Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015424 | [Haemophilus] ducreyi strain VAN1, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015424_1 | 433954-434165 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015424_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP015424_1
>1.1|433977|40|NZ_CP015424|CRISPRCasFinder CACCTTAAAGAACAAATCCAAATTTACAGCGGGCAACATG >1.2|434040|40|NZ_CP015424|CRISPRCasFinder TACGTTAAATAATGATTCAGAGCTTGCAGCCAATAATTTA >1.3|434103|40|NZ_CP015424|CRISPRCasFinder AACTTTAAATGATGCTTCTAAACTCTCTGCGAATAAGTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015424_1
The CRISPR arrays of NZ_CP015424_1 >merge|NZ_CP015424|1|433954-434165|CRISPRCasFinder ACATTAAACACTTCTAACAATATCACCTTAAAGAACAAATCCAAATTTACAGCGGGCAACATGACCTTAAACGTGACTAATAATGTTACGTTAAATAATGATTCAGAGCTTGCAGCCAATAATTTAACCTTAAACGTGACTAAGAATGTAACTTTAAATGATGCTTCTAAACTCTCTGCGAATAAGTTGGACTTGAATGTTACCGATAATGT >NZ_CP015424|1|1|433954-434165|CRISPRCasFinder ACATTAAACACTTCTAACAATAT CACCTTAAAGAACAAATCCAAATTTACAGCGGGCAACATG ACCTTAAACGTGACTAATAATGT TACGTTAAATAATGATTCAGAGCTTGCAGCCAATAATTTA ACCTTAAACGTGACTAAGAATGT AACTTTAAATGATGCTTCTAAACTCTCTGCGAATAAGTTG GACTTGAATGTTACCGATAATGT
>NZ_CP015424.1|WP_155727101.1|432188_432326_+|hypothetical-protein MTKDLIKQARESVPLNQQLHHLKNKEAYENTDQQLSYQVNGSISF >NZ_CP015424.1|WP_010945346.1|430162_431824_+|phospho-sugar-mutase MTTIFTIAQHWLAQDPDLETQNELSHLIDNAKAGGKQALKELTARFGGRLQFGTAGLRGPLQAGPMGMNRVLVAQAAAGLALYLKTYDKQPSIVIGYDGRKNSDVFARDTAEIMAGVGIKAYLLPRKLPTPVLAYAIKHLDTTAGVMVTASHNPPEDNGYKVYLGKANGGGQIVSPADQQIAAFIDQVATGNIRELARSQDFNLLDDEVINAYIEKTARLSQENKMALNYVYTAMHGVGYEVLQKTLKQAGLSQPKLVSEQIEPDGNFPTVSFPNPEEKGALDLAIKLAQQENAEFIIANDPDADRLAVAIPDAQGIWKSLHGNVLGCLLGWHLAKKYHAQGQQGVLACSLVSSPALAEIAKKYGLKSEETLTGFKYIGKVDNLLFGFEEAIGYLVDPDKVRDKDGISAAVAFLDLVLYLKKQGKTILDYINEFNQQFGAYISGQISIRVSDLAEISKLMTALRNNPPTKIGGVKVTQLIDHTKTDRQSDILVFNLANGSRLITRPSGTEPKIKFYLDVKGNNGQQEAERALAHFDESVRQMLRQTQYGNQDC >NZ_CP015424.1|WP_041603527.1|427876_429241_+|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MTPFSVVILAAGKGTRMYSDLPKVLHPIAGKSMVKHVIDTVKQMDAKQIHLVYGHGGDLLKTHLKTEPLNWVLQAEQLGTGHAMQQAATFFADDENILMLYGDTPLITAQTLTRLIAAKPANGIALLTVELADPTGYGRIIRQNGSVVAIVEQKDASPTQLTICEVNTGVMVASGASFKKWLSRLNNQNAQGEYYITDIIAMANQEGYSVQAVQANTLMEVEGANNHLQLAALERFYQQTQAEKLLLSGVSLMDPHRFDLRGSLQYGKDIQIDVNVILEGEVKLGNRVRIGAGCILKNCVVGDDVDIKPYSVFENAIIGNKAQVGPFARLRPGAKLEAESHVGNFVEIKNAHIGKGSKVNHLAYVGDAEVGENCNLGAGVITCNYDGANKFKTTIGNNVFVGSDVQLIAPVNIADGATIGAGATITKNIAENELVISRVPQRHIQGWQRPTKKK >NZ_CP015424.1|WP_010945348.1|424642_427753_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MFTDIFIKRPVLAISISIVFIILGLQAMFKLQVREYPEMTNTIITVTTNYAGADAETMQAFITSKLEESIAQADNIDYIKSDSAPSTSNITIKMKLNTNPGIAVADITSKVNAVRSQLPSNIDDPSIRSSTGAMEAIVFIRFSSKELSAPQLTDYIERVVKPQMFTVNGVSKINYFGGASFGLRIWLDPAKIAGLGLSANEVTAALAANNVQTAAGNSNGYYTEYRNKVETTTKSVEELASLVIKTLPNGSNIKLGDIAEISLEKARDDSRGIVNGREAVVLAVEAASTANALDVAKHIYPKFAEIQSNLPASVEAEVIYDKTIAINSSIKEVVKTILEAVIIVLVVIVLFLGSFRAMIIPIVTIPISLIGVLMVLQGFGFTINLLTLLGLILAIGLVVDDAIVVLENVERHIKQNGETPFRAAIIGTREIATPVIAMTITLMAVYSPMALMSGITGSLFKEFSLTLAGAVFISGVAALTLSPMMTSKILKQSEKPSWLEQRIEKTLHKVTDIYTKILLVVMASRYAILVFAGLIFASLPMLFNSLSSEVAPAEDRGIVMGMASGPANVNMDYMQDVMFPVAQQINQLPEVNATQIMPGFPSSNGSFMLVPLKDWSERTRSQKEVLAEVNKITNEVTEASVIGFEFPEISTGESGLPFSFVITTANDYRDLAQVASDFLLAAQSSGQFFFNQLDLKFDTASMAIKIDREKMGTYGVTAADIRSVLGSFLSGATLARVDIDGRAYDIISQVKRSERLSPQDLAKYYVKLKDGSSVPLSTFVSMELKTQPRTLPKLNQLNSATITGVLAGSMGNAVKWAEAKAAEILPAGYYYDFMSESRQYKQEGNALALTFLLAIVMIYLVLAVQFESWRDPMVILVSVPLAISGALVVLNILALPMIGKAGATLNIYSQVGLITLVGLITKHGILMCEVAKEEQLHHGKNKFDAITYAAQIRLRPILMTTAAMIAGLIPLLYATGAGAVMRFSIGIVIVAGLAIGTLFTLFVLPVIYTFLGENHKPLQEFEENKHYPVIAETEHS >NZ_CP015424.1|WP_041603529.1|423387_424629_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MTTETKKPSFFTKVTLWIILALVLLIFAAVIGFNQFIAKSKANAAANPFPPFATVTATTVNATEWTPVIKAVGTIRPNNGAMLSAQAAGSVTAIHIKSGERVTRGQLLIELDSSVEQATLHASESQLPNAKATLSRYRSLVASKSASKAELDKAQATYNQLVANIESLKAAIKRRQIYAPFDGIVGIVKVNLGEYITAATEIVRVEDSSQMKVSFNVPQTNLADITIGQRVAFSVDAIPNQTFEAKVSAIDSAVTKSTGLVAVEAVVDGRGQLMSGMFARLNIALATEMDQVVVPQIAVTYTMYGESAYVLDKLSEQEKEQLLKVLASQTSSPVSGKKAQKLIENIDGVFKARQVEVKTNDRQGIYAQLKNESIKVGTTLVTSGFQRLRNGAYVTIADKQPVGISKPAIETNL >NZ_CP015424.1|WP_010945350.1|422526_422748_-|DUF1414-domain-containing-protein MAKQSKYQSKQFEQLSYDLITILEKHKAPVDLSIMALGNLVSNILLENIQTETQRMVLADTFSTALKNSLKAR >NZ_CP015424.1|WP_010945351.1|420793_422524_-|DUF3413-domain-containing-protein MFKPLRQLLPTYSRQYKEEISQRITWGHWFTLFNVVLALCISTRYAFNADWPNTLSGKLYFFTSLFGHFSFIVFAAYLLLLFPLSFIIKNERTFRGLSVIIATIGQTVLLVDTEVFKQFYLHLSPLVWDLLVTPDDNSELSHQWQLLFVPMPIILLAQMLYSRWCWQKLRSFSRQKWGKFVALFFVACFTATHLIYAWADMRLYRPITSQKANYPLSHPMTARNFLAKHGVINRTKLQLNIAENGRLDSFYLNYPKQHLTFNRKPYTNVLIVNMSGLANEMIVAEKMPHLTQISEKTYRFMNHYGSGDSNAANLLGIFYSLSGQYLDSMLANKQTSPLLTAFKQANYQFGLFSHNSFAAPIYQQSIFAGFSLPKIKGNAQAIEKWTAWLNQRLAKPFFSYLDLAMPRTHNSLAPLEHVDAQFNQIWYALQQHNLLMNTLVIITADQANPTTEMNFTKRHLQVPMMIYWQGENQKINVLSSHLDLLPTLLMQLFAVNNPINDYAQGVNLTSPNERIWALASNHKWTVAIMPNGEQYHLDKFGHFEKYNANGEKVQTKRPPLALFLQMIKQSNQFVEK >NZ_CP015424.1|WP_010945352.1|420241_420592_+|DNA-binding-protein MITQMEIARHELLRDIEDNVSALCKNYNLDTEICEQISTSVADFLAEHYAGQVISFPKDFYYKIAQRDLDIYNDFTGNNWFFLVKKYGMTESGIRKVINRVRKRIMKHQQPDLFCE >NZ_CP015424.1|WP_010945353.1|419722_420124_+|regulatory-protein-GemA MRNKLLQLVHIGKTQLGMDDETYRSLLSQQFYQNSAKNISYSDLIKLVKLLQTKGAKIQLPRSKSSLSPIQRKLWAVWKQMHADSVIDDGSSHGLNSFVKRSLNGDMQWNELTNSQATLILENLKQWQKRVGK >NZ_CP015424.1|WP_010945354.1|419358_419733_+|hypothetical-protein MDQQWLKATLGKGVAMLLILRLKNSPPEDSISATLETWLRVLTYKKHYEQELDQWRFEEAFMYLAQTCDWFPNPKQLLDAMPKRKIKELPPPPPKTVEQEEAERLKALSNLQKIKAMLRGCYAK >NZ_CP015424.1|WP_010945344.1|446421_447993_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MNNIHNHKILILDFGSQYTQLIARRIREIGVYCELWAWDVTEKQIREFNPTGIILSGGPESTTETNSPHAPEYVFKAGVPVLGICYGMQTMAMQLGGLTEASEQREFGYAAVELQHADQLFAKLNDDLTASQPKLDVWMSHGDKVTRLPAGFQTTAVTPTCPIAAMSDEKRRFYGVQFHPEVTHTKSGLALLTNFVENICGCARSWTPENIIEDAVAKIKQKVGNDQVILGLSGGVDSSVTALLLHRAIGKNLHCVFVDNGLLRLNEGDQVMEMFGDKFGLNIIRVNAEERFLEALKGIDEPEAKRKIIGKVFIDIFDDEAKKLTDVKWLAQGTIYPDVIESAASKTGKAHVIKSHHNVGGLPDYMKLGLVEPLRELFKDEVRKIGLTLGLPAEMLNRHPFPGPGLGVRVLGEIKKEYCDLLRNADAIFIEELYKSGWYYKVSQAFTVFLPVKSVGVMGDGRKYDWVVSLRAVETIDFMTAHWAHLPYELLGKISNRIINEVNGISRVVYDVSGKPPATIEWE >NZ_CP015424.1|WP_010945343.1|448142_449606_-|IMP-dehydrogenase MLRIKQEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLSTQLTKTIRLNIPMLSAAMDTVTETKLAISLAQEGGIGFIHKNMSIERQADRVRKVKKFESGIVSEPVTVSPELTLAELAQLVKKNGFAGYPVVDNENNLVGIITGRDTRFVQDLTQTVSKVMTHRDRLVTVKENAKREEILALMHEHRVEKVLMVDDAFKLKGMITVKDFQKAEQKPNACKDEFGRLRVGAAVGAGPGNEERIDALVKAGIDVLLIDSSHGHSEGVLQRVRETRAKYPDLPIVAGNVATAEGAIALADAGASAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIAEAAEALKDRDIPIIADGGIRYFGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGEIELYQGRVFKSYRGMGSLGAMSKGSSDRYFQSDNAADKLVPEGIEGRIPYKGYLKEIIHQQMGDLRSCMGLTGSATIEDLRTKAQFVRISGAGIKESHVHDVTITKEAPNYHMG >NZ_CP015424.1|WP_010945341.1|449875_450502_+|23S-rRNA-(uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase-RlmE MGKKRSASSSRWLAEHFKDQFVQKAHKQKLRSRAYFKLDEIQQSDRLFRPGMTVVDLGAAPGGWSQYAVTQIGNQGRIIACDILDMNPIVGVDFLQGDFREVSVLNALLARVGDEMVDVVMSDMAPNFSGMPSVDIPRAMYLVELALDMCRQVLAPKGSFVVKVFQGEGFDDYLRDIRSMFTTVKVRKPEASRDRSREVYIVATGYKG >NZ_CP015424.1|WP_064083224.1|450543_452463_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MVKNIVLWVVVAIVLMTAFEGFNSNFNNSNTVSYSTFLNDIKSNQLKEVNFKRNDETISVIKNDGTEYKTVMPMNDQYLLSDLAKTNATITGQPQERRGVLFQIFISWFPMVMLIGFWLFYMRQMQGGGRGAMGFGKSKAKMLTPEQVKTRFSDVAGCDEAKEEVSEVVDFLTEPSKFQKLGGRIPKGILMVGPPGTGKTLLAKAIAGEAGVPFFTMAGSDFVEMFVGVGASRVRDLFDQAKKNAPCIIFIDEIDAVGRKRGGAGLSGGHDEREQTLNQMLVEMDGFEGSEGVIIIAATNRADVLDDALTRPGRFDRQVTVDLPNVKGREQILKVHMKKVPLASSVDPMIVARGTPGYSGAQLANLVNEAALFAARKNRTVVTMDDFDKARDKINMGPERRSNTMTEKELMNTAYHEAGHVIVGYLMPEHDPLNKVTIVPRGQALGFAQFLPEGDRVSETFTKLESQLSTLFAGRIAEGLIFGDDKITTGASSDIHRATQIARAMVTQWGFSKELGPLFYQNEDGMGAIKGVSEASQKLIDQEMRIIIDRNYARAKQTLEENIDILHAMKDALLKYETLDRKQIDDLMHRRPVGEPEGWNDDKEENSSNDSSDATSASNTIEEAKPNTDADVADNRVDA >NZ_CP015424.1|WP_010945339.1|452659_453877_+|tyrosine-transporter MKNKILGSALMIAGTTIGAGMLAMPLTSAGMGFGATLFLLISLWGLLAYTGLLFMEVYQTAPKRDVGVASLAEQYFGIVGRVLATATLLVLLYALLAAYITGGGSLLSGILPEIMDSQLTNKIAILLFTTLLGTFVVVGIKGVDGLTRVLFMGKIIAFLLVLAMMLPKAKIENLFAMPLDNLLVISVVPIFFTSFGFHVIMASINNYLEADIGKIRIAIYIGTAIPLIAYLLWQLATHGVLTQAEFVEILKSDPSLNGLVKATSQITGSTFLGEMLRLFSALALITSFLGVAMGIFECIGDLLKRINLPTNRLVLTLVTFIPPLLFALFYPNGFIAALGYAGLLFAFYGMLLPIGLAWRARKLHPNLPYRVSGGNSALLIALLMGIIIMIIPFLIQFGYLPQVMG >NZ_CP015424.1|WP_010945338.1|456558_456945_-|YhcB-family-protein MEQWTTEIWFSISIAFLIGTLCGVLVMRFFKGNIQQQIQLKSELASAEAKIEEQKQQLERHFEQSANLLENLAEDYKKLYTHFAQNSEQLLPESNQVEFFKRLKNHANGDEDNQPRDYSDGSSGLLKS >NZ_CP015424.1|WP_010945337.1|457252_457675_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKTFVAETVKRDWYVVDAAGKTLGRLATELASRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVINAEKVVVTGKKETDKIYYWHTGYVGGIKDATFKEMISRRPEAVIEIAVKGMLPKGPLGRDMFRKLKVYAGNTHNHAAQQPQVLDI >NZ_CP015424.1|WP_010945336.1|457691_458087_+|30S-ribosomal-protein-S9 MTAANQNYGTGRRKSSSARVFIKPGSGNITINQRSLEVYFGRETSRMVVRQPLELVELLDKLDLYITVKGGGISGQAGAIRHGITRALMEYDETLRPALRAAGFVTRDARRVERKKVGLHKARRRPQYSKR >NZ_CP015424.1|WP_010945335.1|458974_459514_+|hypothetical-protein MRLLLIIFCCFLTACQMLKKTFVVPESIPFQGKSYFKVTDNMLEGMRHLLFLPAEGNQHPDNWHNAIFIFLDQNKTSTMMQRMALRKKVFSNQQDTIAQIKIIENELYSAIIYPPTERFNDILLEVSRGRDSACGFAQIQVANKRAILTEKNANLTAYQAELNSLAQQLSTLAWQVACQ >NZ_CP015424.1|WP_010945334.1|459541_460465_+|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MEQQYAKLVKRAANVAIIVACSLILIKTFAWWKTGSISILASMTDSMVDLFASMTNILVLRFALQPADKTHTFGHGKAESLAAIAQSAFITGTAVFLLLQGIHNLNNPVLIEDSQLGVIVSIISIVFTAALVFYQKKVVSITQSPAIQADSLHYQTDLFMNAAILVAMLLNIYGFIYADAIFAIGIALYISINAFKMFWEAVQVLLDKALPEEDINQILTIVANQPQIIGIHDLLTRQAGAVRFIQLHLELEDHLSLLEAHTITDNLEQKILAAFPLSEVIIHQEPTSIVQQELVLGQVKNYVPSYR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
66153 : 88694
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015424|66153:88694|DBSCAN-SWA AATGGTAGCAAAAAAACAAAAAGCAAAACCGATTTATGCCGTTTATCGGGGCGATAAATTCTTTTTTGACGGCACGGCGGAAGAAGTTGCGGGTGCATTAGGAATCAAGGTGGCAAGTGTGCGAAAACTTGCCACACCGAGCCAGCAAGCAAGAAGTGAAAAAGGCACGACCATTGTGAAACTGGGGGCTGAAAATGAAAGTGTATAGCGAATTGGCAGGTAGAGAGTTAAACCGTGAAACCAAGGCGGTTTACGAAGCAGCAGTAAAACTTGAGCTGGCAATGTTGGAATGCGAAGAAATGGATTTAGAGGTAACGGGTGTGGAATGGGGAGGAGGCTATCAACCGAGAATCATTTTAAGAGAAAACTATAAAACGAAGAAATTTGTGAAAAGTGGTACGGCGCAAATCTTTGGAATGAAAACAAAAGCAGGTGTGCGTTATAACTTTTATCAAATGCAAGTACGCGGCGTTAAGTGCATTTGGGAAGGCGAACGTGAATACGGGAAAGTTAGACAAAAAACAAAATTTAAACATTAGGAGGTAAAAAATGAGCAAAGTAGAAATTGGTGGCGAAATTTACTGGAAAGACCCTAACGGCAACTTAAAACCTGATGCGCTAGTAAAAGAAATTGATAAAGAGCGTGACGGGCTAGTCCGTGAGTTTGCACAAAAAGCGAAATCGCATAGCGCTATGCTTAGCCAATTTAAGCGCCAAGTGTTTGATGATGTAGGTGCATTTGTGGGGTTATCCGCCGAGAAATACGGCGTAAAAATTGGTGGCACAAAAGGTAACGTGAGCCTATTTACTTACGACGGTCAGTTTAAGATGCAATTAGCTGTGCAAGACCACATCCGCTTTGATGAGCGCATCCATGCGGCTAAAGCATTGATTGATACCTGTTTGCACGATTGGTCCGAAGGGGCTAAGCCCGAATTAAAAACTTTAATCGACAATGCTTTTGAGGTGGACAAGGAAGGGAATTTATCAACAGCAAAAATCCTCTCTTTGCGCCGTGTAGAGATTGACGACAAACGTTGGAATCAAGCAATGGAAGCGATTAGCGATAGCGTGCAAGTGGTTGGCAGTAAAGATTACGTGCGATTTTATGAACGAAATCAAGACGGAAAATATGTGCCAATTGCATTAGATGTCGCGGGGGCGTAAACGCTAAAGCCCATTTAAACGCTCTTTAAACCCGATTTTAAGGGGCGTTAATAATGAGTTTTAACCTACACAGGAGCAAAAAAATGAACACAAAACAAGAACTCGGTATTTTTAATCGTTATAAACACTATGCGGAAAAAGCAGCACGCATTGAACGCGCAGGCAATTACCCCGAGGCAGTTAAACTATGGGAGACCGCTATGCTTAATGCGAATGACAAACAGAAAAAGCAATACGAATGGGCAAAAGCAAGTGCTGATTTTTGCCGAAGAATGATTTTAAAGCCATTTAGAGGGGAATAAATAATGATGACCGATTCACGCAAAGCAGAGCTCGAAAGCCGATTAAATGAGGCAATTATCCAGCTACAGCAAGCACAAAAATCATTACGAAAAGACGAGTTTACCCACGCTTCAATTTTTATCGGCAACGCCCAAAGCCAATTACCGAAAATGAGAATAGCGCTAGCAACACAAACACATTAGGAGATTAGGAGACAAAAAATGCGCAAAAAACAAGCATATAAAATTTGCTTAGAAGTGATTTTCGAAGATGAGCAGAGTTTAAATCAAGTCGAAGTTAATGCAAAAACAGACGTGCTTGGAGGGCGTATCGCTCGGATTGATTTTAATGGCAATAGTTTTGACATTTTAGAACGTTATGAAGAGTTTATCACCCCGATGCAATTAGCTTTTTTAAACAGTAAAGAGGCTTATAAAACACGTATGCAACAAGCAATTAATAAAACATTGAGTGATCTTTATGAGGAAGAAGATTGGGAAAATGAGGAGGAAGAATGATTAAATGCCCAAACTGTGGTGACGAAGTTATTGAACGTAAAAGCCGAAGTAAAGGAGCCAAAGATCGTTACCGTTGTGTTGGTGCGAGAAGAAGAACAGTTGAAGACTACGAACATCATACGGTAATTAAAGAATGGTATGAGCCATCTTGTGGACTGTTTGGTATTAAAGATATAGAACAAAAAAATGAGGTCCTGTAAATGACATTAATGGAAGCAGAAAAGCATCTTGTTGAAAGAATGCAAATCAAGAAAAACAATAACTGGATATCAGTTAAAGATTCGCTACCAGAAATCAATCCCATTTATGAGTTTTTTGAGAAAACAGGCGATTGTTTATTGTATGGATTGGAAGAGCAAGACGATATCCCGCATCAATTTATCGGCTATATGATACGTGGGAATCGTTTTTACAGCGAAAATGGTGAATGTTACAAAGTAACTCACTGGCAACGCTTGCCAAAACCACCTATTAAGTAAGCGTATTTACAGCCCAAACCACACAGTGGGCTGAATAATATGTTTATAGGAGGAAATATGAAGCTATGCAAATGCCCTATTTGCCACTCCGATTTAACGCTTGAGGCGTTAATTGAAGATGATTCGGGGCGAGAATTATTAAATACAATTACGAATATGTCACACGGTTGTGGACGTGCTGCGGTCGCCTATTTAGGCTTATTTAAGCCAGTTAAGAGCAGCTTATCAAATAGCCGATCATTAAAACTTTTGCAAAGTTTATTAGAAATCTACCCACCATCAAACGTGCTAGAAAAAGCATTAATTGATACCGTTGAGCAAGTCCGCCGAAACCGGCGAGAATCCGGCAGAATTGAACCACTTACTAATCATAATTACTTAAAGAAAGTCTACGAAAGCGTGAAAGTGCAATTTGCTGTCGTGCGAAGTGATAAAGACTTTAAACAGCATAAACACGAAAGCCCCGAACAGCAACAACGCAATGAAGAGGATAAATTAAGAGGTGCTATTCAATACGTTGAGCGAATGAGAAGATTGGGACAGTTAGACAGCATCAAAAATACCGAAAGCTATCAATTATGGCTAAAATGGCAAGAGGAAAAAGCGAATGCCACCGCAAACTAGACAGCAGATGATTCAGAAAATCCATATCGGCAAAAATGAACTCAAAATGACACAAGAAAACTATGTGCGGTTTTTGATTGATGCGGTGGATAAAATGAGTTGTTCGCAGATGACCGATAGCGAATTGATGACCGTTTTGCAGGCGATGAAAGCCAAGGGGTTTAGGGTTAAAAGTAAGCAACACGGCAAAAAGCCAAACGTCGGCAAATTTCCCGAAAACCAAGTACGCCAACGTTATTTAGATAAAATTGAGGCGTTTTTAGCGGAAATGAAAAAGCCTTGGGCTTATGCCCACGGCATTTGCAAAAAATCGTTTGGGATTGACCGCTTGCAATGGTGTACAGAAGACCAGTTACGCAAGATTGTGCAGATGTTGGCTGTAATGGCGCGTAGGCACGGGAAACCAGTGTAGAATTTATTTACAGCCCTTTATGGAGGGCTGAATAATACATTTTACAATTTATTTTGCATAGGTGCTTGACAAGGGCGGGCGAAATCTTTTGAATTTGGCTCGCTCTCAAAAAGCAAGTATGCGGAAACCACAACCGTGATTTTGTGGTATTTTTTTACCTAAAACTTAGGTAAAAATCTCAAAAACTAATTTAAATCTATGACCGACAGTGTGAGGAATACAATACCGCAAGGGAATAACTCCGCTGTTCATACTACAGTTTTGAGCTGTCGGTCGCCCTAATCAAAATAGGGTTTCCTTTCGGAGAAATAGTATGAAAAACTTATCTATTCAAACCTTTACTGGCTCACTTCAAAACCAACCTACTCAATTAATTAATGCTCGTGATTTGCACCAACTTTTACAAGTTGGGAAAGATTTCTCTACTTGGATTAAAGATCGTATAGCAAATTATGGCTTTCAAGAGAATTTAGACTTTTCTCTAGTTTCGGGGGAAACTCGCCCCCCAAATTGGGGGAGCAAGATTTGGGGCGGTCAAAATAAAATTGACTACCACATCACGCTCGATATGGCGAAAGAACTCTGTATGCTGGAACGCTCCGATCTCGGGCAACAAGCACGCCGTTATTTTATTAAAATGGAAAAAGAGGCACTTGCCGCTCGCCAGCTTACGCAAGCCTTGCCACCTGTGAAAAACACCGTGGAAATCCCCACCGCAAAATATATTGAGCTGTTGGAAACGCAAAATCAGCTGTTAAAACAAACGCTCAAACCTGCAAATTACAAACTCCGCCTAAGCCAAGAGGAGAAAAGCCGTATTTTAAGCCTGCATCAACAGGGCTTAAGTACGGGGCAAATCGTCAAACAGACGGTGCGTTCTGAATCTGCGGTGCGTGGTGTGATTAAAGGCTAAGGGGGAAATTATGTATCAAGAAAATGAATTTGATAAATTAGAAAACATTGACGGCATTGCTGACGATATGCGTTGTTTGGCGCATATGATTGAAATTGTCGGGCACTCTTGCGAAACAGTTGATATGACGGGGCTGGCAGGGATTCTGAATGTAATGGCGTGTAAGGTAAGTTGCGAAAGTCGGCAAGCCGTTAAATTGCTTCACGCAAAGGGCAATTGATTTTCACATTAAGACCGCTGAAAAGCGGTCTTTTTTTTCATTTTTTTGCAAAAAATCTCCAAAAAGTTCACAGATTTAAAAAATCCATGGAAGAATAACCACCTTTGATGATTTATTAAGAGGTGGCTATGCAATTTGAAAATGTACAAGACTATTTGCCTGAGTGTGTGCAAACGATTGTGGACGTGATTGGACTCCCTGCAACCGAAAAACTGGTGCGGGCGTTTGGTGGCTTTTCGTTTCAGTTTTCACGCTCAAAAACCTATTTTGACCGTTTGCGTGATATACTCGGTCAAGAAGATGCGGTCAAATTGCAGCAGTTTATGGACAGAAGCGAGGTATATATCCCTCGCTGTGAGGTGGCATTACGAATGTTACGCAATCA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33 | Haemophilus_phage(36.0%) | tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
