Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP011260 | Mycoplasma mycoides subsp. mycoides strain Ben1 chromosome, complete genome | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_CP011260
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
927425 : 938105
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011260|927425:938105|DBSCAN-SWA CTTATTTATTAAACACTCTATTAAAAATATAATCAACATGTCTTAAAAAGAATTGATCATCAAAAAGTTGTTCTAATTTATCAATTAAAACAAATTCAGTTAATTTACTATTTAAAACTTCAGTTTTAAAATCTAAATTATTTTTAGAGCATTTAAAAGTGATTTGTTGAATTAAATCATAAACTTGATCTCTAGTAACATTTGGTTGTTCTAATAAAATAAATGTTAAAACTCTTTGAGAAAAGTAAATATTTTTAGCTTGTTTAATGTGTTCTAACATTTGAGTTTTATTAATAACTAAATTAGTTAATGTTTCATTCATTCTTTTTAATATATAAACAATTAAATTAAAAATATCTGGTAAATAAATTCTTTCATTTGAAGAATGAGAAATATCTCTTTCATGTCATAAATTATTATTTTCTAAAACAATATGAACAATTGATTTAATATATCTACTTAATCCAGCTACATTTTCACTAGAAATTGGGTTTTTTTTATGAGGCATTGAAGAACTACCTTTTTGGTTTTTTAAAAAACCTTCAGCAAGTTCATTAACATCACTTCTTTGAAATAATCTAATTTCAGTTGAAATTTTTTCTAAAGTTGAAGCAATATTTGCTAAAACTTCAACTAAAAAAATATGTCTATCTCTTTGGCTTACTTGAGTTGATAAACTATCAATGTTCATATTTAATTTATTAGCTACATATAATTCGATTTGCGGATCTAAGTTAGCATAATTTCCCATTGATCCTGATATTTTAACAACTTCTATATCATTTCTAGCTAATTCAAAACGTTTAATATGTCTTAAAAATTCATCATATCATAAACAAAACTTTAACCCTAAACTAGTAGGTTCACCATACATTCCATGAGTTCTTCCCATAATTAATGTATTTTTATGTTCTATAGCTAGTGTTTTTAAAGTCTTTAAAATATTTTCTAATTCATTAAAAACAATTTGATTAGATTGTTTAATTAAATAATTTTGAGCAGTGTCAACAATGTCAGTTGAAGTAATTCCTAAATGAATTCATTTACTTTCATTATCTAATTGTTCTGATAACATTCTAGTAAAAGCAACAACATCATGTTTTGTCTCTTGTTCAATTTCTAACATTCTATTTAAATCAACTTTTAAATCATTATTAATTTTAAAAAGATCATCTTTATTGATTTTTATAATTTTAGCTCAACCATTAGTTACTAATTGTTCAATTTTTAACCAAGTGTTGTATTTATTTTGATCACTTCAAATATCTGTGATTTCTTTAACTTGATATCTACTAATCATCAAATTCACCTTTAATTAAAATTGTTTGTTTACGATCTGATCCTACTGAAAATCCTAAAAATGGAACTTTTACAATTTCTTCAATTCTTTTAATGTATTTTTGAGCATTAATTGGTAGTTCTTCAAAAGAAGTTACTTTAGTAATATCTTGATTTCAACCATCTAATTCCTCATAAACTGGTTCACATCTTTTTAATTCATAATCACTTGCTGGAAATCAATCAATAATTTTTCCATCTAATTTATAATGTGTACAAATTTTAATTTTTGTTTCTGTATCTAAAACATCAAATAAAGTTAAAAATAACTGATCAATACCACCAACTCTAATTGCATATTTTAAAGCAACTAAATCTAGTCAACCTATTCTTCTTGGTCTTCCAGTGTTTAATCCATATTCTCTTCCACGTTCTCTTAATTTATGAGCTAGTTCTGTTTTAATTTCACTAACCATAGCTCCAGATCCAACTCTAGTATTATAAGCTTTAACAATTCCTAAAACTTTATTAATTTGTTTATTATGAATTCCAGTTCCAATTGAAGCATTATTAGCTGAGCAATTTGAAGAAGTTACAAATGGATAAGTCCCATGATCTATATCTAATAAAACGCCCTGAGCTCCTTCAAATAAAACAAATTTATTTTCATTAATTAAATTAGAAACTTCATACCCACTATCAATAATATTATTTTTAATAAACTGGTAATTTGTCATCGATTCGTTATAAATAACATCAAAATCTAAAGGTTCATGATTATAAACTTTAGTAATGATTTGATTATGATAATCTAAGTTTTCTTTTAATATCTCTTTAAAATTAGGGTTTTGAAAATCACAAATTCTAATTCCATATCTAGCTGCTTTATCAGCATAAGTAGGACCAATTCCTCTTTTTGTTGTTCCTATTTTATTTTCTTTTCTATTTTCTTCTTGTAATTGATCTATTAAAGCATGTCAATCAAAAATTAAATGTGCTCTATCTGAAACAAAAACATTATCAGTACTAATATTTGATTCATTTAATCTTTTAATTTCATTAACTAAACTTTTTAAATTAATTACTGTTCCATTACCAATAATGTTTTTTACTTTAGGATTAAATACTCCTGATGGAATAATTGTTACTTTATGACGTTTATTATTAAATTCAATCATATGTCCAGCATTATCTCCACCAGCAAATCTTACAACAACATCAGCTTTTTGACTAAAATAATCTGTTATTTTTCCTTTACCTTCATCTCCTCATTGGCTACCTACAATAACTAATGACTTATAGTTGTTTTTCATAAATTCTCCTTAAGAACGTGTTTTAAAAATATCTTCTAAAAAAGATATCGAAAAATTCATTATAATATTATTTAACTTTTATTCCAATAAAATTAGTAAAAATTTAAAAATAAAAAATTAGGATAAAAATTAAAAACTACTTTTTCTCCCGAACCCCATATTTCGGACTAAAATCCAGGAAATGGGGTTTTTATATGTCTAAATTAAATTTAGAAAAAAAGTTAAAAATTGTTAAAGAAGCTAAAAAACTTAATATTAAAAAGAGTACTTATTTAGCAAATAAATATGATATTTCAGTTGATACTGTAGAAAGTTTAGTTAATAGATTTGAAGCGTTTGGAATAGAAGGGCTAATTAATAAGGAAAAAAAGCCTTATTATAGTGCAAAGCTAAAACTAAAATTGTATTATATAAACTTGAAACTAATCACTCATATGATGAAGTCGCAAAAAAGTTTAATATTATTTATTCATCAACTATAGCTGGTTGAGTTAAAAAATATAGAGAATATGGATTTTTAGGGTTAAATAATAATATAGGAAGACCTAAGAAAATTATGAAAAACCCTAATAAAAAACCAGCTAAAATAAAGAAATCACAAGTAAAAATCAATAATGAACAACAAATTAAAGAATTAAAAGAACAAGTGGAATACTATAAGTTGGAGGCTGAATTCTGAAAAAAGTTCCACACCTTGTTGACAAAAGAAAAATCAACAAGGAAAAAACAAAAGTAGTTTTAGAATTGTTAAAAACACATAAAAAAGTTAAGATTCCTATTCTCTTAAAAATAGCTAAATTACCTAAATCGTCTTTTTATGAATGAAAACATAAGTTAGAAAATACAATAGATAAAGATAAAGAATTAAAGGAAATGATTGTTGACATTTTTAGCAAATCATTTGAAACGTATGGGTATAGAAGGCTAAAAATGGCCTTAAAATCAAAAGGATATATTGTAAATCACAAAAAGATTTTAAGGTTAACTAAAGAGCTTGGAGTTCAGTGTATTAAATTTAGAACAAAAAATGGAAGATATAGTTCTTATAAAGGAACTGTTGGAAAAATTGCAGATAATGTTTTAAAAAGAAATTTTCATTCTTTACAAGCAAACAAACTTTGATGCACTGATGTAACAGAGTTTAAAGTTAATGGTCAAAAGTTATATTTATCACCAATTATTGATCTTTACAATGATGAAATTATTTCATATTCAATTCAAACCAATCCTAACTTAAACCTAACAAATTCAATGCTAGACAAAGCACTTAAAAAGGTTAAAAATACAAATGGTTTGTTGATTCATTCTGATCAGGGATTTCATTATCAGCACATTAGTTGAGCTAAAAAACTAGAAGAAAATAACATAACACAAAGTATGTCTAGAAAAGGTAATTGCTTAGATAATGCTATTATAGAAAACTTCTTTGGTTTATTAAAGCAAGAAATTTATTATGGTGAAAAATATAATTCAGTAGAAGAGTTAACTAAAAGAATTCATAAATATATTTATTGATATAACAACATAAGAATAAAAGAAAAATTAAAAGGATTGTCTCCTGTACAATTCAGAAAACAATCCTGTTATAATATTGAAAAATTTTAGTCCGTGTTTATGGTAGCGGGGGGGTTTTAAAAGTTGTTTTTTTATTAAAAAAATAAAAAAACCAAATACTAAAATTTTAATACTTGGTTAAAAATTTATTAAATTTTACATGCATCACATTCGTAGTTTTCACTATCTTCTAAAACATCTTGACGAATTCTTACATAATAAATTGAAGAACAACCTTGTTTAAAGGCATTAACATATGCTTTGTTTAAATCTCTAGTTGTTGCTTTATCAGTCATAAATAAAGTTAGTGAAATTGCTTGATCAACATGTTGCTGAGCTGCTGCAACAATATTAATAATTGGATCTGGTCCTAATTCATAAGCACCCATTGCATAATATCCCATATTATCAAAATTAATTTGATATGCTGGAACATAAACTCTTCCTAATTTTCCTTCTTTTCTAACTTCAACAGTTGAAACTACTGGTTGTAGTGAAGGAGTACATGATGATAAATAACTAATTGATCCAGTTGGAGCAACTGCCATTAAATGTGAATTTGCTAAACCTGTTTTTTTAATTTCTTCAACTAATTGAATTCAATCAGCTTGACTTGGAATTTGAACATCATAATCTTTAAATAATTCTTTTACTCTATTTGTTTGTGGTGTTCATTTATCAAATTCACACTTAGTATATTTATCAAATCAAGAACCATCAGCAAATCTTGATTGATCAAATGAAGCAAATTTTTCAAATTCTTGAGCTAATTTATTTGAAGCTTTAAAAGCATTATAAGCAACTGTATAAAAGAACATATTAGTAAAATCAACAGCTTCAGGTGAATCATACATA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TATAAGTCACTAAAAACATTTGGAATCAATCCTAAATTAACTAATAAACAAGTTTTAGATCCAATATTTATTAATCACACTTTAACTCAAATCAAAGAGCAAATTAAAGATGAAACTGAGGTTGAACTATTAAATATTTCTTTATTAAGATATATGGACAAAGCTAAATATGGATTAGAAAATATTGGTCATTTTGGTTTAGCTAGTGATTGTTATACTCATTTTACTTCTCCAATTAGAAGATATTCAGATTTATTAGTTCATAGATATCTAAAACAATACTTAATTACAAAAGATCTAGAAAAAACTAGTTTAGAAAATAATACAAATTATATTAATAAAGTAAGTAATATTATTAATGATACTGAAACTAAAAGTGTTGAATGTGAAAGAGAAGTTATTAAAGCGTGTATGTGTGAATATATGCTAAATAAAATTAATACTACTTATACAGCAACAATTTCAGCAGTTTTAAAATTTGGAATTTTTATTCAATTAGATAATTTAGTTGAAGGATTAGTTCATATTTCAAATATGAATAGTGATTTAGTTTATGATGAAACTAACCGTATTTTAATTAAACCAGATAATACTTATTATAGAATAGGACAAAAAGTTAAAGTTAAACTAATTAGTGTTGATATTAAAAAAAGAACAATTGATTTTGTTTTAATAGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP011260|927425:938105|931718_933881_-|WP_015545587.1|DBSCAN-SWA