CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP011261	Mycoplasma mycoides subsp. mycoides strain Ben50 chromosome, complete genome	2 crisprs	NA	0	2	7	0

1. NZ_CP011261

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP011261_1

• CRISPR_ID: NZ_CP011261_1
• CRISPR_location: 967290-967426
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of NZ_CP011261_1

Consensus_repeat	Method
GATAATAGATATGATCAAAATCA	PILER-CR

spacers of NZ_CP011261_1

>1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR
TAACAAAAATAACAATTATCATAATCAGTACTAT
>1.2|967370|37|NZ_CP011261|PILER-CR
ATATAGTGATTATGATGATGACAGATATTATGATCAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011261_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP011261_1

>merge|NZ_CP011261|1|967290-967426|PILER-CR
GATAGATATTATCAAAATGATAACAAAAATAACAATTATCATAATCAGTACTATGATAATAGATATGATCAAAATCAATATAGTGATTATGATGATGACAGATATTATGATCAAGATTATAGATATGATCAAAATTA

>NZ_CP011261|1|1|967290-967426|PILER-CR
GATAGATATTATCAAAATGATAA	CAAAAATAACAATTATCATAATCAGTACTATGAT
AATAGATATGATCAAAATCAATA	TAGTGATTATGATGATGACAGATATTATGATCAAGAT
TATAGATATGATCAAAATTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP011261.1|WP_011167037.1|978786_979086_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|213395
NZ_CP011261.1|WP_011167020.1|962706_963030_-|membrane-arginine-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224207
NZ_CP011261.1|WP_015545271.1|975691_976852_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP011261.1|WP_011167030.1|959083_959812_+|ROK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224851
NZ_CP011261.1|WP_011167020.1|971141_971465_-|membrane-arginine-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224207
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|960022_961624_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|227708
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|976892_978494_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|227708
NZ_CP011261.1|WP_015545272.1|981365_982943_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-alpha	unknown	unknown	gnl|CDD|236448
NZ_CP011261.1|WP_011167041.1|982954_983500_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-delta	unknown	unknown	gnl|CDD|184053
NZ_CP011261.1|WP_039275770.1|957422_957614_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|961788_962694_-|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237071
NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|970223_971129_-|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237071
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|968457_970059_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|227708
NZ_CP011261.1|WP_060954707.1|955113_955365_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP011261.1|WP_015545425.1|958844_959081_+|ROK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273246
NZ_CP011261.1|WP_011167029.1|957708_958683_+|serine-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|365903
NZ_CP011261.1|WP_011167016.1|955414_957445_+|PTS-transporter-subunit-EIIC	unknown	unknown	gnl|CDD|182245
NZ_CP011261.1|WP_015545588.1|980521_981364_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-gamma	unknown	unknown	gnl|CDD|235535
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|953368_954970_+|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|227708
NZ_CP011261.1|WP_060954709.1|979085_980513_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta	unknown	unknown	gnl|CDD|236447

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP011261.1|WP_011167037.1|978786_979086_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|213395	cd12152, F1-ATPase_delta, mitochondrial ATP synthase delta subunit. The F-ATPase is found in bacterial plasma membranes, mitochondrial inner membranes and in chloroplast thylakoid membranes. It has also been found in the archaea Methanosarcina barkeri. It uses a proton gradient to drive ATP synthesis and hydrolyzes ATP to build the proton gradient. The extrinisic membrane domain, F1, is composed of alpha, beta, gamma, delta, and epsilon subunits with a stoichiometry of 3:3:1:1:1. Alpha and beta subunit form the globular catalytic moiety, a hexameric ring of alternating subunits. Gamma, delta and epsilon subunits form a stalk, connecting F1 to F0, the integral membrane proton translocating domain. In bacteria, which is lacking a eukaryotic epsilon subunit homolog, this subunit is called the epsilon subunit.	4.64566e-18
NZ_CP011261.1|WP_011167020.1|962706_963030_-|membrane-arginine-transporter	gnl|CDD|224207	COG1288, COG1288, Predicted membrane protein [Function unknown].	1.27544e-13
NZ_CP011261.1|WP_011167030.1|959083_959812_+|ROK-family-protein	gnl|CDD|224851	COG1940, NagC, Transcriptional regulator/sugar kinase [Transcription / Carbohydrate transport and metabolism].	6.76134e-40
NZ_CP011261.1|WP_011167020.1|971141_971465_-|membrane-arginine-transporter	gnl|CDD|224207	COG1288, COG1288, Predicted membrane protein [Function unknown].	1.27544e-13
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|960022_961624_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	gnl|CDD|227708	COG5421, COG5421, Transposase [DNA replication, recombination, and repair].	6.48484e-19
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|976892_978494_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	gnl|CDD|227708	COG5421, COG5421, Transposase [DNA replication, recombination, and repair].	6.48484e-19
NZ_CP011261.1|WP_015545272.1|981365_982943_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-alpha	gnl|CDD|236448	PRK09281, PRK09281, F0F1 ATP synthase subunit alpha; Validated.	0
NZ_CP011261.1|WP_011167041.1|982954_983500_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-delta	gnl|CDD|184053	PRK13436, PRK13436, F0F1 ATP synthase subunit delta; Provisional.	9.93019e-59
NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|961788_962694_-|carbamate-kinase	gnl|CDD|237071	PRK12353, PRK12353, putative amino acid kinase; Reviewed.	0
NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|970223_971129_-|carbamate-kinase	gnl|CDD|237071	PRK12353, PRK12353, putative amino acid kinase; Reviewed.	0
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|968457_970059_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	gnl|CDD|227708	COG5421, COG5421, Transposase [DNA replication, recombination, and repair].	6.48484e-19
NZ_CP011261.1|WP_015545425.1|958844_959081_+|ROK-family-protein	gnl|CDD|273246	TIGR00744, Glucokinase_Glucose_kinase., ROK family protein (putative glucokinase). This model models one branch of the ROK superfamily of proteins. The three members of the seed alignment for this model all have experimental evidence for activity as glucokinase, but the set of related proteins is crowded with paralogs of different or unknown function. Proteins scoring above the trusted_cutoff will show strong similarity to at least one known glucokinase and may be designated as putative glucokinases. However, definitive identification of glucokinases should be done only with extreme caution. [Unknown function, General].	3.30657e-07
NZ_CP011261.1|WP_011167029.1|957708_958683_+|serine-hydrolase	gnl|CDD|365903	pfam00144, Beta-lactamase, Beta-lactamase. This family appears to be distantly related to pfam00905 and PF00768 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase.	2.66384e-40
NZ_CP011261.1|WP_011167016.1|955414_957445_+|PTS-transporter-subunit-EIIC	gnl|CDD|182245	PRK10110, PRK10110, PTS maltose transporter subunit IICB.	5.84941e-80
NZ_CP011261.1|WP_015545588.1|980521_981364_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-gamma	gnl|CDD|235535	PRK05621, PRK05621, F0F1 ATP synthase subunit gamma; Validated.	2.68007e-113
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|953368_954970_+|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	gnl|CDD|227708	COG5421, COG5421, Transposase [DNA replication, recombination, and repair].	6.48484e-19
NZ_CP011261.1|WP_060954709.1|979085_980513_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta	gnl|CDD|236447	PRK09280, PRK09280, F0F1 ATP synthase subunit beta; Validated.	0

