Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015431 | [Haemophilus] ducreyi strain GHA3, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,csa3 | 0 | 0 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015431_1 | 766034-766245 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015431_1
|
3 spacers
spacers of NZ_CP015431_1
>1.1|766057|40|NZ_CP015431|CRISPRCasFinder CACCTTAAAGAACAAATCCAAATTTACAGCGGGCAACATG >1.2|766120|40|NZ_CP015431|CRISPRCasFinder TACGTTAAATAATGATTCAGAGCTTGCAGCCAATAATTTA >1.3|766183|40|NZ_CP015431|CRISPRCasFinder AACTTTAAATGATGCTTCTAAACTCTCTGCGAATAAGTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015431_1
The CRISPR arrays of NZ_CP015431_1 >merge|NZ_CP015431|1|766034-766245|CRISPRCasFinder ACATTAAACACTTCTAACAATATCACCTTAAAGAACAAATCCAAATTTACAGCGGGCAACATGACCTTAAACGTGACTAATAATGTTACGTTAAATAATGATTCAGAGCTTGCAGCCAATAATTTAACCTTAAACGTGACTAAGAATGTAACTTTAAATGATGCTTCTAAACTCTCTGCGAATAAGTTGGACTTGAATGTTACCGATAATGT >NZ_CP015431|1|1|766034-766245|CRISPRCasFinder ACATTAAACACTTCTAACAATAT CACCTTAAAGAACAAATCCAAATTTACAGCGGGCAACATG ACCTTAAACGTGACTAATAATGT TACGTTAAATAATGATTCAGAGCTTGCAGCCAATAATTTA ACCTTAAACGTGACTAAGAATGT AACTTTAAATGATGCTTCTAAACTCTCTGCGAATAAGTTG GACTTGAATGTTACCGATAATGT
>NZ_CP015431.1|WP_155727101.1|764268_764406_+|hypothetical-protein MTKDLIKQARESVPLNQQLHHLKNKEAYENTDQQLSYQVNGSISF >NZ_CP015431.1|WP_010945346.1|762242_763904_+|phospho-sugar-mutase MTTIFTIAQHWLAQDPDLETQNELSHLIDNAKAGGKQALKELTARFGGRLQFGTAGLRGPLQAGPMGMNRVLVAQAAAGLALYLKTYDKQPSIVIGYDGRKNSDVFARDTAEIMAGVGIKAYLLPRKLPTPVLAYAIKHLDTTAGVMVTASHNPPEDNGYKVYLGKANGGGQIVSPADQQIAAFIDQVATGNIRELARSQDFNLLDDEVINAYIEKTARLSQENKMALNYVYTAMHGVGYEVLQKTLKQAGLSQPKLVSEQIEPDGNFPTVSFPNPEEKGALDLAIKLAQQENAEFIIANDPDADRLAVAIPDAQGIWKSLHGNVLGCLLGWHLAKKYHAQGQQGVLACSLVSSPALAEIAKKYGLKSEETLTGFKYIGKVDNLLFGFEEAIGYLVDPDKVRDKDGISAAVAFLDLVLYLKKQGKTILDYINEFNQQFGAYISGQISIRVSDLAEISKLMTALRNNPPTKIGGVKVTQLIDHTKTDRQSDILVFNLANGSRLITRPSGTEPKIKFYLDVKGNNGQQEAERALAHFDESVRQMLRQTQYGNQDC >NZ_CP015431.1|WP_041603527.1|759956_761321_+|bifunctional-UDP-N-acetylglucosamine-diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate-N-acetyltransferase-GlmU MTPFSVVILAAGKGTRMYSDLPKVLHPIAGKSMVKHVIDTVKQMDAKQIHLVYGHGGDLLKTHLKTEPLNWVLQAEQLGTGHAMQQAATFFADDENILMLYGDTPLITAQTLTRLIAAKPANGIALLTVELADPTGYGRIIRQNGSVVAIVEQKDASPTQLTICEVNTGVMVASGASFKKWLSRLNNQNAQGEYYITDIIAMANQEGYSVQAVQANTLMEVEGANNHLQLAALERFYQQTQAEKLLLSGVSLMDPHRFDLRGSLQYGKDIQIDVNVILEGEVKLGNRVRIGAGCILKNCVVGDDVDIKPYSVFENAIIGNKAQVGPFARLRPGAKLEAESHVGNFVEIKNAHIGKGSKVNHLAYVGDAEVGENCNLGAGVITCNYDGANKFKTTIGNNVFVGSDVQLIAPVNIADGATIGAGATITKNIAENELVISRVPQRHIQGWQRPTKKK >NZ_CP015431.1|WP_064088466.1|756722_759833_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MFTDIFIKRPVLAISISIVFIILGLQAMFKLQVREYPEMTNTIITVTTNYAGADAETMQAFITSKLEESIAQADNIDYIKSDSAPSTSNITIKMKLNTNPGIAVADITSKVNAVRSQLPSNIDDPSIRSSTGAMEAIVFIRFSSKELSAPQLTDYIERVVKPQMFTVNGVSKINYFGGASFGLRIWLDPAKIAGLGLSANEVTAALAANNVQTAAGNSNGYYTEYRNKVETTTKSVEELASLVIKTLPNGSNIKLGDIAEISLEKARDDSRGIVNGREAVVLAVEAASTANALDVAKHIYPKFAEIQSNLPASVEAEVIYDKTIAINSSIKEVVKTILEAVIIALVVIVLFLGSFRAMIIPIVTIPISLIGVLMVLQGFGFTINLLTLLGLILAIGLVVDDAIVVLENVERHIKQNGETPFRAAIIGTREIATPVIAMTITLMAVYSPMALMSGITGSLFKEFSLTLAGAVFISGVAALTLSPMMTSKILKQSEKPSWLEQRIEKTLHKVTDIYTKILLVVMASRYAILVFAGLIFASLPMLFNSLSSEVAPAEDRGIVMGMASGPANVNMDYMQDVMFPVAQQINQLPEVNATQIMPGFPSSNGLFMLVPLKDWSERTRSQKEVLAEVNKITNEVTEASVIGFEFPEISTGESGLPFSFVITTANDYRDLAQVASDFLLAAQSSGQFFFNQLDLKFDTASMAIKIDREKMGTYGVTAADIRSVLGSFLSGATLARVDIDGRAYDIISQVKRSERLSPQDLAKYYVKLKDGSSVPLSTFVSMELKTQPRTLPKLNQLNSATITGVLAGSMGNAVKWAEAKAAEILPAGYYYDFMSESRQYKQEGNALALTFLLAIVMIYLVLAVQFESWRDPMVILVSVPLAISGALVVLNILALPMIGKAGATLNIYSQVGLITLVGLITKHGILMCEVAKEEQLHHGKNKFDAITYAAQIRLRPILMTTAAMIAGLIPLLYATGAGAVMRFSIGIVIVAGLAIGTLFTLFVLPVIYTFLGENHKPLQEFEENKHYPVIAETEHS >NZ_CP015431.1|WP_041603529.1|755467_756709_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MTTETKKPSFFTKVTLWIILALVLLIFAAVIGFNQFIAKSKANAAANPFPPFATVTATTVNATEWTPVIKAVGTIRPNNGAMLSAQAAGSVTAIHIKSGERVTRGQLLIELDSSVEQATLHASESQLPNAKATLSRYRSLVASKSASKAELDKAQATYNQLVANIESLKAAIKRRQIYAPFDGIVGIVKVNLGEYITAATEIVRVEDSSQMKVSFNVPQTNLADITIGQRVAFSVDAIPNQTFEAKVSAIDSAVTKSTGLVAVEAVVDGRGQLMSGMFARLNIALATEMDQVVVPQIAVTYTMYGESAYVLDKLSEQEKEQLLKVLASQTSSPVSGKKAQKLIENIDGVFKARQVEVKTNDRQGIYAQLKNESIKVGTTLVTSGFQRLRNGAYVTIADKQPVGISKPAIETNL >NZ_CP015431.1|WP_010945350.1|754606_754828_-|DUF1414-domain-containing-protein MAKQSKYQSKQFEQLSYDLITILEKHKAPVDLSIMALGNLVSNILLENIQTETQRMVLADTFSTALKNSLKAR >NZ_CP015431.1|WP_010945351.1|752873_754604_-|DUF3413-domain-containing-protein MFKPLRQLLPTYSRQYKEEISQRITWGHWFTLFNVVLALCISTRYAFNADWPNTLSGKLYFFTSLFGHFSFIVFAAYLLLLFPLSFIIKNERTFRGLSVIIATIGQTVLLVDTEVFKQFYLHLSPLVWDLLVTPDDNSELSHQWQLLFVPMPIILLAQMLYSRWCWQKLRSFSRQKWGKFVALFFVACFTATHLIYAWADMRLYRPITSQKANYPLSHPMTARNFLAKHGVINRTKLQLNIAENGRLDSFYLNYPKQHLTFNRKPYTNVLIVNMSGLANEMIVAEKMPHLTQISEKTYRFMNHYGSGDSNAANLLGIFYSLSGQYLDSMLANKQTSPLLTAFKQANYQFGLFSHNSFAAPIYQQSIFAGFSLPKIKGNAQAIEKWTAWLNQRLAKPFFSYLDLAMPRTHNSLAPLEHVDAQFNQIWYALQQHNLLMNTLVIITADQANPTTEMNFTKRHLQVPMMIYWQGENQKINVLSSHLDLLPTLLMQLFAVNNPINDYAQGVNLTSPNERIWALASNHKWTVAIMPNGEQYHLDKFGHFEKYNANGEKVQTKRPPLALFLQMIKQSNQFVEK >NZ_CP015431.1|WP_064088465.1|748221_752733_+|chromosome-partition-protein-MukB