CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP015114	Staphylococcus condimenti strain DSM 11674 chromosome, complete genome	2 crisprs	cas3,cas14j,c2c9_V-U4,DinG,DEDDh,csa3,WYL	0	1	7	0

1. NZ_CP015114

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP015114_1

• CRISPR_ID: NZ_CP015114_1
• CRISPR_location: 1484734-1484812
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP015114_1

Consensus_repeat	Method
TTTTTAGAGGTTTTCTAGAGGTTTT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP015114_1

>1.1|1484759|29|NZ_CP015114|CRISPRCasFinder
TAATTATTCATCAAACTATATCCTTAATT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015114_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP015114_1

>merge|NZ_CP015114|1|1484734-1484812|CRISPRCasFinder
TTTTTAGAGGTTTTCTAGAGGTTTTTAATTATTCATCAAACTATATCCTTAATTTCGCGAGAGGTTTTCTAGAGGTTTT

>NZ_CP015114|1|1|1484734-1484812|CRISPRCasFinder
TTTTTAGAGGTTTTCTAGAGGTTTT	TAATTATTCATCAAACTATATCCTTAATT
TCGCGAGAGGTTTTCTAGAGGTTTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP015114.1|WP_047132257.1|1487999_1488623_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238045
NZ_CP015114.1|WP_052766757.1|1475959_1476952_-|leukocidin-family-pore-forming-toxin	unknown	unknown	gnl|CDD|369625
NZ_CP015114.1|WP_047132252.1|1480236_1480872_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224054
NZ_CP015114.1|WP_047132250.1|1477130_1479029_-|glycosyltransferase-family-2-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366154
NZ_CP015114.1|WP_047132263.1|1495571_1495952_+|general-stress-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378584
NZ_CP015114.1|WP_047132260.1|1491491_1492958_-|IMP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|235507
NZ_CP015114.1|WP_047132259.1|1489933_1491475_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234614
NZ_CP015114.1|WP_052766758.1|1485630_1486464_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225420
NZ_CP015114.1|WP_047132261.1|1492991_1494260_-|purine-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|274468
NZ_CP015114.1|WP_047132264.1|1496059_1496725_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP015114.1|WP_047132265.1|1496842_1497817_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP015114.1|WP_165380013.1|1473931_1474645_-|phosphoadenylyl-sulfate-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|129526
NZ_CP015114.1|WP_063164644.1|1482656_1482776_-|YydF-family-exported-signaling-peptide	unknown	unknown	gnl|CDD|188592
NZ_CP015114.1|WP_047132247.1|1471924_1473769_-|assimilatory-sulfite-reductase-(NADPH)-flavoprotein-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|273882
NZ_CP015114.1|WP_052766759.1|1486429_1487131_-|putative-DNA-binding-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225420
NZ_CP015114.1|WP_047132253.1|1481635_1482598_-|YydG-family-peptide-radical-SAM-peptide-maturase	unknown	unknown	gnl|CDD|188593
NZ_CP015114.1|WP_047132255.1|1483519_1484116_-|complement-inhibitor-SCIN-family-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP015114.1|WP_047132256.1|1484276_1484681_+|NUDIX-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|240032
NZ_CP015114.1|WP_126498527.1|1474959_1475967_-|beta-channel-forming-cytolysin	unknown	unknown	gnl|CDD|273388
NZ_CP015114.1|WP_047132262.1|1494261_1494840_-|xanthine-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|181705

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP015114.1|WP_047132257.1|1487999_1488623_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|238045	cd00093, HTH_XRE, Helix-turn-helix XRE-family like proteins. Prokaryotic DNA binding proteins belonging to the xenobiotic response element family of transcriptional regulators.	9.42494e-15
NZ_CP015114.1|WP_052766757.1|1475959_1476952_-|leukocidin-family-pore-forming-toxin	gnl|CDD|369625	pfam07968, Leukocidin, Leukocidin/Hemolysin toxin family.	4.49347e-59
NZ_CP015114.1|WP_047132250.1|1477130_1479029_-|glycosyltransferase-family-2-protein	gnl|CDD|366154	pfam00535, Glycos_transf_2, Glycosyl transferase family 2. Diverse family, transferring sugar from UDP-glucose, UDP-N-acetyl- galactosamine, GDP-mannose or CDP-abequose, to a range of substrates including cellulose, dolichol phosphate and teichoic acids.	2.92039e-23
NZ_CP015114.1|WP_047132252.1|1480236_1480872_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|224054	COG1131, CcmA, ABC-type multidrug transport system, ATPase component [Defense mechanisms].	8.46724e-18
NZ_CP015114.1|WP_047132263.1|1495571_1495952_+|general-stress-protein	gnl|CDD|378584	pfam11181, YflT, Heat induced stress protein YflT. YflT is a heat induced protein.	1.54242e-05
NZ_CP015114.1|WP_047132260.1|1491491_1492958_-|IMP-dehydrogenase	gnl|CDD|235507	PRK05567, PRK05567, inosine 5'-monophosphate dehydrogenase; Reviewed.	0
NZ_CP015114.1|WP_047132259.1|1489933_1491475_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase	gnl|CDD|234614	PRK00074, guaA, GMP synthase; Reviewed.	0
NZ_CP015114.1|WP_052766758.1|1485630_1486464_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|225420	COG2865, COG2865, Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain and an uncharacterized domain shared with the mammalian protein Schlafen [Transcription].	3.30768e-14
NZ_CP015114.1|WP_047132261.1|1492991_1494260_-|purine-permease	gnl|CDD|274468	TIGR03173, pbuX, xanthine permease. All the seed members of this model are observed adjacent to genes for either xanthine phosphoribosyltransferase (for the conversion of xanthine to guanine, GenProp0696) or genes for the conversion of xanthine to urate and its concomitant catabolism (GenProp0640, GenProp0688, GenProp0686 and GenProp0687). A number of sequences scoring higher than trusted to this model are found in different genomic contexts, and the possibility exist that these transport related compounds in addition to or instead of xanthine itself. The outgroup to this family are sequences which are characterized as uracil permeases or are adjacent to established uracil phosphoribosyltransferases.	5.12922e-168
NZ_CP015114.1|WP_165380013.1|1473931_1474645_-|phosphoadenylyl-sulfate-reductase	gnl|CDD|129526	TIGR00434, Phosphoadenosine_phosphosulfate_reductase, phosophoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin). This enzyme, involved in the assimilation of inorganic sulfate, is designated cysH in Bacteria and MET16 in Saccharomyces cerevisiae. Synonyms include phosphoadenosine phosphosulfate reductase, PAPS reductase, and PAPS reductase, thioredoxin-dependent. In a reaction requiring reduced thioredoxin and NADPH, it converts 3(prime)-phosphoadenylylsulfate (PAPS) to sulfite and adenosine 3(prime),5(prime) diphosphate (PAP). A related family of plant enzymes, scoring below the trusted cutoff, differs in having a thioredoxin-like C-terminal domain, not requiring thioredoxin, and in having a preference for 5(prime)-adenylylsulfate (APS) over PAPS. [Central intermediary metabolism, Sulfur metabolism].	6.95701e-110
NZ_CP015114.1|WP_063164644.1|1482656_1482776_-|YydF-family-exported-signaling-peptide	gnl|CDD|188592	TIGR04077, hypothetical_protein_HMPREF0348_0872, exported signaling peptide, YydF/SAG_2028 family. This family describes a rare family of small proteins, about 50 residues in length, that includes YydF from Bacillus subtilis and SAG_2028 from Streptococcus agalactiae 2603V/R. Mutational analysis and genomic context show that members of this family likely are modified by a (variably present) radical SAM enzyme, are exported by an ABC transporter, and serve as signaling peptide. The member from Bacillus subtilis induces the LiaRS two-component system. [Regulatory functions, Protein interactions].	5.91382e-13
NZ_CP015114.1|WP_047132247.1|1471924_1473769_-|assimilatory-sulfite-reductase-(NADPH)-flavoprotein-subunit	gnl|CDD|273882	TIGR01931, Sulfite_reductase_flavoprotein_alpha-component, sulfite reductase [NADPH] flavoprotein, alpha-component. This model describes an NADPH-dependent sulfite reductase flavoprotein subunit. Most members of this family are found in Cys biosynthesis gene clusters. The closest homologs below the trusted cutoff are designated as subunits nitrate reductase.	0
NZ_CP015114.1|WP_047132253.1|1481635_1482598_-|YydG-family-peptide-radical-SAM-peptide-maturase	gnl|CDD|188593	TIGR04078, radical_SAM_domain_protein_protein, peptide modification radical SAM enzyme, YydG family. Members of this radical SAM protein family for peptide modification occur only in the context of members of family TIGR04077, which average about 50 amino acids in length. In Bacillus subtilis, this protein (YydG) appears to act on its cognate target peptide (YydF) prior to its export, and result in the creation of a signaling molecule that induces the LiaRS two-component system. [Regulatory functions, Protein interactions].	1.3343e-142
NZ_CP015114.1|WP_052766759.1|1486429_1487131_-|putative-DNA-binding-domain-containing-protein	gnl|CDD|225420	COG2865, COG2865, Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain and an uncharacterized domain shared with the mammalian protein Schlafen [Transcription].	1.34964e-16
NZ_CP015114.1|WP_047132256.1|1484276_1484681_+|NUDIX-domain-containing-protein	gnl|CDD|240032	cd04676, Nudix_Hydrolase_17, Members of the Nudix hydrolase superfamily catalyze the hydrolysis of NUcleoside DIphosphates linked to other moieties, X. Enzymes belonging to this superfamily require a divalent cation, such as Mg2+ or Mn2+, for their activity and contain a highly conserved 23-residue nudix motif (GX5EX7REUXEEXGU, where U = I, L or V), which functions as a metal binding and catalytic site. Substrates of nudix hydrolases include intact and oxidatively damaged nucleoside triphosphates, dinucleoside polyphosphates, nucleotide-sugars and dinucleotide enzymes. These substrates are metabolites or cell signaling molecules that require regulation during different stages of the cell cycle or during periods of stress. In general, the role of the nudix hydrolase is to sanitize the nucleotide pools and to maintain cell viability, thereby serving as surveillance & "house-cleaning" enzymes. Substrate specificity is used to define families within the superfamily. Differences in substrate specificity are determined by the N-terminal extension or by residues in variable loop regions. Mechanistically, substrate hydrolysis occurs by a nucleophilic substitution reaction, with variation in the numbers and roles of divalent cations required.	2.66716e-22
NZ_CP015114.1|WP_126498527.1|1474959_1475967_-|beta-channel-forming-cytolysin	gnl|CDD|273388	TIGR01002, synergohymenotropic_toxin, beta-channel forming cytolysin. This family of cytolytic pore-forming proteins includes alpha toxin and leukocidin F and S subunits from Staphylococcus aureus, hemolysin II of Bacillus cereus, and related toxins. [Cellular processes, Toxin production and resistance].	2.27509e-85
NZ_CP015114.1|WP_047132262.1|1494261_1494840_-|xanthine-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|181705	PRK09219, PRK09219, xanthine phosphoribosyltransferase; Validated.	6.77236e-115

Protein sequences

>NZ_CP015114.1|WP_047132256.1|1484276_1484681_+|NUDIX-domain-containing-protein
MPPKHIVSASCVVLNDENNILLIKSPLRGWEIPGGQIENGETIREGVIREVKEESGIDVELTEFCGVFQNTEHSIINNLFKGEYIGGKLTTSDESLEVGFFIYTEVMEKVTWGNFTERIHLCFSEKEKPFLISF
>NZ_CP015114.1|WP_047132255.1|1483519_1484116_-|complement-inhibitor-SCIN-family-protein
MNFKQFLLSGLAVALLGSAGANVFSNQAEAASYGAYEFRDYDVTAKENLKNLLNASSYYKAMAKESGARFYQNKLNQELHFAKKQQNASNDSQVVTAINRLSAVYNEVFQIHLQTEKGSSDVQSKKTELQNLIIKANSLLTESHHSMNQDEAQLKKTVEQAKTVLNQAQPGYELVNAISSVQQGIKNVEQYKAFVNHR
>NZ_CP015114.1|WP_063164644.1|1482656_1482776_-|YydF-family-exported-signaling-peptide
MKNLEFKNLVNDSEKLAKVNDLWYFVKSKSHRWIVGSGH
>NZ_CP015114.1|WP_047132253.1|1481635_1482598_-|YydG-family-peptide-radical-SAM-peptide-maturase
MYNKSVSINLVSKCNAACAHCCFSCSPQASIKMDDSYIKETVLEFSKNPNIEVISFTGGEIFLNYKFLEELLIITKSYNKKVTLISNGFWGSSRKLLKKYFSDFKKYNVIALTISYDEYHAPFVKLESIKNIFKFRMKYPEIDVSLNMAVTKDKMSNTILSELGSSVIGVKITKFPIITVGAAKDKISKNNIHNFYNIEKDRDVLYCPGYEIVYHHDGEIYPCCSPAIFETQISLREEKYQTLERTIEKLNSNILLYIIRREGFNWFLDILKEQKLLNDFGIPLDFPSVCSVCGSLFNDQYKINFFKPYMEKYYYETIKI
>NZ_CP015114.1|WP_047132252.1|1480236_1480872_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein
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>NZ_CP015114.1|WP_047132250.1|1477130_1479029_-|glycosyltransferase-family-2-protein
MTKDLAIIVPVYNKELFLDDTMKSIDNLDIDKSEIEVIFIDDVSTDQSLEKLKVYENEYDYVKVVELEENTGSPSTPRNVGVEVSDSKYITFLDADDWLDAEGFPKLLQQALDTQNDILFGQSLRHKDHSISKIARFSSYETAYYLVPYEIDKIFRAVGPPGKIIRASVIKENDIQFEHMKYGEDKLFFTEVIAKAQSAGMNDAVAYHVNRYGVNQSLISETDIFEKTSCNLEVLKKLFELDIPETARHNAISRIIEMDYLSRLFMNKRFLKSEDKQLFYDAFAEMETILDRHHLNIKDYLTEDKYEKVYQLLSQSDKEKAVKLIEILVKGERAPRYVSNGLVHFVLPETLQEIAPLTEEFFAVYSGTEEADGQFYEVIQLYKKMAAQISRVQLVKLGDESVTKDVGYQVRGGRLRVPTKELEEADFNFNIQITYDYYRPCTVNMNLPSAIKHHALKRQQFKAEFEDKRFKNETNQPKFVDTTKYYDENPGKVFAAKQFKVYEDVEFQKEAPREIEVGELFTVEDIQYTEKGTPRLTLKDGSVVTANKKFVSVLDEAKGKDYLIEPPRKVQVLKVCKAYNDRNFKDEAGAKFAKDDIENITKIVFSSNGTPRLKTDKGIYMTANRNFVEPIQ
>NZ_CP015114.1|WP_052766757.1|1475959_1476952_-|leukocidin-family-pore-forming-toxin
MKWKEMLVTLIPASVLILGTIMPSEVIARDIKQDEIGKDGQVTKRTQVGSDINGGFTQILNFDFIDDPKYDKDALVLSTKGNIASQLEYGKFRENPLFFSQMRFPGEFGVRIHVKDNPKTEILDYLPKNNIESVDVSETFGYNIGGSISSNESGSITGGVNYSKTINYKQNNYRTLLSSDTSNQSVGWNVIASSLFYNGHTNVRGDLNLFRNDAGDRIEHDPRTFLAGKSTLPSLVRSGFTPDFLTYLSNDKQNTKTQITVRYQRLNDEIDAAFYSSNFAIVPQMGRYYMNISGNAFTATYEIDWKNKKVKMLKQESEQIGKSPLEKAGE
>NZ_CP015114.1|WP_126498527.1|1474959_1475967_-|beta-channel-forming-cytolysin
MNKMRSGILKIITLSTLLALTTGTAASLTDQAKANSNFITEVKNNGTEKVASDSMIYKRTATASDLNKHITQSLQFNFIKDESYDKETVVLKTAGNIASNARILDPYAVYTSTKRWPGEYKVSVNLPETDSTAIIDYAPRNHDETREVSDTVGFNIGGGLNIKKGGDANINAKYNFSETIKYKQDAYRTFLETPTTGKDITWGVVEAYNINVRGYGPYNREKENDKLGLYGNELFLNGRKSSKNAGKNFVDQNQLPALIASSFNPEFLTVFSHDYDDKGKSIIKVKYERVMDDYLITWKTFYWKGFNNKNVAKESITVAYEIDWDNHNVKVIGAV
>NZ_CP015114.1|WP_165380013.1|1473931_1474645_-|phosphoadenylyl-sulfate-reductase
MTYTNFASNPFDSLNIFDETKGAYHVLKWAYDTYGDEIVYACSFGAEGIVLIDLISQVKPDARIVFLDTGLHFEETYDLIDRVKAKYPELNIELKKPDLTVDEQAEHYGDNLWRRDPNQCCYIRKVKPLEEVLTGQIAWVSGLRREQSPTRANTDFLNKDERFQSVKVCPLIHWTWDNVWDYIKSNELPYNTLHDQNYPSIGCAPCTSPVAAGGDSREGRWSNNMKTECGLHVGRKS
>NZ_CP015114.1|WP_047132247.1|1471924_1473769_-|assimilatory-sulfite-reductase-(NADPH)-flavoprotein-subunit
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>NZ_CP015114.1|WP_052766758.1|1485630_1486464_-|hypothetical-protein
MFFPNFHLDYRNRTHYSEDERWIDRVASGEVGNEEVNLFNFYNTVLNRLVNTVLDGFALNPETQVRQGVKTDVEVSLREALANLLIHADYEDNSSIIVEAYKNNYVFINPGELLVTKEEFARGGESNPRNSTIVTLFRKAGYSERAGSGGMKIFRAALKNKFRMPEIHSSEGKTKLKIWKIDLVDSYENLIEQEKTILRYIVKENRKIKMKEIEALEGFTEYIAKTNVNSLIDKGIVKKFGKSRSTTYGLKPNSSEMIANIEHNMRNMQESIINENR
>NZ_CP015114.1|WP_052766759.1|1486429_1487131_-|putative-DNA-binding-domain-containing-protein
MEQEFLNEGTTIEYKKAQDGVPKSFWETYSSFSNTEGGTIYLGVSEEKQGCVVTGVKNANQYIQTIVDTANDKKFTNFNNIYNSNIKVLKEDGLEYIKIYIPEVKSENKPLHVKNNINNSYIRRNDSDHKMSGEEIRRFLRDADPKSDSELLSNFNIDDLDLDAVKKYKNLIHERNSDMDILSMDNWEFLKRYGAVGKDRIENEFKLKKGALLFFGKEQAILDVFSKFPFRLS
>NZ_CP015114.1|WP_047132257.1|1487999_1488623_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MENRIAELRKEKNMTLKQLAEELNIRDNTLSQYETGKRNPQSGLLQEIANFFGVSMEYILKATDKRDYPIVDNSSAIELLEKIANEKEFNYSHISKNTALNLSLWIINNMDYIKEQHPNLLYTASFLVKSTISENKILQHYSEMRKKQFKIVDEIDDILLEREFYGASVEQVLEFLHQSERIGYEHTKKLMEYIRQLPTDEYEDEDF
>NZ_CP015114.1|WP_047132259.1|1489933_1491475_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase
MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSYTIDPEIYNLGVPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIIHAKADELFFGLPEEQTVWMSHSDKVIEIPEGFESIADSPSTPYAAIEDKERRIYGVQFHPEVRHTEYGNDILRNFVRRICDCTGEWTMENFIDLEIEKIREQVGDRKVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMDKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMQFELIEPINTLFKDEVRALGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREVIREEGLEREIWQYFTVLPGMRSVGVMGDYRTYDYTIGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDVTSKPPSTIEWE
>NZ_CP015114.1|WP_047132260.1|1491491_1492958_-|IMP-dehydrogenase
MWENKFAKESLTFDDVLLIPAESNVLPKEVDLSVELSDRIKLNIPVVSAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVVHKNMNIEDQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEEKVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKISDVMTKEDLITAPVGTTLDEAEAILQKHKIEKLPLTENGKLKGLITIKDIEKVHEYPFAAKDSLGRLLCAAAIGISKDTDIRAEKLVEAGVDALVIDTAHGHSQGVIDQVKHIKQTYPEVTVIAGNVATGEATKALFEAGADVVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQITAVYDCATEARKQGKAIIADGGIKFSGDIVKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGETEIFQGRQYKTYRGMGSLGAMESGSNDRYFQEDKVPKKYVPEGIEGRIAYKGLLQDNIYQLMGGVRSGMGYTGSHNLKELREEAMFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSR
>NZ_CP015114.1|WP_047132261.1|1492991_1494260_-|purine-permease
MKNFVLSLQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEEIAYLVTVDIFMCGVATFLEANKITGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGLDVLYGSLFISGILVVLIAPVFSFVVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYVAGGQGSKDYGDMKNIILGFATLLIILILQRFTRGFLKSIAILIGLFAGTALAGVFGVVDLNQVGTAHWFELPRPFRFAGFGFDLGATLVFFIVALVSLIESTGVYTALSKITGRTLERKDYRKGYTAEGLAIILGSIFNAFPYTAYSQNVGLVSLSGVKKNNVIYGMVILLLICGCIPKLGALANVIPLSVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGGIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPEAFKAMGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGLKYQQNEENVK
>NZ_CP015114.1|WP_047132262.1|1494261_1494840_-|xanthine-phosphoribosyltransferase
MEALRQKVKEDGVVIGEKILKVDGFLNHQIDAQLMYDIGETFYEQFKDQKVTKILTVEASGIAPAIMVAYKFGVPCLFAKKAKPNTLNKGFYQTDIHSFTKNKTNSVIISEEFLGEHDRVLIIDDFLANGDASLGLNRLVHQAGAETVGVGIVVEKSFQQGRTRLEEAGLKVSSLCEVASLSGNKVTLVGEE
>NZ_CP015114.1|WP_047132263.1|1495571_1495952_+|general-stress-protein
MADILILTSQDEIFDALKRKLDEGYTKDELSVISKNKLHIDSVESTDMKVQSTSGTFSDRVARLLTGEDGEEAVLAHYDLTDTEKKVCKREILNGNIIILAGKHPHSRKEFKNEYDEKKPEKEYEI
>NZ_CP015114.1|WP_047132264.1|1496059_1496725_+|hypothetical-protein
MEFKLIKQTSDPLYEAALNLYDNYQFGNVRQQHHVFKQSLENKRTKNDYVFIVGLDNDEVVSLATAHYEATTNSAFIIYLVAIDTPEREQYLTDTLAQVQNELDHLAERVHNREVNFFMMEALPLPESTEEKDADLLFKRHRFLNDHGFEEQTEIDYKRPGLDKEMPPIALNLFLHTRIPLTKDIYATSVKSCYILKYVFANHLSRKRVYPLLEEMDLRKS
>NZ_CP015114.1|WP_047132265.1|1496842_1497817_+|hypothetical-protein
MLTKEFAQRVDLSEKQVRKIVQHLEERGYHLNKTEYRGREATDFQEEDIELFKEIADKVKKTNSYELAFEELEKENDFLQIVVKEDNEKLPSDQNFAKILNDLHNDISKMREERQMLGQMISQVHQQQKDLQTLQQQMTDKLDQHAETLKAIETAQQEHAKAVADNTKAVESNTAKVLAQPKETKKEEQKTPSAESAKNEPAKTTSSNDKQNSTADFKGAAVSAQPEKKEENKSASAVQSEAKPEASATTASNKEDSASTENKTASDKSDQKEQKSVSAAEMQETPETTTPEPEIPVDAPRNEHQPTAQHKQEKKGFFARLFGM

