CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP015129	Lactiplantibacillus plantarum strain CAUH2 plasmid pCAUH203, complete sequence	0 crisprs	csa3	0	0	0	0
NZ_CP015128	Lactiplantibacillus plantarum strain CAUH2 plasmid pCAUH202, complete sequence	0 crisprs	RT	0	0	0	0
NZ_CP015127	Lactiplantibacillus plantarum strain CAUH2 plasmid pCAUH201, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP015126	Lactiplantibacillus plantarum strain CAUH2 chromosome, complete genome	1 crisprs	csa3,DinG,cas3,DEDDh	0	0	7	0

1. NZ_CP015126

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP015126_1

• CRISPR_ID: NZ_CP015126_1
• CRISPR_location: 2738260-2738345
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP015126_1

Consensus_repeat	Method
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP015126_1

>1.1|2738283|40|NZ_CP015126|CRISPRCasFinder
CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015126_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP015126_1

>merge|NZ_CP015126|1|2738260-2738345|CRISPRCasFinder
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATTCGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAATAAGAAACTTAAAGTATCTTATT

>NZ_CP015126|1|1|2738260-2738345|CRISPRCasFinder
TAAGAAACTTAAAGTGTCTTATT	CGCATAACTGGTATAATACGCTATATAAAGAAAAAGTCAA
TAAGAAACTTAAAGTATCTTATT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP015126.1|WP_003642344.1|2732321_2733359_+|aldehyde-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187538
NZ_CP015126.1|WP_063096828.1|2745717_2746173_-|acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|100047
NZ_CP015126.1|WP_003642357.1|2746482_2747319_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|212492
NZ_CP015126.1|WP_011102039.1|2730243_2730609_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224647
NZ_CP015126.1|WP_013355936.1|2743767_2744661_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|187572
NZ_CP015126.1|WP_003642350.1|2740248_2741043_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224045
NZ_CP015126.1|WP_013355931.1|2735758_2735950_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP015126.1|WP_003643398.1|2738362_2738962_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP015126.1|WP_011102040.1|2731628_2732195_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
NZ_CP015126.1|WP_013355932.1|2736196_2736436_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP015126.1|WP_003642346.1|2734293_2735247_-|aldo/keto-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|381318
NZ_CP015126.1|WP_003642351.1|2741039_2742038_+|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_CP015126.1|WP_003642355.1|2744954_2745701_-|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674
NZ_CP015126.1|WP_003642342.1|2730741_2731470_+|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674
NZ_CP015126.1|WP_003643401.1|2743274_2743787_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|274100
NZ_CP015126.1|WP_003642345.1|2733507_2734074_-|DUF1211-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226078
NZ_CP015126.1|WP_013355933.1|2736766_2738245_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|129794
NZ_CP015126.1|WP_013355935.1|2742034_2743030_+|iron-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
NZ_CP015126.1|WP_050577158.1|2739082_2739964_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238558
NZ_CP015126.1|WP_003642340.1|2729675_2729960_+|DUF1905-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378097

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP015126.1|WP_003642344.1|2732321_2733359_+|aldehyde-reductase	gnl|CDD|187538	cd05227, AR_SDR_e, aldehyde reductase, extended (e) SDRs. This subgroup contains aldehyde reductase of the extended SDR-type and related proteins. Aldehyde reductase I (aka carbonyl reductase) is an NADP-binding SDR; it has an NADP-binding motif consensus that is slightly different from the canonical SDR form and lacks the Asn of the extended SDR active site tetrad. Aldehyde reductase I catalyzes the NADP-dependent reduction of ethyl 4-chloro-3-oxobutanoate to ethyl (R)-4-chloro-3-hydroxybutanoate. Extended SDRs are distinct from classical SDRs. In addition to the Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet) core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids. Extended SDRs are a diverse collection of proteins, and include isomerases, epimerases, oxidoreductases, and lyases; they typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	7.62333e-95
NZ_CP015126.1|WP_063096828.1|2745717_2746173_-|acetyltransferase	gnl|CDD|100047	cd03357, LbH_MAT_GAT, Maltose O-acetyltransferase (MAT) and Galactoside O-acetyltransferase (GAT): MAT and GAT catalyze the CoA-dependent acetylation of the 6-hydroxyl group of their respective sugar substrates. MAT acetylates maltose and glucose exclusively at the C6 position of the nonreducing end glucosyl moiety. GAT specifically acetylates galactopyranosides. Furthermore, MAT shows higher affinity toward artificial substrates containing an alkyl or hydrophobic chain as well as a glucosyl unit. Active MAT and GAT are homotrimers, with each subunit consisting of an N-terminal alpha-helical region and a C-terminal left-handed parallel alpha-helix (LbH) subdomain with 6 turns, each containing three imperfect tandem repeats of a hexapeptide repeat motif (X-[STAV]-X-[LIV]-[GAED]-X).	5.688e-52
NZ_CP015126.1|WP_011102039.1|2730243_2730609_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224647	COG1733, COG1733, Predicted transcriptional regulators [Transcription].	1.16334e-31
NZ_CP015126.1|WP_003642357.1|2746482_2747319_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|212492	cd05327, retinol-DH_like_SDR_c_like, retinol dehydrogenase (retinol-DH), Light dependent Protochlorophyllide (Pchlide) OxidoReductase (LPOR) and related proteins, classical (c) SDRs. Classical SDR subgroup containing retinol-DHs, LPORs, and related proteins. Retinol is processed by a medium chain alcohol dehydrogenase followed by retinol-DHs. Pchlide reductases act in chlorophyll biosynthesis. There are distinct enzymes that catalyze Pchlide reduction in light or dark conditions. Light-dependent reduction is via an NADP-dependent SDR, LPOR. Proteins in this subfamily share the glycine-rich NAD-binding motif of the classical SDRs, have a partial match to the canonical active site tetrad, but lack the typical active site Ser. This subgroup includes the human proteins: retinol dehydrogenase -12, -13 ,and -14, dehydrogenase/reductase SDR family member (DHRS)-12 , -13 and -X (a DHRS on chromosome X), and WWOX (WW domain-containing oxidoreductase), as well as a Neurospora crassa SDR encoded by the blue light inducible bli-4 gene. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet), an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Classical SDRs are typically about 250 residues long, while extended SDRs are approximately 350 residues. Sequence identity between different SDR enzymes are typically in the 15-30% range, but the enzymes share the Rossmann fold NAD-binding motif and characteristic NAD-binding and catalytic sequence patterns. These enzymes catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser (Ser-138, 15-PGDH numbering) and/or an Asn (Asn-107, 15-PGDH numbering) contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Extended SDRs have additional elements in the C-terminal region, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif. Some atypical SDRs have lost catalytic activity and/or have an unusual NAD(P)-binding motif and missing or unusual active site residues. Reactions catalyzed within the SDR family include isomerization, decarboxylation, epimerization, C=N bond reduction, dehydratase activity, dehalogenation, Enoyl-CoA reduction, and carbonyl-alcohol oxidoreduction.	4.07613e-56
NZ_CP015126.1|WP_011102040.1|2731628_2732195_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	7.31502e-05
NZ_CP015126.1|WP_003642350.1|2740248_2741043_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224045	COG1120, FepC, ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components [Inorganic ion transport and metabolism / Coenzyme metabolism].	5.60764e-114
NZ_CP015126.1|WP_013355936.1|2743767_2744661_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|187572	cd05262, SDR_a7, atypical (a) SDRs, subgroup 7. This subgroup contains atypical SDRs of unknown function. Members of this subgroup have a glycine-rich NAD(P)-binding motif consensus that matches the extended SDRs, TGXXGXXG, but lacks the characteristic active site residues of the SDRs. This subgroup has basic residues (HXXXR) in place of the active site motif YXXXK, these may have a catalytic role. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	3.70513e-130
NZ_CP015126.1|WP_003643398.1|2738362_2738962_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	4.95133e-09
NZ_CP015126.1|WP_013355933.1|2736766_2738245_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit	gnl|CDD|129794	TIGR00711, Uncharacterized_MFS-type_transporter_YhcA, drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily. This subfamily of drug efflux proteins, a part of the major faciliator family, is predicted to have 14 potential membrane-spanning regions. Members with known activities include EmrB (multiple drug resistance efflux pump) in E. coli, FarB (antibacterial fatty acid resistance) in Neisseria gonorrhoeae, TcmA (tetracenomycin C resistance) in Streptomyces glaucescens, etc. In most cases, the efflux pump is described as having a second component encoded in the same operon, such as EmrA of E. coli. [Cellular processes, Toxin production and resistance, Transport and binding proteins, Other].	1.13969e-71
NZ_CP015126.1|WP_003642346.1|2734293_2735247_-|aldo/keto-reductase	gnl|CDD|381318	cd19092, AKR_BsYcsN_EcYdhF-like, Bacillus subtilis YcsN, Escherichia coli YdhF and similar proteins. Bacillus subtilis YcsN and Escherichia coli YdhF are prototypes of this family. They are uncharacterized aldo/keto reductase family oxidoreductases.	5.65843e-131
NZ_CP015126.1|WP_003642351.1|2741039_2742038_+|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	6.03952e-81
NZ_CP015126.1|WP_003642355.1|2744954_2745701_-|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	2.40011e-91
NZ_CP015126.1|WP_003642342.1|2730741_2731470_+|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	1.6523e-89
NZ_CP015126.1|WP_003643401.1|2743274_2743787_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|274100	TIGR02366, conserved_hypothetical_protein, probable dihydroxyacetone kinase regulator. The seed alignment for this family was built from a set of closely related uncharacterized proteins associated with operons for the type of bacterial dihydroxyacetone kinase that transfers PEP-derived phosphate from a phosphoprotein, as in phosphotransferase system transport, rather than from ATP. Members have a TetR transcriptional regulator domain (pfam00440) at the N-terminus and sequence homology throughout.	3.33884e-08
NZ_CP015126.1|WP_003642345.1|2733507_2734074_-|DUF1211-domain-containing-protein	gnl|CDD|226078	COG3548, COG3548, Predicted integral membrane protein [Function unknown].	5.75015e-29
NZ_CP015126.1|WP_013355935.1|2742034_2743030_+|iron-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	1.35687e-78
NZ_CP015126.1|WP_050577158.1|2739082_2739964_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|238558	cd01138, FeuA, Periplasmic binding protein FeuA. These proteins have predicted to function as initial receptors in ABC transport of metal ions in some eubacterial species. They belong to the TroA superfamily of periplasmic metal binding proteins that share a distinct fold and ligand binding mechanism. A typical TroA protein is comprised of two globular subdomains connected by a single helix and can bind their ligands in the cleft between these domains.	3.71721e-55
NZ_CP015126.1|WP_003642340.1|2729675_2729960_+|DUF1905-domain-containing-protein	gnl|CDD|378097	pfam08922, DUF1905, Domain of unknown function (DUF1905). This domain is found in a set of hypothetical bacterial proteins.	1.07383e-22

