Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP013042 | Endosymbiont of Bathymodiolus septemdierum str. Myojin knoll isolate A1 | 2 crisprs | cas3,DEDDh,csa3,cas6,DinG,cas2,cas1,cas9 | 1 | 2 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP013042_1 | 1076887-1077055 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_AP013042_1
|
2 spacers
spacers of NZ_AP013042_1
>1.1|1076924|29|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder AAATAAATATGTGCAAAGACATTCTGGCT >1.2|1076990|29|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder TTCGGCAGTCGCCTTAGTCGGTGGTGGCT |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP013042_1
The CRISPR arrays of NZ_AP013042_1 >merge|NZ_AP013042|1|1076887-1077055|CRISPRCasFinder AGTTATAGACCCCTCCCTCTCTCTGGTCTGATATACTAAATAAATATGTGCAAAGACATTCTGGCTAGTTATAGACCCCTCCCTCTCTCTGGTCTGATATACTTTCGGCAGTCGCCTTAGTCGGTGGTGGCTCGTTATAGACCCCTCCCTCTCTCTGGTCTGATATACT >NZ_AP013042|1|1|1076887-1077055|CRISPRCasFinder AGTTATAGACCCCTCCCTCTCTCTGGTCTGATATACT AAATAAATATGTGCAAAGACATTCTGGCT AGTTATAGACCCCTCCCTCTCTCTGGTCTGATATACT TTCGGCAGTCGCCTTAGTCGGTGGTGGCT CGTTATAGACCCCTCCCTCTCTCTGGTCTGATATACT
>NZ_AP013042.1|WP_066044999.1|1075913_1076849_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA MSIQPNTAVFLMGPTASGKTDFAIELSKQFPVRLISVDSALIYKGMDIGTAKPNAETLRQYPHQLINICNPEDSYSAFDFVQDAKTQIQIAFNNNETPILVGGTAFYFNALEHGLSDLPESTPESREKFTQLLCEKGASTLHQDLATIDPTAAKRIHPNDAQRITRALEVFDISGKTLTELQGNKQLGLTYPVKKIILMPPRPELHARIEQRFLSMIDNDFLAEVKTLKQNPALHEDLPSIRCVGYRQAWQYLNNEIDKATMIEKSIIATRQLCKRQSTWLRNEPNALTLEMPDITKAIEFIHNERPLHDS >NZ_AP013042.1|WP_066044997.1|1074834_1075845_-|CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen-reductase MFTIENQATGKVFRTEGNGPILDDALIHGLNFPYGCQKGFCGKCKATIIEGEVGYDTDVPNGITPEEVADGMALLCQCHAKSDVSLVVEELDSLADIKVKILPCKVESITHLNHDVAQIFLKIPGAESLQYFAGQYIDLIHPDFEPRAFSIANAPKNSNLIELHVRLVDGGKFTHFIFNEMKEKSLLKLEGPKGDFFFREDSKKPVILLAGGTGFAPIKSIVEHAIATNLSRQIYVYWGAREACDLYMDLPQQWANTHDNIHFVPVLSEADEAWQGKTGYVHDSVLADFEDLTGYEVYACGPPAMVKSAANTFVAQGMIKDNFFSDAFVFAYTKEK >NZ_AP013042.1|WP_066044995.1|1074526_1074832_-|BolA-family-transcriptional-regulator MDMQQHLTEQLTTALSPAHLQVLNESKNHSGPATQSHFKLIVVSDEFTGLKLIDRHRFINQLFKEELTHIHALAMHTYTPSEWKMKQGAPASPQCAGGSKS >NZ_AP013042.1|WP_070104565.1|1072985_1074587_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MEDETGRTRFSAVCRGVKILRILLLLSFVLLSACSTQETTSDKHFVNFTVAEKPVKLISSKIEGEDLWRYISRGSTLKARSQRDLYWHIKWFKENPDYLTRVTKRAGPYLHLVIQEVKKAGLPIELALLPIVESAYYPFSYSHGTASGLWQFIPDTGRLYGLKQNYWMDERRSVIRSTRAAVAYLKNLHTLFKGDWLLAIASYNSGPGRVQKAVKKNKAKGRKADFWNISLPAETRGYVPRLLAVAELIKHPEKYGQTITPISNMPKLESVFVYSQLDLSLISEWTGLSLDEIYTLNPDLNRWATPDTTRYELLLPIDKVARFKKARASYPKQKQLRYKRYTIKSGDSLNSLAKRFNSSVSYIKSINNIKGTRIKLGQKIIITIPKKAKDYYSLSIEQRKKQRFNSRKYGKKITHIVAKGEILWVISNRYGVPVDSIIKWNYLSNATKGLQIGKKLVIWQVPKTKASALKNLTKKGVNVKRTLSYKVKSGDNLSTIAHKFKVRISQLRQWNNLAKNKPLKIGKKLKIIKSIVE >NZ_AP013042.1|WP_066044991.1|1072266_1072977_-|hypothetical-protein MNQLPVNKVFIAGFAFAMTHWKKILEISLVPLVISLPLLMMLPELLMVAKQVFLAIEQTAPDTPLPEIILPDNTGIYFILFLYGNISLSIDMYRLVILGRQSVGITPVFDLGKIARFFGLTLLVGMVTIVPLVLTNLLILQFIISFLMVPITLNFVNIAIGKPSRYRWGLSFPTHMNLFFLQVIVPMLVVLLLTSLAKLIGFGVGAEWVARVLVFYWSAITLALCYQLLTTSGKTP >NZ_AP013042.1|WP_066044989.1|1071524_1072292_+|FtsQ-type-POTRA-domain-containing-protein MIKKQNRRYNAHKKTTAQRLMPIAKILSILIILGFTIWGVVKIKEMDFLQTKITWQIDNNLLVAQSHLESKVQPLIKNKYLLLNLIEIKQVLENEPWIATANIKRLFFNSIQVSIKTHKIAMRWENINCKQKSVPGCLGYISTNGTLFMPRKTVKSNAVLAHSKAEQAVITQLYQDYQNYQKSSGEMRIHAFSKTQIDTLIFKPNIKVILGYQQKQQRLERFLKAYKELKKTTPKVKLNRASFDMRYPKGFSLKL >NZ_AP013042.1|WP_066044987.1|1070653_1071532_+|D-alanine--D-alanine-ligase MIAVLMGGNSAEREVSLNSGEAVYNALKNQGVDCFKFDWHGNNLDTLWVQNFDKAFIVLHGRGGEDGYIQQQLEQRNIKYTGSGATTSEQCMNKATTKNIWRQHNLPLSPSVLSKVGQKIPDIDFPLPWAVKPILEGSSVGISKVKTIEGLNKALELAWEYDEIALIEQWVEGSEYTVSILKGEALPVIQIKTNQGFYDYASKYLANDTQYLCPCGLSDDNEQLLKEIAMRAFTLMGAETWGRVDFILDKENLPYLLEINTVPGMTSHSLVPMAVKARGMSFDELVMEILND >NZ_AP013042.1|WP_066044984.1|1069823_1070657_+|UDP-N-acetylmuramate-dehydrogenase MRLRNESMHKHCSLRAGGKVKDFFVPDTINELSDFLKNNQQPILILGLGSNLLVRDCGFNGTAIKLTHLNQLTFKDGLIHAGAGVTLAKLSRFCESQQLNGVEFLSAIPGSVGGALAMNAGAFGADIWSFVESVNTINHSGKVFMRDKSEYDIAYRSVIPHQKDEIFIGANLKTSQTEKQDNIKVLLKKRNESQPIGLPNCGSVFKNPPNNHAAKLIEDSGLKGFCIGGACVSKKHANFIINQNNATTNDIENLIQHIQQTVKSNCEIDLETEVVII >NZ_AP013042.1|WP_066044981.1|1068417_1069827_+|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MNNLRPAFTSRIKKIHFIGIGGSGMSGIAEVLHNLDYQISGSDLIQSPITQRLQALGCKIFHQHHQDNVQNVDAVVISSAINSENPELIKARKNNIAVMPRAEMLAEIMRFRFGIAVAGTHGKTTTTSLITHILNTAKLDPTYIIGGILNSSGINAKLGESDYLVAEADESDASFLLLQPMLSVITNIDQDHMSTYDNDYNKLKDAFISFTSNLPFYGACVVCGDDIGVQSILEKISRPTVTYGFSDNVDIQAIDISQIGRKMHFEVRCHCHKNIEPFKVELNGIGKHNVLNTLAAIGVACELDIDTHLIQNALKSFSGVARRLDFHGILNIDNKKTLLFDDYGHHPNEIKAVLESLRDTYKNRRLMVIFQPHRYTRTRDLFDDFCHALSKVDALILLDVYAANEQPIANISSSTLANSIRQRSTVSPIVVKDVNEALKVLPNIVQDNDVILTLGAGNIHSLVSLLTKK >NZ_AP013042.1|WP_066044979.1|1067957_1068425_+|2-C-methyl-D-erythritol-2,4-cyclodiphosphate-synthase MIKTGIGQDSHAFINGKPLVLGGVTFDHPQGLKGNSDADVILHSLTNAISSITGKNILGAEADKLCKQGVTDSAEYLKLALVDLGDWHIDHIAITMECLVPKIFPNIDAIKSNIANLTNIKITDVGLTATTGEGLTAFGRGEGIQVFTIITVSNE >NZ_AP013042.1|WP_066045001.1|1077112_1077442_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MLNKNDRFMRLIVFFDLPTKTKQDKRVYTVFRRYLLKDGFIMLQFSVYSRVCKGLDSVESHLKYLKSILPPKGNIRMLQVTEKQYARMEILLGSVKKTEKSAGKQLLLF >NZ_AP013042.1|WP_066045004.1|1077431_1078322_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSWQTLLISNPCKLSIKNGNILLRRLDDEDANIAISEVSAIVIENPQVTMTAVFMSHCADSNIVVIFSDEKYTPIGVFHPFYQHSRMTKHAFLQNNWSQSFKNRVWQKIVKAKILNQQQTLIKITKQPNKQLSLIASKVQSADKTNREAYAATIYWRTLFENFKRNNTNDIRNSALDYGYSIVRSAIARSISASGFVPAFGFHHKNELNAFNLVDDLIEPFRAFIDFEVYLLNPSKTGTKLTFKMRADLVNILNKQVVFKQEKTTLLNAIQMMVFGLLSASEHQDIDLLLLPRHAQ >NZ_AP013042.1|WP_066046126.1|1078446_1079670_+|IS256-family-transposase MNQQKLRAFAGELAKDIHTQDDLADLSASLVKMTIEAALGAEMEHHLGYPKYGQNGNESNASNNARNGYYSKIVKGNHGEVELAIPRDRNANFEPAIIEKGQTRLGAFDNQILSLYAKGMSTRDIVTTFKEMYDADISATLVSNVTQAVITQATEWRNRPLDEIYPIVYLDGIVIKVRQDKQIIKKTMYIALGVNLEGKKECLGLWLSKNESSKFWLGVLNDIANRGVKDILIASVDGLTGFPEAINAVFPQADVQLCIVHMVRNSLKYVGYKEHKNVASDLKQIYQSITEEEALLALDEFEYKWDTQFPSIAKSWRRNWDNVATLFAYPEAIRKAIYTTNAIESLNSMIRKSIKNRKIFNHDNSAFKVVFLAIEAASKKWTMPIRNWSQAMNQFIILHEDRLKDYV >NZ_AP013042.1|WP_066045006.1|1079711_1082876_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MRILGVDLGVASVGWALVNDKNNKIIDSGVRIFTQSTNREGKTLAAVRRSFRGGRRVLSRRKQRLNQLKKLFIAHKLLSKSEFKHLFNSKNRLDIWQLRAKGLEQQLNNKEWARVLYHIAKRRAYQSNRKSEESGNTDKKKVLSGISKNEKKMNELGYKTIGEMLYTENRYPDNRIRRNKKDQYKHSISRDLLRKEIDVLFESQRDFGNQFATDGLKEHYKDIAFTQRPIKFKADLVGKCTFETQEYRGAKNCFSVEKSTLLSKINNTDLIDKSTGEIKRLFEISEFDKLLDIFYSIKEVKYTTLRKQLKITDAFKFKQLDYHQNFEYKTNIKAKIEDFYKLEDWLTPEQKVLLEKQVLDDKKEKFKCYKYSSIRSILSLSESQKFNGVKYDTKVENTVFGKLNGYHSIKKELNKEVFDLLFIDKDKFNKIAEILSYQKDDKSATQDLKKQVFNDFNMDKTIVNEAINSLLNISFSGFNSLSLKAINKLLPYLCQGLKYHDAVAHSEYKHHSQFKAANPQQYLRPLNKEENYQITSPTVKRVFSQFRKVLNAVIRKHGSFDAMHIEMARELKNSKKIKFEIQTGQKEYAQEKEAIRVKFLEIFKYEGSGRDLLKLRLYEQQHGKCIYSKKEIEINKLLEDGYVEIDHILPWSRTFDNSLNNKALCLSAENQNKANQTPFEYLTNSDKNSKDSKEWQEYKNYVSSFAGIKQAKKHKLLNTTLPPRRGNDFSDDIKNPESGFLARNLNDTAYASRFIKNFVQNHLQFSQNDTIKQKVKVRSGALTNQLRYNWGIEEKNRDNNLHHAEDAIILAFATQGEVQRMSTISAKREDFKYQTAKERKIKFTPPFSDFKSVLDESVGDIFVSFAPRRKISGAAHKATIKPKDTGGKYKFPVNNGMAENGVIQRVDVFKNAKNKYQFIVFYPADFYKDDFPELDLKGNEIDKNVQFLFSLFKDDLIEFKTKKTKTKDSKHLLAYFKYIRSDGKIAFQQNYKAEIERKESDNKKGYKDILLATGSGLASLKKYQVSVLGDIAEVKNEKRLPLIKQMYKSKPKKK >NZ_AP013042.1|WP_066045008.1|1083069_1084353_-|UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine--D-glutamate-ligase MKLVLGLGDTGLSIARFLSKQNIAYRIADSRQNPPSLNNCPQSPILGDWTLDLLADIDEIFISPGIAQTEPIVLWAKQQNISIVSDIELFSRHAQAPIIGITGSNGKSTVTQLFGEMIANDGKKVAIGGNIGKPALDCLDDDIAYYVLELSSYQLDYTQNLRLFTGVVLNITPDHLDRYLSFEHYAQSKLSLYTHCQTSVINIDEPLTSKQSSSKIFGMDIPKNPKDFGTVTCHNSTYLLKGDTSLMCIDDMPLIGEHNIKNALAALSLGDQIGLSTEAMIATLKTFKGLEHRLEKVTEKNNITYYNDSKATNAISTITAIQALISTHKNIILIMGGVAKQEDYHPLFTLINEHKIPVVLIGKDTHKFEKSITNTTLANTLEDAITTAQSLIIKGAILLSPACASFDMFDNFEQRGRMFKDYVNSAH >NZ_AP013042.1|WP_066045010.1|1084413_1085082_+|Bax-inhibitor-1-family-protein MSTFTTTATMGSVQVKNKVLSDTMRLLSYTLVFGGLSSWFAVTTGAGFGSAMVASLVAIAVIWFVLPKTQNSNKGIVTAFAVAGLLGYSLGPMLTHYLAMPNGASLVMQALTGTGVSFFAISFYAQNTKKDFSFMGGMIFFAMVGVIALSLINIFFIESSFVSLAISFAVVLLMGAFMLMQMSSIINGGERNYIAATVGLYLSLHNMFASLLHILGAFGGDD >NZ_AP013042.1|WP_066045012.1|1085074_1085602_+|RNA-pyrophosphohydrolase MIDREGYRANVGIVITNDKQQVLLAKRFKKEGWQLPQGGIDKGENELEALLRELEEEVGLRAEHIEVVAKTPKWLRYDLPKNKRSKYCVGQKQVWFLLKLIGSESDIKLDTHTKIEFEDWKWVDYWHPIEAIIDFKKPIYEDMLKALAPVLFNNQHKVPVQYSRPLKCSAITFSK >NZ_AP013042.1|WP_066045014.1|1085651_1086929_+|homoserine-dehydrogenase MNIGILGLGTVGGGVVNVLAKNNAEIKRRTGASIQVTHAAVRDVNQARICPTDHIKLTEDPLTIVNDASIDVVLELMGGTGLAKELVEAALRNGKHVITANKALIATHGNALLALAKSNNVHLLFEAAVAGGIPILKSLEQGLSANQVEMVAGIINGTGNFILTEMRDKGRDFADVLKEAQELGYAEADPTFDVEGIDAAHKLAILASIAFGCELDFDKVSSEGISEVSGEDVAFATELGYSIKHLGIAKKINGQIQMRVHPTLIPKTQLLANVDGVMNAVLVKGNAVGPTLYYGAGAGAEATASAVIADLVDVIKGTVSADVFGWKSLKAVQSQNVNDIESVFYLRLLAKDTTGVLADITSILANHNISVESVVQKQIDAQNNAHIAIITNSVETGDINTAVAEIQEKDFIQAAIKIIHVETLD >NZ_AP013042.1|WP_066045016.1|1086943_1088014_+|threonine-synthase MSKRYTGLINHYKNRLPVDKNTKFISLGEGNTPLIRLENIPALLGKNVDIYVKYEGLNPTGSFKDRGMTMAVTKAVEAGSKAIICASTGNTSASAAAYAARAGIKAFVLIPEGKIALGKLAQAMMHGAVIIQIKGNFDDGMRLVKEVANHAPVSIVNSINPFRLQGQKTAAFEIVEELGDAPDYHCLPVGNAGNISAHWMGYKEYNQDGISAKTPSMVGYQAEGAAPFTKGEMVDNPETIATAIRIGHPQSWDLAHKVKEESNGWFDAISDEAILAAQKLLTEQEGIFCEPASATSLAGAMIDINNGKIPEGSTIVCTLTGHGLKDPDTAIAQCKSEMILINPVMDEVKNAILENM >NZ_AP013042.1|WP_066045018.1|1088023_1089211_+|AAA-family-ATPase MKIESIKIKNFKAFKNAEMKDIPRFCVIVGANGSGKTTLFNVFGFLKDALTDDVNTAFNKRGRFNEVISRDCSGSIEFEIKFRAKDTSKNNPIITYSLSISQKNGKALVEKEVLKYRRGSKGTPWHFLEFSNGKGYAVTNELDGDTDINELSREEQTLKSPDILAIKGLAQFEKFPAVIALSELIDNWHVSDIHVNEARNIQQADYAEHLSTLGENLSNVVDYLHNNHKSTLDEIIKILQQRILGISKVEAKTIETGQVLLKIQDESFDKPFLVRYISDGTIKMLAYLVLLYDPKPYPLLCVEEPENQLYPHLLEELAEEFRAYANRGEQVFVSTHSPDFLNAVEVNEVFYLSKNNGYTTIKRISDDEQIKAFMNDGDKMGYLWKQGFFDQLGKQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP013042_2 | 1317388-1317531 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_AP013042_2
|
1 spacers
spacers of NZ_AP013042_2
>2.1|1317430|60|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder TGAGTATAAGCATTGCCGCGGTTGTAAAAGGCCTTGGCATACTTTGGGTTTAAGTCAATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_AP013042_2
The CRISPR arrays of NZ_AP013042_2 >merge|NZ_AP013042|2|1317388-1317531|CRISPRCasFinder GCCTTATCATAATCTTCAATGGCTTTTTCAAACTGTTTTAAATGAGTATAAGCATTGCCGCGGTTGTAAAAGGCCTTGGCATACTTTGGGTTTAAGTCAATAGCCTTATCATAATCTTCAATGGCTTTATCAAACTGTTTTAAA >NZ_AP013042|2|2|1317388-1317531|CRISPRCasFinder GCCTTATCATAATCTTCAATGGCTTTTTCAAACTGTTTTAAA TGAGTATAAGCATTGCCGCGGTTGTAAAAGGCCTTGGCATACTTTGGGTTTAAGTCAATA GCCTTATCATAATCTTCAATGGCTTTATCAAACTGTTTTAAA
>NZ_AP013042.1|WP_066045483.1|1316419_1316722_-|ribosome-assembly-RNA-binding-protein-YhbY MNKLTNNQKKFLRARGHALKPIVMVGQHGLSESVLKELEISMTKHELLKIKIRAEDREDRQRMIDEIVNVTQAHLIQVIGAVMVIYRGFDEEPEIILPRK >NZ_AP013042.1|WP_066045480.1|1315334_1316420_-|lipid-A-disaccharide-synthase MKIAISAAETSGDLIGSKLVTALKAQNSDIQIQGLAGDKMIEAGCEQLWDQKRVNVMGLSEVLKKLPALLQLRKTIIDYFSKNKPDVFIGVDGPDFNFMIEKKLKRRGVKTVHFISPSVWAWRQSRVKKIKKSTDLVLCLFPFEVDFYQKHQQRALFVGHPLAETLHPRVNYQSSKKILLMPGSRVSEITRLLPEMLVATSIMAQQDAQLTFHLALANDELLAWAKPLAEKANVSISTGDAHQRMPESDLVLVASGTAALELALLGVPMVVVYKLSVFSYFIVSRLVKIEHVSLPNIIANKSLVPELIQDEANGANIAEKAMTILQNDSALLVQEFNAIHQQLNMNASEESARLISEFVNE >NZ_AP013042.1|WP_083503000.1|1314532_1315342_-|carboxylating-nicotinate-nucleotide-diphosphorylase MNKIIELALNEDIGSGDVSAHLLEDKIVSAQVIARESAIICGVEYAQAVFLSLDKDIQIEWHFKEGERIQAKQVLCTLSGASNSIISGERVALNFLQTLSAVATQTKTLVDKIAHTNAQLLDTRKTIPGLRLAQKQAVKCGGGVNHRIGLFDAIMLKENHIIAAGSITKAVQLAKDQYPDLPLIVEVEDLEQLTEVLGLTGITRALCDNFSITDLIQAVKLANHKLPLEASGNIDENTIVKVAETGVDYISTGSITKNIQAIDLSLRFS >NZ_AP013042.1|WP_083502999.1|1313785_1314553_+|3'(2'),5'-bisphosphate-nucleotidase-CysQ MMFDQILPSLIKLTTKVGDEILSHYKNDIKVEFKTDETPLTIADKNAHRAIAEALSKLTPNTPVLSEESTVVDFKERSKWTEYWLIDPLDGTKDFIERTGEFCICIAYIKNHRAIFGLVYAPITRVHYYGFEGVAYKYHQNIQTIINACMKKQPLRIVTGHHSSNNSKLKAHFATLGEYELNNLGSALKFCEIAQGHYDYYPRFGPCSEWDTAAGGCILQNAGGLVVDENGKPLRYNTQDSLLSPPFFASGKPKG >NZ_AP013042.1|WP_066045471.1|1311762_1313574_+|RNA-polymerase-sigma-factor-RpoD MKSTTKAHKQALQNLITVGKDKGYLTYAELNDMLPEDLLTQDQIEPIVSILEELDIIVSETVPDADTLVVESGAKAQSTSAEAATAALAALDSEFGRTTDPVRMYMREMGVVDLLEQEDEIRIAKEIEEGIFEIMQAITLYPSITDLFFKAHMRLEEGKCKMTDVIIGYQNDAQDFAKKKAAFDSGEFDDDDEYADMEEMEYTGPDEDQVYLRYDKILKAAKKYEDTNKEYGLHDKKTISTRTALAKNLSDLRLAPKLVSTMVDVVCERIAKVKKQEKIIQNACLYADMERKQFFDLFTDNETNFDWLKNAKLDKKVKDKLADSEDKIYYAQKNLKEYEEEMQLTIAELKAINKLYRRGDRRAKTAKAQMIEANLRLVISIAKKYANRGLQFLDLIQEGNVGLMKAVDKFEYRRGYKFSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMIETINKLNRVKRQLLQKYGREASPEELSVEMELPESKIIKILKIAKEPLSMETPVGDDEDSNIGDFIEDINLSSPVETTTKESLRETTGDLLANLSSREAKVLKMRFGIDMNTDHTLEEVGRQFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRAHKLASFLE >NZ_AP013042.1|WP_066045468.1|1310714_1311677_+|ribose-phosphate-pyrophosphokinase MSLDKIKIFSGNANPQLSGEIISNLNVIQGKALVSKFSDGEARVEILENVRGCDVFVLQPTCGPSPAETLMELLVIVDALKRSSASRITAVVPYLGYSRQDRRSRLTRVPITAKLAAKMIEAAGVDRILTVDLHADQIQGFFNIPIDNIYAQPVLIEDILAQNYKDIVVVSPDVGGVVRARAAAKRLNDADLAIIDKRRPEANVVEVMNVIGKVKGRTCVLIDDMVDTAGTLCQAAAILKERGAKKVVAYATHAVLSGKAIVNINNSELDELVATNTIPLSAPATNCKKIRQLSLAPKLAEVIKRISEEQSISTIFSDAK >NZ_AP013042.1|WP_066045465.1|1309508_1310342_+|4-(cytidine-5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol-kinase MSKTWLSPAKINLFLHINSKREDGYHNLQTIFQLLDYYDELTFEIRQDGVISRISGNETVPEAEDLIIRAAKALQKSTGTALGADISVLKKIPAGGGLGGGSSNAATTLLALNQLWNTKYSTKQLSEIGLSLGADVPIFIAGHSAWAEGVGEALTPICLPKHHFLVVCINKHISTKKIFSHKALTMTPIIGKIQPFSELINPHNDCLEAAIELEDEILEALTHLKLSENYLYEPRMTGTGCCVFVAFENEKDALVALRNVPRQWLGFVAKAIDTLPK >NZ_AP013042.1|WP_066045462.1|1308970_1309516_+|oligoribonuclease MSNKETNLIWIDLEMTGLLPESDVIIEIATIVTDKDLNILAEGPALAIHQSDVLLDKMDEWNTEHHTNSGLVKRVKESTTSTLQAEIKTIEFLQQWVDKGASPMCGNTICQDRRFLYNAMPKLEKFFHYRHIDVSTLKELIKRWKPEAALEREGESEHLALADIRESIRELKHYRKTFINV >NZ_AP013042.1|WP_066045459.1|1307950_1308970_+|anthranilate-phosphoribosyltransferase