Crispr_ID: NZ_CP015114_2

• CRISPR_ID: NZ_CP015114_2
• CRISPR_location: 1487141-1487227
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP015114_2

Consensus_repeat	Method
TCTAGAGGTTTTCTAGAGGTTTT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP015114_2

>2.1|1487164|41|NZ_CP015114|CRISPRCasFinder
CTAGAGGTTTTCTAGATTTTTCCTAGATTTTCCTAGATTTT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015114_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP015114_2

>merge|NZ_CP015114|2|1487141-1487227|CRISPRCasFinder
CCTTTCAGTTTTCTAGAGGTTTTCTAGAGGTTTTCTAGATTTTTCCTAGATTTTCCTAGATTTTCCTAGATTTTCTCTAGAGGTTTT

>NZ_CP015114|2|2|1487141-1487227|CRISPRCasFinder
CCTTTCAGTTTTCTAGAGGTTTT	CTAGAGGTTTTCTAGATTTTTCCTAGATTTTCCTAGATTTT
CCTAGATTTTCTCTAGAGGTTTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP015114.1|WP_052766757.1|1475959_1476952_-|leukocidin-family-pore-forming-toxin	unknown	unknown	gnl|CDD|369625
NZ_CP015114.1|WP_047132252.1|1480236_1480872_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224054
NZ_CP015114.1|WP_047132250.1|1477130_1479029_-|glycosyltransferase-family-2-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366154
NZ_CP015114.1|WP_047132263.1|1495571_1495952_+|general-stress-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378584
NZ_CP015114.1|WP_047132260.1|1491491_1492958_-|IMP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|235507
NZ_CP015114.1|WP_047132259.1|1489933_1491475_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234614
NZ_CP015114.1|WP_052766758.1|1485630_1486464_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225420
NZ_CP015114.1|WP_047132265.1|1496842_1497817_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP015114.1|WP_047132264.1|1496059_1496725_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP015114.1|WP_047132257.1|1487999_1488623_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238045
NZ_CP015114.1|WP_063164644.1|1482656_1482776_-|YydF-family-exported-signaling-peptide	unknown	unknown	gnl|CDD|188592
NZ_CP015114.1|WP_047132261.1|1492991_1494260_-|purine-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|274468
NZ_CP015114.1|WP_063164623.1|1497852_1499505_-|IS1182-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|372705
NZ_CP015114.1|WP_052766759.1|1486429_1487131_-|putative-DNA-binding-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225420
NZ_CP015114.1|WP_047132253.1|1481635_1482598_-|YydG-family-peptide-radical-SAM-peptide-maturase	unknown	unknown	gnl|CDD|188593
NZ_CP015114.1|WP_047132255.1|1483519_1484116_-|complement-inhibitor-SCIN-family-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP015114.1|WP_047132256.1|1484276_1484681_+|NUDIX-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|240032
NZ_CP015114.1|WP_126498527.1|1474959_1475967_-|beta-channel-forming-cytolysin	unknown	unknown	gnl|CDD|273388
NZ_CP015114.1|WP_169746296.1|1499981_1501307_+|L-cystine-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224736
NZ_CP015114.1|WP_047132262.1|1494261_1494840_-|xanthine-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|181705

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP015114.1|WP_052766757.1|1475959_1476952_-|leukocidin-family-pore-forming-toxin	gnl|CDD|369625	pfam07968, Leukocidin, Leukocidin/Hemolysin toxin family.	4.49347e-59
NZ_CP015114.1|WP_047132252.1|1480236_1480872_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|224054	COG1131, CcmA, ABC-type multidrug transport system, ATPase component [Defense mechanisms].	8.46724e-18
NZ_CP015114.1|WP_047132250.1|1477130_1479029_-|glycosyltransferase-family-2-protein	gnl|CDD|366154	pfam00535, Glycos_transf_2, Glycosyl transferase family 2. Diverse family, transferring sugar from UDP-glucose, UDP-N-acetyl- galactosamine, GDP-mannose or CDP-abequose, to a range of substrates including cellulose, dolichol phosphate and teichoic acids.	2.92039e-23
NZ_CP015114.1|WP_047132263.1|1495571_1495952_+|general-stress-protein	gnl|CDD|378584	pfam11181, YflT, Heat induced stress protein YflT. YflT is a heat induced protein.	1.54242e-05
NZ_CP015114.1|WP_047132260.1|1491491_1492958_-|IMP-dehydrogenase	gnl|CDD|235507	PRK05567, PRK05567, inosine 5'-monophosphate dehydrogenase; Reviewed.	0
NZ_CP015114.1|WP_047132259.1|1489933_1491475_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase	gnl|CDD|234614	PRK00074, guaA, GMP synthase; Reviewed.	0
NZ_CP015114.1|WP_052766758.1|1485630_1486464_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|225420	COG2865, COG2865, Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain and an uncharacterized domain shared with the mammalian protein Schlafen [Transcription].	3.30768e-14
NZ_CP015114.1|WP_047132257.1|1487999_1488623_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|238045	cd00093, HTH_XRE, Helix-turn-helix XRE-family like proteins. Prokaryotic DNA binding proteins belonging to the xenobiotic response element family of transcriptional regulators.	9.42494e-15
NZ_CP015114.1|WP_063164644.1|1482656_1482776_-|YydF-family-exported-signaling-peptide	gnl|CDD|188592	TIGR04077, hypothetical_protein_HMPREF0348_0872, exported signaling peptide, YydF/SAG_2028 family. This family describes a rare family of small proteins, about 50 residues in length, that includes YydF from Bacillus subtilis and SAG_2028 from Streptococcus agalactiae 2603V/R. Mutational analysis and genomic context show that members of this family likely are modified by a (variably present) radical SAM enzyme, are exported by an ABC transporter, and serve as signaling peptide. The member from Bacillus subtilis induces the LiaRS two-component system. [Regulatory functions, Protein interactions].	5.91382e-13
NZ_CP015114.1|WP_047132261.1|1492991_1494260_-|purine-permease	gnl|CDD|274468	TIGR03173, pbuX, xanthine permease. All the seed members of this model are observed adjacent to genes for either xanthine phosphoribosyltransferase (for the conversion of xanthine to guanine, GenProp0696) or genes for the conversion of xanthine to urate and its concomitant catabolism (GenProp0640, GenProp0688, GenProp0686 and GenProp0687). A number of sequences scoring higher than trusted to this model are found in different genomic contexts, and the possibility exist that these transport related compounds in addition to or instead of xanthine itself. The outgroup to this family are sequences which are characterized as uracil permeases or are adjacent to established uracil phosphoribosyltransferases.	5.12922e-168
NZ_CP015114.1|WP_063164623.1|1497852_1499505_-|IS1182-family-transposase	gnl|CDD|372705	pfam13751, DDE_Tnp_1_6, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis.	2.84058e-26
NZ_CP015114.1|WP_052766759.1|1486429_1487131_-|putative-DNA-binding-domain-containing-protein	gnl|CDD|225420	COG2865, COG2865, Predicted transcriptional regulator containing an HTH domain and an uncharacterized domain shared with the mammalian protein Schlafen [Transcription].	1.34964e-16
NZ_CP015114.1|WP_047132253.1|1481635_1482598_-|YydG-family-peptide-radical-SAM-peptide-maturase	gnl|CDD|188593	TIGR04078, radical_SAM_domain_protein_protein, peptide modification radical SAM enzyme, YydG family. Members of this radical SAM protein family for peptide modification occur only in the context of members of family TIGR04077, which average about 50 amino acids in length. In Bacillus subtilis, this protein (YydG) appears to act on its cognate target peptide (YydF) prior to its export, and result in the creation of a signaling molecule that induces the LiaRS two-component system. [Regulatory functions, Protein interactions].	1.3343e-142
NZ_CP015114.1|WP_047132256.1|1484276_1484681_+|NUDIX-domain-containing-protein	gnl|CDD|240032	cd04676, Nudix_Hydrolase_17, Members of the Nudix hydrolase superfamily catalyze the hydrolysis of NUcleoside DIphosphates linked to other moieties, X. Enzymes belonging to this superfamily require a divalent cation, such as Mg2+ or Mn2+, for their activity and contain a highly conserved 23-residue nudix motif (GX5EX7REUXEEXGU, where U = I, L or V), which functions as a metal binding and catalytic site. Substrates of nudix hydrolases include intact and oxidatively damaged nucleoside triphosphates, dinucleoside polyphosphates, nucleotide-sugars and dinucleotide enzymes. These substrates are metabolites or cell signaling molecules that require regulation during different stages of the cell cycle or during periods of stress. In general, the role of the nudix hydrolase is to sanitize the nucleotide pools and to maintain cell viability, thereby serving as surveillance & "house-cleaning" enzymes. Substrate specificity is used to define families within the superfamily. Differences in substrate specificity are determined by the N-terminal extension or by residues in variable loop regions. Mechanistically, substrate hydrolysis occurs by a nucleophilic substitution reaction, with variation in the numbers and roles of divalent cations required.	2.66716e-22
NZ_CP015114.1|WP_126498527.1|1474959_1475967_-|beta-channel-forming-cytolysin	gnl|CDD|273388	TIGR01002, synergohymenotropic_toxin, beta-channel forming cytolysin. This family of cytolytic pore-forming proteins includes alpha toxin and leukocidin F and S subunits from Staphylococcus aureus, hemolysin II of Bacillus cereus, and related toxins. [Cellular processes, Toxin production and resistance].	2.27509e-85
NZ_CP015114.1|WP_169746296.1|1499981_1501307_+|L-cystine-transporter	gnl|CDD|224736	COG1823, COG1823, Predicted Na+/dicarboxylate symporter [General function prediction only].	0
NZ_CP015114.1|WP_047132262.1|1494261_1494840_-|xanthine-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|181705	PRK09219, PRK09219, xanthine phosphoribosyltransferase; Validated.	6.77236e-115

