Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015426 | [Haemophilus] ducreyi strain VAN3, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015426_1 | 938163-938374 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015426_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP015426_1
>1.1|938186|40|NZ_CP015426|CRISPRCasFinder CACCTTAAAGAACAAATCCAAATTTACAGCGGGCAACATG >1.2|938249|40|NZ_CP015426|CRISPRCasFinder TACGTTAAATAATGATTCAGAGCTTGCAGCCAATAATTTA >1.3|938312|40|NZ_CP015426|CRISPRCasFinder AACTTTAAATGATGCTTCTAAACTCTCTGCGAATAAGTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015426_1
The CRISPR arrays of NZ_CP015426_1 >merge|NZ_CP015426|1|938163-938374|CRISPRCasFinder ACATTAAACACTTCTAACAATATCACCTTAAAGAACAAATCCAAATTTACAGCGGGCAACATGACCTTAAACGTGACTAATAATGTTACGTTAAATAATGATTCAGAGCTTGCAGCCAATAATTTAACCTTAAACGTGACTAAGAATGTAACTTTAAATGATGCTTCTAAACTCTCTGCGAATAAGTTGGACTTGAATGTTACCGATAATGT >NZ_CP015426|1|1|938163-938374|CRISPRCasFinder ACATTAAACACTTCTAACAATAT CACCTTAAAGAACAAATCCAAATTTACAGCGGGCAACATG ACCTTAAACGTGACTAATAATGT TACGTTAAATAATGATTCAGAGCTTGCAGCCAATAATTTA ACCTTAAACGTGACTAAGAATGT AACTTTAAATGATGCTTCTAAACTCTCTGCGAATAAGTTG GACTTGAATGTTACCGATAATGT
>NZ_CP015426.1|WP_155727101.1|936397_936535_+|hypothetical-protein MTKDLIKQARESVPLNQQLHHLKNKEAYENTDQQLSYQVNGSISF >NZ_CP015426.1|WP_010945346.1|934371_936033_+|phospho-sugar-mutase MTTIFTIAQHWLAQDPDLETQNELSHLIDNAKAGGKQALKELTARFGGRLQFGTAGLRGPLQAGPMGMNRVLVAQAAAGLALYLKTYDKQPSIVIGYDGRKNSDVFARDTAEIMAGVGIKAYLLPRKLPTPVLAYAIKHLDTTAGVMVTASHNPPEDNGYKVYLGKANGGGQIVSPADQQIAAFIDQVATGNIRELARSQDFNLLDDEVINAYIEKTARLSQENKMALNYVYTAMHGVGYEVLQKTLKQAGLSQPKLVSEQIEPDGNFPTVSFPNPEEKGALDLAIKLAQQENAEFIIANDPDADRLAVAIPDAQGIWKSLHGNVLGCLLGWHLAKKYHAQGQQGVLACSLVSSPALAEIAKKYGLKSEETLTGFKYIGKVDNLLFGFEEAIGYLVDPDKVRDKDGISAAVAFLDLVLYLKKQGKTILDYINEFNQQFGAYISGQISIRVSDLAEISKLMTALRNNPPTKIGGVKVTQLIDHTKTDRQSDILVFNLANGSRLITRPSGTEPKIKFYLDVKGNNGQQEAERALAHFDESVRQMLRQTQYGNQDC >NZ_CP015426.1|WP_041603527.1|932085_933450_+|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MTPFSVVILAAGKGTRMYSDLPKVLHPIAGKSMVKHVIDTVKQMDAKQIHLVYGHGGDLLKTHLKTEPLNWVLQAEQLGTGHAMQQAATFFADDENILMLYGDTPLITAQTLTRLIAAKPANGIALLTVELADPTGYGRIIRQNGSVVAIVEQKDASPTQLTICEVNTGVMVASGASFKKWLSRLNNQNAQGEYYITDIIAMANQEGYSVQAVQANTLMEVEGANNHLQLAALERFYQQTQAEKLLLSGVSLMDPHRFDLRGSLQYGKDIQIDVNVILEGEVKLGNRVRIGAGCILKNCVVGDDVDIKPYSVFENAIIGNKAQVGPFARLRPGAKLEAESHVGNFVEIKNAHIGKGSKVNHLAYVGDAEVGENCNLGAGVITCNYDGANKFKTTIGNNVFVGSDVQLIAPVNIADGATIGAGATITKNIAENELVISRVPQRHIQGWQRPTKKK >NZ_CP015426.1|WP_010945348.1|928851_931962_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MFTDIFIKRPVLAISISIVFIILGLQAMFKLQVREYPEMTNTIITVTTNYAGADAETMQAFITSKLEESIAQADNIDYIKSDSAPSTSNITIKMKLNTNPGIAVADITSKVNAVRSQLPSNIDDPSIRSSTGAMEAIVFIRFSSKELSAPQLTDYIERVVKPQMFTVNGVSKINYFGGASFGLRIWLDPAKIAGLGLSANEVTAALAANNVQTAAGNSNGYYTEYRNKVETTTKSVEELASLVIKTLPNGSNIKLGDIAEISLEKARDDSRGIVNGREAVVLAVEAASTANALDVAKHIYPKFAEIQSNLPASVEAEVIYDKTIAINSSIKEVVKTILEAVIIVLVVIVLFLGSFRAMIIPIVTIPISLIGVLMVLQGFGFTINLLTLLGLILAIGLVVDDAIVVLENVERHIKQNGETPFRAAIIGTREIATPVIAMTITLMAVYSPMALMSGITGSLFKEFSLTLAGAVFISGVAALTLSPMMTSKILKQSEKPSWLEQRIEKTLHKVTDIYTKILLVVMASRYAILVFAGLIFASLPMLFNSLSSEVAPAEDRGIVMGMASGPANVNMDYMQDVMFPVAQQINQLPEVNATQIMPGFPSSNGSFMLVPLKDWSERTRSQKEVLAEVNKITNEVTEASVIGFEFPEISTGESGLPFSFVITTANDYRDLAQVASDFLLAAQSSGQFFFNQLDLKFDTASMAIKIDREKMGTYGVTAADIRSVLGSFLSGATLARVDIDGRAYDIISQVKRSERLSPQDLAKYYVKLKDGSSVPLSTFVSMELKTQPRTLPKLNQLNSATITGVLAGSMGNAVKWAEAKAAEILPAGYYYDFMSESRQYKQEGNALALTFLLAIVMIYLVLAVQFESWRDPMVILVSVPLAISGALVVLNILALPMIGKAGATLNIYSQVGLITLVGLITKHGILMCEVAKEEQLHHGKNKFDAITYAAQIRLRPILMTTAAMIAGLIPLLYATGAGAVMRFSIGIVIVAGLAIGTLFTLFVLPVIYTFLGENHKPLQEFEENKHYPVIAETEHS >NZ_CP015426.1|WP_041603529.1|927596_928838_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MTTETKKPSFFTKVTLWIILALVLLIFAAVIGFNQFIAKSKANAAANPFPPFATVTATTVNATEWTPVIKAVGTIRPNNGAMLSAQAAGSVTAIHIKSGERVTRGQLLIELDSSVEQATLHASESQLPNAKATLSRYRSLVASKSASKAELDKAQATYNQLVANIESLKAAIKRRQIYAPFDGIVGIVKVNLGEYITAATEIVRVEDSSQMKVSFNVPQTNLADITIGQRVAFSVDAIPNQTFEAKVSAIDSAVTKSTGLVAVEAVVDGRGQLMSGMFARLNIALATEMDQVVVPQIAVTYTMYGESAYVLDKLSEQEKEQLLKVLASQTSSPVSGKKAQKLIENIDGVFKARQVEVKTNDRQGIYAQLKNESIKVGTTLVTSGFQRLRNGAYVTIADKQPVGISKPAIETNL >NZ_CP015426.1|WP_010945350.1|926735_926957_-|DUF1414-domain-containing-protein MAKQSKYQSKQFEQLSYDLITILEKHKAPVDLSIMALGNLVSNILLENIQTETQRMVLADTFSTALKNSLKAR >NZ_CP015426.1|WP_010945351.1|925002_926733_-|DUF3413-domain-containing-protein