATCGTTGATATTGGTGACGAGCAAGCGGTTGTATTTAAAATGGAATCACATAACCACCCTTCAGCAATTGAACCATACCAAGGTGCAGCAACAGGTGTTGGTGGAATTATTCGTGACGTATTCTCAATGGGTGCACGTCCAGTAGCAATGTTAAACTCACTTCGTTTTGGTGAATTAGATGCTTCAAAACGTGTGAAATTCTTATTTGAAGAAGTTGTTGCGGGAATCGCTGGTTACGGTAACTGTATCGGTATTCCAACAGTAGGTGGCGAAATTCAGTTCGACCCTTGCTACGAAGGAAATCCTCTTGTGAATGCGATGTGTGTTGGTTTAATCGACCATAAAGACATTCAAAAAGGTGTTGCTTCTGGTGTTGGGAACACAGTGATGTATGTAGGTGCAAAAACAGGTCGTGACGGTATTCATGGTGCAACATTCGCTTCAGAAGAATTAGACGAGAATGCAGAAGAAAAGCGCCCAGCAGTTCAAGTAGGTGATCCATTCATGGAAAAACTATTATTAGAAGCTTGTTTAGAACTTGTGAAGTTCGAATCATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCAGCAGGCTTAACTTCTTCAGCAGCAGAAATGGCTTCTAAAGCAGGCATGGGTATTGAGATGAATCTTGATGCTGTTCCACAACGTGAAACAGGTATGACAGCTTATGAAATGATGTTATCTGAATCTCAAGAGCGTATGTTAGTCGTTGTGAAAAAAGGTGAAGAACAACCAATCGTTGATCTATTTGCAAAATACGGATTAGATGCCGTATCAGTAGGTGTTGTAACAGACGATAAAATGTTCCGCTTAAAACATAAAGGTGAGATTGTTGCAGAAGTGCCAGCAGATGCATTAGCAGAAGATGCACCTGTTTACCATAAACCTTCAGCAGTTCCAGCTTATTATACAGAGTTCCAACAAATCGAAAATGTAGAACCAGAAGTAACAGATTATAAAGAAACATTAAGTGCATTATTACAACAAGCGACAATTGCTTCAAAAGAATGGGTTTATGAACAATATGACCATCAAGTAAGAACAAATACGGTTGTAAAACCAGGTTCAGATGCAGCGATTATTCGCGTACGTGGTACGAATAAAGGTTTAGCAATGACAACTGACTGTAACTCACGTTATATCTACTTAGACCCTGAAACAGGCGGTAAAATTGCAGTTGCAGAAGCAGCACGTAATATCGTATGTTCAGGCGGTCGTCCATTAGCAATTACAGACTGTTTAAACTTCGGTAACCCAGAAAAGCCTGAAATCTTCTGGCAAATCGAAAAATCAGCAGACGGTATTGCAGCAGCATGTCTAGCATTAGAATCTCCTGTAATCGGCGGTAACGTATCACTTTATAACGAACGTAGTAATGAAGCTATCTACCCAACACCGACAATCGGTATGGTTGGTTTAGTAGAGGATTTACAACACGCAACAACACAAGAAGTAAAGCATGCAGGTGACTTCGTTTATGTAATTGGTGACACGAAAACAGAATTCGGTGGTTCAGAATTACAAAAATTAATGAACGGTCGTATTTTCGGACAAGCACCATCAATTGATTTAGAAGTAGAAGCAGCACGCCAAAAAGCATTACTACAAGCAATTCAAGCAGGACTTATTGCATCAGCGCATGATGTAGCAGAAGGTGGTTTAGCTGTGGCAATCGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013217|362890:371211|365025_365274_+|WP_068450744.1|DBSCAN-SWA MKKVKVYVTLRESILDPQGSAVQGSLHNMGYEEVADVRIGKYLELQIEPKERDMDTLIKEMCEKLLTNTVIEDYRYEVEEAN >NZ_CP013217|362890:371211|370644_371211_+|WP_068450756.1|DBSCAN-SWA MTKKSIAVFASGSGSNFQAIAEAIEQGELQATIRLVVTDKPDAYVIERAKTKGISVLAIRPKDFSSKQAYEAAILEVLEEKEVEWLVLAGYMRLIGETLLDAYRSRIVNIHPSLLPSFPGKDAIGQALDHGVKVTGVTVHYVDEGMDTGTIIMQKAVDVIDGDRERTEAAIHAVEHDVYKAALQKLWH >NZ_CP013217|362890:371211|365275_365962_+|WP_068450747.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDLDMYHTIKDVLGEEVEYVWHDATDLSAYDGILVPGGFSYGDYLRCGAMANQSNVMEEVKKAAEAGKPVLGVCNGFQILTEAGLLPGALLRNKNLKFICKDVNLRVVNNDTLFTNQYDKDEIITIPIAHGEGNYYCDAETLEQLQQNNQIVFTYESENPNGSLADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAADEVLGNAQGLALFKSIVKQWRESNVNQA >NZ_CP013217|362890:371211|362890_364186_+|WP_068450740.1|DBSCAN-SWA MIARYTRPEMGAIWTEENRYQAWLEVEILACEAWAELGVIPKEDVQKLRENASFEIDRILEIEKETRHDVVAFTRAVSETLGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYQIKQANDIIRKDIQNFIDIITEKAKEHKMTVCMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWLEEMRRNQVRFEAAAKTIEAGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGLTPAPISTQTLQRDRHAEYFSVLALIATSIEKFATEIRGLQKSETREVEEGFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMVGMARLVRGHMVTAFENVPLWHERDISHSSAERVIIPDTTIALNYMLNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMTRTFGLIYSQRVLLALIEKGLSREEAYDTVQPLTARSWDEQIQFRPLVEENEKISSLLSPAEIEDCFDYNYHLKNVDMIFERLGLN >NZ_CP013217|362890:371211|368152_369577_+|WP_068450751.1|DBSCAN-SWA MLAEIRGLNEECGVFGIWGNQSPAHLSYYGLHALQHRGQEGAGIVVSDGHHLKAVKGEGLVNDVFNEEKLKSVDGKAAIAHVRYTTAGGAGIENVQPLLFHSSTGSLSIAHNGNLVNANRLKKYLERQGSIFHSSSDTEVLAHLIKKSTHATFSEKVKNALTLLEGAYSFLVMTKDEMIVARDRNGLRPLSLGKLGEAYVVASETCAFDLIGAETVRSVEPGEMLIINDEGVQSVRFAEIQNRAMCAMEYVYLARPDSNIDGINVHMARKRMGKQLAKECAHIEADVVTGVPDSSISAAIGFAEESGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPTQELRERGVKMKLSPVVQVVKGKRVIMVDDSIVRGTTSRRIVKMLKEAGAAEVHVVISSPPMTDPCYYGIDTSTHEELIASSHSVDEMCEAIGADSLTFLSVEGMVESIDRPYEGENKGLCLACFTSKYPTEIFPDTILPHEKELLV >NZ_CP013217|362890:371211|364312_365029_+|WP_068450742.1|DBSCAN-SWA MEKGQLLYEGKAKRLYATNEENVLFVAYKDSATAFNGEKKEEIAGKGVLNNKITSLIFEKLHAAGIPSHFIRQISDTEQLVKKVEIIPIELVVRNIAAGSLATRLGIEEGTKLKRPIVEYYYKDDALGDPFITTEHIDILEIATPEEVETLYQKGLEVNAVLQPFFHEIGVTLVDFKLEFGRDEQGTVLLADEISPDTCRLWDEETKQHLDKDVFRRNLGSLTEVYEIILSRLGGFTK >NZ_CP013217|362890:371211|369589_370645_+|WP_068450754.