MNIQEAIKAVIAKQDLTQEQMHSVMSDIMTGKTEDAQIGGFLVGLSMKGETVAEITAAAKVMRSLATQVNLKNPKHLVDTCGTGGDGLGLFNISTACAFVVAAAGAQVAKHGNRSISSKSGSADVLEAAGVNLDMTPEEISKSVEKIGVGFMFAPAHHSAMKHAIGARKSLAVRTIFNVLGPLTNPAKAPHQVMGVYDKNLVEPIANVLKSLGSKQVMVVHSKDGLDEISIADDTFVAELKDGKVTTYTINPTDFGLPLGDLNDIKAEDAESSLLLIQNALDGTDGAAKNIVALNAGAAIYVSGVVDSLQAGVNKAMKILNSGVAHQKLDDFVKESTGC >NZ_AP013042.1|WP_066045457.1|1306730_1307954_+|aminopeptidase-P-N-terminal-domain-containing-protein MTNQHRQKKLLSQLKDGALVIIATNPEQTRNGDVHYPFRPHSDFWYLTGFTEPESVAVFSREGYTIFLREKDQKRQIWDGERLGVKSALEVLKADYAYSIDALKTQLPQLIKNATTVYYDFKPCKLDDDIMECLATTQTQSLGEYLHEMRLIKDDNEIALMQKAADISVETHQLAMQETAPKLFEYEIASIFDGNFRKYNAEHAYTPIVAGGKNACVLHYIQNNKVLNEGELLLIDAGCEVEGYASDITRTFPINGIFSGAQQQIYQLVLDAQLAAIAAIKPGVAITTPHNIATEIIQQGLIDLGILTKNGDVKQFYMHGTGHWLGMDVHDVGCYQQGKQDREYEIGMVTTVEPGIYIRKSDKINPIYWDIGVRIEDNILVIKGGNRVLTQALEKEIDDIEKIMETQ >NZ_AP013042.1|WP_083503001.1|1317690_1318932_-|diaminopimelate-decarboxylase MSFSYQNQTLHAESIAIMELMDAYGSPLYVYSRTDIENNWREFDQAFGAHPHLVCYAVKANSNIAVLNVLAKLGSGFDIVSIGELERVLKAGGEASKCVFSGVAKTVIEIERALEVGVRCFNVESESELDRINTVAKSIGKKAPISIRVNPNVDAKTHPYISTGLKENKFGVDIGEAIDLYKKANNADYLEVQGLDCHIGSQITDVSPFLDALDKVLALVWQLNDEGISIHHLDLGGGVGIDYDGEQTINIKAYIDAIINKVGQTEIILEPGRAIVGNAGIFVTKVEFLKQNSEHSFAIVDGAMNDLLRPSFYNAYHQVLPVNENATGTKAQWDLVGPICETGDFLAKNRDLSLSEGDYLALMSAGAYGFSMSSNYNSRPRVAEVMVSGENHQLVRKRESVQDLFAKERLYEG >NZ_AP013042.1|WP_066045491.1|1319087_1319753_-|leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein-transferase MIEIPPSFFLKSPSTPFPDASLALDEPNGLIAIGGDLSSERLISAYQQGIFPWYSDNEPVIWYSPNPRMIITPEALHIAKSLGKTLRSNQFEVRINADFDSVIRHCKSVIRKDQTGTWIDADMVRAYTELYHQGVVQSVEVYQNDVLVGGLYGVRMGRVFFGESMFSKVSNASKIAFVHLVKNMDYEMIDCQVESTHLKSLGAFNIPRDVFIQKLQKLLLK >NZ_AP013042.1|WP_066045495.1|1319749_1320295_-|ADP-compounds-hydrolase-NudE MKKKPIVTNIKNIATTKFFNIQSMDIEFSNGEKRQYERLKPDGDGAVLVIPMLDDDTVLMIYEYSGGTDRYELALTKGKIDAGESPIEAANRELIEEIGYGARQLSFVKTMTLAPGYQSNFTHIILAQDLYKDSAQGDEPEPLEVVKHKLSDLENLVYNEDLTEARTIAALYMAKEIIRNQ >NZ_AP013042.1|WP_066045498.1|1320313_1320580_-|thioredoxin-family-protein MIEVKVLGTGCANCKATQKLIEKVCSDNAIPISIEKIEDTAQIMSYGIMSTPGVVVDGKIAHAGGIPDAKTVLSWFKSQCCPTDNDCC >NZ_AP013042.1|WP_157059398.1|1320594_1321500_-|sulfurtransferase MRILISFILVLISQFALANRDFLIDSDWLSERIEDKNIRVLEVRYHPHRYFTIGHIPGAVQVQRFKDLGDNNANPIMRFPSKKAFEDTLRRWGINNDSTIVIYDDSGTALASRVYFLLELYGFNMNQVKILNGGSRAWNSFEDMTTETTRVSRGNVVLQEKNPNLFIEWQDVYGDVVSERDKNIVLLDARPHKMYTGEVIKHSILAGHIPGAINIVSMKGISAQEWIDEKGLIDLYAQIPKDKTIYVYCHDGFRMSLAYLQLKSLGYKHVKLYNGGWSHWGNRLTLPTVEDEAPYAGDYEL >NZ_AP013042.1|WP_066045504.1|1321517_1321769_-|hypothetical-protein MASFKPNYIIPGHRHITNLVEASKDTYDYLVFLRDEIRKVVANDDCIMIATNINQDKFNYLKILKALQEKMPNNVFLQLEFEN >NZ_AP013042.1|WP_066045508.1|1321864_1322278_-|arsenate-reductase-ArsC MHEKKYLILCTGNSCRSIIAEALLNYDLSYCVNAYSAGVAASGKVNPNAEKILKQNNMWSENYHSKAIETILGVKFDLVVTVCGNAQETCPTFPGKTEVIHIGFDDPDGQAFDVFKQTFMQIREKLVPVVSDKLCLS >NZ_AP013042.1|WP_066045511.1|1322277_1322493_-|DUF2892-domain-containing-protein MTINNAVNFMAGSVVTLGLALAHFNGTIDITNTSWLWLSAFVGLNLMQMAITGFCPAKFIFKLLGLKDTKG >NZ_AP013042.1|WP_066045514.1|1322495_1323833_-|hypothetical-protein MKKYYKNWILLILIVITGQSVIAIAAPDPLKDPKYCGSCHQRIYKEWSGSLMGKDLNNSIVYQFYTGTNPAGKKDGLGFQPLMHGKNGDCADCHVPELALEKHAKGEEVDLGIAMKQKLDHGISCNFCHSIADVHINKDKNGRYNTRIFETVTMDHSGVKYGPRADAKSLAHPTMKSDLIRDSKLCGTCHLNQEKFLSISQYDDWKKAYTSGKTNQTCQQCHMPILPGRHKLATVTGLNNPKRITRAHTFVGAHDTEMLKKALTLEVKPEVKNGKLIVNTTVENVGAGHKVPGSGPIRNVILKIEVTDVDGKILNYIGDKRGLLPPLAGFGNPKTKKRGPNDWAGKPGKMYAKVYKSKPIAKMGNRSMVGVGGFLADAVVFDTALKPREPDHAKFVYALPKNTKSIKIKARIVYRDAFKPLSDKKGWKLAQREMITVNKIFNLKE >NZ_AP013042.1|WP_066045517.1|1323881_1324568_-|hypothetical-protein MKKYLLGSILITLSISSIASDFACKVPVQSFGNIKKMTAGDFSPNVLFKDVKLSNTSVGYGPGADHQYELTIVNGVVYMARPGKDDEVMMRTILKEADGAAMLQIATPKAWKLYGEMDDIDSFNGLAFEMDDVVEEIECGENVLMPFKIIGYANSLTWSMDTENPRVVNSKNQSVEVVGLYNVNNKQKYFMVKGYNIHPHVLLTNLGEAGHLRNISLQAGAKLYLPQK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP013042_1 | 1.2|1076990|29|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder | 1076990-1077018 | 29 | NZ_AP013042.1 | 1372282-1372310 | 0 | 1.0 |
NZ_AP013042_1 | 1.2|1076990|29|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder | 1076990-1077018 | 29 | NZ_AP013042.1 | 1394063-1394091 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.2|1076990|29|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder matches to position: 1372282-1372310, mismatch: 0, identity: 1.0
ttcggcagtcgccttagtcggtggtggct CRISPR spacer ttcggcagtcgccttagtcggtggtggct Protospacer *****************************
2. spacer 1.2|1076990|29|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder matches to position: 1394063-1394091, mismatch: 0, identity: 1.0
ttcggcagtcgccttagtcggtggtggct CRISPR spacer ttcggcagtcgccttagtcggtggtggct Protospacer *****************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_AP013042_1 | 1.2|1076990|29|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder | 1076990-1077018 | 29 | NZ_CP034999 | Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23a, complete sequence | 608450-608478 | 7 | 0.759 |
NZ_AP013042_1 | 1.1|1076924|29|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder | 1076924-1076952 | 29 | NC_019760 | Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.02, complete sequence | 24629-24657 | 8 | 0.724 |
1. spacer 1.2|1076990|29|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034999 (Rhizobium acidisoli strain FH23 plasmid pRapFH23a, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
ttcggcagtcgccttagtcggtggtggct CRISPR spacer ggcaacagtcgccttagtcggaggtgctt Protospacer *..**************** **** .*
2. spacer 1.1|1076924|29|NZ_AP013042|CRISPRCasFinder matches to NC_019760 (Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.02, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
aaataaatatgtgcaaagacattctggct CRISPR spacer caataaagatgtgcaaagccattcacctg Protospacer ****** ********** ***** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
392238 : 400681
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP013042|392238:400681|DBSCAN-SWA