Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014539 | Acinetobacter baumannii strain XH859 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,RT,cas3,csa3,WYL | 0 | 0 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
815196 : 823293
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014539|815196:823293|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014539|815196:823293|817795_818788_+|WP_000527288.1|DBSCAN-SWA MGNKYYDQLVNNDSHFEITFNDFEEFITFIRPDKLHVKDLMTQLRLEFNPSAVNFPFFKIKDFKGYSTLDKSIIYRGHGESDWDLKPTFYRNKKNIGWVKTNWSVDQNYESEILLKFQDSCDLAGVQLPSDNDQLRRRQKNKLSKYRKSFGRDQLDWFDDDFFELAVYAQHYGVETRLLDWTKNPFVASYFACSHALKMNYDPNSKFCIWVLNSESITNELNQVLEVLDPPKGLNQHISHQQGVLTYTKNHIKIFNKFGTRPCLKDILKYYESGYRLLKITLGYELIVELFNYCNIHNFNACHLFRGANGAAMHTTDLLNFDDYKYPIED >NZ_CP014539|815196:823293|817225_817681_+|WP_000549863.1|DBSCAN-SWA MHLDLSLAVEEGMQSSVTRDKSIEEIDNVLFEVDQAVKKATNNKVEFGWRKKGFNTLGLLTGLTSLPITDVKIESQEPESRVLYVSATDDKTQRFDITILVISPDGFPCEMNVNGNKLISHDAESLLEQFKPLLSSAFVGDKIRKLMKKGA >NZ_CP014539|815196:823293|816350_817235_+|WP_001076477.1|DBSCAN-SWA MNQSLFVGFWNINLSPPIGNRWNKSKVDKKIKVSRVIQGLLKLDFDFLCLCEVSPEDMEFIDNSIQLIGMGYDYNIYRKNYGGLYFDTCVIFKNTFDFVQSKVEVDGEEKNKLKVFQKYEFLSGHLEERIIFYVTHWLSQLNDNKEKRRTVASFIKKDTNDEKKFFNKTKFVVLGDFNVEPYDSAILEGLRSTRDQKVISNNSSLFYNPFWKFLQIKEDQPSGTHHCTKNEFHHWHIYDQILVSGNFFRDGWNLDDNLVLVFDDKMISSLHNDSFSNPSDHLPICLKLEKTKCI >NZ_CP014539|815196:823293|821029_822058_-|WP_000805204.1|DBSCAN-SWA MKPTLFTPETWAEFTQQLKNSWEKDNAGTDSPIFVVQEKKIVWGLDPASDSVEITNIVDADDESTYKSIDDFFESLKATDKHALNGLAIEEEDELFLDVKASTQINILSDWNERNIHICHGKYFWEDVNCHLTRSAADAFIKRKSHDFGELRVFVKSLYWCEEFKNLLNAIISGEVGLTSIDDDNILNVLGPIEPKADKEINSTQAKKSAKKANNKEENWTRYHNDKPVESPLAGLIEKLKKTKTADAANSLIEETKDWASEDQKSFLTELNKHLVIIAGQSKENISISERVKRATDLTTLDAIEIDISEADERIQEPLMELVIKRRKELEVENNFLLESPQ >NZ_CP014539|815196:823293|818965_819181_-|WP_001292077.1|DBSCAN-SWA MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI >NZ_CP014539|815196:823293|819383_819893_-|WP_000578497.1|DBSCAN-SWA MIFYDRAFFEENFKKTETFKQESNIRKNDILVFSETMNGYFNIVTNKAWLLWKKEMQAHADWYKNDDPIAYKWAKDGSPEYEADFYTSAKAWAAAKAQAGPTWISVKDEEPPTDIMVLICWDDAPDVTPEQDYITIDEDLNSVWANYYNDPPSHWMHFHSVPNVSGAEQ >NZ_CP014539|815196:823293|820418_820598_-|WP_000464381.1|DBSCAN-SWA MFEVKTAVQFDDDDVWIGSVLISKCGGNDEWTAYLDNDVEKEFETLEQAVTYCLEQAND >NZ_CP014539|815196:823293|815196_816354_+|WP_000947475.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPIMGCKEARQLARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPINEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFKRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPAERMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYIFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKTTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVENWIGTNS >NZ_CP014539|815196:823293|822921_823293_-|WP_001260065.1|DBSCAN-SWA MRTNYLRGSKRYENNLNGQVNQKSTFREFVGKDEEHGLYKVRLGYTVYAANHTLTRVYTVNENNELTPVSQYTLNTKEWILRNLETEIKYRRGRELGQILQKTHIPSPDRKAYKIRRGFLGTR >NZ_CP014539|815196:823293|819889_820426_-|WP_000609004.1|DBSCAN-SWA MINLANQREALIAEVEVFKKDSMELWFVPDLAASYTNRDFFSYSIIEDNQVFFMIEQTRQLWEFWNKAKDHNLPKGSVLIVEDQIKTMWQDNEEPENCVNKEKDFNCLGDCLDIEDIISITKQRYAYISAEKVYGTWVAKFEAGELKKDYFFVGSQKECEEIVESNKALYSSRMGANS >NZ_CP014539|815196:823293|819177_819387_-|WP_000028957.1|DBSCAN-SWA MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG >NZ_CP014539|815196:823293|822070_822751_-|WP_000643997.1|DBSCAN-SWA MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIEADIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKAKAICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLFLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI >NZ_CP014539|815196:823293|820598_820889_-|WP_000986115.1|DBSCAN-SWA MMRNIPDSMSFPFTVWMCENGYYPSHKNGFIILKRGKEVAKISMNETKDGYPMNDICQKKFASFCRAWMNRDKHFIEQLRLRGLARLNQKSYQMVA >NZ_CP014539|815196:823293|818794_818965_-|WP_000119264.1|DBSCAN-SWA MSWYSLRQLAKELGMAPNTFKKYYLEKFPPDRESKTYKGWTSQSVAKIKVEIQGAK |
14 | Acinetobacter_phage(57.14%) | integrase | attL 810523:810537|attR 822435:822449 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1044806 : 1115886
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014539|1044806:1115886|DBSCAN-SWA 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88 | Acinetobacter_phage(87.27%) | transposase,integrase,capsid,terminase | attL 1041146:1041205|attR 1115900:1117081 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1337589 : 1372731
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014539|1337589:1372731|DBSCAN-SWA 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32 | Salicola_phage(25.0%) | transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1530074 : 1553188
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014539|1530074:1553188|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014539|1530074:1553188|1546752_1546938_-|WP_002026779.1|DBSCAN-SWA MFPNQLTFYFNYRISGDTSGGLQLFGLIGLIYGPIIFALTMVLLRLYTIEFKDFLERQDNS >NZ_CP014539|1530074:1553188|1550100_1550985_+|WP_000155092.1|DBSCAN-SWA MTIQDIQSLAEAHGLLLTDKMNFNEMGIDFKVVFALDTKGQQWLLRIPRRDGMREQIKKEKRILELVKKHLSVEVPDWRISSTELVAYPILKDNPVLNLDAETYEIIWNMDKDSPKYITSLAKTLFEIHSIPEKEVRENDLKIMKPSDLRPEIANNLQLVKSEIGISEQLETRYRKWLDNDVLWADFTQFIHGDLYAGHVLASKDGAVSGVIDWSTAHIDDPAIDFAGHVTLFGEESLKTLIIEYEKLGGKVWNKLYEQTLERAAASPLMYGLFALETQNESLIVGAKAQLGVI >NZ_CP014539|1530074:1553188|1536441_1537017_+|WP_001176353.1|DBSCAN-SWA MQLLGSVASPFVRRLRLVLAGQPYQFVALNIFESEGRSVLVQHNPARKVPVLVDGEQVIFDSGVIYRYLASKLKFKPLSWDQENGLTTINACTDSLVELLLCKRSGFDVTEDKLFFNLQHERIQATLEALEQQIRAGHFGDWDYPGISLFTLIDWILFRDLVDLKPFPVLLQFRNAHLNRPMVAETDPRLS >NZ_CP014539|1530074:1553188|1532297_1533137_+|WP_000259031.1|DBSCAN-SWA 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20 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2570554 : 2585350
