Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012273 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1532 plasmid pL21532-4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP012270 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1532 plasmid pL21532-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP012272 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1532 plasmid pL21532-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP012274 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1532 plasmid pL21532-5, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP012269 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1532 chromosome, complete genome | 6 crisprs | csa3,RT,DEDDh,cas3,csn2,cas2,cas1,cas9,WYL,DinG | 0 | 7 | 21 | 0 |
| NZ_CP012271 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1532 plasmid pL21532-2, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
1. NZ_CP012269
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012269_1 | 362321-362469 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012269_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012269_1
>1.1|362371|49|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder TTTCGTAATCTATTGTCTATTTTGCTTTCGCAAAATCTTATCCTCATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012269_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012269_1 >merge|NZ_CP012269|1|362321-362469|CRISPRCasFinder CGGATGTCCATCCGTTATAACCGCTAAAGCGCTAAGCCGGACTGGCTCCTTTTCGTAATCTATTGTCTATTTTGCTTTCGCAAAATCTTATCCTCATTACGGATGTCCATCCGTTATAACCGCTAAAGCGCTAAGTCGGACTGGCTCCT >NZ_CP012269|1|1|362321-362469|CRISPRCasFinder CGGATGTCCATCCGTTATAACCGCTAAAGCGCTAAGCCGGACTGGCTCCT TTTCGTAATCTATTGTCTATTTTGCTTTCGCAAAATCTTATCCTCATTA CGGATGTCCATCCGTTATAACCGCTAAAGCGCTAAGTCGGACTGGCTCCT
>NZ_CP012269.1|WP_056986242.1|361117_362260_-|PIN/TRAM-domain-containing-protein MKKNIIKAVFALAGGGIGVILLPPLWVLVSLNKYWWLNNSVTNFLVGAIIFFIISLFLAGYIEKLVKRLERHIAAIPPVRLFYGSLSTVVGLVLAILISTLFYRQQTFFLNTVIPIILMLTFGYLGFRIGTTQADEWRKLFTWRKEPENAKNVLERKVDDNFHHYKILDTNILIDGRIYDLIKTGFIEGTLLVPNFVLYELQYIADSSDSIKRVRGRRGLDILNKLQNEHVMPVEMYEGDYDEIDEVDSKLIQLAKDKDAVIVTNDYNLNKVSQFQNVQVLNINALANALKPRVIPGENMHVMVVKNGTERQQGVAYLDDGTMVVVEEGKYFINQELDVVVTSALQTDAGRMIFAKPLHSTRGIADKKPDQKPDKKKSGK >NZ_CP012269.1|WP_046872021.1|359507_360995_-|glutamate--tRNA-ligase MAKSKIRVRYAPSPTGHLHIGNARTALFNYLFARHYKGKFIIRIEDTDTSRNIKDGERSQLENLKWLGLDWDEGPDKPGDYGPYRQSERKAIYLPLIQELIDKDLAYESYETEEELQAQREAQKARGEMPHYEYEYAGMTEDEKQAKIAESKAAGLEPVIRFRVPEHKTYAWDDIVKGKISFDSSTIGGDFVIQKRDGMPTYNFAVVVDDHKMEISHVFRGDDHVANTPKQLMIYEAFGWEPPKFGHMSLIINSETGKKLSKRDESVLQFIEQYRSLGYLPDAMMNFIVLLGWSPVGESEIFNQRELIKMYDEKRLSKSPAAFDGKKLEWINNQYVKAADEDRVMDSALKQLIKAGNIEKGASPERIEWARKLINLYKRQMSYTAQINDMADLFFNGPDEIDEEAKQEMAADTALPVLKAIYAKFEKMEIFDTVEILASIKAVQKETGVKGRALWMPIRIAITHEMHGPELPETIELLGQKTSMSHLKAMIDEMD >NZ_CP012269.1|WP_046872022.1|357941_359348_-|cysteine--tRNA-ligase MINLYNTMTRKKEPFQPITPGVVNMYVCGPTVYNYIHIGNARSIIAFDTVRRYFEYRGFKVNFVSNFTDVDDKMINTAKKEGTTVPKLAEKFIQAFMQDSKAINVEPATVNPRATQNVPEIVDFIQVLIDKGYAYASDGDVYYRTRKFANYGKLSGQNIDELEQGASEHINDEETARKEDPIDFALWKGAKADEISWDAPWGKGRPGWHIECSVMATKYLGDTIDIHAGGEDLEFPHHENEIAQSEAKTGKKFANYWMHNGFVTVGDENEKMSKSLGNFVTVHDIINEMDPQILRLFMATTQYRRPIQYTRENLEEAGNNLAKLQNAFANLNYRFQNSESGADAGTDKRVKELVEQFTTAMDDDFNVQNGIAVVYELAKVLNVYSEQATVKKETLELLKTTFVQLVSIFGIKLEEGQLEDETIKQLIVERDAARDNKDFKRSDEIRDQLKEQGINLEDTPQGTRWKRA >NZ_CP012269.1|WP_046872023.1|357518_357938_-|Mini-ribonuclease-3 MTENDTYKQLNGIALAYLGDAVYEVYIRRHLINKGLTKPTKLHHTATNFVSAKAQAALIDVMKEQDILTETEQDYFKRGRNSKSHTSAKNTSVLTYRISTGFEALMGYLSLSGQQERLDWLANWCITQVEEGKITHATK >NZ_CP012269.1|WP_062903837.1|356743_357532_-|23S-rRNA-(guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase-RlmB MPQNNYNQDQSSTDTNEGQGDFIIGRHSAVAALKSQQTINKVFIQENLKSDAIHDIVKLAEKRKLIVSIVPKRKLDHLADGENHQGVVLAIAAFEYATIDDVFQKAKDQDESPFILILDNIEDPHNLGSILRTADAAGVHGVIIPKHRAVGLTSTVAKTSAGAIEHVPVVRVVNLVNTVKELKKRGMWIFGTDMDGTDYRKWDAKGSIGLIIGNEGKGISPLLKKQVDETLTIPMVGQVQSLNASVAASLLIYQGFSTRHPL >NZ_CP012269.1|WP_046872025.1|355999_356596_-|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MSNFNRQVDEDREAELIKNSKMGDSASFEILFRQYCPIVIHIKDKYFLRTYDLDDWLQEGRIIFFNTLANYDTKRHITLGKYFQANFQNRVYSLIRREMAVKRRSDLFCNSLETMKTESGEYERLFMTKHGGPDELVVLKENCERYYSDLSRFEAQVFKYYYQGKHSVEIASLLHCEVPRVSNAVSRCRNKFAKRVSK >NZ_CP012269.1|WP_080945499.1|355726_355876_-|50S-ribosomal-protein-L33 MSQKQIALACSVCGSRNYTVAANPNRTTRLEVKKYCKHCNKHTIHRETR >NZ_CP012269.1|WP_046871044.1|355545_355713_-|preprotein-translocase-subunit-SecE MKFIKSVIQEMHEVTWPNARQLRKDSSSVIGLSVFFVAFFALVDWLIQLLLSSLK >NZ_CP012269.1|WP_046871045.1|354853_355402_-|transcription-termination/antitermination-protein-NusG METTEKNWYVLHTYSGYENKVKANLESRSLSMGMENNIFRVVVPEEEEHETKNGKDKVTMKKEFPGYVLVEMVMSDQAWYIVRNTPGVTGFVGSHGSGSKPSPLLPDEAERILRHLGMSVRHATIDVEVGETVKIVDGAFSGLTGKITEVDNKNMTLKVNINMFGRETSTELDMEQVDKLDS >NZ_CP012269.1|WP_046871046.1|354271_354697_-|50S-ribosomal-protein-L11 MAKKVANLVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGMLIPVVITVYEDRSFDFVTKTPPASVLLKKAAGVEHGSGEPNTNKVATVTKDQVKEIAETKMQDLNAANVESAMRMVEGTARSMGFDVKD >NZ_CP012269.1|WP_046872019.1|362604_363975_-|DNA-repair-protein-RadA MAKAKTQFVCQNCGYVSPRFLGRCPGCGQWNTLVEERVGAEKENHKARVSFEGKRAKPQILSEVDMSEAPRIKTGLKEFNRVLGGGIVPGSLVLIGGDPGIGKSTLMLQISGQLSETKRRVLYVSGEESAAQIKMRAERLHVASENFYLFPETDMTNIQDAIKEVKPSFVIIDSIQTMQEPDIQSAVGSVAQVREVTAELMQIAKTNNITIFIVGHVTKGGAIAGPKILEHMVDTVLYFEGDLHHTYRILRAAKNRFGSTNELGIFEMRESGLREVANPSEIFLEERLKDATGSAIVVSMEGTRPILVEIQALMTPTTYGNAKRTATGLDHNRVSLIMAVLEKRANFLLQNQDAYLKAAGGVKLDEPAIDLAIAISIASSYRNIGTDPMDAFVGEIGLTGEVRRVSRIEQRVAEAQKLGFKRIYIPKNNLQGWTPPTGIKVVGVATLSDALKRVFH >NZ_CP012269.1|WP_046872018.1|364061_364598_-|dUTP-diphosphatase MKRGFEVVSKDKEQALNLPYRSTTNAAGYDFEASKDFVLPSIWKANFLKVIWLLHHNKIVTEADLVSGSKDLKPFLVPTGIKAYMQNDEYLLLANRSSSPLKWNVILPNGVGIIDADYYNNESNEGEIYFQLINMGLRDITIKKGERIGQGIFMPYLQADGKDERAQVRKGGFGSSGM >NZ_CP012269.1|WP_052694540.1|364789_365134_+|N-acetyltransferase MKFTNDGKQIKFMHEDKLGGDVTYFSIRDDQTLVIEQVFVDPSLRGQGIAQQLMVEMLTYAKNQNKKIYPLCPYAQVYLTKHPEYQFLIDPQIPVDDQTKNSLQEMEQNNNGTK >NZ_CP012269.1|WP_046872017.1|365120_365807_+|ribose-5-phosphate-isomerase-RpiA MEQNELKKLVGQEAVKFIKDNMVVGLGTGSTVKFMVDALGERVKNENLHITGVPTSNRTAEQAKSLGISVKSVDEVDHIDLTIDGADEISADYQGIKGGGAAHLFEKIVATNSTKVMWIVDESKMVSTLGKFPLPLEVIPYGSKQVFKKLDAKGLHPKFRLDDSGNHVLTDSKNYVIDLHLGEIKHPHELADYLIKQVGIVEQGLFLDMVNTVIVGRQNGPEVIQARP >NZ_CP012269.1|WP_046872016.1|365860_367243_+|C1-family-peptidase MFIYQRLGVNILSNNSISKDQVARYAKNYNEQNKSKVLERAVTKNGILAASEGLRGGADFSPVFSIDLETGAVANQKQSGRCWMFAALNTMRHHLSEEFKIKDFELSQNYTFFWDKFEKSNWFYENVIATADKPTSDRKVSWLMNEPQGDGGQWDMLCAIIDKYGIVPESVYPETYNSNKSNEFNTLLNEKLRKDAVELRELVNDDKTSDEQVQSRKEKMLEEVYRMASYSFGEPPTSFDWEYRDDDKNFHREAGLTPKSFYEKFVGWDLKDYVSIINAPTDDKPFNHTYSIEMLGNVVGGRQVKHLNLTMHDFKQAAINQLKAGHSVWFGCDVGQHSEPRKRGLLDLGVYDEESLFDIDLSMSKAERLDYSESLMTHAMVITGVDLVDGEPKKWKVENSWGDKVGTKGYMVMTDDWMSEYCYQVVVDKQFLTEDQRKAQAEEPTQLLPWDPMGALAYKD >NZ_CP012269.1|WP_046872014.1|368540_369584_-|DMT-family-transporter MRKTVGYISFATLMFSLMEIALKLAGGAFDPIQLNLIRFAIGGLVLLPIALRALKKQHRRLNWQDLRLFGLTGFVCVIISMTLYQLAIVYSPAATVAVLFSCNPVFALIFSYLILHERLGRANIISVVISVIGLLVIVNPTHIKNVVGLTLAVTSALTFGLYSIISRYGSQKRDLNGIVMTCFTFLTGTVELFVIVMLTHVPAIGRAMGQVSFLKQFVNIPVIHNISWQYVPLLFFIGVCVTGGGFAFYFLAMETSDVSTASLVFFIKPALAPILAALILGETITVPTIVGIVIILLGSVVTFMGNRSKSVRSEMGKPVYPEKEQSETDDSLVDKVKGLNSNFEDED >NZ_CP012269.1|WP_056986256.1|369673_370627_-|AEC-family-transporter MTIFLHSIQGVVTIIVMIAVGYILSWRNWFDEGSSRLIAKLVTQIALPAYMISTITHDFTAKKLLSTLPDLRFPVLSMLILFALSMVLVRVLRIKEQHKGLFESMFLNSNTVFIGLPVNMALFGTSSLPYVLVYYMANTTIFWTLGVWLIQRDGTESHKFNLKTTLGKIFSPPLLGFIVGVFLVLLHIQLPQFILSDCQYIGGLTIPLSMFFIGIAIQRAGIKNMKLNRDSLGVLSGRFIFAPLLMTLLVLPMPVPLLMKQVFILQSAMPVMTNAPVVAKLYHADEQYAAIMVTETTLLSLIIIPLLMMFVKSGLIT >NZ_CP012269.1|WP_080945559.1|370808_371894_+|LCP-family-protein MKDTKKSHKKIWWTIGIILVLLIAGGAKAYSMYANAKDTVNSAYQKTKTPSTRNVSNVIKNKKPLNVLVLGTDTGALGRKTTGLSDTIMVASLNAQKETTYMTSIPRDTEVTIDGSTEKINSAYEIGGVSQSIKSVQTLLDVPVDFYVVMNMGGLEDLVNAVGGVNVTPPLTFKYGSANVKKGVKTHLTGKEALSYSRMRYDDPDGDYGRQKRQRQIILAIAKKALSISSVTRFQSILNSVKKNMKTNLTFNDMLALRFNYKNASHHIKSTTLKGDSQTINGLSYQVAPTSERRRVSNKIRKELGLKATTTLKESQESSNTADSSSSSASSDSNTSSSSAINSSSINSDPFSSASTPQTTP >NZ_CP012269.1|WP_062903838.1|371943_372723_-|carboxyltransferase MPEKNLEEKINLVRSPKRLTAHQLTSQLVTDFFEIHGDRQLGDDPAVTTGIGLFHQRPITIIGINRGTNIEQRREVNGGAVRVTGYRKALRVIKAAEKFNRPVISFINMPGADASVFSEQHGQSEAIADLIAKMGQLKVINIALFLGEGHSGGALAFSNANAILMLENALFSVASPEAVQAILKNRDETRDASEFLPMTAQQLKKIGLTDSIISETPAGSLVQRINDELMKTMKRFEKLDGEQLRQQRRVKFEKVLKLN >NZ_CP012269.1|WP_062903839.1|372715_373513_-|acetyl-CoA-carboxyl-transferase MSHMPENNSWQACRYCGKHVHKLQWHPNYRCPFCGQLQRLTIKQRLRITIDADSWQSFETVGTSTDFLDFPGYTEKLKRAQDKTGEAEAMCAGTAKIGGFPVVIGVMDSHFMMGTLNTTIGAVIKQVMAESVARKLPLILFVASGGARMQEGIFSLLQMNTILNQWSQLEDSKNLVVNILTDPTMGGVSASFGFKADYVLAEDHAQIGFAGKRVIAQTTHEQLSDTFQTAEDLLAHGLVDQVIQREKVRSQLITLLRIHFGGNHA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012269_2 | 645297-645729 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012269_2
|
6 spacers
spacers of NZ_CP012269_2
