Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013667 | Coxiella burnetii strain 3262 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas5f,cas7f,cas6f,DEDDh,cas3 | 0 | 1 | 9 | 0 |
NZ_CP013668 | Coxiella burnetii strain 3262 plasmid QpH1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013667_1 | 1347289-1347370 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013667_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013667_1
>1.1|1347314|32|NZ_CP013667|CRISPRCasFinder CTTCGTCCTTCGGCGAGGCCTCTTTCGAAACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013667_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013667_1 >merge|NZ_CP013667|1|1347289-1347370|CRISPRCasFinder TTTTTGTTCGAGTCTTTCAGCTAAGCTTCGTCCTTCGGCGAGGCCTCTTTCGAAACCTTTTTGCTCGAGTCTTTCAGCTAAG >NZ_CP013667|1|1|1347289-1347370|CRISPRCasFinder TTTTTGTTCGAGTCTTTCAGCTAAG CTTCGTCCTTCGGCGAGGCCTCTTTCGAAACC TTTTTGCTCGAGTCTTTCAGCTAAG
>NZ_CP013667.1|WP_012220006.1|1346746_1347019_-|hypothetical-protein MDPPLLSTISFDEKKAVAFVYPASQFKLATIGALMNYARLMLIGLSASQSHRMNQLNQPQVLPYFHQPSLFRTRLVCLLLLILFFTHGGV >NZ_CP013667.1|WP_046036891.1|1345730_1346750_+|IS110-like-element-IS1111A-family-transposase MKDIKILGVDIAKDVFQLCGIDEWGEVIYTRRVKRAQYVSTVASLKVGCVVMEACGGANHWYRTFMGMGIPTQLISPQHVKPYVKSNKNDRNDAQAIAEAASRASMRFVRGKTVEQQDVQALLKIRDRLVKSRTALINEIRGLLQEYGLTMARGAKRFYEELPLILASEAVGLTPRMKRVLNCLYTELLNRDEAIGDYEEELKAVAKANEDCQRVQSIPGVGYLTALSVYASVGDIHQFHRSRQLSAFIGLVPRQHSSGNKEVLLGISKRGNVMLRTLLIHGARALLRHVKNKTDKKSLWLKALIERRGMNRACVALANKNAPIIWALLTRQETYRCGA >NZ_CP013667.1|WP_080713307.1|1344969_1345572_-|DUF1601-domain-containing-protein MTMKNPIPLDPIPLIRDFFHTAKQQKNRPLSLNPQDYQTIKSILDNQSHPAFNAQSIANLLLALAYRRTRWATLLNKELDRPLLHAIAQNADRFNPQDIANTLWALATMGINWRYVQENGSHLSLVHVIARNYNQFALKGAIQIMWAVLWFDIQLPENVLQHLKTVIASSKQPQSSRLHQRFAKLLARKVTLPFHNEYPI >NZ_CP013667.1|WP_012220346.1|1343429_1344836_-|CBU_1063-family-Dot/Icm-T4SS-effector MPSLKEELLDVLNFEVKDLPVFSSLEDELVVVGLDIDGLIFNHRYLTPYRPPYEEKIRKEIQNFHSPEYLEAHKLHIQESADCLIKKIKKIIDKKEAKVICASTPQGPGTDFGNAIKIDENLGKIKTDSCVVALTSIVEKLKIDGHGVELDTYLLADTNQDGETFLSISRETQNYNEKYQVKSAEKEPNYFKEKFNILYTHVHRLAVENPNKKISYHFLDDREDIIVQLSHYYNEYPQLIPKNVSVTLHLYHDDRYESFEKFDPIEGSGVVDPDYKRTFQNFTKYSVRNSTDLAENRKNTTEILLQQVKLQFEFYTKLLNDKILSLKNTENFDQKDLIDKLEALRDHAVKIKHEAPARSLKLLKLGTQVVLYAEKCIENKFKTTVARINQRQIVTETLKKAAENFGHRKWTFLRSIAEFLLTTILPLGILIRIGNKICHNQFTIFAPSKSSRHAVELGESAKKTFTAG >NZ_CP013667.1|WP_005768280.1|1343139_1343424_+|hypothetical-protein MAESVDDLTVEYVEDGVVTLKELDKVILTKGAWCTILFKIQTWNRSKQEYNPVSYTIRRYQKRSGEFKQRSKFTISSNDQAQKIIDTLSKWMSE >NZ_CP013667.1|WP_011996944.1|1342557_1343112_+|RNA-2',3'-cyclic-phosphodiesterase MKKIHSSIRTFIAVPLFPAERDQLQTAIKPLIKQWTHLRWLPPENWHLTLRFLGDVTPEALEILRQATAKEAKETIKFKININKIDTFPPEKLRLLVAYIERQEHLSQLFFNLDQAAEKAGLAREERLFLPHITLAKSRRPIRHFDPLDCDLSIHAEELVIFESRPTNDGSQYVPLYKFQFSLH >NZ_CP013667.1|WP_040953318.1|1340704_1342486_-|SLC13-family-permease MFQGPYTILIILVITMALFIWGYWRYDIVAAIALMLATLTGAVPFSKVYTGFSNPAVITVACVMIISQVITRSGAVAFMVRKITVAAKYHNLYVIILCVIAAILSAFMNNVGALALMMLVALRSSLKMKRSASLVLMPLALASAMGGLVTMIGTPPNLLISFYREQSTGQPFALFDYARVGFYVALAGVLFIALIGWRLLPRKRKGTRQPEDLFQIEDYLTEIKIPEKSPTIDKSIREFEKLIEAEFSIIGLIRKGKKHFALSPDEKLQPHDVLIVEISSEDLQELLQAGKIELVGDKKISSEVLKSKEVGIVEAVVPPGSRVENRSAESIRLRARYRLNLLAIARQGNPFRERLREINFRAGNVVLLQGPVDVLEENVASLGFLPLLERGLDVGMKRMAFLPIIIFIFAIFLAGVQWVPVEVAFGGAVILLLLFRLLPTRLIYESIDWPVIILLGAMIPVGEALQSTGGTTLIAHFISSFTKDYPPFIILGLVMIITMTLSDFMNNAATAVVMAPIGVSIAHSIHASVDPFLMAVAIAASCSFLTPIGHQNNALVMGPGGYKFFDYIRLGLPLEIVVLVLSLPLILWAWPLS >NZ_CP013667.1|WP_012220345.1|1339937_1340708_+|tRNA-2-thiocytidine(32)-synthetase-TtcA MSEKRVEKKLIHYVKKALNDYRMINTGDRVMVCLSGGKDSYTLLSLLNSIRIEGNYKFDIFAFVLDQSQPGWDDSALRGWLDDKKIPYEILTRDTYSIVKEKIPAGKTYCSLCSRLRRGIIYRYAEEQGFSKIALGHHRDDLIQTLLMSVFYNGQIRSMPPKLLSDNRRHVLIRPLAYCQERDIIKYAMEQQFPLIPCNLCGSQKNLMRQRVKRLISDLAKENPKVPSNMLRALSNIKPSQLMDHELWNFRELNVD >NZ_CP013667.1|WP_129545642.1|1337877_1338135_-|adenylate/guanylate-cyclase-domain-containing-protein MHGGDVMFGMVGEANRLEGTVIGDTVNLCARLLNYNETYKSPVLISESLKQHVDLDQANITARYLDEVTPKGITTPVRIYAVQTG >NZ_CP013667.1|WP_124224376.1|1335828_1336608_-|adenylate/guanylate-cyclase-domain-containing-protein MEFLNIKTVDAMKSGAHVDKPSTVLFADIVNFTAMANVSDVPKTFQYINTYTSSSSPVIRQHDGFVVKYFGDAILALFGGAQASVAAIQSAIQMIHRLKKIKSTKQTDISIGVSITSGLAELGIAGSDDRIGIVLLGSPVNRATGFNSLTRLFRVAILITEPVYQEIKLSSQFHTRFLDQVSSIDKKKQINVYEVFDADEQTIIDKKVSIMPHYEAAIRDFNARKFKTALAQLKKCLSILPDDQASQIYLERCQKELKQ >NZ_CP013667.1|WP_005769011.1|1347674_1348106_-|Rpn-family-recombination-promoting-nuclease/putative-transposase MKKIHNPHDYYFRTAMSDTRVAKEFFEYHLPNNILKAADLNSLQLQKSSFIDEHLKASMADVLYSVKLNRRPGYFYIIVEHQRNPDKLMPYRLLRYILRIIDHHLKKKDYLPLPIVVPLVFYNGKKRYPFQRIFLLYLAKKSH >NZ_CP013667.1|WP_040953278.1|1348187_1348562_-|response-regulator MITKKPIKKPLILLVEDNTFIQKIHVQLLKKLNCEVTLAIDGQSALALYSDKFDLIFLDINLSEMNGMEVCKAIRQRTSSTPIIALTSESSKNKPRYFSTGINDFIKKPTTQAALKRVLNYWIQ >NZ_CP013667.1|WP_010957785.1|1348777_1348888_+|hypothetical-protein MRFFLHLLKSGGDGYEAFEGRTLGQSKAGASGARND >NZ_CP013667.1|WP_080713298.1|1348880_1349507_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTKLSRREFAKKSGIANTTLQHWEDGEKHTLPEKSVRRFIKALLNLGVHCSYDWLMHGKGPAPQYAGHVIFQEETTDLPTHGARQKNEDEEIKEELTLFLSRNKNTVHLVVSDDAMEPRFVQGEVVAGVRVYGKEIEKLIGLDCIVLVQGDDLLLRTILKGDVEGYYHLGYTNPKTTASKPFLYNIELVNAAPVIWARRNSHRYKSPK >NZ_CP013667.1|WP_005769002.1|1349527_1350118_+|hypothetical-protein MDKGYHKTVGGIGGHILRRFIHLSMLIIPFLYYSYAKSRFNLFGLSYKSLLLVIIGLMLLFEIVRLKRGWLLWGQREREGKNFSSLAWTIVSLCLVLLLAPGKQYAIPIIWSCAIVDPLLGELRRTQLSRTWIVFIGIVVVMLIWGLASWWFKLDWLLVLLMGPLVVILEWPNFRWLDDNALVQLVPLLVILILYG >NZ_CP013667.1|WP_040953279.1|1354348_1356301_-|acetoacetate--CoA-ligase MEASKPLWEPSSETRLQSQMSHFISDINKRFSLKIEGYPALYQWSIDQPALFWKAVWDFCGISASQAPTNVLVRGKRMEESQWFLGAKLNFAENLLRHRNQNVALIFTSETGFSRSITYAELYTEVAALAGFLRQCHVVPGDRVVGVLSNQIETVIAMLATASVGAIWSACSPDFGLEGLIDRFGQIKPKVLFAVDSHTYKGKTYHHLDKIRQLQQQLTSLTHTIIVPNHQKNIAINELKNASLYPDCLRATSLPFYFEALPFDHPVYILYSSGTTGKPKCMVHSAGGTLLQHLKELILHTDLRPSQRIFFYTTCSWMMWNWLMSSLAVGATVVLYDGAPFYPTPTALFDLIDKVGISIFGVGAKILEPAEKFDLVPKKTHNLLSLKTILTTGSPLLPKSFDYVYNNVKSDIQLSSISGGSDIISCFALGNSLLPVYRGELQCIGLGMDVKIFNDDGDFVIEEKGELVCKSPFPSMPIYFWNDPEGKKYHQAYFDKYPNTWAHGDYAKTTKRGTLIIYGRSDTTLNPGGIRIGTAEIYQQVEKIKEILDCLVTSQQWKGDERIILFVVLQKETTLTDPLRKKIQTTIRQNLSPHHVPNKIIAVPDLPRTKSGKIVELAVKKIINGESVNNLTALENPKILEYFQNLKELG >NZ_CP013667.1|WP_010957788.1|1356598_1356730_+|hypothetical-protein MLLVDQALLQQAILLGWTSELPIIVKMNDLPKEKQPHSADPDF >NZ_CP013667.1|WP_040953280.1|1357141_1358677_+|MFS-transporter MFSYFLAKGSFNHVYKERYSESYYHAIAEKDKIFKITLVISAFLSMIFLDQTAVGVTLASIQKELVLSASTIAWIMNAYMITLSAFLLLFARLSDSIGIKNLFCAGILIFLLASLSCAVSNSGAGLIINRGLQGIGASMGYATYLLIFNNQVPANKRGKVLGKSAAFAAVFLALGPLIGGFFSNVISWRYLFWLNVPICLVCFYFAISACNKDSHPVNHAFLDKLGLLIYLFAMTGLIFFLMEGPTLGWTNPAILISLISSLLFFTLFVYHEKRQRQPLIEMALFKNKEFFASVLILFGNYACITTMAFWALWIEQVLGYSPLMTGVALLPAGVPFGIIIDGSHTGFKTSMDALNLTTKPFVFSHSGVYCLAPHVRNVRDEQIKSVAATGGVIGVNGLGILLGDVNASIGKYVDHIDYITKLVGAQHVAIGLDNLYFANQFSEFMSQQGITHPQAYASKVNNATLWRCLQPENVIEVVEMLLQRGYSENEIKGILGGNILRIMGYFSSCSN >NZ_CP013667.1|WP_040953281.1|1358776_1359463_+|GMP-synthase MKIHYIMHAPFEKLSAIEVWATQKSYDLSGTHVYKGEKLSRALNFDCLILMGGPQSPFKTDKYPYLLDEIQFVKKALAGNKKILGICLGAQLIAEALGAKTLHSPYKEIGIYPIQTLPEATDDPFFSKLPKSFDVMHWHNDMPGIPKDVVLLAKGEGCPHQAFRYGDRVYGFQFHMELTLSVIEEMIEKYRGDLEPGKFVRTKEEMLHSNYNEVNAKMFTFLDYLEGV >NZ_CP013667.1|WP_005768975.1|1361061_1361934_+|methylisocitrate-lyase MSPGKLFRQAVANEHPLQIVGAINAYCALLAENVGFKAIYLSGGGVANTLGLPDLGITDLHDVLEDARRITAATHLPLLVDIDTGFGGAFTIARAIKEMERAQVAAVHMEDQVAQKRCGHRPGKELVNTNEMVDRIKAAVDVKSNDFVLIARTDAYAVEGLKATIDRACTYVEAGADMIFAEALENINDYPTFCKAVKVPVLANMTEFGKTPLYTAAQLADHGVKMVLYPRSADRAMSKAALAVYEDIKKHGVQTASLPFMQTREALYEVLNYHAYEDKLNQLFKRKEDD |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013667_1 | 1.1|1347314|32|NZ_CP013667|CRISPRCasFinder | 1347314-1347345 | 32 | NC_009620 | Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01, complete sequence | 767068-767099 | 8 | 0.75 |
1. spacer 1.1|1347314|32|NZ_CP013667|CRISPRCasFinder matches to NC_009620 (Sinorhizobium medicae WSM419 plasmid pSMED01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
cttcgtccttcggcgaggcctctttcgaaacc CRISPR spacer tgcctcgcttcggcgaggcctctttcgcaaca Protospacer . .* . ******************** ***
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
500356 : 569918
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013667|500356:569918|DBSCAN-SWA TTTAGGCGCCACAGCGATACGTTTCTTGGCGTGTTAAAAGCGCCCAAATGATCCGCGCATTTTTATTCGCTAACGTCACACAAGCGCGATTCATTCCGCGGCGCTCAATGAGTGCTTTTAACCACAGACTCTTTTTATCCGTTTTATTTTTTACATGACGCAATAGCGCACGGGCGCCATGAATCAATAACGTCCTTAACATCACATTGCCGCGTTTACTAATCCCCAACAACACCTCCTTATTCCCACTCGAATGTTGTCGAGGGACCAACCCAATAAACGCCGACAACTGCCGGGAACGATGAAATTGATGAATGTCACCCACGCTCGCATAAACCGAGAGCGCCGTTAAATAACCCACCCCCGGGATGCTCTGTACCCGTTGACAATCCTCATTGGCTTTTGCCACCGCTTTTAATTCCTCCTCGTAATCACCAATCGCTTCGTCCCGGTTCAACAATTCGGTATACAAACAATTCAACACCCGTTTCATCCGCGGTGTTAATCCCACCGCTTCGCTCGCTAAAATCAACGGGAGCTCTTCATAAAATCGCTTGGCACCACGCGCCATCGTGAGTCCGTATTCTTGCAACAACCCCCGAATCTCATTGATCAGCGCCGTGCGGCTTTTGACTAAACGATCGCGTATCTTTAACAGCGCTTGAACGTCTTGTTGTTCCACCGTTTTACCCCGCACAAACCGCATCGAGGCGCGGGAAGCCGCTTCAGCTATCGCCTGCGCATCGTTACGATCATTCTTGTTACTTTTGACATACGGTTTGACGTGCTGCGGACTGATCAACTGCGTTGGGATACCCATCCCCATAAACGTCCGATACCAATGGTTCGCTCCTCCACACGCTTCCATCACCACGCAGCCCACCTTAAGACTGGCTACGGTGGATACATACTGAGCACGCTTAACCCGTCTCGTGTAGATCACTTTACCCCACTCATCAATTCCACACAGTTGAAAAACATCTTTTGCAATATCAACACCCAGTATTTTAATATCTTTCATGGACCTTCTCCTTTTTTTGAAAATAGAAATTCTATGTTGGCGCATTATGACGCCGTCTTTAAGGGGTGGGTCCATTTCATTGGGCTACTTTACTAAATCTGGAAGTCAGGAAAATTAGAGTTACTGTTAAGCGTTTAGGCTTATTGGCAATTAGTTATGCTGAACCGGAAAGGCCCTAAACTTGCCAGACCATTTCTTCGACGGGCCGATAGAGGCTGTATTGCAATTTTTGGACGCAATTCATCAAATAATCACTGTAACTGCTTTTAGGCATGGCTTCAGCCAAGCGTTGCAACTGATCCGCAGTAATAAATCCTTTTAGATAAGCAATTTCCTCCAAGCAAGCCAGCTTCAAGCCTTGGCGCTCTTCAATAATCTTCACAAACTGTCCCGCTTCGGTCAAAGAGTGATGCGTACCGGTATCCAACCAAGCGGCGCCGCGTCCTAGAACAACCACAGATAATTGCTTTCTGTCTAAATAAACGCGATTAACATCCGTAATCTCTAATTCACCGCGCGAAGAAGGCTTGATGTGTTTAACAATATCGACGACTTGATTATCATAGAAATAAAGACCGGTTACCGCATAATTTGATTTTGGGCACTTTGGTTTCTCGTCCAAAGAGATCGCATGGCCTTCTTTGTTAAACTCAACAACGCCGTATTCACTGGGATTATTGACGTAATAACCGAAAATAGTAGCGCCGTGTTTGTGCTGCACCACTTCTCGTAATTTGTTCACGAGCTGTGACATGTAGAATATGTTGTCACCCAGAATTAAACTGACATTATCATTTCCGATAAAAAACCGCCCGACATTGAACGCGTCAGCTAAGCCTCGCGGTTGATCTTGAATAGCGTAAGATAAATTAATTCCCCATTGCGAACCGTCTTTGAGTAAATCTTGCATAAGGGGCACGCTTTGAGGCGTTGAAGTAATGAGAATGTCACGTATCCCCGCTAACATGAATACGGATAGCGGATAGTAGATCATGGGTTTATCGTAGATCGGCAGTAAGTGCTTATTAATTACTGCTGTCAATGGATAGAGTCGCGATCCGGTGCCGCCTGCTAATATGATGCCTTTCATAAGCGAATCCTATCGGAAATATCAAAAAATTGCAGCAGATTTTTACTATTTCAAAAAAATGTTATGCTGGGCAAGCCGACAACCTTAGTGGACGTTTAAAAGATGATGGGACAAAAATTAACCAACCTGCAGGGAGAAGCGAAGTATCAATGGTCGGTATTGATTAGTATCTTTTGCGCCAGTTTGATATTTAAATTGGTGGTCTTTTTCGCGTTCTATCGGGGCGATGTTCATCAGCTCTTACAACCGGATTCCGGCACCTACCTCGAGCCGGCCATGGCACTTCTTAAACAAGGAAATTATGGCCATATTTTTATACGCACTCCCGGCTATCCGACATTTATAGCAGCTTTTTTTTATCTTTTTGGCCATAATTTATCGGCTATTATTATTGCTCAACTTATTTTAAGCATAATTCCAATTTTTTGCGGCTATTTAATAACCCGTCGGTTATTTAATGGTCGCGCAGGGTTAATTACGGCTGTTTTTTTGGCTGTCGATTATCTTTTTTTCAGCTATGCCTATTTTGTGCTAACCGATTATCTTTACGCGGTGACGCTAAGCCTAGTTTTTTTATTTGGCGTTTGGGTATTAACGGAGAGTAACCCGAAATATAGACACGCTTTTTTGCTCGGGTTGTTTTTTGCTATCGCAACGCTCATTCGTCCGGTTAATTATTATTTGCTATTTCCTAGCGTGGCAGGCCTATTTATTTATTTGAGGTTCCAAAAATTACGTTTTAAAAAGATATTCCTGATAACATTATTAATGCTCTTACCCAATGTTTTATTGGTAGGAGGTTGGCAAATTCGAAATAAAATAGCGATGGGCACCTTTCAATACAGTGGAATCACCACTCCTGCGAATGTTAAAAACTATTTTCCTCAGAATTACGCCTTATATGTTGAAAAATATGGTGATCCCCAGTCACATTATTTAAAAGCTAATTTTAAAATTATAACCGACCATCCGTCTTTAGCGCTCAAACAAATGGGAATAGGGTTTGCTAAATTGATGTTGGGTTCAAACCCCATTTTGGTTGATTTTTTTTGCCGCCCAGAAAATATTAAATTTTATTGGAAAATGCAGGGAAAAATACAACAGTTATTTTGGCGAGGAGATTTTAGGCAAGGTATCGATGAGCTTTTATCTCATCCAGCCGCGATGACCGTTTTCTTATACAAAATCGGCTTGGTGTTCCTTAATCTGATGCTCTATGTCCTATTTATTATTGGCGTAAGAGCCTTGTATATCAGAAATTTATTAAAACCTAAATTGTTTGCCCATCTTTTTCTTGCTGGCAGCGCTTTGTATTTCATCTTGCTCTGCTCTAACAACGCTTCTTATGCGCGCTTTCGACTACCATTTCAATTACTCATTGACTTTTATGCTTCGGTCGGCTGGGTAGCGGTGTGGGTTAAAATCAAAAAACTTTCTTTTTATCCAACGAAACGAATAGATTCCTCCATAACTTGCGTAAATTACGATAAGTAATTCAAAAGGTGTGCGAAATCGAGCGGTTGAAACAGCGCTTGAAGAGAGAATAATAAAATACAGCGTACACTCCAGCAAAAATAAGTGCGAGAAATAATTTTCGTTCAATTTGAATTTAAACAAGGTCAATAACGCTATCGCTACGAAGAAATAAGTAAAAAACAAAAAAAATCGCATAGGAGCTGCGACAACCACCGAGAAAAATTCACCCCAACTGTTATTTTTTAACAGCTTTGAAATACGAAAATGCCATAAGTCCTGTTTTTTGTGTTTAAACACAAGGTAATTAATGCCAGGACTAAAAAACCGAGCAAAAGAAGCATCTGAGCCTAACATTAAACGGGGGAAGCCCGCGATCATTTGTTTAACCAGAGCAACGGGGTGCTTAATCAAAAAAGCCAGGGCTGTCTTCGCCATAAATTTCGTTTTTTCCGCAGGAGATAACGGGCCCTGTTCTTTAAGTTTTTCAATTAGAGCTTTTACATTCTTAGGTGGGGGATCTTTGGGTTTTTGAATAATATCGCCCATGTAATTCCAGTAGAGATTGAAAGCCATTATATTGCTATAGGCGAAAGTGTTAAAGTGCAATTTATTTCTGACTTGCCAGCCGCCCACCATCACCAGACTGGGCGCAGTCAATAGTAATAACCCCATAATAATCTTTTTCCAGGGAAAACGATTTCGAATAAAATAGATTGTAGTTCCAATCGCCACTGGAAAAATTAAATAATAACTAATAGGCCGGATAAAAGTAGCGAAAGCCAGAGTTAAACCTAATGAAAAAATAAGCCCTAATTTGTAGGAACGACTTGAAAACAAATACGTCCCAATTAAAAATGTGAAACCAATAACGATAGCAAAAAGGAGTTCCGTTAAGATCACTAAGGTATAGCTTAATAGGAGGAAATTGAAAGCGATAAGGAAAGCTGAAAGATAAGCCGCGGATAGCGAAAATAACCGGTAAGTTATGTAATAAGCCTCGATAATCAACAAACTGCTTAATAGTATTTGCGCGATGACAATGGCGGTCAAGTGCTGTCCGAATAAAGCAAAAATAATAGTGATAAAAGTGGGATACCCGGGTGTTCGTTCAAATAGGTCACCGTAATTTCCGTGTAATAGGAGCGTTTTTGCAGGCGTAAGATAATCGAATGAATCGGGTCGAATAATTTGATAAATGTTCCCATGGTAACAGATAAAAAAAAGGCTTAACTTAAATAAGAGAGAAAAGAAAATGATACTCGGCAGTATCCATTGTTGGTTTAATAAAAACGGTTTGTAAGCTAATGCGAAGAGGGCTGTCTTTCCTGGAAGCGCTTCCTTCATTCTTTTAATCCAAAAACATCGAACTCACTGACTCTTTCTGATTAATGCGAGAAATGGTTTCCGCAATAA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60 | Streptococcus_phage(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
687083 : 737607
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013667|687083:737607|DBSCAN-SWA 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50 | Streptococcus_phage(71.43%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
743223 : 795316
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013667|743223:795316|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(45.45%) | transposase,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
