Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014791 | Staphylococcus aureus strain MCRF184 chromosome, complete genome | 8 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 4 | 3 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014791_1 | 216561-216671 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014791_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014791_1
>1.1|216591|51|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder CAAAAGAAGCCAAGCAAAACAAATGCATATAACGTAACAACACATGCAAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014791_1
The CRISPR arrays of NZ_CP014791_1 >merge|NZ_CP014791|1|216561-216671|CRISPRCasFinder GGCCAAGTATCATATGGCGCTCGTCCGACACAAAAGAAGCCAAGCAAAACAAATGCATATAACGTAACAACACATGCAAACGGCCAAGTATCATATGGCGCTCGTCCGACA >NZ_CP014791|1|1|216561-216671|CRISPRCasFinder GGCCAAGTATCATATGGCGCTCGTCCGACA CAAAAGAAGCCAAGCAAAACAAATGCATATAACGTAACAACACATGCAAAC GGCCAAGTATCATATGGCGCTCGTCCGACA
>NZ_CP014791.1|WP_000211606.1|214314_214659_-|complement-inhibitor-SCIN-family-protein MTTQMKIKTYLVAGIKAALLDTTGIKLASKSETTSHTYQHQALVDQLHELIVNTDLNKLSYLNLDAYQKRDILAAHYIAKSAIRTKNLDQMTKAKHRLESIYDSISNPLHSQNN >NZ_CP014791.1|WP_000822598.1|212387_214151_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MKRISKDIWAVFKLLYQNKGRFSINALLLQLIMIFISSTYLILLFNMMLKVAGQSQLTINNWMEIVSHPASVILLIIFILSVAFLIYVEFSLLVYMVYAGFDRQIITFKSIFKNAFVNVRKLIGVPVIFFVIYLMLMIPIANLGLSSVLTKNIYIPKFLTEELMKTTKGIIIYGTFMIAVFILNFKLIFTLPLTILNRQSLFKNMRLSWQITKRNKFRLVIEIVILELIIGAILTLIISGATYLAICVDEEGDKFLVSSILFVVLKSSLFFYYLFTKLSLISVLVLHLKQENVLDQPGLEFKYPKPKRKSRFFIISMVLAVTCFVGYNMYLLYNNTINTNISIIGHRGFEDKGVENSIPSLKAAAKANVEYVELDTIMTKDKQFVVSHDNNLKRLTGVNKNISESNFKDVVGLKMRQNRHEAKLVSLDEFIETAKQSNVKLLVELKPHGKEPADYTQRVIDILKKHGVEHQYRVMSLDYDVMTKLKKEAPYLKCGYIIPLQFGHFKETSLDFFVIEDFSYSPRLVNQAHLENKEVYTWTINGEEDLTKYLQTNVDGIITDDPALADQIKEEKKDETYFDRSIRILFE >NZ_CP014791.1|WP_000911657.1|211310_212066_+|pyruvate-formate-lyase-activating-protein MLKGHLHSVESLGTVDGPGLRYILFTQGCLLRCLYCHNPDTWKISEPSREVTVDEMVNEILPYKPYFDASGGGVTVSGGEPLLQMPFLEKLFAELKENGVHTCLDTSAGCANDTKAFQRHFEELQKHTDLILLDIKHIDNDKHIRLTGKPNTHILNFARKLSDMKQPVWIRHVLVPGYSDDKDDLIKLGEFINSLDNVEKFEILPYHQLGVHKWKTLGIAYELEDVEAPDDEAVKAAYRYVNFKGKIPVEL >NZ_CP014791.1|WP_000894660.1|209038_211288_+|formate-C-acetyltransferase MLETNKNHATAWQGFKNGRWNRHVDVREFIQLNYTLYEGNDSFLAGPTEATSKLWEQVMQLSKEERERGGMWDMDTKVASTITSHDAGYLDKDLETIVGVQTEKPFKRSMQPFGGIRMAKAACEAYGYELDEETEKIFTDYRKTHNQGVFDAYSREMLNCRKAGVITGLPDAYGRGRIIGDYRRVALYGVDFLMEEKMHDFNTMSTEMSEDVIRLREELSEQYRALKELKELGQKYGFDLSRPAENFKEAVQWLYLAYLAAIKEQNGAAMSLGRTSTFLDIYAERDLKAGVITESEVQEIIDHFIMKLRIVKFARTPDYNELFSGDPTWVTESIGGVGIDGRPLVTKNSFRFLHSLDNLGPAPEPNLTVLWSVRLPDNFKTYCAKMSIKTSSIQYENDDIMRESYGDDYGIACCVSAMTIGKQMQFFGARANLAKTLLYAINGGKDEKSGAQVGPNFEGINSEVLEYDEVFKKFDQMMDWLAGVYINSLNVIHYMHDKYSYERIEMALHDTEIVRTMATGIAGLSVAADSLSAIKYAQVKPIRNEEGLVVDFEIEGDFPKYGNNDDRVDDIAVDLVERFMTKLRSHKTYRDSEHTMSVLTITSNVVYGKKTGNTPDGRKAGEPFAPGANPMHGRDQKGALSSLSSVAKIPYDCCKDGISNTFSIVPKSLGKEPEDQNRNLTSMLDGYAMQCGHHLNINVFNRETLIDAMEHPEEYPQLTIRVSGYAVNFIKLTREQQLDVISRTFHESM >NZ_CP014791.1|WP_000837099.1|207482_208451_-|extracellular-solute-binding-protein MKSKIYILLLFLIFLSACANTRHSESDKNVLTVYSPYQSNLIRPILNDFEKQEHVKIEIKHGSTQVLLSNLHNEDLSERGDVFMGGVLSETIDHPEDFVPYQDTSVTQQLEDYRSNNKYVTSFLLMPTVIVVNSDLQGDIKIRGYQDLLQPILKGKIAYSNPNTTTTGYQHMRAIYSMHHRVSDVHQFQNHAMQLSKTSKVIEDVAKGKYYAGLSYEQDARTWKNKGYPVSIVYPIEGTMLNVDGIALVKNAHPHPKRKKLVQYLTSRSVQQRLVAEFDAKSIRKDVSEQSDQSIENLKNIPLIPKSKLPDIPHHKFLEMIQ >NZ_CP014791.1|WP_000127975.1|205929_207486_-|sensor-histidine-kinase MTAYKPYRHQLRRSLFASTIFPVFLVIIIGLVSFYAIYIWIEHRTIHQHVDESQLSLHHTEKQIQTFITQHNNSFQELDLTNHHDVTATKRELLKLIHQQPATLYYELSGPNQFITNNYEHLNTKNMYLFSTHQLKFKNSTYMLKIYMANTPRLSEIKKDNRQFALIVDQYDNILYANDDRFTIGEKYRPQQFGFMNESVKLNRADHRLIIYKDIHENIEDGITLLIVMAVVLVLLVIFGFISADNMAKRQTKDIETIIQKIYYAKNRHLGTYTPLKNNSELEEINNYIYDLFESNEQLIHSIEHTERRLRDIQLKEIERQFQPHFLFNTMQTIQYLITLSPKLAQTVVQQLSQMLRYSLRTNSHTVELNEELNYIEQYVAIQNIRFDDMIKLHIESSEEARHQTIGKMMLQPLIENAIKHGRDTESLDITIRLTLARQNLHVLVCDNGIGMSSSRLQYVRQSLNNDVFDTKHLGLNHLHNKAMIQYGSHARLHIFSKRNQGTLICYKIPLSRGNVDV >NZ_CP014791.1|WP_000477521.1|205178_205937_-|response-regulator-transcription-factor MFKVVICDDERIIREGLKQIIPWGDYHFNTIYTAKDGVEALSLIQQHQPELVITDIRMPRKNGVDLLNDIAHLDCNVIILSSYDDFEYMKAGIQHHVLDYLLKPVDHAQLEVILGRLVRTLLEQQSQNGRSLASCHDAFQPLLKVEYDDYYVNQIVDQIKQSYQTKVTVSDLIQHIDVSESYAMRTFKDHVGITIVDYLNRYRILQSLQLLDRHYKHYEIADKVGFSEYKMFSYHFKKYLQMSPSDYCKQAK >NZ_CP014791.1|WP_001008721.1|203440_204820_+|hexose-6-phosphate:phosphate-antiporter MNFFDIHKIPNKGIPLSVQRKLWLRNFMQAFFVVFFVYMAMYLIRNNFKAAQPFLKEEIGLSTLELGYIGLAFSITYGLGKTLLGYFVDGRNTKRIISFLLILSAITVLIMGFVLSYFGSVMGLLIVLWGLNGVFQSVGGPASYSTISRWAPRTKRGRYLGFWNTSHNIGGAIAGGVALWGANVFFHGNVIGMFIFPSVIALLIGIATLFIGKDDPEELGWNRAEEIWEEPVDKENIDSQGMTKWEIFKKYILGNPVIWILCVSNVFVYIVRIGIDNWAPLYVSEHLHFSKGDAVNTIFYFEIGALVASLLWGYVSDLLKGRRAIVAIGCMFMITFVVLFYTNATSVMMVNISLFALGALIFGPQLLIGVSLTGFVPKNAISVANGMTGSFAYLFGDSMAKVGLAAIADPTRNGLNIFGYTLSGWTDVFIVFYIALFLGMILLGIVAFYEEKKIRSLKI >NZ_CP014791.1|WP_000603756.1|202713_203208_-|isoprenylcysteine-carboxyl-methyltransferase-family-protein MILSILLIFFCIRLVSLKISINHSKQLKADGAVEYGVKNSKFLAMTHVLIYVLAGVEAFINKDTFSFANGIGLVILIFAYIMLFMVIKTLGGIWTLKLFILPNHPIIKSGLYKITKHPNYFLNIIPELIGVLLLTHATYTTILLVPYAYFLYVRIKQEEKLMNI >NZ_CP014791.1|WP_000690407.1|201387_202356_+|sugar-phosphate-isomerase/epimerase MKIGVFSVLFYDKNFEDMLDYVAESGLDMIEVGTGGNPGDKFCKLDELLENEDKRQAFMKSITDRGLQISGFSCHNNPISPDPIEAKEADETLRKTIRLANLLDVPVVNTFSGIAGSDDTAKKPNWPVTPWPTAYSEIYDYQWSEKLIPYWQDLAEFAKEQDVKIAIELHAGFLVHTPYTMLKLREATNEYIGANLDPSHLWWQGIDPIAAIRILGQANAIHHFHAKDTYINQENVNMYGLTDMQPYGNVATRAWTFRTVGYGHSPYVWADIISQLIINGYDYVLSIEHEDPIMSVEEGFQKACQTLKSVNIYDKPADMWWA >NZ_CP014791.1|WP_031774836.1|216939_217047_-|hypothetical-protein MCVRTRLVSSSSVRLSKAIIIAVIVVCHIDVRGLF >NZ_CP014791.1|WP_001154623.1|217344_218529_-|thiolase-family-protein MQEAYIVAYGRSAAAKAKQGALFHERPDDVAAKVLQGVLKRIDGKFNKNMIEDVIVGTAFPEGLQGQNIARTIALRTGLSDTVPGQTVNRYCSSGLQTIAIAANQIMAGQGDILVAGGVELMSAVPMGGNEPTNNPTLQYDDIGASYPMGLTAENIASQFDVSREDQDAYAVRSHQRAYDAQRDGRFKDEIIPIQVNSVEYTNAGPKVHTNIFDQDEFIRPDTTMEALAKLRTVFKADGTVTAGTSAPLSDGAGFVVLMSGDKVKELGVTPIARFVGYKAVGVDPKIMGIGPAYAIPEVLSLSNLSVEDIDLIELNEAFASQTIASIKEVGLDISRTNVNGGAIALGHPLGATGAMLTARLLNEMGRRPDSRYGMVTMCIGVGMGAAAIFEYVR >NZ_CP014791.1|WP_000154508.1|218558_220820_-|3-hydroxyacyl-CoA-dehydrogenase/enoyl-CoA-hydratase-family-protein MTINKVTVLGAGTMGAQLAALFVNAGLKVKLLDIVVDKNDPNLIAKKSYDKITDKKRPLLFDLNLASHLTYGNFDDDLVNDDADLYIEAVKEDIEIKHAVWQQVLQHAKEDALFATNTSGIPINAIAKAFNEKDQERFFGLHFFNPPRIMKLVELIPTSHTKESIILDVKNFAQNVLGKGVIVVNDVPGFVANRVGTQTMNDIMYRAEQHKLSIVDVDALTGQAIGRPKTGTYALSDLVGLDIAVSVIKGMQQVPEETPYFHDVKIVNTLFENGALGRKTKQGFYKKDKETKARLVYDVEKQDYVPVSQPQLPILNEFNKDVVHNLDVIFNAQDEAGLFLWETLRNNFYYSAINVPKATDDFRDIDRALVWGFNWKLGPFQLWDAMGYERVKTRMEDELGDLPQWISDLDGGFYKQDETIEYATPVSHFVKDELWDKGDAKLSVTHDNQLLLKLQSKNNVITDEFNDALVDAIDLLENEHYTSMVIYADGNNFSVGANLFLMKKAHEDGLVDDVVAQSIDKLHYSFNRLKYSLKPVVTAVQGRALGGGCELVLYSPIVVAASETYIGLVEAGVGLLPSGGGLAEMADRILRTSHKFDDKQASMTKVLTNIAFAKASTNAFEARRYGYLRDTDTIIFNTTQRVEVALKRAKYEAETNYIPNPRHQYIALGEDFKALIQGQLDAQRRGHFISDHDYHIALNIATILAGGDLPRNTFINQRYIQSLEKIGFIDLLKSKKSYERIAHMLKTGKPLRN >NZ_CP014791.1|WP_000142193.1|221006_222218_-|glutaryl-CoA-dehydrogenase MTFEKETVLKTLFPEDVLSIAKGLTDGEVEFLQQVDSLLESKYRENINQHWIDATVPEDYFKDLGELNYFNNPLLYKDRPNAKMPSQLFQFFMSYLLARFDISLATLLGVHQGLGHNTFYFGGSKEQIAKYVPKLQSHELRTCFALTEPEHGSDVAGGLETVAERQGDTWVINGEKKWIGGAHVSDVIPVFAVNKETGKPHCFVVRPEQDGVNIEVIDNKIALRIVPNALIKLTNVKVDEADRLQNITSFKDIAKILYSTRAGVAYMATGGMAGALRATLDYVTERKQFGKPISKYQLIQEKLAMMQGNLAQAMATCAQLANMQAHGEYDEVATSTAKMMNALRLRETVAMGRGITGGNGILADDYDIARFFSDAEAIYTYEGTHEINALVIGRALTGDSAFV >NZ_CP014791.1|WP_001008393.1|222329_223835_-|acyl--CoA-ligase MNFDWIKTRSDFDDDKPAVIDHAKQTSWTYQQLNARADNMAHYLTSQGVKKGDVIGIFAPNDIAILDLLFACFKTGAVFLPLNWRLNPKEIAAIVEDAQLKLLFYAEKHLSSLTDIDQNLLHMDIDVAQYDEIVNPDYHQPFQATPVEPQDLAALIYTSGTTGSPKGVMFSYESFVHNGANLELTYKFNSNYITIVSTPMFHVLGFNDTVLPVLMSGGTLILQRYFNGEELNDMIAQYHPTFIIMIPTMYYSTLRASNFNPENFKAMDYIIQGGSQPLPSIQAAFKQYGINIINGYGLTEAPLVLVNTPENSKRKPMSIGKAVMFVDARILDDNGEEVPTGEIGELAIKAKNVTPGYWNKPAETAKAFHGRYLLTGDLAKMDDDGDIFIIDRKKELIITGGENVLPSEVENALAEHPLIDRCVVVGYDHPKYGESIAAAIILREDEPHYAEILDQHMRSRLAGYKVPRMYVPVTHMPLNSTQKPDKLAIRQMMNDKVSQTL >NZ_CP014791.1|WP_078255079.1|223860_225438_-|acyl-CoA:acetate/3-ketoacid-CoA-transferase MEVTCLKQITWHDLQHIIKDGDVIGLPALAVANLPAEVLRAVLAQHDTYHTPNDLTFILANDIHSLGAAPDLDDFIERRMIKRVIMSILTASSKTAQAMKNNDIEAYFLPQGIITTHYRQSNQLLPGVITKIGLNTAVDPRYGGGKVNTRTTDDLVSLVTIDDETYLHYTFPSVDVALLRGTYADQQSNIYLTQEAYLSECYHVALNTKANHGKVIVQVKDLVDDYQLKPNEVVIPGNLVDYVYVTEDEKNHRQVIQSHYLPALSGEERIDGIPEPALPFNSRKLILRRAAQFLTYGDTISIGYGINNELSNLLHEECVEHDVQPILDIGIFGGFVGSREHFGMNYNADVRMPHDRAWDFIYNNGVSVAYLSFAEVDQYGNVNVSYFNGRLNGCGGFIDITQSVNKIIFSGTFVAGNHVSCHNQRLSIETEGQNQKFVSDVSHIDFNAQYSQSLEQEVYFVTDRAVFELTNQGLKLIEIAPGLDLHKDILNQMAFKPIIADHLKLIDTSIYKEKWGELKQSIHKV >NZ_CP014791.1|WP_001265705.1|225795_226467_+|type-1-glutamine-amidotransferase MRVNVLQHTPNEGVGYIGEWAKESGHEVYIYHPYMNDGVLPLAEETDMLVILGGPMNPDDEMPWIQSERELILVLMAQNKPIYGACFGAQQISKALGYAVLKSPVKEVGWDDVYLESEIIPNIPSRLKALHWHEDMFQIPQQAELLFSGNHIRNQGFIIDHHVIGLQFHFEPGPDDVREMVLNDAQYINHSILEQSAEDILAFEVPKQNRQAIFRILDFITQA >NZ_CP014791.1|WP_072468834.1|226688_227831_+|PrsW-family-intramembrane-metalloprotease MSSAITQSTKTSDIHNESIDKQMDDKAYETAQNTDLKHEARSLFDNATKSIGRLAGNDESLNLNLKDMFSEVFKPHTKNEADEIFIAGTAKTTPAICDISEEWGKPWLFSRVFIAFTVTFIGLWVMAAFFNNTNAIPGLIFIGALTVPLSGLFFFYESNAFKNISIFEVIIMFFIGGVFSLLSTMVLYRFVVFSDQFERFGSLTFFDAFLVGLVEETGKALIIVYFVNKLKTNKILNGLLIGAAIGAGFAVFESAGYILNFALGENVPLLDIVFTRAWTAIGGHLVWSAIVGAAIVIAKEQHGFEFKDILDKRFLIFFLSAVGLHGIWDTSLTILGSDTLKIFILIVVVWILVFILMGAGLKQVNLLQKEFKDQQKKVDE >NZ_CP014791.1|WP_000361245.1|228372_228924_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MDKRIKKTQRTLKQTMITLLKEQHIEDITVTDICDKSDIVRRTFYAHFNDKYDLVERIMSDYISDFVEICHFKEQINFKLGNIKWFEYLYNNKDIFSVLFKSSISALFSKKLETVIYKQLENKIAKSVINEGISKSTLLCFLTSAVLGVMVNFALNGDSDYQNKADETLILLKPYLKNDILNS >NZ_CP014791.1|WP_000412502.1|229077_229722_+|SDR-family-oxidoreductase MEKKNILIIGASGQISQELIDLLLDKTEHHLTLYLRNKAKLMNIEDGNRVTLIEADATDEAALENALDQIDVVFASLAGNIDEQAQAIVSAMEKKNVQRLIFVTALGIYDEVPGAFGKWNNDNIGPYLPPYKKAADIIEASSLDYTVLRPAWLTNNDEIEYETTVKGENFKGTEVSRKSVAALGLEIIENPSIHVKESLGVNKPNTDGDKPHWL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014791_2 | 671971-672064 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014791_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014791_2