Protein sequences

>NZ_CP015114.1|WP_052766759.1|1486429_1487131_-|putative-DNA-binding-domain-containing-protein
MEQEFLNEGTTIEYKKAQDGVPKSFWETYSSFSNTEGGTIYLGVSEEKQGCVVTGVKNANQYIQTIVDTANDKKFTNFNNIYNSNIKVLKEDGLEYIKIYIPEVKSENKPLHVKNNINNSYIRRNDSDHKMSGEEIRRFLRDADPKSDSELLSNFNIDDLDLDAVKKYKNLIHERNSDMDILSMDNWEFLKRYGAVGKDRIENEFKLKKGALLFFGKEQAILDVFSKFPFRLS
>NZ_CP015114.1|WP_052766758.1|1485630_1486464_-|hypothetical-protein
MFFPNFHLDYRNRTHYSEDERWIDRVASGEVGNEEVNLFNFYNTVLNRLVNTVLDGFALNPETQVRQGVKTDVEVSLREALANLLIHADYEDNSSIIVEAYKNNYVFINPGELLVTKEEFARGGESNPRNSTIVTLFRKAGYSERAGSGGMKIFRAALKNKFRMPEIHSSEGKTKLKIWKIDLVDSYENLIEQEKTILRYIVKENRKIKMKEIEALEGFTEYIAKTNVNSLIDKGIVKKFGKSRSTTYGLKPNSSEMIANIEHNMRNMQESIINENR
>NZ_CP015114.1|WP_047132256.1|1484276_1484681_+|NUDIX-domain-containing-protein
MPPKHIVSASCVVLNDENNILLIKSPLRGWEIPGGQIENGETIREGVIREVKEESGIDVELTEFCGVFQNTEHSIINNLFKGEYIGGKLTTSDESLEVGFFIYTEVMEKVTWGNFTERIHLCFSEKEKPFLISF
>NZ_CP015114.1|WP_047132255.1|1483519_1484116_-|complement-inhibitor-SCIN-family-protein
MNFKQFLLSGLAVALLGSAGANVFSNQAEAASYGAYEFRDYDVTAKENLKNLLNASSYYKAMAKESGARFYQNKLNQELHFAKKQQNASNDSQVVTAINRLSAVYNEVFQIHLQTEKGSSDVQSKKTELQNLIIKANSLLTESHHSMNQDEAQLKKTVEQAKTVLNQAQPGYELVNAISSVQQGIKNVEQYKAFVNHR
>NZ_CP015114.1|WP_063164644.1|1482656_1482776_-|YydF-family-exported-signaling-peptide
MKNLEFKNLVNDSEKLAKVNDLWYFVKSKSHRWIVGSGH
>NZ_CP015114.1|WP_047132253.1|1481635_1482598_-|YydG-family-peptide-radical-SAM-peptide-maturase
MYNKSVSINLVSKCNAACAHCCFSCSPQASIKMDDSYIKETVLEFSKNPNIEVISFTGGEIFLNYKFLEELLIITKSYNKKVTLISNGFWGSSRKLLKKYFSDFKKYNVIALTISYDEYHAPFVKLESIKNIFKFRMKYPEIDVSLNMAVTKDKMSNTILSELGSSVIGVKITKFPIITVGAAKDKISKNNIHNFYNIEKDRDVLYCPGYEIVYHHDGEIYPCCSPAIFETQISLREEKYQTLERTIEKLNSNILLYIIRREGFNWFLDILKEQKLLNDFGIPLDFPSVCSVCGSLFNDQYKINFFKPYMEKYYYETIKI
>NZ_CP015114.1|WP_047132252.1|1480236_1480872_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein
MKINNYSLKVKGKKLVENCDLNFYPGQINHIVGKNGVGKSQLAKDFMLNNSRNIPKSISDNTTLISSFSNIPNDITKEFLLVLLKAKFPNSSPTFSEINKILKIEEIPSKVLIKNMSDGQKQKLKLLSFLLEDNSLIILDEITNALDKKTVNEIYLFINDFIKNNPSKTIVNITHNLSDLSSIPGKYFIFKDYRIEEYLSKEEVINDYINL
>NZ_CP015114.1|WP_047132250.1|1477130_1479029_-|glycosyltransferase-family-2-protein
MTKDLAIIVPVYNKELFLDDTMKSIDNLDIDKSEIEVIFIDDVSTDQSLEKLKVYENEYDYVKVVELEENTGSPSTPRNVGVEVSDSKYITFLDADDWLDAEGFPKLLQQALDTQNDILFGQSLRHKDHSISKIARFSSYETAYYLVPYEIDKIFRAVGPPGKIIRASVIKENDIQFEHMKYGEDKLFFTEVIAKAQSAGMNDAVAYHVNRYGVNQSLISETDIFEKTSCNLEVLKKLFELDIPETARHNAISRIIEMDYLSRLFMNKRFLKSEDKQLFYDAFAEMETILDRHHLNIKDYLTEDKYEKVYQLLSQSDKEKAVKLIEILVKGERAPRYVSNGLVHFVLPETLQEIAPLTEEFFAVYSGTEEADGQFYEVIQLYKKMAAQISRVQLVKLGDESVTKDVGYQVRGGRLRVPTKELEEADFNFNIQITYDYYRPCTVNMNLPSAIKHHALKRQQFKAEFEDKRFKNETNQPKFVDTTKYYDENPGKVFAAKQFKVYEDVEFQKEAPREIEVGELFTVEDIQYTEKGTPRLTLKDGSVVTANKKFVSVLDEAKGKDYLIEPPRKVQVLKVCKAYNDRNFKDEAGAKFAKDDIENITKIVFSSNGTPRLKTDKGIYMTANRNFVEPIQ
>NZ_CP015114.1|WP_052766757.1|1475959_1476952_-|leukocidin-family-pore-forming-toxin
MKWKEMLVTLIPASVLILGTIMPSEVIARDIKQDEIGKDGQVTKRTQVGSDINGGFTQILNFDFIDDPKYDKDALVLSTKGNIASQLEYGKFRENPLFFSQMRFPGEFGVRIHVKDNPKTEILDYLPKNNIESVDVSETFGYNIGGSISSNESGSITGGVNYSKTINYKQNNYRTLLSSDTSNQSVGWNVIASSLFYNGHTNVRGDLNLFRNDAGDRIEHDPRTFLAGKSTLPSLVRSGFTPDFLTYLSNDKQNTKTQITVRYQRLNDEIDAAFYSSNFAIVPQMGRYYMNISGNAFTATYEIDWKNKKVKMLKQESEQIGKSPLEKAGE
>NZ_CP015114.1|WP_126498527.1|1474959_1475967_-|beta-channel-forming-cytolysin
MNKMRSGILKIITLSTLLALTTGTAASLTDQAKANSNFITEVKNNGTEKVASDSMIYKRTATASDLNKHITQSLQFNFIKDESYDKETVVLKTAGNIASNARILDPYAVYTSTKRWPGEYKVSVNLPETDSTAIIDYAPRNHDETREVSDTVGFNIGGGLNIKKGGDANINAKYNFSETIKYKQDAYRTFLETPTTGKDITWGVVEAYNINVRGYGPYNREKENDKLGLYGNELFLNGRKSSKNAGKNFVDQNQLPALIASSFNPEFLTVFSHDYDDKGKSIIKVKYERVMDDYLITWKTFYWKGFNNKNVAKESITVAYEIDWDNHNVKVIGAV
>NZ_CP015114.1|WP_047132257.1|1487999_1488623_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MENRIAELRKEKNMTLKQLAEELNIRDNTLSQYETGKRNPQSGLLQEIANFFGVSMEYILKATDKRDYPIVDNSSAIELLEKIANEKEFNYSHISKNTALNLSLWIINNMDYIKEQHPNLLYTASFLVKSTISENKILQHYSEMRKKQFKIVDEIDDILLEREFYGASVEQVLEFLHQSERIGYEHTKKLMEYIRQLPTDEYEDEDF
>NZ_CP015114.1|WP_047132259.1|1489933_1491475_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase
MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSYTIDPEIYNLGVPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIIHAKADELFFGLPEEQTVWMSHSDKVIEIPEGFESIADSPSTPYAAIEDKERRIYGVQFHPEVRHTEYGNDILRNFVRRICDCTGEWTMENFIDLEIEKIREQVGDRKVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMDKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMQFELIEPINTLFKDEVRALGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREVIREEGLEREIWQYFTVLPGMRSVGVMGDYRTYDYTIGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDVTSKPPSTIEWE
>NZ_CP015114.1|WP_047132260.1|1491491_1492958_-|IMP-dehydrogenase
MWENKFAKESLTFDDVLLIPAESNVLPKEVDLSVELSDRIKLNIPVVSAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVVHKNMNIEDQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEEKVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKISDVMTKEDLITAPVGTTLDEAEAILQKHKIEKLPLTENGKLKGLITIKDIEKVHEYPFAAKDSLGRLLCAAAIGISKDTDIRAEKLVEAGVDALVIDTAHGHSQGVIDQVKHIKQTYPEVTVIAGNVATGEATKALFEAGADVVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQITAVYDCATEARKQGKAIIADGGIKFSGDIVKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGETEIFQGRQYKTYRGMGSLGAMESGSNDRYFQEDKVPKKYVPEGIEGRIAYKGLLQDNIYQLMGGVRSGMGYTGSHNLKELREEAMFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSR
>NZ_CP015114.1|WP_047132261.1|1492991_1494260_-|purine-permease
MKNFVLSLQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEEIAYLVTVDIFMCGVATFLEANKITGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGLDVLYGSLFISGILVVLIAPVFSFVVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYVAGGQGSKDYGDMKNIILGFATLLIILILQRFTRGFLKSIAILIGLFAGTALAGVFGVVDLNQVGTAHWFELPRPFRFAGFGFDLGATLVFFIVALVSLIESTGVYTALSKITGRTLERKDYRKGYTAEGLAIILGSIFNAFPYTAYSQNVGLVSLSGVKKNNVIYGMVILLLICGCIPKLGALANVIPLSVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGGIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPEAFKAMGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGLKYQQNEENVK
>NZ_CP015114.1|WP_047132262.1|1494261_1494840_-|xanthine-phosphoribosyltransferase
MEALRQKVKEDGVVIGEKILKVDGFLNHQIDAQLMYDIGETFYEQFKDQKVTKILTVEASGIAPAIMVAYKFGVPCLFAKKAKPNTLNKGFYQTDIHSFTKNKTNSVIISEEFLGEHDRVLIIDDFLANGDASLGLNRLVHQAGAETVGVGIVVEKSFQQGRTRLEEAGLKVSSLCEVASLSGNKVTLVGEE
>NZ_CP015114.1|WP_047132263.1|1495571_1495952_+|general-stress-protein
MADILILTSQDEIFDALKRKLDEGYTKDELSVISKNKLHIDSVESTDMKVQSTSGTFSDRVARLLTGEDGEEAVLAHYDLTDTEKKVCKREILNGNIIILAGKHPHSRKEFKNEYDEKKPEKEYEI
>NZ_CP015114.1|WP_047132264.1|1496059_1496725_+|hypothetical-protein
MEFKLIKQTSDPLYEAALNLYDNYQFGNVRQQHHVFKQSLENKRTKNDYVFIVGLDNDEVVSLATAHYEATTNSAFIIYLVAIDTPEREQYLTDTLAQVQNELDHLAERVHNREVNFFMMEALPLPESTEEKDADLLFKRHRFLNDHGFEEQTEIDYKRPGLDKEMPPIALNLFLHTRIPLTKDIYATSVKSCYILKYVFANHLSRKRVYPLLEEMDLRKS
>NZ_CP015114.1|WP_047132265.1|1496842_1497817_+|hypothetical-protein
MLTKEFAQRVDLSEKQVRKIVQHLEERGYHLNKTEYRGREATDFQEEDIELFKEIADKVKKTNSYELAFEELEKENDFLQIVVKEDNEKLPSDQNFAKILNDLHNDISKMREERQMLGQMISQVHQQQKDLQTLQQQMTDKLDQHAETLKAIETAQQEHAKAVADNTKAVESNTAKVLAQPKETKKEEQKTPSAESAKNEPAKTTSSNDKQNSTADFKGAAVSAQPEKKEENKSASAVQSEAKPEASATTASNKEDSASTENKTASDKSDQKEQKSVSAAEMQETPETTTPEPEIPVDAPRNEHQPTAQHKQEKKGFFARLFGM
>NZ_CP015114.1|WP_063164623.1|1497852_1499505_-|IS1182-family-transposase
MYKNYNMSQISLPLTTEFTFSESDTASIVNEIVEKIPETAFDSYKNHRGAPSHNPRMMLKIILYAYSNSIFSGRKIEFALKDSIRFMWLAQEQQPSYRTINRFRSDSRTNKLIKDCFVVFRTFLVENQYIDEEAIYIDGTKIEADANKYTFVWRANTERYSNANLEKSEAAYEELLQKEIIPNIKEESSKEIQSHELEAIEDCLNKKVEELTDDIESSNDTEQRKILRSERTELKKHKKVITECKEKKEKYEEQKKILGTRNSYSKTDNDATFMRMKDDHMRNGQLKPAYNIQVGTNNQFALAVGVYQNPTDTRTLENFLNRIQEVNSDIPEYIVCDAGYGSESNYGIVIDIFNRTPVMPYGMFLKEQKRKYKNNPFNSLNWNYDEKDDKYICPNNKILFFSGYRYSTDKYGYQRQFKEYKCYDCIDCPLRQECMNPKAKPDTLKTIRRNMVWEFYKQFTREKLSDPKTSSIYSKRKIDVETFFGNLKANLGFTRMSVRGIEKVETEVSIACMATNLKKLTALRADFFFKLYKKRTISFSIVKIVLFSGF
>NZ_CP015114.1|WP_169746296.1|1499981_1501307_+|L-cystine-transporter
MAKKHVAFSKRVFAALGIGIVLGTILHLAYGSDSKIITTTTDWFSIVGDGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQLGEKFAKIGFFIFVFLIGTVAVAAIIGIISALVFGLDASSIDLGSAEHARGTEISQKAKEMTASTLPQQILELLPSNPFLDFTGQRTTSTIAVVIFATFIGFAYLRVARKQPDNGHIIKRAIEAVYAVIMSVVTFVLRLTPYGILAIMASTIATSDFGAIWTLGKFVLASYAALITMFIIHLIIVGLLGLNPWRYLRKTAEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQKSRLGVPEGIANLSASFGLSIGQNGCAGIYPAMLAVMVAPVAHVQVDFQFIITLIAVVVICSFGVAGVGGGATFAAILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGAGTAKLTKNLDKEKFNSNQYGDLSTDY

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP015114_1	1.1|1484759|29|NZ_CP015114|CRISPRCasFinder	1484759-1484787	29	NC_007021	Staphylococcus phage Twort, complete genome	81319-81347	7	0.759
NZ_CP015114_1	1.1|1484759|29|NZ_CP015114|CRISPRCasFinder	1484759-1484787	29	MT151386	Staphylococcus virus Twort, complete genome	123848-123876	7	0.759

1. spacer 1.1|1484759|29|NZ_CP015114|CRISPRCasFinder matches to NC_007021 (Staphylococcus phage Twort, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

taattattcatcaaactatatccttaatt	CRISPR spacer
aacccactcatcgaactatatccttaata	Protospacer
 * ..*.*****.*************** 

2. spacer 1.1|1484759|29|NZ_CP015114|CRISPRCasFinder matches to MT151386 (Staphylococcus virus Twort, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

taattattcatcaaactatatccttaatt	CRISPR spacer
aacccactcatcgaactatatccttaata	Protospacer
 * ..*.*****.*************** 

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	81816 : 113323	32	Staphylococcus_phage(96.15%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_2	226435 : 235576	7	uncultured_Mediterranean_phage(50.0%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_3	351424 : 360001	11	Staphylococcus_phage(28.57%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	685238 : 754580	94	uncultured_Caudovirales_phage(43.64%)	protease,holin,tRNA,plate,integrase,capsid,terminase,portal,tail	attL 702981:702996|attR 754896:754911
DBSCAN-SWA_5	834183 : 920632	101	Staphylococcus_virus(45.28%)	protease,holin,transposase,plate,capsid,terminase,head,portal,tail	NA
DBSCAN-SWA_6	1139155 : 1148012	7	uncultured_Caudovirales_phage(66.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_7	2159541 : 2220082	52	Bacillus_phage(30.0%)	protease,holin,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP015114|81816:113323|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP015114|81816:113323|96205_97051_+|WP_047131942.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_047131955.1|83208_84216_+	o-succinylbenzoate synthase	A0A2H4PQM0	Staphylococcus_phage	1.3e-93	51.9
WP_047131954.1|84212_84470_-	membrane protein insertion efficiency factor YidD	A0A2H4PQM5	Staphylococcus_phage	7.3e-30	70.6
WP_075140937.1|84559_85033_+	nucleoside triphosphatase YtkD	A0A2H4PQM4	Staphylococcus_phage	5.3e-34	46.4
WP_047131953.1|85016_85793_+	S9 family peptidase	A0A2H4PQM6	Staphylococcus_phage	3.3e-94	65.3
WP_047131952.1|85843_87436_-	phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)	A0A2H4PQN1	Staphylococcus_phage	2.7e-255	79.0
WP_047131951.1|87823_89020_+	methionine adenosyltransferase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	1.2e-188	82.1
WP_047131950.1|89117_90017_+	NERD domain-containing protein	A0A2H4PQQ8	Staphylococcus_phage	4.0e-99	74.8
WP_047131949.1|90145_90988_+	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	2.5e-111	68.6
WP_047131948.1|91966_92323_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131947.1|92315_92687_-	fluoride efflux transporter CrcB	A0A2H4PQR0	Staphylococcus_phage	7.3e-39	67.8
WP_047131946.1|92756_93062_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131945.1|93246_93963_+	transaldolase	M1PR54	Cyanophage	2.9e-20	35.1
WP_047131944.1|94090_94543_+	hypothetical protein	A0A2H4PQT8	Staphylococcus_phage	6.2e-16	42.9
WP_052766745.1|94526_94970_-	competence protein ComK	NA	NA	NA	NA
WP_052766744.1|94962_95463_-	sigma-70 family RNA polymerase sigma factor	A0A2H4PQT5	Staphylococcus_phage	1.4e-24	48.0
WP_015900622.1|95665_95887_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131942.1|96205_97051_+	N-acetylglucosaminidase	A0A1W6JQU5	Staphylococcus_phage	1.8e-40	43.3
WP_047131941.1|97178_98660_+	FAD/NAD(P)-binding protein	A0A2H4PQX2	Staphylococcus_phage	6.5e-14	64.5
WP_047131940.1|99065_100115_+	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A2H4PQS8	Staphylococcus_phage	2.0e-118	58.3
WP_047131939.1|100121_100754_+	riboflavin synthase	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	1.3e-72	63.3
WP_047131938.1|100769_101951_+	bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	8.2e-169	71.8
WP_047131937.1|101982_102441_+	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	4.3e-57	78.3
WP_047131936.1|102505_103504_-	proline dehydrogenase family protein	A0A2H4PQT6	Staphylococcus_phage	1.3e-114	64.2
WP_047131935.1|103759_104590_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_047131934.1|104782_105739_+	L-lactate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_047131933.1|105803_106361_-	class I SAM-dependent methyltransferase	A0A2H4PQV0	Staphylococcus_phage	3.6e-58	59.5
WP_047131932.1|106365_107322_-	TIGR01212 family radical SAM protein	A0A2H4PQV5	Staphylococcus_phage	4.3e-67	85.9
WP_047131931.1|107590_108769_+	MFS transporter	A0A2H4PQR6	Staphylococcus_phage	8.2e-169	76.0
WP_047131930.1|109257_111672_+|tRNA	leucine--tRNA ligase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	85.8
WP_047131929.1|111692_112010_+	rhodanese-like domain-containing protein	A0A2H4PQR9	Staphylococcus_phage	1.3e-33	69.5
WP_047131964.1|112066_113323_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	A0A2H4PQX1	Staphylococcus_phage	1.9e-38	73.5