805692 : 855272
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013667|805692:855272|DBSCAN-SWA 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50 | Streptococcus_phage(42.86%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
866745 : 933714
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013667|866745:933714|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(40.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1084544 : 1142841
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013667|1084544:1142841|DBSCAN-SWA 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56 | Streptococcus_phage(35.71%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1305026 : 1348106
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013667|1305026:1348106|DBSCAN-SWA ATTGATCATTGATCAATTACGTTTGTCATTTCGTCAGGTAAAATTAAATCATCCATTTAAAATCGAGGCGATTGTTATTTTGCCTGATCATCTCCATATGATTATGACATTACCAAAAAATGACGCCAAATATTCTCAACGATGGAATTTAATTAAAGGTTATTTTTCTCGTTCAATAGAAAAAAATGAAAGAATTTCCATGAGTCGGAAATCGAAACGAGAACGAGGAATTTGGCAAAGACGATTTTGGGAGCACCTTATTCGTAATGAAGATGTTTTTGAAAAGCATGTCAATTACATTCATTATAATCCGGTAAAACACGGGTGTGTGGAAAATCCTATGGACTGGCAATACTCAAGTATTCATTATTACGTCACTAAAGGTATTTTACCTGCCAACTGAGCCGCTGACCTTGATAAGAATGATAGTTTTGGAGAATAAAATCTCATACCGTTGGGCTTCGCAAGCTCAGCTCAACCTACGTGCTAAAATTGCCAATTTAAGCGAGGTTGGGCTGAGCTTGTGAAGCACAATAAAAATTGTTTACCGGTAGCAACCAAGCGCTTTATATTCTTGTTCTTCTTTCTCTTGTTGCTGAAACATAAGATGGAACTGGGTGGTTTTTGCTAAAAAGCTTAACGCAATGTCGTCAAAAATGATTCTTGTTTCATGTTTTGAAGTTTCACCCTTGGATTGTTCTGAAGCCAATAAGCCTTGAGGCAGTATGTTGCCCGCCTCATCATGCTTTCCTTTTCCATCAGGGCACTTAGCGCTTTTTGTAACAGAATTGATAACATCACTTAAATTAAAGATATCAAACTGAATATTTTTAGTTACCGGATGGTTTGAAGTTAAATTCGCTGAGTTAATTTCGAGAGCGAGCGCTTTTAATTCTTCTAATGATTCAACTTCACAATGCTGATAAACAGTGAGATAATGCATCTTCCAGTTACCGCTGTAGAACAAAGCGATACCTTCTGCTCCTAAATTTTCTTTTCTTACTAGGGGATTTTTTTTACTCGTTTTCAATTCTATTGAACCGTTCAATGTTTCAACTAACGAAATGTATGCATCACGTATCCCCCCACCGATAGAAATTTGGTATACTTGTGATAGTGACTCTGGGTTCATTCGCGGAGCTCCTAATGTGTAACATTTCCTTTCTTTTGTTTGAAAAACGGTAATAACGCCGCAACCATTTGGATCAAAGTACTGTCCTTCTTCATTTTTTTCTTTCAAAATTGAGGGAATCTTTTGTTCAGAGACAGGCTTGTCTGGTGTAACTGTAAACTTTACAGCTTGGTAGCCTTGGATTTCCTCTATTTGGGAATCGGAATTAACTTTCTGTTCATTACTTCGCATATTATTTTTCTCCAATTGAAGTTATCGCCACGGGGTTATCAGTTCCAAGGGCTCACTCAGGTATAATGTCACTAGTGTATTATCAGGAAATTTCTGGTTAAACCTTTCAAGGAGGCAAAATGAAGCTTTAGATTAAAAGCTCCCAGATAAACTTAAAGAGGGGTTAAGTCGAGTATATAAGTTGAATCCGAATTAATTTTTCACCCAGCATCATCGCTTACAATGGCGAGGTCAACATTAAAACCATGCGACAAAATACTTTCAACCAAGGCTTCTTCCGTCGCAATTCTGCAATGATGAGAACTAATAATATCCAGAGTCTTTAAATGGGGTTGCCAAGCTTCTTTGTTAACGAAGGTCCCGGAATTCTTTTCAAGTAATTCAAACTGGTTTTTGGAAAGCGCTGTTTTTTCATATAATACAAGGCATTTTCATCAACACAATAATCTTTTTTGCCCGCCTGCAATGGCTTGTAGCGGATACGTAGCGCTCGAGCATTTTTTCTAAATCGGGATAGAATTTCTACTACTTCTTGCTTTTTATCTCGGTGACACCGTTATTTTGACTAACGACATAATCAGAAGTAGAACTTGTTAGACTAGCATGACACTTTTCATCCGTTAAGGTTTGCAGACACCTTGTATGGTGGCAAGTAACTCCACTTAGGTGGGCTCTAACATAAAGTATACCCTAGTTAAAAATGTTGTTCGACTCGGGTATAGATATAAAGCCAATTCCCGTGTCTTTTGTAGTTGTTTGGCTATAATTAGCGGTTTCGCCAGGCTTGATAGTAACTGCTCCTTTGGCTATACCATTCAATCTTAAGGTTCCTGAATCCGTAGTTCTTACCAATACAGTTACTGGCTTACTATATTTATTGACGATACTGCCTATTGTATGGCATCCAAAGGCAACACCATTAACCAACAAAGCCCCTAAACTGCATACCACTAAAAGCTTAAATGTTGAATTGAAGTACATACCCCTCCCATCTTTCCAGTTTTGTATAAATTATAGCATAATATTGCAGGTTGGGGCAATGGAGGCTTCGGTTACCTTTTATTTTGAGCCAGCCAGGGACATTACATTCCATTTGTTTGGGTTTATAACATGCTAAATAAGCAATGGCTTAAACAGTTGATTAACGCACAACCGGCCACGTGCCTGGGAAACCGTTATGTGCCGTGTTTCCCGCTCATACGACGCCCATGCGGGGATAAACCGCCAATTAAGCACATCAAAAATATTGCGAGATTGTGTTCCTCGCTCATGTAACGAAAATACCGGTTATCGCTCCAATTTTTAAAAAAATAAAAAGTTGGTCAAAAAATTAAATCCTGCCAAATTCATTTAATTAGAGAACATGAAAGACGCCCCAGTTTTCAGTAATTAAGTGCGGATAATTATAAAATTCTTGCATTTTAACAGTTTTATCTTTTGGCGATCGCGCAAGGCAATCACTCCTGCAACAACCCCTGCCGCATTCCCAATAATATTAATTCTGCATCGTTTTTAACGTTCAATTTTTTAAATATCGCAACGCGATAAGTGGAAACGGTTTTGGGACTAAGGTGAAGCTTTTGGGCAATGGTTTCTGTCGGAACTCCTCGCACCATCATTAAAAGGATTTCCATCTCACGATCAGAAATACTATCCAAAACGCCAGAAACTTGGCTGGTCATTTTAGAAATAGCTAATTGGCTGGCAATTTTAGGACTAATAATTCGCTTACCTTTCTGAACTTCCTTTATGGCTTGGATTAATTCTTCTTGTTCAGCCTCCTTAGTAAGATAACTGTGTACGCCAACTTCAAGCAATCGGCGAGAGAAAGTTTTATTCTTTTCACTAGTCAGGATAATCACTTTGGTTTCGGGGTATTGTCGAAGCAGCTTTTGACTGATGTATAAACCGCTAAAATCCGGCAAGTGAACGTCGAGCAAAATAACGTTGGGTCTTTTTTCACGGGCACTGGCTAACGCCATTTCTCCCGTTTCTGCTTCTCCAATAACCTTCACGCCAGAAGCATCCTTTAACAAGAGCTTCAATGCTTCTCGGACTAATTGTTCATCATCCACGATCAGAACAGAAATCATCGGCTCACTCCTTTGAACCTATTTTACACTCTTAAGGAAATATTAAAAGAAGAGACTGTTATTCGATCACATCAATGGCTTTACCTTTCATTTCCGGTAATAACAAAGTGACTAAAATGCCAATAAGACAAACAACTGCAAGAAGCGCCATGGTGTAGCGTAATCCTTGGGTGTGCAAAATGTGGGGTAAGAAAAAAGCGCCTACAAAAGCGCCTACCTTACCCCAAGCGGCTGAAATTCCATGGGCCCTTGCGCGCAAACTGGTGGGGTAGATTTCCGAAGGAATTAAAAAAGTGGTGGTATTTGGTCCAAAATTAACGAAGAAAAAGCTGATGCCGAAAATGGCAATAAATAACGGGATGTGCTGAGTCAAGTGAGGGATAAGCGCGATAGCGCCGTAAGCCACTGCAATCATAAAAAATCCAAACATTTGCAAAAATTTTCTCCCAATGCGGTCGATATAAGTAGCGGCTAAGAGATAACCAGGGACAGCAAAAACAAAAAAAGTTAAAGCGGTTAAAAGGGTATTAGTGACTAATTGAGCTTGAGGATTAAGCCATTTTAAAATAAGGACCGATGAAACGCTGTTTCCATAAAAGGCGACATCCAGCAGAAACCATGCACTCGCCGTCCCAATGAGACGGACGAGCCATTTTTTTTCAAATAAATAGTGCTGTGGGTGAGGAACTTGCTGGGCTTTAATTTTTTTGGTGAAGCCTGTTAAATCTGACACGACTCGGCTAACGGCAACCGGCGGCGATTTTTTCAGAAGATAGTGGGGCGTTTCTTCAATTTGTCGTCGAAGATAGAAAACAGAAGCCGCTGGGATGGCCCCAATACCTAGCAAAATGCGCCAAACCAGCGTGTGCGAAAGCGGGGTGACCAATAAAAGAGAAGCCAATAAAGGGCCGACCACCAAACCGAGCGCTTGCATGGCAAAGACGAGCAAGACTAAAAAACCACGTCTTTGACTGGGCGCATATTCGCTGGCGATAATAGCACTGGAAGGATAATCACCACCAATGCCTAAACCGACGACTATTCGAGAGAACAAAAGCCATCCGTAGGAGGGGGGAAACGCAGAAAGAATAGCTCCGAAAAAAAGGATAAGAACTTCTACACCATACAGCCTTTTTCGCCCAAATTTGTCAGACAAAACACCAAAAGAAATGGCGCCAACAGCCGCCGCCGCCAGCGCGGCGCCGTTTAATAAAGCTAATTGGGAAATGGTTAAATGCCAGATTGGAGTGAGGATGGTGGTAACAACCCCGATGATAAATAAATCATAAGCATCGGTAAAAAACCCCATTCCCGCCGTAAAAACGATTCGCCAATGGAATGCTTTGATATTACTCTCATCATCCTTCACGACGATAACCCATCGCATCAAGACCCGCCTCGAGATAGTCTGCCAATTGAGGCTTAGATAATAAATATTCGGCCGTCCGGTTCGTCCATCCTGCCTCGGCTTCTGCGAAGCTCTCTTCCCAGTCGCTAAAATCGCCCCGCCCTAAATACATAAGCGCAACGAGCTGCATTTGTTG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47 | Streptococcus_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1612847 : 1675400
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013667|1612847:1675400|DBSCAN-SWA 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57 | Streptococcus_phage(18.18%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2071315 : 2080235
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP013667|2071315:2080235|DBSCAN-SWA 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TCTGTCCTCTGTCCTCTGTCCTCTGTCCCCCGCTGACTACAGTATTGTTTTTTAATCGGAGTCCCTCCATCCTTTCTTCATGTCAATTACACAATGGCCAACGAGCGAGCGAGCGCGGGAAAAATTGCTCCGAGAAGATGCGCATATCCTCTCGGATGCGGAGCTGATCGCTGTGATCATCCAAAAAGGCGTGCGCGGGTGCAACGCGTTGAATTAGCACGCGAATGGCTCAATCATCTCGGCGGGCTCGCTAGTCTACTGAATGCTGATTTTCACCGTCTTTCCGGCTTACGCGGTCTTGGAAAAGCGGTCTATTGTAAGCTCAAAGCGGCCGCCGAATTACAACGGCGTTACCTCCGTCAGTCACTCGAGCGAAAAGGCTAACTCGGCTGCACTCAAGACGCCCAGCAACTTCTCTACGCCCAGTTGCGCCATCATGAAAGCGAAGTTTTTGCCTGTCTTTTTCTGGATAACCGTCATCGCATCATTCAGTTCGAAAAGCTTTAATCAAGCCTCCGTCCATCCGCGGGAAATCATTAAACGCGCCCTCTACCATAATAGCGCTGCCCTCATCGTCGCCCACAACCACCCCTCCGGCGTCCCCGACCCCAGTCAAGCCGACCGCGCCGCCACAACCCATCTCAAAGAAGCTCTCGCCTTGATCGACGTGCGGCTGCTCGATCATATTATTATCGGTGATCGAAATTCGTTTTCTTTTGCAGAAAGCGGGCTGCTTTGACTCTGGCGGCTGACGCCCCCGATTGCTTGCGCGTAGCTTCTATTTCTGGTATAAAATCGAGCCTTATCGCTGAAAGTATCGGAGAGTATTGTCATGGCGAAAGTATGCCAAGTGACTGGGAAACGGCCCCAAAGTGGGAATAACGTCTCTCATGCAAACAAAAAAACCAACCGTCGTTTTTTACCTAACTTGAAAAAACGCCGTTTCTGGCTGCCGGATGAAAAACGTTTTATAACGTTGACCGTTTCTACGCACGGCATGCGAATCATCGACAAGCTCGGTATCAATGCAGTTCTCAAAAAAATTCGGGAACGCGAAAAAGAAAGCAAATAAGGGTTAACCAATGGCTGTCAGTCCACGCGAAAAAATAATGCTCCAATCTACCGGAAAAACCAAAGCGGGCAAACCGACCGGTACCTTTTACACGACTTATAAAAATAAGCGAAATACCACCGATAAATTAAATATCAAAAAATTCGACCCCCGTGCCTGGAATTCTGAAACGAGCAAATGTGGAATGCATGTACTTTTCAAAGAAAAGAAAATCCCGAAATAACACTAGGGTCTAGTTATTTTTCATCTTGTAATCGCTGATACTTCTTCATTAAATCCTCTTTAGATTCATGAAAATCTAAAGGAATACAATCGACAGGACAAACCTGGCGGCATTGAGGTTCGTCGAAGTGACCAACGCACTCTGTGCATCGGTTAGAGTTAATTTCATAAATCAACTCGCCCATGGAAATCGCATCATTCGGGCATTCGGGTTCGCAGACATCGCAATTAATACATTCTTCAGTAATTTTTAAAGCCATAGAATTAATGTTATTTATTTTTCTCTTCTTTTTTGTAAATGACGGGCAACTAAAGAGGGAACGAACGGCGATACGTCGCCGCCGAGAGTAACGATTTCTCTTACCATGGTTCCAGAAACATAACTGTAACCTTCTCGTGCCGGTAAAAAAATAGTTTCAATTTCGGGTGATAATTGATAGTTCATATGCGCTAGCTGGAATTCATAATCAAAATCAGAAACGGCGCGAAGGCCGCGTAAAATAAAGTTAGCCTGGTGTGTTTTGGCAAAATCCACCAAAAGTCCGGTAAGGGGCAGAACTTCAACACGCTCATCAGTCAATACGTCAGCAATTAAATTAACGCGTTCCTCCAGTTTTAAATGAGGATCTTTACGGCTGGTGGGAGCACACGCAACGATTATTTTGTTAAATAAGGGTAAAGCGCGCTCGATAATATCTACGTGGCCGTTGGTCAACGGATCAAAGGTTCCTGGGTAGATGGCGATTGGTTTCATGCTAGCGCCTTTGTATCACCCTCTTTCTCCAACCCTTTCCCCCTAAAGGGAAAAGGAAGTAGTGAAGAGGGGTTTTTTATAATTCGTTCAATGCCTCGATCAGGGCATTTTGCTTTCAGTTCCAAAATAGACTCGCCGCCGGGTAAAATCAAGTCTTCTGCGACTTCAGCCAGTGGATAAAGCACAAATTCCCGCACAAAAAGTCCCGGATGGGGAAGACAAAGCTCATCGCTCTGAAGCGCAAGATCTCCATACAATAAAATATCGAGATCGATAATCCGCGGCCCCCATCGTTTCCCGCCCCGACACCGGCCTTGTTTTTCTTCAAGTCGTTGCAATGCTTTCAAAAGCATTTGGGGGGACAAGGTAGTTTCAACCGCTGCTACGGCGTTGATGTAATCCGGTTGATCAGTCGGGCCCAACGGTTTGCTCCGATAAAAGCTGGAATAGCCAAGACAAGCAGTTTGCGGCAACGTGGACAAATTACTTACCGCGATTTGCACTTGCTTGAGCGGATTATCCAGGTTTGCCCCTACGCCAACATAGGCTATTGTCATTGTGTTTTTCTCGCGAGCTCATTAATCAACTGTTCACGCTGCTTAGAAGTTCCATCGCGAAACGCCCGCCACCAATACACAATTTCGGTCAGCGGTTCACCAGCGCGTTCTCGTAATTCTAAAAAATCAAAAGCAGCTCGGAAAAAACGTTGTTGCGCAATTCGGTAAACACGAGTGTGGCGCCGGCGTTCTAAATGGTATTGCAACATCCAAACGGAACGCATCATTGCAGTTAATCGACGAGGAAGGGGTAATATTGTCACCTGTCGCTGTAAAGCGGTGTTTATCCCGTGATACAACGCTGGGAATAGGCGTTTATGTTTTTTAAAATGCTGTTGCATTAATTCTTGCACGGGGGGCCATAAAAAAATAGCGAATAAAAATCCCGGATTTAAACTTTGTTGGTTGTGAAAACGTTCGTCAGTGACTTTTAAAGCCAATTTAATTAAATTTTCGTAAAGCGGCTGTCGTGTTTTTTCTAAAATAGTGGCGGCTTCCGGGAATAAAGTTCGCATATAATGCGTTTGCTTTAACAATTGGTAAGAGCGAACCGCGTGTCCTTCAAAAAATATCTTTAAAACTTCTGTAAAAAGACGAGCGGAAGGCACATGACGCAATAGATTATGCAACTTTTTTAAAGGTTCTTCGGTGTCCGGATGGATTTTGAAATCCAATTTCGCCGCTAGCCGGATGGCTCGTAGCAATCGTACCGGGTCCTCATGGTAACGTTGGGTAGGATCGCCAATCATACGAATTAATCGCTGGTGCAAATCCCTCATACCGCCCGTAAAATCGATAACGGAAAAATCGGTGATGTTATAGTAGAGCGCATTAACGGTAAAATCCCGCCGCCAAGCATCTTCTTCAATTGTGCCATAGGTGTTATCTTCCGATAGCATAGTCGCCCCTGTTTTTTGCATTTCACTCAGCGGTTCTTCTTTTAATAACTCTTCTGCATTCGCGCGGAAGGTTGATACCTCAATAATTTCATTGGGAAAGTAAACATGAACTAAGCGAAATCGTCGACCAATAAGGTGGCTGTTTTTGAAGAGTTTTCGTATTTCGTGGGGGCGCGCATTGGTAGCGATATCAAAGTCTTTTGGGTGATAGCTTAATAACATGTCTCGCACACCGCCTCCCACCAGATAGGCCTCATAACCGGATTTGCTAAGACGATACAACACCCTCAGCGCGTTGGGACTGATGTCGCTGCGCGAGATAGAATGATTTTTACGTTTAATGACTCGGGGCCGGTCTTTCTTTCGTTCAAAGCGGAGCAAATAGCTAATTTTCCGCCACTGAGAAGGTTTAAACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP013667|2071315:2080235|2077396_2077609_+|WP_005771448.1|DBSCAN-SWA