>2.1|671996|44|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder ACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014791_2
The CRISPR arrays of NZ_CP014791_2 >merge|NZ_CP014791|2|671971-672064|CRISPRCasFinder CCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAACCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG >NZ_CP014791|2|2|671971-672064|CRISPRCasFinder CCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG ACAAAGGAATACAGTTGGATGCTAACGCACCAACTGCATAAGAA CCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG
>NZ_CP014791.1|WP_000687415.1|671014_671881_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAEILYISQPAVTQRLKAIENAFGVDIFIRTKKQLITTTEGTMIIEHARDMLKRERLFFDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPEVLSLYNAQFPNVEIQVQVGSTEQIKANHRDYHVMITRGNKVMNLANTHLFNDDHYFIFPKNRRDDVTKLPFIEFQADPIYINQIKQWYNDNLEQDYHATITVDQVATCKEMLISGVGVTILPEIMMKNISREQFEFEKVEIDNEPLIRSTFMSYDPSMLQLPQVDSFVNLMASFVERPKA >NZ_CP014791.1|WP_061869670.1|670254_670899_+|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLIDREYTEVKVNNNRFKGIIGLVTMKKVRDPLEVTVVGQNIIVADDNYKWLQILPEKKRYSITVMFDNKGNPLEYYFDINIKNITQKGNARTVDLCLDVLALPSGEYELVDEDDLMFALESEQITKKQFHEAYMIAHQIMAELENDFKGFQKKIMYYFNKINAKAQKNRQKPQNKTNFEKSKQIKPKQYNQTKNHQQQKKN >NZ_CP014791.1|WP_001806154.1|669993_670110_+|hypothetical-protein MLQLFLMKLTLNGFENDKTIIFIFLKNHFYEEMCVLSN >NZ_CP014791.1|WP_000844823.1|669428_669902_+|cupin MKTAKQWINELQLESHPEGGFYRETIREVLKDGHRAPFSSIYFLLTDDNISHFHRIDADEVWYYHAGDSLTIHMINPDGAYTTATLGTDIQNGDVLQYVVPKGTIFASSIENLNSYSLVGCMCQPAFEFKQFELFKQSELFVQYPHLKSVIEKYALK >NZ_CP014791.1|WP_000532969.1|668712_669429_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPNPESNQALRLVLERAKTYSVPNHIIEKAIDKAKGAGDENFDHLRYEGFGPSGSMLIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDHVATFGIEGKTVDDILETLMEQDVDVNDVIDDNGLTIVYAEPDQFAVVQDALRAAGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSEEDQVTFEKLIDALEDLEDVQNVFHNVDLK >NZ_CP014791.1|WP_001805574.1|668163_668523_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarX MNTEKLETLLGFYKQYKALSEYIDKKYKLSLNDLAVLDLTMKYCKDEKVLMQSFLKTAMDELDLSRTKLLVSIRRLIEKERLSKVRSSKDERKIYIYLNDDDISKFNALFEDVEQFLNI >NZ_CP014791.1|WP_061869669.1|665867_668018_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAKSCLHILTNNEYATTRCQDGIVLFWPIDGEIELQKFRKSKIIEDDIYIINHLDVFSIKNNKKTIMLYLSSDWFAELGFTFFNYHYTAKLIKSSYNLKCLLLKLTYRYLDNQPINDADIRKLQDIIKIIAKEASMDKKIAQNQYRYAYYGDLRDELEYIYQNVNQRLTLKSVADKLFVSKSNLSSQFHLLMGMGFKKYIDTLKIGKSIEILLTTDSTISNISEHLGFSSSSTYSKMFKSYMDITPNEYRNLSKFNKCIMLNPEPLVGGMAQEVKEVILNYIDHYKNHLTDVIHIDEDKFEIPKLFQTVIQINTYTEMKLVFLEGIFKTLLNKNSQVVFFIMPSILKSKNTMSEEEKFTIIKTIIESDLKIAFNINDIETTYYVEEAFMNVIRQLSPNEINHHNNYEVHFVFDLSLMEIRTIYRMILKLHNIMLNVKLGLNITCLFDKPSVFKSLVSQIKRLKFDSLIIDNANLSSPYLMGESDELLLKNILHFKNLKQVINELDIEQEKLIFLNVENHKLLNNKERDLSNSAPLIYKTLSALYHNFDGFGLNIFDNHQTFNAMHLYDKNGFKTTLGLILEKFIEYVSKPKYENSYYSIFDIENYYCLVIYDWRVIESETIMSNFEDSQVYINFKNNVLNDKYLIVIETLDENSGNINHLISKELRDKYEWNPSLLSKIDNYLKPAIEIKEHNFSINSLNINVTFNALYIIKIGKK >NZ_CP014791.1|WP_000081596.1|664526_665171_+|hypothetical-protein MSQNTNHSYFQQNQHAQSISKVWLYFMYYWIIFGIGCYLGQFLPLSWRQPLSFGLLIIILATLVFERARRFGLIISHIYAVVIGLLSYATFTTYLQNLGPDIFYKNIALAIFAFIAFGIIGYFFVGDASSIGKYLFVTLITLIIASLIGIFLQNPIFYTIITVVSLLLFLLYTLYDFNRLKRGDYSPREMGFNLFINLLNIIKDILYLANMFRR >NZ_CP014791.1|WP_000731644.1|663368_664166_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITATSGAAAFLTHHDAQASTQHTVQSGESLWSIAQKYNTSVESIKQNNQLDNNLVFPGQVISVGGSDAQNTSNTSPQAGSASSHTVQAGESLNIIASRYGVSVDQLMAANNLRGYLIMPNQTLQIPNGGSGGTTPTATTGSNGNASSFNHQNLYTAGQCTWYVFDRRAQAGSPISTYWSDAKYWAGNAANDGYQVNNTPSVGSIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNMNYRTIPASEVSSYAFIH >NZ_CP014791.1|WP_000120368.1|661775_662783_+|inorganic-phosphate-transporter MSYIIIVTIAVVIFSLIFDFINGFHDTANAVATAVSTRALTPKTAILMAAVMNFIGALTFTGVAGTITKDIVDPFKLENGLVVVLAAILAAIIWNLATWFYGIPSSSSHALIGSIAGAAIASEGSFGVLHYQGFTKIIIVLIVSPIIAFCVGFLMYSIFKVIFKNANLTRANRNFRFFQIFTAALQSFSHGTNDAQKSMGIITLALIVANVQNDGSVEPQLWVKFACATAMGLGTAIGGWKIIKTVGGNIMKIRPANGAAADLSSALTIFVASSLHFPLSTTHVVSSSILGVGASNRAKGVKWSTAQRMIITWVITLPISALLAGLLFYILNLFF >NZ_CP014791.1|WP_000367064.1|672081_673302_+|MFS-transporter MDMFAALLQIKNYKLFVANMFLLGMGIAVTVPYLVLFATKDLGMTTNQYGLLLASAAISQFTVNSIIARFSDTHHFNRKIIIILALLMGALGFSIYFFVDTIWLFILLYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINVSSSKDRAQFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGAQLIGLKGYAGLFGGTISIILFTLVLQVFFYKDLNIKHPISTQQHVEKIAPNMFKDKTLLLPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTDYLKENEQHVGYLASLCAGLEVPFMIILGVLSSRLQTRTLLIYGAIFGGLFYFSIGVFKNFYMMLAGQVFLAIFLAVLLGIGISYFQDILPDFPGYASTLFSNAMVIGQLGGNLLGGAMSHWVGLENVFFVSAASIMLGMILIFFTKNQKITKEDVIST >NZ_CP014791.1|WP_000152582.1|673298_673787_+|DUF456-domain-containing-protein MTIILWLLIIAAFMLAFVGLIKPIIPSVLVLWVGFLIYQFGFHNQHLSWVFYVSMALLTILILCADFLANKYFVNRFGGSKFGEYAALIGVVIGCFVLPPFGIIIIPFILVFIVELIQGYSFERAVKVSIGSIVAFLTSSIAQAIIMFIMIVWFFIDALLIN >NZ_CP014791.1|WP_000842865.1|673885_674575_-|DUF1129-family-protein MKSTAQLTKENNVKSLRLSNTDREIFENYMTYMRSDFRVNPHDTELIINRILKQLLSAEQHGLLALDFFNHDPKAHAIKELKAMPNETFKNIFKYIYQHIVLLIGIVSFLKGFLGFFMEKSGSNLYFVSFPFSVVVGFFIVFLFIWFSFKTIQLQCFNNSNWIWIFTYLAIILLIVGFFYVFFIPQSLLAFGPYIQVSNWVFIIFSFIVMPIGLRIERNISKKHSHTFL >NZ_CP014791.1|WP_001259685.1|674702_675146_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MRTLNKDEHNYIKQIASIHETLLSQSESNYKCTKLSIALRYEMICSRLEHTNDKIYIYENEGQLIAFIWGHFSNEKSMVNIELLYVEPQFRKLGIATQLKIALEKWAKTMNAKQISSTIHKSNLPMISLNKDLGYQVSHVKMYKDID >NZ_CP014791.1|WP_000733438.1|675212_675602_+|hypothetical-protein MKKLIISIMAVMLFLTGCGKSQEKATLEKDIDNLQKENKELKDKKEKLQQEKEKLADKQKDLEKEVKDLKPSKEDNKDDKKDNKKDEDKDKEASQDKQPKDQTKSSNKDNHKKPTSTDKDQKANDKHQP >NZ_CP014791.1|WP_000545116.1|675739_676039_+|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELENITGRTIADSTGEIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYRLNHQQDFIDATFTALKSDRARLKEVPVHVELISYISKSK >NZ_CP014791.1|WP_000638623.1|676118_676661_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIYCETERLILRDWHEDDLLPFQKMNATYDVRKYFPSLLSYRRSELDMRTMDAVIKDYGIGLFAVEDKESHQWIGFIGLNYIPETSEYPFKELPLYEIGWRLLPEFWGKGLATEGANATLKLAEQHQIYDVYSFTAEANKASQRVMEKIGMTVYDHFELPNLSKYHLLKRQVRYYINLRK >NZ_CP014791.1|WP_000820900.1|676755_677322_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKRIAVYCGASKGHDPSYVQKAYNLGKYFAEQGYELVFGAGSIGIMGAIQDGVLDHGGKAIGVMPKMLDEHEITSQRLTELILVDSMHERKNKMAELADAFVMAPGGAGSLEEFFEMYSWAQIGIHEKPIAIYNINGFFNPLQTMIDHMIEEGFIDPKYRALAPLCDTKESLIESILNFKPLGTRSYD >NZ_CP014791.1|WP_000148819.1|677323_677782_-|YaiI/YqxD-family-protein MTHIIIDGDACPVVDSIIDLTTETGIFVTIIRSFSHFSNQLYPPHVSTLYVDDGPDAVDYKIVQLSTKDDIVITQDYGLASLLVDKVLIVMHHNGKIYNSKNIQQLLDKRYINAQIRKQGGRHKGPPPFTKQDQKVFEQSLLRVIHRIKELD >NZ_CP014791.1|WP_000358502.1|677784_678468_-|hypothetical-protein MDKKKVIKFMINVLPIVLVPLIVERKRIKQHPDVQKVTDATSKVASKTSAAISNTASDVKEYVGDKKQDFENKRELKKFAREHDPAYIEKKGEKLAKQNRKDADKMNKILQKNIEKRHKEEQKAREKNEIQRIKDMKKTQKYEEKAGLTPNKLDEKTEKKGDKLAEKNRKEIAKMNKKLQKNIEKRHKEEQKRQQEADKARIKSFKKYKDYVAKSASQQNKENNTEA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014791_3 | 770760-770843 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014791_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014791_3
>3.1|770785|34|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder TTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014791_3
The CRISPR arrays of NZ_CP014791_3 >merge|NZ_CP014791|3|770760-770843|CRISPRCasFinder GTAAGCTGACTTTACGTTAGCTTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATCGTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT >NZ_CP014791|3|3|770760-770843|CRISPRCasFinder GTAAGCTGACTTTACGTTAGCTTCT TTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATC GTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT
>NZ_CP014791.1|WP_000134963.1|769328_770264_+|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >NZ_CP014791.1|WP_000057562.1|767822_769262_+|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP014791.1|WP_001224792.1|767329_767815_+|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNISIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP014791.1|WP_000513299.1|766482_767322_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSFGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIIYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP014791.1|WP_000958224.1|765544_766477_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP014791.1|WP_000662699.1|762339_765168_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKNIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHHIEIESQTVQQMVDRIMELETRTKIQLLAPVISHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNEVPELDKNKNHTIEVVVDRLVVKEGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGQRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNINLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDK >NZ_CP014791.1|WP_000229257.1|760346_762332_+|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKMKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDRGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP014791.1|WP_000638419.1|759841_760078_+|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP014791.1|WP_000538142.1|759194_759845_+|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENG >NZ_CP014791.1|WP_000749393.1|758181_759021_+|CHAP-domain-containing-protein MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQQGTQVKTPVQHNYVSNVQAQKQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKTVKSPVRKASQAKRVVQQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NZ_CP014791.1|WP_000369722.1|771091_772003_+|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP014791.1|WP_001248939.1|771999_772995_+|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP014791.1|WP_000006551.1|773104_774049_+|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP014791.1|WP_001049165.1|774611_775199_+|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP014791.1|WP_000675904.1|775380_777015_+|NAD-dependent-malic-enzyme MKGIELLNNPFLNKGTAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKRLFLMAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANDRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTGAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLNDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVDYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSNTVNWKNLNEVIENIKPTVLIGTSTQTGAFTEDAVKEMFKHTERPVIFPLSNPTKLSEATAQDLLKWTNGKALIGTGIPYNDIEYNGVNYSIGQANNALMYPGLGLGLIASNAKKVNQQILSAASHALGGMVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETIDDIDKAIEAEIWYPKYKSYI >NZ_CP014791.1|WP_000816297.1|777341_778244_-|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINKESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLISK >NZ_CP014791.1|WP_000070822.1|778946_779576_+|DUF4887-domain-containing-protein MSNQNYDYKTNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQTNQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQASQQNSQSTTNKQNNANDK >NZ_CP014791.1|WP_000654030.1|780184_781198_+|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP014791.1|WP_000279414.1|781250_782261_+|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP014791.1|WP_001074749.1|782399_783590_+|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLDLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014791_4 | 1768216-1768304 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014791_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014791_4
>4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder CAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAAG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014791_4
The CRISPR arrays of NZ_CP014791_4 >merge|NZ_CP014791|4|1768216-1768304|CRISPRCasFinder CAATGCGCGTTGGGGTACGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAAGCAATGCGCGTTGGGGTACGGGCCCCAACAT >NZ_CP014791|4|4|1768216-1768304|CRISPRCasFinder CAATGCGCGTTGGGGTACGGGGCCCCAACA CAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAAG CAATGCGCGTTGGGGTACGGGCCCCAACAT
>NZ_CP014791.1|WP_000492904.1|1767288_1767909_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKVLNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDMFAPPTLNEILIDEESEDAPYHLALLSNAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFYSGLIFGYTYLKTKRLEVPILIHFINNLLAM >NZ_CP014791.1|WP_001168913.1|1766486_1767122_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFFITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFKINLLSFKKLTLSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHTPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILIWG >NZ_CP014791.1|WP_001030473.1|1765746_1766190_-|hypothetical-protein MNKASFDKKVKKQLWFLNKKEKQALDQRLSSITDKDNVNFNKPITFANGYLRENVFRSKETKSYSVFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFVNPKVELSTTVVILTIIGAILLMLVSIYLIKITTSYFTKKLLEHKFNGH >NZ_CP014791.1|WP_001152694.1|1765316_1765760_+|competence-protein-ComK MQDISTKHLLYIQTATSNHLETKCVFLYHEYNLEFPITKAIPYYAKLHFTSASILIDAAKSILNINKLVPIYLNPKTILFPIKQKRAPIQTYINAHYIIGMTEMGNSTMLHFKNGKTLEVDEPMSLISKKCYESLALKHFIENTNDH >NZ_CP014791.1|WP_000671060.1|1764733_1765204_+|RNA-polymerase-sigma-factor MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSNQSLSSFLFMRLNFYLIDLFRQQKRLNDIILCENHSPILTEQPTYFNEYDLRLQDVCALLNHRERQWLMLYLEGYKQYEIADSMSLSTSTIKLIKASVKRKCQRFFE >NZ_CP014791.1|WP_000384171.1|1764310_1764535_-|hypothetical-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK >NZ_CP014791.1|WP_001032834.1|1763181_1764036_-|autolysin MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEINGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLNK >NZ_CP014791.1|WP_000989113.1|1761802_1763095_+|arsenite-efflux-transporter-membrane-subunit-ArsB MMTTLATLIFLVTLLFVLWQPKGLDIGITALTGAFIAVITGVVSFSDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGSGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGAALILTPIVLAMVKNIGFSKRAIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLASLLVLWLYFRKAIPKTFEDNKIKRPIDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLILARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVVFGLRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNIHGLLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKNGIIITIPVLFFTLLGLYLTLILF >NZ_CP014791.1|WP_000221174.1|1761488_1761803_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTYKELATFLKVLSDPSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNFVTTRKIGNTHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >NZ_CP014791.1|WP_001261660.1|1759343_1760846_-|FAD-dependent-oxidoreductase MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTIYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTNSEQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNEQDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSANLPSVRGTMIDVSFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFKKLVHRRTGNHIADLKYDLARPTEMGIFQSMIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSKMIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYNVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQQQRSDNQ >NZ_CP014791.1|WP_001096494.1|1768467_1769181_-|transaldolase MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >NZ_CP014791.1|WP_000091443.1|1769439_1769742_+|hypothetical-protein MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIILILSIIFADRSIKSLKPDADWIRIASKSLPWIILIVILVHIFSIVHTFGFI >NZ_CP014791.1|WP_001200545.1|1769997_1770363_+|fluoride-efflux-transporter-CrcB MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIEFFSNHPTLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDHQQFITLLLYAVTSYVFGILLCYVGIKLGGGLS >NZ_CP014791.1|WP_000623468.1|1770359_1770713_+|CrcB-family-protein MISIILVIIGGGLGAIARSAVTDYFNHIFTSKLPIATLIVNLVGSFLIGLTIGLSISISWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFNINLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI >NZ_CP014791.1|WP_000453324.1|1770962_1771796_-|aldo/keto-reductase MEVKTFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGTGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAVMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFRIFDFELSDEQMTRIDGLNQDKRIGPDPKTFEG >NZ_CP014791.1|WP_000366165.1|1772007_1772916_-|NERD-domain-containing-protein MDLSSPVVIGLIIAVVIALIFFVLFLVALGSKKKVKRQTEEKYEQQEQNIKKSHEEALEKERIQNKKTITKQQEDYNHMVSTKDREIDALKLFSKNHSEYVTDMRLIGIRERLVKEKRIRPEDMHIMANIFLPKDGFNNIERISHLVLTRTGLYIIDSQLLKGHVYNGISGGQFKDLPPMEQVFDTLDLDKSRPQTIVMDQNDDKRSLSFVNYSDQIEAIKQLAEDLQKHLGAKYTPTSILYFNPKNEGDVTISNYNQNSAVKVLVGAEQLDEFFNKFVFHGRIQYNVEDLQQMMDKIESFN >NZ_CP014791.1|WP_000933821.1|1773040_1774234_-|methionine-adenosyltransferase MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINDQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKDAVK >NZ_CP014791.1|WP_000109912.1|1774605_1776198_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase-(ATP) MSVDTYTETTKIDKLLKKPTSHFQLSTTQLYNKILDNNEGVLTELGAVNASTGKYTGRSPKDKFFVSEPSYRDNIDWGEINQPIDEETFLKLYHKVLDYLDKKDELYVFKGYAGSDKDTMLKLTVINELAWHNLFAKNMFIRPESKEEATKIKPNFTIVSAPHFKADPEVDGTKSETFVIISFKHKVILIGGTEYAGEMKKGIFSVMNYLLPMQDIMSMHCSANVGEKGDVALFFGLSGTGKTTLSADPHRKLIGDDEHGWNKNGVFNIEGGCYAKAINLSKEKEPQIFDAIKYGAILENTVVSEDGSVDFEDNRYTENTRAAYPINHIDNIVVPSKAAHPNTIIFLTADAFGVIPPISKLNKDQAMYHFLSGFTSKLAGTERGVTEPEPSFSTCFGAPFFPLHPTVYADLLGELIDLHDVDVYLVNTGWTGGKYGVGRRISLHYTRQMVNQAISGKLKNAEYTKDSTFGLSIPVEIEDVPKTILNPINAWSDKEKYKAQAEDLIQRFEKNFEKFGEKVEHIAEKGSFNK >NZ_CP014791.1|WP_001827685.1|1776577_1777324_-|S9-family-peptidase MPIESVTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPLHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTELLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVTSYTIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGATHERFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHS >NZ_CP014791.1|WP_000672013.1|1777328_1777802_-|nucleoside-triphosphatase-YtkD MKFRDKDNRQVNLTFKKDNEIADGNHVLAIPTFKNQLLFTKHNLRGIEFPGGKRERGESSAEAVTRELYEETGAKVKNIHYIAQYTIETHDQTDFVKDVYFIEVESLVSKNDYLETAGPVLFNCINDIELAQRSFLLQDSTILKCVERVQSLGFYQT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014791_5 | 1821494-1821627 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014791_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP014791_5