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP015114|226435:235576|DBSCAN-SWA
AATGGATGATAGAATGGTAGACCAATCACTGCATGAAGATGAATCATCATTTGAATTATCATTAAGACCTCATTTCTTAAAACAATATATTGGTCAAGCTTCTATTAAATCGAATTTGGAAGTATTTATCAAAGCAGCTAAGTTGAGAGAAGAGCCGCTCGATCATGTTTTATTATTTGGTCCCCCAGGTTTAGGTAAAACAACGCTATCAAATATTATTGCTAATGAAATGGAAGTCAACATTCGTACTGTAACAGGACCAGCAATTGAACGTCCTGGAGATTTAGCTGCTATATTATCTGGTTTACAACCTGGTGATGTATTGTTTATAGATGAAATACATCGACTTAGCAGTGTAGTTGAAGAAGTATTATATCCAGCAATGGAAGATTTTTATTTAGATATTGTAATTGGAAAAGGTGAAGAAGCTAGAAGTATTCGAATTGATTTACCTCCTTTCACATTAGTTGGAGCAACAACAAGAGCAGGAAGCTTAACAGGACCGCTTCGTGATCGCTTCGGTGTACATTTGCGCTTAGAATATTATAAAGAATCTGAGTTGAAAGATATCATTATTCGTACAGCAGAAGTTCTAAACACAAAAATAGACGAAGAAAGTGCGATTGAATTAGCTAAAAGAAGTCGCGGCACACCAAGGATAGCCAATCGTCTCCTAAAACGAGTCAGAGACTTCCAACAAGTCAATGAAGATGACATGATTTACATCGAAACAACTAAACGTGCATTGCAATTATTACAAGTCGATGATTATGGATTAGATTATATTGACCATAAAATGATGAATTGTATTATCAATCAATACAATGGTGGTCCAGTTGGCTTAGATACAATTGCTGTTTCAATCGGAGAAGAAAGAATTACGATTGAAGATGTCTATGAGCCATTTTTGATACAAAAAGGTTTCCTAGAACGTACGCCAAGAGGACGAAAAGCAACACCATTAGCATATGAGCATTTTGAAGCGAAGAATAGAAAGAGGGACAATTTTGAATATTGAAGAATTTGATTATGATTTGCCAGAAGAGTTGATAGCACAGACACCTTTAAAAGACAGAGATACAAGTCGATTATTAGTGCTGCATAAAGAAAATGGTGAATTAGAACATCGTCATTTTAAAGATATTATTGATTATATTAATCCAGGAGATACATTAGTATTAAATGATACAAAAGTAATGCCAGCCAGATTGTTCGGTGTTAAACAAGAAACTAAAGCCAAAGTTGAAATGTTGATGCTGACACAAATTGAAGGCGATGATTGGGAAGTATTGCTTAAACCTGCCAAAAGGATTAAAGTCGGTCAAAAGTTATCATTTGGCGAAGGAAAAATAGAAGCAGAATGTATTGAGGAACTAGAACAAGGCGGCAGAATTATGCGTCTTTCATATGATGGAATTTTACAAGAACGTTTAGACGAACTTGGTGAAATGCCTTTACCTCCATATATCAAAGAACGCTTAGAAGACCAAGACAGATATCAAACAGTCTATGCTAAAGCGACAGGTTCAGCCGCTGCACCGACGGCTGGTCTTCACTTTACAGATGAATTATTAGATGAACTGAAAGCTAAAGGTGTGAATCTTGCTTTCATCACTTTACATGTAGGTTTAGGTACATTCAGACCTGTAAGTGTAGATAATATAGACGACCATGAAATGCATAGCGAATATTACCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAACCAAACCAAGCAAAACGACAAGCGCATTATTTCTGTCGGAACAACATCTACACGAACTTTAGAAACGATTCGCCGAGATTATGATAGATTTACTGCTGCAAGCGGATGGACTGATATTTTTATTTATCCTGGATTTGAATTCAAAGCAATTGATGGATTGATTACAAACTTCCATTTGCCGAAATCAACTTTAGTGATGTTGGTCTCTGCTTTCAGTTCAAGACAGTATATCTTACATGCATACCGTACAGCCGTAGAAATGAAATATCGTTTCTTCAGCTTCGGTGATGCGATGCTAATTATTTAAGGGAGTTGAAAACAGGTGAAGCCTGCAGTAACATATGAACACATAAAAACGTGTAAACAATCTGGAGCAAGACTCGGTATTGTACACACACCTCATGGTTCTTTTGAAACACCAATGTTTATGCCAGTAGGAACCAAAGCCACAGTAAAAACAATGAGTCCGGAAGAATTGCATGACATCAATGCAAAAATCATTTTAGGTAATACATACCATCTATGGTTACAACCTGGAAATGAATTAATTAAACGCGCGGGCGGACTGCATCAATTTATGAATTGGGATGGACCAATTTTAACAGATTCTGGCGGTTTCCAAGTATTCAGCTTGAGTAACTTGAGAAAAATCACAGAAGAAGGCGTATATTTCAGACACCATAAAAATGGTTCTAAGCTATTTTTAAGCCCTGAAAAATCAATGGAAATCCAAAATGATCTAGGTTCAGATATTATGATGGCTTTTGATGAATGTCCGCCGATGCCAGCTGAATACAAATATGTCAAAGATTCTATAGAAAGAACGACAAGATGGGCGGAACGTTGTCTAAAAGCACATGCACGTCCTGAAGACCAAGCACTATTCGGTATTATTCAAGGCGGTGAATATAAAGATTTACGCCAACAAAGTGCTGAAGAACTGGTCAAATTAGATTTTCCTGGGTACGCAATTGGTGGGTTGTCAGTGGGCGAACCTAAACCTGTCATGTATGATATGGTGGAACACACTGAACAATTTATGCCTAAAGATAAACCGCGTTATTTAATGGGTGTCGGATCACCCGATGCATTAATTGAATGCAGTATTCGAGGTATGGACATGTTTGATTGTGTATTACCGACACGAATTGCGCGTAATGGTACTTGTATGACATCAGAAGGTCGTGTGGTCATTAAAAATGCAAAGTATGCCGATGATTTAGGACCGCTTGATCCTAATTGCGATTGTTATACATGTCGTAATTATTCACGCGCATATTTAAGACATTTAATTAAAGCCGAAGAAACTTTCGGTATACGTCTTACTACTTACCATAATCTTTATTTTCTGTTAAAATTAATGGAGGATATCAGACAGGCCATTAGGGAAGATCGTCTTTTAGATTTTAAAGAGGAATTCTTTGAGCAATATGGATTGAATGTAGAAAATCCTAAAAACTTTTAAAGGAGTAATGTTTGTGAATTTAACTGGTCTTATTTTACCTATTGCATTATTAGCTCTTATGTGGTTCTTTATGATTCGACCACAACAAAAACGTCAAAAGGAACACCGCGAAATGATTAACCGTTTAGAAGCGGGTCAACACGTAACTACAATTGGTGGTATTAAAGGTGTTGTACGTTCTTTAGATGAAACTACAGTCGTGATTTCTGTAAACGATAAAGGCACTCAATTAACTTTTGAAAAGCCTGCAATCAAACAAGTAAATCCAGACTAAATATTAAAACAATATTGAATGCATATAGGTTACAAGGTTAAGGGCTTTCCTATATACATAATATTGATTATATAAACACCTCCTATTTATCTTCGGGATATAATAGGAGGTGTTTTTAATTGTAAGGAATATTACTTTTGCGTTGCGTTTTTAATACAATGTTTTAAAAAGAAAAAATAGCGTGTATAATGAAGCATTGGTACACGACTTAACTCTAAATTTAATATTATAAACAACACTTAAAGTAATACGTTTTTAAATCTATTGCGTTTGCGTCGATTAAATTTATAAAATCGGGTGTTTTGAAAGTTAAGTAAAGTTATAGTACGCTTGTAAAGTTCATTCAATTACTGCAATTGAACGAGAAACGTGTTATTTGTTCTGTTTTGACTTGCAGTAGGTTTGAATAATCGAGTATGCTATTTACATAAGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAACAGTAGAATAATTACATTCTTACTGTTGGTTGTTCTGCTTTTTGCAGGTATGGCAGCAACCTATAAGAGTGTAGTTAAAGACGTCCGTTTAGGATTGGACCTTCAAGGTGGATTTGAAGTTTTATATCAAGTTAATCCACTCGAAAAAGGTGAGAAAATTGACGATAAGGCTGTTCAAGCGACAGCTAAAACTTTAGAAAATAGGGTCAATGTACTCGGAGTTTCCGAACCTAAAATTCAAGTTGAAAATAATAATCGGATTCGTGTTCAATTAGCCGGTGTTAAAAATCAAAATGAAGCACGAGACATCTTATCTTCTCAAGCCAATTTGACAATTCGTGATTCTGATGATCATGTTAAATTGACAGGTAAAGATTTAGTCCAAGGTTCTGCAAAACAAGAATTCAAACAAAATACAAACCAACCTGCCGTTACTTTTAAACTGAAAGATAGTAAGAAATTCAAAAAGGTAACAGAAGAGATTTCTAAACGTAAAGATAACGTGATGGTCGTTTGGTTAGATTATGAAAAAGGCGACAGTTATCAAAAAGAAAAAGATAAAAAAGATCCTAAATATGTATCAGCTGCATCAGTAGACCAACCAATCAATTCAGACAGTGTTGAAATTTCTGGTGGATTCAATGGTGAAAAAGGTGTTCAAAAAGCAAAACAAATTGCTGACTTATTGAACTCTGGTTCATTGCCAGTTCACTTGAAAGAATTATATTCTAACTCAGTTGGTGCACAGTTCGGTCAAGATGCATTAGATAAAACAATTTTCGGTTCATTATTAGGTGTCGGCATTATCTATCTATTCATGGTCGGCTTCTATAGATTGCCAGGTATTATTGCTGTTATTACATTAACAACATATATTTACATCACGCTTGTAGCATTTAACTTTATACATGGTGTGTTAACATTGCCAGGATTAGCCGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCAGTAGATGCTAACATTATTATGTATGAACGTATAAAAGATGAATTGAGGATTGGAAGAACCCTCAAACAAGCTTTCCATAAAGCGAATAAAAGCTCCTTTATTACAATACTTGATGCCAACTTAACAACTGTATTAGCAGCAGCTGTATTGTTCTTCTTTGGTGAAAGTGCTGTAAAAGGTTTTGCTACAATGCTATTGCTTGCAATATTAATGAGTTTCGTTACAGCAGTATTCTTAACACGTATCTTATTATCATTGCTAGTACAATCAAATTACTTTAAGAAAAGTTTCTGGTTATTTGGTGTTAATAAGAAAGACAGACATGACCTCAGTGAAGGAATCGATGTGTATGAATTGAAAACACCATATGATCATTGGAACTTTATGAAATTGGCCAAACCATTGTTTTGGTTCAGCGGTATTGTTATTTTAGCTGGCGTAATTATTCTCTTCATTTTCAAATTGAATTTAGGAATTGACTTTACGAGCGGTACTCGTGTTGATATGAAAGCAGATCATAAGATAACACAACAAAGTGTAACGAGTACGTTGGAAAAAGCAGGTATGAAACCTGACCAAGTTTCTCTATCTGGAAATAACGATAGTGCTTCTGTTCAATTCAAGCATGATTTAAGTAAAAATGAAGTTGCTAAAGTTAAAACAACGATAAATAAAAAATTCGGCAATGATCCGACTGTAAATACAGTATCACCTGTTATCGGTCAAGAAATTGCTAAGAACGCATTATTATCATTAATATACGCTTCAATCGGTATGATTATTTACATTTCATTACGATTTGAATGGCGCATGGGACTTTCATCAATATTGGCATTACTACATGACGCCTTTATGATTGTTGCAGTGTTCAGCTTATTCAGATTAGAAGTTGATGTAACATTTATCGCAGCCGTACTGACAATTATCGGTTATTCAATCAACGATACAATTGTGACGTTCGACAGGGTTCGCGAGAACTTGCGTAAAATCAAAGTAATCACAAAGCCTGAACAAATTGATCGTATTGTAAACCATTCAATCAGACAAACAATGACAAGATCTATAAATACAGTATTAACAGTTGTAATTGTAGTAGTTGCACTATTGATATTCGGTGCTTCTAGTATCTTCAACTTCTCATTAGCGTTGCTTATCGGATTGATTTCTGGTGTATTCTCATCTATCTTTATCGCAGTTCCGTTATGGGGTATGATGAAAAAACGTCAACTTAAGAAATCACCAGACCATAAATTAGTGGTTTATCGTGAAAAACGCAGTAACGATGAAAAAATACTTGTATAATTTATATTTGTTATTGAGCTCCCGGAATTCTTTCCGGGAGTTTTTCTATTTAAAAAATGTTAAGATAGAGAAGTTGCTTTTTATTTAGAGCGTTCTTTTGTATAATGACATGTGGAAATGAGGGAAGCCGATTTATGATTAAAGCTAAATTTAAATGGGACCTACAACAAAATACTAATAAAATCTCAGATGAAATCGCATCAGAAATGAAATTAACACCTATTGTCCGTAAAATTATGGAAAGTAAAAATATTACGGATAAACAAGAGATTGCAGCCTTATTAAAAAAATCCTCGATTAAGCACGATCCTTATACAATGAGTGATATGAAAAAAGCAATTGATCGTATCAATAAAGCAATTGATAATCATGAACGTATTTTAATTTACGGAGATTATGATGCGGATGGTGTGACTTCAACTACAATCTTAGTTTCTGTTTTACAGGAATTAGGGGCTGAAGTTGGTTGGTACATACCCAATCGCTTTACAGAAGGTTACGGCCCGAATGAAGCAGCATTTAAAAACGCCTACGATGAAGGTATTAACCTTATCATAACAGTGGATAACGGTATACAAGGTCATTCTGAAATTAAAACAGCTCAAGAATTAGGTATGGATGTTATACTTACAGACCACCATGAAATTGGAGAAACATTACCTGAAGCTTTTGCAATTGTTCACCCTATGCATCCAGAGTTTAATTATCCTTTCAAATATTTAAGCGGTGCAGGTGTTGCATTGAAATTAGCACAAGCTTTATTAGATCATCCTTCGCCATATTATTCAGCGTTAGCTGCTATTGGTACGATTGCTGACTTGGTCTCATTAACTGATGAAAACCGTGCAATTGTACAAGATGGACTAGATATACTGAATCAAACGCAATATCCATCGATTCAAGCATTGTTAAATAATGCAGGTTATAAAGATACAATTACTGAAGAAACAATCGGCTTTGTGATTGGACCAAGACTAAATGCGGTCGGCAGATTAGATGATGCAAGTTTAGCAGCTGAATTACTGATGTCTGATAATGATGAAGAAGCGGAGTTTCTTGCTGAGCAAGTTGAACATTTCAATCAAGAAAGAAAAGATATTGTTAAAGAAATATCGGATGAAGCTGTATTAATGGCGGCCGAACAAGTAGAGAAAGGTAATCAATTTCTTGTCTTAGCACAAGAGAATTGGCACGAAGGTGTGTTAGGAATTGCAGCTTCGAAGGTCGTTGAAACATATGGTTTGCCAACGATTATTTTAAATATTGATACGGCACAAAATTTTGCAAAAGGTTCAGCTAGAAGTATTGAACAAGTATCAATGTATGACATTTTGGATAAAGAACGTGCATTAATAACTAAATTCGGCGGTCATCATATGGCTGCAGGAATGACGCTGCCTATCGAAAATATAGAAAAGTTGAGCGTTGCACTGAATGAGCACATGAAAGAAATTTCAAAAGAAAAGGACCTTTCTCCACGAAAAACTGTGGACTTACTTTTGGAAGAAAACGAAATTACAGTAAAAAATATTAGAGATATTCAAAAACTGAGACCTTTTGGGACAGATTTCACAAGTCCGCTTTTTCAATTGAATAATGCTAAAATTGTTCAAGCAAAGGGAATAGGACAAGAAGGCAAGCACCTTAAAATGACAATTGGCGACTCAAAAATTCAAAGCCTTTATTGGCAGCATGGTGAATATGCAAATCAAATTGAACCCAATCAGCCCATTAACATGATTGGTACGTTACAAATCAATGAATGGAATGGTAATCAATCTCCCCAATTTATGGTTCAAGATATGGCATCAGAGGCACTTCAAATTTTAGATTTCAGAGGCAAAGCCAGACAACATATTATTTCAAATGACGATTTGCTTACAGCTGAAATTGTTAACAAAAAATCAAATAAAGACCATGAACATCAATATTTTTATGGGGATATGATTCCTAACCAATATGAGCGTTATGTTTTTAAAGAATTGCCACTTACAATTGAGTCTATGCAATCGACTTTAACTTCAATTGTAGAAAGCCAAATTATTTTAGAGTTGAATCATCAAAATTCAATTTATTTTGATGGATTACCGAACCTAGATAAATTCAAAGCTTGCTATAAAGCATTGCTTGCAAAAAATGAAGTGGATTTAAAACAGGATGGTATGCAATTAAGTGAGTACCTGAATGTGAAACCGCAAGTTCTAATCTTTATGCTTAAAGTTTTTAATGAATTAAATTTCATTAAAGATAATAATGGTATAATAACTGTGAACAAAGATGTAGAAAAGAAAGAAATTACTTCTAGTCGTCTCTATCAAGCAAGAATGAAACGTATTGATGTAGAAAAATTTTTACTTTACGATGATTTCTCAAAAGTTAAACTTTGGATTAAAGACCAGCTAGCAAAGTAATTAGGAGGAAATAGATAATATGGATTTAAAACAATATGTGTCAGAAGTACAAGATTGGCCAAAAGAAGGTGTCGATTTCAAAGACATTACTACAATCATGGATAATGGAGAAGCATATGGTTATGCAACAGATCAAATTGTAGAATTTGCGCGTGAAAAACAAGTGGATATTGTTGTCGGACCTGAAGCACGCGGCTTTATCATTGGTTGTCCGGTTGCATATTCAATGGGTATTGGATTTGCTCCTGTAAGAAAAGAAGGAAAATTACCACGTGAAGTTATTCGTTATGAATATGATTTAGAGTATGGCACTAATGTACTTACGATGCATAAGGATGCCATTAAACCAGGTCAACGTGTATTAATTACTGATGATTTGCTAGCAACAGGCGGAACAATTGAAGCTACAATTAAACTTGTAGAAGAATTAGGTGGTATTGTTGTAGGTATTGCCTTTATTATAGAATTAAAATACTTGCATGGTATCGATAAGCTTGATGGTTACGAAGTTTTAAGTTTAATTTCTTATGATGAATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP015114|226435:235576|227441_228467_+|WP_047131840.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MNIEEFDYDLPEELIAQTPLKDRDTSRLLVLHKENGELEHRHFKDIIDYINPGDTLVLNDTKVMPARLFGVKQETKAKVEMLMLTQIEGDDWEVLLKPAKRIKVGQKLSFGEGKIEAECIEELEQGGRIMRLSYDGILQERLDELGEMPLPPYIKERLEDQDRYQTVYAKATGSAAAPTAGLHFTDELLDELKAKGVNLAFITLHVGLGTFRPVSVDNIDDHEMHSEYYQMTQETADLLNQTKQNDKRIISVGTTSTRTLETIRRDYDRFTAASGWTDIFIYPGFEFKAIDGLITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRQYILHAYRTAVEMKYRFFSFGDAMLII
>NZ_CP015114|226435:235576|228482_229625_+|WP_015900497.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MKPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELHDINAKIILGNTYHLWLQPGNELIKRAGGLHQFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVYFRHHKNGSKLFLSPEKSMEIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYKYVKDSIERTTRWAERCLKAHARPEDQALFGIIQGGEYKDLRQQSAEELVKLDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYDMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSEGRVVIKNAKYADDLGPLDPNCDCYTCRNYSRAYLRHLIKAEETFGIRLTTYHNLYFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF
>NZ_CP015114|226435:235576|229638_229899_+|WP_082107853.1|DBSCAN-SWA
MNLTGLILPIALLALMWFFMIRPQQKRQKEHREMINRLEAGQHVTTIGGIKGVVRSLDETTVVISVNDKGTQLTFEKPAIKQVNPD
>NZ_CP015114|226435:235576|235057_235576_+|WP_047131836.1|DBSCAN-SWA
MDLKQYVSEVQDWPKEGVDFKDITTIMDNGEAYGYATDQIVEFAREKQVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEATIKLVEELGGIVVGIAFIIELKYLHGIDKLDGYEVLSLISYDE
>NZ_CP015114|226435:235576|226435_227452_+|WP_047131841.1|DBSCAN-SWA
MDDRMVDQSLHEDESSFELSLRPHFLKQYIGQASIKSNLEVFIKAAKLREEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVTGPAIERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFYLDIVIGKGEEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYKESELKDIIIRTAEVLNTKIDEESAIELAKRSRGTPRIANRLLKRVRDFQQVNEDDMIYIETTKRALQLLQVDDYGLDYIDHKMMNCIINQYNGGPVGLDTIAVSIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFEAKNRKRDNFEY
>NZ_CP015114|226435:235576|230350_232627_+|WP_047131838.1|DBSCAN-SWA
MKKNSRIITFLLLVVLLFAGMAATYKSVVKDVRLGLDLQGGFEVLYQVNPLEKGEKIDDKAVQATAKTLENRVNVLGVSEPKIQVENNNRIRVQLAGVKNQNEARDILSSQANLTIRDSDDHVKLTGKDLVQGSAKQEFKQNTNQPAVTFKLKDSKKFKKVTEEISKRKDNVMVVWLDYEKGDSYQKEKDKKDPKYVSAASVDQPINSDSVEISGGFNGEKGVQKAKQIADLLNSGSLPVHLKELYSNSVGAQFGQDALDKTIFGSLLGVGIIYLFMVGFYRLPGIIAVITLTTYIYITLVAFNFIHGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAFHKANKSSFITILDANLTTVLAAAVLFFFGESAVKGFATMLLLAILMSFVTAVFLTRILLSLLVQSNYFKKSFWLFGVNKKDRHDLSEGIDVYELKTPYDHWNFMKLAKPLFWFSGIVILAGVIILFIFKLNLGIDFTSGTRVDMKADHKITQQSVTSTLEKAGMKPDQVSLSGNNDSASVQFKHDLSKNEVAKVKTTINKKFGNDPTVNTVSPVIGQEIAKNALLSLIYASIGMIIYISLRFEWRMGLSSILALLHDAFMIVAVFSLFRLEVDVTFIAAVLTIIGYSINDTIVTFDRVRENLRKIKVITKPEQIDRIVNHSIRQTMTRSINTVLTVVIVVVALLIFGASSIFNFSLALLIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPDHKLVVYREKRSNDEKILV
>NZ_CP015114|226435:235576|232761_235038_+|WP_047131837.1|DBSCAN-SWA
MIKAKFKWDLQQNTNKISDEIASEMKLTPIVRKIMESKNITDKQEIAALLKKSSIKHDPYTMSDMKKAIDRINKAIDNHERILIYGDYDADGVTSTTILVSVLQELGAEVGWYIPNRFTEGYGPNEAAFKNAYDEGINLIITVDNGIQGHSEIKTAQELGMDVILTDHHEIGETLPEAFAIVHPMHPEFNYPFKYLSGAGVALKLAQALLDHPSPYYSALAAIGTIADLVSLTDENRAIVQDGLDILNQTQYPSIQALLNNAGYKDTITEETIGFVIGPRLNAVGRLDDASLAAELLMSDNDEEAEFLAEQVEHFNQERKDIVKEISDEAVLMAAEQVEKGNQFLVLAQENWHEGVLGIAASKVVETYGLPTIILNIDTAQNFAKGSARSIEQVSMYDILDKERALITKFGGHHMAAGMTLPIENIEKLSVALNEHMKEISKEKDLSPRKTVDLLLEENEITVKNIRDIQKLRPFGTDFTSPLFQLNNAKIVQAKGIGQEGKHLKMTIGDSKIQSLYWQHGEYANQIEPNQPINMIGTLQINEWNGNQSPQFMVQDMASEALQILDFRGKARQHIISNDDLLTAEIVNKKSNKDHEHQYFYGDMIPNQYERYVFKELPLTIESMQSTLTSIVESQIILELNHQNSIYFDGLPNLDKFKACYKALLAKNEVDLKQDGMQLSEYLNVKPQVLIFMLKVFNELNFIKDNNGIITVNKDVEKKEITSSRLYQARMKRIDVEKFLLYDDFSKVKLWIKDQLAK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_047131841.1|226435_227452_+	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	8.5e-05	29.1
WP_047131840.1|227441_228467_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_015900497.1|228482_229625_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	3.4e-87	45.5
WP_082107853.1|229638_229899_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	6.3e-05	41.0
WP_047131838.1|230350_232627_+	protein translocase subunit SecDF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	2.0e-30	36.1
WP_047131837.1|232761_235038_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	1.9e-76	31.2
WP_047131836.1|235057_235576_+	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	6.2e-28	45.1