Protein sequences

>NZ_CP015126.1|WP_013355933.1|2736766_2738245_-|DHA2-family-efflux-MFS-transporter-permease-subunit
MQAKAKISKATMTIAWVVVFGAMAPLLDSTMINIAINNLVTSFHSSVTTVQWAVTGYLLATGVAVPFSSWLLNRFDGKAVFVAGEILFGLGSIFAAVVPNIQLLIIARLVQGFAGGLIMPLLTTLLVQTAGAAVMGQMMATVGLPMILGPLIGPVIGGIIIKFASWHWIFWINVPVVLISIALILWKMPNYPAQNRTAKMDFIGILLLIVSSSAIIYSLVNAAHTDRFNNATSIEMLILGAIALISYVVWAAWQKERAVVPLHLFKFASFDGAGLGLFIAGTVLNGAMLLLPLYFQNVRGMSVINAALALLPQGAGMLVSRTLTGRLTDQIGAKYVVLGSVVITFVGTLPFYWFGQQTSYWILALILFVRGIGAGGILMPLMADAYTGMQPGQVPAATIGTRIIQNIGSAFGSALITTIVTAYSTHQVNVFERHLKAGTYHVDAAHLQVFTTSHLQAIRLAAFQQGFLVIAIAAIVIILPTLLLTNKLKAAK
>NZ_CP015126.1|WP_013355932.1|2736196_2736436_-|hypothetical-protein
MKKVYLRYQKQVDSFININKIMLLLEFVLLFVVKGSIDHYNQLPYDWFAYLTTLIHYFLGTFAFFGIILVIECVWNKFK
>NZ_CP015126.1|WP_013355931.1|2735758_2735950_+|hypothetical-protein
MAAFSEKQLKKAPITDQEFEKVVAVAKPDVQGIHSVCQQLVISFIAEERFLAVFGDGTCHPSN
>NZ_CP015126.1|WP_003642346.1|2734293_2735247_-|aldo/keto-reductase
MKTIQIGASQLKASAVALGIMRMVRLDTDAAANVLETVHDRGVNFIDSADIYGNGDSERIFGQALKQSSLKREDFFIQSKGGIVLDPEKSSGELVFGQRYDFSKQHLIATVDKILQRMQLDYLDSFLLHRPDPLMDPAEVAAAFDELQATGKVRHFGVSNFNPMQVEMLQAAVSQKLMINQLQFGVMHTGPIQFGLHTNMQDTASLNHDGEIIEYSRLHHMTIQAWSPYQYGMFAGTFIDNPKFPELNAKLQELADQYHVTKNAIATAWILRHPANMQVILGSMNPQHLDESIAGTDVTLTRQEWYDVYFAAGNDLP
>NZ_CP015126.1|WP_003642345.1|2733507_2734074_-|DUF1211-domain-containing-protein
MNKARLEAFTDAIIAIVLTLLVLDLPRPQTPSVRALFAEWQSIYVYIITFTLLISIWLNHHDLFVQVKKIDRVVFWANSFWLLCQSFIPFMASWITKFPHSKWPAVFYILTGFVWMLAYQLLVAAVRRLNPHIHRMSSPALSVVFGGFLVVLTVALINPDVGLFLIPVHAFASVILATKRKWHLRKYF
>NZ_CP015126.1|WP_003642344.1|2732321_2733359_+|aldehyde-reductase
MQKQLVVVTGGSGFIAIHIIRQLLQQGYAVRTTVRSLAKAPVIKEMLTNGGITDLSALEIVVADLAHDEHWSEAMAGATYAIDVASPTPKLNFKNKAEMIRPAVDGVRRVLTASRDAGVKRVVLTSAYGAIFAGHKNRTTPYTEADWSDLNWKAIHPYQESKTRAELAAWDFINHEGRGLELTTVNPVAVMGPVLSAKYSHSNIQIQQFLEGQVKAVPNVDSGYVDVRDVASLHLLAMTAPQANGERFLATTGETLSMLDVANVLRQAFPAFASQLPTKTIPNAAVKLAAKARPELRMVASLVGTYAETSNHKAQTLLDWHPRPAAESIIATAQSMIDLGIVTKP
>NZ_CP015126.1|WP_011102040.1|2731628_2732195_-|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
MAATNHAQAIKKDSQTYLTTALLQLLRTHDLDTITVTQVVKRAGVSRMAFYRNFTTLEDLLTAYFAPAIAARFQDVLQHVPANRKLLAMGQFFSDFAPTLRLAEQRGFENIIQQLFNANMTNYYQATMTNGMLTAVQLKYWTRFMSAGVYAIWREWLLGGQLESLTTIHEILATLQTATMQALTQAQK
>NZ_CP015126.1|WP_003642342.1|2730741_2731470_+|SDR-family-oxidoreductase
MKPLVVITGASSGFGAEIAKLFAADNYPLLLLGRRQAKLAALSANFENAMIDTVDVTNYHQFETAVRKAEAKYGKTDLLVNNAGLMLLGNVQNQDPQEWQTMLNTNVMGVLNGTQIVLNDMRDREHGTILNMSSLAGKKTFVNHAAYVASKFGVHGLSETLREENAPKNVRVMLVAPGAAETELLTHVTSKSALSDYEAWKASMGGLTLDPKHVAATVKFMYDMPQNVNIREVDIAATAQDA
>NZ_CP015126.1|WP_011102039.1|2730243_2730609_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator
MLKERVTAQPRYRNEFDATMQLIRGKWKIMILFELAEVKVSRFADLQHHIQAVSHKTLASQLKELEQDELIERHDFKTAQPHVEYRLTAKGQSLIPILDAICTWGDQHVDPALIERSLCDE
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>NZ_CP015126.1|WP_003643398.1|2738362_2738962_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
MTKTRRRGAELENAIYQAARDILNQDGLEQLTFANVAEQAGTSKPVIYRRWRSPLELAIAAIQDQIITENHGQLDEVSLTGQTLSEDLFQVLKRFTVSINTFNQALVITWFHHLDQQANPEVKDLLNAVKKIDAHAIERVCQRAQQRGELRTGTLSCDLQLMPFDWLRYRAFANEPITDATLHLLVDDLLVPAYQHALG
>NZ_CP015126.1|WP_050577158.1|2739082_2739964_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
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>NZ_CP015126.1|WP_003642350.1|2740248_2741043_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
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>NZ_CP015126.1|WP_003642351.1|2741039_2742038_+|iron-ABC-transporter-permease
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>NZ_CP015126.1|WP_013355935.1|2742034_2743030_+|iron-ABC-transporter-permease
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>NZ_CP015126.1|WP_003643401.1|2743274_2743787_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator
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>NZ_CP015126.1|WP_013355936.1|2743767_2744661_-|SDR-family-oxidoreductase
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>NZ_CP015126.1|WP_003642355.1|2744954_2745701_-|SDR-family-oxidoreductase
MSIKGKVVVITGASSGIGAATAKLLAAKGAKVVLGARREERLQALSQAIGDNAVYQVTDVTDRQQVRALIDLAVSKFGRVDVLYNNAGTMPQGNLSDREYDKWQMMLNVNIMGVLNGIGEVLPIMQKQHDGLIIATDSVAGHVVYPASAVYNGTKYAVRAIMEGLRQEEKEHGIRSTIVSPGAVRTELVNTIGNTQIQAGISELMNADDRQGLALNPEDIANAVLFAIDQPKHVAISEVLVRPAQQEV
>NZ_CP015126.1|WP_063096828.1|2745717_2746173_-|acetyltransferase
MNVTREPSEIRERLAEITGQTIDISVEIRVPLWTDYGRNLKIGKRIFINDNVQITDLGGIELADDVLIGPGAMLLSVNHPLDPAKRHAVEVQPIHIERNAWIGAGAKVLAGVTVGENAVVGAGAVVTKSVPANTVVAGVPAKVIKTIEQVD
>NZ_CP015126.1|WP_003642357.1|2746482_2747319_+|SDR-family-NAD(P)-dependent-oxidoreductase
MQSKLAVIIGGTSGVGKHTAIDLANQNYHVIIVGSRADKGRQAQADISQATGNQAVQLALADLSTKTGVQQFAHQLAAMTDHIDILLNSIGVMLPERHLSADGYDLNLVLNYLTHFWTIQALLPLLKHSDQARILLVGALPFVINHAKVSLPDFDAPATSKYNAMTVTAQATAARVLLTLALSERLTATNVTINIFHPGYVPDSNFGAGGSWVSRLAGRILGESFSRKNSPIGAWLATAPELTHTSGHFYDDRLRQVRLSKQYTRSKANDLWRLSSQY