>5.1|1821517|32|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder AGTAAATTTGGATCCTCAATTTCTACAGACGA >5.2|1821572|33|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder CAGAAACTGGCGGAAAGTCAGCTTTCAATAACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014791_5
The CRISPR arrays of NZ_CP014791_5 >merge|NZ_CP014791|5|1821494-1821627|CRISPRCasFinder TGCAAGTTAGCGGGGCCCAACATAGTAAATTTGGATCCTCAATTTCTACAGACGATGCAAGTTGGCGGGGCTCCAACACAGAAACTGGCGGAAAGTCAGCTTTCAATAACGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA >NZ_CP014791|5|5|1821494-1821627|CRISPRCasFinder TGCAAGTTAGCGGGGCCCAACAT AGTAAATTTGGATCCTCAATTTCTACAGACGA TGCAAGTTGGCGGGGCTCCAACA CAGAAACTGGCGGAAAGTCAGCTTTCAATAACG TGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACA
>NZ_CP014791.1|WP_000901019.1|1820798_1821194_-|hypothetical-protein MLGKYWIQLLIATVIISLISIKAFPLAIGALYLPIIFKVIKLQLNLSKGLIDDVNAQTFIKSNQSGIVISVICCLLITGILYYTLDGFYASLTGVLGTLVALNPYTTIVSAVLYILTAIATVEATKTKYRN >NZ_CP014791.1|WP_000116239.1|1819217_1820603_-|class-II-fumarate-hydratase MSVRIEHDTFGEIEVPADKYWGAQTERSKRNFPVGKERMPIEVVYGFAQLKRAAALANFDLGKLSEAKKDAIVYACDQILSGELDEHFPLVVWQTGSGTQSNMNVNEVVSYVANMYLKDHQSDESIHPNDDVNKSQSSNDTFPTAMHVALYQEVETKLEPALKLLRNTLKEKEDKFDSIIKIGRTHLQDATPIKLGQEISGWRYMLDRCETMLSESKKHILNLAIGGTAVGTGINAHPEFGDKVAQYISENTGYPFVSSENKFHALTAHDEVVQLHGTLKALAGDLMKIANDVRWLASGPRAGLAEISIPENEPGSSIMPGKVNPTQCEMLTMVAVQVMGNDTVVGFASSQGNFELNVYKPVIMHNTLQSIYLLADGMETFNNNCAVGIEPIEENIDNYLNQSLMLVTALNPHIGYEKAAQIAKKAHKESLTLKESAIQTGYVTEEQFEAWIKPEDMVDPH >NZ_CP014791.1|WP_000669377.1|1817939_1818761_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MKFKIPENFNDLSLRDIFQQLKVPKKDLHHLNMSKDITINDKPARLMDKVHTGDDVFVPTIDEKSNYVPSYRYAQIKYEDDDMAIVMKPKGVKTHPNDLKESNTLMNHVIYTIDSDYVEPIHRLDQETVGLLIVAKNPLMKKILDRMLEDNDITRIYKANVKALLPLKPQTIDMPIGKDKFHSNKRRVSPTGQRAITHILTSKMIKETVCQLEIKLDTGRTHQIRVHLAEIGHPVIGDPLYGDSTLRQLELESYKIEFVHPLTKEVISVSLDD >NZ_CP014791.1|WP_061869728.1|1816664_1817777_-|GAF-domain-containing-sensor-histidine-kinase MEQRTRLALLKEIAEFLNEETEMYSMTQGALKYLIEGSNFTTGWIFFINSVGEHELVSHVALPQSLTADHCHYIKDGSCWCVKAFNQRRLMKASNIVNCSRINLASKAFPSQNDNITHHATVPLKSGQEQFGILNVASPNTEIYSDEDLELLESVAFQLGSAIKRIYLTDREKEAAKINERNRLARDLHDSVNQMLFSVKLTAHAAYGMSNEFIAKQAFKTIEETSQNAVNEMRALIWQLKPVGLEQGLIHALTAYSKLMHIQLNVNVEGLIDLSNEIEENIYRALQECINNVKKHADTNKMDLTLKQMNDILYIDVIDYGQGFEIDNVQIASSHGINNIKQRVKLLRGKVTFHSQPTKGTQIQFTIPIK >NZ_CP014791.1|WP_001045134.1|1816019_1816643_-|response-regulator-transcription-factor MNKVILVDDHYIVRQGLRFLLSTIENIEVLQDFADGETFLEYLKEHEHPDIVLLDLVMPGMNGIEITEYIKAHYPEIKVLVLTSYVDDEHVISAINKGADGYEMKDVEPQQLIETIRRVMNDEKMIHPKAQDVIETVSQKPHYTNKLSKREIEVLREMVKGKTNKEIAETLFVSEKTIKTHVSHIFSKLQVSDRTQAAIYAMENKLI >NZ_CP014791.1|WP_000375864.1|1815197_1815662_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDRQSFTDLIQTKFKMVRIEAGYTQDTMAQTIGLSKKTLVQIEKERVLPNWTTCISICALFRDSEVLNSTFGCDPLEIVQTISRNHCAYPNHAPTSDIYWNNIETRNGYILQSNKVSNIYRVLNPDNQPIFGTSKMREAETYFNRNAKEELVHI >NZ_CP014791.1|WP_000992509.1|1813894_1815019_-|DUF445-domain-containing-protein MNALFIIIFMIVVGAIIGGITNVIAIRMLFHPFKPYYIFKFRVPFTPGLIPKRREEIATKIGQVIEEHLLTETLINEKLKSEQSQQAIESMIQQQLQKLTKDQLSIKQITSQIDIDFEQVLQTNGNQYIASQLNNYYTKHQNQTIASLLPNQLVAFLDQHVDNATDLLCDRARNYLSSAKGTQDINDMLDTFFNEKGKLIGMLQMFMTKESIADRIQQELIRLTSHPKARTIVTSLITNEYQTFKDKPLNELLDASQFNEIAENLSVYVTTNASKQANKPVVTLMPQFVDYLEGQLSSKLPNLIVEQLSIHLSTIMKKVDLRGLIEEQINTFDLDYIEKLIIEIANKELKLIMSLGFILGGIIGFFQGLVAIFV >NZ_CP014791.1|WP_000290301.1|1813481_1813826_-|YlbF/YmcA-family-competence-regulator MAVNLYDYANQLEQALRESEEYKAIKEAFANVKANEESKKLFDEFRETQINFQQKQMQGEEIAEEDLQKAQEQAQAIEKDENISALMNAEQKMSQVFQEINQIIVKPLDEIYAD >NZ_CP014791.1|WP_061869727.1|1812859_1812943_-|hypothetical-protein MAVGSLGVLTTTEIAFPTEIFEKYQRT >NZ_CP014791.1|WP_000238227.1|1811351_1812548_-|exonuclease-SbcCD-subunit-D MVKFIHCSDLHLDSPFKSKSHISPKIFEDVQKSAYESFKNIVDIALQQDVDFVIIAGDLFDSENRTLRAEIFLKQQFERLQNEQIFVYVCHGNHDPLSSKISSNWPDNVSVFSNKVETYEAITKSGETIYIHGFSYENRASYENKIDEYPSSQGQKGIHIGVLHGTYSKSSVNERYTEFILEDLNSKLYHYWALGHIHERQQLSDMPVINYSGNIQGRHFNEQGEKGCLLIEGDHLKLKTKFYPTQYIRFEEATIETDKTSKQGLYEVIQNFKEQVREEGKAFYRLTLVINSETLISPQDLLQVEEMITDYEENENQFVYIDELKIQYAQNDESPLVNEFSAELLVDQTVFDKAMSDLYLNPRASKFLDDYGTFDHTALVNRAEEILKAEMRGEQNDN >NZ_CP014791.1|WP_000031109.1|1821883_1822036_-|hypothetical-protein MSKDKDPKLNYHEEENSMVTDFEDLKELGKEMEQISDQNDQEKNSEEESQ >NZ_CP014791.1|WP_001251224.1|1822060_1822660_-|glucosamine-6-phosphate-isomerase MAMNFKVFDNSQLVAEYAADIIRKQFNNNPTTIAGFHLDTDQAPVLDELKKNVEKHAVDFSQINILDYDDKKSYFEALGVPAGQVYPIAYEKDAIELIADKIKTKENKGKLTLQVVSIDEQGKLNVSIRQGLMEAREIFLVVTGANKRDVVEKLYQENGKTSFEPADLKAHRMVNVILDKEAAAGLPEDVKAYFTSRFA >NZ_CP014791.1|WP_000181394.1|1822818_1823289_-|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MTNHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTNTHLHLIKPLGFRTDDKMLKRAGLDYWEFVNITYHDSIEAFFEATNGEYYLLTKFGKKTYSDFDFSNHDKDFYFIFGKETTGLPDWVKEKYQDTALRIPMSEHIRSLNLSNTAALLIYEALRQQDFPGLN >NZ_CP014791.1|WP_001796463.1|1823293_1824436_-|tRNA-epoxyqueuosine(34)-reductase-QueG MGGIRLDTKQLKQDIIDYAYTIGIDSIGFTTADPFDELKQKLEAYHANGYASGFEESDITLRTEPKLSLPTARSIIAIAVGYPNKLKGAPKSVRGDRRGLFARASWGQDYHTIMRKRLDMLAAFIESKVPDVEIKSMVDTGVLSDRAVAERAGLGFVGRNGFVINPKLGTWTYLGEMLVSIPFEPDDPLLDSCGDCTICVDRCPTSALVGNGQLNSQKCISFLTQTKGYMPDQYRYKIGNRLYGCDTCQQVCPKNRGINTEQDDIILEPEILKPRLVPLLRMSNKEFKQTYGHLAGAWRGKKPIQRNAILALAHFNEVDAIPELKKVAITDERPMIRATAYWAIGQILGEEARDFINANYDQEDAAVQNEMIKGLDTRRE >NZ_CP014791.1|WP_001144055.1|1824571_1825300_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MPVIKINNLNKVFGDNEVLKDINLEINQGEVVAIIGPSGSGKSTLLRCMNLLEVPTKGQVIFEGNDLTEKGTQVDKLRQKMGMVFQNFNLFPHKKVVDNIILAPKLLKKDNNDELHKEALSLLDKVGLKEKADVYPNQLSGGQKQRVAIARALAMHPDVILFDEPTSALDPEVVGDVLKVMKDLAKEGMTMVVVTHEMGFAKDVSDKVIFMADGVVVESGTPVEIFEQPQHERTQNFLARVL >NZ_CP014791.1|WP_000649917.1|1825286_1826744_-|ABC-transporter-permease-subunit MKCLIRFILVLGLLISSAMVYINPTAHAEQNQTWEKIKERGELRVGLSADYAPMEFEHTVNGKTEYAGVDIDLAKKIAKDNNLKLKIVNMSFDSLLGALKTGKIDIIISGMTSTPERKKQVDFSDSYMMTKNIMLVKKDKVSEYKDIKDFNNKKVGAQKGTEQEKIAQTEIENASITSLSRLPDVILALKSGKVEGAVVEKPVAEAYLKQNPKLGISNVKFNEEEKDTVIAVPKDSPKLLSQINKTIKEVKDKGLIDKYMTNAANAMNDDSGFISKYGSFFLKGIKITILISLIGVALGSILGAFVALMKLSKIKIISWIASIYIEILRGTPMLVQVFIVFFGITAALGLDISALVCGTIALVINSSAYIAEIIRAGINAVDKGQMEAARSLGLNYRQTMKSVIMPQAIKNILPSLGNEFVTLIKESSIVSTIGVGEIMFNAQVVQGISFDPFTPLLVAAALYFVLTFVLTRIMNMIEGRLNASD >NZ_CP014791.1|WP_000063547.1|1827002_1828064_-|PTS-transporter-subunit-IIC MSNAKNADNKQFFSKILNSIGAGVVIALVPNALLGEILKIFKSGNEILELTYQLVILIQSFMAFIIGVLAAHQFKFNGAGAAIVGTSAMIGSGAVVYSNNSFMLKGIGDIINTSLVVIIACLIYMVLQNKLGSFELIILPVLVPIVSGGIGLITLPYIRKITQAIGNVIHSFTDLNPLLMSILISVAFSLLMVTPISLVAIATAISLNGLGSGAANLGIVAACVTFLFGSLRVNSIGVNAVLLIGAAKMMIPVYLKNLIISIPLTINGIITGIIAYVLQVKGTPLSAGFGYTGLVGPINAFNRMSGDPTMNIILLALGYFVIPFVSAFIVHELCKKFIPIYSNDIYKFEVPKQ >NZ_CP014791.1|WP_000110011.1|1836804_1837251_-|peroxide-responsive-transcriptional-repressor-PerR MSVEIESIEHELEESIASLRQAGVRITPQRQAILRYLISSHTHPTADEIYQALSPDFPNISVATIYNNLRVFKDIGIVKELTYGDSSSRFDFNTHNHYHIICEQCGKIVDFQYPQLNEIERLAQHMTDFDVTHHRMEIYGVCKECQDK >NZ_CP014791.1|WP_061869729.1|1837347_1838298_-|hydroxyacid-dehydrogenase MKVVGLNRMREVETELQQRFSDVDFKFYKKASEIPESDLANLDILVGYDGGINEVFLRRCPNLKWIAWFATGVNILPLDYIADHGILLTNGKGVQAKQLSEYILAFILDDYKKMKLSYDNQRQHIYDSKITGKRLSGQTVLFLGTGAIATRTAKLAKAFNMNLIGLSKSGQNKDEFDDIYTIESFESTLPNADIVINTLPETQETIHLLKKKHFELMKDEALFINIGRGTIVKEALLIEVLKSRVIRHAYLDVFENEPLKPNHELYELDNVTITAHITGNDYEAKYDLLDIFKNNLVNFLNKNSLIENEVDAKKGY >NZ_CP014791.1|WP_001011611.1|1838838_1840128_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MNFSESERLQQLSNEYILGGVNSPSRSYKAVGGGAPVVMKEGHGAYLYDVDGNRFIDYLQAYGPIITGHAHPHITKAIQEQAAKGVLFGTPTELEIEFSKKLRDAIPSLEKIRFVNSGTEAVMTTIRVARAYTKRNKIIKFAGSYHGHSDLVLVAAGSGPSQLGSPDSAGVPESVAREVITVPFNDINAYKEAIEFWGDEIAAVLVEPIVGNFGMVMPQPGFLEEVNEISHNNGTLVIYDEVITAFRFHYGAAQDLLGVIPDLTAFGKIVGGGLPIGGYGGRQDIMEQVAPLGPAYQAGTMAGNPLSMKAGIALLEVLEQDGVYEKLDSLGQQLEEGLLKLIEKHNITATINRIYGSLTLYFTDEKVTHYDQVEHSDGEAFGKFFKLMLNQGINLAPSKFEAWFLTTEHTEEDIKQTLKAADYAFSQMK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014791_6 | 1828730-1828857 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014791_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014791_6
>6.1|1828768|52|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder ATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATCATTATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014791_6
