Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014541 | Acinetobacter baumannii strain XH856 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014541_1 | 2301884-2301969 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014541_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014541_1
>1.1|2301907|40|NZ_CP014541|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014541_1
The CRISPR arrays of NZ_CP014541_1 >merge|NZ_CP014541|1|2301884-2301969|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP014541|1|1|2301884-2301969|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP014541.1|WP_000795915.1|2300646_2300883_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP014541.1|WP_001124846.1|2299752_2300364_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP014541.1|WP_000885229.1|2299070_2299682_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP014541.1|WP_000376215.1|2298458_2298914_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP014541.1|WP_001990047.1|2296753_2298400_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP014541.1|WP_000115408.1|2293123_2296588_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP014541.1|WP_000107128.1|2292167_2293127_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP014541.1|WP_001025680.1|2291739_2292024_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP014541.1|WP_002017921.1|2291516_2291630_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP014541.1|WP_000937460.1|2290792_2291428_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP014541.1|WP_000983628.1|2302600_2303014_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP014541.1|WP_000432330.1|2303155_2304034_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP014541.1|WP_001990041.1|2304090_2306235_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP014541.1|WP_001145693.1|2306289_2307699_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP014541.1|WP_000482091.1|2308014_2308494_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP014541.1|WP_000108365.1|2308778_2309000_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP014541.1|WP_000132044.1|2309105_2309423_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP014541.1|WP_000498477.1|2309507_2309729_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP014541.1|WP_001136759.1|2309816_2310245_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP014541.1|WP_000251637.1|2310514_2310658_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1151045 : 1165842
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014541|1151045:1165842|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1328804 : 1349648
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014541|1328804:1349648|DBSCAN-SWA 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19 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1528288 : 1562519
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014541|1528288:1562519|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP014541|1528288:1562519|1540489_1540912_+|WP_000647820.1|DBSCAN-SWA MKASKLIRDKGLQYAKEIVDSAPDNATEWNEGYEFQCGQSVEISPADREKYFVDLVELKRLVESLKIISDLGGVEKLTPAFITTDKHVGYTHVRMVGNGRLSFLDDFCDFIPDGSISIKRVMTAIRDHESIYGGGESHAN >NZ_CP014541|1528288:1562519|1543672_1544101_+|WP_000341071.1|DBSCAN-SWA MDDKEYFWLTQKKELKTKPKSRPLPKAKEKYLEAEETLFQELEEHRIGYRRKFQFESTKNWRFDFYIVKLNLLIEIAGSPWAVGRGGTKIANSFNKYDLALDRGYVFERLEPHQIESGYAINWIKSELARIEDGSDQTISSN >NZ_CP014541|1528288:1562519|1541932_1542433_+|WP_000783470.1|DBSCAN-SWA MKMNMPVQQHILQAVDWSRFSFEEWCRQLGAWLNGDTETMVKIVKTMPTKRITQKQREKLIAMYMSDENLKDRLCIRRKGTCCELNDNEARAIHRLIIDIKLIEDHILQEWISAIWSHHVMGNSLRDIAQSNDTSVNQIRQDLKCGMAYIKSRNPHFRFETFEKTA >NZ_CP014541|1528288:1562519|1553794_1554463_+|WP_000914808.1|DBSCAN-SWA MLKKSLHDQIKIIGFWTVGGVFWYLVIAFFLKSKYPIFDYSFNLEIAYDVIKDALTLAASFLAPVAAFVLFSDWRVQHKALKNEKLSEDILRILNTELLSFYNFNPRSKSDVEDFNNHQMQFHRNVANIYVMLDEIDANEVQANHFIENIKKIEVDLDGLYMSIFKQIEIVIEHDAISDFLDTHSMRKKEILLKKLKKFENINETHYENLIKVISQLKPLKV 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54 | Acinetobacter_phage(98.0%) | integrase,capsid,terminase | attL 1522397:1522411|attR 1542495:1542509 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1566429 : 1582225