>2.1|645333|30|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder,CRT ATGTGTATACAGTCAAGCTTTTTTACATTA >2.2|645399|30|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder,CRT TGCCCTCAAAAACGTTAGCCAACGCCACAC >2.3|645465|30|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder,CRT CATGAGTGGTACTTAACCGACGACGACCGG >2.4|645531|30|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder,CRT AAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAACGG >2.5|645597|30|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder,CRT ACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGATTGT >2.6|645663|30|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder,CRT TGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACCCCG >2.7|645531|27|NZ_CP012269|PILER-CR AAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAA >2.8|645597|27|NZ_CP012269|PILER-CR ACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGAT >2.9|645663|27|NZ_CP012269|PILER-CR TGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACC |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012269_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012269_2 >merge|NZ_CP012269|2|645297-645729|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACATGTGTATACAGTCAAGCTTTTTTACATTAGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTGCCCTCAAAAACGTTAGCCAACGCCACACGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACCATGAGTGGTACTTAACCGACGACGACCGGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACAAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAACGGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGATTGTGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACCCCGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACT >NZ_CP012269|2|2|645297-645729|CRISPRCasFinder TTCCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ATGTGTATACAGTCAAGCTTTTTTACATTA GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGCCCTCAAAAACGTTAGCCAACGCCACAC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC CATGAGTGGTACTTAACCGACGACGACCGG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC AAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAACGG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGATTGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACCCCG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACT >NZ_CP012269|2|1|645297-645728|CRT TTCCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ATGTGTATACAGTCAAGCTTTTTTACATTA GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGCCCTCAAAAACGTTAGCCAACGCCACAC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC CATGAGTGGTACTTAACCGACGACGACCGG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC AAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAACGG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGATTGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACCCCG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC >NZ_CP012269|2|1|645492-645728|PILER-CR CGGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC AAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAA CGGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGAT TGTGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACC CCGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
>NZ_CP012269.1|WP_046872502.1|644705_645167_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MQVTVKSFSELSNTELFKIYKLRTQVFVVEQLCAYQEVDDEDLIAQHLQFTNEAQQLVAYLRIIPETNETIVHIGRVVVNPLFRKQGYGRKLITSGLETIKKDMPKVTTVKIQAQAYLRSFYQSFGFKPVSDVYLDTGIPHLDMILELQGNKK >NZ_CP012269.1|WP_046872501.1|644139_644613_-|CinA-family-protein MDEKLVNYVINTLIEENLSITAAESLTGGLFQSEITTVPGSSAVFSGGFVTYADEVKTQLLSVPKELIQQYGVVSYEVAVAMAQGAQKVLKTDLAISFTGAAGPTGLEGEDAGTAWIGITFHGQTDAYDLRKPELERNAFREACCQFAFQKISDLLV >NZ_CP012269.1|WP_063510373.1|643183_643999_-|DUF1275-domain-containing-protein MRRHVYPAYQQLYFGAFLAAIAGGLDAYTYLQHGGVFAGLQTGNLILLGVSLSKGQFVKVGYYLIAIIAFGLGTIFIRHMQHFFKQNYLKRAYFVLGYEFVLMVLVAMISQRAPDVITVMLLAITAAAQLQEFRKLQDGPFTSLMMTGNIRTTAENLYTGYVHHDVTAQQKATDTGIVIGSFAAGAFLSGIFVPWLKDAAILVPAVLVLGAVFYLAQHSKSTPNRKDPQSDSNEKAWSETTRASVHPHTSEDDTKTDSEPETRSSRRRRKL >NZ_CP012269.1|WP_046872091.1|641784_642696_+|LysR-family-transcriptional-regulator MTIDDLKDFVTLYQTRNVSDAAVELMMTQSALSKRIQAMENELATKLISTKNKRHLVITESGEVFFRYAKTILTQYGLLTNELAEYRELKKGTLHIGSVPVMSQYGLMEKTSQFMADYPQINIRLEELEGEELLEMLQTKQLDLGILRNMQSQLLNKSQFQFIDIDQDELKIILPITHPLAKQKRISMNNLRDIEVVSLNPGSGIYEQVGNLYQQAGFTPNIRFTSTHIETLLGIIAKSERVTFLFEKSAEPFMTDQFVSRSFETPIYNKLQLVYPQGELTQAGRRFVGYMEVSGTKRLKHKN >NZ_CP012269.1|WP_046872092.1|640161_641637_-|UbiD-family-decarboxylase MAKKDVYDLRKVLDELKKEPGQYHETNVEVDPDAELSGVYRYIGAGGTVQRPTQEGPAMMFNNVKGFPHTRVLMGLMASRKRVGKMFHHDYHTLGQFLNDSVENPVDPVMVKEADAPTHEVVHKATDPDFDIRKLVAAPTNTPQDAGPYITVGVVYGSNPDKTMSDVTIHRMVLEDKDKLGIYIMPGGRHIGKFAEEYEKMNKPMPITINIGLDPAVTIGATFEPPTTPLGYNELGVAGAIRQEPVQLVDGLTVDEKAIARSEYTLEGYIMPNERIQEDINTHTGKAMPEFPGYDGDANPALQVIKVTAVTHRKDPIMQSVIGPSEEHVSMAGIPTEASILSLTNRAIPGKVLNVYNPPAGGGKLMTIMQIRKENKADEGIQRQAALLAFSSFKELKTVFLVDEDVDIFDMNDVVWTINTRFQADQDIVVLPGMRNHPLDPSERPEYDPKSIRTRGMSSKLIIDGTVPFDMKDQFERAQFKEVKDWKKYLE >NZ_CP012269.1|WP_056985954.1|639578_640139_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MKKIIVGITGASGTVYAIDLLEKLHQLDDVEVHLVMSQWAKKNLELETDYSLQQIKALADKTYNVNDQGATIASGSFLNDGMVIVPASMKTVATIAYGIGDNLIARAADVTIKEQRKLVIVPRETPLSVIHLENLTKLAKIGAQIIPPMPAFYNHPKTIQDLVNHQTMKVLDAFGIPNEVDERWKE >NZ_CP012269.1|WP_056985953.1|637912_639256_-|MFS-transporter MGILVETSLNVTMNTLSNQFGVSVGTVQWITTAYLLLVTIMMAAMAFIMRRFKFRSIFIFSAAAFIVGSIVCAIADSFWILLIGRMIQAIATGLATPLMFQIINVKIPRQHVGTYNGVASMLTSLSPALGPTYGGILNTLMNWRWIFWVVLPLSVIVLIMGMINIDIPVQHKRGEKLSFDSIGMVWLSLVLIGFVWTFNEAGLAGWTSAAFWISLVISILLLLSYAWYNSKSSKEVLDFSLLKKKSVFLHLINYFVLAFVNIGISWLLPMVAEVNLHQTSMVAGLLVLPGALIGAIISPSTGAIMDKKGAFLPLMIGNICLLASVVLFFFLNDVMTSMILLILFVILRVGVAFSFGNVMGAASQQVVPEKRGDINSLFNMMQQYAGAMGTVILASVISSLELHGGSTFSQVRQGSKIDYVILSVLALVALITVIINKSTRNHMTKNN >NZ_CP012269.1|WP_046870605.1|637229_637691_-|universal-stress-protein MQVDKLKEPLVFHRVLLTVDADDPNSSTRAFQYATTMAHDYQVELCIVSVLEDDDISIFDVMTPGKVDKKEDVVRQAVEDYTTIAEELGVKHVTGLTVGASDVDDVILDKVIPRFKPDLIVCGSDTEDSKHRVPGAVGLRIAKRAQVSVIVVR >NZ_CP012269.1|WP_062903915.1|635815_637186_-|Nramp-family-divalent-metal-transporter MAKNSNEEKHHIISSTDGANKSLDEINGSVSVPQNAGVFKTFLAYLGPGVLVSVGYMDPGNWITSISGGTQFKYRLLSVVLISSLIAMLLQAMAARLGIVTGRDLAQLTREKTSKFGGTVLFIITELAIMATDVAEIIGSAIALELLFGFPLIVGIIITTFDVLLLMLLMKLGFRKIEAIVATLVAVILFVFLYEVILAQPNMPEVLKGFAPGKDLIQNKSMLYIGLGIVGATVMPHNLYLGSSISQTRNFDRNDHKSIRSAIRYTVADSNMQLTVAFVVNCLLLILGAALFFGTNSDLGRFVDLYNALGDSKIVGAIASPVLSTLFAVALLSSGQSSTITGTLSGQIIMEGFIRLKMPMWAQRLVTRLVSVLPVLAFAIYYHGNEAKIENLLTFSQVFLSIALPFAMIPLILFTSSKKIMGEFANRPWVKVCAWIAAVVLVILNVWLIITTVSAL >NZ_CP012269.1|WP_046870607.1|633490_635239_-|pyruvate-oxidase MSKTINAGIAMMKVIEDWDVKQVYGIPGGSINSTMEALRVEQDKIDYVQVRHEEVGAFAAAAHAKLTGKIGVCFGSAGPGATHLFNGLYDAQMDHAPVLAIIGQVGTSDMNWDSFQEMNENPMFADVSVYNRTVMTADSLPHVIDEAIRRAYKENGVAVVTIPNDFGTKDIPADFWSSGHSYVKPLLPQPDEEKIKAALKLISEAKHPVIFAGIGVNGATEELVTLSKHLKLPVVMSAISKGMIPDDFEGNMGSAYRVSTKPGNETLEQADLIMMIGADFPFARTKGMFNPDAKFIQVDIDSSKIGKRHNVDVPILSDAKQAMKQLVALSDEVAHRRFYDACVANRKNWRAYLQQLADKTTSPLGVGSVFKQINRISTGNDVFAIDVGDVTMNSLRFLNMNEKQKFTTSALFATMGYGMGAAIAGKLTYPDRQVFNLTGDGAFAMVMQDLLTQVKEKLHIINVVFSNESFDFIKDEQEDEKQKYFGVDLQGADFAMIAHGMGALGISVHTYDEMVAAFDTAKQVEGPVVIDVKIHNNRPLPAEKLQLDPATNSAAEIAAFKKRYDADILQPFSVYLNEFEVE >NZ_CP012269.1|WP_017866964.1|645817_646075_+|transposase MTKKKYSVDFRKMIVKLYQDGAPVADLTDEYGVSNVTIYKWINLYKEDKGSGISKSDVLALQKRLKQLESENDILKKALTIFAKK >NZ_CP012269.1|WP_145912924.1|646059_646944_+|IS3-family-transposase MRQKVNPDDWQTAVDINLKHHSIKETCKVLSVPRSTYYEHQQNHVSPQAKRRKTLSQSIKRIYFNSRRIYGAPKILKALQKEGKTASIKLVQRLMRQMGLKSITRKKWHYQQTNDIDATNYSNILAQDFRTTSPNQKWCADITYIHTKANGWCYLSSIQDLYSRKIIAHKISRHMTADLVISTFQQAFETRKTTNNLIVHTDLGSQYRSAGFEQILAQHHIRHSYSKRGCPYDNSCLESFHASLKKEEVYQHHYQDFEEANAAIFSYIESFYNSSRIHSSIDYLTPNEKEKLVA >NZ_CP012269.1|WP_046871852.1|647721_648327_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNITYYPFKPIIINTTKPTLIETSNQKVYTDLISGLKGYSDVIKISDDDFKLVECERAVKWVGDAFVEADLNKMFQGQLQKKIVSKLDDDTRLQLTDLNNKLKSLIFDATFSLDLPLKVDSEFDPVKLVKYCNVGFVSALNRDPYDIIETVLKTASELKETKILILTNVRNYLSVSQFNELVSLISTLDLNILFIEFSDNR >NZ_CP012269.1|WP_062903916.1|648323_648629_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMVMFDLPVETSEDRRNYRKFRKALLNEGFLMVQYSIYVRVCVDKKSANLMEKRIATFSPANGLIQSLMVTEKQYNSMNFIVEESKQDVRNSADRTIII >NZ_CP012269.1|WP_062903917.1|648606_649509_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRTVVVTQHAKISYSGHCVVVQTQDSTNQIPVSDIQILLISTTRAVITSAVISELAKHQSKVIFTDNSGEPVTETMDYYPNNRDPQLLQTQFNWNEERKTSLWTKIIVQKITNQIYVTEALGINAQDLKDELAKLEINDVTNREAVVARKYFSLLFESESSRRNFSPINAALNYGYAIILSAVNLEIAANGYLTQLGVHHHSQENDFNLGSDLMEPFRPIVDWWVKQKKFNDFTPDIKFGLVDLLNLKMKYNGQNTILRNAITKHVDNCLKYLSGEIDKIKIEVEISEVSNNAINGHV >NZ_CP012269.1|WP_062903918.1|649725_653862_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTNEKYSIGLDIGTSSIGFAVVNDNNRVIRVKGKNAIGVRLFDEGKAAADRRSFRTTRRRLSRRRWRLKLLREIFDAYITPVDEAFFIRLKESNLSPKDSKKQYSGDILFNDRSDKDFYEKYPTIYHLRNALMTEHRKFDVREIYLAIHHIMKFRGHFLNATPANNFKVGRLNLEEKFEELNDIYQRVFPDESIEFRTDNLEQIKEVLLDNKRSRADRQHTLVSDIYQSSEDKDIEKRNKAVATEILKASLGNKAKLNVITNVEVDKEAAKEWSITFDSESIDDDLAKIEGQMTDDGHEIIEVLRSLYSGITLSAIVPENHTLSQSMVAKYDLHKDHLKLFKKLINGMTDTKKAKNLRAAYDGYIDGVKGKVLPQEDFYKQVQVNLDDSAEANEIQTYIDQDIFMPKQRTKANGSIPHQLQQQELDQIIENQKAYYPWLAELNPNPDKKRQQLAKYKLDELVTFRVPYYVGPMITAKDQKNQSGAEFAWMIRKEPGNITPWNFDQKVDRMATANQFIKRMTTTDTYLLGEDVLPAQSLLYQKFEVLNELNKIRIDHKPISIEQKQQIFNDLFKQFKNVTIKHLQDYLVSQGQYSKRPLIEGLADEKRFNSSLSTYSDLCGIFGAKLVEENDRQEDLEKIIEWSTIFEDKKIYRAKLNDLTWLTDDQKEKLATKRYQGWGRLSRKLLVGLKNSEHRNIMDILWITNENFMQIQAEPDFAKLVTDANKGMLEKTDSQDVINDLYTSPQNKKAIRQILLVVHDIQNAMHGQAPAKIHVEFARGEERNPRRSVQRQRQVEAAYEKVSNELVSAKVRQEFKEAINNKRDFKDRLFLYFMQGGIDIYTGKQLNIDQLSSYQIDHILPQAFVKDDSLTNRVLTNENQVKADSVPIDIFGKKMLSVWGRMKDQGLISKGKYRNLTMNPENISAHTENGFINRQLVETRQVIKLAVNILADEYGDSTQIISVKADLSHQMREDFELLKNRDVNDYHHAFDAYLAAFIGNYLLKRYPKLESYFVYGDFKKFTQKETKMRRFNFIYDLKHCDQVVNKETGEILWTKDEDIKYIRHLFAYKKILVSHEVREKRGALYNQTIYKAKDDKGSGQGSKKLIRIKDDKETKIYGGYSGKSLAYMTIVQITKKNKVSYRVIGIPTLALARLNKLENDSTENNGELYKIIKPQFTHYKVDKKNGEIIETTDDFKIVVSKVRFQQLIDDAGQFFMLASDTYKNNAQQLVISNNALKAINNTNITDCPRDDLERLDNLRLDSAFDEIVKKMDKYFSAYDANNFREKIRNSNLIFYQLPVEDQWENNKITELGKRTVLTRILQGLHANATTTDMSIFKIKTPFGQLRQRSGISLSENAQLIYQSPTGLFERRVQLNKIK >NZ_CP012269.1|WP_046871856.1|654056_654569_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MKISVPTSNGLLLDKYSKHAAPEQIYNGNPSISFPIDIQDVPDNATTLALTLLDFDAVPVCGFPWIHWTAVNIPADKSVTIPENASQSNVIDFIQGNNSTAGSLIGATDPLTTRHYIGPTPPDKNHDYWLSIYALDTTLSLQNGFWLNEFYHAAKGHIISKQRLSIISRA >NZ_CP012269.1|WP_062903919.1|654784_655030_+|hypothetical-protein MLLNSKNLSVLEVQVLGIYQAKIEIKTISGKCLFVYPTQTQKDDPLFWQSLKDIIKAKLWLPINKTLNQLIDSDWLVPLNT >NZ_CP012269.1|WP_046871858.1|655087_655570_-|winged-helix-DNA-binding-protein MDEKQYQTITQLLKQLSATENHNQHEAWIAKQAAIKENPQKNHLTHNDLDILGVLLQGEKTVSEVVEAVQITQGGTSRRINHLEKLDLLEKFKRPTNKKTVYLKLTADGQKLATAHIALHKHLHEETVQALAEFSDSELAVVTRFLRKLADAQKDFETRY >NZ_CP012269.1|WP_062903920.1|655687_656689_+|zinc-binding-alcohol-dehydrogenase-family-protein MKALIIKDFKTAPMIDLNVPTPVADTKFDTLIDVLAAPIENFDKANATGRHYSSTYWHPAFPSIPGASGIGRRVDNGKLVAFPARTLKPRFGSFAEQTVANSKLLFEIPEDTDIYSSTAAASSLTTSIAPLQFSLEMKPGNTVLINGATGFAGQLAIQAAKALGAAEIIGTGRNPERLAALKDLGATQTISLADDDETILNNLSNMKIKGDLIILDYLWGHPIELILKSIVPTSLEMKRATSLVSIGAVAGQNITLPSTALRTSGLQIIGMQTPKVMQNQQAVYQAVWKLLGTGKIKTTVKTISLEDAAKNIDWQKPVPSGVRTVIKVSEIKR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012269_3 | 646994-647624 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012269_3
