Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1534 chromosome, complete genome | 7 crisprs | csa3,RT,DEDDh,cas3,csn2,cas2,cas1,cas9,WYL,DinG | 7 | 8 | 20 | 1 |
| NZ_CP012286 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1534 plasmid pL21534-3, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP012284 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1534 plasmid pL21534-1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP012287 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1534 plasmid pL21534-4, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
| NZ_CP012285 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1534 plasmid pL21534-2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
1. NZ_CP012283
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283_1 | 486341-486639 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012283_1
|
6 spacers
spacers of NZ_CP012283_1
>1.1|486366|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder TTGAAACTTTGCTGCCA >1.2|486408|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder GAGTCTTAGTATTCTGT >1.3|486450|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder GTGTAGTTGTAGTCCCA >1.4|486492|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder GAGTTGTTACATTACCA >1.5|486534|38|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder TGGTGATTGTGGTACCACCATCTGTGATGATCGTGCCA >1.6|486597|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder GTGTCTTCGTATTTTGT |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012283_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012283_1 >merge|NZ_CP012283|1|486341-486639|CRISPRCasFinder CCTGGAGTCGTAATTGTGCCACCATTTGAAACTTTGCTGCCACCTGGTGTGGTCTGTGTACCGCCTGGAGTCTTAGTATTCTGTCCTGGTGTGGTTACTTTACCGCCTGGTGTAGTTGTAGTCCCACCTGGGGTAACTTTGTTACCACCTGGAGTTGTTACATTACCACCTTTGGTGATTGTTGTACCACCCTTGGTGATTGTGGTACCACCATCTGTGATGATCGTGCCACCCGGTGTGGTTGTTGTGCCGCCTGGTGTCTTCGTATTTTGTCCCGGTGTCTTTACAGTGCCACCTGG >NZ_CP012283|1|1|486341-486639|CRISPRCasFinder CCTGGAGTCGTAATTGTGCCACCAT TTGAAACTTTGCTGCCA CCTGGTGTGGTCTGTGTACCGCCTG GAGTCTTAGTATTCTGT CCTGGTGTGGTTACTTTACCGCCTG GTGTAGTTGTAGTCCCA CCTGGGGTAACTTTGTTACCACCTG GAGTTGTTACATTACCA CCTTTGGTGATTGTTGTACCACCCT TGGTGATTGTGGTACCACCATCTGTGATGATCGTGCCA CCCGGTGTGGTTGTTGTGCCGCCTG GTGTCTTCGTATTTTGT CCCGGTGTCTTTACAGTGCCACCTGG
>NZ_CP012283.1|WP_046872291.1|483691_485059_+|ISLre2-family-transposase MYILADFIESLGNLDSLFDLEEQVILHLRKSFQLVVAEYLRQLDETLVPSIPAENTFINRQARTIEFMFGAVNFERRCYLRPNGSYYFPLDEQLQLEERKRISPYFKSVVAKIGQTTTMRNTAAMINLASQTDISAWSVDRIIRDMADTVKTEEKSSEEKLVKKRKVENLVVEGDAFEIHKINRRRQDVHHYIVFESGLDGTRSNKVEFVGINQKKVQKRVTDYIEKYYKISEMTVFTASDGGPGYNPKSMREIVPSAQRVEFTIDRYHFVKKIKQTFGLFNPLVDKAVKSVSLYDQNQLNVILDTFESQIKTDKELESLRVLRQYLARNWQFIKSPHDRGFMRVGKLGSVESSHRAYTYRMKKQGKVWSEKGLEAMLKLIEARVNGKLDKYLRGGLRKLQELTIEIATESLKTLSSAQLSNKHHSKHIGVLSGKIPVDAPTSSPIGAMAKIFSN >NZ_CP012283.1|WP_062909602.1|480417_481428_-|glycosyltransferase-family-2-protein MQKTVSIIIPFHNEPIYTVFNVLTSINNQIGINFEKVEVILVNDGGPELPNGKDTFRLLKNLDVIYLRSSEGHGPGPARQMGMDHASGQYFMFMDADDQFHIDGALLDFFNVTDKKNYDIIAGKYVEQAKSIENGNLFYVFHDNNENYSIFSKWFNRDLIERYHIRWADDLKVFEDTYFVGLAYEFATNIKQIDAYSYTWLYNSKSVGRRIDNSGISFDDQLHIWSRGRRYFLEQVQEYKAARVEDWFVDYVADIYYRQKKFKPANMEKFTEEHIHLLREFSSYWLPARVKIMQAIISYNIKKTNYTGLSNDDAIKFLYDTEQYALGNQFSEKETK >NZ_CP012283.1|WP_056986064.1|479431_480415_-|glycosyltransferase-family-2-protein MDAKKEFRPTVSIIIPFYNEDEYQLMIALSSINYQIGIDFREVEIILVGDGGKKLKSLDDFSVLNNLNIRYKYFTNSGGAGVARQRGMEMAKGRYYMFVDADDEFYYDGALQEFFDVVKKGDHEVIVAKYIEQGRNADGSYFYLHNDPVWSAAYAKWFNRDYVERMGLHWLDDVRIFEDVYFCAMAVELASDVVWLDSFVYSWLYNEKSTVRDPALKFNIRLDQWAKMNKYYLRKIKEKAPQKLAFDFGNSIATLFYWEKKNPGYDEKTLDHEQQLMLKENADLWGSTQDIMQQQLQALHQPGSEYENYDISDFSKYLAHSEKLLKS >NZ_CP012283.1|WP_062909601.1|477973_479167_+|CotH-kinase-family-protein MATLFIGSDTASRSKAKSKISSVTIRQPNGENTLAQIKFSVQGNYTKDFKRRNFEFELYNDFEQSQSKLVKFGTWQPRSKFSLRGDYTDQTHSRNGTGYSLWKEILATEKIYPEKIRDKEMLGTIQTQPVNVFFDGMNYGIYSLSSYFDANSLKLDSNNEDEILLLALDGYTNDKDLAFANPTARLNDSDFGVMSHHTAADKKLFTNTNRLMKFIHSSTDQEFHKNAQNYFDPLNLIDYILFTGALDAFDNVTHNTTVFTYDGKHWLFSLIDLDISFDIDADGKLLSNPHPVLNHIDSPLFKRIFACFPEEVESRWQELRKTILSEDHVIDAYKQKMDEIGGTNFAADQNIWHSPTGPTSSLANVTNFVHRQLPKCDHIIEKSFHSNLLNGFKIDFK >NZ_CP012283.1|WP_056986062.1|477430_477931_+|SH3-like-domain-containing-protein MSDSNYDVYVNNMVEVNYDATIDQTARFDGLYKGMMWPYNHGDVAGNRDARPLHGTAIHVTQEANLNTGMTFVKFNWQGNDVWIPKEGVIPPTFDSQISLTNQLATLAKTNIDYPYFKDIPQTKKFSHIPIGYINKDRIAGQTILVTARAIRSDNQEFKQFFTNGS >NZ_CP012283.1|WP_046871591.1|476308_477199_-|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MLRRFQQTSFFDFITIFLRRYKKGNISNNGIVLAYYTLLSFFPLLLLIGNVLPLLNLPVNTVLKYVNRIMPENIYKILSPLIKQLLTTNNGGVLSIGVVVALWSASKGISAFQQALNATYDMENTTNAILMRILSFLIVLLFMVALIIIVFSFSFGQVALAYLTPLLQIPQDFINFVETIKWPITILGIWLILTILYMIVPMARVRWRYAWAGALFAMIGLVILTQFFTLYLRYFGGAVTTYKTIGTFIIIMLWLDFLAEIMLIGGVINAALQEKISGLPFKPKLSHLKRNHQTSH >NZ_CP012283.1|WP_046871592.1|475911_476274_-|DUF3899-domain-containing-protein MTITENIKKHKALTSEALIVILMLIDWLIFKDPLKVSNHFFMAGLLLLIVGIFFVLERGHLFTGWFRRPAKGEDDSDRKKIDVHKVGREKNGPIVITKPARYFLNIGSFTIIVSVLISLF >NZ_CP012283.1|WP_046870767.1|474043_475429_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MRKSQKTEQIADHRWMAGLEDQEHIGARSTASGENTRMSGIKFQDLVLARNNLNLAYQRVTKNKGAAGLDGMTVEDLLPYLKEHRKELLEQLANGTYKPAPVKRVEIPKPNGGTRKLGIPTVVDRMVQQAVAQVMSPVFEQAFSESSFGFRPGRSAQQAIKQVVSFYNEGFHRVVDLDLKAYFDTVNHDLLIKFIEQYVNDPWLTKLIRRFLTSGVMNHGLFESSEKGTPQGGPLSPLLANIYLNELDKELTKRGHKFVRYADDCNIYVKSQRAGQRVLESISNFLEGRLKVTVNQKKTQVGSPLRLKFLGFSLGVGHGGAYVRPAKEPKLRIKQALKQITKRNRGVSTDKIFQEIQQKMRGWIQYFSVGKMTTFIQTLDKWLRSRIRQYIWKQWKKTKTKINNLKRLGLSTSDAVKSANTRKGYWRTAHSKTLLYTLTNEKLERLGLMNLTKTLQFIQSA >NZ_CP012283.1|WP_062903874.1|473146_473953_+|sugar-phosphatase MIKLIAIDLDGTLLTDDKHIAAETVTAIKQASQSGVKVVLCSGRPLTGVAEHLHTLGLSGNDQYVITFNGALVQTIEGRVLIHHTLNYNDYTDLEALSRKLHNHFHVETENHIYTANKNISPYTIGESFYVRMAIRYRAVGDMPANFKISKGMFIDPPEKITELRKKIPQTFLDKYYFVQSEPYFLEVLNKSASKGNALKGLTKRLNLLPENVMTIGDQGNDLSMLQFAGTPVAMGNAIPEAKKLATFITSTNEENGVAKAIQKFVLD >NZ_CP012283.1|WP_062903873.1|471773_473150_+|HD-domain-containing-protein 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MGKNNILGRAKKIDEHYKMYKDGKRWMFAGMAMLSLGIGMATQVNDAHADTVVPTANVATTSSASKSSAASSTASSSASVSSASNSSVTSNSVNSSSASVGSASKSGATSSATSSSASVSSASNSSVTSSTVSSSTSVSSVSKSGATSSTATSNVTSNVKVPSSVTSISDATSSATVTNLVDPTNADIAAAKSAALIAYETTGKPQMITAAAAASVTAFTSTKTTVDTNPSTETDVSKTNPTKVTEDTGQGEQGTDALQAGSGAPTSTNMNVVVGSTIGVSGTVAGDQKTYLQVEVPDGLKANTNGNATVYTTISIPADDLSILTGLIEGIGTALSNGAKLVDAIPGVNFNAQGVVDAFDVSTLISKLGTGVFSAPVTQSADGKYMYVDITGDTGISNILTQDITQTITNLTNAVSAIHVTATVLGFTTDVSGTAASDIMSFLTPAINALKASITTGGSFINKIGSATLVGQIQTTVPVTAVTPTVTGATGSYTLEAQYVNDNTLEADIADLGNNTAKAVLTYKNTPVVSVSKVAGDSKSGYQITGTTTGGGAAARGVTVTVTDSAGNVVGTGVSDANGNTQSELMAALGLKVL >NZ_CP012283.1|WP_046871185.1|489886_490504_-|response-regulator-transcription-factor MIKIMIVDDHPIYRDGLRVAFKDKKDLKIMAEAENGKIALQKLDTVEIDIVLLDIRMPVLDGIATLGRIKSQFPKVKVIILTGYEDVNVFSKAMSLKTDGFILKSATAQIIFQTIHDVMEGKVIVSPKLLRNTTDYRNLRYELTDEDLDVLTRIAKGERTSKIAGDLHFGERTIKSHLTNIYEKLGVNSRVAAVAKVMQLGLIKL >NZ_CP012283.1|WP_052694479.1|490761_491835_-|DUF916-and-DUF3324-domain-containing-protein MKRKNLFLILITMVLGVLLTIPVSASELSFGVEANLPENQVDKGVTYFDLNLKPGATQTVTVTVTNSSKDQVKIEPEVNTATTNLNGTVEYQKVAKKNLDTSLKYSLADYVKPVEKTVVLNGKQTKKIHLKITMPKEKFNGVMAGGLRLQDKNQEVSKNAKKKKGTTVQNEYAYLIGIVLQQNTKKVLPDMKLASVKPGQVNLRNVINARLRNVKATYLNKLSVNAKVTKQGNSKVLYRQKRTNMQMAPNSVFNYGLQLNGQSLKAGRYVMNITAKSKKQTWHFKKTFTITREKAAKLNAKDVSIKKDYTWIYVSVGVLIILLLIAIAFWLSRRKLKAKEAENEALRQQLNKHEEDD >NZ_CP012283.1|WP_062909605.1|491861_492590_-|WxL-domain-containing-protein MINKKLLLSVLSIGTLVLGAVAPVTAFAAESRIEQSTATAAFKENTVDPVDPVDPTNPTDPTDPEIPGTGETGPLTIDYVSSFDFGTHNIPTADATYTAADAKKGDGTAIPNYVQVSDRRAGTPKGWSLTVKEEKQFVDTTGSELSGAALSLGTSQKQAASVGYPTSNDTVTSTTTGTALVPGATTSVMKADVGGGAGTWVDVFGEAGASSVKLMVPAAAHPNADSYSTKLTWTLADTPSGD >NZ_CP012283.1|WP_144010372.1|492977_493343_-|hypothetical-protein MKRGLLLTILTITSMCLINSPIRGDTHVSEVTSEGRVGFTKGTISPSYPPSDLRPADKVPNGPDTTIKPTVPVSAAKKQQFLPQTDEESDGILQVFGSLGFVVVAWYWMKKNQVRRHNQKN >NZ_CP012283.1|WP_046871182.1|493358_494864_-|hypothetical-protein MKRILKSLLVFVALTSIFGFYSHRNTYAEEADPMFSLTATKSLMKVGDKVEVKATRLRELTADSENFTLVVPTGMQLDENALSQSSQAANFQSHQESDKLILTVTDQTVKNFTIPLIAETAGTFSLSVLSANQLVTSNVVHVTAMAVPVESSSSTTSGTQAESTSSSAISDSSSTASSTSEQPESSSSADVVSESSSSSSSSETVAKSATSSANKKVISGRSMATAAISIDQTPNILQVSDLYYYGGSTGQPISGFFQDPDKEKVTVNFIITKTSGGGATPPNSGQVQTLGVINTSGGNVKDKFSYMIPAKSLAVHNAGSVGSVYKLTIQFTDGGTKPSSIRQANFRLLYVDGELTLTAPDSIGFGTDLDAKATGNPVYMNKTVTGNPLAVKDTRKIPTGAIVNGWSVTATLAKQMTGTNNEGVLANSLHYINAGTDYVLGPAAVPVKALPKSEPGTTNNISATWNSTNGLAFEPTAGQPVGGGAYSGAVTWTLQDTPGNK >NZ_CP012283.1|WP_062903875.1|495077_496613_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNKADLLEKTQQSLFKIMEILYLSDGSVSKQTLAQKLDLSPATLKRYLDDLQVDVQPLIDEKKITFCIGANTAEFKLIQNFALDDWIFRLYLKDAPKFQILMYIYKHGSMDSYQLQDDLNMSEASLYRVIKQLNKLLKEFELTIHNGHLQGSGLQVRFFYYILFQLTNYFPPKKSFAIDKFVDGLQSELHFYFHSEAVHRVDSWLIISQQRLGSQSVMDSEIPKRVRELYQKNELYQQVSKCYKQAFHMRSATKEQFEIEAFCVMLISMSVFNSKTNVARRFYDIYNSQKTQLADLVEKMNHTITSTLKISRHQWPFELMKLVFDICARPFCFTGDLAHMDEIYSEYYMTHFFSQEARLVVKELMQIFKKEPSTPFSQFIKQNENYFQRRLLFVIRDFRYQQIKDIDIGVDTTFDYYISQMVIDQVRQIFKKDIRVNVTYYQPGNAYDLVLTNYHEEPYDDTDYTYWLTNLGTIHDLEMIKKIVEKNFYAETPVHHLMLKQPNKLHNTKKW >NZ_CP012283.1|WP_046871146.1|496789_497335_-|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MNSGRPTPPRPNDHKTDSSVKGELTYEDKVVQKIIGIALEEIDGLLTVDGGFFSNVKDKLVNNDDVRAGINTEVGKKQVAVDMDIVAEYGTDIEDIFEQMKRVITREVKEMTHLEVIEVNVNVVDVKTREEYEADSETVQDKAMNAADKTGDFASRKTEDAKHAMSKGRHKIDEKTEPRVE >NZ_CP012283.1|WP_046871141.1|497411_497606_-|DUF2273-domain-containing-protein MQTFIDKYKLPIIGGVIGLILAILLVTIGFFQTLLLVVLVILGAAVGMYVDRTKLLERYLNNKN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283_2 | 487325-487553 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012283_2
|
4 spacers
spacers of NZ_CP012283_2
>2.1|487350|41|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder GTGTCTTTATTGTTGTGCCACCTGGCGATGTTACCGTACCA >2.2|487416|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder GCGTAATAGTTGAACCA >2.3|487458|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder GTGTCGTTGTTGTGCCACCTGGT >2.4|487506|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder GCGTTGTTGTCGTTGTTGTACCG |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012283_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012283_2 >merge|NZ_CP012283|2|487325-487553|CRISPRCasFinder CCTGGAGTTATTGTTGTGCCACCTGGTGTCTTTATTGTTGTGCCACCTGGCGATGTTACCGTACCATTTGGTGTTGTTTTTGTACCACCTGGCGTAATAGTTGAACCACCTGGCATTGTTACTTTTCCACCTGGTGTCGTTGTTGTGCCACCTGGTGTTGTTGTTGTCGTTGTACCACCCGGCGTTGTTGTCGTTGTTGTACCGCCTGGTGTCTTTGTTGTGCCACCTG >NZ_CP012283|2|2|487325-487553|CRISPRCasFinder CCTGGAGTTATTGTTGTGCCACCTG GTGTCTTTATTGTTGTGCCACCTGGCGATGTTACCGTACCA TTTGGTGTTGTTTTTGTACCACCTG GCGTAATAGTTGAACCA CCTGGCATTGTTACTTTTCCACCTG GTGTCGTTGTTGTGCCACCTGGT GTTGTTGTTGTCGTTGTACCACCCG GCGTTGTTGTCGTTGTTGTACCG CCTGGTGTCTTTGTTGTGCCACCTG
>NZ_CP012283.1|WP_046872291.1|483691_485059_+|ISLre2-family-transposase MYILADFIESLGNLDSLFDLEEQVILHLRKSFQLVVAEYLRQLDETLVPSIPAENTFINRQARTIEFMFGAVNFERRCYLRPNGSYYFPLDEQLQLEERKRISPYFKSVVAKIGQTTTMRNTAAMINLASQTDISAWSVDRIIRDMADTVKTEEKSSEEKLVKKRKVENLVVEGDAFEIHKINRRRQDVHHYIVFESGLDGTRSNKVEFVGINQKKVQKRVTDYIEKYYKISEMTVFTASDGGPGYNPKSMREIVPSAQRVEFTIDRYHFVKKIKQTFGLFNPLVDKAVKSVSLYDQNQLNVILDTFESQIKTDKELESLRVLRQYLARNWQFIKSPHDRGFMRVGKLGSVESSHRAYTYRMKKQGKVWSEKGLEAMLKLIEARVNGKLDKYLRGGLRKLQELTIEIATESLKTLSSAQLSNKHHSKHIGVLSGKIPVDAPTSSPIGAMAKIFSN >NZ_CP012283.1|WP_062909602.1|480417_481428_-|glycosyltransferase-family-2-protein MQKTVSIIIPFHNEPIYTVFNVLTSINNQIGINFEKVEVILVNDGGPELPNGKDTFRLLKNLDVIYLRSSEGHGPGPARQMGMDHASGQYFMFMDADDQFHIDGALLDFFNVTDKKNYDIIAGKYVEQAKSIENGNLFYVFHDNNENYSIFSKWFNRDLIERYHIRWADDLKVFEDTYFVGLAYEFATNIKQIDAYSYTWLYNSKSVGRRIDNSGISFDDQLHIWSRGRRYFLEQVQEYKAARVEDWFVDYVADIYYRQKKFKPANMEKFTEEHIHLLREFSSYWLPARVKIMQAIISYNIKKTNYTGLSNDDAIKFLYDTEQYALGNQFSEKETK 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MSDSNYDVYVNNMVEVNYDATIDQTARFDGLYKGMMWPYNHGDVAGNRDARPLHGTAIHVTQEANLNTGMTFVKFNWQGNDVWIPKEGVIPPTFDSQISLTNQLATLAKTNIDYPYFKDIPQTKKFSHIPIGYINKDRIAGQTILVTARAIRSDNQEFKQFFTNGS >NZ_CP012283.1|WP_046871591.1|476308_477199_-|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MLRRFQQTSFFDFITIFLRRYKKGNISNNGIVLAYYTLLSFFPLLLLIGNVLPLLNLPVNTVLKYVNRIMPENIYKILSPLIKQLLTTNNGGVLSIGVVVALWSASKGISAFQQALNATYDMENTTNAILMRILSFLIVLLFMVALIIIVFSFSFGQVALAYLTPLLQIPQDFINFVETIKWPITILGIWLILTILYMIVPMARVRWRYAWAGALFAMIGLVILTQFFTLYLRYFGGAVTTYKTIGTFIIIMLWLDFLAEIMLIGGVINAALQEKISGLPFKPKLSHLKRNHQTSH >NZ_CP012283.1|WP_046871592.1|475911_476274_-|DUF3899-domain-containing-protein MTITENIKKHKALTSEALIVILMLIDWLIFKDPLKVSNHFFMAGLLLLIVGIFFVLERGHLFTGWFRRPAKGEDDSDRKKIDVHKVGREKNGPIVITKPARYFLNIGSFTIIVSVLISLF >NZ_CP012283.1|WP_046870767.1|474043_475429_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MRKSQKTEQIADHRWMAGLEDQEHIGARSTASGENTRMSGIKFQDLVLARNNLNLAYQRVTKNKGAAGLDGMTVEDLLPYLKEHRKELLEQLANGTYKPAPVKRVEIPKPNGGTRKLGIPTVVDRMVQQAVAQVMSPVFEQAFSESSFGFRPGRSAQQAIKQVVSFYNEGFHRVVDLDLKAYFDTVNHDLLIKFIEQYVNDPWLTKLIRRFLTSGVMNHGLFESSEKGTPQGGPLSPLLANIYLNELDKELTKRGHKFVRYADDCNIYVKSQRAGQRVLESISNFLEGRLKVTVNQKKTQVGSPLRLKFLGFSLGVGHGGAYVRPAKEPKLRIKQALKQITKRNRGVSTDKIFQEIQQKMRGWIQYFSVGKMTTFIQTLDKWLRSRIRQYIWKQWKKTKTKINNLKRLGLSTSDAVKSANTRKGYWRTAHSKTLLYTLTNEKLERLGLMNLTKTLQFIQSA >NZ_CP012283.1|WP_062903874.1|473146_473953_+|sugar-phosphatase MIKLIAIDLDGTLLTDDKHIAAETVTAIKQASQSGVKVVLCSGRPLTGVAEHLHTLGLSGNDQYVITFNGALVQTIEGRVLIHHTLNYNDYTDLEALSRKLHNHFHVETENHIYTANKNISPYTIGESFYVRMAIRYRAVGDMPANFKISKGMFIDPPEKITELRKKIPQTFLDKYYFVQSEPYFLEVLNKSASKGNALKGLTKRLNLLPENVMTIGDQGNDLSMLQFAGTPVAMGNAIPEAKKLATFITSTNEENGVAKAIQKFVLD >NZ_CP012283.1|WP_062903873.1|471773_473150_+|HD-domain-containing-protein MDYRNQMLPMEKVFRDPVHDYVYVQNQVILDLINTKEFQRLRRIHQLGTTSLVFHGAEHTRFSHSLGCYEVARRICDNFERNYPTKTPGDGLWDNSERLVTLCAALLHDIGHGAYSHTFEHIFHTDHEWYTEQIITSPETEVNKVLRRVSPKFPDEVASVISHKYPNPQVVQMISSQIDADRMDYLLRDSYYTGTNYGTFDLTRILRVMRPYKGGIAFSISGVHAVEDFIVSRFQMYLQVYFHPVSRSMEMILSHLLQRANEIYGGNQKDADKQRNFVPYFLLPFFDHTATVTDYLRLDDGVLNTYFQQWEDDQDPVLNDLSKRFLNRIPLKSVRFTHETEYLLPELRNLIEKAGFNSTYYTAVNDSYDPPYDAYDPSTSKPRTQIELMQHDGTLVELSTASALVAAITGRVSGDQRFFFPKKMLSQDAGELFHPLYQEFQSYIKNGVLMDAKEGHLS >NZ_CP012283.1|WP_062909604.1|487676_489461_-|KxYKxGKxW-signal-peptide-domain-containing-protein MGKNNILGRAKKIDEHYKMYKDGKRWMFAGMAMLSLGIGMATQVNDAHADTVVPTANVATTSSASKSSAASSTASSSASVSSASNSSVTSNSVNSSSASVGSASKSGATSSATSSSASVSSASNSSVTSSTVSSSTSVSSVSKSGATSSTATSNVTSNVKVPSSVTSISDATSSATVTNLVDPTNADIAAAKSAALIAYETTGKPQMITAAAAASVTAFTSTKTTVDTNPSTETDVSKTNPTKVTEDTGQGEQGTDALQAGSGAPTSTNMNVVVGSTIGVSGTVAGDQKTYLQVEVPDGLKANTNGNATVYTTISIPADDLSILTGLIEGIGTALSNGAKLVDAIPGVNFNAQGVVDAFDVSTLISKLGTGVFSAPVTQSADGKYMYVDITGDTGISNILTQDITQTITNLTNAVSAIHVTATVLGFTTDVSGTAASDIMSFLTPAINALKASITTGGSFINKIGSATLVGQIQTTVPVTAVTPTVTGATGSYTLEAQYVNDNTLEADIADLGNNTAKAVLTYKNTPVVSVSKVAGDSKSGYQITGTTTGGGAAARGVTVTVTDSAGNVVGTGVSDANGNTQSELMAALGLKVL >NZ_CP012283.1|WP_046871185.1|489886_490504_-|response-regulator-transcription-factor MIKIMIVDDHPIYRDGLRVAFKDKKDLKIMAEAENGKIALQKLDTVEIDIVLLDIRMPVLDGIATLGRIKSQFPKVKVIILTGYEDVNVFSKAMSLKTDGFILKSATAQIIFQTIHDVMEGKVIVSPKLLRNTTDYRNLRYELTDEDLDVLTRIAKGERTSKIAGDLHFGERTIKSHLTNIYEKLGVNSRVAAVAKVMQLGLIKL >NZ_CP012283.1|WP_052694479.1|490761_491835_-|DUF916-and-DUF3324-domain-containing-protein MKRKNLFLILITMVLGVLLTIPVSASELSFGVEANLPENQVDKGVTYFDLNLKPGATQTVTVTVTNSSKDQVKIEPEVNTATTNLNGTVEYQKVAKKNLDTSLKYSLADYVKPVEKTVVLNGKQTKKIHLKITMPKEKFNGVMAGGLRLQDKNQEVSKNAKKKKGTTVQNEYAYLIGIVLQQNTKKVLPDMKLASVKPGQVNLRNVINARLRNVKATYLNKLSVNAKVTKQGNSKVLYRQKRTNMQMAPNSVFNYGLQLNGQSLKAGRYVMNITAKSKKQTWHFKKTFTITREKAAKLNAKDVSIKKDYTWIYVSVGVLIILLLIAIAFWLSRRKLKAKEAENEALRQQLNKHEEDD >NZ_CP012283.1|WP_062909605.1|491861_492590_-|WxL-domain-containing-protein MINKKLLLSVLSIGTLVLGAVAPVTAFAAESRIEQSTATAAFKENTVDPVDPVDPTNPTDPTDPEIPGTGETGPLTIDYVSSFDFGTHNIPTADATYTAADAKKGDGTAIPNYVQVSDRRAGTPKGWSLTVKEEKQFVDTTGSELSGAALSLGTSQKQAASVGYPTSNDTVTSTTTGTALVPGATTSVMKADVGGGAGTWVDVFGEAGASSVKLMVPAAAHPNADSYSTKLTWTLADTPSGD >NZ_CP012283.1|WP_144010372.1|492977_493343_-|hypothetical-protein MKRGLLLTILTITSMCLINSPIRGDTHVSEVTSEGRVGFTKGTISPSYPPSDLRPADKVPNGPDTTIKPTVPVSAAKKQQFLPQTDEESDGILQVFGSLGFVVVAWYWMKKNQVRRHNQKN >NZ_CP012283.1|WP_046871182.1|493358_494864_-|hypothetical-protein MKRILKSLLVFVALTSIFGFYSHRNTYAEEADPMFSLTATKSLMKVGDKVEVKATRLRELTADSENFTLVVPTGMQLDENALSQSSQAANFQSHQESDKLILTVTDQTVKNFTIPLIAETAGTFSLSVLSANQLVTSNVVHVTAMAVPVESSSSTTSGTQAESTSSSAISDSSSTASSTSEQPESSSSADVVSESSSSSSSSETVAKSATSSANKKVISGRSMATAAISIDQTPNILQVSDLYYYGGSTGQPISGFFQDPDKEKVTVNFIITKTSGGGATPPNSGQVQTLGVINTSGGNVKDKFSYMIPAKSLAVHNAGSVGSVYKLTIQFTDGGTKPSSIRQANFRLLYVDGELTLTAPDSIGFGTDLDAKATGNPVYMNKTVTGNPLAVKDTRKIPTGAIVNGWSVTATLAKQMTGTNNEGVLANSLHYINAGTDYVLGPAAVPVKALPKSEPGTTNNISATWNSTNGLAFEPTAGQPVGGGAYSGAVTWTLQDTPGNK >NZ_CP012283.1|WP_062903875.1|495077_496613_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MNKADLLEKTQQSLFKIMEILYLSDGSVSKQTLAQKLDLSPATLKRYLDDLQVDVQPLIDEKKITFCIGANTAEFKLIQNFALDDWIFRLYLKDAPKFQILMYIYKHGSMDSYQLQDDLNMSEASLYRVIKQLNKLLKEFELTIHNGHLQGSGLQVRFFYYILFQLTNYFPPKKSFAIDKFVDGLQSELHFYFHSEAVHRVDSWLIISQQRLGSQSVMDSEIPKRVRELYQKNELYQQVSKCYKQAFHMRSATKEQFEIEAFCVMLISMSVFNSKTNVARRFYDIYNSQKTQLADLVEKMNHTITSTLKISRHQWPFELMKLVFDICARPFCFTGDLAHMDEIYSEYYMTHFFSQEARLVVKELMQIFKKEPSTPFSQFIKQNENYFQRRLLFVIRDFRYQQIKDIDIGVDTTFDYYISQMVIDQVRQIFKKDIRVNVTYYQPGNAYDLVLTNYHEEPYDDTDYTYWLTNLGTIHDLEMIKKIVEKNFYAETPVHHLMLKQPNKLHNTKKW >NZ_CP012283.1|WP_046871146.1|496789_497335_-|Asp23/Gls24-family-envelope-stress-response-protein MNSGRPTPPRPNDHKTDSSVKGELTYEDKVVQKIIGIALEEIDGLLTVDGGFFSNVKDKLVNNDDVRAGINTEVGKKQVAVDMDIVAEYGTDIEDIFEQMKRVITREVKEMTHLEVIEVNVNVVDVKTREEYEADSETVQDKAMNAADKTGDFASRKTEDAKHAMSKGRHKIDEKTEPRVE >NZ_CP012283.1|WP_046871141.1|497411_497606_-|DUF2273-domain-containing-protein MQTFIDKYKLPIIGGVIGLILAILLVTIGFFQTLLLVVLVILGAAVGMYVDRTKLLERYLNNKN >NZ_CP012283.1|WP_062903876.1|497616_498186_-|alkaline-shock-response-membrane-anchor-protein-AmaP MNKWSKTFLIICSLVLLLLSLVIVSLTWPWGTSSAFLYAIREFFFANYYAHMTLFWLGIAVAAASVIAIIVVLFVPHNKTTFRLKDDRGKLTIHKKAIDGVVRSMLNEKDFIGSPKVNTTATNRKIHVNVSGDIKRTSALADHMEEWSARVEERVRNLVGSDHNVKVKVKLERYQKRGNATSSGQPRVE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283_3 | 645386-645818 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012283_3
|
6 spacers
spacers of NZ_CP012283_3
>3.1|645422|30|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder,CRT ATGTGTATACAGTCAAGCTTTTTTACATTA >3.2|645488|30|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder,CRT TGCCCTCAAAAACGTTAGCCAACGCCACAC >3.3|645554|30|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder,CRT CATGAGTGGTACTTAACCGACGACGACCGG >3.4|645620|30|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder,CRT AAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAACGG >3.5|645686|30|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder,CRT ACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGATTGT >3.6|645752|30|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder,CRT TGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACCCCG >3.7|645620|27|NZ_CP012283|PILER-CR AAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAA >3.8|645686|27|NZ_CP012283|PILER-CR ACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGAT >3.9|645752|27|NZ_CP012283|PILER-CR TGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACC |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012283_3
The CRISPR arrays of NZ_CP012283_3 >merge|NZ_CP012283|3|645386-645818|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTCCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACATGTGTATACAGTCAAGCTTTTTTACATTAGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTGCCCTCAAAAACGTTAGCCAACGCCACACGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACCATGAGTGGTACTTAACCGACGACGACCGGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACAAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAACGGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGATTGTGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACCCCGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACT >NZ_CP012283|3|3|645386-645818|CRISPRCasFinder TTCCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ATGTGTATACAGTCAAGCTTTTTTACATTA GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGCCCTCAAAAACGTTAGCCAACGCCACAC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC CATGAGTGGTACTTAACCGACGACGACCGG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC AAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAACGG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGATTGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACCCCG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACT >NZ_CP012283|3|1|645386-645817|CRT TTCCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ATGTGTATACAGTCAAGCTTTTTTACATTA GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGCCCTCAAAAACGTTAGCCAACGCCACAC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC CATGAGTGGTACTTAACCGACGACGACCGG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC AAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAACGG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGATTGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACCCCG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC >NZ_CP012283|3|1|645581-645817|PILER-CR CGGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC AAAGAGCTGCGGAAGTTGTCGGACCAA CGGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ACCCATTTTGACGCCTGATTGTTCGAT TGTGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGGACCACAGGATATGTGGAAGCGACC CCGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
>NZ_CP012283.1|WP_046872502.1|644794_645256_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MQVTVKSFSELSNTELFKIYKLRTQVFVVEQLCAYQEVDDEDLIAQHLQFTNEAQQLVAYLRIIPETNETIVHIGRVVVNPLFRKQGYGRKLITSGLETIKKDMPKVTTVKIQAQAYLRSFYQSFGFKPVSDVYLDTGIPHLDMILELQGNKK >NZ_CP012283.1|WP_046872501.1|644228_644702_-|CinA-family-protein MDEKLVNYVINTLIEENLSITAAESLTGGLFQSEITTVPGSSAVFSGGFVTYADEVKTQLLSVPKELIQQYGVVSYEVAVAMAQGAQKVLKTDLAISFTGAAGPTGLEGEDAGTAWIGITFHGQTDAYDLRKPELERNAFREACCQFAFQKISDLLV >NZ_CP012283.1|WP_063510373.1|643272_644088_-|DUF1275-domain-containing-protein MRRHVYPAYQQLYFGAFLAAIAGGLDAYTYLQHGGVFAGLQTGNLILLGVSLSKGQFVKVGYYLIAIIAFGLGTIFIRHMQHFFKQNYLKRAYFVLGYEFVLMVLVAMISQRAPDVITVMLLAITAAAQLQEFRKLQDGPFTSLMMTGNIRTTAENLYTGYVHHDVTAQQKATDTGIVIGSFAAGAFLSGIFVPWLKDAAILVPAVLVLGAVFYLAQHSKSTPNRKDPQSDSNEKAWSETTRASVHPHTSEDDTKTDSEPETRSSRRRRKL >NZ_CP012283.1|WP_046872091.1|641873_642785_+|LysR-family-transcriptional-regulator MTIDDLKDFVTLYQTRNVSDAAVELMMTQSALSKRIQAMENELATKLISTKNKRHLVITESGEVFFRYAKTILTQYGLLTNELAEYRELKKGTLHIGSVPVMSQYGLMEKTSQFMADYPQINIRLEELEGEELLEMLQTKQLDLGILRNMQSQLLNKSQFQFIDIDQDELKIILPITHPLAKQKRISMNNLRDIEVVSLNPGSGIYEQVGNLYQQAGFTPNIRFTSTHIETLLGIIAKSERVTFLFEKSAEPFMTDQFVSRSFETPIYNKLQLVYPQGELTQAGRRFVGYMEVSGTKRLKHKN >NZ_CP012283.1|WP_046872092.1|640250_641726_-|UbiD-family-decarboxylase MAKKDVYDLRKVLDELKKEPGQYHETNVEVDPDAELSGVYRYIGAGGTVQRPTQEGPAMMFNNVKGFPHTRVLMGLMASRKRVGKMFHHDYHTLGQFLNDSVENPVDPVMVKEADAPTHEVVHKATDPDFDIRKLVAAPTNTPQDAGPYITVGVVYGSNPDKTMSDVTIHRMVLEDKDKLGIYIMPGGRHIGKFAEEYEKMNKPMPITINIGLDPAVTIGATFEPPTTPLGYNELGVAGAIRQEPVQLVDGLTVDEKAIARSEYTLEGYIMPNERIQEDINTHTGKAMPEFPGYDGDANPALQVIKVTAVTHRKDPIMQSVIGPSEEHVSMAGIPTEASILSLTNRAIPGKVLNVYNPPAGGGKLMTIMQIRKENKADEGIQRQAALLAFSSFKELKTVFLVDEDVDIFDMNDVVWTINTRFQADQDIVVLPGMRNHPLDPSERPEYDPKSIRTRGMSSKLIIDGTVPFDMKDQFERAQFKEVKDWKKYLE >NZ_CP012283.1|WP_056985954.1|639667_640228_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MKKIIVGITGASGTVYAIDLLEKLHQLDDVEVHLVMSQWAKKNLELETDYSLQQIKALADKTYNVNDQGATIASGSFLNDGMVIVPASMKTVATIAYGIGDNLIARAADVTIKEQRKLVIVPRETPLSVIHLENLTKLAKIGAQIIPPMPAFYNHPKTIQDLVNHQTMKVLDAFGIPNEVDERWKE >NZ_CP012283.1|WP_056985953.1|638001_639345_-|MFS-transporter MGILVETSLNVTMNTLSNQFGVSVGTVQWITTAYLLLVTIMMAAMAFIMRRFKFRSIFIFSAAAFIVGSIVCAIADSFWILLIGRMIQAIATGLATPLMFQIINVKIPRQHVGTYNGVASMLTSLSPALGPTYGGILNTLMNWRWIFWVVLPLSVIVLIMGMINIDIPVQHKRGEKLSFDSIGMVWLSLVLIGFVWTFNEAGLAGWTSAAFWISLVISILLLLSYAWYNSKSSKEVLDFSLLKKKSVFLHLINYFVLAFVNIGISWLLPMVAEVNLHQTSMVAGLLVLPGALIGAIISPSTGAIMDKKGAFLPLMIGNICLLASVVLFFFLNDVMTSMILLILFVILRVGVAFSFGNVMGAASQQVVPEKRGDINSLFNMMQQYAGAMGTVILASVISSLELHGGSTFSQVRQGSKIDYVILSVLALVALITVIINKSTRNHMTKNN >NZ_CP012283.1|WP_046870605.1|637318_637780_-|universal-stress-protein MQVDKLKEPLVFHRVLLTVDADDPNSSTRAFQYATTMAHDYQVELCIVSVLEDDDISIFDVMTPGKVDKKEDVVRQAVEDYTTIAEELGVKHVTGLTVGASDVDDVILDKVIPRFKPDLIVCGSDTEDSKHRVPGAVGLRIAKRAQVSVIVVR >NZ_CP012283.1|WP_062903915.1|635904_637275_-|Nramp-family-divalent-metal-transporter MAKNSNEEKHHIISSTDGANKSLDEINGSVSVPQNAGVFKTFLAYLGPGVLVSVGYMDPGNWITSISGGTQFKYRLLSVVLISSLIAMLLQAMAARLGIVTGRDLAQLTREKTSKFGGTVLFIITELAIMATDVAEIIGSAIALELLFGFPLIVGIIITTFDVLLLMLLMKLGFRKIEAIVATLVAVILFVFLYEVILAQPNMPEVLKGFAPGKDLIQNKSMLYIGLGIVGATVMPHNLYLGSSISQTRNFDRNDHKSIRSAIRYTVADSNMQLTVAFVVNCLLLILGAALFFGTNSDLGRFVDLYNALGDSKIVGAIASPVLSTLFAVALLSSGQSSTITGTLSGQIIMEGFIRLKMPMWAQRLVTRLVSVLPVLAFAIYYHGNEAKIENLLTFSQVFLSIALPFAMIPLILFTSSKKIMGEFANRPWVKVCAWIAAVVLVILNVWLIITTVSAL >NZ_CP012283.1|WP_046870607.1|633579_635328_-|pyruvate-oxidase MSKTINAGIAMMKVIEDWDVKQVYGIPGGSINSTMEALRVEQDKIDYVQVRHEEVGAFAAAAHAKLTGKIGVCFGSAGPGATHLFNGLYDAQMDHAPVLAIIGQVGTSDMNWDSFQEMNENPMFADVSVYNRTVMTADSLPHVIDEAIRRAYKENGVAVVTIPNDFGTKDIPADFWSSGHSYVKPLLPQPDEEKIKAALKLISEAKHPVIFAGIGVNGATEELVTLSKHLKLPVVMSAISKGMIPDDFEGNMGSAYRVSTKPGNETLEQADLIMMIGADFPFARTKGMFNPDAKFIQVDIDSSKIGKRHNVDVPILSDAKQAMKQLVALSDEVAHRRFYDACVANRKNWRAYLQQLADKTTSPLGVGSVFKQINRISTGNDVFAIDVGDVTMNSLRFLNMNEKQKFTTSALFATMGYGMGAAIAGKLTYPDRQVFNLTGDGAFAMVMQDLLTQVKEKLHIINVVFSNESFDFIKDEQEDEKQKYFGVDLQGADFAMIAHGMGALGISVHTYDEMVAAFDTAKQVEGPVVIDVKIHNNRPLPAEKLQLDPATNSAAEIAAFKKRYDADILQPFSVYLNEFEVE >NZ_CP012283.1|WP_017866964.1|645906_646164_+|transposase MTKKKYSVDFRKMIVKLYQDGAPVADLTDEYGVSNVTIYKWINLYKEDKGSGISKSDVLALQKRLKQLESENDILKKALTIFAKK >NZ_CP012283.1|WP_145912924.1|646148_647033_+|IS3-family-transposase MRQKVNPDDWQTAVDINLKHHSIKETCKVLSVPRSTYYEHQQNHVSPQAKRRKTLSQSIKRIYFNSRRIYGAPKILKALQKEGKTASIKLVQRLMRQMGLKSITRKKWHYQQTNDIDATNYSNILAQDFRTTSPNQKWCADITYIHTKANGWCYLSSIQDLYSRKIIAHKISRHMTADLVISTFQQAFETRKTTNNLIVHTDLGSQYRSAGFEQILAQHHIRHSYSKRGCPYDNSCLESFHASLKKEEVYQHHYQDFEEANAAIFSYIESFYNSSRIHSSIDYLTPNEKEKLVA >NZ_CP012283.1|WP_046871852.1|647810_648416_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNITYYPFKPIIINTTKPTLIETSNQKVYTDLISGLKGYSDVIKISDDDFKLVECERAVKWVGDAFVEADLNKMFQGQLQKKIVSKLDDDTRLQLTDLNNKLKSLIFDATFSLDLPLKVDSEFDPVKLVKYCNVGFVSALNRDPYDIIETVLKTASELKETKILILTNVRNYLSVSQFNELVSLISTLDLNILFIEFSDNR >NZ_CP012283.1|WP_062903916.1|648412_648718_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMVMFDLPVETSEDRRNYRKFRKALLNEGFLMVQYSIYVRVCVDKKSANLMEKRIATFSPANGLIQSLMVTEKQYNSMNFIVEESKQDVRNSADRTIII >NZ_CP012283.1|WP_062903917.1|648695_649598_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRTVVVTQHAKISYSGHCVVVQTQDSTNQIPVSDIQILLISTTRAVITSAVISELAKHQSKVIFTDNSGEPVTETMDYYPNNRDPQLLQTQFNWNEERKTSLWTKIIVQKITNQIYVTEALGINAQDLKDELAKLEINDVTNREAVVARKYFSLLFESESSRRNFSPINAALNYGYAIILSAVNLEIAANGYLTQLGVHHHSQENDFNLGSDLMEPFRPIVDWWVKQKKFNDFTPDIKFGLVDLLNLKMKYNGQNTILRNAITKHVDNCLKYLSGEIDKIKIEVEISEVSNNAINGHV >NZ_CP012283.1|WP_062903918.1|649814_653951_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTNEKYSIGLDIGTSSIGFAVVNDNNRVIRVKGKNAIGVRLFDEGKAAADRRSFRTTRRRLSRRRWRLKLLREIFDAYITPVDEAFFIRLKESNLSPKDSKKQYSGDILFNDRSDKDFYEKYPTIYHLRNALMTEHRKFDVREIYLAIHHIMKFRGHFLNATPANNFKVGRLNLEEKFEELNDIYQRVFPDESIEFRTDNLEQIKEVLLDNKRSRADRQHTLVSDIYQSSEDKDIEKRNKAVATEILKASLGNKAKLNVITNVEVDKEAAKEWSITFDSESIDDDLAKIEGQMTDDGHEIIEVLRSLYSGITLSAIVPENHTLSQSMVAKYDLHKDHLKLFKKLINGMTDTKKAKNLRAAYDGYIDGVKGKVLPQEDFYKQVQVNLDDSAEANEIQTYIDQDIFMPKQRTKANGSIPHQLQQQELDQIIENQKAYYPWLAELNPNPDKKRQQLAKYKLDELVTFRVPYYVGPMITAKDQKNQSGAEFAWMIRKEPGNITPWNFDQKVDRMATANQFIKRMTTTDTYLLGEDVLPAQSLLYQKFEVLNELNKIRIDHKPISIEQKQQIFNDLFKQFKNVTIKHLQDYLVSQGQYSKRPLIEGLADEKRFNSSLSTYSDLCGIFGAKLVEENDRQEDLEKIIEWSTIFEDKKIYRAKLNDLTWLTDDQKEKLATKRYQGWGRLSRKLLVGLKNSEHRNIMDILWITNENFMQIQAEPDFAKLVTDANKGMLEKTDSQDVINDLYTSPQNKKAIRQILLVVHDIQNAMHGQAPAKIHVEFARGEERNPRRSVQRQRQVEAAYEKVSNELVSAKVRQEFKEAINNKRDFKDRLFLYFMQGGIDIYTGKQLNIDQLSSYQIDHILPQAFVKDDSLTNRVLTNENQVKADSVPIDIFGKKMLSVWGRMKDQGLISKGKYRNLTMNPENISAHTENGFINRQLVETRQVIKLAVNILADEYGDSTQIISVKADLSHQMREDFELLKNRDVNDYHHAFDAYLAAFIGNYLLKRYPKLESYFVYGDFKKFTQKETKMRRFNFIYDLKHCDQVVNKETGEILWTKDEDIKYIRHLFAYKKILVSHEVREKRGALYNQTIYKAKDDKGSGQGSKKLIRIKDDKETKIYGGYSGKSLAYMTIVQITKKNKVSYRVIGIPTLALARLNKLENDSTENNGELYKIIKPQFTHYKVDKKNGEIIETTDDFKIVVSKVRFQQLIDDAGQFFMLASDTYKNNAQQLVISNNALKAINNTNITDCPRDDLERLDNLRLDSAFDEIVKKMDKYFSAYDANNFREKIRNSNLIFYQLPVEDQWENNKITELGKRTVLTRILQGLHANATTTDMSIFKIKTPFGQLRQRSGISLSENAQLIYQSPTGLFERRVQLNKIK >NZ_CP012283.1|WP_046871856.1|654145_654658_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MKISVPTSNGLLLDKYSKHAAPEQIYNGNPSISFPIDIQDVPDNATTLALTLLDFDAVPVCGFPWIHWTAVNIPADKSVTIPENASQSNVIDFIQGNNSTAGSLIGATDPLTTRHYIGPTPPDKNHDYWLSIYALDTTLSLQNGFWLNEFYHAAKGHIISKQRLSIISRA >NZ_CP012283.1|WP_062903919.1|654873_655119_+|hypothetical-protein MLLNSKNLSVLEVQVLGIYQAKIEIKTISGKCLFVYPTQTQKDDPLFWQSLKDIIKAKLWLPINKTLNQLIDSDWLVPLNT >NZ_CP012283.1|WP_046871858.1|655176_655659_-|winged-helix-DNA-binding-protein MDEKQYQTITQLLKQLSATENHNQHEAWIAKQAAIKENPQKNHLTHNDLDILGVLLQGEKTVSEVVEAVQITQGGTSRRINHLEKLDLLEKFKRPTNKKTVYLKLTADGQKLATAHIALHKHLHEETVQALAEFSDSELAVVTRFLRKLADAQKDFETRY >NZ_CP012283.1|WP_062903920.1|655776_656778_+|zinc-binding-alcohol-dehydrogenase-family-protein MKALIIKDFKTAPMIDLNVPTPVADTKFDTLIDVLAAPIENFDKANATGRHYSSTYWHPAFPSIPGASGIGRRVDNGKLVAFPARTLKPRFGSFAEQTVANSKLLFEIPEDTDIYSSTAAASSLTTSIAPLQFSLEMKPGNTVLINGATGFAGQLAIQAAKALGAAEIIGTGRNPERLAALKDLGATQTISLADDDETILNNLSNMKIKGDLIILDYLWGHPIELILKSIVPTSLEMKRATSLVSIGAVAGQNITLPSTALRTSGLQIIGMQTPKVMQNQQAVYQAVWKLLGTGKIKTTVKTISLEDAAKNIDWQKPVPSGVRTVIKVSEIKR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283_4 | 647083-647713 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012283_4
|
9 spacers
spacers of NZ_CP012283_4
>4.1|647119|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAAGGGTAATACATTAATTGTAGGTGAA >4.2|647185|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGCGTAGGCAATGTAAACCCTGTAATACA >4.3|647251|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTATGTTCAAGGCCAAACCCAAACGGGC >4.4|647317|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTGAGAATGAGCCATACATGAACGTCCAT >4.5|647383|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCTGGGCCAGAATCAATTTGGTCTTGCGT >4.6|647449|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTG >4.7|647515|31|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGT >4.8|647582|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGTCAGCGTTAAACGGCACTGGTATCAC >4.9|647648|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGCACTCGTAGGATTACAAACGATACCT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012283_4
The CRISPR arrays of NZ_CP012283_4 >merge|NZ_CP012283|4|647083-647713|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTTAAAGGGTAATACATTAATTGTAGGTGAAGCTTTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACCCGCGTAGGCAATGTAAACCCTGTAATACAGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACGATTATGTTCAAGGCCAAACCCAAACGGGCGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTTTGAGAATGAGCCATACATGAACGTCCATGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTGCTGGGCCAGAATCAATTTGGTCTTGCGTGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACGCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTGGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACTTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGTGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACGATGTCAGCGTTAAACGGCACTGGTATCACGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAACATTGCACTCGTAGGATTACAAACGATACCTGCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC >NZ_CP012283|4|2|647083-647713|PILER-CR GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTAAAGGGTAATACATTAATTGTAGGTGAA GCTTTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC CCGCGTAGGCAATGTAAACCCTGTAATACA GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATTATGTTCAAGGCCAAACCCAAACGGGC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTGAGAATGAGCCATACATGAACGTCCAT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGCTGGGCCAGAATCAATTTGGTCTTGCGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATGTCAGCGTTAAACGGCACTGGTATCAC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ATTGCACTCGTAGGATTACAAACGATACCT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC >NZ_CP012283|4|4|647083-647713|CRISPRCasFinder GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTAAAGGGTAATACATTAATTGTAGGTGAA GCTTTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC CCGCGTAGGCAATGTAAACCCTGTAATACA GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATTATGTTCAAGGCCAAACCCAAACGGGC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTGAGAATGAGCCATACATGAACGTCCAT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGCTGGGCCAGAATCAATTTGGTCTTGCGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATGTCAGCGTTAAACGGCACTGGTATCAC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ATTGCACTCGTAGGATTACAAACGATACCT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC >NZ_CP012283|4|2|647083-647713|CRT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTAAAGGGTAATACATTAATTGTAGGTGAA GCTTTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC CCGCGTAGGCAATGTAAACCCTGTAATACA GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATTATGTTCAAGGCCAAACCCAAACGGGC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTGAGAATGAGCCATACATGAACGTCCAT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TGCTGGGCCAGAATCAATTTGGTCTTGCGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GCTTGGATTGTGAGACCAAACTAATCAGTG GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC TTTCAACCAGCTTTCTTGGCTTTTGGAAAGT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC GATGTCAGCGTTAAACGGCACTGGTATCAC GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC ATTGCACTCGTAGGATTACAAACGATACCT GCTCTTAACTATATTGATTCGACACTCTTCTAAAAC
>NZ_CP012283.1|WP_145912924.1|646148_647033_+|IS3-family-transposase MRQKVNPDDWQTAVDINLKHHSIKETCKVLSVPRSTYYEHQQNHVSPQAKRRKTLSQSIKRIYFNSRRIYGAPKILKALQKEGKTASIKLVQRLMRQMGLKSITRKKWHYQQTNDIDATNYSNILAQDFRTTSPNQKWCADITYIHTKANGWCYLSSIQDLYSRKIIAHKISRHMTADLVISTFQQAFETRKTTNNLIVHTDLGSQYRSAGFEQILAQHHIRHSYSKRGCPYDNSCLESFHASLKKEEVYQHHYQDFEEANAAIFSYIESFYNSSRIHSSIDYLTPNEKEKLVA >NZ_CP012283.1|WP_017866964.1|645906_646164_+|transposase MTKKKYSVDFRKMIVKLYQDGAPVADLTDEYGVSNVTIYKWINLYKEDKGSGISKSDVLALQKRLKQLESENDILKKALTIFAKK >NZ_CP012283.1|WP_046872502.1|644794_645256_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MQVTVKSFSELSNTELFKIYKLRTQVFVVEQLCAYQEVDDEDLIAQHLQFTNEAQQLVAYLRIIPETNETIVHIGRVVVNPLFRKQGYGRKLITSGLETIKKDMPKVTTVKIQAQAYLRSFYQSFGFKPVSDVYLDTGIPHLDMILELQGNKK >NZ_CP012283.1|WP_046872501.1|644228_644702_-|CinA-family-protein MDEKLVNYVINTLIEENLSITAAESLTGGLFQSEITTVPGSSAVFSGGFVTYADEVKTQLLSVPKELIQQYGVVSYEVAVAMAQGAQKVLKTDLAISFTGAAGPTGLEGEDAGTAWIGITFHGQTDAYDLRKPELERNAFREACCQFAFQKISDLLV >NZ_CP012283.1|WP_063510373.1|643272_644088_-|DUF1275-domain-containing-protein MRRHVYPAYQQLYFGAFLAAIAGGLDAYTYLQHGGVFAGLQTGNLILLGVSLSKGQFVKVGYYLIAIIAFGLGTIFIRHMQHFFKQNYLKRAYFVLGYEFVLMVLVAMISQRAPDVITVMLLAITAAAQLQEFRKLQDGPFTSLMMTGNIRTTAENLYTGYVHHDVTAQQKATDTGIVIGSFAAGAFLSGIFVPWLKDAAILVPAVLVLGAVFYLAQHSKSTPNRKDPQSDSNEKAWSETTRASVHPHTSEDDTKTDSEPETRSSRRRRKL >NZ_CP012283.1|WP_046872091.1|641873_642785_+|LysR-family-transcriptional-regulator MTIDDLKDFVTLYQTRNVSDAAVELMMTQSALSKRIQAMENELATKLISTKNKRHLVITESGEVFFRYAKTILTQYGLLTNELAEYRELKKGTLHIGSVPVMSQYGLMEKTSQFMADYPQINIRLEELEGEELLEMLQTKQLDLGILRNMQSQLLNKSQFQFIDIDQDELKIILPITHPLAKQKRISMNNLRDIEVVSLNPGSGIYEQVGNLYQQAGFTPNIRFTSTHIETLLGIIAKSERVTFLFEKSAEPFMTDQFVSRSFETPIYNKLQLVYPQGELTQAGRRFVGYMEVSGTKRLKHKN >NZ_CP012283.1|WP_046872092.1|640250_641726_-|UbiD-family-decarboxylase MAKKDVYDLRKVLDELKKEPGQYHETNVEVDPDAELSGVYRYIGAGGTVQRPTQEGPAMMFNNVKGFPHTRVLMGLMASRKRVGKMFHHDYHTLGQFLNDSVENPVDPVMVKEADAPTHEVVHKATDPDFDIRKLVAAPTNTPQDAGPYITVGVVYGSNPDKTMSDVTIHRMVLEDKDKLGIYIMPGGRHIGKFAEEYEKMNKPMPITINIGLDPAVTIGATFEPPTTPLGYNELGVAGAIRQEPVQLVDGLTVDEKAIARSEYTLEGYIMPNERIQEDINTHTGKAMPEFPGYDGDANPALQVIKVTAVTHRKDPIMQSVIGPSEEHVSMAGIPTEASILSLTNRAIPGKVLNVYNPPAGGGKLMTIMQIRKENKADEGIQRQAALLAFSSFKELKTVFLVDEDVDIFDMNDVVWTINTRFQADQDIVVLPGMRNHPLDPSERPEYDPKSIRTRGMSSKLIIDGTVPFDMKDQFERAQFKEVKDWKKYLE >NZ_CP012283.1|WP_056985954.1|639667_640228_-|UbiX-family-flavin-prenyltransferase MKKIIVGITGASGTVYAIDLLEKLHQLDDVEVHLVMSQWAKKNLELETDYSLQQIKALADKTYNVNDQGATIASGSFLNDGMVIVPASMKTVATIAYGIGDNLIARAADVTIKEQRKLVIVPRETPLSVIHLENLTKLAKIGAQIIPPMPAFYNHPKTIQDLVNHQTMKVLDAFGIPNEVDERWKE >NZ_CP012283.1|WP_056985953.1|638001_639345_-|MFS-transporter MGILVETSLNVTMNTLSNQFGVSVGTVQWITTAYLLLVTIMMAAMAFIMRRFKFRSIFIFSAAAFIVGSIVCAIADSFWILLIGRMIQAIATGLATPLMFQIINVKIPRQHVGTYNGVASMLTSLSPALGPTYGGILNTLMNWRWIFWVVLPLSVIVLIMGMINIDIPVQHKRGEKLSFDSIGMVWLSLVLIGFVWTFNEAGLAGWTSAAFWISLVISILLLLSYAWYNSKSSKEVLDFSLLKKKSVFLHLINYFVLAFVNIGISWLLPMVAEVNLHQTSMVAGLLVLPGALIGAIISPSTGAIMDKKGAFLPLMIGNICLLASVVLFFFLNDVMTSMILLILFVILRVGVAFSFGNVMGAASQQVVPEKRGDINSLFNMMQQYAGAMGTVILASVISSLELHGGSTFSQVRQGSKIDYVILSVLALVALITVIINKSTRNHMTKNN >NZ_CP012283.1|WP_046870605.1|637318_637780_-|universal-stress-protein MQVDKLKEPLVFHRVLLTVDADDPNSSTRAFQYATTMAHDYQVELCIVSVLEDDDISIFDVMTPGKVDKKEDVVRQAVEDYTTIAEELGVKHVTGLTVGASDVDDVILDKVIPRFKPDLIVCGSDTEDSKHRVPGAVGLRIAKRAQVSVIVVR >NZ_CP012283.1|WP_046871852.1|647810_648416_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNITYYPFKPIIINTTKPTLIETSNQKVYTDLISGLKGYSDVIKISDDDFKLVECERAVKWVGDAFVEADLNKMFQGQLQKKIVSKLDDDTRLQLTDLNNKLKSLIFDATFSLDLPLKVDSEFDPVKLVKYCNVGFVSALNRDPYDIIETVLKTASELKETKILILTNVRNYLSVSQFNELVSLISTLDLNILFIEFSDNR >NZ_CP012283.1|WP_062903916.1|648412_648718_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMVMFDLPVETSEDRRNYRKFRKALLNEGFLMVQYSIYVRVCVDKKSANLMEKRIATFSPANGLIQSLMVTEKQYNSMNFIVEESKQDVRNSADRTIII >NZ_CP012283.1|WP_062903917.1|648695_649598_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRTVVVTQHAKISYSGHCVVVQTQDSTNQIPVSDIQILLISTTRAVITSAVISELAKHQSKVIFTDNSGEPVTETMDYYPNNRDPQLLQTQFNWNEERKTSLWTKIIVQKITNQIYVTEALGINAQDLKDELAKLEINDVTNREAVVARKYFSLLFESESSRRNFSPINAALNYGYAIILSAVNLEIAANGYLTQLGVHHHSQENDFNLGSDLMEPFRPIVDWWVKQKKFNDFTPDIKFGLVDLLNLKMKYNGQNTILRNAITKHVDNCLKYLSGEIDKIKIEVEISEVSNNAINGHV >NZ_CP012283.1|WP_062903918.1|649814_653951_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTNEKYSIGLDIGTSSIGFAVVNDNNRVIRVKGKNAIGVRLFDEGKAAADRRSFRTTRRRLSRRRWRLKLLREIFDAYITPVDEAFFIRLKESNLSPKDSKKQYSGDILFNDRSDKDFYEKYPTIYHLRNALMTEHRKFDVREIYLAIHHIMKFRGHFLNATPANNFKVGRLNLEEKFEELNDIYQRVFPDESIEFRTDNLEQIKEVLLDNKRSRADRQHTLVSDIYQSSEDKDIEKRNKAVATEILKASLGNKAKLNVITNVEVDKEAAKEWSITFDSESIDDDLAKIEGQMTDDGHEIIEVLRSLYSGITLSAIVPENHTLSQSMVAKYDLHKDHLKLFKKLINGMTDTKKAKNLRAAYDGYIDGVKGKVLPQEDFYKQVQVNLDDSAEANEIQTYIDQDIFMPKQRTKANGSIPHQLQQQELDQIIENQKAYYPWLAELNPNPDKKRQQLAKYKLDELVTFRVPYYVGPMITAKDQKNQSGAEFAWMIRKEPGNITPWNFDQKVDRMATANQFIKRMTTTDTYLLGEDVLPAQSLLYQKFEVLNELNKIRIDHKPISIEQKQQIFNDLFKQFKNVTIKHLQDYLVSQGQYSKRPLIEGLADEKRFNSSLSTYSDLCGIFGAKLVEENDRQEDLEKIIEWSTIFEDKKIYRAKLNDLTWLTDDQKEKLATKRYQGWGRLSRKLLVGLKNSEHRNIMDILWITNENFMQIQAEPDFAKLVTDANKGMLEKTDSQDVINDLYTSPQNKKAIRQILLVVHDIQNAMHGQAPAKIHVEFARGEERNPRRSVQRQRQVEAAYEKVSNELVSAKVRQEFKEAINNKRDFKDRLFLYFMQGGIDIYTGKQLNIDQLSSYQIDHILPQAFVKDDSLTNRVLTNENQVKADSVPIDIFGKKMLSVWGRMKDQGLISKGKYRNLTMNPENISAHTENGFINRQLVETRQVIKLAVNILADEYGDSTQIISVKADLSHQMREDFELLKNRDVNDYHHAFDAYLAAFIGNYLLKRYPKLESYFVYGDFKKFTQKETKMRRFNFIYDLKHCDQVVNKETGEILWTKDEDIKYIRHLFAYKKILVSHEVREKRGALYNQTIYKAKDDKGSGQGSKKLIRIKDDKETKIYGGYSGKSLAYMTIVQITKKNKVSYRVIGIPTLALARLNKLENDSTENNGELYKIIKPQFTHYKVDKKNGEIIETTDDFKIVVSKVRFQQLIDDAGQFFMLASDTYKNNAQQLVISNNALKAINNTNITDCPRDDLERLDNLRLDSAFDEIVKKMDKYFSAYDANNFREKIRNSNLIFYQLPVEDQWENNKITELGKRTVLTRILQGLHANATTTDMSIFKIKTPFGQLRQRSGISLSENAQLIYQSPTGLFERRVQLNKIK >NZ_CP012283.1|WP_046871856.1|654145_654658_+|YbhB/YbcL-family-Raf-kinase-inhibitor-like-protein MKISVPTSNGLLLDKYSKHAAPEQIYNGNPSISFPIDIQDVPDNATTLALTLLDFDAVPVCGFPWIHWTAVNIPADKSVTIPENASQSNVIDFIQGNNSTAGSLIGATDPLTTRHYIGPTPPDKNHDYWLSIYALDTTLSLQNGFWLNEFYHAAKGHIISKQRLSIISRA >NZ_CP012283.1|WP_062903919.1|654873_655119_+|hypothetical-protein MLLNSKNLSVLEVQVLGIYQAKIEIKTISGKCLFVYPTQTQKDDPLFWQSLKDIIKAKLWLPINKTLNQLIDSDWLVPLNT >NZ_CP012283.1|WP_046871858.1|655176_655659_-|winged-helix-DNA-binding-protein MDEKQYQTITQLLKQLSATENHNQHEAWIAKQAAIKENPQKNHLTHNDLDILGVLLQGEKTVSEVVEAVQITQGGTSRRINHLEKLDLLEKFKRPTNKKTVYLKLTADGQKLATAHIALHKHLHEETVQALAEFSDSELAVVTRFLRKLADAQKDFETRY >NZ_CP012283.1|WP_062903920.1|655776_656778_+|zinc-binding-alcohol-dehydrogenase-family-protein MKALIIKDFKTAPMIDLNVPTPVADTKFDTLIDVLAAPIENFDKANATGRHYSSTYWHPAFPSIPGASGIGRRVDNGKLVAFPARTLKPRFGSFAEQTVANSKLLFEIPEDTDIYSSTAAASSLTTSIAPLQFSLEMKPGNTVLINGATGFAGQLAIQAAKALGAAEIIGTGRNPERLAALKDLGATQTISLADDDETILNNLSNMKIKGDLIILDYLWGHPIELILKSIVPTSLEMKRATSLVSIGAVAGQNITLPSTALRTSGLQIIGMQTPKVMQNQQAVYQAVWKLLGTGKIKTTVKTISLEDAAKNIDWQKPVPSGVRTVIKVSEIKR >NZ_CP012283.1|WP_062903921.1|657130_657634_+|transcription-elongation-factor-GreA MEAIKLVREATMSEPYFNKITATGYHEIEKEIEELKAKRPALTKCLAAAAALGDRSENAEYTFSKRDLRQLESRLHFLNKQLQYSKIVQPTNNQIVEIGKKVTIEFVDDHDQMDYQLVGKQEADIKTNKISLVSPLGSALLNKTVGDIVTIHAPEETYQVKILSVNL >NZ_CP012283.1|WP_046871860.1|657690_658539_-|aldo/keto-reductase MSVLTDTFELANGVKIPKVGFGTWQTPAGDVAYQAVRNALKVGYRHIDTAKAYGNEEDVGRAVRDSGIARDQIFVTSKLPAHSKTYDEAMADFESTFKKLNIDYVDLYLVHAPWPWDEIGKDCDKGNVEVWRAMQDIYASGRVKAIGVSNFNVHDLKNVLADAKVKPMVNQIQYYVGYTEPKITSFAKQNGILVEAYSPLATGGLLKNDQMLALAKENKVSVAQLALRFCLQNNILPLPKAVGQSHIEDNAKLDFEISDEDMEKLNGMPDTAPEHSHNKTQG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283_5 | 1053525-1053750 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012283_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012283_5
>5.1|1053562|64|NZ_CP012283|PILER-CR TCCGTCACGCTTGTGATTCTCTTTTTGACTTGTCGAGCTGTCCTAAGACTCGGCGGAAAGCAGC >5.2|1053663|64|NZ_CP012283|PILER-CR AGAGTCGTGCTTATGATCAGCCTCTTGTTTTACCGAACTGTCCTAAGACTCAGCGGAAAGTAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012283_5
The CRISPR arrays of NZ_CP012283_5 >merge|NZ_CP012283|5|1053525-1053750|PILER-CR CGGATGCGGGATCGCAATCCCGCATCCGTCACGCTTGTGATTCTCTTTTTGACTTGTCGAGCTGTCCTAAGACTCGGCGGAAAGCAGCAGGCAAAGACGGGCGTATGTGGGATCGCAATCCCGCGAGAGTCGTGCTTATGATCAGCCTCTTGTTTTACCGAACTGTCCTAAGACTCAGCGGAAAGTAGCAGGCAAAGACGGGCGCGTGCGGGATCGCAATCCCGCG >NZ_CP012283|5|3|1053525-1053750|PILER-CR CGGATGCGGGATCGCAATCCCGCATCCGTCACGCTTG TGATTCTCTTTTTGACTTGTCGAGCTGTCCTAAGACTCGGCGGAAAGCAGCAGGCAAAGACGGG CGTATGTGGGATCGCAATCCCGCGAGAGTCGTGCTTA TGATCAGCCTCTTGTTTTACCGAACTGTCCTAAGACTCAGCGGAAAGTAGCAGGCAAAGACGGG CGCGTGCGGGATCGCAATCCCGCG
>NZ_CP012283.1|WP_046871035.1|1052647_1053481_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MNNNVLIGYKQRDNFVDRLTGTTKLIGLIALSVIGMTSFDTRFLLVLTVCSLALFRVSGIKFHEVSFILGFITVFSVLNLIAVYIFGPKYGVHLYGSEHVIWQGIGPYNLTWEQLFYEFNLFLKYIFTVPLALIFLMTTNPSEFSSSLNRIGISYRISYAVSLALRYIPDVQNDYRQISRAQQARGNEISKKGKLTHRVKVAGQILLPLIFTSLDRIETISQAMELRRFGKLKKRTWYAARPMKRNDFLALIVIALVVLVGIYLFKVNGGRFYNPFK >NZ_CP012283.1|WP_046871034.1|1050945_1052655_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNNPIISFQDVSFQYQSQSEPTLNHLNFDIYAGEKVLIAGPSGSGKTTISRLMNGLIPSAYPGKLSGKILINGQSVTDQTIFDLSLKVGTVLQDPDTQFVGLTVAEDIAFALENDGEKQSVLKQKASEWAKQLGISEIINNHPQEISGGQKQRVAMAGVLVDEGKILLFDEPLASLDPVAGRESIELIDEMQKKGDTTTVIIEHRIEDVLYKSVDRIILVDEGEIVANDTPDTILKSGILAKLGLREPLYLSALKYAGVDLKQVAHVDNVNDVALTENTVAAVKKWVQPHHSQTLATDQEPVLKAKDISFSYDSKQVLNKLNLSIQPGEMVSLVGRNGVGKTTLSNIITGFLHQSSGSLTLNGKVMDDDSIKERADHIGYVLQDPNMMISKNTVSEEVALGLTLRQVTPDEIETRVAETLKVCGLFEYRHWPISALSFGQKKRVTIAAILVLNPELLILDEPTAGQDWRHYTEMLTFIRDLNQKTGISVIFITHDMHLMMEYSDRVVVLNDGVIAYDDQPMKLFANLDLLKQASLVETSLFTLAQRVKVDPEDLIASFIDQERVGQRDE >NZ_CP012283.1|WP_046871033.1|1050383_1050941_+|ECF-type-riboflavin-transporter-substrate-binding-protein MHKKQGISVRTVVAIGIGTAIFFVLMRYIPIPTGVPDTNINLAYGFLALMGSIFGPVAGGLIAFLGHMFNDLTWGEPWWTWIVADGIYGILFGLTKKYLNIENGGLTKHKLVIFNVYQIIISVLVWGIIAPTGDVLVYSEPASKVYLQGITSVICNALSVGILGTILLVAYARTRSKKGSLKKES >NZ_CP012283.1|WP_062904003.1|1048441_1049959_+|PTS-transporter-subunit-EIIC MAKKDYTKLASDIIENIGGKENVKSLIHCITRLRFYLKDESIAKDDVIKNLDGVIDVRHAQGQYQVVIGAAVTDVYDAVIAQLGQEFADPDATEAAVQETKAAAGSAKEPDNRSFGQKIKDGFNALTGVITGSMMPVVGLLAASGILKGLLQMAVDFHWTVPTSQTYIIISAMGDSAFYFLPIIVGFTAAKRLKSDPVIMAIIGGVLVYPSLFSIATGTKTTGTFLGMALNINLFGLPIHMVNYTYSIFPIIAGAWMAHYIEIWLKKWIPQILQMIFVPLFEVIIVSAIIIIFVGPAITLVSTGISWLLDAILKFNYPIAGLIIGGFYQSLVIFGLHWAIVPLIANDIASKGYSYLNAIVSMTMVAQGAAVLAIFLKSKIASIKELSGAAAISAFVGITEPSIYGINLKYGRAFLTASIGAAAGGLVSGLLNVNMYGFTGSIIGFPSFFTPAKFGGGMSNEINFWIATAVTLVVAFGCTWAFGFKDADVAAEKKVVRRKTIGKDA >NZ_CP012283.1|WP_062904002.1|1047928_1048423_+|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MFGFGKRKKVATDNAIYAPVTGQVIDLSKVSDPVFAQKAMGEGLGVKPSDGKIVSPVAGAVTMVAGTKHALGFTMANGLEVLIHMGVDTVDLKGAPFTVSVKPGDIVNGGDAIATIDLDQIHDANLDDVIIVVFTNSADKLDHLDVTTGETTAKAKIGMVTVKI >NZ_CP012283.1|WP_062904001.1|1046984_1047701_-|trehalose-operon-repressor MRNKFNAIYQDLADKINHHNYPVDSYLPSETQLSELYGTSRETIRKALSELLTNGFIQKIRGKGSIVLNLQRFNFPVSGITSFKELNNSLHMNSTTEVLCLEDQHVPLEKFDYQSSSPLLATYVERLRKTNNEPIVLDHDYILKSVVPEISHKVAADSLYDYFENQLGLTISYATKKITVESPTKEEAQLLELNEHQDVVIVRSQTCLEDTTLFQFTESVHRPDRFSFVDFARRQKIN >NZ_CP012283.1|WP_062904000.1|1045319_1046972_-|alpha,alpha-phosphotrehalase MSFQNKIIYQIYPKSFYDSDGDGIGDLQGIIKKIPYLVKLNIDMIWFNPFFVSPQNDNGYDIADYCKVDPRFGTMADFDELARKLKENHIGIMLDMVLNHTSTSHEWFQKALAGNKKYQAFYYIRDPKPNGDLPTNWESKFGGPTWAKFGNTGKYYLHLYDPSQADLDWHNPEVRQALYKVINFWRAKGVHGFRFDVINVTGKEEKLIDAPTNVASKTLYTDTPIVQDYLKEMNQASFGQDPDAITVGEMSSTSIANSVQYTLPGNHELSMVFTFHHLKVDYVNGEKWSKMPFDFMKLKGILNEWQSGMAKGGGWNALFWNNHDQPRAINRFGDPIHYRAKSAEMLATTMHLLRGTPYIYMGEEIGMSDPDYTSMSDYVDIECKNAYQELLNAGKSPSEAFEIIKTKSRDNSRTPMQWNNSKYAGFSTHKPWLMPTNQAKVNVQDELDHGEIFTYYQKLIKLRKTMPIISEGNFKPLLENDHQVFAYLRTYRNQTLLVLNNFYGKATTVQLPSEMTKLHGKVLISNYDESIELQDQLELKPYQSVAFLLN >NZ_CP012283.1|WP_046871028.1|1044092_1044734_+|hypothetical-protein MQHRYLKMLIYFCVWMGLNILWVLRSISYPTVDSTMLVGKSIALHFAPIVGITVLLLMTLFKWRPLNLVALIWLVLATITARPPIYLLSVGMFGGILVLICDVYLTVIICNHDQPVKYVNQIAVILGIAFFLCLLSPKLSAQFASSGYSDPVTATKTEITVTKKNTNQLKTNNVTRITPRHPKIYLNGVGDINLKIRRIGIFYFSYADYVYKW >NZ_CP012283.1|WP_046871027.1|1043319_1043916_+|hypothetical-protein MHKIPSTAFAKAGIYEKEKVDYIKKCFTPMRVSINDQIFPRSQKNSDKESHKIGREIFGLATPETIEFNDTEIRVIDKDKKVVETTKATDVQYIQFGVIRRMTTYMWSPGFYYELTMTLGTSSGNYYLLNGDFAVYEQLKAWGEKQNIEIEDPFELASITTDAHVFGAGDPSTWGTLLDKTFITKVAKVADLNYPEEV >NZ_CP012283.1|WP_062904297.1|1042154_1043060_+|EamA-family-transporter MMSKSTRGILYASIGAICWGISGPIAQILFANYHMKLTWLIGSKMLFGGILLLVFGMLQKKQRPKLFAIWHGKKAIIQLLIFTIFGMTAMQAVYYKAVAVGNAATATILQFLSPVFIVVFTIIRYKRVPRRGDVWAIVAALVGTYLLITGGNPTSLTISPAALFWGVVTGVAAAAYVLLPEKILNQYGSLTVSSWSMLVGGVLFMFIQPAWRDVPHFDAKGWAGYLFIVIFGSVIAYFIYLASLAYISATATGLLDAFEPLSATIVSVVFLNLKFGVMETIGTILILSTVFILAIANRHSS >NZ_CP012283.1|WP_155387016.1|1053910_1054069_+|hypothetical-protein MKYENKTKTDNQVLKTIQPDKSMEAGMRLLAQLKKAEKGSFHSLEEVRHKLF >NZ_CP012283.1|WP_046872520.1|1054251_1054458_+|hypothetical-protein MEKNWLKTAVSVTMSGEGHEEGLKRSFGNMPETVTDDQIKGLGSVLEAVSKDKFDFATVTTTEKVVNN >NZ_CP012283.1|WP_046872521.1|1054518_1054752_+|DUF2922-domain-containing-protein MKQLDMEFVSSLGKVRHIKLKYVSEDLEPAAVKTAMTQLAGLKVFVKDDEELYAQPQAAKYIETINTPLFDDKAVKA >NZ_CP012283.1|WP_052694578.1|1054915_1055806_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNDFLKVKHLNMKIGKRKILKDINFSCRKGHITGLIGPNGAGKTTIMKCILGLYPYHKASIILNGTDIKSSNILNVGIGALIENPSIYPFLTGTEHLVMYAKDKNCIEDIVQALKMQSFINKKSKDYSLGMKQKLGIAIALLDNPQLIILDEPMNGLDPSSTYLLRNLLLKLAKQGITILISSHILSELEKIIDDVVMINNGKVILNVSKNKLEQQSQSTLFLSTNHNDKALKVLLEQGFKAQESNGMIKAFNISSSNLNELLAVIINNDIRLLGLEHKENGLEDTLLKLIESENN >NZ_CP012283.1|WP_056986019.1|1055807_1056575_+|ABC-transporter-permease MSSLINQEIYKLCHKKTVQFTPLVLFLAMLVVGIITKNGSDNRFYIEAGYAGFQWITIILIIECASMVAMEFQYGTIKHLIYESNNRMKIYLSKLLTMFLYDVLLHIFTLVFTIVIKYLTVGTNVSFSQNYLYHASLFQNLFTNTLVDFLGSLIIVSSVFMMASLMNSSAIAIAVGIGFIFIGEGLSSALISALIKKIPLIKWNPFNMLNIANQWSNPDYFSTTHLTQTQLINGNILYTLIFIVMSFLFFRKKRV >NZ_CP012283.1|WP_046872498.1|1056604_1057828_-|MFS-transporter MKKIRRVIISDFFDSLSIGAFITYAYWYIYETTKNQSLVSILGTISMAAMLLSFIGGYIVDQQSKVNLLRAIILIRCLLVVIGLLLLYLFHSNLKTLFLVVIANSLLSIVYTPLSESIAPVLVENKKELFKANSWVSLANQLASVSSSGLSVLFVLWRKPIWALLGLGLSVLISYLTILHVPADAAPIKKHSLSFRETMSDFKHGLLLIVHNRLISLMIPIALISNFCFWSIWLLMPKYSVDIFNQYKIVYNVIDISFTIGGILGAAAFSKYHGRLKTGIFYPALLVGQSIMLILLGVNAWVKPSIINVFFISILWIGYGIFNSISSVLYFSIIQMSASNDTIGLIIGAVLTIFSLANPIAAALSAPISRLYTLPTIIVIFGSIMLFAALVVFSPYFNKELAKYDKK >NZ_CP012283.1|WP_062904005.1|1058389_1058605_+|hypothetical-protein MADFAEKTALLDTATKDIFDWSNDATPLRDAMWDKVMESNSHNTDATSEQAAKWEDMNDSDLKAAAEKLLK >NZ_CP012283.1|WP_046872216.1|1058714_1059050_+|hypothetical-protein MNKLKTKYDVYRYTGIPVVKDASGNYKFKLDDMGHVKPHSWRTGKHTKGKFKQRGQVFLTENRLFIAVITAEKMSFNQRHSVTPLQRFTSETINESLLKTGTELVRNLQDD >NZ_CP012283.1|WP_046872215.1|1059042_1060164_+|A/G-specific-adenine-glycosylase MIEWSDATIKEFQTTLLAWYDANRRDLPWRQDHDPYHVWVSEIMLQQTQVNTVIPYYQRFMASFPTVEKLAQAPEEQLLKAWEGLGYYSRVRNMQRAARQLLTDNGGQWPHTKAELQKLVGIGPYTAGAIASIAFNQPEPAVDGNAFRVFSQLLEIDADITKPQSRSLFEEVIRKIISKDRPGDFNQAIMDLGSSYMTAKNPDNEHSPVKKFNQAYLDGRLDEFPVRSKRLKPVDKQYFALVIETPGGFLFQQRASNELLAKLWLFPLVDADQLKESHPELNATTIIKAVEEKFVSETEIQTELQLIDTPIVNHTFTHQKWHVTLLYAKLQEELDLSHFSGKVVPVKKFATLAWPTVQKKLWQAFKKRQIQLF >NZ_CP012283.1|WP_046872214.1|1060180_1060873_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MKTLVIVAHPNLVDSGTQKFLKTSLAKMDSVTWHVLNEGHFDVTAEQDLLQENDRIIFQFPLYWYSAPAILKQWEDEVLTRNFVYGTGHALAKKELGIVVSTGDRQKGFVAGGEEQFTLSELLRPYQALAHKGEMTYLPPFPIFQFAYLSEQAKQRLLVSYQQYITNSDFESFHGQELWFEQQLSKKISEVQGSSNSQKTAQILGVIQDNRENLEELGWTLSMIKDDEDE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283_6 | 1234730-1234869 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012283_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012283_6
>6.1|1234771|58|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder CTATTCTCGGTACGGTGTCCATCCTTGCTATGGCATTCCAATGCCAAGTCGGACTGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012283_6
