Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014786 | Lactobacillus reuteri strain ZLR003 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas14j,DinG,DEDDh,RT,cas3,csa3 | 0 | 2 | 17 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014786_1 | 928700-929106 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014786_1
|
7 spacers
spacers of NZ_CP014786_1
>1.1|928723|19|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder TTGGTCACCCTTGTTATCT >1.2|928765|34|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder GGTATCAGTGCCCTTGTTGCCGTTGTCTGGCTTT >1.3|928822|19|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder CTTATTACTCTTATTGTCG >1.4|928864|43|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder GTTAGTAGGGGCTGTAGGATTAGTTGGCTTGTCATCACCCTTT >1.5|928930|31|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder TTGATCACCCTTATTGTCGTCCTTACCAGTA >1.6|928984|34|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder AGTGGTTGGGTTAGTTGGCTTATCGTCACCCTTT >1.7|929041|43|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder TTGATTACCCTTGTTGTTGTCATCCTTGCCAGTGTTAGGCTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014786_1
The CRISPR arrays of NZ_CP014786_1 >merge|NZ_CP014786|1|928700-929106|CRISPRCasFinder GCAGGTGTGGTTGGTGTTGTTGGTTGGTCACCCTTGTTATCTGTTGGCTTAGATGGTGTTACAGGGGTATCAGTGCCCTTGTTGCCGTTGTCTGGCTTTGCAGGGTTAGTAGGAGTTACAGGCTTATTACTCTTATTGTCGTCTGGCTTAGTAGGCGTTGTAGGGTTAGTAGGGGCTGTAGGATTAGTTGGCTTGTCATCACCCTTTGATGGGTTAGTAGGTGTTGTAGATTGATCACCCTTATTGTCGTCCTTACCAGTATTTGGCTTAGTAGGATTTGTAGGAGTGGTTGGGTTAGTTGGCTTATCGTCACCCTTTGATGGGTTAGTAGGTGTTGTAGGTTGATTACCCTTGTTGTTGTCATCCTTGCCAGTGTTAGGCTTAGATGGGTTAGTAGGGGTTGTAGG >NZ_CP014786|1|1|928700-929106|CRISPRCasFinder GCAGGTGTGGTTGGTGTTGTTGG TTGGTCACCCTTGTTATCT GTTGGCTTAGATGGTGTTACAGG GGTATCAGTGCCCTTGTTGCCGTTGTCTGGCTTT GCAGGGTTAGTAGGAGTTACAGG CTTATTACTCTTATTGTCG TCTGGCTTAGTAGGCGTTGTAGG GTTAGTAGGGGCTGTAGGATTAGTTGGCTTGTCATCACCCTTT GATGGGTTAGTAGGTGTTGTAGA TTGATCACCCTTATTGTCGTCCTTACCAGTA TTTGGCTTAGTAGGATTTGTAGG AGTGGTTGGGTTAGTTGGCTTATCGTCACCCTTT GATGGGTTAGTAGGTGTTGTAGG TTGATTACCCTTGTTGTTGTCATCCTTGCCAGTGTTAGGCTTA GATGGGTTAGTAGGGGTTGTAGG
>NZ_CP014786.1|WP_063164269.1|927171_928149_-|IS30-family-transposase MTYKHLTTRELTLIADFWYQGTKAYRAAKLLQRSQETIYRVYRFLNDGKTIDQYLQTYQRHKRRCGRKQTQLPTIEVNYIHAQIKAGWTPDTIIGRHEHPISCSMRTLYRMFARNQYGFSVKQLPMKGKRHPNGYVEHRGKAGQLGRSIYQRYRDFPHYQHEFGHFEADTVQGKAHRGAVMTLVERQSKVMIVLNIHHKTDEAVNCQLDQWLAKLPRHFVKSITFDNGKEFAGWREIANKYDLHTYFAEVGAPNQRGLNENNNGLLRRDGLSKKLDFRDLPDELVTQLMHRRNNIPRKSLNYRTPLEVFLSHVTEEQLSLFSNLN >NZ_CP014786.1|WP_003674676.1|925731_927144_+|aryl-sulfate-sulfotransferase MGQSIFPTGVTNFRPSKTWSGYTLFNAKNEGTILIDMNGKIVHEWKDLQGFPNKMINGGKVFGSLRCRKSSDAYQDYADLTEIDWDGNIRWSFTHNEEVTDQEIGKTWVARVHHDYQLEGNPVGYFVPGQETKDDFKKVLLLTHHDRKIGSISPYPLLDHVLLEIDRNGNKLWSWSTLDHFNDFPLTDEQKNAIFKNPNFQSASKEGDVFHINYASYLGPNKWFDQGDQRFKPNNILMGSREAMMSWIVDHDTGKIVWLLGPDFTKSFTLRNLGPLVGMHNVHLIPKGLPGAGNILALNNGGWAGYGAPNQTSSTGMRTTRIDGSEVIEFNPITLEKKWSFSAKDMGYKVAAHANYFYSPLQGSVQRLPNGNTLIDEGAGGRFLEVTPSHEIVWEYIYPYIADHLIYRAYRIPYDWIPQLSPSTEIAVTPPANSEFHLPGAADPSLNPITTVSVTGAYGYNKPSPAKNNN >NZ_CP014786.1|WP_003675989.1|918513_919695_+|IS66-family-transposase MKRIGQHIYSREARLKPAELYCVNLIQETYKCDECINSNGSEVLISSEMPQSLLPHSYFSSTILAKVAELKFNLALPFHRQIKLWQAIGLQVDARLLAANIIKVSQTYLEPLYDYLQGLVKTEPVIHMDETPFKVIDESNGNGYFWVTRSTKEFNKHQITMFHYYNTRAGKTIGQILGQQYSGVIMCDGYGGYSDRLYPQAKFGSCLVHIRREFYRITCLLKKEQLKNSKAYQVLQLMRPVFHEEKQLAYHTHKEKLVQRRLHVKPLMDKLYAYLENINFPQGRLRAAINNALKLKTRVYRIFEDGRVPLTNNPVEQAIRPSTLIRKNSLFAKSTAGAQANAIFYTLVATANQNHLNIYKYFKYLFDHLPNRKDEGLEAYLPWSKKVQTECHK >NZ_CP014786.1|WP_003675988.1|917602_918103_-|thiol-peroxidase MEITINGEKHQLVGNPPAIGDEFPHFKVFDKDNNKIKMKELLGKVTLLSVVPDINTPVCSIQTKHFNSTMDEFDEVNFLTISTNTIADQQKWCAAEGVKKMQLVSDAEESFGYESKLLIPDEGILARSVWILDKEGKVVYREIVDELVNEPKYDQAIAALRELLKK >NZ_CP014786.1|WP_063164268.1|916946_917315_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MNQNEFDKKIKYFHENMPKQCPILYSMKIIGSKWKIPIMWYLMLNDGQHYNELKRSIGSITNTMLTKSLRELEEDGLLKRISKGTVPPSVTYHLTDTGKDLIYTMGDLFEWGKNLMEETQRN >NZ_CP014786.1|WP_035162004.1|916504_916834_-|hypothetical-protein MPFIMSRVNIKISKNKELMLKKRLGLAIANVPGKSEKVLMVGFQDNYPLYLRGNGNEPLAYIEVSIFGTESHTGYEGLNTDITKAFYDILGIQLDHLYIKYDDISSWGV >NZ_CP014786.1|WP_172381020.1|914123_914825_-|DUF3642-domain-containing-protein MRFSKAFLVATSIIAIGLYTSGCSSSSTSSNSSKSSSAQVSSVKKEESHIVGSYRDDADGAAITLNSDGTGTYVMANPTQADIHDQLTWKKEKNNYIINLNDSNYDTPIDARLNEDNLSLVGNDEWPNQSFKRVHGDFDVDNFLKEQHAKTSSSTTKDTHSKESSTHARAALKKWASDHHKDTNKIDNLKATTDLSEPDEGWAFVDDNGTEYAIVRNGKVYPRPVIDGGTSSN >NZ_CP014786.1|WP_003675974.1|912411_913911_-|peptide-MFS-transporter MSKQKNLDTSFFGQPRGLSTLFFTEMWERFSYYGMRAILLFYMYYAVTKGGLGMDQATAASIMSIYGSLVYLASVVGGWLSDRVWGSRRTVFIGGVLIMFGHIALSLPFGVSALYVSIALIVIGTGLLKPNVSEMVGGLYSPEDRRRDSGFSMFVFGINLGAAVAPWAVPWAANGFGLNLFHGEMNFHAGFSLAAIGMFFGLVQYVVDGRKYLSKDSLYPDDPIDKESLRPVIIWSIVGVVALVIILGLLAAMGQLNINNIITIITVIAIALPIYYFVMMLNSKKVTKDEKSRVVAYIPLFIAAAIFWAIEESGSVVLALFAEQRTILHIGGWHFAAANFQTLNPLFIMILTPFFVVLWDHWKKQPSAPGKFAAGLVIAGLSYVWMALPAMIHGTTAGRVSPFWLVGSWFIVEIAEMLISPIGLSVTTKLAPKAFKSQMMSMWFLADAAGQAVNAQVVKYYSSATEVPYFLIIGAVSIVFGLILCLFVKKIHGLMDGVD >NZ_CP014786.1|WP_003675973.1|911521_912352_-|metallophosphoesterase MKIAVSSDLHLDLNHADVAEIITQQAHYLTSHGIDHYFFVGDAFNDFEQTSAYFAELQSQLPTTKVHYLAGNHDMLKGVTYEQLENLDDDLYFHNRFIDIPQTNWRIIGNNGWYDYSFSTYKSNVKEVAQWKRAYWVDRSIMQPMNDPERMAIVLHQVEEALEQAHNQQKQVIFMTHFAPIREALPHPLIESVRRQRMWEMTTAMLGSRHLGALLAKFPEVKAVFYGHLHYAQPLITVGNIEYRNQAVGVRRKNSEDWKGESLLDQWISRLYTKKI >NZ_CP014786.1|WP_063164267.1|910518_911163_-|hypothetical-protein MPKQGHFAKSMRTKQLNDFKVKRNATGATIDDEQLTDFLVVRFALTAKKRVQSETRETVQRFLIEICDSLQENDGDLLAIIPNLLASLNARVPWQFYPEILGEWDLLQKFLQKELPAVPLEKPLRIKHPVTTQEMETLIAKLLAKKITAITFINQPGVDQNKKDQMVTMMLTTTYRDQRIEWEKVRLLLAPFKFEIAPELDEETKDWLKKLAEK >NZ_CP014786.1|WP_003676621.1|930802_931402_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MSKWIKQFLMAGLAGLIRPKHNRKYSLETKVAAVKAYLSSAYSNQELLQRYQIRNISQLHQWVISYNSGNLTVNQTTRKRARRMGRKVTFDEKKSIVQWTIDHDNNYKAAAEKYNVSYQRVYSWVRKYQENNDWAALKDNRGRNKGKEPTNELERLRKKVRELEAREREREVQIAFAKKLVEIRNREVDRPDDIKQFRK >NZ_CP014786.1|WP_117115084.1|931338_932247_+|IS3-family-transposase MSRNTQSGGGSTGRYQAIQEMIAEGYSVRELTKAAGVSRQAYYKWLKHDPNEREIEELELLKLIKQLENEHKQSVGYDKMTRLINLSQQVPYKVNKKRIIRIMRKHGIKADYRQPKHKRIQAQQTYEAENILKRQFDQSAANQVWVTDTTELTYGIRRNKVRLHVVLDLYGQYPVSWLITPTETAKGAIKVFEQARVSEGGLAPLIHTDRGSAYISKAFNQYLAINGTCHSYSAPGTPADNAVIEHWWADFKAIWIAHLPKAQTLTELEQQVETGITYFTEEFISAKRNDLTAAEYRFGKAS >NZ_CP014786.1|WP_081120415.1|932358_932499_-|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MLINWHDPDHVYLVCGKTDLRKGIDGLAMVIAENYGLELYDNSLFL >NZ_CP014786.1|WP_035161508.1|932488_932677_-|hypothetical-protein MEEKHDIVAPVFKAKGKPVSKAKISSRPVVKMKAGNIQLTIFKGTNPSLAAEIVKAVVHYAH >NZ_CP014786.1|WP_081120416.1|932927_937235_-|YSIRK-type-signal-peptide-containing-protein MLSRKNYKETIRKQTPTKQHYTIKKLTVGVASVLIGLSFMGELEGDSVHADTMTAGSESTSVTSTTAQDGLKKSPQLYLQVTDTNNPSTPSSASSTGTIKNVTSSAAVQVKSASDEEDSDSTLAKGENKFAQSAVKDSVTDGKTSTAEINPAKLSSPALITQLNQSLAKSSTSDALKANDELEIKATDPTNYPNCGDVDGPLFELDSGQLVNKDEVISLKDMYILQILKLVNTKDSNFQYVILTMNRKDTADRSIYLFGTGSNYSDATVFKAKPNDTYELGESGYSFTYTEPTTINGHDVDGSSYVTGSTYYDGWYLKPQHLQIIYSLGNYNPSNTDATSVGEIMPSYEKVPVIKYSGVPSNIISQPKVYIVGFTGQEFNVTDIINNYKKVLKGYYLQNPNVASMGTLSQFENGGYYLKTYYDDNGNVDFKGLYHQIDDQGTMEVSVLNANNEIIAGPEIIPAGGSYEFKYYNWTARNPYVTSSAHEVTLKYAKLGSVIPVDENGNKINDGWQYVNDPDDASKATSPYEKAPVIDGYVAVSPDETIVLPHNLSSDTKIYYRKSIKVTYSGSDSKTYDGNPANFDPTTVQWSGLAGLNTSTLTSADFTWNTTDQKAPTAAGKYTLSLNTTGEAALRKANPNYDLKTISGSYTYTINPLGIDKVTYSGSDSKTYDGNPANFDPTTVQWSGLAGLNTSTLTSADFTWNTTDQKAPTAAGKYTLSLNTTGEAALRKANPNYDLKTISGSYTYTINPLGIDKVTYSGSDSKTYDGNPANFDPTTVQWSGLAGLNTSTLTSADFTWNTTDQKAPTAAGKYTLSLNTTGEAALRKANPNYDLKTISGSYTYTINPLGIDKVTYSGSDSKTYDGNPANFDPTTVQWSGLAGLNTSTLTSADFTWNTTDQKAPTAAGKYTLSLNTTGEAALRKANPNYDLKTISGSYTYTINPLGIDKVTYSGSDSKTYDGNPANFDPTTVQWSGLAGLNTSTLTSADFTWNTTDQKAPTAAGKYTLSLNTTGEAALRKANPNYDLKTISGSYTYTITPKMITEAQDVTYDGSYTKTYDGQAASVADIKDPTWTVKGLVNSDKYDHSGLTNEDFNWMKDGQPISGPEAGVGKYVLTLNQHGLDKLNQQNPNYQVDESALSGQYTYTITPLTVVAVNYKGYDKKVYDGRPGVINLDKLVWDELPDGTNLNLSGLTSAYFSWDTPNHEAPTEVGRYTISLTKQGEDLLQSENPNYNFIKFTGTFIYDITPMAEVTVTYNGADGKIYDGQPGTINPAKLTWSKLPDGTSLKMPTWSAGDFAWDTADGLAPTAVGTYQIKLTDAGKAALKKANPNYDLSSITGVFTYEIKPAQTPETPGQTPEQQPGQTPEQQPDQNTNQSGTSENGFGPSARPNASTNSNASQLPQTGNDHSNTALAGLALASLIAMLGLGKKRKHD >NZ_CP014786.1|WP_063164271.1|937876_938836_-|beta-galactosidase MAYTNKLHVIYGDGALGVAGDDFHYIFSYERGGLESMKIKGKEWLYRVPTPTFWRATTDNDRGNGFNVRSAQWVGADLFQKCVGIDLTVGDHHFDELPVAPRTNDFTGDEVTDGVVISYTFATLTIPSTHVTVSYEVQADGQIKVGVYYAGKAGLPELPVCGLRLIVPTEATGYTYAGLSGETYPDRMAGATRGTFTVKGLPVAKYLVPQENGMHMATDWVEITRNTTQNNADHDRAPFSLRVAKDDQPINFSCLPYTAEELENATHIEELPLARRTVLVVAGAVRGVGGIDSWGADVEEQYHIPADRDIEFSFLLNAK >NZ_CP014786.1|WP_063164272.1|939117_940086_-|hypothetical-protein MNSRIYTSIFNLKNITALEDIEQWRSEHCDDPVRHSKRHQEEFKRLPDGERNYRYSWNNIGEVESLPFSYGGKEINFVEASARIEYAKRKIFDSDHHYLPKKERTNLENIDIIFFEMNQKFFILIEESREKQIDRVLRLIGKANYEEVENLSSDFFNWLVYLYSENEGKLNSKIGITSISGFLGNVFDDENVVSSKSEETIKLIATRAFISTGGILREVKLNVDDSNNYNICFKMDDRCRTVISVNESVPYMTPNALEKGERLVLYMYTSLLPCLQKMFQAKKAGFKNKKKKFAKKIGLQVVKEIMDINNIHKDEIEPLDIN >NZ_CP014786.1|WP_063164273.1|940078_940768_-|hypothetical-protein MKSVFEALAKFLVGFLTAIIVSNKANILLKLLINMGIHNRSLQNTIVSLLVTFFVTCIVAILDHVYTNILFPMKINITSEQNEVKFKPNNNIYEPQRLNMHYEITPGGSLTMWMLKRLNVDLLVFFNPNYIDIALEEDKKWDFSGKEQEGLGFTEKMNQLHFLVLNSYFSEGKANKKYTVSVGMEICPKRIQNQEISLDYAMKSKKKMISTLLCKVHICDFKCKGVTDE >NZ_CP014786.1|WP_063164274.1|940751_941279_-|hypothetical-protein MKSYKILYQEDQHKNFSDYFKKENIDYIEGKINGSFAIQYNPQKLNSLLNEKEFFAKWIEYGIKQAIMTDQKFAFLILNLERIGISFLDCETNDGDNREIICDEDDRVSRELLLDLVSDEYKYILSATFFSKTHRNKIKLTQKGILHFEKSGEEIKTLIDIVNVGNEALNNEKCI >NZ_CP014786.1|WP_063164275.1|942109_943636_-|lysine--tRNA-ligase MSQELDQMRVRREKMEELKEAGIEPFGRRFKRDHLAQDLHDKFDQYDKEELNEMGAKVIIAGRMTRKRSSGKAGFADFVDRTGKIQVYARKDMVGDEPYHVFKRSDIGDFLGIEGDVIKTDTGELTVRAHKITFLSKALRPLPNKWDGVTDPETIYRQRYLDLISNPESFKRFHQRTAIIKAVRKYMDDNGFTEVETPILNTQAGGANARPFITHHNALDIDMYLRIATELYLKRLIVGGFERVYELGRIFRNEGMDPHHNPEFTTMETYAAYFDFQDVMDETEGIVKAAAKVVSDDGKITYQGHEIDLGGNFKRITMVDAVKEKTGIDFSDESMTDEDAKKLADEHKVEYKPYWTKGHILNAFFEEFVEDTLIQPTFVYEFPVEVSPLAKRNADNPAMTDRFELYVDGSELANAFSELNDPIDQKERFEMQAKEKANGNDEAEPVDLDYVQALEYGMPPTGGLGIGIDRLVMLLTDAKSIRDVILFPTMRPEKEQKNGSKKKKNNKK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014786_2 | 1885524-1885880 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014786_2
|
4 spacers
spacers of NZ_CP014786_2
>2.1|1885547|55|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder AAAAAATATGTCTAGTATGTTTAGTGCAGATCCTGAGTTAAAACATCTTAATTTA >2.2|1885625|55|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder TAAAGATATGTCATTTATGTTTTCTTCATCGAATTTAGTTGTCCCTGAGAGCATT >2.3|1885703|55|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder CACTAATATGGAAGGAATGTTTAGAGGGATTGATACACTCCAATCATTAAATTTG >2.4|1885781|55|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder TACTAATATGGCTTTAATGTTCCAAGACGATGCAGCGTTAAAAACAGTTAACTTA >2.5|1885734|27|NZ_CP014786|PILER-CR AGAGGGATTGATACACTCCAATCATTA >2.6|1885812|38|NZ_CP014786|PILER-CR CTTTAATGTTCCAAGACGATGCAGCGTTAAAAACAGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014786_2
