Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015201 | Chryseobacterium glaciei strain IHBB 10212 plasmid pMP02, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP015199 | Chryseobacterium glaciei strain IHBB 10212 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DEDDh,WYL,cas3,csa3,RT,PD-DExK | 0 | 1 | 4 | 0 |
NZ_CP015200 | Chryseobacterium glaciei strain IHBB 10212 plasmid pMP01, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015199_1 | 842914-843072 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015199_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP015199_1
>1.1|842941|39|NZ_CP015199|CRISPRCasFinder GCCTAACTGTACCTGAACATCAGTATTGTCATCTCCAAG >1.2|843007|39|NZ_CP015199|CRISPRCasFinder GCCGTTCTGAAGCTGATAAGCAAAGTTATCACTACCCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015199_1
The CRISPR arrays of NZ_CP015199_1 >merge|NZ_CP015199|1|842914-843072|CRISPRCasFinder CTGTACTCCTGTAGCTTCATTTCTTCTGCCTAACTGTACCTGAACATCAGTATTGTCATCTCCAAGCTGAATAGAAGAAGCTTCGTTTCTTCTGCCGTTCTGAAGCTGATAAGCAAAGTTATCACTACCCAACTGAATAGAAGAAGCTTCATTTCTTCT >NZ_CP015199|1|1|842914-843072|CRISPRCasFinder CTGTACTCCTGTAGCTTCATTTCTTCT GCCTAACTGTACCTGAACATCAGTATTGTCATCTCCAAG CTGAATAGAAGAAGCTTCGTTTCTTCT GCCGTTCTGAAGCTGATAAGCAAAGTTATCACTACCCAA CTGAATAGAAGAAGCTTCATTTCTTCT
>NZ_CP015199.1|WP_066751315.1|842032_842431_-|hypothetical-protein MFKLGWSVFALLIFLSVKSQLLDWDRINSNTVLNVIAGQNPDQMMSYSNIIQMGDANNAELSLNAKTNISIKQLGDYNSLYFNNSFTDTETKTAITTQGNNNIIDVTGSNSISDGLQIQVKGDNKTIFMRNY >NZ_CP015199.1|WP_066759484.1|841293_842022_-|hypothetical-protein MKNFYSLILCSFIFLSVSISGQEDKKINAKIESKTMEGQINLKAVVTNSTAIYKELNYLLVSIKKGNGGNLSNNQQSGKFSINPNETKVLSEINVNLEKKDALKVFLYVKDEETQKLIAKDSLELNNDSFKKKVSKVEEDVVFELKGLTIDETKSKVGKDFYDFFYLQYSQLPDKSNSAITISELPGRGTNGQINIEIDDKVVYSFMTNPSEDYLKEQLTNSLKYIKEFNAKKNLIKNEFIY >NZ_CP015199.1|WP_066751313.1|840871_841282_-|curli-assembly-protein-CsgF MKTLILILTFFAGIFLGKSQQLVYKPVNPAFGGDTFNYQWLLSSANAQNQFDQKNDYSDLLGNLNSVDSFSQSLNRQVLSELSRKLFEDQFGEGSIQPGNYLFGSMYLQVTTTAQGLLINILDTSTGDQSEIVIPK >NZ_CP015199.1|WP_066751311.1|839474_840839_-|curli-production-assembly-protein-CsgG MRAYTYTRIFFCAVMLCVIQACSSLFGLPSNPEKSTMGENTSYTAELKNLPLPKEKVVIGVYKFRDQTGQYKPSENGNNWSTAVPQGTTTILIKALEDSKWFIPIERENIANLLNERQIIRSTRQEYLKDAEKNSQALPPLLYAGILLEGGVISYDSNIMTGGLGARYFGIGASTQYRQDRITIYLRAVSTLNGEILKTVYTSKTILSTSVNGSFFRYIDTERLLEAEVGMTQNEPVQLAVSEAIEKSVKSLIVEGIRDKIWGKSVDNTVDYQALIDNYNREQEQNQNRAIGNRYPDNQRGKFSIFAQAEGQKIKDDYINPKMNIGGKLGFKYFISPNFNVEVSGNYFTLENENIVKRNYFVPEVNLEFLVFPKYKFTPYIYGGLGAMYSEFKPNYKGQVGGGLEYLIDKNVAVRASAQYDLGFKDNWEGLVNGKRKDQAMRFALGINFYIGNK >NZ_CP015199.1|WP_066751309.1|837951_839463_-|carboxypeptidase-like-regulatory-domain-containing-protein MKTLIQLISIIIFSVCLFSCNEELVDQAQTGILKGKVVKRGTNEPIANVKIFTAPTTQTVFSGTDGSFEIANMPVGNYSVKAELSGYLTNFQAVNVQNQNQVVTVVFEMDDDESLNSPPTTPVLLSPVDNAVNQPLSVELTWNATDPDTTDVLKYSLTVKNNLDTNVIQVNDLTAKHYSLSNLKFGVSYFWQVSVSDGIHQPVLSSISKFTTNTVPSNRYHYAQKQNGNLVIVSSDASGNNFQFTNSSYNSWRPRKNNNAGLIAFLRTEGGSAHLYTANPDGSNLFKVTSVPVAGFNNFEMDFSWSTNGQELIYSNFNKLYKINKDGSGLTLIYTTLDGSMISECDWSYDGSKIALKTNDFNGYNVKIYIVDMVGSVVKTILTGVAGAAGGLNFSVDGQLLLYTKDVSAYQDGSGNYRQLDSRIFIYNLATNTNIDISTESDKPLGTNDLDPRFSPNNAQVIFMNTSNDNVSQKNVMTIDLSSSMTDLIRTALFSNAEMPDYE >NZ_CP015199.1|WP_066759483.1|837109_837757_+|response-regulator-transcription-factor MKPRLTIFDEPVLYTEGLSKLLTQSKIFNTIDVFNCYEALSIQLKKEPPEFLMISSNMLMLTELYKSVESITSENKNIKIIIIGNSYDIVDIRKLFNKGIKSYLDKNSRYDEFIKSIQALLLNEIYICDHAKDRMINFISSEHAQKRLQIKDPLTRREMEILKLICDGLSSKDICEKLFISINTVETHRKRILLKLNVKNSVGVVKYALENHMID >NZ_CP015199.1|WP_066759482.1|836412_836889_+|OsmC-family-protein MSKDHHYKTTIQWTGNKGTGTSNYRSYERSHTVSIENKAIIEASSDPAFRGDKTKHNPEDLFLSSLSSCHMLWYLHFCSEAGIIVTDYTDNATGIMEETTNGSGHFREVTLNPTVIITEESMIEKAKELHHKANEFCFIANSVNFPVKHIPLVLVKSI >NZ_CP015199.1|WP_066751307.1|834742_836302_+|ribonuclease-E/G MKKELIVSHEGDFTKIALLEDGRLCELHEEEDKSDFIVGDLFIGKVKKLAPNLNAAFVNIGYDKDAFLHYQDLGPQYLTYKKFLKDTISKKQSTSSLKSFEIQPEIDKNGTVEKVIVKDDLVLLQITKEPISTKGPRISTQVSLTGRFLVLIPFDNKVSISKKIKSYEEKERLRTLIESIKPEGFGVIIRTVAEGKKVADLHNDMNQLIQKWESTFKNIQKNKFPSKVLSEEDKASAILRDNFNQDFVSIICDDEQMVEEMKNYVEVIAPERKNIVQFYDSHIPLLEYYNVEKQLKQSFGKHVNIPSSKGAYLVIEHTEALHVVDVNSGNNITTGNAANKEHALNVNKMAATEIARQLRLRDMGGIIVIDFIDMPNPDHRRDLFEHLKAEMMRDKARHKILPPSKFGLIQITRQRNRQEKQIETKEDNPNKDGEIIAPIVIVERLEETIRNIIQKDKGKLYLHVHPFVEAYLTKGIKSIQMKWFIKYKKWVTIIPRDSFKYLEYKIYNSKKEELIGYSN >NZ_CP015199.1|WP_027388329.1|834076_834367_+|integration-host-factor-subunit-beta MTKAELVNTISNKLGTEKNETQKVVEAFMQEIRTSMYNGDNVYLRGFGSFIIKTRAAKTGRNISKNTAIEIPAHNIPAFKPSKSFVEKVKTKVTVK >NZ_CP015199.1|WP_066751305.1|833265_833937_+|response-regulator-transcription-factor MSKLLTNTVRFSIADSDFYFKKIMIKTLMENPFYMLLNDCNNGHEIVNRIYRRQEDVFIIELFMPVLSGIEAIKYIRKSNSETPIITYSGTYQEDMAEILSKIPNTFYCQKKSSVIKDIVKGQIASNTFDYEAYSKEWEQQPLAVQEYMDRQKQSQGELSSTEIQLMKFCYEGFSNKEIGEKLNLSTRTIDTYINRLTEKLGLKTKLHLIRFCVENGYYNSSM >NZ_CP015199.1|WP_066751319.1|843712_844342_+|CoA-pyrophosphatase MENFGKDLLRKIKSVELPGEHAHGVFSPPSRPVFTYDEVLAKNPKFAAVNIILYIKDDEWYFPLILRTENERDRHSGQISLPGGKREETDRDFAETAVRETSEEIGIEKHYVRIIREMSPIYIPPSNFYVYPYISYTKKDPKFILQHTEVVETIEFPITSFLNLPDKPEIMALPSAGGHEVPVINFNGYIIWGATAMILSEFSQLLKKM >NZ_CP015199.1|WP_054511251.1|844369_845176_+|1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate-acyltransferase MAKKNIFTDAFGTPYFLKRLIIFILGLVSYRRFNGFNKLKITGTEHLVDLPDSNVLFVCNHQTYFADVAAMYHAFCAVNNGYLDTIKNPIYLLNPKIDFYYVAAEETMNKGILPKIFKIAGAVTVKRTWRAEGQNVNRMVDLTEVDNIMKALDNGWVATFPQGTTSAFAQGRRGTAKLVKNQRPIVIPIKINGFRRAFDKKGLRVKVTGVKPTMEFKAPLDIDYDNEKAPEILLKIMTAIEQTEDFNVLHNYDEELKAKKLEQKDSDN >NZ_CP015199.1|WP_066751322.1|845188_845626_+|hypothetical-protein MKRIIGILFAIIVLVSCNSQKVYSDFDISYSKNGGPSPIYENLLIKANNVHYSFEGQGKKIKKEFKLTNEDLKKLDNVLSQNNFRRIQEDRKKLYDNVTTSINVKKGPNEGSKTDASLVMPNYKTNWDNILNAFQEIINNNVKKQ >NZ_CP015199.1|WP_066751325.1|845631_846969_+|peptidoglycan-synthetase MNTHFIAIGGSAMHNLAIALKDKGYQVTGSDDAIFEPSKSRLEKKGILPQEMGWFPEKITSDIDAVILGMHAHQDNPELAKAKELGLKIYSYPEFLYEQSKTKTRVVIAGSHGKTTITSMILHVLNFHQKDVDYMVGAQLEGFDCMVKLTQDNDFMVLEGDEYLSSPIDLRSKFLLYQPNIALMSGIAWDHINVFKTFDDYIEQFRRFVASITPGGVLVYNEEDAEVVKVVETAENYFRKIPYKTPEYEINNGQVYLKTEMGDIPLSVFGAHNLLNLEGARHICHTLGIMDEDFYDAIMSFKGASKRLEKVEREDKGILYKDFAHAPSKVKAAVKAFCEQFKNEKKYGFLELHTYSSLNPVFLEQYDHAMDGLEEAIVFYSEDALKIKRMDPISPDLIKEKFKNENLKVFTNAEELHAYWETLDKTNGVFLMMSSGNFGGLDLTK >NZ_CP015199.1|WP_066751328.1|847098_847974_-|aldo/keto-reductase MQKKTYTGQPVITLNNGVDIPALGFGVWQIDDQKVCEDTVIKAIQTGYRMIDTAAIYQNEVGVGKAIQNSGVNREDLFITSKLWVQDTTYDKATSAFHRTLDRLQLEYLDMYLIHWPYSDFIGAWKALEELYHEGKIKAIGVCNFTVEKLEELKANSSILPVVNQIELHPIFQQKELQVYNRENNIVTQPWSPLGNGNAELLNNESLKAIAEKHNKTVAQVILRWHLQEGFCAIPKSVTPSRIEENFNVFDFELSEDEMNIVRSLDTGKRLFFDPKDPEWEQKMLNVVVDI >NZ_CP015199.1|WP_066751331.1|848213_849809_+|T9SS-type-A-sorting-domain-containing-protein