MMNTNELFDQTAVNSSQDKPLNPPFAVAQPANIARGKFRSLTLINWNGFFARTFDFDELVTTLSGGNGAGKSTTMAGFVTALIPDLTLLNFRNTTEAGSTSSSRDKGLYGKLKAGVCYAVLETVNSRAQRIITGVRLQQIAGRDKKVDIRPFSLQNVPMADSVISLFTEQVANKARVLSLNDLKEKFEETAVTFKPYHSITDYHSFMFDLGILPKRLRSSSDRNKFYKLIEASLYGGISSVITKSLRDYLLPENSGVRQAFQDMEAALRENRMTLEAIKVTQSDRDMFKHLITEATQYVSADYMRNANERRGNVVSALAQRRTWYDTKAKLLVEEQRLIEFSREVADINLTEQSLESEYNVANDHLNLVMNALRHQEKIIRYQDEVDALNEKLEQQQIALEEVSEQVEDAQAHTDEIDDRVDGLRSQIADYQQALDAQQTRALQYQQAITALQKAQQLCALPHLDLDNLKDYQTEFEAQAQDITDHVFELEQRLSISDMTKTQFEKAYQLVCKVSGEIDRSQAWSEATQLLATFPDQKMQAAQAVALRQKLADLEQRLHQQQKVQRLIAEFNQQAAKKLTDFTALENHFEQQQIKLEDLEAELANVIELRSVHRQQQEQLTQQYNQLAKTAPAWHTARSVLTRLEEQCAEQFENSQAIMHCMQEMLRKEREATLERDELARTEAALASQISQLSQADGAEDIRLNQLAERLGGVLLSELYDDVSLQDAPYFSALYGEARHAIVVRDLTSVKAQLEKLTDCPNDLYLIEGDPTAFDDTVFSAEELYDSVIVKVSNRQWRYSKFPEVPLFGRAAREKHLITLKTERDDIAEQHAESAFNVQKYQRLHQHLSQFVGTHLNIAFQPDPEMLMQEIALERQEIEGQLNQAVENEHYLRQQADHLKAELQMLNKILPLANTLADETVMERFEECREQLQSAEENELFVRQFGQYLTQLAPIATSLQTDPSKFEQLEHDYQQAKSTQRILQQKVFALSDVMQRRLHFNYSEENQCEGSALTEQLRTDLALAQQEREQARQRLRQAQAQFTQYNQVLISLRSAYDAKYQMLQELMQEIDDLGVRGDSAAEECARLRRDELQQQLSQQRARKGYLDKQLGIIEAEIDNLNRLLRKTERDYQTQRELVVQAKASWCLVQKLSRNSDVEKRLNRRELAYQSAEELRSISDKALGALRTAVADNEYLRDSLRASEDSRKPENKVAFFIAVYQHLRERIRQDIIRTDDPIDAIEQMEIELSRLINELTSREKKLAISAESVANILRKTIQREQNRILQLNQGLQNIAFGQVKGVRLVVNIRDTHSILLNALSDQHEQHKDLFESQKLSFSEALAMLYKRVNPHIELGQRMPQTIGEELLDYRNYLDLEVETLRSADGWMRAESSALSTGEAIGTGMSILLMVVQSWEEESRRMRAKDILPCRLLFLDEAARLDAMSINTLFELCERLDMQLLIAAPENISPEHGTTYKLVRKILANQEYVHVVGLKGFGQQMNKST >NZ_CP015431.1|WP_010945396.1|747505_748222_+|chromosome-partition-protein-MukE MTEYIQDAIPAKLAIAIANPIFPQLDSQLRAGRHISIEMLDEHAFLMDFQTELESFYRRYHVDLIRAPEGFFYLRPKASTLIARSAMSEMEMLVGKVLCYLYLSPERLAQQGIFSQDDVYEELLNLADENKLLKAVNPRSTGSDLDRAKLAEKVGGALRRLARIGIITRVGEQNSKKFIISEAVFRFGADVRAGDDPREVQLRLIRDGEATTPTLLTTEAIEFAEDGARDELEESEAE >NZ_CP015431.1|WP_010945397.1|746161_747493_+|chromosome-partition-protein-MukF MQNELAQTIPELISWTKEREFSLSLPSDRLAFLLVISIYNNEQTDGELLESDLIDLFRYVSNVFEQSEASLLQRANNAINDLVKQRFLNRFSSEFTEGLAIYRVTPLGVGVSDYYVRQREFSSLRLSIQLSIVADEIQRASVAAEQGGDERYWRNNVFAPLKFSVAEIFDSIDLSQRMMDENQHQIREQIAGLLSQNWHEAIINCQQLLDETSINLRELQDTLNAAGDKLQSQLLRIQSCLISRDDLAFVDQLIVNLQNKLDRIMSWGQQAIDLWIGYDKHVHKFIRTAIDMDKNRVFGQRLRQSIQNYFSSPWLLYTAKAEALLDLRDDEAMLNEMEAVGELPMALEYESLTDVQTQIVTAIQAELAHFRDTAQPINLGAVLREQLARYPQSRHFDVARIIVDQAVKLGMASQDHQAVYPVWQPIDDFSAAVQAHLIDQYDK >NZ_CP015431.1|WP_010945344.1|778501_780073_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MNNIHNHKILILDFGSQYTQLIARRIREIGVYCELWAWDVTEKQIREFNPTGIILSGGPESTTETNSPHAPEYVFKAGVPVLGICYGMQTMAMQLGGLTEASEQREFGYAAVELQHADQLFAKLNDDLTASQPKLDVWMSHGDKVTRLPAGFQTTAVTPTCPIAAMSDEKRRFYGVQFHPEVTHTKSGLALLTNFVENICGCARSWTPENIIEDAVAKIKQKVGNDQVILGLSGGVDSSVTALLLHRAIGKNLHCVFVDNGLLRLNEGDQVMEMFGDKFGLNIIRVNAEERFLEALKGIDEPEAKRKIIGKVFIDIFDDEAKKLTDVKWLAQGTIYPDVIESAASKTGKAHVIKSHHNVGGLPDYMKLGLVEPLRELFKDEVRKIGLTLGLPAEMLNRHPFPGPGLGVRVLGEIKKEYCDLLRNADAIFIEELYKSGWYYKVSQAFTVFLPVKSVGVMGDGRKYDWVVSLRAVETIDFMTAHWAHLPYELLGKISNRIINEVNGISRVVYDVSGKPPATIEWE >NZ_CP015431.1|WP_064088468.1|780222_781686_-|IMP-dehydrogenase MLRIKQEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLSTQLTKTIRLNIPMLSAAMDTVTETKLAISLAQEGGIGFIHKNMSIERQADRVRKVKKFESGIVSEPVTVSPELTLAELAQLVKKNGFAGYPVVDNENNLVGIITGRDTRFVQDLTQTVSKVMTHRDRLVTVKENAKREEILALMHEHRVEKVLMVDDAFKLKGMITVKDFQKAEQKPNACKDEFGRLRVGAAVGAGPGNEERIDALVKAGIDVLLIDSSHGHSEGVLQRVRETRAKYPDLPIVAGNVATAEGAIALADAGASAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIAEAAEALKDRDIPIIADGGIRYFGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGEIELYQGRVFKSYRGMGSLGAMSKGSSDRYFQSDNAADKLVPEGIEGRIPYKGYLKEIIHQQMGGLRSCMGLTGSATIEDLRTKAQFVRISGAGIKESHVHDVTITKEAPNYHMG >NZ_CP015431.1|WP_010945341.1|781955_782582_+|23S-rRNA-(uridine(2552)-2'-O)-methyltransferase-RlmE MGKKRSASSSRWLAEHFKDQFVQKAHKQKLRSRAYFKLDEIQQSDRLFRPGMTVVDLGAAPGGWSQYAVTQIGNQGRIIACDILDMNPIVGVDFLQGDFREVSVLNALLARVGDEMVDVVMSDMAPNFSGMPSVDIPRAMYLVELALDMCRQVLAPKGSFVVKVFQGEGFDDYLRDIRSMFTTVKVRKPEASRDRSREVYIVATGYKG >NZ_CP015431.1|WP_064083224.1|782623_784543_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MVKNIVLWVVVAIVLMTAFEGFNSNFNNSNTVSYSTFLNDIKSNQLKEVNFKRNDETISVIKNDGTEYKTVMPMNDQYLLSDLAKTNATITGQPQERRGVLFQIFISWFPMVMLIGFWLFYMRQMQGGGRGAMGFGKSKAKMLTPEQVKTRFSDVAGCDEAKEEVSEVVDFLTEPSKFQKLGGRIPKGILMVGPPGTGKTLLAKAIAGEAGVPFFTMAGSDFVEMFVGVGASRVRDLFDQAKKNAPCIIFIDEIDAVGRKRGGAGLSGGHDEREQTLNQMLVEMDGFEGSEGVIIIAATNRADVLDDALTRPGRFDRQVTVDLPNVKGREQILKVHMKKVPLASSVDPMIVARGTPGYSGAQLANLVNEAALFAARKNRTVVTMDDFDKARDKINMGPERRSNTMTEKELMNTAYHEAGHVIVGYLMPEHDPLNKVTIVPRGQALGFAQFLPEGDRVSETFTKLESQLSTLFAGRIAEGLIFGDDKITTGASSDIHRATQIARAMVTQWGFSKELGPLFYQNEDGMGAIKGVSEASQKLIDQEMRIIIDRNYARAKQTLEENIDILHAMKDALLKYETLDRKQIDDLMHRRPVGEPEGWNDDKEENSSNDSSDATSASNTIEEAKPNTDADVADNRVDA >NZ_CP015431.1|WP_064088469.1|784739_785957_+|tyrosine-transporter MKNKILGSALMIAGTTIGAGMLAMPLTSAGMGFGATLFLLISLWGLLAYTGLLFMEVYQAAPKRDVGVASLAEQYFGIVGRVLATATLLVLLYALLAAYITGGGSLLSGILPEIMDSQLTNKIAILLFTTLLGTFVVVGIKGVDGLTRVLFMGKIIAFLLVLAMMLPKAKIENLFAMPLDNLLVISVVPIFFTSFGFHVIMASINNYLEADIGKIRIAIYIGTAIPLIAYLLWQLATHGVLTQAEFVEILKSDPSLNGLVKATSQITGSTFLGEMLRLFSALALITSFLGVAMGIFECIGDLLKRINLPTNRLVLTLVTFIPPLLFALFYPNGFIAALGYAGLLFAFYGMLLPIGLAWRARKLHPNLPYRVSGGNSALLIALLMGIIIMIIPFLIQFGYLPQVMG >NZ_CP015431.1|WP_010945338.1|788638_789025_-|YhcB-family-protein MEQWTTEIWFSISIAFLIGTLCGVLVMRFFKGNIQQQIQLKSELASAEAKIEEQKQQLERHFEQSANLLENLAEDYKKLYTHFAQNSEQLLPESNQVEFFKRLKNHANGDEDNQPRDYSDGSSGLLKS >NZ_CP015431.1|WP_010945337.1|789332_789755_+|50S-ribosomal-protein-L13 MKTFVAETVKRDWYVVDAAGKTLGRLATELASRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVINAEKVVVTGKKETDKIYYWHTGYVGGIKDATFKEMISRRPEAVIEIAVKGMLPKGPLGRDMFRKLKVYAGNTHNHAAQQPQVLDI >NZ_CP015431.1|WP_010945336.1|789771_790167_+|30S-ribosomal-protein-S9 MTAANQNYGTGRRKSSSARVFIKPGSGNITINQRSLEVYFGRETSRMVVRQPLELVELLDKLDLYITVKGGGISGQAGAIRHGITRALMEYDETLRPALRAAGFVTRDARRVERKKVGLHKARRRPQYSKR >NZ_CP015431.1|WP_064088470.1|791054_791594_+|hypothetical-protein MRLLLIIFCCFLTACQMLKKTFVVPESIPFQGKSYFKVTDNMLEGMRHLLFLPAEGNQHPENWHNAIFIFLDQNKTSTMMQRMALRKKVFSNQQDTIAQIKIIENELYSAIIYPPTERFNDILLEVSRGRDSACGFAQIQVANKRAILTEKNANLTAYQAELNSLAQQLSTLAWQVACQ >NZ_CP015431.1|WP_010945334.1|791621_792545_+|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MEQQYAKLVKRAANVAIIVACSLILIKTFAWWKTGSISILASMTDSMVDLFASMTNILVLRFALQPADKTHTFGHGKAESLAAIAQSAFITGTAVFLLLQGIHNLNNPVLIEDSQLGVIVSIISIVFTAALVFYQKKVVSITQSPAIQADSLHYQTDLFMNAAILVAMLLNIYGFIYADAIFAIGIALYISINAFKMFWEAVQVLLDKALPEEDINQILTIVANQPQIIGIHDLLTRQAGAVRFIQLHLELEDHLSLLEAHTITDNLEQKILAAFPLSEVIIHQEPTSIVQQELVLGQVKNYVPSYR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