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP015114|351424:360001|DBSCAN-SWA
GATGGAAACAAGTTATGATGTTGTTATCGAAGAATATTTAAAATTTATTCAAATTGAAAAAGGATTAAGCGCTAATACGATTGGTGCTTACAGACGGGACTTGAATAAATACAAAGAATATTTAGTGTTAAAAAAGATTAATAATATAGATTTTATTGATCGTGAGATTATTCAACAATGTTTAGGATATTTACATGACGATGGCCATTCAGCTAAATCAATAGCGCGTTTTATTTCTACAGTCAGAAGTTTCCATCAATTTGCATTAAGAGAGCGTTATGCAGCTAAAGATCCGACTGTATTGATTGAAACACCTAAGTATGAACGTCGGTTGCCTGATGTTCTAGATGTAGAGGATGTTCTTGCTTTGCTTGAAACACCTGATTTATCTAAAAATAATGGTTATAGAGACCGAACAATACTGGAATTATTATATGCGACTGGTATGCGGGTGACTGAATTGATACATGTTCGTGTTGAAGATGTGAATTTAATAATGGGATTTGTGCGTGTTTTCGGTAAGGGGAGTAAGGAAAGAATCATACCTTTAGGCGAAACTGTAATCGATTATTTAAAAAAATATATTGAAACAGTGCGTCCGCAACTGTTAAAACAAACTGTAACAGATGTATTATTTTTAAATCTTCATGGTAAACCTTTATCAAGACAAGGTATTTGGAAGCTTATAAAACAATATGGTGTTAAAGCAAATATTAATAAGAAATTAACACCTCACTCACTTCGCCACTCATTTGCGACGCATTTGCTTGAAAATGGTGCTGATTTGAGAGCTGTACAAGAAATGTTGGGCCATTCGGATATTTCTACAACTCAACTTTACACACATGTTTCAAAATCACAAATCAGAAAAATGTATAATGAATTCCATCCAAGAGCCTGACTGTTTAAAATAATGCACATCCATTCGAAAATTGGGTGTGCATTATTTTAATTTTCGTCTTTTTAATGCCTCATTGCGAGCAAGTTCAACTGCATGACGATCTCTTAATAAATGATGGTCGTAAATATAAGGAGAGTCATTTATTTTCGTCATCAATTGATAATCAGGATATTTGGATTTCAATCTGTTTTTTGTAGATTTTAATAGAGGTAATTCTACAACTTGGAACGTGTTATTTTGAGCTGCTTGTTTTTCTAATTGAGCTAGTAACTCTATATACTTATGTTTCTTTAAACCTAATTGCTCTAAATTGCTCAAATTATGATTTGCCACACGAGAAGCACGTTTAAATAATGTAGCAGCCCCTTTGCAATTGCCTCTTCTAAAGTGATAACAGCCTGTAGCGCATAAAATTAAGCTGACTACTGCATCCTCTTTTGTAAAGTCGGGTTGTTCCTTCCATGCTTCTTCTAAAATGTCATGACATAAAAAATAGTGTTGTTGCGCATGAAATTGATAATAAAATGACAAAAGTGCTTCATTCAATTTATTCACCTCCTGCTTCTCATTTATTTATTTTCAGCATTCATGTATAATATTTTACTGAATGATATACGCAATATGCAATTAAAGAAGGAGTAAGACTGTTACTAATAATACAATCAAACGATTATAAGCATATCCAAATATATTTATAATTGAATTGAGGTGACAATGATGTATAAGACTAAAGACATAATTGGAAAAATAAGCAATGCTGTTTCCAATCCGTCTAATCGTAAATATACAGCATACAATCGGGCTGCGAACCCATCGCAATGGGATGTACTAAAATAAAAGAAAAAGGTTACATTCTAACAAATAATATAAAATCCGCAACCATTGTTAAAGAATATGACAGATATTATGTCTCGGTATTAGTTGATCAACGCCTTTCTCCTGTTTTTAAATCAAAACAGACAGAGGACATCGGTATTGATTTGGGACTGAAAGAAGCTGTATTCACACCCTCCGGTGTGAAAATCAGAAGCTTCAAAACGAATCAAACGATTGTTAAACTTGATAAATCTTTGAAAAGACAACGACGAAAATTATCCAGGAAGAAAAAAGGTTCTCATAATTGGAATAAGCAGTTGTTGAAAGTACAAAGATTATACCGACGTATTAAAAACATTAAAAGAAAAATCAAACGCAAAGGCATGATGAGAAACAAAAGATGGGCCAATAGTTTTCAACAGATCGGACTCGGTTACATTGTTGAATGATTAAAAATCAAATGCCATGATTATGGTATTGAATTACGCTATGTCGACAGATTCTATCCCTCCAGTCAAATATGTTCGGATTGCGGCCACATACAACCCATGTCTTTGAATCAAAGAACGTACCATTATCATCATTTTGGAATGATTTAAGACAGAGATAACAATGCCAGTATTAATTTGAAACAAGCAACAGATTACATCGTGATAGTGTAATAAAAATAAAGAAAGGAAAACTGCTGAAAGGTTATCACACAATTTAAATGTCTCTATAAAGTTTCAAACTACGGTGGGCTACATCGGAAGTAACGCTCTGGGAGAGGTTTATAGACTTGATTTCAAATGGAATCAACCTCGTTGAAAAGAGAAATTCTCTAATGACATTTGAATATGTTTTTAGTAGCAGAAAGAAATGTACGAAGTTAAACTAGATGCTTTCAATGGTCCCTTAGATTTATTACTCCATTTAATACATAAGTATGAAATCGATATTTATGATATCCCAATGAAAGCTTTAACAGAGCAATATATGAACTATATTCATGCAATGAAAAAACTAGAAATTAATATAGCGAGTGAATATCTAGTAGTGGCTTCTGAATTATTGATGATTAAAAGTAAAATGCTTTTACCACAACATGATACTGAAATAGATGATGAGATTGAAGATCCAAGGGAAGACTTAGTAGGTCGTTTAATTGAGTATCAAAATTACAAAGAATATACTGAATTTCTAAATGAACTCAAAGAGCAGCGCGAGCAATTTTACAGCAAGCATCCGACCGATCTAAGTCATTTAGAATCTATAGAAACTTGGGATGATACTCAAACAATTGATTTAACCGAATTAATTATGGCTTATCAAAGAATCAAAACAAGAACATCTTTCAACACGCCTAAAAGTGTTACGATTCAAAAAGAAACTTTTACGATTGAACAAGCATCTAAACAAGTCACTGAAAAACTTGCAGTTTCTAGCTCCATTAACTTTTTTAGTTTGTTTACTTTCAATGAGAATACAGAAGAAGTCGTTACACATTTCTTGGCTATACTAGAAATGTCGAAAACGGGAATTATACAAATTAACCAAGTTAAAGATTTTGCAGATATTAACATTACTAGAGGTGTAAACTATGGTATTGGAGCTTAAAGGAATACTTGAAGGATTATTATACACAGCAGGTGACGAGGGGTTGGAAATTGAACAACTCACGGAAATCTTAGAGATTTCTGAAGAAGCTTTAAGTGAACTTGTTGCAAATTATAATTCTCCAGGTTTAATTATTCAACAATATGGTTCTACATTAGTTTTAACTACAAAATCAGAAGTTGCATCTTATGTAGAAAAATTGGTGAAGAATCAATCAAATATGAAACTTTCACAAGCTGCAATGGAAGTATTATCAATTATCGCTTATAATCAACCAGTAACTAGAAGTGATATTGAAATTATACGTGGCATAAATTCAGATGGTGCAGCTAAAACATTGATTGCGAGAGGATTAGTTGAAGCTAAAGTTGAAGATAATTCTCGCAGTCAGCAACTTTATACAACCCCTTTATTCTTAAATGTTTTTGGTATGACAAATTTGGATGAACTTCCAACAACAGAAGAAGAGGAAGAAGAAATCGAATCATTTTTCAATAATCTGATTAACCAAAAAGGAGATAATAATGAGTAAAGAATTAGAAAGATTACAAAAAAGAATTGCAAATAGCGGTTATACTTCAAGAAGAAAAGCAGAAACTTTAATTGTTGAAGGCAAAGTTAAAGTTAACGGTGAAACTGTTACAGAATTAGGTACGAAAGTTAAAGCATCAGACAATGTAGAAGTTGAAGGCGTTAAACTTGAACAAGAAGACAAATTATACATTTTGTTTTATAAACCAGCGCAAGTCATCACGAGTGTTTCTGATGATAGAGGTCGAACAGTTGTAACTGATTACTTTGATGACTTAGAAACTCGTATTTATCCAGTTGGAAGATTAGATTACGATACGTCAGGGCTTTTATTATTAACAAATGATGGAGAATTTACTAATTTAATGACGCATCCTAGATATAAAATCAAGAAAAAATATGTTGCTAAATTAAAAGGGTATTTGATGAGAGATGAAGTAAAAGCTCTAGAAAAAGGCGTTCAATTAGAAGATGGGAAAACCGGTCCAGCTGAAGTTAAAATTAAAAACCAAAATAAAGAAAAAAACACAACTGTTGTAGAGATTACAATCTCAGAAGGAAGAAATCGACAAGTAAGACGTATGTTCGAACATTTTGGTCACGAGGTATCAAAATTATCTCGGATTGAACTTGCAGATTTCCTTACACTTAAAGGACTAAATGCGGGAGAAGGTCGTGTGCTGACACCGCATGAAGTGAAAAAGCTTAGAAACTTAGCGGAAAACGGCTAATAGATTCATAAAAACAATGTGCTTATTGGGGCATTTAAATATATTATGAAAATAAAGCAGCCGATAAGTTTCAATTATCTTGTTGATATATGCTTATGATATAATATATATTGAAGTGAAAAGTCATTTGTTATAAAGTAGCTAAATAAAATTGGCGCCTAAACAATGATACAGTCAAATCTTAATTATCCAATAAAAATAAAAGATATGAACAAATAAATTCATACTAGATACCCAAATTATGTATCTACTTTATTTGTTGAGTCATATCAATACTTTTGGATACTCACATGGGAGGTAACAATAATTATGACAAAAATACTTGTCGTTGATGATGAAGAAAGAATTCGAAGACTGCTTAAATTATATTTAGAAAGAGAATCTTTTGATATCGAAGAAGCTCAAGACGGCAAAGAAGCATTAGATAAGGCATTAAATACTGATTATGCTTGTATCTTACTAGATTTAATGCTTCCTGAACTAGATGGTATTGAAGTTGCAAACCGTTTGAGAGAATACAAAGACACACCAATTATAATGCTAACAGCAAAAGGCGAAGAAACGAATCGCGTAGAAGGATTCGAATCAGGTGCAGATGATTATATTGTCAAACCTTTCTCACCACGTGAGGTAGTCTTGCGAGTTAAAGCATTACTTAGACGCACTTTAACAGCAACTTCAGAACAAAATGAACCTCACGCAAGAGACTTGATTGAATTTAAACACCTTGTCATTGATAATGATGCACATCGTGTACTTGCAGATGGCACTCAGGTCAATTTAACACCTAAAGAATATGAACTTTTAATATTCTTAGCCAAAACACCTAACAAAGTTTTTGATCGTGAACAATTATTAAAAGATGTTTGGCATTATGAATTCTACGGTGACTTGCGTACTGTAGATACTCATGTTAAACGTCTAAGAGAAAAGCTGAACCGCGTATCTTCTGATGCAGCACATATGATACAAACCGTGTGGGGTGTAGGCTATAAATTTGAGGTCAACAATAATGATGCAACGACTTAATAGTGTTGTCATAAAACTGTGGTTAACTATAATTCTTATAGTAACGACAGTTTTAATTTTACTAAGTGCAGCCTTAATTACTTTTATTCAAAACTATTATACGCAAGATACTGAGCAATCTTTAATAAAAGATGCTAAACGAATTAGCATGTTACTTGAAGAATCAGACAATAAGTCATTAGCTATTAAACATAGTAAAGCTTTAATTGAAGATCCGAGTGGTTTAATCATCATGAAAAATAAGAATGATGAATATTATAATTCTCACTCTAAGTTAAAAAATGAAATGATGAATGTTATTACTAAAAACCCGAAATATCAAAAAGTATTTACTAATAATAAAAAAACATCACAGCACATTAAATTAAAAGTCGATGGGAAAGTCAGAACATACGTATTACTTGGCTATCCGACAAAAATTGATACAAATAACCCCCATGGTGCTGTATTCATTTATCAAGACCTTAAAAGTATAGATGATACAAATAATGTCATTACTATTATTATTTTAGTAACAGCTGTAATTTTCTTAATTATTACCACTGTTTTTGCATTCTTTTTATCATCACGAATTACAAAACCGCTTCGCCAATTACGCACGCAAGCTCTAAATCTTTCTGAAGGTGACTATTCACAAGTCAATGATATCAATTCAAAAGATGAAATAGGAGAACTAGCACATTCCTTCAATATAATGAGTAGTGATATACAAAGACATATTGATGAAATATCAGCTTCTAAAAATATCAGAGACAGCCTAATCAATTCGATGGTAGAAGGCGTGTTAGGTATCAACGAAAAAAGAGAAATTATTCTTTCTAATGAAATGGCAAAAAAAATGGCTGAACAGCTTCGAACTACTAAAAAAGAACAATTTACTGACCAAATGGATCGCACATTCAAAGAAAAAGAAATTCAATTCCAAGACTACGAAGTGAATAATCGATTTTATGTCGTTATCATGAGTTACATCGAACAATTTCAGCCGAATCAAAGCGGTGTTGTAGCGATTATTCGAGACATGACCAATGAACATCAATTGGATCAAATGAAAAAAGATTTCATAGCTAATGTATCTCATGAATTACGTACACCAATTGCTTTATTACAAGGTTATACAGAATCAATTGTTGATGGGGTTGTTTCAGAACCTGATGAAATCAGAGATTCACTTTCAATTGTACTGGACGAAACGCAGCGTTTAAATCGTCTCGTAAATGAATTATTAAATGTAGCGAGAATGGACGCAGAAGGCCTATCAGTTAATAAAGAAGTACAACCTATTGATGATTTGTTAGAGCGTATGCAATTGAAATATCGACAACAAGCTGAAGATTTACAAATTGATATTAAATTAGCACCTGATACATCTGGTCAACTTTGGTATTACGATACAGATAGAATGGAGCAAGTATTAACAAATTTAGTGGACAATGCTTCTCGTTATACTTCACCGGGAGACGCGATTACTATCAGTGCTTCAGAATCTGATAAATACGACATTTTGTATGTAGCAGATACAGGCAGCGGCATTGCACCTGAGCATATTGATTTAGTATTCGATAGATTTTATAAAGTAGATGCTTCTCGAAAACGTGGTAAAGAGGGAACAGGATTAGGACTCTTTATTTGTCGCATGATTATTGAAGCACAAGGTGGAACGATTGACTTAAAAAGCCGTTTAGGTGAAGGGACTACATTTATAATTAAATTGCCTAAGCCGCCAAAAAATAATTAATACTATTTTTAAAGCATCCATTTTACTGGATGCTTTTTTTAAGCAATCGAATTGAATGATTGTATCTAATCCGATATAATAGATAAGAAAATAAAATAATAATGAAATTCATCTTCGGGGTCGGGTGAAAGTCCCAACCGGCAGTAAATTAAGCCTGCGACCTGTATTTATATTATAAATATGGCTGATCTAGTGAGATTCTAGAGCCGACAGTATAGTCTGGATGGGAGAAGATGGAGGGTTTATTTGTTGTGCTTAAATTCCTCCTATTCGCGTAAGATGAATGGAAGGAGTATTTATGAATCAACAAAAAAACAAACGCTTAATCATTATAAGTATGATGAGTGCAATCGCGTTTATTTTGATGTTTATCAAATTTCCGCTGCCATTTTTACCACCATACTTAACATTGGACTTTAGTGATGTTCCAGCATTGCTTGCAACATTTCTATTTGGACCAGTGGCAGGAGTTATTGTAGAACTTATTAAAAATTTACTTAACTTCCTTTTCAATATGGGGGATCCAATCGGACCTGTAGCAAACTTTTCAGCTGCAGTCAGTTTTTTACTTACTGCGTTTTATGTAAGTAAATTAATTAAAGGCAAATGGAACTTAGTTATCGGCTTAATTGCAGGCACTTTAGTTATGACTCTAATATTGAGCATTTTAAACTACTTTGTTCTATTACCTTTATACGGAATGATTATGAATCTTTCAGATGTAGTGAAAAATTTAAAAATAATTATAGTATCAGGTATTATCCCATTCAACATTATAAAAGGAATTGCAGTATCAGCTATTTTCCTTTTACTATATAAACGACTAAAAAAAGCATTAAGTTATTAATATTCAGAAACCCAGAAATTTGAAAAATAATTTCTGGGTTTTTAATTAAAAAAGAGACCAAAACAAGCAATATGTTTTGATCTCTTCCATTCAATCTATAATTAGCGAAGAATACTAACTGAATTGACGATTGACTATCATTATTCGAATTTTAGTGCATCTCCATCAAAAGGTTCATCTGCTATTTTAATAGAATCAGTAGGGCAACCTTCCAGTGCATCTTCCATGTCTTCATATAATTCTTCAGGTACTTCAGCGGTACCTTCATTATCATCAAGAATCACGTATGCAATGCCTTCATCGTCGTAGTCATAAATATCTGGAGCTGCTGCACCGCAAGCACCACATGCAATACATGTATCCATATCTACAATCGTATATTTAGCCAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP015114|351424:360001|359063_359612_+|WP_047131041.1|DBSCAN-SWA
MNQQKNKRLIIISMMSAIAFILMFIKFPLPFLPPYLTLDFSDVPALLATFLFGPVAGVIVELIKNLLNFLFNMGDPIGPVANFSAAVSFLLTAFYVSKLIKGKWNLVIGLIAGTLVMTLILSILNYFVLLPLYGMIMNLSDVVKNLKIIIVSGIIPFNIIKGIAVSAIFLLLYKRLKKALSY
>NZ_CP015114|351424:360001|354719_355268_+|WP_047131037.1|DBSCAN-SWA
MVLELKGILEGLLYTAGDEGLEIEQLTEILEISEEALSELVANYNSPGLIIQQYGSTLVLTTKSEVASYVEKLVKNQSNMKLSQAAMEVLSIIAYNQPVTRSDIEIIRGINSDGAAKTLIARGLVEAKVEDNSRSQQLYTTPLFLNVFGMTNLDELPTTEEEEEEIESFFNNLINQKGDNNE
>NZ_CP015114|351424:360001|351424_352324_+|WP_047131033.1|DBSCAN-SWA
METSYDVVIEEYLKFIQIEKGLSANTIGAYRRDLNKYKEYLVLKKINNIDFIDREIIQQCLGYLHDDGHSAKSIARFISTVRSFHQFALRERYAAKDPTVLIETPKYERRLPDVLDVEDVLALLETPDLSKNNGYRDRTILELLYATGMRVTELIHVRVEDVNLIMGFVRVFGKGSKERIIPLGETVIDYLKKYIETVRPQLLKQTVTDVLFLNLHGKPLSRQGIWKLIKQYGVKANINKKLTPHSLRHSFATHLLENGADLRAVQEMLGHSDISTTQLYTHVSKSQIRKMYNEFHPRA
>NZ_CP015114|351424:360001|352366_352870_-|WP_047131034.1|DBSCAN-SWA
MNEALLSFYYQFHAQQHYFLCHDILEEAWKEQPDFTKEDAVVSLILCATGCYHFRRGNCKGAATLFKRASRVANHNLSNLEQLGLKKHKYIELLAQLEKQAAQNNTFQVVELPLLKSTKNRLKSKYPDYQLMTKINDSPYIYDHHLLRDRHAVELARNEALKRRKLK
>NZ_CP015114|351424:360001|356304_357027_+|WP_103163165.1|DBSCAN-SWA
MMTKILVVDDEERIRRLLKLYLERESFDIEEAQDGKEALDKALNTDYACILLDLMLPELDGIEVANRLREYKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTLTATSEQNEPHARDLIEFKHLVIDNDAHRVLADGTQVNLTPKEYELLIFLAKTPNKVFDREQLLKDVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSSDAAHMIQTVWGVGYKFEVNNNDATT
>NZ_CP015114|351424:360001|353142_353589_+|WP_047131035.1|transposase|DBSCAN-SWA
MGCTKIKEKGYILTNNIKSATIVKEYDRYYVSVLVDQRLSPVFKSKQTEDIGIDLGLKEAVFTPSGVKIRSFKTNQTIVKLDKSLKRQRRKLSRKKKGSHNWNKQLLKVQRLYRRIKNIKRKIKRKGMMRNKRWANSFQQIGLGYIVE
>NZ_CP015114|351424:360001|353998_354736_+|WP_047131036.1|DBSCAN-SWA
MYEVKLDAFNGPLDLLLHLIHKYEIDIYDIPMKALTEQYMNYIHAMKKLEINIASEYLVVASELLMIKSKMLLPQHDTEIDDEIEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEFLNELKEQREQFYSKHPTDLSHLESIETWDDTQTIDLTELIMAYQRIKTRTSFNTPKSVTIQKETFTIEQASKQVTEKLAVSSSINFFSLFTFNENTEEVVTHFLAILEMSKTGIIQINQVKDFADINITRGVNYGIGA
>NZ_CP015114|351424:360001|353595_353739_+|WP_082107845.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKCHDYGIELRYVDRFYPSSQICSDCGHIQPMSLNQRTYHYHHFGMI
>NZ_CP015114|351424:360001|359752_360001_-|WP_047131042.1|DBSCAN-SWA
MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAYVILDDNEGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIADEPFDGDALKFE
>NZ_CP015114|351424:360001|355260_355998_+|WP_047131038.1|DBSCAN-SWA
MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLIVEGKVKVNGETVTELGTKVKASDNVEVEGVKLEQEDKLYILFYKPAQVITSVSDDRGRTVVTDYFDDLETRIYPVGRLDYDTSGLLLLTNDGEFTNLMTHPRYKIKKKYVAKLKGYLMRDEVKALEKGVQLEDGKTGPAEVKIKNQNKEKNTTVVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHEVSKLSRIELADFLTLKGLNAGEGRVLTPHEVKKLRNLAENG
>NZ_CP015114|351424:360001|357010_358765_+|WP_047131040.1|DBSCAN-SWA
MMQRLNSVVIKLWLTIILIVTTVLILLSAALITFIQNYYTQDTEQSLIKDAKRISMLLEESDNKSLAIKHSKALIEDPSGLIIMKNKNDEYYNSHSKLKNEMMNVITKNPKYQKVFTNNKKTSQHIKLKVDGKVRTYVLLGYPTKIDTNNPHGAVFIYQDLKSIDDTNNVITIIILVTAVIFLIITTVFAFFLSSRITKPLRQLRTQALNLSEGDYSQVNDINSKDEIGELAHSFNIMSSDIQRHIDEISASKNIRDSLINSMVEGVLGINEKREIILSNEMAKKMAEQLRTTKKEQFTDQMDRTFKEKEIQFQDYEVNNRFYVVIMSYIEQFQPNQSGVVAIIRDMTNEHQLDQMKKDFIANVSHELRTPIALLQGYTESIVDGVVSEPDEIRDSLSIVLDETQRLNRLVNELLNVARMDAEGLSVNKEVQPIDDLLERMQLKYRQQAEDLQIDIKLAPDTSGQLWYYDTDRMEQVLTNLVDNASRYTSPGDAITISASESDKYDILYVADTGSGIAPEHIDLVFDRFYKVDASRKRGKEGTGLGLFICRMIIEAQGGTIDLKSRLGEGTTFIIKLPKPPKNN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_047131033.1|351424_352324_+	site-specific tyrosine recombinase XerD	A0A0K2CP59	Brevibacillus_phage	2.1e-39	32.1
WP_047131034.1|352366_352870_-	DUF309 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131035.1|353142_353589_+|transposase	transposase	W5R8S3	Staphylococcus_phage	5.0e-34	52.1
WP_082107845.1|353595_353739_+|transposase	transposase	W0TV12	Staphylococcus_phage	2.1e-10	65.2
WP_047131036.1|353998_354736_+	segregation/condensation protein A	NA	NA	NA	NA
WP_047131037.1|354719_355268_+	SMC-Scp complex subunit ScpB	A0A1B1IVT7	uncultured_Mediterranean_phage	2.9e-07	30.3
WP_047131038.1|355260_355998_+	rRNA pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_103163165.1|356304_357027_+	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	1.8e-46	41.5
WP_047131040.1|357010_358765_+	HAMP domain-containing protein	A0A1V0SGX0	Hokovirus	1.9e-20	32.7
WP_047131041.1|359063_359612_+	ECF transporter S component	NA	NA	NA	NA
WP_047131042.1|359752_360001_-	ferredoxin	A0A127AYY7	Bacillus_phage	1.5e-16	52.0