Protein sequences

>NZ_CP011261.1|WP_011167020.1|962706_963030_-|membrane-arginine-transporter
MFIFFIPLSFLIASTSGFATAVFPLLGGVVIKNNIDILASGSITTFSFASGLVNLITPTSGIVMCSIAVARMDYAKFIKSMAPYMLILTTSSLALLLIGAAIRKTIV
>NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|961788_962694_-|carbamate-kinase
MSKIVIAIGGNALGNSPTEQLEIVKKTAKSLVDFIVQGNDIVIVHGNGPQVGMINSAFDIANKNETKSPILDFPECGSMSQGYIGYHLQQAIDNELKQRNINKPTVALVTQTLVDKNDAAFLKPTKPIGSFLSETEAKKLAKENDWNIVEDAGRGWRRVIASPKPIDIIEKDAILQLVNNSFIVIAGGGGGIPVYLKDDKLVGIAAVIDKDFAAAKIAEIIDAESLIILTAIDKVMINYKKENQQALDQITLAQAQEYIDQNQFAPGSMLPKVQAVMSFVKKTNGKPAYIGSLEQAPTFPT
>NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|960022_961624_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase
MSIGVPRPDNKGFVYRLGYGYLHELKQYHDDPLAIIKAIIANFPLSWTKEQARTKLDEIFKEKKETKKEVLERFKGYEVVEKLFDYFNIFNDCSPTKSTTLKDVVLQLIYQRIKNPISVFNTYKTAKKEKIDTHSKNSFYRSLDYIAKNKDEILRNLNAKICANTNRKIDVLWFDATTTYFETFSREGYKKPGYSKDGKFKEDQIVIGMATDENGIPLHYKIFPGNVADPNTLIPFMLEIADIYEVNSVTIIADKGMSVNRNIRFLESKNWKYIISYRMKAGSKQFKEYILDEKDYINDGGLIYKTRDIASSYNKKRINGHFRRQIISFSQKRATKDKNDRDILIQNFTKKMNKDNLVSCDDLAGSKKYRFFKPINKGAFYELDIEKIQEDQKYDGYYVYETNRTDLSVKEVINLYSKQWQIESNFKTLKGKLSLRPMYLSTWNHIVGYICLCFISLVFLNYIIYILNSKLGLTGKSKITEHKVINVIKEVKEIEVFVNKQKIETIQVYNDELQESWQTYQILLELLTKEKVT
>NZ_CP011261.1|WP_011167030.1|959083_959812_+|ROK-family-protein
MAPNIENGWFNYDLKTEAEFLFKKPVYVINDVNAAALGEYRKGSGLVYKSGLFYWLGIGIGGAIICDGKLISGSHGFAGEFGHGGSNNHNLKCNCGLNNCIEKVCSATTIPNSLLTILKNKYSEFYNKHFSNIKDLDMKLLFEIYNNLNKPIELKNSLLEIYDELFNHISLLIHALDPEVVVIGGGGSLAGNNLLELFQLGVKNKLTDSYKDIVDFKLALLKNDAGMIGAAFYALEQSLKTN
>NZ_CP011261.1|WP_015545425.1|958844_959081_+|ROK-family-protein
MKKILGIDLGGTSAKVGVISQNGDLEHSFSITNPKTKIIENLYFEISKILKTLNVDENDIMLVGITAPGGLLIIIKEL
>NZ_CP011261.1|WP_011167029.1|957708_958683_+|serine-hydrolase
MEFVNIEKTINSFIDKKYFKNAAIRIAKDKKIIYSKQFGYNDQNNTILLKGDEIYQAYSMTKPITTLAALLLIDKKLISLDDDLSKYIPSFKNKNIKIWNLLTMTSGLTYSGNKSNTQLQIKKVLDDWKINNYTLEQLCDELSKVDLLFVPSTNWYYGLSLDVLSRVIEVVSNKSYRDFVKEEIFNKLNMNDSDYYLFDKKRKANVFRWTYKDDQNQLDQVENFDFLFQSIDKLPVCNLGGSGLFTTADDYLKFLNVLIDGKLEDSSQLISLDLLNQMKSDQLTKNNLKQFFNWNLNEDYSYGFGGRVRIKNHNDNNVIITSRT
>NZ_CP011261.1|WP_039275770.1|957422_957614_+|hypothetical-protein
MKKPKATRTKSTKAKSSVSKSTKSTSKSSSKLTKSTSSKAKSSSSKPKTTKAKSTSSKTKTTK
>NZ_CP011261.1|WP_011167016.1|955414_957445_+|PTS-transporter-subunit-EIIC
MFKSSFKDKLKAFAANIMPTLSKLSKAFLLPIALLPIAGVFLGVGAAIAANTPEQSTLWFIGKVMGNMGDVCFGNLPVLFCISVALAYTKDSGVAAITAVVGFLVFNGVQAPLFIAPATKTNDKVFEYSLLWYKHVSNSLTGSNMGILSLNTGVLGGIFVGAIAAKCYNKFHQTQLPTAISFFSGTKLVPIITFVAVIPLSFIFMMAWPVIGLGLNKFGQVSGTLPYGTDSLIFEIVERSLVPFGLHHVFYAPLWWTSAGGSIAEGFNTLNTQSEEVKKAFVDSYNKLHGTNHNNLKAIIDIVKAKDALWGAVGDQIISQRVIGHLNILNFTDVEKLGINLGRFQSGKFGFMLLGLPSAALAMWLAAPKENRQQVFGIYFSAAFTCFLTGITEPIEYTFLFVAPWLFYGVHMPLASIAFWATGALQTHITQTVSGGIIDYIVFGIIPFISGAMKPISAFGVLGVAVVLAPIYFCAFYFLIKLFNVKTPGRDGNAEAKLYTKADFKASKGLNVDGSKMSSSADDKEQARLAKAAAIIEYLGGEENIVDVDSCASRLRLTVVDAKKADIDGIKSLGGTTGALVKGNNIQIVYGGEQEAIKPRMQKLLEQQRHEKMMSHSEMKSEEMKSENMGMTCESNQACDKKDEACSCEKDCMCEEPNKVEEQPVSEMKVEKTKSN
>NZ_CP011261.1|WP_060954707.1|955113_955365_+|hypothetical-protein
MLLMLVVKTELIVNLGILGFGILFILLGLFLFWKQKNKNRYSFENQNRESKNAWEFVKKNFYLLVLTIGFLFIITAIITLITK
>NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|953368_954970_+|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase
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>NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|968457_970059_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase
MSIGVPRPDNKGFVYRLGYGYLHELKQYHDDPLAIIKAIIANFPLSWTKEQARTKLDEIFKEKKETKKEVLERFKGYEVVEKLFDYFNIFNDCSPTKSTTLKDVVLQLIYQRIKNPISVFNTYKTAKKEKIDTHSKNSFYRSLDYIAKNKDEILRNLNAKICANTNRKIDVLWFDATTTYFETFSREGYKKPGYSKDGKFKEDQIVIGMATDENGIPLHYKIFPGNVADPNTLIPFMLEIADIYEVNSVTIIADKGMSVNRNIRFLESKNWKYIISYRMKAGSKQFKEYILDEKDYINDGGLIYKTRDIASSYNKKRINGHFRRQIISFSQKRATKDKNDRDILIQNFTKKMNKDNLVSCDDLAGSKKYRFFKPINKGAFYELDIEKIQEDQKYDGYYVYETNRTDLSVKEVINLYSKQWQIESNFKTLKGKLSLRPMYLSTWNHIVGYICLCFISLVFLNYIIYILNSKLGLTGKSKITEHKVINVIKEVKEIEVFVNKQKIETIQVYNDELQESWQTYQILLELLTKEKVT
>NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|970223_971129_-|carbamate-kinase
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>NZ_CP011261.1|WP_011167020.1|971141_971465_-|membrane-arginine-transporter
MFIFFIPLSFLIASTSGFATAVFPLLGGVVIKNNIDILASGSITTFSFASGLVNLITPTSGIVMCSIAVARMDYAKFIKSMAPYMLILTTSSLALLLIGAAIRKTIV
>NZ_CP011261.1|WP_015545271.1|975691_976852_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|976892_978494_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase
MSIGVPRPDNKGFVYRLGYGYLHELKQYHDDPLAIIKAIIANFPLSWTKEQARTKLDEIFKEKKETKKEVLERFKGYEVVEKLFDYFNIFNDCSPTKSTTLKDVVLQLIYQRIKNPISVFNTYKTAKKEKIDTHSKNSFYRSLDYIAKNKDEILRNLNAKICANTNRKIDVLWFDATTTYFETFSREGYKKPGYSKDGKFKEDQIVIGMATDENGIPLHYKIFPGNVADPNTLIPFMLEIADIYEVNSVTIIADKGMSVNRNIRFLESKNWKYIISYRMKAGSKQFKEYILDEKDYINDGGLIYKTRDIASSYNKKRINGHFRRQIISFSQKRATKDKNDRDILIQNFTKKMNKDNLVSCDDLAGSKKYRFFKPINKGAFYELDIEKIQEDQKYDGYYVYETNRTDLSVKEVINLYSKQWQIESNFKTLKGKLSLRPMYLSTWNHIVGYICLCFISLVFLNYIIYILNSKLGLTGKSKITEHKVINVIKEVKEIEVFVNKQKIETIQVYNDELQESWQTYQILLELLTKEKVT
>NZ_CP011261.1|WP_011167037.1|978786_979086_-|hypothetical-protein
MGIKLKILTPNGTFVENKEVDIINLKTIDGDIGVLANMAPFVTALRNDTLNFKIKNTYTYIHVDQGLVVISKNQCKIITENLYLVDKQDRELPTPLKLT
>NZ_CP011261.1|WP_060954709.1|979085_980513_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta
MVSKNTTDKKKNQSIGKVIQVLGPVVDVKFSENSIPKIYDALIVDNNGKKLVLEVEQNIGDEIVRTIAMGPTEGLKRGLDVINTNSPITAPTGMEVLGRMFNVLGDPIDEKPDLDVKREPIHKDAPKYEELVATTEILETGIKVIDLMIPFTKGGKVGLFGGAGVGKTILIQELINNIAKAHNGVSVFAGVGERTREGNDLYHEFIEAGVLNKTCLVFGQMNEPPGARMRVALTGLTIAEYFRDQKNMDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLSTEMGSLQERITSTKNGSITSVQAVYVPADDLTDPAPATTFTHLDARIVLDRSIASLGIYPAVDPLASSSRVLDPEIVGQEHYDIALRVQIALQKYQDLQSIIAILGMDELSEEDKLIVQRARKIRNFLSQSFFVGEKFTGRPGVFVKVNDTVRSFKSILDGEVDYIPETYFLYSSIIDDVIEKYNKDKDK
>NZ_CP011261.1|WP_015545588.1|980521_981364_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-gamma
MPNLKGLKTEILSVKNISRITNAMQLVASAKLRKISKKVIDTHNYVSEVYSLFNDIISQVDKSVFLKDSNFETKKTLWIVINSNLGLCGGYNSNVNKLVLQNLKTNDEIFAIGSKAVSFFRSKKIKIKDQVTNIDINFTNEKAKIISNDLLAMYINREFDEIKIVYTKFINNVTFEPAIIRIFPIVKSELHFTHKQKIIFEPDADQILNNTISIYINAIIYGTVIESQVSEQASRRTAMENATNNGQNLEHELSLKYNRQRQGAITQEISEIVSGANAQS
>NZ_CP011261.1|WP_015545272.1|981365_982943_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-alpha
MSFNIKEISEMIEEQIRNYNKEIVQTEQGTVVSVGDGIALIYGLDNAIMGEFLKFPNNVYGMVLNLEESAVGAVILGDETLIREGDIVKRTNKVVETPVGDALLGRVINALSKPIDNLGPINFTKTRPIERVATSVMARRSVSQPLETGILAIDSAIPIGKGQRELIIGDRQTGKTAIAIDAIINQKNKNVKCIYVAIGQKDSTIVQVVEKLKKYGAMEYTVVVNAGASQPAPLQYLSPYVGVTIAEEWMENGNDVLIIYDDLSKHAVSYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAARVNENYGGGSITALPIIETQAGDISAYIPTNVISITDGQIFLSSELFNQGVRPAVDIGPSVSRVGSAAQIKSIKQVSGTLKLELAQYYELELFAKFGSDLDEATKATLDQGAKIIQMLIQKQHNPLEQVDQAILLLTIKSHLIKWLPVESIYNFKHEILSHFKNDKHAFELRKKLDEQKTFDDQLQQQILKEAQKVVLKITKNINEYKPGTFGNISEYQNLGK
>NZ_CP011261.1|WP_011167041.1|982954_983500_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-delta
MILKETTINNYATALFNIAVKEKLVDDYIIQVDALIKSLADKDEFNKLVTYSNKEQKKQAILIIENTFSSFGFDIYLINALKILVENQLFINTRMILKVLYKKLLAYKNIVLGEVYSTEKLTKTQLNAIKKKISNKVNKKVELVNKIDPTLIGGIKVSVEDKVFDGSIKAKLEALKKQMNT