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	297461 : 399866	97	Staphylococcus_phage(14.29%)	protease,bacteriocin,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	537411 : 630208	106	Lactobacillus_phage(36.36%)	terminase,plate,head,tRNA,portal,tail,capsid,protease,integrase	attL 538323:538337|attR 574438:574452
DBSCAN-SWA_3	819903 : 867388	40	Staphylococcus_virus(20.0%)	protease,integrase,transposase	attL 865670:865690|attR 868459:868479
DBSCAN-SWA_4	1295846 : 1308624	11	Lactobacillus_phage(70.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_5	2137294 : 2167806	29	Oenococcus_phage(47.83%)	terminase,head,portal,tail,capsid,protease	NA
DBSCAN-SWA_6	2170949 : 2181678	23	Lactobacillus_phage(63.64%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_7	2389886 : 2398397	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP015126|297461:399866|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003641987.1|370291_371668_+	HlyD family secretion protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003641999.1|382523_382712_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642000.1|382701_383124_+	DUF3284 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003643816.1|383346_384702_+	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_063096655.1|384719_386156_+	6-phospho-beta-glucosidase	A0A0B5JD41	Pandoravirus	9.7e-31	25.5
WP_003642003.1|386276_387173_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003642009.1|392712_393987_+	hydroxymethylglutaryl-CoA reductase, degradative	NA	NA	NA	NA
WP_003642010.1|393979_394939_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642011.1|394960_395665_+	NAD-dependent protein deacylase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP015126|537411:630208|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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538323:538337	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_011101097.1|568023_568557_+	hypothetical protein	O03915	Lactobacillus_phage	4.9e-36	51.7
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WP_041153537.1|595277_596798_+	AAA family ATPase	NA	NA	NA	NA
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WP_003640949.1|602317_602893_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1G5S9X4	Enterococcus_phage	6.4e-26	41.7
WP_063096679.1|602974_603985_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A096XT60	Enterococcus_phage	3.1e-108	60.5
WP_013355235.1|604012_606178_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A8E2R1	Enterococcus_phage	2.2e-268	63.3
WP_003640952.1|606316_606547_-	redoxin NrdH	X2KRY7	Enterococcus_phage	2.8e-09	40.0
WP_003640953.1|606769_607378_+	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003640954.1|607380_607887_+	nucleoside deaminase	NA	NA	NA	NA
WP_013355236.1|608412_610110_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1U9WR94	Streptococcus_virus	3.0e-55	37.0
WP_003640956.1|610131_610440_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_003637790.1|610455_611055_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_003640957.1|611069_611321_+	YaaL family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003640965.1|612380_612710_+	cyclic-di-AMP receptor	NA	NA	NA	NA
WP_013355238.1|612726_613746_+	DNA polymerase III subunit delta'	M1NSC1	Streptococcus_phage	2.1e-32	33.5
WP_003640967.1|613770_614118_+	DNA replication initiation control protein YabA	M1PFV3	Streptococcus_phage	2.4e-12	33.3
WP_013355239.1|614216_615113_+	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	4.4e-82	55.7
WP_003640969.1|615116_615902_+	acyl-ACP thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_013355240.1|616040_617036_+	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	2.0e-51	38.5
WP_003640973.1|619113_619968_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_022638341.1|619964_620768_-	phosphonate ABC transporter, permease protein PhnE	NA	NA	NA	NA
WP_003640975.1|620757_621528_-	phosphonate ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	4.9e-13	31.8
WP_003640976.1|621565_622618_-	PhnD/SsuA/transferrin family substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_003640977.1|622897_623623_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
WP_063096680.1|623606_624185_+	ribosomal protein S18-alanine N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003640979.1|624177_624633_+	ribosomal protein S18-alanine N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011101143.1|624637_625684_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex transferase subunit TsaD	A0A0R6PI74	Moraxella_phage	1.0e-61	41.4
WP_013355247.1|626570_628553_-	ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L0W2	Tupanvirus	4.4e-50	29.2
WP_003640983.1|628721_629399_+	redox-sensing transcriptional repressor Rex	NA	NA	NA	NA
WP_011101144.1|629563_630208_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