The CRISPR arrays of NZ_CP014786_2 >merge|NZ_CP014786|2|1885524-1885880|CRISPRCasFinder,PILER-CR AGTAACTGGAATGTAAGTAATGTAAAAAATATGTCTAGTATGTTTAGTGCAGATCCTGAGTTAAAACATCTTAATTTAAATAACTGGGATACTAGCAACGTTAAAGATATGTCATTTATGTTTTCTTCATCGAATTTAGTTGTCCCTGAGAGCATTGAGAACTGGGATACTGGTAATGTCACTAATATGGAAGGAATGTTTAGAGGGATTGATACACTCCAATCATTAAATTTGAATAATTGGGATACACATAATGTTACTAATATGGCTTTAATGTTCCAAGACGATGCAGCGTTAAAAACAGTTAACTTAAATAATTGGGACACACATAATGTCACTAATATGGAAGACATGTTT >NZ_CP014786|2|2|1885524-1885858|CRISPRCasFinder AGTAACTGGAATGTAAGTAATGT AAAAAATATGTCTAGTATGTTTAGTGCAGATCCTGAGTTAAAACATCTTAATTTA AATAACTGGGATACTAGCAACGT TAAAGATATGTCATTTATGTTTTCTTCATCGAATTTAGTTGTCCCTGAGAGCATT GAGAACTGGGATACTGGTAATGT CACTAATATGGAAGGAATGTTTAGAGGGATTGATACACTCCAATCATTAAATTTG AATAATTGGGATACACATAATGT TACTAATATGGCTTTAATGTTCCAAGACGATGCAGCGTTAAAAACAGTTAACTTA AATAATTGGGACACACATAATGT >NZ_CP014786|2|1|1885683-1885880|PILER-CR AACTGGGATACTGGTAATGTCACTAATATGGAAGGAATGTTTAGAGGGATT GATACACTCCAATCATTAAATTTGAAT AATTGGGATACACATAATGTTACTAATATGGCTTTAATGTTCCAAGACGAT GCAGCGTTAAAAACAGTTAACTTAAATAATTGGGACAC ACATAATGTCACTAATATGGAAGACATGTTT
>NZ_CP014786.1|WP_063164445.1|1881711_1884429_+|KxYKxGKxW-signal-peptide-domain-containing-protein MENKKHFKLYKSGKKWIVATIITIAISTGIVFSENVLADTQQPQSTGQVQKINNPTNDQTYDHQDKGNYGYLDQANFNDNQLQVTGWQATNQSLDEQNRFVIAYDSTTNKELGRSKVINNVTRPDVAKVHNVYNAANSGYNSNIKLNTKNMQDENDSIQVVSRYSNTQTGEGQHTDWWSQPIEIDKSNYGSLDQFQVQNGQLSVAGWHATNGSINRDHHFLILFDQTASHEISRQEVKEVARPDVVRVYPNIMNADNSGFKAVFNVANLDPNHQYQILSRYSNAANGEGSYVTEWFAPRRIAPVNRVNEGWLDSFNISEPGQLTVAGWHASDLSNVASNRFIIIFDRTANRQVASMKINGIARSDVAKAYPHVLNAENAGFNVTFNLNSLQPGHQYSVVSRYSADPNGNGNDGQHIDFWSSPVTLNQTASYVDQVKMTDQGLHVQGWMASDNSLIQQNPYLIVLFDGKEITRQKLSLIARPDVGRVYPAMYGSAKSGFSTDIKLSTDQLNKLVNGNLQILLRFSAATDGNPYLNQGVTDQLSSNYSTNMGNANISLNGNNINIKGWHEAIGENSRPYQYLIVVGLDGHEFYRVKLDNTNSNLNSSNTSWLNNNKSSFAATLPVSAAMNHRGIKVLHRYTDDANGNGNYLDFWSPQIDINDGFQSLNGGIVYYDPVNGQLATGWRTINGNRYYFSDGYECQPDPDDLWVYNDQLHGRMYTGINWVDGHCYNFGNDGIARALPQNDGWSWPFPQSGEGWHYQGQKFGYTSNIRKNGYHDGLDFGTQDHPGSAVHAVHGGRVLDVNTVRDNNGQTMWWFTTIWDGRFLYVYQEAFSNRNKITVKPNDIIYAGQVIGYRDKDHLHLGINTSPNYGVDLKNSFVPSWSDSSKATGHGEWIDPEWAIRNRI >NZ_CP014786.1|WP_063164444.1|1877027_1878065_+|family-43-glycosylhydrolase MHKTTIRFIDENGASIITDQNVRLIKFPFVTHVNGYKQVSGIHYIQQDHQFVAKYKPEKNPLKQVKAAHFIGVTFQPTTVPITKGTQSDPFILSRQYDNGSRSGRDTLRILIGESYKKMKVLNANYPAVSVRDPSIMKQGNKYYIIYTRGLMSTTDFNHWEQINWSSVPGFDYSQDWAPEFVQGHDGKDYVIMSMQKKGNKHHQIMITSFNNGKIGKNWVEITGNLPINTIDPNLQYANGQYYLFCKNENTRKLVMGTSNNLTGPYKMERVQFDSSKYGSIEGPEAIIHNGIISLVFDTYDTQKNGTVSFHGLHYVERNVNGNRWSKMKKINSSIVTRHGQIILN >NZ_CP014786.1|WP_003668625.1|1875364_1876942_+|peptide-chain-release-factor-3 MSPKELAEAVNKRRTFAIISHPDAGKTTITEQLLLFGGVVREAGTVKARKTGNFAKSDWMEIEKKRGISVTSSVMQFDFQGKRINILDTPGHEDFSEDTYRTLMAVDSAVMVIDSAKGIEPQTKKLFQICKMRGIPIFTFMNKFDRDAREPLDLLNEVEDVLGIETYPINWPIGSGHQFKGIYDRFNHRVALTHPADENNPYLPLDEDGNVEGDNPLAGDGEWQDAMDGMELVEVAGNELDQEKIAKGDQTPVFFGSALTNFGVQTFLETYLQFAPAPSDHKTEDGDVVKPLDPEFSGFVFKIQANMNPRHRDRIAFVRICSGEFDRGMDVTLSRTKKPMRLSNVTEFMADTRENVETAVAGDIIGLYDTGNFQIGDSIYNGKKDIQFEKLPQFTPELFVRVSAKNVMKQKSFHKGINQLVQEGAVQLYRSYSTGDYILGAVGQLQFEVFKFRMQNEYNSEVVMEPMGTKTARWIDPDQLDEKMSSSRNILVKDIHDQPLFLFENQFAENWFKQKYPDVKLTAKL >NZ_CP014786.1|WP_063164443.1|1873708_1875178_-|LCP-family-protein MDNNNNNESREHYRKRMEERIQREVNERKRREREEAHNKRENRLRREEEQSSPDYQPPKKHHYRTPNWVRALIGLLICLVVAGGFYEYHKVHSVAKGVFGAGDGKISKKLQKGEPVSVLAMGTDVGALDRGNKGGNTDSLELFTINPKKKTITMTSIPRDILVRVETSDGPDYVKINAAYSINGPKQTVKQVSELLDVPIDYYAVINMGVLEKVVNSVGGVEVNNPFAFDYEGHHFKKGKQHLNGANALKYSRMRYDDPNNDYGRQKRQQQILKSVINKFKASGSIGAANKILDAVGDGVKTNIPIDDIATLYGNYHGAMNNVKTYHFQGQNATIEGVSFQIASPKEINRVSKLVRAQLGLKAKNVVNHETKMYKSQPHYNGYNETDFILPGGASYNDPGSGNGSDEVIGSSRASRRSTNETKSSSTYTAGNNESYSESRAVPAAGNQTQTAPIQHHYSTPQYHTYNGYHSTYTHPTYGNHYGYTHRYY >NZ_CP014786.1|WP_063164442.1|1872547_1873666_+|AI-2E-family-transporter MSKQKFYHWLFWPLLLLTVATLIWMCTKIQFIFQPFLTFISVVFVPLIISGFLYYMLNPVLKLFMKIKIGRFHMNRGIASLLIVLLLIVIVVGGIAMLIPTVVKEISTLVRNMPQTVTGIQHLINDTIEHSFLRNVDLNAYYRQFDHQLAGYAQKVLQGLSTRVGDIIGMLTNVTVVTITVPVMLFYMLKDGSKLIPSIQKWLSPHHAKEVNDLLGKMNSTLSSYISGQMIECLFVGVFTSIGYVVIGQPLAIVLGIVAGLTNIIPYIGPYIGIAPALFVALTMAPNKIIWVIVVVIVVQQVDGNIVYPNIIGKTLQIHPLTIIMLLLAAGHIAGIGGMILCIPFYAVIKTVCEYFFDIYRIEHPVDKTKTE >NZ_CP014786.1|WP_063164433.1|1871548_1872517_+|IS30-family-transposase MTYKHLTTRELTLIADFWYQGTKAYRAAKLLQRSQETIYRVYRFLNDGKTIDQYLQTYQRHKRRCGRKQTQLPTIEVNYIHAQIKAGWTPDTIIGRHEHPISCSMRTLYRMFARNQYGFSVKQLPMKGKRHPNGYVEHRGKAGQLGRSIYQRYRDFPHYQHEFGHFEADTVQGKAHRGAVMTLVERQSKVMIVLNIHYKTDEAVNCQLDQWLAKLPRHFVKSITFDNGKEFAGWRAIANKYDLHTYFAEVGAPNQRGLNENNNGLLRRDGLSKKLDFRDLPDELVTQLMHRRNNIPRKSLNYRTPLEVFLSHVTEEQLSPFF >NZ_CP014786.1|WP_063164441.1|1868775_1871397_+|KxYKxGKxW-signal-peptide-domain-containing-protein MEIKKHYKLYKDGKNWCAMALAVAAVSAGLVLGNTNVKADTPTDNVPVVKTTNPTTGDANAELASQEKAAQAKDNGNYGYLDAAQVVSNNDLHVSGWQATNQAAGKDNRYLVAYDSTTNTELGRTSVTENVARPDVAKAYPDVVNAKDSGYQATMNNLDWSKVKSVDDQIHIVSRYSDAATGEGDHVDNWSQPINLDKGNYAYLDNFSVANNQLQVSGWNATNKALGKTTHYVILYDRTAGHEITRVKVELTVRPDVAKAYSQVINAKDSGFNTAFSLAGIDLNHELQIISRYSDAANGEGNYVSYWYAPQKFAPANTSNQGSLDSFNLSNGQLIVSGWHATDYSQVENNHYLILFDNTNKTQVKSIKVTNVARPDVAKAYPTVATAGQSGFNANFGPVNLTPGHSYSLVSRYSTLDGGNGDNGQSKITDYWFNPVTLDQQASYVDSFTKTDNGYNVKGWMVSDQSINKPNAYLILLNDGQEIARTKVELTDRPDVAKVYPSIYNSQKSGFNGEFKVNSAKANGTLKVIMRFAGDDANQNYSDQYSQDYPTNAGNFDNIHVTASQVSLSGWHASTQAGNKPYEWLIVLDNNGQELYRQEITDKNISRNDVQNVYPYIEGANKSGFQVTMNIPTKMQGHLVRFIHRLTDDKDGNGNFIDLSSNPVLVNLQFNLNENGINRYILNNHINHATITVNHVIPSDTTDVYSETEDGKPNMVVVHETANPNDSIWGEINYEKANYNKAFVHAFVDENQIIEISPTDHEAWGAAYPANGRAVQFEQVEVYGANNFARELVNAAYYTAYKMNEYGMIPSLAQANGTGTLWSHHNVTQYIANGKTDHTDPDGYWANRASRYFGTSYTMKDFFELVKYEYSHL >NZ_CP014786.1|WP_063164440.1|1867864_1868704_+|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase MTKILITGANGQLGSELRNLLDERGVAYDAFDSNQMDITDQAVVNEKISALEPEVIYHCAAYTAVDNAEDVAKDLNWQVNVDGTRNVAEAAKRVGAKMVYISTDYVFDGANEGEYEVDAPTNPRNEYGKAKLAGEKAIQETLTDYYIIRTSWVFGKYGKNFVYTMLRLAKDHDQLTVVNDQFGRPTWTRTLAEFMTYLVDHDQPFGTYQLSNENSCSWYEFATEILKDKDVEVAPVDSSAYPAKAYRPRHSIMSLKKAEDTGFEIVDWQTALNKFMEII >NZ_CP014786.1|WP_063164439.1|1866677_1867718_+|dTDP-glucose-4,6-dehydratase METFKNIIVTGGAGFIGSNFVHYVVNHHPEVEHITVLDKLTYAGNPANLDGLPKDKVELVVGDICDKDLVDQLVSKADAVVHYAAESHNDNSLIDPTPFIQTNIVGTSVLINACRKYDVRYHHISTDEVYGDLPLREDLPGHGEGKGEKFTPESPYRPSSPYSSSKASSDLLVRAWVRSFGLRATISNCSNNYGPYQHIEKFIPRQITNILSGIRPKLYGSGKNVRDWIHTNDHSRAVWDILTKGKIGETYLIGADGEKNNKEVLEMILELMGQPKDAYDHVKDRPGHDLRYAIDATKLRTELGWEPEFTDFKTGLQHTIDWYTEHQDWWKDEKVAVEAKYAKNGQ >NZ_CP014786.1|WP_003664372.1|1866084_1866666_+|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase MGKLNVQTTKLQDVKIITPAVFGDHRGFFEETYSDRDFKAAGIDFNFIQDNQSLSTQAGVLRGLHFQRGKAAQTKLIRVVTGAVLDVIVDLRKGSPTYKQWEGYILSASNHRQLLVPRGFAHGFLTLTDNVNFVYKCDNYYDAEADGGISFKTPELNIDWPIEFDKAITSEKDAAQPTLTEFEKDNPFVYGEI >NZ_CP014786.1|WP_063164447.1|1888592_1888976_+|GntR-family-transcriptional-regulator MNFDFNDSMPLYQQIADQLEEMIFSGGFDEGSQVPSTTQLSQQLHINPATVLKGMNILVNKGLLEKRRGLGMFVKKGAQQKIMEQRKESFYNDYVKSLLVEAGKLGITKQHLLDLIERGENDGSINS >NZ_CP014786.1|WP_079376125.1|1888953_1889820_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MMDQLIVKNIVKKYRRQTVLDNISFTLEPAKIYGLLGRNGAGKTTLLNIMSNRIFPTSGEVKIGNEDVNNNDDLLSKIFLMSEVNLYPRHMKISQTFDLADAAYNNFDYDLANRLLKVFGLNDRMKITNLSTGQRTASKLIVALAVNADYVLLDEPILGLDANHRDSFYKELVKTYQERPRTFVLSTHLIEEIQQLVEHVLIMDQHHIIINEDTEGLLAKAYTISGPEKMVDEYTAGLKVLKTEMMGNIKTAYLLDRLDEQRVIPDQIKIGHYDLQHLFIYLTNGGEY >NZ_CP014786.1|WP_063164449.1|1889819_1890506_+|hypothetical-protein MKNQKRNLVISTMFQQAGDATGIALGWGLGIVLIIYLLELIISHNLESFLVSLQALPGIASSILNILLMALFLVTPYTDFKWAIQNGISRKTLWQGRILSLFLMTLAVWFIAQLVDLMNTPFDLASAWHSLLWYFGLSLTMMAIGNGFALLNRRWKWIVGIGLPMACLVLLMMLVYSLVGLIPALSASGVFKSIIISNITGWVILVVYLIIVYALARFFNNKIQLRRD >NZ_CP014786.1|WP_016496665.1|1890564_1891290_-|MucBP-domain-containing-protein MIDKFKTGNPIWVYYNDIDSGANLTVPQLLRGFIGQEYQIEQKQFPNYRYVKTEGETKGTFDMRQRIVHLFYRKQNWGEVQSIEMYLHLDAPTQIFDTAGGMPVGAPLPADITVKSFHRVATKNGQFWYEIGADQWIKYDQMHVVDNPFNQDIRKEKSKLINNLTVIPLKNVQAKVDYLHNKSINVYDAPYGNKVAEIPNGETITLIGKLNDNDEITWYQVGRKKYITSNYIQIEYPEDDE >NZ_CP014786.1|WP_003674710.1|1891439_1892048_+|ECF-transporter-S-component MAKTRHQQIRHNTTLAIFIAIILLQDFVPFFGNIPLGPLSITTLHVTVIIAAIVLGPVDGAIIGGIWGLLTWVRAFVAPSSPLAPLVFVNPLVSVVPRIMIGILAGYTFILMCRLIKAKYIAAVGAAIVGTLTNTGLVLGFIYLFYRTPAVAQTYGVNVNHLLIALETVMATNGLAELILAIIIVPMVALPVLEVRRRLEVS >NZ_CP014786.1|WP_063164450.1|1892099_1894304_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MQCQYCHQNPATIHLQMNFNGQRIQIDLCQNCYQKLQNLQTDMMNGGNGMNNFGFGSLEDFMNAMNNMQSQAAGANGQNMNGHSQRQGGGRNGKGILGQYGINLTDLARQGKIDPVIGRDNEIKRVIEILNRRTKNNPVLIGEAGVGKTAVVEGLAQAIVSGQVPEKLANKEIIRLDVVSLVQGTGIRGQFEKRMQQLMEEVRKNKNIILFIDEIHEIMGAGNAEGGMDAGNVLKPALARGDFQLVGATTLNEYRKIEKDAALARRFQPVEVDEPSVEETIRILNGIKSRYQDYHHVKYTDDAIVAAAKLSDRYIQDRYLPDKAIDLLDEAGSKKNLTLKNVDPNAIENEIHTAEAHKQQAADNQDYEKAAFYRDQVAKLEKAKKEAEENHTEDSATVTVKDMQRIVEERTNIPVGDLQKQEENQLRDLDKKLDEHVIGQTQAVDKVARAIRRNRIGLNKSGRPIGSFLFVGPTGVGKTETAKQLALQLFGSKDVMIRFDMSEYMDKTSTSKLIGAAPGYVGYEEAGQLTEQVRRHPYSLILLDEVEKAHPDVMHMFLQILDDGRLTDSQGRTVSFKDTIIIMTSNAGTGDSEASVGFGAESNGSTHSIIDKLTNYFKPEFLNRFDDIVQFNALSKDDLMKIVNLMIDDVNNMLTDKNLHIEVTNNVEEKLVDMGFDPKMGARPLRRVIQEQIEDRIADYVLDHSDAHKLVAKLDDNGDIVVEETEEVPTIAKK >NZ_CP014786.1|WP_003674706.1|1894580_1894766_+|hypothetical-protein MAEENFEQLLDDLRNKKIDHFVITPENFQQFQPIFHSYAYRSQIEGEAQRGGKIIYQLRER >NZ_CP014786.1|WP_003664342.1|1894887_1895154_+|phosphocarrier-protein-HPr MEKREFTITSETGIHARPATILVQAASKFSSDITLSYEGKSVNLKSIMGVMSLGVGQNAKVTITANGDDEKEALDTVAETMKKEGLTD >NZ_CP014786.1|WP_003674704.1|1895153_1896884_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MSILLTGLAASSGVTIAPAHLLVESDLSIKKQHTADENHEVARLHDSFALSKTELQHLSKHAHELLGQRAVTIIDTQIAILDDPTLQEKIIDRINSHHDTAEWAVKRVEDYYLSVFERKNDNEYLYARATALRDVTKRVLSHLLNVSLPDPGLLDHRAIFVANNITPTDTAQFDKRYVAGIVTTNGGRTSHFTIMSKTLSLPAVVGVKNATTIIHDGDLLIVDGIHGKVIVNPTNEEIEHYRLLAGKFIQEQQKWGALKDKQTVSADGRRFEVGANVGTFADVIDAQEDGAEGIGLLRTEFLYMSKDELPTEEQQFNAYKRFVSAMNEQRVVARTLDIGGDKKLGMVALPHEDNPYLGFRAIRIGLARPEILRPQLRALLRASVYGRLAIMFPMIATIEEFQAARAILDEEKEKLEQAGIQVAKNIEVGMMLEIPAVAVMAEHFAKYVDFFSIGSNDLIQYLFAVDRGNQQVAYLYQELHPAVLRMVRQVIEAAHAEGKWVGMCGEMANNAYAVPLLMAMGLDEFSMSSSQILRVRSLINQLNTRKLQPLVHRAIHAETAAAVQKLVEKYVPQVKL >NZ_CP014786.1|WP_063164451.1|1897117_1898335_+|glycosyltransferase-family-4-protein MNIGIFTDTYFPQVSGVATSIKTLRDELIAQGHHVYIFTTTDPKAKHDDVENGIYRFASIPFVSFSDRRIAVRGVFRAIKLAKKFQLDIVHNQTEFALGVMGKTVAKHLHIPCLHTYHTMYQDYLHYIANGHILKPNDVARLAHLYLKNISGIIAPSDRVLDTLTSYHVESPIRVIPTGINLRVYSKRDSAEEIANLRAKLGYGEETSVLLSLSRLAYEKNIHSLIEAMPDILAHKPDAQLLIVGDGPARHTLERQVREMQLNDNISFAGEISNDEVYHYYQMADVFVSASDSESQGLTYDEALASDLPIVVMRSEYTDQLIDDAAIGISFQKRADLVKGVLFYLNQPKNSESRLKRQQKLHEISAEVFVEKVVQFYQDCQNDMSVQDELNQTEKSHRLFHRPRS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014786_3 | 2208883-2208998 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014786_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014786_3
>3.1|2208915|52|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder AAGTGAATCAACAACTAGTACCTCAAATGTTAGTTCTGATTCAACATCAAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014786_3