|
9 spacers
spacers of NZ_CP012269_3
>3.1|647030|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAAGGGTAATACATTAATTGTAGGTGAA >3.2|647096|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGCGTAGGCAATGTAAACCCTGTAATACA >3.3|647162|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTATGTTCAAGGCCAAACCCAAACGGGC >3.4|647228|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGAGAATGAGCCATACATGAACGTCCAT >3.5|647294|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTGGGCCAGAATCAATTTGGTCTTGCGT >3.6|647360|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTG >3.7|647426|31|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGT >3.8|647493|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGTCAGCGTTAAACGGCACTGGTATCAC >3.9|647559|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCACTCGTAGGATTACAAACGATACCT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012269_3
The CRISPR arrays of NZ_CP012269_3 >merge|NZ_CP012269|3|646994-647624|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTTAAAGGGTAATACATTAATTGTAGGTGAAGCTTTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACCCGCGTAGGCAATGTAAACCCTGTAATACAGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACGATTATGTTCAAGGCCAAACCCAAACGGGCGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTTTGAGAATGAGCCATACATGAACGTCCATGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTGCTGGGCCAGAATCAATTTGGTCTTGCGTGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACGCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGTGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACGATGTCAGCGTTAAACGGCACTGGTATCACGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACATTGCACTCGTAGGATTACAAACGATACCTGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC >NZ_CP012269|3|2|646994-647624|PILER-CR GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTAAAGGGTAATACATTAATTGTAGGTGAA GCTTTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC CCGCGTAGGCAATGTAAACCCTGTAATACA GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATTATGTTCAAGGCCAAACCCAAACGGGC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTGAGAATGAGCCATACATGAACGTCCAT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGCTGGGCCAGAATCAATTTGGTCTTGCGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATGTCAGCGTTAAACGGCACTGGTATCAC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ATTGCACTCGTAGGATTACAAACGATACCT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC >NZ_CP012269|3|3|646994-647624|CRISPRCasFinder GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTAAAGGGTAATACATTAATTGTAGGTGAA GCTTTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC CCGCGTAGGCAATGTAAACCCTGTAATACA GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATTATGTTCAAGGCCAAACCCAAACGGGC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTGAGAATGAGCCATACATGAACGTCCAT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGCTGGGCCAGAATCAATTTGGTCTTGCGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATGTCAGCGTTAAACGGCACTGGTATCAC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ATTGCACTCGTAGGATTACAAACGATACCT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC >NZ_CP012269|3|2|646994-647624|CRT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTAAAGGGTAATACATTAATTGTAGGTGAA GCTTTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC CCGCGTAGGCAATGTAAACCCTGTAATACA GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATTATGTTCAAGGCCAAACCCAAACGGGC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTGAGAATGAGCCATACATGAACGTCCAT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGCTGGGCCAGAATCAATTTGGTCTTGCGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATGTCAGCGTTAAACGGCACTGGTATCAC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ATTGCACTCGTAGGATTACAAACGATACCT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
>NZ_CP012269.1|WP_145912924.1|646059_646944_+|IS3-family-transposase MRQKVNPDDWQTAVDINLKHHSIKETCKVLSVPRSTYYEHQQNHVSPQAKRRKTLSQSIKRIYFNSRRIYGAPKILKALQKEGKTASIKLVQRLMRQMGLKSITRKKWHYQQTNDIDATNYSNILAQDFRTTSPNQKWCADITYIHTKANGWCYLSSIQDLYSRKIIAHKISRHMTADLVISTFQQAFETRKTTNNLIVHTDLGSQYRSAGFEQILAQHHIRHSYSKRGCPYDNSCLESFHASLKKEEVYQHHYQDFEEANAAIFSYIESFYNSSRIHSSIDYLTPNEKEKLVA >NZ_CP012269.1|WP_017866964.1|645817_646075_+|transposase MTKKKYSVDFRKMIVKLYQDGAPVADLTDEYGVSNVTIYKWINLYKEDKGSGISKSDVLALQKRLKQLESENDILKKALTIFAKK >NZ_CP012269.1|WP_046872502.1|644705_645167_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MQVTVKSFSELSNTELFKIYKLRTQVFVVEQLCAYQEVDDEDLIAQHLQFTNEAQQLVAYLRIIPETNETIVHIGRVVVNPLFRKQGYGRKLITSGLETIKKDMPKVTTVKIQAQAYLRSFYQSFGFKPVSDVYLDTGIPHLDMILELQGNKK >NZ_CP012269.1|WP_046872501.1|644139_644613_-|CinA-family-protein MDEKLVNYVINTLIEENLSITAAESLTGGLFQSEITTVPGSSAVFSGGFVTYADEVKTQLLSVPKELIQQYGVVSYEVAVAMAQGAQKVLKTDLAISFTGAAGPTGLEGEDAGTAWIGITFHGQTDAYDLRKPELERNAFREACCQFAFQKISDLLV >NZ_CP012269.1|WP_063510373.1|643183_643999_-|DUF1275-domain-containing-protein MRRHVYPAYQQLYFGAFLAAIAGGLDAYTYLQHGGVFAGLQTGNLILLGVSLSKGQFVKVGYYLIAIIAFGLGTIFIRHMQHFFKQNYLKRAYFVLGYEFVLMVLVAMISQRAPDVITVMLLAITAAAQLQEFRKLQDGPFTSLMMTGNIRTTAENLYTGYVHHDVTAQQKATDTGIVIGSFAAGAFLSGIFVPWLKDAAILVPAVLVLGAVFYLAQHSKSTPNRKDPQSDSNEKAWSETTRASVHPHTSEDDTKTDSEPETRSSRRRRKL >NZ_CP012269.1|WP_046872091.1|641784_642696_+|LysR-family-transcriptional-regulator MTIDDLKDFVTLYQTRNVSDAAVELMMTQSALSKRIQAMENELATKLISTKNKRHLVITESGEVFFRYAKTILTQYGLLTNELAEYRELKKGTLHIGSVPVMSQYGLMEKTSQFMADYPQINIRLEELEGEELLEMLQTKQLDLGILRNMQSQLLNKSQFQFIDIDQDELKIILPITHPLAKQKRISMNNLRDIEVVSLNPGSGIYEQVGNLYQQAGFTPNIRFTSTHIETLLGIIAKSERVTFLFEKSAEPFMTDQFVSRSFETPIYNKLQLVYPQGELTQAGRRFVGYMEVSGTKRLKHKN >NZ_CP012269.1|WP_046872092.1|640161_641637_-|UbiD-family-decarboxylase MAKKDVYDLRKVLDELKKEPGQYHETNVEVDPDAELSGVYRYIGAGGTVQRPTQEGPAMMFNNVKGFPHTRVLMGLMASRKRVGKMFHHDYHTLGQFLNDSVENPVDPVMVKEADAPTHEVVHKATDPDFDIRKLVAAPTNTPQDAGPYITVGVVYGSNPDKTMSDVTIHRMVLEDKDKLGIYIMPGGRHIGKFAEEYEKMNKPMPITINIGLDPAVTIGATFEPPTTPLGYNELGVAGAIRQEPVQLVDGLTVDEKAIARSEYTLEGYIMPNERIQEDINTHTGKAMPEFPGYDGDANPALQVIKVTAVTHRKDPIMQSVIGPSEEHVSMAGIPTEASILSLTNRAIPGKVLNVYNPPAGGGKLMTIMQIRKENKADEGIQRQAALLAFSSFKELKTVFLVDEDVDIFDMNDVVWTINTRFQADQDIVVLPGMRNHPLDPSERPEYDPKSIRTRGMSSKLIIDGTVPFDMKDQFERAQFKEVKDWKKYLE >NZ_CP012269.1|WP_056985954.1|639578_640139_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MKKIIVGITGASGTVYAIDLLEKLHQLDDVEVHLVMSQWAKKNLELETDYSLQQIKALADKTYNVNDQGATIASGSFLNDGMVIVPASMKTVATIAYGIGDNLIARAADVTIKEQRKLVIVPRETPLSVIHLENLTKLAKIGAQIIPPMPAFYNHPKTIQDLVNHQTMKVLDAFGIPNEVDERWKE >NZ_CP012269.1|WP_056985953.1|637912_639256_-|MFS-transporter MGILVETSLNVTMNTLSNQFGVSVGTVQWITTAYLLLVTIMMAAMAFIMRRFKFRSIFIFSAAAFIVGSIVCAIADSFWILLIGRMIQAIATGLATPLMFQIINVKIPRQHVGTYNGVASMLTSLSPALGPTYGGILNTLMNWRWIFWVVLPLSVIVLIMGMINIDIPVQHKRGEKLSFDSIGMVWLSLVLIGFVWTFNEAGLAGWTSAAFWISLVISILLLLSYAWYNSKSSKEVLDFSLLKKKSVFLHLINYFVLAFVNIGISWLLPMVAEVNLHQTSMVAGLLVLPGALIGAIISPSTGAIMDKKGAFLPLMIGNICLLASVVLFFFLNDVMTSMILLILFVILRVGVAFSFGNVMGAASQQVVPEKRGDINSLFNMMQQYAGAMGTVILASVISSLELHGGSTFSQVRQGSKIDYVILSVLALVALITVIINKSTRNHMTKNN >NZ_CP012269.1|WP_046870605.1|637229_637691_-|universal-stress-protein MQVDKLKEPLVFHRVLLTVDADDPNSSTRAFQYATTMAHDYQVELCIVSVLEDDDISIFDVMTPGKVDKKEDVVRQAVEDYTTIAEELGVKHVTGLTVGASDVDDVILDKVIPRFKPDLIVCGSDTEDSKHRVPGAVGLRIAKRAQVSVIVVR >NZ_CP012269.1|WP_046871852.1|647721_648327_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNITYYPFKPIIINTTKPTLIETSNQKVYTDLISGLKGYSDVIKISDDDFKLVECERAVKWVGDAFVEADLNKMFQGQLQKKIVSKLDDDTRLQLTDLNNKLKSLIFDATFSLDLPLKVDSEFDPVKLVKYCNVGFVSALNRDPYDIIETVLKTASELKETKILILTNVRNYLSVSQFNELVSLISTLDLNILFIEFSDNR >NZ_CP012269.1|WP_062903916.1|648323_648629_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMVMFDLPVETSEDRRNYRKFRKALLNEGFLMVQYSIYVRVCVDKKSANLMEKRIATFSPANGLIQSLMVTEKQYNSMNFIVEESKQDVRNSADRTIII >NZ_CP012269.1|WP_062903917.1|648606_649509_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRTVVVTQHAKISYSGHCVVVQTQDSTNQIPVSDIQILLISTTRAVITSAVISELAKHQSKVIFTDNSGEPVTETMDYYPNNRDPQLLQTQFNWNEERKTSLWTKIIVQKITNQIYVTEALGINAQDLKDELAKLEINDVTNREAVVARKYFSLLFESESSRRNFSPINAALNYGYAIILSAVNLEIAANGYLTQLGVHHHSQENDFNLGSDLMEPFRPIVDWWVKQKKFNDFTPDIKFGLVDLLNLKMKYNGQNTILRNAITKHVDNCLKYLSGEIDKIKIEVEISEVSNNAINGHV >NZ_CP012269.1|WP_062903918.1|649725_653862_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTNEKYSIGLDIGTSSIGFAVVNDNNRVIRVKGKNAIGVRLFDEGKAAADRRSFRTTRRRLSRRRWRLKLLREIFDAYITPVDEAFFIRLKESNLSPKDSKKQYSGDILFNDRSDKDFYEKYPTIYHLRNALMTEHRKFDVREIYLAIHHIMKFRGHFLNATPANNFKVGRLNLEEKFEELNDIYQRVFPDESIEFRTDNLEQIKEVLLDNKRSRADRQHTLVSDIYQSSEDKDIEKRNKAVATEILKASLGNKAKLNVITNVEVDKEAAKEWSITFDSESIDDDLAKIEGQMTDDGHEIIEVLRSLYSGITLSAIVPENHTLSQSMVAKYDLHKDHLKLFKKLINGMTDTKKAKNLRAAYDGYIDGVKGKVLPQEDFYKQVQVNLDDSAEANEIQTYIDQDIFMPKQRTKANGSIPHQLQQQELDQIIENQKAYYPWLAELNPNPDKKRQQLAKYKLDELVTFRVPYYVGPMITAKDQKNQSGAEFAWMIRKEPGNITPWNFDQKVDRMATANQFIKRMTTTDTYLLGEDVLPAQSLLYQKFEVLNELNKIRIDHKPISIEQKQQIFNDLFKQFKNVTIKHLQDYLVSQGQYSKRPLIEGLADEKRFNSSLSTYSDLCGIFGAKLVEENDRQEDLEKIIEWSTIFEDKKIYRAKLNDLTWLTDDQKEKLATKRYQGWGRLSRKLLVGLKNSEHRNIMDILWITNENFMQIQAEPDFAKLVTDANKGMLEKTDSQDVINDLYTSPQNKKAIRQILLVVHDIQNAMHGQAPAKIHVEFARGEERNPRRSVQRQRQVEAAYEKVSNELVSAKVRQEFKEAINNKRDFKDRLFLYFMQGGIDIYTGKQLNIDQLSSYQIDHILPQAFVKDDSLTNRVLTNENQVKADSVPIDIFGKKMLSVWGRMKDQGLISKGKYRNLTMNPENISAHTENGFINRQLVETRQVIKLAVNILADEYGDSTQIISVKADLSHQMREDFELLKNRDVNDYHHAFDAYLAAFIGNYLLKRYPKLESYFVYGDFKKFTQKETKMRRFNFIYDLKHCDQVVNKETGEILWTKDEDIKYIRHLFAYKKILVSHEVREKRGALYNQTIYKAKDDKGSGQGSKKLIRIKDDKETKIYGGYSGKSLAYMTIVQITKKNKVSYRVIGIPTLALARLNKLENDSTENNGELYKIIKPQFTHYKVDKKNGEIIETTDDFKIVVSKVRFQQLIDDAGQFFMLASDTYKNNAQQLVISNNALKAINNTNITDCPRDDLERLDNLRLDSAFDEIVKKMDKYFSAYDANNFREKIRNSNLIFYQLPVEDQWENNKITELGKRTVLTRILQGLHANATTTDMSIFKIKTPFGQLRQRSGISLSENAQLIYQSPTGLFERRVQLNKIK >NZ_CP012269.1|WP_046871856.1|654056_654569_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MKISVPTSNGLLLDKYSKHAAPEQIYNGNPSISFPIDIQDVPDNATTLALTLLDFDAVPVCGFPWIHWTAVNIPADKSVTIPENASQSNVIDFIQGNNSTAGSLIGATDPLTTRHYIGPTPPDKNHDYWLSIYALDTTLSLQNGFWLNEFYHAAKGHIISKQRLSIISRA >NZ_CP012269.1|WP_062903919.1|654784_655030_+|hypothetical-protein MLLNSKNLSVLEVQVLGIYQAKIEIKTISGKCLFVYPTQTQKDDPLFWQSLKDIIKAKLWLPINKTLNQLIDSDWLVPLNT >NZ_CP012269.1|WP_046871858.1|655087_655570_-|winged-helix-DNA-binding-protein MDEKQYQTITQLLKQLSATENHNQHEAWIAKQAAIKENPQKNHLTHNDLDILGVLLQGEKTVSEVVEAVQITQGGTSRRINHLEKLDLLEKFKRPTNKKTVYLKLTADGQKLATAHIALHKHLHEETVQALAEFSDSELAVVTRFLRKLADAQKDFETRY >NZ_CP012269.1|WP_062903920.1|655687_656689_+|zinc-binding-alcohol-dehydrogenase-family-protein MKALIIKDFKTAPMIDLNVPTPVADTKFDTLIDVLAAPIENFDKANATGRHYSSTYWHPAFPSIPGASGIGRRVDNGKLVAFPARTLKPRFGSFAEQTVANSKLLFEIPEDTDIYSSTAAASSLTTSIAPLQFSLEMKPGNTVLINGATGFAGQLAIQAAKALGAAEIIGTGRNPERLAALKDLGATQTISLADDDETILNNLSNMKIKGDLIILDYLWGHPIELILKSIVPTSLEMKRATSLVSIGAVAGQNITLPSTALRTSGLQIIGMQTPKVMQNQQAVYQAVWKLLGTGKIKTTVKTISLEDAAKNIDWQKPVPSGVRTVIKVSEIKR >NZ_CP012269.1|WP_062903921.1|657041_657545_+|transcription-elongation-factor-GreA MEAIKLVREATMSEPYFNKITATGYHEIEKEIEELKAKRPALTKCLAAAAALGDRSENAEYTFSKRDLRQLESRLHFLNKQLQYSKIVQPTNNQIVEIGKKVTIEFVDDHDQMDYQLVGKQEADIKTNKISLVSPLGSALLNKTVGDIVTIHAPEETYQVKILSVNL >NZ_CP012269.1|WP_046871860.1|657601_658450_-|aldo/keto-reductase MSVLTDTFELANGVKIPKVGFGTWQTPAGDVAYQAVRNALKVGYRHIDTAKAYGNEEDVGRAVRDSGIARDQIFVTSKLPAHSKTYDEAMADFESTFKKLNIDYVDLYLVHAPWPWDEIGKDCDKGNVEVWRAMQDIYASGRVKAIGVSNFNVHDLKNVLADAKVKPMVNQIQYYVGYTEPKITSFAKQNGILVEAYSPLATGGLLKNDQMLALAKENKVSVAQLALRFCLQNNILPLPKAVGQSHIEDNAKLDFEISDEDMEKLNGMPDTAPEHSHNKTQG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012269_4 | 986139-986364 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012269_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012269_4
>4.1|986176|64|NZ_CP012269|PILER-CR TCCGTCACGCTTGTGATTCTCTTTTTGACTTGTCGAGCTGTCCTAAGACTCGGCGGAAAGCAGC >4.2|986277|64|NZ_CP012269|PILER-CR AGAGTCGTGCTTATGATCAGCCTCTTGTTTTACCGAACTGTCCTAAGACTCAGCGGAAAGTAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012269_4
The CRISPR arrays of NZ_CP012269_4 >merge|NZ_CP012269|4|986139-986364|PILER-CR CGGATGCGGGATCGCAATCCCGCATCCGTCACGCTTGTGATTCTCTTTTTGACTTGTCGAGCTGTCCTAAGACTCGGCGGAAAGCAGCAGGCAAAGACGGGCGTATGTGGGATCGCAATCCCGCGAGAGTCGTGCTTATGATCAGCCTCTTGTTTTACCGAACTGTCCTAAGACTCAGCGGAAAGTAGCAGGCAAAGACGGGCGCGTGCGGGATCGCAATCCCGCG >NZ_CP012269|4|3|986139-986364|PILER-CR CGGATGCGGGATCGCAATCCCGCATCCGTCACGCTTG TGATTCTCTTTTTGACTTGTCGAGCTGTCCTAAGACTCGGCGGAAAGCAGCAGGCAAAGACGGG CGTATGTGGGATCGCAATCCCGCGAGAGTCGTGCTTA TGATCAGCCTCTTGTTTTACCGAACTGTCCTAAGACTCAGCGGAAAGTAGCAGGCAAAGACGGG CGCGTGCGGGATCGCAATCCCGCG
>NZ_CP012269.1|WP_046871035.1|985261_986095_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MNNNVLIGYKQRDNFVDRLTGTTKLIGLIALSVIGMTSFDTRFLLVLTVCSLALFRVSGIKFHEVSFILGFITVFSVLNLIAVYIFGPKYGVHLYGSEHVIWQGIGPYNLTWEQLFYEFNLFLKYIFTVPLALIFLMTTNPSEFSSSLNRIGISYRISYAVSLALRYIPDVQNDYRQISRAQQARGNEISKKGKLTHRVKVAGQILLPLIFTSLDRIETISQAMELRRFGKLKKRTWYAARPMKRNDFLALIVIALVVLVGIYLFKVNGGRFYNPFK >NZ_CP012269.1|WP_062904004.1|983559_985269_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNNPIISFQDVSFQYQSQSEPTLNHLNFDIYAGEKVLIAGPSGSGKTTISRLMNGLIPSAYPGKLSGKILINGQSVTDQTIFDLSLKVGTVLQDPDTQFVGLTVAEDIAFALENDGEKQSVLKQKASEWAKQLGISEIINNHPQEISGGQKQRVAMAGVLVDEGKILLFDEPLASLDPVAGRESIELIDEMQKKGDTTTVIIEHRIEDVLYKSVDRIILVDEGEIVANDTPDTILKSGILAKLGLREPLYLSALKYAGVDLKQVAHVDNVNDVALTENTVAALKKWVQPHHSQTLATDQEPVLKAKDISFSYDSKQVLNKLNLSIQPGEMVSLVGRNGVGKTTLSNIITGFLHQSSGSLTLNGKVMDDDSIKERADHIGYVLQDPNMMISKNTVSEEVALGLTLRQVTPDEIETRVAETLKVCGLFEYRHWPISALSFGQKKRVTIAAILVLNPELLILDEPTAGQDWRHYTEMLTFIRDLNQKTGISVIFITHDMHLMMEYSDRVVVLNDGVIAYDDQPMKLFANLDLLKQASLVETSLFTLAQRVKVDPEDLIASFIDQERVGQRDE >NZ_CP012269.1|WP_046871033.1|982997_983555_+|ECF-type-riboflavin-transporter-substrate-binding-protein MHKKQGISVRTVVAIGIGTAIFFVLMRYIPIPTGVPDTNINLAYGFLALMGSIFGPVAGGLIAFLGHMFNDLTWGEPWWTWIVADGIYGILFGLTKKYLNIENGGLTKHKLVIFNVYQIIISVLVWGIIAPTGDVLVYSEPASKVYLQGITSVICNALSVGILGTILLVAYARTRSKKGSLKKES >NZ_CP012269.1|WP_062904003.1|981055_982573_+|PTS-transporter-subunit-EIIC MAKKDYTKLASDIIENIGGKENVKSLIHCITRLRFYLKDESIAKDDVIKNLDGVIDVRHAQGQYQVVIGAAVTDVYDAVIAQLGQEFADPDATEAAVQETKAAAGSAKEPDNRSFGQKIKDGFNALTGVITGSMMPVVGLLAASGILKGLLQMAVDFHWTVPTSQTYIIISAMGDSAFYFLPIIVGFTAAKRLKSDPVIMAIIGGVLVYPSLFSIATGTKTTGTFLGMALNINLFGLPIHMVNYTYSIFPIIAGAWMAHYIEIWLKKWIPQILQMIFVPLFEVIIVSAIIIIFVGPAITLVSTGISWLLDAILKFNYPIAGLIIGGFYQSLVIFGLHWAIVPLIANDIASKGYSYLNAIVSMTMVAQGAAVLAIFLKSKIASIKELSGAAAISAFVGITEPSIYGINLKYGRAFLTASIGAAAGGLVSGLLNVNMYGFTGSIIGFPSFFTPAKFGGGMSNEINFWIATAVTLVVAFGCTWAFGFKDADVAAEKKVVRRKTIGKDA >NZ_CP012269.1|WP_062904002.1|980542_981037_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MFGFGKRKKVATDNAIYAPVTGQVIDLSKVSDPVFAQKAMGEGLGVKPSDGKIVSPVAGAVTMVAGTKHALGFTMANGLEVLIHMGVDTVDLKGAPFTVSVKPGDIVNGGDAIATIDLDQIHDANLDDVIIVVFTNSADKLDHLDVTTGETTAKAKIGMVTVKI >NZ_CP012269.1|WP_062904001.1|979598_980315_-|trehalose-operon-repressor MRNKFNAIYQDLADKINHHNYPVDSYLPSETQLSELYGTSRETIRKALSELLTNGFIQKIRGKGSIVLNLQRFNFPVSGITSFKELNNSLHMNSTTEVLCLEDQHVPLEKFDYQSSSPLLATYVERLRKTNNEPIVLDHDYILKSVVPEISHKVAADSLYDYFENQLGLTISYATKKITVESPTKEEAQLLELNEHQDVVIVRSQTCLEDTTLFQFTESVHRPDRFSFVDFARRQKIN >NZ_CP012269.1|WP_062904000.1|977933_979586_-|alpha,alpha-phosphotrehalase MSFQNKIIYQIYPKSFYDSDGDGIGDLQGIIKKIPYLVKLNIDMIWFNPFFVSPQNDNGYDIADYCKVDPRFGTMADFDELARKLKENHIGIMLDMVLNHTSTSHEWFQKALAGNKKYQAFYYIRDPKPNGDLPTNWESKFGGPTWAKFGNTGKYYLHLYDPSQADLDWHNPEVRQALYKVINFWRAKGVHGFRFDVINVTGKEEKLIDAPTNVASKTLYTDTPIVQDYLKEMNQASFGQDPDAITVGEMSSTSIANSVQYTLPGNHELSMVFTFHHLKVDYVNGEKWSKMPFDFMKLKGILNEWQSGMAKGGGWNALFWNNHDQPRAINRFGDPIHYRAKSAEMLATTMHLLRGTPYIYMGEEIGMSDPDYTSMSDYVDIECKNAYQELLNAGKSPSEAFEIIKTKSRDNSRTPMQWNNSKYAGFSTHKPWLMPTNQAKVNVQDELDHGEIFTYYQKLIKLRKTMPIISEGNFKPLLENDHQVFAYLRTYRNQTLLVLNNFYGKATTVQLPSEMTKLHGKVLISNYDESIELQDQLELKPYQSVAFLLN >NZ_CP012269.1|WP_158231699.1|976811_977348_+|hypothetical-protein MLVGKSIALHFAPIVGITVLLLMTLFKWRPLNLVALIWLVLATITARPPIYLLSVGMFGGILVLICDVYLTVIICNHDQPVKYVNQIAVILGIAFFLCLLSPKLSAQFASSGYSDPVTATKTEITVTKKNTNQLKTNNVTRITPRHPKIYLNGVGDINLKIRRIGIFYFSYADYVYKW >NZ_CP012269.1|WP_046871027.1|975933_976530_+|hypothetical-protein MHKIPSTAFAKAGIYEKEKVDYIKKCFTPMRVSINDQIFPRSQKNSDKESHKIGREIFGLATPETIEFNDTEIRVIDKDKKVVETTKATDVQYIQFGVIRRMTTYMWSPGFYYELTMTLGTSSGNYYLLNGDFAVYEQLKAWGEKQNIEIEDPFELASITTDAHVFGAGDPSTWGTLLDKTFITKVAKVADLNYPEEV >NZ_CP012269.1|WP_062904297.1|974768_975674_+|EamA-family-transporter MMSKSTRGILYASIGAICWGISGPIAQILFANYHMKLTWLIGSKMLFGGILLLVFGMLQKKQRPKLFAIWHGKKAIIQLLIFTIFGMTAMQAVYYKAVAVGNAATATILQFLSPVFIVVFTIIRYKRVPRRGDVWAIVAALVGTYLLITGGNPTSLTISPAALFWGVVTGVAAAAYVLLPEKILNQYGSLTVSSWSMLVGGVLFMFIQPAWRDVPHFDAKGWAGYLFIVIFGSVIAYFIYLASLAYISATATGLLDAFEPLSATIVSVVFLNLKFGVMETIGTILILSTVFILAIANRHSS >NZ_CP012269.1|WP_155387016.1|986524_986683_+|hypothetical-protein MKYENKTKTDNQVLKTIQPDKSMEAGMRLLAQLKKAEKGSFHSLEEVRHKLF >NZ_CP012269.1|WP_046872520.1|986865_987072_+|hypothetical-protein MEKNWLKTAVSVTMSGEGHEEGLKRSFGNMPETVTDDQIKGLGSVLEAVSKDKFDFATVTTTEKVVNN >NZ_CP012269.1|WP_046872521.1|987132_987366_+|DUF2922-domain-containing-protein MKQLDMEFVSSLGKVRHIKLKYVSEDLEPAAVKTAMTQLAGLKVFVKDDEELYAQPQAAKYIETINTPLFDDKAVKA >NZ_CP012269.1|WP_052694578.1|987529_988420_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNDFLKVKHLNMKIGKRKILKDINFSCRKGHITGLIGPNGAGKTTIMKCILGLYPYHKASIILNGTDIKSSNILNVGIGALIENPSIYPFLTGTEHLVMYAKDKNCIEDIVQALKMQSFINKKSKDYSLGMKQKLGIAIALLDNPQLIILDEPMNGLDPSSTYLLRNLLLKLAKQGITILISSHILSELEKIIDDVVMINNGKVILNVSKNKLEQQSQSTLFLSTNHNDKALKVLLEQGFKAQESNGMIKAFNISSSNLNELLAVIINNDIRLLGLEHKENGLEDTLLKLIESENN >NZ_CP012269.1|WP_056986019.1|988421_989189_+|ABC-transporter-permease MSSLINQEIYKLCHKKTVQFTPLVLFLAMLVVGIITKNGSDNRFYIEAGYAGFQWITIILIIECASMVAMEFQYGTIKHLIYESNNRMKIYLSKLLTMFLYDVLLHIFTLVFTIVIKYLTVGTNVSFSQNYLYHASLFQNLFTNTLVDFLGSLIIVSSVFMMASLMNSSAIAIAVGIGFIFIGEGLSSALISALIKKIPLIKWNPFNMLNIANQWSNPDYFSTTHLTQTQLINGNILYTLIFIVMSFLFFRKKRV >NZ_CP012269.1|WP_046872498.1|989218_990442_-|MFS-transporter MKKIRRVIISDFFDSLSIGAFITYAYWYIYETTKNQSLVSILGTISMAAMLLSFIGGYIVDQQSKVNLLRAIILIRCLLVVIGLLLLYLFHSNLKTLFLVVIANSLLSIVYTPLSESIAPVLVENKKELFKANSWVSLANQLASVSSSGLSVLFVLWRKPIWALLGLGLSVLISYLTILHVPADAAPIKKHSLSFRETMSDFKHGLLLIVHNRLISLMIPIALISNFCFWSIWLLMPKYSVDIFNQYKIVYNVIDISFTIGGILGAAAFSKYHGRLKTGIFYPALLVGQSIMLILLGVNAWVKPSIINVFFISILWIGYGIFNSISSVLYFSIIQMSASNDTIGLIIGAVLTIFSLANPIAAALSAPISRLYTLPTIIVIFGSIMLFAALVVFSPYFNKELAKYDKK >NZ_CP012269.1|WP_062904005.1|991003_991219_+|hypothetical-protein MADFAEKTALLDTATKDIFDWSNDATPLRDAMWDKVMESNSHNTDATSEQAAKWEDMNDSDLKAAAEKLLK >NZ_CP012269.1|WP_046872216.1|991328_991664_+|hypothetical-protein MNKLKTKYDVYRYTGIPVVKDASGNYKFKLDDMGHVKPHSWRTGKHTKGKFKQRGQVFLTENRLFIAVITAEKMSFNQRHSVTPLQRFTSETINESLLKTGTELVRNLQDD >NZ_CP012269.1|WP_046872215.1|991656_992778_+|A/G-specific-adenine-glycosylase MIEWSDATIKEFQTTLLAWYDANRRDLPWRQDHDPYHVWVSEIMLQQTQVNTVIPYYQRFMASFPTVEKLAQAPEEQLLKAWEGLGYYSRVRNMQRAARQLLTDNGGQWPHTKAELQKLVGIGPYTAGAIASIAFNQPEPAVDGNAFRVFSQLLEIDADITKPQSRSLFEEVIRKIISKDRPGDFNQAIMDLGSSYMTAKNPDNEHSPVKKFNQAYLDGRLDEFPVRSKRLKPVDKQYFALVIETPGGFLFQQRASNELLAKLWLFPLVDADQLKESHPELNATTIIKAVEEKFVSETEIQTELQLIDTPIVNHTFTHQKWHVTLLYAKLQEELDLSHFSGKVVPVKKFATLAWPTVQKKLWQAFKKRQIQLF >NZ_CP012269.1|WP_046872214.1|992794_993487_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MKTLVIVAHPNLVDSGTQKFLKTSLAKMDSVTWHVLNEGHFDVTAEQDLLQENDRIIFQFPLYWYSAPAILKQWEDEVLTRNFVYGTGHALAKKELGIVVSTGDRQKGFVAGGEEQFTLSELLRPYQALAHKGEMTYLPPFPIFQFAYLSEQAKQRLLVSYQQYITNSDFESFHGQELWFEQQLSKKISEVQGSSNSQKTAQILGVIQDNRENLEELGWTLSMIKDDEDE |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012269_5 | 1172446-1172585 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012269_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012269_5