MAVSPREKIMLQSTGKTKAGKPTGTFYTTYKNKRNTTDKLNIKKFDPRAWNSETSKCGMHVLFKEKKIPK >NZ_CP013667|2071315:2080235|2078358_2078919_-|WP_005771454.1|DBSCAN-SWA MTIAYVGVGANLDNPLKQVQIAVSNLSTLPQTACLGYSSFYRSKPLGPTDQPDYINAVAAVETTLSPQMLLKALQRLEEKQGRCRGGKRWGPRIIDLDILLYGDLALQSDELCLPHPGLFVREFVLYPLAEVAEDLILPGGESILELKAKCPDRGIERIIKNPSSLLPFPFRGKGLEKEGDTKALA >NZ_CP013667|2071315:2080235|2074232_2075648_-|WP_005771434.1|DBSCAN-SWA MAAQGKINQWNVPEIVPATLFRAYDIRGPVTSEALTPGLAYAVGLSIGSEAREQGQKAIVVGRDGRLSGPKLTAALIQGLCETGLAVLNVGLVPTPLVYFATNRLETNSGVMVTASHNPGHHNGFKIVLNGKTLRSEEIATIRTRILERRFVKGHGAVVDVDIIEDYESYITKHIQLDRPLKVVVDCGNGIAGKVAPALYRKLGCEVVELFCEVDGHFPNHHPDPTIPANLTDLIHKVKETQADLGLAFDGDADRLGIVTDKGEIIWPDRQMMLFSMDVLSRLPGSDIVFDVKCSRSLAEIIKKYGGNPVMWRTGHSILKAKLFEIGAPLAGEMSGHIFFKDEWFGFDDGIYVGARLLRIISQTNQRTSEIFAELPDSVNTPELKLPMTEEKKQPFMQALLKKADFGNAKLITIDGLRVEFEDGWGLIRPSNTSPYLILRFEADTEEKLKRIQEIFRTQLRMIDNALELPF >NZ_CP013667|2071315:2080235|2077622_2077868_-|WP_005771450.1|DBSCAN-SWA MALKITEECINCDVCEPECPNDAISMGELIYEINSNRCTECVGHFDEPQCRQVCPVDCIPLDFHESKEDLMKKYQRLQDEK >NZ_CP013667|2071315:2080235|2077882_2078362_-|WP_040953212.1|DBSCAN-SWA MKPIAIYPGTFDPLTNGHVDIIERALPLFNKIIVACAPTSRKDPHLKLEERVNLIADVLTDERVEVLPLTGLLVDFAKTHQANFILRGLRAVSDFDYEFQLAHMNYQLSPEIETIFLPAREGYSYVSGTMVREIVTLGGDVSPFVPSLVARHLQKRREK >NZ_CP013667|2071315:2080235|2078915_2080235_-|WP_041952431.1|DBSCAN-SWA MFKPSQWRKISYLLRFERKKDRPRVIKRKNHSISRSDISPNALRVLYRLSKSGYEAYLVGGGVRDMLLSYHPKDFDIATNARPHEIRKLFKNSHLIGRRFRLVHVYFPNEIIEVSTFRANAEELLKEEPLSEMQKTGATMLSEDNTYGTIEEDAWRRDFTVNALYYNITDFSVIDFTGGMRDLHQRLIRMIGDPTQRYHEDPVRLLRAIRLAAKLDFKIHPDTEEPLKKLHNLLRHVPSARLFTEVLKIFFEGHAVRSYQLLKQTHYMRTLFPEAATILEKTRQPLYENLIKLALKVTDERFHNQQSLNPGFLFAIFLWPPVQELMQQHFKKHKRLFPALYHGINTALQRQVTILPLPRRLTAMMRSVWMLQYHLERRRHTRVYRIAQQRFFRAAFDFLELRERAGEPLTEIVYWWRAFRDGTSKQREQLINELARKTQ >NZ_CP013667|2071315:2080235|2077146_2077386_+|WP_005771445.1|DBSCAN-SWA MAKVCQVTGKRPQSGNNVSHANKKTNRRFLPNLKKRRFWLPDEKRFITLTVSTHGMRIIDKLGINAVLKKIREREKESK >NZ_CP013667|2071315:2080235|2075625_2076111_-|WP_010957483.1|DBSCAN-SWA MCLTGGRSAMTHSVQLKILDKRLGSEFPLPAYATTGSAGLDLRACLDEPLKIEPDETCLISTGLAIYLGHSNVAATILPRSGLGHKHGIVLGNLVGLIDSDYQGPLMVSCWNRGKEPYTINPGDRIAQLVVLPILKAQFAVVEEFELTERGAGGFGSSGQN >NZ_CP013667|2071315:2080235|2072766_2074236_+|WP_040947703.1|DBSCAN-SWA MRYKRHMEAKEEALDIDFAIECFRKSRETNLIDLANAFIEASNREDISSTALIAWKIREFFNDKPHEDCVNYFNYITQLPDDIPAKSYLLGMAYFLGVGVKQNTGRAKFFLRKATKAGEPNATVELFEIYSEEREKDQAQIYLNQALEKNHPRAQWLAANHSLEKEELENAKTLFQKAAIQGMPLAKHNLFLYQRQNLTPLFEAVQAGSVEALARLFAVCGNKYQIKEAKRCYEAVLFTNNPYAIYRFACFLEHEKYSKDAWGLFLLLSEWTETAPLLLSLVFSSIAYMLYEKRIGQESNLDAIVYYGKAIEYCIEAIENEHFEALNKLEEIFTWIPKIFNLSNWNYFYDAILNKGLLEDNTTLLPLAIKHCNSLKNYLISNYQSLSLENKSKLRRALEIANTLLSQPFHTAEAYLGDEIKEKKLNALVNWLTARENREENLSFIKNVMSNITPNRLSIKTIFKRSKSEETLEQEGKQEQRHSKQSFTF >NZ_CP013667|2071315:2080235|2071315_2072095_-|WP_012220156.1|DBSCAN-SWA MRIITLNLNGIRAAARRGFFDWLKRQKADIVCLQETKACLEITNGDQFHPKGYHCYYHDAEKSGYSGVGIYCREKPDRVTTRLGWEHADKEGRYIQADFGSLSVASLYMPSGTTGEHRQKIKFDFMDRYMKRLKNIVHSKRSFIICGDWNIVHKEIDIKNFKSNQKHSGCLPEERAWLDEVFTKVGLVDAFRVVNQKPDQYTWWSSRGRAWEKNVGWRIDYQVITSDLKNSVKSERIYKDKRFSDHAPLIIDYEREISD >NZ_CP013667|2071315:2080235|2072122_2072770_+|WP_010957485.1|DBSCAN-SWA MCNNDFMNQATEIAKLLLNIKAVTLNLHEPYRYTSGILSPIYCDNRLIISYPEKRKMIIEAFLQLIEKNHLSFDIVAGTATAGIPHAAWIADRLDLPMIYVRAKAKTHGKQNQIEGRIRKGQRALIVEDLISTGKSALAAGLALREKGVTVTDCIAIFSYQLPQAQQNFSDANINCHALSHFDTLIEMAVDEGYIDEIEKQKALAWNKDPEHWQP |
11 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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