The CRISPR arrays of NZ_CP014786_3 >merge|NZ_CP014786|3|2208883-2208998|CRISPRCasFinder AGTACATCGACTAGTCAATCGAATACTTCTACAAGTGAATCAACAACTAGTACCTCAAATGTTAGTTCTGATTCAACATCAAGTAGTACCTCAACCAGCGAATCAAATACTTCTAC >NZ_CP014786|3|3|2208883-2208998|CRISPRCasFinder AGTACATCGACTAGTCAATCGAATACTTCTAC AAGTGAATCAACAACTAGTACCTCAAATGTTAGTTCTGATTCAACATCAAGT AGTACCTCAACCAGCGAATCAAATACTTCTAC
>NZ_CP014786.1|WP_016496748.1|2208081_2208279_+|hypothetical-protein MNKKEDHDQPQSLIQQDALKRLEKVEEEKRQPYKKKKEPINFRSVLMTLLLILVVGMMLIGYFIR >NZ_CP014786.1|WP_003675575.1|2206763_2208089_+|accessory-Sec-system-glycosylation-chaperone-GtfB MLNLFDNFDQASFDFLRSQRTAQIKIPTVVINDDGFLPPEVESPIKYWGNYNVNKKPLYFDHLSLPRYWRILSTAAQGHIYDLDKKRADIIYQATDNTRQVKEVRWLNNNGKVSWIDHYNRYGYRFAQTYYRNEQPAWRKYYDKKNRVFLEWNLIAGDFFLDVDGGYHFPSLIELVKYYLQTRHFKLDHIFYNTLNQGLSVSLNLPADGSDTLFWHEPLSGDELPGNMKFLMENSTRTKHIIFQRYTDWQRIGANLKNNHVDFGFLGTIYPHPRANQLRPQALILTNSDEIVELSTLIKNLPNIKFHIAAVTEMSGKLLAYQQYENVELYPNVSSARVKQLIADCDIYLDINRQNEILDAVRGAFEQNMLIVGFDETLHEPQFVTPQNMFKVNEAQKMSKHIMAALLKPALMKELIDTQRQLASEVSVQDYQRMIGALQSE >NZ_CP014786.1|WP_003675577.1|2205232_2206771_+|accessory-Sec-system-glycosyltransferase-GtfA MTVYNINLGIGWASSGVEYAQSYRAQAFRNLNISAKFVFSDLILGNNIADLTANLGFNADQIIWLYNFFTDIKIAPSTFLLDTFVEQNHLEQRNFSLLPNNGTKELQYKSEEEKLTIVPRYNNREKQTIDQVTYIFNNRLIKRDFYSYTKYATEYYSGEEKDNQVIFREFYNENGTIAYTQHLDGDGHELFEFPDQNYYSKTDLYREMLRKFNFKADDIIILDRMDEDKQLVNGQLIFEHHLPAKLVIPVHADHYDKHYTNDHQVLWNNFYEYQFMHYQDVAAYVVATDRQRDLLASQQKHFNHAKPQINTIPVGSLEHLVKPKGTRKKHSLITASRLANEKHIDWVIEATVAAHKIVSDLTLDIYGEGGERSRLQNLITKNNADSYIKLMGQHDLKDVYQKYETYIAGSTSEGFGLSLMEAVGSGLSMIGFDVPYGNQTFIVDQQNGYLLPYTEDWSNSRKEQLLADAIVKNFTEADLTSFHEKSYSLAESYLTKNVAKQWQQLIGELQHA >NZ_CP014786.1|WP_016496747.1|2202869_2205218_+|accessory-Sec-system-translocase-SecA2 MTYPNFRLQKVKHTLAKVNALTAEMRGMSDEELKHQTVLLKKELANGKTVDDILPRAFATIREADYRILGMFPYDVQVMGAIVLNQGNIAEMKTGEGKTLTATMPLYLNALTGKGAMLLTPNGYLAQRDKEQLQPVYEWLGLTVSLGFTNSDQKPLPQVKREWYNSDIVYTTASSLAFDYLFNNLATRIDDQYLRPFNYVIIDEVDAILLDEATSPFVVSSTPMVQSNLYRLTDDFIHTLQPEIDYKLNEDRTAVWLTLHGIRQAQRFFRITDLFTNRYREVYRHIILALRAHFIMENGHDYLVSEGKVVLLDEANGRLKRGVKVSTGLHQAIEAKEQVDLTPNQQVAASITFPSLFGLFNKIAGMSGTVKSDEQEFFEVYKMRVIQIPTRKKVIRRDYPEQIYLTTRQKLIHALDETIELHKAGRPVLLVAGSVENSEIISELLLDQGIPHNVLNAFNVAREADIVKDAGQRGAVTVATNMAGRGTDIKLGAGVKELGGLAVIGTEMLPTRVKLQLAGRAGRQGDPGSSKFYISLEDSYLAKNSTKRFKNYYRQLQKKKTDKQLRSPRLKMSIAMLNDRVAANQQMARSNVNKNEIALKIQRKYLYDRRDQLMRTAHLETEVGKWLSRGISLYLDKKVKWNALELRHLMNQHFTYDVVDLPDNLELDHKKIQKYLEQFCQKELEQKAKVLINSEQLNQFYRSALLNALDSSWTDQMAYLSKLSVIVQPWTTAQRNPKFMYQEKAYQAFEKMFDTVAKKVVDNLMLSTIRLNKDNNLIVHFN >NZ_CP014786.1|WP_003675581.1|2201978_2202866_+|accessory-Sec-system-protein-Asp3 MQQFINQGYWESSNAYSAGSDIKINSDYSVLFHNSLMAPGKVIMSWNSVNSYQATKLVPQLPILRNNHKYRLSVNAKAAPIYSLIIRLTFFDAQEHEIDHVEFQQRSIEFVYPPEAVQYRLELINNGLTDLTFQRFEICDADLPVSVHEDVWFHEPINEDVKGKLNLLLIADNKRVRKTYPDLKKYEDYKMQPISVAWQSSADVVAILKQWLISNRIYDANVISTNPKLDQVVLELKMELSTINAVVTNQTDPQSQIADVIYPLLPPTTWSSPVLVNPDWPIIFSVIQEINSKEG >NZ_CP014786.1|WP_016496746.1|2200488_2201976_+|accessory-Sec-system-protein-Asp2 MNVLQLGAQNWADKYKIPNEITWNYNTYPQAGIKRFDLVIITEGVQLEDNLWSKLQWQVPPYCVLYSPFAERDLNEAGLNFIKCQEARQIVEEPQELINQLPIRFFQGQSGIRFAPTKLLLNDPVGTFVDGGHLTLKIEADEWTNLGSYQQNVYIDPQRLLKFSLEYSQKSNIKVRLRVFVRPNGGDGNSKDQYLLDFSRNNEEQELPIGLEDAPRFASVSVEVLGKGKLTLGTLHARWSRRDYGEFLAGGKRLIAPVNGEDIPYYFNPGDLRPPLHVYFSGARGLEGFEAYPLFRRNHTPALLFTDPRLAMGQFYTGEAIESQIKDTIIVTLKKLGFDRQQLVLNGISMGTYPAIKLGAQLSPYAINVAKPTVNLGQVALRARLERPDEFDTIFDIDRQLVASLTSEQLEQLDMDFWNLMNQNDLTKTRIYVGYMKNDDYDNLAMKKMQENSAIQSAQLFVSKGFPGRHNDNRAVVQWFVSRLTEINNAFGRGE >NZ_CP014786.1|WP_003675585.1|2198965_2200477_+|accessory-Sec-system-protein-Asp1 MDYLVPAWHELLEGWSYTIPKLEFDDAVSHIKVFQTNQKPFSLIITDYQPQLSTKLNQLTISPTQIFSTFDYLQGVHHVDSQIIDYRDFNWPTGAYYNFTNFRVIVMVKENPYAKVTFDTQGKILWVDYLEKDKISRRLLLDSRGFVSREELFENGQPYQYIYYDEQGYWRFKHDVKSDRVEINKRFSELTDYLHYEHLNDLLEEIITKYVLSKFDINQDNLIVTLDDQAVIDQKNYLPYQPIFSLSRWHRYHESLDELKSQELNLVADNNETKNNIKKQSNIDATIIPLFQSRFNLGHSQRSDQEQIGLFIESMTKDEVDKVLELLYQRLLKSPDAIALTVMSYSTEKLQQAQQALENLKQTHQGEFILASEEQNEVEEILTKQIGIPKLTIDTKRISTPAEAGRQLDSLRILIDWGNQLDEFLQISAISTGIPQIYRQPNSQIKNYQNGLICPQISDINKGLNYYLGNLKHWNEALIYNVQLMNQLSAAELQKKWEKVLTK >NZ_CP014786.1|WP_003675586.1|2197772_2198963_+|accessory-Sec-system-protein-translocase-subunit-SecY2 MTQKIQLNNLLKRLGATFFILIIYILGCTISLPLVNISTTFRRVLANSSLGIMSFMSGGNLQRLSLFSVGLNPLMISMMIIQLLTMMRLFYFDTFSIKQTMRIQQWLTLIFAIIQSLALTLMLNLTTNLLTSLAVTLMLTAGSLFVVWLGNMNTRFGIGGTITIILFNIISGTLPNLLSSIGKIVGQSYGILWLALIVLASFGLLIFWISFNRAYYPIKMVDTMMSSHDKPIILPLGLNMGAMMTYMVGMSLLMIPTLLANILGPQSLFANPYFEIVLSGILAFALFYFFTFVQFDPKEQAKTMLHNNNYIIGIRPGEPTKKYLQHLVIHVSFFGALLNTIQLSFGLLGSRILGNFAGLAILPMNIIMIVMFMQGIKDQLLMLLFPLRYARLIKDE >NZ_CP014786.1|WP_063164569.1|2196745_2197753_+|sugar-transferase MTVHITNLYGQSFQSTAQIAQNQIAKIGRELGFNELGIYSYNWPDEPSVALDTRFDGIIASVSNNDTVIFQSPTWNSIEWDQAFIDHLAPYNVKKIIFIHDIIPLMFESNRYLLPQFIDYYNKADLIIAPSQPMVDFLRANGLTVEKVVLQHMWDHCASVDFTVTPQNTGVINFAGNLEKFQLVGHWHYPDNPLYAFAKVIDVEPTDNIKFMGWQSDPVLLSKLRHNGGFGLVWSNEPYCKNYMHLNANHKLSTYLAAGLPVIVNENIAESETILRKGLGIVADNLDEAIEKVQGMDDQSYNEMVQRVDDFARLIREGYFAKKALTEAVFKLYYQ >NZ_CP014786.1|WP_003675593.1|2185300_2186968_+|FAD-dependent-oxidoreductase MAEQHLYDLIIVGAGPAGLSAGLYAGRATLDTLILEGDTVGGQVTTTSVVYNYPAVEKVDGTQLMNQMQSQVASFGVEIQHDAVEKFDLTGEVKTLIGKSGQKYTARSVIIATGANPKKVGFPGENEFRGRGIAYCSTCDGELFTGLQVFVVGGGYAAAEEADYLSRFAKHVTVLVRGDHFACPVLTAKRALDNPKVSVEYNTEVKEVSGDDYLTTATLVNNKTGEETVYHVDDGDQTFGMFIYIGTQPATKALANILDLDDRGYIMTDENGKTNIDGVYAAGDVIHKNLRQIVTAASDGAVASTAAERYIIMQKEKQGIPIHAETNKKPAKTVGQTSELSQQENTTPHEGNWLPAEIDQQLQPIFARLTKDIKLQVLTNGTELSNQLVSFVEEFASLDQHLQMETKPAPADVKYLPQLRLLDADGNDTGLHYAGIPTGHELNSLVLGVYNVAGPGQTIAPEMVERIKKLAPTKIRIGVSLTCHFCPDVVAACQRMASLNAGITATMIDLQHFPELRKEKKIMSVPATMIDDDPVIFGSQSLEELVTAVEKHHQN >NZ_CP014786.1|WP_063164571.1|2209218_2210922_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MSTSTASQAQSSTSTSTSTTNDLTASQTVAKARALTLRLFAALNTTANTYGTPIISSDGLSVTYYGKGTDSVSNNPIYYIVKVTNNLNGTVSFTITYTLKDPITGEISAGPSSRSDVYHFGNSIYAKTATFNMGSGYSNGTLTSVVTLDANGNTVYNMTSGVHLYNTSGNSYDFYDLDAQGQGLTYQNINSSTRYNNYGKNKVISEQITVTFNYNESSSNLNYTIAPYVSYTSGLNEGNYFTNSVSGTEPSKSNSTSVSQSTSKQQSTSASRSTSNGQSVSTSKQVSQSNSQSISASQAASTSLSQSASKSASVSASESTSASVSASESTSASVSASESTSASLSSSESASSSASASASISSSLSTSASVSASISGSNFTSDSPVNPQPDNPSTSISDSESMSISTSESISVSASGSTSISDSGSTSLSASDSTSTSISGSSSNGSESTSGSQSPVTPFPDNSGSTSMSTNGSGNDSISLSLSITNSTNTSSLENTSASVTDKHMTVDLTAQNSVENGNANKPSQQNKKLPQTGNASQTTAELLGLMSLEAVLLLLIAKKKKHNEDK >NZ_CP014786.1|WP_142490597.1|2211040_2211730_-|ATP-binding-protein MKKLTSICLIISVFTIGLENRMNQYQKLVDKEIAYQQQKSLKRRIKRARFPIIKLLSDFDYQFQPSINQQQIAEFATMSFLDNQENIVFIGSPGVGKTHLSIGLGIEACRQDVRTLFINCHELILRLKAAQGKQHLERVMRRYERYDLLIIDELGYLPISAEEAKLLFQLINGRYERKSTIITTNVPLSSWGAVLHSTATAEAILDRLVYHSHVIKIKGKSYRLASVNS >NZ_CP014786.1|WP_063164572.1|2211668_2212889_-|IS21-family-transposase MRKDVYERMRYFVVEKIKPNYSAIARQYGVDPRTVKTAYLRAQNGETIVRNQRKRRSKLDGFQDIIKDKYTAGCSARAIYDFIVEKGFTGKYTIVKDYCRHFRKAQTKKATIRVEHTMGLSAQVDWKEQVTMTDQNGVPHTFSIFLYVLPYSKFKFLKLTLDQKQDTLFKCLFEAFKATGGIPKEIWFDNMSTVVDHKLSDFHHHRFNERFLSFSHDAGFHPIACRPFRPQTKGCVEALARTMGRLKPYDGEFSTINDLNDIVDRLAKRLNHEKSQSNNQKPVELWTKEKEHFRSLNHDLVRYFHSDQTRKVSRDSMIRFQNHQYSVSPNYIGKEVEIKLTPDDKTIHIFYQGVEIQKHDLTNKQFNYDLHDKHAILKSDLMADKTDEEINQYMLNNLSIYDRIGE >NZ_CP014786.1|WP_003667025.1|2213007_2214411_-|C69-family-dipeptidase MGNKLTACTSILIGKDASIDGTIMIGRNEDAKAAWPKHMVVHQRGEMPNHFISKDTRLELDLPEESARYTATPEWTDKDGLFEEDGINEYDVAMSATESAYSNALVLGYDPLVENGLNEEAMITVVLPYVKTAREGVQRLGNLIAKYGTGETNGVLFADNDEAWYFETGAGHYWVAQRIPDDSYAVVANQLAIQEIDFNDSANFMFHPGIQEFVEKHDLNPDPSTFNFRKIFGTADRSDAIYSEPRVWAGHQMFSPRQATDETPESTELPFIMKPDHKLSIFDAQNYLSNHYEGTEFDPLGHGEHAHKYRPISLAKTQESHILQMNRPGANIHWLAMGVAAESTYVPFFNGITDTPAPYKRGKLPAQLNSAYWIFKHTSVLVDSHLHDFLPLLRDVQKERNAAAIKMIAETDRRLPSLKGEARAIFLTRQSDDYATDTLNAYKKLSLELITKMTDYCELNFNTDENL >NZ_CP014786.1|WP_003676754.1|2214549_2216379_+|monovalent-cation:proton-antiporter-family-protein MQQLSLLIVMLAALIIPIIMARFKVSSIPTAIAEIITGIILGKSFLNIVNPNWTLNMMSSMGVIMLMFLSGMEINFDLFRKTPGKKRDSKSPVVMASQAFGLIIAAALIIAIVISRLGLFKDVLLATIIFSTVALGVVIATLKEKDILQKPVGQTILLTAVLGEVVPMLALTFYASINGGNARRLWLIVLLFLAAFILLRRFKQPYVWFNKISKSTTQLDVRLAFFLIFALVTIAETVGAENILGAFLAGMVMKLLQPSETTEDRLNSIGYGFLIPFFFIMTGDRLDLKNLFANHQALALIPILVIGFILAKLPTMIIYRRRFKLRNSFAGSFLVATTITLVLPTLEVARNLHAITQAQSAAFTLAAVIVCIIAPIAFNSTYKLEKADLIKQKVNFIGTNTLTVPISQQLYKNWYDVRMVTDNENNFKIYNSQVKHLEYMPKLDAESLEQGGYFDCDIIVVGFLNDHKSARLAQIAKEHGVKRVIASQNNPRLDPKDVSALREKGIEIFNSFNVQSSVLRALIESPLILRMLTDTEAGLYEATLLNSRYSGRELHTLPFVNKITISRIFRNRKPIDPHGDTVLEYGDHILFTGDRQAAEEVRENLQGRK >NZ_CP014786.1|WP_003663508.1|2216461_2216647_+|4-oxalocrotonate-tautomerase MPLVHIDLIEGRTDEQLKALVKDVTAAISKDANVPAERVHIVLNEMRKDRYSVAGKMVSDK >NZ_CP014786.1|WP_063164573.1|2216781_2218284_+|glycerol-kinase-GlpK 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MTKISVKTKLKAVEEYANGNVTLASVRHKYGIAEHDFQIWVGIYARFGKGPLLNPPKVTGDFRLNLVKWKQENLASISETWIHFGYRSPGSVYQWERLYNKQGPQALLRLRRGRKPKNGQTTRQESRQASSAPKTEPNLTKRKLIVKDTTRCLKKIDSLEKASKKELAQVIYDLKAKYLLKDLIDALPISMSTYQYWQNRFEHPDEDEEELKAVIKGLFNYYQAEYGVRRLSTQIRDYYRLIGKKTPNHKRIQRLMHEMGLKCIKYNRRVRKYDSSKGPNGKKAKNKLNRRFMSNRKYQKMVCDITELKAHDGRKVYLEIIKDLATNQLLTWSISQHPNLQFALDPLQQLLKQLPHTGYQLTLHTDQGWHYQHRAWRKLLRQGNIRQSMSHRATCLDNAACETVFSKLKAEIGPDTSYCNQEELSQAINEWIHFYNERRIQTKLGNQTPLQYEQNLVA >NZ_CP014786.1|WP_016496755.1|2220374_2220611_-|hypothetical-protein MEKHEIDRQAKWLHIKYDGEDRDDECVNELSIYQNADESELQMLVSNIDFDNISHDNTFALTKEDAKVLIDYLQKWIN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014786_2 | 2.5|1885734|27|NZ_CP014786|PILER-CR | 1885734-1885760 | 27 | MK448831 | Streptococcus phage Javan83, complete genome | 18431-18457 | 4 | 0.852 |
NZ_CP014786_2 | 2.5|1885734|27|NZ_CP014786|PILER-CR | 1885734-1885760 | 27 | MT900488 | Streptococcus phage SA01, complete genome | 17964-17990 | 4 | 0.852 |
NZ_CP014786_2 | 2.5|1885734|27|NZ_CP014786|PILER-CR | 1885734-1885760 | 27 | MK449006 | Streptococcus phage Javan78, complete genome | 18431-18457 | 4 | 0.852 |
NZ_CP014786_2 | 2.5|1885734|27|NZ_CP014786|PILER-CR | 1885734-1885760 | 27 | MK448671 | Streptococcus phage Javan115, complete genome | 17403-17429 | 5 | 0.815 |
NZ_CP014786_1 | 1.2|928765|34|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder | 928765-928798 | 34 | NZ_CP039697 | Novosphingobium sp. ABRDHK2 plasmid pABRDHK22, complete sequence | 133936-133969 | 10 | 0.706 |
1. spacer 2.5|1885734|27|NZ_CP014786|PILER-CR matches to MK448831 (Streptococcus phage Javan83, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
agagggattgatacactccaatcatta CRISPR spacer acaatgattgatacattccaatcatta Protospacer * *. **********.***********
2. spacer 2.5|1885734|27|NZ_CP014786|PILER-CR matches to MT900488 (Streptococcus phage SA01, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
agagggattgatacactccaatcatta CRISPR spacer acaatgattgatacattccaatcatta Protospacer * *. **********.***********
3. spacer 2.5|1885734|27|NZ_CP014786|PILER-CR matches to MK449006 (Streptococcus phage Javan78, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
agagggattgatacactccaatcatta CRISPR spacer acaatgattgatacattccaatcatta Protospacer * *. **********.***********
4. spacer 2.5|1885734|27|NZ_CP014786|PILER-CR matches to MK448671 (Streptococcus phage Javan115, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
agagggattgatacactccaatcatta CRISPR spacer acaatgattgatacattccaatcattg Protospacer * *. **********.**********.