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CTTGGCAAAAACGGATACCGCGTCTTTCGATTCCATTTTGGTATTGGATTTCGGTAGTCAGTATAATCAATTGATTACCCGGCGCATTCGTGATTTCGGCGTTTATTCGGAACTACTTCCGAACACGATCACCGCTGAAGAAATCAAGGCCCGTCACCCGAAAGGTATTATCTTTTCTGGTGGCCCCAACAGTGTTTACGATGATGGCGCCTTTCGGGTTGACCCGGAGATTTTCAAGTTGGGCTTACCAATCTTGGGGATTTGTTACGGCATGCAACTGATGACCTACACGCTTGCGGGCGGGAAGGTCGAATCAGCTGATAACCGTGAATACGGCAAGGCGAACATTGACGTGACGAGTGACTCGGCGACCCTATTTAAGAACATGCCAGCTGAGCAGTCAGTGTGGATGAGTCATGGTGACTTGGTTACTCAGGCACCTGATGGTTTTGACGTGGTGGCCACTTCTAAGAACTGCCCGATTGCGGCAATTCAAGATGTTGACCGGAAGTTATATGGGATTCAATTCCATGCTGAAGTTCGGAATACGGACTACGGTAATGATATTCTACGGCACTTTGCATTTGACGTTTGCCAAGCTGAAGCTAACTGGTCAATGGATGATTTCATTGATATGCAGATTGAAAAGATCCGCGCTGAAGTTGGCGACAAAAAGGTCTTACTGGGACTTTCCGGTGGGGTTGATTCCAGTGTCGTCGGTGTGTTATTGCACAAGGCCATTGGCACGCAATTAACCAGTATTTTCGTTGACCATGGTTTGTTACGGAAGGGCGAAGCTGATCAAGTTATGGCGAGCCTAGAAGGTAAGTTCGGCTTGAACATCATCAAAGTTGATGCTAAGGACCGCTTCTTAAGCAAGTTGGCTGGTGTCAGTGATCCTGAACGGAAACGTAAGATTATTGGTAACGAATTTATCCAAGTGTTTGATGAAGAAGCCACGAAGTTAAACGGGATGGAATTCCTCGCACAGGGGACCCTCTACACCGATGTGATTGAAAGTGGGACTTCAACGGCCCAAACAATCAAGTCACATCATAATGTTGGTGGTTTGCCAGAAGACATGCAGTTCAAGTTGATTGAACCGCTACGGACGTTATTTAAGGACGAAGCACGGGAACTCGGTGAAAAGCTAGGGATGCCGTCTGACCTTGTTTGGCGTCAACCATTCCCCGGCCCTGGTCTCGGAATTCGGGTTATTGGTGAGATTACGGAAGATAAGTTAGAAATCGTGCGCGATAGTGACTTTATCTTACGTGATGAAATCAAAAAAGCCGGCTTGGACCGTGAAATCTGGCAATACTTCACCGTATTACCAGGTATCAAGTCAGTCGGTGTCATGGGTGACGGCCGGACCTACGATTACACCGTTGGTATTCGGGCCGTAACATCAATCGACGGTATGACCGCCGACTTTGCACGTATTCCATGGGATGTCTTACAAAAGATCTCAGTGCGGATCGTCAATGAAGTCGATCACGTTAACCGCATCGTGTACGATGTTACGAGTAAGCCACCTTCGACAATTGAATGGGAATAGGATTTATTGAAATTCAACAGTTCCTATCAGTGCCAATTGGCAATAAACGCTGATTCTTGCGGTGGTTAGCAAAAATCAAATACGATACAATCAGATACAATTTGATAAAAAGAGGCTGTGACATAACTAGCCTCTGTATAAGTAAATGGGACGAGAAACCGAATTTTGGTTTCTCGTCCCATTTGTTTACGCCTTTGATTTTTAAAGCTGGTCCCTACCGTGACCAGTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTACGTTGAGCGTAGATCTGACCAGTTTCTGGAGCTGAAAGTAATTCTCGTTGTTTCGATTTGAAATATTCCCAATTTTCGTTCACGGAAATCCTTTTAAGATATCCTTTTGGTGTTAGTGCCGCGGAAATTAGTTGATGATTTTCATCATACTTTTCGGCAATGTATTCTTTAAAGTCACGGGTAAAACCATACTTATCAGTCCGTCGACGATAAGCATTAAAATTAAACCGGACGTTTTGCGGATTGATAAAATAATCATCTTTTTCATGATAGTCCCAGTTCATAACCTTACGGTCATCACTTTGCCATTTTCGACTATTCTCTTTAAGCATTGTGCCGTAGGGAATCAAAACGGTATGCTGACCGAATTCATCTTCCAAGTACCGATAATTACTTTCGGAACCGTATCCGGCATCGGTAACGATGGTGTGACCTAACACATTGTTGGCCTTTAAATGTTCAATAAACGGTTGTAAGGTTCGTGTGTCGGTTGGATTTTGGAAAAGCCGATATCCCGTAATGAACTGATTACTCGTGGCGATTTGAACGTTGTAGGCAGGTTTTAATTGACCGTTTTGCATCGGATCTTCCTTGACCCGCATAAAGGTGGCATCGTGATCCGTCTTAGAGTAGCTGTTACGCTGACCATAGATTGCTTGCTGTGCTTGGTGTTCACGCATTTTATCACGTCGTTTATCCAACTTACGTTTTTGTGATTTAACAGTCCGGCGTTGCTGTTTGGCTGGGTTCGGGGAAACCTGCTTAGTTGCTTCCACGGTTTCATTAAGGACCACTAAGTGATCCTCAACCTTGCTAATCATGATATCCAATAGTTCGGGAGTCAGCTCTGATCCTGCCGGAATTTCACCGACAATTTTAGCTTCATGAAGCTCGCCTAACAGGTCAACGAGTTTTTCGCGATTCATCTTGTCAAATCGTATCGTATTCTTCTTCCAAACAAAGCTATACTTGTTGGCGTCGGCTAGGATCTTAGTTCCATCAATAAATGAAACATCATCAATCATGCCATTTTGACGAAGATATTGGGTTAGCTGTGATAAGCTATCGGTTGTCAAAGTGGCCAGTTCATCAGAAATTCTAAAGCGACAAATCGTCCGGTAGGACGGAATTTGGTCGGCAATTAACCACCCAGCTGGCTTGTTTTCACGGGCAAACCGTTCAATTTTACGACTGCTGAAAATGCCATAGCAGTATGCTAAAAGGACCAGTTTTAACATGGCACCGAGGTTATATTCCCGCGGACGGCCAAACTGGTAATCATATTTTAGTTTTAAACTCTCAACAAGCTGGTTGATGTAACGAGCAGGATGATGCTCTTCTGGTTGGTAATCCAAGGCGATACTCAAAGTGGTTTGATTCATGTTATAATAATCTTGCATATTAGGAATGTCCTTTCGAGGATAATTTCGTAGAGTATCGGGTGCGACCGATGCTCTTTTTTTATTTTCTATTATATCAAAAACAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGCTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTTTTATTTTGCACAGCGGGTGGTACAGAATTTCAAATGTCGTTTTTGATCCCGTTAAATACATTCATGGCACCTTCTTTTGAAGCACGGGTGTAGTCGTTAGTTTGCTGGATATTGGCGTGTCCCAACCAGTGCATAACATCTGAGTCGGATAGGCGGTCTGATTTTGCGCGAGTAGCAAAGTAATGACGCAACTGATGGGGATGAACTTTAATCCCACATTTTCCTGATAATCGCTTCATGAGCGTTGAAGGTTGTGCCGGGTGAAATGGATTACCTGTCTGAGGATTCAGCCATAGAAAGTGATCCTGTGGAACTGGTTTTCCTAAGTTCATCAGGATATTATCTGATGCTTTAATAGCAAACCGAATCGTATCGACCATTTCACCGTAGACCCAGATTGTTCGGTATGCGGATGGCGTCTTTAACGGGCCACCATCTTTGGCCTCCGAGGTTCGTCCCATGTCGAACTTAATGGCACAGACCTCACGTTGATTAACCTCATCAAATTCAAATTGAAATGATGAACGGGTTCGCAGACCCATTAACTCCGCGCGACGTTCTCCAAGAGTTAGCATATAGATCATACTATAGTCATAGCGACTCAGATGTTCCTTAGCGTACTTCATGTACGCATCAAAATCATCCTTAGATAGAGACTGGTCACGCGGTGCTTTACCATTGATATTCATATGGCGTAATTTATTTTTATAAATGATGTCGTTAGTTTCGGCATCATTCATGATTAATTGCATCACGCTGTTAATTCGTTCAACCGTGTTTTTGGCAAGATCCTTTTCGGCTAAACTATCAATAAATTCTTGGTAGGCGGAGCGACTGAGCTCATCAAGCTTGACATTCCCAAAGGGCGCTTGAAACCATTCCTTGTAATAATTTTTCATGCTCCTAGAAGTGATGGGCCGCCAGATGTTGAGTTTTACTTTACGGTCATAGATTCGCCAGAAGTAAGCGTCTACTGTGACTTTATGCCCTTCAATTTGGCCAACTTTGTCGGTGGCTAGTTCTAGCTCAAATTTTTTCAAAAGTAAGTCGGCATCGGCTGCACTTAAGAATCCTGACTTACTCCAATAGTCCGACTTGCCAGTACTTGATTTATACTTGCGCCTTGTCCCATAACGTTTACCTTTCTGGGTTGGATACGAGTAAACACCGGGGTAGCGTTTAAGTGGAGTCCATTTACGTGGCACTTAGCTCATTCCTTTCTTGTACGTTCGTAGTCCGTAATAGTTGAGTCCATAAATTTGATGGTGTGGATAAACTGTTGATAACTTTCTTTATCTGTTGGGAAGGGAATATCTGTATTAAGAAAGTTGCAGTTTGTAGATTCCAAATCATCTTTTAGGTGTTCTATGACTTCTATACGATTGCTAAAATCCATGATTATAAGGCCTCCTTTCAATTATTCTTGAATATCAAAATGTACCGTATTTGAACCGTGAGTACTTAGCGAACGTACGTTCTTTTGGCGGCTTAAATAAAAGGGCTAATGCCCTTAATTAAGTTTCTTTGGTGAAT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>NZ_CP015126|819903:867388|857179_857752_+|WP_003641180.1|DBSCAN-SWA
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MTKGQRIAEMRKRKDESQNVLSKVLHVSPSTIGMWETDQRAIKDEDLSKLADHFGVTTDYILGRKVDLGNVPVAAHIDGDFEDLSDEERQEINDYIEFKKAQFKKRKENENKD
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>NZ_CP015126|819903:867388|852555_853101_+|WP_003641173.1|DBSCAN-SWA
MSRLAKFTVTLVGIVLVLLAVFELGQLYPIPWLTSWLADLTINYPMVWSILLMVFAIIAGIVGILLVIVGLFRPVKVSTLTYDGKVGQLTIPQRALERDLQYRLVNQLNLIDPEVHLKLRRRRRVRVKIDAMVNTDASLETTAQQAATLAQDYLKNQLGLTVEQPVVQVKPANHQRKLTVV
>NZ_CP015126|819903:867388|853793_854234_+|WP_003641176.1|DBSCAN-SWA
MEATATSLKPEVVFDDTVLAKIASNTAQEVEGVLSLQGNLIDDISNRFTDKDRPQTGVSVDTDDDDQTVGIELTAILAYGKNGQEILARVADKVAKAVKSMTGYQVTKLKLVVKDMLTTEEWRQQNDKQEKAPEKKHPEPKDDGPH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_063096690.1|821525_823217_-|transposase	IS1182 family transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	1.1e-92	41.3
WP_013355292.1|823398_824574_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A1X9I5C3	Streptococcus_phage	2.6e-37	30.5
WP_033098994.1|824579_824765_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013355293.1|824879_825746_-	KilA-N domain-containing protein	Q4ZC41	Staphylococcus_virus	8.1e-81	57.5
WP_049787978.1|826004_826934_-	DUF4428 domain-containing protein	O48432	Lactobacillus_phage	3.1e-22	31.2
WP_049787979.1|826970_828107_-	DUF4428 domain-containing protein	O48432	Lactobacillus_phage	4.1e-16	26.3
WP_154813574.1|828152_828293_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013355295.1|828555_828897_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A059T669	Listeria_phage	6.9e-20	53.9
WP_114403795.1|829061_829277_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_114403796.1|829227_830475_-|transposase	ISL3-like element ISP1 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_013355297.1|830713_831307_+	type IV toxin-antitoxin system AbiEi family antitoxin domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641164.1|831783_832152_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641165.1|832385_832754_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	E9LUL4	Lactobacillus_phage	5.9e-17	42.7
WP_013355298.1|833291_836255_+	DNA2/NAM7 family helicase	NA	NA	NA	NA
WP_011101204.1|836556_837249_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_013355299.1|837468_837813_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011101206.1|837944_839243_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_063096691.1|839516_842021_+	LPXTG cell wall anchor domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_021355861.1|842152_842467_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2H4J6F9	uncultured_Caudovirales_phage	3.3e-08	36.0
WP_013355302.1|842629_845203_+	SEC10/PgrA surface exclusion domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_082222630.1|845343_847119_+|transposase	IS1182 family transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	1.9e-92	41.3
WP_033098993.1|847153_847744_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033098992.1|847743_848811_+	DUF4767 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_013355305.1|848877_849234_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011101208.1|849828_850212_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641171.1|850201_852049_+	acetyltransferase	A0A1R3Y5Q6	Salmonella_virus	4.5e-20	23.3
WP_003641172.1|852289_852544_+	GlsB/YeaQ/YmgE family stress response membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641173.1|852555_853101_+	alkaline shock response membrane anchor protein AmaP	NA	NA	NA	NA
WP_003641174.1|853113_853296_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003644046.1|853310_853733_+	Asp23/Gls24 family envelope stress response protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641176.1|853793_854234_+	Asp23/Gls24 family envelope stress response protein	NA	NA	NA	NA
WP_016511031.1|854437_855238_+	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_013355308.1|855369_856380_+	DUF4767 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003644049.1|856741_857074_+	PTS lactose/cellobiose transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_003641180.1|857179_857752_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013355309.1|857933_860468_+	M1 family metallopeptidase	A0A0P0IY26	Acinetobacter_phage	9.3e-69	27.3
WP_011101215.1|863579_865166_+	type I restriction-modification system subunit M	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	9.3e-176	62.9
WP_063096692.1|865162_866320_+	restriction endonuclease subunit S	A0A2H4PQP5	Staphylococcus_phage	1.1e-13	24.8
865670:865690	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_013355312.1|866470_867388_+|integrase	site-specific integrase	A8ATM2	Listeria_phage	2.7e-74	45.0
868459:868479	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP015126|1295846:1308624|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_013355469.1|1302765_1303326_+	hypothetical protein	A0A2P0ZL75	Lactobacillus_phage	6.5e-100	98.4
WP_013355470.1|1303396_1303837_-	nucleoside 2-deoxyribosyltransferase	A0A2P0ZL88	Lactobacillus_phage	1.2e-75	97.9
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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MAVMIHSKYGYEPPEWVQADARLDKWCKNKKRRAKQHGAFSLENKAKPVYQASQGDGFKLGNKG
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MKLKKNLTVFDLQRFAADASAGLAGTGTKLEMSVDGTKFDEIGGIKTVPDMGSDPENIDVTDLSDTKKKSVPGIENTSTLAFTFVYKGSNFATALTHNGDNKQYKWKVTYPDGMTASFTGSYTVKMGNVAVNGALEYTISIIISDGPDFATASSSAGA
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MTKFLNVIQATLKANYKKPAYWAQIIGSVLIIGLAVATVFFGVRIDANAVVLVITAVGAILAFVGAITDNSILEDTGNTIKTKSSTLASTEQTVVEALAEAQAKIEAANSAVASQAEAQASQAVVAAYSQAASAAAVGDTATASSAATLASSLAANLDSNAQPDAETASESTSQAGEK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003641420.1|2139248_2139641_-	YxeA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003644667.1|2139863_2140715_+	polysaccharide deacetylase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_063096755.1|2141636_2142173_-	hypothetical protein	E9LUS0	Lactobacillus_phage	1.1e-35	97.6
WP_003644510.1|2142184_2142448_-	hemolysin XhlA family protein	E9LUR9	Lactobacillus_phage	2.0e-38	100.0
WP_063096756.1|2142447_2143620_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	E9LUR8	Lactobacillus_phage	6.2e-201	89.7
WP_021732622.1|2143747_2144182_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046811036.1|2144184_2144634_-	DUF1617 family protein	A0A2P0ZLE0	Lactobacillus_phage	2.8e-21	40.5
WP_063096757.1|2144655_2149998_-	hypothetical protein	Q6SE68	Lactobacillus_prophage	2.4e-143	58.9
WP_099739626.1|2150012_2150345_-	hypothetical protein	V5UQS8	Oenococcus_phage	2.2e-42	73.4
WP_063096758.1|2150388_2156220_-	hypothetical protein	V5URV5	Oenococcus_phage	4.1e-229	41.1
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WP_003642826.1|2156606_2157005_-	hypothetical protein	V9QJA0	Oenococcus_phage	3.0e-46	74.8
WP_063096759.1|2157104_2157581_-|tail	phage tail protein	Q6SE73	Lactobacillus_prophage	1.0e-45	58.7
WP_003642824.1|2157589_2157955_-	hypothetical protein	V5UQS4	Oenococcus_phage	3.0e-29	53.4
WP_063096760.1|2157954_2158506_-	HK97 gp10 family phage protein	V5URV0	Oenococcus_phage	2.0e-64	61.7
WP_046947686.1|2158498_2158855_-	hypothetical protein	V5US85	Oenococcus_phage	3.2e-36	62.3
WP_024971556.1|2158854_2159187_-|head,tail	phage head-tail connector protein	V9QJ97	Oenococcus_phage	1.8e-12	45.3
WP_003642820.1|2159198_2159375_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642819.1|2159387_2160410_-|capsid	major capsid protein	V5US24	Oenococcus_phage	3.7e-117	62.5
WP_021732628.1|2160429_2160780_-	hypothetical protein	V5UTH9	Oenococcus_phage	4.5e-30	63.8
WP_063096761.1|2160794_2161472_-	DUF4355 domain-containing protein	Q6SE80	Lactobacillus_prophage	4.6e-15	32.1
WP_063096762.1|2161644_2161851_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642815.1|2161902_2162181_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033609661.1|2163987_2164284_-|protease	ribosomal-processing cysteine protease Prp	D2J003	Enterococcus_phage	1.1e-10	40.2
WP_063096763.1|2164213_2165722_-|portal	phage portal protein	V5US18	Oenococcus_phage	8.1e-137	52.2
WP_063096764.1|2165733_2166972_-|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	M1PG09	Streptococcus_phage	2.9e-140	61.3
WP_063096765.1|2166961_2167558_-|terminase	terminase small subunit	H9A0M8	Staphylococcus_phage	1.4e-12	42.3
WP_063096766.1|2167611_2167806_-	hypothetical protein	E9LUP6	Lactobacillus_phage	1.7e-07	58.0

