Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN890332 | Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum KG16-1 isolate LEKG1 plasmid II, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LN890331 | Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum KG16-1 isolate LEKG1 chromosome I | 0 crisprs | cas3,DinG,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 8 | 0 |
NZ_LN890333 | Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum KG16-1 isolate LEKG1 plasmid III, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_LN890334 | Leuconostoc gelidum subsp. gasicomitatum KG16-1 isolate LEKG1 plasmid IV, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
40988 : 86114
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN890331|40988:86114|DBSCAN-SWA TATGAGAATCATTAGGGTATTTAGTATATCAATATTTTTATTGGTGGCTACTTTTATTATTCAAAGAATAACACAATATGCATTGAAACCATTATTATTTAGTTCTTTACAAGTATTATTTGTAGCAGAAATTTTGACTATTATTTTTGCTTTTGTCGTGGGGAAATGGTTAAAAATTAACTTTTACTGGCAATTACCAAAATTTCAAAACTACCATGAATATACGGCTTTTGTTTTACCTGTGCTGCTTGTCGCCGCCATTTCCACTATTTCTATCATGACAATGCCAACTATTTCAATCTTGCAATGGTTAGAAGGCATTCTTTTAGTATTATCAGTTGCAGTAGCAGAGGAACTAATTTTAAGAGGTGTTGTGCTTAATTTATTTGTTAAGCTATTTTCTGGCACAACAAAGTATGCAGAAGTATATATGTGCATTGCCACTAGTATTGTGTTCTCTTCTGCTCACTTAATGAATTTAGTTCACCAATCTCTTTTTCAGACTTTGGATCAGATGATTGGTGTCTTCGGATTGGGTATGGTTTTAGGGATGCTATATATCCGCTCCGGAAGTTTAATACTACCAATTTTATTACATTCATTTTTTGATTTACCTGGCGTTGTTGAAGGAAATCTCATAGGCAATACTACATATGCGTCTGGCATTGGCAAAACATTGAATATGTTGTATATTGCTATTGCCGCATCAATTTATGTGATATGTTATCTGAAACCGTTGAATAGGGATAAATTTAATTTGATTAAACGTGTGAAATCCCGAAATTGAAGGTGCGTGACGTATTTCTTTATTTATTAAATTTTTTTAATAAATAAAGAAGAATTAATCTACTGGGCGTGTATATGCTAGAAAACTCAAATAGTGGCACATATCATAAGTTCATTTTTCTTATTGTCATTGGGTTATATCATATTATCCTATCATGTGTGTACGGGGAACAATAGGACTAATACTTAGTGGCATATATATGCACTTGCTAAGAGATTTACCAATCTTTATATTTGATATTTTTTAGTTAAAAAAGGGGGACAAATGAATATACGGAATAAATAGGAATGACTATCATATGATGAATTAAAGCAGGTAACTGAAGCATTCAAAAAACAGCGTATGATGTAGGTCAATGTCAGCTGACATGTTTATTGATGTTTTGTCTTTCAGATGTGGTCATTGGTCGTGTAACTTATGGATTCTTTAATAATTAATGAATGTCCATCACTGATCTTTTAATATGTTAAAAACAAATTTGGAATTAAATATATTGCGTAAAAGGAAACTAAAATTATGTCATTAAAAAATATCATATTATCTATTTTCAAAAAAATAAGGCAATTCTTTGAACTCATTTTAGTCACAATATTAATTTATATGATTCTACTCATACCAGATGTTTTTCTCTTTATGGGTGATTTAAATCAATATACTTGGATACGGTTAGTATTGAATATCATTGCAGGTGGATTAATTGCTTATTTTGGGTATCGCTATTTAGTGAAGCAAGCAGATGTTGTCTTTGAGCGTCTGAATCGTAAAAAAGTTGGCATGTCCGTCATTATATTTGTTATAACATGGCTGTTTCTAACTTTTGGGTTACCTGCGATATTTGGGCATAATCCGTTACCGGGCAGTAATCAACATGCCATTGATACTATATTCAATCATTTAACGAATTGGTGGACACTGTTATTATTTAGTTTTAATATTGTTGTGATTGCGCCGATTGTTGAAGAAGTGTATTTTCGTGGCATTATGTTTGAAGAGGCCAAACCGCTTGGGAGAGTTGTTCAAATCTTGTGGCCAACGTTGATGTTTGCATTGGTGCATTCACCATCGACATTGGAACAGTGGGCAATTTACTTAACGGCTGGTAGTGTATTGATGGTTGTTAGAGTGGTGACTAAAAAATTGCAGTATACGATCATGTTCCATAGCCTACATAATTTAGTAGCATTGTTGTCATAAATTTTCGTTTGAAAATAATTTGTTTGACGGAAAAACATTGCGAACGCAACATTTTAGATCTAATTTTTAACACAGTTAGGGAGAATCCAATGGTTCAGATAATTAACTTAATATTGCAGATTATAATTGCTATAGTAATAACTGCCGTTTTTGTAGACATACTTATAAAAGGGTTGAAAGTTAACCCTTTCGGATTTAATGCAACTTATTTGTCATATTCACTGCTCTTTTTAGGTTTAGGGTTAACGTTATTGCAATTAAATTATTTTTCTGTGATGATTGCTACGCTCGCAGCCTTTGATTTGTGGTTGTCTGAGAGAAAAAAGTAGTAAAACAATGTGAACCTAAATATTAAAGGGATAAGTTTTGACTTTACAATGATTTAACGTGTCATGATAAGAACCAGATTAACCAAAATAAAAAAGCGTTTCACCTATGAAATATATAGGTTGAAGCGCTTTTTCTGTGATGATTGTTTTATATTTTAGTAATAATGGTTGGTTTAACTATCATAAATTCGTCAATCATTGCTTATGTATCGCGATATAACTAAAATTGATAATGTCTTTTTTCGTCATTATTGATAAAAATAAAGGTATAGACTAGGAAAATGCTTAACATAAAGATTTGCATGAGTATGGTTTTGAGTGTGACAGGCGCTGTTGCAAGAGGTGACGAGCTATATAAAAATGACGGCAAATTGAGTAAGCAATGCGCTAAAAATGGTATTAATAGGCTACCTGACCGGATATACAGCATACTTACTAGACAGCCAAAAGCAAAAGTATAAATCATCTGGTTAAGTGTTTGCATAGCGTTTTGATTAAACAAATTCATCGCGTGTGATAATGAAAATGTCAAGGAGGATAATAATATACTAAGCTGTACACGCCATTTATGATGCTTAAAGTAGACAAGTAGCGCTCCAAAAATTAGGCCACGGGAGAGATATTCCTCAAAAAAAACAGCTGTAATCATAGCCAATACAAGCATAAGAGAATGAGGCAAGTGGTTAACAATCATTTTCAAAATGGCAGGATCATAAAGAAGAGGGAGTGACGCGTGTACAACATATAACATGATAGGAATAACATAAACTAATTTATCTAGCCAAGTATCATGTGCAGGAATAATAAATATTTTGACTACTTTGTATTTGCGATTAACTAAGTATAATATGCTAGTAATGGATAGGGAGTTCAGTATAACTATTAAATTATCAGTTAGGTGTGTGAAATGGGCTAACAGTTTTTCAAAGCCAATAGTGAGTAAATCACTGCCAATCCAGAGCAATAAAATGAGCAACAATAAATTTTTTTAGATTTCATATTATTAGTTTAGCATAGTTAAAGCGTCTGATGAAGTGCCATTATGGCAACTAAAAATTAATTATGGTAAGATTAACATTGTACTGACCGTATGTTCACAGTATGTCAGAAATAAAGGGTAGTGGGGAAAAATGAAAAAAATCGTAATAGATCGTAATTTTTATAAAAAACATGATATATACTTTGGTATTATGGCAGTTATATTATCAGTGCTTATACTACAAAGGCCAATAAGTGCACCACTTTTTATAGGAAGCATCATTTTCCTAGTATTGTCAATGATAAGAATCATTTTTTCAGTTGTCTCAATTAAACAGATTAATTAAATTGAAAAAAATATTTGTTAGCACGAATGACAGTGTTAACAAATATTTTTTTATATTCATGAACATGTTATCAAAGCTGTTTTTACCACAATAAACAACAAAAGTCACTAACATATTTCAGCGCAAATAATGGGTAAATATGTGAAAAATTAGGGATTGCAATTTGGTAAACTATAATTAGGGATTGATAAATGTTTATCAAAAAAATTAATGACATACCGCAAGTTGATGAACGTGATTATGAGGGCTCACATTTGAAAGGTGTTATTGATGATTATAAGAAAAACCCTAATTAGTAAAGTTGCTGTAAGAGATACAGCCATATTCGTGGCAGCGATACTGCCAAATATGGCTGTATCCATTTCTATCCAAATGTTTCTGGTATTGGCTGGCTTTCTTTTTATTATTTCTGTAATTTTATATATTTTGGACATGTTTTTTTTATCATGTACGAGTATTGGGAAAAACGAGTTGATAAATATACTGAAAAATTATAATAATACCCTTCTATTTTTTGAACACTGTAAAGGTAATTTTTTAAAGATTTTAAAATATGAGCTGATACACAGCTGGCATATCTTAGTGGGTATCAGCTCATCATGCTCATAATTACTTCAAACAGCAGTAAATCAGAAATAGCCGACGTTTTAAATGTTGATCCTGTGTTTTCAATTATACGTCCTGAAAACGGGTATACGATACCAAAATGGAGGGAAAAAGTTTCTGTTATACTTAACATCACTATCATAACTTGTTTCTTTTTTGAATGTTTTATTGATAGGGTTGCTTGATCGAAGCATTAAATAGTGTGTTCATATCATTAATGATTTTACAATTCATACTAACTTTATTTTAAGTTTGTGTATCAAATAAAAAAGAAATTCAAGTTAAGGACATGTTTTTATGGGCAAGGCAGTATCTTAAATTTATCAAGTAAGAAGTAAGCTAATTATTAGAAATCATAAGTTAATTTGCTTTTTAGGTAGTATGAAATAATTTTATTTATTATACAGTAACAAAAAGTCCTCTTCAGGCTGTGGTGGCAGAGTTATAATGGAGTGTAGATGCAGAAGGATTAGGGTTCCGTAGAAATGAAAGGATTGGTTCTTGATATGAAAGAAAACAACATTCTATCTGATATCAATAAGTTATTAGCAGATAATATTAGTCAGGACGAACGAGAAATTTTAAGCCATGCTAAAAAAGAACTAGAAAAGAAGTCATCCTTTTCTAGGATAATTTCAGACCTCAGAGGAGAATTAACACCTTTAGCCGTAAGCCAGAAACTTTCTAAGAACGTTGGCACACTTTATCTAAAAATTAATAGTCATGAATTTCAAAGTAAAAATTTCGGAGGCGGGCTTA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44 | Planktothrix_phage(22.22%) | protease,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
380336 : 390653
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN890331|380336:390653|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN890331|380336:390653|381068_381836_+|WP_060391256.1|DBSCAN-SWA MIKYGFIGTGNMAQAMIKGLLGKGVSANNIAVSSPRSAAKLTEKWGVISLSAQKLIDESSLIVLAFLPNQLENVTAKLDFQDKLVVSVLAGITLEQLISATHTTQIVRTLPNVNVAINQGVTAFSKTELTTTNSTTFKIFSDYLGSSVDLAESQFAIFSAVAGSGPAYVFKYIDALAQAGIANGLEAKLATDIATQTVLGSAKTLALSTQTAKELQNAVTSPGGSTRAGLDDFDTHNFDDVIAHAIKATVEHKHL >NZ_LN890331|380336:390653|388178_388505_-|WP_010387316.1|DBSCAN-SWA MYQPTHNTNTVVEENIQHSGRNVMFLSADWCGDCRAIKPFVQNIKDTISKTANWFDADRDENLDVATKYNMRGIPSFVLFENGTEISRIGHGERLTPDQVLDWYQKTL >NZ_LN890331|380336:390653|389528_390653_+|WP_060391262.1|DBSCAN-SWA MITTTTKLHYRFDQVGSYLRPDRLKKAREQFANGQIDKQALLIIQHEEIKKVVDEQVKVGLSAVTDGEFNRSWWHLDFLGQLGGFEFYEQENSYKFHGANTRTTNVRLNGKVHANFAHPFFEDFTYLQSIVPAGIEVKQTIPSPTLVIKRDHRSDLWSNYYATWTGFLDDVAQAYHDTLQHFYDLGARYIQLDDTTWAYLITQLNANRDNLKEREKYEQLAEDNVYVINKALSNLPDDLKLSTHICRGNFKSTYLFEGGYEPVAKYLGQLNYDGFFLEYDDARSGDFKPLSDIWHNRQNVEIVLGLLTSKSADLEDEKTIISRIIAAQKYVSKSNLALSTQCGFSSTEEGNVLTIPDQWQKLALVKKIADEQLS >NZ_LN890331|380336:390653|380336_380981_+|WP_013231232.1|DBSCAN-SWA MIVLSGTIGAGKTSLTEMLANHLDSKAFYESVDDNPILPLFYENPKKYGFLLQIYFLNKRLAQIKVAQTTGKNNIVDRSIYEDALLFQLTADLNRATQTEVDIYKSLVDNMMADITGVDDIKNPDLLIHVRVSFETMLERIEKRGRSFEQIAANPDLYEYYKELNKRYDAWFESYDRSPKVQIDGDRFDFVMNDEARYKVLDMIDTKLSEVDTK >NZ_LN890331|380336:390653|381923_382661_+|WP_041771812.1|DBSCAN-SWA MTNNAGKTKQIRTKKTLTSMTWVLIVGGLIATLAVWLFAKPIVLTTNTIPTGFSVQGVAINQASGYVDYSNLASNGVDYVYLRATTGTSFVDDSYQSSYNRARSAQLKVGSIQVYDASVDALTQAQYFIDNVGNRVGQLPIAFYVTDNQIDTQASIDRLAKLIQILNTHYNKSTVIYTTPSVKSKLSSTISEAKYWLIDTDTTNKSHVNQFIQYSEDHTIGSGLKAIKMPTSVFNGTEKEFEGIK >NZ_LN890331|380336:390653|382657_383659_+|WP_060391257.1|DBSCAN-SWA MIKFGVIGTNWITKMFIAAAIETGEYELSKIYSRTQERGESFLRTLTVDDVDIVTTLSDLYTGIDLVYIASPNSLHFEQSKVAIEAGVHVIVEKPTTSNPAEFAEIEKLLTLYPEVRYFEAARHVHQPNFKVIQQTMGELTQLQGATLVYQKYSSRYDAYLAGEEPNVLSRNFSAGALYDLGVYPIYAAIALFGAPRAVQYLPILLTNGADGKGTASLFYDDFNVTLLFGKTANSYLSSEIYGLKETIAISNIAELDTITYHDGDGHADNIGQKTDDNPMIHEAQDFADIINDPVENHTKYNQWFQLAKQVNQTLFDLRSSADIEFPADKKEY >NZ_LN890331|380336:390653|385219_385909_+|WP_013231235.1|DBSCAN-SWA MAKAIRILLIEDDVNLADNIVGFLEDFADVNVVNNGLDGEFEGQESPYDLIISDLMLPGENGFEVIKYLRKNGIETPVLILTAKSSLDDKIEGFNVGADDYLTKPFYREELLVRVKALLRRAGVYSEDNMIAVGDVLINLENRGVQVHGQQIKLVGKEFDILTYLAQNKNIIVTRDQIFDRVWGIDSDTTINVVNIYLNNLRRKLESVGQNDLIKTLRNIGFILEVKDA >NZ_LN890331|380336:390653|387239_388109_+|WP_060391260.1|DBSCAN-SWA MKHSLITVAVVAAVVGGGVVYSGTQTNSWFQQQAATKKVAHISGQASIAQTAYTSNDSATTAYNKVKNAVVTVQNLKNNSAQQSDGFAGLFGQTQQEGGQSSPKIETASEGSGVIYKITNGTAYIITNNHVVANSDALQVITAGGTKIKATVVGTDVEKDLALIKVQTTVIKSAASFGKIDGLQSGQQVLAIGSPLGSDYATSVTSGIISAPRRELSSQQTGFSTAKVIQTDAAINPGNSGGPLINLAGEVIGINSSKIASSNDGVSVEGMGFAIPADIVQSFIAKTEK >NZ_LN890331|380336:390653|389022_389478_+|WP_060391261.1|DBSCAN-SWA MSVILQNGLLKRERLTFGVRMAHIGQDAQKIAEYLSAHIKVTRVLHPALVNHDGHDIQMKQANSGDAILSFDVNSAAHARSIVQFFKMPVFSVCLGAVDIIISFLSKMGHAALNARLLANVGISPGLLCFSVGLEDTDDLIADLEQSLVQI >NZ_LN890331|380336:390653|383663_384980_+|WP_060391258.1|DBSCAN-SWA MAIKPELQDKFNNQFEQPTPIQDAVWERFSTGENIFGLAPTGTGKTLAFILPMLSRIDVKVKRTQVLILAPSQELAMQTTAVAREWGALVGVSVASLIGGANGRRQSDKLKKEKPHIVIGTLGRVLTMVDGGALKLNGIQTVIFDEADAMLTEERHDSLQELADQLPETVQLGLFSATSGVDLKYVADTFHQEVRPISVGTDAPASIRHEFQYVDQKARANMLIQLARHDQQALVFFNTISGLVNMQATLRHAHVSVMSIGSNDKRQVQRADALRLFKKGEVTLLLVTDVAARGLDIEDLPLVVNAQLPQSKKIYVHRTGRTGRMGKPGRVLNLGNDHDIRDLKRELGDDFELIKAANAFADKKDALTKNKPSERERSNGNDREKTDTTLSVTQNTQNVTPKMKQKSTSEIIDKPKKKKRLKVSKDKGKPKWANKREN >NZ_LN890331|380336:390653|385901_387185_+|WP_060391259.1|DBSCAN-SWA MPNVINKQQQIRGFLLLIASFFVIFSVLGSVIYWSYTRTIFQNSDTAITQQIKQYDLAGALQNSADANRKSPLLLQSNMLADVWVYDKDKKLVVDDRIPEPMQSTYKKKFKYTSKFILSRPKTAQIGNDYYRGVKVNFINGAKNNDGKSVKYGVITVNVTDTIFNLNQFKKVILWSFGTFGLLALMVSYWISLKNMKPILKAWQQQQDFVNNAAHELRTPMAVIQGKLENMLTRPESTVREQSDAIILSLSEVRRLTSLTNNMLTLAKSGSNMTRIEKESTDIAEFLSRIVAPYQEMAEFEGKQVLLSTQVNQPVFIDQKRIHQLLVLLVDNAMKYSESGATVSISAMIEKRKFVLSVADTGRGISDKAKKHVFDRFYREDKTGSRQTGGTGLGLSIAEWIVHAHGGKIIVLDNQPKGTIIKVTLPL |
11 | Bacillus_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
858274 : 905907
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN890331|858274:905907|DBSCAN-SWA 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62 | Leuconostoc_phage(48.57%) | protease,head,capsid,portal,terminase,tRNA,tail,integrase | attL 873517:873532|attR 887681:887696 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1039411 : 1101111
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN890331|1039411:1101111|DBSCAN-SWA TATGAGTGATGAAACACCAAAAAAACGAAAGCGCCAACCACATATAAATGAAAATCAACGGCATATGATTGAATATTTGTGGAATATTGAGAAAATGACCCAATCTGATATTGCTAGGCGCTTGGGATATACACCGTCATCAATACTACGTGAACTACACCGTGGGAACACACTTGATTTTTCACATTTAGATAGACGAACACTGTTGAATATGGATATACACGCACGTATTAAGTATTCGGCACAACGTGGGCAATATCTTGCGTTAAAAAAGCGTAGTAAAATGGGGACTGGTTTAAGATTGACACCTGAATTAAAAGAAATCATTGAGATTTGGGTTAATGATGAACATTGGACACCTGAACAAATTGCTGGTAATGTACAAGATGTCGATGTGTCCGCATCTGTCATTAGATTATGGGCTAGACAAGGACTACTAGATATTCGGACACACAAGTATCATCGTCAAAATGGGACACCAAAAGAACGTACAGTAGCCCAAACAAGACGTGCTAAAGAACGTGAAATTGCAAGACTACGCGATCAATTAAAAAATGACGGCGAATTAGTCCGTCACTCTATATTTGATCGCTCACAGGTAGTAGAAAGTCGTAAACAGTTTGGACACTGGGAAATTGATTTGGTTTTACCTGCAAAAATGAATAATCAACGGTATCAAGATACGACTGCAATTATGACTTTAACCGAACGCAAAACGCGATTTACAGCGTTAATATTAGTCCGGAGTAAGAAATCTAGTGATATGGTTGAAGCCTTTAAGGTATTTTATGAACGCTATGGTAAAGCCGTGCGCACTGTGACCGCTGATAATGGCTCTGAATTTATTTCATGGGACTTTTTAGAGTATGTCCAGAAACAACTTAAAATCAAGCTATATTATGCTACACCGTCATCACCACAGCAACGTGGTACTAATGAAAACAGAAATCGTAAGCTACGTGATTGGTACCCTAAAGGCACGTCATTTAAAGATGTGAAGCAACGACAACTAGATGAAGTGGCTTCTAAAATGAATGCAATGCCACTTAGACAAGCACTTGACGGCAAACGACCTATGGTAGTCTTTGAACAAGAATATAAAGCGATGCAACGTTATCGTAGAGCTTATGAAAAGCGTAAACAGCGTATGTTTGAAGAACGCGAAAATAAGAAAAAATAAGCTATCAAAATCAGTAATATAAATAATAAACAAAAGACACTAGATATGTCTTTTTTATTTGTGCTTAAAATATAAATATGGTAGATTGTAAAATTAAACCGAACACTTGAATAAAAAAGCCACAGCGCCTTTAATGGTAATTGTCTAAAACAACCATAAAGGAACTGCGACTCATGACTAGTTTATCATCTCAAGAACGCACTGTCATTCAAACTTTACTCGAATTGAATTATTCTGTTCGTGCCATTGCGCGCTTTATTAAACGCTCTCCTTCAACCGTTTCGATTGAAATTCATCAAGTTACACCCTATAAAGCTGAGATTGCTCATGCGTTGGCATTGAAAAAACGTCATCTACGTGGTCGTCATGACACGCTAACACCAGCTATCGCTGTCTTTTTGAATCACCACATTGGTATATTGAAGTGGTCACCAGAAACCGCTGCGCATGTTTTAGGGTTACCTTTCAAAACGATTTATAATTGGCTCAATGCTGGTCGACTCAAACTATCATTGGCTGATTTACCTGACAAAGGTATCCGTCAAAAGCGTCAATCTGATGGTAGACGACAAGTATTTGTGCATGGTCGTTCGATTGAAACGAGACCTGAAAGTGTGAAAGCACGACAAACCTTTGGACATTTTGAAGTTGACACCATGCAATCGGGTAAAAGACGTGGCGATGTGCTGGTGACAATTACTGAAAGACTAAGCCGGCAACATATCGTGAGACGGGTCACTGGGCGCAATAGTCAGGCAGTGACACCAGTCTTAATTCGTTTTTTTCAAGGGATCAAAAATGCCAAGTCAATCACTGTTGATCGTGGGCGAGAATTTGCAAAATATAACGAAATCGAGCAAAAACTAGGCATTCCAGTCTATTTTGCGCACCCATATTCACCAGAAGAACGTGGGAGTAATGAGATATTAAATCGATACGTCCGTCGTTTTATACCGAAAGAACGCAAAATTGAAACAGTTAGCGCCAAAGAATTAGATCAAATTAATCATTGGATCAATGCGAGACCAATGAAAACACTCAACTGGCAATCACCACGAAAGGTTTTTCAGCAGTTTGCAGTGTTCGGTTAATTCTTGCAATCTACCATATTTAAAGACGGTTTAATTGATTGAAATATTTGATATACTAGTGAGTAAATAGATTGCTTAAAGGCTGTATAGAGATGTTTTAAAAGCGTGTAATCAAGGTTTACTTTTAAACGAAATCGTGATAATATTAAAAAAGTTGTGCTTTGTTATAAAAATAAAGTGCTTTAAGTTTACAGCAATGTTTCTAATAGATTACTATAATATTAAACATGTGGTTTTTGGGTTGACATTCGCCCCGAACACATTAGTTGACATAATATATATTATCGAAAGTAACATATGTCGGGCAGATTGCAAGCTGATTTATATATCCTATTCATTGGATTTAATTACAAATAAAAAAGCCAACACATATTCATGCTAACTTTGTAACCTAGTCCTCAATAATGAGCCAAATTGCTGTAAAAATAAAATATAGCAACTTTGCTTAAAAAAACTATATTTCTTGTACGTTAACCTTAATTTTATCACTGCTACTTGCAGTAACCATGATATTTTGGCCCAATGGCACGGTGAATATTGGTTGAGTATGTCCAAAATCTAAATCATATATTACTGGTATTGTTTTTAAGATTAAAAACTTATCTAAAATAACTCGAAGTTTCTGTTCACTCATTTCATTAACAGTAGGAAATCTGCCTATTACAAGTGCCTTTATATCAGTGTGTATTTGTAATATCTGAGCTAACTCACGAGAAAACTCAAGTGGGTCTCCATCTTCTGCTTGTTCAATAAAAACAATTGGACTTTGTGTTTTCGGAAAAAATTTTGTTCCTGCTTGTAAACAGTATGTCTGACTATTGCCACCAGTTGAGATACCTGTCGCTTGACCATTAGTATACACTTTCCATTTATTTGCCATTGGATTACGTGCCAATGACTTGTCAAACCACAAATCACTAATCCAAACATTACTAGGTTTTAATTCAAATGAACTATTTAATGCTGCCTTTAACCACTCTGTTGTTTGATATTTTTGTAAATCATCCATCTTGAATGAAGAGTAACATGGTCCATAATAAGTAACCTCATTTGTCATTGCACGAATTGCGTTATGTAGACTAGTTGTATCCGAATACCCAAAAAACATTTTTGGATTCAAACGCACAACATTCCAATCAATATGTGGCAATAATTCGTTCGAATTCAACCCGCCGATGGTAGTCATAATTGCTTTAACATTTTTGTCACCGAATGCATCGTGAAAGTCCGAAACTCGCGATGATATACTACTAGAATAGAACGCATCGTTTTCAAGAATATGTTTCCCGAAAGTTACTTTAAATCCTAAGTTCTCTAATCGTTTTTTTGCAATTAAATTGTCCTTAAAACCACCAACTCTCTTTATTGAGGAACTGGGAGATATAATTCTAATTTCGTCACCTTTTGTTAGATTTAAAGCCATCATAGATCACCATTTTTCTTTTAACATTAATTATTTATTATACCTTACGATAACGACGCAGTCCAAAAACATTGGCCACGAGTAAGACAACTATAAATATAATTAGCATCAAAAGTTCAGGTAAAATATTTGCAAAACTTTTCCCATACAAAATAACATCAGTCATTGCATTTGAAGCGTACTTCATTGGCAATATGTTGCCAATCCATTGTGCCCAGGTTGCCATAGAATCTAATGGTATAATTCCTGAAAAAATAATTTGTGGCACAACAATAATAGGAATAAATTGCATCATTTGAAATTCTGAATTTGCCAATGTTGATAGTAGTAATCCAAAAGTTAATGCAACTAAAGCCAGCAATAGATTAATTATGAATACATTGAGTATCGAGCCTGTTACTTGGACATTTAATACATAAATGGTGAAAAATACAATTATCGTTGTTTGAATAATAGCCACTAAACTATAACTCAAAATATATCCAAAAACTATTTCTGATCTTTTAACCGGTGTGGCGAGTAACCTACCCAGTGTGCCTGAAGTACGTTCTTTGAGTAAAGACATGCCTGAAATCAAAAAGACAAATAGGAAAACAAAAAATCCCATAAATATTGGCATTATTGATGAAAAATAAGTTGTATTTTTATTGCCGTAGTTATATGACTCTTTTAAATTAACACCATTAGTAGTATTTTTATTATCAGAATTCATGCCAAGTTTTTCTGTCATTTGTTTAAGCGTATCAGCCATTTGAAAAGTTTTTTCTTGAGTAAATGAAGCGCTCAAAATACGCCTAATCATCGCAGTTTTTGAGGCAGAAGTGTTTGCGTACAACACACTATAATCATCATGTTGATTTTCTTCGAAAATTGCATCTACTTTTTGATTATCTAACGCTTTTTTAGCTTCTTTTTTATTATCATATTCCTTTACATTAACATGTTTAACATCATTAATAGTAGATTTCATAGACCTTTGCACATTAACAACACCTATATTTACAGATGTACTAGTATTAATTGAAAAAACATAATTTAGCAGTGTCAATATTAATACAGGCGCTAAAAATAGCATAGCTAAAGTTCTCTTATCTCTTATTAATTCTAAAAATATTCGTTTTGAAATAGCTATTGTTCTCCTCATTTTAACTCACCTTCAGCTTTCAAAAATACTTTTTCTATGCTATCAACATGATACTGGCTCTCTAAGTTTTGAGGTGAATCGTTGGCTATTAATTCGCCACCTAATAACAGCGCCACACGATCAACTAACTCAGCTTCATCCATAACGTGTGTTGTCACTAAA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47 | Staphylococcus_prophage(13.33%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1268502 : 1277278
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN890331|1268502:1277278|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN890331|1268502:1277278|1274950_1275694_-|WP_010390629.1|DBSCAN-SWA MDSIEYEKRTITRGALKYTGKAKQVYTTDDPDILWVHYLDQATALNGKVKETISGKGELNSAISQLLFNYLTGNNIKNHYLHSISKTDELITSLDILPIEVVTRNYASGHFVSKFAATPMQKLTPIVQEFYYKSDALDDPFINDSQILALNYATNDELTKLRAESTIINRHLIDLFRQANIQLIDFKLEFGRTKNGDILLADELSPDNMRLVDIATGNSLDKDVFRKHSGDVTVGYQEVLTRLQQII >NZ_LN890331|1268502:1277278|1274007_1274676_-|WP_013231710.1|DBSCAN-SWA MKAAVISFPGSNCDFDMLYALQGFGVDAEIISAKQNSLTGFDAIFLPGGFSYGDYLRTGAIARFSPIMSAVTQAANAGKLIVGVCNGFQILTEAGLLPGQLLPNAKPGFICDEVALHVANGQTAFSSAYDVDETILIPIAHAEGNYFADETTLAKLEKNDQIVFRYVNNPNGSAHDIAGIMNEQGNVFGMMPHPERAVDAVLGNIDGQNFFKSILSGILTKV >NZ_LN890331|1268502:1277278|1271724_1273947_-|WP_013231709.1|DBSCAN-SWA MTTVINSELSPEQVRDSKIYTQWGLTETEYNLIVTELKRLPNFTETGIFSGMWSEHVSYKKSKPILRKFWSNNERVLQGPGEGAGILDIGDGQAVVFKAESHNHPSFVEPYEGAATGVGGILRDIFSMGAQPIAVLDSLRFGELDNTHTKHIVDGVIAGIAGYGNAIGIPTVGGEISFDDVYAGNPLVNVMAVGLIDQTAMQVGQAKGIGNSIIYVGAKTGRDGINGASFASAEFSTEQASDRSAVQVGDPFLEKLVMDATLKAVKDHSDIIVGIQDMGAAGLLSSSSEMAAKAGMGITLNLDLVPQRELHMTPYELMLSESQERMVLVVKHGEEQPIIDLFQEADLDAVIIGKVTDNGRYILEFEGNRVADVPINFLTHAPKQDLPMIAPKRLSEFSDTQYQPDMSQVKATIKALMAQSTIASKASLFKHFDAMVRADTVIKPGGDASLVRIRGTKKALAMTTDVNARFLYLNPRVGAKMAVAEAARNIVATGATPIGITDGLNFGSPDNPEVYYELDQSVAGINDMAKQLNTPIISGNVSLYNETDGQAIYPTPMIGMVGLLDDISQATTMAFKRAGDVIYLIGETTDSFNGSEIQKLQLGKIIGQLFEFNDETELASQGLVREAIAKNLLASVHDLSEGGMIVSLLESSFAGDLSFNIATKQSDKYLFSETPSRFIVSVPQTKVADFEHLAGKQATKIGLVTSESDVVINTLTQTIALSREEIQTVYQESISWQLKG >NZ_LN890331|1268502:1277278|1270123_1271743_-|WP_010390625.1|DBSCAN-SWA MAIKGIEQQQIAQRLAQQTEKTRVNVRSLNEECGIFGVWGRQDAAQLTYYGLHALQHRGQEGAGIVSNNNGHLWQERGLGLLSDVFRDPARIDALAGTAAIGHVRYATAGSHGVENIQPLMVNFHDMQISLAHNGNLTNAMSLREDLEEEGAIFQSSSDSEILLHLIRRSKATTFVDKLKEALNIVRGGFAYLLLTPHGLYAALDPHAFRPFVVGQMPEGNYIVTSETAALDVIGARFVRDVQPGELLAIDDDGLTIDSYTRNTALHIDSMEYIYFARPDSTIYGVNVHKARKRMGAALAVEQPVPDADIVVGVPNSSLSAAAGFAEATGLPNEMGLVKNQYIARTFIEPTQDKRERAVRMKLSAVKDVVRDKNVVLVDDSIVRGTTSMFIVRMLKEAGAKSVHVRIASPIFKFPSFYGIDMQTTKELMGANNTLEEMREKIEADSLGFLSVDQLVKAIDLPYDGQGTGLTTAYFDGHYPSPIYDYTASLSNFVAKDLVDFAPEPMTIYHPRQVASLRNEETLADGTIHLDSQTIQGVE >NZ_LN890331|1268502:1277278|1275680_1276796_-|WP_013231711.1|DBSCAN-SWA MTNIVLPPATIGIIGGGQLGQMMALSAKMMGYKVGVLDPTVASPAGQVSDFQIVAEYDDVSALTELSKRSDVLTYEFENVDIVTLSKQKKSLPQGTRLLEITSNRLTEKTFVQNIAKVPVAKFIAIHDAKEFKVAVAKIKFPAILKTVSGGYDGHGQWHVDNQDDVDQIVKKFPTGTLILEQKVPFQKELSIMVTRDVQNNVTMWPISENVHVDHILKTSFVPANISAVLTKKIQQIATEIANALDLRGVLGIELFVSDDNVWVNELAPRPHNSGHYSIEATNVSQFEGHIRSITGLTIPEITLEKPALMLNLLGDEIQQARNDLVNHSEWHFHDYGKAAIKRNRKMGHITVVGEDNIKKLYEWSQAHGQH >NZ_LN890331|1268502:1277278|1269086_1270124_-|WP_010390623.1|DBSCAN-SWA MIEQNAYQQAGVDIKAGEKAVELMKDAVSDTYTDNVLDGLGGFGAAFALGSDYKNPVLVSGADGVGTKLLLAIAANKHDTIGQDLVAMVANDILAQGAKPAFMLDYLAVDKMRPEVVATIVTGIAKAAKASGMALIGGESAELPGLYAPNHYDLAAFAVGVAERDQLLAPKNVKSGDVLIGLPSSGIHSNGYSLVRHVLGIQTDADFNHLAAETQETLMTPTTLYAKSVWPLVAQGIIQSMAHITGGGLIENLPRAYTSELSAQINWGSWPVLPIFNTLQKAGSLSVEDMLLTFNNGLGMVLIVKSEASKQVMSQLSQANQPAYLIGEMIARQESGVVFQGVAPW >NZ_LN890331|1268502:1277278|1274672_1274939_-|WP_010390627.1|DBSCAN-SWA MYLAKIYVTYKPSILDPQGEVIKAALKRMDYVGIDQVAQGKYFEVKLNAKDVDAATAEVESFTDALLINQNTETYRFDLSLVSDEVDV >NZ_LN890331|1268502:1277278|1268502_1269093_-|WP_010390621.1|DBSCAN-SWA MVKSVRLAVFASGTGTNFQALHDAILQRHLHAEIVRLIVDKSAAGALNLAKIFGIPATFIKYSEYKTKPEAEQAILNQLKIDEVDGILLAGYMRILTPTLIDNYPSKIINLHPAMLPNFPGRHSILDAYEADVDMTGVTVHFVDNGIDTGKIIAQQKVPRLPNDTLQDLETRMHNVEHVLYPNTLEQLLNEGVFLK >NZ_LN890331|1268502:1277278|1276792_1277278_-|WP_010390630.1|DBSCAN-SWA MTQVAVVMGSTSDWPAMQQTTLLLEKLGITYEKHVISAHRMPEQLQTFGQAAQKNGLQVIIAGAGGAAHLPGMIAANTLVPVIGVPMQSHALNGMDSLLSIVQMPAGIPVATVAIGDAGAKNAGILAAQIIALHHEEVREKLVVFRKEQTQKSIVSEAELI |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1288334 : 1373239
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LN890331|1288334:1373239|DBSCAN-SWA CTTACATTTTCTCTAAACGCGCAATACGTTCTTCTATTGGTGGATGAGTATCAAATAAATGTGCCTTTTTCTTTAATGGATTACTAATATATAAAGCCGCTGATGAAGGGTCAACATTTTGCATCGGCTTTGCTGAACCCAACTTACGTAGCGCAGAAATTAATTCTTCTGGATTACGCGTTAATTCAACACTACCAGCATCCGCTAAATACTCTCGATTACGTGAAATAGCCATTTGTATCATAGCCGCAACTAATGGTGCTAAAACCATCACCGCAATAGAAAAGACAAAAAGTAATATTTGCAAACCACCGCCACTGCTGTTATTATCACGATTATCGCGGTTACGATTACCACTACCAAAAAACCACCAGTTACTGCCTAAATTAGTCAACAACGTAATTGCTGCGGTCAGTGCTAACGCAATTGTTGAGATACGAATATCATAATTACGGACGTGACTCATCTCGTGCCCAATAACACCTTCAAGTTCATGGCGATCCATAATTGCTATCAGACCCGTAGTAGCTGCAACGGCAGCATTTTTAGGACTATTTCCCGTTGCAAAAGCATTAGGGCTTGCATCGTCAATAATAAACACACGTGGCATAGGCAGTTGTCCAACCATTGCCATATCTTCGACAGTGTGCCACAATTCCGGTGCTTGATCGGCTTGGGTAATTTCTTTACCATGATTCATTGCCATGACAACATTAGTAGAATTACTAATCATAATCACAGTATAAATCGCACCAATGATTAACGCACCCACGATTCCCATAGTAAGCGAATTTAATAGCATGTACCCTACCGCTGCGCCAACAATGCCAACTAGAATGAGAAAACCAACCAAAAGCACGATGGTTCGGCGCTTATTTGATTGTATTTGCTCATATAACATTAAAATTTAACCGTAGGGACGTCTTTTTCAGTTTCTGGTACAGCAATAAATTCACTTGGTTCAAAATGATGTATTCCCGCGATGATATTGCTAGGAAACGACTGTAGCTTTGTATTATAGCTCGCCGTTGTCGTATTGAACAATTGACGGGAATAAGCAATTTTATTTTCAGTATTAGTTAATTCTTCTTGCAGTTTTGTAAAATTAGCACTTGCTTTTAAATCAGGATAGGCTTCAGCAACAGCAAATAAGTGCGTCAACGCACCTGATAGTTGGTCTGAAGCTGCCATAGTTGCAGCTGGACCTTGTGCACTATTAACACTTGTTCGTGCGTCAGTAACCGCTTGTAAAGTTGTCTTTTCAAAATCAGCATAACCTTTAACTGTGTTCACTAAATTAGGAATTAAGTCATTTCTGCGCTTTAATTGCACATCAATTTGGCTCCATGATTCCTTAGTCTGCATGCGATATTTAATTAAACTATTGTAAATGCTAATCCAGATAATCGCAATCACTACAACTACGGCAATAATAATAACTAATGTCATACGTGCTACCTCTTTCTATTATGGGTGGTTTAGGACAGTGGAGACTTCTGCGCTATTAAACTAAAAACGCCTTATGCTATTTTCTCATAATATGTGTCAATCTACAAACACTTCACGCTTATCTTTTAAGCCAACTACTGTTAAGTGATCACTATACCACTGATAAAAAAATGGTAATTGTTGAAATAACGTGTAAATGGTAACATCTCTATTATCATCTATAATATCATAAGTCCATTGTACATGCCCATCATTTATGTGATGTGTCGTTAATCTAAGTGATACTTCACCAATTGTAATGACAGCACCAGATTTTTTACCTGTCATACGTTTTAAAATAAATTGTTGCTTAGCACCGAGTACAAACAAACTATCCAAAATATTTGTGGACAAATCCTTTCGCAGCATTTCCAAATCAACCTGTTTTTGTGCATCAATACCCGGTAAATCAATATCATATGCTATCTCAGTGAATTGTGAGGCAATCGCTGTTAAACGTTTTTGAAATATGTCTAAAGCATCCAAACCAGCAAGTTGCACGGCTTGTGTTTGAACTAGTTTTGCAAACTGTTTTGTATCTAAATAAAAACGTTTATGCGCTATATCCCAGTACAATACTCTTAGATTTTGTGCCGTTTCTACTAAATAATAACCACCCGCAGCAAGTGGGGCTTGCACAAAACGAAAGGTCGCATTCGGCCACTCTGAAAAATGTAATTCCGCAACTTTTTGCGCGTTAGGCAAAACAACTTTAGTTGGTGACAATGATGCTTGATCAGAAATTTTTGCAAACGCAATAGTTACCCAGTGTGTACTTGGAAACCAATAATCATTGTCAATCCGGACCATTTTAGACTGGTGACTATCGAAAGCTAGAATCTTTTGCAAAATAACAAGTAATTCTGGCATATTTTCAGTCATGCTTAACGCATCAATTAAAATTTGTAACTGATTAAACAAATCTAAATCTGCTTTTAATTGACTACTATATAATTGTGTCTCAAACTTATCCATTATTCACTATTTCTGATCTAATTTTGCCATATATGACATATATATATGCTGCAATTCTGTGATAAAAGTTGGCACATCAACAAAATGTGCTAAAATCGCCTGTAATTCTAATTGTCGCAGTGTATCCTCTTTTTCAAACCTTAACAAATACGCTTGTTGTTTGTTCAGCTTTTCTTCAACTTCTGGCACACGCTTTTGAGTTGCAACCAATAACTCTTGCTTTTTTTCTAATGCCTCTCGTGTCACTTTGTCACTACGTCCAAATAATCCTGATTTATTAGTGACCATTTCTGATAATTGATCTTCAATGACTTGCAACTCTAATGAACGTTTTGTGTTATCGGCTAAAAAGGACTCTAAACCGGCTATCACTTTTTTTACTTCTTGAATTTTAGTTGTATTAATTGTCTCTGTCACAGGTAACTCGGATGTTTCTAAGAGTTCAGAAATAATTGCGTCATTACCTGTCAGTGTCACAGTTAACACATTTAAAGTTCCTAACTGTCGATGATCCCACCAATCACCTAAGTAAACATCATAAAGAGTCGCATTATCGGCAACAGGTTCCAATGTCAAAAAATCAAAATTTGTGACAATGTAGTTAATTAATTCAGGTGCCAAAAATGCTGCAATATCTTTTTTTATATCCACGACTAAACAATCTAGCTGTGCCATAGATATTTCAGATGATATGTTTTTGAATCTATCATTAAATTTATGCAAATCTATTAGCTGATAAACTTCTGATATTTGATTATTTTTAATGGCAGACTGCAAATCTCTTAAATATGAAATTTTACGCTCTAATTGATTAACAAGTTCTGGTTGTAATATTGTTTGCGTGTCTTTAATTGTCATTTTATGCCTCCACTATGCACAAATCTTAATTTTAGCATACACCAACTAGATTCTTAAAAATAGACTGTTAACAGTTTTTTATCTAATTATTATAAAAAAAACGATGATCTCTCATCGTTTTGGTCGCAACTTAGCTGGTATATATCGTATTTTATTACCTAATAAATCATCACCAAATCCCATACGCAAATACAAAATTATCACGACAATGCCACCAATAGCAGCACTAATCAGAGCAGTGATGGTAACTGAAACTTTTGTGTCCATTGGGAACAAAAAGTTACTCATCAAAAATACAACCACGTAAGAAACAATTGCCATAGTTGCTGCGCCAATAAATAATTGCCACAGTTCTTGACCAACAGAGGATAATGATACGCCATAAGCCGCTTGAAGGTAATCCAGCATGTAAGCTATCGCAATTGCCATCCCAATCATACTTGCTATCAAAGCCCCCATACCTTCAAAATACCGAATACTAGGTACTTGAAGTGCAATTTTGACTAACAAGCCCAAAACGAAAGCCTTGATAACAATTGATACTTCCGATAATGCTTGAAGAACAAACGCCAATAACATAAACAAACTAAATACAATTGCTAATATCGTTGAAAACTGTAATAAGTAAATTCCCTCTTGGTTTGATACGTCAATTGGATAAAACATTTTGTAAAGTGGCGCCGCAATGGCAAACATTCCCAGTGCACTTGGAAACATAACCAATGCAAACAATTTAATCACTTGTTTTAGCTGATCTTGAATATTTTCCCGTGTTAAAGTCGCTTTACTCCCGGAAAGCATTGGCAGTGCCGTTGCTGCAATACTTGTTGAAAAAGGTACAATAATCATAATTAATTTATTAGGATTTGCACTAAATAAGGCAAACTGAGTCTGCAGCTGTATATTAGTATTCGCAAAAAAATGATTCATGATATTAAAATAAGTATATTGATCTACTAATTGGAATAATGTTATTGCTGATCCAATAATAATAAATGGCCATGATTCTTTTAAAATATTAAAAATTAAACTTAATGTTGGCTTTTTGACATGTTGTGCATTTGAATATAAAGGTTTAATCAAAATATAGCGATATTTGAACCATCCCCAGATAAGCACTAACATACTAAATATAGCGCCAATAAACGCCGCAAAAGTAGATTGTACAACAACACCGCTCCAATTACCAGGATTAACTCGCAAAATAATAACAGCTGTAACTAGCATGTAAATAACACGCGCAATTTGTTCTATAACCTGTGACAATGCCGAAATACTCATGAGCTGATAGCCTTGAAAGATACCACGAAGCATAGACATCAACGGGAAGATAGCAACAGCTGGTGCTAGTGAATGTAAAACTGGAATAAAATTGGCATTTCCCATAGAAAGTATGGGTGTCAAAAGATAGATCGCGGAACCAAATACAATTCCTAATATGACCCCTAATATCATAGATTGCCGCATAAGTTGACGAGATTGATATATATCATGCCTTGCATTAAATTCTGCCACTAATTTTGAAATTGCAGCTGGAACGCCAAACGTCGCGATCGCCAAAAAAATTGCATAAATGGTGTATCCTTGTGAGAATAAACCATTAGCACGGTTAGAATTAGAACCCAGTAATGCCATCCAAGGCACAATATAAATTGCTCCCAATATACGCGATACAATAT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MADEQRPGDLKMRSQHVDKINVDGQILSADEILARAQQRVQKKQQSSDQKTLKKRLLTPDEIAAIKAKNDQSRQQIIKKKPSLVQNQKVDPFSEKMPTLDMEQQAKDSNQATLVKGSAWLSVGNIVSRILGAIYIVPWMALLGSNSNRANGLFSQGYTIYAIFLAIATFGVPAAISKLVAEFNARHDIYQSRQLMRQSMILGVILGIVFGSAIYLLTPILSMGNANFIPVLHSLAPAVAIFPLMSMLRGIFQGYQLMSISALSQVIEQIARVIYMLVTAVIILRVNPGNWSGVVVQSTFAAFIGAIFSMLVLIWGWFKYRYILIKPLYSNAQHVKKPTLSLIFNILKESWPFIIIGSAITLFQLVDQYTYFNIMNHFFANTNIQLQTQFALFSANPNKLIMIIVPFSTSIAATALPMLSGSKATLTRENIQDQLKQVIKLFALVMFPSALGMFAIAAPLYKMFYPIDVSNQEGIYLLQFSTILAIVFSLFMLLAFVLQALSEVSIVIKAFVLGLLVKIALQVPSIRYFEGMGALIASMIGMAIAIAYMLDYLQAAYGVSLSSVGQELWQLFIGAATMAIVSYVVVFLMSNFLFPMDTKVSVTITALISAAIGGIVVIILYLRMGFGDDLLGNKIRYIPAKLRPKR |
99 | Lactobacillus_phage(27.91%) | protease,capsid,portal,terminase,tRNA,tail,integrase | attL 1296024:1296041|attR 1362257:1362274 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1553371 : 1631644
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN890331|1553371:1631644|DBSCAN-SWA TTTAAAATAAACGCGCATTTGGCTTATTATAACCATATTCTTCCATTACAGTCGCTCTAAACGCTAATAATTCGTCATGTTCAATCGCTGTTCGCATATCTTCCATAAACTGTAATAAATAGCGTAAATTATGTTGTGATGCTAACTGTGCGCCTAAAATTTCGTTTGCGTTAAATAAATGATGTAAGTAAGAGCGTGTTAAATTTTGAAATGGATTGTAATTTGGATTATCAAACTGTCTTTGATTGCCAAATTGATTTGTTCGAATTGGATTGGCTGAATAATAACTCAAATCCGGATCTAACGGTGTAAAATCATTTTTATACTTTGAATTTTTAATAACCACACGTCCACGACGTGTCATTAATGTCCCTTTACGGGCAATACGTGTTGGCAACACCGAGTCAAACATATCTACCCCTCGTATGACCCCGTCTATCAAAGAATCCGGTGCAGCCACACCCATTAGGTACCGTGGCTTGTCTTCAGGCAATAATGGCATAGTAAAATCCAATACGCGATTCATTTCTAACTTTGATTCACCAACCGAAAGGCCACCAACTGCATATCCAGGCAAATCCATTCCCACTAAGCCATTCGCTGATTCTGTGCGTAATGCTTTAAATCCTGCCCCTTGAACAATACCAAATAGTCCTTGAGAATCTGTTTTTTTATGAGCTACTTGTGCACGTTCTGCCCAGCGAAGAGAACGTTGCATTGACTCCTTAATATAATCATAACTTTCAAAATAAGGAATTGCCTCGTCAAGTTGCATCATGACATCCGAACCTAAATTGTTTTGTATTCGCATAGCCACTTCAGGTGACAAAAACATTTTGTCACCATTCACATGATTTTGAAAAGTTACACCTTCTTCTTGTAACTTACGAGCATCTGACAATGAAAAAACTTGAAAGCCACCCGAATCTGTCAAAATAGCTTGATCCCAACCCATATACTGATGTAATCCGCCAGCTTGTGCTATCAATTCATCTCCTGGGCGTACCCATAAATGATAAGTATTACTTAAAATGAATTGTGATCCCATATCTTTTAGTTCACGTGTGCCTACACCTTTTACTGCTCCTTGTGTGCCAACAGGCATAAACATTGGTGTTTCAAAGGTACCATGTGGCGTATGAATACGACCGCGCCGTGCGCCTGTATGTTTTTCAGTATGAAGATGCTCATACCATACTGCTGGTTTCTTATTTGTCATTTTATCCTCGTTTATTACGCAATTTCAATCCATTCTATTCTACCAGTTTTATCGACACAAAAAAAGATTTTACCAAAAATAATAGCAAAACCCTTTGACACACAAGTTTTATACAATAATTTTCAATTGCGCATTTTCCGACATACTCCAATAACTATCACGCGTCACGATAAATGAATCTAACATTGGTACTGTCATTTGTTCCCCAAGCAACTTTAATCTTTGACTAAATTGCACATCAGCATCTGATGGTTTCAGATTACCACTAGGATGATTATGAACAATCATAAATCCAAGCGCATTAGCATGCAAAGCACGTTGAAAAATCTCACGCGGTGAGGCCTGCACATGCGTTAAACTACCAACAAAAATGGTCTCCCATCCAATAACACTCAACTGTGCATCAAGCAAAGCAACACACAATTGTTCTTGAGGTAGATGACCAATTTGTCGTTGTGCGTAATACCCAATTTCTTCTGAAAATTTAGCGCTCAAAAGTTTGGGACGTGTTGCCATTGCGATATGTTTCCCAATTTCTACGCCAATCAGTAATGCTTTATTTTGTGTTGGATTTTGAGCAATAAAATCCTCTGCAGCATCATGTGTCATTTCATTCAAATTATAATCATTTGGAAAGTGACGTCGTAATTCTTTTAATGCATCCTTTCCATTCTGACCAAGTACTGTATAAAATTTTTTTATTTGTTCATTTAAAGCCATTGTTCACCTCTAAGAGATGATACGTAACTAACCTTTTTTGTTCACACTTGTCAAAACACGAACAGAAAAAATTGCTGCCAACACAATTAAAAAAACATCTATTCTAAATAACCAAGTTGCCCCCAAGTGAGTCGCTGTAATGAGTCGGTCGGCCGAATCCGCATGTTTTTGGAAAATTGAAATAATGCCTGCAGCTAAAGCAATCCCAACTGCTGCTGAATAATTATTTGTGGCTGTGAAGATCGAATTTCCTGCACTTTGATAATTAGTTGGTACATGACTGATTGCATTGGTCATATTATTACCAAACCAGAAACCAGAGCCGAGTTGAATAACCAAAAAACTAAATAGCATGCCATATAAACTAATTGGCAACACTGCCATCATAATTGTACCAATAAGAATCAGGACTAATCCGATCATTATTGGTAATCTTGCACCATAGCGGTCATAAAGTCGACCTGATATAATCGCCATTAAAGCATAACCTAGGGCTCCTGGTAGCAGGGTCAAACCTGCAACCTGTGAATTTTGAAATAATACCATTTGTATTGTCATTGGTAATGCATAATTAAATGTTAAATTAACAACTTGCGTTATAAATGAAGCCGTAATACTTAACGAAAATATTTTGAATTTGAAAATAGCTGGATTCAACAGCGGATTAACAACATGTGGCGCGTAAAGTAAATAACCGCCAATGCCGCCAAACATCATCAAAAGTAACGCCACACTCGTAATATTTGTCACACCATGCGAACTAATACGCTCAATGACAAAAATACCAGCGACAAAGAATGCACTAAGCAATACCCAACCAATCAAGTCTAATTTTTCTTTTGTTAAACGAGATACTTGTTTAATAGTAAACCAGCCAATAACCAGCGACCCTATTTGAACTGGTAAAACAACCCAAAAGACTGTACGCCAACCAAAATTCTGCGTTAAATAACCACCAAAAGCTGGCCCAATTGCTGGTGCAAATGAAATAATTAGCGACCCGATACCAACCATTGTACCGCGTTTGTTTTCCGGTACTTGTTCAAAAATGACGTTATACATAAGGGGCATGCCTACACCACCGCCGATACCTTGTAATAGTCTACCAAACAGTGTCAATCCAAAATTACTACTCACAGCATCAATTAACACACCAACAATCGAAATCACTGTTGCCACCATAAATTGGCTTCTATTTGTAAAGCGTTGCTTCAACCATGGCGATAAAATAACTACCATACTCGTCAGCAAAATAACGCCAGATGTTAGCCACTGTACTGTACTAGATGTCACATCAAATTCTGTCATCAACAGTGGAAAACTGACATTCAACGCTGTTTCCAGCATGATATCAGAGAATCCCAATAACCCTATCGACACGACACTAAGTATTAATCGTGTTGATAATTCCCCCTCTAATTTTGGCATATCTCTCCTCGTACCTCACTAACAAAATATAAAGAACCAGTAAAAATGATCATATCTGTATGACATTGATGATATGCTTCATGCCAATTTTCAGCTACTTTAACACCATACTTTTGTGCCACTGTTTTAATATCTAAACTGTGTCGACCATTTGGACCAACAAAAGGGACCAACATAATTTGAAAACGCTTGTTTTTTAAAATATCATCAAAAGCCGATACGACGTTTTTATCCATTAAGCTACCAATAATTAACGTCATAGTCATTGTTTGATATAAAGGCGTATTGAGTGCTTGATAAAGTTCTTTTAAACCTTGAGCATTGTGAGCGCCATCAATCATCACATTTGGCTTAATTAATTCAAAACGTGCAGCGAAATGGCTCTCTCTTAATCCCTGTTTAATATCAATGCTTTTAATATTCCTATCAAAAGCCGCGACAGCGGCGACTGCAGTTGCAGTGTTTTGAATTTGATATTTGCCCGGCAACCCTTGTTCAAAATCATTAAGTGATCCTTGAAGCAAAGATACATTTGCGCGATCAGCAATCACGCGACGCGCGTTTTCAGGTAGATTGCCAATGACAACCGACATATTATTATGAATAATGCCGGCTTTTTGCCATGCAATTTCTTCAATTGTATGACCCAACAATACTTGATGATCTAAACCAATGCTTGTAATTACAGCTACCTTAGCATTTGGCATGACATTAGTTGAGTCTAACTGCCCACCAATACCGACTTCAATAACTAATGCGTCTAATTTTTGCTGTGCAAAATAAGTAAACATCACTGCTGTCAATACTTCAAACTCTGTTGGTATATCAGGTGCCAATTGCACATCTACTTTTTTTAAAGTTTCAGCAACTTTTTTTGTAATAGCTACTAAATGTGCTTCCGAAATTAATTCATTATTAATTTGAATGCGTTCACGAAAATCAATAATATACGGAGAAATAAACAAACCGGTTTTGTAACCAGACACACGTAAAATATTACTTGTCATAGTAGCTACGGAACCTTTCCCATTTGTTCCTGTCACATGTATTGCAGGTGGTAGCTGGTCTTGTGGATTTCCTAATGATTTAAGTAACGCATACATGCGGTCCATTGATTCTTTGCGACCACCTTTTGGCCGCCCATGTATAAAGGTAATGGCCTCTGCAGTTGTTTTCATTTTGAGTCTCCATGTTTAAACAATGAAAAACCATCCAAATATTGTTTGGACGGTTTCATCGTGTGTATTTAAACTATCATAATTTGTGAACAAAATATCATTGTTGCGTTTTTCTAATAGGCATCAGATTATACGCTTTTACTGATTAATCTTTTTCACGTACTGTAAATTCGCGACGTTGACGTGGTGCCCCGCCGCCATTGTTTGAACGACGTTCTGTTGAGCGACCATCACGACGCTTGTAATCGCCGAAACGACGTTCACCGTTTGATCCTGAACCACCGTCACGTGATGATTCACGACGTTGTCCTGCACCATTACTAGAGCGTGAATCGCCATTTCCACTTCGGTTGCCACGATAACCACCACCGCTATTACCACGACGACGATCACCACCACGGCTACCACCATTACGTGAACCGCCACCATTACCACGACGTCTTGGTAGTGGTCGT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88 | Lactobacillus_phage(20.83%) | protease,head,capsid,portal,terminase,tRNA,tail,transposase,integrase | attL 1596268:1596325|attR 1605114:1605171 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1747173 : 1758070