Crispr_ID: NZ_CP011261_2

• CRISPR_ID: NZ_CP011261_2
• CRISPR_location: 975725-975861
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of NZ_CP011261_2

Consensus_repeat	Method
GATAATAGATATGATCAAAATCA	PILER-CR

spacers of NZ_CP011261_2

>2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR
TAACAAAAATAACAATTATCATAATCAGTACTAT
>2.2|975805|37|NZ_CP011261|PILER-CR
ATATAGTGATTATGATGATGACAGATATTATGATCAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP011261_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP011261_2

>merge|NZ_CP011261|2|975725-975861|PILER-CR
GATAGATATTATCAAAATGATAACAAAAATAACAATTATCATAATCAGTACTATGATAATAGATATGATCAAAATCAATATAGTGATTATGATGATGACAGATATTATGATCAAGATTATAGATATGATCAAAATTA

>NZ_CP011261|2|2|975725-975861|PILER-CR
GATAGATATTATCAAAATGATAA	CAAAAATAACAATTATCATAATCAGTACTATGAT
AATAGATATGATCAAAATCAATA	TAGTGATTATGATGATGACAGATATTATGATCAAGAT
TATAGATATGATCAAAATTA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP011261.1|WP_011167037.1|978786_979086_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|213395
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NZ_CP011261.1|WP_011167030.1|959083_959812_+|ROK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224851
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NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|960022_961624_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|227708
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|976892_978494_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|227708
NZ_CP011261.1|WP_015545272.1|981365_982943_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-alpha	unknown	unknown	gnl|CDD|236448
NZ_CP011261.1|WP_011167041.1|982954_983500_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-delta	unknown	unknown	gnl|CDD|184053
NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|961788_962694_-|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237071
NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|970223_971129_-|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237071
NZ_CP011261.1|WP_011167043.1|984075_984381_-|ATP-synthase-subunit-C	unknown	unknown	gnl|CDD|235949
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|968457_970059_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|227708
NZ_CP011261.1|WP_011167045.1|985291_985672_-|MG406-family-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP011261.1|WP_015545425.1|958844_959081_+|ROK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273246
NZ_CP011261.1|WP_011167029.1|957708_958683_+|serine-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|365903
NZ_CP011261.1|WP_011167042.1|983501_984047_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-B	unknown	unknown	gnl|CDD|349951
NZ_CP011261.1|WP_015545588.1|980521_981364_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-gamma	unknown	unknown	gnl|CDD|235535
NZ_CP011261.1|WP_011167044.1|984410_985274_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-A	unknown	unknown	gnl|CDD|235617
NZ_CP011261.1|WP_015545271.1|967256_968417_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP011261.1|WP_060954709.1|979085_980513_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta	unknown	unknown	gnl|CDD|236447

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP011261.1|WP_011167037.1|978786_979086_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|213395	cd12152, F1-ATPase_delta, mitochondrial ATP synthase delta subunit. The F-ATPase is found in bacterial plasma membranes, mitochondrial inner membranes and in chloroplast thylakoid membranes. It has also been found in the archaea Methanosarcina barkeri. It uses a proton gradient to drive ATP synthesis and hydrolyzes ATP to build the proton gradient. The extrinisic membrane domain, F1, is composed of alpha, beta, gamma, delta, and epsilon subunits with a stoichiometry of 3:3:1:1:1. Alpha and beta subunit form the globular catalytic moiety, a hexameric ring of alternating subunits. Gamma, delta and epsilon subunits form a stalk, connecting F1 to F0, the integral membrane proton translocating domain. In bacteria, which is lacking a eukaryotic epsilon subunit homolog, this subunit is called the epsilon subunit.	4.64566e-18
NZ_CP011261.1|WP_011167020.1|962706_963030_-|membrane-arginine-transporter	gnl|CDD|224207	COG1288, COG1288, Predicted membrane protein [Function unknown].	1.27544e-13
NZ_CP011261.1|WP_011167030.1|959083_959812_+|ROK-family-protein	gnl|CDD|224851	COG1940, NagC, Transcriptional regulator/sugar kinase [Transcription / Carbohydrate transport and metabolism].	6.76134e-40
NZ_CP011261.1|WP_011167020.1|971141_971465_-|membrane-arginine-transporter	gnl|CDD|224207	COG1288, COG1288, Predicted membrane protein [Function unknown].	1.27544e-13
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|960022_961624_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	gnl|CDD|227708	COG5421, COG5421, Transposase [DNA replication, recombination, and repair].	6.48484e-19
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|976892_978494_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	gnl|CDD|227708	COG5421, COG5421, Transposase [DNA replication, recombination, and repair].	6.48484e-19
NZ_CP011261.1|WP_015545272.1|981365_982943_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-alpha	gnl|CDD|236448	PRK09281, PRK09281, F0F1 ATP synthase subunit alpha; Validated.	0
NZ_CP011261.1|WP_011167041.1|982954_983500_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-delta	gnl|CDD|184053	PRK13436, PRK13436, F0F1 ATP synthase subunit delta; Provisional.	9.93019e-59
NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|961788_962694_-|carbamate-kinase	gnl|CDD|237071	PRK12353, PRK12353, putative amino acid kinase; Reviewed.	0
NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|970223_971129_-|carbamate-kinase	gnl|CDD|237071	PRK12353, PRK12353, putative amino acid kinase; Reviewed.	0
NZ_CP011261.1|WP_011167043.1|984075_984381_-|ATP-synthase-subunit-C	gnl|CDD|235949	PRK07159, PRK07159, F0F1 ATP synthase subunit C; Validated.	1.95577e-15
NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|968457_970059_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase	gnl|CDD|227708	COG5421, COG5421, Transposase [DNA replication, recombination, and repair].	6.48484e-19
NZ_CP011261.1|WP_015545425.1|958844_959081_+|ROK-family-protein	gnl|CDD|273246	TIGR00744, Glucokinase_Glucose_kinase., ROK family protein (putative glucokinase). This model models one branch of the ROK superfamily of proteins. The three members of the seed alignment for this model all have experimental evidence for activity as glucokinase, but the set of related proteins is crowded with paralogs of different or unknown function. Proteins scoring above the trusted_cutoff will show strong similarity to at least one known glucokinase and may be designated as putative glucokinases. However, definitive identification of glucokinases should be done only with extreme caution. [Unknown function, General].	3.30657e-07
NZ_CP011261.1|WP_011167029.1|957708_958683_+|serine-hydrolase	gnl|CDD|365903	pfam00144, Beta-lactamase, Beta-lactamase. This family appears to be distantly related to pfam00905 and PF00768 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase.	2.66384e-40
NZ_CP011261.1|WP_011167042.1|983501_984047_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-B	gnl|CDD|349951	cd06503, ATP-synt_Fo_b, F-type ATP synthase, membrane subunit b. Membrane subunit b is a component of the Fo complex of FoF1-ATP synthase. The F-type ATP synthases (FoF1-ATPase) consist of two structural domains: the F1 (assembly factor one) complex containing the soluble catalytic core, and the Fo (oligomycin sensitive factor) complex containing the membrane proton channel, linked together by a central stalk and a peripheral stalk. F1 is composed of alpha (or A), beta (B), gamma (C), delta (D) and epsilon (E) subunits with a stoichiometry of 3:3:1:1:1, while Fo consists of the three subunits a, b, and c (1:2:10-14). An oligomeric ring of 10-14 c subunits (c-ring) make up the Fo rotor. The flux of protons through the ATPase channel (Fo) drives the rotation of the c-ring, which in turn is coupled to the rotation of the F1 complex gamma subunit rotor due to the permanent binding between the gamma and epsilon subunits of F1 and the c-ring of Fo. The F-ATP synthases are primarily found in the inner membranes of eukaryotic mitochondria, in the thylakoid membranes of chloroplasts or in the plasma membranes of bacteria. The F-ATP synthases are the primary producers of ATP, using the proton gradient generated by oxidative phosphorylation (mitochondria) or photosynthesis (chloroplasts). Alternatively, under conditions of low driving force, ATP synthases function as ATPases, thus generating a transmembrane proton or Na(+) gradient at the expense of energy derived from ATP hydrolysis. This group also includes F-ATP synthase that has also been found in the archaea Candidatus Methanoperedens.	1.64918e-24
NZ_CP011261.1|WP_015545588.1|980521_981364_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-gamma	gnl|CDD|235535	PRK05621, PRK05621, F0F1 ATP synthase subunit gamma; Validated.	2.68007e-113
NZ_CP011261.1|WP_011167044.1|984410_985274_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-A	gnl|CDD|235617	PRK05815, PRK05815, F0F1 ATP synthase subunit A; Validated.	2.36833e-35
NZ_CP011261.1|WP_060954709.1|979085_980513_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta	gnl|CDD|236447	PRK09280, PRK09280, F0F1 ATP synthase subunit beta; Validated.	0