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP015126|2170949:2181678|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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>NZ_CP015126|2170949:2181678|2173524_2174433_-|WP_063096773.1|DBSCAN-SWA
MDYFKQRRAYRNFKMYEASVSNGQNNLYRELLDYANDEGKLDVQFRMKNSALLSLTGLSEPGLDKARNSLVQLGLIKYVRGKKNVKTPEYRIINLYSRSAGYPTSNPTTSHKSRPTGLDKVGQPVGQGGGQPVEHKELTSTDPDLTDTDSYDDDAGVTREQVINDWTNLWGFPNGIARPEIDEWLEEFKPEVIAYAIWVAGEHQIGSNACLKYVRAIVAGWKKRNITTLEQAKKAAANHDDRMKSERKPSGYSKPRRKEVTPKWMQNGASRADSKPNSSDNQQDDMSDEDFLALMNSQEEAK
>NZ_CP015126|2170949:2181678|2180280_2180478_-|WP_046811055.1|DBSCAN-SWA
MKQKQVTQLLVELHELNKTLKTIASSLERKEVSHDIFPGIAFKAAPVSKEEFVKHYGEYVKRCSN

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_063096772.1|2172521_2173244_-	phage antirepressor KilAC domain-containing protein	Q8SDM9	Staphylococcus_phage	8.0e-50	45.1
WP_003642800.1|2173240_2173528_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063096773.1|2173524_2174433_-	DnaD domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_162786277.1|2174513_2175266_-	PD-(D/E)XK nuclease-like domain-containing protein	A0A0P0IZH9	Lactobacillus_phage	7.8e-72	50.6
WP_063096775.1|2175297_2176197_-	recombinase RecT	E9LUM3	Lactobacillus_phage	3.5e-63	53.3
WP_082222636.1|2176193_2176580_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063096777.1|2176908_2177196_+	hypothetical protein	A0A2H4JEH2	uncultured_Caudovirales_phage	1.6e-22	48.9
WP_063096778.1|2177445_2177958_-	transcriptional regulator	D6PST4	Lactobacillus_phage	1.9e-29	45.3
WP_063096779.1|2178024_2178330_-	DUF771 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642792.1|2178341_2178512_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046811051.1|2178536_2178833_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046811052.1|2178832_2179039_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003642789.1|2179181_2179412_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A0K2CNE2	Brevibacillus_phage	8.5e-06	36.8
WP_063096780.1|2179417_2179912_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046811054.1|2180011_2180284_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_046811055.1|2180280_2180478_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063096781.1|2180494_2180731_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003644967.1|2180881_2181250_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	E9LUL4	Lactobacillus_phage	5.7e-20	44.1
WP_063096782.1|2181261_2181678_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	A0A0M4RD70	Bacillus_phage	5.9e-05	30.6