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQAGVNIEAGYEAVQRMKSHVERTARKGIMGTFGGFGGMFDLSELNLKEPVLISGTDGVGTKLKLAFMVDKHDTIGIDCVAMCVNDIVAQGAEPLYFLDYVAVGKAVPEKIEQIVKGVADGCVQSGAALIGGETAEMPGLYEEDEYDLAGFAVGAAEKANIVTGEKIQEGDVLVGIASSGVHSNGYSLVRKIMFADAGFTPDTVVAGYEQLGPIGEALLTPTKLYAKPVLDVLKEVDVHGMAHITGGGFYENLPRMMPAGLATEVDLGTWPVLPIFDLLAEQGKLQQKDLYNVFNMGIGFVLAVPAAQAEKVIELVEKHGEKAYTIGRVVAGEGVRFNGEHDGSLV >NZ_CP013217|362890:371211|365945_368177_+|WP_068450749.1|DBSCAN-SWA MSTKLEPTAQQIKEQKLYASMGLTDEEFALVESILGRTPNWTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKHVLQGPGEGAGIVDIGDEQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVAMLNSLRFGELDASKRVKFLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEIQFDPCYEGNPLVNAMCVGLIDHKDIQKGVASGVGNTVMYVGAKTGRDGIHGATFASEELDENAEEKRPAVQVGDPFMEKLLLEACLELVKFESLVGIQDMGAAGLTSSAAEMASKAGMGIEMNLDAVPQRETGMTAYEMMLSESQERMLVVVKKGEEQPIVDLFAKYGLDAVSVGVVTDDKMFRLKHKGEIVAEVPADALAEDAPVYHKPSAVPAYYTEFQQIENVEPEVTDYKETLSALLQQATIASKEWVYEQYDHQVRTNTVVKPGSDAAIIRVRGTNKGLAMTTDCNSRYIYLDPETGGKIAVAEAARNIVCSGGRPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSADGIAAACLALESPVIGGNVSLYNERSNEAIYPTPTIGMVGLVEDLQHATTQEVKHAGDFVYVIGDTKTEFGGSELQKLMNGRIFGQAPSIDLEVEAARQKALLQAIQAGLIASAHDVAEGGLAVAIAETTFGTNLGVNVTLEGSATTALFSESQSRFVVTVKPEFAARFEEVVADAKQIGVVTEEANIVINSSEQQPLIEGTVAEFQDAWKGAIPCLLKSEA |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1143243 : 1153554
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013217|1143243:1153554|DBSCAN-SWA TTTAGACTGCAGTAGATAATTTATTTCTAATAGTTAGAGTTTCTCTATACTCTTCAGCAACAGCAGTTTTTTTGAATTCGACAGTTTTATCAAAATTATTTGATACAACATTTTCAATTTCATCTAATGAAACATTAAAAAACTCTTTTCGGCTATTAACCATGTTAACTTTTTTATGATCAAATTCTTTATGGAGTATTGATTCAAGAGCAGGTGCATCTTCACTAAAAATAAAAGCGTGTACATCGAATTTGAACGGTACTGACGCATCACCTAATTCGTTAACTCTATCCATAGGTTCTAATCTTCTTGTCATACCGATTTTATAAATATTCTCACCGAATGAGCCTATATTTGAAATTATATAAACATATCCAGCGCGTGTATTTTGTTCACGATAATGTATCAAATCTTTTTGCCTAATCGTTTCAACAAGCTGTAGTTCCAGTTCTTTGATTTTTTCTTCTAATGCAGTAGTATCTTTACTTTGAGATTGAAGTAGTTGTTTTTTCAGTTTTTCAAGAGCATTATTGAAGTGAGTTTCTTCTTTTGTAACTTTTTCAATTTCTTTTTCAATTTCTTTTCTCGCTTTTTCTTCCTCTCTCATTTGCTCACGTATTTGTCTTTGCTCTTCTTTTTCATCCTTTACTTTTATAGCATATTCCAAAGCAAGATCTAATTCAGCTTGTTTTAATTCAAGATACAAACCTTCAATTGAAACCATATTTTTTTCATTAAGTTTATTGATTTGTTCAAATGACTTATTTATTTTTTTTCTAGAATTTTCATAGTTAGATACAGTTACTTTATTGATAGTTACATCACATTCATTGTTAAATGACCTAATCGCCATTTTTATAGTGTTAGCATTCATTTTCTTACCTTCAGCAGAACTGCCGTTGACAGTCCAACCCGAATAATAAGAAACAGCAGTTTTATCTTTTACGGCAATTTTTTGGTCATTTCTAATATCTTTCAAACGTTCTTTATAGGCTGATGAATTTTCAAGGTCATATTTAGTTTCATAAAAACCAAATGATTGTAAAAGAACTTCTTCATCTAATTGAATAATTTCATCATTTAGATTAGCTATTTTTTTTACAAGATCGCTTTTTTCATTTTCTTTTTCATTTAATTCGTTTTGCAGATTAAGAAGTGTATTATCTAAATTAGCTGTAATTTTAGCTTCTTCTTTTTTAGCATTTTCGATAATAGTGTTAGCTGAAAGTTTTGCATCGGAAATAATTTGTTCTTTTTCCACGTCTATTTCCTGTCTTAACATGTCTATGAAATTTTCTTTTTCAGATTCAAAAAATTGACTTCTGTTTTCAATTTTAGAATTTAAATCAAAAAGGTGACTTTCTAATTTTTCTTTCTCACTTAACTGATAGTAAAACAATGTTATTTTTTTCTCTCTGAACCTAGCAGCTATAGAAATGATTAACGCTGGTAAACAAATTCCTATAGTTAATAAACTCAAAAACGATAATAAAATAATCATCCATATTTGGGTGTACCAGGGATACTTTCTTTTTTGGTCGTTATTCAACGTAGTTCCTCCTGTTAAAAATTATTTTGTGGATATTAATCTCTTTAAATAGGAGATTAATATCTATTGTCGAAAAATGTCGTAAGCAATATTACCTACATAGATTCCAAAAAATAAGAGACAATTAATTGTCTCTATTTTTTCGTTCTTGCTGAGCTTTAATGATTTCGTAATAAACTTCGAAATCTTCAAGCATTGAGCGTAAATCATCTGGTTTGTCTTTGAAGTTAACAATCGGTGACTTGTCGAAAAACTCTAATACTTCTTTTTGGTAATCTGTGAGTTCAACATTGTTCTCGGCAGATGCTTGTTTTTTATCTGTTTTTCCTAGTAAATAATCGGTTGAAACATCAAAGAAGTCAGCTATCTGTTTAAGCGTTTCAAAATCAGGCTCACGTGTACCTTGTTCATAATTAGAGATTTTTCCACGAGAGAACCCTAGTTTTTCAGCTAAGTCATATTGACTTAAATTACGTTGCTTTCTTAAATCAGCAATTTTTTTACCAAACATCAAAATCACCTCTTGTTTAATAGTATATAGGTAGAAACTCTGTGTTTCTACTTTTTCTTCTAGTTAGAAACAAAAAGTTTCTTAAAAACGTTGACAGACACAAAATGTTTCTGTTATAGTTCATTCAAGGAAACAAATTGTTTCTTTTAAAGGAGGTGGGAAAATGAGTAATAAACGTGAAAATTTAATAATTTTACGAGGTGAGAAATCAAGACGAGAAATAGCGGCTATATTAGAAATCACACCACAAATGTTAGGCGCAATAGAAAGAGGTAGTAGAACACCATCGCTTAATTTAGCTAAAAAAATCGCGGATTTATATAACAAGCCTATTGATGATATTTTTTTTAATCTAAAAGGAAACGAAATGTGTCTACTTTGATTACCAATAAGTAAATTCCCTAAAATACAAAACAATAAACGAAAGAAGGAATACGTATGAATCAAATTTCATTAGTAAACGAACAAAGCATGAACAATTTAATGACCAGCTTAGATATTGCTGAATTAACTGGCAAAAGACACGCAGACGTGATGCGTGATGTAAGACACGAGATTGAAGAATTAGGTGTTGAAATAGGTGAACGCATTTTTGCTCACACCTCATACAAGGATAAAAGCAATCGCGATTCACCTTGTTACAAATTCGGTAAAGAAGGCGCAATGCAATTAGCACTTAAATACGATGCAAAAACGCGTTACAAAGTTATCAAACGCATTGAAATGCTAGAACAGCAACAAAATACACATTCATACATGATTGAAGATCCTGTTGAACGAGCAAAACGATGGATCATCGAACAGCAAGAGAAACAGTTGCTAATTGCTGAAAACAGCGTGAAGGACCAATTGATTGGTGAATTAAAGCCGAAAGCTGACTATACAGACAAGATTCTTCAAAGCACTGGTTTAATGACTATCACACAAATTGCCAAAGATTACGGCATGTCAGCACAAAAGATGAACGCGATTCTACATGAATTGAAAGTGCAGTATTCGCAAAATAGACAGTGGTTACTCTACAGCAAGTATCACGCAGAAGGTTACACGCACAGCGAAACGATTCCAATCACGCATTCAGATGGTACGCCAGGCACTAAACTCAACACGAAGTGGACGCAAAAGGGGCGTTTATTCTTGTATCAACTTCTTAAAAAGAACGGCATTTTACCGACAATCGAAAAACGAAACGAGGTGTAACACATGAATTTTCATCACATCAAGAAATTAGCAGAGTATAACGGTCAGTTACCGAAGTTGATTTCAGAAATTTCAAAAAAAGATGCACAGAAAGCTTTCGCTTTATTGGAAGATTGGGCGAATCATAAACGTCCACTCAAAGAAATTTATGACGAAGCACGAGGTGAACTAGCATGACAGTAAAAGACATGTACGACTTACAACGTCATACAGCGATGATTGATTTGCTATCTGTTGAAATCAACGTAGCGATGCAGCGCAAAGAGTATTTAAAAGTCGAGGATCTACTCAACATGCAGTTGCAAGCAATCAGAGAAATCAAACGCATACGCAATCGACAGCAGTACGCGATTACCATGCACGACATGGCTCGACGGTTGAGTGAAAAAGGTATTGCAGCAGAGGTGGTGAGGAAACTTGAATGAATGGTTTTTAGCAGCACTAGTCATTGTGTATGTAGCAACAGTATTAAAAATAGATGCAGATATGGAGGAATGAAAATGAAGAAACTAGAACGTCACGAATTAATGTTAGCAATAATTGCCGAGCGTGAAGGTCATGGCATGGCACAAGCGCACGAAACAGAAAAGACGATGATTGAGTTAGAAAACTACTTCGAACAGCACTACAAAGTTTTCGAAGCAGACGCACCAACGCACGAAATCATTGAAATCGCACTCGATATGATGGGCGAATCAGCTTTCATCGAAATGTTAGAGCGCAACGACTTCTCGGACATCTTTGAAATGCTGGCAATCGAGGGTTATGTCACACAAGTCATGGGCGTGTGGGTGGTATCGATTGAACACGCATGGCTCAAACACCAAGAAATTGCATAAAAAAATGCCCATTGCAAGTGGGCAAAAGAAAAAATAAAAGTTTCGTACAGTATATCAAATAATCGGGGGTTAGACAAATGACAACATATCAATGTAACACTGTGACAACAGCGCACGAATGCGAATACTGTCACGCAGAAGTCGCAGAAGGCTTCGTGTATCGAGAAGAAAGCTATTTCTGTGACTTAGATTGCTTCACAGAAAAAATGCTGTCAACGGGCGTATTAGAAGAAATCGAAGGAGGAAATGGCAATGACAATGACTAATGTAAATGAAGCAACGAATTATGTTGTGTACGATATCGAGCAAGTGAGCGCGATCATGCGCGAAGTGAAAGAAATCGAAGAACAAGTGAAAGAAGTAGAAAAAATGCGCGATGAAGCAATTGCACACGCAAACGCTTTTTACCAAAAACAAATGGAAAAACTAACAAAAGAACGTGAGTGGAGAGAGTCGCAAGTGATTGACTACCATCAGCGTTTATTAGCCGAAAATCCGTCACGTAAAACGATTGAAACACCATTCGGGAAGATTAAGTCCACCACGCGCAAAGCGACGTTTAAAAAGCCAGATAACGACGTTTTACTAGCTGTCTTGGAAACGAACGGGTACGACGACTTAATCAAAGAAAAAGTGACACGCACACCAGATTGGGCGAATTTTAAAAAGTCGCTAAAAATCATGGACGAACGTGTAGTAGATGAAAATGGGTTGATTATCGAAGATGTCGAAATTGAGCCTGCGGCAGTCACTTTTAAAGTTGAGGTGGAGTAAATGAAGAAATCAGAATCAATTGGCGAATTAGCAAAAGCATTAGCGAAATTCCAAGCGAGTGTGAAGCAACCGTTAAAAGATGCGAATAACCCATTTTTCAAAAGTAAATATGTACCACTTGAAAATGTCGTTGAATCAATCACAGAAAGCGCTGGGGCACTTGGTCTTAGCTTCATTCAATACCCAGTAAATGCAGACAATCGCGTTGGCGTTATCACTATTTTAATGCATGAGTCAGGCGAATGGATTGAAACGGAACCGATTTACGCAACGCCAGCAAAACAAGATCCGCAAGCTACTGGTTCGGCTATCACGTATCTAAAACGATATAGCTTATCAGCAGTGTTCGGTATCACGTCTGACGAGGACGACGATGGCAATAGCAATGCACAACAAAGCAATCAAAATAATTATCGTCAACAACAGCCACGACAACAAGCAAATAGCAATAACATTTCAGACGCGCAAATTAAAGCGATGAAGGCTAAGTTAAACAACTTAAATAAGCATACAGGTATCGAAATGCAAACGATTTATGTTGATACGTTGAAACAATGTAATATCCCAGAGCAAATCGCTACAAAAGATTTAAGCAAAGCGCAAGCGATTAAAGTCATCACAGCACTAGCGGAACGCGAAGCAGAGTTTGTTTAAAAAAATAGGGGATGAACTTTCGTCCCCTTCTTAAAAAGAGGTGAATCAAATGCAAATTCATACACATCATCTTGAATTTTTACAAGAAGCGCAAGAGGTGTTTCGTGAAAACTTGAAACAAGTGACATACATCAATGACGATGGTGATTTAATCGCATTATGTTATCGCTATGCAGATGAAACGGTGCCATCAATAAAAATATTAGAACTTGGCCCCGAAGTCGCGTTCTTCGCAAATATCCTAGATACACAAATAAAAATCGACTAACAGCGAGGGGGTTATGAGATTGGAACAAAATGAATTGCGTTTTAAAAAGAGAAAGAGAAAATTTACGCAAGTTGATAACGAAATTGTTAATAATGCCGAACTATCGTGGCAAGCAAAAGGTTTGATGTTGTATTTAATCAGTAAGCCTGAAGGTTGGCAATTTTACGAAACAGACATCGAAAAAAGAGCTTCCAACGGTAAGAGCAGCGTGAGAAATATCATTAAAGAATTATTAGATGCGGGATATCTAGAACGTGGCGAAAGAATGCGTGATGACAAAGGTTATTTACGAGGTTATGTATATAGCATTGTGGAGTATCAATTAGATGATTATGACGGAAAGTCCTACATCCGTTTTTCCAAAGTAGGAAAATCCAAAATAGGAAATTCCAAAGTAGGATTATCCAAGGTAGGAAAATCGGACACTAGTAATACTAAAAGTTCTAGTAATACTAAAAGTTCTAGTAATACTGAAAAAGACAACAAGACTAATGGAAAAAATAAGTCGTCGTCATCTGAAATCTTCAATTTTTATGAATCTGAATTTGGACCACTATCCAATTTTATCGCAGAAGAAATCGGCTACATGATTGAAGATACAAACGAAGAACTTGTACTCGAAGCACTCAAGCTATCTGTACGAGCAAATAAACGCACAATCAAATATGCAGCAGCTATTACTCGTAATTGGCGTAACGAAAATATTAAGTCAATCGATGACTTACGAGCAGCGGAAAAAGCGAAAGGACGTGGACGTGATGACAAAAACGATGGAAGAAGTGTTCGAAGCGTTGAAGAAGAAGATTACTATAGTCGACTCGCAAACTTCTCAAGTGACGACTTATGACTGTGAAAAGTGCAAGGATCAGTTCGGATGGATTGAAAAGCGTGAAGCAGATGTATTTGGCAACGGTCAATTAGTACGCGAAGAAGAAGTTTGGGTAACATGCACATGCGTTGAACAACGACGAATTGAACGACTAGCAAAGCAGTCGCAGATCACCGAGAAATTTTCAGAAAAGAAATTTAGCAACTTTAGTTCCGATGTGAGCGATGAAGTAAAATCACTCGCACGATTAGCAAAGAAATACTTCGATGATTTTAACGACATCCGACACAATCAGCAAAACAGCATCGCGTTACTTGGACAGCCTGGTATTGGTAAGACACATCTTTTAATGGCTGTTAGTAACTTGCTACTTGCGAAAGGTAAACAAGTGATGTACTTCCCGTATGTTTCGACTTTAAAAGCAATGCAAGCGAACAACTTTGAGAACGATGCACGCATTACAGAGAGCGCTTGTAAAGCAGAAATTCTATTTATTGATGATTTATATAAGCCGGTTGACAGAAAGCCACAGGCGAGCGAATGGCAGTGCTCAAAGATGTACGACATTATCAATCATCGTTACTTAAACAACTTACCGATTTTGCTAAGTAGCGAATTAAATTTCGGTGAAATGTTAGCGGTAGATGAAGCGATTGCTTCACGACTTTTTGAAATGTCTAAGCAGTACACGAAGTCGATTAATAAAAACGCAAAATTGAATTATCGAATGAAAGAATTGTTCGGGGGTGCGCAATAGTGAGATGGGAATTTGAATCATTTGAAATTGAAGCCATTAATAAAAATAAGACTTTGGCATTCATGAATATTCGAATAAACGGAATCGAACATTGTCTATTTGTTGTTAAAGAGAAAAAAGGTATTCGTATTGATAGATTCTTTTCAAAAAATACAGAATTAAAAGCTAGTCATTATGAAATGCTTTTTATGCTTTGGTGGTTAGATGAAGTTTTCAAATACAAGTCTTTGCCAGTTATTCATAATTCAGAAGAATTAAGATACTACTTTACGGGTTTTGTAACTGCAGAAGGTTTGGAAGAGTTCTTTGAATTTAGAGAAGTCCCTAGTAATCAAACAAGTGGTTTATCAATTACTGATAGTAAAGGTAGTACGAAACATCTTTCTGGAATGAAGAACTTGCAATTGACAACAAACATTTTCGAAATCGTGCCAAAAGAAATCGAAGAACTGGTAAAAGAAATCGAACTACAAACAGCGATCAACATTGCGTTGGATAACAACGACAAAGAAACGTTCATGCTACTAACTAATCAGGAGGTAACGACATGAAACCAATCTACATCAGCAATGACATCAAAGAATCATTCACAGAACTTCGCATCACGAACTTAGACACCGGCAGGCAACACAAGCACATCTGTTACGACTATGACGAGTTAGTTTATCGTCGCAGTCAGTACACAGATAAAAGCAAGTGGCACGTCGAGGAAAGGGGTTATGCACCATGCAGCGCAACAAAAATGGCATTGTAGTGGATATTCGCAGTAGTAAGTTGTCGAGTGCGACAGTGTTGTCGCAGGACTATGAAATGCTCGAACTTGATTTTGTCGAATTACAAAAGTTTGGATTGCATATCATCGCGCCTGCGGACGATCCGGAAGTTCCAGAATACATGGCAGATGGCTACACAGAGATTTCACGTTTCAAAGCCAATGTGGCAGTACCAAAGCGGAAGGAGGTGCAAGTATGTCAATCAAACAAAAAATTGCGCAAGACCAAATCTTGTCAGCGATTCAAGCGAAATTCGAAGCGCAGACGCTCAAAGGTGTAGAAAAATACGGTCAAACGGTTGCAGACAACGATTTAACAGCAATCGAATGGATTGACCATGCGATTGATCACATCGTATATCTAGAGTGCTTGAAAGCGAGGTTACTACAACATGAGTCTTAAAAAGCGTTACATCGTGTTTCAGGATTACAACTTAGATTTTACTTATCAGCAAGTGGCGCAGTTTAAAAAGTTATGGAAACAAGGCTATTCAACAAGTTCTATCGCTAAAAAGCTATATTGCAAAATCGTAGAAAGTGACTTGTTAGCGATGGATTTATTGCTGCATGGCAAAATTAAAAATCGTCCAGGTGGTCTTGCCGGTACGAAAGAAATTGAAGATAACAAAATACGGATTGAGGTGTAGAACATGTATGGGCGTAAAAAGATTGATCGTAAAGTACTTACAAGTCACAACGAAGTGTATGTTAAACAAAAATTACAATCTGCATTAGAACGCGGCTGGGAGCAGATTAGCGATATTCAATACAAAAACGGGATTTACGGTGTGTGCTTACAATTCGATATCGCTAAGAATTCAAGAAAAAATCAGATAAAGAAAGAGGTAAGAGCATGACAGATAAACAACGATTAGCAGTGCTGGTGCAATTAGCAAACAGCGTGCATGAATATAGTCATATCATTAAACCAGAACAGTACAAAGAAATGGAAAGCTTCCAGCAAGTTGTTTTCAACGCTTTACATTCATTTTTCGAATGTGATTTAGAAGAAAATTCGGAAATGATTGAAGATGAAATGGAAGTTGCAGCAGTTGAATATATGTTTGAAGAAATGAAGTATTTCACAGAGAAATACGGAAAAGAGGAGAATTAATTTGAATAATGTATCACTTATCGGAAGATTAACAAAAGATCCAGAGCTTCGTTATACGCCATCTGGTGTAGCAGTTGCACGTTTTACACTTGCTGTAAACCGTACATTCTCGAACCAACAAGGCGAAAGACAAGCAGACTTCATTAATATCGTAACATGGCGCAAGACAGCCGAAAACACAGCTAATTTCCTTCGTAAAGGTTCTTTAGCAGGCATTGTTGGGCACATTCAAACAGGGAGCTATGACGGTCAAGACGGAAAGAGAGTATTTACCGTTGAGGTTGTCGCAGAGAATGTACAGTTTTTAGAGCCAAAGAGTACGCAGAGCGCACCGAATGGCAATGGCAATACAAATGGGTATCAGCAACAGCAAAACGCACCACAGAGCAATTATGGTGGTCAAGAAGCCTTTAATCAGAGCGTGAAGATTGACGAAGATGATTTGCCGTTTTAAGACGGATAAGAAACATAATGTGAATCAAAAAGGAGGAAAATTAATGGGAACATATTTTGAAACGAAACACGATACTTTTAATCTTAAATTCAAGGAACATGAGGTATTCGATGGGAAGATGGTAATAGTCGATGAATCAGATGATCCATATCTTTGGATTGACAAAGAATCTGGAAAAGTCAGTTTCGGTGGAAAATACTTCTTACAATACAAAGAACAACGATTATTAGAAACGTTATTAGAATTTGTTTATACGACACATAAATTAATTGATAACGTTGATATTGACGAAGTGAAAGCCGATTTCGTAAAAAACCTTATTAAATTTGAAGAAATTAATAATGACTTTGCATTAAAGTAACTTGCACATCACGACCAAAAAGCGTAATAAAAGGGGGGAGTCAAATGTCTAAAATGAGAAAGGTTTATGCGCTATATAAAGGTGAGAATCTTATTGCAGATGGAACAATTCAAGAGATTCATGAGCGTACTGGCAAGAAGGTAGATACACTTTTATTCATGACTTGCCCAGTATATAAAAAACGCATTAAAAGCGGAAAGAACAGGCTGACTATGACGGAATTGGAGTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013217|1143243:1153554|1146675_1146927_+|WP_068452769.1|DBSCAN-SWA MTVKDMYDLQRHTAMIDLLSVEINVAMQRKEYLKVEDLLNMQLQAIREIKRIRNRQQYAITMHDMARRLSEKGIAAEVVRKLE >NZ_CP013217|1143243:1153554|1144915_1145302_-|WP_082701394.1|DBSCAN-SWA MFGKKIADLRKQRNLSQYDLAEKLGFSRGKISNYEQGTREPDFETLKQIADFFDVSTDYLLGKTDKKQASAENNVELTDYQKEVLEFFDKSPIVNFKDKPDDLRSMLEDFEVYYEIIKAQQERKNRDN >NZ_CP013217|1143243:1153554|1149702_1150623_+|WP_082701397.1|DBSCAN-SWA MQQLLLVIGVTKILSQSMTYEQRKKRKDVDVMTKTMEEVFEALKKKITIVDSQTSQVTTYDCEKCKDQFGWIEKREADVFGNGQLVREEEVWVTCTCVEQRRIERLAKQSQITEKFSEKKFSNFSSDVSDEVKSLARLAKKYFDDFNDIRHNQQNSIALLGQPGIGKTHLLMAVSNLLLAKGKQVMYFPYVSTLKAMQANNFENDARITESACKAEILFIDDLYKPVDRKPQASEWQCSKMYDIINHRYLNNLPILLSSELNFGEMLAVDEAIASRLFEMSKQYTKSINKNAKLNYRMKELFGGAQ >NZ_CP013217|1143243:1153554|1150622_1151174_+|WP_068452789.1|DBSCAN-SWA MRWEFESFEIEAINKNKTLAFMNIRINGIEHCLFVVKEKKGIRIDRFFSKNTELKASHYEMLFMLWWLDEVFKYKSLPVIHNSEELRYYFTGFVTAEGLEEFFEFREVPSNQTSGLSITDSKGSTKHLSGMKNLQLTTNIFEIVPKEIEELVKEIELQTAINIALDNNDKETFMLLTNQEVTT >NZ_CP013217|1143243:1153554|1147587_1148115_+|WP_082701395.1|DBSCAN-SWA MAMTMTNVNEATNYVVYDIEQVSAIMREVKEIEEQVKEVEKMRDEAIAHANAFYQKQMEKLTKEREWRESQVIDYHQRLLAENPSRKTIETPFGKIKSTTRKATFKKPDNDVLLAVLETNGYDDLIKEKVTRTPDWANFKKSLKIMDERVVDENGLIIEDVEIEPAAVTFKVEVE >NZ_CP013217|1143243:1153554|1153368_1153554_+|WP_068452809.1|DBSCAN-SWA MSKMRKVYALYKGENLIADGTIQEIHERTGKKVDTLLFMTCPVYKKRIKSGKNRLTMTELE >NZ_CP013217|1143243:1153554|1145465_1145684_+|WP_068452764.1|DBSCAN-SWA MSNKRENLIILRGEKSRREIAAILEITPQMLGAIERGSRTPSLNLAKKIADLYNKPIDDIFFNLKGNEMCLL >NZ_CP013217|1143243:1153554|1143243_1144791_-|WP_068452762.1|DBSCAN-SWA MNNDQKRKYPWYTQIWMIILLSFLSLLTIGICLPALIISIAARFREKKITLFYYQLSEKEKLESHLFDLNSKIENRSQFFESEKENFIDMLRQEIDVEKEQIISDAKLSANTIIENAKKEEAKITANLDNTLLNLQNELNEKENEKSDLVKKIANLNDEIIQLDEEVLLQSFGFYETKYDLENSSAYKERLKDIRNDQKIAVKDKTAVSYYSGWTVNGSSAEGKKMNANTIKMAIRSFNNECDVTINKVTVSNYENSRKKINKSFEQINKLNEKNMVSIEGLYLELKQAELDLALEYAIKVKDEKEEQRQIREQMREEEKARKEIEKEIEKVTKEETHFNNALEKLKKQLLQSQSKDTTALEEKIKELELQLVETIRQKDLIHYREQNTRAGYVYIISNIGSFGENIYKIGMTRRLEPMDRVNELGDASVPFKFDVHAFIFSEDAPALESILHKEFDHKKVNMVNSRKEFFNVSLDEIENVVSNNFDKTVEFKKTAVAEEYRETLTIRNKLSTAV >NZ_CP013217|1143243:1153554|1149050_1149884_+|WP_082701396.1|DBSCAN-SWA MRLEQNELRFKKRKRKFTQVDNEIVNNAELSWQAKGLMLYLISKPEGWQFYETDIEKRASNGKSSVRNIIKELLDAGYLERGERMRDDKGYLRGYVYSIVEYQLDDYDGKSYIRFSKVGKSKIGNSKVGLSKVGKSDTSNTKSSSNTKSSSNTEKDNKTNGKNKSSSSEIFNFYESEFGPLSNFIAEEIGYMIEDTNEELVLEALKLSVRANKRTIKYAAAITRNWRNENIKSIDDLRAAEKAKGRGRDDKNDGRSVRSVEEEDYYSRLANFSSDDL >NZ_CP013217|1143243:1153554|1152510_1152963_+|WP_068452804.1|DBSCAN-SWA MNNVSLIGRLTKDPELRYTPSGVAVARFTLAVNRTFSNQQGERQADFINIVTWRKTAENTANFLRKGSLAGIVGHIQTGSYDGQDGKRVFTVEVVAENVQFLEPKSTQSAPNGNGNTNGYQQQQNAPQSNYGGQEAFNQSVKIDEDDLPF >NZ_CP013217|1143243:1153554|1145740_1146502_+|WP_068452767.1|DBSCAN-SWA MNQISLVNEQSMNNLMTSLDIAELTGKRHADVMRDVRHEIEELGVEIGERIFAHTSYKDKSNRDSPCYKFGKEGAMQLALKYDAKTRYKVIKRIEMLEQQQNTHSYMIEDPVERAKRWIIEQQEKQLLIAENSVKDQLIGELKPKADYTDKILQSTGLMTITQIAKDYGMSAQKMNAILHELKVQYSQNRQWLLYSKYHAEGYTHSETIPITHSDGTPGTKLNTKWTQKGRLFLYQLLKKNGILPTIEKRNEV >NZ_CP013217|1143243:1153554|1152248_1152509_+|WP_068452802.1|DBSCAN-SWA MTDKQRLAVLVQLANSVHEYSHIIKPEQYKEMESFQQVVFNALHSFFECDLEENSEMIEDEMEVAAVEYMFEEMKYFTEKYGKEEN >NZ_CP013217|1143243:1153554|1147418_1147607_+|WP_068452773.1|DBSCAN-SWA MTTYQCNTVTTAHECEYCHAEVAEGFVYREESYFCDLDCFTEKMLSTGVLEEIEGGNGNDND >NZ_CP013217|1143243:1153554|1147002_1147341_+|WP_068452771.1|DBSCAN-SWA MKKLERHELMLAIIAEREGHGMAQAHETEKTMIELENYFEQHYKVFEADAPTHEIIEIALDMMGESAFIEMLERNDFSDIFEMLAIEGYVTQVMGVWVVSIEHAWLKHQEIA >NZ_CP013217|1143243:1153554|1148115_1148769_+|WP_068452777.1|DBSCAN-SWA MKKSESIGELAKALAKFQASVKQPLKDANNPFFKSKYVPLENVVESITESAGALGLSFIQYPVNADNRVGVITILMHESGEWIETEPIYATPAKQDPQATGSAITYLKRYSLSAVFGITSDEDDDGNSNAQQSNQNNYRQQQPRQQANSNNISDAQIKAMKAKLNNLNKHTGIEMQTIYVDTLKQCNIPEQIATKDLSKAQAIKVITALAEREAEFV >NZ_CP013217|1143243:1153554|1151811_1152042_+|WP_156422341.1|DBSCAN-SWA MFQDYNLDFTYQQVAQFKKLWKQGYSTSSIAKKLYCKIVESDLLAMDLLLHGKIKNRPGGLAGTKEIEDNKIRIEV >NZ_CP013217|1143243:1153554|1153006_1153324_+|WP_068452807.1|DBSCAN-SWA MGTYFETKHDTFNLKFKEHEVFDGKMVIVDESDDPYLWIDKESGKVSFGGKYFLQYKEQRLLETLLEFVYTTHKLIDNVDIDEVKADFVKNLIKFEEINNDFALK >NZ_CP013217|1143243:1153554|1146505_1146679_+|WP_156422340.1|DBSCAN-SWA MNFHHIKKLAEYNGQLPKLISEISKKDAQKAFALLEDWANHKRPLKEIYDEARGELA >NZ_CP013217|1143243:1153554|1152045_1152252_+|WP_068452799.1|DBSCAN-SWA MYGRKKIDRKVLTSHNEVYVKQKLQSALERGWEQISDIQYKNGIYGVCLQFDIAKNSRKNQIKKEVRA >NZ_CP013217|1143243:1153554|1151591_1151798_+|WP_068452794.1|DBSCAN-SWA MSIKQKIAQDQILSAIQAKFEAQTLKGVEKYGQTVADNDLTAIEWIDHAIDHIVYLECLKARLLQHES >NZ_CP013217|1143243:1153554|1151170_1151377_+|WP_068452791.1|DBSCAN-SWA MKPIYISNDIKESFTELRITNLDTGRQHKHICYDYDELVYRRSQYTDKSKWHVEERGYAPCSATKMAL >NZ_CP013217|1143243:1153554|1148818_1149037_+|WP_068452780.1|DBSCAN-SWA MQIHTHHLEFLQEAQEVFRENLKQVTYINDDGDLIALCYRYADETVPSIKILELGPEVAFFANILDTQIKID |
22 | Listeria_phage(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
1158573 : 1174093
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013217|1158573:1174093|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013217|1158573:1174093|1168053_1168590_+|WP_082701399.1|tail|DBSCAN-SWA MKMSLKNGKDTIMLVQPVDAEHGTAALVIAQQTESTYSIENDVKDEQTKFGRIVGYGNNSESFEFSAYGAKNDPGQMAVFKAIEDKKQLKVWEVDTTLDESNKHDAMFAYVIVESAERSNAQDGYEEISGTFQVYGKAQRGKIDKLPTEVVEFGQYGFEKPGEYKGEADNRVQAPLVP >NZ_CP013217|1158573:1174093|1158573_1158987_+|WP_068452837.1|DBSCAN-SWA MSKYNNKKVVYAGITFDSKAERDYYLYLLDLKQRGIVTDIQLQPSFLLQEKFRKNGKLYREITYKADFEVTYADGHIEIVDVKGMVTKDFAIKQKLFEYKYPALRLLLMAYSKMDGGWIELSELKKARSSRKKLKKL >NZ_CP013217|1158573:1174093|1159840_1160293_+|WP_068452839.1|terminase|DBSCAN-SWA MKQKKLTPKQQVFAEHYIESGNATESAVKAGYSKKYANTNASKLLQNTTIKSYIDEKLSEMSSERIASATEVLETLTAIIRGESRSAVLRGLGEGYQEIDEKMPPTTTERIRAAELLGKRYKLFTEKAEVEVSGAVEFIDDIGSDLDDED >NZ_CP013217|1158573:1174093|1160279_1161551_+|WP_068452840.1|terminase|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013217|1158573:1174093|1169207_1169435_+|WP_068452876.1|DBSCAN-SWA MLKGAMLRDIKRYEDMAVQAIMHARAANEKRVDVKKLFNADKAKRQILKQEEPEKDFTRFDKAQKAMQNFVIKSS |
20 | Bacillus_phage(27.27%) | capsid,portal,head,tail,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2924711 : 2932291