Protein sequences

>NZ_CP011261.1|WP_011167020.1|971141_971465_-|membrane-arginine-transporter
MFIFFIPLSFLIASTSGFATAVFPLLGGVVIKNNIDILASGSITTFSFASGLVNLITPTSGIVMCSIAVARMDYAKFIKSMAPYMLILTTSSLALLLIGAAIRKTIV
>NZ_CP011261.1|WP_060954708.1|970223_971129_-|carbamate-kinase
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>NZ_CP011261.1|WP_080512646.1|968457_970059_-|IS1634-like-element-IS1634-family-transposase
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>NZ_CP011261.1|WP_015545271.1|967256_968417_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP011261.1|WP_011167020.1|962706_963030_-|membrane-arginine-transporter
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>NZ_CP011261.1|WP_015545425.1|958844_959081_+|ROK-family-protein
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MILKETTINNYATALFNIAVKEKLVDDYIIQVDALIKSLADKDEFNKLVTYSNKEQKKQAILIIENTFSSFGFDIYLINALKILVENQLFINTRMILKVLYKKLLAYKNIVLGEVYSTEKLTKTQLNAIKKKISNKVNKKVELVNKIDPTLIGGIKVSVEDKVFDGSIKAKLEALKKQMNT
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MKLVTFASIKDNLATWNKFNGILITILLVVIIVCIISIIYNKKIRNYNIDDKMPGFLVLVNVFVASVENIVVSILGKKYQKLTPYIMYLFAYIFIGCLLSILGLEAQGTSFTVTLSMGMVTFIMIYYFGIKYQKLAFFKRFRNPVELFTQFTPLISISFRLFGNLIGGSIILGLLYGLLIGFQLSWGVNNIQVDGMTRWASYAIWNPELVENGYLKQYEYWWAGLNLFTTPIMPFLHMYFDLFSGVIQSTVFAMLTLSYWSAQIDDNEKRADLIDQVKEEITNKYQS
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MLKQTFLDKQLKKALIFNTIWWLILIIIFIVFSVIKTLNWINLISLVIAYFCSYIAIFLLFLTKLLIIKYQNPYLIYLMFLLRIGIYVIPLFIALLLSDENIFSYLGILIGYSSNLVIPFFIHKRL

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
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NZ_CP011261_1	1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR	967313-967346	34	KY065487	Streptococcus phage IPP48, complete genome	1573-1606	7	0.794
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NZ_CP011261_1	1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR	967313-967346	34	KT337358	Streptococcus phage phiARI0468-4, complete genome	35716-35749	7	0.794
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NZ_CP011261_1	1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR	967313-967346	34	KY065491	Streptococcus phage IPP53, complete genome	1572-1605	7	0.794
NZ_CP011261_1	1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR	967313-967346	34	DQ113772	Streptococcus pneumoniae bacteriophage MM1 1998, complete genome	1660-1693	7	0.794
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NZ_CP011261_1	1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR	967313-967346	34	NC_022791	Streptococcus phage phiBHN167 complete genome	30134-30167	7	0.794
NZ_CP011261_2	2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR	975748-975781	34	KX550065	Streptococcus phage SpGS-1, complete genome	1780-1813	7	0.794
NZ_CP011261_2	2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR	975748-975781	34	KT337348	Streptococcus phage phiARI0378, partial genome	35768-35801	7	0.794
NZ_CP011261_2	2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR	975748-975781	34	KY065487	Streptococcus phage IPP48, complete genome	1573-1606	7	0.794
NZ_CP011261_2	2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR	975748-975781	34	AJ400629	Streptococcus pneumoniae bacteriophage MM1 attachment site attP	78-111	7	0.794
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NZ_CP011261_2	2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR	975748-975781	34	NZ_CP009064	Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-3, complete sequence	3129-3162	10	0.706

1. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KX550065 (Streptococcus phage SpGS-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

taacaaaaataacaattatcataatcagtactat	CRISPR spacer
caacaaaaataacaattatgataatagcaattat	Protospacer
.****************** ***** .  *.***

2. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KT337348 (Streptococcus phage phiARI0378, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

3. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KY065487 (Streptococcus phage IPP48, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

4. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to AJ400629 (Streptococcus pneumoniae bacteriophage MM1 attachment site attP) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

5. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KT337358 (Streptococcus phage phiARI0468-4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

6. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KT337347 (Streptococcus phage phiARI0285-3, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

7. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KY065491 (Streptococcus phage IPP53, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

8. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to DQ113772 (Streptococcus pneumoniae bacteriophage MM1 1998, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

9. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to AJ302074 (Streptococcus pneumoniae bacteriophage MM1 complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

10. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to NC_022791 (Streptococcus phage phiBHN167 complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

11. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KX550065 (Streptococcus phage SpGS-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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12. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KT337348 (Streptococcus phage phiARI0378, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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13. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KY065487 (Streptococcus phage IPP48, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

14. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to AJ400629 (Streptococcus pneumoniae bacteriophage MM1 attachment site attP) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

15. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KT337358 (Streptococcus phage phiARI0468-4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

16. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KT337347 (Streptococcus phage phiARI0285-3, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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17. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to KY065491 (Streptococcus phage IPP53, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

18. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to DQ113772 (Streptococcus pneumoniae bacteriophage MM1 1998, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

19. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to AJ302074 (Streptococcus pneumoniae bacteriophage MM1 complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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caacaaaaataacaattatgataatagcaattat	Protospacer
.****************** ***** .  *.***

20. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to NC_022791 (Streptococcus phage phiBHN167 complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794

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.****************** ***** .  *.***

21. spacer 1.1|967313|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to NZ_CP009064 (Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706

taacaaaaataacaattatcataatcagtactat	CRISPR spacer
aaacaagactaacaattatcataatataaaaaac	Protospacer
 *****.* ****************  . *  *.

22. spacer 2.1|975748|34|NZ_CP011261|PILER-CR matches to NZ_CP009064 (Borreliella afzelii K78 plasmid lp28-3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706

taacaaaaataacaattatcataatcagtactat	CRISPR spacer
aaacaagactaacaattatcataatataaaaaac	Protospacer
 *****.* ****************  . *  *.