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP015114|685238:754580|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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MSKTYNNRYLKDSDGEIYLPMTSTECIIDIDKINNANSIIELNSKINNLEELVELQGKEIEKLKEKLNQKESEVIE
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MVMSDKERADKYRKAYYELLDDIKMYRSEWAELEHYIRLKIQWNPSSSQYKNVRHEMDRIKGGIVE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_047131320.1|691356_692151_-	peptidoglycan editing factor PgeF	NA	NA	NA	NA
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WP_047131322.1|693581_694994_-	cell division protein FtsA	NA	NA	NA	NA
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WP_015900045.1|700582_700987_-	cell division protein FtsL	NA	NA	NA	NA
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WP_047131327.1|702530_704144_-	bacillithiol biosynthesis cysteine-adding enzyme BshC	NA	NA	NA	NA
702981:702996	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_047131329.1|704794_705475_-	noncanonical pyrimidine nucleotidase, YjjG family	NA	NA	NA	NA
WP_047131330.1|705680_705863_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_126498524.1|706198_706954_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_047131331.1|707887_708598_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063164608.1|709145_710609_-	SH3 domain-containing protein	U3PDY3	Staphylococcus_phage	1.1e-210	79.1
WP_052766788.1|710605_711073_-|holin	phage holin	U3PJ27	Staphylococcus_phage	2.3e-66	79.2
WP_063164609.1|711129_711528_-	hypothetical protein	A0A2H4JCM1	uncultured_Caudovirales_phage	2.0e-58	87.9
WP_047133029.1|711514_711937_-	hypothetical protein	A0A2H4JID2	uncultured_Caudovirales_phage	3.1e-62	79.3
WP_082107888.1|711974_712127_-	XkdX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047133028.1|712146_712518_-	DUF2977 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_052766786.1|712517_713996_-|plate	BppU family phage baseplate upper protein	A8ATB2	Listeria_phage	6.7e-43	54.0
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WP_082107887.1|716179_717769_-|tail	phage tail protein	A0A2H4JAF8	uncultured_Caudovirales_phage	2.0e-258	79.9
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WP_156483152.1|724816_724969_-	hypothetical protein	A0A2H4JAE7	uncultured_Caudovirales_phage	6.8e-20	94.0
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WP_047133016.1|727403_727691_-	hypothetical protein	A0A059T7R0	Listeria_phage	1.0e-11	47.3
WP_047133015.1|727708_728920_-|capsid	phage major capsid protein	Q4ZD74	Staphylococcus_phage	5.8e-85	45.4
WP_047133014.1|728931_729639_-|protease	Clp protease ClpP	A0A2H4J8Y7	uncultured_Caudovirales_phage	6.0e-42	50.8
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WP_047133012.1|730795_732466_-|terminase	terminase large subunit	A0A059T7Q8	Listeria_phage	8.8e-201	60.9
WP_047133033.1|732462_732804_-	hypothetical protein	A0A2H4J5M7	uncultured_Caudovirales_phage	6.3e-29	59.6
WP_082107889.1|733011_733449_-	HNH endonuclease	A0A1W6JQ75	Staphylococcus_phage	3.5e-48	64.1
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WP_047133010.1|734525_734996_-	Holliday junction resolvase RecU	H9A0M5	Staphylococcus_phage	4.6e-46	57.8
WP_047133031.1|734992_735175_-	hypothetical protein	Q4ZC78	Staphylococcus_virus	5.2e-06	55.2
WP_047133009.1|735174_735348_-	transcriptional regulator	Q4ZC79	Staphylococcus_virus	5.2e-16	75.4
WP_047133008.1|735344_735578_-	DUF1381 domain-containing protein	A0A1W6JQD0	Staphylococcus_phage	6.0e-15	91.5
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WP_103163183.1|736784_736985_-	hypothetical protein	Q4ZC85	Staphylococcus_virus	1.5e-22	74.2
WP_063164613.1|736968_737370_-	hypothetical protein	A0A1S5SFT9	Streptococcus_phage	1.9e-13	33.6
WP_047133049.1|737366_737777_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063164614.1|737763_737967_-	hypothetical protein	Q4ZC88	Staphylococcus_virus	5.8e-14	62.7
WP_174531717.1|737918_738605_-	N-6 DNA methylase	B7T0H3	Staphylococcus_virus	1.5e-82	67.3
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WP_047130970.1|740234_740465_-	hypothetical protein	A0A2H4J7L3	uncultured_Caudovirales_phage	7.2e-13	49.3
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WP_156483154.1|745323_745488_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047130979.1|745484_745715_-	DUF771 domain-containing protein	A0A2H4J5V1	uncultured_Caudovirales_phage	2.2e-22	66.7
WP_046100574.1|745774_745981_+	hypothetical protein	A0A2H4JCI8	uncultured_Caudovirales_phage	5.6e-17	60.6
WP_046100573.1|746387_746588_-	hypothetical protein	A0A2H4J2L6	uncultured_Caudovirales_phage	4.6e-08	59.6
WP_047130981.1|746599_747367_-	phage regulatory protein/antirepressor Ant	I6TJS0	Staphylococcus_virus	1.5e-110	80.9
WP_047130982.1|747380_747605_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A2H4JEA4	uncultured_Caudovirales_phage	1.0e-35	98.6
WP_047130983.1|747761_748091_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A2H4J5G9	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-52	94.5
WP_047130984.1|748105_748573_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	A0A2H4J463	uncultured_Caudovirales_phage	3.6e-51	66.4
WP_047130985.1|748675_748918_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_156483155.1|749181_749328_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063164615.1|749324_749945_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047132460.1|750076_751105_+|integrase	site-specific integrase	A0A1Q1PVY8	Staphylococcus_phage	5.4e-116	60.6
WP_052766765.1|751780_752722_-	HIRAN domain-containing protein	R9QTP0	Staphylococcus_phage	1.1e-46	59.4
WP_052766764.1|752800_753271_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052766763.1|754088_754580_-	serine acetyltransferase	A0A2H4J5A8	uncultured_Caudovirales_phage	6.3e-06	27.6
754896:754911	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP015114|834183:920632|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_047132390.1|834183_835662_-	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	1.6e-73	48.2
WP_047132389.1|835679_836246_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	1.1e-30	39.7
WP_047132388.1|836242_837280_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	2.2e-69	43.5
WP_047132387.1|837284_838706_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	4.3e-47	31.0
WP_047132386.1|838684_840874_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	1.3e-138	39.5
WP_047132385.1|840866_841538_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ	NA	NA	NA	NA
WP_015899943.1|841537_841804_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurS	A0A1B1IU82	uncultured_Mediterranean_phage	2.9e-05	35.0
WP_047132384.1|841803_842508_-	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	E3SPA9	Prochlorococcus_phage	2.1e-50	46.4
WP_047132383.1|842507_843635_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	NA	NA	NA	NA
WP_041612960.1|843621_844104_-	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	3.1e-21	44.0
WP_047132382.1|844312_845170_+	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	8.4e-38	38.8
WP_047132381.1|845286_846363_-	M42 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_063164607.1|846581_847898_+|transposase	ISL3 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	8.0e-48	32.2
WP_047132933.1|847973_849122_-	nitric oxide dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_047132932.1|849507_849825_+	DUF5011 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_047132931.1|850125_851238_+	cytochrome aa3 quinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_047132930.1|851237_853220_+	cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I	NA	NA	NA	NA
WP_047132929.1|853212_853815_+	cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III	NA	NA	NA	NA
WP_047132928.1|853811_854102_+	cytochrome aa3 quinol oxidase subunit IV	NA	NA	NA	NA
WP_047132927.1|854238_855147_+	ribonucleoside hydrolase RihC	NA	NA	NA	NA
WP_047132926.1|855227_855980_+	DeoR/GlpR transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_047132925.1|856172_856604_+	RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_047132924.1|856622_857138_+	galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB	NA	NA	NA	NA
WP_047132923.1|857137_858085_+	1-phosphofructokinase family hexose kinase	NA	NA	NA	NA
WP_047132922.1|859153_860443_+	arsenite efflux transporter membrane subunit ArsB	A0A2H4PQU3	Staphylococcus_phage	2.6e-168	70.6
WP_047132921.1|860458_860860_+	arsenate reductase (thioredoxin)	A0A2H4PQT9	Staphylococcus_phage	8.7e-46	66.7
WP_047132920.1|860901_862308_-	6-phospho-beta-galactosidase	NA	NA	NA	NA
WP_063164616.1|863588_865055_-	SH3 domain-containing protein	U3PDY3	Staphylococcus_phage	6.8e-205	77.7
WP_052766788.1|865051_865519_-|holin	phage holin	U3PJ27	Staphylococcus_phage	2.3e-66	79.2
WP_063164617.1|865575_865974_-	hypothetical protein	A0A2H4JCM1	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-58	87.1
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WP_156483156.1|866456_866624_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063164618.1|866623_867151_-	hypothetical protein	A0A2H4JE36	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-36	45.1
WP_063164619.1|867228_867411_-	hypothetical protein	A0A2H4JE36	uncultured_Caudovirales_phage	2.3e-06	44.3
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WP_052766781.1|867590_868091_-	hypothetical protein	A0A2H4J9L3	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-40	77.7
WP_047132652.1|869455_871375_-	glucosaminidase domain-containing protein	Q4ZCC7	Staphylococcus_virus	0.0e+00	98.9
WP_015978139.1|871424_871814_-	ORF043	Q4ZCC9	Staphylococcus_virus	6.0e-52	100.0
WP_047132651.1|871806_872250_-	hypothetical protein	Q4ZCD0	Staphylococcus_virus	7.0e-73	90.5
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WP_052766778.1|872770_874207_-|plate	BppU family phage baseplate upper protein	A0A2H4JH16	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-47	43.2
WP_047132650.1|874203_876282_-|tail	tail fiber domain-containing protein	A0A2H4JFY2	uncultured_Caudovirales_phage	7.0e-139	61.1
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WP_002480806.1|882085_882583_-	hypothetical protein	Q4ZCE0	Staphylococcus_virus	4.9e-91	100.0
WP_047132645.1|882640_883204_-|tail	phage major tail protein, TP901-1 family	Q4ZCE1	Staphylococcus_virus	1.4e-97	99.5
WP_047132644.1|883207_883630_-	DUF3168 domain-containing protein	Q4ZCE2	Staphylococcus_virus	1.9e-75	97.9
WP_047132643.1|883640_884054_-	HK97 gp10 family phage protein	Q4ZCE4	Staphylococcus_virus	6.8e-70	89.1
WP_047132642.1|884040_884376_-|head	phage head closure protein	Q4ZCE5	Staphylococcus_virus	9.7e-59	96.4
WP_002480801.1|884377_884674_-|head,tail	phage head-tail connector protein	Q4ZCE6	Staphylococcus_virus	4.6e-52	100.0
WP_015978146.1|884673_884955_-	Rho termination factor N-terminal domain-containing protein	Q4ZCE7	Staphylococcus_virus	1.1e-44	100.0
WP_015978113.1|884967_885792_-|capsid	N4-gp56 family major capsid protein	Q4ZCE8	Staphylococcus_virus	6.6e-149	100.0
WP_047132641.1|885810_886404_-	phage scaffolding protein	Q4ZCE9	Staphylococcus_virus	2.7e-75	98.5
WP_047132640.1|886530_887475_-|head	phage head morphogenesis protein	Q4ZCF0	Staphylococcus_virus	4.1e-171	97.5
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WP_047132638.1|888858_890115_-|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	Q4ZCF2	Staphylococcus_virus	8.9e-222	90.4
WP_047132637.1|890111_890543_-|terminase	terminase small subunit	Q4ZCF3	Staphylococcus_virus	2.2e-63	85.8
WP_047132636.1|890631_890901_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047132635.1|890923_891145_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052766777.1|891391_891796_-	sigma-70 family RNA polymerase sigma factor	A0A1J0MFD1	Staphylococcus_phage	1.9e-40	62.4
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WP_082107877.1|891949_892081_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	B8R685	Lactobacillus_phage	9.1e-05	55.0
WP_052766776.1|892111_892366_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_126498525.1|892344_892668_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_103163170.1|892730_892904_-	transcriptional regulator	A1BUB4	Staphylococcus_virus	1.9e-05	48.8
WP_174531718.1|892948_893266_-	hypothetical protein	U3PBR4	Staphylococcus_phage	1.2e-42	86.9
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WP_103163183.1|893701_893902_-	hypothetical protein	Q4ZC85	Staphylococcus_virus	1.5e-22	74.2
WP_063164621.1|893885_894290_-	hypothetical protein	A0A141E233	Streptococcus_phage	8.0e-15	34.2
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WP_063164622.1|894683_894878_-	hypothetical protein	Q4ZC88	Staphylococcus_virus	2.8e-10	56.7
WP_047131743.1|894864_895587_-	HNH endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_052766743.1|895609_895852_-	hypothetical protein	Q4ZC89	Staphylococcus_virus	4.0e-06	38.3
WP_047131742.1|895842_896433_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_156483158.1|896438_896615_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131741.1|896611_897313_-	PTS transporter subunit EIIC	A0A2H4J5E6	uncultured_Caudovirales_phage	7.3e-24	73.6
WP_047131740.1|897328_897658_-	PTS lactose/cellobiose transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_047131739.1|897958_898573_-	PepSY domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131738.1|898762_899890_-	serine hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_047131737.1|899953_901606_-	phospho-sugar mutase	A0A1X9I671	Streptococcus_phage	4.9e-95	37.1
WP_047131736.1|902007_903309_+	LCP family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131735.1|903330_903801_+	DUF2538 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131734.1|903906_904329_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_047131733.1|904798_908827_+	glucosaminidase domain-containing protein	H9A0W8	Staphylococcus_phage	5.5e-55	48.7
WP_047131732.1|908935_909355_-	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_047131731.1|909705_910710_+	acyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131730.1|910858_912022_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_126498526.1|912163_912619_-	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_047131728.1|912914_913733_-	1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase	NA	NA	NA	NA
WP_047131727.1|913725_914541_-	2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_047131726.1|914533_916201_-	2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3- cyclohexene-1-carboxylic-acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_047131725.1|916193_917546_-	isochorismate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_047131724.1|917767_918706_+	1,4-dihydroxy-2-naphthoate polyprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_047131723.1|918734_919304_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_047131722.1|919542_919752_+	TM2 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131721.1|919764_919971_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131720.1|920029_920632_-|protease	CAAX protease	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP015114|1139155:1148012|DBSCAN-SWA
ATTAGCTTTCATAGTTGCGGCTTCCTTTCAACAACATCACTAGGAATATAAATGTGCCGAACACACCGAGTGTGAGTCCGATATTAATTTCATAAGGATAGACAATCAATCTTCCGAGTATATCTGAAAAAAGTACGAAGATTGCACCAAGCAACACTGTATGCGGCAGCGCGTGCTTCAAATGATCGCCGCGATAGATTGAAACAATGTTTGGAACGATTAAGCCTAAGAAGGGGAGTGCTCCTACTGTTACAACGACTAAAGCCGTCATTGTTGCTGTGATTGTAAGACCGAACATCATAATTCGTTCATAATTGACACCTAAATTATGACTGAAGTCTTTGCCCATTCCAGCGATTGTAAAATAATTTGCGAACATATATGTAACAATGAGTAATGGTACGCTGAGATACAGGATTTCATAACGTCCGCTGGTAATAATAGCAAAATTGCCATTTAACCAGTTGCCAATACTTTGAACAGCGTTTGTGCGTAATGCGACAAAAGTTGTGAGGCTGGAGATGATTCCTCCGATCATGATTCCGAGAAGCGGAACGAAGATGACGTCTTTAAAACGAATGACTTGTATCAACTTCATAAAGAAAAATGTTCCTGCAATACTTAATAACATTGCGAATAAAAGCTTTATCAGAATGTGTGCGTGCGGGAAAAACACAAGTGCAATTAAAATACCGAGCTTCGCCCACTCCATCGTTCCTGCAGTAGTTGGGCTGACAAATTTATTCTGCATCATCTGCTGCATAATTAAACCTGCTAAAGCAAGAGAACTACCAGATATGATAATGCTGACTGTTCGAGGAATACGACTTGAAAATAGAATATTACGTTGTTCTGCTGATAAATGGAACATATCTGCCAATCCTAGTTGGCTGACACCGATAAATAAAGATAAGATGCTTAAGACAATAAAAATTAAAAATAATACGGGTCCCCGCATCAGCTGCCTGATAATCATAATTTACTTTAATCCTTTCTACTGTTGTGTTGAATATGATTACTCACAACTGTTGTGAAACTGATAATCATTATCACTTAATATCTATCGTATCATGGAAAAATTTTTTGGCAATAGATTTTTAGACTTTTAGATTTTTTCATTTGAAGATCAAGATTAAATATGTAACTTTCATGTACTTTACCTTCCAAAATGTAAAAATTATCTAACTATAAAAAAGCGTTGAATCCGACTGCAAATCATTTCAGTCAGATCCAACGCTCTTTAGGTTAATCTAAATCATTTATTTTTCATCATCAAAGATAAAGTCTTCATCTTGTAGTGGTTCAACATTTAAAGCTAAAGTATAGCCATCACCTTTAACTGAGAAGAAGTCGTGGTTTTTTGTTGAAGTATCGAGTGCGTTTTCAATAATTGGATTGAATTCGCGCTCCTCAAAGTATGGTTCAAATCCTAAGTTTGAAAGTGCTTTGTTTCCATTATATCGTACGTAATTTAATACATCTTCTGACAAACCGATATCGTCATAAAGTTTATGAGTATAAGATACTTCATTTTTGTATAGCTCTTCTAATAGTTTATACATATGTTGATCAGCACGTTGTTTTTCATTCTCAGAAAGTTCGTTGCGTAAGTGCTGTGCATCTAAACCTGTAAACACACCATGAATAGATTCATCAAGTAAGATTTTACGGATAATTTCACCAGACGTTGTCATGCGTCCTTGTCCAGCTAAGTATAAAGGATAGTAGAATCCTGAATAGAATAAGAATGTTTCTAAGAACACACTTGAAACACGAGCAATATATTGATCATAAACTGAAGCTTCTTTAGCCCAAAGTTTATGATAATTGCCAACAATCTTATCTGATTTATACTTCAAATGCGGTTCTTCTAAAACCCATGTATCTAATAAATAGTTTGTTTCACTAGATGGTAGTAATGTTGTGAAAATATGAGAATAACTTTTAGCATGAATTTGTTCCATCATTGCCATAAAAGAATAAACTGCTTTTTTACGTAAATCCTTAGTATGAAGCATAATTAATGGCATACCATCATCAGCTTGGTGTGTATCTAATCCAGTTAATCCTGCTAATGCTTTTTTAAATGTATCTTGTTCCTCAGGTGTTAAAGTTTTCCAGCTTGCAATATCTTTAGAGACTTTAAATTCTGTTTCTACCCACATTTGGGAAATGTTTTGTCTCCAAAACATATTTGTCATATCTTCTTGCGTGTTCCAATTGACAGCAATCATCAAAGCGCATTCTCCATTCTTCTATAAATTTTATTAGTTTCACTTTAAGTACTTAAATGCGGGACCACTTACACATATACTGTCATCGTGTAAAGGTCCCGATTTTCTTTCTATTAATACAATTTGCTAGTATCTATGTGATTAAATCGCGCAGCTTGTACACTCATCTACGCTCAATAATTTGTTTCGTGTATAGTAAAGAGATTTTAAACCTTTATGGTGCGCATAAACATATAGACGTGATAATTCGCGTGTAGATATTTCAGAATTTACATATAGAATTGTTGAAATTCCTTGGTCAACATGTTGTTGTATTGTTGCGACTAAATCAATTAAACGCATTTGATCTGTGTTAAATGCTGATTTGTAATACCACATTGTTTGCGGTGATAAGAATGGCATAGGATAAAATGTTTCTGAGTTACCATAAGTACGGCGTTCAATTTGATCAACAATCGGCATTACTGAACTTGTTGCGTTTTGAACGTAAGAAATACTTTGTGTTGGTGCAATCGCTAAGCGGTATGCATGGTATAAACCATATTCTTTAACATCTTTTTCTAATGCTTTCCAATCTTCAGCTGTTGGAATTTCTAATCCTTCAAATAAAGCTTTAACTTTTTCATATTCAGGAACAATGTCAGCTTGCGTATATTTTTCAAAATATTTTCCGCTTGCATAGTCTGATTTATCAAAGTCTTGGTATGCTTGTCCGCGTTCTTTAGCAGTTTGCATTGAACGTTCAATTGAATAATAGTTCATTGTCATAAAGAATACATTCGCAAAATCTTTAGCTTCTTCAGACTCATATCCAATTTGATTTTTAGCAAGATAACCATGTAAATTCATAACACCTAGACCTACAGAGTGCAGTTCACTGTTAGCTTTACGCACGCCCGGAGCATTTTGGATATTTGCTTCGTCACTTACAACTGTTAAAGCATCCATACCAGTATGCACTGAATCTCTGAATTTACCTGATTCCATTACATTTACAATATTTAATGAACCTAAGTTACATGAAATGTCACGTTTAATTTCATCTTCAATACCGTAATCATTAATTACTGATGTTTCTTGTAATTGGAAAATCTCGGTACATAAATTACTCATTTTAATTTGACCGATATTAGAATTAGCATGTACTTTGTTTGCATTGTCTTTAAACATTAAATAAGGATAACCTGATTGCAATTGCGTTTGTGCAATTGTATTTAACATTTCACGTGCATCTTTTTTATGTTTTAAAATATTAGGATTTTTAACCATATCATCATAATATTTATCTAAATCAATATCATCTAACGTCACACCATATTCGTTATAAACAGTATGTGGTGCAAACATATAAAAGTCTTCGCCGTTCTTAGCAAGTTCAAAGAATTTAGCAGGTACAATTAAGCCTGTTGAGATTGTTGATAAACGGATATCTTCATCAGCGTTAACCTTTTTAGTATCTAAAAATTCTTCAACATCATAATGGAAAATATTCAAATATACTGCGCCAGCGCCAGGTCTTTGACCAAGTTGATCGGCATAACTGAATCCGCCTTCTAACGACTTAGCTACAGGTAAAACACCTTTAGCAACGCCTTTGATACCTTTAATTGCTTCACCGCGTGCACGAAGTTTAGATAAGTTGATTGCTACACCGCCACCGATTTTACTTAATTGTTTTGCTGTTGAATCAATAAAGTTGATTGAATTCAAGCTGTCATCTACTTCTAATAAGAAACATGACACTAGTTCACCGCGGCGGGCACGACCAGCATTTAAAAATGTTGGAGTAGCAGGTTGGTATCTTTGCTCAATCATTGATGAAATAAATTGGCGTGCTTGTTCTTTATCCCCATCAGCTAAATATAGTGACACGATAGTCACATGTTGAGGATAATCTTCTAAATATTGCTTTTTATCATTTGTTTTAAGTGCATAGTCTTTGAAAAATTTACTTGCAGACATATAACTGGCAAATTTGAAAGGAATACTACGTGCAAAATCTGTTAACTCTTTTAAGTCTTCTTCGCTGTATTGCGCAAATACGTCTACATAGAAATCATTATCGACAAGATAGTGCAAACGTTCAATTTCACTATCGAAATAAATAGTGTGATCTTTAATCTCTTCAAGATAAACTGCTAACGCTTCTTGGTCTTTTTCTAAACTGAAAAAGCCATCTTCTTTACGCTTTGTTACCTCATTATTTAATTCAATATGATTATATTGCTTTTCGTTCATTGTCTTCATAAAAATGCCCCACCTTATCTTTAAACTCTTCAACGTCTTTTTTTGTTCCTTGTACTTCAAATTTCATTAAAAGCGGCACCATATAATCTTTAGATATTGTATCGCTGGCCTTCGCAAAATTTTGTCCCCAATTGCGATTACCGCTTCCAACTACTCCTCTAATCATTGTGCCGTTATGCTGTAAGAATGTCTGCACAACATCTGGTACTTCTCCAAAACCAATGGTACTAGTGACCAATATATAGGGTTCATCTATGCGTACTTCCGCACAGTTATCATTTGTAATTTCTAAGGTGTCTTCAAATCCTGATCTTGCGATAAAGCGTCTTACGTTTCCTGTGAATGAGAAATAAACTACCTTCATTGAATCACCCGCTTTCTTAAAAAGAACGCGCCATTCTTCATCTCCATAGATTAGGCAGAAGCCATAAATAAAAAACATGACAAGCTGTCTGATTACTATTGTTGTTTCATGAATGAGACCTTGTGCCTGTTGCATGTTTGCAATTTATTACGATATTAGAATGCACTTTCTTATAACACTACATATTGTGGTTACTTAATTTATGGGTTACACTTGCTTGATTGTATATCTTATAATTTCTTCTGTTCTAAATTGAACGCAATTACAAGAATACCAATGCGTATTAACTGCTTTCAACCATTAATTACTCTTTAATCATGAATTAATCTCTTAAACATTACTTTGTACTTTCAAAATAATGAGGTGTGAAATTGCTTTAAAATAGTTAATTTTAATTTTAGCAATTTCCAACTCGACCACAACATATAGTGTTAACTTTCGTTCTTCAATACTATATTATGTGATTCATTATACCTAACCCACTTTGTAATTTCAAAGAGAATCACTGTGCAAAAATTTATTTTAAATTGTCATAATCGATGTAATAAGCGTCACATCTATCGTTAACGAACAAAACTTTTTTAAAAAACGTGCTTAAAATAAATAATTGTAGTTTTACCCTTGATTTTTTTAAAAATTATGCACTTCTTGAAAAATCAAGGGTCTTCGAAATGCTGGCCTGTTAAGCTTGATGCAACTCTTTCAATATCTATAAATATTTACAAATTATATAGAACGCAAATCATCCTGAATTGCAGAACGTATGTTCGATTAAATTATATCGATTCTCAGAAAGATTTGCAAGGTCTTATAGCCACGTTAATTTGAATTATGCTAAGATGATATACGTTAAGTTTTGGAGAAAGTAGAGGCGAAAATATGGACCCAAAAATAAAAGGCATCATTGCAATCCTCATTTCAGCAATCGGTTTTAGTTTTATGTCGCTATTTTTCAGACTTTCAGGAGATTTGCCTGTTTTTCAGAAATCTTTAGCACGTAACTTAGTTACGACGTTGATTCCTTTATATTTCTTATATAAATATAAACAGCCCATGTTTGGTAAATTGAGCAGCCAACCCTTGTTGATTACCCGTTCTACTCTTGGCTTAGTCGGTGTCTTATTAAATATTTATGCTATTGATCATATGTTGTTGAGTGATGCCGATACTTTAATGAAATTAAATCCATTCTGGACAATTTTATTAAGTTTAGTTTTTTTACATGAGAAAGTACGTAAATATCAAATTACTGCTATGATAATAGCAATTATCGGGATGTTATTTGTAGTACAACCTCAATTCTCATCAGCAATGATACCTGCAATCGGTGGTTTGTTCTCTGGAATTTTTGCTGCCGCTGCTTATACATGCGTACGCGCCTTAAGTAGTCGTGAAGCACCTTATACAATTGTGTTTTATTTTTCATTCTTTTCGATTATTGCTTTAATTCCGTTTGTAATATTCACATACGAACCCATGTCAAGCATGCAAATTGTATATTTAATTGGTGCAGGCTTATCAGCAGCTGTTGGTCAAATCGGTATTACACTTGCTTATAGTTACGCTCCTGCTCGTGATATTTCAATATTCACGTATGCATCTATTATTTTTACTGCTATTATGGGAATTGTCATTTTTGGAGAATCTCCAGATTTATATGCAACACTTGGATACGTTATTATTATCAGTGCAAGCTATTATATGTTTGAAAAAGCACGTCGACAAAGCAAAACTAAACTTGCGCGTACACATAAAGGAGAGAATTAAAAATGTCTAATGAAGGACGTAAAAAAGAAGAACTAGAAGATATTACGTTATTAGGGAATCAAAATAATACGTATAACTTTGATTATAGACCTGATGTCTTAGAAACATTTGACAACAAACATCAAGGAAGAGATTATTTTGTAAAATTCAATTGTCCTGAGTTCACATCACTTTGCCCTATTACTGGACAACCTGATTTTGCAACAATTTATATTTCCTATATACCAAATGTAAAAATGGTAGAATCTAAATCATTAAAACTTTACTTATTCAGCTTCAGAAACCATGGTGATTTTCACGAAGACTGTATGAATATTATCATGAATGATTTAATTGATTTAATGGACCCTCATTATATTGAAGTCTGGGGCAAATTCACACCACGCGGCGGTATTTCAATCGATCCATATACAAATTATGGCCGTCCAGATTCTAAGTATGAACAAATGGCTGAATACCGTATGATGAATCATGATTTATATCCAGAAACAATTGATAACAGATAATTTAAATTAAAGCATCCGCTTTGTACTGCACCCTAAAGTTGAAAATGAAAAACTCAACTTTAGAAGTCCGCTGCACTTCGGGTGCTTTTTTGATAATTAAATAATATTCTCCCTTTAGTGTAATAAACATATATAATAATATTAAACAATATTCAGAATTTTCTTGTATATTTTTCTTTGATGGCTTAAACTTATTTTTAAGCGGTTAGGGGGAAAATTATGAATAAAAAACAATATACACGCGAAGAGGTTGTCAACAGCATTCCACGTACAGGCTTCTTTGGACATCCTAAAGGACTTAGCACATTATTCTTCACTGAATTTTGGGAGAGATTCAGTTATTATGGTATGAAAGCCATTTTAGTTTATTACCTATACTATTCAGTCGCAAAAGGCGGCTTTGGATTAGATGAATCTGTTGCAATGCAAATCGTGGCATTATACGGAACATTAATTTATATGTCCGGCGTCATCGGTGGTTGGATAGCCGACCGAATAACAGGTACACAAAATGCAGTTTTCTTTGGCGGAATATTTATAATGTTCGGTCATATTATCTTAAGTTTACCTGGTAATTTAACAGCTGTAATGATTGCATTATTGCTATTAATCATCGGTACAGGTTTATTAAAACCTAACATTTCAACAACTGTCGGAGAATTATACGAAAAAAATGATCCTCGTGTAGACTCAGCATTTACAATCTTCTACATGGGTATCAATGCAGGTGCTTTATTATCCCCGCTTATTACAGGTTACTTGCAAACTCGTATTGGCTTTCATGCAGGATTCGCCACTGCAGCAATCGGTATGTTTATCGGACTTGTTGTTTATTGGACTAAACGTAAGAAATATTTGAATTTAGCAGGTTTAACAGTACATAATCCAATGTCTAAAAGTGATGTGAAGAAATTTTCACTTATTACCATTATCGTCGTTGCAGCATTTGTACTATACCTTGTTATCTTAAAAGTTTTTAATGCATTAACTATCGAAAACTTCAGCTTACTTGTCACTATTCTCGGTATTGCTTTACCAGTTTACATTGTGACACGTATGTTGATGAGTAAAGAAGCAACTCCAGAAGAAAAATCACGCGTACGAAGTTATATTCCGTTATATATTACATCAGTTGCATTCTGGATGATCCAAGAACAAGGTTCAACAATTCTTGCAAACTTTGCAGATAAAAATACACAATTAAAAATGTCTGAACTTACAGGCGGAGCAATTCATTTTGATATTCCGGCAGCTTGGTTCCAATCACTTAACCCTATTTTCATCGTTGCATTAGCTCCAGTGTTTGCTACATTATGGGTAAAACTAGGCAAACGAAATCCATCTACTGTAATGAAATTTGCGATCGGTGCAATTATTGCGGGTCTTTCTTATCTCATTATGATGATTCCATTGGCTGGCGGTTTACATGGTGAATTAATCAATCCTATTTGGTTAGTACTCAGCTTTTTACTCATTACAATTGGTGAGCTTTGTATATCTCCAGTAGGTTTAGCGACAACTACTAAACTCGCACCATATGCTTTTACAGCCCAAATGATGAGTTTATGGATGTTAAGTAATGCGACAGCCCAAGGATTAAATGCACAACTTGTTGTTGTATATAAATCAATGAATCCTTCACAATACTTCATGTATTCAGGTTTGTTAACAATTATTATCGGTGTTCTACTCATTATCGTTTCACCTATGGTTAAACGTGCTATGAAAGGTATCCACTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP015114|1139155:1148012|1140413_1141388_-|WP_047132708.1|DBSCAN-SWA
MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLTPEEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTKDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVLEEPHLKYKSDKIVGNYHKLWAKEASVYDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGRMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSENEKQRADQHMYKLLEELYKNEVSYTHKLYDDIGLSEDVLNYVRYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTSTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEPLQDEDFIFDDEK
>NZ_CP015114|1139155:1148012|1143606_1143999_-|WP_047132780.1|DBSCAN-SWA
MKVVYFSFTGNVRRFIARSGFEDTLEITNDNCAEVRIDEPYILVTSTIGFGEVPDVVQTFLQHNGTMIRGVVGSGNRNWGQNFAKASDTISKDYMVPLLMKFEVQGTKKDVEEFKDKVGHFYEDNERKAI
>NZ_CP015114|1139155:1148012|1146491_1148012_+|WP_047132712.1|DBSCAN-SWA
MNKKQYTREEVVNSIPRTGFFGHPKGLSTLFFTEFWERFSYYGMKAILVYYLYYSVAKGGFGLDESVAMQIVALYGTLIYMSGVIGGWIADRITGTQNAVFFGGIFIMFGHIILSLPGNLTAVMIALLLLIIGTGLLKPNISTTVGELYEKNDPRVDSAFTIFYMGINAGALLSPLITGYLQTRIGFHAGFATAAIGMFIGLVVYWTKRKKYLNLAGLTVHNPMSKSDVKKFSLITIIVVAAFVLYLVILKVFNALTIENFSLLVTILGIALPVYIVTRMLMSKEATPEEKSRVRSYIPLYITSVAFWMIQEQGSTILANFADKNTQLKMSELTGGAIHFDIPAAWFQSLNPIFIVALAPVFATLWVKLGKRNPSTVMKFAIGAIIAGLSYLIMMIPLAGGLHGELINPIWLVLSFLLITIGELCISPVGLATTTKLAPYAFTAQMMSLWMLSNATAQGLNAQLVVVYKSMNPSQYFMYSGLLTIIIGVLLIIVSPMVKRAMKGIH
>NZ_CP015114|1139155:1148012|1141529_1143635_-|WP_047132709.1|DBSCAN-SWA
MKTMNEKQYNHIELNNEVTKRKEDGFFSLEKDQEALAVYLEEIKDHTIYFDSEIERLHYLVDNDFYVDVFAQYSEEDLKELTDFARSIPFKFASYMSASKFFKDYALKTNDKKQYLEDYPQHVTIVSLYLADGDKEQARQFISSMIEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDIRLSTISTGLIVPAKFFELAKNGEDFYMFAPHTVYNEYGVTLDDIDLDKYYDDMVKNPNILKHKKDAREMLNTIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSVINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHTGMDALTVVSDEANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNQIGYESEEAKDFANVFFMTMNYYSIERSMQTAKERGQAYQDFDKSDYASGKYFEKYTQADIVPEYEKVKALFEGLEIPTAEDWKALEKDVKEYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNSETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMRLIDLVATIQQHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHHKGLKSLYYTRNKLLSVDECTSCAI
>NZ_CP015114|1139155:1148012|1139155_1140124_-|WP_047132779.1|DBSCAN-SWA
MRQLMRGPVLFLIFIVLSILSLFIGVSQLGLADMFHLSAEQRNILFSSRIPRTVSIIISGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALVFFPHAHILIKLLFAMLLSIAGTFFFMKLIQVIRFKDVIFVPLLGIMIGGIISSLTTFVALRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSVPLLIVTYMFANYFTIAGMGKDFSHNLGVNYERIMMFGLTITATMTALVVVTVGALPFLGLIVPNIVSIYRGDHLKHALPHTVLLGAIFVLFSDILGRLIVYPYEINIGLTLGVFGTFIFLVMLLKGSRNYES
>NZ_CP015114|1139155:1148012|1144878_1145766_+|WP_047132710.1|DBSCAN-SWA
MDPKIKGIIAILISAIGFSFMSLFFRLSGDLPVFQKSLARNLVTTLIPLYFLYKYKQPMFGKLSSQPLLITRSTLGLVGVLLNIYAIDHMLLSDADTLMKLNPFWTILLSLVFLHEKVRKYQITAMIIAIIGMLFVVQPQFSSAMIPAIGGLFSGIFAAAAYTCVRALSSREAPYTIVFYFSFFSIIALIPFVIFTYEPMSSMQIVYLIGAGLSAAVGQIGITLAYSYAPARDISIFTYASIIFTAIMGIVIFGESPDLYATLGYVIIISASYYMFEKARRQSKTKLARTHKGEN
>NZ_CP015114|1139155:1148012|1145768_1146272_+|WP_047132711.1|DBSCAN-SWA
MSNEGRKKEELEDITLLGNQNNTYNFDYRPDVLETFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIDLMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPDSKYEQMAEYRMMNHDLYPETIDNR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_047132779.1|1139155_1140124_-	ABC transporter permease	A0A2H4IY97	uncultured_Caudovirales_phage	5.4e-134	76.9
WP_047132708.1|1140413_1141388_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A2H4J4P3	uncultured_Caudovirales_phage	2.7e-173	93.2
WP_047132709.1|1141529_1143635_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4J2N6	uncultured_Caudovirales_phage	0.0e+00	87.2
WP_047132780.1|1143606_1143999_-	class Ib ribonucleoside-diphosphate reductase assembly flavoprotein NrdI	A0A2H4J545	uncultured_Caudovirales_phage	1.6e-44	68.5
WP_047132710.1|1144878_1145766_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_047132711.1|1145768_1146272_+	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	E7DN65	Pneumococcus_phage	6.0e-52	65.0
WP_047132712.1|1146491_1148012_+	peptide MFS transporter	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	2.2e-73	37.3