MNENKNTIVLDDVDDEYIKLNARSKIFLKDQDNFQLDVKAAELYLKNYIEPRMKKFSSLKERLDYLLENQYYDSEILNKYSFDQISQLNHYAYSFNHHFPSFMGALKFFNAYGLKTFDTTMYLETYTDRVLMNALFLGNGNFNKAKDLLKDMMLGRFQPATPTFLNAAKKHRGEYVSCYLLRTEDNMESICRTISTSLQLSKRGGGVAICLTNLRETGSPIKNISGLSSGPIPVMKILEDSFTYADQLGQRQGAGAVYISAHHPDIISVLDTKRENADEKIRIKSLSLGLVIPDITFELARDNKDMALFSPYDVQKTYGKPLSDISITEKYYEMLENPNIKKTYISARKFFLTVAELHFESGYPYILFEDTVNRRNAHDKKGRIIMSNLCSEIVQVSTASEYNSDLSFIKTGEDICCNLGSLNIDKMMKSGKEFSDSIYNAISALDIVSRNSDLSASPSIQKGNALNHAVGLGAMNLHGFLAINKIMYDSPEAVDFTNMFFYTVAYNAFKASNKLAQEFEKFASFDQSRFADGSWFDKYTKCEFDKWTPQTNRVKELFKDYDVQIPSQADWIQLVEEIKKTGLANSHLMAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVSTVEVRKEGKLGRVYVPAYQINFDNMGYYAMGAYELGPDPIINIVAAAQQHVDQAISLTLFMTDKATTRDLNKAYVNAFKQGCSSIYYVRIRQDVLEDSENYECDACKI >NZ_CP011260|927425:938105|928716_930015_-|WP_011167008.1|DBSCAN-SWA MKNNYKSLVIVGSQWGDEGKGKITDYFSQKADVVVRFAGGDNAGHMIEFNNKRHKVTIIPSGVFNPKVKNIIGNGTVINLKSLVNEIKRLNESNISTDNVFVSDRAHLIFDWHALIDQLQEENRKENKIGTTKRGIGPTYADKAARYGIRICDFQNPNFKEILKENLDYHNQIITKVYNHEPLDFDVIYNESMTNYQFIKNNIIDSGYEVSNLINENKFVLFEGAQGVLLDIDHGTYPFVTSSNCSANNASIGTGIHNKQINKVLGIVKAYNTRVGSGAMVSEIKTELAHKLRERGREYGLNTGRPRRIGWLDLVALKYAIRVGGIDQLFLTLFDVLDTETKIKICTHYKLDGKIIDWFPASDYELKRCEPVYEELDGWNQDITKVTSFEELPINAQKYIKRIEEIVKVPFLGFSVGSDRKQTILIKGEFDD >NZ_CP011260|927425:938105|935670_935955_+|WP_013729883.1|DBSCAN-SWA MINLLASTTKLAQQLILGFEIFIFIIAFIMIAIGLLQNKQSQTGLSALNGGNEELFSNSKERGLDKTLSIWMLVLGIIFFIIALTISIITNTML >NZ_CP011260|927425:938105|935990_938105_+|WP_011167012.1|DBSCAN-SWA MESKIIEVLKTNKHKVSLNKLLTYFNALDYSLIKNYLDQLEKNNKITISLENNIYLLDQIYKKGTIKLNPKGFGFINDINKIDGEDHFIARVDLNNSIHQDEVVYILKQEEDNRLKAIVIELIKRNKIYLIGEINRSFDKRFLDFIPNDKSFDSFRFVIVNKNEFKYEEFNIIKAKIISCKERKIFIRLIKIIGNSKKASDRILAIAEEFEIKTSFDKQTLDNAKQINLSTDKLEKEFLKRQNNSLVNKTIVTIDGIDSKDLDDAICVEKLKNNNYKLFVAIADVSYFVRYKTALDKEALLRGNSTYLANKVIPMLPNILSDDLCSLNPNTKKLVFVCEMEFDNNANMLNKKVYESVIISKARLNYDEVNNYFKTKTWTHCEQTKKMLDVAYELYKKLEDLKAKKGTISFDVREPKIILDKNLNVIDIKTKTADQAEKLIEQFMVSCNEAVAELIYQKDLPFLYRNHNKPDEDELINWYKSLKTFGINPKLTNKQVLDPIFINHTLTQIKEQIKDETEVELLNISLLRYMDKAKYGLENIGHFGLASDCYTHFTSPIRRYSDLLVHRYLKQYLITKDLEKTSLENNTNYINKVSNIINDTETKSVECEREVIKACMCEYMLNKINTTYTATISAVLKFGIFIQLDNLVEGLVHISNMNSDLVYDETNRILIKPDNTYYRIGQKVKVKLISVDIKKRTIDFVLIE >NZ_CP011260|927425:938105|933867_934341_-|WP_011167010.1|DBSCAN-SWA MHSNVKKVTDKDVIKPVGIPFVVYFSSISNNTHRFIQKLEIENIRIPYELDQSISVNRDYVLVTPTYSGGGEYVEGAVPKQVIKFLNNKENRSFCRGVISSGNTNFGDTFGIAGPIISKKLNVPFLYQFELLGTQHDVSQIKQILFRFWEDGNNERK >NZ_CP011260|927425:938105|927425_928724_-|WP_015545429.1|DBSCAN-SWA MISRYQVKEITDIWSDQNKYNTWLKIEQLVTNGWAKIIKINKDDLFKINNDLKVDLNRMLEIEQETKHDVVAFTRMLSEQLDNESKWIHLGITSTDIVDTAQNYLIKQSNQIVFNELENILKTLKTLAIEHKNTLIMGRTHGMYGEPTSLGLKFCLWYDEFLRHIKRFELARNDIEVVKISGSMGNYANLDPQIELYVANKLNMNIDSLSTQVSQRDRHIFLVEVLANIASTLEKISTEIRLFQRSDVNELAEGFLKNQKGSSSMPHKKNPISSENVAGLSRYIKSIVHIVLENNNLWHERDISHSSNERIYLPDIFNLIVYILKRMNETLTNLVINKTQMLEHIKQAKNIYFSQRVLTFILLEQPNVTRDQVYDLIQQITFKCSKNNLDFKTEVLNSKLTEFVLIDKLEQLFDDQFFLRHVDYIFNRVFNK >NZ_CP011260|927425:938105|934349_935369_-|WP_011167011.1|DBSCAN-SWA MAKEQKYYHESVSPIEFVKNNFKGNLRSVNWNVINDEKDLEVWNRITQNFWLPEKIPVSNDLSSWRSLSSEWQQLVTRTFTGLTLLDTVQATVGDVAQIEHSLTDHEQVIYSNFAFMVGVHARSYGTIFSTLCSSEQIEEAHEWVVKTETLQKRAKALIPYYTGTDPLKSKVAAALMPGFLLYGGFYLPFYLSARGKLPNTSDIIRLILRDKVIHNYYSGYKYQKKVAKLPVEKQTEMKEFVFKLLYELIDLETAYLKELYAGFDIVDDAIRFSVYNAGKFLQNLGYDSPFSEEETRIEPEIFNQLSARADENHDFFSGNGSSYVMGVSVETEDEDWEF |
7 | Lactococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1002542 : 1087868
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP011260|1002542:1087868|DBSCAN-SWA 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58 | Hokovirus(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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