The CRISPR arrays of NZ_CP014791_6 >merge|NZ_CP014791|6|1828730-1828857|CRISPRCasFinder AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTACACCTATACCTCATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATCATTATTAAATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTGCACCTATACCTC >NZ_CP014791|6|6|1828730-1828857|CRISPRCasFinder AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTACACCTATACCTC ATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATCATTATTA AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTGCACCTATACCTC
>NZ_CP014791.1|WP_000063547.1|1827002_1828064_-|PTS-transporter-subunit-IIC MSNAKNADNKQFFSKILNSIGAGVVIALVPNALLGEILKIFKSGNEILELTYQLVILIQSFMAFIIGVLAAHQFKFNGAGAAIVGTSAMIGSGAVVYSNNSFMLKGIGDIINTSLVVIIACLIYMVLQNKLGSFELIILPVLVPIVSGGIGLITLPYIRKITQAIGNVIHSFTDLNPLLMSILISVAFSLLMVTPISLVAIATAISLNGLGSGAANLGIVAACVTFLFGSLRVNSIGVNAVLLIGAAKMMIPVYLKNLIISIPLTINGIITGIIAYVLQVKGTPLSAGFGYTGLVGPINAFNRMSGDPTMNIILLALGYFVIPFVSAFIVHELCKKFIPIYSNDIYKFEVPKQ >NZ_CP014791.1|WP_000649917.1|1825286_1826744_-|ABC-transporter-permease-subunit MKCLIRFILVLGLLISSAMVYINPTAHAEQNQTWEKIKERGELRVGLSADYAPMEFEHTVNGKTEYAGVDIDLAKKIAKDNNLKLKIVNMSFDSLLGALKTGKIDIIISGMTSTPERKKQVDFSDSYMMTKNIMLVKKDKVSEYKDIKDFNNKKVGAQKGTEQEKIAQTEIENASITSLSRLPDVILALKSGKVEGAVVEKPVAEAYLKQNPKLGISNVKFNEEEKDTVIAVPKDSPKLLSQINKTIKEVKDKGLIDKYMTNAANAMNDDSGFISKYGSFFLKGIKITILISLIGVALGSILGAFVALMKLSKIKIISWIASIYIEILRGTPMLVQVFIVFFGITAALGLDISALVCGTIALVINSSAYIAEIIRAGINAVDKGQMEAARSLGLNYRQTMKSVIMPQAIKNILPSLGNEFVTLIKESSIVSTIGVGEIMFNAQVVQGISFDPFTPLLVAAALYFVLTFVLTRIMNMIEGRLNASD >NZ_CP014791.1|WP_001144055.1|1824571_1825300_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MPVIKINNLNKVFGDNEVLKDINLEINQGEVVAIIGPSGSGKSTLLRCMNLLEVPTKGQVIFEGNDLTEKGTQVDKLRQKMGMVFQNFNLFPHKKVVDNIILAPKLLKKDNNDELHKEALSLLDKVGLKEKADVYPNQLSGGQKQRVAIARALAMHPDVILFDEPTSALDPEVVGDVLKVMKDLAKEGMTMVVVTHEMGFAKDVSDKVIFMADGVVVESGTPVEIFEQPQHERTQNFLARVL >NZ_CP014791.1|WP_001796463.1|1823293_1824436_-|tRNA-epoxyqueuosine(34)-reductase-QueG MGGIRLDTKQLKQDIIDYAYTIGIDSIGFTTADPFDELKQKLEAYHANGYASGFEESDITLRTEPKLSLPTARSIIAIAVGYPNKLKGAPKSVRGDRRGLFARASWGQDYHTIMRKRLDMLAAFIESKVPDVEIKSMVDTGVLSDRAVAERAGLGFVGRNGFVINPKLGTWTYLGEMLVSIPFEPDDPLLDSCGDCTICVDRCPTSALVGNGQLNSQKCISFLTQTKGYMPDQYRYKIGNRLYGCDTCQQVCPKNRGINTEQDDIILEPEILKPRLVPLLRMSNKEFKQTYGHLAGAWRGKKPIQRNAILALAHFNEVDAIPELKKVAITDERPMIRATAYWAIGQILGEEARDFINANYDQEDAAVQNEMIKGLDTRRE >NZ_CP014791.1|WP_000181394.1|1822818_1823289_-|tRNA-(uridine(34)/cytosine(34)/5--carboxymethylaminomethyluridine(34)-2'-O)--methyltransferase-TrmL MTNHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTNTHLHLIKPLGFRTDDKMLKRAGLDYWEFVNITYHDSIEAFFEATNGEYYLLTKFGKKTYSDFDFSNHDKDFYFIFGKETTGLPDWVKEKYQDTALRIPMSEHIRSLNLSNTAALLIYEALRQQDFPGLN >NZ_CP014791.1|WP_001251224.1|1822060_1822660_-|glucosamine-6-phosphate-isomerase MAMNFKVFDNSQLVAEYAADIIRKQFNNNPTTIAGFHLDTDQAPVLDELKKNVEKHAVDFSQINILDYDDKKSYFEALGVPAGQVYPIAYEKDAIELIADKIKTKENKGKLTLQVVSIDEQGKLNVSIRQGLMEAREIFLVVTGANKRDVVEKLYQENGKTSFEPADLKAHRMVNVILDKEAAAGLPEDVKAYFTSRFA >NZ_CP014791.1|WP_000031109.1|1821883_1822036_-|hypothetical-protein MSKDKDPKLNYHEEENSMVTDFEDLKELGKEMEQISDQNDQEKNSEEESQ >NZ_CP014791.1|WP_000901019.1|1820798_1821194_-|hypothetical-protein MLGKYWIQLLIATVIISLISIKAFPLAIGALYLPIIFKVIKLQLNLSKGLIDDVNAQTFIKSNQSGIVISVICCLLITGILYYTLDGFYASLTGVLGTLVALNPYTTIVSAVLYILTAIATVEATKTKYRN >NZ_CP014791.1|WP_000116239.1|1819217_1820603_-|class-II-fumarate-hydratase MSVRIEHDTFGEIEVPADKYWGAQTERSKRNFPVGKERMPIEVVYGFAQLKRAAALANFDLGKLSEAKKDAIVYACDQILSGELDEHFPLVVWQTGSGTQSNMNVNEVVSYVANMYLKDHQSDESIHPNDDVNKSQSSNDTFPTAMHVALYQEVETKLEPALKLLRNTLKEKEDKFDSIIKIGRTHLQDATPIKLGQEISGWRYMLDRCETMLSESKKHILNLAIGGTAVGTGINAHPEFGDKVAQYISENTGYPFVSSENKFHALTAHDEVVQLHGTLKALAGDLMKIANDVRWLASGPRAGLAEISIPENEPGSSIMPGKVNPTQCEMLTMVAVQVMGNDTVVGFASSQGNFELNVYKPVIMHNTLQSIYLLADGMETFNNNCAVGIEPIEENIDNYLNQSLMLVTALNPHIGYEKAAQIAKKAHKESLTLKESAIQTGYVTEEQFEAWIKPEDMVDPH >NZ_CP014791.1|WP_000669377.1|1817939_1818761_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MKFKIPENFNDLSLRDIFQQLKVPKKDLHHLNMSKDITINDKPARLMDKVHTGDDVFVPTIDEKSNYVPSYRYAQIKYEDDDMAIVMKPKGVKTHPNDLKESNTLMNHVIYTIDSDYVEPIHRLDQETVGLLIVAKNPLMKKILDRMLEDNDITRIYKANVKALLPLKPQTIDMPIGKDKFHSNKRRVSPTGQRAITHILTSKMIKETVCQLEIKLDTGRTHQIRVHLAEIGHPVIGDPLYGDSTLRQLELESYKIEFVHPLTKEVISVSLDD >NZ_CP014791.1|WP_000110011.1|1836804_1837251_-|peroxide-responsive-transcriptional-repressor-PerR MSVEIESIEHELEESIASLRQAGVRITPQRQAILRYLISSHTHPTADEIYQALSPDFPNISVATIYNNLRVFKDIGIVKELTYGDSSSRFDFNTHNHYHIICEQCGKIVDFQYPQLNEIERLAQHMTDFDVTHHRMEIYGVCKECQDK >NZ_CP014791.1|WP_061869729.1|1837347_1838298_-|hydroxyacid-dehydrogenase MKVVGLNRMREVETELQQRFSDVDFKFYKKASEIPESDLANLDILVGYDGGINEVFLRRCPNLKWIAWFATGVNILPLDYIADHGILLTNGKGVQAKQLSEYILAFILDDYKKMKLSYDNQRQHIYDSKITGKRLSGQTVLFLGTGAIATRTAKLAKAFNMNLIGLSKSGQNKDEFDDIYTIESFESTLPNADIVINTLPETQETIHLLKKKHFELMKDEALFINIGRGTIVKEALLIEVLKSRVIRHAYLDVFENEPLKPNHELYELDNVTITAHITGNDYEAKYDLLDIFKNNLVNFLNKNSLIENEVDAKKGY >NZ_CP014791.1|WP_001011611.1|1838838_1840128_+|glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase MNFSESERLQQLSNEYILGGVNSPSRSYKAVGGGAPVVMKEGHGAYLYDVDGNRFIDYLQAYGPIITGHAHPHITKAIQEQAAKGVLFGTPTELEIEFSKKLRDAIPSLEKIRFVNSGTEAVMTTIRVARAYTKRNKIIKFAGSYHGHSDLVLVAAGSGPSQLGSPDSAGVPESVAREVITVPFNDINAYKEAIEFWGDEIAAVLVEPIVGNFGMVMPQPGFLEEVNEISHNNGTLVIYDEVITAFRFHYGAAQDLLGVIPDLTAFGKIVGGGLPIGGYGGRQDIMEQVAPLGPAYQAGTMAGNPLSMKAGIALLEVLEQDGVYEKLDSLGQQLEEGLLKLIEKHNITATINRIYGSLTLYFTDEKVTHYDQVEHSDGEAFGKFFKLMLNQGINLAPSKFEAWFLTTEHTEEDIKQTLKAADYAFSQMK >NZ_CP014791.1|WP_001796444.1|1840420_1841515_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MRLGARIFKTGIAIILAMSIASLLPDDVGLKALAGVSAVVAMQPSIYRSFKTVSDQALGNVIGAILSVTMVTIFSDNFIIMGVTVIVLIAILFKFNLAHVATLASVTALIIMGQHTGSFYITAFYRFVLVMIGVISSSLVNFVFLPPKFETKIYYNSLNISSDIFMWFKLVLNDTTEFNNIKQDSHNLKQRVEKLEKIYDYYSEERPITKKHIHQQNRKKILFREVVQTTRQAYEVLNKLSRYQNDLYLLNNNFLLQIKLDLDSLTAFHEQILASLSKKARYNVTHVDYELDNPQKKDLLSTFQHELINHPYQTEYSFANVMQIVAAIEEYRHHLEHLDRIRISFFTYHRSDADIEIVEEDFDL >NZ_CP014791.1|WP_000597236.1|1841705_1843442_-|SAV1866-family-putative-multidrug-efflux-ABC-transporter MIKRYLQFVKPYKYRIFATIIVGIIKFGIPMLIPLLIKYAIDGVINNHALTTDEKVHHLTIAIGIALFIFVIVRPPIEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKKLYNHLQALSARFYANNQVGQVISRVINDVEQTKDFILTGLMNIWLDCITIIIALSIMFFLDVKLTLAALFIFPFYILTVYVFFGRLRKLTRERSQALAEVQGFLHERVQGISVVKSFAIEDNEAKNFDKKNTNFLTRALKHTRWNAYSFAAINTVTDIGPIIVIGVGAYLAISGSITVGTLAAFVGYLELLFGPLRRLVASFTTLTQSFASMDRVFQLIDEDYDIKNGVGAQPIEIKQGRIDIDHVSFQYNDNEAPILKDINLSIEKGETVAFVGMSGGGKSTLINLIPRFYDVTSGQILIDGHNIKDFLAGSLRNQIGLVQQDNILFSDTVKENILLGRPTATDEEVVEAAKMANAHDFIMNLPQGYDTEVGERGVKLSGGQKQRLSIARIFLNNPPILILDEATSALDLESESIIQEALDVLSKDRTTLIVAHRLSTITHADKIVVIENGHIVETGTHRELIAKQGAYEYLYSIQNL >NZ_CP014791.1|WP_000251252.1|1843731_1844274_-|DUF402-domain-containing-protein MVRESIPKEGENIKIQSYKHDGKIHRVWSETTILKGTDHVVIGGNDHTLVTESDGRTWITREPAIVYFHSEYWFNVICMFREDGIYYYCNLSSPFVCDEEALKYIDYDLDIKVYPNGKYHLLDEDEYEQHMNQMNYPHDIDIILRRNVDILQQWIEQKKGPFAPDFIKVWKDRYKKIRQY >NZ_CP014791.1|WP_000284741.1|1844576_1845614_-|A/G-specific-adenine-glycosylase MYQQSSFKENLIHWFDENQREMPWRQTTNPYYIWLSEVMLQQTQVKTVIDYYHRFVERFPTVEVLSQASEDEVLKYWEGLGYYSRARNFHTAIKEVHDKYEGIVPKDPDQFKALKGVGPYTQAAVMSIAYNVPLATVDGNVFRVWSRLNDDYRDIKLQSTRKSYEQELLPYVTTEAGTFNQAMMELGALICTPKNPLCLFCPVQENCEAFDKGTFEKLPVKSKNVSKKVIEQSVFLIRNNQGQYLLQKRSEKLLHGMWQFPMFESEHARREMTEKIGHDIQPVETPIFELKHQFTHLTWKIKVYAVSGTINIETLPDDMIWFDLSDRDQYTFPVPMSKIYQFING >NZ_CP014791.1|WP_061869730.1|1845765_1846743_+|metal-dependent-hydrolase MDTATHIAIGVGLTALATQDPAMASTFGATATTLIVGSLIPDGDTVLKLKDNATYISHHRGITHSIPFTILWPILITFLIFTFFSGTNPFHVWMWAQLAVFLHVFVDIFNSYGTQALRPITNKWIQLSVINTFDPIISTVLCIGIVLWVIGLHPFAVFFPIIALLIIYYMIRFKMRAVIKQQALKAIQQEHHPVKVFVAPTIKFMEWRVAIQTDAHDYVGKAYGRNVVFSDKVERQKLSTDSILWKVKGNKDIRTFLNFSSIYRWQTTTLADGSTEIRLIDLRYLKNNHYSFVAIAHVTNDNVIDHSYIGWVFTEDKLQRKLYAK >NZ_CP014791.1|WP_000886472.1|1847003_1847840_-|hypothetical-protein MLDNIILYFKNLPHTKRYVTERLKQSWKSFLIVLAACLILIIASETLFSFSHLTDVKEVRWLFRLIALIVFAVLMFTIYISYHHYMNDFLVTKLFNISAATPVVIMSILSFIMLVILTMISALVKPVNFETSYIALFYFIVMATIFVGLISVTFGLIRLLTEKINIIFYGICVLCFLVLPIIFIPNPNHVFINHILMLNPMYYIVNGIAQSIIFGISSMENIPYHFYFILFLCLIAAVNFVLARYTTHAIYNKTSKVTQTDNQQDVSKDSTDEADTSS >NZ_CP014791.1|WP_000535840.1|1847848_1849366_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MGSSIVLKLLKVTHYYRNKQNKKWYLPFGYDAEDIDLNNISLHIYQGEALGIIGEPESSKAMVGQLLAGAIKPDKGKVVCTEDLFYGYIEDQSLIHQTVEAYTAQLVQLFPYEINDHKAEQIIQYAHLGDYKTKPVNHISKAAYAQLLLSIARSSKSNIIILNHVIDYLTPQFIERAIELTNDYIENNLTIVSIGDDIDKISQVSNYIAWFSHGQLRMEGSLKQVIPSFKEHERDRLSLNSKEEIENFDLDWKKNRTRIPEMTYNFKRVERYNHAKPPKFLVRFWTLASGTILGLALMMLLIFNNIGIISITDFTNRATMQNENKDPYGEKLAYGIAFNGSVDMQGDKQVTIPKYSVVTITGENSKNYRVTADNKTYYISKDKLEYFNPAGLYQTHSFKKLAPYMKSNYSNYYAYFNSQLHKKHSSVIKTLVPDDDNRFVASVTQQPIQLLFNDNNQLYGFVYPIVDKKELKDKFNINNNIWITKVGNGYCIANLKEDKWIYIEL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014791_7 | 2153828-2153966 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014791_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014791_7
>7.1|2153879|37|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014791_7
The CRISPR arrays of NZ_CP014791_7 >merge|NZ_CP014791|7|2153828-2153966|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGATTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA >NZ_CP014791|7|7|2153828-2153966|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA TTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA
>NZ_CP014791.1|WP_000655242.1|2152739_2152922_-|hypothetical-protein MKDSIFWKKAFIPVYFIVAMLVFLLFRFYIKTDNFSIYLMIIFLICLGTASIIYNYKTNR >NZ_CP014791.1|WP_001622005.1|2152557_2152758_+|hypothetical-protein MSLSLVFSRWRFEIVVLWWNEFVVLWRYKNAVLWQFQNGVSIKKSQQDLELTVTYTFHTYIYRLVL >NZ_CP014791.1|WP_000130128.1|2150604_2152269_-|acetolactate-synthase-AlsS MTDKKYTAADIVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGIVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPVESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGVISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELETQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISEKVDEPFINQQHLDELEQLRTHIDEETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDDTTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVDFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN >NZ_CP014791.1|WP_000186132.1|2149863_2150568_-|acetolactate-decarboxylase MTNVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHIRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFTNANIDYKDISDEIREAE >NZ_CP014791.1|WP_000769707.1|2149062_2149488_+|MAP-domain-containing-protein MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNLIDPSTIKQIQIVVK >NZ_CP014791.1|WP_000044372.1|2147953_2148769_-|HAD-IIB-family-hydrolase MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVMTAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSIGNHNKDRRILESLVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY >NZ_CP014791.1|WP_000214774.1|2146211_2147729_+|glycosyltransferase MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKEVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKKYARYFKDNNYIMYKKWINGQLSHIDYFQNRKRIKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKMFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYPKVENMQNNDVKKIFTIHTNHFLSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKELDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAVSFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRGLYTKASLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKKIIHVLKKETLISQFSENARTTIKTNFSYEAVSKKWIELIDEKSK >NZ_CP014791.1|WP_000143638.1|2145923_2146202_+|hypothetical-protein MTFNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIVFNGSNPYLALNHIIVAEIENYSSLETFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK >NZ_CP014791.1|WP_001044440.1|2144194_2145049_-|M23-family-metallopeptidase MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKREFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDDTMEQIWIDKAKQFGVSVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKKQGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVNGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFLNNRELIKGDVVCGLQGE >NZ_CP014791.1|WP_061869744.1|2141575_2143996_+|polysaccharide-lyase-8-family-protein MTYRMKKWQKLSTITLLMAGVITLSDGEFRSVDKHQIAVADTNTQTPNYEKLKNTWLDVNYGYDKYDESNPDMKKKFEATENEAKKLLSEMKTESGRTYLWESSKDIDTKSADMTRTYRNIEKIAEAMNHPKTTLKNDENKKKLKDALEWLHKNAYGKDPDKKVADLKTNFSKSAPQKNTNLNWWDYEIGTPKSLTNTLILLNGDISSDEKKKYTAPIKTFAPKSDEILSSVGKAEPAKGGNLVDIAKVKLLESIIEEDKDMTKNSIDSFNKVFTYVQSNSTGKERNGFYKDGSYIDHQDVPYTGAYGVVLLEGISQMMPMIKETPFKETSQNDTILKSWIDDGFMPLIYKGEMIDLSRGRAISRENETSHSASVTVMKSLLRLSDAMDESTKAKYKKIVKTSVKSDSSYKQNDYLSSYSDISKMKALMEDSTLSTNDLTQQLKIYNDMDRVTYHNKDLDFAFGLSMTSKNVARYESINNENLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATADMKRLAGTTTLDNEEPKENKNSDKTFVGGTKFDDQHASIGMEFENQDKTLTAKKSYFILNDKIVFLGTGIKNTDSSMNPVTTIENRKANGYTLYTDDKQTTNSDNQETNSVFLESTDTKKNIGYHFLNKSKINVKKESHTGKWSEINKSQKTEDKKDEYYEVTQKHSNSDNKYGYVLYPSLSKDVFKSKASQVTVVKQDDDFHVVKDNESVWAGVNYSDSAKTFEINGTKVEVKAKGMFILKKKDDKTYECSFYNPESTNTASDIESKISMTGYSITNKNASTTNESGVRFELTK >NZ_CP014791.1|WP_000170975.1|2155742_2156141_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR >NZ_CP014791.1|WP_001250038.1|2156154_2156592_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >NZ_CP014791.1|WP_001221849.1|2156831_2157635_-|tRNA-pseudouridine(38-40)-synthase-TruA MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNKAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKTDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEISDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND >NZ_CP014791.1|WP_000791632.1|2157639_2158446_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKNKLIIGRYLPNDSYVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFVCHSPLTYLWVFALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGLYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPIAIILFVLKYSGV >NZ_CP014791.1|WP_000027572.1|2158435_2159296_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MSIRFNDVSYTYQQGTPYEHQAIHDINTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALIKPTSGTVTIDDVTVTHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMDLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSVLAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKTIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKEKEKLAGWHIGLPDIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK >NZ_CP014791.1|WP_000389669.1|2159292_2160102_-|energy-coupling-factor-transporter-ATPase MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIENVKSGEIFYNNQTITDDNFEKLRKDIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRIVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKINQMLGHQTSFLTYEGLVNQL >NZ_CP014791.1|WP_000542274.1|2160639_2161008_-|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV >NZ_CP014791.1|WP_000569649.1|2161024_2161969_-|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-alpha MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED >NZ_CP014791.1|WP_000101625.1|2162043_2162433_-|30S-ribosomal-protein-S11 MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV >NZ_CP014791.1|WP_000090796.1|2162456_2162822_-|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGVDIPREKRVVISLTYIYGIGTSTAQKILEEANVSADTRVKDLTDDELGRIREVVDGYKVEGDLRRETNLNIKRLMEISSYRGIRHRRGLPVRGQKTKNNARTRKGPVKTVANKKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014791_8 | 2344111-2344204 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014791_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014791_8
>8.1|2344137|42|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014791_8
The CRISPR arrays of NZ_CP014791_8 >merge|NZ_CP014791|8|2344111-2344204|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG >NZ_CP014791|8|8|2344111-2344204|CRISPRCasFinder TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTC TTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG
>NZ_CP014791.1|WP_000019132.1|2343103_2343970_-|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNEITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP014791.1|WP_001125208.1|2342090_2342777_-|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP014791.1|WP_000762708.1|2341832_2341937_+|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP014791.1|WP_000038955.1|2340219_2341659_-|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIEMMNQIKIDTMLHGYHAGFLFALLITVISFFCSFMLQGKKKEVDSHQ >NZ_CP014791.1|WP_000825936.1|2339319_2340099_-|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVVIAFVFILAACGNNSSKDKEASKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKAEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSKSAFAFSKKVDDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP014791.1|WP_000479573.1|2338619_2339339_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQLHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKVLRSIARVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYRQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP014791.1|WP_000615468.1|2337891_2338623_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVGKGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEIFNNPKTEELKRFLNVINEE >NZ_CP014791.1|WP_001012230.1|2336544_2337795_+|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLIDPYLIENLRNAEGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESAEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMLYKLQTYLKHKRR >NZ_CP014791.1|WP_000819842.1|2335927_2336290_-|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDERVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP014791.1|WP_000162809.1|2335309_2335909_-|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAEDHHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK >NZ_CP014791.1|WP_001791249.1|2344398_2344503_-|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKKVLYGEMQ >NZ_CP014791.1|WP_000792549.1|2344597_2345911_+|hypothetical-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQSSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNKYYQYKGLIDKTVLTTIGSGYGSYIKPLEVSKESGNLAKSYAQVRNYVTESINTGKVLYAFYQKPELVKTAIKAQETATTFKNALTGIFKSFWK >NZ_CP014791.1|WP_000594516.1|2346446_2347376_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHEKGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_CP014791.1|WP_000916696.1|2347943_2348891_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLEKAKAANDTEDIGKGNDVEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDPNVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFVTASGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSGDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFKNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_CP014791.1|WP_001056918.1|2348892_2349870_+|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MNMNKLVKSSVATSMALLLLSNTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKAAGNINSGYERPNPKDYDFSKIYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNYKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETEINK >NZ_CP014791.1|WP_000200952.1|2349928_2350396_-|QueT-transporter-family-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLILSVILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NZ_CP014791.1|WP_000286884.1|2350406_2351099_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQNLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_CP014791.1|WP_000971558.1|2351109_2352225_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKTVGYIDRQYIEVENQRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKNDFEKFMRKYSYHLSSSRLISGSSAAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLTLFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKSLNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQILLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >NZ_CP014791.1|WP_001046647.1|2352202_2353210_-|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYGTCENKENKNDVSRAN >NZ_CP014791.1|WP_001110067.1|2353211_2354570_-|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKCKLLSHIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRNCKENGLMIRNLENVITFVPLLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014791_3 | 3.1|770785|34|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 770785-770818 | 34 | NZ_CP014791.1 | 1003039-1003072 | 0 | 1.0 |
NZ_CP014791_1 | 1.1|216591|51|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 216591-216641 | 51 | NZ_CP014791.1 | 216455-216505 | 1 | 0.98 |
NZ_CP014791_4 | 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1768246-1768274 | 29 | NZ_CP014791.1 | 884022-884050 | 2 | 0.931 |
NZ_CP014791_7 | 7.1|2153879|37|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 2153879-2153915 | 37 | NZ_CP014791.1 | 2153790-2153826 | 2 | 0.946 |
1. spacer 3.1|770785|34|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to position: 1003039-1003072, mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttggggcccacaccccaacttgcacattatc CRISPR spacer ttgttggggcccacaccccaacttgcacattatc Protospacer **********************************
2. spacer 1.1|216591|51|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to position: 216455-216505, mismatch: 1, identity: 0.98
caaaagaagccaagcaaaacaaatgcatataacgtaacaacacatgcaaac CRISPR spacer caaaacaagccaagcaaaacaaatgcatataacgtaacaacacatgcaaac Protospacer ***** *********************************************
3. spacer 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to position: 884022-884050, mismatch: 2, identity: 0.931
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer cagagaatttcgaaaagaaattctacaag Protospacer ***********.* ***************
4. spacer 7.1|2153879|37|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to position: 2153790-2153826, mismatch: 2, identity: 0.946
agctcacaaaacccttgatatcattggtttcccatga CRISPR spacer agctcacaaaacccttgatatcactggtttctcatga Protospacer ***********************.*******.*****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014791_4 | 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1768246-1768274 | 29 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 202405-202433 | 5 | 0.828 |
NZ_CP014791_4 | 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1768246-1768274 | 29 | NC_021539 | Listeria phage LP-030-2, complete genome | 30990-31018 | 5 | 0.828 |
NZ_CP014791_4 | 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1768246-1768274 | 29 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 36648-36676 | 5 | 0.828 |
NZ_CP014791_4 | 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1768246-1768274 | 29 | MN693250 | Marine virus AFVG_25M507, complete genome | 24474-24502 | 6 | 0.793 |
NZ_CP014791_4 | 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1768246-1768274 | 29 | MN693116 | Marine virus AFVG_25M217, complete genome | 37740-37768 | 6 | 0.793 |
NZ_CP014791_4 | 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1768246-1768274 | 29 | NZ_CP039965 | Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence | 1307898-1307926 | 7 | 0.759 |
NZ_CP014791_4 | 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1768246-1768274 | 29 | MH791411 | UNVERIFIED: Escherichia phage Ecwhy_1, complete genome | 54760-54788 | 7 | 0.759 |
NZ_CP014791_4 | 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1768246-1768274 | 29 | MT446416 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH47, complete genome | 202998-203026 | 7 | 0.759 |
NZ_CP014791_4 | 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1768246-1768274 | 29 | MH494197 | Escherichia phage CMSTMSU, complete genome | 237333-237361 | 7 | 0.759 |
NZ_CP014791_5 | 5.2|1821572|33|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1821572-1821604 | 33 | KM983333 | Clostridium phage phiCTC2A, complete genome | 10857-10889 | 9 | 0.727 |
NZ_CP014791_5 | 5.2|1821572|33|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1821572-1821604 | 33 | KM983330 | Clostridium phage phiCT19406A, complete genome | 10857-10889 | 9 | 0.727 |
NZ_CP014791_5 | 5.2|1821572|33|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1821572-1821604 | 33 | KM983329 | Clostridium phage phiCT9441A, complete genome | 11318-11350 | 9 | 0.727 |
NZ_CP014791_5 | 5.2|1821572|33|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1821572-1821604 | 33 | NZ_CP032676 | Rhodococcus rhodochrous strain ATCC BAA870 plasmid pNit, complete sequence | 171591-171623 | 9 | 0.727 |
NZ_CP014791_5 | 5.1|1821517|32|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1821517-1821548 | 32 | NZ_AP018257 | Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid2 DNA, complete genome | 239932-239963 | 10 | 0.688 |
NZ_CP014791_5 | 5.1|1821517|32|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder | 1821517-1821548 | 32 | NZ_AP019369 | Silvanigrellales bacterium RF1110005 plasmid 79K, complete sequence | 62249-62280 | 11 | 0.656 |
1. spacer 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tagagaatatcaacaagaaattataaatg Protospacer .******* ************* ** * *
2. spacer 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to NC_021539 (Listeria phage LP-030-2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tagagaatatcaacaagaaattataaatg Protospacer .******* ************* ** * *
3. spacer 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tagagaatatcaacaagaaattataaatg Protospacer .******* ************* ** * *
4. spacer 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to MN693250 (Marine virus AFVG_25M507, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer aagagaattgcaacaagaaattctaatgc Protospacer ******** *************** .
5. spacer 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to MN693116 (Marine virus AFVG_25M217, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer agcaaaatttcaacaagagattctacaaa Protospacer . *.*************.*********.
6. spacer 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039965 (Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer atgagaatttcaccaagaaattcggcatc Protospacer ********** ********** .**
7. spacer 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to MH791411 (UNVERIFIED: Escherichia phage Ecwhy_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tgtaaaatttcatcaaggaattctacaac Protospacer .. *.******* ****.**********
8. spacer 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to MT446416 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH47, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tgtaaaatttcatcaaggaattctacaac Protospacer .. *.******* ****.**********
9. spacer 4.1|1768246|29|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to MH494197 (Escherichia phage CMSTMSU, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tgtaaaatttcatcaaggaattctacaac Protospacer .. *.******* ****.**********
10. spacer 5.2|1821572|33|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to KM983333 (Clostridium phage phiCTC2A, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cagaaactggcggaaagtcagctttcaataacg CRISPR spacer gatgaactggctgaaagacagctttcaattgga Protospacer * .******* ***** *********** . .
11. spacer 5.2|1821572|33|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to KM983330 (Clostridium phage phiCT19406A, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cagaaactggcggaaagtcagctttcaataacg CRISPR spacer gatgaactggctgaaagacagctttcaattgga Protospacer * .******* ***** *********** . .
12. spacer 5.2|1821572|33|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to KM983329 (Clostridium phage phiCT9441A, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cagaaactggcggaaagtcagctttcaataacg CRISPR spacer gatgaactggctgaaagacagctttcaattgga Protospacer * .******* ***** *********** . .
13. spacer 5.2|1821572|33|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032676 (Rhodococcus rhodochrous strain ATCC BAA870 plasmid pNit, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
cagaaactggcggaaagtcagctttcaataacg CRISPR spacer cagaaactggcggaaaggcggcttccgacgcgt Protospacer ***************** *.****.*.*..