MKINYKKMVPFIGILCSSAITAQAPAIEWQKSLGGTNSDRAHTIIQTADGGYMISGASNSNNGNVTGNHGNQDYWLAKLNATGNLQWQKSLGGTGTDYGSSIIQTADGGYVVAGTSDSNNGNVTGNHGLTDGWVLKLNSDAGIIYWQKSFGGTNYDVINQMIPTTDGGYIFAGNSSSNNGDVTGNNGYVDYWIVKINADGNLQWKKSLGGTGDDRAISIVQTNDGGYAVAGYAENNNGDVIGNHGGKDYWILKLNTDGGVIFWKKSLGGSHQDLAYSIKQTSDGGYIVAGNAFSNDGDVTGNHDGTDAWIVKLNSDGNLQWQKALGGTKVDDASSIIQTADGGYLAVGSTTSNDGQVTGYHAPSSTGPGEAPLSYDYWAVKLNATGSIQWQKCLGGSGSDEASSVIQTADGGYVIAGSSNSNNGDVSGNHGDYDIWVVKLAQDNLATNEVLKDDIKVNIFPNPTKDNITLKLDYSTPSMEVTITDMLGKIIHTQKLEGLTTKINTNNLKKGVYFLNLIGGKENVSKKFIKE >NZ_CP015199.1|WP_066751333.1|849961_850903_-|LysR-family-transcriptional-regulator MVNLEWYRTFKAIYKTGTLTGAAEALFISQPGVSLHLSSLEAYVGYKLFDRTGRKMHPTERGKVLFNAVSDPLTKLEDVEKNFQKSTEKTTPTISVGMCFETFQTTLEQYVSSLPFNLIISFGEYPEMLDQLDKGILDLIITPKKGISPNIQHEAFSSEQIILVGGKDVDTESFKKVLKTKDKEQIESWLKEEKWYGTTGDMEHLFQFWTLNFGHKPDFRANYIVPNLNSIIRCLKGGKGLAVIPDFLCKNEIENGEVKLIWEGEKKLENTLYFGCRKNTSYQSEIAHIKGLFRQVMSKDAFTADSQISMILE >NZ_CP015199.1|WP_066751336.1|851040_851781_-|metallophosphoesterase-family-protein MQIAIFSDVHGNLPALEVVLNDIEERGIHQKFCLGDLVDFAPWGNEVIEKIKNLNIPCLMGNHDERIAFDIPVIPLTKHSEEETAARFLAIDHSKKYITKENKKYLSELPFHLKLNYKIGKKHWNIQLVHSSLKSNDTYLYESENDNIFIDLLNDSQSDVVIMGHTHLSFKKYFDGKWAINSGSVGRSREENRLASYVILTLDEDNITPEIIQLEYPLEEVAQKIEESEIPNYYASFLRNEKLSVF >NZ_CP015199.1|WP_066751338.1|852130_852745_+|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MKKVLIINGGQNFGHSGGKYNKTIADSTLEVLQKFENVEVKTTTIDEGYNKDEEVQKFVWADVIIYHTPIWWFQLPNGFKKYIDEVFTAGHAKGIYMSDGRTSDNPQTNYGTGGMLGGRKYMVTTSWNAPETAFTLPGEFFNETSVDNGPLFGFHRMNAFVSLEKMESFHFHDVEKNANIERDMKVYKEHLTNIFEQELKPQLA >NZ_CP015199.1|WP_066751340.1|852744_853032_+|antibiotic-biosynthesis-monooxygenase MKIYLTAVIKAKEEHRTEVLEVLQNMVSETRKEEANELYTLHQGIEDKNHFIFYEIWKDQEGLTQHNQQPYIQAFGDLVDEKLQEKPQIYLTNII |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015199_2 | 4718560-4718783 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015199_2
|
3 spacers
spacers of NZ_CP015199_2
>2.1|4718583|34|NZ_CP015199|CRISPRCasFinder TGACCTTGTATTATTTTACACACGTCAGCCAGGA >2.2|4718640|57|NZ_CP015199|CRISPRCasFinder CAATCGAATACCTGTATCTCTTTTACTCAGGTTGCTATTGTGCAGGAAAAATTCCCA >2.3|4718720|41|NZ_CP015199|CRISPRCasFinder CAGCTAAGAACCTATATCTTTTTTACGCAGGTCGATTGACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015199_2
The CRISPR arrays of NZ_CP015199_2 >merge|NZ_CP015199|2|4718560-4718783|CRISPRCasFinder ACCTAGCCTTTTTTTACGCAGGTTGACCTTGTATTATTTTACACACGTCAGCCAGGAACCTGTGCCTAACTTACGCAGGTCAATCGAATACCTGTATCTCTTTTACTCAGGTTGCTATTGTGCAGGAAAAATTCCCAACCTATATCTCTTTTACTCAGGTCAGCTAAGAACCTATATCTTTTTTACGCAGGTCGATTGACTAGCTGTATCTATTTTACACATCT >NZ_CP015199|2|2|4718560-4718783|CRISPRCasFinder ACCTAGCCTTTTTTTACGCAGGT TGACCTTGTATTATTTTACACACGTCAGCCAGGA ACCTGTGCCTAACTTACGCAGGT CAATCGAATACCTGTATCTCTTTTACTCAGGTTGCTATTGTGCAGGAAAAATTCCCA ACCTATATCTCTTTTACTCAGGT CAGCTAAGAACCTATATCTTTTTTACGCAGGTCGATTGACT AGCTGTATCTATTTTACACATCT
>NZ_CP015199.1|WP_034706501.1|4717878_4718139_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MRVNLVTKEDLQEFKTELLEDIKNLFNIKISEQKLWLRSSEVKELLKISTGTLQNLRVSGTLSYTRVGGTLYYNYKDIEKMLNGKG >NZ_CP015199.1|WP_066759173.1|4716141_4717131_-|site-specific-DNA-methyltransferase MSIGEKLTQKYKSKLGKLFVGNSLELLTNDKKLSKLKGKVNLIVTSPPFPLNNKKQYGNEKGDEYKDWFIKLAPIFSDLLTDDGSLVIEIGNAWEPERPVQSLLHLECLLGMVKHPEANLRLIQEFICYNPSKLPSPAQWVTVNRLRTVDSYTHVWWIAKNDFPKADNSKVLRPYSDSMKQLLKRQSYNSGKRPSEHQISEKGFLKDNGGSISHNFFEMEALEEKREVRLPHSVLSFSNTNSNGYFLKTCRDKGITPHPARMSGGLVNFFIQFLTDEDDLVLDPFSGSNTTGYCAEKLNRKWISFEIKEDYIKQAIIRFSDPELKSPLK >NZ_CP015199.1|WP_066759171.1|4714113_4716132_-|DUF87-domain-containing-protein MKTVDKIKQLVSVDPLKVGKQTELFVGHPFSLDYNKANILVCDADKERVKGIAQGTFLLAFYDNEETVEEAILLRALAPAKLPTDSAMISSMIEYYKDNLPTSGKSSKLDDFTRYEFSFSGLECRVLGTFYRNGNNVEFGADLENFYSAHHYSVYKVNKDVLGYIVNQRDSPDIIPGNDNEFSIGHVRYSSSLRFQSKNEEDKAEVYIHPADLLGKRTALFGMTRTGKSNTVKKVIEATSQISSKATATLPSKSPNTIEENLKSFDTNGAPKYPVGQLIFDVNGEYANKNLQDEGTAIFEKYKTNTVRYSILEKSDADFKIMKVNFYKDIVTGFSYICASLEDEKGDYITSLKVLDFTPPPLDNEHFDEWTRYNKNKAIYFCCLNKAGFNPSTNFTVKFKADATIKKLVSEKYKELDIEKGVSLDEAESWFLCAWENINDKVFTDYKKKKGKDWFSDEMKSLMIFLTQKKDGRSVSGFDKFKKVAKMHTNTTENSFEVDISKHLRKGGIVIIDLSQGDPKLQEIFLERISKKIFSDSMSRFTDSLPNNFIQFYFEEAHNLFPKKDDKDLSQIYNRIAKEGAKLNLGMIYATQEVSSISSNILKNTQNWFIAHLNNEDEIKELRKYYDFDDFADALIRFSAKNDKGFVRMKTYSNPFIVPVQIDKFSVEISTK >NZ_CP015199.1|WP_066759169.1|4712767_4714108_-|DNA-double-strand-break-repair-nuclease-NurA MAYSSRTGKRPDELASKSSHSFLINDEEVQSFLENCEYPKSAEEVELDRSRIIKIQYPEENSIEHIIAMDGGYSTIPVRKTFPSSLITFFQFGEIFLNTEDLNNMSEMPFISRESMSALKDLERSKLVLPTKNVSYNSNITLTHSVRSTIYEYFKKKGDEKNNLLSTTYWLIFNLFDQPEESFNLTICPHCKGKNQDILRANFNSEYTTNCPECNGILYLTDCFRLHEVIDDELGAGGILGYLVNLIEQINIIHTIKYIKETQPKLLDKFFFIKDGPLAFFGQTANMHKHVRKLCNYLFEHHNLFLAGLEKSGAFVEHADEIKNLLEPGEALLLTNKHIYSYILPGDPENTQPYAGTSYYSSKIIFKSRDERVYVITLPVENENIVLNPQKDDFKNLDTILWNIEKLRCDMYDNSIVPVALANKLISLSSHPSSSILEKFAKKHTK >NZ_CP015199.1|WP_066759167.1|4710569_4712771_-|AAA-family-ATPase MIYVERNIIPVPKVFYSKEVEIAKKRLEEFYLKSKESRSQQKYSQPFEKELRDKFLEALREVFKGKCAYCESPISFNRTQSEYDHFRPKGGARGLDKEFSTDHYWWLAYNWNNIYLSCSHCNQYKSTWFPVEGKRIPLNTPYKEVVDNEKALLIDPCIDKPEEHLIFNEQGGIEAISSKGITTIEILKLDRSELVNSRLEALKELYGEWELLLKLLRKKESNRDDIKKLYDAWQYKYTIHSGEPYLGIQRFMLSKWLGNRPEIQEYLSTIDGKETKTPVNTLAQDFLYSKAENFKETEKDNIEQSISSIKHIYVEKIELKNFKCFSSLELEFNHNSDSLIGNEPWLLFLGENGVGKSSLLKAFVIGLTGDEYIKSLELKGRDLLKHGARNGFIRIHLVGAIRPIEVTFNKTEIKTTLHQPIVNIVAYNSIRLNPKEGKIQPEKGDFYGAKAKNLFDYTFSLIDADTWLVKLFKKDKDAFDRVAISLKDLMLLENDDTISIIKNQPIIKRNGDVFSIDELSDGYRSIFYLAVDIMATLAGENVTFDLAEGMVLIDEIGTHLHPRWRMEVVTRLRKAFPKIRFVVTTHEPLCLRGLRAGETVVLTKNQENEVIALTELPDPSELRVDQILTSDFFGLKSTIDPETERLFDEYYLILALEENDRTEEQKNRLLDLSQIIPRIKHLGDTEREELTYYVIDELLARRTREDGPKIKEELKAEALKRVESIWKTLDTKK >NZ_CP015199.1|WP_066759165.1|4709669_4710563_-|hypothetical-protein MIKVDRSQVSKPSALDKKNKAGKTETERAIEHYTSPTFDGTTNFDFKIYSDSEVKQALINLFKGKCAYCESTFLHVYSGDVEHFRPKGEIEEASPHKKPGYYWLAADWHNLLLSCRNCNQKLSHSLYGIGTKKTMGKMNQFPLSDLTKYVRKHDNVNGIADEEPHRLLLNPCIDNPEDHLEYGDEGVIRPKKDAGGNKSVMAEKSIDVYVLQRMYLVQSREKKLIEMQAQIQRVKEATENYNDIIGSPDTTKKFYFERILKREMEGLKKFLNPKEEYVGMARQVVGEFLRVNFGITI >NZ_CP015199.1|WP_066759163.1|4708869_4709667_-|HNH-endonuclease MNWVKENRNKLSINNYVRKADAKTNYWLDLSEGRINNYRKLTNDNFNIIIYGNDNLETDFYIIPFEELKHLLLENNFAKSEGRRRWIGNIINHHISLSNTGVKLNISHRYSNPIPFKVEPLILNIESTNDYAIENAKREIQVRIKQSAFRKKVLENFDYKCCLTGIIENDLLVASHIIPWASKIDTRLSPHNGLCLSTLYDSLFDKGYFSIDEKYQVIITPKLDELSLQTQNWLSEISGKTISLPLNYEISTVALKFHREKVFIK >NZ_CP015199.1|WP_066759161.1|4707070_4708822_-|hypothetical-protein