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	110917 : 195404	58	Bacillus_phage(15.38%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_2	199753 : 277143	59	Bacillus_phage(17.65%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_3	341926 : 429384	59	Tupanvirus(15.38%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	658929 : 761289	53	Moumouvirus(25.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	844671 : 899487	38	Ralstonia_phage(25.0%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_6	941458 : 1017183	55	Lactococcus_phage(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	1023329 : 1100974	50	Hokovirus(27.27%)	transposase,tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP011261|110917:195404|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_011166314.1|121901_122771_-	deoxyribonuclease IV	A0A2H4UU70	Bodo_saltans_virus	2.0e-26	31.5
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WP_011166316.1|123729_125865_-	peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_015545309.1|126114_127464_+	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_011167134.1|127516_128431_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166319.1|128833_129706_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase	A0A127AW70	Bacillus_phage	2.7e-60	44.6
WP_107682110.1|130114_130354_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015545528.1|130422_131184_+	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
WP_011166322.1|131247_132786_+	ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A1V0SKJ1	Klosneuvirus	1.1e-53	29.3
WP_015545552.1|133798_135025_+	threonine ammonia-lyase	A0A1W6JHY1	Lactococcus_phage	4.1e-14	27.3
WP_039275551.1|135242_136823_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_011166325.1|136834_137695_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_011166326.1|137970_138687_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166327.1|139003_140419_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_080512646.1|142010_143612_-|transposase	IS1634-like element IS1634 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_015545662.1|145438_146206_+	glucosamine-6-phosphate deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_011166334.1|146209_147883_+	PTS transporter subunit EIIC	NA	NA	NA	NA
WP_011166335.1|148014_149466_+|tRNA	glutamate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_015545613.1|149468_150683_+	HD domain-containing protein	E3T4P8	Cafeteria_roenbergensis_virus	3.3e-32	31.6
WP_011166337.1|150708_151137_+	DNA-directed RNA polymerase subunit delta	NA	NA	NA	NA
WP_011166338.1|151227_152826_+	CTP synthase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	1.2e-133	48.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_162492251.1|199753_201167_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	1.7e-64	48.1
WP_011166377.1|201208_202048_-	nucleotidyl transferase AbiEii/AbiGii toxin family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011166381.1|207025_207520_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011166383.1|208996_210007_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011166384.1|210020_211721_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	2.9e-10	43.4
WP_015545443.1|211722_213591_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	5.0e-11	40.4
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WP_011166392.1|222453_222975_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_060954612.1|222980_225425_+	DUF853 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_015545545.1|225552_226473_+	Fic family protein	A0A1V0E025	Clostridioides_phage	2.8e-07	26.9
WP_060954746.1|226874_227327_+	SocA family protein	A0A0N9SGM1	Paenibacillus_phage	2.0e-22	44.4
WP_011166397.1|227850_229005_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166398.1|229038_230325_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_060954747.1|230572_232096_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166400.1|232173_232857_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166401.1|233224_233620_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166402.1|233623_234292_-	DNA methyltransferase	A7YG95	Campylobacter_phage	1.7e-06	37.8
WP_011166403.1|234292_235096_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166404.1|235174_235588_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011166406.1|236591_236816_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_015545489.1|238215_238521_-	single-strand-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166410.1|238633_239119_-	DUF285 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166411.1|239172_240465_-	DUF285 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166412.1|240519_240651_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_148639449.1|241169_242581_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.0e-65	48.5
WP_015545564.1|243871_245701_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	1.6e-22	24.3
WP_011166415.1|245732_246497_-	Eco47II family restriction endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_011166416.1|246489_247515_-	DNA cytosine methyltransferase	F2Y148	Organic_Lake_phycodnavirus	8.6e-82	47.0
WP_060954613.1|247507_248779_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
WP_011166418.1|248768_249662_-	guanylate kinase	A0A0M5KCK5	Mollivirus	1.4e-11	33.1
WP_039275580.1|249664_250222_-	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
WP_011166420.1|250295_250898_+	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	1.6e-06	33.0
WP_011166421.1|251087_251633_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	5.7e-08	29.7
WP_011166422.1|251658_251850_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_011166423.1|251868_252234_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_011166424.1|252598_253654_+	spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	6.2e-35	38.2
WP_011166425.1|253653_254646_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_060954615.1|254630_257759_+	ABC transporter permease subunit	Q6GZ01	Mycoplasma_phage	1.4e-13	29.4
WP_015545546.1|259196_259874_-	chromate transporter	NA	NA	NA	NA
WP_015545410.1|260470_260608_-|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_060954857.1|260816_262229_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_015545555.1|263818_264850_+	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011166435.1|266606_267290_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_011166503.1|345926_346829_-	ribosome small subunit-dependent GTPase A	NA	NA	NA	NA
WP_011166504.1|346838_347954_-	serine/threonine protein kinase	A0A1V0SDC3	Indivirus	7.6e-15	29.0
WP_015545512.1|350254_350671_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA
WP_011166509.1|350672_351236_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
WP_060954632.1|356789_359930_+	STREFT protein	NA	NA	NA	NA
WP_162492245.1|360780_362382_+|transposase	IS1634-like element IS1634 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_011166518.1|365328_366456_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166519.1|366433_367138_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	2.7e-18	30.9
WP_011166520.1|367140_368973_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_060954634.1|370731_371412_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015545294.1|371392_372817_+|tRNA	proline--tRNA ligase	A0A2K9L3R9	Tupanvirus	1.5e-84	34.6
WP_015545652.1|372829_373447_+	ribonuclease HI	A0A2H4JH24	uncultured_Caudovirales_phage	3.5e-30	36.1
WP_011166525.1|373448_374336_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166526.1|374359_376162_+	elongation factor 4	E4ZFJ7	Streptococcus_phage	7.2e-23	25.7
WP_060954635.1|376188_376995_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_060954636.1|377011_378736_-|tRNA	aspartate--tRNA ligase	A0A2K9L0E9	Tupanvirus	1.9e-17	28.1
WP_060954765.1|378744_379989_-|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A1V0SFH3	Hokovirus	1.9e-22	28.4
WP_013729457.1|380173_380527_+	30S ribosome-binding factor RbfA	NA	NA	NA	NA
WP_011166532.1|380576_381455_+|tRNA	tRNA pseudouridine(55) synthase TruB	NA	NA	NA	NA
WP_011166533.1|381441_381996_+	FAD synthetase	NA	NA	NA	NA
WP_080512646.1|384484_386086_+|transposase	IS1634-like element IS1634 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011166536.1|386127_386997_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166537.1|387206_387488_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_060954639.1|387512_389291_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_011166540.1|389503_389770_+	30S ribosomal protein S15	NA	NA	NA	NA
WP_011166541.1|390000_390645_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_139589001.1|390700_392126_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.1e-65	48.5
WP_060954640.1|392150_394013_-	translation initiation factor IF-2	E3T4N3	Cafeteria_roenbergensis_virus	5.3e-21	23.7
WP_011166543.1|394034_394334_-	50S ribosomal protein L7ae	NA	NA	NA	NA
WP_011166544.1|394320_394608_-	YlxR family protein	NA	NA	NA	NA
WP_039275603.1|394582_396337_-	transcription termination/antitermination protein NusA	NA	NA	NA	NA
WP_011166546.1|396345_396840_-	ribosome maturation factor RimP	NA	NA	NA	NA
WP_011166547.1|396953_397604_-	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_060954641.1|397616_402065_-	PolC-type DNA polymerase III	A0A0A7RWA3	Clostridium_phage	4.5e-18	31.5
WP_011166549.1|402073_403099_-	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_015545634.1|403298_404375_-	aminopeptidase P family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166551.1|404519_405530_+|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	A0A0U2SGL3	Niemeyer_virus	6.2e-08	25.9
WP_015545599.1|405558_406428_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166553.1|406540_407173_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166554.1|407402_408473_-	DNA recombination protein RmuC	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_011166786.1|683357_685133_-	molecular chaperone DnaK	A0A1V0SH73	Hokovirus	4.7e-128	46.5
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WP_013729691.1|685792_686815_-	heat-inducible transcription repressor HrcA	NA	NA	NA	NA
WP_011166789.1|686819_688961_-	AAA domain-containing protein	K4FB40	Cronobacter_phage	2.3e-116	36.5