>5.1|1172487|58|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder CTATTCTCGGTACGGTGTCCATCCTTGCTATGGCATTCCAATGCCAAGTCGGACTGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012269_5
The CRISPR arrays of NZ_CP012269_5 >merge|NZ_CP012269|5|1172446-1172585|CRISPRCasFinder CCTCCTCGATTTTTAAATGACTATTTTGCATACGCAAAATCCTATTCTCGGTACGGTGTCCATCCTTGCTATGGCATTCCAATGCCAAGTCGGACTGGCCCTCCTCGATTTTTAAATGACTATGTTGCATACGCAAAATC >NZ_CP012269|5|4|1172446-1172585|CRISPRCasFinder CCTCCTCGATTTTTAAATGACTATTTTGCATACGCAAAATC CTATTCTCGGTACGGTGTCCATCCTTGCTATGGCATTCCAATGCCAAGTCGGACTGGC CCTCCTCGATTTTTAAATGACTATGTTGCATACGCAAAATC
>NZ_CP012269.1|WP_062903741.1|1170953_1172321_+|ISLre2-family-transposase MYILADFIESLGNLDSLFDLEEQVILHLRKSFQLVVAEYLRQLDETLVPSIPAENTFINRQARTIEFMFGAVNFERRCYLRPNGSYYFPLDEQLQLEERKRISPYFKSVVAKIGQTTTMRNTAAMINLASQTDISAWSVDRIIRDMADTVKTEEKSSEEKLVKKRKVENLVVEGDAFEIHKINRRRQDVHHYIVFESGLDGTRSNKVEFVGINQKKVQKRVTDYIEKHYKISEMTVFTASDGGPGYNPKSMREIVPSAQRVEFTIDRYHFVKKIKQTFGLFNPLVDKAVKSVSLYDQNQLNVILDTFESQIKTDKELESLRVLRQYLARNWQFIKSPHDRGFMRVGKLGSVESSHRAYTYRMKKQGKVWSEKGLEAMLKLIEARVNGKLDKYLRGGLRKLQELTIEIATESLKTLSSAQLSNKHHSKHIGVLSGKIPVDAPTSSPIGAMAKIFSN >NZ_CP012269.1|WP_046871523.1|1169971_1170472_+|O-acetyl-ADP-ribose-deacetylase MAFKVIRGDITTMKVDAIVNAANTTLLGSGGVDGAIHRAAGPELLAACRLLHGCQTGEAKITPGFKLPAKFVIHTPGPIWRGGHQHEAELLHNSYQNSLNLADQNHCVSVAFPSISTGVYRFPLQAGAKIAVTTIREFLKTAQSVKDVTMVCFDEGTYQAYLEVQK >NZ_CP012269.1|WP_046871524.1|1168792_1169959_+|hypothetical-protein MDSVLYDLEFAKNDQRLANVFPKEQETFYTGFVNSIGADGVILNTYDDTGQADGAVYVQFDAIENVEFDSPDLDNMLETIQIAENDQLFTVMDRIPDFVSTSDLIKQVVEDAYKNEQFLVLTRSDLENYQEGKVTAVHENDFEMHLVDKFDLTHEVLTTIKYTEAEIVEFSGRELAVETATWPEIAKQQPESRLTLTDTKDFYAVLKNAEQKQELITINDETKSSNFFVGTVNAVNKSEVLCNLVDMAGQFGGYSLIRLDAIVSITLKSDYMQVMEAFINYQKKNQTFVQPVLNEERLFDATDDLIMALIKQTETFSRVLSISLLTGAREMGYITDVTTDTFRFHVIDADLYVDQTGIEIVIEDVDELSFDFLNAVLIENHLRDKGLL >NZ_CP012269.1|WP_046871525.1|1167587_1168781_+|MFS-transporter MDDRTKQTFSWPLFLSPFVSRLGDALFVFGLNWFIVRATGHASLLGIVQGIGGIVLVAGDLFAGPLVDKYNRKLIMLLADIVSFLACLIMAGIMDVNKPVFYQLVLLTCIIDIGLAFNFPAAKAVVPEIIRSDKLSTFNSWSNTGLTLADIVAPLFGGFLLTLHWINFRSFLFINALSFLLSFIFTLALKYKPEKDHTKESMPILESLVKGLNYVRNKRDVFRLIIFDAFLAAMYAGYTLLLPYDVDHYYNGDEKLYSYVLTLVAVGGMLGGLSLVLNKHQPRIKTNYQDAFILAIVLILTGIWINYGLLLVSAFAYGFYTSRMSIRMMTIVQNLTDIAFLGRVFSIWFLCFDSMHPLGSFVFGFISDWFNHGTFFVLGGLVLLGLLVVYLMGRNSD >NZ_CP012269.1|WP_046871526.1|1167061_1167442_+|iron-sulfur-cluster-biosynthesis-family-protein MNIKFDSVSADKVQAHLDDNKRLLLTFEDGVGDYSQHAMIHMQVQFTINVVAKDMPTTGYNAVVHSNIGDLLIKDYSTDDLEENMSMKFNTHLGTLQLSGDGGAIDDNVGFIDFTDKNGIKNNPAR >NZ_CP012269.1|WP_046871527.1|1166006_1166534_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MEKFEKYRPILTPHFTLDWLTAAKVKDIYALRHDANVAKMSDRDVDSDIQATVDYVNKIMRAIMNNDSLLWGISERKIEKFLGTFCIWNFNDSKTAAEVRFEVLPNQQNHGIMTEILQRMTEFSFNELGLEKLYAVAKQSNTPAITVLKKTGFEIDPTYPGSQNTLSFSLCATTR >NZ_CP012269.1|WP_046871528.1|1165130_1165997_+|viroplasmin-family-protein MAAKKKFYAVAKGKQTGIFTDWNETKPMIDGFPGAKYKGFKTEAEARQWLNDGGVISKTKPTKKVNTAQSHQANDTEIIVYTDGGSRNTGNVNGGHVKKQDKAAWAYLINVAGKQISDSQGEFGATNNRMEIMALLRALEWLVENQKQTDEISVVTDSQYVLNAIQKHWLAGWKRRGWKRGSGQPLANSELWRQLDGLLPKFSHLQFYWTKGHATNEGNVFVDHLLNQTMDKMSGGQVANKAIRASSPAQTASKLTKKAQKKSVPTSETQKSLDAIKKSLEKLEWYND >NZ_CP012269.1|WP_046871529.1|1164806_1164989_+|hypothetical-protein MRFGNFSNRDYRIALDTETQLFWASEKNDPSIKASGVTITEALDKLNEKTNGLVQQQYAN >NZ_CP012269.1|WP_046871530.1|1164157_1164409_-|hypothetical-protein MRKIFTLSIIGVVLVGLVFLTLSSCGDHKASFDTSTVGSSKQDSTYGAWWEHMWSLPDKNSSNKKNNPRKNSVTKFSNDDNKK >NZ_CP012269.1|WP_046871531.1|1162644_1163958_+|NCS2-family-permease MGEKIKNYFQIDQLHTTVKREILAGFTTFISMAYILFVNPSVLGASGMDKGAVFTATALASALGCFLMGILAKYPIATAPALGINAFFAYSVCIGMKIPWQTALAGVFVASLIFIVITIFKLREMIINAIPADLKYAISSGIGLFIAFIGLHDGGLIVANKSTVVGLGSLGVATTWLTIFGLILTSILMVRRVPGGIFIGMAATAILGLLTGLIKAPAQWVSTAPSLKPTFMVGVEHIGDINTVQLWVVVLTFLLVTFFDTAGTLVGLAQQAGFMKDNKMPRVGKALMSDSTAMLAGSVLGTSPVGAYVESSAGIAVGGRSGLTAVTTGVLFILGLFFSPMLAVVTSQVTAPALIIVGVLMAQSMKHIAWEKMEIAIPAFLILIGMPLTYSVSDGIALGFIMYPITMVAAKRGKEVHPIMYGLFFVFIFFLYILNKG >NZ_CP012269.1|WP_046871521.1|1172817_1173498_+|noncanonical-pyrimidine-nucleotidase,-YjjG-family MKYQNLLFDVDDTLLDFHAAENQALKALFAEIKYPLTDDMVTYFRALNEHMWQRFELGQLDRQTLVNTRFTKLFAHFNETVDGIKYEQIYREFLNQGHQLEPHALELLNSLKDQFNLFIVSNGIGSVQQHRLNDSGLSTYFKHIFVSEEVGYQKPRIEFFDFIANHISGFTPKNALIIGDSLTSDIQGGANAGIDSVWFNPALQPNHSSVSPTYQIDDLLDLKEIL >NZ_CP012269.1|WP_046871520.1|1173680_1174133_+|MarR-family-transcriptional-regulator MEKHLGINRQIHVLANCSTRKFNESFLDDDITGKQGGVLHFLLMRAGKQKIYQRDIEEHFGIRRSSVTSLLQKLEDNGYITRESVADDARLKLIVLTPKAMAFQKSVVQGTIDFEARMLQGVSEDEIATWQKVTQQMTRNLKDKKIGSDK >NZ_CP012269.1|WP_046871519.1|1174132_1175869_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKRIGHSVREYKKYALISPILVAIETFIETFIPYLMSKMIDKGIIPGNLAYIEKLGVFMLIGTFISLAGGAGASWYSSKASAGFAKNLRHDLYHHIQDFSFEDVDHFSTSSIVVRLTTDIMNIQQAFQMLIRAAARAPLMLIFSITMAFTVDAQMAMVFVVSVPLMAIGLTVIIAIGRPLFKKVYQRYDGLNRVVRENLRGIRVVKTYNRAELEDKKAEKASSSIYEVFSKAERILQLNSPIMQFVMYGTLLFLAWFGAKRIVGGTMQTGQLVSLLAYAMSVLMSLNILSNVFNQMTISLASAQRIDEVLTYKSTLTNPKNPLTDVKTGEIDFDHVDFAYADDGVTRLEDINLHIKPGETIGIIGETGSGKSSLVQLIPRLYDVSHGSVKVGDQDVRDYDIRTLRDNVSMVLQQNVLFSGSIADNLRWGDEQATDEQLVQAAKLAQADDFINSLPDGYDTYIEQGGSNVSGGQKQRLTIARALLKNPKILILDDSTSAVDTHTDSLIQTAFREELPEMTKLIIAQRISSVQGADRIVVIDQGKIEAVGTHDELMNSDDLYQDIYNSQIKGGETHAKN >NZ_CP012269.1|WP_062904042.1|1175855_1177751_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQRTRVAGRAKLDGSAWQILWRLLKYIMQKSHFALFIAFFSVIVSAGASVVGTLFIQRLIDDYITPLMKVAHPNFTPLLHMIILMGAIYLLGVIGTLLYSQLMIMTGQKLQKRIRDEMFTHMQQLPLSYFDSNDYGDVMSRYTNDVDTLRQMVEQSFPMFINALFNVVFTLTAMITLSPTLTIISLIVFALSIFIVRKLSSKSSYYFRMQQKALGNIDGYIEEMLNGQKVIKVFSHEDQAKAGFDKRNEALRQDASMANGLSTMLFPIMGNVGNILYVLIAVVGGYFAVNHITPITLGEIAAFVQLSRSFSQPIAQITMQLNSIIMGLAGAQRMFQLFDEPVEQDSGDTTLVYVTENEQHELTETSERTDKWAWKTPEKDGNVKLTPVKGHIEFKDVSFSYDGKKTVLHHISLDAKPGEKMAFVGATGAGKTTITNMLNRFYDISSGQILYDGIDIQNIQKASLRLSMGIVLQDTNLFTASIRDNIRYGRLNATDEEVVEAAKLANADSFIRNLLKGYDTVIDGSGSDLSQGQRQLLSIARAAIADPPTMIMDEATSSIDTRTEALVQSGMDNLMKGRTTFVIAHRLSTIHNSDEILVIEDGRIIEAGNHESLMQEKGEYYELYTGKTILE >NZ_CP012269.1|WP_062904288.1|1178358_1179564_-|IS110-family-transposase MEIIFGIDVSKHSSNVAILADDSVIKEFKITNDRIGYETLDDALNSFKSPKVIFESSGIYSRSIRAFLQRKNWIYTEINPLAAKKDMDGFRHNKNDQLDAVALATAMAHYHYQSTFREAGVYEELHDLERTYQEFNEDLVRAKNRLHKNLQLTFPEVEQFISTTDGTLYWHVVQQFPHPTFVLETKLSELAQLILKATLKNMSEKRALGLAEHLKELANKSAPAVSSDACAVSSVVYLAGEVERLNDKKDEIIREMSQISVSLNEIPILQSIPGFGIKTAVCLLAELGDISRFHSSNAINAYIGIDLIQYQSGDYEMGQHIRKRGNSYARKILFKAVLNMVCAAKYHPSNVSILYQRKKQSSSETHTKKIAIAAMGRLIRTIYHLIKNNELYDSRKCLPQH >NZ_CP012269.1|WP_062904043.1|1180039_1180363_+|hypothetical-protein MIQIPQDMTEVKVKIAQLEELGHKSNEKQVVFDAIQDNAQAILDEQLEGHYDSCTLDNDKITIYETPEKPIGSVKSQRASFEEDFRKNANNMFIYLQQEISKVINQR >NZ_CP012269.1|WP_046871516.1|1180379_1181198_+|HAD-family-hydrolase MSIKLIASDIDGTFLDDQHEFDRTRFQNQLDEMNRRGIHFVVASGNQYLHCTKVMTGINGDLTYVAEDGALIVEKGKMLDSSPIEPELWQKVVTSVDEQPILANAVIILSGEKAAHTNVTPQNEVWGRTGYFYENLTHASDFSTVTDEIYKVDVNWPDLADIRDKYNVLTTEFGNQLTEVMSGYSGIDIIKPHVTKAYGLVQLQRIWNVSMAETMTFGDNQNDAEMLKHAKYGYAMKNASPEAKAATSLVTPLDNNHSGVLDMIDRVLNDQI >NZ_CP012269.1|WP_046871515.1|1181505_1182588_+|hypothetical-protein MNGKRIKTVILATLAMLALTACRSQDQKRSSSKATTSVSRSATKVSKRKTVKTSDTTSQSSSSAKESAPKTNTMNFDQIKQGNYGSLQGTWTETGHSASKDGQAVEKGGTDTLTVSNGTITNGSTKVQKQTLTDAAGEHSLVFKTKDDVLTANLADEDVAINWMVTFYPKGTTNKYKTNNDSGKNSQNMIVVWTSNNSYTEIFAQTSTTPSVSKTANAAKTTKATKPVETGLNLAQISRNNFSSLVGTWKNTDGKTIIVTNEVKNKPTGSNVAYSKGAVVKGTDGNGHSRVITAGKVTSGYIQGGIGTFDSDAAVSAFDPLTIIPKNVKLSDADDSDSTRDRLILGGGQGGYATQAYYKE >NZ_CP012269.1|WP_046871514.1|1183041_1183599_+|DUF5067-domain-containing-protein MKKKNEAGTATKKRPIYKRIWFWLLVLIMIGGIGAIAGGSGNDSSENQADSKTEKQSESTADKSHKVGDEATVGKVSYKLNSVETTDERNEFEDTNPKNVVVAKYTVTNNSDEDVPVGTDLDVYGSDGKKLKSYAVSDNTLDSVASGKKADVEAAYGVDELGNIELHFSPLASFDDAVKFHTTVE >NZ_CP012269.1|WP_046871513.1|1183791_1184184_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MRLVAYPAILDDSENKPGQYTVTFPDVPGAITDGNNLEEALYNAPEALGLVLFDEKVLPKSSSLQTIQKQNPDKIVTYISVDLDFIRRNSYKPTVKKNTRIPAELAKKAENQGINFSATLTAALEEKLSN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012269_6 | 1256903-1257053 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012269_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012269_6