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014541|1566429:1582225|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014541|1566429:1582225|1566429_1567638_-|WP_000343018.1|transposase|DBSCAN-SWA MDEATIKSMAAELAKGLKTPEDLNQMTAVFKKFMIETALNTELSDHLGYEKHQPKKGSNSRNGFSSKTITTQDGQLALDIPRDREGSFEPQIIKKHQTRITSMDDQILSLYAKGMTNREIVAFFKEMYDADVSASLISKVTDAVIEQVTEWQNRALDSLYPVVYLDCIVVKVRQHSNVINKSVYLALGINMDGQKELLGMWIAQTEGAKFWLSVMTELKNRGVQDILVACVDGLKGFPDAIASVYPHTDIQLCIVHVVRNSLRFVSWKDYKAVTSGLKAIYQASTEENALKSLDIFCDQWNHQYPKIGESWRANWENIRTIFSYPAEIRHAIYTTNAIESLNSVIRHSTKKRKIFSSDDSVKKVIYLATSNAAKKWTMPIQNWRLAMNWFTIQFDDRLKDHL >NZ_CP014541|1566429:1582225|1574650_1575040_+|WP_000433908.1|DBSCAN-SWA MEPVSTSGFTALLKLYGIAIMVTLAVGLVAAVVLMTRMPRSPQEWGVGLICTVVSSLAGGSFIIVKWGLHEWVTDVWGMIALGGFFFVCGLPGWALVRWIFNFIDKQEGKTIVEVIKEFKKARKDIENS >NZ_CP014541|1566429:1582225|1570278_1570785_+|WP_000368375.1|DBSCAN-SWA MDNEYAKFFFNRKVDVYQLECIELSHPSFMNIYRIVRNDDRGVYVQHKEGSGQVYYEFLPASIQRSGMLGDLDQTLTVSISGLGDVMPDEFERVIEGQYPDVKPTVNYRIYSSDNLNSPMFYLLGLQLSSVAMNHKAVTFKAESPRLNTAKTGDIFALDRFTGLKGAI 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>NZ_CP014541|1566429:1582225|1576477_1576738_-|WP_000124482.1|DBSCAN-SWA MARSSDVEYKMRMTQELKEKILESAKLNSRSMNADIVARLEKSFENQNYEKTVELIPTETLMMELASRMKGYTITVSEKSDIKKAP >NZ_CP014541|1566429:1582225|1569880_1570279_+|WP_000277443.1|DBSCAN-SWA MYKLKLNPQTSGYGVTPGDDVKRQQMDGGRGRYYIDVKRNSHIVDVNWNLSKTDFNKMMAFWRIYQNKPASFYADLVIDQGTRQQYQCNFIPNSFKTNEVNGNLYRVNAQLEVVQNQPNLTADIALIKDWEV >NZ_CP014541|1566429:1582225|1576903_1577803_+|WP_000096283.1|DBSCAN-SWA MSSLALSFNEVKFNPVPRQDGQIWLSSGELAQALGYKQENAVSKIFNRNSDEFTENMTQIIDNPRLPNLGMRIFSLRGCHLIAIFARTAVAKQFRKWVLDVLDKEVGTPVAKTHKSEREPLTNAVNLLVAKTKHLNYSDAYKLVHQRFNVQHIDEIPYDMIPVAVEYVHHLIAMYSSAEKKAQGSLFDNETLGLVKDLVDAIISQNFVTSKIYRAIHMLSNEQGHYLAEYAFKTNIAVLKLTRTMDLRGPLNREIISDDLKTISYTTGNQHYGDRWFHPLMESSRLMGVLEISGSLIRH >NZ_CP014541|1566429:1582225|1568681_1569440_+|WP_000856592.1|DBSCAN-SWA 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18 | Acinetobacter_phage(92.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2562203 : 2621653
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014541|2562203:2621653|DBSCAN-SWA 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55 | Escherichia_phage(25.0%) | integrase,tRNA,transposase | attL 2604627:2604686|attR 2620885:2621705 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2698723 : 2727397
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP014541|2698723:2727397|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2731355 : 2743703
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP014541|2731355:2743703|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_8 |
2969676 : 2984188
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP014541|2969676:2984188|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP014541|2969676:2984188|2971219_2971591_-|WP_000977810.1|DBSCAN-SWA MMKRLRQRQRQQRSIFAMLQSNSRETSTFKSSETVTPKEQQAQSAKPRYIFTELGKEKLCKHCQEYWPVDSEFWFMVKAKRKDGSVVHRPDSACKGCYDSTYRPNLSKGKYQKRSNHEKGAAA >NZ_CP014541|2969676:2984188|2970815_2971223_-|WP_000995576.1|DBSCAN-SWA MNCFQEKQLIQIDEEQKVIKFTRKRELIECDHKHIQISEEESEVLCIDCKTKLNPVLWIAKYLRQLNQVTDRNNRMLAEVRVIQSKLEKKNKFMCKSCHAVNEIDFKKLPSQAAITRGMSVIEQEFDGMKVEFCQ >NZ_CP014541|2969676:2984188|2982731_2983106_-|WP_000818521.1|DBSCAN-SWA MAEKLLANASSKLTLEEKAKMEWIAKLEGKNSLSNLIRSMCKKKISEVEGEMAGKSSLEVIKNICTRKVSEAESEYQFLRNVFCGSKDNGYTRDTFELVPLRAEKSRHTNASDKSVQLDLLSWK >NZ_CP014541|2969676:2984188|2973606_2974650_-|WP_000124472.1|DBSCAN-SWA 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23 | Acinetobacter_phage(53.85%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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