WP_015545416.1|689124_689991_-	Cof-type HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_011166791.1|689990_690536_-|tRNA	tRNA (cytidine(34)-2'-O)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011166792.1|690548_691151_-	RdgB/HAM1 family non-canonical purine NTP pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_015545590.1|691351_693850_+	MOLPALP family lipoprotein	NA	NA	NA	NA
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WP_015545383.1|695284_696832_-	ATP F0F1 synthase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MAKFSAIITDKVGLHARPASVLAKEASKFSSHITIMVGEKQGNLKSIMNVMAMAIKTGTEVTIQADGNDEEQAIQAIKQTMIDTALIQG
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MYKQRWEIELVNDFYKNTLELDSVKVDDDLSVYADELLIIGYRIKINLKMQVYLKLKHIEK
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MEFKKELKEIIKNAIFHTVGTNAKTYLKRFKDKYSEFNSFYISPNSKINNNINVMNENDKEIDIFTSDATYDQFCLVLTAFGYIKNVNGNWKIINKELSTKQVADNIFSKSLNKNVSIYRQSKIITLLVNLNIINESNYQDFKLKGKRTNQVKIKNLKAEVSPWEKDVCSDAELITYCLKKIENYEFIKKEK
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MSNRFNKEFWKELAHDFMFELNDEDLENLMSVEDKLFDDFKKITSIDTTDVEPTFYTVNQIHSYLRDDEPIQTNCQKEILENAPTKHDDYITIARVVK
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MYLTRKKIKKTISIGSLSSLLLMPLVAASCKKNGNDEKFQIINNESNPQTSNQMTPPILLMIMMIGLIKMRKQTIIKIQNLQ
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MSKDKALLRINQLKEQLNLWSKQYYVDDNPSVDDTEYDLALKELISLETLYPELITSDSPSQKVGGMVSEKFLKITHKTPMLSLGNVFSFDEFLDFNTQISKISNTLDNQYVAELKIDGLSISLVYENGSLVSAATRGNGVVGEDVTINARTIKSIPLKISKKERVEVRGEIYLSKAEFEKINQKRLLNNEDLFINPRNAAAGTLRQLDSKIVASRNLDAFLYYYISDDSNNLTQYQSILKLNELGFKTNKETMLCKNLDEIKAYIDKYTNLKNDLDYQIDGIVFKINDKNLQNSLGFTSKIPKWAIAYKFPAEIKQTKLLDIFATVGRTGKITYNAKLEPVFLMGAKISAATLNNAEYIKTKDLRINSIVKIKKAGDVIPEVIEAIKDEDFYKLEKFKPALYCPNCHSLLEKNENEVDQFCINSSCSMKILRSLQHFSSREAMNIVSLGDRSLEILFNLKIIQNISDIYKLEEYKDQILAIDNFGLKSYLNLIDSINMSKNNSLEKVLFGLGIRHIGSKTAKILARKYQNIDNLMSASYDELIQINSIGESLALSIIDWFKIEDNLKLIDELKSFNINFNYLGAKINSDSIIANKSFVITGTLTRPREEFKTLIENNAGKVIGSISKQTDYLLAGNNVGSKLEKAKKLGVKIIDEQQFFDLLKSEKG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_011166932.1|847867_849874_-	NAD-dependent DNA ligase LigA	A0A0K2QQN8	Ralstonia_phage	1.5e-101	35.1
WP_011166933.1|849877_851899_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166934.1|851901_852810_-	RluA family pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_011166935.1|852812_853781_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_011166936.1|853837_854107_-	HPr family phosphocarrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_060954695.1|854171_856340_-	UvrD-helicase domain-containing protein	A7KV33	Bacillus_phage	3.2e-94	35.1
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WP_011166939.1|857111_858068_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_060954696.1|858356_858674_-	DUF285 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166941.1|858679_859213_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166942.1|859546_860476_-	peptide-methionine (R)-S-oxide reductase MsrB	NA	NA	NA	NA
WP_011166943.1|860589_862773_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_060954698.1|865377_866280_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166947.1|868250_868829_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015545618.1|868831_869671_-	hypothetical protein	O80242	Mycoplasma_phage	4.0e-77	60.3
WP_015545388.1|871909_873802_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_060954699.1|873813_874713_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_162492250.1|876567_876705_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_039275742.1|878185_880018_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_011166955.1|879981_880731_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	8.1e-13	31.4
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WP_162492250.1|891671_891809_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_060954702.1|894896_896210_-	BspA family leucine-rich repeat surface protein	NA	NA	NA	NA
WP_080512646.1|897885_899487_+|transposase	IS1634-like element IS1634 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MHSNVKKVTDKDVIKPVGIPFVVYFSSISNNTHRFIQKLEIENIRIPYELDQSISVNRDYVLVTPTYSGGGEYVEGAVPKQVIKFLNNKENRSFCRGVISSGNTNFGDTFGIAGPIISKKLNVPFLYQFELLGTQHDVSQIKQILFRFWEDGNNERK
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MKKILGIDLGGTSAKVGVISQNGDLEHSFSITNPKTKIIENLYFEISKILKTLNVDENDIMLVGITAPGGLLIIIKEL
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MIIFTQQSHIPTWAVYLILVLGFFGLIISLYGASTAFKYNKNLKNKNNYKKVLNLLSTRQAYSWTQIDNIDQQGYFLIGITLKDSDDNKNKPLITLLKITDLKTDISKFKSNINDYKNIINYLKQYNLTTKNLVFIIIEKVENLDELDKLLIEWNSLISA
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MSEHLIVKNKKAYFNYEIIQTYQAGIVLNGPEIKSIRNHDVSINEAFVLIRKKEIYILNMNVKKYQFANYIKGLEETRTRKLLLHKKEIIKILNKIKQENLTIIPVKLYFKNDYVKLEIALAKGKKLHDKRQTIKKRDTERKELKNYK
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MLLMLVVKTELIVNLGILGFGILFILLGLFLFWKQKNKNRYSFENQNRESKNAWEFVKKNFYLLVLTIGFLFIITAIITLITK
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MLHTAFISNILANYLGAMSIILPNILTVSGDIKYIGAGLASVGILGTGVGQGLIGQGACLAIGRNPEMASKVTSTMIVSAGISESGAIYSLVIAILLIFVV
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MISRYQVKEITDIWSDQNKYNTWLKIEQLVTNGWAKIIKINKDDLFKINNDLKVDLNRMLEIEQETKHDVVAFTRMLSEQLDNESKWIHLGITSTDIVDTAQNYLIKQSNQIVFNELENILKTLKTLAIEHKNTLIMGRTHGMYGEPTSLGLKFCLWYDEFLRHIKRFELARNDIEVVKISGSMGNYANLDPQIELYVANKLNMNIDSLSTQVSQRDRHIFLVEVLANIASTLEKISTEIRLFQRSDVNELAEGFLKNQKGSSSMPHKKNPISSENVAGLSRYIKSIVHIVLENNNLWHERDISHSSNERIYLPDIFNLIVYILKRMNETLTNLVINKTQMLEHIKQAKNIYFSQRVLTFILLEQPNVTRDQVYDLIQQITFKCSKNNLDFKTEVLNSKLTEFVLIDKLEQLFDDQFFLRHVDYIFNRVFNK
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>NZ_CP011261|941458:1017183|992344_993313_-|WP_011166340.1|DBSCAN-SWA
MKIKLLILTIAKLSLLSFSSILFLKNENHFNINYKMKMEMKTQKTEQPHKYKEGDRTEIVQIGFYKRGNEITIKQIPYYVKKVPDKLPDEIQSLYRAFAHRYKDQNHPTVTGFEKWDTSKIKNMSYVFYDNQLIDADLSEWKTSNVTNMDGMFKNAIKFNNKEKPLKWNTEKVESMESMFDGAESFKQNLKDWKVDKVTKNKNFSRASGIFEHIDKKPSWKITEHNDPIIKKPESTEPKVIIHPSPSRPKQTIPLTKLINPIIKSTPNSNQNLGIPKTNLSTTPQQSKKLSTPAIVGIVVGSQVVLTSLAAGIPYLIKRFKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_015545429.1|941458_942757_-	adenylosuccinate lyase	A0A1B3B081	Gordonia_phage	5.5e-17	30.2
WP_011167008.1|942749_944048_-	adenylosuccinate synthase	L7Y4J5	Megavirus	2.1e-56	34.4
WP_015545587.1|945751_947914_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	V9VI16	Lactococcus_phage	1.2e-162	44.3
WP_011167010.1|947900_948374_-	class Ib ribonucleoside-diphosphate reductase assembly flavoprotein NrdI	R4JF54	Bacillus_phage	7.9e-14	35.0
WP_011167011.1|948382_949402_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	B5LJM6	Mycobacterium_phage	1.9e-97	53.7
WP_013729883.1|949703_949988_+	preprotein translocase subunit SecG	NA	NA	NA	NA
WP_011167012.1|950023_952138_+	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	1.9e-59	32.2
WP_011167013.1|952147_952594_+	SsrA-binding protein SmpB	W5RAM5	Staphylococcus_phage	4.1e-20	37.8
WP_011167014.1|952593_953076_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080512646.1|953368_954970_+|transposase	IS1634-like element IS1634 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_060954707.1|955113_955365_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011167016.1|955414_957445_+	PTS transporter subunit EIIC	A0A2I7SAJ6	Vibrio_phage	8.7e-09	45.5
WP_039275770.1|957422_957614_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011167029.1|957708_958683_+	serine hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_015545425.1|958844_959081_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011167030.1|959083_959812_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011167020.1|962706_963030_-	membrane arginine transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_060954708.1|970223_971129_-	carbamate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_011167020.1|971141_971465_-	membrane arginine transporter	NA	NA	NA	NA
WP_015545271.1|975691_976852_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080512646.1|976892_978494_-|transposase	IS1634-like element IS1634 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011167037.1|978786_979086_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_060954709.1|979085_980513_-	F0F1 ATP synthase subunit beta	NA	NA	NA	NA
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WP_011167045.1|985291_985672_-	MG406 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_015545345.1|985812_986436_-	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_060954710.1|986535_987777_-	serine hydroxymethyltransferase	A0A219Y950	Aeromonas_phage	4.7e-98	51.3
WP_015545390.1|987760_988204_-	ribose 5-phosphate isomerase B	NA	NA	NA	NA
WP_011167049.1|988282_988579_+	rhodanese-like domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011167050.1|988587_990774_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_011166340.1|992344_993313_-	DUF285 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011166339.1|993327_994290_-	BspA family leucine-rich repeat surface protein	NA	NA	NA	NA
WP_015545406.1|995255_996662_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015545297.1|999471_1002129_+	HAD-IC family P-type ATPase	M1HI01	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	9.9e-37	25.4
WP_011167059.1|1002187_1003726_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_015545684.1|1003697_1004378_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015545437.1|1004523_1006104_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_015545630.1|1006207_1006804_+	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011167064.1|1007499_1007700_+	DUF951 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_060954713.1|1007735_1008830_+	redox-regulated ATPase YchF	NA	NA	NA	NA
WP_039275787.1|1008801_1009509_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_015545529.1|1009577_1011344_+	YfcC family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_015545554.1|1013712_1015176_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011167070.1|1015282_1015573_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080512646.1|1015581_1017183_-|transposase	IS1634-like element IS1634 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP011261|1023329:1100974|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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MEKEINIDQVEQVEQVEHIKPKNTQKISKTTKKKLKVKKEKEPKNFRTWFKELPVRMSKEFFKIRWTSSGSLGKKFLIVIIFMSIFALLFFGVDVVIQYLFRLIKAI