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014539|2570554:2585350|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2749921 : 2796431
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP014539|2749921:2796431|DBSCAN-SWA 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56 | Acinetobacter_phage(66.67%) | capsid,terminase,tail,integrase,holin,tRNA | attL 2741193:2741207|attR 2766738:2766752 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3695390 : 3721829
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP014539|3695390:3721829|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP014539|3695390:3721829|3716007_3716718_-|WP_020752340.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKLSDEYLPVRKAQTVYGSISGNYAFRGEKTIWFESTLERDFILKQEFNNNVIDVIGQPVVIPYITELGNQSTYTPDFLVQFSSSNCDDFEDFPVPMLIEIKPKKKLVEDWDKLKPKFRAAHRFAADKGWKFKIISETRLYDQYWENINFLKKFRRSHVGAVDQQLLLDTLQELGQSTINQLPAHLFKDKTNVLKGIHQVWALVAKRMIACDLYCPLTAETVIWVNQNDAFVRNI >NZ_CP014539|3695390:3721829|3711719_3712809_+|WP_085940413.1|transposase|DBSCAN-SWA MTHLNELYLILNKYLKWNKSHLKCFALIMLVIILKQTCNLSSASKALPIKCLPQSFYRRMQRFFAGQYFDYRQISQLIFNMFSFDQVQLTLDRTNWKWGKRNINILMLAIVYRGIAIPILWTLLNKRGNSDTKERIALIQRFIAIFGKDRIVNVFADREFIGEQWFTWLIEQDINFCIRVKKNFIVTNHLGKNHKISDLFRHLKVGQIECRKRRILVGRVKLYISALQLENGELLLVVSPQFNANAIQDYALRWEIETLFSCLKGRGFNLENTRLTDPRRVKKLIAVLAISFCWCYLTGEWQHDQKKAIKIKKHGRLSMSLFRYGLDYVQMAIQRLIGFGKKEEFKEILAILRRQNPDRIRVL >NZ_CP014539|3695390:3721829|3708541_3709631_+|WP_085940413.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MTHLNELYLILNKYLKWNKSHLKCFALIMLVIILKQTCNLSSASKALPIKCLPQSFYRRMQRFFAGQYFDYRQISQLIFNMFSFDQVQLTLDRTNWKWGKRNINILMLAIVYRGIAIPILWTLLNKRGNSDTKERIALIQRFIAIFGKDRIVNVFADREFIGEQWFTWLIEQDINFCIRVKKNFIVTNHLGKNHKISDLFRHLKVGQIECRKRRILVGRVKLYISALQLENGELLLVVSPQFNANAIQDYALRWEIETLFSCLKGRGFNLENTRLTDPRRVKKLIAVLAISFCWCYLTGEWQHDQKKAIKIKKHGRLSMSLFRYGLDYVQMAIQRLIGFGKKEEFKEILAILRRQNPDRIRVL >NZ_CP014539|3695390:3721829|3703680_3705045_+|WP_000108584.1|DBSCAN-SWA MSTTVIILAAGKGTRMRSQLPKVLQPLAGRPLLGHVIKTAKQLLAENIITIYGHGGDHVKKTFAQENIQWVEQAEQLGTGHAVQMTLPVLPKDGISLILYGDVPLVRQTTLEQLIEVSNKTGIGMITLHVDNPTGYGRIVRQDGKIQAIVEHKDATEAQRQIQEINTGIYCVSNAKLHEWLPKLSNENAQGEYYLTDIVAMAVADGLEIASIQPELAFEVEGVNDRLQLAALEREFQKQQAKELMQQGVTFADPARFDLRGTVKVGHDVRIDVNVIIEGDCELGDFVEIGAGCILKNTTIAAGTKVQAYSVFDGAVVGENTQIGPFARLRPGAKLANEVHIGNFVEVKNTTIGLGSKANHFTYLGDAEIGAESNIGAGTITCNYDGANKHKTTIGDAVFIGSNSSLVAPVTIGNGATVGAGSVITKDVAEQSLSFERAQQISKANYQRPQKLKK >NZ_CP014539|3695390:3721829|3706981_3707782_-|WP_001063770.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP014539|3695390:3721829|3695873_3696353_-|WP_000778126.1|DBSCAN-SWA MKLSSIPVVKLPLVDVSTDPLDLLVAGLALRMKQLARTSPKFIELVHDRAFRIQIGTDLGVARQIIINHGHIDTVAGSPEKADFILQFADSEQGVKTLLKGDPTAFMTGMQDGSIKMEGDFSLLVWFNQAAKLIPPKLPKPVKDKVRQARAFIKEKTGR |
24 | Staphylococcus_phage(40.0%) | transposase,integrase,tRNA | attL 3696512:3696527|attR 3722837:3722852 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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