5. spacer 1.2|928765|34|NZ_CP014786|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039697 (Novosphingobium sp. ABRDHK2 plasmid pABRDHK22, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ggtatcagtgcccttgttgccgttgtctggcttt CRISPR spacer gtgatcggtgcccttgttgccgttttcgcgaaag Protospacer * ***.***************** ** *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
9642 : 73200
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014786|9642:73200|DBSCAN-SWA ATTAGAAAAAAGGTGAAAGTTGTTCTTCTGTGACATGACTCAAGAATACTTCTAATGGTGTACGATAATTAAGAGATTTTCGTGGGATATTGTTGCGACGATGCATTAGCTGAGTGACTAGTTCGTCTGGTAAATCGCGAAAATCTAGCTTTTTACTAAGACCATCACGACGCAAGAGGCCGTTATTATTTTCGTTTAACCCTCGTTGATTGGGAGCACCAACTTCCGCAAAATAGGTGTGAAGATCATACTTATTGGCTATTTCTCGCCATCCAGCAAATTCTTTCCCGTTATCAAAAGTAATTGATTTAACAAAGTGACGTGGCAGTTTAGCGAGCCATTGATCAAGCTGGCAATTCACTGCTTCGTCTGTTTTATGATGAATATTAAGGACAATCATTACTTTGGATTGTCGCTCTACTAGCGTCATTACCGCTCCGCGGTGAGCTTTACCTTGAACTGTATCAGCTTCAAAGTGCCCAAATTCATGTTGGTAATGCGGAAAATCACGATATCGTTGATAGATACTGCGTCCTAATTGGCCAGCTTTACCACGATGTTCCACATAGCCATTGGGATGGCGTTTTCCTTTCATCGGTAGCTGTTTAACGGAAAAGCCATACTGATTGCGGGCAAACATGCGATAAAGGGTGCGCATACTGCAGCTAATTGGGTGTTCATGACGACCAATAATAGTATCAGGAGTCCAACCTGCCTTGATTTGCGCATGGATATAGTTAACTTCGATAGTTGGCAGTTGAGTCTGCTTCCGACCACAACGACGCTTATGTCGCTGATAAGTCTGAAGATATTGGTCGATGGTTTTACCGTCGTTGAGGAAACGATAAACACGATAGATGGTTTCTTGACTACGCTGAAGTAATTTAGCAGCCCGATAAGCTTTAGTACCTTGATACCAAAAATCAGCTATGAGAGTTAATTCACGTGTGGTAAGATGTTTATAGGTCATTTGTGATTGCCTTTCTTTTGATTAGGGATATTCAAAAGTCTATCACAAATGGCTTTTTATTTTTTCTAACTTAATTTTACAAACGACGAAATATATAAAAAAAGATAGGGTTGCAATTATATGCCCTTTTATTTTAAATAATGACAAATATACTGTTGAATCTATGAAGAAGTTAAATTTACCTAAATGTCAAATTATTGTTGATCCAATGAAATGTATTACATCTGCTAGCTTAACTAACATTAATATTATTAGAAGCTTAGGTGGATTTAATGAAAAATTATTTATCGATTGTGTTGATACTGATATTAATTGTAGGATTATGGGGCATGATTATAAGATACTTCAAGATAATGAAGCATATTTACTGCAAACAATGGGAAAAGCAAAAAAGATTGGTATTCTTAATGCACTTTATTCCTTAACTAATTTGGATTTCTTTAGGAAAGTAATGAATGTACCAGTTTATGGTGATTTGAGACTGTATTATATGTCAAGAAATTCTCGTTATATTCGAAAAACATATCATAATCCAAGTAAAAAAGTTTCTTTTACTTATATGCTTACTCAGTTTTTATATTTTACAGTTTTCTTTCCCATAAATCGCAGTCGGGTTAAGATGTGGAGAGCTGTTATTAAAGGCTTTAATGACTATAAGAATATAAAATGAGGGTTTTAAATGATTTCTGTAGTAATGGCTACGTTTAATAGTAGCAAATACATTGTTCAGCAATTAAATTCAATTATTCAAAATAATGATCAAATAGATGAAATGATAATAGTTGATGATTGTTCTAACGATAATACAGTTCCAATTATCCAAAACATAATTTCAAAATATCATTTAGATAAATGGCGAGTATATGAAAATAAAAGTAATTTAGGATATAGAAAAACCTTTCGAAAGGCTATTAGTAAAACACATGGTGATATTATCGTACTATGCGATCATGATGATATCTGGATAAAAAATAAGATTTCAATTATTCGTAATGCATTTAAAGAGAATGATAATATATTGTACTTAGCAACGAAATATATCCAAATAGATGGAAATGGCGATTTAGTAAAAGTTAAATTGAAAAAAAATAGAGCTAATAACAACTTAATAAAACATAGTGTTACACCACATGACTTAGTAAAGCTTAATTTTAAGGATATTGCTGTTTATAATATTGCTCCTGGATGTACTTGTGCTTTTAGTAGAAAGATTTTGCCGGATTTTTTAACATTCCAAGACAAAATCTTACCACATGACTGGGCATTAGCGACAATTGCTGCTGTAAAACAAGGATTATATTATCTTGATATTCCTACAACTAAATATAGGATTTATGATGGTAATACTATTGGTTTAGTTCATCAATCAATTTATAGAAAACGATTAACTTTATGTCAAAAAAATTTAACTGAAAAGAAAGAAATGCTTTTACTTGCTAAAGAATTAGATGCATCTAAAAAAGATATTGAATATTTACAAAGGGTAGTCGATTTGTTCGATATACGCTATAAGAATTTAAGTGACAGGAATATTTTATTTGATATTATTTTAGTATTCCAAAGTTATGGGGTAAGTACCTTATATGAAAGCATTTTAATGGATATAGTATCGATTCTTAAAATAAAGGGGAAATAAATTGGCTATTTTGTTTTTTATATTATTAATTTTATTGGGATTGGTTTTTAATATAAAGTATTGGTATGTACCAATAATTGCTTTTTTAGTTTATCTAACATATAACTCAACTTTAATTCCTGATTATGAAAATTATAATGCTATGTATAATTTTATTGCTAACGGTAATCAGGATATAAATGGAGGATGGGGATGGTATTGGGTATGCTACTATGCAGCTCAATGGGGACTAACGTACTCGGGCCTAAGAGCAATTATTATGTTGGTAGGATGCTCAATAATTTTAATAACATTCCACTATTTTAAGATTAGTAATAAATATTCTTTCACTTGGTCTTTATTTTTATTATATCCTGCTCTTTTAGAAATTGTTCAAATTAGATTTTTTTTAGCTGAAGCTATTGTGTTTTTATCTTTTATATTTGTATCAAAAGATGATGTTAAAAGTAAAATTGTTTCTATAATTATAATTATAATTGCTAGTCAGGTACACAGTTCAATGTATTTGTTTTTATTATTTATTATCTTTATGTGCTGTTATAATGTAATAATAGAGCGTACTAACACAATTATTTTTATTATACTAGTGGCATCTTTTGCCATGAGAGGCTTAATGGCAAAAATAATCACCATATTTGTGAACGATCAAAGACAGGACCGTTATATTACTAATGGTCAATCTCTAGGACCATTTGGAATAGTTTCAACTATCGCTACTGTAATGGTCTTCTATCTTCTTATGAGAGAAATAATAATGAGAACGTCCATTAAAGAAGTTGGGGTTAGGCATTTTGCGTTAATAAAACTTGTATATATATTAAGTGTCTTTTCCTTTATATTAATTCCACTATCGACTTTTGACCCAAATTATTTCAGACTTCAAAGGTTAATTTGGCTTCCTATGTTTAATGTTATTGCTATCTTAATTAATAGTAATAAGCCTTTATATTTAATGAATCAGAGCTTTTCTCCAAAGCTTGTAATAACTTGTCTAACATTAATCGGAAATATAGCGTTTATTTGTACATTTAACTTCAATATACTTGTAGGTATTTTTGAGCAATAAGGAGGGAATACGTTGAATATAACGTTTTGTGTAAAAGGGATTGCAACACATCCTATAGGTGGTCATAAAGTTATTTATGAGTTAGCTAATAGATTGGCACAGAGAGGTCATATTATTACTTTAGTTGTTCCATCTGAAGATAACTTATATCAATTGCCTTTACTAAATTCTGGAGGACGGGTTTTTCTAAGTAAACTTTTATTTAAATTAGGAATTTTACCAAATTGGTTTAAATTTGATAATAAAGTGAATGTGAAAATCGTAAATGGTTTTGAGGAGAAAAACTTTCCTAATGCTGATTATATAGTTGCCACGGCCTATGAAACAGCTAAACCAGTTGCAAAACTTCCTTTATTTAAAGGGAAAAAAGTATATTTAATACAAGATTTTGAAAATTGGGAAGCTAGTGATGCTGATGTAATCGATACATATAGATTAGGAATGAAAAATATAGCTATTTCTAAATGGTTACAGTTATTAGTGCAAAAGTATGATGAGAATAAAACGTTATACTTACCCAATGCTATAAACACTGATATTTTTAAGATTACCTCCCCTGTTGAGAAACGTGATCCACAAACTATAGGATTATTGTACCATTTAGGAAGCCATAAAGGCCTTAAGTATTCTTTTAAGGCACTGAATATAGTGAAGAGTAAATTTCCAAATATAAATGTTGTGATGTTTGGAGCACCTAAAAAGCCCACTAATTTACCGGATTGGTATACATACTATCGAAAGGTTAATTCAAGCAGTATGCCTAAAATTTATAATAAGTGTGGTATTTTTTTATGTGGAACTATTAATGAGGGCTTTGGTTTAACCGGTGCGGAGAGTATGGCTTGCGGGTGTGCTTTGGTATCTACTAATTATAAGGGAGTCCGTGAATATGCCATAAATGGTAGTAACTCTTTGTTATCGCCAATAAAAGATTATCAATCTTTAGCTAATAATATAATAACTTTGATAAGTGATGATAAATTACGTATTAATATTGCTAAACAAGGTGCTAGTGATATTGAAAATATGGATTGGGATAACACCGTTAATAAGTTTGAAAAAATAATTGTATGACGACAACATACTTGTTAGTTTGGTAATGGTTTTTTTGTGTCCTGAAATGTCAATTTAAGTTAGAAAGAAAATAGTTGCTCATCAGTGACGTAAGACATGAATACTTCATATGGAGTTCGATAGCCTAGTGATTTACGGGGCAGGTTATTTCGCTTACTCATCAGTTGGGTTACCAATTCATCAGGAAGATTGCGGAAATCTAGCTGTTTCGTTAAGCCATCCCGGCGTAAAAGACCGTTGTTGGTTTCGTTCAG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51 | Catovirus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
85316 : 143845
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014786|85316:143845|DBSCAN-SWA 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55 | unidentified_phage(44.44%) | integrase,transposase | attL 93809:93868|attR 149680:149855 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
249148 : 256320
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014786|249148:256320|DBSCAN-SWA CGTGCATAAGAAGTTTACCTACATTGTCTACCAAATTATTATGGCTATCTTAGCCGTTATCTCGATTGAGATGCTGATCGCATATTATGCCAAGCGAATCAATATTGATACCTACCCTTACAATATGATTGACAATGGGATTTGGTTGGTCTTCTTTACTGATTACGTTATCCGCCTGATTATTTCACCAGATAAACGCGAATTTGTTAAAGATAATATCTTTGACCTTCTATCAATCATTCCTGCCAGCAGTCTTTTCTTTCTCTTCCGAATTGGGCAAATTGGTAGAACCTTTCAGATGCTTAAACTCATGCGCATTATGCGTTTGGTCGGATTTACCGGTCGTCTGGGCGTCTTCTTTGAGCAAAATGAGTTGCTCTACTACTTGTACATTACGATTGCTGTCATAATGGTAGTCGCAGCAATGTTTTGTATCTCGGAGAAAGTCTCTTATGAAACAGCCCTGTGGTGGGCAATTACAACTGCTACTACGATTGGTTACGGGGATGTGATTCCTAAGACCGGAATTGGCCGGGCAGCCGCGATTGTCTTGATGCTCTTAGGAATTGGTTTTATTGGGATGCTTACCAGTACAATTACTGAGTTCTTTGCCAAAAAAGACGAACGGAAGATTTCCGCCCAGTTAGTCAAAATCCAACATGAAAATCGCCAACTAAAGGCTGAGTTAGACGAAATCAAGCGTTTGATTCAGAAAAATAAACGTTAGCAAATAACCTCCATTCTTGGATAAATCCTTGAATGGAGGTTATTTTTAATTTATTTGTCGATTTAACGAGATCATCTCTAGTAAGCTTTGTGCAGTGATCGCTCCTTCATTACCCGCTTTGAGTCCCGCTCGTTGCATTGCTTGTTCAATGTTATCGGTAGTAAGGATGCCAAATGTAATTGGAATATTGCTCGTTAAGTTAAGATTCATTACGCCACTAGCAACATTTTGACAAATTAAATCGTAGTGATCTGTTTCACCTTTGATAACAGCGCCTAACGTCAAAATGCCGTCATATTCCTTTTTTGCCAATAATTGTTTCGTCATAAACGGAATTTCAAATGCTCCTGGTACATGATAAACATCAACATTTTCAAGGCCAAACTTAGCTAACATCTCTGTGGCCCCTTGAACCAATTGCTTAGTAACCGTTTCATTAAAATCAGCAACAACGATTCCAATTTTTGCAGTTTGAACATTAAATTTTCCAGTAAATTCTTTCATAATTAAATTAAGCCTCCAAATTTAGTAAATGGTGAAATTTATTTTTCTTTGTGATCAAATAATTCTCGTCGTAGTTATTAGGCGCTATTTCTAATGGTAGACGTTCATTGATTTCAATATCGCCAAGTTGTAGTTGCGCAATTTTATCAGGATTATTAGTGAGCAAGTTGACCTTGGTTACTCCTAACTGATGCAAAATCGCAATCGCTTGGTCATATTGTCGCTCATCTGGTGCAAAGCCTAGTTTTTCATTTGCCTCGACAGTATCATAGCCATGTTCTTGCAAATGATAGGCTCGCAATTTGTTTGCTAAACCAATTCCTCGTCCTTCTTGCCGCAAATAAATAATAATCCCGCTGCCGTTCTTCTCAATTTGGCGCATTGCTTCATGAAGTTGAGGACCACAATCACAGCGAAGGGAACCAAGAACATCGCCAGTAAAGCATTCTGAATGCAAGCGAACCATTACAGGAGTAGTTGGATCAATATCTCCTTTTATCAGCGCTAGATTATTGTCATCAAACCATCGTAAGCGAAAGTCACCATACTGAGACGGGAGATGCACCTCTTCTACTGGTTTGCTCGCTAAACTTTGCCGGTATTCCTGAAGTTCTTTGATCGTAATGATGGGTAAGCCAAATTCGGCTGCTTTCTCATGAAGTTCCACTGATCGCGCCATTTCACCATTGTCTTTTAAAATCTCACAGATATAAGCAACTGGTTCCACTCCAGCCAAGCGCGCAAGATCAACCGCAGCTTCAGTATGACCATCGCGTTCTAATACCCCATTTTTCTTGGCGACCAAGGGAAAGATATGGCCTGGCTTGTAGAAATCTTCGTTCTTAGCAGTTGGCGCGGCAAGATGAGTAATGGTGCGCCAACGATCAAAGGCTGAAATTCCCGTTGTTGTCGAATGATGGTCAACGCTGATCGTAAAAGCCGTACCAAAAGGATCCGAATTATCAGTAGTCATCTGAGGTAATTTCAGTCGTTCAGCTACTTCCGGTGCCATGGGAACACACATCAATCCACGAGCATACTTAGTCATAAAGTTAACTTTTTCAGGGGTAGCTTCACTAGCAAGCCCCACCAAATCGCCTTCTGCTTCGCGGTCTGCATCATCCATGACAATTGCTAAACCACCTTCTTGCAGATGCTTAATCGTTGCTTGAATTTTCTTTACATCCATTATTTTCGGCCTCCTAGTAAATTTGCGACTACATATTTACCTAAAATATCGGTTTCTAGATTAACTTCATCCCCTACTTTAAGCGTATCTAAGTTAGTCACGAGTTGAGTGTGAGGAATCAGGCCAACTGTAAACCAATTGTCACCGGTTTCCATCACGGTTAAACTTACGCCATTAATCGCGATACTTCCTTGCGCTACCACTTGACCATGCAGGCGTTGCGGAAGACTAAATTGCACTTCAATAGCATTTTCATTGACAGTCCGCTTTAAAACTCGTGATAGTTCGTCAACATGCCCCGCTACAATATGACCTTCTAGCCGTGCGCCGATTTGCAATGAACGTTCAAGATTTACCAGGGATCCTTTTTCCAAGTTTTTGAACGTTGTCTTTTCAAAGGTTTGTGGCATTAATGTCGTCGTAAATTGATTGTTGTTGATTTCTACGACCGTTAAACATGTCCCATTTACCGCAATTGAATCGCCAAGTTGCACGGTAATTAAAAAATCATCACTATGAGGTTCAACCACCAATTCAATCGTTTCGCCATCTTGGGTAATTTTTACTATTCGTCCCGTTTCCGCAACTAAACCACTAAACATTTTCAATCTTCCTTTCTGCAATCCTAATATTATTTTCTAAGATTTTAATTTCCTGATGGGTAAAATTCATTGGGCAAGCTAGTTCCATGCCGCTAACACCTTTTTTGCCAAGCATGTGGGGAGCTACGTATGTAATAAGCTCTTCAAATAAGCCTTCCTGTAAAAAGGCTTGATGGACAGTCGGACCCCCTTCCACATAAACAGATTGAATTTCTCGACAACCAAGTTCATGCAAGATGTCGTTAATCGACCACGTCCGGCGATAAAACACCCGAATGCCTTTAGCAAACTGATCTTGTAGCGAACTATTTTCCGTAAAAATCCAAGTAGGTGCCTGCCCGTCAGTCAACAAGTGTAAGGTTGGATTATCTTTTAAACGTCCCCGGCGGTCAAGAACAATCCTTACTGGCGGAAACTTTGTCGGACTAGTCGTTAATAAAGTTGGATTATCGATAATTGCGGTTTGGCTTCCAATCAAGATTCCTTGAAAATTACCACGCTCGGTATGAACCATTTTTGCCACAGCAGAATTAGTAATCGCCGTTCGTTGACCTTTTTCTGCGGCCACGCGATAGTCAAGACTCACTGCTTGTTTTAAAGTTACCCATGGTCGTCGGTACCGATAGAAGAAATTGTAATGCGGATTTAAGGCTTGGGCTGCTTCTTTAAGGACGCCCGTTTTGACAATAATATTTTGCTGTTGAAGGGTAGCAATTCCTTTTCCAGTGACAAGCTGGTGCGGGTCTGTTTCTGCAATCACAACCCTCGTGATACCTGCGTCAATAATCGCCTGACTACATGGCGGTTGTTTTCCATAGTGATTGCAGGGTTCCAACGTGACATAAAGAGTTGCTCCCTGTAACTGTTTCGGCGTAAGTTTACCTATTGCATCCCGTTCAGCGTGAATTCCGCCATATTCGTGAGTATGACCTCGCGCTAAAACTTGACTATTCTTAACAATAACTGCCCCAACACGAGGATTTTTCCAGGTTTCATTGCCAGCCTTTGTTGCTTCAGTGATTGCCATTTGCATGAAATGAACATCTTCCACTCTAATCATCCTTTCCAAAATAAAAACGCCCTAAGATTTTCTCTCGGGGCGTTAAATGGTTACTAAAAAAACAGCTCGGCAAAATAAAACCGGATAACATCACTGCTATCCGGGGCTTTACGTTTAAACTGATTGTGTAATTTTTCATTTTCTTCTCCCATCCAGACTATACTGTCGGTACCAGATTTTCACTGGTTCAACCGTTAACACAAATGCTAACGGGTCACGGACTCCAAGCGTACTTGTTACCGTCGGTTGGGAATCTCACCCTGCCCCGAAGAAAATTAGATTGTTAAATTTACATATAGTGTAACTCTTCACTTTCTTTTTGTAAACAGCAAATTTATTTCTGTGAGAAACTTTGCAGGGTATCCATGATCAATTGGATGAATTTCTCACGGTCAATATCAAGGAGGACTTCAGTATTTTGGGGCTTGTCGGTTAATTGATAGTAATCACAAACCGTCTCACCCCGAGTAAGGTCTCCCTGAGTTTCAACATCCACATTCATTTTATCAGTCTCAAACATGGTGGGATCAATAAGCCAAGCAATCGTACATGGGTCATGGAGTGGCGCACCCTTAAAGCCCCACTTAGGATTTTCATGGTACTGTTCAAAGAAGTTTAGGAGACCATAGAAAGCCTGGGCAACTGGATTGTCGATTTGCCCGATTTGCTCAATTTCATCCTTCATAATCTGCGCTTTATGGGTCACGTTCAACGGTGCTATTACCAGAGGCAGCCCAAAGTTCATTACAATCTTAGCTGCTTCTGGATCAACAAAAATATTAAATTCGACTGATGGCCGCCAGTTACCAAGTCCCATTGCCCCACCCATGAAGACAATCTGATCAATCTTTTCTTTCGCCAAATCGGGATAGACCCGTAAGAATAAGGCCGCATTTGTCATTGGACCGGTAACTACTAAGGTAACTTTCTCATCACTTTCACGAAGAGTTTTAGCAATCAACTCAATAGCTGGAATTGGTTGAACTTTGAAATCGGGATCAGGAAGGTCCGCACCATCCAAACCTGTCTCCCCATGAACTTCCGGTGCAGTTTCAAGCGGCTCAACCAGCGGAGTTTGATTTCCCTGAGCAACTGGAATATCTTCTCGATGGAGTAAAGTTAACATCCGCATCGCATTATTTAAAGTTTTGTCCGGTGTTTGATTACCAGCAGAAGTTGTTACGGCAAGGACATCAATCTTCGGTGAAGCAACAGCCATCGTTAACGCCAATGCATCATCATGTCCGGGATCGCAGTCAAGGATTATCTTTTTGGTCATTTGTTATCGGCATCCTTTCTTTGTGAATCGTTAGTATAGCGGTTACATTAATTATAACAAATGAACATTATTCCGTTTAATGTCGATCATTGAACTACTCCCACTTAGCTAAACCTACGGTTTAATGCTTGAAGTGGGAGATTCTGGAAACATCGCATACTTACCCTACCGATTCTGAACGAACCTTCAAGCAGAGGTTACGACTATTAACCAAGGCTCATCCCGAGCCTAACTTTATCTATCGGATAGCTAATCCTTTTTGCAAGATAACTTGTGCAGCGTTAATATCACGATCTAAATGTTTACCACAGTTTGGACAATCCCACTCACGTACCGCTAACCATTCCGATTTATTCAATCCTAACCGATGATTATTCTTCCCACAATTAGCACAAACTTGGCTAGTATATGACGGATTGACCTGAATAAGCTTTTTACCGTACCAGTCACACTTATATTGCAATATATCTACTAATTTTGACCAGCTAGCGTTAGCGATTGCTCTAGCTAAATGGTGATTCTTCATCATTCCCTTAGTATTAAGTTTTTCCAACACAATGATGTCGTACTTTTTGACCAATTTAGTAGTGAATTTTTGTAGCTGATCCAACCGTTGGTTGGCAATCTTTTGCCGATACTTCGCCACCATAATACGAGCTTTCTGATAATTTTTAAAATCGTCTAATTGCCGTGGAACTAACACTTTATTATGATGATCCCAGGCGATTTCCTGCTGGGCCTTTAAGAATCGACGACTACGCAATTTCTCCCAACGATACAACTTTTTACGGTATTTATCTTCAAAATGATTGATCGGTTCCTTGCATCCATCTGAAAGATTAAGTAATGACTTAAGTCCTAAATCGCCACCAATATATTTACTTGTTTTAGGAAGAGTTTGGTTTTCGCTTTCCACTAAAACAGTAATGTAATATTGACCAGCAACGTTCAGACGAACAGTGACATTCTTAATTTTACCCATTGGCAATCGACCAGCTCTAAAATAGACGATACCGAGTTTTGGTAACTTTATATGATGGCAATCTAAAACTTTAATATTGCCATTAACGTACTTTGAATTGTAGCTCTGAGAATATTTTCTGGATTTAAATCGAGGGAACTTATTTTGACCTTTAAAAAAGCGTTGAAAAGCATCTGCTAAATTGCGATTAGCACTTTGCAAAGCAGTTGATTCTGCTTGTTTCAACCAAGGATACTCAACCTTAAGTTGTTTCAACAGATTATTCATCCCAAAGGCATTCACAAATTTAGCTTCCGGATTATTCTTGCGCCGTTCAATTTGCATATTAAGCATTTGATTCCATACAAAACGAACACAACCGAAGGTCTGCCAGAGCTGATTTCGTTGTGCTGAATTTGGATAGATGCGCATTTTAACGGCTTTTAGAACCATTATTTTCTCCCTTGACTTTCAATATATCGTTTTACAACTTCTAAAGGCGCTCCACCAGTGCTAATTAAGCAATAGCTTTGTGTCCAAAAGGCTGATTTCCAAAGATACTGCTTGATTTCTGGAAATTGTTTTTTGACCATTCTGGAGCTAGACGATTTGTAAGCATTTAAAAATTTAGCCATTTCCGTATGAGGCGTTGCTCTAAACAAAACATGTACGTGGTCCTGATCATGATTCCATTCTTGCAAATTAATGCCGTATGCTTGTCCCACAACTACAAAACGATGTTTAAGATATTCAGATATTTCATCGTTAATTACTTTTCGACGATACTTAACCACCATTACCAAATGGTAATTAAGTAAGTATACTGAATGCTGATTTCTATCTAATTCTAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014786|249148:256320|251566_252169_-|WP_063164094.1|DBSCAN-SWA