>6.1|1256957|43|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder AAAAAGCAGAAAAGAGATGGGCCCACAAGTAAACGGAATCGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012269_6
The CRISPR arrays of NZ_CP012269_6 >merge|NZ_CP012269|6|1256903-1257053|CRISPRCasFinder ATCCCGCGGGAAGGATAGTTATATTTTGACTTTTGCTTTGTCGAGCCGTCCTCAAAAAAGCAGAAAAGAGATGGGCCCACAAGTAAACGGAATCGCAATCCCGCGGGAAGGATAGTTATATTTTGACTTCTGCTTTGTCGAGCCGTCCTCA >NZ_CP012269|6|5|1256903-1257053|CRISPRCasFinder ATCCCGCGGGAAGGATAGTTATATTTTGACTTTTGCTTTGTCGAGCCGTCCTCA AAAAAGCAGAAAAGAGATGGGCCCACAAGTAAACGGAATCGCA ATCCCGCGGGAAGGATAGTTATATTTTGACTTCTGCTTTGTCGAGCCGTCCTCA
>NZ_CP012269.1|WP_172793946.1|1256056_1256848_+|HAD-family-phosphatase MDIDGTLISHNQNVSLMTKKVIEQLQQKGFIFYIATGRMLSLAQVIQKRINPKVEIIASNGSVYQKGHHLHQDHLGWKAISTVYDVTMELGLSTNFFSTDRTFYTKNKPWDLSRLARMRVMQDGAGKFEDVHDRDHLNEVSDQIINGIVIAQGQLDKLAIARKKLLEADVLNVSSSSSDNIELIPKRIDKASAVRAITNQYGIPVDHTIAFGNDKNDLGMLKAVGTGVAMGNSADEIKTQADVVTETSEDDGLPKYLKRRFLD >NZ_CP012269.1|WP_046872431.1|1255390_1255870_-|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MSIINILYISIAGNTRSFTQDLQDYAKEQHSKDATNPLITLKEISEETDFETERHPYFAFVPTYLDGGNGVDNGVKELMTNVLGEYIAYKNNRKLCLGVIGSGNRNFGLQYCLTAKRYARDYGFDYLDNYELRGNSTDCKRIYETLKKNNVLKKAPEEV >NZ_CP012269.1|WP_046872432.1|1254467_1255328_+|aldo/keto-reductase MAKLTKLTDTYELNNGTKIPIVGFGTWQTPDGDVAEKSVEEALAAGYRHIDTAFAYGNEQSVGKGIKDSGVARDQLWVTSKLDGKDHGYENTKRAVDKSLTNLGLDYLDMFLIHWPNPIAYRDTWEQTNADTWRAMEEAQKAGKIRAIGVSNFRPKHLDALLKTATVVPQVNQIFLNPSDLQPEVVKYDDDHNILSEAYSPLGTGKIFGVSELKTMSEKYHKTVAQVVLRWSLQHGFLPLPKSVHNERIIENTKLFDFEIDDADMKKIDGLRGLAGLATDPDTITW >NZ_CP012269.1|WP_046872433.1|1253474_1254131_-|membrane-protein MDKHADFKKRLFFFVISIILNSFSNALTVASHCGSALWTASSVNLSSWLNFPLSNVLFVEGLAVILANALLLQHFDWHRMLGNLVFMIPFSYLVGTISTNLDAHGFLTLPLWIRILADALGIVGIGIAVSIYQRANIVLHPNDDLTYIVRFRFMHGRAAKAQWISYIPAISIILLTFIMTHQIHAVGLGTVLAFILQGAVTGWADQHVFTTLKHHLNV >NZ_CP012269.1|WP_046872434.1|1252597_1253389_-|tyrosine-protein-phosphatase MVRSRILQLQKGGNFRELGGYETIAGKTIKWHKIIRSGKLADLTDADIAYLNDYGLKYDVDFRSPEEKATSPDRIPDQAKYLFIPVFSTDETQNSKQTERLQRKMDTDPTTGRLQMQHAYKDIITNPHSQKAYRSFFDVLLENDGEKSTLLFHCTAGKDRTGMGAVFFLNALGVNEDTIKADYLLTNKVIQQQQIMLTKTLKLQGASSAFIQSMRDLQSVQISFYNTAMDQIEKTSGDMAAYLHEYLHLSDSDIQDLRHIYLE >NZ_CP012269.1|WP_062904058.1|1251733_1252567_-|alpha/beta-fold-hydrolase MKRKNLIGFGLVAPLALGITGITAASARLYDYAFRRVDYVPETSADKQKYADEYYNYVNWFHNIPTHHWTLHADDLENRVEATFIPAAKLDSKKTVIIAHGYKGNGETMSNYAKMFYDMGYNVLLPDDRAHGRSSGDYINFGWIDRLDFVDWANSVVSRIGADSQIIMFGVSMGGATIQMTSGENLPPQVKLMISDCGYSSLRDELSYLLKEQFNLPSKIFVPLINAINHHRMGFSIDDVSSIRQLRKNTGSLSNRIGGDFERHIHFGECAFCLLMN >NZ_CP012269.1|WP_052694465.1|1250500_1251748_+|ISL3-family-transposase MQMSLTNSILCLFEITDPNLIVTGISKERCSTNQRIHVVHATLSYQLLKCPHCGHKSLIKNGTHMSHLRLGTLSGGRYEMHLKRQRYQCKDCSKTCGAKTKLVNRNETFTHNIKHQVIVLARDMLTSKEIAKLCGISPSSVQRILNANIHLAYRVKHLPENLCFDEFRSCNHWMSFNCCDAVSHRRIVTLKDRLSKDIIDYFEARFSVQERAQVQSVTIDMNAEYGSFIHRLFPNAATIIDRFHIIQLAGRALDNERTQTIRTIQDKHSPIYHILKSQWRLFHLDEIKVNDSKAVYLRGINEYMTQQNAIDLALDAFPRFRSVYQTYQGILSAIHQKDANAFQSLLTNYQPTSNQMDITINTFIKNGSALLNSCRYPFSNGPIEGLNRKIKALKRNCFGFRNIDNFFIRISLIHE >NZ_CP012269.1|WP_062904057.1|1250164_1250449_-|alpha/beta-hydrolase MSFFIFLIFKTDKKPVLVIHQYQKVQTQNTRPFLFIHGEKDIYVPTYMVDESFEACPDPKEIWIVPNASHAESFWINPQAYQTKIQQFIDKYSK >NZ_CP012269.1|WP_046872436.1|1249660_1250071_+|transcriptional-regulator-Spx MDKITVLWGPSCGSARRACHWLDTQELTYDKVNVVSTAITLDTLKKVLSLTEYGAEEIISERSKIFKKFGREYIDSLTISELHRLLVNYPSLIKKPIIFTHNKLQVGFNEDEIRSFIPRETRRVSFAQMLNILHDA >NZ_CP012269.1|WP_062904056.1|1248928_1249186_-|hypothetical-protein MRTKYWSDFILAIIVIIACVVGWFTGYFQNGSNYSSIEKTLILILAFSVLFRLRMDMKGANRWEAVSAAFPGVAFLLAVVLLAFL >NZ_CP012269.1|WP_046872429.1|1257121_1258507_-|HlyC/CorC-family-transporter MDSGQIISDTIIILITFIMAYFFVAAEFALVESRLSALEEAKETAVGGRLKKINRAIHMVSNLNEYLSTTQVGTSVCGIILGWIGESYVEYFIIKFFGSTHLINQASLHAIGAIIGVLLLTYLEVVITEIVPKNISIDIPLKVLMRLVNPLHWFHTIFYPFVWLLNTSANGIVKLMGMEPAEENNEVLSQAEILSLSKNSVTGGELDQNDYVYMQRAFDFNDKVAKDIMIDRTQLVVLNVDVTVDEALRVYLQKRFSRFPVVANNDKDKILGYVYNYDLVRQSRVDGKVKVSKLLRNIITVPETVLIQDVLQRMLKKQTPISVVVDEYGGTSGIITDKDIYEEVFGTISDEVDDVSGDYIHKESDGSYRVSGKTTMYDFERYFGIDVPGFEGEDVVTIGGYVIDHHPNIQVHDQVRIDRYNFEVLDNENAHIDWFHVTSISDNEFKKLKEDAETKRLNANG >NZ_CP012269.1|WP_056986457.1|1261567_1261951_+|hypothetical-protein MAKDDKVKVETDAEQIAKIDFDKEDVKQAADMIEEKGFVTRNDFPDLKDRLWSEGFYEKIEDEFHQRDNENPYIFFERFDFVGGAIESIIFDMDQVKTREKALHVLGDALDLKVQDKPNETHKMVTY >NZ_CP012269.1|WP_062904059.1|1262194_1262623_+|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MANELRNADFDDFAPFDFYDNFGKNFFKSMTQGSSMKTDIRENEKDYEVSAELPGLKKENISLNYDNDTLTIEGKHNVNKEKKDEKGNLIRQERSFSNTSRQFYLPDIDRDKISASYDGGVLKITLPKSESKLESGKQIPIN >NZ_CP012269.1|WP_052694569.1|1262683_1263214_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MKNLQTKNYELHFPVQSDVDILFRYRSNIEIAHSEGRIPDKSRQETAKFLTQLLSKIDAGIVNYWLISDHTKNHLGGISIWGFNQEKTEAEVGYDILPKFQGKGVISEVFPEIEQYAFTVLKLQKLSVYTSKIDILSQHILRKNHYRLIEHWIEKNLKGEPTDMFHFAKTIEEYQK >NZ_CP012269.1|WP_046872425.1|1263311_1264385_-|IS30-family-transposase MKEVFVLAQEQLTISHLKGHHLTQIERGKIAGLLAAGKSARQIAAEIGVCHQTINNELKRGCIQQVKKVNGKEQYFNVYAPDTAQIHYQTNRQRCHRPLNFKSITNFLAYFDDHFHQDHWSPDAAVGFAHKHRLFKRTEMVCTKTLYNYIDAQLLEIRNLDLLEKTKRRTKHHWSHKHRRLIGKSIEERPECVDKRSEFGHFEIDTVVGKRSGHECVLLTFTERKTRFDFIRLIEGKDADSVAYAIKGICAEFGDLIKSVTADNGTEFTALEEAFTGVADIYYAHPYSSSERGTNETHNRMIRRYLPKGYSLDTVSPKTVAIVEDRLNQLPRRILKYQAPEKAFQIEAARARRAHIA >NZ_CP012269.1|WP_145912950.1|1264738_1265716_+|aldo/keto-reductase MVINLFIGVIFLKQITIGGKKVSNVALGIMRMDALDTDAATKVIETAVDNGVNFIDTADIYGGGKSDLVFQKALDKSSVSRDDLWIQSKVGIRNSNDDGSGKPYGNRYDFSKQHIIDAVNHELQSLKLDYLDSVLLHRPDPLMELNEVAEAFDELQTAGKVRHFGVSNFNPMQFDMLQGAVSQKLMFNQLQFGIMHSNMIGFGMHTNMQDAHSIDHDGQFIEYSRIHDIVIQAWSPYQWGNFNGPFIDNPKFPELNKKMQALADQYGVTKNAIATAWILRHPAKFQVLVGSMNPQHIKESLAGSDVEMTGQEWYDIYYAAGNDMP >NZ_CP012269.1|WP_046872422.1|1265886_1266453_-|DUF5067-domain-containing-protein MKSFKKVFSILMIGLVATSLTACSSGNTSKSSQQSSSSEKKVSSAKKAVKKTATLSDQTFKTPQGTFLITENHVTASATKNKQVLILKYTFTNTSKSQLVPSDYWYKYVKATQIVNGSTKTLEQGSLPFSTAATTDDNLENSSVSEIKPNHHINAEGSWQLDKNGAPVKVSFYDTHKQLVGTRQYDTN >NZ_CP012269.1|WP_046872421.1|1266462_1266798_-|hypothetical-protein MFELTKKRRVSDEVKEIIPQPVIDGLWKTLKQMQADDLVVSPVIAFVFSDDYTEDTIYVMGLQNSGDVAKEYDLAYSGKKDFLGNGTIVIVKDKPKTISMSISAVNNQTKE >NZ_CP012269.1|WP_046872420.1|1266949_1267486_+|DUF1836-domain-containing-protein MNELETYNRWLKTVREVKLPHWDELPNFDLYMDQVVALLSGYTGPLGMDPVTPTMINNYVKQKAVVAPTKKKYQVMQVADILLITLLKQAYPINVIRSGIDRITATDYPKQAYDRFIDIVNQKIARIGLEHTTTMAKNLAEQLMQVTSNMIVDQVQTSELIRLLQRSEEHTPTTLNKK >NZ_CP012269.1|WP_052694568.1|1267975_1269376_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MIKDLDNKKDVDEPQLMVNDLVKKAHIALDRLSVMDQEQIDKIVHAMAEAGYHARQKLAKMAVDETGRGVYEDKVIKNQFATKDIYNSIKNDKTVGIISDDKETGIMKVAEPVGVIASATPVTNPSSTVFHNALLAIKTRNPIVFAFHPFAQKTCVETGRVIAEAAVKAGAPENSVQWITKPSMDATTDLMNHDGVATVVATGGAGMVKSAYSTGKPALGVGPGNVPVYVEKTADLKQSLDDIVLSKAFDNGMICASESNMVVDAEIYADVKSGLKERGAYFVKDADMENFESTVMNREKESVNPKVAGQSAYSIAQWAGIEDCPKDAKFLVAEMNGLGGEYILSHEKLSPVLTMVKAKDQDDAVHLMKRGLNLGGLGHTVGLHTKDDALINRFALEMDACRILINTPTSQGAIGYKYNNVTPSLTLGCGSWGKNSISHNLEDWDLLNIKTVAKRLPKLRHEGLDF |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012269_2 | 2.9|645663|27|NZ_CP012269|PILER-CR | 645663-645689 | 27 | NZ_CP015585 | Roseomonas gilardii strain U14-5 plasmid 1, complete sequence | 150011-150037 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012269_3 | 3.7|647426|31|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647426-647456 | 31 | NC_011990 | Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84b, complete sequence | 89039-89069 | 7 | 0.774 |
| NZ_CP012269_2 | 2.1|645333|30|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder,CRT | 645333-645362 | 30 | CP046512 | Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence | 129098-129127 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012269_3 | 3.1|647030|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647030-647059 | 30 | NZ_MK439959 | Escherichia coli strain Ec-2Lar plasmid pC-Ec2-KPC, complete sequence | 47279-47308 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012269_3 | 3.1|647030|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647030-647059 | 30 | NC_015283 | Prochlorococcus phage P-RSM4, complete genome | 97956-97985 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012269_3 | 3.1|647030|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647030-647059 | 30 | AB711120 | Bacillus phage PM1 DNA, complete genome | 40725-40754 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012269_3 | 3.8|647493|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647493-647522 | 30 | NZ_CP016890 | Pantoea agglomerans strain C410P1 plasmid unnamed1, complete sequence | 419338-419367 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012269_3 | 3.8|647493|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647493-647522 | 30 | MN693541 | Marine virus AFVG_25M436, complete genome | 28757-28786 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012269_3 | 3.9|647559|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647559-647588 | 30 | AF191797 | His2 virus, complete genome | 14590-14619 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012269_2 | 2.6|645663|30|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder,CRT | 645663-645692 | 30 | NZ_CP015585 | Roseomonas gilardii strain U14-5 plasmid 1, complete sequence | 150008-150037 | 9 | 0.7 |
1. spacer 2.9|645663|27|NZ_CP012269|PILER-CR matches to NZ_CP015585 (Roseomonas gilardii strain U14-5 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
tggaccacaggatatgtggaagcgacc CRISPR spacer cggaccgcaggatatggggaagcgttt Protospacer .*****.********* ******* ..