MKLTGKIVITFNDIFPDEEPKSINEYLDGIDKDLLLKFGTFLLGFSQNSKYENPLEFLKMYFSQENQEFFNKVLSGLDQFIKQTKWEIESYSFPYVASSLSFFENAFDKEYEITKNYTNQEIEIRVFKAYLLFNKFNTTDRTLILNDSLKYLKGDRSKYATAYCIGLFLNNSDLVNYDIKKVFTTQVLRAISFFEFLESRNDTRELLKEFYKEYDISNYQEYIKRLLPIQIAVLKKEKESHIDIDITQNDGKESSISFLNKFSIKESELLKDFDFKNIRSSPMYRFDEKTFRLIFPLFVLELIGNGLYFKFKHINDRLAKEKKAKDLYGLKTYDFSEKYILHKILKEYFGNRYFQKNGDELDAQYDGAPDYYVRNGKKIFLFESKDILINAIAKQSSDFSKIEKEMSIKLYKNEEGKPKAVLQIINNIRKILSKKLEFDSNYNTKNLIVYPILVLHYRIFDTAGLNKWVNFWFQEELNKLGKEGFYTSNIKPLTLIDIDTLIFHKEVFASRKLSLEEVLNEYGNDYINFTAKGKKYRSEEDVIQASKNSFIPFGHYLDNKIDLKKLREVPKEFMEKTYGLLNK >NZ_CP015199.1|WP_066759159.1|4703002_4707049_-|hypothetical-protein MYYKNKEKIEAIQNIIKPFEIDRNHNKNDKALQADIYWNASIFFAKILIKAVIQKNYCSKEDVEKFSKKYNTENNTSIDIDSLFKKFWLREILGIIHIPDAVRKVIYDFEKNQSYKEELRFVREVYKTYQTKTTNKTEYQKFIAQYKIKNNVNLDKEWLSTNWIKTSKKSKDDIDVGNIIYYSVLLDNWDEFEFLYKLKKNKLEYNSKGLELSKKNFNAIHTAHQLYFIKAPSIDDLKEQRIIKEIDNKYYINFYDCEISYWGTLSDTIGGFVWEDLISDDKIPDDKERVIIFVRKMLYWENSWSDFYKHITKESKNRFIKSALELILEEQDIVGVENEFFKCFIDESVGSRYAFQGGIDLVEEALKPSTNYYELYEHMRFLSKKHQGNLFYIQEVRNDLAFLIKTIVCCDNPFSKTKGSDSEKIEHYPLIKSLLENSLSKPYLLWETCHFLIQDKPTIIPYLMEVPYFSTLAFSLVDKLKIESSIAEINRSIKFKLIEDSIKLSLDSILSSQKHTNKEIALLIFQFYKEINKDKYQSLSNVRREEDVYEIREYQKKKEQLLISIIEDCRVNGFDTYNSSSEFLLPKIISELIEIFKNYEEPILYLNGTIQFPILVLDGLSWLSKCSIYSKYEKQIQDIEDIREILSDSFKEIYLDKIEQKSVQKKDFQSNNIIESLPSWAERNERLNLIDWVYPVALLSDSEKLKEFLSPRINLKKAEHEYDEENRFNASKIRTHLFVLLTVLKKITTNKAEYFLIYDKLKDVKISIEQNILDLLKQYAVVGKPSKIDILSSSFEQKVFRASKEEELLPQVAQAINWFGDKNKVITILIDTSDLLRLLIILDWVTSEGIKKEIIERIKKAKLIDFFKSQSWIPEIELTLSKLSHYKELIVQTEEALDYWEKNITSKRNEIEYKQASFVVRLMLAYNQKDIQQINNLEEPGKNAFEVRGFKPYDYKQFFIGLIHFEDKPKEAYKIFDRLYNQFKESSSVCINRFAAKINWATKNDDIIIKNKLLNESLEEWEDAGKNLSEQSIESIIDKVWVNKLTVYYHLKNVTEFEQLFLSLPDPYQMMEEVAKMRIELFLEHIKQQEAIYYLNKVKEYHKFSDGSNLDFINELSSLVDDKSNIELLKASYNEIFSKKPQTLIKIFPEKLNGQIDIGNFIAKEFAIATNKALDKILSIDEIKNEDKYNDLVQICLESRFSVFGWIVKDQTRGAFSGRGLHPGERDILIQNSNSETILVCEAFIYRDVRTTQSHLKKIFNYHHQKENLLVLIYDLGLSSNFENKWKKYLKETLPKLNYPTDFEIDSSKTKDLTDNLNYKASAIKIAMTFHGKSTTIHHLMINLKYKI >NZ_CP015199.1|WP_066759155.1|4699354_4700107_-|hypothetical-protein MRKIKLHFYAVVFIAGIKVHGQVGVGTASPYPSAVLDLNSSKKGLLLPRIALTSTADITTVSNPAKGLLVYATQNAGTGITAIQKDTLYKFDGTNWKAFTTREKFIANELPKIVAVGRKTTTEPCTAATTNGLFNLNVRSSTSITATGAFTAPQAGYYMFSVRIIQLMAPSPSQPFNASPYIQAQNLATYSYLYRGSGPSAQPASVLGVIYLASGASTQGFRWFLGNNTCTTDSRIQGQEVTWEYLGNPL >NZ_CP015199.1|WP_066759175.1|4718924_4720625_-|AraC-family-transcriptional-regulator MHYHHKISLLIFNLFFFFLNAQELQSLSYKTISDLYENYPENDSRAMVFVNKYIEKAKKENNWKKQIIGYEDAIYYTEDINRKLSYADNAIVVAFKLSDRDIISRAYLGKGIVYYYNKRQYKYALEQYLKAYQFSRNSSDDYLINKIDYHLGMVKSYLGYYEAAAVHFKNTTKYFEESMKENLHPNIRLNNESGYFNSIYRLSNCYENLRLYNKEDSLISIGLQKLKNINEHLLEYGYFQKGKGVQLLRKGNTDEALKHLKLSRDILVNNQDYNSLTAVYFYLGKLYWLKGNRAESLVYLNKVDSMINKVQFTTPEIRSSYKYLITDATENGSLGKRLYYSDQFLLTNSTLNVDFAMLSSKIHEEYDTERLLEEKQLLENKLRNDFYFLVATPVIFVLLFFLVIKLRNRERKFPGKFIKLWKKFRKYYSFLIANKKTSEKKKTHNPEIIDDIKEKLKKFEEDRRFLDKNLTLPMVAKMFGRTHSQLSYVLNEHLNVSFTQYLKVLRIKYITALLLENDLYLKYNIENLAHECGMSSRQLFSTHFLEINGIRPIDFIKNRMKEIDEN >NZ_CP015199.1|WP_157886092.1|4720898_4721327_+|hypothetical-protein MKKVKTRVVEFISYFFILLFCYAGISKIMDFENFQIQISESPLLSAYAAFLPFAIIILELIIAGLLCYRKTRNTGLIGSFILMLIFTGYIFFIIHTSENLPCSCGGILEKMSWNQHLIFNIGCVLLDAIALIMNIKYSRPAR >NZ_CP015199.1|WP_157886093.1|4721607_4721922_+|hypothetical-protein MKFNQFLKMNAVAIAAVMFTGATMSFKIIEKKTADQQFYYNSTDTSAGAFSQESNWAVGAGSSCLTTGNKPCTISVPEGQDLVDVIGGMTNSQVLAIHPSERRQ >NZ_CP015199.1|WP_066759182.1|4721983_4723333_-|RagB/SusD-family-nutrient-uptake-outer-membrane-protein MRKIKILVISLSLILTSFGCSDFLDEKSDLKLATPDRLEDNQMLLNNYGFLNVDFASSGETSSDDYYLTDADYYGLSFEASKRLHIWMPDNVASPISSGNDWSTCYRSIYVCNAVLFNMQDKNFTGEQADNIRGQALALRAFRYLDAAQIWCPAYNPQTAGTDLGLPLRLDPDMNIPSVRSTVKQTYNQIISDLQTAIPLLLPKQISGMRISRAAAYGLLARAYLYIGDYNNALKNTEQALNINNDLMDFNILNPNADYPIEEMNKEVLLWTAMGYESHLIPAKIPDHIYQMYDNNDLRKTVFFNKNTANEVLFKGYYNNVNGPIVSVATDELYLMAAECNVRLNKIQEGMSYLNNLLVKRWKTGTYIPMTANSQAEALNIILKERRKELLIRGLRWSDLKRYNRDGANITLTRTVNGQTYTLSPNDLRYAIAIPEDIITLTGMPQNPR >NZ_CP015199.1|WP_082891219.1|4723344_4726524_-|SusC/RagA-family-TonB-linked-outer-membrane-protein MKKLLVLPILCYCVPIMAQQMFTGSVIDETTRLPVMGATIAIQNSKTVTTTDKNGKFSLSTNDKKINLVILGKGYEEQVIILELPLKETLKINLSEKIAQIDEVVLTTGYQKIPKERSTGSFSSVSNSALNTQVSINILDRLAATANGIVINKGTSQGGAQIMVRGLSTIQGPKTPLIVVDNFPYDGDISNLDPNIVENITVLKDAAASSIWGARAANGVIVITTKTAKYNQPVTVNFNTYLMTSPKPDFNYLKVMSSADFIDVEQELFKKNFYNTDINSTSHPVLSPVVDLLNKEKKGLLSSEYVRNEIERLKTIDSRDQYRKYMYQPLENRQYSLSMAGGAPQFSWTSSLGYDDNTGNLGEKYERVNLRFQNTWQPLKNLTLNTGIFFTHSATQNGRSAYGSIIMKTNSVPYMEMADKYGNALAVSKSYEQSYKSALGNGKLLDWNYYPLTDWQHNSAKSKSSEIILNAGLNYKILKGLDVDIKYQYQRTTGLSNTLYDEESYFVRDYVNRFTVINSNGSLTYNVPKGAIMDKNNSQLLINNFRGQLNFNRGFGKHQISAILGSEVRDANSQSGNNRYYGYDPNNLSFGMVDLSKRFPIIAGGTAFIDNMNSLRESTNRFVSVYANAAYTFDNRYTISGSARRDASNLFGLKTNDQWNPFWSTGISWNVANEKFYSVSWLPNLKLRGSYGFNGNINPAMVAVTTMALLGVSTYTQEQMARFDNYYNPQLRWETIRMINAGLDFATKNNRISGSVEYFQKKGENLFGQVPLDYTIGLSSLVWNVAGIEGKGVDVELKTININKSFRWLTTLNFSTYKDKVTNYYPSSTIARNFVLASVPISGIEGLPVYSMFGYQWTGLDPQTGDPRGYFNGEISKDYAKIMGADVKELQYFGSAIPTVYGSFTNTFAYKQLSLDVGITYKMGYYFRRPSINYTSLFREWNGHSDYEQRWQKPGDEAFTNVPSNQYQTNSNRDAFYAGSAALIEKGDHIRLQYINLGYEISKKQWRGLPIKSLQLYANVGNLGILWQESKSGIDPDFNLGNNTLKPPMTCTLGLKAKF >NZ_CP015199.1|WP_082891220.1|4726582_4727884_-|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKNIFCRGLMSFVFIIVFTTTSYAQNKSLKIGESLPESIWTNPFPVVNHSRKATNLSEDKNKLILIDFWSTWCSACLMSLPKIEALQQKFRDRVKILPVSSQDRFALDKFFSSPNGKKYKSMMSTYEDKALHELFPHAGVPFIIWIKDGKFFNSTDAGQLTEQTINEVLSGDKSSLQTIIQMNRERPLMLSDDYDRQKNVQLLNYSFFAKGKIPDIGAGGTYRKTATGKIHGRQFTNLPLWDMYYAIGYELFKRQDKTSFTEKRMVIDVNQPEQLIPIEKADGSNDGTNLYNYEFIIPEQKSDSLYNYMLEDLNRYSGYTVTLEKRPVKCLVLVRTSTKDKLATKGGEKRSTFPRTPSILRNVPLKNMVNMLNGEINIKELFIDETGYTGNVDLEVSGVKDIATLKKELQKYDLDLRPEERQLLMMIIKDQLN >NZ_CP015199.1|WP_066759190.1|4728503_4728752_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MDEEKEVIIAICKYVYTNWISKAKSQREFASKCDIEESTVRRIKNIALGTSKTDYNMSVKTIAKICRKKEVTLEELFQNIKK >NZ_CP015199.1|WP_066759192.1|4728912_4729965_+|nucleoid-associated-protein MPKESVLTQAEKASAKIEKFIFHIIIESELNPFFLDEVDLTDEQLDFFRLQFLEAAEGTQFDFNDNSTSEVYKNCEKIIENPSENFFTISKDLTASFKSHHKKNMNDGVFITALVSINDSNNLIFLLKLDNRKVFEYKRTGNKAILEEIKNTFVEDKRSIQKLAIIDVTDYYKWDVLAYDRSPGVGKTISDFFRDFLVVHEKETPTTLTTNTVKAITNWTISNRADLDPVQEISSYKNRVIDYLTNCSMVDFKKLIDRVIDDSDSSRKRKLKKSLKEFLEDLGLYGQSFKPSRSVLNTAQKKNIRQTAEGIKIEWQGDANDVNIDIPNIPSSNDGFYHITIKTRDVKVVK >NZ_CP015199.1|WP_066759194.1|4729970_4731467_+|hypothetical-protein MDFDKLIEIIDSYDSINVKESWGYIEISCDINKRENLQKIKLLKDYLSGEGFPNSISIKIDNARVDDDDLDSYLEDDTSNWEININKIPFFNTGYIDVRQNFFYSIEKFQEWLSGLSPFEKENPFHKKNNLIINGLDHVILGDKFKIIPYKFNGNIESFVIGESLPDLNRINEVVHSLTSEELIISPLSFVYQTKSNNETIISILNKLASISLSASIVNEIKSDDFITVDGIRRLNLKLFDDHDIYKKEFYNDLLKVVKWIYEEKTITRQKLFNDRISLELDESKTYINALSIHLKNSLSQASQRYNFVILERKDKYISELKDLLKDVRSQSDLYSQKIRTLLNNLLRDVLAAIVLVGFTIFTKFSDNLLLDKISLLKYVFYFLAIYYVLSAIIQAIVDITDVQVSKNEMLYWKATTKELIPEKDFKKHIENSLKDRKRSLKILYPTIIILYLLLAYTCYKFPIYFHSISSEKTKKEKINNDKVSKYRSQQSSGSSGR >NZ_CP015199.1|WP_082891221.1|4731411_4732449_+|nucleoid-associated-protein MIKFLNIEVNKVAVHQVGNKSLDEQVNFSDTLVDISDERLVRIFLKYFLSSFSGNEMYDFFNEVGIEQNEIYTLIKRIFENPDDLFKQSKIIAQHLYNCSTHPKIKNGDLFIVYFNNIIIDNINTDAIGIFKSESKENYLKVDLEKKIHFVNYDEGTNINKLDKGCLVFKIDESYKVCIIDNLNKANEASYWKDDFLSIRPIKNDYHQTNEFLSIAKQFVTKQLDEEFKISKADKIDYLNRSVDYFKSHGSFDKQEFEELVFEDKGLIESFRTFDQAYRQENEIELYDNFDISTQAVKKQARVFKNVLKLDKNFHIYIHGNADLITQGIDENGRKYYKIFYEEEN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015199_2 | 2.1|4718583|34|NZ_CP015199|CRISPRCasFinder | 4718583-4718616 | 34 | NZ_CP039041 | Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence | 116600-116633 | 10 | 0.706 |