35102 : 54233
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015431|35102:54233|DBSCAN-SWA 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31 | Vibrio_phage(21.05%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
57723 : 66347
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015431|57723:66347|DBSCAN-SWA CATGGCATACAAAACCGGTACGGCTCGCAATGAGCGCGATTTGCTTGATATTTTAAACACGTTTTTAACCACCGACTCGGAGCTTGTCGCTAACGGGCAGGCGTGGACGGTGTTGTTAGACCGCACCTTGCCCGCGACGGCAACGCAAAAAGAAATCCGTCAAATCGCGTGGAAATCTACGGGCACGGGCATTGAGCAAGATATTTATATTTGTGCATCGTCAGCAAATCTTATTGCCGCCGACACATACAATCTTAACTTTTGGGGCGGTACATTTTTTAATCCAAGCTTTGTCACGCCAACCGCAATCCACGGCGGGCTGATTAATCCGTCGCCGGGTGTGGCATTGTTTGCGGATAGCCGCCCGATTGAGTATCACATCGTTGCGGACGGGCGTTGTTGCAAAATCGTCACCCGTATTTCGCAGGTTTGCTCTAGTGCGTATTTGGGCTTTATTTTGCCAACCGTGCCGCCGACAGAATATCCATACCCGCTTTGTATTGCGGGCAGCGCGCCATTGGTGTCCGATACTAATAGTGCAGTCTTTATCCGGTATTCGCAATCCAACGAGTATCATTCGTCGATAGTTAATCCGTCCTATGGTAATTGCTGGCTGATGACACCGGACCAGACTTGGCGAGATTTTTACGGGCAAAACTACAAAAATATCACGACAGATTCCTCCTCTCAGTTTTTGTATCCGATGGGCAATTTTTATCTTTATAGCGGCTATATGCAGCCGCAAATCATGACAAAAATGGGGGCATCTGCAGGCGGAAGCTATCCGTTATTACAAGTTGAGTTTTTTAGCACCGGCAAATCTAGCCAAGGCGGTAATCGATGGGGCGCAATGGACGGAGTGTATTGGATTCCCGGCTTGCAACGTGCGGCGGGCGATAACGTCACGATTGCCGATGGGCGGCGTGGCGTGGTGTTTAACGGCGGATTTAGAGTCGGCACCAAAGATTACTTTGTCATAGAGACGGGGGCGTAAGATGGCGTATCAAACAGGGACGGCAAAAACACTAAACGAGTTGCTGATTAAACTTGCCGAGTTTGCGCAAGCACAAGGCTGGGTGGTTGATAAAGCGGTGGATAACGAGCTTTATTTGCATAATAAAGATGGGTTTTGGGTGTTGTATTTAAACACAAACAATAATGTGTTTTTTACCTTGGCAAATACCGGATTTAACAATAATAAGAGCCGCACGGAGCAACCGGGCAGCTCACACGCTAACGCTTATGGAGAGGTTAATACTGCGACAACACAGTTACACAAAGGCAATTATGTGTCTTATGATTTTTTTTGCACCGCCCAATATTTACATGTTGTTGTGCAAATCGAAGCGGAGCGTTTCCGCCATTTTGGGATTGGCACGCTTGATAAAGAGGGAGACTACGTTGGCGGGCAATATGCTTACGGTACATATATCACAAACAATTACGCGTATTATCAAAATTCCGACCATGCCTACGGGTTTTCGCCGGGGGCGAATGGCAATCAGGCTGTGGTACGCGCAGACGGAATTGGCGGTGATACAAAGTCGCCGTGGTATTTTGCGCCTAACGCCGTCAATGACTATAACGATCTAAATAAACGCGATTATGGCAAATATATATTGACACTCGGGCGCGCATCTATGTCTACAAATGTTAGCACTTATCACCCGGACGCGATTCTTGTTAATTACTCCCAATCAAAATTCGGTCAAGTGCTTATCCCATGTCCACACAGCTTGATAGCGCACGGTATAGACGGTGTATTCCGCCGCTTGGGAATTTTGCCCGACCGTTACGAGTGTACGATGCGCGGCATTCAGCCGCGTCAAATCCTGACGATTACCGGCGAGCGTTGGATGATTATCCCGAGTGCACAGTATGACGCGCGCAATGTGGCATATATCGAGGAGGGTAAAAACAACTCCGGCGTGCAAGGCGTGGCGTATCGTATTGTTGAGTAACGCAAATGGCTGATATTACTGCATTTAAAGCAAGAAAAGGACAATCCGGCGCGCTTAAAGATACGGGTTATCTTGACGGGTTGACAACTTATCGCGGTGCGGATAAGCGCATTCTTGCGCCCCCACGCAAATTACTTGCGGGTGAGCTGACAAACGGCATACAAGCAGACTTAACACAGCCGACTCGTGCACATATCGTGCGTAACTATTATGTGGATTTATATAGTCGGATTTATGTTATCCCTCATATCGTCAATCTTGGTTCAATCTCAACGGAGCAGACTTTCAGTGTGCAAGTCTGGAATGCTAACAAAAGTGCGGTCAAATTGCTTTCCGTTTCCGTGGTTGGCGGTGAGGGGATTGAGTTAAACGGTCCGACATCAGGGACATTTAACGCACTCGCGCTTAAAAAGTGGACGATTAAAGTGGGTATGCAGGGCACGCCGGTGATTGATTGCGTCGTAACCTTTAATTTTTTAGGTAAAAATCCCATTACGCTACATATTACCGGCTCCCGCTCCACTGATTGGGCGTTTGCGCCGGATTGGGGCGATAACGTCACCGAAAATCTGGAGTTTTTGACCCGTGTACATCAATCGGTGACGGGCGCGGAGCAACGCATTGCGCGCCGCTTATCCCCGCGCCGCACCTTTGAGTTTAAAGTGGCGTTAAGTGCGGTGGCGCGTCAAGCTTTTGAAAGCGCGCTTTACGGCTACGGCTCGCGGGTGTGGTCGCTGCCGATTTACACCGACGCTACGCGGCTTGCCGAATCTGTGACCGCAGGCAAGGCGGAAATCCATTTAGACACCACAGGGCGGGATTTTAGCGTGCAAGGGCGCGCGCTGTTAGTTGCCGGTGCGCAAAAAGAAATGGTTGAGATTACCGCTATTGCACCGGATAAACTCACACTTAAACGCGCCATCGTCAGCAATTTTGACCGTGCTTTTACGCTTGTTTATCCGCTTCGCGCCGCGGTGCTGACGGATATGCCGATTGTGACGAGATTGAGCGACGGCGCGGCGACGGCACAAGTGCGGTTGCAAATTAGTGAGCATAACGGCTGGCAAGATGATATTGCGCATTTGCCGACCTACCGCAACCATCCTGTGCTTGAACCGACCTCGGAGTGGTCGGAAGACATCACCGCGCAATATATGCGATTAATCAAAAGGTTAGATAACGAGACGGGCTTGCCGTATTACTTAGACACCGCAAACAAGGCATTCCAACTCACCAATTACCGCTTTGTTTTGTCCGACCGCGATATGCAACGCAAGCTGCGTAATCTTTTTTACTACTTGCGCGGGCGTCAGCGTGCGATTTGGGTTGCAACGTCCGCGACTGACGTGACGCCTGTGGGTGATTTACTGGGCAAAACGTTAGACATCGCGTTTATTAATTACACCGCGGCATTGCAAAAACAAACGGGACGGCAAGACGTGCGAATTGAATGCACCGACGGGCGGATTTTTTATCGTCGCATTGTATCGGCAGCCGTAGTTGACAGTAACACCGAGCGCTTGGCATTAGATGGCGAGACGCTGCACATCAAGCAAAGCGAGATACTAAAAATCTCCTTTTTGACGCTATCGCGGCTTGATAGCGACACCATAAGCTGGGTACATCACACCGACGCGGACGGGGTGGCAACAGTGAGCGTAAGTTTTCGCGGTTTGCGCGACGAGCTTGAGATTTAACCGCACTTTAAACGGCTTTTAAACGGGATTTAAAACAATGAGCTATTTAGACAAAACACACTCAATCGCCGACGGGCAACCGGTGAATTTGTATCAATTTGTGCGCGGCAACAACGAGAAAATCTGGCGATTTTGCGACGCCGACCAAGATTTAGAGATTAACGGCGAGAAGTGGCTTGCGGTGGCAATGAGCGACGAGCGAAGCGCAGCGGGCGAAGGCAAGGTGACAATCAAAATGCCAAGCAACAATCCCGTGGCGCGCTTATATCGCGGGATTCCGCCAAGTCAAACAGTTACGCTTACAATCATGCGTCTAAACTGGATGGATAGCGAGATTCGGATTGTGTGGATTGGCACGATAATTGAGGCAAAACGCCCCGAAATCCAAACTACGCAACTGATTTCCGCGGGCTTGTCAGAAACCATGGAAAGCGCCGGATTGCGCTTAACATGGGGTCGCAACTGCCCTTATACACTCTATGACACGGATTGCAAAGTTAAGCCGGGTAACTTTGCCGTAGCAGGATTATCTATCACTGCGATGGACGGTGTATCAATCACCGTGGATTTACCGCAAAACTTACCGCAAGGCTGGTTTAATGCGGGATTTATCGAATGGCTGGATGACGGTGTGGTTGAGACCCGCGCGGTGACCGTGCATGAGCATAATAAATTAACGCTCATGGGCGGGACGCAAAAACTATCCATTGGCACCGTGATTAAAGTCTATCCGGGGTGCGACGGGCGGGCGCAAACGTGCCTTAAAAAATTTAACAACATGCTTAATTTTGGGGGGATTCCGCATATGCCGACAAAATCCCCGTATGACGGCTCAAGAGTATTTTAGGAGGGATTTATGTGGGCAGCAATCGGATGGGCAATCGTGCGCGCGGTAATCGTGGTGGCTATCAGCTATCTTGTCAGCCAAGCCACCGCCCGCAAGCAGTCAAACAACAGCCCCGAGGCGGTCGGGGCAAAAGATTGGAATTTTCCGCAAATCGACGAGGGGACGCCACAATGCGTATTTTTCGGCGATTGTTGGACTGAGGATTGGCAGGTGTTGGCATACGGAAATTATCGCACAACTGAGATTAAAAAAGGATAAGTTATGGACAATATCACTATCACAATGCAAGACATGCGCCGCATGGAGTTTTGCGCCGCAGGCGTGGAGGCGTTTTTTGTGCGTGAGGGGTTGGATTATGCCGATTTTTTAGCGCACGGCATTGATTCTTCTGTGCTGTTAGACACGGGCAGTGTGTTTGCCCGTAAATGCGTCAGTGCGGCGATTGAGGCACGCAAGGAGACTAAATAATGGGCGGTAAAAAAGGTGGACCGGTCACGGTTGGTTATCGCTACTACTGGGATATTCATTCCGGACTTGGGCGCGGTCCTGTCAACGAGATCGTTGAAATCCGCGTGGACGATAAGACGGCATATGTCGGTAAGCCGGGCGAAATTACACAATCTCAAGCCATTTTTATTAATAAGCCTAATTTATTTGGCGGGGATAATACGGGCGGCGAAGGCGGAATCCAAGGGCGCATGGAAATCTTAATGGGCGAGCCAGACCAAAAACCGAGCCAAATGCTGATTAATCTGCTAAAAGGCATTTTAAACCCAGCCTATCTAAGCGGTGCGGTGTTTGGCGGTGGAAAACGCATTAGATCACCGAGATATTTTGAGAGCGATAAGTTTTTTTTCAAACGGCGATATTATTCCGGGCGAATTAGATCAGAAAGACCAGATTCCGGGCTTTCGCGGCATTGTGACTACGGTTTATAGCGGGTTGATTAGTTGCTATAACGCATACCCAAAAAAACACAGTTATCGCGTGCGGCGCAGTGATAAAGGCTGGCATGACGGCGCGGTGTGGTATCTGGAAAAAGCGAAAATCATGCTGCGTAACGACAATCTAAAAATTAAAGGGTTGACGCCGGAACAAGAAGAAAATGTGCGTGCAATCCACGCCATGAATCCCGCGCATATCTTAGTTGAGTGCGCCACAAATAAGAGTTGGGGCGGTAAAAAAGAATTATCCGATTTAGATTTGGATAGTTACAAAAAAGCGGCGGATACGTTGTATGAAGAGGGATTCGGCTTGTGTATCCGCTACAACCGTCAAACGTCGATTAAAGAGTTTATCCAGCAAATTGTAGATCATATCGGCGCGGCACAATATGACAACGTAGAAACGGGCAAACAAACCATTAAGCTTATTCGACGCGATTACAAGCCCGAGGATTTACCGGTGTTTAATTACGACAACGGGATTTTATCGGTGCGTGATGATGACAGCGGCGCAACGGATAAGCAGCCGAATCAAGTGATTGTTAAGTATCGTGAGCCGGTAAGCAATCGCGACGACCAAGCTATCGCCAATAATATCGCTTCCGTGCGCATGCACGGGGTGATAAGCAAAACGGTGGAATACAAAGGCGTGCCGACGTTTGACTTAGCCGCGCGCCTTGCGCGGGATTTGGAGCTTGTGGCAAGCGGATTGACGCGTCTTAAGATTGTATTTGATATGCGCGCATCTGAACTTAAGCCCGGTGATGTTGTGCGCGTCAATTTGCCCGACCGCGATATTGTTGACGTGGTGTTCCGCGTGGGCAAACTTGAAAACGGCAACGACGGCGAAATTATTGCAACTTGTATCCAAGATGTATTCGGCTTGCCCGCGGCTAATTACTCGACGCAAAAGGGCGAATCCCTTTACATTCCGCCCGATTATACCGCCAATCCGATTCAGCAGGCGCGCTTAATTGAGGTGCCGTATCATGTGTTGCCGCTTGTGTTATCGGACGCAGAGCGCGCGTTTGTTAAGCCGACGGATTGTTTTGTGTGGGCGTTGGGCGCGCAACCCACCGCGCTTTCGGTGGGCTACGACATGCTTGTTGATGTGGGCGGTGGCTATACGCAAACCGCCACGGGGTCATTTACGCCGTTTGTGCGATTGCTGGAGCCTGTGAGCCCGTATCAAACAAACATTAAAATCAAGCTTGAGGGCGATTATGCGGCGGTTGCGGGCGCGTTAGCACTCATTGTTGATGATGAGATTATCAAGATTGATGCCGTGGATTTTAAAACCGGCACAATGACCGTGGGGCGAGGTTGCGCGGATACCGTTCCGCAAGCGCACAAAGCGGACGCGGTGGCGTGGTGTTACTTACTCGCCGCAGGGACGGACGAGAGCAAATATACGGTCAATGAGCGACTTAACGTTAAGTTACTCACTCGCACCGCGCAACAGACGCTTGATGAGAGCAAAGCCGAGGTGTTGACATTAACAACTCAACAACGGCAAGCCCGTCCTTTTTGTGTTGAGCTGGGCGTACCGCGACCGCGACGTACAAGCGGACAAACTGATTCCGCACTCGGACGACAGCACGCTCCTCGGCGATGGCGTCAGCTATGAGATTACGCTATTAGACGGCGGTAACGTTGTGCGCAAAATTACCACCCGTGAGGCGCAGTTTAGTTATCCGGACGCGGCAAAAATCGACGGCGAGCAATTTGACAAAATTAGCTTATATAGCGTCAAAAACGGCTTGCGGAGCTTGTGGGGCTATCAATTTGCGCTTGCTGGCGTGATGCAATTATTAAGCGCGTGGGACTATAACAGAGCATTTAGCAAAGGCAATAACTTTGTTAATCATTATGATGATAACGATATGCCGGGCGGTAAATACGTCATGTTATCGTCATATGCTAAGTCAGATAGTGAGATTTATCATGCGTTTACATTGACAGCAGGACAATACAAGCGATTTGCATTGTCGTATAAAGTCGGCTCATATAATCAGCGCAAGGGGCTTTGTACGGTTGCCGTGCAGTTATATGTGGGGGACAGATTAGTCAAAGAGTTGTTATCACAACAATTTGGTAATTACGACAAGAGCGAGTGGCATCCGCAACAGGTGACTGATGACTTGCCGGCTGATGTAACGGAGATCCGATTCAGGGTTAATCCTATCGGCGAGTTGCGTAATAACGCGATTGCGTTTACCGATATTATATTGCGCGCAGGAGGAGATTAGCTTTCAAAACACAATAAAAAATGACCGCACTTTTAGATAAAAAAAGGAAAAAAGCAAAATAAGGACTTACAATGCCGGACAAACAAGGAGCGCGCGATGTTTAAACAAGCTCCACTCCCGTTTACGGGTCAAAAGCGCATGTTTTTAAATCATTTTAAAGCCGTTTTAAATGAGCATATCGTGGGCGATGGTGAGGGCTGGACGATTGTAGATGTATTCGGCGGCTCAGGATTATTAAGTCACACCGCTAAACAACTCAAGCCAGCCGCGCGCGTGATTTATAACGACTTTGACGGCTATGCCGAACGGTTAAAGCATATTGATGACATTAACCGCTTGCGTGGGCAAATTCATGCGTTATTGCGTGACGTGCCGTCGCAAAAACGTATTACAGACAAAGCCCTCAAAACTAAGATTATTGCAACAATTAACGCATTTGACGGCTACAAAGATTTAGCGAGCTTGTCAAGCTGGTTGTTGTTTTCCGGGCAGCAGGTTGCAACATTTGATGATCTCTTTAAAAAAGACTTTTGGTGTTGTATCCGTCAAAGCGACTATCCGCGCGCGGAAGGCTATTTGGACGGGATTGAGGTGACAAGCGAGTCGTTTCATACGTTGCTCCCGCAGTTTATCGCAGACAAAAAGACGTTATTTGTGCTTGACCCACCCTATTTATGCACTAAACAAGAGAGCTACAAGCAGGCGCATTATTTTGACTTAATCGACTTCCTGCGCTTAGTCAATATCACCCGACCGCCGTATATCTTCTTCTCCTCGACTAAATCGGAGTTTGTGCGCTTTATTGAGTACATGCAGACGGATAAGGTACATAACTGGCAAGCGTTCGACGGCGCGCAACGCATTGCAATTAAGACTAATCTTAATTATCACGGCGAGTACGAGGATAATTTAGTTTACAAGTTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015431|57723:66347|57723_58716_+|WP_064088394.1|DBSCAN-SWA MAYKTGTARNERDLLDILNTFLTTDSELVANGQAWTVLLDRTLPATATQKEIRQIAWKSTGTGIEQDIYICASSANLIAADTYNLNFWGGTFFNPSFVTPTAIHGGLINPSPGVALFADSRPIEYHIVADGRCCKIVTRISQVCSSAYLGFILPTVPPTEYPYPLCIAGSAPLVSDTNSAVFIRYSQSNEYHSSIVNPSYGNCWLMTPDQTWRDFYGQNYKNITTDSSSQFLYPMGNFYLYSGYMQPQIMTKMGASAGGSYPLLQVEFFSTGKSSQGGNRWGAMDGVYWIPGLQRAAGDNVTIADGRRGVVFNGGFRVGTKDYFVIETGA >NZ_CP015431|57723:66347|62236_62485_+|WP_010944200.1|DBSCAN-SWA MWAAIGWAIVRAVIVVAISYLVSQATARKQSNNSPEAVGAKDWNFPQIDEGTPQCVFFGDCWTEDWQVLAYGNYRTTEIKKG >NZ_CP015431|57723:66347|59688_61380_+|WP_064088395.1|DBSCAN-SWA MADITAFKARKGQSGALKDTGYLDGLTTYRGADKRILAPPRKLLAGELTNGIQADLTQPTRAHIVRNYYVDLYSRIYVIPHIVNLGSISTEQTFSVQVWNANKSAVKLLSVSVVGGEGIELNGPTSGTFNALALKKWTIKVGMQGTPVIDCVVTFNFLGKNPITLHITGSRSTDWAFAPDWGDNVTENLEFLTRVHQSVTGAEQRIARRLSPRRTFEFKVALSAVARQAFESALYGYGSRVWSLPIYTDATRLAESVTAGKAEIHLDTTGRDFSVQGRALLVAGAQKEMVEITAIAPDKLTLKRAIVSNFDRAFTLVYPLRAAVLTDMPIVTRLSDGAATAQVRLQISEHNGWQDDIAHLPTYRNHPVLEPTSEWSEDITAQYMRLIKRLDNETGLPYYLDTANKAFQLTNYRFVLSDRDMQRKLRNLFYYLRGRQRAIWVATSATDVTPVGDLLGKTLDIAFINYTAALQKQTGRQDVRIECTDGRIFYRRIVSAAVVDSNTERLALDGETLHIKQSEILKISFLTLSRLDSDTISWVHHTDADGVATVSVSFRGLRDELEI >NZ_CP015431|57723:66347|61417_62227_+|WP_064088396.1|DBSCAN-SWA MSYLDKTHSIADGQPVNLYQFVRGNNEKIWRFCDADQDLEINGEKWLAVAMSDERSAAGEGKVTIKMPSNNPVARLYRGIPPSQTVTLTIMRLNWMDSEIRIVWIGTIIEAKRPEIQTTQLISAGLSETMESAGLRLTWGRNCPYTLYDTDCKVKPGNFAVAGLSITAMDGVSITVDLPQNLPQGWFNAGFIEWLDDGVVETRAVTVHEHNKLTLMGGTQKLSIGTVIKVYPGCDGRAQTCLKKFNNMLNFGGIPHMPTKSPYDGSRVF >NZ_CP015431|57723:66347|58717_59683_+|WP_010944195.1|DBSCAN-SWA MAYQTGTAKTLNELLIKLAEFAQAQGWVVDKAVDNELYLHNKDGFWVLYLNTNNNVFFTLANTGFNNNKSRTEQPGSSHANAYGEVNTATTQLHKGNYVSYDFFCTAQYLHVVVQIEAERFRHFGIGTLDKEGDYVGGQYAYGTYITNNYAYYQNSDHAYGFSPGANGNQAVVRADGIGGDTKSPWYFAPNAVNDYNDLNKRDYGKYILTLGRASMSTNVSTYHPDAILVNYSQSKFGQVLIPCPHSLIAHGIDGVFRRLGILPDRYECTMRGIQPRQILTITGERWMIIPSAQYDARNVAYIEEGKNNSGVQGVAYRIVE >NZ_CP015431|57723:66347|62488_62695_+|WP_010944201.1|DBSCAN-SWA MDNITITMQDMRRMEFCAAGVEAFFVREGLDYADFLAHGIDSSVLLDTGSVFARKCVSAAIEARKETK >NZ_CP015431|57723:66347|65516_66347_+|WP_010944205.1|DBSCAN-SWA MFKQAPLPFTGQKRMFLNHFKAVLNEHIVGDGEGWTIVDVFGGSGLLSHTAKQLKPAARVIYNDFDGYAERLKHIDDINRLRGQIHALLRDVPSQKRITDKALKTKIIATINAFDGYKDLASLSSWLLFSGQQVATFDDLFKKDFWCCIRQSDYPRAEGYLDGIEVTSESFHTLLPQFIADKKTLFVLDPPYLCTKQESYKQAHYFDLIDFLRLVNITRPPYIFFSSTKSEFVRFIEYMQTDKVHNWQAFDGAQRIAIKTNLNYHGEYEDNLVYKF |
7 | Pseudomonas_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
403208 : 425720
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015431|403208:425720|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015431|403208:425720|417600_418524_+|WP_064088433.1|head|DBSCAN-SWA MSFKKSELLNVLDTAFKKEFGKGLSLISPQWGLIAMKISSSTKTNTYGWLGFFPKMREWVGERQIKKMQAQAMSIENKTFESTVSISRTDIEDDQAGLFAPVVQQAGQSAAELPDDLVFSLLAKGKSTLCYDGQNFFDTDHPVYENVDGTGSHKEQSNLTTGSASEHPTFYILDDTNAIKPFIWQERSAPEIETKFDPSRSDKVFMEDVYLWGVRARGNAGFGFWQLIHCVEETELTADAVMKVLAQMRMLKGDGGKLLNIRPSTILVPPALEFKARQLFEAEIINGSTNPLKGVLKVAVSAQIATA >NZ_CP015431|403208:425720|415860_416277_+|WP_010944514.1|DBSCAN-SWA MIKIEINGIDEIIAKLNLIANKTENKTDLMRNIAGTMESAVQTNFEVGGRPKWLGIKHRKGVPLVDSENLMDSITSAYDNDTAFVGTNEEYAAIHQFGGMAGRGCKVKIEARPFLTLTEQDKSDILEEITDYWQRLLQ >NZ_CP015431|403208:425720|406260_406689_+|WP_010944500.1|DBSCAN-SWA MPPQTRQQMIQKIHIGKNELKMTQENYVRFLIDAVDKMSCSQMTDSELMTVLQAMKAKGFRVKSKQHGKKPNVGKFPENQVRQRYLDKIEAFLAEMKKPWAYAHGICKKSFGIDRLQWCTEDQLRKIVQMLAVMARRHGKPV >NZ_CP015431|403208:425720|414417_415728_+|WP_064088431.1|head|DBSCAN-SWA 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MANSELNLALKIKADLNDALSKFKTLEKELQAGAAASQGLGKGAQTGAGGLDGLAKKADEATSKLGKTRAGVESISKQLAELKKQALGFTLGKVAIGNLVQTSDEFKSLEARIKLVSRSNLEAKGTFHGLMAVAQETGTAFSATAELYTRVFRSLGDTANSGEVLRFTKTVSQAMTVSGAGAQEAQAAIIQLSQGMAAGALRGEEFNSVSEQAPIILELLQKSLGKTRGELRKMAEEGQLTTEVIMTAVAEGADSIQKQYEQMPLTIGKAVTQLSNTWLEFIGNTDKTLGASTLVSAAISTLANNLEGLAGIAILVGTAYTARYLSAMYTSIGVKSKAAIAESAHMTAINASATASVRQAQATVVLMQAVNGETVSVGRATQAYGALAVAKARAAAVNVGAGLFSLIGGSFGFAVTALAGLAAAYFYLKSQEEEAERQFAQSLTTLDANIEKTKALVEARTQLGEMGGFSDRMEQLKVNTASLDGAKQKLEALIAERDKLLNQNRTSVMGGLINADEVNALNTQIDELQQKIDSMSTASSELANITQAQLAVAWDAAIEAGGTLAEKLTEIGDPQHPEAVKLLTEAIKGSETEALAMKTEVEELTQKLKKDLSQASTTAIERLEAMRTKFEGIAAQAGMSGNAVQGFINKINEAIGLQTQLEQKQAEKKGGDELEKLRTRARQSGMSELEKNLDNARNNSNWTAEQKKEAEALYQTIEANQKKLREQAEANKAQRKAESDAKKAAQDTRRTAEEATNKLRELNSDYLRLTGQTAKADLLDVQSKYNQLLALFSKANNQEGINLVKKMLPLEGAKVQLNGIQSEVNNVIQQQSAKEQQIQAQVQTGLISHFEGQQRLKDMYAQTVAEIEKQLPLLERLAQMPDAQGEAAGAMLEQMKLKIQELKQTGNELENAFKQGLTQGIQSALMGLAEGTMSLGDAVKQLALTVINSMAQIAAQQLAMQATSAISGFFGGAGAAVTAATGGFISGPGTGTSDSIPARLSNGEFVVRAASVQKYGVGFLHAINRGHLRKYATGGLVSAPSMPSYNEPTLTHEMQNGTAGQQAVASPVNIQQILAVDSAELFTAGINTVAGERAVMTVIRANKQTLKQELG >NZ_CP015431|403208:425720|416530_417601_+|WP_064088432.1|DBSCAN-SWA MFKQKFKLNRIACSFQLNREANGLIQLFPFGWFEPQDGREGAWYVDDSNGYQLANEINALQIELMVDYEHQTLFIAENGKGNPAAGWIRRAEYRTGEGLFADVAWTEKATAEIKDGIYRYISPLFLADASGRVIKVLNAALTNRPALYNLREAVAMSAQFSQFLNVEEEGQSNMKELLIKLFGLSATATDAEIEAELTALSAAKGDSDVALKAVYGALAQAKSETVALSAKVNNPDPAKYVALADLQTVQTELNTLKQSINDKERDALIQTALSDGRLLPAQKAWAESLGKQNLTALSDFLATVSPNPALLGTQTGGQNPNADAQKVALSDAEIAGAKALGISADEYIQRYKQETK |
32 | Haemophilus_phage(37.5%) | head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
440324 : 455665
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015431|440324:455665|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015431|440324:455665|450077_451118_+|WP_064088443.1|DBSCAN-SWA MSNTQLSYKDAGVDIHAGNELVESIKADVKRTRRPEVMGGLGGFGALCSLPTKYKEPVLVSGTDGVGTKLRLAIDLNKHDTIGQDLVAMCVNDLVVQGAEPLFFLDYYATGKLEVNVAAEVIKGIADGCEMAGCALVGGETAEMPGMYHAGDYDLAGFCVGVVEKAEIIDGLAVKAGDTLIALASSGPHSNGYSLIRKVLEVSGANATDELVGKPLSEHLLAPTKIYVKSVLSLIKQVEVHAIAHLTGGSFWENIPRVLPKATKAVINEQSWQWPAVFKWLQEKGNISRYEMYRTFNCGVGMVIAVSSKDVETALAVLTQAGENAWVIGHIDHLTQEGEQVEIIES >NZ_CP015431|440324:455665|443912_444995_-|WP_010944541.1|DBSCAN-SWA MNLLSMNILERYIGKTIIMMMFAVLLMSSGLVFIIKLVEEFKNVGEGNYDALTATYYALLMLPSDIKEFVPVVLLIGGLLGLSNLASHSELVVMQSTGFSRFRIGLAVMKTAIPIIILTMSASEWIIPKVEQFARNMRSVAQSGGSMLSTNGGFWAKDGNNFLYIRHIENEHQLNNISIYHFENKVLTSVSQADSALFNGKDWTLQNLQTATITDHGIQTTHQANQNWQTTITPSKLGIVSLKPESLSIAGLADYVSFLTETGQDSKRFQIAFWRKVYQPISMAVMMLLAISFIFGPLRSSAMGTKLFIGIIAGFIFYVSNIVFGNMTLVFSWLPIAIGALIPSLICLAIVWWLLTKKRD >NZ_CP015431|440324:455665|451173_451461_+|WP_010944551.1|DBSCAN-SWA 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11 | Streptomyces_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
524862 : 535444
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015431|524862:535444|DBSCAN-SWA ATTAATTTGCCATTTTGATAAATAATTCTTCGAGACGATTAGATTTATTGCGCATACTTTGTACTTCGATACCTTGTTGAGCAAGTTGTTGAAACAGTTTGGTTAAACCTTGTGTTCGTTTCACTTCAACTTCAATCGTATTGTCATCTAACCATTTAAAGGTGTAATCATTAATAGTAAGCGATTGATTTTTATCTGTTTTTTGTAAATCTAATACAAACGTTTCACTTTCTAATTTTGCTAATAATGCTTTGATTGAGGTGTTTTCAATAAGTAAACCGTTTTGAATAATACCTATATTGCGACAGAGTGTTTCAGCTTCTTCCAAATAGTGTGTCGTCAGAATGATGGTGGTTCCTTGTTGATTAATTTCACGCAAGAAATCCCATAATGAGCGACGTAATTCGATATCTACGCCAGTAGTCGGTTCATCTAAAATTAATAATTTTGGATTATGCATCAATGCTCTAGCAATCATCAGACGCCGTTTCATGCCACCAGACAATTCACGAGTAAGGTGATAACGTTTTTCCCATAATTCTAGTTTTTTAAGCCAAGTTTCTGCACGTATTAAAGCTTGTTGATAAGGAATACCATAGTAGCCCGCTTGTTGCGTTAATACATTAATCACTTTCTCAAATTGATTAAAATTAAATTCTTGTGGAACTAAGCCAATTTGTTGTTTTAGCTGAATTTTCTGTGTGTCTAAGTCATAGCCAAATGCTTTGACTGTACCACTTGTTTTATTCACTAATGAGCTAATAATGCCAATAGTGGTTGATTTACCTGCACCATTATGGCCTAGTAACGCATAAAAATCGCCTTGCTTAACGACGAGATCGATTCCTTTTACCGCTTGTACCCCGGTTGGATAGGTTTTAACAAGTTGATGTATTTCAAGAGCATTCATTTGATTATCCATTATATGTTGGCGACAGCACGAATAGTTGATTCATCAATTTCAGCTGCAAAGGTATCACGTAATAGCATTAATTTTTCATCATTATTCAATGCTTGCTTAGCCGCTAAAGTTAATTTCTCAAAAATCATCCGGCGAATTTCTAGTGGCGTTTTGTGTTCGGCACTTTCGCCTATCACTAATTTATAAGTGAATCCTTTGTCTGCTAACGCGAGTGTTAAACTTTTTCGTGATTCTTCATTGTCTAAGTGTGACATTGACGGTTTTAAAACTAAATCTAATTGTTGGGCTGTTGTTTGTGCAAGATAGCTATTAAGTGCTATTTGACGTGAAAAGCTACTGAGATTAAGGGTATTAATAATCTGACACCATTGATCTTGTTCGCAAGCAAGTTCAATGGTTTTGGCAACTAATTCAGGCGTTTTATCTTGTAAAATAGCCTGTTTAATTTCAGCAGGTTTAGTGCTTTTGTTCTCAATCGCTAACTCTGGATCTAGCCAAGTCCAACAATAATCTTCTTCGGTTGATTGACTGTCGACTTCCGGCTCAGAGGGTTGACTCGTCACTTTAGCGGTAGAATGAGCTAAATTCATCAAACGTTCTTGTAAATCTAACGATTGATGTTGTGTGTTGGTCGTTATCTCTGTTGGCGAACTTGTTGAATTAACCGTTATAGATTTACGCTTTTTTTTTTCGTGTTGATTTAATTCAACGTGCTTTTGTTGTAATTGTTTCCGCGCTTGCATTGCAACAAGTGCGGGTGAGATTAGCGTATTATTTGTGCTATCTGTAATATTAGCCGGCACAGTTTGTTGCGCAGACTTTATTGATCGTTTGCTTGAAGATTCGACCGCTTGTGCACTTGTTTTATCTGTTGTTACTTGTGTTAAATTTGCTTTGAGCTGTTCAAGCTTATGTTGGGTATTGTCAACCATTGCCGACTGTTCGTTATTTGCTTGATTTAGTTGCGCACGTTGGTTAATTTCTTCAGTACGTTTAGGATGAAATGCTAAGGCACGTAAAAATACCATTTCTACACCAATACTTTGTTCTGGTGCATAAGCTAATTCTTTTTTGCCGATGAGCATTAACTGATAAAAAAATTGCACATCTTCAGGTGGTATCTGTTTTGCGAGCAAATGTAATGGCGTGTCTGATGGTGTTTCTTGTTTAAGCAATTGCAACATTGCAATTTGGTGTAAGGTTTCTGCCACATCATTTAGCAATTGTTGCCAGTCAATGCCTTTTGTTGCAATGTTTTGGATAATAGCCATAACTTGATCGCCATTTGCTTGGGCTAGAGCCATCACTAATTCAAGCGGTTGATCATCATCGATTAAGCCTAACATTTCGCTAACTATCGGTAATGTAATATTGGCATTACTTACGGCAATCGCTTGGTCTGTCAAACTTAATGAATCTCGAATACTACCTTGAGCTGCTTTTGCTAGTTTTTCAATGGCGGCTAATTCATAAGGAATGTTTTCTTGCGTGAGAATAAACTCAAGATGCTGGCTAAGTTGCGTTGGTGTTAAAGCTCTTAAATGAAATTGCATACAACGCGATAAAATAGTCACCGGTAATTTTTGAGGATCGGTGGTCGCAAGCAAAAATTTTACATATTCGGGCGGTTCTTCAAGTGTTTTGAGTAAAGCATTAAAACTATGCCGTGAGAGCATATGTACTTCATCAATCAGATAAACTTTAAAGCGCCCAACTGTAGGCTTATATTGGACATTATCTAATAATTCTCGTGTATCTTCTACTTTCGTTCGAGAAGCCGCATCGATCTCAATTAAATCAATGAATCTACCTTCTTCAATTGCTTTGCAATTTTCACATTTGCCACAAGGTGTGGCGGTAATGCTTGTTTCACAATTGAGTCCTTTAGCAAACAAGCGGGCGATTGATGTTTTACCAACGCCTCGTGTACCAGAAAAAAGGTAAGCATGATGTAATTTATCTTGACGTAGACCGTTTTCTAATGCGGATAATACGTGTTGTTGCCCAATTACTTCTGAAAATCGTTGTGGACGCCATTTACGTGCTAAAACTTGGTAGCTCATGGATTTTTATCGTTTATTAAGAGAGGATTAATGGCCGTCAAATTCCACTAGTGTGAATGATTTGATGCCGATTTGTTCAAGTCGTGCTTTACCGCCTAAATCGGGTAACCCAATAACAAAAGCCGCATTTTTAACTTGACCGCCTAATTGGCGAATTAATTTGGCGGTCGCATCAATAGTGCCACCAGTAGCTAATAGATCATCTACCACTAATACGTTGTCATCTTGATTGATAGAATCTAGGTGCATTTCAAGTGTATCTTCACCATATTCAAGGGCATAGGATTGCGAAATAACGGCTCTTGGTAATTTATGAGGTTTACGCACTAATACAAAGGGTAGCCCTAATGCTAGGGCTACAGGCGCTCCAAAGATAAAACCACGAGATTCTGTGCCGACGACTTTAGTGATGCCTTTATTTTTGAATTCTGCGACGATTGCATCTATAGATGCTTTAAATGCGGTAGGATTTTCTAGTAAAGAAGTAATATCACGGAAAATGATGCCAACTTTGGGGTAATTAGGAATAGATTTGATAGATGATTTAATTAAATCTAGCTGATTCATTTTTGACCTTCTAAAAAGAATAAGATAATGGGTAAAATTTAACAAAAATCACTGAAATTACAAGAAAAATTTGGCATAAATAACGGTTAGGCGTTTATAAAGCGACTATCTTTTTAGCGAACAATAATATGAAAAAGACCGCTTGTACAGATAAGCGGTCTAATTTAGCCTAATATTGGCAATTTATGGCGCTTTTTATGGGTATTTAACTAGCTTGCAAATAATGTACAATGCCACCAAATACTTTCTCTAAATTTTGATGATTAAATGTTGTTGCCGTTGGGCCCGAAGCAAGCAATGTACGATTAATCATTAATACTTGATCGCAAAAACTAGATACACTGTTGAGATTATGAGTAGAAACCAATACTAAATGCCCTTCACTCCGCAATTGTTGAAGTAAAGCTACAATGGCATTTTCTGTTTTGACATCAACACCAGTAAATGGTTCATCTAATAAAATAATCTGGCTTTCTTGCGCTAAGGCTCGGGCCAGAAATACCCGCTTTTTCTGTCCGCCTGAGAGTTCACCAATTTGCCGATGTTGCAAATGGCTAATATCAACACGTTGCATAGCTTGTTCAACTTTCTGTTTATCTAGTGCAGATGGATTGCGTAAAAAATTCATATAACCATAACGGCCCATCATCACAACGTCATAAACAGATACGGGGAATTGCCAATCCACTTCTTCACTTTGAGGCACATAAGAAACAAGGTTTTGTTTAAGTGCTTTTTGAATGGGCATTTGGTTCAGTAATACTTGACCGGTTAACGGCTTAACTAATCCCATCAAGCTTTTAAAAAGCGTTGATTTACCACCGCCATTTACGCCAATTAATGCACAAACAGTGCCATGCTGAAGCTGGAAAGAGACATTTTCTAAGGCTAAATGTCCGTTGTTGTAACGGACGGTTAATTTATCAACAGAAATGGATGCTGTAGCTTGTGTTATATTGTTCATTTAGGCTCTTTTTTGCTCGCTTCAAAACCATCTACTATAGTAGAAATTGTCACTTTTAATAAATCTAAATAAGTGGGTACAGGTCCTTCTTTGGTGGAGAGTGAATCAACGTATAATACCCCGCCATATAACGCGCCTGTTTCTTTAGCAACTTGTTTTGCAGGCTTATCTGATACAGTGCTCTCGCTAAATACGACTGGAATATGATTAGCTTTAACTCCATCAATTACTTTTCTCACTTGTTGTGGTGAACCTTGTTCTTCAGCATTAATGGGCCATAAATATAATTCTTGTAAGCCATAATCTTGTGCAAGGTAGCTAAATGCCCCTTCACTGGTTACTAACCAACGTTGTTTTTCAGGAATAACGGATAAGCGTTGGCGAAGTGGCTCAGAGATTGCTTTTATTTTTTCGGCATAGGCTTTTGCATTTTGATTATAGCTAACCGCATTTTCGGGATCGTATTTGACCAAGGCAGCTCGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015431|524862:535444|528618_529377_-|WP_010945596.1|DBSCAN-SWA MNNITQATASISVDKLTVRYNNGHLALENVSFQLQHGTVCALIGVNGGGKSTLFKSLMGLVKPLTGQVLLNQMPIQKALKQNLVSYVPQSEEVDWQFPVSVYDVVMMGRYGYMNFLRNPSALDKQKVEQAMQRVDISHLQHRQIGELSGGQKKRVFLARALAQESQIILLDEPFTGVDVKTENAIVALLQQLRSEGHLVLVSTHNLNSVSSFCDQVLMINRTLLASGPTATTFNHQNLEKVFGGIVHYLQAS >NZ_CP015431|524862:535444|529373_530279_-|WP_010945595.1|DBSCAN-SWA MNLSFLKKTLIIACAMGTTVAIAAPFKVVTTFTVIQDIAQNVAGDKAIVESITKPGAEIHDYQPTPKDIVKAQKADLILQNGMNLERWFERFFENVKNTPAVVVTEGIQPIAILEGEYKNLPNPHAWMSSANALQYIENIRAALVKYDPENAVSYNQNAKAYAEKIKAISEPLRQRLSVIPEKQRWLVTSEGAFSYLAQDYGLQELYLWPINAEEQGSPQQVRKVIDGVKANHIPVVFSESTVSDKPAKQVAKETGALYGGVLYVDSLSTKEGPVPTYLDLLKVTISTIVDGFEASKKEPK >NZ_CP015431|524862:535444|531597_532149_+|WP_041603561.1|DBSCAN-SWA MKLNFPTYLTLFRVVLIPLFIAAFYLPEGWYAPEISTLIFFIASITDAFDGYLARKWNQTTRLGAFLDPVADKILVTVAFVCIVEYYHSWWITIPVSIMIAREILISALREWMAEIGERASVAVSIWGKVKTACQMLALGGMLWRQSTFMEILAFILLYISAILTIWSMLQYLKASKKSLMKS >NZ_CP015431|524862:535444|525782_527846_-|WP_064083123.1|DBSCAN-SWA MSYQVLARKWRPQRFSEVIGQQHVLSALENGLRQDKLHHAYLFSGTRGVGKTSIARLFAKGLNCETSITATPCGKCENCKAIEEGRFIDLIEIDAASRTKVEDTRELLDNVQYKPTVGRFKVYLIDEVHMLSRHSFNALLKTLEEPPEYVKFLLATTDPQKLPVTILSRCMQFHLRALTPTQLSQHLEFILTQENIPYELAAIEKLAKAAQGSIRDSLSLTDQAIAVSNANITLPIVSEMLGLIDDDQPLELVMALAQANGDQVMAIIQNIATKGIDWQQLLNDVAETLHQIAMLQLLKQETPSDTPLHLLAKQIPPEDVQFFYQLMLIGKKELAYAPEQSIGVEMVFLRALAFHPKRTEEINQRAQLNQANNEQSAMVDNTQHKLEQLKANLTQVTTDKTSAQAVESSSKRSIKSAQQTVPANITDSTNNTLISPALVAMQARKQLQQKHVELNQHEKKKRKSITVNSTSSPTEITTNTQHQSLDLQERLMNLAHSTAKVTSQPSEPEVDSQSTEEDYCWTWLDPELAIENKSTKPAEIKQAILQDKTPELVAKTIELACEQDQWCQIINTLNLSSFSRQIALNSYLAQTTAQQLDLVLKPSMSHLDNEESRKSLTLALADKGFTYKLVIGESAEHKTPLEIRRMIFEKLTLAAKQALNNDEKLMLLRDTFAAEIDESTIRAVANI >NZ_CP015431|524862:535444|527873_528413_-|WP_010945597.1|DBSCAN-SWA MNQLDLIKSSIKSIPNYPKVGIIFRDITSLLENPTAFKASIDAIVAEFKNKGITKVVGTESRGFIFGAPVALALGLPFVLVRKPHKLPRAVISQSYALEYGEDTLEMHLDSINQDDNVLVVDDLLATGGTIDATAKLIRQLGGQVKNAAFVIGLPDLGGKARLEQIGIKSFTLVEFDGH >NZ_CP015431|524862:535444|530746_531412_-|WP_010945593.1|DBSCAN-SWA MENRLIANTAHNQSLLSTHKVLRNTYLLLSMTLAFSAIVAYFAMAMNAPALPWWGLLIGFYGLLFLTNTNANSAIGLACVFALTGFLGYTLGPILNRYVGAGLGDAVMLALASTALVFFSCSAYILTTKKDMSFLSGMMMALFIVLLVGVIANIFLAIPALSLAMSVLFALFSTGAILLTTSNIIHGGETNYIRATVDLYVSLYNLFLSLLQIFGVLSKDD >NZ_CP015431|524862:535444|530349_530685_-|WP_010945594.1|DBSCAN-SWA MHMIECNGKQYLTDPTGYLLNLNDWSTELAIAIASKEQINLTEEHWEIIWLVRDFYQEYKTSPAIRMLVKAMTLKFGEEKGNSRYLQRLFPEGPAKQATKIAGLPKPIKCL >NZ_CP015431|524862:535444|534151_535444_+|WP_064088449.1|DBSCAN-SWA MQNLRYPIDSKPPFGLSVLLAVQHLLAALGGIIAVPLVIGNVLKLPTSDTIVLVNAALLVSGIVTIIQCRGIGPIGLRLPSVMGTSFTFVAAALAIGFSEYGVAGIMGSSLIGSLVMIIGSFFMPYVRKLFPPVVTGIVVMMIGLSLIPVAVDWFAGGQKGAPHYADPANLAMATFVLVLVVILVQWGKGIFSAAAIVIGMLVGYAVALALGWINFEAIQNAEAFAIPQPLHFGLAFPISGIIGMSIAYLVTIVESSGNFLALGNATQTEITGKHLRGGVLCDGLGSAFAAVMSTTPFSSFAQNIGVISLTGVASRYVVTVMGVLLVLAGVFPWLGAIIVSIPSPVLGGAGLMMFAMIIAAGIQMLDKVERSKRNGLIIAISIGCGLAVTTRPELLDKLPNFFKEVFGSGITVGSVLALLLNLILPEDKH >NZ_CP015431|524862:535444|524862_525771_-|WP_041603563.1|DBSCAN-SWA MNALEIHQLVKTYPTGVQAVKGIDLVVKQGDFYALLGHNGAGKSTTIGIISSLVNKTSGTVKAFGYDLDTQKIQLKQQIGLVPQEFNFNQFEKVINVLTQQAGYYGIPYQQALIRAETWLKKLELWEKRYHLTRELSGGMKRRLMIARALMHNPKLLILDEPTTGVDIELRRSLWDFLREINQQGTTIILTTHYLEEAETLCRNIGIIQNGLLIENTSIKALLAKLESETFVLDLQKTDKNQSLTINDYTFKWLDDNTIEVEVKRTQGLTKLFQQLAQQGIEVQSMRNKSNRLEELFIKMAN >NZ_CP015431|524862:535444|532235_534074_+|WP_064083124.1|DBSCAN-SWA MSQFNAKAFLADVPHLPGVYRMYDANQAIIYVGKAKDLKKRLASYFRSQVASKKIEALVGNIHHIDTTITHSETEALLLEHNYIKQHQPKYNVLLRDDKSYPYLLLTKHQHPRLTAFRGSKKVAGEYFGPYPNVSAVRESLNLLQKIFPIRQCEDNYYKNRSRPCLQHQIGRCLAPCVTGYCSQQEYDNQVKWVRLFLQGKDSQVIDYLMQKMEIAASELDFETAARFRDQIQSVRAVQEKQFVANQRLDDLDIISIAYQSGLACVHILFIRQGKVLGNRAYFPKVPSHTDLTELADTFIGQFYLQLNQHRSIPNQIILDQPLTESNALAQLLTEQAGHKVTIITNHVRGDKSRYLALAQTNARAALSLQLKQSTTIHKRYDALKILLKLPTIKRMECFDISHTMGSQTVASCVVFDENGPLKSDYRRFNIEGITGGDDYAGMEQALVKRYDKPLPIEKIPDIIFIDGGKGQLNRALQVFEKLTVAWDKHKPLLIGVAKGAERKAGLETLIIGRLKKEIHLPIDSPALHLIQHIRDESHHHAISGHRKKRQKAFVESGLESIAGVGAKRRQALLKYLGGMQGVKSATLAEIESVPGISKTLAGVIFDTLHNS |
10 | uncultured_Caudovirales_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1071341 : 1077854
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015431|1071341:1077854|DBSCAN-SWA GATGCAAATTAACCTCTCCCAACAGCCTGCGCCATCAATATGGGGAGAAAAAGCTATCCTTTCTGCCCATCAAAATGGCTTTACCATTCATCTTCACGCTGATAGCCTAACCACTATTCAAAAAGCAGCACGTAAAATTAAAAATCAAAATATCCTCAACGTATCACTAGTTGGCGAAGGGTGGGGCTTGGAAGAGTGTTGGGCTTTTCAGCAAGGGTTTGTGAGTGTTCACCATCGTGGAAAAATACAGTATCCACCACTTGCTGAACAGCACGCTGAATTAGAAGCACGGTTAAGCTGTACTGATTTTGCGCGAAAAATTATCAACGAAGCATCAAATACATTAACCCCTGAACAACTCGCTAAACAAGCGACTGAATTTATTACACAACAAGCGATCAAATATAACCTTCACAACGTTGTTAAATTTGAAATAATACAAGGTCAGGCATTAGATACCGCAAATTATGCCGGCATTTGGGCGGTTGGCAAAGGTTCAGCTAATCCGCCCGCTTTACTTAAATTAGATTTTAATCCAACCGGTGATGAAAATGCGCCGGTATTAGCCTCTTTAGTTGGTAAAGGCATCACCTTTGATAGCGGAGGTTATAGCCTTAAACCCAGTGATTCAATGAGTACCATGCGTACCGATATGGGCGGAGCAGCATTAGTTACTGCCGCATTAGGCCTAGCAATTGCTCGCGGTTTAACCGCACGTGTTAAACTATATCTCTGTTGTGCTGAAAATATGGTGAGCAGTCGCGCGGTTAAGCTCGGTGATCTTATTCATTACCGCAATGGTATTTCAGTTGAAGTATTAAATACGGATGCAGAAGGTAGATTAGTATTGGCTGATGGCCTGATTGATGCAGCTGCTGACCAAGCACAATTTATTATTGACGCTGCCACCTTAACCGGCGCAGCCAAAGTGGCTGTTGGCAATGATTACCATACTGTGTTAGCAATGGATGTTCAATTAGTCAACCAGTTATTAACTGCTGCTGACGCGGAAAATGAACCTTTTTGGCGATTGCCTTTTGCTGAATTTCATAGAACACAAATTAGCTCTTGCTTTGCAGATATTGCTAACATTAGCTCTGTACCTGTCGCAGCAGGTGCTAGCACTGCTTGTGGCTTTTTATCGTATTTCGTGCCAAATTATCAGCAGAATTGGCTACACATTGACGCTTCCGCCACTTTCCACCGTTCTGCAAGCGATCTATGGGCGGTGGGAGCAACAGGATTAGGCATTAGAACCTTAGCTAATTTATTACTAAGCAAAGCAACTGCCAAAAACACGTAGAATTTGACCGCATCTACTTCAATAACGTAAGCGGTTACATAACGAGCTAATTAATGATAATTTCCCTTAGATGAGGTTTATTTAGGATATTATGAACTATCTGACGCAGGCAACGGAGACACTCAGTTTATATAGTCAGGCGATCGACCGATTGCAACACAATCTTGACCAACATTTCAATCAAGCAGTCGAAATGATTTTAAACTGTGCAGGACGCGTAGTGGTGGCAGGAATTGGCAAATCTGGATTAGTCGGTAAAAAAATGGTAGCAACTTTTGCCTCAACCGGCACACCAAGTTTTTATTTACACCCAACTGAAGCCTTTCACGGTGATTTAGGAATGTTAAAAGCTATTGATATTGTATTATTAATATCAAACAGTGGCGAAACTGATGATGTAATCAAATTACTGCCGAGCTTAAAAAATTTTGGTAACCAAATTATTGCAATGACGGGTAATCGCCATTCAACATTGGCACAACATGCTGATTTAGTATTGGATATTAGTGTTGAACGTGAGGCTTGCCCAAATAATCTTGCGCCCACGACGTCCACTTTAGTCACAATGGCATTAGGCGATGCTTTAGCAATTGCCTTGATAAAAGCACGTGATTTCAAAGCACACGATTTTGCCCGCTTTCATCCTGGTGGCAGCCTAGGGCGTAAATTACTGAATAGAGTAAAAGATGTAATGCAAACTAAATTGCCCATTACTTCACCCACTGCCGATTTTAGTACCATTTTAAGTGTAATGAATGAAGGCAGAATGGGATTAGCGCTGATTATGCAAGGCGAACAATTATGCGGTATCATTACTGATGGTGATATTAGACGTACACTTGCACAATTTGGAGCGACAAGTTTAAGCAAAACCGCTGAACAAATTATGACGAAAAAACCGAAAACTATTTTAGATTCTGTTTATTTAGCTAAAGCCGAAGAAATGATGAAAGCGCTACACATTCATTCATTAATTGCCGTAAATGACATTGGGCAAGTTTCTGGCATTCTTGAATTTTCAAACTAAGGATAAAATGGCAAAATCAAATTATATTACCCGTGCCGGCTGGCAAGCACTCGATCAAGAGCTGAAATATCTTTGGAAAGAAGAACGCCCAAAGGTAACACAATCAGTTTCAGAAGCAGCTGCATTAGGCGATCGCAGTGAAAATGCTGAATATATTTACGGTAAACGGCGGTTACGCGAAATTGATCGGCGGATTCGATTTCTTTCGAAGCGACTAGAAGCCTTACAAATCATTGATTATCATCCACAACAAGCTGGCAAAGTGTTCTTTGGTGCTTGGATAGAATTAGAAAACAATGAGGGCGAAATTAATCAATATCGAATTGTCGGTTGTGATGAATTTGACCCAACCAAAAATTGGATTTCGATTGATTCGCCCGTTGCACGTGCTTTAATCGGTAAATGCGTTGATGATGAAATTGAAGTACAAACGCCAACAGGCAAAGCTGTGTTTTATATCAATAAAATTTGGTATGACACAAAATCGCTTTATTAAGCCAACTGATTACTTCCCTTCACTTGGCTCTCAAATAGCGGTTATTTTTGGCCTAAATTTGCCAAAATAAACCGCTTCAGCTCACCATTATAGTGCTTTTAATACATTCACCATTTCGATTGCACCTAAAGCACATTCTGCGCCTTTATTGCCCGCTTTTGTGCCCGCACGCTCAATGGCTTGTTCAATACTTTCTGTGGTCAATACACCAAACATAATTGGCACACCCGTTTGTAACGCTACTGCACCAATGCCTTTTGCTACTTCATTACAAACATAATCATAATGCGTGGTTGAGCCACGTATCACCGTACCTAAGCAAATTACTGCATCATATTTACCGCTTTCTGCCATTTTTTTGGCAACAAGTGGAATTTCAAAAGCACCTGGCACCCAAACAGTGTCAATATCCGATTCTACCGCACCGTGGCGCACGAGTGTATCTACTGCACCACTTAATAATTTATCATTAATAAAATCATTAAAACGTGCCGTTACAATGCTGAATTTTAAACCTGTAGCGACTAAATTACCGGTAATTTTTGCCATGTTGATCTGTCCTTATCAAATAAAAAATTGTGAGATCACAAGTATTAATACTTGTGGTTAAAATAAGATGGATTGTTTGTGTAAGAGCGCCATTTTGTCCAACACGACGCTATTGTTCAAAGTTAAACATATGCCCCATTTTGATCTGTTTTACTTTCAAGTAATCAATATCATTTTGGTTTGGTTCAACAATAATTGGCTCACGTGCGATAATATTTAAGCCTTGTTGTTTTAAGCCACTAATTTTGGCTGGATTATTGGTCAATAAGCGAGTGGATTTCACGCCTAAGGCTTGGAAAATCTGCGCACCAATATAGTATTCGCGTTCATCTTCCTTAAAACCTAGCGCAAGGTTTGCCTCAACCGTATCCATACCTTTATCTTGTAGTTCATAGGCACGTAATTTATTAATTAAACCAATACCGCGACCTTCTTGGCGTAAATATAATACAACGCCTCGCCCTTCTTTCTCAATTTGCGTCATTGCTGCAGCAAATTGTTGGCCACAATCACAACGTTGAGAACCAAAGGCATCGCCGGTTAAGCATTCTGAATGGATACGTGCTAATACGGCTTGACCATCACCAATCTCGCCTTTTACTAAAGCGATATGTTCTTTGCCTGAAATCACTTCAACAAAACTATGCGCCATAAATTCACCATATTTAGTCGGCATTTTCACAACTGAAACCAATTTAACCAAGCTGTCATATTTACGGCGATATTCTTGTAGCTGCGCAATGGTAATAAAAGGCATATTATGTTTAACGGCTAAGGCTTGCAATTGTGGCATAGTCATCATAGTGCCATCATCAGCCATGATTTCACAACATAAGCCTGCAGGCTTTAAGCCTGCTAAGCGCGCTAAATCGACTGTTGCTTCTGTATGGCCATTACGTACCAACACGCCCCCCTCTTTAGCAATCAGTGGGAACATATGCCCTGGGCGACGAAAATCAGCCGCTTGTGCATTTTGCTCAAGCATTTTTAATGCGGTCAGTGAGCGTTCAAAGGCTGAAATACCGGTGCCCGTATTAATATGATCAACGGATACAGTGAAAGCTGTTTCATGATTATCCGTATTATTTGTTACCATTGGATGAAAACTTAATTTATCCGCTAGCGCTTGTGAAATTGGCGTACAAATCAAACCTTTGCCATAAGTCGCCATAAAATTAATATTTTCTGGTGTAGCAAATTCTAAGGCACAAATGAAATCGCCTTCATTCTCACGGTTTTCATCATCAGAAACTAAAATAATTTTGCCTGCCGCAATTGCTGCTAAGGCTTCATCTACTGTTGAAAATTGAAACATTGTTTTCTCTTGTTAAACTTAAATACGCAACGCCACGTAATCATTGTGGAATAAATTAAAAACCTACTTTTTCTAAAAACTCAGCAGTAATTGCATTTTTAGATGGTGTATTTGTCCGCTTCATTACAAACCGTTCGATATATTTACCAACGATATCATTTTCTAAATTCACTATACTACCTATCGTTTTTGTGGCTAAATTAGTTTGATTAATCGTATGCGGAATAATTGACACGCGAAAACTCTCCTGATCAGTATCAACTACAGTTAAACTAATACCATCAATGGTAATTGAGCCTTTTTCTACAATATAACGCATTAATTTAGGGCTAGTTTTAACCCGATACCAAGTAGAGTGATTTGCGGGAGTAATTTGAATAATTTCACCGGTGCCATCAATATGGCCAGATACAATATGACCACCAAAACGGCCATTCATTGGCATTGCACGTTCTAGATTAACCGGGCTAGCTACGTGTAACTGTGCCAACGATGTACGGCGTAAAGTTTCTGCCATCACATCGGCTGTAAATTGTGTTGAGTTAAAAGAAGTGACGGTTAAACAGACACCATTCACGGCTATGCTATCGCCTAAATGTACATCTTTGAGTACCTTGCAAGCATTAATGGTCAGTACCGCAAAATCACCTGATTGCTTGATATTCGCAACTTTACCCACTTCTTCAATAATACCTGTAAACATAAATTCTCCTGCTGTCAGCTTGCTAATTTTTGCGATGATGAAACGTCATAATCTAACAAGATATCGTCGCCTATGTATTGTGTGGATTTAAGCGTTAAATTAACCGCTTCCGCTAGTTGCAAAATACCTGCACCACCGATAGGACTTTTGGCAGTGCTTCCGCCTAATAATTTAGGTGCAATATAACAATGAATTCTGTTAACAACGCCAGCTTTCAATGCACTAAAATTCAGTGTTGATCCCCCTTCAAGCAAGACACTGTCAATTTGCATTGCACCTAATTTGGCTAATAAATCAACTAAATCAACTTGTTTGTTGGCTACCTTACATTGGATAATTTGCACGCCAAAGGCTTTCAATTGCGCTATTTTTGTACTATCAGTTGAAGCGGTTGCAATAATGGTTGGATATTGGCGCGCTGTTTGAACTAATTGACACGCTAGAGGCGTTCGTAAGTGGCTATCGCACACAACGCGTATTGGTTGTTTAGCATTCGGCATTCGACTATTTAACATCGGATTATCCGCTAATACGGTGCCCACTCCAACCATAATGGCGCTATATTGATGACGTGTGATTTGCACATTTTGGCGTGCTAATTCACCGCTAATCCATTTGGATTCACCTGTAGCGGTAGCAATTTTACCATCTGCTGTCATTGCATATTTAAGCAACACATAAGGAGATGTAGTTTGCATATAATGAAAAAAAATGGGGTTGAGCTGATCGCAAGCTTCTCGCATAAAATCAGTGATCACTTCTATGCCCGCTGCTTGTAATTGTTTAATCCCCTTCCCCGTAACCAGTGGATTAGGATCACGAGAGCCCACAAACACTTTGTTAATTCCTCGTTCAATAAGCAAATCAGTACAAGGCGGTGTGCGCCCATGATGGCAACAAGGCTCAAGTGTAACGTAAGCAGTGGCCCCTGTGAGATCTTGCTGACAATTTAAAATAGCATTACGCTCTGCGTGCCATTCGCCTACCTTTTGGTGATAGCCTTCTGCGATGATTTGATCATTTTTAACGATCACACAGCCCACTAATGGATTAGGATTAGTCCAACCACGTGCTTGTTCTGCCAGTGCTATCGCACGAGCCATATAGTCAACATCTGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015431|1071341:1077854|1073677_1074166_+|WP_010945070.1|DBSCAN-SWA MAKSNYITRAGWQALDQELKYLWKEERPKVTQSVSEAAALGDRSENAEYIYGKRRLREIDRRIRFLSKRLEALQIIDYHPQQAGKVFFGAWIELENNEGEINQYRIVGCDEFDPTKNWISIDSPVARALIGKCVDDEIEVQTPTGKAVFYINKIWYDTKSLY >NZ_CP015431|1071341:1077854|1074824_1076030_-|WP_010945067.1|DBSCAN-SWA MFQFSTVDEALAAIAAGKIILVSDDENRENEGDFICALEFATPENINFMATYGKGLICTPISQALADKLSFHPMVTNNTDNHETAFTVSVDHINTGTGISAFERSLTALKMLEQNAQAADFRRPGHMFPLIAKEGGVLVRNGHTEATVDLARLAGLKPAGLCCEIMADDGTMMTMPQLQALAVKHNMPFITIAQLQEYRRKYDSLVKLVSVVKMPTKYGEFMAHSFVEVISGKEHIALVKGEIGDGQAVLARIHSECLTGDAFGSQRCDCGQQFAAAMTQIEKEGRGVVLYLRQEGRGIGLINKLRAYELQDKGMDTVEANLALGFKEDEREYYIGAQIFQALGVKSTRLLTNNPAKISGLKQQGLNIIAREPIIVEPNQNDIDYLKVKQIKMGHMFNFEQ >NZ_CP015431|1071341:1077854|1076747_1077854_-|WP_010945065.1|DBSCAN-SWA MTDVDYMARAIALAEQARGWTNPNPLVGCVIVKNDQIIAEGYHQKVGEWHAERNAILNCQQDLTGATAYVTLEPCCHHGRTPPCTDLLIERGINKVFVGSRDPNPLVTGKGIKQLQAAGIEVITDFMREACDQLNPIFFHYMQTTSPYVLLKYAMTADGKIATATGESKWISGELARQNVQITRHQYSAIMVGVGTVLADNPMLNSRMPNAKQPIRVVCDSHLRTPLACQLVQTARQYPTIIATASTDSTKIAQLKAFGVQIIQCKVANKQVDLVDLLAKLGAMQIDSVLLEGGSTLNFSALKAGVVNRIHCYIAPKLLGGSTAKSPIGGAGILQLAEAVNLTLKSTQYIGDDILLDYDVSSSQKLAS >NZ_CP015431|1071341:1077854|1076085_1076733_-|WP_010945066.1|DBSCAN-SWA MFTGIIEEVGKVANIKQSGDFAVLTINACKVLKDVHLGDSIAVNGVCLTVTSFNSTQFTADVMAETLRRTSLAQLHVASPVNLERAMPMNGRFGGHIVSGHIDGTGEIIQITPANHSTWYRVKTSPKLMRYIVEKGSITIDGISLTVVDTDQESFRVSIIPHTINQTNLATKTIGSIVNLENDIVGKYIERFVMKRTNTPSKNAITAEFLEKVGF >NZ_CP015431|1071341:1077854|1074253_1074715_-|WP_010945068.1|DBSCAN-SWA MAKITGNLVATGLKFSIVTARFNDFINDKLLSGAVDTLVRHGAVESDIDTVWVPGAFEIPLVAKKMAESGKYDAVICLGTVIRGSTTHYDYVCNEVAKGIGAVALQTGVPIMFGVLTTESIEQAIERAGTKAGNKGAECALGAIEMVNVLKAL >NZ_CP015431|1071341:1077854|1072734_1073670_+|WP_010945071.1|DBSCAN-SWA MNYLTQATETLSLYSQAIDRLQHNLDQHFNQAVEMILNCAGRVVVAGIGKSGLVGKKMVATFASTGTPSFYLHPTEAFHGDLGMLKAIDIVLLISNSGETDDVIKLLPSLKNFGNQIIAMTGNRHSTLAQHADLVLDISVEREACPNNLAPTTSTLVTMALGDALAIALIKARDFKAHDFARFHPGGSLGRKLLNRVKDVMQTKLPITSPTADFSTILSVMNEGRMGLALIMQGEQLCGIITDGDIRRTLAQFGATSLSKTAEQIMTKKPKTILDSVYLAKAEEMMKALHIHSLIAVNDIGQVSGILEFSN >NZ_CP015431|1071341:1077854|1071341_1072643_+|WP_041603676.1|DBSCAN-SWA MQINLSQQPAPSIWGEKAILSAHQNGFTIHLHADSLTTIQKAARKIKNQNILNVSLVGEGWGLEECWAFQQGFVSVHHRGKIQYPPLAEQHAELEARLSCTDFARKIINEASNTLTPEQLAKQATEFITQQAIKYNLHNVVKFEIIQGQALDTANYAGIWAVGKGSANPPALLKLDFNPTGDENAPVLASLVGKGITFDSGGYSLKPSDSMSTMRTDMGGAALVTAALGLAIARGLTARVKLYLCCAENMVSSRAVKLGDLIHYRNGISVEVLNTDAEGRLVLADGLIDAAADQAQFIIDAATLTGAAKVAVGNDYHTVLAMDVQLVNQLLTAADAENEPFWRLPFAEFHRTQISSCFADIANISSVPVAAGASTACGFLSYFVPNYQQNWLHIDASATFHRSASDLWAVGATGLGIRTLANLLLSKATAKNT |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1154636 : 1169680
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP015431|1154636:1169680|DBSCAN-SWA 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15 | uncultured_Mediterranean_phage(12.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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