MFSGLVAETGRIVKITQDGETIELVVEPHSDDFLITVQLGDSIAVNGTCLTVVEINNNQFTTTLMPQTFEKTTFKNLEKGSLVNLERSLQIGARLEGHIVAGHVDELSRVLKRTVNENAIEVQFSLPQRLHGQVVAQGSIAINGVSLTVMETGDNWFTVGLIPHTQLVTNLDTLKVGDEVNLETDILGKYVVANLLGGRK >NZ_CP014786|249148:256320|255921_256320_-|WP_041816984.1|transposase|DBSCAN-SWA MELDRNQHSVYLLNYHLVMVVKYRRKVINDEISEYLKHRFVVVGQAYGINLQEWNHDQDHVHVLFRATPHTEMAKFLNAYKSSSSRMVKKQFPEIKQYLWKSAFWTQSYCLISTGGAPLEVVKRYIESQGRK >NZ_CP014786|249148:256320|253563_254508_-|WP_063164096.1|DBSCAN-SWA MTKKIILDCDPGHDDALALTMAVASPKIDVLAVTTSAGNQTPDKTLNNAMRMLTLLHREDIPVAQGNQTPLVEPLETAPEVHGETGLDGADLPDPDFKVQPIPAIELIAKTLRESDEKVTLVVTGPMTNAALFLRVYPDLAKEKIDQIVFMGGAMGLGNWRPSVEFNIFVDPEAAKIVMNFGLPLVIAPLNVTHKAQIMKDEIEQIGQIDNPVAQAFYGLLNFFEQYHENPKWGFKGAPLHDPCTIAWLIDPTMFETDKMNVDVETQGDLTRGETVCDYYQLTDKPQNTEVLLDIDREKFIQLIMDTLQSFSQK >NZ_CP014786|249148:256320|254746_255922_-|WP_063164097.1|transposase|DBSCAN-SWA MVLKAVKMRIYPNSAQRNQLWQTFGCVRFVWNQMLNMQIERRKNNPEAKFVNAFGMNNLLKQLKVEYPWLKQAESTALQSANRNLADAFQRFFKGQNKFPRFKSRKYSQSYNSKYVNGNIKVLDCHHIKLPKLGIVYFRAGRLPMGKIKNVTVRLNVAGQYYITVLVESENQTLPKTSKYIGGDLGLKSLLNLSDGCKEPINHFEDKYRKKLYRWEKLRSRRFLKAQQEIAWDHHNKVLVPRQLDDFKNYQKARIMVAKYRQKIANQRLDQLQKFTTKLVKKYDIIVLEKLNTKGMMKNHHLARAIANASWSKLVDILQYKCDWYGKKLIQVNPSYTSQVCANCGKNNHRLGLNKSEWLAVREWDCPNCGKHLDRDINAAQVILQKGLAIR >NZ_CP014786|249148:256320|249919_250378_-|WP_035157468.1|DBSCAN-SWA MKEFTGKFNVQTAKIGIVVADFNETVTKQLVQGATEMLAKFGLENVDVYHVPGAFEIPFMTKQLLAKKEYDGILTLGAVIKGETDHYDLICQNVASGVMNLNLTSNIPITFGILTTDNIEQAMQRAGLKAGNEGAITAQSLLEMISLNRQIN >NZ_CP014786|249148:256320|250385_251567_-|WP_063164093.1|DBSCAN-SWA MDVKKIQATIKHLQEGGLAIVMDDADREAEGDLVGLASEATPEKVNFMTKYARGLMCVPMAPEVAERLKLPQMTTDNSDPFGTAFTISVDHHSTTTGISAFDRWRTITHLAAPTAKNEDFYKPGHIFPLVAKKNGVLERDGHTEAAVDLARLAGVEPVAYICEILKDNGEMARSVELHEKAAEFGLPIITIKELQEYRQSLASKPVEEVHLPSQYGDFRLRWFDDNNLALIKGDIDPTTPVMVRLHSECFTGDVLGSLRCDCGPQLHEAMRQIEKNGSGIIIYLRQEGRGIGLANKLRAYHLQEHGYDTVEANEKLGFAPDERQYDQAIAILHQLGVTKVNLLTNNPDKIAQLQLGDIEINERLPLEIAPNNYDENYLITKKNKFHHLLNLEA >NZ_CP014786|249148:256320|252161_253229_-|WP_063164095.1|DBSCAN-SWA MIRVEDVHFMQMAITEATKAGNETWKNPRVGAVIVKNSQVLARGHTHEYGGIHAERDAIGKLTPKQLQGATLYVTLEPCNHYGKQPPCSQAIIDAGITRVVIAETDPHQLVTGKGIATLQQQNIIVKTGVLKEAAQALNPHYNFFYRYRRPWVTLKQAVSLDYRVAAEKGQRTAITNSAVAKMVHTERGNFQGILIGSQTAIIDNPTLLTTSPTKFPPVRIVLDRRGRLKDNPTLHLLTDGQAPTWIFTENSSLQDQFAKGIRVFYRRTWSINDILHELGCREIQSVYVEGGPTVHQAFLQEGLFEELITYVAPHMLGKKGVSGMELACPMNFTHQEIKILENNIRIAERKIENV >NZ_CP014786|249148:256320|249148_249874_+|WP_063164092.1|DBSCAN-SWA MHKKFTYIVYQIIMAILAVISIEMLIAYYAKRINIDTYPYNMIDNGIWLVFFTDYVIRLIISPDKREFVKDNIFDLLSIIPASSLFFLFRIGQIGRTFQMLKLMRIMRLVGFTGRLGVFFEQNELLYYLYITIAVIMVVAAMFCISEKVSYETALWWAITTATTIGYGDVIPKTGIGRAAAIVLMLLGIGFIGMLTSTITEFFAKKDERKISAQLVKIQHENRQLKAELDEIKRLIQKNKR |
8 | Staphylococcus_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
304847 : 312912
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014786|304847:312912|DBSCAN-SWA ATTATTCTGTATAGTATAGCAAACAACAAGCACCCATTCCAGTGTGGGTTGCAATAATCGGCACTGTCTCTCGAACAGTAACCTCGATTTCTGGATAAAGTTCTTTTAGTTTTGCTAATAAACGTTCTACTTCTTTGCCAGCATCGACATGAGAAATTCCAATTCGCTTAACTTTTGGTCCCCGTGCCATTTCATCTAAAATCTTATCCCATTCTTTATGCATCGATTTAATACCCCGGCCTTTTGATTCAATATGAATCTGACCATCATACACATGGAGCATAACCTTAATGTTTAACAGGTTAGAAATAGCACCAGCAAATTTACTGATTCGTCCACCAGCAACTAAATTATCAAGGTTATCAATTGCCAAGTAAAGTTCAGATTTACTAAGTACTTCTTTCATCTTAGCAATTGCATCCTCAACGCTACCACCGGCTTCAATCACTTGGGCTGCTTCAAGTATTTCAAAGCCCATTACTTGGTCGGTTGACTGAGAATCGTAGACTGTAACTTTTGTCTTCGTCATTCCAGCCGCTTGTTCAGCCGCATGGACGGTCCCACTAATTGATTCCATCATTATAACGCATAATACTTCGCTACCATCTTCGCCTAGCTTATCAAAAGCATCAACAAACTTTCCAATTGGTGGTTGGGAAGTCTTTGGTAGTGACTTAGCATTCTTCATCATTTCAGGGAACTGTTCGTTTGTAATTGTTTCACGCTCAACGTATACCGCCCCATCGATCATTACACTTAATGGTATAATTGTAATGTCATATTTTTTAATTTCTTCATCAGTTAATCCTGCTGATGAGTCACAAACAATTTTTATCTTTGCCATGAAACTTACCACTCTTCCTGAACAATTTGTGCTATAATTATCTAGTATTGAGAACTAGATAATTTATTTCAAGTACTATTATACTCAATTTTATCTAATTTTGTAGGATCAATTACTATTTATTTAGTATAACAAAAATATTTTAAAAATTCATTGGTCTTTGGAAAGGGGTTTTTTGATGGATACACAAAAAGAGACAAGAGATCGGCGTACTTTGTTAATAGAAATAGGTAATGCCGTTACTCATGGGATCGGGGCAGGATTATCGATCGCTGGCTTGATCTTGTTAATTATCAGAGCTGTTCATACTGGTAGTCCCATGCGAATTGTTACCTTTACTATTTACGGAAGTGCTTTAATTCTTTTTTACCTTTCGTCAACCTTATTTCATGCCTTGATCTTTACACGAGCCAAACGGGTTTTTCAAATTCTCGACCATTCAATGATCTTTGTGCTTATTGCCGCAACTTATACCCCCTATTGCTTAGTTAGCATTCGCGGCTGGTTAGGTTGGACAATTTTCGGAGTGATTTGGGGCCTATCCGTTATCGGAATCGTATATAAATGTATTTGGTTAAAACATAAAAGTAAATATTCAACCATTATTTACATTCTTATGGGCTGGCTATGTCTAGTTGCCTTCATGCCTCTCTGGCGTGCTCTTGGTCCAGTTGGCTTCGGATTACTTTTACTGGGAGGACTTTCCTTTACTCTTGGTGCCCTCTTTTACAGCCGTCCAACGGCATATACCCATTTGATTTGGCATATTTTTGTCCTCATCGGCACGATATTAATGTATTTTTCAATTCTTTTATACGTTTAGTTCCCATTCTTCAAAACGACAAATTAGCTGGTCATCTTTTTCATAATCATTGTGATTTACTAAGTGCCAACGGTCATAATCGATCGTTGGCATTTTTGTATCTCCAACAATTTGCTTATTTATCACCGTTCGTGTTAGCTTTGTCGCCATTGGAAGTAATTGCTGATAGATCATTGCCCCACCGATTACAAAATATTCGTTTGGATTTGCTTTAAGATATTCTTTAAGGGCAGCTAAAGAATGAACGACTTCCACTCCTTCAGCATCTATGTTCCTACTGGTAAGCACAATATTTTCCCGCTTAGGCAACGGTTTATTGCCAAGTGAGGCAAAAGTTCTTCGCCCCATTATAATTGGGTGACCAGTAGTCTTTGTCTTAAAATGCTTCATATCAGCAGAAACATGCCATGGAATTGTATTATCTTTGCCAATCCAGCCATTTAAATCTTCGGCCCAGATTAAATTCAGCTCACTCATTTTGAACCACTCCTTTTAAACTGCTACGGGAGCCTTGATTGCCGGCTCATGAGTATAGCCTTCTAACTTAATATCAGTCATTTCATATTGATCGATTGGTTTTGGTTCAGCAGGTAAAATCAATTTAGGAGCTTCATGAGGTGTTCTTGTCAGCTGTTCTTTAACTTGATCAAGATGGTTCAGATAAATGTGAGCATCCCCTAATGTATGAACAAACTCGCCAGGTTCTAAACCGCATTGGTGAGCAATCATATGCGTTAATAAGGCATAACTAGCGATATTGAATGGAACCCCTAAAAAGATGTCGGCACTCCGTTGATAGAGCTGACAACTAAGCTTTCCATCATTAACATAAAATTGGAACATGGTGTGACATGGAGGGAGAGCCATAGAAGGAACATCTTCTGGATTCCAAGCCGAAACAATCATCCGTCGTGAATCCGGAGTAGTTTTAATCTGCTGGATAACATTAGCAATTTGATCAATTGTGTCGCCTTGACCCGTCTTCCATTTTCGCCACTGACTTCCATAAACAAGTCCTAAATCGCCATATTTTTGGGCAAAATCATCATCTTCAAGAATTCGCTGACAGAAAGCTTTCTTTTCTTGAAGATAGACCTGCTTAAACTCTGGATCTTTAAGCCAGCGGTGACCAAAGTCCGTCATATCTGGACCTTGATATTCATCACTTTCCACCCACTTCTTAAATGCCCATTCATCCCAAATATGATTCTTGTGTTGAAGTAAGAAGCGAATGTTGGTATCACCGCGTAAAAACCATAGTAATTCACTCTTAATCAAGCCAAATGGGACTTTCTTAGTCGTTAAAATAGGAAAACCTTTGCTTAGGTCAAATCGCATCTGATATCCGAAAACAGATTTAGTACCTGTTCCTGTCCGATCACCCTTTTGATGTCCATTCGCCAAAACATAACGGATTAAGTCTAAGTATTGCTCTTCATTTACATTTGTTGCCATCCTTATTTGTCCCTTCCTTTACTCGTCAACGTATGTGCTTAAATACTCCCAACGAGCTGTCTTTTCATCAATTTTTTCTTGTATTTCATTTAGCTGCTTCTGTAACTTAGCAATTTTCGTATAATCGCTTGCTGCTTCAGCCATTTCATTTTCTAATTGCTGATGCTGTTGATCAAGGGCATCTAATTCTTCATCAATATGATCCCACTCGAGTTGTTCAGCATAAGTAAGTTTTGTTTTTTCTTTTTTAGCTGGTTCTTGCTTATTTACCTGCTTTTTGGCAAGGGCTTTTTGATCATTTTTAAGCTCTTTATTCTTATCTGCCTCTTCCTTTTTAGCAGTTAGATAATCAGTAAAGCGTCCCGTATAACGCTCAATATCTCCATTCCCGTTGAAGACTAGCAAATTGTCAGCCACTTTATCTAAGAAATAGCGATCATGAGAAACCGTAATTACAGTTCCCGCAAAATTATCTAGGTAATCTTCAAGAACTGTTAATGTTCCAATATCAAGGTCGTTAGTTGGCTCATCTAGTAATAAGACATTGGGCTGCTGCATTAAGATCTTTAAGAGGTATAATCGCCGCTTTTCACCCCCAGAAAGCTTTCGAATCAAAGTACCATGCATAAAACGAGGGAATAAGAAGCGTTCTAATAATTGGGTAACGCTGAGCTTATTGCCATCCTTATCAGTAACATTATCTGCAATTTCAGACAAGAAACTAATCATCCGCTTATCATTGTCAATTCCTTCTGTTTGCTGGGTATAATACCCTAACTTAACGGTTTCCCCAATCTTAAGGACACCACTATCTAGGGGGACACGTTGGGCAATCACGTTTAATAAACTCGTCTTACCCGCCCCGTTTTCACCAGTAATTCCAATTCGATCACCTGCCTGAACAAGCCAATTGAAGTCATGGAGGATTTGGTGATTATCAAATTTTAAGTTAGCATCCTTAAATTGAATAACATCTTTCCCTAGACGTTGTGATCCGAGATTGATAGCAATATCTTCATCGGTTTTAAGATTACCGATTTTTCCTTCTAATTCGTGGAACCGATTGATTCGCCCTTTTTGTTTTGTGGAACGGGCTTTTGCACCTGTCCGCATCCAGGCTAATTCTTTTTTATATAGCTGTTGATTCTTTTTCTCAGTATCTTTAGCTAACTCTACTCGTTCCGCCTTTTTTGCTACAAAGTCCTGATAATTTCCCTCGCAGTGATAAAGTTTACCAAAAGATAGCTCCCAGATATGATTTGTAATTTGATCAAGGAAGTACCGATCATGGGTAACAACGAGGACAGCACCCTTATAACTGCGAAGGAAATCCTGGAGCCAAACTACCGAATCAAGGTCTAAGTGGTTAGTCGGTTCATCGAGCAATAAGAGGTCTGGCTGTTGAATTAAGACTTGCGCTAACCCAACCCGTTTCTTTTGTCCTCCAGAAAGTTGAGCAATCTTTTGACTTACATCTTTTATCTTTAACTGGGTCAGAATCGTCTTCACCCGACTATCCGCTTCCCATGCATCTTCTTGGTCCATCCGTGCCTGCATTTTTGTGTAACGGTCGATTGCTTGTGGATCTTCTGGGTGCTTTGTAAAGCGTTCAAGAGCCAGCTCATATTGACGAATTGTTTCAAAGACTGGTTGTTTACCTTCAAAAACAGCTTCCATGATTGTTTTGTTTTCATCAAGTTCAGGCTGCTGTTTTAAATAACCGATCGTGTAATCATTAGGCTTAGTGATCTGTCCGCCGCCTTCTGGATTTACTTCCCCACTAATTACGTTAAGAAGACTGGTTTTTCCACTTCCATTAACACCAATCAGTCCAATTCGATCATTTTCATTGATAATAAACGAAATATCATCAAATAAGGTCTTCTCACCGTATGTGCTGGTTAGACCCTCTGCACGCATTGTTTGCATATTATCCCTCTTTCGTTATCTCTTCTACTTTTTCTAATAAGACTGTTGCATCGTTAACTATCTCACCATTTATCACTGCCAGCGTTAATTGCTGAAGAATCTTCCCCATCAATGGTCCCGGTTTTACCCCCGCTTTGGTAATTAATACTCGACCATCAATTGCTAATTCTTTAGCGTTTTTAATTGGTAACTTTTGATAAGCTTTTTGCAATTCTTCATCATCAATTGCCCATCCATATAACTTAGCTACTTGGTTAGCATCATGGAGGGCTGTTTCACCGGTATTAAACATTAGTGTTGGTGTAAGCGCACGTTGACGAATTGCTTGGACTGCTGGAACTACTTTTTTGACCTGCGCAATTAAATCATTTGCTGTTTTCCACTTCTTTAAGAATTTACCAATTTCTTTTTGATCAAGCTGGAGTTGTAAGCTTAAAACTGACCATAATTGAGCCTCATTTTCCAAATGCCATTGGTTAAGGATTAATAAAGCCGATAAAGCAGCTTGAGCATTTTCCAACCCTGGACAATATTGATACAATCCAGTCGCAATAAAATCTTTTAAGCCCGCTACTGGATTTTGACCCAACAATAGTTTTTCTAACTCAACCCGGATTCGTTCAACTGCAATTTTTTCTAATAATGGTGCATTTTCTTTAATCCCTTTTAATGTTGCAGTATCAATGACAAAATCAAGCTTACTTGCAAAACGCACGGCCCGCATCATCCGTAAAGCATCTTCATGAAAACGTTCATTAGGGTTACCAACCGCTTTAATAAGATGTTTTTGCAGGTCTTCTAGTCCGTCAAATAGATCAATAACTTCCCCATCTTCGCGCAAGGCGAGGGCATTAATCGTAAAGTCTCGACGCTGGAGATCTTCACTTAATGAACGAACAAAAGTCACTTTATCAGGACGGCGGTAGTCTTGGTAACCTGACTCGGTTCTAAAAGTAGTTGTTTCATATCCCGTTCCATGGTCGAGAATCATAACTGTACCATGTTCAATTCCGGTATCAACAGTATGGTTAAAAATCGCCTTTATTTCACTAGGGTAAGCACTCGTCGCTATATCTATATCATGAATCTCATCATGCAAGATAGTGTCACGGACACAACCGCCAACAAAATATGCTTCGTAGCCAGCCTCCTCTATTTTTTGTAAGACAGGTCGTGCTGGTTCAAATATAGCTGGTAATTGTTTTATTTTCATTTAATCATGTCCTCATTTTGATAATCAAAGTTGATTATAACAAATTAAGTTACTACTAAAAAGAGACAGGAAGCGTAAAGAACGGCTAAAATCGTTAACGTTTCCTGTCTCATTTAAATTAAAAATTATTTGTAATCTTCATATTGGTCATAAAGATCTTGCATTTCAGTGTCTGTTGGGACTAACCGGAGATAGTGTTCCAATTCATCCATTAACTTATCAGTTTCACCAGTTTCGCGGTAGTAATTAATTAATTCTTTTAAGAATGTTGGATTTTCACTATAAGCCGGCAAAGCAGCTTCATAATATTTTCCGGCTAATTCAAGCTGGTCAGTTCGTTGATATGACCGTGCTAGATTCCAATATAATTGTGGATCTGTTTCATCTTCTTTTACCAATGGACTCAGGAGTTTAATATTTGCCTCATCATCGTGTTGGTGAAGCAAGAAATTACTATATTGCAAAGTAATCGTCATATTCTCTGGAGCAAGTTCATGCGCCTTTACCAAGTATTTCTTCATTAACTTTTGATCGCCAAGGTGGCTGGTAATTTCAGCTGCTAATGAATAAAGGTATTCATTGTATTGATCAACACTGAGCCCTTCTTGGACAACTCGTAATGCCTGCTGATACTTATTTTCCTTTTCATACGCCTTTGCTAGTTCAGGATAAGCAGATGCATATTGGTTATCATCGTTAATAAGATCCTCTAAAGTTTTTATTGCCTTTTCAGTATCTCCTAATTGAAGTTGGGTCAGCCCCTTTTGGAAACGAATATCACTAGTCTGGTATTCCGGTTTAACCTGATTGAAGTACCCTAAAGCCTTCTTAAACTGACCGCTCTGAGCGTAACAAATCCCTAGACGTCCAGCTATATCAACTTTTGCAAAGTCAGTATACCCATTTTTAATTAGTTGGAAGTAATATTGGATTGCTTCAGAATATTGGCCAACCATAAAGTAAAATTCACCAAGCGCAAATTCAACAGCTGGTTCATCGGGAGCCAACGCGTAAGCTTCTTTTAACTTTTCCTCCGTCACTTCAAATTCTTCTTCAGTCTGATATAAATCCGCAGCAACCAGTAATGATTGAACATAAGCTGGCGAGTCTGGTTTAATCTGGGCTAAGTATGATAAAGCTTCGTCATTATGTCCTTCATCAATTGCAATCGTCGCTAAATTAGTCTTTAATTCGTCTTCATCTGGATAACGATCTAATAATTTTAAGTAGATCGTTCGTGCCTGTTGAAGAAAGCCTAGTGCATATAGTTCTTCTGCAAGGCTAAATAACATATCATCATCATCATTAATCAGTGCAAGTTTAAATGAGTTTTGGGCTTCTTTTAACTTTCCTGCTTCTAATTGATCAAGCATTTGTTCTGAGTAGGTCATATTATGCCCTCCTTTTACTATCACTTTTAAATATATCACAATCGATGATTTTAAGCATTGAACAAGTCTTTAAAAAGAAAAAAGACTGGGAAGGATAAATTCTTTCCTAGTCTCTTTTTAACATTTAACTGTTAATTACTTAACAGCGTCCTTTAAAGCTTTACCAGGCTTGAATGCTGGTACCTTGCTTGCAGGAATGTTGATTTCTTCTCCAGTTTGTGGGTTGCGGCCCTTACGTGCAGCACGTTGACGTACTTCGAAGTTACCGAAGCCGATCAATTGAACCTTTTCACCCTTAGCTAAAGATGCTTGAATTGAACTGAAAACAGCATCTACAGCTGCAGTAGCATCCTTCTTGGTTAAGCCAGTTGCAGTAGCAACATTGCTTACTAATTCTGCTTTGTTTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014786|304847:312912|312636_312912_-|WP_003666054.1|DBSCAN-SWA