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013217|2924711:2932291|DBSCAN-SWA TATGATGAATCGTTTTGAACATTCTCCATGCGGTTATATGCAGCTAAGTTTAGATGGTGAAATTTTAAATCTAAATGAGACAATGGCGAAATGGTTGAAGATGGATAAGCAACAACTACTTCATCAATCCATTGAAAAAGTATTATCGAAAGTAAGTATGATGATGTTCTATTCTTATTTTTATCCAAAAATCTCAATTCAAGGGCATGTTGAAGAGATGCTGCTGACATTAAAAACAGCTGAAGGTACAAGTGATTCATATGTATTAAATGCTAAAAAATTCGAAGAAAAAACACCTATTATTGATTGCGTGTTTATGCGAATTAATCGTCGAGTCGATCATGAAAAAGAATTGAGAAATGTACAGTATGCTCTACAAGATGCATTAAAACAAAATCAAATTGCAGTAGAAGCATTAGAAAAAATTAACCAGCAAATTGAAGAGCAAAAAGCAAAATTAGAACAGATGAATTTGGAGTTGTCACAAATATCTCATGTGGATGCTTTAACAGGTGCTTATAATCGACGTTATCTAAATGAACGTATGGAAGAGATTATGCAAGAGAAGGTACTATTATCTGTGATTATGGTAGATATTGATCACTTTAAAAAGGTAAACGATACGTATGGACATTTAACAGGTGATGTTGTCTTAACAAAGTTATCGAAGTGTCTAAGTAATACTTTAGGTGATAAAGGGATTGTAACGCGCTATGGTGGAGAAGAGTTTGCGTTATTATTACCTTTAATTGATGCAGATGAAGCACTAGAAATTGCACAGTTTTTAAATCGTGAAGTAGGAAACCAAGAATTTGAAGTTGTAGACCATATTACAATTAGTTTAGGTGTATCAACACGTACAGAAGAGGACACGATTACAACACTATTTAAAAGAGCAGATGATGCGCTATACTATGTTAAAAATAATGGGCGCAATCAGGCAGTTCATGCAAATCAATTATGATAAAATGAAGCTATGTTAGAAAAGGAAGTGTATGTATGACATTTGAAGAAGTATTACCAAAACTGAAAAATGGCGAAAAAGTAATTCGTGACGGTTGGAGCGGTCCAGAACTATATGTAAAATTAGTAGGGGCTTCTCAATTCGATGGAGAAAACTTAAATCCATATTTTTTAATTAATGTAGAAGGCGAAGGTTACACGATGTTCCAACCGACAGTGTGTGACATTTTAGCCGAAGATTGGTCAATTGTAGAATAACAATAAGCTGCGCTCTAATTTTAGAGCCAGCTTCTTTTCATATGGAGGAATATAAATGGATTTTAATCAAAAAGTGGTTTTTGTAACAGGCGCAAATTCAGGAATCGGAGCTGCACAAGTAGCTTTATTTTTAGAAAAAGGCGCTTATGTATATGGTTTTGACTTAGAAGATACACAGATGAAACAGATGAAAAGCTTATTTCCAAAACAGTTTGCCTATAGCGTAGGAGATGTATCGAATAAGTTTCATGTGAAACAATCTGTGAAACATGCGCTCGAAACATTTCATACGATTCATATTTTACTAAATACTGCAGGTGTATTAGATGGTTATGCGAAAACATTAGATACAGATGAGGAGCTTTGGGATCGAATTATGAATACGAATGTCAAAGGAACGTATTTCGTAACGAATGAAGTATTGCCGATTATGTTAGAGCAGAAAAAAGGTGCCATCATCAATATGGCTTCCATTGCAGGGCTTGTAGCTGGCGGAGGAGGAGCAGCTTATACTGCTTCAAAACATGCGATTGTCGGTTACACGAAACAAGTAGACCAAGATTATTGCAGAGAAGGAATTCGCGTGAATGCGATTGCACCAGGAGCTATTCATACACCGATGAATGCAGCTGATTTTGAAGGAGATGGTGAAATGGCAAAATGGGTAGCAGAACAGACACCAGCTGGAAGATGGGCAAAGCCAGAAGAAGTAGCGAGTCTAACAAGTTATCTTGCAAGCGATGACGCCGATTATATTCACGGCACAGTTATTCCAATTGATGGGGGCTGGATAGCCAAATAAGAATTTGTTATAATAATTCGGTAAGCAAAATGCTTACACTACGGCACTTCAGATCGGGTGAAAACTCGCTTCCTTTGGTCGTAGTTATTACTGGATTACTTAAATAGTAGTACCACAAAGGAGAAGAAAAATGAATAATACGTCGATTACAAAAAGCTCAACAAGTATTTCTGAGCTGTCGAAAACAGCACTGGTTGCCTCATTATATGTGGTCGTAACCGTTTTTTTAGCTGTCATTAGTTTTGGTGCCATCCAATTACGTTTATCGGAGATGCTAAATTATTTAGCTTTGTATCATAAGCGTTATGTTATAGGTGTCACAGTAGGTGTAATCATCGCTAATTTTGCCTCACCCACTTGGTTCTTAGATGTACCGATTGGTGGAGTTGCGACATTTGTTGTGTTAATGATTTGTCGCTATGCAACGCGAAATATGCAAAATATGAAATTAAAAATGGTTATTACGGCACTTATTTTCGCTGCCTCTATGTTTACTGTAGCATTGCAATTATATGTATTAGCAGATTTACCATTCTGGGAAACATGGTTGTTTGTTGGAATTGGTGAGTTATTATCAATGACAGTAGGCGGAATTACCATTTATTTAATTAGTAAACGAATTAATTTATATAAATAATGAATTGATTAAATTACGTGCATAATCTGTGCGTAATTTTTTATTACAATAAATAGGTTTTATGGTCTAATAAAATGTAAAAAAATGTATGATAAAATATAAAAAAGACTTATTGTTCATTGTCTTAAGTAATGTAGATAATAAATAAAATAGCAGTGGATTATATGATAATAAAGAAATCTTTTTATTATTAATTTGCTATAATAAAAAAATCATTAAAAGTGAAGGAGGAAGTGAGAGGTGGTTAAACGAAAAAGCAGTATCCGCTTAAAAGTAACTTTAGGCTATATCGTGATTATCGTTTGTGTTTTACTATCATCTATTCTCATTTTAGAGAAAGTCACTGTTTTAAACGGTAAAAGAAGTGATGTCACGAATCGCAATTTAGAAGTGCATCAAATGATTAACACAGTAGAACAATCGATTATTCAAATTGAAAAAAAGCAAAATAGTTATATTTTAACAGGAGAAAAAAGATACATAAATGAGTATGAGGAACAGCGTATAAATGTTCTTAACGATTTAGAAAATCTGAAAAATGTAGTAGCAAAACAGTCCAATGAAAAAATACTTGCATTAGATTTAGAAAAAAGTGTGAATAAGTGGATAACGCTTATCGTTGAACCTTCTCTCAAAATTAGAGAAGAAAAAAGTGAATCAGCGGCTACCATATTTTTAAAACAAAAAGTAGAAAATGCTGAAATACCTAATATAAATCGTAGTATAAATCGTTTACGTCAAGAACAAAATACAATTTTGAATGATGATACTGAAAACTTAGAGCATACAAGTGTTCAACTTATGTGGATCTTTTTCATATTAATTTTATCAATTATGTTAGTCGGTCTATTTATTTCAAATTATGTTTCAAAAAATATTATTCAAGCGATTCAAAATGTAAAAAAAACGATTCAAAATATTCGCCAAAAAGGTGGCGATTTAAAAGAACGTATTGATATTATATCGCGAGATGAAGTAAGGGATTTAACTATTGAAACAAATCAATTATTAGATCAACTTGAAGAAAAAGAATGGGTTCAAAATAATGTGAATCATATTATTTATGCATATCAAGGAGTCAATGATATCCATACATTAGCCGATGTTATCTTATCTGAAATATCGCAAGTTATTCATGCAGTACATAGCGTTTTTTATTTGCGGGAAGAACAGGATAACGATATATTGTATGTAAAAAAAGGTGCTTTTGCTGAGAATAATTTGGATATTGGGAGAGACTCATTTAAATTAGGTGAAGGATTAATCGGCCAAGTAGCAAAAGATGGGCATATGTATAAAATGGCTGTAAGTCCAGAAAATACACATGTCATTTCGACTAGTTTAATAGATACAACACCTAGGATGCTATTATTAATGCCTGTCTATTTTAACCGTCAAGTAATTGCAATTTTAGAGTTTGCAACGCTTGATACTTTTGAAGAAAAGCATATTCAACTATTAAATAAAGTAAATGAAACACTCGGAATATCGATTGATAGTGTAAAACACATGATGCATATTGAGTCGCTATTATCAGATTCTAATCGCTTAACAGAGGAATTGCAGGTTCAATCTGAAGAATTGCAAACACAATCTGAAGAATTGCAAACACAGTCTGAGGAGTTACAAGCACAGACGAATGAATTATCGACAATGAATGATAGTTTAGCAATTCGTACAAAAGAAGCGGAAGCAAGAACGCGTGAGTTAGCACTTGCAAATCGAGATATCGAGACACAGGCGAGGGAAATTGCTCAGGGTGCAAAATATAAATCGGAATTTTTAGCGAATATGTCACATGAGTTAAGAACGCCACTTAATAGTATCTTATTGTTATCAGAAATGCTGACAGACCAAGAAAATAGTCATTTATCAGATGAAGAAAAAGAGTTTGCGAAAGTCATTCATTCTTCAGGACAGGACTTATTAGAGCTTATTAATGATATTTTAGATTTATCTAAAATTGAAACGGGTAAAGTGAATATTGAGTTTTCTGATGTAAATATTAGTGAGTTACCAACAATTTTAAAAGCAAATTTTGCGCATTTTGCTAAACAAAAAGATTTAACTTATCATATTGAAATCTTAGGAGAAATACCAAAACTATTCTTTACAGATGAATTAAGATTGCGTCAAATATTGAAAAACTTTTTATCTAATGCCTTTAAGTTTACAGAACAAGGGAAAGTAGAAGTTCGTATTCAAAGCGCGGCGTTAATTACAGAAGAAATGCAGAAAGTAAGCGACGATTGGCTTGAGATTGCTGTTGAGGATACAGGCATTGGTATTCCGAAAGAAAAACATAGTATTATTTTTGAATCGTTCCACCAAGTAGACGGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013217|2924711:2932291|2927610_2930307_+|WP_068457063.1|DBSCAN-SWA MVKRKSSIRLKVTLGYIVIIVCVLLSSILILEKVTVLNGKRSDVTNRNLEVHQMINTVEQSIIQIEKKQNSYILTGEKRYINEYEEQRINVLNDLENLKNVVAKQSNEKILALDLEKSVNKWITLIVEPSLKIREEKSESAATIFLKQKVENAEIPNINRSINRLRQEQNTILNDDTENLEHTSVQLMWIFFILILSIMLVGLFISNYVSKNIIQAIQNVKKTIQNIRQKGGDLKERIDIISRDEVRDLTIETNQLLDQLEEKEWVQNNVNHIIYAYQGVNDIHTLADVILSEISQVIHAVHSVFYLREEQDNDILYVKKGAFAENNLDIGRDSFKLGEGLIGQVAKDGHMYKMAVSPENTHVISTSLIDTTPRMLLLMPVYFNRQVIAILEFATLDTFEEKHIQLLNKVNETLGISIDSVKHMMHIESLLSDSNRLTEELQVQSEELQTQSEELQTQSEELQAQTNELSTMNDSLAIRTKEAEARTRELALANRDIETQAREIAQGAKYKSEFLANMSHELRTPLNSILLLSEMLTDQENSHLSDEEKEFAKVIHSSGQDLLELINDILDLSKIETGKVNIEFSDVNISELPTILKANFAHFAKQKDLTYHIEILGEIPKLFFTDELRLRQILKNFLSNAFKFTEQGKVEVRIQSAALITEEMQKVSDDWLEIAVEDTGIGIPKEKHSIIFESFHQVDGATVRKYGGTGLGLAISKEYAKLLGGFIQVESEEGIGSTFTLYLPNMRQCQENIEAMQGSLAVQPEEKVNIFQGKKILMIDDDRRNIYSMRTLLESKGAIVTSGESGLECLQKLQYNTDYDAVLMDIMMPGMNGYEVIQIIREQMNLDLPIIAVTAKAMEIDRDQCMKVGASDYISKPLNMEQLLSILRVWLTKEVKVK >NZ_CP013217|2924711:2932291|2925986_2926733_+|WP_068457055.1|DBSCAN-SWA MDFNQKVVFVTGANSGIGAAQVALFLEKGAYVYGFDLEDTQMKQMKSLFPKQFAYSVGDVSNKFHVKQSVKHALETFHTIHILLNTAGVLDGYAKTLDTDEELWDRIMNTNVKGTYFVTNEVLPIMLEQKKGAIINMASIAGLVAGGGGAAYTASKHAIVGYTKQVDQDYCREGIRVNAIAPGAIHTPMNAADFEGDGEMAKWVAEQTPAGRWAKPEEVASLTSYLASDDADYIHGTVIPIDGGWIAK >NZ_CP013217|2924711:2932291|2924711_2925674_+|WP_068457051.1|DBSCAN-SWA MMNRFEHSPCGYMQLSLDGEILNLNETMAKWLKMDKQQLLHQSIEKVLSKVSMMMFYSYFYPKISIQGHVEEMLLTLKTAEGTSDSYVLNAKKFEEKTPIIDCVFMRINRRVDHEKELRNVQYALQDALKQNQIAVEALEKINQQIEEQKAKLEQMNLELSQISHVDALTGAYNRRYLNERMEEIMQEKVLLSVIMVDIDHFKKVNDTYGHLTGDVVLTKLSKCLSNTLGDKGIVTRYGGEEFALLLPLIDADEALEIAQFLNREVGNQEFEVVDHITISLGVSTRTEEDTITTLFKRADDALYYVKNNGRNQAVHANQL >NZ_CP013217|2924711:2932291|2926863_2927370_+|WP_068457058.1|DBSCAN-SWA MNNTSITKSSTSISELSKTALVASLYVVVTVFLAVISFGAIQLRLSEMLNYLALYHKRYVIGVTVGVIIANFASPTWFLDVPIGGVATFVVLMICRYATRNMQNMKLKMVITALIFAASMFTVALQLYVLADLPFWETWLFVGIGELLSMTVGGITIYLISKRINLYK >NZ_CP013217|2924711:2932291|2931163_2932291_-|WP_068457071.1|DBSCAN-SWA MSILLVDDNLINLFTLEKLLKSSGYEDCIPLNSSKDLLTYMRTPAHAKNVDLILLDIMMPEMDGLEACRQIKAMNHAKNVQIIFVTALEDKKKLVEALDIGGSDYISKPLNKTELLARIRVALRLKKELDWHTEHDKKIQIELNLASKVQQNLLSTPFENEQLKIDVSYCPSSNLSGDLYYWYRLDENRYAIILLDMMGHGISSSLICMYISSVLRETINNIVEPVAVMTELNRYMSILHSETDNGIPYYFTGIYLVIDTKDKTIEYINAGHPAGYLTLDEKTVQPLSSNTMAVGFFDKLCAIKDKVHYENDFQIVLFTDGVLEAIHADEYIAEEKIKAHCSHHWICPNTVIDELLPPDQQLNQTDDMCVILIQG >NZ_CP013217|2924711:2932291|2925709_2925931_+|WP_068457053.1|DBSCAN-SWA MTFEEVLPKLKNGEKVIRDGWSGPELYVKLVGASQFDGENLNPYFLINVEGEGYTMFQPTVCDILAEDWSIVE >NZ_CP013217|2924711:2932291|2930303_2931140_+|WP_068457067.1|DBSCAN-SWA MIHERETIEVELLLQAIHQLTGYDFRDYSRPSIMRRIHHRMKMNQMDSVSILQNEVFTNKEMLHQLLQDFSINVTEMFRNPLFFKYIREEILPIFKELSEIRIWHAGCSTGEEAFSMAILLKEAGLLEKSKIYATDMNEEVLKIAKEGKIPLSKMKNYTKNYQLSGGKQSFSQYYTTDEEYAYLQEDLVKSISFMQHNLVTDQSFNEFHMILCRNVLIYFNIGLQNKVQKIFFDSLSTGGILGLGHRETLQFTDVCKFYETKSTEHQIYKKKEMRYDE |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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