103298 : 118556
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015424|103298:118556|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015424|103298:118556|106886_107969_-|WP_010944541.1|DBSCAN-SWA MNLLSMNILERYIGKTIIMMMFAVLLMSSGLVFIIKLVEEFKNVGEGNYDALTATYYALLMLPSDIKEFVPVVLLIGGLLGLSNLASHSELVVMQSTGFSRFRIGLAVMKTAIPIIILTMSASEWIIPKVEQFARNMRSVAQSGGSMLSTNGGFWAKDGNNFLYIRHIENEHQLNNISIYHFENKVLTSVSQADSALFNGKDWTLQNLQTATITDHGIQTTHQANQNWQTTITPSKLGIVSLKPESLSIAGLADYVSFLTETGQDSKRFQIAFWRKVYQPISMAVMMLLAISFIFGPLRSSAMGTKLFIGIIAGFIFYVSNIVFGNMTLVFSWLPIAIGALIPSLICLAIVWWLLTKKRD >NZ_CP015424|103298:118556|115985_118556_-|WP_010944553.1|DBSCAN-SWA 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11 | Streptomyces_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
187625 : 198207
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015424|187625:198207|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015424|187625:198207|193509_194175_-|WP_010945593.1|DBSCAN-SWA MENRLIANTAHNQSLLSTHKVLRNTYLLLSMTLAFSAIVAYFAMAMNAPALPWWGLLIGFYGLLFLTNTNANSAIGLACVFALTGFLGYTLGPILNRYVGAGLGDAVMLALASTALVFFSCSAYILTTKKDMSFLSGMMMALFIVLLVGVIANIFLAIPALSLAMSVLFALFSTGAILLTTSNIIHGGETNYIRATVDLYVSLYNLFLSLLQIFGVLSKDD >NZ_CP015424|187625:198207|192136_193042_-|WP_010945595.1|DBSCAN-SWA MNLSFLKKTLIIACAMGTTVAIAAPFKVVTTFTVIQDIAQNVAGDKAIVESITKPGAEIHDYQPTPKDIVKAQKADLILQNGMNLERWFERFFENVKNTPAVVVTEGIQPIAILEGEYKNLPNPHAWMSSANALQYIENIRAALVKYDPENAVSYNQNAKAYAEKIKAISEPLRQRLSVIPEKQRWLVTSEGAFSYLAQDYGLQELYLWPINAEEQGSPQQVRKVIDGVKANHIPVVFSESTVSDKPAKQVAKETGALYGGVLYVDSLSTKEGPVPTYLDLLKVTISTIVDGFEASKKEPK >NZ_CP015424|187625:198207|196914_198207_+|WP_010945590.1|DBSCAN-SWA MQNLRYPIDSKPPFGLSVLLAVQHLLAALGGIIAVPLVIGNVLKLPTSDTIVLVNAALLVSGIVTIIQCRGIGPIGLRLPSVMGTSFTFVAAALAIGFSEYGVAGIMGSSLIGSLVMIIGSFFMPYVRKLFPPVVTGIVVMMIGLSLIPVAVDWFAGGQKGDPHYADPANLAMATFVLVLVVILVQWGKGIFSAAAIVIGMLVGYAVALALGWINFEAIQNAEAFAIPQPLHFGLAFPISGIIGMSIAYLVTIVESSGNFLALGNATQTEITGKHLRGGVLCDGLGSAFAAVMSTTPFSSFAQNIGVISLTGVASRYVVTVMGVLLVLAGVFPWLGAIIVSIPSPVLGGAGLMMFAMIIAAGIQMLDKVERSKRNGLIIAISIGCGLAVTTRPELLDKLPNFFKEVFGSGITVGSVLALLLNLILPEDKH >NZ_CP015424|187625:198207|194360_194912_+|WP_041603561.1|DBSCAN-SWA MKLNFPTYLTLFRVVLIPLFIAAFYLPEGWYAPEISTLIFFIASITDAFDGYLARKWNQTTRLGAFLDPVADKILVTVAFVCIVEYYHSWWITIPVSIMIAREILISALREWMAEIGERASVAVSIWGKVKTACQMLALGGMLWRQSTFMEILAFILLYISAILTIWSMLQYLKASKKSLMKS >NZ_CP015424|187625:198207|190636_191176_-|WP_010945597.1|DBSCAN-SWA MNQLDLIKSSIKSIPNYPKVGIIFRDITSLLENPTAFKASIDAIVAEFKNKGITKVVGTESRGFIFGAPVALALGLPFVLVRKPHKLPRAVISQSYALEYGEDTLEMHLDSINQDDNVLVVDDLLATGGTIDATAKLIRQLGGQVKNAAFVIGLPDLGGKARLEQIGIKSFTLVEFDGH >NZ_CP015424|187625:198207|194998_196837_+|WP_064083124.1|DBSCAN-SWA MSQFNAKAFLADVPHLPGVYRMYDANQAIIYVGKAKDLKKRLASYFRSQVASKKIEALVGNIHHIDTTITHSETEALLLEHNYIKQHQPKYNVLLRDDKSYPYLLLTKHQHPRLTAFRGSKKVAGEYFGPYPNVSAVRESLNLLQKIFPIRQCEDNYYKNRSRPCLQHQIGRCLAPCVTGYCSQQEYDNQVKWVRLFLQGKDSQVIDYLMQKMEIAASELDFETAARFRDQIQSVRAVQEKQFVANQRLDDLDIISIAYQSGLACVHILFIRQGKVLGNRAYFPKVPSHTDLTELADTFIGQFYLQLNQHRSIPNQIILDQPLTESNALAQLLTEQAGHKVTIITNHVRGDKSRYLALAQTNARAALSLQLKQSTTIHKRYDALKILLKLPTIKRMECFDISHTMGSQTVASCVVFDENGPLKSDYRRFNIEGITGGDDYAGMEQALVKRYDKPLPIEKIPDIIFIDGGKGQLNRALQVFEKLTVAWDKHKPLLIGVAKGAERKAGLETLIIGRLKKEIHLPIDSPALHLIQHIRDESHHHAISGHRKKRQKAFVESGLESIAGVGAKRRQALLKYLGGMQGVKSATLAEIESVPGISKTLAGVIFDTLHNS >NZ_CP015424|187625:198207|191381_192140_-|WP_010945596.1|DBSCAN-SWA MNNITQATASISVDKLTVRYNNGHLALENVSFQLQHGTVCALIGVNGGGKSTLFKSLMGLVKPLTGQVLLNQMPIQKALKQNLVSYVPQSEEVDWQFPVSVYDVVMMGRYGYMNFLRNPSALDKQKVEQAMQRVDISHLQHRQIGELSGGQKKRVFLARALAQESQIILLDEPFTGVDVKTENAIVALLQQLRSEGHLVLVSTHNLNSVSSFCDQVLMINRTLLASGPTATTFNHQNLEKVFGGIVHYLQAS >NZ_CP015424|187625:198207|193112_193448_-|WP_010945594.1|DBSCAN-SWA