The CRISPR arrays of NZ_CP012283_6 >merge|NZ_CP012283|6|1234730-1234869|CRISPRCasFinder CCTCCTCGATTTTTAAATGACTATTTTGCATACGCAAAATCCTATTCTCGGTACGGTGTCCATCCTTGCTATGGCATTCCAATGCCAAGTCGGACTGGCCCTCCTCGATTTTTAAATGACTATGTTGCATACGCAAAATC >NZ_CP012283|6|5|1234730-1234869|CRISPRCasFinder CCTCCTCGATTTTTAAATGACTATTTTGCATACGCAAAATC CTATTCTCGGTACGGTGTCCATCCTTGCTATGGCATTCCAATGCCAAGTCGGACTGGC CCTCCTCGATTTTTAAATGACTATGTTGCATACGCAAAATC
>NZ_CP012283.1|WP_062903741.1|1233237_1234605_+|ISLre2-family-transposase MYILADFIESLGNLDSLFDLEEQVILHLRKSFQLVVAEYLRQLDETLVPSIPAENTFINRQARTIEFMFGAVNFERRCYLRPNGSYYFPLDEQLQLEERKRISPYFKSVVAKIGQTTTMRNTAAMINLASQTDISAWSVDRIIRDMADTVKTEEKSSEEKLVKKRKVENLVVEGDAFEIHKINRRRQDVHHYIVFESGLDGTRSNKVEFVGINQKKVQKRVTDYIEKHYKISEMTVFTASDGGPGYNPKSMREIVPSAQRVEFTIDRYHFVKKIKQTFGLFNPLVDKAVKSVSLYDQNQLNVILDTFESQIKTDKELESLRVLRQYLARNWQFIKSPHDRGFMRVGKLGSVESSHRAYTYRMKKQGKVWSEKGLEAMLKLIEARVNGKLDKYLRGGLRKLQELTIEIATESLKTLSSAQLSNKHHSKHIGVLSGKIPVDAPTSSPIGAMAKIFSN >NZ_CP012283.1|WP_046871523.1|1232255_1232756_+|O-acetyl-ADP-ribose-deacetylase MAFKVIRGDITTMKVDAIVNAANTTLLGSGGVDGAIHRAAGPELLAACRLLHGCQTGEAKITPGFKLPAKFVIHTPGPIWRGGHQHEAELLHNSYQNSLNLADQNHCVSVAFPSISTGVYRFPLQAGAKIAVTTIREFLKTAQSVKDVTMVCFDEGTYQAYLEVQK >NZ_CP012283.1|WP_046871524.1|1231076_1232243_+|hypothetical-protein MDSVLYDLEFAKNDQRLANVFPKEQETFYTGFVNSIGADGVILNTYDDTGQADGAVYVQFDAIENVEFDSPDLDNMLETIQIAENDQLFTVMDRIPDFVSTSDLIKQVVEDAYKNEQFLVLTRSDLENYQEGKVTAVHENDFEMHLVDKFDLTHEVLTTIKYTEAEIVEFSGRELAVETATWPEIAKQQPESRLTLTDTKDFYAVLKNAEQKQELITINDETKSSNFFVGTVNAVNKSEVLCNLVDMAGQFGGYSLIRLDAIVSITLKSDYMQVMEAFINYQKKNQTFVQPVLNEERLFDATDDLIMALIKQTETFSRVLSISLLTGAREMGYITDVTTDTFRFHVIDADLYVDQTGIEIVIEDVDELSFDFLNAVLIENHLRDKGLL >NZ_CP012283.1|WP_046871525.1|1229871_1231065_+|MFS-transporter MDDRTKQTFSWPLFLSPFVSRLGDALFVFGLNWFIVRATGHASLLGIVQGIGGIVLVAGDLFAGPLVDKYNRKLIMLLADIVSFLACLIMAGIMDVNKPVFYQLVLLTCIIDIGLAFNFPAAKAVVPEIIRSDKLSTFNSWSNTGLTLADIVAPLFGGFLLTLHWINFRSFLFINALSFLLSFIFTLALKYKPEKDHTKESMPILESLVKGLNYVRNKRDVFRLIIFDAFLAAMYAGYTLLLPYDVDHYYNGDEKLYSYVLTLVAVGGMLGGLSLVLNKHQPRIKTNYQDAFILAIVLILTGIWINYGLLLVSAFAYGFYTSRMSIRMMTIVQNLTDIAFLGRVFSIWFLCFDSMHPLGSFVFGFISDWFNHGTFFVLGGLVLLGLLVVYLMGRNSD >NZ_CP012283.1|WP_046871526.1|1229345_1229726_+|iron-sulfur-cluster-biosynthesis-family-protein MNIKFDSVSADKVQAHLDDNKRLLLTFEDGVGDYSQHAMIHMQVQFTINVVAKDMPTTGYNAVVHSNIGDLLIKDYSTDDLEENMSMKFNTHLGTLQLSGDGGAIDDNVGFIDFTDKNGIKNNPAR >NZ_CP012283.1|WP_046871527.1|1228290_1228818_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MEKFEKYRPILTPHFTLDWLTAAKVKDIYALRHDANVAKMSDRDVDSDIQATVDYVNKIMRAIMNNDSLLWGISERKIEKFLGTFCIWNFNDSKTAAEVRFEVLPNQQNHGIMTEILQRMTEFSFNELGLEKLYAVAKQSNTPAITVLKKTGFEIDPTYPGSQNTLSFSLCATTR >NZ_CP012283.1|WP_046871528.1|1227414_1228281_+|viroplasmin-family-protein MAAKKKFYAVAKGKQTGIFTDWNETKPMIDGFPGAKYKGFKTEAEARQWLNDGGVISKTKPTKKVNTAQSHQANDTEIIVYTDGGSRNTGNVNGGHVKKQDKAAWAYLINVAGKQISDSQGEFGATNNRMEIMALLRALEWLVENQKQTDEISVVTDSQYVLNAIQKHWLAGWKRRGWKRGSGQPLANSELWRQLDGLLPKFSHLQFYWTKGHATNEGNVFVDHLLNQTMDKMSGGQVANKAIRASSPAQTASKLTKKAQKKSVPTSETQKSLDAIKKSLEKLEWYND >NZ_CP012283.1|WP_046871529.1|1227090_1227273_+|hypothetical-protein MRFGNFSNRDYRIALDTETQLFWASEKNDPSIKASGVTITEALDKLNEKTNGLVQQQYAN >NZ_CP012283.1|WP_046871530.1|1226441_1226693_-|hypothetical-protein MRKIFTLSIIGVVLVGLVFLTLSSCGDHKASFDTSTVGSSKQDSTYGAWWEHMWSLPDKNSSNKKNNPRKNSVTKFSNDDNKK >NZ_CP012283.1|WP_046871531.1|1224928_1226242_+|NCS2-family-permease MGEKIKNYFQIDQLHTTVKREILAGFTTFISMAYILFVNPSVLGASGMDKGAVFTATALASALGCFLMGILAKYPIATAPALGINAFFAYSVCIGMKIPWQTALAGVFVASLIFIVITIFKLREMIINAIPADLKYAISSGIGLFIAFIGLHDGGLIVANKSTVVGLGSLGVATTWLTIFGLILTSILMVRRVPGGIFIGMAATAILGLLTGLIKAPAQWVSTAPSLKPTFMVGVEHIGDINTVQLWVVVLTFLLVTFFDTAGTLVGLAQQAGFMKDNKMPRVGKALMSDSTAMLAGSVLGTSPVGAYVESSAGIAVGGRSGLTAVTTGVLFILGLFFSPMLAVVTSQVTAPALIIVGVLMAQSMKHIAWEKMEIAIPAFLILIGMPLTYSVSDGIALGFIMYPITMVAAKRGKEVHPIMYGLFFVFIFFLYILNKG >NZ_CP012283.1|WP_046871521.1|1235101_1235782_+|noncanonical-pyrimidine-nucleotidase,-YjjG-family MKYQNLLFDVDDTLLDFHAAENQALKALFAEIKYPLTDDMVTYFRALNEHMWQRFELGQLDRQTLVNTRFTKLFAHFNETVDGIKYEQIYREFLNQGHQLEPHALELLNSLKDQFNLFIVSNGIGSVQQHRLNDSGLSTYFKHIFVSEEVGYQKPRIEFFDFIANHISGFTPKNALIIGDSLTSDIQGGANAGIDSVWFNPALQPNHSSVSPTYQIDDLLDLKEIL >NZ_CP012283.1|WP_046871520.1|1235964_1236417_+|MarR-family-transcriptional-regulator MEKHLGINRQIHVLANCSTRKFNESFLDDDITGKQGGVLHFLLMRAGKQKIYQRDIEEHFGIRRSSVTSLLQKLEDNGYITRESVADDARLKLIVLTPKAMAFQKSVVQGTIDFEARMLQGVSEDEIATWQKVTQQMTRNLKDKKIGSDK >NZ_CP012283.1|WP_046871519.1|1236416_1238153_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKRIGHSVREYKKYALISPILVAIETFIETFIPYLMSKMIDKGIIPGNLAYIEKLGVFMLIGTFISLAGGAGASWYSSKASAGFAKNLRHDLYHHIQDFSFEDVDHFSTSSIVVRLTTDIMNIQQAFQMLIRAAARAPLMLIFSITMAFTVDAQMAMVFVVSVPLMAIGLTVIIAIGRPLFKKVYQRYDGLNRVVRENLRGIRVVKTYNRAELEDKKAEKASSSIYEVFSKAERILQLNSPIMQFVMYGTLLFLAWFGAKRIVGGTMQTGQLVSLLAYAMSVLMSLNILSNVFNQMTISLASAQRIDEVLTYKSTLTNPKNPLTDVKTGEIDFDHVDFAYADDGVTRLEDINLHIKPGETIGIIGETGSGKSSLVQLIPRLYDVSHGSVKVGDQDVRDYDIRTLRDNVSMVLQQNVLFSGSIADNLRWGDEQATDEQLVQAAKLAQADDFINSLPDGYDTYIEQGGSNVSGGQKQRLTIARALLKNPKILILDDSTSAVDTHTDSLIQTAFREELPEMTKLIIAQRISSVQGADRIVVIDQGKIEAVGTHDELMNSDDLYQDIYNSQIKGGETHAKN >NZ_CP012283.1|WP_062904042.1|1238139_1240035_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQRTRVAGRAKLDGSAWQILWRLLKYIMQKSHFALFIAFFSVIVSAGASVVGTLFIQRLIDDYITPLMKVAHPNFTPLLHMIILMGAIYLLGVIGTLLYSQLMIMTGQKLQKRIRDEMFTHMQQLPLSYFDSNDYGDVMSRYTNDVDTLRQMVEQSFPMFINALFNVVFTLTAMITLSPTLTIISLIVFALSIFIVRKLSSKSSYYFRMQQKALGNIDGYIEEMLNGQKVIKVFSHEDQAKAGFDKRNEALRQDASMANGLSTMLFPIMGNVGNILYVLIAVVGGYFAVNHITPITLGEIAAFVQLSRSFSQPIAQITMQLNSIIMGLAGAQRMFQLFDEPVEQDSGDTTLVYVTENEQHELTETSERTDKWAWKTPEKDGNVKLTPVKGHIEFKDVSFSYDGKKTVLHHISLDAKPGEKMAFVGATGAGKTTITNMLNRFYDISSGQILYDGIDIQNIQKASLRLSMGIVLQDTNLFTASIRDNIRYGRLNATDEEVVEAAKLANADSFIRNLLKGYDTVIDGSGSDLSQGQRQLLSIARAAIADPPTMIMDEATSSIDTRTEALVQSGMDNLMKGRTTFVIAHRLSTIHNSDEILVIEDGRIIEAGNHESLMQEKGEYYELYTGKTILE >NZ_CP012283.1|WP_062904043.1|1240676_1241000_+|hypothetical-protein MIQIPQDMTEVKVKIAQLEELGHKSNEKQVVFDAIQDNAQAILDEQLEGHYDSCTLDNDKITIYETPEKPIGSVKSQRASFEEDFRKNANNMFIYLQQEISKVINQR >NZ_CP012283.1|WP_046871516.1|1241016_1241835_+|HAD-family-hydrolase MSIKLIASDIDGTFLDDQHEFDRTRFQNQLDEMNRRGIHFVVASGNQYLHCTKVMTGINGDLTYVAEDGALIVEKGKMLDSSPIEPELWQKVVTSVDEQPILANAVIILSGEKAAHTNVTPQNEVWGRTGYFYENLTHASDFSTVTDEIYKVDVNWPDLADIRDKYNVLTTEFGNQLTEVMSGYSGIDIIKPHVTKAYGLVQLQRIWNVSMAETMTFGDNQNDAEMLKHAKYGYAMKNASPEAKAATSLVTPLDNNHSGVLDMIDRVLNDQI >NZ_CP012283.1|WP_046871515.1|1242142_1243225_+|hypothetical-protein MNGKRIKTVILATLAMLALTACRSQDQKRSSSKATTSVSRSATKVSKRKTVKTSDTTSQSSSSAKESAPKTNTMNFDQIKQGNYGSLQGTWTETGHSASKDGQAVEKGGTDTLTVSNGTITNGSTKVQKQTLTDAAGEHSLVFKTKDDVLTANLADEDVAINWMVTFYPKGTTNKYKTNNDSGKNSQNMIVVWTSNNSYTEIFAQTSTTPSVSKTANAAKTTKATKPVETGLNLAQISRNNFSSLVGTWKNTDGKTIIVTNEVKNKPTGSNVAYSKGAVVKGTDGNGHSRVITAGKVTSGYIQGGIGTFDSDAAVSAFDPLTIIPKNVKLSDADDSDSTRDRLILGGGQGGYATQAYYKE >NZ_CP012283.1|WP_046871514.1|1243678_1244236_+|DUF5067-domain-containing-protein MKKKNEAGTATKKRPIYKRIWFWLLVLIMIGGIGAIAGGSGNDSSENQADSKTEKQSESTADKSHKVGDEATVGKVSYKLNSVETTDERNEFEDTNPKNVVVAKYTVTNNSDEDVPVGTDLDVYGSDGKKLKSYAVSDNTLDSVASGKKADVEAAYGVDELGNIELHFSPLASFDDAVKFHTTVE >NZ_CP012283.1|WP_046871513.1|1244428_1244821_-|type-II-toxin-antitoxin-system-HicB-family-antitoxin MRLVAYPAILDDSENKPGQYTVTFPDVPGAITDGNNLEEALYNAPEALGLVLFDEKVLPKSSSLQTIQKQNPDKIVTYISVDLDFIRRNSYKPTVKKNTRIPAELAKKAENQGINFSATLTAALEEKLSN >NZ_CP012283.1|WP_046871512.1|1244906_1245125_-|hypothetical-protein MVIVNSPQKQDEIIKLLTDYKSDDVNFEFVKKTGMKMEFKTTADDAAAAKLAKSLIKGEKWGSVLFFQAIAG |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283_7 | 1358990-1359140 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012283_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012283_7
>7.1|1359044|43|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder AAAAAGCAGAAAAGAGATGGGCCCACAAGTAAACGGAATCGCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012283_7
The CRISPR arrays of NZ_CP012283_7 >merge|NZ_CP012283|7|1358990-1359140|CRISPRCasFinder ATCCCGCGGGAAGGATAGTTATATTTTGACTTTTGCTTTGTCGAGCCGTCCTCAAAAAAGCAGAAAAGAGATGGGCCCACAAGTAAACGGAATCGCAATCCCGCGGGAAGGATAGTTATATTTTGACTTCTGCTTTGTCGAGCCGTCCTCA >NZ_CP012283|7|6|1358990-1359140|CRISPRCasFinder ATCCCGCGGGAAGGATAGTTATATTTTGACTTTTGCTTTGTCGAGCCGTCCTCA AAAAAGCAGAAAAGAGATGGGCCCACAAGTAAACGGAATCGCA ATCCCGCGGGAAGGATAGTTATATTTTGACTTCTGCTTTGTCGAGCCGTCCTCA
>NZ_CP012283.1|WP_193394619.1|1358143_1358935_+|HAD-family-phosphatase MDIDGTLISHNQNVSLMTKKVIEQLQQKGFIFYIATGRMLSLAQVIQKRINPKVEIIASNGSVYQKGHHLHQDHLGWKAISTVYDVTMELGLSTNFFSTDRTFYTKNKPWDLSRLARMRVMQDGAGKFEDVHDRDHLNEVSDQIINGIVIAQGQLDKLAIARKKLLEADVLNVSSSSSDNIELIPKRIDKASTVRAITNQYGIPVDHTIAFGNDKNDLGMLKAVGTGVAMGNSADEIKTQADVVTETSEDDGLPKYLKRRFLD >NZ_CP012283.1|WP_046872431.1|1357477_1357957_-|class-Ib-ribonucleoside-diphosphate-reductase-assembly-flavoprotein-NrdI MSIINILYISIAGNTRSFTQDLQDYAKEQHSKDATNPLITLKEISEETDFETERHPYFAFVPTYLDGGNGVDNGVKELMTNVLGEYIAYKNNRKLCLGVIGSGNRNFGLQYCLTAKRYARDYGFDYLDNYELRGNSTDCKRIYETLKKNNVLKKAPEEV >NZ_CP012283.1|WP_046872432.1|1356554_1357415_+|aldo/keto-reductase MAKLTKLTDTYELNNGTKIPIVGFGTWQTPDGDVAEKSVEEALAAGYRHIDTAFAYGNEQSVGKGIKDSGVARDQLWVTSKLDGKDHGYENTKRAVDKSLTNLGLDYLDMFLIHWPNPIAYRDTWEQTNADTWRAMEEAQKAGKIRAIGVSNFRPKHLDALLKTATVVPQVNQIFLNPSDLQPEVVKYDDDHNILSEAYSPLGTGKIFGVSELKTMSEKYHKTVAQVVLRWSLQHGFLPLPKSVHNERIIENTKLFDFEIDDADMKKIDGLRGLAGLATDPDTITW >NZ_CP012283.1|WP_046872433.1|1355561_1356218_-|membrane-protein MDKHADFKKRLFFFVISIILNSFSNALTVASHCGSALWTASSVNLSSWLNFPLSNVLFVEGLAVILANALLLQHFDWHRMLGNLVFMIPFSYLVGTISTNLDAHGFLTLPLWIRILADALGIVGIGIAVSIYQRANIVLHPNDDLTYIVRFRFMHGRAAKAQWISYIPAISIILLTFIMTHQIHAVGLGTVLAFILQGAVTGWADQHVFTTLKHHLNV >NZ_CP012283.1|WP_046872434.1|1354684_1355476_-|tyrosine-protein-phosphatase MVRSRILQLQKGGNFRELGGYETIAGKTIKWHKIIRSGKLADLTDADIAYLNDYGLKYDVDFRSPEEKATSPDRIPDQAKYLFIPVFSTDETQNSKQTERLQRKMDTDPTTGRLQMQHAYKDIITNPHSQKAYRSFFDVLLENDGEKSTLLFHCTAGKDRTGMGAVFFLNALGVNEDTIKADYLLTNKVIQQQQIMLTKTLKLQGASSAFIQSMRDLQSVQISFYNTAMDQIEKTSGDMAAYLHEYLHLSDSDIQDLRHIYLE >NZ_CP012283.1|WP_062904058.1|1353820_1354654_-|alpha/beta-fold-hydrolase MKRKNLIGFGLVAPLALGITGITAASARLYDYAFRRVDYVPETSADKQKYADEYYNYVNWFHNIPTHHWTLHADDLENRVEATFIPAAKLDSKKTVIIAHGYKGNGETMSNYAKMFYDMGYNVLLPDDRAHGRSSGDYINFGWIDRLDFVDWANSVVSRIGADSQIIMFGVSMGGATIQMTSGENLPPQVKLMISDCGYSSLRDELSYLLKEQFNLPSKIFVPLINAINHHRMGFSIDDVSSIRQLRKNTGSLSNRIGGDFERHIHFGECAFCLLMN >NZ_CP012283.1|WP_052694465.1|1352587_1353835_+|ISL3-family-transposase MQMSLTNSILCLFEITDPNLIVTGISKERCSTNQRIHVVHATLSYQLLKCPHCGHKSLIKNGTHMSHLRLGTLSGGRYEMHLKRQRYQCKDCSKTCGAKTKLVNRNETFTHNIKHQVIVLARDMLTSKEIAKLCGISPSSVQRILNANIHLAYRVKHLPENLCFDEFRSCNHWMSFNCCDAVSHRRIVTLKDRLSKDIIDYFEARFSVQERAQVQSVTIDMNAEYGSFIHRLFPNAATIIDRFHIIQLAGRALDNERTQTIRTIQDKHSPIYHILKSQWRLFHLDEIKVNDSKAVYLRGINEYMTQQNAIDLALDAFPRFRSVYQTYQGILSAIHQKDANAFQSLLTNYQPTSNQMDITINTFIKNGSALLNSCRYPFSNGPIEGLNRKIKALKRNCFGFRNIDNFFIRISLIHE >NZ_CP012283.1|WP_062904057.1|1352251_1352536_-|alpha/beta-hydrolase MSFFIFLIFKTDKKPVLVIHQYQKVQTQNTRPFLFIHGEKDIYVPTYMVDESFEACPDPKEIWIVPNASHAESFWINPQAYQTKIQQFIDKYSK >NZ_CP012283.1|WP_046872436.1|1351747_1352158_+|transcriptional-regulator-Spx MDKITVLWGPSCGSARRACHWLDTQELTYDKVNVVSTAITLDTLKKVLSLTEYGAEEIISERSKIFKKFGREYIDSLTISELHRLLVNYPSLIKKPIIFTHNKLQVGFNEDEIRSFIPRETRRVSFAQMLNILHDA >NZ_CP012283.1|WP_062904056.1|1351015_1351273_-|hypothetical-protein MRTKYWSDFILAIIVIIACVVGWFTGYFQNGSNYSSIEKTLILILAFSVLFRLRMDMKGANRWEAVSAAFPGVAFLLAVVLLAFL >NZ_CP012283.1|WP_046872429.1|1359208_1360594_-|HlyC/CorC-family-transporter MDSGQIISDTIIILITFIMAYFFVAAEFALVESRLSALEEAKETAVGGRLKKINRAIHMVSNLNEYLSTTQVGTSVCGIILGWIGESYVEYFIIKFFGSTHLINQASLHAIGAIIGVLLLTYLEVVITEIVPKNISIDIPLKVLMRLVNPLHWFHTIFYPFVWLLNTSANGIVKLMGMEPAEENNEVLSQAEILSLSKNSVTGGELDQNDYVYMQRAFDFNDKVAKDIMIDRTQLVVLNVDVTVDEALRVYLQKRFSRFPVVANNDKDKILGYVYNYDLVRQSRVDGKVKVSKLLRNIITVPETVLIQDVLQRMLKKQTPISVVVDEYGGTSGIITDKDIYEEVFGTISDEVDDVSGDYIHKESDGSYRVSGKTTMYDFERYFGIDVPGFEGEDVVTIGGYVIDHHPNIQVHDQVRIDRYNFEVLDNENAHIDWFHVTSISDNEFKKLKEDAETKRLNANG >NZ_CP012283.1|WP_056986457.1|1363654_1364038_+|hypothetical-protein MAKDDKVKVETDAEQIAKIDFDKEDVKQAADMIEEKGFVTRNDFPDLKDRLWSEGFYEKIEDEFHQRDNENPYIFFERFDFVGGAIESIIFDMDQVKTREKALHVLGDALDLKVQDKPNETHKMVTY >NZ_CP012283.1|WP_062904059.1|1364281_1364710_+|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MANELRNADFDDFAPFDFYDNFGKNFFKSMTQGSSMKTDIRENEKDYEVSAELPGLKKENISLNYDNDTLTIEGKHNVNKEKKDEKGNLIRQERSFSNTSRQFYLPDIDRDKISASYDGGVLKITLPKSESKLESGKQIPIN >NZ_CP012283.1|WP_062909687.1|1364770_1365301_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MKNLQTKNYELHFPVQSDVDILFRYRSNIEIAHSEGRIPDKSRQETAKFLTQLLSKIDAGIVNYWLISDHTKNHLGGISIWGFNQEKAEAEVGYDILPKFQGKGVISEVFPEIEQYAFTVLKLQKLSVYTSKIDILSQHILRKNHYRLIEHWIEKNLKGEPTDMFHFAKTIEEYQK >NZ_CP012283.1|WP_046872425.1|1365398_1366472_-|IS30-family-transposase MKEVFVLAQEQLTISHLKGHHLTQIERGKIAGLLAAGKSARQIAAEIGVCHQTINNELKRGCIQQVKKVNGKEQYFNVYAPDTAQIHYQTNRQRCHRPLNFKSITNFLAYFDDHFHQDHWSPDAAVGFAHKHRLFKRTEMVCTKTLYNYIDAQLLEIRNLDLLEKTKRRTKHHWSHKHRRLIGKSIEERPECVDKRSEFGHFEIDTVVGKRSGHECVLLTFTERKTRFDFIRLIEGKDADSVAYAIKGICAEFGDLIKSVTADNGTEFTALEEAFTGVADIYYAHPYSSSERGTNETHNRMIRRYLPKGYSLDTVSPKTVAIVEDRLNQLPRRILKYQAPEKAFQIEAARARRAHIA >NZ_CP012283.1|WP_145912950.1|1366825_1367803_+|aldo/keto-reductase MVINLFIGVIFLKQITIGGKKVSNVALGIMRMDALDTDAATKVIETAVDNGVNFIDTADIYGGGKSDLVFQKALDKSSVSRDDLWIQSKVGIRNSNDDGSGKPYGNRYDFSKQHIIDAVNHELQSLKLDYLDSVLLHRPDPLMELNEVAEAFDELQTAGKVRHFGVSNFNPMQFDMLQGAVSQKLMFNQLQFGIMHSNMIGFGMHTNMQDAHSIDHDGQFIEYSRIHDIVIQAWSPYQWGNFNGPFIDNPKFPELNKKMQALADQYGVTKNAIATAWILRHPAKFQVLVGSMNPQHIKESLAGSDVEMTGQEWYDIYYAAGNDMP >NZ_CP012283.1|WP_046872422.1|1367973_1368540_-|DUF5067-domain-containing-protein MKSFKKVFSILMIGLVATSLTACSSGNTSKSSQQSSSSEKKVSSAKKAVKKTATLSDQTFKTPQGTFLITENHVTASATKNKQVLILKYTFTNTSKSQLVPSDYWYKYVKATQIVNGSTKTLEQGSLPFSTAATTDDNLENSSVSEIKPNHHINAEGSWQLDKNGAPVKVSFYDTHKQLVGTRQYDTN >NZ_CP012283.1|WP_046872421.1|1368549_1368885_-|hypothetical-protein MFELTKKRRVSDEVKEIIPQPVIDGLWKTLKQMQADDLVVSPVIAFVFSDDYTEDTIYVMGLQNSGDVAKEYDLAYSGKKDFLGNGTIVIVKDKPKTISMSISAVNNQTKE >NZ_CP012283.1|WP_046872420.1|1369036_1369573_+|DUF1836-domain-containing-protein MNELETYNRWLKTVREVKLPHWDELPNFDLYMDQVVALLSGYTGPLGMDPVTPTMINNYVKQKAVVAPTKKKYQVMQVADILLITLLKQAYPINVIRSGIDRITATDYPKQAYDRFIDIVNQKIARIGLEHTTTMAKNLAEQLMQVTSNMIVDQVQTSELIRLLQRSEEHTPTTLNKK >NZ_CP012283.1|WP_052694568.1|1370062_1371463_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein MIKDLDNKKDVDEPQLMVNDLVKKAHIALDRLSVMDQEQIDKIVHAMAEAGYHARQKLAKMAVDETGRGVYEDKVIKNQFATKDIYNSIKNDKTVGIISDDKETGIMKVAEPVGVIASATPVTNPSSTVFHNALLAIKTRNPIVFAFHPFAQKTCVETGRVIAEAAVKAGAPENSVQWITKPSMDATTDLMNHDGVATVVATGGAGMVKSAYSTGKPALGVGPGNVPVYVEKTADLKQSLDDIVLSKAFDNGMICASESNMVVDAEIYADVKSGLKERGAYFVKDADMENFESTVMNREKESVNPKVAGQSAYSIAQWAGIEDCPKDAKFLVAEMNGLGGEYILSHEKLSPVLTMVKAKDQDDAVHLMKRGLNLGGLGHTVGLHTKDDALINRFALEMDACRILINTPTSQGAIGYKYNNVTPSLTLGCGSWGKNSISHNLEDWDLLNIKTVAKRLPKLRHEGLDF |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283_1 | 1.1|486366|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 486366-486382 | 17 | NZ_CP012283.1 | 485853-485869 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP012283_1 | 1.2|486408|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 486408-486424 | 17 | NZ_CP012283.1 | 485895-485911 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP012283_1 | 1.2|486408|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 486408-486424 | 17 | NZ_CP012283.1 | 486000-486016 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP012283_1 | 1.3|486450|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 486450-486466 | 17 | NZ_CP012283.1 | 485937-485953 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP012283_1 | 1.3|486450|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 486450-486466 | 17 | NZ_CP012283.1 | 486042-486058 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP012283_1 | 1.4|486492|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 486492-486508 | 17 | NZ_CP012283.1 | 486084-486100 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP012283_1 | 1.5|486534|38|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 486534-486571 | 38 | NZ_CP012283.1 | 486126-486163 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP012283_1 | 1.6|486597|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 486597-486613 | 17 | NZ_CP012283.1 | 486189-486205 | 0 | 1.0 |
| NZ_CP012283_2 | 2.3|487458|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 487458-487480 | 23 | NZ_CP012283.1 | 486168-486190 | 2 | 0.913 |
1. spacer 1.1|486366|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to position: 485853-485869, mismatch: 0, identity: 1.0
ttgaaactttgctgcca CRISPR spacer ttgaaactttgctgcca Protospacer *****************
2. spacer 1.2|486408|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to position: 485895-485911, mismatch: 0, identity: 1.0
gagtcttagtattctgt CRISPR spacer gagtcttagtattctgt Protospacer *****************
3. spacer 1.2|486408|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to position: 486000-486016, mismatch: 0, identity: 1.0
gagtcttagtattctgt CRISPR spacer gagtcttagtattctgt Protospacer *****************
4. spacer 1.3|486450|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to position: 485937-485953, mismatch: 0, identity: 1.0
gtgtagttgtagtccca CRISPR spacer gtgtagttgtagtccca Protospacer *****************
5. spacer 1.3|486450|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to position: 486042-486058, mismatch: 0, identity: 1.0
gtgtagttgtagtccca CRISPR spacer gtgtagttgtagtccca Protospacer *****************
6. spacer 1.4|486492|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to position: 486084-486100, mismatch: 0, identity: 1.0
gagttgttacattacca CRISPR spacer gagttgttacattacca Protospacer *****************
7. spacer 1.5|486534|38|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to position: 486126-486163, mismatch: 0, identity: 1.0
tggtgattgtggtaccaccatctgtgatgatcgtgcca CRISPR spacer tggtgattgtggtaccaccatctgtgatgatcgtgcca Protospacer **************************************
8. spacer 1.6|486597|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to position: 486189-486205, mismatch: 0, identity: 1.0
gtgtcttcgtattttgt CRISPR spacer gtgtcttcgtattttgt Protospacer *****************
9. spacer 2.3|487458|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to position: 486168-486190, mismatch: 2, identity: 0.913
gtgtcgttgttgtgccacctggt CRISPR spacer gtgtggttgttgtgccgcctggt Protospacer **** ***********.******
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283_2 | 2.4|487506|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 487506-487528 | 23 | NZ_CP039340 | Ralstonia solanacearum strain UW386 plasmid pUW386, complete sequence | 1352118-1352140 | 2 | 0.913 |
| NZ_CP012283_2 | 2.4|487506|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 487506-487528 | 23 | MG592425 | Vibrio phage 1.042.O._10N.286.45.B8, partial genome | 6192-6214 | 2 | 0.913 |
| NZ_CP012283_2 | 2.4|487506|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder | 487506-487528 | 23 | NZ_AP017461 | Candidatus Endomicrobium trichonymphae strain Rs-D17 plasmid pRSTT2, complete sequence | 3657-3679 | 3 | 0.87 |
| NZ_CP012283_3 | 3.9|645752|27|NZ_CP012283|PILER-CR | 645752-645778 | 27 | NZ_CP015585 | Roseomonas gilardii strain U14-5 plasmid 1, complete sequence | 150011-150037 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012283_4 | 4.7|647515|31|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647515-647545 | 31 | NC_011990 | Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84b, complete sequence | 89039-89069 | 7 | 0.774 |
| NZ_CP012283_3 | 3.1|645422|30|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder,CRT | 645422-645451 | 30 | CP046512 | Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence | 129098-129127 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012283_4 | 4.1|647119|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647119-647148 | 30 | NZ_MK439959 | Escherichia coli strain Ec-2Lar plasmid pC-Ec2-KPC, complete sequence | 47279-47308 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012283_4 | 4.1|647119|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647119-647148 | 30 | NC_015283 | Prochlorococcus phage P-RSM4, complete genome | 97956-97985 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012283_4 | 4.1|647119|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647119-647148 | 30 | AB711120 | Bacillus phage PM1 DNA, complete genome | 40725-40754 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012283_4 | 4.8|647582|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647582-647611 | 30 | NZ_CP016890 | Pantoea agglomerans strain C410P1 plasmid unnamed1, complete sequence | 419338-419367 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012283_4 | 4.8|647582|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647582-647611 | 30 | MN693541 | Marine virus AFVG_25M436, complete genome | 28757-28786 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012283_4 | 4.9|647648|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 647648-647677 | 30 | AF191797 | His2 virus, complete genome | 14590-14619 | 8 | 0.733 |
| NZ_CP012283_3 | 3.6|645752|30|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder,CRT | 645752-645781 | 30 | NZ_CP015585 | Roseomonas gilardii strain U14-5 plasmid 1, complete sequence | 150008-150037 | 9 | 0.7 |
1. spacer 2.4|487506|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039340 (Ralstonia solanacearum strain UW386 plasmid pUW386, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.913
gcgttgttgtcgttgttgtaccg CRISPR spacer gcgttgatgtcgttgttgtcccg Protospacer ****** ************ ***
2. spacer 2.4|487506|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to MG592425 (Vibrio phage 1.042.O._10N.286.45.B8, partial genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.913
gcgttgttgtcgttgttgtaccg CRISPR spacer gcgttgttgtctttgttgtagcg Protospacer *********** ******** **
3. spacer 2.4|487506|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP017461 (Candidatus Endomicrobium trichonymphae strain Rs-D17 plasmid pRSTT2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
gcgttgttgtcgttgttgtaccg CRISPR spacer tcgttgttgtcgttgttgtacta Protospacer ********************..
4. spacer 3.9|645752|27|NZ_CP012283|PILER-CR matches to NZ_CP015585 (Roseomonas gilardii strain U14-5 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
tggaccacaggatatgtggaagcgacc CRISPR spacer cggaccgcaggatatggggaagcgttt Protospacer .*****.********* ******* ..
5. spacer 4.7|647515|31|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011990 (Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
tttcaaccagctttcttggcttttggaaagt CRISPR spacer tatatgacagctttcttggcttttgcatagt Protospacer * * . ****************** * ***
6. spacer 3.1|645422|30|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP046512 (Bacillus cereus strain JHU plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atgtgtatacagtcaagcttttttacatta CRISPR spacer cctctcatatagtccagcttttttacatta Protospacer . . .***.**** ***************
7. spacer 4.1|647119|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK439959 (Escherichia coli strain Ec-2Lar plasmid pC-Ec2-KPC, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttaaagggtaatacattaattgtaggtgaa CRISPR spacer ttaaagggtaaaacattatttgtttttccg Protospacer *********** ****** **** * .
8. spacer 4.1|647119|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015283 (Prochlorococcus phage P-RSM4, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttaaagggtaatacattaattgtaggtgaa CRISPR spacer gataatggtaatacattaattgaaggaaca Protospacer ** **************** *** . *
9. spacer 4.1|647119|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AB711120 (Bacillus phage PM1 DNA, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttaaagggtaatacattaattgtaggtgaa CRISPR spacer gctgcgagaaatacattaattgtagatgaa Protospacer . . *.* ****************.****
10. spacer 4.8|647582|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP016890 (Pantoea agglomerans strain C410P1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gatgtcagcgttaaacggcactggtatcac CRISPR spacer gatgtcagcgttaaccggcaccagatagtc Protospacer ************** ******..* *
11. spacer 4.8|647582|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693541 (Marine virus AFVG_25M436, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gatgtcagcgttaaacggcactggtatcac CRISPR spacer taactcagcggtatacggcactggtattgg Protospacer * ****** ** *************..
12. spacer 4.9|647648|30|NZ_CP012283|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AF191797 (His2 virus, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
attgcactcgtaggattacaaacgatacct CRISPR spacer cagacattcgtaggattacaaacgattgcg Protospacer .**.******************* *
13. spacer 3.6|645752|30|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP015585 (Roseomonas gilardii strain U14-5 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
tggaccacaggatatgtggaagcgaccccg CRISPR spacer cggaccgcaggatatggggaagcgttttgc Protospacer .*****.********* ******* ...