2. spacer 3.7|647426|31|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011990 (Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tttcaaccagctttcttggcttttggaaagt CRISPR spacer tatatgacagctttcttggcttttgcatagt Protospacer * * . ****************** * ***
3. spacer 2.1|645333|30|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP046512 (Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atgtgtatacagtcaagcttttttacatta CRISPR spacer cctctcatatagtccagcttttttacatta Protospacer . . .***.**** ***************
4. spacer 3.1|647030|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK439959 (Escherichia coli strain Ec-2Lar plasmid pC-Ec2-KPC, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttaaagggtaatacattaattgtaggtgaa CRISPR spacer ttaaagggtaaaacattatttgtttttccg Protospacer *********** ****** **** * .
5. spacer 3.1|647030|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015283 (Prochlorococcus phage P-RSM4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttaaagggtaatacattaattgtaggtgaa CRISPR spacer gataatggtaatacattaattgaaggaaca Protospacer ** **************** *** . *
6. spacer 3.1|647030|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AB711120 (Bacillus phage PM1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttaaagggtaatacattaattgtaggtgaa CRISPR spacer gctgcgagaaatacattaattgtagatgaa Protospacer . . *.* ****************.****
7. spacer 3.8|647493|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016890 (Pantoea agglomerans strain C410P1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gatgtcagcgttaaacggcactggtatcac CRISPR spacer gatgtcagcgttaaccggcaccagatagtc Protospacer ************** ******..* *
8. spacer 3.8|647493|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693541 (Marine virus AFVG_25M436, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gatgtcagcgttaaacggcactggtatcac CRISPR spacer taactcagcggtatacggcactggtattgg Protospacer * ****** ** *************..
9. spacer 3.9|647559|30|NZ_CP012269|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AF191797 (His2 virus, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgcactcgtaggattacaaacgatacct CRISPR spacer cagacattcgtaggattacaaacgattgcg Protospacer .**.******************* *
10. spacer 2.6|645663|30|NZ_CP012269|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015585 (Roseomonas gilardii strain U14-5 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tggaccacaggatatgtggaagcgaccccg CRISPR spacer cggaccgcaggatatggggaagcgttttgc Protospacer .*****.********* ******* ...
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
148963 : 186384
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012269|148963:186384|DBSCAN-SWA AATCAATGACCCTGTTCGGAACCTCAAAGGACGAAAGAAAACACAAATAGTTGATCAGATCAGGGTCGAACAAGAGTCTCTTCCGAAATCTAACCGGTATAAAGTCGGCGATATTCTTAAGACCATTGGACTTAAGAAAGCGACTTATCATGATGAACGTAAACGTATCAAAAATTATGTAGATAAGTATGAAGATGTAAAAGTAGAGATACTAAAAATTGCCGAAAGCGGAAGATATCGCGGACGTCTAACCTACGGTTATCGTCGCGTTCAAGAAGAGCTCATTAAATTAGATATCCATCTATCAGACGCCGTAGTGCGTCGTTTGATGGATGAATTAAATGTTCAAGTAAGCCTTTATAACCGCCACAGAAATGGTAGATATTCATCTTATAAAGGTACAGTTGGAAAAGTGGCCCGTAACGTTCTACATCAGCATTTTAATGAAACCGTACCTTTCAAAGTATTACATACCGATGTTACACAAGTACGCTTGGCCGATACTAAGTGGGCTTACGTTTCAGCTATTACTGACGAAGCAAGCAAGGAAGTTTTAGCATTTCAAGTAAGTAATAGTCCTAACAGTAAACTAATTATGGATACACTCGATGAACTCACAGAAAATATTCCGGAAGGAATAAAACCAATAATTCATTCAGATCAAGGTTGGCATTATCAATTGAATTACTATACCGATAAACTCTCTGAAAAAAAATTTATACAAAGCATGTCTCGTAAGGGAAACTGTCTTGATAATGCGCCAATTGAAAGCTTCTTTCATCTTCTTAAAACAGAATGTCTTAATGGATTTCCACAGTGTAAAGATATTGGAGAATTCAAGGAAATCACAAAGAATTACGTCGATTGGTTTAACAATCGACGAATATCACAGAAAACAAAAGGCATGACTCCCTGCGAATACAGGGAACATGCCTTAGCAGTTTAAAAATATTCAATTTTGTCTAACTTTTGTGTTGCACTTTACTGTTTAATTTCATCCAAAAACTTTTTCATTTCTTTTTGGTTCTTAAAGGATGGAAAATCCCCTAACAATACCTTTGATGCTTGTTTTGCTTGTGTACCATAATTTTGCACGATTAATATTGATTTTTGTAAACTCGCATTAGTAAACAAATCTTTAGGCAAATTCAAGAAGCCTTGTAAATAAATGTTATTCTTACAATAGTTCAATAAATTAGCTGCTTGGTCCGTTTGAAAAATATTAGTTGGCACCAAGAATAATCCAAATCCACTAGCAACAACATGATTCATTGCTTGTTCAATCAGCAAATGATGAACGTACGAATGCCCTTCTGTACTATGTGTTTGATACTTTTTAACACGAACATCAATTGGATAGTAACCAACGGGCAAGTCAGAAACCGCAACATCGGCTGAATTAAATACTAACTGATCTAAGGCGTCCTGATGAAACAAGTCGACATCTAAATTCTGTAATCTAGAATTAATATCTGCCATTGCCAACATTGAATCATCATTATCAATTCCAATTCCAGAGATTTTGGTTTCCTTGTGATTTTGATGAATATCATTCATGATTGTAGTAAGTAGGTTTCCAGTTCCAACTGCCGGATCAAGAACTGTCAGTGTCTTAGTATCTGCAAGTAATTCTTGTAGCAAATAGGCGAATAACATCCCAATCGTATCAGGTGTCATCTGATGATTTGCCTGAATATGATCCTGTTGAGACGCATTCAGAATAGCCAATTGAAGAGCTTGTCGAACAACCTCAGCATTGAGTTGCTTGATATTTGTTTCTTCATAAAAATGCTCTAAATTATGCCTTGCACTCGTGCTAGGCTTACCATCCTCAATATGAACCTCACCAGAAATTAGGTTATCACCAGTTTCAATTAAAGCATCCAAATAAGAACTATCTAGCTCTTTCATTAGAATTTCGGTACTTTCATCAATTATATTAAATAATTGTTCAACTTCATCATTATTCGTAATCTTTCACCTCATTATTAACTTAAACTCCTAAAATAGTTTAACATTAATTCAATGAAATTGGCATTTATAGCGGTTGACTCCTCAATTGAAATTTAAAACAATGATGGTTCTTTAAAAGAACCACAATTTTTTTATCTTCAATCTTGGCGGTTCCAATACTTGATATAATTGATTTTTGGTCCTTATTAGTTTTTCTCTTTAAAATCAATACATTACATAACATTCGTCCTTCATTTGCTTCAATCATTCTAGTCTGATCAGTAATGTGTGCCTGTCGATTTTGTTCAATTTGAAAAACTAAGCCACTATAAATAGTCAAAAAAACGATTGCACTCAGTAAAACATACCCAGATTTATTTTTTTTGAATATATACATTCTCTTTTTTTGTTTCTCCATTATCAAAATCTATTTTTAGTTTTAAAAAAGGCTCTTTATAATCAAAACTAACCGCCTTAATATGAGCAATTAACGGAATATATCCAGGAGAAAAACGTAATTCATCTTGATACTTTTCCAGTTTATAAACTTTATTTTCAGCATTGCTTTCTAAATAAACATAGGTGCTGCTGTTACTCTTAAATCGAAAATCATGTTTTTCTGATTCTAATTCACCAACTAATAATTGCAAATTTGCTGAATTACTTTGTTGCGAAAAAGAAATATTCGTTAACTTTGTACTAAACGAAATAAGCTGATAAATCACTCCCAAAACGACTAACGAAATTGCAACTTCTATTAGTGTGAATCCTTCTTTTTTATTCAAACTCTATTTTCCTTATAACGTGATGTTGAGTGCCTTCTAAAACTAATAACCTCGTTGAGTACTTAAGCGTATCGCTACCAATATGCATTTCTTGATCTTTTTTTTCATCAAACCGGCGACTTCCTTCCAACATTTCACGGCTAATTAAAACTTGGTTTGCCAATTTTTTATCAACTTGTCGTTCATTTTGAATACAATCATGAACAAGGACTAACGTAATACTTATTAGCATCAATGCAACAAGCGATTCACTTAAGATAAAACCATTTTTATTCTCTTTTAATATGATAAACACCCCACCCTAACTGCACGGTCATCCGATAAGTACATTTATTAATTTTTGAATTAAATGCGATTGTCTGGGGCTTGACATAGCCATCACTACCGATTTTAATCTCTTGATTGCTGAATAAAGAAAGTGTTTTCGGTAATTGCACTTCATAATTTTCCTTATCAAATGTCTTTAAAGGTCTAAAACTAACCTTATTTCCGGCTTTATCAAAAGAAATATAGGTAACAACTCCTTCTAAATTAGCAAATTGTTCATAGCGTTTCCATTCACGATCAAACGTTGCCCAAAATTCCTTCTCATGCTGTTGTTCAATGACTCTTTTAAATGCCATGTTTCCTGTTGAAAACAGCAAAGAAACAATAGTCAAAACTACCAGTGATTCTATTAATGTGAACCCATGCTTTGATTTGCTCATGATTCTAGCTAATTAACTGCTTTATCGTCTTTAATCGTAATATTATTTTTCTTTGCTTGATCAAGTTGTTTGTCAGTTAAATACCCTTTTTCCTCCAATTCATCAAGTGAAGCCGGTAATTTTTGATGCTCATTTTCGTATAAATCAACTTGTGTCTGAACCACTTCAACCATTGCGTTACCATGAATCTTTTTGGCATTATTTCGTTGTTGTGCAATATTTGGCAATACAATTAAAATCAAAAGCGAAATGATAAATAAGACCACGGTCATTTCAATCAAAGTAAATCCTTTTTTTAAACGTTGTTCTTTTTTCATTTATAAACACCCTCCATTGAATGATACATTGGCAACAACATACTTAAATACATAAACACAATAATAAGTCCAATCAGTAAAAACATGAGTGGCTGTACTAATCCAATTAATCTTTCGATCTGTTTCGTTAATTTTTGATATTTAATTTTGGAAAACATCACAAGTTCTCGACCTAAGGCTTCCCCCGTATTGCCTTTATTTAATAACACATTCAGTTCTTGCGGAATGAATGGATAACGATTAACAAATGTGGATGTTTTTCCACCTTCTGCTAACTGTTTTTCAAGAGCCGTACCAATCTGAAAAAGCAACGAGGTTGACGAAAAGTTTGCTAACATCGCACAGATACTTTTAATTCCTAATCCGCTTTTTAATAGCATCGCTAAATTTAAAGATAGGTAATAGTGACAATAGGTTCGATAAACATTTCCTACAATTGGCACATGACAAACTAGTTCTACCCGTTTCACGGCTGGCTTTTTTAAAAACCTCTTCATATAAACAATTAAACTACCAATTAGAATTCCCAAAACTAGAAAAATAAAAATGGTCGATCCTTTTATTGCATGAACTTGTGTAGCAGCATTCCACATATTTAATTCAGGAAAAATGTAAGCTTTCATTCCAACCATCAATGCACCTAAAAAGATCAATAACAAAGCCGGATATTCAAGCAATTGAAGTAACTTTGTTTGTTGTTTTTGCTTTGCAGTTAAATATATTCCCAACGATTGCAAGCTTTCGGACAAATCTCCATGTTTTTCTGAAATTAAGATTTGATAGAAAATGTCTTCATTCAAAAACGGTTTAATCGCCTTTGAAAAGGAATCTCCACGTTCCAGGCCACTAATTATTTGCTCGATTTGGTGTTTTTTTGCAGGAATCACAACCTTTATAAAAGTCAGTGCTTCCCCTAAACTAAATCCAACCGCTAATAAATCAGCTAATAACATAAAAAATCTTGCCTGAACCTTGACTGAAAATTTAACCTTCTTGATATTCCAACAATGTTTTTTCTGAAATATTGTGTTTTTGATATTCTTTTTCAAGACACTCTCCCCATCTTACGTTCATTTTTTGATTGGGCATCTTATGAAAAGCATTCTGCAGTTCTTCCCCATCCATAATGTCAAAAAGTGCTGCTACCTCTCCTTTTTTCACAGGAATTAAGTGTTGATATGCAATTCCCGTTAAAGCCTGTTGCAGCATTTCCGTATCTATATTGAATTGCTGTAATC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40 | Bacillus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
205051 : 229973
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012269|205051:229973|DBSCAN-SWA 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27 | Lactobacillus_phage(36.36%) | terminase,bacteriocin,integrase,transposase,head,capsid,portal,tail | attL 206905:206920|attR 220951:220966 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
245631 : 302558
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012269|245631:302558|DBSCAN-SWA 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47 | Streptococcus_phage(22.22%) | transposase,tRNA,holin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
332098 : 452001
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012269|332098:452001|DBSCAN-SWA 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108 | Streptococcus_phage(16.22%) | terminase,protease,integrase,transposase,head,capsid,portal,tRNA,tail | attL 325127:325144|attR 457468:457485 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
464239 : 522994
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012269|464239:522994|DBSCAN-SWA 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53 | Pseudomonas_phage(22.22%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
542795 : 603855
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012269|542795:603855|DBSCAN-SWA 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48 | Bacillus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
665119 : 727625
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012269|665119:727625|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(23.08%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
770084 : 836973
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012269|770084:836973|DBSCAN-SWA 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45 | Bacillus_phage(22.22%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
890501 : 947268
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP012269|890501:947268|DBSCAN-SWA 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49 | Bacillus_phage(28.57%) | transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
950682 : 964365