MFKPLRQLLPTYSRQYKEEISQRITWGHWFTLFNVVLALCISTRYAFNADWPNTLSGKLYFFTSLFGHFSFIVFAAYLLLLFPLSFIIKNERTFRGLSVIIATIGQTVLLVDTEVFKQFYLHLSPLVWDLLVTPDDNSELSHQWQLLFVPMPIILLAQMLYSRWCWQKLRSFSRQKWGKFVALFFVACFTATHLIYAWADMRLYRPITSQKANYPLSHPMTARNFLAKHGVINRTKLQLNIAENGRLDSFYLNYPKQHLTFNRKPYTNVLIVNMSGLANEMIVAEKMPHLTQISEKTYRFMNHYGSGDSNAANLLGIFYSLSGQYLDSMLANKQTSPLLTAFKQANYQFGLFSHNSFAAPIYQQSIFAGFSLPKIKGNAQAIEKWTAWLNQRLAKPFFSYLDLAMPRTHNSLAPLEHVDAQFNQIWYALQQHNLLMNTLVIITADQANPTTEMNFTKRHLQVPMMIYWQGENQKINVLSSHLDLLPTLLMQLFAVNNPINDYAQGVNLTSPNERIWALASNHKWTVAIMPNGEQYHLDKFGHFEKYNANGEKVQTKRPPLALFLQMIKQSNQFVEK >NZ_CP015426.1|WP_010945352.1|924450_924801_+|DNA-binding-protein MITQMEIARHELLRDIEDNVSALCKNYNLDTEICEQISTSVADFLAEHYAGQVISFPKDFYYKIAQRDLDIYNDFTGNNWFFLVKKYGMTESGIRKVINRVRKRIMKHQQPDLFCE >NZ_CP015426.1|WP_010945353.1|923931_924333_+|regulatory-protein-GemA MRNKLLQLVHIGKTQLGMDDETYRSLLSQQFYQNSAKNISYSDLIKLVKLLQTKGAKIQLPRSKSSLSPIQRKLWAVWKQMHADSVIDDGSSHGLNSFVKRSLNGDMQWNELTNSQATLILENLKQWQKRVGK >NZ_CP015426.1|WP_010945354.1|923567_923942_+|hypothetical-protein MDQQWLKATLGKGVAMLLILRLKNSPPEDSISATLETWLRVLTYKKHYEQELDQWRFEEAFMYLAQTCDWFPNPKQLLDAMPKRKIKELPPPPPKTVEQEEAERLKALSNLQKIKAMLRGCYAK >NZ_CP015426.1|WP_010945344.1|950630_952202_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MNNIHNHKILILDFGSQYTQLIARRIREIGVYCELWAWDVTEKQIREFNPTGIILSGGPESTTETNSPHAPEYVFKAGVPVLGICYGMQTMAMQLGGLTEASEQREFGYAAVELQHADQLFAKLNDDLTASQPKLDVWMSHGDKVTRLPAGFQTTAVTPTCPIAAMSDEKRRFYGVQFHPEVTHTKSGLALLTNFVENICGCARSWTPENIIEDAVAKIKQKVGNDQVILGLSGGVDSSVTALLLHRAIGKNLHCVFVDNGLLRLNEGDQVMEMFGDKFGLNIIRVNAEERFLEALKGIDEPEAKRKIIGKVFIDIFDDEAKKLTDVKWLAQGTIYPDVIESAASKTGKAHVIKSHHNVGGLPDYMKLGLVEPLRELFKDEVRKIGLTLGLPAEMLNRHPFPGPGLGVRVLGEIKKEYCDLLRNADAIFIEELYKSGWYYKVSQAFTVFLPVKSVGVMGDGRKYDWVVSLRAVETIDFMTAHWAHLPYELLGKISNRIINEVNGISRVVYDVSGKPPATIEWE >NZ_CP015426.1|WP_010945343.1|952351_953815_-|IMP-dehydrogenase MLRIKQEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLSTQLTKTIRLNIPMLSAAMDTVTETKLAISLAQEGGIGFIHKNMSIERQADRVRKVKKFESGIVSEPVTVSPELTLAELAQLVKKNGFAGYPVVDNENNLVGIITGRDTRFVQDLTQTVSKVMTHRDRLVTVKENAKREEILALMHEHRVEKVLMVDDAFKLKGMITVKDFQKAEQKPNACKDEFGRLRVGAAVGAGPGNEERIDALVKAGIDVLLIDSSHGHSEGVLQRVRETRAKYPDLPIVAGNVATAEGAIALADAGASAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIAEAAEALKDRDIPIIADGGIRYFGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGEIELYQGRVFKSYRGMGSLGAMSKGSSDRYFQSDNAADKLVPEGIEGRIPYKGYLKEIIHQQMGDLRSCMGLTGSATIEDLRTKAQFVRISGAGIKESHVHDVTITKEAPNYHMG >NZ_CP015426.1|WP_010945341.1|954084_954711_+|23S-rRNA-(uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase-RlmE MGKKRSASSSRWLAEHFKDQFVQKAHKQKLRSRAYFKLDEIQQSDRLFRPGMTVVDLGAAPGGWSQYAVTQIGNQGRIIACDILDMNPIVGVDFLQGDFREVSVLNALLARVGDEMVDVVMSDMAPNFSGMPSVDIPRAMYLVELALDMCRQVLAPKGSFVVKVFQGEGFDDYLRDIRSMFTTVKVRKPEASRDRSREVYIVATGYKG >NZ_CP015426.1|WP_064083224.1|954752_956672_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MVKNIVLWVVVAIVLMTAFEGFNSNFNNSNTVSYSTFLNDIKSNQLKEVNFKRNDETISVIKNDGTEYKTVMPMNDQYLLSDLAKTNATITGQPQERRGVLFQIFISWFPMVMLIGFWLFYMRQMQGGGRGAMGFGKSKAKMLTPEQVKTRFSDVAGCDEAKEEVSEVVDFLTEPSKFQKLGGRIPKGILMVGPPGTGKTLLAKAIAGEAGVPFFTMAGSDFVEMFVGVGASRVRDLFDQAKKNAPCIIFIDEIDAVGRKRGGAGLSGGHDEREQTLNQMLVEMDGFEGSEGVIIIAATNRADVLDDALTRPGRFDRQVTVDLPNVKGREQILKVHMKKVPLASSVDPMIVARGTPGYSGAQLANLVNEAALFAARKNRTVVTMDDFDKARDKINMGPERRSNTMTEKELMNTAYHEAGHVIVGYLMPEHDPLNKVTIVPRGQALGFAQFLPEGDRVSETFTKLESQLSTLFAGRIAEGLIFGDDKITTGASSDIHRATQIARAMVTQWGFSKELGPLFYQNEDGMGAIKGVSEASQKLIDQEMRIIIDRNYARAKQTLEENIDILHAMKDALLKYETLDRKQIDDLMHRRPVGEPEGWNDDKEENSSNDSSDATSASNTIEEAKPNTDADVADNRVDA >NZ_CP015426.1|WP_010945339.1|956868_958086_+|tyrosine-transporter MKNKILGSALMIAGTTIGAGMLAMPLTSAGMGFGATLFLLISLWGLLAYTGLLFMEVYQTAPKRDVGVASLAEQYFGIVGRVLATATLLVLLYALLAAYITGGGSLLSGILPEIMDSQLTNKIAILLFTTLLGTFVVVGIKGVDGLTRVLFMGKIIAFLLVLAMMLPKAKIENLFAMPLDNLLVISVVPIFFTSFGFHVIMASINNYLEADIGKIRIAIYIGTAIPLIAYLLWQLATHGVLTQAEFVEILKSDPSLNGLVKATSQITGSTFLGEMLRLFSALALITSFLGVAMGIFECIGDLLKRINLPTNRLVLTLVTFIPPLLFALFYPNGFIAALGYAGLLFAFYGMLLPIGLAWRARKLHPNLPYRVSGGNSALLIALLMGIIIMIIPFLIQFGYLPQVMG >NZ_CP015426.1|WP_010945338.1|960767_961154_-|YhcB-family-protein MEQWTTEIWFSISIAFLIGTLCGVLVMRFFKGNIQQQIQLKSELASAEAKIEEQKQQLERHFEQSANLLENLAEDYKKLYTHFAQNSEQLLPESNQVEFFKRLKNHANGDEDNQPRDYSDGSSGLLKS >NZ_CP015426.1|WP_010945337.1|961461_961884_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKTFVAETVKRDWYVVDAAGKTLGRLATELASRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVINAEKVVVTGKKETDKIYYWHTGYVGGIKDATFKEMISRRPEAVIEIAVKGMLPKGPLGRDMFRKLKVYAGNTHNHAAQQPQVLDI >NZ_CP015426.1|WP_010945336.1|961900_962296_+|30S-ribosomal-protein-S9 MTAANQNYGTGRRKSSSARVFIKPGSGNITINQRSLEVYFGRETSRMVVRQPLELVELLDKLDLYITVKGGGISGQAGAIRHGITRALMEYDETLRPALRAAGFVTRDARRVERKKVGLHKARRRPQYSKR >NZ_CP015426.1|WP_010945335.1|963183_963723_+|hypothetical-protein MRLLLIIFCCFLTACQMLKKTFVVPESIPFQGKSYFKVTDNMLEGMRHLLFLPAEGNQHPDNWHNAIFIFLDQNKTSTMMQRMALRKKVFSNQQDTIAQIKIIENELYSAIIYPPTERFNDILLEVSRGRDSACGFAQIQVANKRAILTEKNANLTAYQAELNSLAQQLSTLAWQVACQ >NZ_CP015426.1|WP_010945334.1|963750_964674_+|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MEQQYAKLVKRAANVAIIVACSLILIKTFAWWKTGSISILASMTDSMVDLFASMTNILVLRFALQPADKTHTFGHGKAESLAAIAQSAFITGTAVFLLLQGIHNLNNPVLIEDSQLGVIVSIISIVFTAALVFYQKKVVSITQSPAIQADSLHYQTDLFMNAAILVAMLLNIYGFIYADAIFAIGIALYISINAFKMFWEAVQVLLDKALPEEDINQILTIVANQPQIIGIHDLLTRQAGAVRFIQLHLELEDHLSLLEAHTITDNLEQKILAAFPLSEVIIHQEPTSIVQQELVLGQVKNYVPSYR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
264203 : 283235
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015426|264203:283235|DBSCAN-SWA AATGACATCAAGAGAGCAAATTATCGAATTAATCAAGTCTGGCGAGTTTACCCAAGCGGAATTGGCGCGTCAGATGGGGGTAAATAGCGGAGCGTTAAGCAGCTATTTAGGCGGTAAATACAAAGGCAATGTGGAAAACATTGAAAACGTACTAGCAAGCTGGTTAAGCACCCGCGATAAGAAAGAAAAAGTGTTTGTGGAAGCACCGCATTTTATCGAAATTCCGACCGCAGATAAAGTATTTAAAGCGTTAGACATGGCGCGCTTTTGCAAAACCATCGTGCCGATTTTTGGCGCAAGCGGTGTAGGCAAAACCAAGGCATGCCAAGAATACAAAAAACGCTATCAAAACGTGTGGATGATTACTATTAGCCCGTCACGCGCAAGCCTGAATGCGTTTTTGTATGAGTTGGCGTTAGAGCTTGGCATTAAAGACGCACCGCGCCGTAAAGACCGTTTAAGTCGCCTTATTTTAGACAATTTAAAAGACACTGAGGGCTTAGTGATTGTTGATGAAAGCGATCACCTAACTTACGACTCCATCGAAGAATTGCGCTACTTGCAAGAAAAAGCCGAAGTGGGCTTTGCATTAATCGGCAATGACAAGGTTTACACCAAAATGCAAGGCGGTGCAAACCAAGCGCACGAATATGCGCGACTTTGGAATCGTATCGGCAAAAAATGCCAAATTAAAGCCAGCAAAAAAGGCGATATTAAGGCGGTGGCACAGGCTTGGGGCTTAGATGTGCAAGATAAAGATTTGATGACCGTATTGTACGACATCGGCGGTAAAGCAGGCGGACTGCGCGCCCTAACCCAATATTTACGCCTCGCCGGAATGACTGCCAAAGGGCAAGGCACCGGCATCACACTAGACCTTATTTTAACCGCGCAAGCGGAAATGACCGGGAGCGAATAATGAAAGCCGTAAAAACACTGTTATTTCTGACCGCACTTTTTAGCCTTGGCGCACAGCCAGCCGGACAGTGCGACGATAACGACAAAGCGTGCTGGGAAATGTTGGCAAAAGCGCAATGGAACGAGGAGTTTGGCGATACGCCGCCGAATATGACCCCACAGCAAGAGAAAGAAACGTGGGAATGGCTGAAAAAGCATTATCCGAATACTGATTTTAACAACACCATCAACTAATTAGGAGTAAACATGGAAAACCAAGAAATTCCGCAAGGCTACCGCCGAAATGCAAAAGGTGCGCTTATCCCCGAGGCGTCAATTAAAGCCATCGACAAAGAGCGCGATGAGTTAGTCAACGACATTGTACGCAAAGCCGAAATCGTGCAAGAAATCTTAAAAGGCTTTAAGAACGAAGTGTTTGGCGATATTTCCGCGTTTGTTGAGCTTTCCGCCGAGCAATACGGCGCGCAAATTGGGGGTAAAAAAGGCAATGTGACAGTTTACAGCTTTGATGGCAAATACCGTGTACAACGCGCCATTAGCGAGCATTTGCAATTTGATGAACGGATTATGGCAGCAAAAGCCTTAATCGAAGAATGCTTGCAAGACTGGGCGGCTGGCAGTCGCGCCGAGCTAAAAGCGATTATCGACCGCGCCTTTGATGTTGACAAAGAGGGCAACCTCAACACCAACAAAATTTTAGCCTTGCGCCGTGTAAATATCAGTGATTCGCGTTGGGTGCGCGCCATGGACGCGATTTCTGACAGCGTGCAAGTGGTTGGCTCCAAGTCTTATATCCGCATTTATAAGCGCGTGGGCGACACCGACCGTTACGAGCCGATCTCGTTGGACTTGGCGAATGTGTAAGGGGCGCAAAATGGAAATGAATTACAAAGAATTGTCAGGATTGGCACGCGAAGTAGAACGCGCAGGCGATTTAAGCTACGCGGCGTCAGTTTGGCACAAAGCCGCAGGCAAAGCCAAGAAAGAGGCAAACAAACAATGGGCAGTCCGCCGCGCGGCATTTTGTGAGCGTTGGTGCGGACGGATCGAAAAGGAGAAAAATAATGATGGAGCTGTTGTTACTACTCGCTAAATTTTATCTGTTATTTGCGCTAGTGTTGTTCGTTATTTGCGCTAAGTGGTTGTAATAAAAAGGAAATGAAATGGACGATAGATTAATGACATTAATGACGTTTTGGGGTTGGGGCAGTTTTATCGCGATAGTGATTATGCTCGCCCTCACCCGCCGATAAGCTTATTTACAGCGCATTGCGCGCAGTGCGCTGAATAATGAGTTTAACAACAAAAGAGGAGCTAAAAATGGCGAAATATCTGGTCCGTTTATACGGCATGGTAGAACTACCAATCGAGGCGGAAACTATTGAAGCAGCGTTAGAAGTTTGCGATTTAAACAATAACGACATCAATATGTTACCGCATGTAATTACTGAGGTTTATGACGTTATAGAAGTGGAAGAGGTTTAAAGATGAGTTATATCGGACAACCTTTTAGATCCGACGAGCAAGTCAAAGCGGATTTAATCCGAGATTTGGTTGCAACCGTGGATGTGCTGGAAATCGCAAAAGACCGCTTAATCGACGGCGACGCACAGGAAACTACGCGCTTATTTCGGGCGGTGCAAGGCGATTTAAATCGCTATGAGGCGTTGATTAGACAGGTTTATAAGCCAACAAATAAGGATTGATTATGAGAAAACACAAAGATGAATTGCGCCTTTTGATTACTGCTGAAGTTAAAAGCAAGAGCATAAACGAAACGGTTGTTGTATCTAAAAAGGCTTGGGGCAAATTATCATTTAAACAACAAATGCAAACGGTGCGGGAAATGGTGTTTGATTCGCTTGAGCAAAATATATCGTTTGAAGAGTTGGGCAAGGAAGAAACAAAATGAAGCACGAAACAACAATAAACTTTACAGCAAAATTGGAAGAAAACGGCGAAATCGGCATATCCATCAAAGATTTAAACGGCGATAAAACGCCTGAATTTTGTCAAGCTCAATTATCAATCATTATTATGCTGATGTTTAAAAATAGCGAACGCGTTATTGCTCATTTTTTAGATAAGTTAGATGCTGAAAAGCAAATTACGACGAATATCAACATAATTTGCGAAGAAACCGACGATGACATTACGTTAGATATGAATGTGAAAGACGGTATGGGGTATTTGTTTTTGAATTTTATTAAAGAGCAATATGCCGAGTTTGAAGTTGAAGAATAGGTGAAAATATGACAGAAGAAAACAAACAACAAAACCAAGAAGCGGAAAACACTTATCAATTTGAAAAACTGAGCGACTTTTTGCAACTTTCGCCGGAACAATTTGAGCGGATGTTACCCGATTTAAAGACGTGGTTTTATACAACAAAATCGGTATTTAGTGACATAGCGATTTTAAATGACTTGATAAAACGTCAAGGCGTTGAGGGTGAGGTTAAAGTGCAATCGCCCGGTATGACTTGGATTGATGACGGCAAAAATGAGCTGTTGGGTTATAACATTAAAGTTAGAAAAGGTCACTAATATGCAAAACGAGAAAACGCTTAGAAAAATCAAAAAGCTATTGGCGTTGAGTAAGTCCTCAAACCCGCACGAAGCGGCGAAAGCGTTAGAGATGGCGCAAAAATTAATGCAGGAAAATCGCATTAATCAAGTGGAAATTGAGTTTAGTCAGTATCACGGCAAACAGAAAACCGCGAAGAAATCGGCGCGTTATGTGCATCAGTTGGTTGGTGTAATTACACGGGCTTTTGGTGTAGATGCTTACATGTCTAATTTTTATCCGGACAAAGACGAGGCGGAAGAAAAAATGCACGTTGTGTTTTATGGCGCGGAGGAACGCCCTGAAATTGCCTCTTACTGTTTTGACGTGTTATATCGCCAGTTACAAACCGCCCGCAAGGAGTTTTTAGCGACACAAAGCAAGCGATTAAAACGCTCAACGCTAATTTCCCGTGGGGATGAATTTTGCCAAGGTTGGGTGTTTGGCGTCCATGAAAACGTTAAAGAGTTTGCAATGACACCGGAAGAAAAAGGCAAGTTGGAGCGATACCGATATAACGGTTTTAAAGACCTACAGACCGCGAAAGTGCGCGATGCAGGCGAAACAAGAGACTACGGATTGGCATTAAGTCAAGGCTATAAACAAGGGTCGAAAGTTACGTTAAATCATGGGGTGAATGGGAAAGAAACGACTAAATTGGGGGGTGATGAGATGAAAGAGAATAATGGTTGGATTGCATGTAATTTAGGGAGTGCGTAATGAAAGAACTCACAAAAGAAGATTTAAAAGTCGGTCACGTTTACTCGGCGAAACGCAAAACCACATCGGGATTTTTTAGATTGATTAACGACCGCCAGATCCTACATATTGGGCGAGAGTTATTGGACGGTGCTTATGTGCAATATGACAGCCCGACAGTAAAAGATGGTCGCCATTATCCGAAAGTACCGATAGATAAATTTTTGAAGTGGGCAAAAGAAGACATCACAGACCAAATGCCGAAAGATTTAAGTTGGCGGACAGATAGAGGCTAAAACCCATTTACAGCCCATTAAGCAATATCAGTGGGCTGAATAATGTGTTTTAAACAGACTTTAAACGAGGTTTAAAAATGAAATGTAAATGCCCCGCTTGCGGTGCGATTAACTCGCTTGACGCGCTTGTGGCGAACGAGAAAGCGGGAGAGGCTATTGCCCTTGCGCTATCGTTTAACGGCGAGCTAGGCAAGGCGTTAATCAGTTATTTGGGGCTGTTTCGCCCCGAAAAATCCGCGCTGAGTTTTGACCGTGTGGCGGTGATTTTGGGCGAGTTGTTGCCTTGCGTGCAGGCAGGCGAAATCAAACGCGACGGCAAAACTTACCCTGCGCCCGTTGAGGCGTGGATTTATGCGATTAATAGCATGTTAGCAAGCCGACACAACTTAAAATTGCCGATGAAAAACCACGGCTATTTGTTTGAGATTATTAGCCGTTGGCAGGGTCAAAGTGCGGTTAAATCTACGGCTGTTTCGGCTCAAACCGCGCCAAAAAGTAACACAATGAGAGTGATTAAAGGGA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31 | Vibrio_phage(21.05%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
570357 : 592898
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015426|570357:592898|DBSCAN-SWA 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33 | Haemophilus_phage(36.0%) | head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
607502 : 622760
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015426|607502:622760|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015426|607502:622760|616216_616891_-|WP_010944547.1|DBSCAN-SWA MNRSTRSHKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIQEFKRENVEVITFQYGQRHSIELEKAAWIAQNLGIKQTVIDTSVIKAITTNALITEATIKQDGDKPNTFVDGRNALFLLYTAIYAKGQGIQTIFTGVCETDFSGYPDCRDIFIKSMNVTLNLAMDYNFNIRTPLMYLTKKQTWALADQLGAFEYVREHTHTCYLGVEGGCHTCPSCLLREKGLNEYLAEKSGEKNV >NZ_CP015426|607502:622760|618268_618556_+|WP_010944551.1|DBSCAN-SWA MIMLVIYAVLINAVCFYLMYWDKRQAVKKMQRIAESNLLFLTAMGGFIGVFLAIKYLRHKSKKWYFHFTVSLAGLFWLLVLPILYYVLIFNHKNF >NZ_CP015426|607502:622760|613603_615103_+|WP_010944544.1|DBSCAN-SWA 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11 | Streptomyces_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
691829 : 702411
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015426|691829:702411|DBSCAN-SWA ATTAATTTGCCATTTTGATAAATAATTCTTCGAGACGATTAGATTTATTGCGCATACTTTGTACTTCAATACCTTGTTGAGCAAGTTGTTGAAACAGTTTGGTTAAACCTTGTGTTCGTTTCACTTCAACTTCAATCGTATTGTCATCTAACCATTTAAAGGTATAATCATTAATAGTAAGCGATTGATTTTTATCTGTTTTTTGTAAATCTAATACAAACGTTTCACTTTCTAATTTTGCTAATAATGCTTTGATTGAGGTGTTTTCAATAAGTAAACCGTTTTGAATAATACCTATATTGCGACAGAGTGTTTCAGCTTCTTCCAAATAGTGTGTCGTCAGAATGATGGTGGTTCCTTGTTGATTAATTTCACGCAAGAAATCCCATAATGAGCGACGTAATTCGATATCTACGCCAGTAGTCGGTTCATCTAAAATTAATAATTTTGGATTATGCATCAATGCTCTAGCAATCATCAGACGCCGTTTCATGCCACCAGACAATTCACGAGTAAGGTGATAACGTTTTTCCCATAATTCTAGTTTTTTAAGCCAAGTTTCTGCACGTATTAAAGCTTGTTGATAAGGAATACCATAGTAGCCCGCTTGTTGCGTTAATACATTAATCACTTTCTCAAATTGATTAAAATTAAATTCTTGTGGAACTAAGCCAATTTGTTGTTTTAGCTGAATTTTCTGTGTGTCTAAGTCATAGCCAAATGCTTTGACTGTACCACTTGTTTTATTCACTAATGAGCTAATAATGCCAATAGTGGTTGATTTACCTGCACCATTATGGCCTAGTAACGCATAAAAATCGCCTTGCTTAACGACGAGATCGATTCCTTTTACCGCTTGTACCCCGGTTGGATAGGTTTTAACAAGTTGATGTATTTCAAGAGCATTCATTTGATTATCCATTATATGTTGGCGACAGCACGAATAGTTGATTCATCAATTTCAGCTGCAAAGGTATCACGTAATAGCATTAATTTTTCATCATTATTCAATGCTTGCTTAGCCGCTAAAGTTAATTTCTCAAAAATCATCCGGCGAATTTCTAGTGGCGTTTTGTGTTCGGCACTTTCGCCTATCACTAATTTATAAGTGAATCCTTTGTCTGCTAACGCGAGTGTTAAACTTTTTCGTGATTCTTCATTGTCTAAGTGTGACATTGACGGTTTTAAAACTAAATCTAATTGTTGGGCTGTTGTTTGTGCAAGATAGCTATTAAGTGCTATTTGACGTGAAAAGCTACTGAGATTAAGGGTATTAATAATCTGACACCATTGATCTTGTTCGCAAGCAAGTTCAATGGTTTTGGCAACTAATTCAGGCGTTTTATCTTGTAAAATAGCCTGTTTAATTTCAGCAGGTTTAGTGCTTTTGTTCTCAATCGCTAACTCTGGATCTAGCCAAGTCCAACAATAATCTTCTTCGGTTGATTGACTGTCGACTTCCGGCTCAGAGGGTTGACTCGTCACTTTAGCGGTAGAATGAGCTAAATTCATCAAACGTTCTTGTAAATCTAACGATTGATGTTGTGTGTTGGTCGTTATCTCTGTTGGCGAACTTGTTGAATTAACCGTTATAGATTTACGCTTTTTTTTTTCGTGTTGATTTAATTCAACGTGCTTTTGTTGTAATTGTTTCCGCGCTTGCATTGCAACAAGTGCGGGTGAGATTAGCGTATTATTTGTGCTATCTGTAATATTAGCCGGCACAGTTTGTTGCGCAGACTTTATTGATCGTTTGCTTGAAGATTCGACCGCTTGTGCACTTGTTTTATCTGTTGTTACTTGTGTTAAATTTGCTTTGAGCTGTTCAAGCTTATGTTGGGTATTGTCAACCATTGCCGACTGTTCGTTATTTGCTTGATTTAGTTGCGCACGTTGGTTAATTTCTTCAGTACGTTTAGGATGAAATGCTAAGGCACGTAAAAATACCATTTCTACACCAATACTTTGTTCTGGTGCATAAGCTAATTCTTTTTTGCCGATGAGCATTAACTGATAAAAAAATTGCACATCTTCAGGTGGTATCTGTTTTGCGAGCAAATGTAATGGCGTGTCTGATGGTGTTTCTTGTTTAAGCAATTGCAACATTGCAATTTGGTGTAAGGTTTCTGCCACATCATTTAGCAATTGTTGCCAGTCAATGCCTTTTGTTGCAATGTTTTGGATAATAGCCATAACTTGATCGCCATTTGCTTGGGCTAGAGCCATCACTAATTCAAGCGGTTGATCATCATCGATTAAGCCTAACATTTCGCTAACTATCGGTAATGTAATATTGGCATTACTTACGGCAATCGCTTGGTCTGTCAAACTTAATGAATCTCGAATACTACCTTGAGCTGCTTTTGCTAGTTTTTCAATGGCGGCTAATTCATAAGGAATGTTTTCTTGCGTGAGAATAAACTCAAGATGCTGGCTAAGTTGCGTTGGTGTTAAAGCTCTTAAATGAAATTGCATACAACGCGATAAAATAGTCACCGGTAATTTTTGAGGATCGGTGGTCGCAAGCAAAAATTTTACATATTCGGGCGGTTCTTCAAGTGTTTTGAGTAAAGCATTAAAACTATGCCGTGAGAGCATATGTACTTCATCAATCAGATAAACTTTAAAGCGCCCAACTGTAGGCTTATATTGGACATTATCTAATAATTCTCGTGTATCTTCTACTTTCGTTCGAGAAGCCGCATCGATCTCAATTAAATCAATGAATCTACCTTCTTCAATTGCTTTGCAATTTTCACATTTGCCACAAGGTGTGGCGGTAATGCTTGTTTCACAATTGAGTCCTTTAGCAAACAAGCGGGCGATTGATGTTTTACCAACGCCTCGTGTACCAGAAAAAAGGTAAGCATGATGTAATTTATCTTGACGTAGACCGTTTTCTAATGCGGATAATACGTGTTGTTGCCCAATTACTTCTGAAAATCGTTGTGGACGCCATTTACGTGCTAAAACTTGGTAGCTCATGGATTTTTATCGTTTATTAAGAGAGGATTAATGGCCGTCAAATTCCACTAGTGTGAATGATTTGATGCCGATTTGTTCAAGTCGTGCTTTACCGCCTAAATCGGGTAACCCAATAACAAAAGCCGCATTTTTAACTTGACCGCCTAATTGGCGAATTAATTTGGCGGTCGCATCAATAGTGCCACCAGTAGCTAATAGATCATCTACCACTAATACGTTGTCATCTTGATTGATAGAATCTAGGTGCATTTCAAGTGTATCTTCACCATATTCAAGGGCATAGGATTGCGAAATAACGGCTCTTGGTAATTTATGAGGTTTACGCACTAATACAAAGGGTAGCCCTAATGCTAGGGCTACAGGCGCTCCAAAGATAAAACCACGAGATTCTGTGCCGACGACTTTAGTGATGCCTTTATTTTTGAATTCTGCGACGATTGCATCTATAGATGCTTTAAATGCGGTAGGATTTTCTAGTAAAGAAGTAATATCACGGAAAATGATGCCAACTTTGGGGTAATTAGGAATAGATTTGATAGATGATTTAATTAAATCTAGCTGATTCATTTTTGACCTTCTAAAAAGAATAAGATAATGGGTAAAATTTAACAAAAATCACTGAAATTACAAGAAAAATTTGGCATAAATAACGGTTAGGCGTTTATAAAGCGACTATCTTTTTAGCGAACAATAATATGAAAAAGACCGCTTGTACAGATAAGCGGTCTAATTTAGCCTAATATTGGCAATTTATGGCGCTTTTTATGGGTATTTAACTAGCTTGCAAATAATGTACAATGCCACCAAATACTTTCTCTAAATTTTGATGATTAAATGTTGTTGCCGTTGGGCCCGAAGCAAGCAATGTACGATTAATCATTAATACTTGATCGCAAAAACTAGATACACTGTTGAGATTATGAGTAGAAACCAATACTAAATGCCCTTCACTCCGCAATTGTTGAAGTAAAGCTACAATGGCATTTTCTGTTTTGACATCAACACCAGTAAATGGTTCATCTAATAAAATAATCTGGCTTTCTTGCGCTAAGGCTCGGGCCAGAAATACCCGCTTTTTCTGTCCGCCTGAGAGTTCACCAATTTGCCGATGTTGCAAATGGCTAATATCAACACGTTGCATAGCTTGTTCAACTTTCTGTTTATCTAGTGCAGATGGATTGCGTAAAAAATTCATATAACCATAACGGCCCATCATCACAACGTCATAAACAGATACGGGGAATTGCCAATCCACTTCTTCACTTTGAGGCACATAAGAAACAAGGTTTTGTTTAAGTGCTTTTTGAATGGGCATTTGGTTCAGTAATACTTGACCGGTTAACGGCTTAACTAATCCCATCAAGCTTTTAAAAAGCGTTGATTTACCACCGCCATTTACGCCAATTAATGCACAAACAGTGCCATGCTGAAGCTGGAAAGAGACATTTTCTAAGGCTAAATGTCCGTTGTTGTAACGGACGGTTAATTTATCAACAGAAATGGATGCTGTAGCTTGTGTTATATTGTTCATTTAGGCTCTTTTTTGCTCGCTTCAAAACCATCTACTATAGTAGAAATTGTCACTTTTAATAAATCTAAATAAGTGGGTACAGGTCCTTCTTTGGTGGAGAGTGAATCAACGTATAATACCCCGCCATATAACGCGCCTGTTTCTTTAGCAACTTGTTTTGCAGGCTTATCTGATACAGTGCTCTCGCTAAATACGACTGGAATATGATTAGCTTTAACTCCATCAATTACTTTTCTCACTTGTTGTGGTGAACCTTGTTCTTCAGCATTAATGGGCCATAAATATAATTCTTGTAAGCCATAATCTTGTGCAAGGTAGCTAAATGCCCCTTCACTGGTTACTAACCAACGTTGTTTTTCAGGAATAACGGATAAGCGTTGGCGAAGTGGCTCAGAGATTGCTTTTATTTTTTCGGCATAGGCTTTTGCATTTTGATTATAGCTAACCGCATTTTCGGGATCGTATTTGACCAAGGCAGCTCGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015426|691829:702411|699202_701041_+|WP_064083124.1|DBSCAN-SWA MSQFNAKAFLADVPHLPGVYRMYDANQAIIYVGKAKDLKKRLASYFRSQVASKKIEALVGNIHHIDTTITHSETEALLLEHNYIKQHQPKYNVLLRDDKSYPYLLLTKHQHPRLTAFRGSKKVAGEYFGPYPNVSAVRESLNLLQKIFPIRQCEDNYYKNRSRPCLQHQIGRCLAPCVTGYCSQQEYDNQVKWVRLFLQGKDSQVIDYLMQKMEIAASELDFETAARFRDQIQSVRAVQEKQFVANQRLDDLDIISIAYQSGLACVHILFIRQGKVLGNRAYFPKVPSHTDLTELADTFIGQFYLQLNQHRSIPNQIILDQPLTESNALAQLLTEQAGHKVTIITNHVRGDKSRYLALAQTNARAALSLQLKQSTTIHKRYDALKILLKLPTIKRMECFDISHTMGSQTVASCVVFDENGPLKSDYRRFNIEGITGGDDYAGMEQALVKRYDKPLPIEKIPDIIFIDGGKGQLNRALQVFEKLTVAWDKHKPLLIGVAKGAERKAGLETLIIGRLKKEIHLPIDSPALHLIQHIRDESHHHAISGHRKKRQKAFVESGLESIAGVGAKRRQALLKYLGGMQGVKSATLAEIESVPGISKTLAGVIFDTLHNS >NZ_CP015426|691829:702411|698564_699116_+|WP_041603561.1|DBSCAN-SWA MKLNFPTYLTLFRVVLIPLFIAAFYLPEGWYAPEISTLIFFIASITDAFDGYLARKWNQTTRLGAFLDPVADKILVTVAFVCIVEYYHSWWITIPVSIMIAREILISALREWMAEIGERASVAVSIWGKVKTACQMLALGGMLWRQSTFMEILAFILLYISAILTIWSMLQYLKASKKSLMKS >NZ_CP015426|691829:702411|701118_702411_+|WP_010945590.1|DBSCAN-SWA MQNLRYPIDSKPPFGLSVLLAVQHLLAALGGIIAVPLVIGNVLKLPTSDTIVLVNAALLVSGIVTIIQCRGIGPIGLRLPSVMGTSFTFVAAALAIGFSEYGVAGIMGSSLIGSLVMIIGSFFMPYVRKLFPPVVTGIVVMMIGLSLIPVAVDWFAGGQKGDPHYADPANLAMATFVLVLVVILVQWGKGIFSAAAIVIGMLVGYAVALALGWINFEAIQNAEAFAIPQPLHFGLAFPISGIIGMSIAYLVTIVESSGNFLALGNATQTEITGKHLRGGVLCDGLGSAFAAVMSTTPFSSFAQNIGVISLTGVASRYVVTVMGVLLVLAGVFPWLGAIIVSIPSPVLGGAGLMMFAMIIAAGIQMLDKVERSKRNGLIIAISIGCGLAVTTRPELLDKLPNFFKEVFGSGITVGSVLALLLNLILPEDKH >NZ_CP015426|691829:702411|691829_692738_-|WP_041603563.1|DBSCAN-SWA MNALEIHQLVKTYPTGVQAVKGIDLVVKQGDFYALLGHNGAGKSTTIGIISSLVNKTSGTVKAFGYDLDTQKIQLKQQIGLVPQEFNFNQFEKVINVLTQQAGYYGIPYQQALIRAETWLKKLELWEKRYHLTRELSGGMKRRLMIARALMHNPKLLILDEPTTGVDIELRRSLWDFLREINQQGTTIILTTHYLEEAETLCRNIGIIQNGLLIENTSIKALLAKLESETFVLDLQKTDKNQSLTINDYTFKWLDDNTIEVEVKRTQGLTKLFQQLAQQGIEVQSMRNKSNRLEELFIKMAN >NZ_CP015426|691829:702411|694840_695380_-|WP_010945597.1|DBSCAN-SWA MNQLDLIKSSIKSIPNYPKVGIIFRDITSLLENPTAFKASIDAIVAEFKNKGITKVVGTESRGFIFGAPVALALGLPFVLVRKPHKLPRAVISQSYALEYGEDTLEMHLDSINQDDNVLVVDDLLATGGTIDATAKLIRQLGGQVKNAAFVIGLPDLGGKARLEQIGIKSFTLVEFDGH >NZ_CP015426|691829:702411|696340_697246_-|WP_010945595.1|DBSCAN-SWA MNLSFLKKTLIIACAMGTTVAIAAPFKVVTTFTVIQDIAQNVAGDKAIVESITKPGAEIHDYQPTPKDIVKAQKADLILQNGMNLERWFERFFENVKNTPAVVVTEGIQPIAILEGEYKNLPNPHAWMSSANALQYIENIRAALVKYDPENAVSYNQNAKAYAEKIKAISEPLRQRLSVIPEKQRWLVTSEGAFSYLAQDYGLQELYLWPINAEEQGSPQQVRKVIDGVKANHIPVVFSESTVSDKPAKQVAKETGALYGGVLYVDSLSTKEGPVPTYLDLLKVTISTIVDGFEASKKEPK >NZ_CP015426|691829:702411|697316_697652_-|WP_010945594.1|DBSCAN-SWA MHMIECNGKQYLTDPTGYLLNLNDWSTELAIAIASKEQINLTEEHWEIIWLVRDFYQEYKTSPAIRMLVKAMTLKFGEEKGNSRYLQRLFPEGPAKQATKIAGLPKPIKCL >NZ_CP015426|691829:702411|692749_694813_-|WP_064083123.1|DBSCAN-SWA MSYQVLARKWRPQRFSEVIGQQHVLSALENGLRQDKLHHAYLFSGTRGVGKTSIARLFAKGLNCETSITATPCGKCENCKAIEEGRFIDLIEIDAASRTKVEDTRELLDNVQYKPTVGRFKVYLIDEVHMLSRHSFNALLKTLEEPPEYVKFLLATTDPQKLPVTILSRCMQFHLRALTPTQLSQHLEFILTQENIPYELAAIEKLAKAAQGSIRDSLSLTDQAIAVSNANITLPIVSEMLGLIDDDQPLELVMALAQANGDQVMAIIQNIATKGIDWQQLLNDVAETLHQIAMLQLLKQETPSDTPLHLLAKQIPPEDVQFFYQLMLIGKKELAYAPEQSIGVEMVFLRALAFHPKRTEEINQRAQLNQANNEQSAMVDNTQHKLEQLKANLTQVTTDKTSAQAVESSSKRSIKSAQQTVPANITDSTNNTLISPALVAMQARKQLQQKHVELNQHEKKKRKSITVNSTSSPTEITTNTQHQSLDLQERLMNLAHSTAKVTSQPSEPEVDSQSTEEDYCWTWLDPELAIENKSTKPAEIKQAILQDKTPELVAKTIELACEQDQWCQIINTLNLSSFSRQIALNSYLAQTTAQQLDLVLKPSMSHLDNEESRKSLTLALADKGFTYKLVIGESAEHKTPLEIRRMIFEKLTLAAKQALNNDEKLMLLRDTFAAEIDESTIRAVANI >NZ_CP015426|691829:702411|695585_696344_-|WP_010945596.1|DBSCAN-SWA MNNITQATASISVDKLTVRYNNGHLALENVSFQLQHGTVCALIGVNGGGKSTLFKSLMGLVKPLTGQVLLNQMPIQKALKQNLVSYVPQSEEVDWQFPVSVYDVVMMGRYGYMNFLRNPSALDKQKVEQAMQRVDISHLQHRQIGELSGGQKKRVFLARALAQESQIILLDEPFTGVDVKTENAIVALLQQLRSEGHLVLVSTHNLNSVSSFCDQVLMINRTLLASGPTATTFNHQNLEKVFGGIVHYLQAS >NZ_CP015426|691829:702411|697713_698379_-|WP_010945593.1|DBSCAN-SWA MENRLIANTAHNQSLLSTHKVLRNTYLLLSMTLAFSAIVAYFAMAMNAPALPWWGLLIGFYGLLFLTNTNANSAIGLACVFALTGFLGYTLGPILNRYVGAGLGDAVMLALASTALVFFSCSAYILTTKKDMSFLSGMMMALFIVLLVGVIANIFLAIPALSLAMSVLFALFSTGAILLTTSNIIHGGETNYIRATVDLYVSLYNLFLSLLQIFGVLSKDD |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1238342 : 1244855
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015426|1238342:1244855|DBSCAN-SWA GATGCAAATTAACCTCTCCCAACAGCCTGCGCCATCAATATGGGGAGAAAAAGCTATCCTTTCTGCCCATCAAAATGGCTTTACCATTCATCTTCACGCTGATAGCCTAACCACTATTCAAAAAGCAGCACGTAAAATTAAAAATCAAAATATCCTCAACGTATCACTAGTTGGCGAAGGGTGGGGCTTGGAAGAGTGTTGGGCTTTTCAGCAAGGGTTTGTGAGTGTTCACCATCGTGGAAAAATACAGTATCCACCACTTGCTGAACAGCACGCTGAATTAGAAGCACGGTTAAGCTGTACTGATTTTGCGCGAAAAATTATCAACGAAGCATCAAATACATTAACCCCTGAACAACTCGCTAAACAAGCGACTGAATTTATTACACAACAAGCGATCAAATATAACCTTCACAACGTTGTTAAATTTGAAATAATACAAGGTCAGGCATTAGATACCGCAAATTATGCCGGCATTTGGGCGGTTGGCAAAGGTTCAGCTAATCCGCCCGCTTTACTTAAATTAGATTTTAATCCAACCGGTGATGAAAATGCGCCGGTATTAGCCTCTTTAGTTGGTAAAGGCATCACCTTTGATAGCGGAGGTTATAGCCTTAAACCCAGTGATTCAATGAGTACCATGCGTACCGATATGGGCGGAGCAGCATTAGTTACTGCCGCATTAGGCCTAGCAATTGCTCGCGGTTTAACCGCACGTGTTAAACTATATCTCTGTTGTGCTGAAAATATGGTGAGCAGTCGCGCGGTTAAGCTCGGTGATCTTATTCATTACCGCAATGGTATTTCAGTTGAAGTATTAAATACGGATGCAGAAGGTAGATTAGTATTGGCTGATGGCCTGATTGATGCAGCTGCTGACCAAGCACAATTTATTATTGACGCTGCCACCTTAACCGGCGCAGCCAAAGTGGCTGTTGGCAATGATTACCATACTGTGTTAGCAATGGATGTTCAATTAGTCAACCAGTTATTAACTGCTGCTGACGCGGAAAATGAACCTTTTTGGCGATTGCCTTTTGCTGAATTTCATAGAACACAAATTAGCTCTTGCTTTGCAGATATTGCTAACATTAGCTCTGTACCTGTCGCAGCAGGTGCTAGCACTGCTTGTGGCTTTTTATCGTATTTCGTGCCAAATTATCAGCAGAATTGGCTACACATTGACGCTTCCGCCACTTTCCACCGTTCTGCAAGCGATCTATGGGCGGTGGGAGCAACAGGATTAGGCATTAGAACCTTAGCTAATTTATTACTAAGCAAAGCAACTGCCAAAAACACGTAGAATTTGACCGCATCTACTTCAATAACGTAAGCGGTTACATAACGAGCTAATTAATGATAATTTCCCTTAGATGAGGTTTATTTAGGATATTATGAACTATCTGACGCAGGCAACGGAGACACTCAGTTTATATAGTCAGGCGATCGACCGATTGCAACACAATCTTGACCAACATTTCAATCAAGCAGTCGAAATGATTTTAAACTGTGCAGGACGCGTAGTGGTGGCAGGAATTGGCAAATCTGGATTAGTCGGTAAAAAAATGGTAGCAACTTTTGCCTCAACCGGCACACCAAGTTTTTATTTACACCCAACTGAAGCCTTTCACGGTGATTTAGGAATGTTAAAAGCTATTGATATTGTATTATTAATATCAAACAGTGGCGAAACTGATGATGTAATCAAATTACTGCCGAGCTTAAAAAATTTTGGTAACCAAATTATTGCAATGACGGGTAATCGCCATTCAACATTGGCACAACATGCTGATTTAGTATTGGATATTAGTGTTGAACGTGAGGCTTGCCCAAATAATCTTGCGCCCACGACGTCCACTTTAGTCACAATGGCATTAGGCGATGCTTTAGCAATTGCCTTGATAAAAGCACGTGATTTCAAAGCACACGATTTTGCCCGCTTTCATCCTGGTGGCAGCCTAGGGCGTAAATTACTGAATAGAGTAAAAGATGTAATGCAAACTAAATTGCCCATTACTTCACCCACTGCCGATTTTAGTACCATTTTAAGTGTAATGAATGAAGGCAGAATGGGATTAGCGCTGATTATGCAAGGCGAACAATTATGCGGTATCATTACTGATGGTGATATTAGACGTACACTTGCACAATTTGGAGCGACAAGTTTAAGCAAAACCGCTGAACAAATTATGACGAAAAAACCGAAAACTATTTTAGATTCTGTTTATTTAGCTAAAGCCGAAGAAATGATGAAAGCGCTACACATTCATTCATTAATTGCCGTAAATGACATTGGGCAAGTTTCTGGCATTCTTGAATTTTCAAACTAAGGATAAAATGGCAAAATCAAATTATATTACCCGTGCCGGCTGGCAAGCACTCGATCAAGAGCTGAAATATCTTTGGAAAGAAGAACGCCCAAAGGTAACACAATCAGTTTCAGAAGCAGCTGCATTAGGCGATCGCAGTGAAAATGCTGAATATATTTACGGTAAACGGCGGTTACGCGAAATTGATCGGCGGATTCGATTTCTTTCGAAGCGACTAGAAGCCTTACAAATCATTGATTATCATCCACAACAAGCTGGCAAAGTGTTCTTTGGTGCTTGGATAGAATTAGAAAACAATGAGGGCGAAATTAATCAATATCGAATTGTCGGTTGTGATGAATTTGACCCAACCAAAAATTGGATTTCGATTGATTCGCCCGTTGCACGTGCTTTAATCGGTAAATGCGTTGATGATGAAATTGAAGTACAAACGCCAACAGGCAAAGCTGTGTTTTATATCAATAAAATTTGGTATGACACAAAATCGCTTTATTAAGCCAACTGATTACTTCCCTTCACTTGGCTCTCAAATAGCGGTTATTTTTGGCCTAAATTTGCCAAAATAAACCGCTTCAGCTCACCATTATAGTGCTTTTAATACATTCACCATTTCGATTGCACCTAAAGCACATTCTGCGCCTTTATTGCCCGCTTTTGTGCCCGCACGCTCAATGGCTTGTTCAATACTTTCTGTGGTCAATACACCAAACATAATTGGCACACCCGTTTGTAACGCTACTGCACCAATGCCTTTTGCTACTTCATTACAAACATAATCATAATGCGTGGTTGAGCCACGTATCACCGTACCTAAGCAAATTACTGCATCATATTTACCGCTTTCTGCCATTTTTTTGGCAACAAGTGGAATTTCAAAAGCACCTGGCACCCAAACAGTGTCAATATCCGATTCTACCGCACCGTGGCGCACGAGTGTATCTACTGCACCACTTAATAATTTATCATTAATAAAATCATTAAAACGTGCCGTTACAATGCTGAATTTTAAACCTGTAGCGACTAAATTACCGGTAATTTTTGCCATGTTGATCTATCCTTATCAAATAAAAAATTGTGAGATCACAAGTATTAATACTTGTGGTTAAAATAAGATGGATTGTTTGTGTAAGAGCGCCATTTTGTCCAACACGACGCTATTGTTCAAAGTTAAACATATGCCCCATTTTGATCTGTTTTACTTTCAAGTAATCAATATCATTTTGGTTTGGTTCAACAATAATTGGCTCACGTGCGATAATATTTAAGCCTTGTTGTTTTAAGCCACTAATTTTGGCTGGATTATTGGTCAATAAGCGAGTGGATTTCACGCCTAAGGCTTGGAAAATCTGCGCACCAATATAGTATTCGCGTTCATCTTCCTTAAAACCTAGCGCAAGGTTTGCCTCAACCGTATCCATACCTTTATCTTGTAGTTCATAGGCACGTAATTTATTAATTAAACCAATACCGCGACCTTCTTGGCGTAAATATAATACAACGCCTCGCCCTTCTTTCTCAATTTGCGTCATTGCTGCAGCAAATTGTTGGCCACAATCACAACGTTGAGAACCAAAGGCATCGCCGGTTAAGCATTCTGAATGGATACGTGCTAATACGGCTTGACCATCACCAATCTCGCCTTTTACTAAAGCGATATGTTCTTTGCCTGAAATCACTTCAACAAAACTATGCGCCATAAATTCACCATATTTAGTCGGCATTTTCACAACTGAAACCAATTTAACCAAGCTGTCATATTTACGGCGATATTCTTGTAGCTGCGCAATGGTAATAAAAGGCATATTATGTTTAACGGCTAAGGCTTGCAATTGTGGCATAGTCATCATAGTGCCATCATCAGCCATGATTTCACAACATAAGCCTGCAGGCTTTAAGCCTGCTAAGCGCGCTAAATCGACTGTTGCTTCTGTATGGCCATTACGTACCAACACGCCCCCCTCTTTAGCAATCAGTGGGAACATATGCCCTGGGCGACGAAAATCAGCCGCTTGTGCATTTTGCTCAAGCATTTTTAATGCGGTCAGTGAGCGTTCAAAGGCTGAAATACCGGTGCCCGTATTAATATGATCAACGGATACAGTGAAAGCTGTTTCATGATTATCCGTATTATTTGTTACCATTGGATGAAAACTTAATTTATCCGCTAGCGCTTGTGAAATTGGCGTACAAATCAAACCTTTGCCATAAGTCGCCATAAAATTAATATTTTCTGGTGTAGCAAATTCTAAGGCACAAATGAAATCGCCTTCATTCTCACGGTTTTCATCATCAGAAACTAAAATAATTTTGCCCGCCGCAATTGCTGCTAAGGCTTCATCTACTGTTGAAAATTGAAACATTGTTTTCTCTTGTTAAACTTAAATACGCAACGCCACGTAATCATTGTGGAATAAATTAAAAACCTACTTTTTCTAAAAACTCAGCAGTAATTGCATTTTTAGATGGTGTATTTGTCCGCTTCATTACAAACCGTTCGATATATTTACCAACGATATCATTTTCTAAATTCACTATACTACCTATCGTTTTTGTGGCTAAATTAGTTTGATTAATCGTATGCGGAATAATTGACACGCGAAAACTCTCCTGATCAGTATCAACTACAGTTAAACTAATACCATCAATGGTAATTGAGCCTTTTTCTACAATATAACGCATTAATTTAGGGCTAGTTTTAACCCGATACCAAGTAGAGTGATTTGCGGGAGTAATTTGAATAATTTCACCGGTGCCATCAATATGGCCAGATACAATATGACCACCAAAACGGCCATTCATTGGCATTGCACGTTCTAGATTAACCGGGCTAGCTACGTGTAACTGTGCCAACGATGTACGGCGTAAAGTTTCCGCCATCACATCGGCTGTAAATTGTGTTGAGTTAAAAGAAGTGACGGTTAAACAGACACCATTCACGGCTATGCTATCGCCTAAATGTACATCTTTGAGTACCTTGCAAGCATTAATGGTCAGTACCGCAAAATCACCTGATTGCTTGATATTCGCAACTTTACCCACTTCTTCAATAATACCTGTAAACATAAATTCTCCTGCTGTCAGCTTGCTAATTTTTGCGATGATGAAACGTCATAATCTAACAAGATATCGTCGCCTATGTATTGTGTGGATTTAAGCGTTAAATTAACCGCTTCCGCTAGTTGCAAAATACCTGCACCACCGATAGGACTTTTGGCAGTGCTTCCGCCTAATAATTTAGGTGCAATATAACAATGAATTCTGTTAACAACGCCAGCTTTCAATGCACTAAAATTCAGTGTTGATCCCCCTTCAAGCAAGACACTGTCAATTTGCATTGCACCTAATTTGGCTAATAAATCAACTAAATCAACTTGTTTGTTGGCTACCTTACATTGGATAATTTGCACGCCAAAGGCTTTCAATTGCGCTATTTTTGTACTATCAGTTGAAGCGGTTGCAATAATGGTTGGATATTGGCGCGCTGTTTGAACTAATTGACACGCTAGAGGCGTTCGTAAGTGGCTATCGCACACAACGCGTATTGGTTGTTTAGCATTCGGCATTCGACTATTTAACATCGGATTATCCGCTAATACGGTGCCCACTCCAACCATAATGGCGCTATATTGATGACGTGTGATTTGCACATTTTGGCGTGCTAATTCACCGCTAATCCATTTGGATTCACCTGTAGCGGTAGCAATTTTACCATCTGCTGTCATTGCATATTTAAGCAACACATAAGGAGATGTAGTTTGCATATAATGAAAAAAAATGGGGTTGAGCTGATCGCAAGCTTCTCGCATAAAATCAGTGATCACTTCTATGCCCGCTGCTTGTAATTGTTTAATCCCCTTCCCCGTAACCAGTGGATTAGGATCACGAGAGCCCACAAACACTTTGTTAATTCCTCGTTCAATAAGCAAATCAGTACAAGGCGGTGTGCGCCCATGATGGCAACAAGGCTCAAGTGTAACGTAAGCAGTGGCCCCTGTGAGATCTTGCTGACAATTTAAAATAGCATTACGCTCTGCGTGCCATTCGCCTACCTTTTGGTGATAGCCTTCTGCGATGATTTGATCATTTTTAACGATCACACAGCCCACTAATGGATTAGGATTAGTCCAACCACGTGCTTGTTCTGCCAGTGCTATCGCACGAGCCATATAGTCAACATCTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015426|1238342:1244855|1241254_1241716_-|WP_010945068.1|DBSCAN-SWA MAKITGNLVATGLKFSIVTARFNDFINDKLLSGAVDTLVRHGAVESDIDTVWVPGAFEIPLVAKKMAESGKYDAVICLGTVIRGSTTHYDYVCNEVAKGIGAVALQTGVPIMFGVLTTESIEQAIERAGTKAGNKGAECALGAIEMVNVLKAL >NZ_CP015426|1238342:1244855|1240678_1241167_+|WP_010945070.1|DBSCAN-SWA MAKSNYITRAGWQALDQELKYLWKEERPKVTQSVSEAAALGDRSENAEYIYGKRRLREIDRRIRFLSKRLEALQIIDYHPQQAGKVFFGAWIELENNEGEINQYRIVGCDEFDPTKNWISIDSPVARALIGKCVDDEIEVQTPTGKAVFYINKIWYDTKSLY >NZ_CP015426|1238342:1244855|1241825_1243031_-|WP_010945067.1|DBSCAN-SWA MFQFSTVDEALAAIAAGKIILVSDDENRENEGDFICALEFATPENINFMATYGKGLICTPISQALADKLSFHPMVTNNTDNHETAFTVSVDHINTGTGISAFERSLTALKMLEQNAQAADFRRPGHMFPLIAKEGGVLVRNGHTEATVDLARLAGLKPAGLCCEIMADDGTMMTMPQLQALAVKHNMPFITIAQLQEYRRKYDSLVKLVSVVKMPTKYGEFMAHSFVEVISGKEHIALVKGEIGDGQAVLARIHSECLTGDAFGSQRCDCGQQFAAAMTQIEKEGRGVVLYLRQEGRGIGLINKLRAYELQDKGMDTVEANLALGFKEDEREYYIGAQIFQALGVKSTRLLTNNPAKISGLKQQGLNIIAREPIIVEPNQNDIDYLKVKQIKMGHMFNFEQ >NZ_CP015426|1238342:1244855|1243748_1244855_-|WP_010945065.1|DBSCAN-SWA MTDVDYMARAIALAEQARGWTNPNPLVGCVIVKNDQIIAEGYHQKVGEWHAERNAILNCQQDLTGATAYVTLEPCCHHGRTPPCTDLLIERGINKVFVGSRDPNPLVTGKGIKQLQAAGIEVITDFMREACDQLNPIFFHYMQTTSPYVLLKYAMTADGKIATATGESKWISGELARQNVQITRHQYSAIMVGVGTVLADNPMLNSRMPNAKQPIRVVCDSHLRTPLACQLVQTARQYPTIIATASTDSTKIAQLKAFGVQIIQCKVANKQVDLVDLLAKLGAMQIDSVLLEGGSTLNFSALKAGVVNRIHCYIAPKLLGGSTAKSPIGGAGILQLAEAVNLTLKSTQYIGDDILLDYDVSSSQKLAS >NZ_CP015426|1238342:1244855|1238342_1239644_+|WP_041603676.1|DBSCAN-SWA MQINLSQQPAPSIWGEKAILSAHQNGFTIHLHADSLTTIQKAARKIKNQNILNVSLVGEGWGLEECWAFQQGFVSVHHRGKIQYPPLAEQHAELEARLSCTDFARKIINEASNTLTPEQLAKQATEFITQQAIKYNLHNVVKFEIIQGQALDTANYAGIWAVGKGSANPPALLKLDFNPTGDENAPVLASLVGKGITFDSGGYSLKPSDSMSTMRTDMGGAALVTAALGLAIARGLTARVKLYLCCAENMVSSRAVKLGDLIHYRNGISVEVLNTDAEGRLVLADGLIDAAADQAQFIIDAATLTGAAKVAVGNDYHTVLAMDVQLVNQLLTAADAENEPFWRLPFAEFHRTQISSCFADIANISSVPVAAGASTACGFLSYFVPNYQQNWLHIDASATFHRSASDLWAVGATGLGIRTLANLLLSKATAKNT >NZ_CP015426|1238342:1244855|1243086_1243734_-|WP_010945066.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEVGKVANIKQSGDFAVLTINACKVLKDVHLGDSIAVNGVCLTVTSFNSTQFTADVMAETLRRTSLAQLHVASPVNLERAMPMNGRFGGHIVSGHIDGTGEIIQITPANHSTWYRVKTSPKLMRYIVEKGSITIDGISLTVVDTDQESFRVSIIPHTINQTNLATKTIGSIVNLENDIVGKYIERFVMKRTNTPSKNAITAEFLEKVGF >NZ_CP015426|1238342:1244855|1239735_1240671_+|WP_010945071.1|DBSCAN-SWA MNYLTQATETLSLYSQAIDRLQHNLDQHFNQAVEMILNCAGRVVVAGIGKSGLVGKKMVATFASTGTPSFYLHPTEAFHGDLGMLKAIDIVLLISNSGETDDVIKLLPSLKNFGNQIIAMTGNRHSTLAQHADLVLDISVEREACPNNLAPTTSTLVTMALGDALAIALIKARDFKAHDFARFHPGGSLGRKLLNRVKDVMQTKLPITSPTADFSTILSVMNEGRMGLALIMQGEQLCGIITDGDIRRTLAQFGATSLSKTAEQIMTKKPKTILDSVYLAKAEEMMKALHIHSLIAVNDIGQVSGILEFSN |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1317803 : 1332847
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015426|1317803:1332847|DBSCAN-SWA 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15 | uncultured_Mediterranean_phage(12.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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