Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP013022 | Francisella persica ATCC VR-331 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas3,DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_CP013022
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
398178 : 406004
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013022|398178:406004|DBSCAN-SWA AATGAAAAATATCGATCAATATTATATGCAACAAGCACTCACTATAGCCAATAGAGGTAGACTCACAGTGTCACCTAATCCAATAGTTGGTTGCATAATAGTAAAAAATGGTGCTATAGTCTCAGAAGGCTGGCATGCTATGGCTGGTAAGGCTCATGCCGAAGTATATGCCATAGCCAAAGCTGGTACACAAGCTAGAAATTCTACTATGTATGTCACCCTTGAACCTTGTTGTCACCAAGGCAGAACAGGTCCTTGCACAGATACTATTATTAATGTTGGTATAAAAAAGGTAATTATTGCTACACTTGATCCAAACCCAAAAGTTGCTGGCAAAGGTGTCGACAAACTTAGAAATGCTGGCATAACAGTTGAAATCGGTTTGCTAGAGAAACAAGCACAAGAATTAAATAAAATATTTTTTCACTACCAAAAAACCAAAAAACCTTTTGTTTATGCAAAATGGGCAATGTCATTAGATGGTAAAATAGCTGTTAATGGTAATGATGAAAAAAAAATAAGTTCACACCAAGCATTTATATACACTCACCAGTTACGCAATATTTGTGATGCTATCTTAATTGGCAAGCAAACCTTAATTGATGATAATCCAACCCTTGATGTAAGAATAAATATTAACAAAATAAAGCATCCAACCAGGTTTATACTATCTAATCATCTCACAACTATAAATCATCATTGGCAAGTTTTAGATCAAAGTCATGCCAAGACGATTTTTGTTTGCTCAAAGATCTCTACGAAAGTAGTAACCAAGCTTAATCAGCTTGGTATTGAGTATTGGTTATTACCACAAAGTCAAAATCAGCTTTGTTTAGATAGTCTGCTTGAGAAGATGGGCAACATGGGTATAACTAGCCTACTTATTGAGGGAGGCAATAAAACCTTGCTTAATTTTACCAGCCAAAAGCTTGTTAATGAGTTTTATACATACTTAGCTCCGGTAATAATAGCTGATTACAACCCTAAACAACAGTTAAGCTTCAATCAAGTCTCTATGGGCGAGGACATAATAATAAACTCTTGTTTTAAGGAAAATGTTAATGTTTAATGGTATAGTTCAACAACTAGGAACAATTAAAAAAATAATAGCTAAAGATAGTCTAAAAACTTTTTGTATCGAATTTGAAAATAGTCTTAAATGCAACATTGGAGATAGTGTCGCAATTAATGGTACTTGTCTTACTGTTACAGCGCTTGATAAGCAAAATTTAACAGCAAATTTTAATGCCGTACTAGAGACACTTAAAAAAACTAACCTTGATAACCTAAAGGAGAAGCAACTAGTAAATACTGAACTTGCAATGCGCTATGGTGATTATGTTGGTGGACATATGGTACAAGGTCATGTTGATGAGCCAGGGCAAATCAAAAATATTAATAATGTTGGTGGCGCATGGTTAATCGAAATTTCTGCTTCTAAAGAATTTCTAAAATACCTAGTAAAAAAAGGTTTTGTAGCTATAGATGGCATGAGTATAACTGTAATAGATGTACTTAAAGATTCATTTACTGTGACTTTGATACCACACACTATTGAGGTCACTATAACAAAAAACTATACTAGTGGTTCTATAGTAAATCTTGAAGCTGATGCAACATGTAAATATATCTACAAATATATACAAGGATTTAAAGAAAATGTTTAAACAAATAAAAAGTAATATTGAAAATGCCATACAAACTCTTAAGCAAGGTAAACCTGTAGTTGTACTTGATGATTACTATAGAGAAAACGAAGGCGATCTAATTCTACCAGGTCAAAAAGCTACAAAAGCAAATATTGCTTTTATGCTTGAGCACACTAGTGGCATCATTTGTTTGGCAATGGATTCAAAAAAAGCTTGCCAGTTAAATCTAACTCCAATGGTAGCTGCTGATCAAAATAATAACACTTTTACTACTCCTTTCACTATAACTATAGAAGCTAAAGAAGGTGTAACTACCGGAGTATCAGCAAAAGATAGAGCACACACTATACAAGTAGCATCAAAAGTTGATGCTAAAGCAGAAGAACTGGCTAGACCTGGCCATATATTTCCTCTTATCGCCAATGATAAAGGCGTACTTGGTAGAAATGGTCACACCGAGGCAACTGTCGATCTTATGAAACTAAGTGGTTTTAACAGTGCTGGTGTACTTTGTGAGCTTATGAATAAAGATGGCACAATGATGAAAGCTCCTCAGTTAGAAGCATTTGCTAAAAAGTATGATTTACCTCTTTTAACGATTGCAGAAATCTATCAATATCGCCTAGCTACAGAAATCTTTATTGAAAAAGCTGCTAGTTCTACTATTCCATTTGATCATGTTGGTGAGCTTGAAATAACAGTTTATAGGGATAAATTCAATGGTGAAGAAGTAGTTGTACTTTCTAAAACTACTAATAGTGAAAAGCCGCTAGTAAGAATGCACTCTTCATGTATAACTGGTGATTTATTTGGCTCTTTGCGCTGTGACTGCCAAGCTCAATTAAGAAAAGCTATGCAAATGGTAAGTCAAGAAGGTGGTTATCTAATATATCTAGACCAGGAAGGTCGCGGTATTGGTCTAACAAATAAACTTAAAGCTTATAACCTGCAAATGCACCAGAATATGGATACAATCGAAGCAAATGTTGCTCTGGGACTGCCTGTTGATGCCCGCAAATATGATCTTGCTATTCAAGTACTAAAATATAACAAAATTGATAATTGCAGACTCATATCTAATAATCCAAAAAAAATCTCTGCTCTTGAAATAGTTGGGATACAAGCTGAAGCTGTAGCTTGTGAAGCTTTTGTCAACTCTCACAACAAAAATTATTTAATGACTAAAAAAGATAAAATGAAACACACAATTAAAGGAATATAGGCATAAATTATGAGAAAACTAGCAATCATTTCAAGTGGATTTAATTCTTTAATAACTGAAAAAATGCTTGAAGGTGCCCTAGAAGAAGCATATGCCCAAGGCTTAAAAGATAGTCAGATTTGCATTAAAAAAGTCCCTGGTGCAGTTGAACTTCCATATGCAGCAAAACTACTAGCAGAAACTAAAGAATTTGATGCAATAGTGCTACTAGGTTGTATAATCCGTGGCGAAACAGACCACTATAATTATGTTTGCGATCAAGTAAGTTATGGCACACAAAAAGTTATGCATCAATATAATTTACCAGTAATTTTTGGTATATTAACCACCCATAACAAAGAGCAAGCCTTAGAAAGAGTTGGTGGCAAAAAAGGTCATAAGGGTAGATACTCCGTCCAAGCTGCTATAACTATGGCACAGATGAAAAAAGATATATTAGAACAAGGAGTATAAATATGTCTTTAGAAATTCTAAAGTACCCTCACCAAGTTTTAAGAGAGGTTGCTAAAGAAGTCACAAAAGATGAAATCAACTATGATTTACGCACAACCATAGCTGAGATGCGTGAACTAATGTTAAAAGCTGGCGGTATCGGGCTTGCAGCGATACAAGTTGGTATAAAAAAAAGATTCTTTATCATGTACGATAACTTAGAAAAACAAAATCCTGAAATAATCACTATCATTAACCCTCAAATAATTGAGCAAAGTGGTAAAATAATTGATGAAGAGGGCTGTCTTTCATTTCCTGGTATTTCCGCAAAGGTAAATAGAGCCACTACAGTCAAGATAAAGGCTCTTAATGAATTTGGTGATGAAATTGAGATTGAGAAAGATGGCTTTCTAGCGCGTTGTATCCAACATGAGATAGATCACCTTAATGGTATAACTTTTTTTGATCATCTTGGTTCACTAAAACGCAAAATGATAGAGAAAAAGTATAAAAAACTAATGCAAGAAAATACTATACGTTGATTTTTGATTATTTTTATATAATCAAGACTTTACTTTTTAGCAGCATTACGCAAGAATTATATCCTGTAACTCTACTATCAAATCATGGATTTAGTATGCGCAATATATTCAAAAAAATATCTTTAATATCATTACTGAGCATAATTATAGCGTCATGTGGTATGCTATCTAACGACGAGTTCGTTTATTTAGGTCATGGTAAAAACTATCCTGATTATCAGCTCTATTATGATAAGACACAAAAACTTTTCGTTCTAATTGATAAGAGAAATGGCTGTTTCCAAAAGAATGATACTGGTACTTGTCTTGCATTTACATTAAAGCAAGCACGCGAATTTAGGGAATATGTTTTAGCTAAGATGATAGAAATAGATCTTAGACTTGCTAAAGATAACTACGGAAGCTACACTATTGCAGAGCTACAAAAAGCTGGTATTACTACGGCCAATAAACCGATTAAAACTAAAAAAGTATATGCAACTCCGATTAGACAGATTGTCCTTGATAGAAAACAACAATATCACCTTGTTAGAAAAGAGTATGAAATAAATTCAAATCTGGTAGCGATGGTTGTTACTGATAAAGAAGGTAAGAAGCGCATAAAAGTTGCGTATACTGTCGATTTCCCTGGTTTAGAGAAAGAGTATAGTACTGAGCTTAGACCATTTATTATTGATCCAGAGTATTTATATACACACATGACTATTGATACTGTTCATGAAGCTCAATTCATGCAAAGTAATATTATGAAGAGTCAGACTAATGTTAAAAAAGAAGTTGATGAATATCTCAAAGATGTTGTCGACAATGGCAAAAAAGATACTGGTTATACTCACCAAGATATTGCAAGTAGTGTCGCAGCATTAGATAAAGATCTAATAACAAAAGTAAATGAACAGCACGAAGATAAAAAAGCTACACTAGCAAGTGGTAGTAGCGTTAGGAATATAATAAAAACTCCTGTCAACCAAAAATATAATGCTAATAGTGGTAGCACAATACAGGCTGCTACAAAAACTGCTCAAACTATACAAGCTAATACTGCAGATATACCTAAAGCAACTTTAGCAAGTGACAATAAAATAAAAAGTAAAAATAGTTCTAAATAATTACTCCACCACCTAGACAAACATCATCAGCATAAAATACTACTGACTGTCCTGGTGTGATTGCTCTTTGTGGCTGATCAAAAGTTACTTTAACCGAGCCATCACGATTTACTTCTACTTCACAATCTTGATCTTTTTGTCTATAGCGAATTTTTGCCGAACATCTAAACTTAGCTGCTGGAGCCATATCCGCTACCCAACTTAGTCCTATAGCTTGTAGTGACTGCTTAAATAGCATTGGGTGATCATGACCTTGCACAGCAATCAAAACATTATTTTCTAAATCTTTTTTTGCCGCAAACCACGGTATTTCTTGACGATCTTTTACACCACCTATACCAAGACCATGCCTTTGACCGATTGTATAATACATCAGTCCATCATGCATACCTATCTTGATACCGTTTTCATCGTGGATTTCACCTTTTTGAGAAGGTAGATACTTAGACAAGAATTCTTTAAACTTACGCTCACCAATAAAACAAATTCCCGTACTATCTTTTTTATCAAATGTCACAAGATTATTTTCTTTTGCAAGTTCTCGCACTTTAGATTTCTCAACACCGCCTATAGGAAAAATTGTTTGTCTTAACTGCTCTTGACCTAGTGTGTATAAAAAATATGTTTGATCCTTATTATCATCCAAACCCTTAACTAACTGTACTGAACCATCATTAGCTACTCTTGTGCGAGCATAATGCCCCGTAGCGATATAATTACCTCCTAGTAAATGCACATAATTTAAAAATGCTTTAAACTTTATTTCTTTATTACAAAGTATATCAGGGTTAGGTGTTCTACCAGCTTTATACTCTGTTAGAAAATGCTCAAAGACATTATCCCAATATTCTGCAGCAAAGTTGATCTTTTTGAAAGGTATGCCGATAGAGTCACATACAGTTTGAGCATCAGCAATATCTTGTTCTGCTAAGCAAAATTCATCCGTGTCATCTTCCTCCCAGTTTTTCATAAACACACCTGTTACATCATAGCCTTGCTGTTTCAAGAGCAAAGCCGAAACTGATGAATCTACACCTCCAGATATACCTACTATTACTTTTTTGTTTTGCATAATAAATCTATAAATTTTATTTTATAAGTATAGATAGGAAAGCTTCTTGAGGAATCTCAACAGAACTAATATTCTTCATTCTCTTTTTACCCTCTTTTTGCTTCTCTAAGAGTTTTTTCTTACGTGAAACATCGCCACCATAGCATTTTGCTAAGACATTCTTACGTAATGCCTTAACAGTACTTCTAGCGATAATAGTACCACCGATTGCTGCTTGAATCGCCACTTCAACCATTTGTCTAGGAATAAGTTCCTTTAGACGCTCAACAAGTTCTCTACCTTTATATTTAGCTTGATCTCTATGTACAATACTTGCTAAAGCATCAACCTTGTCACCATTTATAAGTACATCTAAGCGTACCATATCTGCAGATTCATAACGAATTAACTCATAATCTAGCGAACCATAGCCTTTGGTTATTGACTTAAGCGTATCAAAGAAATCAGACACAACTTCGATCATTGGCAAATCATAAGTTATCGAAACCTGATTCCCAACATAATTCATATTAACCTGAGAACCTCTTTTCTCAACACAGATATTAATTACACTACCAACATAATCTTTTGGAACGAGAATATTCGCTCTTACAATTGGCTCTTGTATCTCAGCTATTACTCCTAGTTCTGGTAGTTTAGATGGATTATCAACCTCTATAATTTCACCATTTTTTTTAAGAGCTTTATAAACAACTGTTGGTGCTGAAGTAATTAAATCAAGGTTGTACTCTCGTTCTAATCTCTCTTGGATAATCTCCATATGTAACATACCCAAGAAACCACATCTAAAGCCAAAACCTAAAGCTTGTGATACCTCTGGTTCAAAAAATAATGAGGCGTCATTTAAACTTAGTTTTTCTAGAGCTTCTCTAAAATCAGGATAATCATCTGAGCTTATGGTAAACATACCAGCATAAACTTGAGGTTGAACCTTTTTAAATCCAGGTACAGGTTTATCTGTTGGGTTATGTGCATGTGTGAGCGTATCACCAACTGAGGCACCGTGAATATCTTTAATCCCAGCAACGATAAAGCCAACCTCTCCTGCTTTGAGATGATCTAGATCTTTCATTTTAGGCGTAAATACCCCAAGTCTATCAACCTGATAAGTGACTCCCGTTGACATAACTTTTACTTTCTCACCTTTTTTGATAATACCATTTCTAATTCTAACTAAAGATACAACACCCAGATAATTATCAAACCATGAGTCAATAATCAACGCCTGTAATTTATCTTCTACACTTCCTTGTGGCGCTGGGACTTTGGCAACTATTGTTTCTAAAACATCCTCTACACCTATACCTGTTTTTGCGCTACATTTTGTTGCATCTGTAGCATCTATACCGATTATTTCTTCGATTTCTTGCGCTACTTTATCTGACTCTGCAGACGGTAGATCAATTTTATTTAATACTGGTATAACTTCTAGATTCTGTTCAATAGCGGTATAACAGTTTGCTACTGTCTGGGCTTCTACACCTTGAGCTGCATCTACCACAAGCAAAGCTCCTTCACAAGCTGCTAATGAGCGTGATACCTCATAAGAGAAATCAACATGACCTGGCGTATCAATGAAATTCAGCTGATATGTCTGGCCATCTCTAGCTGTATAATCAAGCGTTACAGACTGCGCCTTAATCGTAATCCCACGCTCTCTTTCTATATCCATAGAGTCGAGCACTTGCTCCTTCATTTCACGCTCACTTAGACCATTACAGATTTGTATAAATCTATCCGAAAGAGTTGATTTTCCATGGTCAATATGAGCAATTATCGAAAAGTTTCTGATATTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013022|398178:406004|399238_399844_+|WP_064461546.1|DBSCAN-SWA MFNGIVQQLGTIKKIIAKDSLKTFCIEFENSLKCNIGDSVAINGTCLTVTALDKQNLTANFNAVLETLKKTNLDNLKEKQLVNTELAMRYGDYVGGHMVQGHVDEPGQIKNINNVGGAWLIEISASKEFLKYLVKKGFVAIDGMSITVIDVLKDSFTVTLIPHTIEVTITKNYTSGSIVNLEADATCKYIYKYIQGFKENV >NZ_CP013022|398178:406004|401057_401501_+|WP_064461547.1|DBSCAN-SWA MRKLAIISSGFNSLITEKMLEGALEEAYAQGLKDSQICIKKVPGAVELPYAAKLLAETKEFDAIVLLGCIIRGETDHYNYVCDQVSYGTQKVMHQYNLPVIFGILTTHNKEQALERVGGKKGHKGRYSVQAAITMAQMKKDILEQGV >NZ_CP013022|398178:406004|404219_406004_-|WP_064461551.1|DBSCAN-SWA MKNIRNFSIIAHIDHGKSTLSDRFIQICNGLSEREMKEQVLDSMDIERERGITIKAQSVTLDYTARDGQTYQLNFIDTPGHVDFSYEVSRSLAACEGALLVVDAAQGVEAQTVANCYTAIEQNLEVIPVLNKIDLPSAESDKVAQEIEEIIGIDATDATKCSAKTGIGVEDVLETIVAKVPAPQGSVEDKLQALIIDSWFDNYLGVVSLVRIRNGIIKKGEKVKVMSTGVTYQVDRLGVFTPKMKDLDHLKAGEVGFIVAGIKDIHGASVGDTLTHAHNPTDKPVPGFKKVQPQVYAGMFTISSDDYPDFREALEKLSLNDASLFFEPEVSQALGFGFRCGFLGMLHMEIIQERLEREYNLDLITSAPTVVYKALKKNGEIIEVDNPSKLPELGVIAEIQEPIVRANILVPKDYVGSVINICVEKRGSQVNMNYVGNQVSITYDLPMIEVVSDFFDTLKSITKGYGSLDYELIRYESADMVRLDVLINGDKVDALASIVHRDQAKYKGRELVERLKELIPRQMVEVAIQAAIGGTIIARSTVKALRKNVLAKCYGGDVSRKKKLLEKQKEGKKRMKNISSVEIPQEAFLSILIK >NZ_CP013022|398178:406004|401503_402022_+|WP_064461548.1|DBSCAN-SWA MSLEILKYPHQVLREVAKEVTKDEINYDLRTTIAEMRELMLKAGGIGLAAIQVGIKKRFFIMYDNLEKQNPEIITIINPQIIEQSGKIIDEEGCLSFPGISAKVNRATTVKIKALNEFGDEIEIEKDGFLARCIQHEIDHLNGITFFDHLGSLKRKMIEKKYKKLMQENTIR >NZ_CP013022|398178:406004|402117_403131_+|WP_064461549.1|DBSCAN-SWA MRNIFKKISLISLLSIIIASCGMLSNDEFVYLGHGKNYPDYQLYYDKTQKLFVLIDKRNGCFQKNDTGTCLAFTLKQAREFREYVLAKMIEIDLRLAKDNYGSYTIAELQKAGITTANKPIKTKKVYATPIRQIVLDRKQQYHLVRKEYEINSNLVAMVVTDKEGKKRIKVAYTVDFPGLEKEYSTELRPFIIDPEYLYTHMTIDTVHEAQFMQSNIMKSQTNVKKEVDEYLKDVVDNGKKDTGYTHQDIASSVAALDKDLITKVNEQHEDKKATLASGSSVRNIIKTPVNQKYNANSGSTIQAATKTAQTIQANTADIPKATLASDNKIKSKNSSK >NZ_CP013022|398178:406004|398178_399246_+|WP_064461545.1|DBSCAN-SWA MKNIDQYYMQQALTIANRGRLTVSPNPIVGCIIVKNGAIVSEGWHAMAGKAHAEVYAIAKAGTQARNSTMYVTLEPCCHQGRTGPCTDTIINVGIKKVIIATLDPNPKVAGKGVDKLRNAGITVEIGLLEKQAQELNKIFFHYQKTKKPFVYAKWAMSLDGKIAVNGNDEKKISSHQAFIYTHQLRNICDAILIGKQTLIDDNPTLDVRININKIKHPTRFILSNHLTTINHHWQVLDQSHAKTIFVCSKISTKVVTKLNQLGIEYWLLPQSQNQLCLDSLLEKMGNMGITSLLIEGGNKTLLNFTSQKLVNEFYTYLAPVIIADYNPKQQLSFNQVSMGEDIIINSCFKENVNV >NZ_CP013022|398178:406004|399836_401048_+|WP_064461791.1|DBSCAN-SWA MFKQIKSNIENAIQTLKQGKPVVVLDDYYRENEGDLILPGQKATKANIAFMLEHTSGIICLAMDSKKACQLNLTPMVAADQNNNTFTTPFTITIEAKEGVTTGVSAKDRAHTIQVASKVDAKAEELARPGHIFPLIANDKGVLGRNGHTEATVDLMKLSGFNSAGVLCELMNKDGTMMKAPQLEAFAKKYDLPLLTIAEIYQYRLATEIFIEKAASSTIPFDHVGELEITVYRDKFNGEEVVVLSKTTNSEKPLVRMHSSCITGDLFGSLRCDCQAQLRKAMQMVSQEGGYLIYLDQEGRGIGLTNKLKAYNLQMHQNMDTIEANVALGLPVDARKYDLAIQVLKYNKIDNCRLISNNPKKISALEIVGIQAEAVACEAFVNSHNKNYLMTKKDKMKHTIKGI >NZ_CP013022|398178:406004|403123_404203_-|WP_064461550.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQNKKVIVGISGGVDSSVSALLLKQQGYDVTGVFMKNWEEDDTDEFCLAEQDIADAQTVCDSIGIPFKKINFAAEYWDNVFEHFLTEYKAGRTPNPDILCNKEIKFKAFLNYVHLLGGNYIATGHYARTRVANDGSVQLVKGLDDNKDQTYFLYTLGQEQLRQTIFPIGGVEKSKVRELAKENNLVTFDKKDSTGICFIGERKFKEFLSKYLPSQKGEIHDENGIKIGMHDGLMYYTIGQRHGLGIGGVKDRQEIPWFAAKKDLENNVLIAVQGHDHPMLFKQSLQAIGLSWVADMAPAAKFRCSAKIRYRQKDQDCEVEVNRDGSVKVTFDQPQRAITPGQSVVFYADDVCLGGGVII |
8 | Indivirus(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
793922 : 803977
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013022|793922:803977|DBSCAN-SWA TGTGATAAACTTGGTACTTTGTGGTGGTAGTGGTACTAGGCTTTGGCCTATTAGCAGAAAGCTATTGCCAAAGCAGTTTGTGAAAATGTTTAGTGATAAGTCATTATTTCAGTTAACTGTAGAGAGAAATTCCACTTTATGCAGTTTAACGATGGTAGTTTCTAACGAAGGACAGTTGTTTTTAGCAAAAGATCAGTTAGATGAGCTTGGTATTTTAGATAAAAGTATTTTTCTCGAAGAACCAGTTGGTAGAGATACTGCTCCTGCAATTGCTCTTGCATGTATGAAGTTAGATCCACAGGAAATTGTATTTGTTACACCATCTGATCATGTTATTAATGTTGATGACGGGTACAGAAGTATATTGGTTCAGGCTAAGAGATTAGCTAGTGAGGGGTTCCTTGTCACGTTTGGTGTAACACCAACTTTTGCCAATACTGGTTTTGGTTATATTAAATCTTCAGGTGACTTTGATGTTGGGAGCTTTCATGAGAAGCCTAATGCTGATACAGCAGAGAAGTTTTTAGCAGATGGATCTTATTATTGGAATTCTGGAATGTTTATGTTTAAGGCTGGAGTCTTCTTAGAAGAGTTAAAAAAACACTCACTAGAAATATATGCAGCGTGTGTTGAGGTTTATGATAAAAGTGACTTGAAAAATTCAGATGCTATAAAATATGATGATATGATGAGTATTCCAGCTAAGTCTATAGACTATGCGGTGATGGAAAAATCTGATAGGATAAAAATGGTCGTCGCTGACATTGTCTGGAATGATGTAGGTAGCTTTGACTCTCTTTTTGATCAACTTCCTAAAGATAGCAATAATAATACAATAAATAGCAACCATATTAGTATTGATAGTAAAAATAATCTAATCCATAGTGAGAATGGTTCTAAGAAAGTTGCTACTATTGGAGTAGAAGACTTAATAGTTGTTGATAGTGGAGATGCTCTTCTTATTGCTAAAAAAGGGAGTTCACAACGAGTAAAAGAAGTTGTAGAGCTTTTAAGTGATGAATTGAAAAATATTCACTTAAAAGCACATAGACCATGGGGTACATATACTGTTTTGGAAGATACTCCAGGTTACAAAATTAAAAAAATAGAAGTCAAACCAGGCAAAAGATTGTCTTTGCAGAAGCACTATCACCGTAGCGAACATTGGATAGTAGTATCAGGTACTGCTACAGTTACTAAGGGGGATCAAGAATTTATCGTTAGACCTAATGAATCTGTGTATATTCGTATGGGAGAGGTGCATAGACTAGCAAATAATGGCAAGATTCCAGTGGTCTTAATTGAGGCGCAAGTTGGTGAATATACTGGTGAAGATGATATTGTTAGACTTGAAGATGATTTTAATAGAATTTAATAAAGTAAATAATAAGGGTTACAAATGAAAAAAGTAGCATTAATAACAGGTATTACTGGTCAAGATGGTTCCTATTTAGCAGAGTTTTTATTAAAGAAAGACTATATAGTTCATGGTATCAAAAGAAGAAGTTCGCTCTTTAATACAGATAGAATAGATCATCTTTATCAAGATCCTCATTTTGAAAATAGAAATCTAATTCTACACTATGGTGATATGACGGACTCTATGAATTTAACTAAAATTATAGCAGATACGCAACCATATGAGATCTATAATCTAGCGGCTATGAGTCACGTACATGTTTCATTCGAGACTCCTGAATATGTTGCTAATGCTGATGGTACTGGTACGCTTAGAATTCTTGAGGCTGTTAGACTTCTTGGTTTAGAGAAAAAAACTAAAATTTATCAAGCAAGTACTTCTGAACTTTATGGTAAGGTTCAAGCAATTCCACAAAGCGAAACTACTCCATTCTATCCAAGATCACCTTACGCAGTTGCTAAGATGTATGCTTTTTGGATAACTGTAAACTATAGAGAGGCGTATGGTATGTATGCTTGTAACGGTATTTTATTTAACCATGAGTCTCCAGTTCGTGGTGAGACTTTCGTAACTAGAAAGATTACAAGAGCAGCATCTAAGATAGCTCTAAATCTTCAAGATAAACTATATCTAGGTAATCTAGATGCGAAAAGAGATTGGGGTCATGCAAAAGATTATGTAAGAATGATGTGGATGATTCTTCAGGCTGATCAGCCTGAAGATTGGGTTATTGCTACTGGTCAAACAACTACAGTTAGAGATTTTGTTAAGTTATCATTTGCTTATGCTGGTATTAACCTAAGATTTGAAAATGAAGGTATTGATGAGATTGGTGTGGTTGATTCTGTAGACTTATCTAGAGCTGAGGAATTAGGGGTTAATTTATCGCATTTGTCAGAAGGTCAGGTAGTAGTTTGTGTTGATCCTAGATACTTTAGACCGACTGAAGTGGACTTATTATTAGGAGATCCTACAAAGGCTGAGCAAAAATTAGGCTGGAATAGGGAGTATGACCTAAGAGATCTTGTTAATGATATGATGGAAAGTGATCTTAAGTTAATGACAAAAGATGTTTATTTAAAAGAAGGTGGCTATAAAATTATGAGCTATTTTGAGTAAGGAATTATTAGAGATGCATGAAGATAGCAAAATATATGTAGCTGGTCACAGAGGCTTGGTTGGTTCTGCTATTGTTAAGAATCTTCAGTCTAAAGGCTATACTAATTTGGTACTAAAAACTCATGCTGAACTTGATTTAACAAATCAAAAAGTTGTTGAAGATTTTTTTAGTGCTGAAAAACCTGAATATGTAATTCTTGCCGCTGCTAAGGTTGGTGGGATTGTTGCAAATAATACTTATAGAGCAGAGTTTATTTATGATAATATTCAGATTCAAAATAATGTTATTCACCAAAGCTATGTAAATGGAGTTAAGAAGCTTCTATTTTTAGGCAGTACATGTATTTATCCTAAAGAAGCCTCTCAGCCAATGCAGGAAGATTGCTTACTAACTAGCCCATTAGAATATACCAATGAGCCGTATGCTATTGCTAAGATTGCGGGTATAAAAATGTGTGAAAGCTATAATTTACAGTATGGTACAAACTTTATATCTGTGATGCCGACTAACTTATATGGACCAAATGATAACTTTGATCTTGAAAAATCGCATGTTTTACCAGCTTTGATTAGAAAAATACATCTTGCTAAACTTCTTAATGAAGGGAAAATAGAAGATGTGTTAAAAGATTTAGCTATAGACTCTATTGAGCAGGCTAAGCAATACCTGTCTAAATTTGGTATAAGCAAAAGTTCTGTGGAGATATGGGGTACAGGTAAGCCAAGAAGAGAGTTTTTATATTCTGAAGATATGGCAGATGCTTGTGTGTTTTTACTTGAGAATAGAGATTTTAAAGATACTTACTCTAATGATTCAAAAGAAATAAGAAACACTCATATTAATATTGGTACTGGTATTGATATCTCTATTAGAGAATTGGCTGAACTTATCAAAAAAAATATTGGGTTTGATGGTGAGCTTAAATTTAATACTGTTAAGCCAGATGGTACTATGGTTAAACTTACAGATCCATCTAAGCTTCACTCTCTAGGATGGAAGCATAAAGTTGATCTTGAAGATGGTATCAGAAGGATATATGATTGGTATCTGGCAAAGTCATAGTTTTACATTTTGAACATCGAGTAGAGTTATGTTGTCTATAAATATCTCTTTGATTGAAATTTAGTGGCTCTACTCGTATACTATCTATTAGATACTGAAGTGTGTTCTTATTAGGATAATTTATGAAAGGAATAATATTAGCTGGTGGTAGTGGTACTAGGCTATATCCAATTACAAAAGGCGTAAGTAAGCAACTAACACCTATATACGATAAGCCACTTATATATTACCCTCTGTCTGTGTTGATGCTAGCAGGATTAAGGGATATCTTAGTAATTACAACAGAACAAGACCAACCTAGTTTTAAAAATCTTTTAGGAGATGGTTCTGATTTAGGTATTAATCTTAAATATATAGTACAGCCTTGTCCTGATGGACTTGCTCAAGCTTTTATATTAGCAGAAGAGTTTTTGGAAGGTGATTCAGCTTGTCTTGTGCTAGGTGATAATATTTTTTATGGGCATGGTTTACCAAAAATGTTCGCTAAAAGTATTCAAGATGTAGAAAAAGAGAATTGTGCTAGCATCTTTGGTTATTATGTAGATGATCCTGAAAGATATGGAGTTGCTGATTTTGATGCAGAAGGAAGTGTTGTAAGTATCGAAGAAAAACCAAAAAAACCAAAATCCAATTATGCAGTCGTAGGGCTATATTTCTATCCTAATGATGTTGTGGAGAAAGCTAAGCAGGTACAGCCATCAGAGAGAGGAGAGCTAGAGATTTCAACGCTTAATCAGATGTATTTGGATGAAGTACGCCTAAAAGTTAAGACTATGGGTAGAGGGTATGCATGGTTAGACACTGGTACGCATGAAAGTATGCTTGCTGCTAGTAATTTCATTCAAACTATAGAAGATAGACAAGGATTAAAAGTTGCATGCCTTGAAGAAATTGCTTATGAAATGGGCTATATTTCTAAAGAACAGCTTCTAAAGTTAGCACAGCCATTGAAGAAAAATCAATATGGTCAATATTTGATCAAAAGAGCTAAAGAAAGAGTGGTGCCACGATGAAATTTACTCGTGCAGATATTGAGGATGTTATCATCTGTGAACCGGCTGTACATGGCGATCACAGGGGATACTTTGTTGAAACTTTTCGCGAAGATAAACTGTTTGATTTCTTAGGTTATAATATTAATTTTTGCCAGGATAATGAGTCAAAAAGTTCTTATGGTGTGCTTAGAGGATTGCATTATCAACTGCCACCTCATTCACAGACAAAGCTCGTAAGAGTTATACAAGGTAGTGTACTTGATGTTGCTGTGGATATTCGTAATGGTAGTCCTACATTTGGTCAGTATGTTGCTGTAGAGCTAAGTGCTGAGAATAAAAAGCAGGTACTAGTCCCTAGAGGTTTCGCTCATGGTTTTGTTGTTTTAGAGGATGATACTATATT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ACTGGAAAAGAGTGGAATTGATGTATGGAGCATTAAAAAGTTCTGGAGAAATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013022|793922:803977|796473_797523_+|WP_064460768.1|DBSCAN-SWA MHEDSKIYVAGHRGLVGSAIVKNLQSKGYTNLVLKTHAELDLTNQKVVEDFFSAEKPEYVILAAAKVGGIVANNTYRAEFIYDNIQIQNNVIHQSYVNGVKKLLFLGSTCIYPKEASQPMQEDCLLTSPLEYTNEPYAIAKIAGIKMCESYNLQYGTNFISVMPTNLYGPNDNFDLEKSHVLPALIRKIHLAKLLNEGKIEDVLKDLAIDSIEQAKQYLSKFGISKSSVEIWGTGKPRREFLYSEDMADACVFLLENRDFKDTYSNDSKEIRNTHINIGTGIDISIRELAELIKKNIGFDGELKFNTVKPDGTMVKLTDPSKLHSLGWKHKVDLEDGIRRIYDWYLAKS >NZ_CP013022|793922:803977|797645_798536_+|WP_064460769.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPITKGVSKQLTPIYDKPLIYYPLSVLMLAGLRDILVITTEQDQPSFKNLLGDGSDLGINLKYIVQPCPDGLAQAFILAEEFLEGDSACLVLGDNIFYGHGLPKMFAKSIQDVEKENCASIFGYYVDDPERYGVADFDAEGSVVSIEEKPKKPKSNYAVVGLYFYPNDVVEKAKQVQPSERGELEISTLNQMYLDEVRLKVKTMGRGYAWLDTGTHESMLAASNFIQTIEDRQGLKVACLEEIAYEMGYISKEQLLKLAQPLKKNQYGQYLIKRAKERVVPR >NZ_CP013022|793922:803977|801132_802125_+|WP_064460773.1|DBSCAN-SWA MFNNKIILITGGTGSFGKKYTEILLSEYNPKKIIIYSRDELKQFEMSQVYDAPCMRYFIGDVRDPERLKEAMQSVDYVIHAAAQKQVPAAEYNPMECIKTNIHGAENVIKAALSNNVEKVIALSTDKAANPINLYGATKLASDKLFVAANNMVGARKTRFSVVRYGNVLGSRGSVIPYFQKLISEGVKELPITHEKMTRFLITLEEGVRFVLKNFERMQGGEIFVPKIPSMYMTELAKAMAPDLSLKIIGIRPGEKLHEIMCPSDDSHLTLEFDDHYVLCPTIQFAYKTNFLENAIGEKGKFVEQGFEYNSGNNTEWLTKESFLEMMSRM >NZ_CP013022|793922:803977|799193_800072_+|WP_064460771.1|DBSCAN-SWA MRILVTGSSGQLGSELKELVQNSKFKIQNYIFVFTDSKLLDITNHEAIEKFIKDNNIKIIINCAAYTAVDKAESNMEMADKINHLAVVNISRIAKNYNIKLIHISTDYVFNGENFKPYIETDTTNPQGIYGATKLASEKAIQSINPKNTIIIRTSWVYSYYGTNFVKTMMHLGSERESLGVIFDQVGTPTYARDLASAILQILPKLNNQDVEVYNYSNEGVASWYDFAREIMRIAKLNCKVNPIETVDYPTQAKRPHYSVLNKNKIKQDFDITIPYWKDSLQDCIKRLQKDL >NZ_CP013022|793922:803977|803278_803977_+|WP_064460775.1|DBSCAN-SWA MRLAVIPARGSSKRIPRKNIKHFDGKPIIAHSIQALLDSKVFDRVIVSTDDAEIAEVAKQYSAEVPFMRPSNISDDFATTGDVIKHAVEWYYSKGECVETVCCLYATAPFIKSQDLIDSVGILETGDTECVFSATEFSYPIFRSFALDQQLRPKMFWPENFTKRSQDLQVAYHDAGMFYIAKPSIFIEQKPLFSDYSKAYLIPHYRVQDIDTLEDWKRVELMYGALKSSGEI >NZ_CP013022|793922:803977|802127_803282_+|WP_064460774.1|DBSCAN-SWA MDFIPYGRQNISAEDIEAVVEALKSDFLTQGPAVIRFEESVAKYCNVKYTFAVANATCALHLAYLALDVGKGDVIWISPNTFLSTANAALICGADVDFVDICSKTYNMSVDALEKKLIEAKTIGKLPKVVTPVHFAGQSCDMQRIYELSKEYDFAIVEDAAHAIGGRYIDKPIGSCQYSDITIFSFHPVKIITTAEGGMLTTNCYKLAQKISLLRTHGMTRDKSLMINEVEGPWYYEMIDLGYNYRITDIQCALGLSQMSRLDEFVARRHVVMDKYKELMSDCKEVILPHQFEKSYSGLHLFPVVVPANKRRKVFEYLRDNGVGVNVHYIPVYLQPFYQKLGFKQGYCKNAESYYYGAISLPMYPDLTCDQIKFICDKLRYVLK >NZ_CP013022|793922:803977|793922_795296_+|WP_064461723.1|DBSCAN-SWA MINLVLCGGSGTRLWPISRKLLPKQFVKMFSDKSLFQLTVERNSTLCSLTMVVSNEGQLFLAKDQLDELGILDKSIFLEEPVGRDTAPAIALACMKLDPQEIVFVTPSDHVINVDDGYRSILVQAKRLASEGFLVTFGVTPTFANTGFGYIKSSGDFDVGSFHEKPNADTAEKFLADGSYYWNSGMFMFKAGVFLEELKKHSLEIYAACVEVYDKSDLKNSDAIKYDDMMSIPAKSIDYAVMEKSDRIKMVVADIVWNDVGSFDSLFDQLPKDSNNNTINSNHISIDSKNNLIHSENGSKKVATIGVEDLIVVDSGDALLIAKKGSSQRVKEVVELLSDELKNIHLKAHRPWGTYTVLEDTPGYKIKKIEVKPGKRLSLQKHYHRSEHWIVVSGTATVTKGDQEFIVRPNESVYIRMGEVHRLANNGKIPVVLIEAQVGEYTGEDDIVRLEDDFNRI >NZ_CP013022|793922:803977|800074_801133_+|WP_064460772.1|DBSCAN-SWA MYKAKNILVTGAAGFIGSNYVRMMLSRYNDIKIVSYDKITYAGSLDNLRGLANEHNHTFIKGDICDEALVYKTLKNHSIDTIVHFAAESHVDNSIVNPKVFLETNVIGTFILLNCAKRYWLDELGLDENSCRFHHVSTDEVYGTLAKYEPAFNETKAYEPNSPYSASKAGSNHIARAYYHTYKLPVTISNCSNNYGPYQHPEKLIPVVINSCINQKPIPVYGDGSNIRDWLYVVDHCDAIQTVVAKGVVGEVYNIGGINEVDNLTLINTICKLMDEYKPRNAPHSRLISFVEDRKGHDWRYAIDNGKIQNELGWKPSQDFERMFKETIEFYIGEINTVVSTKVCKMFNKKSI >NZ_CP013022|793922:803977|795320_796460_+|WP_064460767.1|DBSCAN-SWA MKKVALITGITGQDGSYLAEFLLKKDYIVHGIKRRSSLFNTDRIDHLYQDPHFENRNLILHYGDMTDSMNLTKIIADTQPYEIYNLAAMSHVHVSFETPEYVANADGTGTLRILEAVRLLGLEKKTKIYQASTSELYGKVQAIPQSETTPFYPRSPYAVAKMYAFWITVNYREAYGMYACNGILFNHESPVRGETFVTRKITRAASKIALNLQDKLYLGNLDAKRDWGHAKDYVRMMWMILQADQPEDWVIATGQTTTVRDFVKLSFAYAGINLRFENEGIDEIGVVDSVDLSRAEELGVNLSHLSEGQVVVCVDPRYFRPTEVDLLLGDPTKAEQKLGWNREYDLRDLVNDMMESDLKLMTKDVYLKEGGYKIMSYFE >NZ_CP013022|793922:803977|798532_799105_+|WP_064460770.1|DBSCAN-SWA MKFTRADIEDVIICEPAVHGDHRGYFVETFREDKLFDFLGYNINFCQDNESKSSYGVLRGLHYQLPPHSQTKLVRVIQGSVLDVAVDIRNGSPTFGQYVAVELSAENKKQVLVPRGFAHGFVVLEDDTIFAYKVDSYYSPDCDRGIAFDDNYIAIDWQVPSSELKLSVKDKVQPKLAQASDLFEYGANYY |
10 | Escherichia_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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