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP015126|2389886:2398397|DBSCAN-SWA
CTTAAATTGCTCCTTCATTAATGAGTGTCTGTAATACATCTGGATAAAATTGGTGTTCACAATCATGAATCCGGGTCGCCAGGCTGGCTAGCGTATCGTCTGGTGCAACCGGAACGACCCGCTGGGCAATAATTTGCCCGGTATCGATTCCGGCATCGATATAGTGAATGGTAACGCCCGTCTCAGTCACACCAGCGGCAAAAGCATCCTCGATGCCGTGACGACCAGGAAACTTTGGTAACAATGCTGGGTGAATATTGATGATTTTATGAGCATACGCATTCAAGAGGGTCGGACCAATAATGCGCATGTACCCGGCCAATAATACCAGTTCAATTTGCCGTGCTTGCAAGGCCGTCAAAATGATTGCTTCCGCGGCCGCTTTATTCGCATAATCATGAAAATCAACAATTAATATCGGTACGTTAGCTGCCCGGGCCTTGTCAATTACCGGCGCTGTCGGTTGATCACACACAAGTAACCCAATCACTACCGGTAATTGTCGTTCAATAATCGCTTGGTGGAGTGCAACAAAGTTGGTGCCATTACCCGAAGCAAATACTGCAATTTTATTAGGCATGCTCAGCCTCCTCAAAAACGACGGGTGTCGTACCAGTTTGGACTGTTCCAACTCGATAATAGGACTGAGCGTTGGCCGTCAAATTAGCCGTCACAGCTGCCACTTGGTCGGGGTGAACGATCAGAACCATTCCCAAGCCCAGGTTAAAGGTCGACCGAAGATCCGTAGCAGTCAGCCCACCGAGTTCGGCCAATAACGTCATAATTGGCGGTACCGGCCATTGACCCAATTCAAGGTGCGCACTCAAGCCCGCCGGTAACGCTCTGGCGACGTTCTCAATCAAGCCGCCCCCGGTAATGTGGGCGATACTCGTCACTAATTTCTGCTGTAACAATGGTTGAACTGCATCAACGTAAATGGTCGTTGGTCGTAAAATTTCCGTTTGTAAATCATGACCAAGTTCGTCAAAAACCGTGGTCAATTGGTAGTCGTGTTGTTTGAATAAAATATCACGAACTAGACTAAACCCATTCGAGTGGAGGCCATTAGACGGCAACCCAATCAAGACGTCCCCAGCCCGAACATTTGCTGGTGATAACAGGTCCGCGCGGTTCGCAATTCCGACCGCAAAACCAGCGAGGTCGTAATGGTCCTGACCATACATATCGGGCATCTCCGCAGTCTCGCCACCAATCAACGCTGTATGGGCCTGCTGACAGCCCGCGACAACGCCAGTCAAAATGGCTTTGACCCGCTTCTGGTCCGTATGTCCAAGACCTAAGTAATCTAAAAAGAACTGGGGGGTCGCGCCTTGTGCCAAAATATCATTCACACACATTGCGACCAAGTCAATTCCAATCGTGGTATGTTGATCAGCAGCGATTGCGACTAAGAGCTTAGTCCCCACACCATCCGTCCCCGCTACTAACACGGGATCGTTGGCAGTTGCATCCGGACTAAGTGGAAACGCTCCCCCAAACGCGCCTAATTGCTGATTACCACTCATTTGTTTGACCGTCTTTAAGACGTCGTAACCAGCGTTGATATCAACGCCAGCCCGCTTATACGCATCGCTCACTTGATCACCCCTTCATGATTGGCTTGTAATTGCGCAATTTCCGCATCATACTCGGCTTGGTAATCATACAGGGCCGTTGGATAATCCCCATTAAAATAGGCCATGCATAGTCCACCATACGGTTCGGTGGTCGACAAGCCAACTGCATCAACGACGCCCTGTTCACTGAGAAAACCAAGTGAGTCCGCACCAAACGTCTGACACATCTCCCGAATCGTTTGCTGAGCCGCAATCAATTCATTAGTCGATTGAATATCGATACCGTAAAAACATGGATAGCGTAATGGTGGCGATGCAATTCGTAAATGAACTGACTTTGCACCCGCATCTTTCAATAATTTGACGATCCGCCGACTGGTGGTACCACGTACAATCGAATCATCGATTAAGACGACTCGTTTACCAGCGACAACACCTTTGACCGCTGAAAGCTTCATCCGAACCCCCTGTTCTCGCAATGCTTGGGTCGGCTGAATAAAGGTCCGTGACGAATATTGATTTTTAATTAATCCCATCTCGTAAGGCAGGCCACTCGCTTCCGCATAGCCGGTCGCCGCTGATAAAGATGAATTGGGTACCCCGACAACAATGTCGGCGTCCACGGGCTGTTCAACAGCGAGCTGAGCACCCATTCGTTTACGTGCAGAATGGACGTTGACGCCGTGAATATCAGAATCTGGACGTGCAAAGTAGATAAACTCCATTGAACAAATCGCCAACTGTGTATCAGTCGTATAATGGTCGATCGTCAAACCATGATCATCGATCGTTAACAATTCTCCCGGCTGAACATCTTGAACAAACGTCGCACCAATCGTATCAAGCGCGCAAGTTTCACTACAAACGACGTACCCGCCCGTGGGTAACTGACCGACGACTAATGGTCGTAACCCGTTAGGATCCAAAGCGGCAATCAAACAATCATTCGTTAGTAGTAAGTAAGCAAAGCCTCCGTGGACTTGACGTAAAGCATCCTTAACCTGTTCCGTTAACGTTGCTGCGGGGCTGCGTCGAATCAGATGCATTAAAATCTCACTATCAGAACTAGCATGAAAAATGGCACCATGCTGTTCCAACCGTCGCCGCAGTGTCACCGCGTTCGTCAAATTGCCGTTATGTGCGAGTGCAAACTGTGAGTCGCTAAAATTAAAACTCAAGGGTTGAATGTTTTCCAATCCATGATTACCAGCCGTGGCATAGCGTACATGGCCGACTGCAGCTTGACCCGTCAAACGTGCCAACCGCCGTGGGTCCCGAAAGACATCAGCCAACAACCCTAGTCCGCGTTCCGTCTGCAGTTTGCCGTGATCATTCGCCGTGATACCGGCTCCTTCTTGCCCCCGGTGTTGTAACGCATGGAGCCCAAAGTACGTTAATTGGGCGGCGTCCGGCGAGCCCCAAACCCCAAAGACGCCACATTCTTCATTCAGACTTCTTACTTCAGTAGGCATGGTAAGGCCCCTTCCCACAACTGTTTGGCGAAACTAACCTTAATATCAAACGCCTGATCAGCAGTTTGAACGTGTAGCCGATCCGTTGCAGTTGTTCGTCCTAAATAGGTCACATATGGTTCCATTAAACTTTCAAACGCGGCTTGCTGTGCTGGTGTCACCGAGATAACAAATCGTGACTGCGTTTCCGCAAAGAAGTTGGCAGCGGGCAAGTCACTGGCCAGTTCCACCCCGATATTTTGTGGAAAACATGATTCGGCAATCGTCGTAATCAAGCCACCTTCAGAAACATCGTGGGCACTAGCAACTAGTCCTTTTTGAATCGCAGTTAACAATAGACGCTGATTACGATTTTCAGTCACAAGGTCAAAATCAAACAGCTCGCCACTGATCGTTCCCGTCAACATCTTTTGCAGCTCACTACCATTGAAATCGGCTTCTGTGGTACCTAACACGTAGACTGCATCGCCAGCGTGTTTAAAATCGCTAGTCGTAATATCTTTCTGATGCTTAATTAACCCGACCATCCCAATCATTGGGGTGGGATAGATGGCTTCCCCGTTCGATTCATTGTTCAACGAGACATTGCCAGAAATCACGGGCGTATTGAATAATTGGCATGCACGAGCGATGCCCATCGCCGATTCGTCCAAATCGTAAAATTGTTCAGGTTTCTCTGGATTACCATAGTTCAAGCAATCAGTGATGCCTAAAGGTTGCCCACCGGAAGCGACAATGTTTCGAGCAGCTTCCGCAACGGCGATTTCCCCACCGACACGGGGGTTTAAGTATAAGTATCGCCCGTTAACATCGGTGGTGACCGCCAACGCCTTATCCGTATGTCGAATCCGTATGACCCCCGCATCGGAACCCGGCTTGACGACCGTATTCGTTTGGACCTGCGAGTCATACGTTCCATATAACGACGCTTTGGAAGCAATCGTTGGCTGTTGGAGCATCTTCTTCAATGTGCCAGTTGCATCAACTAGTCGTGGCATAAATTGATGATGGCTCTGATGGTTCAAGCGCGTTGGTCGTTTCTTTTCGCGTTCATAGACCGGCGCTTTGGTCGCAAGTGCATCGACGGGAACATCTGCAACTAACTTACCATGATGGAATAATTGATACTGGTGGCCGGCTGTCACTTTACCAATTGTGACAGCATCAAGACCGTACTTTTCAAAGACTTGATAAATTTCTGCTTCGGCACCAGCTTTGACACATAGTAACATCCGCTCCTGTGATTCAGAGAGCATCAGTTCAAACGGCGTCATGCCAGTTTCACGTTGTGGTACCAAGTCAAGATTCAGTGACAACCCACTGCCTGCTTTGGACGCCATTTCGGCTGAGGAGGAAACTAGGCCCGCCGCGCCCATATCTTGAATCCCGATTAAAACATCACGATGTTCATGAATAACCTCGAGACACGCCTCCATCAATAATTTTTCCATAAAGGGATCACCAACTTGAACCGCGGAACGCTGGGTTTCATTGGCGTCATTAAATTCAGCAGAGGCAAAGGACGCACCGTTAATGCCGTCACGCCCCGTTTTTGCGCCGACATAAATAACGGCGTTGCCAATTCCTGTTGCTTGGCCCTTCTGAATATCAGCTTGATCCAAGATTCCAACACACATGGCGTTCACCAACGGGTTCTTCTGATAACTCGCATCAAATACCGTATCACCACCGATTGTCGGAATTCCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATGCCGGCGACTACTTGCGAAATCAAGTATTTCGTATGAGCATCAGTCGGTTCCCCAAAGCGAAGACTGTCCAGCAGCGCAATCGGCCGGGCCCCCATCGAAAAGATGTCCCGAATGATACCACCCACACCCGTTGCCGCACCCTCATAAGGTTCAACTGCAGACGGATGATTATGACTTTCAGCTTTAAAGACCACGGCCTGACCATCACCGATGTCGATAATACCGGCGCCTTCACCAGGCCCTTCAAGTACCTGTTCACCCTGCGTCCAAAATTTTTTCAAGACTGGTTTTGAATTCTTGTAGGAGCAATGTTCGCTCCACATGCCGGAAAACAACCCGGTTTCAGTCTCGTTAGGTAAGCGTTGAAGGACCTTATCCGTTAATAATTGATACTCAGCATCGGTTAAGCCCCAATCCCGATAGACCTTAGAATCGCGAACATCTGTAGGTGATAATGGTTGCTTTTTAAGCATGGGTGACCTCCTCTTGACTCGCAATGACCGATTGAAAAATTCCGAGACCGTCCGTGGAACCTAAGATCATCTCCACGGCCCGTTCCGGATGGGGCATCATCCCAAGCACATTTCCCGCTTCATTTGTAATGCCAGCAATATTAGCCGTGCTGCCATTTGGATTCTCGACGTATTCGAAGATGATTTGATGATTAGCACGTAATTGCGCCAAGGTGGCCTCATCACAATAATAATTGCCTTCGCCGTGGGCAATCGGTAAACTAATTTGATCTGTCGATCCGTATGCGGTGGTAAAAATCGTCTCATGATTGGCAATTCGTAATGGGCTGTCCTGACAAATAAACTTCGCTGAGCGATTGGCCTGCAATGCACCAGGTAATAATCCGGCTTCGGTCAAGACTTGAAAGCCATTGCAGATTCCGATGACTGGTTTACCAGCGTTAGCAAATGCAATAACGGCCGGCATGATGGGCGCAAAGCGGGCAATCGCACCACTCCGTAAATAATCACCGTACGAAAAGCCACCAGGTAACACCACCGCGTCATAACCTGCTAATGAGGTCGCTGTCGCCGGAATCAAATCAGCCGTAACGTGTAAAATATCGCGCAAGGCATTCACCATGTCATGATCACAATTAGAACCAGGAAAGACTGGTACGGCAAATTTCATCATTACAAAGCCTCCATCTCAGTAATTTCGTAACGATAAGTTTCCATATTAACGTTGGCTAACAAGCGATCACACATCTCGTCGATTTCAGCGGCAACTGGCCGATCATCCGCGTGAATTTTCACCTCAAAATACTTACCTAATTCAACGGCATCGACATTCGTATATCCAAGTCGGTGTAAGGCATCATGAATCGCCTCACCCTTGGGGTCTAGAATTGATTGCTTATAAGTCACATAGATTTTAACTAAGTACATGTTAGGCCTCCTCAACGGTTGCTAGCCGCGTCAATACTTCCTGATAAACACTAGTCAAGTCGCCTAGATCCTTGCGGAAGACATCCTTATCAAGCGATGCACCGGTCTTTAGGTCGACTAACCGACAACTATCTGGTGAGATTTCATCAGCCAGCAAGACTTTACCGGTGGTCGTCAACCCAAATTCGATTTTAAAATCAACGAGCTGTACCCCCATCGCCGCAAAAATTGCCGTCAAACGCTGGTTAACCTGTAAGGCCTGCCGTTTAATTTCCGCCACGATTGCCGGTGTTGCAACATTTAGCGCGTGGATTTGTGAATCATTGATAAATGGATCATCCAGCTGATCACTCTTATAGAAAAATTCCAGTACTGGTTCTGCAAATTTGGTTAAGTGTGGCACGGCAAATTTACGCTCAAAACTACCCGAAGCCGCATTCCGAACAACTGTCTCCAAGGGAATCATGGTCACGCGACGGACAAGTTGCACATAGTCTGAAGGTTGCTCAATAAAATGGTTGGCAATGCCGTGATTGGCTAAGTCTTTGAAAATCAAACTCGCGATGCGATTATTCAATCGGCCTTTCTGGTCAATGGGAACCTTCCGCTTACCATTTAGCGCTGTTGCTTGATCTAAGTATTCGACCCATAGAATTTCAGGATCATTAGTGGCATACATCGCTTTCGCTTTACCCGTGTAAAGCAAAGCTTGTTTCTCAATCGCTGCCGTCATTATTATTGTTCCCCTTTCAAATTTGCCAACGACGCTAATGCTGCGTCAATATCGTGATTTAATACGGTGACATGACCCATCTTGCGCTGGGGCTTAATGGCCGCCTTACCGTAGTCGTGAAAATGCCATTCTGGGTGTTCAACCAACTGTTGACGTGCCACTGTTAAGTCATCACCTAGCAGATTACGCATCACTGCCGGACTGGTCTGCGTAATGGCCGGAATCGGTAAGCCACAGATACTTCGAATATGGGCCTCAAACTGCGAGATGTTGCAGGCCTCAATCGTATAGTGACCAGAATTATGTGGGCGTGGTGCCAGTTCATTGACTAATAAAGTATCATCCGGTAAAACAAAGAATTCGATTCCTAGCACGCCGCGTAGTTCCAGAGATTCAGCAATCGAAACCGCAATTTTGCGGGCCGCACTATGAACACTGGGCTGAACATTAGCTGGGGCAATCGTTGTGTGTAAGATATGATGTTGATGCTGATTTTCAACTAACGGAAAAGTCGTAACAACACCAGCAGCACTACGCGTCACCATCATGGAAACTTCTGTTCGAAATTTCTGCCGCGCCTCTAGAATGCACGGCTGTGTCAATAAGGCACTAGCGGCTTTTGTCACCACTGCTGTGTCTAGATCCGTTTGTCCGTGACCATCGTAGCCACCTGCCGCCGTTTTGAGAATTGCCGGCGTACCAACACGGTTGAGGGCGTAATTTAATGACTGTAAATCCGTCACCGGTGCGAAAGATGTGACTGGGATGCCATGATCATGAAGAAATTGCTTCTCATTAAGACGATCTCCAGTAATATGCAGGAGTGCAGTGCCCTGCGGTAACTTTGAATAGGCTTGCGCAGCAATCAAAGCATTCTCATCAACGTTTTCAAACTCGTAGGTCAAGACATCACTACGGCGCGCTAGATCAAGTAAAGCCGCCTGATCATCATAAGCCGCAACAATCTGAAAATCTGCGACCTGGGCTGCCGGTGCTTTGGGTGTCGGGTCAAGGACACCTACCCGATAGCCCATCGCCTTCGCGCTAAGCGTCATCATCTGACCGAGTTGACCGCCACCAACGATTCCGATCGTTGCGGGTGGTAAGAGTGCTTCCTTAAAATTGGCGTTCACTTTGTTCAGCCTCCTGACGTTGACGAGCACGAAATTCTCCAATTGCATGTTGTACTTGTGGTTCCCGTAAACCGATAATTTGGGCGGCCATTAGCGCACCATTCTTAGCCCCCGCATCACCAATCGCCATCGTCGCCACGGGTACGCCAGCTGGCATCTGTACGATTGACAATAACGAATCAACTCCGTTCAACGTATGGGTCTTAATGGGCACCCCAATTACCGGGAGTAGTGTATTGGCAGCTAGCATCCCGGGTAAATGGGCAGCGCCCCCCGCACCCGCAATAATAACTTGAATTCCCCGTGACGCTGCTTCTTCACCATAGGATTGTAATGTCTGGGGCATTCGGTGGGCCGAAATAACGTGACGCTCATAAGAGACTCCCAGTGCCGTTAACTGTTCTGCCGCTAATTGCATGGTTGGCCAATCAGAAATTGACCCCATAATCAAACCAACTTTCGCCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP015126|2389886:2398397|2396800_2397931_-|WP_063096803.1|DBSCAN-SWA
MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYSKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASLANLKGEQ
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MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL
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MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA
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MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK
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MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA
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MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI
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MAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF
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MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003645867.1|2389886_2390465_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	1.3e-21	33.9
WP_013355836.1|2390457_2391483_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3F760	Synechococcus_phage	5.4e-60	40.7
WP_003642591.1|2391479_2392934_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	2.5e-50	34.0
WP_003645864.1|2392918_2395138_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	4.5e-144	39.3
WP_011101895.1|2395130_2395811_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_003642588.1|2395810_2396065_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	NA	NA	NA	NA
WP_003642587.1|2396066_2396798_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4SM18	Cyanophage	1.6e-37	37.3
WP_063096803.1|2396800_2397931_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_003645861.1|2397914_2398397_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	2.3e-16	41.0