1. spacer 2.1|4718583|34|NZ_CP015199|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tgaccttgtattattttacacacgtcagccagga CRISPR spacer aaactttatattattttacacacgtccatgagtg Protospacer .**.**.****************** .. ** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
202227 : 213441
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015199|202227:213441|DBSCAN-SWA GATGAGTAGTTTCGCGTTATTTATCATTGTTTTGATCTATCTGGCACTTTTGTTCTTAGTCGCTCATTTGGCGGAGAAGAAAAAAAGCAAAGTCTGGATCAACAATCCTTACATTTACGCATTGTCTTTGGCTGTGTATTGCACGGCCTGGACGTACTACGGAAGCATTGGTGTTGCGGCTACGAGTGGACTTAATTATCTTCCGATTTACATTGGCCCCATCATAGTAATTCCGGCATGGATTTACATTAATACCAGAATTGTAAGGATTTCAAGGGTTAATAAAATCAGTAGTCTGGCAGATTTTATTTCGTTAAGATACGGGAACAGCAGAAGTTTCAGTGCAATTATTACGATCGTATGTCTTTTGGCGATTGTTCCTTACATTGGTTTACAGATTAAGGCGATTTCCGAAACATTTCATTTGGTTACAGAAACGCCAATGTCTAAAAATATTTTGACTGATAATGCCACTTTTGTTGTTGTTTTAATTGCTTTATTTTCATCTTATTATGGAACAAAATATGTAGATGCTTCTGAAAAACGTTTGGGAATTATTTCCGCTATTGCATTGGAAAGTTTTCTAAAATTATTCTTCATCATTATTTTAGGACTTTTCGTTATTTATTATGCTTTTGATGGGTTTTCAGACATTTATGAGAAGGCGAGTAAGTTTGAAGATTTTAAAGCAAAAAATACCTTCAACGGAATTGAAGGTGCGATGAACTGGATGGTTCTTTGTTTGATTTCAGGAACAGCAATTTGCATTCTTCCGAGACAGTTTCACACCTCGATTATTGAAAACAGACAGGAAAAACACATCAAAACTACGATTTGGTTTTTTCCTCTTTACTTATTGATTTTCACCATTTTTATCTTCCCAATCGCTTGGGGTGGAAGGTTAATTTTTGATGGGCAAAACGTTAATCCGGAGTTCTACTCTATTTTAATTCCGCAACATTTTGATAATACTTTAATTACGGTTTTTGTATTTCTTGGAGGCTTAAGTTCTTGTATTTCAATGATTATCATTTCTGCGATTACTTTATCTATTATGCTTTCAAACAATTTAATTATTCCTTACAGCTTATTGGGAAAATTTAAATCAGAAAATGAAGTTCAGAACACCAGAAACATTACCAACATTAGGAAATTCAGTATTTTCGCATTGATTATCATGGCGTTTGGTTTTTATAAATATTTTATTTTAAAAACTTCGCTGGATTCTGTTGGTTTGATTTCATTTGTCGTGATTGGACAATTGGCTCCCGCATTTTTTGGAGCATTATTCTGGAGAAGAGGAACATACAAAGGCGCAGTGATCGGATTGCTGGCAGGATTAGCAATTTGTTATTTCGGATTAATTATTCCACAATATTACTTCTCTTATAATCAAGAATTAAAGGGAGTTTTGAGAGAAATGTATAATGCTTTTGATTTTTTCAGCATCTCTTTTTTGAGTAAAATTCCGCAGATTTTCTTTTGGTCGATGCTCGTGAATACTGCTTTGTTTACCATTATTTCTGTTAGCGTAAAAGGAAATTATCGTGAAAGAAATTTCGCGGAATTATATGTTGATATTGATAAATACATTCAAAACCACGAAAATGCTTTCATTTGGCGCGGAACAGCTTATGTTTCAGACATTAAAAACATTCTTGAAAGGTTTTTAGGTAAAAATAAAACAGAACAGGCCTTAAGAATATTCAATTTAAAATACAGCATTGATTCCCAAACCGAGACTGCCGATTCAAGATTCATTAAATTTTCAGAAAACCTTTTGGCAGGGAGAATTGGAACTGCTTCTGCAAAGATTTTAATTGAAGGCGTAACAAAAGAAGATAAAATATCTTTAAAGGAAGTTTTAAATATTTTAGAGGAATCTAAAGAAAATATTACACTTAATAAAAAGCTAACCGAACAGTCGGATGAACTCCAAAAACTATCGGATGATTTAAGAAAAGCCAATGAAAGCCTAATTATCAAAGATCACCAAAAAGACGATTTCCTAGATTCTGTTGCTCATGAATTAAGAACTCCAATTACCGCGATTCGTTCGGCCGGAGAAATTTTAGCTGATGACGACGATATTCCTTTAGACATCAAAAGAGAATTTTTAAATAATATCATCACAGAATCCGATAGATTAAGCGAAATCATTAACGATATTTTATACTTAGATAAATTGGAACATGGTGAAATTGCCTTAAATATTCAACAAAATAATATTCTTGAAACCTATAAAAAATCTGTAAATCCACTTCTTCATTTAATTCAGCAGAAAAACATTCATTTAAGCGAGGTAAATCTTTTAAATCAATTTATATTTGAATATGATGAAGCGAGGATGATTCAGTTATTTCAGAATATTTTGGGAAATGCTTTAAAATTCACAGACGATCAAGGAACGATACAAACTAAATTATCCGAAAAGGAAAATCAATTAACAATTAAAATCTTCAACACAGGAAAAACAATTCCTGAAGAAGATCTGGAAATGATCTTTGATAAATTTTATCAATCTAAAAATCAAAATATCTTAAAACCAACCGGAAGCGGACTTGGATTGGCGATTTCAAAGAAAATTGTACAAGCCCAAGGCGGAACCATAAAAGCAGAAAACAGCAGACTGGGCGTGACCTTCACCATCACCCTCTCCGAAAAAATAAAAGAGATTAAAAATGAAGTTGAACACAATTAAAACACGATATGAAAAAGATAATCATTGCAGATGATGAGCACAAAATATTAATGTCACTGGAATACAGTTTCAAGAAAAATGGCTACGACGTTTACATCGCAAGAGACGGAACCGAAGTATTGGAATTTTTAAAAACCATGATTCCCGACGTCATTCTACTCGACATTATGATGCCAAATTTGGACGGATACAGTACGCTAGACAACATTAAACAAGACGAAAAATTAAAAGATACAAAAGTCATTTTTCTGAGCGCAAAAAACAATCCGAGAGATATTGAAAAAGGCTTAGAAATGGGAGCTGATGCCTATGTTACAAAACCTTATTCTATTAAAAAATTGATGCAGCAGATTGAGGAAATGTTTGAATAGAATTTTATTTAAACACAAATATCACGAATAAATCACGCCAATAAAACACCCTAATTTGTGTCTTTTGTGAAAAAATTGGTGCAATTAGTGTTTAAAACCAAACACAAAAAATTAATATGAACACAGAGAGTTTATTTAAACAAAGCATAGAAGACAAAGAGAATTTCTGGAAAGAACAGGCTCAGGAAATCGATTGGTTTGAATTTCCTACCCAAATTCTTTCCAAAGATCAAAATGATTACGCCCAATGGTACTCCGATGGAAAACTGAATATGTGCTATTTGTGTATCGATAAACATATTGAAAACGGCTTCGGAGAGCAAATTGCCATTGTTTACGACTCTCCGGTTACCAATCAAAAAATACAATATACTTTCAATCAAGCGAAAGAAGAAATTTCAAAATTGGCGGGAGGCTTGGCTTCTTTGGGTTTAAAAAAAGGAGACACCGCCGTTATTTACATGCCGATGATTCCGCAGACGCTTTTTGCGATGTTGGCCTGCGCAAGAATTGGAGTCATTCATAATGTGGTTTTTGGAGGTTTTGCACCAAATGAATTGGTTGTGAGAATTGACGATTGCAAACCAAAAGCTTTAATCACAGCAACCGCAGGAGTAGAAATCGCCAAGAGAATTCCTTATTTGCCATTAGTTGAAAAAGCCATTGAACTCGCTCAGGATAAAGTTGAAAATATTATTGTTTACAACAGAAAATTAGTTGAAAATCAACATGAAATGTTTGATGGATTAATTGACTATGAAGAATTAGTTCAAAAATCAAAACCTGTTGATTGTATTTCTGTTGAATCCACTCATCCACTCTATTTGCTATATACCTCAGGAACGACAGGAAAGCCAAAAGGAATTACCCGCGATACAGGAGGTTACGCCACTGCTTTGAAATTTTCAATGAAATATATTTATGGAATTGAGCAAGGAGAAACATTTTGGGCAGCATCCGATTTTGGTTGGGCAGTAGGTCATAGTTTTTCGGTTTATGGACCTTTAATTAACAGAAATACCACCATTATTTTCGAAGGAAAACCCATTATGACTCCCGATGCAGGAACATTTTGGAGAATCATTTCCGAATATAAAGTTTCTGCAATGTTTACAGCTCCAACGGCAATTCGAGCGATTAAAAAAGAAGATCCAAACGGAGAATTGGTCAAAAAATATGATTTAAGCCATTTCAAAAAACAGTTTTTGGCAGGTGAAAGATGTGATGTTGCCACGTTGGATTGGTTTGAAAAACATATCGGAGTGCCCGCAATCGATCATTGGTGGCAGACAGAATCTGGCTGGCCGATGTTAGGTTTAATGACTTTCGATGATAATTATAAAATCAAAAGAGCTGCTGCCGGAAAACCAATTCCGGGGTATGATATTAAGATTTTTGATGAAAATGGATATGAGTTGGATGCTCATCAGGAAGGTTATTTAATTATAAAACTTCCGCTTCCGCCTGGTTCATTATTAGGAATTTGGAATGATAACGAAAGATTCCAAAACAGTTATTTGTCACAATATAAAGGCTATTATTTTTCCGGAGACGGAGCCATAAAAGATGAAGACGGTTATATTTTCATCACAGGAAGAGTGGATGATGTGATCAATGTAGCAGGACACCGACTTTCAACGTCAGAAATGGAGGAAATTGTTTCGTCACATCCCGATGTTGCAGAATGTGCCGTTGTCGGAATTGATGATGATCTGAAAGGTCAGATTCCTTTTGCAACGGTGGTTTTGAAGAATGGTTCAACAATTTCGGAAGAAGAGGTTGAAAAGGATATTGTAAAATCGGTTCGTGAAAAAATTGGAGCCGTTGCCTGTCTTAAAAATGTAATGATTGTCAAACGTTTGCCGAAAACACGTTCAGGAAAAATTTTAAGAAAGCTCATTAGAACATTATTAGACGGTAAGGAATTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015199|202227:213441|204935_205298_+|WP_066750193.1|DBSCAN-SWA MKKIIIADDEHKILMSLEYSFKKNGYDVYIARDGTEVLEFLKTMIPDVILLDIMMPNLDGYSTLDNIKQDEKLKDTKVIFLSAKNNPRDIEKGLEMGADAYVTKPYSIKKLMQQIEEMFE >NZ_CP015199|202227:213441|210053_212264_+|WP_066750202.1|DBSCAN-SWA