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP012269|950682:964365|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP012269|950682:964365|963238_964123_-|WP_105782191.1|transposase|DBSCAN-SWA MRQKVNPDDWQTAVDINLKHHSIKETCKVLSVPRSTYYEHQQNHVSPQAKRRKTLSQSIKRIYFNSRRIYGAPKILKALQKEGKTASIKLVQRLMRQMGLKSITRKKWHYQQTNDIDATDYSNILAQDFRTTSPNQKWCADITYIHTKANGWCYLSSIQDLYSRKIIAHKISRHMTADLVISTFQQAFETRKTTNNLIVHTDLGSQYRSAGFEQILAQHHIRHSYSKRGCPYDNSCLESFHASLKKEEVYQHHYQDFEEANAAIFSYIESFYNSARIHSSIDYLTPNEKEKLVA >NZ_CP012269|950682:964365|959097_959919_+|WP_158511251.1|DBSCAN-SWA MNKMYKVFIQRIDYRITLASFTLLMIISGVQYLQSAIQISAREGIFHDSPYTSWLSMDQFNFIPILFFLLVPLLASIPGATLIIKDLKEHFTRQLILRLGGLKVAWGYLLTSLILGSILVGGTLLINFLAFFLLLPNTVPDIFLNLNIAVITQDTMWVSLYYTQPFLHALFSIVVATVWSGLFAAFATSMAWFINNRFFAVASGLILQVGLMLLNMVFPLPRQISYIPYDFMHESASANVSGKVVLIMTLVMTAVIILLALIGGRIRAYEASN >NZ_CP012269|950682:964365|957001_957886_-|WP_145912937.1|transposase|DBSCAN-SWA 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22 | Bacillus_phage(88.89%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
1048054 : 1091517
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP012269|1048054:1091517|DBSCAN-SWA 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36 | Bacillus_phage(60.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
1103006 : 1145917
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP012269|1103006:1145917|DBSCAN-SWA 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43 | Streptococcus_phage(20.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_13 |
1229811 : 1338992
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP012269|1229811:1338992|DBSCAN-SWA 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97 | Streptococcus_phage(25.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_14 |
1377677 : 1412997
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP012269|1377677:1412997|DBSCAN-SWA 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33 | Bacillus_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_15 |
1447962 : 1494617
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP012269|1447962:1494617|DBSCAN-SWA 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45 | Streptococcus_phage(15.38%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_16 |
1541691 : 1602060
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP012269|1541691:1602060|DBSCAN-SWA 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59 | Bacillus_phage(21.05%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_17 |
1617264 : 1689538
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP012269|1617264:1689538|DBSCAN-SWA 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60 | Streptococcus_phage(23.53%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_18 |
1803138 : 1859714
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP012269|1803138:1859714|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(18.75%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_19 |
1863326 : 1912365
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP012269|1863326:1912365|DBSCAN-SWA 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46 | Bacillus_phage(50.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_20 |
1961694 : 1971601
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP012269|1961694:1971601|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP012269|1961694:1971601|1965031_1965877_-|WP_062904245.1|DBSCAN-SWA MAKVKIVTDSSCGVTDQEVQDYNITIVPLTVMIDDTIYVERETISNEEFLNKMQHSKALPKTSQPPIGKFVETFDKLGEDGSQVICFDMLEAISGTVHAAEQAAQLSKTDVTVVDSQTTDRALAFQVIEAAKLAQAGKSRDEILKAAVNIRDHTKLYMGVMTLDNLVKSGRISHMTGMISGFLNIRIVLQVTQGELKVVAKGRGMKTINKFFDEVYKKMAKTSNIKAIGISHVGALQTVLPIKEKIQEMFPDIKILVRETVPIIATHGGPGAFALMYYTGD >NZ_CP012269|1961694:1971601|1963988_1964927_-|WP_046871116.1|DBSCAN-SWA MKKITDWVIMLIVFVVIIALVVLGLNYYFPTHSTPDQSSKTTHIVHKATKTKKKHIRITALGDSLTQGVGDSKNEGGYTKRLQKKIKSNYNVKTKVANYGVSGERSDQILKRVKQDSKLQKSIKNSDAITITVGGNDLFQALQKYSTASSGEFTLSLEKLNIKYATHVQDLLKQVRKYNSNAPIYVVGIYNPFFVYFPNITQINKAITNFDETTQAAVSQTKSAYFISVNKLLSRGQYQSAKSLSELKQSSTAKSIDDMQISKVEKNLENTKEKNIYISSSDHFHPNPTGYDQMTRLLLRSLHTHDQWLYEE >NZ_CP012269|1961694:1971601|1963377_1963983_-|WP_046871117.1|DBSCAN-SWA MKNRTELPKKKGLNLWKWAFIALLAIVIAFGIFFRMRIANTPVPDTQSQITTTKASSVDVKLNKEQLNALMAAYLKPYQSNKDFSYQLKVNKQVLLIGKVKVLGSNVNYALSFTPKVQSSGNIVLTAKHLAVGALSISPKLVLDYINSNYNLPKWISIKDKVITLNLQNIKTANGVYFKAKKLDIKNDKFIFLINIPKQSN >NZ_CP012269|1961694:1971601|1970725_1971601_+|WP_046871138.1|DBSCAN-SWA MVKKESMRFKDLFMIFLGCCLYGLGLAAINIPNHLAEGGATGITLIFRALFHIDPAYSTILINIPLLAIGYRFLGKRALYYTIFGTLMLSMWLWIWQRVPINIDIGHDMFIAGILAGLAGGFGSGLVYRFGGTTGGTDVIARIIEQKRGIPMGQTLFVLDAVVLTISLCYIDIRQMMYTLLAAFVFSKIVTFTQVGSYAERGILVISDNYQLIADQLMESLQRGASFVHVQGAYSKDEKKMVFCVLSPNELSEAKRIVNQLDPHAFISIIDVHEVIGEGFTYDSPTGKKVS >NZ_CP012269|1961694:1971601|1966480_1967431_-|WP_062904246.1|DBSCAN-SWA MLEQAYLNLEKYVLENGNYKDDRTGTGTYSIFGYQMRFNLAEGFPILTTKRVPFGLIKSELMWFLHGDTNIRYLLEHHNHIWDEWAFKKWIESNQYTGPDMTDFGRRSLKDQSFADQHHEQKKIFDDKILNDDTFAKEFGDLGNVYGSQWRAWKTSTGGTIDQISEVIHTIKTNPDSRRMIVSAWNPEDIPSMALPPCHTMFQFYVVDGKLSCQLYQRSGDIFLGVPFNIASYALLTCLIAKETGLEPGEFIHTLGDAHIYANHVEQVKTQLSRSPRPAPKLIIDSQAKSIFDYDVKDIHLEGYNPYPAIKAPVAV >NZ_CP012269|1961694:1971601|1961694_1963125_-|WP_062904244.1|DBSCAN-SWA MDKKQPKTVKRTTLIWSIIIALLVGGGLAYGVAYVQTRAVISQAQSTTASMQKIQAVYSTIEDNYYKPVSAQKVTNGAIKGMISSLNDPFSEYLDKTDATSLNNQISSSFSGIGAEVQKSGQYIKIISPIKGTPAKKAGLQPGDLIIAVNDKSIAGKSVTEAVSLMRGKIGTKVTLTLKRNNKDFKQTLTREKITVNTVNSRVINKKIGYIQITSVSERTASELKTALKNLDKKGVKSYVLDVRDNPGGLMDQALKMSSMFLKNGKVIMRVQAKTGQQQVYKAGKKYDGGYKVTKPVAVLMNGGSASAAEIFAGALHQSANAPLIGTQSYGKGTVQTVSDFKDKSEMKITIAKWLTPNGSWINKKGLTPTYKADYPKYAYLQLINTDKTYKIEDVSTQVKTLQKELKALGYFEGKTNGYFGKTTQTAVEAYQQKNKLTVTGTADSKAILNIETKIQSQIAKNDNALKKAENVLNKK >NZ_CP012269|1961694:1971601|1963136_1963367_-|WP_046871118.1|DBSCAN-SWA MSVSKTFYQFLMTQRNPESYDPISEFANNAFYDQAFPKQSTNFDELSKYLELNGNYLPSMTIFDETWQKYLDSNAH >NZ_CP012269|1961694:1971601|1967449_1969351_-|WP_046871112.1|DBSCAN-SWA MQTLKAENLTETYGTKTLFDHINFLINAHDRIGLIGTNGTGKTSLLNVLANIDPQDSGEIETPKNYTVGYLRQTPTLDDNMTIMDAVFAGSQTVFKTIRFYEETLEKYSANPESADNQRQFELAEQRMNQDDAWTAESDVKTILTQLHITDLSQKIGTLSGGQQKRVDLAQTLIQAPDLLMLDEPTNHLDFDSIAWLEKYLAAYKGALLIVTHDRYFLDQVANQIWELSFGKLYQYPGNYQAYVAEKAVQEEQAASQSQKQHQLYKQELAWMRRGPQGRGTKQQARINRFDTLSDSVNAPAKNTDNIAVQLGQQRLGKKVISLKDASLRLGSHLILDKFTDLIQADERVGITGNNGTGKSTLLNVIAGRIPLDSGTIDIGETVKLGYYTQKIEPIPEDKRIINYLSEVGAGVLNANGERISVTNLLEQFLFPRAMHGTLIRKLSGGEKRRLYLLKILMQQPNVLLLDEPTNDLDIGTLTVLEDYLANFQGTVITVSHDRYFLDKVADHLLIFEGHDKIAHFSGRFTNYLHQINETQQVSEKQVQPPEPTSSKNSTDDQKEKTKLTYAEQLEWQTIEADIDKLENQKKDCQSQMNATADDYGKLADLQKEIDDLDAQIDKKMTRWEYLSQYTTD >NZ_CP012269|1961694:1971601|1969357_1970581_-|WP_062904247.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQIKKLPQEFITARPILQTIEGAGYEAYFVGGSVRDTILKDHIHDVDIATSAFPSEVKDLFKKTIDTGIKHGTVMVLDHQQKYEVTTFRTESGYQDFRRPDKVTFVRSLEEDLKRRDFTVNALALKEDGTVVDLFSGLQDLQNHILKAVGIPEERFHEDALRMMRAVRFASKLDFVIEEKTEAAIKHNAPLLKKIAVERILVEFEKMMMGQATTKGVKYFLEIGLYAYCPQFEGKLKPLSQLLNLNPKFRLTTETQVWLLICHTLELSREQSRSFLRAWKTSNELIAEVESGIQLLNAISKNSVSEKLLFRTGKKVLQSVINVLLAMNSKIDTSTLLARYNELPIKSTHELNVNGHDLLTANITTPGPQMGRIISYLLDGVLTGQFKNNQSELLLKAKKYTSSNLES >NZ_CP012269|1961694:1971601|1965946_1966462_-|WP_046871114.1|DBSCAN-SWA MLAFIWAESKNGVIGSHNQLPWHIPDDTSYFKQLTTNHPVVMGRKTFESFGAKPLPNRLNIVLTRQTSLKETDNLKVYHSVEKFLADFSSDSRLIFIIGGKEIYRQLYPYAEKLYRTRIDDCFAGDTKMIAIDYSKWRLVETLTGSGPKKKPIPHRFEVYERKNTARVSND |
10 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_21 |
2059962 : 2067728
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP012269|2059962:2067728|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP012269|2059962:2067728|2064010_2064265_-|WP_046871205.1|DBSCAN-SWA MAEKDEEFQKLIKRINELAHKAKSDGLTDLEIIERKDLRQRYLKRFREGFKSQVEMMQVFDKSGKEVTPEKVKNVQRKKGLRDD >NZ_CP012269|2059962:2067728|2065596_2066541_+|WP_141306420.1|transposase|DBSCAN-SWA MNDPVRNLKGRKKTQIVDQIRVEQESLPKSNRYKVGDILKTIGLKKATYHDERKRIKNYVDKYEDVKVEILKIAESGRYRGRLTYGYRRVQEELIKLDIHLSDAVVRRLMDELNVQVSLYNRHRNGRYSSYKGTVGKVARNVLHQHFNETVPFKVLHTDVTQVRLADTKWAYVSAITDEASKEVLAFQVSNSPNSKLIMDTLDELTENIPEGIKPIIHSDQGWHYQLNYYTDKLSEKKFIQSMSRKGNCLDNAPIESFFHLLKTECLNGFPQCKDIGEFKEITKNYVDWFNNRRISQKTKGMTPCEYREHALAV >NZ_CP012269|2059962:2067728|2059962_2061759_-|WP_062904275.1|DBSCAN-SWA MQNKKESIWAHTMTTKEQFRTIKRMLPFTKPFWKQFVVAIIFAGIVSVINILLPRLIQYYMDHFLIHSSTPLSIMFLFAGLYFLGAILQAIFQFGQTFLYAMGAERTLERVRVLLFRKLHKLGMNYFDATPAGSIVSRVTNDTMSLQDFWTLFLTLIVGVFGMASALVAMFTTNAKITWATLSLLPFLVFIIWFYQKYSSTVYRRMRENLSQLNTKISESLVGIGVIQQFRQEKRIESEFEKTNNEYLFARFSMIRMNSLLLNPIINLMYALGVVIALGLFGINAFKEPVAAGVIYAFVSYIDSFYNPMSSMMDYLSTFQDGLVASTRILRIFDNESYQPKQNEQSDLEISEGKVEFKHVTFSYDGKNNVLNDISFTVNPGEAVALVGSTGSGKSSTINLLMRFYEFQSGQILVDGHDIRDYAEAELRKKIGLVLQEPFLFYGDIASNIRMYNEDITDDQIRRAAQFVQADHFIEELPNGYHNKVIERGVEYSGGQRQLISFARTIASDPKILILDEATAHIDTETEDMIQGSLKKMSQSRTSLVIAHRLSTIQDANQILVLKHGRIIERGTHDELLAKKGMYYDMYQMQGNTKVETE >NZ_CP012269|2059962:2067728|2064402_2065032_+|WP_046871206.1|DBSCAN-SWA MSKTSESKQFAVLRYIYDKVNEKGYPPTVREIGEAVSLSSTSTVHGHIERLQKKGLLQKDPTKPRALEITPAGLEELGVSATPNKIPILGTVTAGAPILAVEEATDFFPLPPDFEHEDGDLFMLNIRGESMIQAGILNGDQVIVRKQSSADNGDIVIAMTEENEATCKRFFKETDHIRLQPENDTMAPIILDNVSILGRVVGLYRDKIY >NZ_CP012269|2059962:2067728|2065111_2065645_+|WP_002331365.1|DBSCAN-SWA MVKYSSELKAEVVSEYLQGDISISLLSKKRNLPRIQVGRWIQNFRLSGADALKRRRVKRSFSVEFKVDVINYYQTHDETLAEVSAKFDVNSCQISLWRTAFNQYGIEALKPHPKGRKTKVKHNKKKLRKLVNKNEIDQLREELTKKNQELYDAKLENEILKKSMTLFGTSKDERKHK >NZ_CP012269|2059962:2067728|2066603_2067728_-|WP_046871207.1|DBSCAN-SWA MKVIVAPDSFKNSMTAKKATESIVAGLKKVDPKIKTVSLPMADGGEGTMTVLMDHFKGNRYSVEVTDAIGRPIKAELGLTEDKAKVAVIDMASASGIEHLKGAELNPFRATTFGTGQLLQASLAHRPKKIYLGVGGSATNDGGAGMAMALGFQFLNKAGKSIDLGNGGLSELETIVAPTKKVISVPLIVLNDVANPLLGPDGATNVFGTQKGASSDDKKVLEENLHHLSLVVQRDLGKDFASDWGTGGAGGLSYGLKTFFGAQLTSGIDSILKLLDFKEKVVNADYLITGEGSFDTQSRNGKVPFGLAEACLKLNPECKVIVLAGRIAPDLGELPANIKLVKSINDGQPLAKQTLDMGSENIYHLSEWLTSNYL >NZ_CP012269|2059962:2067728|2061748_2063512_-|WP_046871203.1|DBSCAN-SWA MSIFRKLAWFFKIEKWNYLIGVIFLLLVAVLNVLPPKIIGNLVQLISTNKLKATTLTFSLIVLVSVAILQYLFRFGWRSRIFGGAARLEKTLRSRLFTHYMQMDQTFYQEHRTGDLMAHATNDLQAIQQVAGSGILSFADSIITGITTIIAMMVLVDWRLTLLAMIPFPLLAISAGYLGTKIHIAFRKSQAAFSRLNNKTQESVMGIKVIKSLGQDKEDTADFEKLIDQTIKINRKVNALDAMFNPMTTILIGVSYMITLVLGGSFVVHNVINIGQLVSFISYITMLIWPMFAIGNLFNIMERGNASYDRVNLLLHAKSSIIDDKHAVKQRATGDLNFAIQSFTYPGDEQSSLNRVSFKLPAGNTLGLVGKVGTGKSTIMKLILREFDDYKGEITVGGINIKDYALNTYLPSIGYVPEESFLFSDTIKNNIKFGDFSATDEEVIEAAKKSDLYDDILDQPDQFDTEVGEQGVSLSGGQRQRLAIARALIINPEILLLDDALSAVDGETEHEILKELRKERKGKTTIIAAHRLSSVMNANEILVLDSGEIIQRGTHEELLKQDGWYQDMFHRQQMETKIAKEGDLDAE >NZ_CP012269|2059962:2067728|2063623_2063851_-|WP_046871204.1|DBSCAN-SWA MSTGIWILIVVIALLLGAVGGFFAARKYMESYLKNNPPINEDMLRTMMLQMGQKPSQKKLHQMMSSMQNQAKHQK |
8 | Bacillus_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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