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LN890331|1747173:1758070|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LN890331|1747173:1758070|1749089_1749434_-|WP_060391714.1|DBSCAN-SWA MSILIGIIFIALIGYIFDQRRHIKFLKLVNYNQETRHIMTKHQRYLLDHQIETYKFLLDTLGYDRDAISEGNYTKHEPNPEKLQAIQAEFQQKERIYRSKNIQFETELEVREID >NZ_LN890331|1747173:1758070|1749873_1751277_-|WP_060391715.1|DBSCAN-SWA MAEIDTAPLKPVTKKMPSWLDVQYNETGEIGKTTVNVERLAEYVAGQTHFYTDNNNLAGYLFSGQYWKRYANFKQADNALSSRVATLLKQHKKLTSAKQVKNVVDLIRVVTVKDVADYIDFTDKPYMVSFTNGTLDMRTLEIKPNAPEYHALGGLDYPVSDKDLPTPKTDEFFTRLLGNENAKLLYKFIGYGFKRNYLPFQNFVILYGKGGNGKGTVLTYIGQRLYSGNVSELSLQAFGDKFKTVGLVGKYANIGSDIPANYMPNTENLKLAVSGKEKFEVESKGVQAFSIVNYATLFFSANDLPNIRRDSGLDRRPLVLTTQGKGFTNADGKSELFDEDELLDERPAFTRKVIKMFMDAERARTLNIPENVQKATAEWLKNADIVSQWLDEHTEETKDRRPTAKYMYQQFSRDIEDMGMQERINRNTFYSRMENLGIKSSKSVTISSLDDERGKSTKRFLDVKYVE >NZ_LN890331|1747173:1758070|1752383_1752701_-|WP_060391717.1|DBSCAN-SWA MTDISLSNIEQQILNTLPAGRAQAITLEQLAYLLRINKKRVSDIVANLRKRGYLIGSNRQSHGGMYLIVTSNEFWETVNTLQKSVNSQQTIINALLQHEERFARI >NZ_LN890331|1747173:1758070|1755403_1755808_+|WP_060391724.1|DBSCAN-SWA MTNDFKIVKIISDHEFIISAGLKQSVSEGDRFIIFDRHGEKILDPDSGESLGYLDVNKGTIIVRNVFENMSLASTEPHLVGGINNQFAGVNAFIGIKQPTPLKVDYSQITPLNESLEPSLIKLGDSVKPLDSGN >NZ_LN890331|1747173:1758070|1752991_1753225_-|WP_060391719.1|DBSCAN-SWA MTVSNDELMEELAELKWQLTQDRHVWKRAENVAKHFDVSLGTVKSWKRRGLITGYKHDKIVIYDVNAIERDLFQVEN >NZ_LN890331|1747173:1758070|1753286_1753445_-|WP_060391720.1|DBSCAN-SWA MSIYVQTLQKLFDMLPELADSHNMSGHSLAKAEIMSAYEHLDRALTLLTIKN >NZ_LN890331|1747173:1758070|1748634_1749027_-|WP_060391713.1|DBSCAN-SWA MDVEALVERFGKPKRTYAQKEKSMFYAYVYRLVMGELIKRKLTTYKAIMFVLRFTTHDNKTRAYQETHPMASKRTANVNANKYHKRFDVYIAHAITMNLVYKGRLTLAYDIKFINTNGIDRYVNKLILEL >NZ_LN890331|1747173:1758070|1754542_1754977_+|WP_060391722.1|DBSCAN-SWA MYEYLDYTSPLDYFNDVVVQYNVDRPKHTKIIIAEMAGSVYDPDVALPSDNTIIINPNFKTKFSLPFRKFHELQHILTGEQHKTYAFSPLAKNDAEISANAYAFKMLADFYFDENTDRYSKLYDFMAYFGITMSLESSVIKNIT >NZ_LN890331|1747173:1758070|1752697_1752976_-|WP_060391718.1|DBSCAN-SWA MKKGIKKAHPLPTKVVDEPCYKRPYYGFCYTHFNMKQDNNTKLIITLEQVDYINSLFDEPMFVIDMVTKTFKPVDEKRFHSWLDRIERGGEQ >NZ_LN890331|1747173:1758070|1748421_1748622_-|WP_060391712.1|DBSCAN-SWA MTADIEQPQSWPKWMKRTEAHKYISVADNTFIKRYVNTGKVKAYPTEHGIRYDRDEIDEAVRHYYD >NZ_LN890331|1747173:1758070|1754991_1755414_+|WP_060391723.1|DBSCAN-SWA MKSILFSLVSAAIMWVIYLITPISKVSALLVLFIFIVLIFGIDNFVQLKNEKLSTLQEKEKLKKEKLKNKKLLQDIKALQQNQLGLNHLIEQKDDSIDKISKRANTLGSAINTLIAQDTTGKLAPYINNLLQIGEYTNDK >NZ_LN890331|1747173:1758070|1747173_1748295_-|WP_060391711.1|integrase|DBSCAN-SWA MKLQQVDTPKGKVWEVNGYFINQTQKVRVKKRGFDSKQSARQWFNNQSVLFDNGESKYNKKTTPNIMTVKELYNMWLETYQHTVEESTLNRTMNMFKVHIIPEWGDVLVTDIRPLDLQRYINTLHGKILFYRKVAGYFRRLLNIAVRMDMLDVDPFSKIELPKPRHNTNKPKQFMDVDEFKAFVDVLDSQYKYINKQAYTLLRLGAFTGMRTEELLAMQWQHVDFNSGYINIVQALGRGLNGRTYIKEPKSQTSRRTLKIDNRMLSVLADWYEVSNYKNANDYVFNNQGKTLQVLRPNKWLHDVSDKYGVAVGLSMHKLRHTWATLALDQGASVKQVQTYLGHADVSMTLDVYSDITKRASDETGDVLSNLID >NZ_LN890331|1747173:1758070|1751263_1752085_-|WP_082699529.1|DBSCAN-SWA MNKWEHIKQYQHFGAYVFMALPNQKHNGVAGGYHNSFNNGDELQTWLAEHPDYQNGNIGIDLSKSNLVVVDIDKHKHNGMKSIGAWFKAHTINPETIQDTYVERTATGGSHAFYIIPNGKIKPKNVINVINGVDVLSDTAITVAPSVIDDEPYRAVTPFETIQQAPEWVYKLSEYQNNTNTPSNQRKSRYTNLERWLMVKNGFETGQRNDQAMSLAGYLFALDVEPQSIYDILQVTNERSSEPLIDHELNTIYMSARKREERKRVRINSYGRD >NZ_LN890331|1747173:1758070|1752081_1752381_-|WP_060391716.1|DBSCAN-SWA MIKNNTLDKLNEMLEEKKVTETGHAITLNNVNDDVQVLLEYAKSMTDYIERINDNEFAANRDFIKSDYMSDEITKSTTAIIMLNEYLDKAVALLAKAQR >NZ_LN890331|1747173:1758070|1757518_1758070_+|WP_060391727.1|DBSCAN-SWA MRTVTDYKKLNIKNIVSNIRSVKDYVRFNGHKVKLTTTSPNYGGVRYWFLCPACNKRKATLYQLKSVIACRTCAKLYYPLQDNKVQRNNISQFLYYDRLLSKTRTELNPKFEWAFHSYLRYDPITSSLHNKPKGMHLTTYVHKLEYIDSLTNKMHNCMQVINLDKQHHADKINKQIDMIFSSR >NZ_LN890331|1747173:1758070|1754173_1754542_+|WP_060391721.1|DBSCAN-SWA MSITAERIKEQRKIKKLTQTALAELVNSSRSSIAQIETDKYNVSFAMLSLIADALDTTVDYLQGKTDNAFKQAENASNDGDDKKHVDLADDELIMSFEGKELSEDYKKSILAFVKMLREERK >NZ_LN890331|1747173:1758070|1756293_1757187_+|WP_060391726.1|DBSCAN-SWA MGTKPFKTHNQQLKILRDRGLDVPTSAKRSLESYGYYSIVNGYKWSFLQRGVNGKPITPEQYIKNATFQEIQSLYNFDSELRSILFEALLKYEASLSADLAYRFSEAHPEEHSYLAINNYTRDSQQVHSVVKTISSLSGVIQYKSAQKNAINHYVNKHRHVPLWVLVNFLTFGDFNYFYQILTNDIKVKIAKDFSKRRQTTYHAKSLSIRPDTIMVVNHLVNHFRNAVAHGEITFSKKINKTPNLQSIKLPLGIQNTTLNSQAGVFELVIALKVVLQKKDIQKTFKRIETAFFGLSK >NZ_LN890331|1747173:1758070|1755889_1756114_+|WP_156415758.1|DBSCAN-SWA MGSEPATTVQYELTEVKSYPGMEEYSQEEIYNAFEDLSNEGYIKNTSQRIFGNPYIQFKSLTTTGKKQLDSYND |
18 | Leuconostoc_phage(76.92%) | integrase | attL 1737127:1737141|attR 1752316:1752330 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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