MANKAELVSNVATATGLTKKDATAAVDAVFSSIQASLAKGEKVQLIGFGNFEVRQRAARKGRNPQTGEEINIPASKVPAFKPGKALKDAVK >NZ_CP014786|304847:312912|307005_307968_-|WP_063164119.1|DBSCAN-SWA MATNVNEEQYLDLIRYVLANGHQKGDRTGTGTKSVFGYQMRFDLSKGFPILTTKKVPFGLIKSELLWFLRGDTNIRFLLQHKNHIWDEWAFKKWVESDEYQGPDMTDFGHRWLKDPEFKQVYLQEKKAFCQRILEDDDFAQKYGDLGLVYGSQWRKWKTGQGDTIDQIANVIQQIKTTPDSRRMIVSAWNPEDVPSMALPPCHTMFQFYVNDGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTHMIAHQCGLEPGEFVHTLGDAHIYLNHLDQVKEQLTRTPHEAPKLILPAEPKPIDQYEMTDIKLEGYTHEPAIKAPVAV >NZ_CP014786|304847:312912|311235_312501_-|WP_003674239.1|DBSCAN-SWA MTYSEQMLDQLEAGKLKEAQNSFKLALINDDDDMLFSLAEELYALGFLQQARTIYLKLLDRYPDEDELKTNLATIAIDEGHNDEALSYLAQIKPDSPAYVQSLLVAADLYQTEEEFEVTEEKLKEAYALAPDEPAVEFALGEFYFMVGQYSEAIQYYFQLIKNGYTDFAKVDIAGRLGICYAQSGQFKKALGYFNQVKPEYQTSDIRFQKGLTQLQLGDTEKAIKTLEDLINDDNQYASAYPELAKAYEKENKYQQALRVVQEGLSVDQYNEYLYSLAAEITSHLGDQKLMKKYLVKAHELAPENMTITLQYSNFLLHQHDDEANIKLLSPLVKEDETDPQLYWNLARSYQRTDQLELAGKYYEAALPAYSENPTFLKELINYYRETGETDKLMDELEHYLRLVPTDTEMQDLYDQYEDYK >NZ_CP014786|304847:312912|307986_309897_-|WP_063164120.1|DBSCAN-SWA MQTMRAEGLTSTYGEKTLFDDISFIINENDRIGLIGVNGSGKTSLLNVISGEVNPEGGGQITKPNDYTIGYLKQQPELDENKTIMEAVFEGKQPVFETIRQYELALERFTKHPEDPQAIDRYTKMQARMDQEDAWEADSRVKTILTQLKIKDVSQKIAQLSGGQKKRVGLAQVLIQQPDLLLLDEPTNHLDLDSVVWLQDFLRSYKGAVLVVTHDRYFLDQITNHIWELSFGKLYHCEGNYQDFVAKKAERVELAKDTEKKNQQLYKKELAWMRTGAKARSTKQKGRINRFHELEGKIGNLKTDEDIAINLGSQRLGKDVIQFKDANLKFDNHQILHDFNWLVQAGDRIGITGENGAGKTSLLNVIAQRVPLDSGVLKIGETVKLGYYTQQTEGIDNDKRMISFLSEIADNVTDKDGNKLSVTQLLERFLFPRFMHGTLIRKLSGGEKRRLYLLKILMQQPNVLLLDEPTNDLDIGTLTVLEDYLDNFAGTVITVSHDRYFLDKVADNLLVFNGNGDIERYTGRFTDYLTAKKEEADKNKELKNDQKALAKKQVNKQEPAKKEKTKLTYAEQLEWDHIDEELDALDQQHQQLENEMAEAASDYTKIAKLQKQLNEIQEKIDEKTARWEYLSTYVDE >NZ_CP014786|304847:312912|306501_306990_-|WP_063164118.1|DBSCAN-SWA MSELNLIWAEDLNGWIGKDNTIPWHVSADMKHFKTKTTGHPIIMGRRTFASLGNKPLPKRENIVLTSRNIDAEGVEVVHSLAALKEYLKANPNEYFVIGGAMIYQQLLPMATKLTRTVINKQIVGDTKMPTIDYDRWHLVNHNDYEKDDQLICRFEEWELNV >NZ_CP014786|304847:312912|304847_305690_-|WP_063164117.1|DBSCAN-SWA MAKIKIVCDSSAGLTDEEIKKYDITIIPLSVMIDGAVYVERETITNEQFPEMMKNAKSLPKTSQPPIGKFVDAFDKLGEDGSEVLCVIMMESISGTVHAAEQAAGMTKTKVTVYDSQSTDQVMGFEILEAAQVIEAGGSVEDAIAKMKEVLSKSELYLAIDNLDNLVAGGRISKFAGAISNLLNIKVMLHVYDGQIHIESKGRGIKSMHKEWDKILDEMARGPKVKRIGISHVDAGKEVERLLAKLKELYPEIEVTVRETVPIIATHTGMGACCLLYYTE >NZ_CP014786|304847:312912|309898_311110_-|WP_003674237.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKIKQLPAIFEPARPVLQKIEEAGYEAYFVGGCVRDTILHDEIHDIDIATSAYPSEIKAIFNHTVDTGIEHGTVMILDHGTGYETTTFRTESGYQDYRRPDKVTFVRSLSEDLQRRDFTINALALREDGEVIDLFDGLEDLQKHLIKAVGNPNERFHEDALRMMRAVRFASKLDFVIDTATLKGIKENAPLLEKIAVERIRVELEKLLLGQNPVAGLKDFIATGLYQYCPGLENAQAALSALLILNQWHLENEAQLWSVLSLQLQLDQKEIGKFLKKWKTANDLIAQVKKVVPAVQAIRQRALTPTLMFNTGETALHDANQVAKLYGWAIDDEELQKAYQKLPIKNAKELAIDGRVLITKAGVKPGPLMGKILQQLTLAVINGEIVNDATVLLEKVEEITKEG >NZ_CP014786|304847:312912|305868_306513_+|WP_003666062.1|DBSCAN-SWA MDTQKETRDRRTLLIEIGNAVTHGIGAGLSIAGLILLIIRAVHTGSPMRIVTFTIYGSALILFYLSSTLFHALIFTRAKRVFQILDHSMIFVLIAATYTPYCLVSIRGWLGWTIFGVIWGLSVIGIVYKCIWLKHKSKYSTIIYILMGWLCLVAFMPLWRALGPVGFGLLLLGGLSFTLGALFYSRPTAYTHLIWHIFVLIGTILMYFSILLYV |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
323343 : 433267
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014786|323343:433267|DBSCAN-SWA TCTATGCACGCGGATGATATTTCATATAGTTAGCAGATAACTGTTGCGGCGAAACCTGTAAATATGGTTGGAGAGCCTTCATCGCGTTATAACCAAGGATTCCTTGGATTAATTGGACGTCGGCGCCATTTTCTATTAAATGAACAGCAAAAGAATAGCGCATGGTTTGAGGAGTAACTTCCTTTTTGATTTTAGCCTCACTAACCCATTCCTTCATTTTTTTCCAAATTCCTTGCCGCGTCAAAGGATAACCATGGGCATTTAAGAACACCCGCGTTTCGTGCTCATCTCTGAGTAAACGTGGCCGACCGCGGTCTAGGTAGTCGGTAAGCCACTTAACTGCTGGTTGACTTAAGGGAATCATTCGTTCACGTTCATTCTTTCCCGTTAGTTGTAGAAGCCTAACGTCGAGATGAAGTGCTGTCAGATCCAAAGCAATTACTTCACTAACCCTCATTCCCGTTGCATCCATAATCTCTAACAACGCTCGATCACGAAGGCCGATGGGGGTTGAAACATCCGGAACTGCCAGTAGTTGTTCAATTTCTTTTTCAGTTAAAATTACCGGTGTAGGTGGTTGTTTAAAGGTATACTGGTGATCAATCATTTCCATTGGATTAATGGTTAGGTTATGGTGACGGATCATGTATTTATAAAATTGCCGTAAACTTGAAATCACACGGTTAATTGTTGAATTAGCTTTCCCCTGCTGACGAAGACTATTGAGGAGGTCAATTAGCAAATAGTGGTCCACCTGTTGCCAATCGACAATCCCTCGATCTTCTAAATAAGTCACAGTTTGTTCTAAGTCACGTTGATAACTCATCAAGGTATTATCGCTTAATTGTCGTTCATCTTTTAAAAAAGCTAAAAACGCAGCCACTTCATTATTCATTAATCTTGATTCTCTTTTACTAGGATTAATTGGCCATTTTCTTGTTTTACTAATTTTTCTTTAAGTAAATGTCCAATAGCACGTTTAAACTGCCCCTTGCTTATGCCAAAAACATCGCGAATGATCGATGGGTCCGTCTTATCAGTGTATGGTAAGCGGTGATTTATATCATGTTCTAACATTGTCAAAATCATTTGTGCATCTTCACCAATAGCTTGGTAGGCACGAGGCTTAAGGGAGAGATTGAGACTACCATGTGACGAAATTCCAATAACCCGCGCTTTAACCCGTTGACCTAATCGTGGTTCTTGGTCTCGTTCACTTGGATGGATGAATCCTAAACGATAATCATCAGTAATCACAAAGGTTCCACTCATCTTAAGGCGGTAAACTGTGGCATAAGTATCATGGTTTAGTAATCGTTTATCTGGAGCTGCTGAAATAGTTTGATAGATTTGATCATCTGCTAGTTTACCCCATAAACGGTCCTTATCATCAACTTGAAGCGCCATTAATAAACGGTCACCTGGTTGTGGCCATAAGTGTTTTAGGCTTGGTAAGTCATCTAAAGAGACAACAATATCCTTATTAGGGAGACCAATATCAACAAAAACTCCTAGATCACGACGCACATTAACTACCGTACCATAATCATAATGGTCAACCTGGATCGTTGGGATATATTTACAGGTCATCTGTAGTTGATGGTCCTCATTCTCGTAAACAAAACCTCGTACCTGTCCACCAATATGTAATTCTTGGGGACTTTCATTTTTCGGTAATCGATACGTTTGTCCATTACGATCTGGTTGAACAAAATAATCGGTATCATTTTCATCAATCATTACCGCTGTAACAACTTTTCCTAATGCTGAATTCATTTTTATCACTTATCCTTTTTTATTCTATATCGATTTTACACGGTAAAGGCTTATTTTGCTAGTAAGATCAATGATTATCATTGGTATAAAAAAAGACCGGTTACTAATGACCGATCTTTTTGTAGACAATATTATAAAATATTAGTCGATAGTCTTAACACGCATCATGTTAGTTGCACCTGGTACACCTAAAGGAACACCAGCAACGATGATGATCTTGTCGCCCTTCTTAGCAAAGCCAAGTTCAACAGCCTTCTTAGCAGCTAAGTCGAACATTGTATCAGTGTTCTTCATTTCATCAACAACGTATGGTTGAACACCCCAGTTGATCATAAGTCCACGTTCTACACGTTCGTTTGGAGTTAATGCAACGATATCAGCATTAGGACGGTACTTAGAAATCATCTTAGCAGTGTAGCCTGAAGCAGTGTAAGCAACAATTGTGTGGATGTCTAAGTCTTTAGCTGCGTTAGCAACAGCAGAACCGATAGTTTCAGTTACGTCAGACTTGTCCCAATCAAACTTTTCAGTACCGAATTCCCAAAGGTGGTTTTCAGCCTTGATATCAATGTCGTTCATCATTGCAACAGATTCAACTGGGTAGTCACCGTTAGCACTTTCACCAGAAAGCATAGTAGCATCAGTACCATCAAATACGGCGTTAGCAACGTCTGATACTTCGGCACGGGTTGGACGTGGGTTTTCTTGCATTGAGTCAAGCATTTGGGTAGCAGTAATAACTGGCTTACCTAATTCGTTACAACGCTTGATCATGTGCTTTTGAACAATTGGCACATTTTGGGCAGGAATTTCAACACCCATGTCACCACGAGGTACCATTAAACCGTCAGAAACAGCAATGATTTCTTCAAAGTTGTCGATACCTTCTTGAGATTCAATCTTAGGGAAAATTTGAACATCTTCCATGTTCTTTTCCTTAAGTAATTCACGAATGTCAAGAACATCTTGAGCCTTACGAACGAAGGATGCAGCAATGTAGTTGATCTTGTTTTCCAAACCAAAACGAATATCGCTACTGTCCTTTTCAGTAATACCTGGTAAGTTGATTGATACACCAGGGGCGTTAACACCCTTCCGAGAACCAAGAACACCATGGTTTAAGACGTGACATACAAGTTCCTTGTTTGCATCGTCTTTTTCATCAATAACCATGTCAATTAAACCATCATCAAAAAGAACATGGCCACCAACATGAGTATCATCGTATAAGCCTGGGTAGGTAACAGCAATCTTGTCATGAGTACCTTCAATTGAAGGATCCATTGAAATGCGAACCTTGTCGCCAATTTCAAAGTTGATCTTACCTTCTTTTTGAACAGTAGTCCGAATTTCGGCACCCTTAGTATCAAGCATAAGACCAACGTGCTTGCCAGTAATTTCTTCAGCCTTGTGTACGTTTTCGATCCGACCCAAGTGTTCTGGGTGGTCACCGTGTGAGAAGTTGAAACGGAAAATGTTAGCTCCCGCATTGATCAACTTAACGATCGTATCAACATCAGTACTTGCAGGACCAAGTGTACTTACAATCTTGGTTTTCTTCATAAATGAATCTCTCCTTTTGCATCTATAGCATCAATCACGATCTGTAATTGTATGCCTCATTTGCACACTGTTATGATAGCACTTTTCAAATAACGTGTCTTTATTTTTTATGCAAAAGGTTTTAAAAAAGCGCTATCATTCTAAAATTAGTTATTTTTTCTAACTGTTATTTAATTTTAGAGCTTTCAGTGATTACTATTAAGCTGTTGTAAGACAACGTTTTCTTGGCCAAGAACAGCAACAAGCGCCTTTTTTGCTTTCTGAGAATTTTTTAACCATCGTTTTTGGTCAAGCAAGATCTTCTTATCGTTTGCTGGATAAAACAACAAGACAGGAATTGAACCATGGTATTCATTAAAAATATTATTTAACTCTCGATGCACCATCTCAGTGTCTAATGACGGTAAGATTCGTAAAACCCATCGTTGACTAGGACGCTCCTGTTGAACTTTTTTAACATCCTGCAATTGATTAGCAACTAATTGTAGGCCTCGTCCCTCCCGATATTCTACTCGGCCTCTGACAATTAAGATCTTATTTGTTTCTAGTTGCTCTTTGAACTGCTGATATTGTTTAGGAAAGACAGTAATATCAACTGCTCCGGTCTCATCTGTTCCATTAACAAAGGCCATTTCCCGATGTTCACGTTTAGTATAAATAGTCTTAACGTGATTTGTAAGAACAATTATTGTCGCTTCTGAATTCGGGTATAAATCTGCAATTTTAGTTGCATGGAGCTGCTGTCCTAATTGGTAATATTGAGTAACCGGGTGGCCAGAAAGATATACTCCTAAGTATTCATTCTCCTTCGTTAAACGGGTTAACAGAGGAAATTCGTTTCGTTGGTCGATTGCCGTTTGGAGCGTAGGATCGTCAAAATTAGCAAAACCGGCAAACAACTCAATCCCGGAAATTAATTTAGGAAGGGCGTCAATCATCTCGGCCCGGTTGTACCCCATATTATCAAAGGCCCCACTATAAATTAATGGTTCGATTAATTCTTGCTTTTGCCAACGTTCTGGAATGCGGGTAATAAAATTGCGAAGATCTGTAAACTTGCCATTTTCCTGTCGTTCTTCAAGAATTGCGGCGACAAAATCACGACGTACTCCTTTAATAGCAGAAAAGCCAAAATAAACTGTCCCATCATGTAATAGAAAACTACTCTCACTTATATTGATTCGCGGACCACTAATCTTGACGCCAAATTGCTTTGCATCCCCCACGTGACGCTTCAATTTCTCAATATTAGTTTCTGCATTCATTAGGGCAGTAAAAAAAGCTGCAGGGTAATGAACTTTCAAATATGCCATCTCAAACGCCATCATAGAATAAGCAACTGCATGCGAATGATTGAACCCATAATTAGCAAAGCGATCAATATATTCAAATACCTGGTGAGCAACTTGTGCTGAATAGCCGTGTTCTGTTGCACCGGCAATAAATTTTGTCCGCATATCCTCCATTGTGGCCTTTTTCTTCTTACTCATTGCCCGGCGTAAAAGATCCGCTTCTCCTAAGGTAAAACCAGCCATTACTGAGGCCAGCTGCATTACCTGCTCTTGATAGACCAAGATACCGTAAGTTGGTCCCAGAATCTTTTCAAGTGAAGGAGCAGGATAAGCAATTTTCTCTTTTCCAGCTTTGCGGGCGGTAAAATG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111 | Lactobacillus_phage(47.62%) | portal,transposase,integrase,capsid,tRNA,head,plate,terminase,tail,holin,protease | attL 315315:315330|attR 423139:423153 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
513709 : 568738
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP014786|513709:568738|DBSCAN-SWA 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50 | Acinetobacter_phage(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
652403 : 719393
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP014786|652403:719393|DBSCAN-SWA 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59 | unidentified_phage(18.75%) | integrase,transposase | attL 701234:701248|attR 722308:722322 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
876434 : 948889
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP014786|876434:948889|DBSCAN-SWA 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58 | Bacillus_virus(20.0%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1005090 : 1298382
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP014786|1005090:1298382|DBSCAN-SWA 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236 | Bacillus_phage(15.94%) | tRNA,integrase,transposase,protease | attL 1048794:1048813|attR 1068685:1068704 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1305984 : 1435001
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP014786|1305984:1435001|DBSCAN-SWA AATGACCTATAAACATCTTACCACACGTGAATTAACTCTCATAGCTGATTTTTGGTATCAAGGTACTAAAGCTTATCGGGCTGCTAAATTACTTCAGCGTAGTCAAGAAACCATCTATCGTGTTTATCGTTTCCTCAACGACGGTAAAACCATCGACCAATATCTTCAGACTTATCAGCGACATAAGCGTCGTTGTGGTCGGAAGCAGACCCAACTGCCAACTATCGAAGTTAACTATATCCATGCGCAAATCAAGGCAGGTTGGACTCCTGATACTATTATTGGTCGTCATGAACACCCAATTAGCTGCAGTATGCGCACCCTTTATCGCATGTTTGCCCGCAATCAGTATGGCTTTTCCGTTAAACAGCTACCAATGAAAGGAAAACGCCATCCCAATGGTTATGTGGAACATCGTGGTAAAGCTGGCCAATTAGGACGCAGTATCTATCAACGATATCGTGATTTTCCGCATTACCAACATGAATTTGGGCACTTTGAAGCTGATACAGTTCAAGGTAAAGCTCACCGCGGAGCGGTAATGACGCTAGTAGAGCGACAATCCAAAGTAATGATTGTCCTTAATATTCATCATAAAACAGACGAAGCAGTGAATTGCCAGCTTGATCAATGGCTCGCTAAACTGCCACGTCACTTTGTTAAATCAATTACTTTTGATAACGGGAAAGAATTTGCTGGATGGCGAGAAATAGCCAATAAGTATGATCTTCACACCTATTTTGCGGAAGTTGGTGCTCCCAATCAACGAGGGTTAAACGAAAATAATAACGGCCTCTTGCGTCGTGATGGTCTTAGTAAAAAGCTAGATTTTCGCGATTTACCAGACGAACTAGTCACTCAGCTAATGCATCGTCGCAACAATATCCCACGAAAATCTCTTAATTATCGTACACCATTAGAAGTATTCTTGAGTCATGTCACAGAAGAACAACTTTCACCTTTTTTCTAATTTAAATTGACATTTCAGGATAAATTTAATTTGCCTTAAAAGGAGTAAAAAAGTGCGCTCAAATAAGTTAACAAAAATCATTATTACTTCTACTCTCGCACTATCTTTATTAGCAGTGCCAGTTAGCCAGGCCACAGTTTTGGCTGCTGAGACAACTAGTGAAAGTACGAGCAGCAGTTCAACTACCCAGACCCATACGTTAAATAAATCATATGTTGTATATGGAGCAGGGGCTGCCGAGAAGAATGAATTAAATAATGTGCTAGCAGTCGATGATAACTTTACAACGTTGACCGCTACTGCCAGTGATTATCAGAAGTATATTAATCCGAATGGTTCGACAACTAATGCTGCCATGGTTAGTTCGGTAGCAATTGTCCCCACCGATCCAGGTTCGGGGATTAAAGTTAATGTAAAAAAGTTTAATGGTGAGGATAATATTACGAAAGTTACTGCCCAACAGTACGCTATGGTTGCGCAAATGGCGGGGGTTACGGATGTTACTATTACCGTTAGCGCTAACCGAGCTGTTTCTGGAGAGTCAGCTTTAACCGGAGTCTATAAAGCAATTGCGGCAGATGGAGTTAGTTTAAATGAGCAAAATACACAATCTGCTAACCAAATGTTGACCGCAACAAATGGGGCAATTGAAGCTAATAAGGATGATAGTAAATATCCGGGTAAGTTGATGGCTGCGGTTGGTGATACCACTAAAGAAATTAACCAACAAAAGAAACAAGGAACTACCCCAACGCAAAATCAAATTCAAGTAATCTTTAATCAGAAACTTGAAGAGCGAAACATTTACAATGAAACAAAGAATCATGAACAACCAATTATCAATGCGCTTGTTCAGTTTAATAATGCTCCAATTAGTTCAAGTAAAGACTATAGCTCGCACGTAACTGATACGATTAATAATGTAAAGAACTCATCAGGAGATATGATGAATAAGGCGAAAAAATTCTTGAATTCTCAAGACGGTCAGGCAGTTAAGCAACAAGCTCAGTCTTGGTGGACCCGATTTGTTAACTGGATCCGTAGCTGGTTTTAATTGACGTAAAAAATAAGAGGCAGGTGAAAATAAAATTTTCATCCTGTCTCTTATTTGTTTAGTCTAAAGTTACTTCACCAGCAACATCGGTATTGAAGAAGTCTGCAATTTCTTTAACATCCATCCCTTGACCAAGCCCCCACATTAATTTAGTGATGGCACTTTCAGAAGTCATGTCGCGGGCGCTGATTGCTCCTTCTAGTAGTGCAAGTCGTCCGACCTCGTATTTTGTTAGGTCGCTTCGTTCATAAAGACACTGACTAGAAGTAATAATTGGAATGCCGTTTCGGATTAATTCACCAACTGCAGCGACCATATTTCGCCGAATCGAGGTCATTCCTCCGAGACCATACGCTTCAATCACAATTCCATGACAGCCATTCTTAGCCATTGCATGGAGCAAGGCAGGATCAAATCCGGGAAAAAGCTTTACCAGTGAAACATGAGTGTCGATCTTAGTATTTAATTGACTTTTACCAGGCTGGGGATGCCGGTGATCTCTAATGGAAAAGCCGTCTGAAGTAACTTCTCCTACTGGTGGGACATTCACACTTTCGAAAGCATCGAAGGCGGTTGTCCGCACTTTAACACTCCGACAACCACGCATTACTTTACGATTAAAAGCAATATAGACTCCTGGCTCGCAGTTAGCGGCGGCTGCAAAGGCAAGTCGTAAGTTATCAGGAGCATCACTAAGAATCACATTCATAGGAACTTGGCTTCCAGTTAGCACAACAGGAATATTAATATGTTGAAGCATGAAAGTCAGCATCGAAGCAGTATAAGCCATCGTATCTGTCCCATGCGAAACGACGATCCCATCATATTCATTACGATGGTCATAGATCGCTTCGGCAATAATTTTCCATTCTTCTGGCTGGATGTTAGATGAATCTAATTCGAGAATATCACGAACAGTAATGTCATATTCCAGCCGACCAAGCATTTTTATTAATTCTTCACCAGATTCGCCTGGAGCTAGTCCTTCATCAGAGACAACCGAGGCAATAGTTCCACCGGTTGAAAGGAGTAATAATTTTTTCGTCATTTTTAGTCACCATGATTCATTTTTTATTAATATTTTAAATAGGGATTTTCAGCGAAACAAGTTAAACGCCTATAATTTAACTTAAATTAGGCCAATTTTGATTAATTTCATTAAGTAGAGGCGTTAAAGAACTTTTTTGTTTTTTACGGTAGTTAGCATAGAACGTCATTGTGGCAGCTTCATCGGTAATCGGGAGTCTAACTCGATCGTCCTTTGAAGTACGTTGTCGTGGATTAGCTGTTGTTATATTAGTGCTAAAGTATGGGAAACTAGAATATTTTGTGATTTCAGTAAGTGCGGCCCATTCTTCTTGATATAAAAATTTAGCATTTGGAATATATTTTTGGATAATTTCTTTCCACGGTCCGATATCGTTCAAAACGACAAAACTTAAGCCGGCTAGGTCCTTGAAAGAAACCTGTTGGGAATTAGCAAGGTACATAAATTTATCAAGATTAACATAGAGATTTTCAGCACCTAAATAACGCGATTCAATTTGATCAGTTTGAATCTCTTGGTTGCTGATAATTATTGAATTTTCATTATTTAAAAGTGAAGCGGTGATTTGGTCAGGAGTAATAAACTGCTCGTCAATCGAAATTTGTGTAGAGAAAGATGCACTTTTTACACGAAGCAGAATTAATGGGCCCGGAGCAATTGATGCAATTTTAATTACTGATTATCGAGCAGCATAATTTTGAAGTTGTTGAACAAAATTACGGTTGACGGCGAGAACTTCAGTAGCTTTTTCAGCAGCTAATTTTCCGGTATCAGTAAGGATGATGCGGTTAGGTTGGCGGTCAAATAATTGAATTCCAAGCTCGTCTTCTAATTTTTGCATCCCCCGGGTAACGGTCGGTTGGGTAACGTTAAGTTTTTCAGCGGTTTTAGCAAGTGTTTTTTCACTGGCAAAGGTCACTAATTCTTTAAGCAAGTAATTGTCAATCATTAGACCACTCCTTGATAGTATACGCTGATTGTATACTACCATGTAAAGGTAGTAATTTTCAATTTGTAAATTAGCAATTAATATATAGACAACAATTAATTACAGGAAGGAAGAATGATTTTATGACAAATGTACCAACAGTAAAATTAAATAACGGAGTAGAAATGCCAACCCTTGGATTTGGAGTATTCCAAGTTCCAGACTTAAGCCAAGCTGAACAAGCAGTTACCGATGCTCTTGAAGTCGGCTATCGTTTAATTGATACTGCTGCTGCTTACCAAAACGAAGAAGCAGTTGGAAGGGCAATTAAGAATAGTAGTGTAAACCGTGAAGATGTCTTTGTAACTTCTAAGTTATGGGTGTCTGATTTTAACTATAAGCGGGCTAAAGCAGGGATTGACGCTTCACTGCAAAAACTTGGCCTTGATTACATGGATCTTTACCTTCTCCACCAACCATATGGCGATACAATGGGGGCTTGGCGAGCATTACAAGAAGCACAGAAAGAAGGTAAGATTCGCGCAATCGGTGTATCGAACTTCTACGCTGACCAACTAAAGGATCTTGAATTAACAATGCCAGTTAAGCCAGCGGTCAACCAAATTGAAGTTAACCCTTAGTATCAACAAGATCAAGAGGTTAAGTTTGCGCAAAGTGAAGATATTCGTGTTGAAGCATGGGCACCATTTGCGGAAGGTAAGCATGATATCTTTACCAACGAAACAATTGCGGAAATTGCTGCCAAGTATGGCAAGAGCAATGGTCAAGTAATTCTTCGCTGGCTTTTACAACGGGGTATTACTGTCATTCCAAAGTCAGTCCACAAGAACCGGATGGAAGAAAATATCGATGTCTTTGATTTTGAACTTTCCAATGATGATATGAAAAAGATAGCTAGTCTTAACAAGAAGGAAAGTCAATTCTTTGACCACCGTGATCCGGTTACGATTGAACAAATCTTTGGCTCCAGCTTAAAGAT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107 | unidentified_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1513371 : 1576283
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP014786|1513371:1576283|DBSCAN-SWA AATGTATTTGATGTGTGTGAGTTTGAATTATCATCAATTACCAATTGAATTACGAGAGAAATTTTCTTTTTCAGCTGACGAGATTCCCAAAGCTAATAGGTTGCTTAATGCGGAAAAGAGTATTTTAGAAAACTTGTTGATTTCAACCTGTAATCGGACTGAAATTTATGCGGTAGTGGACCAGGTTCATACGGGTCGCTATTACATTAAACGTTTTTTGGCGGAGTGGTTCCATTATACGGTAGAAGAATTTAATCAGTATGTTTCAATTACCACCAAGGATGATGCTGCAAGTCATCTTTTCCGAGTAATTGTGGGGCTGGATTCTTTAATTAAAGGTGAGCCGCAGATCCTGGGACAGATGAAAAATGCATTTCAAGTTGCAACAGATCAAGGAACAACCGGAGTAATATTGAATCATCTGTTTCGGCAGGCAATTACATTCTCTAAAAGAATGCATACAGAGTATCGGGTAAGTGAACTGGCTCAGTCTTCTAGTCAAGCAGGATTACATCAAATTAAAAGCGATTTTGGTTCATTAGAAGGTAAGAGTTTGGCGGTAATTGGGTTAGGACATATTGGTAAACATACTGCTTATAATGCTAGTAACATGGGCTTTAGTAAAGTTTTACTATTGAACCGCACAGACCAGAAAGCTAAACAGATTGCTAACGAGTTGCAAGGGGTAGTGGAAGCACGACCATTTAGCCGGTTAGATTCAGTGATGGCAGAGGTTGATGCTGCTGTTTTTGCTGCTTCAGTAAAAGAGCCACTATATCGGGTAACCGATGATCGTCAGCAAGTGATTGTTGATTTGGGTGTTCCACGAAATGTCGCCTATGATAGTGAATCCGTCAATTACTATGATATCGATAATTTGCACTCAATATTAGAAACGAATGACACCAAGAAAAATCAAATGTTAAATCAAATTGCTAAAGAAATTCCCCTTGAAGTTAACAACTTTTATGTTTGGGAAAAGCAATTGCATATTGTTCCTGTAATTAGAGGGCTTCGTGAGCATTCATTAAAAATTGAAGGAGAAGCATATGATAGTCTTCTACGTAAATTACCAGAATTAAATGCCCATGAACGTAAAGTAATTAGTAAGCATATGAAGAGTATCATTAACCAGATGATTAAGGGACCAATCAAAGAGATCAAAGAGTTATCAGTAACGCCAGGAGCGACATCGGATATTGACTTTTTCTGTAAAATCTTTGGGATGGACAATTTAAAGGTGGAGAATCAAGAAAATGACAGATAAAGTAATTGTTGGTAGTCGGAAAAGTAAGCTGGCAATGGCGCAAACCAAGCTAGTGATTGCATCGCTTAAGGAACTTTTTCCGACAACACAATTTGAAATTAAGAATGTTATTACTGAGGGCGATCGTAATCAGCAAGCAAGCCTAGCTAAAATTGGCGGTAAGGGTGTTTTTGTAAAAGAGATTGAAGAAGAGTTAAAAAATTGTACCATTGATTTTGCTGTTCATAGTCTTAAGGATGTAATGCCGGTACTGCCTGATGAATTAACACTTGGCGCCTTCCCTAAACGAGTATCGCCGTTTGATTGTTTGGTGAGCCGTCAAGAATTCGCCAGTCTTGATGCTCTTCCACACGGTGCCCGAATTGGTACTAATAGTTTGCGCCGTCAGGGTCAGTTATTGAATGTTCGACCGGATTTAAAAATTATACCGATTAGGGGTAATATAGACACTAGGCTAAAGAAAATAGACACAGAAAATCTTGCCGGAGTTGTCTTAGCTGAGGCAGGGCTAGACCGCTTGAGTATTGACTTAAGCAGCTATCATCAGCTATCACTAAAAGATATTATTGTTCCAGCTGTTGGGCAGGGATGTTTAGCAATTGAATGTAGGAAGGCGGATGAAAGAGTACGCAAAATGCTTGATCAGATTAATGATCCGCAATCGGCAAAGTGTATTCATATCGAACGAGAATTCATGCGTGAGTTAGGAGGAAGCTGTAATTTCCCAATTGGTGGGCATGCTTACTTACAGGACCAGCAGATTGTTTTTGACGGGTTAATAGCATCCCCTAATGGTGAACACTTAATTAAAGAAGTAGCAGTTCCTGCCAATAAGCCTGGAGTCGGCAAGGTGGTTGCTGATCAGTTATTGGCTAAGGATAATTTTGGAATTATTGAAGGAGATTAGTAATAATGTTGCAATTTGATCGTCATCGTCGTTTACGTACTAGCGCTGCAATGCGAGATTTGGTAAGAGAAACTCATTTAAATAAAGATGATTTAATTATGCCGGTTTTCGTGGACGCAACAATCAACGGCAAAGAAGAAATTCCGTCAATGCCGGGAATTTACCGGTATAGTCTTGATACCATTTTGGATGAAATCAAGGAAATCGTGGACCTTGGTATTAAATCAATTATTATTTTTGGTGTTCCAGAGAAAAAAGACGAGGTTGGAACCAGCGCTTGGGAAGAGAATGGTATTGTCCAACAAGCGATTCGGTTAATCAAGAAAAACTATCCTGAATTAATCGTAATTGCAGATACCTGCTTATGTGAATACACCAGTACCGGTCACTGCGGAATTCTTAAAGACGGAATAGTCTTAAACGATGAATCCTTAGAATATCTTACTAAAACAGCAGTTAGCCAAGTGGCAGCCGGTGCGGATATTATTGCGCCATCAAATGCAATGGACGGTTATGTCGCTGCTATTCGTCAAGGATTAGATGAAGCAGGATTCAAGAACACACCAATTATGTCCTATGCTGTAAAATTTGCTTCATCATTTTATGGTCCATTCCGTGACGCTGCTGATGGTTCACCTAAAGAAGGACCTAAAGATCGAAAAACATACCAAATGGATCCAGCTAATCGCCTAGAAGCATTGCGTGAAGTAGCTAGTGATGAAAAGGAAGGTGCTGATTTTGTGATGGTTAAACCAGCAATGGCCTTCTTAGATATTATGCGTGAAGTTCGTAACCATACTTTATTACCACTAGTTGCATATAATGTTTCCGGTGAATATGCAATGGTTAAGGCAGCTGCAGCTAATGGCTGGATTAATGAGGACCAAATAGTTTATGAAAGTTTGGTTGGAATGAAACGAGCTGGGGCAGACTTAATTATTACTTACTTTGCCAAGGACGTTGCTAAAAAACTTTAATTTGTTAGGTGGGTTTATTTTGAGTAAATTAAATACAACAAGATCAAAGGCAGCTTTTAAGGAAGCGCAAAAGTATATGCCAGGCGGGGTTAATAGTCCTGTACGAGCATTTAAAAATGTTGGTGGCGATCCGCTTTTTATTGACCATGGTAAAGACGAATATATTTACGATATTGATGGAAATAAATATATTGATTATGTTTTATCATGGGGTCCGCTAATTTTAGGACATGCAGACGATCAAGTAGTAGCTGAGCTTGATAAGGCAGTTGCAAAAGGCACGAGCTATGGTGCGCCTACATTACAGGAAACTGAATTAGCAAAAATTGTTAATAAGATTATGCCATCAATAGAAATGATTCGGATGGTATCTTCAGGAACGGAAGCGACAATGAGTGCTATTCGGTTAGCCCGTGGGTACACTCGCCGCGAGAAGATTGTAAAGTTTGTGGGTAATTATCATGGACACAGTGATTCGCTATTAGTTGACGCAGGGTCAGGTTTAGCAACATTTGGCATTAATACTTCGCCTGGTGTACCTGATGACCTTGCTTACGATACCTTAACAGTTGCCTACAATGATGTGGACGGTGTTAAGAAATTATTTGCAGATCATGGGGATGAAATTGCTTGTGCGATTGTTGAACCAGTAGCGGGAAATATGGGTGTTATTCCTGGTACTCAAGACTTCTTGCAAACTCTTCGTGATGTTACCAAAGAGCACGGGTCCCTTCTTATTTTTGATGAAGTAATGTCTGGCTTCCGAGCAGCATATCATGGTGTACAAAGTTTAGTTAATATTACCCCTGATTTAACAACACTAGGCAAAGTTATTGGTGGAGGACTTCCAGTGGGTGCGTTTGGTGGTCGTCGTGAAATTATGGAGCAAATTACCCCTGCTGGTAGTATTTATCACGCTGGAACCCTTTCTGGAAATCCATTAGCAATGACAGGCGGAATCAGTACGCTTAAGCAATTAACCCCTGAAGATTATGTTGAGATGGATAAAAAAGTTACAGCATTAACTGATGGGATTAAGCAAGCTGCAGATAAGTATGGTGTACCAATGACTGTTCATCATGTTGGAACAATGTGGAGCTACTTCTATAATGGTGATTCAATTAATAACTTTGATGATGTAAAGGCATGTGATCAGAAACTCTTTGAAAAGTGCTTCTGGGAACTATTAGCCCATGGTATTTATGTTGCACCTTCACAATTTGAAACAAACTTTATTTCTACTAAGCACACTGATGAGGACATTGAAAAGACAATTGCAGCATTTGATGCAGCATTTAATGCGGCAACCAAGTAAATAAAAGATTAAAAGGCTGTGGCAAGGAATTGTCACGGCTTTTTTTGAAAGAAGTGAAAAAATGGGAAAGCAAAACTTAACCCTTGTCTTAGGCGGTGCCAAGAGCGGTAAGTCAGAATTTGCTGAAAGTTTATATTCGCGCCAAGAAAAGGTTTGCTATATCGCAACTGGTGTAGTAAAAAATCCGGACGGTGAAATGCAATTACGAATAAAACGCCATCAAGAGCGCCGATCAGCTAATTGGACAACGCGAGAACAATATAGAGATATTGCAGAAGCGATTGAAGATAATCCTTTAGATGGCTACTTACTTGATGATGCGATAATGCTAGTTACAAACTTGTTTTATGATTTTGTGCTAACTAAAACAACGCCAGAAAGAATAGATGCTTATTTAGAGCAAACATCTTCGACAGAAATAGCAAAAATTCGACAAATGATTCTTGATGAGTGGACAAAAATTTTAATAGCGCAAAAGCAGAATAGTCAATCAATGGTAATAGTTAGCGATGAAGTTGGCTTAGGAGTAGTACC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59 | Streptococcus_phage(17.65%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1614128 : 1660942
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP014786|1614128:1660942|DBSCAN-SWA 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MENSVALEVKNLQVLYGDKHVVHDVSMKFPANKITAMIGASGSGKSTLLRSLNRMNDDLATVKGEINFHDLNINQPKVNVYRIRQQIGMVFQQPTPFPLSIYENVIYGLRLAGVKDRQILDQRVEESLRQAALWEEVKDHLKESALALSGGQQQRLCIARTLAVQPEIILMDEPTSALDPVSTSQIEETLVQLKEKFTIIMVTHNMQQASRSADWTAFMHQGKLIEFNQTADIFMNPRQQQTADYLSGKFG >NZ_CP014786|1614128:1660942|1637284_1638049_-|WP_041821602.1|DBSCAN-SWA MCPNETIKHQLNHRTIRAFKPINLSAEQLNTLYSVASHTPTSMFMQQMSIMHITDPDKRAAIREISKQPYVGANGDLFILLVDLYRNQQIRQQKGKDDGRLHTADIFFQGLDDAIMAAQNIIVAAESMGLGVVPLGSIKNEPQKIIEVLNLPKMTFPVLGLQIGVPNQEPQLKPRLPLKFIAFDNDYPKEIKLSDLSDYDQEVTTYYDLRDANQRIDSFTNQIAGAKLDRHYTKRDEIMKVLHQQGLCTDEGID |
35 | Planktothrix_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1687936 : 1747414
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP014786|1687936:1747414|DBSCAN-SWA AATGACCTATAAACATCTTACCACACGTGAATTAACTCTCATAGCTGATTTTTGGTATCAAGGTACTAAAGCTTATCGGGCTGCTAAATTACTTCAGCGTAGTCAAGAAACCATCTATCGTGTTTATCGTTTCCTCAACGACGGTAAAACCATCGACCAATATCTTCAGACTTATCAGCGACATAAGCGTCGTTGTGGTCGGAAGCAGACCCAACTGCCAACTATCGAAGTTAACTATATCCATGCGCAAATCAAGGCAGGTTGGACTCCTGATACTATTATTGGTCGTCATGAACACCCAATTAGCTGCAGTATGCGCACCCTTTATCGCATGTTTGCCCGCAATCAGTATGGCTTTTCCGTTAAACAGCTACCAATGAAAGGAAAACGCCATCCCAATGGTTATGTGGAACATCGTGGTAAAGCTGGCCAATTAGGACGCAGTATCTATCAACGATATCGTGATTTTCCGCATTACCAACATGAATTTGGGCACTTTGAAGCTGATACAGTTCAAGGTAAAGCTCACCGCGGAGCGGTAATGACGCTAGTAGAGCGACAATCCAAAGTAATGATTGTCCTTAATATTCATCATAAAACAGACGAAGCAGTGAATTGCCAGCTTGATCAATGGCTCGCTAAACTGCCACGTCACTTTGTTAAATCAATTACTTTTGATAACGGGAAAGAATTTGCTGGATGGCGAGAAATAGCCAATAAGTATGATCTTCACACCTATTTTGCGGAAGTTGGTGCTCCCAATCAACGAGGGTTAAACGAAAATAATAACGGCCTCTTGCGTCGTGATGGTCTTAGTAAAAAGCTAGATTTTCGCGATTTACCAGACGAACTAGTCACTCAGCTAATGCATCGTCGCAACAATATCCCACGAAAATCTCTTAATTATCGTACACCATTAGAAGTATTCTTGAGTCATGTCACAGAAGAACAACTTTCACCTTTTTTCTAATTTAAATTGACATTTCAGGTTTTAAATAACAAGATAACATGAAGCTAGTTTAGCCGCCCTTCTTGTTGAAAAGATTAATTTCTTTTGCGAACATTCTTTTGTATTCAAGTATAAATTGACGTAAGATAAAGATATTATTTCGATATAGAAAGGGTTAAGACGATGAATACTCGTGATTTACAATACTTTGCCATGTTAGTTAAATTAAAAAATTATACGCAAGTAGCAAAGTATTTTAATGTTTCTCAACCTAGTATTACCCAGGCAATTCGTCGCCTTGAGCAAGAATTTGACACAAAATTAGTGCGCAAAGATCGTGTTCATAGGGATGAAATGATTACGCGCAGTGGGCAGTTACTATATGAAAAAGCGTTGGCGATAAACAAAAAAATAGACATTGCCCATCAAGAAATAGCACGGTCCGATCAACGACAAATAAAATTCGGCCTTCCGCCAATCATTGGAAAAATGTATATTTCACACATTATCGGCAATCTTTCTAAGCAGCTTCTTCAACGAATAAAAATCGTTTCTGTGGGGTCTCATGAATTGCTAAGTGAATTACAAGCGGGCAAGATCGATATTGCCATGCTGGGTTCAATTGCACCAATTGATCAAACCGGTATTTTTGCGGAATTAATAACTGCGCGACCATTTAGTATCATCGTAAGTGCTGATCATCCGCTTGCAAAGAAAAAGGCGGTTAGTTTTCAAGACTTAACGAACGAAATCTTTATTAATTATGACCAGCAATATGTGCATAAAGCTGCCTTCCAAGCCTATTCTACCTATGCCCAAATTAATCCACAAACGGCAATTTATAAGGTGCCAAATGTTTCCTGGATTAAAGAATTAGTACGACAAAATAAGGGAATTAGTTTGATGGTTAAAGATGCGGTAAAGGATGAACCAGGAATTGTTGCCCTCGATATTGAAGACCCAATTCCCGAAAAATTTTTTATTTCGCTTGCCACACGGGAGGATTACATTTTAAGCGATGATGAACAGCAATTAATCACTAAATTAAAAGAAATTACTCCCGTCGCTTGACAGCCGCCGTATAATTAAATAGTTAAGAGAATTGATAAGAGGAGCTTGATGGGTTTTGAGTAAGGATAAAGAGATCTCAGCGAATGATTTTGCGCCGACTGAACATTTGTCTGATAAGCATCATATGGCGATTCCATGGCATGACTTTTTTACAAATGATAATTTCACCCCTGCTTATGAGGCTAATTTAGTGGAACGAGCAGCGATTGTCGGACGAATTGGATTAATGATGCTTTCTTATGGAACAGGGGCATGGCGAGTCCGTGATTCAATGAATACGGTTGCTCGGACGTTAAAAATGACTTGTTCAGTCGATATTGGGTTAGTTTCCCTCGAATATACTTGTATGGATGCTCACCATAGTTACACGCAGGCAATATCTTTACCAAGCACAAGTGTAAATACGACGAAACTTTCGCAGATGGAACGATTTATTAAAGAATTTGACCAGCATGGGAGTGAGATGACAATTGGGGAAATCCACTCCCGTCTGGAGGAAATTGCTCACTCAAAAGGGAATTATGCTCCTTACCAAGTAGGATTAGCAGCCGCTCTGGCATGTAGCGCCTTCGTATTTTTACTTGGAGGTGGACCAGTTGAAATGTTTTGTAGTTTTATCGGGGCTGGCCTTGGAAACTATGCCCGCCGTAAGATGATTGACCGTCATATTACCTTATTTGCGGGAGTCGCGGTTGCGGTTGCAGTTGCGTGCCTTTCTTACCTGCTGGCCTTAAGTTTGATGCAATTAACATTTAATGTGAGTTCGCGTCATGAAGCAGGGTATATCGGCGCAATGCTGTTTATTATTCCGGGATTTCCATTTATTACTAGTGGCCTTGATATTTCAAAACTTGACATGCGGTCCGGGCTTGAACGAATGACCTATGCAATCGCAATTATTACAGTTGCTACGTTGGTCGGGTGGATTGTAGCATTAATGGTTAATCTCCGTCCTGAGAATTTTCAAGCATTGCCGCTATCTGCATTAATGCTCTTTTTACTCCGGCTGCCAGCTAGCTTTTGTGGGGTATTTGGCTTCTCAATAATGTTTAACAGTACGCCTAAAATGGCATCTATTGCCGGTTGTATTGGTGCGATTGCTAATACCTTACGCTTAGAATTAACGGACTTGACCGGAATACCGGCCGGAGCAGCCGCATTTTTAGGGGCGTTAGTTGCTGGGTTATTGGCATCAATTGTTAAACGTAAGATTCAATATCCGCAAATTTCAATCACGGTTCCATCGATTGTTATTATGGTTCCGGGACTTTATATGTATCGGGCAATGTATAATATCGGTTTAACTTCAATTAGTTTAGGGACGCTTTGGATGACCAAGGCGCTTATGATTGTTGTATTCTTGCCAATGGGATTGATCGCTGCTCGTATTCTTACAGATTCTAAGTGGCGACATAATGGATAGGAGATTGAGAATATGATTGCAGAATATCCGCCAACACTTCTGGCAGAGGTAAAAGAAAAAACAAAGAATCGACAATTAACAGGCTTTACTCCAGGTCAAGGACCACTTAATCCAGACTTGATGTTAGTAGGAGAAGCTCCTGGTCGTCACGAAGAAAAGGTAAATATTCCTTTTTCTGGTGCTTCCGGTCAAGAACTGATGAAATTAATTGAATCAATCGGATATTCACGTTCAACCGTTTATATTACCAGTATAGTTCGTCAACGGCCTTATAGTATTAAGAAGGCAGTCGATAAGAAGACGGGTGAAGTAATTGAAAAACACCCTAACCGAACGCCAACTAAAAAAGAAGTCTTAGCATTTGCCCCTTTGTTTGATTGGGAATTAGCTCAAGTTAAGCCGAAAATTATTGTTACGCTTGGCAATACGGCTTTACAACGGCTGCTTGGTAGTCAGGCTAATATTGGTAAGCTTCATGGGCAACTTCTCCACGAAAAAATTCAACGGACTAATGACGCGCATGATGGTTATGAGTTGACGACTGACAAGCATTGGATTATGCCAATGTATCATCCGGCCGCAGTACTCTATGCCCGCCGATTGGAGCCTACTATTAAAGCAGATTGGCAACAGTTAGGGCAGGATATTAAGAAAATGAAAAGATAACCATTATACTTTTTATGCCTAAGGTCGTATAATGGAAAACAGTTTGTAATTCAAGAGGATGGGACAACGCACTTAGATGCTCTGTTCCATCCTCTTTAGTACGGAGAGAATTAAAGGGGATGAAAAAGTGGAATTACAACAACGACGAACAATTGTTACTGGGGCGTTGCTACTATCTAACATCATGGCGGGGATGGATGGTACGATTGTAAATACGGCCTTGCCAGCTATTACCAGTGACCTTCATGGGTTGCAATATATGGGGTGGATCATCGCAACTTTTCTTTTGGGAATGGCTGTTGCAACCCCATTATGGAGTAAGTTTGGTGAGCATAAGGGAAATAAGCAAGCCTATATTACTGCTACCTCCATGTTTTTAGTTGGAGCAATCTTTCAAGGATTAGCCCCTAATATTTTATGGTTTATTATCGCGCGAACTGTAATGGGAATTGGTGCTGGAGGGATGAATACAATTCCGTTTATTGTTTTTGCTGAATTGTACGACAACCTAAAAAAACGAGCTCAAGTATTAGGGATTGCCAGTGCTTGTTTTGGAACTGCTTCGATTATTGGTCCCCTACTCGGTGGATGGATTGTTGATGCGTTGAGTTGGCACTGGGTTTTCTATGTTAATGTGCCGATTGCCTTAATTGCGATTACCATTATTAGTCTGTTCTATAAGAATGTGAAAAAGCAAGCTGCTGGTAAGCCGGTTGATTATCTTGGAGCGACTTTATTGGTAGTCAGTTTAGTAATGATTTTAGTAGCTGTTCAATTAATTGGTTCAGCATCTGGATTAGTAGTGGGCTGTTTATTTGTTGTTGGCCTCTTATTGCTTGGCGGAATGATAAAAGTTGACAGTAAGGCGGTAGACCCAATTGTTCCTAGTCG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52 | Lactobacillus_phage(18.18%) | integrase,transposase,protease | attL 1719240:1719261|attR 1725499:1725520 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1764616 : 1814881
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP014786|1764616:1814881|DBSCAN-SWA 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46 | Bacillus_phage(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1858428 : 1868704
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP014786|1858428:1868704|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP014786|1858428:1868704|1866677_1867718_+|WP_063164439.1|DBSCAN-SWA METFKNIIVTGGAGFIGSNFVHYVVNHHPEVEHITVLDKLTYAGNPANLDGLPKDKVELVVGDICDKDLVDQLVSKADAVVHYAAESHNDNSLIDPTPFIQTNIVGTSVLINACRKYDVRYHHISTDEVYGDLPLREDLPGHGEGKGEKFTPESPYRPSSPYSSSKASSDLLVRAWVRSFGLRATISNCSNNYGPYQHIEKFIPRQITNILSGIRPKLYGSGKNVRDWIHTNDHSRAVWDILTKGKIGETYLIGADGEKNNKEVLEMILELMGQPKDAYDHVKDRPGHDLRYAIDATKLRTELGWEPEFTDFKTGLQHTIDWYTEHQDWWKDEKVAVEAKYAKNGQ >NZ_CP014786|1858428:1868704|1866084_1866666_+|WP_003664372.1|DBSCAN-SWA MGKLNVQTTKLQDVKIITPAVFGDHRGFFEETYSDRDFKAAGIDFNFIQDNQSLSTQAGVLRGLHFQRGKAAQTKLIRVVTGAVLDVIVDLRKGSPTYKQWEGYILSASNHRQLLVPRGFAHGFLTLTDNVNFVYKCDNYYDAEADGGISFKTPELNIDWPIEFDKAITSEKDAAQPTLTEFEKDNPFVYGEI >NZ_CP014786|1858428:1868704|1860924_1861197_+|WP_172395798.1|DBSCAN-SWA MILDNFNDEITIYAIELPNNKIKLTDHDWTLNNLEEHGVNIRRSKTRRKIFENEVTSYGVVVSDDELSLTASKSKFTEAKHRFVEGGCRM >NZ_CP014786|1858428:1868704|1862503_1863241_+|WP_003676198.1|DBSCAN-SWA MNQYQKLVDNLTKLNLHNMAASIADYRQQVNDNQISFSEALLKLTDKEITYQQQESLKRRIKRARFPIIKRLNDFNYQFQPSINPQQIAEFATMSFLDNQENIIFIGSPGVGKTHLSIGLGIEACRQDVRTLFINCHELILRLKAAQEKQHLERVMRRYERYDLLIIDELGYLPISTEEAKLLFQLINGRYERKSTIITTNVPLSSWGAVLHSTATAEAILDRLVYHSHVIKIKGKSYRLASVNS >NZ_CP014786|1858428:1868704|1858428_1860747_+|WP_063164434.1|DBSCAN-SWA MASDSNSKNNQFRVVLPVIFTFGASLVFFQGNAHADDTNVTANTAVTTTQTSDNQQSSNYQNANVALMSAQAVQTHVAEQTANTDPNKGAVDISAENAQNVANAPAVDTQPNVSTNQISNTQANPENGTASTTVSGTGNINTNGLSARNVQFLESIHQGAVDGWKQFGVLPSLTGAQAIIESGWGQSALTTQGHNLFGIKGSYNGQSVTMPTYEYYGGRYVQINDAFRAYPSNYESIVDHGRFLKENSRYSNLIGQKDYQTVTRLIRQDGYATDPQYTNTLNRVIQQYNLTAWDQEAFNDNINTGHIDNVSVQGDNLKVEGWHATNNYDQSMHHFIILLDGNTKQELYRQEVPGTYRQDVQNVYPNAKISGWGGFSLTVPNSANFAGKAIQVVSRYTKNTNGEPNGGDDLWFNSVNLNTNAGYLDNFNIDAATNTLNISGWHATDQSAGKDHHFIILFDATKNRELGRYEVNSVIRNDVAKVYNVYNAGKSGFNLQVNISPALIGDNIQVISRYSNAANGEGNYVDYWFAPKTFNANQSYLDQVTISDNQVHVSGWQAADASVKQQNHFVILYDATTHREIARKQVSNVSRPDVQRAYPNIANAGKSGFDVTFDFNRAAYAGHQLQVISRYSDANNGEGNRTDAWFAPTTVPSNNQGFLDSFVVKNGEVTVTGWQAADQSYNQKNHFVILYDATTHREIARQQVTNLDRPDVQKAYPSIYNSAKSGFKAAFKLDSSLIGHEIQVVSRYSDANNGEGNRTDFWFDAIKLQRLY >NZ_CP014786|1858428:1868704|1865201_1866071_+|WP_063164438.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPITRGISKQLIPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIRDILVISTPEYMPLFQELLGDGTNLGLNFSYKVQEKPNGLAEAFILGEDFIGDDSVCLILGDNIYYGAGLSDLVQSAAKKTDGATVFGYHVNDPERFGVVDFDDQMHALSIEEKPAHPKSNYAVTGLYFYDNQVVDIAKNIKPSDRGELEITDVNKEYLRQGKLDVKLMGRGYAWLDTGTHDSMLEAANFIATIEKRQNLKVASLEEIAYRMGYINKDQLVELAQPLKKNDYGQYLLRLAQQD >NZ_CP014786|1858428:1868704|1867864_1868704_+|WP_063164440.1|DBSCAN-SWA MTKILITGANGQLGSELRNLLDERGVAYDAFDSNQMDITDQAVVNEKISALEPEVIYHCAAYTAVDNAEDVAKDLNWQVNVDGTRNVAEAAKRVGAKMVYISTDYVFDGANEGEYEVDAPTNPRNEYGKAKLAGEKAIQETLTDYYIIRTSWVFGKYGKNFVYTMLRLAKDHDQLTVVNDQFGRPTWTRTLAEFMTYLVDHDQPFGTYQLSNENSCSWYEFATEILKDKDVEVAPVDSSAYPAKAYRPRHSIMSLKKAEDTGFEIVDWQTALNKFMEII >NZ_CP014786|1858428:1868704|1863667_1864795_-|WP_063164437.1|transposase|DBSCAN-SWA MTHLNDTMSTSLLTTHKKNAHLTKEERVMIATLKSQGLSNRAIGRQLGVNHQTINNELNRGTVRQLRRQKSNGKIYEYSYYIYSYEAGQATYLEHHRHSGRRRLYYSSKQFLRLADQLMLGEFDDHHYSPQAVIYKARDLMNDGTLIPKSVVTLYQWINEGVLRTSNLDLFEKPKRKHRTHPQAKRCLGPNIAQRPQTADQRSEIGHWELDTVQGQKNGNDSVVLVMTDRLSRVNITSKIAGKTAHAVNQFFINLRQKMGTDAYYRIFKTITSDNGSEFSELTQVHDHVFYADPYSPWERGSNEINNRFLRKEITKGEAINNYSSAQIIATNDWMNHYPRAMFNGHSSMDIYRKALYQEISQLHQPIINWSVLFI |
8 | Escherichia_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
2003039 : 2092348
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP014786|2003039:2092348|DBSCAN-SWA TATGGGACTAAGAGAGAAATTAGCTGAACTTCGTGAAGAAGGATTGCAAGATATTAAACAATCAGAGGATTTAAAACGAATTAATGAAATCCGCGTAAAGATGCTGGGAAAGAAAGGCCCTATTACGTCAGTTCTTCGAGGCATGCGTGACCTCAGCGCTGAAGAACGACCAAAAGTAGGGCAATTTGCTAACAAGGTGCGGGATGAATTGTCAGCAGCGATTGAAGAAAAGCGTGCTGAGCTAGAACAGGCCGCTATGAACGCTAAGTTAGCAGCCCAAACAATTGATGTTACTCTTCCTGGTACACCAGTAGCACAAGGACAACCCCATGTTATTCAACAAATTATTGACCAAGTTGTGGACTTGTTTGTATCAATGGGTTATGAAGTAGCAGTTGGGGATGAAGTTGAACAAGAAGTTTATAACTTTGAAAAGCTTAACTTGCCTAAAGATCACCCCGCTCGTGACATGCAAGATACATTTTATGTTACCCCATCTGTTTTGATGCGGACACAAACGTCACCAATGCAAGCGCGGATGCTTGAAAAACATGATTTTAGTCAGGGTCCATTAAAGATGATTTCACCAGGTAAGGTTTATCGACGTGATACTGATGATGCAACGCACAGTCACCAATTCCACCAAATTGAAGGAATGGTTGTTGGTAAAAATATTACGATGGCCGATTTGAAAGGAACTCTTGAAGCAGTTGCTCAAAACCTCTTTGGTGATAAGTTAGAGGTTCGCTTACGGCCAAGTTACTTCCCATTTACTGAGCCATCAGTTGAAGCAGATATTACTTGTTTCAACTGCCTTGGTAAGGGTTGTGCAATTTGTAAACAAACTGGTTGGATTGAAGTGCTTGGTGCCGGAATGGTTCATCCAAATGTGCTTAAGATGTCAGGCGTTGATCCAGAAGAATACGGCGGTTTTGCCTTTGGACTTGGACCAGATCGTTTTGCCATGCTGAAGTACGGCGTTGACGATATTCGTAACTTCTACCAAAATGATGTCCGCTTCCTTAACCAATTTGACCAGAAAGGATAATGTGAAATGAAAGTATCATATCAATGGCTTCAAGAATACCTTGATTTAGATGTTGCCCCCCAAGATTTAGCTGAAAAGATTGCTCGTACCTCTGTTGACATTAATGACGTTTACTCACTGAGCGACGGATTAAAAAAGATCGTTGTTGGGGAAGTAGTGAAATGTGAAAATCACCCTGACTCAGACCACCTTCATGTTTGTCAAGTGGACGTTGGCGAAGAAGAACCGATCCAAATTGTTTGTGGTGCTCCTAATGTTCAAGAAGGTAAAAAGGTAATCGTTGCCCTTCACGGTGCGCGAATTGCTGATAACCAAAAGATTAAGCGTGGTAAGATTCGTGGTGTTGAGTCAAACGGAATGCTTTGTGCTCTTCAAGAAATTGGTTTTAGCGACAAGATTGCGCCTAAAGATTACGAAGATGGTATCTACTTCTTACCAGATGATGCTAAAAACGGTGATCCCGTATTTAAGTACTTAGGGATGGACGACACGATCATCGATACAGATGTAACTCCTAATCGTGGAGATATGCTTAGTATTTATGGAAATGTTAATGACATCGCAGCCTTTTACGGGTTAAAGTCGCATTTTAAAGAAGTTGCAATTAAAGAAGAAGGGACTGAAAAGACAGCGGACCTTCTTCAAGCAGAAATTGCTGATACTAAGATTGTGCCAACTTATAAATTACGGGTAATTAAAGGTGTTAAAATTGCCGAAAGTCCATTATGGCTTCAAATTCGCCTCTGGAACAGTGGTATTCGTCCTGTAAATAATGTCGTGGATGTGACTAACTATATCCTCCTTAAATATGGTCAACCCCTCCACAGCTATGATTATGACCAATTATCTGGTAAAAACTTTGGGGTTCGCCACGCTAATGAAGGTGAAAAGTTTGTTACGTTAGACGGGGATGAACAAACCTTAAAAGCAAATGATATTGTTGTAACTGTCGATGACCAGCCAGTTGCGCTTGCGGGAACGATGGGTGGAGAAGGAACTGCAGTAAGTGATGATACGACAACAGTTGCCCTTGAAGCAGCCATTTTTGATCCAGTAATGGTCCGGAAGCAAGCACGGCGCTTAGATCTTCATAGTGAATCCTCAATGCGGTTTGAACGCGGAATCAATCCAGCAAAAGTTGAAACCGCATTGAATGAAGCAGCCGAAATGATTAAGGAGCTTGCGGGGGGAACGATTACAGCAGGAATTGTAACTGGTAGTGAAGCGCCAGCAGTTGATACCCCAATCAAACTATCCCTTGCAAAGATTAATCATGTTCTGGGAACTTCATTAACCATGGAACAAGTTACTGATATTTTTGATCGCTTGGCATTTGCTTACACTGTTGATGGTGATGATCAATTAACAGTAATTGCCCCAGCACGGCGGTGGGATATTAGTCTTGCAGCAGATCTTTATGAAGAAATTGCGCGGATTTACGGTTATGATAACTTGCCATCTACTTTACCAACGATGACGCGTAACCGAGGAGGACTTACTCCACGTCAACGGTTTATTCGGGCAAGTCGTCATGACCTCGAAGGAATGGGCTTAACTCAAGCAATTAGCTATTCTCTCACAACTGTTGAAAAGGCTAAGCAATTCCAAATTAAGCCACTCGCTGAACCAATGAAACTTGACTTCCCAATGAGTTCGGACCATGTAGCTACCCGGATGAATATTGTTGGCGGCTTGCTTAATGATATTGCTTACAACGTGGCGCGGAATGTTGACAATGTAGCACTATATGAAGAAGGCCGGGTATTCTTGCCAATGGGGGATGAACGTCCAGTAGAACAAGAACACCTTGCAGCAGCTGTCACTGGTCAAATGGTAGCTAATAGCTGGAACAAGAAGGATCAACCAGTTGATTTCTTCCAACTAAAAGGGATCGTTGAACGTTACCTTAAGAATATGGGAATTGCTGGTAAGGTTGCTTATGTCCCAACTAGTGATCGGCCAGAAATGCATCCAGGACGAACAGCCGATATTACGGTTGATGACCAATTAGTTGGCTTCATTGGTCAAGTTCACCCACAAATTGCTAAGGAATACAAGATTCCAGAAACATACGTATTTGAATTAAATCTAGAATCATTATTAGCTGCACCAAAGATTGAAAATGAATATACACCTATTAGTAAGTATCCTTCAATCACTCGCGATATTGCCCTCTTGGTTGATGATGATGTTGAAAATGCAACGATTGTAGAAGCTATTAAGCAAAAGGGTGGTGCTTACCTTAAGGATATTCACCTATTTGATGTTTATGCTGGTTCTCACCTTCCTGCTGGCAAGAAGTCATTAGCTTACACCTTAACTTATCAAGATGATAAAGGAACGTTAACTGAAGATCAAGTAAACGCAGCCTTTGATAAGGTTACTGCTTACTTGCGAGATAAGGTTGATGCAGAAATTCGGTAAAAGTTAAAAGGCTGAAATTTTTCGGCCTTTTTTTAGTGCAAATAATTATTTTTTACGTATTTATATTATAGGACCAATCGCTAAACTAATAATTAGTGGTTGAAGGACTTAAATTTTTCTGCTATTTTATTAATAGTTTGATAATAAAATAATGATATTTAATATAAAGAGGGATAAACGAAATAATGAAATCAACAACAAAGAAAATTCTTGCATCGTCGTTAGGGGTAGCTGGCGCAATGGCAATGGGCACGGTAACTGCTAAGGCTGATACAACTGTTACCGTCAATGCTGGCGATAGTTTAAACGGAATTGCTCAAAAGTATAATGTTAGTGCGGATGATATTGCAACCGCTAATCATCTGCAAAATAAAGAATTGATTTTTGCCGGACAAAAGCTGATAATTCCAACCAAGGATAAAAATGAAACACCTGCTAATAACACTGTGAAAAAGGATCAAGCTAATAAGAACAGTCAAAGTCTACAAGATTCTGTTAACAAGGCAATGTCTTATTTAGGAACTCCGTATGTTTGGGGCGGTAATAAGCCAGGTGGATTTGATTGTTCTGGGTTGGTTCAATATTGCTACGGTATTCCTCAACGAACGACGTATGAACAACAAGCTTTAGGACCACATATTCACGATAATGTCTTAAACGCGCCATACGGGGCCCTCATTTTTTATGGTTCTGATGATGCGCCATACCACGTCGCTATTTCACTAGGGGATGGTCAGATTATCCAAGCTCCAAATAAAAATGAAACAGTTAAAATTACTGACCAACAATACTTCCCTGGAAATTACTATGTTGTTATGCATTAATATTCACTTTTTACCTCGCCTTTAATAATTTAAATTAGTAATTATCTTGCGCATCACAAAAGAGTGCTATATACTATTTCAGATTAGAAAGTTTAATGAGGGAGACAAATTGATGAGTATTCAACAGAATAAGCGTCCAGTAGTTATTGGTGTTACAGGTGGTTCCGGTAGTGGAAAGACAACGGTAAGTAATAAAATCTATGACCAATTGCATGGGCAAGCGATCCAGATTATTAACCAAGATACTTACTATAATGATCAGTCAGATATGACAATGGATGAACGTAAAGCAGTAAATTATGATCATCCGCTTGCATTTGATACAGATTTTTTGATTAAACAGCTAACGGATTTGCGGAGTAATAAGGCTATTGAGATGCCGGTGTACGACTATACACAATATACGCGTTCCGACAAAACCGTTCATGTAGAACCGACTGATGTCATTATTTTAGAAGGAATCTTAATTCTTGATGATGAACGTTTACGGGATTTAATGGATATTAAAGTTTATGTTGATACAGATGATGATATTCGGATCATTCGTCGAATTCAACGTGATATGGTAGAGCGTGGACGGTCCCTTGATTCAATTATTACTCAGTACCTGGCTACGGTAAAACCAATGTACCATCAATTTGTTGAACCAACTAAACGCTATGCTGACATTATTGTGCCAGAAGGTGGCGAAAACCAAGTTGCAA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85 | unidentified_phage(26.09%) | tRNA,integrase,transposase | attL 2053739:2053758|attR 2082893:2082912 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
2098757 : 2148186
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP014786|2098757:2148186|DBSCAN-SWA 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50 | unidentified_phage(22.22%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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