TTTAGCGCATAGTAACCAATTCTTCTGCGCTTGATGGATGAATGGCAACGGTATCGTCAAATTGTTTTTTAGTTGCGCCTATCTTAATAGCCACTGCAAAACCTTGTAACATTTCATCCGCGCCATGACCGATGATATGACAACCGACTACTTTTTCATCATCGCCAGCACACACCAACTTAAGTGCAGTCGTGGTTTTATGATCCAATAGGGCATCTGCCATCGGCGTGAATTCTGATTGATAAATTTTAACTTTGTCAAATTTCTCATTTGCTTCTGCTTCGGTTAGTCCAATTGTGCCAATCGGTGGATGTGAAAACACCACAGTAGCAATATTGTTATAATCTAGGTGCCTATCTTTCATATCATTGTAAATCCTATCTGACAGTCTTCTACCTGCGGCAATGGCAACTGGCGTGAGTGGCGTGCGCCCAGTTGCATCACCAAGTGCAAAAATATTCTCCACATTGGTTGTTTGGAATTTATCTGTTGGAATAAAACCCCTTTGATTGCACGCAACGCCTGCATTTTCCAAACCTAAATGTTGTGTCATTGGGTTTCTGCCGACTGCCCAAATGATTTGCTCAAAGCCACCAAATTCACCGTGATTGGTAAAAATGGTTTTATCAACAGAGACTTTATCAATCGTAGTACCATGATGAATTTTAATACCATGTGCCGTGTAGTCTTTTTCCAATGCTGCTTGAATTATCGGGTCAAAGCCTCGTAACAAGGTATCTGCCCTGCCAAAAATCTCAACCTCACTACCAAGTGCATTTAGCACACCCGCCAATTCAACACCGATATAGCCACCACCAATCACCGCAACTTTCTTAGGCAATGCTTCTAATTCAAAAAACCCATCAGAAGTAATACCGTATTCTGCGCCTTCAATGTGCGGCACCGCTGGTTCACCACCAGGCGATAAAACGATATAATCGGCACTGTAATTTTTACCATTCACAGATACGGTATTTTTATCTACCAACTTGCCGAAGCCATGAATGTAATCAATGCCCAATTTTTCTAAATATCCATCGTACCAAGTGGTAATACCATTAATGTAGTTATCTCTTGCTGTTTTTAACGCTTTCCAATCAAAGTTTTTCAGCTCAACATCAAACCCAAACCCCTTGGCGCTGTTAATCTGTGTTGCTGTATTGGCCGCAAACCACATTACTTTTTTAGGCACACAGCCGACATTCACGCAAGTACCACCAATGGTTTTAACCTCAATCACCAAACATTTTTTGCCGTATTCTGCTGCGCGTTCTACCGCTGATAGTCCACCAGAACCCGCACCAATTGCAATCATATCATAATGTTTTTTCATTTTTTTCTCCTAAAAAAAAGGGCTTTCGCCCTTATTTGAATTCATTCAAGAAATTAATGCGCAATCGGTTTGTCGGTAAATAAATAATCTTTTAGTTCTTTGTCAAAAGCCTTATCCTTGCGTCTAATCCACTCTAGCACCATTGCGGCATGTTCTTTTTCTTCATCACGATTATGTGCCAAAATTGTCGATAATTCGCTGTCTTGACACGCATCAATACGCTGATTATACCAATCAATTGCCTCTAATTCTTCCATTAAAGAGACAATTGCTTTGTGCATATCTTTGGTTTCTTAGGTTAAGTTTTTCTCAGCTTCGTGATAGCCTTCATTTGCCATGATTATTCTCCTTTAAAATATTGTTCTAATTCATCAGCGCCGCCAATATATTTACCACCGATAAATATTTGTGGTGTGGTACTTTTTCCACTCACTGCGTTTAATGAACGAGAGGTGATACCTTTGCCAAGCTCTATTATTTCAACATAAATTTTGTGTTTTTCTAATAAGTCTATCGCTCTTTTGCAATGTGGACAGCCTTTGCGAGAAAACAAGGTAGCTGTTTTTGGCACAATTGCATTAGGGTTGATGTAATTTAGCATTGTATCAGCATCAGATACCTCAAATGGGTCGCCTTCTACCTCTGGTTCAATAAACATTTTTTCAATAATACCATTTTTAATCAACATAGAATAACGCCACGACCTTTTGCCAAAGCCTAAATGATTTTTATCTATCAACATTCCCATACCATCGGTAAATTCGCCATTGCCATCGGGAAGCATGGTAATGTTTTCAGCCTCTTGATCTTTTTTCCATTCATTCATTACAAAAGTATCATTAACCGATATGCAAACAATTTCATCCACACCATTTTCTTTAAAAATAGGGGCTAATTCATTAAAACGCGGCAAGTGTGAAGAGGAGCAAGTGGGTGTGTAGGCGCCAGGTAGTGAAAATACAATAACCGTTTTATTATTAAAAATATCATCACTTGTAATATCTACCCACTGATGATTGCGCTGTGTTTTAAAAGTGACACTAGGCACTTTATTTGCTGTTTTATCTTCTAACATGATTACTCCTTATTGATTAAAATGTTATTTTAGATAGAATTAATTATTAAGTAAAACGAAAAATATTGATTATAATGATTGATAAAAACGATTATCAATATTTATGCTACCTTCACTTAAAAATTTAACATACCTTTTAGCGCTTAAAAAGCACCTGCATTTTTCCAAGGCTGCAAAGGCTTGTTTTGTGAGTCAATCAACCCTAAGTGCCGGCATCAATAAATTAGAACAAGACTTAAATGTGCAATTAGTTGAGCGAACCAATAAATATGTTTTATTTACACCAATAGGCGTAAGGATTGCTAAATATGCTCAAGATGTAATGTTTTCAATGCAAGATTTGATCGGGGTGGCTGATTTAGATTTTTTTAACTCAACCATTAAAATTGGCATCATTCCAACCATTGCCGCTTATTTGTTGCCAGAATTTGTCGCCAAGGTCAAACAAAACTATCCAAAACTTAAATTAGTTATTATTGAAGATACCAGTGCCAATCTTTTATTGAAAGTTGCACAATTAGAAATAGATTTTGCGATTTTTGCATTTCCATTTGAAGAAAGAGAAAATATCATTCAAAAGCGAATTTTTGAAGATAAATTGTATTTGGTTAAACACCAAAATGGTCAAAATAATGAATTATTGTTATTAGAACAAGGGCATTGTTTAAGAAGTCATATCTTAGATAATGACAATATTGATAAAACAAAAGTCTCAGAATATACTTGTGCCAGTTTAGAAACTTTAGTGATTATGATTAACATGGAAATTGGGGTAAGTTTTTTACCAAAAATTGTTATAGATAGTGGAATTTTAGATAAATATCCAGAGCTGATTATTGACAAAAACCAAGTGGTATTATCTCGTGATATTGGTATTATTTATCGTAAAAATACGCCTAATGAAGATGGAATTTTGACATTAAGTTTATTTTTAAGGTGAATGCTTTTTTACTTACTTATCGATATTTTTTTATCAAAGCCGATAAAATGATATAACTTTCTAAGTCCATTACACCGTTTACTTTATTAGGTCTAAAATGTCTTTGAAAGGCAGATATAATAGAGCGATATAACTCAGGGTCATTCGGGGCAGCGCTAAAACTATAGCCATATTTTATTAAAGATTGTTTGACTATTTCCTTATCAGGGACAGATTTAAGCCTGTGGGTAAAATATTCAATATCAGATTTATCATACCAAGCAGAAAGTCCGTTTTTAGCCAATTTTTTCCATGGGAACAATGTTCCAGGATCTATTTTTCTACTGGGGGCAATGTCGGAGTGACCAATGATATTGATATCTTTAATAGCATAGCGCTGTTTGATTTGCTTAACTAAAAATATCAGCGCCTCAATTTGTTGCTGAGTAAAGGGGTATAGATTACCATCTTTATTGACAATCTCTATGCCAATAGAGGAGTTGTTTAAATCTGAATCTGAGCCCCACGCACTAACGCCCGCATGCCAACTGCGTTTAGATTCTGGCACCAGTTGATAGATAATATCAGGATATTTTTTACTTATTGCATTATTGATCAAATAATGAGAGCTGACTGCTCTATGCACATCCTTGCCAAGTAATTCTTCAAATGACCTTTCAGTATCAGCAACTGTATAATGAATAATAATTTGCCTTATTCTTGAATTGAAATTATCAGATTTGTATTCTTTATTGATAACAAAGTTTTGGGCGTTTGTCATATTTAAAATAGAAGATAATAAAGTGAAAGTGGTTATTTTAAATAAATATTTCATTAATTTTTTTTAAACAATTAATGATAATTATAACTAATTTCTTTTGAGATAGGATTTTTATTATAACCCTGCTTTTAAACTTACCTTGATAAATTGATCTAAATTGCCATCTAATACATCCCTTGTATTGCTGCTTTCAAAACCTGTGCGTAAATCTTTAATGCGCGATTGGTCTAATACATACGAGCGGATTTGACGCCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTGTCTTCCAGTTCTTGATTTTCGCTGTTGCGTTTTTGTATTTCTAATTCGTAAAGTTTGGATTTAAGTTGTTTCATCGCCTGATCTTTGTTGGCGTGTTGTGAGCGACCGTCTTGACATTGCACCACAGTGTTGGTGGGCAAGTGGGTAATGCGTACGGCTGACTCTGTCTTGTTGACATGTTGCCCACCTGCGCCACTAGCGCGGTAGGTGTCGATGCGAATATCAGTTTTGTTGATGTCAATATTAATGTTGTCGTCTATTTCAGGAGAAACGAAAACTGAGCAAAAAGAGGTGTGGCGTTTGCCGTTGGCATTAAAGGGTGATTTTCTGACCAAGCGATGAATACCGATTTCACTACGCAACCAGCCGTAAGCATAGTCACCTTCAAAGTGAATGGTGGCAGATTTGATGCCTGCCACTTCGCCTGCGGAGGCTTCCATTAATTTCACTTTGAAATCGTGTTTTTCACCCCAACGCAAATACATTCGTAATACCATCTCTGCCCAGTCCTGGGCTTCGGTGCCACCTGAGCCCGATTGAACATCAAGATAAGCAGAATTGGCGTCTAATTTACCATTGAACATTCTTTGGAATTCCAAGCGCTCAATTGCAGTTTCGCAGGTTTGTAAATCAATCATGAGGCTATTAGCGGTATCCTCATCATTTTCAGATTGTGCCATATCTAAGAGTTCTGTTGCATCTTCTAAAACCGCATTAGATTGGTCGAATACTGTGCATATATTTTCTAAGATGGATTTTTCCTTGCCTAATGCTAAAGCAATTTCTTGATTAGACCAAACATCGGGATTTTCCATTTCCAATAGCACTTCTTCAAGACGAGCGCGTTTTTCTTCTAAATTAAGGTGCTGTGATAGCGCGATAGAACGCTGAATTAAGTCGTCAATTTTTTGATAAGTGGGCGAGAGTTCCATAATGGGTATTTTATTCTTTTAAAAACAAAAAAGCCCCAAAAAATGGGGCTTTTTTTTATTTCTGTTTAGATAGTTATTTTCTAAGACCTAAGCGAGAAATTAAATCTGAATAAGCAGGAACATCATTACTTCTAAGGTAAGTCAATAACTTTTTACGCTGAGAAACTAAACGCAAAAGACCTCTTCTTGAGTGATGGTCTTTTTTATGTGTCTTAAAATGCTCAGTTAAATGCTTGATGCGTGCTGTTAATAAAGCGACTTGAACATTGGTTGAACCGGTATCGCCTTCTGCGGTTTGGTATTCTTTGATGATTGCTTGTGTATCAATTGACATAATTATGTTATCTATTGGATGAAAATATAAAAAGAGCAATTATACGCTAATTGGATTTTATTTGCCAATCTTTTAGTAAAAAATCTCTTCGCCTTTTGGGCGGCTTTTAAAACGACGGTGAATCCATAGGTATTGCTCGGGCGTTGTGAGGATTTGTCGCTCTAGTATTTTATTAGTAAGCGTGGCATTTTGCTGTGCATCTGCTGATGGATACACTTCCAGCGGGGGGGAAAAATTTAGTTTATAGCCTAGTTCTATGCGTGTGAATGCCAGTGGGATAACCACCGTGTTATCGATATTTGCTAATTTTGCAGTGGCTTTAATGGTGGCAGTTTCTACGCCAAAGAAGGGTGCAAAAACTGAGTTTTTTACACCTAAGTCCTGGTCGGGCGCGTACCAAATTGGTAATCCTGATTTTAAGGTTTTAATGAGGGACCTTGAATCTTTAGTCTTAACCATTATTGCACCATGTTTGATAAATTGCTTGGTCATTTCTGCGTCAAATAGCGCATTATTTTGTGGTCGATAGATATCGGCAAATTTAAAATTTTGTAACAAAATCCTACCTGCCAACATCATCGTCGTAAAATGCCCAACCAATAAAATGACATTTTTTTTCTGCGCTATGGCGTCTTCCAAAATATCGATATTGCTGATACTATAAATTTTTCTAAGTGCGGAATCTGCTAAATAAAAACAATTGGCGGATTCGAAAAAAGCAATACCAAGCGACTCAAAATGTTGCCTTGCTAGTTGCTCAACTTCGGATTTGCTTTTATGTGGAAAGCACTTGGCAATATTTACCAGTGCAATGCGTCTAAATTTGCTCAATATTCGATATAAAACACGCCCCATGGATTTGCCCATAGAGATTTGTGTCTTAATCGGCAGTCTTGCCCCTAATTTCATTAAAGCAATTAAAATCCAAGTTGGGATAAATTTAGGATGATAAAAATTCTGTTTTGTCATTAAAATGTGTTCTTATATATGCCTTACATTAGTGAAAATTTTCTTAATGATTTACCCAATCAAATCGACATTGTAGATTTGATTGGCAAACGCTTGACGCTCAAAAAATCAGGCAGTGGTTATCGTGCACCTTGCCCATTTCACGGAGGCAAAAATCCAAACCTTGCTGTGAATGCACAGGAGCAATTTTATCACTGTTTTAAATGTGGCGAGAGTGGCAATGCAATTAGTTTTATCCAAAAATACGAAAACGCATCGTTTGTCGAAGCCGTAGAAACCATTGCTAGCGAATTTGGATTGACAATTATATATGATAAAAACACTACACCTATTGACCCCAGTTTAGAGCGTTATCGTTTGCTATCTGAAAAAGTCGGCGAATTTTATCGGCAACAATTAAAGACCTCTCCCGCCAAAGCCAAAGCGGTTAATTATGCAAAAAAACGCGGTATCAGTAGTGAAATTGCCAAGCGTTTTGCTTTGGGTTTTGCCACGCCAGGCAACAAAGATTTATTAACCCATTTTGAAAAAACCGAGCAAGATGTTATTGATTTAAAAGCCTTGGGTTTAATCAAAACAGGCGAATACGGCGACTACGATTTTTTCCGTGACCGTTTAATGTTCCCAATTCACAATAGCAAAGGCTATGTTGTTGCTTTTGGCGGACGAGCGTTTGACAAAAATGCCAAAGCAAAATACCTTAATTCTCAAGAAAGCCCTATCTTTTTCAAATCAAAAGAACTCTACGGACTGCATCATGCACGCAAATTCTCACGCACAATGGACTATATCTTGGTGGTTGAAGGTTATATGGATGTGGTTGCATTACATCAAGCAGGTATCACCAAAGTGGTGGCAACTTTAGGCACAGCAACTACCCCAGAGCATTTGCAAACATTAATGCGCACCACCAAAACCATTGTCTTTTGCTTTGACGGTGATGATGCAGGTCGCGCTGCGGCGTGGAAGGCACTTAAAATCACTTTGCCAATGATCAAAGCAGGTTTATTAATTAAATTTTTATTTCTACCCGACGGCGAAGACCCAGATACTTTGGTTAAAAAAGAATCAGCGCTTTCTTTTGAAAAACGCATTGAAAAAGCACAACCCCTTTCAAGGTTTTTATTTGAACACACCAAAAAAGAAGTCGATTTTAACAGCATTGAAGGCAAGACTTTATTCTTAGAAAAAGTCTCAGTATTGATTGCACAAGTAACCTATGATGTTTATCAACAACAATTGATTGATGGCGTTGCAAACGAAGTTGGGCAAAGCGTCAAACAAGTCCAAACTATTTTTGACAGACGAACAGAAACCTTGCAAGTACAAGCCCTGCAAGCCCCACTTGAAATGAATGATGAATCTGCAATACCAGACTACGAAATTGACCATCACACCGATTTTGTTCCTGCTAAAAAAGAAAATAACGCCACTAAAACCTTAATGTCAAAGATGATTAGCCTGTTTCTCAATTATCCGTCATTGGCGGATAGTACCGTCGAAGTTAGAGTGCGTAATATTGATAAATCAGAAGTATTATTAGAATTAATCCATTCTGCAGAAATTGACGAAGATATCACTCAAGAGGACCTTATTAAACCCTTTAAACCCAAGTCTGGCGTCTATAAGCGCCTACAGGAACTCTGCACTCTCACGCCGCACTTAAGCGAAAACCAAGCCCGTGATGAATTTCAATCCGCCCTAAACGCCGCTGAGAAATTTCAAGAAAGCACTAAAGTAAAAAATTTAATTTCAAGTGCCAACACTCTAGAGGCGCAACGAAAAGTGATGGAAGGCATTCAGAAAAGTAAGGTTAAAAAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_AP013042|392238:400681|392238_393570_-|WP_066043481.1|DBSCAN-SWA