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP015114|2159541:2220082|DBSCAN-SWA
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MFGISLTSLIIRFVFGGLAVALATVISAKLGGKLGGIFSTFPAVYLAALVTLAVDFRGQNLIQESIHLSSGAVIGIVGCILSVALTAYAVQKIGFRRGAIFSVVSWFILSCIILALKHI
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MSDLFTNTEHIKQPLSKDPFDSTKIMKRDFWLIPLYVILLNIVPFLLILPVWMYESSIHSHISKTTQSFILTIGTVLGEIILLFIFYLMHRKYLIPLAVKRFAQAKKYILIVVLAYISMMVVTAAYDGLMRLLPKAYQFTETQNQMLILKMFDNPWAWPVLFIDIVILTPFVEELLFRHLIIHELGKKIGYIAGAVISALVFAFVHVTSAHSPFEYGVYLIMAIALVYVYMKSGRNLAVSISLHMLINAIGFISIIVQYLK
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MKYMIGVDVGTTSTKSVLYDENGNFLRKHNIGYDMNTPDVDTSEENPDEIFDAVLMTIKAVIREERVAADDIKLISFSAQMHSLIAMDNEQNPITESITWADNRASRYADIIRDEHQGHEIYKRTGTPIHPMSPLSKIFWMKHEKPEVYSNAKKYIDIKGYILYQLYGKYVMDYSIGSATGMMNLESLSWDNDVLKLLGITKEQLPELVPTTHIMTGMKHRYSNLLGINPDTPIIVGASDGVLSNLGVNSYKKGEVAVTIGTSGAIRTVIDHPRTDEKGRIFCYVLTEDQYVIGGPVNNGGIILRWLRDELLASEVETAKRLGVDPYDVLTKIASRVEPGSKGLIFHPYLAGERAPLWNANARGSYFGLTLAHKKEHMIRAALEGVLYNLYTVYLALIEVMGETPTAIKATGGFAKSEVWRQMMADIFATDVIVPESYESSCLGACVLGLKALGEIDDFSIIEEMVGTTHAHEPNQKAVEMYQQLISIFIDLSRSLESQYAKIADFQRHHL
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MLSIKNLTKIYSGNKKAVDDVSIDVQSGEFVAFIGTSGSGKTTALRMINRMIEATSGQIMIDGKDVRKMNAVELRRSIGYVIQQIGLMPHMTIKENIVLVPKLLKWSQEKKDEKARELIKLVDLPEEYLDRYPSELSGGQQQRIGVVRALAAEQDIILMDEPFGALDPITRDTLQDLVKELQKKLGKTFIFVTHDMDEAIKLADRICIMSNGKVVQYDTPDNILRYPANDFVRDFIGQNRLIQDRPNMRTVQDAMITPITVGANESLNTAVDIMRRHRIDTIFVVNNQNKFLGYMDIEDINQGLRSGKELIDTMQRDIYRVNVNSKLQDTVRTILKRNVRNVPVVNDQDTLVGLITRANLVDIVYDSIWGEGAEEAQYEAERKEAEQSEQQKHTSSETTEKDNVGHDEMSDSGVER