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
113480 : 163562
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012283|113480:163562|DBSCAN-SWA 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47 | Bacillus_phage(50.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_2 |
176640 : 218982
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012283|176640:218982|DBSCAN-SWA 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45 | Lactobacillus_phage(27.78%) | head,transposase,portal,integrase,tail,terminase,capsid,bacteriocin | attL 170648:170664|attR 224108:224124 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
225281 : 285952
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012283|225281:285952|DBSCAN-SWA 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57 | Streptococcus_phage(17.65%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
329772 : 458832
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012283|329772:458832|DBSCAN-SWA 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119 | Streptococcus_phage(12.82%) | head,transposase,portal,integrase,tail,protease,terminase,capsid,tRNA | attL 321803:321820|attR 449703:449720 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
465504 : 523270
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012283|465504:523270|DBSCAN-SWA 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49 | Pseudomonas_phage(20.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
543071 : 577099
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012283|543071:577099|DBSCAN-SWA 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29 | Bacillus_phage(62.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
665208 : 727714
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012283|665208:727714|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(23.08%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
770173 : 839710
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012283|770173:839710|DBSCAN-SWA 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46 | Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(11.11%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
848995 : 896797
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP012283|848995:896797|DBSCAN-SWA 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54 | Bacillus_phage(41.67%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
926776 : 1003254
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP012283|926776:1003254|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(23.53%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
1014321 : 1033688
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP012283|1014321:1033688|DBSCAN-SWA 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32 | Bacillus_phage(80.0%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
1115449 : 1158912
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP012283|1115449:1158912|DBSCAN-SWA 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36 | Bacillus_phage(60.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_13 |
1264274 : 1376824
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP012283|1264274:1376824|DBSCAN-SWA 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116 | Lactobacillus_phage(52.63%) | head,transposase,portal,integrase,tail,protease,terminase,capsid,tRNA | attL 1290322:1290381|attR 1376892:1378443 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_14 |
1395579 : 1441079
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP012283|1395579:1441079|DBSCAN-SWA 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40 | Streptococcus_phage(41.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_15 |
1548815 : 1595469
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP012283|1548815:1595469|DBSCAN-SWA 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46 | Streptococcus_phage(15.38%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_16 |
1642543 : 1702913
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP012283|1642543:1702913|DBSCAN-SWA 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57 | Bacillus_phage(21.05%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_17 |
1718117 : 1790392
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP012283|1718117:1790392|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(25.0%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_18 |
1926859 : 1991410
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP012283|1926859:1991410|DBSCAN-SWA 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55 | Bacillus_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_19 |
2060247 : 2070154
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP012283|2060247:2070154|DBSCAN-SWA 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TAAACCAGTTTCTTTAGCAATTAGGCAAGTTAATAAAGCATAACTAGCAATATTAAATGGAACTCCGAGGAAAATATCCCCACTACGTTGATACAGCTGACAACTAAGTTTGCCATCAACAACATAAAATTGAAACATTGTGTGACAAGGTGGCAAAGCCATTGATGGAATATCCTCAGGGTTCCACGCCGAAACAATCATCCGCCGAGAATCAGGATTAGTTTTAATTGTGTGAATCACTTCACTAATTTGATCGATTGTTCCGCCAGTGGAGGTTTTCCAAGCACGCCATTGGCTACCGTATACATTACCTAAATCACCAAACTCTTTAGCGAATGTATCATCGTTTAGGATTTTGTCATCAAAAATCTTCTTTTGTTCATGATGCTGATCGGCAAAGCTTTGATCTTTTAAAGAACGACGGCCAAAGTCGGTCATATCAGGACCTGTGTATTGATTACTTTCAATCCATTTTTTAAACGCCCATTCGTCCCAAATATGGTTATGGTGTTCCAATAAATAACGAATATTGGTATCCCCATGTAAAAACCACATAAGTTCACTTTTAATTAGGCCAAAAGGAACGCGTTTAGTTGTTAATATTGGGAATCCCTCTGCCAAATTAAAACGCATTTGATAACCAAAAATACTATAGGTACCTGTTCCTGTTCGATCATCTTTGTAGTTACCATTTTCCAAAACGTACTTTTCTAAATTTAGATAGGCTTGTTCTAACATTGTGATTTCTCCTTGGATTTAATCCGTTGTGTATTGGCTCAGATATTCCCAGCGGGTCATTTTCTTATCAATTTGAGCATCCAGATCATCAATTTCTTTTTGAAGATCGGCTAATTTACCATAATCGTCTGCAGTAGCATTCATTTGTGATTGACAATCCTTTTTTTGATTCTCTAATTTATCAATATCTGCTTCAATTGTTTGCCATTCCAGCTGCTCCACATAGGTTAACTTAGTTTTTTCTTTTTGGTCATCAGTTGAATTTTTCGATGAAGTAGGTTCAGGAGGTTGAACCTGCTTTTCAGATACCTGTTGGGTTTCATTAATTTGATGAAGATAATTTGTAAAACGTCCAGAAAAATGAGCTATTTTGTCATGGCCCTCAAATATTAATAAATGGTCTGCCACTTTATCTAAGAAATAACGATCATGAGAAACCGTAATAACTGTGCCTTGAAAATTAGCTAAATAATCTTCTAAAACGGTAAGTGTCCCAATATCAAGATCGTTTGTAGGCTCATCAAGTAACAAAACATTTGGCTGCTGCATTAAAATTTTTAATAAATACAGACGGCGTTTTTCACCGCCAGAAAGTTTTCGAATTAATGTTCCATGCATTGCGCGGGGGAAAAGAAATTGTTCCAACAAGTTCGTCACACTAATCCGTTCGCCATTTGCATTTAACACCCCCGCCCCAACTTCGCTAAGATAATTAATTATGCGTTTATCTTCAGGAATTGGTTCAATCTTTTGTGTATAATAGCCTAACTTAACAGTTTCTCCAATATCAATTGTGCCAGAATCTAGTGGGATGCGCCCGGCAATGACGTTAAGTAATGTCGATTTTCCAGTCCCGTTATTTCCAGTAATTCCGACACGTTCGTCTGCTTGGATAAGATCAGTAAATTTATCCAAAATTAGGTGTGAGCCTAACCGAAGTGAAGCATCTTTCAAGGAAATTACTTTCTTGCCTAATCGCTGCTGACCTAGTTGAACTGCAATGTTATCGGTGTTTTTAGCAGGTGCATTTACAGAATCACTTAAAGTATCAAACCGGTTAATCCGTGCCTGTTGCTTGGTACCCCTTCCCTGAGGTCCCCGCCGCATCCACGCAAGCTCTTGTTTATAGAGTTGGTGTTGTTTTTGTGATTGGGATGCTGCTTGTTCTTCTTGAACAGCTTTTTCGGCTACATAAGCTTGGTAATTACCGGGATACTGGTATAACTTACCAAATGAAAGCTCCCAAATTTGATTGGCTACTTGATCAAGGAAATACCGATCATGGGTGACGATTAAAAGTGCACCCTTGTAAGCAGCTAAATATTTTTCTAACCAAGCAATAGAATCAAAATCAAGATGATTAGTAGGCTCGTCTAACATTAACAAATCTGGAGCCTGAATTAAGGTTTGGGCAAGATCTACTCGCTTTTGTTGACCCCCAGATAATGTACCAATTTTTTGACTAAGATCTGTAATGTGTAATTGAGTCAAAATTGTTTTAACATCACTTTCAGCAGTCCAAGCATCGTCTTGATTCATACGTTGCTCGGCCAATTCAAATTGGCGTTGATTATCAGCGCTCTCAGGATTTGCAGAATATTTTTCCAAAGTTTCTTCATAAAAACGAATTGTTTTGAAAACGGTCTGTGAGCCGGCAAATACAGCATCCATAATGGTCATGTTATCGTCCAATGTAGGTGTTTGTCTTAAATAACCAACCGTGTAATTCTTTGGTGTCTCAATTTCACCACTGTCTTGCGGATCAATATTTGCGAGCACATTTAAGAGACTCGTTTTTCCAGTCCCATTTGTTCCAATTAGCCCAATTCGATCATGGGCATTGATCAAGAAATTAATGTGATCAAATAGTGTTTTTGTGCCGTACGTTTCTGTTAAATTTTCAGCTTTTAAAGTTTGCATGCATAATCAGCTTTCTAAATTTGAAGAGGTATATTTTTTTGCTTTCAGGAGTAATTCTGATTGATTGTTTTTAAACTGACCAGTGAGAACCCCATCAAGCAGATAACTAATGATGCGGCCCATTTGTGGACCGGGGGTCGTGATGTTAGCCGTTAATAGGTCGTGGCCGTTCACGTTAAGCTCATGCGTAGATTTAATGGGTAGTTCGTTGTAACGAGCCAAAAGAGTTGAGGTATCAATTTTACTATTCATCGCAAGTAAAACATTTATTACACTCTGAAGTACCTTTTTGCCAGTCCGAAATAATAATTTTTCGGAGACACTGTTTTTGGAAATGGCATTTAATAACTGAATGCCACTTTCCACTTCAGCAATTAACTCGTTAGAGGTTTTCCAAGCACGTAAAAATGAACGACTTTGCTCACGAGAAAGTTCAAGTGTATGACAAATTAACAGCCAAACTTGAGTTTCTGTAGTTAAACGAAACTTTGGATTGAGATTTAGTAACTGGCTAAGCGGTTTTAATTTGCCCTCAAACTGTGGGCAATAAGCATAGAGCCCTATTTCAAGAAAGTACTTTACACCTTTAGTAGTGGCCTGTCCCATCATCATTTTTTCGAATTCAACTAAAATTCTTTCTACGGCAATTTTTTTTAATAATGGTGCGTTATGCTTAATGGCTGCTTCTGTCTTCTCTTCAATAACGAAATCAAGCTTACTGGCAAAACGAACGGCCCGCATCATCCGTAGTGCATCTTCATGAAAGCGTTCTTCAGGGATGCCAACTGCTTTTAAAATATGATTTTGCAAATCTTGTAATCCAGAAAAAAGATCAACAACAGTTCCATCCTCTTTGAGAGCCAGAGCATTTACTGTAAAGTCTCGTCGTTTTAAATCTTCTTCCAAGGAACGAACGAACGTTACTTTGTCTGGTCTGCGAAAATCTTGGTAGCCACTTTCTGTTCTAAATGTGGTAACCTCATATTTTTGCTGATGATCAAGAACCATTACGGTACCGTGTTTAATTCCGGTATCAATCGTTTTTTTAAAGAGATCTTTAACTTCAGAAGGAAAAGCACTAGTGGCAATATCCACATCATGAATATGGTCTTTTAAAATTGTGTCGCGGACGCTGCCACCAACAAAATATGCTTCGTAACCCGCCCCTTCAATTGTTTGAAGAATGGGACGTGCAGTAATAAACTCTTGGGGTAATTTTTTAATTTGCATACACAACTCGCCAACCTAAACTTTTAATAATTTTAATTTTAAACTTACGCTTAATCTTAACAGAATATGGCCATTTTTAAAAATAGATGCGATTGGTTAGATCAACGAATATGTTATGATATTGAGGTAAAGCAGGTGAAAAATATGGTAAAAAAAGAGTCAATGCGGTTCAAAGATTTATTTATGATTTTTCTTGGTTGTTGTTTATATGGCCTTGGTTTAGCAGCAATTAATATTCCTAATCATTTGGCAGAAGGTGGTGCCACAGGAATTACACTGATTTTTCGGGCATTATTTCATATTGATCCCGCCTATTCAACCATTTTAATTAATATTCCGTTACTAGCAATTGGGTACCGTTTTTTAGGGAAACGAGCGCTGTACTACACCATTTTTGGGACATTGATGTTATCAATGTGGCTGTGGATCTGGCAACGGGTGCCGATCAATATTGATATTGGTCATGATATGTTTATTGCTGGAATTTTGGCCGGTTTAGCGGGTGGATTCGGAAGTGGCCTCGTCTACCGTTTTGGCGGAACAACCGGTGGAACTGATGTGATTGCGCGGATTATTGAACAAAAGCGTGGTATACCAATGGGACAAACCCTATTTGTTTTAGATGCGGTTGTTTTGACGATTTCTCTTTGCTATATCGATATTCGTCAAATGATGTATACATTGCTTGCAGCATTTGTTTTTTCAAAAATTGTGACGTTTACTCAGGTTGGTTCTTATGCAGAGCGTGGAATTCTAGTTATTAGTGATAATTATCAATTAATTGCAGATCAATTAATGGAAAGTTTGCAGCGTGGTGCCAGTTTTGTTCATGTTCAAGGAGCTTATTCAAAAGATGAAAAGAAAATGGTGTTTTGTGTTTTGTCGCCCAATGAGCTAAGCGAGGCCAAAAGAATTGTGAATCAACTAGATCCGCATGCTTTTATTTCGATCATTGATGTTCATGAAGTGATTGGCGAAGGATTTACTTATGATTCGCCAACTGGTAAGAAAGTTAGTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP012283|2060247:2070154|2062541_2063480_-|WP_046871116.1|DBSCAN-SWA MKKITDWVIMLIVFVVIIALVVLGLNYYFPTHSTPDQSSKTTHIVHKATKTKKKHIRITALGDSLTQGVGDSKNEGGYTKRLQKKIKSNYNVKTKVANYGVSGERSDQILKRVKQDSKLQKSIKNSDAITITVGGNDLFQALQKYSTASSGEFTLSLEKLNIKYATHVQDLLKQVRKYNSNAPIYVVGIYNPFFVYFPNITQINKAITNFDETTQAAVSQTKSAYFISVNKLLSRGQYQSAKSLSELKQSSTAKSIDDMQISKVEKNLENTKEKNIYISSSDHFHPNPTGYDQMTRLLLRSLHTHDQWLYEE >NZ_CP012283|2060247:2070154|2061689_2061920_-|WP_046871118.1|DBSCAN-SWA MSVSKTFYQFLMTQRNPESYDPISEFANNAFYDQAFPKQSTNFDELSKYLELNGNYLPSMTIFDETWQKYLDSNAH >NZ_CP012283|2060247:2070154|2066002_2067904_-|WP_062909725.1|DBSCAN-SWA MQTLKAENLTETYGTKTLFDHINFLINAHDRIGLIGTNGTGKTSLLNVLANIDPQDSGEIETPKNYTVGYLRQTPTLDDNMTIMDAVFAGSQTVFKTIRFYEETLEKYSANPESADNQRQFELAEQRMNQDDAWTAESDVKTILTQLHITDLSQKIGTLSGGQQKRVDLAQTLIQAPDLLMLDEPTNHLDFDSIAWLEKYLAAYKGALLIVTHDRYFLDQVANQIWELSFGKLYQYPGNYQAYVAEKAVQEEQAASQSQKQHQLYKQELAWMRRGPQGRGTKQQARINRFDTLSDSVNAPAKNTDNIAVQLGQQRLGKKVISLKDASLRLGSHLILDKFTDLIQADERVGITGNNGTGKSTLLNVIAGRIPLDSGTIDIGETVKLGYYTQKIEPIPEDKRIINYLSEVGAGVLNANGERISVTNLLEQFLFPRAMHGTLIRKLSGGEKRRLYLLKILMQQPNVLLLDEPTNDLDIGTLTVLEDYLANFQGTVITVSHDRYFLDKVADHLLIFEGHDKIAHFSGRFTNYLHQINETQQVSEKQVQPPEPTSSKNSTDDQKEKTKLTYVEQLEWQTIEADIDKLENQKKDCQSQMNATADDYGKLADLQKEIDDLDAQIDKKMTRWEYLSQYTTD >NZ_CP012283|2060247:2070154|2069278_2070154_+|WP_046871138.1|DBSCAN-SWA MVKKESMRFKDLFMIFLGCCLYGLGLAAINIPNHLAEGGATGITLIFRALFHIDPAYSTILINIPLLAIGYRFLGKRALYYTIFGTLMLSMWLWIWQRVPINIDIGHDMFIAGILAGLAGGFGSGLVYRFGGTTGGTDVIARIIEQKRGIPMGQTLFVLDAVVLTISLCYIDIRQMMYTLLAAFVFSKIVTFTQVGSYAERGILVISDNYQLIADQLMESLQRGASFVHVQGAYSKDEKKMVFCVLSPNELSEAKRIVNQLDPHAFISIIDVHEVIGEGFTYDSPTGKKVS >NZ_CP012283|2060247:2070154|2065033_2065984_-|WP_062904246.1|DBSCAN-SWA MLEQAYLNLEKYVLENGNYKDDRTGTGTYSIFGYQMRFNLAEGFPILTTKRVPFGLIKSELMWFLHGDTNIRYLLEHHNHIWDEWAFKKWIESNQYTGPDMTDFGRRSLKDQSFADQHHEQKKIFDDKILNDDTFAKEFGDLGNVYGSQWRAWKTSTGGTIDQISEVIHTIKTNPDSRRMIVSAWNPEDIPSMALPPCHTMFQFYVVDGKLSCQLYQRSGDIFLGVPFNIASYALLTCLIAKETGLEPGEFIHTLGDAHIYANHVEQVKTQLSRSPRPAPKLIIDSQAKSIFDYDVKDIHLEGYNPYPAIKAPVAV >NZ_CP012283|2060247:2070154|2067910_2069134_-|WP_062904247.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQIKKLPQEFITARPILQTIEGAGYEAYFVGGSVRDTILKDHIHDVDIATSAFPSEVKDLFKKTIDTGIKHGTVMVLDHQQKYEVTTFRTESGYQDFRRPDKVTFVRSLEEDLKRRDFTVNALALKEDGTVVDLFSGLQDLQNHILKAVGIPEERFHEDALRMMRAVRFASKLDFVIEEKTEAAIKHNAPLLKKIAVERILVEFEKMMMGQATTKGVKYFLEIGLYAYCPQFEGKLKPLSQLLNLNPKFRLTTETQVWLLICHTLELSREQSRSFLRAWKTSNELIAEVESGIQLLNAISKNSVSEKLLFRTGKKVLQSVINVLLAMNSKIDTSTLLARYNELPIKSTHELNVNGHDLLTANITTPGPQMGRIISYLLDGVLTGQFKNNQSELLLKAKKYTSSNLES >NZ_CP012283|2060247:2070154|2060247_2061678_-|WP_062904244.1|DBSCAN-SWA MDKKQPKTVKRTTLIWSIIIALLVGGGLAYGVAYVQTRAVISQAQSTTASMQKIQAVYSTIEDNYYKPVSAQKVTNGAIKGMISSLNDPFSEYLDKTDATSLNNQISSSFSGIGAEVQKSGQYIKIISPIKGTPAKKAGLQPGDLIIAVNDKSIAGKSVTEAVSLMRGKIGTKVTLTLKRNNKDFKQTLTREKITVNTVNSRVINKKIGYIQITSVSERTASELKTALKNLDKKGVKSYVLDVRDNPGGLMDQALKMSSMFLKNGKVIMRVQAKTGQQQVYKAGKKYDGGYKVTKPVAVLMNGGSASAAEIFAGALHQSANAPLIGTQSYGKGTVQTVSDFKDKSEMKITIAKWLTPNGSWINKKGLTPTYKADYPKYAYLQLINTDKTYKIEDVSTQVKTLQKELKALGYFEGKTNGYFGKTTQTAVEAYQQKNKLTVTGTADSKAILNIETKIQSQIAKNDNALKKAENVLNKK >NZ_CP012283|2060247:2070154|2063584_2064430_-|WP_062904245.1|DBSCAN-SWA MAKVKIVTDSSCGVTDQEVQDYNITIVPLTVMIDDTIYVERETISNEEFLNKMQHSKALPKTSQPPIGKFVETFDKLGEDGSQVICFDMLEAISGTVHAAEQAAQLSKTDVTVVDSQTTDRALAFQVIEAAKLAQAGKSRDEILKAAVNIRDHTKLYMGVMTLDNLVKSGRISHMTGMISGFLNIRIVLQVTQGELKVVAKGRGMKTINKFFDEVYKKMAKTSNIKAIGISHVGALQTVLPIKEKIQEMFPDIKILVRETVPIIATHGGPGAFALMYYTGD >NZ_CP012283|2060247:2070154|2064499_2065015_-|WP_046871114.1|DBSCAN-SWA MLAFIWAESKNGVIGSHNQLPWHIPDDTSYFKQLTTNHPVVMGRKTFESFGAKPLPNRLNIVLTRQTSLKETDNLKVYHSVEKFLADFSSDSRLIFIIGGKEIYRQLYPYAEKLYRTRIDDCFAGDTKMIAIDYSKWRLVETLTGSGPKKKPIPHRFEVYERKNTARVSND >NZ_CP012283|2060247:2070154|2061930_2062536_-|WP_046871117.1|DBSCAN-SWA MKNRTELPKKKGLNLWKWAFIALLAIVIAFGIFFRMRIANTPVPDTQSQITTTKASSVDVKLNKEQLNALMAAYLKPYQSNKDFSYQLKVNKQVLLIGKVKVLGSNVNYALSFTPKVQSSGNIVLTAKHLAVGALSISPKLVLDYINSNYNLPKWISIKDKVITLNLQNIKTANGVYFKAKKLDIKNDKFIFLINIPKQSN |