MSYDLEQENKEILARYKDLISNTYRTLDEENNKLIRKAFDIALDAHKDQRRKSGEPYIYHPIAVAKIVATEIGLGATSIACALLHDVIEDSDYTYEDLKKIFGEKIANIVNGLTKISIMNHQNISVQSENYRKLLLTLSEDFRVILIKIADRLHNMRTLESMAPDKQKKIASETVYIYAPMAHRLGLYNIKSELEDLSLKYNNPEVFNEITEKLELAKENRERYIDEFKKEASERLKEEGLNFTIKGRAKAISSIYRKMLKQGVSFEEVFDNYAIRIIYKSDAKNEKFLAWKIYSIVTDVYHSNPSRMRDWITQPRSTGYESLHLTVLGPDKKWIEVQIRSERMDEIAEKGVAAHYKYKEGYKQSSDDKNFERWVTEIRDVLEQQQDLSTSELLDNIKLNLYSKEVFVFTPKGEIKILPTNATALDFAFSVHSDLGMKCLGAKINGKLVPISYVLQNGDQVDILSSQNQKPKFDWLEFVVTSKAKSKIKGYLNSQKNQLVEEGKETLQRKLRHAKINFNDEEINKLQKFFNLKTSQELFLKFQSNELDASSLRKYIESKNVFNNLLSRFRKSPTKNTAYIEPKEQNLDMIVFGKDEEKLNYTYAKCCTVIPGDKIFGFITISEGIKVHSDNCPNAINLRAQYDYRVIPAKWVNAESFQNRVKIEIEGLDRMGMINDITAVISGSMGMDMKSMSIESNNGIFTGNINLEVKNKSQLEETFTKLKDINGVSRVRRLQS >NZ_CP015199|202227:213441|205414_207301_+|WP_066750195.1|DBSCAN-SWA MNTESLFKQSIEDKENFWKEQAQEIDWFEFPTQILSKDQNDYAQWYSDGKLNMCYLCIDKHIENGFGEQIAIVYDSPVTNQKIQYTFNQAKEEISKLAGGLASLGLKKGDTAVIYMPMIPQTLFAMLACARIGVIHNVVFGGFAPNELVVRIDDCKPKALITATAGVEIAKRIPYLPLVEKAIELAQDKVENIIVYNRKLVENQHEMFDGLIDYEELVQKSKPVDCISVESTHPLYLLYTSGTTGKPKGITRDTGGYATALKFSMKYIYGIEQGETFWAASDFGWAVGHSFSVYGPLINRNTTIIFEGKPIMTPDAGTFWRIISEYKVSAMFTAPTAIRAIKKEDPNGELVKKYDLSHFKKQFLAGERCDVATLDWFEKHIGVPAIDHWWQTESGWPMLGLMTFDDNYKIKRAAAGKPIPGYDIKIFDENGYELDAHQEGYLIIKLPLPPGSLLGIWNDNERFQNSYLSQYKGYYFSGDGAIKDEDGYIFITGRVDDVINVAGHRLSTSEMEEIVSSHPDVAECAVVGIDDDLKGQIPFATVVLKNGSTISEEEVEKDIVKSVREKIGAVACLKNVMIVKRLPKTRSGKILRKLIRTLLDGKEFQIPSTIDDEKIIEEIQQKIEEYRA >NZ_CP015199|202227:213441|212265_213441_+|WP_066750204.1|DBSCAN-SWA MNLSVYFKKFFNNSQSSGIILIFCVLVSLLIANSSAGEDFQHFLDNEIGVELFHLKYPVSIWINDGLMAIFFLLVGLEIKREMVEGELSSFKNASLPIFAAIGGMTIPAGIYSIFNAETPYANGWGIPMATDIAFSLAIISMLGSKIPNSIKIFLAALAIVDDLGAILVIAIFYTEQIHWTYLLLSFGVTALLFLLNFLKVTKIYFYIIPGLFLWYFLHHSGIHATIAGVLLAFSIPTNASNVKISPLEKLEHTLYFPVSFLIMPIFALTNTNIAFNNGMLEGLTSTLGLGIIGGLIIGKLIGINLFSLIAIKFKLSSLPQNSSWTQMIGVGFLAGIGFTMSIFIALLSFKGEIEIQDEAKFAILIASFLAAVLGYVILNLGSKKKEVIEN >NZ_CP015199|202227:213441|207361_209269_+|WP_066750198.1|DBSCAN-SWA MRNYLIEDLPHYFEEYKNSIKNPKKFWDKIADQNFVWYQRWSKVVKYDMNEAKIVWFKNAKLNITKNCIDRHLNERGEKTAIIWEPNDPKEAAQHISYNELYTRVNKTANILRDMGIEKGDRVCIYLPMIPELAVTMLACAKLGAVHSVIFAGFSASAVASRINDCEAKMIITSDGSYRGSKVLDLKSIVDEALEKTPTIENVLVVKRTHNEIKMKEGRDHWIADLYEKASLDFVTVIMDAEDPLFILYTSGSTGKPKGMLHTCAGYMVYTAYTFKNIFNYQENDIYWCTADIGWITGHSYILYGPLCNGATTVIFEGVPTYPEPDRFWEVIEKHKITQFYTAPTAIRSLAKESAEWVDKHDLSSLKVIGSVGEPINDEAWHWFNDHVGRKKCPIVDTWWQTETGGIMISPLPFITPTKPTYATLPLPGVQPVLMDDKRNEITGNQVTGNLCIRFPWPGIARTIWGDHQRYKETYFTAFPGKYFTGDGALRDEVGYYRITGRVDDVIIVSGHNLGTAPIEDSINQHPAVAESAIVGYPHDIKGNALYGYVVLKETGESRQRENLKKEINQLISDQIGPIAKLDKIQFVSGLPKTRSGKIMRRILRKIAEGDFNSFGDISTLLNPEIVEEIKNEKI >NZ_CP015199|202227:213441|202227_204927_+|WP_066750191.1|DBSCAN-SWA MSSFALFIIVLIYLALLFLVAHLAEKKKSKVWINNPYIYALSLAVYCTAWTYYGSIGVAATSGLNYLPIYIGPIIVIPAWIYINTRIVRISRVNKISSLADFISLRYGNSRSFSAIITIVCLLAIVPYIGLQIKAISETFHLVTETPMSKNILTDNATFVVVLIALFSSYYGTKYVDASEKRLGIISAIALESFLKLFFIIILGLFVIYYAFDGFSDIYEKASKFEDFKAKNTFNGIEGAMNWMVLCLISGTAICILPRQFHTSIIENRQEKHIKTTIWFFPLYLLIFTIFIFPIAWGGRLIFDGQNVNPEFYSILIPQHFDNTLITVFVFLGGLSSCISMIIISAITLSIMLSNNLIIPYSLLGKFKSENEVQNTRNITNIRKFSIFALIIMAFGFYKYFILKTSLDSVGLISFVVIGQLAPAFFGALFWRRGTYKGAVIGLLAGLAICYFGLIIPQYYFSYNQELKGVLREMYNAFDFFSISFLSKIPQIFFWSMLVNTALFTIISVSVKGNYRERNFAELYVDIDKYIQNHENAFIWRGTAYVSDIKNILERFLGKNKTEQALRIFNLKYSIDSQTETADSRFIKFSENLLAGRIGTASAKILIEGVTKEDKISLKEVLNILEESKENITLNKKLTEQSDELQKLSDDLRKANESLIIKDHQKDDFLDSVAHELRTPITAIRSAGEILADDDDIPLDIKREFLNNIITESDRLSEIINDILYLDKLEHGEIALNIQQNNILETYKKSVNPLLHLIQQKNIHLSEVNLLNQFIFEYDEARMIQLFQNILGNALKFTDDQGTIQTKLSEKENQLTIKIFNTGKTIPEEDLEMIFDKFYQSKNQNILKPTGSGLGLAISKKIVQAQGGTIKAENSRLGVTFTITLSEKIKEIKNEVEHN >NZ_CP015199|202227:213441|209573_209939_+|WP_066750200.1|DBSCAN-SWA MSNILAGLFEHHSDYKQLETDLESSGFGSSDYIVYLDDTHHYSQYMTSVCVKDKEQIDNAKSIFNQNSVVKTYLFENVSIEQADFNTIKRLIDARNRAEIHNSPNVKIKASSHGMDSEVKF |
7 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2113959 : 2120811
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015199|2113959:2120811|DBSCAN-SWA CATGAAAACTATAAATTATTTAAAAGGAGATGCAACAAACCCTCAAACAAAAGGAAATAAAATCATCATTCATATTTGCAATGATATAGGAGGTTGGGGAAAAGGTTTTGTAATGGCAATTTCTAAACGGTGGAAAAATCCTGAAACTGAATATAGAAAATGGTTTCAAAGCGGAGAAAATTTTAATCTTGGTGAAATTCAAATTGTTCAAGTTGAAGAAGATATTTGGATTTGTAATATGATTGGTCAACATAAAACGATTTCAAACTCCAAAGGAATTGCTCCAATTAGATATGAAGCTGTCGAAAAATGTTTAAACAAACTAATTGATGAAGCCTTACAATTAAATGCAAGTGTACATATGCCGAGAATTGGCTGCGGTTTAGCGGGAGGAAAATGGGAAGAAATTGAGCCAATTATTGAAAGAACATTGTTGAAAAATAATGTGGAAGTATATGTTTATGATTTTGAATAAAACTTAAATAATGAAAACAACAACACTTTACAGACCTGTCGGAGAAAAGGAAATGGTTTTAATTATCGAAAGCAATTTCAAAAAATTTCCACCAAGATTAGAATGGCAGCCGATTTTCTATCCTGTTTTAGACGAAGATTATGCCTCCGAAATCGCAGAAAAATGGAATACTAGAGATGAAGCAGGAAACTATCTCGGCTTTGTAACCAAATTTGAAGTGTTGGAAGAAGAAATTAATAAATATCCTGCACAAAATGTCGGAGCCAGAAATCATAATGAATTATGGGTTCCATCAGAAAAGCTAGAAATATTCAATCAGGCGATTGTTGGAAACATTGAAGTGATAAAAGTATTTATGGGAGATCAATTTAAAGACTCTGAAAATGCTGAATTGGAAAGCCTGATGTTAAATATAAAAAAACTAACCATGACAAATAAAGGAATGGCAAAAGATACATTAGACATCTTAGCCAAAAAATATTATATAAACGAAAACTACGAAAAAAAAATATAGAAAACGAACTGGAAATCTCTAAAAAAGAAACCATTTTATTTTCATCAGAAGAGCTTTCGGAAATGCTGAATAATGAACTTCCGAAAACAGATTTTGAAACAACATTTGAAGTCTGGAATTGCAGTTCTTTAAAAGCAATTTTAAGATTAAGCGAAGAAGAAGATCAGCAGAAAATTATGTGCCTGAATTTCGCCTCTGCAAAAAATCCGGGAGGAGGTTTTATCAACGGAGCAGAAGCGCAGGAAGAAAGCCTGGCAAGAACTTCTGCCTTGTATGAAACTCAACTTCAGGCTTGGGATTATTACACCGTTCACCGTGCGATGGAATCGTGTTTTTACACAGATATGATGATTTACAGTCCGAAAGTTCCTGTTTTCAGGAAACATAAAGGAGAATTATTACCGAAACCTGTTTTGTGTAATTTTATCACTTCTCCCGCTGTAAATGCAGGAGTTGTCAAACGACAGGAGCCAGAGAGAGCGGATGAAATTTTCGGAGCAATGGACATGAGAATGGATAAAATGCTGGCTTTAGCTTTACATCAAGGAAATGAAACATTGATTTTAGGGGCTTGGGGTTGTGGCGTTTTTAAAAATGATCCGAAAGAAATTGCAGAATTATTTAAAAAGCATCTTCACGGAAAGTATAAAAATAAATTTAAAAAAGTGGTTTTTGCAGTTCTGACGAAGAAAGAAGAAATGATAAAACCATTTGAGGAAATATAATGAAACTTAAACTAAAAAAATATAAAGAACAAATAAAAGATTGGCCTCAAAAAGGGTATCACATCATGGCACAATATGACGATGAGAAAATTATTGTATATCAGTCTTATAAAAGAAATATTGGTGAATTTGCCGTTAAAAATCAATATTTTGGTGGTGAATTCAGTTTAGAAAGAATGACTTGGATAAAACCCAACTTTCTTTGGATGATGTATCGAAACGGTTGGGGAACAAAAGAAGGACAGGAATATGTTTTGGCAATACATTTAAAAATGTCTGCTTTCAAAAGATATTTAGAAAATGCTGTCTATTCTTCTTACAACGACAGATTGGAAATTTCCAGAGAAGAATGGCAAGATCAGGTAAAAGAATCTTCGGTGAGATTGCAATGGGATCCAGATCACGATCCTTTTGGAGGTAAGCTGGAAAGAAGAGCAATTCAAATTGGTTTAAGAAATGAATTTACCCATTCTTTCGCTAAAGAAGATATTATTCTGATTGAAGATATTTCAGATTTTGTAAAGGAACAAAACCAATGTGTTCTGAATGATGATTTGGAAAATTTAATTCTTCCTGAAGAAAAACCATTGCTTTTTGATGATGAAGATTTAAATAAAAAATTAAGGTTAACTAAAACTAAATATCATGAAAATTGAAGTAACATTAGGCGATATCACAAGAATTAAGGCAGATGCAATCGTCAACGCAGCCAATTCATCCTTACTTGGCGGAGGAGGAGTTGACGGTGCAATTCATCGTGCAGGCGGAGATACGATTTTAGAAGAATGTAGAAAGATCAGAAACAGACAAGGTAAATGCAAAACTGGAGAAGCAGTTGTAACAACAGCCGGAAATCTTCCTGCAAAATATGTCATTCACACCGTCGGTCCGGTTTGGAATGATAATGAAAAAGAAAGCTCAGAATTGTTGGCGAATTGCTATAAAAATTCTTTGAAATTGGCAGAAAGTTTAGCGGTAAAAACGATTTCTTTTCCGGGAATCAGTACAGGAGTGTATGGTTTTCCAAAAGAATTGGCAGCAAAAATTGCCGTTGATGAGGTGAAAAAATTTCAGTCAAAAAACATTGAAAAAGTAATTTTCGTCTGTTTTGGAGATGAAAATGAAGAAATTTATAAAAAATTATTAAGAGAATAAATTAATGCTCATTTGCTGAGTGAAACGCCTTTGCGAACGAAAATATGCAGAATAATTTTAAATAAAATCTTTGCGGACTTTGCGTTTAAAAATAAAAACAGGAAAACAAATGAAAAAACTAACCATATTAAGCGGTGCCGGAATCAGCGCCGAAAGCGGAATAAAAACATTCAGAGACGGAGATGGCCTTTGGGAAAATCATAGTATAACGGATGTGGCAAGTCCGGAAGGATGGAAAAAAGACAGAGAATTGGTTCTTGAATTTTACAATCAAAGACGTCGTCAGATCCATGAAGTATATCCAAACGATGCTCACAAATTAATAGCAGATTTAGAAAAATACTTTGAAGTTCAGATTATTACTCAAAATATCGACGATCTGCACGAAAGAGCAGGATCAACAAATATTCTTCACATTCATGGAGAATTGTTAAAATCTTGTTCTTGCAACAATAAAGGTTTGATCTATGAACAAAAAGACGACATTAACATTGGAGATAAAGCAGAAGATGGAGCACAATTAAGACCTTTTATCGTTTGGTTTGGGGAAGATGTTCCTTTGATGAAAGAAGCAACGAAAAAAGCAAAAGAAGCAGATATTTTCTTGGTAATCGGAACATCTTTACAGGTGTATCCGGCGGCAGGATTGATCCACGAGATCAAAGATGACTGTCTTTTAATTGTAATCAACCCCAACGAAACAGGCTTTGGATACGGACAAAGAGCTGTTGTCATGAAAGAGCCCGCAACAAAGGGAATGAAATTGTTATTTGATAAGCTTGTAAATCTAGCCTAATGAAAAATATTGTAAAAGCAGGAATTTTCGGAGTTTGTATTGGCGATGCTTTGGGCGTTCCGGTGGAATTTAAGAAGAGAGAAGATCTAAAAAAGTCACCTGTTACAGGATATTTGGAATATATGTCATGGAATCAACCCAAAGGAACCTGGAGTGACGACAGTTCTTTAACTCTTTGTCTTGGAGAAGAATTGACAAAAGGTTACGATTTAGAAAAAATAGGCGAAAGCTTCGTAAAATGGAACAAATACGGGCATTGGACCGCTCACGGAAGACTTTTTGATATTGGCGGAACAACAAGACATTCCATTGCAAGATTGATTAAGGGAGAAAGTGCAAAATTTTCTGGAAATATTTTTGAAGAAGATAACGGGAATGGTTCTTTGATGAGAATTCTTCCCTTAGCTTTTTATCTTAAAGATGAGGAAAATATTGAAAAACTATATCAAACCATAAAAGAAGTTTCATCAATTACTCACGGACATTTCCGTTCTGTTTTTGCATGTTTTATTTATGTGATTTTTGCCATTGAATTGATTAAAGGAAAAGATAAAAAAGAAGCATATAATCATGTTCAGAAAACAGCTTTAGAATATGCAGAAATTCAAGGTTTTAACCCAAAAGAAGTTGAACTTTTTGAAAGAATTTTAAAGCATGATATTTCAAAATATTCTGAAGATGAAATTAAAAGCAGCGGTTACGTTCTTCACAGTTTAGAAGCCTCTTTATGGTGTTTTCTAAACTCAGAAAGTTATTCTGAAACTGTTTTGAAAGCTGTCAATCTAGGAGAAGACACTGATACAACAGGAGCCATCACAGGCGGAATAGCAGGAATTTATTATGGTTTTGAAAATATTCCTGAAGAATGGATTTCTGAGTTAGTGAGAAAAGAGGATATTGAAAATTTGTGTGAAAAATTTTATAACGAATTAGAATGGAAAATATTGTAAAAGCCGGAATTTTCGGAGTTTGTATTGGTGATGCGTTGGGTGTTCCGGTGGAATTCAGAAGTAGAGAGCAGTTGAAACGTTCACCCGTTACAAAAATGAGAGCTTTGGGAACTCATCGTCAACCTGCAGGAACATGGAGTGACGATAGTTCTTTAGCTTTATGTCTTGCTGAAAGCCTTTGTCAGGGCTATGATTTAGAAGATACAGCTTTGAAATTTTTACAATGGTACAATGCCGAAATCTGGACTCCACACGGAAGAGTTTTCGATATTGGAATTGCTACTTCACAAGCGATTCACAGAATTAGCAAAGGAACTTCTCCAACATTATGCGGCGGAACCTCGGAGTTTGATAATGGCAATGGTTCTTTGATGAGAGTTTTGCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015199|2113959:2120811|2116936_2117623_+|WP_066759604.1|DBSCAN-SWA MKKLTILSGAGISAESGIKTFRDGDGLWENHSITDVASPEGWKKDRELVLEFYNQRRRQIHEVYPNDAHKLIADLEKYFEVQIITQNIDDLHERAGSTNILHIHGELLKSCSCNNKGLIYEQKDDINIGDKAEDGAQLRPFIVWFGEDVPLMKEATKKAKEADIFLVIGTSLQVYPAAGLIHEIKDDCLLIVINPNETGFGYGQRAVVMKEPATKGMKLLFDKLVNLA >NZ_CP015199|2113959:2120811|2119533_2120079_+|WP_066754066.1|DBSCAN-SWA MNEQQKKKTSKFLSYVLRHHPELIDLNLDENGWANVDELITKSKKDSYEGFTFEELDEIVQTNAKKRFAFNEDKTRIRASQGHSIDINLALIPQQPPEFLYHGTAQNNIESILEKGIEKRSRQHVHLSQDKETATNVGMRHGKPIILTIRTQKMFEDGIEFYLSENKVWLTDHVDAKYISN >NZ_CP015199|2113959:2120811|2113959_2114433_+|WP_066754057.1|DBSCAN-SWA MKTINYLKGDATNPQTKGNKIIIHICNDIGGWGKGFVMAISKRWKNPETEYRKWFQSGENFNLGEIQIVQVEEDIWICNMIGQHKTISNSKGIAPIRYEAVEKCLNKLIDEALQLNASVHMPRIGCGLAGGKWEEIEPIIERTLLKNNVEVYVYDFE >NZ_CP015199|2113959:2120811|2116317_2116827_+|WP_066754062.1|DBSCAN-SWA MKIEVTLGDITRIKADAIVNAANSSLLGGGGVDGAIHRAGGDTILEECRKIRNRQGKCKTGEAVVTTAGNLPAKYVIHTVGPVWNDNEKESSELLANCYKNSLKLAESLAVKTISFPGISTGVYGFPKELAAKIAVDEVKKFQSKNIEKVIFVCFGDENEEIYKKLLRE >NZ_CP015199|2113959:2120811|2115671_2116328_+|WP_066754060.1|DBSCAN-SWA MKLKLKKYKEQIKDWPQKGYHIMAQYDDEKIIVYQSYKRNIGEFAVKNQYFGGEFSLERMTWIKPNFLWMMYRNGWGTKEGQEYVLAIHLKMSAFKRYLENAVYSSYNDRLEISREEWQDQVKESSVRLQWDPDHDPFGGKLERRAIQIGLRNEFTHSFAKEDIILIEDISDFVKEQNQCVLNDDLENLILPEEKPLLFDDEDLNKKLRLTKTKYHEN >NZ_CP015199|2113959:2120811|2118557_2119523_+|WP_066754064.1|DBSCAN-SWA MENIVKAGIFGVCIGDALGVPVEFRSREQLKRSPVTKMRALGTHRQPAGTWSDDSSLALCLAESLCQGYDLEDTALKFLQWYNAEIWTPHGRVFDIGIATSQAIHRISKGTSPTLCGGTSEFDNGNGSLMRVLPLLFYIKDFPIEKRFEITKDVSSITHGHIRSALACFIYLELALEILTGKDKWDAYKTMQEKVRNFLDQNPICSQNEMDKFHRILELKVGEYDLAPLHTLQEEEISSSGYVLHSLEASLWCFLNSESYSEAVLKAVNLGEDTDTTGAITGGIAGIYYGFENIPEEWVAELVRKEDIENLCIKLENKLKK >NZ_CP015199|2113959:2120811|2120079_2120811_+|WP_066754068.1|DBSCAN-SWA MKRTLVVGDIHGGFKALQQVFERANVTENDKLIFLGDYVDGWSESSKIIQFLIELSEKQECIFIKGNHDAWTEDWISLGDAPNVWLSNGGKSTVESYADYSLEDLNLHLEFFQRMKNYYVDEENRLFIHAGYSSMHGPEKEVYSSNYRWDRTLWETAVAMDKKLSKNSNLYPKRFLLYNEIFIGHTPTLYLGIKHPVNKANIWNLDTGAAFTGNLSIMDVDTKEFWQSDPLPSLYPNEKGRNN >NZ_CP015199|2113959:2120811|2117622_2118573_+|WP_066754063.1|DBSCAN-SWA MKNIVKAGIFGVCIGDALGVPVEFKKREDLKKSPVTGYLEYMSWNQPKGTWSDDSSLTLCLGEELTKGYDLEKIGESFVKWNKYGHWTAHGRLFDIGGTTRHSIARLIKGESAKFSGNIFEEDNGNGSLMRILPLAFYLKDEENIEKLYQTIKEVSSITHGHFRSVFACFIYVIFAIELIKGKDKKEAYNHVQKTALEYAEIQGFNPKEVELFERILKHDISKYSEDEIKSSGYVLHSLEASLWCFLNSESYSETVLKAVNLGEDTDTTGAITGGIAGIYYGFENIPEEWISELVRKEDIENLCEKFYNELEWKIL |
8 | Serratia_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3096807 : 3103860
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015199|3096807:3103860|DBSCAN-SWA TTTATTGTCCTAAATAAACAAAAATATACGTTGACAAATACTTAGGAGTTAAATTCAACGGAGTACTTGATCCTCCTGTAGAAAGGTTATAAGTGTGCGTGTGAGCACCGGCACTGGCTGTGGTTGATATTTGCGAATCATTATCAACTACGGTTTGGTTATTTCCACCTTCTACACTGTCTGTAACGCCACTTGCTCTGTCATTATAAGTATGGGTATGAGCTCCGGCACTTGTAGTTGTAGCATTATAAGTCGTGCTTGGAAGGTTAACTCTTGCAAGGGTAACAGAAGTGCTTCCACTGGTTGCTCCTAATGTTTCTGATGCTGATTTTGCCTTTAAAAATTTATCTGAACTATCCGGTAAAATGGTTGAGAATCCCAGAGAAGTTGCATTTGTTTGTGCAGCAGCGGGCAAGGTTGATACTGTTCTTCCGTTTAAAAGATACCATCCTTCGTGATCGGTTGCTGTGCTGCTGTGTTTTATATCTCCTATGGTTGGTGTCTGTACTTCCAGTTTATTCCATGAAGTTCCGTCATTGTAATAAAATCCGGGGGTTACACTTGTAAGAGCGGTTGCTGTGGCTGTATTTGTGTTATAAACCGTAATTCCTGCAATATGACTCGGAAGTGGACTTGGGTTATTAGTTGCCGCTAAAGATACTTTTGGCATTAATAATCCTTTATTTCTGTTTTGTGAATATAATTCTAAGGCTGCATCCCTGTTGGGAGAAGGTGTCGCTGTAACACCGGCTGTGATCATAACCTGAGCCTGAGTAAAAGTGCAAGCTACAAGTAAGAATATGTAATTTAATTTTTTCATTGATTGATGTGTTTTTGTTTATTTCCCTAAATAAATGAAGTTCTGAACAACCAAATGTTTAGGATACTGATTGATAGCTGTATTAGTTCCTCCGCTTGGTACAGAGAAGGTATGCTGGTGATCTCCTGCAGCTCCTGTTGTTCTTACTTCTGTGTTAACCGTTCTTGTTGTATTTTGTCCTCCGGCATTGTAATTCCAATAATTAACACCTCTGTTGGTGTAACTATGAGTGTGGGCTCCACTTTGAACGGTGCTTCCTGTAATGCTTAGATTGGGCAAATTAGCCTGAGTGATTGAGTAAGAATTATTTCCTCCCACGGCAGCCAGAGTTTCTGAAGTATTTTTACCTTTCAAAATTCTGTCGCTTGAATTGGGCAGAGTAGTGGCAAAACCAAGTGAAGAAGCGTTTGTTTGACCAATTGTTGGTAAAGTTGTGATATTTCTTCCATTCAACAAATACCAACCGTCGTGGTCTGTTGTTATAACACTTGATTTAATATCTCCAATTCTTGGAAGATTATCATTGATGGACATTAAAACCCATTTGGCTCCGTCATTATAATATAATCCCGGAATTACATTATTGGGTGAAGTTCCTGCTGTTGCTATATTGTAAACCCACATTCCTTCAACATGGCTACCCATCGGAGAAGCTGAGTTTAAGGAAGTAAGAGAAACAGTATTCATAAGAAGTCCTTTATTGGTACTGTTTAATTCTAAAATTGCAGAGTTGGAAGGATTTGAAGTACCGATACCAACTTGGGACTTTACTATTGCGAAAAAAAGGATCCCTATCGATGTGTAAAATAATCTTGTTCTCATAATTAGTTTCCTAAATAGATAAATACGTTAGTAATGATGTTGTCTGGTTTTAAGCTTACAGCCTGACTGCTTCCTAATGTGAAACTCAGAGAGTGGGTATGTGCTCCCGAGCTAGCAGTTGTGTCATTTACACTTGCTGCATTGGAAACCGGATTATTAGTTCCTGCCGCAACACCATTTGTAGTTGAGTTTGTCGGATTATCTGTATAAGTATGCGTATGACTTCCTGTCGTATCTGTTGTTCCTGTGAACGTTACATTCGGTAAATTGGCTTGTGCTAAAACAAAGGTATCACTTCCAGATGGTGTTCCTATATTGTCGCTTCCACTTGTATTTTTTAAATATCTGTCGGTTGCATCAGGTAAAATTGCAGAAAAGCCTAAAGAAGCAGCTCTCGCTCTTTGATTTACAGCTAATGTAGATACTGTTCTTCCGTTTAAAAGATACCATCCATTATGATCGGCACTTTGGAACCCGTTTTTAATATCCCCTATTTGAGGTTTTTTCGTTGATAATTTTACCCAAGAAGTTCCATTATTATAGTACAAACCGGGGGTAACATTATTAGGTGAAGTTCCTGCTGTTGCCGTATTATAAACGATCATTCCCGCAGTATGTGAGGCGAGAGGGGCGGGTAAATTTGTAGATTGTAATGTAATTCTGGTGAGTAAAAAACCTTTGTTGTTGGATGTACTTTCGAGATGTAAAACACTTTCAGTATTAATTACTCCTGAAGAATTTGAAATTTTTACCTGTGCGTTTATGTCATAGAAGGATGTGAATAAAATCAATGGAATGACTTTATTTACGTTGATAATTTTTATCATAACGTTTAGAATGAAATAATTTTTATTGTGTTGTGAGCTGCAAAAATATAAAAAAATAAAGAATAGTCTTAATTGAAAATCAATGATTTATTCAGTAAATATCACCATTTGGAGAGTGTTAATTGAATATTTGTAGTATTAATCGAAGATAAACGAAAAATAAACATTTATGAATGCTATATTAAATTTTTATTAAAATTTAAAAACACAAAAAAAAGCACGCTAAAAAACGTGCTTTTATGAATAATATACTGAAATTTATTACTTGTATCCTATGCTTCGCAAGCAGAACATGAAACAAAATTCACCATCATTTCTTTAGAAACTGATGAACTTCTTTGGTAATACAACGTCTTAACTCCTTTTTTCCAAGCCTCGATGTAAAGGTAGTTTACATCTTTTACCGGCATTGTAGAAGGAATTTGTAGGTTTAATGATTGAGCTTGGTCAATATACTGTTGTCTCTGAGCAGCCTGAGAAATGATCTCCATTGGAGAAATTTCCTTAAATGTTTTGAATACTGCTTTTTCCTCGTCAGTTAATTCAGCCAAATGCTGAACAGAACCGTGATTTAGCATAATCGTTCTCCAAGTTTCCTCGTTGTCTAATCCTTTTTCTTCTAATAATTTAGCCAAGTATTTGTTCTTACGCATAAAGTTTCCTTTAGCCAAACCTGCTTTGTAATAGTTAGAGGCGAAAGGCTCAATTCCAGGAGAAGTTTGTCCTAAAATTGCAGAACTTGAAGTCGTAGGGGCGATCGCCATTGTTGTGGTATTTCTCAATCCGTAACCTTTCAATAATTCCGGTTCTCCGTAGATGTTTGCAAGCTCTCTTGAAGCTGTTTCTGCCTGTTCTTTGATATGTTTGAATGCTCTCGCATTGAATTGAGTTGCCTCAAAACTTTCAAACGGAATCATATTTTTCTGTAAATAAGAATGGTATCCTAAAACTCCTAAACCAAGCGCTCTGTGACGCAATGCGAAGTTTCTAGCTCCTTGTAAATAGTAGTTCCCTTCAGTTTTTTCGATAAATTCAGTTAGAACTGCATCCAAGAAATAAACAGCCAATTTTACAGCGTCCGTATCTTTCCATTCGTCGTACAATTCTAAGTTCATAGAAGATAAACAACAGATGAAAGATTCTTCTCTTGTTGAAGGAAGCATGATTTCAGAACAAAGGTTACTTGCATTTACAGGCATTCCTAAGTCTTTGTAAACCTGAGGTTTATTTCTGTTAACGTTATCTGTAAAGAAAATATAAGGTAGCCCTTTTTGCTGACGGCTTTCCAATACTCTTGCCCAGATTTTACGTTTATCCATATCTCCGTCAATCATATCCTGCATCCAGTAATCAGGGACACAAATTCCTGTAAATAGATTCTGGATCGGACTTCCGATGTCTTTAATTGATAAAAATTCTTCAATATCTCCGTGGTCAATATCCAAATAAGCAGCAAAAGCACCTCTTCTTACACCGCCTTGAGAAACTACATCCATTGCAGTATCAAACAATTTCATGAAAGAAACAGCTCCTGAAGATTTTCCGTTATCGGTTACCGCAGTACCTCTGTTACGAAGTTCCCCGAAATAACCTGAAGTTCCCCCTCCAATTTTTGTCTGCATGATCACTTCACCCATTTTGTGGGTAATTCCTTCAATACTGTCCGGAATGTGAACGTTGAAACAAGAGATTGGAAGACCTCTCTGCGTTCCCATGTTTGCCCAAACCGGAGAAGAGAAACTGATCCATCCTTTCACGATCATTTCCTTGAAAGCTGCCTGTAGCTCAGGCTTGTATAATTTTTTTGCAGCTGCGGTGGTGATTCTGTCGATAGCTCCGTCTACAGTCTCCCCCTTCAACAGATATCCTCTGTTAAGCATTTGCTCAGACTCTTCATTGAGCCACCATATATTTGAATTTTGCTCTTCCATAGATGTTTGTATGTTTTCAAACCTCTGAGTTTGTTTTATTACTCAGAAATTTTGTGTTGTTTATATTGATTGTAAAATTTCTACTTTATGAGAACCGTTCAGTCCGCTTTCATCTCTTAACCTTTGAAACTCTTTAAAAGATGGTACATTCAAAACCTCATGCTGAACCGCTTCATTGATATAATTTGAATAATGAACAAAGGTAACGCCGTCTTCTTTTACATAAACTTTATATTCAAATGTTTCCTGATCTAAATTTTTAAAATCATTCAAAAACTTTTGAATATTGATCTTGTTTTCTGAAACGAAGTCTGGGTTTACTGTGTAAGATACGATTACGTTGATCATTATTTTTTTTGTTTGATATTTAAATCTGCTTGTTCATTGCGAGGAACGAAGCAATCTCTTAATAATCTTAACCTCTTAATAACTTCTTAGTGGTTTAAAATTTTAATTATTAATATTTAAGATGCTTCGACAGGCTCAGCATGACATCGCTAATACTAACTGCTTTGACGCTCGCTTCGCTCGCGCTCTTTATCCAAAATTCAGAATCTAAAATCTAGAAAAGATCATTCGCCGTAATACTCTTATCATGTTTCGTATAATCCACAGGTCTTTTTGCAAAGAAATCATCCATAGAGTTTGCGAAAACCTCTTCTTCAAACCATTTCATTGGACGATATTGCTCCGGAGTAATATTGTAACGAGTATCCATATTAATTTTCTTTAAACTGTCGTCAACACGGTATTTCATGAAGTTTAATAGGTCTTCTTTTGAGAAGAAGCTTAATTCTCCTAATTCAAAAATCCAATCAATGATTTCGCCTTCTAGTTCTACAGATTGATCAACTAAAGTATAAATATCTTCAATATCAGAATCAGTCAATAAATCAGGTTGCTCTTCGCGGATTTTATTGATTAAATAAATTCCTGCATTAGCGTGAATTTGCTCATCAATAGAAGTCCAAGCGATAATATTAGAAACATTTTTCATGTATCCTTTAAATCTTGTGAAAGAAAGAATGATCGCAAATTGTGAGAAAAGCGATACGTTTTCAATCAGGATACTGAATAATAAAAGAGAAGAAACATATTCTTTCGGTGTTGTAGAATTCGCGTGCTTAAGAACGTTTGATAAGAAATCAATTCTCTTTTTTACGGCAGGAATTTCTATAACGTTAGAGAATTCTTCGCTATATCCTAAAACTTCTACCAAACGGGAATAGGCTTCAGAATGACGGAACTCACATTCTGCAAAAGTAGCTCCAAGACCGTTTAATTCAGGCTTTGGCATGTGGTTGTATAGGTTTCCCCAGAATGTCTTTACAGACACCTCGATCTGTGCAATGGCTAAAAGCGCATTTTTTACAGCATGTTTTTCGTGCGGTTCCAATTGTGAATGAAAATCCTGAACATCTGCGGTAAAATCCACTTCCGAATGTACCCAGAACGATTTGTTGATTGCCTCTACAAATTGAAGAACCTCAGGGTATTCAAATGGTTTATAGCTTACTCTTTTATCAAAAATTCCCATATTAAAATGTCTTTAAAATTAAAATAATTAGATCACTGTGGATAAGATTCAAGAAATAATTAACGTTCTGATTATTTGAAACTTATAATTAAAAGTTATTCACCCAAACGACGCGCTTATTTCTTGTTACGTGCGAAGCACAAAGGTCGAAAAAAAGAACTGATTTTAAAAGGGGCAAATACTAATTGATTGACTTTTAACCTTAAAAGTTTTCCACATTTACATGAAACTTGCTCTGATATTGGCTTATACACTATTATTCAGCAAAAATAAATAAAATTGCCAAGTTACAGTTAAACACGTTATCGTAAATACCTATAAACAAAATAGAAAATAGTTAAACACTAAATTATTTGAATAAATTTTTATTCTTGTAACAAATTGAAATTTACTTCTACTTATTAGGATATAAAACATACATCACTTAATGTTAGTAATTCAGGATCTACATAAATCATACGATACAGGAAAAAGCAAGTTGCACGTTCTCAAGGGTATTAATCTTAATATTTCCGAAGGCGAGTTTGTTTCTATTATGGGAAGTTCCGGTTCCGGAAAATCTACACTCCTTAATATTATTGGTATTCTGGATGAAAAAGATTCAGGGACTTATGAATTGGATGGAGTTCCCATTGAGCATTTATCTGAAATAAAAGCTGCGGAGTACAGAAGTAAATTTCTTGGTTTTATTTTCCAGTCTTTTAACTTGATAGGATATAAAACAGCTTTGGATAATGTTGCCCTTCCTTTATATTATCAAAACGTTCCCAGAAAAGAGCGTGACAGAAAAGCGATGGAATATTTAGAGAAAGTAGGTCTTGCACAGTGGGCAAACCACCTTCCTAACGAACTTTCCGGAGGACAGAAGCAAAGAGTTGCGATTGCAAGAGCTTTGATTACCAATCCTAAAATTGTTTTGGCGGATGAACCAACGGGAGCATTGGATTCTAAAACAACACATGATATTATGAAACTTCTTCAGGATATTAATAATGAAGGAAAAACAATCATCGTTGTAACCCACGAACCTGATGTTGCAGCACAGACGAAGAGAAACGTCATTTTAAAAGACGGTATCATTGAAAGTGATGAGTTTATAAAGCAGATTGTTTTGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015199|3096807:3103860|3097644_3098448_-|WP_066755484.1|DBSCAN-SWA MRTRLFYTSIGILFFAIVKSQVGIGTSNPSNSAILELNSTNKGLLMNTVSLTSLNSASPMGSHVEGMWVYNIATAGTSPNNVIPGLYYNDGAKWVLMSINDNLPRIGDIKSSVITTDHDGWYLLNGRNITTLPTIGQTNASSLGFATTLPNSSDRILKGKNTSETLAAVGGNNSYSITQANLPNLSITGSTVQSGAHTHSYTNRGVNYWNYNAGGQNTTRTVNTEVRTTGAAGDHQHTFSVPSGGTNTAINQYPKHLVVQNFIYLGK >NZ_CP015199|3096807:3103860|3099547_3101206_-|WP_066755488.1|DBSCAN-SWA MEEQNSNIWWLNEESEQMLNRGYLLKGETVDGAIDRITTAAAKKLYKPELQAAFKEMIVKGWISFSSPVWANMGTQRGLPISCFNVHIPDSIEGITHKMGEVIMQTKIGGGTSGYFGELRNRGTAVTDNGKSSGAVSFMKLFDTAMDVVSQGGVRRGAFAAYLDIDHGDIEEFLSIKDIGSPIQNLFTGICVPDYWMQDMIDGDMDKRKIWARVLESRQQKGLPYIFFTDNVNRNKPQVYKDLGMPVNASNLCSEIMLPSTREESFICCLSSMNLELYDEWKDTDAVKLAVYFLDAVLTEFIEKTEGNYYLQGARNFALRHRALGLGVLGYHSYLQKNMIPFESFEATQFNARAFKHIKEQAETASRELANIYGEPELLKGYGLRNTTTMAIAPTTSSSAILGQTSPGIEPFASNYYKAGLAKGNFMRKNKYLAKLLEEKGLDNEETWRTIMLNHGSVQHLAELTDEEKAVFKTFKEISPMEIISQAAQRQQYIDQAQSLNLQIPSTMPVKDVNYLYIEAWKKGVKTLYYQRSSSVSKEMMVNFVSCSACEA >NZ_CP015199|3096807:3103860|3101266_3101554_-|WP_066755491.1|DBSCAN-SWA MINVIVSYTVNPDFVSENKINIQKFLNDFKNLDQETFEYKVYVKEDGVTFVHYSNYINEAVQHEVLNVPSFKEFQRLRDESGLNGSHKVEILQSI >NZ_CP015199|3096807:3103860|3103170_3103860_+|WP_066755494.1|DBSCAN-SWA MLVIQDLHKSYDTGKSKLHVLKGINLNISEGEFVSIMGSSGSGKSTLLNIIGILDEKDSGTYELDGVPIEHLSEIKAAEYRSKFLGFIFQSFNLIGYKTALDNVALPLYYQNVPRKERDRKAMEYLEKVGLAQWANHLPNELSGGQKQRVAIARALITNPKIVLADEPTGALDSKTTHDIMKLLQDINNEGKTIIVVTHEPDVAAQTKRNVILKDGIIESDEFIKQIVL >NZ_CP015199|3096807:3103860|3098450_3099275_-|WP_066755486.1|DBSCAN-SWA MIKIINVNKVIPLILFTSFYDINAQVKISNSSGVINTESVLHLESTSNNKGFLLTRITLQSTNLPAPLASHTAGMIVYNTATAGTSPNNVTPGLYYNNGTSWVKLSTKKPQIGDIKNGFQSADHNGWYLLNGRTVSTLAVNQRARAASLGFSAILPDATDRYLKNTSGSDNIGTPSGSDTFVLAQANLPNVTFTGTTDTTGSHTHTYTDNPTNSTTNGVAAGTNNPVSNAASVNDTTASSGAHTHSLSFTLGSSQAVSLKPDNIITNVFIYLGN >NZ_CP015199|3096807:3103860|3096807_3097626_-|WP_066755480.1|DBSCAN-SWA MKKLNYIFLLVACTFTQAQVMITAGVTATPSPNRDAALELYSQNRNKGLLMPKVSLAATNNPSPLPSHIAGITVYNTNTATATALTSVTPGFYYNDGTSWNKLEVQTPTIGDIKHSSTATDHEGWYLLNGRTVSTLPAAAQTNATSLGFSTILPDSSDKFLKAKSASETLGATSGSTSVTLARVNLPSTTYNATTTSAGAHTHTYNDRASGVTDSVEGGNNQTVVDNDSQISTTASAGAHTHTYNLSTGGSSTPLNLTPKYLSTYIFVYLGQ >NZ_CP015199|3096807:3103860|3101768_3102743_-|WP_054510330.1|DBSCAN-SWA MGIFDKRVSYKPFEYPEVLQFVEAINKSFWVHSEVDFTADVQDFHSQLEPHEKHAVKNALLAIAQIEVSVKTFWGNLYNHMPKPELNGLGATFAECEFRHSEAYSRLVEVLGYSEEFSNVIEIPAVKKRIDFLSNVLKHANSTTPKEYVSSLLLFSILIENVSLFSQFAIILSFTRFKGYMKNVSNIIAWTSIDEQIHANAGIYLINKIREEQPDLLTDSDIEDIYTLVDQSVELEGEIIDWIFELGELSFFSKEDLLNFMKYRVDDSLKKINMDTRYNITPEQYRPMKWFEEEVFANSMDDFFAKRPVDYTKHDKSITANDLF |
7 | Vibrio_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3609628 : 3681343
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015199|3609628:3681343|DBSCAN-SWA AATGAAAACATCAGATTTTAATTTTGATCTTCCTGAGGAATTATTAGCAGAACACCCATCAGAGCACAGAGATGAGTCTAGATTAATGGTTCTTGACAGAAAAACACAAACTATCGAACATAAATTATTTAAAGATGTGGTTGATTATTTTGATGAAAAAGATTTATTTATTTTCAACAATACTAAAGTTTTCCCTGCACGTCTTTATGGAAATAAAGAAAAAACAGGAGCTAAAATTGAAGTTTTCCTTTTAAGAGAGCTTGATAAAGAGACTCGCGTTTGGGATGTTTTGGTAGATCCGGCAAGAAAAATCAGAATTGGTAACAAATTATTCTTCACAGAAGACGAATCTTTGGTAGCTGAGGTTATCGATAATACTACTTCTAGAGGAAGAACATTGAGATTCTTATTTGATGGTTCTTACGAAGAATTCAGAACTAAATTAAAAGAATTAGGAGAAACTCCACTTCCAAAATACATCAAAAGAGCAGTAGAGCCTGAAGATGCTGAAAGATATCAGACAATTTATGCTAAGATTGAAGGAGCGGTAGCGGCGCCAACTGCTGGTTTACACTTCTCAAGACATTTAATGAAGAGATTAGAGATCAAAGGAATTGATTTTGCTGAAGTTACGCTTCACGTAGGATTAGGAACTTTCAACCCAATTGAAGTTGAGGATCTTTCTAAACATAAAATGGAGTCTGAAGAAATCATCATCGATGAGAAAAATGCAGACATCATCAACAAAGCAGTAGACGAGCACAGAAGAGTTTGTGCTGTTGGTACAACAACAATGAGAGCGTTGGAAACTTCTGTTTCTTCAAACAAGAAAATTTCTGCTTTCAACGGTTGGACGAATAAATTTATCTATCCGCCTCACGATTTCGGAGTTGCAAATACAATGATTACTAACTTCCACACGCCAAAATCAACTCTATTGATGATGATTGCAGCGTTTGCAGGAAGAGATTTCATTATGCAAGCTTATGAAGAAGCCGTAAAAGAGAAATATAAGTTCTACTCTTACGGTGATGCAATGTTAATTTTATAAAAAGATAATAGGAAATAGGATTTAGGGCTTAGTTTGTCCCTAGATCCTGATTCCTAATACCTAAACCCTCAAATGAAAGATATCCGTACTTTATCACTAGACCAGCTTAATGACTACTTTTTGACGTTAGGTGAAAAGCCGTTTCGTGCAAAACAGGTATATGACTGGTTGTGGAGTAAAAATCTCCATTCGATTGATGAAATGACGAATCTTTCGAAAACACTTCGTGAAAGAATTTCCGAAGAATATACTATAAATCCTGTTTCTGTTGATCAGCTTCAAAGAAGTACAGACGGAACCATCAAAAACGGAGTGAAACTTCACGACGGATTGTTGGTAGAATCTGTTTTGATTCCTACAGAAACAAGAACTACAGCTTGTGTTTCTTCACAGGTTGGATGCTCATTAAACTGCGAATTCTGTGCTACAGCAAGACTGAAAAGAATGAGAAATCTTGAAGTTGCTGAAATTGTAGACCAGGTTGCCTTGATCGATAGCCAGAGTAAAATGTATTTCGAAAGACCGCTTTCCAACATTGTTTTTATGGGAATGGGAGAGCCGATGATGAATTACAAAAATGTAGTGGAAGCCATCCGAAAAATCACCCAGCCGGAAGGTTTGGGAATGTCTCCAAGAAGAATTACCGTTTCTACATCGGGAATTCCAAAGATGATCAAAATGTTGGCTGATGATGATTTGCGCGTGAAATTGGCGTTGTCCCTTCACTCAGCAATTGAATCTAAGCGTAACGAAATCATGCCGTTCTCGGATAAATTCCCGTTAACGGATATTATGGATTCTCTTCAATATTGGTACAAAAAAACAGACTCAGTAATCACTTTTGAATATTGTGTTTGGAAAGGTATTAATGATGGCGATGAAGATATTAAAGCTTTGATCAGATATTGTAAACAGGTTCCTTCTAAGGTTAATTTAATTCAATACAACCCGATCGGCGACGGAAAATATGATAAATGCAACAAAAAGGCAGAAGAAAATTATGTTCAACAGCTTGAAAATGCAGGGATTACTGTCATGATTCGAAAGAGTAGAGGTGGAGATATTGACGCAGCTTGTGGACAACTGGCCAACAAAACGGCTGATGCTGTGAATTAAAATTTCATTAAAAAATCAAAAATAATTCTTAACGATTTCTTAAAATCCTACATTTGTATAAAACTAATGTACAATGACGGATTACTTTTTAGGTGAAGACGGATTAGAAAATGTCTATGCTTGGTCGATCCCGATTCTTGCTGCTGTTATTTTGGCGGAAATGATCTACAGTCATATTTCTGAAGCCAAATTATACAATGGAAAAGACGTTGCAACAAGTGTTTTTCTTGCATTGATGAACTTCGGACTGGATCTTTTGATGAAGGTTTCCGCGATGGGGGTCATGTTTTTCTTTTACAATCACCGAATTTTTTCCTGGGATTTTACAATCTGGTATTGGCTGATTTGCTTTGTAATTACAGATTTTGCATATTACGTTCTTCATTATGTTGATCACCATTCAAGAGCATTTTGGGCGGTGCATATCACGCATCACAGTTCGGAATATTTCAATTTGACGACAGGTTTCAGAAGTCCTGTTCTGCAACCACTTTATCGATATTTATACTTTTCTCCCTTAGCTTTTTTAGGCTTTAATCCTTGGCATATTATGGTTGTTTATGCAATTGGTCAGGTGTACGGAACGTGGGTTCATACACAAACGGTAAAAACGATGGGAATTCTTGAATATATTTTGGTGACCCCTTCTCATCACCGTGTTCATCACGCCTGTAATATCAAATATCTCGACAGAAATATGGGAATGTGTCTTATTATTTGGGATAAAATTTTCGGCACTTTTGAAAAAGAAGATCCCAATGTTCCTGTGAAATACGGAATTTATCCAAAAATGCCAGATAACAAACCTGATACAGTTCTTTTTTATGAATGGAGAAAGATTTGGAAAGATATTAAACAACCAGATTTAAAATTTTCAGACAGAATTAATTATCTTTTTAATTCTCCCGGCTGGAGACATGATGGAACCGGAAAAACGGTAAGACAATATCAAAGAGAGCATTTGGAAAAGCAAACTAGAAGACAGAAACTGAAGAAATCAGCTTGATTCTTCAAACACAAATAAGCACAAATGTTTTTCACAAATCACACAAATCTCTTCTAAGAATTATATTACCAAACAGTTTGTCATTGACTACGCCGAATCTTCGATTTCTGACGAAGGAAGGATCTCAACATTAATTGTAGAGTCTAGATTCCTGCGGAATGACAAAGTGGGCACATAAATTTGTGTAATTTGTGAAAAATATTCGTGCAATTCGTGTTTAAATAAAAATTTAAAAAAGATTATTTTTACTCCATGAAAAAGCTTTTCCTAATAATAACAACTGTAATTTCCACCTACTCATTTTCGCAACAATCTGATTTTCTTAAAATAAGAAAATACAGAGTAAATTATCTTGATGAAAAATTAAAGGAAACATCAGGATTAAGTTTTTTCAATGAAAAACTATACACTTTCAATGACAGTGGAAATTCTCCCGAACTTTTTGAGATTGATAAAAACTCTGGAAATATTCTCAATACCTTAAAAATTAATGCTAAAAATAAAGATTGGGAAGCGCTCGCAAATGATGGAAAATACTTCTACATCGGAGATTTTGGGAATAATGGAGGAACAAGACGAGATCTTGAAATCAATAAAGTTCCTTTTCAAAATAATGAATTGAAAAATGATTCTGTTAAAATAATTTCATTCTATTATCCAGACCAGACAGAATTTATTCCTAAATACACCAATACTGATTACGATGCAGAAGCAATGATCTATTTAAATGGAAAACTTCATATTTTTTCAAAAGAATGGGCGTCAAGATCGGTTTCACATTATATTGTTGATCCTGAAATTTCAGAAAAACAAAAAGCCGAAAAAATAGAATCTTATAAAACTAATTTCGTTGTTACAGATGCTTCTTATTTCGATAAAAAGCTTTATTTGATAGGCTATACAAAGAAAACAGAAGTATTTTTGGATGTCTTTGATGAAACAGAATCCGGAATCTTTTTTAAGCAAACTCCAAAGCATTATTATCTCGGAAGTTCTTTGTCAATCGGGCAGATCGAGGGCATTGCTGTTGATGAAAAAGGAGTTTATATTTCTGGTGAAAAATTCAGTTCGCCGTTGGGAGGAGCAAAGCAGAGTTTTTATTTTATTCCGAAAGATAAACTCTAAGATTAATTTCACTTAAAATTGACTGAAAAAAATTATCTTTGTGAGATTAATAATTATTATCCATCATTCGTAGATTTTGGCAAATATTGTAGAAGACATCAAACACCCGATCAATGAGGAAATGAAACTTTTCGAACAGAAGTTTTATGAATCAATGCAAAGCAAAGTGCCTTTATTAGATAAAGTAACTCGTTTTATCGTTACTACTAAAGGAAAACAGATGCGTCCGATGTTTGTATTTCTTTGTGCAAAACTAATTGGCGACGTCAATGAGAAAACTTTTCGTGGAGCTTCCATGATCGAGCTTATTCATACAGCGACTTTGGTTCATGATGATGTGGTGGATGAAAGTTTTAAAAGACGTAATTTTTTCTCAATCAATGCGTTGTGGAAAAATAAAATTGCGGTTTTGGTAGGAGATTATCTTTTGTCGAAATCAGTTTTATTATCTACAGACCATAAAGACTACGATCTGTTGGCCGTTATTTCAAGAACGATTCGTGAAATGTCTGAAGGCGAGCTTCTTCAATTAGAAAAAGCCAGAAAATTAGATATTACGGAAGATGTTTATTATGAAATTATCCGTCAGAAAACGGCTACTTTAATCGCTGCCTGTTGTGAAATTGGTGTTTTATCCAATAACGCTGATGAAACTCTTGCCAAGAAAATGCAGGATTTCGGAACGTATACAGGAATGGCTTT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60 | uncultured_phage(28.57%) | plate,tail,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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