Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014223 | Anaerotignum propionicum DSM 1682 strain X2 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,RT,WYL,DEDDh,cas4,cas3 | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
757959 : 767453
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014223|757959:767453|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014223|757959:767453|764791_765994_-|WP_066047956.1|integrase|DBSCAN-SWA MAKKKNTVRADGRIAVQVYLGEFDGKRKYKTVYGKNQKEAEAKAQELKSSMYRGIDITADRDTFEFWMEAWCALKSTEVTHGRMESYKRSLKKYEPLYSLPITRLKTADFQQIILTLAKENPNTGEPSAKSSLKQIRSVGLQVCQLAIDNRVMDYNPVGPVKIPRVPQGNIRRALTQEEQQWIIDTPHRAQTAAMIMMFAGLRRGELLALTWSDISFKDATIDINKTVEFINGQPVLKNTAKSKNSIRTINIPDILVDFLHEKKKICTDSVIVCPSAKGQLMSEISWRRLWDSYLTDLNIKYGNFRNQISGQPKSKFQPQGVPCVIPRFTAHWLRHTYATMLYFAEVDVLTAKEQLGHSDVQTTLNIYTHLDGKHKRKSMDKLNSYLAGGTNNNSPIAKI >NZ_CP014223|757959:767453|759628_760144_+|WP_066047949.1|DBSCAN-SWA MSNANNQQFAVSIIVSNQSGTLTRISSLFSQRNFNIDSFTCGETINPEVSRMTITATGDANKKDQLLKQISKLYDVKKVELMTTDNTILRELLIAKVNATGENLQTILEAANVFRSKVVDMSPGSVCIEITGESSKLNAFLTYVAPYGILEYCRTGLIAVERGSKCLYGVE >NZ_CP014223|757959:767453|760122_761163_+|WP_072743437.1|DBSCAN-SWA MLIWCRVISKYNYKGECKMAKMYYEQDAKKEMLAGKKVAVVGYGSQGHAHALNLKDSGADVVVALYEGSKSKARAEADGLTVMTTPEAVKAADIIMILVNDETQAKMYQADIKPYLKSGSTLAFAHGFNIHYGQIVPPNDVDVIMIAPKGPGHVVRSTYKEGFGVPALIAVFQDASGNAKDVALAYADGLGATRAGVLETTFREETETDLFGEQAVLCGGVSALMKAGFDTLVEAGYQPENAYFECIHEMKLIIDLVVKEGLSFMRYSCSDTAEYGDYTAGPKIITEQTREAMRGILKDIQDGSFAREWILENQANRPHFNAMRRMQKAHLSESVGAELRSHMRQH >NZ_CP014223|757959:767453|757959_759618_+|WP_066047947.1|DBSCAN-SWA MELSGCQILIETLIEQGVTTLFGYPGGTVLSIYDELYKNRHRINHVLTAHEQGAAHAADGYSRASGQVGVCVATSGPGATNLMTGLATAKADSIPMVAITGNVPMELIGSDSFQEVDTFGLSIPVTKHSFRVDNVETLAETVREAFRLAKSGRPGPVLVDIPKNIQLDKTEYAPKGIAEKLTDSKPDTALLDQAVKMINESKSPVIYCGGGVINANCSEIITKLIEKTDAFMVCSMMGLTAMDNCHPKYLGMSGMHGRFAATKAISECDLVIAAGVRFTDRATGNRSKFAPKAKIIHLDVDSAEHGKNIDATLQISGDLYFALCYINSKLEPQKHPEWEEEVRGYKNKTKEVSLPKGYLLPGQVIGAVNCRATPETNIATDVGQHQMWVAQYYNFKKPRTLQTSGGLGTMGYGMGAAIGAAMATGNKTVLFTGDGSFGMNLNELATAVSQELPLIIVVLNNGVLGMIRQWQNLFFENHFMSSNLERKTDFVKLAEAFGATGLRAANLEELDKAMDKAFALNNPVLIDCLIPDEENVFPMVPPNGSMDDIILK >NZ_CP014223|757959:767453|766128_766587_-|WP_066047958.1|DBSCAN-SWA MNKYDYLLDIAERNGVMVCEKQFKSDAKGLCKGSKIGISKDLANAEKACVLAEELGHYFTTVGNILDQSIENNRKQEKVARVWGYNHLIRIDDLIQPILDGCSNIFEVAEFLEVTAECLLEIIGAFKEKYGAVYIAGEYKIIFNDYGYCVLN >NZ_CP014223|757959:767453|766611_767052_-|WP_066047961.1|DBSCAN-SWA MKVGERIRLQRKKIGMSADQLADIIGTSRSTIFRYENGAIEKMPTSALEPIAEALRTTPAYLMGWVNSEDNERFALSIDADNIIVELEKLNELGRKEAIKRVEELTHINKYSAKSKINHLTPIAAHNDNADDEDQQNLMKKDIDEL >NZ_CP014223|757959:767453|767231_767453_+|WP_066047963.1|DBSCAN-SWA MNTNMQLLKGKIVERQTTQEAVADAVGIDRSTFYRKLKTNGMSFSIAEAHKIVAAIPLTMEEAMAIFFDNTVA >NZ_CP014223|757959:767453|761544_762147_-|WP_066047953.1|DBSCAN-SWA MDKHKIITISRQYGSGGRIVGKLLAERLGIPFYDNEIISLAAEKTGLSKECFVNAEETSTGNLLLSLTTLTPSVESFGLPLNEKIFLVQSQVIKEVAEKGSCVIVGRSADYILSETENCINVFLQADLKDRINRAVAQYDLPEKNAEASVIKTDKRRANYYNYFTGLKWGAAENYDLILNTSRMDLEKIVDVIEKYVSLI >NZ_CP014223|757959:767453|762431_764243_+|WP_066047954.1|tRNA|DBSCAN-SWA MGEALAGLKRSCMCCDVNETMIGKEVTVMGWVQRRRDLGQLIFIALRDKTGLVQIAIDGNVAEKELFEKAESVRSEFVLAVRGQVAPRTEGNINPNMKTGTIEIIATELRILSEAETTPFQIEDNISVKDDLRFKYRYLDLRRPSQLNNLVLRHKVVQVMRNFLDQENFLEIETPILGISTPEGARDYLVPSRVHPGSFYGLPQSPQQYKQLLMVSGMDRYYQIAKCFRDEDLRADRQPEFTQVDMELSFIDVEDILDINERMMQKVFRDILNVEIPLPLKRMTYKEAMERFGSDKPDVRFGMELVNISEVVGDTDFVVFKTALEAGGSVRAINAKGCGAFPRKKIDSLVEFVKTYRAKGLAWIAINEDGSLKTQIAKFFTEEKLAEIVERMDGKPGDLILICADQDKVVFDSLGALRLELSKMLELTKADDFNFLWITEFPMLEWDEEAGRFVAVHHPFTAPMDEDIDLLETDPGKVRAKAYDIVLNGYELGGGSIRIHRRDVQQKMFGLLGFTMEDAQQRFGYFLDAFKYGAPPHGGLAFGLDRIIMLMCGASSIRDVIAFPKVKDASCPMTDAPTVVDEKQLDELAISIKKEILVSEEAE |
9 | Ostreococcus_tauri_virus(16.67%) | integrase,tRNA | attL 749373:749387|attR 768745:768759 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
770576 : 790502
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014223|770576:790502|DBSCAN-SWA TATGAGCCATGCTTTATTATCTGCAAGTGCGGCCGATAAGTGGCTGCACTGCACCCCCTCAGCTAGAATGGAGTCAGTTTTGCCAGACACTGCAGGGGAGTCTGCCCAGGAGGGATCTCTTGCCCATGAGCTGGCCGAGTTAAAAGCAAGACGACATTTTCATGGAATGGATAAGGGCGCCTTTACCCGTAAGTTTAACAAAATAAAGAGCAACGAATTGTATATTGTGGATATGGATCACGATACGGACACATACGTAGAATACTTAAAAGATGTTGAAATGATGTTTTCTTCAAAACCCTATGCGGTGTTTGAAACGAAAGTGGACTATTCCCATATTGCTCCTGAAGGGTTTGGAACCGCCGATAGTATTATGATTGGTGGAGGACATCTTCATATCGTGGACTTTAAGTATGGGAAAACCGTTCAAGTGGATTGCGTAGATAACCCACAAATGAAGCTGTATGCTTTGGGCGCTTTGAAAAAGTATGATCTTTTATACGACATTAAGGACATTACCTTACATATTGTACAGCCTAGAATGAGCAATATTTCTTCTTGGACGATTAATTGTGAGAACCTAAATACTTGGGGTGAAAGCATTAAGCCCGTAAGTCAAATGGCATTCGATGGTTCAGGTGAATGCGTTGTGGGCGGCTGGTGTGATAGTCATTTCTGCAAATGCCGTGCTACCTGCAGGGCGTATATGGAACGTATGCAACGTGTAACACAATTCATGGACAAGCTTCCACCCGTACTTACGGATGATGAAGTGGGGCAGTGCCTTACCTTAGCAGCTGACATTAAAAAATGGTATTCCCTTTTAGAAAAATACGCAATGACTGCGCTGCTGGAAGGCAAAAACATTGCCGGTTGGAAAGTAGTAGAAGGGCGCAGCAACAGGGCGTTCAATGACATTGACCAGGCATACAAAGCCTTATCTGTATCAGGGATAGACGAATCTTTGCTGTACAAGCGAGTGCCCATCACTCTTACAGATTGCGAAATTATGCTAGGGAAAAAAGGTTTCTCTGAAATGCTGGCGGATTACGTTGTAAAACCTCCTGGCAAACCCACTATTGCTCCGGAGAGTGATCCAAGAAAGAACTATAACCCTGCAATGGCAGATTTTGCAGGACTTGAATCTAATAAATAATTACATATTGAAAGGATGATTTTATGTATCAGAATATCGCAACAAAATGCCTCACAGGTGAGGTAAGAATTTCTTTTGAGCACCTTGCAAGACCTTACAGCAATAACGGCGGTGAGCCAAAGTACAGCTGCACGATTTTAATTCCAAAGACAGATACCGCTACATATAACGACCTTCTTTCGGCTTTGCAGACTGCTTATGAGCAGGGGGTAAATGATAAGTGGAAAGGCTCCCGTCCTCAGTTGAGATACCCTGTAATTTACGATGGCGACGGCGTTAGACCTTCAGGGGAAGCCTTTGGTGTGGAGTGCAAGGGTCACTGGGTTGTAACTGCATCCAGTAAGCAACAGCCCCAGGTGGTACATCAATCAAATGTTTCTGTGCAGTTGGCCGAGACGGATATTTACAGCGGTATGTACGCCCGTGTTACAGTAAATTTCTTCCCTTACGAAAGCAGTGGAAATAGGGGAGTAGGCTGTGGACTGGGAAACGTCATGAAAACAAGAGACGGTGAGCCCTTAAGTGGCAGAGCAAATGCAGAGAATGACTTTGCCGGTGCAGGAACGCCTGCAGCTGCAATGCCAATGGGCGGCCCCGGAATGCCTGGATATGCGGCAACTCCTATGGGAAACGCTGCAATGCCCGCTGCTTATAATCCTGCCCCCAGATATGCCCCGGCAGCACCTACAGGCAATATTAACCCAATCACCGGCTTACCTATGTAATCGGGTATGAGGGGGCACATATCCGTCGATATTGAAACCTTCTCCTCCGTTGATATTAACAAGTCCGGGCTTTACAAATATGTTCAAAGCCCGGATTTTTCAATCTTACTGTTAGCTTATAGTATTGACGGCGGGGCGGTGGAAATTATCGACCTTACGAAAACGGAGTTACCAATTGTTATTAAACATTGGCTTTTACATTCTGGTCACATAAAACATGCTTATAATGCTGCCTTTGAGTGGTACTGCTTGTCGAAGTATTTTGGTCTAAAGGAAGAGGAAAGAACAGAGTGGTTGAAACAATGGCGTTGTACGATGATGCATAGTCTTTACTGTGGTTACGTGGCTAAACTGGAGGATGCGGGCAAAGCAATAGGATTGCCGCAGGAAAAACAGAAATTAGCAACAGGGAAAGCTTTAATCAAAACTTTCTGCTCACCCTGTAAACCTTCAAGATCCAATGGAAACAGAACGAGAATTCTACCGGAACATGAGCCGGAACGGTGGAACCTTTTCAAAGAATATTGTAAGCAGGATGTTGTTACAGAGATGGAAATTGAAAATAGGCTGTCTCATTTTCCGGTACCTGATTTGGTGCAGGAGCAATGGGTTTTAGATCAGATACAGAATGAGAGAGGCGTTGCCATAGATCTTGATCTGATAGATGGGGCGTTATATTGCGACAGTGTGGCAACGGAAAAGGCAACAAATATTTCTAGGGCAATTACAAACCTTGAAAACCCTAACAGCCTGGCACAGCTAAAAAAATGGATTGGAGAAAGAACGGGAATAAAAATCTCTAGTTTAAATAAGGAAACTGTGGGTGATATGCTGGATGCGGAAATTCCCGTTTCGGTTCGGAGAGTTTTGGAGTTGCGGCAGCAATTGGGAAAAACAAGTGTATCAAAGTATAAGGCTATGACACGGGCTGAATGCACTGATGGAAGATTGCGTGGATCTCTCCAATTCTACGGTGCGAACCGCACAGGAAGATGGGCGGGACGATTGGCCCAGGTGCAGAATCTTCCAAGAACGTACCTCCATGGTGCAGAGTTGGACTTAGCAAGAAAGTTTGTGAAATTGAAAAATCCCAATGCCATACAGCTGACCTTTGGTAGCGTGCAGGATACCCTTTCCCAGCTAGTAAGAACGGCATTTATACCCGAGAAAGGCAAAGTTTTTGTGGATGCTGATTTCTCTGCCATTGAGGCAAGGGTGGTTGCTTGGCTTGCGGGGGAAAACTGGGTTCTGGAGGTATTCCGTACCCATGGAAAGATTTACGAGGCCACAGCGGCGCAAATGTTTGGGGTACCTATTGAAAAGATTGTAAAAGGAACACCCGAATATGCATTAAGACAAAAGGGGAAGGTTGCCACCCTTGCCCTTGGATATAATGGTGGACCAGGGGCACTTATCAACATGGGTGCGTTGAAAATGGGGATACCTGAGGAAGAATTACAGGAAATTGTGTATAAATGGCGAGGTGCAAATCAAGCAATCGTTCGATGCTGGAAAGCCCTGGAACATGCAGCCATACAAGCAATTAAAACTGGCAGAGCTGTTGGTACCCATTGTCTGGTGTTTGCTAGAGAGGCAGACATTACAAAGGGGCAAGACTTCCTTACAATATTGCTTCCTTCAGGGAGAAAGCTTTTTTATGCAAAACCTCATTTAACTTTAAACCAGTGGGGAAATGAATCCATTGGATATTATGGAATGAACCAGACTTCTAAGAACTGGGAACCTACAGAAACCTATGGAGGTAAATTAACGGAGAATGTGGTGCAGGCCATTGCAAGGGATTGTTTGGCGCATACCCTAACTGTTTTGGAAGCCCAAGGGTACAAAATTGTTTTCCATGTTCACGATGAAGTTATTATCGAAATAGAAAAGGAGAAAGCTGACCTTGATAAGGTTTGCCAGATTATGAGCCAACCCATACCCTTTGCACCGGGATTGCCCATGGCTGCAGATGGCTGGGTGGGGGACTATTTTACGAAAGACTGAGGTGACAAGTTTTGCAAAATGACAGACAAATAACCATATCTACTGCAGGTAGCAGAAAGGCCACGAACTGGCAGCCTCAGACCATGCGTATAGCAGAATTATTTGAAAAGCTTCGCACTCCTTTGCGGGGAAAAGAAACTCTTTCGGCTTATATGAGCATGAAAAAGCACCAACAGGATGAGCTGAAGGATGTGGGGGGCTTTATTGGTGGCAACCTGACAGGACGTCGTAAAAAGGGTGCGGTATTAAATCGTGATGTAATTACACTGGATATGGATAATTGCCCCCCTGAAAGCACAAAAGCAATCCTGCAACGCCTTTCCAGCTTAGGCATGATGTATGCTGTTTATTCTACAAGAAAGCATAGCCCCGCAGCGCCTAGACTTCGTGTTGTGGTGCCGACTGATAGAAAGATGCTTCCGGAAGAATACGAACCCATCGCCCGTAAATTGGCGGCACTGGTACAGCCGGAAATGCATTGGTTTGATCCCACGACTTTTCAAGTGGAACGTTTAATGTATTGGCCCAGTTGCTGTGTAGATAGTGAGTACATATTTACTTATGAAGATAAGCCGTTATTGTCTGCCGACGGAATGCTTGGCACCTATGAAAATTGGTTAAATGTTGCCTCTTGGCCACAAGTGCCGGGAGAACAGAAACTACGAGAGAGGTCAGCGGCAAAGCAGGGAGATCCAACAGAAAAGAAAGGTACCGTAGGTGCATTTTGTAGGATTTACAGTGTCGTGCAGGCAATGGACACCTTTCTACCCGGTGTTTATGCGCCTACGGAGCAGTCTGACAGATACACATTCGTAGGTGGTTCTACCACAGGCGGTGCCATCATTTATGACGATGAAAAATTTCTTTTTTCCCATCATGCCTCAGATCCATGCAGTGGACAGTTGGTAAATGCCTTTGACTTGGTTCGACTGCATTTGTTTGGTGAACAGGATGATGAAGCAAAAGAAGGTACCCCTACTAATAAATTGCCCAGCTATGACCTGATGTGCCGTAAGGCAATAGAGGATAAGGACGTTCTTGCGCTGCTCCAAAAAGAACGTATGGAGCAAGCGGAAACAGAATTTAAAGATATACAAGAAGGCTTTGCAGAA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23 | Faecalibacterium_phage(37.5%) | portal,capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
862925 : 873898
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014223|862925:873898|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014223|862925:873898|865236_865707_+|WP_066048144.1|tail|DBSCAN-SWA MSNITMLSKDAISAKKAECFITIEGNRYNFMSAISVEAKMEKTKAEVPILGRMNKGHKAVGANGTGSATFHYNTSIFRELMKRYQDTGEDVYFDMQITNEDPTSNVGRQTIILRDCNIDSMVIAKFDADGEYLDEEMEFTYESFEMPETFQMLSGM >NZ_CP014223|862925:873898|865727_866147_+|WP_066048146.1|portal|DBSCAN-SWA MSLSAFLNPVKEETCKVVASKRFIDEDGKPVEWELRTITADEDEAIRKACTKRMPIPGRKGQFSQETDLNKYLGLLAVSCTVYPNLNDVELQNGYGVMGADNLLKTMLHAGEYTQYVSKVQELNGYDSSMDELVEEAKN >NZ_CP014223|862925:873898|872094_872286_+|WP_066048163.1|DBSCAN-SWA MADFTANYNLEKPAQSDFYNVEVQNKNMDKIDTALAGAKYIISPSGEKYKWGMDTDGLFLEEV >NZ_CP014223|862925:873898|870502_871564_+|WP_066048158.1|plate|DBSCAN-SWA MYEEMTFETVLDRMLSRVSSDIDKREGSIIYDALAPAAAELCQMYIDLDIVLNETFADTASRDYLILRAKERGITPYEATKAIGKAVFNCSVPIGSRFNLEDFNYQVTEVISSQDFTYKVICETVGSDANHNLGTMIPIQYIQGLTKAELVEVLTPGEDAESTQSLRKRYLNSFDRQAFGGNRADYMEKINAISGVGGCKVYRAWNGGGTVKCVVLNSQYQKPSKSLIEDVQTTVDPTQNAGDGLGIAPIDHVVTIEGVTETPIAIASTITYESGWSFGECEPYIEEILDRYFMELSKGWADSGNLVVRISQIESRLLDMDGILDIGNTTINGEAKNLMLDENCIPIRGDFYG >NZ_CP014223|862925:873898|873387_873519_+|WP_072743449.1|DBSCAN-SWA MFGILKTRYEKNFVRKDQLQKYVAFGKITAKEYEQITGEDLPE >NZ_CP014223|862925:873898|873607_873898_+|WP_066053692.1|DBSCAN-SWA MIQALVTAMGIWFLQQSLSKREKAAQRREQEREEMEYKLLTAVNASIALGEATAKAVQRIPDAHCNGDMTEALCYTTTVKHDLKNFLHRKAVEKIV >NZ_CP014223|862925:873898|872289_873009_+|WP_066048166.1|DBSCAN-SWA MASGDKFYLADKETLDEVKGKIGSTADTGGSSTAGSVFGKINYLVSQVSSYLASIYSWVNTLTGKIGNSNDSEGTATTGTVMGKLNYLVTHGSNNLTDVYKYVLGIGNTNDSQGNTTSGSVMGKLNYLISQVSTYLSSIYSSISTVNSKLNSLMNGIFIKSIQRGVSYSANVSIANVNPAKCIVLLNGIYSSSSTEMASPGYRVSFVSEVTGTYLISITSTSLNVNGNGYFSWQVIEFY >NZ_CP014223|862925:873898|871556_872102_+|WP_066048161.1|DBSCAN-SWA MAEIQSYFPDLLKEVKEFQKLAEAENPELLFLWDELKQALDNQFIDTATKTGVARRERMLKITPKATDTLEERKFRLLARYNENLPYTLRTLHSQLSILCGEKGYRLETNYGAFSLKAKLELTNKKNVEAVEEMMERIVPVNMLLTLELLYNQHQELWQLTHGAMRAYTHDGLREEVFGNG >NZ_CP014223|862925:873898|863732_863921_+|WP_066048141.1|DBSCAN-SWA MAKQGNQENKKEERYFSKEAILQSQKYGANGDLLFAILADDKVFTSMEIDNTIDEFQKGKVR >NZ_CP014223|862925:873898|869701_870112_+|WP_072743416.1|DBSCAN-SWA MSELAQLIKKAAKDQMDSSKPMDIIIGEVVSAAPLKIKLDSKITLTESFLILTKAVVDYSVNMTVNHTTETHTHSHTYQDDSTTRTTQPNTHNHAYVGSKNFTIHNKLKVGDYVILLRAHGGQKFIVLDIVGGGTL >NZ_CP014223|862925:873898|868755_869709_+|WP_096348657.1|DBSCAN-SWA MLNIVNVDKEYTPIVAGDIKWSTERAGVPGSLTFDVVKNGELNFHEGNLVKLCVDKTPVFLGYVFQKKRSKGEIISVTAYDQLRYLKNKDSFIFEKLTATEFIHRVAKYFSLERGEIADTQYIIEKGVLDNKTLFDMIQEVLDTTLMNTKKLYVLYDDFGKLALKNIEDMKLDILLDEKTAENFDYVSSIDGETYNQIKIAFDSKKKKGLQDGVMVQDEENIKKWGVLQYYEKSKTEVGVKEKANALLDLYNRKTRTLSIKNAFGSPNVRAGCSLRVALKLGDINVNHYFVCEKVTHTFREDMHLMDLTLRGGDILV >NZ_CP014223|862925:873898|863921_865220_+|WP_066048142.1|tail|DBSCAN-SWA MGLGGGTYLVQNKTLPGAYINFISAARASATLSDRGYAAMALELDWGVDGEMFTIENGDFQKDSLKILGYDYSHEKLKGLRDLFCNAKTLYAYRLNSGNKAVNPFATARYSGIRGNDIKIMISANVDEPTKFDVVTLMENTKVDIQTVAEAAELKDNNFVVFKKDGVLQETAATPLAGGTNGQTTGASYQAFLDKAEAYSFNTLGCLSKEESIKGLFVAFTKRLRDEMGIKFQTVMFNKAADYEGIINLKNKVTDGEETSLVYWLTGATAGCAVNKSIANKEYDGEFLVDTAYKQSQYAAALDAGEFVFHKIGDEVRVLDDINSFVSVNTDKNEDFASNQVIRVIDQIGNDIAVLFNTRYMGKVQNNESGRIAFWNDLVSYNKQMEQIQAIENFVSDELIVKKGNDKKSVVVVNPVTPVCAMTKLYMTVVVE >NZ_CP014223|862925:873898|866422_868111_+|WP_066048148.1|DBSCAN-SWA MGTIKTSIQLFDGATPGLLDIANALNRAVLGFEALERASSNCIDTNSLREGREELNMTKSSFQQIQDSIKAAGEQQKKFNKTISTGAEISEGIFSNQEKASGIVDSNSGADLSEMGQKALGSSNISSGVVGSGGNLSLGTGEEFPEEKAKQTKNDKVNAAVDTLSSVIPQGYTSTDEMKNSMFAAADEIDTKFSGLSQVLGSVWSGVTGEQVEAIKVTDLLANSWGSFAPVVTGAAAAMNLYNLAMDAGKVIQVLQAAATVIGAAFNKLWTTSVEEQTAAQAGLNSAILTCPITWIIASIIALIAIIFAVVAWINKTKETSISAVGIIAGAFAVLGAGIFNIFAFIWNIVAIFVNFLFNVFQDPIAAIKTLFYDLAINVIGFIRKIAEGIEALLNKIPGLEIDITSNLDGLLSELEKKSQDVKDKAGFEDVMQTLDYKDYSNAFNSGYYKGEQLQNTYGGIFSGSSAGDGGMDQLLQNTANTAANTGAMTDNMEISQEDIRYLRDISERDAINRFTTAQVSVDFKNEATINSDMDIDGVMNKFTDVLREAIFTQAEEVHAIV >NZ_CP014223|862925:873898|870108_870510_+|WP_066048156.1|DBSCAN-SWA MTPKVNEELANTFVRLSLPSKTYRLDREKNRIYGFCDGVEAVKQAVYKALLTERYAWVIYSWNYGSELNGLFGKQMTTIYPEVKRRIEEALLQDDRIKKVGDFSFEKTRNTLHVTFTVESTVGVFESEVNLNV >NZ_CP014223|862925:873898|873022_873364_+|WP_066048168.1|DBSCAN-SWA MFQYAQLNQEKICVGISQLSGKVDAENMILINEDAEVLGMQYNNGIWEKLAQLEPNAASPSELEQMDTQQMDTQQIMQAFTDVELRNLEIQQRQELLAQQIANIELAMLGGNT >NZ_CP014223|862925:873898|868097_868763_+|WP_066048150.1|DBSCAN-SWA MPLYKVSIGQVALPVAPSKITMKIKNNNKTMELIDGSEINFIRTPGLKEFSFEFLIPHVKYPFAYYPDGFQTAQVYIDALKLMKIEKKWFQFDIQRQLPNGKTEFETSETVTLEDYTITEDTGNGLDFIANVTLKQYNEHKITHVEPVQTTEDGVVVKEVTERKSDKKTSNVYTVKKGDSLWKICKAQLGDGANFKEIAKLNGISNPNLIYPGQVIQIGNA >NZ_CP014223|862925:873898|862925_863339_+|WP_066048139.1|DBSCAN-SWA MARWAKVDFKQLTKLRDEVNKFHGEEFPKFQEKMEREMATRLVLKALKRTPTDPKDSPGIRAGWSIGDVRYEGGSYSIEVYNSCIYANSVEWGYLAKDGRTLIPGRFMLHLSEEELRQDADKVIEEKLMEVLRRGFP >NZ_CP014223|862925:873898|863335_863761_+|WP_066048140.1|DBSCAN-SWA MISKLMTGIEHAIRKEFPETTYKIYTETTEYDSPCFFIRCISQSRNAKLGERFMLNTSFEVQYFSGRGNNECWEVAEKLRELLDVISLGEDLVQGRNGNYRVDSGVLHFVMDYNLPMMREQDAVDLMEEVTVYGKARESGK |
18 | Clostridium_phage(63.64%) | plate,portal,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1103997 : 1121995
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014223|1103997:1121995|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014223|1103997:1121995|1119390_1119747_+|WP_066048766.1|DBSCAN-SWA MLDLQKASTELYEVKWLDGSILKLQKPTRAMELSFFDMQNKEMDEKTAQTLLYNLLFRIFNRREPVTIEKKGFFHKLTKKKELLEITESEIEKIPYDILFEVLKEYFDYYYKNLKMGE >NZ_CP014223|1103997:1121995|1107095_1107236_+|WP_096348679.1|DBSCAN-SWA MVCLKCSESKAYMIMRQLNDELTKKGFMTMRGRIPKKYFEERFNIS >NZ_CP014223|1103997:1121995|1117414_1117705_+|WP_066048750.1|DBSCAN-SWA MELAEQVKLITGNANDALISLMLNKAKGEIESYLNLGYDTKYDNIAVDIAVLKINRLGSEGLSSQGYSGASESYVDGFPQEIRMQLDRFKKKWGAL >NZ_CP014223|1103997:1121995|1108399_1108645_+|WP_066048719.1|DBSCAN-SWA MNRELLEVVDLCVQCCNENSFYVSFEYNGKINRFEVRIYERKNGLSMVSATQKSHWFICRANDNEKLAGIKNFLEEILKML >NZ_CP014223|1103997:1121995|1109900_1110077_+|WP_157881635.1|DBSCAN-SWA MQLSTAVMIVKNLENKKFSDDDRVEAITQVVDMPSHHSVTKDELLKAMRYLIDIFYEG >NZ_CP014223|1103997:1121995|1115959_1116601_+|WP_066048743.1|DBSCAN-SWA 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32 | Clostridium_phage(38.46%) | portal,terminase,tail,integrase | attL 1103982:1104001|attR 1127025:1127044 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1360823 : 1426135