14. spacer 5.1|1821517|32|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP018257 (Calothrix sp. NIES-4071 plasmid plasmid2 DNA, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
agtaaatttggatcctcaatttctacagacga CRISPR spacer cgtaaatttgcatccgcaatttctttctcagc Protospacer ********* **** ******** . *
15. spacer 5.1|1821517|32|NZ_CP014791|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019369 (Silvanigrellales bacterium RF1110005 plasmid 79K, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.656
agtaaatttggatcctcaatttctacagacga CRISPR spacer ttgaaatttgtatcatcaatttctacttcaat Protospacer ******* *** *********** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
703032 : 710851
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014791|703032:710851|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTACGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCATTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCATAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCATAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGTGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAAGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAGCAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACGCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTAAGTGAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGATATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTTATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGCGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCTTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGACTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGCTGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACAATTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATAACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGGTGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGTCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAATTGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGGAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCCTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCACCAGGGCCGGGTAATCCTGATGATTATCCAATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGGTTACAGCAAAAAACGATGAAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTACATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAGGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTATTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATCTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCCACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTTTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTAAAAAAGCGGAAAACATAAATTCAATATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAACATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTTGAAGGCGAAACGTATCAGGTGAACTATACGGCGCGCTTAACGGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACTGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGTAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTACTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTCATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAACTAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATTACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTAGAAAGTTCACCTCGTGGAATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCGATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014791|703032:710851|706965_707679_-|WP_001062976.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKSDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP014791|703032:710851|708103_708772_-|WP_000446726.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKQFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP014791|703032:710851|707682_708102_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP014791|703032:710851|704748_705222_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP014791|703032:710851|709122_709716_+|WP_000604517.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKVTAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP014791|703032:710851|706282_706867_-|WP_000637683.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP014791|703032:710851|705562_706003_-|WP_001093554.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAAAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP014791|703032:710851|704087_704774_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP014791|703032:710851|709699_710851_+|WP_001217805.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFKKAENINSIYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP014791|703032:710851|703032_704088_-|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
722827 : 737103
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014791|722827:737103|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAACTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCAGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAGGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGACTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGATGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACGTATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCATCACATGTTCCGGTACTCATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCATTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGAAAAGGGCACCACATGGTATGAATATGTGCCAAAATGCGGTGTGAATGATGAGGTGAGAGCATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATTAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCACAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAAGAAAAATAAATCACTTGAACCATTTTATGTAGCAAATAAAATGCATATACTGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCTCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTCGTAGAGCATAGAACATTGATTTATGTTCCAGCCTGAATCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTAAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGTCAGATTACATGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGGCGCATAAACCACTATGATTTAAATTACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAGTTATATCTCTGTTTTTGAAAAAAGGTAATAGCTTAAAGCTAATAACAGCGAATATAATGTAAGTTGAATCTTATGATTACACTTTAAACCTAATATAATATCCCATTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGATAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGTTAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATTCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGTCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGCTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGATAATAACTGACATTGATGTCTATAGAGTGGGGCGAGAAAATATAGTTATAGTTGTCTATAACGAGCATATTAAGTTTTTATTTATATTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGATGCGTTAGTTAAATACCAAATACTCATCATTTGAGCATTGAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCTGTTGGTGATAAGCAAAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGTACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGACTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGTGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAAATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATACCATAAATGTTTAATACATTAGAACCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATGAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATTACAATAATTAATACAATTGCTAACACAACACTTCCGATGATAAGACCATATTTTTTCTTTTCTGCTGGAGTCAATGGATTAGTAGGTTTCATACCCACACTACCTAAGTTTTTACGATTGAAAAGTACATACCAAACTAAACCTAGCGCCATACCAACAGCTGCAATTAAGAATCCGCCATGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAGCGGCCAACAATATTTGAAATATTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATAATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAACGCAAACGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAGTAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCACCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCGTAAACTGACATGATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCGAAGTACATGTAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014791|722827:737103|733084_734056_+|WP_000562500.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDVWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP014791|722827:737103|722827_723886_+|WP_000663021.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNDDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP014791|722827:737103|730500_730899_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP014791|722827:737103|728832_729699_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP014791|722827:737103|730861_732967_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP014791|722827:737103|728312_728813_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP014791|722827:737103|724043_724592_+|WP_000197263.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEKEK >NZ_CP014791|722827:737103|726287_726389_+|WP_031785486.1|DBSCAN-SWA MIITDIDVYRVGRENIVIVVYNEHIKFLFILIS >NZ_CP014791|722827:737103|725279_726197_-|WP_000429016.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLTIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP014791|722827:737103|735388_736345_+|WP_061869676.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQSITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVIPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLVTMVLFALLLFQVIFKIGQFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVILVTLLIITIYLVPYLDVLLLGRAEAINLGISYEQLTRFLLVIVSILVSISTTLVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEISILIDLIGGSYFIYLLVKRRNAQ >NZ_CP014791|722827:737103|726466_727972_-|WP_000193753.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGTSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP014791|722827:737103|736341_737103_+|WP_000616861.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTIHNQTILEDISIVIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRHRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLQMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGRLVKSDLKDNVIQSNVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP014791|722827:737103|734430_735402_+|WP_000876313.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINVALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRVIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
978377 : 986850
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014791|978377:986850|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014791|978377:986850|979974_980679_+|WP_000174048.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETDQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP014791|978377:986850|983775_985260_+|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP014791|978377:986850|986283_986850_+|WP_000238657.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVDHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP014791|978377:986850|980678_980942_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP014791|978377:986850|980943_981615_+|WP_000666803.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKTNNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP014791|978377:986850|981607_983797_+|WP_061869691.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACEILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEYEPLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQFFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP014791|978377:986850|985252_986281_+|WP_000030827.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYESVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGVVEKDDYVDGSEVKERQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQDVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP014791|978377:986850|978846_979971_+|WP_001010404.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPTEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGDNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDNRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP014791|978377:986850|978377_978860_+|WP_001622461.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1242208 : 1256665
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014791|1242208:1256665|DBSCAN-SWA 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23 | Staphylococcus_phage(57.14%) | integrase,portal,terminase,capsid | attL 1236031:1236048|attR 1259504:1259521 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1529697 : 1538009
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014791|1529697:1538009|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGCTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAGCCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAGCATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAATCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAATGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTAACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCCTTACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGCTGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAGCCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCTTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGCAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAACTTTCGGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014791|1529697:1538009|1531508_1532855_-|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP014791|1529697:1538009|1536209_1538009_-|WP_001217237.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEKALTYLLERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISFMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP014791|1529697:1538009|1530608_1531499_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP014791|1529697:1538009|1532968_1534069_-|WP_000683915.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTALKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESKGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKLRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP014791|1529697:1538009|1534879_1535986_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP014791|1529697:1538009|1529697_1530483_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP014791|1529697:1538009|1534071_1534749_-|WP_000624564.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTESLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSAQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINEEIAVIERVL |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1607324 : 1616368
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP014791|1607324:1616368|DBSCAN-SWA TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATTTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTCGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATTGACGTAGGTAAATCTCTTAATATTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGTTCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGTGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGTATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCCACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATTATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAAGGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCGAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCCGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCACTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGCCTTGGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGATATCTGTGTCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACAATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATAATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCAAAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCAGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTCGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCTGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCTTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGGTCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATTGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGTATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAAAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAATGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCGTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCAGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGCGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATAATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATACGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATTAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCGGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATACATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAGCATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGCCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTTGCAACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATAGCACTTTCATCATCAATACCTGTGCCCAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGAGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTCTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGTTTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP014791|1607324:1616368|1613174_1614314_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP014791|1607324:1616368|1615363_1616368_-|WP_061869715.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQTMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDDESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP014791|1607324:1616368|1607864_1610138_-|WP_061869714.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKAIERIKRAIVNDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNNQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGTVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVILRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIEKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP014791|1607324:1616368|1614336_1615362_-|WP_001019180.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETANLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDYDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP014791|1607324:1616368|1610341_1612621_-|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP014791|1607324:1616368|1607324_1607843_-|WP_000364543.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP014791|1607324:1616368|1612895_1613156_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1739512 : 1785009
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP014791|1739512:1785009|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCATTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAATAATGCTGCGCCTGTAATTAGTGCTAATTCTTTTAATGGTAAATCCATTTCTTCAGAACCAGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCACTTCTTGTTTATCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCAGGTTGCCCCACTTTTGGTGACGCTTTTATCACTTCAGCAGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAATAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCGATCATTCTATTACCATCTGCAACATATTGATCTATTAACGCTTTCACTTTAGCCAATTGTTCTGGTGTTGCAATCGCTTTGAATTTCGCATAGGTTTGTTGCGCAATATTTTCAATGCGCATTAAGCTATGTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACCGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCTGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGTACTAAATGCGTAACACGTGCAATATCTTGGTTGATTGTTTTTTCGGCCTCCGGTTTTTTAACAGGATGCACATCTAAACCTTGTATTGTTTGAAGATTAAATGATGCTGTTTTATCCACTTGTGCATTGCTACGGTCATGATCAAGTTGTCCGATTGCTGCGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAAAACACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAACATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCATTGAGCAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCCCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATGTGTTGTTTCGCTTTTATTAATGCTTGTTCTACTTGTGCTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCATTATTTGATTTGATTAAATTAATTTTATGAGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAACGCTGTTGTTTTAACTGTTGTTGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATCGATACTATTTTGATTAACTTGCGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTGACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTTGTTACCATCAGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATATCATTTTTAATTGCATTAACAATTTTATTTAACGCAGCAATAGCAACATTTCGTTCATCTTGCGTTGTATCTAGCGTATTTCGTATTGCAGCGAGTTGATTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTGCGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATCGTTTGATTTCTAACATCATTGACAGCTGCATCTTGTGTCGTATTGTCTATATTTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCGTTAATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCAGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGGTTATCTGCGCTCGCTTTTATGGCTTCTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGTGCTTTTTAACCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGTTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAATGCAATGTCGTCAAGCGCTTGATTTGTTGAGTCATTAACTTGCTGATTTGTTCTATCATTTGTGATATTTGTCATAGCTTTAGCAACTAAATCATTGATTTTATCTAACGCCGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCTTGATTAATTTGCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCTGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATCATTTTTATCGCAGTTATACCATCTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGCTAATGCTTGTAAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTAATCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACTGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCCACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCTGCATTTGTATTAGCTAGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAATGTTGATTGCAGCATTCTTCTCATCATCTGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATACTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTCATTGCTTGTTTACCTGCTTGTAATGCTTGATCTACTTCTGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAAATCTTGATCTACTTGATTTAATGCTACTTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAGTCCGTTAATACACCTGTGGCTGATTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGTACCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATCTATTGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGATATCGCCTCACGTGCTTTTTCATTTACAGTATTACGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTCGCCGGTTGAATCGCAAGTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGCAATTGTTGTGCTGCTTGTTGCTCTTCTAAGGTCGCATCATTATTATTAAATATCGCATTATGTTGCGTTTCTGCACTTTGATCAATAGCGTTTTTAGCATCTGTTTTAACCTTTGTAGCTGGCTCAATGGCCTGTATTCCTTGAATCGCATTTGTCTTCACTTGCTCAACATCAGCATTGCTATTAGCATTTAAAATATTAGTATTCGCAGCAGCTACAGCAGCATTTACTTTCTCAATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTTGCATCAGGATTAGCATTGATCTCTGCGATATGCTGTTGTGCATCATGTGATACGGCATCTCTTGCAGCTTGCTTAACAACAGTTACAGGAGCAATTGGATTAATGACATTTAGACCATCACCTTTGGCAGTATCTACATCATCATTGGTTGTCGCTTGATTGATTTGTTCTAATGCGTGGTTTGTGGCTTGCGTTAATTCATTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCTTGTGTTGCTTCTCTATTGCTATTTATTTGTTGTCGTTTCGTTGCTGTCGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCTGCTTGTTTGTGTGTCACTTGTGGCACAACTGCACCAATTGTATTAATACCATTATTTTTAGCTGTTTCAACATCAGCATTGGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTTGTTAATTGATTTAATGCATCTTGAATTTCGTCTTGAGTAGCATCTGGTGTGTTATTGATAATTTCTCTTTGTTTCGCTGCTTTATCACGTATAGCTTGTTTAGCATTTGGTTTAACAACCGGTGTTGCAGTATCACCACTTAAGGTCTGTATACCTTGATCCTTAATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTCCCAATAATTTCATTTTTATGTTCCTCGATAACTTGAATCGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGGTTAACTAAATCTTCCATGTCATCAACTTTTCTATTAACGGCATTTTCAGCGTCAACACTACGAATTAACGTATGTTGCATCTGATTTGCTAATGAATCGATATCTGCTTGAGAAACTCTTTTGTTTAAAGGTACATTGTTACGGTTTTCATCTAAAATTGTTTGTGCGCGTCTTTTAAGATCATTAAAAATATCTAATGATGCAAATGTATAATCCGCCTGTTGAATTCGTCTATCGACTTCAGCTTGTAATGCGTCTTTATTCATGATGATATCAATTGTATATGGATTTGTACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGAAAATGTTTTATACGTTAATGTATCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTTGGCACATTGTTCACACGTATCTTATACTTCAAATCCAATATTTTATCAGGCATAAGTCGTGCCGGTGAATTCCCTGAACCT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43 | Staphylococcus_phage(94.29%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1876861 : 1973658
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP014791|1876861:1973658|DBSCAN-SWA 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101 | Staphylococcus_phage(70.0%) | integrase,head,tail,holin,capsid,portal,protease,tRNA | attL 1936249:1936266|attR 1943074:1943091 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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