MKKHYDMIAIGAGSGGLSAVERAAEYGKKCLVIEVKTIGGTCVNVGCVPKKVMWFAANTATQINSAKGFGFDVELKNFDWKALKTARDNYINGITTWYDGYLEKLGIDYIHGFGKLVDKNTVSVNGKNYSADYIVLSPGGEPAVPHIEGAEYGITSDGFFELEALPKKVAVIGGGYIGVELAGVLNALGSEVEIFGRADTLLRGFDPIIQAALEKDYTAHGIKIHHGTTIDKVSVDKTIFTNHGEFGGFEQIIWAVGRNPMTQHLGLENAGVACNQRGFIPTDKFQTTNVENIFALGDATGRTPLTPVAIAAGRRLSDRIYNDMKDRHLDYNNIATVVFSHPPIGTIGLTEAEANEKFDKVKIYQSEFTPMADALLDHKTTTALKLVCAGDDEKVVGCHIIGHGADEMLQGFAVAIKIGATKKQFDDTVAIHPSSAEELVTMR >NZ_AP013042|392238:400681|396459_397554_-|WP_083502953.1|DBSCAN-SWA MELSPTYQKIDDLIQRSIALSQHLNLEEKRARLEEVLLEMENPDVWSNQEIALALGKEKSILENICTVFDQSNAVLEDATELLDMAQSENDEDTANSLMIDLQTCETAIERLEFQRMFNGKLDANSAYLDVQSGSGGTEAQDWAEMVLRMYLRWGEKHDFKVKLMEASAGEVAGIKSATIHFEGDYAYGWLRSEIGIHRLVRKSPFNANGKRHTSFCSVFVSPEIDDNINIDINKTDIRIDTYRASGAGGQHVNKTESAVRITHLPTNTVVQCQDGRSQHANKDQAMKQLKSKLYELEIQKRNSENQELEDNKSDIGWGRQIRSYVLDQSRIKDLRTGFESSNTRDVLDGNLDQFIKVSLKAGL >NZ_AP013042|392238:400681|397960_398857_-|WP_066043492.1|DBSCAN-SWA MTKQNFYHPKFIPTWILIALMKLGARLPIKTQISMGKSMGRVLYRILSKFRRIALVNIAKCFPHKSKSEVEQLARQHFESLGIAFFESANCFYLADSALRKIYSISNIDILEDAIAQKKNVILLVGHFTTMMLAGRILLQNFKFADIYRPQNNALFDAEMTKQFIKHGAIMVKTKDSRSLIKTLKSGLPIWYAPDQDLGVKNSVFAPFFGVETATIKATAKLANIDNTVVIPLAFTRIELGYKLNFSPPLEVYPSADAQQNATLTNKILERQILTTPEQYLWIHRRFKSRPKGEEIFY >NZ_AP013042|392238:400681|398875_400681_+|WP_066043494.1|DBSCAN-SWA MPYISENFLNDLPNQIDIVDLIGKRLTLKKSGSGYRAPCPFHGGKNPNLAVNAQEQFYHCFKCGESGNAISFIQKYENASFVEAVETIASEFGLTIIYDKNTTPIDPSLERYRLLSEKVGEFYRQQLKTSPAKAKAVNYAKKRGISSEIAKRFALGFATPGNKDLLTHFEKTEQDVIDLKALGLIKTGEYGDYDFFRDRLMFPIHNSKGYVVAFGGRAFDKNAKAKYLNSQESPIFFKSKELYGLHHARKFSRTMDYILVVEGYMDVVALHQAGITKVVATLGTATTPEHLQTLMRTTKTIVFCFDGDDAGRAAAWKALKITLPMIKAGLLIKFLFLPDGEDPDTLVKKESALSFEKRIEKAQPLSRFLFEHTKKEVDFNSIEGKTLFLEKVSVLIAQVTYDVYQQQLIDGVANEVGQSVKQVQTIFDRRTETLQVQALQAPLEMNDESAIPDYEIDHHTDFVPAKKENNATKTLMSKMISLFLNYPSLADSTVEVRVRNIDKSEVLLELIHSAEIDEDITQEDLIKPFKPKSGVYKRLQELCTLTPHLSENQARDEFQSALNAAEKFQESTKVKNLISSANTLEAQRKVMEGIQKSKVKK >NZ_AP013042|392238:400681|395601_396399_-|WP_070104546.1|DBSCAN-SWA MKYLFKITTFTLLSSILNMTNAQNFVINKEYKSDNFNSRIRQIIIHYTVADTERSFEELLGKDVHRAVSSHYLINNAISKKYPDIIYQLVPESKRSWHAGVSAWGSDSDLNNSSIGIEIVNKDGNLYPFTQQQIEALIFLVKQIKQRYAIKDINIIGHSDIAPSRKIDPGTLFPWKKLAKNGLSAWYDKSDIEYFTHRLKSVPDKEIVKQSLIKYGYSFSAAPNDPELYRSIISAFQRHFRPNKVNGVMDLESYIILSALIKKYR >NZ_AP013042|392238:400681|397627_397894_-|WP_173636500.1|DBSCAN-SWA MIMSIDTQAIIKEYQTAEGDTGSTNVQVALLTARIKHLTEHFKTHKKDHHSRRGLLRLVSQRKKLLTYLRSNDVPAYSDLISRLGLRK >NZ_AP013042|392238:400681|394748_395585_+|WP_066043486.1|DBSCAN-SWA MLPSLKNLTYLLALKKHLHFSKAAKACFVSQSTLSAGINKLEQDLNVQLVERTNKYVLFTPIGVRIAKYAQDVMFSMQDLIGVADLDFFNSTIKIGIIPTIAAYLLPEFVAKVKQNYPKLKLVIIEDTSANLLLKVAQLEIDFAIFAFPFEERENIIQKRIFEDKLYLVKHQNGQNNELLLLEQGHCLRSHILDNDNIDKTKVSEYTCASLETLVIMINMEIGVSFLPKIVIDSGILDKYPELIIDKNQVVLSRDIGIIYRKNTPNEDGILTLSLFLR >NZ_AP013042|392238:400681|393910_394645_-|WP_066043483.1|DBSCAN-SWA MLEDKTANKVPSVTFKTQRNHQWVDITSDDIFNNKTVIVFSLPGAYTPTCSSSHLPRFNELAPIFKENGVDEIVCISVNDTFVMNEWKKDQEAENITMLPDGNGEFTDGMGMLIDKNHLGFGKRSWRYSMLIKNGIIEKMFIEPEVEGDPFEVSDADTMLNYINPNAIVPKTATLFSRKGCPHCKRAIDLLEKHKIYVEIIELGKGITSRSLNAVSGKSTTPQIFIGGKYIGGADELEQYFKGE |
8 | Erysipelothrix_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
862995 : 881560
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP013042|862995:881560|DBSCAN-SWA TATGGCAAATTTATTCGTCATTGCGGCGCCATCAGGCTGCGGGAAAACTTCTTTGGTTAAAGCCTTGATTGCGCAAACAGATGACCTATGCGTTTCTGTCTCACATACCACACGCAATGCGCGCCCTGGTGAAATTCACGGGGAAAATTATTTCTTTGTCTCTAAAGAAGCGTTTGACAAAATCAACAAAGAAAATGGTTTTATTGAGTCAGCACAAGTGTTTGATAACTACTATGGCAGTGCTAAAAAAACGGTTGAAGATTTATTAGCAGATGACAAGGATGTGATTTTAGAGATTGACTGGCAAGGTGCTAGACAAGTTAAAAAGAGTTTTCCAGAGGTGGTCAGTATTTTTATCGTCCCCCCTTCTATTGAAGCCCTTAGAGAACGATTAACGGGTAGAGGACAGGATGATTCTAGTATTATTGAGCGTAGAATGCGTGATGCTGTCAGTGAAACTCAACATTACGATGAATTCGATTACTTGGTGATAAATAATGATTTTGAAACTGCCTTACAGGATATATTAACCATTATTCATGCTCAAAAATTCAACATCAAGCAACAGTCAAATAGACACCAGGCGCTACTTAAAACCCTTATTAAATAACGCCATTATGAGTAAAGATCTGACAACGCCTACCGTTCAAACTTCTCAAGACTTAACGGTTCAGAAATACCCACCCATTTTGTCAGCAGCAGAAGAGCACGACCTGGCAGTTGACTTGTTTGAAAACCACAATTTAGAAGCAGCAAGAAAATTAGTCTTATCACATATGCGTTTTGTAGCATTCATTGCCCACGGCTATAAGGGCTATGGACTTGAGCAAGATGACTTAATTCAAGAGGGCACCATTGGACTAATGAAGGCGGTTAAAAAGTTTAACCCTAATCGTAATGTACGCCTCGCTTCTTATGCGGTGTATTGGATTCGTGCAGAAATCCACGAATTTATCTTTAAGAATTGGAAAATTGTCAAAGTTGCCACTACCAAAGAGCAACGCAAGTTATTTTTTAAGTTAAAAAAAGCCAAAGCCAATATTTACACCTCACTAAATACAGAACAAGCTAAAGAGATTGCCAACGACCTTGGTGTACGCCCAAAAGATGTTTTAGAGATGGAATCGCGCTTACAGTTTAATGATGTGGCATTTGAAGTGACAGATGAAGAAGAAAGCACTTCTCCGGTACATTATTTAACCGATGAAAACACCCGAAGCCCTGAACAATTGGCACTCAGTGACGACTCGCAAAAGCATCATCAACAACAGCTTTATACGGCACTCTCTTCACTTGATGAAAGAAGTTTGGATATTTTACAGTCTAGGTACTTGAAAGAAGAGAAAACGACCTTACATACTTTAGCGAAGAGATACAATATTTCTGCTGAAAGAGTTAGACAACTTGAAAACAAAGCAATGCAGAAGTTAAAAAACTCAATGGATAAACAAAATTAATTACATTAAATAGGAGAAAAAAATGAATATTCGCCCCCTTCACGACCGTGTGGTCGTCCGTAGATCAGAAGAAGAGCAAACCACAGCAAGTGGCTTAATTATTCCTGGTTCAGCAGCCGAAAAACCTTCCGAAGGTATTGTCGTTGCCGTTGGCAGTGGCAGAAAAACGGATGCAGGTGAGATTATCGCCTTAGAAGTTAAAGTTAGTGACAAAGTATTGTTCGGTCAGTTTGCTGGCACAGAAATCAGCGCTGATAATGAAACCCTATTGGTAATGAGCGAAAGCGATATTGTTGCCGTTGTTGAATAAAGGAGAATAAAATGAGTGCAAAAGACATAGAATTTGGAATTGATGCAAGAAATTTAATGCTAAATGGTGTTAATATTTTAGCAGATGCAGTAAAAGTAACCCTGGGACCTAAAGGTCGTAATGTGGTTTTAGATCGTTCATTCGGCGCCCCGACCATCACCAAGGACGGTGTTTCAGTTGCCCAAGAAATTGAACTTGAGAACAAGTTTGAAAATATGGGTGCGCAAATGGTCAAAGAGGTTGCCTCTAAAACCAACGATATCGCAGGTGATGGTACAACAACAGCAACTGTTTTGGCGCAATCTTTGATTACCGAGGGTGTTAAAGCCGTTTCTGCGGGTATGAATCCAATGGATCTTAAACGCGGCATTGATAAAGCTACAGAGGTTGCAGTTAAAGCCTTGCGTGAACTTTCACAACCTTGTGATGACACAAAATCAATTGCGCAAGTCGGTACAATTTCTGCAAATTCTGACACTTCTGTTGGTGATATTATTGCCGAAGCAATGAATAAAGTAGGCAAAGAAGGCGTGATTACAGTTGAAGAAGGTTCAGGTCTTGATAACGAATTAGATGTGGTTGAAGGTATGCAATTTGAGCGTGGCTATTTGTCGCCTTATTTTGTCAACAATCAAGACAATATGAGTGCTGATTTGGATCAGCCATTAATTTTGTTAAATGAATCAAAAATCTCAAATATTCGTGATTTATTGCCAGCATTAGAAATCGTACAGAAATCAGGTCGACCATTGCTGGTTATTGCTGAAGACATTGAAGGTGAGGCATTAGCAACTTTGGTGGTTAATAATATGCGTGGCATTGTTAAAGTCGTGGCGGTTAAATCACCTGGCTTTGGCGACCGTCGTAAAGCAATCTTACAAGACCTTGCAGTATTAACAGGTGGTGTGGTAATTTCAGAAGAAATCGGCTTGTCATTAGAGACCATTACCGAAGACCAATTAGGCTATGCTAAGCGTATTGAAGTCGGCAAAGACGAGACTATCGTGGTTGATGGTGCGGGCACAAAAGAGCAAATTGATGGTCGTGTTAAGCAAATCAAAGCACAATTAGAACAGACAACTTCTGAATACGACCAAGAGAAGTTATCAGAGCGATTGGCTAAATTATCAGGCGGCGTTGCTGTGATTAAAGTCGGTGCTGCAACCGAAGTTGAGATGAAAGAAAAGAAAGACCGTGTTGATGACGCACTACACGCAACCCGTGCCGCCGTACAAGAAGGTGTGGTTCCGGGTGGTGGTGTTGCGTTAGTTCGTGCGATTAAAGCATTAGACAAACTTACAAGCGACAACCATGACCAAGGTGTTGGTATTAACATCACTAAACGCGCAATGGAAGCCCCACTTAGGCAAATCGTTGCAAATGGTGGTGGCGAGCCTTCTGTTGTGCTTAATGAAGTATTAAACAGCAAAGGCAATCACGGCTACAACGCCGGCACAGAAGAGTATGGTGATATGTTGAAAATGGGTATCCTTGACCCAACCAAAGTAACCCGCGCTGCCTTACAACATGCGGCGAGCATTTCTGGTTTAATGATTACCACTGAAGCAATGATTACTGATGCACCGCAAGCAGCCGGTGTGCCGGCTGGTGATGCAGGAATGGGTGGTGGAATGCCAGGCATGATGTAGTAAAATAACAGTTAATTTTATTAGCTAATTAAAAAAAAAGCCTCGTTTACGCGAGGCTTTTTTTGGTATGATACTTCGCAAAATATTATTGAGTATTAATAAATAAAGTATGGGCAACTACGACTCCTCCTCCATTGAAGTATTATCAGGCTTAGACCCAGTTCGTAAGCGACCAGGGATGTACACGGAAACCGAACGACCTAATCATTTGGCGCAGGAAGTGATTGACAACAGTGTTGATGAGGCAGTGGCTGGACATGCAACGAAAATCAATGTGGTGCTTTATAAGGACGGCTCTATCTCTGTGGAAGACGATGGTCGTGGTATGCCGGTTGATATTCATCTTGAAGAAGGGATTTCTGGTGTTGAGGTAATTCTTACTAAGTTACATGCAGGCGGTAAGTTCTCAAATGATTCTTATCAGTTCTCTGGCGGTTTACATGGGGTTGGTATCTCTGTAGTTAACGCCCTATCGACCTTAGTGGAGATTTGGATTAAACGCAACTCTAAAGAGCATTACATTGCTTTTTCTGATGGTAATGTCAAAACCCCGCTTGTAGAAGTAGGTACAGTTGGTAAGTACAACACAGGGACTAAAGTTAAATTCATTCCAGATCCACAGTTTTTTGATACGGCTAAATTTTCTACCACCAAACTCAGACATAACTTGCGCTCAAAAGCAGTGTTGTGCCCTGGGTTAGAGGTTAATTTTTATAATGAAGTTGATGACACAACCGACAGTTGGAAATACAAAGAAGGTTTAAAAGATTATTTGTCAGTTTCACTCGATGGCCTGGATTGCTTGCCAGAAGTACCATTCGTAGTTACGCATGAATCGGATGAGGCACAAATGCATTGCTCGTTGTCATGGACAGAATATAACACCAATATTATTGGCGAAAGTTATGTTAACCTCATTCCCACTTCACAGGGCGGTACACATGTTAATGGCTTACGCTCTGGCTTGACAGATGCTTTAAAAGAATTTTGTGAATTTAGAAGTTTGTTACCAAAGAATGTTAAGTTAACACCGGACGATGTCTGGCAAAAAATTGCCTACGTATTATCCATTAAAATATTAGACCCGCAATTTTCAGGACAGACCAAAGAAAGGTTATCCTCAAGAGAATGTGCTAGTTTCGTTACCAATGTGGTGAAAGATGCCTTTAGCCTTTGGCTGAACCAACATACCTCAATTGCAGAAAAAATTGCCGAATTGGCAATTATGAACGCCCAGTCACGACTCAAAACAGGTAAAAAGGTTATTCGTAAAAAAATTGTCAGCGGTCCAGCCCTGCCAGGTAAGTTATCTGATTGTACTAGTCATGACCTTAGCCAAACTGAGGTTTTTTTGGTGGAAGGTGATTCTGCTGGAGGCTCTGCCAAGCAGGCCCGTGATAAAGAATATCAGGCGATTTTGCCATTAAGAGGTAAAATTTTGAACACCTGGGAAGTAGATTCTGACCAAGTATTGGCGAGCAATGAAATCCACGACATTAGTGTTGCCATTGGTCTAGAACCAAACTGCGAAGACCTATCAGGATTACGCTACGGTAAGATTTGTATCTTGGCAGATGCAGATTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_AP013042|862995:881560|879096_879609_-|WP_066044612.1|DBSCAN-SWA MQNYFELFSLEVGFDLDVNALEGAYLAKISEHHPDKFVTKSDKEQSIALQNTSLINTAFNTLKSPLLRATYLLELQNINAFDEKDTQMDMDFLMSQIALRESLEDIEKSKDVLQLDDFTEDIDSKVRENICQIQSSFKNNNINKIKNLVRELKFYTQLNAQANRLMDEWL >NZ_AP013042|862995:881560|875332_876403_+|WP_066044605.1|DBSCAN-SWA MADLTQDSIENILEGVTDKYTEQGIVADSIEIDGGKAIINILLSYPAQSYHQELSEAITSALSGKGISDVTVNIDTKIAKYATQKGVDVLSEVKNIIAIASGKGGVGKSTTAVNLALALQAEGAKVAILDADIYGPSQPRMLGVSKLKPETTGEGKLLPILGHGMQSMSIGYLVDEDNPMIWRGPMVTQALEQMLRDTLWRGVDYMIIDLPPGTGDTQLTLSQKIPVSGSVIVTTPQDIALLDAKKGLKMFEKVNIPILGIVENMSLHICSECGHEEAIFGTGGGKSMAKDANVNFLGALPLEIDIRTDVDEGTPTVAKNPEGRVAQIYKEIAKKVAAKLTLQDKALGAFPSITIE >NZ_AP013042|862995:881560|877245_879093_-|WP_066044611.1|DBSCAN-SWA 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MNLTPNFKPKDIVETIRVLIEEGLKVVELTTKGKTWAEVIESMDMFEFKLGQQANVNSHLNAVLFSEEFNEEYEKTLPLITNFYTEVSSNQALYQAYKNLLDTNLNEQQAYIIKESIKGFELSGVGLEGQVSKRFKAIKERLSILNNQFSKNSLLATNEWKKVVTKEDLAGYDDVSLAKVKTDNGYEISLQAPIYIDVMTYADNRALREEIYKAYVSRASEVGITDKSFDNRAIMDEILSLRQEMAGILGFSNYAEYSIAAKMVESESQVIDFLEDLVARSKPQAEQELAELKTFSGMKLMPWDLSYYAEKLKEKKFGFKKSDLTPYFPEQQVLKGLFATIENLYQVSIILVKENSYHSDVRVLDISNAAGLVGRVYLDIYARKGKRGGAWMADYQPLMGDNKPIAFVVCNFNSPTKDKPALFEFDEIVTLFHEFGHALHHLLTKVKYPSAAGISGVPWDGVELPSQYMEFFCYEKSVVKLLSKHWKTAESLPDKLYGKLIDAKNFQSALGMLRQCEFSLWDVKTHSKNKDTYEVLNEVRAETALMPIVKENRFLNTFGHIFSGGYAAGYFSYKWAEVLAADAYYYVQSQGGIGSQASQDFMQCILETGGSADFMKQYLKFRGERPSTKALLMSNGIILENNDILDKKNR >NZ_AP013042|862995:881560|863611_864451_+|WP_066044584.1|DBSCAN-SWA MSKDLTTPTVQTSQDLTVQKYPPILSAAEEHDLAVDLFENHNLEAARKLVLSHMRFVAFIAHGYKGYGLEQDDLIQEGTIGLMKAVKKFNPNRNVRLASYAVYWIRAEIHEFIFKNWKIVKVATTKEQRKLFFKLKKAKANIYTSLNTEQAKEIANDLGVRPKDVLEMESRLQFNDVAFEVTDEEESTSPVHYLTDENTRSPEQLALSDDSQKHHQQQLYTALSSLDERSLDILQSRYLKEEKTTLHTLAKRYNISAERVRQLENKAMQKLKNSMDKQN >NZ_AP013042|862995:881560|876414_876840_+|WP_066044607.1|DBSCAN-SWA MDYLTEFRGRFIGIMQWSDCHALFENLIANPAEDWYLYDTLLPMPEVTIDADNLVKSLTEIHALLKTKHQERYCGIVYVDDLKNPSFVKIFNPNNLGKVCGSSENPPIPQWLLSKTKPKDVIEKFALPMEEKGFISKFFKF >NZ_AP013042|862995:881560|862995_863604_+|WP_066044582.1|DBSCAN-SWA MANLFVIAAPSGCGKTSLVKALIAQTDDLCVSVSHTTRNARPGEIHGENYFFVSKEAFDKINKENGFIESAQVFDNYYGSAKKTVEDLLADDKDVILEIDWQGARQVKKSFPEVVSIFIVPPSIEALRERLTGRGQDDSSIIERRMRDAVSETQHYDEFDYLVINNDFETALQDILTIIHAQKFNIKQQSNRHQALLKTLIK |
19 | Lake_Baikal_phage(14.29%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
895658 : 903551
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP013042|895658:903551|DBSCAN-SWA AATGGCAGGCATAAACAAAGTAATATTAGTAGGTAACTTAGGGCAAAAACCTGAAATTAAATACGCAACAAATGGTAATGCAATTACTAATTTATCTATCGCAACCAGCGAATCTTGGACTGATAGAGCAACTGGTCAAAAACAAGAAAAAACAGAATGGCATAGAGTAAGTGTGTTTGGAAAGTTGGCTGAAATCATCGGTCAATACTGCGATAAAGGTTCAAAACTTTATGTTGAAGGAAAATTACAAACACGCAAGTGGCAAGACCAATCAGGTGCTGACCGTTACACCACCGAAGTGGTGGTTTCAGGTTTTGGCGGCACTATTCAAATGCTAGATTCTCGCAATACTGCAGGTGCTAGTACTCCAGCGCCTCAGCAACAGCAAGCAGCGCCACAATCTGCACCAATACAACAAAGTCAAACCCCTGTCGCTGACCCAATCACCCCAGTAGATAATTCGGGTTTTGATGATGATATCCCGTTTTAAAGGTTAGTCAACACAGTTTAGGTACAAAAAAAGCCCGCAAATAGCGGGCTTTTTTATTAATTTTCAAATAATTATTTGGCTCGGATTGTACTTTCTTTATCGTCCCAATAGTTGGCTTTATTTTTCAAAACCCAACGCACACCTCCTTTTGGATCCTCAACATCACCCTTATAGCGAGGAATAAGATGCACATGCAAATGCATCACGCTTTGCCCTGCGGCTTGTCCGTTATTGACGCCAATATTATAAGCATCTGGGGAAAACTCTTCATCTAAGATTTTTTTGGCATTTTGCACAGCCCTGCCAATTGCTAATAATTCTTCATCTGTGGCTTCAAAAAATGTAGCAAAGTGGCGTTTAGGCACAACTAAAGTATGCCCAGGAGAAGCGGGATAGCTATCAATAAAGGTCTTTGTGTAATCACATTCGCCAATGATACGCTCGTCTCTGAGATGACAAAAAATACAATCTTTACCCATGGTTTTATCGATTTGAAAAAAGGCATTATTTTACGCAATAAAAAAGCCTGTTGCTACAGGCTTTTTAAATGGTTATCTAAACCCAATCAAAGAAACAACAAATTATTTAACCTGATTCGCTGTAGCTGGGATTTTTGCATTATTATTGTATGGATTATAACCATAATACGGATTGTAACCATAATTATTACCCCAACCGTTGTTATCAAATTCATCAAACATATTGCTCATTTCCTCAGAATACCAACGAGGGTCCCAATAATCATACGGGTTATAAGCAAAAAAACCGTTATCTTGCCGATAGTAGCCATTATTATTATAATTACTAACGCCATTATCCCAAGGCATATTGTTGTTATTCCAAAAAGCATTTGCACTCATTGTGAGTGTAAATATCACGATTGCTAAAATTTTCTTCATGTTGTTTTCTCCTATGATGATTGTTCAACGGAATACATTATAACATACTAATATAGATTATAAAAAAATATCTTTTACGCTGTTAGGTATAATGCCCCTGATGAATCAGAAAGCATTGTTACAATCCCTTTTAAAGCAAAGAATTCTAGTGCTAGATGGCGCCATGGGTACGATGATTCAAAAGCACAAACTTAGTGAAGCTGATTATCGTGGCGAGCGTTTTAAAGACTGGCATATCCTTGTGCAAGGTAATAACGACTTGCTGTCACTAACTCAACCAGAAATTATTAAAGGTATTCATTGCGAATATCTTGAAGCTGGCGCAGATATTCTTGAAACTAATACCTTTAATGCTACGCAAACTTCTATGTCAGATTATAAGATGGAAGAATTGGCGTATGAAATCAATGTAAAGAGCGCCAAACTCGCTAGACAAGCCTGCGATAAATTTTCCACCATTGACAAACCTCGCTTTGTCGCAGGTGTTATCGGCCCTACTTCGCGTACTTGCTCTTTGTCACCTGATGTTAATGACCCAGGGTTTAGAAATGTATCATTTGATGAATTAGTCGTTGTTTACACTGAGGCAACTCGTGGTTTGATTGAGGGCGGCAGCGACATTATCTTGATTGAAACCATTTTTGACACATTAAATGCCAAAGCTGCTATTTTTGCGGTACAACAAGTATTTGAAGAGGATGAGGTTGAATTGCCGATTATGATTTCAGGCACGATTACCGATGCCTCTGGTCGCACTCTATCGGGTCAAGTCACTGAAGCCTTTTATAACTCACTACGACACGCAAACCCTATTTCTATAGGTCTTAATTGCGCCTTAGGTCCTGATTTATTACGCCAATATGTCGCTGAACTTTCTCGTGTTGCCAGTACTTATGTTTCTGCACATCCAAACGCAGGTTTGCCGAATGAATTTGGCGAATATGACTTGGATGCGCCAACCATGAGTGAGCAAGTTAGCGAATGGGCAAAATCAGGTTTGGTTAATATCTTGGGTGGCTGCTGTGGCTCTACGCCTGAACATATTAAAGCCATTGCCAATGCGATTGACGGTTTGCCACCACGCAAAATACCTAATATTACACCCGAATGTCGCCTTGCTGGCTTAGAGGCTTTTAATATTGGTGAAAACTCTTTGTTTGTCAATATTGGTGAACGCGCCAATATTACCGGTTCTGCAAAATTTAAGCGACTTATTCTGAATGAAGAATACGAAGAGGCGCTTGATGTTTGTCGCACACAAGTGGAAGAAGGGGCACAAGTTGTTGACATAAATATGGACGAAGGTATGCTTGATGGTAAGGCAGCTATGATTCGCTTTATGAATCTAATTGCCTCCGAGCCAGACATTTCCAAAGTGCCTATTATGGTTGATTCTAGCAAGTGGGAAATCATTGAAGCAGGGTTAAAATGCACACAAGGAAAGCCTATTGTTAACTCAATCTCACTCAAAGAAGGCAAGAAAAACTTTGTTAAATACGCCAAATTATGCAAACGCTACGGCGCGGCAATCATTGTGATGGCGTTTGATGAAGATGGTCAGGCAGATACACAGGAACGCAAAATTGAGATTTGCACCAATGCCTATCATATTTTAGTTAACGAGGTTAATTTTCCGCCAGAAGATATTATTTTTGACCCAAATATCTTTGCCATTGCCACGGGTATTGAAGCGCATAATAATTATGGCGTTGATTTTATTGAGGCAACAAGAGAAATCACCAAAAACCTGCCTTATGCAAAAGTATCGGGCGGTGTTTCCAATGTTTCCTTCTCATTCAGGGGGAATAATACTGTGCGTGAGGCAATTCACTCGGTATTTTTATATCACGCCATCAAAGCAGGTATGACGATGGGTATCGTCAATGCAGGGCAATTAGTCGTGCTTGATGACATCGACCCTAAGCTTAGAAAAGCCGTGGAAGATGTGGTATTAAATAATGATGCAGAAGCAGGCGAGCGCTTGGTGGATATTGCTGAAGAATTTTCAGGAGAATTAGCCAAAAGAGACAACAGCAAAGATTTAGAGTGGCGTAGTTGGGCAGTGGAAAAACGCTTAGAACATTCGCTAGTTAAAGGTATTACCAAATTCATTGACGAAGACACTAAAGAGGCCTTTAAAAAACTCGGTCGCCCTATTTTGGTGATTGAGGGTCCATTAATGGACGGTATGAATGTCGTTGGCGACTTGTTTGGTGCGGGCAAAATGTTCTTGCCACAAGTGGTGAAATCAGCACGAGTAATGAAAAAATCAGTAGCTTGGCTTGATCCTTATTTAGAAGCAGAAAAATCAGATTGCGCCTCCATGTCAAACGGAAAAATTTTAATGGCAACGGTAAAAGGCGATGTCCATGACATTGGTAAAAATATTGTTGGCGTAGTATTATCCTGCAATAACTATGAAATCATCGACCTTGGTGTGATGGTGCCTACTGAGACCATTTTAGAAACGGCAAAAAAAGAAAATGTAGATATCATCGGACTCTCGGGCTTAATCACCCCTTCTCTTGATGAAATGGTGTTTGTCGCCAAGGAAATGAAACGACAAGGTTTTGATTTGCCACTTATGATTGGCGGCGCCACCACTTCCAAAGCGCATACAGCGGTTAAAATTGAACCTGAATATGATAAGGGTGTATTTTATGTGCAAGATGCCTCTAAATCGGTTGGTGTTGCCAGTAGTTTACTTTCAAAAGAATTAAAGCCTGCATTATTAGCCGAAACCAAAGCCGATTACGAAAAAGTTCGCCAGCGTCGTGCCAACAAAGGCAAAAGTAAACTGATAACAATGGATAAAGCCAGAGCTAACAAGCCCAAACTAAACTTTGACTCAATCACTACGCCACATAAAATCGGCATTCAAGTTTTTAAAGATTATGATTTGGCTGAAATTTTTGAATTTATTGATTGGACGCCATTTTTCAAAACTTGGGAGTTAGCCGGTAAATTCCCAGACATTCTAACCGATGAAGTCGTTGGCGAATCTGCCTCAGAATTATACAAAGATGCTAAAGCAATGTTCAAAAAAGTCATTGGCAGAAAGTTATTACAAGCCAATGCAGTTGTCGGCATATTCCCTGCCAATAGTGTCAATGAAGATATTGAACTCACCAATGAGAATGGCGAAGTCTTTATGGTCATCAACCATCTACGCCAACAACTAGACAAAAAAGGCAACACGCCAAATTTCTGCCTCAGCGACTTTATTGCCCCGAAAGACAGTGGCATCCAAGACTACATTGGCGCCTTTGCTGTTACCGCTGGCATTAACATAGACCCATTGATCGAAGCCTTTGAGGCTGACCACGACGACTACAATTCTATTATGATTAAAGCTGTTGCAGACCGATTGGCAGAAGCCTTTGCAGAATTAATGCACTACAAATTCCGTACTGAAATTTGGGGCTACAGTAATGAAGATATTAACAATGACGAATTTATTGAGGAAAAATACCGTGGCATCCGCCCTGCTCCAGGCTATCCGGCCTGCCCAGAGCACAGTGAAAAAGAAAAAATATGGCAGTTACTTGATGTTGAAAATAACACTGGTATGACGCTCACCAGTTCCTACGCAATGCTTCCAACTGCCGCCGTCAGCGGTTGGTATTTTGCACATCCAGATTCTCGTTACTTTGGTGTCGCCAAAGTCAATCAAGAGCAATTAGAAAACTACGCTAAACGCAAAGGCGTCTCCACGGAGCAAGCTGAACGCCTACTTTCTCCTAATTTAGAATAAAAAAACTAACTGCGGTTTTTGCTTGATTGAATTTTCATTACTGTTACTTTAACACTTTCAGCGCCTTTACCTTGCCCACCTTTATACATGCTACTCAGCGTAATATAACTACCCGCAAATAAAGCAATGACAATTAGCAGAACGATATATTTCATGTTCATGCGTTAACCTCAATTTTTCTAAGAGATTGTGCCAGTTTATCTAATGAGGCGTTAATAAGTTTATATGCACCCTCTGCACCGTAGGTTTTAGCGACCTCTAGGGCTTCGTTAATAACGACCTTGTAGGGGATCTCAATGCTATTTTTGAGTTCGTACGTACCAAGATAAAGAATGGCATGTTCAACAGTGCCTAGCTCTTCAGTATCGCGACTGATGGTTGGGGCAATTAACGCATCTAATTCTGTGCGACTTTTCATAATGTTAAGGAACAAGTTGGAAAAAAAGGCTTTGGATATCTTGCCATTTTTTTGATTGATAAATTGTTGCTCAATTTGCAACACTTCCCCACCTGATACGGAATACTGGTACAAGGCTTGCACAACACGCTCTCTGGAGCGGTGCTTTGGCGTGGTGAATGACATTTATACCTCCACCTGTTTCATTAGATAAAGCATTTCAATCATTGCCATAGTAGCTTCTTCGCCTTTGTTACCCTTGTAACCCCCTGCTCTGCCGATGGTTTGCGCCATATTACTGGTGGTTAATACGCCGAATGTGGTTGGCACTCCATACTGGTAAGATACATCGGCAATACCGCGTGCACATTCATTGCAAACAAAGTCAAAATGTGGGGTTTCACCATTAATTACCGCACCCAAAGTAACAATACCTTGGTATTTTCCAGCGCTTGCTAATGTCTTAGCCATTAAAGGAATTTCAAACGCACCTGGCACATAAAAAACATCAACATTGTCTAACTTGATACCATATTTAGCAAGCGTTTCTTGTGCTGCTGTCAATAATTTATCGCCAATTTCTTGGTAGAAATAACCAACGATAATTGCAACCTTGCTGTTGGCTAAAAAATTACCATTTGCGTCTTTATCAAATTTAAAATCCATACCTATTCCTTATTTACTTGTATTAATATATTCAACTACCTCTAAGCCAAAACCTTTAAGGGCATGAAGTTTTCTTGGGTTGCCTAAGATTTTCATTTTTTTAACACCGAGATCCGATAAGATTTGCGCACCAACACCATAAGTCTTAATGTCATCAATAGGCTCTTTACCCGACTCATCAATGTGCTGCACGATAGAAACATCTGTTTGCTTTCTTAATAATAAGAATACACCCGTGCCATCTTCGGCAATGTACTTTAAGGCTTCGTCAACACTAAAACCCTTTGAATTTTCTTTTAGCACATCTTTAAAAATGTCTTCCATGTGGACGCGTACACAGGTTTCACTACCATCAGTGATATCACCTTTAACTAAGGCTAAATGTGTTTCATTGTGAATGCTATCAAGGAATGATAGCAATTTGAATGTACCATATTCTGTTTCAAACGCGCGTTCATTAATGCGTTCAATGGTTTTTTCATTTTCAATACGATAAGAAATCAAGTCTTCGATGGTCCCCCATTTGATTTGATGCTTTTCAGCAAAGTCCTCAAGGTCATCACGACGCGCCATAGAACCATCTTCATTTAAAATCTCAACAATTACCGATGCAGGCTCTAATCCTGCAAGGCGTGCTAAATCACAGCCTGCCTCGGTATGCCCTGGGCGAATCAACACACCACCTGGCTGCGCCATTAGTGGAAAAATATGTCCAGGCTGGACAATGTCAGATGGCTTGGCATTTGGTGCAACAGCATCTAACACAGTTTTCGCCCTGTCTGCTGCGGAAATACCCGTGGTAACACCCTTCACAGCTTCAATAGAAACCGTAAAATTAGTACCGTTCACATCATTATTCTGCGCCACCATCAGCGGTAAATTTAAGCGCTGACAGCGCTCCTGAGTCAAAGTTAAACAAATCAAACCACGACCATGGGTCGCCATAAAATTAATATCTTCCTTGGTGCAAGTCGCTGCAGGGATGATTAAATCGCCTTCATTTTCGCGATCCTCGTCGTCCATCAAAATAATCATCTTACCTTGCTTATAATCCTCTAATATCGCTTCAATACTGGCTTTATTTCTCATTGTCGTTATTTATTATTTAATAATTGTTCAAGATGGCGGGCAATCATATCAACTTCAATATTCACCACATCCCCTATATTCAGTTGCACTAGCGTCGTTGCCATCAGTGTGTGTGGCACAACATTAATGTCAAATACATTCTCATTAATGTTGTTCACTGTCAAACTCACACCATTCACGGTAATTGATCCTTTTCTAGCAATGTATTTTACCAAAGACTGCGATACGCTAATTTTAAAACGCGTAGATTTACCTTCGGTTACCTTATCTACCACTTCCCCCCGTCCATCTACATGTCCGCTAACTATATGACCGTCAATGCCTTGATTAATGCGCAATGATTTTTCAAGGTTAACATTATTGCCAACCGACAGATCGCCTAAAATAGAGCAATCCAGCGTTTCCTGTGACACATCCGCCTTAAAGCCATCACTGTCTAGATCAATCACCGTTAAACATACGCCACTGACAGCAATACTGTCACCAATAGCAACAGTGTCAAAATCTAAATCAACAGATAAAAAAGTGAACACTACACCTTTTTTGTGCGTGGTTTTGATTTTAACCTGACCGATGGCCTGTATGATACCTGTAAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_AP013042|895658:903551|895658_896147_+|WP_066044639.1|DBSCAN-SWA MAGINKVILVGNLGQKPEIKYATNGNAITNLSIATSESWTDRATGQKQEKTEWHRVSVFGKLAEIIGQYCDKGSKLYVEGKLQTRKWQDQSGADRYTTEVVVSGFGGTIQMLDSRNTAGASTPAPQQQQAAPQSAPIQQSQTPVADPITPVDNSGFDDDIPF >NZ_AP013042|895658:903551|896218_896626_-|WP_066044641.1|DBSCAN-SWA MGKDCIFCHLRDERIIGECDYTKTFIDSYPASPGHTLVVPKRHFATFFEATDEELLAIGRAVQNAKKILDEEFSPDAYNIGVNNGQAAGQSVMHLHVHLIPRYKGDVEDPKGGVRWVLKNKANYWDDKESTIRAK >NZ_AP013042|895658:903551|901383_901863_-|WP_066044649.1|DBSCAN-SWA MDFKFDKDANGNFLANSKVAIIVGYFYQEIGDKLLTAAQETLAKYGIKLDNVDVFYVPGAFEIPLMAKTLASAGKYQGIVTLGAVINGETPHFDFVCNECARGIADVSYQYGVPTTFGVLTTSNMAQTIGRAGGYKGNKGEEATMAMIEMLYLMKQVEV >NZ_AP013042|895658:903551|900805_900961_-|WP_157059388.1|DBSCAN-SWA MNMKYIVLLIVIALFAGSYITLSSMYKGGQGKGAESVKVTVMKIQSSKNRS >NZ_AP013042|895658:903551|900957_901383_-|WP_066044647.1|DBSCAN-SWA MSFTTPKHRSRERVVQALYQYSVSGGEVLQIEQQFINQKNGKISKAFFSNLFLNIMKSRTELDALIAPTISRDTEELGTVEHAILYLGTYELKNSIEIPYKVVINEALEVAKTYGAEGAYKLINASLDKLAQSLRKIEVNA >NZ_AP013042|895658:903551|901872_902952_-|WP_066044651.1|DBSCAN-SWA MRNKASIEAILEDYKQGKMIILMDDEDRENEGDLIIPAATCTKEDINFMATHGRGLICLTLTQERCQRLNLPLMVAQNNDVNGTNFTVSIEAVKGVTTGISAADRAKTVLDAVAPNAKPSDIVQPGHIFPLMAQPGGVLIRPGHTEAGCDLARLAGLEPASVIVEILNEDGSMARRDDLEDFAEKHQIKWGTIEDLISYRIENEKTIERINERAFETEYGTFKLLSFLDSIHNETHLALVKGDITDGSETCVRVHMEDIFKDVLKENSKGFSVDEALKYIAEDGTGVFLLLRKQTDVSIVQHIDESGKEPIDDIKTYGVGAQILSDLGVKKMKILGNPRKLHALKGFGLEVVEYINTSK >NZ_AP013042|895658:903551|897146_900800_+|WP_066044645.1|DBSCAN-SWA MNQKALLQSLLKQRILVLDGAMGTMIQKHKLSEADYRGERFKDWHILVQGNNDLLSLTQPEIIKGIHCEYLEAGADILETNTFNATQTSMSDYKMEELAYEINVKSAKLARQACDKFSTIDKPRFVAGVIGPTSRTCSLSPDVNDPGFRNVSFDELVVVYTEATRGLIEGGSDIILIETIFDTLNAKAAIFAVQQVFEEDEVELPIMISGTITDASGRTLSGQVTEAFYNSLRHANPISIGLNCALGPDLLRQYVAELSRVASTYVSAHPNAGLPNEFGEYDLDAPTMSEQVSEWAKSGLVNILGGCCGSTPEHIKAIANAIDGLPPRKIPNITPECRLAGLEAFNIGENSLFVNIGERANITGSAKFKRLILNEEYEEALDVCRTQVEEGAQVVDINMDEGMLDGKAAMIRFMNLIASEPDISKVPIMVDSSKWEIIEAGLKCTQGKPIVNSISLKEGKKNFVKYAKLCKRYGAAIIVMAFDEDGQADTQERKIEICTNAYHILVNEVNFPPEDIIFDPNIFAIATGIEAHNNYGVDFIEATREITKNLPYAKVSGGVSNVSFSFRGNNTVREAIHSVFLYHAIKAGMTMGIVNAGQLVVLDDIDPKLRKAVEDVVLNNDAEAGERLVDIAEEFSGELAKRDNSKDLEWRSWAVEKRLEHSLVKGITKFIDEDTKEAFKKLGRPILVIEGPLMDGMNVVGDLFGAGKMFLPQVVKSARVMKKSVAWLDPYLEAEKSDCASMSNGKILMATVKGDVHDIGKNIVGVVLSCNNYEIIDLGVMVPTETILETAKKENVDIIGLSGLITPSLDEMVFVAKEMKRQGFDLPLMIGGATTSKAHTAVKIEPEYDKGVFYVQDASKSVGVASSLLSKELKPALLAETKADYEKVRQRRANKGKSKLITMDKARANKPKLNFDSITTPHKIGIQVFKDYDLAEIFEFIDWTPFFKTWELAGKFPDILTDEVVGESASELYKDAKAMFKKVIGRKLLQANAVVGIFPANSVNEDIELTNENGEVFMVINHLRQQLDKKGNTPNFCLSDFIAPKDSGIQDYIGAFAVTAGINIDPLIEAFEADHDDYNSIMIKAVADRLAEAFAELMHYKFRTEIWGYSNEDINNDEFIEEKYRGIRPAPGYPACPEHSEKEKIWQLLDVENNTGMTLTSSYAMLPTAAVSGWYFAHPDSRYFGVAKVNQEQLENYAKRKGVSTEQAERLLSPNLE >NZ_AP013042|895658:903551|902957_903551_-|WP_066044654.1|DBSCAN-SWA MFTGIIQAIGQVKIKTTHKKGVVFTFLSVDLDFDTVAIGDSIAVSGVCLTVIDLDSDGFKADVSQETLDCSILGDLSVGNNVNLEKSLRINQGIDGHIVSGHVDGRGEVVDKVTEGKSTRFKISVSQSLVKYIARKGSITVNGVSLTVNNINENVFDINVVPHTLMATTLVQLNIGDVVNIEVDMIARHLEQLLNNK |
8 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1137581 : 1150786
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_AP013042|1137581:1150786|DBSCAN-SWA 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13 | Bacillus_virus(22.22%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1240435 : 1252311
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP013042|1240435:1252311|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_AP013042|1240435:1252311|1243838_1244588_-|WP_066045312.1|DBSCAN-SWA MKILISNDDGFDAQGIKTLVQYLSKDHQVVVVAPNENKSASSSSLTLNRALQPIKIKKNTYSVDATPSDCVHLALSGLLEDEFDLVVTGINFGANLGDDVIYSGTVAGAIEGRFLGLPSLAISLASWEGEHFETAGIIAQRLVAQISHAPLSHDTVLNVNVPDVPIDEIQGLQTTRLGKRHQSEQSLPDKDDASKFWIGENGKEADNGVGTDFYAVANGFVSVTPLQIDLTKYNEMDTVSLWLDLIEQA >NZ_AP013042|1240435:1252311|1248772_1249231_+|WP_066045320.1|tRNA|DBSCAN-SWA MCDNLIDSQWMALAIEQALLAEKINEVPVGAVLIQDEQLIASAHNQPISNNDPTAHAEIQLLRKAGEKLNNYRLPNTTLYVTLEPCTMCLGAMVHARINRIVFGAFDEKTGVCGSCQNLANSDCFNHNIQVTGGILATECKTLLQNFFKRRR >NZ_AP013042|1240435:1252311|1249982_1250918_-|WP_173636502.1|DBSCAN-SWA MMKYSIVFPGQGSQSLGMLSDLADNFASVKVTFEHASDVLGYDLWKLTQEDQEGLNQTQKTQPAMLAAGYATYEVLENEIDLSPVCMAGHSLGEYTALVASGALGFADGIKLVQHRAELMQSAVPAGVGAMAAILGLDDETVVKVCTQYSGEGIVEAVNFNSKGQVVIAGNKESVDVTCDLMKAAGAKRAVILPVSVPSHCSLMNDAATMLANALQGVQFRLGGVDVLHNVDAKKATDADDIRAKLVAQLHRPVLWTGTVQAMHDMGVSRLIEAGPGKILTGLTRRIEKSLTASAILTTENIAAISQEIEQ >NZ_AP013042|1240435:1252311|1240435_1242124_+|WP_066045308.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSDNTTNNKPVINFIRHQINDDLDKNLHDSIQTRFPPEPNGYLHIGHAKSICLNFGLAKDYNGKCNLRFDDTNPSKEEVEFIDSIKNDVQWLGFDWDGEVRYTSNYFPKFYQYAKELIDKGLAFVCFLNAEETREYRGTLKQAGKNSPYRDTSKAENLDLLAKMKDGKFSEGECVLRAKIDMASPFICLRDPTLYRIRFDKHHQTGNEWRIYPMYDFAHCISDAIEGITHSLCTLEFQDNRRLYDWILENLDDFNKPNRPHQYEFSRLNLEYTVMSKRKLQQLVEYNLVTGWDDPRMPTLSGLRRRGYTAAGIRDFIDRIGISKVDSMTDMSILEASIRDDLNTVAPRTMGVIDPIKVIIENYPEDKIESLQAPIHPQNEAMGKREIFFSRMLYIDRSDFEEVAPNKKFKRLALNKEVRLRNAYVINATTFDTDFDGNITTVYATYDAETLGKNPADGRKVKGVIHFVEASKALKAEFRLYDRLFTLENPGKNDHFEQLLNSESLITTHGVVEPGMKNAEPEQAYQFEREGYFCRDDKDESKYLIFNKTVGLRDTWSSSKIS >NZ_AP013042|1240435:1252311|1249239_1249986_-|WP_066045322.1|DBSCAN-SWA MNNLAGKIVLVTGASRGIGQAIALTLGGAGATVIGTATSDKGADAISATLKENGVIGVGMALNVTNNDQIAEVMNAIVDTYGAVDILINNAGITRDNLLMRMKEEEWDDIMNTNLASVYKMSKAVLRGMMKKKAGRIISIASVVGAMGNAGQTNYAAAKAGIMGFTKSLAREVGARGITVNAVAPGFIKTDMTDALPEEQKDALAKQIPMGRLGLVEEVANSVLFLAGDAGSYITAQTLHVNGGMYTV >NZ_AP013042|1240435:1252311|1242120_1243866_-|WP_066045310.1|DBSCAN-SWA MVRFDRAGLKILLIWLGITLLDLFVVRDFSWIFEHWNSKRVVVNYGLTALAMMLLLFILSPIIRYFKTGKYLVFAFIAVPMWVQMSHYEVYRSFASSSGFREFSQDPSLVLSVWMDQFNWLKSTIILLFVYGLLSLLSGVKTKIVRWRYGLNVIGFTLLYLLTTFSWYGVNNFQNSTLSYYSTLLQMSRMQVLEFKYDKPSVIPSQLSTEGLPNIIYIVGESLTLSHMSIYGYKRNTTPQLAQLEKDRQLIKYNNALSIGTHTRLSVPYMLVGIEGIDPKGRIYQTPTVFNYAKARGYTTAFISAQDTDWGHIKEMFVDESVDYFWHGVDMNKNASVHKGADDMRVLNEIALPYIAKVGKQKTPFFLVLQMDGSHYPYAEHSTKKHKIFLPENTPNSINAYDNTVVKTDEYLFKIIQKMRQEYPNSWVFYSTDHGQGLGGKAGKFNQDPHLNTIHNPLLISAPKSKIAQLLRNQDAPVSQADIVPSILDIIGMKPDKNINGKSLLKPINSNRLRVVSQYMPTQHNDPRAVLAEPNLKLYTLDFEKMSVSFPDEKKVIHFKDWDARHQKIFIGARFGSLIAN >NZ_AP013042|1240435:1252311|1250991_1251249_-|WP_066045325.1|DBSCAN-SWA MAHKKAGGSTNNGRDSVSKRLGVKKFGGQVALAGNILVRQRGTKFHPGTNVRKGKDDTLFATADGKVVFAKKGKFMRQYISIESA >NZ_AP013042|1240435:1252311|1251672_1252311_+|WP_083502997.1|DBSCAN-SWA MIILKTNMGDIHIELDAKNAPITSKNFIDYVKSGFYDGTIFHRVIKNFMIQGGGFTEDMKEKPSKKEIKNEAKNGLKNSKYTIAMARTAAPHSASSQFFINTSNNSFLDYPGQDGWGYCVFGEVVKGEEIVDKINDVNTGNLGMHADVPNDAVIITKATVKTPTKKKPVAKKVATKKKPVAKKAVVKNPATKKTTAKKATTKKTATKKTTKK >NZ_AP013042|1240435:1252311|1251262_1251574_-|WP_066045328.1|DBSCAN-SWA MYAVIKTGGQQFRVEQGMTLKVEKLEVEIGKSITFDDILMVADGDKVQIGAPTVAKASVEAKIIAQGKGKKVHILKFRRRKHSMKQQGHRQLFTEIEITKIKA >NZ_AP013042|1240435:1252311|1244584_1246810_-|WP_066045314.1|protease|DBSCAN-SWA MIEAGLQQEINYIMTKARNNRLEFVTVEHLLIALFNIDEVVSFLRNKQVNLEEFRADLEDYIDSNTPLIPQQSEIDIVPTVGFQRVLQRSVYQAQSAQKNTVYAMNILVSIFSEKESYAVYLLKQNGVSRLEVMEAMSTQTAAYTDDDRDYKTDAKPKKKNKNALETYTTNLCEKSKSGKIDPLLGREEEVLRTVQILSRRRKNNPLFVGQAGVGKTAIAQGIAKKIVDGKVPEVLKNASIYSLDVGVLVAGTKYRGDFEKRLKSVLSDLEKIPDAILFIDEIHTIVGAGSVSGGSLDASNLLKPALADGTLKCMGSTTYEEYRKVFEKDHALSRRFQKIDIDEPSVDDTIKILNGLKEAYQTHHKVKYSKASLVSAVELSHRYMNDRRLPDKAIDVIDEVGALQQIQPKSKRKVNIGVGDIEDIVAKLARIPSRQVTKDDKSLLKSLEADLKLGVFGQEKAVESLSTAIKLSRSGLAHEDKPMGSFLFAGPTGVGKTEICKQLARIMGVKLLRFDMSEYMERHSISKLVGSPPGYVGYDEGGLLTEAVNANPYAVLLLDEVEKAHPDIFNLLLQVMDNGKLTDANGREVDFSNVILVMTSNIGAQSVGRASIGFNEQDHSLDYEGELKKAFTPEFRNRLSEVIYFNSLNEKTIVFVVNKFLFELESALEDKNVSLIVSETSRKWFAKNGYDAKMGARPMSRLIEKEIRKPLADELLFGKLVTGGTVKVEIKKDKITLTIK >NZ_AP013042|1240435:1252311|1246818_1247112_-|WP_066045316.1|protease|DBSCAN-SWA MDDTLTKTAKPKLKKPSQFQVLLLNDDYTEMDFVIEVLMQFFAKTEEAAHAIMLKVHIDGEGVCGIYSHDVAQTKVTQVIDFSRSNEQPLMCVVREV >NZ_AP013042|1240435:1252311|1247195_1248770_+|WP_066045318.1|DBSCAN-SWA MENIHKDKILILDFGSQYTQLIARRVREIGVYCELLPYDVDENFIKRFNPKGIILSGGPDTVTLDDSARAPQIVFDLGVPILGICYGMQTMATQLGGLAVSADKHEYGFAKVRARNHSSLLNNIMDEVNDEGHGLLDVWMSHGIEVKELPKGFKLIASTDNCAIAGFANVEKHYYGLQFHPEVTHTKQGVHILERFVSGICDCEKNWTTDNIITDLIQALKNQIGDGNVLLGLSGGVDSSVVAVLLHQAIGNQLTCVFVDNGLLRLNEGDEVMKTFAENMGVKVIRADAQEKFYNALSNENEPEAKRKIIGRTFVEVFEEEAKHLDNIKFLAQGTIYPDVIESAGAASGKAKVIKSHHNVGGLPDDLAFELVEPLKELFKDEVRTIGVKLGIPAHMLYRHPFPGPGLGVRILGQVKQEYANILREADAIFMDELYKNDLYDKVNQAFAVFLPIKSVGVTGDERRYDYVIALRAVETIDFMTARWAHLPYDFLDTVSNRIMNEISRVSRVVYDISGKPPATIEWE |
12 | Escherichia_phage(12.5%) | protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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