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_011167097.1|1049472_1049676_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011167098.1|1049925_1050864_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_015545575.1|1052862_1053897_+	ribose-phosphate diphosphokinase	V5KSY5	Escherichia_phage	2.1e-19	32.3
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WP_060954722.1|1055444_1056761_+	replicative DNA helicase	A0A1P8VVQ6	Streptococcus_phage	1.0e-71	38.3
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WP_060954723.1|1058271_1059198_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011167108.1|1059206_1060532_+|tRNA	cysteine--tRNA ligase	M1PG92	Moumouvirus	1.9e-52	34.6
WP_011167109.1|1060533_1061268_+	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_013729926.1|1061328_1061490_+	50S ribosomal protein L33	NA	NA	NA	NA
WP_060954724.1|1061489_1061813_+	preprotein translocase subunit SecE	NA	NA	NA	NA
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WP_011167115.1|1072869_1073880_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_015545361.1|1073887_1075333_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	1.4e-13	29.7
WP_011167117.1|1075325_1076660_+	ABC transporter ATP-binding protein	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	1.0e-05	25.2
WP_080512646.1|1076759_1078361_-|transposase	IS1634-like element IS1634 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080512674.1|1078563_1078827_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011167119.1|1078823_1079750_-	NAD(P)-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_011167120.1|1079762_1080767_-	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A1V0SG19	Hokovirus	1.2e-48	35.2
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WP_060954726.1|1086622_1087549_-	UDP-galactopyranose mutase	NA	NA	NA	NA
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