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014223|1360823:1426135|DBSCAN-SWA 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72 | Faecalibacterium_phage(50.0%) | terminase,head,integrase,protease,portal,plate,tail | attL 1353456:1353472|attR 1420185:1420201 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2149426 : 2158089
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP014223|2149426:2158089|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP014223|2149426:2158089|2149426_2151055_-|WP_066051174.1|DBSCAN-SWA MAKEIKYSTEARSAMAAGVDKLANTVKVTLGPKGRNVVLDRKFTSPLITNDGVTIAKDIELEDPYENMGAQLVKEVATQTNDVAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNIAAGANAIILRKGMHKATEAAVAEIKKMSQAVTTKKHISNVAAISAGDDEVGDMIADAMEKVTNDGVITVEESKTMKTELELVEGMQFDKGYLSSYMSTDMEKMVAILEDPYILVTDKKISNIQELVPVLEQVMQANGKILIIADDVEGEALATLVVNKLRGTFTCVAVKAPGYGERRKAQLADIAALTGAQVISEEIGLDLKETTLDMLGRAKTVRVEKELTIIADGAGAKDEIEGRIHQIRKAIDETDSDFDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETEMKEKKLRMEDALAATRAAVEEGIVAGGGTVLVHAIESVKAACENLTGDEKTGAAIVIKALEAPLRQIVENAGLEGSVIVNKVKEMPEGVGFNALTEEYVEMVEAGILDPAKVTRSALQNATSVASSFLTTEAVVAELPSKAPAMPDPGMGGMGGYM >NZ_CP014223|2149426:2158089|2151751_2152612_-|WP_066051180.1|DBSCAN-SWA MLDVAIIGGGPAALSAALNCRQRNKTVCVFGRSLDSSLLFTAEKVDNYLGMPDVNGEELLNHFYAHAVKKGVEFQECRVTQILNVGEHYMINAENNFIEAKAIILATGLSKSKGIAGEIDYLGKGVSYCVTCDGMLYRNKKVVVVSENEEGEAEANFLADICKEVSYIPLYKNITFLKDNVKVINAAPKAVVGAEDKVAALETDKETVSCDGIFFAKNTMPPDSLLFGLKTDGKNIEVDRRMATNLPRVYAAGDCTGAPYQIAKAVGEGLVAALSAVSDIDKMKNV >NZ_CP014223|2149426:2158089|2155747_2156188_-|WP_066051186.1|DBSCAN-SWA MEYSEKVMDHFMNPRNVGVIEDASGVGQVGNAKCGDIMKVYLKIEDGRIEDAKFKTFGCGAAVATSSMATELVKGKTIQEALEVTNKAVMEALDGLPPVKVHCSCLAEEALHAALWDYAEKNGVKIEGLKPPVDDVDELHHMENEE >NZ_CP014223|2149426:2158089|2157669_2158089_+|WP_066051192.1|DBSCAN-SWA MEFHERLRQLRKEKKITQAALAKELTYGATAISNYESGHNQPSISDLKKIASIFNVSLDFLLGVNEIRRPYEPDKKTDEYEILNEYFGKLDDRGKKELLLYIQWLLSRQDNDGGDPYASNNIFQNSPLQVAQKPEEFKL >NZ_CP014223|2149426:2158089|2151074_2151362_-|WP_066051177.1|DBSCAN-SWA MKLSPLGDKVVLKQLEAEETTKSGLILTSQSKEKPQEAIVVAVGPGGMVGDTKVEMVLKEGDHVIFSRYGAMEIKFDGEEYLVMKQNDILAVVKD >NZ_CP014223|2149426:2158089|2156215_2157397_-|WP_066051189.1|DBSCAN-SWA MATKIYMDNAATTPVRDEVLDTILPYFKEFYGNASSVYSIAKESKKALEKAREQVAKGIGAKAEEIYFTAGGSESDNMALRGVAEALAKKGNHIITTKIEHHAILHTGEYLEKQGCEVTYLPVDEFGKISLEELEKSIRPETILISVMFANNEIGTIQPIAEIGKLAHEKGILFHTDAVQAVGHVAIDVNEMNIDLLSMSGHKLGAPKGIGAIYIRKGIPILPLIFGGAQEKKKRAGTENIPGIVGLGKAVELAVSEMETETKRLIHLRDKLINGILEKVPHSRLNGHPTDRLPGNCNISFGYIEGESMLLLLDAMGVAASSGSACTSGSLDPSHVLMAIGLPHEIAHGSLRLTLDRGNTEEEVDFILEKIPDVVQKLRDMSPLYEEVANKKA >NZ_CP014223|2149426:2158089|2153020_2155099_-|WP_066051183.1|DBSCAN-SWA MKNYTADKVRNVVLLGHSGSGKTTYAEAALFYSGATKRFGKVDEGNTVGDYEAEEIRRKVSINTSVLPVEWQDTKINFLDTPGYFDFISEAKMAMSVADTALILVSAKSGVEVGTEKAWESIEEMHLPRFFFVNQMDDENADFEKTLADLRSNFGKAVAPLQIPFNDEDGKFVGFINLIKRDARKKVNGKLQACEVPEDKIDEVEVLRSMLVEVAAESSEELMEKFFNDIELTEEEIYDGLLLGIENRSIAPVMCGSATLGYGVKLLMNTLVRFTPPAMESKKNFHAFIDGTDTVLCSTDDKNFSAFVFKTISDPYIGRLNLFRVMTGKLDNTMSIYNVEKDTMEKVGHLYIVRGKEQIEVNELHTGDIGALAKLSNTSTQDTLTCKEHPIVIPKLPLPSSVLSMAIQPKGKGDEDKLSAALSKIREEDPTIKMEVNKETKQTIISGIGEQQLDVMVNKLKTKYKIEVEMIDPIIPYRETIKGKSSVRGRYKKQSGGHGQFGDIVMEFEPSGDMSLPYVFEEKIFGGSVPKQYFPAVEKGLQECVLNGVLAGYPVVGLKATLTDGSYHPVDSSEMAFKMATSVAFKEGVPQAKPTLLEPIDHVEVLIPEKYMGDIMGDINKRRGRILSMDSVGSKKCIVAEVPASEMHKYATDLRSLTQSRGDYKHYFERYEEVPAEIQKKIIERRIAEKEK |
7 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2509404 : 2523755
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP014223|2509404:2523755|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP014223|2509404:2523755|2518816_2520061_-|WP_066054027.1|capsid|DBSCAN-SWA MKSLDLIQEERNVILQRMNSAITEDNPEQFNQAFKDLANNVQEAVMQEYEQAVQGADSCILAQRGVRQLTSQENVYYQKVIDAMKSVDPKQAITLIDDVMPTTVIDEIFTYLQENHPLLNEVDFQNTGAVTKWLLSATSGTAGWGELCGEIVDELSATFSILELGSTKLSAYIPVCNAMLDLGPAWLDRYVRTVLAEAIAVGLETAIVDGDGNEKPLGMTRALSGAVDGVHPHKTAVAITKLDAPTYGGLLDTLSKAPNNKRRPIPSVLLVVNPTDYFTKVFPATTVRATDGTFRSDVFPYPTKTIQSTAVPVGRAVIGLGKQYFMGLGTGKGGKIEHSDHAMFKEDKRLYRAKLYGNGRPKDENAFVYLNIEDLENYVLEVKVTSTSELRQTNEVITNGEGGTSQGEGEPENP >NZ_CP014223|2509404:2523755|2520130_2520892_-|WP_066052094.1|protease|DBSCAN-SWA MRTIWKLEQSVSPDTLEMYIYESIRPDSYDWWNDEVITSETSANHFREELAKYPNAKFINLYVNSYGGDVKEAMGIHSQLKRHQACVTGYVDGFAASAASYILTACDKVVMASPTMQMLHDMWNMSIGNAREHRKNAEDLDAIMKGNRQAYLDKSNGKLNEEQLIEIMAAETWLTATQCFEYGLCDEIGERQVDMAKAAEALKESHEALQRKNLELVAKLKQLATPPKEPTPQPPAEPQQNRLQKFMTSVKGC >NZ_CP014223|2509404:2523755|2522069_2523755_-|WP_066052101.1|terminase|DBSCAN-SWA 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13 | Clostridium_phage(50.0%) | capsid,terminase,protease,portal,plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2850056 : 2903457
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP014223|2850056:2903457|DBSCAN-SWA 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57 | Clostridium_phage(23.53%) | capsid,terminase,tRNA,integrase,portal,plate,tail | attL 2877512:2877571|attR 2903612:2903675 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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