Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014861 | Erysipelothrix rhusiopathiae strain GXBY-1 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,csa3,WYL,cas3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014861_1 | 1357813-1357889 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014861_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014861_1
>1.1|1357842|19|NZ_CP014861|CRISPRCasFinder TTCTTCCGGTTTCACTTCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014861_1
The CRISPR arrays of NZ_CP014861_1 >merge|NZ_CP014861|1|1357813-1357889|CRISPRCasFinder GGATTTGTTTCAGGTTTCACTTCTGGTTTTTCTTCCGGTTTCACTTCTGGTTTTTCTTCCGGTTTCACTTCCGGTTT >NZ_CP014861|1|1|1357813-1357889|CRISPRCasFinder GGATTTGTTTCAGGTTTCACTTCTGGTTT TTCTTCCGGTTTCACTTCT GGTTTTTCTTCCGGTTTCACTTCCGGTTT
>NZ_CP014861.1|WP_013852751.1|1356879_1357395_-|NUDIX-hydrolase MIIKYFDDDQFKAANICNVRNTVRCFVLNEFGQCAMILIKGQDLFGKRNHYESPGGGIEVGESMIQAVHREIQEELGYEVDSISYLASVVDAYHRLELTTVHNYFVCKLAKKTCYARTCLELQLFDSIEWKLPNVWLDILDKPQDGVNELVHARERFMMRYFVDKQETLRD >NZ_CP014861.1|WP_013852752.1|1356401_1356926_+|methyltransferase-domain-containing-protein MNHKERSHKWMKQFLNKDSIVVDMTCGNGYDTHFLANHAGHVYAIDIQEEAILSSKQLNQNFSNITYIHSDHSRVNFEEKAPFTGAIYNLGYLPRSDKSIITTSHTTVSSLKNIFPLLTDFLVIACYLKHEGGYEEYEAVRDYIISTNMPYETLEYETPLSPVTFLVYLRNNAS >NZ_CP014861.1|WP_013852753.1|1355562_1356381_+|metallophosphoesterase MSKKKLAVLLGLIAIVSSLIYFEMTHFAPQRVKLRIETVESTRIPASFNNLSIGFLSDVYSHEENLDKALIELDSFKPDMIIFGGNLFKAAPSEKEQAAMIEKLSKVNAKLGKYAVLGENDIRKANEVTQEVLTQSGFKLISNTKIDVHNFTTESIQLVGIDANNDINKETEFPYPTTSEDLFNITIANNPDNVKEFDDTEVDLMLSGKTMGGYIRLPLIGSITESSDYINKRQTVDETTLIISSGIGLKEPEMRLLSNPDVMIVILKSPEA >NZ_CP014861.1|WP_013852754.1|1353697_1355566_+|ribonuclease-J MDEKNMKLRKTDTLVYALGGLGEVGKNMYCIEHDDEIIIIDCGVMFPEENLLGVDYVIQDYAHLIRNQKKVKALVITHGHEDHIGGIPFLLQKVNVPQIYAPQFAKAQIERKLEERKIRTKHKIQEIDSKSTIKTKHFVIGFFNVVHSIPDALGVLVNTPNGRIVSTGDFKFDLTPVGNNPDYQIMSYMGEIGVTLLMSDSTNAEVSGFSISEKEVGREIKRIFNKTEGRIIIATFASNVYRVQQIIEAAIADGRKIAIFGRSMDNVVNIARKLGHIDAADKHFVNAHQLNKLPADQSCIICTGSQGEPLAALSRIANGTHRQISIMPGDTVVFSSSPIPGNATSVSHVVNQLTRAGANVLTNSPLNSIHTTGHASKEEQTLMLQLIKPKFFMPMHGEYKMLKAHRQTAIETGVDPDNIFICSNGDVVALRDGVAFMSDTRIQADDIYVDGNDSSGLSTAVLKDRKILSDSGLVSVVVTIDSRQNKILCKPTIVTRGFVFIKENQTLLKEAELVVYEALKKRMTKKVTFGEIKNTIRGSLEPFLYKHTQRNPLVIPVILNQKTAMTPVKVENKKENSGQETKPVKKQKKNNNKQNNEPKQQQKDAKKPKTPKATKPQQAREA >NZ_CP014861.1|WP_013852755.1|1353116_1353689_+|peptide-deformylase MHDINMDTIVLDPNPVLREKCEPVSFPLSEEDRNTLENMLQYVRDSRDPELAEKYNLQPANGIAAPQIGVAKQMTALVVDLEDKHGNIKTVEYALVNPKIVSNSVKQCALSYGEGCLSIRKDYPGLVRRSQRIKVLAYDMITDQRIEIVAKDILAIVLQHEIDHLNGVLFYDHIDSKDPWMAEKGLKIIE >NZ_CP014861.1|WP_013852756.1|1351684_1352941_-|FtsW/RodA/SpoVE-family-cell-cycle-protein MKKRKISLKMPMGYNRPIHAAALILNIFGVLMVISGSMTSGSTPKSLVLVGVKELVFVIVSYIMMVMVARRFSLNYFRKNYAKILLLMVGMLGITLVFPAVNGAKAWINLKVMTIQPSEFAKIFGILTIATFLADRNKRTSASTFDMVKKPFFIILAIFVFVVKAQHDLGSAVVIIGVAYICVLIPSHDKLTRLQKVMFILAGVGIIGLIFLDSSFGISLIEKLNIPPYMIGRFKTSSNPFLDRYGSGYQIFNGMVAMFKGGLFGMGYGNSLIKYGYLPEAHTDFILAVTIEELGMIGFSVILIGYGTMLFQLVKYSFKVKKESDKVILMGTVAYIMIHFIFNIGGITALIPLTGVPLLFISKGGSSRMAIMIAIGLTQNVISRYEMGIINVKRKDQLRIKQEETKRKENLKRLTEVV >NZ_CP014861.1|WP_013852757.1|1351139_1351685_-|16S-rRNA-(guanine(966)-N(2))-methyltransferase-RsmD MRVVAGRFGSRPIKTLKGDTTRPTTDKVRAAIFNRIGPFFNEGAMLDVFGGSGAMAIESISRGIERAVVFEKDVRAFSVIQDNIKTFGLESRIQLKKGDSMKLLETVSGSFEFVFLDPPYRYAQTLKIIKLIIKRDLVVDGGLIICETDKNYDLPDEIDGYSLDCVKDYGISKVRYYKKDK >NZ_CP014861.1|WP_013852758.1|1350005_1351037_-|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MLTPRKIEIFKAIVKEFINTAEPVGSKTLIDKYNLSYSSATIRNEMSDLEKIGLLEKTHTSSGRIPSTKGYRFYVEHLMDEEENYGIETAIAQIFSDRRLGIDEAIRQSCDILSQMTNLTTVVLGPSAMNETLKSVQLIPLSEFNAMAVFVTESGHAEHRIFNFDSKVDVNDLEACTSILNERLKGTELSEVVDKMESLRPILSKRIEKYEVLFEAFVGAFVKFAQDEVYLSGERNMLYQPEFSNIEKLREMMDMLENSEMWRNLSTGQNHLSLKKGDQSEIVWVDDMAVVSSSFNLLDNHEHKLMIVGPSRMEYSRVVSLMDYVSEMIETVYGKGGNDEQDE >NZ_CP014861.1|WP_043892556.1|1349449_1350025_-|nucleotide-exchange-factor-GrpE MMSKTNKTAEEFNEEVQLEQEVEATDSEELETSNSENEASETDEAIDENEALRKEIETLKNDYFKMLADTENLKKRLQREHDQLRKYRIQGFAADVLPVLDNLERALKQETTDEALREGVQMIYDQLMASLKAEGVEPINALNQPFDPNIHQAMMTEEKEGVESNIVIEEFQKGYMLKDRILRASLVKVSQ >NZ_CP014861.1|WP_013852760.1|1347633_1349436_-|molecular-chaperone-DnaK MSKVIGIDLGTTNSAVSVMDGGEAKVITNPEGNRTTPSVVSFKNGERIVGDAAKRQVVTNPNSAVSVKRLIGTGEKVTLEGKDYTPEEISAMILGYMKSYAEDYLGEKVTKAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAFGIDKTDKEEKVLVFDLGGGTFDVSILELADGTFEVLSTAGDNKLGGDDFDNIVVDYLVDIFKKENGIDLSSDKMAMQRLKEAAEKAKKDLSSTVNASISLPFISAGENGPLHLETTLSRAKFEEMTKSLVERTMVPVRQALKDAGLTKNDIHQVLLVGGSTRIPAVVEAVKNELGKEPNKSVNPDEVVAMGAAIQGGVISGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTVLIERNTTIPTSKSQVFSTAADNQPAVDINVLQGERPMAKDNKSLGLFKLDGIAPAKRGIPQIEVTFDIDVNGIVNVSAMDKGTNKKQSITISNSSGLSDEEIERMVREAEENASEDLRLKEEAELKNRAEQFIHQIDESLASEDSPVDDAQKEEVTKLRDELQAAMDNNDFETLKEKLDQLEQAAQAMSQAMYEQQAGQAEVDASSSDETVVDAEFEEKN >NZ_CP014861.1|WP_013852749.1|1362430_1363426_-|substrate-binding-domain-containing-protein MKRVTIYDVAKEAGVSLATVSRVINGLEIVREETRVKVETAIDKLGYKPNAIAQGLALQKTTTIALLVPEASFGYTGQIINGLIDVAKIYKYNIMLHTMTEGIVDIKDVIDDIIKSRVDGVIIYNDKLMENELAELNKYQFPIVIIGNKMSDKQISSVYVDIEKAVYELTMQKIQMDPKNRVAVIQDRKNDFTTNQMVSGVQRAYQELGIDDEGYIEIPVDYRRSYDYFLDHIESMNYNFLIANRDSQAISAMNAAHECNMNIPEDLEIVCLIDTKYNSMVRPRLSSFAIPSYDLGAVAMRVLTKMLNEDEVEDKEIELSYLYTPRQSTKN >NZ_CP014861.1|WP_013852748.1|1363422_1364304_-|hypothetical-protein MSKYDEILNELVYQIDDVVYNFYSESNEIIAAKNGQERLLTFRDKTLNTINDMNVRSLEIISGFKDSDLIQERAEHLLEKNKDIVNSALEVLRAAPERNEFFDDLGNLATGIFESAKTTFQKVEESETFDRFKEGALLGLKKMQKGLDDLAKHPGVVKSTEIVKEKTKEAVDAGTQIVKDTSKNVADWVSEQELRAKAEKVSKEVHAGAETVKVKVHDGAEKVSEFVEDTVETKAHEFEEDAFSFLDTLEEELDQVSRDAESNLEPSNIVEAAEKQVRELDKKLDEVKEDEEV >NZ_CP014861.1|WP_003773209.1|1364296_1364713_-|hypothetical-protein MDALIQNLREVSILIAPIVGVVCLIILAMILYRIYVVVRDLPKTIDRVNGVIDSTQSSVDQLQAPLNTLNNVTNTVDLVNQSAVSAVSSVASYGAKHSDAIVNWTKDLLDKRRNGRNPESSDVQETGDEKEEDFGIYE >NZ_CP014861.1|WP_003773207.1|1364758_1366084_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MSMKNKPIYFIGIKGTGMAALARICYKMGYEVMGSDIDRHFFTEDALRALNIPIVPFNKNNIKDNTVVIIGNAFLDDHEEVQAAKANPTVETYRYHEYLGKMMDSYRTIAVSGSHGKTTTTTLLRDMLSYSKETGYLIGDGRGDLQRDDEYFAVEACEFRRHFLAYKPKIAIMTNFEIDHVDYFKSVEDYLSAFKEFAKNVESLIVVWGDDPHYQDLSFDVETWSYGFGEGNKIRATELEKTTTHSIFDVEVDGKRIHRFNLPIVGDHMILDALAVIAVGLYEGIEPNDIEAGLQTFTGAKRRFVIETGKDNVYIDDYAHHPTEVRVTLEAARTRYPDRKIVGIFKPHRVGRVYYFADEFADALSLADEVCLCPFTSIDDAEEGIDIDITYLQDRIEDSHVVDLNDHDLDLLESFGPAVYVFMSSKDIYDLKDALKIRFND >NZ_CP014861.1|WP_003773206.1|1366067_1366703_-|hypothetical-protein MFRRLASVLFKEEEIVIEEEISDHVGEVEIPELKPILPKEKKIVEKPKTVTEHVDITEPVISEKPITDMTPDEAVKAASELNRKSRMITADDDLAKRKMERAKAARTSELEVKKFEYQRKDIISPMYGGPSQPSEPLDIPKKNKASKHVPVAEVISPMYGKVQEESKAEARKIDESLMDLRVDDIISNEGKGETVQVSLYDYLEGIDEHEE >NZ_CP014861.1|WP_003773205.1|1366726_1367431_-|hypothetical-protein