MHMIECNGKQYLTDPTGYLLNLNDWSTELAIAIASKEQINLTEEHWEIIWLVRDFYQEYKTSPAIRMLVKAMTLKFGEEKGNSRYLQRLFPEGPAKQATKIAGLPKPIKCL >NZ_CP015424|187625:198207|187625_188534_-|WP_041603563.1|DBSCAN-SWA MNALEIHQLVKTYPTGVQAVKGIDLVVKQGDFYALLGHNGAGKSTTIGIISSLVNKTSGTVKAFGYDLDTQKIQLKQQIGLVPQEFNFNQFEKVINVLTQQAGYYGIPYQQALIRAETWLKKLELWEKRYHLTRELSGGMKRRLMIARALMHNPKLLILDEPTTGVDIELRRSLWDFLREINQQGTTIILTTHYLEEAETLCRNIGIIQNGLLIENTSIKALLAKLESETFVLDLQKTDKNQSLTINDYTFKWLDDNTIEVEVKRTQGLTKLFQQLAQQGIEVQSMRNKSNRLEELFIKMAN >NZ_CP015424|187625:198207|188545_190609_-|WP_064083123.1|DBSCAN-SWA MSYQVLARKWRPQRFSEVIGQQHVLSALENGLRQDKLHHAYLFSGTRGVGKTSIARLFAKGLNCETSITATPCGKCENCKAIEEGRFIDLIEIDAASRTKVEDTRELLDNVQYKPTVGRFKVYLIDEVHMLSRHSFNALLKTLEEPPEYVKFLLATTDPQKLPVTILSRCMQFHLRALTPTQLSQHLEFILTQENIPYELAAIEKLAKAAQGSIRDSLSLTDQAIAVSNANITLPIVSEMLGLIDDDQPLELVMALAQANGDQVMAIIQNIATKGIDWQQLLNDVAETLHQIAMLQLLKQETPSDTPLHLLAKQIPPEDVQFFYQLMLIGKKELAYAPEQSIGVEMVFLRALAFHPKRTEEINQRAQLNQANNEQSAMVDNTQHKLEQLKANLTQVTTDKTSAQAVESSSKRSIKSAQQTVPANITDSTNNTLISPALVAMQARKQLQQKHVELNQHEKKKRKSITVNSTSSPTEITTNTQHQSLDLQERLMNLAHSTAKVTSQPSEPEVDSQSTEEDYCWTWLDPELAIENKSTKPAEIKQAILQDKTPELVAKTIELACEQDQWCQIINTLNLSSFSRQIALNSYLAQTTAQQLDLVLKPSMSHLDNEESRKSLTLALADKGFTYKLVIGESAEHKTPLEIRRMIFEKLTLAAKQALNNDEKLMLLRDTFAAEIDESTIRAVANI |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
734133 : 740646
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015424|734133:740646|DBSCAN-SWA GATGCAAATTAACCTCTCCCAACAGCCTGCGCCATCAATATGGGGAGAAAAAGCTATCCTTTCTGCCCATCAAAATGGCTTTACCATTCATCTTCACGCTGATAGCCTAACCACTATTCAAAAAGCAGCACGTAAAATTAAAAATCAAAATATCCTCAACGTATCACTAGTTGGCGAAGGGTGGGGCTTGGAAGAGTGTTGGGCTTTTCAGCAAGGGTTTGTGAGTGTTCACCATCGTGGAAAAATACAGTATCCACCACTTGCTGAACAGCACGCTGAATTAGAAGCACGGTTAAGCTGTACTGATTTTGCGCGAAAAATTATCAACGAAGCATCAAATACATTAACCCCTGAACAACTCGCTAAACAAGCGACTGAATTTATTACACAACAAGCGATCAAATATAACCTTCACAACGTTGTTAAATTTGAAATAATACAAGGTCAGGCATTAGATACCGCAAATTATGCCGGCATTTGGGCGGTTGGCAAAGGTTCAGCTAATCCGCCCGCTTTACTTAAATTAGATTTTAATCCAACCGGTGATGAAAATGCGCCGGTATTAGCCTCTTTAGTTGGTAAAGGCATCACCTTTGATAGCGGAGGTTATAGCCTTAAACCCAGTGATTCAATGAGTACCATGCGTACCGATATGGGCGGAGCAGCATTAGTTACTGCCGCATTAGGCCTAGCAATTGCTCGCGGTTTAACCGCACGTGTTAAACTATATCTCTGTTGTGCTGAAAATATGGTGAGCAGTCGCGCGGTTAAGCTCGGTGATCTTATTCATTACCGCAATGGTATTTCAGTTGAAGTATTAAATACGGATGCAGAAGGTAGATTAGTATTGGCTGATGGCCTGATTGATGCAGCTGCTGACCAAGCACAATTTATTATTGACGCTGCCACCTTAACCGGCGCAGCCAAAGTGGCTGTTGGCAATGATTACCATACTGTGTTAGCAATGGATGTTCAATTAGTCAACCAGTTATTAACTGCTGCTGACGCGGAAAATGAACCTTTTTGGCGATTGCCTTTTGCTGAATTTCATAGAACACAAATTAGCTCTTGCTTTGCAGATATTGCTAACATTAGCTCTGTACCTGTCGCAGCAGGTGCTAGCACTGCTTGTGGCTTTTTATCGTATTTCGTGCCAAATTATCAGCAGAATTGGCTACACATTGACGCTTCCGCCACTTTCCACCGTTCTGCAAGCGATCTATGGGCGGTGGGAGCAACAGGATTAGGCATTAGAACCTTAGCTAATTTATTACTAAGCAAAGCAACTGCCAAAAACACGTAGAATTTGACCGCATCTACTTCAATAACGTAAGCGGTTACATAACGAGCTAATTAATGATAATTTCCCTTAGATGAGGTTTATTTAGGATATTATGAACTATCTGACGCAGGCAACGGAGACACTCAGTTTATATAGTCAGGCGATCGACCGATTGCAACACAATCTTGACCAACATTTCAATCAAGCAGTCGAAATGATTTTAAACTGTGCAGGACGCGTAGTGGTGGCAGGAATTGGCAAATCTGGATTAGTCGGTAAAAAAATGGTAGCAACTTTTGCCTCAACCGGCACACCAAGTTTTTATTTACACCCAACTGAAGCCTTTCACGGTGATTTAGGAATGTTAAAAGCTATTGATATTGTATTATTAATATCAAACAGTGGCGAAACTGATGATGTAATCAAATTACTGCCGAGCTTAAAAAATTTTGGTAACCAAATTATTGCAATGACGGGTAATCGCCATTCAACATTGGCACAACATGCTGATTTAGTATTGGATATTAGTGTTGAACGTGAGGCTTGCCCAAATAATCTTGCGCCCACGACGTCCACTTTAGTCACAATGGCATTAGGCGATGCTTTAGCAATTGCCTTGATAAAAGCACGTGATTTCAAAGCACACGATTTTGCCCGCTTTCATCCTGGTGGCAGCCTAGGGCGTAAATTACTGAATAGAGTAAAAGATGTAATGCAAACTAAATTGCCCATTACTTCACCCACTGCCGATTTTAGTACCATTTTAAGTGTAATGAATGAAGGCAGAATGGGATTAGCGCTGATTATGCAAGGCGAACAATTATGCGGTATCATTACTGATGGTGATATTAGACGTACACTTGCACAATTTGGAGCGACAAGTTTAAGCAAAACCGCTGAACAAATTATGACGAAAAAACCGAAAACTATTTTAGATTCTGTTTATTTAGCTAAAGCCGAAGAAATGATGAAAGCGCTACACATTCATTCATTAATTGCCGTAAATGACATTGGGCAAGTTTCTGGCATTCTTGAATTTTCAAACTAAGGATAAAATGGCAAAATCAAATTATATTACCCGTGCCGGCTGGCAAGCACTCGATCAAGAGCTGAAATATCTTTGGAAAGAAGAACGCCCAAAGGTAACACAATCAGTTTCAGAAGCAGCTGCATTAGGCGATCGCAGTGAAAATGCTGAATATATTTACGGTAAACGGCGGTTACGCGAAATTGATCGGCGGATTCGATTTCTTTCGAAGCGACTAGAAGCCTTACAAATCATTGATTATCATCCACAACAAGCTGGCAAAGTGTTCTTTGGTGCTTGGATAGAATTAGAAAACAATGAGGGCGAAATTAATCAATATCGAATTGTCGGTTGTGATGAATTTGACCCAACCAAAAATTGGATTTCGATTGATTCGCCCGTTGCACGTGCTTTAATCGGTAAATGCGTTGATGATGAAATTGAAGTACAAACGCCAACAGGCAAAGCTGTGTTTTATATCAATAAAATTTGGTATGACACAAAATCGCTTTATTAAGCCAACTGATTACTTCCCTTCACTTGGCTCTCAAATAGCGGTTATTTTTGGCCTAAATTTGCCAAAATAAACCGCTTCAGCTCACCATTATAGTGCTTTTAATACATTCACCATTTCGATTGCACCTAAAGCACATTCTGCGCCTTTATTGCCCGCTTTTGTGCCCGCACGCTCAATGGCTTGTTCAATACTTTCTGTGGTCAATACACCAAACATAATTGGCACACCCGTTTGTAACGCTACTGCACCAATGCCTTTTGCTACTTCATTACAAACATAATCATAATGCGTGGTTGAGCCACGTATCACCGTACCTAAGCAAATTACTGCATCATATTTACCGCTTTCTGCCATTTTTTTGGCAACAAGTGGAATTTCAAAAGCACCTGGCACCCAAACAGTGTCAATATCCGATTCTACCGCACCGTGGCGCACGAGTGTATCTACTGCACCACTTAATAATTTATCATTAATAAAATCATTAAAACGTGCCGTTACAATGCTGAATTTTAAACCTGTAGCGACTAAATTACCGGTAATTTTTGCCATGTTGATCTATCCTTATCAAATAAAAAATTGTGAGATCACAAGTATTAATACTTGTGGTTAAAATAAGATGGATTGTTTGTGTAAGAGCGCCATTTTGTCCAACACGACGCTATTGTTCAAAGTTAAACATATGCCCCATTTTGATCTGTTTTACTTTCAAGTAATCAATATCATTTTGGTTTGGTTCAACAATAATTGGCTCACGTGCGATAATATTTAAGCCTTGTTGTTTTAAGCCACTAATTTTGGCTGGATTATTGGTCAATAAGCGAGTGGATTTCACGCCTAAGGCTTGGAAAATCTGCGCACCAATATAGTATTCGCGTTCATCTTCCTTAAAACCTAGCGCAAGGTTTGCCTCAACCGTATCCATACCTTTATCTTGTAGTTCATAGGCACGTAATTTATTAATTAAACCAATACCGCGACCTTCTTGGCGTAAATATAATACAACGCCTCGCCCTTCTTTCTCAATTTGCGTCATTGCTGCAGCAAATTGTTGGCCACAATCACAACGTTGAGAACCAAAGGCATCGCCGGTTAAGCATTCTGAATGGATACGTGCTAATACGGCTTGACCATCACCAATCTCGCCTTTTACTAAAGCGATATGTTCTTTGCCTGAAATCACTTCAACAAAACTATGCGCCATAAATTCACCATATTTAGTCGGCATTTTCACAACTGAAACCAATTTAACCAAGCTGTCATATTTACGGCGATATTCTTGTAGCTGCGCAATGGTAATAAAAGGCATATTATGTTTAACGGCTAAGGCTTGCAATTGTGGCATAGTCATCATAGTGCCATCATCAGCCATGATTTCACAACATAAGCCTGCAGGCTTTAAGCCTGCTAAGCGCGCTAAATCGACTGTTGCTTCTGTATGGCCATTACGTACCAACACGCCCCCCTCTTTAGCAATCAGTGGGAACATATGCCCTGGGCGACGAAAATCAGCCGCTTGTGCATTTTGCTCAAGCATTTTTAATGCGGTCAGTGAGCGTTCAAAGGCTGAAATACCGGTGCCCGTATTAATATGATCAACGGATACAGTGAAAGCTGTTTCATGATTATCCGTATTATTTGTTACCATTGGATGAAAACTTAATTTATCCGCTAGCGCTTGTGAAATTGGCGTACAAATCAAACCTTTGCCATAAGTCGCCATAAAATTAATATTTTCTGGTGTAGCAAATTCTAAGGCACAAATGAAATCGCCTTCATTCTCACGGTTTTCATCATCAGAAACTAAAATAATTTTGCCCGCCGCAATTGCTGCTAAGGCTTCATCTACTGTTGAAAATTGAAACATTGTTTTCTCTTGTTAAACTTAAATACGCAACGCCACGTAATCATTGTGGAATAAATTAAAAACCTACTTTTTCTAAAAACTCAGCAGTAATTGCATTTTTAGATGGTGTATTTGTCCGCTTCATTACAAACCGTTCGATATATTTACCAACGATATCATTTTCTAAATTCACTATACTACCTATCGTTTTTGTGGCTAAATTAGTTTGATTAATCGTATGCGGAATAATTGACACGCGAAAACTCTCCTGATCAGTATCAACTACAGTTAAACTAATACCATCAATGGTAATTGAGCCTTTTTCTACAATATAACGCATTAATTTAGGGCTAGTTTTAACCCGATACCAAGTAGAGTGATTTGCGGGAGTAATTTGAATAATTTCACCGGTGCCATCAATATGGCCAGATACAATATGACCACCAAAACGGCCATTCATTGGCATTGCACGTTCTAGATTAACCGGGCTAGCTACGTGTAACTGTGCCAACGATGTACGGCGTAAAGTTTCCGCCATCACATCGGCTGTAAATTGTGTTGAGTTAAAAGAAGTGACGGTTAAACAGACACCATTCACGGCTATGCTATCGCCTAAATGTACATCTTTGAGTACCTTGCAAGCATTAATGGTCAGTACCGCAAAATCACCTGATTGCTTGATATTCGCAACTTTACCCACTTCTTCAATAATACCTGTAAACATAAATTCTCCTGCTGTCAGCTTGCTAATTTTTGCGATGATGAAACGTCATAATCTAACAAGATATCGTCGCCTATGTATTGTGTGGATTTAAGCGTTAAATTAACCGCTTCCGCTAGTTGCAAAATACCTGCACCACCGATAGGACTTTTGGCAGTGCTTCCGCCTAATAATTTAGGTGCAATATAACAATGAATTCTGTTAACAACGCCAGCTTTCAATGCACTAAAATTCAGTGTTGATCCCCCTTCAAGCAAGACACTGTCAATTTGCATTGCACCTAATTTGGCTAATAAATCAACTAAATCAACTTGTTTGTTGGCTACCTTACATTGGATAATTTGCACGCCAAAGGCTTTCAATTGCGCTATTTTTGTACTATCAGTTGAAGCGGTTGCAATAATGGTTGGATATTGGCGCGCTGTTTGAACTAATTGACACGCTAGAGGCGTTCGTAAGTGGCTATCGCACACAACGCGTATTGGTTGTTTAGCATTCGGCATTCGACTATTTAACATCGGATTATCCGCTAATACGGTGCCCACTCCAACCATAATGGCGCTATATTGATGACGTGTGATTTGCACATTTTGGCGTGCTAATTCACCGCTAATCCATTTGGATTCACCTGTAGCGGTAGCAATTTTACCATCTGCTGTCATTGCATATTTAAGCAACACATAAGGAGATGTAGTTTGCATATAATGAAAAAAAATGGGGTTGAGCTGATCGCAAGCTTCTCGCATAAAATCAGTGATCACTTCTATGCCCGCTGCTTGTAATTGTTTAATCCCCTTCCCCGTAACCAGTGGATTAGGATCACGAGAGCCCACAAACACTTTGTTAATTCCTCGTTCAATAAGCAAATCAGTACAAGGCGGTGTGCGCCCATGATGGCAACAAGGCTCAAGTGTAACGTAAGCAGTGGCCCCTGTGAGATCTTGCTGACAATTTAAAATAGCATTACGCTCTGCGTGCCATTCGCCTACCTTTTGGTGATAGCCTTCTGCGATGATTTGATCATTTTTAACGATCACACAGCCCACTAATGGATTAGGATTAGTCCAACCACGTGCTTGTTCTGCCAGTGCTATCGCACGAGCCATATAGTCAACATCTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015424|734133:740646|737045_737507_-|WP_010945068.1|DBSCAN-SWA MAKITGNLVATGLKFSIVTARFNDFINDKLLSGAVDTLVRHGAVESDIDTVWVPGAFEIPLVAKKMAESGKYDAVICLGTVIRGSTTHYDYVCNEVAKGIGAVALQTGVPIMFGVLTTESIEQAIERAGTKAGNKGAECALGAIEMVNVLKAL >NZ_CP015424|734133:740646|736469_736958_+|WP_010945070.1|DBSCAN-SWA MAKSNYITRAGWQALDQELKYLWKEERPKVTQSVSEAAALGDRSENAEYIYGKRRLREIDRRIRFLSKRLEALQIIDYHPQQAGKVFFGAWIELENNEGEINQYRIVGCDEFDPTKNWISIDSPVARALIGKCVDDEIEVQTPTGKAVFYINKIWYDTKSLY >NZ_CP015424|734133:740646|739539_740646_-|WP_010945065.1|DBSCAN-SWA MTDVDYMARAIALAEQARGWTNPNPLVGCVIVKNDQIIAEGYHQKVGEWHAERNAILNCQQDLTGATAYVTLEPCCHHGRTPPCTDLLIERGINKVFVGSRDPNPLVTGKGIKQLQAAGIEVITDFMREACDQLNPIFFHYMQTTSPYVLLKYAMTADGKIATATGESKWISGELARQNVQITRHQYSAIMVGVGTVLADNPMLNSRMPNAKQPIRVVCDSHLRTPLACQLVQTARQYPTIIATASTDSTKIAQLKAFGVQIIQCKVANKQVDLVDLLAKLGAMQIDSVLLEGGSTLNFSALKAGVVNRIHCYIAPKLLGGSTAKSPIGGAGILQLAEAVNLTLKSTQYIGDDILLDYDVSSSQKLAS >NZ_CP015424|734133:740646|737616_738822_-|WP_010945067.1|DBSCAN-SWA MFQFSTVDEALAAIAAGKIILVSDDENRENEGDFICALEFATPENINFMATYGKGLICTPISQALADKLSFHPMVTNNTDNHETAFTVSVDHINTGTGISAFERSLTALKMLEQNAQAADFRRPGHMFPLIAKEGGVLVRNGHTEATVDLARLAGLKPAGLCCEIMADDGTMMTMPQLQALAVKHNMPFITIAQLQEYRRKYDSLVKLVSVVKMPTKYGEFMAHSFVEVISGKEHIALVKGEIGDGQAVLARIHSECLTGDAFGSQRCDCGQQFAAAMTQIEKEGRGVVLYLRQEGRGIGLINKLRAYELQDKGMDTVEANLALGFKEDEREYYIGAQIFQALGVKSTRLLTNNPAKISGLKQQGLNIIAREPIIVEPNQNDIDYLKVKQIKMGHMFNFEQ >NZ_CP015424|734133:740646|735526_736462_+|WP_010945071.1|DBSCAN-SWA MNYLTQATETLSLYSQAIDRLQHNLDQHFNQAVEMILNCAGRVVVAGIGKSGLVGKKMVATFASTGTPSFYLHPTEAFHGDLGMLKAIDIVLLISNSGETDDVIKLLPSLKNFGNQIIAMTGNRHSTLAQHADLVLDISVEREACPNNLAPTTSTLVTMALGDALAIALIKARDFKAHDFARFHPGGSLGRKLLNRVKDVMQTKLPITSPTADFSTILSVMNEGRMGLALIMQGEQLCGIITDGDIRRTLAQFGATSLSKTAEQIMTKKPKTILDSVYLAKAEEMMKALHIHSLIAVNDIGQVSGILEFSN >NZ_CP015424|734133:740646|738877_739525_-|WP_010945066.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEVGKVANIKQSGDFAVLTINACKVLKDVHLGDSIAVNGVCLTVTSFNSTQFTADVMAETLRRTSLAQLHVASPVNLERAMPMNGRFGGHIVSGHIDGTGEIIQITPANHSTWYRVKTSPKLMRYIVEKGSITIDGISLTVVDTDQESFRVSIIPHTINQTNLATKTIGSIVNLENDIVGKYIERFVMKRTNTPSKNAITAEFLEKVGF >NZ_CP015424|734133:740646|734133_735435_+|WP_041603676.1|DBSCAN-SWA MQINLSQQPAPSIWGEKAILSAHQNGFTIHLHADSLTTIQKAARKIKNQNILNVSLVGEGWGLEECWAFQQGFVSVHHRGKIQYPPLAEQHAELEARLSCTDFARKIINEASNTLTPEQLAKQATEFITQQAIKYNLHNVVKFEIIQGQALDTANYAGIWAVGKGSANPPALLKLDFNPTGDENAPVLASLVGKGITFDSGGYSLKPSDSMSTMRTDMGGAALVTAALGLAIARGLTARVKLYLCCAENMVSSRAVKLGDLIHYRNGISVEVLNTDAEGRLVLADGLIDAAADQAQFIIDAATLTGAAKVAVGNDYHTVLAMDVQLVNQLLTAADAENEPFWRLPFAEFHRTQISSCFADIANISSVPVAAGASTACGFLSYFVPNYQQNWLHIDASATFHRSASDLWAVGATGLGIRTLANLLLSKATAKNT |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
813594 : 828638
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015424|813594:828638|DBSCAN-SWA 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15 | uncultured_Mediterranean_phage(12.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1427090 : 1446122
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015424|1427090:1446122|DBSCAN-SWA 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31 | Vibrio_phage(21.05%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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