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_047131646.1|2160848_2161520_+	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_047131604.1|2161711_2162704_+	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	Q89388	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	7.9e-40	30.8
WP_047131603.1|2162755_2164552_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	4.6e-46	29.7
WP_047131602.1|2164535_2166323_+	ABC transporter ATP-binding protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.1e-46	27.7
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WP_047131645.1|2166950_2167976_+	zinc ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131600.1|2168136_2168571_+	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_047131599.1|2168638_2169532_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131598.1|2169955_2171389_+	melibiose:sodium transporter MelB	NA	NA	NA	NA
WP_082107850.1|2171404_2172250_-	AraC family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_047131597.1|2172341_2175350_+	beta-galactosidase	L0N6M2	Herpes_simplex_virus	3.6e-128	31.0
WP_047131596.1|2175409_2177362_-	fructose-bisphosphatase class III	NA	NA	NA	NA
WP_047131595.1|2177590_2178439_+	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.4e-13	29.0
WP_047131594.1|2178435_2179095_+	ABC-2 transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_047131593.1|2179150_2179771_-	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131592.1|2180296_2181571_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_047131591.1|2181718_2182021_+	antibiotic biosynthesis monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_047131590.1|2182134_2182842_+	acetolactate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_070704985.1|2182989_2184891_+	FUSC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131589.1|2184975_2185389_+	DUF2188 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131588.1|2185614_2186814_-	GTP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131587.1|2187092_2187791_+	GTP pyrophosphokinase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131586.1|2188507_2190616_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit	H6X3M6	Enterobacteria_phage	3.2e-115	37.9
WP_047131585.1|2190792_2191401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131584.1|2191518_2192121_-	FMN-binding negative transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_047131583.1|2192251_2192932_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_047131582.1|2192958_2194494_+	gluconokinase	NA	NA	NA	NA
WP_047131581.1|2194619_2195981_+	gluconate permease	NA	NA	NA	NA
WP_047131580.1|2196054_2196876_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131579.1|2196943_2198176_+	acetylornithine deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_047131578.1|2198297_2200472_-	RNA degradosome polyphosphate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_047131642.1|2200685_2202218_-	exopolyphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_047131577.1|2202556_2203021_+	DUF1307 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131576.1|2203217_2204003_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_047131575.1|2204144_2204885_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_103163147.1|2205017_2205689_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	1.4e-19	35.9
WP_047131574.1|2205685_2206459_+	iron export ABC transporter permease subunit FetB	NA	NA	NA	NA
WP_047131573.1|2206641_2207835_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_047131572.1|2207877_2209242_-	carboxylesterase/lipase family protein	A0A0G2Y6W1	Acanthamoeba_polyphaga_mimivirus	7.1e-23	31.7
WP_047131571.1|2209347_2211006_-	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_047131570.1|2211513_2212110_+	YdeI/OmpD-associated family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131569.1|2212880_2214131_+	ABC transporter ATP-binding protein	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	1.6e-21	53.8
WP_047131568.1|2214130_2214766_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_047131567.1|2214783_2215725_+	osmoprotectant ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
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WP_047131565.1|2216492_2217263_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_047131564.1|2217348_2217900_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_047131563.1|2217901_2218264_-	DUF3147 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131562.1|2218282_2218642_-	DUF3147 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047131561.1|2218922_2219624_-|holin	antiholin-like protein LrgB	NA	NA	NA	NA
WP_047131560.1|2219620_2220082_-|holin	antiholin-like murein hydrolase modulator LrgA	NA	NA	NA	NA