MSLRKLMTALLLLLLVSGCTPAAINYDDLVKSALSRPMPEATNHNKKYYRYYLLPDVGIKQSTQISTLYEIDRKPIMLDLDVANIVAKRYTEITENNEGKEKGDQKEDSKIQFSSLIKEEAVSYRTTGTYVDGSDKEQHFIFSIVDLEKHKAVVLENGQVDMMAIVNDANMDMIVQSMFTTMRSITVNEDLVVQDFSKKDIITYHERYEEFFEHAIPESGAISDIIDKTAPKTE >NZ_CP014861.1|WP_013852747.1|1367417_1368482_-|M42-family-metallopeptidase MLNEKQLNWFETLTQLDGVSGHEHQVAQYLFNEYSNYTDEILRDNLGSILAVRRSNKKNAPKVLVLGHMDEVGFLVREVTETGVLKIHPVGGWFSQVLLGHRVRVTTRHGEVYDGAIGATPPHMLSAEERLKPIQIPQMTVDVGATTPEEVHAMGIQIGDMVVVDGEFNVLNKGKRLLAKAFDNRYGCVMGLDLLEALKDQELDYDLYVGCSVQEEVGLRGAQTVANLVKPDLAIILDCSPANDALDSKAIGKLGGGVLVRVMDGNMIATKDLIYKFVDICNEHDIKHQYYFSPGGTDAGAVHKSNSGVKTLTCCLCARNIHTSSSILDTDDYLAAREALLHFIDKKTWGDVIA >NZ_CP014861.1|WP_013852746.1|1368481_1369114_-|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MRLRKKEWSSEVFETFADYTVTEFETIKGNWKEALGSELLHLEIGSGKGDYWHQLSALYPDRGIVAMERDFTASSIALKKLEKNPGDHKRFIYGDAENLNDMFAPGEVDVVHLNFSDPWPKKRHTKRRLTYKDKLDEYYSVLSDKGEIWMKTDNVGLFNYSLVSVGQHKFELVEVDVDFRSHEHEDPFTEYERKFHEMGQPIFRAIWRKK >NZ_CP014861.1|WP_013852745.1|1369212_1370280_+|nucleotidyltransferase-family-protein MKNKLTATGIIVEYNPLHNGHCYHIKKTREITRCDVLIAVMSPNFVQRGEPAYLDKWVRTEAALESGVDLVLELPTIYTLQSADVFAFKAVEILNHVGIQSLVFGSESNVLPVKPQFDKGLLKQGHSFAHASNTSNHQSNDILGVYYVQACQTYGITPLTILRTNNYHDQSISTSIASASAIRKAHQEGISVSHTTPLNLNTLTSYQLKEYEPFIHYLLSVHPSKTLSQNSLVSEGIQNLFIKHRHLPLDVLIETCTSKRYTRSRVQRTLMNLLLNFTKDLEQPLEHVRVLGMNTKGKAYLRQLSDDEIPYTTQFKHYQFKELELRATEVYTLPKDETIKKRLLKQEVSELIIKT >NZ_CP014861.1|WP_013852744.1|1370269_1371364_-|methionine-adenosyltransferase MNLVFFTSESVTDGHPDKMCDQIADAILDQALKQDPNSKMAVEATIKDNFVLIYGEANTKAVIDYTQVAKDVIADIGYPEDYEVMVKVNKQSSQINNAVISQENVGAGDQGIMFGFACNETENYMPLPIHLAHALSKRLSDAKSEIDWLYPDGKTQVTVAYEGNEPKFVHTVLVSASHKAGIDHATIEKTVMESIIKPVIDSKWITEETRFIVNPSGEFSIAGPFSDSGTTGRKIVVDSYGGFGRIGGGCFSSKDPSKVDRSAAYFSRYVAKSVVAAGLCDKIELQLSYAIGLSDPLSIHIDTFGTHKRPESEILDIIKANFDFKVGNIISELDLLRPIYRDTANFGHFGRDGFPWEVIKPLKF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
193532 : 202380
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014861|193532:202380|DBSCAN-SWA TATGCGTAAATTGCCTTACAGTCAAGACGCTGAGATGGCTCTTTTAGGAACGCTATTGGTGTTCCCAGAGTCAGTTGCAGTTGTTGAAGAATATGATATGCAAGTCGATGACTTTTATAATACCGAGCACCAAAAAATATTTTCTCATATGTTAGAAATTATTGAACGTGGTCGTGTTTTAGATGCAACGACTTTAATAACCCGATTAAAAGATCAACACGAAATTGATAGTGTGGGTGGTGTGGAATACTTGTTTGCACTTACAGAAAACAGTGCAACACCAGCAAGTGTGAAACATTATATTGAAGTTGTTCAAGAAAAAGCTCAAATGCGCCGACTCATTGATGTTGGGCAGTCTATTGCTGAAAAGGGTTTTGACTCTACTACTGAACTTACAGCACTGCTTGATGAGGCAGAACAGAGAATTTTAGAAGTAACACGAGTTCGTCGAACAACTGAAATGCAACGCAGTCGTGAGGTCGTAAATGAAGTAATGGAGAATTTAAACCGAATTCGTGATAACCACGATCGCATTACTGGTTTAAAGACCAATTACAGTCATTTAGATAATGTCACAAACGGTTTGCAACGTGGCGATTTAATTATCTTAGCGGCGCGTCCATCTGTAGGTAAGACGGCTTTTGCCTTAAACCTTGCATTGAATGCAGCACGTCACAATAAAGATGAAAAAGCAGGAATGGCGATCTTCTCCCTTGAAATGCCTGCAACACATTTGATTTCACGTATGTTAAGTGCGCAATCTTCTGTTAAGAGTGAGTATTTACGAACGGGTAATCTAAACGATGAACAATTAAACAACGTCTATGCAGGCGCCAATGTTTTATCGAAACTCAATATCTTTATTGATGATAGTTCAACAATTACAGTTCCTGAAATTTTTTCGAAATGCCGAAAACTAAAATCCGAAGGTAATTTAGATATGATTGTGATTGACTATATTCAGTTGATTTCAGGACGTGGGAAAACAGAATCACGTCAACAAGAAGTTTCGGAAATCTCACGTGGACTCAAACAGTTGGCCCGTGAAATGGATTGCCCGGTTATTGCGCTCTCGCAATTATCACGTTTAGTGGAACGTCGAGACAGTAAAATTCCTCAATTGAGTGATTTACGTGAATCTGGTTCGATTGAGCAAGATGCGGATATTGTAATGTTCTTGTACCGTGAAGATTATTATAAAGACCGCGAAGGTGAAGAGGATGATGGTCCTCAAATGCCGAAACCAGAACAACAAGAAGTATTACTAAAAATGGCGAAACACCGTAATGGTGCATTGGCAGACATTACACTCATGTTCAATGCTTCCATTAGTAAGTTCTATGGTGTTGCCGGAGACGGAGGTAGAATGTAATATGAAAAAACATAAAAACCTCATTATGATATCTGTCGTATTTCTTTTTGCGATTGGGTTAGGGTACCTTTATAAGTCACCAACTTCAGCATCAGAAATTAAAACAGCGTATGAAGCAATCGATTCATCATCTGCTATATTTCCACAAGAAGTTGTAACTGTAAATGATAAACCTGTAGTGATTACAAAGCTTTATCGCGAACAAAAACTAGTAGGGGTCTTGAAAGATTCGACACGTCTACAGAAGATGTTTGATGAAGTGTATGAAAATGAATATAAAGAAGAATTCCCAGATTCTAAGTTGGGATTCATTGATGACCTTATTCAAGTAGATGAAATGAGTTTCAATGTTTATGAAGATCGTGATAATGATATTTTTGACTATCTCTATAAAGAAAACTTATTTGCGATTGAGGCAAATAAAGTCACATTCTCAAATGGAGCCATCATCTATGTAAAGAATTCTGAAGATTTTGATTCAGCGCGTGATAAATTCATACAAAACTTTACCAGTGAGAGCACATTTGATGCAATCAAAAATAATAAAAAAATTCCTGCAATTACGGACTATGGAACTAAGGATATTGATGTAAAAGTTAAAGAAACCGTTAAAGTAACGCGGGGACTTGCGACGAAGGATAAAATCCTAAAAGATGAAACAGAAATTCTGACATTCTTAAGTTATGGGTATAATCCAAAAGTTGAAACTTATAAAATTAAACCATTTGATACATTAGAAGGTATTGCATATCACAGTGGTATGAACGTTAATCAGATTCAATCCATTAATGCGGATAAAATCAAAGATGTGAATCAGGTGCTTGAAGTTGGATCAGAGCTTCGAGTAAGTAAGTTTGATTCACCATTCACAGTTACTGTAACCAAGCAACGTATGACGACGGAACCAGTATATCCTGAAAAAACAGTATATCAATCCGATCCAGAACTTGCGGAAGGTAAAGAAGTTGTGGATGTCGTGGAACAAAATGGTGCTCGTGATGTTATTTATGAAGATGTTTATGAGAATGGTGCATCCATCTCAACGAAAGAAATATCAAGTAAAGAAACTAAGAAACCAGTACGTGGTGTTATTCGATATGGTACAAAAGTTGAACCTAAAGTTGGTAGTGGTGCATGGCGTTGGCCTTTAGATAATGCCTATGTTCTTTGTGGTTATGGTTGTTATCCAAATCACTCGGGTACAGACTTTTCAACACACGGTAGTGGCTATGGACCAATCTACGCAATTGACCGTGGTGTTGTCACAACAAACTCATACGATCCAGGAGGATGGGGTAACTATATCGTTATTGACCATGGTAATGGATACAGATCCCTTTATGCCCATATGGCAAGTCCAGGTTATTTCCAAGCAGGACAAACTGTCGCAAAGGGTGAAAACATTGGTTATGTTGGTATGACGGGTCGAACAAGTTATCCACACGTCCATCTTGAAATTATTGTGGGTGGTGGAACACGTGTTGATGCATGTGGTGTTATTGGCTGTTAGTTTTTATCAAATCGAAGTATAAACGAGATTACGGTCTCGTTTGTGCTTTCCAAAAGGAGTTGGTCTAATGAAGCAACATAAAGAACTGAAATTAATCCTGATAACTTTTATAGTCTCAGTACTTATTACGTATGCAATCGAAACAGTGAGTGCGAATACGAGTGTTGTGGATTTATACAAATTAACCGACACATCTACATCAATCTTTCCACAAGAGTCTGAAGGAAAGTCTGATAAACCCATTGAAGTCACAAAACTTTATCGTGACGAAAAACTAGTGGGCATTATCAGCGACGGTTCGAAATTAAATAAGATGTTTGATAAGGTTTACGAAGAAGAATATAAAGCTGAATTCCCAGATTCAAAGCTAGGTTTTATCGATGACTTAATTCTCGTTAAAGAATTGAGCTTTAATCACTATGAAGATCGTGATGATGAAATATTTCAATATCTCTATGATGAAAAACTCTTTGCGATTGAAGTAAATCAAGTTACATTTTCTAATGGTGCGATCATTTATGTTAAGAATATCGATGACTTCAACAAAGCACGTGATACATTTATTCGGAACTTTACAGATGACAAAACATTTGATGCGATGAAAAACAATCGAAAAATTGAAAGCATCAAAGATTATGGGACACATGATGTTAATGTGGAAGTAGAAGAAACAGTTCAAATTAGCAAAGGATTGACATCCAAAGAAAATATTCTTATGAATGAAAGTGATGTTTTAACCTTTCTAAGTTATGGATATAATCCAAAAGTTGAAATTTATGAAGTCCAACCGTATGACACAATCGCAGGGATTGCTTGGCATAAAGGTATGGATGCAAATCAAATAAAATATATAAATAGTGATATAATTAAAGATGTAAACCAGGTGCTTGAGGTTGGATCGAAACTTCGAGTCAGTAAGTTTAATTCTCCTTTTACCGTTAAAATCACTCGAGAACGAATGACCTCAGAAGTTGTTTATCCCGAGTCAACAATCTACGAATCTGACCCAGAATTATCTGAAGGGAAGGAAGTTGTGGATGTTGTGGAACAAAATGGTAAGCGAGATGTGGTTTATGAAGATGTTATTGTGAATGGTGCTCCAAAGTCTTCGGAGGAAATTCGAACACAAGTAACGAAAGAGCCAATTCGTGGAAAAGTTCGTTATGGTACGAAGGTTGAACCACGGATTGGGTCGGGTAACTATCGTTGGCCGTTAGATAACGCGAATATTTCATGTGTCTATGGAAATTCATGTTACTACAACCATAATGGAACTGATTTTGTTCTCAATGGTGGTGGTTTTGGTCCAATATATGCAGTTGACCGAGGTGTTGTATCGGAAACTGTAAGTGGTTGTTTTGAAGGAAATTATGGATGTGGAAGTGGTTGGGGTAATCATATTGTGATTGATCATGGTAATGGTTATACAACGCTTTATGCACATATGGCTACAGGTCCTTACTTCAATGTTGGTGATCTTGTAAAACGTGGTGATAATATTGGATATATGGGTATGACAGGTACAACTTATGGTCCTCATGTTCATTTAGAGTTCCGCTATCACGGCGTGCGGGTAGACCCATGCACCGTAATGGGATGTTAGGTAAAGGAAGATGTTTATGAAATATTCAATGCTTGCGAGCGGTTCTAAAGGGAACTGTTGTCTAGTAGAATCGCAAGGGGTTCGAATTATGATTGATTGTGGAACCACAAAGCGTTATCTCAAACAAAGTTTTGAATCGCTAGCGCTAACATTTGATGATGTGGATTGTGTTTTGATTACACACGATCATGGTGATCATACCAGTCAGTTGAAGCATTTTGCTCACCATCAAATCTACTGTCCTTCGGAGATTATGTTTAACCATACAAAGGTAGAACCGTATACCCCATTTCACGTTGGACCGTTTATAATCACGGCAGTGAAAACATCTCACGACGCGGATGATTCAGTAGGATATATTGTTGATGACGGGAGTCGTAAACTTGTGTATATTACCGATACGGGTTACATTCGTGAGCAGGATTTTGAATTGATCAAAGATGCCGATTACTACATCTTGGAAAGCAATCACGATCCTGAATTACTGATGCAAACCAATCGTCCTTATGCCATTAAGCGTCGTATATTATCGGATACAGGTCACTTGTCTAATGAAGAAGCGGGTGTTCTGTTATCTAAAGTTGTTTCGGAAAAAACAAAGGAAATTTTACTAGCCCATCTTAGTTCGGAAGCTAATGATGAATATTTAGCCTTGTCAACGGTACGTGAATTAGTTGATAATGAGGGGATTGAATTCAATGTCGCTAAACAATTTGAAATTGTAATTGGAGGATATCAAATATGAGAAAAGATCAAGGATTTAAAAATACATTTATTGGAATTTTAGTTATTTTACTTGCATGGAATGGATTTCTAACCTATCAAGTCTACGACCTAAACAATCGTCCAACAGTCACTGAGAAGACCGAAGATGGTAAAACTGTAGAAAAAGTTGTTACAGAATTTGAAACAGATCCAACGAAAGTCGTTGAAAATGTTCGCGACCAAGTTGTGAGTGTATTAAATGTCCAAAGTGGACAACTTGCGGGTAGTGGATCAGGTGTAGTGTACAAAAATGAAGGTGGTAAGATTCACATTATCACCAATAATCACGTAACTGAAAAAGGTGAACAATACTATGTTCAATTCTCAAATGGCGAAAAAGTAGAAGCGAAACTTTTAGGCGCGGATCCTTTTACAGATTTAGCACTACTTCAAGTAGAAACTGATTCGGATGTGAAGCCAATGAAACTGGGGGATTCTTCTGTTGTTAAGGTGGGGGAATTTGTCCTCGCTATTGGAAGTCCAGTAGATTTAGAATTCGCAAACTCCGTAACATTTGGAGTTATTTCTGGAAAAGATCGTAAAGTTCCAGTTGATTTAAATGGAGACCGTAATCCGGATTGGGATATGGTTGTAATGCAAACAGATGCTGCAATTAACCCGGGAAATAGTGGTGGAGCACTTGTAAACATGAATGGAGAATTAATTGGTATTAATTCCATGAAACTCTCTTCAGCTCAAGTTGAAGGAATGGGATTCTCAATTCCTATCAATGAAGTGGTTCCAATCATTAAACAAATTGAAGAAACTGGAAAAGTACAATATCCAGTTATAGGGATTTCAGGTGTTTCGGTTTCTGAAATGAACCCATTCCTTAAAAATTACTATAAAGTTCCTTCAGATGTAAATGCGGGAGTATTTATTGCTGAGTTAACTCAAAATGGACCAGCACGTAAAGCAGATATTAAAGAGGGTGACATTCTAACCCATATTAATGACAAAGCCATTTCGAGTTATCGCGAGTTTAGACGTGAACTATATGCACATAAAGTCGGTGATACCGTTAAACTAACGATAAATCGTAATGGAGAAATTCACGAGGTAGAGGTAACATTGCAGTGATAAAAATTATCGCAATTGGAAAAATTAAAGAAAAACCAATGCAAGCACTGATTCAAGAATATGAGAAACGCCTTAAACCCATTCATTCTGTCGAAATGATTGAACTAACAAACTCAAATAAAAGCGATGTTACGAGTATCATTGAAGATGAATGTCAAAGAATACTTGAGAAAATTGATGATCGCGACTATGTGGTATTGATGGACTTAAGTGGAAAAGATTTGGACTCGGTTTCGATGAGTGAAAAAATAATGGATCTCATCGATATGGGAAAGCCAATCACATTTATTATTGGTGGTTCTCACGGTGTAAACCAATCAATAAGAGAACGTTCTAACTATCGTTGGAAGATTTCAAACCTTACTTTTCCACATCAACTTGTCCGCCTTATGTTGTATGAACAAGTGTATCGGTTTTTTATGATTTCAAAAAATCATCCATATCACAAGTAAAAAAAGACTAATCATTGTATTAATCTTTAAAATAGTATAAAATTGAAATGAAAAGTAGGAGGTTATACTTATGAAAGAGATTACAGTAACAGTTATTGATCCTGTTGGATTGCATGCGCGTCCTGCAACCGTAGCAGTAAATGCAGCAAGCAAATTCAAGAGCGAAATCAAAATCAGCTACAAAGGTAAAGCTGTAAACATGAAGTCAATCATGGGCGTTATGTCATTAGGAATTCCAACTCAGTCAGAAATCGTTATTTCTGCTGAAGGCGAAGATCAAGATGATGCAATCGCTACAATTGAAGAAGTACTAAAAGCACAAAAAGTAATTGCTTAATTTTATAATTAGAATAAAATAGAAGATGAGAATCTTCTATTTTTTTTATGCAGGAGGGAATTATGTCATTAGATAGATGGAATGAGTTGGCTCGCGATTATTCATGGATTGAGGAAGCAATGCAAACTATGGATGAAAGCACAAAACATGACGCTTTTTATAAGTCATTAGAATTTGGTACTGCAGGTATGCGCGGATTATTAGGAATCGGACCTAACCGCATGAATGTTTATACGGTAGCGAAAGCAAGTGTGGGATTTGCGAAATACTTAGTTGAGACATTTAAAGATCAAGAATTAAAAATAGCGATTGCATATGACAACCGTCATATGTCTAAAGAATTTGCGGACGTGAGTGCGATGGTATTATCAACTTACGGGATTAAAAGTTACATCTTTTCACAACCTCGTCCAACCCCCGAGTTATCATTTGCAGTTAGAACGTTAAACTGTGTTGGTGGAATTGTTATTACAGCAAGTCATAACCCGAAAGAATACAATGGTTACAAAGTATACGATGAAAATGGATGTCAATTGGTGGATCACAAGATTGCTCGTGTTATTTCTCTCATCAATGAAGAACCGGATGAAACGAAGGTGGATATCAATCAGGGTAATCGTTCAATGATTACTTATATGGAAGCTGATTTTGATGAAACCTATAAAGATGCAATCCATTCAATTCAACTACGTCCAGAGGAAGTAAAAACCTTATCCGTTGTGTTTACATCGCAACATGGAACATCCTATCCACTTGTACCGGATATCTTAACGAATGCAGGATACAATGTTATTCCTGTCATGGAACAAAGTAATTATGACCCTAATTTTAGTAATACAAAAACTCCGAATCCCGAAGAAAAAGCGTCCTATGATTTAGCCGTGGAATATGCGGTAAAACACGATGCTGATCTTGTACTCAGTTGTGATCCGGATGCAGACCGTATGGGTATTGTGGTTAAACACCATGACGAGTATGTTTACCTTACCGGAAACCAAGGTGGATCCATACTTCAAGAATATATCTATGCAACACGAATTGAAAAAGAAACCATGCCTGAAAATCCAATTATGTTTAATACCGTCGTTACTTCTGACTTAGGAGAAAAGATTGCGCAATCTTACGGTGTGAATGTAGAGAAGACATTAACGGGTTTTAAATACATCGGTGATAGCATCGAAAATCACAATAAAGTGGGTGATTTTAATTTTGTATTTGGTTATGAAGAAAGCTACGGTTATCTTCTCGCAGATTTTGTGCGTGATAAAGATGCTTTGCAAGCATGTATGATGGTTGCGGAAGCGGCAAACTATTACAAAAATCATGGCTTAACACTCGTTGATGTTTTAAACGGTCTTTATGACAGACATGGTGCGTATCATGAAACACAAGTAGCAATTACGTTATCCGGACAAGAGGGTTTAAATCGTATTCAAGAAATCCTAACAACATTTAGAGAATCAAATATCGAAGCGTTTGCGGGAATTAAGGTTCTTTACCGAGATGATTATTTAACATCATCACGTTCAAACGGTGAAAGATTAACATTACCAAAATCGAATGTTATTAAGTATAGCCTTGAAGATGGATCTTGGATTGCAATTCGACCATCTGGTACGGAACCAAAATGCAAGTTTTACTATTGCGTTGTAGGTAAAACAATTGAAGAATCACTCTTAAAATTTGAAGCACTAAAAAAAGATATTAATGAAAGAGCGCAACTCGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014861|193532:202380|193532_194903_+|WP_003774361.1|DBSCAN-SWA MRKLPYSQDAEMALLGTLLVFPESVAVVEEYDMQVDDFYNTEHQKIFSHMLEIIERGRVLDATTLITRLKDQHEIDSVGGVEYLFALTENSATPASVKHYIEVVQEKAQMRRLIDVGQSIAEKGFDSTTELTALLDEAEQRILEVTRVRRTTEMQRSREVVNEVMENLNRIRDNHDRITGLKTNYSHLDNVTNGLQRGDLIILAARPSVGKTAFALNLALNAARHNKDEKAGMAIFSLEMPATHLISRMLSAQSSVKSEYLRTGNLNDEQLNNVYAGANVLSKLNIFIDDSSTITVPEIFSKCRKLKSEGNLDMIVIDYIQLISGRGKTESRQQEVSEISRGLKQLAREMDCPVIALSQLSRLVERRDSKIPQLSDLRESGSIEQDADIVMFLYREDYYKDREGEEDDGPQMPKPEQQEVLLKMAKHRNGALADITLMFNASISKFYGVAGDGGRM >NZ_CP014861|193532:202380|198032_198761_+|WP_013853428.1|DBSCAN-SWA MKYSMLASGSKGNCCLVESQGVRIMIDCGTTKRYLKQSFESLALTFDDVDCVLITHDHGDHTSQLKHFAHHQIYCPSEIMFNHTKVEPYTPFHVGPFIITAVKTSHDADDSVGYIVDDGSRKLVYITDTGYIREQDFELIKDADYYILESNHDPELLMQTNRPYAIKRRILSDTGHLSNEEAGVLLSKVVSEKTKEILLAHLSSEANDEYLALSTVRELVDNEGIEFNVAKQFEIVIGGYQI >NZ_CP014861|193532:202380|200712_202380_+|WP_013853426.1|DBSCAN-SWA MSLDRWNELARDYSWIEEAMQTMDESTKHDAFYKSLEFGTAGMRGLLGIGPNRMNVYTVAKASVGFAKYLVETFKDQELKIAIAYDNRHMSKEFADVSAMVLSTYGIKSYIFSQPRPTPELSFAVRTLNCVGGIVITASHNPKEYNGYKVYDENGCQLVDHKIARVISLINEEPDETKVDINQGNRSMITYMEADFDETYKDAIHSIQLRPEEVKTLSVVFTSQHGTSYPLVPDILTNAGYNVIPVMEQSNYDPNFSNTKTPNPEEKASYDLAVEYAVKHDADLVLSCDPDADRMGIVVKHHDEYVYLTGNQGGSILQEYIYATRIEKETMPENPIMFNTVVTSDLGEKIAQSYGVNVEKTLTGFKYIGDSIENHNKVGDFNFVFGYEESYGYLLADFVRDKDALQACMMVAEAANYYKNHGLTLVDVLNGLYDRHGAYHETQVAITLSGQEGLNRIQEILTTFRESNIEAFAGIKVLYRDDYLTSSRSNGERLTLPKSNVIKYSLEDGSWIAIRPSGTEPKCKFYYCVVGKTIEESLLKFEALKKDINERAQLD >NZ_CP014861|193532:202380|196480_198016_+|WP_003774364.1|DBSCAN-SWA MKQHKELKLILITFIVSVLITYAIETVSANTSVVDLYKLTDTSTSIFPQESEGKSDKPIEVTKLYRDEKLVGIISDGSKLNKMFDKVYEEEYKAEFPDSKLGFIDDLILVKELSFNHYEDRDDEIFQYLYDEKLFAIEVNQVTFSNGAIIYVKNIDDFNKARDTFIRNFTDDKTFDAMKNNRKIESIKDYGTHDVNVEVEETVQISKGLTSKENILMNESDVLTFLSYGYNPKVEIYEVQPYDTIAGIAWHKGMDANQIKYINSDIIKDVNQVLEVGSKLRVSKFNSPFTVKITRERMTSEVVYPESTIYESDPELSEGKEVVDVVEQNGKRDVVYEDVIVNGAPKSSEEIRTQVTKEPIRGKVRYGTKVEPRIGSGNYRWPLDNANISCVYGNSCYYNHNGTDFVLNGGGFGPIYAVDRGVVSETVSGCFEGNYGCGSGWGNHIVIDHGNGYTTLYAHMATGPYFNVGDLVKRGDNIGYMGMTGTTYGPHVHLEFRYHGVRVDPCTVMGC >NZ_CP014861|193532:202380|200383_200650_+|WP_003774368.1|DBSCAN-SWA MKEITVTVIDPVGLHARPATVAVNAASKFKSEIKISYKGKAVNMKSIMGVMSLGIPTQSEIVISAEGEDQDDAIATIEEVLKAQKVIA >NZ_CP014861|193532:202380|198757_199861_+|WP_016357484.1|DBSCAN-SWA MRKDQGFKNTFIGILVILLAWNGFLTYQVYDLNNRPTVTEKTEDGKTVEKVVTEFETDPTKVVENVRDQVVSVLNVQSGQLAGSGSGVVYKNEGGKIHIITNNHVTEKGEQYYVQFSNGEKVEAKLLGADPFTDLALLQVETDSDVKPMKLGDSSVVKVGEFVLAIGSPVDLEFANSVTFGVISGKDRKVPVDLNGDRNPDWDMVVMQTDAAINPGNSGGALVNMNGELIGINSMKLSSAQVEGMGFSIPINEVVPIIKQIEETGKVQYPVIGISGVSVSEMNPFLKNYYKVPSDVNAGVFIAELTQNGPARKADIKEGDILTHINDKAISSYREFRRELYAHKVGDTVKLTINRNGEIHEVEVTLQ >NZ_CP014861|193532:202380|199857_200313_+|WP_003774367.1|DBSCAN-SWA MIKIIAIGKIKEKPMQALIQEYEKRLKPIHSVEMIELTNSNKSDVTSIIEDECQRILEKIDDRDYVVLMDLSGKDLDSVSMSEKIMDLIDMGKPITFIIGGSHGVNQSIRERSNYRWKISNLTFPHQLVRLMLYEQVYRFFMISKNHPYHK >NZ_CP014861|193532:202380|194904_196413_+|WP_003774363.1|DBSCAN-SWA MKKHKNLIMISVVFLFAIGLGYLYKSPTSASEIKTAYEAIDSSSAIFPQEVVTVNDKPVVITKLYREQKLVGVLKDSTRLQKMFDEVYENEYKEEFPDSKLGFIDDLIQVDEMSFNVYEDRDNDIFDYLYKENLFAIEANKVTFSNGAIIYVKNSEDFDSARDKFIQNFTSESTFDAIKNNKKIPAITDYGTKDIDVKVKETVKVTRGLATKDKILKDETEILTFLSYGYNPKVETYKIKPFDTLEGIAYHSGMNVNQIQSINADKIKDVNQVLEVGSELRVSKFDSPFTVTVTKQRMTTEPVYPEKTVYQSDPELAEGKEVVDVVEQNGARDVIYEDVYENGASISTKEISSKETKKPVRGVIRYGTKVEPKVGSGAWRWPLDNAYVLCGYGCYPNHSGTDFSTHGSGYGPIYAIDRGVVTTNSYDPGGWGNYIVIDHGNGYRSLYAHMASPGYFQAGQTVAKGENIGYVGMTGRTSYPHVHLEIIVGGGTRVDACGVIGC |
8 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
528331 : 541706
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014861|528331:541706|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014861|528331:541706|530997_538641_+|WP_062810423.1|DBSCAN-SWA MQVNDFKNIQEAIKYEVLQDEKEYLKLLKVIGNNQKYDFSSQLSIYNKEPEARACATFDMWKKYFGRVVMRGEKGIPILVGSDVNKKVSYIFDISQTTSMDRNINEVSLWQFDHENHKEALKEIIRDSSFEASDSLNENIFSLSRIYGDEYINLALADLRIDIEDRLSFEKFMRDSISYAVANRFNTVYPMDMENLKNNFSRINTISLEQIGLVISRVSEDIIDSTIEKSKEVDRARLLTERAGGDYNRDIENTNEDRGGQNDLYRRDDRSRSRDGRVFTDGSDRGNSNEDRRENLGHDGEGSGIYGEISESDLRSSKTVLPGRERGHGELEETSGNVRGENTFEPPEGNSDSGSGLYQERESQDDESTRIDREDDERESRGIPRTDEQLDGNSEENGNQGIRGSLENEISQEKEADEASFFDGKNTENRKDYWIVEFNENHELVPDYSGQIVTKELINVLRQKDINVKDHNQTLGENEFGEMTDDYIGYFKFYFDHYVDGEVVEHYRLDLGDGEEVNEREFSYLEEQVALSEEKSLQEEVKEKIEPKFKIGDQVRYKDKDFTITDFDELSGGLKTVTIRDNMEYMGGMIRGSEVIPYRNDSYLEEIFENLSQTPEKLAVKVGKEFILEDENTFDRINLIETGTYVEINGEEYPLYKGETFEESRKIDDLLDSGNYEIYNLSEHEKQIERQVEQESFIDDHNPEIDQMMDRYNVPREAAENLLRGKEDLKNLGYEPNKERLSFARNYDLKNHIYLEYLTPSERLDKNIKAIKMLKRLENENRSPREYEQAYLADYLGWGGLADVFDEEKGGQWLEARNILKENLTNEEYMNAKESTLTSFYTPREVMDGIYKTLTDMGFKTGNILEPSAGVGNFIGNMPSEMQSSKVYGVEKDSLSGRIARELYPEANIQIKGFEETNFSNNFFDLVIGNVPFGDFKVNDRKYNRNKFLIHDYFFAKSIDKVRNGGIIAFITSSGTMDKKDESVRKYINARCEFLGAMRLPNTTFKGLAGTEVTSDIILLKKRDSVIERDDDWIHLATDKNGLTYNKYFVDNPQMVLGNMKEVSGRFGNTITCDEKEDEKLKDLMDIASKEISSNSKYEEVELLEDEELSLPATDDVKNFSYTIIDEEVYLRENSVLIKQNISDKNKEKIKDYLDVMNALKDVIEKQKDDFSDEEIKESQAKLNEVYDNFSKKHGFINSLSNTRALKEDSNFPLVSSIEILDDEDNFKAKSDIFSKRTITKAKVVDHVDTSLEALVLSVSQKGYVDFEYMESITNKDRDTLIGELEGEIFLDIKDTDLINNRMPFENFDNDDPFHFSYVSADEYLSGNIREKIGYLNSYIGEIENVIDLAPSEKKDTLLNELGKLKYQREKLQEVMPEELTASDINVRLGATWIPQKDIEDFTFNLLKTPGYDRWNINIRFSPHTSEWNIEGKSVDSTNDLANMTYGTSRVNAYKLIENALNLKDTKVFDQVINDDGSKTSVLNKKETMLASQKQELIKEEFKNWIFEDPDRRYRLEKIYNEKFNSIRNREFDGSNLTFDGMNTEIRLREHQKNAIARTLYGGNTLLAHVVGAGKTFEMVASAMESKKLGLASKSLFVVPNHLTTQIGREFMQLYPSANIMVADKKDFQPKNRKRFIGRIATGEYDAVIIGHSQFEKIPMSKEYQVRHIQDQIDDIVSFIDENKRNRGENFTVKQLEKTKKKLLVRLEKLNDDFKKDDVITFEELGVDKLFIDEAHNYKNLFLHTKMRNVAGIGQSEAFKSSDMYMKCRYMDEMTNGKGVVFATGTPISNSMTELYTMQRYLQYDDLKARGLEHFDAWASTFGETENTFELSPEGTGYRQKTRFSKFYNLPELMSMFKEVADIKTSDMLNLPVPEANFEVIKTKPTEEQKEILEAISERADAVRNNQVEPTEDNMLKITNDGKKLALDQRLINPLLPDDPNSKVNVCVKNIFSIWDKTKENSSTQLVFSDMSTPKGDGEFNIYDDIRNKLVNMGIPKEEIAFIHEADTDKQKDELFSKVRRGEVRVLLGSTQKMGAGTNVQNKLIALHDLDVPWRPSDLEQRSGRIVRQGNENDKVNIFRYVTENTFDAYLWQTIENKQKFISQIMTSKTPVRVAEDVDEASLSYSEIKALATGNPLIKEKMDLDNEVTKLKMLEANYKSNKYKLEDKVNKIYPQSILKTEMEIQAVKEDIANVEKLGEGDSKFTSISLGTNKILDKKEAGEKLLEEIKKVKINDSKVIGKYRNLDLQVSFNFMTNTHTFKLLGKAEYFGELSNSTDGNITRLDNAIEKMPSRLERLNQNLENYKESLENAKVELTKPFEKADELRDKTLRLAEINKLLDMGEVEELENQSPLLEDLKRAIVDYSNYEFSESNSYEDFDKLYPHLSHIGLAYTETPDGKHSIQYEVNLEEKTWTQYVDNVAIRTESFVEEDISNSQAIKDMTEAIKMSSFDDLVAVDEEDLKQALGLEIDDDGNFYDPLAKDLDNDGIPDRYDNDFKDSDYFESTYDVEDNLHAREEKPSILGQISKFKSEEEKDKNQEKSEKGQER >NZ_CP014861|528331:541706|540842_541706_+|WP_002294505.1|DBSCAN-SWA MRSEKEMMDLVLSLAEQDERIRIVTLEGSRANINIPKDEFQDYDITYFVSDIEPFISNDDWLNQFGNIIMMQKPEDMELFPPEEKGFSYLMLFDDYNKIDLTLLPLEELDNYLKGDKLIKVLIDKDCRIKRDIVPTDIDYHVRKPSAREYDDCCNEFWNVTPYVIKGLCRKEILFAIDHLNQILRFELLRMMSWKVGIKTEFSLSVGKNYKYINKYIDEDLWNRLLSTYRMDSYENIWKSLFICHQLFREVSKEVAELLGFDYPEYGKNITRYTEDMYKKYVENDYF >NZ_CP014861|528331:541706|528331_530053_+|WP_062810421.1|DBSCAN-SWA MKLVIAEKPSVAVAIAKVIGARTRKNGYYEGNGYIVSWCVGHLIQMASPDKIDEKWKKWSIDTLPIIPEEYIYEVSKSTKKQYGVLKKLLNDKNIDTVINACDAGREGELIFRLVYNQAKCKKKIQRLWISSMENKAIEDGFRNLKSGENFEDLYRSASARAIADWLVGMNLSRLYSCIYKETYSVGRVQTPTLYLIAKRDSEINLFKKQKYYTVDLSYGELKLVSDRIDRIEVAEQLLNLLEDEIVITEVEDKEIRTKPDKPYDLTTLQREANKYFGYSANDTLNLAQGLYEKKLITYPRTDSRYLTDDMVTTMKELLGGLEDDFKINESNFKSIFNSSKVTDHYAIIPTISGIGKAKDLSDKESKIYNLIKDKLLASCSDNLKESSRKIRYEYDKFNFNASGKTVIDEGYTKYLKSYGKERQENELPDIKTGDKIKLTSKNISEKFTKAPSHYNEDTLLKAMESAGVESLDKDIEVERKGLGTPATRAGIIENLIHKDLIRRDKKNLLVTEKGNRLVSIVEDKFKSAETTSEWEMKLAKISSGEVDKEDFLREIEDSIRELVDRYKNNLNE >NZ_CP014861|528331:541706|530045_531011_+|WP_062810422.1|DBSCAN-SWA MNKVKILELFGGIGAIRKAFINLKIPYEVVDYVEIDKACVKSYNALYGEDYKSKSVVGYKAPNEKIDLIMHGSPCQDFSRIGKKQGGVKNSGTRSSLLFETIRIIKEMKEKPKWIIWENVKGVLDRNMRDSFFIYLKELENLGYESKYEILNAMDFGIPQKRERIFVVSYLGKNNFSFNKLEKKKTRLLSEFLEKNVSELYTMTQPYMLKFLNKGIDNSFRGRLKVIKDFSYTISTKQMRVPNSGIIDIGNGKYRYLTERECLRLMGFDDCDIDKLEEVHPRRKNCTSSKLYKQAGNSIVVDILMAIIKEIHRMEVGNASK >NZ_CP014861|528331:541706|539486_539696_+|WP_062810425.1|DBSCAN-SWA MGFSYNKLWKLLIDKNMKKTDLQCAIATTPKTIAKMGRDENVSLETLGKICEYFQCDIGDIIEYRRKND >NZ_CP014861|528331:541706|538684_539341_+|WP_062810424.1|DBSCAN-SWA MKYKDIRENLEEMMNDNYKDFIKALVSIEKGVNDEKALEEVYVLYMNNDTTGLLSDDFDYMIDDMKEQGKIVENVSDIEAKDDLINLVGNIAGQVENLERENANGEKFKVSNFSLVSKDNDGNKVYTNCSAYGDKTKDLENLKQGDFVKIFGQVKTSIDNNGKEHKNVRMLSSKLLKAKEQVKSQDKDKKSILGQIKSFKTDDKTKFNKKDHSKGAER >NZ_CP014861|528331:541706|539688_540810_+|WP_178085409.1|DBSCAN-SWA MTKENLDFINNNGEKVLQLNDDIFKNIYAPQMVEFYDKVEQKNNKIKLKYESKSLNMDRSITSKNIIGVSMFAGAGGLDIGAHLAGINIKYASDINEDCVKTLESNDIFDNSIKEAIDINDIDVSSIKKKLQDEDYDNIFFQKYSQMSRSQKGLAGAGEWETLKKMLPDFKGKRVLDLGCGYGWHCIYAMENGASSVVGVDISHKMLEVAKGKTHFPQIEYECCAIEDVDFPEESFDVILSSLAFHYVADYENLIKKIYRMLKAGGNLVFTVEHPVFTAHGTQDWYYNEKGEILHFPVDNYYYEGKRTAMFLEEKVTKYHRTLTTYLNTLLSNSFIINQIVEPQPPENMMDIPGMADEMRRPMMLIVSAKKKM |
7 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
545284 : 574464
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014861|545284:574464|DBSCAN-SWA 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32 | Streptococcus_phage(96.3%) | integrase | attL 534643:534658|attR 573121:573136 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1218560 : 1342536
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014861|1218560:1342536|DBSCAN-SWA 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117 | Erysipelothrix_phage(16.22%) | transposase,tRNA,holin,tail,integrase,bacteriocin,protease,terminase,portal,capsid | attL 1213383:1213399|attR 1338595:1338620 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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