10 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_20 |
2158514 : 2166280
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP012283|2158514:2166280|DBSCAN-SWA GTTATTCAGTTTCTACTTTGGTATTTCCTTGCATTTGGTACATATCGTAATACATACCTTTCTTAGCAAGTAATTCATCATGAGTTCCACGCTCAATAATTCGTCCATGCTTTAGAACCAAAATTTGGTTAGCATCTTGAATCGTTGACAACCGATGGGCAATCACAAGAGACGTGCGACTTTGGCTCATCTTTTTCAAACTTCCTTGAATCATATCTTCTGTTTCTGTATCAATATGTGCAGTTGCTTCATCCAAAATTAAGATCTTAGGATCACTGGCAATTGTACGAGCAAAAGAAATTAATTGACGTTGACCGCCTGAGTACTCCACCCCACGTTCAATCACTTTGTTATGGTAACCATTTGGTAGTTCCTCAATGAAATGATCAGCTTGAACAAACTGAGCTGCCCGTCGAATTTGATCATCAGTAATATCTTCATTATACATGCGGATATTTGAAGCAATATCCCCATAAAATAGAAATGGTTCTTGTAAAACTAATCCAATTTTTTTCCGCAACTCCGCTTCTGCATAATCACGAATGTCATGGCCGTCAACAAGGATTTGACCAGATTGAAACTCATAAAATCGCATTAAAAGATTGATGGTTGAACTCTTACCACTACCAGTTGATCCAACTAAAGCCACAGCTTCACCAGGATTAACCGTAAAGCTAATATCATTTAAAACGTTATTTTTACCATCGTACGAAAAAGTAACGTGTTTAAATTCCACTTTTCCTTCTGAGATTTCAAGATCTGACTGCTCATTTTGTTTTGGTTGATAACTTTCATTATCGAAAATTCGTAAAATTCGAGTGCTTGCAACAAGCCCATCTTGGAAAGTAGAAAGATAATCCATCATAGACGACATTGGATTGTAAAAACTATCGATATAACTTACAAATGCATAAATAACTCCTGCAGCTACTGGTTCTTTGAAAGCATTAATACCAAATAATCCTAACGCAATCACAACGCCCAGCGCATACATTAAATTAATGATTGGATTTAAAAGCAAAGAGTTCATACGAATCATTGAAAATCGGGCAAATAAGTATTCGTTATTTGTTTTTTCAAATTCACTTTCAATTCTTTTTTCTTGGCGAAATTGTTGAATAACTCCAATTCCGACCAATGACTCACTAATTTTGGTGTTTAACTGGCTTAAGTTTTCTCTCATTCTTCGATAAACCGTTGAACTATATTTTTGGTAAAACCAAATTATAAAAACTAAGAATGGTAATAATGATAGCGTCGCCCAGGTAATCTTCGCATTCGTTGTAAACATAGCAACCAAAGCAGAAGCCATCCCAAAAACGCCCACAATAAGTGTTAAAAACAGCGTCCAGAAGTCCTGTAAACTCATCGTATCATTAGTTACCCGAGACACTATTGATCCAGCCGGGGTGGCATCAAAGTAATTCATCCCCAATTTATGCAATTTCCTAAATAAAAGAACCCGTACTCTTTCTAACGTTCGTTCGGCTCCCATTGCATAAAGGAAAGTTTGCCCAAACTGAAAAATTGCTTGTAATATTGCTCCTAGAAAATATAAACCAGCAAACAAAAACATAATCGAAAGTGGCGTTGAACTATGGATTAAAAAATGATCCATATAATATTGAATCAACCTGGGAAGTAAAATATTAATTACACTTACAATTCCTGCAAAAATAATTGCAACCACAAATTGTTTCCAAAAAGGTTTTGTAAAAGGCAACATTCGTTTAATTGTACGAAATTGTTCTTTAGTGGTCATAGTATGTGCCCAAATTGATTCTTTTTTATTCTGCATCTAGGTCACCCTCCTTTGCAATTTTAGTTTCCATTTGTTGTCTATGGAACATATCTTGATACCAACCATCCTGCTTAAGTAACTCTTCGTGAGTTCCTCGTTGAATAATTTCACCACTGTCAAGAACCAAAATTTCGTTAGCATTCATCACACTGCTTAACCGGTGCGCAGCAATTATGGTCGTCTTGCCTTTACGTTCCTTACGCAATTCCTTTAAAATTTCATGTTCTGTTTCACCATCAACCGCAGAAAGGGCATCATCCAGGAGAAGGATCTCTGGATTAATAATCAGTGCCCGCGCAATGGCAAGCCGCTGGCGTTGACCGCCAGACAATGACACGCCTTGCTCACCAACCTCGGTATCAAACTGATCAGGTTGATCTAAAATGTCGTCATACAAATCACTTTTTTTAGCAGCTTCTATAACTTCTTCGTCAGTCGCAGAAAAGTCGCCAAATTTAATATTGTTTTTGATCGTATCAGAAAAAAGAAAACTTTCTTCTGGCACATACCCAATCGATGGTAAATATGTGTTTAACGCATAATCCTTAATGTTAATGCCGCCAACCGTTATTTCTCCCTTATAGTCGTCAAACTCACGTAAAATAAGTTTCATAATCGTTGATTTTCCGGTTCCAACTTTTCCAACCAAACCAAGGGTATTTCCAGCTGGTAATTTAAAACTGACACGATTTAAACTACTTTGTTCGTCACCTGGATAGGTAAAGGACTGAATTGCGAAATTTAAATCACCAGTTGCACGTTGTTTAACCGCATGTTTGTCATCAATAATGCTAGATTTTGCGTGTAACAACAAATTGACTCGATCATAACTCGCATTTCCACGTTCCATGATATTAAACAAATTACCAATGGCAAACATTGGCCAAATCAGCATGGTAATGTATGAAATGAACGAAACAAGTTGTCCAATATTAATGACGTTATGAACAACAAATGATCCGCCTAAAACAAGGGTAATCATGTAAGAAACACCAATCAAAATAGTGGTCATCGGATTAAACATTGCATCTAAAGCGTTAACTTTCCGATTAATTTTGATAGTCTGATCAATTAATTTTTCAAAATCAGCAGTATCTTCTTTATCTTGTCCAAGCGATTTGATCACTTTAATTCCCATAACACTTTCCTGTGTTTTGTTATTTAACCGTGAAAAGGCCGCCTGTGATTTACGAAAAGCAATATGAATCTTTGTTCCTAAATAACCAGCACTAATGGCAAGTAATGGGAACGGAATCATAGCCAACAACGTTAAGCGCCAATCTACAAGTACCATCATGGCAATAATTGTTGTAATACCGGTAATAATCGAATCAGCAAATGATAAAATTCCAGAACCAGCAACTTGTTGAATGGCCTGTAAATCATTAGTTGCATGGGCCATCAAGTCTCCTGTGCGATGTTCCTGATAGAAAGTTTGATCCATCTGCATGTAATGAGTAAAAAGCCGACTACGCAACGTTTTTTCTAGCCGAGCCGCCCCACCGAAAATCCGTGATCGCCAGCCAAATCGAAAAAGGTATTGTAGAATCGCAACACTTACTAAAACAATCAATGAAAACGTCAAAGTTGTTGCTTTTAACTTATTGGTACTGATTAATTGAACCAAATTACCAATAATTTTAGGTGGTAAAACATTTAAGACAGCCACGAGAAGAAGAAAAATAACTCCAATTAGATAATTCCATTTCTCTATTTTAAAAAACCAAGCTAATTTCCGAAATATTGACACGAGTTACTCCTCCTATTTGTTTACTATCTTTCAAATTTCCTCTAATTTTTGGCAACAAAAAAAGGACAAAAATAATCTTTGTCCTTTATCATTCATAAAATCTGTCTAAAACTATTTTTGATGTTTAGCTTGATTCTGCATAGAAGACATCATTTGATGTAACTTCTTTTGCGATGGTTTTTGTCCCATTTGCAACATCATAGTTCGTAACATATCTTCATTGATCGGAGGATTATTCTTAAGATAGCTTTCCATATATTTACGAGCAGCGAAGAAACCACCTACTGCCCCAAGTAATAACGCAATAACAACAATTAAAATCCAAATTCCTGTTGACAATGTTCTAACCTCCTTACAATTATGTATACTACTCTATAGTACACAAAAACTTCACAAAATAAAAGAGGTCATCCTGATTTCCCTATCAGTACCTCTTATTCTATCATTAAATTTAAATAAGAAAAGATTAAATGACCATTACAAAACTAAATGATCGATTTAATCATCACGAAGTCCCTTTTTCCGCTGAACATTTTTCACTTTTTCCGGGGTAACTTCTTTACCACTCTTATCAAACACTTGCATCATTTCAACTTGACTTTTAAAACCTTCTCTAAATCGTTTTAAATATCTCTGACGCAGGTCTTTACGTTCAATGATTTCTAAATCTGTTAAGCCATCACTCTTGGCTTTATGGGCTAATTCATTAATCCTTTTAATTAATTTTTGAAATTCTTCATCTTTTTCTGCCAATTTTTTCACTCCCGATTTGTTTACCAATGATTTTACACTGTTATTGATTTTTTTTCAAAAAATTGAACCCGAACGTTTGTTTGAATACTGTAATTGCATATGGTAAAATGAGAACAAGAAAATGCGAGGTGCTCACAATGTCAAAAACATCTGAAAGTAAGCAATTTGCTGTGCTTAGATACATATATGATAAAGTAAACGAAAAAGGATATCCACCAACTGTGCGTGAGATTGGTGAGGCAGTTTCCCTCTCCTCTACTTCTACTGTCCATGGCCATATTGAAAGATTACAAAAAAAGGGACTTTTACAAAAAGACCCTACCAAACCACGTGCTTTAGAAATTACACCTGCGGGTTTAGAGGAATTAGGTGTTAGTGCCACCCCTAATAAAATTCCGATCTTAGGAACTGTCACTGCTGGTGCACCAATTTTAGCCGTTGAAGAAGCAACTGACTTTTTTCCACTTCCTCCTGATTTTGAACACGAGGATGGTGATTTATTCATGTTGAATATTCGTGGAGAAAGCATGATTCAGGCTGGAATTTTAAATGGTGATCAAGTTATTGTTCGTAAACAAAGCTCTGCAGATAACGGTGATATTGTCATTGCCATGACAGAAGAAAATGAGGCCACTTGCAAACGGTTCTTCAAAGAAACTGATCATATTCGCTTACAACCCGAAAATGATACCATGGCTCCAATTATTTTAGATAACGTTAGTATCCTTGGCCGTGTAGTTGGCTTATATCGGGATAAGATTTATTAAACATAAAGGTTCAGTGGATGAAATAAAGTGCTCCATAATTGTTAGACAAGAAATCTAACAGTTATGGAGCACTTTTTCTATGGTCAAATATAGTTCAGAATTAAAAGCAGAAGTCGTTAGTGAATATCTTCAAGGTGACATTAGTATCAGTCTTCTTTCAAAGAAACGTAACTTGCCTCGAATACAAGTAGGTAGATGGATACAAAACTTTCGTTTGAGCGGCGCAGACGCTCTTAAACGAAGAAGAGTTAAACGAAGTTTCTCAGTTGAGTTTAAAGTTGATGTGATAAACTACTATCAAACTCATGATGAAACTTTAGCCGAAGTATCCGCAAAATTTGATGTTAATTCTTGTCAAATCAGTCTTTGGAGGACAGCCTTCAATCAGTATGGTATAGAAGCCTTGAAGCCTCATCCGAAAGGCAGAAAAACCAAAGTGAAACATAATAAGAAGAAATTACGTAAGTTAGTAAACAAGAACGAAATCGATCAACTTCGTGAAGAATTGACGAAAAAGAATCAAGAATTATATGATGCAAAATTGGAGAACGAAATCTTAAAAAAATCAATGACCCTGTTCGGAACCTCAAAGGACGAAAGAAAACACAAATAGTTGATCAGATCAGGGTCGAACAAGAGTCTCTTCCGAAATCTAACCGGTATAAAGTCGGCGATATTCTTAAGACCATTGGACTTAAGAAAGCGACTTATCATGATGAACGTAAACGTATCAAAAATTATGTAGATAAGTATGAAGATGTAAAAGTAGAGATACTAAAAATTGCCGAAAGCGGAAGATATCGCGGACGTCTAACCTACGGTTATCGTCGCGTTCAAGAAGAGCTCATTAAATTAGATATCCATCTATCAGACGCCGTAGTGCGTCGTTTGATGGATGAATTAAATGTTCAAGTAAGCCTTTATAACCGCCACAGAAATGGTAGATATTCATCTTATAAAGGTACAGTTGGAAAAGTGGCCCGTAACGTTCTACATCAGCATTTTAATGAAACCGTACCTTTCAAAGTATTACATACCGATGTTACACAAGTACGCTTGGCCGATACTAAGTGGGCTTACGTTTCAGCTATTACTGACGAAGCAAGCAAGGAAGTTTTAGCATTTCAAGTAAGTAATAGTCCTAACAGTAAACTAATTATGGATACACTCGATGAACTCACAGAAAATATTCCGGAAGGAATAAAACCAATAATTCATTCAGATCAAGGTTGGCATTATCAATTGAATTACTATACCGATAAACTCTCTGAAAAAAAATTTATACAAAGCATGTCTCGTAAGGGAAACTGTCTTGATAATGCGCCAATTGAAAGCTTCTTTCATCTTCTTAAAACAGAATGTCTTAATGGATTTCCACAGTGTAAAGATATTGGAGAATTCAAGGAAATCACAAAGAATTACGTCGATTGGTTTAACAATCGACGAATATCACAGAAAACAAAAGGCATGACTCCCTGCGAATACAGGGAACATGCCTTAGCAGTTTAAAAATATTCAATTTTGTCTAACTTTTGTGTTGCACTTTAGAAATGCCTTGAACCTTTTTTTATTTACAAATAATTGCTAGTCAACCATTCACTCAAGTGATAAATATTTTCAGAGCCCATGTCGAGAGTTTGTTTGGCTAGTGGTTGCCCGTCATTAATGCTTTTAACCAATTTGATATTTGCAGGTAATTCACCTAAATCAGGTGCAATTCTACCTGCTAAAACAATAACTTTACATTCTGGATTGAGTTTCAAACAGGCTTCGGCAAGTCCAAACGGTACCTTTCCATTTCTGGATTGCGTATCAAATGATCCCTCACCAGTAATTAAATAATCAGCATTCACAACTTTTTCTTTAAAATCAAGTAATTTTAGAATGCTGTCTATACCTGATGTTAATTGCGCACCAAAAAATGTTTTTAAGCCATAACTTAGCCCTCCGGCACCTCCAGTTCCCCAATCGGAAGCAAAATCTTTACCCAAATCTCGTTGAACAACCAGTGACAGATGGTGGAGATTTTCTTCAAGAACCTTTTTATCATCTGAAGAGGCCCCTTTTTGTGTACCAAAAACATTAGTTGCTCCATCCGGTCCTAAAAGCGGATTAGCCACATCATTTAAAACAATTAGTGGGACTGAAATGACCTTTTTCGTGGGTGCAACAATTGTTTCAAGTTCACTCAACCCGCCGTTTCCTAAATCAATAGACTTCCCGGCTTTATTCAAAAACTGAAAGCCTAGCGCCATTGCCATCCCGGCTCCACCATCATTGGTGGCACTGCCACCGACACCTAAATAAATTTTCTTTGGTCGATGGGCCAAACTTGCCTGGAGTAATTGGCCCGTTCCAAATGTTGTAGCTCTAAATGGATTAAGTTCAGCACCTTTTAAATGTTCTATGCCACTGGCAGATGCCATATCAATTACCGCCACTTTGGCTTTGTCTTCGGTTAGCCCAAGTTCTGCCTTAATTGGTCGTCCAATCGCATCAGTGACTTCAACAGAATAACGATTACCTTTAAAATGGTCCATCAACACTGTCATTGTTCCTTCACCACCATCCGCCATTGGTAAAGAAACCGTCTTAATTTTTGGATCGACCTTTTTCAATCCTGCCACAATACTTTCAGTAGCCTTTTTTGCAGTCATGCTATTTTTAAATGAATCCGGAGCGACAATAACTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP012283|2158514:2166280|2158514_2160311_-|WP_062904275.1|DBSCAN-SWA MQNKKESIWAHTMTTKEQFRTIKRMLPFTKPFWKQFVVAIIFAGIVSVINILLPRLIQYYMDHFLIHSSTPLSIMFLFAGLYFLGAILQAIFQFGQTFLYAMGAERTLERVRVLLFRKLHKLGMNYFDATPAGSIVSRVTNDTMSLQDFWTLFLTLIVGVFGMASALVAMFTTNAKITWATLSLLPFLVFIIWFYQKYSSTVYRRMRENLSQLNTKISESLVGIGVIQQFRQEKRIESEFEKTNNEYLFARFSMIRMNSLLLNPIINLMYALGVVIALGLFGINAFKEPVAAGVIYAFVSYIDSFYNPMSSMMDYLSTFQDGLVASTRILRIFDNESYQPKQNEQSDLEISEGKVEFKHVTFSYDGKNNVLNDISFTVNPGEAVALVGSTGSGKSSTINLLMRFYEFQSGQILVDGHDIRDYAEAELRKKIGLVLQEPFLFYGDIASNIRMYNEDITDDQIRRAAQFVQADHFIEELPNGYHNKVIERGVEYSGGQRQLISFARTIASDPKILILDEATAHIDTETEDMIQGSLKKMSQSRTSLVIAHRLSTIQDANQILVLKHGRIIERGTHDELLAKKGMYYDMYQMQGNTKVETE >NZ_CP012283|2158514:2166280|2162954_2163584_+|WP_046871206.1|DBSCAN-SWA MSKTSESKQFAVLRYIYDKVNEKGYPPTVREIGEAVSLSSTSTVHGHIERLQKKGLLQKDPTKPRALEITPAGLEELGVSATPNKIPILGTVTAGAPILAVEEATDFFPLPPDFEHEDGDLFMLNIRGESMIQAGILNGDQVIVRKQSSADNGDIVIAMTEENEATCKRFFKETDHIRLQPENDTMAPIILDNVSILGRVVGLYRDKIY >NZ_CP012283|2158514:2166280|2162562_2162817_-|WP_046871205.1|DBSCAN-SWA MAEKDEEFQKLIKRINELAHKAKSDGLTDLEIIERKDLRQRYLKRFREGFKSQVEMMQVFDKSGKEVTPEKVKNVQRKKGLRDD >NZ_CP012283|2158514:2166280|2163663_2164197_+|WP_002331365.1|DBSCAN-SWA MVKYSSELKAEVVSEYLQGDISISLLSKKRNLPRIQVGRWIQNFRLSGADALKRRRVKRSFSVEFKVDVINYYQTHDETLAEVSAKFDVNSCQISLWRTAFNQYGIEALKPHPKGRKTKVKHNKKKLRKLVNKNEIDQLREELTKKNQELYDAKLENEILKKSMTLFGTSKDERKHK >NZ_CP012283|2158514:2166280|2162175_2162403_-|WP_046871204.1|DBSCAN-SWA MSTGIWILIVVIALLLGAVGGFFAARKYMESYLKNNPPINEDMLRTMMLQMGQKPSQKKLHQMMSSMQNQAKHQK >NZ_CP012283|2158514:2166280|2160300_2162064_-|WP_046871203.1|DBSCAN-SWA MSIFRKLAWFFKIEKWNYLIGVIFLLLVAVLNVLPPKIIGNLVQLISTNKLKATTLTFSLIVLVSVAILQYLFRFGWRSRIFGGAARLEKTLRSRLFTHYMQMDQTFYQEHRTGDLMAHATNDLQAIQQVAGSGILSFADSIITGITTIIAMMVLVDWRLTLLAMIPFPLLAISAGYLGTKIHIAFRKSQAAFSRLNNKTQESVMGIKVIKSLGQDKEDTADFEKLIDQTIKINRKVNALDAMFNPMTTILIGVSYMITLVLGGSFVVHNVINIGQLVSFISYITMLIWPMFAIGNLFNIMERGNASYDRVNLLLHAKSSIIDDKHAVKQRATGDLNFAIQSFTYPGDEQSSLNRVSFKLPAGNTLGLVGKVGTGKSTIMKLILREFDDYKGEITVGGINIKDYALNTYLPSIGYVPEESFLFSDTIKNNIKFGDFSATDEEVIEAAKKSDLYDDILDQPDQFDTEVGEQGVSLSGGQRQRLAIARALIINPEILLLDDALSAVDGETEHEILKELRKERKGKTTIIAAHRLSSVMNANEILVLDSGEIIQRGTHEELLKQDGWYQDMFHRQQMETKIAKEGDLDAE >NZ_CP012283|2158514:2166280|2164148_2165093_+|WP_141306420.1|transposase|DBSCAN-SWA MNDPVRNLKGRKKTQIVDQIRVEQESLPKSNRYKVGDILKTIGLKKATYHDERKRIKNYVDKYEDVKVEILKIAESGRYRGRLTYGYRRVQEELIKLDIHLSDAVVRRLMDELNVQVSLYNRHRNGRYSSYKGTVGKVARNVLHQHFNETVPFKVLHTDVTQVRLADTKWAYVSAITDEASKEVLAFQVSNSPNSKLIMDTLDELTENIPEGIKPIIHSDQGWHYQLNYYTDKLSEKKFIQSMSRKGNCLDNAPIESFFHLLKTECLNGFPQCKDIGEFKEITKNYVDWFNNRRISQKTKGMTPCEYREHALAV >NZ_CP012283|2158514:2166280|2165155_2166280_-|WP_046871207.1|DBSCAN-SWA MKVIVAPDSFKNSMTAKKATESIVAGLKKVDPKIKTVSLPMADGGEGTMTVLMDHFKGNRYSVEVTDAIGRPIKAELGLTEDKAKVAVIDMASASGIEHLKGAELNPFRATTFGTGQLLQASLAHRPKKIYLGVGGSATNDGGAGMAMALGFQFLNKAGKSIDLGNGGLSELETIVAPTKKVISVPLIVLNDVANPLLGPDGATNVFGTQKGASSDDKKVLEENLHHLSLVVQRDLGKDFASDWGTGGAGGLSYGLKTFFGAQLTSGIDSILKLLDFKEKVVNADYLITGEGSFDTQSRNGKVPFGLAEACLKLNPECKVIVLAGRIAPDLGELPANIKLVKSINDGQPLAKQTLDMGSENIYHLSEWLTSNYL |
8 | Bacillus_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Click the colored protein region to show detailed information
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012283.1|WP_144010372.1|492977_493343_-|hypothetical-protein |
492977_493343_-
Protein sequences of NZ_CP012283.1|WP_144010372.1|492977_493343_-|hypothetical-protein>NZ_CP012283.1|WP_144010372.1|492977_493343_-|hypothetical-protein MKRGLLLTILTITSMCLINSPIRGDTHVSEVTSEGRVGFTKGTISPSYPPSDLRPADKVPNGPDTTIKPTVPVSAAKKQQFLPQTDEESDGILQVFGSLGFVVVAWYWMKKNQVRRHNQKN |
121 aa aa | NA | NA | NA | 465504-523270 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|486366|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012283 position: 485853-485869, mismatch: 0 ttgaaactttgctgcca CRISPR spacer ttgaaactttgctgcca Protospacer ***************** 2. spacer 1.2|486408|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012283 position: 485895-485911, mismatch: 0 gagtcttagtattctgt CRISPR spacer gagtcttagtattctgt Protospacer ***************** 3. spacer 1.2|486408|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012283 position: 486000-486016, mismatch: 0 gagtcttagtattctgt CRISPR spacer gagtcttagtattctgt Protospacer ***************** 4. spacer 1.3|486450|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012283 position: 485937-485953, mismatch: 0 gtgtagttgtagtccca CRISPR spacer gtgtagttgtagtccca Protospacer ***************** 5. spacer 1.3|486450|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012283 position: 486042-486058, mismatch: 0 gtgtagttgtagtccca CRISPR spacer gtgtagttgtagtccca Protospacer ***************** 6. spacer 1.4|486492|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012283 position: 486084-486100, mismatch: 0 gagttgttacattacca CRISPR spacer gagttgttacattacca Protospacer ***************** 7. spacer 1.5|486534|38|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012283 position: 486126-486163, mismatch: 0 tggtgattgtggtaccaccatctgtgatgatcgtgcca CRISPR spacer tggtgattgtggtaccaccatctgtgatgatcgtgcca Protospacer ************************************** 8. spacer 1.6|486597|17|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012283 position: 486189-486205, mismatch: 0 gtgtcttcgtattttgt CRISPR spacer gtgtcttcgtattttgt Protospacer ***************** 9. spacer 2.3|487458|23|NZ_CP012283|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012283 position: 486168-486190, mismatch: 2 gtgtcgttgttgtgccacctggt CRISPR spacer gtgtggttgttgtgccgcctggt Protospacer **** ***********.****** |